View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8949_low_30 (Length: 414)

Name: NF8949_low_30
Description: NF8949
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8949_low_30
NF8949_low_30
[»] chr1 (142 HSPs)
chr1 (176-407)||(11584172-11584406)
chr1 (3-130)||(11584044-11584171)
chr1 (29-267)||(32404542-32404781)
chr1 (29-283)||(8796236-8796491)
chr1 (29-283)||(48431399-48431661)
chr1 (40-267)||(40416409-40416637)
chr1 (32-282)||(52561590-52561841)
chr1 (125-283)||(41560352-41560511)
chr1 (41-286)||(2544638-2544878)
chr1 (84-283)||(6025687-6025887)
chr1 (87-283)||(25979231-25979428)
chr1 (126-285)||(52921204-52921364)
chr1 (41-283)||(3818856-3819099)
chr1 (176-283)||(34444531-34444638)
chr1 (67-284)||(33560857-33561075)
chr1 (103-284)||(36339803-36339984)
chr1 (126-283)||(39318253-39318410)
chr1 (158-283)||(19936617-19936742)
chr1 (103-283)||(38807671-38807852)
chr1 (40-263)||(38868920-38869144)
chr1 (152-280)||(52532619-52532747)
chr1 (126-284)||(49347392-49347551)
chr1 (126-283)||(1210869-1211027)
chr1 (126-283)||(30202130-30202288)
chr1 (152-276)||(8676869-8676996)
chr1 (191-283)||(28090694-28090786)
chr1 (86-265)||(29577161-29577340)
chr1 (159-283)||(43375598-43375722)
chr1 (112-283)||(28511797-28511973)
chr1 (126-283)||(4029246-4029404)
chr1 (138-282)||(29128919-29129065)
chr1 (32-241)||(32230996-32231206)
chr1 (126-283)||(51440765-51440923)
chr1 (92-240)||(9599437-9599586)
chr1 (40-283)||(10569071-10569311)
chr1 (177-285)||(25715324-25715432)
chr1 (126-281)||(37462878-37463033)
chr1 (89-283)||(50846652-50846844)
chr1 (169-283)||(4707221-4707334)
chr1 (126-283)||(34792349-34792507)
chr1 (152-282)||(52292191-52292320)
chr1 (29-283)||(5338751-5338995)
chr1 (154-283)||(10200306-10200435)
chr1 (131-283)||(22090225-22090378)
chr1 (197-282)||(22175341-22175426)
chr1 (174-278)||(19908040-19908144)
chr1 (145-280)||(39140659-39140794)
chr1 (190-285)||(50257759-50257854)
chr1 (135-284)||(50806802-50806950)
chr1 (126-283)||(8672042-8672200)
chr1 (126-283)||(51602180-51602338)
chr1 (46-194)||(30834066-30834215)
chr1 (158-282)||(4590533-4590657)
chr1 (132-283)||(11941580-11941732)
chr1 (181-285)||(35828560-35828664)
chr1 (155-283)||(37311755-37311883)
chr1 (184-284)||(40568409-40568509)
chr1 (198-285)||(21769709-21769796)
chr1 (196-283)||(44941776-44941863)
chr1 (92-249)||(9509408-9509566)
chr1 (158-240)||(48865750-48865832)
chr1 (131-267)||(7124270-7124407)
chr1 (196-285)||(42337751-42337840)
chr1 (155-283)||(4001455-4001583)
chr1 (155-283)||(4415503-4415631)
chr1 (156-283)||(7133302-7133429)
chr1 (138-236)||(7762484-7762583)
chr1 (42-194)||(15577461-15577611)
chr1 (201-283)||(26113439-26113521)
chr1 (41-194)||(28528394-28528548)
chr1 (230-284)||(28533696-28533750)
chr1 (126-194)||(853874-853943)
chr1 (196-281)||(1290033-1290118)
chr1 (170-283)||(15086091-15086204)
chr1 (193-265)||(2694437-2694509)
chr1 (126-285)||(19908382-19908542)
chr1 (163-279)||(27072491-27072607)
chr1 (152-236)||(27520254-27520338)
chr1 (32-285)||(27847795-27848057)
chr1 (203-283)||(29577454-29577534)
chr1 (333-396)||(347107-347170)
chr1 (34-223)||(990518-990709)
chr1 (208-283)||(1704834-1704909)
chr1 (176-283)||(6084150-6084257)
chr1 (221-280)||(7210930-7210989)
chr1 (126-220)||(8628154-8628249)
chr1 (44-151)||(13827703-13827810)
chr1 (228-283)||(26299295-26299350)
chr1 (208-283)||(39123369-39123443)
chr1 (88-222)||(42501194-42501329)
chr1 (228-283)||(43481798-43481853)
chr1 (196-283)||(44751679-44751766)
chr1 (131-282)||(8342885-8343034)
chr1 (41-186)||(12261810-12261956)
chr1 (104-193)||(26299187-26299277)
chr1 (135-268)||(29807989-29808123)
chr1 (201-283)||(41017217-41017298)
chr1 (29-194)||(43423746-43423912)
chr1 (149-283)||(50636230-50636363)
chr1 (155-283)||(696423-696552)
chr1 (135-195)||(8203222-8203283)
chr1 (333-386)||(13031128-13031181)
chr1 (333-386)||(17557710-17557763)
chr1 (349-394)||(31626233-31626278)
chr1 (29-221)||(1661457-1661639)
chr1 (152-240)||(11331247-11331335)
chr1 (152-240)||(11489268-11489356)
chr1 (135-194)||(19969301-19969361)
chr1 (208-283)||(27704157-27704233)
chr1 (131-282)||(43240380-43240532)
chr1 (230-286)||(46423213-46423269)
chr1 (87-186)||(50771653-50771753)
chr1 (172-240)||(52900685-52900753)
chr1 (216-283)||(2914123-2914190)
chr1 (230-284)||(4380189-4380242)
chr1 (126-283)||(9592858-9593016)
chr1 (152-266)||(18469099-18469213)
chr1 (173-283)||(24020267-24020377)
chr1 (165-283)||(31274401-31274519)
chr1 (333-403)||(40571591-40571660)
chr1 (357-399)||(41590514-41590555)
chr1 (178-283)||(42539212-42539318)
chr1 (231-285)||(43028806-43028860)
chr1 (137-283)||(51812645-51812791)
chr1 (230-283)||(4318845-4318898)
chr1 (134-194)||(7083022-7083083)
chr1 (245-286)||(29975443-29975484)
chr1 (174-239)||(31979646-31979711)
chr1 (245-282)||(34545563-34545600)
chr1 (211-284)||(38877342-38877415)
chr1 (230-283)||(41165511-41165564)
chr1 (246-283)||(42340099-42340136)
chr1 (126-194)||(44008703-44008772)
chr1 (232-281)||(52073050-52073099)
chr1 (350-386)||(347352-347388)
chr1 (131-194)||(478807-478871)
chr1 (251-283)||(7922075-7922107)
chr1 (208-272)||(17269000-17269064)
chr1 (331-403)||(38076374-38076446)
chr1 (155-283)||(39515868-39515996)
chr1 (127-266)||(45510850-45510990)
chr1 (198-266)||(52981424-52981492)
[»] chr7 (114 HSPs)
chr7 (29-280)||(28627936-28628188)
chr7 (29-245)||(47848701-47848917)
chr7 (29-283)||(38135213-38135467)
chr7 (92-283)||(2885722-2885914)
chr7 (126-285)||(40979926-40980086)
chr7 (103-284)||(36136865-36137047)
chr7 (131-283)||(12966145-12966298)
chr7 (132-283)||(9210704-9210856)
chr7 (126-285)||(45601600-45601760)
chr7 (29-283)||(40169676-40169936)
chr7 (158-283)||(27893563-27893688)
chr7 (29-168)||(6420605-6420745)
chr7 (92-283)||(7273190-7273382)
chr7 (30-283)||(36101777-36102019)
chr7 (88-237)||(1569102-1569252)
chr7 (126-283)||(11594084-11594242)
chr7 (126-283)||(31682602-31682760)
chr7 (126-283)||(37618069-37618227)
chr7 (126-283)||(39906372-39906530)
chr7 (152-261)||(40391845-40391954)
chr7 (108-283)||(1011153-1011328)
chr7 (132-283)||(42187572-42187723)
chr7 (32-283)||(43491338-43491590)
chr7 (126-283)||(12841275-12841433)
chr7 (173-267)||(42969870-42969964)
chr7 (154-283)||(45836482-45836611)
chr7 (29-260)||(26741917-26742151)
chr7 (94-246)||(35922346-35922498)
chr7 (135-282)||(38103616-38103762)
chr7 (126-284)||(34869544-34869703)
chr7 (152-282)||(14057629-14057759)
chr7 (152-282)||(14367657-14367787)
chr7 (126-283)||(38900081-38900238)
chr7 (154-283)||(21078070-21078199)
chr7 (158-286)||(28541940-28542069)
chr7 (135-286)||(37976368-37976520)
chr7 (89-240)||(47796195-47796347)
chr7 (172-283)||(27648951-27649062)
chr7 (126-272)||(35906212-35906359)
chr7 (29-168)||(43282435-43282576)
chr7 (126-283)||(22349744-22349902)
chr7 (169-283)||(38607160-38607274)
chr7 (131-283)||(44855174-44855325)
chr7 (190-283)||(28208328-28208421)
chr7 (173-282)||(34035155-34035264)
chr7 (131-263)||(43281960-43282092)
chr7 (40-240)||(48202745-48202946)
chr7 (135-246)||(21517417-21517529)
chr7 (104-183)||(30814771-30814851)
chr7 (152-240)||(36239839-36239927)
chr7 (152-280)||(40149016-40149143)
chr7 (155-283)||(43281828-43281956)
chr7 (126-265)||(49029400-49029540)
chr7 (40-194)||(30144813-30144968)
chr7 (90-283)||(7220844-7221038)
chr7 (159-285)||(8519044-8519170)
chr7 (158-283)||(28355322-28355448)
chr7 (111-223)||(28562425-28562539)
chr7 (126-267)||(36652116-36652258)
chr7 (153-283)||(41483639-41483769)
chr7 (29-122)||(35713722-35713815)
chr7 (156-281)||(46355858-46355983)
chr7 (126-286)||(22174124-22174281)
chr7 (199-283)||(25891086-25891170)
chr7 (155-283)||(29650538-29650666)
chr7 (172-284)||(48919283-48919395)
chr7 (126-280)||(6374992-6375147)
chr7 (33-239)||(24434407-24434614)
chr7 (172-283)||(32631735-32631846)
chr7 (164-286)||(33731997-33732117)
chr7 (117-226)||(1531418-1531528)
chr7 (138-267)||(3457497-3457626)
chr7 (219-281)||(6263477-6263539)
chr7 (159-285)||(8492234-8492360)
chr7 (29-151)||(25579210-25579332)
chr7 (152-282)||(36193668-36193798)
chr7 (182-272)||(47852268-47852358)
chr7 (215-283)||(28708595-28708663)
chr7 (208-283)||(4604754-4604829)
chr7 (154-281)||(31681022-31681149)
chr7 (87-213)||(32368407-32368534)
chr7 (130-188)||(40830330-40830389)
chr7 (29-100)||(42187497-42187568)
chr7 (196-283)||(47652742-47652829)
chr7 (40-110)||(28021002-28021072)
chr7 (126-283)||(33349806-33349964)
chr7 (132-240)||(44401170-44401277)
chr7 (230-283)||(31005434-31005487)
chr7 (230-283)||(31869102-31869155)
chr7 (245-286)||(41157899-41157940)
chr7 (155-283)||(24598188-24598315)
chr7 (211-283)||(33281097-33281168)
chr7 (227-283)||(44425208-44425264)
chr7 (152-283)||(15682325-15682456)
chr7 (130-188)||(29653641-29653700)
chr7 (184-283)||(33073112-33073211)
chr7 (157-270)||(34926535-34926645)
chr7 (40-111)||(39811995-39812066)
chr7 (228-283)||(48515502-48515557)
chr7 (174-232)||(5577538-5577596)
chr7 (32-225)||(13859066-13859260)
chr7 (152-194)||(24549777-24549819)
chr7 (139-272)||(33103063-33103197)
chr7 (41-194)||(5335959-5336111)
chr7 (228-285)||(20158669-20158726)
chr7 (173-238)||(23404589-23404654)
chr7 (103-163)||(36245524-36245585)
chr7 (145-194)||(36514297-36514346)
chr7 (230-283)||(40630663-40630716)
chr7 (32-60)||(7189450-7189478)
chr7 (227-283)||(20525052-20525108)
chr7 (216-272)||(27021736-27021792)
chr7 (179-263)||(30814145-30814229)
chr7 (210-282)||(34029677-34029749)
[»] chr3 (112 HSPs)
chr3 (29-281)||(39600683-39600936)
chr3 (29-284)||(45289090-45289346)
chr3 (32-283)||(54128408-54128661)
chr3 (29-283)||(42510016-42510269)
chr3 (39-285)||(54364974-54365222)
chr3 (87-283)||(48508320-48508517)
chr3 (92-279)||(50960641-50960829)
chr3 (87-283)||(45486849-45487045)
chr3 (153-284)||(15296059-15296190)
chr3 (106-285)||(29475792-29475970)
chr3 (179-285)||(14415258-14415363)
chr3 (29-289)||(42026530-42026791)
chr3 (133-283)||(19676081-19676232)
chr3 (158-272)||(19737141-19737254)
chr3 (87-240)||(23534613-23534767)
chr3 (179-283)||(40991609-40991713)
chr3 (152-283)||(49042087-49042219)
chr3 (126-283)||(12096705-12096863)
chr3 (158-272)||(19758044-19758157)
chr3 (161-283)||(29601052-29601174)
chr3 (108-221)||(40116530-40116644)
chr3 (126-283)||(52138924-52139082)
chr3 (32-224)||(39235168-39235361)
chr3 (126-283)||(5168956-5169114)
chr3 (126-240)||(49841742-49841855)
chr3 (154-283)||(38060867-38060996)
chr3 (172-272)||(40116349-40116449)
chr3 (105-237)||(41482183-41482318)
chr3 (39-281)||(659562-659805)
chr3 (158-285)||(36304123-36304250)
chr3 (182-285)||(40106618-40106721)
chr3 (41-194)||(21200587-21200741)
chr3 (89-206)||(33755419-33755537)
chr3 (169-283)||(52156084-52156198)
chr3 (154-283)||(22225-22354)
chr3 (176-280)||(32170580-32170684)
chr3 (136-267)||(34844589-34844721)
chr3 (196-284)||(48734146-48734234)
chr3 (196-275)||(24541340-24541419)
chr3 (208-283)||(31146907-31146981)
chr3 (40-194)||(46431768-46431917)
chr3 (154-285)||(47233594-47233725)
chr3 (156-283)||(49503568-49503695)
chr3 (196-279)||(52927852-52927935)
chr3 (172-283)||(53262312-53262423)
chr3 (210-284)||(24778608-24778682)
chr3 (175-285)||(30797820-30797930)
chr3 (138-283)||(31454225-31454371)
chr3 (154-283)||(51447717-51447846)
chr3 (133-272)||(55244408-55244553)
chr3 (131-284)||(11284122-11284271)
chr3 (201-285)||(31566159-31566243)
chr3 (87-194)||(37598259-37598366)
chr3 (92-222)||(38430938-38431069)
chr3 (184-283)||(47555332-47555431)
chr3 (39-176)||(31261049-31261186)
chr3 (104-257)||(37228184-37228338)
chr3 (170-283)||(2133612-2133725)
chr3 (155-284)||(35033300-35033429)
chr3 (158-283)||(53519737-53519862)
chr3 (126-257)||(37228052-37228184)
chr3 (163-287)||(48712071-48712195)
chr3 (172-283)||(311309-311420)
chr3 (196-283)||(7895880-7895967)
chr3 (124-282)||(26490437-26490596)
chr3 (120-194)||(27893207-27893282)
chr3 (208-283)||(46148235-46148310)
chr3 (126-283)||(28245561-28245719)
chr3 (45-143)||(50249430-50249528)
chr3 (126-281)||(30294125-30294279)
chr3 (158-278)||(36049309-36049427)
chr3 (190-283)||(45374477-45374570)
chr3 (131-194)||(19162676-19162740)
chr3 (155-283)||(25191531-25191659)
chr3 (219-283)||(29928294-29928358)
chr3 (219-283)||(29977448-29977512)
chr3 (184-284)||(38850304-38850404)
chr3 (183-283)||(39208790-39208890)
chr3 (228-280)||(41529988-41530040)
chr3 (208-283)||(7120790-7120865)
chr3 (139-193)||(36820067-36820122)
chr3 (216-283)||(37083292-37083359)
chr3 (134-188)||(41087876-41087931)
chr3 (86-192)||(43254975-43255082)
chr3 (219-286)||(52882659-52882726)
chr3 (126-272)||(54279144-54279291)
chr3 (131-188)||(2340812-2340870)
chr3 (237-283)||(24084322-24084368)
chr3 (251-285)||(50891993-50892027)
chr3 (349-391)||(52480159-52480201)
chr3 (158-283)||(388262-388387)
chr3 (40-113)||(3870615-3870688)
chr3 (221-282)||(21862742-21862803)
chr3 (134-194)||(26990345-26990406)
chr3 (198-287)||(31337556-31337645)
chr3 (173-214)||(44571599-44571640)
chr3 (230-283)||(45834600-45834653)
chr3 (94-178)||(46146188-46146273)
chr3 (135-240)||(52678893-52678997)
chr3 (350-399)||(54861606-54861655)
chr3 (231-283)||(3987564-3987616)
chr3 (230-286)||(7278693-7278749)
chr3 (360-396)||(10485124-10485160)
chr3 (126-193)||(20262421-20262489)
chr3 (245-285)||(33307363-33307403)
chr3 (235-283)||(39512777-39512825)
chr3 (251-283)||(41230515-41230547)
chr3 (152-240)||(41842566-41842654)
chr3 (208-283)||(48532164-48532240)
chr3 (167-281)||(49888356-49888467)
chr3 (358-386)||(50070736-50070764)
chr3 (214-286)||(53214868-53214940)
[»] chr8 (103 HSPs)
chr8 (47-284)||(29520695-29520932)
chr8 (46-285)||(35914599-35914839)
chr8 (87-279)||(32931046-32931238)
chr8 (41-284)||(45419276-45419518)
chr8 (32-283)||(30559723-30559980)
chr8 (104-283)||(28169494-28169673)
chr8 (40-259)||(29700314-29700534)
chr8 (40-283)||(30783042-30783281)
chr8 (103-283)||(2216389-2216568)
chr8 (135-283)||(490470-490617)
chr8 (126-282)||(9904883-9905040)
chr8 (105-283)||(35643608-35643785)
chr8 (88-282)||(35362651-35362846)
chr8 (91-283)||(30198266-30198459)
chr8 (152-282)||(14459046-14459177)
chr8 (35-249)||(43904699-43904914)
chr8 (126-283)||(11523723-11523881)
chr8 (126-225)||(17491712-17491812)
chr8 (30-219)||(45512558-45512749)
chr8 (40-281)||(16917222-16917462)
chr8 (126-283)||(36565241-36565399)
chr8 (131-283)||(36545278-36545431)
chr8 (172-284)||(44529396-44529508)
chr8 (126-280)||(12491141-12491296)
chr8 (182-283)||(42584540-42584640)
chr8 (154-279)||(45041320-45041444)
chr8 (108-235)||(28238819-28238947)
chr8 (208-282)||(3464172-3464246)
chr8 (154-283)||(25473403-25473532)
chr8 (158-283)||(33076282-33076406)
chr8 (70-265)||(18742041-18742236)
chr8 (70-265)||(18747005-18747200)
chr8 (131-283)||(23492164-23492316)
chr8 (164-283)||(10824189-10824308)
chr8 (134-224)||(33827816-33827907)
chr8 (126-283)||(40813448-40813606)
chr8 (131-283)||(14903690-14903843)
chr8 (154-283)||(21121299-21121427)
chr8 (173-283)||(31715992-31716104)
chr8 (198-283)||(41031420-41031505)
chr8 (198-283)||(41031526-41031611)
chr8 (211-283)||(1928587-1928659)
chr8 (87-194)||(38178349-38178457)
chr8 (155-283)||(42469727-42469855)
chr8 (208-283)||(27556302-27556377)
chr8 (130-240)||(38391936-38392047)
chr8 (220-283)||(39651028-39651091)
chr8 (87-240)||(5908731-5908885)
chr8 (231-285)||(9695815-9695869)
chr8 (152-282)||(25288915-25289045)
chr8 (152-282)||(36069753-36069883)
chr8 (152-222)||(44373920-44373990)
chr8 (130-194)||(4011211-4011276)
chr8 (126-194)||(16994533-16994602)
chr8 (198-283)||(35323970-35324055)
chr8 (29-224)||(41971849-41972033)
chr8 (174-283)||(44047532-44047641)
chr8 (152-260)||(79178-79286)
chr8 (152-224)||(24399848-24399920)
chr8 (178-282)||(36143518-36143622)
chr8 (140-283)||(39967499-39967643)
chr8 (155-267)||(42854020-42854132)
chr8 (87-281)||(7531646-7531841)
chr8 (176-283)||(21425221-21425328)
chr8 (126-267)||(2796677-2796819)
chr8 (152-266)||(16035744-16035858)
chr8 (135-188)||(16351511-16351565)
chr8 (152-282)||(25300250-25300380)
chr8 (198-284)||(26363684-26363769)
chr8 (153-283)||(39953264-39953394)
chr8 (230-283)||(14742082-14742135)
chr8 (126-222)||(41444400-41444500)
chr8 (126-194)||(43733331-43733400)
chr8 (163-284)||(12966311-12966434)
chr8 (131-194)||(23023354-23023418)
chr8 (231-283)||(31309583-31309635)
chr8 (29-121)||(36143392-36143484)
chr8 (181-283)||(43350731-43350830)
chr8 (172-280)||(44699637-44699745)
chr8 (180-283)||(3473749-3473852)
chr8 (107-177)||(5127376-5127447)
chr8 (172-283)||(15215412-15215523)
chr8 (231-282)||(18473973-18474024)
chr8 (251-286)||(32838888-32838923)
chr8 (196-283)||(8255531-8255620)
chr8 (131-188)||(24558612-24558670)
chr8 (126-179)||(25985642-25985696)
chr8 (208-266)||(30689942-30690000)
chr8 (40-169)||(30748495-30748625)
chr8 (209-283)||(32276893-32276967)
chr8 (169-282)||(36394949-36395063)
chr8 (201-279)||(39702154-39702232)
chr8 (42-100)||(39760612-39760670)
chr8 (208-283)||(41212068-41212145)
chr8 (126-194)||(10079996-10080065)
chr8 (246-283)||(16008395-16008432)
chr8 (228-277)||(18741859-18741908)
chr8 (228-277)||(18746823-18746872)
chr8 (251-283)||(32043837-32043869)
chr8 (29-77)||(35643808-35643856)
chr8 (251-283)||(39947098-39947130)
chr8 (231-283)||(45317575-45317627)
chr8 (219-279)||(45512448-45512508)
[»] chr2 (112 HSPs)
chr2 (45-283)||(38434995-38435234)
chr2 (29-283)||(12141571-12141826)
chr2 (87-282)||(18958996-18959192)
chr2 (84-279)||(33504305-33504502)
chr2 (29-283)||(9556369-9556624)
chr2 (87-272)||(26784351-26784537)
chr2 (126-281)||(26670892-26671048)
chr2 (131-283)||(33287550-33287703)
chr2 (152-283)||(9496017-9496148)
chr2 (126-287)||(38452682-38452844)
chr2 (32-240)||(43751990-43752199)
chr2 (126-283)||(2610712-2610870)
chr2 (135-284)||(31959654-31959804)
chr2 (154-283)||(12734853-12734982)
chr2 (126-283)||(25834803-25834960)
chr2 (67-267)||(37470149-37470350)
chr2 (43-283)||(44437721-44437962)
chr2 (132-283)||(12882045-12882197)
chr2 (29-283)||(6218994-6219247)
chr2 (87-237)||(45436927-45437078)
chr2 (131-283)||(28508807-28508960)
chr2 (176-284)||(13474213-13474321)
chr2 (40-115)||(43260442-43260517)
chr2 (125-283)||(43573130-43573288)
chr2 (149-280)||(45077875-45078008)
chr2 (126-282)||(3243654-3243811)
chr2 (126-282)||(45543074-45543230)
chr2 (156-280)||(19336896-19337020)
chr2 (110-224)||(37452285-37452400)
chr2 (40-282)||(37481618-37481861)
chr2 (126-283)||(3866196-3866354)
chr2 (103-281)||(35755247-35755430)
chr2 (170-283)||(227358-227471)
chr2 (154-283)||(3481307-3481436)
chr2 (152-284)||(9996622-9996757)
chr2 (199-283)||(12520062-12520146)
chr2 (196-283)||(9531600-9531687)
chr2 (92-281)||(13149421-13149612)
chr2 (32-194)||(42543265-42543428)
chr2 (126-283)||(7326160-7326318)
chr2 (158-283)||(11412865-11412992)
chr2 (169-283)||(30306200-30306314)
chr2 (126-283)||(35643072-35643230)
chr2 (126-283)||(36183575-36183733)
chr2 (131-283)||(451648-451801)
chr2 (131-283)||(7431889-7432042)
chr2 (131-267)||(19235000-19235137)
chr2 (158-282)||(7615427-7615550)
chr2 (169-281)||(8180948-8181060)
chr2 (197-284)||(32443832-32443920)
chr2 (27-194)||(43832123-43832291)
chr2 (184-283)||(3635323-3635422)
chr2 (126-284)||(18424377-18424535)
chr2 (126-283)||(4807719-4807877)
chr2 (153-283)||(8197541-8197671)
chr2 (153-283)||(8202301-8202431)
chr2 (29-188)||(12026100-12026260)
chr2 (199-283)||(19863432-19863516)
chr2 (199-283)||(19867764-19867848)
chr2 (199-283)||(19872665-19872749)
chr2 (151-283)||(28960211-28960343)
chr2 (169-284)||(11992107-11992222)
chr2 (87-284)||(26850320-26850518)
chr2 (169-283)||(38328370-38328482)
chr2 (29-166)||(907707-907845)
chr2 (202-272)||(3720426-3720496)
chr2 (33-115)||(7825391-7825473)
chr2 (203-285)||(12474925-12475007)
chr2 (202-284)||(17429251-17429333)
chr2 (169-283)||(45367625-45367739)
chr2 (172-281)||(23997773-23997882)
chr2 (87-187)||(29548733-29548834)
chr2 (200-281)||(34931631-34931712)
chr2 (87-183)||(36869943-36870040)
chr2 (155-272)||(38430038-38430155)
chr2 (152-240)||(23915736-23915824)
chr2 (181-261)||(36366816-36366896)
chr2 (198-282)||(39709202-39709286)
chr2 (152-236)||(42149707-42149791)
chr2 (209-272)||(440924-440987)
chr2 (126-185)||(8187233-8187291)
chr2 (137-283)||(12489802-12489949)
chr2 (29-100)||(13240929-13241000)
chr2 (126-281)||(39029705-39029867)
chr2 (156-281)||(2905995-2906120)
chr2 (358-395)||(11064484-11064521)
chr2 (174-267)||(13443924-13444017)
chr2 (230-283)||(17670697-17670750)
chr2 (230-283)||(41763043-41763096)
chr2 (208-284)||(3030886-3030961)
chr2 (208-284)||(10516748-10516824)
chr2 (126-285)||(19855586-19855746)
chr2 (155-283)||(41197227-41197355)
chr2 (44-128)||(45077797-45077881)
chr2 (229-284)||(16521006-16521061)
chr2 (333-388)||(33456025-33456080)
chr2 (125-224)||(33625257-33625361)
chr2 (229-284)||(35704215-35704270)
chr2 (350-388)||(3008440-3008478)
chr2 (151-205)||(12443134-12443188)
chr2 (221-282)||(624687-624748)
chr2 (154-267)||(6230280-6230393)
chr2 (333-398)||(7252235-7252300)
chr2 (182-283)||(9394630-9394731)
chr2 (231-284)||(16113674-16113727)
chr2 (246-283)||(36608682-36608719)
chr2 (152-188)||(1626346-1626382)
chr2 (245-285)||(2073305-2073345)
chr2 (231-283)||(2515171-2515223)
chr2 (155-259)||(19224935-19225039)
chr2 (359-403)||(33455859-33455903)
chr2 (203-283)||(42549837-42549917)
[»] chr5 (102 HSPs)
chr5 (50-283)||(14667819-14668053)
chr5 (40-283)||(7678521-7678759)
chr5 (117-267)||(9235164-9235312)
chr5 (29-283)||(7359261-7359514)
chr5 (29-266)||(30588476-30588712)
chr5 (29-283)||(6859408-6859663)
chr5 (29-283)||(43475267-43475521)
chr5 (39-192)||(15489583-15489737)
chr5 (29-240)||(6889020-6889232)
chr5 (126-283)||(4496508-4496666)
chr5 (29-272)||(32516583-32516825)
chr5 (129-283)||(11675656-11675812)
chr5 (87-282)||(12576861-12577057)
chr5 (41-194)||(2712983-2713137)
chr5 (159-283)||(418034-418158)
chr5 (196-283)||(18855802-18855889)
chr5 (133-283)||(29816513-29816664)
chr5 (126-272)||(38685091-38685238)
chr5 (42-283)||(79553-79795)
chr5 (126-283)||(10639426-10639584)
chr5 (126-283)||(12492384-12492542)
chr5 (126-283)||(28976859-28977017)
chr5 (131-283)||(29922413-29922566)
chr5 (132-283)||(28012-28164)
chr5 (157-283)||(20367049-20367175)
chr5 (174-283)||(5558314-5558423)
chr5 (126-282)||(20456897-20457054)
chr5 (217-285)||(9234102-9234170)
chr5 (159-283)||(17340437-17340560)
chr5 (29-283)||(23979973-23980226)
chr5 (172-283)||(41894237-41894355)
chr5 (126-284)||(3301968-3302127)
chr5 (126-283)||(2915496-2915653)
chr5 (29-265)||(29938142-29938374)
chr5 (131-267)||(1275393-1275530)
chr5 (103-283)||(6788168-6788348)
chr5 (41-225)||(14749346-14749531)
chr5 (182-267)||(32442141-32442226)
chr5 (155-283)||(13561386-13561514)
chr5 (32-283)||(24178540-24178792)
chr5 (175-283)||(36551320-36551428)
chr5 (29-284)||(43557832-43558082)
chr5 (126-272)||(1287590-1287737)
chr5 (152-283)||(2090564-2090695)
chr5 (126-283)||(14665838-14665994)
chr5 (154-284)||(16913881-16914012)
chr5 (153-283)||(28276390-28276520)
chr5 (126-281)||(2075475-2075632)
chr5 (126-285)||(16347378-16347536)
chr5 (158-281)||(27799988-27800108)
chr5 (32-283)||(26884689-26884940)
chr5 (41-196)||(42199325-42199481)
chr5 (40-194)||(9917539-9917694)
chr5 (44-187)||(21952399-21952541)
chr5 (184-283)||(30213758-30213857)
chr5 (208-283)||(38132543-38132618)
chr5 (139-194)||(28186864-28186921)
chr5 (42-279)||(38501422-38501660)
chr5 (202-283)||(5860035-5860116)
chr5 (216-284)||(27386555-27386623)
chr5 (117-283)||(5305754-5305913)
chr5 (131-265)||(27998570-27998705)
chr5 (357-396)||(38069563-38069602)
chr5 (133-283)||(38684611-38684762)
chr5 (208-283)||(42576217-42576292)
chr5 (89-194)||(1525731-1525837)
chr5 (32-142)||(15986879-15986989)
chr5 (29-123)||(21093779-21093873)
chr5 (126-283)||(34273137-34273295)
chr5 (230-280)||(39040985-39041035)
chr5 (230-283)||(408494-408547)
chr5 (198-271)||(683713-683786)
chr5 (202-283)||(11069162-11069243)
chr5 (179-276)||(15252751-15252848)
chr5 (125-272)||(15588401-15588547)
chr5 (134-194)||(33667567-33667628)
chr5 (227-283)||(4653478-4653534)
chr5 (126-225)||(43035105-43035205)
chr5 (172-283)||(2393048-2393158)
chr5 (131-194)||(4460337-4460400)
chr5 (136-194)||(10082834-10082893)
chr5 (160-283)||(28411835-28411958)
chr5 (103-185)||(28676696-28676779)
chr5 (228-283)||(35118322-35118377)
chr5 (208-283)||(36123182-36123257)
chr5 (359-398)||(40261053-40261092)
chr5 (217-285)||(41108725-41108795)
chr5 (357-403)||(7095911-7095956)
chr5 (40-122)||(11675548-11675630)
chr5 (155-281)||(14911326-14911452)
chr5 (228-282)||(25938196-25938250)
chr5 (210-283)||(2645199-2645272)
chr5 (197-266)||(14330185-14330254)
chr5 (40-100)||(18351091-18351152)
chr5 (365-398)||(32337562-32337595)
chr5 (130-222)||(37918160-37918253)
chr5 (87-151)||(8082087-8082151)
chr5 (245-285)||(10989083-10989123)
chr5 (103-214)||(15168872-15168984)
chr5 (210-278)||(28985292-28985360)
chr5 (371-403)||(31973408-31973440)
chr5 (228-284)||(40265461-40265516)
[»] chr6 (56 HSPs)
chr6 (113-283)||(34505-34676)
chr6 (32-283)||(9593710-9593958)
chr6 (89-283)||(8364643-8364838)
chr6 (103-285)||(5095935-5096118)
chr6 (87-283)||(12890660-12890857)
chr6 (126-283)||(28085500-28085658)
chr6 (168-285)||(9706937-9707054)
chr6 (44-283)||(579460-579700)
chr6 (29-284)||(31818559-31818814)
chr6 (32-237)||(24665840-24666047)
chr6 (126-283)||(34143765-34143923)
chr6 (126-283)||(34156381-34156539)
chr6 (171-284)||(34934829-34934942)
chr6 (107-272)||(43063-43230)
chr6 (126-280)||(30031380-30031535)
chr6 (154-283)||(10098896-10099023)
chr6 (131-222)||(6055832-6055924)
chr6 (108-283)||(12133902-12134077)
chr6 (172-283)||(3206459-3206570)
chr6 (152-266)||(655411-655525)
chr6 (126-283)||(32756045-32756203)
chr6 (166-283)||(31818996-31819113)
chr6 (159-283)||(5897615-5897739)
chr6 (156-240)||(14389204-14389288)
chr6 (155-282)||(608315-608442)
chr6 (126-194)||(1747730-1747799)
chr6 (154-283)||(30679549-30679678)
chr6 (210-283)||(33730175-33730247)
chr6 (126-282)||(33997545-33997702)
chr6 (131-193)||(1681611-1681674)
chr6 (196-283)||(5258148-5258235)
chr6 (40-188)||(32913356-32913506)
chr6 (230-287)||(1615219-1615276)
chr6 (174-283)||(9568872-9568980)
chr6 (126-194)||(10617323-10617392)
chr6 (28-224)||(25493909-25494106)
chr6 (103-215)||(28026895-28027008)
chr6 (131-190)||(7080469-7080529)
chr6 (216-284)||(18130813-18130881)
chr6 (363-398)||(1206154-1206189)
chr6 (42-97)||(7150508-7150563)
chr6 (92-206)||(31831936-31832051)
chr6 (152-267)||(34560387-34560502)
chr6 (178-236)||(12222187-12222245)
chr6 (198-283)||(34939296-34939382)
chr6 (25-82)||(306337-306394)
chr6 (198-283)||(4245872-4245957)
chr6 (32-236)||(26291811-26292012)
chr6 (139-194)||(38900-38956)
chr6 (154-222)||(1748006-1748074)
chr6 (176-240)||(3210551-3210615)
chr6 (87-182)||(4948405-4948501)
chr6 (87-182)||(4955376-4955472)
chr6 (208-280)||(21089604-21089676)
chr6 (216-284)||(23888477-23888545)
chr6 (198-266)||(32097934-32098002)
[»] chr4 (152 HSPs)
chr4 (40-283)||(13805265-13805509)
chr4 (87-283)||(28351644-28351841)
chr4 (117-283)||(53540405-53540572)
chr4 (103-283)||(35690372-35690553)
chr4 (41-283)||(2557671-2557916)
chr4 (32-283)||(51421760-51422012)
chr4 (87-272)||(39708518-39708704)
chr4 (162-283)||(55007907-55008028)
chr4 (87-282)||(26037506-26037702)
chr4 (126-283)||(31959814-31959972)
chr4 (126-283)||(48174093-48174251)
chr4 (29-225)||(50662414-50662612)
chr4 (29-225)||(50680766-50680964)
chr4 (159-283)||(25574982-25575106)
chr4 (132-283)||(45204840-45204991)
chr4 (155-282)||(26024851-26024978)
chr4 (90-283)||(37488179-37488373)
chr4 (135-286)||(23906294-23906446)
chr4 (172-283)||(28236353-28236464)
chr4 (126-283)||(436353-436511)
chr4 (157-283)||(5306452-5306578)
chr4 (126-283)||(52569515-52569673)
chr4 (126-283)||(56375414-56375572)
chr4 (87-263)||(34233044-34233221)
chr4 (87-283)||(39100536-39100733)
chr4 (32-225)||(21107018-21107216)
chr4 (126-284)||(49987532-49987691)
chr4 (126-283)||(1777017-1777175)
chr4 (126-267)||(4440977-4441119)
chr4 (126-283)||(8286563-8286721)
chr4 (87-220)||(21945701-21945835)
chr4 (154-240)||(30621244-30621330)
chr4 (158-280)||(31459151-31459273)
chr4 (87-267)||(47147458-47147637)
chr4 (126-283)||(47265195-47265353)
chr4 (174-283)||(34208269-34208378)
chr4 (152-280)||(37042667-37042795)
chr4 (33-282)||(53518325-53518571)
chr4 (161-281)||(55388213-55388333)
chr4 (126-283)||(21236982-21237140)
chr4 (126-283)||(53707918-53708076)
chr4 (131-283)||(6957727-6957880)
chr4 (131-283)||(12494792-12494945)
chr4 (153-238)||(31043224-31043309)
chr4 (155-283)||(21528442-21528570)
chr4 (152-284)||(28550454-28550586)
chr4 (29-153)||(29398845-29398969)
chr4 (40-283)||(40932924-40933159)
chr4 (126-284)||(48622542-48622701)
chr4 (198-283)||(25427862-25427947)
chr4 (30-222)||(47611755-47611948)
chr4 (131-278)||(7947066-7947214)
chr4 (87-194)||(25967350-25967458)
chr4 (126-285)||(31403032-31403192)
chr4 (87-193)||(26356704-26356811)
chr4 (87-240)||(7681953-7682107)
chr4 (137-194)||(10209171-10209229)
chr4 (173-283)||(19154863-19154973)
chr4 (172-286)||(27450177-27450290)
chr4 (126-283)||(33190848-33191006)
chr4 (126-283)||(46582826-46582983)
chr4 (125-206)||(55809067-55809149)
chr4 (198-283)||(50854-50939)
chr4 (135-271)||(8598953-8599090)
chr4 (40-113)||(28497527-28497600)
chr4 (126-285)||(20591304-20591463)
chr4 (176-280)||(31339699-31339803)
chr4 (155-283)||(32479192-32479320)
chr4 (220-283)||(46715266-46715330)
chr4 (179-283)||(51438623-51438727)
chr4 (152-283)||(2589223-2589354)
chr4 (184-283)||(19969364-19969463)
chr4 (184-283)||(20601652-20601751)
chr4 (172-283)||(26510559-26510669)
chr4 (159-234)||(27049226-27049301)
chr4 (228-283)||(30634106-30634161)
chr4 (45-283)||(31961266-31961505)
chr4 (197-280)||(38841607-38841690)
chr4 (126-283)||(44719361-44719522)
chr4 (208-283)||(45209205-45209280)
chr4 (208-282)||(3979127-3979201)
chr4 (201-283)||(19061935-19062017)
chr4 (179-285)||(29209173-29209279)
chr4 (181-283)||(29398984-29399086)
chr4 (89-194)||(31897517-31897623)
chr4 (209-279)||(36255526-36255596)
chr4 (179-285)||(36799655-36799761)
chr4 (169-283)||(37798019-37798133)
chr4 (126-283)||(42293265-42293423)
chr4 (40-225)||(42639078-42639264)
chr4 (41-194)||(46372063-46372217)
chr4 (92-265)||(55579122-55579295)
chr4 (154-260)||(56439594-56439700)
chr4 (198-283)||(12443292-12443377)
chr4 (103-271)||(18966706-18966875)
chr4 (350-403)||(24001543-24001596)
chr4 (126-218)||(26024984-26025077)
chr4 (252-285)||(29182686-29182719)
chr4 (41-169)||(35555761-35555890)
chr4 (233-286)||(47372936-47372989)
chr4 (230-283)||(50238615-50238668)
chr4 (230-283)||(50238701-50238754)
chr4 (87-136)||(56439744-56439793)
chr4 (151-277)||(7544537-7544655)
chr4 (216-280)||(15661875-15661939)
chr4 (40-285)||(21879145-21879397)
chr4 (107-170)||(48033190-48033254)
chr4 (126-217)||(50679628-50679720)
chr4 (159-267)||(56225226-56225334)
chr4 (198-281)||(1095642-1095725)
chr4 (228-283)||(15665328-15665383)
chr4 (87-240)||(20105561-20105716)
chr4 (32-151)||(31339566-31339684)
chr4 (40-107)||(45176044-45176111)
chr4 (231-286)||(50471757-50471812)
chr4 (41-279)||(54470246-54470485)
chr4 (229-283)||(1211392-1211446)
chr4 (181-283)||(16875752-16875854)
chr4 (29-79)||(28236210-28236260)
chr4 (175-249)||(30480297-30480371)
chr4 (169-283)||(33227377-33227491)
chr4 (29-194)||(33709951-33710117)
chr4 (161-283)||(41192221-41192343)
chr4 (126-283)||(43434048-43434206)
chr4 (159-241)||(44384988-44385070)
chr4 (233-283)||(46153940-46153990)
chr4 (92-265)||(47372741-47372915)
chr4 (350-388)||(50830702-50830740)
chr4 (228-278)||(50862858-50862908)
chr4 (157-215)||(52360012-52360070)
chr4 (227-285)||(54529644-54529702)
chr4 (165-263)||(54935313-54935411)
chr4 (126-194)||(934520-934588)
chr4 (216-285)||(28348272-28348341)
chr4 (350-399)||(31901198-31901247)
chr4 (350-399)||(31965062-31965111)
chr4 (152-185)||(33225931-33225964)
chr4 (126-277)||(44860957-44861107)
chr4 (126-194)||(45569098-45569167)
chr4 (231-284)||(49686923-49686976)
chr4 (231-284)||(49738549-49738602)
chr4 (230-283)||(49939734-49939787)
chr4 (112-188)||(53517640-53517717)
chr4 (198-283)||(54963648-54963732)
chr4 (351-403)||(8008560-8008611)
chr4 (154-194)||(29182605-29182645)
chr4 (177-225)||(34379579-34379627)
chr4 (245-285)||(49416951-49416991)
chr4 (91-194)||(51009200-51009304)
chr4 (251-283)||(51051455-51051487)
chr4 (196-284)||(51811279-51811365)
chr4 (235-283)||(56130404-56130452)
[»] scaffold1318 (1 HSPs)
scaffold1318 (154-283)||(484-613)
[»] scaffold0050 (1 HSPs)
scaffold0050 (126-283)||(58226-58384)
[»] scaffold0570 (1 HSPs)
scaffold0570 (126-283)||(948-1106)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (155-285)||(16732-16862)
[»] scaffold0024 (2 HSPs)
scaffold0024 (126-284)||(82843-83001)
scaffold0024 (197-264)||(48135-48202)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (153-282)||(160325-160454)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (131-283)||(25532-25685)
[»] scaffold0018 (3 HSPs)
scaffold0018 (154-283)||(31621-31750)
scaffold0018 (109-196)||(178507-178595)
scaffold0018 (31-123)||(44029-44121)
[»] scaffold0491 (2 HSPs)
scaffold0491 (70-265)||(3846-4041)
scaffold0491 (228-277)||(3664-3713)
[»] scaffold0392 (1 HSPs)
scaffold0392 (198-272)||(6783-6857)
[»] scaffold0325 (1 HSPs)
scaffold0325 (89-188)||(11884-11984)
[»] scaffold0199 (1 HSPs)
scaffold0199 (151-283)||(14733-14865)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (152-283)||(4787-4918)
[»] scaffold0168 (1 HSPs)
scaffold0168 (196-283)||(28889-28976)
[»] scaffold1858 (1 HSPs)
scaffold1858 (182-272)||(887-976)
[»] scaffold0245 (1 HSPs)
scaffold0245 (196-281)||(16438-16523)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (190-283)||(86609-86702)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (231-283)||(163194-163246)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 142)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 176 - 407
Target Start/End: Original strand, 11584172 - 11584406
Alignment:
Q  176 tagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgatt 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11584172 tagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgatt 11584271  T
Q  276 gt---tgttgtataaatgttaaaaagtcccacaatagatgagatatggcctgaccatgttctcacctttcaaattgattttgttaggttgagttaggtcc 372  Q
    ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  11584272 gttgttgttgtataaatgttaaaaagtcccacaatagatgagatatggcctgaccatgttctcacctttcaaatcgattttgttaggctgagttaggtcc 11584371  T
Q  373 aacccaaattctaatatggtatcagagtctaccca 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11584372 aacccaaattctaatatggtatcagagtctaccca 11584406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 3 - 130
Target Start/End: Original strand, 11584044 - 11584171
Alignment:
Q  3 agcagagatgaggatgttgcgtagatgtggaaaataagcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatat 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11584044 agcagagatgaggatgttgcgtagatgtggaaaataagcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagtttctacaataaggagagtagatat 11584143  T
Q  103 gatggaggatagttagatcacatgaggc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11584144 gatggaggatagttagatcacatgaggc 11584171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 29 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 32404781 - 32404542
Alignment:
Q  29 gtggaaaataagcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgag 128  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  ||||  ||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||| |||    
T  32404781 gtggaaaataggcttaggtggtttggatatgtagagagaagacctgtagattctatagtaaggagagtagagaagatggaggatagtcatatcacaagag 32404682  T
Q  129 gcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggta 227  Q
    | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||  | ||||| ||||| ||||||| ||||| ||||      
T  32404681 gtagaggaagacctacaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagagattaatgagttaaatccaaacatggtttatgatataacataatggcg 32404582  T
Q  228 taatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataag 267  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  32404581 taatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 32404542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 29 - 283
Target Start/End: Original strand, 8796236 - 8796491
Alignment:
Q  29 gtggaaaataagcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgag 128  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| |||||  ||| ||||| ||||| ||    | ||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||  |||    
T  8796236 gtggaaaataggtttaggtggtttggacatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcggatggaggatagtcagatcactagag 8796335  T
Q  129 gcagaggaagacctataaaaactt-aagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggta 227  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||   ||||||||| ||||||| ||||||||||      
T  8796336 gcagaggaagaccaataaaaactttaagagaaactattaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcg 8796435  T
Q  228 taatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  8796436 taatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 8796491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 29 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 48431661 - 48431399
Alignment:
Q  29 gtggaaaataagcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgag 128  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |  | ||| |||||| |||  |||||||||||||  ||| ||| |||    
T  48431661 gtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacttgtagattttgtagtaaagagagttgatcagatggaggatagtcggattacaagag 48431562  T
Q  129 gcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagat-------taatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacat 220  Q
    | ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||       |||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  48431561 gtagaggaagacccaaaaaaactataagagaaactattaagaaagatttagagatttatgaataatgagttggatccaaatatggtttgtgataaaacat 48431462  T
Q  221 tatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
     ||||  ||||||||||| | || | ||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  48431461 catggcttaatttgatccttgtagctgaccccacttagtaggataaggcttggttgttgttgt 48431399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 40 - 267
Target Start/End: Original strand, 40416409 - 40416637
Alignment:
Q  40 gcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaaga 139  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||| ||||  |||||||| |  | ||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||   || |||| |||||    
T  40416409 gcttaggtggtttaggcatgtagagagaagaactgtagattttgtagtaaggagagtagatcagatgcaggatagtcagatcaccaaagacagaagaaga 40416508  T
Q  140 cctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatcc 238  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  40416509 cctagaaaaactataagacaaactattaagaaagatctatagattaatgagttggatcgaaatatggtttatgatagaacattatggtgtaatgtgatcc 40416608  T
Q  239 atctaaccgactccacttagtgggataag 267  Q
     | || ||||| |||||||||||| ||||    
T  40416609 ctttagccgaccccacttagtgggttaag 40416637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 52561841 - 52561590
Alignment:
Q  32 gaaaataagcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggca 131  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||  ||| |||||   |||||  | || || | |||||||||  ||||||||| |||||||| | | |||| |    
T  52561841 gaaaataggcttaggtggtttcggcatgtagagagaagaccgatagatgttgcagtacgaagagtagatcagatggaggagagttagattagaagaggta 52561742  T
Q  132 gaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataa 230  Q
    ||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |  | || ||||||||||   ||    
T  52561741 gaggaagacttagaaaaactataagagaaactgttaggaaagatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttcgggtagaacattatggcgaaa 52561642  T
Q  231 tttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttg 282  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  52561641 tttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 52561590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 125 - 283
Target Start/End: Original strand, 41560352 - 41560511
Alignment:
Q  125 tgaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattat 223  Q
    ||||| ||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||| ||   |||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  41560352 tgaggtagaagaagacctagaaaagctataagagaaactattaggatacatttagagattaatgagttggatccaaatatgggttatgatagaacattat 41560451  T
Q  224 ggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||  ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  41560452 ggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 41560511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 41 - 286
Target Start/End: Original strand, 2544638 - 2544878
Alignment:
Q  41 cttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagac 140  Q
    |||||||||||||| |||||  ||| ||||| | ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||||| | | |||  |||| ||||||||||    
T  2544638 cttaggtggtttggacatgtagagagaagacctatagattctatagtaaggagagtagatcagatggaggatagtcaaa-cactagaggtagaggaagac 2544736  T
Q  141 ctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatcca 239  Q
    ||| ||||||| | ||||||||||| |     ||||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  2544737 ctagaaaaactatcagagaaactataa-----gatttggaaatcaatgagttggagcgaaatatggtttataatagaacattatggcataatttgatcca 2544831  T
Q  240 tctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgtata 286  Q
    | || ||||| ||||||||||| | ||| |||| |||||||||||||    
T  2544832 tgtagccgaccccacttagtggtaaaaggcttggttgttgttgtata 2544878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 84 - 283
Target Start/End: Original strand, 6025687 - 6025887
Alignment:
Q  84 caataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagat 182  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||| |||| | |||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||| || ||| |||||||    
T  6025687 caataaggagagtagatcagatgtagggtagtcaaatcactagaggcagaggaagacctagaaaaactataagagatactagtaaaaaagatctagagat 6025786  T
Q  183 taatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttg 282  Q
    |||||| |||||   ||||||||| | ||||| ||||| ||||  | ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||    
T  6025787 taatgagttggatagaaatatggtatctgatagaacatgatggcgtcatttgatccatgtagccgattccacttagtgggataatacttggttgtttttg 6025886  T
Q  283 t 283  Q
    |    
T  6025887 t 6025887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 87 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 25979428 - 25979231
Alignment:
Q  87 taaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaa 185  Q
    ||||||||||||||   |||||||| ||| || | | | |||| ||||||||||| || |||||| | |||||||| ||||  |||||||||||| | ||    
T  25979428 taaggagagtagatcgaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacccatgaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaa 25979329  T
Q  186 tgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||  | ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  25979328 tgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 25979231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 126 - 285
Target Start/End: Original strand, 52921204 - 52921364
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||| |||||||||||||  |||||| | |||||||| ||||  |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||     
T  52921204 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgaattggatccaaatatggtttatgatagaacactatt 52921303  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgtat 285  Q
    |  | ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  52921304 gcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtat 52921364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 41 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 3819099 - 3818856
Alignment:
Q  41 cttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagac 140  Q
    |||| |||||||||||||||  | | ||||||||| ||||||  | ||| ||||||||||  |||||||| || | | | |||  |||  ||||||||||    
T  3819099 cttaagtggtttgggcatgtagaaagaagacttgtggattctctagtaaagagagtagatcagatggagggtaatcaaaccactagagaaagaggaagac 3819000  T
Q  141 ctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatcca 239  Q
    ||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |   ||||||||| ||||||  |||||||||     ||||||||||    
T  3818999 cttgaaaaactataagagaaactattaagaaagatttagagattaatgagttgaatagaaatatggtttatgatggaacattatgtcgccatttgatcca 3818900  T
Q  240 tctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    | || |||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||    
T  3818899 tgtagccgactgcacttagtgggataaggcttggtcgttgttgt 3818856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 176 - 283
Target Start/End: Original strand, 34444531 - 34444638
Alignment:
Q  176 tagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgatt 275  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||    
T  34444531 tagagattaatgagttggatccaaatatggtttataataaaacattatggtgtaatttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggtt 34444630  T
Q  276 gttgttgt 283  Q
    ||||||||    
T  34444631 gttgttgt 34444638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 67 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 33561075 - 33560857
Alignment:
Q  67 aagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactatt 165  Q
    ||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||  ||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||    
T  33561075 aagacctgtagattctgtagtaaggagagtagatatgatggagggtagtcaaatcactagaggcagaggaagtcctagaaaaactgtaagggaaactatt 33560976  T
Q  166 aagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggata 265  Q
    ||| | ||| |||||||||  || |||||   ||||||||| ||| | | |||||||||  ||  |||||||||| || || || | |||||||||||||    
T  33560975 aagtaagatctagagattagcgagttggatataaatatggtatatcagagaacattatgacattgtttgatccatgtagccaaccctacttagtgggata 33560876  T
Q  266 agacttgattgttgttgta 284  Q
    || ||||  ||||||||||    
T  33560875 aggcttggctgttgttgta 33560857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 103 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 36339984 - 36339803
Alignment:
Q  103 gatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaat 201  Q
    |||||||||||  ||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| || |||||||| ||||||  |||     
T  36339984 gatggaggatacctagatcactagaggtagaggaagacctagaaaaactatcagagaaactattaggaaagattt-gaaattaatgagttggacagaaac 36339886  T
Q  202 atggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgta 284  Q
    |||||  ||||||||||||||||   ||||||||||||| || | ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||    
T  36339885 atggttaatgataaaacattatgaagtaatttgatccatgtagctgactccacttagtgggaaaatgcttggttgttgttgta 36339803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 126 - 283
Target Start/End: Original strand, 39318253 - 39318410
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||| |||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||  |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  39318253 gaggtagaggaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatg 39318352  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |  ||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  39318353 gcgtaatttgatccatgtagccgac-ccgcttagtgggataaggcttgtttgttgttgt 39318410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 158 - 283
Target Start/End: Original strand, 19936617 - 19936742
Alignment:
Q  158 aaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccactta 257  Q
    ||||||||| ||| ||||||||  ||||||| || || |||||||||||  |||||| ||||||| ||  ||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  19936617 aaactattaggaaagatttagatgttaatgagttagatccaaatatggttaatgatagaacattacggcgtaatttgatccatgtagccgactccgctta 19936716  T
Q  258 gtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  19936717 gtgggataagacttgattgttgttgt 19936742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 103 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 38807852 - 38807671
Alignment:
Q  103 gatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaat 201  Q
    ||||||||| ||| |||||| | |||  || ||||||||||  |||||| |||||||||| ||||  |||||||||||| | || || ||||| ||||||    
T  38807852 gatggaggagagtcagatcaaaagagctaggggaagacctaagaaaactataagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaacgagttggatccaaat 38807753  T
Q  202 atggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||  ||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  38807752 atggtttatgatagaacactatggcgtaatttgttccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 38807671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 40 - 263
Target Start/End: Original strand, 38868920 - 38869144
Alignment:
Q  40 gcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaaga 139  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| || ||| |||||||||  |   ||||||||||||  |||||||| |||| | ||||   |||||||| |||||    
T  38868920 gcttaggtggtttgggcatgtagagagaacactagtagattctctagcgaggagagtagattagatggagggtagtcaaatcattagaggcagaagaaga 38869019  T
Q  140 cctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatcc 238  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||  |||||   | ||||||| ||||||| ||||||||||  |  ||||||||    
T  38869020 cctagaaaaactataagagaaattattaagaaagatctagcgattaatgggttggatagatatatggtatatgatagaacattatggcgtcgtttgatcc 38869119  T
Q  239 atctaaccgactccacttagtggga 263  Q
    || || ||||| |||||||||||||    
T  38869120 atgtagccgaccccacttagtggga 38869144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 152 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 52532747 - 52532619
Alignment:
Q  152 taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactc 251  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||| || ||||| |    
T  52532747 taagagaaactattaggaaagatttagaaattaatgagttggaacaaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgattcatgtagccgaccc 52532648  T
Q  252 cacttagtgggataagacttgattgttgt 280  Q
    |||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  52532647 cacttagtgggaaaaggcttggttgttgt 52532619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 126 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 49347551 - 49347392
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||| |||||||||||||  |||||| | |||||||| ||||  |||||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||| ||||||| |||| ||||    
T  49347551 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatg 49347452  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgta 284  Q
    |  | ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  49347451 gcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgta 49347392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 126 - 283
Target Start/End: Original strand, 1210869 - 1211027
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||| |||||||||||||  |||||| | |||||||| ||||  |||||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||| ||||||| |||| ||||    
T  1210869 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatg 1210968  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |  | ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  1210969 gcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 1211027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 126 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 30202288 - 30202130
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||| |||||||||||||  |||||| | |||||||| ||||  |||||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||| ||||||| |||| ||||    
T  30202288 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatg 30202189  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |  | ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  30202188 gcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 30202130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 152 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 8676996 - 8676869
Alignment:
Q  152 taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaata---tggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccga 248  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||||   |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  8676996 taagagaaactattaaaaaagatttagagattaatgagttggaccgaaatatggtggtctatgatagaatattatggcataatttgatccatgtagccga 8676897  T
Q  249 ctccacttagtgggataagacttgattg 276  Q
    ||||  |||||||| ||||  |||||||    
T  8676896 ctccggttagtgggttaaggattgattg 8676869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 191 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 28090786 - 28090694
Alignment:
Q  191 tggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28090786 tggatccaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgt 28090694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 86 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 29577340 - 29577161
Alignment:
Q  86 ataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagatta 184  Q
    ||||||||| |||||  |||||| |||||| |||||||  |||| ||||||||||||| |||||||  || | ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  29577340 ataaggagattagatcagatggaagatagtaagatcactagaggtagaggaagacctagaaaaactacaacataaactattaagaaagatctagagatta 29577241  T
Q  185 atgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggata 265  Q
    ||||  |||| | ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||  | ||| || || || |||||||||||||||    
T  29577240 atgagctggatcaaaatatggt-tatgatagaacattatggcataatttatttcatgtagccaaccccacttagtgggata 29577161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 159 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 43375722 - 43375598
Alignment:
Q  159 aactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttag 258  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||| |||||||||  |||||||||||||| || || |  ||||||||    
T  43375722 aactattaagaaagatttagagattaatgagttggaccgaaatatggttcatgatagaacattatgacataatttgatccatgtagccaatcccacttag 43375623  T
Q  259 tgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||||   ||| ||||||||||    
T  43375622 tgggataaagattggttgttgttgt 43375598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 112 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 28511973 - 28511797
Alignment:
Q  112 tagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctat 210  Q
    |||| |||||||  ||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||| || || ||| || || ||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||    
T  28511973 tagtcagatcactagaggcagagaaagacctagaaaaactattagagaaattactaggaaagacttggagattaatgagttggaccaaaacatggtttat 28511874  T
Q  211 gataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtggg----ataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||| || || ||||| ||||||||||||    |||||||||| ||||||||||    
T  28511873 gatagaacattatggcgtaatttgatcaatgtagccgaccccacttagtgggatacataagacttggttgttgttgt 28511797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 126 - 283
Target Start/End: Original strand, 4029246 - 4029404
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||| |||||||||||||  |||||| | |||||||| ||||  ||||||||| || | ||||| ||||| |||||| |||| ||||||| |||| ||||    
T  4029246 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttaaaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatataacactatg 4029345  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4029346 gcgacatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgt 4029404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 138 - 282
Target Start/End: Original strand, 29128919 - 29129065
Alignment:
Q  138 gacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgat 236  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||  | ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  29128919 gacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagaggttaacaagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggtgtaatatgat 29129018  T
Q  237 -ccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttg 282  Q
     |||| || ||||| |||||||||| |||||| |||| || ||||||    
T  29129019 cccatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttggtttttgttg 29129065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 32 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 32231206 - 32230996
Alignment:
Q  32 gaaaataagcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggca 131  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |    ||||| |||||||||   |||||||| ||| |  | | | |||| |    
T  32231206 gaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacttgtagatgccgtcataagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggta 32231107  T
Q  132 gaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataa 230  Q
    ||||||||||||  |||||| | |||||||| ||||  |||||||||||| | ||||| ||||| |||||  |||||||||||| |||| |||||| |||    
T  32231106 gaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaagttggtctatgatagaacactatggtgtaa 32231007  T
Q  231 tttgatccatc 241  Q
    |||||||||||    
T  32231006 tttgatccatc 32230996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 126 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 51440923 - 51440765
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||| |||||||||||||  |||||| | |||||||| ||||  ||||||||| || | ||||| ||||| |||||| |||| ||||||| |||| || |    
T  51440923 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttataggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactacg 51440824  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |  | ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51440823 gcgtcatttgattcatgtaaccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgt 51440765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 92 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 9599586 - 9599437
Alignment:
Q  92 agagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaactt-aagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaat 190  Q
    |||||||||  ||||||||| ||| |||||| | |||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||  |||||||| ||||||| |    
T  9599586 agagtagatcagatggaggagagtcagatcataagaggtagaggaagacctagaaaaactacaagagaaactattaggaaatatttagagtttaatgagt 9599487  T
Q  191 tggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccat 240  Q
    | || ||| ||||||| ||||||| ||| ||||||  |||||||||||||    
T  9599486 ttgatccagatatggtttatgatagaacgttatggcgtaatttgatccat 9599437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 40 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 10569311 - 10569071
Alignment:
Q  40 gcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaaga 139  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||  | || |||| ||||||  |||||||| || | | |||||  |||||||||||| |    
T  10569311 gcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacctgtagattctgtagtacggagggtagattagatggagggtaatcaaatcactagaggcagaggaaca 10569212  T
Q  140 cctataaaaacttaagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatcca 239  Q
    |  | ||||   ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||||   |||||| || ||||||| ||||||||  ||| ||||||||||    
T  10569211 caaaaaaaa---taaaagaaactattaagaaagatctagagattaataagctggatagaaatatcgtatatgatagaacattataatatcatttgatcca 10569115  T
Q  240 tctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    | || |||  ||||||||  |||||||| |||| ||||||||||    
T  10569114 tgtagccggttccacttaaagggataaggcttggttgttgttgt 10569071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 177 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 25715432 - 25715324
Alignment:
Q  177 agagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattg 276  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||| || |||||||  ||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||| |||| |||    
T  25715432 agagattaatgagttgaaccgaaatatggtttatgatagaatattatggcgtaatttgatccatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttggttg 25715333  T
Q  277 ttgttgtat 285  Q
    |||||||||    
T  25715332 ttgttgtat 25715324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 126 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 37463033 - 37462878
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||| ||||||  ||||| ||||||| |||||||||| || | ||| ||||||||| ||||||| || || | ||||||||| ||| ||| |||||||||    
T  37463033 gaggtagaggattacctagaaaaactataagagaaacgatcaggaatgatttagaggttaatgagtttgatc-aaatatggtttatcatagaacattatg 37462935  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgtt 281  Q
    |  ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  37462934 gcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 37462878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 89 - 283
Target Start/End: Original strand, 50846652 - 50846844
Alignment:
Q  89 aggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaacttaagagaaactattaagaaggatttagagattaatga 188  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| | | |||||  ||||||||||||||| |  ||| |  | ||||||||||||  ||| ||||| || ||||| ||    
T  50846652 aggagagtagatcagatggaggataatcatatcactagaggcagaggaagacttggaaata--tcagagaaactatttggaaagatttggaaattaacga 50846749  T
Q  189 attggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
     ||| ||| |||||| || ||||||| |||||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||| ||  |||| ||||||||||    
T  50846750 gttgaaccaaaatatagtttatgatagaacattatggcataatttgatctatgtagccgacaccacttagtgggaaaatgcttggttgttgttgt 50846844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 169 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 4707334 - 4707221
Alignment:
Q  169 aaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataaga 268  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| |||||| |||| ||||||| |||| |||||  ||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||     
T  4707334 aaggatttagaggttaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtaatttgat-catgtagccgaccccacttagtgggataagg 4707236  T
Q  269 cttgattgttgttgt 283  Q
    |||| ||||||||||    
T  4707235 cttggttgttgttgt 4707221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 126 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 34792507 - 34792349
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||| |||||||||||||  |||||| | |||||||| ||||  ||||||||| || | ||||| ||||| |||||| |||| ||||||| |||| ||||    
T  34792507 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttaaaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatg 34792408  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |  | ||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  34792407 gcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatgggataaggcttggttgttgttgt 34792349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 152 - 282
Target Start/End: Original strand, 52292191 - 52292320
Alignment:
Q  152 taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactc 251  Q
    ||||||||||||||| ||| || || ||||||||||| ||||||| || ||| || ||||||| || ||||| |  ||||||||||||| ||||| || |    
T  52292191 taagagaaactattaggaaagacttggagattaatgagttggacc-aattattgtttatgatagaaaattattgagtaatttgatccatgtaaccaaccc 52292289  T
Q  252 cacttagtgggataagacttgattgttgttg 282  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  52292290 cacttagtgggataaggcttggttgttgttg 52292320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 29 - 283
Target Start/End: Original strand, 5338751 - 5338995
Alignment:
Q  29 gtggaaaataagcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgag 128  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||   ||| ||||| ||||||| ||  | ||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||  |||    
T  5338751 gtggaaactgagcttaggtggtttgggcatgcagagagaagacctgtagatgctttagtaaggagagtagatcagatggaggatattcagatcactagag 5338850  T
Q  129 gcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggta 227  Q
    ||||| | ||||||| ||||||| |||||||||           ||| ||||||||||||| ||||| | |||| || | ||| ||| ||||||||||      
T  5338851 gcagaagtagacctagaaaaactataagagaaa-----------gatctagagattaatgagttggatcgaaatgtgatttattatagaacattatggcg 5338939  T
Q  228 taatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||||||||| || || ||  ||||||||| |||||| || | ||||||||||    
T  5338940 taatttgatccatgtagccaacctcacttagtgagataaggctcggttgttgttgt 5338995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 154 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 10200435 - 10200306
Alignment:
Q  154 agagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactcca 253  Q
    ||||| |||||||  || |||||||||||  |||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| || |||||  ||    
T  10200435 agagagactattagaaaagatttagagatcgatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacatcatggtgtaatttgatccatgtagccgacctca 10200336  T
Q  254 cttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |||| ||||||||  |||| ||||||||||    
T  10200335 cttaatgggataatgcttggttgttgttgt 10200306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 131 - 283
Target Start/End: Original strand, 22090225 - 22090378
Alignment:
Q  131 agaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtata 229  Q
    |||||||||||||  |||||| | |||||||| ||||  |||||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||| ||||||| |||| ||||   |     
T  22090225 agaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgtc 22090324  T
Q  230 atttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  22090325 atttgatccatgtagccgaccccactaagtgggataaggcttggttgttgttgt 22090378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 197 - 282
Target Start/End: Original strand, 22175341 - 22175426
Alignment:
Q  197 caaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttg 282  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  22175341 caaatatggtttatgatagaacattatggtagaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttggtgttg 22175426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 174 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 19908144 - 19908040
Alignment:
Q  174 tttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttga 273  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||  |||||||| |  |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  19908144 tttagagattaatgagttggattcaaatatggtttatgattgaacattattgcgtaattttatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttga 19908045  T
Q  274 ttgtt 278  Q
    |||||    
T  19908044 ttgtt 19908040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 145 - 280
Target Start/End: Original strand, 39140659 - 39140794
Alignment:
Q  145 aaaaacttaagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaa 244  Q
    ||||| ||| |||||||||||| |||  |||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| |  |||| ||||||||||  ||||||||| ||| ||     
T  39140659 aaaaagttatgagaaactattaggaaaaatttagaggttaattagttggatccaaatatggtttcagatagaacattatggcgtaatttgattcatgtag 39140758  T
