View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8961_low_7 (Length: 755)

Name: NF8961_low_7
Description: NF8961
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8961_low_7
NF8961_low_7
[»] chr3 (142 HSPs)
chr3 (1-667)||(54634710-54635397)
chr3 (4-668)||(6716084-6716770)
chr3 (1-380)||(45282875-45283260)
chr3 (1-380)||(25637321-25637704)
chr3 (1-380)||(3617342-3617724)
chr3 (1-380)||(4600638-4601019)
chr3 (5-380)||(4598421-4598798)
chr3 (1-380)||(10211288-10211669)
chr3 (5-380)||(800983-801355)
chr3 (1-380)||(10209068-10209449)
chr3 (6-380)||(10056112-10056489)
chr3 (6-380)||(10058334-10058711)
chr3 (6-380)||(10060556-10060933)
chr3 (6-380)||(10062778-10063155)
chr3 (6-380)||(10065000-10065377)
chr3 (5-309)||(7779903-7780208)
chr3 (12-380)||(23200045-23200420)
chr3 (238-604)||(6718331-6718718)
chr3 (16-380)||(23197850-23198221)
chr3 (455-654)||(8477790-8477990)
chr3 (181-380)||(10067222-10067419)
chr3 (7-380)||(9636028-9636410)
chr3 (7-380)||(5258048-5258427)
chr3 (406-620)||(2671111-2671328)
chr3 (102-380)||(45095050-45095335)
chr3 (477-654)||(40372268-40372446)
chr3 (7-380)||(5260227-5260606)
chr3 (7-380)||(19683792-19684172)
chr3 (455-668)||(25637012-25637225)
chr3 (455-667)||(3617034-3617246)
chr3 (455-654)||(7167670-7167870)
chr3 (7-380)||(37408344-37408723)
chr3 (483-667)||(800685-800870)
chr3 (455-604)||(45282628-45282778)
chr3 (475-667)||(1306411-1306604)
chr3 (455-667)||(4598894-4599107)
chr3 (455-667)||(4601115-4601328)
chr3 (455-659)||(10058034-10058240)
chr3 (455-659)||(10060256-10060462)
chr3 (455-659)||(10062478-10062684)
chr3 (455-659)||(10064700-10064906)
chr3 (102-380)||(7762151-7762437)
chr3 (455-659)||(10055812-10056018)
chr3 (455-659)||(10066922-10067128)
chr3 (482-654)||(22172674-22172847)
chr3 (475-667)||(23198337-23198530)
chr3 (475-667)||(23200536-23200729)
chr3 (405-667)||(10208778-10209042)
chr3 (7-380)||(7764353-7764729)
chr3 (455-654)||(28503331-28503530)
chr3 (455-667)||(6718288-6718481)
chr3 (102-380)||(9581168-9581454)
chr3 (455-650)||(27352097-27352293)
chr3 (455-654)||(28501164-28501363)
chr3 (475-669)||(26928078-26928273)
chr3 (482-654)||(18656843-18657017)
chr3 (455-667)||(10210978-10211191)
chr3 (541-667)||(7782586-7782712)
chr3 (503-667)||(33386137-33386302)
chr3 (102-380)||(39153358-39153644)
chr3 (102-272)||(34491212-34491383)
chr3 (14-380)||(5236368-5236739)
chr3 (450-604)||(8738585-8738740)
chr3 (450-604)||(9090823-9090978)
chr3 (466-667)||(37408036-37408236)
chr3 (99-272)||(49199462-49199638)
chr3 (106-272)||(4569952-4570120)
chr3 (102-272)||(29196383-29196555)
chr3 (503-668)||(37726134-37726300)
chr3 (102-380)||(40734383-40734669)
chr3 (102-380)||(760732-761018)
chr3 (503-667)||(27453416-27453581)
chr3 (102-272)||(44700476-44700646)
chr3 (102-380)||(32744433-32744709)
chr3 (99-272)||(43401794-43401970)
chr3 (102-380)||(29682244-29682530)
chr3 (102-380)||(40735268-40735554)
chr3 (102-339)||(44331470-44331716)
chr3 (113-380)||(22835010-22835285)
chr3 (99-268)||(30236129-30236299)
chr3 (482-669)||(2672416-2672604)
chr3 (6-141)||(10067439-10067576)
chr3 (99-272)||(43403737-43403913)
chr3 (106-272)||(6095600-6095767)
chr3 (102-270)||(31314447-31314616)
chr3 (106-272)||(41819523-41819691)
chr3 (106-272)||(54593704-54593871)
chr3 (102-380)||(51398699-51398985)
chr3 (482-660)||(2676581-2676760)
chr3 (102-380)||(16498915-16499200)
chr3 (475-604)||(32143754-32143884)
chr3 (106-272)||(46860474-46860642)
chr3 (113-272)||(53921511-53921671)
chr3 (102-272)||(29813063-29813234)
chr3 (126-380)||(29810753-29811016)
chr3 (113-270)||(32891105-32891264)
chr3 (609-669)||(45282583-45282642)
chr3 (482-654)||(8512642-8512815)
chr3 (481-561)||(32475885-32475966)
chr3 (481-561)||(32480743-32480824)
chr3 (99-214)||(40913352-40913467)
chr3 (115-253)||(46173377-46173515)
chr3 (102-289)||(9666463-9666659)
chr3 (607-667)||(32143868-32143928)
chr3 (482-654)||(8517522-8517695)
chr3 (102-272)||(23391906-23392077)
chr3 (503-604)||(27986001-27986103)
chr3 (104-269)||(47304254-47304420)
chr3 (144-272)||(51352150-51352278)
chr3 (482-654)||(24968519-24968692)
chr3 (607-667)||(27974433-27974493)
chr3 (106-212)||(55301972-55302079)
chr3 (200-305)||(5433971-5434086)
chr3 (607-667)||(27985957-27986017)
chr3 (590-654)||(36029640-36029704)
chr3 (609-657)||(40734084-40734132)
chr3 (608-667)||(40845220-40845279)
chr3 (143-272)||(36018852-36018982)
chr3 (609-654)||(16264896-16264941)
chr3 (609-654)||(21711768-21711813)
chr3 (609-654)||(27027273-27027318)
chr3 (609-654)||(30709271-30709316)
chr3 (615-654)||(8738554-8738593)
chr3 (615-654)||(9090792-9090831)
chr3 (589-668)||(27038588-27038667)
chr3 (405-444)||(45282809-45282848)
chr3 (155-267)||(4055813-4055926)
chr3 (592-654)||(32475997-32476059)
chr3 (592-654)||(32480855-32480917)
chr3 (609-667)||(39032017-39032075)
chr3 (511-657)||(40735015-40735161)
chr3 (201-260)||(28253363-28253423)
chr3 (155-214)||(4075520-4075581)
chr3 (114-172)||(27305719-27305777)
chr3 (616-654)||(1730921-1730959)
chr3 (330-380)||(7782375-7782424)
chr3 (473-519)||(7782538-7782584)
chr3 (524-558)||(22172864-22172898)
chr3 (199-252)||(25517069-25517121)
chr3 (609-654)||(35926057-35926101)
chr3 (609-654)||(40592257-40592302)
chr3 (609-650)||(48438782-48438823)
[»] chr6 (97 HSPs)
chr6 (1-667)||(27647467-27648126)
chr6 (1-380)||(16554762-16555144)
chr6 (1-380)||(16631318-16631700)
chr6 (1-373)||(16653012-16653387)
chr6 (1-380)||(16578411-16578793)
chr6 (1-380)||(16616587-16616969)
chr6 (1-380)||(25421198-25421580)
chr6 (1-380)||(6027141-6027520)
chr6 (7-380)||(411994-412369)
chr6 (1-380)||(34166973-34167354)
chr6 (1-380)||(33341997-33342380)
chr6 (16-380)||(3072670-3073036)
chr6 (6-380)||(34164751-34165128)
chr6 (5-380)||(6097349-6097717)
chr6 (1-301)||(13153886-13154189)
chr6 (455-668)||(16578889-16579102)
chr6 (455-668)||(16616278-16616491)
chr6 (7-380)||(2171431-2171814)
chr6 (455-667)||(16554454-16554666)
chr6 (455-667)||(16631010-16631222)
chr6 (7-380)||(31404579-31404957)
chr6 (473-669)||(411683-411881)
chr6 (12-380)||(5406109-5406481)
chr6 (12-380)||(5410434-5410806)
chr6 (455-669)||(5674227-5674442)
chr6 (448-667)||(25420797-25421016)
chr6 (7-380)||(5413299-5413675)
chr6 (7-380)||(16452232-16452612)
chr6 (473-667)||(3073148-3073343)
chr6 (7-380)||(30834438-30834819)
chr6 (405-667)||(2171838-2172104)
chr6 (455-669)||(6136335-6136549)
chr6 (475-667)||(22709452-22709645)
chr6 (455-659)||(34166673-34166879)
chr6 (500-654)||(30125030-30125185)
chr6 (455-659)||(13150856-13151062)
chr6 (455-667)||(33342475-33342688)
chr6 (455-671)||(34164440-34164657)
chr6 (455-667)||(6026834-6027046)
chr6 (472-654)||(11857373-11857555)
chr6 (455-604)||(16652759-16652909)
chr6 (541-669)||(6097860-6097988)
chr6 (472-654)||(14741938-14742120)
chr6 (472-654)||(22010201-22010383)
chr6 (427-604)||(5266432-5266610)
chr6 (7-380)||(33160254-33160636)
chr6 (106-272)||(21588931-21589098)
chr6 (106-272)||(21593664-21593831)
chr6 (102-380)||(9183028-9183314)
chr6 (99-272)||(3808701-3808877)
chr6 (482-654)||(6438898-6439071)
chr6 (542-667)||(26253589-26253714)
chr6 (106-269)||(17758026-17758191)
chr6 (106-272)||(2972940-2973107)
chr6 (102-380)||(16568928-16569193)
chr6 (448-558)||(25421000-25421110)
chr6 (7-201)||(5408974-5409164)
chr6 (106-272)||(17762990-17763158)
chr6 (106-360)||(28137409-28137671)
chr6 (106-270)||(26830124-26830289)
chr6 (102-380)||(26954283-26954568)
chr6 (106-272)||(22424826-22424995)
chr6 (503-667)||(23896792-23896957)
chr6 (106-269)||(5043630-5043795)
chr6 (473-667)||(16839137-16839331)
chr6 (482-570)||(28155167-28155256)
chr6 (482-667)||(33329932-33330118)
chr6 (587-671)||(34151824-34151907)
chr6 (99-238)||(603082-603222)
chr6 (102-272)||(33211182-33211353)
chr6 (472-604)||(14737128-14737260)
chr6 (482-667)||(33335429-33335615)
chr6 (155-272)||(3038953-3039071)
chr6 (482-668)||(6005821-6006008)
chr6 (482-561)||(5343879-5343959)
chr6 (155-272)||(4045423-4045542)
chr6 (609-667)||(16652716-16652773)
chr6 (205-380)||(16567091-16567265)
chr6 (106-218)||(26800642-26800755)
chr6 (503-668)||(5756950-5757116)
chr6 (609-654)||(5266596-5266641)
chr6 (609-654)||(14737097-14737142)
chr6 (592-654)||(5343990-5344052)
chr6 (405-519)||(6097741-6097858)
chr6 (611-654)||(28155102-28155145)
chr6 (609-654)||(5016981-5017026)
chr6 (609-654)||(31085958-31086003)
chr6 (524-556)||(16554659-16554691)
chr6 (524-556)||(16578864-16578896)
chr6 (524-556)||(16616484-16616516)
chr6 (524-556)||(16631215-16631247)
chr6 (524-556)||(16652902-16652934)
chr6 (609-660)||(5571755-5571806)
chr6 (405-444)||(16554697-16554736)
chr6 (405-444)||(16631253-16631292)
chr6 (405-444)||(16652940-16652979)
chr6 (524-558)||(11857331-11857365)
[»] chr1 (100 HSPs)
chr1 (1-667)||(9036003-9036690)
chr1 (1-380)||(40282269-40282649)
chr1 (1-380)||(21053850-21054230)
chr1 (1-380)||(9987094-9987474)
chr1 (1-380)||(20622133-20622514)
chr1 (1-380)||(44203526-44203906)
chr1 (7-380)||(51765280-51765663)
chr1 (457-667)||(20622610-20622821)
chr1 (473-667)||(40281958-40282154)
chr1 (475-667)||(21053540-21053733)
chr1 (473-667)||(9986785-9986980)
chr1 (7-380)||(8550688-8551070)
chr1 (455-668)||(44203217-44203430)
chr1 (7-380)||(20762557-20762932)
chr1 (407-669)||(51764988-51765254)
chr1 (7-273)||(13316256-13316521)
chr1 (475-667)||(19360912-19361105)
chr1 (12-380)||(3189216-3189590)
chr1 (12-380)||(3198033-3198407)
chr1 (12-380)||(3206872-3207246)
chr1 (483-667)||(19365768-19365953)
chr1 (542-667)||(24202251-24202376)
chr1 (7-380)||(3156751-3157129)
chr1 (455-604)||(24793709-24793859)
chr1 (482-654)||(39445897-39446070)
chr1 (482-659)||(41391001-41391178)
chr1 (482-654)||(44023389-44023562)
chr1 (482-654)||(25439411-25439584)
chr1 (102-380)||(28220223-28220509)
chr1 (106-272)||(37168297-37168465)
chr1 (102-380)||(834164-834450)
chr1 (102-380)||(31659123-31659409)
chr1 (482-654)||(1054526-1054699)
chr1 (106-272)||(13547090-13547257)
chr1 (482-654)||(25444604-25444777)
chr1 (102-380)||(4552634-4552920)
chr1 (99-272)||(42297968-42298143)
chr1 (455-586)||(24786905-24787037)
chr1 (106-272)||(13549001-13549168)
chr1 (466-667)||(13604095-13604296)
chr1 (102-272)||(28265551-28265722)
chr1 (106-272)||(29136247-29136415)
chr1 (106-272)||(47255340-47255508)
chr1 (102-380)||(28223418-28223704)
chr1 (102-380)||(44455045-44455331)
chr1 (106-272)||(7482231-7482399)
chr1 (106-272)||(11348698-11348865)
chr1 (106-272)||(31925708-31925875)
chr1 (102-380)||(3847118-3847404)
chr1 (102-380)||(37503554-37503837)
chr1 (102-272)||(37033068-37033241)
chr1 (104-272)||(19754494-19754664)
chr1 (102-272)||(49918350-49918521)
chr1 (126-272)||(23555286-23555433)
chr1 (106-272)||(47115171-47115340)
chr1 (102-380)||(196904-197191)
chr1 (102-342)||(37559864-37560115)
chr1 (102-272)||(45644351-45644523)
chr1 (102-272)||(50169207-50169378)
chr1 (102-380)||(13659333-13659619)
chr1 (106-272)||(193611-193778)
chr1 (143-380)||(1833407-1833652)
chr1 (110-272)||(34603576-34603740)
chr1 (482-604)||(41398656-41398778)
chr1 (102-272)||(50167172-50167343)
chr1 (102-321)||(46064861-46065089)
chr1 (102-380)||(13137973-13138257)
chr1 (102-272)||(19752685-19752857)
chr1 (161-272)||(41360914-41361026)
chr1 (126-380)||(15820192-15820455)
chr1 (141-267)||(22079322-22079449)
chr1 (590-660)||(21536119-21536189)
chr1 (473-519)||(24202379-24202425)
chr1 (106-187)||(28242391-28242472)
chr1 (102-272)||(30476443-30476614)
chr1 (609-654)||(24793678-24793723)
chr1 (106-251)||(927977-928123)
chr1 (482-561)||(43988054-43988134)
chr1 (524-650)||(26644390-26644517)
chr1 (609-671)||(3282273-3282335)
chr1 (102-380)||(10925108-10925397)
chr1 (102-269)||(40122193-40122363)
chr1 (609-659)||(41398764-41398814)
chr1 (296-380)||(13316518-13316601)
chr1 (609-654)||(13598967-13599012)
chr1 (132-218)||(6808507-6808595)
chr1 (609-653)||(37070334-37070378)
chr1 (129-258)||(3460710-3460841)
chr1 (144-218)||(16455676-16455750)
chr1 (199-272)||(37879005-37879079)
chr1 (200-269)||(8871143-8871213)
chr1 (106-187)||(37876767-37876848)
chr1 (168-267)||(12318585-12318685)
chr1 (186-250)||(48382441-48382505)
chr1 (191-254)||(32736952-32737015)
chr1 (191-254)||(35109493-35109556)
chr1 (144-218)||(5459961-5460035)
chr1 (126-187)||(36683766-36683828)
chr1 (142-258)||(37282728-37282846)
chr1 (609-650)||(16124197-16124238)
[»] chr8 (86 HSPs)
chr8 (1-380)||(3439396-3439776)
chr8 (1-380)||(25689847-25690228)
chr8 (1-380)||(15290417-15290798)
chr8 (1-380)||(15470786-15471167)
chr8 (1-380)||(42575219-42575599)
chr8 (7-380)||(2627627-2628002)
chr8 (457-667)||(3439088-3439297)
chr8 (7-380)||(31218142-31218521)
chr8 (7-380)||(34254235-34254611)
chr8 (7-380)||(17982538-17982917)
chr8 (455-654)||(36979802-36980002)
chr8 (413-654)||(33037299-33037543)
chr8 (7-380)||(34256411-34256787)
chr8 (455-654)||(4759546-4759746)
chr8 (455-654)||(30656070-30656270)
chr8 (473-667)||(1261414-1261609)
chr8 (7-380)||(19945263-19945643)
chr8 (7-380)||(44303739-44304119)
chr8 (7-380)||(42498079-42498459)
chr8 (455-654)||(18852639-18852839)
chr8 (483-667)||(2627318-2627503)
chr8 (482-654)||(10683751-10683924)
chr8 (405-667)||(15290143-15290407)
chr8 (405-667)||(15470512-15470776)
chr8 (455-654)||(18870033-18870233)
chr8 (475-670)||(26288324-26288520)
chr8 (475-670)||(26301581-26301777)
chr8 (475-670)||(26313575-26313771)
chr8 (103-380)||(1746216-1746501)
chr8 (455-604)||(25689604-25689753)
chr8 (455-667)||(42575696-42575909)
chr8 (455-654)||(6311724-6311923)
chr8 (474-654)||(7289439-7289620)
chr8 (543-667)||(31042908-31043032)
chr8 (472-654)||(25327676-25327858)
chr8 (482-654)||(39784337-39784510)
chr8 (102-380)||(43036308-43036594)
chr8 (12-380)||(12702542-12702921)
chr8 (102-380)||(15212671-15212957)
chr8 (102-380)||(33352035-33352321)
chr8 (102-379)||(27811164-27811449)
chr8 (106-272)||(4283524-4283691)
chr8 (106-272)||(42434992-42435159)
chr8 (503-667)||(7412787-7412952)
chr8 (102-270)||(40321082-40321251)
chr8 (7-374)||(4731549-4731922)
chr8 (102-380)||(6598857-6599143)
chr8 (102-380)||(6674310-6674596)
chr8 (106-272)||(18655400-18655567)
chr8 (102-380)||(3303667-3303953)
chr8 (455-604)||(10688661-10688810)
chr8 (102-272)||(40221745-40221916)
chr8 (112-272)||(18141821-18141981)
chr8 (143-272)||(30291606-30291737)
chr8 (112-272)||(1292471-1292631)
chr8 (102-268)||(41366612-41366778)
chr8 (155-272)||(9765745-9765863)
chr8 (102-377)||(5689159-5689442)
chr8 (143-380)||(30143227-30143470)
chr8 (132-269)||(40328782-40328922)
chr8 (482-667)||(35745793-35745979)
chr8 (143-269)||(44353796-44353923)
chr8 (99-270)||(10930193-10930365)
chr8 (106-268)||(11383989-11384152)
chr8 (102-380)||(1345368-1345654)
chr8 (106-360)||(4162405-4162663)
chr8 (106-272)||(8965692-8965859)
chr8 (609-670)||(25689558-25689618)
chr8 (102-197)||(4743211-4743306)
chr8 (161-272)||(19491755-19491867)
chr8 (111-218)||(18106087-18106191)
chr8 (111-218)||(10015136-10015241)
chr8 (609-654)||(10688630-10688675)
chr8 (106-213)||(3073875-3073981)
chr8 (201-380)||(10929686-10929871)
chr8 (113-272)||(3772192-3772352)
chr8 (117-187)||(8153844-8153914)
chr8 (609-654)||(5701964-5702009)
chr8 (609-659)||(4456575-4456625)
chr8 (106-187)||(4733792-4733873)
chr8 (200-267)||(1822297-1822365)
chr8 (200-267)||(1856742-1856810)
chr8 (186-360)||(41364927-41365110)
chr8 (405-444)||(3439330-3439369)
chr8 (590-624)||(11383406-11383440)
chr8 (130-248)||(11712024-11712145)
[»] chr7 (114 HSPs)
chr7 (1-668)||(32060216-32060889)
chr7 (12-380)||(20343789-20344158)
chr7 (1-380)||(18392090-18392470)
chr7 (1-380)||(18388654-18389034)
chr7 (40-380)||(24789733-24790075)
chr7 (1-380)||(6594452-6594832)
chr7 (1-380)||(6592234-6592614)
chr7 (7-380)||(39731261-39731635)
chr7 (15-380)||(43504063-43504431)
chr7 (455-667)||(24789426-24789639)
chr7 (405-667)||(20343500-20343762)
chr7 (7-376)||(35853804-35854180)
chr7 (202-380)||(1562103-1562278)
chr7 (455-654)||(2058393-2058592)
chr7 (413-654)||(21640167-21640411)
chr7 (455-667)||(18392568-18392780)
chr7 (7-380)||(25766861-25767237)
chr7 (413-654)||(20357040-20357284)
chr7 (7-380)||(48408687-48409071)
chr7 (7-380)||(29990940-29991317)
chr7 (1-195)||(1560559-1560757)
chr7 (455-667)||(6592709-6592921)
chr7 (473-667)||(21646448-21646643)
chr7 (473-667)||(43504526-43504721)
chr7 (455-668)||(6594925-6595138)
chr7 (473-667)||(39730933-39731128)
chr7 (7-380)||(23554925-23555305)
chr7 (475-667)||(18409206-18409399)
chr7 (475-667)||(18414082-18414275)
chr7 (7-380)||(4178660-4179037)
chr7 (475-668)||(48408397-48408591)
chr7 (455-623)||(1532947-1533116)
chr7 (7-342)||(25615785-25616119)
chr7 (472-654)||(12406663-12406845)
chr7 (455-671)||(1562375-1562591)
chr7 (102-272)||(34310712-34310884)
chr7 (482-660)||(21811745-21811924)
chr7 (102-380)||(14069830-14070116)
chr7 (102-380)||(14379858-14380144)
chr7 (482-654)||(24023831-24024004)
chr7 (487-654)||(4873541-4873709)
chr7 (7-360)||(19502083-19502443)
chr7 (503-670)||(25767381-25767543)
chr7 (102-380)||(30024729-30025015)
chr7 (455-568)||(18389132-18389246)
chr7 (106-272)||(22269973-22270140)
chr7 (102-272)||(41317431-41317602)
chr7 (114-342)||(47673953-47674189)
chr7 (7-272)||(27347817-27348081)
chr7 (106-272)||(8359316-8359485)
chr7 (102-380)||(41649008-41649292)
chr7 (110-272)||(6431971-6432134)
chr7 (102-380)||(38671219-38671505)
chr7 (503-667)||(47264102-47264267)
chr7 (464-667)||(2479757-2479960)
chr7 (108-272)||(29608737-29608902)
chr7 (7-380)||(18126529-18126910)
chr7 (99-380)||(26417201-26417489)
chr7 (104-380)||(43864129-43864413)
chr7 (126-374)||(48491470-48491727)
chr7 (487-654)||(31109082-31109251)
chr7 (143-380)||(4586046-4586291)
chr7 (102-342)||(31732966-31733215)
chr7 (106-272)||(3258995-3259162)
chr7 (106-272)||(4508707-4508874)
chr7 (102-272)||(8153342-8153513)
chr7 (106-218)||(32358055-32358167)
chr7 (102-380)||(47676133-47676419)
chr7 (106-272)||(48599335-48599502)
chr7 (102-380)||(1113542-1113828)
chr7 (106-272)||(4253529-4253697)
chr7 (102-380)||(48489316-48489602)
chr7 (472-654)||(12397311-12397480)
chr7 (593-667)||(1532884-1532958)
chr7 (99-254)||(2390301-2390456)
chr7 (111-272)||(2360978-2361140)
chr7 (106-380)||(31105394-31105676)
chr7 (590-669)||(44847617-44847696)
chr7 (102-272)||(36146405-36146576)
chr7 (102-269)||(495980-496148)
chr7 (113-253)||(23565069-23565210)
chr7 (270-380)||(24514934-24515043)
chr7 (482-654)||(16880475-16880648)
chr7 (482-654)||(16885330-16885503)
chr7 (116-272)||(23343975-23344130)
chr7 (482-654)||(24265689-24265862)
chr7 (482-561)||(24260926-24261006)
chr7 (103-247)||(2759195-2759339)
chr7 (106-272)||(4510549-4510716)
chr7 (106-272)||(4512391-4512558)
chr7 (561-667)||(21983761-21983867)
chr7 (111-267)||(22328395-22328556)
chr7 (524-668)||(21989388-21989532)
chr7 (106-272)||(36574517-36574683)
chr7 (99-218)||(6359946-6360065)
chr7 (201-272)||(24525992-24526065)
chr7 (1-45)||(24790230-24790274)
chr7 (106-207)||(18396384-18396486)
chr7 (102-187)||(24525499-24525584)
chr7 (102-272)||(12097864-12098027)
chr7 (610-667)||(18390506-18390562)
chr7 (113-187)||(31518988-31519063)
chr7 (592-654)||(24260833-24260895)
chr7 (609-654)||(79955-80000)
chr7 (104-179)||(30814530-30814605)
chr7 (163-272)||(31518795-31518905)
chr7 (405-452)||(2058322-2058371)
chr7 (590-624)||(4509335-4509369)
chr7 (590-624)||(4511177-4511211)
chr7 (590-624)||(6431467-6431501)
chr7 (590-624)||(14070348-14070382)
chr7 (590-624)||(14380376-14380410)
chr7 (200-253)||(28617182-28617234)
chr7 (608-653)||(49092237-49092282)
[»] chr5 (109 HSPs)
chr5 (1-380)||(29720256-29720636)
chr5 (1-380)||(29722416-29722796)
chr5 (1-380)||(29751055-29751436)
chr5 (12-380)||(22536197-22536563)
chr5 (1-380)||(10593151-10593532)
chr5 (1-380)||(25078013-25078395)
chr5 (1-380)||(25135982-25136364)
chr5 (1-380)||(40379985-40380365)
chr5 (1-380)||(40382196-40382576)
chr5 (1-380)||(9789119-9789500)
chr5 (1-380)||(16544302-16544685)
chr5 (1-380)||(16546524-16546907)
chr5 (1-380)||(18441539-18441924)
chr5 (7-380)||(16409367-16409743)
chr5 (7-380)||(26177775-26178150)
chr5 (405-668)||(22536590-22536853)
chr5 (7-380)||(26170666-26171030)
chr5 (473-667)||(29719965-29720161)
chr5 (455-668)||(24136271-24136485)
chr5 (7-380)||(30182474-30182852)
chr5 (455-667)||(10592844-10593055)
chr5 (455-669)||(40379676-40379890)
chr5 (7-380)||(25412647-25413024)
chr5 (455-667)||(16546216-16546428)
chr5 (455-667)||(40381889-40382101)
chr5 (483-667)||(9789624-9789809)
chr5 (7-380)||(13342946-13343324)
chr5 (473-667)||(26177466-26177661)
chr5 (455-667)||(16543994-16544206)
chr5 (483-667)||(18442048-18442233)
chr5 (7-380)||(36073947-36074327)
chr5 (489-667)||(29722152-29722332)
chr5 (455-654)||(27450198-27450397)
chr5 (455-667)||(29751532-29751724)
chr5 (482-654)||(30631763-30631936)
chr5 (455-654)||(27445355-27445554)
chr5 (455-654)||(43599106-43599306)
chr5 (455-654)||(43604598-43604798)
chr5 (455-654)||(43610090-43610290)
chr5 (455-659)||(25077713-25077918)
chr5 (455-659)||(25135682-25135887)
chr5 (7-342)||(13239674-13240016)
chr5 (473-667)||(16407641-16407836)
chr5 (455-654)||(1456650-1456849)
chr5 (543-667)||(29752266-29752390)
chr5 (473-667)||(26170357-26170552)
chr5 (7-380)||(32636709-32637088)
chr5 (473-667)||(16409077-16409272)
chr5 (489-654)||(29402562-29402728)
chr5 (102-253)||(37439161-37439313)
chr5 (106-272)||(213465-213633)
chr5 (102-380)||(13488088-13488374)
chr5 (482-654)||(15045095-15045267)
chr5 (542-667)||(15465000-15465125)
chr5 (482-654)||(28807088-28807261)
chr5 (106-272)||(40147261-40147428)
chr5 (503-667)||(9352807-9352972)
chr5 (104-272)||(28278316-28278485)
chr5 (102-380)||(42428427-42428713)
chr5 (7-380)||(30682827-30683203)
chr5 (542-667)||(36931843-36931968)
chr5 (106-380)||(31182858-31183138)
chr5 (143-380)||(39468587-39468832)
chr5 (455-604)||(43592661-43592811)
chr5 (102-380)||(28750652-28750938)
chr5 (106-272)||(5058047-5058212)
chr5 (102-342)||(8565943-8566192)
chr5 (85-380)||(33831565-33831866)
chr5 (102-379)||(533655-533940)
chr5 (450-604)||(31180633-31180787)
chr5 (106-380)||(16451966-16452247)
chr5 (108-272)||(27637615-27637781)
chr5 (484-660)||(37556131-37556308)
chr5 (484-660)||(37560953-37561130)
chr5 (102-380)||(537910-538196)
chr5 (482-667)||(2785777-2785963)
chr5 (482-667)||(33768586-33768772)
chr5 (482-667)||(33791718-33791904)
chr5 (102-380)||(42426232-42426518)
chr5 (155-272)||(13695740-13695859)
chr5 (475-584)||(38219837-38219947)
chr5 (106-376)||(3075659-3075937)
chr5 (455-538)||(35388084-35388169)
chr5 (102-268)||(38747009-38747176)
chr5 (106-258)||(16640941-16641091)
chr5 (155-269)||(9049392-9049506)
chr5 (106-272)||(27015531-27015690)
chr5 (482-668)||(31396488-31396675)
chr5 (617-667)||(35388196-35388246)
chr5 (104-266)||(316769-316933)
chr5 (102-182)||(19806454-19806534)
chr5 (609-654)||(31180773-31180818)
chr5 (609-654)||(43592797-43592842)
chr5 (609-668)||(14520796-14520855)
chr5 (482-667)||(31401346-31401532)
chr5 (104-218)||(33906028-33906144)
chr5 (524-558)||(43592636-43592670)
chr5 (524-558)||(43599081-43599115)
chr5 (524-558)||(43604573-43604607)
chr5 (524-558)||(43610065-43610099)
chr5 (143-380)||(42309973-42310218)
chr5 (524-556)||(10593048-10593080)
chr5 (156-218)||(10054867-10054929)
chr5 (609-659)||(11916452-11916502)
chr5 (524-558)||(27445330-27445364)
chr5 (524-558)||(27450173-27450207)
chr5 (524-558)||(29751507-29751541)
chr5 (106-187)||(42926977-42927058)
chr5 (609-650)||(12083667-12083708)
[»] chr4 (107 HSPs)
chr4 (1-667)||(8392982-8393669)
chr4 (1-667)||(8395191-8395878)
chr4 (1-380)||(7124794-7125176)
chr4 (1-380)||(7122575-7122957)
chr4 (1-380)||(5138183-5138565)
chr4 (1-380)||(5135957-5136340)
chr4 (1-380)||(31495203-31495593)
chr4 (7-380)||(13992195-13992569)
chr4 (477-654)||(24742387-24742565)
chr4 (12-380)||(29999719-30000088)
chr4 (483-667)||(31495717-31495902)
chr4 (7-380)||(56178540-56178919)
chr4 (475-667)||(13992686-13992879)
chr4 (455-659)||(7122274-7122479)
chr4 (455-654)||(51520839-51521038)
chr4 (483-659)||(7124496-7124673)
chr4 (475-667)||(28467977-28468170)
chr4 (455-654)||(56141523-56141723)
chr4 (472-654)||(9223911-9224093)
chr4 (104-380)||(52095361-52095645)
chr4 (406-604)||(29760995-29761196)
chr4 (7-380)||(48142927-48143312)
chr4 (472-654)||(9228698-9228880)
chr4 (455-668)||(5135648-5135862)
chr4 (482-654)||(5733061-5733235)
chr4 (455-667)||(5137875-5138088)
chr4 (482-671)||(3814421-3814609)
chr4 (7-380)||(5369986-5370369)
chr4 (102-380)||(9927455-9927740)
chr4 (482-654)||(18856124-18856297)
chr4 (99-268)||(2209717-2209889)
chr4 (482-654)||(45347329-45347502)
chr4 (472-626)||(18712295-18712449)
chr4 (542-668)||(31985126-31985252)
chr4 (102-380)||(12739547-12739833)
chr4 (109-272)||(41964415-41964580)
chr4 (104-380)||(37740511-37740794)
chr4 (102-380)||(5429564-5429850)
chr4 (7-380)||(34570318-34570697)
chr4 (102-377)||(47038408-47038689)
chr4 (102-272)||(36463386-36463557)
chr4 (106-272)||(40632445-40632612)
chr4 (102-380)||(5871705-5871991)
chr4 (102-380)||(26175633-26175919)
chr4 (99-272)||(26364236-26364410)
chr4 (668-744)||(44882117-44882193)
chr4 (102-270)||(46147388-46147557)
chr4 (106-272)||(46703500-46703669)
chr4 (106-272)||(12073392-12073560)
chr4 (99-270)||(12119540-12119714)
chr4 (102-253)||(12743922-12744073)
chr4 (102-253)||(12745311-12745462)
chr4 (106-272)||(41639426-41639593)
chr4 (106-272)||(37229722-37229890)
chr4 (102-272)||(48893635-48893810)
chr4 (99-272)||(54883020-54883194)
chr4 (104-272)||(36994524-36994693)
chr4 (106-269)||(379383-379548)
chr4 (106-254)||(6655975-6656123)
chr4 (143-380)||(12747794-12748039)
chr4 (102-380)||(52082660-52082940)
chr4 (104-376)||(54199906-54200185)
chr4 (106-272)||(8648139-8648306)
chr4 (126-272)||(8665408-8665556)
chr4 (102-272)||(45687179-45687351)
chr4 (106-272)||(6542180-6542349)
chr4 (102-289)||(52467351-52467546)
chr4 (106-265)||(5207843-5208003)
chr4 (102-272)||(27416962-27417133)
chr4 (106-218)||(50673848-50673960)
chr4 (99-268)||(50262694-50262865)
chr4 (143-272)||(4587958-4588089)
chr4 (551-654)||(18860406-18860509)
chr4 (145-253)||(12744087-12744195)
chr4 (145-272)||(12745476-12745604)
chr4 (114-272)||(35662441-35662600)
chr4 (542-668)||(5148177-5148303)
chr4 (106-272)||(31474150-31474318)
chr4 (111-257)||(26699447-26699596)
chr4 (482-603)||(45356861-45356983)
chr4 (7-187)||(29254580-29254758)
chr4 (609-670)||(29761182-29761242)
chr4 (155-272)||(24969112-24969230)
chr4 (683-739)||(44864243-44864299)
chr4 (106-327)||(51337000-51337231)
chr4 (607-667)||(5143807-5143867)
chr4 (606-654)||(8689049-8689097)
chr4 (687-739)||(44849988-44850040)
chr4 (102-289)||(3913424-3913618)
chr4 (102-198)||(13009441-13009536)
chr4 (609-654)||(16628358-16628403)
chr4 (609-654)||(38151923-38151968)
chr4 (610-654)||(3778116-3778160)
chr4 (270-309)||(35369614-35369653)
chr4 (608-654)||(5268704-5268750)
chr4 (130-218)||(33989899-33989989)
chr4 (609-654)||(6742901-6742946)
chr4 (609-654)||(10047932-10047977)
chr4 (609-650)||(16622783-16622824)
chr4 (200-268)||(48142473-48142542)
chr4 (270-380)||(13009604-13009714)
chr4 (184-272)||(41639263-41639353)
chr4 (200-258)||(1983252-1983309)
chr4 (186-267)||(44967910-44967992)
chr4 (609-654)||(36314716-36314761)
chr4 (609-654)||(36328925-36328970)
chr4 (609-654)||(54867745-54867790)
[»] chr2 (72 HSPs)
chr2 (1-380)||(6266583-6266964)
chr2 (1-380)||(12647280-12647660)
chr2 (1-292)||(13655923-13656220)
chr2 (7-380)||(32289457-32289832)
chr2 (7-380)||(4484232-4484614)
chr2 (7-380)||(30833230-30833612)
chr2 (7-380)||(4503037-4503415)
chr2 (7-380)||(45099640-45100018)
chr2 (455-654)||(9295874-9296074)
chr2 (455-654)||(14291913-14292113)
chr2 (455-654)||(11098399-11098599)
chr2 (7-380)||(36205569-36205946)
chr2 (7-380)||(5723160-5723537)
chr2 (475-668)||(25410073-25410267)
chr2 (455-668)||(12647755-12647968)
chr2 (7-380)||(36987979-36988358)
chr2 (475-668)||(3492184-3492378)
chr2 (475-667)||(30832921-30833114)
chr2 (473-667)||(32289148-32289343)
chr2 (483-667)||(6266274-6266459)
chr2 (102-380)||(2334414-2334700)
chr2 (473-668)||(4484728-4484924)
chr2 (7-272)||(6594908-6595175)
chr2 (475-667)||(40739264-40739457)
chr2 (7-342)||(29867791-29868133)
chr2 (487-654)||(39811489-39811657)
chr2 (102-342)||(34139767-34140017)
chr2 (106-272)||(45726929-45727096)
chr2 (102-380)||(723741-724027)
chr2 (102-379)||(38312126-38312411)
chr2 (102-380)||(14633822-14634109)
chr2 (126-380)||(42362237-42362500)
chr2 (102-380)||(11151588-11151874)
chr2 (102-380)||(11690386-11690672)
chr2 (106-272)||(35446885-35447052)
chr2 (102-272)||(36318006-36318177)
chr2 (102-272)||(36773562-36773733)
chr2 (106-272)||(26353184-26353351)
chr2 (543-671)||(32247229-32247356)
chr2 (589-654)||(44310483-44310548)
chr2 (108-272)||(1631735-1631900)
chr2 (106-267)||(33648176-33648340)
chr2 (102-342)||(17057366-17057615)
chr2 (102-342)||(17085349-17085598)
chr2 (104-272)||(24398055-24398228)
chr2 (111-272)||(42288117-42288278)
chr2 (102-272)||(33162447-33162618)
chr2 (141-272)||(13121769-13121899)
chr2 (102-180)||(17450671-17450748)
chr2 (106-218)||(17490149-17490261)
chr2 (482-667)||(19344824-19345010)
chr2 (155-272)||(7815323-7815441)
chr2 (482-653)||(19349682-19349854)
chr2 (102-272)||(11067305-11067476)
chr2 (607-668)||(28258668-28258729)
chr2 (106-218)||(7451173-7451284)
chr2 (102-179)||(39284930-39285007)
chr2 (609-654)||(8389636-8389681)
chr2 (464-604)||(28258713-28258853)
chr2 (607-654)||(36757430-36757477)
chr2 (609-671)||(33528093-33528155)
chr2 (238-380)||(39284770-39284920)
chr2 (609-654)||(10706738-10706783)
chr2 (609-654)||(21630511-21630556)
chr2 (609-654)||(39483443-39483488)
chr2 (143-268)||(14202450-14202569)
chr2 (613-669)||(33118696-33118752)
chr2 (129-173)||(42412118-42412162)
chr2 (615-654)||(20522794-20522833)
chr2 (117-214)||(28671989-28672088)
chr2 (524-557)||(7450869-7450902)
chr2 (609-654)||(23077957-23078002)
[»] scaffold0565 (2 HSPs)
scaffold0565 (1-380)||(2498-2878)
scaffold0565 (455-667)||(2973-3185)
[»] scaffold0674 (2 HSPs)
scaffold0674 (1-380)||(3620-4000)
scaffold0674 (455-667)||(4098-4310)
[»] scaffold0137 (2 HSPs)
scaffold0137 (1-380)||(6167-6549)
scaffold0137 (455-667)||(5859-6072)
[»] scaffold0491 (4 HSPs)
scaffold0491 (7-380)||(11063-11445)
scaffold0491 (7-380)||(8637-9019)
scaffold0491 (407-667)||(9045-9308)
scaffold0491 (464-671)||(11550-11757)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (7-380)||(434418-434798)
[»] scaffold0188 (1 HSPs)
scaffold0188 (407-668)||(17430-17695)
[»] scaffold1519 (2 HSPs)
scaffold1519 (7-380)||(802-1180)
scaffold1519 (475-626)||(523-675)
[»] scaffold0286 (3 HSPs)
scaffold0286 (405-667)||(21939-22205)
scaffold0286 (51-314)||(11508-11778)
scaffold0286 (322-380)||(22229-22286)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (102-327)||(114539-114774)
[»] scaffold1808 (1 HSPs)
scaffold1808 (1-138)||(1-139)
[»] scaffold0355 (1 HSPs)
scaffold0355 (482-654)||(3349-3522)
[»] scaffold0464 (1 HSPs)
scaffold0464 (482-654)||(760-933)
[»] scaffold0135 (1 HSPs)
scaffold0135 (472-654)||(34566-34748)
[»] scaffold0140 (1 HSPs)
scaffold0140 (542-667)||(7911-8036)
[»] scaffold0006 (4 HSPs)
scaffold0006 (466-667)||(132752-132953)
scaffold0006 (102-380)||(149094-149380)
scaffold0006 (609-654)||(6252-6297)
scaffold0006 (609-654)||(3060-3105)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (106-272)||(18004-18171)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (7-272)||(20319-20583)
[»] scaffold0466 (2 HSPs)
scaffold0466 (106-272)||(7327-7494)
scaffold0466 (590-624)||(6750-6784)
[»] scaffold0510 (1 HSPs)
scaffold0510 (503-667)||(1083-1248)
[»] scaffold1455 (1 HSPs)
scaffold1455 (591-654)||(1721-1784)
[»] scaffold0087 (2 HSPs)
scaffold0087 (503-660)||(43441-43599)
scaffold0087 (607-669)||(36322-36384)
[»] scaffold0665 (2 HSPs)
scaffold0665 (472-604)||(8098-8230)
scaffold0665 (609-654)||(8216-8261)
[»] scaffold0236 (1 HSPs)
scaffold0236 (106-248)||(10515-10656)
[»] scaffold0197 (2 HSPs)
scaffold0197 (482-654)||(13796-13969)
scaffold0197 (481-667)||(18663-18850)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (482-654)||(176462-176635)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (473-654)||(1751-1932)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (473-654)||(148456-148637)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (607-668)||(45744-45805)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (160-268)||(80338-80447)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 460; Significance: 0; HSPs: 142)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 460; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 54635397 - 54634710
Alignment:
Q  1 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54635397 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaa 54635298  T
Q  101 gagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54635297 gagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa 54635198  T
Q  200 ggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaag 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  54635197 ggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaag 54635098  T
Q  300 gtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnn 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||                       
T  54635097 gtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgctccctttgatttcccaagtctctctctcttccaactc 54634998  T
Q  400 nnnnntcaaatctgcacaagaacactttatactagcctccctctgaagcaatcacgtcac--------------------gatttgcgtacaacccaagg 479  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||  |||||                    ||||||||||| |||||||     
T  54634997 cctcttcaaatctgcacaagaacactttatactagccttcctctgttgcaatcgtgtcacgattttcccaatcgtgtcatgatttgcgtaccacccaaga 54634898  T
Q  480 tatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttccca-aatcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctc 578  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||    
T  54634897 aaagaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccacaatcgtgccacgattttgcaccctgcaacttagctc 54634798  T
Q  579 acggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 667  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54634797 acggcaccccgaaatcgtgtcacaatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagac-aatctcaaca 54634710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 423; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 6716770 - 6716084
Alignment:
Q  4 caaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaaga 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6716770 caaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaactcaaaaatacaatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaaaga 6716671  T
Q  103 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaagg 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6716670 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaagg 6716571  T
Q  202 ttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggt 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  6716570 ttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggt 6716471  T
Q  302 gtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||                         
T  6716470 gtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttactccctttgatttcccaagtctctctctcttccaaccctt 6716371  T
Q  402 nnntcaaatctgcacaagaacactttatactagcctccctctgaagcaatcacgtcacgattt--------------------gcgtacaacccaaggta 481  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  | ||||  ||||||||||                    |||||| |||||||  |    
T  6716370 tcttcaaatctgcacaagaacactttatactagtcttcctctgttgaaatcgtgtcacgattttccaaatcgtgtcacgatccgcgtaccacccaagaaa 6716271  T
Q  482 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttccca-aatcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcac 580  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6716270 cgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccacaatcgtgacacgattttgcaccctgcaacctagctcac 6716171  T
Q  581 ggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaacaa 668  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  6716170 ggcaccccgaaatcgtgtcacgataccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttcaagac-aatctcaacaa 6716084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 1 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 45283260 - 45282875
Alignment:
Q  1 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaaaagcacca 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45283260 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaactagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaaagcacca 45283161  T
Q  99 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaa---gggat 193  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||    
T  45283160 a-gagattgttcactcagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaaaaagggat 45283062  T
Q  194 acaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctc 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  45283061 acaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctt 45282962  T
Q  294 tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  45282961 tgcaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgctccctttgattccccaag 45282875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 25637704 - 25637321
Alignment:
Q  1 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaataca--caatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaaaagcac 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25637704 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaaagcac 25637605  T
Q  97 caaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggat 193  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  25637604 caaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggat 25637505  T
Q  194 acaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctc 293  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  25637504 acaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctctc 25637407  T
Q  294 tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  25637406 tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagatac-ccctttgatttcccaag 25637321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 3617724 - 3617342
Alignment:
Q  1 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaataca-caatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa-aagcacca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |    
T  3617724 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaacac-a 3617626  T
Q  99 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatac 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  3617625 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac 3617526  T
Q  196 aaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctcta 295  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  3617525 aagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctcttta 3617426  T
Q  296 caaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  3617425 caaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc-ccctttgatttcccaag 3617342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 380
Target Start/End: Original strand, 4600638 - 4601019
Alignment:
Q  1 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaa-aagcacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||     
T  4600638 caacaaaacaccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaaca-aatcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacac- 4600735  T
Q  98 aaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggata 194  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  4600736 aaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaata 4600835  T
Q  195 caaaaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctc 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  4600836 caaaaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgatt--ctctc 4600933  T
Q  294 tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  4600934 tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagctt-tccctttgatttcccaag 4601019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 5 - 380
Target Start/End: Original strand, 4598421 - 4598798
Alignment:
Q  5 aaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaag 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |  | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||| ||||    
T  4598421 aaaacaccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaacaaagca-acaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacac-aaag 4598518  T
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatacaaa 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||     
T  4598519 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaag 4598618  T
Q  199 aggttacaagaaattagcttgacaa-gttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctaca 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  4598619 aggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgatt--ctctctaca 4598716  T
Q  298 aggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  4598717 gggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagctt-tccctttgatttcccaag 4598798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 10211669 - 10211288
Alignment:
Q  1 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaa-aagcacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |  | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| || |||     
T  10211669 caacaaaacaccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaacaaagca-acaatcacaagataaacaaggagagggaagatgaaaacaataaacac- 10211572  T
Q  98 aaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggata 194  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  10211571 aaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaata 10211472  T
Q  195 caaaaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctc 293  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  10211471 caagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgatt--ctctc 10211374  T
Q  294 tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  10211373 tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaaccctagagctt-tccctttgatttcccaag 10211288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 5 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 801355 - 800983
Alignment:
Q  5 aaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtg-agaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagag 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||    
T  801355 aaaacagcacctagatctaatctaggaaacaagtggaaaaacacaatacacaa------gataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaa-gag 801263  T
Q  104 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaagg- 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |     
T  801262 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaaga 801163  T
Q  202 -ttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaag 299  Q
     |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  801162 gttacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaa-ccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctcttcaag 801064  T
Q  300 gtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  801063 gtgtttcccatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagagtttcttcctttgatttcccaag 800983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 10209449 - 10209068
Alignment:
Q  1 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaa-aagcacc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |  | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| || |||     
T  10209449 caacaaaacaccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaacaaagca-acaatcacaagataaacaaggagagggaagatgaaaacaataaacac- 10209352  T
Q  98 aaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggata 194  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||    
T  10209351 aaagagattggtcacccagtttggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggacta 10209252  T
Q  195 caaaaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctc 293  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  10209251 caagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgatt--ctctc 10209154  T
Q  294 tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  10209153 tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaaccctagagctt-tccctttgatttcccaag 10209068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 6 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 10056489 - 10056112
Alignment:
Q  6 aaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaaga 102  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |  |   || |||||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||| |||||    
T  10056489 aaacaccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaacaaagcaactaaacacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacac-aaaga 10056391  T
Q  103 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatacaaaa 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |    
T  10056390 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 10056291  T
Q  200 ggttacaagaaattagcttgacaa-gttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaa 298  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  10056290 ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgatt--ctctctacaa 10056193  T
Q  299 ggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  10056192 ggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaactctagagcttc-ccctttgatttcccaag 10056112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 6 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 10058711 - 10058334
Alignment:
Q  6 aaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaaga 102  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |  |   || |||||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||| |||||    
T  10058711 aaacaccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaacaaagcaactaaacacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacac-aaaga 10058613  T
Q  103 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatacaaaa 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |    
T  10058612 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 10058513  T
Q  200 ggttacaagaaattagcttgacaa-gttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaa 298  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  10058512 ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgatt--ctctctacaa 10058415  T
Q  299 ggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  10058414 ggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaactctagagcttc-ccctttgatttcccaag 10058334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 6 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 10060933 - 10060556
Alignment:
Q  6 aaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaaga 102  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |  |   || |||||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||| |||||    
T  10060933 aaacaccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaacaaagcaactaaacacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacac-aaaga 10060835  T
Q  103 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatacaaaa 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |    
T  10060834 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 10060735  T
Q  200 ggttacaagaaattagcttgacaa-gttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaa 298  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  10060734 ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgatt--ctctctacaa 10060637  T
Q  299 ggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  10060636 ggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaactctagagcttc-ccctttgatttcccaag 10060556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 6 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 10063155 - 10062778
Alignment:
Q  6 aaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaaga 102  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |  |   || |||||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||| |||||    
T  10063155 aaacaccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaacaaagcaactaaacacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacac-aaaga 10063057  T
Q  103 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatacaaaa 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |    
T  10063056 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 10062957  T
Q  200 ggttacaagaaattagcttgacaa-gttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaa 298  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  10062956 ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgatt--ctctctacaa 10062859  T
Q  299 ggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  10062858 ggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaactctagagcttc-ccctttgatttcccaag 10062778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 6 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 10065377 - 10065000
Alignment:
Q  6 aaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaaga 102  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |  |   || |||||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||| |||||    
T  10065377 aaacaccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaacaaagcaactaaacacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacac-aaaga 10065279  T
Q  103 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatacaaaa 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |    
T  10065278 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 10065179  T
Q  200 ggttacaagaaattagcttgacaa-gttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaa 298  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  10065178 ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgatt--ctctctacaa 10065081  T
Q  299 ggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  10065080 ggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaactctagagcttc-ccctttgatttcccaag 10065000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 5 - 309
Target Start/End: Original strand, 7779903 - 7780208
Alignment:
Q  5 aaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaa-cacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagag 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |||    
T  7779903 aaaacagcacctagatctaatctaggaaacaagtgaaaaaacacaatacacaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaa-gag 7780001  T
Q  104 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggt 202  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7780002 attgttcacccactttggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaggt 7780101  T
Q  203 tacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggt 301  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7780102 tacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaa-ccctaatttctacccttttcccaatctcacgaagacactcaatgattttctctcttcaaggt 7780200  T
Q  302 gtttccca 309  Q
    ||||||||    
T  7780201 gtttccca 7780208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 12 - 380
Target Start/End: Original strand, 23200045 - 23200420
Alignment:
Q  12 cacctagatctaatctaggaaacaag-tgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttc 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||    
T  23200045 cacctagatctaatctaggaaacaaaatgaaaaacacaaaccacaagcataagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaaaga--ttgttc 23200142  T
Q  111 acccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaag 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  23200143 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaattcactatcaatgagttcttacaaaa-agatacaaaagggttacaag 23200241  T
Q  209 aaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcac------caagacactcaatgattttctctctacaagg 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||      |||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  23200242 aaattagctttgacaagttcacaaagaac-aactctaatttctaccatttttcccaatctcaccaagaacaagacactcaatgattttcactcaccaagg 23200340  T
Q  301 tgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    ||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23200341 tgtttacaatgtttcccaacccaagagaaactctaatcaaag-accctaaaccctagagttgctccctttgatttcccaag 23200420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 238 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 6718718 - 6718331
Alignment:
Q  238 aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatc 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6718718 aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatc 6718619  T
Q  338 aaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcaaatctgcacaagaacactttatactagcct 437  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||                        |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6718618 aaagaaccctaaaccctagagttactccctttgatttcccaagtctctctctcttccaaccctttcttcaaatctgcacaagaacactttatactagtct 6718519  T
Q  438 ccctctgaagcaatcacgtcacgattt--------------------gcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagt 517  Q
     ||||||  | ||||  ||||||||||                    |||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6718518 tcctctgttgaaatcgtgtcacgatttttcaaatcgtgtcacgatccgcgtaccacccaagaaacgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagt 6718419  T
Q  518 ttcacgatcgtgtcacgatttccca-aatcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgat 604  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6718418 ttcacgatcgtgtcacgatttcccacaatcgtgacacgattttgcaccctgcaacctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgat 6718331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 16 - 380
Target Start/End: Original strand, 23197850 - 23198221
Alignment:
Q  16 tagatctaatctaggaaacaag-tgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcaccc 114  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||  ||||||||||    
T  23197850 tagatctaatctaggaaacaaaatgaaaaacacaaaccacaagcacaagataaaaggagagagaagaggaaaacaaagacaccaaaga--ttgttcaccc 23197947  T
Q  115 agttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaat 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  23197948 agttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaattcactatcaatgagttcttacaaaa-agatacaaaagggttacaagaaat 23198046  T
Q  213 tagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcac------caagacactcaatgattttctctctacaaggtgtt 304  Q
    |||| |||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||      |||||||||||||||||||| |||  |||||||||    
