View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8946_low_6 (Length: 587)

Name: NF8946_low_6
Description: NF8946
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8946_low_6
NF8946_low_6
[»] chr8 (64 HSPs)
chr8 (12-572)||(2316917-2317477)
chr8 (68-362)||(43117414-43117709)
chr8 (68-368)||(28564944-28565244)
chr8 (68-368)||(28572567-28572867)
chr8 (68-368)||(41837754-41838054)
chr8 (68-368)||(42555893-42556193)
chr8 (68-360)||(5589973-5590265)
chr8 (72-361)||(22658150-22658439)
chr8 (72-368)||(4231279-4231575)
chr8 (72-368)||(36060417-36060713)
chr8 (72-362)||(4697872-4698162)
chr8 (68-368)||(7242435-7242734)
chr8 (68-368)||(24796853-24797153)
chr8 (68-362)||(41388071-41388365)
chr8 (72-368)||(7012397-7012692)
chr8 (68-368)||(21434899-21435199)
chr8 (68-362)||(6316942-6317236)
chr8 (72-368)||(3659626-3659922)
chr8 (68-368)||(3886580-3886880)
chr8 (68-368)||(1098117-1098417)
chr8 (80-363)||(10092319-10092602)
chr8 (74-363)||(1183887-1184176)
chr8 (72-368)||(7413091-7413387)
chr8 (162-368)||(38567189-38567395)
chr8 (76-368)||(41169757-41170043)
chr8 (73-368)||(7421860-7422148)
chr8 (76-249)||(197268-197441)
chr8 (76-249)||(312105-312278)
chr8 (214-368)||(9830667-9830821)
chr8 (214-363)||(197267-197417)
chr8 (214-363)||(312104-312254)
chr8 (70-249)||(9830673-9830851)
chr8 (99-246)||(25642676-25642823)
chr8 (100-251)||(43117412-43117563)
chr8 (96-246)||(11635828-11635978)
chr8 (100-277)||(7421994-7422172)
chr8 (96-246)||(36108837-36108987)
chr8 (214-362)||(5590005-5590154)
chr8 (214-362)||(22658178-22658327)
chr8 (230-359)||(36108837-36108967)
chr8 (68-160)||(34934284-34934376)
chr8 (96-247)||(25382979-25383129)
chr8 (234-359)||(25642697-25642823)
chr8 (214-359)||(8996417-8996561)
chr8 (214-368)||(11635819-11635974)
chr8 (230-360)||(25382999-25383129)
chr8 (234-357)||(17836498-17836622)
chr8 (420-487)||(2295990-2296057)
chr8 (100-251)||(6316940-6317090)
chr8 (96-246)||(8995039-8995189)
chr8 (230-359)||(8995039-8995169)
chr8 (271-363)||(38567307-38567399)
chr8 (100-250)||(4697871-4698020)
chr8 (98-228)||(17836514-17836644)
chr8 (68-134)||(38567401-38567467)
chr8 (96-249)||(32017916-32018069)
chr8 (100-249)||(38567195-38567343)
chr8 (97-246)||(8996417-8996564)
chr8 (236-363)||(32017942-32018070)
chr8 (214-344)||(43073117-43073247)
chr8 (97-228)||(43073120-43073250)
chr8 (214-266)||(34934316-34934368)
chr8 (327-362)||(8996526-8996561)
chr8 (310-350)||(42559031-42559071)
[»] chr1 (69 HSPs)
chr1 (68-363)||(25298886-25299181)
chr1 (68-368)||(51139745-51140045)
chr1 (68-368)||(16692747-16693047)
chr1 (68-368)||(23177401-23177701)
chr1 (72-368)||(33011859-33012155)
chr1 (68-368)||(47561786-47562086)
chr1 (68-351)||(40567042-40567325)
chr1 (68-368)||(29981505-29981805)
chr1 (68-360)||(40428579-40428871)
chr1 (68-368)||(45836903-45837203)
chr1 (68-368)||(48708215-48708515)
chr1 (72-368)||(17285095-17285392)
chr1 (72-368)||(919512-919808)
chr1 (72-368)||(42372029-42372325)
chr1 (68-368)||(44052257-44052557)
chr1 (72-363)||(46224564-46224853)
chr1 (68-360)||(8086297-8086589)
chr1 (68-368)||(29170001-29170301)
chr1 (68-368)||(37125752-37126052)
chr1 (68-360)||(24790502-24790795)
chr1 (68-368)||(8530142-8530448)
chr1 (68-362)||(24542578-24542873)
chr1 (68-368)||(6849812-6850111)
chr1 (100-368)||(24544548-24544816)
chr1 (80-362)||(9042229-9042510)
chr1 (100-362)||(24542724-24542987)
chr1 (100-362)||(24542838-24543101)
chr1 (100-362)||(24542952-24543215)
chr1 (100-362)||(24543066-24543329)
chr1 (100-362)||(24543180-24543443)
chr1 (100-362)||(24543294-24543557)
chr1 (100-362)||(24543408-24543671)
chr1 (100-362)||(24543522-24543785)
chr1 (100-362)||(24543636-24543899)
chr1 (100-362)||(24543750-24544013)
chr1 (100-362)||(24543864-24544127)
chr1 (100-362)||(24543978-24544241)
chr1 (100-362)||(24544092-24544355)
chr1 (100-362)||(24544206-24544469)
chr1 (100-362)||(24544320-24544583)
chr1 (100-362)||(24544434-24544697)
chr1 (72-219)||(37343082-37343229)
chr1 (214-368)||(44317626-44317780)
chr1 (214-362)||(40567144-40567293)
chr1 (85-250)||(49001410-49001576)
chr1 (96-249)||(9246840-9246993)
chr1 (68-249)||(44317632-44317812)
chr1 (91-247)||(32540528-32540684)
chr1 (214-362)||(8086408-8086557)
chr1 (96-246)||(21852069-21852219)
chr1 (214-362)||(24790613-24790763)
chr1 (232-363)||(9246862-9246994)
chr1 (233-360)||(32540556-32540684)
chr1 (230-359)||(21852069-21852199)
chr1 (214-362)||(40428611-40428760)
chr1 (214-362)||(49001425-49001575)
chr1 (99-242)||(46601074-46601217)
chr1 (107-239)||(29055884-29056015)
chr1 (230-352)||(29055893-29056015)
chr1 (214-332)||(37343082-37343201)
chr1 (214-355)||(46601074-46601216)
chr1 (99-249)||(25030324-25030467)
chr1 (104-250)||(9042367-9042511)
chr1 (233-363)||(25030323-25030447)
chr1 (327-362)||(45807077-45807112)
chr1 (213-251)||(45807075-45807113)
chr1 (329-362)||(1243675-1243708)
chr1 (394-422)||(29169937-29169965)
chr1 (326-358)||(43060319-43060351)
[»] chr6 (32 HSPs)
chr6 (68-362)||(12698560-12698853)
chr6 (72-368)||(2660641-2660937)
chr6 (68-368)||(11450304-11450603)
chr6 (68-363)||(7021882-7022176)
chr6 (72-362)||(26468514-26468804)
chr6 (68-368)||(15469149-15469448)
chr6 (68-368)||(34023341-34023641)
chr6 (68-351)||(24130043-24130326)
chr6 (80-362)||(34127563-34127845)
chr6 (70-368)||(9078857-9079154)
chr6 (70-368)||(24635271-24635569)
chr6 (68-368)||(8560485-8560786)
chr6 (68-362)||(23258753-23259048)
chr6 (81-368)||(16461220-16461508)
chr6 (72-368)||(14882965-14883261)
chr6 (99-352)||(12996359-12996613)
chr6 (100-362)||(23258899-23259161)
chr6 (214-362)||(12996464-12996612)
chr6 (214-363)||(13405307-13405457)
chr6 (91-249)||(13405298-13405456)
chr6 (100-251)||(12698558-12698707)
chr6 (96-249)||(7536522-7536675)
chr6 (214-363)||(7536521-7536671)
chr6 (214-362)||(24130075-24130224)
chr6 (239-359)||(10290526-10290647)
chr6 (96-207)||(31968932-31969044)
chr6 (100-251)||(23259013-23259163)
chr6 (125-246)||(10290526-10290647)
chr6 (233-308)||(31968955-31969031)
chr6 (230-352)||(1398066-1398188)
chr6 (96-247)||(2064778-2064928)
chr6 (279-355)||(31489894-31489970)
[»] chr3 (62 HSPs)
chr3 (68-368)||(29125843-29126143)
chr3 (68-363)||(11231954-11232249)
chr3 (72-368)||(44254404-44254700)
chr3 (68-368)||(28952191-28952491)
chr3 (68-361)||(50527433-50527726)
chr3 (68-368)||(12251307-12251607)
chr3 (72-355)||(32270722-32271006)
chr3 (72-361)||(27742552-27742841)
chr3 (68-360)||(22729287-22729579)
chr3 (68-368)||(52202041-52202341)
chr3 (72-363)||(35083857-35084148)
chr3 (68-360)||(1092677-1092969)
chr3 (72-368)||(36633546-36633835)
chr3 (68-360)||(49657011-49657303)
chr3 (72-368)||(16908622-16908908)
chr3 (81-362)||(21259133-21259415)
chr3 (116-368)||(13594721-13594973)
chr3 (100-368)||(21259266-21259534)
chr3 (72-368)||(52571236-52571524)
chr3 (178-368)||(49169852-49170042)
chr3 (68-248)||(25246137-25246317)
chr3 (73-368)||(45045268-45045563)
chr3 (81-249)||(7160216-7160384)
chr3 (215-368)||(18163777-18163930)
chr3 (68-249)||(18163783-18163963)
chr3 (155-331)||(743958-744125)
chr3 (214-362)||(32270750-32270900)
chr3 (214-368)||(44205471-44205626)
chr3 (214-368)||(4618210-4618362)
chr3 (68-249)||(44205477-44205658)
chr3 (214-362)||(49657043-49657192)
chr3 (228-362)||(13594719-13594854)
chr3 (96-235)||(31174500-31174639)
chr3 (214-362)||(22729398-22729547)
chr3 (214-368)||(7160235-7160390)
chr3 (214-362)||(50527465-50527614)
chr3 (230-348)||(31174520-31174639)
chr3 (230-359)||(34660814-34660943)
chr3 (214-362)||(27742664-27742813)
chr3 (106-246)||(34660814-34660953)
chr3 (230-362)||(1092725-1092858)
chr3 (214-359)||(2618953-2619098)
chr3 (76-249)||(4618216-4618386)
chr3 (100-249)||(49169858-49170006)
chr3 (100-249)||(13594819-13594967)
chr3 (96-246)||(2618953-2619102)
chr3 (214-361)||(25246169-25246317)
chr3 (155-239)||(52499197-52499281)
chr3 (96-228)||(576405-576536)
chr3 (72-156)||(49170168-49170252)
chr3 (234-344)||(576428-576539)
chr3 (279-362)||(744032-744114)
chr3 (96-157)||(18657974-18658035)
chr3 (279-352)||(52499208-52499281)
chr3 (100-170)||(743998-744067)
chr3 (234-266)||(18657979-18658011)
chr3 (147-238)||(30587572-30587663)
chr3 (214-279)||(49170158-49170224)
chr3 (294-355)||(18657913-18657974)
chr3 (327-360)||(25894699-25894732)
chr3 (327-360)||(25911666-25911699)
chr3 (178-226)||(18657929-18657977)
[»] chr7 (76 HSPs)
chr7 (68-368)||(26873762-26874062)
chr7 (72-368)||(22723579-22723875)
chr7 (72-368)||(45350110-45350406)
chr7 (72-368)||(46027739-46028035)
chr7 (68-368)||(31065422-31065722)
chr7 (68-368)||(36358109-36358409)
chr7 (70-368)||(43859150-43859448)
chr7 (72-362)||(17166931-17167222)
chr7 (75-368)||(44467827-44468120)
chr7 (68-368)||(44142821-44143120)
chr7 (80-363)||(36675298-36675581)
chr7 (70-362)||(44723864-44724156)
chr7 (68-352)||(40055666-40055950)
chr7 (80-368)||(42241740-42242028)
chr7 (72-368)||(9624055-9624351)
chr7 (72-356)||(23469199-23469483)
chr7 (74-360)||(29075000-29075276)
chr7 (73-368)||(39976380-39976675)
chr7 (72-368)||(31428796-31429092)
chr7 (72-362)||(41367724-41368014)
chr7 (74-368)||(16834080-16834376)
chr7 (72-249)||(8461764-8461941)
chr7 (72-249)||(31931827-31932004)
chr7 (80-246)||(46828761-46828926)
chr7 (96-245)||(25174216-25174365)
chr7 (73-218)||(29663010-29663155)
chr7 (72-249)||(23562564-23562740)
chr7 (77-249)||(18104240-18104411)
chr7 (214-362)||(23469227-23469376)
chr7 (100-251)||(17166929-17167080)
chr7 (214-362)||(40055769-40055918)
chr7 (246-368)||(18104295-18104417)
chr7 (214-368)||(31931855-31932010)
chr7 (214-363)||(8461763-8461913)
chr7 (96-245)||(16649537-16649685)
chr7 (96-245)||(17623898-17624046)
chr7 (214-358)||(25174216-25174361)
chr7 (96-246)||(29502072-29502222)
chr7 (214-359)||(46828781-46828926)
chr7 (90-228)||(9014478-9014623)
chr7 (96-246)||(30781079-30781228)
chr7 (90-246)||(22499716-22499868)
chr7 (230-368)||(23562608-23562746)
chr7 (233-359)||(29502095-29502222)
chr7 (94-228)||(9013902-9014035)
chr7 (214-362)||(29075026-29075165)
chr7 (230-358)||(16649557-16649685)
chr7 (230-358)||(17623918-17624046)
chr7 (90-222)||(9021516-9021648)
chr7 (96-242)||(28754878-28755023)
chr7 (214-331)||(29663010-29663128)
chr7 (96-247)||(40883349-40883499)
chr7 (103-210)||(4248865-4248972)
chr7 (233-343)||(9014476-9014587)
chr7 (96-203)||(24779581-24779688)
chr7 (214-343)||(9013900-9014029)
chr7 (234-355)||(28754878-28754999)
chr7 (230-359)||(30781079-30781208)
chr7 (295-356)||(22566606-22566667)
chr7 (100-183)||(6961163-6961246)
chr7 (214-359)||(22499726-22499868)
chr7 (214-355)||(8727794-8727936)
chr7 (175-243)||(22566599-22566667)
chr7 (232-305)||(4248880-4248954)
chr7 (230-277)||(6961182-6961230)
chr7 (310-363)||(6961111-6961164)
chr7 (315-360)||(40883349-40883394)
chr7 (230-308)||(24779601-24779680)
chr7 (149-206)||(14629638-14629695)
chr7 (95-199)||(8727837-8727941)
chr7 (140-239)||(4248984-4249083)
chr7 (263-350)||(14629639-14629726)
chr7 (247-352)||(4248977-4249083)
chr7 (214-335)||(9021516-9021638)
chr7 (201-249)||(6961112-6961160)
chr7 (391-419)||(9014390-9014418)
[»] chr5 (48 HSPs)
chr5 (68-368)||(26525028-26525328)
chr5 (70-368)||(16823190-16823488)
chr5 (68-368)||(3631318-3631618)
chr5 (68-368)||(7440279-7440579)
chr5 (80-363)||(43348698-43348981)
chr5 (72-368)||(30772938-30773234)
chr5 (68-368)||(43358469-43358769)
chr5 (68-368)||(25701220-25701519)
chr5 (76-368)||(32304459-32304751)
chr5 (72-368)||(8074041-8074337)
chr5 (68-368)||(13013053-13013353)
chr5 (68-368)||(13084441-13084741)
chr5 (80-368)||(9595976-9596264)
chr5 (74-368)||(41084386-41084680)
chr5 (83-362)||(26296822-26297101)
chr5 (72-368)||(10925568-10925864)
chr5 (82-368)||(15374174-15374445)
chr5 (72-289)||(26784968-26785185)
chr5 (68-339)||(15374301-15374586)
chr5 (70-249)||(9737621-9737799)
chr5 (214-363)||(9737651-9737800)
chr5 (72-251)||(20656773-20656952)
chr5 (230-368)||(29390328-29390466)
chr5 (78-246)||(20487040-20487208)
chr5 (96-249)||(19577120-19577273)
chr5 (214-359)||(20487040-20487186)
chr5 (90-242)||(41817525-41817677)
chr5 (214-362)||(20656801-20656950)
chr5 (100-246)||(37042496-37042643)
chr5 (96-239)||(22578874-22579017)
chr5 (214-360)||(26785010-26785157)
chr5 (230-363)||(19577140-19577274)
chr5 (248-368)||(5844165-5844285)
chr5 (128-251)||(26296980-26297103)
chr5 (110-249)||(29390334-29390472)
chr5 (234-355)||(41817525-41817647)
chr5 (233-359)||(37042515-37042643)
chr5 (214-352)||(22578878-22579017)
chr5 (90-246)||(28662185-28662341)
chr5 (232-359)||(28662185-28662313)
chr5 (152-239)||(20071209-20071296)
chr5 (138-249)||(30050074-30050184)
chr5 (252-363)||(30050074-30050185)
chr5 (243-352)||(20071186-20071296)
chr5 (136-249)||(5844171-5844283)
chr5 (295-363)||(30062714-30062782)
chr5 (203-249)||(30062735-30062781)
chr5 (310-354)||(20117490-20117534)
[»] chr2 (50 HSPs)
chr2 (72-368)||(44545532-44545828)
chr2 (68-363)||(26293224-26293519)
chr2 (68-368)||(34983335-34983635)
chr2 (68-363)||(36435981-36436276)
chr2 (68-362)||(1020867-1021161)
chr2 (84-368)||(2249640-2249924)
chr2 (70-368)||(23869722-23870020)
chr2 (72-368)||(11764853-11765149)
chr2 (68-362)||(1114837-1115131)
chr2 (68-368)||(16194311-16194611)
chr2 (68-368)||(6749805-6750105)
chr2 (68-362)||(26860461-26860755)
chr2 (68-368)||(13615762-13616062)
chr2 (72-360)||(7366218-7366506)
chr2 (72-368)||(12995025-12995321)
chr2 (68-368)||(38527233-38527532)
chr2 (68-368)||(31392606-31392904)
chr2 (84-368)||(42016562-42016846)
chr2 (68-363)||(28745303-28745586)
chr2 (99-363)||(11935205-11935470)
chr2 (181-368)||(38763773-38763960)
chr2 (82-360)||(3836154-3836431)
chr2 (68-249)||(22674652-22674833)
chr2 (72-249)||(43471370-43471547)
chr2 (68-249)||(41699249-41699427)
chr2 (68-249)||(34494388-34494568)
chr2 (214-368)||(34494420-34494574)
chr2 (96-247)||(31643551-31643702)
chr2 (230-368)||(43471414-43471553)
chr2 (238-368)||(19283899-19284029)
chr2 (72-241)||(19283847-19284015)
chr2 (96-238)||(29141871-29142013)
chr2 (84-241)||(2077563-2077720)
chr2 (100-249)||(38763779-38763927)
chr2 (214-368)||(22674684-22674839)
chr2 (100-251)||(26860607-26860757)
chr2 (214-368)||(41699243-41699395)
chr2 (214-360)||(31643555-31643702)
chr2 (96-246)||(32099999-32100154)
chr2 (96-246)||(29035340-29035490)
chr2 (214-351)||(29141875-29142013)
chr2 (214-354)||(2077563-2077704)
chr2 (234-362)||(3836192-3836319)
chr2 (232-359)||(29035362-29035490)
chr2 (233-359)||(32099999-32100131)
chr2 (68-121)||(38763961-38764014)
chr2 (295-363)||(17526052-17526120)
chr2 (182-249)||(17526052-17526119)
chr2 (99-131)||(17526001-17526033)
chr2 (326-362)||(44788476-44788512)
[»] chr4 (71 HSPs)
chr4 (68-368)||(11650765-11651065)
chr4 (68-368)||(12700367-12700667)
chr4 (68-368)||(44745389-44745689)
chr4 (68-350)||(31663966-31664248)
chr4 (70-368)||(43564477-43564775)
chr4 (72-368)||(13233289-13233585)
chr4 (68-363)||(31581549-31581844)
chr4 (68-368)||(16925165-16925465)
chr4 (68-368)||(38141356-38141656)
chr4 (80-368)||(2654721-2655009)
chr4 (72-368)||(18491246-18491542)
chr4 (80-368)||(36954821-36955109)
chr4 (68-362)||(36584488-36584782)
chr4 (72-368)||(6755888-6756183)
chr4 (72-368)||(40228233-40228529)
chr4 (72-368)||(13612895-13613191)
chr4 (72-368)||(44134553-44134848)
chr4 (70-368)||(19653446-19653743)
chr4 (80-363)||(41832440-41832724)
chr4 (68-368)||(52581515-52581816)
chr4 (72-368)||(54795532-54795828)
chr4 (68-350)||(22647189-22647470)
chr4 (72-368)||(27270412-27270708)
chr4 (80-368)||(50767093-50767381)
chr4 (74-363)||(4632509-4632799)
chr4 (82-368)||(10096270-10096555)
chr4 (157-360)||(44817438-44817640)
chr4 (72-248)||(51001542-51001717)
chr4 (217-368)||(45670019-45670170)
chr4 (90-242)||(36801795-36801947)
chr4 (214-362)||(31663998-31664147)
chr4 (214-359)||(13857680-13857826)
chr4 (96-245)||(13869211-13869360)
chr4 (97-246)||(13857680-13857829)
chr4 (214-354)||(7638702-7638842)
chr4 (100-250)||(36584487-36584636)
chr4 (96-241)||(7638698-7638842)
chr4 (96-241)||(10393896-10394041)
chr4 (214-358)||(13869211-13869356)
chr4 (103-249)||(45670025-45670170)
chr4 (214-362)||(22647289-22647438)
chr4 (80-237)||(26653060-26653217)
chr4 (68-143)||(45670169-45670244)
chr4 (214-355)||(36801805-36801947)
chr4 (271-362)||(44817439-44817530)
chr4 (100-247)||(44817495-44817640)
chr4 (230-350)||(26653096-26653217)
chr4 (233-361)||(51001542-51001670)
chr4 (96-180)||(7776903-7776987)
chr4 (96-249)||(18668994-18669150)
chr4 (96-249)||(18707742-18707898)
chr4 (96-249)||(18735245-18735401)
chr4 (90-249)||(133416-133574)
chr4 (237-354)||(10393896-10394014)
chr4 (229-363)||(18707741-18707880)
chr4 (233-363)||(133415-133545)
chr4 (233-363)||(18735244-18735379)
chr4 (214-291)||(7776905-7776983)
chr4 (229-363)||(18668993-18669132)
chr4 (319-363)||(9046131-9046175)
chr4 (96-199)||(18715048-18715150)
chr4 (96-157)||(5734193-5734254)
chr4 (95-192)||(9046035-9046131)
chr4 (234-266)||(5734198-5734230)
chr4 (234-290)||(9046060-9046116)
chr4 (206-249)||(9046131-9046174)
chr4 (329-363)||(18714844-18714878)
chr4 (294-355)||(5734132-5734193)
chr4 (281-358)||(15632201-15632278)
chr4 (229-266)||(18715095-18715132)
chr4 (178-226)||(5734148-5734196)
[»] scaffold0050 (1 HSPs)
scaffold0050 (74-368)||(19105-19399)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (73-362)||(65112-65402)
scaffold0014 (100-361)||(65000-65261)
[»] scaffold0978 (2 HSPs)
scaffold0978 (72-360)||(1171-1459)
scaffold0978 (230-362)||(1282-1415)
[»] scaffold0002 (3 HSPs)
scaffold0002 (136-368)||(331831-332063)
scaffold0002 (249-362)||(331950-332064)
scaffold0002 (74-143)||(332441-332510)
[»] scaffold0131 (2 HSPs)
scaffold0131 (162-368)||(11237-11443)
scaffold0131 (271-362)||(11356-11447)
[»] scaffold0041 (2 HSPs)
scaffold0041 (96-247)||(82785-82935)
scaffold0041 (315-360)||(82890-82935)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (152-239)||(303814-303901)
scaffold0003 (243-352)||(303791-303901)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 441; Significance: 0; HSPs: 64)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 441; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 2317477 - 2316917
Alignment:
Q  12 acagacaaaggggataaaaacactcactagaagtcagcggcggagttagnnnnnnntgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||       ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2317477 acagacaaaggggataaaaacactcactagaagtcaatggcggagtcagaaaaaaatgtcagggtgggccactaaaattaactattgaaaaattgtttaa 2317378  T
Q  112 agtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgac 211  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2317377 agtctcgcaaactagatctataactgaattatttaaatttttcgggtgaaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgac 2317278  T
Q  212 ataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaa 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2317277 ataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcgggtgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaa 2317178  T
Q  312 acataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttgannnnnnnnnnnnnctgggtgggccacagcccatgaagggctcc 411  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||             | | |||||||||||| |||||||||||||    
T  2317177 acataaaaccaacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatcgttgattttttaatttttccgagtgggccacagctcatgaagggctcc 2317078  T
Q  412 gccactgctagaagtgaaatgttcatacaaataatgcattctgatatagttctttatgttgaaataataataagatgcagtggtggaaaaagtggtaatg 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2317077 gccactgctagaagtgaaatgttcatacaaataatgcattctgatatagttctttatgttgaaataataataagatgcagtggtggaaaaagtggtaatg 2316978  T
Q  512 gtgtagctcatggactagcccaattagctatcacggacgctaataagatttgggtggaaaa 572  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  2316977 gtgtagctcatggactagcccaattagctatcactgaccctaataagatttgggtggaaaa 2316917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 68 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 43117709 - 43117414
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccacta 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  43117709 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaagttgtttaaagtctcgcaaattagacctataattgaattatttaaatttttcgggtgggccacta 43117610  T
Q  168 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaa-tttt 266  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43117609 aaccaatttgcaggaatttggatcaaccgaaacctaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttt 43117510  T
Q  267 cggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataat 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43117509 cggatgggccattacaccactttgcaggaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataat 43117414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 68 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 28565244 - 28564944
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccacta 167  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  28565244 tgtcagggtgggccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaattagactcataattgaattatttaaatttttcgggtgggccacta 28565145  T
Q  168 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28565144 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaacctaaaaccgacataaaattgtataaaatctcacaaaatagacctataattgaatcatttaaattttc 28565045  T
Q  268 ggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttg 367  Q
    || ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28565044 gggtgggccactacaccactttgcaagaatttggatcaaccaaaacataaaactgacacaaaattgcataaaatctcgcaaaatagacctataatcgttg 28564945  T
Q  368 a 368  Q
    |    
T  28564944 a 28564944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 68 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 28572867 - 28572567
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccacta 167  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  28572867 tgtcagggtgggccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaattagactcataattgaattatttaaatttttcgggtgggccacta 28572768  T
Q  168 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28572767 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaacctaaaaccgacataaaattgtataaaatctcacaaaatagacctataattgaatcatttaaattttc 28572668  T
Q  268 ggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttg 367  Q
    || ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28572667 gggtgggccactacaccactttgcaagaatttggatcaaccaaaacataaaactgacacaaaattgcataaaatctcgcaaaatagacctataatcgttg 28572568  T
Q  368 a 368  Q
    |    
T  28572567 a 28572567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 68 - 368
Target Start/End: Original strand, 41837754 - 41838054
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccacta 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||    
T  41837754 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgtaaattagacctataattgaattatttaaatttttcgggtgtgccacta 41837853  T
Q  168 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41837854 caccaatttgcgggaatttggatcaaccaaaacctaaaatcgacataaaattgtataaaatctcccaaaataaacctataattgaattatttaaattttc 41837953  T
Q  268 ggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttg 367  Q
    || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41837954 gggtggaccactacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgcataaaatctcgcaaaatagacctataatcgttg 41838053  T
Q  368 a 368  Q
    |    
T  41838054 a 41838054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 68 - 368
Target Start/End: Original strand, 42555893 - 42556193
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccacta 167  Q
    ||||||||||| | | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  42555893 tgtcagggtgggctattaaaataaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaattagacatataattgaattatttaaatttttcgggtgggccacta 42555992  T
Q  168 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 267  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42555993 caccaaattgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 42556092  T
Q  268 ggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttg 367  Q
    || ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  42556093 gggtgggccactgcaccactttgcaggaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgcataaaatctcgcaaaatagacctataatcgttg 42556192  T
Q  368 a 368  Q
    |    
T  42556193 a 42556193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 68 - 360
Target Start/End: Original strand, 5589973 - 5590265
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccacta 167  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5589973 tgtcagggtgggccactaaaatttaccattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaattagatctataattgaattatttaaatttttcgggtggaccacta 5590072  T
Q  168 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5590073 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaacctaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttg 5590172  T
Q  268 ggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctata 360  Q
    || ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  5590173 gggtgggccactacaccactttgtaggaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgcataaaatctcgaaaaatagacctata 5590265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 72 - 361
Target Start/End: Original strand, 22658150 - 22658439
Alignment:
Q  72 agggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacacc 171  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22658150 agggtgggccattaaaattaacttttgaaaaattgtttaaagtctcgcaaattagacctataattgaattatttaaatttttcgggtgggccactacacc 22658249  T
Q  172 aatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcggat 271  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22658250 aatttgtgggaattgggatcaaccgaaacctaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcgggt 22658349  T
Q  272 gggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataa 361  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22658350 gggccactacaccactttgcaggaatttggatcaatcaaaacataaaaccgacacaaaattgcataaaatctcgcaaaatagacctataa 22658439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 72 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 4231575 - 4231279
Alignment:
Q  72 agggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacacc 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||  |||||||||    
T  4231575 agggtggaccactaaaattaactattaaaaaattgtttaaagtctcgcaaattagacctataattgaattatttaaatttttcggatggggcactacacc 4231476  T
Q  172 aatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcggat 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4231475 aatttgcgggaatttggatcaaccgaaacctaaaatcgacataaaattgtataaaatctcgtaaaatagacctataattgaattatttaaattttcgggt 4231376  T
Q  272 gggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttga 368  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  4231375 gggccactacaccactttgcaggaatttagatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgcataaaatctcgtaaaatagacctataatcgttga 4231279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 72 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 36060713 - 36060417
Alignment:
Q  72 agggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacacc 171  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36060713 agggtgggccactaaaattaactattaaaaaattgtttaaagtctcgcaaattagacctataattgaattatttaaatttttcgggtggaccactacacc 36060614  T
Q  172 aatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcggat 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36060613 aatttgcgggaatttggatcaaccgaaacttaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcgggt 36060514  T
Q  272 gggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttga 368  Q
    | |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  36060513 gtgccactacaccactttccaggaatttggatcaaccaaaacataaaattgacacaaaattgcataaaatctcgcaaaatatacctataatcgttga 36060417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 72 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 4698162 - 4697872
Alignment:
Q  72 agggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacacc 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||    
T  4698162 agggtgggccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtcttgcaaattagacctataattgaattatttaaatttttcgggtgagccactacacc 4698063  T
Q  172 aatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcggat 271  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4698062 aatttgcgggaatttggataaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagatctataattgaattatttaaattttcggat 4697963  T
Q  272 gggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataat 362  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| || |||||||||    
T  4697962 gggccactacaccactttgcaggaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgcataaaatcttgtaaagtaaacctataat 4697872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 68 - 368
Target Start/End: Original strand, 7242435 - 7242734
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccacta 167  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  7242435 tgtcagggtgggccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaattagacctataattgaattatttaaatttttcgggtgggccacta 7242534  T
Q  168 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  7242535 caccaatttgcgggaatttggatcaaccaaaacctaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacatataattgaattatttaaa-tttc 7242633  T
Q  268 ggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttg 367  Q
    || ||||||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  7242634 gggtgggccactataccattttgcaggaatttggatcaaccaaaacataaaaccaacacaaaattgcataaaatctcgcaaaataaacctataatcgttg 7242733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 68 - 368
Target Start/End: Original strand, 24796853 - 24797153
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccacta 167  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24796853 tgtcagggtgggccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcacaaattagacctataattgaattatttaaatttttcgggtggaccacta 24796952  T
Q  168 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 267  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||     
T  24796953 caccaatttgcggtaatttggatcaaccgaaacctaaaatcgacataaaattgtataaaatctcgcaaattatatctataattgaattatttaaattttt 24797052  T
Q  268 ggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttg 367  Q
    || ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  24797053 gggtgggccactacaccactttgcaggaatttggatcaaccaaaacataaaaccgatacaaaattgcataaaatcttgcaaaatagacctataatcgttg 24797152  T
Q  368 a 368  Q
    |    
T  24797153 a 24797153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 68 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 41388365 - 41388071
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccacta 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||    
T  41388365 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattatttaaagtctcgcaaattagacctataattgaattatttaaatttttcgggtgggctacta 41388266  T
Q  168 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 267  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41388265 caccaatttgcgggaatttgaatcaaccgaaacctaaaaccgacataaaattgtataaaatctcacaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 41388166  T
Q  268 ggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataat 362  Q
    || |||  || |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  41388165 gggtggatcactacaccactttgcaggaatttggataaaccaaatcataaaaccgacacaaaattgtataaaatcttgcaaaataaacctataat 41388071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 72 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 7012692 - 7012397
Alignment:
Q  72 agggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacacc 171  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  7012692 agggtggaccactaaaatta-ctattgaaaaattgtttaaagtctcacaaattagacctataattgaattatttaaatttttcgggtggaccactactcc 7012594  T
Q  172 aatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcggat 271  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  7012593 aatttgcgggaatttggatcaactgaaacctaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttagggt 7012494  T
Q  272 gggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttga 368  Q
    || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  7012493 ggaccactacaccactttgcaggaatttggatcaaccaaaacataaaaccgatacaaaattgcataagatatcgcaaaatagacctataatcattga 7012397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 68 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 21435199 - 21434899
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccacta 167  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||| |||||| ||||||    
T  21435199 tgtcaggatgggccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaattagacctataattgaattatttaaactttttgggtgggccacta 21435100  T
Q  168 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21435099 caccaatttgcgggaatttggatcaaccaaaacctaaaaccgacataaaattgtataaaatctagcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 21435000  T
Q  268 ggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttg 367  Q
    |  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||    
T  21434999 gagtgggccactacaccactttgcaggaatttggatcaaccaaaacataaaaccaacacaaaattgcataaaacctcgcaaaataaacctataatcgttg 21434900  T
Q  368 a 368  Q
    |    
T  21434899 a 21434899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 68 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 6317236 - 6316942
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccacta 167  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  6317236 tgtcagggtgggccactaaaagtaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaattagacctttaattgaattatttaaatttttcgggtgggccacta 6317137  T
Q  168 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  6317136 caccaatttgcgggaatttggatcatccgaaacctaaaatcgacataaaattgtataaattctcgcaaaataaaactataattgaattatttaaattttc 6317037  T
Q  268 ggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataat 362  Q
    || ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  6317036 gggtgggccactacaccactttgcaagaatttggatcaaccaaaacataaaatcgacacaaaattgcataaaatctcacaaaatagacctataat 6316942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 72 - 368
Target Start/End: Original strand, 3659626 - 3659922
Alignment:
Q  72 agggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacacc 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||    
T  3659626 agggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaattagacctataattgaattatttaaatttttcgggtgagccactacacc 3659725  T
Q  172 aatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcggat 271  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  3659726 aatttgcggaaattttgatcaaccgaaacctaaaaccgatataaaattgtataaaatctcgcaaaacagacctataattgaattatttaaatttccgggt 3659825  T
Q  272 gggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttga 368  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  3659826 gggccactacaccactttgcaggaatttggatcaaccaaaacgtaaacctgacacaaaattgcataaaatctcgcaaaatagacttataatcgttga 3659922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 68 - 368
Target Start/End: Original strand, 3886580 - 3886880
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccacta 167  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||  || ||    
T  3886580 tgtcagggtgggccactaaaattaacttttaaaaaattgtttaaagtctcacaaattagacctataattaaattatttaaatttttcgggtgggtcagta 3886679  T
Q  168 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 267  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3886680 caccaatttgcgggaattgggatcaaccaaaacctaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttt 3886779  T
Q  268 ggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttg 367  Q
    || ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3886780 ggttgggccactacaccactttgcaggaatttggatcaaccaaaacataaaatcgacacaaaattgcataaaatctcgcaaaatagacctataatcgttg 3886879  T
Q  368 a 368  Q
    |    
T  3886880 a 3886880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 68 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 1098417 - 1098117
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccacta 167  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  1098417 tgtcagggtgggccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcacaaattagacctataattgaattatttaaatttttcggttggaccacta 1098318  T
Q  168 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 267  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1098317 caccaatttgcagaaatttggatcaaccgaaacctaaaactgacataaatttgtataaaatctcacaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 1098218  T
Q  268 ggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttg 367  Q
    || ||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||    
T  1098217 gggtgggccactacaccactttataggaatttggatcaaccaaaacataaaactgatacaaaattgcataaaatatcgcaaattagacctataatcgttg 1098118  T
Q  368 a 368  Q
    |    
T  1098117 a 1098117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 80 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 10092602 - 10092319
Alignment:
Q  80 ccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcg 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  10092602 ccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaattagacctataattgaattatttaaatttttcggatgggccactataccaatttgcg 10092503  T
Q  180 ggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcggatgggccatt 279  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  10092502 ggaatttggatctaccaaaacctaaaatcgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagatctataattgaattatttaaattttcgggtgggccact 10092403  T
Q  280 acaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatc 363  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10092402 acaccattttgcaggaatttggatcaactaaaacaaaaaaccaacacaaaattgcataaaatctcgcaaaatagacctataatc 10092319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 74 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 1184176 - 1183887
Alignment:
Q  74 ggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaa 173  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  1184176 ggtgggccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaattagatctataattgaattatttaaatttttcggatgggccactacaccaa 1184077  T
Q  174 tttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcggatgg 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  1184076 tttgcgggaatttggatcaaccgaaacctaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgcaaattagacctataattgaattatttaaatttttgggtgg 1183977  T
Q  274 gccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatc 363  Q
     ||| ||||| |||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1183976 tccactacactactttttaggaatttgaatcaaccaaaacataaaaccgatacaaaattgcataaaatctcgcaaaatagatctataatc 1183887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 72 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 7413387 - 7413091
Alignment:
Q  72 agggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacacc 171  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||||||    
T  7413387 agggtgggccattaaaattaaccgttgaaaaattgtttaaagtctcgcaaaatagacctataattgaattgtttaaatttttcgggtggactactacacc 7413288  T
Q  172 aatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaa-ttttcgga 270  Q
    | |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||     
T  7413287 actttgagggaatttgaatcaaccgaaacctaaaaccgacataaaaatgtataaaatctcg-aaaatagacctataattgaattatttaaattttttggg 7413189  T
Q  271 tgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttga 368  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7413188 tgggccactacaccactttgcgggaatttggatcaatcaaaacctaaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatcgttga 7413091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 162 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 38567395 - 38567189
Alignment:
Q  162 ccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaa 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38567395 ccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaacctaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatcgaattatttaa 38567296  T
Q  262 attttcggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataa 361  Q
    |||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  38567295 attttcgggtgggccactacacaactttgcaggaatttggatcaacaaaaacataaaatcaacacaaaattgcataaaatctcgcaaaatatacctataa 38567196  T
Q  362 tctttga 368  Q
    || ||||    
T  38567195 tcgttga 38567189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 76 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 41170043 - 41169757
Alignment:
Q  76 tggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatt 175  Q
    ||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||| |  |||| |||||||      ||||||| |||||||| || |||| ||||||||||| ||    
T  41170043 tggaccattaaaattatccgttgaaaaattgtttaaagttttacaaaatagacct------gaattatttaaatttt-cgagtgggccactacaccactt 41169951  T
Q  176 tgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaa-ttttcggatggg 274  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  41169950 tgcgggaatttggattaaccaaaacctagaaccgacataaaattatataaaatctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttttggatggg 41169851  T
Q  275 ccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttga 368  Q
     || ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  41169850 tcactacaccactttgcgtgaatttagatcaacctaaacctaaaaccgacacaaaattatttaaaatatcgtaaaatagacgtataaactttga 41169757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 73 - 368
Target Start/End: Original strand, 7421860 - 7422148
Alignment:
Q  73 gggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacacca 172  Q
    |||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  7421860 gggtgggccacaaaaattatccgttgaaaaattgtttaaagtcttgcaaaatagacatataattgaattgtttaaattttt-gggtggatcactacacca 7421958  T
Q  173 atttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaa-ttttcggat 271  Q
     ||||||||||||| ||| |||||||| ||      || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |    
T  7421959 ctttgcgggaatttagattaaccgaaaact------gatataaaattttataaaatctcgcaaaatagacctataattgaa-tatttaaatttttcgggt 7422051  T
Q  272 gggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttga 368  Q
    ||| || |||| |||||| |  ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  7422052 gggtcactacatcacttttcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaataaacctataatcgttga 7422148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 76 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 197441 - 197268
Alignment:
Q  76 tggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatt 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||| || ||| ||| ||||||||||    
T  197441 tggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtatcgcaaattagacttataattgaattatttaaattttttggatgggccattacaccaatt 197342  T
Q  176 tgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataat 249  Q
    ||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  197341 tgcagaaatttggatcaaccgaaacttaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataat 197268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 76 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 312278 - 312105
Alignment:
Q  76 tggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatt 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||| || ||| ||| ||||||||||    
T  312278 tggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtatcgcaaattagacttataattgaattatttaaattttttggatgggccattacaccaatt 312179  T
Q  176 tgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataat 249  Q
    ||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  312178 tgcagaaatttggatcaaccgaaacttaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataat 312105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 214 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 9830821 - 9830667
Alignment:
Q  214 aaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaac 313  Q
    |||||||| |||| | ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9830821 aaaattgtttaaagtttcgcaaattagacctatgattgaattatttaaattttcagatgggccactacaccactttgcaggaatttggatcaaccaaaac 9830722  T
Q  314 ataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttga 368  Q
    |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  9830721 ataaaatcgacacaaagttgcataaaatctcgcaaaataaacctataatcgttga 9830667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 214 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 197417 - 197267
Alignment:
Q  214 aaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc-ggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaa 312  Q
    |||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||    
T  197417 aaaattgtttaaagtatcgcaaattagacttataattgaattatttaaattttttggatgggccattacaccaatttgcagaaatttggatcaaccgaaa 197318  T
Q  313 cataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatc 363  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  197317 cttaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatc 197267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 214 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 312254 - 312104
Alignment:
Q  214 aaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc-ggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaa 312  Q
    |||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||    
T  312254 aaaattgtttaaagtatcgcaaattagacttataattgaattatttaaattttttggatgggccattacaccaatttgcagaaatttggatcaaccgaaa 312155  T
Q  313 cataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatc 363  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  312154 cttaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatc 312104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 70 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 9830851 - 9830673
Alignment:
Q  70 tcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactaca 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||| |||| ||||| | ||| ||||||||    
T  9830851 tcagggtggaccactaaaattaactgttgaaaaattgtttaaagtttcgcaaattagacctatgattgaattatttaaa-ttttcagatgggccactaca 9830753  T