Q  245 ccgactccacttagtgggataagacttgattgttgt 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  39140759 ccgaccccacttagtgggataatgcttggttgttgt 39140794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 190 - 285
Target Start/End: Original strand, 50257759 - 50257854
Alignment:
Q  190 ttggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgtat 285  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || || || |||||||||| |||||| |||  ||||||||||||    
T  50257759 ttggaccaaaatatggtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccaaccccacttagtgagataaggcttcgttgttgttgtat 50257854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 135 - 284
Target Start/End: Original strand, 50806802 - 50806950
Alignment:
Q  135 gaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataattt 233  Q
    ||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||  |||||   ||||||||| |||||||||||| |||||  |  |||    
T  50806802 gaagacctagaaaaacaataagagaaactatcaagaaggat--agagattaatgcgttggataaaaatatggtttatgataaaacactatggcgttgttt 50806899  T
Q  234 gatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgta 284  Q
    ||| ||| |||||||| ||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  50806900 gattcatgtaaccgaccccatttagtggaataaggcttggttgttgttgta 50806950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 126 - 283
Target Start/End: Original strand, 8672042 - 8672200
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||| |||||||||||||  |||||| | |||||||| ||||  |||||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||| ||||||| |||| |||     
T  8672042 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactata 8672141  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |  | ||||||||||| || || || ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  8672142 gcgtcatttgatccatatagccaaccccacttagtaggataaggcttggttgttgttgt 8672200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 126 - 283
Target Start/End: Original strand, 51602180 - 51602338
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||| |||||||||||||  |||||| | ||| |||| ||||  | |||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||| ||||||| ||||| |||    
T  51602180 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagaaaaaccattagaagggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacatcatg 51602279  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |  | ||||||||||| || || || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  51602280 gcgtcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 51602338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 46 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 30834215 - 30834066
Alignment:
Q  46 gtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctata 145  Q
    ||||||||| | |||  ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||| | |||| | |||    |||| ||||||||||||| |    
T  30834215 gtggtttggtcgtgtagagagaagacttgcagattctataataaggagagtagatcagatggaaggtagtcaaatcgatagagggagaggaagacctaga 30834116  T
Q  146 aaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattgga 194  Q
    ||| || ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  30834115 aaagctataagagaaactattacgaaagatctagagattaatgagttgga 30834066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 158 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 4590657 - 4590533
Alignment:
Q  158 aaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccactta 257  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||   | ||||| | | ||||| |||| |||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  4590657 aaactattaagaaagatttatagattgatgagttggatagatatatgatatgtgatagaacaatatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccactta 4590558  T
Q  258 gtgggataagacttgattgttgttg 282  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||    
T  4590557 gtgggataaggtttggttgttgttg 4590533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 132 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 11941732 - 11941580
Alignment:
Q  132 gaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataa 230  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||  || ||||||||||||| ||| ||||| |  | |||||| ||||||||||||||||||  ||     
T  11941732 gaggaagacctagaaaaacaataagagaagctattagaaaagatttagagattattgagttggatcggagtatggtttatgataaaacattatggcgtat 11941633  T
Q  231 tttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |||||||||| ||  || |  |||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  11941632 tttgatccatgtagtcggcctcacttagtgggatacggcttggttgttgttgt 11941580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 181 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 35828664 - 35828560
Alignment:
Q  181 attaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgt 280  Q
    |||||||| |||||   ||||||||| || |||| |||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||||| |||||||    
T  35828664 attaatgagttggatggaaatatggtttacgatagaacattatggcaatatttgatccatgtaaccgaccccgcttagtgggaaaagacttggttgttgt 35828565  T
Q  281 tgtat 285  Q
    |||||    
T  35828564 tgtat 35828560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 155 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 37311883 - 37311755
Alignment:
Q  155 gagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccac 254  Q
    ||||||| ||||  || ||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||| | ||||| |||| |||||  | ||||||||||| || ||||| ||||    
T  37311883 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccac 37311784  T
Q  255 ttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  37311783 ttagtgggaaaaggcttggttgttgttgt 37311755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 184 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 40568509 - 40568409
Alignment:
Q  184 aatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| ||||||| || | |||||  ||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  40568509 aatgagttggaccaaaatatggtttatgatagaaaactatggcgtaatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 40568410  T
Q  284 a 284  Q
    |    
T  40568409 a 40568409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 198 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 21769796 - 21769709
Alignment:
Q  198 aaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgtat 285  Q
    ||||||||| | ||||| ||||||||||  ||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  21769796 aaatatggtttgtgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgtgataaggcttggttgttgttgtat 21769709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 196 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 44941863 - 44941776
Alignment:
Q  196 ccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |||||| |||| ||||||| |||| |||||  ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  44941863 ccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 44941776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 92 - 249
Target Start/End: Original strand, 9509408 - 9509566
Alignment:
Q  92 agagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaat 190  Q
    |||||||||  ||||||||| ||| | || | | |||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||| ||  |||||| |    
T  9509408 agagtagatcagatggaggagagtcatattagaagaggtagaggaagacctagaaaaactataagataaactattaggaaagatttacagcctaatgagt 9509507  T
Q  191 tggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgac 249  Q
    | || ||||||||||| ||||||  ||||||||||  ||||| ||||||| || |||||    
T  9509508 tagagccaaatatggtttatgattgaacattatggcgtaattcgatccatgtagccgac 9509566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 158 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 48865832 - 48865750
Alignment:
Q  158 aaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccat 240  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| || ||| ||||||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  48865832 aaactatcaagaaagatttagaggttaatgaattagatccagatatggtttatgatagaatattatggtgtaatttgatccat 48865750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 267
Target Start/End: Original strand, 7124270 - 7124407
Alignment:
Q  131 agaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtata 229  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||  |||||||||||||||   ||||||||| || |||| | ||||||||| |     
T  7124270 agaggaagatcaataaaaactataagagaaactattgagaaagatctattgattaatgaattggatagaaatatggtataggatagagcattatggtgtc 7124369  T
Q  230 atttgatccatctaaccgactccacttagtgggataag 267  Q
     |||||||||| || | |||  ||||||||||||||||    
T  7124370 gtttgatccatgtagctgacctcacttagtgggataag 7124407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 285
Target Start/End: Original strand, 42337751 - 42337840
Alignment:
Q  196 ccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgtat 285  Q
    |||||| |||| ||||||| |||| ||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  42337751 ccaaatttggtgtatgatagaacactatggcatcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtat 42337840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 155 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 4001583 - 4001455
Alignment:
Q  155 gagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccac 254  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||| | ||||| |||  ||||  || ||||||||||| || || || ||||    
T  4001583 gagaaaccattaaaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaaccctatgacatcatttgatccatgtagccaaccccac 4001484  T
Q  255 ttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  4001483 ttagtgggaaaaggcttggttgttgttgt 4001455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 155 - 283
Target Start/End: Original strand, 4415503 - 4415631
Alignment:
Q  155 gagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccac 254  Q
    ||||||| ||||  || ||||||||| | ||||| ||||| | ||||||| | | | ||| |||||||||| || ||||||||||| || |||||||||     
T  4415503 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatctaaatatgattttttatagaacattatggcatcatttgatccatgtagccgactccat 4415602  T
Q  255 ttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  4415603 ttagtggaaaaagacttggttgttgttgt 4415631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 7133429 - 7133302
Alignment:
Q  156 agaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccact 255  Q
    |||||||||||  || ||||| |  |||||||| ||||||| ||||| |||  |||||| |||||| |||  ||||||||||||| || | ||| |||||    
T  7133429 agaaactattagaaatgatttggtaattaatgagttggaccgaaatacggtgaatgatagaacattttggcctaatttgatccatgtagctgaccccact 7133330  T
Q  256 tagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  7133329 tagtgggaaaaggcttggttgttgttgt 7133302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 7762583 - 7762484
Alignment:
Q  138 gacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgat 236  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||  || ||||||||  ||||||| ||||| | ||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||    
T  7762583 gacctagaaaaactataagagaaactattagaaaagatttagatgttaatgagttggatctaaatatggtttataatagaacattatggtgtaatttgat 7762484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 194
Target Start/End: Original strand, 15577461 - 15577611
Alignment:
Q  42 ttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacc 141  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| ||||| ||  ||||||  | ||||||||||||||  ||||||   |||| | |||||  |||| ||||||||| |    
T  15577461 ttaggtggtttgagcatgtatagagaagacatgcggattctgtagtaaggagagtagatcagatgga---tagtcacatcactagaggtagaggaagatc 15577557  T
Q  142 tataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattgga 194  Q
    || |||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  15577558 taaaaaaataataagagaaactattaagaaggatatagagattaatgagttgga 15577611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 201 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 26113521 - 26113439
Alignment:
Q  201 tatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||| || ||||   |||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  26113521 tatggtttatgatagaacattatggcttaatttgatccatgtagccgagctcacttagtgggataagactacattgttgttgt 26113439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 41 - 194
Target Start/End: Original strand, 28528394 - 28528548
Alignment:
Q  41 cttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagac 140  Q
    |||||||||||| |||||||   || ||||||||| ||||||  | |||||| |||||||   |||||||  ||| | ||| |  || | || |||||||    
T  28528394 cttaggtggtttcggcatgtcgggagaagacttgtggattctgtagtaaggacagtagatcaaatggaggggagtcaaatccctagaagtaggggaagac 28528493  T
Q  141 ctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattgga 194  Q
    ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  28528494 ctaaaaaaactataacagaaactattaagaaggatctagagattaatgagttgga 28528548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 230 - 284
Target Start/End: Original strand, 28533696 - 28533750
Alignment:
Q  230 atttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgta 284  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28533696 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgta 28533750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 853943 - 853874
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattgga 194  Q
    |||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||    
T  853943 gaggcagaggaagacctaaaaaatctatacgagaaactattaagaaggatctagagattagtgagttgga 853874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 196 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 1290118 - 1290033
Alignment:
Q  196 ccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgtt 281  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||||| ||||| ||| ||||||| |||  ||||||||    
T  1290118 ccaaatatggtttatgatagaacattatggcataatttgatccatgtggccgaccccactcagttggataaggcttagttgttgtt 1290033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 283
Target Start/End: Original strand, 15086091 - 15086204
Alignment:
Q  170 aggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagac 269  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||| | | ||||| |||| ||||   | ||||||||||| || || || ||||||||||||||||| |    
T  15086091 aggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggc 15086190  T
Q  270 ttgattgttgttgt 283  Q
    ||| ||||||||||    
T  15086191 ttggttgttgttgt 15086204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 2694509 - 2694437
Alignment:
Q  193 gacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggata 265  Q
    |||| |||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||||||| || | ||| |||||||||||||||    
T  2694509 gaccaaaatatagtttatgatagaacattatggtatagtttgatccatttagcagaccccacttagtgggata 2694437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 19908542 - 19908382
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaactt-aagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||| |||||| | | |||  || |||||||||||||| || |||||  |||||||||| ||| ||| ||  ||||     
T  19908542 gaggcagaggtagacctagaaaaactttaagagacattgttagaaaagatttagagattaacgagttggattcaaatatggtttataatagaatcttatt 19908443  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgtat 285  Q
    |  || |||||||||| || | ||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||    
T  19908442 gcgtagtttgatccatgtacctgaccccacttagtgggataaggcttggtcgttgctgtat 19908382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 27072607 - 27072491
Alignment:
Q  163 attaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtggg 262  Q
    |||| ||| |||||||| ||||| || ||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||| || |||||    |||||||||    
T  27072607 attaggaaagatttagaaattaaagagttggacagaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccatgcttagtggg 27072508  T
Q  263 ataagacttgattgttg 279  Q
    | ||| |||| ||||||    
T  27072507 aaaaggcttggttgttg 27072491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 27520338 - 27520254
Alignment:
Q  152 taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgat 236  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||  |||| ||||||||| | ||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  27520338 taagagaaactattagaaaaaatttagagattaatgagctggatccaaatatgatttatgatagaacattatgatgtaatttgat 27520254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 27848057 - 27847795
Alignment:
Q  32 gaaaataagcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggca 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||| ||||||| ||  | || | |||||| ||  ||||||||| ||| || ||| | |||| |    
T  27848057 gaaaataagcttaggtggtttgggcatgcagagagaagacctgtagatgctgtagtatgaagagtatatcagatggaggagagtcagctcagaagaggta 27847958  T
Q  132 gaggaagacctataaaaact--taagagaaactatt----aagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatgg 225  Q
    ||||||||||| | |||| |  |||||||||||| |    ||||  ||||||||| ||||||| || |    ||||||||| ||||||  |||||||||     
T  27847957 gaggaagacctttgaaaaattataagagaaactactaccaaagatagatttagaggttaatgagtttggttgaaatatggtttatgatggaacattatgc 27847858  T
Q  226 tataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttg---attgttgttgtat 285  Q
      |||||| |||||| || ||||   |||||||||||||||| ||||   |||||||||||||    
T  27847857 cgtaattttatccatgtagccgatctcacttagtgggataaggcttggtcattgttgttgtat 27847795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 203 - 283
Target Start/End: Original strand, 29577454 - 29577534
Alignment:
Q  203 tggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |||| ||||||| |||| |||||  | ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  29577454 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 29577534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 333 - 396
Target Start/End: Original strand, 347107 - 347170
Alignment:
Q  333 ctcacctttcaaattgattttgttaggttgagttaggtccaacccaaattctaatatggtatca 396  Q
    |||||||| |||  || |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  347107 ctcaccttacaagctggttttgtaaggttgagttagggccaacccaaattctaatatgttatca 347170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 990709 - 990518
Alignment:
Q  34 aaataagcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcaga 133  Q
    ||||| ||| ||||||||| || |||| |||| ||||| | ||||||||  |  |||||||||||||  ||||||  ||||| |||||||   |||||||    
T  990709 aaataggctcaggtggtttaggtatgtaaagagaagacatatagattctgtagcaaggagagtagattagatggaatatagtcagatcactgtaggcaga 990610  T
Q  134 ggaag-acctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattat 223  Q
    ||||| || |   |||||| | |||||||||||| |||  ||| ||||||||||||| ||||| | | ||||||| ||||||| ||||||||    
T  990609 ggaagcacattggaaaactattagagaaactattgagatagatctagagattaatgagttggatcaacatatggtttatgatagaacattat 990518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 208 - 283
Target Start/End: Original strand, 1704834 - 1704909
Alignment:
Q  208 tatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||||||||||| |  | ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  1704834 tatgatagaacatcatggcataatttgatccatgttgctgaccccacttagtgtgataagacttggttgttgttgt 1704909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 283
Target Start/End: Original strand, 6084150 - 6084257
Alignment:
Q  176 tagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgatt 275  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||| |||| |||||  ||||||||||||| ||   ||   |||||||||||||||| |||| ||    
T  6084150 tagagattaatgagttggatcaaaatatggtttatgatagaacaatatggcgtaatttgatccatgtatttgatctcacttagtgggataaggcttggtt 6084249  T
Q  276 gttgttgt 283  Q
    ||| ||||    
T  6084250 gttattgt 6084257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 221 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 7210989 - 7210930
Alignment:
Q  221 tatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgt 280  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || | |||||||    
T  7210989 tatggcataatttgatccatgtaaccgaccccacttagtgggataagcctcggttgttgt 7210930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 126 - 220
Target Start/End: Original strand, 8628154 - 8628249
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacat 220  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| || | |||||| || || |||| |||||    
T  8628154 gaggtagaggaagacctagaaaaactataacagaaactattaggaaagatttagaggttaatgaatttgatcaaaatatagtttacgatagaacat 8628249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 44 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 13827810 - 13827703
Alignment:
Q  44 aggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagaccta 143  Q
    ||||||||||| |||||  ||| ||||  ||||||||||  | ||||||||||||||   |||||  ||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  13827810 aggtggtttggacatgtagagagaagaagtgtagattctgtagtaaggagagtagatcatatggaacatagtcagatcactagaggcagaggaagaccta 13827711  T
Q  144 taaaaact 151  Q
     |||||||    
T  13827710 gaaaaact 13827703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 228 - 283
Target Start/End: Original strand, 26299295 - 26299350
Alignment:
Q  228 taatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  26299295 taatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgctgttgt 26299350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 208 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 39123443 - 39123369
Alignment:
Q  208 tatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||||| || ||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  39123443 tatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgac-ccccttagtggtgtaagactcgattgttgttgt 39123369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 222
Target Start/End: Original strand, 42501194 - 42501329
Alignment:
Q  88 aaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaat 186  Q
    ||||||||||| |  |||||||| |||| | ||||   |||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||    
T  42501194 aaggagagtagttcagatggagggtagtcaaatcattagaggtagaggaaaacctagaaaaactataagagaaattattaagaaagatctatagattaat 42501293  T
Q  187 gaattggacccaaatatggtctatgataaaacatta 222  Q
    || |||||   ||||||||  ||||||| |||||||    
T  42501294 gagttggatagaaatatggaatatgatagaacatta 42501329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 228 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 43481853 - 43481798
Alignment:
Q  228 taatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  43481853 taatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 43481798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 196 - 283
Target Start/End: Original strand, 44751679 - 44751766
Alignment:
Q  196 ccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |||||| |||| ||||||| |||| |||||  | ||||||||||| || |||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  44751679 ccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 44751766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 8343034 - 8342885
Alignment:
Q  131 agaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtata 229  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||| |||||   |||||| || | ||||  |||||||||         
T  8343034 agaggaagacctagaaaaactataagagaaacaattaataaagatctagagattaatgagttggatagaaatatagtatttgatggaacattatg---ac 8342938  T
Q  230 atttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttg 282  Q
     ||||||| || || | ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8342937 gtttgatcaatgtatctgatcccacttagtgggataaggcttgattgttgttg 8342885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 12261956 - 12261810
Alignment:
Q  41 cttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagac 140  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||||||| | |||| |  | ||| ||| |||||| |||||||||| ||| | |||||  ||||  | | |||||    
T  12261956 cttaggtggtttgggcatgtggagggaagacttttggattttgtagtaatgagggtagatctgatggaggagagtcaaatcactagaggtggggtaagac 12261857  T
Q  141 ctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaat 186  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| ||||||| | |||| |||||||    
T  12261856 ctagaaaaactataagagaaactagtaagaagaaattagggattaat 12261810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 193
Target Start/End: Original strand, 26299187 - 26299277
Alignment:
Q  104 atggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattgg 193  Q
    |||||||||||| |||| ||  |||| ||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  26299187 atggaggatagtcagattaccagaggtagaggaaaacctaggaaaactataagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttgg 26299277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 268
Target Start/End: Original strand, 29807989 - 29808123
Alignment:
Q  135 gaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataattt 233  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||| || ||||||||| || | ||||| || ||| |   ||||||||| | |||||||||| |||||    ||||    
T  29807989 gaagacctagaaaaactataagagaaacgatcaagaaggatctaaatattaacgagttgaataaaaatatggtttttgataaaacactatggcgacattt 29808088  T
Q  234 gatccatctaaccgactccacttagtgggataaga 268  Q
    ||| ||| || |||| |||||||||||||||||||    
T  29808089 gattcatgtagccgattccacttagtgggataaga 29808123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 41017298 - 41017217
Alignment:
Q  201 tatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |||||| ||||||| |||||||| | |||||||| || || || | ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  41017298 tatggtttatgatagaacattatagcataatttggtcgatgtagc-gactccacttagtggaataagacttggttgttgttgt 41017217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 194
Target Start/End: Original strand, 43423746 - 43423912
Alignment:
Q  29 gtggaaaataagcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgag 128  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||| |  | |||| ||||||||   ||||||   |||| | |||||  |||    
T  43423746 gtggaaactaggcttaggtggtttggccatgtagagagaagacttgtagattatgtagtaagtagagtagactagatggatagtagtcaaatcactagag 43423845  T
Q  129 gcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattgga 194  Q
    | ||||||||||||| ||||| |  |||||| || |||||||| ||| ||||||||| ||| |||||    
T  43423846 gtagaggaagacctagaaaaattacaagagagaccattaagaaagatctagagattagtgagttgga 43423912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 149 - 283
Target Start/End: Original strand, 50636230 - 50636363
Alignment:
Q  149 acttaagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccga 248  Q
    |||||||| ||||||||||||   || ||||||||| ||| |||||   ||||||||| ||||||| | |||||||  || |||||||| || ||  |||    
T  50636230 acttaaga-aaactattaagataaatctagagattattgagttggataaaaatatggtatatgatagagcattatgacatcatttgatcaatgtagtcga 50636328  T
Q  249 ctccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
     || |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  50636329 ttctacttagcgggataaggcttgattgttgttgt 50636363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 155 - 283
Target Start/End: Original strand, 696423 - 696552
Alignment:
Q  155 gagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattat-ggtataatttgatccatctaaccgactcca 253  Q
    ||||||| ||||  || ||||||||| | ||||| || || ||||||||||| | ||||| |||| ||| ||  | |||||||| || || ||||| |||    
T  696423 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagtttgatccaaatatggtttttgatagaacactattggcgtcatttgatcaatgtagccgacccca 696522  T
Q  254 cttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  696523 cttagtgggataaggcttggttgttgttgt 696552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 8203283 - 8203222
Alignment:
Q  135 gaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggac 195  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||    
T  8203283 gaagacctagaaaaactataagagaaactattaaaaaagatctagagattaatgagttggac 8203222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 333 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 13031181 - 13031128
Alignment:
Q  333 ctcacctttcaaattgattttgttaggttgagttaggtccaacccaaattctaa 386  Q
    |||||||| |||| || ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13031181 ctcaccttacaaactggttttgtagggttgagttaggtccaacccaaattctaa 13031128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 333 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 17557763 - 17557710
Alignment:
Q  333 ctcacctttcaaattgattttgttaggttgagttaggtccaacccaaattctaa 386  Q
    |||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17557763 ctcaccttacaagctgattttgtaaggttgagttaggcccaacccaaattctaa 17557710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 349 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 31626278 - 31626233
Alignment:
Q  349 attttgttaggttgagttaggtccaacccaaattctaatatggtat 394  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31626278 attttgtagggttgagttaggtccaacccaaattctaagatggtat 31626233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 221
Target Start/End: Original strand, 1661457 - 1661639
Alignment:
Q  29 gtggaaaataagcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgag 128  Q
    |||||||||| ||| || ||||||| ||||||  ||| ||||| | |||||||||   ||| |||||  |||  ||||||||||| |||||||||  |||    
T  1661457 gtggaaaataggctcagatggtttgagcatgtagagagaagacctatagattctag--taatgagagctgatcagatggaggataattagatcactagag 1661554  T
Q  129 gcagaggaagacctataaaaacttaagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacatt 221  Q
    | ||| ||||||||||||        |||||||||||| ||| |||||||| ||||| || ||||||| |||| |||| | ||||| ||||||    
T  1661555 gtagatgaagacctataa--------gagaaactattaggaaagatttagaaattaacgagttggaccgaaatgtggtttgtgatagaacatt 1661639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 11331335 - 11331247
Alignment:
Q  152 taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccat 240  Q
    ||||||||||||||   || ||||||||| ||||| | |||||   ||||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||||||    
T  11331335 taagagaaactatttgaaaagatttagaggttaataagttggatttaaatatggtttatgatgaaacattatgatgtaatttgatccat 11331247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 11489356 - 11489268
Alignment:
Q  152 taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccat 240  Q
    ||||||||||||||   || ||||||||| ||||| | |||||   ||||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||||||    
T  11489356 taagagaaactatttgaaaagatttagaggttaataagttggatttaaatatggtttatgatgaaacattatgatgtaatttgatccat 11489268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 19969361 - 19969301
Alignment:
Q  135 gaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattgga 194  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| |||||    
T  19969361 gaagacctagaaaaactataagagaaactattaacaaagatctagagattaatgagttgga 19969301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 283
Target Start/End: Original strand, 27704157 - 27704233
Alignment:
Q  208 tatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtggg-ataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||||| || ||||| || ||||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  27704157 tatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccgcttagtgggaaaaagacttgtttgttgttgt 27704233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 43240532 - 43240380
Alignment:
Q  131 agaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtata 229  Q
    |||||||||||||  |||||| | |||||||| ||||  || |||||| |  | ||||| ||||| |||||| |||| ||||||| |||| |||||  |     
T  43240532 agaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaatgatttatatgtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtc 43240433  T
Q  230 atttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttg 282  Q
    ||||||| ||| || |||||  |||||||||||||||| |||  |||||||||    
T  43240432 atttgattcatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttagttgttgttg 43240380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 230 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 46423269 - 46423213
Alignment:
Q  230 atttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgtata 286  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  46423269 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgttgttgtata 46423213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 50771753 - 50771653
Alignment:
Q  87 taaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaa 185  Q
    ||||||||||||||  ||||||||  ||| | || ||  |||| || |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  50771753 taaggagagtagatcagatggaggggagtcaaatgactagaggtaggggaagacctagaaaaactataagcgaaactattaagaaggacctagagattaa 50771654  T
Q  186 t 186  Q
    |    
T  50771653 t 50771653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 52900753 - 52900685
Alignment:
Q  172 gatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccat 240  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||| |||| |||||   ||||||||||||    
T  52900753 gatttagagattaatgagttggactgaaatatggtttatgatagaacactatggcggaatttgatccat 52900685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 216 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 2914190 - 2914123
Alignment:
Q  216 aacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||||||  || |||||||||| || || || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  2914190 aacattatggcgtactttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 2914123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 230 - 284
Target Start/End: Original strand, 4380189 - 4380242
Alignment:
Q  230 atttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgta 284  Q
    |||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4380189 attttatccatgtagccgac-ccacttagtgggataagacttggttgttgttgta 4380242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 126 - 283
Target Start/End: Original strand, 9592858 - 9593016
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||| |||||||||||||  ||| || | |||||||| ||||  || ||||||||| | ||||| || ||   |||| |||| ||||||| |||| |||     
T  9592858 gaggtagaggaagacctaggaaacctattagagaaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagttagatttaaatttggtgtatgatagaacactata 9592957  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |  | ||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  9592958 gcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatgggataaggcttggttgttgttgt 9593016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 152 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 18469213 - 18469099
Alignment:
Q  152 taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactc 251  Q
    ||||||||||| ||| |||  ||| |||| | ||||| |||||  ||||||| || ||||||  ||||||||||| ||||||| | ||| ||  |||| |    
T  18469213 taagagaaacttttaggaaatattaagaggtcaatgagttggatacaaatatagtttatgatcgaacattatggtgtaatttggttcatgtagacgaccc 18469114  T
Q  252 cacttagtgggataa 266  Q
    |||||||||||||||    
T  18469113 cacttagtgggataa 18469099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 24020377 - 24020267
Alignment:
Q  173 atttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttg 272  Q
    |||||||| | ||||| ||||| |||||| || | ||||||| |||| |||||  | |||||||||||  | || || |||||| |||||||||| ||||    
T  24020377 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgcagccaaccccactttgtgggataaggcttg 24020278  T
Q  273 attgttgttgt 283  Q
     ||||||||||    
T  24020277 gttgttgttgt 24020267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 165 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 31274519 - 31274401
Alignment:
Q  165 taagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggat 264  Q
    |||||| ||| |||||||| |||| || ||   ||||||||| ||||||| ||| ||||||  ||||||||||  | || | ||| ||||||||||||||    
T  31274519 taagaaagatctagagatttatgagttagattgaaatatggtttatgatataacgttatggcgtaatttgatctgtgtagctgaccccacttagtgggat 31274420  T
Q  265 aagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||  |||| ||||||||||    
T  31274419 aatgcttggttgttgttgt 31274401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 333 - 403
Target Start/End: Original strand, 40571591 - 40571660
Alignment:
Q  333 ctcacctttcaaattgattttgttaggttgagttaggtccaacccaaattctaatatggtatcagagtcta 403  Q
    |||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  40571591 ctcaccttacaagttggttttgtaaggttgagttaggcccaatccaaatt-taagatggtatcaaagtcta 40571660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 357 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 41590555 - 41590514
Alignment:
Q  357 aggttgagttaggtccaacccaaattctaatatggtatcagag 399  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41590555 aggttgagttagg-ccaacccaaattctaagatggtatcagag 41590514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 178 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 42539318 - 42539212
Alignment:
Q  178 gagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattat-ggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattg 276  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||| | || ||||||| ||||| || ||| ||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||| ||| |||| ||     
T  42539318 gagatcaatgagttggaccaaaatttagtttatgatagaacatcattggtgtaatttgatccatgtagacgaccccacttagtgggaaaaggcttggtta 42539219  T
Q  277 ttgttgt 283  Q
    |||||||    
T  42539218 ttgttgt 42539212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 231 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 43028860 - 43028806
Alignment:
Q  231 tttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgtat 285  Q
    |||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  43028860 tttgattcatgtaagcgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtat 43028806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 137 - 283
Target Start/End: Original strand, 51812645 - 51812791
Alignment:
Q  137 agacctataaaaacttaagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgat 236  Q
    ||||||| |||| | ||||||||||| ||||||| ||| ||||  ||||||| || || | ||||||||| ||||||| || ||||||   |||||| ||    
T  51812645 agacctaaaaaaccataagagaaacttttaagaaagatctagatgttaatgagttagatcgaaatatggtttatgatagaatattatgccgtaatttaat 51812744  T
Q  237 ccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
      || ||  |||| ||||| ||||||||||| |||| || |||||||    
T  51812745 atatatatacgaccccactaagtgggataaggcttggtttttgttgt 51812791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 4318898 - 4318845
Alignment:
Q  230 atttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  4318898 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgt 4318845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 194
Target Start/End: Original strand, 7083022 - 7083083
Alignment:
Q  134 ggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattgga 194  Q
    |||||||||| |||| || |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||    
T  7083022 ggaagacctagaaaagctataagagaaactattaagatggaactagagattaatgagttgga 7083083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 286
Target Start/End: Original strand, 29975443 - 29975484
Alignment:
Q  245 ccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgtata 286  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  29975443 ccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtata 29975484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 31979711 - 31979646
Alignment:
Q  174 tttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatcca 239  Q
    |||||||||||||||  ||||  |||||||||| ||||||||||| |||||  ||||| |||||||    
T  31979711 tttagagattaatgagctggattcaaatatggtttatgataaaacgttatgacataatctgatcca 31979646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 34545600 - 34545563
Alignment:
Q  245 ccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttg 282  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34545600 ccgaccccacttagtgggataagatttgattgttgttg 34545563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 211 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 38877415 - 38877342
Alignment:
Q  211 gataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgta 284  Q
    |||| ||||||||||  | ||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  38877415 gatagaacattatggcgtcatttgatccatgtagccgaacccacttagtgggataaggcttggttgtggttgta 38877342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 283
Target Start/End: Original strand, 41165511 - 41165564
Alignment:
Q  230 atttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  41165511 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgt 41165564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 283
Target Start/End: Original strand, 42340099 - 42340136
Alignment:
Q  246 cgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42340099 cgactccatttagtgggataagacttggttgttgttgt 42340136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #133
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 194
Target Start/End: Original strand, 44008703 - 44008772
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattgga 194  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||  |||| ||| ||||||| ||||| |||||    
T  44008703 gaggcagaggaagacctagaaaaaatctaagagaaactatcgagaaagatctagagatcaatgagttgga 44008772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #134
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 232 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 52073099 - 52073050
Alignment:
Q  232 ttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgtt 281  Q
    ||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  52073099 ttgatccatgtagccgaccccacttggtgggataaggcttgattgttgtt 52073050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #135
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 350 - 386
Target Start/End: Original strand, 347352 - 347388
Alignment:
Q  350 ttttgttaggttgagttaggtccaacccaaattctaa 386  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  347352 ttttgtaaggttgagttaggttcaacccaaattctaa 347388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #136
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 131 - 194
Target Start/End: Original strand, 478807 - 478871
Alignment:
Q  131 agaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattgga 194  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||| |||||    
T  478807 agaggaagacctacaaaatctataagagaaactattaggaaagttttagaggttaatgagttgga 478871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #137
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 251 - 283
Target Start/End: Original strand, 7922075 - 7922107
Alignment:
Q  251 ccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7922075 ccacttagtgggataagacttggttgttgttgt 7922107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #138
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 208 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 17269064 - 17269000
Alignment:
Q  208 tatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttg 272  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||| ||| ||||    
T  17269064 tatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccatttagtgggaaaagtcttg 17269000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #139
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 331 - 403
Target Start/End: Original strand, 38076374 - 38076446
Alignment:
Q  331 ttctcacctttcaaattgattttgttaggttgagttaggtccaacccaaattctaatatggtatcagagtcta 403  Q
    |||||||||| ||||  | |||||| ||| ||| ||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  38076374 ttctcaccttacaaaccggttttgtaagggtgatttaggacaaacccaaattctaagatggtttcagagtcta 38076446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #140
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 155 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 39515996 - 39515868
Alignment:
Q  155 gagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccac 254  Q
    ||||||||||||||||  |  |||| |||||||| ||||| | ||||||||  |||| || |||||||||| ||  ||||||| || || |  ||  ||     
T  39515996 gagaaactattaagaaaaacctagaaattaatgagttggatcaaaatatggattatggtagaacattatggcattgtttgatctatgtagctaaccacaa 39515897  T
Q  255 ttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  39515896 ttagtgagataagacttggttgttgttgt 39515868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #141
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 127 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 45510990 - 45510850
Alignment:
Q  127 aggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatgg 225  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| || |||||| |||| |||| || || |||  |||||| ||| | |  |||||||| ||||||| ||||  || |    
T  45510990 aggcagaggaaaacctagaaaaactatacgagaaattattgagaaagacttggaggctaatgagttgaatcggaatatggtttatgatagaacaccatag 45510891  T
Q  226 tataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataa 266  Q
      |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  45510890 cgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 45510850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #142
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 198 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 52981492 - 52981424
Alignment:
Q  198 aaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataa 266  Q
    ||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||| | || || || |||||| |||||||||    
T  52981492 aaatatggtttatgatagaatattatggtgtaatttgatccttgtagccaaccccacttggtgggataa 52981424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 114)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 29 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 28628188 - 28627936
Alignment:
Q  29 gtggaaaataagcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgag 128  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||| |  | ||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||| |||    
T  28628188 gtggaaaattggcttaggtggtttgggcatgtaaagagaaaacctgtagattatgtagtaaggagagtagatccgatggaggatagtcaaatcacaagag 28628089  T
Q  129 gcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggta 227  Q
    | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||  ||||| |||| ||||||| ||||||||||      
T  28628088 gtagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagagattaatgagttggatgcaaatgtggtttatgatagaacattatggcg 28627989  T
Q  228 taatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgt 280  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  28627988 taatttgatccatgtagccgactccacttagtgggataaggcttagttgttgt 28627936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 29 - 245
Target Start/End: Original strand, 47848701 - 47848917
Alignment:
Q  29 gtggaaaataagcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgag 128  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||  | ||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||  |||    
T  47848701 gtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtcgagagaagacttgtaaattctgtactaaggagagtagatcagatggaggatagtctgatcactagag 47848800  T
Q  129 gcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggta 227  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||  ||| ||||| | |||||||||  |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||     
T  47848801 gcagaggaagaactagaaaaactataagagaaactatt-ggaaagatttggggattaatgagctggatccaaatatggtttatgatagaacattatggtt 47848899  T
Q  228 taatttgatccatctaac 245  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  47848900 taatttgatccatttaac 47848917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 29 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 38135467 - 38135213
Alignment:
Q  29 gtggaaaataagcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgag 128  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||  | | |||||  ||||||| |  | |||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||   |||    
T  38135467 gtggaaaataggcttaggtggtttggacatgtagacagaagaccagtagattttgtagtaaggaga-tagatcagatggaggatagtcagatcattagag 38135369  T
Q  129 gcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggta 227  Q
    ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||| || |||||||      
T  38135368 gcagatgaagacctagaaaaagtataagagaaactattaaaaaagatttagagattaatgagttggaccgaaatatgggttatgatagaatattatggcg 38135269  T
Q  228 taatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||| |||||| ||| |||| ||||| ||||    
T  38135268 taatttgatccatctagctgaccccacttggtgggacaaggcttggttgttattgt 38135213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 92 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 2885914 - 2885722
Alignment:
Q  92 agagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaat 190  Q
    |||||||||  ||||||||| ||| || ||| | |||| ||| |||||||||  |||||| |||||||||| ||||  || ||||||| | | ||||| |    
T  2885914 agagtagatcagatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagaagaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaatgatttagtggtcaatgagt 2885815  T
Q  191 tggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  2885814 tggacccaaatatggtttatgatagaacactatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 2885722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 126 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 40980086 - 40979926
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||  || ||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  40980086 gaggtagaggaagacctaggaaaactataagagaaactattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatg 40979987  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgtat 285  Q
    |  ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  40979986 gcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtat 40979926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 103 - 284
Target Start/End: Original strand, 36136865 - 36137047
Alignment:
Q  103 gatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaat 201  Q
    ||||||||| ||| |||||| | || | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  36136865 gatggaggagagtcagatcagaagaagtagaggaagacctagaaaaactataagagaaactatttggaaagatttagatgttaatgaattggatccaaat 36136964  T
Q  202 atggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgta 284  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |  |||||||||  || |||||||   | |||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  36136965 atggtttatgatagaacattatagggtaatttgatttatttaaccgatcgcgcttagtgggataaggcttggttgttgttgta 36137047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 131 - 283
Target Start/End: Original strand, 12966145 - 12966298
Alignment:
Q  131 agaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtata 229  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||   ||||||||| ||||||||| |||||||  ||     
T  12966145 agaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaagaaatatttagagattaatgatttggatagaaatatggtatatgataaatcattatgccatt 12966244  T
Q  230 atttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
     |||||| ||| || ||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  12966245 gtttgattcatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 12966298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 132 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 9210856 - 9210704
Alignment:
Q  132 gaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataa 230  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||| |||  |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||    
T  9210856 gaggaagacctaggaaaactataagagaaacttttaggaaaaatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttatgatacaacattatggcgtaa 9210757  T
Q  231 tttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |||||||||| || | ||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  9210756 tttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttcgttgttgttgt 9210704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 126 - 285
Target Start/End: Original strand, 45601600 - 45601760
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||    
T  45601600 gaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaaccattaagaaagatctagagattaatgagttggatcaaaatatgatttatgatagaacactatg 45601699  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgtat 285  Q
    || ||||||||||||| || | ||   |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  45601700 gtgtaatttgatccatgtagctgaactcacttagtgggataaggcttggttgttgtggtat 45601760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 29 - 283
Target Start/End: Original strand, 40169676 - 40169936
Alignment:
Q  29 gtggaaaataagcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgag 128  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||  ||||||| |     |||||||||||||   ||||||||| |||||||| |  |||    
T  40169676 gtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagataagacacgtagattttgtgtgaaggagagtagatcaaatggaggattgttagatccctggag 40169775  T
Q  129 gcagaggaagacctataaaaact-------taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacatt 221  Q
    ||||||||||||| |||||||||       ||||||||||||||||||| || | |||||||| | | ||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  40169776 gcagaggaagacccataaaaactataagactaagagaaactattaagaaagactcagagattagttagttggaccaacatatggtctatgatagaacatt 40169875  T
Q  222 atggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |  |  ||| ||||||| | |||||||| |||||||  |||| ||| |||| ||||||||||    
T  40169876 acagcgtaagttgatccgtgtaaccgaccccacttaacgggaaaag-cttggttgttgttgt 40169936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 158 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 27893688 - 27893563
Alignment:
Q  158 aaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccactta 257  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||| | ||||||| |||||||||| |||||||||| ||| || ||||| | |||||    
T  27893688 aaactattaagaaagatttagagattaatgagctggaccgaaatatgttttatgatagaacattatggcataatttgattcatgtagccgaccctactta 27893589  T
Q  258 gtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||| |||||| |||| ||||||||||    
T  27893588 gtgcgataaggcttggttgttgttgt 27893563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 29 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 6420745 - 6420605
Alignment:
Q  29 gtggaaaataagcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgag 128  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||  |||| | |||||| |||||||  |||    
T  6420745 gtggaaactaggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacttgtagatactgtagtaaggagagtagatcagatgaatgatagtcagatcactagag 6420646  T
Q  129 gcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaag 168  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  6420645 gcagaggtagacctataaaaactataagagatactattaag 6420605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 92 - 283
Target Start/End: Original strand, 7273190 - 7273382
Alignment:
Q  92 agagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaat 190  Q
    |||||||||  ||||||||| ||| || ||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||  ||  ||| |||| | ||||| |    
T  7273190 agagtagattggatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagaggaagacctatgaaaactataagagaaaccattagaaaatattcagaggtcaatgagt 7273289  T
Q  191 tggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||  |||||||||| ||||||| | || ||||   ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7273290 tggattcaaatatggtttatgatatagcactatgacgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 7273382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 30 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 36102019 - 36101777
Alignment:
Q  30 tggaaaataagcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgagg 129  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||| ||||| | |||||| |  || | |||||||||||   |||||| ||||| |||||||  ||||    
T  36102019 tggaaaataggcttaggtggtttggggatgtagagagaagacctatagattttgtaacagggagagtagatcatatggagaatagtcagatcactagagg 36101920  T
Q  130 cagaggaagacctataaaaacttaagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtata 229  Q
    |||||||||||||| ||||| |           |||| ||| |||||| |||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||   ||    
T  36101919 cagaggaagacctagaaaaatt-----------attatgaaagatttatagattaatgagttggatcaaaatatggtttatgatagaacattatgacgta 36101831  T
Q  230 atttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||||||| ||   ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  36101830 atttgatccatgtagttgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 36101777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 88 - 237
Target Start/End: Original strand, 1569102 - 1569252
Alignment:
Q  88 aaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaat 186  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| ||||  |  |||||||||| || |||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  1569102 aaggagagtagatcagatggaggatagtcagattgctagaggcagaggtagtcctagaaaaactataagagtaactattaagaaagatctagagattaat 1569201  T
Q  187 gaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatc 237  Q
    || ||||| | ||||||||| ||||||| ||||||| ||  ||||||||||    
T  1569202 gagttggatcaaaatatggtttatgatagaacattacggcgtaatttgatc 1569252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 126 - 283
Target Start/End: Original strand, 11594084 - 11594242
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||| |||||||||||||  |||||| | |||||||| ||||  |||||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||| ||||||| |||| ||||    
T  11594084 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatg 11594183  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |  | ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  11594184 gcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 11594242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 126 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 31682760 - 31682602
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||| |||||||||||||  |||||| | |||||||| ||||  |||||||||||| | ||||||||||| ||| || |||| ||||||| |||| ||||    
T  31682760 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgaattggatccatatttggtttatgatagaacactatg 31682661  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |  | ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  31682660 gcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 31682602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 126 - 283
Target Start/End: Original strand, 37618069 - 37618227
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||| |||||||||||||  |||||| | |||||||| ||||  |||||||||||| | ||| | ||||| |||||| |||| ||||||| |||| ||||    
T  37618069 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaataagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatg 37618168  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    || | ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  37618169 gtgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 37618227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 126 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 39906530 - 39906372
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||| |||||||||||||  |||||| | |||||||| ||||  |||||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||| ||||||| |||| ||||    
T  39906530 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgacttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatg 39906431  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |  | ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  39906430 gcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 39906372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 152 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 40391954 - 40391845
Alignment:
Q  152 taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactc 251  Q
    |||||||||||| || ||| |||||||| |||||| | ||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |    
T  40391954 taagagaaactagtaggaatgatttagaaattaataagttggaccgaaatatggcttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatctaaccgaccc 40391855  T
Q  252 cacttagtgg 261  Q
    ||||||||||    
T  40391854 cacttagtgg 40391845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 108 - 283
Target Start/End: Original strand, 1011153 - 1011328
Alignment:
Q  108 aggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggt 206  Q
    |||| ||| |||||| | |||| ||||||||||||| ||||| | | ||||||| ||||| |||  ||||| || ||||||| ||||| |||| ||||||    
T  1011153 aggagagtcagatcaaaagaggtagaggaagacctagaaaaattatgagagaaattattaggaaatatttaaaggttaatgatttggatccaa-tatggt 1011251  T
Q  207 ctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
     || |||| ||||||||||| |||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  1011252 ttaggatagaacattatggtgtaatttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 1011328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 132 - 283
Target Start/End: Original strand, 42187572 - 42187723
Alignment:
Q  132 gaggaagacctataaaaacttaagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacatt-atggtataa 230  Q
    |||||||||||| ||||   ||||||||||||||| |||  |||||||||||||| | ||||| |||||| |||| ||||||| |||||| ||||  |||    
T  42187572 gaggaagacctaaaaaattataagagaaactattaggaaatatttagagattaattagttggatccaaat-tggtttatgatagaacatttatggcgtaa 42187670  T
Q  231 tttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  42187671 tttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctttgttgttgttgt 42187723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Original strand, 43491338 - 43491590
Alignment:
Q  32 gaaaataagcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggca 131  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||  ||| |||||  |||||| |     |||| ||||| |||  ||||||||| ||| || ||| | |||| |    
T  43491338 gaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaagagttgatcagatggaggagagtcaggtcaaaagaggta 43491437  T
Q  132 gaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataa 230  Q
    ||||||||||||  |||| | |||||||||| ||||  ||| |||||||| | ||| | ||||| ||||||||| | ||||||| |||| |||| | |||    
T  43491438 gaggaagacctaggaaaattataagagaaaccattagaaagaatttagaggtcaataagttggatccaaatatgatttatgatagaacactatgatgtaa 43491537  T
Q  231 tttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  43491538 tttcatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 43491590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 126 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 12841433 - 12841275
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||| |||||||||||||  |||||| | |||||||| ||||  |||||||||||| | ||||| ||| | |||||| |||| ||||||| |||| ||||    
T  12841433 gaggtagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttgtatccaaatttggtttatgatagaacactatg 12841334  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |  | ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  12841333 gcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 12841275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 173 - 267
Target Start/End: Original strand, 42969870 - 42969964
Alignment:
Q  173 atttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataag 267  Q
    |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  42969870 atttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttatgattgaacattatcgtataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 42969964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 154 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 45836611 - 45836482
Alignment:
Q  154 agagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactcca 253  Q
    |||||||| ||||  |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||  | ||||||||||| || ||||| |||    
T  45836611 agagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgacccca 45836512  T
Q  254 cttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |||||||||||||| || | ||||||||||    
T  45836511 cttagtgggataaggctcggttgttgttgt 45836482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 29 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 26742151 - 26741917
Alignment:
Q  29 gtggaaaataagcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgag 128  Q
    |||||||||| | ||||||||||||  |||||  ||||| ||| | |||||| |    ||||||||||||||  ||| ||| ||||| |||||||  |||    
T  26742151 gtggaaaataggattaggtggtttgaacatgtagagaaacgacctatagattttgtggtaaggagagtagatcagatagagaatagtcagatcactagag 26742052  T
Q  129 gcagaggaagacctataaaaact---taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatgg 225  Q
    |||||||||||| || |||||||    |||| ||||||||| |||  |||| || || ||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  26742051 gcagaggaagacgtagaaaaactatcaaagataaactattaggaaatatttggaaataaatgagttggaccgaaatatggtttatgatagaacattatgg 26741952  T
Q  226 tataatttgatccatctaaccgactccacttagtg 260  Q
      |||||||||| || ||||| |  ||||||||||    
T  26741951 cgtaatttgatcaatgtaaccaatcccacttagtg 26741917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 94 - 246
Target Start/End: Original strand, 35922346 - 35922498
Alignment:
Q  94 agtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaacttaagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattgg 193  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||| | |||| |||||||||| || |||||  |  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||     
T  35922346 agtagatatgatgaaagagagttagatcagaagaggtagaggaagacttaaaaaaaactttgagaaactattaagaaagatttagaggttaatgagttga 35922445  T
Q  194 acccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaacc 246  Q
    | | ||||||| | ||||||| |||||||||   ||||||||||||| |||||    
T  35922446 atctaaatatgatttatgatagaacattatgacctaatttgatccatataacc 35922498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 135 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 38103762 - 38103616
Alignment:
Q  135 gaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataattt 233  Q
    |||| |||| ||||||| ||||||| ||||||| |||  | | |||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||||    
T  38103762 gaaggcctagaaaaactataagagagactattaggaaatactaagagattaatgagttggatccaaatattgtttatgataaa-cattatggtgtaattt 38103664  T
Q  234 gatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttg 282  Q
    ||||| | || ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  38103663 gatcc-tgtagccgaccccagttagtgggataagacttggttgttgttg 38103616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 126 - 284
Target Start/End: Original strand, 34869544 - 34869703
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||| |||||||||||||  |||||| | |||||||| ||||  |||||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||| ||||||| |||| ||||    
T  34869544 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatg 34869643  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgta 284  Q
    |  | ||||||||||| || ||||| | | ||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  34869644 gcgtcatttgatccatgtagccgaccctaattagtgggataaggcttggttgttgttgta 34869703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 152 - 282
Target Start/End: Original strand, 14057629 - 14057759
Alignment:
Q  152 taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactc 251  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||  || ||  |||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||| || || || |    
