View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8950_low_9 (Length: 716)

Name: NF8950_low_9
Description: NF8950
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8950_low_9
NF8950_low_9
[»] chr6 (83 HSPs)
chr6 (19-702)||(27187269-27187952)
chr6 (19-702)||(27261288-27261971)
chr6 (19-702)||(28292137-28292820)
chr6 (19-702)||(28262962-28263645)
chr6 (19-702)||(28341711-28342394)
chr6 (19-700)||(24312935-24313616)
chr6 (19-700)||(29591687-29592368)
chr6 (19-702)||(1542849-1543532)
chr6 (19-700)||(2874570-2875251)
chr6 (19-700)||(16626484-16627165)
chr6 (19-700)||(25112385-25113066)
chr6 (19-700)||(5838986-5839667)
chr6 (19-697)||(19864520-19865198)
chr6 (19-688)||(25609640-25610309)
chr6 (19-691)||(27331209-27331881)
chr6 (19-691)||(27391949-27392621)
chr6 (19-691)||(16927416-16928088)
chr6 (19-691)||(18407718-18408391)
chr6 (19-679)||(22078478-22079136)
chr6 (19-679)||(16963155-16963815)
chr6 (19-691)||(22762231-22762903)
chr6 (19-691)||(23078302-23078974)
chr6 (19-486)||(12497859-12498326)
chr6 (19-486)||(12510575-12511042)
chr6 (246-695)||(22433929-22434378)
chr6 (19-486)||(12505188-12505655)
chr6 (19-445)||(25765312-25765737)
chr6 (19-691)||(25768024-25768696)
chr6 (19-691)||(21471434-21472106)
chr6 (392-679)||(17032589-17032876)
chr6 (19-691)||(19879131-19879803)
chr6 (54-688)||(15459204-15459838)
chr6 (65-691)||(17415365-17415991)
chr6 (54-691)||(34645362-34645999)
chr6 (19-691)||(10468625-10469297)
chr6 (78-691)||(14381243-14381856)
chr6 (19-691)||(21563908-21564580)
chr6 (19-691)||(22796408-22797080)
chr6 (36-695)||(11280277-11280936)
chr6 (19-690)||(27560394-27561065)
chr6 (129-626)||(1640715-1641212)
chr6 (19-688)||(24364245-24364914)
chr6 (115-690)||(28282590-28283165)
chr6 (54-691)||(18794558-18795195)
chr6 (19-504)||(8766111-8766596)
chr6 (19-276)||(21833172-21833429)
chr6 (279-691)||(19453513-19453925)
chr6 (19-206)||(17032395-17032582)
chr6 (19-406)||(18197608-18197995)
chr6 (364-691)||(5296982-5297308)
chr6 (369-690)||(27559765-27560086)
chr6 (19-283)||(14131363-14131627)
chr6 (117-505)||(18800873-18801261)
chr6 (19-277)||(25750642-25750900)
chr6 (36-385)||(11287680-11288029)
chr6 (475-691)||(15896383-15896599)
chr6 (472-691)||(21569767-21569986)
chr6 (192-292)||(11291818-11291918)
chr6 (144-679)||(16382161-16382696)
chr6 (585-700)||(21836964-21837079)
chr6 (538-691)||(8762709-8762862)
chr6 (600-691)||(20637077-20637168)
chr6 (585-691)||(18197504-18197610)
chr6 (144-679)||(16098008-16098543)
chr6 (144-679)||(23996206-23996741)
chr6 (144-679)||(25742876-25743410)
chr6 (144-466)||(15078365-15078687)
chr6 (19-113)||(22433830-22433924)
chr6 (148-264)||(25750908-25751024)
chr6 (144-679)||(18837696-18838231)
chr6 (157-466)||(21412939-21413248)
chr6 (157-465)||(1648786-1649094)
chr6 (219-679)||(18571684-18572144)
chr6 (629-695)||(22442710-22442776)
chr6 (159-464)||(25655456-25655760)
chr6 (219-434)||(16233242-16233457)
chr6 (19-107)||(18787721-18787809)
chr6 (576-661)||(23027522-23027607)
chr6 (21-97)||(1640634-1640710)
chr6 (387-466)||(1652274-1652353)
chr6 (558-679)||(21927577-21927698)
chr6 (559-679)||(1648602-1648722)
chr6 (489-637)||(14625068-14625216)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (19-702)||(109434-110117)
scaffold0029 (19-691)||(112559-113231)
scaffold0029 (54-691)||(95636-96273)
[»] chr3 (75 HSPs)
chr3 (19-702)||(15589251-15589934)
chr3 (19-691)||(53384888-53385560)
chr3 (19-702)||(20061913-20062596)
chr3 (19-702)||(10005188-10005871)
chr3 (19-702)||(10905798-10906481)
chr3 (19-702)||(48425035-48425718)
chr3 (19-702)||(16635361-16636044)
chr3 (19-702)||(16756444-16757127)
chr3 (19-702)||(43162685-43163368)
chr3 (19-700)||(15348106-15348787)
chr3 (19-702)||(6600335-6601007)
chr3 (19-700)||(13252278-13252959)
chr3 (19-700)||(5424791-5425471)
chr3 (19-700)||(15402371-15403052)
chr3 (19-700)||(15724795-15725475)
chr3 (19-700)||(26792260-26792941)
chr3 (19-700)||(15338857-15339538)
chr3 (19-700)||(16412143-16412824)
chr3 (19-700)||(12497836-12498517)
chr3 (19-700)||(14876360-14877041)
chr3 (19-700)||(16806787-16807468)
chr3 (19-697)||(16371001-16371679)
chr3 (19-691)||(17489438-17490110)
chr3 (19-700)||(16691748-16692433)
chr3 (19-691)||(16492051-16492723)
chr3 (19-691)||(9522307-9522979)
chr3 (19-691)||(15247735-15248407)
chr3 (19-691)||(15208479-15209151)
chr3 (19-691)||(15227247-15227919)
chr3 (54-691)||(13971979-13972616)
chr3 (19-691)||(13322511-13323183)
chr3 (19-691)||(14086271-14086943)
chr3 (19-691)||(15952827-15953499)
chr3 (390-697)||(11564545-11564852)
chr3 (174-683)||(15015634-15016131)
chr3 (411-691)||(14126464-14126744)
chr3 (19-681)||(18134215-18134877)
chr3 (19-691)||(12360401-12361073)
chr3 (19-690)||(8758942-8759613)
chr3 (19-690)||(41177120-41177791)
chr3 (19-688)||(13941622-13942291)
chr3 (19-688)||(10383567-10384235)
chr3 (19-691)||(11303632-11304304)
chr3 (54-691)||(12850138-12850775)
chr3 (19-688)||(47123542-47124211)
chr3 (452-697)||(15061777-15062022)
chr3 (115-690)||(16836370-16836945)
chr3 (54-688)||(10419907-10420541)
chr3 (115-690)||(44776941-44777516)
chr3 (19-592)||(11960992-11961565)
chr3 (19-691)||(16329520-16330190)
chr3 (115-690)||(16380788-16381362)
chr3 (348-688)||(28754245-28754585)
chr3 (354-691)||(17492563-17492900)
chr3 (381-691)||(14573889-14574199)
chr3 (348-685)||(4678365-4678702)
chr3 (312-583)||(13001800-13002070)
chr3 (21-283)||(14571448-14571710)
chr3 (354-595)||(26008948-26009189)
chr3 (144-679)||(8274281-8274816)
chr3 (537-691)||(16828061-16828215)
chr3 (144-679)||(16742585-16743120)
chr3 (144-678)||(15576473-15577007)
chr3 (471-691)||(16338371-16338591)
chr3 (157-672)||(18748401-18748916)
chr3 (192-434)||(17192865-17193107)
chr3 (217-431)||(6712539-6712753)
chr3 (144-434)||(13975172-13975462)
chr3 (294-466)||(14183007-14183179)
chr3 (530-679)||(6152733-6152882)
chr3 (19-106)||(31689067-31689154)
chr3 (19-106)||(31945070-31945157)
chr3 (509-679)||(13967222-13967392)
chr3 (360-434)||(6152978-6153052)
chr3 (552-646)||(17193224-17193318)
[»] chr5 (69 HSPs)
chr5 (19-700)||(27668294-27668975)
chr5 (19-700)||(19769861-19770542)
chr5 (19-700)||(40708681-40709362)
chr5 (19-702)||(34566395-34567078)
chr5 (19-702)||(27518308-27518991)
chr5 (19-700)||(22332691-22333372)
chr5 (19-702)||(16356403-16357086)
chr5 (19-700)||(41770743-41771424)
chr5 (19-700)||(14999543-15000224)
chr5 (19-700)||(27610255-27610936)
chr5 (19-700)||(27685204-27685885)
chr5 (21-700)||(37291300-37291979)
chr5 (19-679)||(29475898-29476558)
chr5 (19-700)||(22134569-22135250)
chr5 (19-700)||(22348326-22349005)
chr5 (19-697)||(23573643-23574321)
chr5 (19-700)||(18775678-18776352)
chr5 (20-679)||(23516443-23517102)
chr5 (19-672)||(20798661-20799314)
chr5 (19-659)||(23440126-23440766)
chr5 (19-688)||(25423090-25423759)
chr5 (61-691)||(21497850-21498479)
chr5 (19-561)||(21984248-21984790)
chr5 (19-691)||(20467909-20468581)
chr5 (19-691)||(23471130-23471802)
chr5 (19-691)||(26738540-26739190)
chr5 (194-691)||(21339099-21339596)
chr5 (19-688)||(24749370-24750039)
chr5 (19-691)||(22235733-22236405)
chr5 (19-691)||(21563786-21564451)
chr5 (19-691)||(21890572-21891244)
chr5 (19-691)||(22381082-22381754)
chr5 (19-691)||(23079902-23080574)
chr5 (19-688)||(22502562-22503231)
chr5 (19-688)||(14886807-14887476)
chr5 (19-655)||(22461835-22462471)
chr5 (19-688)||(25847958-25848627)
chr5 (19-688)||(20342165-20342834)
chr5 (54-691)||(28923581-28924218)
chr5 (19-664)||(37545336-37545982)
chr5 (54-691)||(20821371-20822008)
chr5 (54-691)||(28894755-28895392)
chr5 (115-690)||(17269148-17269722)
chr5 (19-688)||(24798213-24798882)
chr5 (54-679)||(20773678-20774302)
chr5 (19-581)||(21404737-21405285)
chr5 (19-433)||(24735682-24736096)
chr5 (249-691)||(21831574-21831998)
chr5 (19-325)||(23442472-23442778)
chr5 (382-613)||(919-1150)
chr5 (453-688)||(24716342-24716577)
chr5 (19-277)||(24737012-24737270)
chr5 (19-223)||(20573422-20573626)
chr5 (459-688)||(24620111-24620340)
chr5 (400-691)||(28916226-28916517)
chr5 (19-196)||(21343666-21343843)
chr5 (459-691)||(21496481-21496713)
chr5 (144-679)||(21937013-21937548)
chr5 (577-691)||(21407597-21407711)
chr5 (144-679)||(24581219-24581753)
chr5 (144-679)||(27011092-27011627)
chr5 (144-466)||(11210732-11211054)
chr5 (19-247)||(21662297-21662524)
chr5 (19-247)||(21665758-21665985)
chr5 (531-679)||(25244175-25244323)
chr5 (531-679)||(25308327-25308475)
chr5 (219-434)||(23503526-23503741)
chr5 (369-436)||(21229241-21229308)
chr5 (531-592)||(16065604-16065665)
[»] chr2 (62 HSPs)
chr2 (19-702)||(16998600-16999283)
chr2 (19-702)||(16981752-16982435)
chr2 (19-702)||(17063317-17064000)
chr2 (19-702)||(9609736-9610419)
chr2 (19-702)||(10868450-10869133)
chr2 (19-702)||(27217616-27218299)
chr2 (19-700)||(44385731-44386412)
chr2 (19-700)||(22325018-22325699)
chr2 (19-702)||(17066978-17067658)
chr2 (19-700)||(24261970-24262651)
chr2 (19-700)||(24709633-24710314)
chr2 (19-700)||(27370869-27371550)
chr2 (19-702)||(21145201-21145873)
chr2 (19-691)||(23188608-23189279)
chr2 (19-697)||(24675089-24675767)
chr2 (19-697)||(24707647-24708325)
chr2 (19-537)||(16924860-16925378)
chr2 (19-697)||(21325431-21326109)
chr2 (19-538)||(24878319-24878838)
chr2 (19-697)||(22756630-22757306)
chr2 (19-688)||(23063677-23064346)
chr2 (314-700)||(41608547-41608933)
chr2 (77-672)||(24825472-24826067)
chr2 (19-691)||(30211088-30211760)
chr2 (23-691)||(45529121-45529783)
chr2 (19-691)||(27365250-27365922)
chr2 (19-691)||(23293558-23294230)
chr2 (19-691)||(23276376-23277048)
chr2 (19-580)||(23087050-23087611)
chr2 (19-679)||(11358057-11358717)
chr2 (19-688)||(20832585-20833254)
chr2 (19-688)||(31830258-31830927)
chr2 (19-690)||(27787341-27788012)
chr2 (115-690)||(12574049-12574624)
chr2 (19-688)||(1063351-1064020)
chr2 (19-292)||(23138637-23138910)
chr2 (19-292)||(23550427-23550700)
chr2 (19-232)||(27377101-27377314)
chr2 (540-702)||(16923010-16923172)
chr2 (538-702)||(16925479-16925643)
chr2 (354-691)||(19652223-19652557)
chr2 (545-700)||(20442675-20442830)
chr2 (533-700)||(24876911-24877078)
chr2 (387-688)||(20828227-20828528)
chr2 (19-159)||(41609047-41609187)
chr2 (394-691)||(24948564-24948861)
chr2 (158-679)||(22276018-22276538)
chr2 (510-688)||(21125331-21125509)
chr2 (20-259)||(24653946-24654185)
chr2 (603-691)||(23107901-23107989)
chr2 (196-624)||(23817291-23817719)
chr2 (576-691)||(23110892-23111007)
chr2 (537-691)||(24641860-24642014)
chr2 (19-188)||(24944967-24945136)
chr2 (144-466)||(12640315-12640637)
chr2 (144-679)||(24831370-24831905)
chr2 (246-679)||(25128474-25128907)
chr2 (192-679)||(22761752-22762239)
chr2 (157-679)||(24569851-24570373)
chr2 (246-300)||(27368394-27368448)
chr2 (19-80)||(24833355-24833416)
chr2 (390-466)||(23890753-23890829)
[»] chr1 (46 HSPs)
chr1 (19-700)||(16350293-16350974)
chr1 (19-700)||(51333187-51333868)
chr1 (19-700)||(33390723-33391404)
chr1 (19-700)||(19106351-19107032)
chr1 (19-700)||(21830287-21830968)
chr1 (19-661)||(41354202-41354844)
chr1 (19-700)||(21836934-21837615)
chr1 (19-700)||(17044709-17045390)
chr1 (19-700)||(16078350-16079008)
chr1 (19-679)||(50619959-50620619)
chr1 (19-691)||(16369281-16369953)
chr1 (19-563)||(20249834-20250378)
chr1 (19-573)||(20136762-20137316)
chr1 (19-691)||(19760569-19761241)
chr1 (19-436)||(21747519-21747935)
chr1 (19-688)||(19854298-19854966)
chr1 (19-687)||(20939770-20940438)
chr1 (19-688)||(37677063-37677733)
chr1 (54-691)||(20835591-20836231)
chr1 (19-693)||(22432817-22433491)
chr1 (19-679)||(20856476-20857136)
chr1 (19-688)||(20294396-20295065)
chr1 (442-691)||(21749348-21749597)
chr1 (117-621)||(41307907-41308411)
chr1 (471-691)||(22361947-22362167)
chr1 (19-325)||(19664945-19665251)
chr1 (420-691)||(24099306-24099577)
chr1 (19-439)||(31550136-31550556)
chr1 (19-208)||(50612602-50612791)
chr1 (387-691)||(19662844-19663143)
chr1 (444-688)||(31539703-31539947)
chr1 (566-691)||(20139361-20139486)
chr1 (19-272)||(20244184-20244437)
chr1 (144-679)||(20831107-20831642)
chr1 (19-133)||(21163264-21163378)
chr1 (115-283)||(11382674-11382842)
chr1 (19-283)||(20075170-20075434)
chr1 (609-679)||(20250376-20250446)
chr1 (144-679)||(20914319-20914854)
chr1 (196-432)||(22135520-22135756)
chr1 (19-193)||(20395194-20395368)
chr1 (157-310)||(21202371-21202524)
chr1 (530-679)||(22135272-22135421)
chr1 (654-699)||(41353357-41353402)
chr1 (144-318)||(46518830-46519004)
chr1 (537-646)||(20184683-20184792)
[»] chr7 (72 HSPs)
chr7 (19-702)||(18177700-18178383)
chr7 (19-702)||(8198586-8199269)
chr7 (19-702)||(10870953-10871636)
chr7 (19-700)||(11236844-11237525)
chr7 (19-700)||(15160688-15161369)
chr7 (19-702)||(44790980-44791663)
chr7 (19-700)||(8707563-8708244)
chr7 (19-700)||(18551389-18552070)
chr7 (19-700)||(14332355-14333036)
chr7 (19-700)||(13686021-13686703)
chr7 (19-702)||(11552731-11553414)
chr7 (19-702)||(12687459-12688142)
chr7 (19-700)||(16947-17628)
chr7 (19-702)||(14954578-14955261)
chr7 (20-580)||(23516520-23517080)
chr7 (19-694)||(15154294-15154964)
chr7 (240-700)||(9596236-9596696)
chr7 (54-691)||(15624545-15625182)
chr7 (19-691)||(12206418-12207090)
chr7 (19-691)||(15102221-15102891)
chr7 (19-571)||(15203837-15204389)
chr7 (210-691)||(11771881-11772362)
chr7 (30-691)||(21661933-21662591)
chr7 (19-691)||(14263862-14264534)
chr7 (19-691)||(19147170-19147842)
chr7 (19-691)||(20746569-20747241)
chr7 (19-691)||(11388046-11388717)
chr7 (351-691)||(14039986-14040326)
chr7 (351-691)||(14350016-14350356)
chr7 (19-691)||(16071912-16072584)
chr7 (19-688)||(8211749-8212418)
chr7 (19-688)||(11305884-11306553)
chr7 (19-691)||(13021316-13021988)
chr7 (19-691)||(16950089-16950761)
chr7 (19-690)||(18053572-18054243)
chr7 (19-688)||(49152260-49152929)
chr7 (19-691)||(6413470-6414142)
chr7 (19-691)||(14285994-14286666)
chr7 (19-691)||(13665512-13666168)
chr7 (165-535)||(35964646-35965016)
chr7 (19-690)||(14129832-14130503)
chr7 (23-691)||(1025-1693)
chr7 (19-690)||(14433650-14434321)
chr7 (115-688)||(23505491-23506064)
chr7 (19-691)||(12455662-12456333)
chr7 (19-346)||(14037765-14038092)
chr7 (19-346)||(14347795-14348122)
chr7 (115-634)||(23199418-23199937)
chr7 (115-688)||(26118226-26118799)
chr7 (216-690)||(15340587-15341061)
chr7 (351-688)||(13968289-13968626)
chr7 (576-702)||(23203242-23203368)
chr7 (576-702)||(23509369-23509495)
chr7 (221-579)||(12456940-12457298)
chr7 (157-679)||(14936443-14936965)
chr7 (144-679)||(4440011-4440546)
chr7 (144-679)||(7823983-7824518)
chr7 (144-679)||(27107426-27107961)
chr7 (157-679)||(15364036-15364558)
chr7 (192-434)||(12368473-12368715)
chr7 (27-283)||(26288063-26288318)
chr7 (144-679)||(21674185-21674720)
chr7 (247-403)||(12193742-12193898)
chr7 (348-637)||(45146842-45147131)
chr7 (19-138)||(15340455-15340574)
chr7 (150-687)||(40790-41327)
chr7 (558-679)||(17924148-17924269)
chr7 (564-672)||(23641951-23642059)
chr7 (531-653)||(15171642-15171764)
chr7 (159-300)||(13378796-13378937)
chr7 (348-466)||(13353438-13353556)
chr7 (597-655)||(17144936-17144994)
[»] chr4 (63 HSPs)
chr4 (19-702)||(8386381-8387064)
chr4 (19-700)||(18297174-18297855)
chr4 (19-698)||(19778157-19778836)
chr4 (19-702)||(29038764-29039447)
chr4 (19-702)||(12476569-12477252)
chr4 (19-700)||(27711305-27711986)
chr4 (19-700)||(14303340-14304020)
chr4 (19-700)||(23955716-23956397)
chr4 (19-700)||(40473009-40473690)
chr4 (19-702)||(12523645-12524328)
chr4 (19-700)||(8052985-8053666)
chr4 (19-702)||(14680536-14681219)
chr4 (19-593)||(14266368-14266942)
chr4 (19-697)||(16251810-16252488)
chr4 (19-700)||(18226808-18227489)
chr4 (19-691)||(16354816-16355488)
chr4 (19-694)||(7090402-7091076)
chr4 (19-691)||(14850737-14851409)
chr4 (189-694)||(1639793-1640298)
chr4 (323-697)||(15147249-15147623)
chr4 (19-513)||(14159461-14159955)
chr4 (19-691)||(15002995-15003667)
chr4 (19-496)||(14652277-14652754)
chr4 (210-691)||(8706078-8706559)
chr4 (19-691)||(1648908-1649580)
chr4 (19-691)||(15245893-15246565)
chr4 (190-691)||(15414657-15415158)
chr4 (19-688)||(3264428-3265097)
chr4 (19-688)||(11206865-11207534)
chr4 (19-688)||(29453171-29453840)
chr4 (19-691)||(33222887-33223564)
chr4 (19-328)||(15149740-15150049)
chr4 (19-244)||(15364355-15364580)
chr4 (117-691)||(15358721-15359295)
chr4 (126-691)||(27900462-27901027)
chr4 (19-691)||(20890952-20891623)
chr4 (240-691)||(15077825-15078276)
chr4 (19-595)||(16145881-16146459)
chr4 (19-688)||(44661500-44662169)
chr4 (19-499)||(15070382-15070862)
chr4 (501-691)||(14691353-14691543)
chr4 (19-505)||(51605998-51606484)
chr4 (185-348)||(16676417-16676580)
chr4 (550-691)||(14159970-14160111)
chr4 (219-637)||(13247814-13248232)
chr4 (540-691)||(15319641-15319792)
chr4 (144-679)||(14997410-14997945)
chr4 (144-679)||(9290929-9291464)
chr4 (19-170)||(14927151-14927302)
chr4 (144-466)||(15293013-15293335)
chr4 (144-466)||(55375214-55375536)
chr4 (126-283)||(16752669-16752826)
chr4 (157-434)||(12132298-12132574)
chr4 (19-250)||(42702872-42703103)
chr4 (217-637)||(12342548-12342968)
chr4 (37-179)||(18164332-18164474)
chr4 (19-69)||(18607823-18607873)
chr4 (144-300)||(16445234-16445390)
chr4 (548-688)||(18549694-18549834)
chr4 (19-87)||(15415214-15415282)
chr4 (354-466)||(16685557-16685669)
chr4 (552-591)||(15423974-15424013)
chr4 (318-433)||(18549949-18550064)
[»] chr8 (71 HSPs)
chr8 (19-700)||(19112725-19113406)
chr8 (19-698)||(17674090-17674769)
chr8 (19-661)||(19484974-19485616)
chr8 (19-650)||(20017865-20018496)
chr8 (19-700)||(22120239-22120920)
chr8 (19-700)||(30313209-30313890)
chr8 (19-681)||(15533415-15534077)
chr8 (19-700)||(32600179-32600860)
chr8 (19-679)||(22133127-22133787)
chr8 (19-700)||(22046408-22047089)
chr8 (22-679)||(16408131-16408788)
chr8 (19-700)||(19978002-19978683)
chr8 (19-679)||(22164278-22164937)
chr8 (27-697)||(21166606-21167275)
chr8 (19-691)||(23650076-23650748)
chr8 (19-691)||(21921809-21922481)
chr8 (19-691)||(21250977-21251648)
chr8 (19-691)||(21788433-21789104)
chr8 (19-691)||(21393939-21394611)
chr8 (260-700)||(18856853-18857293)
chr8 (19-691)||(22987236-22987903)
chr8 (287-700)||(22040162-22040575)
chr8 (139-691)||(22377528-22378079)
chr8 (139-691)||(22383703-22384254)
chr8 (22-691)||(20396199-20396868)
chr8 (19-679)||(20388134-20388794)
chr8 (222-689)||(23949158-23949624)
chr8 (21-679)||(19851448-19852106)
chr8 (21-679)||(19857484-19858142)
chr8 (19-691)||(1266274-1266945)
chr8 (19-691)||(23654962-23655634)
chr8 (19-691)||(31416548-31417220)
chr8 (19-691)||(22061507-22062179)
chr8 (19-691)||(29303500-29304172)
chr8 (19-691)||(20009974-20010646)
chr8 (19-688)||(14565177-14565846)
chr8 (19-691)||(21840452-21841124)
chr8 (19-688)||(6679146-6679815)
chr8 (19-690)||(31570917-31571588)
chr8 (19-688)||(803750-804419)
chr8 (19-688)||(6603693-6604362)
chr8 (19-688)||(12304793-12305462)
chr8 (129-690)||(22051008-22051569)
chr8 (354-691)||(20975725-20976062)
chr8 (19-291)||(22032067-22032339)
chr8 (351-688)||(16271301-16271638)
chr8 (18-379)||(21681856-21682217)
chr8 (19-397)||(20007885-20008263)
chr8 (19-370)||(21324804-21325156)
chr8 (19-257)||(23948924-23949162)
chr8 (19-223)||(15441216-15441420)
chr8 (415-691)||(22371371-22371647)
chr8 (471-688)||(27355035-27355252)
chr8 (144-679)||(16877181-16877716)
chr8 (157-679)||(22315364-22315886)
chr8 (144-679)||(21196588-21197123)
chr8 (19-256)||(16265127-16265364)
chr8 (573-700)||(22129005-22129132)
chr8 (144-679)||(21850423-21850958)
chr8 (144-463)||(20652635-20652954)
chr8 (144-679)||(22982596-22983128)
chr8 (19-259)||(28982392-28982632)
chr8 (19-259)||(28987612-28987852)
chr8 (348-679)||(23157098-23157428)
chr8 (19-194)||(27347261-27347436)
chr8 (654-699)||(19484130-19484175)
chr8 (530-679)||(23900822-23900971)
chr8 (567-693)||(19863639-19863765)
chr8 (567-693)||(19868276-19868402)
chr8 (150-433)||(19863223-19863506)
chr8 (150-433)||(19867860-19868143)
[»] scaffold0459 (1 HSPs)
scaffold0459 (19-700)||(414-1095)
[»] scaffold0028 (6 HSPs)
scaffold0028 (19-702)||(43154-43837)
scaffold0028 (19-700)||(8485-9155)
scaffold0028 (313-700)||(15241-15617)
scaffold0028 (54-691)||(50148-50785)
scaffold0028 (185-316)||(13832-13963)
scaffold0028 (144-672)||(106226-106754)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (19-700)||(620-1301)
scaffold0044 (19-700)||(14360-15041)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (19-700)||(6937-7620)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (19-700)||(7377-8047)
[»] scaffold0042 (3 HSPs)
scaffold0042 (19-700)||(65405-66086)
scaffold0042 (238-679)||(39466-39906)
scaffold0042 (19-188)||(39926-40095)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (19-700)||(33198-33879)
scaffold0109 (19-700)||(8596-9277)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (19-700)||(4030-4711)
[»] scaffold0005 (4 HSPs)
scaffold0005 (19-697)||(278458-279136)
scaffold0005 (19-341)||(308659-308981)
scaffold0005 (19-496)||(164538-165015)
scaffold0005 (19-690)||(260308-260979)
[»] scaffold0403 (2 HSPs)
scaffold0403 (19-691)||(6372-7044)
scaffold0403 (381-686)||(3153-3458)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (141-700)||(7519-8078)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (83-700)||(7854-8471)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (19-691)||(6023-6695)
scaffold0120 (19-691)||(1158-1830)
scaffold0120 (144-405)||(22819-23080)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (19-697)||(63659-64337)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (19-696)||(6014-6691)
[»] scaffold0284 (1 HSPs)
scaffold0284 (84-700)||(21932-22548)
[»] scaffold1355 (1 HSPs)
scaffold1355 (19-693)||(676-1350)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (19-697)||(451-1128)
[»] scaffold0106 (4 HSPs)
scaffold0106 (19-691)||(14039-14711)
scaffold0106 (237-700)||(17660-18122)
scaffold0106 (19-691)||(31410-32082)
scaffold0106 (623-691)||(18489-18557)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (19-691)||(328-999)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (27-691)||(5229-5893)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (19-691)||(9343-10015)
[»] scaffold0012 (3 HSPs)
scaffold0012 (19-691)||(229043-229715)
scaffold0012 (19-691)||(219051-219723)
scaffold0012 (144-655)||(32667-33176)
[»] scaffold0081 (3 HSPs)
scaffold0081 (32-691)||(49506-50165)
scaffold0081 (538-697)||(19121-19280)
scaffold0081 (597-697)||(34604-34704)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (19-697)||(180217-180877)
scaffold0020 (413-691)||(101186-101464)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (19-691)||(14713-15385)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (19-691)||(32387-33058)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (270-700)||(12738-13168)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (19-691)||(25353-26025)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (19-691)||(14877-15549)
scaffold0040 (459-691)||(113121-113353)
[»] scaffold0011 (6 HSPs)
scaffold0011 (19-691)||(26167-26839)
scaffold0011 (19-691)||(195338-196008)
scaffold0011 (19-687)||(148570-149238)
scaffold0011 (19-188)||(68577-68746)
scaffold0011 (144-434)||(121841-122131)
scaffold0011 (246-466)||(180151-180371)
[»] scaffold0004 (5 HSPs)
scaffold0004 (19-691)||(112021-112693)
scaffold0004 (19-691)||(203102-203774)
scaffold0004 (19-691)||(117568-118240)
scaffold0004 (19-691)||(322704-323376)
scaffold0004 (19-691)||(385819-386491)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (19-691)||(908-1580)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (19-679)||(1005-1659)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (19-687)||(4032-4699)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (19-691)||(3140-3812)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (19-613)||(126911-127505)
scaffold0022 (500-691)||(80128-80319)
[»] scaffold0894 (2 HSPs)
scaffold0894 (19-568)||(1139-1688)
scaffold0894 (559-691)||(2914-3046)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (19-691)||(116539-117211)
scaffold0037 (144-616)||(98140-98612)
[»] scaffold0507 (3 HSPs)
scaffold0507 (96-691)||(9047-9642)
scaffold0507 (144-307)||(351-514)
scaffold0507 (348-463)||(216-331)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (196-691)||(15832-16327)
scaffold0333 (19-356)||(15493-15829)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (19-691)||(16050-16722)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (19-694)||(24702-25377)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (120-477)||(628-985)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (20-669)||(12633-13282)
[»] scaffold0730 (1 HSPs)
scaffold0730 (19-691)||(5225-5896)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (306-679)||(6336-6709)
scaffold0358 (19-79)||(6273-6333)
[»] scaffold0023 (7 HSPs)
scaffold0023 (218-694)||(4085-4561)
scaffold0023 (403-691)||(130532-130820)
scaffold0023 (237-691)||(58972-59426)
scaffold0023 (541-697)||(29008-29163)
scaffold0023 (403-505)||(134626-134728)
scaffold0023 (33-183)||(4567-4717)
scaffold0023 (19-97)||(36974-37052)
[»] scaffold0600 (1 HSPs)
scaffold0600 (19-691)||(3875-4547)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (333-691)||(10-368)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (19-640)||(10425-11045)
[»] scaffold0001 (8 HSPs)
scaffold0001 (19-691)||(90566-91238)
scaffold0001 (20-475)||(448060-448515)
scaffold0001 (459-691)||(390834-391066)
scaffold0001 (19-282)||(162113-162376)
scaffold0001 (381-634)||(114542-114795)
scaffold0001 (117-187)||(175361-175431)
scaffold0001 (606-691)||(89888-89973)
scaffold0001 (144-288)||(78666-78810)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (19-688)||(41970-42639)
scaffold0010 (19-691)||(47033-47705)
scaffold0010 (438-687)||(2340-2589)
[»] scaffold0298 (3 HSPs)
scaffold0298 (19-691)||(19983-20655)
scaffold0298 (19-691)||(12995-13667)
scaffold0298 (19-691)||(16765-17437)
[»] scaffold0739 (1 HSPs)
scaffold0739 (19-492)||(2-475)
[»] scaffold0139 (3 HSPs)
scaffold0139 (19-661)||(27519-28161)
scaffold0139 (19-687)||(787-1454)
scaffold0139 (537-661)||(34290-34414)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (19-691)||(6670-7342)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (19-691)||(9798-10465)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (19-691)||(33311-33983)
scaffold0076 (144-679)||(40383-40918)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (19-691)||(47124-47796)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (19-691)||(51497-52169)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (19-691)||(13535-14207)
scaffold0034 (54-691)||(4587-5224)
scaffold0034 (546-691)||(67897-68042)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (29-691)||(4760-5422)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (342-691)||(7963-8311)
[»] scaffold0348 (1 HSPs)
scaffold0348 (19-691)||(6183-6856)
[»] scaffold0319 (1 HSPs)
scaffold0319 (306-691)||(1552-1937)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (19-691)||(27226-27897)
[»] scaffold0192 (2 HSPs)
scaffold0192 (19-691)||(26142-26814)
scaffold0192 (357-691)||(26862-27196)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (19-691)||(48841-49513)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (19-691)||(248613-249285)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (19-482)||(16987-17450)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (19-691)||(28402-29075)
scaffold0064 (19-691)||(40393-41066)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (322-571)||(46531-46780)
scaffold0007 (19-681)||(86154-86810)
[»] scaffold0326 (1 HSPs)
scaffold0326 (19-691)||(18171-18843)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (19-691)||(39739-40410)
[»] scaffold0067 (3 HSPs)
scaffold0067 (19-691)||(60848-61519)
scaffold0067 (19-691)||(67236-67907)
scaffold0067 (19-691)||(51814-52485)
[»] scaffold0483 (2 HSPs)
scaffold0483 (19-626)||(9782-10389)
scaffold0483 (585-691)||(12060-12166)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (20-691)||(42784-43455)
[»] scaffold0235 (4 HSPs)
scaffold0235 (19-691)||(21305-21977)
scaffold0235 (219-466)||(26006-26253)
scaffold0235 (501-637)||(26288-26424)
scaffold0235 (618-691)||(11091-11164)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (19-691)||(19120-19792)
scaffold0058 (63-283)||(58448-58668)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (19-691)||(528-1200)
scaffold0104 (624-691)||(12582-12649)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (19-678)||(37202-37861)
scaffold0026 (117-395)||(38103-38382)
scaffold0026 (117-277)||(27385-27545)
[»] scaffold0017 (2 HSPs)
scaffold0017 (399-697)||(197106-197404)
scaffold0017 (348-466)||(21927-22045)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (19-691)||(98-770)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (19-691)||(2751-3423)
scaffold0035 (567-688)||(12833-12954)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (19-691)||(48668-49339)
scaffold0053 (19-631)||(57511-58122)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (19-688)||(16350-17019)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (19-691)||(6872-7542)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (54-415)||(16375-16736)
scaffold0138 (618-691)||(8721-8794)
[»] scaffold0124 (3 HSPs)
scaffold0124 (19-691)||(38-705)
scaffold0124 (19-691)||(10888-11560)
scaffold0124 (144-679)||(7456-7991)
[»] scaffold0761 (2 HSPs)
scaffold0761 (459-697)||(4727-4965)
scaffold0761 (144-679)||(32-567)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (133-691)||(1908-2466)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (54-679)||(18884-19509)
scaffold0090 (117-679)||(23109-23671)
[»] scaffold0114 (4 HSPs)
scaffold0114 (19-691)||(43505-44177)
scaffold0114 (19-691)||(44517-45189)
scaffold0114 (19-634)||(20122-20737)
scaffold0114 (19-184)||(36055-36220)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (19-691)||(26261-26933)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (150-691)||(1-541)
[»] scaffold0518 (1 HSPs)
scaffold0518 (115-691)||(10865-11441)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (19-679)||(25511-26171)
scaffold0113 (19-283)||(16676-16940)
[»] scaffold0375 (2 HSPs)
scaffold0375 (450-697)||(3442-3689)
scaffold0375 (234-350)||(3694-3810)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (19-690)||(12420-13087)
[»] scaffold0742 (1 HSPs)
scaffold0742 (115-691)||(5309-5885)
[»] scaffold0324 (2 HSPs)
scaffold0324 (451-691)||(19636-19876)
scaffold0324 (19-204)||(16957-17142)
[»] scaffold0203 (2 HSPs)
scaffold0203 (19-582)||(13994-14557)
scaffold0203 (19-163)||(9039-9183)
[»] scaffold1001 (1 HSPs)
scaffold1001 (349-615)||(1-267)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (19-483)||(5756-6219)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (411-691)||(18839-19119)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (237-688)||(2992-3443)
scaffold0222 (19-106)||(3487-3574)
[»] scaffold0877 (1 HSPs)
scaffold0877 (19-379)||(206-566)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (509-691)||(25464-25646)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (234-691)||(5086-5543)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (174-679)||(880-1385)
[»] scaffold0198 (2 HSPs)
scaffold0198 (19-283)||(27967-28231)
scaffold0198 (618-697)||(24097-24176)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (19-277)||(30-288)
[»] scaffold0149 (3 HSPs)
scaffold0149 (462-691)||(11302-11531)
scaffold0149 (471-691)||(6871-7091)
scaffold0149 (19-198)||(13380-13559)
[»] scaffold0232 (1 HSPs)
scaffold0232 (450-691)||(2509-2750)
[»] scaffold1710 (2 HSPs)
scaffold1710 (216-653)||(86-523)
scaffold1710 (144-289)||(946-1091)
[»] scaffold0682 (2 HSPs)
scaffold0682 (19-300)||(191-472)
scaffold0682 (606-691)||(470-555)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (355-691)||(5969-6307)
[»] scaffold0323 (1 HSPs)
scaffold0323 (396-678)||(4945-5227)
[»] scaffold0621 (1 HSPs)
scaffold0621 (540-691)||(1988-2139)
[»] scaffold0249 (2 HSPs)
scaffold0249 (19-415)||(4912-5308)
scaffold0249 (410-679)||(1618-1887)
[»] scaffold0924 (1 HSPs)
scaffold0924 (19-409)||(3891-4281)
[»] scaffold0126 (2 HSPs)
scaffold0126 (450-691)||(41350-41589)
scaffold0126 (19-106)||(45845-45932)
[»] scaffold0069 (1 HSPs)
scaffold0069 (19-451)||(38761-39193)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (19-283)||(1211-1475)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (144-679)||(46279-46814)
scaffold0066 (489-691)||(68225-68427)
[»] scaffold0574 (2 HSPs)
scaffold0574 (537-690)||(844-997)
scaffold0574 (19-247)||(4217-4445)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (19-283)||(14086-14349)
scaffold0266 (489-679)||(9507-9697)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (144-679)||(23519-24054)
[»] scaffold0165 (2 HSPs)
scaffold0165 (473-691)||(4884-5102)
scaffold0165 (19-227)||(1177-1385)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (348-679)||(7497-7828)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (573-691)||(4425-4543)
scaffold0270 (573-691)||(11555-11673)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (144-679)||(14383-14918)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (451-691)||(32953-33193)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (144-679)||(3284-3818)
[»] scaffold0244 (2 HSPs)
scaffold0244 (537-652)||(17877-17992)
scaffold0244 (219-523)||(25959-26263)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (144-679)||(13033-13568)
[»] scaffold0808 (2 HSPs)
scaffold0808 (157-466)||(913-1222)
scaffold0808 (552-679)||(700-827)
[»] scaffold0145 (1 HSPs)
scaffold0145 (606-691)||(39645-39730)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (144-679)||(3521-4056)
[»] scaffold0021 (4 HSPs)
scaffold0021 (246-465)||(71446-71665)
scaffold0021 (564-679)||(33059-33174)
scaffold0021 (165-300)||(13397-13532)
scaffold0021 (585-679)||(24529-24623)
[»] scaffold0019 (2 HSPs)
scaffold0019 (19-178)||(136119-136278)
scaffold0019 (387-499)||(136278-136390)
[»] scaffold1032 (1 HSPs)
scaffold1032 (19-168)||(2023-2172)
[»] scaffold0357 (1 HSPs)
scaffold0357 (157-434)||(14661-14938)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (144-679)||(24005-24540)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (219-456)||(1293-1530)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (144-679)||(27912-28447)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (564-687)||(81470-81593)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (192-679)||(3590-4077)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (157-466)||(9125-9434)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (144-679)||(14782-15316)
scaffold0132 (219-679)||(43738-44198)
[»] scaffold0305 (2 HSPs)
scaffold0305 (530-672)||(11167-11309)
scaffold0305 (348-434)||(10985-11071)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (217-468)||(8748-8999)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (537-679)||(5693-5835)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (509-679)||(18541-18711)
[»] scaffold0447 (2 HSPs)
scaffold0447 (157-289)||(5879-6011)
scaffold0447 (157-289)||(10493-10625)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (360-679)||(14478-14798)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (157-289)||(8488-8620)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (500-679)||(3565-3744)
[»] scaffold0876 (1 HSPs)
scaffold0876 (360-464)||(2897-3001)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (387-466)||(17-96)
[»] scaffold1061 (1 HSPs)
scaffold1061 (618-691)||(2187-2260)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 604; Significance: 0; HSPs: 83)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 604; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 702
Target Start/End: Original strand, 27187269 - 27187952
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27187269 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgctgcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaaaat 27187368  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27187369 ctgatatggaccaatgaatttcggggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 27187468  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27187469 ttaaattcaagatcttttcttcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctcggatcatctgaactttctcagtagttt 27187568  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  27187569 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagtcctgcatctccgaccatacagagcctcgaacggtgccat 27187668  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27187669 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 27187768  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27187769 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 27187868  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  27187869 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctccttgatgt 27187952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 604; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 27261971 - 27261288
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27261971 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgctgcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaaaat 27261872  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27261871 ctgatatggaccaatgaatttcggggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 27261772  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27261771 ttaaattcaagatcttttcttcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctcggatcatctgaactttctcagtagttt 27261672  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  27261671 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagtcctgcatctccgaccatacagagcctcgaacggtgccat 27261572  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27261571 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 27261472  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27261471 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 27261372  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  27261371 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctccttgatgt 27261288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 580; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 28292820 - 28292137
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  28292820 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaaaat 28292721  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28292720 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttaacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 28292621  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    | ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28292620 ttaaattcaagatcttttctacacttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctcggatcatctgaactttctcagtagttt 28292521  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28292520 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccat 28292421  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28292420 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaatggaagatgactgtccgaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaataaa 28292321  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  28292320 tcctctagtgactgaattgtcctctccaactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 28292221  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  28292220 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctctttgatgt 28292137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 576; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 28263645 - 28262962
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||    
T  28263645 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaatat 28263546  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28263545 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 28263446  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28263445 ttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctcggatcatctgaactttctcagtagttt 28263346  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28263345 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatatccgaccatataaagcctcgaaaggtgccat 28263246  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28263245 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactgtcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaataaa 28263146  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28263145 tcctctagtgactgaattgtcctctccgactgaccatccgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 28263046  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| || |||||||    
T  28263045 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcaaaatctctttgatgt 28262962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 576; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 28342394 - 28341711
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||    
T  28342394 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaatat 28342295  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28342294 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 28342195  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28342194 ttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctcggatcatctgaactttctcagtagttt 28342095  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28342094 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatatccgaccatataaagcctcgaaaggtgccat 28341995  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28341994 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactgtcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaataaa 28341895  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28341894 tcctctagtgactgaattgtcctctccgactgaccatccgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 28341795  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| || |||||||    
T  28341794 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcaaaatctctttgatgt 28341711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 574; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 24313616 - 24312935
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  24313616 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 24313517  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  24313516 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 24313417  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    || |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24313416 tggaactcaagatctttcctatgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 24313317  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24313316 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 24313217  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24313216 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactgtcccaagttcctccttgttcaagaacacaaattctcaacaaa 24313117  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  24313116 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 24313017  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 700  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  24313016 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 24312935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 566; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 29592368 - 29591687
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  29592368 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 29592269  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  29592268 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 29592169  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29592168 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 29592069  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  29592068 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 29591969  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29591968 tccaatactagaatgataactattattatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcgagaacacaaattctcaacaaa 29591869  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  29591868 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcactctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 29591769  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 700  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  29591768 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaagggacaccatgcaacttcacaatctccttgat 29591687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 564; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 1543532 - 1542849
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  1543532 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 1543433  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1543432 ctgatacagaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgccctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcc 1543333  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  1543332 tgaaactcaagatcttttctgcgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgggacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagttt 1543233  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1543232 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttatgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccat 1543133  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1543132 tccaatactagaatgatagctattattgtaagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagctcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 1543033  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1543032 tcctctagtgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 1542933  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||    
T  1542932 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttaatgt 1542849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 562; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 2875251 - 2874570
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  2875251 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccactgttccaactctttccaatat 2875152  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||     
T  2875151 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttatttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaactcgtggtctccttct 2875052  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2875051 tgaaactcaaaatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttcattttctcttggatcatccgaactttctcagtagttt 2874952  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2874951 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacccgactcaaaccagcacaacggggttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccat 2874852  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2874851 tccaatacttgaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 2874752  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2874751 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 2874652  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 700  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||    
T  2874651 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaagttcacaatctccttgat 2874570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 558; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 16627165 - 16626484
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  16627165 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 16627066  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  16627065 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 16626966  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16626965 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcaatagttt 16626866  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16626865 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 16626766  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16626765 tccaatactagaatggtaactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattttcaacaaa 16626666  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  16626665 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcatctttgaacccaaggcctcttgcaaacttt 16626566  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 700  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  16626565 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 16626484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 554; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 700
Target Start/End: Original strand, 25112385 - 25113066
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||    
T  25112385 catacttctgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccgactctttccaatat 25112484  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25112485 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcagcttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcc 25112584  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25112585 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataagtcttttgtcgactctgcgacgctttaattttctcttgaatcatctgaactttctcagtagttt 25112684  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  25112685 gctgaacgatcgctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcataacggaattctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccat 25112784  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25112785 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaatcctcaacaaa 25112884  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  25112885 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataggccgaacttaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaactct 25112984  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 700  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  25112985 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 25113066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 458; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 5839667 - 5838986
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||    
T  5839667 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgtaaattcgaaagatgcggtggtaaaccaactcgatacgccactgttccaactctttccgatat 5839568  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||     
T  5839567 ctgatacggaccaataaacttcgaagtcaacttcttagacttcaacgcacgtcctacacctgtcataggagtgactctcaaaaacgtgtggtctccttct 5839468  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||| |    
T  5839467 tgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcattttctcttaaatcatcttgactttctctgtagtct 5839368  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  5839367 gctgaacaatctctggtcctaagaccaccctatctcctgattcaaaccaacacaacgaagttctacatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgtcat 5839268  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  5839267 tccaatgctagaatgataactattattatacgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccctgctcaagaacacaaactctcaacaaa 5839168  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  5839167 tcctctaacgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactct 5839068  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 700  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  5839067 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctaactgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatttccttgat 5838986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 447; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 697
Target Start/End: Original strand, 19864520 - 19865198
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || ||||  | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||| | ||    
T  19864520 catacttctgaagttgcgacacatgaaagacatcatacaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaaatctttccgatat 19864619  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||     
T  19864620 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacatccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacacgtggtctccttct 19864719  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |    
T  19864720 tgaaactcaagatcttttctgcacttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtct 19864819  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  19864820 gctgaccaatctctggtcctaagaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagccgcaaaaggtgccat 19864919  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  19864920 tccaataccaaaatgataactattattatacgtgaactcaatcaacggaagatgactagcccaggttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaa 19865019  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  19865020 tcctctagcgactgaatcgtcctatccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactct 19865119  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 697  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  19865120 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgtaggaacaccatgaaacttcacaatctcctt 19865198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 434; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 688
Target Start/End: Complemental strand, 25610309 - 25609640
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  25610309 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgcgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccaacacgatacgccaccgttccaactctttccgatat 25610210  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    || ||| |||||||| ||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||     
T  25610209 ctaatacggaccaataaatctcggaatcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccggtcacaggtgtgactctcaaaaacatgtggtctccttct 25610110  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||    
T  25610109 tgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgtgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagttt 25610010  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  25610009 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaatggagttctgcatctccgaccatacaaagcatcataaggtgccat 25609910  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  25609909 tccaatactagaatgataactattattgtacgtgaactttatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaa 25609810  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    || |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  25609809 tcttctaacgactgaatcgtcctttccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttt 25609710  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 688  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  25609709 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatggtcgaaggaacaccatgcaacttcac 25609640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 409; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 27331881 - 27331209
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||  | ||    
T  27331881 catacttccgaagttgcgacacatcaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaactctttctgatat 27331782  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| || |||||     
T  27331781 ctgatatggaccaataaatctcggagtcaacttcctttacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtgatccccttct 27331682  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  27331681 tgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcaactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcattttaactttctcagtagttt 27331582  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | |||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  27331581 gttgaacattctcgggtcctaaaaccaccctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccat 27331482  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||     
T  27331481 tccaatactagaatgataactattattgtacatgaacactatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagcacacaaaccctcaacaag 27331382  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  27331381 tcctctagcgactgaatcgtcctctctgacagaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaactcaaagcctcttgcaaacttt 27331282  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||    
T  27331281 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatactcgaaagaacaccatgcaacttcacaat 27331209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 409; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 27392621 - 27391949
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||  | ||    
T  27392621 catacttccgaagttgcgacacatcaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaactctttctgatat 27392522  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| || |||||     
T  27392521 ctgatatggaccaataaatctcggagtcaacttcctttacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtgatccccttct 27392422  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  27392421 tgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcaactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcattttaactttctcagtagttt 27392322  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | |||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  27392321 gttgaacattctcgggtcctaaaaccaccctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccat 27392222  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||     
T  27392221 tccaatactagaatgataactattattgtacatgaacactatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagcacacaaaccctcaacaag 27392122  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  27392121 tcctctagcgactgaatcgtcctctctgacagaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaactcaaagcctcttgcaaacttt 27392022  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||    
T  27392021 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatactcgaaagaacaccatgcaacttcacaat 27391949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 405; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 16928088 - 16927416
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | || |||| |||||||||||||||| ||||| || |  ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||    
T  16928088 catactttcgaagttgcgacacatgtaatatatcgtgcgaattcgaaagatgcggtggtaatccaagacgatacgccaccgttccaactctttccaatat 16927989  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||     
T  16927988 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacactagtcacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 16927889  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| || ||||| |||||||  |||||| | ||||| |    
T  16927888 tgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttttcgactctgcggcgctttcatcttttcttgaatcatctttactttccctgtagtct 16927789  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16927788 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccat 16927689  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||  ||||||| || |||||||| |||||||||    
T  16927688 tccaatactagaatgatagctattgttatacgtgaactctattaacgggagatgactgtcccaagttccagcttgctctagcacacaaatcctcaacaaa 16927589  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |  || |||||||||||||||||||    
T  16927588 tcctctaacgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttggtacctaaagcctcttgcaaacttt 16927489  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||    
T  16927488 tccaaaatctagaagtaaatctcgggtctctatttgatacaatgctcgaaggaataccatgcaacttcacaat 16927416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 402; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 18408391 - 18407718
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  18408391 catactttcgaagttgcgacacatgaaacacatagtgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccacccgatacgccaccgttccaactctttccgatat 18408292  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | || | ||||||||||| ||||||||| ||||     
T  18408291 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacacgagttactctcaaaaatacgtggtcttcttct 18408192  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||| ||| ||||| |||||||    
T  18408191 tgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactattttgtcgactctacgacgctttcatcttctcttgaattatcttaaccttctcggtagttt 18408092  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  18408091 gttgaacaatctctggtcctaataccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcataaggtgccat 18407992  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctatta-ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 517  Q
    |||||||||||||||||| ||| || || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  18407991 tccaatactagaatgataactagtatttgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaa 18407892  T
Q  518 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 617  Q
    ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  18407891 atcttctaacgactgaatcgtcctctccgactgaccctctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactt 18407792  T
Q  618 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  18407791 ttccaaaatctagacgtaaaccttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 18407718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 402; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 22079136 - 22078478
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| | ||    
T  22079136 catacttccgaagttgctacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccgtaccaactctttccgatat 22079037  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||| ||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||     
T  22079036 ctgatacggacgaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccaatcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttct 22078937  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||| | ||||||| ||| |||||||| ||||    
T  22078936 tgaaactcaagatctttcctaagcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttcatcttttctggaatcatcttaaccttctcagtggttt 22078837  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  22078836 gttgaacaatctctagtcctaagaccactttttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccat 22078737  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||| || |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| | ||||||||    
T  22078736 tccaatactagaa--ataactattattgtacgtgaactttatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcgagttcacaaactttcaacaaa 22078639  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    || || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  22078638 tcttccagcgactgaatcgtcctctccgactaaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagagcctaaagcctcttgcaaacttt 22078539  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 679  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22078538 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacgatgctcgaaggaacaccatg 22078478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 401; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 16963815 - 16963155
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||| |||||||||| ||||| | ||    
T  16963815 catactttcgaagttgcgacacatgtaatacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaacacgatacgccatcgttccaactatttccgatat 16963716  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    ||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||     
T  16963715 ctgatatggaccaataaatctcggagtcaacttcttttacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacttggtctccttct 16963616  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||  |||||||| ||||| |    
T  16963615 tgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatctttactttctctgtagtct 16963516  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16963515 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgactcaaatcaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccat 16963416  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||| | |||||||| || |||||||| || ||||||    
T  16963415 tccaatactagaatgatagctattgttagacgtgaactctattaacgggagatgactgtcccaagtttcaccttgctctagcacacaaatccttaacaaa 16963316  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |  || |||||||||||||||||||    
T  16963315 ttctctaacgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgctgaactcaacctcaacttggtacctaaagcctcttgcaaacttt 16963216  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 679  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16963215 tccaaaatctagaagtaaatctcgggtctctatctgatataatgctcgaaggaacaccatg 16963155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 22762903 - 22762231
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||| | ||    
T  22762903 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacaaagtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccacttgatacgccatcgttccaactctttccgatat 22762804  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||  |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||     
T  22762803 ctgattcggaccaataaatctcggggtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcacaaatacgtggtctccttct 22762704  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| ||||  ||||||| ||||||||||| |||  | ||||| |||||||| ||||||| ||| |||| |||| |||    
T  22762703 tgaaactcaagatctgtcctacgcttatcattgtaactctattgtcgactctccgaaactttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaattt 22762604  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  22762603 gttgaacaatctctggtcctaagactactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagtctcgtaaggtgccat 22762504  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  22762503 tccaatactagaatgataactattattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatctcaagttcctccttcctcaagtacacaaactctcaacaaa 22762404  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    || |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||| |||||||||    
T  22762403 tcttctaacgactgaatcgtcctctccgactaaccatcagtttgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttataacctaaagcctctggcaaacttt 22762304  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  22762303 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 22762231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Original strand, 23078302 - 23078974
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || || |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||| | ||    
T  23078302 catacttccgaagttgcgatacatgtaatacttcttgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccgtttaaactctttccgatat 23078401  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| | || ||| ||  |||| |||||||||||||||||||| || || || |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||     
T  23078402 ctgatacgaacaaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgcccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtgatctccctct 23078501  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  23078502 tgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgagtctgcgatgctttcatcttttcttgaatcatcttaactttctcagtagttt 23078601  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  23078602 gttgaacaatttctggtcctaaaaccacactctcacctgactcaaaccaacacaacggagttatgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccat 23078701  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  23078702 tccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctataaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaag 23078801  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |  || | ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||  | || |||| |||||| ||||| |    
T  23078802 tattccaacgactgaatcgttctctccgactgaccatctctctgcggacgatacgccgaactcaacctcaacttataacctaaagactcttgtaaactct 23078901  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23078902 tcaaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaat 23078974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 486
Target Start/End: Original strand, 12497859 - 12498326
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  12497859 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 12497958  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    ||| || |||||||| ||  |||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| | || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12497959 ctgttacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgaattcaaggcacgtccaacaccggtcacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 12498058  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  12498059 tgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagttt 12498158  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  12498159 gttgaacaatctcgggtcctaagaccattctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgtcat 12498258  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttc 486  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12498259 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttc 12498326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 12511042 - 12510575
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  12511042 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 12510943  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    ||| || |||||||| ||  |||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| | || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12510942 ctgttacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgaattcaaggcacgtccaacaccggtcacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 12510843  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  12510842 tgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagttt 12510743  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  12510742 gttgaacaatctcgggtcctaagaccattctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgtcat 12510643  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttc 486  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12510642 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttc 12510575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 246 - 695
Target Start/End: Original strand, 22433929 - 22434378
Alignment:
Q  246 tcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagacca 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22433929 tcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagacca 22434028  T
Q  346 ctctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattatt 445  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  22434029 ctctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactgttatt 22434128  T
Q  446 ataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctcc 545  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||    
T  22434129 gtaagtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctctttgctcaagtacacaaaccctcaacaaatcttctaacgacttaatcgtcctctcc 22434228  T
Q  546 gactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggat 645  Q
    |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  22434229 gactaatcatctgtctgcggatgatacgctgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatccagaagtaaatcttggat 22434328  T
Q  646 ctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 695  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||    
T  22434329 ctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcactatttcc 22434378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 19 - 486
Target Start/End: Original strand, 12505188 - 12505655
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  12505188 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgaaaaatcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 12505287  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    ||| || |||||||| ||  |||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| | || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12505288 ctgttacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgaattcaaggcacgtccaacaccggtcacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 12505387  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |    
T  12505388 tgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatattctcttgaatcatcttaacattctcagtagtat 12505487  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| |||    
T  12505488 gatgaacaatctcgggtcctaagaccaatctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataaaaaacctcaaaaggtgacat 12505587  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttc 486  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12505588 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttc 12505655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 19 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 25765737 - 25765312
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||| | ||    
T  25765737 catacttccaaagttacgacacatggaacacatcgtgcaagttcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacaccaccgttccaactctttccgatat 25765638  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    ||||||  ||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||   |||||||||||| |||||||||||||||     
T  25765637 ctgatacagaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacagcg-tgactctcaaaagcacgtggtctccttct 25765539  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| |    
T  25765538 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctacgacgctttcattttctcttgaatcatctttactttctcagtagtct 25765439  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25765438 gctgaacaatctctggtcctaagaccactttttcacctgactcaaaccaacacaatggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 25765339  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattatt 445  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||    
T  25765338 tccaatactagaatgataactattatt 25765312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Original strand, 25768024 - 25768696
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||| |||||||| || || ||||  |||||||| |||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||||||| | ||  | ||    
T  25768024 catacttccgaagctgcgacacgtgaaacacatcatgcaaattggaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaactctctcagatat 25768123  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    ||| || |||||||| ||||| |  ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||||| || ||||||||     
T  25768124 ctggtacggaccaataaactttgaagtcaatttcttagacttcaacgcacgtcctacacccgtcataagagtgactctcagaaacacatgatctccttct 25768223  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||   |||| ||  || ||||| |||||||    
T  25768224 tgaaactcaagatccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcaacttgaccttctccgtagttt 25768323  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | ||||| |  || ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  25768324 gatgaactaaatccggtccaaagaccacactttctcccgactcaaaccaacacaatggagtcctgcacctccgaccacacaaagcttcgaacggtgccat 25768423  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||||| ||||| || |  || || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||| | ||||    
T  25768424 accaatactcgaatggtaacagttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactcttagcaaa 25768523  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||| |  |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| |    
T  25768524 tcctcgaatgactgaatcgttttctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaactttgaacccaaggcatcttggaaactct 25768623  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||||||||| ||| |||| || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  25768624 tccaaaatcttgaattaaacctcggatctctatcggacacaatactcgatggaactccatgtaacttcacaat 25768696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Original strand, 21471434 - 21472106
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||||||| | ||  | ||    
T  21471434 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaactctctcagatat 21471533  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    ||| || ||| |||| |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||     
T  21471534 ctggtacggatcaataaacttcggagtcaacttcttagatttcaacgcacgtcctacccccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccttct 21471633  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||   || | ||  || ||||| ||||| |    
T  21471634 tgaaactcaagatcctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttattaacttgaccttctccgtagtct 21471733  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | ||||| |  || ||||| || ||  | ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  21471734 gatgaaccaaatccggtcccaacactgcactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagtcctgcacctccgtccatacaaagcttcgaacggtgccat 21471833  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||| |  ||     
T  21471834 accaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaaatgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactcttagaaag 21471933  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||  |||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |    
T  21471934 tcctctaatgactgaatagttctctcccactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaatctcaactttgaacccaaggcatcttgcaaactct 21472033  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    ||||||| || ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  21472034 tccaaaaccttgaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgatggaactccatgaaacttcacaat 21472106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 392 - 679
Target Start/End: Original strand, 17032589 - 17032876
Alignment:
Q  392 accatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcct 491  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||  |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17032589 accatataaagcttcaaaaggtgccattctgatactagaatgataactattagtgtaagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcct 17032688  T
Q  492 tgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaact 591  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  17032689 tgttcaagaacacaaattctcaacaaatcttctagcgactgaattgtcctttccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaact 17032788  T
Q  592 tcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 679  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17032789 tcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 17032876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Original strand, 19879131 - 19879803
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||||| |  || ||||||||||| || |  ||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||| ||||||||| | ||  | ||    
T  19879131 catacttccgcaactgtgacacatggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggtaaacccaccctataagccactgttccaactctctcagatat 19879230  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| | ||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||     
T  19879231 ctgatatgggccaataaactttggagtcaacttcttagatttcaatgcacggcctacacctgccataggagtgactctcaagaacacatgatctccctct 19879330  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| |  |||   || | || ||| || || |||||||    
T  19879331 tgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgaccctttcatctgttctcttattaacttaaccttttctgtagttt 19879430  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | ||||| || ||||| || || | ||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||| || || || ||||||||    
T  19879431 gttgaactatgtctggccccaacatcacactttctcccgattcaaaccaacacaaaggagttctgcaccttcgtccatacaatgcttcaaacggtgccat 19879530  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||| | |    
T  19879531 accaatactcgaatggtaactattgttgtaagtaaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacaccctcaataga 19879630  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||  || || || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  19879631 tcctctaaggattgtatcgtcctctctgactgtccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgagcccaaagcatcttgcaaactct 19879730  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  19879731 tccagaatctagatgtgaacctcggatctctatctgatacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaat 19879803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 54 - 688
Target Start/End: Original strand, 15459204 - 15459838
Alignment:
Q  54 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttct 153  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||     
T  15459204 tgcaaattcgaaagatgaggtggtaatcccactctatacgccacagttccaactctttctgaaatctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcc 15459303  T
Q  154 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgata 253  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | || |||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  15459304 tcgacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtaaccctcagaaaaacatggtcaccttcctgaaactcaagatctttcctacgcttgtcatggta 15459403  T
Q  254 actcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttca 353  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   ||||||   |||||||| ||||| |  ||||| |  || ||||| || || || |||||     
T  15459404 gctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctaatcatcctgactttctccgtagtctcgtgaaccaaatccggtcccaacacaacactttct 15459503  T
Q  354 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 453  Q
    || ||||||||||| || |  ||||| || || ||||||||||| ||||| || || |||||||| |||||||| |||||||| || ||||| || ||||    
T  15459504 cccgactcaaaccaacatagaggagtcctacacctccgaccatataaagcttcaaatggtgccataccaatacttgaatgataactgttattgtatgtga 15459603  T
Q  454 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 553  Q
    | || ||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| |  || |  ||||||||||  || || ||||||||||||||||||||    
T  15459604 attctatcaatggtagatgactatcccaagctccaccctgctcaagtacacatacccttagtaaatcctctaaagattggattgtcctctccgactgacc 15459703  T
Q  554 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 653  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || || ||||| || || || |||||  |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  15459704 atcagtctgcggatgataagccgaactcaacttcaattttgaacccaacgcgtcctgtaaactcctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatct 15459803  T
Q  654 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 688  Q
    || || || ||||| ||||||||||| | ||||||    
T  15459804 gacactatactcgacggaacaccatgcaacttcac 15459838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 65 - 691
Target Start/End: Original strand, 17415365 - 17415991
Alignment:
Q  65 aagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaa 164  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||| ||||| ||||||||  | ||  | |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||     
T  17415365 aagatgcggtggcaaacccactctatatgccactgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaat 17415464  T
Q  165 gcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtc 264  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||| || ||||| || |||||||||||  | |||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  17415465 gcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcataaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgccatggtaactcttctgtc 17415564  T
Q  265 gactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaa 364  Q
    |||||| |||||| ||||| || ||    |||||||  |||||||| ||||| || ||||| |  || ||||| || || || |||||  ||||||||||    
T  17415565 gactctacgacgctttcatcttttcccttatcatcttgactttctctgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactttcttctgactcaaa 17415664  T
Q  365 ccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaac 464  Q
    |||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||  ||||||| ||||| || || || || || |||||||| ||| ||    
T  17415665 ccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgtcatatcaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcgac 17415764  T
Q  465 ggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcg 564  Q
    || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | | ||| ||||||||| |  || || || ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17415765 ggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactatcagcaaatcctccaatgattggatcgtcctcttcgactgaccatctgtctgcg 17415864  T
Q  565 gatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgct 664  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||    
T  17415865 gatgataagccgaacttaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttccaaaatctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatact 17415964  T
Q  665 cgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||    
T  17415965 cgacggtacaccatgtagcttcacaat 17415991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 54 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 34645999 - 34645362
Alignment:
Q  54 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttct 153  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| || | || ||| ||||| ||||||||| | ||  | ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||    
T  34645999 tgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaattctatacgccacagttccaactctctcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaacttct 34645900  T
Q  154 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgata 253  Q
    | || || || ||||| || ||||| ||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||| || ||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  34645899 tagattttaatgcacgacccacacctgtcataggagtgaccctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgata 34645800  T
Q  254 actcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttca 353  Q
     ||||| ||||||||||||||||| ||||| |  |||   |||| || ||| || || |||||||| ||||| || |||||||| || | ||| |||||     
T  34645799 gctcttctgtcgactctgcgacgctttcatatgttctcttatcaacttaaccttttctgtagtttgttgaactatgtctggtcccaacatcacactttct 34645700  T
Q  354 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 453  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||| |    
T  34645699 cccgactcaaaccaacacaaaggagtcctgcatctgcgaccatacaatgcttcaaacggtgccataccaatactcgaatggtaactattgttataagtaa 34645600  T
Q  454 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 553  Q
    | || |||||||| |  || |||||||| | ||| ||||||||||| ||||| |  || | |||||||||||  || || ||||||||||||||||||||    
T  34645599 attctatcaacggtaagtggctatcccacgctccaccttgctcaagtacacatacccttagcaaatcctctaaagattggattgtcctctccgactgacc 34645500  T
Q  554 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 653  Q
    ||| |||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  34645499 atcagtctgcggatgataagctgaactcaatttcaatttcgatcccaacgcatcttgtaaactcttccaaaatcttgaagtaaaccttggatccctatct 34645400  T
Q  654 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  34645399 gatacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaat 34645362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 10469297 - 10468625
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||  ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||  ||||    
T  10469297 catacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaggttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaaccctctctgaaat 10469198  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  10469197 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 10469098  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||   |||| |   |||||||||||||| |    
T  10469097 tgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtct 10468998  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
      ||||| |  || ||||| || || || || ||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  10468997 catgaaccaaatccggtcccaacacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccat 10468898  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||||| || |||||||| || |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| | | |||||||| || ||||| |  |||||||||    
T  10468897 accaatactcgagtgatagctgttgttataagtgaactcaatcaacggtaggtgactatcccaagcttcaccttgctcgagcacacacaccctcaacaaa 10468798  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    || || |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||| |    
T  10468797 tcttccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaatttcgaacccaaagcatcctgtaaactct 10468698  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    ||||||| ||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||| || |||||||||||    
T  10468697 tccaaaacctagaggtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccgtgcagcttcacaat 10468625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 78 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 14381856 - 14381243
Alignment:
Q  78 aaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacac 177  Q
    ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||| | |||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  14381856 aaaccaactctatatgccactgttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacac 14381757  T
Q  178 cagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgc 277  Q
    | ||||||||| | || |||| ||| || || || || ||||||||||||||  | ||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  14381756 ccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcgtgataactcttctgtccactctgcgacgc 14381657  T
Q  278 cttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacgga 377  Q
     ||||| || |||   |||||||  |||||||| ||||| || ||||| |  || | ||| || || || || || | ||||||||||||||| || |||    
T  14381656 tttcatcttttctcttatcatcttgactttctctgtagtctgatgaaccaaatccgatcccaacacgacactctctcatgactcaaaccagcataaagga 14381557  T
Q  378 gttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactat 477  Q
    || || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || ||||| |    
T  14381556 gtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactattgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactgt 14381457  T
Q  478 cccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccga 577  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||| |  || |  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||    
T  14381456 cccaagttccaccttgcttaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgatttgatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagctga 14381357  T
Q  578 actcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacacca 677  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||| || || |||    
T  14381356 actcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcggatctctattcgacacaatactcgacggtactcca 14381257  T
Q  678 tgtagcttcacaat 691  Q
    ||||||||||||||    
T  14381256 tgtagcttcacaat 14381243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 21564580 - 21563908
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||||| | ||| |||||||| || || |  ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  21564580 catacttccgtaattgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattctaaagatgaggcggcaaacccactctatacgccactgttccaaccctctcagatat 21564481  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||| |||| |||||||||| ||||| || ||||| ||     
T  21564480 ctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcaaaggagtgactctcaagaacacatgatctccctct 21564381  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||| |  |||   |||| || ||| || |   |||| |    
T  21564380 tgaaactcaaggtccttcctacgtttgtcatgatagctcttctgtcgactctacgacgctttcatctgttctcttatcaacttaaccttttttttagtct 21564281  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    ||||||| || |||||||| || | ||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| | ||| |||||||| |||||||| ||||| ||  ||||    
T  21564280 gctgaactatgtctggtcccaacatcacactttctcctgactcaaaccaacataaaggagtccggcacctccgaccgtacaaagcttcgaacggaaccat 21564181  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||||| ||||| || |||||  | || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||    
T  21564180 accaatactcgaatggtaactattgatgtaggtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacatactctcagcaaa 21564081  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |    
T  21564080 tcctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagtcgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactct 21563981  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||||||||| ||||| || || | |||||||||  | ||||| |||||  | |||||||| ||||| |||||    
T  21563980 tccaaaatcttgaagtgaacctcgaatctctatcctacacaatactcgaccgtacaccatgaagcttaacaat 21563908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 22797080 - 22796408
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  22797080 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactgttccaaccctctcagatat 22796981  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
     |||||  ||||||| ||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||| || ||||| ||     
T  22796980 atgatacagaccaataaacttaggagtcaacttcctagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaacacatgatctccctct 22796881  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||  | || |||||||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||| ||||| || ||    ||||||| ||| ||||| ||||| |    
T  22796880 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttatgtagactttgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttaaccttctctgtagtct 22796781  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | ||||| |  || ||||  || || || || || ||||||||||| || || || ||||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||    
T  22796780 gatgaaccaaatccggtcgcaacactacactctctcctgactcaaatcaacataaaggagtcctgcacctccgaccgtacaaagctttgaacggtgccat 22796681  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||    
T  22796680 accaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaatctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaa 22796581  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||||  ||| ||||| || |||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| |    
T  22796580 tcctctgacgattgaatcgttctctccgactgaccatatgtttgcgaatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaatgcatcttgcaaactct 22796481  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  22796480 tccaaaatcttgaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaactccatgcaacttcacaat 22796408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 36 - 695
Target Start/End: Complemental strand, 11280936 - 11280277
Alignment:
Q  36 gacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatga 135  Q
    ||||||||||| || |  |||||||| |||||||| || ||||||||||| | ||||||||| ||||||||| | ||  | ||||||||||| ||||| |    
T  11280936 gacacatggaacacgtcatgcaaatttgaaagatgagggggtaaacccaccctataagccactgttccaactctctcagatatctgatatgggccaataa 11280837  T
Q  136 acttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttt 235  Q
    |||| || ||||||||||| || || || ||| |||||||||| ||||||||  ||| |||||| ||||| || ||||| || ||||||||||| || ||    
T  11280836 actttggagtcaacttcttagattttaatgcatgtcctacacctgtcataggtgtgattctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtcctt 11280737  T
Q  236 tctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggt 335  Q
     ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |  |||   || | || ||| || || |||||||| ||||| || ||||||    
T  11280736 cctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatatgttctcttattaacttaaccttttctgtagtttgttgaactatgtctggt 11280637  T
Q  336 cctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgat 435  Q
    || || | ||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| |    
T  11280636 cccaacatcacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagttctgcatcttcgatcatacaatgcttcaaacggtgccataccaatactcgaatggt 11280537  T
Q  436 agctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaat 535  Q
    | ||||| || ||||| || ||  ||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||| | ||| ||||  || || ||    
T  11280536 aactattgttgtaagtaaattctgtcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacaccctcaaaagatcttctaaggattgcat 11280437  T
Q  536 tgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagta 635  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||     
T  11280436 tgtcctctctgactggccatcggtctgaggatggtaagccgaactcagcctcaatttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagatgtg 11280337  T
Q  636 aatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 695  Q
    || || |||||||||||||||||||| ||||| | || |||||| | |||||||||||||    
T  11280336 aacctcggatctctatctgatacaatactcgatgtaataccatgcaacttcacaatttcc 11280277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 19 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 27561065 - 27560394
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||||| |  || ||||| ||||| ||||  ||||| ||||| ||||| || || || || |||| ||| |||||||||||||   | ||  ||||    
T  27561065 catacttccgcaactgtgacacgtggaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccaatcctctctgaaat 27560966  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| | ||| || || || || ||     
T  27560965 ctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctct 27560866  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||   ||||||||  ||||| || ||||| |    
T  27560865 tgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctccctgatcatcttgactttttctgtagtct 27560766  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
     |||||| |  || ||||| || || || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  27560765 cctgaactaaatccggtcccaacacaacactttctcctgattcaaaccaacacaatggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtgccat 27560666  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    ||| ||||| |||||||| || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| | |||||||||     
T  27560665 tcctatactcgaatgataactgttgttgtaggtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaag 27560566  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    || || |  || || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| || || ||||| |    
T  27560565 tcttccaatgattggatcgttctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactct 27560466  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 690  Q
    |||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27560465 tccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaa 27560394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 129 - 626
Target Start/End: Original strand, 1640715 - 1641212
Alignment:
Q  129 ccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaa 228  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| |||| |||  ||||||| | |||||| || |||||||||| ||| ||||    
T  1640715 ccaataaacctcggggtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctgtcacaggggtgactcttagaaacacatgatctccttcctaaaattcaa 1640814  T
Q  229 gatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatca-tctgaactttctcagtagtttgctgaacaa 327  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||   |||| | ||| |||| || ||||| || ||||| |    
T  1640815 ggtcctttctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctcttatcaatttgaccttt-tctgtagtctgatgaacta 1640913  T
Q  328 tctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatact 427  Q
    | |||||||| || |  || |||||||| |||| |||||| || |||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  1640914 tatctggtcccaacattacactttcacccgacttaaaccaacataacggagttctgcacctccgtccatgcaaagcttcgaacggtgccataccaatact 1641013  T
Q  428 agaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagc 527  Q
     ||||| || || || || || |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| |    
T  1641014 cgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaac 1641113  T
Q  528 gactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaat 626  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1641114 gactgaatcgttctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaacgcctcttgcaaacttttccaaaat 1641212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 19 - 688
Target Start/End: Original strand, 24364245 - 24364914
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| || |||||| | ||  ||||    
T  24364245 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgtaccaactctctctgaaat 24364344  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||  | |||||||  ||||| || ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  24364345 ctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcagcgcacgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 24364444  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||   |||| |   |||||||||||||| |    
T  24364445 tgaaactcaagatcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtct 24364544  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
      ||||| |  || ||||| || || || || ||||  |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| | ||||||    
T  24364545 catgaaccaagtccggtcccaacacaacactctcactcgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacgatgccat 24364644  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | ||||||||||    
T  24364645 accaatactcgagtgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcaacaaa 24364744  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    || || | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |    
T  24364745 tcttccaacgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactct 24364844  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 688  Q
    |||| || |||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  24364845 tccagaacctagaagtgaacctcggatctctattcgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcac 24364914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 115 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 28283165 - 28282590
Alignment:
Q  115 aaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcc 214  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||  | || |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| | ||| || || || ||    
T  28283165 aaatctgatacgggccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcacc 28283066  T
Q  215 ttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagta 314  Q
     || |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||  ||||||||  ||||| || |||    
T  28283065 ctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgta 28282966  T
Q  315 gtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtg 414  Q
    || | |||||| |  || ||||| |  || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||    
T  28282965 gtctcctgaaccaaatccggtcccagcacaacactttctcctgactcaaaccaacacaacggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtg 28282866  T
Q  415 ccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaa 514  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || || || || |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||    
T  28282865 ccattcctatactcgaatgataactgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaa 28282766  T
Q  515 caaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaa 614  Q
    ||| || || |  || || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| || || |||    
T  28282765 caagtcttccaatgattggatcgttctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaa 28282666  T
Q  615 cttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 690  Q
    || ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28282665 ctcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaa 28282590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 54 - 691
Target Start/End: Original strand, 18794558 - 18795195
Alignment:
Q  54 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttct 153  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||||||  | |   | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  18794558 tgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactcgatatgccactgttccaaccctcttagatatctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttct 18794657  T
Q  154 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgata 253  Q
    | || || || ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| || ||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  18794658 tagattttaaggcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactgaaggtctttcctacgattgtcatgata 18794757  T
Q  254 actcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttca 353  Q
     ||||| ||||||||||||||||| ||||| |  |||   |||| || ||| || || ||||| || || || || ||||| || || | ||| |||||     
T  18794758 gctcttctgtcgactctgcgacgctttcatctgttctcttatcaacttaaccttttctgtagtctgttgcactatgtctggccccaacatcacactttct 18794857  T
Q  354 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 453  Q
    ||| |||||||||| ||||| |||||| |||| || ||||| ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || ||||| || || || |    
T  18794858 cctaactcaaaccaacacaaaggagttatgcaccttcgaccgtacaaggcttcaaatggtgccataccaatactcgaatggtaactattgttgtaggtaa 18794957  T
Q  454 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 553  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  | ||||||||  || || || ||||||||||| |||||    
T  18794958 actctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtagatcctctaaagattgtatcgtcctctccgattgacc 18795057  T
Q  554 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 653  Q
    ||| || || |||||||| ||| ||||||  ||||| ||||| |||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||    
T  18795058 atccgtatgaggatgataagccaaactcagcctcaatttcgaacccaaagcatcttgcaaacgcttccataatctagaagtgaacctcggatctctatct 18795157  T
Q  654 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    || ||| | ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  18795158 gacacagtactcgacggaacaccatgcatcttcacaat 18795195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 19 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 8766596 - 8766111
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||  |||||||| ||||||||  | ||  ||||    
T  8766596 catactttcgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtaagccactgttccaaccctctctgaaat 8766497  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||||||||| | |||||||| ||||||||||| |  ||||||| | | || |||| |||||| || || || |||    
T  8766496 ctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacccttgtcatagaagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcc 8766397  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| || |||  ||||||||  |||||||| ||||| |    
T  8766396 tgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgacgccttcatcttttctctgatcatcttgactttctctgtagtct 8766297  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
      ||||| |  || |||||  | || || || || ||||||||||||||||| ||  |||| ||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  8766296 catgaaccaaatccggtccccacacgacactctctcctgactcaaaccagcataaatgagtcctgcacctccaaccatacaaagcttcgaacggtgccat 8766197  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacac 504  Q
     |||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  8766196 accaatactcgaatggtaactgttattgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagaacac 8766111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 19 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 21833429 - 21833172
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||| | ||    
T  21833429 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccattccaactctttccgatat 21833330  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| ||||| || ||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||     
T  21833329 ctgatacggacctataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacctccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacatgtggtttccttct 21833230  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacg 276  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21833229 tgaaattcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacg 21833172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 279 - 691
Target Start/End: Original strand, 19453513 - 19453925
Alignment:
Q  279 ttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggag 378  Q
    ||||| ||||||  |||||||| ||||||||| ||||| || ||||| |  |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||    
T  19453513 ttcatcttctctctgatcatcttaactttctctgtagtctgatgaaccaaatctggtcccaacaccacactctctcctgactcaaaccagcataaaggag 19453612  T
Q  379 ttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatc 478  Q
    | ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||  | || || || | |||||| ||||| || || ||||||||    
T  19453613 tcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaattgttgttgtatgcgaactctatcaatggtaggtgactatc 19453712  T
Q  479 ccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaa 578  Q
    ||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||   |||||||| |  || |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19453713 ccaagctccaccttgctcaagcacacacactctctgtaaatcctccaatgattagatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaa 19453812  T
Q  579 ctcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccat 678  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| || | ||| ||||| || |||||||    
T  19453813 ctcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaggtgaacctcggatccctatccgacataatactcgacggtacaccat 19453912  T
Q  679 gtagcttcacaat 691  Q
    |||||||||||||    
T  19453913 gtagcttcacaat 19453925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 206
Target Start/End: Original strand, 17032395 - 17032582
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||    
T  17032395 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccgatat 17032494  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacg 206  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17032495 ctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaacgcacgtcccacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacg 17032582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 18197995 - 18197608
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||  || | ||||| | ||    
T  18197995 catacttccgaagttgcgaaacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggcaaacccactcgatacgccactgtttaaattctttccgatat 18197896  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    || |||  ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||  |||| | || ||||| ||| ||| || || | ||| ||     
T  18197895 cttatacagaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaattcgcgtcctacacttgtcacaagagtgactttcagaaatacatgatatccctct 18197796  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||||| ||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||  || ||||||||||| |    
T  18197795 tgaaacttaaggtctttccgacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcatcttttcttaaatcatctttaccttctcagtagtct 18197696  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctc 406  Q
    | | ||||||| |||||||||| |||||  | |||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18197695 gttaaacaatcgctggtcctaaaaccacattctcacctgacttaaacgaacacaacggagttctgcacctccgaccatacaaagcctc 18197608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 364 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 5297308 - 5296982
Alignment:
Q  364 accagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaa 463  Q
    ||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||||| || |||||    
T  5297308 accagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaattctatcaa 5297209  T
Q  464 cggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgc 563  Q
    ||| || ||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |  || || || ||||||||||||||||||||||||||     
T  5297208 cggtaggtgactatccca-gctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctga 5297110  T
Q  564 ggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgc 663  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| |    
T  5297109 ggatgataagccgaacccaacctcaatttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatac 5297010  T
Q  664 tcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||    
T  5297009 tcgaaggaactccatgtagcttcacaat 5296982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 369 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 27560086 - 27559765
Alignment:
Q  369 cacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaa 468  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || || || |||||||| |||||||| |    
T  27560086 cacaatggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtgccattcctatactcgaatgataactgttgttgtaggtgaactctatcaacggta 27559987  T
Q  469 gatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatg 568  Q
    | ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| || || |  || || || || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27559986 ggtgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaagtcttccaatgattggatcgttctctccgactgaccatctgtctgaggatg 27559887  T
Q  569 atatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaa 668  Q
    ||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||    
T  27559886 ataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaa 27559787  T
Q  669 ggaacaccatgtagcttcacaa 690  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  27559786 ggaactccatgtagcttcacaa 27559765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 19 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 14131627 - 14131363
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||  | || |||||||||| ||| ||||| ||||||||| | ||  | ||    
T  14131627 catacttccgtaactgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgttgtggcaaacccactctatatgccactgttccaactctctcagatat 14131528  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||| |||| |||||| || |||||||||    
T  14131527 ctgatacggaccaataaacttcgaagtcaacttcttagacttcaatgcacgacctacacctgtcataggagtgaccctcagaaacacatgatctccttcc 14131428  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcat 283  Q
    |||||||| || || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14131427 tgaaactccaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcat 14131363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 117 - 505
Target Start/End: Original strand, 18800873 - 18801261
Alignment:
Q  117 atctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||| ||||||||  |||||| |||||| ||||||||| | ||||||| ||| || || || || |    
T  18800873 atctgatatggaccaatgaactttgaagtcaactgcttcgacttcaattcacgtcttacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatccccct 18800972  T
Q  217 cctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 316  Q
    | |||||||||||  | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||   |||||||  |||||||| |||||    
T  18800973 cttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctaatcatcttgactttctccgtagt 18801072  T
Q  317 ttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcc 416  Q
     || ||||| |  || ||||| || || || ||||| ||| ||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |  |||    
T  18801073 ctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactttctcctaactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacgaggcc 18801172  T
Q  417 attccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacaca 505  Q
    || |||||||| ||||| || || || || ||| ||||||| || ||||| || ||||||||||||| ||| |||||||| || |||||    
T  18801173 ataccaatactcgaatggtaactgttgttgtaaatgaactctataaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctctagtacaca 18801261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Original strand, 25750642 - 25750900
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || | ||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||||||| | ||  | ||    
T  25750642 catacttccgaagatgcgacacatgaaacatatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaactctctcagatat 25750741  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    ||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| | || ||||||||| |||||| || ||||||||     
T  25750742 ctggtacggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgtcttacacccgtcacaagagtgactctcagaaacacatgatctccttct 25750841  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgc 277  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  25750842 tgaaactcaagatcctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgc 25750900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 36 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 11288029 - 11287680
Alignment:
Q  36 gacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatga 135  Q
    ||||||||||| || |  |||||||| |||||||| || ||||||||||| | ||||||||| ||||||||| | ||  | ||||||||||| ||||| |    
T  11288029 gacacatggaacacgtcatgcaaatttgaaagatgagggggtaaacccaccctataagccactgttccaactctctcagatatctgatatgggccaataa 11287930  T
Q  136 acttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttt 235  Q
    |||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||  |||||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||| || ||    
T  11287929 actttggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacccgtcataggggtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtcctt 11287830  T
Q  236 tctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggt 335  Q
     ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |  |||   || | || ||| || || |||||||| ||||| || ||||||    
T  11287829 cctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatatgttctcttattaacttaaccttttctgtagtttgttgaactatgtctggt 11287730  T
Q  336 cctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgca 385  Q
    || || | ||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  11287729 cccaacatcacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagttctgca 11287680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 475 - 691
Target Start/End: Original strand, 15896383 - 15896599
Alignment:
Q  475 tatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgc 574  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| || || | |||||||||  | || |||||||||  |||||||||||||||||| ||    
T  15896383 tatcccaagttcctccttgctctagtacacaaactctcaacaagtcttccaacgactgaatcattctttccgactgattatctgtctgcggatgatacgc 15896482  T
Q  575 cgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaaca 674  Q
    |||||||||  ||||||| || || | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||   |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15896483 cgaactcaacttcaacttagaacctacagcctcttgcaaactcttccaaaatatagaagtatacctcacatctctatctgatacaatgctcgacggaaca 15896582  T
Q  675 ccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||||||||||||||||    
T  15896583 ccatgtagcttcacaat 15896599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 472 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 21569986 - 21569767
Alignment:
Q  472 gactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgata 571  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  || || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21569986 gactatcccaagctccaccttgctcaagtacacatactctcagcaaatcctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgata 21569887  T
Q  572 tgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagga 671  Q
     | ||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || | |||||||||  | ||||| |||||  |     
T  21569886 agtcgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcgaatctctatcctacacaatactcgaccgt 21569787  T
Q  672 acaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||||||| ||||| |||||    
T  21569786 acaccatgaagcttaacaat 21569767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 192 - 292
Target Start/End: Original strand, 11291818 - 11291918
Alignment:
Q  192 actctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctt 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11291818 actctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacacttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctctt 11291917  T
Q  292 g 292  Q
    |    
T  11291918 g 11291918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 144 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 16382696 - 16382161
Alignment:
Q  144 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 243  Q
    ||||||||| |  |||| |||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  16382696 gtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 16382597  T
Q  244 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 343  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  16382596 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 16382497  T
Q  344 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 443  Q
      | || || || ||||||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||| |||| | || ||     
T  16382496 agcactctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagcatgaaaactgttg 16382397  T
Q  444 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 543  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  16382396 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 16382297  T
Q  544 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 643  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  16382296 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 16382197  T
Q  644 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 679  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  16382196 atcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 16382161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 585 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 21837079 - 21836964
Alignment:
Q  585 ctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagct 684  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  21837079 ctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaact 21836980  T
Q  685 tcacaatttccttgat 700  Q
    ||||||| ||||||||    
T  21836979 tcacaatctccttgat 21836964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 538 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 8762862 - 8762709
Alignment:
Q  538 tcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaa 637  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||| ||    
T  8762862 tcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttccagaatctagaagtgaa 8762763  T
Q  638 tcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
     || ||||||||||| || ||||| ||||| || || |||||||||||||||||    
T  8762762 cctcggatctctatccgacacaatactcgacggtacgccatgtagcttcacaat 8762709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 600 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 20637168 - 20637077
Alignment:
Q  600 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  20637168 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 20637077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 585 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 18197610 - 18197504
Alignment:
Q  585 ctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagct 684  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18197610 ctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgatggaacaccatgtagct 18197511  T
Q  685 tcacaat 691  Q
    |||||||    
T  18197510 tcacaat 18197504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 144 - 679
Target Start/End: Original strand, 16098008 - 16098543
Alignment:
Q  144 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 243  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || ||||| |||| |||  | |||||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| ||||| | ||    
T  16098008 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggtttcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcctct 16098107  T
Q  244 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 343  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||  ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| || |  ||||| |  || ||||  || |||||||| |     
T  16098108 tatcatgataactcttctgtctactctaagacgctttcatcttctcttggatcatcttaaccttttatgtagtctcttgcacaacttccggtcctaacaa 16098207  T
Q  344 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 443  Q
      | ||||| |||||||||||||| |||||||| || || || ||||||||||||||||| || || || ||||| || |||||||||||| |  | ||     
T  16098208 ggcactttctcctgactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcttcaaacggagccataccgatactagaatgaaaattgttg 16098307  T
Q  444 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 543  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |     ||||||| |  | |||||||| |  | ||||  |||||||||||| || |    |||||| |||||||    
T  16098308 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcatcccaactaacaccttgctccaacatacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 16098407  T
Q  544 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 643  Q
        ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  16098408 ttttctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 16098507  T
Q  644 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 679  Q
    ||| | |||||| ||||| || ||||| | ||||||    
T  16098508 atcccgatctgacacaatactagaaggtataccatg 16098543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 144 - 679
Target Start/End: Original strand, 23996206 - 23996741
Alignment:
Q  144 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 243  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || ||||||||| | || || ||||||||||| || ||  | |||||||||| ||| || || | ||    
T  23996206 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcataggattcacccttaaaaacacgtgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 23996305  T
Q  244 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 343  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  23996306 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 23996405  T
Q  344 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 443  Q
      | || || || ||||||||||| |||||||| || || || |||||||||||||| ||||| ||  |||||||||| ||||||| |||| | || ||     
T  23996406 agcactctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaggcctcaaacagtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 23996505  T
Q  444 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 543  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      || |||    | |||||||| |  ||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  23996506 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtctcaaccaacaccttgctctaacacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 23996605  T
Q  544 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 643  Q
    ||  ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  ||||||||| || ||||||  |||||||||| ||  |    
T  23996606 ccatctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaaccttcccaaaacttagaagtaaacctcag 23996705  T
Q  644 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 679  Q
    ||| | |||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  23996706 atcccgatctgacacaatactagaaggaataccatg 23996741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 144 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 25743410 - 25742876
Alignment:
Q  144 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 243  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || ||||| |||| | || |  | ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  25743410 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaagattctccctcaaaaacacttgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 25743311  T
Q  244 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtccta-aga 342  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||| |||||||| ||||||| ||| || || ||||| |  || ||||  || ||||||| | |    
T  25743310 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgctctcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaacttccggtcctacaaa 25743211  T
Q  343 ccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatt 442  Q
     ||||  |||||||||||||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| | || ||    
T  25743210 gcact--ttcacctgactcaaaccaacacaacggtgtcctacagctccgaccatacaaagcctcaaacggagccattccaatactagaatgaaaactgtt 25743113  T
Q  443 attataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctc 542  Q
     || ||||| ||||| || ||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    ||  || ||||||    
T  25743112 gttgtaagtaaactcaattaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctagatagtcctc 25743013  T
Q  543 tccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 642  Q
    |||| ||| ||||| ||||| ||||| || |  || |||||||||||||| |  ||||||||  |||| ||||| | ||||||  |||||||||| ||      
T  25743012 tccgtctgcccatcggtctgaggatggtaagtagatctcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgtaaactctcccaaaacgtagaagtaaacctca 25742913  T
Q  643 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 679  Q
    |||| | |||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  25742912 gatcccgatctgacacaatactagaaggaataccatg 25742876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 144 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 15078687 - 15078365
Alignment:
Q  144 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 243  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || ||||||||||  ||| | | ||||||||| || || || ||  |||||||||| | ||| |||||   ||    
T  15078687 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccagtcactggattcagtctcaaaaatacatgatcaccaacctgaaactcgatatcctttctcttct 15078588  T
Q  244 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 343  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| || ||| ||||||||| ||| || || ||||| |  || ||||  || |||||||| |     
T  15078587 tatcatgataactcttatgtctactctgagacgctttcatcttttctcggatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaacttccggtcctaacaa 15078488  T
Q  344 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 443  Q
      | ||||| |||||||||||||| |||||||| ||  | || |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | || ||     
T  15078487 ggcactttctcctgactcaaaccaacacaacggtgtcttacacctccgatcatacaaagcctcaaacggtgccattccaatactagaatgaaaactgttg 15078388  T
Q  444 ttataagtgaactcgatcaacgg 466  Q
    || ||||| ||||| ||||||||    
T  15078387 ttgtaagtaaactcaatcaacgg 15078365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 19 - 113
Target Start/End: Original strand, 22433830 - 22433924
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttcc 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  22433830 catacttccgaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttcc 22433924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 148 - 264
Target Start/End: Original strand, 25750908 - 25751024
Alignment:
Q  148 acttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtc 247  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25750908 acttcttagatttcaacgcacgtcctacacccgtcacaggagtgactctcagaaacacatgatctccttcttgaaactcaagatcctttctacgcttgtc 25751007  T
Q  248 atgataactcttttgtc 264  Q
    ||| |||||||| ||||    
T  25751008 atggtaactcttctgtc 25751024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 144 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 18838231 - 18837696
Alignment:
Q  144 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 243  Q
    ||||||||| |  ||||||||||| | || ||||| |||| |||| | || | ||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  18838231 gtcaacttcctacacttcaaagcatgaccaacaccggtcacaggattcacccacaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 18838132  T
Q  244 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 343  Q
    | |||||||||||||| | |  |||||| ||||||||||| || ||||| ||||||| ||| || || ||||| |  || ||||  || ||| |||| |     
T  18838131 tatcatgataactcttctatgtactctgagacgccttcatcttttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaacttccggtgctaacat 18838032  T
Q  344 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 443  Q
      | || || || ||||||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||| | || ||     
T  18838031 agcactctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattcggatactagaatgaaaactgttg 18837932  T
Q  444 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 543  Q
    || ||||| ||||| ||||| || | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||||||||| || |    |||||| |||||||    
T  18837931 ttgtaagtaaactcaatcaatggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 18837832  T
Q  544 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 643  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  18837831 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaaactcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaaattagaagtaaacctcgg 18837732  T
Q  644 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 679  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  18837731 atcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 18837696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 157 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 21413248 - 21412939
Alignment:
Q  157 acttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataact 256  Q
    ||||||||||||| || |||||||| | |||| | |||| ||| ||||  || || ||  |||||||||||| ||| ||||| | ||| |||||||||||    
T  21413248 acttcaaagcacgaccaacaccagttacaggattcactcacaagaacatatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 21413149  T
Q  257 cttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacct 356  Q
    |||  ||| |||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| ||| || || |||||||  || ||||   | |||||||| |   | ||||| ||     
T  21413148 cttcggtctactctgagacgctttcatcttttcttggatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaactcccggtcctaacaatgcgctttctccg 21413049  T
Q  357 gactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaact 456  Q
    || |||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||  ||||||| || ||| |||||||| | || ||||| ||||| ||||    
T  21413048 gattcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacagtgccataccgatattagaatgaaaactgttattgtaagtaaact 21412949  T
Q  457 cgatcaacgg 466  Q
    | ||||||||    
T  21412948 caatcaacgg 21412939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 157 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 1649094 - 1648786
Alignment:
Q  157 acttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataact 256  Q
    ||||||||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||| |||||||| ||    
T  1649094 acttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgatagct 1648995  T
Q  257 cttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacct 356  Q
    ||| |||| |||||| ||||||||||| || || || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |   |  | || ||     
T  1648994 cttctgtctactctgagacgccttcatcttttcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaataaagcattctctccg 1648895  T
Q  357 gactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaact 456  Q
    ||||||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| | || || || ||||| ||||    
T  1648894 gactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaact 1648795  T
Q  457 cgatcaacg 465  Q
    | |||||||    
T  1648794 caatcaacg 1648786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 219 - 679
Target Start/End: Original strand, 18571684 - 18572144
Alignment:
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||| ||| ||||| | ||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||| ||||||| || ||||||| ||| || || |||||||    
T  18571684 tgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttccttttctcctgaatcatcttaacattttccgtagttt 18571783  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
      || | ||  ||||||| ||| |   | |||||||||||||||||||| |||||| | || || || |||| ||||||||||||||| || || | |||    
T  18571784 cttgcataacttctggtcttaataaagcactttcacctgactcaaaccaacacaacagtgtcctacacctcctaccatacaaagcctcaaacggagtcat 18571883  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    ||| |||||||||||| | || || || ||||| ||||| || ||| | | ||     |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||    
T  18571884 tccgatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaattaactgtaaatattcgtcccaactaacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaa 18571983  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||| |     || || ||||||||||  |  ||||| ||||| ||||| || || ||| ||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| |    
T  18571984 tcctccaaactttggatagtcctctccgttttcccatcggtctgaggatggtaagcagaaatcaatctcaacttggttcccaaagcagcttgcaaactct 18572083  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 679  Q
     ||||||  |||||||||| || |||||   |||||| ||||| ||  |||||| ||||||    
T  18572084 cccaaaacttagaagtaaacctcggatcctgatctgacacaatactataaggaataccatg 18572144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 629 - 695
Target Start/End: Original strand, 22442710 - 22442776
Alignment:
Q  629 agaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 695  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||    
T  22442710 agaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcactatttcc 22442776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 159 - 464
Target Start/End: Original strand, 25655456 - 25655760
Alignment:
Q  159 ttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactct 258  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||  || | |||||||||||||| || || ||  ||||||||||||  || ||||| | ||| | |||||||||||    
T  25655456 ttcaaagcacgaccaacaccagttatcagattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtcctttctcctcttattatgataactct 25655555  T
Q  259 tttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctga 358  Q
    | |||| |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||| |   |||| |  || ||||  |||| |||||| |   | |||||| ||||    
T  25655556 tctgtctactctgagacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacttttttcttagtctcttgcacaacttctgatcctaacaaagcactttca-ctga 25655654  T
Q  359 ctcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcg 458  Q
    ||||||||| |||||||   | || || ||||||||||||||| |||| ||||||  |||| | |||||||||||| | || || || ||||| |||||     
T  25655655 ctcaaaccaacacaacgacatcctacacctccgaccatacaaatcctcaaaaggtttcatttcgatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcc 25655754  T
Q  459 atcaac 464  Q
    ||||||    
T  25655755 atcaac 25655760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 219 - 434
Target Start/End: Original strand, 16233242 - 16233457
Alignment:
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||| ||| ||||| | ||| |||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||| || ||||| || |||| ||| || || ||||| |    
T  16233242 tgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactttgagacgccttcatcttttcttgaataatcttaaccttttccgtagtct 16233341  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
      || ||||  ||  ||||||| |   | || || || ||||||||||| |||||||| || || || || ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  16233342 cttgcacaacttccagtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacaccttcgaccatacaaagcctcaaacggtgccat 16233441  T
Q  419 tccaatactagaatga 434  Q
    ||| ||||||| ||||    
T  16233442 tccgatactagcatga 16233457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 19 - 107
Target Start/End: Original strand, 18787721 - 18787809
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaact 107  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||| |  || |||||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  18787721 catactttcgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaatatgtgatggcaaacccactctatatgccactgttccaact 18787809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 576 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 23027607 - 23027522
Alignment:
Q  576 gaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaat 661  Q
    |||||||| |||||||| |  |||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  23027607 gaactcaacctcaacttagttcccaaagcatcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctcggatccctatctgacacaat 23027522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 97
Target Start/End: Original strand, 1640634 - 1640710
Alignment:
Q  21 tacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccac 97  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||| |||||| ||| |||||    
T  1640634 tacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaatccactctatatgccac 1640710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 387 - 466
Target Start/End: Original strand, 1652274 - 1652353
Alignment:
Q  387 ctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacgg 466  Q
    |||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||| | || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  1652274 ctccgaccatacaaagcctcaaacggagccattccgatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacgg 1652353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 558 - 679
Target Start/End: Original strand, 21927577 - 21927698
Alignment:
Q  558 gtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgata 657  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |  ||||| ||  |||||||||||| ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || |    
T  21927577 gtctggggatgataagcagaactcaacctcaacttagttcccaatgcagcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgaca 21927676  T
Q  658 caatgctcgaaggaacaccatg 679  Q
    |||| || ||||||| ||||||    
T  21927677 caatactagaaggaataccatg 21927698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 559 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 1648722 - 1648602
Alignment:
Q  559 tctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatac 658  Q
    |||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || ||    
T  1648722 tctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacac 1648623  T
Q  659 aatgctcgaaggaacaccatg 679  Q
    ||| || ||||||| ||||||    
T  1648622 aatactagaaggaataccatg 1648602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 489 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 14625216 - 14625068
Alignment:
Q  489 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 588  Q
    |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| ||| |||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||    
T  14625216 ccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcatctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctca 14625117  T
Q  589 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaa 637  Q
    | || |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  ||||||||||    
T  14625116 atttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaa 14625068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 596; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 596; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 110117 - 109434
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  110117 catacttccgaagttgcgacacatggaagacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 110018  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  110017 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcc 109918  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  109917 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 109818  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  109817 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccgt 109718  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  109717 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctctttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 109618  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  109617 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcgtcttgcaaacttt 109518  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  109517 tccaaaatctagaagtaaatcttggttctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctccttgatgt 109434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Original strand, 112559 - 113231
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||| || |  ||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||| ||||||||| | ||  | ||    
T  112559 catacttccgcaactgcgacacatggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggtaaacccaccctataagccactgttccaactctctcagatat 112658  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||     
T  112659 ctgatatgggccaataaactttggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatgatctccctct 112758  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |  |||   ||||  |  || || |  |||||||    
T  112759 tgaaactcaagatccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatctgttctcttatcaagtttaccttttatgtagttt 112858  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | ||||| || |||||||| || | ||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||    
T  112859 gttgaactatgtctggtcccaacatcacactttcccccgattcaaaccaacacaaaggagttctgcaccttcgaccatacaatgcttcaaacggtgccat 112958  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||||| ||||| || || || || ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||| |  ||||||| |    
T  112959 accaatactcgaatggtaactgttgttgtaagtaaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgcacaagtacacacaccctcaacaga 113058  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    || ||||  || || || ||||||||  ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  113059 tcttctaaggattgtatcgtcctctctaactgaccatctttctgaggatgataagccgaactcagcctcaatttcgagcccaaagcatcttgcaaactct 113158  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||| |||||||| || || || | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  113159 tccagaatctagatgtgaacctcgaatctctatctgatacaatactcgacggaacaccatgcagcttcacaat 113231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 54 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 96273 - 95636
Alignment:
Q  54 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttct 153  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||| | || ||| ||||| ||||||||| ||||  |||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||      
T  96273 tgcaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaattctatacgccacagttccaactctttctgaaatctgataaggaccgatgaactttggagtcaactttc 96174  T
Q  154 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgata 253  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | || |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  96173 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcaaaaaaacatggtcaccttcctgaaattcaaggtctttcctacgcttgtcatgata 96074  T
Q  254 actcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttca 353  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||   ||||| |  ||||||||| ||||| |  ||||| |  || || || || || || |||||     
T  96073 gctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctccctgatcaccctaactttctccgtagtctcatgaaccaagtccggccccaacacaacactttct 95974  T
Q  354 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 453  Q
    || ||||||||||| || |  |||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||||    
T  95973 cccgactcaaaccaacatagaggagttctacacctccgaccatataaagcttcgaatggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtga 95874  T
Q  454 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 553  Q
    | || ||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| |  || | |||||||||||  || || |||||||| |||||||||||    
T  95873 attctatcaatggtagatgactatcccaagctccaccctgctcaagtacacatacccttagcaaatcctctaaagattggattgtcctttccgactgacc 95774  T
Q  554 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 653  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  95773 atcagtctgcggatgataagccgaactcaacctcaatttcgaacccaacgcatcttgtaaacttctccaaaatctcgaagtaaaccttgggtctctatct 95674  T
Q  654 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    || || || ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  95673 gacactatactcgacggaacaccatgcaacttcacaat 95636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 596; Significance: 0; HSPs: 75)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 596; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 15589934 - 15589251
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  15589934 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 15589835  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15589834 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 15589735  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15589734 tgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 15589635  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15589634 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 15589535  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15589534 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgcttaagaacacaaattctcaacaaa 15589435  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15589434 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 15589335  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  15589334 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctctttgatgt 15589251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 593; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 53385560 - 53384888
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  53385560 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaaaat 53385461  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  53385460 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaactttttcgacttcaaagcacgtcctacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 53385361  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53385360 tgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 53385261  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  53385260 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacagagcctcgaacggtgccat 53385161  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53385160 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcatccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 53385061  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  53385060 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatccgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 53384961  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  53384960 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaat 53384888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 592; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 20062596 - 20061913
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  20062596 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 20062497  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20062496 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacgccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 20062397  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20062396 tgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 20062297  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20062296 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 20062197  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20062196 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 20062097  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20062096 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 20061997  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  20061996 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaattctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctctttgatgt 20061913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 584; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 702
Target Start/End: Original strand, 10005188 - 10005871
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  10005188 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 10005287  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10005288 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 10005387  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10005388 tgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 10005487  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10005488 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 10005587  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10005588 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgttcaagaacacaaattctcaacaaa 10005687  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  10005688 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgtaaacttt 10005787  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||    
T  10005788 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgt 10005871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 580; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 702
Target Start/End: Original strand, 10905798 - 10906481
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  10905798 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 10905897  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  10905898 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 10905997  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10905998 tgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 10906097  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  10906098 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccaaccatacaaagcctcgaacggtgccat 10906197  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  10906198 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcctcgttcaagaacacaaattctcaacaaa 10906297  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10906298 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 10906397  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||    
T  10906398 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgt 10906481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 580; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 702
Target Start/End: Original strand, 48425035 - 48425718
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  48425035 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 48425134  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  48425135 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 48425234  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48425235 tggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 48425334  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  48425335 gctgaacaatctctagtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagccttgaacggtgccat 48425434  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48425435 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 48425534  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  48425535 tcctctagcgactgaattgttctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 48425634  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  48425635 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatgt 48425718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 576; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 702
Target Start/End: Original strand, 16635361 - 16636044
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  16635361 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 16635460  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  16635461 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 16635560  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16635561 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 16635660  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16635661 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 16635760  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16635761 tccaatactagaatgataactattattatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 16635860  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16635861 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 16635960  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||    
T  16635961 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgt 16636044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 576; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 16757127 - 16756444
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  16757127 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaaaat 16757028  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16757027 atgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacatgtggtctccttcc 16756928  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16756927 ttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgccttcattttctctcggatcatctgaactttctcagtagttt 16756828  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  16756827 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcatctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaggcctcgaacgatgccat 16756728  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16756727 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactgtcccaagttcctccttgctcaagcacacaaattctcaacaaa 16756628  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16756627 tcctctagcgactgaattgtcctctctgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 16756528  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  16756527 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctctttgatgt 16756444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 576; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 702
Target Start/End: Original strand, 43162685 - 43163368
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  43162685 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 43162784  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  43162785 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 43162884  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43162885 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 43162984  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  43162985 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 43163084  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43163085 tccaatactagaatgataactattattatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 43163184  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  43163185 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 43163284  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||    
T  43163285 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgt 43163368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 566; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 15348787 - 15348106
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  15348787 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 15348688  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  15348687 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 15348588  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15348587 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 15348488  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  15348487 gctgaacaatctttggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaggcctcgaacggtgccat 15348388  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15348387 tccaatactagaatggtaactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 15348288  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  15348287 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 15348188  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 700  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||    
T  15348187 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcataatctccttgat 15348106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 562; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 702
Target Start/End: Original strand, 6600335 - 6601007
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6600335 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgtcccaactttttccaaaat 6600434  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6600435 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 6600534  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6600535 ttgaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctcggatcatctgaactttctcagtagttt 6600634  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6600635 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacagagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 6600734  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||    
T  6600735 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacgaaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaac-----------acaaa 6600823  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  6600824 tcctctagcgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 6600923  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  6600924 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctctttgatgt 6601007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 554; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 700
Target Start/End: Original strand, 13252278 - 13252959
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  13252278 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 13252377  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13252378 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 13252477  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13252478 tgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 13252577  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  13252578 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagtcctgcatctccgaccatacaaggcctcgaacggtgccat 13252677  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13252678 tccaatactagaatggtaactattattatatgtgaactcgatcaacggaagatgactgtcccaagttcctccttgttcaagaacacaaattctcaacaaa 13252777  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  13252778 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 13252877  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 700  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  13252878 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 13252959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 550; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 5425471 - 5424791
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  5425471 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 5425372  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  5425371 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaag-cacgtggtctccttcc 5425273  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5425272 tgaaattcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 5425173  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  5425172 gctgaacaatctctggtcctaagaccgctctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctctgaccatacagagcctcgaacggtgccat 5425073  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5425072 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactgtcccaagttcctccttgttcaagaacacaaattctcaacaaa 5424973  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  5424972 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 5424873  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 700  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||    
T  5424872 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaactttacaatctccttgat 5424791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 546; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 15403052 - 15402371
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||    
T  15403052 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaattctttccaatat 15402953  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15402952 ctgatacggaccaatgaacatcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacgccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 15402853  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15402852 tgaaactcaaaatcttttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaaccttctcagtagttt 15402753  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  15402752 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatgtaaagcctcgaaaggtgccat 15402653  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  15402652 tccaatacttgaatgataactattattatatgtgaactcgattaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcgagaacacaaatcctcaacaaa 15402553  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15402552 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccagctgtctatggatgatacgccgaactcaatctcagcttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 15402453  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 700  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  15402452 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgagggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 15402371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 542; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 15725475 - 15724795
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  15725475 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 15725376  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15725375 ctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtgactctaaaaaacacgtggtctccttcc 15725276  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |    
T  15725275 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttcattttctcttggatcatccgaa-tttctcagtagtct 15725177  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15725176 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccat 15725077  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15725076 tccaatacttgaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 15724977  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15724976 tcctctagcgactgaattgtcctctctgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 15724877  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 700  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| | | |||| || ||||||||    
T  15724876 tccaaaatctacaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgcctgaaggaacaccatgcaacctcacgatctccttgat 15724795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 538; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 26792941 - 26792260
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||    
T  26792941 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaatccactcggtaagccatcgttccaactctttccaatat 26792842  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||     
T  26792841 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacactagtcataggagtgactcttaaaaacacgtggtctccttct 26792742  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26792741 tggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 26792642  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26792641 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcataatggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccat 26792542  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26792541 tccaatacttgaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgcttaagaacacaaattctcaacaaa 26792442  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  26792441 tcctctagcgactgaattgtcctctctgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaacctcaactttgaacccaaagcctcttgcaaacttt 26792342  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 700  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  26792341 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctggaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 26792260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 534; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 700
Target Start/End: Original strand, 15338857 - 15339538
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| ||    
T  15338857 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaagctaccgttccaattctttccaatat 15338956  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15338957 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacgccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 15339056  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15339057 taaaactcaagatcttttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatttgctcttggatcatctgaaccttctcagtagttt 15339156  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15339157 gatgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgtatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccat 15339256  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  15339257 tccaatacttgaatgataactattattatatgtgaactcgattaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcgagaacacaaatcctcaacaaa 15339356  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  15339357 tcctctagcgactgaattgtcctcttcgactgaccatctgtctgtcgatgatacgccgaactcaatctcagctacgaacccaaagcctcttgcaaacttt 15339456  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 700  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  15339457 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgagggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 15339538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 534; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 16412824 - 16412143
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  16412824 catacttccgaagttgtgacacatggaaaacgttgtccaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 16412725  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||     
T  16412724 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttca 16412625  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16412624 tgaaactcaaggtcattcctacgcttatcatgataactcttttgccaactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttcttagtagttt 16412525  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  16412524 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccaaccatataaagcctcgaaaggtgccat 16412425  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16412424 tccaatacttgaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctgaagaacacaaattctcaacaaa 16412325  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16412324 tcctctagcgactgaattgtcctctctgactgaccatctgtttgtggttgatactccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 16412225  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 700  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  16412224 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 16412143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 530; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 700
Target Start/End: Original strand, 12497836 - 12498517
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  12497836 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 12497935  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  12497936 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 12498035  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  12498036 tgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 12498135  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12498136 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccat 12498235  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12498236 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 12498335  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  12498336 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 12498435  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 700  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||    
T  12498436 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatttgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgat 12498517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 502; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 14877041 - 14876360
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  14877041 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcagtggtaatccaactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 14876942  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||     
T  14876941 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtaactctcaaaaacacgtggtctccttct 14876842  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||| |    
T  14876841 tgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtct 14876742  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14876741 gctgaacaatctcgggtcctaagaccgctctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccat 14876642  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14876641 tccaatactagaatgataactattattatatgtgaactcgatcaacggaatatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaa 14876542  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14876541 tcttctagcgactgaattgtcctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 14876442  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 700  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||| ||||||||    
T  14876441 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaatctcacaatctccttgat 14876360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 486; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 16807468 - 16806787
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| | | ||    
T  16807468 cataattccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaagttcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaaattttttcgatat 16807369  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| ||||| |  ||  || | ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  16807368 ctgatacggaccgaaaaatctcagagtcaacttctttgacttcaaagcacatccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 16807269  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |    
T  16807268 tgaaactcaagatcctttctgcgcttatcatgataattcttctgtcgactttgcgacgctttcattttctcttgaatcattttaactttctcagtagtct 16807169  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  16807168 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgtcat 16807069  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16807068 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaa 16806969  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  16806968 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaactttgaacccaaagcctcttgctaacttt 16806869  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 700  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||    
T  16806868 tccaaaacctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacctcacgatctccttgat 16806787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 471; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 697
Target Start/End: Original strand, 16371001 - 16371679
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||| |||||| ||||  | ||    
T  16371001 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacgacatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcaatacgccaccgtcccaactctttctgatat 16371100  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||||     
T  16371101 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacatccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtagtcttcttct 16371200  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  16371201 tgaaattcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 16371300  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  16371301 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccat 16371400  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16371401 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcaatcaatgaaagatgaatatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaa 16371500  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  16371501 tcctctagcgactgaatcgtcctttccgaccgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttt 16371600  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16371601 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatttcctt 16371679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 465; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Original strand, 17489438 - 17490110
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  17489438 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 17489537  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  17489538 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 17489637  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||    
T  17489638 tgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagttt 17489737  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  17489738 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccat 17489837  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  17489838 tccaatactagaatgataactattattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaga 17489937  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    || |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  17489938 tcttctaacgactgaatcatcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttt 17490037  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  17490038 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatcggacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 17490110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 453; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 700
Target Start/End: Original strand, 16691748 - 16692433
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  ||||| | ||    
T  16691748 catacttccgaagttgtgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccacacgatatgccaccgttccaaccctttccgatat 16691847  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
     ||||| |  ||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16691848 ttgatacgacccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 16691947  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||||| ||  | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |    
T  16691948 tgaaactcaagatccttcttgcgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttttcagtagtct 16692047  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16692048 gctgaacaatctcgggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatatccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccat 16692147  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16692148 tccaatactagaatgataactattgttgtatgtgaactcgatcaatggaagatgactatcccaagttcccccttgctcaagaacacaaactctcaacaaa 16692247  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcct----cttgcaaa 614  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||    
T  16692248 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatccgtctgtggatgataagctgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctctagcttgcaaa 16692347  T
Q  615 cttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 700  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||    
T  16692348 cttttccaaaatctagaagtaaatcttagatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacaatctccttgat 16692433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 441; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 16492723 - 16492051
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||    
T  16492723 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgaaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccaatat 16492624  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    ||||||  ||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  16492623 ctgatacagaccaataaatctcggagtcaacttctttgactttaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 16492524  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||    
T  16492523 tgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagttt 16492424  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||    
T  16492423 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgatacaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcacaaggtgtcat 16492324  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  16492323 tccaatactagaatgataactgttattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagtacctccttgctcaagaacacaaacccttaacaaa 16492224  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  16492223 tcttctaacgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgcggatgatacaccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttt 16492124  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  16492123 tccataatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 16492051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 437; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Original strand, 9522307 - 9522979
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||   | ||    
T  9522307 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcaaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaactctttttgatat 9522406  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  9522407 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 9522506  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| | ||| |||||||||||||    
T  9522507 tgaaagtcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgtgacgctttcatcttttcttgaatcattttaaccttctcagtagttt 9522606  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  9522607 gttgaacaatctctggtcctaagaccactctctcacctgactcaaaccaagacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccat 9522706  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  9522707 tccaatactagaatgataaatattattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagtccctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaa 9522806  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |    
T  9522807 tcttctagcgactgaaacgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactct 9522906  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  9522907 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 9522979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Original strand, 15247735 - 15248407
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| | ||    
T  15247735 catatttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggttgtaaacccactcgatacgccaccgttccaattctttccgatat 15247834  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    || ||| ||||||||  || |||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| || || ||||||||     
T  15247835 ctaatacggaccaatacacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacatgatctccttct 15247934  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||   | ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  15247935 tgaaactcattgtttttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 15248034  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  15248035 gttgaacaatttctggtcctaaaaccacactctcacctgactcaaaccaacacaacggagttctacatctccgactatacaaagcctcaaaaggtgccat 15248134  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| || |||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  15248135 tccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaactatatcaatagaagatgactatcccaagttcctccttgctcaattacacaaactctcaacaaa 15248234  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||||| ||||| ||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |    
T  15248235 tcctctaacgactaaatcgttctctccaactgaccatctgtctgctgatgatacgccgagctcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactct 15248334  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  15248335 tccaaaatctagaagtaaatctcatatctctatctgatacaatgctcaaaggaacaccatgcaacttcacaat 15248407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Original strand, 15208479 - 15209151
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||  | ||    
T  15208479 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgaaaattcgaaagatgcggttgtaaacccactcgatactccaccgttccaattctttctgatat 15208578  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||  |||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| || || ||||||||     
T  15208579 ctgattcggaccaataaacctcggagtcaacttcttttacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacatgatctccttct 15208678  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||||||||  | ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| || ||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  15208679 tgaaactcaatgtttttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctacgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 15208778  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  15208779 gttgaacaatttctggtcctaaaaccacactctcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgtccatataaagcctcaaaaggtgccat 15208878  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  15208879 tccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaatagaagatgactatcccaagttcctccttgctcaaatacacaaactctcaacaaa 15208978  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    || |||| |||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || || | | ||||||||||| | |    
T  15208979 tcttctaacgactgaatcattctctcagactgaccatctgtctgcggatgatacgccgagctcaacctcaacttagaacctacaacctcttgcaaaatct 15209078  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  15209079 tccaaaatctagaagtaaatctcatatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 15209151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Original strand, 15227247 - 15227919
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||| ||||||||| | ||  | ||    
T  15227247 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactgttccaactctctcagatat 15227346  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    ||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||     
T  15227347 ctggtacggaccaataaacttcggcgtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctgtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttct 15227446  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatca-tctgaactttctcagtagtt 317  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||   |||| | ||| |||| |  |||||     
T  15227447 tgaaactcaagatcctttctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacactttcatcttctctcttatcaatttgacctttttt-gtagtc 15227545  T
Q  318 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcca 417  Q
    |||||||| |  |||||||| || |  || | |||||  ||||||||||| || |||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||| |||||||    
T  15227546 tgctgaactaaatctggtcccaacattacaccttcactcgactcaaaccaacataacggagttctgcacctccaaccatacaaatcttcgaacggtgcca 15227645  T
Q  418 ttccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 517  Q
    | |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||| | |||||||||    
T  15227646 taccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggcaggtgactatcccaagctccaccttgcttaagtacacacactctcaacaa 15227745  T
Q  518 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 617  Q
    |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||  ||| ||||||||||| || |||||| | |||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  15227746 atcctctaacgactgaatcgttctctccgactgaccaattgtttgcggatgataagctgaactccacctcaactttgaacccaacgcctcttgcaaactt 15227845  T
Q  618 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  15227846 ttccaaaatctagatgtaaatcttggatctctatccgatacaatactcgatggaacaccatgcagcttcgcaat 15227919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 54 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 13972616 - 13971979
Alignment:
Q  54 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttct 153  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| || |||| ||| ||||| ||||||||| ||||  |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  13972616 tgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaactctatacgccacagttccaactctttctgaaatctgataaggaccaataaacttcggagtcaacttct 13972517  T
Q  154 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgata 253  Q
    | || || || ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  13972516 tagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgata 13972417  T
Q  254 actcttttgtcgactctgcgacgccttcatt--ttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactcttt 351  Q
     ||||| ||||||||||||||||| |||||   |||||||  || | || ||| || || |||||||| ||||| || |||||||| || | ||| ||||    
T  13972416 gctcttctgtcgactctgcgacgctttcatccgttctctt--attaacttaaccttttccgtagtttgttgaactatgtctggtcccaacatcacacttt 13972319  T
Q  352 cacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagt 451  Q
    | || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || ||||| || |||||    
T  13972318 ctcccgactcaaaccaacacaaaggagttctgcaccttcgaccatacaaggcttcaaacggtgccataccaatactcgaatggtaactattgttgtaagt 13972219  T
Q  452 gaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactga 551  Q
     ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||| | ||||||||  || || || |||||||||||||||    
T  13972218 aaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacaccctcaatagatcctctaaggattgtatcgtcctctccgactga 13972119  T
Q  552 ccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctat 651  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||    
T  13972118 ccatctgtctggggatgataagccgaactcagcctcaatttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcggatctctat 13972019  T
Q  652 ctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  13972018 ctgatacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaat 13971979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 13323183 - 13322511
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||   ||||||||||||||||| || || ||||| |  | ||| ||||| |||||||   | ||||| ||    
T  13323183 catacttccgaagctgcgacacatggaatacaccatgcaaattcgaaagatgtggtggaaaaccaatcctatatgccactgttccaatcctctccaatat 13323084  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||| | ||||||| |||||| |||||||| |||    
T  13323083 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacccccgtcataggagtaactctcagaaacacatggtctccctcc 13322984  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||  | |||  ||||||||  |||||||| ||||| |    
T  13322983 tgaaacccaagatctttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatcctttctatgatcatcttgactttctctgtagtct 13322884  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | ||||| |  || ||||| || ||  | || | |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  13322883 gatgaaccaaatccggtcccaacacagcactctgacctgactcaaaccagcataaaggagttctgcacctccgaccgtacaaagcttcgaatggtgccat 13322784  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||||| ||||| ||  | || || || || ||||| ||||| || || ||||||||||||| | | ||||||||||| ||||| | ||| |  |||    
T  13322783 accaatactcgaatggtaattgttgttgtaggtaaactctatcaaaggtaggtgactatcccaagcttcaccttgctcaagcacacatactcttaggaaa 13322684  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||| |||| |||||| | ||||||||||| |    
T  13322683 tcctctaaggattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaaccttaacctcgaacccaaaacatcttgcaaactct 13322584  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||| |||||||||||||| ||  |||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  13322583 tccagaatctagaagtaaacctcagatccctatctgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 13322511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Original strand, 14086271 - 14086943
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||||| |  |||||||| ||||| || |  ||||||||||||||||| || || |||||||| | ||||||||| || || ||| | ||  | ||    
T  14086271 catacttccgcaactgcgacacgtggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggcaaacccaccctataagccactgtcccgactctctcagatat 14086370  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||     
T  14086371 ctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatgatctccctct 14086470  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcatt--ttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 316  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||   |||||||  || | || ||| || || |||||    
T  14086471 tgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatccgttctctt--attaacttaaccttttccgtagt 14086568  T
Q  317 ttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcc 416  Q
    ||| ||||| || |||||||| || | ||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||||    
T  14086569 ttgttgaactatgtctggtcccaacatcacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagttctgcaccttcgaccatacaaggcttcaaacggtgcc 14086668  T
Q  417 attccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaaca 516  Q
    || |||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||| |    
T  14086669 ataccaatactcgaatggtaactattgttgtaagtaaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacaccctcaata 14086768  T
Q  517 aatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaact 616  Q
     ||||||||  || || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  14086769 gatcctctaaggattgtatcgttctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaatttcgagcccaaagcatcttgcaaact 14086868  T
Q  617 tttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
     ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  14086869 cttccagaatctagaagtgaacctcggatctctatctgatacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaat 14086943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 15953499 - 15952827
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || |||||||||   || ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  15953499 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatat 15953400  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| | |||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||| | | ||||| ||| || || ||||| ||     
T  15953399 ctgatacgaaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcgtacacccgtcataggagtaaatctcagaaatacatgatctccctct 15953300  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||  | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||   |||||||  |||||||| ||||| |    
T  15953299 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctctgtagtct 15953200  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | ||||| |  || ||||| || || || ||||| || ||||||||| | || || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  15953199 gatgaaccaaatccggtcccaacacaacactttctcccgactcaaacaaacataaaggagttctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 15953100  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||||| |||||  | || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||     
T  15953099 accaatactcgaatggcaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaac 15953000  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||  || || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |    
T  15952999 tcctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatatgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaaactct 15952900  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  15952899 tccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaactccatgtaacttcacaat 15952827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 390 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 11564852 - 11564545
Alignment:
Q  390 cgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctc 489  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11564852 cgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcaatcaacggaagatgactatcccaagttcctc 11564753  T
Q  490 cttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaa 589  Q
    ||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  11564752 ctttctcaagaacacacactctcagcaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactaaccatctgtctgcagatgatacgccgaactcaatttcaa 11564653  T
Q  590 cttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcaca 689  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11564652 cttcgaacccaaagcctcttgctaacttttccaaaatctagaagaaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcaca 11564553  T
Q  690 atttcctt 697  Q
    || |||||    
T  11564552 atctcctt 11564545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 174 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 15016131 - 15015634
Alignment:
Q  174 acaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcg 273  Q
    ||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |    
T  15016131 acaccggtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatccttcctacgcttatcatgataactcttttgtctactctgag 15016032  T
Q  274 acgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaa 373  Q
    |||| ||||| |||||    |||| || ||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||  |||||  | ||||| || ||| |||| |||||    
T  15016031 acgctttcatcttctccctaatcaacttaaccttctctgtagtttgttgaacaatttctggtcctagtaccacattctcaccggattcataccaacacaa 15015932  T
Q  374 cggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatga 473  Q
     |||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || || |||||  |||||||||||||||| |  ||||||    
T  15015931 tggagttctgcatctccgatcatacaatgcttcgaacggtgccattccaatgctagaatggtaactgttattgcaagtgaactcgatcaatgagagatga 15015832  T
Q  474 ctatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatg 573  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||            ||||||||||||||    
T  15015831 ctatcccaagttccgccttgctcaagtacacaaattctcaacaagtcctccaacgtctgaattgtcctctccga------------ctgcggatgatatg 15015744  T
Q  574 ccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaac 673  Q
    |||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  15015743 ccgaactcaaactcaacttagaacccaacgcctcctgcaaactcttcctaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatactcgacggaac 15015644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 411 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 14126744 - 14126464
Alignment:
Q  411 ggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattc 510  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14126744 ggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcaatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactc 14126645  T
Q  511 tcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttg 610  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  14126644 tcaacaaatcctctagcgactgaatcctcctcaccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttg 14126545  T
Q  611 caaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  14126544 aaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 14126464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 19 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 18134877 - 18134215
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| || |||||||| || || ||||| |||| ||||||||| ||||||||  | ||  ||||    
T  18134877 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagtttgaaagatgtggtggcaaaccaactctataagccactgttccaaccctctctgaaat 18134778  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||  | || || |||    
T  18134777 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagtaactctcagaaatacaagatcaccctcc 18134678  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||| |  ||||| || ||||| |    
T  18134677 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctccgatcattttgactttatctgtagtct 18134578  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | ||||| |  || ||||| || || || || || ||||||||||||||||| || ||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  18134577 gatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggattcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 18134478  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||    
T  18134477 accaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtaaa 18134378  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||| |  || || || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||| ||||||||||| |||||||  || |||||||| |    
T  18134377 tcctccaatgattggatcgtccgctccgactgaccatctgtctgaggatgataagttgaactcaacctcaacttcgaacccaaagtgtcctgcaaactct 18134278  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 681  Q
    |||| |||||| |||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||    
T  18134277 tccagaatctataagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgta 18134215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 12361073 - 12360401
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| |||||||| || ||  ||||    
T  12361073 catacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccttctctgaaat 12360974  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | || ||||| |||||||||||||  ||||||| | | ||||||| ||| || || || || |||    
T  12360973 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgatttcaatgcacgtcctacacatgtcatagaagtaactctcagaaatacatgatcaccctcc 12360874  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||    |||||||  |||||||| |||||      
T  12360873 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactttgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgactttctctgtagtcc 12360774  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | ||||| |  |||||||| || ||  | || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  12360773 gatgaaccaagtctggtcccaatacagcactctctcctgactcaaaccagcataatggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 12360674  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| | | |||| |||    
T  12360673 accaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatccgaagctccaccttgctcaagtacacacactttcaataaa 12360574  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||| |  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || || |    
T  12360573 tcctccaaagattgtatggtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgtaatctct 12360474  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||| |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||| | || ||||||||||||||||||||    
T  12360473 tccataatctagatgtgaacctcggatccctatccgacacaatactctacggtacaccatgtagcttcacaat 12360401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 19 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 8759613 - 8758942
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || || ||||  ||||| ||||| ||||| || || || || |||| ||| ||||||||||| | | | ||  ||||    
T  8759613 catacttccgcagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaat 8759514  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| | ||| || || || || ||     
T  8759513 ctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctct 8759414  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||  ||||||||  ||||| || ||||| |    
T  8759413 tgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtct 8759314  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
     |||||| |  || ||||| || || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  8759313 cctgaaccaaatccggtcccaacacaacactttctcctgactcaaaccaacacaacggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtgccat 8759214  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    ||| ||||| |||||||| || || || || |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| | |||||||||     
T  8759213 tcctatactcgaatgataactgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaag 8759114  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| || || ||||| |    
T  8759113 tcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactct 8759014  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 690  Q
    |||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8759013 tccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaa 8758942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 19 - 690
Target Start/End: Original strand, 41177120 - 41177791
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||||||||||| ||||| || || ||||  ||||| ||||| ||||| || || || || |||| ||| ||||||||||| | | | ||  ||||    
T  41177120 catacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaat 41177219  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||  | || |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| | ||| || || || || ||     
T  41177220 ctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctct 41177319  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||  ||||||||  ||||| || ||||| |    
T  41177320 tgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtct 41177419  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
     |||||| |  || ||||| |  || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  41177420 cctgaaccaaatccggtcccagcacaacactttctcctgactcaaaccaacacaacggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtgccat 41177519  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    ||| ||||| |||||||| || || || || |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| | |||||||||     
T  41177520 tcctatactcgaatgataactgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccatgttcaagcacacacactctcaacaag 41177619  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| || || ||||| |    
T  41177620 tcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactct 41177719  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 690  Q
    |||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41177720 tccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaa 41177791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 688
Target Start/End: Original strand, 13941622 - 13942291
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||||||||||| ||||| || || ||||  ||||| ||||| ||||| || || || || |||| ||| ||||||||||| | | | ||  ||||    
T  13941622 catacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaat 13941721  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||  | || |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| | ||| || || || || ||     
T  13941722 ctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctct 13941821  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||  ||||||||  ||||| || ||||| |    
T  13941822 tgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtct 13941921  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
     |||||| |  || ||||| || || || ||||| ||| | |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  13941922 cctgaaccaaatccggtcccaacacaacactttctccttattcaaaccaacacaacggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaagggtgccat 13942021  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    ||| ||||| |||||||| || || || || |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| | |||||||||     
T  13942022 tcctatactcgaatgataactgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaag 13942121  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| || || ||||| |    
T  13942122 tcctccattgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagtctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactct 13942221  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 688  Q
    |||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  13942222 tccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcac 13942291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 19 - 688
Target Start/End: Original strand, 10383567 - 10384235
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| |||||||| || || || ||||| |||| ||| ||||| || |||||| | ||  ||||    
T  10383567 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaaggtgtggtggcaaaccaactctatatgccactgtaccaactctctctgaaat 10383666  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| ||||||||||| || || ||||||||  | |||||||||||||| || ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  10383667 ctgatacggaccaatgaatttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccgacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 10383766  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||   |||| |   |||||||||||||| |    
T  10383767 tgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtct 10383866  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
      ||||| |  || ||||| || || |  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  10383867 catgaactaaatccggtcccaacacaatactttcacccgactcaaaccagcacaaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccat 10383966  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||| || |  ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||    
T  10383967 accaatactcgagtgatagctgttgttataagtgaactcaatcaaaggcaagtgactgtcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaa 10384066  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    || || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||| ||    
T  10384067 tcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgcaaacatt 10384166  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 688  Q
    |||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||  | ||||||||||| ||||||||    
T  10384167 tccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatact-aacggaacaccatgaagcttcac 10384235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 11304304 - 11303632
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||| |||||||||||||| | || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| |||||  |||||||  | ||  | ||    
T  11304304 catacttctgaagttgcgacacaagaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactattccaaccctctctgatat 11304205  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||    ||||||| ||| || || || || ||     
T  11304204 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacctgtcatagggaaaactctcagaaatacatgatcaccctct 11304105  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||| | ||  ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||   |||||||  || ||||| ||||  |    
T  11304104 tgaaactcaagagccttcatacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactttgcgacgctttcatcttttctcttatcatctttaccttctccgtagcct 11304005  T
Q  319 gctgaa-caatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcca 417  Q
    | |||| |||  || ||||| || || || || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||     
T  11304004 gatgaatcaaattc-ggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgcct 11303906  T
Q  418 ttccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 517  Q
    | |||||||| ||||| || || ||||| || |||||||  |||||||| || ||||||||||||| |||  |||||||||| ||||| | ||| |||||    
T  11303905 taccaatactcgaatggtaactgttattgtatgtgaactatatcaacggtaggtgactatcccaagctccaacttgctcaagtacacacactcttaacaa 11303806  T
Q  518 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 617  Q
    |||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||     
T  11303805 atcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaacttcgatcccaaggcgtcctgcaaactc 11303706  T
Q  618 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  11303705 ttccaaaatctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 11303632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 54 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 12850775 - 12850138
Alignment:
Q  54 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttct 153  Q
    ||||||||| ||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||||||| | ||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  12850775 tgcaaattccaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaactctctcagatatctggtatggaccaataaacttcggagtcaacttct 12850676  T
Q  154 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgata 253  Q
    | |||||||| ||||| |||| ||| |||| |||| ||||||||| |||||| || ||| | || |||||||||||  | ||| | ||||||||||| ||    
T  12850675 tagacttcaacgcacgacctatacccgtcacaggagtgactctcagaaacacatgatcttcctcttgaaactcaagggcctttattcgcttgtcatggta 12850576  T
Q  254 actcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttca 353  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||| || |||   ||||  |  ||||| |  |||||||| ||||| |  |||||||| || || || |||||     
T  12850575 actcttctgtcgactctgcgacactttcatcttttctcttatcaatttgactttttatgtagtttgatgaactaaatctggtcccaacactacactttct 12850476  T
Q  354 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 453  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | | ||| |||||||| |||||||| ||||| ||  | || || || ||||    
T  12850475 cccgactcaaaccaacacaatggagttctgcacctccgaccatacaaatctttgaacggtgccataccaatacttgaatggtaattgttgttgtacgtga 12850376  T
Q  454 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 553  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  12850375 actctatcaacgatagatgactatcccaagctccaccttgctcaagaacacacaatctcagcaaatcctctaacgactgaatcgttctctccgactgacc 12850276  T
Q  554 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 653  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||  |||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||| || ||  ||||||||||     
T  12850275 atctgtctacggattataagccgaactcaacctcaactttgaatccaaggcctcttgtaaactcttccaaaaccttgaagtgaacctcagatctctatcc 12850176  T
Q  654 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    || |||||||| || || |||||||| | |||||||||    
T  12850175 gacacaatgcttgatgggacaccatgcaacttcacaat 12850138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 19 - 688
Target Start/End: Original strand, 47123542 - 47124211
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||| ||||||| || || ||||| || |||| |||||||||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| || |||||| | ||  ||||    
T  47123542 catacctccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacagtaccaactctctctgaaat 47123641  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||| ||||| || ||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||| |||| |||| ||||||||| ||| || || || || |||    
T  47123642 ctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtcaaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcc 47123741  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| || |||   |||| |   |||||||||||||| |    
T  47123742 tgaaattcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgccgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtct 47123841  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
      || || |  || ||||| || || || |||||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  47123842 catgcaccaaatccggtcccaacacaacactttcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccat 47123941  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||||| || |||||||| || |||||||| || || ||||| || |  ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||    
T  47123942 accaatactcgagtgatagctgttgttataagtaaattcaatcaaaggcaagtgactgtcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaa 47124041  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    || || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||  ||||||| || |||||||| || || |||||||    
T  47124042 tcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaactttgaacccaaagcgtcctgtaaacttt 47124141  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 688  Q
    |||| || |||||||| || || ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| || |||||    
T  47124142 tccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatgctagacggaacaccatgaagtttcac 47124211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 452 - 697
Target Start/End: Original strand, 15061777 - 15062022
Alignment:
Q  452 gaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactga 551  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  15061777 gaactcaatcaatggaaaatgactatcccaagttccaccttgctcaagaacataaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctttccgactga 15061876  T
Q  552 ccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctat 651  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15061877 ccatctgtctgcgtatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactattccaaaatctagaagtaaatcttggatctctat 15061976  T
Q  652 ctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 697  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15061977 ctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatttcctt 15062022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 115 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 16836945 - 16836370
Alignment:
Q  115 aaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcc 214  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| || || || ||    
T  16836945 aaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcacc 16836846  T
Q  215 ttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagta 314  Q
     ||||||||||||||  | || || ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || ||    |||||||  || ||||||||     
T  16836845 ctcctgaaactcaagggccttcctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgtgacgctttcatcttttcccttatcatcttgaccttctcagtc 16836746  T
Q  315 gtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtg 414  Q
    || |  ||||| |  |||||||| || || || || || ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  16836745 gtctcatgaaccaaatctggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataacggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtg 16836646  T
Q  415 ccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaa 514  Q
    |||| || ||||| ||||| || || || || || |||||||| | ||| || || ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||  | ||||||    
T  16836645 ccatacctatactcgaatggtaactgttgttgtaggtgaactctaccaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacgcactctcaa 16836546  T
Q  515 caaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaa 614  Q
    ||||||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  16836545 caaatcctccaaggattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaa 16836446  T
Q  615 cttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 690  Q
    || ||||| |||||||| || || || ||||||||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  16836445 ctcttccagaatctagatgtgaacctcggatctctatccgatgcaatactcgacggaactccatgaagcttcacaa 16836370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 54 - 688
Target Start/End: Complemental strand, 10420541 - 10419907
Alignment:
Q  54 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttct 153  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||| | || ||| ||||| ||||| ||| ||||  |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||     
T  10420541 tgcaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaattctatacgccacagttccgactctttctgaaatctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcc 10420442  T
Q  154 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgata 253  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | || |||| ||| || || || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  10420441 tcgacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtaaccctcagaaaaacatgatcaccttcctgaaattcaaggtctttcctacgcttgtcatggta 10420342  T
Q  254 actcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttca 353  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   ||||||   |||||||| || || |  ||||| |  || ||||| || || || |||||     
T  10420341 gctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctaatcatcctgactttctccgtggtctcatgaaccaaatccggtcccaacacaacactttct 10420242  T
Q  354 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 453  Q
    || ||||||||||| || |  ||||| || || ||||||||||| ||||| || || |||||||| |||||||| |||||||| || || || || ||||    
T  10420241 cccgactcaaaccaacatagaggagtcctacacctccgaccatataaagcttcaaatggtgccataccaatacttgaatgataactgttgttgtatgtga 10420142  T
Q  454 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 553  Q
    | || ||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| |  || |  ||||||||||  || || ||||||||||||||||||||    
T  10420141 attctatcaatggtagatgactatcccaagctccaccctgctcaagtacacatacccttagtaaatcctctaaagattggattgtcctctccgactgacc 10420042  T
Q  554 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 653  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||  |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  10420041 atcagtctgcggatgataagccgaactcaacctcaattttgaacccaacgcgtcctgtaaactcctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatct 10419942  T
Q  654 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 688  Q
    || || || ||||| ||||||||||| | ||||||    
T  10419941 gacactatactcgacggaacaccatgcaacttcac 10419907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 115 - 690
Target Start/End: Original strand, 44776941 - 44777516
Alignment:
Q  115 aaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcc 214  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| || |||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| | ||| || || || ||    
T  44776941 aaatctgatacgggccaatgaacttcggagttaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacctgtcatcggagtgactcttagaaatacatgatcacc 44777040  T
Q  215 ttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagta 314  Q
     || || ||||||||  | || || | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||  ||||| || |||    
T  44777041 ctcttggaactcaagggccttcctcctcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgta 44777140  T
Q  315 gtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtg 414  Q
    || | |||||| |  |||||||| || || || ||||| |||| ||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||    
T  44777141 gtctcctgaactaaatctggtcccaacacaacactttctcctgtctcgaaccaacacaaaggagtcctgcaccttcgaccatataatgcttcgaatggtg 44777240  T
Q  415 ccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaa 514  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || || || || |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||    
T  44777241 ccattcctatactcgaatgataactgttgttgtaggtgaactctatcaatggcaggtgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaa 44777340  T
Q  515 caaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaa 614  Q
    ||| || || |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| || || |||    
T  44777341 caagtcttccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgagcccaaagcatcctgtaaa 44777440  T
Q  615 cttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 690  Q
    || ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  44777441 ctcttccagaacctagaagtaaacctcggatctctatccgacacaatgctagacggaacaccatgtagcttcacaa 44777516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 19 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 11961565 - 11960992
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||| | |||| |||||||||  |||||||| | ||  ||||    
T  11961565 catacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtgggggcaaatcaactctataagccactattccaactctctctgaaat 11961466  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||| ||| | |||||||| ||||||| |||||  |||| |||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  11961465 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaatttcctcgacttcaatgcacgtcgtacactcgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 11961366  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||| | || || ||||||||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||| || ||    ||||| |  || || ||||| || |    
T  11961365 tgaaactcaagagccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcaaagccttcatcttttcccttatcattttgaccttttcagtcgtct 11961266  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
      ||||| |  || ||||| || || || || |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  11961265 catgaaccacatccggtcccaacacaacactctcacctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 11961166  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||| ||||||    
T  11961165 gccaatactcgaatgatagctgttgttataagtgaactcaatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactcttaacaaa 11961066  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaactt 592  Q
    ||||| |  || || || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  11961065 tcctccaatgattggatcgtcctttccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaactt 11960992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 16330190 - 16329520
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||| || |||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||| | ||  ||||    
T  16330190 catacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaactctctctgaaat 16330091  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||||||| | | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  16330090 ctgatacggaccgatgaactttggagtcaactacctcgacttcaatgcacgtccaacacctgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 16329991  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||| | |||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||| || ||    |||| |   |||||||||||||| |    
T  16329990 tgaaactcaagagcctttctttgcttgtcatggtaactcttatgtcgactctgtgaagctttcatcttttcccttatcaacctgactttctcagtagtct 16329891  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
      ||||| |  || ||||| || || || || ||||||||||||||||| || |  ||||| || || |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  16329890 catgaaccaagtccggtcccaacacaacactctcacctgactcaaaccaacatagaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccat 16329791  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||    |||||||||    
T  16329790 accaatactcgagtgatagctgttgttataagtgaactcaatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgctaaagtacacacc--ctcaacaaa 16329693  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    || || |  || ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |    
T  16329692 tcttccaatgattgaattgtcctctccgactaaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcttgtaaactct 16329593  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||| || |||||| | || || ||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||| || |||||||||||    
T  16329592 tccagaacctagaaatgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccgtgcagcttcacaat 16329520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 155; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 115 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 16381362 - 16380788
Alignment:
Q  115 aaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcc 214  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| ||||| || || || ||    
T  16381362 aaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttaaaaatacatgatcacc 16381263  T
Q  215 ttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagta 314  Q
     ||| ||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||   |||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||  || || || |||    
T  16381262 atcccgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactct---gtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgaccttttctgta 16381166  T
Q  315 gtttgctgaacaatctctggtcctaagacca---ctctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaag 411  Q
    || |  ||||| |  || |||||  | ||||   | || || || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |    
T  16381165 gtctcatgaaccaaatccggtcccca-accataacactctctccggactcaaaccagcacaacggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaacg 16381067  T
Q  412 gtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattct 511  Q
    |||| || || ||||| ||||| || || || || || |||||||| ||||| || || ||| ||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | |||    
T  16381066 gtgcgatacctatactcgaatggtaactgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgattatcccaagctccaccttgttcaagcacacacactct 16380967  T
Q  512 caacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgc 611  Q
    ||||| |||||| |  || || ||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||    
T  16380966 caacagatcctccaatgattggatcatcctctccgactgaccatctgtctgagaatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcgtcctgc 16380867  T
Q  612 aaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 690  Q
    ||||| ||||| || ||||| || ||  | ||||| ||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  16380866 aaactcttccagaacctagaggtgaacatcggatccctatccgacacaatacttgaaggaactccatgtagcttcacaa 16380788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 348 - 688
Target Start/End: Original strand, 28754245 - 28754585
Alignment:
Q  348 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 447  Q
    |||||||| |||||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || ||||    
T  28754245 ctttcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctgttgttat 28754344  T
Q  448 aagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccga 547  Q
    |||| ||||| ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |  || |||||||||||||||||    
T  28754345 aagtaaactcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccga 28754444  T
Q  548 ctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatct 647  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||    
T  28754445 ctgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtaaacctcggatct 28754544  T
Q  648 ctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 688  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||||||    
T  28754545 ctatctgacacaatactagacggaacaccatgaagcttcac 28754585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 354 - 691
Target Start/End: Original strand, 17492563 - 17492900
Alignment:
Q  354 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 453  Q
    ||||||||||||||||  || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||| | |||||||| ||||| || || ||||    
T  17492563 cctgactcaaaccagcttaaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgatcggtgccataccaatattcgaatgataactattgttgtatgtga 17492662  T
Q  454 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 553  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  || || || |||||||||||||||||    
T  17492663 actctatcaacggtaggtgactatcccaagatccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaatgattggatcgtcctctccgactgacc 17492762  T
Q  554 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 653  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||     
T  17492763 atctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaagttcgaccccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatcc 17492862  T
Q  654 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    || ||||  | | | ||||||||||| | |||||||||    
T  17492863 gaaacaacacacaacggaacaccatgcaacttcacaat 17492900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 381 - 691
Target Start/End: Original strand, 14573889 - 14574199
Alignment:
Q  381 ctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccc 480  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || || || || || || |||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  14573889 ctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgattggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatccc 14573988  T
Q  481 aagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaact 580  Q
    ||| ||| ||||||||||| | ||| |   ||| ||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14573989 aagctccaccttgctcaagtatacacaccatcagcaaatcctctaacgactgaatcgtactctctgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaact 14574088  T
Q  581 caatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgt 680  Q
    ||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||   |||||||||||| ||||| ||||| | ||| ||||||    
T  14574089 caacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctgaaatctctatctgacacaatactcgacgaaactccatgt 14574188  T
Q  681 agcttcacaat 691  Q
    | |||||||||    
T  14574189 aacttcacaat 14574199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 348 - 685
Target Start/End: Original strand, 4678365 - 4678702
Alignment:
Q  348 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 447  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || || |    
T  4678365 ctttctcctgactcaaaccaacacaacggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaagggtgccattcctatactcgaatgataactgttgttgt 4678464  T
Q  448 aagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccga 547  Q
    | |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||| |  || || || |||||||||||    
T  4678465 aggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaagtcctccaatgattggatcgtcctctccga 4678564  T
Q  548 ctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatct 647  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || |||||     
T  4678565 ctgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatcc 4678664  T
Q  648 ctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagctt 685  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  4678665 ctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagctt 4678702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 312 - 583
Target Start/End: Original strand, 13001800 - 13002070
Alignment:
Q  312 gtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaag 411  Q
    |||||||| ||||| |  |||||||| || || || ||||| || ||||||||||| || || |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |    
T  13001800 gtagtttgatgaactaaatctggtcccaacactacactttctcccgactcaaaccaacataatggagttttgcacctccgaccatacaaagcttcgaacg 13001899  T
Q  412 gtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattct 511  Q
    ||||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| || ||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||    
T  13001900 gtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctattaacggtaaatgactatcccaagctcc-ccttgctcaagtacacacactct 13001998  T
Q  512 caacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaa 583  Q
    || ||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  13001999 catcaaatcctctaacgactgaatcgttctctccgaatgaccatctgtttgcgggtgataagccgaactcaa 13002070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 283
Target Start/End: Original strand, 14571448 - 14571710
Alignment:
Q  21 tacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatct 120  Q
    |||||| |||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||  || || || ||||||| ||| ||||| ||||||||  | ||  | ||||    
T  14571448 tacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatatggtggcaagcccactctatatgccactgttccaaccctctcagatatct 14571547  T
Q  121 gatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctg 220  Q
    |||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| || ||||| || ||    
T  14571548 gataaggaccaataaacttaggagtcaaattcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcaaaaacacatgatctccctcttg 14571647  T
Q  221 aaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcat 283  Q
    |||||||||  | || |||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  14571648 aaactcaagggccttcctacgcttgtcacggtaactcttcagtcgactctgcgacgctttcat 14571710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 354 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 26009189 - 26008948
Alignment:
Q  354 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 453  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |    
T  26009189 cctgactcaaaccaacacaaaggagttctgcaccttcgaccatacaaggcttcaaacggtgccataccaatactcgaatggtaactattgttgtaagtaa 26009090  T
Q  454 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 553  Q
    ||||  ||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  | ||||||||  || || || |||||||||||||||||    
T  26009089 actctctcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtagatcctctaaagattgtatcgtcctctccgactgacc 26008990  T
Q  554 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 595  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||| |||||    
T  26008989 atctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaatttcga 26008948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 144 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 8274816 - 8274281
Alignment:
Q  144 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 243  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  8274816 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 8274717  T
Q  244 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 343  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  8274716 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 8274617  T
Q  344 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 443  Q
      | || || || ||||||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| | || ||     
T  8274616 agcactctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 8274517  T
Q  444 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 543  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |     ||||| |||||||    
T  8274516 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactttgaatagtcctct 8274417  T
Q  544 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 643  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  ||||||||| || ||||||  |||||||||| || ||    
T  8274416 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaaccttcccaaaacttagaagtaaacctcgg 8274317  T
Q  644 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 679  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  8274316 atcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 8274281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 537 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 16828215 - 16828061
Alignment:
Q  537 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 636  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||| |    
T  16828215 gtcctctccgactgaccatctgtctacggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaaattcttccaaaatctagaagtga 16828116  T
Q  637 atcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    | || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  16828115 acctcggatctctatccgacacaatactcgacggaactccatgcaacttcacaat 16828061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 144 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 16743120 - 16742585
Alignment:
Q  144 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 243  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | ||| |||||| ||| ||||| | ||    
T  16743120 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgacactcaatatcctttctcctct 16743021  T
Q  244 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 343  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || ||||| |  || ||||  || |||||||| |     
T  16743020 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaacttccggtcctaacaa 16742921  T
Q  344 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 443  Q
      | || || || ||||||||||| || ||||| || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| | || ||     
T  16742920 agcactctctccggactcaaaccaacaaaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 16742821  T
Q  444 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 543  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| |  ||||||  |||||||||||| || |    |||||| |||||||    
T  16742820 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaacacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 16742721  T
Q  544 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 643  Q
    | | ||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  || |||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  16742720 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcctaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctggg 16742621  T
Q  644 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 679  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  16742620 atcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 16742585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 144 - 678
Target Start/End: Original strand, 15576473 - 15577007
Alignment:
Q  144 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 243  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| ||||| | ||    
T  15576473 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcctct 15576572  T
Q  244 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 343  Q
    | |||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || ||||| |   | ||||  || ||||| || |     
T  15576573 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtctctcgcacaacttccggtccaaacaa 15576672  T
Q  344 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 443  Q
      | || || || ||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||  | || ||     
T  15576673 agcactctctccagactcaaaccaacataacggtgttctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgcaaactgttg 15576772  T
Q  444 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 543  Q
    || ||||| ||||| |||||||  | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  15576773 ttgtaagtaaactcaatcaacgataaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 15576872  T
Q  544 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 643  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  15576873 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 15576972  T
Q  644 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccat 678  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||||| |||||    
T  15576973 atcccgatccgacacaatactagaaggaataccat 15577007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 471 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 16338591 - 16338371
Alignment:
Q  471 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 570  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| |  || |||||||| || |  || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  16338591 tgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacaccctaaacaaatcttccaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgat 16338492  T
Q  571 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 670  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||| | || || ||||| ||||| || ||||| || || ||    
T  16338491 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaactgaacctcggatccctatccgacacaatacttgacgg 16338392  T
Q  671 aacaccatgtagcttcacaat 691  Q
     ||||| || |||||||||||    
T  16338391 tacaccgtgcagcttcacaat 16338371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 157 - 672
Target Start/End: Original strand, 18748401 - 18748916
Alignment:
Q  157 acttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataact 256  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | |||  | ||||| |||||||| || || ||  | ||||||||||  |  || || | ||| |||||||||||    
T  18748401 acttcaaagcacgtccaacaccagttacagggttcactcttaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatgttcttcctcctcttatcatgataact 18748500  T
Q  257 cttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacct 356  Q
    ||| |||| |||||| ||| | ||||| || ||||| ||||||| |||||| || ||||| |  || |||| ||| |||||||| |   | |||||||||    
T  18748501 cttctgtctactctgagacactttcatcttatcttgaatcatcttaactttttccgtagtctcttgcacaacctccggtcctaacaaagcactttcacct 18748600  T
Q  357 gactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaact 456  Q
    || |||||||| |||||||  || || || ||||||||||||||| |||| || |||||||| || |||||||||||| |  | || || ||| | ||||    
T  18748601 gattcaaaccaacacaacgacgtcctacacctccgaccatacaaaccctcaaacggtgccataccgatactagaatgaaaattgttgttgtaactaaact 18748700  T
Q  457 cgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatc 556  Q
    | |||||||| | |       ||||| |  | |||||||| | |||||||  ||| ||||||||||| |    |||||| |||||||| | ||| |||||    
T  18748701 caatcaacggtaaacattcgacccaactgacaccttgctccaaaacacaagctcttaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatc 18748800  T
Q  557 tgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgat 656  Q
     ||||| |||||||| || |||||||| ||||| || |  ||||||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||| || |||||   ||||||     
T  18748801 ggtctggggatgataagcagaactcaacctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctcggatcctgatctgac 18748900  T
Q  657 acaatgctcgaaggaa 672  Q
    ||||| || |||||||    
T  18748901 acaatactagaaggaa 18748916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 192 - 434
Target Start/End: Original strand, 17192865 - 17193107
Alignment:
Q  192 actctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctt 291  Q
    ||||| |||||||| || || ||  |||||||||||| ||| ||||| | ||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| |||||||    
T  17192865 actctaaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctctt 17192964  T
Q  292 ggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccg 391  Q
    | ||||||| ||| || || ||| | |  || ||||  || |||| ||| || || ||||| ||| | |||||||| |||||||| || || || |||||    
T  17192965 gaatcatcttaaccttttccgtactctcttgcacaacttccggtcgtaacacaacactttctccttattcaaaccaacacaacggcgtcctacacctccg 17193064  T
Q  392 accatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatga 434  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| || ||||||| ||||    
T  17193065 accatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagcatga 17193107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 217 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 6712753 - 6712539
Alignment:
Q  217 cctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 316  Q
    ||||||||||||  || || || | ||| |||||||||||||| || | |||||| ||||| ||||| |||| ||| ||||||| ||| || |  |||||    
T  6712753 cctgaaactcaatgtccttcctcctcttatcatgataactcttctgcctactctgagacgctttcatcttcttttgaatcatcttaaccttttatgtagt 6712654  T
Q  317 ttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcc 416  Q
     |  || |||| ||| |||||||| |   | ||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||| || || | ||||||||||||||| || ||||||    
T  6712653 ctcttgtacaacctccggtcctaacaaagcactttcgcctgactcataccaacacaacggcgttctacaccttctaccatacaaagcctcaaacggtgcc 6712554  T
Q  417 attccaatactagaa 431  Q
    ||||| |||||||||    
T  6712553 attccgatactagaa 6712539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 13975462 - 13975172
Alignment:
Q  144 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 243  Q
    ||||||||| |  |||||||| |||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  13975462 gtcaacttcctacacttcaaaacacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 13975363  T
Q  244 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 343  Q
    | |||||||| ||||| |||| |||||| || |||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  |  ||||  || || ||||| |     
T  13975362 tatcatgatagctcttctgtctactctgagatgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttccacaacttccggccctaacaa 13975263  T
Q  344 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatga 434  Q
        || || || ||||||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||    
T  13975262 aggactctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatga 13975172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 294 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 14183179 - 14183007
Alignment:
Q  294 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgac 393  Q
    ||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||| || | ||| || || || |||||||  |||||| |||| ||||| || ||||| |||||||       
T  14183179 atcatcttaaccttctcaatagtctgctgaacaatttccgatcccaacacaacactttcactcgactcataccaacacaaaggtgttctacatctcctct 14183080  T
Q  394 catacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacgg 466  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||  ||||| | ||||| || ||||| ||||| ||||||||    
T  14183079 catacaaagcatcgaaaggagccataccaatacttaaatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacgg 14183007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 530 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 6152882 - 6152733
Alignment:
Q  530 ctgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatcta 629  Q
    |||||| |||||||| |  || ||||| ||||| ||||  || || ||||||||||||||||| |  | ||||||  |||||||||||| ||||||  ||    
T  6152882 ctgaatagtcctctctgtttgcccatcagtctgaggatagtaagcagaactcaatctcaacttagttctcaaagcagcttgcaaactttcccaaaactta 6152783  T
Q  630 gaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 679  Q
     |||||||||| ||||| | |||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  6152782 taagtaaatctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaataccatg 6152733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 19 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 31689154 - 31689067
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaac 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || |  ||||| |||| ||| ||||| ||||||||    
T  31689154 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtgtcaaaccaactctatatgccactgttccaac 31689067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 19 - 106
Target Start/End: Original strand, 31945070 - 31945157
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaac 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||  ||| ||||| ||||||||    
T  31945070 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactttatatgccactgttccaac 31945157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 509 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 13967392 - 13967222
Alignment:
Q  509 tctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctct 608  Q
    ||||||||||||||| ||   |||||| ||||||| || ||| ||||| ||||| ||||| |  || ||||||||||||||||| |  || |||||  ||    
T  13967392 tctcaacaaatcctccagactctgaatagtcctcttcgtctgcccatccgtctgaggatggttagcagaactcaatctcaacttagttccaaaagcagct 13967293  T
Q  609 tgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 679  Q
    ||||||| || ||||||  |||||||||| || || || | ||  || |||||||| ||||||| ||||||    
T  13967292 tgcaaaccttcccaaaacttagaagtaaacctcggttcccgatacgacacaatgctagaaggaataccatg 13967222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 360 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 6153052 - 6152978
Alignment:
Q  360 tcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatga 434  Q
    |||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || || |||||  | ||||||||||||    
T  6153052 tcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaatggagccatctcgatactagaatga 6152978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 552 - 646
Target Start/End: Original strand, 17193224 - 17193318
Alignment:
Q  552 ccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatc 646  Q
    ||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |  |||||||   |||||||||||| || |||  |||||||||| ||||||||    
T  17193224 ccatcggtctggggatgataagcagaactcaacctcaacttagttcccaaagaagcttgcaaactttccctaaacttagaagtaaaccttggatc 17193318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 594; Significance: 0; HSPs: 69)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 594; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 27668975 - 27668294
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27668975 catactttcgaagttgcgacacgtggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaaaat 27668876  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27668875 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 27668776  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27668775 tgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 27668676  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27668675 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 27668576  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27668575 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactgtcccaagttcctccttgttcaagaacacaaattctcaacaaa 27668476  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  27668475 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 27668376  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 700  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  27668375 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 27668294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 578; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 700
Target Start/End: Original strand, 19769861 - 19770542
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||    
T  19769861 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccgactctttccaatat 19769960  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  19769961 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 19770060  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19770061 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 19770160  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19770161 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 19770260  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19770261 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 19770360  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  19770361 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 19770460  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 700  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  19770461 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 19770542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 578; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 700
Target Start/End: Original strand, 40708681 - 40709362