Q  170 ccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataat 249  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||| |||  ||||| ||||| ||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  9830752 ccactttgcaggaatttggatcaaccaaaacataaaatcgacacaaagttgcataaaatctcgcaaaataaacctataat 9830673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 99 - 246
Target Start/End: Original strand, 25642676 - 25642823
Alignment:
Q  99 aaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaa 198  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| ||    
T  25642676 aaaaattgttcaaagtctcgtaaaataggcctataactaaattatttaaatttttcgggtggaccacttcaccactttgcgagaatttggatcaaccaaa 25642775  T
Q  199 atctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctat 246  Q
    | |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  25642776 acctaaaaccgacacaaaattatataaaatctcgcaaaatagacctat 25642823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 100 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 43117563 - 43117412
Alignment:
Q  100 aaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaa 199  Q
    |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||    
T  43117563 aaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaatttttcggatgggccattacaccactttgcaggaatttggatcaaccaaaa 43117464  T
Q  200 tctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattg 251  Q
      ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43117463 cataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataattg 43117412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 96 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 11635978 - 11635828
Alignment:
Q  96 ttgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaacc 195  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||| |||||||||||  |    
T  11635978 ttgaaaaattgtttaaagtctcacaaaatagacctataattgaattatttaaatttttcgggtgggtcactagaccactttgcggaaatttggatcagtc 11635879  T
Q  196 gaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctat 246  Q
    |||| |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  11635878 gaaacctaaaaccgacacaaaattatataaaatttcgcaaaatagacctat 11635828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 100 - 277
Target Start/End: Original strand, 7421994 - 7422172
Alignment:
Q  100 aaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaa 199  Q
    |||||| | |||| ||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||  ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  7421994 aaaattttataaaatctcgcaaaatagacctataattgaat-atttaaatttttcgggtgggtcactacatcacttttcgggaatttggatcaaccgaaa 7422092  T
Q  200 tctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataat--tgaattatttaaattttcggatgggcca 277  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  |  ||| ||||| |||||||||||||||    
T  7422093 tctaaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaataaacctataatcgttgattttttaatttttcggatgggcca 7422172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 96 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 36108987 - 36108837
Alignment:
Q  96 ttgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaacc 195  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  36108987 ttgaaaatttgtttaaagtctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaatttttcggatgggccactacaccactttgcgggaatttggatcagcc 36108888  T
Q  196 gaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctat 246  Q
     ||| ||||||||| || || |||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  36108887 caaacctaaaaccgtcacaacattgtatagaatcttgcaaaatagacctat 36108837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 214 - 362
Target Start/End: Original strand, 5590005 - 5590154
Alignment:
Q  214 aaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaatttt-cggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaa 312  Q
    |||||||| |||| | ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||| |||||  ||||||||||||||| |||    
T  5590005 aaaattgtttaaagtctcgcaaattagatctataattgaattatttaaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaa 5590104  T
Q  313 cataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataat 362  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5590105 cctaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataat 5590154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 214 - 362
Target Start/End: Original strand, 22658178 - 22658327
Alignment:
Q  214 aaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaatttt-cggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaa 312  Q
    |||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||   ||||| ||||||||| |||    
T  22658178 aaaattgtttaaagtctcgcaaattagacctataattgaattatttaaatttttcgggtgggccactacaccaatttgtgggaattgggatcaaccgaaa 22658277  T
Q  313 cataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataat 362  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22658278 cctaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataat 22658327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 230 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 36108967 - 36108837
Alignment:
Q  230 tcgcaaaatagacctataattgaattatttaaatttt-cggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaa 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| || |||| |||||||| |||||    
T  36108967 tcgcaaaatagacctataattgaattatttaaatttttcggatgggccactacaccactttgcgggaatttggatcagcccaaacctaaaaccgtcacaa 36108868  T
Q  329 aattgtataaaatctcgcaaaatagacctat 359  Q
     |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  36108867 cattgtatagaatcttgcaaaatagacctat 36108837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 68 - 160
Target Start/End: Original strand, 34934284 - 34934376
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtgg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  34934284 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaattagacctataattaaattatttaaatttttcgggtgg 34934376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 96 - 247
Target Start/End: Original strand, 25382979 - 25383129
Alignment:
Q  96 ttgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaacc 195  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||||| ||| | ||| ||||| |||||| ||||||||||||||     
T  25382979 ttgaaaaattgttcaaagtctcgcaaaataggcctataactaaattatttaaatttttcggatgggctacttcaccactttgcgagaatttggatcaact 25383078  T
Q  196 gaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctata 247  Q
     ||| |||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  25383079 aaaacctaaaaccgacacaaaa-tatataaaatctcgcaaaatagacctata 25383129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 234 - 359
Target Start/End: Original strand, 25642697 - 25642823
Alignment:
Q  234 aaaatagacctataattgaattatttaaatttt-cggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaatt 332  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| ||| | |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25642697 aaaataggcctataactaaattatttaaatttttcgggtggaccacttcaccactttgcgagaatttggatcaaccaaaacctaaaaccgacacaaaatt 25642796  T
Q  333 gtataaaatctcgcaaaatagacctat 359  Q
     ||||||||||||||||||||||||||    
T  25642797 atataaaatctcgcaaaatagacctat 25642823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 214 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 8996561 - 8996417
Alignment:
Q  214 aaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaatttt-cggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaa 312  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |   ||||||| |||  ||||| ||||||||||| |||    
T  8996561 aaaattgtttaaaatctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaatttttcggatagcctcctacaccatttt--atgaaattggatcaacctaaa 8996464  T
Q  313 cataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctat 359  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  8996463 cttaaaaccgacacaaaattgcataaaatctcgtaaaataaacctat 8996417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 214 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 11635974 - 11635819
Alignment:
Q  214 aaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaatttt-cggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaa 312  Q
    |||||||| |||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || || ||||||||||   |||||||||||  | |||    
T  11635974 aaaattgtttaaagtctcacaaaatagacctataattgaattatttaaatttttcgggtgggtcactagaccactttgcggaaatttggatcagtcgaaa 11635875  T
Q  313 cataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttga 368  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  11635874 cctaaaaccgacacaaaattatataaaatttcgcaaaatagacctatgatcattga 11635819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 230 - 360
Target Start/End: Original strand, 25382999 - 25383129
Alignment:
Q  230 tcgcaaaatagacctataattgaattatttaaatttt-cggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaa 328  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| | | |||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  25382999 tcgcaaaataggcctataactaaattatttaaatttttcggatgggctacttcaccactttgcgagaatttggatcaactaaaacctaaaaccgacacaa 25383098  T
Q  329 aattgtataaaatctcgcaaaatagacctata 360  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  25383099 aa-tatataaaatctcgcaaaatagacctata 25383129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 234 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 17836622 - 17836498
Alignment:
Q  234 aaaatagacctataattgaattatttaaatttt-cggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaatt 332  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||  || |||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  17836622 aaaatagacctataattaaattatttaaatttttcggatgggccactacatcactttgcagaaacttggatcacccgaaacctaaaaccgacacaaaatt 17836523  T
Q  333 gtataaaatctcgcaaaatagacct 357  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||    
T  17836522 gtataaaatcttacaaaatacacct 17836498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 420 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 2296057 - 2295990
Alignment:
Q  420 tagaagtgaaatgttcatacaaataatgcattctgatatagttctttatgttgaaataataataagat 487  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2296057 tagaagtgaaatgttcatacaaataatgcattctgatatagttctttatgttgaaataataataagat 2295990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 100 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 6317090 - 6316940
Alignment:
Q  100 aaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaa 199  Q
    |||||||| |||| ||||||||| || | |||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||    
T  6317090 aaaattgtataaattctcgcaaaataaaactataattgaattatttaaatttt-cgggtgggccactacaccactttgcaagaatttggatcaaccaaaa 6316992  T
Q  200 tctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattg 251  Q
      ||||| ||||| ||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  6316991 cataaaatcgacacaaaattgcataaaatctcacaaaatagacctataattg 6316940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 96 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 8995189 - 8995039
Alignment:
Q  96 ttgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaacc 195  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||| || |||| | ||||||||||||  |    
T  8995189 ttgaaaaattgctcaaagtctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttttgggtgggccactacatcactttgtgagaatttggatcagac 8995090  T
Q  196 gaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctat 246  Q
     ||| || ||||||| | ||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  8995089 aaaaccttaaaccgatacaaatttgtataaaatctctcaaaatagacctat 8995039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 230 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 8995169 - 8995039
Alignment:
Q  230 tcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc-ggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaa 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||| |||||||   ||||||||||||  |||||| | ||||||| ||||    
T  8995169 tcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttttgggtgggccactacatcactttgtgagaatttggatcagacaaaaccttaaaccgatacaa 8995070  T
Q  329 aattgtataaaatctcgcaaaatagacctat 359  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8995069 atttgtataaaatctctcaaaatagacctat 8995039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 271 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 38567399 - 38567307
Alignment:
Q  271 tgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatc 363  Q
    ||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38567399 tgggccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaacctaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatc 38567307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 100 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 4698020 - 4697871
Alignment:
Q  100 aaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaa 199  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||    
T  4698020 aaaattgtataaaatctcgcaaaatagatctataattgaattatttaaatttt-cggatgggccactacaccactttgcaggaatttggatcaaccaaaa 4697922  T
Q  200 tctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataatt 250  Q
      ||||||||||| ||||||| ||||||| | | ||| || ||||||||||    
T  4697921 cataaaaccgacacaaaattgcataaaatcttgtaaagtaaacctataatt 4697871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 98 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 17836644 - 17836514
Alignment:
Q  98 gaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccga 197  Q
    |||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||| |||||||| || ||||| | || |||||||| ||||    
T  17836644 gaaaaattgtttattgtctcgtaaaatagacctataattaaattatttaaatttttcggatgggccactacatcactttgcagaaacttggatcacccga 17836545  T
Q  198 aatctaaaaccgacataaaattgtataaaat 228  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||    
T  17836544 aacctaaaaccgacacaaaattgtataaaat 17836514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 68 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 38567467 - 38567401
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataa 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38567467 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaattagacctataa 38567401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 96 - 249
Target Start/End: Original strand, 32017916 - 32018069
Alignment:
Q  96 ttgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaacc 195  Q
    |||||||||||||||||||||   | | ||||||||||| |||||| |  |||  |||||  ||||||||||| ||| |||| || |||||||| |||||    
T  32017916 ttgaaaaattgtttaaagtcttttataatagacctataattgaattgttaaaaaatttcgaatggaccactacgccactttgtggaaatttggaccaacc 32018015  T
Q  196 gaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataat 249  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  32018016 gaaatctaaaatcgacacaaaattgtataaaatctcttaaaatagacctataat 32018069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 100 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 38567343 - 38567195
Alignment:
Q  100 aaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaa 199  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||  |||    
T  38567343 aaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatcgaattatttaaatttt-cgggtgggccactacacaactttgcaggaatttggatcaacaaaaa 38567245  T
Q  200 tctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataat 249  Q
      ||||| | ||| ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  38567244 cataaaatcaacacaaaattgcataaaatctcgcaaaatatacctataat 38567195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 97 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 8996564 - 8996417
Alignment:
Q  97 tgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccg 196  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| | | |  |||||||| |||    ||| |||||||||||     
T  8996564 tgaaaaattgtttaaaatctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaatttttcggatagcctcctacaccatttt--atgaaattggatcaacct 8996467  T
Q  197 aaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctat 246  Q
    |||  ||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||    
T  8996466 aaacttaaaaccgacacaaaattgcataaaatctcgtaaaataaacctat 8996417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 236 - 363
Target Start/End: Original strand, 32017942 - 32018070
Alignment:
Q  236 aatagacctataattgaattatttaaat-tttcggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgt 334  Q
    |||||||||||||||||||| || |||  ||||| |||| ||| ||| ||||||||    |||||||| ||||| |||  ||||| ||||||||||||||    
T  32017942 aatagacctataattgaattgttaaaaaatttcgaatggaccactacgccactttgtggaaatttggaccaaccgaaatctaaaatcgacacaaaattgt 32018041  T
Q  335 ataaaatctcgcaaaatagacctataatc 363  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  32018042 ataaaatctcttaaaatagacctataatc 32018070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 214 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 43073247 - 43073117
Alignment:
Q  214 aaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaac 313  Q
    |||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||| | ||||||||||| ||  ||||||||||  |  ||||    
T  43073247 aaaattgtttaaagttttgcaaaatagacctataatttaaatatttaaattttcgggtaggcaactacaccactttacagaaatttggatcgcctgaaac 43073148  T
Q  314 ataaaaccgacacaaaattgtataaaatctc 344  Q
     |||||| || | |||||||| |||||||||    
T  43073147 ttaaaactgaaataaaattgtttaaaatctc 43073117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 97 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 43073250 - 43073120
Alignment:
Q  97 tgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccg 196  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| | || ||| |||| ||||||||| | | ||||||||| ||| | | ||||||||||  | |    
T  43073250 tgaaaaattgtttaaagttttgcaaaatagacctataatttaaatatttaaa-ttttcgggtaggcaactacaccactttacagaaatttggatcgcctg 43073152  T
Q  197 aaatctaaaaccgacataaaattgtataaaat 228  Q
    |||  |||||| || |||||||||| ||||||    
T  43073151 aaacttaaaactgaaataaaattgtttaaaat 43073120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 214 - 266
Target Start/End: Original strand, 34934316 - 34934368
Alignment:
Q  214 aaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaatttt 266  Q
    |||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34934316 aaaattgtttaaagtctcgcaaattagacctataattaaattatttaaatttt 34934368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 327 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 8996561 - 8996526
Alignment:
Q  327 aaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataat 362  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8996561 aaaattgtttaaaatctcgcaaaatagacctataat 8996526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 310 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 42559071 - 42559031
Alignment:
Q  310 aaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaa 350  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42559071 aaacctaaaatcgacacaaaattgtataaaatctcacaaaa 42559031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 248; Significance: 1e-137; HSPs: 69)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 68 - 363
Target Start/End: Original strand, 25298886 - 25299181
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccacta 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  25298886 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaattagacctataattgaattatttaaatttttcgggtgggccacta 25298985  T
Q  168 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 267  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25298986 cactaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 25299085  T
Q  268 ggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatc 363  Q
     | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25299086 cggtgggccactacaccactttgcaggaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaagttgcataaaatctcgcaaaatagacctataatc 25299181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 68 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 51140045 - 51139745
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccacta 167  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  51140045 tgtcagggtgggccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaattagacttataattgaattatttaaatttttcgggtgggccacta 51139946  T
Q  168 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  51139945 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaacctaaaaccgacataaaattgtaaaaaatctcgcaaaataaacctataattgaattatttaaattttc 51139846  T
Q  268 ggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttg 367  Q
    || ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  51139845 gggtgggccactacaccactttgcaagaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatcgttg 51139746  T
Q  368 a 368  Q
    |    
T  51139745 a 51139745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 68 - 368
Target Start/End: Original strand, 16692747 - 16693047
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccacta 167  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  16692747 tgtcacggtgggccactaaaattaaatattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaattagacatataattgaattatttaaatttttcgggtgggccacta 16692846  T
Q  168 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16692847 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaacctaaaaccgacataaaattgtataaaatctcacaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 16692946  T
Q  268 ggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttg 367  Q
    || ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  16692947 gggtgggccactacaccactttgtaggaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgcataaaatctcgtaaaatagacctataatcgttg 16693046  T
Q  368 a 368  Q
    |    
T  16693047 a 16693047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 68 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 23177701 - 23177401
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccacta 167  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  23177701 tgtcagggtgggccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcacaaattagacctataattgaattatttaaatttttcggatggaccacta 23177602  T
Q  168 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  23177601 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacatataattgaattatttaaattttt 23177502  T
Q  268 ggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttg 367  Q
    || ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  23177501 gggtgggccactacaccactttgcagaaatttggatcaaccaaaatataaaatcgatacaaaattgcataaaatctcgcaaaatagacttataatcgttg 23177402  T
Q  368 a 368  Q
    |    
T  23177401 a 23177401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 72 - 368
Target Start/End: Original strand, 33011859 - 33012155
Alignment:
Q  72 agggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacacc 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  33011859 agggtgggccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaattagaaaaataattgaattatttaaatttttcggatgggccactacacc 33011958  T
Q  172 aatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcggat 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33011959 aatttgcgggaatttggatcaaccgaaacctaaaaccgacataaaattgcataaaatctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcgggt 33012058  T
Q  272 gggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttga 368  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  33012059 gggccactacaccactttgcaggaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgcataaaatctcacaaaatagacctataatcgttga 33012155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 68 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 47562086 - 47561786
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccacta 167  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47562086 tgtcagggtgagccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaattagacctataattgaattatttaaatttttcgggtggaccacta 47561987  T
Q  168 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  47561986 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaacctaaaaccgacataaaattgtataaaatttcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttt 47561887  T
Q  268 ggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttg 367  Q
    || |||  || |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  47561886 ggttggttcactacatcactttgcagtaatttggatcaaccaaaacataaaacctacacaaaattgcataaaatatcgcaaaatagacctataatcgttg 47561787  T
Q  368 a 368  Q
    |    
T  47561786 a 47561786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 68 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 40567325 - 40567042
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccacta 167  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  40567325 tgtcagggtgggccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaattagacctataattgaattatttaaatttttcgggtgggccacta 40567226  T
Q  168 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40567225 caccaatttgcgggaatttggatcaaccaaaacctaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataattgaactatttaaattttc 40567126  T
Q  268 ggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaat 351  Q
    || ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40567125 gggtgggccactacaccactttgcaggaatttggatcaactaaaacataaaaccaacacaaaattgcataaaatctcgcaaaat 40567042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 68 - 368
Target Start/End: Original strand, 29981505 - 29981805
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccacta 167  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  29981505 tgtcagggtgggccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaattagacatataattgaattgtttaaatttttcgggtggaccacta 29981604  T
Q  168 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 267  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29981605 taccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaacttaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 29981704  T
Q  268 ggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttg 367  Q
    || ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||| |||    
T  29981705 gggtgggccactacaccactttgcaggaatttggataaaccaaaacttaaaaccgacacaaaattgcataaaatatcacaaagtagacctataatcgttg 29981804  T
Q  368 a 368  Q
    |    
T  29981805 a 29981805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 68 - 360
Target Start/End: Original strand, 40428579 - 40428871
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccacta 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  40428579 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaattaaatttataattgaattattttaatttttcgggtgggccacta 40428678  T
Q  168 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40428679 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaacctaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagaactataattgaattatttaaattttc 40428778  T
Q  268 ggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctata 360  Q
    |  ||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40428779 gagtggactactacaccactttgcaggaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgcataaaatctcgcaaaatagacctata 40428871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 68 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 45837203 - 45836903
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccacta 167  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45837203 tgtcagggtggacaactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtttcaaaaattagacctataattgaattatttaaatttttcgggtggaccacta 45837104  T
Q  168 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 267  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45837103 caccaatttgcaggaatttgaatcaaccgaaacctaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataattaaattatttaaattttc 45837004  T
Q  268 ggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttg 367  Q
    || ||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  45837003 gggtggaccactacaccactttgcaggaatttagatcaaccaaaacataaaaccgatacaaaattgtataaaatctcgcaatatagacctataatcgttg 45836904  T
Q  368 a 368  Q
    |    
T  45836903 a 45836903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 68 - 368
Target Start/End: Original strand, 48708215 - 48708515
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccacta 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||   |||||    
T  48708215 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtcttgcaaattagacctataattgaattatttaaatttttcgggtgagacacta 48708314  T
Q  168 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48708315 caccaatttgcgggaatttggatcaaccaaaacctaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 48708414  T
Q  268 ggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttg 367  Q
     | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  48708415 aggtgggccactacaccactttgcaggaatttggatcaacaaaaacataaaatcgatataaaattgcataaaatctcgcaaaatagacctataatcgttg 48708514  T
Q  368 a 368  Q
    |    
T  48708515 a 48708515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 72 - 368
Target Start/End: Original strand, 17285095 - 17285392
Alignment:
Q  72 agggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcggg-tggaccactacac 170  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  17285095 agggtgggccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcacaaattagacctataattgaattatttaaatttttcggggtggaccactacac 17285194  T
Q  171 caatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcgga 270  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17285195 caatttgcggaaatttggatcaaccgaaacctaaaaccgacgtaaaattgtataaaatctcacaaaatagacctataattgaattatttaaattttcggg 17285294  T
Q  271 tgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttga 368  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  17285295 tgggccactacaccactttgcaggaatttggatcaaccaaaacataaaaccgatataaaattgcataaaatctcgcaaattagacctataatcgttga 17285392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 72 - 368
Target Start/End: Original strand, 919512 - 919808
Alignment:
Q  72 agggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacacc 171  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  919512 agggtgggcgactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgtaaattagacctataattgaattatttaaattttttgggtggactactacacc 919611  T
Q  172 aatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcggat 271  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  919612 aatttgctggaatttggatcaatggaaacctaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcaggt 919711  T
Q  272 gggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttga 368  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  919712 gggccactacaccactttgcaggaatttggatcaaccaaaacataaaaccaacacaaaattgcataaaatctcgcaaaatagatctataatcgttga 919808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 72 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 42372325 - 42372029
Alignment:
Q  72 agggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacacc 171  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  42372325 agggtgggccgctaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaattagatcaataattgaattatttaaattttttgggtgggccactacacc 42372226  T
Q  172 aatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcggat 271  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  42372225 aatttgcaggaatttggatcaaccgaaacctaaaaccaacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcgggt 42372126  T
Q  272 gggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttga 368  Q
    || ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  42372125 ggaccactacaccactttgcaggaatttagatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgcataaaatctcacaaaatagacctataatcattga 42372029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 68 - 368
Target Start/End: Original strand, 44052257 - 44052557
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccacta 167  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  44052257 tgtcagggtgggccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaattagacctataattgaattatttaaatttttcgggtgggccacta 44052356  T
Q  168 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 267  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44052357 caccaatttgcgagaatttgaatcaaccaaaacctaaaaccgacataaaattctataaaatctcacaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 44052456  T
Q  268 ggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttg 367  Q
    || |||| || |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  44052457 gggtgggtcactacaccactttgtaggaatttggatcaatcaaaacataaaaccaacacaaaattacataaaatctcgcaaaatagacctataatcgttg 44052556  T
Q  368 a 368  Q
    |    
T  44052557 a 44052557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 72 - 363
Target Start/End: Original strand, 46224564 - 46224853
Alignment:
Q  72 agggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacacc 171  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  46224564 agggtgggccactaaaattaactattgaaaaattgttta--gtctcgcaaattagacctataattgaattatttaaatttttcaggtgggccactacacc 46224661  T
Q  172 aatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcggat 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  46224662 aatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagatctataattgaattatttaaattttcgggt 46224761  T
Q  272 gggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatc 363  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  46224762 gggccactacaccactttgcaggaatttggatcaacaaaaacataaaatcgatacaaaattgcataaaatctcgcaaaatagatttataatc 46224853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 68 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 8086589 - 8086297
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccacta 167  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  8086589 tgtcagggtgggccattaaaattaaccattaaaaaattgtttaaagtctcgcaaattaaacttataattgaattatttaaatttttcgtgtgggccacta 8086490  T
Q  168 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8086489 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaacctaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 8086390  T
Q  268 ggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctata 360  Q
    || ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||    
T  8086389 gggtgggccactacaccactttgcaggaatttggatcaaccaaaacataaaacctacataaaattgcataaaatctagcaaaatagatctata 8086297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 68 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 29170301 - 29170001
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccacta 167  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||     
T  29170301 tgtcagggtgggccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcacaaattagacctatagttgaattatttaaatttttcgggtggatcactg 29170202  T
Q  168 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 267  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  29170201 caccaatttgcggaaatttggatcaaccgaaacctaaaaccgacataaatttgtataaaatctcacaaaatagacctataattgaattatttaaattttt 29170102  T
Q  268 ggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttg 367  Q
    || ||||| | |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  29170101 gggtgggctactacaccactttgtaggaatttggatcaaccaaaacataaaatcgatacaaaattgcataaaatctcgcaaattagacctataatcgttg 29170002  T
Q  368 a 368  Q
    |    
T  29170001 a 29170001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 68 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 37126052 - 37125752
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccacta 167  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||    
T  37126052 tgtcagggtgggccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcacaaattagacctataattgaattatttaaatttttcgggtgagccacta 37125953  T
Q  168 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 267  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37125952 caccaatttgcgggaattttgatcaaccgaaacctaaaactgatataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 37125853  T
Q  268 ggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttg 367  Q
    || |||| || |  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  37125852 gggtgggtcactgtaccactttgcaggaatttggatcaaccaaaacgtaaaactgacgcaaaattgcataaaatatcgcaaaatagacctataatcgttg 37125753  T
Q  368 a 368  Q
    |    
T  37125752 a 37125752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 68 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 24790795 - 24790502
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccacta 167  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||  ||  ||||||    
T  24790795 tgtcagggtgtgccactaaaattaaccattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaatttgacctataattgaattatttaaatttttcgcttgagccacta 24790696  T
Q  168 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatc-taaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaatttt 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24790695 caccaatttgcgggaatttggatcaacccaaaacgtaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaatttt 24790596  T
Q  267 cggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctata 360  Q
    ||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  24790595 cgggtggaccactacaccactttgcaggaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgcataaaatctcgcaaaacagacttata 24790502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 68 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 8530448 - 8530142
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccacta 167  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  8530448 tgtcagggtgggccactaaaattaacttttgaaaaattgtataaagtttcgcaaattagatctataattgaattatttaaatttttcgggtggaccactg 8530349  T
Q  168 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtata------aaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaa 261  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||      |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8530348 caccaatttgcgggaattgggatcaaccgaaacctaaaaccgacagaaaattgtataaaattaaaatctcgcaaaatagacctataattgaattatttaa 8530249  T
Q  262 attttcggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataa 361  Q
    |||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8530248 attttcaggtgggccactacaccactttgcaagaatttggatcaaccagaacataaaatcgacacaaaattgcataaaatctcgcaaaatagacctataa 8530149  T
Q  362 tctttga 368  Q
    || ||||    
T  8530148 tcgttga 8530142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 68 - 362
Target Start/End: Original strand, 24542578 - 24542873
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccacta 167  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||    
T  24542578 tgtcagggtgggccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgctaattagaactataattgaattatttaaatttttcgggtgtgccacta 24542677  T
Q  168 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaa-tttt 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24542678 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaacctaaaaccgacataaaattgtataaaatttcacaaaatagacctataattgaattatttaaattttt 24542777  T
Q  267 cggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataat 362  Q
    ||| || |||| ||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  24542778 cgggtgtgccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaacctaaaaccgacataaaattgtataaaatttcacaaaatagacctataat 24542873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 68 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 6850111 - 6849812
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccacta 167  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  6850111 tgtcagggtgggccactaaaattaattattgaaaaattgtttaaagtctcacaaatta-acctataattgaattatttaaatttttcgggtgaaccacta 6850013  T
Q  168 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 267  Q
     || ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6850012 tactaatttgcagaaatttggatcaaccgaaacctaaaaccgatataaatttgtataaaatctcacaaaatagatctataattgaattatttaaattttc 6849913  T
Q  268 ggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttg 367  Q
    || ||||||| |||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  6849912 gggtgggccactacaccactttgtagaaatttgaatcaaccaaaacataaaaccgatacaaaattgtataaaatctcgcaaattagacctataatcgttg 6849813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 100 - 368
Target Start/End: Original strand, 24544548 - 24544816
Alignment:
Q  100 aaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaa 199  Q
    |||||||| |||| | || |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24544548 aaaattgtataaaatttcacaaaatagacctataattgaattatttaaatttttcgggtgtgccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaa 24544647  T
Q  200 tctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcggatgggccattacaccactttgcatgaattt 299  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  24544648 cctaaaaccgacataaaattgtataaaatttcacaaaatagacctataattgaattatttaaattttcgagtgggccactacaccactttgcaggaattt 24544747  T
Q  300 ggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttga 368  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  24544748 ggatcaaccaaagcataaaaccgacacaaaattgcataaaatctcgcaaaatagacttataatcgttga 24544816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 80 - 362
Target Start/End: Original strand, 9042229 - 9042510
Alignment:
Q  80 ccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcg 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9042229 ccactaaaattaactattgaaaaattatttaaagtctcacaaattagacctataattgaattatttaaattttttgggtggaccactacaccaatttgcg 9042328  T
Q  180 ggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcggatgggccatt 279  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |    
T  9042329 gaaatttggatcaaccgaaacctaaaaccgacttaaatttgtataaaatctcacaaaatagacctataattgaattatttaaattttcgggtgtgccact 9042428  T
Q  280 acaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataat 362  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  9042429 acaccactttgtaggaatttggatcaaccaaaacataaaatcgatac-aaattgcataaaatctcgtaaattagacctataat 9042510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 100 - 362
Target Start/End: Original strand, 24542724 - 24542987
Alignment:
Q  100 aaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaa 199  Q
    |||||||| |||| | || |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24542724 aaaattgtataaaatttcacaaaatagacctataattgaattatttaaatttttcgggtgtgccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaa 24542823  T
Q  200 tctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaa-ttttcggatgggccattacaccactttgcatgaatt 298  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||| |||||  |||||    
T  24542824 cctaaaaccgacataaaattgtataaaatttcacaaaatagacctataattgaattatttaaatttttcgggtgtgccactacaccaatttgcgggaatt 24542923  T
Q  299 tggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataat 362  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  24542924 tggatcaaccgaaacctaaaaccgacataaaattgtataaaatttcacaaaatagacctataat 24542987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 100 - 362
Target Start/End: Original strand, 24542838 - 24543101
Alignment:
Q  100 aaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaa 199  Q
    |||||||| |||| | || |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24542838 aaaattgtataaaatttcacaaaatagacctataattgaattatttaaatttttcgggtgtgccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaa 24542937  T
Q  200 tctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaa-ttttcggatgggccattacaccactttgcatgaatt 298  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||| |||||  |||||    
T  24542938 cctaaaaccgacataaaattgtataaaatttcacaaaatagacctataattgaattatttaaatttttcgggtgtgccactacaccaatttgcgggaatt 24543037  T
Q  299 tggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataat 362  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  24543038 tggatcaaccgaaacctaaaaccgacataaaattgtataaaatttcacaaaatagacctataat 24543101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 100 - 362
Target Start/End: Original strand, 24542952 - 24543215
Alignment:
Q  100 aaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaa 199  Q
    |||||||| |||| | || |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24542952 aaaattgtataaaatttcacaaaatagacctataattgaattatttaaatttttcgggtgtgccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaa 24543051  T
Q  200 tctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaa-ttttcggatgggccattacaccactttgcatgaatt 298  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||| |||||  |||||    
T  24543052 cctaaaaccgacataaaattgtataaaatttcacaaaatagacctataattgaattatttaaatttttcgggtgtgccactacaccaatttgcgggaatt 24543151  T
Q  299 tggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataat 362  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  24543152 tggatcaaccgaaacctaaaaccgacataaaattgtataaaatttcacaaaatagacctataat 24543215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 100 - 362
Target Start/End: Original strand, 24543066 - 24543329
Alignment:
Q  100 aaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaa 199  Q
    |||||||| |||| | || |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24543066 aaaattgtataaaatttcacaaaatagacctataattgaattatttaaatttttcgggtgtgccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaa 24543165  T
Q  200 tctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaa-ttttcggatgggccattacaccactttgcatgaatt 298  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||| |||||  |||||    
T  24543166 cctaaaaccgacataaaattgtataaaatttcacaaaatagacctataattgaattatttaaatttttcgggtgtgccactacaccaatttgcgggaatt 24543265  T
Q  299 tggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataat 362  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  24543266 tggatcaaccgaaacctaaaaccgacataaaattgtataaaatttcacaaaatagacctataat 24543329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 100 - 362
Target Start/End: Original strand, 24543180 - 24543443
Alignment:
Q  100 aaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaa 199  Q