T  23198047 tagctttgacaagttcacaaaaaac-aactctaatttctaccatttttcccaatctcaccaagaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtt 23198145  T
Q  305 tcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    | | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  23198146 tacaatgtttcccaacccaagagaaactctaatcaaag-accctaaaccctagagttgctccctttgattttccaag 23198221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 455 - 654
Target Start/End: Original strand, 8477790 - 8477990
Alignment:
Q  455 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcac 553  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  8477790 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttctcaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccac 8477889  T
Q  554 gattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaa 653  Q
    ||||| ||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8477890 gatttggcatccagcaaactagctcacggcacctcgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacaatttctctgttcttccagaccacaaatttgaa 8477989  T
Q  654 g 654  Q
    |    
T  8477990 g 8477990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 181 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 10067419 - 10067222
Alignment:
Q  181 ttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactc 279  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10067419 ttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactc 10067320  T
Q  280 aatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaa 379  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  10067319 aatgatt--ctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaactctagagcttc-ccctttgatttcccaa 10067223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 380
Target Start/End: Original strand, 9636028 - 9636410
Alignment:
Q  7 aacaccacctagatctaatctaggaaac-aagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagat 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | |||||| || || ||  ||||| |||||||||||||| ||| | |||   |||||||  |||| |||||||    
T  9636028 aacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcataaatcacaagcacaagataaaagg-gagagcagagagaaacaaacacacc-aagagat 9636125  T
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggtt 203  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  9636126 tgttcacccagttcggttcaaacttgacctactttggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaa-agatacaaaagggtt 9636224  T
Q  204 acaagaaattag-cttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttt--tcccaatctc-------accaagacactcaatgattttctctc 293  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||       |||||||||||||||||||||| |||    
T  9636225 acaagaaattagttttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaatgaccaagacactcaatgattttcactc 9636323  T
Q  294 tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
      |||||||||| | || |||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  9636324 accaaggtgtttacaatatttcccaacccaagagagactctaatcaaag-accctaaaccctaaagtttcttcctttgatttcccaag 9636410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 7 - 380
Target Start/End: Original strand, 5258048 - 5258427
Alignment:
Q  7 aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagat 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||||  ||||| || || ||||||||||||  ||||   |||||||  |||||||||  |    
T  5258048 aacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaccacaagcaaaatataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaaaga--t 5258143  T
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggtt 203  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||| ||||    
T  5258144 tgttcaccaagttcggtccaaacttgacctactctggagaagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt-ccaaagagatacaaaagggtt 5258242  T
Q  204 acaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctc 293  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||    
T  5258243 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc 5258341  T
Q  294 tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
      |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  5258342 accaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagtttctccctttgatttctcaag 5258427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 406 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 2671328 - 2671111
Alignment:
Q  406 caaatctgcacaagaacac--tttatactagcctccctctgaagcaatcacgtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggata 503  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||||| || ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2671328 caaatctgcacaagaacacaatatatactagtcttcctctgaagaaatcgtgtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggata 2671229  T
Q  504 cttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacg 602  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  2671228 cttaacgagcaagtttctaaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcatcctgcaaactagctcacggcaccttgaaatcatgtcacg 2671129  T
Q  603 atgccaaaatcgtgtcac 620  Q
    ||||||||||||||||||    
T  2671128 atgccaaaatcgtgtcac 2671111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 102 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 45095335 - 45095050
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa- 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||     
T  45095335 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaag 45095237  T
Q  200 ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctc 291  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |    
T  45095236 ggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcac 45095138  T
Q  292 tctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    ||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |  | ||||||||||||||    
T  45095137 tcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagttgcctcttttgatttcccaag 45095050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 477 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 40372446 - 40372268
Alignment:
Q  477 aggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctag 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||  ||||||| ||||    
T  40372446 aggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaaactag 40372347  T
Q  576 ctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40372346 ctcacggcacctcgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaag 40372268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 380
Target Start/End: Original strand, 5260227 - 5260606
Alignment:
Q  7 aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagat 105  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| ||| |||| || |||||  ||||| || || ||||||||||||  ||||   |||||||  |||||||||  |    
T  5260227 aacaacacctagatctaatttaggaatcaaagtgaaaagcacaaaccacaagcaaaatataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaaaga--t 5260322  T
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggtt 203  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||| ||||    
T  5260323 tgttcaccaagttcggtccaaacttgacctactttggagaagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt-ccaaagagatacaaaagggtt 5260421  T
Q  204 acaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctc-------accaagacactcaatgattttctctc 293  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||       |||||||||||||||||||||| |||    
T  5260422 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaccaagacactcaatgattttcactc 5260520  T
Q  294 tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
      |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  5260521 accaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagttgcctcctttgatttcccaag 5260606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 380
Target Start/End: Original strand, 19683792 - 19684172
Alignment:
Q  7 aacaccacctagatctaatctaggaa-acaagtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagaga 104  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| || |||| || |||||||||||||||  ||||   |||||||  |||||||||      
T  19683792 aacagcacctagatctaatctaggaataaaagtgaaaaacacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaaaga-- 19683887  T
Q  105 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggt 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||    
T  19683888 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactatggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagggt 19683986  T
Q  203 tacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctc 293  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||| |||||||||||| |||    
T  19683987 tacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacattcaatgattttcactc 19684085  T
Q  294 -tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
       |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||    ||||||||||||||||    
T  19684086 acccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-acccttaaccctaaagttaactcctttgatttcccaag 19684172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 455 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 25637225 - 25637012
Alignment:
Q  455 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttccca-aatcgtgtcac 553  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  25637225 gtcacgatttgcgtccgtcccaaggaacgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccacaatcgtgccac 25637126  T
Q  554 gattttgca-ccctgcaa-tctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttg 651  Q
    || |||||| ||||||||  ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25637125 ga-tttgcacccctgcaaccctagctctc-gcacctcgaaatcgtgtcacgatgccacaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaattta 25637028  T
Q  652 aagacaaatctcaacaa 668  Q
    ||||| |||||||||||    
T  25637027 aagac-aatctcaacaa 25637012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 455 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 3617246 - 3617034
Alignment:
Q  455 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgattt-cccaaatcgtgtcac 553  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| | |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  3617246 gtcacgatttgcgtccgtcccaaggaacgaccagccgttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgattttcccaaatcgtgacac 3617147  T
Q  554 gattttgcaccc-tgcaatc-tagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttg 651  Q
    ||||| |||||| ||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3617146 gattt-gcacccctgcaaccctagctcacggcatcc-gaaatcgtgtcacgataccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttg 3617049  T
Q  652 aagacaaatctcaaca 667  Q
    ||||| ||||||||||    
T  3617048 aagac-aatctcaaca 3617034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 455 - 654
Target Start/End: Original strand, 7167670 - 7167870
Alignment:
Q  455 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcac 553  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  7167670 gtcacgatttgcgtctgacccaaggtatgaccagtccttatcagtgatacttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccac 7167769  T
Q  554 gattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaa 653  Q
    ||||| ||  ||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  7167770 gatttggcgtcctgcaaactagctcacggcaccttgaaattgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaacacaaatttgaa 7167869  T
Q  654 g 654  Q
    |    
T  7167870 g 7167870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 7 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 37408723 - 37408344
Alignment:
Q  7 aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaata-cacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagaga 104  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||| | | ||||| || |||||||||||||||  ||||   |||||||  |||||||||      
T  37408723 aacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcactaaatcacaagcaaaagataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaaaga-- 37408628  T
Q  105 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggt 202  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||    
T  37408627 ttgttcacccagttcgatccaaacttgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagggt 37408529  T
Q  203 tacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctc 293  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||| |||||| |||    
T  37408528 tacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaataattttcactc 37408430  T
Q  294 tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
       ||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  37408429 actaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accataaaccctaaagttgcctcctttgatttcccaag 37408344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 483 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 800870 - 800685
Alignment:
Q  483 gaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttccca-aatcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacg 581  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||||    
T  800870 gaccattccttatcatggaaacttaacgagcaagtttgcaaatcgtgtcacgatttcccacaatcgtgtcacgatttggcaccccgcaaaccagctcacg 800771  T
Q  582 gcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 667  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  800770 gcatcacgaaatcgtgtcacgatgccaaattcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaattcgaagacaaatctcaaca 800685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 455 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 45282778 - 45282628
Alignment:
Q  455 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacga-tttcccaaatcgtgtcac 553  Q
    |||||||| ||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45282778 gtcacgatctgcgtaccacccaagaaacgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgattttcccaaatcgtgtcac 45282679  T
Q  554 gattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgat 604  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45282678 gaatttgcaccctgcaacctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgat 45282628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 475 - 667
Target Start/End: Original strand, 1306411 - 1306604
Alignment:
Q  475 caaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatct 573  Q
    ||||||| |||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |     
T  1306411 caaggtacgacctgtccttatcctggaaacttaacgagcaagtttgagaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaacc 1306510  T
Q  574 agctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 667  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  1306511 agctcacgacaccacgaaatcgtgtcacgatgccaaattcatgtcacgatttctctgttcttccagaccataaatttgaagccaaatctcaaca 1306604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 455 - 667
Target Start/End: Original strand, 4598894 - 4599107
Alignment:
Q  455 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttccc--aaatcgtgtca 552  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| ||    
T  4598894 gtcacgatttgcgtccgtcccaaggaacgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcttgatcgtgtcacgatttcccagaaatcgtgcca 4598993  T
Q  553 cgattttgca-ccctgcaa-tctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaattt 650  Q
    ||| |||||| ||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4598994 cga-tttgcacccctgcaaccctagctcacggca-tccgaaatcgtgtcgcgatcccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccaaaccacaaattt 4599091  T
Q  651 gaagacaaatctcaaca 667  Q
    |||||| ||||||||||    
T  4599092 gaagac-aatctcaaca 4599107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 455 - 667
Target Start/End: Original strand, 4601115 - 4601328
Alignment:
Q  455 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttccc--aaatcgtgtca 552  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| ||    
T  4601115 gtcacgatttgcgtccgtcccaaggaacgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcttgatcgtgtcacgatttcccagaaatcgtgcca 4601214  T
Q  553 cgattttgca-ccctgcaa-tctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaattt 650  Q
    ||| |||||| ||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4601215 cga-tttgcacccctgcaaccctagctcacggca-tccgaaatcgtgtcgcgatcccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccaaaccacaaattt 4601312  T
Q  651 gaagacaaatctcaaca 667  Q
    |||||| ||||||||||    
T  4601313 gaagac-aatctcaaca 4601328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 455 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 10058240 - 10058034
Alignment:
Q  455 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttccc--aaatcgtgtca 552  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  10058240 gtcacgatttgcgtacgtcccaaggaacgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcttgatcgtgtcacgattttcccaaaatcgtgtca 10058141  T
Q  553 cgattttgcaccc-tgcaatc-tagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaattt 650  Q
    |||||| |||||| ||||| | || ||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10058140 cgattt-gcacccctgcaaccctaactcacggcatcc-gaaatcgcgtcacgataccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccaaaccacaaattt 10058043  T
Q  651 gaagacaaa 659  Q
    |||||||||    
T  10058042 gaagacaaa 10058034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 455 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 10060462 - 10060256
Alignment:
Q  455 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttccc--aaatcgtgtca 552  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  10060462 gtcacgatttgcgtacgtcccaaggaacgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcttgatcgtgtcacgattttcccaaaatcgtgtca 10060363  T
Q  553 cgattttgcaccc-tgcaatc-tagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaattt 650  Q
    |||||| |||||| ||||| | || ||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10060362 cgattt-gcacccctgcaaccctaactcacggcatcc-gaaatcgcgtcacgataccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccaaaccacaaattt 10060265  T
Q  651 gaagacaaa 659  Q
    |||||||||    
T  10060264 gaagacaaa 10060256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 455 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 10062684 - 10062478
Alignment:
Q  455 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttccc--aaatcgtgtca 552  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  10062684 gtcacgatttgcgtacgtcccaaggaacgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcttgatcgtgtcacgattttcccaaaatcgtgtca 10062585  T
Q  553 cgattttgcaccc-tgcaatc-tagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaattt 650  Q
    |||||| |||||| ||||| | || ||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10062584 cgattt-gcacccctgcaaccctaactcacggcatcc-gaaatcgcgtcacgataccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccaaaccacaaattt 10062487  T
Q  651 gaagacaaa 659  Q
    |||||||||    
T  10062486 gaagacaaa 10062478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 455 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 10064906 - 10064700
Alignment:
Q  455 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttccc--aaatcgtgtca 552  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  10064906 gtcacgatttgcgtacgtcccaaggaacgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcttgatcgtgtcacgattttcccaaaatcgtgtca 10064807  T
Q  553 cgattttgcaccc-tgcaatc-tagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaattt 650  Q
    |||||| |||||| ||||| | || ||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10064806 cgattt-gcacccctgcaaccctaactcacggcatcc-gaaatcgcgtcacgataccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccaaaccacaaattt 10064709  T
Q  651 gaagacaaa 659  Q
    |||||||||    
T  10064708 gaagacaaa 10064700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 102 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 7762437 - 7762151
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  7762437 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaag 7762339  T
Q  201 -gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcacc-------aagacactcaatgattttct 290  Q
     ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||       |||||||||||||||||||     
T  7762338 agttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttctcaatctcaccaatgaataagacactcaatgattttca 7762240  T
Q  291 ctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |||  |||||||||  | || |||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  7762239 ctcaccaaggtgttcacaatatttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaag 7762151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 455 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 10056018 - 10055812
Alignment:
Q  455 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttccc--aaatcgtgtca 552  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  10056018 gtcacgatttgcgtccgtcccaaggaacgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcttgatcgtgtcacgattttcccaaaatcgtgtca 10055919  T
Q  553 cgattttgcaccc-tgcaatc-tagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaattt 650  Q
    |||||| |||||| ||||| | || ||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10055918 cgattt-gcacccctgcaaccctaactcacggcatcc-gaaatcgcgtcacgataccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccaaaccacaaattt 10055821  T
Q  651 gaagacaaa 659  Q
    |||||||||    
T  10055820 gaagacaaa 10055812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 455 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 10067128 - 10066922
Alignment:
Q  455 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttccc--aaatcgtgtca 552  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  10067128 gtcacgatttgcgtccgtcccaaggaacgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcttgatcgtgtcacgattttcccaaaatcgtgtca 10067029  T
Q  553 cgattttgcaccc-tgcaatc-tagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaattt 650  Q
    |||||| |||||| ||||| | || ||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10067028 cgattt-gcacccctgcaaccctaactcacggcatcc-gaaatcgcgtcacgataccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccaaaccacaaattt 10066931  T
Q  651 gaagacaaa 659  Q
    |||||||||    
T  10066930 gaagacaaa 10066922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 482 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 22172847 - 22172674
Alignment:
Q  482 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcac 580  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||  ||||||| || ||||||    
T  22172847 tgaccagtccttatcagagatccttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaaactggctcac 22172748  T
Q  581 ggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22172747 ggcacctcgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaag 22172674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 475 - 667
Target Start/End: Original strand, 23198337 - 23198530
Alignment:
Q  475 caaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttc-ccaaatcgtgtcacgattttgcaccctgcaatct 573  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |     
T  23198337 caaggtacgaccagtccttatcctggaaacttaacgagcaagtttgcaaatcgtgtcacgattcctccaaatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaacc 23198436  T
Q  574 agctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 667  Q
    ||||||||||| | | |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23198437 agctcacggcatcacaaaatcgtgtcacgatgtcaaattcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaaatctcaaca 23198530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 475 - 667
Target Start/End: Original strand, 23200536 - 23200729
Alignment:
Q  475 caaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttc-ccaaatcgtgtcacgattttgcaccctgcaatct 573  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |     
T  23200536 caaggtacgaccagtccttatcctggaaacttaacgagcaagtttgcaaatcgtgtcacgattcctccaaatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaacc 23200635  T
Q  574 agctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 667  Q
    ||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23200636 agctcacagcatcacaaaatcgtgtcacgatgccaaattcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaaatctcaaca 23200729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 405 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 10209042 - 10208778
Alignment:
Q  405 tcaaatctgcacaagaacacttta-tactagcctccctctgaagcaatcacgtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggata 503  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||   |||||  |||||||||||||| |  ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  10209042 tcaaatctgcacaagaacacttaagtactagtcttcctctgttccaatcgtgtcacgatttgcgtccgtcccaaggaacgaccagtccttatcaaggata 10208943  T
Q  504 cttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttccc--aaatcgtgtcacgattttgcaccc-tgcaatc-tagctcacggcaccccgaaatcgtgtc 599  Q
     ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||| |||||| ||||| | || ||||||||| || ||||||| |||    
T  10208942 tttaacgagcaagtttcttgatcgtgtcacgattttcccaaaatcgtgccacgattt-gcacccctgcaaccctaactcacggcatcc-gaaatcgcgtc 10208845  T
Q  600 acgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 667  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10208844 acgataccaaaatcgtgtcatgatttccctgttcttccaaaccacaaatttgaagac-aatctcaaca 10208778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 7 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 7764729 - 7764353
Alignment:
Q  7 aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagaga 104  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| ||| |||| || ||||| || |||| || |||||||||||||||  ||||   |||||||  |||||||||      
T  7764729 aacagcacctagatctaatcttggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaaacaaaagataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaaaga-- 7764634  T
Q  105 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gt 202  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||    
T  7764633 ttgttcacccagttcggtctaaatttgacctactctggaggagagattcatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagagt 7764535  T
Q  203 tacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctct 294  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||       |||||||||||||||||||| |||     
T  7764534 tacaagaaattagctttaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttccc--tctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 7764438  T
Q  295 acaaggtgtttcccatgttttc-aacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
     |||||||||| | |||||| | ||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||| ||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  7764437 ccaaggtgtttacaatgtttcctaacccaagaga-aatctaatcaaag-accctcaactctaaagttacctcctttgatttcccaag 7764353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 455 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 28503530 - 28503331
Alignment:
Q  455 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcac 553  Q
    ||||||||||||||   ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||| |||    
T  28503530 gtcacgatttgcgtctgacccaaggt-tgacaagtccttatcagggatacttaacgagcaagtttctgaattgtgtcacgatttcccaagatcgtgccac 28503432  T
Q  554 gattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaa 653  Q
    ||||| ||  || |||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  28503431 gatttggcgtccagcaaactagctcacggccccttgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaggccacaaatttgaa 28503332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 455 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 6718481 - 6718288
Alignment:
Q  455 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttccca-aatcgtgtcac 553  Q
    ||||||||  |||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  6718481 gtcacgatccgcgtaccacccaagaaacgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccacaatcgtgacac 6718382  T
Q  554 gattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaa 653  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||                   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6718381 gattttgcaccctgcaacctagctcacggcaccccgaaatcgt-------------------gtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaa 6718301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 102 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 9581454 - 9581168
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||      
T  9581454 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagggatacaaatg 9581356  T
Q  200 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctc 291  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||       |||||||||||||||||||| |    
T  9581355 ggttaaaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccatttccgaatcccacaaatgaacaagacactcaatgattttcac 9581257  T
Q  292 tc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||    ||||||||||||||||    
T  9581256 tcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-acccttaaccctaaagttaactcctttgatttcccaag 9581168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 455 - 650
Target Start/End: Complemental strand, 27352293 - 27352097
Alignment:
Q  455 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcac 553  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  27352293 gtcacgatttgcgtccgtcccaaggtatgaccagtccttatcagtgataattaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccac 27352194  T
Q  554 gattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaattt 650  Q
    ||||| |    |||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  27352193 gatttggtgttctgcaaacaagctcacggcaccttgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttttctgttcttcgagaccacaaattt 27352097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 455 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 28501363 - 28501164
Alignment:
Q  455 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcac 553  Q
    |||| |||||||||   ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||| |||||| |||    
T  28501363 gtcatgatttgcgtctgacccaaggt-tgacaagtccttatcagggatacttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgattttccaagatcgtgccac 28501265  T
Q  554 gattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaa 653  Q
    ||||| |   ||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  28501264 gatttggtgtcctgcaaactagctcacggccccttgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaggccacaaatttgaa 28501165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 475 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 26928273 - 26928078
Alignment:
Q  475 caaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatct 573  Q
    ||||||| |||| |||||||||  | | ||||||||||||||||| |  |||||||||||||| | ||| || |||||||||||| ||||||||||| |     
T  26928273 caaggtacgacctgtccttatcctgaaaacttaacgagcaagtttgaaaatcgtgtcacgattccacaagattgtgtcacgatttggcaccctgcaaacc 26928174  T
Q  574 agctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaacaat 669  Q
    |||||||||||   | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26928173 agctcacggcataacaaaatcgtgtcacgatgccaaattcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaaatctcaacaat 26928078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 482 - 654
Target Start/End: Original strand, 18656843 - 18657017
Alignment:
Q  482 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagct-ca 579  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||| || ||| ||    
T  18656843 tgaccagtccttatcagtgatacttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgtcacgatttggcgtcctgcaaacttgcttca 18656942  T
Q  580 cggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  18656943 cggcaccacgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcatgatttctctgttctttcagaccacaaatttgaag 18657017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 455 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 10211191 - 10210978
Alignment:
Q  455 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttccc--aaatcgtgtca 552  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||  |||||||| ||    
T  10211191 gtcacgatttgcgtccgtcccaaggaacgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcttgatcgtgtcatgattttcccaaaatcgtgcca 10211092  T
Q  553 cgattttgcaccc-tgcaatc-tagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaattt 650  Q
    |||||| |||||| ||||| | || ||||||||| ||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10211091 cgattt-gcacccctgcaaccctaactcacggcatcct-aaatcgcgtcacgataccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccaaaccacaaattt 10210994  T
Q  651 gaagacaaatctcaaca 667  Q
     ||||| ||||||||||    
T  10210993 aaagac-aatctcaaca 10210978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 541 - 667
Target Start/End: Original strand, 7782586 - 7782712
Alignment:
Q  541 caaatcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccaga 640  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7782586 caaatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaaccagctcaccgcatcacgaaatcgtgtcacgatgccaaattcgtgtcacgatttccctgttcttctaga 7782685  T
Q  641 ccacaaatttgaagacaaatctcaaca 667  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||    
T  7782686 ccacaaatttgaagccaaatctcaaca 7782712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 503 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 33386302 - 33386137
Alignment:
Q  503 acttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaaa-tcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcac 601  Q
    ||||||| ||||||||| |  |||||||||||||| | |||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| | | ||||||||||||    
T  33386302 acttaaccagcaagtttgaaaatcgtgtcacgattccacaaaatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaaccagctcacggcatcacaaaatcgtgtcac 33386203  T
Q  602 gatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 667  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33386202 gatgccaaattcgtgtcacgatttctctgttctttcggaccacaaatttgaagccaaatctcaaca 33386137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 102 - 380
Target Start/End: Original strand, 39153358 - 39153644
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 200  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |    
T  39153358 agattgttgacccagttcagtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgttctctccaatccactatcaatgagttctta-taaagggatacaaatg 39153455  T
Q  201 -gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 290  Q
     ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||     
T  39153456 agttacaagaaattagcttaaacaagctcacaatgaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcacacatgaacaagacactcaatgattttca 39153554  T
Q  291 ctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
     ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  39153555 ttcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaag 39153644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 102 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 34491383 - 34491212
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |    
T  34491383 agattgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 34491286  T
Q  201 -gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 272  Q
     ||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34491285 agttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 34491212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 380
Target Start/End: Original strand, 5236368 - 5236739
Alignment:
Q  14 cctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaa-tacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttca 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||| | ||||| || |||||||||||||||   ||| |||  ||||  |||||||||  ||||| |    
T  5236368 cctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaatccacaagcaaaagataaaaggagagaagagaggaa--caaacacaccaaaga--ttgttga 5236463  T
Q  112 cccagttcggtccaaacttgacctactctgaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaa 210  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| |||| ||| ||||||  ||||| |||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||    
T  5236464 cccagtttggtccaaa-ttgacctaatctggggaaagattgatctctcgaatccattatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaa 5236561  T
Q  211 attagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctc-tacaagg 300  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||   |||||    
T  5236562 attagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaagg 5236660  T
Q  301 tgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    ||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |  |||| |||||||||||    
T  5236661 tgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctccttcgatttcccaag 5236739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 450 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 8738740 - 8738585
Alignment:
Q  450 atcacgtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgt 548  Q
    |||| |||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||    
T  8738740 atcatgtcacgatttgcgtccgttccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgt 8738641  T
Q  549 gtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgat 604  Q
    | |||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  8738640 gccacgatttagcgtcctgcaaactagctcacggcaccttgaaatcatgtcacgat 8738585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 450 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 9090978 - 9090823
Alignment:
Q  450 atcacgtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgt 548  Q
    |||| |||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||    
T  9090978 atcatgtcacgatttgcgtccgttccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgt 9090879  T
Q  549 gtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgat 604  Q
    | |||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  9090878 gccacgatttagcgtcctgcaaactagctcacggcaccttgaaatcatgtcacgat 9090823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 466 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 37408236 - 37408036
Alignment:
Q  466 cgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaaatcgtgtcacgattttgcaccc 565  Q
    ||||| |||||||||| |||||  |||||||  | | ||||||| | ||||||| |  ||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||  |||||    
T  37408236 cgtacgacccaaggtacgaccaa-ccttatcctgaaaacttaaccaacaagtttgaaaatcgtgtcacgatttacacaatcgtgccacgatttgacaccc 37408138  T
Q  566 tgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaa 665  Q
    ||||| | ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  37408137 tgcaaaccagctcacggcactacaaaatcgtgtcacgatgccacaatcgtgtcacgatttctttgttcttccaaaccacaaatttgaagccaaatctcaa 37408038  T
Q  666 ca 667  Q
    ||    
T  37408037 ca 37408036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 99 - 272
Target Start/End: Original strand, 49199462 - 49199638
Alignment:
Q  99 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaa 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  49199462 aagagattgttcacccagttcggtccaaccatgacctagtctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaa 49199560  T
Q  198 aa--ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 272  Q
    ||  |||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  49199561 aatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccttaatttctacccattttcccaatctcaccaa 49199638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 106 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 4570120 - 4569952
Alignment:
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| | |||    
T  4570120 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagtt 4570022  T
Q  204 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 272  Q
    |||||||||||||||  | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4570021 acaagaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 4569952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 102 - 272
Target Start/End: Original strand, 29196383 - 29196555
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 199  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | || || ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||      
T  29196383 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 29196480  T
Q  200 ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 272  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29196481 ggttccaagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 29196555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 503 - 668
Target Start/End: Original strand, 37726134 - 37726300
Alignment:
Q  503 acttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaaa-tcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcac 601  Q
    ||||||| | ||||||| |  |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||| | | ||||||||||||    
T  37726134 acttaaccaacaagtttgaaaatcgtgtcacgattccacaaaatcgtgtcacgatttgacaccctgcaaaccagctcacggcatcacaaaatcgtgtcac 37726233  T
Q  602 gatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaacaa 668  Q
    |||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37726234 gatatcaaattcgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaagccaaatctcaacaa 37726300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 102 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 40734669 - 40734383
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 200  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | || || ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |    
T  40734669 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagggatacaaatg 40734572  T
Q  201 -gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 290  Q
     ||||||||||||||| ||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||     
T  40734571 tgttacaagaaattaggttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 40734473  T
Q  291 ctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt-tctccctttgatttcccaag 380  Q
    |||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||| |||||||||| |||||    
T  40734472 ctcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttatct-cctttgattttccaag 40734383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 102 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 761018 - 760732
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 199  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||| |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||      
T  761018 agattgttaacccatttcagtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagggatacaaatg 760921  T
Q  200 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 290  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||     
T  760920 ggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaga-cctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttca 760822  T
Q  291 ctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    ||| | ||||||||||   ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||    ||||||||||||||||    
T  760821 ctcatccaaggtgtttataatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-acccttaaccctaaagttaactcctttgatttcccaag 760732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 503 - 667
Target Start/End: Original strand, 27453416 - 27453581
Alignment:
Q  503 acttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttccca-aatcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcac 601  Q
    ||||||| ||||||||| |  |||||||||||||| | || |||| ||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||| | | ||||||||||||    
T  27453416 acttaaccagcaagtttgaaaatcgtgtcacgattccacacaatcatgtcacgatttggcaccctacaaaccagctcacggcatcacaaaatcgtgtcac 27453515  T
Q  602 gatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 667  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27453516 gatgccaaattcgtgtcacaatttctctgctctttcagaccacaaatttgaagccaaatctcaaca 27453581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 102 - 272
Target Start/End: Original strand, 44700476 - 44700646
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-ag 200  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||    
T  44700476 agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatgtggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttac-aaagagatacaaatag 44700573  T
Q  201 gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 272  Q
    ||||||||||||||||||  ||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44700574 gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 44700646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 102 - 380
Target Start/End: Original strand, 32744433 - 32744709
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 200  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| || | |||||   |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |    
T  32744433 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggatagatttatctcttcaatccactatcaaagagttcttac-aaagtgatacaaatg 32744530  T
Q  201 -gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctaca 297  Q
     ||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||  ||||||||||||| ||||  |||||||| ||| | |||||||||||||| |||  ||    
T  32744531 agttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa--ctaatttctacccattttttcaatctca-caaaatactcaatgattttcactcacca 32744627  T
Q  298 aggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    | |||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  32744628 atgtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaag 32744709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 99 - 272
Target Start/End: Original strand, 43401794 - 43401970
Alignment:
Q  99 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaa 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||    |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||    
T  43401794 aagagattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattaatttctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagataaaa 43401892  T
Q  198 aa--ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 272  Q
    ||   ||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43401893 aatgcgttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 43401970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 102 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 29682530 - 29682244
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 199  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||      
T  29682530 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgatctaatctaggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagggatacaaatg 29682433  T
Q  200 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 290  Q
    ||| |||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||     
T  29682432 ggtgacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cataatttctacccattttcccaatctcacaaataaacaagacactcaatgattttca 29682334  T
Q  291 ctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| | ||    ||||||||||||||||    
T  29682333 ctcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-acccttaaccctaaatttaactcctttgatttcccaag 29682244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 102 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 40735554 - 40735268
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 199  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||      
T  40735554 agattgctgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaact 40735457  T
Q  200 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 290  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||       ||||||||||||||||||||     
T  40735456 ggttacaataaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 40735358  T
Q  291 c-tctacaaggtgtttcccatgttttc-aacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    | | | |||||||||| | |||||| | ||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  40735357 cttttccaaggtgtttacaatgtttcctaacccaagaga-actttaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaag 40735268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 102 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 44331716 - 44331470
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 200  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||| |    
T  44331716 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaataagttcttac-aaagagatacaaatg 44331619  T
Q  201 g-ttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 290  Q
    | |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||       ||||||||||||||||||||     
T  44331618 gcttacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcctaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 44331520  T
Q  291 ctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaa 339  Q
    |||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  44331519 ctcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaa 44331470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 113 - 380
Target Start/End: Original strand, 22835010 - 22835285
Alignment:
Q  113 ccagttcggtccaaacttgacctactctga-ggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaa 210  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | ||  ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  22835010 ccagttcggtccaa-cttgacctaatatggcggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagggatacaaatgggttacaagaa 22835107  T
Q  211 attagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctc-tacaagg 300  Q
    ||||||||  ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||   |||||    
T  22835108 attagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaagg 22835206  T
Q  301 tgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    || || | ||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |  |||||||||| |||||    
T  22835207 tgattacaatgtttcccaacacaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgattttccaag 22835285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 99 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 30236299 - 30236129
Alignment:
Q  99 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaa 197  Q
    |||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  30236299 aagaaattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaa 30236202  T
Q  198 a-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctca 268  Q
    | ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30236201 ataggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctca 30236129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 482 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 2672604 - 2672416
Alignment:
Q  482 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctag-ctca 579  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  || |||| || | |||     
T  2672604 tgaccagtccttatcagagatacttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtggcacgattttgcttccagcaaacttggctcc 2672505  T
Q  580 cggcacc-ccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaacaat 669  Q
    ||||| | ||||  ||||||||||||  |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||    
T  2672504 cggcatctccga--tcgtgtcacgattacaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaaattccaacaat 2672416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 6 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 10067576 - 10067439
Alignment:
Q  6 aaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaaga 102  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |  |   || |||||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||| |||||    
T  10067576 aaacaccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaacaaagcaactaaacacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacac-aaaga 10067478  T
Q  103 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg 141  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10067477 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctg 10067439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 99 - 272
Target Start/End: Original strand, 43403737 - 43403913
Alignment:
Q  99 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaa 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||    
T  43403737 aagagattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagataaaa 43403835  T
Q  198 aa--ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 272  Q
     |   |||||||||||| |||||  ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43403836 catgagttacaagaaatgagcttcaacaagctcacaaagaac-aagcctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 43403913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 106 - 272
Target Start/End: Original strand, 6095600 - 6095767
Alignment:
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 203  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  6095600 tgttcacacagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 6095697  T
Q  204 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcaccaa 272  Q
    ||||||||||| |||  | ||||| |||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  6095698 acaagaaattaacttcaagaagtttacaaagaac-aaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaa 6095767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 102 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 31314616 - 31314447
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 199  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||||||||| | || || ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||      
T  31314616 agattgttgactcagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagatattgatctctccaatccactatcaaagagttcttacaaaa-agatacaaatg 31314519  T
Q  200 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcacc 270  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  31314518 ggttacaagaaattagcttcaacaagatcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcacc 31314447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 106 - 272
Target Start/End: Original strand, 41819523 - 41819691
Alignment:
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa--ggt 202  Q
    ||||||||||||| |||||||   ||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||  |||    
T  41819523 tgttcacccagtttggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatgtctccaatccactat-aatgagttcttac-aaagagatacaaaatgggt 41819620  T