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  40708681 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 40708780  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||     
T  40708781 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgcggtctccttct 40708880  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40708881 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 40708980  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40708981 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 40709080  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40709081 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 40709180  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  40709181 tcctctagcgactgaattgttctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 40709280  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 700  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||    
T  40709281 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttaacaatctccttgat 40709362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 576; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 702
Target Start/End: Original strand, 34566395 - 34567078
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  34566395 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 34566494  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  34566495 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 34566594  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34566595 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 34566694  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  34566695 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 34566794  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34566795 tccaatactagaatgataactattattatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 34566894  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  34566895 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 34566994  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||    
T  34566995 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgt 34567078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 572; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 702
Target Start/End: Original strand, 27518308 - 27518991
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  27518308 catactttcgaagttgtgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 27518407  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27518408 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgaggtctccttcc 27518507  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27518508 tgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 27518607  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  27518608 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccaaccatacaaagcctcgaacggtgccat 27518707  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27518708 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcccccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 27518807  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  27518808 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgtcgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 27518907  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||    
T  27518908 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgt 27518991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 570; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 22333372 - 22332691
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  22333372 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 22333273  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  22333272 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 22333173  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |    
T  22333172 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttcattttctcttggatcatccggactttctcagtagtct 22333073  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22333072 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccat 22332973  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22332972 tccaatacttgaatgataactattattgtctgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctgaacaaa 22332873  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22332872 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctttctgcggatgatatgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 22332773  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 700  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||| || ||||||||    
T  22332772 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacgatctccttgat 22332691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 568; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 702
Target Start/End: Original strand, 16356403 - 16357086
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  16356403 catactttcgaagttgcgacacatggagaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 16356502  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  16356503 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 16356602  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16356603 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 16356702  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16356703 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 16356802  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16356803 tccaatactagaatgataactattattatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 16356902  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16356903 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 16357002  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 702  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||    
T  16357003 tccaaaatctagaagtaaatcttggatccctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgt 16357086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 566; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 700
Target Start/End: Original strand, 41770743 - 41771424
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41770743 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaaaat 41770842  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41770843 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 41770942  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41770943 tgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 41771042  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41771043 gctgaacaatctctggtcctaagaccgctctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 41771142  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41771143 tccaatactagaatgataactattattataagtgagctcgatcaacggaagatgactgtcccaagttcctccttgttcaagaacacaaattctcaacaaa 41771242  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  41771243 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctgaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 41771342  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 700  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  41771343 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 41771424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 562; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 15000224 - 14999543
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  15000224 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 15000125  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  15000124 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 15000025  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    || ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15000024 tggaactcaagatcttttctacacttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 14999925  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  14999924 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagtctcgaaaggtgccat 14999825  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14999824 tccaatacttgaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaaattcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 14999725  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  14999724 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatatgtttgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaaacctcttgcaaacttt 14999625  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 700  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  14999624 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 14999543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 558; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 700
Target Start/End: Original strand, 27610255 - 27610936
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  27610255 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagttgcggtggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 27610354  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27610355 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 27610454  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27610455 tgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcggcgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 27610554  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27610555 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 27610654  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27610655 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactgtcccaagtccctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 27610754  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  27610755 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacaccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 27610854  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 700  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  27610855 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 27610936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 558; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 27685885 - 27685204
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  27685885 catactttcgaagttgcgacacgtggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 27685786  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  27685785 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 27685686  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27685685 tggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattctctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 27685586  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||    
T  27685585 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaggcctcgaaaggtgtcat 27685486  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27685485 tccaatacttgaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 27685386  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27685385 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 27685286  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 700  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  27685285 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 27685204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 556; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 37291979 - 37291300
Alignment:
Q  21 tacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatct 120  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  37291979 tactttcgaagttgagacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatct 37291880  T
Q  121 gatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctg 220  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37291879 gatacggaccaataaacttcggggtcaacttttttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttg 37291780  T
Q  221 aaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgc 320  Q
     |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37291779 gaactcaagatctttcctacacttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtctgc 37291680  T
Q  321 tgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattc 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37291679 tgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattc 37291580  T
Q  421 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 520  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37291579 caatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 37291480  T
Q  521 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 620  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37291479 ctctagtgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttc 37291380  T
Q  621 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 700  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  37291379 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 37291300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 545; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 29476558 - 29475898
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |     
T  29476558 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatac 29476459  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29476458 ctgatatggaccaatgaacttcgtggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacatccgtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 29476359  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  29476358 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgtgacgccttcattttctcttggatcatccgaactttttcagtagtct 29476259  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29476258 gttgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccat 29476159  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29476158 tccaatacttgaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaaaaaa 29476059  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  29476058 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgctgaactcaacctcaacttcgaaccccaagcctcttgcaaacttt 29475959  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 679  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29475958 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatg 29475898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 542; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 700
Target Start/End: Original strand, 22134569 - 22135250
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  22134569 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccactgttccaactctttccaatat 22134668  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22134669 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcc 22134768  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  22134769 tgaaactcaagatcttttctgcgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatctgaactttctcagtagtct 22134868  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22134869 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaactagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccat 22134968  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22134969 tccaatacttgaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacaaaaattctcaacaaa 22135068  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22135069 ttctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctatctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 22135168  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 700  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||| || ||||||||    
T  22135169 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacgatctccttgat 22135250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 519; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 700
Target Start/End: Original strand, 22348326 - 22349005
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||    
T  22348326 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtaggccaccgttccaactctttccaatat 22348425  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22348426 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcc 22348525  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
     ||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22348526 cgaaactcaagat--tttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgattctgcgacgctttaattttctcttgaatcatctgaactttctcagtagttt 22348623  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22348624 gctgaacaatctctggtcctaagactactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcacctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccat 22348723  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  22348724 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaatccccaacaaa 22348823  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22348824 tcattgagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctctgcttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 22348923  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 700  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  22348924 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 22349005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 499; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 697
Target Start/End: Original strand, 23573643 - 23574321
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  23573643 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 23573742  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  23573743 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 23573842  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  23573843 tgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 23573942  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  23573943 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccat 23574042  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  23574043 tccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaa 23574142  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  23574143 tcctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactct 23574242  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  23574243 tccaaaatctagaagtaaatcttggatcaataaatgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatttcctt 23574321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 460; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 700
Target Start/End: Original strand, 18775678 - 18776352
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||   ||||||||||||| ||||| | ||    
T  18775678 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacatcaccgttccaactctttccgatat 18775777  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  18775778 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcagggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaagacgtggtctccctcc 18775877  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  18775878 tgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttcattctctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 18775977  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18775978 gctgaacaatctcgggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccat 18776077  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    || ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  18776078 tcgaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatca-------atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaagtttcaacaaa 18776170  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |    
T  18776171 tcctctagcgactgaattgtcctctctgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacctaaggcctcttgcaaactct 18776270  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 700  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||    
T  18776271 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacctcataatctccttgat 18776352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 456; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 679
Target Start/End: Original strand, 23516443 - 23517102
Alignment:
Q  20 atacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatc 119  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||  | |||    
T  23516443 atacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcttgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcgatatgccaccgttccaactctttctgatatc 23516542  T
Q  120 tgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcct 219  Q
    | ||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23516543 taatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtctccttctt 23516642  T
Q  220 gaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttg 319  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||| ||| ||||  ||||||||    
T  23516643 gaaactcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatgatcttaaccttcttggtagtttg 23516742  T
Q  320 ctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccatt 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  23516743 ctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataccaagcctcaaaaggtgccatt 23516842  T
Q  420 ccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaat 519  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  23516843 ccaatactagaatgataactattattgtacgtgaactctatcaacggaagatgattatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaat 23516942  T
Q  520 cctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactttt 619  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||    
T  23516943 cctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaaccctcttgcaaactctt 23517042  T
Q  620 ccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 679  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23517043 tcaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 23517102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 442; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 672
Target Start/End: Original strand, 20798661 - 20799314
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||||||| ||||  | ||    
T  20798661 catatttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccaatcgatatgccaccggtccaactctttctgatat 20798760  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
     ||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  20798761 ttgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccggtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 20798860  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |    
T  20798861 tgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactttgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtct 20798960  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  20798961 gctgaacaatctttggtcctaagacctctctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccat 20799060  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  20799061 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcaatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactcgcaacaaa 20799160  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||    
T  20799161 tcctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtccgcggataataagccaaactcaatctcaacttagaacccaaaacctcttgcaaacttt 20799260  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 672  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20799261 tccaaaatctaaaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 20799314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 433; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 659
Target Start/End: Original strand, 23440126 - 23440766
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  23440126 catacttccgaagttgcgacacatggaatacttcttgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccctctcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 23440225  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||     
T  23440226 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttcattgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 23440325  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  23440326 tgaaacttaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcattttaactttctcagtagttt 23440425  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  23440426 gctgaacaatctctggttttaagaccactctttctcctaactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctgaaaaggtgccat 23440525  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23440526 tccaatactagaatgataactattattgtatgtaaactcaatcaatggaagatgactatcccaagttccaccttgctcaagaacacaaactctcaacaaa 23440625  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  23440626 tcctctagcgactgaatttttctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacaccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttt 23440725  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgataca 659  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23440726 tccaaaacctagaagtaaatcttggatctctatctgataca 23440766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 422; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 688
Target Start/End: Original strand, 25423090 - 25423759
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  25423090 catagttccgaagttgcaacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccacctgatacgccaccgttccaactctttccgatat 25423189  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| || ||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||     
T  25423190 ctgatacgggccaataaatctcggagtcaacttctttcacttcaacgcacgtccaacaccagtcacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 25423289  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||    
T  25423290 tgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagttt 25423389  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  25423390 gttgaacaatctttggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccat 25423489  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  25423490 tccaatactagaatgataactattattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatccctagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaa 25423589  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    || |||| ||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  25423590 tcttctaacgactgaatcgtcttctctgtctgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttt 25423689  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 688  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  25423690 tccaaaatctagaagtaaaccttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcac 25423759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 61 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 21498479 - 21497850
Alignment:
Q  61 tcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgactt 160  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||  | |||||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||    
T  21498479 tcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacaccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgactt 21498380  T
Q  161 caaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttt 260  Q
    |||  ||||||| ||||| |||| | || ||||||||||||  || || ||||| || |||||||| |  ||| | |||||||| ||||| |||||||||    
T  21498379 caattcacgtccaacaccggtcacaagagtgactctcaaaactacatgatctccctcttgaaactcgatgtctatcctacgcttatcatggtaactcttt 21498280  T
Q  261 tgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgact 360  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  21498279 tgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgttgaacaatctcgggtcctaaaaccacactttcacctgact 21498180  T
Q  361 caaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgat 460  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||    
T  21498179 caaaccaacacaacggagttctacatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacttttattttacgtgaactctat 21498080  T
Q  461 caacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtc 560  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||    
T  21498079 caatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacataaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgttctctccggctgaccatctatc 21497980  T
Q  561 tgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaa 660  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21497979 tgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaaattttccaaaatccagaagtaaatcttggatctctatctgacacaa 21497880  T
Q  661 tgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  21497879 tgctcgaa-gaacaccatgcaacttcacaat 21497850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 21984790 - 21984248
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||| || |||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||| | ||    
T  21984790 catacctctgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccagctctttccgatat 21984691  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||     
T  21984690 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccaatcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccctct 21984591  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||    
T  21984590 tgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataacttttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagttt 21984491  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  21984490 gttgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaatggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccat 21984391  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| || |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  21984390 tccaatactagaatgattactattattgtacgtgaactctatcaatgaaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaa 21984291  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtct 561  Q
    || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21984290 tcttctaacgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtct 21984248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 20468581 - 20467909
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| ||||| ||| | | | |||| || ||    
T  20468581 catacttccgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaaacccactcaatacgccactgtttctattctttctaatat 20468482  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||| | |||||||| ||| || | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  20468481 ctgacacggaccaataaacctcagagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacatggtctccttcc 20468382  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||| || |||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  20468381 tgaaattcaaggtctttcctacgtttatcatgataactcttcagtcaactctgcgacgctttcatcttttcttggatcaacttaacattctcagtagttt 20468282  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    ||||||| || | |||||| || || || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||| || ||| || || ||||||||    
T  20468281 gctgaacgatttatggtcccaaaactacactctcacctgactcgaaccaacacaacggagtcctacacctccgaccatgcagagcttcaaatggtgccat 20468182  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  20468181 tccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaaatctcaacaag 20468082  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||| | |||||||||  |||| || ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |    
T  20468081 tcctccaacgactgaatcatcctttcagactggccatctgtctgcggataatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactct 20467982  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  20467981 tccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgcttgacagaacaccatgtagcttcacaat 20467909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Original strand, 23471130 - 23471802
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||  | |     
T  23471130 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcgttggtaaacccactcgatacgccaccgttccaattctttctgatac 23471229  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||| ||| ||   |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||   || ||||||||||||| || || ||||||||     
T  23471230 ctgatacggaccaataaacctccaagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacttgagtgactctcaaaaatacatgatctccttct 23471329  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||| || | ||| ||||||| ||| |||||| ||||||    
T  23471330 tgaaactcaaggtcttgcctacgcttatcatgattactcttttgccgactctgagacgctttcatcttttgttgaatcatcttaaccttctcaatagttt 23471429  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | |||||||| | ||| || || || || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  23471430 gttgaacaatttatggccccaaaactacactctcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcatcaaaaggtgccat 23471529  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  23471530 tccaatactagaatgatagctgttattgtacgtgaactctattaatgggagatgactatcccaagttcccccttgctcaagtacacaaactctcaacaag 23471629  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||| | |||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| || |||||||| || || |||||||||| |||||| |    
T  23471630 tcctccaacgactgaatcattctctccgactgaccatctgtctacggatgatacgcctaactaaacctcaacttagaacctaaagcctctttcaaactct 23471729  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  23471730 tccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgcttgaaggaaaaccatgtagcttcacaat 23471802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 26739190 - 26738540
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||  | ||    
T  26739190 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcttgcaaattcgaaagatgcgttggtaaacccactcgatacgccaccgttccaattctttctgatat 26739091  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||| |||| |||||||| |  || |||| |||     
T  26739090 ctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacatccaacaccagtcacaggagtgaccctcaaaaatatatgatctctttct 26738991  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  26738990 tgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaactttctcagtagttt 26738891  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | || ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||  |||||||    
T  26738890 gttgtacaatttctggtcctaaaaccacactctcacctgactcgaaccaacacaatggagttctgcatctccaaccatacaaagccttaaattgtgccat 26738791  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||| |||| |||| ||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  26738790 tccattactggaataataactgttattgtacgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacataaactctcaacaaa 26738691  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||                 
T  26738690 tcctctaacgactgaatcgttctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttagaacctaaagcc------------- 26738604  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
             || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  26738603 ---------tataagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 26738540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 194 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 21339596 - 21339099
Alignment:
Q  194 tctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 293  Q
    ||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||     
T  21339596 tctcaaaaatacttggtctcgttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttcatcttttcttga 21339497  T
Q  294 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgac 393  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21339496 atcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatttctggtcctaaaaccacactctcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgac 21339397  T
Q  394 catacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttg 493  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21339396 catacaaagcctcgaatggtgccattccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaattctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttg 21339297  T
Q  494 ctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttc 593  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||     
T  21339296 ctcaagtacacaaactctcaacaagttctctaacgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaacctcaactta 21339197  T
Q  594 gagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    || || ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  21339196 gaacctaaaacctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 21339099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 19 - 688
Target Start/End: Complemental strand, 24750039 - 24749370
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||||| | |||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  24750039 catacttccgtaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactgttccaaccctctcagatat 24749940  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||     
T  24749939 ctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacccgtcataggagtgactctcaagaacacatgatctccctct 24749840  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |  |||   |||| || ||| || || ||||| |    
T  24749839 tgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatctgttctcttatcaacttaaccttttctgtagtct 24749740  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    ||||||| || |||||||| || | ||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  24749739 gctgaactatgtctggtcccaacatcacactttctcccgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 24749640  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||    
T  24749639 accaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaa 24749540  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||  || || || |||||||||||||||||||||||||  ||||| || | ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  24749539 tcctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctaaggatgctaagtcgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaaactct 24749440  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 688  Q
    |||| ||||| ||||| || || | ||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  24749439 tccagaatcttgaagtgaacctcgaatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagcttcac 24749370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 22236405 - 22235733
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| | ||| ||||||||  | ||  | ||    
T  22236405 catacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgacactgttccaaccctctctgatat 22236306  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | || |||| ||| || || || || |||    
T  22236305 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcc 22236206  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||  || |||||  |||||||| ||||| |    
T  22236205 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgaccatcttgactttctctgtagtct 22236106  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | ||||| | ||| ||||| || || || || || ||||||||||||||| | || |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  22236105 gatgaaccaactccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagaataaaggagtcttgcacctccgaccatacaaagcttcgaacgatgccat 22236006  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||||| ||||| || || || || || ||||| || |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||    
T  22236005 accaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaattctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtaaa 22235906  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||| |  || || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| |    
T  22235905 tcctccaaagattgtatcatcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaagcgtcttgcaaactct 22235806  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||| ||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  22235805 tccagaatctagaagtgaaccttggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 22235733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 21564451 - 21563786
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||| || | |||| | ||  | ||    
T  21564451 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactgtccaaactctatcagatat 21564352  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    ||||||||||||||| |||   || ||||| ||||| |||||||||||||| |  ||||  |||| | || ||||||||| |||||| |||||||||||     
T  21564351 ctgatatggaccaataaaccgtggagtcaaattcttagacttcaaagcacgactaacacgtgtcacatgagtgactctcagaaacacatggtctccttct 21564252  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatca-tctgaactttctcagtagtt 317  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||| | ||| | ||||||   |||| | ||| |||| || |||||     
T  21564251 tgaaactcaaggtcctttcttcgcttgtcatgataactcttctgccgactttgcgacactttcgtcttctctcttatcaatttgaccttt-tctgtagtc 21564153  T
Q  318 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcca 417  Q
    || ||||| || ||| |||| || || || |||       |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||    
T  21564152 tgatgaactatatctagtcccaacactacactt-------actcaaaccaacataacggagttctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgtca 21564060  T
Q  418 ttccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 517  Q
    | |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||| ||||| | ||||| |||    
T  21564059 taccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagcttcaccttgctcaagtacacacactctcagcaa 21563960  T
Q  518 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 617  Q
    |||||||| ||||||||| |   ||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  21563959 atcctctaacgactgaatcgctttctccgactgaccatatgtttgcggatgataagctgaactcaacctcaacttagaacccaacgcctcttgcaaactt 21563860  T
Q  618 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  21563859 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatccgacacaatgctcgatggaacaccatgcagcttcacaat 21563786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 21891244 - 21890572
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | ||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  21891244 catacttccgaagttgcgacacatgaaacatatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctcagatat 21891145  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||  | ||||||| |||||| || ||||| ||     
T  21891144 ctgatacggaccaataaactttggagtcaacttcttagacttcaacgcacatcctacaccagtcataggtgtaactctcagaaacacatgatctccctct 21891045  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||  | || |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| || |||   |||||||  |||||||| ||||| |    
T  21891044 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctatcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctctgtagtct 21890945  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | ||||| |  |||| ||| || || || ||||| || ||||||||||| || || |||||  || | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  21890944 gatgaaccaaatctgttcccaacactacactttctcccgactcaaaccaacataatggagtcttgtacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 21890845  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||| ||||||||| ||| | |||||||||  |||| ||||||| ||||    
T  21890844 accaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgagtatcccaagctccacgttgctcaagtgcacacattctcagcaaa 21890745  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| |    
T  21890744 tcctctaacgactgaatcgttctctctgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaaggcatcttgcaaactct 21890645  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  21890644 tccaaaatcttgaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgatggaactccatggaacttcacaat 21890572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Original strand, 22381082 - 22381754
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||||||||||||||||||  | ||  ||||    
T  22381082 catacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctctgaaat 22381181  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  22381182 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcatcggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 22381281  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||    ||||| |  || ||||||||||| |    
T  22381282 tgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcattttgaccttctcagtagtct 22381381  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
      ||||| |  || ||||| || || || || |||||||||||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| |||||  |||||||    
T  22381382 catgaaccaaatccggtcccaacacaacactctcacctgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaatagtgccat 22381481  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     || ||||| || |||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||    
T  22381482 acctatactcgagtgatagctgttgttatatgtgaactcaatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaa 22381581  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    || || |  || || || |||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| |    
T  22381582 tcttccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgcctaaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcctgcaaactct 22381681  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||| || ||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22381682 tccagaacctagaggtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaat 22381754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 23080574 - 23079902
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||| ||||||||  | ||  ||||    
T  23080574 catacttccgaagctgcaacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggtaaaccaactctataagccactgttccaaccctctctgaaat 23080475  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  23080474 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcttacacccgtcataggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 23080375  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||  ||  | ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| || ||    |||||||  |||||||||||||| |    
T  23080374 tgaaactatagggcctttctccgcttgtcatgataactcttctgtcgaatctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgactttctcagtagtct 23080275  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
      || || |  |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  23080274 catgcaccaagtctggtcccaacaccacactctctcctgactcaaaccagcatagaggagtcctgcacctccgaccatataaagcttcgaacggtgccat 23080175  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  23080174 accaatactcgagtgatagctgttgttatatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaa 23080075  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    || || |  || || || ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||| || |||||||| |    
T  23080074 tcttccaatgattggatcgtcctctccgactaaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcaaacccaaagcatcctgcaaactct 23079975  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||| || ||||| || || || | ||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||    
T  23079974 tccagaacctagaggtgaacctcgaatccctatccgatacaatactcgacggtacaccgtgcagcttcacaat 23079902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 19 - 688
Target Start/End: Original strand, 22502562 - 22503231
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||| | ||  ||||    
T  22502562 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaactctctctgaaat 22502661  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  22502662 ctgatacggaccgatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 22502761  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| || ||||| || ||    |||| |   |||||||||||||| |    
T  22502762 tgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgaagctttcatcttttcccttatcaacctgactttctcagtagtct 22502861  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
      ||||| |  |||||||| || || || || ||||| |||||||||||||| || |||||  | || |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  22502862 catgaaccaagtctggtcccaacacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcttacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccat 22502961  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||    
T  22502962 gccaatactcgagtgatagctgttgttataagtgaactcaatcaatggcaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaa 22503061  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    || || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| |    
T  22503062 tcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaatgcgtcctgtaaactct 22503161  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 688  Q
    |||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  22503162 tccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatgctcgatggaacaccatgaagcttcac 22503231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 19 - 688
Target Start/End: Complemental strand, 14887476 - 14886807
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| || |||| | | ||  ||||    
T  14887476 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgtaccaattctctctgaaat 14887377  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  14887376 ctgatacggaccaataaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 14887277  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||   |||| |   |||||||||||||| |    
T  14887276 tgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtct 14887177  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
      || || |  || ||||| || || || |||||||| |||||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  14887176 catgcaccaaatccggtcccaacacaacactttcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccggccatacaaggcttcgaacggtgccat 14887077  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  14887076 accaatactcgagtgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaa 14886977  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    || || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||  ||||||| || |||||||| || || |||||||    
T  14886976 tcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaactttgaacccaaagcgtcctgtaaacttt 14886877  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 688  Q
    |||| || |||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  14886876 tccagaacctagaagtgaacctcggatctctatctgacacaatgctagacggaacaccatgaagcttcac 14886807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 19 - 655
Target Start/End: Original strand, 22461835 - 22462471
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||||| | |||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||  ||||    
T  22461835 catacttccgcaattgcgacacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatacgccacagttccaactctttctgaaat 22461934  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    ||| || |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| | || |||| ||| || ||||| ||||||    
T  22461935 ctggtaaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcccacacccgtcataggagtaaccctcagaaaaacatggtcaccttcc 22462034  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    |||||||  |||||||| |||||||    
T  22462035 tgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctccctaatcatcttgactttctctgtagttt 22462134  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
      ||||| |  || || || || || || ||||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  22462135 catgaaccaattccggccccaacacaacactttctcccgactcgaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 22462234  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||| ||| ||||| || || || || || || || || ||||| || || ||||| ||||||| ||| || |||||||| ||||| ||||| |  |||    
T  22462235 accaacactcgaatggtaactgttgttgtatgtaaattctatcaatggtaggtgactgtcccaagctccaccctgctcaagtacacatattcttagtaaa 22462334  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||  || || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||| ||||| |    
T  22462335 tcctctaatgattggatcgtcctttccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaatttcgaacccaacgcatcttgtaaactct 22462434  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctga 655  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  22462435 tccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctga 22462471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 19 - 688
Target Start/End: Original strand, 25847958 - 25848627
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||| |||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||  || ||||| ||||||||| | ||  ||||    
T  25847958 catacttctgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgaggtggcaaaccaactctgtatgccacagttccaactctctctgaaat 25848057  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| ||||||||||| || || ||||||||  | || |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||| || || || || |||    
T  25848058 ctgatacggaccaatgaatttaggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgactctcaaaaaaacatgatcaccctcc 25848157  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatca-tctgaactttctcagtagtt 317  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||   |||| ||||| |||||||||||||     
T  25848158 tgaaactcaagatcctttttccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaatctga-ctttctcagtagtc 25848256  T
Q  318 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcca 417  Q
    |  ||||| |  || ||||| || || || || ||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  25848257 tcatgaaccaagtccggtcccaacacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgcca 25848356  T
Q  418 ttccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 517  Q
    | |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  ||||| ||||||| ||| ||||||||||| | ||| || ||||||||    
T  25848357 taccaatactcgagtgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactgtcccaagctccaccttgctcaagcatacacatcctcaacaa 25848456  T
Q  518 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 617  Q
    ||| || |  || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||| |     
T  25848457 atcttccaatgattgaattgttctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaattc 25848556  T
Q  618 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 688  Q
    ||||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  25848557 ttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatgctcgacggaacaccatgaagcttcac 25848627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 19 - 688
Target Start/End: Original strand, 20342165 - 20342834
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| || |||||| | ||  ||||    
T  20342165 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccactgtaccaactctctctgaaat 20342264  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||| |||| |||  ||||||||| ||| || || || |  |||    
T  20342265 ctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacctgtcaaaggggtgactctcagaaaaacatgatcacgctcc 20342364  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||   |||| |   |||||||||||||| |    
T  20342365 tgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtct 20342464  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
      ||||| |  || ||||| || || || || ||||| ||||||||| |||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  20342465 catgaaccaagtccggtcccaacacaacactctcacccgactcaaactagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccat 20342564  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||    
T  20342565 accaatactcgagtgatagctgttgttataagtgaactcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacaccctcaacaaa 20342664  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    || || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |    
T  20342665 tcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactct 20342764  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 688  Q
    |||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| || || || |||||||| ||||||||    
T  20342765 tccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatacttgacggtacaccatgaagcttcac 20342834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 54 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 28924218 - 28923581
Alignment:
Q  54 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttct 153  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| || |||| ||| ||||| ||||||||| ||||  |||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||      
T  28924218 tgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaactctatacgccacagttccaactctttctgaaatctgataaggaccgatgaactttggagtcaactttc 28924119  T
Q  154 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgata 253  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  28924118 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatggtcaccttcctgaaattcaaggtctttcctacgcttgtcatgata 28924019  T
Q  254 actcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttca 353  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||   ||||| || ||||| |  ||||| |  || ||||| || || || |||||     
T  28924018 gctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcctgactttttccgtagtctcatgaaccaaatccggtcccaaaacaacactttct 28923919  T
Q  354 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 453  Q
    || ||||| ||||| || |  ||||| || ||  |||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||||    
T  28923918 cccgactcgaaccaacatagaggagtcctacacttccgaccatataaagcttcgaatggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtga 28923819  T
Q  454 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 553  Q
    | || ||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| |  || | |||||||||||  || || ||||||||||||||||||||    
T  28923818 attctatcaatggtagatgactatcccaagctccaccctgctcaagtacacatacccttagcaaatcctctaaagattggattgtcctctccgactgacc 28923719  T
Q  554 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 653  Q
    ||| |||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||| || |||||||| ||||| |||||||||    
T  28923718 atcagtctgcggatgataagctgaactcaatttcaatttcgatcccaacgcatcttgtaaacttctccaaaacctcgaagtaaaccttgggtctctatct 28923619  T
Q  654 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    || || || ||||| ||||  ||||| | |||||||||    
T  28923618 gacactatactcgacggaatcccatgcaacttcacaat 28923581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 19 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 37545982 - 37545336
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| || |||||| | ||  ||||    
T  37545982 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacagtaccaactctctcagaaat 37545883  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctca-aaaacacgtggtctccttc 217  Q
    |||||| |||||||| ||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||| |||| |||| || || || || ||    
T  37545882 ctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaaacatgatcaccctc 37545783  T
Q  218 ctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtt 317  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| || |||   |||| |   ||||||||||||||     
T  37545782 ctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactgttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaaccttactttctcagtagtc 37545683  T
Q  318 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcca 417  Q
    |  || || |  || ||||| || || || |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||  ||||||    
T  37545682 tcatgtaccaaatccggtcccaacacaacactttcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaggcttcgaacagtgcca 37545583  T
Q  418 ttccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 517  Q
    | |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  37545582 taccaatactcgagtgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaa 37545483  T
Q  518 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 617  Q
    ||| || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||| || || || ||| ||    
T  37545482 atcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaaatt 37545383  T
Q  618 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgct 664  Q
    ||||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||||||    
T  37545382 ttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatgct 37545336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 54 - 691
Target Start/End: Original strand, 20821371 - 20822008
Alignment:
Q  54 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttct 153  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||| | || ||| ||||| ||||||||  ||||  |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||     
T  20821371 tgcaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaattctatacgccacagttccaaccctttctgaaatctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcc 20821470  T
Q  154 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgata 253  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | || |||| ||| || || || ||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||| ||    
T  20821471 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaaaacatgatcaccttcctgaaattcaaggtctttcttacgcttgtcatggta 20821570  T
Q  254 actcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttca 353  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||  ||||||||| ||||| |  ||||| |  || || || || || || |||||     
T  20821571 gctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcctaactttctctgtagtctcatgaaccaaatccggccccaacacaacactttct 20821670  T
Q  354 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 453  Q
    || ||||||||||| || |  ||||| || ||  |||||||||| ||||| || || |||||||| |||||||| |||||||| || || || || ||||    
T  20821671 cccgactcaaaccaacatagaggagtcctacacttccgaccatataaagcttcaaatggtgccataccaatacttgaatgataactgttgttgtatgtga 20821770  T
Q  454 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 553  Q
      || ||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| |  || | |||||||||||  || || ||||||||||||||||||||    
T  20821771 gttctatcaatggtagatgactatcccaagctccaccctgctcaagtacacatacccttagcaaatcctctaaagattggattgtcctctccgactgacc 20821870  T
Q  554 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 653  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||  |||||||||| |||||||| || || |||||||||    
T  20821871 atcagtctgcggatgataagccgaactcaacctcaattttgaacccaacgcgtcctgtaaactcctccaaaatcttgaagtaaacctcgggtctctatct 20821970  T
Q  654 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    || || || ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  20821971 gacactatactcgacggaacaccatgcaacttcacaat 20822008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 54 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 28895392 - 28894755
Alignment:
Q  54 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttct 153  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| || |||| ||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||      
T  28895392 tgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaactctatacgccagagttccaactctttctgaaatctgataaggaccgatgaactttggagtcaactttc 28895293  T
Q  154 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgata 253  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  28895292 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatggtcaccttcctgaaattcaaggtctttcctacgcttgtcatgata 28895193  T
Q  254 actcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttca 353  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||   ||||| || ||||| |  ||||| |  || ||||| || || || |||||     
T  28895192 gctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcctgactttttccgtagtctcatgaaccaaatccggtcccaaaacaacactttct 28895093  T
Q  354 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 453  Q
    || ||||| ||||| || |  ||||| || ||  |||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||||    
T  28895092 cccgactcgaaccaacatagaggagtcctacacttccgaccatataaagcttcgaatggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtga 28894993  T
Q  454 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 553  Q
    | || ||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| |  || | ||||| | |||  || || ||||||||||||||||||||    
T  28894992 attctatcaatggtagatgactatcccaagctccaccctgctcaagtacacatacccttagcaaattcactaaagattggattgtcctctccgactgacc 28894893  T
Q  554 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 653  Q
    ||| |||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||| |||||  | ||||| |||||| ||||||| || |||||||| ||||| |||||||||    
T  28894892 atcagtctgcggatgataagctgaactcaatttcaatttcgatcccaacacatcttgtaaacttctccaaaacctcgaagtaaaccttgggtctctatct 28894793  T
Q  654 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    || || || ||||| ||||  ||||| | |||||||||    
T  28894792 gacactatactcgacggaatcccatgcaacttcacaat 28894755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 180; E-Value: 8e-97
Query Start/End: Original strand, 115 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 17269722 - 17269148
Alignment:
Q  115 aaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcc 214  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| | ||| || || || ||    
T  17269722 aaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcacc 17269623  T
Q  215 ttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagta 314  Q
     || |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||  ||||| || |||    
T  17269622 ctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgta 17269523  T
Q  315 gtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtg 414  Q
    || | |||||| |  || ||||| || || || || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||    
T  17269522 gtctcctgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccaacacaacggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtg 17269423  T
Q  415 ccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaa 514  Q
    ||||||| ||||| ||||| || || || || || |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||    
T  17269422 ccattcctatactcgaatggtaactgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaa 17269323  T
Q  515 caaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaa 614  Q
    ||| || || |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | | |||||| ||||| |||| ||| || || |||    
T  17269322 caagtcttccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaa-ttagtctcaatttcgaacccagagcgtcctgtaaa 17269224  T
Q  615 cttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 690  Q
    || ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17269223 ctcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaa 17269148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 19 - 688
Target Start/End: Complemental strand, 24798882 - 24798213
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| || |||||| | ||  ||||    
T  24798882 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacagtaccaactctctctgaaat 24798783  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| || ||||| ||||| || ||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||| |||| |||| ||||||||| ||| || || || || |||    
T  24798782 ctgatacggtccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtcaaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcc 24798683  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcat-ctgaactttctcagtagtt 317  Q
     ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||  |||| || ||    ||||| |||| |||||||||||||     
T  24798682 agaaactcaagatccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctctcatcttttcccttatcattctga-ctttctcagtagtc 24798584  T
Q  318 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcca 417  Q
    |  ||||| |  ||  |||| || || || |||||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  24798583 tcgtgaaccaaatccagtcccaacacaacactttcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgcca 24798484  T
Q  418 ttccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 517  Q
    | |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  24798483 taccaatactcgagtgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactgtcccaagctcctccttgctcaagcacacacactctcaacaa 24798384  T
Q  518 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 617  Q
    ||| || |  || ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||  |||  ||||| ||||| || || || |||||     
T  24798383 atcttccaatgattgaattgtcctttccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcagtttcgaccccaaggcgtcctgtaaactc 24798284  T
Q  618 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 688  Q
    ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  24798283 ttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatgctagacggaacaccatgaagcttcac 24798213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 54 - 679
Target Start/End: Original strand, 20773678 - 20774302
Alignment:
Q  54 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttct 153  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| || |||| ||| ||||| ||||||||| ||||  |||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||      
T  20773678 tgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaactctatacgccacagttccaactctttctgaaatctgataaggaccgatgaactttggagtcaactttc 20773777  T
Q  154 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgata 253  Q
    | |||||||| ||||||||||| || ||||||||| | || |||| ||| || ||| | ||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||    
T  20773778 tcgacttcaatgcacgtcctacgcccgtcataggagtaaccctcagaaaaacatggcccccttcctgaaactgaagctctttccgacgcttgtcatgata 20773877  T
Q  254 actcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttca 353  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||  |||||||| ||||| |  ||||| |  || ||||| || || ||  ||||     
T  20773878 gctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctaatcatcttgactttctctgtagtctcatgaaccaattccggtcccaaaacaacattttct 20773977  T
Q  354 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 453  Q
    || ||||| ||||| || || |||||  | ||  |||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||||    
T  20773978 cccgactcgaaccaacataaaggagtcttacacttccgaccatataaagcttcgaatggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtga 20774077  T
Q  454 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 553  Q
    | || ||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| |  || | |||||||||||  || || | ||||||||||||||||||    
T  20774078 attctatcaatggtagatgactatcccaagctccaccctgctcaagtacacatacccttagcaaatcctctaaagattgga-tgtcctctccgactgacc 20774176  T
Q  554 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 653  Q
    ||| |||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||    
T  20774177 atcagtctgcggatgataagctgaactcaatttcaatttcgaacccaacgcatcttgtaaacttctccaaaatctcgaagtaaaccttgggtctctgtct 20774276  T
Q  654 gatacaatgctcgaaggaacaccatg 679  Q
    || || || ||||| ||||| |||||    
T  20774277 gacactatactcgacggaaccccatg 20774302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 19 - 581
Target Start/End: Original strand, 21404737 - 21405285
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||||  || || ||||||||||| || ||||||||||||| ||| || || || |||||| ||||| ||||    
T  21404737 catacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcatgtaagttcgaaagatgtggtggtaaacccactctatacgcaactgtcccaactctttccgaaat 21404836  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |  ||||| |||  ||| ||||  |||||||| || |  |||||||| ||||| |||| | || ||||||| |||||||| || |||||||      
T  21404837 ctgatacgagccaataaaccacggagtcagtttctttgattttagcgcacgtccaacaccggtcacaagagtgactctaaaaaacacatgatctccttg- 21404935  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
                   || |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| || |||   |||| || ||| ||||||||||| |    
T  21404936 ---------------ttcctacgcttatcatgataactcttttgtctactctgtgacaccttcatattttctctaatcaacttaaccttctcagtagtct 21405020  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaa--gcctcgaaaggtgcc 416  Q
    | |||||||| |||||||| |  | |||  | ||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||   || ||||| ||||||    
T  21405021 gttgaacaatgtctggtcccagtatcacaatctcaccggactcataccaacacaacgaagttctgcatctccgaccatacaacacgcttcgaacggtgcc 21405120  T
Q  417 attccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaaca 516  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  21405121 attccaatactagaatggtaactgttattataagtgaactcgatcaatgaaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacataaactctcaaca 21405220  T
Q  517 aatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 581  Q
    | ||||| | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  21405221 agtcctccaacgactgaattgtcctctccgtctgtccatctgtctgtggatgatacgccgaactc 21405285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 24736096 - 24735682
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||||| | |||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  24736096 catacttccgtaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactgttccaaccctctcagatat 24735997  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||     
T  24735996 ctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacccgtcataggagtgactctcaagaacacatgatctccctct 24735897  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |  |||   |||| || ||| || || ||||| |    
T  24735896 tgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatctgttctcttatcaacttaaccttttctgtagtct 24735797  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    ||||||| || |||||||| || | ||| |||||  | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  24735796 gctgaactatgtctggtcccaacatcacactttcttccgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 24735697  T
Q  419 tccaatactagaatg 433  Q
     |||||||| |||||    
T  24735696 accaatactcgaatg 24735682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 249 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 21831998 - 21831574
Alignment:
Q  249 tgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactc 348  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||   || | || ||| || |  ||||| || |||||||| || ||||| || || || |    
T  21831998 tgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttattagcttaaccttttatgtagtctggtgaacaatatccggtcccaacactacac 21831899  T
Q  349 tttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattata 448  Q
      ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||| |||||| ||||||||| | || || || || ||    
T  21831898 cctcacccgactcaaaccaacataacggagttctgcacctccgaccatacaaagcttcaaatggtgtcattcctatactagaaaggtaactgttgttgta 21831799  T
Q  449 agtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgac 548  Q
     |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||                   
T  21831798 cgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagtcccaccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcctctaacgactga--------------- 21831714  T
Q  549 tgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctc 648  Q
       |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21831713 ---ccatgtgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaacgcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttcgatctc 21831617  T
Q  649 tatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||  || |||||||||||    
T  21831616 tatctgacacaatgctcgacagaacacggtgcagcttcacaat 21831574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 19 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 23442778 - 23442472
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||| |||||   || ||||| ||||||||  | ||  | |     
T  23442778 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaaccactttgtatgccactgttccaaccctctcagataa 23442679  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||     
T  23442678 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacatcttagacttcaacacacgtcctacacccgtcataggagtgactctcaaaaacacatgatctccctct 23442579  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||   |||||||  |||||||| ||||| |    
T  23442578 tgaaactcaagagccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctctgtagtct 23442479  T
Q  319 gctgaac 325  Q
    | |||||    
T  23442478 gatgaac 23442472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 382 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 1150 - 919
Alignment:
Q  382 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 481  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||| |    
T  1150 tgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatccta 1051  T
Q  482 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 581  Q
    || ||| ||||||||||| ||||| | |||||  ||||||||||  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1050 agctccaccttgctcaagtacacacactctcagtaaatcctctaaagattgtatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactc 951  T
Q  582 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaa 613  Q
    || ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  950 aacctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaa 919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 453 - 688
Target Start/End: Complemental strand, 24716577 - 24716342
Alignment:
Q  453 aactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgac 552  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||  || || || ||||||||||||||||    
T  24716577 aactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcctctaatgattggatcgtcctctccgactgac 24716478  T
Q  553 catctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatc 652  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || | |||||||||    
T  24716477 catctgtctgaggatgctaagccgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatcttgaagtgaacctcgaatctctatc 24716378  T
Q  653 tgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 688  Q
     || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  24716377 cgacacaatactcgacggaacaccatgaagcttcac 24716342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 24737270 - 24737012
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||||| | |||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  24737270 catacttccgtaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactgttccaaccctctcagatat 24737171  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||     
T  24737170 ctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacccgtcataggagtgactctcaagaacacatgatctccctct 24737071  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgc 277  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  24737070 tgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgc 24737012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 223
Target Start/End: Original strand, 20573422 - 20573626
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| | ||    
T  20573422 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccgttccaattctttccgatat 20573521  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||| ||| | |  ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||| || || ||||||||     
T  20573522 ctgatacggaccaataaaccttgaagtcaacttccttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcagtggagtgactctcaaaaatacatgatctccttct 20573621  T
Q  219 tgaaa 223  Q
    |||||    
T  20573622 tgaaa 20573626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 459 - 688
Target Start/End: Complemental strand, 24620340 - 24620111
Alignment:
Q  459 atcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctg 558  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||  || || || ||||||||||||||||||||||    
T  24620340 atcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctg 24620241  T
Q  559 tctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatac 658  Q
    |||| ||||| || | ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || | ||||||||| || ||    
T  24620240 tctgaggatgctaagtcgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatcttgaagtgaacctcgaatctctatccgacac 24620141  T
Q  659 aatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 688  Q
    ||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  24620140 aatactcgacggaacaccatgaagcttcac 24620111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 400 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 28916517 - 28916226
Alignment:
Q  400 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 499  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||||| || ||||| || |||||||||||||||| ||| || ||||||||    
T  28916517 aagcttcgaatggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaattctatcaatggtagatgactatcccaagctccaccctgctcaag 28916418  T
Q  500 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 599  Q
     ||||| |  || | |||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||| |||    
T  28916417 tacacatacccttagcaaatcctctaaagattggattgtcctctccgactgaccatcagtctgcggatgataagctgaactcaatttcaatttcgatccc 28916318  T
Q  600 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    || || ||||| |||||| ||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||  ||||| | |||||||||    
T  28916317 aacgcatcttgtaaacttctccaaaacctcgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaatcccatgcaacttcacaat 28916226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 21343843 - 21343666
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  | ||    
T  21343843 catacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccgttccaactctttctgatat 21343744  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactct 196  Q
    || ||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  21343743 cttatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgctcgtccaacaccagtcacaggagtgactct 21343666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 459 - 691
Target Start/End: Original strand, 21496481 - 21496713
Alignment:
Q  459 atcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctg 558  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  || ||||| || |||||| |||||||||||     
T  21496481 atcaacgatagatgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaatgattgaatcgttctctcctactgaccatcta 21496580  T
Q  559 tctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatac 658  Q
    | |||| |||||| ||||||||||| || ||||| || ||||  || | ||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||    
T  21496581 tttgcgaatgataagccgaactcaaccttaacttagaacccagggcattttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacac 21496680  T
Q  659 aatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    ||| || || ||||| ||||| | |||||||||    
T  21496681 aatacttgatggaaccccatgcaacttcacaat 21496713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 144 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 21937548 - 21937013
Alignment:
Q  144 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 243  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || || |||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  21937548 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcacccttaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 21937449  T
Q  244 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 343  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || || || || |     
T  21937448 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggcccaaacaa 21937349  T
Q  344 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 443  Q
      | ||||| || || |||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||| |||| | || ||     
T  21937348 agcactttctccggattcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagcatgaaaactgttg 21937249  T
Q  444 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 543  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| ||||| |    
T  21937248 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtccttt 21937149  T
Q  544 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 643  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  21937148 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 21937049  T
Q  644 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 679  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  21937048 atcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 21937013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 577 - 691
Target Start/End: Original strand, 21407597 - 21407711
Alignment:
Q  577 aactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacacc 676  Q
    ||||||| |||||||| |  ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  21407597 aactcaaactcaacttaggacccaacgcctcctgcaaactcttccgaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatactcgacggaacacc 21407696  T
Q  677 atgtagcttcacaat 691  Q
    |||||||||||||||    
T  21407697 atgtagcttcacaat 21407711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 144 - 679
Target Start/End: Original strand, 24581219 - 24581753
Alignment:
Q  144 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 243  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || || | ||||||||| || ||  | |||||||||| ||| || || | ||    
T  24581219 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcacccttacaaacacgtgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 24581318  T
Q  244 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 343  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || || ||||  || ||||  || |||||||| |     
T  24581319 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtggtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 24581418  T
Q  344 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 443  Q
      | || || || ||||||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| | || ||     
T  24581419 agcactctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 24581518  T
Q  444 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 543  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      ||||||    | |||||||| |  ||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  24581519 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaaccaacaccttgctccaacacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 24581618  T
Q  544 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 643  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  ||||||||| || ||||||  |||||||||| || ||    
T  24581619 ctgtctg-ccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaaccttcccaaaacttagaagtaaacctcgg 24581717  T
Q  644 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 679  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  24581718 atcccaatccgacacaatactagaaggaataccatg 24581753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 144 - 679
Target Start/End: Original strand, 27011092 - 27011627
Alignment:
Q  144 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 243  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| | || | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| || || | ||    
T  27011092 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacatgattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 27011191  T
Q  244 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 343  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  27011192 tatcatgataactcttatgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 27011291  T
Q  344 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 443  Q
      | || || ||  |||||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||| |||| | || ||     
T  27011292 agcactctctccgaactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaatggtgtcattccgatactagcatgaaaactgttg 27011391  T
Q  444 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 543  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| |  ||| ||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  27011392 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctctaacacataagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 27011491  T
Q  544 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 643  Q
    ||| ||| ||||| ||||| ||||| || ||  |||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  27011492 ccgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcaaaactcaatctcaacttagttcccaaagcaacttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 27011591  T
Q  644 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 679  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  27011592 atcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 27011627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 144 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 11211054 - 11210732
Alignment:
Q  144 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 243  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || ||||| |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| |||||| || | ||    
T  11211054 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatctttcctcctct 11210955  T
Q  244 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 343  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| || || ||||| ||||| || ||||||| |||||| || ||||| |  || ||||  || |||||||| |     
T  11210954 tatcatgataactcttctgtctactctgagatgctttcatcttctcctgaatcatcttaactttttccgtagtctcttgcacaacttccggtcctaacaa 11210855  T
Q  344 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 443  Q
     || || || || ||||||||||| |||||||  || || || |||| ||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||| | |||||     
T  11210854 aacactctctccggactcaaaccaacacaacgatgtcctacacctcctaccatacaaggcctcaaacggtgtcattccaatactagaatgaaaactattg 11210755  T
Q  444 ttataagtgaactcgatcaacgg 466  Q
    || ||||| ||||| ||||||||    
T  11210754 ttgtaagtaaactcaatcaacgg 11210732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 21662524 - 21662297
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||| ||||||||||||||||| || || ||||  ||||||||| |||||||||| || |||||||||| ||| | ||  ||||||||| ||||| | ||    
T  21662524 catatttccgaagttgcgacacttgaaatacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggcaaacccactctatacgtcattgttccaactctttccgatat 21662425  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    ||||||   |||||| ||| |||  ||||||||||| || ||||| ||||| || |||||  |||||||| ||||||| | |||||| || ||| ||||     
T  21662424 ctgata-caaccaataaacctcgaagtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctatcataggagtgactcttagaaacacatgatctgcttct 21662326  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtc 247  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  21662325 tgaaattcaaggtctttcctacgcttgtc 21662297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 21665985 - 21665758
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||| ||||||||||||||||| || || ||||  ||||||||| |||||||||| || |||||||||| ||| | ||  ||||||||| ||||| | ||    
T  21665985 catatttccgaagttgcgacacttgaaatacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggcaaacccactctatacgtcattgttccaactctttccgatat 21665886  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    ||||||   |||||| ||| |||  ||||||||||| || ||||| ||||| || |||||  |||||||| ||||||| | |||||| || ||| ||||     
T  21665885 ctgata-caaccaataaacctcgaagtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctatcataggagtgactcttagaaacacatgatctgcttct 21665787  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtc 247  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  21665786 tgaaattcaaggtctttcctacgcttgtc 21665758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 531 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 25244323 - 25244175
Alignment:
Q  531 tgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctag 630  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||| ||||| |||||||| |  ||| |||| |||||||| |  |||||||||  ||||||||| | | ||||  |||    
T  25244323 tgaatagtcctctcggtctgaccatcagtctgaggatgataaggagaattcaacctcaacttagttcccaaagccgattgcaaactctcctaaaacttag 25244224  T
Q  631 aagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 679  Q
    ||||||| || |||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||    
T  25244223 aagtaaacctcggatctctatctgacacaatgctagatggaataccatg 25244175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 531 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 25308475 - 25308327
Alignment:
Q  531 tgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctag 630  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||| ||||| |||||||| |  ||| |||| |||||||| |  |||||||||  ||||||||| | | ||||  |||    
T  25308475 tgaatagtcctctcggtctgaccatcagtctgaggatgataaggagaattcaacctcaacttagttcccaaagccgattgcaaactctcctaaaacttag 25308376  T
Q  631 aagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 679  Q
    ||||||| || |||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||    
T  25308375 aagtaaacctcggatctctatctgacacaatgctagatggaataccatg 25308327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 219 - 434
Target Start/End: Original strand, 23503526 - 23503741
Alignment:
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||| ||| ||||| | ||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||| ||| || || ||||| |    
T  23503526 tgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtct 23503625  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
      || || |  || |||||||| |   | |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||  | |||||||||||||||||||  || || |||||    
T  23503626 cttgcaccacttccggtcctaacaaagcactttcaccagactcaaaccaacacaacggtgtcctagacctccgaccatacaaagccttaaacggagccat 23503725  T
Q  419 tccaatactagaatga 434  Q
     || | ||||||||||    
T  23503726 accgacactagaatga 23503741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 369 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 21229308 - 21229241
Alignment:
Q  369 cacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgata 436  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  21229308 cacaaaggagtcctgcatctgcgaccatacaatgcttcgaatggtgccattcctatactcgaatgata 21229241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 531 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 16065665 - 16065604
Alignment:
Q  531 tgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaactt 592  Q
    |||||||| |||||||  |||||||| ||||| |||| ||| || |||||||||||||||||    
T  16065665 tgaattgttctctccgcatgaccatcagtctgaggataataagcagaactcaatctcaactt 16065604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 592; Significance: 0; HSPs: 62)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 592; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 702
Target Start/End: Original strand, 16998600 - 16999283
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  16998600 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 16998699  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  16998700 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 16998799  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16998800 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 16998899  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16998900 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 16998999  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16999000 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 16999099  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16999100 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgtggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 16999199  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||    
T  16999200 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgt 16999283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 588; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 702
Target Start/End: Original strand, 16981752 - 16982435
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  16981752 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 16981851  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  16981852 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 16981951  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16981952 tggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 16982051  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16982052 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 16982151  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16982152 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 16982251  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16982252 tcctctagcgactgaattgttctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 16982351  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  16982352 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatgt 16982435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 588; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 702
Target Start/End: Original strand, 17063317 - 17064000
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  17063317 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 17063416  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  17063417 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 17063516  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17063517 tggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 17063616  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17063617 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 17063716  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17063717 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 17063816  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  17063817 tcctctagcgactgaattgttctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 17063916  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  17063917 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatgt 17064000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 576; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 702
Target Start/End: Original strand, 9609736 - 9610419
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  9609736 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 9609835  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  9609836 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 9609935  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9609936 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 9610035  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  9610036 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 9610135  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9610136 tccaatactagaatgataactattattatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 9610235  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  9610236 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 9610335  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||    
T  9610336 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgt 9610419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 572; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 702
Target Start/End: Original strand, 10868450 - 10869133
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  10868450 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccactgttccaactctttccaatat 10868549  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10868550 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 10868649  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10868650 tgaaattcaagatctttcctacgcttatcatgatagctcttttgtcgactctgcgacaccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 10868749  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  10868750 gctgaacaatctctggtcctaagaccaccctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccgtacaaagcctcgaacggtgccat 10868849  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10868850 tccaatactagaatgataactattgttataagtgaactcgatcaacgggagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 10868949  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10868950 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 10869049  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  10869050 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctctttgatgt 10869133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 572; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 702
Target Start/End: Original strand, 27217616 - 27218299
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  27217616 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 27217715  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27217716 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 27217815  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27217816 tgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgtatcatctgaactttctcagtagttt 27217915  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27217916 gctgaaaaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 27218015  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27218016 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgattaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 27218115  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  27218116 tcctctagcgactgaattgttctgtccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 27218215  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||    
T  27218216 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgt 27218299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 566; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 44386412 - 44385731
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  44386412 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 44386313  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44386312 ctgatacggaccaatgaatttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 44386213  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44386212 tgaaattcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcgttttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 44386113  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44386112 gctgaacaatctctggtcctaagaccgctctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 44386013  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44386012 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagtccctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 44385913  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44385912 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgatcatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 44385813  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 700  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||    
T  44385812 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatccccttgat 44385731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 562; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 22325699 - 22325018
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  22325699 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 22325600  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22325599 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttgtttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 22325500  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22325499 tgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 22325400  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22325399 gctgaacaatctctggccctaagaccgctctttctcctgattcaaaccaacaccacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 22325300  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22325299 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactgtcccaagttcctccttgttcaagaacacaaattctcaacaaa 22325200  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  22325199 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 22325100  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 700  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  22325099 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 22325018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 556; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 702
Target Start/End: Original strand, 17066978 - 17067658
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  17066978 catactttcgaagt-gcgacacatgaaaaacgt-gtgcaa-ttcgaaagatgcggcggtaaacccactcgtaaagccaccgttccaactctttccaatat 17067074  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  17067075 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 17067174  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17067175 tggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 17067274  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17067275 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 17067374  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17067375 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 17067474  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  17067475 tcctctagcgactgaattgttctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 17067574  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  17067575 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatgt 17067658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 554; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 700
Target Start/End: Original strand, 24261970 - 24262651
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  24261970 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 24262069  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
     |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  24262070 atgatacagaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 24262169  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24262170 tggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 24262269  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24262270 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccat 24262369  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24262370 tccaatacttgaatgataactattattgtatgtggactcgatcaacgggagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 24262469  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24262470 tcctctagcgactgaattgtcctctctgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 24262569  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 700  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  24262570 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 24262651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 554; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 700
Target Start/End: Original strand, 24709633 - 24710314
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  24709633 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtacaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 24709732  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  24709733 ctaatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 24709832  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24709833 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 24709932  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||    
T  24709933 gctgaacaatctctggtcctaagaccgctctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaggcctcaaacggtgtcat 24710032  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24710033 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 24710132  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  24710133 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 24710232  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 700  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  24710233 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgcttgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 24710314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 550; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 700
Target Start/End: Original strand, 27370869 - 27371550
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  27370869 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaatccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 27370968  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  27370969 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacatcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 27371068  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27371069 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 27371168  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27371169 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacatagttcttcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 27371268  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27371269 tccaatactagaatggtaactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 27371368  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  27371369 tcctctagcgactgaattgtcctctctgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 27371468  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 700  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  27371469 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 27371550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 498; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 21145873 - 21145201
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||    
T  21145873 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgataagccatcgttccaactctttccaatat 21145774  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    ||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21145773 ctgatacagatcaataaacttcggggtcaacttctttgatttcaaagcacgtcctacacccgtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 21145674  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21145673 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatctgaactttctcagtagttt 21145574  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21145573 gctggacaatctttggtcctaagaccactctttcacctaactcaaaccagcacaacggagttttgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccat 21145474  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||           |||    
T  21145473 tccaatactagaatgataactattgttgtatgtgaactcgatcaacggaagatggctatcccaagttcctccttgctcaagaacac-----------aaa 21145385  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  21145384 tcctctagcgactgaattgtcctctctgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaaacttt 21145285  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||    
T  21145284 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttaatgt 21145201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 477; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Original strand, 23188608 - 23189279
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| |||||||||| ||||| | ||    
T  23188608 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatctcactcgatacgccatcgttccaactctttccgatat 23188707  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23188708 ctgatacggaccaataaatcttggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacatgtggtctccttcc 23188807  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||   | ||| ||||||||||| |    
T  23188808 tgacactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatctatttaaccttctcagtagtct 23188907  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23188908 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacaca-cggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccat 23189006  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    ||| | |||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||    
T  23189007 tcctaaactagaatgataactattgttgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaaaaacacaaactctcaataaa 23189106  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23189107 tcctctagcgactgaactgtcctctccgactgaccatctatctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 23189206  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  23189207 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacctcacaat 23189279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 471; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 697
Target Start/End: Original strand, 24675089 - 24675767
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  24675089 catacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatccaactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 24675188  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||     
T  24675189 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggggtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 24675288  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  24675289 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 24675388  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  24675389 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaatggagttctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccat 24675488  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  24675489 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcaatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacagactctcagcaaa 24675588  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  24675589 tcctctagcgactgaatcatcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactct 24675688  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||    
T  24675689 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatatgatacaatgctcgaaagaacaccatgcaacttcacaatctcctt 24675767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 467; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 24708325 - 24707647
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  24708325 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgtcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 24708226  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||  ||  | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  24708225 ctgatacggaccaaaaaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 24708126  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||||| || || ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  24708125 tgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgatatttcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 24708026  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  24708025 gctgaacaatttctggtcctaagaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccat 24707926  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||    
T  24707925 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcaatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaaccctcaataaa 24707826  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  24707825 tcttctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactct 24707726  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 697  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  24707725 tccaaaatctaaaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcataatttcctt 24707647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 459; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 537
Target Start/End: Original strand, 16924860 - 16925378
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  16924860 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 16924959  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  16924960 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 16925059  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16925060 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 16925159  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16925160 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 16925259  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16925260 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 16925359  T
Q  519 tcctctagcgactgaattg 537  Q
    |||||||||||||||||||    
T  16925360 tcctctagcgactgaattg 16925378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 459; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 21326109 - 21325431
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||| | ||    
T  21326109 catacttctgaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgtcccaactctttccgatat 21326010  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  21326009 ctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 21325910  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  21325909 tgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaactttctcagtggttt 21325810  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  21325809 gttgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacccgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccagataaagcctcaaaaggtgccat 21325710  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  21325709 tccaatactagaataataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagcacacaaactctcaacaaa 21325610  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  21325609 tcctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccggactcaatctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttt 21325510  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  21325509 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatataatgctcgacagaacaccatgcaacttcacaatttcctt 21325431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 420; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 24878838 - 24878319
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  24878838 catactttcgaagttgcgacagatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccacttggtaagccaccgttccaactctttccaatat 24878739  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24878738 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcc 24878639  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  24878638 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatccgaactttctcagtagttt 24878539  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  24878538 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcacctccgaccatataaagcctcgaaaggtgtcat 24878439  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24878438 tccaatactataatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaatcctcaacaaa 24878339  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgt 538  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  24878338 tcctcgagcgactgaattgt 24878319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 412; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 22757306 - 22756630
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  22757306 catacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 22757207  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||     
T  22757206 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgatttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctctttct 22757107  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| || ||||||||||||| | |    
T  22757106 tgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcaccttaactttctcagtaatct 22757007  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  22757006 gttgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgactc--accaacacaacggagttctacatctccgaccatataaagcctcaaagggtgccat 22756909  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    ||||||||||||| | || || ||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||  |||||||||    
T  22756908 tccaatactagaacggtaactgttattgtacgtgaagtctatcaacggaagatgactatccgaagtccctcctttctcaagtacacaaaccctcaacaaa 22756809  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |    
T  22756808 tcctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgtgtatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgaaaactct 22756709  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 697  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  22756708 tccaaaatctagaggtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcctt 22756630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 406; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 688
Target Start/End: Original strand, 23063677 - 23064346
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||  | ||    
T  23063677 catacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttcagatat 23063776  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||| | |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  23063777 ctgaaacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaaaacgtggtctccttct 23063876  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||    
T  23063877 tgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtctactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagttt 23063976  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  23063977 gttcaacaatctctggtcctaagaccacactttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcataaggtgccat 23064076  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  23064077 tccaatacttgaatgataactattattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagtacctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaa 23064176  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    || || |  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  23064177 tcttcaaaagactgaatcatcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttt 23064276  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 688  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  23064277 tccaaaatctagaagtaaaacttggatctctatctgacacaatgcttgaaggaacaccatgcaacttcac 23064346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 314 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 41608933 - 41608547
Alignment:
Q  314 agtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggt 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41608933 agtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggt 41608834  T
Q  414 gccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctca 513  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41608833 gccattccaatacttgaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctca 41608734  T
Q  514 acaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaa 613  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41608733 acaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctacggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaa 41608634  T
Q  614 acttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 700  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||    
T  41608633 acttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctgtctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatccccttgat 41608547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 77 - 672
Target Start/End: Complemental strand, 24826067 - 24825472
Alignment:
Q  77 taaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctaca 176  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| | ||||  | |||||||| | |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||    
T  24826067 taaacccactcgatacgccaccgtcccaattctttctgatatctgatacgaaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaaca 24825968  T
Q  177 ccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacg 276  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||||| || |  |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24825967 ccagtcacaggagtgactcttaaaaatacattatctccttcctaaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcctttgtcgactctgcgacg 24825868  T
Q  277 ccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacgg 376  Q
    | ||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || || || || ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  24825867 ctttcatcttttcttggatcatcttaaccttctcagtagtttgctgaacaatttctggtcccaaaactacactctcacctgactcaacccaacacaacgg 24825768  T
Q  377 agttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgacta 476  Q
    ||| || || ||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||    
T  24825767 agtcctacacctccgaccatacagagcttcaaaaggtgccataccaatactagaatgttaactattattatacgtgaactctatcaacgggagatgacta 24825668  T
Q  477 tcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccg 576  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24825667 tcccaagttccaccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcttccagcgactgaatcgttctttccgattgaccatctgtctgcggatgatacgccg 24825568  T
Q  577 aactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 672  Q
    |||| || |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24825567 aacttaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 24825472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 277; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 30211760 - 30211088
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||||  || || |||||||||||||| ||||||||||||  ||| || |||   |||||||||||| ||||    
T  30211760 catacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcatgtaagttcgaaagatgcggtggtaaacccactttatacgcaaccaccccaactttttccgaaat 30211661  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| || ||||| ||| |||| ||||  |||||||| || |  || ||||| ||||| |||| | |  ||||||| |||||||| |||||||||||     
T  30211660 ctgatacgggccaataaacctcggagtcagtttctttgattttagcgcccgtccaacaccggtcacatgggtgactctaaaaaacacatggtctccttct 30211561  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||   |||| || ||| ||||||||||| |    
T  30211560 tgaaactcaagatccttcctacgcttatcacggtaactcttttgtctactctgcgacgctttcatcttttctctaatcaacttaaccttctcagtagtct 30211461  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | |||| ||| | ||||| ||  || || || |||   |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||    
T  30211460 gttgaataatgtatggtcttagtactacactctcattggactcataccaacacaacagagttctgcatctccgaccatacaacgtttcgaacggtgccat 30211361  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  30211360 tccaatgctagaatggtaactgttattgtaagtgaactcgaccaatggaagatgactatcccaagttcccccttgctcaagtacacaaactctcaacaag 30211261  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |    
T  30211260 tcctccaacgactgaattgtcctctccgtctgtccatctgtctgcggatgatacaccgaactcaaactcaacttagaacccaacgcctcctgcaaactct 30211161  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30211160 tccaaaatctagaagtaaatcttggatccctatctgatacaatactcgatggaacaccatgtagcttcacaat 30211088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 23 - 691
Target Start/End: Original strand, 45529121 - 45529783
Alignment:
Q  23 cttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctga 122  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||   | || ||| |||||||| | ||||||||||||| ||| || ||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  45529121 cttccgaagttgtgacacatgaaacacatcacgtaagttcaaaagatgcagtggtaaacccactctatacgcaaccgtcccaactctttccgaaatctga 45529220  T
Q  123 tatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaa 222  Q
    |||||  |||| ||| |||| ||||  |||||||| || |  |||||||| |||||||||| | || ||||||||| |||||| |||||| |      ||    
T  45529221 tatgggtcaataaacctcggagtcagtttctttgattttagcgcacgtccaacaccagtcacaagagtgactctcataaacacatggtcttc------aa 45529314  T
Q  223 actcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctg 322  Q
    |||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| || |||   |||| || ||| |||| |||||| || ||    
T  45529315 actcaagatccttcctaggcttatcatgataactcttttgtctactctgcgatgctttcatcttttctctaatcaacttaaccttcttagtagtctgttg 45529414  T
Q  323 aacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattcca 422  Q
    |||||| || ||||| || ||||| || ||||| |||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  45529415 aacaatgtccggtcccaataccacactctcaccggactcataccaacacaatggagttttgcatctccgaccatacaacgcttcgaacggtgccattcca 45529514  T
Q  423 atactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcct 522  Q
    || ||| |||| || || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  45529515 atgctaaaatggtaactgttattataaatgaactcgatcaatggaagatgattatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctgaacaagtcct 45529614  T
Q  523 ctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttcca 622  Q
    | | ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||    
T  45529615 ccaacgactgaattgtcctctacgtctgtccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaaactcaacttagaacccaacgcctcctgcaaactcttcca 45529714  T
Q  623 aaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  45529715 aaatctagaagtaaatcttggatccctatctgatacaatactcgatgcaacaccatgtagcttcacaat 45529783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 27365922 - 27365250
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||| || |  ||||||||||||||||| || ||||| || |||| ||| ||||| ||||||||| ||||  ||||    
T  27365922 catacttccgcaactgcgacacatggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaactctatacgccacagttccaactctttctgaaat 27365823  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||| ||     
T  27365822 ctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgaccctcaagaacacatgatctccctct 27365723  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |  |||   || | || ||| || || |||||||    
T  27365722 tgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatctgttctcttattaacttaaccttttccgtagttt 27365623  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | ||||| || |||||||| || | ||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||| || || || ||||||||    
T  27365622 gttgaactatgtctggtcccaacatcacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagttctgcaccttcgtccatacaaggcttcaaacggtgccat 27365523  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||| | |    
T  27365522 accaatactcgaatggtaactattgttgtaagtaaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacaccctcaataga 27365423  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  27365422 tcctctaaggattgtatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaatttcgagcccaaagcatcttgcaaactct 27365323  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  27365322 tccagaatctagaagtgaacctcggatctctatctgatacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaat 27365250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Original strand, 23293558 - 23294230
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| || |||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||  ||||    
T  23293558 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttagaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgaaat 23293657  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||| || || || || |||    
T  23293658 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcaccctcc 23293757  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| || |||  ||||||||  ||||||||  |||| |    
T  23293758 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttccgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctctatagtct 23293857  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | ||||| |  || ||||| || || || || || |||||||||||||  || || ||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  23293858 gatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccgacataaaggagtcctcaacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 23293957  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||    
T  23293958 accaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcagcaaa 23294057  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
     |||| |  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |    
T  23294058 ccctccaaagattgtatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgtaagctct 23294157  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  23294158 tccagaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 23294230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Original strand, 23276376 - 23277048
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||| | ||    
T  23276376 catactttcgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctccgatat 23276475  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||| ||||  | |||||||| |||||||| |||||  |||||||| | | ||||| ||| || || || || |||    
T  23276476 ctgatacggaccaatgaactttggagtcgacttactcgacttcaatgcacgtcccacacccatcataggagtaaatctcagaaatacatgatcaccctcc 23276575  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||   |||||||| ||||| |    
T  23276576 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttatgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcatgactttctccgtagtct 23276675  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | ||||| |  || ||||| || || || || || ||||||||||||||||| || | ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  23276676 gatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataaagaagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 23276775  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||||| |||||||| || || || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| | | | ||| ||||    
T  23276776 accaatactcgaatgataactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagctccaccttgctcaagtacaaacactttcagcaaa 23276875  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||| |    
T  23276876 tcctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaaccttaacttcgaacccaatgcatcttgcaaactct 23276975  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||| ||||||||||| || || | ||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||    
T  23276976 tccagaatctagaagtgaacctcgaatcactatccgacacaatactcgacggtacaccatgcagcttcacaat 23277048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 19 - 580
Target Start/End: Original strand, 23087050 - 23087611
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || |||| ||||| ||| ||||| ||||||||| | ||  | ||    
T  23087050 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacacactctatacgccactgttccaactctctcagatat 23087149  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| |||| | || |||||||||||||||| |||||||||||     
T  23087150 ctgatatggaccaataaacctcggcgtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctgtcacaagagtgactctcaaaaacacatggtctccttct 23087249  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||   ||||  | ||| || ||| |||| |    
T  23087250 tgaaactcaaggacctttctacacttgtcatgataactcttctgtcgactctacgacgctttcatcttctctcttatcaatttaaccttttcaatagtct 23087349  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |  ||||||| |||||||| || |  || |||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  23087350 gacgaacaatatctggtcccaacattacactttcacccgactcaaaccaacataacggagttccgcacctccgaccatacaaagcttcgaatggtgccat 23087449  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||| | ||||| || || || || || |||||||| |||||||  || ||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||| | ||||| ||||    
T  23087450 accaatagtcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacgataggtgactatcccaagctccaccttgctaaagtacacacactctcagcaaa 23087549  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaact 580  Q
    ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||    
T  23087550 tcctctaacgactgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgccgatgataagctgaact 23087611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 19 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 11358717 - 11358057
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| || |||||||| ||  ||||    
T  11358717 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgtaccaactttctctgaaat 11358618  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||  | |||||||||||||| || ||||| |||| |||| ||||||||| ||| || || || || |||    
T  11358617 ctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccaacacccgtcaaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcc 11358518  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||   |||| |   |||||||||||||| |    
T  11358517 tgaaactcaagatcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtct 11358418  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
      ||||| |  || ||||| || || || || ||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  11358417 catgaaccaagtccggtcccaacacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccat 11358318  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  ||||||||||||| ||| |||||||| || ||||| |  |||||||||    
T  11358317 accaatactcgagtgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgctctagcacacacaccctcaacaaa 11358218  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    || || |  || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |    
T  11358217 tcttccaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactct 11358118  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 679  Q
    |||| || |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||    
T  11358117 tccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatgctagacggaacaccatg 11358057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 19 - 688
Target Start/End: Original strand, 20832585 - 20833254
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| || |||||| | ||  ||||    
T  20832585 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgtaccaactctctctgaaat 20832684  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||  | ||||||||||| || || ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  20832685 ctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 20832784  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatca-tctgaactttctcagtagtt 317  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| || ||||| || |||   |||| ||||| |||||||||||||     
T  20832785 tgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgaagctttcatcttttctcttatcaatctga-ctttctcagtagtc 20832883  T
Q  318 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcca 417  Q
    |  ||||| |  || ||||| || || || || ||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  20832884 tcatgaaccaaatccggtcccaatacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgcca 20832983  T
Q  418 ttccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 517  Q
    | |||||||| || |||||||| || ||||||||||| || ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||    
T  20832984 taccaatactcgagtgatagctgttgttataagtgaattcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaa 20833083  T
Q  518 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 617  Q
    ||| || |  || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||||    
T  20833084 atcttccaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactt 20833183  T
Q  618 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 688  Q
    ||||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  20833184 ttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcac 20833254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 19 - 688
Target Start/End: Original strand, 31830258 - 31830927
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||||||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| || |||||| | ||  ||||    
T  31830258 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacagtaccaactctctctgaaat 31830357  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||| ||||| || ||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||| |||| |||| ||||||||| ||| || || || || |||    
T  31830358 ctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtcaaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcc 31830457  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| || |||   |||| |   |||||||||||||| |    
T  31830458 tgaaattcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgccgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtct 31830557  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
      || || |  || ||||| || || || |||||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  31830558 catgcaccaaatccggtcccaacacaacactttcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccat 31830657  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||||| || |||||||| || |||||||| || || ||||| || |  ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||    
T  31830658 accaatactcgagtgatagctgttgttataagtaaattcaatcaaaggcaagtgactgtcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaa 31830757  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    || || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||  ||||||| || |||||||| || || |||||||    
T  31830758 tcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaactttgaacccaaagcgtcctgtaaacttt 31830857  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 688  Q
    |||| || |||||||| || || ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| || |||||    
T  31830858 tccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatgctagacggaacaccatgaagtttcac 31830927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 19 - 690
Target Start/End: Original strand, 27787341 - 27788012
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||||||||||| ||||| || || ||||  ||||| ||||| ||||| || || || || |||| ||| ||||||||||| | | | ||  ||||    
T  27787341 catacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaat 27787440  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||  | || |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| | ||| || || || || ||     
T  27787441 ctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctct 27787540  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||  ||||| ||  ||||| || ||||| |    
T  27787541 tgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcaccttgactttttctgtagtct 27787640  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
     |||||| |  || ||||| |  || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  27787641 cctgaaccaaatccggtcccagcacaacactttctcctgactcaaaccaacacaacggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtgccat 27787740  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    ||| ||||| || ||||| || || || || |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| | |||||||||     
T  27787741 tcctatactcgagtgataactgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaag 27787840  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    || || |  || || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| || || ||||| |    
T  27787841 tcttccaatgattggatcgttctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactct 27787940  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 690  Q
    |||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27787941 tccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaa 27788012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 180; E-Value: 8e-97
Query Start/End: Original strand, 115 - 690
Target Start/End: Original strand, 12574049 - 12574624
Alignment:
Q  115 aaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcc 214  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||  | || || | ||| || || || ||    
T  12574049 aaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggggtaacccttagaaatacatgatcacc 12574148  T
Q  215 ttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagta 314  Q
     || |||||||||||  | || || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||  ||||||||  ||||| || |||    
T  12574149 ctcttgaaactcaagggccttcctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgta 12574248  T
Q  315 gtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtg 414  Q
    || | |||||| |  || ||||| || || || ||||| | |||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||    
T  12574249 gtctcctgaaccaaatccggtcccaacacaacactttctcttgactcgaaccaacacaacggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtg 12574348  T
Q  415 ccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaa 514  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || || || || |||||||| ||||| || || ||||| ||||||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||    
T  12574349 ccattcctatactcgaatgataactgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactgtcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaa 12574448  T
Q  515 caaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaa 614  Q
    ||| || || |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| || || |||    
T  12574449 caagtcttccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaa 12574548  T
Q  615 cttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 690  Q
    || ||||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12574549 ctcttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaa 12574624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 19 - 688
Target Start/End: Original strand, 1063351 - 1064020
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||| | |||| ||| ||||| || |||| | | ||  ||||    
T  1063351 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaagcaactctatatgccacagtaccaattctctctgaaat 1063450  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||  | ||||||||||| || || ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  1063451 ctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 1063550  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||  |||| || |||   |||| |   |||||||||||||| |    
T  1063551 tgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctctcatcttttctcttatcaaccttactttctcagtagtct 1063650  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
      || || |  |||||||| || || || || ||||  |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  1063651 catgtaccaaatctggtcccaacacaacactctcacacgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccat 1063750  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  1063751 accaatacttgaatgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactgtcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaa 1063850  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    || ||    || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||  |||| ||||| ||||| || || || ||||| |    
T  1063851 tcttcccatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaatttcgaacccaaggcgtcctgtaaactct 1063950  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 688  Q
    |||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| || || ||||||||||| || |||||    
T  1063951 tccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactagacggaacaccatgaagtttcac 1064020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 19 - 292
Target Start/End: Original strand, 23138637 - 23138910
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||   |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||  | ||    
T  23138637 catacttccgaagttgcgacacatgaaagacaccatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacctactcgatatgccaccgttccaactctttctgatat 23138736  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | || ||||||||||||| || |||||||||||     
T  23138737 ctgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaagagtgactctcaaaaatacctggtctccttct 23138836  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttg 292  Q
    |||||||| || |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  23138837 tgaaactcgaggtctttcgtacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttg 23138910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 19 - 292
Target Start/End: Original strand, 23550427 - 23550700
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||   |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||  | ||    
T  23550427 catacttccgaagttgcgacacatgaaagacaccatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacctactcgatatgccaccgttccaactctttctgatat 23550526  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | || ||||||||||||| || |||||||||||     
T  23550527 ctgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaagagtgactctcaaaaatacctggtctccttct 23550626  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttg 292  Q
    |||||||| || |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  23550627 tgaaactcgaggtctttcgtacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttg 23550700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 19 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 27377314 - 27377101
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  27377314 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaacccgatacgccaccgttccaactctttccgatat 27377215  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27377214 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 27377115  T
Q  219 tgaaactcaagatc 232  Q
    ||||||||||||||    
T  27377114 tgaaactcaagatc 27377101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 540 - 702
Target Start/End: Original strand, 16923010 - 16923172
Alignment:
Q  540 ctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatc 639  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16923010 ctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatc 16923109  T
Q  640 ttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 702  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  16923110 ttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatgt 16923172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 538 - 702
Target Start/End: Original strand, 16925479 - 16925643
Alignment:
Q  538 tcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaa 637  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16925479 tcctctccgactgaccatctgtttgtggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaa 16925578  T
Q  638 tcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 702  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||    
T  16925579 tcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgt 16925643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 354 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 19652557 - 19652223
Alignment:
Q  354 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 453  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || |   | ||||    
T  19652557 cctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgt---atgtga 19652461  T
Q  454 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 553  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |  || || || |||||||||||||||||    
T  19652460 actctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaaagattgtatcgtcctctccgactgacc 19652361  T
Q  554 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 653  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||  ||||     
T  19652360 atctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaatttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcggatccttatcc 19652261  T
Q  654 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    || ||||| ||||| || || |||| || |||||||||    
T  19652260 gacacaatactcgacggtactccatataacttcacaat 19652223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 545 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 20442830 - 20442675
Alignment:
Q  545 cgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgga 644  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20442830 cgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgga 20442731  T
Q  645 tctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 700  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  20442730 tctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacatcacaatctccttgat 20442675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 533 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 24877078 - 24876911
Alignment:
Q  533 aattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaa 632  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24877078 aattgtcctctccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatgtagaa 24876979  T
Q  633 gtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 700  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  24876978 gtaaatcttggatctctatctgatacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 24876911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 387 - 688
Target Start/End: Original strand, 20828227 - 20828528
Alignment:
Q  387 ctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttc 486  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||| || ||||| || |  ||||||||||||| ||    
T  20828227 ctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctgttgttataagtgaattcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctc 20828326  T
Q  487 ctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatct 586  Q
    | ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||    
T  20828327 caccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacct 20828426  T
Q  587 caacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttc 686  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || |||    
T  20828427 caacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttc 20828526  T
Q  687 ac 688  Q
    ||    
T  20828527 ac 20828528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 19 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 41609187 - 41609047
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41609187 catacttccaaagttgcgacacgtggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggctgtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaaaat 41609088  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgact 159  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41609087 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgact 41609047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 394 - 691
Target Start/End: Original strand, 24948564 - 24948861
Alignment:
Q  394 catacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttg 493  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| |||||    
T  24948564 catacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttg 24948663  T
Q  494 ctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttc 593  Q
    |||||| ||||| | ||||   |||||||| |  || |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||    
T  24948664 ctcaagcacacacactctctgtaaatcctccaatgattagatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacatc 24948763  T
Q  594 gagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    ||  |||| || ||||||||||| ||||| |||||| |||| || || ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||    
T  24948764 gaaaccaatgcatcttgcaaactcttccagaatctataagtgaacctcggatccctatctgatacaatactcgacggtacaccatgcagcttcacaat 24948861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 158 - 679
Target Start/End: Original strand, 22276018 - 22276538
Alignment:
Q  158 cttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactc 257  Q
    |||||||||||| || ||||| |||| |||| | |||||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| ||||| | ||| ||||||||||||    
T  22276018 cttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactc 22276117  T
Q  258 ttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctg 357  Q
    || |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  ||  ||||||| |   | || || || |    
T  22276118 ttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccagtcctaacaaggcactctctccgg 22276217  T
Q  358 actcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactc 457  Q
    |||||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||| | || || || ||||| |||||    
T  22276218 actcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactc 22276317  T
Q  458 gatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatct 557  Q
     |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||||| ||  |||||     
T  22276318 aatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctccgtctacccatca 22276417  T
Q  558 gtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgata 657  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |   |||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || |    
T  22276418 gtctggggatggtaagcagaactcaatctcaacttagtttccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatc-gaca 22276516  T
Q  658 caatgctcgaaggaacaccatg 679  Q
    |||| || ||||||| ||||||    
T  22276517 caatactagaaggaataccatg 22276538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 510 - 688
Target Start/End: Complemental strand, 21125509 - 21125331
Alignment:
Q  510 ctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctctt 609  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||| || ||||| || ||||    
T  21125509 ctcaacaaatcctctaacgattgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagtcgaactcaacctcaactttgaacccaatgcatctt 21125410  T
Q  610 gcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 688  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  21125409 gcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcggatctctatctgacacaatactcgatggaaccccatgtaacttcac 21125331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 259
Target Start/End: Original strand, 24653946 - 24654185
Alignment:
Q  20 atacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatc 119  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| |||||||| ||  |  |||||    
T  24653946 atacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccttcactgaaatc 24654045  T
Q  120 tgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcct 219  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| ||| |||||||||| ||||||||| | || |||| ||| || || || || ||||    
T  24654046 tgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcaagtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcct 24654145  T
Q  220 gaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactctt 259  Q
    ||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||    
T  24654146 gaaactcaagggccttcctacgcttatcatgataactctt 24654185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 603 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 23107989 - 23107901
Alignment:
Q  603 gcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  23107989 gcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatcggacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 23107901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 196 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 23817719 - 23817291
Alignment:
Q  196 tcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggat 295  Q
    |||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| ||||| |  || |||||||||||||| |||| |||||| ||||| || || |||||||||||    
T  23817719 tcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctccttttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttgatcttctcttggat 23817620  T
Q  296 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 395  Q
    ||||| |||||| || ||||| |  || |||| ||| |||||||| |   | ||||  | |||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||    
T  23817619 catcttaactttttccgtagtctcttgcacaacctccggtcctaacaaagcactttatcttgactcaaaccaacacaacggtgtcctacatctccgacca 23817520  T
Q  396 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 495  Q
    ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||| | || || || ||||| ||||| ||||| || | |      ||||||    | |||||||    
T  23817519 tacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaatggtaaacatacgtcccaacagacaccttgct 23817420  T
Q  496 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 595  Q
    | | |||||||  |||||||||||| || |    |||||| || ||||  | ||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |     
T  23817419 ccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagttctctttgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagt 23817320  T
Q  596 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaa 624  Q
     ||||||||  |||||||||||| |||||    
T  23817319 tcccaaagcagcttgcaaactttcccaaa 23817291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 576 - 691
Target Start/End: Original strand, 23110892 - 23111007
Alignment:
Q  576 gaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacac 675  Q
    |||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  23110892 gaactcaaccttaactttgaacccaatgcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatccgacacaatgctcgacggaacac 23110991  T
Q  676 catgtagcttcacaat 691  Q
     ||| | |||||||||    
T  23110992 aatgcaacttcacaat 23111007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 537 - 691
Target Start/End: Original strand, 24641860 - 24642014
Alignment:
Q  537 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 636  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  24641860 gtcctatccgactaaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaagtcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtga 24641959  T
Q  637 atcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    | || ||| ||||||| || | ||| ||||| || |||||||||| |||||||||    
T  24641960 acctcggacctctatccgacataatactcgacggtacaccatgtaacttcacaat 24642014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 188
Target Start/End: Original strand, 24944967 - 24945136
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||  ||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | |   ||||    
T  24944967 catacttccgaagctgcgacacatgaaacccatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctttgaaat 24945066  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagga 188  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  24945067 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttccttgacttcaatgcacgtcctacacccgtcatagga 24945136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 144 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 12640637 - 12640315
Alignment:
Q  144 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 243  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || ||||| ||||  ||| | || ||||| ||||| || |||||  |||||||||||| ||| || || | ||    
T  12640637 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccgacaccggtcaccggattcaccctcaagaacacatgatctccaacctgaaactcaatatccttcctcctct 12640538  T
Q  244 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 343  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  12640537 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 12640438  T
Q  344 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 443  Q
      | || || || ||||||||||| || ||||| || || || |||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||| |||| | || ||     
T  12640437 agcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagcatgaaaactgttg 12640338  T
Q  444 ttataagtgaactcgatcaacgg 466  Q
    || ||||| ||||| ||||||||    
T  12640337 ttgtaagtaaactcaatcaacgg 12640315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 144 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 24831905 - 24831370
Alignment:
Q  144 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 243  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || |||||||||||| | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||  | | ||    
T  24831905 gtcaacttcctacacttcaaagcacgacccactccagtcataggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcgttctct 24831806  T
Q  244 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 343  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  24831805 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 24831706  T
Q  344 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 443  Q
      |  | || || ||||||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||  |||| | || ||     
T  24831705 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactaacatgaaaactgttg 24831606  T
Q  444 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 543  Q
    || ||||| ||||| ||||| || | |      |||||| |  | |||||||| |  ||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  24831605 ttgtaagtaaactcaatcaatggtaaacattcgtcccaactaacaccttgctccaacacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 24831506  T
Q  544 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 643  Q
    | | ||| ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  |||||||   |||||||||| | ||||||  |||||||||| ||  |    
T  24831505 ctgtctgcccatcggactgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagtccccaaaggagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcag 24831406  T
Q  644 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 679  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  24831405 atcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 24831370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 246 - 679
Target Start/End: Original strand, 25128474 - 25128907
Alignment:
Q  246 tcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagacca 345  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| || || ||||| |||||||| ||||||| |||||| || ||||| |  || |||| ||| | |||||| |  |    
T  25128474 tcatgataactcttctgtctactctgagatgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttttccgtagtctcttggacaacctccgatcctaacaaaa 25128573  T
Q  346 ctctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattatt 445  Q
    | |||||||| ||||||||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||| || || |||| ||| || ||||| |||||| | || || ||    
T  25128574 cactttcacccgactcaaaccaacataacggcgtcctacacctccgaccatacaaagcatcaaacggtgtcataccgatacttgaatgaaaactgttgtt 25128673  T
Q  446 ataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctcc 545  Q
     ||||| ||||| |||||||  | |       ||||| |  | | |||||| | || ||||  ||| || ||||||||||    |||||| ||||||||     
T  25128674 gtaagtaaactcaatcaacgacaaacattcgacccaactgacactttgctccaaaatacaagctcttaataaatcctctaaactctgaatagtcctctct 25128773  T
Q  546 gactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggat 645  Q
      ||| ||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||| || ||||    
T  25128774 atctgcccatcggtatggggatgataagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcatcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctcggat 25128873  T
Q  646 ctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 679  Q
    | | |||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  25128874 cccgatctgacacaatactagaaggaataccatg 25128907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 192 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 22762239 - 22761752
Alignment:
Q  192 actctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctt 291  Q
    |||||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||||||  | | |||||||||||||||||| |  | |||||| ||||| ||||| |||||||    
T  22762239 actctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatctttcatcctcttgtcatgataactcttcttcctactctgagacgctttcatcttctctt 22762140  T
Q  292 ggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccg 391  Q
    ||||||||| ||| || |  ||||| |  || ||||  || |||||||| |   | ||||| ||||| |||||||| |||||||  || || || |||||    
T  22762139 ggatcatcttaaccttttatgtagtctcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactttctcctgattcaaaccaacacaacgacgtcctacacctccg 22762040  T
Q  392 accatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcct 491  Q
    |||||||||||| || || |||||||| || |||||||||||| | || || || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||    
T  22762039 accatacaaagcttcaaacggtgccataccgatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacacct 22761940  T
Q  492 tgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaact 591  Q
    ||||  | |||||||  ||||||||||||||| |     ||||  |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || |  ||||||||||||||||    
T  22761939 tgcttcaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactttgaagagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagaagaactcaatctcaact 22761840  T
Q  592 tcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 679  Q
    | |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || ||||| ||  |||||| ||||||    
T  22761839 tagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactaaaaggaataccatg 22761752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 157 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 24570373 - 24569851
Alignment:
Q  157 acttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataact 256  Q
    ||||||||||||| || |||||||| | | || | |||||||| || || || || ||  |||||||||||| ||| ||||| | ||| |||||||| ||    
T  24570373 acttcaaagcacgaccaacaccagttacatgattcactctcaagaatacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgatagct 24570274  T
Q  257 cttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacct 356  Q
    ||| | || |||||| ||||  ||||| ||||||||  |||||| ||| || || ||||| |  |  ||||  || |||||||| |  || ||||| |||    
T  24570273 cttctatctactctgagacgttttcatcttctcttgattcatcttaaccttttccgtagtctctttcacaacttccggtcctaacaaaacactttctcct 24570174  T
Q  357 gactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaact 456  Q
     |||||||||| |||||||| || || || ||| ||| ||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||| | || || || ||||| ||||    
T  24570173 aactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctctgacgatataaagcctcaaacggtgccattccgatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaact 24570074  T
Q  457 cgatcaacggaagatgacta-tcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccat 555  Q
    | |||||||| | |  |||  ||| || |    |||||||| | |||||||| |||||||||||| || |    |||||| ||||| || |  || ||||    
T  24570073 caatcaacggtaaac-actcgtccgaactgaaaccttgctccaaaacacaaactctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctttctgtttgcccat 24569975  T
Q  556 ctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctga 655  Q
    | || || ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||| || ||||| | ||||||    
T  24569974 cggtgtgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctga 24569875  T
Q  656 tacaatgctcgaaggaacaccatg 679  Q
     ||||| || ||||||| ||||||    
T  24569874 cacaatactagaaggaataccatg 24569851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 246 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 27368448 - 27368394
Alignment:
Q  246 tcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatct 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  27368448 tcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatct 27368394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 24833416 - 24833355
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaa 80  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || ||||||    
T  24833416 catacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaaa 24833355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 390 - 466
Target Start/End: Original strand, 23890753 - 23890829
Alignment:
Q  390 cgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacgg 466  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| | || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  23890753 cgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacgg 23890829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 590; Significance: 0; HSPs: 46)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 590; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 16350974 - 16350293
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  16350974 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 16350875  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  16350874 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 16350775  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16350774 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 16350675  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16350674 gctgaacaatttctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 16350575  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16350574 tccaatactagaatgataactattattatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 16350475  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16350474 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 16350375  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 700  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  16350374 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 16350293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 582; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 51333868 - 51333187
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  51333868 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 51333769  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      
T  51333768 atgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttat 51333669  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51333668 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 51333569  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  51333568 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 51333469  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51333468 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 51333369  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  51333368 tcctctagcgactgaattgttctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 51333269  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 700  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  51333268 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 51333187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 570; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 33391404 - 33390723
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  33391404 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 33391305  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  33391304 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 33391205  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33391204 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 33391105  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  33391104 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaggcctcgaacggtgccat 33391005  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33391004 tccaatactagaatggtaactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 33390905  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  33390904 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 33390805  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 700  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  33390804 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 33390723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 562; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 700
Target Start/End: Original strand, 19106351 - 19107032
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  19106351 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggtagtaatccaactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 19106450  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19106451 ctgatatggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaacgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 19106550  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  19106551 tgaaactcaagatcttttctccgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagttt 19106650  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  19106651 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcgaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagactcaaaaggtgccat 19106750  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19106751 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaa 19106850  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19106851 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 19106950  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 700  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  19106951 tccaaaatctagaagtaaatattggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 19107032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 558; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 700
Target Start/End: Original strand, 21830287 - 21830968
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  21830287 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 21830386  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  21830387 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 21830486  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  21830487 tgaaactcaagatcttttccacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttagatcatctgaaccttctcagtagttt 21830586  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21830587 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctacatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccat 21830686  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  21830687 tccaatacttgaatgataactattattatatgtgaactcgattaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcgagaacacaaatcctcaacaaa 21830786  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21830787 tcctccagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 21830886  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 700  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||| || ||||||||    
T  21830887 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacgatctccttgat 21830968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 555; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 41354844 - 41354202
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  41354844 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaaaat 41354745  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41354744 ctgatatggaccaatgaacttcgaggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 41354645  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  41354644 ttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctcggatcatctgaactttctcagtggttt 41354545  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41354544 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcaccggattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 41354445  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41354444 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttactcaagaacacaaattctcaacaaa 41354345  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  41354344 tcctctagcgactgaattgtcctctccgattgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcagacttt 41354245  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaat 661  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41354244 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaat 41354202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 554; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 700
Target Start/End: Original strand, 21836934 - 21837615
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  21836934 catacttttgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 21837033  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  21837034 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 21837133  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21837134 tggaactcaagatcttttctacgctgatcatgataactcttttgtcgactatgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactgtctcagtagttt 21837233  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  21837234 gttgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttgtgcatctccgaccatacaaagcgtcgaacggtgccat 21837333  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21837334 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 21837433  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  21837434 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 21837533  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 700  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  21837534 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 21837615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 514; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 17045390 - 17044709
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  17045390 catacttccgaagttgcgacacatggaacacgtcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 17045291  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17045290 ctgatacggaccaataaatctcggggtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccggtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcc 17045191  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  17045190 tgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 17045091  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17045090 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccat 17044991  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17044990 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcatccttgctcaagaacacaaactctcaacaaa 17044891  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17044890 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcagatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 17044791  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 700  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  17044790 tccaaaacctagaagtaaatcttggatctctgtctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacctcacaatctccttgat 17044709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 447; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 16079008 - 16078350
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||| | ||    
T  16079008 catacttccgtagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccattccaactctttccgatat 16078909  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16078908 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 16078809  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||                   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  16078808 tg-------------------cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 16078728  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  16078727 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagccttaaaaggtgccat 16078628  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16078627 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgattatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaa 16078528  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |    
T  16078527 tcctccagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctacggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaagccaaagcctcttgcaaactct 16078428  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 700  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||| | ||||||| ||||||||    
T  16078427 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag----accatgtaacctcacaatctccttgat 16078350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 413; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 50620619 - 50619959
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| || ||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||  | ||    
T  50620619 catacttccgaagttacgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatacggtggtaaacccactcgatatgccaccattccaactctttctgatat 50620520  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||| | ||     
T  50620519 ctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtgatcttcctct 50620420  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  50620419 tgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcatcttttgttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 50620320  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
      ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  50620319 attgaacaatctcaggtcctaaaaccacactttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgcaat 50620220  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  50620219 tccaatactagaatgataactattattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaatttcctccttgctcaagtacacaaaccctcaacaaa 50620120  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |    
T  50620119 tcctctaacgactgaatcgttctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactct 50620020  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 679  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50620019 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 50619959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Original strand, 16369281 - 16369953
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| |||||||| || || || ||||||||||||||| ||||  | ||    
T  16369281 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccaacacggtacgccaccgttccaactctttctgatat 16369380  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||| |||| ||||||||||||| || || ||||||||     
T  16369381 ctgatatagaccaataaacctcgaagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacacttgtcacaggagtgactctcaaaaatacatgatctccttct 16369480  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| || ||||| |||||||  || || ||| ||||||    
T  16369481 tggaattcaaggtctttcctacgcttatcatgataacccttttgtcgactctacgacgctttcatcttttcttgaatcatctttaccttttcaatagttt 16369580  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||  | |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||| |||    
T  16369581 gttgaacaatctctggtcctaaaaccacattctcacctcactcaaaccaacacaacgaagttctgcacctcctaccatacaaagcctcaaaaagtgtcat 16369680  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  16369681 tccaatactagaatgataactgttattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccacgttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaag 16369780  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    || || | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||  |    
T  16369781 tcttccaacgactgaatcgttctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttatagcctaaagcctcttgcaaaccct 16369880  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16369881 tccaaaatctagaagtaaatctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 16369953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 563
Target Start/End: Original strand, 20249834 - 20250378
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||  | ||    
T  20249834 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaaggtgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaactctttctgatat 20249933  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    || ||| ||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||     
T  20249934 cttatacggaacaataaatttcggagtcaacttctttgacttcaacgctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttct 20250033  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  20250034 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaactttctcagtagttt 20250133  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  20250134 gttgaacgatctctggtcctaagaccactctttcgcttgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccat 20250233  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  20250234 tccaatactagaatgataactattattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttccaccttgctcaagtacataaactctcaacaaa 20250333  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgc 563  Q
    ||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  20250334 tcctccaacgactgaatcgtcctctccaactgaccatctgtctgc 20250378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 573
Target Start/End: Original strand, 20136762 - 20137316
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||| ||||| || |||||| ||||| | ||    
T  20136762 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgccgtggtaaaccaacacgatacgccactgtcccaactctttccgatat 20136861  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    ||||||  ||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||     
T  20136862 ctgatacagaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgaggtctccttct 20136961  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  20136962 tgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacactttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 20137061  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||    
T  20137062 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctaactcaaaccaacacaacgaagttctgcatctccgaccatacaaagcttcataaggcgccat 20137161  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  20137162 tcctatactagaatgataactattattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagtccctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaa 20137261  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatg 573  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20137262 tcctctagcgactgaatcgttctttccgactgaccatctgtctacggatgatatg 20137316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 19761241 - 19760569
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| || | ||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||  | ||    
T  19761241 catactaccgaagttgcgatacatgaaacatatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaaacccactcgatacgccaccgttccaattctttcggatat 19761142  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| || ||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| | || |||||||||||||||| |||||||||||     
T  19761141 ctgatacggtccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccaatcacaagagtgactctcaaaaacacatggtctccttct 19761042  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  19761041 tgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttcatcttttcttggatcaacttaaccttctcagtagttt 19760942  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    ||||||| || |||||||| || || || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||| ||| |||||||||| |||    
T  19760941 gctgaacgatatctggtcccaaaactacactctcacctgactcgaaccaacacaacggagtcctacacctccgaccatacagagcttcgaaaggtgtcat 19760842  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||     
T  19760841 tccaatactagaatgataactgttattgtacatgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcagcaag 19760742  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    || || | ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||| || || ||||| ||||||||||| |    
T  19760741 tcttccaacgactgaatcgttctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaacttaacttcaacttagaacctaaagcttcttgcaaactct 19760642  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    || |||||||||| ||||| || |||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  19760641 tctaaaatctagaggtaaacctcggatttctatccgatacaatgttcgatggaacaccatgtagcttcacaat 19760569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 19 - 436
Target Start/End: Original strand, 21747519 - 21747935
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  21747519 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatat 21747618  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| | |||||| ||  ||||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| | | ||||||||||||     
T  21747619 ctgatacgaaccaataaatctcggattcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaacatatgtggtctccttct 21747718  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
     |||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  21747719 agaaactcaagatcttt-ctacgcttattatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 21747817  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  21747818 gttgaacaatctctggtcctaagaccactctttcgcctaactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgagcatacaaagcctcataaggtgccat 21747917  T
Q  419 tccaatactagaatgata 436  Q
    ||||||||||||||||||    
T  21747918 tccaatactagaatgata 21747935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 19 - 688
Target Start/End: Original strand, 19854298 - 19854966
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||  || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||  ||||    
T  19854298 catacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatttggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgaaat 19854397  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    ||||||  ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||| | ||||||| ||| || || ||||| ||     
T  19854398 ctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcccgacctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatctccctct 19854497  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||  ||||||||  |||||||| ||||| |    
T  19854498 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactttgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtct 19854597  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | ||||| |  || ||||| || || || || || ||||||||||||||||  || ||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||  |||||||    
T  19854598 gatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcgtaaaggagtcctgcacctccgactatacaaagcttcgaaccgtgccat 19854697  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||| ||||| || || | |||||  |||    
T  19854698 accaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactc-atcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacgcacactctcagtaaa 19854796  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||| || || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| |    
T  19854797 tcctccagtgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgcaaactct 19854896  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 688  Q
    |||||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  19854897 tccaaaatctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcac 19854966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 19 - 687
Target Start/End: Complemental strand, 20940438 - 20939770
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  20940438 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgatat 20940339  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||| || || || || |||    
T  20940338 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcaccctcc 20940239  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||  ||||||||  ||||||||  ||||||    
T  20940238 tgaaactcaagggccttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgatgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctctatagttt 20940139  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | ||||| |  || ||||| || || || || || |||||||||||| |||| || ||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  20940138 gatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaactagcataaaggagtcctatacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 20940039  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
      ||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||| |||    
T  20940038 aacaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcaataaa 20939939  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||| |  || || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||   ||||||||| | |||||| | ||||||||||| |    
T  20939938 tcctccaaagattgtatcgtcctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagtcgaactcggcctcaacttctaacccaaaacgtcttgcaaactct 20939839  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttca 687  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||    
T  20939838 tccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatacttgacggtacaccatgtagcttca 20939770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 19 - 688
Target Start/End: Original strand, 37677063 - 37677733
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||  || ||||| || |||||| | ||  ||||    
T  37677063 catacttccgaagctgagagacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctgtatgccactgtaccaactctctctgaaat 37677162  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa-aaacacgtggtctccttc 217  Q
    |||||| |||||||| ||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||| ||||| ||| || || || || ||    
T  37677163 ctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcaagaaaaacatgatcaccctc 37677262  T
Q  218 ctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtt 317  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||    |||| |   ||||||||||||||     
T  37677263 ctgaaactccagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcaacctgactttctcagtagtc 37677362  T
Q  318 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcca 417  Q
    |  ||||| |  || ||||| || || || || ||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  37677363 tcatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgcca 37677462  T
Q  418 ttccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 517  Q
    | |||||||| || |||||||| || ||||||||||| || ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||||||||| || || | |||||||||    
T  37677463 taccaatactcgagtgatagctgttgttataagtgaattcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacgcacactctcaacaa 37677562  T
Q  518 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 617  Q
    ||| || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || |||||     
T  37677563 atcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactc 37677662  T
Q  618 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 688  Q
    ||||| || |||||||| || || ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  37677663 ttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatgctagacggaacaccatgaagcttcac 37677733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 54 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 20836231 - 20835591
Alignment:
Q  54 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttct 153  Q
    ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||| | ||  |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  20836231 tgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttct 20836132  T
Q  154 tt---gacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatg 250  Q
    |    ||||| || | |||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||| || || || || |||| ||||| |||  | || | ||||||||||||    
T  20836131 tcttcgacttaaatgtacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctaaaacttaagggccttccaacgcttgtcatg 20836032  T
Q  251 ataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctt 350  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||  |||||||| ||||| || ||||| |  |||||||| || || || ||     
T  20836031 ataactcttatgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtctgatgaaccaaatctggtcccaaaacaacactc 20835932  T
Q  351 tcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataag 450  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| || || || || || |    
T  20835931 tctcctgactcaaaccagcataaaggagttctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggagccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacg 20835832  T
Q  451 tgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactg 550  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||| |  ||  | || || |||||||| ||    
T  20835831 tgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctccaaggatggtatcgttctctccgattg 20835732  T
Q  551 accatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctcta 650  Q
    ||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||  | || ||||| ||||||||||| || || ||||| |||    
T  20835731 accgtctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgtcagctcttccagaatctagaagtgaacctcggatcccta 20835632  T
Q  651 tctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    || || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  20835631 tccgacacaattctcgacggtacaccatgtagcttcacaat 20835591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 19 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 22433491 - 22432817
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||  |||| |||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||| ||||  | ||  ||||    
T  22433491 catacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcatattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataggccacagttgcaaccctctctgaaat 22433392  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| | ||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| | || ||||  ||||| || || || |||    
T  22433391 ctgatacgaaccgatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcccacacccgtcataggagtaaccctcaggaacacatgatcaccctcc 22433292  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||  |||||||| |||||| || ||||| |    
T  22433291 tgaaactcaaggggctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttaactttttctgtagtct 22433192  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
      ||||| |  |  ||||| || ||||| ||  | ||||||||||||||||| || ||||| || || |||| |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  22433191 catgaaccaaattcggtcccaacaccacactcgctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccaaccatacaaagcttcgaatggtgccat 22433092  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     || ||||| ||||| || || || ||||| |||||||| |||| | | || ||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||| |  |||||||||    
T  22433091 acctatactcgaatggtaactgttgttatatgtgaactctatcagcagtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaaccacacacaccctcaacaaa 22432992  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    || || |  || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| |    
T  22432991 tcttccaatgattggattgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactct 22432892  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaattt 693  Q
    |||| || ||| |||| || || ||||| ||||| || ||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  22432891 tccagaacctataagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaaggaacttcatgcagcttcacaattt 22432817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 19 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 20857136 - 20856476
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||||| | |||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||  ||||    
T  20857136 catacttccgcaattgcgacacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatacgccacagttccaactctttctgaaat 20857037  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    ||| || |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| | || |||| ||| || ||||| ||||||    
T  20857036 ctggtaaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcccacacccgtcataggagtaaccctcagaaaaacatggtcaccttcc 20856937  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||| |||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||    |||||||  |||||||| |||||||    
T  20856936 tgaaacgcaaggtccttcctacgcttgtcgtgatagctcttttgtcgactctgcgacactttcatcttctccctaatcatcttgactttctccgtagttt 20856837  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
      ||||| |  ||  | || || || || ||||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  20856836 catgaaccaattccagccccaacacaacactttctcccgactcgaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcaaacggtgccat 20856737  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||| ||| ||||| || || || || || || || || ||||| || || ||||| ||||||| ||| || |||||||| ||||| ||||| |  |||    
T  20856736 accaacactcgaatggtaactgttgttgtatgtaaattctatcaatggtaggtgactgtcccaagctccaccctgctcaagtacacatattcttagtaaa 20856637  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||  || || || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||| ||||| |    
T  20856636 tcctctaatgattggatcgtcctttccgactgaccatatgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaatttcgaacccaacgcatcttgtaaactct 20856537  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 679  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || || || |||||||||||    
T  20856536 tccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatacttgacggaacaccatg 20856476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 19 - 688
Target Start/End: Original strand, 20294396 - 20295065
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| || |||||| | ||  ||||    
T  20294396 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgtaccaactctctctgaaat 20294495  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || || ||     
T  20294496 ctgatatggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctct 20294595  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcat-ctgaactttctcagtagtt 317  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||    ||||| |||| ||| |||||||||     
T  20294596 tgaaactcaagatccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcattctgacctt-ctcagtagtc 20294694  T
Q  318 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcca 417  Q
    |  ||||| |  || ||||| || || || || ||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||| ||||||||| || ||||| |||||||    
T  20294695 tcatgaaccaagtccggtcccaacacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccaaccatacaaggcttcgaacggtgcca 20294794  T
Q  418 ttccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 517  Q
    | |||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||| ||| || |||||||| ||||| |  ||||||||    
T  20294795 taccaatactcgagtgatagctgttgttataagtgaactcaatcaatggaaggtgactatccgaagctccaccctgctcaagcacacacaccctcaacaa 20294894  T
Q  518 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 617  Q
    ||| || |  || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || | |||     
T  20294895 atcttccaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtagactc 20294994  T
Q  618 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 688  Q
    ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| ||||||||    
T  20294995 ttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgaagcttcac 20295065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 442 - 691
Target Start/End: Original strand, 21749348 - 21749597
Alignment:
Q  442 tattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcct 541  Q
    ||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  21749348 tattatacgtgaactttatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcttctaacgactgaatcgtcct 21749447  T
Q  542 ctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatctt 641  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21749448 ctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatctt 21749547  T
Q  642 ggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  21749548 ggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 21749597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 117 - 621
Target Start/End: Original strand, 41307907 - 41308411
Alignment:
Q  117 atctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctt 216  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || |||||||| || |||||||| ||||||| |||||| ||||||||| | || |||| |||||| |||||||| |    
T  41307907 atctgatacggaccaataaacttaggagtcaactttttagacttcaatgcacgtcatacacccgtcataggagtaaccctcagaaacacatggtctccct 41308006  T
Q  217 cctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 316  Q
    | |||||||||||    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||   || || |  |||||||| |||||    
T  41308007 cttgaaactcaaggggctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttattattttgactttctccgtagt 41308106  T
Q  317 ttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcc 416  Q
     || ||||| |  ||  |||| || ||||| ||||| ||  |||||||||| || || |||||  |||| || |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  41308107 ctgatgaaccaaatccagtcccaacaccacactttctcccaactcaaaccaacataaaggagtcatgcaccttcgaccatacaaagcttcgaacggtgcc 41308206  T
Q  417 attccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaaca 516  Q
    || |||||||| ||||| ||  | || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||    
T  41308207 ataccaatactcgaatgctaattgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagca 41308306  T
Q  517 aatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaact 616  Q
    |||||||||  || || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||    
T  41308307 aatcctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaatctcaacttagaacccaaggcatcttgcaaact 41308406  T
Q  617 tttcc 621  Q
     ||||    
T  41308407 cttcc 41308411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 471 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 22362167 - 22361947
Alignment:
Q  471 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 570  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| || | | ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22362167 tgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctgaacaaatcttccaacaactaaatcgtcctctccgactgaccatatgtctgcggatgat 22362068  T
Q  571 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 670  Q
    | ||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  22362067 acgccgaactcaacctcaacttagatcttaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgggtctctatctgacacaatgctcgaagg 22361968  T
Q  671 aacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    ||||||||| | |||||||||    
T  22361967 aacaccatgcaacttcacaat 22361947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 19 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 19665251 - 19664945
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||  ||||    
T  19665251 catacttccgaagttgcgacacatgaaatacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgaaat 19665152  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||| | ||||||| ||| || || ||||| ||     
T  19665151 ctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacccccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatctccctct 19665052  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||  |||||||| ||||| |    
T  19665051 tgaaactcaagggctttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtct 19664952  T
Q  319 gctgaac 325  Q
    | |||||    
T  19664951 gatgaac 19664945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 420 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 24099577 - 24099306
Alignment:
Q  420 ccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaat 519  Q
    |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  24099577 ccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaat 24099478  T
Q  520 cctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactttt 619  Q
    |||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  24099477 cctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacctcgatcccaaagcatcttgcaaactctt 24099378  T
Q  620 ccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    ||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  24099377 ccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccgtgtagcttcacaat 24099306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 19 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 31550556 - 31550136
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||||||||||||||| || || ||||| ||||  || ||||| || |||||| | ||  ||||    
T  31550556 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctgtatgccactgtaccaactctctctgaaat 31550457  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||  | ||||||||||| || || ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  31550456 ctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 31550357  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| || |||   |||| |   |||||||| ||||| |    
T  31550356 tgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactttgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctccgtagtct 31550257  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
      ||||| |  || ||||| || || || |||||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  31550256 catgaactaaatccggtcccaacacaacactttcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccat 31550157  T
Q  419 tccaatactagaatgatagct 439  Q
     |||||||| || ||||||||    
T  31550156 accaatactcgagtgatagct 31550136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 50612791 - 50612602
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| || ||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||  | ||    
T  50612791 catacttccgaagttacgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatacggtggtaaacccactcgatatgccaccattccaactctttctgatat 50612692  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtg 208  Q
    |||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  50612691 ctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtg 50612602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 387 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 19663143 - 19662844
Alignment:
Q  387 ctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttc 486  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||    
T  19663143 ctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccgatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctc 19663044  T
Q  487 ctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatct 586  Q
    | ||||| ||||| ||||| | |||||        || |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  19663043 caccttgttcaagcacacacactctcagtt-----tccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaacct 19662949  T
Q  587 caacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttc 686  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  19662948 caacttcgaacccaaagcatcttgtaaactcttccaaaatctagaggtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttc 19662849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 444 - 688
Target Start/End: Complemental strand, 31539947 - 31539703
Alignment:
Q  444 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 543  Q
    |||||||| ||||| ||||| || |  ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |  || |||||||||||||    
T  31539947 ttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactgtcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctct 31539848  T
Q  544 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 643  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||  ||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||||||| || || ||    
T  31539847 ccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacttcattttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcgg 31539748  T
Q  644 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 688  Q
    ||||||||| || |||||||| || ||||||||||| || |||||    
T  31539747 atctctatccgacacaatgctagacggaacaccatgaagtttcac 31539703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 566 - 691
Target Start/End: Original strand, 20139361 - 20139486
Alignment:
Q  566 atgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctc 665  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||  || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20139361 atgatacgccaaactcaacctcaactcagaacctaaagcttcttgtaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctc 20139460  T
Q  666 gaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||||||||||||| | |||||||||    
T  20139461 gaaggaacaccatgcaacttcacaat 20139486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 272
Target Start/End: Original strand, 20244184 - 20244437
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||  ||||    
T  20244184 catacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaaccaactctataggccactgttccaaccctctctgaaat 20244283  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||  | |||||||| ||| |||| ||||| ||||||||| | || |||| ||| || || || || |||    
T  20244284 ctgatatggaccgatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcatgtcccacacccgtcataggagtaaccctcagaaagacatgatcaccctcc 20244383  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgc 272  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  20244384 tgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgc 20244437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 144 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 20831642 - 20831107
Alignment:
Q  144 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 243  Q
    ||||||||| |  |||| |||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  20831642 gtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 20831543  T
Q  244 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 343  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || || || || |     
T  20831542 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggcccaaacaa 20831443  T
Q  344 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 443  Q
      | ||||| || || |||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||| |||| | || ||     
T  20831442 agcactttctccggattcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagcatgaaaactgttg 20831343  T
Q  444 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 543  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  20831342 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 20831243  T
Q  544 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 643  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  20831242 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 20831143  T
Q  644 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 679  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  20831142 atcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 20831107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 19 - 133
Target Start/End: Original strand, 21163264 - 21163378
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||    
T  21163264 catacttccgaagttgcgacacatggaaaatgtcgtgcaaattcgaaatatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccgatat 21163363  T
Q  119 ctgatatggaccaat 133  Q
    |||||| ||||||||    
T  21163364 ctgatacggaccaat 21163378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 115 - 283
Target Start/End: Original strand, 11382674 - 11382842
Alignment:
Q  115 aaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcc 214  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||| ||||||||| ||| || || || ||    
T  11382674 aaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtccaacacccgtcaaaggagtgactctcagaaaaacatgatcacc 11382773  T
Q  215 ttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcat 283  Q
     ||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  11382774 ctcctgaaactcaagatccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcat 11382842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 20075434 - 20075170
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||  ||| ||||| ||||| ||| | ||  ||||    
T  20075434 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactttatatgccactgttcccactctctctgaaat 20075335  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||| || | ||| || || || || |||    
T  20075334 ctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgacccttagaaaaacatgatcaccctcc 20075235  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcat 283  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||| | |||||| ||||| || |||||    
T  20075234 tgaaactcaagagcctttctccgcttgtcatggtaactcttctatcgactttgcgaagctttcat 20075170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 609 - 679
Target Start/End: Original strand, 20250376 - 20250446
Alignment:
Q  609 tgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 679  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20250376 tgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatttctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 20250446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 144 - 679
Target Start/End: Original strand, 20914319 - 20914854
Alignment:
Q  144 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 243  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || ||||| |||| |||| | || |||||||| || || || ||  | |||||||||| ||| ||||| |  |    
T  20914319 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctccatt 20914418  T
Q  244 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 343  Q
    | | |||||||||||| | || |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || ||||| |  || ||||  || ||| |||| |     
T  20914419 tataatgataactcttctctctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaacttccggttctaacat 20914518  T
Q  344 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 443  Q
      | ||||| || ||||||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| |  | ||     
T  20914519 agcactttctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagtatgaaaattgttt 20914618  T
Q  444 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 543  Q
    || ||||| ||||| ||||| || | |      | |||| || | |||||||| |  ||||||  ||||||||||||||| |    || ||| |||||||    
T  20914619 ttgtaagtaaactcaatcaatggtaaactttcgttccaacttacaccttgctccaacacacaagctctcaacaaatcctccaaactctaaatagtcctct 20914718  T
Q  544 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 643  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |  ||||||||  |||||||||| | ||| ||  |||||||||| || ||    
T  20914719 cagtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaagttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccagaacttagaagtaaacctcgg 20914818  T
Q  644 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 679  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  20914819 atcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 20914854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 196 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 22135756 - 22135520
Alignment:
Q  196 tcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggat 295  Q
    |||||||||| ||||| ||  ||||||||| ||  || ||||| | ||| |||||||||||||| || | |||||| ||||| ||||| ||| | || ||    
T  22135756 tcaaaaacacatggtcaccaacctgaaacttaatgtcctttctcctcttatcatgataactcttctgcctactctgagacgctttcatcttcccctgaat 22135657  T
Q  296 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 395  Q
    ||||| |||||| |  |||||||  || ||||  ||||||||||| |   | |||||||||||||||||||| ||||| || || || || || ||||||    
T  22135656 catcttaacttttttcgtagtttcttgcacaacttctggtcctaacaaagcactttcacctgactcaaaccaacacaatggcgtcctacaccttcgacca 22135557  T
Q  396 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaat 432  Q
    ||||||||||| || ||||||||  | ||||||||||    
T  22135556 tacaaagcctcaaacggtgccatatcgatactagaat 22135520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 20395368 - 20395194
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||| || || | ||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||| |||| ||| |||||  |||||||| | ||  ||||    
T  20395368 catacttccgaagctgagaaatatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactattccaactctctctgaaat 20395269  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgac 193  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||||| ||| | |||||||||||||| || ||||| |||| |||| ||||    
T  20395268 ctgatacggaccgatgaacttaggagtcaaattcctcgacttcaaagcacgaccgacacccgtcaaaggagtgac 20395194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 157 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 21202524 - 21202371
Alignment:
Q  157 acttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataact 256  Q
    ||||||||| |||||| ||||| || |||||| | |||||||||||||  || || ||  |||||||||||| ||| ||| | | ||| |||||||||||    
T  21202524 acttcaaagtacgtccaacaccggttataggattcactctcaaaaacatatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttgtcctcttatcatgataact 21202425  T
Q  257 cttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctc 310  Q
    ||| || |  ||||| || || ||||| |||||||| ||||||| ||| |||||    
T  21202424 cttctgccttctctgagatgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctc 21202371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 530 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 22135421 - 22135272
Alignment:
Q  530 ctgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatcta 629  Q
    |||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |  || |||||  |||||||||||| ||||||  ||    
T  22135421 ctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctggggatgataagcagaactcaacctcaacttagttcctaaagcagcttgcaaactttcccaaaacata 22135322  T
Q  630 gaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 679  Q
    |||||||| || ||||| | ||| || ||||| ||  |||||| ||||||    
T  22135321 gaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactataaggaataccatg 22135272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 654 - 699
Target Start/End: Complemental strand, 41353402 - 41353357
Alignment:
Q  654 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 699  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  41353402 gatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctccttga 41353357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 318
Target Start/End: Original strand, 46518830 - 46519004
Alignment:
Q  144 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 243  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || ||||| |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| || || | ||    
T  46518830 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 46518929  T
Q  244 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    | |||||||| ||||| |||| |||||| |||| ||| || ||||| || ||||||| ||| || || |||||||    
T  46518930 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgtcttaatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagttt 46519004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 537 - 646
Target Start/End: Original strand, 20184683 - 20184792
Alignment:
Q  537 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 636  Q
    |||||||| | ||| | ||| ||||| | |||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||| ||||| | ||||||  |||||||||    
T  20184683 gtcctctctgtctgcctatcagtctgggaatgataagcagaactcaatctcaacttggttcccaaagctacttgtaaactctcccaaaacatagaagtaa 20184782  T
Q  637 atcttggatc 646  Q
    |||| |||||    
T  20184783 atctcggatc 20184792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 588; Significance: 0; HSPs: 72)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 588; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 702
Target Start/End: Original strand, 18177700 - 18178383
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  18177700 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 18177799  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18177800 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgttctacaccagttataggagtgactctcaagaacacgtggtctccttcc 18177899  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||    
T  18177900 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctcgaatcatctaaactttctcagtagttt 18177999  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  18178000 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccat 18178099  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  18178100 tccaatactagaatgatagctattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaatcctcaacaga 18178199  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  18178200 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 18178299  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 702  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18178300 tccaaaatctaaaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgttcgaaggaacaccatgtagcttcacaatctccttgatgt 18178383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 584; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 702
Target Start/End: Original strand, 8198586 - 8199269
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  8198586 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 8198685  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  8198686 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 8198785  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8198786 tggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 8198885  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  8198886 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 8198985  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8198986 tccaatactagaatgataactattattatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 8199085  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  8199086 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 8199185  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||    
T  8199186 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgt 8199269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 580; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 702
Target Start/End: Original strand, 10870953 - 10871636
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  10870953 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 10871052  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10871053 ctgatacggaccaatgaacctcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 10871152  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10871153 tgaaattcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 10871252  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10871253 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 10871352  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10871353 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 10871452  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  10871453 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 10871552  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 702  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||    
T  10871553 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaataccatgcagcttcacaatctctttgatgt 10871636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 574; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 11237525 - 11236844
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  11237525 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 11237426  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  11237425 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 11237326  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11237325 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttcattctctcttggatcatccgaactttctcagtagttt 11237226  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11237225 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggggttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccat 11237126  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11237125 tccaatacttgaatggtaactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 11237026  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11237025 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 11236926  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 700  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||    
T  11236925 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacaatctccttgat 11236844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 574; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 15161369 - 15160688
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  15161369 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 15161270  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  15161269 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 15161170  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15161169 tggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattctctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 15161070  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15161069 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccat 15160970  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15160969 tccaatacttgaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 15160870  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15160869 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 15160770  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 700  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  15160769 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 15160688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 572; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 44791663 - 44790980
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  44791663 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 44791564  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  44791563 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaatttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 44791464  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44791463 tggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 44791364  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  44791363 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 44791264  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44791263 tccaatactagaatgataactattattatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 44791164  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  44791163 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 44791064  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||    
T  44791063 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgt 44790980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 566; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 700
Target Start/End: Original strand, 8707563 - 8708244
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  8707563 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 8707662  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  8707663 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 8707762  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8707763 tggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 8707862  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8707863 gttgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 8707962  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8707963 tccaatactagaatggtaactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 8708062  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  8708063 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccaaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 8708162  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 700  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  8708163 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 8708244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 562; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 18552070 - 18551389
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  18552070 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 18551971  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  18551970 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcagcttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 18551871  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18551870 tggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 18551771  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18551770 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 18551671  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18551670 tccaatactagaatggtaactattattataagtgaactcaatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 18551571  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  18551570 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 18551471  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 700  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  18551470 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 18551389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 554; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 700
Target Start/End: Original strand, 14332355 - 14333036
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||    
T  14332355 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccagtat 14332454  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14332455 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 14332554  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14332555 tgaaattcaagatcttttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 14332654  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  14332655 gctgaacaatttctggtcctaagaccactctttctccttattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaggcctcgaacggtgccat 14332754  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14332755 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaataaa 14332854  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  14332855 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 14332954  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 700  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  14332955 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 14333036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 551; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 700
Target Start/End: Original strand, 13686021 - 13686703
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaa-cattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaa 117  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |    
T  13686021 catactttcgaagttgcgacacatggaaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcgacggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaata 13686120  T
Q  118 tctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttc 217  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13686121 tttgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 13686220  T
Q  218 ctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtt 317  Q
     || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13686221 ttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgatgctttcattctctcttggatcatctgaactttctcagtagtt 13686320  T
Q  318 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcca 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13686321 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccatcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgcca 13686420  T
Q  418 ttccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 517  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13686421 ttccaatacttgaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 13686520  T
Q  518 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 617  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13686521 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaactt 13686620  T
Q  618 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 700  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  13686621 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 13686703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 536; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 11553414 - 11552731
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||    
T  11553414 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacgtcgtgcaaattcgaaagatgtggtggtaaacccactcgataagccaccgttccaactctttccgatat 11553315  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11553314 ctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 11553215  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  11553214 tgaaactcaagatcctttctgcgcttatcatgataactcttttgtcaactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagttt 11553115  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11553114 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccat 11553015  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  11553014 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacggatcctcaacaaa 11552915  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11552914 tcctctagcaactgaattgtcctctccgactgtccatctatctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 11552815  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 702  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||    
T  11552814 tccaaaatctagaaggaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttaatgt 11552731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 524; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 702
Target Start/End: Original strand, 12687459 - 12688142
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||    
T  12687459 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacgtcgtgcaaatttgaaagatgcggtggtaaacccactcgataagccaccgttccaactctttctgatat 12687558  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12687559 ctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactcgcaaaaacacgtggtctccttcc 12687658  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  12687659 tgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 12687758  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12687759 gttggacaatctctggtcctaagaccattctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccat 12687858  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  12687859 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagcacacaaactctcaacaaa 12687958  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12687959 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 12688058  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 702  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||| ||||    
T  12688059 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatccgatacaatgctcgaaggaataccatgcaacttcacaatctccttaatgt 12688142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 502; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 17628 - 16947
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  17628 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 17529  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| || ||||| ||  || | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  17528 ctgatacgggccaataaatctcagagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 17429  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  17428 tgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataacttttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 17329  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17328 gctgaacaatttcgggtcctaagaccactctttcacctgactgaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccat 17229  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17228 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaaactgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaa 17129  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |    
T  17128 tcctctagcgactgaattgtcctctccaactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacctaaagcctcttgcaaactct 17029  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 700  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  17028 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcctcacaatctccttgat 16947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 496; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 702
Target Start/End: Original strand, 14954578 - 14955261
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||    
T  14954578 catacttccgaagttgcgatacatggaaaacgtcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaactcactcgataagccaccgttccaactctttctgatat 14954677  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    || ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14954678 cttatacggaccaataaactttggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 14954777  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  14954778 tgaaactcaagatcctttctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 14954877  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||    
T  14954878 gctggacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagtctcaaaaggtgtcat 14954977  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14954978 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagcacacaaattctcaacaaa 14955077  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  14955078 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctgttgcaaacttt 14955177  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 702  Q
    |  |||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| | | ||||||| ||||| ||||    
T  14955178 tgaaaatcctagaagtaaatcttggatctctatccaatacaatgctcgaaggaataccatgcaacgtcacaatctccttaatgt 14955261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 493; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 23517080 - 23516520
Alignment:
Q  20 atacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatc 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23517080 atacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaaaatc 23516981  T
Q  120 tgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcct 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23516980 tgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcct 23516881  T
Q  220 gaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttg 319  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23516880 gaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgatgccttcattttctctcggatcatctgaactttctcagtagtttg 23516781  T
Q  320 ctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccatt 419  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23516780 ctgaacaatctcttgtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccggcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccatt 23516681  T
Q  420 ccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaat 519  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23516680 ccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagtccctccttgctcaagaacacaaatcctcaacaaat 23516581  T
Q  520 cctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaact 580  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  23516580 gctctagtgactgaattgtcctctccgactgaccatctttctgtggatgatacgccgaact 23516520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 428; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 694
Target Start/End: Complemental strand, 15154964 - 15154294
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  | ||    
T  15154964 catacttccgaagttgcgacacgtgaaatacatcgtgcaaattcgaaagatgcagtggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgatat 15154865  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||     
T  15154864 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttct 15154765  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  15154764 tgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactcggtgacactttcatcttttcttgaatcatcttaactttctcagtagttt 15154665  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | |||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  15154664 gttgaacaatctc-----ctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcataaggtgccat 15154570  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  15154569 cccaatactagaatgataactattattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaag 15154470  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||  ||||||||||    
T  15154469 tcctctagcgattgaatcgttctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctgctgcaaacttt 15154370  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttc 694  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15154369 tccaaaatctagaagtgaatcttggatctctatttgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaatttc 15154294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 240 - 700
Target Start/End: Original strand, 9596236 - 9596696
Alignment:
Q  240 cgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtccta 339  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9596236 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctctgtagtctgctgaacaatctctggtccta 9596335  T
Q  340 agaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagct 439  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||    
T  9596336 agaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacgaagttctacatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaataatagaatgatgact 9596435  T
Q  440 attattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtc 539  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9596436 attattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaattgtc 9596535  T
Q  540 ctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatc 639  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9596536 ctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaatttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatc 9596635  T
Q  640 ttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 700  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  9596636 ttggatctctatctgatacaatgctcgaagggacaccatgtaacctcacaatctccttgat 9596696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 54 - 691
Target Start/End: Original strand, 15624545 - 15625182
Alignment:
Q  54 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttct 153  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| | ||||  | |||||||||| |||||| ||| |||| ||||| |||     
T  15624545 tgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaattctttctgatatctgatatgaaccaataaacctcggagtcaatttcc 15624644  T
Q  154 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgata 253  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||| | || ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||    
T  15624645 ttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaatacatggtctccttcctgaaactcaaggtctttcctaagcttatcatgata 15624744  T
Q  254 actcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttca 353  Q
    |||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || ||| |||| ||||||||| ||||| || |||||||| || |  || || |||    
T  15624745 actcttctatcgactctgcgacgctttcatcttctcttggatcaacttaaccttctaagtagtttgatgaacgatttctggtcccaaaattacactctca 15624844  T
Q  354 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 453  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||  || ||||| |||| ||||| ||||||||||||||| || ||||| || ||||    
T  15624845 cctgactcgaaccaacacaatggagtcctacacctccgaccatacagtgcttcgaatggtgtcattctaatactagaatgataactgttattgtacgtga 15624944  T
Q  454 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 553  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||| | |||||| ||||| || |||||||||||    
T  15624945 actctatcaacagaagatgactatcccaagttcctccatgctcaagtacataaactctcaacaagtcctccaacgactggattgttctttccgactgacc 15625044  T
Q  554 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 653  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15625045 atctgtttgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacccaaaacctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaaccttggatctctatct 15625144  T
Q  654 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  15625145 gacacaatgctcggcggaacaccatgtagcttcacaat 15625182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 12207090 - 12206418
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||| ||| ||||| | ||  | ||    
T  12207090 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactgttgcaactctctcagatat 12206991  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    ||| || | |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||     
T  12206990 ctggtacgaaccaataaacttcggcgtcaacttctttgatttcaaggcacgaccaacacctgtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttct 12206891  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatca-tctgaactttctcagtagtt 317  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||| | ||| |||| || |||||     
T  12206890 tgaaacttaagatcctttctacacttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttttatcaatttgaccttt-tctgtagtc 12206792  T
Q  318 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcca 417  Q
    |||||||| || || ||||| || |  || |||||||| ||||||||||| || ||||||||  |||| |||||| |||||||| | ||||| |||||||    
T  12206791 tgctgaactatatccggtcccaacattacactttcacccgactcaaaccaacataacggagtattgcacctccgatcatacaaaacttcgaacggtgcca 12206692  T
Q  418 ttccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 517  Q
    | |||||||| ||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||| | |||    
T  12206691 taccaatactcgaatggtaactattgttgtacgtgaactctatcaacggcaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactcttagcaa 12206592  T
Q  518 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 617  Q
    |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  12206591 atcctctaacgactgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagctgaactcaacctcaactttgaacccaacgcctcttgcaaactt 12206492  T
Q  618 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  12206491 ttccaaaatctcgatgtaaatcttggatctctatccaacacaatactcgacggaacaccatgcagcttcacaat 12206418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 15102891 - 15102221
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  15102891 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactgttccaaccctctcagatat 15102792  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| || ||||| ||     
T  15102791 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcaaaaacacatgatctccctct 15102692  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||  | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||   |||||||  |||||||| ||||| |    
T  15102691 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacactttcattttttctcttatcatcttgactttctctgtagtct 15102592  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | ||||  |  || ||||| || | |||||| ||  ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  15102591 gatgaatcaaatccggtcccaacaacactctctc--ctgactcgaaccaacacaaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 15102494  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||    