    |||||||| |||| | || |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24543180 aaaattgtataaaatttcacaaaatagacctataattgaattatttaaatttttcgggtgtgccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaa 24543279  T
Q  200 tctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaa-ttttcggatgggccattacaccactttgcatgaatt 298  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||| |||||  |||||    
T  24543280 cctaaaaccgacataaaattgtataaaatttcacaaaatagacctataattgaattatttaaatttttcgggtgtgccactacaccaatttgcgggaatt 24543379  T
Q  299 tggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataat 362  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  24543380 tggatcaaccgaaacctaaaaccgacataaaattgtataaaatttcacaaaatagacctataat 24543443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 100 - 362
Target Start/End: Original strand, 24543294 - 24543557
Alignment:
Q  100 aaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaa 199  Q
    |||||||| |||| | || |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24543294 aaaattgtataaaatttcacaaaatagacctataattgaattatttaaatttttcgggtgtgccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaa 24543393  T
Q  200 tctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaa-ttttcggatgggccattacaccactttgcatgaatt 298  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||| |||||  |||||    
T  24543394 cctaaaaccgacataaaattgtataaaatttcacaaaatagacctataattgaattatttaaatttttcgggtgtgccactacaccaatttgcgggaatt 24543493  T
Q  299 tggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataat 362  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  24543494 tggatcaaccgaaacctaaaaccgacataaaattgtataaaatttcacaaaatagacctataat 24543557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 100 - 362
Target Start/End: Original strand, 24543408 - 24543671
Alignment:
Q  100 aaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaa 199  Q
    |||||||| |||| | || |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24543408 aaaattgtataaaatttcacaaaatagacctataattgaattatttaaatttttcgggtgtgccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaa 24543507  T
Q  200 tctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaa-ttttcggatgggccattacaccactttgcatgaatt 298  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||| |||||  |||||    
T  24543508 cctaaaaccgacataaaattgtataaaatttcacaaaatagacctataattgaattatttaaatttttcgggtgtgccactacaccaatttgcgggaatt 24543607  T
Q  299 tggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataat 362  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  24543608 tggatcaaccgaaacctaaaaccgacataaaattgtataaaatttcacaaaatagacctataat 24543671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 100 - 362
Target Start/End: Original strand, 24543522 - 24543785
Alignment:
Q  100 aaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaa 199  Q
    |||||||| |||| | || |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24543522 aaaattgtataaaatttcacaaaatagacctataattgaattatttaaatttttcgggtgtgccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaa 24543621  T
Q  200 tctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaa-ttttcggatgggccattacaccactttgcatgaatt 298  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||| |||||  |||||    
T  24543622 cctaaaaccgacataaaattgtataaaatttcacaaaatagacctataattgaattatttaaatttttcgggtgtgccactacaccaatttgcgggaatt 24543721  T
Q  299 tggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataat 362  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  24543722 tggatcaaccgaaacctaaaaccgacataaaattgtataaaatttcacaaaatagacctataat 24543785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 100 - 362
Target Start/End: Original strand, 24543636 - 24543899
Alignment:
Q  100 aaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaa 199  Q
    |||||||| |||| | || |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24543636 aaaattgtataaaatttcacaaaatagacctataattgaattatttaaatttttcgggtgtgccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaa 24543735  T
Q  200 tctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaa-ttttcggatgggccattacaccactttgcatgaatt 298  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||| |||||  |||||    
T  24543736 cctaaaaccgacataaaattgtataaaatttcacaaaatagacctataattgaattatttaaatttttcgggtgtgccactacaccaatttgcgggaatt 24543835  T
Q  299 tggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataat 362  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  24543836 tggatcaaccgaaacctaaaaccgacataaaattgtataaaatttcacaaaatagacctataat 24543899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 100 - 362
Target Start/End: Original strand, 24543750 - 24544013
Alignment:
Q  100 aaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaa 199  Q
    |||||||| |||| | || |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24543750 aaaattgtataaaatttcacaaaatagacctataattgaattatttaaatttttcgggtgtgccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaa 24543849  T
Q  200 tctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaa-ttttcggatgggccattacaccactttgcatgaatt 298  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||| |||||  |||||    
T  24543850 cctaaaaccgacataaaattgtataaaatttcacaaaatagacctataattgaattatttaaatttttcgggtgtgccactacaccaatttgcgggaatt 24543949  T
Q  299 tggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataat 362  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  24543950 tggatcaaccgaaacctaaaaccgacataaaattgtataaaatttcacaaaatagacctataat 24544013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 100 - 362
Target Start/End: Original strand, 24543864 - 24544127
Alignment:
Q  100 aaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaa 199  Q
    |||||||| |||| | || |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24543864 aaaattgtataaaatttcacaaaatagacctataattgaattatttaaatttttcgggtgtgccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaa 24543963  T
Q  200 tctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaa-ttttcggatgggccattacaccactttgcatgaatt 298  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||| |||||  |||||    
T  24543964 cctaaaaccgacataaaattgtataaaatttcacaaaatagacctataattgaattatttaaatttttcgggtgtgccactacaccaatttgcgggaatt 24544063  T
Q  299 tggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataat 362  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  24544064 tggatcaaccgaaacctaaaaccgacataaaattgtataaaatttcacaaaatagacctataat 24544127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 100 - 362
Target Start/End: Original strand, 24543978 - 24544241
Alignment:
Q  100 aaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaa 199  Q
    |||||||| |||| | || |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24543978 aaaattgtataaaatttcacaaaatagacctataattgaattatttaaatttttcgggtgtgccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaa 24544077  T
Q  200 tctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaa-ttttcggatgggccattacaccactttgcatgaatt 298  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||| |||||  |||||    
T  24544078 cctaaaaccgacataaaattgtataaaatttcacaaaatagacctataattgaattatttaaatttttcgggtgtgccactacaccaatttgcgggaatt 24544177  T
Q  299 tggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataat 362  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  24544178 tggatcaaccgaaacctaaaaccgacataaaattgtataaaatttcacaaaatagacctataat 24544241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 100 - 362
Target Start/End: Original strand, 24544092 - 24544355
Alignment:
Q  100 aaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaa 199  Q
    |||||||| |||| | || |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24544092 aaaattgtataaaatttcacaaaatagacctataattgaattatttaaatttttcgggtgtgccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaa 24544191  T
Q  200 tctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaa-ttttcggatgggccattacaccactttgcatgaatt 298  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||| |||||  |||||    
T  24544192 cctaaaaccgacataaaattgtataaaatttcacaaaatagacctataattgaattatttaaatttttcgggtgtgccactacaccaatttgcgggaatt 24544291  T
Q  299 tggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataat 362  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  24544292 tggatcaaccgaaacctaaaaccgacataaaattgtataaaatttcacaaaatagacctataat 24544355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 100 - 362
Target Start/End: Original strand, 24544206 - 24544469
Alignment:
Q  100 aaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaa 199  Q
    |||||||| |||| | || |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24544206 aaaattgtataaaatttcacaaaatagacctataattgaattatttaaatttttcgggtgtgccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaa 24544305  T
Q  200 tctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaa-ttttcggatgggccattacaccactttgcatgaatt 298  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||| |||||  |||||    
T  24544306 cctaaaaccgacataaaattgtataaaatttcacaaaatagacctataattgaattatttaaatttttcgggtgtgccactacaccaatttgcgggaatt 24544405  T
Q  299 tggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataat 362  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  24544406 tggatcaaccgaaacctaaaaccgacataaaattgtataaaatttcacaaaatagacctataat 24544469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 100 - 362
Target Start/End: Original strand, 24544320 - 24544583
Alignment:
Q  100 aaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaa 199  Q
    |||||||| |||| | || |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24544320 aaaattgtataaaatttcacaaaatagacctataattgaattatttaaatttttcgggtgtgccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaa 24544419  T
Q  200 tctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaa-ttttcggatgggccattacaccactttgcatgaatt 298  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||| |||||  |||||    
T  24544420 cctaaaaccgacataaaattgtataaaatttcacaaaatagacctataattgaattatttaaatttttcgggtgtgccactacaccaatttgcgggaatt 24544519  T
Q  299 tggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataat 362  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  24544520 tggatcaaccgaaacctaaaaccgacataaaattgtataaaatttcacaaaatagacctataat 24544583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 100 - 362
Target Start/End: Original strand, 24544434 - 24544697
Alignment:
Q  100 aaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaa 199  Q
    |||||||| |||| | || |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24544434 aaaattgtataaaatttcacaaaatagacctataattgaattatttaaatttttcgggtgtgccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaa 24544533  T
Q  200 tctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaa-ttttcggatgggccattacaccactttgcatgaatt 298  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||| |||||  |||||    
T  24544534 cctaaaaccgacataaaattgtataaaatttcacaaaatagacctataattgaattatttaaatttttcgggtgtgccactacaccaatttgcgggaatt 24544633  T
Q  299 tggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataat 362  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  24544634 tggatcaaccgaaacctaaaaccgacataaaattgtataaaatttcacaaaatagacctataat 24544697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 72 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 37343229 - 37343082
Alignment:
Q  72 agggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacacc 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37343229 agggtgggccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaattagaccaataattgaattatttaaatttttcgggtggaccactacacc 37343130  T
Q  172 aatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaatt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  37343129 aatttgcgggaatttggatcaaccgaaacttaaaaccgacataaaatt 37343082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 214 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 44317780 - 44317626
Alignment:
Q  214 aaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaac 313  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||    
T  44317780 aaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataattaaattatttaaattttcgggtgggccactacaccactttacaggaatttagatcaaccaaaac 44317681  T
Q  314 ataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttga 368  Q
    |||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44317680 ataaaatcaacacaaaattacataaaatctcgcaaaatagacctataatcgttga 44317626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 214 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 40567293 - 40567144
Alignment:
Q  214 aaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaatttt-cggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaa 312  Q
    |||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  40567293 aaaattgtttaaagtctcgcaaattagacctataattgaattatttaaatttttcgggtgggccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccaaaa 40567194  T
Q  313 cataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataat 362  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40567193 cctaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataat 40567144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 85 - 250
Target Start/End: Original strand, 49001410 - 49001576
Alignment:
Q  85 aaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaat 184  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  49001410 aaaattaaccgttgaaaaattgtttaaagtctcgcaaaatagatctataattgaattatttaaatttttcggatggaccactacaccactttacgggaat 49001509  T
Q  185 ttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaa--tatcgcaaaatagacctataatt 250  Q
    ||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||    
T  49001510 ttggatcaa-ctaaacctagaaccgacataaaattgtataaaatctctcgcaaaatatacctataatt 49001576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 96 - 249
Target Start/End: Original strand, 9246840 - 9246993
Alignment:
Q  96 ttgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaacc 195  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||| | |||||||||| | ||    
T  9246840 ttgaaaaaatgtttaaagtcttgcaaaatagacctataattgaattatttaaatttttcgagtgggccactacaccactttgtgagaatttggataagcc 9246939  T
Q  196 gaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataat 249  Q
    |||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  9246940 gaaacctaaaaccgatacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagatctataat 9246993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 68 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 44317812 - 44317632
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccacta 167  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| | |||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  44317812 tgtcaaggtgggccactaaaattaactattgaaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataattaaattatttaaa-ttttcgggtgggccacta 44317714  T
Q  168 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataat 249  Q
    ||||| ||| | ||||||| |||||||| |||  ||||| | ||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44317713 caccactttacaggaatttagatcaaccaaaacataaaatcaacacaaaattacataaaatctcgcaaaatagacctataat 44317632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 91 - 247
Target Start/End: Original strand, 32540528 - 32540684
Alignment:
Q  91 aactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggat 190  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||  ||||||||    
T  32540528 aactgttgaaaatttgtttaaagtctctcaaaatagacatataattgaattatttaaatttttcgggtgggccattacaccactttgtggatatttggat 32540627  T
Q  191 caaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctata 247  Q
     |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  32540628 aaaccgaaacctaaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgtaaaatagacctata 32540684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 214 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 8086557 - 8086408
Alignment:
Q  214 aaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaatttt-cggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaa 312  Q
    |||||||| |||| | ||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||| |||    
T  8086557 aaaattgtttaaagtctcgcaaattaaacttataattgaattatttaaatttttcgtgtgggccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaa 8086458  T
Q  313 cataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataat 362  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8086457 cctaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataat 8086408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 96 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 21852219 - 21852069
Alignment:
Q  96 ttgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaacc 195  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |   |||||||||||| |    
T  21852219 ttgaaaaattgtttaaagactcgcaaaatagacctataattgaataatttaaatttttcggatgggccactacaccactttacaaaaatttggatcaatc 21852120  T
Q  196 gaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctat 246  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  21852119 gaaatctaaaacggacacaaaattgtataaaatctcgcaaagtatacctat 21852069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 214 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 24790763 - 24790613
Alignment:
Q  214 aaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaatttt-cggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaacc-aaa 311  Q
    |||||||| |||| | ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||||| |||||  ||||||||||||||| |||    
T  24790763 aaaattgtttaaagtctcgcaaatttgacctataattgaattatttaaatttttcgcttgagccactacaccaatttgcgggaatttggatcaacccaaa 24790664  T
Q  312 acataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataat 362  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24790663 acgtaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataat 24790613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 232 - 363
Target Start/End: Original strand, 9246862 - 9246994
Alignment:
Q  232 gcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcgga-tgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaa 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||   |||||||||| | || |||| ||||||||| ||||||    
T  9246862 gcaaaatagacctataattgaattatttaaatttttcgagtgggccactacaccactttgtgagaatttggataagccgaaacctaaaaccgatacaaaa 9246961  T
Q  331 ttgtataaaatctcgcaaaatagacctataatc 363  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9246962 ttgtataaaatctcgcaaaatagatctataatc 9246994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 233 - 360
Target Start/End: Original strand, 32540556 - 32540684
Alignment:
Q  233 caaaatagacctataattgaattatttaaatttt-cggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaat 331  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||     |||||||| |||| |||| |||||||||||||||||    
T  32540556 caaaatagacatataattgaattatttaaatttttcgggtgggccattacaccactttgtggatatttggataaaccgaaacctaaaaccgacacaaaat 32540655  T
Q  332 tgtataaaatctcgcaaaatagacctata 360  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32540656 tgtataaaatctcgtaaaatagacctata 32540684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 230 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 21852199 - 21852069
Alignment:
Q  230 tcgcaaaatagacctataattgaattatttaaatttt-cggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaa 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||| | |||  |||||| |||||||    
T  21852199 tcgcaaaatagacctataattgaataatttaaatttttcggatgggccactacaccactttacaaaaatttggatcaatcgaaatctaaaacggacacaa 21852100  T
Q  329 aattgtataaaatctcgcaaaatagacctat 359  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  21852099 aattgtataaaatctcgcaaagtatacctat 21852069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 214 - 362
Target Start/End: Original strand, 40428611 - 40428760
Alignment:
Q  214 aaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaatttt-cggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaa 312  Q
    |||||||| |||| | ||||||| || |  |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||| |||    
T  40428611 aaaattgtttaaagtctcgcaaattaaatttataattgaattattttaatttttcgggtgggccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaa 40428710  T
Q  313 cataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataat 362  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40428711 cctaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagaactataat 40428760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 214 - 362
Target Start/End: Original strand, 49001425 - 49001575
Alignment:
Q  214 aaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaa-ttttcggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaa 312  Q
    |||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||||||||||||| | |||    
T  49001425 aaaattgtttaaagtctcgcaaaatagatctataattgaattatttaaatttttcggatggaccactacaccactttacgggaatttggatcaa-ctaaa 49001523  T
Q  313 cataaaaccgacacaaaattgtataaaa--tctcgcaaaatagacctataat 362  Q
    | || |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  49001524 cctagaaccgacataaaattgtataaaatctctcgcaaaatatacctataat 49001575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 99 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 46601217 - 46601074
Alignment:
Q  99 aaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||| || |||| |||    
T  46601217 aaaaattgtttaaagtctcgcaaaatagatttataattgaattatttaaatttttcggatgggccactgcaccactttgcgggaatttagaccaactgaa 46601118  T
Q  199 atctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagac 242  Q
     ||||||||||||| ||| ||||||||  | || ||||||||||    
T  46601117 ttctaaaaccgacacaaagttgtataatctttcacaaaatagac 46601074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 107 - 239
Target Start/End: Original strand, 29055884 - 29056015
Alignment:
Q  107 tttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaa 206  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| || ||| ||| ||||||| ||||| | ||||||||| | |||||||||||||    
T  29055884 tttaaagtctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttttggttgggccaatacaccactttgcagaaatttggataagccgaaatctaaaa 29055983  T
Q  207 ccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaata 239  Q
     ||||| |||||||||  |||| ||||||||||    
T  29055984 tcgacacaaaattgta-caaatctcgcaaaata 29056015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 230 - 352
Target Start/End: Original strand, 29055893 - 29056015
Alignment:
Q  230 tcgcaaaatagacctataattgaattatttaaa-ttttcggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaa 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||  ||||||||| | || |||  ||||| ||||||||    
T  29055893 tcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttttggttgggccaatacaccactttgcagaaatttggataagccgaaatctaaaatcgacacaa 29055992  T
Q  329 aattgtataaaatctcgcaaaata 352  Q
    |||||||  |||||||||||||||    
T  29055993 aattgta-caaatctcgcaaaata 29056015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 214 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 37343201 - 37343082
Alignment:
Q  214 aaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaatttt-cggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaa 312  Q
    |||||||| |||| | ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||| |||||  ||||||||||||||| |||    
T  37343201 aaaattgtttaaagtctcgcaaattagaccaataattgaattatttaaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaa 37343102  T
Q  313 cataaaaccgacacaaaatt 332  Q
    | ||||||||||| ||||||    
T  37343101 cttaaaaccgacataaaatt 37343082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 214 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 46601216 - 46601074
Alignment:
Q  214 aaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaa-ttttcggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaa 312  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||  |||||| || ||||  ||     
T  46601216 aaaattgtttaaagtctcgcaaaatagatttataattgaattatttaaatttttcggatgggccactgcaccactttgcgggaatttagaccaactgaat 46601117  T
Q  313 cataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagac 355  Q
      ||||||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||    
T  46601116 tctaaaaccgacacaaagttgtataatctttcacaaaatagac 46601074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 25030467 - 25030324
Alignment:
Q  99 aaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaa 198  Q
    ||||||| ||||||||||  |||| |||| |||||| | |||||| ||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||||||||         
T  25030467 aaaaattatttaaagtcttccaaaatagatctataattaaattatttaaattttttggttgaaccactacaccactttgcgggaatttggatcaa----- 25030373  T
Q  199 atctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataat 249  Q
      ||| |||||||| || |||||||||||| |||||| ||| || ||||||    
T  25030372 --ctataaccgacacaatattgtataaaatctcgcaagataaacatataat 25030324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 104 - 250
Target Start/End: Original strand, 9042367 - 9042511
Alignment:
Q  104 ttgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatcta 203  Q
    |||| |||| |||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||  ||    
T  9042367 ttgtataaaatctcacaaaatagacctataattgaattatttaaatttt-cgggtgtgccactacaccactttgtaggaatttggatcaaccaaaacata 9042465  T
Q  204 aaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataatt 250  Q
    ||| ||| | ||| ||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  9042466 aaatcgatacaaa-ttgcataaaatctcgtaaattagacctataatt 9042511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 233 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 25030447 - 25030323
Alignment:
Q  233 caaaatagacctataattgaattatttaaa-ttttcggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaat 331  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| || ||  ||| |||||||||||||  ||||||||||||||       || ||||||||||| ||    
T  25030447 caaaatagatctataattaaattatttaaattttttggttgaaccactacaccactttgcgggaatttggatcaac-------tataaccgacacaatat 25030355  T
Q  332 tgtataaaatctcgcaaaatagacctataatc 363  Q
    ||||||||||||||||| ||| || |||||||    
T  25030354 tgtataaaatctcgcaagataaacatataatc 25030323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 327 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 45807112 - 45807077
Alignment:
Q  327 aaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataat 362  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45807112 aaaattgtttaaaatctcgcaaaatagacctataat 45807077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 213 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 45807113 - 45807075
Alignment:
Q  213 taaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattg 251  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45807113 taaaattgtttaaaatctcgcaaaatagacctataattg 45807075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 329 - 362
Target Start/End: Original strand, 1243675 - 1243708
Alignment:
Q  329 aattgtataaaatctcgcaaaatagacctataat 362  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1243675 aattgtttaaaatctcgcaaaatagacctataat 1243708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 394 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 29169965 - 29169937
Alignment:
Q  394 cagcccatgaagggctccgccactgctag 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29169965 cagcccatgaagggctccgccactgctag 29169937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 326 - 358
Target Start/End: Original strand, 43060319 - 43060351
Alignment:
Q  326 caaaattgtataaaatctcgcaaaatagaccta 358  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43060319 caaaattgtttaaaatctcgcaaaatagaccta 43060351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 32)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 68 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 12698853 - 12698560
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccacta 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12698853 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaattagacctttaattgaattatttaaatttttcgggtggaccacta 12698754  T
Q  168 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12698753 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaacctaaaagcgacataaaattgtataaaatctcacaaaatagacc-ataattgaattatttaaattttc 12698655  T
Q  268 ggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataat 362  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12698654 ggatgggccactacaccactttgcaggaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataat 12698560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 72 - 368
Target Start/End: Original strand, 2660641 - 2660937
Alignment:
Q  72 agggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacacc 171  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2660641 agggtgggccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtcttacaaattagacttataattgaattatttaaatttttcgggtggaccactacacc 2660740  T
Q  172 aatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcggat 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2660741 aatttgcgggaatttggatcaaccgaaacctaaaatcgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcgggt 2660840  T
Q  272 gggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttga 368  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2660841 gggccactacaccactttgcaggaatttggatcatccaaaacataaaaccgatacaaaattgcataaaatctcgcaaaatagacctataatcgttga 2660937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 68 - 368
Target Start/End: Original strand, 11450304 - 11450603
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccacta 167  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  11450304 tgtcagggtgggccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaattagacctataattgaattatttaaatttt-cgggtgggccacta 11450402  T
Q  168 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11450403 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaacctaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgtaaaatagaccaataattgaattatttaaattttc 11450502  T
Q  268 ggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttg 367  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||| |||    
T  11450503 ggatgggccactacaccactttgcaggaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgcataagatctcgcaaaatagatatataatcgttg 11450602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 68 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 7022176 - 7021882
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccacta 167  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  7022176 tgtcagggtgggccactaaaattaactattaaaaaattgtttaaagtctcgcaaattagacctataattgaattatttaaatttt-cgggtgggccacta 7022078  T
Q  168 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 267  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7022077 caccaatttgtgggaatttggatcaaccgaaacctaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 7021978  T
Q  268 ggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatc 363  Q
    || ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7021977 gggtgggccactacatcactttgcaggaatttggatcaaccaaaacataaaactgacacaaaattgcataaaatctcgcaaaatagacctataatc 7021882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 72 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 26468804 - 26468514
Alignment:
Q  72 agggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacacc 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  26468804 agggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaattagatctataattgaattatttaaatttttcggtttgtccactacacc 26468705  T
Q  172 aatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcggat 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26468704 aatttgcgggaatttggatcaaccgaaacctaaaactgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcgggt 26468605  T
Q  272 gggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataat 362  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26468604 gggccactacaccactttgcaggaatttggatcaagcaaattataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataat 26468514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 68 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 15469448 - 15469149
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccacta 167  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  15469448 tgtcagggtgggccactaaaattaacttttgaaaaattatttaaagtctcgcaaattagacctataattgaattatttaaatttttcgggtgggccacta 15469349  T
Q  168 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 267  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15469348 caccaatttgcgggaattgggat-aaccgaaacctaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 15469250  T
Q  268 ggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttg 367  Q
    || ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  15469249 gggtggaccactacaccactttgcaggaatttggatcaatcaaaacataaaaccgacacaaaattgcataaaatcttgcaaaatagacctataatcgttg 15469150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 68 - 368
Target Start/End: Original strand, 34023341 - 34023641
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccacta 167  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||    
T  34023341 tgtcagggtgggccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaattagacttataattgaattatttaaatttttcgggtggttcacta 34023440  T
Q  168 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  34023441 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaacctaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgtaaaatagatctataattgaattatttaaattttt 34023540  T
Q  268 ggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttg 367  Q
    || |||| || ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  34023541 gggtgggacactacaccactttgcagaaatttagatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattatataaaatctcgtaaaatagacctataatcgttg 34023640  T
Q  368 a 368  Q
    |    
T  34023641 a 34023641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 68 - 351
Target Start/End: Original strand, 24130043 - 24130326
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccacta 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  24130043 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaattaaacatataattgaattatttaaatttttcgggtgggccacta 24130142  T
Q  168 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 267  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24130143 caccaatatgcgggaatttggatcaaccgaaacctaaaaccggcataaaatcgtataaaaactcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 24130242  T
Q  268 ggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaat 351  Q
    || ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24130243 gggtggaccactacaccactttgcaggaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgcataaaatctcgcaaaat 24130326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 80 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 34127845 - 34127563
Alignment:
Q  80 ccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcg 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  34127845 ccactaaaattaactattgtaaaattgtttaaagtctcgcaaattagacctataattgaattatttaaattttccgggtgggccactacaccaatttgca 34127746  T
Q  180 ggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcggatgggccatt 279  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||    
T  34127745 ggaatttggatcaaccgaaacctaaaaccgacataaaattgtataaaatcttgcaaaatagacctataattgaattatttaaatttttgggtggggcatt 34127646  T
Q  280 acaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataat 362  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34127645 acaccactttgcaggaatttggatcaaccaaatcataaaaccgatacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacttataat 34127563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 70 - 368
Target Start/End: Original strand, 9078857 - 9079154
Alignment:
Q  70 tcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactaca 169  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  9078857 tcagggtggactactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcacaaattagacttataattgaattatttaaatttttcgggtggtccactaca 9078956  T
Q  170 ccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcgg 269  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9078957 ccaatttgcggaaatttggatcaaccgaaacctaaaaccgacgtaaaattgt-ttaaatctcacaaaatagacctataattgaattatttaaattttcgg 9079055  T
Q  270 atgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttga 368  Q
     ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  9079056 gtgggccactacaccactttgcaggaatttggatcaaccaaaacataaaaccgatacaaaattgcataaaatctcgcaaattagacctataatcgttga 9079154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 70 - 368
Target Start/End: Original strand, 24635271 - 24635569
Alignment:
Q  70 tcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactaca 169  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  24635271 tcagggtgggccattaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcacaaattagacctataattgaattatttaaattttttgggtggaccactaca 24635370  T
Q  170 ccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcgg 269  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24635371 ccaatttgcggaaatttggatcaaccgaaacctaaaaccgatttaaatttgtataaaatctcacaaaatagacctataattgaattatttaaattttcgg 24635470  T
Q  270 atgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttga 368  Q
    |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  24635471 atggaccactacaccactttgcaggaatttggatcaaccaaaacataaaaccaatacaaaattgcataaaatctcgcaaattagacctataatcgttga 24635569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 68 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 8560786 - 8560485
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactaga-cctataactgaattatataaatttttcgggtggaccact 166  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  8560786 tgtcagggtgggccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtcttacaaattagatcctataattgaattatttaaatttttcaggtgcaccact 8560687  T
Q  167 acaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaatttt 266  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8560686 acaccaatttgcggaaatttggatcaaccgaaacctaaaaccgacgtaaaattgtataaaatctcacaaaatagatctataattgaattatttaaatttt 8560587  T
Q  267 cggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatcttt 366  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  8560586 cgggtgggccactacaccactttgcaggaatttggatcaaccaaaacataaaaccaatacaaaattgcataaaatctcgcaatttagacctataatcgtt 8560487  T
Q  367 ga 368  Q
    ||    
T  8560486 ga 8560485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 68 - 362
Target Start/End: Original strand, 23258753 - 23259048
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccacta 167  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  23258753 tgtcagggtgggccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcacaaattagatctataattgaattatttaaatttttcggttggaccacta 23258852  T
Q  168 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaa-tttt 266  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23258853 caccaatttgcagaaatttggatcaaccaaaagctaaaaccgacgtaaaattgtataaaatctcacaaaatagacctataattgaattatttaaattttt 23258952  T
Q  267 cggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataat 362  Q
    ||| ||| ||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23258953 cggttggaccactacaccaatttgcagaaatttggatcaaccaaaagctaaaaccgacgtaaaattgtataaaatctcacaaaatagacctataat 23259048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 81 - 368
Target Start/End: Original strand, 16461220 - 16461508
Alignment:
Q  81 cactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgg 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  16461220 cactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaattaaacctataattgaattatttaaatttttcggataggccactacaccaatttgcgg 16461319  T
Q  181 gaatttggatcaaccgaaatctaaaacc-gacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcggatgggccatt 279  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |    
T  16461320 gaatttgaatcaactgaaacctaaaacccgacataaaattatataaaatctcgcaaaatagacatataattgaattatttaaattttcgagtggaccact 16461419  T
Q  280 acaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttga 368  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  16461420 acacaactttgaaggaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgcataaaatctcgcaaaataggcttataatcgttga 16461508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 72 - 368
Target Start/End: Original strand, 14882965 - 14883261
Alignment:
Q  72 agggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacacc 171  Q
    ||||||||| | ||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  14882965 agggtggactattaaaattaaccgttgaaaaattgtttaaagcctagcaaaatagacctataattaaattatttaaatttttcgggtggatcactacacc 14883064  T
Q  172 aatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcggat 271  Q
      || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||| || |||||||||||||||||  | |    
T  14883065 tctt-gcgggaatttggatcaaccgaaatctaaagccgacataaatttgtataaaatctcaaaaaatagacctaaaaatgaattatttaaattttttggt 14883163  T
Q  272 gggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgaca-caaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttga 368  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  14883164 gggccactacaccactttgcgggaatttggatcaaccgaaacctaaaatcgacaccaaaattgtataaaatctcgcgaaatagacttataatcgttga 14883261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 99 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 12996613 - 12996359
Alignment:
Q  99 aaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  12996613 aaaaattgtttaaagtctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaatttt-cggatggaccactacaccactttgcgggaatttggattaaccgaa 12996515  T
Q  199 atctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaa-ttatttaaa-ttttcggatgggccattacaccactttgcatgaa 296  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||||   |||    
T  12996514 acctaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagatctataattgaatttatttaaatttttcgggtgggtcactacaccactttgagggaa 12996415  T
Q  297 tttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaata 352  Q
    |||| ||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12996414 tttgcatcaatcgaaacctaaaaccgatacaaaattgtataaaatctcgcaaaata 12996359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 100 - 362
Target Start/End: Original strand, 23258899 - 23259161
Alignment:
Q  100 aaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaa 199  Q
    |||||||| |||| |||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||    
T  23258899 aaaattgtataaaatctcacaaaatagacctataattgaattatttaaatttttcggttggaccactacaccaatttgcagaaatttggatcaaccaaaa 23258998  T
Q  200 tctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcggatgggccattacaccactttgcatgaattt 299  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| || ||||||  |||||    
T  23258999 gctaaaaccgacgtaaaattgtataaaatctcacaaaatagacctataattgaattatttaaatttttgggtgggccactacaacattttgcagaaattt 23259098  T
Q  300 ggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataat 362  Q
    | |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||    
T  23259099 gaatcaaccaaaacataaaaccgatagaaaattgcataaaatctcgcaagttggacctataat 23259161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 214 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 12996612 - 12996464
Alignment:
Q  214 aaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaac 313  Q
    |||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||| |||| ||||    
T  12996612 aaaattgtttaaagtctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcggatggaccactacaccactttgcgggaatttggattaaccgaaac 12996513  T
Q  314 ataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataat 362  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12996512 ctaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagatctataat 12996464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 214 - 363
Target Start/End: Original strand, 13405307 - 13405457
Alignment:
Q  214 aaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaa-ttttcggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaa 312  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||     ||||||||||||| | |||    
T  13405307 aaaattgtttaaaatctcgcaaaatagacctatgattgaattatttaaatttttcggatgggccattacttcacttcatgggaatttggatcaatcgaaa 13405406  T
Q  313 cataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatc 363  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13405407 cctaaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatc 13405457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 91 - 249
Target Start/End: Original strand, 13405298 - 13405456
Alignment:
Q  91 aactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggat 190  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||| ||| |||  || ||   ||||||||||||    
T  13405298 aactgttgaaaaattgtttaaaatctcgcaaaatagacctatgattgaattatttaaatttttcggatgggccattacttcacttcatgggaatttggat 13405397  T
Q  191 caaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataat 249  Q
    ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13405398 caatcgaaacctaaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataat 13405456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 100 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 12698707 - 12698558
Alignment:
Q  100 aaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaa 199  Q
    |||||||| |||| |||| |||| |||||| |||| |||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||    
T  12698707 aaaattgtataaaatctcacaaaatagacc-ataattgaattatttaaatttt-cggatgggccactacaccactttgcaggaatttggatcaaccaaaa 12698610  T
Q  200 tctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattg 251  Q
      ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12698609 cataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataattg 12698558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 96 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 7536675 - 7536522
Alignment:
Q  96 ttgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaacc 195  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  || ||||||| |||||| |||||| ||||| ||    