Q  203 tacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 272  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41819621 tacaagaaattagcttagacaagctcacaaaaaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 41819691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 106 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 54593871 - 54593704
Alignment:
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 203  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  54593871 tgttcacccagtttggtccaa-cttgacatactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 54593774  T
Q  204 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcaccaa 272  Q
    |||| ||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||    
T  54593773 acaataaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctgcacattttcccaatctcaccaa 54593704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 102 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 51398985 - 51398699
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 200  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |    
T  51398985 agattgttgaccaagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagataaatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 51398888  T
Q  201 -gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctc-------accaagacactcaatgattttct 290  Q
     ||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||       | ||||||||||||||||||||     
T  51398887 agttacaagaaattagcttcaacaagttcactaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcatcaatgaacaagacactcaatgattttca 51398789  T
Q  291 ctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    ||| | |||||||||| | || |||  |||||||||| | ||||||||||||| || || ||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  51398788 ctcatccaaggtgtttacaatatttcccaacccaaga-aaactctaatcaaag-actctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaag 51398699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 482 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 2676760 - 2676581
Alignment:
Q  482 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctag-ctca 579  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  || |||| || | |||     
T  2676760 tgaccagtccttatcagagattcttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtggcacgattttgcttccagcaaacttggctcc 2676661  T
Q  580 cggcacc-ccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaat 660  Q
    || || | ||||  ||||||||||||  |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2676660 cgacatctccga--tcgtgtcacgattacaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaaat 2676581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 102 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 16499200 - 16498915
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 199  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||      
T  16499200 agattgttgacccagttcggtccaa-cttaacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatataaatg 16499103  T
Q  200 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttcta-cccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 290  Q
    ||| |||||||||||||||  ||||| | ||||  ||  |||||||||||||| || |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||     
T  16499102 ggtaacaagaaattagcttcaacaagcttacaa--aaacaaccctaatttctatccgttttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttca 16499005  T
Q  291 ct-ctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    || |  |||||||||| | |||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||   |||| |  ||||||||||||||||    
T  16499004 ctaccccaaggtgtttacaatgtttctcaacctaagaga-actctaatcaaag-accctcaacccacaagttacctcctttgatttcccaag 16498915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 475 - 604
Target Start/End: Original strand, 32143754 - 32143884
Alignment:
Q  475 caaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatct 573  Q
    ||||||| |||| |||||||||  | | ||||||||||||||||| |  |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  32143754 caaggtacgacctgtccttatcttgaaaacttaacgagcaagtttgaaaatcgtgtcacgattccacaagatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaact 32143853  T
Q  574 agctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgat 604  Q
    ||||||||||| | | |||||||||||||||    
T  32143854 agctcacggcatcacaaaatcgtgtcacgat 32143884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 106 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 46860642 - 46860474
Alignment:
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 203  Q
    |||||| ||| ||||||||||   |||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||  ||||    
T  46860642 tgttcatccaattcggtccaacaatgacctactctggaggaaagattgatctctccaatccactatcaatgagttattac-aaagagatacaaatgggtt 46860544  T
Q  204 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 272  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  46860543 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 46860474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 113 - 272
Target Start/End: Original strand, 53921511 - 53921671
Alignment:
Q  113 ccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaa 210  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| | || ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||    
T  53921511 ccagttcggtc-aaacttgatctactccgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaa-tgatacaaatgagttacaagaa 53921608  T
Q  211 attagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 272  Q
    |||||| || ||||| ||||||  |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  53921609 attagctttaacaagctcacaaacaacaaa-cctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 53921671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 102 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 29813234 - 29813063
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 199  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | ||||| | |||| || ||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||| ||||      
T  29813234 agattgttgacccagttcggtccaa-catgaccaaatctgggggagagattgatctctccaatccactataaatgagttcttac-aaagagatgcaaatg 29813137  T
Q  200 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 272  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  29813136 ggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacctatttttccaatctcaccaa 29813063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 126 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 29811016 - 29810753
Alignment:
Q  126 aacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gaca 222  Q
    ||||||||||| |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||    
T  29811016 aacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaaca 29810918  T
Q  223 agttcacaatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcacc-------aagacactcaatgattttctctc-tacaaggtgtttcccatgtt 313  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||||||||   |||||| |||||||||       |||||| |||||||||||| |||   |||||||||| | |||||    
T  29810917 agttcacaaagaac-aactctaatttctacatattttcctaatctcaccaatgaataagacattcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtt 29810819  T
Q  314 t-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |  |||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||| | || |  ||||||||||||||||    
T  29810818 tcccaacccaaaaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaaattacctcctttgatttcccaag 29810753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 113 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 32891264 - 32891105
Alignment:
Q  113 ccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaa 210  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| | || |||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||    
T  32891264 ccagttcggtccaa-catgacctactccgggggagagatttatctctccaatccactatcaacgagttcttac-aaagagatacaaatgagttacaagaa 32891167  T
Q  211 attagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcacc 270  Q
    ||||||||  ||||| |||||| ||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  32891166 attagcttcaacaagctcacaaagaacaaaacttaatttctacccattttctcaatctcacc 32891105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 609 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 45282642 - 45282583
Alignment:
Q  609 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaacaat 669  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45282642 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagac-aatctcaacaat 45282583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 482 - 654
Target Start/End: Original strand, 8512642 - 8512815
Alignment:
Q  482 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatc-tagctca 579  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  || |||| | |||||||    
T  8512642 tgaccagtccttatcagagatacttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttagctca 8512741  T
Q  580 cggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
    | || | ||   ||||||||||||   |||||||||| ||||||| | ||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  8512742 ctgc-ctccctgatcgtgtcacgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttctcccaaaccactaatttgaag 8512815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 481 - 561
Target Start/End: Original strand, 32475885 - 32475966
Alignment:
Q  481 atgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgc 561  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32475885 atgaccagtccttatcagagatacttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgtcacgattttgc 32475966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 481 - 561
Target Start/End: Original strand, 32480743 - 32480824
Alignment:
Q  481 atgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgc 561  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32480743 atgaccagtccttatcagagatacttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgtcacgattttgc 32480824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 99 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 40913467 - 40913352
Alignment:
Q  99 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaa 197  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||    
T  40913467 aagagattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcgatgagttcttac-aaagagatacaa 40913370  T
Q  198 aag-gttacaagaaatta 214  Q
    | | ||||||||||||||    
T  40913369 atgagttacaagaaatta 40913352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 115 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 46173515 - 46173377
Alignment:
Q  115 agttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaat 212  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||    
T  46173515 agttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgaattcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaat 46173418  T
Q  213 tagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc 253  Q
    ||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  46173417 tagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacc 46173377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 102 - 289
Target Start/End: Original strand, 9666463 - 9666659
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 200  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| |||| || ||||||    |||||||||||||||||||||| ||||||||||  || || ||| |    
T  9666463 agattgttgacccagttcggtccaa-ctttacctaatctgggggagagatcaatctctccaatccactatcaaagaattcttacaaagagg-tataaatg 9666560  T
Q  201 -gttacaagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttc 289  Q
     |||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||       ||||||||||||||||||||    
T  9666561 agttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaatctaatttctacccatttttccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttc 9666659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 607 - 667
Target Start/End: Original strand, 32143868 - 32143928
Alignment:
Q  607 caaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 667  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32143868 caaaatcgtgtcacgatttctctgttctttcagaccacaaatttgaagccaaatctcaaca 32143928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 482 - 654
Target Start/End: Original strand, 8517522 - 8517695
Alignment:
Q  482 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatc-tagctca 579  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  || |||| | |||||||    
T  8517522 tgaccagtccttatcagagatacttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttagctca 8517621  T
Q  580 cggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
    | || | ||   ||||||||||||   |||||||||| ||||||| | ||||||| | | ||||| |||||||||    
T  8517622 ctgc-ctccctgatcgtgtcacgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttctcctaaaccactaatttgaag 8517695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 102 - 272
Target Start/End: Original strand, 23391906 - 23392077
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 199  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | || || |||||||   |||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||      
T  23391906 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagatttatctctacaatccactatcaaagagttcttgc-aaagtgatacaaatg 23392003  T
Q  200 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcaccaa 272  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||| |||||| ||||||| | |||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  23392004 ggttacaagaaattatcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cttaatttctactcattttcccaaactcaccaa 23392077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 503 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 27986103 - 27986001
Alignment:
Q  503 acttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttccca-aatcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcac 601  Q
    ||||||| ||||||||| |  |||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| | | ||||||||||||    
T  27986103 acttaaccagcaagtttgaaaatcgtgtcacgattccacacaatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaaccagctcacggcatcacaaaatcgtgtcac 27986004  T
Q  602 gat 604  Q
    |||    
T  27986003 gat 27986001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 104 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 47304420 - 47304254
Alignment:
Q  104 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggataca-aaagg 201  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||| |  ||    
T  47304420 attgttgacccagttcggtc-aaacttgacctaatcttggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-gaagagatacagatggg 47304323  T
Q  202 ttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 269  Q
    |||||||| |||| |||  ||||| |||||| |||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  47304322 ttacaagatattaacttcaacaagctcacaaagaac-aaccataatttctacccattttctcaatctcac 47304254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 272
Target Start/End: Original strand, 51352150 - 51352278
Alignment:
Q  144 gagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcacaatgaacaaaccc 242  Q
    |||||||||  ||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| |  ||||||| ||||||||||||||| ||| | || | |||||||||||||||||    
T  51352150 gagagattgatctctcaaatccactctcaatgagttattacaaa-gaaatacaaatggttacaagaaattaactttaaaaagctcacaatgaacaaaccc 51352248  T
Q  243 taatttctacccttttcccaatctcaccaa 272  Q
    ||| ||||| | |||||| |||||||||||    
T  51352249 taacttctatcattttcctaatctcaccaa 51352278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 482 - 654
Target Start/End: Original strand, 24968519 - 24968692
Alignment:
Q  482 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatc-tagctca 579  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  || |||| | | |||||    
T  24968519 tgaccagtccttatcagagaaacttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctca 24968618  T
Q  580 c-ggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
    | | | |||||  |||||||||||||  | |||||||| ||||||| |  |||||||||| ||||| |||||||||    
T  24968619 ctgcctccccg--atcgtgtcacgattgccaaatcgtgacacgattcctttgttcttccaaaccactaatttgaag 24968692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 607 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 27974493 - 27974433
Alignment:
Q  607 caaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 667  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  27974493 caaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaagccaaatttcaaca 27974433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 212
Target Start/End: Original strand, 55301972 - 55302079
Alignment:
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 203  Q
    |||||||| ||||||||||||   ||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||| |||||    
T  55301972 tgttcaccaagttcggtccaacaatgacctactatggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgaattcttac-aaagagatacaaataggtt 55302070  T
Q  204 acaagaaat 212  Q
    |||||||||    
T  55302071 acaagaaat 55302079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 200 - 305
Target Start/End: Original strand, 5433971 - 5434086
Alignment:
Q  200 ggttacaagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttt--tcccaatctcac-------caagacactcaatgattttc 289  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||       ||||||||||||||||||||    
T  5433971 ggttacaagaaattagctttaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttctaccattttctcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttc 5434070  T
Q  290 tctctacaaggtgttt 305  Q
     |||  ||||||||||    
T  5434071 actcaccaaggtgttt 5434086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 607 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 27986017 - 27985957
Alignment:
Q  607 caaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 667  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  27986017 caaaatcgtgtcacgatttctctgttattccaaaccacaaatttgaaatcaaatctcaaca 27985957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 590 - 654
Target Start/End: Original strand, 36029640 - 36029704
Alignment:
Q  590 aaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
    |||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  36029640 aaatcgtgacacgttgataaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaag 36029704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 609 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 40734132 - 40734084
Alignment:
Q  609 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagaca 657  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40734132 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaagaca 40734084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 608 - 667
Target Start/End: Original strand, 40845220 - 40845279
Alignment:
Q  608 aaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 667  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||    
T  40845220 aaaatcgtgtcacgatttctctgttctcccaaaacataaatttgaagacaaatctcaaca 40845279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 36018982 - 36018852
Alignment:
Q  143 ggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa--ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaa 239  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||   |||||||||||||| |||  ||||| |||||| |||| ||    
T  36018982 ggagagattgacctctccaatccactat-aatgagttcttac-aaagagatacaaaatgagttacaagaaattaacttcaacaagctcacaaagaac-aa 36018886  T
Q  240 ccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 272  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  36018885 ccctaatttcaacccattttcccaatttcaccaa 36018852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 609 - 654
Target Start/End: Original strand, 16264896 - 16264941
Alignment:
Q  609 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  16264896 aaatcgtgtcacgatttcgctgttcttccaaaccacaaatttgaag 16264941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 609 - 654
Target Start/End: Original strand, 21711768 - 21711813
Alignment:
Q  609 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  21711768 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaag 21711813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 609 - 654
Target Start/End: Original strand, 27027273 - 27027318
Alignment:
Q  609 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  27027273 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaag 27027318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 609 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 30709316 - 30709271
Alignment:
Q  609 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  30709316 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaag 30709271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 615 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 8738593 - 8738554
Alignment:
Q  615 tgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8738593 tgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaag 8738554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 615 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 9090831 - 9090792
Alignment:
Q  615 tgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9090831 tgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaag 9090792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 589 - 668
Target Start/End: Original strand, 27038588 - 27038667
Alignment:
Q  589 gaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaacaa 668  Q
    |||||||||||||| ||   |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||| ||| | |||||||    
T  27038588 gaaatcgtgtcacgttgatgaaatcgtgtcacgatttctctgtttttccaaaccacaaacttgaagccaattttcaacaa 27038667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 405 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 45282848 - 45282809
Alignment:
Q  405 tcaaatctgcacaagaacactttatactagcctccctctg 444  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45282848 tcaaatctgcacaagaacactttatactagccttcctctg 45282809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 267
Target Start/End: Original strand, 4055813 - 4055926
Alignment:
Q  155 ctctccaatccactatcaaagagtt-cttacaaaagggatacaaaag--gttacaagaaattagcttg-acaagttcacaatgaacaaaccctaatttct 250  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||  |||||||||||||| |||  |||||||| | | ||||||  ||||||||||    
T  4055813 ctcttcaatccactatcaatgagtttcttacaaa-gagatacaaaagaggttacaagaaattaacttttacaagttctccaagaacaa--cctaatttct 4055909  T
Q  251 acccttttcccaatctc 267  Q
    |||| ||||||||||||    
T  4055910 acccatttcccaatctc 4055926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 592 - 654
Target Start/End: Original strand, 32475997 - 32476059
Alignment:
Q  592 atcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
    |||||||||||||| | |||||||| ||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  32475997 atcgtgtcacgatggccaaatcgtgacacgattcctctgttctcccaaaccacaaatttgaag 32476059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 592 - 654
Target Start/End: Original strand, 32480855 - 32480917
Alignment:
Q  592 atcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
    |||||||||||||| | |||||||| ||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  32480855 atcgtgtcacgatggccaaatcgtgacacgattcctctgttctcccaaaccacaaatttgaag 32480917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 609 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 39032075 - 39032017
Alignment:
Q  609 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 667  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||| | ||||||    
T  39032075 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaacaacaaatttgaagccaattttcaaca 39032017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 511 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 40735161 - 40735015
Alignment:
Q  511 agcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaaa-tcgtgtcacgattttgcaccctgcaatcta-gctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgcca 608  Q
    ||||||||| |  ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||| | | |||||| ||     ||||||||| |||| ||       
T  40735161 agcaagtttgaaaatcgtgtcacgttttcccaaaatcgtgacacgattgagcaccctgcaaaccatgctcactgcttg--gaaatcgtgacacgttgatg 40735064  T
Q  609 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagaca 657  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  40735063 aaatcgtgtcacgatttatctgttcatccaaaccacaaatttgaagaca 40735015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 201 - 260
Target Start/End: Original strand, 28253363 - 28253423
Alignment:
Q  201 gttacaagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcc 260  Q
    |||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  28253363 gttacaagaaattaacttcaacaagctcacaatgaacgaaccctaatttctaccattttcc 28253423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 214
Target Start/End: Original strand, 4075520 - 4075581
Alignment:
Q  155 ctctccaatccactatcaaagag-ttcttacaaaagggatacaaa--aggttacaagaaatta 214  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||    
T  4075520 ctctccaatccactatcaaagagtttcttac-aaagtgatacaaaagaggttacaagaaatta 4075581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 172
Target Start/End: Original strand, 27305719 - 27305777
Alignment:
Q  114 cagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatca 172  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  27305719 cagttcggtccaaa-ttgacctactttggaggagagattgatctctccaatccactatca 27305777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 616 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 1730959 - 1730921
Alignment:
Q  616 gtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  1730959 gtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaag 1730921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 330 - 380
Target Start/End: Original strand, 7782375 - 7782424
Alignment:
Q  330 ctctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7782375 ctctaatcaaaga-ctctaaaacctagagttactccctttgatttcccaag 7782424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 473 - 519
Target Start/End: Original strand, 7782538 - 7782584
Alignment:
Q  473 cccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagttt 519  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  7782538 cccaaggcacgaccagtccttatcatggaaacttaacgagcaagttt 7782584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 524 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 22172898 - 22172864
Alignment:
Q  524 atcgtgtcacgatttcccaaatcgtgtcacgattt 558  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22172898 atcgtgccacgatttcccaaatcgtgtcacgattt 22172864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 199 - 252
Target Start/End: Original strand, 25517069 - 25517121
Alignment:
Q  199 aggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac 252  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  25517069 aggttataagaaattagcttaa-aagctcacaaagaacaaaccctaatttctac 25517121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 609 - 654
Target Start/End: Original strand, 35926057 - 35926101
Alignment:
Q  609 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  35926057 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaacc-caaatttgaag 35926101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 609 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 40592302 - 40592257
Alignment:
Q  609 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  40592302 aaatcatgtcacgatttctccgttcttccaaaccacaaatttgaag 40592257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 609 - 650
Target Start/End: Original strand, 48438782 - 48438823
Alignment:
Q  609 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaattt 650  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  48438782 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttacaaaccacaaattt 48438823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 447; Significance: 0; HSPs: 97)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 447; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 27648126 - 27647467
Alignment:
Q  1 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27648126 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaactcaatacacaa------gataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaa- 27648034  T
Q  101 gagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27648033 gagattgttcacccagttcggtccaaacttgatctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa 27647934  T
Q  200 ggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaag 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  27647933 ggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctctctacatg 27647836  T
Q  300 gtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnn 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                       
T  27647835 gtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaagtctctctctcttccaactc 27647736  T
Q  400 nnnnntcaaatctgcacaagaacactttatactagcctccctctgaagcaatcacgtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaag 499  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||   ||||||  |||||||| ||||||| |||||||  | ||||||||  |||||||    
T  27647735 tctcttcaaatctgcacaagaacactttatactagtcttcctctattgcaatcgtgtcacgatctgcgtaccacccaagaaacgaccagtcaatatcaag 27647636  T
Q  500 gatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttccca-aatcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgt 598  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27647635 gatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttctcacaatcgtgccacgattttgcaccctgcaacctagctcacggcaccccgaaatcgtgt 27647536  T
Q  599 cacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 667  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27647535 cacgatgccacaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaaactcaaca 27647467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 16555144 - 16554762
Alignment:
Q  1 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaaaagcacca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||    
T  16555144 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacacca 16555045  T
Q  99 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggataca 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16555044 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactttggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggataca 16554945  T
Q  197 aaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctac 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  16554944 aaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttac 16554845  T
Q  297 aaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  16554844 aaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgc-ccctttgattccccaag 16554762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 16631700 - 16631318
Alignment:
Q  1 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaaaagcacca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||    
T  16631700 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacacca 16631601  T
Q  99 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggataca 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16631600 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactttggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggataca 16631501  T
Q  197 aaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctac 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  16631500 aaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttac 16631401  T
Q  297 aaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  16631400 aaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgc-ccctttgattccccaag 16631318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 16653387 - 16653012
Alignment:
Q  1 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaaaagcacca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||    
T  16653387 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacacca 16653288  T
Q  99 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggataca 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16653287 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggataca 16653188  T
Q  197 aaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctac 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  16653187 aaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttttacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttac 16653088  T
Q  297 aaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatt 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  16653087 aaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgc-ccctttgatt 16653012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 380
Target Start/End: Original strand, 16578411 - 16578793
Alignment:
Q  1 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaaaagcacca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||    
T  16578411 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacacca 16578510  T
Q  99 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggataca 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16578511 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggataca 16578610  T
Q  197 aaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctac 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  16578611 aaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgagcaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttac 16578710  T
Q  297 aaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  16578711 aacgtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgc-ccctttgattccccaag 16578793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 16616969 - 16616587
Alignment:
Q  1 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaaaagcacca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||    
T  16616969 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacacca 16616870  T
Q  99 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggataca 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16616869 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggataca 16616770  T
Q  197 aaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctac 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  16616769 aaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgagcaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttac 16616670  T
Q  297 aaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  16616669 aacgtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgc-ccctttgattccccaag 16616587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 25421580 - 25421198
Alignment:
Q  1 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaataca-caatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa-aagcacca 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  || |||||||||||||||    |||||||||||||||||| || ||| |    
T  25421580 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagggaagaagaaaacaataaacac-a 25421482  T
Q  99 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatac 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  25421481 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac 25421382  T
Q  196 aaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctcta 295  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  25421381 aagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctcttta 25421282  T
Q  296 caaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  25421281 caaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc-ccctttgatttcccaag 25421198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 6027520 - 6027141
Alignment:
Q  1 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaataca-caatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa-aagcacca 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  || |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||| |    
T  6027520 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaaatg-gagggaagaagaaaacaataaacac-a 6027423  T
Q  99 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatac 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  6027422 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacatactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac 6027323  T
Q  196 aaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctcta 295  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  6027322 aagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctctcta 6027225  T
Q  296 caaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  6027224 caaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc-ccctttgatttcccaag 6027141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 7 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 412369 - 411994
Alignment:
Q  7 aacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagatt 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  412369 aacagcacctagatctaatctaggtaacaagtgaaaaacacaatacacaagcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaaagagatt 412270  T
Q  107 gttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa--ggtt 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||   |||    
T  412269 gttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctctaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaagagtt 412170  T
Q  204 acaagaaattag-cttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtg 302  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  412169 acaagaaattagatttgataagttcacaatgaac-aaccctaatttctacctttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctcttcaaggtg 412071  T
Q  303 tttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  412070 tttcccatgttttcaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagagttactccctttgatttctcaag 411994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 34167354 - 34166973
Alignment:
Q  1 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaataca-caatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa-aagcacca 98  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |    
T  34167354 caacaaaacaccacctagatcaaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaacac-a 34167256  T
Q  99 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaaga-gttctt-acaaaagggatac 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||    
T  34167255 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaataagttctttacaaaaggaatac 34167156  T
Q  196 aaaaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctct 294  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  34167155 aagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgatt--ctctct 34167058  T
Q  295 acaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  34167057 acaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaactctagagcttc-ccctttgatttcccaag 34166973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 380
Target Start/End: Original strand, 33341997 - 33342380
Alignment:
Q  1 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaa---aggagagggaagaagaaaacaa-aagcac 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |  |   || |||||||||||   |||||||||||||||||||||| || |||    
T  33341997 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacaaagcaactaaacacaagataaacaaaggagagggaagaagaaaacaataaacac 33342096  T
Q  97 caaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggat 193  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |    
T  33342097 -aaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggagt 33342195  T
Q  194 acaaaaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctct 292  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  33342196 acaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgatt--ctct 33342293  T
Q  293 ctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  33342294 ctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc-ccctttgatttcccaag 33342380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 16 - 380
Target Start/End: Original strand, 3072670 - 3073036
Alignment:
Q  16 tagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcaccca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || || |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  3072670 tagatctaatctaggaaacaagtgaaaagcataaaacacaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaa-gagattgttcaccca 3072768  T
Q  116 gttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaagg--ttacaagaaat 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||    
T  3072769 gttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaattcactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaagagttacaagaaat 3072868  T
Q  213 tagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatg 311  Q
    ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3072869 tagatttgacaagttcacaatgaacaa-ccctaatttctaccattttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctcttcaaggtgtttcccatg 3072967  T
Q  312 ttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |||  ||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3072968 tttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 3073036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 6 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 34165128 - 34164751
Alignment:
Q  6 aaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaaga 102  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |  |   || |||||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||| |||||    
T  34165128 aaacaccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaacaaagcaactaaacacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacac-aaaga 34165030  T
Q  103 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatacaaaa 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |    
T  34165029 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaga 34164930  T
Q  200 ggttacaagaaattagcttgacaa-gttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaa 298  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  34164929 ggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgatt--ctctctacaa 34164832  T
Q  299 ggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  34164831 ggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaactctagagcttc-ccctttgatttcccaag 34164751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 5 - 380
Target Start/End: Original strand, 6097349 - 6097717
Alignment:
Q  5 aaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtg-agaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagag 103  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  6097349 aaaacagcaccttgatctaatctaggtaacaagtggaaaaacacaatacacaatcacaagatacaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaagag 6097448  T
Q  104 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggt 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||           ||    
T  6097449 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaag----------agt 6097538  T
Q  203 tacaagaaattag-cttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggt 301  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||    
T  6097539 tacaagaaattagatttgacaagttcacaaagaac-aatcctaatttctaccatttttccaatctcaccaaaacactcaatgattttcactcaccaaggt 6097637  T
Q  302 gtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6097638 gtttaccatgtttcccaaccaaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgctccctttgatttcccaag 6097717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 13154189 - 13153886
Alignment:
Q  1 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaataca-caatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa-aagcacca 98  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |    
T  13154189 caacaatacaccacctagatcgaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaacac-a 13154091  T
Q  99 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatac 195  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  13154090 aagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac 13153991  T
Q  196 aaaaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctct 294  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  13153990 aagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctctct 13153893  T
Q  295 acaaggt 301  Q
    |||||||    
T  13153892 acaaggt 13153886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 455 - 668
Target Start/End: Original strand, 16578889 - 16579102
Alignment:
Q  455 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgattt-cccaaatcgtgtcac 553  Q
    |||||||| ||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  16578889 gtcacgatctgcgtaccacccaagaaacgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgattttcccaaatcgtgccac 16578988  T
Q  554 gattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaa 653  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16578989 gattttgcaccctgcaacctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgataccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaa 16579088  T
Q  654 gacaaatctcaacaa 668  Q
    ||| |||||||||||    
T  16579089 gac-aatctcaacaa 16579102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 455 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 16616491 - 16616278
Alignment:
Q  455 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgattt-cccaaatcgtgtcac 553  Q
    |||||||| ||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  16616491 gtcacgatctgcgtaccacccaagaaacgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgattttcccaaatcgtgccac 16616392  T
Q  554 gattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaa 653  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16616391 gattttgcaccctgcaacctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgataccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaa 16616292  T
Q  654 gacaaatctcaacaa 668  Q
    ||| |||||||||||    
T  16616291 gac-aatctcaacaa 16616278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 7 - 380
Target Start/End: Original strand, 2171431 - 2171814
Alignment:
Q  7 aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaa---cacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaaga 102  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||   || || |||||| |||||||||||||| ||| |||||   |||||||  |||||| ||    
T  2171431 aacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaaaaacataaaacacaagcacaagataaaagg-gagagaagagataaacaaatacaccaa-ga 2171528  T
Q  103 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaagg 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| ||    
T  2171529 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaggg 2171627  T
Q  202 ttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctct 292  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||       |||||||||||||||||||| ||    
T  2171628 ttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccatttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 2171726  T
Q  293 ctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2171727 caccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaaactctaatcaaag-accctaaaccctagagttgctccctttgatttcccaag 2171814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 455 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 16554666 - 16554454
Alignment:
Q  455 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgattt-cccaaatcgtgtcac 553  Q
    |||||||| ||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  16554666 gtcacgatctgcgtaccacccaagaaacgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgattttcccaaatcgtgccac 16554567  T
Q  554 gattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaa 653  Q
     ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16554566 aattttgcaccctgtaacctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgataccaaaatcatgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaa 16554467  T
Q  654 gacaaatctcaaca 667  Q
    ||| ||||||||||    
T  16554466 gac-aatctcaaca 16554454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 455 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 16631222 - 16631010
Alignment:
Q  455 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgattt-cccaaatcgtgtcac 553  Q
    |||||||| ||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  16631222 gtcacgatctgcgtaccacccaagaaacgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgattttcccaaatcgtgccac 16631123  T
Q  554 gattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaa 653  Q
     ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16631122 aattttgcaccctgtaacctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgataccaaaatcatgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaa 16631023  T
Q  654 gacaaatctcaaca 667  Q
    ||| ||||||||||    
T  16631022 gac-aatctcaaca 16631010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 380
Target Start/End: Original strand, 31404579 - 31404957
Alignment:
Q  7 aacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaa-cacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagat 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||    |||| |||||  ||||| || |||||||||||||||  ||||   |||||||  |||||||||  |    
T  31404579 aacagcacctagatctaatctaggaatcaaagaggaaagcacaaaccacaagcaaaagataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaaaga--t 31404674  T
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggtt 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  31404675 tgttcacccagttcggtccaaacttggcctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagggtt 31404773  T
Q  204 acaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctcta 295  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||      
T  31404774 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttcccaatctcactgatgaacaagacactcaatgattttcactcac 31404872  T
Q  296 caaggtgtttcccatgtttt-caacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  31404873 caaggtgtttacaatgttttccaacccaagaga-actctaatcaaaagaccctaaaccctaaagttgcctcctttgatttcccaag 31404957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 473 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 411881 - 411683
Alignment:
Q  473 cccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagttt-cacgatcgtgtcacgatttccca-aatcgtgtcacgattttgcaccctgcaa 570  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||     
T  411881 cccaaggtatgaccagtccttatcatggaaacttaacgagcaagtttgcacaatcgtgtcacgatttcccacaatcgtgtcacgatttggcaccctgcag 411782  T
Q  571 tctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaacaat 669  Q
     ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  411781 actagctcacggcaccacgaaattgtgtcacaatgccaaattcgtgtcacgatttccctattcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaacaat 411683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 12 - 380
Target Start/End: Original strand, 5406109 - 5406481
Alignment:
Q  12 cacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttc 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | || || |||||  ||||| || |||||||||||||||  ||||   |||||||  |||||||||  ||||||    
T  5406109 cacctagatctaatctaggaatcaaagagaaaagcacaaaccacaaacaaaagataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaaaga--ttgttc 5406204  T
Q  111 acccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaag 208  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||    
T  5406205 acccagttcggttcaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagggttacaag 5406303  T
Q  209 aaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctctacaagg 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  5406304 aaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaagg 5406402  T
Q  301 tgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    ||||| | ||||||  |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  5406403 tgtttacaatgtttcccaacccgagaga-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagttgcctcctttgatttcccaag 5406481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 12 - 380
Target Start/End: Original strand, 5410434 - 5410806
Alignment:
Q  12 cacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttc 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | || || |||||  ||||| || |||||||||||||||  ||||   |||||||  |||||||||  ||||||    
T  5410434 cacctagatctaatctaggaatcaaagagaaaagcacaaaccacaaacaaaagataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaaaga--ttgttc 5410529  T
Q  111 acccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaag 208  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||    
T  5410530 acccagttcggttcaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagggttacaag 5410628  T
Q  209 aaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctctacaagg 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  5410629 aaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaagg 5410727  T
Q  301 tgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    ||||| | ||||||  |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  5410728 tgtttacaatgtttcccaacccgagaga-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagttgcctcctttgatttcccaag 5410806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 455 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 5674442 - 5674227
Alignment:
Q  455 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcac 553  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  5674442 gtcacgatttgcgtacgtcccaaggtatgaccagtccttatcacggatacttaacgagcaagtttcaaaatcgtgtcacgatttcccaagattgtgtcac 5674343  T
Q  554 gattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaa 653  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5674342 gatttggcaccctgcaaaccagctcacggcatcacaaaatcatgtcacgatgccaaattcatgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaa 5674243  T
Q  654 gacaaatctcaacaat 669  Q
    | ||| | ||||||||    
T  5674242 gccaactatcaacaat 5674227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 448 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 25421016 - 25420797
Alignment:
Q  448 caatcacgtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacga-tttcccaaatc 546  Q
    |||||| |||||||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25421016 caatcatgtcacgatttgcgtccgtcccaaggaacgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgattttcccaaatc 25420917  T
Q  547 gtgtcacgattttgca-ccctgcaa-tctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccac 644  Q
    ||| ||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25420916 gtgccacga-tttgcacccctgcaaccctagctcacggca-tccgaaatcgtgtcacggtcccaaaattgtgtcacgatttccctgttcttccagaccac 25420819  T
Q  645 aaatttgaagacaaatctcaaca 667  Q