T  15102493 accaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaa 15102394  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |    
T  15102393 tcctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactct 15102294  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||  |||| || | ||||||||||||||||||    
T  15102293 tccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatattcgatggtaaaccatgtagcttcacaat 15102221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 19 - 571
Target Start/End: Original strand, 15203837 - 15204389
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||| | ||||   |||    
T  15203837 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatactctaccgttccaattctttctgtaat 15203936  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    ||||||  ||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||| || || || |||||||||| |  | ||||||| |||||||| |||||||||||     
T  15203937 ctgatacagaccaataaacctcggagtcaacttatttgacttcaatgcgcggccaacaccagtcacaaaagtgactctaaaaaacacatggtctccttct 15204036  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||| || ||| ||||| |||||||    
T  15204037 tgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcatggatcaacttaaccttctctgtagttt 15204136  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||||||||  |||||||| || || || || |||||| |||| ||||| ||||||||||| || || ||| |||||||||  || || || ||| ||||    
T  15204137 gctgaacaaaatctggtcccaaaactacactatcaccttactcgaaccaacacaacggagtcctacacctctgaccatacagcgcttcaaatggttccat 15204236  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  15204237 tccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaacggaagatgactattccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaa 15204336  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgata 571  Q
    ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15204337 tcctccaacgactgaattgtcctttccgactgaccatctgtctgcggatgata 15204389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 210 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 11772362 - 11771881
Alignment:
Q  210 tctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttct 309  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||  | ||||| ||||||| ||| ||||    
T  11772362 tctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgttttcatcatttcttgaatcatcttaaccttct 11772263  T
Q  310 cagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaa 409  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||||| ||||||||| || |  ||| |||||||||  ||    
T  11772262 cagtagtttgttgaacaatttccggtcctaaaaccacactctcacctgactcaaatcaacacaacgaagttctgcaccttcttccacacaaagccttaaa 11772163  T
Q  410 aggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaatt 509  Q
     |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |    
T  11772162 tggtgccattccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagtttctccttgctcaagtacacaaact 11772063  T
Q  510 ctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctctt 609  Q
    ||||||||||| || |  |||||||| ||  | ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||    
T  11772062 ctcaacaaatcttccaatgactgaatcgttttttccgactaaccatctgtctgcagatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctctt 11771963  T
Q  610 gcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11771962 gcaaactcctccaaaatctagaagtaaaccttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaat 11771881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 30 - 691
Target Start/End: Original strand, 21661933 - 21662591
Alignment:
Q  30 agttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggac 129  Q
    ||||| |||||||| || ||||  || || |||||||||||||| |||||||||||   ||| || ||||  |||||| ||| | |||||||||| || |    
T  21661933 agttgtgacacatgaaacacatcatgtaagttcgaaagatgcggtggtaaacccacgttatacgcaaccgccccaactctttgcgaaatctgatacgggc 21662032  T
Q  130 caatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaag 229  Q
    |||| ||| |||| || |  |||||||| || |  || ||||| ||||| || | |||  |||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||    
T  21662033 caataaacctcggagttagtttctttgattttagtgcccgtccaacaccggtaagaggggtgactctcaaaaacacatggtctcctt---gaaactcaag 21662129  T
Q  230 atcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatc 329  Q
    ||| || |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| || |||   |||| || ||| || ||| |||| || ||||||||     
T  21662130 atccttcctacgcttatcatgataactcttttgtctactctgtgacgctttcatcttttctctaatcaacttaacattttcattagtctgttgaacaatg 21662229  T
Q  330 tctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactag 429  Q
    |||||||| |  ||||| || ||||| ||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||    
T  21662230 tctggtcccagtaccacactctcaccggactcatcacaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaacgcttcgaacggtgccattccaatgctag 21662329  T
Q  430 aatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcga 529  Q
    |||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| | |||    
T  21662330 aatggtaactattattgtaagtgaactcgattaatggaagatgactatcccaagatcccccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcctccaacga 21662429  T
Q  530 ctgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatcta 629  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| || ||||| ||||| | |||||| ||||||||||||    
T  21662430 ctgaattgtcctctccgtctatccatctgtctgcggatgatacgcctaactcaaactcaacttagaacccaacgcctcctacaaactcttccaaaatcta 21662529  T
Q  630 gaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  21662530 gaagtaaatcttggatccctatctaatacaatactcgatggaacaccatgtaacttcacaat 21662591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 14264534 - 14263862
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || ||||   |||||||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||| ||||||||  ||||  | ||    
T  14264534 catacttccaaagttgcgacacatgaaacacatcaggcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactgttccaaccctttcagatat 14264435  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| || ||||| ||     
T  14264434 ctgatatggaccaataaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctct 14264335  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||  | || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||    |||||||  || ||||  ||||| |    
T  14264334 tgaaactcaagcgccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcgcttatcatcttgacattcttcgtagtct 14264235  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | ||||| |  |  ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  14264234 gatgaaccaaatacggtcccaacactacactttctcctgactcaaaccaacataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 14264135  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||| |||||||| || ||| | | ||||| ||||    
T  14264134 accaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacagtagatgactatcccaagctccaccttgctcgagtacagacactctcatcaaa 14264035  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||| |    
T  14264034 tcctctaacgattgaattgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaaccttaactttgaacccaatgcatcttgcaaactct 14263935  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||||||||||||||| || || |||| |||||| || ||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  14263934 tccaaaatctagaagtgaacctcggatttctatccgacacaatactcgatggaacaccatgcaacttcacaat 14263862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Original strand, 19147170 - 19147842
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || || |||| |||||  || ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  19147170 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacattatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaactcactctgtatgccactgttccaaccctctcagatat 19147269  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| || ||||| ||     
T  19147270 ctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctct 19147369  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||   |||||||  || ||||| ||||| |    
T  19147370 tgaaactcaagggctttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtct 19147469  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | ||||| |  |||||||| || || || ||||| || ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  19147470 gatgaaccaaatctggtcccaacactacactttctcccgactcaaaccaacataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 19147569  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||| ||||| ||| ||||||| ||| ||||| | ||||| ||||    
T  19147570 accaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactattccaagctccaccttgcttaagtacacacactctcagcaaa 19147669  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||| |||| ||| || ||||| || ||||||||||| |    
T  19147670 tcctctaacgattgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagttgaactcaacctcatcttagaacccaaggcatcttgcaaactct 19147769  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||||||||| ||||| || ||  |||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  19147770 tccaaaatcttgaagtgaacctcagatctctatccgacacaatactcgatggaactccatgcaacttcacaat 19147842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Original strand, 20746569 - 20747241
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || || |||| |||||  || ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  20746569 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacattatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaactcactctgtatgccactgttccaaccctctcagatat 20746668  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| || ||||| ||     
T  20746669 ctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctct 20746768  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||   |||||||  || ||||| ||||| |    
T  20746769 tgaaactcaagggctttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtct 20746868  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | ||||| |  |||||||| || || || ||||| || ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  20746869 gatgaactaaatctggtcccaacactacactttctcccgactcaaaccaacataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 20746968  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||| ||||| ||| ||||||| ||| ||||| | ||||| ||||    
T  20746969 accaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactattccaagctccaccttgcttaagtacacacactctcagcaaa 20747068  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||| |||| ||| || ||||| || ||||||||||| |    
T  20747069 tcctctaacgattgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagttgaactcaacctcatcttagaacccaaggcatcttgcaaactct 20747168  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||||||||| ||||| || ||  |||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  20747169 tccaaaatcttgaagtgaacctcagatctctatccgacacaatactcgatggaactccatgcaacttcacaat 20747241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 11388717 - 11388046
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||||| | |||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  11388717 catacttccgtaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactgttccaaccctctcagatat 11388618  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| || |||||| |     
T  11388617 ctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatgatctcct-ct 11388519  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||||||| | || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |  |||   |||| || ||| || || ||||| |    
T  11388518 tgaaactcatggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatctgttctcttatcaacttaaccttttctgtagtct 11388419  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    ||||||| || |||||||| || | ||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| ||||| |||| |||    
T  11388418 gctgaactatgtctggtcccaacatcacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagttctgcaccttcgaacatacaaagcttcgaacggtgtcat 11388319  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||||| ||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  | |    
T  11388318 accaatactcgaatggtaactattgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtaga 11388219  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  11388218 tcctctaaagattgtatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaatttcgaacccaaagcatcttgcaaactct 11388119  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  11388118 tccagaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaat 11388046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 351 - 691
Target Start/End: Original strand, 14039986 - 14040326
Alignment:
Q  351 tcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataag 450  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| || |    
T  14039986 tcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctctgaccatacaaagcctcaaaaggtgtcattccaatactagaatgataactgttattgtacg 14040085  T
Q  451 tgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactg 550  Q
    ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||    
T  14040086 tgaactctattaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactcttaacaaatcctctaacgattgaatcgttctctccgactg 14040185  T
Q  551 accatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctcta 650  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || || | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14040186 accatctgtctgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctagagcctcttgcaaaattttccaaaatgtagaagtaaatcttggatctcta 14040285  T
Q  651 tctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  14040286 tctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 14040326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 351 - 691
Target Start/End: Original strand, 14350016 - 14350356
Alignment:
Q  351 tcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataag 450  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| || |    
T  14350016 tcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctctgaccatacaaagcctcaaaaggtgtcattccaatactagaatgataactgttattgtacg 14350115  T
Q  451 tgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactg 550  Q
    ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||    
T  14350116 tgaactctattaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactcttaacaaatcctctaacgattgaatcgttctctccgactg 14350215  T
Q  551 accatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctcta 650  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || || | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14350216 accatctgtctgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctagagcctcttgcaaaattttccaaaatgtagaagtaaatcttggatctcta 14350315  T
Q  651 tctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  14350316 tctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 14350356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 16072584 - 16071912
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | ||  ||||||||||||||||| || || |||||||||    | ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  16072584 catacttccgaagttgcgacacatgaaacatatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgcatgccactgttccaaccctctcagatat 16072485  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||| || ||||| ||     
T  16072484 ctgatatggaccaataaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaacacatgatctccctct 16072385  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||  | || || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||   |||||||  || |||||  |||| |    
T  16072384 tgaaactcaagggccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccatagtct 16072285  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |  |||| |  |||||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16072284 gacgaaccaaatctggtcccaacactacactttctcctgactcaaaccaacataaaggagttatgcgcctccgaccatacaaagcttcgaatggtgccat 16072185  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||||| ||||| || || || || || |||||||| ||||||   || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||    
T  16072184 accaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaaccataggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaa 16072085  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||| |    
T  16072084 tcctctaacgattgaatcgtcctctctgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaaccttaactttgaacccaatgcatcttgcaaactct 16071985  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||||||||||||| | || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  16071984 tccaaaatctagaactgaacctcggatctctatccgacacaatactcgatggaactccatgtaacttcacaat 16071912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 19 - 688
Target Start/End: Complemental strand, 8212418 - 8211749
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||||||||||| || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||  || ||||| || |||||| | ||  ||||    
T  8212418 catacttccgaagttgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctgtatgccactgtaccaactctctctgaaat 8212319  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||| ||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  8212318 ctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 8212219  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||    |||| |   |||||||||||||| |    
T  8212218 tgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcaacctgactttctcagtagtct 8212119  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
      ||||| |  || ||||| || || || || ||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| || |||||    
T  8212118 catgaaccaaatccggtcccaatacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggcgccat 8212019  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  8212018 accaatactcgagtgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactgtcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaa 8211919  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    || || |  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||    
T  8211918 tcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcttgtaaacttt 8211819  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 688  Q
    |||| || |||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  8211818 tccagaacctagaagtgaacctcggatctctatctgacacaatgctagacggaacaccatgaagcttcac 8211749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 19 - 688
Target Start/End: Complemental strand, 11306553 - 11305884
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| || |||||| | ||  ||||    
T  11306553 catacttccgaagctgagagacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgtaccaactctctctgaaat 11306454  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  11306453 ctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 11306354  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||    |||| |   |||||||||||||| |    
T  11306353 tgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcaacctgactttctcagtagtct 11306254  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
      ||||| |  || ||||| || || |  |||||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  11306253 catgaactaaatccggtcccaacacaatactttcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccat 11306154  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  11306153 accaatactcgagtgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaaggtaagtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaa 11306054  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    || || |  || ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |    
T  11306053 tcttccaatgattgaattgtcctttccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactct 11305954  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 688  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  11305953 tccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcac 11305884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Original strand, 13021316 - 13021988
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||||||||| ||||||||  | ||  ||||    
T  13021316 catacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaaccaactctataagccactgttccaaccctctctgaaat 13021415  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||| ||||| || ||| ||||| | |||||||| ||||||  ||| || ||||||||| |||| |||| ||| || || || || ||     
T  13021416 ctgatacggaccaataaactttggagtccacttcctcgacttcaatgcacgttttacgcccgtcataggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccgtct 13021515  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||| ||  | ||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||    |||||||  || ||||||||||| |    
T  13021516 tgaaactctagggcctttttccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttgaccttctcagtagtct 13021615  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
      ||||| |  || |||||||| ||||| || |  |||||||||||||| || |  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13021616 catgaaccaagtccggtcctaacaccacactctttcctgactcaaaccaacatagaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 13021715  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||| | || ||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  13021716 accaatactcgaatgatagctgttgttataagtgaactctatcaacagtaggtgattatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaa 13021815  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||| |  || || || ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  13021816 tcctccaatgattggatagtcctctccgactaaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaaacttt 13021915  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||| || ||||| || || || ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||    
T  13021916 tccagaacctagaggtgaacctcggatccctatctgatacaatactcgacggtacaccgtgcagcttcacaat 13021988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 16950761 - 16950089
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  || ||||  ||||| ||||||||||| || |  ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  ||||  ||||    
T  16950761 catacttccgaagctgcgacacataaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtgccaaaccaactctatatgccactgttccaaccctttctgaaat 16950662  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||| || || || || |||    
T  16950661 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcc 16950562  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||||||| |  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||| || ||    |||||||  |||||||||||||| |    
T  16950561 tgaaactcatgggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacactttcatcttttcccttatcatcttgactttctcagtagtct 16950462  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | ||||| |  ||  |||| || || || || |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16950461 gatgaaccaagtcctgtcccaacacaacactctcacctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 16950362  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||||| ||||| || || || || || |||||||| ||||| || || ||||||| |||   ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  16950361 accaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaatggtaggtgactattccatactccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaa 16950262  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  16950261 tcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataatccgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaaactct 16950162  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||| ||||||||||| || || | ||||||||| || ||||| |||||  | || |||||||||||||||||    
T  16950161 tccagaatctagaagtgaacctcgaatctctatccgacacaatactcgacagtactccatgtagcttcacaat 16950089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 19 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 18054243 - 18053572
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||||||||||| ||||| || || ||||  ||||| ||||| ||||| || || || || |||| ||| ||||||||||| | | | ||  ||||    
T  18054243 catacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttcctattctctctgaaat 18054144  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||  | || |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||| ||| || || || || ||     
T  18054143 ctgatacgggccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactctcagaaatacatgatcaccctct 18054044  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||  | || || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||  ||||||||  ||||| || ||||| |    
T  18054043 tgaaactcaagggccttcctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtct 18053944  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
     |||||| |  || ||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  18053943 cctgaaccaaatccggtcccaacacaactctttctcctgactcgaaccaacacaacggagtcctgcaccctcgaccatacaaagcttcgaatggtgccat 18053844  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    ||| ||||| |||||||| || || || || |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| | |||||||||     
T  18053843 tcctatactcgaatgataactgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaag 18053744  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| || || ||||| |    
T  18053743 tcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagtctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactct 18053644  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 690  Q
    |||| || |||||||| || || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18053643 tccagaacctagaagtgaacctcggatccctatctgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaa 18053572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 19 - 688
Target Start/End: Original strand, 49152260 - 49152929
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| || |||||| | ||  ||||    
T  49152260 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgtaccaactctctctgaaat 49152359  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||| ||||| || ||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  49152360 ctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 49152459  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||   |||| |   |||||||||||||| |    
T  49152460 tgaaactcaagatccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtct 49152559  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
      || || |  || ||||| || || || |||||||| |||||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  49152560 catgcaccaaatccggtcccaacacaacactttcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 49152659  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  49152660 accaatactcgagtgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacatactctcaacaaa 49152759  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    || || |  || |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||  ||||||| || |||||||| || || |||||||    
T  49152760 tcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatccgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaactttgaacccaaagcgtcctgtaaacttt 49152859  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 688  Q
    |||| || |||||||| || || ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  49152860 tccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatgctagacggaacaccatgaagcttcac 49152929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Original strand, 6413470 - 6414142
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||  ||||    
T  6413470 catacttctgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgaaat 6413569  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||  | |||||||||||| || ||||||||  | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | || |||| |||||| || || || |||    
T  6413570 ctgattcgaaccaatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcc 6413669  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||||||||   | ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||    |||||||  |||||||||||||| |    
T  6413670 tgaaactcaaaggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttcatgttttcccttatcatcttgactttctcagtagtct 6413769  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | ||||| |  ||  | || || || || || || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  6413770 gatgaaccaaatccagacccaacacaacactctctcctgattcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 6413869  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||||||||  || ||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  6413870 accaatactcgaatggtaactgttattgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagccccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaa 6413969  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||| |  || || || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| |    
T  6413970 tcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccttctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacctaaagcatcttgcaaactct 6414069  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||||||||| ||||| || ||  |||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  6414070 tccaaaatcttgaagtgaacctcagatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 6414142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 14286666 - 14285994
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| |||||||   | |   ||||    
T  14286666 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaatcctatatgaaat 14286567  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    ||||||  ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| || || || || |||    
T  14286566 ctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacatcctacacctgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctcc 14286467  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||    ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||| || ||    |||||||  || |||||||| || |    
T  14286466 tgaaactcaagggtctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgacgctttcatcttttcccttatcatcttgaccttctcagtcgtct 14286367  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | ||||| |  || ||||| || || || || ||   |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  14286366 gatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctattgactcaaaccagcacaaaggagtcctgcacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccat 14286267  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||||| ||||| || || || || || |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||| |||    
T  14286266 accaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaataaa 14286167  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||  || || || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||| |||||||| || |    
T  14286166 tcctctaaagattgtatcgtcctcttcgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaattttgaacccaaagcatcttgcaagctct 14286067  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    ||| ||||||||| || || || ||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  14286066 tccgaaatctagatgtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 14285994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Original strand, 13665512 - 13666168
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  ||||  ||||    
T  13665512 catacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctttctgaaat 13665611  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| ||     ||||||| || ||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||| | ||||||| ||| || || ||| | ||     
T  13665612 ctgatacgg-----tgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcccgacctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcttcctct 13665706  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||  | || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||  |||||||| |||||||    
T  13665707 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtgatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagttt 13665806  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | |||||           | || || |  || || ||||||||||||||||| || |||||  |||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  13665807 gatgaac-----------ccaacacaaaactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcatgcccctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 13665895  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||    
T  13665896 accaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcagtaaa 13665995  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||  || || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || || |    
T  13665996 tcctctaatgattggatcgtcctctctgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgtaagctct 13666095  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  13666096 tccagaatctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacgatacaccatgtagcttcacaat 13666168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 165 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 35965016 - 35964646
Alignment:
Q  165 gcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtc 264  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  35965016 gcacgtcatacactagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtccccttcttgaaactcaagatccttcctacgcttatcatgataactcttttgtc 35964917  T
Q  265 gactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaa 364  Q
     |||||||||||||||||| || |||   |||| || ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |  || || || || || |||||| |    
T  35964916 tactctgcgacgccttcatcttttctctaatcaacttaaccttctcagtagtttgttgaacaatgtctggtcccagtactacactatcgccagactcata 35964817  T
Q  365 ccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaac 464  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||     
T  35964816 ccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaacgcttcgaacggtgccattccaatactagaatggtaactgttattataagtgaactcgatcaat 35964717  T
Q  465 ggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaat 535  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||    
T  35964716 agaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcctccaacgactgaat 35964646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 19 - 690
Target Start/End: Original strand, 14129832 - 14130503
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||| || |||||||| || ||||  ||||| ||||| ||||| || || || || |||| ||| |||| ||||||||   | || |||||    
T  14129832 catacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccatcgttccaatcctctctaaaat 14129931  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||  ||||| ||| | ||||| ||||| || || || || |||    
T  14129932 ctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacactcgtcatcggagtaactctaaaaaatacatgatcaccctcc 14130031  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||  | || || ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||    |||||||  || ||||||||  | |    
T  14130032 tgaaactcaagggccttcctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgaccttctcagtcatct 14130131  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
      ||||| |  || ||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  14130132 catgaaccaaatccggtcccaacaccacactctctcctgactcaaaccagcataacggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 14130231  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     || ||||| ||||| || || || || || |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | |||||||| |    
T  14130232 acctatactcgaatggtaactgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcaacaga 14130331  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |    
T  14130332 tcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaactcaaagcatcctgcaaactct 14130431  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 690  Q
    |||| || ||||| || || || ||||| ||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  14130432 tccagaacctagaggtgaacctcggatccctatccgacacaatacttgaaggaactccatgtagcttcacaa 14130503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 23 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 1693 - 1025
Alignment:
Q  23 cttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctga 122  Q
    ||||||||| || |||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||  ||||||||  ||||  ||||||||    
T  1693 cttccgaagctgagacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccagtgttccaaccctttcttaaatctga 1594  T
Q  123 tatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaa 222  Q
    ||  ||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||| | | ||| ||| ||| || || || || |||||||    
T  1593 tacagaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcatagaagtaactttcacaaaaacatgatcaccctcctgaa 1494  T
Q  223 actcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctg 322  Q
    |||||||  | ||||| | ||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||| ||||| || ||    |||||||  || ||||||||||| || ||    
T  1493 actcaagggcctttctcctcttgtcatggtaactcttctgtcgaatctgtgacgctttcatcttttcccttatcatcttgaccttctcagtagtctgatg 1394  T
Q  323 aacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattcca 422  Q
    ||| |  || ||||| || || || || || ||||||||||||||||| || ||||| || || ||| ||||||||||||| | ||| |||||||| |||    
T  1393 aaccaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtccttcacctctgaccatacaaagctttgaacggtgccatacca 1294  T
Q  423 atactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcct 522  Q
    ||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  1293 atactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcct 1194  T
Q  523 ctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttcca 622  Q
    | |  || || || ||| | ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  1193 ccaatgattggatcgtcttttccgactaaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacctcgatcccaaagcatcttgcaaactcttcca 1094  T
Q  623 aaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
     ||||||||||| || |||| ||| ||||| || ||||| ||||| || || |||||||||||||||||    
T  1093 gaatctagaagtgaaccttgtatccctatccgacacaatactcgacggtactccatgtagcttcacaat 1025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 19 - 690
Target Start/End: Original strand, 14433650 - 14434321
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||| || |||||||| || ||||  ||||| ||||| ||||| || || || || |||| ||| |||| ||||||||   | || |||||    
T  14433650 catacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccatcgttccaatcctctctaaaat 14433749  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||  ||||| ||| | ||||| ||||| || || || || |||    
T  14433750 ctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacactcgtcatcggagtaactctaaaaaatacatgatcaccctcc 14433849  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||  | || || ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||    |||||||  || ||||||||  | |    
T  14433850 tgaaactcaagggccttcctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgaccttctcagtcatct 14433949  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
      ||||| |  || ||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  14433950 catgaaccaaatccggtcccaacaccacactctctcctgactcaaaccagcataacggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 14434049  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     || ||||| ||||| || || || || || |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | |||||||| |    
T  14434050 acctatactcgaatggtaactgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcaacaga 14434149  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||| |  || || || ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |    
T  14434150 tcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaactcaaagcatcctgcaaactct 14434249  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 690  Q
    |||| || ||||| || || || ||||| ||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  14434250 tccagaacctagaggtgaacctcggatccctatccgacacaatactagaaggaactccatgtagcttcacaa 14434321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 115 - 688
Target Start/End: Complemental strand, 23506064 - 23505491
Alignment:
Q  115 aaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcc 214  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| | ||| || || || ||    
T  23506064 aaatctgatacggaccaatgaatttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcacc 23505965  T
Q  215 ttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagta 314  Q
     || |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||   ||||| ||  ||||| || |||    
T  23505964 ctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctccctgatcagcttgactttttctgta 23505865  T
Q  315 gtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtg 414  Q
    || | ||| || |  || ||||| || || || ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||    
T  23505864 gtctcctggaccaaatccggtcccaacacaacactttctcccgactcaaaccaacacaacggagttctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtg 23505765  T
Q  415 ccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaa 514  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || || || || |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| || || ||||||||||| | ||||||    
T  23505764 ccattcctatactcgaatgataactgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccctgttcaagaacacacactctcaa 23505665  T
Q  515 caaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaa 614  Q
    ||| || || |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| || || |||    
T  23505664 caagtcttccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagtctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaa 23505565  T
Q  615 cttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 688  Q
    || ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  23505564 ctcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatacacgaaggaactccatgtagcttcac 23505491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Original strand, 12455662 - 12456333
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| || ||||  ||||  ||||||||||| || || ||||| | || ||||||||| |||| |||| | ||  ||||    
T  12455662 catacttccgaagctgc-acacatgaaacacatcatgcaggttcgaaagatgtggtggcaaaccaattctataagccactgttctaactctctctgaaat 12455760  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    ||||||  ||||||||||||| ||  |||||||| | |||||||| |||| ||| ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  12455761 ctgataccgaccaatgaactttggattcaacttcctcgacttcaatgcacatccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 12455860  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||| ||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||    |||| ||  |||||||||||||| |    
T  12455861 tgaaactctagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcaccttgactttctcagtagtct 12455960  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
      || || |  || ||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| || || |||| |||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  12455961 catgtaccaagtccggtcccaacaccacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctcctaccatacaaagcttcgaacggtaccat 12456060  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     || ||||| ||||| || || ||||| || |||||||| |||| ||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | | |||||||     
T  12456061 acctatactcgaatggtaactgttattgtatgtgaactctatcagcggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactgtcaacaat 12456160  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||| | |    
T  12456161 tcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctggggatgataagccgagctcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgtaaattct 12456260  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  12456261 tccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccgtgtagcttcacaat 12456333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 19 - 346
Target Start/End: Original strand, 14037765 - 14038092
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||| | ||    
T  14037765 catacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccattcaaactctttccgatat 14037864  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||||| |||||| ||  | || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  14037865 ctgatatgaaccaataaatcttggtgtcaacttctttgacttcaatgcacgcccaacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtgatctccttct 14037964  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  14037965 tggaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgacgctttcatcttttcttgaatcattttaactttctcagtagttt 14038064  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccac 346  Q
    | |||||||| |||||||| || |||||    
T  14038065 gttgaacaatttctggtcccaaaaccac 14038092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 19 - 346
Target Start/End: Original strand, 14347795 - 14348122
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||| | ||    
T  14347795 catacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccattcaaactctttccgatat 14347894  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||||| |||||| ||  | || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  14347895 ctgatatgaaccaataaatcttggtgtcaacttctttgacttcaatgcacgcccaacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtgatctccttct 14347994  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  14347995 tggaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgacgctttcatcttttcttgaatcattttaactttctcagtagttt 14348094  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccac 346  Q
    | |||||||| |||||||| || |||||    
T  14348095 gttgaacaatttctggtcccaaaaccac 14348122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 115 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 23199937 - 23199418
Alignment:
Q  115 aaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcc 214  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| | ||| || || || ||    
T  23199937 aaatctgatacggaccaatgaatttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcacc 23199838  T
Q  215 ttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagta 314  Q
     || |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||   ||||| ||  ||||| || |||    
T  23199837 ctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctccctgatcagcttgactttttctgta 23199738  T
Q  315 gtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtg 414  Q
    || | ||| || |  || ||||| || || || ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||    
T  23199737 gtctcctggaccaaatccggtcccaacacaacactttctcccgactcaaaccaacacaacggagttctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtg 23199638  T
Q  415 ccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaa 514  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || || || || |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| || || ||||||||||| | ||||||    
T  23199637 ccattcctatactcgaatgataactgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccctgttcaagaacacacactctcaa 23199538  T
Q  515 caaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaa 614  Q
    ||| || || |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| || || |||    
T  23199537 caagtcttccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagtctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaa 23199438  T
Q  615 cttttccaaaatctagaagt 634  Q
    || ||||| || ||||||||    
T  23199437 ctcttccagaacctagaagt 23199418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 115 - 688
Target Start/End: Complemental strand, 26118799 - 26118226
Alignment:
Q  115 aaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcc 214  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||  | ||||||| |||||| || ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || ||    
T  26118799 aaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcagagcacgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcacc 26118700  T
Q  215 ttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcat--tttctcttggatcatctgaactttctcag 312  Q
     |||||||||||||| || || || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||  ||||||||  |||| |   ||||||||||    
T  26118699 ctcctgaaactcaagctccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcctttctctt--atcaacctgactttctcag 26118602  T
Q  313 tagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaagg 412  Q
    |||| |  ||||| |  || ||||| || || || |||||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| ||    
T  26118601 tagtctcatgaaccaaatccggtcccaacacaacactttcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacgg 26118502  T
Q  413 tgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctc 512  Q
    |||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  ||||| ||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | ||||    
T  26118501 tgccataccaatactcgagtgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactgtcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctc 26118402  T
Q  513 aacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgca 612  Q
    |||||||| || |  || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || |    
T  26118401 aacaaatcttccaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgta 26118302  T
Q  613 aacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 688  Q
    |||  ||||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||  ||||||||||| || |||||    
T  26118301 aacgcttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgccggaacaccatgaagtttcac 26118226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 216 - 690
Target Start/End: Original strand, 15340587 - 15341061
Alignment:
Q  216 tcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtag 315  Q
    ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || ||    |||| ||  || |||||||| |    
T  15340587 tcctgaaactcaagggcctttctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgtgacgctttcatcttttcccttatcagcttgaccttctcagtcg 15340686  T
Q  316 tttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgc 415  Q
    | || ||||| |  || ||||| || || || || || |||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  15340687 tctgatgaaccaaatccggtcccaatacaacactctctcctgactcaaactagcataacggagtcctgcacctccgaccatacaaaacttcgaacggtgc 15340786  T
Q  416 cattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaac 515  Q
    ||| || ||||| ||||| ||  | || || || |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | |||||||    
T  15340787 catacctatactcgaatggtaaatgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcaac 15340886  T
Q  516 aaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaac 615  Q
    |||||||| |   | |  || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  15340887 aaatcctccaattatttgatcgtcctttccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcatcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaac 15340986  T
Q  616 ttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 690  Q
    | ||||| || ||||| || || || ||||| ||||| || ||||| || |||||||| | ||||||||||||||    
T  15340987 tcttccagaacctagatgtgaacctcggatccctatccgacacaatactagaaggaactctatgtagcttcacaa 15341061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 351 - 688
Target Start/End: Complemental strand, 13968626 - 13968289
Alignment:
Q  351 tcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataag 450  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||  | || |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||    
T  13968626 tcacccgactcaaaccagcataaaggagtcatacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctgttgttataag 13968527  T
Q  451 tgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactg 550  Q
    ||||| | ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||    
T  13968526 tgaacccaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccgactg 13968427  T
Q  551 accatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctcta 650  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| |||    
T  13968426 accatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatcccta 13968327  T
Q  651 tctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 688  Q
    || || ||||| || || || |||||||| ||||||||    
T  13968326 tccgacacaatacttgacggtacaccatgaagcttcac 13968289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 576 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 23203368 - 23203242
Alignment:
Q  576 gaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacac 675  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23203368 gaactcaatctcaacttcgaccccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacac 23203269  T
Q  676 catgtagcttcacaatttccttgatgt 702  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23203268 catgcagcttcacaatctccttgatgt 23203242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 576 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 23509495 - 23509369
Alignment:
Q  576 gaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacac 675  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23509495 gaactcaatctcaacttcgaccccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacac 23509396  T
Q  676 catgtagcttcacaatttccttgatgt 702  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23509395 catgcagcttcacaatctccttgatgt 23509369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 221 - 579
Target Start/End: Original strand, 12456940 - 12457298
Alignment:
Q  221 aaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgc 320  Q
    |||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||   || | |   |||||||||||||| |      
T  12456940 aaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatgaacctgactttctcagtagtctca 12457039  T
Q  321 tgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattc 420  Q
    ||||| |  || ||||| || ||||| || || |||||||||||| |||| || ||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  12457040 tgaaccaagtccggtcccaacaccacactctctcctgactcaaactagcataaaggagtcctatacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccatac 12457139  T
Q  421 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 520  Q
    ||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| | | |||||| |||||    
T  12457140 caatactcgagtgatagctgttgttatatgtgaactcaatcaacggtaggtgactatctcaagttccaccttgctcaagcacagacactctcaataaatc 12457239  T
Q  521 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaac 579  Q
     || |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  12457240 ttccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaac 12457298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 157 - 679
Target Start/End: Original strand, 14936443 - 14936965
Alignment:
Q  157 acttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataact 256  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| | || | |||||||||||||| || || ||  ||||||||||||  || ||||| | ||| |||||||||||    
T  14936443 acttcaaagcacgaccaacaccagtcacaagattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtcctttctcctcttatcatgataact 14936542  T
Q  257 cttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacct 356  Q
    ||| |||| |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| || ||  ||||||  || ||||  || |||||||| |   | | |||||||    
T  14936543 cttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccttagtttattgcacaacttccggtcctaacaaagcaccttcacct 14936642  T
Q  357 gactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaact 456  Q
    || |||||||| |||||||  || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| | || || || ||||| ||||    
T  14936643 gattcaaaccaacacaacgacgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaact 14936742  T
Q  457 cgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatc 556  Q
    | |||||||| | |      |||||| |  | | |||||| |  ||||||  |||||||||||||||||    |||||| |||||||| | ||| |||||    
T  14936743 caatcaacggtaaacattcgtcccaactgacacattgctccaacacacaagctctcaacaaatcctctaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatc 14936842  T
Q  557 tgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgat 656  Q
     ||||| |||||||| |  ||||||||||||||||| |  || |||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| |||    
T  14936843 ggtctggggatgataagaagaactcaatctcaacttagttcctaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgat 14936942  T
Q  657 acaatgctcgaaggaacaccatg 679  Q
    ||||| || ||||||| ||||||    
T  14936943 acaatactagaaggaataccatg 14936965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 144 - 679
Target Start/End: Original strand, 4440011 - 4440546
Alignment:
Q  144 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 243  Q
    ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| || || ||  ||||||||||||  || || || | ||    
T  4440011 gtcaacttcctacacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagggttcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtccttcctcctct 4440110  T
Q  244 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 343  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||| || || ||||| |  || ||||  || || ||||| |     
T  4440111 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaacttccggccctaacaa 4440210  T
Q  344 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 443  Q
      | ||||||||||| || ||||| |||||||   |||| || || |  |||||||||||||| |   ||||||| ||  ||||||||||| | || ||     
T  4440211 agcactttcacctgattcgaaccaacacaacgacattctacaccttcttccatacaaagcctcaagcagtgccataccggtactagaatgaaaactgttg 4440310  T
Q  444 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 543  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||| |||||||| |    |||||| |||||||    
T  4440311 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaataaatcctccaaactctgaatagtcctct 4440410  T
Q  544 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 643  Q
    | | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |  ||||||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||| || ||    
T  4440411 ctgtctgcccatcggtctggggatgataagcagaactcaacctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctcgg 4440510  T
Q  644 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 679  Q
    ||| | |||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  4440511 atcccgatctgacacaatactagaaggaataccatg 4440546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 144 - 679
Target Start/End: Original strand, 7823983 - 7824518
Alignment:
Q  144 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 243  Q
    ||||||||| |  |||| |||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  7823983 gtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 7824082  T
Q  244 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 343  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || || || || |     
T  7824083 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggcccaaacaa 7824182  T
Q  344 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 443  Q
      | ||||| || || |||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||| |||| | || ||     
T  7824183 agcactttctccggattcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagcatgaaaactgttg 7824282  T
Q  444 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 543  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| ||||| |    
T  7824283 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtccttt 7824382  T
Q  544 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 643  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  || |||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||    
T  7824383 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcctaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 7824482  T
Q  644 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 679  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  7824483 atcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 7824518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 144 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 27107961 - 27107426
Alignment:
Q  144 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 243  Q
    ||||||||| |  |||| |||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  27107961 gtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 27107862  T
Q  244 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 343  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || || || || |     
T  27107861 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggcccaaacaa 27107762  T
Q  344 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 443  Q
      | ||||| || || |||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||| |||| | || ||     
T  27107761 agcactttctccggattcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagcatgaaaactgttg 27107662  T
Q  444 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 543  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| ||||| |    
T  27107661 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtccttt 27107562  T
Q  544 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 643  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  27107561 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 27107462  T
Q  644 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 679  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  27107461 atcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 27107426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 157 - 679
Target Start/End: Original strand, 15364036 - 15364558
Alignment:
Q  157 acttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataact 256  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||| | || | |||||||||||||| || || ||  ||||||||||||  || ||||| | ||| |||||||||||    
T  15364036 acttcaaagcacgaccaacaccggtcacaagattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtcctttctcctcttatcatgataact 15364135  T
Q  257 cttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacct 356  Q
    ||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || ||  || |||  || ||||  || |||| ||| |   | ||||| |||    
T  15364136 cttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccttatttttttgcacaacttccggtcttaacatatcactttctcct 15364235  T
Q  357 gactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaact 456  Q
     | |||||||| |||||||  || || || |||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||| |||| | || || || ||||| ||||    
T  15364236 tattcaaaccaacacaacgtcgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaact 15364335  T
Q  457 cgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatc 556  Q
    | |||||||| | |      |||||| |  | | |||||| |  ||||||  |||||||||||||||||    |||||| |||||||| | ||| |||||    
T  15364336 caatcaacggtaaacattcgtcccaactgacacattgctccaacacacaagctctcaacaaatcctctaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatc 15364435  T
Q  557 tgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgat 656  Q
     ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  || |||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| |||    
T  15364436 ggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcctaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgat 15364535  T
Q  657 acaatgctcgaaggaacaccatg 679  Q
    ||||| || ||||||| ||||||    
T  15364536 acaatactagaaggaataccatg 15364558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 192 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 12368715 - 12368473
Alignment:
Q  192 actctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctt 291  Q
    ||||||||||||||||| || ||  ||||||| |||| ||| ||||| | ||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  12368715 actctcaaaaacacgtgatcaccaacctgaaagtcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcattttctctt 12368616  T
Q  292 ggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccg 391  Q
    ||||||||| ||| || |  ||||| |  || ||||  || ||||| || |   | ||||| || || || ||||| |||||||| || || || |||||    
T  12368615 ggatcatcttaacctttttcgtagtctcttgcacaacttccggtccaaacaaagcactttctccggattcgaaccaacacaacggtgtcctacacctccg 12368516  T
Q  392 accatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatga 434  Q
    ||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||    
T  12368515 accatacaaagcctcaaatggagccataccaatactagaatga 12368473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 27 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 26288318 - 26288063
Alignment:
Q  27 cgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatg 126  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||  ||||| || |||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| |||| |||  ||||  |||||||||| |    
T  26288318 cgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagtttgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttcaaaccctttctgaaatctgatacg 26288219  T
Q  127 gaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactc 226  Q
     ||||||||| || || ||||||||| | |||||||| || ||||||||||| ||||||||| | || |||| ||| || || || || |||||||| ||    
T  26288218 taccaatgaattttggagtcaacttcctcgacttcaatgcgcgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaa-tc 26288120  T
Q  227 aagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcat 283  Q
     ||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  26288119 tagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttatgtcgactctgcgacgctttcat 26288063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 144 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 21674720 - 21674185
Alignment:
Q  144 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 243  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||||| | |||| ||| | |  | |||||||||||||| || || ||  | ||||| ||||  || || || | ||    
T  21674720 gtcaatttcttacacttcaaagcacgtccaataccaatcacaaggttcactctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaattcaatgtccttcctcctct 21674621  T
Q  244 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 343  Q
    | |||||||||||||| |||| ||| || ||||| ||||| |||||||| ||||||| |  ||| || ||||| |  || ||||  || |||||||| |     
T  21674620 tatcatgataactcttctgtctactttgagacgctttcatcttctcttgaatcatcttatatttttccgtagtctcttgcacaacttccggtcctaacaa 21674521  T
Q  344 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 443  Q
      | ||||| |||||||||||||| |||||||  ||  | || |||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||| | || ||     
T  21674520 agcactttctcctgactcaaaccaacacaacgttgtcttacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagaatgaaaactgttg 21674421  T
Q  444 ttataagtgaactcgatcaacgg--aagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcct 541  Q
    || ||||| || || ||||||||  || ||  | |||| || |  |  ||||||| | |||||||  |||||||||||||||||    |||||| |||||    
T  21674420 ttgtaagtaaattcaatcaacggtaaacatt-cgatcc-aactgacatcttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctctaaactctgaatagtcct 21674323  T
Q  542 ctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatctt 641  Q
    ||| | ||| ||||| ||||| | |||||| ||  |||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||| ||     
T  21674322 ctcagtctggccatcggtctgggcatgataagcataactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctc 21674223  T
Q  642 ggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 679  Q
    ||||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  21674222 ggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 21674185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 247 - 403
Target Start/End: Original strand, 12193742 - 12193898
Alignment:
Q  247 catgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccac 346  Q
    ||||||||||||| || | |||||| |||||  |||| |||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||  || |||| ||  |||||||| |   |    
T  12193742 catgataactcttctgcctactctgagacgctctcatcttctcttgaatcatcttaaccttctccgtagtttcttgcacaaccttcggtcctaacaaagc 12193841  T
Q  347 tctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagc 403  Q
      |||||||||||||| |||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||    
T  12193842 attttcacctgactcataccaacacaaaggagttctacacctccgaccatacaaagc 12193898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 348 - 637
Target Start/End: Original strand, 45146842 - 45147131
Alignment:
Q  348 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 447  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || ||||||||||||| |||||| || |||| ||| || |||||||||||  | || || || |    
T  45146842 ctttcacctgattcaaaccaacacaatggcgtcctacacctccgaccatacagagcctccaacggtgtcataccgatactagaatgcaaactgttgttgt 45146941  T
Q  448 aagtgaactcgatcaacggaagatgactat-cccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccg 546  Q
    |||| ||||| |||||||| | |  | | | ||||| |  | |||||||| |  ||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||| |    
T  45146942 aagtaaactcaatcaacggtaaac-attctgcccaactgacaccttgctccaacacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctg 45147040  T
Q  547 actgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaa 637  Q
     ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |  || |||||  |||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  45147041 tctgcccatccgtctgaggatgataagcagaactcaacctcaacttggttccaaaagcagcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaa 45147131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 138
Target Start/End: Original strand, 15340455 - 15340574
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||| || |||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| |||||||||||||   | ||  ||||    
T  15340455 catacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccaccgttccaatcctctctgaaat 15340554  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaact 138  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  15340555 ctgatacggaccaatgaact 15340574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 150 - 687
Target Start/End: Complemental strand, 41327 - 40790
Alignment:
Q  150 ttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcat 249  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || || ||||  ||| ||||||| ||||| || || || |||||||||||||| |  | |||||| || || ||||    
T  41327 ttcttagacttcaaagcacgtccaacgcccgtcaccggagtgactcttaaaaatacatgatccccttcctgaaactccaattattttcttcgtttatcat 41228  T
Q  250 gataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactct 349  Q
    |||| ||||| |||| | | || || || ||||||| |||  | ||| | |  || ||||| || || |||||||||||||||||||| || ||  |  |    
T  41227 gatagctcttctgtctaatttgtgatgctttcatttcctcccgaatcgttttgaccttctcggtcgtctgctgaacaatctctggtcccaacactgcaat 41128  T
Q  350 ttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataa 449  Q
     || || |||||  |||| ||||| || ||||  ||||||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||| ||||||||||  | || || ||||||    
T  41127 ctcgccagactcgtaccaacacaaaggtgttcgacatctcctaccatacaacgcctcaaatggtgccatcccagtactagaatggaaactgttgttataa 41028  T
Q  450 gtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgact 549  Q
    || ||||| || || || |  | |  ||||||| |||| ||||| || |  |||||   ||| ||||| || || |  || ||||| || || ||   ||    
T  41027 gtaaactcaattaatgggaagtaagcatcccaacttcccccttgttccaacacacatgctcttaacaagtcttccaatgattgaatggttctttcgatct 40928  T
Q  550 gaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctct 649  Q
    ||||||| || || || |||||||| ||||||| | | ||||| |  |||||||    ||||||||||  |||||| || || || || |||||||||||    
T  40927 gaccatcagtttgtgggtgatatgcagaactcagttttaacttagtacccaaagtactttgcaaacttccccaaaaccttgatgtgaaccttggatctct 40828  T
Q  650 atctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttca 687  Q
    ||| || ||||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  40827 atccgaaacaatactcgaaggaagaccatgcagcttca 40790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 558 - 679
Target Start/End: Original strand, 17924148 - 17924269
Alignment:
Q  558 gtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgata 657  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    ||||||||  ||||||||||||| |||||  |||||||||| || ||||| | ||| || |    
T  17924148 gtctggggatgataagccgaactcaacctcaacttatttcccaaagcagcttgcaaactttttcaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgaca 17924247  T
Q  658 caatgctcgaaggaacaccatg 679  Q
    |||| || ||||||| ||||||    
T  17924248 caatactagaaggaataccatg 17924269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 564 - 672
Target Start/End: Original strand, 23641951 - 23642059
Alignment:
Q  564 ggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgc 663  Q
    |||||||| || |||||||| || ||||| |  ||||| ||| |||||||||| | ||||||| | | ||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  23641951 ggatgataagcagaactcaaccttaacttagtccccaacgccgcttgcaaactctcccaaaatgtcggagtaaactttggatctctatctgacacaatgc 23642050  T
Q  664 tcgaaggaa 672  Q
    | |||||||    
T  23642051 tagaaggaa 23642059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 531 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 15171764 - 15171642
Alignment:
Q  531 tgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctag 630  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||  |||| || ||||| ||  |||||||||||||||| |   |||||||| |||| |||||||||| |||  |||    
T  15171764 tgaatagtcctcttcgtctgaccatcgatctgaggctgataagcaaaactcaatctcaacttagtttccaaagccgcttgaaaacttttccgaaacatag 15171665  T
Q  631 aagtaaatcttggatctctatct 653  Q
    ||||||| ||  |||||||||||    
T  15171664 aagtaaacctcagatctctatct 15171642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 300
Target Start/End: Original strand, 13378796 - 13378937
Alignment:
Q  159 ttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactct 258  Q
    ||||||||||| || || | ||| |||||| | |||||||||||||| || || ||  ||||||||||||  |  ||||| | ||| |||| ||||| ||    
T  13378796 ttcaaagcacgaccaactcaagttataggattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaattttctttctcctcttatcataataacgct 13378895  T
Q  259 tttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatct 300  Q
    | |||| |||||| || || ||||| ||||||||||||||||    
T  13378896 tctgtctactctgagatgctttcatcttctcttggatcatct 13378937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 348 - 466
Target Start/End: Original strand, 13353438 - 13353556
Alignment:
Q  348 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 447  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||  || || || || | ||||||||||||||| || ||||||||  |  || |||||||| | || |||||||    
T  13353438 ctttcacctgactcataccaacacaacgacgtcctacaccttctaccatacaaagcctcaaacggtgccatatcggtaatagaatgaaaactcttattat 13353537  T
Q  448 aagtgaactcgatcaacgg 466  Q
    |||| ||||| ||| ||||    
T  13353538 aagtaaactcaatcgacgg 13353556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 597 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 17144994 - 17144936
Alignment:
Q  597 cccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctga 655  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||  | |||||||| || ||||||||||||||    
T  17144994 cccaaagcctcttgcatactcttccaaaactttgaagtaaacctcggatctctatctga 17144936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 588; Significance: 0; HSPs: 63)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 588; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 702
Target Start/End: Original strand, 8386381 - 8387064
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  8386381 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 8386480  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8386481 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 8386580  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8386581 tgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 8386680  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  8386681 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcgaacggcgccat 8386780  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8386781 tccaatactagaatgataactattattatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 8386880  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  8386881 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 8386980  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  8386981 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatgt 8387064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 586; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 700
Target Start/End: Original strand, 18297174 - 18297855
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  18297174 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 18297273  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  18297274 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 18297373  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18297374 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 18297473  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18297474 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 18297573  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18297574 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 18297673  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  18297674 tcctctagcgactgaattgttctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 18297773  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 700  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  18297774 tccgaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 18297855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 576; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 19778836 - 19778157
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  19778836 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactctttccaatat 19778737  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  19778736 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 19778637  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19778636 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 19778537  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19778536 gctgaacaatctctggtcctaagaccgctctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 19778437  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19778436 tccaatactagaatggtaactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 19778337  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  19778336 tcctctagcaactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 19778237  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttg 698  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  19778236 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttg 19778157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 576; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 29039447 - 29038764
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  29039447 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 29039348  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  29039347 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 29039248  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29039247 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 29039148  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  29039147 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 29039048  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29039047 tccaatactagaatgataactattattatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 29038948  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  29038947 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 29038848  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||    
T  29038847 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgt 29038764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 572; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 702
Target Start/End: Original strand, 12476569 - 12477252
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  12476569 catactttcgaagttgcgatacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 12476668  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  12476669 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 12476768  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12476769 tgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaacttcctcagtagttt 12476868  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12476869 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 12476968  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12476969 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 12477068  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  12477069 tcctcttgcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 12477168  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||    
T  12477169 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgt 12477252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 570; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 700
Target Start/End: Original strand, 27711305 - 27711986
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  27711305 catacttttgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 27711404  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  27711405 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 27711504  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27711505 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 27711604  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  27711605 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagtctcgaacggtgccat 27711704  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27711705 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 27711804  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  27711805 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcagatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 27711904  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 700  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  27711905 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 27711986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 566; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 14304020 - 14303340
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  14304020 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 14303921  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  14303920 ctgatacggaccaatgaacttcggg-tcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 14303822  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  14303821 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttcattttctcttggatcatccgaactttctcagtagtct 14303722  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14303721 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccat 14303622  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14303621 tccaatactagcatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 14303522  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14303521 tcttctagcgactgaattgtcctctccgactaaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 14303422  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 700  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| || ||||||||    
T  14303421 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacgatctccttgat 14303340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 550; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 700
Target Start/End: Original strand, 23955716 - 23956397
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  23955716 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttatgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 23955815  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  23955816 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 23955915  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23955916 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 23956015  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  23956016 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaggcctcgaacggtgccat 23956115  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23956116 tccaatactagaatggtaactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgacggtcctaagttcctccttgttcaagaacacaaattctcaacaaa 23956215  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  23956216 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaacttaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 23956315  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 700  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  23956316 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 23956397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 550; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 700
Target Start/End: Original strand, 40473009 - 40473690
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||    
T  40473009 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccatcgttccaactctttccaatat 40473108  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40473109 ctgatacagaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcc 40473208  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  40473209 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctacgacgctttcattttctcttgaatcatttgaactttctcagtagttt 40473308  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40473309 gctgaacaatctccggtcctaagaccactctttcacctgactcgaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccat 40473408  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40473409 tccaatactagaataataactattattgtatgtgaactcaatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaatcctcaacaaa 40473508  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  40473509 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcaaacccaaagcctcttgcaaacttt 40473608  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 700  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  40473609 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 40473690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 544; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 702
Target Start/End: Original strand, 12523645 - 12524328
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  12523645 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaatttgaaagatgcggtggtaatccaactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 12523744  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  12523745 ctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 12523844  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  12523845 tgaaactcaagatctttcctacggttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagttt 12523944  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12523945 gctgaacaatctctggtcctaaaaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccat 12524044  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12524045 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaatcctcaacaaa 12524144  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12524145 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 12524244  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 702  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  12524245 tccaaaatctagaagtaaatctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatgt 12524328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 542; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 8053666 - 8052985
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||  ||    
T  8053666 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccacacggtaagccatcgttccaactctttccagtat 8053567  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8053566 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 8053467  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8053466 tgaaattcaagatctcttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 8053367  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  8053366 gctgaacaatttctggtcctaagaccactctctctcctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctccgaccatacaaggcctcgaacggtgccat 8053267  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8053266 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctgaagaacacaaattctcaacaaa 8053167  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  8053166 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 8053067  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 700  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  8053066 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 8052985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 512; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 702
Target Start/End: Original strand, 14680536 - 14681219
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  14680536 catacttccgaagttgcgacacatggaacacgtcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 14680635  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14680636 ctgatacggaccaataaatctcggggtcaacttatttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctcgttcc 14680735  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  14680736 tgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacactttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 14680835  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14680836 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccat 14680935  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  14680936 tccaatactagaatgataactattattgtatatgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagcacacaaactctcaacaaa 14681035  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14681036 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 14681135  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 702  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||| ||||    
T  14681136 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatccgatacaatgctcgaaggaataccatgcaacttcacaatctccttaatgt 14681219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 495; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 14266942 - 14266368
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  14266942 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 14266843  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14266842 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcatacaccagtcataggggtgactctcaaaaacatgtggtctccttcc 14266743  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  14266742 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctctcagatcatctgaaccttctcagtagttt 14266643  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14266642 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccat 14266543  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14266542 tccaatactggaatgatagctattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaatcctcaacaaa 14266443  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttc 593  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14266442 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctatctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttc 14266368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 491; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 16252488 - 16251810
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  16252488 catacttctgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 16252389  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||     
T  16252388 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 16252289  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |    
T  16252288 tgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgcttttattttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtct 16252189  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  16252188 gctgaagaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgtcat 16252089  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||    
T  16252088 tccaataatagaatgataactattattgtacgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaacttacaacaaa 16251989  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16251988 tcctctagtgactgaattgtcctctctgactgaccatctgtctgcgaatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 16251889  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  16251888 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacctcacaatctcctt 16251810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 478; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 18227489 - 18226808
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||    
T  18227489 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatacggtggtaatcccactcgatacgccactgttccaactctttccgatat 18227390  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||| ||  || | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18227389 ctgatacggaccaataaatctcagagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtgctctccttcc 18227290  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||||  || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |    
T  18227289 tgaaactcaagattcttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttcttagtagtct 18227190  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18227189 tctgaacaatctcgggtcctaagaccactctttcacctgactaaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccat 18227090  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18227089 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaa 18226990  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||      
T  18226989 tcctctagcgactgaattgtcctctctgactgaccatctgtctacggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacctaaagcctcttgcaaactcc 18226890  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 700  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  18226889 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctcgatctgatacaatgctcgaaggcacaccatgtaacctcacaatctccttgat 18226808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 473; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 16355488 - 16354816
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||| | ||    
T  16355488 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaagtctttccgatat 16355389  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||     
T  16355388 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtttccttct 16355289  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  16355288 tgaaattcaagatctttcctgcgcttatcatgataattattttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 16355189  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  16355188 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggaattctccatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccat 16355089  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    || ||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16355088 tcaaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcaatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgcttaagaacacaaattctcaacaaa 16354989  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  16354988 tcctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgcctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactct 16354889  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  16354888 tccaaaatctagaagtaaatcttggatatctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgaaacttcacaat 16354816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 424; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 694
Target Start/End: Original strand, 7090402 - 7091076
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  7090402 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatat 7090501  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| | | |||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||     
T  7090502 ctgatacg-agcaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcatccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttct 7090600  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  7090601 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactcttcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 7090700  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||    
T  7090701 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaactgagttctgcatctccgaccatataaagcctcataaggttccat 7090800  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||    
T  7090801 tctaatactagaatgataactattattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctaaagaacccaaaccctcaacaaa 7090900  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    || |||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  7090901 tcttctaacgactaaatcgtcctctccgactgactatctgtctgcggatgatatgctgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttt 7091000  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttc 694  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  7091001 tctaaaatctagaagtaaattttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatttc 7091076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 14851409 - 14850737
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||||||| |||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| | ||    
T  14851409 catacttccgaatttgcgacacatgaaatacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccgttccaattctttcctatat 14851310  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| | || ||||||| ||||| || || ||||||||     
T  14851309 ctgatacggaccaataaacctcggagttaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccggtcacatgagtgactctaaaaaatacatgatctccttct 14851210  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||    
T  14851209 tgaaactcaaggtttttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgtatcatcttaaccttctcaatagttt 14851110  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| || |  |||||||||||||| |||||||||||    
T  14851109 gttgaacaatttctggtcctaaaaccacactctcacctgactcgagccaacacaacggagttctgcaccttcttccatacaaagcctcaaaaggtgccat 14851010  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  14851009 tccaatactagaatgataattgttattgtatgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaag 14850910  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    || || | |||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |    
T  14850909 tcttccaacgactgaatcattctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactct 14850810  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14850809 tccaaaatctagaagtaaacctcagatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaat 14850737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 189 - 694
Target Start/End: Complemental strand, 1640298 - 1639793
Alignment:
Q  189 ctgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttct 288  Q
    |||| ||||||||| || || |||||||| || |||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |    
T  1640298 ctgagtctcaaaaatacatgatctccttcttggaactcaaggtctttcctatgcttatcatgataactcttttgtcaactctgcgacgccttcatctttt 1640199  T
Q  289 cttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatct 388  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  1640198 cttgaatcatcttaactttctcagtagtttgttgaacaatctcgggtcctaaaaccaccctctcacctgactcaaaccaacacaacggagtcctgcatct 1640099  T
Q  389 ccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcct 488  Q
     ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  1640098 tcgaccatacaaagcctcaaaaggtgacattccaatactagaatgataaatattattgtaagtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagtccct 1639999  T
Q  489 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 588  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||    
T  1639998 ccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcctccagcgactgaatcgttctttccgactaaccatctgtctgcggatgatacgccaaactccacctca 1639899  T
Q  589 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 688  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  1639898 acttcgaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgcttgaaggaacaccatgcaacttcac 1639799  T
Q  689 aatttc 694  Q
    ||||||    
T  1639798 aatttc 1639793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 323 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 15147623 - 15147249
Alignment:
Q  323 aacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattcca 422  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  15147623 aacaatatctggtcctaagaacactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccattcca 15147524  T
Q  423 atactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcct 522  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  15147523 atactagaatgataactattattatacgtgaactcaatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcct 15147424  T
Q  523 ctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttcca 622  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||    
T  15147423 ctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgtcgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttcca 15147324  T
Q  623 aaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 697  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  15147323 aaatctaaaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatttcctt 15147249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 19 - 513
Target Start/End: Original strand, 14159461 - 14159955
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||  | ||    
T  14159461 catacttccgaagttccgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccgttccaattctttctgatat 14159560  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| | |||||||  ||||| || |||||| |     
T  14159561 ctgatatggaccaataaacctcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcatgggagtaactctcaggaacacatgatctcctcct 14159660  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| || |||||||| |    
T  14159661 tgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttatgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttcagtagtct 14159760  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | ||||||||||| ||||| || |||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  14159761 gttgaacaatctccggtcccaaaaccacattctcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccgtacaaagcctcaaaaggtgccat 14159860  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctca 513  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||    
T  14159861 tccaatactagaatgataactattattgtacgtgaactctattaatggaaggtgactatcccaagttccaccttgctcaagtacataaactctca 14159955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 15003667 - 15002995
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||| ||||||||| | ||  | ||    
T  15003667 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactgttccaactctctcagatat 15003568  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||||||| |||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| || ||||| ||     
T  15003567 ctgatatggatcaataaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtaactctcaaaaacacatgatctccctct 15003468  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||   |||||||  |||||||| ||||| |    
T  15003467 tgaaactcaagggattttctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctccgtagtct 15003368  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | ||||| |  |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| || ||  |||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  15003367 gatgaactaaatctggtcccaacaccacactttctcccgactcaaaccaacataaaggagtcctccacttccgaccatacaaagctttgaacggtgccat 15003268  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  || | ||||    
T  15003267 accaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacatacgcttagcaaa 15003168  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| |    
T  15003167 tcctctaacgattgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaatgcatcttgcaaactct 15003068  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||||||||| ||||| || || || ||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  15003067 tccaaaatcttgaagtgaacctcgggtctctttccgacacaatactcgacggaactccatgcaacttcacaat 15002995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 19 - 496
Target Start/End: Original strand, 14652277 - 14652754
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||  | ||    
T  14652277 catacttccgaagttgcgacatatgaaacacattgtgcaaattcgaaagatgcggtggtgaacccactcgatacgccaccgttccaattctttctgatat 14652376  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | || ||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  14652377 ctgatacggaccaataaacctcgaagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaatacgtgatctccttct 14652476  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  14652477 tgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 14652576  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | ||||| || |||||||| || |  || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||| |||    
T  14652577 gttgaacgatttctggtcccaaaaatacactctcacctgactcgaaccaacacaacggagttctgcaccttcgaccatacagagcctcaaaaggtgtcat 14652676  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctc 496  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  14652677 tccaatgctagaatgataactgttattgtacgtgaattctatcaacggaagatgaatatcccaagttcatctttgctc 14652754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 210 - 691
Target Start/End: Original strand, 8706078 - 8706559
Alignment:
Q  210 tctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttct 309  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| || |||   || | || |||||| |    
T  8706078 tctccttccttaaattcaaggtctttcctacgcttgtcgtgataactcttgtgtcgattctgcgacgctttcatcttttctcttattagcttaacttttt 8706177  T
Q  310 cagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaa 409  Q
    |  |||| || |||||||| || ||||| || || || |||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  8706178 ctatagtctggtgaacaatatccggtcccaacactacactttcacccgactcaaaccaacataacgaagttctgcacctccgaccatacaaagcttcgaa 8706277  T
Q  410 aggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaatt 509  Q
     |||| |||||  ||||||||||| || || || || || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |    
T  8706278 tggtgtcattcatatactagaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagtcccaccttgctcaagtacacaaact 8706377  T
Q  510 ctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctctt 609  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || | ||| |||||||    
T  8706378 ctcaacaaatcctctaacgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaactcaacgcctctt 8706477  T
Q  610 gcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  8706478 gcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgacggaacaccatgcagcttcacaat 8706559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 1649580 - 1648908
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||||| || ||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || || || |||| ||| ||||| |||||||   | ||  | ||    
T  1649580 catacttccgtagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaacccaactctatatgccacagttccaatcctctctgatat 1649481  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| | ||| || || || || |||    
T  1649480 ctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacacccgtcataggagtaactcttagaaatacatgatcgccctcc 1649381  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||||||||| || || || |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||  ||| ||||  |||||||  ||||| |    
T  1649380 tgaaactcaaggtccttcctccgcttgtcgtggtaactcttatgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctgattatcttgactttcttcgtagtct 1649281  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
      ||||| |  || ||||| || ||||| || || | ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||    
T  1649280 catgaaccaaatccggtcccaacaccacactctctcatgactcaaaccagcataaaggagttctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgacat 1649181  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||||| ||||| || || || || ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||    
T  1649180 accaatactcgaatggtaactgttgttgtaagtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacacactcaacaaa 1649081  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| |    
T  1649080 tcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactct 1648981  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    || ||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||    
T  1648980 tctaaaatctggaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgatggtacaccatgaagcttcacaat 1648908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Original strand, 15245893 - 15246565
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || |||| |||||  || ||||| ||||||||  | ||    ||    
T  15245893 catacttctgaagttgcgacacatgaaacacataatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacgcactctgtatgccactgttccaaccctctctgttat 15245992  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||  | ||||||| ||| || || ||||| |||    
T  15245993 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggggtaactctcagaaatacatgatctccctcc 15246092  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||||||||   | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||   |||||||  || ||||  ||||| |    
T  15246093 tgaaactcaaaggccttcctacgtttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatctttaccttcttcgtagtct 15246192  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | ||||| |  || ||||| || || || ||||| |||||||||||| || | || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  15246193 gatgaaccaaatccggtcccaacacaacactttctcctgactcaaactagaataaaggagttctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 15246292  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||||| ||||| |  || || || || || ||||| |||||||| || ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||    
T  15246293 accaatactcgaatggtgactgttgttgtacgtcaactctatcaacggtagttgactatcccaacctccaccttgctcaagtacacacactctcaccaaa 15246392  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||  || || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |    
T  15246393 tcctctaatgattggatcgttctctccgactgaccatctgtctggggatgataagtcgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactct 15246492  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||||||||||||||| || || | ||||||||| |||||||| ||||| | ||| ||||||| |||||||||    
T  15246493 tccaaaatctagaagtgaacctcgaatctctatccgatacaatactcgacgaaactccatgtaacttcacaat 15246565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 190 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 15415158 - 15414657
Alignment:
Q  190 tgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctc 289  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  15415158 tgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaattcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctc 15415059  T
Q  290 ttggatca-tctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatct 388  Q
        |||| | ||| |||| || ||||| || ||||| || |||||||| || |  || |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  15415058 ccttatcaatttgaccttt-tccgtagtctgttgaactatatctggtcccaacattacactttcacccgactcaaaccaacataacggagttctgcacct 15414960  T
Q  389 ccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcct 488  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||     
T  15414959 ccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggcagatgactatcccaaactcca 15414860  T
Q  489 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 588  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||| |||||| |||| ||| ||||| || ||||||||||| | |||||| ||||||||||| || |||||||| ||||    
T  15414859 ccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcatctaacgattgaatcgttctctccgactggctatctgtttgcggatgataagctgaactcaacctca 15414760  T
Q  589 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 688  Q
    |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| || || ||||||||||| ||||||||    
T  15414759 actttgaacccaacgcctcttgcaaacttttccaaaatctagatgtaaatcttggatctctatccgacacaatacttgacggaacaccatgcagcttcac 15414660  T
Q  689 aat 691  Q
    |||    
T  15414659 aat 15414657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 19 - 688
Target Start/End: Complemental strand, 3265097 - 3264428
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| || |||||| | ||  ||||    
T  3265097 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgtaccaactctctctgaaat 3264998  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||| ||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  3264997 ctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 3264898  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||   |||| |   |||||||||||||| |    
T  3264897 tgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtct 3264798  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
      ||||| |  || ||||| || || || || ||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  3264797 catgaaccaaatccggtcccaacacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccat 3264698  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||    
T  3264697 accaatactcgagtgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaa 3264598  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    || || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||| || || || |||||||    
T  3264597 tcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttt 3264498  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 688  Q
    |||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  3264497 tccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcac 3264428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 688
Target Start/End: Complemental strand, 11207534 - 11206865
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| || |||||| | ||  ||||    
T  11207534 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccactgtaccaactctctctgaaat 11207435  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||| ||| || || || || |||    
T  11207434 ctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcc 11207335  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||   |||| |   |||||||||||||| |    
T  11207334 tgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtct 11207235  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
      ||||| |  || ||||| || || || || ||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  11207234 catgaaccaagtccggtcccaacacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccat 11207135  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||||| || |||||||| || |||||||||||||| | ||| || |  ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||    
T  11207134 accaatactcgagtgatagctgttgttataagtgaactcaaccaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacaccctcaacaaa 11207035  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    || || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |    
T  11207034 tcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactct 11206935  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 688  Q
    || | || |||||||| || ||  |||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  11206934 tcaagaacctagaagtgaacctcagatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagcttcac 11206865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 19 - 688
Target Start/End: Complemental strand, 29453840 - 29453171
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| || |||||| | ||  ||||    
T  29453840 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgtaccaactctctctgaaat 29453741  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||  | ||||||||||| || || ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  29453740 ctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 29453641  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||   |||| |   |||||||||||||| |    
T  29453640 tgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaaccttactttctcagtagtct 29453541  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
      ||||| |  ||  |||| || || || || ||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  29453540 catgaaccaaatcccgtcccaatacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccat 29453441  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||    
T  29453440 accaatactcgagtgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaa 29453341  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    || || |  || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || |||||||    
T  29453340 tcttccaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttt 29453241  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 688  Q
    |||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  29453240 tccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcac 29453171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Original strand, 33222887 - 33223564
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||  ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||| | |   ||||    
T  33222887 catacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcatgttcgaaagatggggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaactctctttgaaat 33222986  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  33222987 ctgatacggaccaatgaactttggtgtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 33223086  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||    |||| ||  ||||||||||||||||    
T  33223087 tgaaactcaagttcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcaacttgactttctcagtagttt 33223186  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
      ||||| |  |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || | ||| |||| |||    
T  33223187 catgaaccaagtctggtcccaacaccacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaatgctttgaatggtgtcat 33223286  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     ||||||||  | || ||  | || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||    
T  33223287 accaatactctattgttattttttgttttatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtaaa 33223386  T
Q  519 tcctctagcgactgaat-----tgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaa 613  Q
    || || |  || || ||     | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||    
T  33223387 tcttccaatgattggatcgtcctctcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcctgtaa 33223486  T
Q  614 acttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    ||| ||||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  33223487 actcttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacgggacaccatgtagcttcacaat 33223564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 19 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 15150049 - 15149740
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||||| | ||    
T  15150049 catacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgtcaccgttccaactctttccgatat 15149950  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||| ||  || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  15149949 ctgatacggaccaataaatctcagagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 15149850  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||| |    
T  15149849 tgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttctcaatagtct 15149750  T
Q  319 gctgaacaat 328  Q
    ||||||||||    
T  15149749 gctgaacaat 15149740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 19 - 244
Target Start/End: Original strand, 15364355 - 15364580
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  15364355 catactttcgaagttgcgacatatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 15364454  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15364455 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 15364554  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgctt 244  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    
T  15364555 tgaaattcaagatcttttctacgctt 15364580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 117 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 15359295 - 15358721
Alignment:
Q  117 atctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctt 216  Q
    ||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||  ||| || || ||||| |    
T  15359295 atctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgatttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcggaaatacatgatctccct 15359196  T
Q  217 cctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 316  Q
    | |||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||   |||||||  || ||||| |||||    
T  15359195 cttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatgaaaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatctttaccttctccgtagt 15359096  T
Q  317 ttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcc 416  Q
     || ||||| |  || ||||| || || || || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  15359095 ctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgcc 15358996  T
Q  417 attccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaaca 516  Q
    || |||||||  ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||| | | |||||  |    
T  15358995 ataccaatacatgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacagacactctcagta 15358896  T
Q  517 aatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaact 616  Q
    ||||||| |  || || || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| |||    
T  15358895 aatcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctctctgaggatgataagtcgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcagact 15358796  T
Q  617 tttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
     |||| |||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  15358795 cttcccaaatcttgaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 15358721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 126 - 691
Target Start/End: Original strand, 27900462 - 27901027
Alignment:
Q  126 ggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaact 225  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||  ||||||||| | || |||| ||| || || || || ||||||||||    
T  27900462 ggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgttctacactcgtcataggagtaaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaact 27900561  T
Q  226 caagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaac 325  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||  |||||||| ||||| |  |||||    
T  27900562 caaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttctatcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtctcatgaac 27900661  T
Q  326 aatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaata 425  Q
     |  || ||||| || || || ||||| || |||||||||||||| || | ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  27900662 caaatccggtcccaacacaacactttctcccgactcaaaccagcataaagaagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaata 27900761  T
Q  426 ctagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctcta 525  Q
    || ||||| || || || || || |||||||| || ||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  || | |||||||||||    
T  27900762 ctcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatgaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacatacccttagcaaatcctcta 27900861  T
Q  526 gcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaa 625  Q
      || || || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||    
T  27900862 aagattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctacggatgataagctgaactcaacctcaattttgaacccaatgcatcttgtaaactcttccaaaa 27900961  T
Q  626 tctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    ||| |||||||| |  || |||||||| || || || ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  27900962 tcttgaagtaaaccccgggtctctatccgacactatactcgacggaacaccatgcatcttcacaat 27901027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Original strand, 20890952 - 20891623
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| |  || |||||||  | ||| ||||| ||||||||  | ||  ||||    
T  20890952 catacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtgttgg-aaacccatcctatatgccactgttccaaccctctctgaaat 20891050  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| | |||||| ||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  20891051 ctgatacgaaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 20891150  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||    |||| |   |||||||||||||| |    
T  20891151 tgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcaacctgactttctcagtagtct 20891250  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
      ||||| |  |  ||||| || || || || |||||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  20891251 catgaaccaaattcggtcccaacacaacactctcacctgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccggccatacaaagcttcgaacggtgccat 20891350  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||    
T  20891351 accaatacttgaatgatagctattgttatatgtgaactcaatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacaccctcaacaaa 20891450  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    || || |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| |    
T  20891451 tcttccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagtcgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcctgtaaactct 20891550  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||| || |||||||| || || |||||| |||| || ||||| || || || ||||| || | |||||||||    
T  20891551 tccagaacctagaagtgaacctcggatctttatccgacacaatacttgacggtacaccgtgcaacttcacaat 20891623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 180; E-Value: 8e-97
Query Start/End: Original strand, 240 - 691
Target Start/End: Original strand, 15077825 - 15078276
Alignment:
Q  240 cgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtccta 339  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||   |||||||  || ||||| ||||| || ||||| |  |||||||| |    
T  15077825 cgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtctgatgaactaaatctggtccca 15077924  T
Q  340 agaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagct 439  Q
    | || || ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||    
T  15077925 acactacactttctcccgactcaaaccaacacaatggagttctgcacctctgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaact 15078024  T
Q  440 attattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtc 539  Q
     || || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||| ||     
T  15078025 gttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaacgactgaatcgtt 15078124  T
Q  540 ctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatc 639  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  15078125 ctcttcgactgaccatttgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtaaacc 15078224  T
Q  640 ttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    | ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  15078225 tcggatctctatccgacacaatactcgatggaaccccatgcaacttcacaat 15078276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 19 - 595
Target Start/End: Original strand, 16145881 - 16146459
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||| | ||  ||||    
T  16145881 catacttccgaagctgcgacacatgtaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaactctctctgaaat 16145980  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||| || || ||  | |||    
T  16145981 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcatcctcc 16146080  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||    |||| ||  |||||||| ||||| |    
T  16146081 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcaccttgactttctccgtagtct 16146180  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | ||||| |  |||||||| || || || || |  ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  16146181 gatgaaccaaatctggtcccaacacaacactctgtcctgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaatcttcgaacggtgccat 16146280  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag--aacacaaattctcaaca 516  Q
     |||||||| ||||| || || ||||| || ||||| || |||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||   ||||| | ||| |  |    
T  16146281 accaatactcgaatggtaactgttattgtatgtgaattctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacacactcttagta 16146380  T
Q  517 aatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 595  Q
    ||||||| |  || ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  16146381 aatcctccaaagattgaatcgtcctcttcgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaaccccaacttcga 16146459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 175; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 19 - 688
Target Start/End: Complemental strand, 44662169 - 44661500
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||| | ||  ||||    
T  44662169 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaactctctctgaaat 44662070  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||  | |||||||  ||||| || ||||| |||| |||| | || |||| ||| || || || || |||    
T  44662069 ctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcagcgcacgaccaacacccgtcaaaggagtaaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 44661970  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||   |||| |   |||||||||||||| |    
T  44661969 tgaaactcaagatcctttctccgcttgtcacggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtct 44661870  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
      ||||| |  || ||||| || || || || ||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  44661869 catgaaccaagtccggtcccaacacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccat 44661770  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacgg-aagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 517  Q
     |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| |  |||| |||| ||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  44661769 accaatactcgagtgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaagacaaga-gactgtcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcaacaa 44661671  T
Q  518 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 617  Q
    ||| || | ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || || || |||||     
T  44661670 atcttccaacgattgaatcgtcctcttcgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcgtcctgtaaactc 44661571  T
Q  618 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 688  Q
    ||||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  44661570 ttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcac 44661500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 19 - 499
Target Start/End: Original strand, 15070382 - 15070862
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || |||||||| |  || ||||| ||||||||| | || || ||    
T  15070382 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccaccctgtatgccactgttccaactctctcaaatat 15070481  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    ||| ||||||||||| |||||||  ||||||||| |  |||||||  |||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| || ||||| ||     
T  15070482 ctggtatggaccaataaacttcgtagtcaacttcataaacttcaacacacgacctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctct 15070581  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||   |||||||  || ||||| ||||| |    
T  15070582 tgaaactcaagggcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtct 15070681  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | ||||| |  |||||||| || || || ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  15070682 gatgaactaaatctggtcccaacactacactttctcccgactcaaaccaacacaatggagttctgcacctctgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 15070781  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 499  Q
     |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  15070782 accaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagctccaccttgctcaag 15070862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 501 - 691
Target Start/End: Original strand, 14691353 - 14691543
Alignment:
Q  501 acacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccca 600  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| || || |    
T  14691353 acacaaactctcaacaagtcctctaacgactgaatcgttctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaacttaacctcaacttagaaccta 14691452  T
Q  601 aagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14691453 aagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 14691543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 19 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 51606484 - 51605998
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||||||||||| ||||| || || ||||  ||||| ||||| ||||| || || || || |||| ||| ||||||||||| | | | ||  ||||    
T  51606484 catacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaat 51606385  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||  | || |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| | ||| || || || || ||     
T  51606384 ctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttataaatacatgatcaccctct 51606285  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||  | ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||  ||||||||  ||||| || ||||| |    
T  51606284 tgaaactcaagggcctttctccgtttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtct 51606185  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
     |||||| |  || ||||| |  || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  51606184 cctgaaccaaatccggtcccagcacaacactttctcctgactcaaaccaacacaacggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtgccat 51606085  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacaca 505  Q
    ||| ||||| || ||||| || || || || |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| || || ||||| |||||    
T  51606084 tcctatactcgagtgataactgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccctgttcaagcacaca 51605998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 185 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 16676580 - 16676417
Alignment:
Q  185 aggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcatt 284  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  16676580 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttgctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacactttcatt 16676481  T
Q  285 ttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactc 348  Q
    |||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16676480 ttctcttaaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactc 16676417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 550 - 691
Target Start/End: Original strand, 14159970 - 14160111
Alignment:
Q  550 gaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctct 649  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14159970 gaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttgggtctct 14160069  T
Q  650 atctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
     ||| |||||||| | |||||||||||||| | |||||||||    
T  14160070 gtctaatacaatgtttgaaggaacaccatgcaacttcacaat 14160111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 219 - 637
Target Start/End: Original strand, 13247814 - 13248232
Alignment:
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||| || || |||||||    
T  13247814 tgaaactcaatatcttttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccgtagttt 13247913  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
      || ||||  || |||||||| |   | ||||| || || |||||||| |||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||| || || |||||    
T  13247914 cttgcacaacttccggtcctaacaaagcactttctccggattcaaaccaacacaacggtgttctacacctcctaccatacaaagcctcaaacggagccat 13248013  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgacta-tcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 517  Q
     | ||||||||||||| | || || || ||||| ||||| |||||||| | |  | || |||||| |  | |||||||| |  ||||||  |||||||||    
T  13248014 cctaatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggta-aacattagtcccaactgacaccttgctctaacacacaagctctcaacaa 13248112  T
Q  518 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 617  Q
    |||||| |    |||||| |||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  ||||||||||     
T  13248113 atcctccaaactctgaatagtcctctccgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactc 13248212  T
Q  618 ttccaaaatctagaagtaaa 637  Q
    | ||| ||  ||||||||||    
T  13248213 tcccagaacttagaagtaaa 13248232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 540 - 691
Target Start/End: Original strand, 15319641 - 15319792
Alignment:
Q  540 ctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatc 639  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||| || |    
T  15319641 ctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcctcttgtaaactcttccaaaaccttgaagtgaacc 15319740  T
Q  640 ttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | |||||||||    
T  15319741 tcggatctctatctgacacaatgctcgatgggacaccatgcaacttcacaat 15319792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 144 - 679
Target Start/End: Original strand, 14997410 - 14997945
Alignment:
Q  144 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 243  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| | || | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  14997410 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaagattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 14997509  T
Q  244 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 343  Q
    | ||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||| || ||||| ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  |  |||||||| |     
T  14997510 tatcatgatgactcttctgtctactctgagacgccttcatcttttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaactttcggtcctaacaa 14997609  T
Q  344 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 443  Q
      | || || |  ||||||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| |||| | || ||     
T  14997610 agcactctctctggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccaatactagcatgaaaactgttg 14997709  T
Q  444 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 543  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  14997710 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactaacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 14997809  T
Q  544 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 643  Q
    ||| ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |   |||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  14997810 ccgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaactttgttgccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 14997909  T
Q  644 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 679  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||| | ||||||    
T  14997910 atcccgatccgacacaatactagaaggtataccatg 14997945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 144 - 679
Target Start/End: Original strand, 9290929 - 9291464
Alignment:
Q  144 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 243  Q
    ||||||||| |  ||||||||||| | || ||| | |||| |||| | || |||||||| || || || ||  |||||||||||| ||| ||||| | ||    
T  9290929 gtcaacttcctacacttcaaagcatgaccaacatcggtcacaggattcaccctcaaaaatacctgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcctct 9291028  T
Q  244 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 343  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  9291029 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 9291128  T
Q  344 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 443  Q
      | ||||| || ||||||||||| ||||| || || || || |||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||| | ||  |     
T  9291129 agcactttctccggactcaaaccaacacaatggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagaatgaaaactgctg 9291228  T
Q  444 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 543  Q
    || ||||| ||||| |||||||  | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||||||||| || |    || ||| |||||||    
T  9291229 ttgtaagtaaactcaatcaacgataaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctaaatagtcctct 9291328  T
Q  544 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 643  Q
    ||| ||| ||||| ||||| ||||| || || | ||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  9291329 ccgtctgtccatcggtctgaggatggtaagcagtactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 9291428  T
Q  644 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 679  Q
    ||| | ||| || ||||| ||  |||||| ||||||    
T  9291429 atcccgatccgacacaatactataaggaataccatg 9291464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 19 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 14927302 - 14927151
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||| ||||||||| ||||| | ||    
T  14927302 catacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcagtacgccactgttccaactctttccgatat 14927203  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgt 170  Q
    |||||| |||||||| ||  | || ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  14927202 ctgatacggaccaataaatctaggagtcaaattctttgacttcaatgcacgt 14927151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 144 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 15293335 - 15293013
Alignment:
Q  144 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 243  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || ||| ||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| || || |  |    
T  15293335 gtcaacttcctacacttcaaagcacgacccactccattcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctccttt 15293236  T
Q  244 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 343  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  15293235 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttctgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 15293136  T
Q  344 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 443  Q
      | ||||| || ||||||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| | || ||     
T  15293135 agcactttctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 15293036  T
Q  444 ttataagtgaactcgatcaacgg 466  Q
    || ||||| ||||| ||||||||    
T  15293035 ttgtaagtaaactcaatcaacgg 15293013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 144 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 55375536 - 55375214
Alignment:
Q  144 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 243  Q
    ||||||||| |  |||||||||| || || |||||||| | |||| | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  55375536 gtcaacttcatacacttcaaagctcgaccaacaccagttacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 55375437  T
Q  244 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 343  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||  || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  ||||||||||| |     
T  55375436 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctactgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgtacaacttctggtcctaacaa 55375337  T
Q  344 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 443  Q
      | ||||||||||| |||||||| |||||| | || || || |||| ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||  | || ||     
T  55375336 agcactttcacctgattcaaaccaacacaacagtgtcctacacctcctaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagaatgtaaactgttg 55375237  T
Q  444 ttataagtgaactcgatcaacgg 466  Q
    || ||||| ||||| ||||||||    
T  55375236 ttgtaagtaaactcaatcaacgg 55375214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 126 - 283
Target Start/End: Original strand, 16752669 - 16752826
Alignment:
Q  126 ggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaact 225  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| || || || || ||||||||||    
T  16752669 ggaccaatgaacttcggagttaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctcctgaaact 16752768  T
Q  226 caagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcat 283  Q
    ||||  | ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  16752769 caagggcctttctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcat 16752826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 157 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 12132574 - 12132298
Alignment:
Q  157 acttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataact 256  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| | || | || ||||||||||| || || ||  | ||||||||||  || || || | ||| |||||| ||||    
T  12132574 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatgtccttcctcctcttatcatgacaact 12132475  T
Q  257 cttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacct 356  Q
    ||| || | ||| || ||||||||||| |||||||| ||||||| ||| || || ||||| |  || ||||  ||||| ||||| |  || |||||||||    
T  12132474 cttctgcctactttgagacgccttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaacttctggacctaacaaaacactttcacct 12132375  T
Q  357 gactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatga 434  Q
    |||||| |||| |||||||  ||||| |||| |||| ||||||||||||| || |||| ||| || ||||||||||||    
T  12132374 gactcataccaacacaacgacgttctacatc-ccgatcatacaaagcctcaaacggtgtcataccgatactagaatga 12132298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 250
Target Start/End: Original strand, 42702872 - 42703103
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||||||||||| ||||| || || ||||  ||||| ||||| ||||| || || || || |||| ||| ||||||||||| | | | ||  ||||    
T  42702872 catacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaat 42702971  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||  | || |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| | ||| || || || || ||     
T  42702972 ctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttataaatacatgatcaccctct 42703071  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatg 250  Q
    |||||||||||  | ||||| || ||||||||    
T  42703072 tgaaactcaagggcctttctccgtttgtcatg 42703103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 217 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 12342968 - 12342548
Alignment:
Q  217 cctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 316  Q
    |||||||||||| ||  || || | ||| |||||||||||||| || | |||||| |||||| | || |||||||| ||||||| ||| || |  |||||    
T  12342968 cctgaaactcaatattcttcctcctcttatcatgataactcttctgcctactctgagacgcccttatattctcttgaatcatcttaaccttttatgtagt 12342869  T
Q  317 ttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcc 416  Q
     |  || |||| ||| |||||||  |   | ||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| || |||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  12342868 ctcttgcacaacctccggtcctagtaaagcactttcacctgactcataccaacacaacgacgttctacacctccaaccatacaaagcctcaaacggtgcc 12342769  T
Q  417 attccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaaca 516  Q
    || ||||||||||||||| |  | || || ||||| ||||| |||||||| | |     | ||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||    
T  12342768 atcccaatactagaatgaaaattgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcaacccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaaca 12342669  T
Q  517 aatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaact 616  Q
    |||| || |    ||||||  ||||||||| ||| ||||| || || |||||||| ||  ||||||| || ||||| |  ||||||||  ||||||||||    
T  12342668 aatcttcaaaactctgaatattcctctccgtctgcccatcagtatggggatgataagcataactcaaccttaacttagttcccaaagcagcttgcaaact 12342569  T
Q  617 tttccaaaatctagaagtaaa 637  Q
     | ||||||| ||||||||||    
T  12342568 ctcccaaaatttagaagtaaa 12342548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 37 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 18164474 - 18164332
Alignment:
Q  37 acacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaa 136  Q
    ||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||||||  | ||  | |||||||| |||||||||||    
T  18164474 acacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaa 18164375  T
Q  137 cttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacacca 179  Q
    ||| || |||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  18164374 ctttggagtcagcttcttagacttcaatgcacatcctacacca 18164332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 18607873 - 18607823
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagat 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18607873 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagat 18607823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 144 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 16445390 - 16445234
Alignment:
Q  144 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 243  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || ||||||| |||| | || || |||||||| || || ||  | |||||||||| ||| || || | ||    
T  16445390 gtcaacttcctacacttcaaagcacgacccactccagtcacaggattcaccctaaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 16445291  T
Q  244 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatct 300  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  16445290 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatct 16445234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 548 - 688
Target Start/End: Complemental strand, 18549834 - 18549694
Alignment:
Q  548 ctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatct 647  Q
    ||||||||| || || || |||||||| ||||||| | | ||||| |  ||||||||   ||||||||||  |||||| || || || || |||||||||    
T  18549834 ctgaccatcagtttgtgggtgatatgcagaactcagttttaacttagttcccaaagcacattgcaaacttccccaaaaccttgatgtgaaccttggatct 18549735  T
Q  648 ctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 688  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  18549734 ctatccgaaacaatactcgaaggaacaccatgcaacttcac 18549694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 15415282 - 15415214
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactc 87  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| |||||| |||| || || ||||||||||    
T  15415282 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaggatgtggtggcaaacccactc 15415214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 354 - 466
Target Start/End: Original strand, 16685557 - 16685669
Alignment:
Q  354 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 453  Q
    ||||||||| |||| || ||||  ||||| || ||||  |||||||||||||| || |||||||| |||||||||| |||| | || || || ||||| |    
T  16685557 cctgactcataccaacataacgacgttctacacctccttccatacaaagcctcaaacggtgccataccaatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaa 16685656  T
Q  454 actcgatcaacgg 466  Q
    |||| ||||||||    
T  16685657 actcaatcaacgg 16685669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 552 - 591
Target Start/End: Complemental strand, 15424013 - 15423974
Alignment:
Q  552 ccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaact 591  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15424013 ccatctgtctgtggatggtatgccgaactcaatctcaact 15423974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 318 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 18550064 - 18549949
Alignment:
Q  318 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcca 417  Q
    |||||||||||||||||||| || ||  |  |||| || |||||  |||| ||||| || ||||  ||||||| |||||||||  |||| || |||||||    
T  18550064 tgctgaacaatctctggtcccaacactgcaatttcgccagactcgtaccaacacaaaggtgttcgacatctcctaccatacaatacctcaaatggtgcca 18549965  T
Q  418 ttccaatactagaatg 433  Q
    | ||||||||||||||    
T  18549964 tcccaatactagaatg 18549949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 574; Significance: 0; HSPs: 71)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 574; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 700
Target Start/End: Original strand, 19112725 - 19113406
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  19112725 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccactgttccaactctttccaatat 19112824  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  19112825 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 19112924  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19112925 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 19113024  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19113025 gctgaataatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 19113124  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19113125 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaatggaagatgactatcccaagttcctccctgctcaagaacacaaattctcaacaaa 19113224  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  19113225 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 19113324  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 700  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  19113325 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 19113406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 572; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 17674769 - 17674090
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  17674769 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 17674670  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  17674669 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 17674570  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17674569 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 17674470  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17674469 gctgaacaatctctggtcctaagaccgctctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 17674370  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17674369 tccaatactagaatggtaactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 17674270  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  17674269 tcctctagcaactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 17674170  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttg 698  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  17674169 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttg 17674090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 555; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 19485616 - 19484974
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  19485616 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaaaat 19485517  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19485516 ctgatatggaccaatgaacttcgaggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 19485417  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  19485416 ttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctcggatcatctgaactttctcagtggttt 19485317  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19485316 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcaccggattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 19485217  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19485216 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttactcaagaacacaaattctcaacaaa 19485117  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  19485116 tcctctagcgactgaattgtcctctccgattgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcagacttt 19485017  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaat 661  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19485016 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaat 19484974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 540; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 650
Target Start/End: Complemental strand, 20018496 - 20017865
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||    
T  20018496 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccagtat 20018397  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20018396 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 20018297  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20018296 tcaaattcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 20018197  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  20018196 gctgaacaatttctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaggcctcgaacggtgccat 20018097  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20018096 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 20017997  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  20017996 tcctctaacgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 20017897  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctcta 650  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20017896 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctcta 20017865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 534; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 22120920 - 22120239
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  22120920 catacttccaaagttgcgacacatggaaaacgttgttcaaatttgaaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 22120821  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22120820 ctgatatggaccaatgaacttcgaggtcaacttccttgacttcaatgcacgtcccacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcc 22120721  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  22120720 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttcattttctcttggatcatccgaactttctcagtagtct 22120621  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22120620 gctgaacaatctctgatcctaagaccactctttcacctcactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccat 22120521  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22120520 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 22120421  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  22120420 tcctctagcgactgaattgtcctctccaactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaactct 22120321  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 700  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | | |||| || ||||||||    
T  22120320 tccaaaatctagaattaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaataccatgcaacctcacgatctccttgat 22120239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 510; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 30313890 - 30313209
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  30313890 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaatttgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 30313791  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30313790 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 30313691  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  30313690 tgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacactttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 30313591  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  30313590 gctgaacaatctcgagccctaagaccactctttcacctgactcaaaccaccacaatggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccgt 30313491  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  30313490 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaactaa 30313391  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30313390 tcctctagcgactgaattgtcctctccaactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 30313291  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 700  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  30313290 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacctcacaatctccttgat 30313209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 495; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 681
Target Start/End: Original strand, 15533415 - 15534077
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  15533415 catacttccgaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 15533514  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||| |||||     
T  15533515 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagccacaggagtgactctcaaaaacatgtggtcaccttct 15533614  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||| |    
T  15533615 tgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgtatcattttaactttctcagtagtct 15533714  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15533715 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccat 15533814  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15533815 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaa 15533914  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15533915 tcctctagcgactgaattgtcctctccaactgaccatctttctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 15534014  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 681  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15534015 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatactcgaaggaacaccatgta 15534077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 490; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 700
Target Start/End: Original strand, 32600179 - 32600860
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  32600179 catacttccgaagttgcgacacatggaacacgtcgtgcaaattcgaaagacgtggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 32600278  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32600279 ctgatacggaccaataaatctcggggtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 32600378  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |    
T  32600379 tgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtct 32600478  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32600479 actgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgaccgaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccat 32600578  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32600579 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaa 32600678  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32600679 tcctataacgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 32600778  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 700  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  32600779 tccaaaacctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacctcacaatctccttgat 32600860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 489; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 22133787 - 22133127
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  22133787 catacttccgaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtattccgactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 22133688  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | || || |||||||||||||   ||||||||||    
T  22133687 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacatgagtgtctctcaaaaacacaatgtctccttcc 22133588  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  22133587 tgaaactcaagatctttcctacacttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagttt 22133488  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22133487 gctgaacaatctcgggtcctaagaccactctttcacttgactcaaacccgcacaacggagttctgcatcaccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccat 22133388  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22133387 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaa 22133288  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22133287 tcttctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgctgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 22133188  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 679  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22133187 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatttgatacaatgctcgaaggaacaccatg 22133127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 482; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 700
Target Start/End: Original strand, 22046408 - 22047089
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  22046408 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcctactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 22046507  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| | |||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22046508 ctgatacgaaccaataaacctcggagtcaatttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcactggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 22046607  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    | |||||||||||| || || || || ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  22046608 taaaactcaagatccttcctgcgtttatcatgataactcttttgtcgactatgcgacactttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 22046707  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  22046708 gctgaacaatctctggtcctaggaccactctttcacctgattcaaaccagcacaacggagttctgcatctctgaccatacaaagcctcaaaaggtgccat 22046807  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22046808 tccaatactagaatgataaccattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaa 22046907  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |    
T  22046908 tcctctagcgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaatttcgaacctaaagcctcttgcaaactct 22047007  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 700  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  22047008 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatatgatgctcgaaggaacaccatgtaacctcacaatctccttgat 22047089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 474; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 16408788 - 16408131
Alignment:
Q  22 acttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctg 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||    
T  16408788 acttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctg 16408689  T
Q  122 atatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctga 221  Q
    ||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||||| || |||||||||||||| ||     
T  16408688 atacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaagagtgactctcaacaatacgtggtctccttcttgg 16408589  T
Q  222 aactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgct 321  Q
    |||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  16408588 aacttaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacactttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgct 16408489  T
Q  322 gaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattcc 421  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  16408488 gaacaatctccggtcctaagaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgtatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccattcc 16408389  T
Q  422 aatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcc 521  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16408388 aatactagaatgataactattattgtatgtgaactcaatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcc 16408289  T
Q  522 tctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttcc 621  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  16408288 tctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttttcc 16408189  T
Q  622 aaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 679  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16408188 aaaatctataagtaaatcttgggtctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 16408131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 466; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 700
Target Start/End: Original strand, 19978002 - 19978683
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  19978002 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgttacgccaccgttccaactatttccgatat 19978101  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  19978102 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 19978201  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  19978202 tgaaactcaagatcctttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 19978301  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  19978302 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatcttcgaccatataaagcctccaaaggtgccat 19978401  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||    
T  19978402 tccaatactagaatgataattgttattgtacgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacactaaatctcaacaaa 19978501  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |    
T  19978502 tcctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgtcgagctcaatctcaacttagaacccaaagcctcctgcaaactct 19978601  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 700  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||    
T  19978602 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatttgttacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatttcattgat 19978683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 465; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 22164937 - 22164278
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  22164937 catacttccgaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatgcgccaccgttccaactctttccgatat 22164838  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| | || ||||| ||||||||||   ||||||||||    
T  22164837 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttatttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacatgagtgactttcaaaaacacaatgtctccttcc 22164738  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  22164737 tgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagttt 22164638  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  22164637 gctgaacaatctcgggtccgaagaccactctttcacttgactcaaacctgcacaacggagttctgcatcaccgaccgtacaaagcctcaaaaggtgccat 22164538  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22164537 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaa 22164438  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    || || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22164437 tcttc-agcgactgaattgtcctctctgactgaccatatgtctgcggatgacacgctgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 22164339  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 679  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22164338 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctaatacaatgctcgaaggaacaccatg 22164278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 451; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 21167275 - 21166606
Alignment:
Q  27 cgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatg 126  Q
    ||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||| |    
T  21167275 cgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaacccaactcgatacgccactgttccaactctttccgatatctgatacg 21167176  T
Q  127 gaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactc 226  Q
    ||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21167175 gaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactc 21167076  T
Q  227 aagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaaca 326  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||    
T  21167075 aagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaaca 21166976  T
Q  327 atctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatac 426  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  21166975 atctctggtcctaagaccactcttccacctgattcaaaccaacacaattgagttctgcatcttcgaccatataaagcctcaaaaggtgccattccaatac 21166876  T
Q  427 tagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctag 526  Q
    |||||||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  21166875 tagaatgataactgttattgtacgtaaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcctctag 21166776  T
Q  527 cgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaat 626  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21166775 cgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaat 21166676  T
Q  627 ctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||    
T  21166675 ctagaagtaaatcttggatctctatctgata-aatgctcgaaggaacaccatgcaactttacaatctcctt 21166606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 445; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Original strand, 23650076 - 23650748
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | ||    
T  23650076 catacttccgaagttgcaacacaagaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccaactcgataagccaccgttccaactcttttcgatat 23650175  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||     
T  23650176 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacatgtggtctccttct 23650275  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  23650276 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgatgcttttatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 23650375  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||    
T  23650376 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcataaggcgccat 23650475  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||     
T  23650476 tccaatactagaatgataactattattgtacgtgaactctattaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacgcaaactctcaacaag 23650575  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  23650576 tcctctagcgactgaatcgttctctccgattgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttt 23650675  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  23650676 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgaaacaatactcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 23650748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 437; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 21922481 - 21921809
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  21922481 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacgtcgtgcaaattcgaaatatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatat 21922382  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| ||||||||  |  |||| ||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||||||||     
T  21922381 ctgatacggaccaatatatctcggagtcaacttcttcgacttcaaagcttgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaatacgtggtctccttct 21922282  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| || ||||| ||||||| ||| || ||||||||||    
T  21922281 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtggactctgcgacactttcatcttttcttgaatcatcttaaccttttcagtagttt 21922182  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  21922181 gctgaacaatctctggtcctaagaccactcttccacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatagaaagcctcataaggtgccat 21922082  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  21922081 tccaatagtagaatgataactattattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaa 21921982  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  21921981 tcctctagctattgaatcgtcctctacgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttt 21921882  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  21921881 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 21921809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 421; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Original strand, 21250977 - 21251648
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  21250977 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 21251076  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||      
T  21251077 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttat 21251176  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | |||||  ||||||| ||| ||||| |||||||    
T  21251177 tgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcaactctgcgacgctttcatct-ctctttaatcatcttaaccttctcggtagttt 21251275  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |   |||||| |||    
T  21251276 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatcttcgaccatacaaagcgtaataaggtgtcat 21251375  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
      |||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  21251376 ctcaatactagaatgataactgttattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaaccctcaacaaa 21251475  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    || |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  21251476 tcttctaacgactgaatcgtcctctccgactgactatctgtctgtggatgatacgccaaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttt 21251575  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  21251576 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 21251648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 401; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 21789104 - 21788433
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||| |||||||||||||| | || |||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||| | ||| ||||| | ||    
T  21789104 catacttctgaagttgcgacacaggaaacacatcgtgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcggtacgccaccgttacgactctttccgatat 21789005  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  21789004 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagaacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 21788905  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    || ||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||    
T  21788904 tggaactcaagatctttcatgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagttt 21788805  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  21788804 gctaaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgatttaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatac-aagcctcataaggtgccat 21788706  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  21788705 tccaatactagaatgataactattattatacgtgaactctatcaatgggagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaaccctcaacaaa 21788606  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    || ||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  | || |||||||||||||||||||    
T  21788605 tcttctaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttaaaacctaaagcctcttgcaaacttt 21788506  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  21788505 tccaaaatctggaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 21788433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 394; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 21394611 - 21393939
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||| |||||||||||||| | || |||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||| | ||| ||||| | ||    
T  21394611 catacttctgaagttgcgacacaggaaacacatcgtgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcggtacgccaccgttacgactctttccgatat 21394512  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  21394511 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagaacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 21394412  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    || ||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||    
T  21394411 tggaactcaagatctttcatgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagttt 21394312  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccga-ccatacaaagcctcgaaaggtgcca 417  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||    
T  21394311 gctaaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgatttaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacccatac-aagcctcataaggtgcca 21394213  T
Q  418 ttccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 517  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  21394212 ttccaatactagaatgataactattattatacgtgaactctatcaatgggagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaaccctcaacaa 21394113  T
Q  518 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 617  Q
    ||| ||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||||||    
T  21394112 atcttctaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttaaaacctaaagcctcttgcaaactt 21394013  T
Q  618 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  21394012 ttccaaaatctggaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 21393939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 260 - 700
Target Start/End: Original strand, 18856853 - 18857293
Alignment:
Q  260 ttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgac 359  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18856853 ttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatccgaactttcttagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagacgactctttcacctgac 18856952  T
Q  360 tcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcga 459  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  18856953 tcaaaccagcacaacagagttatgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatacctattattgtatgtgaactcga 18857052  T
Q  460 tcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgt 559  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18857053 tcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaatcctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgt 18857152  T
Q  560 ctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgataca 659  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18857153 ctgcgggtgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacaca 18857252  T
Q  660 atgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 700  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||| || ||||||||    
T  18857253 atgctcgaaggaacaccatgcaacctcacgatctccttgat 18857293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Original strand, 22987236 - 22987903
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||   | ||    
T  22987236 catacttccgaagttgcgacacatgtattacttcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccgttccaattctttatgatat 22987335  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||  ||| ||||||| ||||| || || ||||||||     
T  22987336 ctgatacggaccaataaacttcagagtcaacttctttgacttcaatgcatgtccaacatcagtcactggagtgactctaaaaaatacatgatctccttct 22987435  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||| | | |||||||| ||||||    
T  22987436 tgaaaatcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatattatctttctcaatagttt 22987535  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | |||||||| | || |||||| ||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||    
T  22987536 gttgaacaatttatgctcctaaaaccacactctcacctaactcgaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccgtacaaagcctcaaaaggtgtcat 22987635  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||| ||  ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  22987636 tccaatactagaatgataattgttattgtacatgaactctattaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaag 22987735  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| || || |||||||||| |||||| |    
T  22987736 tcctctaacgactgaatcgtcctttccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaacgcaacctcaacttagaacctaaagcctcttacaaactct 22987835  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    ||||||||||     ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  22987836 tccaaaatct-----taaatctcgaatctctatctcatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 22987903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 287 - 700
Target Start/End: Original strand, 22040162 - 22040575
Alignment:
Q  287 ctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcat 386  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  22040162 ctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaggaccactctttcacctcattcaaaccagcacaacggagttctgcat 22040261  T
Q  387 ctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttc 486  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22040262 ctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattcgaatactagaatgataactaatattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttc 22040361  T
Q  487 ctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatct 586  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22040362 atccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgattgaattgtcctctccaactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatct 22040461  T
Q  587 caacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttc 686  Q
    ||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||    
T  22040462 caatttcgaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatgttggatctctatctgatacgatgctcgaaggaacaccatgtaacctc 22040561  T
Q  687 acaatttccttgat 700  Q
    ||||| ||||||||    
T  22040562 acaatctccttgat 22040575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 139 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 22378079 - 22377528
Alignment:
Q  139 tcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttct 238  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||| |||| |||||||| || || ||| ||||||||||||||| |||||| ||    
T  22378079 tcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcactggagtgaccctcaaaaatacatgatctgcttcctgaaactcaatatctttcct 22377980  T
Q  239 acgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 338  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| ||| ||||| |||||||| | |||||| |||||||||    
T  22377979 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctccgtagtttgtttaacaatttctggtcct 22377880  T
Q  339 aagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagc 438  Q
    || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || |  |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  22377879 aaaaccacactctcacccgactcgaaccaacacaaaggagttctgcaccttcttccatacaa-gcctcaaatggtgccattccaatactagaatgataac 22377781  T
Q  439 tattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgt 538  Q
    |||| || || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || || | ||||||||| ||    
T  22377780 tattgttgtacgtgaactctattaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcttccaacgactgaatcgt 22377681  T
Q  539 cctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaat 638  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  22377680 tctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaaccaaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaac 22377581  T
Q  639 cttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22377580 ctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 22377528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 139 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 22384254 - 22383703
Alignment:
Q  139 tcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttct 238  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||| |||| |||||||| || || ||| ||||||||||||||| |||||| ||    
T  22384254 tcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcactggagtgaccctcaaaaatacatgatctgcttcctgaaactcaatatctttcct 22384155  T
Q  239 acgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 338  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| ||| ||||| |||||||| | |||||| |||||||||    
T  22384154 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctccgtagtttgtttaacaatttctggtcct 22384055  T
Q  339 aagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagc 438  Q
    || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || |  |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  22384054 aaaaccacactctcacccgactcgaaccaacacaaaggagttctgcaccttcttccatacaa-gcctcaaatggtgccattccaatactagaatgataac 22383956  T
Q  439 tattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgt 538  Q
    |||| || || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || || | ||||||||| ||    
T  22383955 tattgttgtacgtgaactctattaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcttccaacgactgaatcgt 22383856  T
Q  539 cctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaat 638  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  22383855 tctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaaccaaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaac 22383756  T
Q  639 cttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22383755 ctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 22383703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 22 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 20396868 - 20396199
Alignment:
Q  22 acttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctg 121  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||  |||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||  || ||| | ||||  | |||||    
T  20396868 acttccgaagttgttacacatgaaatgcatcatgcaaattcgaaagatgcggtagtaaacccactcgatacgccactatttcaattctttctgatatctg 20396769  T
Q  122 atatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctga 221  Q
    |||  ||||||| ||  |  | ||||  ||| |||||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  20396768 atacagaccaataaatcttagagtcagtttccttgacttcaatgcacgtcctacaccggtcacaggagtgactctaaaaaatacatggtctccttcctga 20396669  T
Q  222 aactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgct 321  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||| | |||| || ||| |||||||||||||| |    
T  20396668 aactcaaggtcttttctacgcttatcatgataacacttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcgcatcaacttaaccttctcagtagtttgtt 20396569  T
Q  322 gaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattcc 421  Q
    |||| || ||| |||| || || || || || |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  20396568 gaacgatatctagtcccaaaactacactctcgcctgactcgaaccaacacaacggagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaatggtgccattcc 20396469  T
Q  422 aatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcc 521  Q
    |||||||||||||||  | ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||    
T  20396468 aatactagaatgataattgttattgtacgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagtcgcaccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcc 20396369  T
Q  522 tctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttcc 621  Q
    || | ||||||||| || || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | || ||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  20396368 tccaacgactgaatcgttctttccgactgaccatctgtctgcagatgatacgccgaactcaaccacagcttagaacccaaagcctcttgcaaactcttcc 20396269  T
Q  622 aaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||   | |||||||| | |||||||||    
T  20396268 aaaatctagaagtaaaccttggatctctatctgacacaatgctcggcaggacaccatgcaacttcacaat 20396199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 19 - 679
Target Start/End: Original strand, 20388134 - 20388794
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||||||| |||||||||||  || ||||  |||| |||||||||||| || || |||||||||| ||| | ||| || |||||| | ||  | ||    
T  20388134 catacttccgaaattgcgacacattaaacacatcatgcacattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgtcactgtcccaactctctcagatat 20388233  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    || |||||||||||| |||   |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||   || ||||||||| |||||| |||||||||||     
T  20388234 ctaatatggaccaataaaccgtggggtcaacttcttagacttcaaagcacgaccaacacctgtcactagagtgactctcagaaacacatggtctccttct 20388333  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatca-tctgaactttctcagtagtt 317  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||   |||| | ||| |||| |  |||||     
T  20388334 tgaaactcaaggtcctttctacgcttgtcatgataactcttatgtcgactctacgacgctttcatcttctctcttatcaatttgacctttttt-gtagtc 20388432  T
Q  318 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcca 417  Q
    || ||||| || ||| |||| || || ||  ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||    
T  20388433 tgatgaactatatctcgtcccaacactacattttaacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcacctccaaccatacaaagcttcgaacggtgcca 20388532  T
Q  418 ttccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 517  Q
    | |||||||| ||||| || || || || ||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||| ||    
T  20388533 tgccaatactcgaatggtaactgttgttgtacatgaactctatcaacggtagatgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcaaaaa 20388632  T
Q  518 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 617  Q
    |||||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||| |||||||    
T  20388633 atcctctaacgactgaatctttctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaacgcctcttacaaactt 20388732  T
Q  618 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 679  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  20388733 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaattatcgacggaacaccatg 20388794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 222 - 689
Target Start/End: Original strand, 23949158 - 23949624
Alignment:
Q  222 aactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgct 321  Q
    |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23949158 aactcaaggtccttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttggatcatcttaactttctcagtagtttgct 23949257  T
Q  322 gaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattcc 421  Q
     ||| || |||||||| || || || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  23949258 -aacgatttctggtcccaaaactacactctcacctgactcgaaccaacacaacggagtcctacacctccgaccatatagagcttcgaaaggtgccattcc 23949356  T
Q  422 aatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcc 521  Q
    ||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||     
T  23949357 aatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtct 23949456  T
Q  522 tctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttcc 621  Q
    || | ||||||||| ||  | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||| ||| ||||| ||| ||||    
T  23949457 tccaacgactgaatcgttatttccgactgaccatctatctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaaacctattgcatactcttcc 23949556  T
Q  622 aaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcaca 689  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23949557 aaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgacggaacaccatgtagcttcaca 23949624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 21 - 679
Target Start/End: Original strand, 19851448 - 19852106
Alignment:
Q  21 tacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatct 120  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| || || |||||||||   || ||||| ||||||||  | ||  | ||||    
T  19851448 tactttcgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatct 19851547  T
Q  121 gatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctg 220  Q
    | ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||| | ||||  ||| ||||||||| |||||| || ||||| || ||    
T  19851548 ggtatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacaaccgtcaacggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttg 19851647  T
Q  221 aaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgc 320  Q
    |||||||||  | |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||   |||||||  || ||||  ||||| |      
T  19851648 aaactcaagggcctttctacgcttgccatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatattttctcttatcatcttgaccttctatgtagtctaa 19851747  T
Q  321 tgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattc 420  Q
    ||||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |    
T  19851748 tgaactaaatctggtcccaacaccacactttcacccgactcaaaccaacacaatggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggttccatac 19851847  T
Q  421 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 520  Q
    ||||||||||||| || || || || || |||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||    
T  19851848 caatactagaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactataccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatc 19851947  T
Q  521 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 620  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||| |||| |||    
T  19851948 ctctaacgactgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaattttgaacccaatgcatcttgcgaactcttc 19852047  T
Q  621 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 679  Q
    ||||| || ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  19852048 caaaaccttgaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgatggaacaccatg 19852106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 21 - 679
Target Start/End: Original strand, 19857484 - 19858142
Alignment:
Q  21 tacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatct 120  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| || || |||||||||   || ||||| ||||||||  | ||  | ||||    
T  19857484 tactttcgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatct 19857583  T
Q  121 gatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctg 220  Q
    | ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||| | ||||  ||| ||||||||| |||||| || ||||| || ||    
T  19857584 ggtatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacaaccgtcaacggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttg 19857683  T
Q  221 aaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgc 320  Q
    |||||||||  | |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||   |||||||  || ||||  ||||| |      
T  19857684 aaactcaagggcctttctacgcttgccatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatattttctcttatcatcttgaccttctatgtagtctaa 19857783  T
Q  321 tgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattc 420  Q
    ||||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |    
T  19857784 tgaactaaatctggtcccaacaccacactttcacccgactcaaaccaacacaatggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggttccatac 19857883  T
Q  421 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 520  Q
    ||||||||||||| || || || || || |||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||    
T  19857884 caatactagaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactataccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatc 19857983  T
Q  521 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 620  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||| |||| |||    
T  19857984 ctctaacgactgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaattttgaacccaatgcatcttgcgaactcttc 19858083  T
Q  621 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 679  Q
    ||||| || ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  19858084 caaaaccttgaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgatggaacaccatg 19858142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Original strand, 1266274 - 1266945
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||  ||||    
T  1266274 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgaaat 1266373  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||| | ||||||| ||| || || || || |||    
T  1266374 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcagaaatacatgatcaccctcc 1266473  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||  | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||    ||||||| | ||| |||||| || |    
T  1266474 tgaaactcaagggcctttctccgcttgtcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttacctt-ctcagtcgtct 1266572  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | ||||| |  || ||||| || || || || || |||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  1266573 gatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaactagcacaaaggagtcctgcacctctgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 1266672  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||||| ||||| || || || || || |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||    
T  1266673 accaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtaaa 1266772  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||  || || || |||||||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| || |    
T  1266773 tcctctaaagattggatcgtcctctccgaccgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaatctcaactttgaacccaaagcatcttgcaagctct 1266872  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||    
T  1266873 tccataatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatgctcgacggtacaccatgcagcttaacaat 1266945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Original strand, 23654962 - 23655634
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||||| |  |||  |||| |||| |||  | ||  | ||    
T  23654962 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccaatatatataccactgttcaaaccctctctgatat 23655061  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||  || ||||| ||     
T  23655062 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaacaaatgatctccgtct 23655161  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| || |||   |||||||  || ||||| ||||| |    
T  23655162 tgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctatcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtct 23655261  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | ||||| |  || ||||| || || || |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  23655262 gatgaaccaaatccggtcccaacacaacactttcacccgactcaaaccagcataaaggagttctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 23655361  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     | |||||| |||||||| || || || || |||||||| |||||||| || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||    
T  23655362 actaatactcgaatgataactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactgtcccaggctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaa 23655461  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||  || || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||| ||||| || ||||||||||| |    
T  23655462 tcctctaatgattggatcgtcctctctgactgaccatctgtctgcggatgataacccgaactcaacctcaactccgaacccaaggcgtcttgcaaactct 23655561  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||| | |||||||||    
T  23655562 tccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggtacaccatgcaacttcacaat 23655634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 31417220 - 31416548
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||| | |||| ||| ||||| ||||||||  ||||  ||||    
T  31417220 catacttccgtagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaagcaactctatatgccactgttccaaccctttctgaaat 31417121  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    || ||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||| || | ||||||| ||| || || || || |||    
T  31417120 ctaatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataagagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcc 31417021  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttca--ttttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 316  Q
    |||||||||||  | ||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||| |||  |||||||  ||||||||||||||    
T  31417020 tgaaactcaagggcctttatccgcttatcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcaccttttccctt--atcatcttgactttctcagtagt 31416923  T
Q  317 ttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcc 416  Q
     || || || |  || ||||| || || || || || ||||||||||||||||| || |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  31416922 ctgatgcactaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcatgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgcc 31416823  T
Q  417 attccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaaca 516  Q
    || | |||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  31416822 atactaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaaca 31416723  T
Q  517 aatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaact 616  Q
    ||||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  31416722 aatcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaaact 31416623  T
Q  617 tttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
     ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| || || |||||||||||||||||    
T  31416622 cttccagaatctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacggtactccatgtagcttcacaat 31416548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 22062179 - 22061507
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  22062179 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaaccctctctgatat 22062080  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
     ||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| ||| |||||||||| ||||||||| | || |||| |||||| || || || |||    
T  22062079 ttgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcatgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcc 22061980  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |  ||||||||  |||||||| ||||| |    
T  22061979 tgaaactcaagagcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttttctgatcatcttgactttctctgtagtct 22061880  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
      ||||| |  || ||||| || || || || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  22061879 catgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagctttgaacggtgccat 22061780  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||| | ||||||||||    
T  22061779 accaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttcctcaagcacacacactctcaacaaa 22061680  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    | ||| |  || || || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||| ||| |    
T  22061679 tactccaatgattggatcgtcctcttcgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcagactct 22061580  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||| || |||||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  22061579 tccagaacctagaagtgaaccttggatccctatccgacacaatactcgacggaactccatgtagtttcacaat 22061507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 29304172 - 29303500
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||||||||| ||||||| | | ||  ||||    
T  29304172 catacttcctaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataagccactgttccaattctctctgaaat 29304073  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| ||||| |||| ||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  29304072 ctgatacggacctatgatctttggagtcaacttccttgacttcaatgcacgtcctacacccgtcattggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 29303973  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcat-ctgaactttctcagtagtt 317  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||    ||||| |||| |||||||||||||     
T  29303972 tgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcattctga-ctttctcagtagtc 29303874  T
Q  318 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcca 417  Q
    |  ||||| |  || ||||| || || || || |||||||||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  29303873 tcatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctcacctgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgcca 29303774  T
Q  418 ttccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 517  Q
    | || ||||| ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||| || || |||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  || |||||    
T  29303773 tacctatactcgaatgatagttgttgttataagtgaactctatcaacggtaggtggctatcccaagctccaccttgctcaagtacacacacccttaacaa 29303674  T
Q  518 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 617  Q
    ||| || |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| || || |||||     
T  29303673 atcatccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacctcgaacccaaagcgtcctgtaaactc 29303574  T
Q  618 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29303573 ttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaaggaaccccatgtagcttcacaat 29303500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 20010646 - 20009974
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||||||||||||||||| || || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  20010646 catacttccgaagttgcgacacgtgaaatacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctcagatat 20010547  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    ||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||| ||||||||| |||||| || ||||| ||     
T  20010546 ctggtacggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacccacacccgtcatcggagtgactctcagaaacacatgatctccctct 20010447  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||  | ||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||   |||||||| || |||||  |||| |    
T  20010446 tgaaactcaagcgccttcttacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatctggaccttctctatagtct 20010347  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | ||||| |  |||||||| || | ||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  20010346 gatgaactaaatctggtcccaacaacacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagtcctacacctccgaccatacaaagtttcgaacggtgccat 20010247  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||    
T  20010246 accaatacttgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaa 20010147  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||  || ||||| || ||||| || ||||| ||||| |    
T  20010146 tcctctaacgactgaatcgttctctccgaatgaccatctgcctgcggatgataagccgaactcacccttaactttgaacccaaggcatcttgtaaactct 20010047  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    ||||||| || ||||| || ||   || |||||| || ||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  20010046 tccaaaaccttgaagtgaacctgaaatttctatccgacacaatactcgatggaacaccatgcaacttcacaat 20009974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 19 - 688
Target Start/End: Original strand, 14565177 - 14565846
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || | || |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| || |||||| | ||  ||||    
T  14565177 catacttccgaagctgagaaacatgaaacaaatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgtaccaactctctctgaaat 14565276  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  14565277 ctgatatggaccaatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 14565376  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| || ||    |||| |   |||||||||||||| |    
T  14565377 tgaaactccagatcctttcttcgcttgtcatggtaacttttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcaacctgactttctcagtagtct 14565476  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
      ||||| |  || ||||| || || |  |||||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  14565477 cgtgaaccaaatccggtcccaacacaatactttcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccat 14565576  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  14565577 accaatactcgagtgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaa 14565676  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    || || |  || ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| |    
T  14565677 tcttccaatgattgaattgtcctttccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactct 14565776  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 688  Q
    |||| || |||||||| || || ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  14565777 tccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatgctagacggaacaccatgaagcttcac 14565846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Original strand, 21840452 - 21841124
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||| |||||||| || || |||| |||||  || ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  21840452 catacttccgaagttgcgacacgtggaatacatcatgcaaatttgaaagatgtggtggcaaactcactctgtatgccactgttccaaccctctcagatat 21840551  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||  |||| ||||||||| || |||||| | ||||| | |||||| || ||||| ||     
T  21840552 ctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcagtgcacctcctacacctgttataggagtaactcttagaaacacatgatctccctct 21840651  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||  | || || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || || |||   |||||||  || ||||| ||||| |    
T  21840652 tgaaactcaagtgccttccttcgcttgtcatggtaactattctgtcgactctgcgacgcttttatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtct 21840751  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | ||||| |  |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  21840752 gatgaactaaatctggtcccaacaccacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggggtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 21840851  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||||| ||||| || || || || || ||||| || |||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||    
T  21840852 accaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaattctatcaacgatagatgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaa 21840951  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||  || ||||| || |||||||||||||||| ||| ||| ||||||  ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||  ||||| |    
T  21840952 tcctctaatgattgaatcgttctctccgactgaccatttgtttgcagatgatgagccgaactcaacctcaacttagaacccaaggcatcttttaaactct 21841051  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  21841052 tccaaaatcttgaagtgaacctcggatctctatctgacacaatactcgatggaactccatgcaacttcacaat 21841124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 19 - 688
Target Start/End: Original strand, 6679146 - 6679815
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| || |||||| | ||  ||||    
T  6679146 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgtaccaactctctctgaaat 6679245  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||||||||| || ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  6679246 ctgatacggaccaataaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 6679345  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||   |||| |   |||||||||||||| |    
T  6679346 tgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtct 6679445  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
      ||||| |  || ||||| || || || || ||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  6679446 catgaaccaaatccggtcccaacacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccat 6679545  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  6679546 accaatactcgagtgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactgtcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaa 6679645  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    || || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||| || || || |||||||    
T  6679646 tcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttt 6679745  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 688  Q
    |||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  6679746 tccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcac 6679815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 19 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 31571588 - 31570917
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||||||||||| ||||| || || ||||  ||||| ||||| ||||| || || || || |||| ||| ||||||||||| | | | ||  ||||    
T  31571588 catacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttcctattctctctgaaat 31571489  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| || |||||||| ||||| ||||||||  | || |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||| ||| || || || || ||     
T  31571488 ctgatacgggccaatgaatttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactctcagaaatacatgatcaccctct 31571389  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||  ||||||||  ||||| || ||||| |    
T  31571388 tgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtct 31571289  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
     |||||| |  || ||||| |  || || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  31571288 cctgaaccaaatccggtcccagcacaacactttctcctgactcgaaccaacacaacggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtgccat 31571189  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| | |||||||||     
T  31571188 tcctatactcgaatgataactattgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaag 31571089  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    || || |  || || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| || || ||||| |    
T  31571088 tcttccaatgattggatcgttctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactct 31570989  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 690  Q
    |||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31570988 tccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaa 31570917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 19 - 688
Target Start/End: Complemental strand, 804419 - 803750
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| || |||| | | ||  ||||    
T  804419 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgtaccaattctctctgaaat 804320  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||| ||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  804319 ctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 804220  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| || ||    |||| |   ||||||| |||||| |    
T  804219 tgaaactccagatcctttcttcgcttgtcatggtaacttttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcaacctgactttcttagtagtct 804120  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
      ||||| |  || ||||| || || || || ||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  804119 cgtgaaccaaatccggtcccaacacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccat 804020  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | ||||||||||    
T  804019 accaatactcgagtgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaaggtaagtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcaacaaa 803920  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    || || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |    
T  803919 tcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccaaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactct 803820  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 688  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  803819 tccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcac 803750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 19 - 688
Target Start/End: Original strand, 6603693 - 6604362
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| || |||| | | ||  ||||    
T  6603693 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgtaccaattctctctgaaat 6603792  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
     ||||| |||||||||||||| || ||||||||  | ||||||||||| || || ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  6603793 ttgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 6603892  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||   |||| |   |||||||||||||| |    
T  6603893 tgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtct 6603992  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
      ||||| |  || ||||| || || || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  6603993 catgaaccaaatccggtcccaacacaacactctcacccgactcaaaccaacacaaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccat 6604092  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||||| || |||||||| || ||||| || ||||| ||||| || |  ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||    
T  6604093 accaatactcgagtgatagctgttgttatacgtaaactcaatcaaaggtaagtgactgtcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaa 6604192  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    || || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || |||||||    
T  6604193 tcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttt 6604292  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 688  Q
    |||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  6604293 tccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcac 6604362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 19 - 688
Target Start/End: Original strand, 12304793 - 12305462
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||| ||||  | ||  ||||    
T  12304793 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgtttcaaccctctctgaaat 12304892  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||||||||  | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||| |||| || | ||| || || || || |||    
T  12304893 ctgatacggaccgatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaggcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctaagaaaaacatgatcaccctcc 12304992  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||    |||| |   |||||||||||||| |    
T  12304993 tgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcaacctgactttctcagtagtct 12305092  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
      ||||| |  || ||||| || ||  | || ||||| |||||||||||||| || || || || || |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  12305093 catgaaccaagtccggtcccaacacagcactctcacccgactcaaaccagcataaaggggtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccat 12305192  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     ||||| || || |||||||| || |||||||||||||| ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||    
T  12305193 accaatgctcgagtgatagctgttgttataagtgaactcaatcaatggcatgtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaa 12305292  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    || || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |  || || ||||| |    
T  12305293 tcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaatgtgtcctgtaaactct 12305392  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 688  Q
    |||| ||  ||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  12305393 tccagaacatagaagtgaacctcggatccctatctgacacaatgctcgacggaacaccatgaagcttcac 12305462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 129 - 690
Target Start/End: Original strand, 22051008 - 22051569
Alignment:
Q  129 ccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaa 228  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||| ||||||| || || || || || ||||||||||    
T  22051008 ccaatgaacttcggagtcaacttccttgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactttcaaaaatacatgatcaccctcttgaaactcaa 22051107  T
Q  229 gatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaat 328  Q
    |  | || || ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||    |||||||  || ||||| || || || ||||| |     
T  22051108 gggccttcctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgaccttctctgtcgtctgttgaaccaa 22051207  T
Q  329 ctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatacta 428  Q
     |||||||| || || || || || ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||     
T  22051208 atctggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataacggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccatacctatactc 22051307  T
Q  429 gaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcg 528  Q
    ||||| || || || || || |||||||| || || || || ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | |||||||| |||||| | ||    
T  22051308 gaatggtaactgttgttgtaggtgaactctataaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcaacagatcctccaacg 22051407  T
Q  529 actgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatct 628  Q
    | || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| || ||    
T  22051408 attggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaatctcaacttggaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacct 22051507  T
Q  629 agaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 690  Q
    ||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  22051508 agaggtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatttagcttcacaa 22051569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 354 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 20976062 - 20975725
Alignment:
Q  354 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 453  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||||    
T  20976062 cctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtga 20975963  T
Q  454 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 553  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||| | |||||  |||||||| |  || || || |||||||||||||||||    
T  20975962 actctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctaaagtacacacactctcagtaaatcctccaatgattgtatcgtcctctccgactgacc 20975863  T
Q  554 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 653  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||| ||||    
T  20975862 atctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcatgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcggatctccatct 20975763  T
Q  654 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  20975762 gacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 20975725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 291
Target Start/End: Original strand, 22032067 - 22032339
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||| |||| ||||| ||||| | ||    
T  22032067 catacttccgaagttgcgaaacatggaaaacatcgtgtaaattcgaaagatgcggtggtaatcctactcgatacgccaacgtttcaactctttccgatat 22032166  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    ||||||   |||||| ||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22032167 ctgatacaaaccaataaatctcggagtcaatttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccatcc 22032266  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctt 291  Q
    | |||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22032267 taaaactcaagatccttcctacgtttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctctt 22032339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 351 - 688
Target Start/End: Complemental strand, 16271638 - 16271301
Alignment:
Q  351 tcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataag 450  Q
    ||||| ||| |||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||    
T  16271638 tcacccgacgcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctgttgttataag 16271539  T
Q  451 tgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactg 550  Q
    |||| || ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||    
T  16271538 tgaattcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccgactg 16271439  T
Q  551 accatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctcta 650  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| |||    
T  16271438 accatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccataacctagaagtgaacctcggatcccta 16271339  T
Q  651 tctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 688  Q
    || || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  16271338 tccgacacaatgctcgacggaacaccatgaagcttcac 16271301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 21682217 - 21681856
Alignment:
Q  18 tcatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||  | ||||||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||| ||||||||  | ||  | |    
T  21682217 tcatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcattcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactgttccaaccctctcagata 21682118  T
Q  118 tctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttc 217  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||| || ||||| ||    
T  21682117 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaacacatgatctccctc 21682018  T
Q  218 ctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtt 317  Q
     |||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| || |||   |||||||  |||||||| |||||     
T  21682017 ttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctacgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctccgtagtc 21681918  T
Q  318 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagt 379  Q
    || ||||| |  |||||||| || || || || || ||||||||||||||||| || |||||    
T  21681917 tgatgaaccaaatctggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagt 21681856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 19 - 397
Target Start/End: Original strand, 20007885 - 20008263
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| ||  | |||||||||| ||| ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  20007885 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtagcaaacccactctatatgccactgttccaaccctctcagatat 20007984  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| ||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||| || ||||| ||     
T  20007985 ctgatatggaccaatgaactttggagtcaccttgttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaacacatgatctccctct 20008084  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    || ||||||||  | || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||   |||||||  || ||||| ||||| |    
T  20008085 tggaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactatgcgacgctttcatcttttctcttatcatctttaccttctccgtagtct 20008184  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccata 397  Q
    | ||||| |  |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| || || |||||  |||| |||||||||||    
T  20008185 gatgaaccaaatctggtcccaacaccacactttctcccgactcaaaccaacataaaggagtcatgcacctccgaccata 20008263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 19 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 21325156 - 21324804
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaa-gatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||| |||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | |   | |    
T  21325156 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaatgatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctatgata 21325057  T
Q  118 tctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttc 217  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | || |||| ||| || || || || ||    
T  21325056 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctc 21324957  T
Q  218 ctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtt 317  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||   |||||||  |||||||| |||||     
T  21324956 ctgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgttttcatcttttctcttatcatcttgactttctctgtagtc 21324857  T
Q  318 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagca 370  Q
    || ||||| |  || ||||| || ||||| || || |||||||||||||||||    
T  21324856 tgatgaaccaaatccggtcccaacaccacactatctcctgactcaaaccagca 21324804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 19 - 257
Target Start/End: Original strand, 23948924 - 23949162
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| | || | ||||  | ||    
T  23948924 catacttccaaagttgcgacacatgaaacacatcgtgaaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgctacgccaccgtactaattctttctgatat 23949023  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||     
T  23949024 ctgatacggaccaacaaacctcggagtcaacttctttgatttcaaagcacgtctaaaaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttct 23949123  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactc 257  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||| |||||||    
T  23949124 tgaaactcaaggtccttcctacgcttatcataataactc 23949162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 223
Target Start/End: Original strand, 15441216 - 15441420
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| |  || ||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  15441216 catacttacgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgaggtggtaatcaaacacgatacgccaccgttccaactctttccgatat 15441315  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||| |||||     
T  15441316 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagccacaggagtgactctcaaaaacatgtggtcaccttct 15441415  T
Q  219 tgaaa 223  Q
    |||||    
T  15441416 tgaaa 15441420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 415 - 691
Target Start/End: Original strand, 22371371 - 22371647
Alignment:
Q  415 ccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaa 514  Q
    |||| |||||||| ||||| || || || || || ||||| || |||||||| || ||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||| |||||||     
T  22371371 ccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaaatctatcaacggtaggtgactatcccaagctccacgttgctcaagtacacacattctcag 22371470  T
Q  515 caaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaa 614  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||| |||||||| || ||||| || |||||||||    
T  22371471 caaatcctctaacgactgaatcgttctctccgactcaccatctgtttgcggattataagccgaacccaacctcaactttgaacccaacgcatcttgcaaa 22371570  T
Q  615 cttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    || |||||||| || |||||||| || ||||||||||  || ||||| ||||| ||||  ||||| | |||||||||    
T  22371571 ctcttccaaaaccttgaagtaaacctcggatctctattcgacacaatactcgatggaagcccatgaaacttcacaat 22371647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 471 - 688
Target Start/End: Original strand, 27355035 - 27355252
Alignment:
Q  471 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 570  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  27355035 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatccgtttgaggatgat 27355134  T
Q  571 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 670  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  27355135 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacgg 27355234  T
Q  671 aacaccatgtagcttcac 688  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  27355235 aacaccatgaagcttcac 27355252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 144 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 16877716 - 16877181
Alignment:
Q  144 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 243  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || ||||| ||||  ||| | || ||||| ||||| || |||||  |||||||||||| ||| || || | ||    
T  16877716 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccgacaccggtcaccggattcaccctcaagaacacatgatctccaacctgaaactcaatatccttcctcctct 16877617  T
Q  244 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 343  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  16877616 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 16877517  T
Q  344 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 443  Q
      | || || || ||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| | || ||     
T  16877516 agcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctgcacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 16877417  T
Q  444 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 543  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  16877416 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 16877317  T
Q  544 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 643  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| |  ||||||||  ||||||||| || ||||||  |||||||||| || ||    
T  16877316 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatcttaacttagttcccaaagcagcttgcaaaccttcccaaaacttagaagtaaacctcgg 16877217  T
Q  644 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 679  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  16877216 atcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 16877181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 157 - 679
Target Start/End: Original strand, 22315364 - 22315886
Alignment:
Q  157 acttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataact 256  Q
    ||||||||||||| |||||||| || | |||| | |||||||||||||| || || ||  ||||||||||||  || || || | ||| |||||||||||    
T  22315364 acttcaaagcacgacctacaccggttacaggattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtccttcctcctcttatcatgataact 22315463  T
Q  257 cttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacct 356  Q
    ||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  |||||||  || |||||||        |||||||||    
T  22315464 cttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttctgtagtttcttgaacaacttccggtcctacccaagaactttcacct 22315563  T
Q  357 gactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaact 456  Q
    |||||| |||| ||||| || ||||| || || | ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| | || || |||||||| ||||    
T  22315564 gactcataccaacacaatggcgttctacaccttctaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagaatgaaaactgttgttataagtaaact 22315663  T
Q  457 cgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatc 556  Q
    | |||||||| |||     | ||||| |  | |||||||| | |||||||  ||| |||||||| || |    || ||| |||||||||| ||| |||||    
T  22315664 caatcaacggtagacattcaacccaactgacaccttgctccaaaacacaagctcttaacaaatcttccaaactctaaatagtcctctccgtctgcccatc 22315763  T
Q  557 tgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgat 656  Q
      |||| |||||||| || | |||||| |||||||| |  ||||||||   ||||||||||| |||||| ||| ||||||| || ||||| | ||| ||     
T  22315764 actctggggatgataagcaggactcaacctcaacttagttcccaaagcagtttgcaaactttcccaaaacctaaaagtaaacctcggatcccgatccgac 22315863  T
Q  657 acaatgctcgaaggaacaccatg 679  Q
    ||||| || ||||||| ||||||    
T  22315864 acaatactggaaggaataccatg 22315886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 144 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 21197123 - 21196588
Alignment:
Q  144 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 243  Q
    ||||||||| |  ||||||||| ||| || || ||||| | |||| | |||||||||||||| || || ||| |||||||||||| ||| ||||| | ||    
T  21197123 gtcaacttcctacacttcaaagtacgaccaactccagttacaggattcactctcaaaaacacatgatcacctacctgaaactcaatatcctttctcctct 21197024  T
Q  244 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 343  Q
    | |||||||||||| | || | |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |   |||| |  || ||||  || |||||||| |     
T  21197023 tatcatgataactcctctgccaactctgagacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttttacatagtctcttgcacaacttccggtcctaacaa 21196924  T
Q  344 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 443  Q
      | ||||| || || |||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | || ||     
T  21196923 agcactttctccggattcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccaatactagaatgaaaactgttg 21196824  T
Q  444 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 543  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |    |||||||| | |||||||  |||||||||||||||||    || ||| |||||||    
T  21196823 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgataccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctctaaactctaaatagtcctct 21196724  T
Q  544 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 643  Q
      | ||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |   |||||||   |||||| || | ||||||  |||||||||| || ||    
T  21196723 atgtctgcccatcggtctggggatgataagcagaactcaatctcaacttagtttccaaagcagtttgcaagctctcccaaaacgtagaagtaaacctcgg 21196624  T
Q  644 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 679  Q
    ||  | |||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  21196623 attccgatctgacacaatactagaaggaataccatg 21196588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 16265364 - 16265127
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||| || |||||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||  ||||    
T  16265364 catacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgaaat 16265265  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  16265264 ctgatacggaccgatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacatccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaagacatgatcaccctcc 16265165  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataact 256  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  16265164 tgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaact 16265127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 573 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 22129132 - 22129005
Alignment:
Q  573 gccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 672  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22129132 gccgaactcaacctcaacttcgaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaattaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaa 22129033  T
Q  673 caccatgtagcttcacaatttccttgat 700  Q
     |||||| | | |||| || ||||||||    
T  22129032 taccatgcaacctcacgatctccttgat 22129005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 144 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 21850958 - 21850423
Alignment:
Q  144 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 243  Q
    ||||||||| |  |||||||| |||| || ||||| |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||  | | ||    
T  21850958 gtcaacttcctacacttcaaatcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcatcctct 21850859  T
Q  244 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 343  Q
    | |||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || || ||||| |     
T  21850858 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttttcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggccctaacaa 21850759  T
Q  344 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 443  Q
      | || || || ||||||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||| |||| | || ||     
T  21850758 agcactctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtaccattccgatactagcatgaaaactgttg 21850659  T
Q  444 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 543  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  21850658 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 21850559  T
Q  544 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 643  Q
    ||| ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  21850558 ccgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 21850459  T
Q  644 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 679  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  21850458 atcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 21850423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 144 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 20652954 - 20652635
Alignment:
Q  144 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 243  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || ||||| |||| | || | ||||||||||| || || || ||  | |||||||| | ||| ||||| | ||    
T  20652954 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacatgattcactctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactctatatcctttctcctct 20652855  T
Q  244 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 343  Q
    | | |||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |  || || | ||| |||||||| |     
T  20652854 tataatgataactcttctgtccactctgagacgctttcatcttctcttggatcatcttaaccttctccgtagtctcttgcaccacctccggtcctaacaa 20652755  T
Q  344 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 443  Q
      | ||||| || |||| |||||| |||||||| || || || |||| ||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||| | |||||     
T  20652754 ggcactttctccggacttaaaccaacacaacggtgtcctacacctcctaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagaatgaaaactattg 20652655  T
Q  444 ttataagtgaactcgatcaa 463  Q
    || ||||| ||||| |||||    
T  20652654 ttgtaagtaaactcaatcaa 20652635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 144 - 679
Target Start/End: Original strand, 22982596 - 22983128
Alignment:
Q  144 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 243  Q
    ||||||||||   ||||||||||||| || |||||| ||| | || | ||||| |||||| | || || ||  |||||||||||| ||||||||  |  |    
T  22982596 gtcaacttctgacacttcaaagcacgaccaacaccaatcacatgattcactctaaaaaacgcatgatcaccaacctgaaactcaatatcttttcaccttt 22982695  T
Q  244 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 343  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| || || ||||| |||||||||||||||| ||| || ||  |||| |  || ||||  || ||| |||  ||    
T  22982696 tatcatgataactcttctgtctactctgagatgctttcatcttctcttggatcatcttaaccttttccatagtctcttgcacaacttccggttcta--ac 22982793  T
Q  344 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 443  Q
     |  |  |||| |||||||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || |||||||| || | |||||||||| |  | ||     
T  22982794 aaagcactcacttgactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgacactagaatgaaaattgttg 22982893  T
Q  444 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 543  Q
    || ||||| ||||| |||||||| |||    | |||||| |  | |||||||| |  ||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  22982894 ttgtaagtaaactcaatcaacggtagacatttgtcccaactgacaccttgctccaagacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 22982993  T
Q  544 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 643  Q
    | |  || ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  ||||| |||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  22982994 ctgtttgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgc-aactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 22983092  T
Q  644 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 679  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  22983093 atcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 22983128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 28982392 - 28982632
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||| |||||||| || || ||||| || || | |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| || |||| | | ||  ||||    
T  28982392 catatttccgaagctgagaaacatgaaacacgtcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgtaccaattctctctgaaat 28982491  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| || ||||| ||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||||  ||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  28982492 ctgatacggtccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtccaacacccgtcaacggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 28982591  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactctt 259  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  28982592 tgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactctt 28982632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 28987612 - 28987852
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||| |||||||| || || ||||| || || | |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| || |||| | | ||  ||||    
T  28987612 catatttccgaagctgagaaacatgaaacacgtcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgtaccaattctctctgaaat 28987711  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| || ||||| ||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||||  ||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  28987712 ctgatacggtccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtccaacacccgtcaacggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 28987811  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactctt 259  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  28987812 tgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactctt 28987852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 348 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 23157428 - 23157098
Alignment:
Q  348 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 447  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || |||| ||| || |||||||||||| | || || || |    
T  23157428 ctttcacctgattcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaatggtgtcataccgatactagaatgaaaactgttgttgt 23157329  T
Q  448 aagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccga 547  Q
    |||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||    ||||||  || ||||||     
T  23157328 aagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactaacaccttgctcca-aacacaagttctcaacaaatcctctaaactctgaataatcttctccgt 23157230  T
Q  548 ctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatct 647  Q
    | | ||||| ||||| || ||||| |  |||||||||||| |||| |  ||||||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||| || | |||     
T  23157229 cggcccatcagtctgggggtgataagtagaactcaatctctacttagttcccaaagcagcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctcgaatcc 23157130  T
Q  648 ctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 679  Q
    | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  23157129 cgatccgacacaatactagaaggaataccatg 23157098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 194
Target Start/End: Original strand, 27347261 - 27347436
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||| || |||||||| || |||| |||||| ||||||||||| || |  ||||| |||  ||| ||||| || |||||  | ||  ||||    
T  27347261 catacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtgccaaaccaactttatatgccactgtcccaaccctctctgaaat 27347360  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgact 194  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||    
T  27347361 ctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgact 27347436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 654 - 699
Target Start/End: Complemental strand, 19484175 - 19484130
Alignment:
Q  654 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 699  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  19484175 gatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctccttga 19484130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 530 - 679
Target Start/End: Original strand, 23900822 - 23900971
Alignment:
Q  530 ctgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatcta 629  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||| ||||| |||||||| |  |||||||  |||||||| |  ||||||||  |||||||||||| ||||||  ||    
T  23900822 ctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctggggatgataagtagaactcagcctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactttcccaaaacata 23900921  T
Q  630 gaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 679  Q
    |||||||| ||  |||| | |||||| |||||  | ||||||| ||||||    
T  23900922 gaagtaaacctcagatcccgatctgacacaatattagaaggaataccatg 23900971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 567 - 693
Target Start/End: Original strand, 19863639 - 19863765
Alignment:
Q  567 tgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcg 666  Q
    |||||||| ||||||| | | ||||| |  ||||||||   ||||||||||  |||||| || || || || |||||||||||||| || ||||| ||||    
T  19863639 tgatatgcagaactcagttttaacttagtacccaaagcactttgcaaacttccccaaaaccttgatgtgaaccttggatctctatccgaaacaatactcg 19863738  T
Q  667 aaggaacaccatgtagcttcacaattt 693  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||    
T  19863739 aaggaacaccatgcaacttcactattt 19863765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 567 - 693
Target Start/End: Original strand, 19868276 - 19868402
Alignment:
Q  567 tgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcg 666  Q
    |||||||| ||||||| | | ||||| |  ||||||||   ||||||||||  |||||| || || || || |||||||||||||| || ||||| ||||    
T  19868276 tgatatgcagaactcagttttaacttagtacccaaagcactttgcaaacttccccaaaaccttgatgtgaaccttggatctctatccgaaacaatactcg 19868375  T
Q  667 aaggaacaccatgtagcttcacaattt 693  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||    
T  19868376 aaggaacaccatgcaacttcactattt 19868402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 433
Target Start/End: Original strand, 19863223 - 19863506
Alignment:
Q  150 ttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcat 249  Q
    ||||| |||||||||||||| || || || ||||  ||| ||||||| ||||| || || || |||||||||||||| |    ||| || |  || ||||    
T  19863223 ttcttagacttcaaagcacgcccaacgcccgtcaccggagtgactcttaaaaatacatgatcgccttcctgaaactccaatgatttccttcttttatcat 19863322  T
Q  250 gataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactct 349  Q
    |||| ||||| |||| ||| || || || |||||| ||||| | ||||| |  || || || || || |||||||||||||| ||||| || ||  |  |    
T  19863323 gatagctcttctgtctactttgtgatgctttcattctctctcgaatcattttgaccttttcggtcgtctgctgaacaatctccggtcccaacactgcaat 19863422  T
Q  350 ttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatg 433  Q
     || || |||||  |||| ||||| || ||||  ||||||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  19863423 ctcgccagactcgtaccaacacaaaggtgttcgacatctcctaccatacaacgcctcaaatggtgccatcccaatactagaatg 19863506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 433
Target Start/End: Original strand, 19867860 - 19868143
Alignment:
Q  150 ttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcat 249  Q
    ||||| |||||||||||||| || || || ||||  ||| ||||||| ||||| || || || |||||||||||||| |    ||| || |  || ||||    
T  19867860 ttcttagacttcaaagcacgcccaacgcccgtcaccggagtgactcttaaaaatacatgatcgccttcctgaaactccaatgatttccttcttttatcat 19867959  T
Q  250 gataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactct 349  Q
    |||| ||||| |||| ||| || || || |||||| ||||| | ||||| |  || || || || || |||||||||||||| ||||| || ||  |  |    
T  19867960 gatagctcttctgtctactttgtgatgctttcattctctctcgaatcattttgaccttttcggtcgtctgctgaacaatctccggtcccaacactgcaat 19868059  T
Q  350 ttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatg 433  Q
     || || |||||  |||| ||||| || ||||  ||||||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  19868060 ctcgccagactcgtaccaacacaaaggtgttcgacatctcctaccatacaacgcctcaaatggtgccatcccaatactagaatg 19868143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0459 (Bit Score: 558; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0459
Description:

Target: scaffold0459; HSP #1
Raw Score: 558; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 700
Target Start/End: Original strand, 414 - 1095
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  414 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccactgttccaactctttccaatat 513  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  514 ctgatacggaccaatgaatttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 613  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  614 tgaaattcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcgttttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 713  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  714 gctgaacaatctctggtcctaagaccgctctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgtcat 813  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  814 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagtccctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 913  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  914 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgatcatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 1013  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 700  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||    
T  1014 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatccccttgat 1095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 556; Significance: 0; HSPs: 6)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 556; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 702
Target Start/End: Original strand, 43154 - 43837
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||| ||    
T  43154 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcagtatgccaccgttccaactctttccaatat 43253  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43254 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgccctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcc 43353  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  43354 tgaaactcaagatcttttctgcacttatcatggtaactcttttgtcgactttgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagttt 43453  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  43454 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaacatataaagcctcgaaaggtgccat 43553  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43554 tccaatactagaatgatagctattattgtaagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagctcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 43653  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43654 tcctctagtgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 43753  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||    
T  43754 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttaatgt 43837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 508; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 700
Target Start/End: Original strand, 8485 - 9155
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||    
T  8485 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgaggtggtaaacccactcggtaagccacccttccaactctttccaatat 8584  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8585 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcc 8684  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    | ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  8685 taaaactcaagatcttttctacgtttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatctgaactttctcagtagtct 8784  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8785 gctgaacaatctccggtcctaagaccactctttcacctaactcgaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccat 8884  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||    
T  8885 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaac-----------acaaa 8973  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8974 tcctccagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 9073  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 700  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  9074 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 9155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 313 - 700
Target Start/End: Original strand, 15241 - 15617
Alignment:
Q  313 tagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaagg 412  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15241 tagtctgctgaacaatctccggtcctaagaccactctttcacctgactcgaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaagg 15340  T
Q  413 tgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctc 512  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              
T  15341 tgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaac---------- 15430  T
Q  513 aacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgca 612  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15431 -acaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgatcccaaagcctcttgca 15529  T
Q  613 aacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 700  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  15530 aacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 15617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 54 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 50785 - 50148
Alignment:
Q  54 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttct 153  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| | ||||||||| || || ||| | ||  | ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||    
T  50785 tgcaaattcgaaagatgagggggcaaacccaccctataagccactgtcccgactctctcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaacttct 50686  T
Q  154 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgata 253  Q
    | || || || ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||| || || |||||||||| |||| |    
T  50685 tagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgttatgaca 50586  T
Q  254 actcttttgtcgactctgcgacgccttcatt--ttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactcttt 351  Q
     ||||| ||||||||||||||||| |||||   |||||||  || | || ||| || || |||||||| ||||| || |||||||| || | ||| ||||    
T  50585 gctcttctgtcgactctgcgacgctttcatccgttctctt--attaacttaaccttttccgtagtttgttgaactatgtctggtcccaacatcacacttt 50488  T
Q  352 cacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagt 451  Q
    | || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || ||||| || |||||    
T  50487 cccccgactcaaaccaacacaaaggagttctgcaccttcgaccatacaaggcttcaaacggtgccataccaatactcgaatggtaactattgttgtaagt 50388  T
Q  452 gaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactga 551  Q
     ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||| | ||||| ||  || || || || ||||||||||||    
T  50387 aaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacaccctcaatagatcctttaaggattgtatcgttctctccgactga 50288  T
Q  552 ccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctat 651  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||    
T  50287 ccatccgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaatttcgagcccaaagcatcttggaaactcttccagaatctagaagtgaacctcggatctctat 50188  T
Q  652 ctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
     ||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  50187 ttgatacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaat 50148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 185 - 316
Target Start/End: Original strand, 13832 - 13963
Alignment:
Q  185 aggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcatt 284  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13832 aggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctaaaactcaagatcttttctacgtttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatt 13931  T
Q  285 ttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 316  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  13932 ttctcttgaatcatctgaactttcttagtagt 13963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 144 - 672
Target Start/End: Complemental strand, 106754 - 106226
Alignment:
Q  144 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 243  Q
    ||||||||| |  |||| |||||| | || ||||| |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  106754 gtcaacttcctacactttaaagcaggaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 106655  T
Q  244 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 343  Q
    | ||||||||| |||| |||| |||||| || || ||||| ||||| || ||||||  ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  106654 tatcatgataaatcttatgtctactctgagatgctttcatcttctcctgaatcatcctaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 106555  T
Q  344 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 443  Q
      | ||||| |  || |||||||| |||||||| || || || |||| ||||||||||||||| || || ||||| || |||||||||||| | || ||     
T  106554 agcactttctctggattcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccaaccatacaaagcctcaaacggagccataccgatactagaatgaaaactgttg 106455  T
Q  444 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 543  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |    ||||| || |  ||||||  ||||||||||||||| |    ||| || |||||||    
T  106454 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgataccttgttccaacacacaagctctcaacaaatcctccaaactctggatagtcctct 106355  T
Q  544 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 643  Q
     || ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||| ||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  106354 tcgtctgcccatcggtctggggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcagactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 106255  T
Q  644 atctctatctgatacaatgctcgaaggaa 672  Q
    ||| | |||||| ||||| || |||||||    
T  106254 atcccgatctgacacaatactagaaggaa 106226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 554; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 554; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 700
Target Start/End: Original strand, 620 - 1301
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  620 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccacttggtaagccaccgttccaactctttccaatat 719  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  720 ttgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 819  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |    
T  820 tgaaactcaagatcttttctacgcttatggtgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttcttactagtct 919  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  920 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccat 1019  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1020 tccaatactttaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcctaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 1119  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1120 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaattcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 1219  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 700  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||| || ||||||||    
T  1220 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacgatctccttgat 1301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 506; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 700
Target Start/End: Original strand, 14360 - 15041
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  14360 catacttccgaagtttcgacacatggaagacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccacccgatacgccaccgttccaactctttccgatat 14459  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14460 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtatccttcc 14559  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  14560 tgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 14659  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14660 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacttgactcaaaccaacacaacggagttctacatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccat 14759  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14760 tccaatactagaatgatgactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaa 14859  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  14860 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttcaaacccaaagcctcttgcaaacttt 14959  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 700  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||    
T  14960 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaaccccatgtaacctcacaatctccttgat 15041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 544; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 544; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 700
Target Start/End: Original strand, 6937 - 7620
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaaga-tgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaa 117  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |    
T  6937 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagaatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaata 7036  T
Q  118 tctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaa-acacgtggtctcctt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  7037 tctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaaacacgtggtctcctt 7136  T
Q  217 cctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 316  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  7137 cttgaaactcaagatcttttccacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttagatcatctgaaccttctcagtagt 7236  T
Q  317 ttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcc 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7237 ttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctacatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgcc 7336  T
Q  417 attccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaaca 516  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  7337 attccaatacttgaatgataactattattatatgtgaactcgattaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcgagaacacaaatcctcaaca 7436  T
Q  517 aatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaact 616  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7437 aatcctccagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaact 7536  T
Q  617 tttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 700  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||| || ||||||||    
T  7537 tttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacgatctccttgat 7620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 508; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 508; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 700
Target Start/End: Original strand, 7377 - 8047
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||    
T  7377 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgaggtggtaaacccactcgctaagccaccgttccaactctctccaatat 7476  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7477 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcc 7576  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  7577 tgaaactcaagatcttttctacgtttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatctgaactttctcagtagtct 7676  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7677 gttgaacagtctccggtcctaagaccactctttcacctgactcgaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccat 7776  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||    
T  7777 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaac-----------acaaa 7865  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7866 tcctctagcgactgaattgtcctctccgcctgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 7965  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 700  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  7966 tccaaaatctagaagtaaatcttggacctctatctgatacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 8047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 506; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 506; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 700
Target Start/End: Original strand, 65405 - 66086
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||    
T  65405 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgataagccaccgttccaactctttctgatat 65504  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  65505 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacgccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 65604  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  65605 tgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 65704  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  65705 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccat 65804  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  65805 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcttccttgctcaagaacacaaactctcaacaaa 65904  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    || |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  65905 tcttctagcgactgaattgtcctttctaactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaatttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 66004  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 700  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||    
T  66005 tccaaaatctagaagtaaatcttggatccctatctgatacaatactcgaaggaacaccatgtaacctcacgatctccttgat 66086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 238 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 39906 - 39466
Alignment:
Q  238 tacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcc 337  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39906 tacgcttatcatgataactcttctgtcgactctacgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatctctggtcc 39807  T
Q  338 taagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatag 437  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||     
T  39806 taagaccactttttcacctgattcaaaccaacacgacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtaccattccaatactagaatgataa 39707  T
Q  438 ctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattg 537  Q
    || ||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39706 ctgttattgtatgtgaaatctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcg 39607  T
Q  538 tcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaa 637  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39606 tcctctccgactga-catctgtctgtggatgatacgccgaactcaatcttaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttttcgaaaatctagaagtaaa 39508  T
Q  638 tcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 679  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39507 tcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 39466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 40095 - 39926
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||||  ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  40095 catacttccgaagttgtgacacatgaaagacatcatgcaagttcgaaagatgcggtggtaatccaactcaatacgccaccgttccaactctttcccatat 39996  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagga 188  Q
    | |||| |||||||| ||  |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  39995 ccgatacggaccaataaatctcggagtcaaattctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacagga 39926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 486; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 486; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 33879 - 33198
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||| | | ||    
T  33879 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtagtaatcccactcgatacgccactgttccaactcttttcgatat 33780  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | || ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  33779 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacatgagtgactttcaataacacgtggtctccttcc 33680  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |    
T  33679 tgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgaatcatcttaactttctcggtagtct 33580  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  33579 gttgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaatggagttctgcatctccaaccatacaaagcttcaaaaggtgccat 33480  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33479 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 33380  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    || ||||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33379 tcttctagcgactgaattttcgtttccggctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 33280  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 700  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |   ||||||| ||||||||    
T  33279 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaattctcgaaggaacaccatgcaatctcacaatctccttgat 33198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 482; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 700
Target Start/End: Original strand, 8596 - 9277
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||| | | ||    
T  8596 catacttccaaagttgcgacacatggaaaacttcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccactgttccaactcttttcgatat 8695  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | || ||||| |||| |||||||||||||||||     
T  8696 ctgatacggaccaataaatctcggagttaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaagagtgactttcaataacacgtggtctccttct 8795  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |    
T  8796 tgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgaatcatcttaactttctcggtagtct 8895  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  8896 gttgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaatggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcaaaaggtgccat 8995  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8996 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 9095  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    || ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9096 tcttctagcgactgaattttcgtttccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 9195  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 700  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |   ||||||| ||||||||    
T  9196 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaattctcgaaggaacaccatgcaatctcacaatctccttgat 9277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 482; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 482; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 4711 - 4030
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||| | | ||    
T  4711 catacttccaaagttgcgacacatggaaaacttcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccactgttccaactcttttcgatat 4612  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | || ||||| |||| |||||||||||||||||     
T  4611 ctgatacggaccaataaatctcggagttaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaagagtgactttcaataacacgtggtctccttct 4512  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |    
T  4511 tgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgaatcatcttaactttctcggtagtct 4412  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  4411 gttgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaatggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcaaaaggtgccat 4312  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4311 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 4212  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    || ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4211 tcttctagcgactgaattttcgtttccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 4112  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 700  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |   ||||||| ||||||||    
T  4111 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaattctcgaaggaacaccatgcaatctcacaatctccttgat 4030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 467; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 467; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 279136 - 278458
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  279136 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 279037  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| ||||| || ||  |||| |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  279036 ctgatacggacctataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcttgtcccacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 278937  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  278936 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 278837  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  278836 gctgaacaatctcttgtcctaggaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccat 278737  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  278736 tccaatactagaatgataactattattgtatgcgaactcaatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaa 278637  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || || || |||||||||||||| |    
T  278636 tcctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaatttagaaccgaaggcctcttgcaaactct 278537  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 697  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  278536 tccaaaacctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcctt 278458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Original strand, 308659 - 308981
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  308659 catactttcgaagttacgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 308758  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  308759 ctgatacggaccaataaactttggggttaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 308858  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  308859 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatccgaactttctcagtagtct 308958  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaag 341  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  308959 gctgaacaatctctggtcctaag 308981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 19 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 165015 - 164538
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||  | ||    
T  165015 catacttccgaagttgcgacatatgaaacacattgtgcaaattcgaaagatgcggtggtgaacccactcgatacgccaccgttccaattctttctgatat 164916  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | || ||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  164915 ctgatacggaccaataaacctcgaagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaatacgtgatctccttct 164816  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  164815 tgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 164716  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | ||||| || |||||||| || |  || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||| |||    
T  164715 gttgaacgatttctggtcccaaaaatacactctcacctgactcgaaccaacacaacggagttctgcaccttcgaccatacagagcctcaaaaggtgtcat 164616  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctc 496  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  164615 tccaatgctagaatgataactgttattgtacgtgaattctatcaacggaagatgaatatcccaagttcatctttgctc 164538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 19 - 690
Target Start/End: Original strand, 260308 - 260979
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||| || |||||||| || ||||  ||||| ||||||||||  || || ||||  |||| ||| |||||||||| ||   | ||  ||||    
T  260308 catacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatatggtggcaaacaaactctatatgccaccgttctaatcctctctgaaat 260407  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | || || ||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| || || || || |||    
T  260408 ctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgattttaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctcc 260507  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||    |||||||  || |||||||| || |    
T  260508 tgaaactcaagggcctttctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgaccttctcagtcgtct 260607  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | ||||| |  || ||||| || || || || || ||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  260608 gatgaaccaaatccggtcccaatacaacactctctcctgactcaaaccagcataacagagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 260707  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     || ||||| ||||| || || || || || |||||||| ||||  || || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | ||||||||||    
T  260708 acctatactcgaatggtaactgttgttgtaggtgaactctatcagtggtaggtgactgtcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcaacaaa 260807  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||| |  || |  || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| |    
T  260808 tcctccaatgattagatcgtcctttccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactct 260907  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 690  Q
    |||| || ||||| || || || ||||| ||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  260908 tccagaacctagaggtgaacctcggatccctatccgacacaatactagaaggaactccatgtagcttcacaa 260979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 453; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 453; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Original strand, 6372 - 7044
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||  ||||| | |||||| ||||||| ||    
T  6372 catacttccgaagttgcgacacatgaaacatatcgtgcaaattcgaaagatgcggtgttaatcccactcgatataccaccatcccaactctttccaatat 6471  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||     
T  6472 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 6571  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| ||| ||||| |||||||    
T  6572 tgaaactcaagatcttttctacgtttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctactcttgaatcatcttaaccttctctgtagttt 6671  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  6672 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccat 6771  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  6772 tccaatactagaatgataactattattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaaccctcaacaaa 6871  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  6872 tcttctaacgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttt 6971  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  6972 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 7044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 381 - 686
Target Start/End: Original strand, 3153 - 3458
Alignment:
Q  381 ctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccc 480  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  3153 ctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttcttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatccc 3252  T
Q  481 aagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaact 580  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  3253 aagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagacgaact 3352  T
Q  581 caatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgt 680  Q
    ||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||    
T  3353 caacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatacttgacggaacaccatgt 3452  T
Q  681 agcttc 686  Q
    | ||||    
T  3453 aacttc 3458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 452; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 452; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 141 - 700
Target Start/End: Original strand, 7519 - 8078
Alignment:
Q  141 ggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctac 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7519 ggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctac 7618  T
Q  241 gcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaa 340  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7619 gcttatcatgataactcatttgtcgactttgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgctgaacaatctttggtcctaa 7718  T
Q  341 gaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagcta 440  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7719 gaccactctttcacctaactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataaaaaacctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataacta 7818  T
Q  441 ttattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcc 540  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  7819 ttattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaatcctcaacaaatcctctagcgattgaattgttc 7918  T
Q  541 tctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatct 640  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7919 tctccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatct 8018  T
Q  641 tggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 700  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||    
T  8019 tggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatacaacttcacaatctccttgat 8078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 450; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 450; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 83 - 700
Target Start/End: Original strand, 7854 - 8471
Alignment:
Q  83 cactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtc 182  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||    
T  7854 cactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccggtc 7953  T
Q  183 ataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttca 282  Q
    |  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  7954 accgaagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttca 8053  T
Q  283 ttttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttct 382  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  8054 ttttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacttgactcaaaccaacacaacggagttct 8153  T
Q  383 gcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaa 482  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8154 gcatcaccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaa 8253  T
Q  483 gttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactca 582  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  8254 gttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactca 8353  T
Q  583 atctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtag 682  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  8354 atctcaacatcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaaactagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaataccatgtaa 8453  T
Q  683 cttcacaatttccttgat 700  Q
    | |||||||  |||||||    
T  8454 cctcacaatcaccttgat 8471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 437; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 437; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Original strand, 6023 - 6695
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| | ||    
T  6023 catacttccgaagttgcgacacaagaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccgtcccaactctttccgatat 6122  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| || ||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||     
T  6123 ctgatacgggccaataaatcttggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggtgtgactctcaaaaatacgtggtctccttct 6222  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||    
T  6223 tgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagttt 6322  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6323 gttgaacaatctttggtcctaagaccactctttcaccagactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgtaaggtgccat 6422  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  6423 tccaatactagaatgataactattattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaag 6522  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||||    
T  6523 tcctctagtgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgctgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcatgcaaacttt 6622  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  6623 tccaaaatctagaagtaaaccttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 6695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 1830 - 1158
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  ||||  | ||    
T  1830 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtgggaaaccaactctatatgccactgttccaaccctttctgatat 1731  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||  ||| || || ||| |  ||    
T  1730 ctgatacggactaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctccgaaatacatgatcttccacc 1631  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||  | || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||    |||||||  ||||||||  |||| |    
T  1630 tgaaactcaagggccttcctacacttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgactttctctctagtct 1531  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | ||||| |  || ||||| || || || || || ||||||||||||||||| || |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  1530 gatgaaccaaatccggtcccaatacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcttgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 1431  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||    
T  1430 tccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtaaa 1331  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||| |  || || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||| || |    
T  1330 tcctccaaagattgtatcgttctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaaccacaacttcgaacccaaagcatcttgcaagctct 1231  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||||||||||||||| || || ||||| || || || || || ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  1230 tccaaaatctagaagtgaacctcggatccctgtccgacacgatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 1158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 144 - 405
Target Start/End: Original strand, 22819 - 23080
Alignment:
Q  144 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 243  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||  || ||||| |||| | || | |||||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  22819 gtcaacttcctacacttcaaagcacaaccaacaccggtcacatgattcactctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 22918  T
Q  244 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 343  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||| ||||| || ||||||| ||| || || ||||| |  || ||||  || |||||||| |     
T  22919 tatcatgataactcttctgtctactctgagactccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaacttccggtcctaacaa 23018  T
Q  344 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcct 405  Q
      | |||||||||||||||||||| |||||||| || |  || |||| ||||||||||||||    
T  23019 agcactttcacctgactcaaaccaacacaacggtgtccaacacctcctaccatacaaagcct 23080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 431; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 431; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 64337 - 63659
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||  | ||    
T  64337 catacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttctgatat 64238  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||||||  ||   ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  64237 ctgatacggaccaatgaatctcacagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaactccagccacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 64138  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    || |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||| |    
T  64137 tggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataattcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtct 64038  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  64037 gctgaacaatatctggtcctaagaccactctttctcctaactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccat 63938  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    ||||||||||||||| ||  | ||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  63937 tccaatactagaatgttaattgttattgtacgtgaactctatcaacggaagatgattatcccaagttcctctttgctcaagtacacaaactctcaacaaa 63838  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| |    
T  63837 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccagagcctcttgcaaactct 63738  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  63737 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctttttctgatataatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcctt 63659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 426; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 426; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 696
Target Start/End: Original strand, 6014 - 6691
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||| |||||||| |||| || ||    
T  6014 catacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagctgcggtggtaatccaactcgatacgccaccattccaactctttctaatat 6113  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||     
T  6114 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtcaaacaccagtcacaggagtgactcttaaaaacacgtggtctccctct 6213  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||||| |  || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  6214 tgaaactcaagatcctgcctgcgcttattatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttctcagtagttt 6313  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6314 gctgcacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccat 6413  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  6414 tccaatactagaatgataaatgttattgtatgtgaactcaatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgatcaagaacataaactctcaacaaa 6513  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  6514 tcctctaacgactgaatcgtcctctccgactaaccatctgtctacggatgatacgccgaacacaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactct 6613  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcct 696  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  6614 tccaaattctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcct 6691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0284 (Bit Score: 421; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0284
Description:

Target: scaffold0284; HSP #1
Raw Score: 421; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 84 - 700
Target Start/End: Original strand, 21932 - 22548
Alignment:
Q  84 actcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtca 183  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  21932 actcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcg 22031  T
Q  184 taggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcat 283  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  22032 caggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatccttcctgcacttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttcat 22131  T
Q  284 tttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctg 383  Q
     |||||||| ||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  22132 cttctcttgaatcattttaactttctcaatagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagatctg 22231  T
Q  384 catctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaag 483  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22232 catctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgtcattccaatactagaatgataactgttattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgattatcccaag 22331  T
Q  484 ttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaa 583  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22332 ttcctccttgctcaaggacacaaactcgcaacaaatcctctagcgactgaattgtccactccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaa 22431  T
Q  584 tctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagc 683  Q
    | |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  22432 tttcaacttcgaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagaaacaccatgtaac 22531  T
Q  684 ttcacaatttccttgat 700  Q
     ||||||| ||||||||    
T  22532 ctcacaatctccttgat 22548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1355 (Bit Score: 415; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold1355
Description:

Target: scaffold1355; HSP #1
Raw Score: 415; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 693
Target Start/End: Original strand, 676 - 1350
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||| |||||||  ||||| | ||    
T  676 catactttcgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaagccaacacgatacgccaccattccaaccctttccgatat 775  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||     
T  776 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttct 875  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  876 tgaaactcaagatcttttctatgcttatcatgataactcttttgttgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaactttctcagtagttt 975  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  976 gttgaacaatctctggtcctaaaaccacactatcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaacatacaaagcctcaaaaggtgccat 1075  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||  ||||||||     
T  1076 tccaatactagaatgataactattattgtacgtgaactctatcaatagaagatgactatcccaagttccttcttgctcaagtacgcaaaccctcaacaag 1175  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||    
T  1176 tcctctagcgactgaatcgtcctttcggactgaccatatgtctgaggatgatacgccaaactcaatctcaacttagaacctaaagcctcctgcaaacttt 1275  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaattt 693  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1276 tccaaaatctagaagtaaatcttagatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaattt 1350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 411; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 1128 - 451
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| |||||||| ||| | ||||| || ||||||||  ||||| ||||| |||||||  | ||    
T  1128 catacttccgaagttgcgacacatgtaatacatcatgcaatttcgaaagttgctgtggtaatccaactcgatattccacctttccatctttttcttatat 1029  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||     
T  1028 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaa-acgtggtctccttct 930  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||    
T  929 tggaactcaagatcttttctacgcttttcatgataactcttttgtcgactctgtgacgcttccatcttctcttgaatcatcttaactttctcggtagttt 830  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  829 gttgaacaatctctggtcctaagatgactctttcacctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccat 730  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    ||||||||| ||||||||  | ||||| || |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  729 tccaatactggaatgataattgttattgtacgtgaactctatccatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaacactcaacaaa 630  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||    
T  629 tcctctagcaactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgctgatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctctttcaaacttt 530  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  529 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcctt 451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 409; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 409; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Original strand, 14039 - 14711
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || |||| || |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  14039 catacttcggaagttgcgacacatgaaacacatagttcaaattcgaaagatgcggtggtaatctcactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 14138  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    || |||  ||||||| ||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||     
T  14139 ctcatacagaccaataaatctcggagtcaactactttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactatcaaaaacatgtggtctccttct 14238  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||  |||||||    
T  14239 tgaaactcaagatctctcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttcttggtagttt 14338  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  14339 gctgaacaatctatggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccat 14438  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  14439 tccaatactagaatgataactattattatacgtgaactatatcaatggaagatgactttcccaagttcctccttactcaagaacacaaaccctcaacaaa 14538  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    || |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||||    
T  14539 tcttctaacgactgaatcgtcctctccgactgagcatctgtttgcggctgatacgccgaactcaacctcaacttagaatctaaagcctcttgcaaacttt 14638  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  14639 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaatgaacaccatgcaacttcacaat 14711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 237 - 700
Target Start/End: Original strand, 17660 - 18122
Alignment:
Q  237 ctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtc 336  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  17660 ctacgcttatcattataacacttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttcttagtagtctgctgaacaatctctggtc 17759  T
Q  337 ctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgata 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17760 ctaagaccactctttcacctgactcaa-ccaacacaacgaagttctacatctctgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgata 17858  T
Q  437 gctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaatt 536  Q
     |||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  17859 actattattttatgtgaactcgatcagtggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagtgactgaatt 17958  T
Q  537 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 636  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17959 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaa 18058  T
Q  637 atcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 700  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||    
T  18059 atcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccgtgtaacctcacaatctccttgat 18122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Original strand, 31410 - 32082
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||||||||||||||||||   || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| |||||||   | ||  | ||    
T  31410 catacttccgaagttgcgacacaaaaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaacctatcagatat 31509  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| | | ||||||| |||||| || | ||| ||     
T  31510 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcatagaagtaactctcagaaacacatgatatccctct 31609  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||  | || |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| || |||  ||||||||  |||||||  |||||||    
T  31610 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactattctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctatgtagttt 31709  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | ||||| |  || | ||| || || || ||||| ||| ||||||||||||| || |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  31710 gatgaaccaaatccgatcccaacacaacgctttctcctaactcaaaccagcataaaggagtcatgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 31809  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
      ||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||| | ||||| ||||    
T  31810 atcaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccactttgctcaagtacacacactctcagcaaa 31909  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||  || || || |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||| |    
T  31910 tcctctaatgattggatcgtcctctccgactgacaatctgtttgcggatgataagctgaactcaaccccaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactct 32009  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  32010 tccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaactccatgcaacttcacaat 32082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 623 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 18557 - 18489
Alignment:
Q  623 aaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  18557 aaatctagaagtaaatcttggatctctatatgatacaatgcttgaaggaacaccatgcaacttcacaat 18489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 397; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 397; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 999 - 328
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||||||||||||  |||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||| | | ||    
T  999 catacttccgaagttgctccacatgaaacacatcctgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccacacgatacgccaccgttccaactcttttcgatat 900  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||  ||||||||||| |||||||||||||||     
T  899 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacacgagggactctcaaaa-cacgtggtctccttct 801  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||    
T  800 tgaaacttaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttctcggtagttt 701  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||    
T  700 gttgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttttgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgtcat 601  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  600 tccaatactagaatgataactattattatacgtgaactctatcaatgggagatgattatctcaagttccttcttgctcaagaacacaaaccctcaacaaa 501  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    || |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||| || || |||||||||||||||||||    
T  500 tcttctaacgactgaatcatcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacaccgaactcaacctcagcttagaacctaaagcctcttgcaaacttt 401  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| |||||| | |||||||||    
T  400 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatcacacacaatgctcgaaggaataccatgcaacttcacaat 328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 397; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 397; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 691
Target Start/End: Original strand, 5229 - 5893
Alignment:
Q  27 cgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatg 126  Q
    ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||  | ||||||||      
T  5229 cgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcagtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttctgatatctgataca 5328  T
Q  127 gaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactc 226  Q
    ||||||| ||  |||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||||||| | ||||||    
T  5329 gaccaataaatctcggagtcgacttccttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatatgtggtctccttctttaaactc 5428  T
Q  227 aagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaaca 326  Q
    ||||||||| || || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||    
T  5429 aagatctttcctgcgtttaccatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttttcagtagtttgctgaaca 5528  T
Q  327 atctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatac 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  5529 atctctggtcctaagaccactctttcacctgaatcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccattccgatac 5628  T
Q  427 tagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctag 526  Q
    | |||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| || |||||    
T  5629 tggaatgataactattattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacgcaaactctcaacaagtcttctag 5728  T
Q  527 cgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaat 626  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || |||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||    
T  5729 cgactgaatcgtcctctccgactaacaatctgtctacagatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaat 5828  T
Q  627 ctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  5829 ctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 5893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 389; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 389; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Original strand, 9343 - 10015
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  9343 catactttcgaagttgcgacacatgaaacacatagtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatat 9442  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    ||||||  ||||||| ||  | || |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||||||     
T  9443 ctgatacagaccaataaatctaggagtcaccttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaacaatacgtggtctccttct 9542  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||| | ||| |||||||    
T  9543 tgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgccttcatcttctcttgaatcatcttaacctactcggtagttt 9642  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  9643 gttaaacaatctctggtcctaaaaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacagagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgtaaggtgccct 9742  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||  ||||| || |||||| || ||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||     
T  9743 tccaatactagaatgataactatcattgtacgtgaactttatcaatggtagatgattaaccctagttcctccttgctcaagtacacaagctctcaacaag 9842  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||||||||| |    
T  9843 tcttctagcgactgaatcgtcctctccgactgatcatctgtttgcggatgatacgctgaactcaacctcaacttagaacgtaaagcctcttgcaaactct 9942  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  9943 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 10015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 385; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Original strand, 229043 - 229715
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | || ||||| ||||||||||||||| ||||| || | ||| || ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  229043 catacttccgaagttgcgacacatgaaacatatcgtgcatattcgaaagatgcggtggtaaccctattcggtacgccaccgttccaactctttccgatat 229142  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||  ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| || || ||||||||     
T  229143 ctgatacggaccaacaaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtcccacaccagtaataggagtgactctcaaaaatacatgatctccttct 229242  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  229243 tgaaattcaaggtcttttctacgtttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 229342  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  229343 gttgaacaatctctggtcctaaaaccacactttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaaacctcataaggtgccat 229442  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  229443 tccaatactagaatgataactattattgtacgtgaactctatcaatggaagatgaatatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaag 229542  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||||| ||||||||| || || ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| || ||||| || || ||| |||||||||||||||    
T  229543 tcctctaacgactgaatcgttctttccgactgaccatttgtctgcgaatgatacgccgaactcaaccttaacttagaacctaaatcctcttgcaaacttt 229642  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  229643 tccaaactctataagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 229715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 219723 - 219051
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||| ||||||||||||| | ||||  | ||    
T  219723 catacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtgttaatcccacttgatacgccaccgttccaattctttctgatat 219624  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||     
T  219623 ctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaacgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtgatcttcttct 219524  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  219523 tgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 219424  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | ||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| || |  |||| |||| |||| || ||||||||    
T  219423 gttgaacgatttctggtcctaaaaccacactctcacctgacttgaaccaacacaacggagttctgcaccttcttccattcaaaacctcaaatggtgccat 219324  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| || ||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  219323 tccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaattctataaacggaagatgattatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaag 219224  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||||| ||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |    
T  219223 tcctctaacgaatgaatcgttctcttcgactgaccatctgtctgcggatgataccccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactct 219124  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  219123 tccaaaatctagaagtaaaccttggatctctatttgatacaatgctcgaaggaacaccatgtcacttcacaat 219051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 144 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 33176 - 32667
Alignment:
Q  144 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 243  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| || ||||| |||| |||  | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  33176 gtcaacttcttacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggtttcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 33077  T
Q  244 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtccta--ag 341  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| || || || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  ||||| ||||  |     
T  33076 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttttcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttctgggcctaacaa 32977  T
Q  342 accactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctat 441  Q
    | ||||||    || ||||||||||| |||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||  || |||||||| || ||||||| |||| | || |    
T  32976 agcactct----ccggactcaaaccaacacaacggtgttctacacctcctaccatacaaagccttaaatggtgccataccgatactagcatgaaaactgt 32881  T
Q  442 tattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcct 541  Q
    | || ||||| ||||| | |||||| | |      |||||  |  | |||||||| |  ||||||  |||||||||||| || |     ||||| |||||    
T  32880 tgttgtaagtaaactcaaccaacggtaaacattcgtcccacctaacaccttgctccaacacacaagatctcaacaaatcttccaaactttgaatagtcct 32781  T
Q  542 ctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatctt 641  Q
    ||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| ||     
T  32780 ctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaactttgttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctc 32681  T
Q  642 ggatctctatctga 655  Q
    ||||| | ||||||    
T  32680 ggatcccgatctga 32667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 364; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 691
Target Start/End: Original strand, 49506 - 50165
Alignment:
Q  32 ttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggacca 131  Q
    |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| | |||||||| || |||    
T  49506 ttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacgggcca 49605  T
Q  132 atgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagat 231  Q
    || ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||| |||| ||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||| |    
T  49606 ataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaacaatcacaggagtgactctaaaaaatatgtggtctccttcttgaaactcaaggt 49705  T
Q  232 cttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctc 331  Q
    |||| |||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||| | || ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  49706 ctttcctacgcttatcatgataaatcttttgccaactctgcgacgctttcctcttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgttgaacaatctc 49805  T
Q  332 tggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaa 431  Q
      ||||||| || || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  49806 gagtcctaaaacaaccctttaacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctctgaccatacaaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 49905  T
Q  432 tgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgact 531  Q
    ||||| |||||||| || |||||| | ||||| ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||  |||||    
T  49906 tgataactattattgtacgtgaacactatcaatggaggataactatcgaaagttcctccttgctcaagtacacaaactcttaacaaatcttcttacgact 50005  T
Q  532 gaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctaga 631  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50006 gaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctaga 50105  T
Q  632 agtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  50106 agtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcaaaggaacaccatgcaacttcacaat 50165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 538 - 697
Target Start/End: Original strand, 19121 - 19280
Alignment:
Q  538 tcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaa 637  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19121 tcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaa 19220  T
Q  638 tcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 697  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  19221 tcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcctt 19280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 597 - 697
Target Start/End: Original strand, 34604 - 34704
Alignment:
Q  597 cccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcct 696  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  34604 cccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcct 34703  T
Q  697 t 697  Q
    |    
T  34704 t 34704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 360; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 697
Target Start/End: Original strand, 180217 - 180877
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||||||||||||||||| || || ||||  || ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |||| |||| ||||  | ||    
T  180217 catacttccgaagttgcgacacttgaaagacatcatgaaaattcgaaagatgcggtggtaagccaactcgatacgccactgttctaactctttctgatat 180316  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||| ||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||| | |||||||||||||| || || || ||     
T  180317 ctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcaggtccaacaccagtcaccggagtaactctcaaaaacacatgatcaccctct 180416  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||| |    
T  180417 tgaaactcaagatcctttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttctcaatagtct 180516  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||    
T  180517 gctgaacaatatctggtcctaagaccactctttctcctgactcaaaccaacacaatggagttctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgtcat 180616  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  180617 tccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacccaaactctcaacaaa 180716  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||||||                  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  180717 tcctctag------------------cgactgaccatctgtctgctgatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactgt 180798  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 697  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  180799 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatccgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcctt 180877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 413 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 101464 - 101186
Alignment:
Q  413 tgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctc 512  Q
    |||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||    
T  101464 tgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctc 101365  T
Q  513 aacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgca 612  Q
    |||||||||||||  || || ||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  101364 aacaaatcctctaatgattggatcatcctctctgactgaccatctatctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgca 101265  T
Q  613 aacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  101264 aactcttccaaaatcttgaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgatggaactccatgcaacttcacaat 101186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 357; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 15385 - 14713
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||  | ||    
T  15385 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccgttccaattctttctgatat 15286  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    ||||||  ||||||| ||| |  | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | || ||||||||||| | || || |||||||||    
T  15285 ctgatacagaccaattaaccttagagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaagatacatgatctccttcc 15186  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  15185 tgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgatgctttcatcttttcttggatcaacttaaccttctcagtagttt 15086  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | ||||| || |||||||| || || || || ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| || || ||||||||    
T  15085 gttgaacgatatctggtcccaaaactacactctcacctgactcgaaccaacacaacgaagttctgcacctccgaccatacagagcttcaaatggtgccat 14986  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  14985 tccaatactagaatgataactattattgtacgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaag 14886  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||| |  |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||| || || ||| |||||||||||||||    
T  14885 tcccccggcgactgaatcgttctctccgactgaccatctgtccgcgggtgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaatcctcttgcaaacttt 14786  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| | || |||||||||||||||||||||||    
T  14785 tccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgataaaatgtttgacggaacaccatgtagcttcacaat 14713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 349; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 33058 - 32387
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  33058 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatat 32959  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||| ||  |||  |||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||| | || ||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  32958 ctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttaacttcaatgcaagtccaacaccagtcacaagagtgactctcaaaaatacgtgatctccttct 32859  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||| || ||||| || ||||| ||||||| ||| |||| ||||||||    
T  32858 taaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgaccctacgatgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttcttagtagttt 32759  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | |||||||| ||||| ||||| ||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||    
T  32758 gttgaacaatttctggccctaaaaccacactcccacctgactcaaaccaacacaacggagttcttcatctccgatcatacaaagcctcaaaagatgccat 32659  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  32658 tccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaag 32559  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    || |||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| |    
T  32558 tcttctaacgactggatcgttctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccaaactcaacctcaacttagaacctaaagcttcttgcaaactct 32459  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||||||||| | |||||||||    
T  32458 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatttgatac-attctcgaaagaacaccatgcaacttcacaat 32387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 347; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 270 - 700
Target Start/End: Original strand, 12738 - 13168
Alignment:
Q  270 tgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagc 369  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  12738 tgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctaactcaaaccaac 12837  T
Q  370 acaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaag 469  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  12838 acaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcaatcaacggaag 12937  T
Q  470 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 569  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12938 atgtctatcccaagttcctccttgctcaagaacacacactctcagcaaatcctctagtgactaaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 13037  T
Q  570 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 669  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13038 taagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 13137  T
Q  670 gaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 700  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  13138 gaacaccatgtaacttcacaatctccttgat 13168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 337; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 26025 - 25353
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||  | ||    
T  26025 catacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccacggttccaattctttctgatat 25926  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||| ||| || | || |  ||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||| || |||| |||||||    
T  25925 ctgatacggaccaataaacatccgagttagtttccttgacttcaatgcacgtccaaccccagtcataggagtgactctaaaaaatacatggtttccttcc 25826  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||||||||  || || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| | || ||| |||||||||||||    
T  25825 tgaaactcaaagtccttcctacgcttatcatgataattcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttggattaacttaaccttctcagtagttt 25726  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    ||||||| || |||||||| || || || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||  || ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  25725 gctgaacgatatctggtcccaaaactacactctcacctgactcgaaccaacacaacggagttctacacttctgaccatacaaagcttcgaatggtgccat 25626  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||     
T  25625 tccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttccaccttgctaaagtacacaaactctcaacaag 25526  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||| | |||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |    
T  25525 tcctccaacgactgaattgttctttcagactgaccatctgtctccggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactct 25426  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25425 tccaaaatctagaagtaaaccatggaactctatctgacacaatgctcgacggaacaccatgtagcttcacaat 25353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 337; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Original strand, 14877 - 15549
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||| | ||||  | ||    
T  14877 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgcggtggtaagcccactcggtacgccaccgttccaattctttctgatat 14976  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
     ||||| |||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||| || || ||||||||     
T  14977 ttgatacggaccaataaacctcggagtcaacttatttgacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtgactatcaaaaatacatgatctccttca 15076  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  15077 tgaaactcaaggtctttcctaagcttatcatgataactcatatgtcgactctgagacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 15176  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  15177 gttgaacaatttctggtcctaaaaccacactctcacctgactcgaaccaacacaatggagttctgcacttcctaccatacaaagcctcaaatggtgccat 15276  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||| || |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||     
T  15277 tccaatactggaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaatggaagatgattatcccaagttcctccttgctcaagtacacaacctctcaacaag 15376  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||  | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |    
T  15377 tccttcaacgactgaatcgttctctccgactgaccatctgtctgaggatgatatgtcgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactct 15476  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  15477 tccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaactttacaat 15549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 459 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 113353 - 113121
Alignment:
Q  459 atcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctg 558  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||| ||| |||| || ||||| |||||||||||||    
T  113353 atcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacgcaaactctcaacaaatcttctagagaccgaatcgttctctctgactgaccatctg 113254  T
Q  559 tctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatac 658  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  113253 tctgcggatgacacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaattaaatcttggatctctatctgatac 113154  T
Q  659 aatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  113153 aatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 113121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 333; Significance: 0; HSPs: 6)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 26839 - 26167
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||   ||||  | ||    
T  26839 catacttccgaagttgcgacacatcaaacacatcatggaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccgtttcaatcctttctgatat 26740  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| || ||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||| |||| | ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  26739 ctgatacgggccaataaacctcggagtcaacttctttcacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtaactctcaaaaatacgtgatctccttcc 26640  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  26639 tggaactcaaggtctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 26540  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | |||||||| | | ||||||| ||||| || |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| || |  |||||||||||||| ||||||| |||    
T  26539 gttgaacaatttattgtcctaaaaccacactctcacctaactcgaaccaacacaacggagttctgcaccttcttccatacaaagcctcaaaaggtgtcat 26440  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  26439 tccaatgctagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaacagaacatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaag 26340  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    || || |   ||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |    
T  26339 tcttccaataactgaatcgttttttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactct 26240  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26239 tccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaat 26167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 196008 - 195338
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| |||||||| || ||  | ||    
T  196008 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccttctctgatat 195909  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | || |||| ||| || || || || |||    
T  195908 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaa-acatgatcaccctcc 195810  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||||  ||||||||  |||||||| ||||| |    
T  195809 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgtctctacgacgctttcatcttctctatgatcatcttgactttctctgtagtct 195710  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | ||||| |  || ||||| || || || || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  195709 gatgaaccaagtccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatataaagcttcgaacggtgccat 195610  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||||| | ||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| | |||||  |||    
T  195609 accaatactcggatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaggtacacacactctcagtaaa 195510  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||  |  || || || |||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || | ||||||||| |    
T  195509 tccttcaaagattgtatcgtcctctccgac-gaccatctgtctgaggatggtaagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatgttgcaaactct 195411  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||    
T  195410 tccaaaatcttgaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggtacaccatgcagcttcacaat 195338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 19 - 687
Target Start/End: Original strand, 148570 - 149238
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||| ||||  || ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  148570 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacctactctgtatgccactgttccaaccctctctcatat 148669  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||| || || || || ||     
T  148670 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcaccctct 148769  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |  |||| |||  | |||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||| || ||    ||||||   ||||||||  |||| |    
T  148770 tagaacttaagggcctttctacggttgtcatggtaactcttccgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcctgactttctctatagtct 148869  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | ||||| |  || ||||| || || || || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| || |||||    
T  148870 gatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaaggttcgaacggagccat 148969  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||||| ||||| || ||  | || || |||||||| ||||| || || ||||||||||||  ||| ||||| ||||| ||||| | |||||  |||    
T  148970 accaatactcgaatggtaactgctgttgtatgtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaacctccaccttgttcaagcacacacactctcagtaaa 149069  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||| |  || || || ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||   ||||||||| ||||| || ||||||| ||| |    
T  149070 tcctccaatgattggatcgtcctttccgactgaccatctttctgaggatgataagccgaactcaactccaacttcgaacccaatgcatcttgcagactct 149169  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttca 687  Q
    |||||||||||||||| || || ||||| ||||| || | ||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  149170 tccaaaatctagaagtgaacctcggatccctatccgacataatactcgacggtacaccatgtagcttca 149238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 68746 - 68577
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  68746 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctcagatat 68647  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagga 188  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  68646 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcatagga 68577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 144 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 122131 - 121841
Alignment:
Q  144 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 243  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || ||||| |||| |||| | || |||||||| || || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  122131 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 122032  T
Q  244 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 343  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| || || ||| |||  || ||||  || | |||||| |     
T  122031 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatgttaaccttttccgtaatttcttgcacaacttccgttcctaacaa 121932  T
Q  344 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatga 434  Q
     || ||||| || || |||||||| |||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||| || || |||| ||| ||||||||||||    
T  121931 aacactttccccggattcaaaccaacacaacggtgttctacacctcctaccatacaaagcctcaaacggagccaatccgatactagaatga 121841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #6
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 246 - 466
Target Start/End: Original strand, 180151 - 180371
Alignment:
Q  246 tcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagacca 345  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  |  |||||||| |  |    
T  180151 tcatgataactcttctgtctactctgagacgacttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttgcggtcctaacaaaa 180250  T
Q  346 ctctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattatt 445  Q
    | ||||| || ||||||||||| ||||| || || || || |||| ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| | || || ||    
T  180251 cactttctccggactcaaaccaacacaatggtgtcctacacctcctaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagaatgaaaactgttgtt 180350  T
Q  446 ataagtgaactcgatcaacgg 466  Q
     ||||| ||||| ||||||||    
T  180351 gtaagtaaactcaatcaacgg 180371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 333; Significance: 0; HSPs: 5)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Original strand, 112021 - 112693
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||  | ||    
T  112021 catacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccgttccaattctttctgatat 112120  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||| ||| | || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  112121 ctgatacggaccaataaacctgggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacatggtctccttcc 112220  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||||||||| || ||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||  |||| || |||||||||| || ||| |||||| ||||||    
T  112221 tgaaactcaaggtccttcttacgcttatcatgatatctcttttgtcgactctgtgatgctatcatcttttcttggatcaacttaaccttctcaatagttt 112320  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | ||||| || |||||||| || || || || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || || |||| |||    
T  112321 gttgaacgatatctggtcccaaaactacactctctcctgactcgaaccaacacaacggagttctgcacctccgaccatacagagcttcaaatggtgtcat 112420  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    | |||||||||||||||| || |||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  112421 ttcaatactagaatgataactgttattgcatgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaag 112520  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||| | ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||| || || ||||||||||||||||| |    
T  112521 tcctccaacgactgaatcgtccttttcgactgaccatctgtctacggatgatacgccgaactcaacttcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactct 112620  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  112621 tccaaaatctagaagtaaacctcagatctctatctgatacaatgcttggcggaacaccatgtagcttcacaat 112693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 277; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 203774 - 203102
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||   | ||    
T  203774 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactgttccaactcttttagatat 203675  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||  |||| |||| | || ||||||| | |||||| |||||||||||     
T  203674 ctgatacggaccaataaacctcggcgtcaacttctttggcttcaaagcacggccagcacctgtcacaagagtgactcttagaaacacatggtctccttct 203575  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| || |||   || | || ||| || |  ||||| |    
T  203574 tgaaattcaaggtctttcctgcgcttatcgtgataaatcttctgtcgactctgcgacgctttcatattttctcttattagcttaaccttttatgtagtct 203475  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | |||||||| |  ||||| || || || || ||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  203474 ggtgaacaatattcggtcccaacactacactctcacccgactcaaaccaacataacagagttctgcacctccgaccatacaaagctttgaatggtgccat 203375  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    ||| ||||||||||| || || || || || |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  203374 tcctatactagaatggtaacttttgttgtacgtgaactctatcagcggtagatgactatcccaagtcccaccttgctcaagtacacaaactctcaacaaa 203275  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||  | | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  203274 tcctctaatggcagaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaacgcctcttgcaaacttt 203175  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  203174 tccaaaatctacaagtaaatcttggatctctatttgacacaatgctcgacggaacaccatgtagcttcacaat 203102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Original strand, 117568 - 118240
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||| | ||    
T  117568 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctccgatat 117667  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||  ||||||||| | || |||| ||| || || || || |||    
T  117668 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcccacactcgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcc 117767  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||  ||||||||  |||||||| ||||| |    
T  117768 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactttgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctccgtagtat 117867  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | ||||| |  || ||||| || || || || || |||||||||||||| || || |||||  | || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  117868 gatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccaacataaaggagtcttacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 117967  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||||| ||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || ||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||    
T  117968 accaatactcgaatggtaactattgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactataccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaa 118067  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||  || ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| |    
T  118068 tcctctaatgattgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaaggcatcttgcaaactct 118167  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  118168 tccaaaatcttgaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgatggtacaccatgtagcttcacaat 118240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Original strand, 322704 - 323376
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||  ||||||||  | ||  | ||    
T  322704 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccattgttccaaccctctctgatat 322803  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||| || || || || |||    
T  322804 ctgatatggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcaccctcc 322903  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||  |||||||| ||||| |    
T  322904 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctccgtagtct 323003  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | ||||| |  || || || || || || || || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  323004 gatgaaccaaatccggacccaacacaacactctctcctgattcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgatcatacaaagcttcgaacggtgccat 323103  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||    
T  323104 accaatactggaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcagtaaa 323203  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||| |  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |    
T  323204 tcctccaaagattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccaaactcagcctcaacttcgaacccaaggcgtcttgcaaactct 323303  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||| ||||| || | ||| ||||| || |||||||| | |||||||||    
T  323304 tccagaatctagaagtgaacctcggatccctatccgacaaaatactcgacggtacaccatgcaacttcacaat 323376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #5
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Original strand, 385819 - 386491
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||||||| | ||  | ||    
T  385819 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaactctctcagatat 385918  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    ||| |||| ||| || |||||||| |||||||||||  ||||||| ||||  |||||||| ||| ||||| ||||||||| ||| |  || ||||| ||     
T  385919 ctggtatgaacctataaacttcggagtcaacttcttatacttcaacgcacaacctacacccgtcgtaggagtgactctcagaaatagatgatctccctct 386018  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||    ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||| || |||   ||||||| ||| ||||| ||||| |    
T  386019 tgaaactcaagggtctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtggactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttaaccttctccgtagtct 386118  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
      ||||| |  |||||||| || || || ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||  |||||||    
T  386119 aatgaactaaatctggtcccaacactacactttctcccgactcaaaccaacacaatggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttagaacagtgccat 386218  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||    
T  386219 accaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaa 386318  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| |    
T  386319 tcctctaacgactgaatcgttatctccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaaggcatcttgcaaactct 386418  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    ||||||| || ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  386419 tccaaaaccttgaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaaccccatgcaacttcacaat 386491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 325; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Original strand, 908 - 1580
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||| |||||||||||| || || ||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||| | ||||  | ||    
T  908 catacttccaaagttgcgacacgtgaaacacatcatgcatattcgaaagatgcggtggtaaacccaatcgatatgccactgttccaattctttctgatat 1007  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||  |||| |||||| | ||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  1008 ctgatatggaccaataaacctcggattcaatttctttcatttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaatacatggtctccttcc 1107  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| || || || |||||||||  || ||  |||||||||||||    
T  1108 tgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcaaatctgcgacgctttaatcttttcttggatccacttaatcttctcagtagttt 1207  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    ||||||| || |||||||| || || || || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  1208 gctgaacgatatctggtcccaaaactacactctcacctgactcaaaccaacacaacagagttctgcacctccaaccatacaaagcttcgaatggtgccat 1307  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||| ||||||| || ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||| ||||||| ||||||||||    
T  1308 tccaatactaaaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaacggaagatgactatctcaagttccaccttattcaagtacacaaactctcaacaaa 1407  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||| | |||||||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  1408 tcctccaacgactgaattgttcttttcgactaaccatctgtctgcggatgatacaccgaactcaacttcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactct 1507  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  1508 tccaaaatctagaagtaaaccttggatctctatctgacacaatgttcgatggaacaccttgtagcttcacaat 1580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 325; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 679
Target Start/End: Original strand, 1005 - 1659
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||| ||||| | ||    
T  1005 catactttcgaagttgcgttacatgaaagacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaacgttccaactctttccgatat 1104  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    | |||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||  |||||||||| || || || ||||||||     
T  1105 ccgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggggtgactctcaagaatacatgatctccttct 1204  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||| ||||  ||| ||| ||| |||||||||||||    
T  1205 ttgaactcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgccgactctgcgacgatttcactttttctta-atcgtcttaaccttctcagtagttt 1303  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | ||     ||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1304 gttg-----tctctggtcctaaaaccacattctcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccat 1398  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||  || |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||    
T  1399 tccaatactagaatgataaatgttatagtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaaattcctcctttctcaagtacacaaactcttaacaaa 1498  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    || |||| ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||| |    
T  1499 tcttctaacgactaaatcgttctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactaaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactct 1598  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 679  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1599 tccaaaatctagaagtaaaactaagatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 1659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 325; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 687
Target Start/End: Original strand, 4032 - 4699
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | ||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||   ||||  | ||    
T  4032 catacttccgaagttgcgacacatgaaacaaatcatgcaaattcgaaagatgcggtagtaaacccacttgatacgccaccgttccaatcctttctgatat 4131  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| || || ||||||||     
T  4132 ctgatatggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacatgatctccttct 4231  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    | ||||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  4232 taaaactcaaggtctttcctacgcttatcatagtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttggatcatcttaaccttctcagtagttt 4331  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
      ||||| || ||||||||||| || || || |||||||| || ||||| ||||||| ||||||||| || |  |||||||||||||| || ||||||||    
T  4332 attgaacgatttctggtcctaaaactacactctcacctgattcgaaccaacacaacgaagttctgca-cttcttccatacaaagcctcaaacggtgccat 4430  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||| ||     
T  4431 tccaatactagaatgataattgttattgtacgtgaactctattaatggaagatgactatcccaagtttctccttgctcaagtaaacaaactctcaagaag 4530  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||  | ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||||| |    
T  4531 tccttcaacgactgaatcgtcctctccgaccgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttataacctaaagcctcttgcaaactct 4630  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttca 687  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4631 tccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttca 4699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 325; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Original strand, 3140 - 3812
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| || ||    
T  3140 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaaacccactcgatacgccaccgttccaattctttcaaatat 3239  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| | |||||| ||| |||  |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| || || ||||||||     
T  3240 ctgatacgaaccaataaacctcgaagtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacatgatctccttct 3339  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  3340 tgaaacttaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttcatcttttcttggatcatcttaaccttctcagtagttt 3439  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | || || || ||||| || ||    || || |||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  3440 gttgcacgatttctggccccaaatttacactctcacttgactcaaactaacacaatggagttctgcatctccggccatacaaagcctcgaatggtgccat 3539  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    ||||||||||||||| || || ||||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||||     
T  3540 tccaatactagaatggtaactgttattgtacatgaactctattaacggaagatgactatcccaagtttctccttgctcaagtacagaaactctcaacaag 3639  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    || |  | ||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |    
T  3640 tctttcaacgactaaatcgttctttccgactgaccatttgtctgcagatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactct 3739  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  3740 tccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 3812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 311; Significance: 1e-175; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 19 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 127505 - 126911
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||  | ||    
T  127505 catacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcatgtaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccattccaactctttctgatat 127406  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| ||| |||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||     
T  127405 ctgatacggatcaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtgatctccttct 127306  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  127305 tggaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctggaacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 127206  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  127205 gttgaacaatttctggtcctaaaaccacactctcacctgacttaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccat 127106  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| || | |||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  127105 tccaatactagaatgataactgttattgtacgcgaactctatcaatggacgatgactatcccaagtccctccttgctcaagtacacaaactctcaacaag 127006  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaa 613  Q
    |||| || ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||| || |  ||||||||||||||    
T  127005 tcctataacgactgaatcgttctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgttgaactcaacctcaacttagaacataaagcctcttgcaa 126911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 500 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 80319 - 80128
Alignment:
Q  500 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 599  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  80319 aacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctctccgaatgaccatctgtccgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaaccc 80220  T
Q  600 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  80219 aaagcctctttcaaactcttccaaaatctttaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctctaaggaacaccatgcaacttcacaat 80128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894 (Bit Score: 310; Significance: 1e-174; HSPs: 2)
Name: scaffold0894
Description:

Target: scaffold0894; HSP #1
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 19 - 568
Target Start/End: Original strand, 1139 - 1688
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  1139 catacttccgaagttgcaacacataaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatat 1238  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| ||| |||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  1239 ctgatacggaacaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtcgaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaatacgtggtctccttct 1338  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| ||| ||||| |||||||    
T  1339 tgaaactcaagatctttcctacacttatcatggtaacttttttgtcgactctgcgacgctttcatcttatcttgaatcatcttaaccttctcggtagttt 1438  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  1439 gttgaacaatctctagtcctaagaccactctttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctacatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccat 1538  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  1539 ttcaatactagaatgataactattattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaa 1638  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatg 568  Q
    || || | ||| || || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  1639 tcttccaacgagtgcatcgtcctctccaactgaccatctgtctgctgatg 1688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 559 - 691
Target Start/End: Original strand, 2914 - 3046
Alignment:
Q  559 tctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatac 658  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2914 tctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatac 3013  T
Q  659 aatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  3014 aatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 3046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 309; Significance: 1e-174; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 117211 - 116539
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| || ||||  ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||  | ||    
T  117211 catacttccgaagttacgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaatatacggtggtaaacccactcgatacgccaccgttacaattctttctgatat 117112  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
     ||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| | ||| | || ||||||||||||| || || |||| |||     
T  117111 ttgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacactattcacatgagtgactctcaaaaatacttgttctctttct 117012  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  117011 tgaaactcaaggtctttcctacgtttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttcatcttttcttggatcaacttaaccttctcagtagttt 116912  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    ||||||| || | |||||| || || || || ||||||||||| ||||| |||||| |||| || || ||||||||||||| | | || || |||| |||    
T  116911 gctgaacgatttatggtcccaaaactacactctcacctgactcgaaccaacacaacagagtcctacacctccgaccatacagaacttcaaatggtgtcat 116812  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||     
T  116811 tccaatactagaatgataactgttattgtacgtcaactctatcaacggaagatgactaacccaagttcctccttgctctagtacacaaactctcaacaag 116712  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||| | |||| |||| || || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |    
T  116711 tcctccaacgacggaatcgttcttttcgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactct 116612  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  116611 tccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgacgaaacaccatgtagcttcacaat 116539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 144 - 616
Target Start/End: Original strand, 98140 - 98612
Alignment:
Q  144 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 243  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || ||||||||| | || || ||||||||||| || ||  | |||||||||| ||| || || | ||    
T  98140 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcataggattcacccttaaaaacacgtgatcaccaacttgaaactcaatatccttactcctct 98239  T
Q  244 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 343  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  ||||||||||| |     
T  98240 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttctggtcctaacaa 98339  T
Q  344 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 443  Q
     || || || || ||||||||||| |||||||| || || || ||||||||||||||| |||| || ||| |||| || ||||||| |||| | || ||     
T  98340 aacactctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaaacctcaaacggtaccataccgatactagcatgaaaactgttg 98439  T
Q  444 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 543  Q
    ||  |||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  98440 ttgaaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 98539  T
Q  544 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaact 616  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  ||||||||||    
T  98540 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaact 98612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 304; Significance: 1e-171; HSPs: 3)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 96 - 691
Target Start/End: Original strand, 9047 - 9642
Alignment:
Q  96 accgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactc 195  Q
    |||||||||| | ||||  | ||||||||  ||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||| ||||||    
T  9047 accgttccaattctttctgatatctgatacagaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaacgcacgtccaacaccggtcacaggagtgactc 9146  T
Q  196 tcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggat 295  Q
    ||||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  9147 tcaaaaatacatgatccccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttggat 9246  T
Q  296 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 395  Q
     |||| ||| ||||||| |||||| |||||||| |||||| |||| ||||  || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || | ||||    
T  9247 tatcttaaccttctcagcagtttgttgaacaatttctggtgctaaaaccagactctcacctgaatcaaaccaacacaacggagtcctgcaccttctacca 9346  T
Q  396 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 495  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9347 tacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactgttattgtatgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgct 9446  T
Q  496 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 595  Q
    |||| |||||||  |||||||| || || | ||| ||||| || || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||    
T  9447 caagtacacaaaccctcaacaagtcttccaacgattgaatcgttctttccgactgacaatctgtctgcggatgatatgccgaacttaacctaaacttaga 9546  T
Q  596 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
     || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9547 acctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaaccttggatctctatctgatacaatgctcgaatgaacaccatgtagcttcacaat 9642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 514 - 351
Alignment:
Q  144 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 243  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || |||| ||| | |||| | |||||||| ||||| || || ||  |||||||||||| ||| || || | ||    
T  514 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacactagttacaggattcactctcaagaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatccttcctcctct 415  T
Q  244 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaacttt 307  Q
    | |||||||||||||| || | |||||| || || ||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  414 tatcatgataactcttctgcctactctgagatgctttcatcttctcttgaatcatcttaacttt 351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 348 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 331 - 216
Alignment:
Q  348 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 447  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||| | || || || || |||||| |||||||||| || |||||||| || |||||||||||| | || || || |    
T  331 ctttcacctgaatcaaaccaacataaccgcgtcctacaccttcgaccacacaaagcctcaaatggtgccataccgatactagaatgaaaactgttgttgt 232  T
Q  448 aagtgaactcgatcaa 463  Q
    |||| ||||| |||||    
T  231 aagtaaactcaatcaa 216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 300; Significance: 1e-168; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 196 - 691
Target Start/End: Original strand, 15832 - 16327
Alignment:
Q  196 tcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggat 295  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| || | ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||    
T  15832 tcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcgaggtatttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaat 15931  T
Q  296 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 395  Q
    ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15932 cattttaactttctcagtagtttgttgaacaatctcgtgtcctaaaaccaccctttcacctaactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 16031  T
Q  396 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 495  Q
     | ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16032 aaaaaagcctcataagatgccattccaatactagaatgataaatattattgtacgtgaacactatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgct 16131  T
Q  496 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 595  Q
    |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  16132 caagtacacaaactctcaacaagtcctctagcgactgaattgttctctccgactgaccatctgtctgaggatgatacgccgaactcaacctcaacttaga 16231  T
Q  596 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  16232 acctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtatatcttggatctctatatgatgcaattctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 16327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 19 - 356
Target Start/End: Original strand, 15493 - 15829
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || |||| |||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  15493 catacttccgaagttgcgacccatgaaacacatcgtgcaaattcgaaa-atgtggtggtaaacctactcgatatgccaccgttccaactctttccgatat 15591  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| | |||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||| ||||||| ||||||||||||||     
T  15592 ctgatacgaaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaagaatgactgtcaaaaatacgtggtctccttct 15691  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||| || | ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  15692 tgaaactcgaggtatttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcattttaactttctcagtagttt 15791  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacct 356  Q
    | |||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||    
T  15792 gttgaacaatctcgagtcctaaaaccaccctttcacct 15829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 297; Significance: 1e-166; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 16722 - 16050
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||  |||| |||||| |||||| | ||||  | ||    
T  16722 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtacaaattcgaaagatgcggtggtaaacctacatgatacgccaccattccaattctttctgatat 16623  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    || ||| |||||||| ||  |||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||  ||| |||| || ||||| || || ||||||||     
T  16622 cttatacggaccaataaatctcggtgtcaacttcttcgacttcaatgcacgtccaacaccaatcactggagtgaccctaaaaaatacatgatctccttct 16523  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||   |||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  16522 tgaaatataagatcctccctacgcttatcatgataactcttttgtcgagtctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 16423  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | |||||||| |||| || ||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||   |||||||||||||| || |||| |||    
T  16422 gttgaacaatttctgttcttaaaaccacactctcacctgactcgaaccaacacaacggagttttgcacctcgttccatacaaagcctcaaatggtgtcat 16323  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    | |||||||||||||||| |||||||| || ||||| || || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||     
T  16322 tgcaatactagaatgataactattattgtacgtgaattctattaatggaagatgactatcccaagtccctccttgctcaagtacgcaaactctcaacaag 16223  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||| | ||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||||| || || ||||||| ||||||||| |    
T  16222 tcctccaacgactgaatcgttctctccgactgaccatttgtctgcggatgatacgccgaacttaacctcaacttagaacctaaagcctattgcaaactct 16123  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16122 tccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaat 16050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 292; Significance: 1e-163; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 292; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 19 - 694
Target Start/End: Complemental strand, 25377 - 24702
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||| | ||    
T  25377 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactgttccaactctttccgatat 25278  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |  ||||| ||| || | ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||| |||| ||||||| | |||||| ||||||||| |     
T  25277 ctgatacgagccaataaacctcagcgtcaacttcttcgatttcaaagcacgaccaacacctgtcacaggagtgactcttagaaacacatggtctcctgct 25178  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||   || | || ||| || || ||||| |    
T  25177 tgaaattcaagatctttcctacgtttgtcgtgataagtcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctcttattagcttaaccttttctgtagtct 25078  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | |||||||| || ||||| || || || |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||| |||    
T  25077 ggtgaacaatatccggtcccaacactacactttcacccgactcaaaccaacagaacggagttctgcacctccgaccatgcaaagcttcgaatggtgtcat 24978  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     | ||||||||||||||| || || || || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  24977 ccaaatactagaatgataactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagtcccaccttgcttaagtacacaaactctcaacaaa 24878  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  24877 tcctctaacgactgaatcattctctccgactgaccatctgtttacggatgataagccgaactcaacctcaacttagatcccaacgcctcttgcaaacttt 24778  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttc 694  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||    
T  24777 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctcaatctgacacaatgctcgacggaacaccatgcaactacacaatttc 24702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 290; Significance: 1e-162; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 120 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 985 - 628
Alignment:
Q  120 tgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcct 219  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  985 tgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcagtgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctaaaaaatacgtggtctccttcct 886  T
Q  220 gaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttg 319  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  885 taaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttcattttctcttgaatcatctgaactttctcagtagtttg 786  T
Q  320 ctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccatt 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  785 ctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaatggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccatt 686  T
Q  420 ccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactat 477  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  685 ccaatactagaacgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactat 628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 282; Significance: 1e-157; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 20 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 13282 - 12633
Alignment:
Q  20 atacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatc 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || ||||  || |||||| |||| || || ||||||||||||| ||| || ||| |||| | | ||||  | |||    
T  13282 atacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgtaaattcaaaagttgtggtggtaaacccactccatacgctaccattcccattctttctgatatc 13183  T
Q  120 tgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcct 219  Q
    ||||| | || ||| ||  |||  ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  13182 tgatacgaactaataaatctcgaagtcaatttcttagacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaataacacatggtctccttctt 13083  T
Q  220 gaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttg 319  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13082 gaaattcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttggatcatctaaactttctcagtagtttg 12983  T
Q  320 ctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccatt 419  Q
    ||||| ||| |||||||| || ||  | || | ||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  12982 ctgaagaatttctggtcccaaaactgcactctaacctgactcgaaccaacacaatggagtcctacacctccgaccatacagagcttcgaatggtgccatt 12883  T
Q  420 ccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaat 519  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |    
T  12882 ccaatactagaatggtaactgttattatatgtgaactctatcaacgggagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagt 12783  T
Q  520 cctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactttt 619  Q
    | || | |||||| || || || ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||  ||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  12782 cttccaacgactgtatcgttctttccgactgaccatctatctgcggatgatacgctgaactgaacatcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactctt 12683  T
Q  620 ccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 669  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  12682 ccaaaatctagaagtaaacctcagatctctatctgatacgatgctcgaag 12633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0730 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 1)
Name: scaffold0730
Description:

Target: scaffold0730; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 5896 - 5225
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||| || || || |||||| |||   ||||    
T  5896 catacttccgatgttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaaactcactctatacgcaactgtcccaactctttatgaaat 5797  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
     ||||| | |||| | ||| |||| | ||  ||||| ||||| |  || ||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||| || |||||||||||     
T  5796 atgatacgaaccattaaacctcggagacagtttcttcgactttagtgctcgtccaacaccggtcacaggagtgactctcaaaaatacatggtctccttct 5697  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||   |||| || ||| ||||| || ||||    
T  5696 tgaaactcaagatccttt-tgcgcttatcatgataactcttttgtctactctgcgacgctttcatcttctctctaatcaacttaaccttctctgttgttt 5598  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | |||||||| || |||||||  |||||  | ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||    
T  5597 gttgaacaatttcaggtcctagtaccacattctcaccggactcataccaacacaacggagttctgcatctccgaccaaacaacgcttcgaacggtgtcat 5498  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    |||||| |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  5497 tccaatgctagaatggtaactgttattatacgtgaactcaatcaatggaagattactatcccaagttcctccttgctcgagtacacaaactctcaacaaa 5398  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||| | ||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||| ||| || ||||| ||||| |||||||  |    
T  5397 tcctcgaacgaatgaattgtcctctctgtctgtccatcggtctgcggatgatacgtcgaactcaaactcagcttagaacccaacgcctcctgcaaaccct 5298  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5297 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatactcgacggaacaccatgtagcttcacaat 5225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 306 - 679
Target Start/End: Original strand, 6336 - 6709
Alignment:
Q  306 ttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcct 405  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6336 ttctcagtagtttgttgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaatggagttctgcatctccgaccatacaaagcct 6435  T
Q  406 cgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacaca 505  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6436 catagggtgccattccaatactagaatgataactgttattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacaca 6535  T
Q  506 aattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcc 605  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  | ||||||    
T  6536 aaccctcaacaaatcttctaacgactgaatcgtcctctccgactgactatctatttgcggatgatatgccgaactcaacctcaacttagaatctaaagcc 6635  T
Q  606 tcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 679  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  6636 tcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatggtcgaaggaacaccatg 6709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 19 - 79
Target Start/End: Original strand, 6273 - 6333
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaa 79  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  6273 catacttccaaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaa 6333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 7)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 218 - 694
Target Start/End: Complemental strand, 4561 - 4085
Alignment:
Q  218 ctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtt 317  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| ||  || |||||||||    
T  4561 ctgaaactcgagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaagcttgtcagtagtt 4462  T
Q  318 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcca 417  Q
    || |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||  ||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  4461 tgttgaacaatttctggtcctaaaaccacactctcacctgactcgaaccaacacaaaggagttctacaaatccaaccatacaaagcctcaaatggtgcca 4362  T
Q  418 ttccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 517  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||  ||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||| | ||||| |||||||||    
T  4361 ttccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaactatatcaatggatgatgactagcccaagttactccttgctgaagtaaacaaactctcaacaa 4262  T
Q  518 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 617  Q
    |||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||     
T  4261 atcctctaacgactgaatcgttctctccaactgaccatctgtgtgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactc 4162  T
Q  618 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttc 694  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4161 ttccaaaatctataagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaatttc 4085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 403 - 691
Target Start/End: Original strand, 130532 - 130820
Alignment:
Q  403 cctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaac 502  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  130532 cctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactgttattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcatccttgctcaagaac 130631  T
Q  503 acaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaa 602  Q
    ||| |  |||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||    
T  130632 acataccctcagcaaatcttctaacgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaa 130731  T
Q  603 gcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  130732 gcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaat 130820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 237 - 691
Target Start/End: Original strand, 58972 - 59426
Alignment:
Q  237 ctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtc 336  Q
    |||||||  |||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||| |||||    |||| || ||| ||||  |||||||  |  ||||| || ||||    
T  58972 ctacgctgatcatgataacgcttttgtctactctacgacgctttcatcttctcccaaatcaacttaaccttctgtgtagttttttcgacaatttccggtc 59071  T
Q  337 ctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgata 436  Q
    |||  |||||  | | ||| || ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||    
T  59072 ctagtaccacattcttaccggattcataccaacacaatggagttctgcatctccgaccatacaatgcttcgaatggtgccatcccaatgctagaatggta 59171  T
Q  437 gctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaatt 536  Q
     || ||||| ||  ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  59172 actgttattgtacatgaactcgatcaatgagagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcctccaacgactgaatt 59271  T
Q  537 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 636  Q
    |||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||    
T  59272 gtcctctctgtctgcccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaaactcaacttagaacccaacgcctcctgcaaactctcccaaaatctagaagtaa 59371  T
Q  637 atcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| || |||||    
T  59372 atcttggatctctatctgatacaatacttgacggaacaccatatagttttacaat 59426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 541 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 29163 - 29008
Alignment:
Q  541 tctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatct 640  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29163 tctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaag-aaatct 29065  T
Q  641 tggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  29064 tggatctctatctgatacaatgctcaaaggaacaccatgcaacttcacaatctcctt 29008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 403 - 505
Target Start/End: Original strand, 134626 - 134728
Alignment:
Q  403 cctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaac 502  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  134626 cctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactgttattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcatccttgctcaagaac 134725  T
Q  503 aca 505  Q
    |||    
T  134726 aca 134728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 33 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 4717 - 4567
Alignment:
Q  33 tgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaa 132  Q
    ||||||| ||| || ||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| | | |||||| |||||||    
T  4717 tgcgacagatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcgatggtaaacccactcgatacgccaccgttccaattctttccgatacctgatacggaccaa 4618  T
Q  133 tgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtca 183  Q
    | ||  |||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  4617 taaatctcggagtaaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtca 4567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 37052 - 36974
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccac 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||| |||| |||| ||||| || ||| |||| |||||    
T  37052 catacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgtaagaggcggtggtaatccaactagatacgccac 36974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0600 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 1)
Name: scaffold0600
Description:

Target: scaffold0600; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Original strand, 3875 - 4547
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||  |||||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  3875 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtaagccactgttccaacactctcagatat 3974  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||| || ||||| ||     
T  3975 ctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgtcataggagtgactatcagaaacacatgatctccctct 4074  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||| ||||| || |||   |||||||  || ||||| ||||| |    
T  4075 tgaaactcaaggactttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgattctccgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtct 4174  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | ||||| |  |||||||| || || || ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  4175 gatgaactaaatctggtcccaacactacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagtcctgcacctccgaccatacgaagcttcgaacggtgccat 4274  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     ||||||||  |||| || || || || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | | ||||||||    
T  4275 accaatactcaaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactatcaacaaa 4374  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| |    
T  4375 tcctctaacgattgaatcgttctctccgactgaccatctctctgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaatgcatcttgcaaactct 4474  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    ||||||| || ||||| || || |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  4475 tccaaaaccttgaagtgaacctcggatctctttccgacacaatactcgatggaacaccatgcaacttcacaat 4547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 333 - 691
Target Start/End: Original strand, 10 - 368
Alignment:
Q  333 ggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaat 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  10 ggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacataatgaagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgtcattccaatactagaat 109  T
Q  433 gatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactg 532  Q
    |||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || || |||||    
T  110 gataactattattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcttcaagagactg 209  T
Q  533 aattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaa 632  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  210 aatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaaggctcttgcaaactcttccaaaatctagaa 309  T
Q  633 gtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  310 gtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 250; Significance: 1e-138; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 19 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 11045 - 10425
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || || ||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||  | ||    
T  11045 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacattatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaatccactctatatgccactgttccaactttctcagatat 10946  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||| ||| |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||     
T  10945 ctgatatggaccaataaacctcggtgtcaacttcttcgatttcaaggcacgacctatacctgtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttct 10846  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    || ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   ||||  ||  | ||||| ||||| |    
T  10845 tgtaactcaagatcctttctacacttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctcttatcaattg-gccttctctgtagtct 10747  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | ||||| || |||||||| || |  || |||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  10746 gttgaactatatctggtcccaacattacactttcacccgactcaaaccaacgtaacggagttctgcacctccgaccacacaaagcttcgaacggtgccat 10647  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||||| ||||| || || || || || || ||| | |||||||  |  ||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||    
T  10646 accaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtaaacactatcaacgacaagtgactattccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaa 10547  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  10546 tcctctaacgactaaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagctgaactcaatctcaactttgaacccaacgcctcttgcaaacttt 10447  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatct 640  Q
    || |||||||||| ||||||||    
T  10446 tcgaaaatctagatgtaaatct 10425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 8)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 91238 - 90566
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||| ||||  || ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  91238 catacttccgcagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacctactctgtatgccactgttccaaccctctcagatat 91139  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    || |||||||| ||| ||||| |  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||||| | ||||||| |||||| || ||||| ||     
T  91138 ctaatatggactaataaactttgaagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcgtaggagtaactctcagaaacacatgatctccctct 91039  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||  | || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||   |||||||  |||||||| ||||| |    
T  91038 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctccgtagtct 90939  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | ||||| |  |||||||| ||  | || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  90938 gatgaactaaatctggtcccaacgctacactttctcctgactcaaaccaacataaaggagttctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 90839  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  90838 accaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcagcggtagatgactatcccaagctccaccttgctcaagaacacacactctcagcaaa 90739  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||   |||||  | ||||||||||| |    
T  90738 tcctctaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcacacccaagccatcttgcaaactct 90639  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  90638 tccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgatacaatactcgacggaaccccatgcaacttcacaat 90566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 20 - 475
Target Start/End: Original strand, 448060 - 448515
Alignment:
Q  20 atacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatc 119  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||| | ||||| | ||     
T  448060 atacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccacttgatgcgccaccgttccaattctttccgatatt 448159  T
Q  120 tgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcct 219  Q
    ||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||  ||| | |||| ||||||| ||||| ||||| |||||||| |    
T  448160 tgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgctcgtccaacaatagttacaggagtgactctaaaaaatacgtgatctccttctt 448259  T
Q  220 gaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttg 319  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| || ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  448260 gaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgatagctcttctgtcgactctgcgacactttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttg 448359  T
Q  320 ctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccatt 419  Q
     |||||||| |||||||  || ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |  |||||||||||||| || |||||||||    
T  448360 ttgaacaatttctggtcaaaaaaccacactctcacctgactcgaaccaacacaacggagttctgcaccttcttccatacaaagcctcaaatggtgccatt 448459  T
Q  420 ccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgact 475  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| |||||||| || |||||    
T  448460 ccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaacgggaggtgact 448515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 459 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 391066 - 390834
Alignment:
Q  459 atcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctg 558  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  391066 atcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcctctaacgactgaatcgttctttccgactgaccatctg 390967  T
Q  559 tctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatac 658  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  390966 tctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctttatctgatac 390867  T
Q  659 aatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    ||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  390866 aatgctcgatggaacaccatgcaacttcacaat 390834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 19 - 282
Target Start/End: Original strand, 162113 - 162376
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||  | ||    
T  162113 catacttctgaagttgcgaaacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaactctttctgatat 162212  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| || ||||| ||  |||| ||||| |||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||     
T  162213 ctgatacgggccaataaatctcggagtcaagttctttgacttcgacgctcgtccaacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctacttct 162312  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttca 282  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  162313 tgaaacacaagatcttttttacgcttatcatgataactcttttgttgactctgcgacgctttca 162376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 381 - 634
Target Start/End: Original strand, 114542 - 114795
Alignment:
Q  381 ctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccc 480  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||  | ||||| || |||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  114542 ctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgagtggtaagtgttattgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatccc 114641  T
Q  481 aagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaact 580  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||||||| |  || || || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  114642 aagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtaaatcctccaatgattggatcgtccactccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaact 114741  T
Q  581 caatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagt 634  Q
    ||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||||||    
T  114742 caacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttccaaaatctagaagt 114795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #6
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 117 - 187
Target Start/End: Original strand, 175361 - 175431
Alignment:
Q  117 atctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 187  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  175361 atctgatacggaccaataaacttcgggatcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacacccgtcatagg 175431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #7
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 606 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 89973 - 89888
Alignment:
Q  606 tcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  89973 tcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgatacaatactcgacggaaccccatgcaacttcacaat 89888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #8
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 144 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 78810 - 78666
Alignment:
Q  144 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 243  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| | || | |||||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  78810 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactcctgtcacatgattcactctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 78711  T
Q  244 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttct 288  Q
    | |||||||||||||| |||| | |||| || |||||||| ||||    
T  78710 tatcatgataactcttctgtctaatctgagatgccttcatcttct 78666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 19 - 688
Target Start/End: Complemental strand, 42639 - 41970
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||| | ||  ||||    
T  42639 catacttccgaagttgcgacacatggaacacatcaagcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaactctctctgaaat 42540  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||| ||||||||| ||||||||| | || |||| ||| || || || || |||    
T  42539 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacttcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcc 42440  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||| || |||  ||||||||  |||||||| ||||| |    
T  42439 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttcagtcgactctgcgacgcttccatcttttctctgatcatcttgactttctctgtagtct 42340  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | ||||| |  |  ||||| || || || || || ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  42339 gatgaaccaaatacggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 42240  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  42239 accaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaa 42140  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  42139 tcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaaactct 42040  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 688  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  42039 tccagaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcac 41970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 47705 - 47033
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||| | ||  ||||    
T  47705 catacttccgaagttgcgacacatggaacacatcaagcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaactctctctgaaat 47606  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||  ||||||||| ||||||||| | || |||| ||| || || || || |||    
T  47605 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcatttcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcc 47506  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||| || |||  ||||||||  |||||||| ||||| |    
T  47505 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttcagtcgactctgcgacgcttccatcttttctctgatcatcttgactttctctgtagtct 47406  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | ||||| |  |  ||||| || || || || || ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  47405 gatgaaccaaatacggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtccttcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 47306  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||  ||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||    
T  47305 accaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcttaagctccaccttgctcaagcacacacactctcagtaaa 47206  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  47205 tcctctaaagattgtatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcttgcaaactct 47106  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||| || |||||||| || |||||||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||||||    
T  47105 tccagaacctagaagtgaaccttggatccctatccgacacaatacttgacggtacaccatgcagcttcacaat 47033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 438 - 687
Target Start/End: Original strand, 2340 - 2589
Alignment:
Q  438 ctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattg 537  Q
    |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  2340 ctattattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactaccccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcctctaacgactgaatcg 2439  T
Q  538 tcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaa 637  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  2440 ttctctccgactgaccatctgtttgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttacaacctaaagcctcttgcacactcttccaaaatctagaggtaaa 2539  T
Q  638 tcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttca 687  Q
     || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2540 cctcggatctctatctgatacattgctcgaaggaacaccatgtagcttca 2589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 245; Significance: 1e-135; HSPs: 3)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Original strand, 19983 - 20655
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||    ||||||||||||||||| || || ||||||||||  || ||||| |||||||| || ||  | ||    
T  19983 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacgccatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccttctctgatat 20082  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||| || || ||||| ||     
T  20083 ctgatacggaccaatgaactttggagtaaacttcttcgacttcaacgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatctccctct 20182  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||    |||||||  | ||||||  |||| |    
T  20183 tgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgggacgctttcatcttttcccttatcatcttgagtttctctatagtct 20282  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | ||||| |  || ||||| ||||| || || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||    
T  20283 gatgaaccaaatccggtcccaagacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgtcat 20382  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20383 accaatactcgaatggtaacttttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagaacacaaactctcaacaaa 20482  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||| |  || || || ||||||||||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |    
T  20483 tcctccaatgattggatcgtcctctccgactaaacatctgtctgcggatgataaaccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactct 20582  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  20583 tccaaaatctagaagtgaacctcggatcgctatccgacacaatactcgacggaactccatgcaacttcacaat 20655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 13667 - 12995
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||| ||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||| | ||    
T  13667 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttctaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctccgatat 13568  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||| | ||| || || || || |||    
T  13567 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcc 13468  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||  | || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||  |||||||| ||||| |    
T  13467 tgaaactcaagggccttcctacgtttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtct 13368  T
Q  319 gctgaa-caatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcca 417  Q
    | |||| |||| || ||||| || || || || ||   ||||||||||||||| ||  |||| || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  13367 gatgaatcaat-tccggtcccaacacaacactctctattgactcaaaccagcataaatgagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgcca 13269  T
Q  418 ttccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 517  Q
    | |||||||| ||||  || || || || || |||||||| ||| |||| || ||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  ||    
T  13268 taccaatactcgaatagtaactgttgttgtatgtgaactctatctacggtaggtgactatcctaagctccaccttgctcaagcacacacactctcagtaa 13169  T
Q  518 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 617  Q
    |||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| || ||     
T  13168 atcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaatccaatgcatcttgtaagctc 13069  T
Q  618 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    ||||||||| ||||| | || || ||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  13068 ttccaaaatttagaaatgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 12995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 17437 - 16765
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||| ||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||| | ||    
T  17437 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttctaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctccgatat 17338  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | || || | ||| || || || || |||    
T  17337 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctaagaaatacatgatcaccctcc 17238  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||  | || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||  |||||||| ||||| |    
T  17237 tgaaactcaagggccttcctacgtttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtct 17138  T
Q  319 gctgaa-caatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcca 417  Q
    | |||| |||| || ||||| || || || || ||   ||||||||||||||| ||  |||| || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  17137 gatgaatcaat-tccggtcccaacacaacactctctattgactcaaaccagcataaatgagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgcca 17039  T
Q  418 ttccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 517  Q
    | |||||||| ||||  || || || || || |||||||| ||| |||| || ||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  ||    
T  17038 taccaatactcgaatagtaactgttgttgtatgtgaactctatctacggtaggtgactatcctaagctccaccttgctcaagcacacacactctcagtaa 16939  T
Q  518 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 617  Q
    |||||| |  || || || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| || ||     
T  16938 atcctccaatgattggatcgtccgctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaatccaatgcatcttgtaagctc 16839  T
Q  618 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    ||||||||| ||||| | || || ||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  16838 ttccaaaatttagaaatgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 16765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0739
Description:

Target: scaffold0739; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 19 - 492
Target Start/End: Original strand, 2 - 475
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||  |||||||| ||||| | ||    
T  2 catacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgaaaatttgaaagatgcggtggtaaaccaactcgatatgccactattccaactctttccgatat 101  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||| || |  || ||     
T  102 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaactttttttacttcaaagcacgtccaacaccagtcaccggattgactctcaaaaacacatgataaccctct 201  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||| |||||||||| |||| |    
T  202 tgaaactcaagatcctttctacggttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgactcatcttaactttctcaatagtct 301  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  302 gctgaacaatatctagtcctaagaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccaaccatataaagcctcaaaaggtgccat 401  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcctt 492  Q
    |||||||||||||| |||  | ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  402 tccaatactagaattataattgttattgtatgtgaactctatcaacggaagatggctatcacaagttccacctt 475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 3)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 19 - 661
Target Start/End: Original strand, 27519 - 28161
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || ||||  ||||||||| ||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  27519 catacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaaattcaaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgatat 27618  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    || ||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||| || ||||| |||    
T  27619 cttatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcgatgcacgtcctacacctgtcataggagtaactctcagaaacacatgatctccctcc 27718  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||  |||||||| ||||| |    
T  27719 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctttgatcatcttgactttctctgtagtct 27818  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | |||||    |||||||| || || || ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  27819 gatgaaccgaatctggtcccaacacaacactttctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaaacttcgaacggtgccat 27918  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||||| ||||| || || || || || ||||| || |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | |||||  |||    
T  27919 accaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaattctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcagtaaa 28018  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||| |  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |    
T  28019 tcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcagcctcaacttcgatcccaaggcgtcttgcaaactct 28118  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaat 661  Q
    ||||||||||| |||| || || |||||||||||||| |||||    
T  28119 tccaaaatctataagtgaacctcggatctctatctgacacaat 28161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 687
Target Start/End: Complemental strand, 1454 - 787
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  | ||||||||||||||| ||    ||||| |||   || ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  1454 catacttccgaagttgcgacacatgaaatacatcattcaaattcgaaagatgtggtttcaaacctactttttatgccactgttccaaccctctcagatat 1355  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||| || ||||| ||     
T  1354 ctgatacggaccaat-aacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacccgtcataggaatgattctcagaaacacatgatctccctct 1256  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||  | || |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| || |||   |||||||  |||||||  ||||| |    
T  1255 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttcttcgtagtct 1156  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | ||||| |  |||||||| || |||||  |||| | |||||||||||| || |  ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  1155 gatgaactaaatctggtcccaacaccacattttctcttgactcaaaccaacatagaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggttccat 1056  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||||| ||||| || ||||| || ||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||| | ||||| || |    
T  1055 accaatactcgaatggtaactattgttgtacatgaactctatcaacggtagatgactatcccaagctccaccttgctcgagtacacacactctcagcaga 956  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| |    
T  955 tcctctaacgattgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggacgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgcaaactct 856  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttca 687  Q
    ||||||| || ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| | ||||||||||| |||||    
T  855 tccaaaaccttgaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgatgaaacaccatgtaacttca 787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 537 - 661
Target Start/End: Original strand, 34290 - 34414
Alignment:
Q  537 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 636  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||| |    
T  34290 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcagcctcaacttcgatcccaaggcgtcttgcaaactcttccaaaatctataagtga 34389  T
Q  637 atcttggatctctatctgatacaat 661  Q
    | || |||||||||||||| |||||    
T  34390 acctcggatctctatctgacacaat 34414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 7342 - 6670
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||  |||||||| ||||||||| | ||  | ||    
T  7342 catacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtaagccactgttccaactctctcagatat 7243  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||| | || |||| |||||| || ||||| ||     
T  7242 ctggtatggaccaatgaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgtcataggagtaaccctcagaaacacatgatctccctct 7143  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||   |||| ||  || || || |||||||    
T  7142 tgacactcaagggcttttctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatattttctcttatcaacttgaccttttctgtagttt 7043  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | ||||| |  |||||||| || ||||| |||||    ||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||  |||    
T  7042 gatgaactaaatctggtcccaacaccacactttctgtcgactcaaaccaacacaattgagttctgcacctccgaccatacaatgcttcgaacggtatcat 6943  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||||| ||||| ||  | || ||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||    
T  6942 accaatactcgaatggtaattgttgttatacgtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaa 6843  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||||| || |||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |    
T  6842 tcctctaacggctgaatcgttctctccgactgaccatttgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcctcttgtaaactct 6743  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    ||||||| || ||||| || ||  |||||||||| || |||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  6742 tccaaaaccttgaagtgaacctcagatctctatccgacacaatgttcgatggaaccccatgtaacttcacaat 6670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Original strand, 9798 - 10465
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||| ||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  9798 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcaaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctcagatat 9897  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||||| || ||||| ||     
T  9898 ctgataaggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgtcctacacccgccataggagtaactctcagaaacacatgatctccctct 9997  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||||||| |     | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||   |||||||  || ||||| ||||| |    
T  9998 tgaaactcacg-----tcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtct 10092  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | ||||| |  |||||||| || ||||| ||||| || | ||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  10093 gatgaactaaatctggtcccaacaccacactttctcccgtctcaaaccaacataaaggagttctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 10192  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||| | ||| | ||||| ||||    
T  10193 accaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagctccaccttgttcaagtagacacactctcagcaaa 10292  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||| |    
T  10293 tcctctaacgattgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaaggcatcttgaaaactct 10392  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  10393 tccaaaatcttgaagtgaaccttggatctctatccgacacaatactcgatggaactccatgcaacttcacaat 10465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 33983 - 33311
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||||| |  |||||||| ||||| || |  ||||||||||||||||| || || |||||||| | ||||||||| || || ||| | ||  | ||    
T  33983 catacttccgcaactgcgacacgtggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggcaaacccaccctataagccactgtcccgactctctcagatat 33884  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||     
T  33883 ctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatgatctccctct 33784  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcatt--ttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 316  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||   |||||||  || | || ||| || || |||||    
T  33783 tgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatccgttctctt--attaacttaaccttttccgtagt 33686  T
Q  317 ttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcc 416  Q
    ||| ||||| || |||||||| || | ||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||||    
T  33685 ttgttgaactatgtctggtcccaacatcacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagttctgcaccttcgaccatacaaggcttcaaacggtgcc 33586  T
Q  417 attccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaaca 516  Q
    || |||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||| |    
T  33585 ataccaatactcgaatggtaactattgttgtaagtaaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacaccctcaata 33486  T
Q  517 aatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaact 616  Q
     ||||||||  || || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  33485 gatcctctaaggattgtatcgttctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaatttcgagcccaaagcatcttgcaaact 33386  T
Q  617 tttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
     ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  33385 cttccagaatctagaagtgaacctcggatctctatctgatacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaat 33311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 144 - 679
Target Start/End: Original strand, 40383 - 40918
Alignment:
Q  144 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 243  Q
    ||||||||| |  |||| |||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  40383 gtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 40482  T
Q  244 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 343  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || || || || |     
T  40483 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggcccaaacaa 40582  T
Q  344 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 443  Q
      | ||||| || || |||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||| |||| | || ||     
T  40583 agcactttctccggattcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagcatgaaaactgttg 40682  T
Q  444 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 543  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| ||||| |    
T  40683 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtccttt 40782  T
Q  544 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 643  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  40783 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 40882  T
Q  644 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 679  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  40883 atcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 40918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 233; Significance: 1e-128; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Original strand, 47124 - 47796
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  47124 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctcagatat 47223  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||| | || |||| |||||| || ||||| ||     
T  47224 ctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgttataggagtaaccctcagaaacacatgatctccctct 47323  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||   |||||||  |||||||| ||||| |    
T  47324 tgaaactcaagggccttcctacgcttttcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctccgtagtct 47423  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | ||||| |  || ||||| || || || ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||    
T  47424 gatgaactaaatccggtcccaacacaacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgtcat 47523  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||    
T  47524 accaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaa 47623  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||  || ||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| |    
T  47624 tcctctaatgattgaatcgttctctctgactgaccatttgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaatgcatcttgcaaactct 47723  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||||||||||||||| || || || |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  47724 tccaaaatctagaagtgaacctcgggtctctatccgacacaatactcgatggaactccatgcaacttcacaat 47796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 233; Significance: 1e-128; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 52169 - 51497
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||||||  ||||  | ||    
T  52169 catacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctttcagatat 52070  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    ||||||||||||| | ||||| || ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| || ||||| ||     
T  52069 ctgatatggaccactaaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcatgtcctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctct 51970  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||  | || |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| || ||||| || |||   |||||||  || ||||| |||||||    
T  51969 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgaagctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagttt 51870  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | ||||| |  || ||||| || || || ||||| || ||||||||||| ||||| |||||  |||| ||||||| ||||||||| ||||| |||| |||    
T  51869 gatgaaccaaatccggtcccaacactacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagtcatgcacctccgactatacaaagcttcgaacggtgtcat 51770  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| | ||||| ||||    
T  51769 accaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagctccaccctgctcaagtacacacactctcagcaaa 51670  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||  || |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||| |    
T  51669 tcctctactgattgaattgttctctccgactaaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaaccttaactttgaacccaatgcatcttgcaaactct 51570  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    ||||||||||| |||| || ||  |||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  51569 tccaaaatctaaaagtgaacctcagatctctatccgacacaatactcgatggaacaccatgtaacttcacaat 51497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 233; Significance: 1e-128; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 14207 - 13535
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || || || |||| ||| ||||| |||||||   ||||  | ||    
T  14207 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaacccaactctatatgccactgttccaatcctttctgatat 14108  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||| || || || ||     
T  14107 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaatttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactcttaaaaacacatgatccccctct 14008  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||    |||||||  |||||||||||||| |    
T  14007 tgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgactttctcagtagtct 13908  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | ||||| |  || ||||| || || || || || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  13907 gatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcatctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccat 13808  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     | |||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  13807 actaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccactttgctcaagcacacacactctcaacaaa 13708  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||| | ||| || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| |    
T  13707 tcctccaacgattggatcgttctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaatgcatcttgcaaactct 13608  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||||||||| ||||| || ||  |||  ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  13607 tccaaaatcttgaagtgaacctctgattcctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 13535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 54 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 5224 - 4587
Alignment:
Q  54 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttct 153  Q
    ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||  | |||||||| |||||||||||||| || |||||||||     
T  5224 tgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 5125  T
Q  154 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgata 253  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||| || || ||  | ||||||||||||||  | || |||||||||||||||||    
T  5124 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcatcctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgata 5025  T
Q  254 actcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttca 353  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||  |||||||| ||||| |  ||||| |  || ||||| || || || || ||     
T  5024 actcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtctaatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctct 4925  T
Q  354 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 453  Q
    | ||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||  |||| || || || || || ||||    
T  4924 cttgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagattcgaacggtgccataccaatactcaaatggtaactgttgttgtatgtga 4825  T
Q  454 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 553  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||| | |||||  |||||||| |  || || || |||||||||||||||||    
T  4824 actctatcaacggtaggtgactatcccaagctccacctttctcaagtacacacactctcagtaaatcctccaatgattggatcgtcctctccgactgacc 4725  T
Q  554 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 653  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| |||||| |||| || || ||||| |||||     
T  4724 atctgtctgaggacgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttccagaatctaaaagtgaacctcggatccctatcc 4625  T
Q  654 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    || | ||| ||||| || |||||||||||||| |||||    
T  4624 gacataatactcgacggtacaccatgtagctttacaat 4587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 546 - 691
Target Start/End: Original strand, 67897 - 68042
Alignment:
Q  546 gactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggat 645  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || || |    
T  67897 gactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaattttgaacccaatgcatcttgtaaactcttccaaaatcttgaagtaaacctcgggt 67996  T
Q  646 ctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    ||||||| || || || ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  67997 ctctatccgacactatactcgacggaacaccatgcaacttcacaat 68042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 29 - 691
Target Start/End: Original strand, 4760 - 5422
Alignment:
Q  29 aagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatgga 128  Q
    ||||||||||||||| || ||||  |||||||| |||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||||||  | ||  | |||| ||| |||    
T  4760 aagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaatttgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctcagatatcttatacgga 4859  T
Q  129 ccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaa 228  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||| | ||||||| ||| || || ||||| || ||||||||||    
T  4860 ccaatgaactttggagtcaatttcttagacttcaatgcacatcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatctccctcttgaaactcaa 4959  T
Q  229 gatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaat 328  Q
    |  | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||   |||||||  |||||||||||||| || ||||| |     
T  4960 gggcctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaa 5059  T
Q  329 ctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatacta 428  Q
     |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | || ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||     
T  5060 atctggtcccaacaccacactttctcctgactcaaaccattataaaggagttctgcacctctgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactc 5159  T
Q  429 gaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcg 528  Q
    ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||   |||||||||| ||    
T  5160 gaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcggaaaatcctctaacg 5259  T
Q  529 actgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatct 628  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||    
T  5260 attgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcagatgataagttgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttccaaaatct 5359  T
Q  629 agaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||||| || || | ||||||||| || ||||| ||||| || |||||||| | |||||||||    
T  5360 agaagtgaacctcgaatctctatccgacacaatactcgatggtacaccatgcaacttcacaat 5422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 230; Significance: 1e-126; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 342 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 8311 - 7963
Alignment:
Q  342 accactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctat 441  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  8311 accactctttcacctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactgt 8212  T
Q  442 tattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcct 541  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  8211 tattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacataccctcaacaaatcttctaacgactgaatcgtcct 8112  T
Q  542 ctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatctt 641  Q
    |||||||||||||| | |||  |||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8111 ctccgactgaccatttttctttggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgc-aacttttccaaaatctagaagtaaatctt 8013  T
Q  642 ggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  8012 ggatctctatctgacacaatgctcgacggaacaccatgcaacttcacaat 7963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 230; Significance: 1e-126; HSPs: 1)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Original strand, 6183 - 6856
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||||| | |||||||||||| || || |  ||||||||||||||| | |  || ||||| | || ||| ||||| ||||||| | ||||  ||||    
T  6183 catacttccgcaattgcgacacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagaagagatggcaaaccaaatctatatgccacagttccaaatctttctgaaat 6282  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa-aaacacgtggtctccttc 217  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | || ||||  ||| || ||||| |||||    
T  6283 ctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcaggaaaaacatggtcaccttc 6382  T
Q  218 ctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtt 317  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||  ||||||||||||||     
T  6383 ctgaaactcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctatgatcatcttgactttctcagtagtc 6482  T
Q  318 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcca 417  Q
    |  ||||| |  || ||||| || || || ||||| ||  |||||||| |||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  6483 tcatgaaccaaatccggtcccaacacaacactttctcccaactcaaacaagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgcca 6582  T
Q  418 ttccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 517  Q
    | |||||||| ||||| || ||||| || || ||||| || ||||| || || ||||||||||||  |||||| |||||||| ||||| || |||| |||    
T  6583 taccaatacttgaatggtaactattgttgtatgtgaattctatcaatggtaggtgactatcccaaactcctccctgctcaagtacacatatcctcagcaa 6682  T
Q  518 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 617  Q
    ||||||||  || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||  ||||     
T  6683 atcctctaaagattggattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaatttcgaacccaacgcatcttgtgaactc 6782  T
Q  618 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || || || ||||| || | |||||| | |||||||||    
T  6783 ttccaaaatctagaagtgaaccttgggtctctatcggacactatactcgaggggataccatgcaacttcacaat 6856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319 (Bit Score: 230; Significance: 1e-126; HSPs: 1)
Name: scaffold0319
Description:

Target: scaffold0319; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 306 - 691
Target Start/End: Original strand, 1552 - 1937
Alignment:
Q  306 ttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcct 405  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1552 ttctcagtggtttgttgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcct 1651  T
Q  406 cgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacaca 505  Q
    |  ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1652 cataaggtgccattccaacactggaatgataactattattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacaca 1751  T
Q  506 aattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcc 605  Q
    || |||||| ||||| || |   | |||||  |||||  |||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||    
T  1752 aactctcaaaaaatcatcaaaaaaatgaatcatcctcaacgacagaccatctatctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcc 1851  T
Q  606 tcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||    
T  1852 tcttgcaaacttttacaaaatctagaagtaaatcttggatctatatctgatacaatgtttgaaggaacaccatgcaacttcacaat 1937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Original strand, 27226 - 27897
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || || |||||||  || ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  27226 catatttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaatcccactctgtatgccacggttccaaccctctctgatat 27325  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||| | ||||||| ||| || || | ||| ||     
T  27326 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgacataggagtaactctcagaaatacatgatatccctct 27425  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||| |||||  |||  ||||||| |||||| |||||||| |||||||||| || ||| ||||| || |||   |||||||  |||||||| ||||| |    
T  27426 tgaaattcaaggccttc-ctacgctcgtcatggtaactcttctgtcgactctacggcgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctccgtagtct 27524  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | ||||| |  |||||||| || || ||  |||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  27525 gatgaaccaaatctggtcccaacacaacattttctcctgactcgaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 27624  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||    
T  27625 accaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaa 27724  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||| |  || || || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |    
T  27725 tcctccaatgattgtatagtcctctccgactgaccatctgtctacggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactct 27824  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  27825 tccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 27897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 225; Significance: 1e-123; HSPs: 2)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Original strand, 26142 - 26814
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||| ||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||||||| | ||  | ||    
T  26142 catacttccgaagttgcgacacatggaacacgtcatgcaaattcaaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaactctctcagatat 26241  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    ||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||     
T  26242 ctggtacggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacggcctacacccgtcataggagtgactctcaaaaacacatgatctccctct 26341  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| || || || |||   |||||||  || ||||| ||||| |    
T  26342 tgaaactcaagggcctttctacgcttgtaatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttgatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtct 26441  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | ||||| |  || | ||| || || ||  |||| || ||||||||||  ||||| |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  26442 gatgaaccaaatccgctcccaacactacattttctcccgactcaaaccgacacaaaggagtcttgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 26541  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||||||||||| || || || || || |||||||| |||||||| ||||||||||   ||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||    
T  26542 accaatactagaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactataaaaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaa 26641  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||| || || |    
T  26642 tcctctaacgactaaatcgttctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgtaagctct 26741  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    ||||||| || ||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||| | |||||||||    
T  26742 tccaaaaccttgaagtgaaccttggatctctatccgacacaatactcgatggtacaccatgcaacttcacaat 26814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 357 - 691
Target Start/End: Original strand, 26862 - 27196
Alignment:
Q  357 gactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaact 456  Q
    ||||||||||  ||||| |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||    
T  26862 gactcaaaccgacacaaaggagtcttgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatacttgaatggtaactgttgttgtacgtgaact 26961  T
Q  457 cgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatc 556  Q
    | |||||||| |||||||||||  ||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  26962 ctatcaacggtagatgactatctgaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaacgactaaatcgttctctccgactgaccatc 27061  T
Q  557 tgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgat 656  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||| || || |||||||| || ||||| || |||||||||||||| ||     
T  27062 tgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgtaagctcttccaaaaccttgaagtgaaccttggatctctatccgac 27161  T
Q  657 acaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    ||||| ||||| || |||||||| | |||||||||    
T  27162 acaatactcgatggtacaccatgcaacttcacaat 27196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 225; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 49513 - 48841
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||  ||||    
T  49513 catacttccgaagctgcgatacatgtaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataggccacagttccaaccctctctgaaat 49414  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||| |||| |||||| || || || ||     
T  49413 ctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcccacacccgtcataggaatgaccctcagaaacacatgatcaccctct 49314  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||  ||||||||  ||||| || ||||| |    
T  49313 tgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttttctgtagtct 49214  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
      ||||| |  |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  49213 catgaaccaaatctggtcccaacaccacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 49114  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     || ||||| ||||| || || || || || |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||| |||    
T  49113 acctatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaatggcaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaataaa 49014  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| |    
T  49013 tcctctaaagattgtatcgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactct 48914  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||| || |||||||| || || ||||  ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  48913 tccagaacctagaagtgaacctcggattcctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagctttacaat 48841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 225; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Original strand, 248613 - 249285
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||||||||||| ||||| || || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| |||||||||  |||||||||| ||  ||||    
T  248613 catacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataagccacttttccaactttctctgaaat 248712  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  248713 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 248812  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||| ||    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||    |||||||  ||||||| |||||| |    
T  248813 tgaaactctagggactttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgactttcttagtagtct 248912  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
      ||||| |  |  ||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| || || |||| |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  248913 catgaaccaagttcggtcccaacaccacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctcctaccatacaaagcttcgaacggtgccat 249012  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     || ||||| ||||| || || ||||| || |||||||| |||| ||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  249013 acctatactcgaatggtaactgttattgtatgtgaactctatcagcggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaa 249112  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||| | ||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| |    
T  249113 tcctccaacgattggatcgtcctctcagactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactct 249212  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||| || ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||||||    
T  249213 tccagaacctagaggtaaacctcggatccctatctgacacaatactcgacggtactccatgtagcttcacaat 249285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 19 - 482
Target Start/End: Original strand, 16987 - 17450
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||  | ||    
T  16987 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccacttgatacgccaccgttccaattctttctgatat 17086  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| | ||| | || ||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  17087 ctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacacaaatcacatgagtgactctcaaaaatacgtgatctccttct 17186  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| || ||||| ||||||| ||| ||| |||||||||    
T  17187 tgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacactttcatcttttcttgaatcatcttaaccttcacagtagttt 17286  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | ||||  || |||||||| || || ||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  17287 gttgaatgatttctggtcccaaaactacaatctcacctgactcgaaccaacacaacggagttctacacctccgaccatacagagcctcaaaaggtgccat 17386  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaa 482  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  17387 tccaatgctagaatgataactgttattgtacgtgaattctatcaacggaagatgactatcccaa 17450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 223; Significance: 1e-122; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 29075 - 28402
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |  ||||  ||||||||||| ||||| |  ||  ||||||||| ||| ||||| || |||||| | ||  | ||    
T  29075 catacttctgaagttgcgacacatgaagcacatcatgcaaattcgagagatgtgatgggtaacccactctatatgccactgtcccaactctctcagagat 28976  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    ||||||||||||||| |||   || |||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||| | || |||||||||||||||| |||||||||||     
T  28975 ctgatatggaccaataaaccgtggagtcaacttctttgacttcaaagcacgacagacacctgtcacatgagtgactctcaaaaacacatggtctccttct 28876  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg-atca-tctgaactttctcagtagt 316  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |   |||| | ||| |||| ||  ||||    
T  28875 tgaaactcaaggtcctttctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactttgcgatgctttcatcttctcctcttatcaatttgaccttt-tctatagt 28777  T
Q  317 ttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcc 416  Q
     || ||||| || | |||||| || ||  | || |||||  |||||||| |  | ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  28776 ctgatgaactatatatggtcccaacactgcactgtcacccaactcaaacaaagataacagagttctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgcc 28677  T
Q  417 attccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaaca 516  Q
    || |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||| ||||| | ||||| ||    
T  28676 ataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagcttcaccttgctcaagtacacatactctcagca 28577  T
Q  517 aatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaact 616  Q
    |||||||||  ||||| || || |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||| || ||||| |||||||||||| |    
T  28576 aatcctctaatgactggatcgttctctccaactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaaccccaacttagaacccaacgcctcttgcaaagt 28477  T
Q  617 tttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  28476 ttttcaaaatctagaagtaaatcttggatctctatccgacacaatgctcgacggaacaccatgcaacttcacaat 28402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 41066 - 40393
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |  ||||  ||||||||||| ||||| |  ||  ||||||||| ||| ||||| || |||||| | ||  | ||    
T  41066 catacttctgaagttgcgacacatgaagcacatcatgcaaattcgagagatgtgatgggtaacccactctatatgccactgtcccaactctctcagagat 40967  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    ||||||||||||||| |||   || |||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||| | || |||||||||||||||| |||||||||||     
T  40966 ctgatatggaccaataaaccgtggagtcaacttctttgacttcaaagcacgacagacacctgtcacatgagtgactctcaaaaacacatggtctccttct 40867  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg-atca-tctgaactttctcagtagt 316  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |   |||| | ||| |||| ||  ||||    
T  40866 tgaaactcaaggtcctttctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactttgcgatgctttcatcttctcctcttatcaatttgaccttt-tctatagt 40768  T
Q  317 ttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcc 416  Q
     || ||||| || | |||||| || ||  | || |||||  |||||||| |  | ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  40767 ctgatgaactatatatggtcccaacactgcactgtcacccaactcaaacaaagataacagagttctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgcc 40668  T
Q  417 attccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaaca 516  Q
    || |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||| ||||| | ||||| ||    
T  40667 ataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagcttcaccttgctcaagtacacatactctcagca 40568  T
Q  517 aatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaact 616  Q
    |||||||||  ||||| || || |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||| || ||||| |||||||||||| |    
T  40567 aatcctctaatgactggatcgttctctccaactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaaccccaacttagaacccaacgcctcttgcaaagt 40468  T
Q  617 tttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  40467 ttttcaaaatctagaagtaaatcttggatctctatccgacacaatgctcgacggaacaccatgcaacttcacaat 40393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 322 - 571
Target Start/End: Original strand, 46531 - 46780
Alignment:
Q  322 gaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattcc 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46531 gaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctcctaccatataaagcctcgaaaggtgccattcc 46630  T
Q  422 aatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcc 521  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  46631 aatactagaatgataactattattgtaagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaatcctcaacaaatcc 46730  T
Q  522 tctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgata 571  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  46731 tctagcgactgaattgtcctctccaactgaccatctgtctgtggatgata 46780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 19 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 86810 - 86154
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||||  || |  |||||||| ||||| ||||||||||||| ||| || ||||  |||||| ||||| ||||    
T  86810 catacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcatgtaggttcgaaagttgcggtggtaaacccactctatacgcaaccgacccaactctttccgaaat 86711  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
     ||||| || ||||| ||| |||  ||||  |||||||| || |  |||||||| ||||| |||| | || ||||||| |||||||| |||| ||||||     
T  86710 ttgatacgggccaataaacctcgaagtcagtttctttgattttagtgcacgtccaacaccggtcacaagagtgactctaaaaaacacatggtatccttct 86611  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||| || |||   |||| || ||| ||||||||||| |    
T  86610 tgaaactcaagatccttcctacgattatcatgataactcttttgtctactctgtgacgcttccatcttttctcttatcaacttaaccttctcagtagtct 86511  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | |||| ||| |||||||| |  |||||  | ||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||    
T  86510 gttgaaaaatgtctggtcccagtaccacagtctcaccggactcataccaacacaacagagttctgcatctccgaccatacaacgcttcgaacggtaccat 86411  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
    | |||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  86410 tgcaatgctagaatggtaactgttattataagtgaactcgatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaag 86311  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||| |  || |||||||||||||||| ||| ||| | ||||| ||||||||     | |||    |||||||  | ||||| ||||| |||||||| |    
T  86310 tcctccaatgattgaattgtcctctccgcctgtccacccgtctgtggatgata----cacctc--cgtcaacttataacccaacgcctcctgcaaactct 86217  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 681  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  86216 tcaaaaatctagaagtaaatcttgggtctctatttgatacaatactcgacggaacaccatgta 86154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 18843 - 18171
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||| ||||||| || || ||||||||||  || ||||| |||| |||  | ||  | ||    
T  18843 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcaaaagatgtggtggaaaacccactctgtatgccactgttctaaccctctctgatat 18744  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    ||||||   |||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||| || ||||| ||     
T  18743 ctgatacaaaccaataaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacatcctacacccgtcataggagtaactctcagaaacacatgatctccctct 18644  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||  | || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||   |||||||  |||||||| ||||| |    
T  18643 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctccgtagtct 18544  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | ||||| |  |||||||| ||  | || ||||| ||||||||||| || || || |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  18543 gatgaactaaatctggtcccaactctacactttctcctgactcaaatcaacataaaggagttttgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 18444  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| | | | | ||||    
T  18443 accaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagctccaccttgctcatgtacacacacttttagcaaa 18344  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||  || || || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| |    
T  18343 tcctctaatgattggatcgtcctcttcgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgcaaactct 18244  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||  || ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  18243 tccaaaatctagaagtgaaccttggatctctatacgacacaatactcgacggaactccatgaaacttcacaat 18171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Original strand, 39739 - 40410
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||||  ||||||||||| ||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  39739 catacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcatgcaaattcgagagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctcagatat 39838  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    | |||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |  || ||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||| || || ||||| |||    
T  39839 cggatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttgagtgcgcgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatctccctcc 39938  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||   || ||||  ||||||||  |||| |    
T  39939 tgaaactcaaggtcctttctacgcttgtcatagtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttataatcttgactttctcgttagtct 40038  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | ||||| |  || ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| ||| || ||   || |||    
T  40039 gatgaaccaaatccggtcccaataccacactttctcccgactcaaaccaacataaaggagt-ctgcacctccgaccatacagagcttcaaacattgtcat 40137  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||||| ||||| || || || || || |||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  40138 accaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaaaggtagatgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcaacaaa 40237  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |    
T  40238 tcctccaatgactgaatcgtcctctccgactgaccatctctttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactct 40337  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  40338 tccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaactccatgtaacttcacaat 40410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 3)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 61519 - 60848
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||| ||||||||  |||   | ||    
T  61519 catacttccgaagctgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactgttccaacccttttagatat 61420  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    ||||||  ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||| | || |||| ||| || || || || |||    
T  61419 ctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccatcataggagtaaccctcagaaatacatgatcgccctcc 61320  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||  ||||||||  |||||||| ||||| |    
T  61319 tgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctctgtagtct 61220  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
      ||||| |  |||| ||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  61219 catgaaccaaatctgatcccaacaccaccctctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 61120  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     || ||||| ||||| || || || || || |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||  ||    
T  61119 acctatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaaaggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaa-taa 61021  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| |    
T  61020 tcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctaaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactct 60921  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  60920 tccagaatctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaat 60848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 67907 - 67236
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||| ||||||||  |||   | ||    
T  67907 catacttccgaagctgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactgttccaacccttttagatat 67808  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    ||||||  ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||| | || |||| ||| || || || || |||    
T  67807 ctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccatcataggagtaaccctcagaaatacatgatcgccctcc 67708  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||  ||||||||  |||||||| ||||| |    
T  67707 tgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctctgtagtct 67608  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
      ||||| |  |||| ||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  67607 catgaaccaaatctgatcccaacaccaccctctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 67508  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     || ||||| ||||| || || || || || |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||  ||    
T  67507 acctatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaaaggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaa-taa 67409  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| |    
T  67408 tcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctaaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactct 67309  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  67308 tccagaatctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaat 67236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 52485 - 51814
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || || |  ||||| ||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||| ||||||||  |||   | ||    
T  52485 catacttccgaagctgcgacacatgaaacacgtcatgcaatttcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactgttccaacccttttagatat 52386  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    ||||||  ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||| | || |||| ||| || || || || |||    
T  52385 ctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccatcataggagtaaccctcagaaatacatgatcgccctcc 52286  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||  ||||||||  |||||||| ||||| |    
T  52285 tgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctctgtagtct 52186  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
      ||||| |  |||| ||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  52185 catgaaccaaatctgatcccaacaccaccctctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 52086  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     || ||||| ||||| || || || || || |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||  ||    
T  52085 acctatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaaaggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaa-taa 51987  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| |    
T  51986 tcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctaaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactct 51887  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51886 tccagaatctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaat 51814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 220; Significance: 1e-120; HSPs: 2)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 19 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 10389 - 9782
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||||| | |||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||  || |    
T  10389 catacttccgcaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaactctttctgaact 10290  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | || |||| ||| || || || || |||    
T  10289 ctgatatggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcc 10190  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||  ||||||||  |||||||| ||||| |    
T  10189 tgaaactcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgatgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtct 10090  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
      ||||| |  || ||||| || || || ||||| || ||| |||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  10089 catgaaccaaatccggtcccaacacaacactttctcccgacccaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaatggtgccat 9990  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  || | ||||    
T  9989 accaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacatacccttagcaaa 9890  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||  || || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || || || || ||||| || ||||| ||||| |    
T  9889 tcctctaaagattggattgtcctctccgactgaccatatgtctgcggatgataagccgaactcaaccttaattttgaacccaatgcatcttgtaaactct 9790  T
Q  619 tccaaaat 626  Q
    ||||||||    
T  9789 tccaaaat 9782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 585 - 691
Target Start/End: Original strand, 12060 - 12166
Alignment:
Q  585 ctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagct 684  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12060 ctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagct 12159  T
Q  685 tcacaat 691  Q
    |||||||    
T  12160 tcacaat 12166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 220; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 20 - 691
Target Start/End: Original strand, 42784 - 43455
Alignment:
Q  20 atacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatc 119  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||| ||| ||||||| || || ||||| |||| ||||||||| |||||||| || ||  |||||    
T  42784 atacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcaaaagatgtggtggcaaaccaactctataagccactgttccaaccttctctgaaatc 42883  T
Q  120 tgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcct 219  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| || | ||| || || || || ||||    
T  42884 tgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtgaccctaagaaaaacatgatcaccctcct 42983  T
Q  220 gaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttg 319  Q
    ||||||| ||    ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||    |||||||  ||||||| |||||| |     
T  42984 gaaactctagggactttctccgcttgtcatggtaactattctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgactttcttagtagtctc 43083  T
Q  320 ctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccatt 419  Q
     ||||| |  || ||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||| || || |||||||||||||| || ||||| ||||||||     
T  43084 atgaaccaagtccggtcccaacaccacactctctcctgactcaaaccagcatagaggagtcctacacctccgaccatacaacgcttcgaacggtgccata 43183  T
Q  420 ccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaat 519  Q
    |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  43184 ccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaat 43283  T
Q  520 cctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactttt 619  Q
    |||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  43284 cctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaaattcagcttcgatcccaaagcatcttgcaaactctt 43383  T
Q  620 ccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    ||| || |||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  43384 ccagaacctagaagtgaacctcggatccctatctgatacaatactcgacggtacaccgtgtagcttcacaat 43455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 4)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 21977 - 21305
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||| | ||    
T  21977 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctccgatat 21878  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    || ||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | || |||| ||| || ||||  || ||     
T  21877 cttatacggaccaatgaacttcggaatcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatggttaccctct 21778  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||    |||||||  |||||||||||||| |    
T  21777 tgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgactttctcagtagtct 21678  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | ||||| |  || ||||| || || || |   | ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  21677 gatgaaccaagtccggtcccaacacaacacccactcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 21578  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||    
T  21577 accaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaa 21478  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||| |  || || || ||| ||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || |    
T  21477 tcctccaaagattgtatcgtcgtctccgactgaccgtctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctct 21378  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||  | ||||||||||||||||||||    
T  21377 tccagaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatacttgacagcacaccatgtagcttcacaat 21305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 219 - 466
Target Start/End: Original strand, 26006 - 26253
Alignment:
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||| ||| ||||| | ||| |||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||    
T  26006 tgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactatgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagttt 26105  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
      || ||||  || ||||| || |   | ||||| || || |||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  26106 cttgcacaacttccggtccaaacaaagcactttctccggattcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccat 26205  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacgg 466  Q
     || ||||||| |||| | || || || ||||| || |||||||||||    
T  26206 accgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaattcgatcaacgg 26253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 501 - 637
Target Start/End: Original strand, 26288 - 26424
Alignment:
Q  501 acacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccca 600  Q
    ||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |  ||||    
T  26288 acacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaagttagttccca 26387  T
Q  601 aagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaa 637  Q
    ||||  |||||||||| | ||||||  ||||||||||    
T  26388 aagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaa 26424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 618 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 11164 - 11091
Alignment:
Q  618 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||  | ||||||||||||||||||||    
T  11164 ttccagaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatacttgacagcacaccatgtagcttcacaat 11091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Original strand, 19120 - 19792
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||   ||||||||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||| | ||    
T  19120 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacaacatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctccgatat 19219  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| | ||||||||| || || ||||||||| | |||||||| ||| |||||||||| ||||||||| | || |||| ||| || || || || |||    
T  19220 ctgatacgaaccaatgaattttggagtcaacttcctcgacttcaatgcatgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccatcc 19319  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||   ||||||||  |||||||| ||||| |    
T  19320 tgaaactcaaggtcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttcatcttttccctgatcatcttgactttctctgtagtct 19419  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
      ||||| |  || ||||| || || || || |  ||||||||||||||| | || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  19420 catgaaccaaatccggtcccaatacaacactctatcctgactcaaaccagaataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 19519  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||||| |||||||| || || || || |||||||| |||||| | || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  19520 accaatactcgaatgataactgttgttgtatgtgaactctatcaacagtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaa 19619  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||| |  || || || ||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| |    
T  19620 tcctccaatgattggatcgtcgtctccgactgaccatctgtctgaggatcataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactct 19719  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  19720 tccagaacctagaagtgaacctcggatccctatcagacacaatactcgacggaactccatgtagcttcacaat 19792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 63 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 58668 - 58448
Alignment:
Q  63 gaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttca 162  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||| |||| | ||||  |||||||||| || ||||| ||| |||| ||||  |||||||| ||||    
T  58668 gaaagatgcggtggtaaacccactctatacgcaaccgtcccaattctttctgaaatctgatacgggccaataaacctcggagtcagtttctttgatttca 58569  T
Q  163 aagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttg 262  Q
      ||| |||| ||||| |||| | || || ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||||||    
T  58568 gtgcatgtccaacaccggtcacatgagtggctctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaagatccttcctatgcttatcatgataactcttttg 58469  T
Q  263 tcgactctgcgacgccttcat 283  Q
    || ||| |||||||| |||||    
T  58468 tctactatgcgacgctttcat 58448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 213; Significance: 1e-116; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Original strand, 528 - 1200
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||  |||||||| ||||||||  | ||  ||||    
T  528 catactttggaagttccgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtaagccactgttccaaccctctctgaaat 627  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
     ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| || || || ||||  |||||||| ||||||||| | |||||||| ||||| || ||||| ||     
T  628 ttgatacggaccgataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcactgcctacacctgtcataggagtaactctcaagaacacatgatctccctct 727  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |  | |   |||| || ||| || || ||||| |    
T  728 tgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcacgatagctcttatgtcgactctgcgacgctttcatctgttttcttatcaacttaaccttttctgtagtct 827  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    ||||||| || |||||||| || | ||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  828 gctgaactatgtctggtcccaacatcacactttctcccgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaaaggagccat 927  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||    
T  928 accaatactcgaatggtaactgttattgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcgcaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtaaa 1027  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || |    
T  1028 tcctccaaagattgtatcgtcctctccgactgaccatctgtctaaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctct 1127  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||  ||||||||||| || ||  |||||||||| || ||||| ||||| || || |||||||||||||||||    
T  1128 tcctgaatctagaagtgaacctcagatctctatccgacacaatactcgacggtaccccatgtagcttcacaat 1200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 624 - 691
Target Start/End: Original strand, 12582 - 12649
Alignment:
Q  624 aatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| || || |||||||||||||||||    
T  12582 aatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggtaccccatgtagcttcacaat 12649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 19 - 678
Target Start/End: Original strand, 37202 - 37861
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||  |||||||| |||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||||||  ||||  | ||    
T  37202 catacttccgaagttgcgagacatgtaacacatcatgcaaatttgaaagatgaggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctttcagatat 37301  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||  ||||||| | |||||| || ||||   |     
T  37302 ctgatatagaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgtcataggggtgactctaagaaacacatgatctctccct 37401  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||||||||   | || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||   ||||||| ||||||||| ||||| |    
T  37402 tgaaactcaatggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttaactttctccgtagtct 37501  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | ||||| |  || ||||| || || ||  |||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  37502 gatgaaccaaatccggtcccaacacaacagtttctcctgactcaaaccaacacaaaggggtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgcgat 37601  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||||| ||||| ||  | || || || |||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||    
T  37602 accaatactcgaatggtaattgttgttgtacgtgaactccatcaacggtagatgactatctcaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaa 37701  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||| || ||||| || ||||| || || |    
T  37702 tcctctagtgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgcggatgataggctgaactgaacctcaactttgaacccaaggcatcttgtaagctct 37801  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccat 678  Q
    ||||||| || ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||    
T  37802 tccaaaaccttgaagtgaacctcggatctctatccgacacaatgctcgatggaaccccat 37861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 117 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 38382 - 38103
Alignment:
Q  117 atctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctt 216  Q
    |||||||| |||||||| || ||  | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||| || || ||||| |    
T  38382 atctgatacggaccaattaatttttgagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatctccct 38283  T
Q  217 cctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 316  Q
    | |||||||||||  | || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| | ||| || |||   |||||||  |||||||| |||||    
T  38282 cttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcttggtaactcttctgtcgactctgcgacgcttccatcttttctctaatcatcttgactttctccgtagt 38183  T
Q  317 ttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactc-aaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 395  Q
     || |||   |  || ||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||| || ||||| ||||| |||||||||    
T  38182 ctgatgattcaaatccggtcccaacacaacactttctcctgactcaaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgacca 38103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 117 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 27545 - 27385
Alignment:
Q  117 atctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctt 216  Q
    |||||||| |||||||| || ||  | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||| || || ||||| |    
T  27545 atctgatacggaccaattaatttttgagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatctccct 27446  T
Q  217 cctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgc 277  Q
    | |||||||||||  | || ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  27445 cttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcgtggtaactcttctgtcgactctgcgacgc 27385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 2)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 399 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 197404 - 197106
Alignment:
Q  399 aaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaa 498  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  197404 aaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataattgttattgtatgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaa 197305  T
Q  499 gaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcc 598  Q
    | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  197304 gtacacaaactctcagcaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgaccgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacc 197205  T
Q  599 caaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 697  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||| |||||    
T  197204 taaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatttgatacaatgctcgaaggaacgccatacaacttcacaatctcctt 197106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 348 - 466
Target Start/End: Original strand, 21927 - 22045
Alignment:
Q  348 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 447  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| ||  |||| || | || ||||||||||||||| || ||||||||  | |||||||||||| |  | || ||||    
T  21927 ctttcacctgactcataccaacacaatggcattctacaccccctaccatacaaagcctcaaatggtgccatatcgatactagaatgaaaattgttgttat 22026  T
Q  448 aagtgaactcgatcaacgg 466  Q
    |||| ||||| ||||||||    
T  22027 aagtaaactcaatcaacgg 22045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Original strand, 98 - 770
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| || |||||||||||||  || ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  98 catatttccgaagttgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctctgatat 197  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||| ||| || || ||||| ||     
T  198 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaaagcacgtcatacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatctccctct 297  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||  |  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| || ||||| || ||    |||||||  |||||||| ||||| |    
T  298 tgaaactcaagggcccttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgatgctttcatcttttcccttatcatcttgactttctctgtagtct 397  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | ||||| |  || ||||| || || || || || ||||||||||||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  398 gatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccgtacaaagcttcgaacggtgccat 497  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     | |||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||| ||||||    
T  498 acgaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactcttaacaaa 597  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||| |  || || ||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || |||||||| || |    
T  598 tcctccaaagattggatcatcctctccgtctgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgcaagctct 697  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||||||    ||||| ||||| || |||||||| | |||||||||    
T  698 tccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccaccacaatactcgatggtacaccatgcaacttcacaat 770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Original strand, 2751 - 3423
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  2751 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctctgatat 2850  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||| || || | ||| ||     
T  2851 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttctcagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcataaatacatgatatccctct 2950  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| | ||||| || ||    |||||||  |||||||| || || |    
T  2951 tgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatggtaacccttctgtcgactctgcgacactttcatcttttcccttatcatcttgactttctctgttgtct 3050  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | ||||| |  || ||||| || || || || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  3051 gatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagctttgaacggtgccat 3150  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || |||||||||||||  || ||||| ||||| ||||| | |||||  |||    
T  3151 accaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagcaccaccttgttcaagcacacacactctcagtaaa 3250  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||| |  || || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || | ||||| ||| |    
T  3251 tcctccaatgattggattgtcctcttcgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcattttgcagactct 3350  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||||||||||||||| || ||  |||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  3351 tccaaaatctagaagtgaacctcagatcactatccgacacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaat 3423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 567 - 688
Target Start/End: Complemental strand, 12954 - 12833
Alignment:
Q  567 tgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcg 666  Q
    |||||||| ||||||| | | ||||| |  ||||||||   ||||||||||  |||||| || || || || |||||||||||||| || ||||| | ||    
T  12954 tgatatgcagaactcagttttaacttagtacccaaagcactttgcaaacttccccaaaaccttgatgtgaaccttggatctctatccgaaacaatacacg 12855  T
Q  667 aaggaacaccatgtagcttcac 688  Q
    ||||||||||||| | ||||||    
T  12854 aaggaacaccatgcaacttcac 12833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 49339 - 48668
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||| || || |||||||||   || ||| | ||||||||  | ||  | ||    
T  49339 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacattatgaaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccgctgttccaaccctctcagatat 49240  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||  | ||||||| |||||| || | ||| ||     
T  49239 ctgatacggaccaataaactttggagtcaacttcttagacttcaacgcacttcctacacctgtcataggtgttactctcagaaacacatgatttccctct 49140  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||  | || |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| || ||||| || |||   |||||||  || ||||| ||||| |    
T  49139 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctatcgactctgcgatgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtct 49040  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | ||||| |  ||  |||| || ||||| ||||||| |||||| ||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  49039 gatgaaccaaatccagtcccaataccacactttcacgtgactcgaaccaacataaaggagttctgcacctccgaccatacaaagcttcgtacggtgccat 48940  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||| | |||     
T  48939 accaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctaagcaa- 48841  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    |||||||  || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||| |    
T  48840 tcctctaatgattgaatcgtcctttccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaaccttaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactct 48741  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    ||||| |||| ||||| || || |||||| |||| || ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  48740 tccaacatcttgaagtgaacctcggatctttatccgacacaatactcgacggaaccccatgtaacttcacaat 48668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 19 - 631
Target Start/End: Complemental strand, 58122 - 57511
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| |||||||||||||   | ||  ||||    
T  58122 catacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccaccgttccaatcctctctgaaat 58023  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    ||||||  |||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| || || || || | |    
T  58022 ctgatacagaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcacccttc 57923  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||| || ||    |||||||  ||  ||||||| || |    
T  57922 tgaaactcaagggcctttctccgcttatcatggtaact-ttttgtcaactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgaccctctcagtcgtct 57824  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | ||||| |  || ||||| || || || || || ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  57823 gatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataacggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 57724  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||||| ||||| || || || || || |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||| | ||||| ||||| | ||||||||||    
T  57723 accaatactcgaatggtaactgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccacctcgttcaagcacacacactctcaacaaa 57624  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||| |  || || || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||| |  |||||||| |    
T  57623 tcctccaatgattggatcgtcttctccgactgaccatctgtctgaggatgataagtcgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgttctgcaaactct 57524  T
Q  619 tccaaaatctaga 631  Q
    |||| || |||||    
T  57523 tccagaacctaga 57511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 203; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 19 - 688
Target Start/End: Complemental strand, 17019 - 16350
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||| | ||  ||||    
T  17019 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaactctctctgaaat 16920  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    || ||| |||||||||||||| || ||||||||  | |||||||||||||| || ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  16919 ctaatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccgacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 16820  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatca-tctgaactttctcagtagtt 317  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||| || |||   |||| ||||| |||||||||||||     
T  16819 tgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcggctctgcgaagctttcatcttttctcttatcaatctga-ctttctcagtagtc 16721  T
Q  318 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcca 417  Q
    |  ||||| |  || ||||| || || || || ||||| |||| ||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  16720 tcatgaaccaagtccggtcccaacacaacactctcacccgacttaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgcca 16621  T
Q  418 ttccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 517  Q
    | |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  16620 taccaatactcgagtgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcaacaa 16521  T
Q  518 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 617  Q
    ||| || |  || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||     
T  16520 atcttccaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactc 16421  T
Q  618 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 688  Q
    ||||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  16420 ttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagcttcac 16350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 198; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 7542 - 6872
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || ||||  ||||| ||||||| ||| || || ||||| |||| ||| ||||| |||||||| || |   ||||    
T  7542 catacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaatatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccttctg--aaat 7445  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||  |||||| | | || |||| ||| || || || || |||    
T  7444 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccatcatagaagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcc 7345  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||||| |||  | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||  ||||||||  |||||||| ||||  |    
T  7344 tgaaacttaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttatgtcgactctgcgatgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctctgtagact 7245  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | ||||| |  || ||||| || || || |  || |||||| |||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  7244 gatgaaccaaatccggtcccaacacaacaccctctcctgacacaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatataaagcttcgaacggcgccat 7145  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||    
T  7144 accaatacttgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacgttagatgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtaaa 7045  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||| |  || || || |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  7044 tcctccaaagattgtatcgtccactccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaacgcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcttgcaaactct 6945  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    | || ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||||||    
T  6944 ttcagaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatacttgacggtacaccatgtagcttcacaat 6872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 54 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 16736 - 16375
Alignment:
Q  54 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttct 153  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | | |||||||| |||||| | ||| || | ||||||||||    
T  16736 tgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccgttccaactcttttcgatatctgatacggaccagtaaacctctgagtcaacttct 16637  T
Q  154 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgata 253  Q
    |||||||||| |  ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  16636 ttgacttcaatgtgcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtgatctccctcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatggta 16537  T
Q  254 actcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttca 353  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| || | ||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||| || |||    
T  16536 actcttttgtcaactctgcgacgctttcatcttttattgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatttttggtcctaaaaccacactctca 16437  T
Q  354 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgc 415  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16436 cctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgc 16375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 618 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 8794 - 8721
Alignment:
Q  618 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  8794 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctaatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 8721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 3)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 705 - 38
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||    ||||||||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||  ||||    
T  705 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacgccatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgaaat 606  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | || || | ||| || || || || |||    
T  605 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctaagaaatacatgatcaccctcc 506  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||  | || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||  |||||||| ||||| |    
T  505 tgaaactcaagggccttcctacgtttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtct 406  T
Q  319 gctgaa-caatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcca 417  Q
    | |||| |||| || ||||| || || || || ||   ||||||||||||||| ||  |||| || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  405 gatgaatcaat-tccggtcccaacacaacactctctattgactcaaaccagcataaatgagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgcca 307  T
Q  418 ttccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 517  Q
    | || ||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | ||||         
T  306 taccgatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctc----- 212  T
Q  518 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 617  Q
    |   || |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||     
T  211 agtttccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgtaaactc 112  T
Q  618 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||||||||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  111 ttccaaaatctagaggtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 38  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Original strand, 10888 - 11560
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||| ||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||| | ||    
T  10888 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttctaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctccgatat 10987  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | || || | ||| || || || || |||    
T  10988 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctaagaaatacatgatcaccctcc 11087  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||  | || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||  |||||||| ||||| |    
T  11088 tgaaactcaagggccttcctacgtttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtct 11187  T
Q  319 gctgaa-caatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcca 417  Q
    | |||| |||| || ||||| || || || || ||   ||||||||||||||| ||  |||| || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  11188 gatgaatcaat-tccggtcccaacacaacactctctattgactcaaaccagcataaatgagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgcca 11286  T
Q  418 ttccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 517  Q
    | |||||||| ||||  || || || || || |||||||| ||| |||| || ||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  ||    
T  11287 taccaatactcgaatagtaactgttgttgtatgtgaactctatctacggtaggtgactatcctaagctccaccttgctcaagcacacacactctcagtaa 11386  T
Q  518 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 617  Q
    |||||| |  || || || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| || ||     
T  11387 atcctccaatgattggatcgtccgctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaatccaatgcatcttgtaagctc 11486  T
Q  618 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    ||||||||| ||||| | || || ||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  11487 ttccaaaatttagaaatgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 11560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 144 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 7991 - 7456
Alignment:
Q  144 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 243  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | |||||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| || || | ||    
T  7991 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcactctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 7892  T
Q  244 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 343  Q
    | |||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || | |||||  || ||||  ||||||||||| |     
T  7891 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgcagtttcttgcacaacttctggtcctaacaa 7792  T
Q  344 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 443  Q
      |  | || || ||||||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| | || ||     
T  7791 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 7692  T
Q  444 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 543  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |     ||||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  7691 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcatcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 7592  T
Q  544 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 643  Q
    ||| ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  7591 ccgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 7492  T
Q  644 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 679  Q
    ||||| ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  7491 atctcgatccgacacaatactagaaggaataccatg 7456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 2)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 459 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 4965 - 4727
Alignment:
Q  459 atcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctg 558  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4965 atcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctg 4866  T
Q  559 tctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatac 658  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4865 tctgtggatgatacgccgaactcaatcccaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatac 4766  T
Q  659 aatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 697  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  4765 aatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcctt 4727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 144 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 567 - 32
Alignment:
Q  144 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 243  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||| || ||||| |||| |||| | || ||||||||||| ||  | ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  567 gtcaacttcctacactccaaagcacggccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgagcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 468  T
Q  244 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 343  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || ||||| |  |  ||||  || |||||||| |     
T  467 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtctctttcacaacttccggtcctaacaa 368  T
Q  344 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 443  Q
      | |||||||| ||||||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||| |  | ||     
T  367 agcactttcaccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaatggtgccattccgatacaagaatgaaaattgttg 268  T
Q  444 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 543  Q
    || ||||| ||||| ||||| || | |      |||||| |  | |||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  267 ttgtaagtaaactcaatcaatggtaaacattcgtcccaactaacaccttgctccaaaacacaagttctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 168  T
Q  544 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 643  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  167 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 68  T
Q  644 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 679  Q
    ||||| |||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  67 atctcgatctgacacaatactagaaggaataccatg 32  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 133 - 691
Target Start/End: Original strand, 1908 - 2466
Alignment:
Q  133 tgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatc 232  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| || ||||| || |||||||||||  |    
T  1908 tgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggc 2007  T
Q  233 ttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttca--ttttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatct 330  Q
     || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||  |||||||  ||  |||| ||||| ||  |||  |  |    
T  2008 cttcctatgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgtcgctttcaccttttctctt--atcatcttgaccctctccgtagtctgaagaatcaaat 2105  T
Q  331 ctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactaga 430  Q
    ||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||    
T  2106 ctggtcccaacaccacactttctcctgactcgaaccaacataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcga 2205  T
Q  431 atgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgac 530  Q
    ||| || || |  || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| | | ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  ||     
T  2206 atggtaactgtagttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctacaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaatgat 2305  T
Q  531 tgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctag 630  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||  |    
T  2306 taaatcgtcctctccgactgaccatctgtctacggatgatatgccgaactcaacctcaacttagaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcgtg 2405  T
Q  631 aagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||| || || |||| |||||| || ||||| ||||| ||||  ||||||| |||||||||    
T  2406 aagtgaacctcggatgtctatccgacacaatactcgatggaagtccatgtaacttcacaat 2466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 54 - 679
Target Start/End: Original strand, 18884 - 19509
Alignment:
Q  54 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttct 153  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||| || |||||| | ||  | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  18884 tgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatacgccactgtcccaactctctcagatatctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttct 18983  T
Q  154 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgata 253  Q
    | || || || ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||||||    
T  18984 tagattttaatgcacgacctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatggtctccctcttgaaactcaaggtccttcatacgcttgtcatgata 19083  T
Q  254 actcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttca 353  Q
     ||||| ||| ||||||||||||| ||||| |  ||||  |||| || ||  || || ||||| || ||||| || | ||| || || | ||| |||||     
T  19084 gctcttctgttgactctgcgacgctttcatctgttcttttatcaacttaatcttttctgtagtctgttgaactatgtatggccccaacatcacactttct 19183  T
Q  354 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 453  Q
    || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |    
T  19184 cccgactcgaaccaacacaaaggagttctgcatcttcgaccatacaatgcttcaaacggtgccataccaatactcgaatggtaactattgttgtaagtaa 19283  T
Q  454 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 553  Q
    ||||   |||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||| || || || ||||||| ||||||| |    
T  19284 actcttccaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacattctcagtaaatcctctagagattgtatcgtcctcttcgactgatc 19383  T
Q  554 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 653  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||| ||||| |||| ||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| ||    |||||||||||     
T  19384 atctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaatttcgaacccagagcatcttgcaaactcttctagaatctagaagtgaactgcggatctctatcc 19483  T
Q  654 gatacaatgctcgaaggaacaccatg 679  Q
    || ||||| ||||| |||||||||||    
T  19484 gacacaatactcgacggaacaccatg 19509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 117 - 679
Target Start/End: Original strand, 23109 - 23671
Alignment:
Q  117 atctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctt 216  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| |    
T  23109 atctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacgacctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatggtctccct 23208  T
Q  217 cctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 316  Q
    | ||||||||||| || ||  |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||| |  ||||  |||| || ||  || || |||||    
T  23209 cttgaaactcaaggtccttcatacgcttgtcatgatagctcttctgttgactctgcgacgctttcatctgttcttttatcaacttaatcttttctgtagt 23308  T
Q  317 ttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcc 416  Q
     || ||||| || | ||| || || | ||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || || ||||||    
T  23309 ctgttgaactatgtatggccccaacatcacactttctcccgactcgaaccaacacaaaggagttctgcatcttcgaccatacaatgcttcaaacggtgcc 23408  T
Q  417 attccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaaca 516  Q
    || |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||   |||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||  |    
T  23409 ataccaatactcgaatggtaactattgttgtaagtaaactcttccaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacattctcagta 23508  T
Q  517 aatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaact 616  Q
    |||||||||| || || || ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||| ||||| |||| ||| |||||||||||    
T  23509 aatcctctagagattgtatcgtcctcttcgactgatcatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaatttcgaacccagagcatcttgcaaact 23608  T
Q  617 tttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 679  Q
     ||| | ||||||||||| ||    ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  23609 cttctagaatctagaagtgaactgcggatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatg 23671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 4)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Original strand, 43505 - 44177
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||  ||||    
T  43505 catacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaaccaactctataggccacagttccaaccctctctgaaat 43604  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||||||||| | || ||||| ||||||||||| || ||||||||| | || |||| |||||| || || || |||    
T  43605 ctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgaattcaatgcacgtcctaccccggtcataggagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcc 43704  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||  | ||||| |||||||||||  ||||||| | |||||||| |||||| ||||| || |||  |||||||| |||||| || ||||| |    
T  43705 tgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggcaactcttctatcgactctacgacgctttcatcttttctctgatcatcttaactttttctgtagtct 43804  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
      ||||| |  || | ||| || ||||| || || ||||||||| ||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  43805 catgaaccaaatccgttcccaacaccacactctctcctgactcataccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 43904  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     || ||||| ||||| || || ||||| || | |||||| |||| | | || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  43905 acctatactcgaatggtaactgttattgtatgcgaactctatcagcagtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacatactctcaacaaa 44004  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||| |  || || |   |||||||||||||||||| | |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| |    
T  44005 tcctccaatgattggaccatcctctccgactgaccatgtatctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaccccaaagcgtcctgtaaactct 44104  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44105 tccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaat 44177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Original strand, 44517 - 45189
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||  ||||    
T  44517 catacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaaccaactctataggccacagttccaaccctctctgaaat 44616  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||||||||| | || ||||| ||||||||||| || ||||||||| | || |||| |||||| || || || |||    
T  44617 ctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgaattcaatgcacgtcctaccccggtcataggagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcc 44716  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||  | ||||| |||||||||||  ||||||| | |||||||| |||||| ||||| || |||  |||||||| |||||| || ||||| |    
T  44717 tgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggcaactcttctatcgactctacgacgctttcatcttttctctgatcatcttaactttttctgtagtct 44816  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
      ||||| |  || | ||| || ||||| || || ||||||||| ||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  44817 catgaaccaaatccgttcccaacaccacactctctcctgactcataccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 44916  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     || ||||| ||||| || || ||||| || | |||||| |||| | | || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  44917 acctatactcgaatggtaactgttattgtatgcgaactctatcagcagtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacatactctcaacaaa 45016  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||| |  || || |   |||||||||||||||||| | |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| |    
T  45017 tcctccaatgattggaccatcctctccgactgaccatgtatctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaccccaaagcgtcctgtaaactct 45116  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45117 tccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaat 45189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 634
Target Start/End: Original strand, 20122 - 20737
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| |||||  |||||||  | ||  ||||    
T  20122 catacttctgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataggccacaattccaacactctctgaaat 20221  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||| || | || |||| |||||| || || || |||    
T  20222 ctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcccacacccgtcataagagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcc 20321  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||   |||||||  ||||| |  ||||| |    
T  20322 tgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctaatcatcttgacttttttcgtagtct 20421  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
      ||||| |  || ||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||||| ||||||||| |||||   || |||    
T  20422 catgaaccaaatccggtcccaacaccacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgactatacaaagcttcgaacaatgtcat 20521  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     || ||||| ||||| || || ||||| || |||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  20522 acctatactcgaatggtaactgttattgtatgtgaactctatcagtggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaa 20621  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||| |  || || || ||||||||||| |||||| |||||||   |||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||| |  || ||||| |    
T  20622 tcctccaatgattggatcgtcctctccgattgaccacctgtctgacaatgataagccgaactcaacctcaacttcaaacccaaagcgttctgtaaactct 20721  T
Q  619 tccaaaatctagaagt 634  Q
    |||| || ||||||||    
T  20722 tccagaaactagaagt 20737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #4
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 184
Target Start/End: Original strand, 36055 - 36220
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| |||||  |||||||  | ||  ||||    
T  36055 catacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcttgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataggccacaattccaacactctctgaaat 36154  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcat 184  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  36155 ctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcccacacccgtcat 36220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 19 - 691
Target Start/End: Original strand, 26261 - 26933
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||| || |||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || |||||  ||| ||||||||| ||||| ||  | ||  ||||    
T  26261 catacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccagctctataagccactgttcccaccctctctgaaat 26360  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  26361 ctgatacggaccgatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 26460  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||| | ||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||    |||| |  ||||||||||||||| |    
T  26461 tgaaactcaagagcctttcttcacttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcaacctaactttctcagtagtct 26560  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
      ||||| |  |||||||| || || ||  ||||||||||||||||||| || || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| ||| ||||    
T  26561 catgaaccaaatctggtcccaacacaacattttcacctgactcaaaccaacataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtaccat 26660  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||    
T  26661 cccaatactcgagtgatagctgttgttataagtgaactcaatcaatggcaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacaccctcaacaaa 26760  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    || || |  || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| |    
T  26761 tcttccaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactct 26860  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||| || |||||||| || ||  |||| ||||| || ||||| || || |  ||||| || |||||||||||    
T  26861 tccagaacctagaagtgaacctcagatccctatccgacacaatacttgacgatacaccgtgcagcttcacaat 26933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 178; Significance: 1e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 150 - 691
Target Start/End: Original strand, 1 - 541
Alignment:
Q  150 ttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcat 249  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| || ||||| || |||||||||||  | || |||||||||||||    
T  1 ttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcat 100  T
Q  250 gataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactct 349  Q
    | |||||||| || |||||||  ||||| ||||| || |||   |||||||  || ||||| ||||| || ||||| |  || ||||| || || || ||    
T  101 ggtaactcttctgccgactctatgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacactacact 200  T
Q  350 ttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataa 449  Q
    ||| |||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| | | ||||  ||||||| ||||| || || || || ||     
T  201 ttctcctgactcaaaccaacataatggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacgtt-ccataacaatactcgaatggtaactgttgttgtac 299  T
Q  450 gtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgact 549  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  300 gtgaactctatcatcggtagatgactatcccaagctccaccttggtcaagtacacacactctcagcaaatcctctagcgactgaatcgttctctccgact 399  T
Q  550 gaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctct 649  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||    
T  400 gaccatctgtttgtggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcggatctct 499  T
Q  650 atctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    ||| || ||||| ||||| || ||| |||| | |||||||||    
T  500 atccgacacaatactcgatggtacatcatgcaacttcacaat 541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0518 (Bit Score: 177; Significance: 5e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0518
Description:

Target: scaffold0518; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 115 - 691
Target Start/End: Original strand, 10865 - 11441
Alignment:
Q  115 aaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcc 214  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||  ||||||| | | || || | |||||| || || ||    
T  10865 aaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacatgtcatagaagtaaccctaagaaacacatgatcacc 10964  T
Q  215 ttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagta 314  Q
     ||||||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || |||  ||||||||  |||||||| |||    
T  10965 ctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctaagacgcattcatcttttctctgatcatcttgactttctctgta 11064  T
Q  315 gtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtg 414  Q
    || |  ||||| |  || ||||| || ||||| || || ||| ||||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  11065 gtctcatgaaccaaatccggtcccaacaccacactctctcctaactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtg 11164  T
Q  415 ccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaa 514  Q
    |||| || ||||| ||||| ||  | || || || |||||||| |||| | | || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||    
T  11165 ccatacctatactcgaatggtaaatgttgttgtatgtgaactctatcagcagtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaa 11264  T
Q  515 caaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaa 614  Q
    ||||||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  11265 caaatcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactgaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaa 11364  T
Q  615 cttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    || ||||| || || ||||| || || ||||||| ||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11365 ctcttccagaacctcgaagtgaacctcggatctccatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaat 11441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 177; Significance: 5e-95; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 19 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 26171 - 25511
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| || ||||  ||||| || |||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||||||  |||   | ||    
T  26171 catatttccgaagttgcgacgcatgaaacacatcatgcaagtttgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctttttgatat 26072  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||| | ||||||| ||| || || || || ||     
T  26071 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacatcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatccccctct 25972  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||    |||||||  || ||||| ||||| |    
T  25971 tgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgagacgctttcatcttttcccttatcatctttaccttctccgtagtct 25872  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | || || |  || ||||| |  || || || || ||| ||||||||||||| || ||| |  |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  25871 gatggaccaaatccggtcccagcacaacactctctcctaactcaaaccagcataaaggattcttgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 25772  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||| | || || | |||||  |||    
T  25771 accaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcatgtacccacactctcagtaaa 25672  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||| |  || || ||  ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || |    
T  25671 tcctccaatgattggatcatcctctctgaccgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaatctct 25572  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 679  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  25571 tccataatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatg 25511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 283
Target Start/End: Original strand, 16676 - 16940
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||| || |||||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| || | ||| |||||  |||||||  | ||  ||||    
T  16676 catacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaacactatatgccactattccaaccctctctgaaat 16775  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  16776 ctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 16875  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcat 283  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||    
T  16876 tgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgccgactctgcgaagctttcat 16940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 172; Significance: 5e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 450 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 3689 - 3442
Alignment:
Q  450 gtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgact 549  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3689 gtgaactctatgaacggaagatgactatccgaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctctccgact 3590  T
Q  550 gaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctct 649  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  3589 gaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgtaaacttttccaaaatctttatgtaaatcttggatctct 3490  T
Q  650 atctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 697  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||    
T  3489 atttgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacaatctcctt 3442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 234 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 3810 - 3694
Alignment:
Q  234 tttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctg 333  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  3810 tttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttctcgttagtttgctgaactatctctg 3711  T
Q  334 gtcctaagaccactctt 350  Q
    |||||||||||||||||    
T  3710 gtcctaagaccactctt 3694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 171; Significance: 2e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 19 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 13087 - 12420
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||| || |||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || || || ||||  || |||||||||||||   | ||  ||||    
T  13087 catacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaagccaactctgtatgccaccgttccaatcctctctgaaat 12988  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    || ||| ||||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||| | ||||||||||| || || || || |||    
T  12987 ctaatacggaccaatgaacttcggagttaacttccttgatttcaaagcacgttctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctcc 12888  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||| ||||| ||||| || | |||||||| |||||| ||||| || ||    |||||||  || |||||||| || |    
T  12887 tgaaactcaagggcctttctccgcttatcatggtaacttttctatcgactctacgacgctttcatcttttcccttatcatcttgaccttctcagtcgtct 12788  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | ||||| |  ||||||||||| || || || || ||||||||||||||||| ||  |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  12787 gatgaaccaaatctggtcctaatacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaagagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 12688  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     || ||||| ||||| || || || || || |||||||| ||||| || ||     || | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||||    
T  12687 acctatactcgaatggtaactgttgttgtaggtgaactctatcaatggtag----gtagcacaagctccaccatgttcaagcacacacactctcaacaaa 12592  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    ||||| |  || || || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| |    
T  12591 tcctccaatgattggatcgtcctttccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactct 12492  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 690  Q
    ||||||||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  12491 tccaaaatctagatgtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacggaactccatgtagcttcacaa 12420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0742 (Bit Score: 170; Significance: 7e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0742
Description:

Target: scaffold0742; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 115 - 691
Target Start/End: Original strand, 5309 - 5885
Alignment:
Q  115 aaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcc 214  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| || || || ||    
T  5309 aaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcacc 5408  T
Q  215 ttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcat-tttctcttggatcatctgaactttctcagt 313  Q
     ||||||||||||||  | || || ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| || |  |||||||  || ||||||||    
T  5409 ctcctgaaactcaagggccttcctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcatctttttcctt-atcatcttgaccttctcagt 5507  T
Q  314 agtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggt 413  Q
     || || ||||| |  || ||||| || || || || || ||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||| | ||| |||    
T  5508 cgtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataacggagtcctgcacttccgaccatacaaagctttgaacggt 5607  T
Q  414 gccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctca 513  Q
    ||||| ||| |||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||   ||||||||| ||||| | |||||    
T  5608 gccataccattactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaagttgctcaagcacacacactctca 5707  T
Q  514 acaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaa 613  Q
    |||||||||||| ||| || || ||||| ||||||| ||||||| ||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||  ||||    
T  5708 acaaatcctctaacgattggatcgtcctttccgactaaccatctttctgacgatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtccagcaa 5807  T
Q  614 acttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
     || ||| | || ||||| || || |||||||| ||||| || ||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  5808 gctcttcaagaacctagaggtgaaccttggatccctatccgacacaatactagaaggaactccatgtagcttcacaat 5885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 169; Significance: 3e-90; HSPs: 2)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 451 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 19876 - 19636
Alignment:
Q  451 tgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactg 550  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  19876 tgaactctatcaatgggagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaaccctcaacaaatcctctaacgactgaattgtcttcaccgactg 19777  T
Q  551 accatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctcta 650  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19776 accatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctctttcaaacttttccataatctagaagtaaatcttggatctcta 19677  T
Q  651 tctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  19676 tctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 19636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 204
Target Start/End: Original strand, 16957 - 17142
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||  |||| ||||| | ||    
T  16957 catacttccgaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccaactcaatacgccaccgttaaaactctttccgatat 17056  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaaca 204  Q
    |||||| | || ||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | || |||||||||||||||    
T  17057 ctgatacgaacaaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaaca 17142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 168; Significance: 1e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 19 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 14557 - 13994
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||||||||||||||||| || || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||  ||| ||||| ||||||||  | ||  ||||    
T  14557 catacttccgaagttgcgacacctgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactttatatgccactgttccaaccctctctgaaat 14458  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | || |||| ||| || || || || |||    
T  14457 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcc 14358  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    | |||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||  ||| ||||  |||| |    
T  14357 taaaactcaagggccttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctttgatcatcttgactatctctatagtct 14258  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    | | ||| |  || ||||| || || || || || ||||||||||||||| | || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  14257 gataaaccaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccaggataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 14158  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||  |||    
T  14157 accaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacattctcagtaaa 14058  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactca 582  Q
    ||||| |  || || || || |||| ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||    
T  14057 tcctccaaagattggatcgttctcttcgactgaccatctgtctacggatgataagctgaactca 13994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 9183 - 9039
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||||||||||||||||| || || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||  ||| ||||| ||||||||  | ||  ||||    
T  9183 catacttccgaagttgcgacacctgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactttatatgccactgttccaaccctctctgaaat 9084  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaa 163  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||    
T  9083 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaa 9039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1001 (Bit Score: 167; Significance: 4e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold1001
Description:

Target: scaffold1001; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 349 - 615
Target Start/End: Original strand, 1 - 267
Alignment:
Q  349 tttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattata 448  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1 tttcacctgattcaaaccaacacaacggagttttgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgtcattccaatactagaatgataactattattata 100  T
Q  449 agtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgac 548  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |  |||||||  || || ||||||    
T  101 cgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcatcaaaagactgaaacgtactatccgac 200  T
Q  549 tgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaac 615  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||    
T  201 taaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaac 267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 165; Significance: 7e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 19 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 6219 - 5756
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||| ||||||||| | ||  | ||    
T  6219 catacttccgaagttgcgacacatg-aaaacatcaagcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccacagttccaactctctcagatat 6121  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||| | || |||| |||||| ||  |||| ||     
T  6120 ctggtatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaatgcacgacctacacccgtcataggagtaaccctcagaaacacatgagctccctct 6021  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||   |||| ||  || || || |||||||    
T  6020 tgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacactttcatcttttctcttatcaacttgaccttttctgtagttt 5921  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
    |  |||| |  |||||||| || || || ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  5920 gacgaactaaatctggtcccaacactacactttctcccgactcaaaccaacacaatggagttctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 5821  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaag 483  Q
     |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  5820 accaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaag 5756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 165; Significance: 7e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 411 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 19119 - 18839
Alignment:
Q  411 ggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattc 510  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  19119 ggtgccattccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaaaggaagatgactatcctaagttcctccttgctcaagtacacaaactc 19020  T
Q  511 tcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttg 610  Q
    |||| || ||||| | |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| || |  ||||||||||     
T  19019 tcaataagtcctccaacgactgaatcattctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaacgcaacctcaacttagaacttaaagcctcttt 18920  T
Q  611 caaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18919 caaactcttccaaaatctagaagtaaacctcagatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaat 18839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 156; Significance: 2e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 237 - 688
Target Start/End: Complemental strand, 3443 - 2992
Alignment:
Q  237 ctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtc 336  Q
    ||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||| ||||||||| ||||| || ||||| |  || | ||    
T  3443 ctacgtttatcacgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttaactttctctgtagtctgatgaaccaaatccgttc 3344  T
Q  337 ctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgata 436  Q
    | || || || || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  3343 ccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggta 3244  T
Q  437 gctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaatt 536  Q
     || || || || |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | || |||||||||||| |  || || ||     
T  3243 actgttgttctatgtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactcgcaacaaatcctccaaagattggatc 3144  T
Q  537 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 636  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||| |||| |    
T  3143 gtgccctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcatgcaaactcttccagaatctataagtga 3044  T
Q  637 atcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 688  Q
    | || ||||| ||||| || ||||| || || || |||||||||||||||||    
T  3043 acctcggatccctatccgacacaatacttgacggtacaccatgtagcttcac 2992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 3574 - 3487
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaac 106  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  | ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||    
T  3574 catacttccgaagtagcgacacatgatacacatcatgcaagttcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaac 3487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0877 (Bit Score: 149; Significance: 2e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0877
Description:

Target: scaffold0877; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 19 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 566 - 206
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||   ||||  | ||    
T  566 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccattccaatcctttctgatat 467  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || | |||| |||||||||||||||| ||||| |||||     
T  466 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtccaacaccggttacaggattgactctcaaaaacacatggtccccttct 367  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||  | |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  366 tgaaactcaatgtctttcctacgcttatcatggtagttgttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttggatcatcttaaccttctcagtagttt 267  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagt 379  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||  | || |||||||| || ||||| |||||| ||||    
T  266 gctgtacaatttctggtcccaaaactgcactctcacctgattcgaaccaacacaacagagt 206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 147; Significance: 4e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 509 - 691
Target Start/End: Original strand, 25464 - 25646
Alignment:
Q  509 tctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctct 608  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  25464 tctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgcctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctct 25563  T
Q  609 tgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  25564 tgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatatctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgaaacttcacaat 25646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 142; Significance: 4e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 234 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 5543 - 5086
Alignment:
Q  234 tttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctg 333  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||  ||||||||  ||||||||  |||| |  ||||| |  || |    
T  5543 tttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctctatagtctcatgaaccaaatccg 5444  T
Q  334 gtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatg 433  Q
    |||| || ||||| || || |||||||||||||| || || ||||| || || |||||||||| |||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||    
T  5443 gtcccaacaccacactctctcctgactcaaaccatcagaaaggagtcctacacctccgaccatccaaagcttcgaacggtgccatacctatactcgaatg 5344  T
Q  434 atagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactga 533  Q
     || || || || || |||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |  || ||     
T  5343 gtaactgttgttgtatgtgaactctatcattggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattgg 5244  T
Q  534 attgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaag 633  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| | || |||||||| ||||| || |||||||    
T  5243 atcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaaacatcctgcaaactcttccagaacctagaag 5144  T
Q  634 taaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    | || ||   ||| ||||| || ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  5143 tgaacctcaaatccctatccgacacaatactcgaaagaactccatgtagcttcacaat 5086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 138; Significance: 9e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 174 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 1385 - 880
Alignment:
Q  174 acaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcg 273  Q
    ||||| ||||||||| | || |||| ||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  1385 acacccgtcataggagtaaccctcagaaaaacatggtcaccttcctgaaactcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcaactctgcg 1286  T
Q  274 acgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaa 373  Q
    |||| ||||| |||||    |||||||  |||||||| ||||| |  ||||| |  || || || || || || ||||| || | ||| |||||||| ||    
T  1285 acgctttcatcttctccctaatcatcttgactttctccgtagtctcatgaaccaaatccggccccaacacaacactttctcccgtctcgaaccagcataa 1186  T
Q  374 cggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatga 473  Q
     ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || || || || ||||| || || |||    
T  1185 aggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttattgtatgtaaattctatcaatggtaggtga 1086  T
Q  474 ctatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatg 573  Q
    || ||||||| ||| || |||||||| ||||| | ||| |  ||||||||||  || || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  1085 ctgtcccaagctccaccctgctcaagtacacatactcttagtaaatcctctaaagattggatcgtcctttccgaatgaccatctgtctgcggatgataag 986  T
Q  574 ccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaac 673  Q
    ||||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||  |||||||  |||| ||||||| ||| || || ||||| |||||    
T  985 ccgaactcaatttcaatttcgaacccaacgcatcttgtaaactcttccaaaatcttcaagtaaactttgggtctctatttgacactatactcgacggaac 886  T
Q  674 accatg 679  Q
     |||||    
T  885 cccatg 880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 133; Significance: 9e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 283
Target Start/End: Original strand, 27967 - 28231
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||    
T  27967 catacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccaactcgatacgccactgttccaactctttccgatat 28066  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||| ||  | ||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||| | |||||||||||||| || || || ||     
T  28067 ctgatacggaccaataaatctaggattcaacttctttgacttcacagcacgtccaacaccagtcaccggagtaactctcaaaaacacatgatcaccctct 28166  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcat 283  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28167 tgaaattcaagatcctttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 28231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 618 - 697
Target Start/End: Original strand, 24097 - 24176
Alignment:
Q  618 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 697  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  24097 ttccaaaatctagaagttaatcttggatctctatccgatccaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcctt 24176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 131; Significance: 1e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 288 - 30
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||| | ||    
T  288 catacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaactcactcgatacgccaccgttccaacactttccgatat 189  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||| ||  || | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | || ||||||| ||||| || || ||||||||     
T  188 ctgatacggaccaataaatctcagagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctaaaaaatacatgatctccttct 89  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgc 277  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  88 tgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataattcttttgtcgactctgcgacgc 30  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 126; Significance: 1e-64; HSPs: 3)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 462 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 11531 - 11302
Alignment:
Q  462 aacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtct 561  Q
    ||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||  || || || |||||||||||||||||||||||||    
T  11531 aacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcaacaaatcctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtct 11432  T
Q  562 gcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaat 661  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||| |||||    
T  11431 gcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcagatctctatctgacacaat 11332  T
Q  662 gctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
     ||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  11331 actcgatggaactccatgtaacttcacaat 11302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 471 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 7091 - 6871
Alignment:
Q  471 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 570  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7091 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcaacaaatcctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 6992  T
Q  571 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 670  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  6991 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcagatctctatctgacacaatactcgatgg 6892  T
Q  671 aacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    ||| ||||||| |||||||||    
T  6891 aactccatgtaacttcacaat 6871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 13559 - 13380
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||  || | ||| ||||||||  | ||  | ||    
T  13559 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgtcactgttccaaccctctcagatat 13460  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctca 198  Q
    ||||||   |||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  13459 ctgatacttaccaattaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcatgtcctacacccgtcataggagtaactctca 13380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0232 (Bit Score: 122; Significance: 3e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0232
Description:

Target: scaffold0232; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 450 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 2750 - 2509
Alignment:
Q  450 gtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgact 549  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  || || || |||||||||||||    
T  2750 gtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaatgattggatcgtcctctccgact 2651  T
Q  550 gaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctct 649  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  2650 gaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggaatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaaccttggatctct 2551  T
Q  650 atctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    ||| |||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||    
T  2550 atccgatacaatactcgacggtacaccatgtaacttcacaat 2509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1710 (Bit Score: 118; Significance: 8e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold1710
Description:

Target: scaffold1710; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 216 - 653
Target Start/End: Original strand, 86 - 523
Alignment:
Q  216 tcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtag 315  Q
    |||| |||||||||  | || |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||  ||||||||  |||||||| ||||    
T  86 tcctaaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgatgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtag 185  T
Q  316 tttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgc 415  Q
    | || ||||| |  |||||||| || || || || || ||||||||||||||||| || ||| | ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  186 tctgatgaaccaaatctggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggattcctgcacctccgaccatataaagcttcgaacggtgc 285  T
Q  416 cattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaac 515  Q
    ||| | |||||| ||||| || |  || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||| | ||| |      
T  286 catacaaatactcgaatggtaacggttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccacattgctcaagcacacacactcttact 385  T
Q  516 aaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaac 615  Q
    ||||||||||  || || || |||||||||   ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| || || || ||||||||||    
T  386 aaatcctctaaagattgtatcgtcctctccatttgaccatctgtgtgcggatgataagccgaactcagcctcaacttcgatcctaaggcgtcttgcaaac 485  T
Q  616 ttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 653  Q
    | ||||| |||||| |||| || || ||||| ||||||    
T  486 tcttccagaatctataagtgaacctcggatccctatct 523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1710; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 1091 - 946
Alignment:
Q  144 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 243  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || ||||| |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  1091 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 992  T
Q  244 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctc 289  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  991 tatcatgataactcttatgtctactctgagacgccttcatcttctc 946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0682 (Bit Score: 118; Significance: 8e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0682
Description:

Target: scaffold0682; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 19 - 300
Target Start/End: Original strand, 191 - 472
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||||| | |||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||  ||||    
T  191 catacttccgcaattgcgacacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagatgaggaggcaaaccaactctatatgccacagttccaactctttctgaaat 290  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||| |||||  ||||||| |||||||||| ||| ||||||||| | || |||| ||| || ||||| || |||    
T  291 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaagttcttcaacttcaacgcacgtcctatacccgtcataggagtaaccctcagaaaaacatggtcaccctcc 390  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatct 300  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||    
T  391 tgaaactcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatct 472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0682; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 606 - 691
Target Start/End: Original strand, 470 - 555
Alignment:
Q  606 tcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    ||||| ||||| || |||||||| |||||||| || || |||||||| || || || ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  470 tcttgtaaactctttcaaaatcttgaagtaaacctcgggtctctatccgacactatactcgacggaacaccatgcatcttcacaat 555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 116; Significance: 1e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 355 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 6307 - 5969
Alignment:
Q  355 ctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaa 454  Q
    |||||||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||| | |||||| || ||||| ||||| || || ||||| || |||||    
T  6307 ctgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacgatgccatacctatactcgaatggtaactgttattgtatgtgaa 6208  T
Q  455 ctcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaat--tctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgac 552  Q
    ||| |||| | | || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |   ||||||||||||||| |  || || || ||||||||||||||||    
T  6207 ctctatcagcagtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacacactctcaacaaatcctccaatgattggatcgtcctctccgactgac 6108  T
Q  553 catctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatc 652  Q
    ||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||  |||| || |||||||| || ||  |||| |||||    
T  6107 catctatctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcatccagaacctagaagtgaacctcagatccctatc 6008  T
Q  653 tgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
     || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6007 cgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaat 5969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0323 (Bit Score: 111; Significance: 1e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0323
Description:

Target: scaffold0323; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 396 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 5227 - 4945
Alignment:
Q  396 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 495  Q
    |||||||| ||||| | |||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||  ||||||    
T  5227 tacaaagcttcgaacgatgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaacttgct 5128  T
Q  496 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 595  Q
    |||||||||| | |||||  |||| |||||  || ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  5127 caagaacacacactctcagtaaatactctaaagattgaatcgtcatctcagactgaccatctgtctgcggatgataagccgaacttaacctcaacttcga 5028  T
Q  596 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccat 678  Q
     |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||    
T  5027 acccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggtacaccat 4945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 108; Significance: 7e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 540 - 691
Target Start/End: Original strand, 1988 - 2139
Alignment:
Q  540 ctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatc 639  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1988 ctctccgactaaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatc 2087  T
Q  640 ttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||    
T  2088 ttgggtctctatctgatacaatgctcgacggaacacgatgcaacttcacaat 2139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 105; Significance: 4e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 5308 - 4912
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  | ||||||||||||||| || || |||||||||   || ||||  ||||||||  | |   | ||    
T  5308 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcattcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactatgtatgccagtgttccaaccctcttagatat 5209  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| | |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||  |||  |||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||| || ||||| ||     
T  5208 ctgatacgaaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacacacaacctacacccgtcataggagtgattctcagaaacacatgatctccctct 5109  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||   |||||||  || ||||| || || |    
T  5108 tgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtggtct 5009  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgc 415  Q
    | ||||| |  | |||| | || ||||| ||||| ||  |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  5008 gatgaactaaatatggttccaacaccacactttctccccactcaaaccaacacaaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgc 4912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 410 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 1887 - 1618
Alignment:
Q  410 aggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaatt 509  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||  | || || || |||||||  |||||||  || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |    
T  1887 aggtgccataccaatactcgaatggtaattgttgttgtacgtgaactttatcaacgacaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacact 1788  T
Q  510 ctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctctt 609  Q
    || | ||||||||||| ||  | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || | ||| || ||||    
T  1787 cttagcaaatcctctaacggttaaatcgttctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaacttcaactttgaactcaatgcatctt 1688  T
Q  610 gcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 679  Q
    ||||||| |||||||| || ||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  1687 gcaaactcttccaaaacctcgaagtgaacctcggatctctatctgacacaatactcgatggaactccatg 1618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0924 (Bit Score: 103; Significance: 7e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0924
Description:

Target: scaffold0924; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 19 - 409
Target Start/End: Original strand, 3891 - 4281
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||| | |||   || ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  3891 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacataatgcaaattcgaaagatgtggaggcaaaacaactatgtatgccactgttccaaccctctcagatat 3990  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    ||||||  ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||| || ||||| ||     
T  3991 ctgatacagaccaatgaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaacacatgatctccatct 4090  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||||  | || |||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||| || |||   |||||||  |||||||| ||||| |    
T  4091 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttatgtcgactctacgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctccgtagtct 4190  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaa 409  Q
    | | ||| |  || ||||| || || || ||||| | ||||||||||||  | |  ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||    
T  4191 gataaactaaatccggtcccaacactacactttctcttgactcaaaccaatatataggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaa 4281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 103; Significance: 7e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 450 - 691
Target Start/End: Original strand, 41350 - 41589
Alignment:
Q  450 gtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgact 549  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||||||| |  || || || |||||||||||||    
T  41350 gtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcagtaaatcctccaaagattggatcgtcctctccgact 41449  T
Q  550 gaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctct 649  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || |  ||||||||    
T  41450 gaccatctgtctgcggatgataagccgaa--caacctcaacttcgaacccaaagcgtcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaaccccggatctct 41547  T
Q  650 atctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    ||  || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  41548 attcgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 41589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 106
Target Start/End: Original strand, 45845 - 45932
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaac 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||| |||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||    
T  45845 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaatgatgtggtggaaaaccaactctatatgccactgttccaac 45932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 102; Significance: 3e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 39193 - 38761
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || || | |||||| ||| ||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| | ||||||| | ||  ||||    
T  39193 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacttcgtgcaagttctaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgctccaactctctctgaaat 39094  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||||||||| | |||||||| ||||| || ||||| |||| |||| ||||||||| ||| || || || || |||    
T  39093 ctgatacggaccgatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgaccgacacccgtcaaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcc 38994  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcat-tttctcttggatcatctgaactttctcagtagtt 317  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||| || |  |||| |   ||||||||||||||     
T  38993 tgaaattcaagatcctttcttcgcttgtcatgataactcttctgtcgactctacgaagctttcatctttttcct-tatcaacctgactttctcagtagtc 38895  T
Q  318 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcca 417  Q
    |  ||||| |  || ||||| || || || || |||||||||||||||||||| || |||||  | || |||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  38894 tcatgaaccaaatccggtcccaacacaacgctctcacctgactcaaaccagcataaaggagtcttacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgcca 38795  T
Q  418 ttccaatactagaatgatagctattattataagt 451  Q
    | |||||||| || |||||||| || ||||||||    
T  38794 taccaatactcgagtgatagctgttgttataagt 38761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 97; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 1475 - 1211
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| | |   || ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  1475 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaatttcgaaagatgtggtggcaaacctattttttatgccactgttccaaccctctctgatat 1376  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||| || ||||| ||     
T  1375 ctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaacacatgatctccctct 1276  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcat 283  Q
    |||||||||||  | || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  1275 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgagacgctttcat 1211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 96; Significance: 1e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 144 - 679
Target Start/End: Original strand, 46279 - 46814
Alignment:
Q  144 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 243  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || ||||| || | |||| | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  46279 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggttacaggatttaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 46378  T
Q  244 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 343  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  46379 tatcatgataactcttttgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 46478  T
Q  344 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 443  Q
      | || || || ||||||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| | || ||     
T  46479 agcactctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 46578  T
Q  444 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 543  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |     ||||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  46579 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcatcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 46678  T
Q  544 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 643  Q
    | |  |||||||| || || ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  ||||| |||| || ||    
T  46679 ctgtatgaccatcggtatgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaaattagaaataaacctcgg 46778  T
Q  644 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 679  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  46779 atcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 46814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 489 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 68427 - 68225
Alignment:
Q  489 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 588  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||| | || || ||||| |||||| |||||||||    
T  68427 ccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctttaacgactgaatcgtcctctccgactgaccatctatttgtgggtgataagccgaagtcaatctca 68328  T
Q  589 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 688  Q
    |||| || |||||   |||||||||||| |||||||| || ||||| || ||  |||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| | ||||||    
T  68327 actttgaacccaagttctcttgcaaactcttccaaaaccttgaagtgaacctcagatctctatccgacacaatactcgatggaaccccatgcaacttcac 68228  T
Q  689 aat 691  Q
    |||    
T  68227 aat 68225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 94; Significance: 2e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 537 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 997 - 844
Alignment:
Q  537 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 636  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  997 gtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtga 898  T
Q  637 atcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 690  Q
    | || ||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  897 acctcggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaa 844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 4445 - 4217
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | |   ||||    
T  4445 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaaccctctttgaaat 4346  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||| || || || ||     
T  4345 ctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactcttaaaaacacatgatccccctct 4246  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtc 247  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||||||    
T  4245 tgaaactcaagggcctttctccgcttgtc 4217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 93; Significance: 6e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 19 - 283
Target Start/End: Original strand, 14086 - 14349
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || |||||||||   || ||||| |||||||| ||| |  | ||    
T  14086 catacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaaccttt-cagatat 14184  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    ||  || | ||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| || ||||| ||     
T  14185 ctagtacgaaccgataaacttcggagtcaacttcttcgacttcaacgcacgacctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctct 14284  T
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcat 283  Q
    |||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  14285 tgaaactcaagggcctttctatgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcat 14349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 489 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 9697 - 9507
Alignment:
Q  489 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 588  Q
    |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||||| ||| ||||| ||||| || || || || |||||||||||||    
T  9697 ccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctccgtctgcccatcggtctgtggttggtaagcagaactcaatctca 9598  T
Q  589 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 679  Q
    |||| |   |||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  9597 actttgtttccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 9507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 84; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 144 - 679
Target Start/End: Original strand, 23519 - 24054
Alignment:
Q  144 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 243  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| | || | || |||||||||||||| || |   | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  23519 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacatgattcaccctcaaaaacacgtgatcactaacttgaaactcaatatcctttctcctct 23618  T
Q  244 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 343  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || |||| ||| |||||||| |     
T  23619 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacctccggtcctaacaa 23718  T
Q  344 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 443  Q
      | || || || ||||||||||| || ||||| || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| |  | ||     
T  23719 agcactctctccagactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaaatgttg 23818  T
Q  444 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 543  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||| ||| |    |||||| |||||||    
T  23819 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactaacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatactccaaactctgaatagtcctct 23918  T
Q  544 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 643  Q
    ||| ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  23919 ccgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 24018  T
Q  644 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 679  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  24019 atcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 24054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 83; Significance: 6e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 473 - 691
Target Start/End: Original strand, 4884 - 5102
Alignment:
Q  473 actatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatat 572  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  4884 actattccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtaaatcctctaacgattgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgataa 4983  T
Q  573 gccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 672  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||| | |  ||||||||||| |||||||| || |||||||| || | ||||||||| || || |||||||| ||||    
T  4984 gccgaactcaacctcaacttagaacccgaggaatcttgcaaactcttccaaaaccttgaagtaaacctcgaatctctatccgacacgatgctcgatggaa 5083  T
Q  673 caccatgtagcttcacaat 691  Q
    | ||||| | |||||||||    
T  5084 ccccatgcaacttcacaat 5102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 227
Target Start/End: Original strand, 1177 - 1385
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||||||  | |   | ||    
T  1177 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctaagatat 1276  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 218  Q
    ||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| || ||||| ||     
T  1277 ctgatacagaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctct 1376  T
Q  219 tgaaactca 227  Q
    |||||||||    
T  1377 tgaaactca 1385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 80; Significance: 4e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 348 - 679
Target Start/End: Original strand, 7497 - 7828
Alignment:
Q  348 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 447  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| |  | || || |    
T  7497 ctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagtctcaaacggtgccattccaatactagaatgaaaattgttgttgt 7596  T
Q  448 aagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccga 547  Q
    |||| ||||| |||||||| | |      |||||| |    |||||||| |  ||||||  |||||||||||| || |    |||||| |||||||| |     
T  7597 aagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgataccttgctccaagacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctcggt 7696  T
Q  548 ctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatct 647  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || |||||     
T  7697 ctgcccatctgtctggggatgataagcagaactcaatctcaaattagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacatagaagtaaacctcggatcc 7796  T
Q  648 ctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 679  Q
      ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  7797 ggatccgacacaatactagaaggaataccatg 7828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 573 - 691
Target Start/End: Original strand, 4425 - 4543
Alignment:
Q  573 gccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 672  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4425 gccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatatagaagtaaacctcagatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 4524  T
Q  673 caccatgtagcttcacaat 691  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  4525 caccatgtaacttcacaat 4543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 573 - 691
Target Start/End: Original strand, 11555 - 11673
Alignment:
Q  573 gccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 672  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11555 gccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatatagaagtaaacctcagatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 11654  T
Q  673 caccatgtagcttcacaat 691  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  11655 caccatgtaacttcacaat 11673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 76; Significance: 9e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 144 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 14918 - 14383
Alignment:
Q  144 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 243  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || ||||  |||| | || | || ||||||||||| || || ||  ||||||| |||| ||| ||||| | ||    
T  14918 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacactggtcacatgattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaattcaatatcctttctcctct 14819  T
Q  244 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 343  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  14818 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 14719  T
Q  344 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 443  Q
      | ||||| || || |||||||| |||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||||| | || ||     
T  14718 agcgctttctccggattcaaaccaacacaacggtgttctacacctcctaccatacaaagcctcaaacggagccattccgatagtagaatgaaaactgttg 14619  T
Q  444 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 543  Q
    || ||||| ||||| |||| ||| | |     ||||||| |  | |||||||| |  ||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  14618 ttgtaagtaaactcaatcatcggtaaacattcatcccaactgacaccttgctccaacacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 14519  T
Q  544 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 643  Q
    ||| ||| ||||| ||||| | | | || || ||||||| ||||||||| |   |||||||  |||||||||| | ||| ||  |||||||||| || ||    
T  14518 ccgtctgcccatcggtctgagaacggtaagcagaactcagtctcaacttagtttccaaagcagcttgcaaactctcccagaacttagaagtaaacctcgg 14419  T
Q  644 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 679  Q
    ||| | |||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  14418 atcacgatctgacacaatactagaaggaataccatg 14383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 73; Significance: 6e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 451 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 33193 - 32953
Alignment:
Q  451 tgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactg 550  Q
    ||||||| |||||||| || ||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || || || ||||||||||||||    
T  33193 tgaactctatcaacggtaggtgattatcccaagctccaccttgctcaagcacacataccctcaacaaatcttccaatgattggatcgtcctctccgactg 33094  T
Q  551 accatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctcta 650  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||| | || |||||||| ||||| || ||||| || || || ||||| |||    
T  33093 accatctgtctgaggatgataagtcgaactcaacctcaacttcgaacccaaatcatcctgcaaactcttccagaacctagaggtgaacctcggatcccta 32994  T
Q  651 tctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    || ||   ||| ||||| || ||||| || |||||||||||    
T  32993 tccgacgaaatactcgacggtacaccgtgcagcttcacaat 32953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 144 - 679
Target Start/End: Original strand, 3284 - 3818
Alignment:
Q  144 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 243  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || | ||| |||| |||| | |||||||||||||| || || ||  |||||||||| |  || ||||| | ||    
T  3284 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaataccggtcacaggattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcgatgtcctttctcctct 3383  T
Q  244 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 343  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| || ||  |||| |  || ||||  || |||||||| |     
T  3384 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccatagtctcttgcacaacttccggtcctaacaa 3483  T
Q  344 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 443  Q
      | ||||| ||||| |||||| | |||||||| ||  | ||||| ||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||| | || ||     
T  3484 agcactttctcctgattcaaactaacacaacggtgtcttacatcttcgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagaatgaaaactgttg 3583  T
Q  444 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 543  Q
    || ||||| ||||| ||||| || | |    | |||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||||||||||||||    | |||| |||||||    
T  3584 ttgtaagtaaactcaatcaaaggtaaacatttgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctctaaactcggaatagtcctct 3683  T
Q  544 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 643  Q
    | |  || ||||| ||||| |||||||| || ||||||||  ||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  3684 ctgtttgcccatcggtctg-ggatgataagcagaactcaacgtcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 3782  T
Q  644 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 679  Q
    ||| | |||| | ||||| || ||||||| ||||||    
T  3783 atcccgatcttacacaatactagaaggaataccatg 3818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 537 - 652
Target Start/End: Original strand, 17877 - 17992
Alignment:
Q  537 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 636  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || | ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  17877 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaaccttaactttgaactcaatgcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtga 17976  T
Q  637 atcttggatctctatc 652  Q
    |||| |||||||||||    
T  17977 atctcggatctctatc 17992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 219 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 26263 - 25959
Alignment:
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||| ||| ||||| | ||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| || || || ||||||| ||| || || |||||||    
T  26263 tgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttttcctgaatcatcttaaccttttccgtagttt 26164  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
      || ||||  ||| ||||||| |     |||||||| || | |||||| |||||||| || || || ||| |||||||||||||||| || ||||||||    
T  26163 cttgcacaacttctagtcctaacaaagaactttcaccggattaaaaccaacacaacggtgtcctacacctcggaccatacaaagcctcaaacggtgccat 26064  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     || ||||||| |||| | || || || ||||| ||||| |||||||| | |   ||||||||| |  | |||||||| |  ||||||  ||||||||||    
T  26063 accgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacatctatcccaactgacaccttgctccaacacacaagctctcaacaaa 25964  T
Q  519 tcctc 523  Q
    |||||    
T  25963 tcctc 25959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 144 - 679
Target Start/End: Original strand, 13033 - 13568
Alignment:
Q  144 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 243  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || ||||| |||| |||  | |||||||| ||||| || || ||  |||||||||||| ||| ||||| | ||    
T  13033 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacagggttcactctcaacaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcctct 13132  T
Q  244 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 343  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||| | ||| || || ||||| |  || ||||  || |||||||| |     
T  13133 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttggatcattttaaccttttccgtagtctcttgcacaacttccggtcctaacaa 13232  T
Q  344 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 443  Q
      |||| || || || |||||||| ||||| || || || || ||| |||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||| | || ||     
T  13233 ggctctctctccggattcaaaccaacacaatggtgtcctacacctctgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagaatgaaaactgttg 13332  T
Q  444 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 543  Q
    || || || ||||| |||||||| | |       ||||| |  | |||||||| |  ||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  13333 ttgtaggtaaactcaatcaacggtaaacattcgacccaaataacaccttgctccaacacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 13432  T
Q  544 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 643  Q
    |||  || ||||| || || ||||| || || ||||||||||| ||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  ||||||||||||| ||    
T  13433 ccgtttgcccatcggtatgaggatggtaagcagaactcaatctgaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaatctcgg 13532  T
Q  644 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 679  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  13533 atcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 13568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0808 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0808
Description:

Target: scaffold0808; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 157 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 1222 - 913
Alignment:
Q  157 acttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataact 256  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| |||| | ||||| ||||| || || || ||  || ||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||    
T  1222 acttcaaagcacgaccaacaccagtcacaggattcactctaaaaaatacatgatcgccaaccagaaactcaatatcttttctcctcttatcatgataact 1123  T
Q  257 cttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacct 356  Q
    ||| |||| |||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||| ||| || || ||||| |  || ||||  || |||||||| |   | |||||||||    
T  1122 cttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttggaccatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactttcacct 1023  T
Q  357 gactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaact 456  Q
     |||||||||| ||||  || || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||| | |||| | || || || ||||| ||||    
T  1022 aactcaaaccaacacattggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattctgatacttgtatgaaaactgttgttgtaagtaaact 923  T
Q  457 cgatcaacgg 466  Q
    | ||||||||    
T  922 caatcaacgg 913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0808; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 552 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 827 - 700
Alignment:
Q  552 ccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctat 651  Q
    ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||    
T  827 ccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgat 728  T
Q  652 ctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 679  Q
    |||| ||||| || |||| || ||||||    
T  727 ctgacacaatactagaagaaataccatg 700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 606 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 39730 - 39645
Alignment:
Q  606 tcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  39730 tcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgatggaacaccatgcaacttcacaat 39645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 68; Significance: 5e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 144 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 4056 - 3521
Alignment:
Q  144 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 243  Q
    ||||||||| |  |||| |||||||| || ||||| |||| |||| | ||||| |||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| | ||    
T  4056 gtcaacttcctacactttaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcactcttaaaaacacatgatcatcaacctgaaactcaatatcctttctcctct 3957  T
Q  244 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 343  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  ||  | ||||| |     
T  3956 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccaggcctaacaa 3857  T
Q  344 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 443  Q
      | || || |  || |||||||| ||||| || || || || |||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||| |||| | || ||     
T  3856 agcactctctctggattcaaaccaacacaatggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagcatgaaaactgttg 3757  T
Q  444 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 543  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| ||||| |    
T  3756 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtccttt 3657  T
Q  544 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 643  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||    
T  3656 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 3557  T
Q  644 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 679  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  3556 atcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 3521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 68; Significance: 5e-30; HSPs: 4)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 246 - 465
Target Start/End: Original strand, 71446 - 71665
Alignment:
Q  246 tcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagacca 345  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| || || ||||| |  || ||||  || |||||||| || |    
T  71446 tcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttggatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaacttccggtcctaacacaa 71545  T
Q  346 ctctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattatt 445  Q
    | ||||| || || |||||||| |||||| | || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| | || || ||    
T  71546 cactttctccagattcaaaccaacacaacagtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagaatgaaaactgttgtt 71645  T
Q  446 ataagtgaactcgatcaacg 465  Q
     ||||| ||||| |||||||    
T  71646 gtaagtaaactcaatcaacg 71665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 564 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 33174 - 33059
Alignment:
Q  564 ggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgc 663  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||| |  ||||||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||| || ||||| | |||||| ||||| |    
T  33174 ggatgataagcagaactcaacctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatac 33075  T
Q  664 tcgaaggaacaccatg 679  Q
    | ||||||| ||||||    
T  33074 tagaaggaataccatg 33059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 165 - 300
Target Start/End: Original strand, 13397 - 13532
Alignment:
Q  165 gcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtc 264  Q
    ||||| || |||||||| | |||| | |||||||| || ||||| || ||  |||||||||||| ||| ||||| |  || |||||||| ||||| | ||    
T  13397 gcacgaccaacaccagttacaggattaactctcaagaatacgtgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctccttttatcatgatagctcttctatc 13496  T
Q  265 gactctgcgacgccttcattttctcttggatcatct 300  Q
     |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  13497 tactctgagacgctttcatcttctcttggatcatct 13532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 585 - 679
Target Start/End: Original strand, 24529 - 24623
Alignment:
Q  585 ctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 679  Q
    |||||||| | |||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| | || |||||| ||||| || || |||| ||||||    
T  24529 ctcaacttagtgcccaaagcaacttgcaaactctcccaaaatatagaagtaaatcttgggtgtcgatctgacacaatactagatggaataccatg 24623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 68; Significance: 5e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 178
Target Start/End: Original strand, 136119 - 136278
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    |||||||||||||||||||||| || || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||| | ||  ||||    
T  136119 catacttccgaagttgcgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaaccaactctatatgccacagttccaactctctctgaaat 136218  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacacc 178  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  136219 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacc 136278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 387 - 499
Target Start/End: Original strand, 136278 - 136390
Alignment:
Q  387 ctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttc 486  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||  || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||    
T  136278 ctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaattgtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctc 136377  T
Q  487 ctccttgctcaag 499  Q
    | |||||||||||    
T  136378 caccttgctcaag 136390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1032 (Bit Score: 62; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold1032
Description:

Target: scaffold1032; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 19 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 2172 - 2023
Alignment:
Q  19 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || |  ||||||||||  || ||||| ||||||||  | ||| | ||    
T  2172 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtgtaaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctccgatat 2073  T
Q  119 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcac 168  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||    
T  2072 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcac 2023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 62; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 157 - 434
Target Start/End: Original strand, 14661 - 14938
Alignment:
Q  157 acttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataact 256  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| | || | |||||||||||||| || || ||  ||||||||||||  || || || | ||| |||||||||||    
T  14661 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgattcactctcaaaaacacatgatccccaacctgaaactcaatgtccttcctcctcttatcatgataact 14760  T
Q  257 cttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacct 356  Q
    ||| |||| |||||| ||| | ||||| |||||||  ||||||| || ||| || ||||| |  || ||||  || |||||||| |  || |||||||||    
T  14761 cttctgtctactctgagactctttcatcttctcttcaatcatcttaaatttttccgtagtctcttgcacaacttccggtcctaacaaaacactttcacct 14860  T
Q  357 gactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatga 434  Q
    ||||||||| | |||||||   | || || ||| |||||||||||||||| || |||||||| || |||| |||||||    
T  14861 gactcaaacaaacacaacgacatcctacacctcggaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatacaagaatga 14938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 60; Significance: 3e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 144 - 679
Target Start/End: Original strand, 24005 - 24540
Alignment:
Q  144 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 243  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || ||||||||||  ||| | ||||| |||||||| || || ||  |||||||||||| ||| ||||| | ||    
T  24005 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccagtcaccggattaactctaaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcctct 24104  T
Q  244 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 343  Q
    | |||||||||||||| |||| ||| || || || || || ||||| || ||||||| ||| || ||  |||| |  || ||||  ||||||||||| |     
T  24105 tatcatgataactcttctgtctactttgagatgctttaatcttctcctgaatcatcttaaccttttccatagtctcttggacaacttctggtcctaacaa 24204  T
Q  344 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 443  Q
      | || |||| |||||| ||| | |||||||| || || || ||| |||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||| |  ||||     
T  24205 agcactctcacttgactcgaactaacacaacggtgtcctacacctctgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccgatactagaatgaaaattattg 24304  T
Q  444 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 543  Q
    || ||||| ||||| | ||| || | |     ||||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||||||||| || |    ||| || |||||||    
T  24305 ttgtaagtaaactctaccaaaggtaaacattcatcccaactaacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctggatagtcctct 24404  T
Q  544 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 643  Q
    ||| ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| ||    ||||||||  |||||||||| | ||||||   |||||| || |||||    
T  24405 ccgtctgcccatcagtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaaattaattcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaactgagaagtgaaccttgg 24504  T
Q  644 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 679  Q
    ||| | |||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  24505 atcccgatctgacacaatactagaaggaataccatg 24540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 58; Significance: 5e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 219 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 1530 - 1293
Alignment:
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||| ||| |||||   ||| |||||||||||||| | || |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| || || ||||| |    
T  1530 tgaaactcaatatcctttctcttcttatcatgataactcttctatctactctgagacgctttcatcttctcttggatcatcttaaccttttccgtagtct 1431  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
      || ||||  || |||||||| |   | |||||||||||||||||| | |||||||| || || || ||| | |||||||||||||| || |||| |||    
T  1430 cttgcacaacttccggtcctaacaaggcactttcacctgactcaaactaacacaacggtgtcctacacctcagtccatacaaagcctcaaacggtgtcat 1331  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaact 456  Q
    ||| |||||||||||| | || || || ||||||||||    
T  1330 tccgatactagaatgaaaactgttgttgtaagtgaact 1293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 56; Significance: 8e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 144 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 28447 - 27912
Alignment:
Q  144 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 243  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || ||||| |||| | || | || ||||||||||| || || ||| | || ||||||| ||| ||||| | ||    
T  28447 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacatgattcaccctcaaaaacacatgatcacctacttgtaactcaatatcctttctcctct 28348  T
Q  244 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 343  Q
    | |||||||||||||| |||| ||| || || |||||||| |||||||| ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  |  |||||||| |     
T  28347 tatcatgataactcttctgtctactttgagatgccttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaactttcggtcctaacaa 28248  T
Q  344 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 443  Q
      | |||||||||||||||||||| ||||| || || || || || | ||||||||||||||| || |||| ||| || ||||||| |||| |  | ||     
T  28247 agcactttcacctgactcaaaccaacacaatggtgtcctacaccttctaccatacaaagcctcaaacggtgtcataccgatactagcatgaaaattgttg 28148  T
Q  444 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 543  Q
    || ||||| ||||| |||||| | | |      |||||| |  | |||||| | | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  28147 ttgtaagtaaactcaatcaacagtaaacattcgtcccaactaacaccttgcaccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 28048  T
Q  544 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 643  Q
    ||| ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||||| |  ||||||||  |||| ||||| | ||| ||  ||||||||||  | ||    
T  28047 ccgtctgcccatcggtctggggatggtaagcagaactcaacctcaacttagttcccaaagcagcttgtaaactctcccagaacttagaagtaaacatcgg 27948  T
Q  644 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 679  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  27947 atcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 27912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 56; Significance: 8e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 564 - 687
Target Start/End: Complemental strand, 81593 - 81470
Alignment:
Q  564 ggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgc 663  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| |    
T  81593 ggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaagctcttccaaaatctagatgtgaacctcggatccctatccgacacaatac 81494  T
Q  664 tcgaaggaacaccatgtagcttca 687  Q
    |||| || ||||||||||||||||    
T  81493 tcgacggtacaccatgtagcttca 81470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 52; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 192 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 4077 - 3590
Alignment:
Q  192 actctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctt 291  Q
    |||||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| ||||| | ||| |||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||| ||||| |    
T  4077 actctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttatgtctactttgagacgccttcatcttctcct 3978  T
Q  292 ggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccg 391  Q
    | ||||||| ||| || |  ||||| |  || ||||  || |||| ||| |   | || || || ||||||||||| |||||||| || || || |||||    
T  3977 gaatcatcttaacctttttcgtagtctcttgcacaacttccggtcttaacaaagcactctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccg 3878  T
Q  392 accatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcct 491  Q
    ||||||||||||||| || || ||||| || |||||||||| | | || || || ||||| ||||| ||||| || | |      |||||| || | |||    
T  3877 accatacaaagcctcaaacggagccatgccgatactagaataaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaatggtaaacattcgtcccaacttacacct 3778  T
Q  492 tgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaact 591  Q
    ||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||| | ||||| |  | ||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||    
T  3777 tgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgattagtcctttttgtctgcccatctgtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaact 3678  T
Q  592 tcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 679  Q
    | |  || ||||   |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | |||  | ||||| || ||||||| ||||||    
T  3677 tagttccgaaagtagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccaacacaatactagaaggaataccatg 3590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 50; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 157 - 466
Target Start/End: Original strand, 9125 - 9434
Alignment:
Q  157 acttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataact 256  Q
    ||||||||||||| || |||||||| | | || | |||||||| || || || || ||  |||||||||||| ||| |||||   ||| |||||||| ||    
T  9125 acttcaaagcacgaccaacaccagttacatgattcactctcaagaatacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcatcttatcatgatagct 9224  T
Q  257 cttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacct 356  Q
    ||| | || |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| || || ||||| |  || ||||  ||  ||||||| |   | |||||||||    
T  9225 cttctatctactctgagacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttctgtagtctcttgcacaacttcctgtcctaacaaagcactttcacct 9324  T
Q  357 gactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaact 456  Q
    ||||||||||| ||||||||    || ||||| ||||||||||||||||| || |||| |||  | |||||||||||| | || || |||||||| ||||    
T  9325 gactcaaaccaacacaacggtaacctacatcttcgaccatacaaagcctcaaacggtgtcatcgcgatactagaatgaaaactgttgttataagtaaact 9424  T
Q  457 cgatcaacgg 466  Q
      ||||||||    
T  9425 aaatcaacgg 9434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 48; Significance: 5e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 144 - 679
Target Start/End: Original strand, 14782 - 15316
Alignment:
Q  144 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 243  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || |||||||||| |||| | || || |||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  14782 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccagtcacaggattcaccctaaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 14881  T
Q  244 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 343  Q
    | ||||||||||| || |||| |||||| ||| ||||||| ||||| |  ||||||| ||| || || ||||| |  || ||||  || |||||||| |     
T  14882 tatcatgataacttttctgtctactctgagacaccttcatcttctcctaaatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaacttccggtcctaacaa 14981  T
Q  344 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 443  Q
      | || || || ||||||||||| |||||||| || || || |||| |||||||||| |||| || ||||| ||  | |||||||||||| | || ||     
T  14982 agcactctctccggactcaaacca-cacaacggtgtcctacacctcctaccatacaaaacctcaaacggtgctatatcgatactagaatgaaaactgttg 15080  T
Q  444 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 543  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |     ||||||| |  | |||||||| |  | |||   |||||||||||| ||||    |||||| |||||||    
T  15081 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcatcccaactgacaccttgctccaacagacacgctctcaacaaatcttctaaactctgaatagtcctct 15180  T
Q  544 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 643  Q
    ||| ||| ||||  ||||| ||||| || || |||||||| |||||||| |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  15181 ccgtctgcccattggtctgaggatggtaagcagaactcaacctcaacttagttcccaaggcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 15280  T
Q  644 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 679  Q
    ||| | |||||| ||||| || |||| || ||||||    
T  15281 atcccgatctgacacaatactagaagaaataccatg 15316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 219 - 679
Target Start/End: Original strand, 43738 - 44198
Alignment:
Q  219 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 318  Q
    |||||||||| ||| ||||| | ||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||| ||| || || ||||| |    
T  43738 tgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttatgtctactctgagacgctttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtct 43837  T
Q  319 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 418  Q
      || ||||  || |||||||| |   | ||||| || ||||||||||| |||| ||| ||  | || |||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  43838 cttgcacaacttccggtcctaataaagcactttctccggactcaaaccaacacagcggtgtcatacacctcctaccatacaaagcctcaaacggtgccat 43937  T
Q  419 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 518  Q
     |  |||||||||||| | || || || ||||| ||||| ||||| || | |      |||||| |  | |  ||||| | |||||||  ||||||||||    
T  43938 actgatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaatggtaaacattcgtcccaactaacacactgctccaaaacacaagctctcaacaaa 44037  T
Q  519 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 618  Q
    || ||||    |||||| |||||||||  ||| ||||| || |  ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| |    
T  44038 tcttctaaactctgaatagtcctctccatctgcccatcggtataaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactct 44137  T
Q  619 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 679  Q
     ||||||  |||||||||| || |||||   ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  44138 cccaaaacttagaagtaaacctcggatccagatccgacacaatactagaaggaataccatg 44198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 47; Significance: 2e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 530 - 672
Target Start/End: Original strand, 11167 - 11309
Alignment:
Q  530 ctgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatcta 629  Q
    |||||| |||||||||  ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |  ||||||||  ||| |||||| | ||||||  ||    
T  11167 ctgaatggtcctctccatctgcccatcggtctggggatgataagcagaactcaacctcaacttagttcccaaagcagcttacaaactctcccaaaactta 11266  T
Q  630 gaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 672  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | ||| || |||||||    
T  11267 gaagtaaatcttggatctcgatctgacataatactagaaggaa 11309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 348 - 434
Target Start/End: Original strand, 10985 - 11071
Alignment:
Q  348 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatga 434  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| | ||||| || |||| ||||||||||| ||| || |||| ||| || ||||||||||||    
T  10985 ctttcacctgactcataccaacacaacagcgttctacacctcctaccatacaaagtctcaaacggtgtcatcccgatactagaatga 11071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 8999 - 8748
Alignment:
Q  217 cctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 316  Q
    ||||||||||||  || || || | ||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| || || |||||    
T  8999 cctgaaactcaatgtccttcctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccgtagt 8900  T
Q  317 ttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcc 416  Q
     |  || ||||  || |||||||| |   | |||||  | || |||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||  ||| |    
T  8899 ctcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactttcttcggattcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaactgtgtc 8800  T
Q  417 attccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaa 468  Q
    ||||| ||| ||| |||| | || || || ||||| ||||| ||||||||||    
T  8799 attccgatattagtatgaaaactgtttttgtaagtaaactcaatcaacggaa 8748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 537 - 679
Target Start/End: Original strand, 5693 - 5835
Alignment:
Q  537 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 636  Q
    ||||| |||| ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||    
T  5693 gtcctatccgtctgcccatcagtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacatagaagtaa 5792  T
Q  637 atcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 679  Q
    | || ||||| | |||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  5793 acctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaataccatg 5835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 509 - 679
Target Start/End: Original strand, 18541 - 18711
Alignment:
Q  509 tctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctct 608  Q
    |||||||||||| |||| |  |||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  || |||||  ||    
T  18541 tctcaacaaatcttctaacctctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttccgaaagcagct 18640  T
Q  609 tgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 679  Q
    |||||||| | ||||||  ||||||||||  ||||||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  18641 tgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacgttggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 18711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 157 - 289
Target Start/End: Original strand, 5879 - 6011
Alignment:
Q  157 acttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataact 256  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||| | || ||||||||||| || || ||  | ||| |||||| ||| ||||| | ||| |||||||||||    
T  5879 acttcaaagcacgaccaacaccggtcataggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgatactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 5978  T
Q  257 cttttgtcgactctgcgacgccttcattttctc 289  Q
    ||| |||| |||||| ||||| ||||| |||||    
T  5979 cttctgtctactctgagacgctttcatcttctc 6011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 157 - 289
Target Start/End: Original strand, 10493 - 10625
Alignment:
Q  157 acttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataact 256  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||| |||||||||||    
T  10493 acttcaaagcacgaccaacaccggtcaaaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 10592  T
Q  257 cttttgtcgactctgcgacgccttcattttctc 289  Q
    ||| |||| |||||| ||||| ||||| |||||    
T  10593 cttctgtctactctgagacgctttcatcttctc 10625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 360 - 679
Target Start/End: Original strand, 14478 - 14798
Alignment:
Q  360 tcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcga 459  Q
    |||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||||||| | || || || ||||| ||||| |    
T  14478 tcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaatggcgccataccgatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaa 14577  T
Q  460 tcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgt 559  Q
    ||||| | | |  |   |||||| |  |  ||||||| | |||||||  ||| ||||||||||| |    |||||| | ||||||   ||| ||||||||    
T  14578 tcaacagtaaacaatcgtcccaactgacagcttgctccaaaacacaagctcttaacaaatcctccaaactctgaatagccctctcgatctgcccatctgt 14677  T
Q  560 ctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc-aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatac 658  Q
    ||  |||||||| || |||||||| |||||||| |  ||| |||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||| |||| ||| | |||| | ||    
T  14678 cttgggatgataagcagaactcaacctcaacttagttcccaaaagcagcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaaccttgaatcccgatctaacac 14777  T
Q  659 aatgctcgaaggaacaccatg 679  Q
    ||| || ||||||| ||||||    
T  14778 aatactagaaggaataccatg 14798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 157 - 289
Target Start/End: Original strand, 8488 - 8620
Alignment:
Q  157 acttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataact 256  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||| | || ||||||||||| || || ||  | ||| |||||| ||| ||||| | ||| |||||||||||    
T  8488 acttcaaagcacgaccaacaccggtcataggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgatactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 8587  T
Q  257 cttttgtcgactctgcgacgccttcattttctc 289  Q
    ||| |||| |||||| ||||| ||||| |||||    
T  8588 cttctgtctactctgagacgctttcatcttctc 8620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 500 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 3744 - 3565
Alignment:
Q  500 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 599  Q
    |||||||  |||||||||||| || |  || | |||||||||||  |  |||||||| ||||| |||||||| ||  ||||||  |||||||| |  |||    
T  3744 aacacaagctctcaacaaatcttccaaagatttaattgtcctcttggtttgaccatcagtctgaggatgataagcaaaactcagcctcaacttagttccc 3645  T
Q  600 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 679  Q
    |||||  |||||||||| | ||||||  |  ||||||| || |||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||    
T  3644 aaagctgcttgcaaactctcccaaaactttaaagtaaacctcggatctctatctgacacaatgctagatggaataccatg 3565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 360 - 464
Target Start/End: Original strand, 2897 - 3001
Alignment:
Q  360 tcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcga 459  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||| ||| | |||||||  ||| |||||||| | || || || ||||| ||||| |    
T  2897 tcaaaccaacacaacggtgttctacacctcctaccatacaaagcctcaaaaagagccattctgatagtagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaa 2996  T
Q  460 tcaac 464  Q
    |||||    
T  2997 tcaac 3001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 387 - 466
Target Start/End: Original strand, 17 - 96
Alignment:
Q  387 ctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacgg 466  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||| | || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  17 ctccgaccatacaaggcctcaaacggtgccataccgatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacgg 96  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1061 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1061
Description:

Target: scaffold1061; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 618 - 691
Target Start/End: Original strand, 2187 - 2260
Alignment:
Q  618 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 691  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||| ||||| || || ||||| | |||||||||    
T  2187 ttccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatttgaaacaatactcgacgggactccatgcaacttcacaat 2260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University