T  7536675 ttgaaaaattgtttaaagtctcacaaaatagacctataattgaattatttaaatttttcgggtgggtcattacaccactttgcgagaatttagatcagcc 7536576  T
Q  196 gaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataat 249  Q
    |||| ||||||  |||| |||||||||||||||    ||||||||| |||||||    
T  7536575 gaaacctaaaattgacacaaaattgtataaaatcctacaaaatagatctataat 7536522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 214 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 7536671 - 7536521
Alignment:
Q  214 aaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaatttt-cggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaa 312  Q
    |||||||| |||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||  |||||| ||||| || |||    
T  7536671 aaaattgtttaaagtctcacaaaatagacctataattgaattatttaaatttttcgggtgggtcattacaccactttgcgagaatttagatcagccgaaa 7536572  T
Q  313 cataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatc 363  Q
    | |||||  |||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||    
T  7536571 cctaaaattgacacaaaattgtataaaatcctacaaaatagatctataatc 7536521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 214 - 362
Target Start/End: Original strand, 24130075 - 24130224
Alignment:
Q  214 aaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaatttt-cggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaa 312  Q
    |||||||| |||| | ||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| | |||  ||||||||||||||| |||    
T  24130075 aaaattgtttaaagtctcgcaaattaaacatataattgaattatttaaatttttcgggtgggccactacaccaatatgcgggaatttggatcaaccgaaa 24130174  T
Q  313 cataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataat 362  Q
    | |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24130175 cctaaaaccggcataaaatcgtataaaaactcgcaaaatagacctataat 24130224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 239 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 10290647 - 10290526
Alignment:
Q  239 agacctataattgaattatttaaatttt-cggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaac-caaaacataaaaccgacacaaaattgtat 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||   |||| ||| |||||||| |||||||||    
T  10290647 agacctataattgaattatttaaatttttcggatgggccactacaccattttgcagaaatttggatcaacttgaaacctaacaccgacac-aaattgtat 10290549  T
Q  337 aaaatctcgcaaaatagacctat 359  Q
    ||||||||||||| |||||||||    
T  10290548 aaaatctcgcaaagtagacctat 10290526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 96 - 207
Target Start/End: Original strand, 31968932 - 31969044
Alignment:
Q  96 ttgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaa-c 194  Q
    ||||||||||||||||||  |  |||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |    
T  31968932 ttgaaaaattgtttaaagagttacaaaatagacctataattaaattatttaaatttttcgggtggaccactacaccactttgcaggaatttagatcaacc 31969031  T
Q  195 cgaaatctaaaac 207  Q
    ||||| |||||||    
T  31969032 cgaaacctaaaac 31969044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 100 - 251
Target Start/End: Original strand, 23259013 - 23259163
Alignment:
Q  100 aaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaa 199  Q
    |||||||| |||| |||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||| || ||||| | |||||| ||||||| |||    
T  23259013 aaaattgtataaaatctcacaaaatagacctataattgaattatttaaattttt-gggtgggccactacaacattttgcagaaatttgaatcaaccaaaa 23259111  T
Q  200 tctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattg 251  Q
      ||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||  | ||||||||||||    
T  23259112 cataaaaccgatagaaaattgcataaaatctcgcaagttggacctataattg 23259163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 125 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 10290647 - 10290526
Alignment:
Q  125 agacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaac-cgaaatctaaaaccgacataaaattgtat 223  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||  |||| |||| |||||||  |||||||||    
T  10290647 agacctataattgaattatttaaatttttcggatgggccactacaccattttgcagaaatttggatcaacttgaaacctaacaccgaca-caaattgtat 10290549  T
Q  224 aaaatatcgcaaaatagacctat 246  Q
    ||||| ||||||| |||||||||    
T  10290548 aaaatctcgcaaagtagacctat 10290526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 233 - 308
Target Start/End: Original strand, 31968955 - 31969031
Alignment:
Q  233 caaaatagacctataattgaattatttaaa-ttttcggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaacc 308  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  31968955 caaaatagacctataattaaattatttaaatttttcgggtggaccactacaccactttgcaggaatttagatcaacc 31969031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 230 - 352
Target Start/End: Original strand, 1398066 - 1398188
Alignment:
Q  230 tcgcaaaatagacctataattgaattatttaaa-ttttcggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaa 328  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||| ||  |||||||||| |   ||||| ||||||| ||| | ||||||| ||||||    
T  1398066 tcgcaaaatagacctataattaaattatttaaatttttcaaatgggacaaaacaccactttacgaaaatttagatcaactaaatc-taaaaccaacacaa 1398164  T
Q  329 aattgtataaaatctcgcaaaata 352  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||    
T  1398165 aattggataaaatctcgtaaaata 1398188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 247
Target Start/End: Original strand, 2064778 - 2064928
Alignment:
Q  96 ttgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaacc 195  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||| ||  |||| |  |||||||| ||||||| |||||||  |||| ||||        
T  2064778 ttgaaaaaatgtttaaagtctcgcacaatagacctataatttaattat-tattttttccatgtggaccattacaccactttgcggagatttagatctgtt 2064876  T
Q  196 gaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctata 247  Q
     ||| ||||||||||  |||||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  2064877 taaaactaaaaccgatgtaaaattgtataaaattttgcaaaacagacctata 2064928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 279 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 31489970 - 31489894
Alignment:
Q  279 tacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagac 355  Q
    ||||||||||||   |||||||||| ||| ||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  31489970 tacaccactttgtgagaatttggattaactaaaacttaaaatcgatacaaaattatataaaatctcacaaaatagac 31489894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 245; Significance: 1e-135; HSPs: 62)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 68 - 368
Target Start/End: Original strand, 29125843 - 29126143
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccacta 167  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||    
T  29125843 tgtcagggtgggccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaattagacctataattgaattatttaaatttttcggatgggccacta 29125942  T
Q  168 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29125943 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaacctaaaaccgacataaaatcgtataaaatctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 29126042  T
Q  268 ggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttg 367  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29126043 ggatgggccactacaccactttgcaggaatttagatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgcataaaatctcgcaaaatagacctataatcgttg 29126142  T
Q  368 a 368  Q
    |    
T  29126143 a 29126143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 68 - 363
Target Start/End: Original strand, 11231954 - 11232249
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccacta 167  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  11231954 tgtcagggtgggccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaattagactcataattgaattatttaaatttttcgggtgggccacta 11232053  T
Q  168 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11232054 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaacctaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 11232153  T
Q  268 ggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatc 363  Q
    || ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11232154 gggtgggccactacaccactttgcaagaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgcataaaatctcgcaaaatagacctataatc 11232249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 72 - 368
Target Start/End: Original strand, 44254404 - 44254700
Alignment:
Q  72 agggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacacc 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  44254404 agggtgggccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaattagacctataattgaattatttaaatttttcgggtgggccactacacc 44254503  T
Q  172 aatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcggat 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  44254504 aatttgcgggaatttggatcaaccgaaacctaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcgggt 44254603  T
Q  272 gggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttga 368  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  44254604 gggccactacaccactttgcaggaatttgaatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgcataaaatctcgcaaaatagatatataatcattga 44254700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 68 - 368
Target Start/End: Original strand, 28952191 - 28952491
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccacta 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  28952191 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcacaaattagacccataattgaattatttaaattttttgggtgggccacta 28952290  T
Q  168 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28952291 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaacctaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctgtaattgaattatttaaattttc 28952390  T
Q  268 ggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttg 367  Q
    || ||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  28952391 gggtgggccactacacccctttgcaaaaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgcataaaatctcgcaaaatagacccataatcgttg 28952490  T
Q  368 a 368  Q
    |    
T  28952491 a 28952491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 68 - 361
Target Start/End: Original strand, 50527433 - 50527726
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccacta 167  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50527433 tgtcagagtgggccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtttcacaaattagacatataattgaattatttaaatttttcgggtggaccacta 50527532  T
Q  168 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 267  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50527533 caccaatttgcgagaatttggatcaaccgaaacctaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 50527632  T
Q  268 ggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataa 361  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  50527633 ggatggaccactacaccactttgcaggaatttggatcaaccaaaacataaaaccgatacaaaattgcataaaatctcgcaaaatagaactataa 50527726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 68 - 368
Target Start/End: Original strand, 12251307 - 12251607
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccacta 167  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| ||| ||    
T  12251307 tgtcagggtgggccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaattagacctatagttgaattatttaaatttttcgagtgggccatta 12251406  T
Q  168 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 267  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12251407 caccaatttgctggaatttggatcaaccgaaatctaaaatcgacataaaattgtataaattctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 12251506  T
Q  268 ggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttg 367  Q
    || ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  12251507 gggtgggccactacaccactttgcaggaatttggatcaaccaaaacataaaatcgacacaaaattatataaaatctcacaaaatagacctataatcgttg 12251606  T
Q  368 a 368  Q
    |    
T  12251607 a 12251607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 72 - 355
Target Start/End: Original strand, 32270722 - 32271006
Alignment:
Q  72 agggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcggg-tggaccactacac 170  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  32270722 agggtgggccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaattagacctataattgaattatttaaatttttcggggtgggccactacac 32270821  T
Q  171 caatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcgga 270  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  32270822 caatttgcaggaatttggatcaaccgaaacctaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcggg 32270921  T
Q  271 tgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagac 355  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32270922 tgggccactacaccactttgcaggaatttggatcaaccaaaatataaaaccgacacaaaattgcataaaatctcgcaaaatagac 32271006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 72 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 27742841 - 27742552
Alignment:
Q  72 agggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacacc 171  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  27742841 agggtggaccactaaaattaacttttgaaaaattgtttaaagtctcgcaaattagacctataattgaattatttaaatttttcgggtgggccactacacc 27742742  T
Q  172 aatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcggat 271  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27742741 aatttacgggaattgggatcaaccgaaacctaaaaacgacataaaattgtataaaatcttgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcggat 27742642  T
Q  272 gggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataa 361  Q
     ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  27742641 aggccactacaccactttgcagaaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgcataaaatctctcaaaatagacctataa 27742552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 68 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 22729579 - 22729287
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccacta 167  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||    
T  22729579 tgtcagggtgggccactaaaatttaccattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaattagatctataattgaattatttaaatttttcggttggtccacta 22729480  T
Q  168 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22729479 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaacctaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttg 22729380  T
Q  268 ggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctata 360  Q
    || ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  22729379 gggtgggccactacaccactttgtaggaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgcataaaatctcgaaaaatagacctata 22729287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 68 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 52202341 - 52202041
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccacta 167  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||| ||||||    
T  52202341 tgtcagggtgggccactaaaattaacttttgaaaaattgtttaaagtctcgcaaattagacctataattgaattatttaaattttttgagtgggccacta 52202242  T
Q  168 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 267  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  52202241 caccaatttgcgggaattgggatcaactgaaacctaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgtaaaatagatctataattgaattatttaaattttt 52202142  T
Q  268 ggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttg 367  Q
    || |||| || ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  52202141 gggtgggtcactacaccactttgcagaaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatcgttg 52202042  T
Q  368 a 368  Q
    |    
T  52202041 a 52202041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 72 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 35084148 - 35083857
Alignment:
Q  72 agggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacacc 171  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||| |    
T  35084148 agggtgggtcactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaattagacctataattgaattatttaaatttttcgggtgggccactacatc 35084049  T
Q  172 aatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcggat 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  35084048 aatttgcgggaatttggatcaaccgaaacctaaaaccaacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataattgaattatttaacttttcgggt 35083949  T
Q  272 gggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatc 363  Q
    || ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  35083948 ggaccactacaccactttacaggaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgcataaaatctcgtaaaattgacctataatc 35083857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 68 - 360
Target Start/End: Original strand, 1092677 - 1092969
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccacta 167  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  1092677 tgtcagggtgggccactaaaattaaccattgaaaaattgttttaagtctcgcaaatcagacctataattgaattatttaaatttttcgcgtgggccacta 1092776  T
Q  168 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1092777 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaacctaaaaccgacgtaaaattgtataaaatctcgcaaaatagatctataattgaattatttaaattttc 1092876  T
Q  268 ggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctata 360  Q
    || ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  1092877 gggtgggccactacaccactttacaggaatttggatcaaccaaaacataaaacccacacaaaattgcataaaatctcgcaaaatagacttata 1092969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 72 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 36633835 - 36633546
Alignment:
Q  72 agggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacacc 171  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||       ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  36633835 agggtggaccactaaaattaaccattgaaaaattatttaaagtctcgcaaattagacc-------gaattatttaaatttttctggtggaccactacacc 36633743  T
Q  172 aatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcggat 271  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36633742 aatttgcaggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataatatctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcgggt 36633643  T
Q  272 gggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttga 368  Q
    |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  36633642 gggccgctacaccactttgcaggaatttggatcaaccaaaacataaaatcgatacaaaattgtataaaatctcacaaaatagacctataatcgttga 36633546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 68 - 360
Target Start/End: Original strand, 49657011 - 49657303
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccacta 167  Q
    |||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  49657011 tgtcagcgtggaccactaaaatttatcattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaattagacctataattgaattatttaaatttttcgggtgggccacta 49657110  T
Q  168 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  49657111 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaacctaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagatctataattgaattatttaaattttc 49657210  T
Q  268 ggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctata 360  Q
     | ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||    
T  49657211 aggtggaccactacaccactttgcaggaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacgtaaaattgcataaaatttcaaaaaatagacctata 49657303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 72 - 368
Target Start/End: Original strand, 16908622 - 16908908
Alignment:
Q  72 agggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacacc 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16908622 agggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctagcaaattagacctataattgaattatttaaatttttcgggtgggccactacacc 16908721  T
Q  172 aatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcggat 271  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  16908722 aatttgcgggaatttggatcaatcgaaacctaaaaccgacataaaattgtataaaatctagcaaaatagacctataattgaattatttaaatttttgggt 16908821  T
Q  272 gggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttga 368  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16908822 gggccactacaccactttgctggaatttggatcaaccaaaacataaaaccgac----------ataaaatctcgcaaaatagacctataatcgttga 16908908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 81 - 362
Target Start/End: Original strand, 21259133 - 21259415
Alignment:
Q  81 cactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgg 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  21259133 cactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtcttgcaaattagacctataattgaattatttaaatttttcggatgggccattacaccaatttgcgg 21259232  T
Q  181 gaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaa-ttttcggatgggccatt 279  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21259233 gaatttggatcaaccgaaacctaaaaccgacataaaattatataaaatctagcaaaatagacctataattgaattatttaaatttttcggatgggccatt 21259332  T
Q  280 acaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataat 362  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21259333 acaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaacctaaaaccgacataaaattatataaaatctagcaaaatagacctataat 21259415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 116 - 368
Target Start/End: Original strand, 13594721 - 13594973
Alignment:
Q  116 tcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataa 215  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  13594721 tcgcaaattagacatataattgaattatttaaatttttcgggttggccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaacataaaaccgacataa 13594820  T
Q  216 aattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacat 315  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||| |||| |||||||||    
T  13594821 aattgtataaaatctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcgggtgggccactacaccactttgtaggaatttgaatcagccaaaacat 13594920  T
Q  316 aaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttga 368  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  13594921 aaaaccgacacaaaattgcataaaatctcgcaaaatagatctataatcgttga 13594973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 100 - 368
Target Start/End: Original strand, 21259266 - 21259534
Alignment:
Q  100 aaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaa 199  Q
    |||||| | |||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21259266 aaaattatataaaatctagcaaaatagacctataattgaattatttaaatttttcggatgggccattacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaa 21259365  T
Q  200 tctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcggatgggccattacaccactttgcatgaattt 299  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||| ||||||    
T  21259366 cctaaaaccgacataaaattatataaaatctagcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcgggtggatcactacaccactttgcaggaattt 21259465  T
Q  300 ggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttga 368  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  21259466 gaatcaaccaaaacataaaatcgacacaaaattgcataaaatctcacaaaatagacctataatcgttga 21259534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 72 - 368
Target Start/End: Original strand, 52571236 - 52571524
Alignment:
Q  72 agggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacacc 171  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  52571236 agggtggactactaaaattaactattgaaaatttgtttaaagtctcacaaattagacctataattgaattgtttaaattttttgggtagaccactacacc 52571335  T
Q  172 aatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcggat 271  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||         || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |    
T  52571336 aatttgcggaaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaatttg--------ctcacaaaatagacctataattgaattatttaaatttttgagt 52571427  T
Q  272 gggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttga 368  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  52571428 gggccactacaccactttgtaggaatttggatcaaccaaaacataaaaccgatacaaaattgcataaaatatcgcaaattagacctataatcgttga 52571524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 178 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 49170042 - 49169852
Alignment:
Q  178 cgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcggatgggcca 277  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  49170042 cgggaatttggatcaatcgaaacctaaaaccgacataaaattgtataaagtcttgcaaaatagacccataattgaattatttaaattttcgggtgggcca 49169943  T
Q  278 ttacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttga 368  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  49169942 ttacaccactttgcagaaattcggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatttcgcaaaatagacctataatcgttga 49169852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 68 - 248
Target Start/End: Original strand, 25246137 - 25246317
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccacta 167  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  25246137 tgtcagtgtgggccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcacaaattagacttataattgaattatttaaatttttcgggtagaccacta 25246236  T
Q  168 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25246237 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaacctaaaaaagacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataa 25246317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 73 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 45045563 - 45045268
Alignment:
Q  73 gggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacacca 172  Q
    |||||| |||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||| || |  ||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  45045563 gggtgggccactaaaattatcttataaaaaattgtttaaagtctcgcaaaataaatatataattgaattatttgaattttt-gggtggaccactacacca 45045465  T
Q  173 atttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaa-ttttcggat 271  Q
     ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |    
T  45045464 ctttgcaggaatttggattaatcgaaacctaaaaccaacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataattaaattatttaaatttttcgggt 45045365  T
Q  272 gggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttga 368  Q
    ||  || ||||| | |||||  ||||||||||||||| |||  ||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  45045364 ggatcactacactagtttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccaacaaaaaattatttaaaatctcgcaaaataaatctataatcattga 45045268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 81 - 249
Target Start/End: Original strand, 7160216 - 7160384
Alignment:
Q  81 cactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgg 180  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7160216 cactaaaattaactattaaaaaattgtttaaagtctcgcaaattagacctataattgaattatttaaatttttcgggtgggccactacaccaatttgcgg 7160315  T
Q  181 gaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataat 249  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7160316 gaatttggattaaccgaaacctaaaactgacacaaaattacataaaatctcgcaaaatagacctataat 7160384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 215 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 18163930 - 18163777
Alignment:
Q  215 aaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaaca 314  Q
    ||||||| |||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18163930 aaattgtttaaagtctcacaaaatagacctataattgaattatttaaattttcgggtggactactacaccactttgcaggaatttggatcaaccaaaaca 18163831  T
Q  315 taaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttga 368  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18163830 taaaaccgatacaaaattgaataaaatctcgcaaaatagacctataatcgttga 18163777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 68 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 18163963 - 18163783
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccacta 167  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  18163963 tgtcagggtgggccacgaaaattaactattgagaaattgtttaaagtctcacaaaatagacctataattgaattatttaaatttt-cgggtggactacta 18163865  T
Q  168 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataat 249  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18163864 caccactttgcaggaatttggatcaaccaaaacataaaaccgatacaaaattgaataaaatctcgcaaaatagacctataat 18163783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 155 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 744125 - 743958
Alignment:
Q  155 gggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaat 254  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  744125 gggtggacgactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaacctaaa-ccgacgtaaaattgtataaaatcttccaaaatagacctataattgaat 744027  T
Q  255 tatttaaattttcggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaat 331  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| ||||        || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  744026 tatttaaattttcgggtggaccactaca--------caggaattttgatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaat 743958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 214 - 362
Target Start/End: Original strand, 32270750 - 32270900
Alignment:
Q  214 aaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc--ggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaa 311  Q
    |||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||    
T  32270750 aaaattgtttaaagtctcgcaaattagacctataattgaattatttaaatttttcggggtgggccactacaccaatttgcaggaatttggatcaaccgaa 32270849  T
Q  312 acataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataat 362  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32270850 acctaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataat 32270900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 214 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 44205626 - 44205471
Alignment:
Q  214 aaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaac 313  Q
    |||||||| |||| | ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  44205626 aaaattgtttaaagtctcgcaaattagacctttaattgaattatttaaattttcgggtgagccactacatcactttgcaagaatttggatcaaccaacac 44205527  T
Q  314 ataaaaccgacac-aaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttga 368  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  44205526 ataaaaccgacacaaaaattgcataaaatctcgcaaaatagatctataatcgttga 44205471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 214 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 4618362 - 4618210
Alignment:
Q  214 aaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaac 313  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| | || |||||||||| |||||     
T  4618362 aaaattgtataaaatctcgcaaaatagacttataattgaattatttaaattttcgggtggaccactaca-cactttgaaagagtttggatcaa-caaaaa 4618265  T
Q  314 ataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttga 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  4618264 ataaaaccgacacaaaattgtataaaatcttgcaaaatagatctataatcgttga 4618210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 68 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 44205658 - 44205477
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccacta 167  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||||    
T  44205658 tgtcagggtgggccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaattagacctttaattgaattatttaaa-ttttcgggtgagccacta 44205560  T
Q  168 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgaca-taaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataat 249  Q
    || || |||||  ||||||||||||||| | |  |||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  44205559 catcactttgcaagaatttggatcaaccaacacataaaaccgacacaaaaattgcataaaatctcgcaaaatagatctataat 44205477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 214 - 362
Target Start/End: Original strand, 49657043 - 49657192
Alignment:
Q  214 aaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaatttt-cggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaa 312  Q
    |||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||| |||    
T  49657043 aaaattgtttaaagtctcgcaaattagacctataattgaattatttaaatttttcgggtgggccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaa 49657142  T
Q  313 cataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataat 362  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  49657143 cctaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagatctataat 49657192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 228 - 362
Target Start/End: Original strand, 13594719 - 13594854
Alignment:
Q  228 tatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaa-ttttcggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacac 326  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  13594719 tatcgcaaattagacatataattgaattatttaaatttttcgggttggccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaacataaaaccgacat 13594818  T
Q  327 aaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataat 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13594819 aaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataat 13594854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 96 - 235
Target Start/End: Original strand, 31174500 - 31174639
Alignment:
Q  96 ttgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaacc 195  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  31174500 ttgaaaaattgtttaaagactcgcaaaatagacctacaattgaattatttaaatttttcggatgaaccactacaccactttgctagaatttggatcaacc 31174599  T
Q  196 gaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaa 235  Q
     ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31174600 aaaacctaaaaccgacacaaaattgtataaaatatcgcaa 31174639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 214 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 22729547 - 22729398
Alignment:
Q  214 aaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaatttt-cggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaa 312  Q
    |||||||| |||| | ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||| |||||  ||||||||||||||| |||    
T  22729547 aaaattgtttaaagtctcgcaaattagatctataattgaattatttaaatttttcggttggtccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaa 22729448  T
Q  313 cataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataat 362  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22729447 cctaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataat 22729398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 214 - 368
Target Start/End: Original strand, 7160235 - 7160390
Alignment:
Q  214 aaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaatttt-cggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaa 312  Q
    |||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||  |||||||||| |||| |||    
T  7160235 aaaattgtttaaagtctcgcaaattagacctataattgaattatttaaatttttcgggtgggccactacaccaatttgcgggaatttggattaaccgaaa 7160334  T
Q  313 cataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttga 368  Q
    | |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7160335 cctaaaactgacacaaaattacataaaatctcgcaaaatagacctataatcgttga 7160390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 214 - 362
Target Start/End: Original strand, 50527465 - 50527614
Alignment:
Q  214 aaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaatttt-cggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaa 312  Q
    |||||||| |||| | || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||| |||||  ||||||||||||||| |||    
T  50527465 aaaattgtttaaagtttcacaaattagacatataattgaattatttaaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgagaatttggatcaaccgaaa 50527564  T
Q  313 cataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataat 362  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50527565 cctaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataat 50527614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 230 - 348
Target Start/End: Original strand, 31174520 - 31174639
Alignment:
Q  230 tcgcaaaatagacctataattgaattatttaaatttt-cggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaa 328  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31174520 tcgcaaaatagacctacaattgaattatttaaatttttcggatgaaccactacaccactttgctagaatttggatcaaccaaaacctaaaaccgacacaa 31174619  T
Q  329 aattgtataaaatctcgcaa 348  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  31174620 aattgtataaaatatcgcaa 31174639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 230 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 34660943 - 34660814
Alignment:
Q  230 tcgcaaaatagacctataattgaattatttaaatttt-cggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaa 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  34660943 tcgcaaaatagacctataattgaat-atttaaatttttcgggtggaccactacaccactttgcaaaaatttggatcagccaaaacctaaaaccgacacaa 34660845  T
Q  329 aattgtataaaatctcgcaaaatagacctat 359  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  34660844 aattatataaaatctcgtaaaatagacctat 34660814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 214 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 27742813 - 27742664
Alignment:
Q  214 aaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaatttt-cggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaa 312  Q
    |||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||| |  ||||| ||||||||| |||    
T  27742813 aaaattgtttaaagtctcgcaaattagacctataattgaattatttaaatttttcgggtgggccactacaccaatttacgggaattgggatcaaccgaaa 27742714  T
Q  313 cataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataat 362  Q
    | ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27742713 cctaaaaacgacataaaattgtataaaatcttgcaaaatagacctataat 27742664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 106 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 34660953 - 34660814
Alignment:
Q  106 gtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaa 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||| || ||| |||||    
T  34660953 gtttaaagtctcgcaaaatagacctataattgaat-atttaaatttttcgggtggaccactacaccactttgcaaaaatttggatcagccaaaacctaaa 34660855  T
Q  206 accgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctat 246  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  34660854 accgacacaaaattatataaaatctcgtaaaatagacctat 34660814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 230 - 362
Target Start/End: Original strand, 1092725 - 1092858
Alignment:
Q  230 tcgcaaaatagacctataattgaattatttaaatttt-cggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaa 328  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||    
T  1092725 tcgcaaatcagacctataattgaattatttaaatttttcgcgtgggccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaacctaaaaccgacgtaa 1092824  T
Q  329 aattgtataaaatctcgcaaaatagacctataat 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1092825 aattgtataaaatctcgcaaaatagatctataat 1092858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 214 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 2619098 - 2618953
Alignment:
Q  214 aaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaa--attttcggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaa 311  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||  ||    
T  2619098 aaaattgtttaaagtgtcgcaaaatagacctataattgaattatttaatttttttcgggtgggccactacaccactttgcaggagtttgaatcaacagaa 2618999  T
Q  312 acataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctat 359  Q
    || ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2618998 acttaaaaccaacac--aattgtataaaatctcgcaaaatagacctat 2618953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 76 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 4618386 - 4618216
Alignment:
Q  76 tggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatt 175  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  4618386 tggaccactaaaattaattattgaaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacttataattgaattatttaaa-ttttcgggtggaccactaca-cactt 4618289  T
Q  176 tgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataat 249  Q
    ||   || |||||||||| | |||  ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  4618288 tgaaagagtttggatcaa-caaaaaataaaaccgacacaaaattgtataaaatcttgcaaaatagatctataat 4618216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 100 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 49170006 - 49169858
Alignment:
Q  100 aaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaa 199  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||| |||| |||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| | |||| ||||||||| |||    
T  49170006 aaaattgtataaagtcttgcaaaatagacccataattgaattatttaaatttt-cgggtgggccattacaccactttgcagaaattcggatcaaccaaaa 49169908  T
Q  200 tctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataat 249  Q
      ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  49169907 cataaaaccgacacaaaattgtataaaatttcgcaaaatagacctataat 49169858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 100 - 249
Target Start/End: Original strand, 13594819 - 13594967
Alignment:
Q  100 aaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaa 199  Q
    |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| |||| || |||    
T  13594819 aaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaa-ttttcgggtgggccactacaccactttgtaggaatttgaatcagccaaaa 13594917  T
Q  200 tctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataat 249  Q
      ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  13594918 cataaaaccgacacaaaattgcataaaatctcgcaaaatagatctataat 13594967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 96 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 2619102 - 2618953
Alignment:
Q  96 ttgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataa-atttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaac 194  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||    
T  2619102 ttgaaaaattgtttaaagtgtcgcaaaatagacctataattgaattatttaatttttttcgggtgggccactacaccactttgcaggagtttgaatcaac 2619003  T
Q  195 cgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctat 246  Q
     ||||  ||||||| ||  | ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2619002 agaaacttaaaaccaac--acaattgtataaaatctcgcaaaatagacctat 2618953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 214 - 361
Target Start/End: Original strand, 25246169 - 25246317
Alignment:
Q  214 aaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaatttt-cggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaa 312  Q
    |||||||| |||| | || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | | ||| ||||||| |||||  ||||||||||||||| |||    
T  25246169 aaaattgtttaaagtctcacaaattagacttataattgaattatttaaatttttcgggtagaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaa 25246268  T
Q  313 cataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataa 361  Q
    | |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25246269 cctaaaaaagacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataa 25246317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 155 - 239
Target Start/End: Original strand, 52499197 - 52499281
Alignment:
Q  155 gggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaata 239  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  52499197 gggtggaccactacaccactttgcggaaatttagatcagccgaaatttaaaaccaacacaaaattgtataaaatctcgcaaaata 52499281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 96 - 228
Target Start/End: Original strand, 576405 - 576536
Alignment:
Q  96 ttgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaacc 195  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||| ||||| || |||||||||   || | ||||||||||| |||||| | | || ||||||||    
T  576405 ttgaaaaattgtttaaagactcgaaaa-tatacctataattgaataatttaaatttttttagtaggccactacaccactttgcgtgtacttagatcaacc 576503  T
Q  196 gaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaat 228  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  576504 gaaatctaaaatcgatacaaaattgtataaaat 576536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 72 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 49170252 - 49170168
Alignment:
Q  72 agggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgg 156  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| | | |||| ||||||||||||    
T  49170252 agggtggaccacaaaaattaatcattgaaaaattgtttaaagtttcgcaaattaaacctataatttagttatttaaatttttcgg 49170168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 234 - 344
Target Start/End: Original strand, 576428 - 576539
Alignment:
Q  234 aaaatagacctataattgaattatttaaattttcgga-tgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaatt 332  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   | | ||||| ||||||||||||| || | || |||||||| |||  ||||| ||| ||||||||    
T  576428 aaaatatacctataattgaataatttaaatttttttagtaggccactacaccactttgcgtgtacttagatcaaccgaaatctaaaatcgatacaaaatt 576527  T
Q  333 gtataaaatctc 344  Q
    ||||||||||||    
T  576528 gtataaaatctc 576539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 279 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 744114 - 744032
Alignment:
Q  279 tacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataat 362  Q
    ||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| |||| |||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  744114 tacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaacctaaa-ccgacgtaaaattgtataaaatcttccaaaatagacctataat 744032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 96 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 18658035 - 18657974
Alignment:
Q  96 ttgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcggg 157  Q
    ||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  18658035 ttgaaaatttgtttaaagactcgtaaaatagacctataattgaattatttaaatttttcggg 18657974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 279 - 352
Target Start/End: Original strand, 52499208 - 52499281
Alignment:
Q  279 tacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaata 352  Q
    |||||||||||||   ||||| ||||| || |||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52499208 tacaccactttgcggaaatttagatcagccgaaatttaaaaccaacacaaaattgtataaaatctcgcaaaata 52499281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 744067 - 743998
Alignment:
Q  100 aaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacac 170  Q
    |||||||| |||| |||  |||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  744067 aaaattgtataaaatcttccaaaatagacctataattgaattatttaaa-ttttcgggtggaccactacac 743998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 234 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 18658011 - 18657979