    |||||||||||| ||||||||||    
T  25420818 aaatttgaagac-aatctcaaca 25420797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 380
Target Start/End: Original strand, 5413299 - 5413675
Alignment:
Q  7 aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagat 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| | || || |||||  ||||| || |||||||||||||||  ||||   |||||||  |||||||||  |    
T  5413299 aacaacacctagatctaatctaggaatcaaagagaaaagcacaaaccacaagcaaaagataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaaaga--t 5413394  T
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggtt 203  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  5413395 tgttcacc-agttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagggtt 5413492  T
Q  204 acaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctcta 295  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||      
T  5413493 acaagaaattagctttgacaagttcgcaaagaac-aaccctaatttctacctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 5413591  T
Q  296 caaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    ||| |||||| | ||||||  |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  5413592 caatgtgtttacaatgtttcccaacccgagaga-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagttgcctcctttgatttcccaag 5413675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 380
Target Start/End: Original strand, 16452232 - 16452612
Alignment:
Q  7 aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaag-ataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagaga 104  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||||  ||||| || ||  ||||||||||||  ||||   |||||||  |||||||||      
T  16452232 aacatcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaccacaagcaaaaatataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaaaga-- 16452327  T
Q  105 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggata-caaaaggt 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||  ||| |||    
T  16452328 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt-ccaaagagatatgaaagggt 16452426  T
Q  203 tacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctct 292  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||       |||||||||||||||||||| ||    
T  16452427 tacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 16452525  T
Q  293 ctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |  |||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||  |||||||||||||||    
T  16452526 caccaaggtgtttacaatgtttctcaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaactctaaagttgcttactttgatttcccaag 16452612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 473 - 667
Target Start/End: Original strand, 3073148 - 3073343
Alignment:
Q  473 cccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttccca-aatcgtgtcacgattttgcaccctgcaat 571  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| |      
T  3073148 cccaaggtatgaccagtccttatcatggaaacttaacgagcaagtttgcaaatcgtgtcacgatttccaacaatcgtgtcacgatttggcaccctgtaga 3073247  T
Q  572 ctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 667  Q
    | ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3073248 ccagctcacggcatcacgaaatcgtgtcacgatgccaaattcgtgtcacgattttcctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 3073343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 7 - 380
Target Start/End: Original strand, 30834438 - 30834819
Alignment:
Q  7 aacaccacctagatctaatctaggaaac-aagtg--agaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagag 103  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||| | |||||  | ||||||||  ||||| || || |||||||||||  |||||   |||||||  ||||||  ||    
T  30834438 aacagcacctagatctaatctatgaatcaaagtgaaaaaaacacaaaccacaagcaaaatataaaaggaga--gaagagataaacaaacacaccaa--ag 30834533  T
Q  104 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-gg 201  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||| ||    
T  30834534 attattcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt-ccaaagagatacaaaaggg 30834632  T
Q  202 ttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctc 291  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |    
T  30834633 ttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcac 30834731  T
Q  292 tctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    ||  | |||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| |||| || ||||||||||| ||||    
T  30834732 tcaccgaggtgtttacaatgtttctcaacccaagaga-actctaatcaaag-accataaaccctaaagttgcttcctttgatttctcaag 30834819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 405 - 667
Target Start/End: Original strand, 2171838 - 2172104
Alignment:
Q  405 tcaaatctgcacaagaacacttta-tactagcctccctctgaagcaatcacgtcacgatttg--cgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaagga 501  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||   ||||  ||||||||| |  |||||  | ||||||| |||| |||||||||  |||    
T  2171838 tcaaatctgcacaagaacacttaaatactagccttccactgataaaatcgtgtcacgattggtacgtacgtcacaaggtacgacctgtccttatcttgga 2171937  T
Q  502 tacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtca 600  Q
     ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| | |||||||||||||    
T  2171938 aacttaacgagcaagttttacaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaaccagctcacggcatcacgaaatcgtgtca 2172037  T
Q  601 cgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 667  Q
    |||||||||| || |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  2172038 cgatgccaaattcatgtcccgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaaaccaaatctcaaca 2172104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 455 - 669
Target Start/End: Original strand, 6136335 - 6136549
Alignment:
Q  455 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttccca-aatcgtgtcac 553  Q
    |||||||||||| | |  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  6136335 gtcacgatttgcttccgtcccaaggaacgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttctggatcgtgtcacgatttcccacaatcgtgccac 6136434  T
Q  554 gattttgcaccctgcaatc-tagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttga 652  Q
    ||||||   |||||||| | |||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6136435 gattttcacccctgcaaccctagctcacggcatcc-gaaatcgtgtctcgattccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccaaaccacaaatttga 6136533  T
Q  653 agacaaatctcaacaat 669  Q
    |||| ||||||||||||    
T  6136534 agac-aatctcaacaat 6136549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 475 - 667
Target Start/End: Original strand, 22709452 - 22709645
Alignment:
Q  475 caaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatct 573  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |     
T  22709452 caaggtacgaccagtccttatcatggaaacttaacgagcaagtttgaaaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaacc 22709551  T
Q  574 agctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 667  Q
    |||||| |||| | | ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22709552 agctcatggcatcacaaaatcgtgtcacgttgccaaattcgtgtcatgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaaatctcaaca 22709645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 455 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 34166879 - 34166673
Alignment:
Q  455 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttccc--aaatcgtgtca 552  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  34166879 gtcacgatttgcgtacgtcccaaggaacgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcttgatcgtgtcacgattttcccaaaatcgtgtca 34166780  T
Q  553 cgattttgcaccc-tgcaatc-tagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaattt 650  Q
    |||||| |||||| ||||| | || ||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34166779 cgattt-gcacccctgcaaccctaactcacggcatcc-gaaatcgcgtcacgataccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccaaaccacaaattt 34166682  T
Q  651 gaagacaaa 659  Q
    |||||||||    
T  34166681 gaagacaaa 34166673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 500 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 30125185 - 30125030
Alignment:
Q  500 gatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaaa-tcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgt 598  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  30125185 gatacttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaaaatcgtgccacgatttggcgtcctgcaaactagctcacggcacctcgaaatcgtgt 30125086  T
Q  599 cacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30125085 cacgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaag 30125030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 455 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 13151062 - 13150856
Alignment:
Q  455 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttccc--aaatcgtgtca 552  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  13151062 gtcacgatttgcgtccgtcccaaggaacgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcttgatcgtgtcacgattttcccaaaatcgtgtca 13150963  T
Q  553 cgattttgcaccc-tgcaatc-tagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaattt 650  Q
    |||||| |||||| ||||| | || ||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  13150962 cgattt-gcacccctgcaaccctaactcacggcatcc-gaaatcgcgtcacgataccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccaagccacaaattt 13150865  T
Q  651 gaagacaaa 659  Q
    |||||||||    
T  13150864 gaagacaaa 13150856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 455 - 667
Target Start/End: Original strand, 33342475 - 33342688
Alignment:
Q  455 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttccc--aaatcgtgtca 552  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| ||    
T  33342475 gtcacgatttgcgtccgtcccaaggaacgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcttgatcgtgtcacgatttcccagaaatcgtgcca 33342574  T
Q  553 cgattttgca-ccctgcaa-tctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaattt 650  Q
    ||| |||||| ||||||||  |||||||||||||  ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  33342575 cga-tttgcacccctgcaaccctagctcacggca-tccgaaatcgcgtcgcgatcccaaaatcgtgtcacgatttccatgttcttccaaaccacaaattt 33342672  T
Q  651 gaagacaaatctcaaca 667  Q
    |||||| ||||||||||    
T  33342673 gaagac-aatctcaaca 33342688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 455 - 671
Target Start/End: Complemental strand, 34164657 - 34164440
Alignment:
Q  455 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgattt--cccaaatcgtgtca 552  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  || |||||||| ||    
T  34164657 gtcacgatttgcgtccgtcccaaggaacgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcttgatcgtgtcacgattttcccaaaatcgtgaca 34164558  T
Q  553 cgattttgca-ccctgcaa-tctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaattt 650  Q
    ||| |||||| ||||||||  ||| |||||||||  ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  34164557 cga-tttgcacccctgcaaccctaactcacggca-tccgaaatcgcgtcacgatcccagaatcgtgtcacgatttccctgttcttccaagccacaaattt 34164460  T
Q  651 gaagacaaatctcaacaataa 671  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  34164459 gaagacaaa-ctcaacaataa 34164440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 455 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 6027046 - 6026834
Alignment:
Q  455 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgattt-cccaaatcgtgtcac 553  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  6027046 gtcacgatttgcgtccgtcccaaggaacgaccggtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttctggatcgtgtcacgattttcccaaatcgtgccac 6026947  T
Q  554 gattttgcaccc-tgcaatc-tagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttg 651  Q
    ||||| |||||| ||||| | |||||| || |||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  6026946 gattt-gcacccctgcaaccctagctctcg-cacctcgaaatcgtgtcacaatgccgcaatcgtgtcacgatttccctattcttccaaaccacaaatttg 6026849  T
Q  652 aagacaaatctcaaca 667  Q
    ||||| ||||||||||    
T  6026848 aagac-aatctcaaca 6026834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 472 - 654
Target Start/End: Original strand, 11857373 - 11857555
Alignment:
Q  472 acccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaa 570  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||  |||||||    
T  11857373 acccaaggt-tgacaagtccttatcagtgttacttaacgagcaagtttctaaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaa 11857471  T
Q  571 tctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
     ||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11857472 actagctcacggccacttgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaag 11857555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 455 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 16652909 - 16652759
Alignment:
Q  455 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacga-tttcccaaatcgtgtcac 553  Q
    |||||||| ||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||    
T  16652909 gtcacgatctgcgtaccacccaagaaacgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgattgtgtcacgattttcccaaatcgttccac 16652810  T
Q  554 gattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgat 604  Q
    || |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16652809 gactttgcaccctacaacctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgat 16652759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 541 - 669
Target Start/End: Original strand, 6097860 - 6097988
Alignment:
Q  541 caaatcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccaga 640  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |    
T  6097860 caaatcgtgtcacgatttagcaccctgcaaaccagctcacggcatcacgaaatcgtgtcacgatgccaaattcgtgtcaggatttccctgttcttccaaa 6097959  T
Q  641 ccacaaatttgaagacaaatctcaacaat 669  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6097960 ccacaaatttgaagacaaatctcaacaat 6097988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 472 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 14742120 - 14741938
Alignment:
Q  472 acccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaa 570  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||  |||||||    
T  14742120 acccaaggt-tgacaagtccttatcagtgatacttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgattttccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaa 14742022  T
Q  571 tctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
     |||||||||| |  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14742021 actagctcacgaccacttgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaag 14741938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 472 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 22010383 - 22010201
Alignment:
Q  472 acccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaa 570  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||  |||||||    
T  22010383 acccaaggta-gacaagtccttatcagtgatacttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaa 22010285  T
Q  571 tctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
     ||| || |||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22010284 actaacttacggccacttgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaag 22010201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 427 - 604
Target Start/End: Original strand, 5266432 - 5266610
Alignment:
Q  427 tatactagcctccctctgaagcaatcacgtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatc 526  Q
    |||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||| |    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||    
T  5266432 tatactagtcttcctctgaagcaatcgtgtcacgatttgcgtccgtttcaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaatgagcaagtttctgaatc 5266531  T
Q  527 gtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgat 604  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5266532 gtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaaactagctcacggcacctcgaaatcgtgtcacgat 5266610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 380
Target Start/End: Original strand, 33160254 - 33160636
Alignment:
Q  7 aacaccacctagatctaatctaggaaac-aagtgagaaacacaata-cacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagaga 104  Q
    |||| |||||||||||||||||| || | |||||| || ||||| | ||||| || ||||||||| | ||| |||||   |||||||  ||||||  |||    
T  33160254 aacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaaacaaaagataaaaag-gagagaagagagaaacaaacacaccaa--aga 33160350  T
Q  105 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gt 202  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||    
T  33160351 ttgttcacccagtttggtccaaacttgaaatactctggaggagagattgatctctccaatccaccatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagagt 33160449  T
Q  203 tacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc--cttttcccaatctcacc-------aagacactcaatga-ttttctc 291  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||   ||||||||||||||||       |||||||||||||| ||||| |    
T  33160450 tacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aactctaatttctacctttttttcccaatctcaccaatgaataagacactcaatgatttttcac 33160548  T
Q  292 tctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    ||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| || || ||||||| |||| |  ||||||||| ||||||    
T  33160549 tcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-actctcaaccctaaagttacctcctttgattccccaag 33160636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 106 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 21589098 - 21588931
Alignment:
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 203  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  21589098 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 21589001  T
Q  204 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 272  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21589000 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 21588931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 106 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 21593831 - 21593664
Alignment:
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 203  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  21593831 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 21593734  T
Q  204 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 272  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21593733 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 21593664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 102 - 380
Target Start/End: Original strand, 9183028 - 9183314
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 199  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||      
T  9183028 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacataatctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 9183125  T
Q  200 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 290  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||       ||||||||||||||||||||     
T  9183126 ggttacaagaaattagcttcaacaaattcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 9183224  T
Q  291 ctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |||   |||||||||| | ||||||  ||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  9183225 ctcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaggaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaag 9183314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 99 - 272
Target Start/End: Original strand, 3808701 - 3808877
Alignment:
Q  99 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaa 197  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  3808701 aagagattgttcacctagttcggtccaatcatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaa 3808799  T
Q  198 aa--ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 272  Q
    ||  |||||||||||||||| ||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  3808800 aatgggttacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacctattttcccaatctcaccaa 3808877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 482 - 654
Target Start/End: Original strand, 6438898 - 6439071
Alignment:
Q  482 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctag-ctca 579  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| || |||| || | ||||    
T  6438898 tgaccagtccttatcagtgatacttaactagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattatgcatccagcaaacttggctca 6438997  T
Q  580 cggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
    ||||||| | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  6438998 cggcacctccaa-tcgtgtcacgattccaaaatcgtgtcacgatttctatgttcttccagaccataaatttgaag 6439071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 542 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 26253714 - 26253589
Alignment:
Q  542 aaatcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagac 641  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||| | | | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  26253714 aaatcgtgtcacgatttggcaccctgctaactatctcacggtatcacaaaatcttgtcacgatgccaaattcgtgtcacgatttctctgttctttcagac 26253615  T
Q  642 cacaaatttgaagacaaatctcaaca 667  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  26253614 cacaaatttgaagacaaatctcaaca 26253589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 106 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 17758191 - 17758026
Alignment:
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 203  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  17758191 tgttcacctagttcggtccaaacttgaactactctagaggggagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 17758093  T
Q  204 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 269  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17758092 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcac 17758026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 106 - 272
Target Start/End: Original strand, 2972940 - 2973107
Alignment:
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 203  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  2972940 tgttcacctagttcggtcgaa-cttgacctactcttgaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 2973037  T
Q  204 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 272  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2973038 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 2973107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 102 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 16569193 - 16568928
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 200  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||            |    
T  16569193 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaa------------g 16569107  T
Q  201 gttacaagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctcta--c 296  Q
    |||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||| || ||  |    
T  16569106 gttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaaacctaatttctacccattttctcaatct---caagacactcaatgattttcact-taccc 16569011  T
Q  297 aaggtgtttcccatgttttc-aacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    ||||||||| | |||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| | ||  | ||||||||||||||||    
T  16569010 aaggtgtttacaatgtttccaaacccaagaga-actctaatcaaag-acccttaaccctaaatttaattcctttgatttcccaag 16568928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 448 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 25421110 - 25421000
Alignment:
Q  448 caatcacgtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaaatcg 547  Q
    |||||| |||||||||||||| |  ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||     
T  25421110 caatcatgtcacgatttgcgtccgtcccaaggaacgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgattttcccaatca 25421011  T
Q  548 tgtcacgattt 558  Q
    |||||||||||    
T  25421010 tgtcacgattt 25421000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 201
Target Start/End: Original strand, 5408974 - 5409164
Alignment:
Q  7 aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagat 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| | || || |||||  ||||| || |||||||||||||||  ||||   |||||||  |||||||||  |    
T  5408974 aacaacacctagatctaatctaggaatcaaagagaaaagcacaaaccacaagcaaaagataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaaaga--t 5409069  T
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaagg 201  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||    
T  5409070 tgttcacc-agttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagg 5409164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 106 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 17763158 - 17762990
Alignment:
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 203  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||| | |||    
T  17763158 tgttcacctagttcggtccaaacttgatctactctggaggagagattgatcactccaatccactatcaatgagttcttccaaaa-agatacaaatgagtt 17763060  T
Q  204 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 272  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  17763059 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 17762990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 106 - 360
Target Start/End: Original strand, 28137409 - 28137671
Alignment:
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 203  Q
    ||||||| || |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||  ||||    
T  28137409 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagaaatacaaatgggtt 28137506  T
Q  204 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctc- 293  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||       |||||||||||||||||||| |||     
T  28137507 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccattctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 28137605  T
Q  294 tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt 360  Q
      |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  28137606 cccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagtt 28137671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 106 - 270
Target Start/End: Original strand, 26830124 - 26830289
Alignment:
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaagg-tt 203  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| || ||    
T  26830124 tgttcacccagttcagtc-aaacttgacctactttggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatggatt 26830221  T
Q  204 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcacc 270  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  26830222 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aactctaatttctacccatttttccaatctcacc 26830289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 102 - 380
Target Start/End: Original strand, 26954283 - 26954568
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 200  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| | |    
T  26954283 agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctactttgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacagatg 26954380  T
Q  201 -gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctc 291  Q
     ||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |    
T  26954381 agttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttataccaatttcccaatctcacatatgaacaagacactcaatgattttcac 26954479  T
Q  292 tctac-aaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    ||  | ||||||||| | ||||||  ||||| |||| | ||||||||||||| || || ||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  26954480 tccccaaaggtgtttacaatgtttcccaacctaagata-actctaatcaaag-actctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaag 26954568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 106 - 272
Target Start/End: Original strand, 22424826 - 22424995
Alignment:
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa---gg 201  Q
    |||||||||||| ||||||||   |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||   ||    
T  22424826 tgttcacccagtacggtccaacaatgacctactctgaaggagagattgatctctccaatccactat-aatgagttcttac-aaagagatacaaaaatggg 22424923  T
Q  202 ttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 272  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  22424924 ttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 22424995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 503 - 667
Target Start/End: Original strand, 23896792 - 23896957
Alignment:
Q  503 acttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaaa-tcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcac 601  Q
    ||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||  |||||||||| | | ||||||  |   | ||||||||||||    
T  23896792 acttaaccagcaagtttaaaaatcgtgtcacgatttcacaaaatcgtaccacgatttgacaccctgcaaaccaactcacgatattacaaaatcgtgtcac 23896891  T
Q  602 gatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 667  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  23896892 gatgccaaaatcgtgtcacgatttttctgttctttcaaaccacaaatttgaaggcaaatttcaaca 23896957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 106 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 5043795 - 5043630
Alignment:
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 203  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||| || |||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||| | |||    
T  5043795 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactatggaggagagattgatctctccaatctactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagtt 5043697  T
Q  204 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcac 269  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  5043696 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctactcattttctcaatctcac 5043630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 473 - 667
Target Start/End: Original strand, 16839137 - 16839331
Alignment:
Q  473 cccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaat 571  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  || ||||     
T  16839137 cccaaggt-tgaccagtccttatcagagatacttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaa 16839235  T
Q  572 c-tagctcacggca-ccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 667  Q
    | | |||||||||| | |||  |||||||||||||  | |||||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  16839236 cttggctcacggcatctccg--atcgtgtcacgattgccaaatcgcgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaatttgaagccaattttcaaca 16839331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 482 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 28155256 - 28155167
Alignment:
Q  482 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaa 570  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  28155256 tgaccagtccttatcagagatacttaaccagcaagtttctggatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcaccctgcaa 28155167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 482 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 33330118 - 33329932
Alignment:
Q  482 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatc-tagctca 579  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  || |||| | | |||||    
T  33330118 tgaccagtccttatcagagatacttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctca 33330019  T
Q  580 cggca-ccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 667  Q
    ||||| | |||  |||||||||||||  | |||||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  33330018 cggcatctccg--atcgtgtcacgattgccaaatcgcgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaatttgaagccaattttcaaca 33329932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 587 - 671
Target Start/End: Complemental strand, 34151907 - 34151824
Alignment:
Q  587 ccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaacaataa 671  Q
    ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34151907 ccgaaatcgcgtcacgatcccagaatcgtgtcacgatttccctgttcttccaagccacaaatttgaagacaaa-ctcaacaataa 34151824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 99 - 238
Target Start/End: Original strand, 603082 - 603222
Alignment:
Q  99 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaa 197  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  603082 aagagattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatcttggggagagattgatttctccaatccactatcaacgagttcttac-aaagagatacaa 603179  T
Q  198 a-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaa 238  Q
    |  |||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||    
T  603180 atgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaa 603222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 102 - 272
Target Start/End: Original strand, 33211182 - 33211353
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 200  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||| ||| || |||||||||| |||| |||||||| |    
T  33211182 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccattataaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 33211279  T
Q  201 -gttacaagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 272  Q
     | |||||||||||| ||| | |||| |||||| |||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  33211280 agctacaagaaattaacttcatcaagctcacaaagaac-aaccataatttctaccaattttcccaatctcaccaa 33211353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 472 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 14737260 - 14737128
Alignment:
Q  472 acccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaa 570  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||  |||||||    
T  14737260 acccaaggt-tgacaagtccttatcagtgatacttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgattttccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaa 14737162  T
Q  571 tctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgat 604  Q
     ||||||||||||  |  ||||||||||||||||    
T  14737161 actagctcacggccacttgaaatcgtgtcacgat 14737128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 482 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 33335615 - 33335429
Alignment:
Q  482 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatc-tagctca 579  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  || |||| | | |||||    
T  33335615 tgaccagtccttatcagagatacttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctca 33335516  T
Q  580 cggca-ccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 667  Q
    ||||| | |||  |||||||||||||  | |||||| |  |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  33335515 cggcatctccg--atcgtgtcacgattgccaaatcgcgaaacgattcctctgttcttccaaaccacaaatttgaagccaattttcaaca 33335429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 155 - 272
Target Start/End: Original strand, 3038953 - 3039071
Alignment:
Q  155 ctctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac 252  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  3038953 ctctccaatccactattaaagagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaaaaagctcacaatgaac-aaccctaatttctac 3039050  T
Q  253 c-cttttcccaatctcaccaa 272  Q
    |  ||||||||||||||||||    
T  3039051 caattttcccaatctcaccaa 3039071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 482 - 668
Target Start/End: Original strand, 6005821 - 6006008
Alignment:
Q  482 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatc-tagctca 579  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  || |||| | | |||||    
T  6005821 tgaccagtccttatcagagatacttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctca 6005920  T
Q  580 cggca-ccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaacaa 668  Q
     |||| | |||  |||||||||||||  | |||||| | ||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||    
T  6005921 tggcatctccg--atcgtgtcacgattgccaaatcgcgacacgattcctctgtttttccaaaccacaaatttgaagccaattttcaacaa 6006008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 482 - 561
Target Start/End: Original strand, 5343879 - 5343959
Alignment:
Q  482 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgc 561  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5343879 tgaccagtccttatcagagatacttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgtcacgattttgc 5343959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 155 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 4045542 - 4045423
Alignment:
Q  155 ctctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctac 252  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||   |||| |||| |||| | ||||||||||||||||| | |||| ||| || ||||||||||||||||||||    
T  4045542 ctctccaatccactatcaatgagttatttacaaagagatataaaatgattacaagaaattagcttcaacaagctcataaagaacaaaccctaatttctac 4045443  T
Q  253 ccttttcccaatctcaccaa 272  Q
    | ||||||||||||| ||||    
T  4045442 cattttcccaatctctccaa 4045423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 609 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 16652773 - 16652716
Alignment:
Q  609 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 667  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16652773 aaatcgtgtcacgatttccctgttctttcagaccacaaatttgaagac-aatctcaaca 16652716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 205 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 16567265 - 16567091
Alignment:
Q  205 caagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctc-tacaaggt 301  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||||  |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||   ||||||    
T  16567265 caagaaattagcttaaacaagctcacaaaaaacaaaacctaatttctaaccattttcccaatctca---agacactcaatgattttcactcacccaaggt 16567169  T
Q  302 gtttcccatgttttc-aacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |||| | |||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||    ||||||||||||||||    
T  16567168 gtttacaatgtttccaaacccaagaga-actctaatcaaag-acccttaaccctaaagttaactcctttgatttcccaag 16567091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 26800755 - 26800642
Alignment:
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa--ggt 202  Q
    |||||| ||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||   ||    
T  26800755 tgttcatccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat-aatgagttcttac-aaagagatacaaaattagt 26800658  T
Q  203 tacaagaaattagctt 218  Q
    ||||||||||||||||    
T  26800657 tacaagaaattagctt 26800642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 503 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 5757116 - 5756950
Alignment:
Q  503 acttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaaa-tcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcac 601  Q
    ||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||  |||||||||| | | |||||| ||   | |||| |||||||    
T  5757116 acttaaccagcaagtttgaaaatcgtgtcacgatttcacaaaatcgtaccacgatttgacaccctgcaaaccaactcacgacattacaaaattgtgtcac 5757017  T
Q  602 gatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaacaa 668  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || |||||  | |||| |||||| ||| ||||| |||||||    
T  5757016 gatgccacaatcgtgtcacaatttctctattcttttaaaccataaatttaaagccaaatttcaacaa 5756950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 609 - 654
Target Start/End: Original strand, 5266596 - 5266641
Alignment:
Q  609 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5266596 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaag 5266641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 609 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 14737142 - 14737097
Alignment:
Q  609 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14737142 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaag 14737097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 592 - 654
Target Start/End: Original strand, 5343990 - 5344052
Alignment:
Q  592 atcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
    |||||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  5343990 atcgtgtcacgatgaccaaatcgtgacacgatttctctgttctcccaaaccacaaatttgaag 5344052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 405 - 519
Target Start/End: Original strand, 6097741 - 6097858
Alignment:
Q  405 tcaaatctgcacaagaacacttta-tactagcctccctctgaagcaatcacgtcacgatt--tgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaagga 501  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| || || ||||   ||||  |||||||||  |||||||  ||| ||||| ||||||||||||||| |||    
T  6097741 tcaaatctgcacaagaacacttaaatactagtcttcccctgataaaatcgtgtcacgattggtgcgtacgtccccaggtacgaccagtccttatcatgga 6097840  T
Q  502 tacttaacgagcaagttt 519  Q
     |||||||||||||||||    
T  6097841 aacttaacgagcaagttt 6097858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 611 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 28155145 - 28155102
Alignment:
Q  611 atcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  28155145 atcgtgtcacgattgctctgttcttccagaccacaaatttgaag 28155102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 609 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 5017026 - 5016981
Alignment:
Q  609 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  5017026 aaatcgtgtcacgatttttctgttcttccaaaccacaaatttgaag 5016981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 609 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 31086003 - 31085958
Alignment:
Q  609 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||    
T  31086003 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttctaaaccacaaatttgaag 31085958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 524 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 16554691 - 16554659
Alignment:
Q  524 atcgtgtcacgatttcccaaatcgtgtcacgat 556  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16554691 atcgtgtcacgatttcccaaatcgtgtcacgat 16554659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 524 - 556
Target Start/End: Original strand, 16578864 - 16578896
Alignment:
Q  524 atcgtgtcacgatttcccaaatcgtgtcacgat 556  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16578864 atcgtgtcacgatttcccaaatcgtgtcacgat 16578896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 524 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 16616516 - 16616484
Alignment:
Q  524 atcgtgtcacgatttcccaaatcgtgtcacgat 556  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16616516 atcgtgtcacgatttcccaaatcgtgtcacgat 16616484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 524 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 16631247 - 16631215
Alignment:
Q  524 atcgtgtcacgatttcccaaatcgtgtcacgat 556  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16631247 atcgtgtcacgatttcccaaatcgtgtcacgat 16631215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 524 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 16652934 - 16652902
Alignment:
Q  524 atcgtgtcacgatttcccaaatcgtgtcacgat 556  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16652934 atcgtgtcacgatttcccaaatcgtgtcacgat 16652902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 609 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 5571806 - 5571755
Alignment:
Q  609 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaat 660  Q
    |||||||||||||||||| || |||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  5571806 aaatcgtgtcacgatttctctattctcccaaaacacaaatttgaagacaaat 5571755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 405 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 16554736 - 16554697
Alignment:
Q  405 tcaaatctgcacaagaacactttatactagcctccctctg 444  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  16554736 tcaaatctgcacaagaacaatttatactagccttcctctg 16554697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 405 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 16631292 - 16631253
Alignment:
Q  405 tcaaatctgcacaagaacactttatactagcctccctctg 444  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  16631292 tcaaatctgcacaagaacaatttatactagccttcctctg 16631253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 405 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 16652979 - 16652940
Alignment:
Q  405 tcaaatctgcacaagaacactttatactagcctccctctg 444  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  16652979 tcaaatctgcacaagaacaatttatactagccttcctctg 16652940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 524 - 558
Target Start/End: Original strand, 11857331 - 11857365
Alignment:
Q  524 atcgtgtcacgatttcccaaatcgtgtcacgattt 558  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11857331 atcgtgccacgatttcccaaatcgtgtcacgattt 11857365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 391; Significance: 0; HSPs: 100)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 391; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 9036690 - 9036003
Alignment:
Q  1 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaaaagcacca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||    
T  9036690 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacacca 9036591  T
Q  99 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaa 197  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9036590 a-gagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctcgaggagagattgtactcttcaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaa 9036492  T
Q  198 aaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctaca 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  9036491 aaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttaca 9036392  T
Q  298 aggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaagnnnnnnnnnnnnnnnnn 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||                     
T  9036391 aggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgc-ccctttgatttcccaagtctctctctctttcaaa 9036293  T
Q  398 nnnnnnntcaaatctgcacaagaacactttatactagcctccctctgaagcaatcacgtcacgatt--------------------tgcgtacaacccaa 477  Q
           |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  | ||||  |||||||||                    ||||||  ||||||    
T  9036292 ctcctcttcaaatctgcacaagaacactttatactagtcttcctctgttgaaatcgtgtcacgattttcccaatcgtgtcacgatctgcgtaacacccaa 9036193  T
Q  478 ggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgattt-cccaaatcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagc 576  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  9036192 gaaacgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttaacaaaatagtgacacgaatttgcaccctgcaacctagc 9036093  T
Q  577 tcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 667  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9036092 tcacggcaccccgaaatcgtgtcacgataccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagac-aatctcaaca 9036003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 40282649 - 40282269
Alignment:
Q  1 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||     
T  40282649 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaa- 40282551  T
Q  101 gagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40282550 gagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa 40282451  T
Q  200 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaa 298  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40282450 ggttacaagaaattagattagacaagttcacaatgaactaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaa 40282351  T
Q  299 ggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40282350 ggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgctccctttgatttcccaag 40282269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 21054230 - 21053850
Alignment:
Q  1 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||     
T  21054230 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaa- 21054132  T
Q  101 gagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa 199  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21054131 gagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa 21054032  T
Q  200 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaa 298  Q
    |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21054031 ggttgcaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacacttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttttctctacaa 21053932  T
Q  299 ggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21053931 ggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgctccctttgatttcccaag 21053850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 9987474 - 9987094
Alignment:
Q  1 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaag-caccaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9987474 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacactatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagacaccaa 9987375  T
Q  100 agagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa 198  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  9987374 -gagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaatgagttcttgcaaaagggatacaaa 9987276  T
Q  199 aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctaca 297  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9987275 aggttgcaagaaattagattagacaagttcacaatgaacaa-ccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctaca 9987177  T
Q  298 aggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9987176 aggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgctccctttgatttcccaag 9987094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 1 - 380
Target Start/End: Original strand, 20622133 - 20622514
Alignment:
Q  1 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||     
T  20622133 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaa- 20622231  T
Q  101 gagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaa--gggatacaa 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  20622232 gagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaaaagggatacaa 20622331  T
Q  198 aaggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctac 296  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  20622332 aaggttacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaa-ccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacagtcaatgattttccctctac 20622430  T
Q  297 aaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  20622431 aaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgctccatttgatttcccaag 20622514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 44203906 - 44203526
Alignment:
Q  1 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaataca-caatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa-aagcacca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |    
T  44203906 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaacac-a 44203808  T
Q  99 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatac 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  44203807 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac 44203708  T
Q  196 aaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctcta 295  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  44203707 aagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctctcta 44203610  T
Q  296 caaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  44203609 caaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc-ccctttgatttcccaag 44203526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 7 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 51765663 - 51765280
Alignment:
Q  7 aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagat 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||  |    
T  51765663 aacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaaccacaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaaga--t 51765566  T
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa--ggt 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||    
T  51765565 tgttcacccagttcggtccaaacttgtcctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaggggt 51765466  T
Q  203 tacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttt--tcccaatctcac------caagacactcaatgattttctctc 293  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |    ||||||||||||||||||||  ||||||||  ||      |||||||||||||||||| | |||    
T  51765465 tacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacccttttctcccaatcaaaccaagaacaagacactcaatgatttacactc 51765366  T
Q  294 tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
      |||||||||| | |||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  51765365 accaaggtgtttacaatgtttccaacccaagagaagctctaatcaaag-accctaaaccctagagttactccctttgatttcccaag 51765280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 457 - 667
Target Start/End: Original strand, 20622610 - 20622821
Alignment:
Q  457 cacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttccca-aatcgtgtcacga 555  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20622610 cacgatttgcgtaccacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacaatcgtgtcacgatttcccacaatcgtgtcacga 20622709  T
Q  556 ttttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaaga 655  Q
    ||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20622710 tttggcaccctgcagactagctcacggcaccacgaaatcgtgtcacgatgccaaattcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaaga 20622809  T
Q  656 caaatctcaaca 667  Q
    ||||||||||||    
T  20622810 caaatctcaaca 20622821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 473 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 40282154 - 40281958
Alignment:
Q  473 cccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagttt-cacgatcgtgtcacgatttccca-aatcgtgtcacgattttgcaccctgcaa 570  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  40282154 cccaaggtatgaccagtccttatcatggaaacttaacgagcaagtttgcacaatcgtgtcacgatttaccacaatcgtgtcacgatttggcaccctgcaa 40282055  T
Q  571 tctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 667  Q
     ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40282054 cctagctcacggcaccactaaatcgtgtcacgatgccaaattcgtgtcacgatttccctattcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 40281958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 475 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 21053733 - 21053540
Alignment:
Q  475 caaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagttt-cacgatcgtgtcacgatttccca-aatcgtgtcacgattttgcaccctgcaatc 572  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||    
T  21053733 caaggtatgaccagtccttatcatggaaacttaacgagcaagtttgcacaatcgtgtcacgatttcccacaatcgtgtcacgatttggcaccttgcattc 21053634  T
Q  573 tagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 667  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21053633 tagctcactgcaccacgaaatcgtgtcacgatgccaaattcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagac-aatctcaaca 21053540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 473 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 9986980 - 9986785