T  14057629 taagagaaactattaggaaagatttagaggttaatgcgttcgattcaaatatggtttatgatagaacattatggggtaatttgatccatgtagccaaccc 14057728  T
Q  252 cacttagtgggataagacttgattgttgttg 282  Q
    |||||||| ||||||| |||  |||||||||    
T  14057729 cacttagtaggataaggcttagttgttgttg 14057759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 152 - 282
Target Start/End: Original strand, 14367657 - 14367787
Alignment:
Q  152 taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactc 251  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||  || ||  |||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||| || || || |    
T  14367657 taagagaaactattaggaaagatttagaggttaatgcgttcgattcaaatatggtttatgatagaacattatggggtaatttgatccatgtagccaaccc 14367756  T
Q  252 cacttagtgggataagacttgattgttgttg 282  Q
    |||||||| ||||||| |||  |||||||||    
T  14367757 cacttagtaggataaggcttagttgttgttg 14367787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 126 - 283
Target Start/End: Original strand, 38900081 - 38900238
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||| |||||||||||||  |||||| | |||||||| ||||  |||||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||| ||||||  |||| ||||    
T  38900081 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgattgaacactatg 38900180  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |  | ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  38900181 gcgtcatttgatccatgtagccgac-ccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 38900238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 154 - 283
Target Start/End: Original strand, 21078070 - 21078199
Alignment:
Q  154 agagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactcca 253  Q
    |||||||| ||||  || ||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||  | ||||||||||| || |||||| ||    
T  21078070 agagaaaccattagtaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacattatggcgtcatttgatccatgtagccgacttca 21078169  T
Q  254 cttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
     ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  21078170 tttagtgggataaggcttggttgttgttgt 21078199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 158 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 28542069 - 28541940
Alignment:
Q  158 aaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccga-ctccactt 256  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||   || |||||| ||||||| ||||| |||| ||| |||||||| | || |||| | ||||||    
T  28542069 aaactattaagaaagatttagagattaatgagttggattgaactatggtttatgatagaacatcatggcatagtttgatccgtgtagccgacccccactt 28541970  T
Q  257 agtgggataagacttgattgttgttgtata 286  Q
    ||| ||||||| |||| |||||||||||||    
T  28541969 agttggataaggcttggttgttgttgtata 28541940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 135 - 286
Target Start/End: Original strand, 37976368 - 37976520
Alignment:
Q  135 gaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataattt 233  Q
    ||||||||| ||||||| |||| ||||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||   ||||     
T  37976368 gaagacctagaaaaactataagtgaaactaatatgaaagatttagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggctaaatta 37976467  T
Q  234 gatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgtata 286  Q
    ||||||| || || || || |||||   ||||||  ||| |||||||||||||    
T  37976468 gatccatgtagccaaccccgcttagcaagataaggtttggttgttgttgtata 37976520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 89 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 47796347 - 47796195
Alignment:
Q  89 aggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatg 187  Q
    ||||||||||||  |||||||||| || |||||||  | |||||| ||||||| | ||||| | |||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||     
T  47796347 aggagagtagatcagatggaggattgtcagatcactaggggcagatgaagaccgagaaaaattataagagaacctattaggaaagatttagaaattaata 47796248  T
Q  188 aattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccat 240  Q
    | ||||||  ||||||||| ||||||| || |||||||  |||||||||||||    
T  47796247 agttggactgaaatatggtttatgatagaatattatggcgtaatttgatccat 47796195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 172 - 283
Target Start/End: Original strand, 27648951 - 27649062
Alignment:
Q  172 gatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagactt 271  Q
    ||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||| ||||||| |||| | |||  ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  27648951 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactgtggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctt 27649050  T
Q  272 gattgttgttgt 283  Q
    | ||||||||||    
T  27649051 ggttgttgttgt 27649062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 126 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 35906359 - 35906212
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||| |||||||||||||  |||||| | |||||||| ||||  |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||| |||| ||||||| |||| ||||    
T  35906359 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttcgaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatg 35906260  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttg 272  Q
    |  | ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  35906259 gcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttg 35906212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 29 - 168
Target Start/End: Original strand, 43282435 - 43282576
Alignment:
Q  29 gtggaaaataagcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgag 128  Q
    ||||||| || |||||||||  ||||||||||  ||| |||||||| |||||||  |  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||    
T  43282435 gtggaaactaggcttaggtgaattgggcatgtagagagaagacttgcagattctgtaggaaggagagtagata-gatggaggatagtcagatcacaagag 43282533  T
Q  129 --gcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaag 168  Q
      | |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  43282534 gtgtagaggatgacctagaaaaactataagagaaactattaag 43282576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 126 - 283
Target Start/End: Original strand, 22349744 - 22349902
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||| ||||||||| |||  |||||| | |||||||| ||||| ||||||||| || | ||| | ||||| |||||| |||| ||||||| || | ||||    
T  22349744 gaggtagaggaagaactaggaaaactattagagaaaccattaaaaaggatttaaaggtcaataagttggatccaaatttggtatatgatagaatactatg 22349843  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |  | ||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22349844 gcgtcatttgatccatgtagtcgaccccacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 22349902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 169 - 283
Target Start/End: Original strand, 38607160 - 38607274
Alignment:
Q  169 aaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataaga 268  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||| | ||||| |||| |||||  |  |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||     
T  38607160 aaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcgtttgatccatgtagccgactccacttagtgggttaagg 38607259  T
Q  269 cttgattgttgttgt 283  Q
    |||| ||||||||||    
T  38607260 cttggttgttgttgt 38607274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 131 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 44855325 - 44855174
Alignment:
Q  131 agaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtata 229  Q
    |||||||||||||  |||||| | |||||||| ||||  || ||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||| |||||||| ||  |||||  ||    
T  44855325 agaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgataacac--tatggcgta 44855228  T
Q  230 atttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  44855227 atttggtccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 44855174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 190 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 28208421 - 28208328
Alignment:
Q  190 ttggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||  | ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  28208421 ttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 28208328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 173 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 34035264 - 34035155
Alignment:
Q  173 atttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttg 272  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||  |||||| |||| |||||  | ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||    
T  34035264 atttagagatcaatgagttggatccaaatatggttcatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggattaggcttg 34035165  T
Q  273 attgttgttg 282  Q
     |||||||||    
T  34035164 gttgttgttg 34035155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 131 - 263
Target Start/End: Original strand, 43281960 - 43282092
Alignment:
Q  131 agaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtata 229  Q
    |||||| |||||| ||||||  |||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||| |||||| |||||  ||    
T  43281960 agaggatgacctagaaaaaccgtaagagaaacaattaagtaagatctagagattaatgagttggatcaaaatatggtttatgacaaaaca-tatggcgta 43282058  T
Q  230 atttgatccatctaaccgactccacttagtggga 263  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||||||    
T  43282059 atttgatctatctagccgacctcacttagtggga 43282092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 40 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 48202946 - 48202745
Alignment:
Q  40 gcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaaga 139  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||||   |||| ||||||| | ||||    ||||||||||||     
T  48202946 gcttaggtggtttgcgcatgtagagagaagacttgtagattctgtagtaaggagagtagatcatatggtggatagtcaaatcattataggcagaggaagg 48202847  T
Q  140 cctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatcc 238  Q
    |||| ||||||| ||||||| |   ||||||| | | ||||| ||||||| |||||   ||||||||| |||| || |||||| ||||  ||||||||||    
T  48202846 cctagaaaaactataagagagatcgttaagaaagttgtagagtttaatgagttggattgaaatatggtttatgttagaacattgtggtgcaatttgatcc 48202747  T
Q  239 at 240  Q
    ||    
T  48202746 at 48202745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 135 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 21517529 - 21517417
Alignment:
Q  135 gaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataattt 233  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | ||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||   ||||||    
T  21517529 gaagacctagaaaaactataagagaaactattaaaaaatatttagagattaataagttggatccaaatatgatttatgatataacattatgacgtaattt 21517430  T
Q  234 gatccatctaacc 246  Q
    ||||  |||||||    
T  21517429 gatctctctaacc 21517417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 104 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 30814851 - 30814771
Alignment:
Q  104 atggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagatt 183  Q
    |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  30814851 atggaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacctagaaacactataagagaaactattaagaaagatctagagatt 30814771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 152 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 36239927 - 36239839
Alignment:
Q  152 taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccat 240  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||||||||||| || ||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  36239927 taagagaaactattaggaaaaatttagagattaacgagttggatccaaatatgctttatgatagaacattatggcgtaatttgatccat 36239839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 152 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 40149143 - 40149016
Alignment:
Q  152 taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactc 251  Q
    |||||||||||| || ||| || || ||||  ||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||   ||||||||| || || |||| ||    
T  40149143 taagagaaactactaggaaagacttggagagcaatgagttggaccaaaatatggt-tatgatagaacattatggcgcaatttgatctatgtagccgaatc 40149045  T
Q  252 cacttagtgggataagacttgattgttgt 280  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  40149044 cacttagtgggataaggcttggttgttgt 40149016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 155 - 283
Target Start/End: Original strand, 43281828 - 43281956
Alignment:
Q  155 gagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccac 254  Q
    ||||||| ||||  || ||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||| | ||||| |||| |||||  | ||||||||||| || ||||| ||||    
T  43281828 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccac 43281927  T
Q  255 ttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  43281928 ttagtgggacaaggcttggttgttgttgt 43281956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 126 - 265
Target Start/End: Original strand, 49029400 - 49029540
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||| |||||||||||||  |||||| | |||||||| ||||  |||||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||| ||||||| |||| ||||    
T  49029400 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatg 49029499  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggata 265  Q
    |  | ||||||||||| || || || |||||||||||||||    
T  49029500 gcgtcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggata 49029540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 40 - 194
Target Start/End: Original strand, 30144813 - 30144968
Alignment:
Q  40 gcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaaga 139  Q
    |||||||| ||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||| | || | |||||||||  |||||||| | || | |||||  ||| || |  ||||    
T  30144813 gcttaggtagtttgggcaggtagagagaagacttgtagattctatagtacgaagagtagatcagatggagggtggtcaaatcactagagacaaaataaga 30144912  T
Q  140 cctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattgga 194  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  30144913 cctataaaaactattcgagaaactattaagaaagatctagagattaatgagttgga 30144968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 90 - 283
Target Start/End: Original strand, 7220844 - 7221038
Alignment:
Q  90 ggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaa-cttaagagaaactattaagaaggatttagagattaatga 188  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| | || ||  ||||||||| |||||||||||||| | |||| |||| |||||| || ||||||||||||||||     
T  7220844 ggagagtagattagatggaggatagtcaaattactagaggcagagtaagacctataaaaaccataagtgaaattattaacaaagatttagagattaatgt 7220943  T
Q  189 attggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
     |||||   | ||||  | | ||||| || ||||||  || ||||||||||| || || || |||||||||||  |||| |||| ||||||||||    
T  7220944 gttggataaagatataatatgtgatagaaaattatgacatcatttgatccatgtagccaaccccacttagtggtgtaaggcttggttgttgttgt 7221038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 8519170 - 8519044
Alignment:
Q  159 aactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttag 258  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||| || ||||| ||| ||||||| ||||||| || | ||||| ||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  8519170 aactgttaggaaagatttagaggttaacgagttggatccatatatggtttatgatagaaaactatggcataatttgatcaatgtaactaaccccacttag 8519071  T
Q  259 tgggataagacttgattgttgttgtat 285  Q
    || |||||| || ||||||||||||||    
T  8519070 tgagataaggctcgattgttgttgtat 8519044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 158 - 283
Target Start/End: Original strand, 28355322 - 28355448
Alignment:
Q  158 aaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatcta-accgactccactt 256  Q
    ||||||||| ||| |||||| || |||||||  |||| | ||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||  ||  | ||| ||||||    
T  28355322 aaactattaggaaagatttataggttaatgaggtggatcaaaatatggtttatgataaaacattatggcggaatttgatccacgtagtctgaccccactt 28355421  T
Q  257 agtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  28355422 agtgggataaggcttggttgttgttgt 28355448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 111 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 28562539 - 28562425
Alignment:
Q  111 atagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatgg-tct 208  Q
    |||||||||| ||| |||| |||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||| || ||||||| | |    
T  28562539 atagttagattacaagaggtagaggatgacctagaaaaaatataagagaaactattatgaaagatttagagattaacgagttggatcctaatatggtttt 28562440  T
Q  209 atgataaaacattat 223  Q
    |||||| ||||||||    
T  28562439 atgatataacattat 28562425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 267
Target Start/End: Original strand, 36652116 - 36652258
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||| |||||||||||||  |||||| | |||||||| ||||  ||||||| |||| | ||||| ||| | |||||| |||| ||||||| |||| ||||    
T  36652116 gaggtagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggattcagaggtcaatgagttgaatccaaatttggtgtatgatagaacactatg 36652215  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataag 267  Q
    |  | ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  36652216 gcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 36652258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 283
Target Start/End: Original strand, 41483639 - 41483769
Alignment:
Q  153 aagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactcc 252  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||| ||||| || |||||   | ||||| | |||| || ||| ||||||| | || |||||||| || ||||| ||    
T  41483639 aagagaaactattaagaaagatctagaaattaacgagttggatatagatatgatatatggtagaactttatggtgtcatatgatccatgtagccgacccc 41483738  T
Q  253 acttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  41483739 acttagtgggataagatttggttgttgttgt 41483769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 122
Target Start/End: Original strand, 35713722 - 35713815
Alignment:
Q  29 gtggaaaataagcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatca 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||| |  | |||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||    
T  35713722 gtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacttgtacattttgtagtaaggagagtagatctgatgaagggtagttatatca 35713815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 46355983 - 46355858
Alignment:
Q  156 agaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccact 255  Q
    |||||| ||||  ||||||||| || | ||||| ||||| |||||| |||| ||||||| |||| ||||  || ||||||||||| || ||||| |||||    
T  46355983 agaaaccattagaaaggatttaaaggtcaatgagttggatccaaatctggtgtatgatagaacactatgccatcatttgatccatgtagccgaccccact 46355884  T
Q  256 tagtgggataagacttgattgttgtt 281  Q
    ||||| |||||| |||| ||||||||    
T  46355883 tagtgagataaggcttggttgttgtt 46355858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 126 - 286
Target Start/End: Original strand, 22174124 - 22174281
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||||||||||| || || ||||||| ||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||| ||   ||||||||| | ||||| |||||||||    
T  22174124 gaggcagaggaaaacgtagaaaaactataagagaaactataaacaaagatctagagattaatgaattagatagaaatatggtatgtgatagaacattatg 22174223  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgtata 286  Q
    |  |  |||||||||| || ||||| ||||| |    ||| || ||||||||||||||||||    
T  22174224 gcgttgtttgatccatgtagccgaccccactaa----gatgaggcttgattgttgttgtata 22174281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 283
Target Start/End: Original strand, 25891086 - 25891170
Alignment:
Q  199 aatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||  |||||| |||| ||||||||||    
T  25891086 aatatggtttataatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtacgataaggcttggttgttgttgt 25891170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 155 - 283
Target Start/End: Original strand, 29650538 - 29650666
Alignment:
Q  155 gagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccac 254  Q
    ||||||| ||||  || ||||||||| | ||||| || || ||||||||||| | ||||| |||| || ||  | ||||||||||| || ||||| ||||    
T  29650538 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagtttgatccaaatatggtttttgatagaacactaaggcgtcatttgatccatgtagccgaccccac 29650637  T
Q  255 ttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  29650638 ttagtgggataaggcttggttgttgttgt 29650666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 172 - 284
Target Start/End: Original strand, 48919283 - 48919395
Alignment:
Q  172 gatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagactt 271  Q
    ||||||||| | ||||| || || ||||||||||| ||||||||| || |||||  | ||||||||||| ||  |||| ||||||| ||||||||| |||    
T  48919283 gatttagaggtcaatgagtttgatccaaatatggtttatgataaaccactatggcgtcatttgatccatgtagtcgaccccacttaatgggataaggctt 48919382  T
Q  272 gattgttgttgta 284  Q
    | |||||||||||    
T  48919383 ggttgttgttgta 48919395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 280
Target Start/End: Original strand, 6374992 - 6375147
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||| ||||||||| |||  |||||| | |||||||| ||||  ||| |||||||| | | ||| ||||| |||||| | || ||||||| |||| ||||    
T  6374992 gaggtagaggaagatctaggaaaactattagagaaaccattagaaagaatttagaggtcagtgagttggatccaaatttagtgtatgatagaacactatg 6375091  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgt 280  Q
    |  | ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  6375092 gcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 6375147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 24434614 - 24434407
Alignment:
Q  33 aaaataagcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcag 132  Q
    |||||| |||| |||| |||| || ||| |||||||||| |||||||| |  | | || || ||||||  |||||| | ||||||||||||   |||||     
T  24434614 aaaataggcttgggtgatttgagcgtgtaaagaaaagacatgtagattttgtagtgagaagggtagattagatggatggtagttagatcactaaaggcaa 24434515  T
Q  133 aggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataat 231  Q
     |||||| ||| ||||| | | | |||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||| |||||||| | || |||| | ||||||| | ||||    
T  24434514 gggaagatctagaaaaattattatagaaactattagaaaagatttagggattaatgaattggactcaaatatgatttaagatacagcattatgatgtaat 24434415  T
Q  232 ttgatcca 239  Q
    ||||||||    
T  24434414 ttgatcca 24434407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 283
Target Start/End: Original strand, 32631735 - 32631846
Alignment:
Q  172 gatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagactt 271  Q
    ||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||| | ||||| |||  |||||  | |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  32631735 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacgctatggcgtcatttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataaggctt 32631834  T
Q  272 gattgttgttgt 283  Q
    | ||||||||||    
T  32631835 ggttgttgttgt 32631846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 286
Target Start/End: Original strand, 33731997 - 33732117
Alignment:
Q  164 ttaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtggga 263  Q
    ||||||| ||| || |||||||||| |  || | ||||||||| ||||||| |||||||||| |  ||||||||||| || |||   |||||||||||||    
T  33731997 ttaagaaagatctaaagattaatgagtgagatcgaaatatggtttatgatagaacattatggca--atttgatccatgtagccggtcccacttagtggga 33732094  T
Q  264 taagacttgattgttgttgtata 286  Q
    |||| |||| |||||||||||||    
T  33732095 taaggcttggttgttgttgtata 33732117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 117 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 1531528 - 1531418
Alignment:
Q  117 agatcacatgaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataa 215  Q
    |||||| | |||| ||||||||||||| ||||||| ||||  ||| ||||| |||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |  ||||     
T  1531528 agatcaaaagaggtagaggaagacctaaaaaaactataagcaaaattattaggaaaaatttagaggttaatgagttggacccaaatatggtttgggatag 1531429  T
Q  216 aacattatggt 226  Q
    |||||||||||    
T  1531428 aacattatggt 1531418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 138 - 267
Target Start/End: Original strand, 3457497 - 3457626
Alignment:
Q  138 gacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgat 236  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||| | |||| |||  | |||||||||| ||||| | |||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3457497 gacctagaaaaactataagaaaaactaattagaaagatcgaaagattaatgagttggatcaaaatattgtttatgataaaacattatggcataatttgat 3457596  T
Q  237 ccatctaaccgactccacttagtgggataag 267  Q
    | || | | |||| | |||||||||||||||    
T  3457597 caatgtgagcgac-ctacttagtgggataag 3457626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 219 - 281
Target Start/End: Original strand, 6263477 - 6263539
Alignment:
Q  219 attatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgtt 281  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  6263477 attatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 6263539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 159 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 8492360 - 8492234
Alignment:
Q  159 aactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttag 258  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||| || ||||| ||| ||||||| ||||||| || | ||||| ||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  8492360 aactgttaggaaagatttagaggttaacgagttggatccatatatggtttatgatagaaaactatggcataatttgatcaatgtaactaaccccacttag 8492261  T
Q  259 tgggataagacttgattgttgttgtat 285  Q
    || |||||| || || |||||||||||    
T  8492260 tgagataaggctcgactgttgttgtat 8492234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 29 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 25579332 - 25579210
Alignment:
Q  29 gtggaaaataagcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgag 128  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||| ||||| ||||||||||    |||| |||||||||  ||||||||||||| | |||||| |||    
T  25579332 gtggaaaataggcttaggtggtttggggatgtagagagaagacatgtagattctgtggtaagaagagtagattagatggaggatagtcaaatcacaagag 25579233  T
Q  129 gcagaggaagacctataaaaact 151  Q
      | | ||||||||| |||||||    
T  25579232 ttaaatgaagacctagaaaaact 25579210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 152 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 36193798 - 36193668
Alignment:
Q  152 taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactc 251  Q
    ||||||| |||||||| || |||| |||||||||||| ||||||   |||||||| ||||||||| |||| | | ||  ||||||| || || | ||| |    
T  36193798 taagagagactattaacaaagattcagagattaatgagttggacaggaatatggtatatgataaagcattgttgcatcgtttgatcaatatagctgaccc 36193699  T
Q  252 cacttagtgggataagacttgattgttgttg 282  Q
    |||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  36193698 cacttagtaggacaagacttggttgttgttg 36193668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 182 - 272
Target Start/End: Original strand, 47852268 - 47852358
Alignment:
Q  182 ttaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttg 272  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||| ||| ||| ||||||||||  ||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  47852268 ttaatgagttggatccaaatgtggtgtatcatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagggggataaggcttg 47852358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 215 - 283
Target Start/End: Original strand, 28708595 - 28708663
Alignment:
Q  215 aaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  28708595 aaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgatgttgt 28708663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 208 - 283
Target Start/End: Original strand, 4604754 - 4604829
Alignment:
Q  208 tatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||| ||||||||||  || |||||||||| || || || |||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  4604754 tatgatagaacattatggcgtactttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataagacttggttcttgttgt 4604829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 154 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 31681149 - 31681022
Alignment:
Q  154 agagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactcca 253  Q
    |||||||| ||||  |||||||||  | | ||||| ||||| ||||||||||  ||||||| || | ||||   ||||||||||||| || ||||| |||    
T  31681149 agagaaaccattagaaaggatttaagggtcaatgagttggatccaaatatggcttatgatagaatactatgacgtaatttgatccatgtagccgacccca 31681050  T
Q  254 cttagtgggataagacttgattgttgtt 281  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  31681049 cttagtgggaaaaggcttggttgttgtt 31681022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 87 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 32368534 - 32368407
Alignment:
Q  87 taaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaa 185  Q
    |||||||| |||||  |||| ||| |||| | |||||  |||||| ||||||| ||| |||| || |||||||| |||||||| | |||||||||||||     
T  32368534 taaggagaatagatcggatgaagggtagtcaaatcactagaggcaaaggaagatctagaaaatctataagagaagctattaaggaagatttagagattag 32368435  T
Q  186 tgaattggacccaaatatggtctatgat 213  Q
    ||| ||||| | ||||||||| ||||||    
T  32368434 tgagttggatcgaaatatggtatatgat 32368407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 188
Target Start/End: Original strand, 40830330 - 40830389
Alignment:
Q  130 cagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatga 188  Q
    |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  40830330 cagaggaagacctagaaaatctataagagaaactattaagaaggatctagaaattaatga 40830389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 29 - 100
Target Start/End: Original strand, 42187497 - 42187568
Alignment:
Q  29 gtggaaaataagcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagat 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||| |  | ||||||||||||||    
T  42187497 gtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtaaagagaaggcctgtagattatgtagtaaggagagtagat 42187568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 196 - 283
Target Start/End: Original strand, 47652742 - 47652829
Alignment:
Q  196 ccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||||||| |  |||| ||||||||||  ||| ||||||| | || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  47652742 ccaaatatggtttcggatagaacattatggcgtaacttgatccctgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 47652829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 110
Target Start/End: Original strand, 28021002 - 28021072
Alignment:
Q  40 gcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggagg 110  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||| ||||  ||||||||||||||||  ||||||||    
T  28021002 gcttaggtggtttgggcatgtagagagaagatttgtaggttctgtaataaggagagtagattagatggagg 28021072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 33349964 - 33349806
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||| |||||||||||||  |||||| | |||||||| ||||  || ||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||| |||  || |||| |||     
T  33349964 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatagtagaacactata 33349865  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |  | ||||||||||| || |||||  |||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  33349864 gcgtcatttgatccatgtagccgacctcacttaatgggataaggcttggttgttgttgt 33349806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 44401277 - 44401170
Alignment:
Q  132 gaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataa 230  Q
    ||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||  | | ||||||| | ||||||| |||||||||   |||    
T  44401277 gaggatgacctagaaaaattataagagaaactattaagaaagatttagagattaacgagtt--atcaaaatatgttttatgatagaacattatgacgtaa 44401180  T
Q  231 tttgatccat 240  Q
    ||||||||||    
T  44401179 tttgatccat 44401170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 230 - 283
Target Start/End: Original strand, 31005434 - 31005487
Alignment:
Q  230 atttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  31005434 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 31005487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 230 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 31869155 - 31869102
Alignment:
Q  230 atttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  31869155 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 31869102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 245 - 286
Target Start/End: Original strand, 41157899 - 41157940
Alignment:
Q  245 ccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgtata 286  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41157899 ccgaccccacttagtgggataaggcttgattgttgttgtata 41157940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 24598315 - 24598188
Alignment:
Q  155 gagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccac 254  Q
    ||||||| ||||  || ||||||||| | ||||| ||| | ||||||||| | | ||||| || ||| ||| || ||||||||||| || ||||||| |     
T  24598315 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaatattttggcatcatttgatccatgtagccgactc-at 24598217  T
Q  255 ttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  24598216 ttaatgggataagacttggttgttgttgt 24598188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 211 - 283
Target Start/End: Original strand, 33281097 - 33281168
Alignment:
Q  211 gataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||   ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  33281097 gatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgga-ccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 33281168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 227 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 44425264 - 44425208
Alignment:
Q  227 ataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| ||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  44425264 ataatttgatccatgtaaccgaccccatttaatgagataagacttgtttgttgttgt 44425208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 152 - 283
Target Start/End: Original strand, 15682325 - 15682456
Alignment:
Q  152 taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactc 251  Q
    |||||||||  ||||  |||||||||||| | ||| | ||||| ||||||||| | ||||||| |||| |||||  || |||||||||| || || || |    
T  15682325 taagagaaatcattagaaaggatttagaggtcaataagttggatccaaatatgatttatgatagaacactatggcgtactttgatccatgtagccaaccc 15682424  T
Q  252 cacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||||| |||||  |||| | ||||||||    
T  15682425 cacttagtgagataaagcttggtagttgttgt 15682456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 130 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 29653700 - 29653641
Alignment:
Q  130 cagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatga 188  Q
    |||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  29653700 cagaagaagaccaagaaaaactgtaagagaaactattaagaaagatctagagattaatga 29653641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 184 - 283
Target Start/End: Original strand, 33073112 - 33073211
Alignment:
Q  184 aatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||| ||||| |||||| |||| ||| |||||||| ||||   | ||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  33073112 aatgagttggatccaaatttggtgtataataaaacaatatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttattgt 33073211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 157 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 34926645 - 34926535
Alignment:
Q  157 gaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccactt 256  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||    || ||||| | ||||||||| ||||||| ||| | ||||  ||||||||||||| || ||||  ||||||    
T  34926645 gaaactattaagaaagatctagagata---gagttggatcgaaatatggtttatgatagaacttaatggcgtaatttgatccatgtagccgatcccactt 34926549  T
Q  257 agtgggataagact 270  Q
    || |||||||||||    
T  34926548 agcgggataagact 34926535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 40 - 111
Target Start/End: Original strand, 39811995 - 39812066
Alignment:
Q  40 gcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggagga 111  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||| ||||  ||||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||    
T  39811995 gcttaggtagtttgggcatgtagagagaagagatgtagattctatagtaaggagagtagatcagatggagga 39812066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 228 - 283
Target Start/End: Original strand, 48515502 - 48515557
Alignment:
Q  228 taatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  48515502 taatttgatccgtgtagccgaccccacttagtgggataagacttggtttttgttgt 48515557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 174 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 5577596 - 5577538
Alignment:
Q  174 tttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatt 232  Q
    |||||||| |||||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||    
T  5577596 tttagagactaatgagttggatccaagtatggtttatgatagaacattatggtgtaatt 5577538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 13859260 - 13859066
Alignment:
Q  32 gaaaataagcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggca 131  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||  ||| |||||  |||||| ||    |||| |||||||||   |||||||| ||| |  | | | |||| |    
T  13859260 gaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgctgtcgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttagaagaggta 13859161  T
Q  132 gaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatgg 225  Q
    ||||||||||||  |||||| | |||||||| ||||  ||||||||||||   ||||| ||||| |||||| |||| ||||||| |||| |||||    
T  13859160 gaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggccaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatgg 13859066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 152 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 24549819 - 24549777
Alignment:
Q  152 taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattgga 194  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  24549819 taagagaaactattaagaaagatctagagattaatgagttgga 24549777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 272
Target Start/End: Original strand, 33103063 - 33103197
Alignment:
Q  139 acctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatc 237  Q
    ||||| ||||||| || |||||| ||||  ||| || |||||||||||||| ||| | |  |||||||| ||||||| ||||  || |  ||||||||||    
T  33103063 acctagaaaaactatacgagaaattattttgaaagacttagagattaatgagttgaatcggaatatggtttatgatagaacaccatagcgtaatttgatc 33103162  T
Q  238 catctaaccgactccacttagtgggataagacttg 272  Q
    ||| || ||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  33103163 catgtagccgaccccacttagtaggataaggcttg 33103197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 194
Target Start/End: Original strand, 5335959 - 5336111
Alignment:
Q  41 cttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagac 140  Q
    |||||||||||||||||| |  ||| ||||  ||| ||||||  | | ||||||||||||  ||||||||  ||| | |||||  |||| || |||| ||    
T  5335959 cttaggtggtttgggcatatagagagaagaactgtggattctgtagttaggagagtagattagatggaggggagtcaaatcactcgaggtaggggaaaac 5336058  T
Q  141 ctataaaaacttaagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattgga 194  Q
    ||  ||||||| | |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  5336059 cttgaaaaact-atgagatactattaagaatgatctagagattaatgagttgga 5336111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 20158726 - 20158669
Alignment:
Q  228 taatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgtat 285  Q
    ||||||||||||| || | ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  20158726 taatttgatccatgtagctgaccctacttagtgggataaggcttggttgttgttgtat 20158669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 238
Target Start/End: Original strand, 23404589 - 23404654
Alignment:
Q  173 atttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatcc 238  Q
    ||||| |||| ||||| || || ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  23404589 atttatagatcaatgagtttgatccaaatatggtgtatgatagaacattatggtgtaattttatcc 23404654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 36245585 - 36245524
Alignment:
Q  103 gatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaacta 163  Q
    |||||||| |||| | |||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36245585 gatggagggtagtcacatcactagagacagaggaagacctataaaaactataagagaaacta 36245524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 36514346 - 36514297
Alignment:
Q  145 aaaaacttaagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattgga 194  Q
    |||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  36514346 aaaaacataagagaagctatcaagaaggatctagagataaatgaattgga 36514297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 283
Target Start/End: Original strand, 40630663 - 40630716
Alignment:
Q  230 atttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  40630663 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgt 40630716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 32 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 7189478 - 7189450
Alignment:
Q  32 gaaaataagcttaggtggtttgggcatgt 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7189478 gaaaataagcttaggtggtttgggcatgt 7189450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 227 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 20525108 - 20525052
Alignment:
Q  227 ataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || | ||||||||||    
T  20525108 ataatttgatccatgtagccgaccccacttagcgggataaggctcggttgttgttgt 20525052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 216 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 27021792 - 27021736
Alignment:
Q  216 aacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttg 272  Q
    |||||||||| | |||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  27021792 aacattatggcacaatttgatccatgttgccgaccccacttagtgggataggacttg 27021736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 179 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 30814229 - 30814145
Alignment:
Q  179 agattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtggga 263  Q
    |||||||| | ||||| | ||||||| | ||||||| ||||||||    ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  30814229 agattaattagttggatcgaaatatgttttatgatagaacattatcacgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtggga 30814145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 210 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 34029749 - 34029677
Alignment:
Q  210 tgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttg 282  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||||| || || || ||||  ||||||||||| |||| |||||||||    
T  34029749 tgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccaaccccaccaagtgggataaggcttggttgttgttg 34029677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 112)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 29 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 39600936 - 39600683
Alignment:
Q  29 gtggaaaataagcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgag 128  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||  |   ||||||||||||  ||| ||||||||| ||||  || |||    
T  39600936 gtggaaaacaagcttaggtggttttggcatgtaaagagaagacctgtagattctgtagcgaggagagtagatcagatcgaggatagtcagattgcaagag 39600837  T
Q  129 gcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggta 227  Q
    | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||| |||| || |||| |||||||||||     
T  39600836 gtagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaagaaagatttagaggttaatgagttggatccaaatctggtttacgatagaacattatggtg 39600737  T
Q  228 taatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgtt 281  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  39600736 taatttgatccatctaaccaaccccactttgtgggataagacttggtttttgtt 39600683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 29 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 45289346 - 45289090
Alignment:
Q  29 gtggaaaataagcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgag 128  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||| || ||||||||||| |  | |||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||    
T  45289346 gtggaaaataggcttaggtggtttgggcacgtagagagaacacttgtagattttgtagtaagaagagtagatcagatggaggatagttagattacaagag 45289247  T
Q  129 gcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggta 227  Q
      ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| | |    
T  45289246 atagaggaagatctatgaaaactataagagaaactattaggaaagatttagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatagca 45289147  T
Q  228 taatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgta 284  Q
    ||||||||||||| |  || || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  45289146 taatttgatccatgtcgccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgta 45289090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Original strand, 54128408 - 54128661
Alignment:
Q  32 gaaaataagcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggca 131  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||  | || || | |||||||||  |||||||| |||| |||||  | |||| |    
T  54128408 gaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagaaaagacctgtagatgatgcagtacgtagagtagatcagatggaggttagtcagatcgaaagaggta 54128507  T
Q  132 gaggaagacctataaaaact--taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtata 229  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||||||||| | ||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||    
T  54128508 gaggaagacctagaaaaactattaagagaaactataaggaaagatttagaggtcaatgagttggacccaaatatggtttatgatagaacattatggcata 54128607  T
Q  230 atttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  54128608 atttgatccatgtaggcgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 54128661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 29 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 42510269 - 42510016
Alignment:
Q  29 gtggaaaataagcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgag 128  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||| ||||| | |||||| |    ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||    
T  42510269 gtggaaaataggcttaggtggtttggacatgt--agagaagacctatagattttgtggtaaggagagtagatcagatggaggatagtcagatcactagag 42510172  T
Q  129 gcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggta 227  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| | |||||||| |||| ||| ||||| || || ||||| ||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||      
T  42510171 gcaaaggaagacctagaaaaactatcagagaaaccattaggaaagatttggaaataaatgagttggaccaaaatatggtttatgattgaacattatggcg 42510072  T
Q  228 taatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||| |||| ||| ||||  |||||||||    
T  42510071 taatttgatccatgtagccgaccccacttagagggaaaaggcttggctgttgttgt 42510016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 39 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 54365222 - 54364974
Alignment:
Q  39 agcttaggtggtttgggcatgt-ga-agaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagagga 136  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||| || || |||||||||||  |||||||||||||||   ||| |||||||| ||| |||  |||||||||||    
T  54365222 agcttaggtggtttgggcatgtagagagagaatacctgtagattctattataaggagagtagatcaaatgaaggatagtcagaccacgagaggcagagga 54365123  T
Q  137 agacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttga 235  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| || || ||||||||||  || |||| ||||||||| ||||||| |||| ||||   ||||||||    
T  54365122 agacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagacttggagattaatgtgttagaccaaaatatggtttatgatagaacactatgacgtaatttga 54365023  T
Q  236 tccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgtat 285  Q
    ||||| || |||||  ||| |||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  54365022 tccatgtagccgaccacac-tagtgggataaggcttggctgttgttgtat 54364974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 87 - 283
Target Start/End: Original strand, 48508320 - 48508517
Alignment:
Q  87 taaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaa 185  Q
    |||| |||||||||  ||||||||| ||| || ||| | |||| |||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||  |||||||||||| | ||    
T  48508320 taagaagagtagatcagatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaa 48508419  T
Q  186 tgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||| |||||  |||||||||| ||||||| |||| |||||  ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  48508420 tgagttggattcaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 48508517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 92 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 50960829 - 50960641
Alignment:
Q  92 agagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaactt-aagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaat 190  Q
    |||||||||  ||||||||| |||  ||||  | |||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| |    
T  50960829 agagtagatcagatggaggagagtcggatcgaaagagggagaggaagacctagaaaaaatttaagagaaactattaggaaaggtttagagattaatgagt 50960730  T
Q  191 tggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttg 279  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| | ||||||||| ||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  50960729 tggatccaaatatggtgtatcatagaccattatggtgtaatttgatccatttagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttg 50960641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 87 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 45487045 - 45486849
Alignment:
Q  87 taaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaa 185  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||  ||| ||    |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| || || ||||||||    
T  45487045 taaggagagtatatgagatggaggatagttagatcactagagaca----aagacctagaaaaactataagagaaactattatgaaagactttgagattaa 45486950  T
Q  186 tgaattggacccaaata---tggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttg 282  Q
    ||| ||||| |||||||   |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  45486949 tgacttggaaccaaataatatggtttatgatagaacattatggcataatttgatccatgtagccggccccacttagtgggataaagcttggttgttgttg 45486850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 153 - 284
Target Start/End: Original strand, 15296059 - 15296190
Alignment:
Q  153 aagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactcc 252  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | |  |||| ||||||||||| ||||||||||||| |  ||||| ||    
T  15296059 aagagaaactattaggaaagatttagaggttaatgaattggatccaaatatgatttcggatagaacattatggtgtaatttgatccatgtggccgacccc 15296158  T
Q  253 acttagtgggataagacttgattgttgttgta 284  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  15296159 acttagtgggataaggcttggttgttgttgta 15296190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 106 - 285
Target Start/End: Original strand, 29475792 - 29475970
Alignment:
Q  106 ggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaacttaagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatgg 205  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| |||| ||  | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||   |||||| |    
T  29475792 ggaggatagttggatcactagaggcagaggaagacctagaaaagctata-agaaactattaagaaagatctagagattaatgagttggattgaaatattg 29475890  T
Q  206 tctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgtat 285  Q
    | ||||||| || | |||||  |||||||| ||||||| || |||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  29475891 tttatgatagaaaactatggcgtaatttgacccatctagccaactccagttagtgggataaggtttggttgttgttgtat 29475970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 179 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 14415363 - 14415258
Alignment:
Q  179 agattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgtt 278  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  14415363 agattaatgagttggacccacatatggtttatgatataacattatggcataatttgat-catgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgtt 14415265  T
Q  279 gttgtat 285  Q
    |||||||    
T  14415264 gttgtat 14415258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 29 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 42026791 - 42026530
Alignment:
Q  29 gtggaaaataagcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgag 128  Q
    ||||||| || |||||||||||||| || |||  ||| || ||||||||||| |  | ||||||||||||||  || |||||||| | | ||| |  |||    
T  42026791 gtggaaactaggcttaggtggtttgagcttgtagagagaaaacttgtagattatttagtaaggagagtagatcagacggaggataatcacatccctagag 42026692  T
Q  129 gcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggta 227  Q
    ||||||||||||| || ||| || ||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||| || ||   ||||||||| ||||||| ||||||||||      
T  42026691 gcagaggaagaccaatcaaagctataagagaaactattaagattgatatagggattaatgagttagatagaaatatggtatatgatagaacattatggcg 42026592  T
Q  228 taatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgtataaat 289  Q
    | ||||||| ||| || ||||| |||| || || ||||||||||| || |||||||| ||||    
T  42026591 ttatttgattcatttagccgaccccacatactgtgataagacttggttcttgttgtagaaat 42026530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 133 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 19676232 - 19676081
Alignment:
Q  133 aggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataat 231  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||| ||||| ||||||||| | ||||||| | ||||||||  | ||    
T  19676232 aggaagacctagaaaaactgtaagagaaactattaggaaaaatttagaggttaatgagttggatccaaatatgctgtatgatagagcattatggcgtgat 19676133  T
Q  232 ttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||||| || | ||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  19676132 ttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttggttgttattgt 19676081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 158 - 272
Target Start/End: Original strand, 19737141 - 19737254
Alignment:
Q  158 aaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccactta 257  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| |||||||    
T  19737141 aaactattaggaaatatttagagattaatgagttggatctcaatatggtttatgataaaacattatggtataatttgatccatgt-agcgaccccactta 19737239  T
Q  258 gtgggataagacttg 272  Q
    |||||||||| ||||    
T  19737240 gtgggataaggcttg 19737254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 87 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 23534767 - 23534613
Alignment:
Q  87 taaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaa 185  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||| | ||||| | ||| ||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  23534767 taaggagagtagatcagatggatgatagttagatcactagaggtagaggaagacccaaaaaaattataacagaaactattaggaaagacttagagattaa 23534668  T
Q  186 tgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccat 240  Q
    ||| ||||||   |||||| | ||||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  23534667 tgagttggactgtaatatgatttatgatagaacattatggcgtaatttgatccat 23534613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 179 - 283
Target Start/End: Original strand, 40991609 - 40991713
Alignment:
Q  179 agattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgtt 278  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || | ||| |||||||||| |||||||||||  ||||    
T  40991609 agattaatgagttggaccaaaatatggtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtgagataagacttggctgtt 40991708  T
Q  279 gttgt 283  Q
    |||||    
T  40991709 gttgt 40991713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 152 - 283
Target Start/End: Original strand, 49042087 - 49042219
Alignment:
Q  152 taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatgg-tctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgact 250  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| |||| |||||  ||||||||||||| || |||||     
T  49042087 taagagaaactattaggaaagatttagaggttaatgagttggatccaaatatggttttatgatagaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgacc 49042186  T
Q  251 ccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |||||| ||| |||||| |||| ||||||||||    
T  49042187 ccacttggtgagataaggcttggttgttgttgt 49042219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 126 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 12096863 - 12096705
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||| |||||||||||||  |||||| | ||| |||| ||||  |||||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||| ||||||| |||| ||||    
T  12096863 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagaaaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatg 12096764  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |  | ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  12096763 gcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 12096705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 158 - 272
Target Start/End: Original strand, 19758044 - 19758157
Alignment:
Q  158 aaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccactta 257  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||| |  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | |||| |||||||    
T  19758044 aaactattaggaaatatttagagattaatgagttggatctcaatatggtttatgatagaacattatggtataatttgatccatgt-agcgaccccactta 19758142  T
Q  258 gtgggataagacttg 272  Q
    |||||||||| ||||    
T  19758143 gtgggataaggcttg 19758157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 161 - 283
Target Start/End: Original strand, 29601052 - 29601174
Alignment:
Q  161 ctattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtg 260  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||| || ||||||| ||||||||| | ||||||||||||| || | ||| ||||||||||    
T  29601052 ctattaagaaagatttagagattaatgagttggattcaaatatagtttatgatagaacattatgatgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtg 29601151  T
Q  261 ggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||| | |||| || |||||||    
T  29601152 ggatacggcttggttcttgttgt 29601174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 108 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 40116644 - 40116530
Alignment:
Q  108 aggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggt 206  Q
    |||||||| |||||||  ||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  40116644 aggatagtcagatcactagagccaaaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggatagatttagagattaatgagttggaccgaaatatggt 40116545  T
Q  207 ctatgataaaacatt 221  Q
     ||||||| ||||||    
T  40116544 ttatgatagaacatt 40116530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 126 - 283
Target Start/End: Original strand, 52138924 - 52139082
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||| |||||||||||||  |||||| | |||||||| ||||  |||||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||| ||||||| |||| ||||    
T  52138924 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatg 52139023  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
       | ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  52139024 acgttatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 52139082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 32 - 224
Target Start/End: Original strand, 39235168 - 39235361
Alignment:
Q  32 gaaaataagcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggca 131  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||||  |  | || | |||||||||  ||||||||| ||| |||||| | |||| |    
T  39235168 gaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacctgtagatgttgtagtacgaagagtagatcagatggaggaaagtcagatcaaaagaggta 39235267  T
Q  132 gaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||||||||| | ||||||| || || ||||||||| ||| ||||||||  ||||||| ||||| | ||||||||| || |||| |||||||||    
T  39235268 gaggaagacccaaaaaaactataggataaactattaggaaagatttagaagttaatgagttggatctaaatatggtttacgatagaacattatg 39235361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 126 - 283
Target Start/End: Original strand, 5168956 - 5169114
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||| |||||||||||||  |||||  | |||||||| ||||  ||||||||| || | ||||| ||||| ||||||||||| | ||||| |||| ||||    
T  5168956 gaggtagaggaagacctaagaaaaccattagagaaaccattagaaaggatttataggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatg 5169055  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |  | ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  5169056 gcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 5169114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 126 - 240
Target Start/End: Original strand, 49841742 - 49841855
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaacttaagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatgg 225  Q
    |||| ||||||||||| | |||||  |||||||||||||||| || ||| || |||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  49841742 gaggtagaggaagacc-agaaaaaaataagagaaactattaacaaagatctaaagattaatgagttggatcgaaatatggtatatgatagaacattatgg 49841840  T
Q  226 tataatttgatccat 240  Q
     ||||||||||||||    
T  49841841 cataatttgatccat 49841855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 154 - 283
Target Start/End: Original strand, 38060867 - 38060996
Alignment:
Q  154 agagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactcca 253  Q
    |||||||| ||||  |||| ||||||  | ||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||  ||||  ||||||||||||| || ||||| |||    
T  38060867 agagaaaccattagaaaggttttagaagtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacaccatggcgtaatttgatccatgtagccgacccca 38060966  T
Q  254 cttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  38060967 cttagtgggataagaattggttgttgttgt 38060996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 172 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 40116449 - 40116349
Alignment:
Q  172 gatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagactt 271  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||  || |||||  | |||||||||||||| |||    
T  40116449 gatttagagattaatgagttggaccgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccacgtagccgacctcgcttagtgggataaggctt 40116350  T
Q  272 g 272  Q
    |    
T  40116349 g 40116349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 105 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 41482318 - 41482183
Alignment:
Q  105 tggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaactt--aagagaaactattaagaagga-tttagagattaatgaattggacccaaat 201  Q
    ||||||| |||  ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||| ||| ||||    
T  41482318 tggaggacagtcggatcactagaggcagaggaagacctagaaaaacttttaagagaaactattaggaaagactttggagattaatgagttgaaccaaaat 41482219  T
Q  202 atggtctatgataaaacattatggtataatttgatc 237  Q
     |||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  41482218 ctggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatc 41482183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 281
Target Start/End: Original strand, 659562 - 659805
Alignment:
Q  39 agcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaag 138  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| || | |||||||||||  | |||| ||||| ||   || ||||  |||| | |||||  |||||| ||||||    
T  659562 agcttaggtggtttgggcatgtagagagaaaatttgtagattctgtagtaagcagagttgaccagagggagagtagtgaaatcactagaggcaaaggaag 659661  T
Q  139 acctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatc 237  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| || |||| | ||||| |||||||||| |||||     ||||  | ||||||| |||||||||| |   |||||||    
T  659662 acctagaaaaactgtaagagaaaccatcaagatgtatttacagattaatgagttggatagggatattatatatgatagaacattatggcagtgtttgatc 659761  T
Q  238 catctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgtt 281  Q
    ||| || ||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  659762 catgtagccgaccccacttagtggggtaaggcttggttgttgtt 659805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 158 - 285
Target Start/End: Original strand, 36304123 - 36304250
Alignment:
Q  158 aaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccactta 257  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||  |||||||||  ||||||||||||| || ||||| ||||| |    
T  36304123 aaactattaagaaagatctagagattaatgagttggatcaaaatatggtttatgataggacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccactca 36304222  T
Q  258 gtgggataagacttgattgttgttgtat 285  Q
     || || ||| || | ||||||||||||    
T  36304223 atgtgacaaggctcggttgttgttgtat 36304250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 182 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 40106721 - 40106618
Alignment:
Q  182 ttaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgtt 281  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||| || ||   ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  40106721 ttaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatgacataatttgatcaatgtagtggaccccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 40106622  T
Q  282 gtat 285  Q
    ||||    
T  40106621 gtat 40106618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 41 - 194
Target Start/End: Original strand, 21200587 - 21200741
Alignment:
Q  41 cttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagac 140  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||||   ||||||  |||| | |||||  | || ||||||||||    
T  21200587 cttaggtggtttgggcatgtagagagaagacatgtagattctgcagtaaggagagtagatcacatggagagtagtcaaatcactagggggagaggaagac 21200686  T
Q  141 ctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattgga 194  Q
    ||| ||||||| | ||| |||||||| |||| ||| |||| |||||||| |||||    
T  21200687 ctagaaaaactattagacaaactatttagaaagatctagatattaatgagttgga 21200741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 89 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 33755537 - 33755419
Alignment:
Q  89 aggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatg 187  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||  ||||||  |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||  | |||||||||||||    
T  33755537 aggagagtagatcagatggaggatggtcggatcactagaggcagaggaaaacctagaaaaactataagagaaactattaggaaaaacttagagattaatg 33755438  T
Q  188 aattggacccaaatatggt 206  Q
    | ||||||| | |||||||    
T  33755437 agttggaccaagatatggt 33755419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 169 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 52156198 - 52156084
Alignment:
Q  169 aaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataaga 268  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||  | || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||     
T  52156198 aaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtcatctgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagg 52156099  T
Q  269 cttgattgttgttgt 283  Q
    || | ||||||||||    
T  52156098 ctcggttgttgttgt 52156084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 154 - 283
Target Start/End: Original strand, 22225 - 22354
Alignment:
Q  154 agagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactcca 253  Q
    |||||||| ||||  |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||| | ||||| |||| |||||  | |||||||| || || ||||| |||    
T  22225 agagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatctatgtagccgacccca 22324  T