Alignment:
Q  234 aaaatagacctataattgaattatttaaatttt 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18658011 aaaatagacctataattgaattatttaaatttt 18657979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 30587663 - 30587572
Alignment:
Q  147 aatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaat 238  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||   |||||| |||||| || |   ||||||| |||||| |||||||||    
T  30587663 aatttttcgtatgggccactacaccattttgcgggaatttggatttgccgaaaactaaaatcgtcgcgaaattgtttaaaatctcgcaaaat 30587572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 214 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 49170224 - 49170158
Alignment:
Q  214 aaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaa-ttttcggatgggccatt 279  Q
    |||||||| |||| | ||||||| || |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||    
T  49170224 aaaattgtttaaagtttcgcaaattaaacctataatttagttatttaaatttttcggatgggccatt 49170158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 294 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 18657974 - 18657913
Alignment:
Q  294 gaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagac 355  Q
    ||||||| ||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  18657974 gaatttgaatcaaccgaaacctaaaaccgatgcaaaattgtataaagtcttgcaaagtagac 18657913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 327 - 360
Target Start/End: Original strand, 25894699 - 25894732
Alignment:
Q  327 aaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctata 360  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25894699 aaaattgtttaaaatctcgcaaaatagacctata 25894732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 327 - 360
Target Start/End: Original strand, 25911666 - 25911699
Alignment:
Q  327 aaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctata 360  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25911666 aaaattgtttaaaatctcgcaaaatagacctata 25911699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 178 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18657977 - 18657929
Alignment:
Q  178 cgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaa 226  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||    
T  18657977 cgggaatttgaatcaaccgaaacctaaaaccgatgcaaaattgtataaa 18657929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 76)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 68 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 26874062 - 26873762
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccacta 167  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26874062 tgtcagggtgggccactaaaattaactattgaaaagttgtttaaagtctcgcaaattagacctttaattgaattatttaaatttttcgggtggaccacta 26873963  T
Q  168 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26873962 caccaatttgcgggaatttggatcaatcgaaatctaaaactgacataaaattgtataaaacctcgcaaattagacctataattgaattatttaaattttc 26873863  T
Q  268 ggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttg 367  Q
    || ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26873862 gggtgggccactacaccactttgcaggaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatcattg 26873763  T
Q  368 a 368  Q
    |    
T  26873762 a 26873762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 72 - 368
Target Start/End: Original strand, 22723579 - 22723875
Alignment:
Q  72 agggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacacc 171  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  22723579 agggtggactactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtttcacaaattagacctataattgaattatttaaattttgcgggtgggccactacacc 22723678  T
Q  172 aatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcggat 271  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22723679 aatttgcgggaaattggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcgggt 22723778  T
Q  272 gggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttga 368  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  22723779 gggccactacaccactttgcaggaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgcataaaatctcgcaaagtagacctataatcgttga 22723875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 72 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 45350406 - 45350110
Alignment:
Q  72 agggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacacc 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  45350406 agggtgggccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaattagacatataattgaattatttaaatttttcgggtgggacactacacc 45350307  T
Q  172 aatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcggat 271  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45350306 aatttgcgggaatttgaatcaaccgaaacctaaaatcgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcggat 45350207  T
Q  272 gggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttga 368  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  45350206 gggccattacaccactttgcagaaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgcataaaatctcgcaaaatagacttataatcgttga 45350110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 72 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 46028035 - 46027739
Alignment:
Q  72 agggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacacc 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  46028035 agggtgggccactaaaattaactattgaaaaatcgtttaaagtctcgcaaattatacctataattgaattatttaaatttttcgggtgggccactacacc 46027936  T
Q  172 aatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcggat 271  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  46027935 aatttgcgggaatttggatcaacctaaatctaaaactgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatttaattatttaaattttcgggt 46027836  T
Q  272 gggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttga 368  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  46027835 gggccactacaccactttgcaagaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgcataaaatctcgcaaaatagacctataatcgttga 46027739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 68 - 368
Target Start/End: Original strand, 31065422 - 31065722
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccacta 167  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||| |||||     
T  31065422 tgtcagagtgggccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaattagacctgtaattgatttatttaaatttttcgggtgggccactg 31065521  T
Q  168 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31065522 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaacctaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 31065621  T
Q  268 ggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttg 367  Q
    || ||| ||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  31065622 gggtggaccactacaccactttgcaggaatttggattaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgcataaaatctcgtaaaatagacctataatcgttg 31065721  T
Q  368 a 368  Q
    |    
T  31065722 a 31065722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 68 - 368
Target Start/End: Original strand, 36358109 - 36358409
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccacta 167  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36358109 tgtcagggtgggccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcacaaattagacctataattgaattatttaaatttttcgggtggaccacta 36358208  T
Q  168 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  36358209 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaacctaaaatcgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagatctataattgaattatttaaattttt 36358308  T
Q  268 ggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttg 367  Q
    || ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| |||    
T  36358309 gggtggaccactacaccactttgcaggaatttggatcaaccaaaacataaaaccgatacaaaattgcataaaatgtcgcaaaatagatctataatcgttg 36358408  T
Q  368 a 368  Q
    |    
T  36358409 a 36358409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 70 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 43859448 - 43859150
Alignment:
Q  70 tcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactaca 169  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43859448 tcagggtgggccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcacaaattagacctataattgaattatttaaatttttcgggtggaccactaca 43859349  T
Q  170 ccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcgg 269  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43859348 ccaatttgcagaaatttggatcaaccgaaacctaaaaccgacgtaaaattgtataaaatctcacaaaatagacctataattgaattatttaaattttcgg 43859249  T
Q  270 atgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttga 368  Q
    |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  43859248 atggaccactacaccactttgcaggaatttggatcaaccaaaacataaaaccgatacaaaattgcataaaatctcgcaaattcgacctataatcgttga 43859150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 72 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 17167222 - 17166931
Alignment:
Q  72 agggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacacc 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  17167222 agggtgggccactaaaattaacttttgaaaaattgtttaaagtctcgcaaattagacctataattgaattatttaaatttttcgggtggaccactacatc 17167123  T
Q  172 aatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaa-ttttcgga 270  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||     
T  17167122 aatttgcgggaattgggatcaaccgaaacctaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttttggg 17167023  T
Q  271 tgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataat 362  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  17167022 tgggccactacaccactttgcaggaatttggatcaaccaaaacataaaaccgatacaaaattgcataaaatctcgcaaaatagaactataat 17166931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 75 - 368
Target Start/End: Original strand, 44467827 - 44468120
Alignment:
Q  75 gtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaat 174  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44467827 gtgggccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcacaaattagatctataattgaattatttaaatttttcaggtggaccactacaccaat 44467926  T
Q  175 ttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcggatggg 274  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44467927 ttgcgggaatttggatcaattgaaacctaaaaccaacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcgggtggg 44468026  T
Q  275 ccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttga 368  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  44468027 ccactacaccactttgcaggaatttggatcaaccaaaacataaaaccaacacaaaattgcataaaatctcgcaaaatagatctataatcgttga 44468120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 68 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 44143120 - 44142821
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccacta 167  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  44143120 tgtcagggtgggccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaattagacctataattgaattatttaaatttttcgggtgggccacta 44143021  T
Q  168 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  44143020 caccaatttgcgggaatttggatcaatcaaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaatttcc 44142921  T
Q  268 ggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttg 367  Q
     | | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  44142920 aggt-ggccactacaccactttgcaggaatttggatcaaagaaaacataaaaccaacacaaaattgcataaaatctcgcaaaatatacctataatcgttg 44142822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 80 - 363
Target Start/End: Original strand, 36675298 - 36675581
Alignment:
Q  80 ccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcg 179  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  36675298 ccactaaaattaactattaaaaaattgtttaaagtcttgcaaattagacctataattgaattatttaaatttttcgggtgggccactacaccaatttgtg 36675397  T
Q  180 ggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcggatgggccatt 279  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  36675398 ggaatttggatcaaccgaaacttaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcgggtgggccact 36675497  T
Q  280 acaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatc 363  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  36675498 acatcactttgcaggaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgcataaaatctcacaaaatagatctataatc 36675581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 70 - 362
Target Start/End: Original strand, 44723864 - 44724156
Alignment:
Q  70 tcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactaca 169  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||| ||||| ||| ||||||||    
T  44723864 tcagggtgggctactaaaattaactattgaaaagttgtttaaagtctcgcaaattagacctataattaaattatttaaattcttcggatgggccactaca 44723963  T
Q  170 ccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcgg 269  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44723964 ccaatttgtgggaatttggatcaaccgaaacctaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcgg 44724063  T
Q  270 atgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataat 362  Q
     ||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  44724064 gtgggcctctacaccactttgcaggaatttagatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctctcaaaataaacctataat 44724156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 68 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 40055950 - 40055666
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccacta 167  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||     
T  40055950 tgtcagggtgcgccactaaaattaactattaaaaaattgtttaaagtctcgcaaattagacctataattgaattatttaaattttttgggtgggccactg 40055851  T
Q  168 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40055850 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaacctaaaactgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 40055751  T
Q  268 ggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaata 352  Q
    |||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40055750 ggatgggccactacaccacttatcaagaatttggatcaaccaaaacatacaaccgatacaaaattgcataaaatctcgcaaaata 40055666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 80 - 368
Target Start/End: Original strand, 42241740 - 42242028
Alignment:
Q  80 ccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcg 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  42241740 ccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctctcaaattagatctataattgaattatttaaatttttcgggtggacgactacaccaatttccg 42241839  T
Q  180 ggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcggatgggccatt 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || | || |    
T  42241840 ggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgtaaaatagatctataattgaattatttaaattttcgggtgagtcact 42241939  T
Q  280 acaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttga 368  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||| ||||    
T  42241940 acaccactttgcaggaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgcataaaatctcacaaattaaacctataatcgttga 42242028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 72 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 9624351 - 9624055
Alignment:
Q  72 agggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacacc 171  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  9624351 agggtgggccactaaaattaactagtgaaaaattgtttaaagtctcgtaaattagatctataattgaattatttaaatttttcgggtgggccactacacc 9624252  T
Q  172 aatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcggat 271  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |    
T  9624251 aatttgcgggaatttggatcaaccaaaacctaaaaccgacataaaattgtataaaatctcggaaaatagacctataattaaattatttaaatttttgggt 9624152  T
Q  272 gggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttga 368  Q
    ||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9624151 gggccacaacaccactttgtaggaatttggatcaaccaaaatataaaaccaacacaaaattgcataaaatctcgcaaaatagacctataatcgttga 9624055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 72 - 356
Target Start/End: Original strand, 23469199 - 23469483
Alignment:
Q  72 agggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacacc 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| | ||| ||||||||||    
T  23469199 agggtgggccactaaaattaacttttgaaaaattgtttaaaatctcgcaaattagacctataattgaattatttaaatttttcagatgggccactacacc 23469298  T
Q  172 aatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcggat 271  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23469299 aatttgcgggaattgggatcaacagaaacctaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcgggt 23469398  T
Q  272 gggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacc 356  Q
    || | | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23469399 ggacaactacaccactttgcaggaatttggatcaaccaaaatataaaaccgacacaaaattgcataaaatctcgcaaaatagacc 23469483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 74 - 360
Target Start/End: Original strand, 29075000 - 29075276
Alignment:
Q  74 ggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaa 173  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29075000 ggtggaccactaaaattaactattaaaaaattgtttaaagtttcgcaaattagacctataattgaattatttaaatttttcgggtggaccactacaccaa 29075099  T
Q  174 tttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcggatgg 273  Q
    ||          ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29075100 tt----------tggatcaaccgaaacttaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcgggtgg 29075189  T
Q  274 gccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctata 360  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  29075190 gccactacaccactttgcaagaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgcataaaatatcgcaaaatagacctata 29075276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 73 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 39976675 - 39976380
Alignment:
Q  73 gggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacacca 172  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39976675 gggtgggccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcacaaattagacctataattgaattatttaaatttttcgggtggaccactacacca 39976576  T
Q  173 atttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcggatg 272  Q
    |||| | | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  39976575 atttacagaaatttggatcaattgaaatctaaaaccgacataaatttgtataaaatctcacaaaatagatctataattgaattatttaaattttcgggtg 39976476  T
Q  273 ggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttga 368  Q
    || || |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  39976475 ggtcactacaccactttgtaggaatttggatcaaccaaaacataaaaccgatacaaaattgcataaaatctcgcaaattagacatataatcgttga 39976380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 72 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 31429092 - 31428796
Alignment:
Q  72 agggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacacc 171  Q
    ||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  31429092 agggtgggctactgaaattaacttttgaaaaattgtttaaagtctcgcaaattaaacctataattgaattatttacatttttcgggtggaccactacacc 31428993  T
Q  172 aatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcggat 271  Q
    ||||| ||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |    
T  31428992 aatttacgggaattgagatcaactgaaacctaaaaccgacataaaattttataaaatctcgcaaaatagatctataattaaattatttaaattttcgggt 31428893  T
Q  272 gggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttga 368  Q
    || ||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  31428892 ggaccactacaccactttgcaggaatttggatcaatcaaaacataaaaccgacacaaaattgcataaaatcttgcaaaatagacctataatcgttga 31428796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 72 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 41368014 - 41367724
Alignment:
Q  72 agggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacacc 171  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  41368014 agggtgggccactaaaattaactattaaaaaattgtttaaagtctcacaaattagatctataattgaattatttaaatttttcgggtggatcactacacc 41367915  T
Q  172 aatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcggat 271  Q
    ||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41367914 aatttgcggaaatttggatcaactaaaacctaaaaccgacataaatttgtataaaatctcacaaaatagacctataactgaattatttaaattttcggat 41367815  T
Q  272 gggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataat 362  Q
    || ||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41367814 ggaccactacaccactttgtagaaatttggatcaaccaaaatataaaatcgatacaaaattgcataaaatctcgcaaattagacctataat 41367724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 74 - 368
Target Start/End: Original strand, 16834080 - 16834376
Alignment:
Q  74 ggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaa 173  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||  |||||| ||||    
T  16834080 ggtgggccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaattagacctataattaaattatttaaattttttgggtgggacactaccccaa 16834179  T
Q  174 tttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgc--aaaatagacctataattgaattatttaaattttcggat 271  Q
    |||| | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16834180 tttgtgagaatttggatcaatcgaaacctaaaaccgacataaaattgtataaaatctctcataatatagacctataattgaattatttaaattttcggat 16834279  T
Q  272 gggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttga 368  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |  ||||||| |||||||||| ||||    
T  16834280 gggccactacaccactttgcagaaatttggatcaaccaaaacataaaactgacacaaaattgcataaaattttacaaaataaacctataatcgttga 16834376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 72 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 8461941 - 8461764
Alignment:
Q  72 agggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacacc 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8461941 agggtgggccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtatcacaaattagatctataattgaattatttaaatttttcgggtggaccactacacc 8461842  T
Q  172 aatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataat 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8461841 aatttgcgggaatttggatcaaccgaaacctaaaacagacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataat 8461764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 72 - 249
Target Start/End: Original strand, 31931827 - 31932004
Alignment:
Q  72 agggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacacc 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  31931827 agggtgggccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaaatctcgtaaattagatctataattgaattatttaaattttttgggtggaccactacacc 31931926  T
Q  172 aatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataat 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31931927 aatttgcgggaatttggatcaaccgaaacctaaaaccgacataaaatcgtataaaatctcgcaaaatagacctataat 31932004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 80 - 246
Target Start/End: Original strand, 46828761 - 46828926
Alignment:
Q  80 ccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcg 179  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||  || |||| |||||||| || |||||||||||||||| ||||||    
T  46828761 ccactaaaattaaccgttgaaaaattgtttaaagtctctcaaaatagatctataatcgagttatttaaatttt-cgagtggaccactacaccactttgcg 46828859  T
Q  180 ggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctat 246  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  46828860 ggaatttggatcaaccgaaacctaataccgacataaaattgtacaaaatctcgcaaaatagacctat 46828926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 96 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 25174365 - 25174216
Alignment:
Q  96 ttgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaacc 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||    
T  25174365 ttgaaaaattgtttaaagtctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaatttttcgggtggaccactacaccactttgtgagaatttggatcaacc 25174266  T
Q  196 gaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagaccta 245  Q
    |||| |||||||| ||| | |||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  25174265 gaaacctaaaaccaacacataattatataaaatctcgcaaaattgaccta 25174216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 73 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 29663155 - 29663010
Alignment:
Q  73 gggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacacca 172  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  29663155 gggtggaccactaaaattaaccgttgaaaaattgtttaaagtcttgcaaaatagacctataattgaattatttaaatttttcgggtgggccactacacca 29663056  T
Q  173 atttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaat 218  Q
     |||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  29663055 ctttgtgagaatttggatcagccgaaatctaaaaccgacacaaaat 29663010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 72 - 249
Target Start/End: Original strand, 23562564 - 23562740
Alignment:
Q  72 agggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacacc 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||||||    
T  23562564 agggtgggccactaaaattaaccgttgaaaaattgtttaaagcctcgcaaaatagacctataattgaattgtttaaatttttcgggtggactactacacc 23562663  T
Q  172 aatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataat 249  Q
    | ||||||| |||||||||||| | ||| || ||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  23562664 actttgcggaaatttggatcaatc-aaaacttaattcgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagatctataat 23562740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 77 - 249
Target Start/End: Original strand, 18104240 - 18104411
Alignment:
Q  77 ggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaattt 176  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||| |||| || ||| |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  18104240 ggaccactaaaattaattattgaaaaattgtttaaagtttagtaaattagatctttaattgaattatttaaatttttcggatgggccactacaccaattt 18104339  T
Q  177 gcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataat 249  Q
    ||||||||||||||||||| |||  | ||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  18104340 gcgggaatttggatcaaccaaaacatgaaaccgacacaaaattgcat-aaatctcgcaaaatagacctataat 18104411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 214 - 362
Target Start/End: Original strand, 23469227 - 23469376
Alignment:
Q  214 aaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaatttt-cggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaa 312  Q
    |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||  ||||| ||||||||  |||    
T  23469227 aaaattgtttaaaatctcgcaaattagacctataattgaattatttaaatttttcagatgggccactacaccaatttgcgggaattgggatcaacagaaa 23469326  T
Q  313 cataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataat 362  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23469327 cctaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataat 23469376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 100 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 17167080 - 17166929
Alignment:
Q  100 aaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaa 199  Q
    |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||    
T  17167080 aaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttttgggtgggccactacaccactttgcaggaatttggatcaaccaaaa 17166981  T
Q  200 tctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattg 251  Q
      ||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  17166980 cataaaaccgatacaaaattgcataaaatctcgcaaaatagaactataattg 17166929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 214 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 40055918 - 40055769
Alignment:
Q  214 aaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc-ggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaa 312  Q
    |||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| | ||||| |||||  ||||||||||||||| |||    
T  40055918 aaaattgtttaaagtctcgcaaattagacctataattgaattatttaaattttttgggtgggccactgcaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaa 40055819  T
Q  313 cataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataat 362  Q
    | |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40055818 cctaaaactgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataat 40055769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 246 - 368
Target Start/End: Original strand, 18104295 - 18104417
Alignment:
Q  246 taattgaattatttaaatttt-cggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctc 344  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  18104295 taattgaattatttaaatttttcggatgggccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccaaaacatgaaaccgacacaaaattgcat-aaatctc 18104393  T
Q  345 gcaaaatagacctataatctttga 368  Q
    ||||||||||||||||||| ||||    
T  18104394 gcaaaatagacctataatcgttga 18104417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 214 - 368
Target Start/End: Original strand, 31931855 - 31932010
Alignment:
Q  214 aaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc-ggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaa 312  Q
    |||||||| |||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||  || ||| ||| ||||||| |||||  ||||||||||||||| |||    
T  31931855 aaaattgtttaaaatctcgtaaattagatctataattgaattatttaaattttttgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaa 31931954  T
Q  313 cataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttga 368  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31931955 cctaaaaccgacataaaatcgtataaaatctcgcaaaatagacctataatcgttga 31932010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 214 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 8461913 - 8461763
Alignment:
Q  214 aaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaatttt-cggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaa 312  Q
    |||||||| |||| |||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||| |||||  ||||||||||||||| |||    
T  8461913 aaaattgtttaaagtatcacaaattagatctataattgaattatttaaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaa 8461814  T
Q  313 cataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatc 363  Q
    | |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8461813 cctaaaacagacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataatc 8461763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 96 - 245
Target Start/End: Original strand, 16649537 - 16649685
Alignment:
Q  96 ttgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaacc 195  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  16649537 ttgaaaaattgtttatagtctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttg-gggtgcaccgctacaccactttgcgggaatttggatcagcc 16649635  T
Q  196 gaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagaccta 245  Q
    |||| |||||| | | | ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  16649636 gaaacctaaaatcaatacaaaattgtataaaatttcgcaaaataaaccta 16649685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 96 - 245
Target Start/End: Original strand, 17623898 - 17624046
Alignment:
Q  96 ttgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaacc 195  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  17623898 ttgaaaaattgtttatagtctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttg-gggtgcaccgctacaccactttgcgggaatttggatcagcc 17623996  T
Q  196 gaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagaccta 245  Q
    |||| |||||| | | | ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  17623997 gaaacctaaaatcaatacaaaattgtataaaatttcgcaaaataaaccta 17624046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 214 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 25174361 - 25174216
Alignment:
Q  214 aaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaatttt-cggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaa 312  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||   ||||||||||||||| |||    
T  25174361 aaaattgtttaaagtctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaatttttcgggtggaccactacaccactttgtgagaatttggatcaaccgaaa 25174262  T
Q  313 cataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagaccta 358  Q
    | ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  25174261 cctaaaaccaacacataattatataaaatctcgcaaaattgaccta 25174216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 96 - 246
Target Start/End: Original strand, 29502072 - 29502222
Alignment:
Q  96 ttgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaacc 195  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||   |    
T  29502072 ttgaaaaatagtttaaagtctcacaaaatagacctataattcaattatttaaatttttcggatgggccactacaccactttgcgggaatttggatctgtc 29502171  T
Q  196 gaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctat 246  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| | |||||||| ||||||    
T  29502172 gaaacctaaaaccaacacaaaattgaataaaatcttgcaaaatatacctat 29502222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 214 - 359
Target Start/End: Original strand, 46828781 - 46828926
Alignment:
Q  214 aaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaac 313  Q
    |||||||| |||| | || ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  46828781 aaaattgtttaaagtctctcaaaatagatctataatcgagttatttaaattttcgagtggaccactacaccactttgcgggaatttggatcaaccgaaac 46828880  T
Q  314 ataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctat 359  Q
     ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46828881 ctaataccgacataaaattgtacaaaatctcgcaaaatagacctat 46828926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 90 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 9014623 - 9014478
Alignment:
Q  90 taactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaac-------tagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcggga 182  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |    
T  9014623 taactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaaaatcaaaatagacctataattaaattatataaatttttcgggtgggccactacaccattttgcgaaa 9014524  T
Q  183 atttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaat 228  Q
    |||||||| |  ||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  9014523 atttggattagtcgaaacctaaaaccgacacaaaattgtataaaat 9014478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 96 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 30781228 - 30781079
Alignment:
Q  96 ttgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaacc 195  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| | ||||| ||| ||| ||||||||| ||||    
T  30781228 ttgaaaaattgtttaaagactcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttttgggtggaccattgcaccactttacggaaatttggattaacc 30781129  T
Q  196 gaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctat 246  Q
    |||| | |||||| ||| ||||||||||||||| | ||||| |||| ||||    
T  30781128 gaaa-ccaaaacctacacaaaattgtataaaattttgcaaagtagatctat 30781079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 90 - 246
Target Start/End: Original strand, 22499716 - 22499868
Alignment:
Q  90 taactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttgga 189  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||| || || ||||| |||||| | |    ||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  22499716 taaccattgaaaaattgtttaaagtctcgtaaaataaacttataattgaatttttt----tttttaggtgggccactacaccactttgcgggaatttaga 22499811  T
Q  190 tcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctat 246  Q
    | |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  22499812 ttaaccgaaacctaaaaccgatataaaattgaataaaatttcgcaaaatagacctat 22499868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 230 - 368
Target Start/End: Original strand, 23562608 - 23562746
Alignment:
Q  230 tcgcaaaatagacctataattgaattatttaaatttt-cggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaa 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| | | |||||||||||||   |||||||||||| |||||| |||  | |||||||    
T  23562608 tcgcaaaatagacctataattgaattgtttaaatttttcgggtggactactacaccactttgcggaaatttggatcaatcaaaacttaattc-gacacaa 23562706  T
Q  329 aattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttga 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  23562707 aattgtataaaatctcgcaaaatagatctataatcgttga 23562746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 233 - 359
Target Start/End: Original strand, 29502095 - 29502222
Alignment:
Q  233 caaaatagacctataattgaattatttaaatttt-cggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaat 331  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||   | |||| ||||||| |||||||||    
T  29502095 caaaatagacctataattcaattatttaaatttttcggatgggccactacaccactttgcgggaatttggatctgtcgaaacctaaaaccaacacaaaat 29502194  T
Q  332 tgtataaaatctcgcaaaatagacctat 359  Q
    || ||||||||| |||||||| ||||||    
T  29502195 tgaataaaatcttgcaaaatatacctat 29502222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 94 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 9014035 - 9013902
Alignment:
Q  94 tattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaa 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||| |||| || |||| || |||| |||||||    
T  9014035 tattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaattagacctataattaaattatataaatttttcggatgggccattacaacattttg-ggaaattcggatcaa 9013937  T
Q  194 ccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaat 228  Q
     | ||| |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  9013936 tccaaacctaaaaccgacacaaaatcgtataaaat 9013902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 214 - 362
Target Start/End: Original strand, 29075026 - 29075165
Alignment:
Q  214 aaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaatttt-cggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaa 312  Q
    |||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||          ||||||||||||| |||    
T  29075026 aaaattgtttaaagtttcgcaaattagacctataattgaattatttaaatttttcgggtggaccactacacca----------atttggatcaaccgaaa 29075115  T
Q  313 cataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataat 362  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29075116 cttaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataat 29075165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 230 - 358
Target Start/End: Original strand, 16649557 - 16649685
Alignment:
Q  230 tcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaa 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||  |||||||||||||  |||||||||||| || |||| ||||| | | |||||    
T  16649557 tcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttggggtgcaccgctacaccactttgcgggaatttggatcagccgaaacctaaaatcaatacaaa 16649656  T
Q  330 attgtataaaatctcgcaaaatagaccta 358  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||    
T  16649657 attgtataaaatttcgcaaaataaaccta 16649685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 230 - 358
Target Start/End: Original strand, 17623918 - 17624046
Alignment:
Q  230 tcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaa 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||  |||||||||||||  |||||||||||| || |||| ||||| | | |||||    
T  17623918 tcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttggggtgcaccgctacaccactttgcgggaatttggatcagccgaaacctaaaatcaatacaaa 17624017  T
Q  330 attgtataaaatctcgcaaaatagaccta 358  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||    
T  17624018 attgtataaaatttcgcaaaataaaccta 17624046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 90 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 9021648 - 9021516
Alignment:
Q  90 taactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttgga 189  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| | |||||||||||||||| |||||| |||| |||| | ||||||| ||||| ||    
T  9021648 taaccattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaaatagaactataattaaattatataaattttttgggtgggccaccacacaattttgcggaaatttaga 9021549  T
Q  190 tcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgta 222  Q
    ||| ||||||  |||||  |||| |||||||||    
T  9021548 tcagccgaaacttaaaattgacacaaaattgta 9021516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 96 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 28755023 - 28754878
Alignment:
Q  96 ttgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaacc 195  Q
    |||||||||||||||||| || | ||| ||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||  ||||   |||||||||||||     
T  28755023 ttgaaaaattgtttaaagacttggaaaatagacttataattgaattatttaatttttttgggtgggccactacaccaccttgcaa-aatttggatcaact 28754925  T
Q  196 gaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagac 242  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  28754924 gaaacctaaaattgacataaaattgtataaaatctcgcaaagtagac 28754878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 214 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 29663128 - 29663010
Alignment:
Q  214 aaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaa-ttttcggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaa 312  Q
    |||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||   |||||||||||| || |||    
T  29663128 aaaattgtttaaagtcttgcaaaatagacctataattgaattatttaaatttttcgggtgggccactacaccactttgtgagaatttggatcagccgaaa 29663029  T
Q  313 cataaaaccgacacaaaat 331  Q
      |||||||||||||||||    
T  29663028 tctaaaaccgacacaaaat 29663010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 96 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 40883499 - 40883349
Alignment:
Q  96 ttgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaattttt--cgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaa 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |   || | ||| |||||  ||||||||||||||| ||| |||| ||  |||||||||      
T  40883499 ttgaaaaattgtttaaagtctcgcaaaatagacctatattt---ttttttaattttttttcgggtggaccactacgccactttggggagatttggatctg 40883403  T
Q  194 ccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctata 247  Q
    |||||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  40883402 ccgaaaactaaaaccgacacaaaagtgtataaaatctcgcataatagacctata 40883349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 103 - 210
Target Start/End: Original strand, 4248865 - 4248972
Alignment:
Q  103 attgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatct 202  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||   ||||| ||||| | |||| ||    
T  4248865 attgtttaaagtcttgcaaaatagacctataattgaattatttaaatttttcgggcgggccactacaccactttgcaaaaatttagatcagctgaaaact 4248964  T
Q  203 aaaaccga 210  Q
    ||||||||    
T  4248965 aaaaccga 4248972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 233 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 9014587 - 9014476
Alignment:
Q  233 caaaatagacctataattgaattatttaaatttt-cggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaat 331  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||   ||||||||| |  | |||| |||||||||||||||||    
T  9014587 caaaatagacctataattaaattatataaatttttcgggtgggccactacaccattttgcgaaaatttggattagtcgaaacctaaaaccgacacaaaat 9014488  T
Q  332 tgtataaaatct 343  Q
    ||||||||||||    
T  9014487 tgtataaaatct 9014476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 96 - 203
Target Start/End: Original strand, 24779581 - 24779688
Alignment:
Q  96 ttgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaacc 195  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| | || |||||| | |||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||| || ||||||| |||||||    
T  24779581 ttgaaaaaatgtttaaagactcgcaaaatggatctataatttaattatttaaatttttcgggtggaccattagaccactttacgtgaatttgaatcaacc 24779680  T
Q  196 gaaatcta 203  Q
    ||||||||    
T  24779681 gaaatcta 24779688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 214 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 9014029 - 9013900
Alignment:
Q  214 aaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaa-ttttcggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaa 312  Q
    |||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||    |||| ||||||| | |||    
T  9014029 aaaattgtttaaagtctcgcaaattagacctataattaaattatataaatttttcggatgggccattacaacattttg-ggaaattcggatcaatccaaa 9013931  T
Q  313 cataaaaccgacacaaaattgtataaaatct 343  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9013930 cctaaaaccgacacaaaatcgtataaaatct 9013900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 234 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 28754999 - 28754878
Alignment:
Q  234 aaaatagacctataattgaattatttaaattttc-ggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaatt 332  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||  || ||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||  |||| |||||  |||| ||||||    
T  28754999 aaaatagacttataattgaattatttaatttttttgggtgggccactacaccaccttgcaa-aatttggatcaactgaaacctaaaattgacataaaatt 28754901  T
Q  333 gtataaaatctcgcaaaatagac 355  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  28754900 gtataaaatctcgcaaagtagac 28754878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 230 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 30781208 - 30781079
Alignment:
Q  230 tcgcaaaatagacctataattgaattatttaaa-ttttcggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaa 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| ||||| ||||||||| |   ||||||||| |||| ||||  |||||| ||||||    
T  30781208 tcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttttgggtggaccattgcaccactttacggaaatttggattaaccgaaac-caaaacctacacaa 30781110  T
Q  329 aattgtataaaatctcgcaaaatagacctat 359  Q
    ||||||||||||| | ||||| |||| ||||    
T  30781109 aattgtataaaattttgcaaagtagatctat 30781079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 295 - 356
Target Start/End: Original strand, 22566606 - 22566667
Alignment:
Q  295 aatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacc 356  Q
    ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22566606 aatttggatcagccgaaacttaaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacc 22566667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 100 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 6961246 - 6961163
Alignment:
Q  100 aaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaa 183  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||  ||||| ||||||||||    