Alignment:
Q  473 cccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaaa-tcgtgtcacgattttgcaccctgcaat 571  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||      
T  9986980 cccaaggtatgaccagtccttattatggaaacttaacgagcaagtttgcaaatcgtgtcacgatttcccaaaatcgtgtcacgatttggcacactgcaga 9986881  T
Q  572 ctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 667  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9986880 ccagctcacggcaccacgaaatcgtgttacgatgtcaaattcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 9986785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 7 - 380
Target Start/End: Original strand, 8550688 - 8551070
Alignment:
Q  7 aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaata-cacaatcacaagataaaaggagagggaaga-agaaaacaaaagcaccaaagag 103  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| | ||||| |||||||||||  |||| | |||| ||||||||||  |||||||||     
T  8550688 aacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaacacaaaatcacaagcacaagataaagagagaag-aagagagaaaacaaacacaccaaaga- 8550785  T
Q  104 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-g 201  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | |    
T  8550786 -ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagggatacaaatgag 8550883  T
Q  202 ttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctct 292  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||||| ||    
T  8550884 ttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcact 8550982  T
Q  293 c-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |   ||| |||||| | |||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||    ||||||||||||||||    
T  8550983 cacccaatgtgtttacaatgtttcttaacccaagaga-actctaatcaaag-acccttaaccctaaagttaactcctttgatttcccaag 8551070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 455 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 44203430 - 44203217
Alignment:
Q  455 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgattt-cccaaatcgtgtcac 553  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  44203430 gtcacgatttgcgtccgtcccaaggaacgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttctggatcgtgtcacgattttcccaaatcgtgccac 44203331  T
Q  554 gattttgcaccc-tgcaatc-tagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttg 651  Q
    ||||| |||||| ||||| | |||||||||||||| | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44203330 gattt-gcacccctgcaaccctagctcacggcacctccaa-tcgtgtcacgattccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttg 44203233  T
Q  652 aagacaaatctcaacaa 668  Q
    ||||| |||||||||||    
T  44203232 aagac-aatctcaacaa 44203217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 7 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 20762932 - 20762557
Alignment:
Q  7 aacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagat 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    |||| || ||||| || |||| || |||||||||||||||  ||||   |||||||  |||||||||  |    
T  20762932 aacagcacctagatctaatctaggaa----gtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaaaga--t 20762841  T
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggtt 203  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||| ||||    
T  20762840 tggtcacctagttcggtccaaacttgacctactctgtaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-gaagagatacaaaagggtt 20762742  T
Q  204 acaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctc 293  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||       ||||| |||||||||||||| |||    
T  20762741 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttctcaatctcaccaatgaacaagatactcaatgattttcactc 20762643  T
Q  294 tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
      |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  20762642 accaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagttgcttcctttgatttcccaag 20762557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 407 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 51765254 - 51764988
Alignment:
Q  407 aaatctgcacaagaacacttta-tactagcctccctctgaagcaatcacgtcacgatttg--cgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggata 503  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||   ||||  ||||||||| |  |||||  | ||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  51765254 aaatctgcacaagaacacttaaatactagccttccactgataaaatcgtgtcacgattggtacgtacgtcacaaggtatgaccagtccttatcatggaaa 51765155  T
Q  504 cttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacg 602  Q
    ||||||||||||||||    |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  51765154 cttaacgagcaagtttgcaaatcgtgtcacgattcctcaagatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaaccagctcacggcatcacgaaatcgtgtcacg 51765055  T
Q  603 atgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaacaat 669  Q
    ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  51765054 atgtcaaattcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttaaagccaaatctcaacaat 51764988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 7 - 273
Target Start/End: Original strand, 13316256 - 13316521
Alignment:
Q  7 aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagat 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||  ||||| || || ||||||||||||  ||||   |||||||  ||| |||||  |    
T  13316256 aacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaacacaaaccacaagcaaaatataaaaggagag--aagagagaaacaaactcactaaaga--t 13316351  T
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggtt 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||| ||||    
T  13316352 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt-ccaaagagatacaaaagggtt 13316450  T
Q  204 acaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaag 273  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13316451 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaag 13316521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 475 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 19361105 - 19360912
Alignment:
Q  475 caaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatct 573  Q
    ||||||| |||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |     
T  19361105 caaggtacgacctgtccttatcctggaaacttaacgagcaagtttgaaaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaacc 19361006  T
Q  574 agctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 667  Q
    ||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19361005 agctcacggcatcacaaaatcgtgtcacgataccaaattcgtgtcacgatttctctgttctttcagaccacaaatttgaagccaaatctcaaca 19360912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 3189590 - 3189216
Alignment:
Q  12 cacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgtt 109  Q
    |||||||||||||||||| || ||| |||| || ||||| || |||| || |||||||||||||||  ||||   |||||||  |||||||||  |||||    
T  3189590 cacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaaaga--ttgtt 3189495  T
Q  110 cacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaa 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||     
T  3189494 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaa-agatacaaaagagttacag 3189396  T
Q  208 gaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctctacaa 298  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||       ||||||||||| |||||||| |||  |||    
T  3189395 gaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttataccctttttccaaatctcaccaatgaacaagacactcagtgattttcactcaccaa 3189297  T
Q  299 ggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    ||||||| | ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  3189296 ggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actttaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaag 3189216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 3198407 - 3198033
Alignment:
Q  12 cacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgtt 109  Q
    |||||||||||||||||| || ||| |||| || ||||| || |||| || |||||||||||||||  ||||   |||||||  |||||||||  |||||    
T  3198407 cacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaaaga--ttgtt 3198312  T
Q  110 cacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaa 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||     
T  3198311 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaa-agatacaaaagagttacag 3198213  T
Q  208 gaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctctacaa 298  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||       ||||||||||| |||||||| |||  |||    
T  3198212 gaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttataccctttttccaaatctcaccaatgaacaagacactcagtgattttcactcaccaa 3198114  T
Q  299 ggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    ||||||| | ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  3198113 ggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actttaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaag 3198033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 3207246 - 3206872
Alignment:
Q  12 cacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgtt 109  Q
    |||||||||||||||||| || ||| |||| || ||||| || |||| || |||||||||||||||  ||||   |||||||  |||||||||  |||||    
T  3207246 cacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaaaga--ttgtt 3207151  T
Q  110 cacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaa 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||     
T  3207150 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaa-agatacaaaagagttacag 3207052  T
Q  208 gaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctctacaa 298  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||       ||||||||||| |||||||| |||  |||    
T  3207051 gaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttataccctttttccaaatctcaccaatgaacaagacactcagtgattttcactcaccaa 3206953  T
Q  299 ggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    ||||||| | ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  3206952 ggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actttaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaag 3206872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 483 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 19365953 - 19365768
Alignment:
Q  483 gaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacg 581  Q
    |||| |||||||||  ||| | ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  19365953 gacctgtccttatcctggaaaattaacgagcaagtttgaaaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaaccagctcacg 19365854  T
Q  582 gcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 667  Q
    ||| | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19365853 gcatcacaaaatcgtgtcacgatgccaaattcgtgtcacgatttctctgttctttcagaccacaaatttgaagtcaaatctcaaca 19365768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 542 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 24202376 - 24202251
Alignment:
Q  542 aaatcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagac 641  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24202376 aaatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaaccagctcacggcatcacgaaatcgtgtcacgatgccaaattcgtgtcacgatttctctgttcttccagac 24202277  T
Q  642 cacaaatttgaagacaaatctcaaca 667  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||    
T  24202276 cacaaatttgaagccaaatctcaaca 24202251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 7 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 3157129 - 3156751
Alignment:
Q  7 aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagaga 104  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||| || |||| || |||||||| ||||||   ||| |||  ||||  |||||||||      
T  3157129 aacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaa--caaacacaccaaaga-- 3157034  T
Q  105 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggt 202  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | || || ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  |||    
T  3157033 ttgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggt 3156936  T
Q  203 tacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctc 293  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||       |||||||||||||||||||| |||    
T  3156935 tacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc 3156837  T
Q  294 tacaaggtgtttcccatgttttc-aacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
      || ||||||| | |||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  3156836 accagggtgtttacaatgtttccaaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaag 3156751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 455 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 24793859 - 24793709
Alignment:
Q  455 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcac 553  Q
    ||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  24793859 gtcacgatttgcgtctgacccaaggtttgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccac 24793760  T
Q  554 gattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgat 604  Q
    ||||| ||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24793759 gatttggcgtcctgcaaactagctcacggcacctcgaaatcgtgtcacgat 24793709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 482 - 654
Target Start/End: Original strand, 39445897 - 39446070
Alignment:
Q  482 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctag-ctca 579  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||  ||||||| || | ||||    
T  39445897 tgaccagtccttatcagtgatacttaacgagcaagtttctggatcgtgtcatgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaaacttggctca 39445996  T
Q  580 cggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
    ||||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39445997 cggcatctc-aaatcgtgtcacgattccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaag 39446070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 482 - 659
Target Start/End: Original strand, 41391001 - 41391178
Alignment:
Q  482 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcac 580  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||  ||||||| || ||||||    
T  41391001 tgaccagtccttatcagtgatacttaatgagcaagtttctgaatcatgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaaactggctcac 41391100  T
Q  581 ggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaa 659  Q
    |||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41391101 ggcatctc-aaatcgtgtcacgattccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaaa 41391178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 482 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 44023562 - 44023389
Alignment:
Q  482 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctag-ctca 579  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||| || | ||||    
T  44023562 tgaccagtccttatcagtgatacttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcatccagcaaacttggctca 44023463  T
Q  580 cggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
    ||||||| | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44023462 cggcacctccaa-tcgtgtcacgattccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaag 44023389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 482 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 25439584 - 25439411
Alignment:
Q  482 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctag-ctca 579  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| || | ||||    
T  25439584 tgaccagtccttatcagagatacttaaccagcaagtttctggatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcatcctgcaaacttggctca 25439485  T
Q  580 cggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
    ||||| | | |||||||||||||||  | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  25439484 cggcatctc-aaatcgtgtcacgattaccaaatcgtgtcacgattgctctgttcttccagaccacaaatttgaag 25439411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 102 - 380
Target Start/End: Original strand, 28220223 - 28220509
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 199  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||      
T  28220223 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 28220320  T
Q  200 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcacc-------aagacactcaatgattttct 290  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||       |||||||||||||||||||     
T  28220321 ggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttccgaatctcaccaatgaataagacactcaatgattttca 28220419  T
Q  291 ctc-tacaaggtgtttcccatg-ttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |||   |||||||||| | ||| ||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  28220420 ctcacccaaggtgttttcaatgcttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaag 28220509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 106 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 37168465 - 37168297
Alignment:
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa--ggt 202  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||  |||    
T  37168465 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaatgggt 37168368  T
Q  203 tacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 272  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37168367 tacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 37168297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 102 - 380
Target Start/End: Original strand, 834164 - 834450
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 199  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||      
T  834164 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctactctgggggagagatagatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagggatacaaatg 834261  T
Q  200 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttcta-cccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 290  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||     
T  834262 ggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctatccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttca 834360  T
Q  291 ctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    | |   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  834361 cgcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actttaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaag 834450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 102 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 31659409 - 31659123
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 199  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||      
T  31659409 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgagggagagattgatctctccaatccactatcaataagttcttac-aaagagatacaaatg 31659312  T
Q  200 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 290  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||       ||||||||||||||||||||     
T  31659311 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-agccctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 31659213  T
Q  291 ctc-tacaaggtgtttcccatgttttc-aacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |||   |||||||||| | |||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  31659212 ctcacccaaggtgtttacaatgtttccgaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaag 31659123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 482 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 1054699 - 1054526
Alignment:
Q  482 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctag-ctca 579  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||  ||||||| || | ||||    
T  1054699 tgaccagtccttatcagtgatacttaactagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaaacttggctca 1054600  T
Q  580 cggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
    ||||||| | || |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1054599 cggcacctccaa-tcgtatcacgattccaaaatcgtgacacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaag 1054526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 106 - 272
Target Start/End: Original strand, 13547090 - 13547257
Alignment:
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 203  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  13547090 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 13547187  T
Q  204 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 272  Q
    |||||||| ||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13547188 acaagaaaatagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 13547257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 482 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 25444777 - 25444604
Alignment:
Q  482 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctag-ctca 579  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||| || | ||||    
T  25444777 tgaccagtccttatcagagatacttaaccaacaagtttctggatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcatcctacaaacttggctca 25444678  T
Q  580 cggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
    ||||| | | |||||||||||||||  | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  25444677 cggcatctc-aaatcgtgtcacgattaccaaatcgtgtcacgattgctctgttcttccagaccacaaatttgaag 25444604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 102 - 380
Target Start/End: Original strand, 4552634 - 4552920
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 199  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||      
T  4552634 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctactctgagggagagattgatctctccaatccattatcaatgagttcttac-aaagggatacaaagg 4552731  T
Q  200 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 290  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||| | ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||       ||||||||||||||||||||     
T  4552732 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaaggacaaa-cctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcc 4552830  T
Q  291 ctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |||   |||||||||| | |||||| |||||||||||||  ||| ||| |||| ||||| ||||||| |||| |  ||||| ||||||||||    
T  4552831 ctcacccaaggtgtttacaatgtttctcaacccaagagaacctc-aattaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttaatttcccaag 4552920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 99 - 272
Target Start/End: Original strand, 42297968 - 42298143
Alignment:
Q  99 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaa 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  42297968 aagagattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaa 42298066  T
Q  198 aag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 272  Q
    | | ||||||||||||||||||  ||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  42298067 atgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaaaaac-aaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaa 42298143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 455 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 24787037 - 24786905
Alignment:
Q  455 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcac 553  Q
    ||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  24787037 gtcacgatttgcgtctgacccaaggtttgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccac 24786938  T
Q  554 gattttgcaccctgcaatctagctcacggcacc 586  Q
    ||||| ||  ||||||| |||||||||||||||    
T  24786937 gatttggcgtcctgcaaactagctcacggcacc 24786905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 106 - 272
Target Start/End: Original strand, 13549001 - 13549168
Alignment:
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 203  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  13549001 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 13549098  T
Q  204 acaagaaatta-gcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 272  Q
    ||| ||||||| | || ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13549099 acatgaaattaggtttaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 13549168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 466 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 13604296 - 13604095
Alignment:
Q  466 cgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaaa-tcgtgtcacgattttgcacc 564  Q
    ||||| |||||||||| |||||  |||||||  | | ||||||| ||||||||| |  ||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||  |||     
T  13604296 cgtacgacccaaggtacgaccaa-ccttatcctgaaaacttaaccagcaagtttgaaaatcatgtcacgattccacaaaatcgtgtcacgatttgacaca 13604198  T
Q  565 ctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctca 664  Q
    |||||| | |||||||| || | | |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13604197 ctgcaaaccagctcacgacatcacaaaatcgtgccacgataccacaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaagacaaatctca 13604098  T
Q  665 aca 667  Q
    |||    
T  13604097 aca 13604095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 102 - 272
Target Start/End: Original strand, 28265551 - 28265722
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 199  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||      
T  28265551 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttac-aaagagatacaaatg 28265648  T
Q  200 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 272  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  28265649 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaac-aaccctaatttctacctattttcccaatctcgccaa 28265722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 106 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 29136415 - 29136247
Alignment:
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 203  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||  |||||||  ||||    
T  29136415 tgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccacgatcaatgagttcttac-aaagaaatacaaatgggtt 29136317  T
Q  204 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 272  Q
     ||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29136316 ccaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 29136247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 106 - 272
Target Start/End: Original strand, 47255340 - 47255508
Alignment:
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 203  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  47255340 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 47255438  T
Q  204 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 272  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  47255439 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 47255508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 102 - 380
Target Start/End: Original strand, 28223418 - 28223704
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 199  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | || || ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||      
T  28223418 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 28223515  T
Q  200 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 290  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| || || | |||| |||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||     
T  28223516 ggttacaagaaattagcttcaacaagttcagaaagatc-aaccataatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 28223614  T
Q  291 ctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |||   |||||||| | | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  28223615 ctcacccaaggtgtcttcaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaag 28223704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 102 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 44455331 - 44455045
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 200  Q
    |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |    
T  44455331 agatcgttgacccagttcggtc-aaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaa-agatacaaatg 44455234  T
Q  201 -gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 290  Q
     ||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||| |||||     
T  44455233 agttacaagaaattagtttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatggttttca 44455135  T
Q  291 ctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |||   |||||||||| | ||||||  |||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |  |||||||||| |||||    
T  44455134 ctcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaaga-aaactctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttaccaag 44455045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 106 - 272
Target Start/End: Original strand, 7482231 - 7482399
Alignment:
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctga-ggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa--ggt 202  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||  |||    
T  7482231 tgttcacctagttcggtccaa-cttgacctactctgaaggagagattgatctctccaattcactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaatgggt 7482328  T
Q  203 tacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 272  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  7482329 tacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttacccaatctcaccaa 7482399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 106 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 11348865 - 11348698
Alignment:
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 203  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||  ||||    
T  11348865 tgttcactcagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctta-gaaagagatacaaatgggtt 11348768  T
Q  204 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 272  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  11348767 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaa 11348698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 106 - 272
Target Start/End: Original strand, 31925708 - 31925875
Alignment:
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 203  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  31925708 tgttcacctagttcggtccaa-cttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 31925805  T
Q  204 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 272  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||    
T  31925806 acaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaac-atccctaatttctacccatttttccactctcaccaa 31925875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 102 - 380
Target Start/End: Original strand, 3847118 - 3847404
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagga-gagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 199  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||      
T  3847118 agattgttgaccaagttcggtccaa-cttgacctaatctggggaagagatggatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagggatacaaatg 3847215  T
Q  200 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 290  Q
    |||||||| || |||||||  ||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||     
T  3847216 ggttacaaaaatttagcttaaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttca 3847314  T
Q  291 ctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  3847315 ctcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcgaccctaaagttacctcctttgatttcccaag 3847404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 102 - 380
Target Start/End: Original strand, 37503554 - 37503837
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 200  Q
    |||||||| ||| |||||| ||||| |||||| || |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||  |||    
T  37503554 agattgttgacctagttcgatccaa-cttgacataatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatac--aag 37503649  T
Q  201 gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctc 291  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |    
T  37503650 gttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttttacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcac 37503748  T
Q  292 tc-tacaaggtgtttcccatgtttt-caacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    ||   |||||||||| | || |||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||  |  ||||||||||||||||    
T  37503749 tcacccaaggtgtttacaatattttccaacccaataga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagtcacctcctttgatttcccaag 37503837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 102 - 272
Target Start/End: Original strand, 37033068 - 37033241
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa- 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||| |||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||     
T  37033068 agattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactatggagaagagattaatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatgcaaaat 37033166  T
Q  200 -ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 272  Q
     | |||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37033167 ggattacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 37033241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 104 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 19754664 - 19754494
Alignment:
Q  104 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-agg 201  Q
    |||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||    
T  19754664 attgttgacccacttcggtccaa-cttgacctaatctgagggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatcgg 19754567  T
Q  202 ttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcaccaa 272  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  19754566 ttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttttctcaatctcaccaa 19754494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 102 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 49918521 - 49918350
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 199  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| | || || ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||      
T  49918521 agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 49918424  T
Q  200 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 272  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  49918423 ggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 49918350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 126 - 272
Target Start/End: Original strand, 23555286 - 23555433
Alignment:
Q  126 aacttgacctactctgaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaa 223  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| | |||| |||||||||| ||  ||||    
T  23555286 aacttgacctactatggggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagttataagaaattagtttcaacaa 23555384  T
Q  224 gttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 272  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  23555385 gttcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 23555433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 106 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 47115340 - 47115171
Alignment:
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa--ggt 202  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||| | ||| |||| |||| |||||||||  |||    
T  47115340 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggagcagagattgatctctccaatccactatcaatgggtttttac-aaagagatacaaaatgggt 47115242  T
Q  203 tacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 272  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  47115241 tacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaa 47115171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 102 - 380
Target Start/End: Original strand, 196904 - 197191
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg--agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa 199  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||     
T  196904 agattgttgatccagttcggtccaa-cttgacctaatctggggggagagataaatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagggatacaaat 197001  T
Q  200 g-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttc 289  Q
    | |||||||||||||| |||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||       ||||||||||||||||||||    
T  197002 gagttacaagaaattaacttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctaccaattttctcaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttc 197100  T
Q  290 tctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
     |||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |  |||||||||| |||||    
T  197101 actcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgattttccaag 197191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 102 - 342
Target Start/End: Original strand, 37559864 - 37560115
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct--gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa- 198  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||  | ||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||     
T  37559864 agattgttgaccaagttcggtccaa-cttgacctaatctagggggagagattgatctctccaattcactatcaacgagttcttac-aaagagatacaaat 37559961  T
Q  199 aggttacaagaaattagctt--gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgatttt 288  Q
     |||||||||||||||||||   |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||       |||||||||||||||||||    
T  37559962 gggttacaagaaattagctttcaacaagttcacaaagaac-aactctaatttctacccattttcctaatctcaccaatgaacaagacactcaatgatttt 37560060  T
Q  289 ctctctac-aaggtgtttcccatgttttc-aacccaagagatactctaatcaaaga 342  Q
    | |||  | || |||||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  37560061 cactcacctaatgtgtttacaatgttttcaaacccaagaga-actctaatcaaaga 37560115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 102 - 272
Target Start/End: Original strand, 45644351 - 45644523
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 200  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |    
T  45644351 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagatattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 45644448  T
Q  201 -gttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttcta-cccttttcccaatctcaccaa 272  Q
     ||| |||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  45644449 agttgcaagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaaacttaatttctatccattttctcaatctcaccaa 45644523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 102 - 272
Target Start/End: Original strand, 50169207 - 50169378
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 200  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  |||| |||||||||||||| |||| ||||| |||| |||||||| |    
T  50169207 agattgttgatccagttcggtccaa-cttgacctaatctaggggagagattgatctcttcaatccactatcaatgagtacttac-aaagagatacaaatg 50169304  T
Q  201 -gttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 272  Q
     |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  50169305 agttacaagaaattagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 50169378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 102 - 380
Target Start/End: Original strand, 13659333 - 13659619
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 199  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||      
T  13659333 agattgttgacccagttcggtccaa-cttaacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatataaatg 13659430  T
Q  200 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttcta-cccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 290  Q
    ||| |||||||||||||||  ||||| | ||||  ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||     
T  13659431 ggtaacaagaaattagcttcaacaagcttacaaaaaac-aaccctaatttctatccgttttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttca 13659529  T
Q  291 ct-ctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    || |  |||||||||| | |||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||   |||| |  ||||||||||||||||    
T  13659530 ctaccccaaggtgtttacaatgtttctcaacctaagaga-actctaatcaaag-accctcaacccacaagttacctcctttgatttcccaag 13659619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 106 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 193778 - 193611
Alignment:
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 203  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||| | |||    
T  193778 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacatactctggagaagagattgatctctccaatccactatcaatgagttattac-aaagagatacaaatgagtt 193681  T
Q  204 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 272  Q
    |||||||||||||||  ||||| | | || |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  193680 acaagaaattagcttcaacaagctaataaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 193611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 143 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 1833652 - 1833407
Alignment:
Q  143 ggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagcttgacaag-ttcacaatgaacaaac 240  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| | |||||||||| ||||||| |  || ||||||| |||| |||    
T  1833652 ggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagttacaagaatttagcttcaatagattcacaaagaac-aac 1833555  T
Q  241 cctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatac 330  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||   |||||||||| | ||||||  ||| |||||||| ||    
T  1833554 cctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaatccaagaga-ac 1833456  T
Q  331 tctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt-tctccctttgatttcccaag 380  Q
    ||||||||||| ||||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||||    
T  1833455 tctaatcaaag-accctcaaccttaaagttatct-cctttgatttcccaag 1833407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 110 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 34603740 - 34603576
Alignment:
Q  110 cacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa--ggttaca 206  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||| ||||| |||||||||| |||| |||| ||||  |||||||    
T  34603740 cacctagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccaccatcaatgagttcttac-aaagagataaaaaatgggttaca 34603643  T
Q  207 agaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 272  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  34603642 agaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttttcaatctcaccaa 34603576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 482 - 604
Target Start/End: Original strand, 41398656 - 41398778
Alignment:
Q  482 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcac 580  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||  ||||||| || ||||||    
T  41398656 tgaccagtccttatcaatgatacttaatgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaaactggctcac 41398755  T
Q  581 ggcaccccgaaatcgtgtcacgat 604  Q
    |||| | | |||||||||||||||    
T  41398756 ggcatctc-aaatcgtgtcacgat 41398778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 102 - 272
Target Start/End: Original strand, 50167172 - 50167343
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 199  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||| |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||      
T  50167172 agattgttgacctagttcggtccaa-cttgagctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttac-aaagagatacaaatg 50167269  T
Q  200 ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcaccaa 272  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  50167270 ggttacaagaaattagctttgacaagctcacaaataac-aaccctaatttctactaattttcccaatctcaccaa 50167343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 102 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 46065089 - 46064861
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 200  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||| | |    
T  46065089 agattgtttacccagttcgatccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatgaatgagttcttac-aaagagatacacatg 46064992  T
Q  201 -gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttcta-cccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 290  Q
     ||||||||||||||||||  || || |||||| ||||||| |||||||| || || |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||     
T  46064991 agttacaagaaattagcttcaacgagctcacaaagaacaaa-cctaatttttatccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttca 46064893  T
Q  291 ctc-tacaaggtgtttcccatgttttcaaccc 321  Q
    |||   |||||||||| | |||||||| ||||    
T  46064892 ctcacccaaggtgtttacaatgttttccaccc 46064861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 102 - 380
Target Start/End: Original strand, 13137973 - 13138257
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||| | ||||||||||  |||| |||||||||||||| | |||||||| |||| ||| ||||      
T  13137973 agattgttgacccagttcggtccaatat-gacctactctaggggagagattgctctcttcaatccactatcaatgtgttcttac-aaagagatgcaaatg 13138070  T
Q  200 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctc 291  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| |  ||||||||||| || |||  |||||||||       |||||||||||||||||||| |    
T  13138071 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacga--cctaatttctatccatttttcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcac 13138168  T
Q  292 tc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    ||   |||||||||| | ||||||  || ||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  13138169 tcacccaaggtgtttacaatgtttcccaccccaagaga-accctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaag 13138257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 102 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 19752857 - 19752685
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgag-gagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 199  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| | || | |||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||||      
T  19752857 agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatatgggagagagattgatctctccaatcctctatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatc 19752760  T
Q  200 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcaccaa 272  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| || ||| |||| |||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||    
T  19752759 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcgcaaagaac-aaccctaatttctacccattttactcaatctcaccaa 19752685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 161 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 41361026 - 41360914
Alignment:
Q  161 aatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttt 257  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||| ||  ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||    
T  41361026 aatccactatcaacgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattt 41360929  T
Q  258 tcccaatctcaccaa 272  Q
    |||||||||||||||    
T  41360928 tcccaatctcaccaa 41360914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 126 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 15820455 - 15820192
Alignment:
Q  126 aacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gaca 222  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||   |||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||  |||    
T  15820455 aacttgacctactctggatgagagatttatctcttcaatgcactatcaatgagttctta-aaaagagatacaaatgtgttacaagaaattagcttcaaca 15820357  T
Q  223 agttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctc-tacaaggtgtttcccatgtt 313  Q
    || |||||| ||||||| |||||||| ||||| | || ||||| ||||       |||||||||||||||||||| |||   |||||||||| | |||||    
T  15820356 agctcacaaagaacaaa-cctaatttttacccatctttccaatatcaccaaagaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtt 15820258  T
Q  314 t-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |  |||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |  | ||||||||||||||    
T  15820257 tcccaactcaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcttttgatttcccaag 15820192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 141 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 22079449 - 22079322
Alignment:
Q  141 gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaa 238  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||| |||||| ||||||||   |||| ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||    
T  22079449 gaggagaaattgatctctccaatccaatatcaatgagttctttacaaagagatacaaaatggttacaagaaattagctttaacaagctcacaaagaacaa 22079350  T
Q  239 accctaatttctacccttttcccaatctc 267  Q
    | | ||||||||||| |||| ||||||||    
T  22079349 a-cataatttctaccatttttccaatctc 22079322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 590 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 21536189 - 21536119
Alignment:
Q  590 aaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaat 660  Q
    ||||||||||||| ||   |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  21536189 aaatcgtgtcacgttgatgaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaagccaaat 21536119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 473 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 24202425 - 24202379
Alignment:
Q  473 cccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagttt 519  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24202425 cccaagatatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagttt 24202379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 28242472 - 28242391
Alignment:
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaa 187  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  28242472 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat-aatgagttcttacaaa 28242391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 102 - 272
Target Start/End: Original strand, 30476443 - 30476614
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 199  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||  | || || ||||||||  || ||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||      
T  30476443 agattgttgacccagttcggtccaa-cttaacctcatatggggtagagattgatctgtccaatccagtatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 30476540  T
Q  200 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 272  Q
    |||||||| |||||| |||  ||||||||| || |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  30476541 ggttacaataaattatcttcaacaagttcataaagaac-aaccctaatttctacctattttcccaatctcaccaa 30476614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 609 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 24793723 - 24793678
Alignment:
Q  609 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24793723 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaag 24793678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 106 - 251
Target Start/End: Original strand, 927977 - 928123
Alignment:
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagga-gagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaagg-tt 203  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||  || ||| ||| |||  ||||| |||||||||| || ||||| ||||||| | ||| ||||||| ||    
T  927977 tgtttacccagttcggtctaa-cttgacctaccttggggaagaggttggtctctctaatccactattaatgagtttttacaaa-gagatccaaaagggtt 928074  T
Q  204 acaagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttcta 251  Q
    ||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  928075 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttcta 928123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 482 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 43988134 - 43988054
Alignment:
Q  482 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgc 561  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  43988134 tgaccagtccttatcagagatacttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttaccaagatcgtggcacgattttgc 43988054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 524 - 650
Target Start/End: Complemental strand, 26644517 - 26644390
Alignment:
Q  524 atcgtgtcacgatttcccaaa-tcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacga 622  Q
    ||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||  |||| ||||| | |||||| | ||   | ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||    
T  26644517 atcgtgtcacgttttcacaaaatcgtgccacgatttgacaccgtgcaaaccagctcatgacattacaaaatcgtgttacgatgacaaaatcgtatcacga 26644418  T
Q  623 tttccctgttcttccagaccacaaattt 650  Q
    || | ||||||||||| |||||||||||    
T  26644417 ttcctctgttcttccaaaccacaaattt 26644390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 609 - 671
Target Start/End: Original strand, 3282273 - 3282335
Alignment:
Q  609 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaacaataa 671  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  3282273 aaatcgtgtcacgatttttctgttcttcctaaccacaaatttgaagccaaatttcaacaataa 3282335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 10925397 - 10925108
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttctt---acaaaagggatacaa 197  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||| ||| | ||||||||||   |||||||||||||||||| || |||||   ||||| | |||||||    
T  10925397 agattgttgacccagttcgatccaa-ctttacctaatctaggggagagattgatttctccaatccactatcaatgaattcttcttacaaa-gagatacaa 10925300  T
Q  198 aag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttcta-cccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattt 287  Q
    | | ||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| |||| ||||||||| || ||||  |||||||||       ||||||||||||||||||    
T  10925299 atgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccataatttctatccattttttcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattt 10925201  T
Q  288 tctctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    || |||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||| |||| |  |||||||||| |||||    
T  10925200 tcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actataatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgattttccaag 10925108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 269
Target Start/End: Original strand, 40122193 - 40122363
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactat--caaagagttcttacaaaagggatacaaa 198  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| | || || ||||||||  ||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  40122193 agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctctaatccactatatcaaagagttcttac-aaagtgatacaaa 40122290  T
Q  199 ag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 269  Q
     | |||| |||||||||||||  ||||| |||||| |||||||  |||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  40122291 tgagttataagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-tctaatttcgacccatttttccaatctcac 40122363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 609 - 659