Q  254 cttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  22325 cttagtgggataaagcttggttgttgttgt 22354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 176 - 280
Target Start/End: Original strand, 32170580 - 32170684
Alignment:
Q  176 tagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgatt 275  Q
    ||||||||||| | |||||   ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||  |||| ||    
T  32170580 tagagattaataagttggatagaaatatggtctatgatataacattatgacataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgagataaagcttggtt 32170679  T
Q  276 gttgt 280  Q
    |||||    
T  32170680 gttgt 32170684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 136 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 34844721 - 34844589
Alignment:
Q  136 aagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttg 234  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||  | || |||||||||||  ||||||  ||||  || ||||||| |||||||||||||||| ||    
T  34844721 aagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaaaacttggagattaatgaggtggaccagaatactgtttatgatagaacattatggtataatatg 34844622  T
Q  235 atccatctaaccgactccacttagtgggataag 267  Q
    |||||| || ||||| ||||| ||| |||||||    
T  34844621 atccatgtagccgaccccactaagtaggataag 34844589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 196 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 48734234 - 48734146
Alignment:
Q  196 ccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgta 284  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||||||||||  ||| ||||||||| || | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48734234 ccaaacatggtttatgatagaacattatggcgtaagttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttgattgttgttgta 48734146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 196 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 24541419 - 24541340
Alignment:
Q  196 ccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgatt 275  Q
    ||||||||||| || |||| ||||||||||  ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  24541419 ccaaatatggtttaggatagaacattatggcgtaatttgatccatgtacccgaccccacttagtgggataaggcttgatt 24541340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 208 - 283
Target Start/End: Original strand, 31146907 - 31146981
Alignment:
Q  208 tatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  31146907 tatgataaaacat-atggtgtaatttgatccatgtagccgactccacttagtgggataaggctcggttgttgttgt 31146981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 40 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 46431917 - 46431768
Alignment:
Q  40 gcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaaga 139  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| | ||  ||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||| | | |||||  ||||||||| |       
T  46431917 gcttaggtggtttgggcatgt--agagaggatctgtagattctgtagtaaggagagtagataagatggaggatactcaaatcactagaggcagagaa--- 46431823  T
Q  140 cctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattgga 194  Q
     ||| ||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| |||||    
T  46431822 -ctagaaaaactataagagaaactattaaaaaagatctagagattaatgagttgga 46431768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 154 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 47233725 - 47233594
Alignment:
Q  154 agagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactcca 253  Q
    |||||||| ||||  ||||| |||||| | |||||||| || ||||||||||| | ||||| |||| |||||  | ||||||| ||| || ||||| |||    
T  47233725 agagaaaccattagaaaggaattagaggtcaatgaattagatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgattcatgtagccgacccca 47233626  T
Q  254 cttagtgggataagacttgattgttgttgtat 285  Q
     ||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  47233625 gttagtgggataaggcttggttgttgttgtat 47233594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 156 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 49503695 - 49503568
Alignment:
Q  156 agaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccact 255  Q
    ||||||||||| ||| ||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||| |  |||| || |||||||  ||||||||||||| || ||||| | |||    
T  49503695 agaaactattaggaaagatttaacggttaatgagttgggtccaaatatggttttggatataatattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccctact 49503596  T
Q  256 tagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  49503595 tagtgggataaggcttggttgttgttgt 49503568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 196 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 52927935 - 52927852
Alignment:
Q  196 ccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttg 279  Q
    ||||||||||| || || | |||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  52927935 ccaaatatggtttacgacagaacattatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttg 52927852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 172 - 283
Target Start/End: Original strand, 53262312 - 53262423
Alignment:
Q  172 gatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagactt 271  Q
    ||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||| | ||||| |||| |||||  | |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  53262312 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataaggctt 53262411  T
Q  272 gattgttgttgt 283  Q
    | ||||||||||    
T  53262412 ggttgttgttgt 53262423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 210 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 24778682 - 24778608
Alignment:
Q  210 tgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgta 284  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  24778682 tgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggctgttgttgta 24778608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 30797930 - 30797820
Alignment:
Q  175 ttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgat 274  Q
    |||||||||| | | ||||| |||||| | || ||||||| |||||||||   |||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| |||| |    
T  30797930 ttagagattattcagttggatccaaatttagtttatgatagaacattatgacgtaatttgatctatgtaaccgaccccacttagtggaataaggcttggt 30797831  T
Q  275 tgttgttgtat 285  Q
    |||||||||||    
T  30797830 tgttgttgtat 30797820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 31454371 - 31454225
Alignment:
Q  138 gacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgat 236  Q
    |||||| ||||||| |||| |||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||   | | ||||| | ||||| |||| |||||  | |||||||    
T  31454371 gacctagaaaaactataagggaaactattaattaggatctagatattaatgaattggagaaagacatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgat 31454272  T
Q  237 ccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
     ||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  31454271 tcatttagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 31454225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 51447846 - 51447717
Alignment:
Q  154 agagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactcca 253  Q
    |||||||| ||||  |||||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||| ||||||| |||| |||||  | ||||||| ||| || ||| | |||    
T  51447846 agagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgattcatgtagccggcccca 51447747  T
Q  254 cttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
     ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  51447746 tttagtgggataaggcttggttgttgttgt 51447717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 272
Target Start/End: Original strand, 55244408 - 55244553
Alignment:
Q  133 aggaagacctataaaaact--taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataa 230  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||||| | |||||||  || ||||||||||||| |||||   ||||||||| ||||||| ||||||||||| |      
T  55244408 aggaagacctagaaaaactcttaagagaaattcttaagaaaaatctagagattaatgagttggatagaaatatggtatatgatagaacattatggtgtcg 55244507  T
Q  231 tttgatccat----ctaaccgactccacttagtgggataagacttg 272  Q
    ||||||||||    || ||| || || |||||||||||||||||||    
T  55244508 tttgatccatgaagctgaccaaccccgcttagtgggataagacttg 55244553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 131 - 284
Target Start/End: Original strand, 11284122 - 11284271
Alignment:
Q  131 agaggaagacctataaaaacttaagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataa 230  Q
    ||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| |    ||||||||||||| |||||   ||||||||| ||||||  |||||||| | ||      
T  11284122 agaggaagacctagaaaactataagagaaactattaagatg----tagagattaatgagttggatataaatatggtatatgattgaacattattgcatcg 11284217  T
Q  231 tttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgta 284  Q
    |||||||||| || || || || ||||||| |||||| |||| |||||||||||    
T  11284218 tttgatccatgtagccaaccccgcttagtgagataaggcttgcttgttgttgta 11284271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 201 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 31566243 - 31566159
Alignment:
Q  201 tatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgtat 285  Q
    |||||| | ||||| |||| |||||| | ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  31566243 tatggtttttgatagaacactatggtgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtat 31566159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 37598366 - 37598259
Alignment:
Q  87 taaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaacttaagagaaactattaagaaggatttagagattaat 186  Q
    |||| |||||||||  |||| ||  |||||| |||||  |||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||    
T  37598366 taagaagagtagatcagatgaagcgtagttaaatcaccagaggcagaagatgacctagaaaaacttaagagaaactattaagatatatctagagattaat 37598267  T
Q  187 gaattgga 194  Q
    || |||||    
T  37598266 gagttgga 37598259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 222
Target Start/End: Original strand, 38430938 - 38431069
Alignment:
Q  92 agagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaactt-aagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaat 190  Q
    |||||||||  ||||||||| ||| | |||| | |||| |||||||||| || |||||||  |||||||||||||  | | | ||||||| ||||||| |    
T  38430938 agagtagatcagatggaggagagtcaaatcaaaagaggtagaggaagacttagaaaaactacaagagaaactattgtggaaggtttagaggttaatgagt 38431037  T
Q  191 tggacccaaatatggtctatgataaaacatta 222  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||    
T  38431038 tggatccaaatatggtttatgatagaacatta 38431069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 47555431 - 47555332
Alignment:
Q  184 aatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||| ||||| |||||| |||| ||||||| |||| |||||  | ||||||||||| || || || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  47555431 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 47555332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 39 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 31261186 - 31261049
Alignment:
Q  39 agcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaag 138  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||| ||||  |||||||| |  | ||| | ||||||||  |||||||| |||| | |||||  |||||||||||||    
T  31261186 agcttagatggtttgggcatgttgagagaagatatgtagattttgtagtaatgtgagtagatcagatggagg-tagtcaaatcactagaggcagaggaag 31261088  T
Q  139 acctataaaaact-taagagaaactattaagaaggattt 176  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  31261087 acctagaaaaactataagagaaactatcaagaaagattt 31261049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 104 - 257
Target Start/End: Original strand, 37228184 - 37228338
Alignment:
Q  104 atggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaac-ttaagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaata 202  Q
    ||||||| |||| | |||||  ||||||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||   | |||    
T  37228184 atggagggtagtcaaatcactagaggcagagaaagacctataaaaacgataagggaaactattaagaaagacttagaaattaacgagttggataaagata 37228283  T
Q  203 tggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccactta 257  Q
    || |  ||| || ||||||||||  |  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  37228284 tgataaatggtagaacattatggcgtcgtttgatccatttaaccgactccactta 37228338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 2133725 - 2133612
Alignment:
Q  170 aggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagac 269  Q
    ||||| ||||| | ||||| ||| | |||||||| || ||||||| |||| |||||  | ||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| |    
T  2133725 aggatgtagaggtcaatgagttgaatccaaatatagtttatgatagaacactatggcgtgatttgatccatgtactcgaccccacttagtgggataaggc 2133626  T
Q  270 ttgattgttgttgt 283  Q
    ||| ||||||||||    
T  2133625 ttggttgttgttgt 2133612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 284
Target Start/End: Original strand, 35033300 - 35033429
Alignment:
Q  155 gagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccac 254  Q
    ||||||| ||||  || ||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||| | ||||| |||| |||||  | ||||||||||| || |||||  ||     
T  35033300 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgttatttgatccatgtagccgacctcat 35033399  T
Q  255 ttagtgggataagacttgattgttgttgta 284  Q
     |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  35033400 ctagtgggataaggcttggttgttgttgta 35033429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 283
Target Start/End: Original strand, 53519737 - 53519862
Alignment:
Q  158 aaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccactta 257  Q
    |||| ||||| || ||||||||| | ||||| ||||| ||||||| ||| | ||||| |||| ||||   | ||||||||||| || ||||| |||||||    
T  53519737 aaaccattaaaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaataaggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgaccccactta 53519836  T
Q  258 gtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||| |||||| |||| ||||||||||    
T  53519837 gtgagataaggcttggttgttgttgt 53519862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 257
Target Start/End: Original strand, 37228052 - 37228184
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaac-ttaagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    ||||||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||   | ||||| |  ||| || |||||||||    
T  37228052 gaggcagagaaagacctataaaaacgataagggaaactattaagaaagacttagaaattaatgagttagataaagatatgataaatggtagaacattatg 37228151  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccactta 257  Q
    |  |  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  37228152 gcgtcgtttgatccatttaaccgactccactta 37228184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 48712195 - 48712071
Alignment:
Q  163 attaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtggg 262  Q
    |||| ||| |||||||| ||| |||| |||||  |||||||||| ||||||| |||||||||  || |||| |||||| ||   ||  ||||||||||||    
T  48712195 attaggaaagatttagatattgatgagttggattcaaatatggtttatgatataacattatgacattatttcatccatgtagttgatcccacttagtggg 48712096  T
Q  263 ataagacttgattgttgttgtataa 287  Q
    ||||  |||| ||||||||||||||    
T  48712095 ataatgcttggttgttgttgtataa 48712071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 172 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 311420 - 311309
Alignment:
Q  172 gatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagactt 271  Q
    ||||||||| | ||| | ||||| ||| ||||||| | ||||| |||| |||||  | ||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  311420 gatttagaggtcaattagttggatccagatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatacatgtagccgaccccacttagtgggataaggctt 311321  T
Q  272 gattgttgttgt 283  Q
    | ||||||||||    
T  311320 ggttgttgttgt 311309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 196 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 7895967 - 7895880
Alignment:
Q  196 ccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |||||| |||| ||||||| |||| |||||  | ||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  7895967 ccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatgggataaggcttggttgttgttgt 7895880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 282
Target Start/End: Original strand, 26490437 - 26490596
Alignment:
Q  124 atgaggcagaggaagacctataaaaactt-aagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacatta 222  Q
    ||||||||| ||||||  || |||||||  ||||||||||||||  || |||||||||| |||||| || || |||||| || | |   ||| || ||||    
T  26490437 atgaggcagtggaagatatagaaaaactagaagagaaactattagaaaagatttagagactaatgagtttgatccaaatgtgatttcatatagaatatta 26490536  T
Q  223 tggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttg 282  Q
    |||  ||||||||||||| ||  |||  |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  26490537 tggcgtaatttgatccatatagtcgatcccacttagtaagataagacttgattgttgttg 26490596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 120 - 194
Target Start/End: Original strand, 27893207 - 27893282
Alignment:
Q  120 tcacatgaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattgga 194  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||    
T  27893207 tcacttgaggtagaggaagacctagaaagactataagagaaactattaaaaaggacctagagattaatgagttgga 27893282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 208 - 283
Target Start/End: Original strand, 46148235 - 46148310
Alignment:
Q  208 tatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  46148235 tatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggtcaaggcttggttgttgttgt 46148310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 283
Target Start/End: Original strand, 28245561 - 28245719
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||| ||| |||||||||  |||||| | |||||||| ||||  || ||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||| ||| ||| |||| ||||    
T  28245561 gaggtagatgaagacctaggaaaactattagagaaacgattagaaatgatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtataatagaacactatg 28245660  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
       | ||||||||||| || ||||  |||||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  28245661 acgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgagataaggcttgattgctgttgt 28245719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 143
Target Start/End: Original strand, 50249430 - 50249528
Alignment:
Q  45 ggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagaccta 143  Q
    ||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||||  | ||||||||||||||  ||||| ||||||| | |||||  |||| |||||||||||||    
T  50249430 ggtggtttgggcatgtagagtgaagacatgtagattctttagtaaggagagtagatcagatgggggatagtcatatcaccagaggtagaggaagaccta 50249528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 30294279 - 30294125
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||| ||||||||||||| || |||| ||||| |||||||||| || |||||| || | ||||| ||||| | || |||| | |||||||||||| ||||    
T  30294279 gaggtagaggaagacctagaagaactataagataaactattaaaaaagatttataggtcaatgagttggatctaagtatgatttatgataaaacactatg 30294180  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgtt 281  Q
    |   |||||| || || ||||| ||   |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  30294179 g--caatttgttctatgtaaccaaccttacttagtgggataaaacttggttgttgtt 30294125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 158 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 36049427 - 36049309
Alignment:
Q  158 aaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccactta 257  Q
    ||||||||| ||| |||||| | |||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||||| ||| |  |||||||||  || || ||| | |||||||    
T  36049427 aaactattaggaaagatttaaaaattaatgaattggatcaaaatatggcctatgattaaacactatagcgtaatttgat--atgtagccggccccactta 36049330  T
Q  258 gtgggataagacttgattgtt 278  Q
    |||||||| | |||| |||||    
T  36049329 gtgggatagggcttggttgtt 36049309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 190 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 45374570 - 45374477
Alignment:
Q  190 ttggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||| |||| |||||| |  |||| ||||||||||  |||||| |||||| || | ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  45374570 ttggatccaactatggtttcggatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 45374477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 19162740 - 19162676
Alignment:
Q  131 agaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattgga 194  Q
    |||||||||||||  ||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  19162740 agaggaagacctaggaaatctataagagaaactattaggaaagatttagagattaatgagttgga 19162676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 283
Target Start/End: Original strand, 25191531 - 25191659
Alignment:
Q  155 gagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccac 254  Q
    ||||||| ||||  || ||||||||| | |||||||| || | ||||||||| | ||||| |||| |||||  | ||||||||||| || | ||  ||||    
T  25191531 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgaattagatcaaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagctgatcccac 25191630  T
Q  255 ttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  25191631 ttagtgggataatgcttggttgttgttgt 25191659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 219 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 29928358 - 29928294
Alignment:
Q  219 attatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||    
T  29928358 attatggcataatttgatcaatataaccgaccccacttagtgggacaaagcttgattgtagttgt 29928294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 219 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 29977512 - 29977448
Alignment:
Q  219 attatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||    
T  29977512 attatggcataatttgatcaatataaccgaccccacttagtgggacaaagcttgattgtagttgt 29977448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 284
Target Start/End: Original strand, 38850304 - 38850404
Alignment:
Q  184 aatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||||| |  ||||| |||| ||||||| |||| ||||   ||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||| ||||  ||||||||||    
T  38850304 aatgaattgaattcaaatttggtttatgatagaacactatgacgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtaggataaaacttagttgttgttgt 38850403  T
Q  284 a 284  Q
    |    
T  38850404 a 38850404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 283
Target Start/End: Original strand, 39208790 - 39208890
Alignment:
Q  183 taatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttg 282  Q
    |||||| | ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||   ||||||||||||| ||   ||| ||| ||||||||||| | |||| |||||||||    
T  39208790 taatgagtaggatccaaatatggtttatgatagaacattatgacgtaatttgatccatgtagaggaccccagttagtgggatatggcttggttgttgttg 39208889  T
Q  283 t 283  Q
    |    
T  39208890 t 39208890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 228 - 280
Target Start/End: Original strand, 41529988 - 41530040
Alignment:
Q  228 taatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgt 280  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  41529988 taatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 41530040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 208 - 283
Target Start/End: Original strand, 7120790 - 7120865
Alignment:
Q  208 tatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |||||||||| ||||||   ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| | | || ||||||||||    
T  7120790 tatgataaaatattatgacgtaatttgatccatataaccgataccacttagtgggatatggcctggttgttgttgt 7120865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 139 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 36820122 - 36820067
Alignment:
Q  139 acctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattgg 193  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  36820122 acctagaaaaactataagagaaactattaagaaagatctagagattaatgagttgg 36820067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 216 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 37083359 - 37083292
Alignment:
Q  216 aacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||||||  ||||||| ||| | || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  37083359 aacattatggcgtaatttggtccttgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 37083292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 134 - 188
Target Start/End: Original strand, 41087876 - 41087931
Alignment:
Q  134 ggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatga 188  Q
    |||||||||  ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41087876 ggaagacctggaaaaactataaaagaaattattaagaaggatttagagattaatga 41087931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 86 - 192
Target Start/End: Original strand, 43254975 - 43255082
Alignment:
Q  86 ataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagatta 184  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||  ||| |||||||  |||| || || ||||||| ||||||| | ||||||||||| | ||||||| ||||||| |    
T  43254975 ataaggagagtagttcagatggagggaagtcagatcactagaggtaggggtagacctagaaaaactatgagagaaactatcaggaaggatctagagataa 43255074  T
Q  185 atgaattg 192  Q
    ||||||||    
T  43255075 atgaattg 43255082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 219 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 52882726 - 52882659
Alignment:
Q  219 attatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgtata 286  Q
    |||||||  ||||||||||||| || || || ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  52882726 attatggcgtaatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggagaaggcttggttgttgttgtata 52882659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 126 - 272
Target Start/End: Original strand, 54279144 - 54279291
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||| ||| |||||||||  |||||| | |||||||| ||||  |||||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||| ||||||| |||| ||||    
T  54279144 gaggtagaagaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatg 54279243  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttg 272  Q
    |  | |||||||| || || ||||  ||||||| |  |||||||||||    
T  54279244 gcgtcatttgatcaatgtagccgatcccacttaataagataagacttg 54279291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 131 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 2340870 - 2340812
Alignment:
Q  131 agaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatga 188  Q
    |||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  2340870 agagaaagacctaggaaaactataagagaaactattaagaaagatctagagattaatga 2340812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 24084368 - 24084322
Alignment:
Q  237 ccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  24084368 ccatgtaaccgactccacttagtgggataaggtttggttgttgttgt 24084322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 251 - 285
Target Start/End: Original strand, 50891993 - 50892027
Alignment:
Q  251 ccacttagtgggataagacttgattgttgttgtat 285  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  50891993 ccacttagtgggataagacttggttgttgttgtat 50892027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 349 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 52480201 - 52480159
Alignment:
Q  349 attttgttaggttgagttaggtccaacccaaattctaatatgg 391  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  52480201 attttgtaaggttgagttaggtccaacacaaattctaagatgg 52480159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 388387 - 388262
Alignment:
Q  158 aaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccactta 257  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||| |  ||   ||||| ||| ||||||| | |||||||   |||||||||| || || || || |||||||    
T  388387 aaactatttagaaagttttagagattaatgagtaagatagaaatacggtatatgatagagcattatgacgtaatttgatcaatgtagccaaccccactta 388288  T
Q  258 gtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |||||||||| |||| |||| |||||    
T  388287 gtgggataaggcttggttgtcgttgt 388262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 3870688 - 3870615
Alignment:
Q  40 gcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggata 113  Q
    |||||| |||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||| | | ||||||||| ||  |||||||||||    
T  3870688 gcttagatggttttggcatgtagagagaagacttgtagattctatagttaggagagtaaatcagatggaggata 3870615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 221 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 21862803 - 21862742
Alignment:
Q  221 tatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttg 282  Q
    |||||| | ||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  21862803 tatggtgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttgcttgttgttg 21862742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 194
Target Start/End: Original strand, 26990345 - 26990406
Alignment:
Q  134 ggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattgga 194  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  26990345 ggaagacctagaaaaactattagagaaactatcaagaaggatctagagatcaatgagttgga 26990406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 198 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 31337645 - 31337556
Alignment:
Q  198 aaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgtataa 287  Q
    ||||||||| | ||||| |||||||||  ||  ||||||| || ||||||||  |||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||    
T  31337645 aaatatggtatttgatagaacattatgacattgtttgatctatttaaccgacctcacttagtggtataaagcttggttgttgttgtataa 31337556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 214
Target Start/End: Original strand, 44571599 - 44571640
Alignment:
Q  173 atttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgata 214  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  44571599 atttagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgata 44571640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 45834653 - 45834600
Alignment:
Q  230 atttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||||||| || || || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  45834653 atttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 45834600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 94 - 178
Target Start/End: Original strand, 46146188 - 46146273
Alignment:
Q  94 agtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttag 178  Q
    |||||||| ||||  ||||||| | |||||  |||||| ||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  46146188 agtagataagatgatggatagtcaaatcactagaggcataggaagatctagaaaaactataaaagaaactattaagaatgatttag 46146273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 52678997 - 52678893
Alignment:
Q  135 gaagacctataaaaacttaagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttg 234  Q
    |||||||||  |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||| |  |||||||| |  |||||| || ||||| |  |||||||    
T  52678997 gaagacctaggaaaact-aagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttgaattcaaatatgattcatgatataatattatagcgtaatttg 52678899  T
Q  235 atccat 240  Q
    ||||||    
T  52678898 atccat 52678893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 350 - 399
Target Start/End: Original strand, 54861606 - 54861655
Alignment:
Q  350 ttttgttaggttgagttaggtccaacccaaattctaatatggtatcagag 399  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  54861606 ttttgttaggttgagttacgcccaacccaaattttaagatggtatgagag 54861655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 283
Target Start/End: Original strand, 3987564 - 3987616
Alignment:
Q  231 tttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |||||| ||| || ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  3987564 tttgattcatgtacccgaccccactttgtgggataagacttggttgttgttgt 3987616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 230 - 286
Target Start/End: Original strand, 7278693 - 7278749
Alignment:
Q  230 atttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgtata 286  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  7278693 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaagcttagttgttgttgtata 7278749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 360 - 396
Target Start/End: Original strand, 10485124 - 10485160
Alignment:
Q  360 ttgagttaggtccaacccaaattctaatatggtatca 396  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  10485124 ttgagttaggcctaacccaaattctaatatggtatca 10485160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 20262489 - 20262421
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattgg 193  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||||    
T  20262489 gaggcagaggaagaccaataaaaactataagataatctatcaagaaagatctagagatcaatgagttgg 20262421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 245 - 285
Target Start/End: Original strand, 33307363 - 33307403
Alignment:
Q  245 ccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgtat 285  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||    
T  33307363 ccgactccacttcgtgggataagacttggctgttgttgtat 33307403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 235 - 283
Target Start/End: Original strand, 39512777 - 39512825
Alignment:
Q  235 atccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  39512777 atccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 39512825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 251 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 41230547 - 41230515
Alignment:
Q  251 ccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41230547 ccacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 41230515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 152 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 41842654 - 41842566
Alignment:
Q  152 taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccat 240  Q
    ||||| ||||||| ||||  ||| ||||| ||||||| || ||   ||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  41842654 taagaaaaactataaagatagatctagaggttaatgagttagattgaaatatggtttttgatagaacattatggtgtaatttgatccat 41842566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 208 - 283
Target Start/End: Original strand, 48532164 - 48532240
Alignment:
Q  208 tatgataaaacattatggtataatttgatcca-tctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||| |||| |||||  | |||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  48532164 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccaatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 48532240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 167 - 281
Target Start/End: Original strand, 49888356 - 49888467
Alignment:
Q  167 agaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataa 266  Q
    |||| ||||| || |||||||| ||||||  ||||||||| |||||   |||||||||   ||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||| ||    
T  49888356 agaatgattttgaaattaatgagttggactgaaatatggtttatga---aacattatgacgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagttggaaaa 49888452  T
Q  267 gacttgattgttgtt 281  Q
    |  ||| ||||||||    
T  49888453 ggtttggttgttgtt 49888467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 358 - 386
Target Start/End: Original strand, 50070736 - 50070764
Alignment:
Q  358 ggttgagttaggtccaacccaaattctaa 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50070736 ggttgagttaggtccaacccaaattctaa 50070764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 214 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 53214940 - 53214868
Alignment:
Q  214 aaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgtata 286  Q
    |||||||| |||  |||||||||||||  | ||||| ||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||    
T  53214940 aaaacattctggcgtaatttgatccatgcagccgaccccatttagtcggataaggcttggttgttgttgtata 53214868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 103)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 47 - 284
Target Start/End: Original strand, 29520695 - 29520932
Alignment:
Q  47 tggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataa 146  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |  | ||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||| |||| |||||||| |||| ||    
T  29520695 tggtttgggcatgtagagagaagacttgtagattttgtagtaaggagagtagatcagatggaggatagtcaaatcacaagaggtagaggaag-cctagaa 29520793  T
Q  147 aaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaac 245  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||| || |    
T  29520794 aaactataagagaaactgttaggaacgatttagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagc 29520893  T
Q  246 cgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgta 284  Q
    | || ||| ||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  29520894 ccaccccatttagtgggataatgcttggttgttgttgta 29520932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 46 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 35914839 - 35914599
Alignment:
Q  46 gtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctata 145  Q
    |||||||||||| ||  ||| ||||| | |||||| || |  ||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||||||||| || |    
T  35914839 gtggtttgggcacgtagagagaagacctatagattttatagcaaggagagtaggtcagatggaggatagtcagatccctagagacagaggaagacataga 35914740  T
Q  146 aaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaa 244  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| || ||  |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||     
T  35914739 aaaactataagagaaactattaggaaagacttgaagattaatgagttggaccaaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtag 35914640  T
Q  245 ccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgtat 285  Q
    | ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  35914639 ctgaccccacttagtgagataagacttggttgttgttgtat 35914599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 87 - 279
Target Start/End: Original strand, 32931046 - 32931238
Alignment:
Q  87 taaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaa 185  Q
    |||||||| |||||  ||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| || |||||    
T  32931046 taaggagactagatcagatggaggatagtcatatcactagaggcagaggaagacctaaaaaaactatcagagaaactattaggaaagattttgaaattaa 32931145  T
Q  186 tgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttg 279  Q
    ||| ||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||    
T  32931146 tgagttggacg-aaatatggtgtatgatagaacattatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaagccttggttgttg 32931238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 41 - 284
Target Start/End: Original strand, 45419276 - 45419518
Alignment:
Q  41 cttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagac 140  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||  |||  || |  |||||||||  ||||||||| ||| |||||  | |||| ||||||||||    
T  45419276 cttaggtggtttgggcatgtagagataagacctgtagaggctagtatga--agagtagatcagatggaggagagtcagatctgaagaggtagaggaagac 45419373  T
Q  141 ctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatcca 239  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||| ||| | |||| |   |||||| || || |||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  45419374 ctagaaaaactataagagaaactattaggaaaggtttaaatcataatgagtttgatccaaatttggtttatgatagaacattatggtgtaatttgatcca 45419473  T
Q  240 tctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgta 284  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  45419474 tgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgta 45419518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Original strand, 30559723 - 30559980
Alignment:
Q  32 gaaaataagcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggca 131  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |  ||| ||||| |||||||| |  | |||||| ||| |||  |||||||||||||  ||||||  |||  |    
T  30559723 gaaaataggcttaggtggtttgggcatttagagagaagacatgtagattttgtagtaaggacagtggatcagatggaggatagtcggatcactagagata 30559822  T
Q  132 gaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataa 230  Q
    || |||||| || ||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||   |||    
T  30559823 gatgaagacttaaaaaaactataagagaaactatcaggaaagatttagagattaatgagttggatccatatatggtttatgatagaacattatgacgtaa 30559922  T
Q  231 tttgatccatctaa-----ccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |||||||||| |||     ||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  30559923 tttgatccatgtaatgtagccgaccccagttagtgggataaggcttggttgttgttgt 30559980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 283
Target Start/End: Original strand, 28169494 - 28169673
Alignment:
Q  104 atggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaata 202  Q
    ||||||||||||  |||  || |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||  ||||||    
T  28169494 atggaggatagtctgattgcaagaggtagaggaagacctaaaaaaactataagagaaactattaggaaagattttgagattaatgagttggattcaaata 28169593  T
Q  203 tggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |||| |||||||||| |||||||| |||||| |||||| ||||| || ||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||    
T  28169594 tggtttatgataaaatattatggtgtaattttatccatataaccaaccccacttagt-ggataaggcttggttgatgttgt 28169673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 40 - 259
Target Start/End: Original strand, 29700314 - 29700534
Alignment:
Q  40 gcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaaga 139  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||||||   | ||||||  | ||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||  |||| |||||||||    
T  29700314 gcttaggtggtttgggcatatagagaaaagaccattggattctgtagtaaggagagtagattagatggaggatagtcatatcactagaggtagaggaaga 29700413  T
Q  140 cctataaaaacttaa-gagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatcc 238  Q
    |||| ||||||| || ||||||||| || ||| || || ||||| ||||| | ||||| |||| | || ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  29700414 cctagaaaaactaaaagagaaactaataggaaagacttggagataaatgagtcggaccaaaattttgtttatgatagaacattatggtgtaatttgatcc 29700513  T
Q  239 atctaaccgactccacttagt 259  Q
    || || |||||||||||||||    
T  29700514 atgtagccgactccacttagt 29700534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 40 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 30783281 - 30783042
Alignment:
Q  40 gcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaaga 139  Q
    |||||||| |||||||| |||  ||||||||| |||||||| |  | ||| ||||||||||     |||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  30783281 gcttaggttgtttgggcttgtagagaaaagacatgtagattttgtagtaaagagagtagat-----ggaggatagtcagatcactagaggcagaggaaga 30783187  T
Q  140 ccta-taaaaacttaagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatcc 238  Q
     ||| ||||| | |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||| | ||||| ||| ||| |||||||||||||   || ||||||||    
T  30783186 tctagtaaaaccataagagaaactatttagaaagatctagagattaatgagttggatcgaaatacggtttataataaaacattatgaggtagtttgatcc 30783087  T
Q  239 atctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    || || ||||| |||  ||||||||||| |||||| |||||||||    
T  30783086 atgtagccgaccccatctagtgggataaaacttgactgttgttgt 30783042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 103 - 283
Target Start/End: Original strand, 2216389 - 2216568
Alignment:
Q  103 gatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaa-cttaagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaat 201  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| || |||    
T  2216389 gatggaggatagtcagatcactagaggtagaggaagacctagaaaaaacataagagaaactattaagaag-atttagagatcaatgagttggatcctaat 2216487  T
Q  202 atggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||| | ||||||| |||||||| || ||||||||||||| || ||||| ||||| |||| |||||| |||| | ||||||||    
T  2216488 atgtt-tatgatagaacattatagtgtaatttgatccatgtagccgaccccactcagtgagataaggcttggtggttgttgt 2216568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 135 - 283
Target Start/End: Original strand, 490470 - 490617
Alignment:
Q  135 gaagacctataaaaacttaagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttg 234  Q
    ||||||||| ||||||| ||  |||||||| | ||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||    
T  490470 gaagacctagaaaaact-aattgaaactataaggaaagatttagagattgatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttg 490568  T
Q  235 atccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  490569 atccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttgtttgttgttgt 490617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 126 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 9905040 - 9904883
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaactt-aagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||| ||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  9905040 gaggtagatgaagacctagaaaaactacaagagaaactattaataaagatttagaaattaatgatttggatcaaaataaggtttatgataaaacattatg 9904941  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttg 282  Q
    ||||| ||| ||| || |||||||||||| ||| | | |||||||||| |||||||||    
T  9904940 gtatattttaatcaatttaaccgactccatttaatagaataagacttggttgttgttg 9904883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 105 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 35643785 - 35643608
Alignment:
Q  105 tggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatat 203  Q
    ||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  35643785 tggaggatagtcagattactagaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaattattaagaaagatctagagattaatgagttggatcgaaatat 35643686  T
Q  204 ggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||| ||||||| ||||   ||  ||| |||||||||| || || || ||||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  35643685 ggtttatgatagaaca--ctgccatattttgatccatgtagcctaccccacttagtgggataatgcttggttgttgttgt 35643608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 88 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 35362846 - 35362651
Alignment:
Q  88 aaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaat 186  Q
    |||||||||||||   |||||||||||| | ||| |   ||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||| ||| ||||| || ||||||    
T  35362846 aaggagagtagatcaaatggaggatagtcaaatccctataggcagaggaagacctagaaaaactatcggagaaactattaggaaagatttggaaattaat 35362747  T
Q  187 gaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttg 282  Q
    || ||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||  | || || ||||||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  35362746 gagttggactgaaatatggtgtatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgcagccaaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttg 35362651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 91 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 30198459 - 30198266
Alignment:
Q  91 gagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaa 189  Q
    ||||||||||  |||| |||||||| ||  |||  |||||||||| |||| || ||||||| ||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||     
T  30198459 gagagtagatcagatgaaggatagtcagtacactagaggcagaggtagacttagaaaaactataagagaaattattaagaaagatattgagattaatgag 30198360  T
Q  190 ttggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||| |  |||||||| ||||||| || |||||||| || ||||||| || |  ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  30198359 ttggatcggaatatggtttatgatagaatattatggtgtagtttgatctatgttgccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 30198266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 152 - 282
Target Start/End: Original strand, 14459046 - 14459177
Alignment:
Q  152 taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccga-ct 250  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||| || |||| |     
T  14459046 taagagaaactattaggaaagatttggagattaatgagttagaccaaaatatggtttatgatggaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaccc 14459145  T
Q  251 ccacttagtgggataagacttgattgttgttg 282  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  14459146 ccactttgtgggataagccttggttgttgttg 14459177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 35 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 43904914 - 43904699
Alignment:
Q  35 aataagcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagag 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||| | |||||  |  | |||| ||| |||||  ||||||||||||| | || ||| |||| | ||    
T  43904914 aataagcttaggtggtttggacatgtagagagaagacctatagatgttgtagtaagaagaatagatcagatggaggatagtcaaattacaagaggtacag 43904815  T
Q  135 gaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataattt 233  Q
    ||||||||| ||| ||| ||||||||||  ||| ||  ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||    
T  43904814 gaagacctagaaatactataagagaaacggttatgagagatttagagattaatgagttggatctaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaattt 43904715  T
Q  234 gatccatctaaccgac 249  Q
    ||||||| || |||||    
T  43904714 gatccatgtagccgac 43904699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 126 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 11523881 - 11523723
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||| |||||||||||||  |||||| | |||||||| ||||  |||||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||| ||||||| |||| ||||    
T  11523881 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatg 11523782  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |  | ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  11523781 gcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 11523723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 126 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 17491812 - 17491712
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  17491812 gaggcacaggaagacctagaaaaactgtaagagaaactattaagaaagacttggagattaatgagttggaccaaaatatggtttatgatagaacattatg 17491713  T
Q  225 g 225  Q
    |    
T  17491712 g 17491712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 30 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 45512749 - 45512558
Alignment:
Q  30 tggaaaataagcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgagg 129  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | |||| ||||  | |||||||   | |||| |||||||||  |||||  |||||| | |||||  ||||    
T  45512749 tggaaaataagcttagatggtttgggcatataaagagaagatctctagattcggtagtaagcagagtagattagatggcagatagtcaaatcactagagg 45512650  T
Q  130 cagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattgga-cccaaatatggtctatgataaaaca 219  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| || || ||||||||||| || || || ||||||||| ||||||| ||||    
T  45512649 cagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagacttggagattaatgagttcgatccaaaatatggtttatgatagaaca 45512558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 40 - 281
Target Start/End: Original strand, 16917222 - 16917462
Alignment:
Q  40 gcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaaga 139  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |  | ||||||||||||||  ||| ||||||||| | |||||   ||| ||| |||||    
T  16917222 gcttaggtggtttgggcatgtaaagagaaggcttgtagatt-tgtagtaaggagagtagatcagattgaggatagtcaaatcactacaggtagaagaaga 16917320  T
Q  140 cctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatcc 238  Q
    |||| |||| || || | |||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| ||      ||||||||    
T  16917321 cctagaaaagctataggtgaaactatcaaggaagatttagagattaatgagttggatagaaatatggtatatgatagaacatt-tgactgcttttgatcc 16917419  T
Q  239 atctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgtt 281  Q
    || || ||| | |||||||||||||||||||||| || |||||    
T  16917420 atgtagccgtccccacttagtgggataagacttggttattgtt 16917462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 126 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 36565399 - 36565241
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||| |||||||||||||  |||||| | |||||||| ||||  |||||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||| ||||||| |||| ||||    
T  36565399 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatg 36565300  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |  | ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  36565299 gcgttatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgttgttgt 36565241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 131 - 283
Target Start/End: Original strand, 36545278 - 36545431
Alignment:
Q  131 agaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtata 229  Q
    |||||||||||||  |||||| | |||||||| ||||  |||||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||| ||||||| |||| ||||   |     
T  36545278 agaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgtc 36545377  T
Q  230 atttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  36545378 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 36545431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 172 - 284
Target Start/End: Original strand, 44529396 - 44529508
Alignment:
Q  172 gatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagactt 271  Q
    ||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||| ||||||| |||| ||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  44529396 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcatcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctt 44529495  T
Q  272 gattgttgttgta 284  Q
    | |||||||||||    
T  44529496 ggttgttgttgta 44529508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 126 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 12491296 - 12491141
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||| ||| |||||||||| |||||| | |||||||| ||||  |||||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||| ||||||| |||| ||||    
T  12491296 gaggtagatgaagacctatgaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatg 12491197  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgt 280  Q
    |  | ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  12491196 gcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttagttgttgt 12491141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 182 - 283
Target Start/End: Original strand, 42584540 - 42584640
Alignment:
Q  182 ttaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgtt 281  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||   ||||||||||  | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42584540 ttaatgatttggatccaaatatggtttatgatagaacattatgacgtaatttgatct-tgtagccgaccccacttagtgggataagacttgattgttgtt 42584638  T
Q  282 gt 283  Q
    ||    
T  42584639 gt 42584640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 154 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 45041444 - 45041320
Alignment:
Q  154 agagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactcca 253  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||| |||||||   ||||||||  ||||||||||||| || | ||| |||    
T  45041444 agagaaactattaggaaagatttagaggttaatgagttggatccaa-tatggtttatgatagcgcattatggcgtaatttgatccatgtagctgacccca 45041346  T
Q  254 cttagtgggataagacttgattgttg 279  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||    
T  45041345 cttagtgggataaggcttggttgttg 45041320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 108 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 28238947 - 28238819
Alignment:
Q  108 aggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggt 206  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||||||||||  ||||| || ||||| | || |||| ||||||| |    
T  28238947 aggatagtcagatcacaagaggcagaggaagacttataaaaattctaaaaggaactattaagaaatatttaaaggttaattagttagaccaaaatatgat 28238848  T
Q  207 ctatgataaaacattatggtataatttga 235  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||||||    
T  28238847 ctataataaaatattatgatataatttga 28238819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 208 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 3464246 - 3464172
Alignment:
Q  208 tatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttg 282  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3464246 tatgatagaacattatggtatagtttgatccatatagtcgattccacttaatgggataagacttgattgttgttg 3464172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 154 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 25473532 - 25473403
Alignment:
Q  154 agagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactcca 253  Q
    |||||||| ||||  |||||||||||| | ||||| || || |||||| |||| ||||||| |||| ||| |  | ||||||||||| || ||||| |||    
T  25473532 agagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagtttgatccaaatttggtgtatgatagaacactatagcgtcatttgatccatgtagccgacccca 25473433  T
Q  254 cttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  25473432 cttagtgggataaggcttggttgttgttgt 25473403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 158 - 283
Target Start/End: Original strand, 33076282 - 33076406
Alignment:
Q  158 aaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccactta 257  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||| ||| || |||||| | ||||||||||||| ||     | |||||||    
T  33076282 aaactattaaaaag-atttagagattaatgagttgtaccaaaatatggtttataatagaatattatgatgtaatttgatccatgtagttatccccactta 33076380  T
Q  258 gtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  33076381 gtgggataagatttgattgttgttgt 33076406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 70 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 18742236 - 18742041
Alignment:
Q  70 acttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaag 168  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||  |  |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||    
T  18742236 acttgtagatgctatagtaaggagagtagataagatggaagatagtcagattgctagaggcagaggtagaccta-aaaaactataagagaaactatttag 18742138  T
Q  169 aaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggata 265  Q
    ||  ||    |||||||||| |||||   ||||||||| ||||||  ||||||| ||  |||||||||| || ||  |||| ||| |||||||||||    
T  18742137 aaaaatcattagattaatgagttggattaaaatatggtttatgattgaacattaaggcttaatttgatcaatgtagtcgaccccaattagtgggata 18742041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 70 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 18747200 - 18747005
Alignment:
Q  70 acttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaag 168  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||  |  |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||    
T  18747200 acttgtagatgctatagtaaggagagtagataagatggaagatagtcagattgctagaggcagaggtagaccta-aaaaactataagagaaactatttag 18747102  T
Q  169 aaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggata 265  Q
    ||  ||    |||||||||| |||||   ||||||||| ||||||  ||||||| ||  |||||||||| || ||  |||| ||| |||||||||||    
T  18747101 aaaaatcattagattaatgagttggattaaaatatggtttatgattgaacattaaggcttaatttgatcaatgtagtcgaccccaattagtgggata 18747005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 131 - 283
Target Start/End: Original strand, 23492164 - 23492316
Alignment:
Q  131 agaggaagacctataaaaacttaagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataa 230  Q
    ||||||||||||| ||||   | |||||||||| | |||| ||| ||| ||||||||| |||||   ||||||| | ||||||| |||| |||||| | |    
T  23492164 agaggaagacctagaaaactattagagaaactactcagaaagatgtagcgattaatgagttggatagaaatatgatatatgatagaacactatggtgtca 23492263  T
Q  231 tttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||| |||||| || ||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  23492264 tttaatccatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttgtttgttgttgt 23492316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 164 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 10824308 - 10824189
Alignment:
Q  164 ttaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtggga 263  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||   ||| ||||||||| || ||||| || | |||| |||    
T  10824308 ttaagaatgatttggagattaatgaattggaccaaaatatggtttttgatagaacattatgaagtaagttgatccatgtagccgaccccgcctagtcgga 10824209  T
Q  264 taagacttgattgttgttgt 283  Q
     ||| |||| ||||||||||    
T  10824208 aaaggcttggttgttgttgt 10824189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 134 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 33827907 - 33827816
Alignment:
Q  134 ggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  33827907 ggaagacgtataaaaactataagagaaactattaaaaaatatttatagattaatgaattggatctaaatatggtttatgatagaacaatatg 33827816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 283
Target Start/End: Original strand, 40813448 - 40813606
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||| |||||||||||||  |||||| | |||||||| ||||  |||||||||||| | | ||| ||||| |||||| |||| | ||||| |||| ||||    
T  40813448 gaggtagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcagtgagttggatccaaatttggtgtgtgatagaacactatg 40813547  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
      || ||||||||||| || || || |||||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  40813548 acatcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaaacttcgttgttgttgt 40813606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 283
Target Start/End: Original strand, 14903690 - 14903843
Alignment:
Q  131 agaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtata 229  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||  |||  ||||||| | |||||| || |||| ||||| ||| |||||||  |||||||||  ||    
T  14903690 agaggaagacctagaaaaactataagagagactattgggaaatatttagaaagtaatgagttagaccaaaataaggtttatgataggacattatggcgta 14903789  T
Q  230 atttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||||||| || |  || ||||||||||||  || ||||| ||||||||||    
T  14903790 atttgatccatgtagcttaccccacttagtggggaaaaacttggttgttgttgt 14903843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 283
Target Start/End: Original strand, 21121299 - 21121427
Alignment:
Q  154 agagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactcca 253  Q
    |||||||| ||||  |||||||||||  | ||||| ||||| || |||||||| ||||||| |||| |||||  ||||||||| ||| || ||||| |||    
T  21121299 agagaaaccattagaaaggatttagaagtcaatgagttggatcctaatatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgat-catgtagccgacccca 21121397  T
Q  254 cttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  21121398 cttagtgggaaaaggcttggttgttgttgt 21121427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 283
Target Start/End: Original strand, 31715992 - 31716104
Alignment:
Q  173 atttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaac--cgactccacttagtgggataagact 270  Q
    |||||||||||||| | ||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||  ||||||||||||| || |  |  | ||||||||||||||||| ||    
T  31715992 atttagagattaattagttggatccaaatatggtttaagatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagcgtcaccaccacttagtgggataaggct 31716091  T
Q  271 tgattgttgttgt 283  Q
    || ||||||||||    
T  31716092 tggttgttgttgt 31716104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 198 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 41031505 - 41031420
Alignment:
Q  198 aaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||||| ||| | | |||||||||  |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  41031505 aaatatggtttatcacagaacattatgagataatttgatccatatagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 41031420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 198 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 41031611 - 41031526
Alignment:
Q  198 aaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||||| ||| | | |||||||||  |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  41031611 aaatatggtttatcacagaacattatgagataatttgatccatatagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 41031526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 211 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 1928659 - 1928587
Alignment:
Q  211 gataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  1928659 gatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 1928587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 87 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 38178457 - 38178349
Alignment:
Q  87 taaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaa 185  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |  |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||  |||| |||||    
T  38178457 taaggagagtagatcagatggaggatagtcaaatcgctagaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaacaaagacctagacattaa 38178358  T
Q  186 tgaattgga 194  Q
    ||| |||||    
T  38178357 tgagttgga 38178349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 155 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 42469855 - 42469727
Alignment:
Q  155 gagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccac 254  Q
    ||||||| ||||  || ||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||| | ||||| |||| |||||  | ||||||||||| || | ||| ||||    
T  42469855 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccac 42469756  T
Q  255 ttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  42469755 ttattgggataaggcttggttgttgttgt 42469727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 27556377 - 27556302
Alignment:
Q  208 tatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||  |||| ||||||||||    
T  27556377 tatgatagaacattatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggttaaagcttggttgttgttgt 27556302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 38392047 - 38391936
Alignment:
Q  130 cagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtat 228  Q
    |||||||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||| ||| || |||||||||| | ||| | ||||||||| ||||||| || |||||||  |    
T  38392047 cagaggaagacctagaaaaactatatgagaaaccattaagaaagatctacagattaatgagtgggatcgaaatatggtatatgatagaatattatggcgt 38391948  T
Q  229 aatttgatccat 240  Q
    ||||| ||||||    
T  38391947 aatttcatccat 38391936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 39651091 - 39651028
Alignment:
Q  220 ttatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  39651091 ttatggtgtaatttgatccatatacccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 39651028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 87 - 240
Target Start/End: Original strand, 5908731 - 5908885
Alignment:
Q  87 taaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaa 185  Q
    ||||||||||||||  | |||||||| || |||||||  ||| || ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || |||  |  ||||||    
T  5908731 taaggagagtagatcaggtggaggatggtcagatcactagagacataggaagacctagaaaaactataagagaaactattaaaaaagatccaaggattaa 5908830  T
Q  186 tgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccat 240  Q
    ||| ||||| | ||||||| | ||||||| ||| |||| |  ||||| |||||||    
T  5908831 tgagttggatcaaaatatgatttatgatagaaccttattgcgtaattggatccat 5908885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 285
Target Start/End: Original strand, 9695815 - 9695869
Alignment:
Q  231 tttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgtat 285  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9695815 tttgatccatgtaaccgaccccgcttagtgggataaggcttgattgttgttgtat 9695869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 152 - 282
Target Start/End: Original strand, 25288915 - 25289045
Alignment:
Q  152 taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactc 251  Q
    ||||||||||  |||  |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||  ||||  ||||||||||| || || | ||| |    