T  6961246 aaaattgttcaaagtctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaatttttcggatgggccaccgcaccattttgcgggaa 6961163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 214 - 359
Target Start/End: Original strand, 22499726 - 22499868
Alignment:
Q  214 aaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaac 313  Q
    |||||||| |||| | ||| |||||| || |||||||||||| |||   ||||  | ||||||| |||||||||||||  |||||| ||| |||| ||||    
T  22499726 aaaattgtttaaagtctcgtaaaataaacttataattgaatttttt---tttttaggtgggccactacaccactttgcgggaatttagattaaccgaaac 22499822  T
Q  314 ataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctat 359  Q
     ||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  22499823 ctaaaaccgatataaaattgaataaaatttcgcaaaatagacctat 22499868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 214 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 8727936 - 8727794
Alignment:
Q  214 aaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcgg-atgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaa 312  Q
    |||||||| |||| | ||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||  | |||||||| || ||||||||| | |||||||||||| || |||    
T  8727936 aaaattgtttaaagtttcgtaaaatagacctacaatcgaattgtttaaattttttgcatgggccactataccactttgtaagaatttggatcagccgaaa 8727837  T
Q  313 cataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagac 355  Q
    ||||||| | |||||||||   ||||||||| | |||||||||    
T  8727836 cataaaatcaacacaaaatgacataaaatcttgtaaaatagac 8727794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 175 - 243
Target Start/End: Original strand, 22566599 - 22566667
Alignment:
Q  175 ttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacc 243  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22566599 ttgcggcaatttggatcagccgaaacttaaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacc 22566667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 232 - 305
Target Start/End: Original strand, 4248880 - 4248954
Alignment:
Q  232 gcaaaatagacctataattgaattatttaaa-ttttcggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatca 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||  ||||| |||||    
T  4248880 gcaaaatagacctataattgaattatttaaatttttcgggcgggccactacaccactttgcaaaaatttagatca 4248954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 230 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 6961230 - 6961182
Alignment:
Q  230 tcgcaaaatagacctataattgaattatttaaa-ttttcggatgggcca 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6961230 tcgcaaaatagacctataattgaattatttaaatttttcggatgggcca 6961182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 310 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 6961164 - 6961111
Alignment:
Q  310 aaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatc 363  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  6961164 aaacctaaaaccgacacaaaattgtataaaatcttgcaaaataaacatataatc 6961111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 315 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 40883394 - 40883349
Alignment:
Q  315 taaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctata 360  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40883394 taaaaccgacacaaaagtgtataaaatctcgcataatagacctata 40883349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 230 - 308
Target Start/End: Original strand, 24779601 - 24779680
Alignment:
Q  230 tcgcaaaatagacctataattgaattatttaaa-ttttcggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaacc 308  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||| | |||||||| |||||||    
T  24779601 tcgcaaaatggatctataatttaattatttaaatttttcgggtggaccattagaccactttacgtgaatttgaatcaacc 24779680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 149 - 206
Target Start/End: Original strand, 14629638 - 14629695
Alignment:
Q  149 tttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaa 206  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||| ||| ||||||    
T  14629638 tttttcgggtggaccactacaccactttgcagggatttggatctaccaaaaactaaaa 14629695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 8727941 - 8727837
Alignment:
Q  95 attgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaac 194  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||  ||||| | ||||||||| |  ||| |||||| |||| ||||   |||||||||||| |    
T  8727941 attgaaaaattgtttaaagtttcgtaaaatagacctacaatcgaattgtttaaattttttgcatgggccactataccactttgtaagaatttggatcagc 8727842  T
Q  195 cgaaa 199  Q
    |||||    
T  8727841 cgaaa 8727837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 239
Target Start/End: Original strand, 4248984 - 4249083
Alignment:
Q  140 ttatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaata 239  Q
    |||| |||||||||||| || ||| |||||||| ||| |  ||||||||||   | |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  4248984 ttatttaaatttttcggatgaacctctacaccactttccaagaatttggatttgctgaaacctaaaaccggcataaaattatataaaatcttgcaaaata 4249083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 263 - 350
Target Start/End: Original strand, 14629639 - 14629726
Alignment:
Q  263 ttttcggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaa 350  Q
    ||||||| ||| ||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||  |||||  | |||||| || | |||||||||||||||    
T  14629639 ttttcgggtggaccactacaccactttgcagggatttggatctaccaaaaactaaaatagtcacaaatttttttaaaatctcgcaaaa 14629726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 247 - 352
Target Start/End: Original strand, 4248977 - 4249083
Alignment:
Q  247 aattgaattatttaaatttt-cggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcg 345  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||  ||  ||||||||||| || ||||||||||   |  |||| |||||||| || |||||| |||||||||| |    
T  4248977 aattgacttatttaaatttttcggatgaacctctacaccactttccaagaatttggatttgctgaaacctaaaaccggcataaaattatataaaatcttg 4249076  T
Q  346 caaaata 352  Q
    |||||||    
T  4249077 caaaata 4249083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 214 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 9021638 - 9021516
Alignment:
Q  214 aaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaa-ttttcggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaa 312  Q
    |||||||| |||| | |||||||||||| |||||||| |||||| |||| |||| || |||||||  |||| | |||||   ||||| ||||| || |||    
T  9021638 aaaattgtttaaagtctcgcaaaatagaactataattaaattatataaattttttgggtgggccaccacacaattttgcggaaatttagatcagccgaaa 9021539  T
Q  313 cataaaaccgacacaaaattgta 335  Q
    | |||||  ||||||||||||||    
T  9021538 cttaaaattgacacaaaattgta 9021516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 201 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 6961160 - 6961112
Alignment:
Q  201 ctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataat 249  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| || ||||||    
T  6961160 ctaaaaccgacacaaaattgtataaaatcttgcaaaataaacatataat 6961112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 391 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 9014418 - 9014390
Alignment:
Q  391 ccacagcccatgaagggctccgccactgc 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9014418 ccacagcccatgaagggctccgccactgc 9014390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 48)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 68 - 368
Target Start/End: Original strand, 26525028 - 26525328
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccacta 167  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  26525028 tgtcagggtgggccactaaaattaattattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaattagacctataattgaattatttaaatttttcgggtgggccacta 26525127  T
Q  168 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26525128 caccaatttgcgggaatttggatcaactgaaaccttaaaccgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 26525227  T
Q  268 ggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttg 367  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26525228 ggatgggccactacaccactttgcaggaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgcaaaaaatctcgcaaaatagacctataatcgttg 26525327  T
Q  368 a 368  Q
    |    
T  26525328 a 26525328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 70 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 16823488 - 16823190
Alignment:
Q  70 tcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactaca 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16823488 tcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaattagacctataattgaattatttaaatttttcgggtggaccactaca 16823389  T
Q  170 ccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcgg 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16823388 ccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaacctaaaaccgacataaaatcatataaaatctcgcaaaatagatctataattgaattatttaaattttcgg 16823289  T
Q  270 atgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttga 368  Q
     |||| || |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16823288 gtgggtcactacaccactttgcaggaatttagatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgcataaaatctcgcaaaatagacctataatcgttga 16823190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 68 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 3631618 - 3631318
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccacta 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  3631618 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtcccgcaaattagacatataattgaattatttaaatttttcgggtgggccacta 3631519  T
Q  168 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3631518 caccaatttgcgggaatttggatcaaccaaaacttaaaatcgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 3631419  T
Q  268 ggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttg 367  Q
    || ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3631418 gggtgggccactacaccactttgcaggaatttggatcaactaaaacataaaaccaacacaaaattgcataaaatctcgcaaaatagacctataatcgttg 3631319  T
Q  368 a 368  Q
    |    
T  3631318 a 3631318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 68 - 368
Target Start/End: Original strand, 7440279 - 7440579
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccacta 167  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  7440279 tgtcagggtgggccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaattagacctataattgaattatttaaaattttcgggtgggccacta 7440378  T
Q  168 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 267  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7440379 caccaatttgcaggaatttggatcaaccaaaacctaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctatagttgaattatttaaattttc 7440478  T
Q  268 ggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttg 367  Q
    || ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  7440479 gggtgggccactacaccactttgcaggaatttggatcaaccaaaacataaaaccaacacaaaattgcataaaatctcgcaaaatagatctataatcgttg 7440578  T
Q  368 a 368  Q
    |    
T  7440579 a 7440579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 80 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 43348981 - 43348698
Alignment:
Q  80 ccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcg 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43348981 ccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaattagacctataattgaattatttaaatttttcgggtgggccactacaccaatttgcg 43348882  T
Q  180 ggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcggatgggccatt 279  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |    
T  43348881 ggaatttggatcaaccgaaacctaaaaccgacataaaatcgtataaaatctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaatttttgggtgggccact 43348782  T
Q  280 acaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatc 363  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43348781 acaccactttgcaggaatttggatcaaccaaaacataaaaccaacacaaaattgcataaaatctcgcaaaataaacctataatc 43348698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 72 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 30773234 - 30772938
Alignment:
Q  72 agggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacacc 171  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30773234 agggtgggccactaaaattaactactgaaaaattgtttaaagtctcacaaattagacctataattgaattatttaaatttttcgggtggaccactacacc 30773135  T
Q  172 aatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcggat 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |    
T  30773134 aatttgcgggaatttggatcaaccgaaacctaaaatcgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagatctataattgaattatttaaatttttgggt 30773035  T
Q  272 gggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttga 368  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  30773034 gggccactacaccactttgcaggaatttgaatcaaccaaaacataaaaccgatacaaaattgcataaaatcttgcaaaatagacctataatcgttga 30772938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 68 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 43358769 - 43358469
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccacta 167  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  43358769 tgtcaggatgggtcactaaaattaactattgaaaagttgtttaaagtctcgcaaattagacctataattgaattatttaaattttttgggtgggccacta 43358670  T
Q  168 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43358669 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgtaacctaaaacagacataaaattgtataaaatctcgcaaaataaacctataattgaattatttaaattttc 43358570  T
Q  268 ggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttg 367  Q
    || |||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  43358569 gggtgggtcactacactactttgcaggaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgcataaaatctcgcaaaatagacctataatcgttg 43358470  T
Q  368 a 368  Q
    |    
T  43358469 a 43358469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 68 - 368
Target Start/End: Original strand, 25701220 - 25701519
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccacta 167  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25701220 tgtcagggtgggccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctaaaaaattagacctataattgaattatttaaatttttcgggtggaccacta 25701319  T
Q  168 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 267  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25701320 caccaatttgtgggaatttggatcaaccgaaacctaaaaccgacat-aaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 25701418  T
Q  268 ggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttg 367  Q
    || ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||| |||    
T  25701419 gggtgggccactacaccactttgcaggaatttagatcaaccaaaacataaaaccgatacaaaattacataaaatcttgcaaaatagatctataatcgttg 25701518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 76 - 368
Target Start/End: Original strand, 32304459 - 32304751
Alignment:
Q  76 tggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatt 175  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32304459 tggatcactaaaattaactattgaaaaaatgtttaaagtctcgcaaattaaacttataattgaattatttaaatttttcgggtgggccactacaccaatt 32304558  T
Q  176 tgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcggatgggc 275  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  32304559 tccgggaatttggatcaaccgaaacctaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataattgaattatttcaatttttgggtgggc 32304658  T
Q  276 cattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttga 368  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  32304659 caatacaccactttgcaggaatttggatcaaccaaaatataaaaccgacacaaaattgcataaaatctcgtaaaatagacttataatcgttga 32304751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 72 - 368
Target Start/End: Original strand, 8074041 - 8074337
Alignment:
Q  72 agggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacacc 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  8074041 agggtgggccactaaaattaaccgttaaaaaattgtttaaagcctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaatttttcggatgggccactacacc 8074140  T
Q  172 aatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcggat 271  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |    
T  8074141 actttgcgggaatttgaatcaaccgaaacctaaaaccgacattaaattgtataaaatctcgcaaaatagatttataattgaattatttaaatttttgggt 8074240  T
Q  272 gggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttga 368  Q
    || ||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8074241 ggaccactacactactttgcgggaatttggatcaaccaaaacctaaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatcgttga 8074337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 68 - 368
Target Start/End: Original strand, 13013053 - 13013353
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccacta 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13013053 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcacaaattaaacctataattgaattatttaaatttttcgggtggaccacta 13013152  T
Q  168 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 267  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13013153 taccaatttgcggaaatttggatcaaccgatacctaaaaccgacataaatttgtataaaatctcacaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 13013252  T
Q  268 ggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttg 367  Q
    |  |||| || ||||||  |||| |  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  13013253 gagtgggacactacacctttttgtagaaatttggatcaaccaaaacataaaactgatacaaaattgcttaaaatctcgcaaattagacctataatcgttg 13013352  T
Q  368 a 368  Q
    |    
T  13013353 a 13013353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 68 - 368
Target Start/End: Original strand, 13084441 - 13084741
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccacta 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13084441 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcacaaattaaacctataattgaattatttaaatttttcgggtggaccacta 13084540  T
Q  168 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 267  Q
     |||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13084541 taccaatttgcggaaatttggatcaactgatacctaaaaccgacataaatttgtataaaatctcacaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 13084640  T
Q  268 ggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttg 367  Q
    || |||| || | ||||  |||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  13084641 gggtgggacactgcacctttttgtagaaatttggatcaaccaaaacataaaatcgatacaaaattgcataaaatctcgcaaattagacctataatcgttg 13084740  T
Q  368 a 368  Q
    |    
T  13084741 a 13084741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 80 - 368
Target Start/End: Original strand, 9595976 - 9596264
Alignment:
Q  80 ccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcg 179  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  9595976 ccactaaaattaactattaaaaaattgtttaaagtctcgtaaattagatctataattgaattatttaaatttttcgggtgggccactacaccaatttgca 9596075  T
Q  180 ggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcggatgggccatt 279  Q
    |||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| |    
T  9596076 ggaatttgaatcaacacaaacctaaaaccgacataaaattgtataaaatctcacaaaatagatctataattgaattatttaaatttttgggtgggccact 9596175  T
Q  280 acaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttga 368  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  9596176 acaccactttgcagaaatttggatcaactaaaatataaaaccgacacaaaattgcataaaatctcgcaaaatagacatataatcgttga 9596264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 74 - 368
Target Start/End: Original strand, 41084386 - 41084680
Alignment:
Q  74 ggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaa 173  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||     
T  41084386 ggtgggccactaaaattaaccgttgaaaaattgtttaaagcctcgcaaaatagacctataattgaattgtttaaatttttccggtggactactacaccac 41084485  T
Q  174 tttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaa-ttttcggatg 272  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  41084486 tttgcgggaatttgaattaaccgaaacctaaaaccgacataaaaatgtataaaatctcg-aaaatagacctataattgaattatttaaattttttggatg 41084584  T
Q  273 ggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttga 368  Q
    ||||| |||||||||||||   |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41084585 ggccactacaccactttgcggaaatttggatcaatcaaaacctaaaatcgacacaaaattctataaaatctcgcaaaatagacctataatcgttga 41084680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 83 - 362
Target Start/End: Original strand, 26296822 - 26297101
Alignment:
Q  83 ctaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcggga 182  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||| | || ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  26296822 ctaaaattaaccgttgaaaaattgtttaaagcctcgcaaaatagatctataattgaattgtttacatttttcgggtggactactacaccactttgcggga 26296921  T
Q  183 atttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaat-tttcggatgggccattac 281  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||    
T  26296922 atttgaatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaaatgtataaaatctcg-aaaataggcctataattgaattatttaaatattttggatgggccactac 26297020  T
Q  282 accactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataat 362  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  26297021 accactttgcgggaatttggatcaaccaaaacctaaaaccgacacaaaattatataagatcttgcaaaatagacctataat 26297101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 72 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 10925864 - 10925568
Alignment:
Q  72 agggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacacc 171  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  10925864 agggtgggtcactaaaattaactattgaaaaattatttaaagtctcacaagttagacctataattgaattatttaaatttttctggtagaccactacacc 10925765  T
Q  172 aatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcggat 271  Q
    |||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |    
T  10925764 aatttgccaaaatttggatcaaccgaaacctaaaaccgacataaatttgtataaaatctcacaaaatagatctataattgaattatttaaattttcaggt 10925665  T
Q  272 gggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttga 368  Q
    || ||| |||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  10925664 ggaccactacaccactttgtaggaatttgaatcaactaaaacataaaaccgatacaaaattacataaaatctcgcaaattagacatataatcgttga 10925568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 82 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 15374445 - 15374174
Alignment:
Q  82 actaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcggg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  15374445 actaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaattagacctataattgaattatttaaatttttcagttgggccactacaccaatttgcggg 15374346  T
Q  182 aatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcggatgggccattac 281  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||               || ||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||    
T  15374345 aatttggatcaaccgaaacctaaaaccgatataaaactgtataa---------------acatataattgaattatttaaatttgtgggtggaccattac 15374261  T
Q  282 accactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttga 368  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15374260 accactttgcaagaatttcgatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgcataaaatctcgcaaaatagacctataatcgttga 15374174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 72 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 26785185 - 26784968
Alignment:
Q  72 agggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacacc 171  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||| |||||| |||  ||||||||||    
T  26785185 agggtgggccactaaaattaaccattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaaaaagacctataattgaattatttaaacttttcgagtgagccactacacc 26785086  T
Q  172 aatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcggat 271  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || |    
T  26785085 aatttgcgggaatttggatcaactgaaacctaaaaccgacataaaattgtataaaatctcacaaaatagacctatagttgaattatttcaatttttgggt 26784986  T
Q  272 gggccattacaccacttt 289  Q
    |||||| |||||||||||    
T  26784985 gggccactacaccacttt 26784968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 68 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 15374586 - 15374301
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccacta 167  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| | |||  |||||    
T  15374586 tgtcagggtggatcactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgtaaattagacctataattgaattatttaaatttttcagttgggtcacta 15374487  T
Q  168 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaac--cgaca-----------taaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaat 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | | |            |||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||    
T  15374486 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaacctaaaactactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaattagacctataattgaat 15374387  T
Q  255 tatttaaa-ttttcggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaa 339  Q
    |||||||| ||||| | ||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||| ||||||||    
T  15374386 tatttaaatttttcagttgggccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaacctaaaaccgatataaaactgtataaa 15374301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 70 - 249
Target Start/End: Original strand, 9737621 - 9737799
Alignment:
Q  70 tcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactaca 169  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||    
T  9737621 tcagggtgggccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaattagacctataattgaattatttaaa-ttttcgggtgggccactaca 9737719  T
Q  170 ccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataat 249  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||  |||  ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9737720 ccactttgcaggaatttggatcaacaaaaacataaaaccgacacaaaattgcataaaatctcgcaaaatagacctataat 9737799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 214 - 363
Target Start/End: Original strand, 9737651 - 9737800
Alignment:
Q  214 aaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaac 313  Q
    |||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  9737651 aaaattgtttaaagtctcgcaaattagacctataattgaattatttaaattttcgggtgggccactacaccactttgcaggaatttggatcaacaaaaac 9737750  T
Q  314 ataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatc 363  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9737751 ataaaaccgacacaaaattgcataaaatctcgcaaaatagacctataatc 9737800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 72 - 251
Target Start/End: Original strand, 20656773 - 20656952
Alignment:
Q  72 agggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacacc 171  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  20656773 agggtggatcactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtttcacaaattagacctataattgaattatttaaatttttcggatggaccactacacc 20656872  T
Q  172 aatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattg 251  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||| | ||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  20656873 aatttgcggaaatttggatcaaccaaaacataaaaccgatacaaaattgcataaaatctcgtaaattagacctataattg 20656952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 230 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 29390466 - 29390328
Alignment:
Q  230 tcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaa 329  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29390466 tcgcaaattagatctataattgaattatttaaattttcgggtgggccactacaccactttgcaggaatttggatcaaccaaaacataaaaccaacacaaa 29390367  T
Q  330 attgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttga 368  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  29390366 attgcataaaatctcgtaaaatacacctataatcgttga 29390328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 78 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 20487208 - 20487040
Alignment:
Q  78 gaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttg 177  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| | |||||||||||| ||  ||||||||||| ||||    
T  20487208 gaccactaaaattaacggttgaaaaattgtttaaagtctcgcaaaatagacttataattgaattttttaaatttttcggatgagccactacaccactttg 20487109  T
Q  178 cgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctat 246  Q
    | ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  20487108 caggaatttggatcagccgaaacctaaaaccgacacaaaattgtataaaatcttgcaaaatatacctat 20487040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 96 - 249
Target Start/End: Original strand, 19577120 - 19577273
Alignment:
Q  96 ttgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaacc 195  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| | |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19577120 ttgaaaaattgtttaatgtctcgcaaaacagacctataattaaattatttaaatttttcgagtgggccactacaccactttgcgggaatttggatcaacc 19577219  T
Q  196 gaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataat 249  Q
     ||||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  19577220 aaaatctagaaccgacacaaaattgtataaaatgttgcaaaatagatctataat 19577273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 214 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 20487186 - 20487040
Alignment:
Q  214 aaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaatttt-cggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaa 312  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| || |||    
T  20487186 aaaattgtttaaagtctcgcaaaatagacttataattgaattttttaaatttttcggatgagccactacaccactttgcaggaatttggatcagccgaaa 20487087  T
Q  313 cataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctat 359  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  20487086 cctaaaaccgacacaaaattgtataaaatcttgcaaaatatacctat 20487040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 90 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 41817677 - 41817525
Alignment:
Q  90 taactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttgga 189  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||| || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  41817677 taaccattgaaaaattgtttaaagactcgtaaaatatacctacaattgaattatttaaatttttcgggtgggccactacaccactttgcagaaatttgga 41817578  T
Q  190 tcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagac 242  Q
    |||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  41817577 tcaaccaaaatctaaaactgacactaaattgtataaaatatcgcaaagtagac 41817525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 214 - 362
Target Start/End: Original strand, 20656801 - 20656950
Alignment:
Q  214 aaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaatttt-cggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaa 312  Q
    |||||||| |||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||   ||||||||||||||||||    
T  20656801 aaaattgtttaaagtttcacaaattagacctataattgaattatttaaatttttcggatggaccactacaccaatttgcggaaatttggatcaaccaaaa 20656900  T
Q  313 cataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataat 362  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  20656901 cataaaaccgatacaaaattgcataaaatctcgtaaattagacctataat 20656950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Original strand, 37042496 - 37042643
Alignment:
Q  100 aaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttt-tcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaa 198  Q
    |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||| ||| |||| |||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  37042496 aaaattatttaaagtctcacaaaatagacctatagttgaattatttaatttttttcgggtgggccaatacgccactttgcgggaatttgaatcaaccgaa 37042595  T
Q  199 atctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctat 246  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  37042596 atctaaaaccgatataaaattgtataaaatctcgcaaaatagatctat 37042643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 96 - 239
Target Start/End: Original strand, 22578874 - 22579017
Alignment:
Q  96 ttgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaacc 195  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||||||| |||  |||||||||||||| ||    
T  22578874 ttgaaaaattgtttaaagtctcgtaaaatagatttataattgaattatttaaatttttcggatgaaccactacaccactttatgggaatttggatcagcc 22578973  T
Q  196 gaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaata 239  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  22578974 gaaacctaaaaccgacacaaaattgtacaaaatctcgtaaaata 22579017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 214 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 26785157 - 26785010
Alignment:
Q  214 aaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaa-ttttcggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaa 312  Q
    |||||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||| ||||||| |||||  ||||||||||||||  |||    
T  26785157 aaaattgtttaaagtctcgcaaaaaagacctataattgaattatttaaacttttcgagtgagccactacaccaatttgcgggaatttggatcaactgaaa 26785058  T
Q  313 cataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctata 360  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26785057 cctaaaaccgacataaaattgtataaaatctcacaaaatagacctata 26785010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 230 - 363
Target Start/End: Original strand, 19577140 - 19577274
Alignment:
Q  230 tcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcgga-tgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaa 328  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  19577140 tcgcaaaacagacctataattaaattatttaaatttttcgagtgggccactacaccactttgcgggaatttggatcaaccaaaatctagaaccgacacaa 19577239  T
Q  329 aattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatc 363  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| ||||||||    
T  19577240 aattgtataaaatgttgcaaaatagatctataatc 19577274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 248 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 5844285 - 5844165
Alignment:
Q  248 attgaattatttaaattttcggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgca 347  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| | |    
T  5844285 attgaattatttaaattttcgggtgggccaccacaccattttgcaataatttggatcaaccaaaacataaaatcgacaccaaattgcataaaatctagta 5844186  T
Q  348 aaatagacctataatctttga 368  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  5844185 aaatagacctataatcgttga 5844165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 128 - 251
Target Start/End: Original strand, 26296980 - 26297103
Alignment:
Q  128 cctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaa 227  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||| |    
T  26296980 cctataattgaattatttaaatattttggatgggccactacaccactttgcgggaatttggatcaaccaaaacctaaaaccgacacaaaattatataaga 26297079  T
Q  228 tatcgcaaaatagacctataattg 251  Q
    | | ||||||||||||||||||||    
T  26297080 tcttgcaaaatagacctataattg 26297103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 110 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 29390472 - 29390334
Alignment:
Q  110 aaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccg 209  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||||||     
T  29390472 aaagtctcgcaaattagatctataattgaattatttaaatttt-cgggtgggccactacaccactttgcaggaatttggatcaaccaaaacataaaacca 29390374  T
Q  210 acataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataat 249  Q
    ||| ||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  29390373 acacaaaattgcataaaatctcgtaaaatacacctataat 29390334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 234 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 41817647 - 41817525
Alignment:
Q  234 aaaatagacctataattgaattatttaaatttt-cggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaatt 332  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||    
T  41817647 aaaatatacctacaattgaattatttaaatttttcgggtgggccactacaccactttgcagaaatttggatcaaccaaaatctaaaactgacactaaatt 41817548  T
Q  333 gtataaaatctcgcaaaatagac 355  Q
    ||||||||| ||||||| |||||    
T  41817547 gtataaaatatcgcaaagtagac 41817525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 233 - 359
Target Start/End: Original strand, 37042515 - 37042643
Alignment:
Q  233 caaaatagacctataattgaattatttaaatttt--cggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaa 330  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||| ||||||| ||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||  ||||||||| | ||||    
T  37042515 caaaatagacctatagttgaattatttaatttttttcgggtgggccaatacgccactttgcgggaatttgaatcaaccgaaatctaaaaccgatataaaa 37042614  T
Q  331 ttgtataaaatctcgcaaaatagacctat 359  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37042615 ttgtataaaatctcgcaaaatagatctat 37042643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 214 - 352
Target Start/End: Original strand, 22578878 - 22579017
Alignment:
Q  214 aaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaatttt-cggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaa 312  Q
    |||||||| |||| | ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||    |||||||||||| || |||    
T  22578878 aaaattgtttaaagtctcgtaaaatagatttataattgaattatttaaatttttcggatgaaccactacaccactttatgggaatttggatcagccgaaa 22578977  T
Q  313 cataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaata 352  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  22578978 cctaaaaccgacacaaaattgtacaaaatctcgtaaaata 22579017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 90 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 28662341 - 28662185
Alignment:
Q  90 taactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttgga 189  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||  | |||| ||||||| |||||   |||||||     
T  28662341 taactgttgaaaaaatgtttaaagtcttgcaaaataaacctataattgaattatttaaatttttcggaggaaccaatacaccagtttgcacaaatttggt 28662242  T
Q  190 tcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctat 246  Q
    ||| ||||||  ||||||  ||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||    
T  28662241 tcagccgaaacttaaaactaacacaaaattgtataaaatctcgtaaaatagatctat 28662185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 232 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 28662313 - 28662185
Alignment:
Q  232 gcaaaatagacctataattgaattatttaaatttt-cggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaa 330  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||| ||||||| ||||||  ||||||| ||| || |||| ||||||  ||||||||    
T  28662313 gcaaaataaacctataattgaattatttaaatttttcggaggaaccaatacaccagtttgcacaaatttggttcagccgaaacttaaaactaacacaaaa 28662214  T
Q  331 ttgtataaaatctcgcaaaatagacctat 359  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  28662213 ttgtataaaatctcgtaaaatagatctat 28662185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 152 - 239
Target Start/End: Original strand, 20071209 - 20071296
Alignment:
Q  152 ttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaata 239  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||  || |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  20071209 ttcggatggaccactacaccactttatggaaatttgaatcaaccgaaatttaaaaccgacataaaattgtataaaatctcacaaaata 20071296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 138 - 249
Target Start/End: Original strand, 30050074 - 30050184
Alignment:
Q  138 aattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaa 237  Q
    |||||| ||||||||| || ||| ||||||||||| ||| ||  |||||| |||||||| || | ||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  30050074 aattatttaaatttttaggttgg-ccactacaccactttacgaaaatttgaatcaaccgtaaccaaaaattgacacaaaattgtataaaatatcgtaaaa 30050172  T
Q  238 tagacctataat 249  Q
    ||||||||||||    
T  30050173 tagacctataat 30050184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 363
Target Start/End: Original strand, 30050074 - 30050185
Alignment:
Q  252 aattatttaaattttcggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaat 351  Q
    |||||||||||||||  | | ||||| ||||||||||| |   |||||| |||||||  |||  ||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  30050074 aattatttaaatttttaggttggccactacaccactttacgaaaatttgaatcaaccgtaaccaaaaattgacacaaaattgtataaaatatcgtaaaat 30050173  T
Q  352 agacctataatc 363  Q
    ||||||||||||    
T  30050174 agacctataatc 30050185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 243 - 352
Target Start/End: Original strand, 20071186 - 20071296
Alignment:
Q  243 ctataattgaattatttaaatt-ttcggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaat 341  Q
    |||||||||||||||| |||   ||||||||| ||| |||||||||||     |||||| ||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  20071186 ctataattgaattattaaaaaaattcggatggaccactacaccactttatggaaatttgaatcaaccgaaatttaaaaccgacataaaattgtataaaat 20071285  T
Q  342 ctcgcaaaata 352  Q
    ||| |||||||    
T  20071286 ctcacaaaata 20071296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 136 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 5844283 - 5844171
Alignment:
Q  136 tgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaa 235  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||| |||||   |||||||||||||| |||  ||||| |||||  |||||| ||||||| | | ||    
T  5844283 tgaattatttaaatttt-cgggtgggccaccacaccattttgcaataatttggatcaaccaaaacataaaatcgacaccaaattgcataaaatctagtaa 5844185  T
Q  236 aatagacctataat 249  Q
    ||||||||||||||    
T  5844184 aatagacctataat 5844171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 363
Target Start/End: Original strand, 30062714 - 30062782
Alignment:
Q  295 aatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatc 363  Q
    |||||| |||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  30062714 aatttgaatcaactaaaactaaaaaccgacacaaagttgtataaaatatcataaaatagacctataatc 30062782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 203 - 249
Target Start/End: Original strand, 30062735 - 30062781
Alignment:
Q  203 aaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataat 249  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  30062735 aaaaccgacacaaagttgtataaaatatcataaaatagacctataat 30062781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 310 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 20117534 - 20117490
Alignment:
Q  310 aaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaataga 354  Q
    |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20117534 aaacttaaaatcaacacaaaattgtataaaatctcgcacaataga 20117490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 50)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 72 - 368
Target Start/End: Original strand, 44545532 - 44545828
Alignment:
Q  72 agggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacacc 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  44545532 agggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaattagacctataattgaattatttaaatttttcaggtggaccactacacc 44545631  T
Q  172 aatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcggat 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  44545632 aatttgcgggaatttggatcaaccgaaacttaaaaccaacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcgagt 44545731  T
Q  272 gggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttga 368  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  44545732 gggccattacaccactttgcaagaatttggatcaaccaaaatataaaaccgacacaaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataatcgttga 44545828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 68 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 26293519 - 26293224
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccacta 167  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  26293519 tgtctgggtgggccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaattagatctataattgaattatttaaatttttcgggtgggccacta 26293420  T
Q  168 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26293419 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaacctaaaaccgacataaaatcgtataaaatctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 26293320  T
Q  268 ggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatc 363  Q
    || ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26293319 gggtgggccactacaccactttgcaggaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgcataaaatctcgcaaaatagacctataatc 26293224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 68 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 34983635 - 34983335
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccacta 167  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||  |||||    
T  34983635 tgtcagggtgggccacaaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaattagacctataattgaattatttaaattttttgggtgggtcacta 34983536  T
Q  168 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 267  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  34983535 caccaatttgctggaatttggatcaaccgaaacctaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttt 34983436  T
Q  268 ggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttg 367  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  34983435 ggatgggccactacaccactttgcaggaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgcataaaatctcgcaaaatagacctataatcgttg 34983336  T
Q  368 a 368  Q
    |    
T  34983335 a 34983335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 68 - 363
Target Start/End: Original strand, 36435981 - 36436276
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccacta 167  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  36435981 tgtcagggtgggccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaattagacctataattgaattatttaaatttttcgggtgggccacta 36436080  T
Q  168 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36436081 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaacctaaaatcgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 36436180  T
Q  268 ggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatc 363  Q
    || ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  36436181 gggtgggccactacaccactttgcaggaatttggatcaagcaaaacataaaaccgacacaaaattgcataaaatatcgcaaaatagacttataatc 36436276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 68 - 362
Target Start/End: Original strand, 1020867 - 1021161
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccacta 167  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| | ||||    