Target Start/End: Original strand, 41398764 - 41398814
Alignment:
Q  609 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaa 659  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  41398764 aaatcgtgtcacgatttctctgttctttcagaccacaaatttgaagccaaa 41398814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 296 - 380
Target Start/End: Original strand, 13316518 - 13316601
Alignment:
Q  296 caaggtgtttcccatgttttc-aacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |||||||||| | |||||| | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  13316518 caaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaaga-ccctaaaccctaaagttgctacctttgatttcccaag 13316601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 609 - 654
Target Start/End: Original strand, 13598967 - 13599012
Alignment:
Q  609 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  13598967 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaag 13599012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 6808595 - 6808507
Alignment:
Q  132 acctactctgagga-gagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt 218  Q
    |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| || ||||||||   |||| |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  6808595 acctactctgaggaagagattgatctctccaatccactataaatgagttctttacaaagagatacaaaagagttacaagaagttagctt 6808507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 609 - 653
Target Start/End: Original strand, 37070334 - 37070378
Alignment:
Q  609 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaa 653  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  37070334 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaa 37070378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 129 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 3460841 - 3460710
Alignment:
Q  129 ttgacctactctgaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagcttga-caagtt 226  Q
    ||||||||||||  | ||| ||||  |||||||||| ||||||||   ||||||   ||||  |||||||||| |||||| |||||||||| | |||| |    
T  3460841 ttgacctactctaggaagatattgatctctccaatcgactatcaatatgttctttacaaagatatacaaaagggttacaataaattagcttcaacaagct 3460742  T
Q  227 cacaatgaacaaaccctaatttctaccctttt 258  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  3460741 cacaaagaacaaactctaatttctaccctttt 3460710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 144 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 16455750 - 16455676
Alignment:
Q  144 gagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt 218  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  16455750 gagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-acagagatacaaatgggttacaagaaattagctt 16455676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 199 - 272
Target Start/End: Original strand, 37879005 - 37879079
Alignment:
Q  199 aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 272  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  37879005 aggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacctattttcccaatctcaccaa 37879079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 269
Target Start/End: Original strand, 8871143 - 8871213
Alignment:
Q  200 ggttacaagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac 269  Q
    ||||||||||||||||||| | | |  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  8871143 ggttacaagaaattagcttcaacgaactcacaaagaacaaaccctaatttctaccattttccaaatctcac 8871213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 187
Target Start/End: Original strand, 37876767 - 37876848
Alignment:
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaa 187  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  37876767 tgttcacccagttcggttcaa-cttgatgtactctggaggagagattgatctctgcaatccactatcaatgagttattacaaa 37876848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 267
Target Start/End: Original strand, 12318585 - 12318685
Alignment:
Q  168 tatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatc 265  Q
    |||||| ||||||||| | |||  |||||||| |||||||||||||||||||  ||||| || | ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  12318585 tatcaatgagttcttaaagaagacatacaaaatggttacaagaaattagcttcaacaagctctccatgaacaaa-cctaatttctacccatttccaaatc 12318683  T
Q  266 tc 267  Q
    ||    
T  12318684 tc 12318685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 48382505 - 48382441
Alignment:
Q  186 aaagggatacaaa-aggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttct 250  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  48382505 aaagtgatacaaataggttacaagaaattaactt-acaagttcacaaagatcaaaccctaatttct 48382441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 191 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 32737015 - 32736952
Alignment:
Q  191 gatacaaa-aggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc 254  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  32737015 gatacaaagaggttacaaaaaattagcttaa-aagttcataaagaacaaaccctaatttctaccc 32736952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 191 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 35109556 - 35109493
Alignment:
Q  191 gatacaaa-aggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc 254  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  35109556 gatacaaataggttacaagaaattagcttaa-aagctcacaaagaacaaaccttaatttctaccc 35109493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 144 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 5460035 - 5459961
Alignment:
Q  144 gagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagctt 218  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||   ||||  ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  5460035 gagagattgatctctccaatctactatcaatgagttctttacaaagaaatataaaatgttacaagaaattagctt 5459961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 126 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 36683828 - 36683766
Alignment:
Q  126 aacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaa 187  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||   ||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  36683828 aacttgacctactctgggggagagattgatttctacaatccactatcaatgagttcttacaaa 36683766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 142 - 258
Target Start/End: Original strand, 37282728 - 37282846
Alignment:
Q  142 aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaa 239  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||  || ||||||||   |||| ||| ||||||| |||| | |||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  37282728 aggagagatttatctctccaatccactactaatgagttctttacaaagagatgcaaaagggttaccataaattagcttcaacaagctcacaaggaacaaa 37282827  T
Q  240 ccctaatttctaccctttt 258  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  37282828 ccctaatttataccatttt 37282846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 609 - 650
Target Start/End: Complemental strand, 16124238 - 16124197
Alignment:
Q  609 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaattt 650  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  16124238 aaatcgtatcacgatttctctgttcttccaaaccacaaattt 16124197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 345; Significance: 0; HSPs: 86)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 3439776 - 3439396
Alignment:
Q  1 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3439776 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaactcaaaacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaa 3439677  T
Q  101 gagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa 199  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3439676 gagattgttcatccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa 3439577  T
Q  200 ggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaag 299  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3439576 ggttacaagaaattagcttgccaagttcataatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctttacaag 3439477  T
Q  300 gtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3439476 gtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttctcaag 3439396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 25690228 - 25689847
Alignment:
Q  1 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||    
T  25690228 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaaaacacactcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaacaaacaccaa 25690129  T
Q  100 agagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25690128 agagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa 25690029  T
Q  199 aggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaa 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  25690028 aggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacctttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaa 25689929  T
Q  299 ggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25689928 ggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttctccctttgatttcccaag 25689847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 15290798 - 15290417
Alignment:
Q  1 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaataca-caatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa-aagcacca 98  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |    
T  15290798 caacaatacaccacctagatcgaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaacac-a 15290700  T
Q  99 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatac 195  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  15290699 aagagattggacacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac 15290600  T
Q  196 aaaaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctct 294  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  15290599 aagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgatt--ctctct 15290502  T
Q  295 acaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  15290501 acaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaaccctagagctt-tccctttgatttcccaag 15290417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 15471167 - 15470786
Alignment:
Q  1 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaataca-caatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa-aagcacca 98  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |    
T  15471167 caacaatacaccacctagatcgaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaacac-a 15471069  T
Q  99 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatac 195  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  15471068 aagagattggacacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac 15470969  T
Q  196 aaaaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctct 294  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  15470968 aagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgatt--ctctct 15470871  T
Q  295 acaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  15470870 acaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaaccctagagctt-tccctttgatttcccaag 15470786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 380
Target Start/End: Original strand, 42575219 - 42575599
Alignment:
Q  1 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |  |  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||    
T  42575219 caacaaaacaccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaacaaagcaaccaaacacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaacac-aa 42575317  T
Q  100 agagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggataca 196  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  42575318 agagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaataca 42575417  T
Q  197 aaaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctcta 295  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  42575418 agaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaatccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgatt--ctctcta 42575515  T
Q  296 caaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  42575516 caaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaaccctagagctt-tccctttgatttcccaag 42575599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 7 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 2628002 - 2627627
Alignment:
Q  7 aacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagatt 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||    
T  2628002 aacaacacctagatctaatctaggaaacaagtgaaaagcataaaacacaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaa-gagatt 2627904  T
Q  107 gttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaagg--tt 203  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |  ||    
T  2627903 attcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacacaagagatacaaaaagagtt 2627804  T
Q  204 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtg 302  Q
     ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2627803 gcaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaa-ccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctcttcaaggtg 2627705  T
Q  303 tttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2627704 tttcccatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagagttactccctttgatttcccaag 2627627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 457 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 3439297 - 3439088
Alignment:
Q  457 cacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaaatcgtgtcacgat 556  Q
    |||||| ||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3439297 cacgatatgcgtaccacccaagaaacgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaaatcgtgtcacgat 3439198  T
Q  557 tttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagac 656  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3439197 tttgcaccctgcaacctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccacaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaagac 3439098  T
Q  657 aaatctcaaca 667  Q
     ||||||||||    
T  3439097 -aatctcaaca 3439088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 7 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 31218521 - 31218142
Alignment:
Q  7 aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagat 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||| || ||||||||||||||||||  ||||   |||||||  |||||||||  |    
T  31218521 aacagcacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaaacataagcacaagataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaaaga--t 31218426  T
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggtt 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||| ||||    
T  31218425 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctctaatccactatcaatgagttctt-ccaaagagatacaaaagggtt 31218327  T
Q  204 acaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc--cttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctc 293  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||    
T  31218326 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc 31218228  T
Q  294 tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
      |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  31218227 accaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagttgcttcctttgatttcccaag 31218142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 7 - 380
Target Start/End: Original strand, 34254235 - 34254611
Alignment:
Q  7 aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagat 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| | || || |||||  ||||| || |||||||||||||||  ||||   |||||||  |||||||||  |    
T  34254235 aacagcacctagatctaatctaggaatcaaagagaaaagcacaaaccacaagcaaaagataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaaaga--t 34254330  T
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggtt 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  34254331 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatcaataagttcttac-aaagagatacaaaagggtt 34254429  T
Q  204 acaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctcta 295  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||      
T  34254430 acaagaaattaactttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 34254528  T
Q  296 caaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |||||||||| | |||| | |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  34254529 caaggtgtttacaatgtctccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagttgcctcctttgatttcccaag 34254611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 7 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 17982917 - 17982538
Alignment:
Q  7 aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagat 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||||  ||||| || || ||||||||||||  ||||   |||||||  |||||||||  |    
T  17982917 aacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaccacaagcaaaatataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaaaga--t 17982822  T
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggtt 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||| ||||    
T  17982821 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt-ccaaagagatacaaaagggtt 17982723  T
Q  204 acaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctc 293  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||    
T  17982722 acaagaaattaactttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc 17982624  T
Q  294 tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
      |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  17982623 accaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagttgcttcctttgatttcccaag 17982538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 455 - 654
Target Start/End: Original strand, 36979802 - 36980002
Alignment:
Q  455 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcac 553  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||| |||||| |||    
T  36979802 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcagagatacttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgattttccaagatcgtgccac 36979901  T
Q  554 gattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaa 653  Q
    ||||| ||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36979902 gatttggcgtcctgcaaactagctcacggcacctcgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaa 36980001  T
Q  654 g 654  Q
    |    
T  36980002 g 36980002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 413 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 33037543 - 33037299
Alignment:
Q  413 gcacaagaacac--tttatactagcctccctctgaagcaatcacgtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacg 510  Q
    ||||||||||||  | |||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||| |   |||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  33037543 gcacaagaacacaatatatactagtctccttctgaagcaatcgtgtcacgatttgcgtccgttccaaggcatgaccagtccttatcagtgatacttaatg 33037444  T
Q  511 agcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaa 609  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33037443 agcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgtcacgatttggcgtcctgcaaactagctcacggcacctcgaaatcgtgtcacgatgccaa 33037344  T
Q  610 aatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33037343 aatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaag 33037299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 7 - 380
Target Start/End: Original strand, 34256411 - 34256787
Alignment:
Q  7 aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagat 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| | || || |||||  ||||| || |||||||||||||||  ||||   |||||||  |||||||||  |    
T  34256411 aacagcacctagatctaatctaggaatcaaagagaaaagcacaaaccacaagcaaaagataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaaaga--t 34256506  T
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggtt 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  34256507 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagggtt 34256605  T
Q  204 acaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctcta 295  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||       |||||||||||||||||||| | |      
T  34256606 acaagaaattaactttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcacacac 34256704  T
Q  296 caaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |||||||||| | |||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  34256705 caaggtgtttacaatgtttccaacccaagata-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagttgcctcctttgatttcccaag 34256787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 455 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 4759746 - 4759546
Alignment:
Q  455 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcac 553  Q
    |||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  4759746 gtcacgatttgcgtccgttccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttctaaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccac 4759647  T
Q  554 gattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaa 653  Q
    ||||| ||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4759646 gatttggcgtcctgcaaactagctcacggcacctcgaaatcgtgtcacgatgtcaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaa 4759547  T
Q  654 g 654  Q
    |    
T  4759546 g 4759546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 455 - 654
Target Start/End: Original strand, 30656070 - 30656270
Alignment:
Q  455 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcac 553  Q
    ||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  30656070 gtcacgatttgcgtctgacccaaggtttgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccac 30656169  T
Q  554 gattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaa 653  Q
    ||||| ||  ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30656170 gatttggcgtcctgcaaactagctcacggcaccttgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaa 30656269  T
Q  654 g 654  Q
    |    
T  30656270 g 30656270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 473 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 1261609 - 1261414
Alignment:
Q  473 cccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaat 571  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||     
T  1261609 cccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttgaaaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaa 1261510  T
Q  572 ctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 667  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  1261509 ctagctcacggcatcacgaaatcgtgtcacgatgccaaattcgtgtcgcgatttctgtgttcttccaaaccacaaatttgaaaccaaatatcaaca 1261414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 7 - 380
Target Start/End: Original strand, 19945263 - 19945643
Alignment:
Q  7 aacaccacctagatctaatctaggaaac-aagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagat 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||  ||||| || || ||||||||||||  ||||   |||||||  |||||||||  |    
T  19945263 aacagcacctagatctaatctaggaatcgaagtgaaaagcacaaaccacaagcaaaatataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaaaga--t 19945358  T
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa--ggt 202  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||||  |||    
T  19945359 tgttcacccagttcggttcaaacttgacctactctcgaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt-ccaaagagatacaaaagtggt 19945457  T
Q  203 tacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctct 292  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||       |||||||||||||||||||| ||    
T  19945458 tacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccataatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 19945556  T
Q  293 ctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |  |||||||||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  19945557 caccaaggtgtttacaatgtttcccgacccaagaga-actctaatcaaag-actctaaaccctaaagttgcttcctttgatttcccaag 19945643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 7 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 44304119 - 44303739
Alignment:
Q  7 aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagat 105  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||| |||| || |||||  ||||| || |||||||||||||||  ||||   |||||||  |||||||||  |    
T  44304119 aacaacacctagatctaatctagaaatcaaagtgaaaagcacaaaccacaagcaaaagataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaaaga--t 44304024  T
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaagg-tt 203  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  44304023 tgttcacctagttcgatccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctta-aaaagagatacaaaaggatt 44303925  T
Q  204 acaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc---ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctct 292  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||   |||||||||||||||       |||||||||||||||||||| ||    
T  44303924 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccttaatttctaccctttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 44303826  T
Q  293 ctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||  | ||||||||||| ||||    
T  44303825 caccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagttgtttcctttgatttctcaag 44303739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 42498459 - 42498079
Alignment:
Q  7 aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagaga 104  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| || |||| || |||||||||||||||  |||| | |||||||  |||||||||      
T  42498459 aacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaacacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagag--aagagggaaacaaacacaccaaaga-- 42498364  T
Q  105 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggt 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||| |||    
T  42498363 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagaaatacaaaagggt 42498265  T
Q  203 tacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc--cttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctct 292  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||       |||||||||||||||||||| ||    
T  42498264 tacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacctttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 42498166  T
Q  293 ctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |  |||||||||| | | ||||  |||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  42498165 caccaaggtgtttacaacgtttcccaacccaagaga-actttaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaag 42498079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 455 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 18852839 - 18852639
Alignment:
Q  455 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcac 553  Q
    |||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  18852839 gtcacgatctgcgtctgacccaaggtatgaccagtccttatcagtgatacttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccac 18852740  T
Q  554 gattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaa 653  Q
    ||||| ||  ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18852739 gatttggcgtcctgcaaactagctcacggcaccttgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtatcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaa 18852640  T
Q  654 g 654  Q
    |    
T  18852639 g 18852639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 483 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 2627503 - 2627318
Alignment:
Q  483 gaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaaa-tcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacg 581  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||    
T  2627503 gaccaatccttatcatggaaacttaacgagcaagtttgcaaatcgtgtcacgatttcccaaaatcgtgtcacgatttggcaccatgcaaaccagctcacg 2627404  T
Q  582 gcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 667  Q
    | | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2627403 gaatcacgaaatcgtgtcacgatgccaaattcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagccaaatctcaaca 2627318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 482 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 10683924 - 10683751
Alignment:
Q  482 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcac 580  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||  ||||||| |||||||||    
T  10683924 tgaccagtccttatcagagatacttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaaactagctcac 10683825  T
Q  581 ggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10683824 ggcaccttgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaag 10683751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 405 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 15290407 - 15290143
Alignment:
Q  405 tcaaatctgcacaagaacacttta-tactagcctccctctgaagcaatcacgtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggata 503  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||   |||||  |||||||||||||| |  ||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  15290407 tcaaatctgcacaagaacacttaagtactagtcttcctctgttccaatcgtgtcacgatttgcgtccgtcccaaggaactaccagtccttatcaaggata 15290308  T
Q  504 cttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttccc--aaatcgtgtcacgattttgcaccc-tgcaatc-tagctcacggcaccccgaaatcgtgtc 599  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||| ||||| | || ||||||||| || |||||||||||    
T  15290307 cttaacgagcaagtttcttgatcgtgtcacgattttcccaaaatcgtgtcacgattt-gcacccctgcaaccctaactcacggcatcc-gaaatcgtgtc 15290210  T
Q  600 acgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 667  Q
     | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15290209 gcaatcccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccaaaccacaaatttgaagac-aatctcaaca 15290143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 405 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 15470776 - 15470512
Alignment:
Q  405 tcaaatctgcacaagaacacttta-tactagcctccctctgaagcaatcacgtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggata 503  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||   |||||  |||||||||||||| |  ||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  15470776 tcaaatctgcacaagaacacttaagtactagtcttcctctgttccaatcgtgtcacgatttgcgtccgtcccaaggaactaccagtccttatcaaggata 15470677  T
Q  504 cttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttccc--aaatcgtgtcacgattttgcaccc-tgcaatc-tagctcacggcaccccgaaatcgtgtc 599  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||| ||||| | || ||||||||| || |||||||||||    
T  15470676 cttaacgagcaagtttcttgatcgtgtcacgattttcccaaaatcgtgtcacgattt-gcacccctgcaaccctaactcacggcatcc-gaaatcgtgtc 15470579  T
Q  600 acgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 667  Q
     | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15470578 gcaatcccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccaaaccacaaatttgaagac-aatctcaaca 15470512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 455 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 18870233 - 18870033
Alignment:
Q  455 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcac 553  Q
    |||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  18870233 gtcacgatctgcgtctgacccaaggtatgaccagtccttattagtgatacttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccac 18870134  T
Q  554 gattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaa 653  Q
    ||||| ||  ||||||| |||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18870133 gatttggcgtcctgcaaactagctcacgacatcttgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaa 18870034  T
Q  654 g 654  Q
    |    
T  18870033 g 18870033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 475 - 670
Target Start/End: Original strand, 26288324 - 26288520
Alignment:
Q  475 caaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatct 573  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| |     
T  26288324 caaggtacgaccagtccttatcatggaaacttaacgagcaagtttgaaaattgtgtcacgatttcccaagattgtgtcacgatttggcaccctgcaaacc 26288423  T
Q  574 agctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaacaata 670  Q
    ||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  26288424 agctcacggcatcacaaaatcatgtcacgatgccaaattcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagtcaagtctcaacaata 26288520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 475 - 670
Target Start/End: Original strand, 26301581 - 26301777
Alignment:
Q  475 caaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatct 573  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| |     
T  26301581 caaggtacgaccagtccttatcatggaaacttaacgagcaagtttgaaaattgtgtcacgatttcccaagattgtgtcacgatttggcaccctgcaaacc 26301680  T
Q  574 agctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaacaata 670  Q
    ||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  26301681 agctcacggcatcacaaaatcatgtcacgatgccaaattcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagtcaagtctcaacaata 26301777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 475 - 670
Target Start/End: Original strand, 26313575 - 26313771
Alignment:
Q  475 caaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatct 573  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| |     
T  26313575 caaggtacgaccagtccttatcatggaaacttaacgagcaagtttgaaaattgtgtcacgatttcccaagattgtgtcacgatttggcaccctgcaaacc 26313674  T
Q  574 agctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaacaata 670  Q
    ||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  26313675 agctcacggcatcacaaaatcatgtcacgatgccaaattcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagtcaagtctcaacaata 26313771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 103 - 380
Target Start/End: Original strand, 1746216 - 1746501
Alignment:
Q  103 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-g 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||   |||| ||||||||| |    
T  1746216 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactatggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt--caaagagatacaaaagg 1746313  T
Q  201 gttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc--cttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||   ||||  |||||||||       ||||||||||||||||||||     
T  1746314 gttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacctttttttttcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 1746412  T
Q  291 ctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |||  |||||||||| | ||||||  ||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  1746413 ctcaccaaggtgtttacaatgtttcccaaccaaagaga-actctaatc-aaggaccctaaaccctaaagttgcttcctttgatttcccaag 1746501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 455 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 25689753 - 25689604
Alignment:
Q  455 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttccca-aatcgtgtcac 553  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||    
T  25689753 gtcacgatttgtgtacaaaccaaggaacgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtgacgatttcccacaatcgtgccac 25689654  T
Q  554 gattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgat 604  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25689653 gattttgcaccctgcaacctagctcacggca-cccgaaatcgtgtcacgat 25689604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 455 - 667
Target Start/End: Original strand, 42575696 - 42575909
Alignment:
Q  455 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttccc--aaatcgtgtca 552  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||  |||||||| ||    
T  42575696 gtcacgatttgcgtccgtcccaaggaaagaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcttgatcgtgtcacgattttcccaaaatcgtgaca 42575795  T
Q  553 cgattttgcaccc-tgcaatc-tagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaattt 650  Q
    |||||| |||||| ||||| | || ||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42575796 cgattt-gcacccctgcaaccctaactcacggcatcc-gaaatcgtgtcgcgatcccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccaaaccacaaattt 42575893  T
Q  651 gaagacaaatctcaaca 667  Q
    |||||| ||||||||||    
T  42575894 gaagac-aatctcaaca 42575909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 455 - 654
Target Start/End: Original strand, 6311724 - 6311923
Alignment:
Q  455 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcac 553  Q
    |||||||||||| |   ||||||||| |||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  6311724 gtcacgatttgcatctgacccaaggt-tgacaagtccttattagtgatacttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccac 6311822  T
Q  554 gattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaa 653  Q
    ||||| ||  ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6311823 gatttggcgtcctgcaaactagctcacggcaccttgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcatgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaa 6311922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 474 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 7289620 - 7289439
Alignment:
Q  474 ccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatc 572  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||  ||||||| |    
T  7289620 ccaaggta-gacaagtccttatcagggatacttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgattttccaagatcgtgtcacgatttggcgtcctgcaaac 7289522  T
Q  573 tagctcacggcacccc-gaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
    ||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7289521 tagctcatggctcccttgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcactatttctctgttcttccagaccacaaatttgaag 7289439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 543 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 31043032 - 31042908
Alignment:
Q  543 aatcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagacc 642  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  31043032 aatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaaccagctcacggcaccacgaaatcgtgtcacgatgccaaattcgtgtcacgatttctctattcttccagacc 31042933  T
Q  643 acaaatttgaagacaaatctcaaca 667  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    
T  31042932 acaaatttgaagtcaaatctcaaca 31042908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 472 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 25327858 - 25327676
Alignment:
Q  472 acccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaa 570  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||  |||||||    
T  25327858 acccaaggt-tgacaagtccttatcagtgatacttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccatgatttggcgtcctgcaa 25327760  T
Q  571 tctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
     ||||||||| ||  |  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25327759 actagctcacagccacttgaaatcgtgccacgaagccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaag 25327676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 482 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 39784510 - 39784337
Alignment:
Q  482 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctag-ctca 579  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||| || | ||||    
T  39784510 tgaccagtccttatcagtgatacttaaccaacaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcatccagcaaacttggctca 39784411  T
Q  580 cggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
    ||||||| | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39784410 cggcacctccaa-tcgtgtcacgattccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaag 39784337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 102 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 43036594 - 43036308
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 200  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |    
T  43036594 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctggaggagagattgatctctcaaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 43036497  T
Q  201 -gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 290  Q
      |||||||||||||| ||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||     
T  43036496 aattacaagaaattagtttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 43036398  T
Q  291 ctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  43036397 ctcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaag 43036308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 380
Target Start/End: Original strand, 12702542 - 12702921
Alignment:
Q  12 cacctagatctaatctaggaaac--aagtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgt 108  Q
    |||||||||||||||||| |||   |||||| |||||||| || |||| ||||||||||| ||||||  ||||   |||||||   ||||||||  ||||    
T  12702542 cacctagatctaatctagaaaatcaaagtgaaaaacacaaaaccacaagcacaagataaagggagag--aagagagaaacaaacataccaaaga--ttgt 12702637  T
Q  109 tcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttaca 206  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||| |||| || |||||| |||||||    
T  12702638 tgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctaggggagagattgatctctccaatccaatatcaatgagttcttac-aaagagacacaaaagggttaca 12702735  T
Q  207 agaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc------ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctct 292  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||||||      |||||||||||||||       ||||||||| |||||||||| ||    
T  12702736 agaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttttttcccaatctcaccaatgaacaagacacttaatgattttcact 12702834  T
Q  293 ctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| | || |  ||||||||||||||||    
T  12702835 caccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaatttacctcctttgatttcccaag 12702921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 102 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 15212957 - 15212671
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 199  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||      
T  15212957 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccattatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 15212860  T
Q  200 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 290  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||| ||||||||||||     
T  15212859 ggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacattcaatgattttca 15212761  T
Q  291 ctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |  | ||||||||||||||    
T  15212760 ctcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcatttgatttcccaag 15212671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 102 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 33352321 - 33352035
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 199  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||      
T  33352321 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 33352224  T
Q  200 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 290  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||     
T  33352223 ggttacaagaaattaggttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttttacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 33352125  T
Q  291 ctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
     ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |   |||||||||||||||    
T  33352124 atcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttaccttctttgatttcccaag 33352035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 102 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 27811449 - 27811164
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 199  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||  |||| |||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||      
T  27811449 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctcttcaatccactatcaatgggttcttac-aaagagatacaaatg 27811352  T
Q  200 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 290  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||     
T  27811351 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 27811253  T
Q  291 ctc-tacaaggtgtttcccatgtttt-caacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaa 379  Q
    |||   |||||||||| | ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| | || |  |||||||||||||||    
T  27811252 ctcacccaaggtgtttacaatgttttccaacctaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaatttacctcctttgatttcccaa 27811164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 106 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 4283691 - 4283524
Alignment:
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 203  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  4283691 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctagaggggagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 4283594  T
Q  204 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 272  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4283593 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaaaaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 4283524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 106 - 272
Target Start/End: Original strand, 42434992 - 42435159
Alignment:
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 203  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  42434992 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatttctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 42435089  T
Q  204 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 272  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  42435090 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 42435159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 503 - 667
Target Start/End: Original strand, 7412787 - 7412952
Alignment:
Q  503 acttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaaa-tcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcac 601  Q
    ||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||| |||| | ||  ||||||||  |||||||||| | |||||||||||   |  |||||||||||    
T  7412787 acttaaccagcaagtttgaaaatcgtgtcacgatttcacaaaattgtaccacgatttgacaccctgcaaaccagctcacggcattacagaatcgtgtcac 7412886  T
Q  602 gatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 667  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  7412887 gatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaagtcaaatttcaaca 7412952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 102 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 40321251 - 40321082
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatac-aaaa 199  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||      
T  40321251 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagtttttac-aaagagatactaatg 40321154  T
Q  200 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcacc 270  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40321153 ggttacaagaaattaacttcaacaagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcacc 40321082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 4731922 - 4731549
Alignment:
Q  7 aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagaga 104  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||| || |||| || |||||||| ||||||   ||| |||  ||||  |||||||||      
T  4731922 aacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaa--caaacacaccaaaga-- 4731827  T
Q  105 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggt 202  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||||||| | |||| || |||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  |||    
T  4731826 ttgttgacccaattcggtccaa-cttgaccgaatctgggggagagatcgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggt 4731729  T
Q  203 tacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctc 293  Q
    ||||||||||||| ||  ||||| |||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||    
T  4731728 tacaagaaattaggttcaacaagctcacaaagagc-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc 4731630  T
Q  294 -tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgattt 374  Q
       |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||    
T  4731629 acccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgattt 4731549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 102 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 6599143 - 6598857
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 199  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | || || ||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||      
T  6599143 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttcttacaaaa-gtatacaaatg 6599046  T
Q  200 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 290  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| || ||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||| ||||||||||     
T  6599045 ggttacaagaaattagcttaaacaagctcgcaaagaacaaa-cttaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacacttaatgattttca 6598947  T
Q  291 ctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt-tctccctttgatttcccaag 380  Q
    |||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  6598946 ctcactcaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttatct-cctttgatttcccaag 6598857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 102 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 6674596 - 6674310
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 199  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | || || ||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||      
T  6674596 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttcttacaaaa-gtatacaaatg 6674499  T
Q  200 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 290  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| || ||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||| ||||||||||     
T  6674498 ggttacaagaaattagcttaaacaagctcgcaaagaacaaa-cttaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacacttaatgattttca 6674400  T
Q  291 ctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt-tctccctttgatttcccaag 380  Q
    |||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  6674399 ctcactcaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttatct-cctttgatttcccaag 6674310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 106 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 18655567 - 18655400
Alignment:
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 203  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  18655567 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactttggaggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 18655470  T
Q  204 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 272  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| |||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  18655469 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccttaatttctacccattttctcaatctcaccaa 18655400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 102 - 380
Target Start/End: Original strand, 3303667 - 3303953
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 200  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |    
T  3303667 agattgtttacccagttcggtccaa-cttgacctactgtgggggagagattgatctcttcaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 3303764  T
Q  201 -gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 290  Q
     ||||||||||||||| ||  ||||| |||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||       ||||| ||||||||||||||     
T  3303765 agttacaagaaattaggttaaacaagctcacaaagaacaaa-cttaatttctacccattttcccaatctcaccaataaacaagatactcaatgattttca 3303863  T
Q  291 ctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| || |||||||||| ||||| |||| || |||| |  ||||||||||||||||    
T  3303864 ctcactcaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-accctaatcaaag-accctcaaccgtaaagttacctcctttgatttcccaag 3303953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 455 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 10688810 - 10688661
Alignment:
Q  455 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcac 553  Q
    |||||||||||| |   ||||||||| |||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  10688810 gtcacgatttgcatctgacccaaggt-tgacaagtccttattagtgatacttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccac 10688712  T
Q  554 gattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgat 604  Q
    ||||| ||  ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  10688711 gatttggcgtcctgcaaactagctcacggcaccttgaaatcgtgtcacgat 10688661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 102 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 40221916 - 40221745
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 199  Q
    ||||| || |||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||      
T  40221916 agattattgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaacgagttcttac-aaagagatacaaatg 40221819  T
Q  200 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 272  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  40221818 ggttacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttaccaatctcaccaa 40221745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 112 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 18141981 - 18141821
Alignment:
Q  112 cccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaaga 209  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||    
T  18141981 cccagtttggtccaa-cttgacctaatctaggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttac-aaagtgatacaaatgggttacaaga 18141884  T
Q  210 aattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 272  Q
    |||||||||  ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  18141883 aattagcttcaacaagctcacaaagaacaa--cctaatttctacccattttcacaatctcaccaa 18141821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 143 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 30291737 - 30291606
Alignment:
Q  143 ggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaac 240  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||     
T  30291737 ggagagattgatctctccaatccactatcaaagaattcttac-aaagtgatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaa 30291639  T
Q  241 cctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 272  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  30291638 cctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 30291606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 112 - 272
Target Start/End: Original strand, 1292471 - 1292631
Alignment:
Q  112 cccagttcggtccaaacttgacctactctgaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaa 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    |||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||    