T  25288915 taagagaaacctttagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatataactctatgacataatttgatctatttagctgaccc 25289014  T
Q  252 cacttagtgggataagacttgattgttgttg 282  Q
    ||| |||||| ||||| |||| |||||||||    
T  25289015 cacctagtggtataaggcttggttgttgttg 25289045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 152 - 282
Target Start/End: Original strand, 36069753 - 36069883
Alignment:
Q  152 taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactc 251  Q
    |||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||    ||||||||| ||||||| ||||||| ||  ||||||||||||| || || |  |    
T  36069753 taagggaaactattaacaaatatttagagattaatgagttgggtagaaatatggtttatgatagaacattacggcgtaatttgatccatatagccaaacc 36069852  T
Q  252 cacttagtgggataagacttgattgttgttg 282  Q
    |||||| ||| ||||  ||||||||||||||    
T  36069853 cacttactggaataatgcttgattgttgttg 36069883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 152 - 222
Target Start/End: Original strand, 44373920 - 44373990
Alignment:
Q  152 taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacatta 222  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||    
T  44373920 taagagaaactattaggaaagacttagagattattgaattgaaccaaaatatgatttatgataaaacatta 44373990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 194
Target Start/End: Original strand, 4011211 - 4011276
Alignment:
Q  130 cagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattgga 194  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||    
T  4011211 cagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaagaaagatctaaagattaatgagttgga 4011276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 16994602 - 16994533
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattgga 194  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||    
T  16994602 gaggaagaggaagacctagaaaaactatatgagaaactattaagaatgatttagagattattgagttgga 16994533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 198 - 283
Target Start/End: Original strand, 35323970 - 35324055
Alignment:
Q  198 aaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||||| ||| |||||| ||||||   ||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  35323970 aaatatggtatataataaaatattatgacgtaatttgatccacgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 35324055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 41972033 - 41971849
Alignment:
Q  29 gtggaaaataagcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgag 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||| ||||| |||||||| |  |  |||||||||||||  | |||| |||||| | |||||  |||    
T  41972033 gtggaaaataagtttaggtggtttggacatgtagagagaagacgtgtagattttctagcaaggagagtagatcaggtggacgatagtcaaatcactagag 41971934  T
Q  129 gcagaggaagacctataaaaacttaagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    ||| ||||| ||||| |||||||           | |||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||| || ||||||| |||||||||    
T  41971933 gcaaaggaaaacctagaaaaact-----------actaagaaagatttagagattaatgagttggactgaaatattgtttatgatagaacattatg 41971849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 44047641 - 44047532
Alignment:
Q  174 tttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttga 273  Q
    ||||||| | ||||| ||||| |||||| |||| ||||||| ||||  ||||  | ||||||||||| || | ||| ||||||||||||||||| ||||     
T  44047641 tttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacaccatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttgg 44047542  T
Q  274 ttgttgttgt 283  Q
    ||||||||||    
T  44047541 ttgttgttgt 44047532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 260
Target Start/End: Original strand, 79178 - 79286
Alignment:
Q  152 taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactc 251  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||   |||||||| || ||||| ||||| ||||  |  |||||||||| || ||||| |    
T  79178 taagagaaactattaagaaagatctagagattaatgagctggatagaaatatggcctgtgatagaacataatggcgtcgtttgatccatgtacccgaccc 79277  T
Q  252 cacttagtg 260  Q
    |||||||||    
T  79278 cacttagtg 79286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 24399920 - 24399848
Alignment:
Q  152 taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||   ||||||||| ||||||| || ||||||    
T  24399920 taagagaaactattaagaaggatctcgagattaatgagttggattgaaatatggtttatgatagaatattatg 24399848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 282
Target Start/End: Original strand, 36143518 - 36143622
Alignment:
Q  178 gagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgt 277  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||||   | || |||||||| || ||||| |||| |||| ||| ||| |||| ||||    
T  36143518 gagattaatgaattcgaccaaaatatggtttatgatagaacattatgacgtcatctgatccatgtagccgaccccacctagtcggaaaaggcttggttgt 36143617  T
Q  278 tgttg 282  Q
    |||||    
T  36143618 tgttg 36143622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 39967643 - 39967499
Alignment:
Q  140 cctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatcc 238  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||   | |||| || |||| || ||||||||||  || ||||||||    
T  39967643 cctagaaaaactataagagaaactattaagaaagatctagcgattaatgagttggattgagatatagtttatgttagaacattatggcgtagtttgatcc 39967544  T
Q  239 atctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    || || ||||  ||||||| || |||||  |||| ||||||||||    
T  39967543 atgtagccgatcccacttattgtgataatgcttggttgttgttgt 39967499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 42854132 - 42854020
Alignment:
Q  155 gagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccac 254  Q
    ||||||| ||||  || ||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||| | ||||| |||| |||||  | ||||||||||| || ||||| |||     
T  42854132 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatataacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccat 42854033  T
Q  255 ttagtgggataag 267  Q
    |||||||||||||    
T  42854032 ttagtgggataag 42854020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 87 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 7531841 - 7531646
Alignment:
Q  87 taaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaa 185  Q
    ||||||||||||||  ||||||||  ||| |||||||  |||| |  || ||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||| ||    
T  7531841 taaggagagtagatcagatggaggggagtcagatcactagaggtaagggtagacctagaaaaactatacgagaaactattaggaaggatctagagataaa 7531742  T
Q  186 tgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgtt 281  Q
    ||| |||||   | | ||||| | ||||| |||| |||||| |  |||||| ||| || ||||   |||||||| ||||||| |||| ||||||||    
T  7531741 tgagttggagaaagacatggtttttgatagaacactatggtgtcgtttgattcatgtagccgaactcacttagtaggataaggcttggttgttgtt 7531646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 283
Target Start/End: Original strand, 21425221 - 21425328
Alignment:
Q  176 tagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgatt 275  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||||| | ||||||| | |||||||| |||||||||||||| || | ||| | ||||||||| ||| | |||| ||    
T  21425221 tagagattaatgagttggatcgaaatatgatttatgatagaccattatggcataatttgatccatgtagcagaccctacttagtggaatatggcttggtt 21425320  T
Q  276 gttgttgt 283  Q
     |||||||    
T  21425321 attgttgt 21425328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 267
Target Start/End: Original strand, 2796677 - 2796819
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||| |||||||||||||  |||||| | |||||||| ||||  |||||||||||| | ||| | ||| || ||||| |||| | ||||| |||| ||||    
T  2796677 gaggtagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaattagttgaactcaaatttggtttttgatagaacagtatg 2796776  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataag 267  Q
    |  ||||||||| ||| ||  |||| |||||||||||||||||    
T  2796777 gcgtaatttgattcatgtagacgaccccacttagtgggataag 2796819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 16035858 - 16035744
Alignment:
Q  152 taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactc 251  Q
    ||||||||||| |||||||  || ||||||||| | | ||||| | ||||||||| |||| || |||||||||   ||||||||| ||| || | ||| |    
T  16035858 taagagaaactgttaagaaatatctagagattacttagttggatcgaaatatggtttatggtagaacattatgacgtaatttgattcatgtagctgaccc 16035759  T
Q  252 cacttagtgggataa 266  Q
    |||||||||||||||    
T  16035758 cacttagtgggataa 16035744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 188
Target Start/End: Original strand, 16351511 - 16351565
Alignment:
Q  135 gaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatga 188  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16351511 gaagacctagaaaaactattagagaaactattaagaaggatctagagattaatga 16351565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 282
Target Start/End: Original strand, 25300250 - 25300380
Alignment:
Q  152 taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactc 251  Q
    ||||||||||  |||  |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||  ||||||||||| || || | ||| |    
T  25300250 taagagaaacctttagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatataacactatgacataatttgatctatgtagctgaccc 25300349  T
Q  252 cacttagtgggataagacttgattgttgttg 282  Q
    ||| |||||| | ||| |||| | |||||||    
T  25300350 cacctagtggaacaaggcttggtggttgttg 25300380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 198 - 284
Target Start/End: Original strand, 26363684 - 26363769
Alignment:
Q  198 aaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgta 284  Q
    ||||||||| ||||||| |||| | | || ||||||||||||| ||  |||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  26363684 aaatatggtttatgatagaacact-tagtgtaatttgatccatgtagtcgaccccactcagtgggataagacttggttgttgttgta 26363769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 39953394 - 39953264
Alignment:
Q  153 aagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactcc 252  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| || ||   ||| ||||| | ||||   ||| |||||  |  |||||| ||| || ||||| ||    
T  39953394 aagagaaactattaggaaggatctagagataaatgagttagagaaaaacatggtttttgatgggacactatggagttgtttgattcatgtagccgacccc 39953295  T
Q  253 acttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39953294 acttagtgggataagacttggttgttgttgt 39953264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 230 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 14742135 - 14742082
Alignment:
Q  230 atttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  14742135 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 14742082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 41444500 - 41444400
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaa--ct-taagagaaactattaagaag-gatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacatt 221  Q
    |||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||  || || | ||||||||| ||||||| ||||||    
T  41444500 gaggcagaggaagacctagaaaaaaactataagagaaactattaagaaaaggtttagagattaatgggtttgatcaaaatatggtttatgatataacatt 41444401  T
Q  222 a 222  Q
    |    
T  41444400 a 41444400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 194
Target Start/End: Original strand, 43733331 - 43733400
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaactt-aagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattgga 194  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||    
T  43733331 gaggtagaggaagacctagaaaaactacaagagaaactatcgagaaggatctagagattaatgagttgga 43733400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 12966434 - 12966311
Alignment:
Q  163 attaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgat--aaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtg 260  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| |  |||||||||| ||||||  | | |||||||  |||||||||||||| || ||||| |    || ||    
T  12966434 attaagaaagatttagagattaatgagttgaattcaaatatggtttatgatagagagcattatgacataatttgatccatatagccgacactgtgtaatg 12966335  T
Q  261 ggataagacttgattgttgttgta 284  Q
     ||||||||||| |||||||||||    
T  12966334 agataagacttggttgttgttgta 12966311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 194
Target Start/End: Original strand, 23023354 - 23023418
Alignment:
Q  131 agaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattgga 194  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||| || |||||||||| |||||    
T  23023354 agaggaagacctagaaaaactataagagaaactactaagaaagatctacagattaatgagttgga 23023418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 283
Target Start/End: Original strand, 31309583 - 31309635
Alignment:
Q  231 tttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31309583 tttgattcatgtagccgacaccacttagtgggataagacttggttgttgttgt 31309635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 121
Target Start/End: Original strand, 36143392 - 36143484
Alignment:
Q  29 gtggaaaataagcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatc 121  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| |  ||||||||| | ||||||||  | || |||||||||||   |||||||||||| |||||    
T  36143392 gtggaaaatagacttaggtggtttgggcatttagagaaaagacctatagattctgtagtatggagagtagatcaaatggaggatagtcagatc 36143484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 43350830 - 43350731
Alignment:
Q  181 attaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgt 280  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||| |   ||| ||||||||||||  || ||||| || || ||||||||||| |||| |||||||    
T  43350830 attaatgagttggaccaaaatatggtttatgatagaactt---ggtgtaatttgatccaagtagccgaccccgctaagtgggataaggcttggttgttgt 43350734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 280
Target Start/End: Original strand, 44699637 - 44699745
Alignment:
Q  172 gatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagactt 271  Q
    ||||| || |||||||| || |||| |||||||||  |||||| |||| |||||  ||||||||||| | || | ||| ||||||||||||| ||| |||    
T  44699637 gatttggaaattaatgagttagaccgaaatatggtgcatgatagaacactatggcgtaatttgatccctgtagcagaccccacttagtgggaaaaggctt 44699736  T
Q  272 gattgttgt 280  Q
    | |||||||    
T  44699737 ggttgttgt 44699745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 180 - 283
Target Start/End: Original strand, 3473749 - 3473852
Alignment:
Q  180 gattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttg 279  Q
    ||||||||| |||||||  ||| |||| ||||||  || |||||||   ||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||    
T  3473749 gattaatgagttggaccggaatttggtttatgattgaatattatggcgaaatttaatccatttagccgaccccacttagtgggataaggctttgttgttg 3473848  T
Q  280 ttgt 283  Q
    ||||    
T  3473849 ttgt 3473852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 107 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 5127447 - 5127376
Alignment:
Q  107 gaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggattta 177  Q
    |||||| | ||||||||  |||||||||| || |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  5127447 gaggattgctagatcactagaggcagaggtaggcctagaaaaactataagagaaactattaagaaagattta 5127376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 172 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 15215523 - 15215412
Alignment:
Q  172 gatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagactt 271  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| | | ||| |||| ||||   | || |||||||| || ||||| ||||||||| ||||||| |||    
T  15215523 gatttagagatcaatgagtttgatccaaatatggtttttaatagaacactatgacgtcatatgatccatgtagccgaccccacttagtaggataaggctt 15215424  T
Q  272 gattgttgttgt 283  Q
    | ||||||||||    
T  15215423 ggttgttgttgt 15215412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 231 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 18474024 - 18473973
Alignment:
Q  231 tttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttg 282  Q
    |||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18474024 tttgattcatgtagccgacaccacttagtgggataagacttggttgttgttg 18473973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 251 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 32838923 - 32838888
Alignment:
Q  251 ccacttagtgggataagacttgattgttgttgtata 286  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32838923 ccacttagtgggataagacttggttgttgttgtata 32838888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 196 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 8255620 - 8255531
Alignment:
Q  196 ccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccga--ctccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||||||| ||||||| | || |||||  ||||||||||||| || ||||  | ||||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  8255620 ccaaatatggtttatgatagaccaatatggcgtaatttgatccatgtagccgagacaccacttagtgggataaagcttggttgttgttgt 8255531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 131 - 188
Target Start/End: Original strand, 24558612 - 24558670
Alignment:
Q  131 agaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatga 188  Q
    ||||||||||| | ||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  24558612 agaggaagaccgagaaaaacaataagagaaattattaagaaagatttagagattaatga 24558670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 126 - 179
Target Start/End: Original strand, 25985642 - 25985696
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaacttaa-gagaaactattaagaaggatttaga 179  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| || | |||||||||||||||||||||||    
T  25985642 gaggtagaggaagacctagaaaaactaaatgggaaactattaagaaggatttaga 25985696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 208 - 266
Target Start/End: Original strand, 30689942 - 30690000
Alignment:
Q  208 tatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataa 266  Q
    ||||||| |||||||||   ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  30689942 tatgatataacattatgacgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 30690000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 40 - 169
Target Start/End: Original strand, 30748495 - 30748625
Alignment:
Q  40 gcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaaga 139  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||| | |||| | |||||||   ||  ||| |||| | |||||  ||  ||||||||||    
T  30748495 gcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacctgtagattctatagtaagcaaagtagatcaaatatagggtagtcaaatcactagaatcagaggaaga 30748594  T
Q  140 cctataaaaa-cttaagagaaactattaaga 169  Q
    |||  ||||| | ||||||||||||||||||    
T  30748595 ccttgaaaaaccgtaagagaaactattaaga 30748625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 283
Target Start/End: Original strand, 32276893 - 32276967
Alignment:
Q  209 atgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  32276893 atgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagacgaacccacttagtgggataaagcttggttgttgttgt 32276967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 169 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 36395063 - 36394949
Alignment:
Q  169 aaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggt-ataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataag 267  Q
    |||||||||||| | ||||| || || |||||| |||| ||||||| |||| ||| ||   | |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  36395063 aaggatttagaggtcaatgagttagatccaaatttggtgtatgatagaacactattgtggcattttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 36394964  T
Q  268 acttgattgttgttg 282  Q
     |||  |||||||||    
T  36394963 gcttcgttgttgttg 36394949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 201 - 279
Target Start/End: Original strand, 39702154 - 39702232
Alignment:
Q  201 tatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttg 279  Q
    |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||| || || |||||  || |||||||||||| ||||| ||||||    
T  39702154 tatggtttttgatagaacattatggtatcatttgatctatgtagccgaccacatttagtgggataaaacttggttgttg 39702232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 42 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 39760670 - 39760612
Alignment:
Q  42 ttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagat 100  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||    
T  39760670 ttaggtggtttgggcatatagagaaaagagttgtagattccgtaataaggagagtagat 39760612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 208 - 283
Target Start/End: Original strand, 41212068 - 41212145
Alignment:
Q  208 tatgataaaacattatggtataatttgatccatc--taaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||| ||  |||| ||||||||||    
T  41212068 tatgatagaacattatggcgtaatttgatccatctatagccgaccccacttagtgggaaaatgcttggttgttgttgt 41212145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 10080065 - 10079996
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattgga 194  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  10080065 gaggtagaggaagacctagagaaactataagaaaaactgttaagaaagatctagagattaatgagttgga 10079996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 16008432 - 16008395
Alignment:
Q  246 cgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16008432 cgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgt 16008395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 277
Target Start/End: Original strand, 18741859 - 18741908
Alignment:
Q  228 taatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgt 277  Q
    ||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  18741859 taatttgatccaagtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgt 18741908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 277
Target Start/End: Original strand, 18746823 - 18746872
Alignment:
Q  228 taatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgt 277  Q
    ||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  18746823 taatttgatccaagtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgt 18746872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 251 - 283
Target Start/End: Original strand, 32043837 - 32043869
Alignment:
Q  251 ccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32043837 ccacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 32043869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 29 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 35643856 - 35643808
Alignment:
Q  29 gtggaaaataagcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtag 77  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||    
T  35643856 gtggaaaatatgcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacatgtag 35643808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 251 - 283
Target Start/End: Original strand, 39947098 - 39947130
Alignment:
Q  251 ccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39947098 ccacttagtgggataagacttggttgttgttgt 39947130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 283
Target Start/End: Original strand, 45317575 - 45317627
Alignment:
Q  231 tttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |||||||||| || ||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  45317575 tttgatccatgtagccgactctaattagtgagataaaacttgattgttgttgt 45317627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 219 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 45512508 - 45512448
Alignment:
Q  219 attatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttg 279  Q
    ||||||| |||||||||||||| || || || |||||||||||||| || |||| ||||||    
T  45512508 attatggcataatttgatccatgtagcctaccccacttagtgggatgaggcttggttgttg 45512448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 96; Significance: 6e-47; HSPs: 112)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 45 - 283
Target Start/End: Original strand, 38434995 - 38435234
Alignment:
Q  45 ggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctat 144  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||   |||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||     
T  38434995 ggtggtttgggcatgtaaagagaagacttgtagatgctttagtaaggagagtagatcatatggaggatagtcagatcactagaggcagaggtagacctag 38435094  T
Q  145 aaaaactt-aagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatcta 243  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||| | |||| |||| ||||||  ||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  38435095 aaaaactacaagagaaactattaagaaagatctagagattaatgtgttggatcgaaatttggtttatgattgaacattatggcgtaatttgatccatgta 38435194  T
Q  244 accgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
     ||||  ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  38435195 gccgatcccacttagtggcataaggcttggttgttgttgt 38435234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 29 - 283
Target Start/End: Original strand, 12141571 - 12141826
Alignment:
Q  29 gtggaaaataagcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgag 128  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||| ||  | | ||||| ||||||||||  | ||||||||||||||  ||| ||||||||| | || ||| |||    
T  12141571 gtggaaaagaggcttaggtggtttgggcacgtagaaagaagacctgtagattctctagtaaggagagtagatcagattgaggatagtcaaattacaagag 12141670  T
Q  129 gcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggta 227  Q
    | ||||||||||||| |||| || || |||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| |    
T  12141671 gtagaggaagacctagaaaagctataggagaaactattaggaaagacttagagattaatgacttggatccaaatatggtatatgatagaacattatggca 12141770  T
Q  228 taatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    | |||||||| || || || || ||| |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  12141771 tgatttgatcgatgtagccaaccccatttagtggggtaaggcttgattgttgttgt 12141826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 87 - 282
Target Start/End: Original strand, 18958996 - 18959192
Alignment:
Q  87 taaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaactt-aagagaaactattaagaaggatttagagattaa 185  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| | ||| || || ||||||||    
T  18958996 taaggagagtagatcagatggaggatagtcagatcatcagaggcagaggaagacctagaaaaactacaagagaaactataaggaaagacttggagattaa 18959095  T
Q  186 tgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttg 282  Q
    ||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||    
T  18959096 tgagttggatcaaaatatggtctatgatagaacattatggcataatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttggttattgttg 18959192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 84 - 279
Target Start/End: Original strand, 33504305 - 33504502
Alignment:
Q  84 caataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagat 182  Q
    |||||| ||||||||||  |||||||| |||| |||||||  ||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  33504305 caataatgagagtagatcagatggagggtagtcagatcactagaggcagagaaaaacctagaaaaactataagagaaactattaagaaagatctagagat 33504404  T
Q  183 t-aatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttg 279  Q
    | ||| | |||||   ||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  33504405 ttaataagttggattgaaatatggtatatgatagaacattatggcgtaatttgatccatctagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttg 33504502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 29 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 9556624 - 9556369
Alignment:
Q  29 gtggaaaataagcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgag 128  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||  ||| |||||  |||||||||  | |||| | |||| ||  ||||||||||||| | |  ||  |||    
T  9556624 gtggaaaataggcttaggtggtttaggcatgtagagagaagacaagtagattctgtagtaagaaaagtatatcagatggaggatagtcaaactactagag 9556525  T
Q  129 gcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggta 227  Q
    ||| ||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||| | | ||||||| ||||||| ||||||| |||     
T  9556524 gcaaaggaagaccttgaaaaactataagataaactattaagaaagatctagtgattaatgagttggatcaagatatggtttatgatagaacattagggtg 9556425  T
Q  228 taatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  9556424 taatttgatacatgtagccgactccacttagtgggatgaggcttggttgttgttgt 9556369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 87 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 26784537 - 26784351
Alignment:
Q  87 taaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaa 185  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||| | |||||  ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  26784537 taaggagggtagataagatggagggtagtcaaatcactagaggcagagaaagacctagaaaaactataagagaaactattaagaaagatatagagattaa 26784438  T
Q  186 tgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttg 272  Q
    ||| ||| |   ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||| || || |   |||||||| ||||||||||||    
T  26784437 tgagttgaatagaaatatggtatatgataaaacattttggtttaatttgatccatgtagccaatctcacttagtaggataagacttg 26784351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 126 - 281
Target Start/End: Original strand, 26670892 - 26671048
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||| || || |||    
T  26670892 gaggtagaggaagacctacaaaaactataaaagaaactattaagaaagatttagagattaatgagttggaccaaaatatgatttatgatagaatataatg 26670991  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgtt 281  Q
    || ||||||||||||| || ||||| |  ||||||||||||||||||| || |||||    
T  26670992 gtgtaatttgatccatgtagccgacactgcttagtgggataagacttggttattgtt 26671048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 131 - 283
Target Start/End: Original strand, 33287550 - 33287703
Alignment:
Q  131 agaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtata 229  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| || || | ||||||||| ||||||| |||||||||  |||    
T  33287550 agaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaagaaagatctagaaattaatgagttagatcgaaatatggtttatgatagaacattatgacata 33287649  T
Q  230 atttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
     |||||||| | || || |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  33287650 gtttgatccttgtagccaactccacttagtgggacaagacttggttgttgttgt 33287703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 152 - 283
Target Start/End: Original strand, 9496017 - 9496148
Alignment:
Q  152 taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactc 251  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||| || || || |    
T  9496017 taagagaaactattcagaaagatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccaaccc 9496116  T
Q  252 cacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  9496117 cacttagtgggacaaggcttggttgttgttgt 9496148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 126 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 38452844 - 38452682
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||| |||||||||||||  |||||| | |||||||| ||||  |||||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  38452844 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgataaaacactatg 38452745  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgtataa 287  Q
    || | ||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  38452744 gtgtcattcgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtataa 38452682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 32 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 43752199 - 43751990
Alignment:
Q  32 gaaaataagcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggca 131  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| |||||  ||| ||||| | |||||| |  | || |||||||||||  ||||||||||| | |||||||  ||||||    
T  43752199 gaaaataggcttaggtgatttggacatgtagagagaagacctatagattatgtagtagggagagtagatcagatggaggatactcagatcactggaggca 43752100  T
Q  132 gaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataa 230  Q
     ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| || |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||| |||| |||| | |||    
T  43752099 taggaagacctagaaaaactatcagagaaactattaggaaagatttggaaattaatgagttggaccgaaagatggtgtatgatagaacactatgttgtaa 43752000  T
Q  231 tttgatccat 240  Q
    ||||||||||    
T  43751999 tttgatccat 43751990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 126 - 283
Target Start/End: Original strand, 2610712 - 2610870
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||  |||||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||| ||||||| |||| ||||    
T  2610712 gaggtagaggaagacctatgaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatg 2610811  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |  | ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  2610812 gcgttatttgatccatgtaaccgaccccacttagtgagataaggcttggttgttgttgt 2610870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 135 - 284
Target Start/End: Original strand, 31959654 - 31959804
Alignment:
Q  135 gaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataattt 233  Q
    |||||||||  |||||| |||||||||| ||||  |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||    
T  31959654 gaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcataattt 31959753  T
Q  234 gatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgta 284  Q
    ||||||| || | ||| ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  31959754 gatccatgtagcagaccccacttagtaggataaggcttggttgttgttgta 31959804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 154 - 283
Target Start/End: Original strand, 12734853 - 12734982
Alignment:
Q  154 agagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactcca 253  Q
    |||||||| ||||  |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||  |||| |||    
T  12734853 agagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggtgtaatttgatccatgtagtcgacccca 12734952  T
Q  254 cttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  12734953 cttagtgggataaggcttggttgttgttgt 12734982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 126 - 283
Target Start/End: Original strand, 25834803 - 25834960
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaacttaagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatgg 225  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||| | |||||| ||||  |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||| | |||    
T  25834803 gaggtagaggaagacctaggaaaactttaaagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactgtgg 25834902  T
Q  226 tataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
      | ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  25834903 cgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 25834960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 67 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 37470350 - 37470149
Alignment:
Q  67 aagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactatt 165  Q
    |||||||||||||| |  | ||||||||||||||  |||||| | |||| |||||||  | || ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  37470350 aagacttgtagattatgtattaaggagagtagattagatggaaggtagtcagatcactagtggtagaggaagacctgaaaaaactataagagaaactatt 37470251  T
Q  166 aagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggata 265  Q
    | ||  ||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||  ||||||| ||||||||||| || |||||||||| || |  |  |||||||||||||||    
T  37470250 aggacagatctagagattaatgagttggatcgaaatatggcatatgatagaacattatggtgtagtttgatccatgtagctaatcccacttagtgggata 37470151  T
Q  266 ag 267  Q
    ||    
T  37470150 ag 37470149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 43 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 44437962 - 44437721
Alignment:
Q  43 taggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacct 142  Q
    |||||||||| |||||||  ||| ||||||||| ||||||  |||||||||  |||||  ||||||||  ||| |||||||  |||| || || ||||||    
T  44437962 taggtggtttcggcatgtagagagaagacttgtggattctgtaataaggagtatagatgagatggaggggagtcagatcactagaggtaggggtagacct 44437863  T
Q  143 ataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatc 241  Q
    | ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||   ||| ||||| | ||||| |||| |||||  |  ||| || |||     
T  44437862 agaaaaactatatgagaaactattaagaaggatctagagataaatgagttggagaaaaacatggtttttgatagaacactatggcgttgtttaattcatg 44437763  T
Q  242 taaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  44437762 tagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 44437721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 132 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 12882197 - 12882045
Alignment:
Q  132 gaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataa 230  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||| || |||  |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| | ||||| |||||| |||  |||    
T  12882197 gaggaagacctataaaagctataagagaaactactaggaaatatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttgtgatagaacattttggcgtaa 12882098  T
Q  231 tttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |||||||||| || || ||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  12882097 tttgatccatgtagcctacctcacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 12882045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 29 - 283
Target Start/End: Original strand, 6218994 - 6219247
Alignment:
Q  29 gtggaaaataagcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgag 128  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||| |||||  |||  |||  |||||||| |  | |||||||||  |||   ||||||||||||  ||||||  |||    
T  6218994 gtggataataggcttaggtggtttggacatgtagagaggagatatgtagattatgtagtaaggagaggtgatcaaatggaggatagtgggatcactggag 6219093  T
Q  129 gcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggta 227  Q
    |||||| ||||||| || ||||| ||| | |||| |||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||     
T  6219094 gcagagaaagacct-tagaaactataatataaac-attaggaaagatttagagattagtgagttggaccgaaatatggtttatgatagaacattatggtg 6219191  T
Q  228 taatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||||||||| || || || |||| |||| ||||||| |||| ||||| ||||    
T  6219192 taatttgatccatgtagccaaccccacctagttggataaggcttggttgttattgt 6219247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 87 - 237
Target Start/End: Original strand, 45436927 - 45437078
Alignment:
Q  87 taaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaa 185  Q
    ||||||||||||||  | | ||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||  | ||| ||||||||||||||    
T  45436927 taaggagagtagatcagtttgaggataatcagatcactagaggcagaggaagacctataaaaattataagagaatctagcaggaaagatttagagattaa 45437026  T
Q  186 tgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatc 237  Q
    || |||||| ||||||||||| | ||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  45437027 tgcattggatccaaatatggtatttgatagaacattacggtgtaatttgatc 45437078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 131 - 283
Target Start/End: Original strand, 28508807 - 28508960
Alignment:
Q  131 agaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtata 229  Q
    |||||||||||||  |||||| | |||||||| ||||  |||||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||| ||||||| |||| |||||  |     
T  28508807 agaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtc 28508906  T
Q  230 atttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  28508907 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 28508960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 176 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 13474321 - 13474213
Alignment:
Q  176 tagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgatt 275  Q
    ||||||||||||| ||||| |  |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||  |  ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13474321 tagagattaatgagttggatcggaatatggtttatgataatacattatggcataatttgatctattgagtcgactccacttagtgggataagacttggtt 13474222  T
Q  276 gttgttgta 284  Q
    |||||||||    
T  13474221 gttgttgta 13474213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 40 - 115
Target Start/End: Original strand, 43260442 - 43260517
Alignment:
Q  40 gcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  43260442 gcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctatagtaaggagagtagatcagatggagggtagt 43260517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 125 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 43573288 - 43573130
Alignment:
Q  125 tgaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattat 223  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||| | || ||| |||||| || ||||||| ||||| ||||||||| | ||||||  ||| ||||    
T  43573288 tgaggtagaggaagacctagaaaaactataagaaaaacaactaggaaagattta-aggttaatgagttggatccaaatatgatttatgatcgaacgttat 43573190  T
Q  224 ggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||  ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  43573189 ggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 43573130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 149 - 280
Target Start/End: Original strand, 45077875 - 45078008
Alignment:
Q  149 acttaagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaa--ttggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaacc 246  Q
    |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||| | |||||| || ||||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||    
T  45077875 acttgagaaaaactattaagaaagatttagagattaatgagagttggatcgaaatatagtttatgatagaacataatggcataatttgatccatgtaacc 45077974  T
Q  247 gactccacttagtgggataagacttgattgttgt 280  Q
    ||| |||||||||| |||||  |||| |||||||    
T  45077975 gaccccacttagtgagataaagcttggttgttgt 45078008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 126 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 3243811 - 3243654
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| | |||||||| ||||  |||||||||||| | ||||| ||||| |||| | |||| ||||||| |||| ||||    
T  3243811 gaggcagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaagtttggtgtatgatagaacactatg 3243712  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttg 282  Q
    |  | ||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  3243711 gcgtcatttgatccaggtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 3243654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 126 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 45543230 - 45543074
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||  || ||||||||| | ||||| || || ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  45543230 gaggtagaggaagacctggaaaaactataagagaaactattagaaaagatttagaggt-aatgagttcgatccaaatatggtttatgatagaacattatg 45543132  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttg 282  Q
    |  || ||||||| || || ||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  45543131 gcgtactttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataatgcttgcttgttgttg 45543074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 156 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 19337020 - 19336896
Alignment:
Q  156 agaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccact 255  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||| || || |  |||||    
T  19337020 agaaactataaagaaagatttagagattaatgagttggatcgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccaatcccact 19336921  T
Q  256 tagtgggataagacttgattgttgt 280  Q
    || ||||||||  |||| |||||||    
T  19336920 tattgggataaagcttggttgttgt 19336896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 110 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 37452400 - 37452285
Alignment:
Q  110 gatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtct 208  Q
    |||||| |||||||| |||| ||||||||||||| ||||| | |||||| | |||||||||| || |||||||||||||| ||||||  ||||||||| |    
T  37452400 gatagtcagatcacaagaggaagaggaagacctagaaaaattataagaggagctattaagaaagaattagagattaatgagttggacagaaatatggttt 37452301  T
Q  209 atgataaaacattatg 224  Q
    |||||| |||||||||    
T  37452300 atgatagaacattatg 37452285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 40 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 37481861 - 37481618
Alignment:
Q  40 gcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaaga 139  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||  ||| |  | | ||||||||||||  ||||||||  |||||||||||  |||| ||| |||||    
T  37481861 gcttaggtggtttgagcatgtagagagaagacttgtgaattttgtagttaggagagtagatcagatggaggggagttagatcactggaggtagatgaaga 37481762  T
Q  140 cctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatcc 238  Q
    || | ||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||| |||||   ||||||||| | ||||| || |||||||| |  |||||| |    
T  37481761 ccaagaaaaactattagagaaactattaagaaagatctagcgataaatgagttggataaaaatatggtatttgatagaaaattatggtgtcttttgattc 37481662  T
Q  239 atctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttg 282  Q
    |||||  |||| |||| |||| ||||||| | || |||||||||    
T  37481661 atctagtcgaccccacgtagtcggataaggcgtggttgttgttg 37481618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 126 - 283
Target Start/End: Original strand, 3866196 - 3866354
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||| ||||||| |||||  |||||| | |||||||| ||||  |||||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||| ||||||| |||| ||||    
T  3866196 gaggtagaggaaaacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatg 3866295  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
      || ||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  3866296 acatcatttgatccatgtagccgaccccacttagtaggataaggcttggttgttgttgt 3866354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 103 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 35755430 - 35755247
Alignment:
Q  103 gatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaat----tggaccc 197  Q
    ||||||||| ||| | |||| | |||| |||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||    |||| ||    
T  35755430 gatggaggaaagtcatatcaaaagagggagaggaaggcctagaaaaactataacagaaactattaggaaagatttagaggttaattaatgggttggatcc 35755331  T
Q  198 aaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgtt 281  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||   |||||||||||||  | ||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  35755330 aaatatggtttatgatagaacattgtgccgtaatttgatccatgcagccgaccctacttagtgggataaggcttggttgttgtt 35755247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 170 - 283
Target Start/End: Original strand, 227358 - 227471
Alignment:
Q  170 aggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagac 269  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||| ||||||| |||| |||||  | ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |    
T  227358 aggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggc 227457  T
Q  270 ttgattgttgttgt 283  Q
    ||| ||||||||||    
T  227458 ttggttgttgttgt 227471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 154 - 283
Target Start/End: Original strand, 3481307 - 3481436
Alignment:
Q  154 agagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactcca 253  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| || |||||  | ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| || | ||| |||    
T  3481307 agagaaactattaggaaagatttggaaattaacaagttggacagaaatatggtctatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagctgacccca 3481406  T
Q  254 cttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |||||| ||| ||| |||| ||||||||||    
T  3481407 cttagttggaaaaggcttggttgttgttgt 3481436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 152 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 9996757 - 9996622
Alignment:
Q  152 taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactc 251  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||| | || || ||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| |    
T  9996757 taagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaacgagttggatccaaatatggtttatgattaaacactatggcataatttgatccatgtagccgaccc 9996658  T
Q  252 cactt---agtgggataagacttgattgttgttgta 284  Q
    |||||   || |||||||| |||| |||||||||||    
T  9996657 cacttagaagagggataaggcttggttgttgttgta 9996622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 199 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 12520146 - 12520062
Alignment:
Q  199 aatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  12520146 aatatggtttatgataaaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 12520062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 196 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 9531687 - 9531600
Alignment:
Q  196 ccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||||||| ||||||  ||||||||||  ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  9531687 ccaaatatggtttatgatggaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 9531600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 92 - 281
Target Start/End: Original strand, 13149421 - 13149612
Alignment:
Q  92 agagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggc-agaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaa 189  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| |||||| | || |  |||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||     
T  13149421 agagtagataagatggaggaaagtcagatcagaagatgttagaggaagacttaggaaaactataagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgag 13149520  T
Q  190 ttggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgtt 281  Q
    | | | |||||||| ||  |||||| |||||||||  |||||||||||||| || ||||   || ||| || ||||||||||| ||||||||    
T  13149521 tagaatccaaatatcgttgatgatagaacattatgacataatttgatccatatagccgatctcaattaatgagataagacttggttgttgtt 13149612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 32 - 194
Target Start/End: Original strand, 42543265 - 42543428
Alignment:
Q  32 gaaaataagcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggca 131  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||| ||||||  | | ||||||||||||   |||||||  ||| |||||||  |||| |    
T  42543265 gaaactaaacttaggtggtttgggcatgtacagagaagacctgtggattctgtagttaggagagtagatcaaatggaggggagtcagatcactagaggta 42543364  T
Q  132 gaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattgga 194  Q
    | || ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  42543365 ggggtagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaggatctagagataaatgagttgga 42543428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 126 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 7326318 - 7326160
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||| |||||||||| ||  |||||| | |||||||| ||||  || ||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||| ||||||| |||| ||||    
T  7326318 gaggtagaggaagacataggaaaactattagagaaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatg 7326219  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |  | ||||||||||| || || || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  7326218 gcgtcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 7326160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 158 - 283
Target Start/End: Original strand, 11412865 - 11412992
Alignment:
Q  158 aaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataa---aacattatggtataatttgatccatctaaccgactccac 254  Q
    ||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    ||||||||||| ||||||||||||| || ||||   |||    
T  11412865 aaactattaggaaagatt-agagattaatgagttggatccaaatatggtttatgatagtagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaactcac 11412963  T
Q  255 ttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  11412964 ttagtaggataaggcttggttgttgttgt 11412992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 169 - 283
Target Start/End: Original strand, 30306200 - 30306314
Alignment:
Q  169 aaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataaga 268  Q
    |||||||||||| | | ||| ||||| |||||| |||| ||||||| |||| |||||  | ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||     
T  30306200 aaggatttagaggtcattgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagg 30306299  T
Q  269 cttgattgttgttgt 283  Q
    |||| ||||||||||    
T  30306300 cttggttgttgttgt 30306314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 126 - 283
Target Start/End: Original strand, 35643072 - 35643230
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||| |||| ||||||||  |||||| | |||||||| ||||  |||||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||| ||||||| |||| ||||    
T  35643072 gaggtagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatg 35643171  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
      || |||| || ||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  35643172 acatcatttaatacatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 35643230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 126 - 283
Target Start/End: Original strand, 36183575 - 36183733
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||| |||||||||||||  |||||| | |||||||| ||||  |||||||||||  | ||||| ||||| |||||| || | ||||||| |||| ||||    
T  36183575 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaagtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagaacactatg 36183674  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||   ||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  36183675 gtgccatttgatccatgtagccgaccccacttagtaggataaggcttggttgttgttgt 36183733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 131 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 451801 - 451648
Alignment:
Q  131 agaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtata 229  Q
    |||||||||||||  |||||| | |||||||| ||||  |||||||||||| | | ||| ||||| |||||| | || ||||||| |||| |||||  |     
T  451801 agaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcagtgagttggatccaaatttagtgtatgatagaacactatggcgtc 451702  T
Q  230 atttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  451701 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggacaaggcttggttgttgttgt 451648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 131 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 7432042 - 7431889
Alignment:
Q  131 agaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtata 229  Q
    ||||||| ||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |   ||||||||| ||| ||| | ||| ||||| |     
T  7432042 agaggaaaacctagaaaaactattggagaaactattaagaaggatctagagattaatgagttgaataaaaatatggtatataatagatcataatggtgtc 7431943  T
Q  230 atttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |||||||||||  |||||||  |||||||||||||||  |||  ||||||||||    
T  7431942 atttgatccatgcaaccgacctcacttagtgggataaagcttagttgttgttgt 7431889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 131 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 19235137 - 19235000
Alignment:
Q  131 agaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtata 229  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||   ||||||||| | ||||| |||||| ||   |     
T  19235137 agaggaagacctagaaaaactataagagaaactattgagaaagatctagagattaatgatttggatagaaatatggtatttgatagaacattctgtcgtc 19235038  T
Q  230 atttgatccatctaaccgactccacttagtgggataag 267  Q
     ||| |||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  19235037 gtttaatccatgtagccaactccacttagtgggataag 19235000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 158 - 282
Target Start/End: Original strand, 7615427 - 7615550
Alignment:
Q  158 aaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccactta 257  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||   ||| ||||| |||||||||||||||||   | ||||||||| |||| ||||  ||| |||    
T  7615427 aaactattaagaaaggtttagagatgaatgaattggatagaaa-atggtatatgataaaacattatgtcgtcatttgatccgtctatccgataccaatta 7615525  T
Q  258 gtgggataagacttgattgttgttg 282  Q
    |||||||||| | ||||||||||||    
T  7615526 gtgggataaggcctgattgttgttg 7615550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 169 - 281
Target Start/End: Original strand, 8180948 - 8181060
Alignment:
Q  169 aaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataaga 268  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||| ||||||| |||| ||| || | ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||     
T  8180948 aaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatagtgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagg 8181047  T
Q  269 cttgattgttgtt 281  Q
    |||  ||||||||    
T  8181048 cttcgttgttgtt 8181060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 197 - 284
Target Start/End: Original strand, 32443832 - 32443920
Alignment:
Q  197 caaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagt-gggataagacttgattgttgttgta 284  Q
    ||||||| || ||| | |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  32443832 caaatatagtttataacaaaacattatggcataatttgatccatgtagccgactccacttagtggggataagacttagttgttgttgta 32443920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 194
Target Start/End: Original strand, 43832123 - 43832291
Alignment:
Q  27 atgtggaaaataagcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatg 126  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||||||||||  ||| || || ||| |||| |  | | ||||||||||||  |||||||  || | | ||||   |    
T  43832123 atgtggaaactaggcttaggtgatttgggcatgtacagagaaaacatgtggattatgtagttaggagagtagatcagatggagagtaatcaaatcagtag 43832222  T
Q  127 aggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattgga 194  Q
    | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  43832223 acgcagaggaagacctaaacaaactataagagaaactattaagaaggatctagagattaatgagttgga 43832291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 184 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 3635422 - 3635323
Alignment:
Q  184 aatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| | ||||| |||| |||||  | ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  3635422 aatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 3635323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 126 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 18424535 - 18424377
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||| |||||||||| ||  |||||| | |||||||| ||||  |||||||||||||| ||| | || || || |||||||| ||||||| |||| ||||    
T  18424535 gaggtagaggaagacataggaaaactattagagaaaccattataaaggatttagagatcaataagtttgatccgaatatggtttatgatagaacactatg 18424436  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgta 284  Q
       | ||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18424435 acgtcatttgatccatgta-ccgtccccacttagtgggataagacttggttgttgttgta 18424377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 283
Target Start/End: Original strand, 4807719 - 4807877
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||| ||| |||||||||  |||||| | |||||||| ||||  ||| |||||||| | ||||| ||||| ||||||  ||| || |||| |||| ||||    
T  4807719 gaggtagatgaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaagtatttagaggtcaatgagttggatccaaattcggtgtacgatagaacactatg 4807818  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |  | ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  4807819 gcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 4807877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 8197671 - 8197541
Alignment:
Q  153 aagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactcc 252  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||   ||||||| | ||||||| || |||||||  |  |||||||||| || ||||| |     
T  8197671 aagagaaactattaagaaagatctaaagattaatgagttggatagaaatatgatatatgatagaatattatggcgtcgtttgatccatgtagccgaccct 8197572  T
Q  253 acttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  8197571 acttagtgggataatgcttggttgttgttgt 8197541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 8202431 - 8202301
Alignment:
Q  153 aagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactcc 252  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||   ||||||| | ||||||| || |||||||  |  |||||||||| || ||||| |     
T  8202431 aagagaaactattaagaaagatctaaagattaatgagttggatagaaatatgatatatgatagaatattatggcgtcgtttgatccatgtagccgaccct 8202332  T
Q  253 acttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  8202331 acttagtgggataatgcttggttgttgttgt 8202301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 29 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 12026260 - 12026100
Alignment:
Q  29 gtggaaaataagcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgag 128  Q
    ||||||| || ||||||||||||||  |||||  ||| ||||| |||||||| |  | ||||||||||||||  ||||| || |||| | |||||  |||    
T  12026260 gtggaaactaggcttaggtggtttgaccatgtagagagaagacctgtagattttgtactaaggagagtagatcagatggtgggtagtcacatcactggag 12026161  T
Q  129 gcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatga 188  Q
    || ||  |||||||| | ||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  12026160 gcggattaagacctagagaaactataggagaaactattaagaaagatctagagattaatga 12026100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 283
Target Start/End: Original strand, 19863432 - 19863516
Alignment:
Q  199 aatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  19863432 aatatggtttatgatagaacattatggcatgatttgatccatgtagccgtccccacttagtgggataaagcttggttgttgttgt 19863516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 283
Target Start/End: Original strand, 19867764 - 19867848
Alignment:
Q  199 aatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  19867764 aatatggtttatgatagaacattatggcatgatttgatccatgtagccgtccccacttagtgggataaagcttggttgttgttgt 19867848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 283
Target Start/End: Original strand, 19872665 - 19872749
Alignment:
Q  199 aatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  19872665 aatatggtttatgatagaacattatggcatgatttgatccatgtagccgtccccacttagtgggataaagcttggttgttgttgt 19872749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 151 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 28960343 - 28960211
Alignment:
Q  151 ttaagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgact 250  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||   | ||||||| | ||||| | || |||||| |  |||||| ||| ||  |||||    
T  28960343 ttaagagaaactgttaagaaggatctagagataaatgagttggagaaagatatggtttttgatagagcactatggtgtcgtttgattcatgtagtcgact 28960244  T
Q  251 ccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  28960243 ccatttagtgggataaggcttggttgttgttgt 28960211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 11992222 - 11992107
Alignment:
Q  169 aaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataaga 268  Q
    |||||||||||| | ||||| || || ||||||||| | | ||||| ||||||||||  | ||||||||||| || | ||| ||||||||||| |||||     
T  11992222 aaggatttagaggtcaatgagttagatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgttatttgatccatgtagctgaccccacttagtggaataagg 11992123  T
Q  269 cttgattgttgttgta 284  Q
    |||| |||||||||||    
T  11992122 cttggttgttgttgta 11992107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 284
Target Start/End: Original strand, 26850320 - 26850518
Alignment:
Q  87 taaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaa 185  Q
    |||||||| |||||  ||||||||||||| | |||||   |||||||| || ||||| |||| || ||||||||  ||||||||   ||||||| ||| |    
T  26850320 taaggagactagatcagatggaggatagtcaaatcactaaaggcagagaaaaacctagaaaatctataagagaagttattaagatatatttagaaattta 26850419  T
Q  186 tgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccat-ctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgta 284  Q
    ||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| || ||  || || || ||||||||||||| |||  ||| |||||||||||    
T  26850420 tgagttggacg-aaatatggtttatgataaaacattatggcgtaatttgttcgatgttagccaaccccacttagtgggaaaaggtttggttgttgttgta 26850518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 38328482 - 38328370
Alignment:
Q  169 aaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataaga 268  Q
    |||||||||||| | ||||||  ||| |||||| ||||  |||||| |||| |||||  | ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||     
T  38328482 aaggatttagaggtcaatgaa--ggatccaaatttggtgcatgatagaacactatggcttcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagg 38328385  T
Q  269 cttgattgttgttgt 283  Q
    |||| ||||||||||    
T  38328384 cttggttgttgttgt 38328370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 29 - 166
Target Start/End: Original strand, 907707 - 907845
Alignment:
Q  29 gtggaaaataagcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgag 128  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||  |    ||||||||| |  ||||||||||| ||||||||| | ||    
T  907707 gtggaaaatagccttagatggtttgggcatgtagagagaagagttgtagattctttagcttggagagtagctcggatggaggataattagatcacttaag 907806  T
Q  129 gcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactatta 166  Q
    |||||||||| |||| ||| | | |||||||||||||||    
T  907807 gcagaggaaggcctagaaatattataagagaaactatta 907845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 202 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 3720496 - 3720426
Alignment:
Q  202 atggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttg 272  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  3720496 atggtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggagaaggcttg 3720426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 33 - 115
Target Start/End: Original strand, 7825391 - 7825473
Alignment:
Q  33 aaaataagcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagt 115  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||  ||| ||||| ||||||||||| | | ||||||||||||  |||||||||||||    
T  7825391 aaaataagcttagttggtttgagcatgtagagagaagacatgtagattctatagtcaggagagtagatgagatggaggatagt 7825473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 203 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 12475007 - 12474925
Alignment:
Q  203 tggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgtat 285  Q
    |||| ||||||| |||| |||||  | ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  12475007 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtat 12474925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 202 - 284
Target Start/End: Original strand, 17429251 - 17429333
Alignment:
Q  202 atggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgta 284  Q
    ||||| ||||||| |||||||||  |||||||||| ||| || ||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||    
T  17429251 atggtatatgatagaacattatgacataatttgattcatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttggttgttgttgta 17429333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 169 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 45367739 - 45367625
Alignment:
Q  169 aaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataaga 268  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||| | | ||||| |||| ||||   | ||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||| |    
T  45367739 aaggatttagaggtaaatgagttggatccaaatatgatttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtcgccgaccccacttagtgggataaaa 45367640  T
Q  269 cttgattgttgttgt 283  Q
    |||| ||||||||||    
T  45367639 cttgtttgttgttgt 45367625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 281
Target Start/End: Original strand, 23997773 - 23997882
Alignment:
Q  172 gatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagactt 271  Q
    ||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||  | ||||||| ||| || ||||| ||||||| |  ||||||||||    
T  23997773 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgataaaacactatggcgttatttgattcatgtatccgaccccacttattcagataagactt 23997872  T
Q  272 gattgttgtt 281  Q
    |||| |||||    
T  23997873 gattattgtt 23997882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 29548834 - 29548733