T  1020867 tgtcagggtgggccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaattagacctataattgaattatttaaatttttcggatgggctacta 1020966  T
Q  168 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 267  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1020967 caccaatttgcgggaatttgaatcaaccgaaacctaaaaccgacataaaattgtataaaatctctcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 1021066  T
Q  268 ggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataat 362  Q
    || ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1021067 gggtgggccactacaccactttgcaggaatttggatcaaccaaatcataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataat 1021161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 84 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 2249924 - 2249640
Alignment:
Q  84 taaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaa 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2249924 taaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaattagacctataattgaattatttaaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaa 2249825  T
Q  184 tttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcggatgggccattacac 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  2249824 tttggatcaaccgaaacctaaaaccgacataaaatcgtataaaatctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcgggtgggccactacac 2249725  T
Q  284 cactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttga 368  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  2249724 cactttgcaggaatttagatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgcataaaatctcgcaaaatagatctataatcattga 2249640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 70 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 23870020 - 23869722
Alignment:
Q  70 tcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactaca 169  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  23870020 tcagggtgggccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaattagattcataattgaattatttaaatttttcgggtgggccactaca 23869921  T
Q  170 ccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcgg 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23869920 ccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaacctaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatatacctataattgaattatttaaattttcgg 23869821  T
Q  270 atgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttga 368  Q
     ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23869820 gtgggccactacactactttgcaagaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgcataaaatctcgcaaaatagacctataatcgttga 23869722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 72 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 11765149 - 11764853
Alignment:
Q  72 agggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacacc 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11765149 agggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaattagacctataattgaattatttaaatttttcgggtggaccactacacc 11765050  T
Q  172 aatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcggat 271  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |    
T  11765049 aatttgcgggaatttggatcagctgaaacataaaaccgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaatttttgtgt 11764950  T
Q  272 gggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttga 368  Q
    || ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  11764949 ggaccactacaccactttgcaggaatttgaatcaaccaaaacataaaaccgacacaaagttgtataaaatcttgcaaaatagacctataatcgttga 11764853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 68 - 362
Target Start/End: Original strand, 1114837 - 1115131
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccacta 167  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  1114837 tgtcagggtgggccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaattagatctataattgaattatttaaatttttcgggtaggccacta 1114936  T
Q  168 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 267  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1114937 caccaatttgcaggaatttggatcaaccgaaacctaaaatcaacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataattaaattatttaaattttc 1115036  T
Q  268 ggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataat 362  Q
    || ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1115037 gggtgggccactacaccactttgcagaaatttggatcaaccaaatcataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataat 1115131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 68 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 16194611 - 16194311
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccacta 167  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||    
T  16194611 tgtcagagtgggccattaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtcttgcaaattagacctttaattgaattatttaaatttttcgggtgggctacta 16194512  T
Q  168 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16194511 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaacctaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 16194412  T
Q  268 ggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttg 367  Q
    || ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  16194411 gggtgggccactacaccactctgcaggaatttggatcaaccaaaacataaaaccaacacaaaattgcataaaatctcgcaaaatagacttataatcgttg 16194312  T
Q  368 a 368  Q
    |    
T  16194311 a 16194311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 68 - 368
Target Start/End: Original strand, 6749805 - 6750105
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccacta 167  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  6749805 tgtcagggtgggccactaaaattaactattgaaaaactgtttaaagtctcgcaaattagacctataattgaattatttaaatttttcgggtgggccacta 6749904  T
Q  168 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6749905 caccaatttgcgggaatttggatcaaccaaaacctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 6750004  T
Q  268 ggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttg 367  Q
    || |||  || ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||| |||    
T  6750005 gggtggatcactacaccactttgcagaaatttggatcaatcaaaacataaaaccaacacaaaattgcataaaatctcaataaatagacctataatcgttg 6750104  T
Q  368 a 368  Q
    |    
T  6750105 a 6750105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 68 - 362
Target Start/End: Original strand, 26860461 - 26860755
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccacta 167  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  26860461 tgtcagggtaggccactaaaattaacttttgaaaaattgtttaaagtctcgcaaattagacctataattgaattatttaaatttttcgggtgggccacta 26860560  T
Q  168 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 267  Q
    || |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26860561 catcaatttgcggaaattgggatcaaccgaaacctaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttt 26860660  T
Q  268 ggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataat 362  Q
    || ||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26860661 gggtgggccactacaccactttgtagaaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacgaaattgcataaaatctcgcaaaatagacctataat 26860755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 68 - 368
Target Start/End: Original strand, 13615762 - 13616062
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccacta 167  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  13615762 tgtcagggtggatcagtaaaattaactattgaaaaattgtttaaaatctcgcgaattagacctataattgaattatttaaatttttcaggtgggccacta 13615861  T
Q  168 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 267  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13615862 caccaatttgcggaaatttggatcaaccaaaacctaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataattaaattatttaaattttc 13615961  T
Q  268 ggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttg 367  Q
    || ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13615962 gggtgggccactacaccattttgcaggaatttggatcaaccaaaacataaaaacaacacaaaattgcataaaatctcgcaaaatagacctataatcgttg 13616061  T
Q  368 a 368  Q
    |    
T  13616062 a 13616062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 72 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 7366506 - 7366218
Alignment:
Q  72 agggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacacc 171  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  7366506 agggtgggccactaaaattaaccattgaaaaattgtttaaagtctcacaaattagacctataattgaattatttaaatttttcgcgtgggccactacacc 7366407  T
Q  172 aatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcggat 271  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |    
T  7366406 aatttgcgggaatttggatcaatcgaaacctaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagatgtataattgaattatttaaattttcgggt 7366307  T
Q  272 gggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctata 360  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7366306 gggccactacaccactttgcaggaatttggatcaagcaaaacataaaactcacacaaaattgcataaaatctcgcaaaatagacctata 7366218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 72 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 12995321 - 12995025
Alignment:
Q  72 agggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacacc 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12995321 agggtgggccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcataaattagacctataattgaattatttaaatttttcgggtggaccactacacc 12995222  T
Q  172 aatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcggat 271  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12995221 aatttgcggaaatttgaatcaaccgaaacctaaaaccgacataaatttgtataaaatcttacaaaatagacctataattgaattatttaaattttcgggt 12995122  T
Q  272 gggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttga 368  Q
    |||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  12995121 gggccactacaccaatttgtaggaatttggatcaaccaaaacataaaaccgatacaaaattgcataaaatctcgcaaattagacctataatcgttga 12995025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 68 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 38527532 - 38527233
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccacta 167  Q
    |||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  38527532 tgtcagagtgggccacgaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcataaattagacctataaataaattatttaaattttttgggtggaccacta 38527433  T
Q  168 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38527432 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaacctaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgcaaaata-acctataattgaattatttaaattttc 38527334  T
Q  268 ggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttg 367  Q
    || ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  38527333 gggtgggctactacaccactttgcaggaatttggatcaaccaagacataaaaccgatacaaaattgcataaaatctcacaaaatagacctataatcgttg 38527234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 68 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 31392904 - 31392606
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccacta 167  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  31392904 tgtcagggtgggtcactaaaattaact-ttgaaaaattgtttaaagtctcgcaaattagacctataattgaattatttaaatttttcgggtgggccacta 31392806  T
Q  168 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 267  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  31392805 caccaatttgcgagaattgggatcaatcgaaacctaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataattgaattacttaaatttt- 31392707  T
Q  268 ggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttg 367  Q
    || ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||| |||    
T  31392706 gggtgggccactacaccactttgcaggaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgcataaaatctaacaaaatagacttataatcgttg 31392607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 84 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 42016846 - 42016562
Alignment:
Q  84 taaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaa 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||    
T  42016846 taaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcacaaattagacctataattgaattatttaaattttttgggtgggccgctacaccaatttgcgggaa 42016747  T
Q  184 tttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcggatgggccattacac 283  Q
    |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||     
T  42016746 tttggatcaaccaaaacttaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaatttttgggtgggccactgcat 42016647  T
Q  284 cactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttga 368  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  42016646 caatttgcaggaatttggatcaaccaaaacataaaaccaacacaaaattgcataaaatctcacaaaatagacctataatcgttga 42016562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 68 - 363
Target Start/End: Original strand, 28745303 - 28745586
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccacta 167  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  28745303 tgtcagggtgggccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgca-----------taattgaattatttaaatttttcaggtgggccacta 28745391  T
Q  168 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 267  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28745392 caccaatttgcgggaatttagatcaaccaaaatctaaaaccggcataaaattatataaaatctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 28745491  T
Q  268 ggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatc 363  Q
    || || |||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28745492 gggtgagccactacaccactttgcaggaatttggat-aaccaaaacataaaatcgacacaaaattgcataaaatctcgcaaaatagacctataatc 28745586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 99 - 363
Target Start/End: Original strand, 11935205 - 11935470
Alignment:
Q  99 aaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaa 198  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11935205 aaaaattgtttaaagtctcacaaaatagatctataattgaattatttaaatttttctggtgggccaatacaccactttgcgggaatttggatcaaccgaa 11935304  T
Q  199 atctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaa-ttttcggatgggccattacaccactttgcatgaat 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| ||||||||||| |  ||||    
T  11935305 atctaaaaccgacataaaattgtataaaacctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttttgggtgggccactacaccactttacgagaat 11935404  T
Q  298 ttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatc 363  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11935405 ttggatcaaccaaaatctaaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacttataatc 11935470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 181 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 38763960 - 38763773
Alignment:
Q  181 gaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcggatgggccatta 280  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  38763960 gaatttggatcaaccaaaacctaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcgggtgggccacta 38763861  T
Q  281 caccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttga 368  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  38763860 caccactttgcaggaatttggatcaaccaaaacataaaaccaacacaaaattgcataaaatctcgctaaatagacctataatcgttga 38763773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 82 - 360
Target Start/End: Original strand, 3836154 - 3836431
Alignment:
Q  82 actaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcggg 181  Q
    ||||||||||||  || ||||||||||||||| |||| ||| ||||  ||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||    
T  3836154 actaaaattaaccgttaaaaaattgtttaaagcctcgtaaaatagatatataattgaattatttaaatttt-cgggtgg-ccactacatcactttgcggg 3836251  T
Q  182 aatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattattt-aaattttcggatgggccatta 280  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  | |||  || ||    
T  3836252 aattttgatcaactgaaacctaaaacagacataaaattgtataaaatctcacaaaatagatctataattgaattatttaaaatttttaggtggttcacta 3836351  T
Q  281 caccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctata 360  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  3836352 caccacttcgcgggaatttggatcaaccaaaacctaaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgtaaaatagatctata 3836431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 68 - 249
Target Start/End: Original strand, 22674652 - 22674833
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccacta 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  || |||||||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  22674652 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctctcaaattagaccttcaattgaattatttaaattttttgggtgggccacta 22674751  T
Q  168 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataat 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22674752 caccaatttgcgggaatttggatcagccgaaacctaaaaccgacacaaaattgcataaaatctcgcaaaatagacctataat 22674833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 72 - 249
Target Start/End: Original strand, 43471370 - 43471547
Alignment:
Q  72 agggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacacc 171  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||||||    
T  43471370 agggtggaccactaaaattaaccgttgaaaaattgtttaaagcctcgcaaaatagacctataattgaattgtttaaatttttcgggtggactactacacc 43471469  T
Q  172 aatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataat 249  Q
    | |||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43471470 actttgcgagaatttggatcaatcaaaacctaaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataat 43471547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 68 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 41699427 - 41699249
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccacta 167  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  41699427 tgtctgggtgggccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaattagacctataattgaattatttaaatttttcgggtggacctcta 41699328  T
Q  168 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataat 249  Q
       ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  41699327 ---caatttgcgggaatttggatcaaccaaaacataaaaccaacacaaaattgcataaaatctcgcaaaatatacctataat 41699249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 68 - 249
Target Start/End: Original strand, 34494388 - 34494568
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccacta 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  34494388 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcacaaattagacctataattgaattatttaaa-ttttcgggtgggccacta 34494486  T
Q  168 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataat 249  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||  |||  ||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  34494487 caccactttgcaggaatttggatcaacaaaaacataaaaccgatacaaaattgcataaaatctcgcaaaagagacctataat 34494568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 214 - 368
Target Start/End: Original strand, 34494420 - 34494574
Alignment:
Q  214 aaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaac 313  Q
    |||||||| |||| | || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  34494420 aaaattgtttaaagtctcacaaattagacctataattgaattatttaaattttcgggtgggccactacaccactttgcaggaatttggatcaacaaaaac 34494519  T
Q  314 ataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttga 368  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  34494520 ataaaaccgatacaaaattgcataaaatctcgcaaaagagacctataatcgttga 34494574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 96 - 247
Target Start/End: Original strand, 31643551 - 31643702
Alignment:
Q  96 ttgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaacc 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||  |    
T  31643551 ttgaaaaattgtttaaagtctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttttgggtggaccaccacaccactttgcgggaatttgaatcaggc 31643650  T
Q  196 gaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctata 247  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  31643651 gaaacttaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgtaaaatagacatata 31643702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 230 - 368
Target Start/End: Original strand, 43471414 - 43471553
Alignment:
Q  230 tcgcaaaatagacctataattgaattatttaaatttt-cggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaa 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| | | |||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  43471414 tcgcaaaatagacctataattgaattgtttaaatttttcgggtggactactacaccactttgcgagaatttggatcaatcaaaacctaaaaccgacacaa 43471513  T
Q  329 aattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttga 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43471514 aattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatcgttga 43471553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 238 - 368
Target Start/End: Original strand, 19283899 - 19284029
Alignment:
Q  238 tagacctataattgaattatttaaattttcggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtata 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  19283899 tagacctataattgaattatttaaattttcgggtgggacactacaccactttgcaggaatttagatcaaccaaaacataaaaccgatacaaaattgcata 19283998  T
Q  338 aaatctcgcaaaatagacctataatctttga 368  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  19283999 aaatctcgcaaaatagatttataatcgttga 19284029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 72 - 241
Target Start/End: Original strand, 19283847 - 19284015
Alignment:
Q  72 agggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacacc 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||  |||||||||    
T  19283847 agggtgggccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcataaattagacctataattgaattatttaaa-ttttcgggtgggacactacacc 19283945  T
Q  172 aatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaataga 241  Q
    | ||||| ||||||| |||||||| |||  ||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  19283946 actttgcaggaatttagatcaaccaaaacataaaaccgatacaaaattgcataaaatctcgcaaaataga 19284015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 96 - 238
Target Start/End: Original strand, 29141871 - 29142013
Alignment:
Q  96 ttgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaacc 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||| |||| || |||  | |||||||||||||||    
T  29141871 ttgaaaaattgtttaaagtctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttttgggtgggccattacatcattttatgagaatttggatcaacc 29141970  T
Q  196 gaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaat 238  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  29141971 gaaatctaaaatcgacacaacattgtataaaatatcgcaaaat 29142013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 84 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 2077720 - 2077563
Alignment:
Q  84 taaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaa 183  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| || || |||||||| ||| |||| |||||    
T  2077720 taaaattaaccgttgaaaaattgtttaaagtctcgtaaaatagacctataattgaattatttaaattttttggatgaaccactaccccactttgtgggaa 2077621  T
Q  184 tttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaataga 241  Q
    ||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  2077620 tttagatcagccgaaagctaaaaccgacacaaaattgtatagaatctcgcaaaataga 2077563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 100 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 38763927 - 38763779
Alignment:
Q  100 aaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaa 199  Q
    |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||    
T  38763927 aaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaatttt-cgggtgggccactacaccactttgcaggaatttggatcaaccaaaa 38763829  T
Q  200 tctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataat 249  Q
      ||||||| ||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  38763828 cataaaaccaacacaaaattgcataaaatctcgctaaatagacctataat 38763779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 214 - 368
Target Start/End: Original strand, 22674684 - 22674839
Alignment:
Q  214 aaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc-ggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaa 312  Q
    |||||||| |||| | || |||| |||||||  ||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||| |||||  |||||||||||| || |||    
T  22674684 aaaattgtttaaagtctctcaaattagaccttcaattgaattatttaaattttttgggtgggccactacaccaatttgcgggaatttggatcagccgaaa 22674783  T
Q  313 cataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttga 368  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22674784 cctaaaaccgacacaaaattgcataaaatctcgcaaaatagacctataatcgttga 22674839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 100 - 251
Target Start/End: Original strand, 26860607 - 26860757
Alignment:
Q  100 aaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaa 199  Q
    |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||  | |||||||||||||| |||    
T  26860607 aaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttt-gggtgggccactacaccactttgtagaaatttggatcaaccaaaa 26860705  T
Q  200 tctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattg 251  Q
      |||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26860706 cataaaaccgacacgaaattgcataaaatctcgcaaaatagacctataattg 26860757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 214 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 41699395 - 41699243
Alignment:
Q  214 aaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaatttt-cggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaa 312  Q
    |||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||  ||||    |||||  |||||||||||||||||||    
T  41699395 aaaattgtttaaagtctcgcaaattagacctataattgaattatttaaatttttcgggtggacctctacaa---tttgcgggaatttggatcaaccaaaa 41699299  T
Q  313 cataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttga 368  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  41699298 cataaaaccaacacaaaattgcataaaatctcgcaaaatatacctataatcgttga 41699243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 214 - 360
Target Start/End: Original strand, 31643555 - 31643702
Alignment:
Q  214 aaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaa-ttttcggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaa 312  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| |||  ||||||||||||  ||||||| ||||  | |||    
T  31643555 aaaattgtttaaagtctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttttgggtggaccaccacaccactttgcgggaatttgaatcaggcgaaa 31643654  T
Q  313 cataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctata 360  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  31643655 cttaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgtaaaatagacatata 31643702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 96 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 32100154 - 32099999
Alignment:
Q  96 ttgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtgg-----accactacaccaatttgcgggaatttggat 190  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||     |||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  32100154 ttgaaaaattatttaaagactcacaaaatagatctataattgaattatttaaatttttcgggtgggtcacaccactacaccactttgtgggaatttagat 32100055  T
Q  191 caaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctat 246  Q
    ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||| || ||||||    
T  32100054 caaccgaaacctaaaactgacacaaaattgtataaaatctcgtaaagtatacctat 32099999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 96 - 246
Target Start/End: Original strand, 29035340 - 29035490
Alignment:
Q  96 ttgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaacc 195  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||| ||||||  ||||| ||||||||    
T  29035340 ttgaaaaattgtttaaagacttgcaaaatagatctataattgaattatttaaatttttcgagtgggaaactacaccactttgcgaaaatttagatcaacc 29035439  T
Q  196 gaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctat 246  Q
    |||| |||||| ||||| ||| ||||| ||||| || |||| |||||||||    
T  29035440 gaaacctaaaatcgacacaaagttgtagaaaatctcacaaagtagacctat 29035490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 214 - 351
Target Start/End: Original strand, 29141875 - 29142013
Alignment:
Q  214 aaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaa-ttttcggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaa 312  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| || |||    ||||||||||||||| |||    
T  29141875 aaaattgtttaaagtctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttttgggtgggccattacatcattttatgagaatttggatcaaccgaaa 29141974  T
Q  313 cataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaat 351  Q
      ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  29141975 tctaaaatcgacacaacattgtataaaatatcgcaaaat 29142013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 214 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 2077704 - 2077563
Alignment:
Q  214 aaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc-ggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaa 312  Q
    |||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||| ||| ||||||||   |||||| ||||| || |||    
T  2077704 aaaattgtttaaagtctcgtaaaatagacctataattgaattatttaaattttttggatgaaccactaccccactttgtgggaatttagatcagccgaaa 2077605  T
Q  313 cataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaataga 354  Q
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2077604 gctaaaaccgacacaaaattgtatagaatctcgcaaaataga 2077563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 234 - 362
Target Start/End: Original strand, 3836192 - 3836319
Alignment:
Q  234 aaaatagacctataattgaattatttaaattttcggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattg 333  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||  |||||| |||||||  |||| |||||| |||| |||||||    
T  3836192 aaaatagatatataattgaattatttaaattttcgggtgg-ccactacatcactttgcgggaattttgatcaactgaaacctaaaacagacataaaattg 3836290  T
Q  334 tataaaatctcgcaaaatagacctataat 362  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  3836291 tataaaatctcacaaaatagatctataat 3836319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 232 - 359
Target Start/End: Original strand, 29035362 - 29035490
Alignment:
Q  232 gcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcgga-tgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaa 330  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||  | |||||||||||||   ||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||     
T  29035362 gcaaaatagatctataattgaattatttaaatttttcgagtgggaaactacaccactttgcgaaaatttagatcaaccgaaacctaaaatcgacacaaag 29035461  T
Q  331 ttgtataaaatctcgcaaaatagacctat 359  Q
    ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  29035462 ttgtagaaaatctcacaaagtagacctat 29035490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 233 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 32100131 - 32099999
Alignment:
Q  233 caaaatagacctataattgaattatttaaatttt-cggatggg-----ccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacac 326  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||     ||| ||||||||||||   |||||| |||||||| |||| |||||| |||||    
T  32100131 caaaatagatctataattgaattatttaaatttttcgggtgggtcacaccactacaccactttgtgggaatttagatcaaccgaaacctaaaactgacac 32100032  T
Q  327 aaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctat 359  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || ||||||    
T  32100031 aaaattgtataaaatctcgtaaagtatacctat 32099999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 68 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 38764014 - 38763961
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaa 121  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38764014 tgtcagggtgggccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaa 38763961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 295 - 363
Target Start/End: Original strand, 17526052 - 17526120
Alignment:
Q  295 aatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatc 363  Q
    ||||| ||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17526052 aatttagatcaactaaaacctaaaactgacactaaattgtataaaatctcgcaaaatagatctataatc 17526120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 182 - 249
Target Start/End: Original strand, 17526052 - 17526119
Alignment:
Q  182 aatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataat 249  Q
    ||||| |||||||  ||| ||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  17526052 aatttagatcaactaaaacctaaaactgacactaaattgtataaaatctcgcaaaatagatctataat 17526119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 131
Target Start/End: Original strand, 17526001 - 17526033
Alignment:
Q  99 aaaaattgtttaaagtctcgcaaactagaccta 131  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17526001 aaaaattgtttaaagtctcgcaaaatagaccta 17526033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 326 - 362
Target Start/End: Original strand, 44788476 - 44788512
Alignment:
Q  326 caaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataat 362  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  44788476 caaaattgtttaaaatctcgaaaaatagacctataat 44788512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 233; Significance: 1e-128; HSPs: 71)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 68 - 368
Target Start/End: Original strand, 11650765 - 11651065
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccacta 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||    
T  11650765 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgtaaattagacctataattgaattatttaaatttttcgggtgtgccacta 11650864  T
Q  168 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11650865 caccaatttgcgggaatttggatcaaccaaaacctaaaatcgacataaaattgtataaaatctcccaaaataaacctataattgaattatttaaattttc 11650964  T
Q  268 ggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttg 367  Q
    || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11650965 gggtggaccactacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgcataaaatctcgcaaaatagacctataatcgttg 11651064  T
Q  368 a 368  Q
    |    
T  11651065 a 11651065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 68 - 368
Target Start/End: Original strand, 12700367 - 12700667
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccacta 167  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||    
T  12700367 tgtcagggtgggccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaattagacctataattgaattatttaaatttttcggatgaaccacta 12700466  T
Q  168 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  12700467 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaacctaaaatcgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatttaactatttaaattttc 12700566  T
Q  268 ggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttg 367  Q
    || ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||    
T  12700567 gggtgggccactacaccactttgcaggaatttggatcaaccaaaacataaaatcgacacaaaattgcataaagtctcgcaaaataaacctataatcgttg 12700666  T
Q  368 a 368  Q
    |    
T  12700667 a 12700667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 68 - 368
Target Start/End: Original strand, 44745389 - 44745689
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccacta 167  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  44745389 tgtcaggatggaccactaaaataaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaattagatctataattgaattatttaaattttttgagtggaccacta 44745488  T
Q  168 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44745489 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaacctaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctacaattgaattatttaaattttc 44745588  T
Q  268 ggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttg 367  Q
    |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  44745589 gagtgggccactgcaccactttgcaggaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgcataaaatcttgcaaaatagacctataatcgttg 44745688  T
Q  368 a 368  Q
    |    
T  44745689 a 44745689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 68 - 350
Target Start/End: Original strand, 31663966 - 31664248
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccacta 167  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  31663966 tgtcagggtgggccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaattagacctataattgaattatttaaatttttcgggtgggccacta 31664065  T
Q  168 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31664066 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaacctaaaaccgacataaaattttataaaatcttgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 31664165  T
Q  268 ggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaa 350  Q
    || ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  31664166 gggtgggccactacaccactttgcaggaatttggatcaaccaaatcataaaaccgactcaaaattgcataaaatctcgcaaaa 31664248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 70 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 43564775 - 43564477
Alignment:
Q  70 tcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactaca 169  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  43564775 tcagggtggaccactaaaatcaactattgaaaaattgtttaaactctcgcaaattagacctataattgaattatttaaatttttcgggtgttccactaca 43564676  T
Q  170 ccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcgg 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  43564675 ccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaacctaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacttataattgaattatttaaatttttgg 43564576  T
Q  270 atgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttga 368  Q
    ||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  43564575 atggggcactacaacactttgcaggaatttggatcaaccaaaacataaaaccaacacaaaattgcataaaatatcgcaaaatagacctataatcgttga 43564477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 72 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 13233585 - 13233289
Alignment:
Q  72 agggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacacc 171  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13233585 agggtgggccactaaaattaattattgaaaaattgtttaaagtctcacaaattagatctataattgaattatttaaatttttcgggtggaccactacacc 13233486  T
Q  172 aatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcggat 271  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  13233485 gatttgcgggaatttggatcaaccgaaacctaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaatttttgggt 13233386  T
Q  272 gggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttga 368  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||    
T  13233385 gggccactacaccactttgcaggaatttggatcaaccaaaacataaaaccgatacaaaattgcataaaatatcgcaaaatagatctataatcgttga 13233289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 68 - 363
Target Start/End: Original strand, 31581549 - 31581844
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccacta 167  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||  ||| ||    
T  31581549 tgtcagggtgggccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaattagacctataattgagttatttaaatttttcggatgagccagta 31581648  T
Q  168 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31581649 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaacctaaaatcgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 31581748  T
Q  268 ggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatc 363  Q
    |  ||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31581749 gagtgggccattacactactttacaggaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgcataaaatctagcaaaatagacctataatc 31581844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 68 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 16925465 - 16925165
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccacta 167  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16925465 tgtcagggtgggccactaaaattaactattgaaaaattatttaaagtctcacaaattagacctataattgaattatttaaatttttcgggtggaccacta 16925366  T
Q  168 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 267  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16925365 caccaatttgcggaaatttggatcaaccgaaacctaaaaccgacataaatttgtataaaatctcacaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 16925266  T
Q  268 ggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttg 367  Q
    || ||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||    
T  16925265 gggtggaccactacaccactttgtaggaatttggatcaaccaaaacataaaaccgatacaaaattgcataaagtctcgcaaattagacctataatcgttg 16925166  T
Q  368 a 368  Q
    |    
T  16925165 a 16925165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 68 - 368
Target Start/End: Original strand, 38141356 - 38141656
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccacta 167  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||    
T  38141356 tgtcagggtaggccactaaaattaactattgaaaaattatttaaagtatcgcaaattagacctataattgaattatttaaatttttcggttgggccacta 38141455  T
Q  168 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38141456 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaacctaaaaccgacataaaattgtataaaatctcacaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 38141555  T
Q  268 ggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttg 367  Q
    || ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  38141556 gggtgggccactacaccactttgcaggaatttggatcaacaaaaacataaaattgatacaaaattgcataaaatctcgcaaaatagacctataatcgttg 38141655  T
Q  368 a 368  Q
    |    
T  38141656 a 38141656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 80 - 368
Target Start/End: Original strand, 2654721 - 2655009
Alignment:
Q  80 ccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcg 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2654721 ccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcacaaattagacctataattgaattatttaaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcg 2654820  T
Q  180 ggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcggatgggccatt 279  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |    
T  2654821 gaaattgggatcaaccgaaatctaaaaccgacgtaaaattgtataaaatctcataaaatagacctataattgaactatttaaattttcggatgggtcact 2654920  T
Q  280 acaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttga 368  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  2654921 acaccactttgcaggaatttggatcaaccaaaacataaaaccgatacaaaattgcataaaatctcgcaaactagatctataatcgttga 2655009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 72 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 18491542 - 18491246
Alignment:
Q  72 agggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacacc 171  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  18491542 agggtgggtcactaaaattaactattgaaacattgtttaaagtctcgcaaattagacttataattgaattatttaaatttttcgggtgggccactacacc 18491443  T
Q  172 aatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcggat 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |    
T  18491442 aatttgcgggaatttggatcaaccgaaacctaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctatagttaaattatttaaattttcgggt 18491343  T
Q  272 gggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttga 368  Q
    ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  18491342 ggggcactacaccactttgcaggaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacataaaattacataaaatctcacaaaatagacctataatcgttga 18491246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 80 - 368
Target Start/End: Original strand, 36954821 - 36955109
Alignment:
Q  80 ccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcg 179  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36954821 ccactaatattaactattgaaaaattgtttaaattctcgcaaattagactcataattgaattatttaaatttttcgggtgggccactacaccaatttgcg 36954920  T
Q  180 ggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcggatgggccatt 279  Q
    || |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  36954921 gggatttggatcaaccgaaacgtaaaatcgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcgggtgggccact 36955020  T
Q  280 acaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttga 368  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36955021 acaccactttgcaagaatttggatcaaccaaaacataaaaccaacacaaaattgcataaaatctcgcaaaatagacctataatcgttga 36955109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 68 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 36584782 - 36584488
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccacta 167  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||  ||||||    
T  36584782 tgtcagggtaggccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaattagacctataattgaaatatttaaatttttcgggtgagccacta 36584683  T
Q  168 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 267  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36584682 caccaattagcgggaatttggatcaactaaaacttaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 36584583  T
Q  268 ggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataat 362  Q
    || ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  36584582 gggtgggccactacaccactttgcaggaatttggatcaaccaaaacataaaactaacacaaaattgcataaaatctcgcaaaatatacctataat 36584488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 72 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 6756183 - 6755888
Alignment:
Q  72 agggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacacc 171  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  6756183 agggtgggccactaaaattaacaattaaaaaattgtttaaagtctcgcaaattaaacctataattgaatcatttaaatttttcgggtgg-ccactacacc 6756085  T
Q  172 aatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcggat 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6756084 aatttgcgggaatttggatcaaccgaaacataaaaccgacataaaatagtataaaatctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcgggt 6755985  T
Q  272 gggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttga 368  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6755984 gggccactacaccactttgcaggaatttggatcaacaaaaacataaaaacaacacaaaattgcataaaatctcgcaaaatagacctataatcgttga 6755888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 72 - 368
Target Start/End: Original strand, 40228233 - 40228529
Alignment:
Q  72 agggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacacc 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||| |    
T  40228233 agggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaatactcgcaaattagacctataattgaattatttaaatttttcgggtgggccactacaac 40228332  T