T  1292471 cccagttcggtccaa-cttgacctactctggggagagatttatttctcaaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagttacaagaa 1292568  T
Q  211 attagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 272  Q
    ||||||||  ||||| |||||| ||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  1292569 attagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cttaatttctacccattttctcaatctcaccaa 1292631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 102 - 268
Target Start/End: Original strand, 41366612 - 41366778
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-ag 200  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||    
T  41366612 agattgttgtcccagttcggtccaa-cttgacctaatctagggagagattgatctctccaatccactataaatgagttcttac-aaagggatacaaatag 41366709  T
Q  201 gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctca 268  Q
    |||| |||||||||||||  ||||| | |||| ||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  41366710 gttaaaagaaattagcttaaacaagcttacaaagaacaaa-cataatttctacccattttctcaatctca 41366778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 155 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 9765863 - 9765745
Alignment:
Q  155 ctctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac 252  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||| |||||| |||| |||||||||||||||    
T  9765863 ctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgccaagctcacaaagaac-aaccctaatttctac 9765766  T
Q  253 cc-ttttcccaatctcaccaa 272  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  9765765 ccattttcccaatctcaccaa 9765745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 102 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 5689442 - 5689159
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 199  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||      
T  5689442 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgaccaaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 5689345  T
Q  200 ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctc-------accaagacactcaatgattttct 290  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||  ||| |||||||||||| |||| ||||||||       | ||||||||||||||||||||     
T  5689344 ggttacaagaaattagctttgacaagctcacaaagcac-caccttaatttctacccatttttccaatctcattaatgaacaagacactcaatgattttca 5689246  T
Q  291 ctc-tacaaggtgtttcccatgttttc-aacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt-tctccctttgatttccc 377  Q
    |||   |||||||||| | |||||| | ||| ||||||| || |||||||||| ||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  5689245 ctcacccaaggtgtttacaatgtttccaaactcaagaga-accctaatcaaag-accctcaaccctaaagttatct-cctttgatttccc 5689159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 143 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 30143470 - 30143227
Alignment:
Q  143 ggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaac 240  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| |||    
T  30143470 ggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aac 30143373  T
Q  241 cctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa-----gacactcaatgattttctctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactc 332  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  ||||      | || ||||||||||| |||   ||| |||||| | ||||||  |||||||||||| ||||    
T  30143372 cctaatttctacccattttcccaatctggccaatgaacaagacacaatgattttcactcacccaatgtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actc 30143274  T
Q  333 taatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  30143273 taatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaag 30143227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 132 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 40328922 - 40328782
Alignment:
Q  132 acctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa--ggttacaagaaattagctt-gacaagttc 227  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||   ||||||||||||||| ||  ||||| ||    
T  40328922 acctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaatgagttacaagaaattagtttaaacaagctc 40328824  T
Q  228 acaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 269  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40328823 acaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcac 40328782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 482 - 667
Target Start/End: Original strand, 35745793 - 35745979
Alignment:
Q  482 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatc-tagctca 579  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||  ||| | | |||||    
T  35745793 tgaccagtccttatcatagatacttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccaacaaacttggctca 35745892  T
Q  580 cggca-ccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 667  Q
    ||||| | |||  |||||||||||||  | |||||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  35745893 cggcatctccg--atcgtgtcacgattgccaaatcgcgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaatttgaagccaattttcaaca 35745979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 143 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 44353923 - 44353796
Alignment:
Q  143 ggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaac 240  Q
    ||||||||||  || | |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||    
T  44353923 ggagagattgatcttttcaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgtgttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aac 44353826  T
Q  241 cctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 269  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44353825 cctaatttctacccattttcccaatctcac 44353796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 99 - 270
Target Start/End: Original strand, 10930193 - 10930365
Alignment:
Q  99 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaa 197  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||| ||    
T  10930193 aagaaattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgtgttcttac-aaagagatataa 10930290  T
Q  198 a-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttcta-cccttttcccaatctcacc 270  Q
    |  |||||||||||||||||||  || || |||||| || | |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  10930291 atgggttacaagaaattagcttcaacgagctcacaaagagc-aaccctaatttctatccattttcccaatctcacc 10930365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 106 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 11384152 - 11383989
Alignment:
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 203  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |   ||||||||||| |||||| | |||||||| |||| |||||||| | |||    
T  11384152 tgttcacccagttcggtcc-aacttaacctactctggaggagagatcgatgtctccaatccagtatcaatgggttcttac-aaagagatacaaatgagtt 11384055  T
Q  204 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctca 268  Q
    |||||||||||||||  ||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  11384054 acaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctca 11383989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 102 - 380
Target Start/End: Original strand, 1345368 - 1345654
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggataca-aaa 199  Q
    |||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| | |||| |||||| |      
T  1345368 agattgttgacctagttcggtctaa-cttgacctactctgggggagagattgaactcttcaatccactatcaatgagttctttc-aaagagatacatatg 1345465  T
Q  200 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 290  Q
    |||||||||||||||||||  | ||  |||||| |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||       ||||||| ||||||||||||     
T  1345466 ggttacaagaaattagcttcaataaactcacaaagaac-aaccctaatttctacacattttcccaatctcacaaatgaacaagacattcaatgattttca 1345564  T
Q  291 ctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |||   |||||||||| | || |||  |||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||| |  |||||||||| |||||    
T  1345565 ctcacccaaggtgtttacaatatttcccaactcaagaga-actctaatcaaa-aaccctcaaccctaaagttacatcctttgattttccaag 1345654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 106 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 4162663 - 4162405
Alignment:
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 203  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||   |||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||| | |||    
T  4162663 tgtttacccaattcggtccaa-cttgacctactcttggggagagattgatatctccaatcc-ctatcaatgagttcttacaaa-gagatacaaatgagtt 4162567  T
Q  204 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctc-t 294  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||| ||| ||  ||||||       |||||||||||||||||||| |||      
T  4162566 acaagaaattagcttcaacaagttctcaaagaacaaa-cctaacttctacccattttcc--tctcactaatgaacaagacactcaatgattttcactcgc 4162470  T
Q  295 acaaggtgtttcccatgtttt-caacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt 360  Q
     |||||||||| | ||||||| |||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  4162469 tcaaggtgtttacaatgttttccaacccaagaga-accctaatcaaag-accctcaaccctaaagtt 4162405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 106 - 272
Target Start/End: Original strand, 8965692 - 8965859
Alignment:
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaagg-tt 203  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| | || || |||||||   |||||| || ||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| ||    
T  8965692 tgtttacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagatttatctctccgatgcactatcaatgagttcttacaaa-gagatataaaagggtt 8965789  T
Q  204 acaagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 272  Q
    | ||||||||| ||| | |||  ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8965790 ataagaaattaacttcaacaaactcataaagaacaaaccctaatttctacctttttcccaatctcaccaa 8965859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 609 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 25689618 - 25689558
Alignment:
Q  609 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaacaata 670  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25689618 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagac-aatctcaacaata 25689558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Original strand, 4743211 - 4743306
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaa 197  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||    
T  4743211 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctactttgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatgggttacaa 4743306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 161 - 272
Target Start/End: Original strand, 19491755 - 19491867
Alignment:
Q  161 aatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttt 257  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||| ||  ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||    
T  19491755 aatccactatcaacgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattt 19491852  T
Q  258 tcccaatctcaccaa 272  Q
    |||||||||||||||    
T  19491853 tcccaatctcaccaa 19491867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 111 - 218
Target Start/End: Original strand, 18106087 - 18106191
Alignment:
Q  111 acccagttcggtccaaacttgacctactctgaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaaga 209  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||  |||||||| | |||||||||    
T  18106087 acccagttcggtccaa-cttgacctattctggggagagattgatctctccaa-acactatcaatgagttcttacaaaa--gatacaaatgagttacaaga 18106182  T
Q  210 aattagctt 218  Q
    |||||||||    
T  18106183 aattagctt 18106191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 10015241 - 10015136
Alignment:
Q  111 acccagttcggtccaaacttgacctactctgaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaaga 209  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||   ||||||||||||||||||| |||||| |  ||||| |||||||| | |||||||||    
T  10015241 acccagttcggtccaa-cttgacctactatggagagagatttatctctccaatccactatcaatgagttcct--aaaagagatacaaatgagttacaaga 10015145  T
Q  210 aattagctt 218  Q
    |||||||||    
T  10015144 aattagctt 10015136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 609 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 10688675 - 10688630
Alignment:
Q  609 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10688675 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaag 10688630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 106 - 213
Target Start/End: Original strand, 3073875 - 3073981
Alignment:
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatac-aaaaggtta 204  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||  |||||||| ||| |||||| |||||||||| |||| ||||| |||| ||||    
T  3073875 tgtttacccagttcggcccaa-cttgacctactatggggagagattgatctctccaagccattatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaaatgtta 3073972  T
Q  205 caagaaatt 213  Q
    |||||||||    
T  3073973 caagaaatt 3073981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 201 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 10929871 - 10929686
Alignment:
Q  201 gttacaagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttccca-atctcaccaa-------gacactcaatgattttctc 291  Q
    |||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||||  |||||||||||| ||| ||| ||||||||||       ||||||||||||||||| |    
T  10929871 gttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaca-taatttctacccattttccatatctcaccaaagaacaagacactcaatgattttcac 10929773  T
Q  292 t-ctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |  | |||||||||| | |||||  |||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  10929772 taatccaaggtgtttacaatgttcccaacccaagaga-actctaatcaaagacccc--aaccctaaagttacctcctttgatttcccaag 10929686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 3772352 - 3772192
Alignment:
Q  113 ccagttcggtccaaacttgacctactctgag-gagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaa 210  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||| | ||||||||||    
T  3772352 ccagtttggtccaa-cttgacctactctgagagatagattgatctctccaatccactatcaataaattcttac-aaagatatacaaatgagttacaagaa 3772255  T
Q  211 attagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttcta-cccttttcccaatctcaccaa 272  Q
    ||||||||  | ||| |||||| ||||||| ||||||||||| |  ||||| ||||||||||||    
T  3772254 attagcttaaataagctcacaaagaacaaa-cctaatttctatcaattttctcaatctcaccaa 3772192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 117 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 8153914 - 8153844
Alignment:
Q  117 ttcggtccaaacttgacctactctgagga-gagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaa 187  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  8153914 ttcggtccaa-cttgacctactctgaggaagagattgatctctccaatcaactatcaatgagttcttacaaa 8153844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 609 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 5702009 - 5701964
Alignment:
Q  609 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  5702009 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaag 5701964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 609 - 659
Target Start/End: Original strand, 4456575 - 4456625
Alignment:
Q  609 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaa 659  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  4456575 aaatcgtgtcacgatttctttgttcttccaaaccacaaatttgaagccaaa 4456625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 4733873 - 4733792
Alignment:
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaa 187  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||| |  ||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  4733873 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagatcgatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaa 4733792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 200 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 1822365 - 1822297
Alignment:
Q  200 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctc 267  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||    
T  1822365 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccataatttctatcctttttgcaatctc 1822297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 200 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 1856810 - 1856742
Alignment:
Q  200 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctc 267  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||    
T  1856810 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccataatttctatcctttttgcaatctc 1856742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 360
Target Start/End: Original strand, 41364927 - 41365110
Alignment:
Q  186 aaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctc-------accaagac 275  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||  |||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||       | ||||||    
T  41364927 aaagggatacaaatgtgttacaagaaattagcttaaacaaactcacaaagaacaaa-cctaatttctaccaattttcccaatctcagtcttgaacaagac 41365025  T
Q  276 actcaatgattttctctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt 360  Q
    |||||||||||||| |||   |||||||||| | ||||||  |||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  41365026 actcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaaaaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagtt 41365110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 405 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 3439369 - 3439330
Alignment:
Q  405 tcaaatctgcacaagaacactttatactagcctccctctg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  3439369 tcaaatctgcacaagaacactttatactagtcttcctctg 3439330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 590 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 11383440 - 11383406
Alignment:
Q  590 aaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatt 624  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11383440 aaatcgtgccacgatgccaaaatcgtgtcacgatt 11383406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 130 - 248
Target Start/End: Original strand, 11712024 - 11712145
Alignment:
Q  130 tgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagctt-gacaagtt 226  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||  |||| |||||||||||||| ||||| ||   |||| |||| |||| |||| ||||||||||||||  ||||| |    
T  11712024 tgacctactttgagggagagattgatctcttcaatccactatcaatgagttatttacaaagagatataaaagggtttcaagaaattagcttcaacaagct 11712123  T
Q  227 cacaatgaacaaaccctaattt 248  Q
    | ||| ||||||| ||||||||    
T  11712124 ctcaaggaacaaaacctaattt 11712145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 340; Significance: 0; HSPs: 114)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 668
Target Start/End: Original strand, 32060216 - 32060889
Alignment:
Q  1 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaataca-caatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa-aagcacca 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  || |||||||||||||||    |||||||||||||||||| || ||| |    
T  32060216 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagggaagaagaaaacaataaacac-a 32060314  T
Q  99 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaa--gggat 193  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||    
T  32060315 aagagattgttcaccaagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaaggggat 32060414  T
Q  194 acaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctc 293  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  32060415 acaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctt 32060514  T
Q  294 tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaagnnnnnnnnnnnnn 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||                 
T  32060515 tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagctt-accctttgatttcccaagtctctctcttcca 32060613  T
Q  394 nnnnnnnnnnntcaaatctgcacaagaacacttta-tactagcctccctctgaagcaatcacgtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtcct 492  Q
               |||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||   |||||  |||||||||||||| |  ||||||| | ||||||||||    
T  32060614 acctcttcccttcaaatctgcacaagaacacttaagtactagtcttcctctgttccaatcgtgtcacgatttgcgtccgtcccaaggaacgaccagtcct 32060713  T
Q  493 tatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacga-tttcccaaatcgtgtcacgattttgca-ccctgcaa-tctagctcacggcaccccg 589  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||  |||    
T  32060714 tatcaaggatacttaacgagcaagtttcttgatcgtgtcacgattttcccaaatcgtgccacga-tttgcacccctgcaaccctagctcacggca-tccg 32060811  T
Q  590 aaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaacaa 668  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32060812 aaatcgtgtcacgataccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagac-aatctcaacaa 32060889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 20344158 - 20343789
Alignment:
Q  12 cacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttca 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20344158 cacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaaaacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttca 20344059  T
Q  112 cccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaaga 209  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20344058 cccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaaga 20343960  T
Q  210 aattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttccca 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  20343959 aattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccca 20343860  T
Q  310 tgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  20343859 tgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgctccctttgattccccaag 20343789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 380
Target Start/End: Original strand, 18392090 - 18392470
Alignment:
Q  1 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaataca-caatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa-aagcacca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |    
T  18392090 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaacac-a 18392188  T
Q  99 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatac 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  18392189 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac 18392288  T
Q  196 aaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctcta 295  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  18392289 aagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctctcta 18392386  T
Q  296 caaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  18392387 caaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc-ccctttgatttcccaag 18392470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 380
Target Start/End: Original strand, 18388654 - 18389034
Alignment:
Q  1 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaataca-caatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa-aagcacca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||| |    
T  18388654 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaaagagagggaagaagaaaacaataaacac-a 18388752  T
Q  99 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatac 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  18388753 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac 18388852  T
Q  196 aaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctcta 295  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  18388853 aagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctctcta 18388950  T
Q  296 caaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  18388951 caaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc-ccctttgatttcccaag 18389034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 40 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 24790075 - 24789733
Alignment:
Q  40 agaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaag-caccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctact 138  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24790075 agaaacacaatgcacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaaacaaagacaccaa-gagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctact 24789977  T
Q  139 ctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaac 236  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24789976 ctggaggagagatagtactctccaatccactatcaaagagtttttacaaaagggatacaaaatgttacaagaaattagctttgacaagttcacaatgaac 24789877  T
Q  237 aaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaat 336  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24789876 aaaccctaatttttacccttttcccaatcttaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaat 24789777  T
Q  337 caaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24789776 caaagaaccctaaaccctagagttgctccctttgatttcccaag 24789733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 262; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 380
Target Start/End: Original strand, 6594452 - 6594832
Alignment:
Q  1 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaataca-caatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa-aagcacca 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  || |||||||||||||||    |||||||||||||||||| || ||| |    
T  6594452 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagggaagaagaaaacaataaacac-a 6594550  T
Q  99 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatac 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  6594551 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac 6594650  T
Q  196 aaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctcta 295  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  6594651 aagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctctcta 6594748  T
Q  296 caaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  6594749 caaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc-ccctttgatttcccaag 6594832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 380
Target Start/End: Original strand, 6592234 - 6592614
Alignment:
Q  1 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaataca-caatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa-aagcacca 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  || ||||||||||| |||    |||||||||||||||||| || ||| |    
T  6592234 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagaaaaacaaggagggaagaagaaaacaataaacac-a 6592332  T
Q  99 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatac 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  6592333 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac 6592432  T
Q  196 aaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctcta 295  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  6592433 aagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccatttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctctcta 6592530  T
Q  296 caaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  6592531 caaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc-ccctttgatttcccaag 6592614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 7 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 39731635 - 39731261
Alignment:
Q  7 aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagat 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||  |    
T  39731635 aacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaaccacaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaaga--t 39731538  T
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  39731537 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagagtt 39731438  T
Q  204 acaagaaattagct-tgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtg 302  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  39731437 acaagaaattagatctgacaagttcacaaagaacaa-ccctaatttctaccctttttccaatctcaccaagacactcaatgattttcactcaccaaggtg 39731339  T
Q  303 tttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    ||| | ||||||  ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39731338 tttacaatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-accctaaaccctagagttactccctttgatttcccaag 39731261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 15 - 380
Target Start/End: Original strand, 43504063 - 43504431
Alignment:
Q  15 ctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacc 113  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||| || || || |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  43504063 ctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcataaaacacaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaa-gagattgttcacc 43504161  T
Q  114 cagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaagg--ttacaagaa 210  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||    
T  43504162 cagttcgatccaaacttgacctactatggaggagagattgaactctccaattcactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaagagttacaagaa 43504261  T
Q  211 attagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttccca 309  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43504262 attagatttgacaagttcacaatgaacaa-ccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcgatgattttctctcttcaaggtgtttccca 43504360  T
Q  310 tgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |||||  ||| ||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43504361 tgtttcccaagccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 43504431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 455 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 24789639 - 24789426
Alignment:
Q  455 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcac 553  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  24789639 gtcaagatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccac 24789540  T
Q  554 gattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaa 653  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24789539 gatttggcaccctgcaaactagctcacggcaccacgaaatcgtgtcacgatgccaaattcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaa 24789440  T
Q  654 gacaaatctcaaca 667  Q
    ||||||||||||||    
T  24789439 gacaaatctcaaca 24789426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 405 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 20343762 - 20343500
Alignment:
Q  405 tcaaatctgcacaagaacactttatactagcctccctctgaagcaatcacgtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatac 504  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  | ||||  |||||||| ||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  20343762 tcaaatctgcacaagaacactttatactagtcttcctctgttgaaatcgtgtcacgatctgcgtaccacccaagaaacgaccagtccttatcaaggatac 20343663  T
Q  505 ttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttccca-aatcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacga 603  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20343662 ttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccacaatcgtgacacgattttgcatccggcaacctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacga 20343563  T
Q  604 tgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 667  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20343562 tgccacaatcgcgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagac-aatctcaaca 20343500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 7 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 35854180 - 35853804
Alignment:
Q  7 aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagat 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| || || || |||||| |||||||||||||| ||| |||||   |||||||  |||||| |||||    
T  35854180 aacagcacctagatctaatctaggaagcaaagtgaaaagcataaaacacaagcacaagataaaagg-gagagaagagagaaacaaacacaccaa-gagat 35854083  T
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggtt 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  35854082 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagggtt 35853984  T
Q  204 acaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctct 294  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||     
T  35853983 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 35853885  T
Q  295 acaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcc 376  Q
     |||||||||| | ||||||  |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||||    
T  35853884 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actcaaatcaaag-accctaaaccctaaagttgctacctttgatttcc 35853804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 202 - 380
Target Start/End: Original strand, 1562103 - 1562278
Alignment:
Q  202 ttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggt 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  1562103 ttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctctctacaaggt 1562200  T
Q  302 gtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  1562201 gtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc-ccctttgattccccaag 1562278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 455 - 654
Target Start/End: Original strand, 2058393 - 2058592
Alignment:
Q  455 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcac 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  2058393 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccac 2058492  T
Q  554 gattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaa 653  Q
    ||||| ||  ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2058493 gatttggcgtcctgcaaactagctcacggcacctc-aaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaa 2058591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 413 - 654
Target Start/End: Original strand, 21640167 - 21640411
Alignment:
Q  413 gcacaagaacac--tttatactagcctccctctgaagcaatcacgtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacg 510  Q
    ||||||||||||  | |||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||| |   |||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  21640167 gcacaagaacacaatatatactagtctccttctgaagcaatcgtgtcacgatttgcgtccgttccaaggcatgaccagtccttatcagtgatacttaatg 21640266  T
Q  511 agcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaa 609  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21640267 agcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgtcacgatttggcgtcctgcaaactagctcacggcacctcgaaatcgtgtcacgatgccaa 21640366  T
Q  610 aatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21640367 aatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaag 21640411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 455 - 667
Target Start/End: Original strand, 18392568 - 18392780
Alignment:
Q  455 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacga-tttcccaaatcgtgtcac 553  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18392568 gtcacgatttgcgtccgtcccaaggaacgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgattttcccaaatcgtgtcac 18392667  T
Q  554 gattttgcaccctgcaa-tctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttga 652  Q
    || ||||||||||||||  ||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18392668 gaatttgcaccctgcaaccctagctcacggcacctc-caatcgtgtcacgattccaaaatcgtggcacgatttccctgttcttccaaaccacaaatttga 18392766  T
Q  653 agacaaatctcaaca 667  Q
    |||| ||||||||||    
T  18392767 agac-aatctcaaca 18392780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 7 - 380
Target Start/End: Original strand, 25766861 - 25767237
Alignment:
Q  7 aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaa-gataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagaga 104  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||  ||||| || || ||||||||| ||| ||| |   |||||||  |||||| ||||    
T  25766861 aacagcacctagatctaatctaggtatcaaagtgaaaaacacaaatcacaagcaaaaagataaaagg-gagagaatagagaaacaaacacaccaa-gaga 25766958  T
Q  105 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaagg-- 201  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||      
T  25766959 ttgttcacccagttcggtctaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt-caaaagagatacaaaagggg 25767057  T
Q  202 ttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttc-ccaatctcac----caagacactcaatgattttctctcta 295  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||     |||||||||||||||||||| |||      
T  25767058 ttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaa-ccctaatttctacccttttttccaatctcaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 25767156  T
Q  296 caaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |||||||||| | |||||| | |   |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  25767157 caaggtgtttacaatgtttccca---aagagaaactctaatcaaaga-ccctaaaccctagagttgctccctttgatttctcaag 25767237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 413 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 20357284 - 20357040
Alignment:
Q  413 gcacaagaacac--tttatactagcctccctctgaagcaatcacgtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacg 510  Q
    ||||||||||||  | |||||||| || ||||||||||||||  | ||||||||||||   ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20357284 gcacaagaacacaatatatactagtcttcctctgaagcaatcgtgccacgatttgcgtctgacccaaggtttgaccggtccttatcaaggatacttaacg 20357185  T
Q  511 agcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaa 609  Q
    ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  20357184 agcaagtttctgaatcatgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaaactagctcacggcaccttgaaatcgtgtcacgatgccaa 20357085  T
Q  610 aatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20357084 aatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaag 20357040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 7 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 48409071 - 48408687
Alignment:
Q  7 aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaa-gataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagaga 104  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||| |||| || |||||  ||||| || || ||||||||| ||| |||||   |||||||  |||||| || |    
T  48409071 aacagcacctagatctaatctaggtatcaaagtgaaaagcacaaatcacaagcaaaaagataaaagg-gagagaagagagaaacaaacacaccaa-gaaa 48408974  T
Q  105 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa--gg 201  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||  ||    
T  48408973 ttgttcacccagttcggtctaaacttgacatactctggaggagagattaaactctccaatccactatcaatgagttatttcaaaagagatacaaaagggg 48408874  T
Q  202 ttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctct 292  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||||| ||    
T  48408873 ttacaagaaattagctttgacaagtttacaaagaac-aacattaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 48408775  T
Q  293 ctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48408774 caccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaaactctaatcaaag-accctaaaccctagagttgctccctttgatttcccaag 48408687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 7 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 29991317 - 29990940
Alignment:
Q  7 aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagat 105  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| ||| | || || |||||  ||||| || |||||||||||||||  ||||   |||||||  |||||||||  |    
T  29991317 aacaacacctagatctaatataggaatcaaagagaaaagcacaaaccacaagcaaaagataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaaaga--t 29991222  T
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggtt 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||  |||| ||||||||| ||||    
T  29991221 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttatta-gaaagagatacaaaagggtt 29991123  T
Q  204 acaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctcta 295  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||      
T  29991122 acaagaaattagctttgacaagttcacaaataac-aaccctaatttctatccttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 29991024  T
Q  296 caaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt-tctccctttgatttcccaag 380  Q
    |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  29991023 caaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagttgtct-cctttgatttcccaag 29990940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 1560559 - 1560757
Alignment:
Q  1 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatac-acaatcacaagataa--aaggagagggaagaagaaaacaaaagcacc 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  | |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  1560559 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacacc 1560658  T
Q  98 aaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatac 195  Q
     ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1560659 -aagagattggttacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac 1560757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 455 - 667
Target Start/End: Original strand, 6592709 - 6592921
Alignment:
Q  455 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgattt-cccaaatcgtgtcac 553  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  6592709 gtcacgatttgcgtccgtcccaaggaacgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttctggatcgtgtcacgattttcccaaatcgtgccac 6592808  T
Q  554 gattttgcaccc-tgcaatc-tagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttg 651  Q
    ||||| |||||| ||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6592809 gattt-gcacccctgcaaccctagctcacggcatcc-gaaatcgtgtcacgatcccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttg 6592906  T
Q  652 aagacaaatctcaaca 667  Q
    ||||| ||||||||||    
T  6592907 aagac-aatctcaaca 6592921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 473 - 667
Target Start/End: Original strand, 21646448 - 21646643
Alignment:
Q  473 cccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaat 571  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||     
T  21646448 cccaaggtatgaccagttcttatcaaggatacttaacgagcaagtttgaaaatcgtgtcacgattttccaagatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaa 21646547  T
Q  572 ctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 667  Q
    | ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  21646548 ccagctcacggcatcacgaaatcgtgtcacgatgccaaatttgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaagccaaatgtcaaca 21646643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 473 - 667
Target Start/End: Original strand, 43504526 - 43504721
Alignment:
Q  473 cccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaat 571  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||     
T  43504526 cccaaggtacgaccagtccttatcatggaaacttaacgagcaagtttgcaaatcgtgtcacgatttcccacgatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaa 43504625  T
Q  572 ctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 667  Q
    | ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  43504626 ccagctcacggcatcacgaaatcgtgtcacgatgccaaattcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagctaaatctcaaca 43504721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 455 - 668
Target Start/End: Original strand, 6594925 - 6595138
Alignment:
Q  455 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgattt-cccaaatcgtgtcac 553  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  6594925 gtcacgatttgcgtccgtcccaaggaacgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttctggatcgtgtcacgattttcccaaatcgtgccac 6595024  T
Q  554 gattttgcaccc-tgcaatc-tagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttg 651  Q
    ||||| |||||| ||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6595025 gattt-gcacccctgcaaccctagctcacggcatcc-gaaatcgtgtcacgatcccaaaatcgtgtcacgatttccctgtttttccagaccacaaatttg 6595122  T
Q  652 aagacaaatctcaacaa 668  Q
    ||||| |||||||||||    
T  6595123 aagac-aatctcaacaa 6595138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 473 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 39731128 - 39730933
Alignment:
Q  473 cccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaat 571  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||||||     
T  39731128 cccaaggtacgaccagtccttatcatggaaacttaacgagcaagtttgcaaatcgtgtcacgattcctcaagatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaa 39731029  T
Q  572 ctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 667  Q
    | ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39731028 ccagctcacggcatcacaaaatcgtgtcacgatgccaaattcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaaatctcaaca 39730933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 7 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 23555305 - 23554925
Alignment:
Q  7 aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagaga 104  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||| |||| || |||||||||||||||  ||||   |||||||  || ||||||      
T  23555305 aacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtaaaaaacacaataccacaagcaaaagataaaaggagag--aagagagaaacaaacacatcaaaga-- 23555210  T
Q  105 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gt 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||| ||    
T  23555209 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagaggtacaaaagtgt 23555111  T
Q  203 tacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc--cttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctct 292  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||       |||||||||||||||||||| ||    
T  23555110 tacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 23555012  T
Q  293 ctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |  |||||||||| | ||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||  |||| |  ||||||||||||||||    
T  23555011 caccaaggtgtttacaatgtttcccaactcaagaga-actctaatcaaag-accttcaaccctgaagttacctcctttgatttcccaag 23554925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 475 - 667
Target Start/End: Original strand, 18409206 - 18409399
Alignment:
Q  475 caaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatct 573  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |     
T  18409206 caaggtacgaccagtccttatcatggaaacttaacaagcaagtttgagaatcgtgtcacgatttctcaagatcgtgtcatgatttggcaccctgcaaacc 18409305  T
Q  574 agctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 667  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  18409306 agctcacggcaccacaaaatcgtgtcacgatgccaaattcgtgttacgatttctctgttcttccagaacacaaatttgaagccaaatctcaaca 18409399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 475 - 667
Target Start/End: Original strand, 18414082 - 18414275
Alignment:
Q  475 caaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatct 573  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| |     
T  18414082 caaggtacgaccagtccttatcatggaaacttaacaagcaagtttgagaatcgtgttacgatttcccaagatcgtgtcacgatttggcgccctgcaaacc 18414181  T
Q  574 agctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 667  Q
    ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  18414182 agctcacggcaccacaaaatcgtgccacgatgccaaattcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccataaatttgaagccaaatctcaaca 18414275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 7 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 4179037 - 4178660
Alignment:
Q  7 aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagat 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||  ||||| || || ||||||||||||  ||||   |||||||  |||||||||  |    
T  4179037 aacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaacacaaaccacaagcaaaatataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaaaga--t 4178942  T
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggtt 203  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||   |||| ||||||||| ||||    
T  4178941 tgttcacctagtttggttcaaacttgacctgctctggaggagagattgaactgttcaatccactatcaatgagttctt--caaagagatacaaaagggtt 4178844  T
Q  204 acaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctct 294  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||     
T  4178843 acaagaaattagctttcccaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 4178745  T
Q  295 acaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
     |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||    
T  4178744 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagttgcttcctttgatttctcaag 4178660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 475 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 48408591 - 48408397
Alignment:
Q  475 caaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatct 573  Q
    ||||||| ||||||||||||||   || |||||||||||||||||    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| |     
T  48408591 caaggtacgaccagtccttatcctagaaacttaacgagcaagtttgcaaatcgtgtcacgatttctcaagatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaacc 48408492  T
Q  574 agctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaacaa 668  Q
    ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48408491 agctcacggcatcacaaaatcgtgtcacgatgccaaattcgtgtcacgatttctctgttctttcagaccacaaatttgaagccaaatctcaacaa 48408397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 455 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 1533116 - 1532947
Alignment:
Q  455 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcac 553  Q
    ||||||||||| |||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1533116 gtcacgatttgtgtatgtcccaaggtataaccagtccttatcaaggatacttaacgagtaagtttcacaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgtcac 1533017  T
Q  554 gattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgat 623  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1533016 gatttggcaccctgcaaactagctcatggcacctcaaaatcatgtcacgatgccaaattcgtgtcacgat 1532947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 25616119 - 25615785
Alignment:
Q  7 aacaccacctagatctaatctaggaaac-aagtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagaga 104  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||| || |||| |||||||||||  |||| | ||||   |||||||  |||||||||      
T  25616119 aacaacacctagatctaatctaggaatcgaagtgaaaagcacaaaaccacaagcacaagataaagagagaag-aagagagaaacaaacacaccaaaga-- 25616023  T
Q  105 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggt 202  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||  |||    
T  25616022 ttgttcgcccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttcttacaaaa-tgatacaaatgggt 25615924  T
Q  203 tacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctc-tacaag 299  Q
    ||||||||||||||||  |||||  ||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  25615923 tacaagaaattagcttaaacaagcgcacatagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatct---caagacactcaatgattttctctcacccaag 25615828  T
Q  300 gtgtttcccatgtttt-caacccaagagatactctaatcaaaga 342  Q
    |||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  25615827 gtgtttacaatgttttccaacccaagaga-actctaatcaaaga 25615785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 472 - 654
Target Start/End: Original strand, 12406663 - 12406845
Alignment:
Q  472 acccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaa 570  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||  | |||||    
T  12406663 acccaaggta-gacaagtccttatcagtgatacttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcttgcaa 12406761  T
Q  571 tctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
     ||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12406762 actagctcacggccacttgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaag 12406845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 455 - 671
Target Start/End: Original strand, 1562375 - 1562591
Alignment:
Q  455 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaaa-tcgtgtcac 553  Q
    |||||||||||||| |  | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||    
T  1562375 gtcacgatttgcgtccgtcacaaggaacgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttaccaaaatcgtgacac 1562474  T
Q  554 gattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaa 653  Q
    |||||   ||||   || | |    |  | | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1562475 gatttaaaacccaaaaaacaaaaaaaaagaaacacgaaatcgtgtcacgataccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaa 1562574  T
Q  654 gacaaatctcaacaataa 671  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  1562575 gac-aatctcaacaataa 1562591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 102 - 272
Target Start/End: Original strand, 34310712 - 34310884
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |    
T  34310712 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaa-agatacaaatg 34310810  T
Q  201 -gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 272  Q
     ||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34310811 tgttacaagaaattagcttcaacaatttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 34310884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 482 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 21811924 - 21811745
Alignment:
Q  482 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatc-tagctca 579  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| | | |||||    
T  21811924 tgaccagtccttatcagagatacttaactagcaagtttctggatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcaccctgcaaacattgctca 21811825  T
Q  580 cggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaat 660  Q
    ||||| | | | |||||||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21811824 cggcatctc-agatcgtgtcacgatggcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaaat 21811745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 102 - 380
Target Start/End: Original strand, 14069830 - 14070116
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 199  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||      
T  14069830 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatcttggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 14069927  T
Q  200 ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 290  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||     
T  14069928 ggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 14070026  T
Q  291 ctc-tacaaggtgtttcccatgtt-ttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |||   |||||||||| | |||||   |||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  14070027 ctcacccaaggtgtttacaatgttacccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcagccctaaagttacctcctttgatttcccaag 14070116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 102 - 380
Target Start/End: Original strand, 14379858 - 14380144
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 199  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||      
T  14379858 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctaggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 14379955  T