Alignment:
Q  87 taaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaa 185  Q
    |||||| |||||||   ||||||| |||| | |||||  || ||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  29548834 taaggatagtagatcaaatggagggtagtcaaatcacgagaagcagaggaagacctgaaaaaactataagagaaattattaagaaagatttagagattaa 29548735  T
Q  186 tg 187  Q
    ||    
T  29548734 tg 29548733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 281
Target Start/End: Original strand, 34931631 - 34931712
Alignment:
Q  200 atatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgtt 281  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||   ||||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  34931631 atatggtttatgatagaacattatggcataatttgatccatatagccgaccgtacttagtgggacaaggcttggttgttgtt 34931712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 183
Target Start/End: Original strand, 36869943 - 36870040
Alignment:
Q  87 taaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagatt 183  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||  |  ||||  |||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36869943 taaggagagtaaattagatggaggatagacaattcactagaggcataggaagagctagaaaaactataagagaaactaataagaaggatttagagatt 36870040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 272
Target Start/End: Original strand, 38430038 - 38430155
Alignment:
Q  155 gagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccac 254  Q
    ||||||| ||||  || ||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||| | ||||| |||| |||||  | ||||||||||| || ||||| ||||    
T  38430038 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccac 38430137  T
Q  255 ttagtgggataagacttg 272  Q
    |||||| |||||| ||||    
T  38430138 ttagtgagataaggcttg 38430155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 23915824 - 23915736
Alignment:
Q  152 taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccat 240  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||||||||||  |||||  || |||||| ||||||| |||| |||||  |||||||||||||    
T  23915824 taagagaaactattaagaaaaatctagagattaatgaggtggacagaactatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatccat 23915736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 261
Target Start/End: Original strand, 36366816 - 36366896
Alignment:
Q  181 attaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgg 261  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| || || || ||| |||||||    
T  36366816 attaatgagttggaccgaaatatggtttataatagaacattatggtgtaatttgatccatgtatccaaccccatttagtgg 36366896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 198 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 39709286 - 39709202
Alignment:
Q  198 aaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttg 282  Q
    ||||||||| ||||||  |||| |||||  ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  39709286 aaatatggtttatgattgaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggatatggcttggttgttgttg 39709202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 42149791 - 42149707
Alignment:
Q  152 taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgat 236  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||  ||||   ||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  42149791 taagagaaactattaagaaagatctagagattattgagctggatagaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgat 42149707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 272
Target Start/End: Original strand, 440924 - 440987
Alignment:
Q  209 atgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttg 272  Q
    |||||| ||||||||||  ||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  440924 atgatacaacattatggcgtaatttgatccatgtagctgactccacttagagggataagacttg 440987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 126 - 185
Target Start/End: Original strand, 8187233 - 8187291
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaacttaagagaaactattaagaaggatttagagattaa 185  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8187233 gaggcataggaagacctagaaaaacttt-gagaaactattaagaatgatttagagattaa 8187291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 137 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 12489949 - 12489802
Alignment:
Q  137 agacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttga 235  Q
    ||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||   | | ||||| | ||||| |||| | |||  |  |||||    
T  12489949 agacctagaaaaactatatgagaaactattaggaaggatctagagataaatgagttggagaaagacatggtttttgatataacactttggcgtcgtttga 12489850  T
Q  236 tccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    | ||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  12489849 ttcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 12489802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 29 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 13241000 - 13240929
Alignment:
Q  29 gtggaaaataagcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagat 100  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||  | ||||||||||||||    
T  13241000 gtggaaactaggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacatgtagattctttagtaaggagagtagat 13240929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 126 - 281
Target Start/End: Original strand, 39029705 - 39029867
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctat-aaaaacttaagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||| |||||||||||||  |||||| |  ||||||| ||||  || ||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  39029705 gaggtagaggaagacctaagaaaaacattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacattatg 39029804  T
Q  225 gtataatttgatcca------tctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgtt 281  Q
    |  | ||||||||||      | || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  39029805 gcgtcatttgatccatgtaggtgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 39029867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 2906120 - 2905995
Alignment:
Q  156 agaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccact 255  Q
    |||||||||||||||  || ||||||| ||||| |||||   | | ||| | ||||||| || |||||||| |  |||||||||| ||||   || ||||    
T  2906120 agaaactattaagaaaaatgtagagatcaatgagttggataaagaaatgttatatgatagaatattatggtgtcgtttgatccatataactagcttcact 2906021  T
Q  256 tagtgggataagacttgattgttgtt 281  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  2906020 tagtgggataagacttgtttgttgtt 2905995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 358 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 11064521 - 11064484
Alignment:
Q  358 ggttgagttaggtccaacccaaattctaatatggtatc 395  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11064521 ggttgagttaggtgcaacccaaattctaatatggtatc 11064484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 174 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 13444017 - 13443924
Alignment:
Q  174 tttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataag 267  Q
    |||||| ||||||||  ||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||  | |||||||| || || ||||| ||| |||||||||||||    
T  13444017 tttagatattaatgagatgggcccaaatatggtttattatagaacattatggcgtcatttgatcgatgtagccgaccccatttagtgggataag 13443924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 230 - 283
Target Start/End: Original strand, 17670697 - 17670750
Alignment:
Q  230 atttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  17670697 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 17670750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 230 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 41763096 - 41763043
Alignment:
Q  230 atttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  41763096 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 41763043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 284
Target Start/End: Original strand, 3030886 - 3030961
Alignment:
Q  208 tatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgta 284  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||||| || | ||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  3030886 tatgatacaacattatggcataattttatccatgtagc-gaccccacttagtgggataagccttggtcgttgttgta 3030961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 10516824 - 10516748
Alignment:
Q  208 tatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgta 284  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||| || | ||   |||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  10516824 tatgataaaatattatggcgtaatttgatccatgtagctgatctcacttagtgggataaggcttggttgttgttgta 10516748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 285
Target Start/End: Original strand, 19855586 - 19855746
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||| |||  |||| |||||||  ||||   ||| ||||| ||||||| | |||||||    
T  19855586 gaggcagaggaagacctagataaactataaaagaaactattaagaaagatccagaggttaatgagctggatagaaacatggtatatgatagagcattatg 19855685  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgtat 285  Q
    |    |||  |||||| || ||||| ||||||||| ||||||  | || ||||||||||||    
T  19855686 gcgccattcaatccatgtagccgaccccacttagtaggataaagcgtggttgttgttgtat 19855746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 41197355 - 41197227
Alignment:
Q  155 gagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccac 254  Q
    ||||||| ||||  || ||||||||| | || || ||||| || |||||||| | ||||| ||||||||||  | ||||||||||| ||  |||| ||||    
T  41197355 gagaaaccattataaaagatttagaggtcaacgagttggatcccaatatggtttttgatagaacattatggcgtcatttgatccatgtagtcgaccccac 41197256  T
Q  255 ttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||  ||||||||| |||| ||||||||||    
T  41197255 ttgatgggataaggcttggttgttgttgt 41197227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 128
Target Start/End: Original strand, 45077797 - 45077881
Alignment:
Q  44 aggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgag 128  Q
    ||||||||| |||||||  ||| || ||||||||||| |  | ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  45077797 aggtggttttggcatgtagagagaaaacttgtagattttgtagtaaggagagtagatcagatggaggatagtcagatcacttgag 45077881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 229 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 16521061 - 16521006
Alignment:
Q  229 aatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgta 284  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  16521061 aatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgttgttgta 16521006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 333 - 388
Target Start/End: Original strand, 33456025 - 33456080
Alignment:
Q  333 ctcacctttcaaattgattttgttaggttgagttaggtccaacccaaattctaata 388  Q
    |||||||| ||||  | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33456025 ctcaccttacaaaccggttttgtaaggttgagttaggcccaacccaaattctaata 33456080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 125 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 33625361 - 33625257
Alignment:
Q  125 tgaggcagaggaagacctataaaaact-taag----agaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaaca 219  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||    |||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||    |||||||| ||||||| ||||    
T  33625361 tgaggcagaggtagacctagaaaaactgtaagagaaagaaactattaagaaatatctagagattaatgagttggaaagtaatatggtttatgatagaaca 33625262  T
Q  220 ttatg 224  Q
    |||||    
T  33625261 ttatg 33625257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 229 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 35704270 - 35704215
Alignment:
Q  229 aatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgta 284  Q
    |||||||| ||| || |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35704270 aatttgattcatgtagccgacatcatttagtgggataagacttgattgttgttgta 35704215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 350 - 388
Target Start/End: Original strand, 3008440 - 3008478
Alignment:
Q  350 ttttgttaggttgagttaggtccaacccaaattctaata 388  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3008440 ttttgtaaggttgagttaggcccaacccaaattctaata 3008478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 151 - 205
Target Start/End: Original strand, 12443134 - 12443188
Alignment:
Q  151 ttaagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatgg 205  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  12443134 ttaagagaaactattaagatatatttagagattaatgagttggatcgaaatatgg 12443188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 221 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 624748 - 624687
Alignment:
Q  221 tatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttg 282  Q
    ||||||||| |||||| ||| || ||||| || |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  624748 tatggtatagtttgattcatgtagccgaccccgcttagtgggataaggcttggttgttgttg 624687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 6230393 - 6230280
Alignment:
Q  154 agagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactcca 253  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||| |||||| ||    |||||||| |||||||||| |||||   ||  ||||||| || || || ||||||    
T  6230393 agagaaactattaagaaaaatctagagattattgaatttgatatgaatatggtatatgataaaatattataacattgtttgatctatgtagcctactcca 6230294  T
Q  254 cttagtgggataag 267  Q
     |||||||||||||    
T  6230293 tttagtgggataag 6230280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 333 - 398
Target Start/End: Original strand, 7252235 - 7252300
Alignment:
Q  333 ctcacctttcaaattgattttgttaggttgagttaggtccaacccaaattctaatatggtatcaga 398  Q
    |||| ||| ||| ||| ||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  7252235 ctcatcttacaagttggttttgtagggttgagttaggctcaacccaaattctaagatggtatcaga 7252300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 182 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 9394731 - 9394630
Alignment:
Q  182 ttaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgtt 281  Q
    ||||||| ||||| || |||||||| ||| ||| | ||||||||  |||||| |||||| || || || |||||| || |||||||||||  ||||||||    
T  9394731 ttaatgagttggatccgaatatggtttataatagagcattatggcttaattttatccatgtagccaaccccacttggtaggataagactttgttgttgtt 9394632  T
Q  282 gt 283  Q
    ||    
T  9394631 gt 9394630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 284
Target Start/End: Original strand, 16113674 - 16113727
Alignment:
Q  231 tttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgta 284  Q
    ||||||| || || ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  16113674 tttgatctatgtagccgactccatttagtgggagaagacttggttgttgttgta 16113727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 36608719 - 36608682
Alignment:
Q  246 cgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36608719 cgactccacgtagtgggataagacttggttgttgttgt 36608682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 152 - 188
Target Start/End: Original strand, 1626346 - 1626382
Alignment:
Q  152 taagagaaactattaagaaggatttagagattaatga 188  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  1626346 taagagaaactattaagaaagatctagagattaatga 1626382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 245 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 2073345 - 2073305
Alignment:
Q  245 ccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgtat 285  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  2073345 ccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtat 2073305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 2515223 - 2515171
Alignment:
Q  231 tttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  2515223 tttgatctatctagccgaccccacttagtgggataaggcttgtttgtcgttgt 2515171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 155 - 259
Target Start/End: Original strand, 19224935 - 19225039
Alignment:
Q  155 gagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccac 254  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||||||  || ||| | | ||||||| |||| |||| | |  |||||||||| || ||||| ||||    
T  19224935 gagaaactattacgaaagatttagatattattgaattggatacatatacgatatatgatagaacactatgatgtcgtttgatccatgtagccgaccccac 19225034  T
Q  255 ttagt 259  Q
    |||||    
T  19225035 ttagt 19225039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 359 - 403
Target Start/End: Original strand, 33455859 - 33455903
Alignment:
Q  359 gttgagttaggtccaacccaaattctaatatggtatcagagtcta 403  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33455859 gttgagttagactcaacccaaattctaagatggtatcagagtcta 33455903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 203 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 42549917 - 42549837
Alignment:
Q  203 tggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||  ||||||||| ||| || || || ||||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  42549917 tggtttatgatagaacatcatggcgtaatttgattcatgtagccaaccccacttagtgggataaagcttggttgttgttgt 42549837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 91; Significance: 6e-44; HSPs: 102)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 50 - 283
Target Start/End: Original strand, 14667819 - 14668053
Alignment:
Q  50 tttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaa 149  Q
    |||||||||||  ||| ||||| |||| ||| |  | ||||||||||||||  ||||||  ||||||| |||||  ||||||| ||||  |||| |||||    
T  14667819 tttgggcatgtagagagaagacatgtacattatgtagtaaggagagtagatcagatggattatagttatatcactagaggcagcggaaatcctagaaaaa 14667918  T
Q  150 ct-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccga 248  Q
    || |||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  14667919 ctataagagaagctactaagaaagatctagagattaatgagttggatccaagtatggtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtaaccga 14668018  T
Q  249 ctccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  14668019 ccccacttagtgggataagacttggttgtagttgt 14668053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 40 - 283
Target Start/End: Original strand, 7678521 - 7678759
Alignment:
Q  40 gcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaaga 139  Q
    |||||||| |||||||| |||  ||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||     |||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  7678521 gcttaggttgtttgggcttgtagagaaaagacatgtagattctgtagtaaggagagtagat-----ggaggatagtcagatcactagaggcagaggaaga 7678615  T
Q  140 ccta-taaaaacttaagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatcc 238  Q
     ||| ||||| | |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||| | ||||| ||| ||| ||||| |||||||   || ||||||||    
T  7678616 tctagtaaaaccataagagaaactatttagaaagatctagagattaatgagttggatcgaaatacggtttataataaa-cattatgaggtagtttgatcc 7678714  T
Q  239 atctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    || || ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  7678715 atgtagccgaccccacttagtgggataaaacttggttgttgttgt 7678759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 117 - 267
Target Start/End: Original strand, 9235164 - 9235312
Alignment:
Q  117 agatcacatgaggcagaggaagacctataaaaacttaagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaa 216  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||| | ||||||||| ||||||| |    
T  9235164 agatcactagaggcagaggaagacctagaaaaact-aagagaaactattaagaaagatatagagattaatgagctggatcgaaatatggtttatgataga 9235262  T
Q  217 acattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataag 267  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  9235263 acattatggcataatttgatccatgtagccgac-ccacttagtgggataag 9235312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 29 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 7359514 - 7359261
Alignment:
Q  29 gtggaaaataagcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgag 128  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| |||||  ||| ||||  ||||||||||  | ||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||  |||    
T  7359514 gtggaaaataggtttaggtggtttgg-catgtagagagaagatatgtagattctgtagtaaggagagtagatcagatggaggatagtcatatcactagag 7359416  T
Q  129 gcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggta 227  Q
    |||||||||  |||| ||||||  |||||||||||||| ||||  || ||||||||||| | ||||| | ||||||||| || |||||| |||||||       
T  7359415 gcagaggaaagcctagaaaaaccataagagaaactatttagaaaaatctagagattaataagttggatcgaaatatggtttacgataaa-cattatgacg 7359317  T
Q  228 taatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||||||||| || | ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  7359316 taatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggacaagacttggttgttgttgt 7359261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 29 - 266
Target Start/End: Original strand, 30588476 - 30588712
Alignment:
Q  29 gtggaaaataagcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgag 128  Q
    |||||||||| | ||| ||||||||||||| |   || ||||||||||||||||  | |||||||||||||||  |||||||||||| || ||||  |||    
T  30588476 gtggaaaataggtttaagtggtttgggcatattcggagaagacttgtagattctgtagtaaggagagtagata--atggaggatagtcaggtcacgagag 30588573  T
Q  129 gcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggta 227  Q
     || ||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||| ||| ||||||| ||||| ||||| | ||||||||| ||| ||| |||||||||       
T  30588574 acataggaagacctagaaaaactataagagaaattgttaagaaagatctagagatgaatgagttggatcgaaatatggtttataatagaacattatgacg 30588673  T
Q  228 taatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataa 266  Q
    | || |||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  30588674 tgatatgatccatgtagccgactccacttagtgggataa 30588712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 29 - 283
Target Start/End: Original strand, 6859408 - 6859663
Alignment:
Q  29 gtggaaaataagcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgag 128  Q
    |||||||| | || |||||||||||| || ||  ||| ||||||||| ||||||  | ||||| || || ||  ||||||||||||| | | |||  |||    
T  6859408 gtggaaaacaggcataggtggtttggacacgtagagagaagacttgtggattctgtagtaaggggaataaattagatggaggatagtcaaaccactagag 6859507  T
Q  129 gcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggta 227  Q
    | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||| | | |||| || ||||||||| ||||||| |||||||||| |    
T  6859508 gaagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagatttacagattagttacttgggccaaaatatggtttatgatagaacattatggca 6859607  T
Q  228 taatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |||||| |||||| |  | ||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||    
T  6859608 taattttatccatgttgctgaccccacttagtgggataaggcttggtagttgttgt 6859663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 29 - 283
Target Start/End: Original strand, 43475267 - 43475521
Alignment:
Q  29 gtggaaaataagcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgag 128  Q
    ||||||| || |||||||||||||||| ||    ||| ||||| |||||||  |  | ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||   ||    
T  43475267 gtggaaactaggcttaggtggtttgggtattcagagagaagacctgtagatgttgtagtaaggagagtagatcagatggaggatagtcagatcactatag 43475366  T
Q  129 gcagaggaagacctataaaaacttaagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtat 228  Q
    | | | | | || || |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||| | ||||||| | |||| || ||| ||||||| |    
T  43475367 gaaaaagtaaacatagaaaaacttaagagaaactattaagaaagatccagagattaatgagttggatcgaaatatgatttatggtagaacgttatggtgt 43475466  T
Q  229 aatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |||||||||||  || || |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  43475467 aatttgatccacgtagccaactccacttaatgggataaggcttggttgttgttgt 43475521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 39 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 15489737 - 15489583
Alignment:
Q  39 agcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaag 138  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||| |||| ||||||||| |  | ||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||  |||||||||||||    
T  15489737 agcttagatggtttgggcatgtagagagaagatttgtagattttgtattaaggagagtagattagatggaggatagttgaatcactagaggcagaggaag 15489638  T
Q  139 acctataaaaac-ttaagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattg 192  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  15489637 acctagaaaaacaataagagaaactattaagaaagacttatagattaatgaattg 15489583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 29 - 240
Target Start/End: Original strand, 6889020 - 6889232
Alignment:
Q  29 gtggaaaataagcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgag 128  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| |||||  ||| ||||||||| |||| |    |||||| | || ||  ||||||||||||| | | ||| ||||    
T  6889020 gtggaaaataggcttaagtggtttggacatgtagagagaagacttgtggattatgtggtaaggacaataaattagatggaggatagtcaaaccacttgag 6889119  T
Q  129 gcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggta 227  Q
    | |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||      
T  6889120 gaagaggaaggcctagaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagagattaattagttgggccaaaatatggtttatgatagaacattatggcg 6889219  T
Q  228 taatttgatccat 240  Q
    |||||| ||||||    
T  6889220 taatttaatccat 6889232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 126 - 283
Target Start/End: Original strand, 4496508 - 4496666
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||| |||||||||||||  |||||| | |||||||| ||||  |||||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||| ||||||| |||| ||||    
T  4496508 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatg 4496607  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    | || ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  4496608 gcatcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 4496666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 29 - 272
Target Start/End: Original strand, 32516583 - 32516825
Alignment:
Q  29 gtggaaaataagcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgag 128  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | | ||| ||||||| || ||||||||||  | || |||||||||||  |||| |||||| | |||| ||| |||    
T  32516583 gtggaaaataggcttaggtggtttagacttgtaaagaaaatacatgtagattctgtagtatggagagtagatcggatgaaggataatcagattacaagag 32516682  T
Q  129 gcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactatta-agaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggt 226  Q
    | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||||||  | |||||  |||||||||| ||||||| || ||||||      
T  32516683 gtagaggaagaccta-aaaaactataagagaaactattagagca-gatttagagattaacaagttggattcaaatatggtttatgatagaatattatgac 32516780  T
Q  227 ataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttg 272  Q
     |||||||||| || ||||||| |||||||| || ||||| |||||    
T  32516781 gtaatttgatcgatataaccga-tccacttaatgagataaaacttg 32516825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 129 - 283
Target Start/End: Original strand, 11675656 - 11675812
Alignment:
Q  129 gcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattgga-cccaaatatggtctatgataaaacattatggt 226  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||    ||||||||| ||||||| ||||||||||     
T  11675656 gcagaggaagacctgtaaaaactataagagaaactattaggacagatttagagattaatgagttggattttaaatatggtttatgatagaacattatggc 11675755  T
Q  227 ataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
     || ||| |||||| || ||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  11675756 gtagtttaatccatgtagccgaccccacttagttggataaggcttggttgttgttgt 11675812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 87 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 12577057 - 12576861
Alignment:
Q  87 taaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaactt-aagagaaactattaagaaggatttagagattaa 185  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||||   |||||  |||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  12577057 taaggagagtagatcagatggagggtagtcctatcactagaggcagaggaagacctagaaaaactacaagataaactattaagaaagatctagagattaa 12576958  T
Q  186 tgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttg 282  Q
    ||| ||| |   ||||||||| ||||||| | ||||||||| | |||| || ||| || ||||| ||| ||||||||||||  |||| |||||||||    
T  12576957 tgagttgaatagaaatatggtatatgatagaccattatggtgtcattttatacatgtagccgaccccaattagtgggataaagcttggttgttgttg 12576861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 41 - 194
Target Start/End: Original strand, 2712983 - 2713137
Alignment:
Q  41 cttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagac 140  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||| ||||||  |  |||||||||||||  ||||||||| ||| | |||||  ||| ||| |||||||    
T  2712983 cttaggtggtttgggcatgtagagagaagacctgtggattctgtatgaaggagagtagatcagatggaggagagtcaaatcactagagtcaggggaagac 2713082  T
Q  141 ctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattgga 194  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  2713083 ctagaaaaactataagagaaactattaagaaggatctagagatgaatgagttgga 2713137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 159 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 418158 - 418034
Alignment:
Q  159 aactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttag 258  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||| || ||||| |||||| |    
T  418158 aacttttaggaaagatttagagattaatgagttggatccaaatgtggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttgg 418059  T
Q  259 tgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||    
T  418058 tgggatatggcttgaatgttgttgt 418034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 196 - 283
Target Start/End: Original strand, 18855802 - 18855889
Alignment:
Q  196 ccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18855802 ccaaatatggtttatgatagaacattatagcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgt 18855889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 133 - 283
Target Start/End: Original strand, 29816513 - 29816664
Alignment:
Q  133 aggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataat 231  Q
    |||||||||||  |||||| | |||||||| ||||  |||||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||| ||||||| |||| |||||  | ||    
T  29816513 aggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcat 29816612  T
Q  232 ttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  29816613 ttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 29816664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 126 - 272
Target Start/End: Original strand, 38685091 - 38685238
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||| |||||||||||||  |||||| | |||||||| ||||  |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  38685091 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacaatatg 38685190  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttg 272  Q
    |  | ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  38685191 gcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttg 38685238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 42 - 283
Target Start/End: Original strand, 79553 - 79795
Alignment:
Q  42 ttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacc 141  Q
    ||||||||||||| |||||  ||| ||||| | ||||||||  | |||||||||| |||   ||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||||||    
T  79553 ttaggtggtttggacatgtagagagaagacctatagattctgtagtaaggagagtcgatcaaatggaggatggtcggatcacaagaggctgaggaagacc 79652  T
Q  142 tataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccat 240  Q
    || ||||||| | ||| ||||||||| ||| ||||| || ||||||||  |||||| |||||||||  |||||| | ||||||||  | |||| ||||||    
T  79653 tagaaaaactatcagataaactattaggaatgatttggaaattaatgagctggaccgaaatatggtgcatgatagaccattatggcgtgatttcatccat 79752  T
Q  241 ctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
     || | | | ||||||||||||| ||| |||| | ||||||||    
T  79753 gtagctggccccacttagtgggaaaaggcttggtggttgttgt 79795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 126 - 283
Target Start/End: Original strand, 10639426 - 10639584
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||| |||||||||||||  |||||| | |||||||| ||||  |||||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||| ||||||| |||| ||||    
T  10639426 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatg 10639525  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |  | ||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  10639526 gcgtcatttgatccatgtagccgaccccactttgtgggataaggcttggttgttgttgt 10639584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 126 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 12492542 - 12492384
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||| |||||||||||||  |||||| | |||||||| ||||  |||||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||| ||||||| |||| ||||    
T  12492542 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatg 12492443  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |  | ||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  12492442 gcgtcatttgatgcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 12492384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 126 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 28977017 - 28976859
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||| |||||||||||||  |||||| | |||||||| ||||  |||||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||| ||||||| |||| ||||    
T  28977017 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattataaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatg 28976918  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |  | ||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  28976917 gcgtcatttgattcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 28976859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 131 - 283
Target Start/End: Original strand, 29922413 - 29922566
Alignment:
Q  131 agaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtata 229  Q
    ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||  |||  |||| || |||| ||||||||||  ||    
T  29922413 agaggaagatctagaaaaactataagagaaactattaagaaagatttagagattaacaagttggactgaaacctggtttacgatagaacattatggcgta 29922512  T
Q  230 atttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||||||| || || ||  ||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  29922513 atttgatccatgtagccaacctcacttggtgggataagccttggttgttgttgt 29922566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 132 - 283
Target Start/End: Original strand, 28012 - 28164
Alignment:
Q  132 gaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataa 230  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| | ||||| ||||||||| | | ||||| |||| ||||| ||||    
T  28012 gaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagaggttaataagttggatccaaatatgatttctgatagaacactatggcataa 28111  T
Q  231 tttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |||||| ||| || | ||| ||| |||||  ||||||||||| || |||||||    
T  28112 tttgatacatgtagctgaccccatttagttagataagacttggtttttgttgt 28164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 157 - 283
Target Start/End: Original strand, 20367049 - 20367175
Alignment:
Q  157 gaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccactt 256  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||   ||||||||||||| || || || ||||||    
T  20367049 gaaactagtaggaaggatctagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgacataacattatgacgtaatttgatccatatagccaaccccactt 20367148  T
Q  257 agtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
     || ||||||| |||| ||||||||||    
T  20367149 ggtaggataaggcttggttgttgttgt 20367175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 174 - 283
Target Start/End: Original strand, 5558314 - 5558423
Alignment:
Q  174 tttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttga 273  Q
    ||||||| | ||||| | ||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||     
T  5558314 tttagaggtcaatgagtaggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttgg 5558413  T
Q  274 ttgttgttgt 283  Q
    |||| |||||    
T  5558414 ttgtcgttgt 5558423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 126 - 282
Target Start/End: Original strand, 20456897 - 20457054
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||| |||||||||||||  |||||| | |||||||| ||||  |||||||||||| | ||| | ||| | | |||| || | ||||||| |||||||||    
T  20456897 gaggtagaggaagacctacgaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaataagttgaatctaaatttgatgtatgatagaacattatg 20456996  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttg 282  Q
    |  | ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20456997 gcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttgattgttgttg 20457054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 217 - 285
Target Start/End: Original strand, 9234102 - 9234170
Alignment:
Q  217 acattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgtat 285  Q
    ||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9234102 acattatgacataatttgatccatgtaaccgaccccacttagtgggataaggcttgattgttgttgtat 9234170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 159 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 17340560 - 17340437
Alignment:
Q  159 aactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttag 258  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||| || || ||||||||||| ||||||| |||||||| | ||| |||||| ||| ||||||| ||   || |    
T  17340560 aactattaagaaagatttagaggttaatgagtttgatccaaatatggtttatgatataacattattgcatactttgattcatttaaccga-tctgtttgg 17340462  T
Q  259 tgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  17340461 tgggataagacttaattgttgttgt 17340437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 29 - 283
Target Start/End: Original strand, 23979973 - 23980226
Alignment:
Q  29 gtggaaaataagcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgag 128  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| |||||  ||| ||  | ||||||||||| | |||| |||||||||  ||| ||  | ||| | || ||| |||    
T  23979973 gtggaaaataggtttaggtggtttggacatgtagagagaaaccctgtagattctatagtaagaagagtagatcagataga--aaagtcatattacaagag 23980070  T
Q  129 gcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggta 227  Q
    | | ||| ||||||| || |||  |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||| |||| ||||  |    
T  23980071 gtataggcagacctagaagaacaataagagaaactattgagaatgatttatagattaatgagttggatctaaatatggtttatgatagaacaatatgaca 23980170  T
Q  228 taatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    || ||  |||||| ||| | || |||||||||||||||| | |||||| |||||||    
T  23980171 tatttcaatccatgtaatcaaccccacttagtgggataatatttgatttttgttgt 23980226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 172 - 283
Target Start/End: Original strand, 41894237 - 41894355
Alignment:
Q  172 gatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatga-------taaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggat 264  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||       || ||||||||||| ||||||||||||| || || || ||||||||||||||    
T  41894237 gatttagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgaattatgatacaacattatggtgtaatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggat 41894336  T
Q  265 aagacttgattgttgttgt 283  Q
    |||||||  ||||||||||    
T  41894337 aagactttgttgttgttgt 41894355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 126 - 284
Target Start/End: Original strand, 3301968 - 3302127
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||| |||||||||||||  |||||  | |||||||| ||||  || ||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||| | ||||| |||| || |    
T  3301968 gaggtagaggaagacctaagaaaaccattagagaaaccattataaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactacg 3302067  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgta 284  Q
    |  | ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  3302068 gcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgta 3302127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 126 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 2915653 - 2915496
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||| |||||||||||||  | |||| | |||||||| ||||  |||||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||| ||||||| |||| ||||    
T  2915653 gaggtagaggaagacctaggataactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggt-tatgatagaacactatg 2915555  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |  | ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  2915554 gcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttattgttgt 2915496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 29 - 265
Target Start/End: Original strand, 29938142 - 29938374
Alignment:
Q  29 gtggaaaataagcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgag 128  Q
    |||||||||| |||||||||||||  || | |  ||| ||||| |||||||||     |||||| |||||||  |||| |||||||| |||||||| |||    
T  29938142 gtggaaaataggcttaggtggtttaagcctatagagagaagacctgtagattcggtggtaaggacagtagattggatgaaggatagtcagatcacaagag 29938241  T
Q  129 gcagaggaagacctataaaaacttaagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtat 228  Q
    | ||||||||||||| |||||||   |||||||||||| ||| ||||||  ||||||||| |||||   ||||||| | |||| || |||||| |||| |    
T  29938242 gtagaggaagacctagaaaaact---gagaaactattaggaatgatttaatgattaatgagttggattgaaatatgatttatg-tagaacattttggtgt 29938337  T
Q  229 aatttgatccatctaaccgactccacttagtgggata 265  Q
    || ||| ||||| || ||||| ||||| ||| |||||    
T  29938338 aagttggtccatgtagccgaccccactcagttggata 29938374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 131 - 267
Target Start/End: Original strand, 1275393 - 1275530
Alignment:
Q  131 agaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtata 229  Q
    ||||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||  |||||||||||| ||||| | ||| | |||||| |||| | ||||| |||||||||   |     
T  1275393 agaggaagacctagaaaaactattagagaaaccattataaaggatttagaggttaatcagttgaatccaaatttggtgtttgatagaacattatgacgtc 1275492  T
Q  230 atttgatccatctaaccgactccacttagtgggataag 267  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  1275493 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 1275530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 103 - 283
Target Start/End: Original strand, 6788168 - 6788348
Alignment:
Q  103 gatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaat 201  Q
    |||||||||| || |||||||  |||||||||||||||||| ||||||| | | || |||||||| ||| || || || |||||||| ||||||  ||||    
T  6788168 gatggaggatggtcagatcactagaggcagaggaagacctagaaaaactatcaaaggaactattaggaaagacttggaaattaatgagttggactgaaat 6788267  T
Q  202 atggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||| | ||||||| |||||||| |  ||||||||| ||| || |||||  |||||||| ||| |||||||| | ||||||||    
T  6788268 atgatttatgatagaacattatagcgtaatttgattcatgtagccgacctcacttagtagga-aagacttggtggttgttgt 6788348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 41 - 225
Target Start/End: Original strand, 14749346 - 14749531
Alignment:
Q  41 cttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagac 140  Q
    ||||| |||||||| |||||  ||| ||||| ||| ||||||    |||||||||| |||  ||||||||  ||| | |||||   ||||||||||||||    
T  14749346 cttagatggtttggacatgtagagagaagacctgtggattctgttgtaaggagagtcgatcagatggaggggagtcaaatcactaaaggcagaggaagac 14749445  T
Q  141 ctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatgg 225  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || |||||   ||||||||| | ||||| |||| |||||    
T  14749446 ctagaaaaactataagagaaactatcaagaaggatctagagattaacgagttggatagaaatatggtttttgatagaacactatgg 14749531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 182 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 32442226 - 32442141
Alignment:
Q  182 ttaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataag 267  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |  |||| ||||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  32442226 ttaatgagttggatccaaatatggttttggatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgactccacttagtgggataag 32442141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 155 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 13561514 - 13561386
Alignment:
Q  155 gagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccac 254  Q
    ||||||| ||||  || ||||||||| | ||||| ||||| |||| |||||| | ||||| |||| |||||  | ||||||||||| || ||||| ||||    
T  13561514 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaactatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccac 13561415  T
Q  255 ttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  13561414 ttagtgggataaggcttgtttgttgttgt 13561386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Original strand, 24178540 - 24178792
Alignment:
Q  32 gaaaataagcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggca 131  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||  |||||| |     |||| |||||||||   |||||||| ||| |  | | | |||| |    
T  24178540 gaaaataggcttagatggtttgggcatgtggagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggta 24178639  T
Q  132 gaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataa 230  Q
    ||||||||||||  |||||| | |||||||| ||||  |||||||||||| | ||||| ||||| |||||| | || ||||||| |||| ||||| || |    
T  24178640 gaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagagttcaatgagttggatccaaatttagtgtatgatagaacactatggcatca 24178739  T
Q  231 tttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||| || || ||||| ||||||| ||  ||||| |||| ||||||||||    
T  24178740 tttgatctatgtagccgaccccacttaatgaaataaggcttggttgttgttgt 24178792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 175 - 283
Target Start/End: Original strand, 36551320 - 36551428
Alignment:
Q  175 ttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgat 274  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||||| | |  || | ||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||| |||| |    
T  36551320 ttagagattaatgagttgcatccaaatatggtttgtattagatcattacggtataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttggt 36551419  T
Q  275 tgttgttgt 283  Q
    |||||||||    
T  36551420 tgttgttgt 36551428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 29 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 43558082 - 43557832
Alignment:
Q  29 gtggaaaataagcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgag 128  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||| || || |||| |||||||||  |||  | ||| || | |||||  ||     
T  43558082 gtggaaactaagcttaggtggtttgggcatatagagagaagacttgtagatgctgcagtaagaagagtagattagataaatgatggtcatatcactagat 43557983  T
Q  129 gcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggta 227  Q
    |  || || |||||| ||||||| ||||||||||  | ||||    ||| ||||||| ||| ||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||       
T  43557982 g--gatgatgacctagaaaaactataagagaaaccgtaaaga----tttggagattattgagttggatcgaaatatggtttatgatagaacattatgact 43557889  T
Q  228 taatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgta 284  Q
    ||| |||||| || || ||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||    
T  43557888 taagttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataaggcctggttgttgttgta 43557832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 126 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 1287737 - 1287590
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||| |||||||||||||  |||||| | |||||||| ||||  |||||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||| |||||||  ||| ||||    
T  1287737 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagtacactatg 1287638  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttg 272  Q
    |  | | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  1287637 gcgtcagttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttg 1287590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 152 - 283
Target Start/End: Original strand, 2090564 - 2090695
Alignment:
Q  152 taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactc 251  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||  | || |||||||| || ||||||  ||||||||||  ||||||||||||| || ||||| |    
T  2090564 taagagaaaatattaggaaagatttagaggttaatgagcttgatccaaatatagtttatgatccaacattatggcgtaatttgatccatgtacccgaccc 2090663  T
Q  252 cacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    || | ||||||||||| |||  ||||||||||    
T  2090664 cattgagtgggataaggctttgttgttgttgt 2090695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 126 - 283
Target Start/End: Original strand, 14665838 - 14665994
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||| ||||| |||||||  |||||| | |||||||| |||| |||| |||||||  | ||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||  | ||    
T  14665838 gaggtagagggagacctaggaaaactattagagaaaccattaggaagaatttagaagtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaac--tctg 14665935  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |  |||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  14665936 gcgtaatttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 14665994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 154 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 16914012 - 16913881
Alignment:
Q  154 agagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccga-ctcc 252  Q
    |||||||| ||||  |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||| || |||| ||||  ||||  | ||||||||||| || |||| | ||    
T  16914012 agagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttacgatagaacaccatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccc 16913913  T
Q  253 acttagtgggataagacttgattgttgttgta 284  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  16913912 acttagtgggataaggcttggttgttgttgta 16913881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 283
Target Start/End: Original strand, 28276390 - 28276520
Alignment:
Q  153 aagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactcc 252  Q
    ||||||||| ||||  ||| |||||||| | ||| | |||||  ||||||| || ||||||| || | |||||| ||||||||||||| || || |||||    
T  28276390 aagagaaaccattagaaagaatttagaggtcaataagttggattcaaatattgtttatgatagaaaactatggtgtaatttgatccatgtagccaactcc 28276489  T
Q  253 acttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  28276490 acttagcgggataaggcttggttgttgttgt 28276520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 2075632 - 2075475
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactatta-agaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattat 223  Q
    |||| |||||||||||||  | |||| | |||||||| |||| | |||||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||| ||||||| || | |||    
T  2075632 gaggtagaggaagacctaggataactattagagaaaccattagaaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaatactat 2075533  T
Q  224 ggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgtt 281  Q
    ||  | ||||||| ||| || || || ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2075532 ggcgtcatttgattcatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttgattgttgtt 2075475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 16347536 - 16347378
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||| |||||||||||||  |||||| | | |||||| ||||  || ||||||||| | ||||| |||||  |||||||||| ||||||| |||| |  |    
T  16347536 gaggtagaggaagacctaggaaaactattaaagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgatttggatacaaatatggtttatgatagaacact--g 16347439  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgtat 285  Q
    |  | ||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16347438 gcgtcatttgatccatgtagccgaccctacttagtgggataagacttggttgttgttgtat 16347378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 281
Target Start/End: Original strand, 27799988 - 27800108
Alignment:
Q  158 aaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccactta 257  Q
    ||||||||||||| ||  | ||||||||||  ||||| | || ||||||   ||||| ||||||||||||||||||||| ||| || || || |||||||    
T  27799988 aaactattaagaaagaacttgagattaatgttttggatcgaactatggt---tgatagaacattatggtataatttgatacatgtagccaaccccactta 27800084  T
Q  258 gtgggataagacttgattgttgtt 281  Q
    |||||||||| |||| ||||||||    
T  27800085 gtgggataaggcttggttgttgtt 27800108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 26884940 - 26884689
Alignment:
Q  32 gaaaataagcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggca 131  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| |||||  ||| |||| ||||||||  |    |||| |||||||||  ||||||||| |||  | ||| | |||| |    
T  26884940 gaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagataagatttgtagatgttgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggta 26884841  T
Q  132 gaggaagacctataaaaacttaagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaa-tatggtctatgataaaacattatggtataa 230  Q
    ||||| || |||  |||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||||  | ||| ||||| |||| | ||||||| |||| || |    ||    
T  26884840 gaggatgagctaggaaaact-aagaaaaactattaggaaagatttagaggttaatgggtcggatccaaaatatgatttatgatagaacactacgacgcaa 26884742  T
Q  231 tttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  26884741 tttgatccatgtagccgaccccacttagtggaataaggcttgattgttgttgt 26884689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 41 - 196
Target Start/End: Original strand, 42199325 - 42199481
Alignment:
Q  41 cttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagac 140  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||  | ||||||||||||||   ||||||  |||| | |||||  | || |||| |||||    
T  42199325 cttaggtggtttgggcatgtagagagaagacatgtagattctgtagtaaggagagtagatcacatggagagtagtcaaatcactagggggagagaaagac 42199424  T
Q  141 ctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacc 196  Q
    ||| ||||||| | ||| |||||||| |||| ||| |||| |||||||| |||||||    
T  42199425 ctagaaaaactattagacaaactatttagaaagatctagatattaatgagttggacc 42199481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 9917694 - 9917539
Alignment:
Q  40 gcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaaga 139  Q
    |||||| ||||||| || ||| |||| ||||| ||| |||| |  | ||| |||||| |||  ||||||||||||| | |||||| ||| ||||||| ||    
T  9917694 gcttagttggtttgtgcgtgtaaagagaagacatgttgattttgtagtaaagagagtcgatcagatggaggatagtcaaatcacaagagacagaggatga 9917595  T
Q  140 cctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattgga 194  Q
    |||| ||||||| | |||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||| |||||    
T  9917594 cctagaaaaactattagagaaactatttagaaagatatagagatcaatgagttgga 9917539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 187
Target Start/End: Original strand, 21952399 - 21952541
Alignment:
Q  44 aggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagaccta 143  Q
    ||||||||||| |||||  ||| ||| | ||| ||||||| | |||||||| |||||  ||||||||  ||| | |||||  |||| || ||||||||||    
T  21952399 aggtggtttggacatgtagagagaagtcctgtggattctatagtaaggagaatagatcagatggaggggagtcaaatcactagaggtaggggaagaccta 21952498  T
Q  144 taaaaacttaagagaaactattaagaaggatttagagattaatg 187  Q
     ||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  21952499 gaaaaact-atgagaaactattgagaaggatctagagattaatg 21952541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 283
Target Start/End: Original strand, 30213758 - 30213857
Alignment:
Q  184 aatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||| ||||| |||||| |||| ||||||| |||| |||||  | ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  30213758 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgtttttgt 30213857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 283
Target Start/End: Original strand, 38132543 - 38132618
Alignment:
Q  208 tatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  38132543 tatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtggccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 38132618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 139 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 28186921 - 28186864
Alignment:
Q  139 acctataaaaact--taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattgga 194  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  28186921 acctataaaaactattaagagaaactattaagaaagatttagagattaatgagttgga 28186864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 42 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 38501660 - 38501422
Alignment:
Q  42 ttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacc 141  Q
    |||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |     |||| |||||||||  ||||||||| |||  ||||| | |||   || |||||||    
T  38501660 ttagatggtttggacatgtaaagagaagacttgtagatgccgtcgtaagaagagtagattagatggaggagagtcggatcaaaagagatggatgaagacc 38501561  T
Q  142 tataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccat 240  Q
    ||  | |||| ||| |||||||||||  ||| |||||||| | ||| | ||||| ||||||||| | ||||||| || | ||| || |||| ||||| ||    
T  38501560 taggagaactataaaagaaactattagaaagtatttagaggtcaataagttggatccaaatatgatttatgatagaaaactatagtgtaatatgatcgat 38501461  T
Q  241 ctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttg 279  Q
     || ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38501460 gtagccgatcccacttagtgggataagacttggttgttg 38501422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 283
Target Start/End: Original strand, 5860035 - 5860116
Alignment:
Q  202 atggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||| ||||||| | ||||||||  |||||||||| || || ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5860035 atggtttatgatagaccattatggcgtaatttgatctatgtagccgaccctacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 5860116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 284
Target Start/End: Original strand, 27386555 - 27386623
Alignment:
Q  216 aacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgta 284  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||    
T  27386555 aacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcatggttgttgttgta 27386623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 117 - 283
Target Start/End: Original strand, 5305754 - 5305913
Alignment:
Q  117 agatcacatgaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataa 215  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| | |||     ||| ||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||     
T  5305754 agatcactagaggcagaggaagacctagaaaaactatatgagaaactatcatgaaaa---tagtgattaatgagttggatccaaataaggtttatgatag 5305850  T
Q  216 aacatta-tggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||| || ||||||||| |      | | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  5305851 aacattaatgatataatttggt------agcagactccacttagtgggataaggcttgatggttgttgt 5305913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 131 - 265
Target Start/End: Original strand, 27998570 - 27998705
Alignment:
Q  131 agaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtata 229  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||| || |||||||||| || ||    || ||| | ||||||| || ||||||   |     
T  27998570 agaggaagacctagaaaaactataagagaaactactaagaaagatctacagattaatgagttagataggaacatgatatatgatagaatattatgacgtc 27998669  T
Q  230 atttgatccatctaaccgactccacttagtgggata 265  Q
     |||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  27998670 gtttgatccatgtaaccgaccccacttagtgggata 27998705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 357 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 38069602 - 38069563
Alignment:
Q  357 aggttgagttaggtccaacccaaattctaatatggtatca 396  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38069602 aggttgagttaggcccaacccaaattctaatatggtatca 38069563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 133 - 283
Target Start/End: Original strand, 38684611 - 38684762
Alignment:
Q  133 aggaagacctataaaaactt-aagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataat 231  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| | |||||   |||||||||   ||||| ||||||||||  | ||    
T  38684611 aggaagacctagaaaaactacaagagaaacttttaagaaagatctagagattaattagttggatagaaatatggtacttgatagaacattatggcgttat 38684710  T
Q  232 ttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||| ||| ||   ||| ||||||||||| ||||  |||| ||||||||||    
T  38684711 ttgattcatgtagttgaccccacttagtggaataaagcttggttgttgttgt 38684762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 208 - 283
Target Start/End: Original strand, 42576217 - 42576292
Alignment:
Q  208 tatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||| ||||| ||||  ||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  42576217 tatgatagaacataatggcgtaatttgatccatgtagccgacccgacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 42576292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 194
Target Start/End: Original strand, 1525731 - 1525837
Alignment:
Q  89 aggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatg 187  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||  |||| || || ||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||  |||||| ||||    
T  1525731 aggagagtagatcagatggaggagagtcagatcactagaggtaggggtagacctagaaaaactacaagagaaactattaggaaggatccagagataaatg 1525830  T
Q  188 aattgga 194  Q
    | |||||    
T  1525831 agttgga 1525837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 15986989 - 15986879
Alignment:
Q  32 gaaaataagcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggca 131  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| |||  ||| ||||  ||||||||||| | |||||||||| |||   |||||||||||| |||||||| |||| |    
T  15986989 gaaaataggtttaggtggtttgggcgtgtagagagaagatatgtagattctatagtaaggagagtggatcaaatggaggatagtcagatcacaagaggta 15986890  T
Q  132 gaggaagacct 142  Q
     | ||||||||    
T  15986889 aatgaagacct 15986879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 123
Target Start/End: Original strand, 21093779 - 21093873
Alignment:
Q  29 gtggaaaataagcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcac 123  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||  |||||||| ||||| |  | ||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  21093779 gtggaaaataggcttaggtagtttgggcatgtagagggaagacttggagattttgtagtaaagagagtagatcagatggaggatagtcagatcac 21093873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 283
Target Start/End: Original strand, 34273137 - 34273295
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||| |||||||||||||  |||||| | |||||||| ||||  |||||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||| ||||||| |||| ||||    
T  34273137 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatg 34273236  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
       | ||| ||||||| || || ||  ||||||||| |||||| |||  ||||||||||    
T  34273237 acgtcattcgatccatgtagccaacctcacttagtgagataaggcttagttgttgttgt 34273295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 230 - 280
Target Start/End: Original strand, 39040985 - 39041035
Alignment:
Q  230 atttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgt 280  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39040985 atttgatccatgtagccgaccccacttaatgggataagacttgattgttgt 39041035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 230 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 408547 - 408494
Alignment:
Q  230 atttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  408547 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 408494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 198 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 683786 - 683713
Alignment:
Q  198 aaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagactt 271  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||| | || |||||||||| || || || |||||||| ||||||||||||    
T  683786 aaatatggtttatgatagaacattatgttgtagtttgatccatgtagccaaccccacttagcgggataagactt 683713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 202 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 11069243 - 11069162
Alignment:
Q  202 atggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||| || | ||| |||| |||||||||| | |||| ||||||||||    
T  11069243 atggtatatgatagaacattatggcgtaatttgatccatatagctgaccccacatagtgggatatggcttggttgttgttgt 11069162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 179 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 15252848 - 15252751
Alignment:
Q  179 agattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattg 276  Q
    ||||||| || ||||| | ||||| ||| ||||||| ||||||||| | || ||| || ||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  15252848 agattaacgagttggatcgaaatagggtttatgatagaacattatgatgtagtttaattcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttgattg 15252751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 125 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 15588547 - 15588401
Alignment:
Q  125 tgaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattat 223  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||  |  ||||||||||  ||||| |||||   ||| ||||| ||||| | ||||||||    
T  15588547 tgaggcagaggacgacctagaaaaactataagagaaactattataa--gatttagagagaaatgagttggataaaaacatggtatatgacagaacattat 15588450  T
Q  224 ggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttg 272  Q
    ||  |  ||||||| || || ||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  15588449 ggcgtcgtttgatctatgtagccgaccctacttagtgggataaggcttg 15588401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 134 - 194
Target Start/End: Original strand, 33667567 - 33667628
Alignment:
Q  134 ggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattgga 194  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  33667567 ggaagacctagaaaaactataagagaagttattaagaaggatctagagattaatgagttgga 33667628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 227 - 283
Target Start/End: Original strand, 4653478 - 4653534
Alignment:
Q  227 ataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |||||||||| ||| || ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  4653478 ataatttgattcatgtatccgaccccacttagtgagataagacttggttgttgttgt 4653534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 225
Target Start/End: Original strand, 43035105 - 43035205
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||  |  |||||||||||| |||  |||| || ||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  43035105 gaggcagaggaagaactagaaaaaccatctgagaaactattaggaaaaatttggaaatttatgagttggaccgaaatatggtgtatgatagaacattatg 43035204  T
Q  225 g 225  Q
    |    
T  43035205 g 43035205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 172 - 283
Target Start/End: Original strand, 2393048 - 2393158
Alignment:
Q  172 gatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagactt 271  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||||||||| || | | ||| || | |||||||| ||||||||||| || ||||  ||||||| ||||||||  |||    
T  2393048 gatttagaggtcaatgaattagacccaaatatagtttctaatagaatactatggtatcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataaagctt 2393147  T
Q  272 gattgttgttgt 283  Q
    | ||||||||||    
T  2393148 g-ttgttgttgt 2393158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 131 - 194
Target Start/End: Original strand, 4460337 - 4460400
Alignment:
Q  131 agaggaagacctataaaaacttaagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattgga 194  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||    