Q  172 aatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcggat 271  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |    
T  40228333 aatttgcgagaatttggatcaaccgaaacctaaaactgacataaaatcgtataaaatctcgccaaatagacctacaattgaattatttaaattttcgagt 40228432  T
Q  272 gggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttga 368  Q
    |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40228433 gggccactacaacactttgcaggaatttggatcaaccaaagcataaaaccgacacaaaattgcataaaatctcgcaaaatagacctataatcgttga 40228529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 72 - 368
Target Start/End: Original strand, 13612895 - 13613191
Alignment:
Q  72 agggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacacc 171  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  13612895 agggtgggccactaaaattaactagtgaaaaattgtttaaagtctcgtaaattagatctataattgaattatttaaatttttcgggtgggccactacacc 13612994  T
Q  172 aatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcggat 271  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |    
T  13612995 aatttgcgggaatttggatcaaccaaaacctaaaaccgacataaaattgtataaaatctcggaaaatagacctataattaaattatttaaatttttgggt 13613094  T
Q  272 gggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttga 368  Q
    ||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13613095 gggccacaacaccactttgtaggaatttggatcaaccaaaatataaaaccaacacaaaattgcataaaatctcgcaaaatagacctataatcgttga 13613191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 72 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 44134848 - 44134553
Alignment:
Q  72 agggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacacc 171  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||     
T  44134848 agggtgggccattaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaattagacctataattgaattatttaaatttttcaggtgggccactacact 44134749  T
Q  172 aatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcggat 271  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  44134748 aatttgcgggaatttggatcaaccaaaacctaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcgggt 44134649  T
Q  272 gggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttga 368  Q
    ||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  44134648 ggatcactacaccactttgcaggaatttggatcaaccaaaacataaaaccaata-aaaattgcataaaatctcacaaaatagacctataatcgttga 44134553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 70 - 368
Target Start/End: Original strand, 19653446 - 19653743
Alignment:
Q  70 tcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactaca 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  19653446 tcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaattagacttataattgagttatttaaatttttcggatggaccactaca 19653545  T
Q  170 ccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcgg 269  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  19653546 ccaatttgtgggaatttggatcaaccgaaacctaaaatcgacataaaattgtataaaatctcac-aaatagacctataattgaattatttaaattttcaa 19653644  T
Q  270 atgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttga 368  Q
     ||||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  19653645 gtgggccattacactattttacaggaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgcataaaatctaacaaaatagacctataatcgttga 19653743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 80 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 41832724 - 41832440
Alignment:
Q  80 ccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcg 179  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41832724 ccactaaaattaacttttgaaaaattgtttaaagtttcgcaaattagacctataattgaattatttaaatttttcgggtgggccactacaccaatttgcg 41832625  T
Q  180 ggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattattt-aaattttcggatgggccat 278  Q
     ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||||     
T  41832624 agaattgggatcaaccgaaacctaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaaagttttgggtgggccac 41832525  T
Q  279 tacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatc 363  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  41832524 tacaccactttgcaggaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacataaaattgcataaaatcttgcaaaatagacatataatc 41832440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 68 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 52581816 - 52581515
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtgg-accact 166  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  52581816 tgtcagggtgggccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaattagacctataattgaattatttaaattttttgggtgggaccact 52581717  T
Q  167 acaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaatttt 266  Q
    ||||||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  52581716 acaccaatttgtggaaatttggatctaccgaaacctaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgtaaaataaacatataattgaattatttaaatttt 52581617  T
Q  267 cggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatcttt 366  Q
     |||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||||||||| ||    
T  52581616 tggatgggcgactacaccactttgcaggaatttggatcaactaaaacatgaaaccgacacaaaactccataaaatattgcaaaatagacctataatcgtt 52581517  T
Q  367 ga 368  Q
    ||    
T  52581516 ga 52581515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 72 - 368
Target Start/End: Original strand, 54795532 - 54795828
Alignment:
Q  72 agggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacacc 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||||||    
T  54795532 agggtgggccactaaaattaaccgttgaaaaattgtttaaagcctcgcaaaatagacctataattgaattgtttaaatttttcgggtggactactacacc 54795631  T
Q  172 aatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaa-ttttcgga 270  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||     
T  54795632 actttgcgggaatttgaatcaaccgaaacctaaaaccgacataaaaatgtataaaatctcg-aaaatagacctataattgaattatttaaattttttggg 54795730  T
Q  271 tgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttga 368  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  54795731 tgggccactacaccactttgcgggaatttggatcaatcaaaatctaaaaccgacacaaaattgtataaaatcttgcaaaatagacctataatcgttga 54795828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 68 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 22647470 - 22647189
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccacta 167  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||| ||||||    
T  22647470 tgtcagggtgggccactgaaattaaccattaaaaaattgtttaaagtctcacaaattagacatataattgaattatttaatttttttgggtgggccacta 22647371  T
Q  168 caccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc 267  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22647370 caccaatttccgggaatttgaatcaaccgaaacctaaaacaaacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttt 22647271  T
Q  268 ggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaa 350  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22647270 gggtgggccactacaccactttgcatgaatttggatcaacaaaaatataaaa-cgacacaaaattgcataaaatctcgcaaaa 22647189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 72 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 27270708 - 27270412
Alignment:
Q  72 agggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacacc 171  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||||||    
T  27270708 agggtggatcactaaaattaaccgttgaaaaattgtttaaagcctcgcaaaatagacctataattgaattgtttaaatttttcgggtggactactacacc 27270609  T
Q  172 aatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaa-ttttcgga 270  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||     
T  27270608 actttgcgggaatttgaatcaaccgaaacctaaaaccgacataaaaatgtataaaatctcg-aaaatagatctataattgaattatttaaattttttggg 27270510  T
Q  271 tgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttga 368  Q
    ||||||| ||||||||||| |  |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  27270509 tgggccactacaccactttacgggaattttgatcaatcaaaacctaaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacttataatcattga 27270412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 80 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 50767381 - 50767093
Alignment:
Q  80 ccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcg 179  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||| | |||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||    
T  50767381 ccactaaaattaaccgttgaaaaattgtttaaagcctcgtaaaatagacctataattgaattgtttaaatttttttggtggactactacaccactttgcg 50767282  T
Q  180 ggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaa-ttttcggatgggccat 278  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || |||||||     
T  50767281 ggaatttgaatcaaccgaaacctaaaaccgacataaaaatgtataaaatctcg-aaaatagacctataattgaattaattaaattttttgggtgggccac 50767183  T
Q  279 tacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttga 368  Q
    |||||||||||||   |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50767182 tacaccactttgcggaaatttggatcaatcaaaacctaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatcgttga 50767093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 74 - 363
Target Start/End: Original strand, 4632509 - 4632799
Alignment:
Q  74 ggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaa 173  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||     
T  4632509 ggtgggccactaaaattaaccgttgaaaaattgtttaaattctctcaaaatagacctataattgaattatttaaattttttgggtggtccactacaccac 4632608  T
Q  174 tttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaa-ttttcggatg 272  Q
    || |||| ||||| |||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||    
T  4632609 ttggcggaaatttagatcaaccgaatcctaaaatcgacacaaaattgtatataatctcgcaaaatagacctatgattgaattatttaaatttttcgcgtg 4632708  T
Q  273 ggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatc 363  Q
     |||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4632709 agccactacaccactttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaactaacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacttataatc 4632799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 82 - 368
Target Start/End: Original strand, 10096270 - 10096555
Alignment:
Q  82 actaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcggg 181  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||   ||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||    
T  10096270 actaaaattaaccgttgaaaaattgtttaaagccttagaaaatagacctataattgaattatttaaatttt-cgagtgggccactacaccattttgcagg 10096368  T
Q  182 aatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcggatgggccattac 281  Q
    |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  || || |||    
T  10096369 aatttggatcaatcgaaacttaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttttgaatggacactac 10096468  T
Q  282 accactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttga 368  Q
    ||||||||||   |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  10096469 accactttgcggaaatttggatcaaccgaaacttaaaaccgacacaaaattatataaaatctcgcaaaatgaacctataatcgttga 10096555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 157 - 360
Target Start/End: Original strand, 44817438 - 44817640
Alignment:
Q  157 gtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaatta 256  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||    
T  44817438 gtgggccactacaccaatttgcaggaatttggatcaatcgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgcagaatagacctataattgaa-ta 44817536  T
Q  257 tttaaattttcggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacc 356  Q
    |||||||||| |||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  44817537 tttaaatttttggatgggccactataccactttgcagaaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgcataaaatttcgaaaaatagacc 44817636  T
Q  357 tata 360  Q
    ||||    
T  44817637 tata 44817640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 72 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 51001717 - 51001542
Alignment:
Q  72 agggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacacc 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  51001717 agggtgggccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagttttacaaattagacctataattgaattatttaaatttttcgggtggaccactacacc 51001618  T
Q  172 aatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataa 248  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  51001617 aatttgcgggaa-ttggatcaaccgaaacctaaaaaagacataaaattgtataaaatattgcaaaatagacttataa 51001542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 217 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 45670170 - 45670019
Alignment:
Q  217 attgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacata 316  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  45670170 attgtataaaatctcgcaaaatagacatataattgaattatttaaattttcgggtgggccactacaccactttgtaggaatttggatcaaccaaaacata 45670071  T
Q  317 aaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttga 368  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  45670070 aaaccgacacaaaattacataaaatctcgcaaaataaacctataatcgttga 45670019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 90 - 242
Target Start/End: Original strand, 36801795 - 36801947
Alignment:
Q  90 taactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttgga 189  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||     
T  36801795 taaccattgaaaaattgtttaaagtctcacaatatagacttataattgaattatataaatttttcgggtgggccactacactattttacgggaatttggt 36801894  T
Q  190 tcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagac 242  Q
    ||| |||||| |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  36801895 tcagccgaaacctaaaaccgacacaaaattatataaaatctcgcaaaatagac 36801947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 214 - 362
Target Start/End: Original strand, 31663998 - 31664147
Alignment:
Q  214 aaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaatttt-cggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaa 312  Q
    |||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||| |||    
T  31663998 aaaattgtttaaagtctcgcaaattagacctataattgaattatttaaatttttcgggtgggccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaa 31664097  T
Q  313 cataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataat 362  Q
    | ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31664098 cctaaaaccgacataaaattttataaaatcttgcaaaatagacctataat 31664147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 214 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 13857826 - 13857680
Alignment:
Q  214 aaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaatttt-cggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaa 312  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||| || |||    
T  13857826 aaaaatgtttaaaatctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaatttttcgggtgggccactacaccactttacagaaatttggatcagccgaaa 13857727  T
Q  313 cataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctat 359  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  13857726 cttaaaaccaacacaaaattgtataaaatctcacaaaatacacctat 13857680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 96 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 13869360 - 13869211
Alignment:
Q  96 ttgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaacc 195  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || || ||||| | ||||||||||| ||    
T  13869360 ttgaaaaaatgtttaaaatctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaatttttcgggtggaccactgcatcactttgcagaaatttggatcagcc 13869261  T
Q  196 gaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagaccta 245  Q
    |||| |||||||||||| |||||  |||||||| || |||||||||||||    
T  13869260 gaaacctaaaaccgacacaaaatgatataaaatctcacaaaatagaccta 13869211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 97 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 13857829 - 13857680
Alignment:
Q  97 tgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccg 196  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| | | ||||||||||| |||    
T  13857829 tgaaaaaatgtttaaaatctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaatttttcgggtgggccactacaccactttacagaaatttggatcagccg 13857730  T
Q  197 aaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctat 246  Q
    |||  ||||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  13857729 aaacttaaaaccaacacaaaattgtataaaatctcacaaaatacacctat 13857680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 214 - 354
Target Start/End: Original strand, 7638702 - 7638842
Alignment:
Q  214 aaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaac 313  Q
    |||||||| |||| | |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||| ||| || ||||    
T  7638702 aaaattgtttaaagtctcgcaaaatagaccaataatggaattattaaaattttcgggtgggccactacaccactttgcgagaatttgggtcagccgaaac 7638801  T
Q  314 ataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaataga 354  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7638802 gtaaaatcgacacaaaattgtataaaatcttgcaaaataga 7638842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 100 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 36584636 - 36584487
Alignment:
Q  100 aaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaa 199  Q
    |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||    
T  36584636 aaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaatttt-cgggtgggccactacaccactttgcaggaatttggatcaaccaaaa 36584538  T
Q  200 tctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataatt 250  Q
      ||||||  ||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  36584537 cataaaactaacacaaaattgcataaaatctcgcaaaatatacctataatt 36584487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 96 - 241
Target Start/End: Original strand, 7638698 - 7638842
Alignment:
Q  96 ttgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaacc 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||    
T  7638698 ttgaaaaattgtttaaagtctcgcaaaatagaccaataatggaattat-taaaattttcgggtgggccactacaccactttgcgagaatttgggtcagcc 7638796  T
Q  196 gaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaataga 241  Q
    ||||  ||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  7638797 gaaacgtaaaatcgacacaaaattgtataaaatcttgcaaaataga 7638842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 96 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 10394041 - 10393896
Alignment:
Q  96 ttgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaacc 195  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||  ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || |||||| ||||  |    
T  10394041 ttgaaaaattgtttacagtctcacaatatagacttataattgagttatataaatttttcgggtgggccactacaccactttgtggaaatttgaatcagac 10393942  T
Q  196 gaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaataga 241  Q
    |||| |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  10393941 gaaacctaaaaccgacacaaaattatataaaatctcgcaaaataga 10393896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 214 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 13869356 - 13869211
Alignment:
Q  214 aaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaatttt-cggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaa 312  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| | || |||||||||  ||||||||||| || |||    
T  13869356 aaaaatgtttaaaatctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaatttttcgggtggaccactgcatcactttgcagaaatttggatcagccgaaa 13869257  T
Q  313 cataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagaccta 358  Q
    | |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  13869256 cctaaaaccgacacaaaatgatataaaatctcacaaaatagaccta 13869211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 103 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 45670170 - 45670025
Alignment:
Q  103 attgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatct 202  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||  |    
T  45670170 attgtataaaatctcgcaaaatagacatataattgaattatttaaatttt-cgggtgggccactacaccactttgtaggaatttggatcaaccaaaacat 45670072  T
Q  203 aaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataat 249  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  45670071 aaaaccgacacaaaattacataaaatctcgcaaaataaacctataat 45670025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 214 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 22647438 - 22647289
Alignment:
Q  214 aaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttc-ggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaa 312  Q
    |||||||| |||| | || |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||  || ||||||| ||||||| ||| |  ||||||| ||||||| |||    
T  22647438 aaaattgtttaaagtctcacaaattagacatataattgaattatttaatttttttgggtgggccactacaccaatttccgggaatttgaatcaaccgaaa 22647339  T
Q  313 cataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataat 362  Q
    | ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22647338 cctaaaacaaacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataat 22647289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 80 - 237
Target Start/End: Original strand, 26653060 - 26653217
Alignment:
Q  80 ccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcg 179  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||| || |||||||| | |||||| |||||||||||| || ||||| |||||| |||       
T  26653060 ccactaaaatttaccattaaaaaattgttttaagtctcgcaaaataaacctataattaaattatttaaatttttcggatgaaccaccacaccactttata 26653159  T
Q  180 ggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaa 237  Q
    | ||||||||| | || |||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  26653160 gaaatttggattagccaaaatttaaaaccgacacaaagttgtataaaatctcgcaaaa 26653217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 68 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 45670244 - 45670169
Alignment:
Q  68 tgtcagggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattat 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  45670244 tgtcagggtgggccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgtaaattagacctataattgaattat 45670169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 214 - 355
Target Start/End: Original strand, 36801805 - 36801947
Alignment:
Q  214 aaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaatttt-cggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaa 312  Q
    |||||||| |||| | || ||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||| | ||| |  |||||||| ||| || |||    
T  36801805 aaaattgtttaaagtctcacaatatagacttataattgaattatataaatttttcgggtgggccactacactattttacgggaatttggttcagccgaaa 36801904  T
Q  313 cataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagac 355  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36801905 cctaaaaccgacacaaaattatataaaatctcgcaaaatagac 36801947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 271 - 362
Target Start/End: Original strand, 44817439 - 44817530
Alignment:
Q  271 tgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataat 362  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| | |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44817439 tgggccactacaccaatttgcaggaatttggatcaatcgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgcagaatagacctataat 44817530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 100 - 247
Target Start/End: Original strand, 44817495 - 44817640
Alignment:
Q  100 aaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaa 199  Q
    |||||||| |||| ||||||| | ||||||||||| |||| ||| ||||||||| || ||| |||||| |||| ||||| | |||||||||||||| |||    
T  44817495 aaaattgtataaaatctcgcagaatagacctataattgaa-tatttaaattttt-ggatgggccactataccactttgcagaaatttggatcaaccaaaa 44817592  T
Q  200 tctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctata 247  Q
      ||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  44817593 cataaaaccgacacaaaattgcataaaatttcgaaaaatagacctata 44817640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 230 - 350
Target Start/End: Original strand, 26653096 - 26653217
Alignment:
Q  230 tcgcaaaatagacctataattgaattatttaaatttt-cggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaa 328  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||  ||||||||||  |  ||||||||| | ||||||  ||||||||||||||    
T  26653096 tcgcaaaataaacctataattaaattatttaaatttttcggatgaaccaccacaccactttatagaaatttggattagccaaaatttaaaaccgacacaa 26653195  T
Q  329 aattgtataaaatctcgcaaaa 350  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  26653196 agttgtataaaatctcgcaaaa 26653217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 233 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 51001670 - 51001542
Alignment:
Q  233 caaaatagacctataattgaattatttaaatttt-cggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaat 331  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||| |||||  ||||| ||||||||| |||| |||||  |||| |||||    
T  51001670 caaattagacctataattgaattatttaaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatt-ggatcaaccgaaacctaaaaaagacataaaat 51001572  T
Q  332 tgtataaaatctcgcaaaatagacctataa 361  Q
    |||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  51001571 tgtataaaatattgcaaaatagacttataa 51001542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 96 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 7776987 - 7776903
Alignment:
Q  96 ttgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgg 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||  |||||||||| |||||||    
T  7776987 ttgaaaaattgtttaaagtctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttttggatgggacactacaccattttgcgg 7776903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 96 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 18669150 - 18668994
Alignment:
Q  96 ttgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaacc 195  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||| ||||||| | |||| || ||||| ||| ||||    
T  18669150 ttgaaaaattgtttaaaga-tcgcaaaatagacctataattgaataatttaaattttgcgggtggacgactacactactttgtggaaatttagattaacc 18669052  T
Q  196 gaaatctaaaaccgacataa----aattgtataaaatatcgcaaaatagacctataat 249  Q
    |||| ||   ||||||| ||    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  18669051 gaaacctgtcaccgacacaaaattaattgtataaaatctcgcaaagtagacctataat 18668994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 96 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 18707898 - 18707742
Alignment:
Q  96 ttgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaacc 195  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||| | ||    
T  18707898 ttgaaaaattgtttaaaga-tcgcaaaatagacctataattgaataatttaaattttgcgggtgggcgactacaccactttgcggaaatttggattaccc 18707800  T
Q  196 gaaatctaaaaccgacataa----aattgtataaaatatcgcaaaatagacctataat 249  Q
    |||| ||   ||||||| ||    ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  18707799 gaaacctgtcaccgacacaaaattaattgtataaaatcttgcaaagtagacctataat 18707742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 96 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 18735401 - 18735245
Alignment:
Q  96 ttgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaacc 195  Q
    |||||| |||||||||||  || |||| ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||| |||| || ||||| ||| ||||    
T  18735401 ttgaaacattgtttaaaga-tcacaaaatagacctataattgaataatttaaattttgcgggtggacgactacaccactttgtggaaatttagattaacc 18735303  T
Q  196 gaaatctaaaaccgacataa----aattgtataaaatatcgcaaaatagacctataat 249  Q
    |||| ||   ||||||| ||    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18735302 gaaacctgtcaccgacacaaaattaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataat 18735245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 90 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 133574 - 133416
Alignment:
Q  90 taactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttgga 189  Q
    |||| |||| |||||| ||||||||||| |||| |||| |||| | |||||||| |||||||||  ||||| |||||| |||| |||||| |||||| ||    
T  133574 taaccattgtaaaattatttaaagtctcacaaaatagatctatgattgaattat-taaattttttaggtgggccactaaaccactttgcgagaatttaga 133476  T
Q  190 tcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataat 249  Q
     ||  ||||| |||||||| ||| |||||| |||||||| || ||||||| |||||||||    
T  133475 ccagtcgaaacctaaaaccaacacaaaattatataaaatctcacaaaatatacctataat 133416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 237 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 10394014 - 10393896
Alignment:
Q  237 atagacctataattgaattatttaaatttt-cggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgta 335  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    |||||| ||||  | |||| |||||||||||||||||| ||    
T  10394014 atagacttataattgagttatataaatttttcgggtgggccactacaccactttgtggaaatttgaatcagacgaaacctaaaaccgacacaaaattata 10393915  T
Q  336 taaaatctcgcaaaataga 354  Q
    |||||||||||||||||||    
T  10393914 taaaatctcgcaaaataga 10393896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 229 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 18707880 - 18707741
Alignment:
Q  229 atcgcaaaatagacctataattgaattatttaaatttt-cggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacaca 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||   ||||||||| | || |||| |   |||||||||    
T  18707880 atcgcaaaatagacctataattgaataatttaaattttgcgggtgggcgactacaccactttgcggaaatttggattacccgaaacctgtcaccgacaca 18707781  T
Q  328 a----aattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatc 363  Q
    |    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  18707780 aaattaattgtataaaatcttgcaaagtagacctataatc 18707741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 233 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 133545 - 133415
Alignment:
Q  233 caaaatagacctataattgaattatttaaattttcggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaatt 332  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| || ||||  | ||||||| || ||||||||||  |||||| || ||  | |||| ||||||| ||||||||||    
T  133545 caaaatagatctatgattgaattattaaattttttaggtgggccactaaaccactttgcgagaatttagaccagtcgaaacctaaaaccaacacaaaatt 133446  T
Q  333 gtataaaatctcgcaaaatagacctataatc 363  Q
     ||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  133445 atataaaatctcacaaaatatacctataatc 133415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 233 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 18735379 - 18735244
Alignment:
Q  233 caaaatagacctataattgaattatttaaatttt-cggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaat 331  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | | ||||||||||||    ||||| ||| |||| |||| |   |||||||||||||    
T  18735379 caaaatagacctataattgaataatttaaattttgcgggtggacgactacaccactttgtggaaatttagattaaccgaaacctgtcaccgacacaaaat 18735280  T
Q  332 t----gtataaaatctcgcaaaatagacctataatc 363  Q
    |    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18735279 taattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatc 18735244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 214 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 7776983 - 7776905
Alignment:
Q  214 aaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaa-ttttcggatgggccattacaccactttgc 291  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||| |||||    
T  7776983 aaaattgtttaaagtctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttttggatgggacactacaccattttgc 7776905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 229 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 18669132 - 18668993
Alignment:
Q  229 atcgcaaaatagacctataattgaattatttaaatttt-cggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacaca 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | | ||||| ||||||    ||||| ||| |||| |||| |   |||||||||    
T  18669132 atcgcaaaatagacctataattgaataatttaaattttgcgggtggacgactacactactttgtggaaatttagattaaccgaaacctgtcaccgacaca 18669033  T
Q  328 a----aattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatc 363  Q
    |    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18669032 aaattaattgtataaaatctcgcaaagtagacctataatc 18668993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 319 - 363
Target Start/End: Original strand, 9046131 - 9046175
Alignment:
Q  319 accgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatc 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9046131 accgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagatctataatc 9046175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 18715150 - 18715048
Alignment:
Q  96 ttgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaacc 195  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||| ||||||| | |||| || ||||| ||| ||||    
T  18715150 ttgaaaaattgtttaaag-atcgcaaaatagacttataattgaataatttaaattttgcgggtggacgactacactactttgtggaaatttagattaacc 18715052  T
Q  196 gaaa 199  Q
    ||||    
T  18715051 gaaa 18715048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 96 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 5734254 - 5734193
Alignment:
Q  96 ttgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcggg 157  Q
    ||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  5734254 ttgaaaatttgtttaaagactcgtaaaatagacctataattgaattatttaaatttttcggg 5734193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 95 - 192
Target Start/End: Original strand, 9046035 - 9046131
Alignment:
Q  95 attgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatca 192  Q
    ||||||||||| |||||||||||  ||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||  ||||| |||||| |||| |||| || |||||||||||    
T  9046035 attgaaaaattatttaaagtctcataaaatagacatataattgaattatttaaattttt-tggtgggccactataccactttgtggaaatttggatca 9046131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 234 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 5734230 - 5734198
Alignment:
Q  234 aaaatagacctataattgaattatttaaatttt 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5734230 aaaatagacctataattgaattatttaaatttt 5734198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 234 - 290
Target Start/End: Original strand, 9046060 - 9046116
Alignment:
Q  234 aaaatagacctataattgaattatttaaattttcggatgggccattacaccactttg 290  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||| || |||||||||    
T  9046060 aaaatagacatataattgaattatttaaattttttggtgggccactataccactttg 9046116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 249
Target Start/End: Original strand, 9046131 - 9046174
Alignment:
Q  206 accgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataat 249  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  9046131 accgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagatctataat 9046174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 329 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 18714878 - 18714844
Alignment:
Q  329 aattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatc 363  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18714878 aattgtataaaatctcgcaaagtagacctataatc 18714844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 294 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 5734193 - 5734132
Alignment:
Q  294 gaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagac 355  Q
    ||||||| ||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  5734193 gaatttgaatcaaccgaaacctaaaaccgatgcaaaattgtataaagtcttgcaaagtagac 5734132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 281 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 15632278 - 15632201
Alignment:
Q  281 caccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagaccta 358  Q
    ||||||||| || |||||||| |   ||||||  |||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  15632278 caccactttacaggaatttggttttgccaaaaactaaaaccgtcgcaaaattgtttaaaatctcgtaaaatagaccta 15632201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 229 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 18715132 - 18715095
Alignment:
Q  229 atcgcaaaatagacctataattgaattatttaaatttt 266  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  18715132 atcgcaaaatagacttataattgaataatttaaatttt 18715095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 178 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 5734196 - 5734148
Alignment:
Q  178 cgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaa 226  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||    
T  5734196 cgggaatttgaatcaaccgaaacctaaaaccgatgcaaaattgtataaa 5734148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0050
Description:

Target: scaffold0050; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 74 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 19399 - 19105
Alignment:
Q  74 ggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaa 173  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19399 ggtgggccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgtaaattagacctataattgaattatttaaatttttcgggtgggccactacaccaa 19300  T
Q  174 tttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcggatgg 273  Q
    |||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19299 ttttttggaatttggatcaaccgaaacctaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagatctataattgaattatttaaattttcgggtgg 19200  T
Q  274 gccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataatctttga 368  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  19199 gccactacaccactttgcaggaatttggataaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgcataaaatctcgcaaaatagacctatgatcgttga 19105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 73 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 65402 - 65112
Alignment:
Q  73 gggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacacca 172  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  65402 gggtgggccactaaaattaacttttgaaaaattgtttaaagtctcgcaaattagacctataattgaattatttaaatttttcgggtgggccactacacca 65303  T
Q  173 atttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaa-ttttcggat 271  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  65302 atttgcgggaattgggatcaaccgaaacctaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaatttttcgggt 65203  T
Q  272 gggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataat 362  Q
    |||||| ||||||| |||||  ||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  65202 gggccactacaccaatttgcgggaattgggatcaaccgaaacctaaaaccgacataaaattgtataaaatctcacaaaatagacctataat 65112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 100 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 65261 - 65000
Alignment:
Q  100 aaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaa 199  Q
    |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  65261 aaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataattgaattatttaaatttttcgggtgggccactacaccaatttgcgggaattgggatcaaccgaaa 65162  T
Q  200 tctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcggatgggccattacaccactttgcatgaattt 299  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  65161 cctaaaaccgacataaaattgtataaaatctcacaaaatagacctataattgaattatttaaattttcgggtgggccactacaccactttgcaggaattt 65062  T
Q  300 ggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  65061 ggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgcataaaatctcgcaaaatagacctataa 65000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0978 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 2)
Name: scaffold0978
Description:

Target: scaffold0978; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 72 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 1459 - 1171
Alignment:
Q  72 agggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttttcgggtggaccactacacc 171  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||| || | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1459 agggtgggccactaaaatttaccattgaaaaactgtttaaagtttcgcaaattaaatctataattgaattatttaaatttttcgggtggaccactacacc 1360  T
Q  172 aatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaaattttcggat 271  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  1359 aatttgcgagaatttggatcaaccgaaacctaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgcaaaatagacatataattgaattatttaaattttcgggt 1260  T
Q  272 gggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctata 360  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  1259 gggccactacaccactttgcaggaatttggatcaaccaaaacataaaatcgacacaaaattgcataaaatctcgaaaagtagacctata 1171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0978; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 230 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 1415 - 1282
Alignment:
Q  230 tcgcaaaatagacctataattgaattatttaaatttt-cggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaa 328  Q
    ||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||    
T  1415 tcgcaaattaaatctataattgaattatttaaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgagaatttggatcaaccgaaacctaaaaccgacataa 1316  T
Q  329 aattgtataaaatctcgcaaaatagacctataat 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1315 aattgtataaaatctcgcaaaatagacatataat 1282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 169; Significance: 2e-90; HSPs: 3)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 136 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 332063 - 331831
Alignment:
Q  136 tgaattatataaatttttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaa 235  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  332063 tgaattatttaaattttttgggtggaccactacaccaatttgcgagaatttggatcaaccgaaacctaaaatcgacataaaattgtataaaatctcgcaa 331964  T
Q  236 aatagacctataattgaattatttaaattttcggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgta 335  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  331963 aatagatctataattgaattatttaaattttcgggtggactactacaccactttgcaggaatttggatcaaccaaaacataaaaccgatacaaaattgca 331864  T
Q  336 taaaatctcgcaaaatagacctataatctttga 368  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  331863 taaaatcttgcaaaatagacctataatcgttga 331831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 249 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 332064 - 331950
Alignment:
Q  249 ttgaattatttaaa-ttttcggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgca 347  Q
    |||||||||||||| |||| || ||| ||| ||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  332064 ttgaattatttaaattttttgggtggaccactacaccaatttgcgagaatttggatcaaccgaaacctaaaatcgacataaaattgtataaaatctcgca 331965  T
Q  348 aaatagacctataat 362  Q
    ||||||| |||||||    
T  331964 aaatagatctataat 331950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 74 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 332510 - 332441
Alignment:
Q  74 ggtggaccactaaaattaactattgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattat 143  Q
    ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||| ||||||||    
T  332510 ggtgggccacgaaaattaactgttgaaaaattgtttaaagtcttacaaattagagctataattgaattat 332441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 151; Significance: 1e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 162 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 11443 - 11237
Alignment:
Q  162 ccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctataattgaattatttaa 261  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  11443 ccactacactaatttgcgggaatttggatcaaccgaaacctaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgcaaaattgatctataattgaattatttaa 11344  T
Q  262 attttcggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataa 361  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  11343 atttttggatgggccactataccactttgcacgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgatacaaaattgcataaaatctcgcaaaataaatctataa 11244  T
Q  362 tctttga 368  Q
    || ||||    
T  11243 tcgttga 11237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 271 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 11447 - 11356
Alignment:
Q  271 tgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctataat 362  Q
    ||||||| ||||| | |||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  11447 tgggccactacactaatttgcgggaatttggatcaaccgaaacctaaaaccgacataaaattgtataaaatctcgcaaaattgatctataat 11356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 96 - 247
Target Start/End: Original strand, 82785 - 82935
Alignment:
Q  96 ttgaaaaattgtttaaagtctcgcaaactagacctataactgaattatataaatttt--tcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaa 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |   || | ||| ||||  |||||||||||||||| ||| |||| ||  |||||||||      
T  82785 ttgaaaaattgtttaaagtctcgcaaaatagacctatattt---ttttttaattttttttcgggtggaccactacgccactttggggagatttggatctg 82881  T
Q  194 ccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaatagacctata 247  Q
    |||||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  82882 ccgaaaactaaaaccgacacaaaagtgtataaaatctcgcataatagacctata 82935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 315 - 360
Target Start/End: Original strand, 82890 - 82935
Alignment:
Q  315 taaaaccgacacaaaattgtataaaatctcgcaaaatagacctata 360  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  82890 taaaaccgacacaaaagtgtataaaatctcgcataatagacctata 82935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 52; Significance: 2e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 152 - 239
Target Start/End: Original strand, 303814 - 303901
Alignment:
Q  152 ttcgggtggaccactacaccaatttgcgggaatttggatcaaccgaaatctaaaaccgacataaaattgtataaaatatcgcaaaata 239  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||  || |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  303814 ttcggatggaccactacaccactttatggaaatttgaatcaaccgaaatttaaaaccgacataaaattgtataaaatctcacaaaata 303901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 243 - 352
Target Start/End: Original strand, 303791 - 303901
Alignment:
Q  243 ctataattgaattatttaaatt-ttcggatgggccattacaccactttgcatgaatttggatcaaccaaaacataaaaccgacacaaaattgtataaaat 341  Q
    |||||||||||||||| |||   ||||||||| ||| |||||||||||     |||||| ||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  303791 ctataattgaattattaaaaaaattcggatggaccactacaccactttatggaaatttgaatcaaccgaaatttaaaaccgacataaaattgtataaaat 303890  T
Q  342 ctcgcaaaata 352  Q
    ||| |||||||    
T  303891 ctcacaaaata 303901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University