T  4460337 agaggaaaacctagaaaaacttaaaagagactattaagaaagacctagagattaatgagttgga 4460400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 136 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 10082893 - 10082834
Alignment:
Q  136 aagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattgga 194  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||    
T  10082893 aagacctagaaaaactataagagaaactagtaacaaggatctagagattaatgagttgga 10082834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 160 - 283
Target Start/End: Original strand, 28411835 - 28411958
Alignment:
Q  160 actattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagt 259  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||   ||| ||| | | ||||| |||| |||||  |  |||||| ||| || ||||| |||||||||    
T  28411835 actattaggaaggatctagagataaatgacttggagaaaaacatgttttctgatagaacactatggcgttgtttgattcatgtagccgaccccacttagt 28411934  T
Q  260 gggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |||||||| |||| ||||||||||    
T  28411935 gggataaggcttggttgttgttgt 28411958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 103 - 185
Target Start/End: Original strand, 28676696 - 28676779
Alignment:
Q  103 gatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaa 185  Q
    |||||||||| || |||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| || ||||| |||||    
T  28676696 gatggaggattgtcagattacaagaggtagaagaagacctataaaaactataagagaaacaattatgaaagaattagatattaa 28676779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 228 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 35118377 - 35118322
Alignment:
Q  228 taatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||||||||| || |||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35118377 taatttgatccatgtacccgacctcatttagtgggataaggcttgattgttgttgt 35118322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 208 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 36123257 - 36123182
Alignment:
Q  208 tatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||| |||||||||||    |||||||||| ||| ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36123257 tatgatagaacattatggtggcgtttgatccatgtaatcggtcccacttagtgggataagacttggttgttgttgt 36123182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 359 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 40261092 - 40261053
Alignment:
Q  359 gttgagttaggtccaacccaaattctaatatggtatcaga 398  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40261092 gttgaattaggcccaacccaaattctaatatggtatcaga 40261053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 217 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 41108795 - 41108725
Alignment:
Q  217 acattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtg--ggataagacttgattgttgttgtat 285  Q
    |||||||||  ||||||||||||| || | ||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  41108795 acattatggcgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtgtgggataaggcttgattgttgttgtat 41108725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 357 - 403
Target Start/End: Original strand, 7095911 - 7095956
Alignment:
Q  357 aggttgagttaggtccaacccaaattctaatatggtatcagagtcta 403  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||    
T  7095911 aggttgagttaggtccaaccaaaattctaatat-gtattagagtcta 7095956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 40 - 122
Target Start/End: Original strand, 11675548 - 11675630
Alignment:
Q  40 gcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatca 122  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| ||| | ||||||||||  | ||||||||||||||   | |||||||||| ||||||    
T  11675548 gcttaggtggtttgggcatgttgagagaaggcctgtagattctgtagtaaggagagtagatcatagggaggatagtcagatca 11675630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 155 - 281
Target Start/End: Original strand, 14911326 - 14911452
Alignment:
Q  155 gagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccac 254  Q
    ||||||| ||||  || ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| | | ||||| || | |||||  | ||||||||||| || ||||| ||||    
T  14911326 gagaaaccattagaaaagatttagaggttaatgagttggatccaaatatgatttttgatagaatactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccac 14911425  T
Q  255 ttagtgggataagacttgattgttgtt 281  Q
    ||| ||| |||||  ||| ||||||||    
T  14911426 ttaatggaataaggtttggttgttgtt 14911452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 228 - 282
Target Start/End: Original strand, 25938196 - 25938250
Alignment:
Q  228 taatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttg 282  Q
    ||||||||| ||| || |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  25938196 taatttgattcatgtagccgactccacatagtgagataagacttggttgttgttg 25938250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 210 - 283
Target Start/End: Original strand, 2645199 - 2645272
Alignment:
Q  210 tgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |||||||||||||| | ||  |||||||||| || ||| | | ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  2645199 tgataaaacattatagcatcgtttgatccatgtagccggccctacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 2645272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 14330254 - 14330185
Alignment:
Q  197 caaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataa 266  Q
    |||||||||| |||||  ||||||||| || ||||||||| ||| || ||||| |||| |||||||||||    
T  14330254 caaatatggtttatgaccaaacattattgtgtaatttgattcatgtagccgaccccacatagtgggataa 14330185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 18351152 - 18351091
Alignment:
Q  40 gcttaggtggtttgggcat-gtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagat 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||    
T  18351152 gcttaggtggtttgggcattgtagagagaagacctgtagattatgcaataaggagagtagat 18351091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 365 - 398
Target Start/End: Original strand, 32337562 - 32337595
Alignment:
Q  365 ttaggtccaacccaaattctaatatggtatcaga 398  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32337562 ttaggcccaacccaaattctaatatggtatcaga 32337595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 222
Target Start/End: Original strand, 37918160 - 37918253
Alignment:
Q  130 cagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacatta 222  Q
    ||||||||| |||| |||| || ||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||| |||||   |||||| || | |||||||||||||    
T  37918160 cagaggaaggcctagaaaacctgtaagagaaactgtttagaaagatatagagattaatgagttggattgaaatattgtatttgataaaacatta 37918253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 87 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 8082151 - 8082087
Alignment:
Q  87 taaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaact 151  Q
    ||||||||||||||  |||| | |||||| |||||| | |||| ||||||||||||| |||||||    
T  8082151 taaggagagtagatcagatgaacgatagtcagatcaaaagaggtagaggaagacctagaaaaact 8082087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 245 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 10989123 - 10989083
Alignment:
Q  245 ccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgtat 285  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  10989123 ccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtat 10989083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 103 - 214
Target Start/End: Original strand, 15168872 - 15168984
Alignment:
Q  103 gatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaat 201  Q
    ||||||||| ||| |||| | | |||| ||||||  ||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||  |||||||| ||||| | ||||| ||| ||    
T  15168872 gatggaggagagtgagattagaagaggtagaggacaacctagaaaaactataagagaaactgttaggaaaaatttagaggttaataagttggatccagat 15168971  T
Q  202 atggtctatgata 214  Q
    ||||| |||||||    
T  15168972 atggtttatgata 15168984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 210 - 278
Target Start/End: Original strand, 28985292 - 28985360
Alignment:
Q  210 tgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgtt 278  Q
    ||||| |||||||| |  ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||    
T  28985292 tgatagaacattatagcttaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggacaaggcttggttgtt 28985360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 371 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 31973440 - 31973408
Alignment:
Q  371 ccaacccaaattctaatatggtatcagagtcta 403  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31973440 ccaacccaaattctaagatggtatcagagtcta 31973408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 228 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 40265516 - 40265461
Alignment:
Q  228 taatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgta 284  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  40265516 taatttgatccatatagtcgactccacttagggggataaggcttg-ttgttgttgta 40265461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 84; Significance: 9e-40; HSPs: 56)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 113 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 34676 - 34505
Alignment:
Q  113 agttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatg 211  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||| || |||||||||| |||||   ||||||||| ||||    
T  34676 agttagatcactagaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaaccattaagaaagatctaaagattaatgagttggattgaaatatggtttatg 34577  T
Q  212 ataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||| ||||||||||  ||||||||||||| || | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34576 atagaacattatggcgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgt 34505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 9593958 - 9593710
Alignment:
Q  32 gaaaataagcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggca 131  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||| ||  | |||| |||||||||  ||||||||| ||| | ||||   |||| |    
T  9593958 gaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacatgtagatgctgtagtaagaagagtagatcagatggaggagagtcaaatcaa--gaggta 9593861  T
Q  132 gaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataa 230  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||  |||    
T  9593860 gaggaagacctagaaaaattataagagaaactattaggaaagacttagagattaatgagttggatcccaatatggtttatgatagaacattatgg--taa 9593763  T
Q  231 tttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |||||||||| || | |||  |||||||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  9593762 tttgatccatatagctgaccacacttagtggcataaggcttggttgttgttgt 9593710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 89 - 283
Target Start/End: Original strand, 8364643 - 8364838
Alignment:
Q  89 aggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatg 187  Q
    ||||||||||||  |||||||||| || |||||||  |||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||     
T  8364643 aggagagtagatcagatggaggattgtcagatcactagaggaagatgaagacctaaaaaaactataagagaaactattaagaaagatttagaaattaata 8364742  T
Q  188 aattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    | ||||||  ||| ||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||| || ||||| || |||||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  8364743 agttggactgaaacatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccgcttagtgggaaaaggctttattgttgttgt 8364838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 103 - 285
Target Start/End: Original strand, 5095935 - 5096118
Alignment:
Q  103 gatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaactt-aagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaat 201  Q
    |||||| || |||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||| ||| ||||||| | ||||||| ||||| | ||||    
T  5095935 gatggaagagagttagatcagaagaggtagaggaagacctagaaaaactagaagagaaactcttaggaaagatttagtggttaatgagttggatcaaaat 5096034  T
Q  202 atggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgtat 285  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||| || || ||||  |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  5096035 atggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatctatgtagccgatcccacttagtgggataaggtttggttgttgttgtat 5096118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 87 - 283
Target Start/End: Original strand, 12890660 - 12890857
Alignment:
Q  87 taaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaa 185  Q
    |||| |||||||||  ||||||||| ||| || ||| | |||| ||| |||||||||  |||||| |||||||||| ||||  |||||||||||  | ||    
T  12890660 taagaagagtagatcagatggaggagagtaaggtcaaaagaggtagatgaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaaggatttagacgtcaa 12890759  T
Q  186 tgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||| || || ||||||||||| ||||||| |||| |||||  ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  12890760 tgagttagatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 12890857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 126 - 283
Target Start/End: Original strand, 28085500 - 28085658
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||| |||||||||||||  |||||| | |||||||| ||||  |||||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||| ||||||| |||| ||||    
T  28085500 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatg 28085599  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    || | ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  28085600 gtgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 28085658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 168 - 285
Target Start/End: Original strand, 9706937 - 9707054
Alignment:
Q  168 gaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataag 267  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| | ||||| |||| ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  9706937 gaaggatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcatcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 9707036  T
Q  268 acttgattgttgttgtat 285  Q
     |||| ||||||||||||    
T  9707037 gcttggttgttgttgtat 9707054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 579460 - 579700
Alignment:
Q  44 aggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagaccta 143  Q
    |||| ||||| ||||||  ||| ||| |||||||||| || | |||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||  ||||||||| |||||||     
T  579460 aggtagtttgagcatgtagagagaaggcttgtagattatatagtaaggagagttgatcagatggaggatagtctgatcactagaggcagagaaagacctc 579559  T
Q  144 taaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatct 242  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||| ||| | | ||||||||| | |||   || |||||||  |||||||||| || |    
T  579560 aaaaaactgtaagagaaactattaagaaagatatagaaattagtgacttgaatcaaaatatggtttctgaaggaaaattatggcgtaatttgatctatgt 579659  T
Q  243 aaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    | ||||  ||||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  579660 agccgatcccacttagtgggataaagcttggttgttgttgt 579700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 29 - 284
Target Start/End: Original strand, 31818559 - 31818814
Alignment:
Q  29 gtggaaaataagcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgag 128  Q
    ||||||||||  |||||||||||| | ||||   ||| ||||| ||| |||||| || |||||| |||||||   ||||||| |||| |||||||   ||    
T  31818559 gtggaaaatagacttaggtggttttg-catgatgagagaagacctgttgattctgcagtaaggaaagtagatcatatggagggtagtgagatcactaaag 31818657  T
Q  129 gcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggta 227  Q
    | ||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||| ||||| | || |||||| ||||||| |||||||||       
T  31818658 gtaggagaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaaggtttggagattaatgagttggatcaaagtatggtttatgatagaacattatgtcg 31818757  T
Q  228 taatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgta 284  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||| |||| ||  |||| |||||||||||    
T  31818758 taatttgatccatgtagccgaccccacttagcgggaaaaagcttggttgttgttgta 31818814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 32 - 237
Target Start/End: Original strand, 24665840 - 24666047
Alignment:
Q  32 gaaaataagcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaa-taaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggc 130  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||  ||| ||||| |||||||| |   | ||||||||||||||  |||| || |||||  ||||||  |||||    
T  24665840 gaaaataggcttaggtggtttggacatgtagagagaagacctgtagatttttgtagtaaggagagtagatcagatgaagcatagtcggatcaccagaggc 24665939  T
Q  131 agaggaagacctataaaaactt-aagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtata 229  Q
    |||||||| | || || ||||  ||||||||||||||||||  |||||||| | ||||| ||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||   ||    
T  24665940 agaggaagtcatagaataactacaagagaaactattaagaaatatttagaggtcaatgagttggatcgaaatatggtttatgatagaacattatgactta 24666039  T
Q  230 atttgatc 237  Q
    ||||||||    
T  24666040 atttgatc 24666047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 126 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 34143923 - 34143765
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||| |||||||||||||  |||||| | |||||||| ||||  |||||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||| ||||||| |||| ||||    
T  34143923 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattacaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatg 34143824  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |  | ||||||||||| ||  |||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  34143823 gcgtcatttgatccatgtagtcgaccccacttattgggataaggcttggttgttgttgt 34143765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 126 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 34156539 - 34156381
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||| |||||||||||||  |||||| | |||||||| ||||  |||||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||| ||||||| |||| ||||    
T  34156539 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattacaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatg 34156440  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |  | ||||||||||| ||  |||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  34156439 gcgtcatttgatccatgtagtcgaccccacttattgggataaggcttggttgttgttgt 34156381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 171 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 34934942 - 34934829
Alignment:
Q  171 ggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagact 270  Q
    |||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||| ||||||| |||| |||||  | ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  34934942 ggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcctcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggct 34934843  T
Q  271 tgattgttgttgta 284  Q
    || |||||||||||    
T  34934842 tggttgttgttgta 34934829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 107 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 43230 - 43063
Alignment:
Q  107 gaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaactt--aagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatg 204  Q
    ||||||||| ||||| |  ||||||| |||||||||| || |||||  ||||||||||||||| || ||| |||||| |||||| ||||| | ||||||     
T  43230 gaggatagtcagatctctagaggcagcggaagacctagaacaacttttaagagaaactattaataaagatctagagagtaatgagttggatcaaaatata 43131  T
Q  205 gtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttg 272  Q
    || ||||||| |  |||||||| |||||| |||||| || ||  |  |||||||||||||||||||||    
T  43130 gtttatgatagagtattatggtgtaattttatccatgtatccagcctcacttagtgggataagacttg 43063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 126 - 280
Target Start/End: Original strand, 30031380 - 30031535
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||| ||||| |||||||  |||||| | |||||||| ||||  |||||||||||| | ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  30031380 gaggtagagggagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatttaaatatggtttatgatagaacactatg 30031479  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgt 280  Q
    |  ||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  30031480 gcgtaatttgatccatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttggttgttgt 30031535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 154 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 10099023 - 10098896
Alignment:
Q  154 agagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactcca 253  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||| | ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||| ||  ||   ||||||||||| ||| |||| |||    
T  10099023 agagaaaccattaaaaaagatttagaggtcaatgagttggatttaaatatggtgtatgatagaacactaacgtc--atttgatccatgtaatcgacccca 10098926  T
Q  254 cttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10098925 cttagtgggataagacttgattgttgttgt 10098896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 131 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 6055924 - 6055832
Alignment:
Q  131 agaggaagacctataaaaactt-aagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacatta 222  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| || || |||||||| || ||| ||| |||||||    
T  6055924 agaggaagacctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacatta 6055832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 108 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 12134077 - 12133902
Alignment:
Q  108 aggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggt 206  Q
    |||||||| |||||||  |||||| ||||||||||| ||||||| ||| | ||| ||||| ||| | |||||| |||||||| ||||| | |||| || |    
T  12134077 aggatagtcagatcactagaggcataggaagacctacaaaaactataatataaaatattaggaaag-tttagaaattaatgagttggatcgaaatgtgat 12133979  T
Q  207 ctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
      || ||| |||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||| || ||| |||| ||||||||||    
T  12133978 tcataatagaacattatggcataatctgatccatgtagccgaccccacttagtgagaaaaggcttggttgttgttgt 12133902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 172 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 3206570 - 3206459
Alignment:
Q  172 gatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagactt 271  Q
    ||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||| | | ||| |||| |||||  | ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  3206570 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttaatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagactt 3206471  T
Q  272 gattgttgttgt 283  Q
    | || |||||||    
T  3206470 ggttattgttgt 3206459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 152 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 655525 - 655411
Alignment:
Q  152 taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactc 251  Q
    ||||||||||||||| |||   ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||| ||||  |||||||||||| ||   |||      
T  655525 taagagaaactattaggaaaactttcgagattaatgaattggaccgaaatatggtttatgacagaacattgtggtgcaatttgatccatgtaggtgacct 655426  T
Q  252 cacttagtgggataa 266  Q
    |||||||||||||||    
T  655425 cacttagtgggataa 655411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 283
Target Start/End: Original strand, 32756045 - 32756203
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||| |||| ||||||||  |||||| | |||||||| ||||  || ||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||| ||||||| |||| ||||    
T  32756045 gaggtagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatg 32756144  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |  | ||||||||||| || ||||  |||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  32756145 gcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtggggtaagacttggatgttgttgt 32756203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 283
Target Start/End: Original strand, 31818996 - 31819113
Alignment:
Q  166 aagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggata 265  Q
    ||||||| ||||||| | ||||| ||||| |||||| |||| ||||||| |||| |||||  | ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  31818996 aagaagggtttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggata 31819095  T
Q  266 agacttgattgttgttgt 283  Q
    |  |||| |||| |||||    
T  31819096 atgcttggttgtggttgt 31819113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 159 - 283
Target Start/End: Original strand, 5897615 - 5897739
Alignment:
Q  159 aactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttag 258  Q
    ||||||||  || |||||||| |||||||  ||||| | ||||||||| |||| || || ||||||   ||||||||||||| || | ||  ||||||||    
T  5897615 aactattagaaaagatttagatattaatgtgttggatcaaaatatggtatatggtagaatattatgacgtaatttgatccatgtagcggatcccacttag 5897714  T
Q  259 tgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||||| |||||||||||||||    
T  5897715 tgggataaggcttgattgttgttgt 5897739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 156 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 14389288 - 14389204
Alignment:
Q  156 agaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccat 240  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| | || || ||||||||||| ||||||| ||||||| ||  |||||||||||||    
T  14389288 agaaactcttaagaaagatttagagattaataagttagatccaaatatggtttatgatataacattagggcgtaatttgatccat 14389204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 282
Target Start/End: Original strand, 608315 - 608442
Alignment:
Q  155 gagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccac 254  Q
    ||||||| ||||  || ||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||| | ||||| || | ||||   | ||||||||||| || ||||| | ||    
T  608315 gagaaaccattagaaaagatttagagttcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaatactatgacgtcatttgatccatgtagccgaccctac 608414  T
Q  255 ttagtgggataagacttgattgttgttg 282  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  608415 ttagtgggataagacttggttgttgttg 608442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 1747799 - 1747730
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattgga 194  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  1747799 gaggcagaggaagacctagaaaaaccataagagaaactggtaagaaggatctagagattaatgagttgga 1747730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 283
Target Start/End: Original strand, 30679549 - 30679678
Alignment:
Q  154 agagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactcca 253  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||  | ||| | ||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||    | |||||||| || || ||||  |||    
T  30679549 agagaaaccattaaaaaggatttagaagtcaataagttggatccaaattcggtctatgatagaacattataacgtcatttgatctatgtagccgatccca 30679648  T
Q  254 cttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  30679649 cttaatgggataagacttggttgttgttgt 30679678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 210 - 283
Target Start/End: Original strand, 33730175 - 33730247
Alignment:
Q  210 tgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |||||||| |||||| |||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  33730175 tgataaaaaattatg-tataatttcatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 33730247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 33997702 - 33997545
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||     ||||||||||||| |||||   |||||||||  |||||  |||||||||    
T  33997702 gaggcagaggaagaccttggaaaactataagagaaactattaagaaaagcctagagattaatgagttggatagaaatatggtacatgattgaacattatg 33997603  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttg 282  Q
    |  | |||||||| ||   ||| ||  |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  33997602 gcgtcatttgatctatgcgaccaaccacacttagtgggataatgcttgattgttgttg 33997545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 131 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 1681674 - 1681611
Alignment:
Q  131 agaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattgg 193  Q
    ||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  1681674 agaggaagacctaaaaaagttataagagaaactattaagaaggatctagagattaatgagttgg 1681611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 196 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 5258235 - 5258148
Alignment:
Q  196 ccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||||||| | |||| ||||| |||||  | ||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  5258235 ccaaatatggtttttgattaaacactatggcgtcatttgatccacgtagccgaccccacttagtgggataagtcttggttgttgttgt 5258148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 40 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 32913506 - 32913356
Alignment:
Q  40 gcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaaga 139  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||| |  |  |||||||||| ||  |||||||| |||| | |||||  |||| |||| |||     
T  32913506 gcttaggtggtttggccatgtagagaaaagagttgtagattatgtagcaaggagagtatattagatggagggtagtcaaatcactagaggtagagaaagg 32913407  T
Q  140 cctataaaaactt--aagagaaactattaagaaggatttagagattaatga 188  Q
     ||| |||||||   || ||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  32913406 tctagaaaaactataaaaagaaactattaagaaagctttagagattaatga 32913356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 230 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 1615276 - 1615219
Alignment:
Q  230 atttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgtataa 287  Q
    ||||||||||| || |||||  || |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1615276 atttgatccatgtagccgacctcatttagtgggataagacttggttgttgttgtataa 1615219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 174 - 283
Target Start/End: Original strand, 9568872 - 9568980
Alignment:
Q  174 tttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttga 273  Q
    ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||| | | ||||||  ||||||||||||| || || || ||||||| |||||||   ||||     
T  9568872 tttagagattattgagttggatccaaatatggtttatgatagaccgttatggcgtaatttgatccatatagccaac-ccacttaatgggatagagcttgt 9568970  T
Q  274 ttgttgttgt 283  Q
    ||||||||||    
T  9568971 ttgttgttgt 9568980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 10617392 - 10617323
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattgga 194  Q
    |||| ||| ||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  10617392 gaggtagaagaaaacctagaaaaactataagagaaaccattaagaaggatctagagattaatgagttgga 10617323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 25494106 - 25493909
Alignment:
Q  28 tgtggaaaataagcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatga 127  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||| || || ||||||||||| | |||   ||||||||   || ||||||||| | || ||| ||    
T  25494106 tgtggaaaataagtttaggtggtttggacatgtatagagaaaacatgtagattctatagtaaaacgagtagatcaaatagaggatagtcatattacaaga 25494007  T
Q  128 ggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    || | | ||||||||| || |||| ||||||||||||| | |||   |||| |||||||||| ||| |   ||||||||| || ||||||||| ||||    
T  25494006 ggtacaagaagacctagaagaactataagagaaactatcaggaaaagtttatagattaatgagttgaatttaaatatggtttacgataaaacaatatg 25493909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 103 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 28027008 - 28026895
Alignment:
Q  103 gatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaat 201  Q
    ||||||||| ||| |||| | | |||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||| ||| |||||| || ||||||| ||| |  |||||    
T  28027008 gatggaggagagtcagattagaagaggtagaggaagacctaaaaaaactataagaaaaaccattatgaaagatttacaggttaatgatttgtattcaaat 28026909  T
Q  202 atggtctatgataa 215  Q
    ||||| ||||||||    
T  28026908 atggtttatgataa 28026895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 190
Target Start/End: Original strand, 7080469 - 7080529
Alignment:
Q  131 agaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaat 190  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||    
T  7080469 agaggaaaacctataaaaactataagagaaactatcaagaaagatctaaagattaatgaat 7080529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 18130881 - 18130813
Alignment:
Q  216 aacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgta 284  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||| || ||||||||| |||  |||||||||||    
T  18130881 aacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacctaatgggataaggcttagttgttgttgta 18130813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 363 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 1206189 - 1206154
Alignment:
Q  363 agttaggtccaacccaaattctaatatggtatcaga 398  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1206189 agttaggtccaacccaaattctaagatggtatcaga 1206154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 42 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 7150563 - 7150508
Alignment:
Q  42 ttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagta 97  Q
    |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| || | |||||||||||    
T  7150563 ttaggtggtttgggcatggggagagaagacttgtagattatatagtaaggagagta 7150508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 92 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 31832051 - 31831936
Alignment:
Q  92 agagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaat 190  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||||||   ||   |||||||  |||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |    
T  31832051 agagtagatcagatggaggatagtcagatcatcagaaatagaggaaagcctagaaaaactatcagagaaactattaagaaagatctagagattactgagt 31831952  T
Q  191 tggacccaaatatggt 206  Q
    |||| ||||| |||||    
T  31831951 tggatccaaacatggt 31831936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 152 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 34560502 - 34560387
Alignment:
Q  152 taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactc 251  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||  ||| | | ||||||| | ||||||| || |||||  |||||||||||| || |||||| |||    
T  34560502 taagagaaactattatgaatgattcagagattagtgtgttgaatctaaatatgatttatgatagaagattattatataatttgatcaatttaaccggctc 34560403  T
Q  252 cacttagtgggataag 267  Q
     || || |||||||||    
T  34560402 tacataatgggataag 34560387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 178 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 12222245 - 12222187
Alignment:
Q  178 gagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgat 236  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| | ||||||||  |||||||||    
T  12222245 gagattaatgaattggaccaaaatttggtttatgatagaccattatggcttaatttgat 12222187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 198 - 283
Target Start/End: Original strand, 34939296 - 34939382
Alignment:
Q  198 aaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccga-ctccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||||| |||||||  | |||||||| ||||||||||||| || |||| | ||||||||||| |||| || |||||||| ||||    
T  34939296 aaatatggtttatgatatgatattatggtgtaatttgatccatatagccgacccccacttagtggcataaaacatgattgttcttgt 34939382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 82
Target Start/End: Original strand, 306337 - 306394
Alignment:
Q  25 agatgtggaaaataagcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattct 82  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | | |||| |||||||||||    
T  306337 agatgtggaaaataagcttaggtggtttctgcatgtagatagaagaattgtagattct 306394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 198 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 4245957 - 4245872
Alignment:
Q  198 aaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||||| | ||||| |||||||||  ||  |||||||||  || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  4245957 aaatatggtatttgatagaacattatgacatcgtttgatccaagtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgtttttgt 4245872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 236
Target Start/End: Original strand, 26291811 - 26292012
Alignment:
Q  32 gaaaataagcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggca 131  Q
    |||||||  |||||||||||||  |||||  ||| ||||||| |||||  | || ||||  ||||||||  ||||||||| |||  ||||| | || | |    
T  26291811 gaaaatagacttaggtggtttg--catgtagagagaagacttatagatgttgcagtaagatgagtagatcagatggaggagagtgtgatcaaaagacgta 26291908  T
Q  132 gaggaagacctataaaaacttaagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataat 231  Q
    |||||||||  | ||||||| | |||||| ||||| ||| |||||||||||| |||| ||| |   ||||||||| ||||||| ||||||||   |||||    
T  26291909 gaggaagactaaaaaaaact-atgagaaattattatgaaagatttagagattcatgagttgaataaaaatatggtttatgatataacattataacataat 26292007  T
Q  232 ttgat 236  Q
    |||||    
T  26292008 ttgat 26292012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 139 - 194
Target Start/End: Original strand, 38900 - 38956
Alignment:
Q  139 acctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattgga 194  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  38900 acctagaaaaactataagagaaactattaggaaggatctagagataaatgagttgga 38956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 154 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 1748074 - 1748006
Alignment:
Q  154 agagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacatta 222  Q
    |||||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||   |||||| || ||||||| |||||||    
T  1748074 agagaaactactaagaaaaatttagagattaatgagttggatagaaatatagtatatgatagaacatta 1748006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 176 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 3210615 - 3210551
Alignment:
Q  176 tagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccat 240  Q
    ||||||||||||| |||||   |||||||   ||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  3210615 tagagattaatgagttggatggaaatatgagttatgatagaacattatggtgtaatttgatccat 3210551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 87 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 4948501 - 4948405
Alignment:
Q  87 taaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagat 182  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||| | | |||  |||| ||||||||||||| |||||||  |||| |||||||| |||| ||| |||||||    
T  4948501 taaggagagtagatcagatggaagatagtcaaaccactagaggtagaggaagacctacaaaaactaaaagaaaaactattgagaaagatctagagat 4948405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 87 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 4955472 - 4955376
Alignment:
Q  87 taaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagat 182  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||| | | |||  |||| ||||||||||||| |||||||  |||| |||||||| |||| ||| |||||||    
T  4955472 taaggagagtagatcagatggaagatagtcaaaccactagaggtagaggaagacctacaaaaactaaaagaaaaactattgagaaagatctagagat 4955376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 208 - 280
Target Start/End: Original strand, 21089604 - 21089676
Alignment:
Q  208 tatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgt 280  Q
    ||||||| |||||||||| ||  |||||||||| || | | | ||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  21089604 tatgatagaacattatggcattgtttgatccatgtagctgcccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 21089676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 216 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 23888545 - 23888477
Alignment:
Q  216 aacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgta 284  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || | ||| |||| || ||||||||| |||  |||||||||||    
T  23888545 aacattatggtgtaatttgatccatgtagcagaccccacctaatgggataaggcttagttgttgttgta 23888477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 198 - 266
Target Start/End: Original strand, 32097934 - 32098002
Alignment:
Q  198 aaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataa 266  Q
    ||||||| | ||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||| || |||| |||||||||||||||||    
T  32097934 aaatatgatttatgatataacattatggcgtaaattgatacatgtagccgattccacttagtgggataa 32098002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 152)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 40 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 13805509 - 13805265
Alignment:
Q  40 gcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaaga 139  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||| ||||| | |||||| |  |  ||||||| |||||   ||||||||| || |||||||  |||||||||||| |    
T  13805509 gcttaggtggtttgggtatgtagagagaagacctttagattttgtagcaaggagactagatcacatggaggattgtcagatcactagaggcagaggaaaa 13805410  T
Q  140 cctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatcc 238  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||| | ||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  13805409 cctagaaaaactataagagaaactatgaagaaagattttgagagtaataagttggacggaaatatggtttatgatagaacattatgggataatttgatcc 13805310  T
Q  239 atctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    || || || || ||||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  13805309 atgtagccaaccccacttagtgggatatggcttggttgttgttgt 13805265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 87 - 283
Target Start/End: Original strand, 28351644 - 28351841
Alignment:
Q  87 taaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaa 185  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||| |||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||     
T  28351644 taaggagagtagatcagatggaggatagtcagattacaagaggtagagaaagacctagaaaaactataagagaaactattacgaaagatttagagattat 28351743  T
Q  186 tgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||| ||||| |||||||| || |||  || ||| |||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||| ||||  |||||||||    
T  28351744 tgagttggatccaaatatagtttatagtagaaccttatggaattatttgatccatgtagccgaccccacttagtggggtaaggcttggctgttgttgt 28351841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 117 - 283
Target Start/End: Original strand, 53540405 - 53540572
Alignment:
Q  117 agatcacatgaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataa 215  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||| || || ||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||     
T  53540405 agatcactagaggcagaggaagacctagaaaaactataagataaactattaggaaagacttggagattaatgagttggacaaaaatatggtttatgatag 53540504  T
Q  216 aacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  53540505 aacattatggcataatttgatccatatagccaaccccactgagtgggataagacttggttgttattgt 53540572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 103 - 283
Target Start/End: Original strand, 35690372 - 35690553
Alignment:
Q  103 gatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaat 201  Q
    ||||||||| ||| |||||| | |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||| || || ||||      
T  35690372 gatggaggaaagtcagatcaaaagaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattacgaaaaatttagaggttaatgagtttgatccaatc 35690471  T
Q  202 atggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    | ||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  35690472 agggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggtttttgttgt 35690553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 41 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 2557916 - 2557671
Alignment:
Q  41 cttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatgg-aggatagttagatcacatgaggcagaggaaga 139  Q
    |||||||||||| |||||||   || ||||||| |||||||| || |||||||| ||| |  ||||| | |||||| | || |   |||| |||||||||    
T  2557916 cttaggtggtttaggcatgtagggagaagacttttagattctccagtaaggagaataggtcagatgggaagatagtcacatgagtagaggtagaggaaga 2557817  T
Q  140 cctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacatta-tggtataatttgatc 237  Q
     ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||| || ||||| | ||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  2557816 tctagaaaaactgtaagagaaactattaagaaggatctgaagattaacgagttggatcgaaatatggtttatgatagaacattattggtgtaatttgatc 2557717  T
Q  238 catctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||| || || |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  2557716 catgtagccaactccatttagtgggataaggcttggttgttgttgt 2557671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Original strand, 51421760 - 51422012
Alignment:
Q  32 gaaaataagcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggca 131  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |  ||| |||||  ||||||  |  |||| | |||||||||   ||||||| | || |||||| | |||| |    
T  51421760 gaaaataggcttaggtggtttgggcatatacagagaagaccggtagatgttgtaatacgaagagtagatcaaatggaggtttgtcagatcaaaagaggta 51421859  T
Q  132 gaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataa 230  Q
    ||||||||  || ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||   |||    
T  51421860 gaggaagatttagaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagaggttaatgaattggatccaaaaatggtttatgatagaacattatgacgtaa 51421959  T
Q  231 tttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |||||||||| || || |   |||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  51421960 tttgatccatgtagccaatctcacttagtgggataaagcttggttgttgttgt 51422012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 87 - 272
Target Start/End: Original strand, 39708518 - 39708704
Alignment:
Q  87 taaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaa 185  Q
    |||| |||||||||  ||||||||| ||| || ||| | |||| |||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||  |||||||||||| | ||    
T  39708518 taagaagagtagatcagatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaa 39708617  T
Q  186 tgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttg 272  Q
    ||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||   ||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  39708618 tgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatgtcgtaatttgatccatgtagtcgaccccacttagtgggataagacttg 39708704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 162 - 283
Target Start/End: Original strand, 55007907 - 55008028
Alignment:
Q  162 tattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgg 261  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||   ||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  55007907 tattaagaaagatttagagattaatgagttggaccgaaatatggtttatgatagatcattatgacgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 55008006  T
Q  262 gataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |||||| |||| ||||||||||    
T  55008007 gataaggcttggttgttgttgt 55008028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 87 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 26037702 - 26037506
Alignment:
Q  87 taaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaa 185  Q
    |||| |||||||||  ||||||||| ||| || | | | |||||||||||| |||||  |||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||    
T  26037702 taagaagagtagatcagatggaggagagtcaggttaaaagaggcagaggaaaacctaggaaaaccataagagaaactattaggaaagatttagaggtgaa 26037603  T
Q  186 tgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttg 282  Q
    ||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||  ||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  26037602 tgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaattggatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggtttggttgttgttg 26037506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 126 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 31959972 - 31959814
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||| |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  |||||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||| ||||||| |||| ||||    
T  31959972 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatg 31959873  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |  | ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  31959872 gcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 31959814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 126 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 48174251 - 48174093
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||| |||||||||||||  |||||| | |||||||| ||||  |||||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  48174251 gaggtagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgataaaacattatg 48174152  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |  | ||||||||||| || | ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  48174151 gcgtcatttgatccatgtagcagaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 48174093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 29 - 225
Target Start/End: Original strand, 50662414 - 50662612
Alignment:
Q  29 gtggaaaataagcttaggtggttt-gggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatga 127  Q
    ||||||| || ||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||   |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||   |    
T  50662414 gtggaaagtaggcttaggtggttttgggcatgtagagagaagacttgtagattctattgtaaggagagtagatctaatgaaggatagttagatcactaaa 50662513  T
Q  128 ggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatgg 225  Q
     ||||||| || |||| ||||| | ||||||||| |||| | || ||| ||||||||||||| || || | ||||||||| |||||||| |||||||||    
T  50662514 tgcagaggtagtcctagaaaaattataagagaaattatttaaaaagatctagagattaatgagtttgatcgaaatatggtttatgataacacattatgg 50662612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 29 - 225
Target Start/End: Original strand, 50680766 - 50680964
Alignment:
Q  29 gtggaaaataagcttaggtggtttg-ggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatga 127  Q
    |||||||||| |||||||||||||  |||||||  ||| ||| |||||||||||   | ||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||   |    
T  50680766 gtggaaaataggcttaggtggtttatggcatgtagagagaaggcttgtagattccgtagtaaggagagtagatccaatgaaggatagttagatcactata 50680865  T
Q  128 ggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatgg 225  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||| ||||| |  |||||||| |||||||| | |||||||    
T  50680866 ggcagaggtagacctagaaaaactataagagaaattatttagaaagatctagagattaatgagttggatcggaatatggtttatgataacatattatgg 50680964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 159 - 283
Target Start/End: Original strand, 25574982 - 25575106
Alignment:
Q  159 aactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttag 258  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||| || | ||| ||| ||||    
T  25574982 aactattaagaaagatctagagattaatgagttggatcgaaatatggtttatgatagaacattgtggtgtaatttgatccatgtagcagaccccatttag 25575081  T
Q  259 tgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||    
T  25575082 tgggataaggcttggttgttgttgt 25575106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 132 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 45204991 - 45204840
Alignment:
Q  132 gaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataa 230  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||  |||    
T  45204991 gaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagagtttaataagttggatccaaatatggtttatgatagaacatta-ggcgtaa 45204893  T
Q  231 tttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||| || || || || | ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  45204892 tttgatctatgtagcccacccaacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 45204840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 155 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 26024978 - 26024851
Alignment:
Q  155 gagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccac 254  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| | | | ||||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||||| || |||||  |||    
T  26024978 gagaaactattaagaaagatctagagattaatgagttggatcgagacatggtttatgatagaacattatggtgtaattttatccatgtagccgacctcac 26024879  T
Q  255 ttagtgggataagacttgattgttgttg 282  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  26024878 ttagtgggataaggcttggttgttgttg 26024851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 90 - 283
Target Start/End: Original strand, 37488179 - 37488373
Alignment:
Q  90 ggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatga 188  Q
    |||||||||||  |||| | ||| || |||||||   ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| |    
T  37488179 ggagagtagatcagatgcatgattgtcagatcaccataggcagaggtagacctagaaaaactataagagaaactattaagaaagatctagaaattaataa 37488278  T
Q  189 attggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
     || || | |||||||||  |||||| | ||||||||  ||||||||||||| || ||  | ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  37488279 gtttgatcaaaatatggttaatgatagagcattatggcgtaatttgatccatgtagccagccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 37488373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 135 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 23906446 - 23906294
Alignment:
Q  135 gaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataattt 233  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||||| ||||  |||||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||| ||||||| |||| |||||  | ||||    
T  23906446 gaagacctagaaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 23906347  T
Q  234 gatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgtata 286  Q
    ||||||| || | ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  23906346 gatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtata 23906294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 283
Target Start/End: Original strand, 28236353 - 28236464
Alignment:
Q  172 gatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagactt 271  Q
    ||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||| ||||||| || |||||||| |||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  28236353 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaatattatggtgtaatttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataagactt 28236452  T
Q  272 gattgttgttgt 283  Q
    | ||||||||||    
T  28236453 ggttgttgttgt 28236464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 126 - 283
Target Start/End: Original strand, 436353 - 436511
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||| |||||||||||||  |||||| | |||||||| | ||  |||||||||||| | ||||| ||| | |||||| |||| ||||||| |||| ||||    
T  436353 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccactagaaaggatttagaggtcaatgagttgaatccaaatttggtgtatgatagaacactatg 436452  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    | || ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  436453 gcatcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 436511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 157 - 283
Target Start/End: Original strand, 5306452 - 5306578
Alignment:
Q  157 gaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccactt 256  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||  ||||||||||||| || |  || ||||||    
T  5306452 gaaactagtaggaaggatctagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgacataacattatggcgtaatttgatccatatagctaaccccactt 5306551  T
Q  257 agtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
     |||||||||| |||| ||||||||||    
T  5306552 ggtgggataaggcttggttgttgttgt 5306578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 126 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 52569673 - 52569515
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||| |||||||||||||  |||||| | | |||||| ||||  |||||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||| ||||||| |||| ||||    
T  52569673 gaggtagaggaagacctacgaaaactattaaagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatg 52569574  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |  | ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  52569573 gcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 52569515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 126 - 283
Target Start/End: Original strand, 56375414 - 56375572
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||| |||||||||||||  |||||| | |||||||| ||||  |||||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||| ||||||| |||| ||||    
T  56375414 gaggtagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtgaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatg 56375513  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
       | ||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  56375514 acgtcatttgatccatgtagccgacctcacttagtgggataagacttggttgttgttgt 56375572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 87 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 34233221 - 34233044
Alignment:
Q  87 taaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaa 185  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| || |||||||  |||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||| | || ||  ||||||||||    
T  34233221 taaggagagtagatgagatggaggatcgtcagatcactagaggcagaggaaaacctagaaaaactatcagagaaactattcataaagacctagagattaa 34233122  T
Q  186 tgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtggga 263  Q
    ||| || || | ||||| ||| ||||||| |||||| | |  ||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  34233121 tgagttagatcaaaataaggtttatgatagaacattgtagcgtaatttgatccatgtagccgacgccactcagtggga 34233044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 87 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 39100733 - 39100536
Alignment:
Q  87 taaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaa 185  Q
    |||| |||||||||  |||||| |||||| || | | | |||| |||||||||||||  |||||| | |||||||| ||||  |||||||| ||| | ||    
T  39100733 taagaagagtagatcagatggaagatagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttggaggtcaa 39100634  T
Q  186 tgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||| ||||| |||||||| || ||| ||| ||||||||||  |||| | |||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  39100633 tgagttggatccaaatattgtttatcatagaacattatggcgtaatataatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 39100536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 32 - 225
Target Start/End: Original strand, 21107018 - 21107216
Alignment:
Q  32 gaaaataagcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagac---ttgtagattctacaataaggagagtagat-atgatggaggatagttagatcacatga 127  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| |  ||| |||||   ||||||||| |  | |||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  ||    
T  21107018 gaaaataggcttaggtagtttgggcatctagagagaagacgacttgtagattatgtagtaaggagagtggatcaagatggagggtagtcagatcactgga 21107117  T
Q  128 ggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatgg 225  Q
     |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  21107118 tgcagcggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagttttagtgattaattagttggatccaaatatggtttatgatagaactttatgg 21107216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 126 - 284
Target Start/End: Original strand, 49987532 - 49987691
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  |||| |||| ||||||  |||||| | |||||||    
T  49987532 gaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaagaaagacttggagataaatgagatggatccaactatggttcatgatagagcattatg 49987631  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgta 284  Q
    |  |||||| |||| ||||   ||| ||||||||| |||||||  ||| |||||||||||    
T  49987632 gcgtaattttatccttctagttgaccccacttagttggataaggtttggttgttgttgta 49987691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 126 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 1777175 - 1777017
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||| |||||||||||||  |||||| | |||||||| ||||  || ||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||| ||||||| |||| ||||    
T  1777175 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacagtatg 1777076  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |  | ||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  1777075 gcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatgggataaggcttggttgttgttgt 1777017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 126 - 267
Target Start/End: Original strand, 4440977 - 4441119
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||| |||||||||||||  |||||| | |||||||| ||||  |||||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||| ||||||| |||| ||||    
T  4440977 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatg 4441076  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataag 267  Q
    |  | ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  4441077 gcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 4441119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 126 - 283
Target Start/End: Original strand, 8286563 - 8286721
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||| |||||||||||||  |||||| | |||||||| ||||  |||||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||| ||||||| |||| ||||    
T  8286563 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatg 8286662  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
       | ||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  8286663 acgtcatttgatccatgtagccgcccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 8286721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 87 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 21945835 - 21945701
Alignment:
Q  87 taaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaa 185  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||  ||||| |||||||||||| ||||||| | | ||||||||||| ||| ||||| || |||||    
T  21945835 taaggagagtagatcagatggaggatagtcacatcactagaggctgaggaagacctagaaaaactatcatagaaactattaggaaagatttggaaattaa 21945736  T
Q  186 tgaattggacccaaatatggtctatgataaaacat 220  Q
    ||| ||||||  ||||||||| ||||||| |||||    
T  21945735 tgagttggactgaaatatggtttatgatagaacat 21945701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 154 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 30621330 - 30621244
Alignment:
Q  154 agagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccat 240  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||  ||| |||||||||    
T  30621330 agagaaactattaagaaagatttagagattaatgtgttggaccgaaatatggtttatgatagaacattatggcttaacttgatccat 30621244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 158 - 280
Target Start/End: Original strand, 31459151 - 31459273
Alignment:
Q  158 aaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccactta 257  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| | ||||  ||||||||||   || ||||||||| || ||||| |||||||    
T  31459151 aaactattaggaaagatttagagattaatgagttggatcccaatatggtgtgtgattgaacattatggcggaacttgatccatgtacccgaccccactta 31459250  T
Q  258 gtgggataagacttgattgttgt 280  Q
    |||||||||| |||| |||||||    
T  31459251 gtgggataaggcttggttgttgt 31459273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 87 - 267
Target Start/End: Original strand, 47147458 - 47147637
Alignment:
Q  87 taaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaacttaaga-gaaactattaagaaggatttagagattaa 185  Q
    ||||||||||| ||  |||||||  ||||  ||||||  |||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  47147458 taaggagagtaaatcagatggagagtagtcggatcactagaggcagaggaagacctagaaaaactatagaagaaactattaagaaagatctagagattaa 47147557  T
Q  186 tgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataag 267  Q
    ||| |||||   | ||||| | ||||||| |||||||||| ||  |||||||||| |||||  | ||| |||||||||||||    
T  47147558 tgagttgga--tagatatgatatatgatagaacattatggcattgtttgatccatgtaaccatccccaattagtgggataag 47147637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 126 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 47265353 - 47265195
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||| |||||||||||||  |||||| | |||||||| ||||  ||| |||||||| | ||||| ||||| |||||| || ||||||||| |||| |||     
T  47265353 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaagaatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatctatgatagaacactata 47265254  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    || ||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  47265253 gtgtaatttgatccatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttggttattgttgt 47265195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 174 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 34208378 - 34208269
Alignment:
Q  174 tttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttga 273  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||   |||||||||||| ||  |||| || |||| ||||||||| ||||     
T  34208378 tttagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggcgcaatttgatccatgtactcgaccccccttattgggataaggcttgg 34208279  T
Q  274 ttgttgttgt 283  Q
    ||||||||||    
T  34208278 ttgttgttgt 34208269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 152 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 37042795 - 37042667
Alignment:
Q  152 taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactc 251  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||   ||||| ||| | ||||| ||||||||||| |  |||||||||| || ||||| |    
T  37042795 taagagaaactattaagaaagatctagagattattgagttggatagaaatacggtatttgatagaacattatggtgtcgtttgatccatgtagccgaccc 37042696  T
Q  252 cacttagtgggataagacttgattgttgt 280  Q
     ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  37042695 gacttagtgggataaggcttggttgttgt 37042667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 33 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 53518571 - 53518325
Alignment:
Q  33 aaaataagcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcag 132  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||  ||| ||||| ||| ||| ||  | || | |||||||||  |||||||   ||| | |||| | |||| ||    
T  53518571 aaaataggcttaggtggtttgggtatgtagagagaagacctgtggatgctgtagtacgaagagtagatcagatggag---agtcaaatcagaagaggtag 53518475  T
Q  133 aggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataat 231  Q
    |||||| |||| ||||||| | ||| |||||| || ||| ||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||| ||||||| |||| |||||  ||||    
T  53518474 aggaaggcctagaaaaactatgagaaaaactaataggaaagatttagaggttaatgagttggatctaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaat 53518375  T
Q  232 ttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttg 282  Q
    |||||||||   | |||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  53518374 ttgatccat-gcagcgaccccacttagtgggataggactcggttgttgttg 53518325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 161 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 55388333 - 55388213
Alignment:
Q  161 ctattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtg 260  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| || || | ||||||| | ||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |   |||| ||||||||||    
T  55388333 ctattaagaaagatttggagattaatgagttagatcgaaatatgatttatgatagaacattgtggtgtaatttgatccatgttgtcgaccccacttagtg 55388234  T
Q  261 ggataagacttgattgttgtt 281  Q
    ||||||| |||| ||||||||    
T  55388233 ggataaggcttggttgttgtt 55388213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 126 - 283
Target Start/End: Original strand, 21236982 - 21237140
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||| |||||||||||||  |||||| | |||||||| ||||  |||||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||| ||||||| |||| ||||    
T  21236982 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtatatgatagaacactatg 21237081  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |  | ||||||| ||| || || || |||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  21237082 gcgtcatttgatacatgtagccaaccccacttagtgggataaggattggttgttgttgt 21237140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 126 - 283
Target Start/End: Original strand, 53707918 - 53708076
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||| ||||||||||| |  |||||| | |||||||| ||||  |||||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||| ||||||| |||| ||||    
T  53707918 gaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatg 53708017  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
       | ||||||||||| ||  ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  53708018 acgtcatttgatccatttagtcgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 53708076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 131 - 283
Target Start/End: Original strand, 6957727 - 6957880
Alignment:
Q  131 agaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtata 229  Q
    |||||||||||||  |||||| | |||||||| ||||  |||||||||||| | ||||| ||||| |||||| || | ||||||| |||| ||||   |     
T  6957727 agaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagaacactatgacgtc 6957826  T
Q  230 atttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  6957827 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 6957880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 131 - 283
Target Start/End: Original strand, 12494792 - 12494945
Alignment:
Q  131 agaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtata 229  Q
    |||||||||||||  |||||| | |||||||| ||||  |||||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||| ||||||| |||| ||||   |     
T  12494792 agaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgtc 12494891  T
Q  230 atttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |||| |||||| || | ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  12494892 atttaatccatgtagcggaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 12494945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 238
Target Start/End: Original strand, 31043224 - 31043309
Alignment:
Q  153 aagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatcc 238  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||| |||| ||| | ||||||||||||    
T  31043224 aagagaaactattaggaaagatttagagattaatgagttggatccaaatatggtttgtgatagaacactattgcataatttgatcc 31043309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 155 - 283
Target Start/End: Original strand, 21528442 - 21528570
Alignment:
Q  155 gagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccac 254  Q
    ||||||| ||||  || ||||||||| | ||||| |||||  |||||||||| | ||||| |||| ||||||   ||||||||||| || ||||| ||||    
T  21528442 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggattcaaatatggtttttgatagaacactatggtggcatttgatccatgtagccgaccccac 21528541  T
Q  255 ttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  21528542 ttagtgggataaggcttggttgttgttgt 21528570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 152 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 28550586 - 28550454
Alignment:
Q  152 taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactc 251  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| || || ||||||||||| | ||||| ||   |||| |||||||||||| || || | ||| |    
T  28550586 taagagaaactattaggaaagatttagaggttaatgagtttgatccaaatatggtttttgatagaaagctatgttataatttgatcaatgtagctgaccc 28550487  T
Q  252 cacttagtgggataagacttgattgttgttgta 284  Q
    |||||| |||||||||  ||| |||||||||||    
T  28550486 cacttattgggataaggtttggttgttgttgta 28550454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 29 - 153
Target Start/End: Original strand, 29398845 - 29398969
Alignment:
Q  29 gtggaaaataagcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgag 128  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||| ||||| | ||||||||  | | |||||||||||   ||| ||||||||| | |||||  |||    
T  29398845 gtggaaaatatgcttatgtggtttgggcatgtagagagaagacctatagattctgtagtgaggagagtagaccggatagaggatagtcaaatcactagag 29398944  T
Q  129 gcagaggaagacctataaaaactta 153  Q
    ||||||||||||||| |||||||||    
T  29398945 gcagaggaagacctagaaaaactta 29398969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 40 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 40933159 - 40932924
Alignment:
Q  40 gcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaaga 139  Q
    ||||||||||||||| ||| |  ||||||||| | |||||||| || ||| ||||||||||  |||||||  |||| | |||||  ||||||||||||||    
T  40933159 gcttaggtggtttggacatttagagaaaagacctatagattctgcagtaaagagagtagatcagatggag--tagtcaaatcaccagaggcagaggaaga 40933062  T
Q  140 cctataaaaacttaagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatcca 239  Q
    |||| ||||    |||| ||||||||   |||| | ||||||||||||| |||||     ||||| | ||||||| ||||||||||     |||||| ||    
T  40933061 cctagaaaa---caagaaaaactatt---aagggtctagagattaatgagttggatagggatatgatatatgatagaacattatggcggcgtttgatgca 40932968  T
Q  240 tctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    | || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  40932967 tgtagccgaccccacttggtgggataaggcttgattgttgttgt 40932924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 126 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 48622701 - 48622542
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||| |||||||||||||  |||||| | |||||||  ||||  || ||||||||| | ||||| || || |||||| |||| ||||||| |||| ||||    
T  48622701 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaatcattagaaaagatttagaggtcaatgagtttgatccaaatttggtgtatgatagaacactatg 48622602  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgta 284  Q
    |  | |||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  48622601 gcgtcatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgta 48622542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 198 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 25427947 - 25427862
Alignment:
Q  198 aaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |||| |||||||||||  |||| || ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  25427947 aaatttggtctatgattgaacactacggtgtaatttgatccatgtaaccgaccccacttaatgagataagacttggttgttgttgt 25427862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 222
Target Start/End: Original strand, 47611755 - 47611948
Alignment:
Q  30 tggaaaataagcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgagg 129  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||| |  ||||| |  ||||||||||||| ||  ||||||||| ||| ||| |    ||||    
T  47611755 tggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacctagagattttgtaataaggagagtaaatcagatggaggagagtcagacccttagagg 47611854  T
Q  130 cagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacatta 222  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||  |||||||||| ||| || |  |||| |||||| ||||||| ||||||| | || |||| |||||||    
T  47611855 cagaggaagacctagaaaaattataattgaaactattaggaaagactaggagactaatgagttggaccaaaatatgctttacgatagaacatta 47611948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 131 - 278
Target Start/End: Original strand, 7947066 - 7947214
Alignment:
Q  131 agaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtata 229  Q
    |||||||||||||  |||||| | |||||||| |||   |||||||||||| | ||| | ||||| |||||| || | ||||||| |||| |||  | ||    
T  7947066 agaggaagacctaagaaaactattagagaaaccatttgaaaggatttagaggtcaatcagttggatccaaatttgatttatgatagaacactatcatgta 7947165  T
Q  230 atttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgtt 278  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  7947166 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgtt 7947214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 87 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 25967458 - 25967350
Alignment:
Q  87 taaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaa 185  Q
    ||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||  ||| ||||||||||| |  || |||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  25967458 taaggagagtagatcagatgaaggatagttaaatcactagagacagaggaagactttgaataactataagagaaactattaaaaaagatctagagattaa 25967359  T
Q  186 tgaattgga 194  Q
     ||||||||    
T  25967358 cgaattgga 25967350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 126 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 31403192 - 31403032
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    ||||| |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||| | |||||   |||| |||| ||||||| | |||||||    
T  31403192 gaggcggaggaagatctagagaaactataagaaaaactattatgaaagatctagagattaattagttggatagaaatgtggtatatgatagagcattatg 31403093  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgtat 285  Q
    || |   ||||||||| ||  |||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  31403092 gtgttgcttgatccatgtagacgaccccacttagtaggataaaacttggttgttgttgtat 31403032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 193
Target Start/End: Original strand, 26356704 - 26356811
Alignment:
Q  87 taaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaa 185  Q
    ||||||||||||||  ||||||||  ||| | |||||  |||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  26356704 taaggagagtagatcggatggaggggagtcaaatcactagaggtaggggaagacctagaaaaactataagagaaactgttatgaaggatctagagattaa 26356803  T
Q  186 tgaattgg 193  Q
    ||| ||||    
T  26356804 tgagttgg 26356811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 87 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 7682107 - 7681953
Alignment:
Q  87 taaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaa 185  Q
    |||||| |||||||  |||||||| |||| | |||||  |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||  || || |||||||    
T  7682107 taaggaaagtagattagatggagggtagtcacatcactagaggcagaggaagacctggaaaaactataagagaaactatcaagaaaaatctatagattaa 7682008  T
Q  186 tgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccat 240  Q
    ||| || ||   ||||||||| |||||||  ||||||| | ||  ||||||||||    
T  7682007 tgagttagatagaaatatggtatatgataggacattattgcatcgtttgatccat 7681953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 137 - 194
Target Start/End: Original strand, 10209171 - 10209229
Alignment:
Q  137 agacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattgga 194  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  10209171 agacctagaaaaactataagagaaactattaagaaggatctagagattaatgagttgga 10209229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 173 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 19154973 - 19154863
Alignment:
Q  173 atttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttg 272  Q
    |||||||| | ||||| ||||| |||||| |||| ||||||| |||| |||||  | |||||||||||  | | ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  19154973 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgttatttgatccatgcagctgaccccacttagtgggataaggcttg 19154874  T
Q  273 attgttgttgt 283  Q
     ||||||||||    
T  19154873 gttgttgttgt 19154863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 172 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 27450290 - 27450177
Alignment:
Q  172 gatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagactt 271  Q
    ||||||||| | ||||| ||||| ||||||||| | | ||||| |||| |||||  | ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  27450290 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgattt-tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctt 27450192  T
Q  272 gattgttgttgtata 286  Q
    | ||| |||||||||    
T  27450191 ggttgctgttgtata 27450177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 33191006 - 33190848
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||| |||||||||||||  |||||| | |||||||| ||||  |||||||||||| | ||||| ||| | |||||| |||| ||||||| |||| ||||    
T  33191006 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttgaatccaaatttggtgtatgatagaacactatg 33190907  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
       | |||||| |||| || ||||| |||| |||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  33190906 acgtcatttgacccatgtagccgaccccacctagtgggataaggcttggttgtttttgt 33190848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 46582983 - 46582826
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| | |||||||| |||   ||||||||| || | ||||| ||||| |||||| |||| ||||||| |||  ||||    
T  46582983 gaggtagaggaagacctatgaaaactattagagaaaccattggaaaggatttaaaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaaccctatg 46582884  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |  | ||||||||||| || || || ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  46582883 gcgtcatttgatccatgtagcctac-ccacttagtaggataaggcttggttgttgttgt 46582826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 125 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 55809149 - 55809067
Alignment:
Q  125 tgaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggt 206  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||    
T  55809149 tgaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaactgttaggaaagatttagaggttaatgagttggatccagatatggt 55809067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 198 - 283
Target Start/End: Original strand, 50854 - 50939
Alignment:
Q  198 aaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| | |||| ||||| ||| || | |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  50854 aaatatggtttatgatagaacattatagcataacttgattcatgtagctgactccacttagtgcgataaaacttgattgttcttgt 50939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 8599090 - 8598953
Alignment:
Q  135 gaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataattt 233  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| || |  ||||||| || ||   ||||| ||| | ||||| ||||||||||  |  |||    
T  8599090 gaagacctagaaaaactataagagaaactattaagaaagatctaaatgttaatgagttagaaagaaataaggtatttgatagaacattatggcgtcgttt 8598991  T
Q  234 gatccatctaaccgactccacttagtgggataagactt 271  Q
    ||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  8598990 gattcatgtagccgacgccacttagtgggataagactt 8598953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 113
Target Start/End: Original strand, 28497527 - 28497600
Alignment:
Q  40 gcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggata 113  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |  | ||||||||||||||  |||||||||||    
T  28497527 gcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacttgtagattatgtagtaaggagagtagatcagatggaggata 28497600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 20591463 - 20591304
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||| |||||||||||||  |||||| |||||||  | ||||  |||||||||||| | ||||| |||||  |||||||||| ||||||| ||||  |||    
T  20591463 gaggtagaggaagacctaagaaaactataagagaccccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggattcaaatatggt-tatgatagaacacaatg 20591365  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgtat 285  Q
       ||||||||| ||| ||  |||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20591364 acgtaatttgattcatatattcgaccctttttagtgggataagacttgattgttgttgtat 20591304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 280
Target Start/End: Original strand, 31339699 - 31339803
Alignment:
Q  176 tagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgatt 275  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||||  |||||| |||||||||   |  |||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||    
T  31339699 tagagattaatgagttggatcgaaatatggtacatgatagaacattatgacgtcgtttggtccatgtatccgaccccacttagtgggataaggcttgctt 31339798  T
Q  276 gttgt 280  Q
    |||||    
T  31339799 gttgt 31339803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 283
Target Start/End: Original strand, 32479192 - 32479320
Alignment:
Q  155 gagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccac 254  Q
    ||||||| ||||  || ||||||||| | ||||| ||||| | ||||||||| | ||||| |||| |||||  | ||||||||||| || ||||| ||||    
T  32479192 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatcaaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccac 32479291  T
Q  255 ttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||| | ||| |||| ||||||||||    
T  32479292 ttagtggaaaaaggcttggttgttgttgt 32479320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 220 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 46715330 - 46715266
Alignment:
Q  220 ttatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttga-ttgttgttgt 283  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  46715330 ttatggcataattcgatccatgtaactgaccccacttagtgggataagacttgatttgttgttgt 46715266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 283
Target Start/End: Original strand, 51438623 - 51438727
Alignment:
Q  179 agattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgtt 278  Q
    |||||||||| |||||   ||||||||| ||| ||| ||||||||||  ||||||||||||| || | ||| | |||| |||||||||| |||| |||||    
T  51438623 agattaatgagttggaatgaaatatggtttataatataacattatggcgtaatttgatccatgtagctgacccaactttgtgggataaggcttggttgtt 51438722  T
Q  279 gttgt 283  Q
    |||||    
T  51438723 gttgt 51438727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 152 - 283
Target Start/End: Original strand, 2589223 - 2589354
Alignment:
Q  152 taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactc 251  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||   ||||||||| | ||||| |||| |||||  |  |||||| ||| || |  || |    
T  2589223 taagagaaactatcaagatggatctagagattaatgagttggatgaaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcgtttgattcatgtagctaaccc 2589322  T
Q  252 cacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    || ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  2589323 cagttagtgggataaggcttggttgttgttgt 2589354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 184 - 283
Target Start/End: Original strand, 19969364 - 19969463
Alignment:
Q  184 aatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||| ||||| |||||| |||| ||||||| |||  |||||  | ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  19969364 aatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacgctatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgttgttgt 19969463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 184 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 20601751 - 20601652
Alignment:
Q  184 aatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||| |||||  |||||||| | ||||||| |||||||||   ||||||||| ||| |||| ||  |||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  20601751 aatgagttggattcaaatatgatttatgatagaacattatgacgtaatttgattcatgtaactgaacccacttagtgggataagagttaattgttgttgt 20601652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 172 - 283
Target Start/End: Original strand, 26510559 - 26510669
Alignment:
Q  172 gatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagactt 271  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |  |||| ||||||||||| ||| | |||| || ||  |||| | ||| | |||||||||||||    
T  26510559 gatttagagattaatgagttggatccaaatatggtttgcgatagaacattatggtgtaagtagatcaatgtagtcgac-ctactgaatgggataagactt 26510657  T
Q  272 gattgttgttgt 283  Q
     |||||||||||    
T  26510658 cattgttgttgt 26510669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 159 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 27049301 - 27049226
Alignment:
Q  159 aactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttg 234  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||  ||||||||||  |||||||    
T  27049301 aactattaagaaagatttatagattaatgagttggttccaaatatggtttatgatcgaacattatggcgtaatttg 27049226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 228 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 30634161 - 30634106
Alignment:
Q  228 taatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  30634161 taatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 30634106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 45 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 31961505 - 31961266
Alignment:
Q  45 ggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctat 144  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||  | | |||||||| |||  |||||||   ||| | |||||  |||| || || |||||||     
T  31961505 ggtggtttgggcatgtagagagaagacttgtggattctgtagttaggagagtggattagatggagaggagtcaaatcactagaggtaggggtagacctag 31961406  T
Q  145 aaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatcta 243  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||| |||||   | | |||||   ||||| |||| ||||   |  |||||| ||| ||    
T  31961405 aaaaactataagagaaactattaggaaagatctagagataaatgagttggagaaagacatggttgttgatagaacactatgacgtcgtttgattcatgta 31961306  T
Q  244 accgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
     |||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  31961305 gccgacctcacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 31961266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 38841690 - 38841607
Alignment:
Q  197 caaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgt 280  Q
    |||||||| ||||| ||| |||| |||| | | |||||||| || ||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||    
T  38841690 caaatatgttctataatagaacactatgatgtgatttgatctatgtaaccgacttcatttagtgggataaaacttgattgttgt 38841607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 126 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 44719522 - 44719361
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagatta---atgaattggacccaaatatggtctatgataaaacatt 221  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||| ||| || | ||||   |||| || ||   ||||| ||| ||| ||| | ||||    
T  44719522 gaggctgaggaagacctagaaaaaatataaaagaaactattaagaaagatctaaatattattaatgagttagatagaaatacggtatataatagagcatt 44719423  T
Q  222 atggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||| |  |||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44719422 atggtgtcgtttgatccatgtagccgaccctacttagtgggataagacttggttgttgttgt 44719361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 208 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 45209280 - 45209205
Alignment:
Q  208 tatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||| || |||||||  || |||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  45209280 tatgatagaatattatggcgtagtttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 45209205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 282
Target Start/End: Original strand, 3979127 - 3979201
Alignment:
Q  208 tatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttg 282  Q
    ||||||| |||||||||   ||||||||||||| || || ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  3979127 tatgatagaacattatgacgtaatttgatccatgtagcctactccacatagtgggataaggcttggttgttgttg 3979201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 19062017 - 19061935
Alignment:
Q  201 tatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |||||| ||||||| |||| |||||  | ||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  19062017 tatggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacctagtgggataaggcttggttgttgttgt 19061935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 29209279 - 29209173
Alignment:
Q  179 agattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgtt 278  Q
    |||||||||| |||||   ||||||||| ||||||| | ||||||||  |  ||||||| || || ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  29209279 agattaatgagttggatagaaatatggtatatgatagagcattatggcgttgtttgatcaatgtagccgaccccacttaatgggataagacttggttgtt 29209180  T
Q  279 gttgtat 285  Q
     ||||||    
T  29209179 tttgtat 29209173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 283
Target Start/End: Original strand, 29398984 - 29399086
Alignment:
Q  181 attaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgt 280  Q
    ||||| || ||||| | ||||| ||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||| || | ||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  29398984 attaacgagttggaacgaaataaggtttatgatagaacattatggcgtaatttgattcatgtagctgaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgt 29399083  T
Q  281 tgt 283  Q
    |||    
T  29399084 tgt 29399086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 31897623 - 31897517
Alignment:
Q  89 aggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatg 187  Q
    |||||||| |||  ||||||||  ||| |||||||  |||| || || ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  31897623 aggagagtcgattagatggaggggagtcagatcactagaggtaggggtagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaggatctagagataaatg 31897524  T
Q  188 aattgga 194  Q
    | |||||    
T  31897523 agttgga 31897517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 36255596 - 36255526
Alignment:
Q  209 atgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttg 279  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||    
T  36255596 atgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtggccgaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttg 36255526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 36799761 - 36799655
Alignment:
Q  179 agattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgtt 278  Q
    |||||| ||| ||| ||| | ||||||| ||||||  |||| ||| | |||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||  ||| ||||||    
T  36799761 agattagtgagttgaaccaatatatggtttatgattgaacaatatcgcataatttgatccatgtagacgaccccacttagtgggataaagcttaattgtt 36799662  T
Q  279 gttgtat 285  Q
    |||||||    
T  36799661 gttgtat 36799655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 283
Target Start/End: Original strand, 37798019 - 37798133
Alignment:
Q  169 aaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataaga 268  Q
    |||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||||| |||| ||||   | |||||||| || || ||||||||| |||||||||||||     
T  37798019 aaggatttagaagtcaatgagttgaatccaaatatggtttatgatagaacaatatgacgtcatttgatcaatgtagccgactccatttagtgggataagg 37798118  T
Q  269 cttgattgttgttgt 283  Q
    |||| || |||||||    
T  37798119 cttggttattgttgt 37798133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 42293423 - 42293265
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||||| |||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| || ||   | ||||||| ||||||| | ||||| |    
T  42293423 gaggcaaaggatgaactaaaaaaactataagagaaactattaagaaagatctagaaattaatgagttagatagacatatggtatatgatagagcattacg 42293324  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
     ||| |||| ||| || || ||| | ||||||||||| ||||| | || ||||||||||    
T  42293323 atatcatttaatctatgtagccggccccacttagtggaataaggcctggttgttgttgt 42293265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 42639264 - 42639078
Alignment:
Q  40 gcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaaga 139  Q
    ||||||||||||||| |||||  ||| ||||||| | ||||||    ||||| | ||| ||  ||||||||  ||| | |||||  |||| ||||||| |    
T  42639264 gcttaggtggtttggacatgtagagagaagacttatggattctgtggtaaggggggtaaattagatggaggggagtcaaatcactagaggtagaggaata 42639165  T
Q  140 cctataaaaactt-aagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatgg 225  Q
     ||| |||||||  |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||   ||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  42639164 tctagaaaaactgcaagagaaactattaagaaagatctagcgattaatgagttggatagaaatatggtatttgatagaacattatgg 42639078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 194
Target Start/End: Original strand, 46372063 - 46372217
Alignment:
Q  41 cttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagac 140  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||| ||||| ||| ||||||  | |||| |||| ||||  ||| ||||  ||  |||||||  |||| || || ||||    
T  46372063 cttaggtggtttgtgcatgtagagagaagacatgtggattctgtactaagaagagcagatcagatagaggggagccagatcactagaggtaggggtagac 46372162  T
Q  141 ctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattgga 194  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  46372163 ctagaaaaactataagagaaactattaggaaggatctagagataaatgagttgga 46372217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 265
Target Start/End: Original strand, 55579122 - 55579295
Alignment:
Q  92 agagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaat 190  Q
    |||||| || |||||||||| ||| | |||| | |||| ||| ||||||||| ||||||| ||| | ||||||||  ||| |||||| || || |||| |    
T  55579122 agagtaaatttgatggaggagagtcaaatcaaaagaggtagaagaagacctagaaaaactataaaataaactattttgaaagatttaaaggttcatgagt 55579221  T
Q  191 tggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggata 265  Q
    ||||   ||| | ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || || |||||||||| ||||    
T  55579222 tggatttaaacaaggtttatgataaa-cattatgatataatttgatccatgtagccaaccccacttagtgtgata 55579295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 56439700 - 56439594
Alignment:
Q  154 agagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactcca 253  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| || |||||| | ||||| | ||||||||| ||||||| |||||||| |  |||||| |||||| || || || |||    
T  56439700 agagaaactattatgaaagatttggaaattaattagttggatcgaaatatggtttatgatagaacattatagcgtaatttaatccatatagccaacccca 56439601  T
Q  254 cttagtg 260  Q
    |||||||    
T  56439600 cttagtg 56439594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 198 - 283
Target Start/End: Original strand, 12443292 - 12443377
Alignment:
Q  198 aaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||  |||  | || ||||||| |||| ||||||||||    
T  12443292 aaatatggtttatgatagaacattatggcataatttgatccatgtagccgatcccaaatcgtaggataaggcttggttgttgttgt 12443377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 103 - 271
Target Start/End: Original strand, 18966706 - 18966875
Alignment:
Q  103 gatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaat 201  Q
    ||||||||||||||  |||||  |||| ||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||  ||||   | ||    
T  18966706 gatggaggatagttcaatcactagaggtagaagaagacctaaaacaactataagagaaactattaagaaagatctacagattagtgagctggattgagat 18966805  T
Q  202 atggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagactt 271  Q
    ||| | ||||| ||||||||||||     |||||| ||| || ||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  18966806 atgatatatgacaaaacattatggcgccgtttgattcatgtagccgaccccactttgtgcgataagactt 18966875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 350 - 403
Target Start/End: Original strand, 24001543 - 24001596
Alignment:
Q  350 ttttgttaggttgagttaggtccaacccaaattctaatatggtatcagagtcta 403  Q
    |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  24001543 ttttgtaaggttgagttaagcccaacccaaattctaagatagtatcagagtcta 24001596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 26025077 - 26024984
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaacttaa-gagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaac 218  Q
    |||||||||||||||||   |||||||   |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| | | | ||||| |||||||||||    
T  26025077 gaggcagaggaagacctggtaaaactttttgagaaactattaagaaagatctagagattaatgagttggatcgagacatggtttatgataaaac 26024984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 252 - 285
Target Start/End: Original strand, 29182686 - 29182719
Alignment:
Q  252 cacttagtgggataagacttgattgttgttgtat 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29182686 cacttagtgggataagacttgattgttgttgtat 29182719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 41 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 35555890 - 35555761
Alignment:
Q  41 cttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagac 140  Q
    |||||||||||||||||| |  ||| ||||| ||| ||||||  | | ||||||||||||  ||| ||||| |||| | ||||  |||| || || ||||    
T  35555890 cttaggtggtttgggcatttagagagaagacctgtggattctgtagttaggagagtagattagatagaggagagttgggtcactagaggtaggggtagac 35555791  T
Q  141 ctataaaaact-taagagaaactattaaga 169  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  35555790 ctagaaaaactataagagaaactattaaga 35555761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 233 - 286
Target Start/End: Original strand, 47372936 - 47372989
Alignment:
Q  233 tgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgtata 286  Q
    |||||||| || ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47372936 tgatccatgtagccgaccctacttagtgggataaggcttgattgttgttgtata 47372989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 230 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 50238668 - 50238615
Alignment:
Q  230 atttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  50238668 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 50238615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 230 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 50238754 - 50238701
Alignment:
Q  230 atttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  50238754 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 50238701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 87 - 136
Target Start/End: Original strand, 56439744 - 56439793
Alignment:
Q  87 taaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagagga 136  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  56439744 taaggagagtagatcagatggaggatagttagatcactagaggcagagga 56439793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 7544655 - 7544537
Alignment:
Q  151 ttaagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgact 250  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || || | |||       ||||||| |||||||| |   |||||||||||| || |||||     
T  7544655 ttaagagaaactattaagaaagatctagagattaatgagtttgatcgaaa-------tatgatagaacattatag-cgaatttgatccatgtagccgacc 7544564  T
Q  251 ccacttagtgggataagacttgattgt 277  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  7544563 ccacttagtgggataagccttggttgt 7544537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 15661939 - 15661875
Alignment:
Q  216 aacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgt 280  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  15661939 aacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggtttggttgttgt 15661875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 21879397 - 21879145
Alignment:
Q  40 gcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaaga 139  Q
    |||||||| |||||| ||||   ||| ||||| ||||||||||  | |||||||| |||||  |||||||| |||| | |||||  ||||  ||||||||    
T  21879397 gcttaggtagtttggacatgcatagagaagacatgtagattctttagtaaggagaatagattagatggagggtagtgaaatcaccagaggtcgaggaaga 21879298  T
Q  140 cctataaaaacttaagagaaactatt-aagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaa----acattatggtataatttg 234  Q
    ||  |||||   |||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||||   | ||||| | ||||||| |    || ||||   || |||||    
T  21879297 cccgtaaaactataagagaaactattcaagaaagatctagagatgaatgagttggatagagatatgatatatgatagatcccactttatttcatcatttg 21879198  T
Q  235 atccatctaaccgactccacttagtgggataagac--ttgattgttgttgtat 285  Q
     ||||| |  ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  21879197 gtccatgtcgccgactccacttagtgggataaggcttttgattgttgttgtat 21879145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 170
Target Start/End: Original strand, 48033190 - 48033254
Alignment:
Q  107 gaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaa 170  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  48033190 gaggatagttaaatcactagaggcagaggaagacttaagaaaactataagagaaactattaagaa 48033254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 217
Target Start/End: Original strand, 50679628 - 50679720
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaa 217  Q
    |||| |||||||||||||  |||||| | |||||||| ||||  |||||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  50679628 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgataaaa 50679720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 267
Target Start/End: Original strand, 56225226 - 56225334
Alignment:
Q  159 aactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttag 258  Q
    |||||||| ||| | ||||||| ||||| |||| || ||||||||||| | | ||| |||| |||| | ||||||||||||| |   |||| ||||||||    
T  56225226 aactattatgaaagttttagaggttaataaatttgatccaaatatggtattttatagaacactatgatgtaatttgatccatgtggtcgaccccacttag 56225325  T
Q  259 tgggataag 267  Q
    |||||||||    
T  56225326 tgggataag 56225334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 198 - 281
Target Start/End: Original strand, 1095642 - 1095725
Alignment:
Q  198 aaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgtt 281  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||  | |||||||| || || ||||| ||  ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  1095642 aaatatggtttatgatagaacattatggcgttatttgatcgatgtacccgaccccgtttagtgggataaggcttggttgttgtt 1095725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 228 - 283
Target Start/End: Original strand, 15665328 - 15665383
Alignment:
Q  228 taatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  15665328 taatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 15665383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 87 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 20105716 - 20105561
Alignment:
Q  87 taaggagagtagatatgatggaggat-agttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagatta 184  Q
    ||||| ||||||||  |||| ||||| ||| |||||||  |||||||| | ||| | | ||||||| ||| |||||| | |||||| ||| ||||||||     
T  20105716 taaggggagtagatcagatgaaggattagtcagatcactagaggcagatgtagatccagaaaaactataaaagaaacgactaagaaagatctagagattg 20105617  T
Q  185 atgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccat 240  Q
    |||| ||||||  ||||||||| |||||||  |||||||||  | |||||||||||    
T  20105616 atgagttggactgaaatatggtatatgataggacattatggcgtcatttgatccat 20105561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 32 - 151
Target Start/End: Original strand, 31339566 - 31339684
Alignment:
Q  32 gaaaataagcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggca 131  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||| |  | |||||| |||||||   ||| ||  |||| | |||||  ||||||    
T  31339566 gaaactaagcttaggtggtttgagcatgtagagagaagacttgtagattatgtagtaaggatagtagatcaaatgaagagtagtca-atcactagaggca 31339664  T
Q  132 gaggaagacctataaaaact 151  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  31339665 gaggaagacctagaaaaact 31339684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 40 - 107
Target Start/End: Original strand, 45176044 - 45176111
Alignment:
Q  40 gcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |  | ||||||| ||| |||||||||    
T  45176044 gcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacttgtagattttgaagtaaggagcgtatatatgatgg 45176111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 231 - 286
Target Start/End: Original strand, 50471757 - 50471812
Alignment:
Q  231 tttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgtata 286  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  50471757 tttgatccatgtaatcgaccccacttagtgggataacgcttggttgttgttgtata 50471812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 41 - 279
Target Start/End: Original strand, 54470246 - 54470485
Alignment:
Q  41 cttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagac 140  Q
    |||| |||||||||||||||  ||| ||||| |||| ||| |  | ||||||||||| ||   ||||||  |||| | || ||  |||||| | ||||||    
T  54470246 cttaagtggtttgggcatgtagagagaagacatgtaaattatgtagtaaggagagtaaatcaaatggagagtagtcaaattactagaggcaaaagaagac 54470345  T
Q  141 ctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatcca 239  Q
    | | ||||||| |||||||| ||||||| || | | ||||||||||||| |||||   ||||||||| |||||   | |||||| |  | ||||||||||    
T  54470346 caagaaaaactataagagaatctattaataaagttctagagattaatgagttggatagaaatatggtatatgactgagcattattgcgtcatttgatcca 54470445  T
Q  240 tctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttg 279  Q
    | || || || |||||||||||||| || |||| ||||||    
T  54470446 tgtagccaaccccacttagtgggattaggcttggttgttg 54470485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 229 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 1211446 - 1211392
Alignment:
Q  229 aatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |||||||| ||| || ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  1211446 aatttgattcatgtagccgaccccacttaatgggataagacttggttgttgttgt 1211392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 181 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 16875854 - 16875752
Alignment:
Q  181 attaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgt 280  Q
    |||||||  ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||  | ||| ||||||||| || | ||| |||||| |||| | |||  |||||||||||    
T  16875854 attaatgtgttggacccaaatatgatttatgatagaacattattatgtaacttgatccatgtagcagaccccactttgtggaaaaaggtttgattgttgt 16875755  T
Q  281 tgt 283  Q
    |||    
T  16875754 tgt 16875752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 29 - 79
Target Start/End: Original strand, 28236210 - 28236260
Alignment:
Q  29 gtggaaaataagcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagat 79  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  28236210 gtggaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacttgtagat 28236260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 175 - 249
Target Start/End: Original strand, 30480297 - 30480371
Alignment:
Q  175 ttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgac 249  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||  |||||   ||||||||||||| || |||||    
T  30480297 ttagagattaatgaattggactaaaatatggtttatgatagaattttatgacgtaatttgatccatgtagccgac 30480371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 169 - 283
Target Start/End: Original strand, 33227377 - 33227491
Alignment:
Q  169 aaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataaga 268  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||| ||||||| |||| ||||   | ||||||||||| || ||||  |||| |||||| |||||     
T  33227377 aaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacctagtggaataagg 33227476  T
Q  269 cttgattgttgttgt 283  Q
    |||| ||||| ||||    
T  33227477 cttggttgtttttgt 33227491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 29 - 194
Target Start/End: Original strand, 33709951 - 33710117
Alignment:
Q  29 gtggaaaataagcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgag 128  Q
    ||||||| || | ||||||||||| |||||||| ||| ||||  ||| ||||||  | ||| |||||| |||  || ||||| |||| |||||||  |||    
T  33709951 gtggaaactaggtttaggtggtttaggcatgtggagagaagaactgtggattctgtagtaaagagagtggatcagaaggagggtagtcagatcactagag 33710050  T
Q  129 gcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattgga 194  Q
     ||| ||||  | |||||||||  || |||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||    
T  33710051 acaggggaatgcttataaaaaccatacgagaaactattaagactgatctagagattaatgagttgga 33710117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 161 - 283
Target Start/End: Original strand, 41192221 - 41192343
Alignment:
Q  161 ctattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtg 260  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||   ||||||||| |||| || ||||||||||  |  || ||||||| || ||||| | || ||||     
T  41192221 ctataaagaaagatctagagattaatgagttggatagaaatatggtatatggtagaacattatggcttcgttcgatccatgtagccgacccgacatagtt 41192320  T
Q  261 ggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||| |||| ||||||||||    
T  41192321 ggataaggcttggttgttgttgt 41192343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 126 - 283
Target Start/End: Original strand, 43434048 - 43434206
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||| |||||||||||||  |||||| | |||||||| ||| | || ||||||||| | ||||| | ||| |||||| || | || |||| |||| || |    
T  43434048 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattgaaaatgatttagaggtcaatgagtcggatccaaatttgatgtaggatagaacactacg 43434147  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |  | ||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  43434148 gcgtcatttgatccatgtagtcgagcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 43434206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 159 - 241
Target Start/End: Original strand, 44384988 - 44385070
Alignment:
Q  159 aactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatc 241  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||    |||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||    
T  44384988 aactattaagaaagatctagagattaataagttggatattaatatggtttatgatagaacattatgatgtaatttgattcatc 44385070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 233 - 283
Target Start/End: Original strand, 46153940 - 46153990
Alignment:
Q  233 tgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  46153940 tgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 46153990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 92 - 265
Target Start/End: Original strand, 47372741 - 47372915
Alignment:
Q  92 agagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaat 190  Q
    |||||||||  || ||||| |||| | |||||  |||||||||| |||| |   |||||| |||||||||||| ||| || |||  |||||||||||| |    
T  47372741 agagtagattagacggagggtagtcaaatcactagaggcagaggtagacttgagaaaactataagagaaactactaataaagatccagagattaatgagt 47372840  T
Q  191 tggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggata 265  Q
    ||||   ||||||||| ||| ||| ||||||||||  |  |||||||||| || || |  |||||||||||||||    
T  47372841 tggatagaaatatggtatattatagaacattatggagtcgtttgatccatgtagcccatcccacttagtgggata 47372915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 350 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 50830740 - 50830702
Alignment:
Q  350 ttttgttaggttgagttaggtccaacccaaattctaata 388  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  50830740 ttttgtaaggttgagttaggcccaacccaaattctaata 50830702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 228 - 278
Target Start/End: Original strand, 50862858 - 50862908
Alignment:
Q  228 taatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgtt 278  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  50862858 taatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgtt 50862908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 157 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 52360070 - 52360012
Alignment:
Q  157 gaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataa 215  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||    
T  52360070 gaaactattaggaaagatttggagattaatgagttggaccaaaatttggtttatgataa 52360012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 227 - 285
Target Start/End: Original strand, 54529644 - 54529702
Alignment:
Q  227 ataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgtat 285  Q
    |||||||||||||| || |||   ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  54529644 ataatttgatccatgtagccggacccatttagtgggataagacttggttgttgttgtat 54529702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 165 - 263
Target Start/End: Original strand, 54935313 - 54935411
Alignment:
Q  165 taagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtggga 263  Q
    ||||||| ||||| ||||||| |  ||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||   |||||||||||||| || || || |||||| ||||||    
T  54935313 taagaagaatttaaagattaacgtgttggaccaagatatggtttatgatagaacattataacataatttgatccatgtagcctaccccacttggtggga 54935411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 934588 - 934520
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattgga 194  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| | ||||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||    
T  934588 gaggcagaggaagac-tagaaaaactattagagaaactattaagaaagttctagagattaatgagttgga 934520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 285
Target Start/End: Original strand, 28348272 - 28348341
Alignment:
Q  216 aacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgtat 285  Q
    ||||||||| | || ||||| |||| || ||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  28348272 aacattatgatgtactttgaaccatgtagccgaccccgcttagtgggataaggcttggttgttgttgtat 28348341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 350 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 31901247 - 31901198
Alignment:
Q  350 ttttgttaggttgagttaggtccaacccaaattctaatatggtatcagag 399  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||  |||||| |||||||||||||||    
T  31901247 ttttgtaaggttgagttaggcccaacttaaattccaatatggtatcagag 31901198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 350 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 31965111 - 31965062
Alignment:
Q  350 ttttgttaggttgagttaggtccaacccaaattctaatatggtatcagag 399  Q
    |||||| |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  31965111 ttttgtaaggttgagttaggctcaactcaaattctaatatggtattagag 31965062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 33225964 - 33225931
Alignment:
Q  152 taagagaaactattaagaaggatttagagattaa 185  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33225964 taagagaaactattaagaaagatttagagattaa 33225931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 277
Target Start/End: Original strand, 44860957 - 44861107
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||||| ||||||||||  ||||||| |||| |||||||||| ||| ||| |||||||  |||| |||||   ||||||||| ||||||  | |||||||    
T  44860957 gaggcaaaggaagaccttgaaaaactataagggaaactattatgaaagatctagagat--atgacttggattgaaatatggtatatgatggagcattatg 44861054  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgt 277  Q
    || |  ||| || | | || ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  44861055 gtgttgtttaattcttgtagccgactccacttagtggaataaggcttgtttgt 44861107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 45569167 - 45569098
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattgga 194  Q
    |||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||||  || ||||||| ||||| |||||    
T  45569167 gaggcagaggaagacctagaaacattataagagaaactattaagaaaaatctagagatcaatgagttgga 45569098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 284
Target Start/End: Original strand, 49686923 - 49686976
Alignment:
Q  231 tttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgta 284  Q
    ||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  49686923 tttgaaccatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgctgta 49686976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 49738602 - 49738549
Alignment:
Q  231 tttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgta 284  Q
    |||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  49738602 tttgatccatgtagccgaccccatttagtgggataaggcttggttgttgttgta 49738549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 49939787 - 49939734
Alignment:
Q  230 atttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  49939787 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgttgttgt 49939734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 188
Target Start/End: Original strand, 53517640 - 53517717
Alignment:
Q  112 tagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatga 188  Q
    |||| |||||||  ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| || || ||  |||||||||||||    
T  53517640 tagtcagatcactagaggcagaggaagacttagaaaaactgtaagagaaactatcaaaaaagaactagagattaatga 53517717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 198 - 283
Target Start/End: Original strand, 54963648 - 54963732
Alignment:
Q  198 aaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||  |||||| |||||| || | ||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  54963648 aaatatggtatatgatagaacat-atggcctaattttatccatgtacctgacccaacttagtgggataagacttagttgttgttgt 54963732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 351 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 8008611 - 8008560
Alignment:
Q  351 tttgttaggttgagttaggtccaacccaaattctaatatggtatcagagtcta 403  Q
    ||||| ||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  8008611 tttgtaaggttgagttaag-ccaatctaaattctaatatggtatcagagtcta 8008560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 154 - 194
Target Start/End: Original strand, 29182605 - 29182645
Alignment:
Q  154 agagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattgga 194  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||    
T  29182605 agagaaactattaagaagtatctagagattaatgagttgga 29182645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 177 - 225
Target Start/End: Original strand, 34379579 - 34379627
Alignment:
Q  177 agagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatgg 225  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||    
T  34379579 agagattaatgagttggaccgaaatatggtttatgatagaatattatgg 34379627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 245 - 285
Target Start/End: Original strand, 49416951 - 49416991
Alignment:
Q  245 ccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgtat 285  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  49416951 ccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtat 49416991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 91 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 51009304 - 51009200
Alignment:
Q  91 gagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaactt-aagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaa 189  Q
    |||||| |||| |||||||| |||||| |||||  || |  |||||||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||  | | ||||||||||||    
T  51009304 gagagttgataagatggagggtagttaaatcactagacgtggaggaagaccgagaaaaactttaagggaaactattaagaagagtgttgagattaatgaa 51009205  T
Q  190 ttgga 194  Q
     ||||    
T  51009204 atgga 51009200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 251 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 51051487 - 51051455
Alignment:
Q  251 ccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51051487 ccacttagtgggataagacttggttgttgttgt 51051455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 196 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 51811365 - 51811279
Alignment:
Q  196 ccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgta 284  Q
    ||||||||||| | ||||| |||| ||||   | ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  51811365 ccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgac-ccacttagtgggataaggcttg-ttgttgttgta 51811279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 235 - 283
Target Start/End: Original strand, 56130404 - 56130452
Alignment:
Q  235 atccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  56130404 atccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 56130452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1318 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold1318
Description:

Target: scaffold1318; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 154 - 283
Target Start/End: Original strand, 484 - 613
Alignment:
Q  154 agagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactcca 253  Q
    |||||||| ||||  |||||||||||| | ||||| ||| |||||||| |||| ||||||| |||| |||||  | ||||||||||| || ||||| |||    
T  484 agagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttgtacccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgacccca 583  T
Q  254 cttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  584 cttagtgggataaggcttgattgttgttgt 613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0050
Description:

Target: scaffold0050; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 126 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 58384 - 58226
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||| |||  | || ||||| ||||| ||||||| | ||||||| ||||||| |||||||||    
T  58384 gaggcagaggaagacctagaaaaacgataagagaaactgttaggaaaaacttggagatcaatgagttggaccaagatatggtttatgatagaacattatg 58285  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
       ||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||| ||| ||| |||||||    
T  58284 tcgtaatttgatccatgtagccgacccaacttagtgggataaggcttcattattgttgt 58226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0570 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0570
Description:

Target: scaffold0570; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 126 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 1106 - 948
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatg 224  Q
    |||| |||||||||||||  |||||| | |||||||| ||||| || ||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||| ||||||| |||| ||||    
T  1106 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattaaaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatg 1007  T
Q  225 gtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |  | ||||||||||| || | ||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  1006 gcgtcatttgatccatgtagctgaccccatttagtgggataaggcttggttgttgttgt 948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 155 - 285
Target Start/End: Original strand, 16732 - 16862
Alignment:
Q  155 gagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccac 254  Q
    ||||||| ||||  || ||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||| | ||||| |||| |||||  | |||||||| || || ||||||||||    
T  16732 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatctatgtagccgactccac 16831  T
Q  255 ttagtgggataagacttgattgttgttgtat 285  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  16832 ttagtgggataaggcttggttgttgttgtat 16862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 126 - 284
Target Start/End: Original strand, 82843 - 83001
Alignment:
Q  126 gaggcagaggaagacctataaaaacttaagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatgg 225  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||  |||||||| ||||  |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||| | ||||||| |||| ||||     
T  82843 gaggtagaggaagacctaggaaaactatagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagaacactatga 82942  T
Q  226 tataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgta 284  Q
      | ||||||||||| || ||||| ||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||    
T  82943 cgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatggaataaggcttggttgttgttgta 83001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 48202 - 48135
Alignment:
Q  197 caaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggat 264  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  48202 caaatatggtgtatgatagaatattatggcgtaatttgatccatgtagccgactccacttagtaggat 48135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 153 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 160454 - 160325
Alignment:
Q  153 aagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactcc 252  Q
    |||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||| || |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||  ||| || || || ||    
T  160454 aagagaaactattaggaaagattaagaaattaatgagttcgaccgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgaatcatgtagccaacccc 160355  T
Q  253 acttagtgggataagacttgattgttgttg 282  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  160354 acttagtgggaaaaggcttggttgttgttg 160325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 131 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 25685 - 25532
Alignment:
Q  131 agaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtata 229  Q
    |||||||||||||  |||||| | |||||||| ||||  |||||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||| ||||||| |||| ||||   |     
T  25685 agaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgtc 25586  T
Q  230 atttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |||| |||||| || | ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  25585 atttaatccatgtagcggaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 25532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 3)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 154 - 283
Target Start/End: Original strand, 31621 - 31750
Alignment:
Q  154 agagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactcca 253  Q
    |||||||| ||||  |||||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||| ||||||| |||| | ||   | ||||||||||| || ||||| |||    
T  31621 agagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactgtgaagtcatttgatccatgtagccgacccca 31720  T
Q  254 cttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  31721 cttagtgggataaggcttggttgttgttgt 31750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 109 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 178595 - 178507
Alignment:
Q  109 ggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacc 196  Q
    ||||||| | |||||  ||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  178595 ggatagtcatatcactagaggcggagtaagacctagaaaaactataagagaaactattaagaaagatatagagattaatgagttggacc 178507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 44121 - 44029
Alignment:
Q  31 ggaaaataagcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcac 123  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||| |  |||||||  | |||||||||||||   ||||||||||||| |||||||    
T  44121 ggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagaccttcagattctctagtaaggagagtagactagatggaggatagtcagatcac 44029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0491
Description:

Target: scaffold0491; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 70 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 4041 - 3846
Alignment:
Q  70 acttgtagattctacaataaggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaag 168  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||  |  |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||    
T  4041 acttgtagatgctatagtaaggagagtagataagatggaagatagtcagattgctagaggcagaggtagaccta-aaaaactataagagaaactatttag 3943  T
Q  169 aaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggata 265  Q
    ||  ||    |||||||||| |||||   ||||||||| ||||||  ||||||| ||  |||||||||| || ||  |||| ||| |||||||||||    
T  3942 aaaaatcattagattaatgagttggattaaaatatggtttatgattgaacattaaggcttaatttgatcaatgtagtcgaccccaattagtgggata 3846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 277
Target Start/End: Original strand, 3664 - 3713
Alignment:
Q  228 taatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgt 277  Q
    ||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  3664 taatttgatccaagtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgt 3713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0392 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0392
Description:

Target: scaffold0392; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 198 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 6857 - 6783
Alignment:
Q  198 aaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttg 272  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| ||||    
T  6857 aaatatggtatatgatataacattatggcataatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttg 6783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0325 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0325
Description:

Target: scaffold0325; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 188
Target Start/End: Original strand, 11884 - 11984
Alignment:
Q  89 aggagagtagatatgatggaggatagttagatcacatgaggcagaggaagacctataaaaact-taagagaaactattaagaaggatttagagattaatg 187  Q
    ||||||||||||  | |||||| |||| | |||||  |||||| | ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11884 aggagagtagatccggtggagggtagtgaaatcactagaggcaaaagaagaactagaaaaactataagagaaactattaagaaggatctagagattaatg 11983  T
Q  188 a 188  Q
    |    
T  11984 a 11984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0199
Description:

Target: scaffold0199; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 151 - 283
Target Start/End: Original strand, 14733 - 14865
Alignment:
Q  151 ttaagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgact 250  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||| || | ||||| |||||  |||||||||| ||||||  |||| |||||  ||||||||||||| || || ||     
T  14733 ttaagagaaaccattagaaaggatttaaaggtcaatgagttggattcaaatatggtttatgattgaacactatggcgtaatttgatccatgtagccaacc 14832  T
Q  251 ccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |||| |||||||||||  |||| ||||||||||    
T  14833 ccacgtagtgggataaatcttggttgttgttgt 14865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 283
Target Start/End: Original strand, 4787 - 4918
Alignment:
Q  152 taagagaaactattaagaaggatttagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactc 251  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||  | ||||| ||  | ||||||||||| ||||||| |||| |||||  ||||||||||| | || ||||| |    
T  4787 taagagaaaccattagaaaggatttagacgtcaatgagttaaatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatccgtgtagccgaccc 4886  T
Q  252 cacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||| |||||||||  |||| ||||||||||    
T  4887 cactttgtgggataacgcttggttgttgttgt 4918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 196 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 28976 - 28889
Alignment:
Q  196 ccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |||||| |||| ||||||| |||| |||||  | ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  28976 ccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 28889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1858 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1858
Description:

Target: scaffold1858; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 182 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 976 - 887
Alignment:
Q  182 ttaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttg 272  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| | ||  || ||||| |||||||||||||||| |||||    
T  976 ttaatgagttggaccgaaatatggtttataataaaacattatggcataatttg-ttcaggtagccgaccccacttagtgggataacacttg 887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0245 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0245
Description:

Target: scaffold0245; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 196 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 16523 - 16438
Alignment:
Q  196 ccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgtt 281  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||||| ||||| ||| ||||||| |||  ||||||||    
T  16523 ccaaatatggtttatgatagaacattatggcataatttgatccatgtggccgaccccactcagttggataaggcttagttgttgtt 16438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 86702 - 86609
Alignment:
Q  190 ttggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||| |||| ||||   ||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  86702 ttggatccaaatatgatgtatgatagaacactatgacgtaatttgatccatgtagtcggctccacttagtgggatacgacttgtttgttgttgt 86609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 163246 - 163194
Alignment:
Q  231 tttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 283  Q
    |||||| ||| || ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  163246 tttgattcatatagccgactccatttagtggaataaaacttgattgttgttgt 163194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University