Q  200 ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 290  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||     
T  14379956 ggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 14380054  T
Q  291 ctc-tacaaggtgtttcccatgtt-ttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |||   |||||||||| | |||||   |||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  14380055 ctcacccaaggtgtttacaatgttacccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcagccctaaagttacctcctttgatttcccaag 14380144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 482 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 24024004 - 24023831
Alignment:
Q  482 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcac 580  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||  ||||||| ||||||| |    
T  24024004 tgaccagtccttatcagtgatacttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaaactagctctc 24023905  T
Q  581 ggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
     ||  |  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24023904 tgccacttgaaatcgtgccacgatgccacaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaag 24023831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 487 - 654
Target Start/End: Original strand, 4873541 - 4873709
Alignment:
Q  487 agtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcac 585  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||  ||||||| ||| || |||||      
T  4873541 agtccttatcagtgatacttaacgagcaagtttctgaattgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaaactatcttacggcca 4873640  T
Q  586 cccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4873641 cttgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaag 4873709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 19502443 - 19502083
Alignment:
Q  7 aacaccacctagatctaatctaggaaac-aagtgagaaacacaata-cacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagaga 104  Q
    |||| |||||||||||||||||| || | |||||| |||| ||| | ||||| ||||| ||||| |||||  |||||   |||||||  ||||||  |||    
T  19502443 aacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaaactcaaaaccacaagcacaaaataaagggaga--gaagagagaaacaaacacaccaa--aga 19502348  T
Q  105 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gt 202  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||    
T  19502347 ttgttcacccacttcgttccaaacttgacttactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagagt 19502249  T
Q  203 tacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctct 292  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||  ||| |||| ||||||||| ||  ||||| |||||||||       ||||||||||||||||| || ||    
T  19502248 tacaagaaattagctttgacaagctcacaaaaaac-aaccttaatttctaaccttttttcgcaatctcaccactgaacaagacactcaatgattctcact 19502150  T
Q  293 ctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt 360  Q
    |  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  19502149 caccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagtt 19502083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 503 - 670
Target Start/End: Original strand, 25767381 - 25767543
Alignment:
Q  503 acttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaaa-tcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcac 601  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  25767381 acttaacgagcaagtttgaaaatcgtgtcacgatttcccaaaatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaaccagctcacggcatcacgaaatcgtgtcac 25767480  T
Q  602 gatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaacaata 670  Q
    ||||||||| | |||||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  25767481 gatgccaaatttgtgtcacgatttc------tttccagaccacaaatttgaagccaaatatcaacaata 25767543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 102 - 380
Target Start/End: Original strand, 30024729 - 30025015
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 199  Q
    |||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||      
T  30024729 agattgttgatccagttcggtccaa-cttgacctactctgggggagtgattgatctctccaatccactatcaaagagttcttac-aaagagatacaaatg 30024826  T
Q  200 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 290  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||       ||||||||||||||||||||     
T  30024827 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 30024925  T
Q  291 ctc-tacaaggtgtttcccatg-ttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |||   |||||||||| | | | ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  30024926 ctcacccaaggtgtttacaacgtttttcaacctaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaag 30025015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 455 - 568
Target Start/End: Original strand, 18389132 - 18389246
Alignment:
Q  455 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacga-tttcccaaatcgtgtcac 553  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18389132 gtcacgatttgcgtccgtcccaaggaacgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgattttcccaaatcgtgtcac 18389231  T
Q  554 gattttgcaccctgc 568  Q
    || ||||||||||||    
T  18389232 gaatttgcaccctgc 18389246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 106 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 22270140 - 22269973
Alignment:
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 203  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  22270140 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatcagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 22270043  T
Q  204 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 272  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22270042 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 22269973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 102 - 272
Target Start/End: Original strand, 41317431 - 41317602
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 200  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |    
T  41317431 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagggatacaaatg 41317528  T
Q  201 g-ttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 272  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  41317529 gattacaagaaattagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaa 41317602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 114 - 342
Target Start/End: Original strand, 47673953 - 47674189
Alignment:
Q  114 cagttcggtccaaacttgacctactctgaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaat 212  Q
    ||||||||||||| |||||| || | || ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||    
T  47673953 cagttcggtccaa-cttgacttaatatggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaat 47674050  T
Q  213 tagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctc-tacaaggtg 302  Q
    ||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||       |||||||||||||||||||| |||   |||||||    
T  47674051 tagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtg 47674149  T
Q  303 tttcccatgtttt-caacccaagagatactctaatcaaaga 342  Q
    ||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  47674150 tttacaatgttttccaacccaagaga-actctaatcaaaga 47674189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 27348081 - 27347817
Alignment:
Q  7 aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagaga 104  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| || |||| || ||||||||  |||||   ||| |||  ||||  |||||||||      
T  27348081 aacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaacacaaaaccacaagcaaaagataaagtgagagaagagaggaa--caaacacaccaaaga-- 27347986  T
Q  105 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggt 202  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  |||    
T  27347985 ttgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctgcaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggt 27347888  T
Q  203 tacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 272  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27347887 tacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aatcctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 27347817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 106 - 272
Target Start/End: Original strand, 8359316 - 8359485
Alignment:
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa--ggt 202  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||  |||    
T  8359316 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaatgggt 8359414  T
Q  203 tacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 272  Q
    ||||||||||||| ||  ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  8359415 tacaagaaattagtttaaacaagctcacaaagaa-aaaccctaatttctacccattttcccaatctccccaa 8359485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 102 - 380
Target Start/End: Original strand, 41649008 - 41649292
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 199  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | || || ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||      
T  41649008 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagggatacaaatg 41649105  T
Q  200 ggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctc 291  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||       |||||||||||||||||||| |    
T  41649106 ggttacaagaaattagctaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctaccaatttttccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcac 41649204  T
Q  292 tcta--caaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    | ||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||||| ||||    ||||||||||||||||    
T  41649205 t-tacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaataaaaga--ccttaaccctaaagttaactcctttgatttcccaag 41649292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 110 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 6432134 - 6431971
Alignment:
Q  110 cacccagttcggtccaaacttgacctactctga-ggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaa 207  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||||||    
T  6432134 cacccagttcggtccaa-cttgacctactctgaaggagagattgatctctccaatccactatcaacgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaa 6432037  T
Q  208 gaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 272  Q
    |||||||||||  ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  6432036 gaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aatcctaatttctacccattttcccaatctaaccaa 6431971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 102 - 380
Target Start/End: Original strand, 38671219 - 38671505
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 200  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | || || | |||||   |||| |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |    
T  38671219 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctattttgggggatagatttatctcttcaatccactatcaatgagttcttac-aaagtgatacaaatg 38671316  T
Q  201 -gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 290  Q
     ||||||| ||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||     
T  38671317 tgttacaataaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcg 38671415  T
Q  291 ctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  38671416 ctcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaag 38671505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 503 - 667
Target Start/End: Original strand, 47264102 - 47264267
Alignment:
Q  503 acttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttccca-aatcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcac 601  Q
    ||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||  |||||| ||| | |||||||| ||   | ||||||||||||    
T  47264102 acttaaccagcaagtttgaaaatcgtgtcacgatttcacacaattgtgccacgatttgacaccctacaaaccagctcacgacattacaaaatcgtgtcac 47264201  T
Q  602 gatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 667  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  47264202 gatgccaaaatcgtgtcacgatttctctattcttccaaaccacaaatttgaagccaaatttcaaca 47264267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 464 - 667
Target Start/End: Original strand, 2479757 - 2479960
Alignment:
Q  464 tgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaaa-tcgtgtcacgattttgca 562  Q
    ||||||| |||||||||| |||||  |||||||  | | ||||||| | ||||||| |  ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||  ||    
T  2479757 tgcgtacgacccaaggtacgaccaa-ccttatcctgaaaacttaaccaacaagtttgaaaatcgtgtaacgatttcacaaaatcgtgacacgatttgaca 2479855  T
Q  563 ccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatct 662  Q
    |||||||| | |||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||| |    
T  2479856 ccctgcaaaccagctcacggcattagaaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacaatttctctgttcttacaaaccacaaatttgaagccaaattt 2479955  T
Q  663 caaca 667  Q
    |||||    
T  2479956 caaca 2479960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 108 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 29608902 - 29608737
Alignment:
Q  108 ttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttac 205  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||   |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| | |||||    
T  29608902 ttcactcagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagtgattgatatctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagttac 29608805  T
Q  206 aagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 272  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29608804 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 29608737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 18126910 - 18126529
Alignment:
Q  7 aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagaga 104  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||| || |||| || |||||||| ||||||  || |    ||||||  |||||||||      
T  18126910 aacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaaaatagaggaacaaacacaccaaaga-- 18126813  T
Q  105 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggt 202  Q
    ||||| |||||| |||||| |||||||||||| |||| || ||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  |||    
T  18126812 ttgttgacccaggtcggtc-aaacttgacctagtctgggggagagattgattcctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggt 18126715  T
Q  203 tacaagaaattagcttg-acaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctc 293  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||||       ||| |||||||||||||||| |||    
T  18126714 tacaagaaattagcttgaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacacatttttccaatctcaccaatgaacaaaacactcaatgattttcactc 18126616  T
Q  294 -tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
       |||| ||||| | ||||||  ||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  18126615 acccaagttgtttacaatgtttcccaacccatgaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaag 18126529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 99 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 26417489 - 26417201
Alignment:
Q  99 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa 198  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||  ||||||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  26417489 aagaaattgttgacccagtttggtccaat-ttgacctaacctggggagagattgatctctccaatccactatcaacgagttcttac-aaagagatacaaa 26417392  T
Q  199 -aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgatttt 288  Q
      ||||||||||||||| |||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||||    
T  26417391 tgggttacaagaaattatcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgatttt 26417293  T
Q  289 ctctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    | | |   |||||||||| | ||||||  ||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||| ||||    
T  26417292 cacccgctcaaggtgtttacaatgtttcccaatccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttctcaag 26417201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 104 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 43864413 - 43864129
Alignment:
Q  104 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgag-gagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-agg 201  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||  |||||||||||||||||||  |||| |||| |||| ||||||||  ||    
T  43864413 attgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaattagtttttac-aaagagatacaaatggg 43864316  T
Q  202 ttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctct 292  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||       |||||||||||||||||||| ||    
T  43864315 ttacaggaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccacttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 43864217  T
Q  293 c-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  43864216 cacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actttaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaag 43864129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 126 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 48491727 - 48491470
Alignment:
Q  126 aacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gaca 222  Q
    ||||||||||| |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||    
T  48491727 aacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctttc-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaaca 48491629  T
Q  223 agttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctc-tacaaggtgtttcccatgtt 313  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||   ||| |||||| | |||||    
T  48491628 agttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaagtgtttacaatgtt 48491530  T
Q  314 t-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgattt 374  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||    
T  48491529 tcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgattt 48491470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 487 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 31109251 - 31109082
Alignment:
Q  487 agtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatct-agctcac-ggc 583  Q
    |||||||||||   ||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||  ||||||| || |||| || |||    
T  31109251 agtccttatcagttatacttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaaacttagcttacaggc 31109152  T
Q  584 accccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
    ||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  31109151 actt-gaaatcgtgccacgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaag 31109082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 143 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 4586291 - 4586046
Alignment:
Q  143 ggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaac 240  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||  |||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||| |||    
T  4586291 ggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagataaaaatgggttacaaaaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aac 4586194  T
Q  241 cctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatac 330  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||| | |||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||    
T  4586193 cctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgatttacactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-ac 4586095  T
Q  331 tctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  4586094 tctaatcaaag-agcctcaaccctaaagttacatcctttgatttcccaag 4586046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 102 - 342
Target Start/End: Original strand, 31732966 - 31733215
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 199  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | || || ||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||      
T  31732966 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccagtatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 31733063  T
Q  200 ggttacaagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 290  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||       ||||||||||||||||||||     
T  31733064 ggttacaagaaattagcttcaccaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcagtctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 31733162  T
Q  291 ctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaaga 342  Q
    |||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  31733163 ctcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaaga 31733215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 106 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 3259162 - 3258995
Alignment:
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 203  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||| |||| |||| |||||||| | |||    
T  3259162 tgttcacccagttcggttcaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgggtttttac-aaagagatacaaatgagtt 3259065  T
Q  204 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 272  Q
    |||| ||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3259064 acaataaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctagtttctacccattttcccaatctcaccaa 3258995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 106 - 272
Target Start/End: Original strand, 4508707 - 4508874
Alignment:
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagga-gagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 203  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  4508707 tgttcacccagttcggtccaa-cttaacctactctgaagaagagattgatctctccaatccactctcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 4508804  T
Q  204 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcaccaa 272  Q
    |||||||||||||||  | ||| |||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  4508805 acaagaaattagcttcaataagctcacaaagaac-aaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaa 4508874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 102 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 8153513 - 8153342
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 200  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||| |    
T  8153513 agattgttgacccagttcagtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttattac-aaagagatacaaatg 8153416  T
Q  201 -gttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcaccaa 272  Q
     |||||||||||||||| |||||||  |||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  8153415 agttacaagaaattagctttgacaatctcacaaagaac-aaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaa 8153342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 106 - 218
Target Start/End: Original strand, 32358055 - 32358167
Alignment:
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 203  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  32358055 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 32358152  T
Q  204 acaagaaattagctt 218  Q
    |||||||||||||||    
T  32358153 acaagaaattagctt 32358167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 102 - 380
Target Start/End: Original strand, 47676133 - 47676419
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 199  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||||||||| | || || ||||||||  ||||||| ||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||      
T  47676133 agattgttgatccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccattccactatcattgagttcttac-aaagagatacaaatg 47676230  T
Q  200 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 290  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||       ||||||||||| ||||||||     
T  47676231 ggttacaagaaattagcttcaacaaattcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcattgattttca 47676329  T
Q  291 ctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt-tctccctttgatttcccaag 380  Q
    |||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  47676330 ctcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttatct-cctttgatttcccaag 47676419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 106 - 272
Target Start/End: Original strand, 48599335 - 48599502
Alignment:
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 203  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||| | |||| |||||||| | |||    
T  48599335 tgttcacccagttcggtccaa-cttgatctgctctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagctctt-ccaaagagatacaaatgagtt 48599432  T
Q  204 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 272  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  48599433 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatatcaccaa 48599502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 102 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 1113828 - 1113542
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 199  Q
    |||||||| || || ||||||| |||||||||||| | || || ||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||      
T  1113828 agattgttgactcaattcggtc-aaacttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatctactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 1113731  T
Q  200 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttcta-cccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 290  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||| |||||| |||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||       ||||||||||||||||||||     
T  1113730 ggttataagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctatccattttctcaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttca 1113632  T
Q  291 ctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |||   |||| ||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  1113631 ctcacccaagttgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacttcctttgatttcccaag 1113542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 106 - 272
Target Start/End: Original strand, 4253529 - 4253697
Alignment:
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaagg-tt 203  Q
    |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||  ||||| |||||| |||||| |||||||| | |||| |||| |||||| ||    
T  4253529 tgtttacctagttcggtccaaa-ttgacctactctgtgggagagattgatctctctaatccattatcaatgagttctttccaaagagatataaaagggtt 4253627  T
Q  204 acaagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 272  Q
    ||| ||||||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  4253628 acatgaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttctaccattttaccaatttcaccaa 4253697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 102 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 48489602 - 48489316
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 199  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||  |||||||||||||||| || ||||| || | |||| ||||||||      
T  48489602 agattgtttacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatgaatgagttattgc-aaagagatacaaatg 48489505  T
Q  200 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 290  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||  ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||| | ||||||||||     
T  48489504 ggttacaagaaattagcttcaacaagttttcaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacatttaatgattttca 48489406  T
Q  291 ctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  48489405 ctcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accatcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaag 48489316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 472 - 654
Target Start/End: Original strand, 12397311 - 12397480
Alignment:
Q  472 acccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaaatcgtgtcacgattttgcaccctgcaat 571  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||          |||  ||   |||||||     
T  12397311 acccaaggta-gacaagtccttatcagtgatacttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaa----------gatcatgg--cctgcaaa 12397397  T
Q  572 ctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
    ||||||||||||  |  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12397398 ctagctcacggccacttgaaatcgtgtcacgataccaaaatcgtgtcgcgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaag 12397480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 593 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 1532958 - 1532884
Alignment:
Q  593 tcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 667  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  1532958 tcgtgtcacgatgccaaattcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaaatatcaaca 1532884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 99 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 2390456 - 2390301
Alignment:
Q  99 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaa 197  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||  | ||||| |||| |||| |||||||    
T  2390456 aagagattattcacctagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatatatgagttattac-aaagagatacaa 2390359  T
Q  198 a-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc 254  Q
    |  |||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  2390358 atgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctaccc 2390301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 111 - 272
Target Start/End: Original strand, 2360978 - 2361140
Alignment:
Q  111 acccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaag 208  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||| |||| || ||||||||   |||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| | ||||||||    
T  2360978 acccagttcggttcaa-cttgacctaatctgggggagagattgatatctcaaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagttacaag 2361075  T
Q  209 aaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 272  Q
    ||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2361076 aaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 2361140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 106 - 380
Target Start/End: Original strand, 31105394 - 31105676
Alignment:
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 203  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||   ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||  ||||    
T  31105394 tgtttacccagttcggtccaa-cttgatctactcttggggagagatttatctctccaatccaccatcaatgagttcttacaaaa-agatacaaatgggtt 31105491  T
Q  204 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctc- 293  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| ||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||     
T  31105492 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaa-aaaatctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactca 31105590  T
Q  294 tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
      |||||||||| | |||||| ||| ||||||| | ||| ||||||||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||| ||||    
T  31105591 cccaaggtgtttacaatgtttctcaccccaagata-actataatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttctcaag 31105676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 590 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 44847696 - 44847617
Alignment:
Q  590 aaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaacaat 669  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  44847696 aaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttttaaaccacaaatttgaagccaaatttcaacaat 44847617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 102 - 272
Target Start/End: Original strand, 36146405 - 36146576
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 199  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| | || || ||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||      
T  36146405 agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctcaaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 36146502  T
Q  200 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 272  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36146503 ggttac-agaaattagcttcaacaagctcacaaataacaaactctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 36146576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 102 - 269
Target Start/End: Original strand, 495980 - 496148
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 199  Q
    |||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||| | | ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||      
T  495980 agattgttgacccggttctgtccaa-cttgacctactataggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctta-taaagagatacaaatg 496077  T
Q  200 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 269  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||| |||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  496078 ggttgcaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-taccctaatttctacccattttcccaatctcac 496148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 113 - 253
Target Start/End: Original strand, 23565069 - 23565210
Alignment:
Q  113 ccagttcggtccaaacttgacctactctgag-gagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaa 210  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||  | |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||    
T  23565069 ccagttcagtccaa-cttgacctactctaggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagagttacaagaa 23565166  T
Q  211 attagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc 253  Q
    ||||| ||  ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||    
T  23565167 attagtttcaacaagctcacaaagaacaagacctaatttctacc 23565210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 270 - 380
Target Start/End: Original strand, 24514934 - 24515043
Alignment:
Q  270 caagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttc-aacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctt 368  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||| | |||||| | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||    
T  24514934 caagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaaga-ccctaaaccctaaagttgcttcctt 24515031  T
Q  369 tgatttcccaag 380  Q
    ||||||||||||    
T  24515032 tgatttcccaag 24515043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 482 - 654
Target Start/End: Original strand, 16880475 - 16880648
Alignment:
Q  482 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatcta-gctca 579  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||   |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||  || |||| ||| |||||    
T  16880475 tgaccagtccttatcagagaaacttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacaatttcccaagatcgtgacacgattttgcttccagcaaactaggctca 16880574  T
Q  580 cggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
    | || | ||   |||||||||||||| |||||||||| ||||||| | ||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  16880575 ctgc-ctccctgatcgtgtcacgatggcaaaatcgtgacacgattcctctgctcttccaaaccactaatttgaag 16880648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 482 - 654
Target Start/End: Original strand, 16885330 - 16885503
Alignment:
Q  482 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatcta-gctca 579  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||   |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||  || |||| ||| |||||    
T  16885330 tgaccagtccttatcagagaaacttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacaatttcccaagatcgtgacacgattttgcttccagcaaactaggctca 16885429  T
Q  580 cggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
    | || | ||   |||||||||||||| |||||||||| ||||||| | ||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  16885430 ctgc-ctccctgatcgtgtcacgatggcaaaatcgtgacacgattcctctgctcttccaaaccactaatttgaag 16885503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 116 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 23344130 - 23343975
Alignment:
Q  116 gttcggtccaaacttgacctactctgaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaagg-ttacaagaaatta 214  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    ||||||||| | |||||| ||||||| ||||| |  |||| ||||| |||||||||||||    
T  23344130 gttcggtccaa-cttgacctactctg-ggagagattaatttctccaatctattatcaatgagttctcacaaa-gatatactaaagggttacaagaaatta 23344034  T
Q  215 gcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 272  Q
    |||| | |||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23344033 gcttcaacaagctcacaaagaataaaccttaatttctacccttttccaaatctcaccaa 23343975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 482 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 24265862 - 24265689
Alignment:
Q  482 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatc-tagctca 579  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  || |||| | |||||||    
T  24265862 tgaccagtccttatcagagatacttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttagctca 24265763  T
Q  580 cggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
    | || | ||   ||||||||||||   |||||||||| ||||||| | ||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  24265762 ctgc-ctccctgatcgtgtcacgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttctcccaaaccactaatttgaag 24265689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 482 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 24261006 - 24260926
Alignment:
Q  482 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgc 561  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24261006 tgaccagtccttatcagagatacttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgtcacgattttgc 24260926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 247
Target Start/End: Original strand, 2759195 - 2759339
Alignment:
Q  103 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagga-gagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag- 200  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||   |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||| |     
T  2759195 gattgttgaccaagttcggtccaa-cttgacctaatctggggaagagattgatatctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatataaatga 2759292  T
Q  201 gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatt 247  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  2759293 gttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatt 2759339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 106 - 272
Target Start/End: Original strand, 4510549 - 4510716
Alignment:
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 203  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||   ||| |||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||  ||||    
T  4510549 tgttcacccagtacggtccaa-cttgacctactctacaggagagattgatttcttcaatccactatcaatgagttctta-taaagagatacaaatgggtt 4510646  T
Q  204 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 272  Q
    |||||||||||||||  | ||  |||||| |||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  4510647 acaagaaattagcttcaataaactcacaaagaac-aaccttaatttctacccattttccaaatctcaccaa 4510716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 106 - 272
Target Start/End: Original strand, 4512391 - 4512558
Alignment:
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 203  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||   ||| |||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||  ||||    
T  4512391 tgttcacccagtacggtccaa-cttgacctactctacaggagagattgatttcttcaatccactatcaatgagttctta-taaagagatacaaatgggtt 4512488  T
Q  204 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 272  Q
    |||||||||||||||  | ||  |||||| |||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  4512489 acaagaaattagcttcaataaactcacaaagaac-aaccttaatttctacccattttccaaatctcaccaa 4512558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 561 - 667
Target Start/End: Original strand, 21983761 - 21983867
Alignment:
Q  561 caccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaat 660  Q
    |||||||||| | |||||||| ||   | ||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |    
T  21983761 caccctgcaaaccagctcacgacattgcaaaatcgtgtcacgatgatgaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaagccaatt 21983860  T
Q  661 ctcaaca 667  Q
     ||||||    
T  21983861 ttcaaca 21983867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 111 - 267
Target Start/End: Original strand, 22328395 - 22328556
Alignment:
Q  111 acccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaag 208  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||| | ||||||||||  ||||| |||||||||| || || ||| |   |||| |||||||||| ||||||||    
T  22328395 acccagttcggtccaacaatgacctactctaggggagagattgatctctcaaatccactattaatgacttccttgcaaagagatacaaaagagttacaag 22328494  T
Q  209 aaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccctt--ttcccaatctc 267  Q
    ||||||||||  ||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||    
T  22328495 aaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaactctaatttctaacctttcttcccaatctc 22328556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 524 - 668
Target Start/End: Original strand, 21989388 - 21989532
Alignment:
Q  524 atcgtgtcacgatttcccaaatcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgat 623  Q
    ||||||||||| ||  | |||||||| |||||||   | |||||||| | |||||||| ||   | ||||||||||||||||   ||||| |||||||||    
T  21989388 atcgtgtcacgtttcacaaaatcgtgccacgattggtcgccctgcaaaccagctcacgacattgcaaaatcgtgtcacgatgatgaaatcttgtcacgat 21989487  T
Q  624 ttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaacaa 668  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||    
T  21989488 ttctctgttcttccaaaccacaaatttgaagccaactttcaacaa 21989532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 272
Target Start/End: Original strand, 36574517 - 36574683
Alignment:
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggtta 204  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||  |||  |||||  |||||||| |||||||||| ||||||||   |||| |||| |||| |||||    
T  36574517 tgtttacccagtttggtccaaa-ttgacctactctagggatggattgatctctccaaaccactatcaatgagttctttacaaagagatataaaagggtta 36574615  T
Q  205 caagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 272  Q
    ||||||||||||||  ||||  |||||| ||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  36574616 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaatcttaatttcta-cctttccccaatctctccaa 36574683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 218
Target Start/End: Original strand, 6359946 - 6360065
Alignment:
Q  99 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagga-gagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaa 197  Q
    |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||| | || ||| |||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  6359946 aagaaattgttgacccagttcgatccaa-cttgacctaatatggggaagagattgatctctccaatcaactatcaatgagttcttac-aaagagatacaa 6360043  T
Q  198 a-aggttacaagaaattagctt 218  Q
    |  |||||||||||||||||||    
T  6360044 atgggttacaagaaattagctt 6360065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 272
Target Start/End: Original strand, 24525992 - 24526065
Alignment:
Q  201 gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 272  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  24525992 gttacaagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaaacctaatttctacccattttcccaatttcaccaa 24526065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 24790274 - 24790230
Alignment:
Q  1 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaac 45  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24790274 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaggtgagaaac 24790230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 18396486 - 18396384
Alignment:
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggtta 204  Q
    |||| |||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || |||||   |||| ||||||||| ||||    
T  18396486 tgtttacccagttcggtccaccattgacctactcttgaggagagattgatctctccaatcctctatcaatgaattctttataaagagatacaaaatgtta 18396387  T
Q  205 caa 207  Q
    |||    
T  18396386 caa 18396384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 187
Target Start/End: Original strand, 24525499 - 24525584
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaa 187  Q
    ||||| || ||||||||| |||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24525499 agattattgacccagttccgtccaa-cttgacctaatcttggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaa 24525584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 102 - 272
Target Start/End: Original strand, 12097864 - 12098027
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 200  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||   ||||||||||||||| |||||||||        || |||||||| |    
T  12097864 agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattcatctctccaatccacta-caaagagtt--------agagatacaaatg 12097953  T
Q  201 g-ttacaagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 272  Q
    | ||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  12097954 ggttacaagaaattaacttcaacaagctcacaatgaacaa-ccctaatttctacccattttcccaatctaaccaa 12098027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 610 - 667
Target Start/End: Original strand, 18390506 - 18390562
Alignment:
Q  610 aatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 667  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18390506 aatcgtggcacgatttccctgttcttctaaaccacaaatttgaagac-aatctcaaca 18390562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 113 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 31519063 - 31518988
Alignment:
Q  113 ccagttcggtccaaacttgacctactctgaggagaga--ttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaa 187  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||  |||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  31519063 ccagttcggtccaa-cttgacctactctggggagagagattgatctctccaatccactgtcaatgagttcttacaaa 31518988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 592 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 24260895 - 24260833
Alignment:
Q  592 atcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
    |||||||||||||| | |||||||| ||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  24260895 atcgtgtcacgatggccaaatcgtgacacgattcctctgttctcccaaaccacaaatttgaag 24260833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 609 - 654
Target Start/End: Original strand, 79955 - 80000
Alignment:
Q  609 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  79955 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaatcacaaatttgaag 80000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 104 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 30814605 - 30814530
Alignment:
Q  104 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagtt 179  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||| | || || ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  30814605 attgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt 30814530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 163 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 31518905 - 31518795
Alignment:
Q  163 tccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagcttgac-aagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttc 259  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||| |||||| |  ||| |||||| ||||||||| |||||||||||  |||||    
T  31518905 tccactgtcaatgagttcttacaaa-gagatacaaatgagttacaagaaactagcttcaataagctcacaaagaacaaacc-taatttctacctattttc 31518808  T
Q  260 ccaatctcaccaa 272  Q
    |||||||||||||    
T  31518807 ccaatctcaccaa 31518795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 405 - 452
Target Start/End: Original strand, 2058322 - 2058371
Alignment:
Q  405 tcaaatctgcacaagaacac--tttatactagcctccctctgaagcaatc 452  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  2058322 tcaaatctgcacaagaacacaatatatactagccttcctctgaagcaatc 2058371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 590 - 624
Target Start/End: Original strand, 4509335 - 4509369
Alignment:
Q  590 aaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatt 624  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4509335 aaatcgtgtcacgatcccaaaatcgtgtcacgatt 4509369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 590 - 624
Target Start/End: Original strand, 4511177 - 4511211
Alignment:
Q  590 aaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatt 624  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4511177 aaatcgtgtcacgatcccaaaatcgtgtcacgatt 4511211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 590 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 6431501 - 6431467
Alignment:
Q  590 aaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatt 624  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6431501 aaatcgtgtcacgatcccaaaatcgtgtcacgatt 6431467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 590 - 624
Target Start/End: Original strand, 14070348 - 14070382
Alignment:
Q  590 aaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatt 624  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14070348 aaatcgtgccacgatgccaaaatcgtgtcacgatt 14070382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 590 - 624
Target Start/End: Original strand, 14380376 - 14380410
Alignment:
Q  590 aaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatt 624  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14380376 aaatcgtgccacgatgccaaaatcgtgtcacgatt 14380410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 28617234 - 28617182
Alignment:
Q  200 ggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc 253  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||| |||||||||||||    
T  28617234 ggttacaagaaattagcttaa-aagctcacaaagaacaaaacctaatttctacc 28617182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 608 - 653
Target Start/End: Original strand, 49092237 - 49092282
Alignment:
Q  608 aaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaa 653  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  49092237 aaaatcgtgtcacaatttctctgttcttccaaactacaaatttgaa 49092282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 338; Significance: 0; HSPs: 109)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 29720636 - 29720256
Alignment:
Q  1 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||     
T  29720636 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaa- 29720538  T
Q  101 gagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29720537 gagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa 29720438  T
Q  200 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaa 298  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29720437 ggttacaagaaattagattagacaagttcacaatgaactaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaa 29720338  T
Q  299 ggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29720337 ggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgctccctttgatttcccaag 29720256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 29722796 - 29722416
Alignment:
Q  1 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||     
T  29722796 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaa- 29722698  T
Q  101 gagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29722697 gagattgttcacccagttcggtccaaatttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa 29722598  T
Q  200 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaa 298  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29722597 ggttacaagaaattagattagacaagttcacaatgaactaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaa 29722498  T
Q  299 ggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29722497 ggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgctccctttgatttcccaag 29722416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 380
Target Start/End: Original strand, 29751055 - 29751436
Alignment:
Q  1 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaag-caccaa 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29751055 caacaaaacaccacctagatataatctagaaaacaagtgagaaacacagtacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagacaccaa 29751154  T
Q  100 agagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa 198  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29751155 -gagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa 29751253  T
Q  199 aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctaca 297  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29751254 aggttacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctaca 29751353  T
Q  298 aggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29751354 aggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgctccctttgatttcccaag 29751436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 12 - 380
Target Start/End: Original strand, 22536197 - 22536563
Alignment:
Q  12 cacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttca 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22536197 cacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaactcaaaacacaatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaa-gagattgttca 22536295  T
Q  112 cccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22536296 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactccccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaa 22536395  T
Q  211 attagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccat 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||    
T  22536396 attagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctctctgcagggtgtttcccat 22536493  T
Q  311 gttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22536494 gttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttctccctttgatttcccaag 22536563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 10593532 - 10593151
Alignment:
Q  1 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaaaagcacca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  10593532 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaggagagggaagtagaaaacaaatacacca 10593433  T
Q  99 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggataca 196  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10593432 a-gagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggataca 10593334  T
Q  197 aaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctac 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  10593333 aaaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttctcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttac 10593234  T
Q  297 aaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  10593233 aaggtgtttcccatgttttctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag-ttccccctttgatttcccaag 10593151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 25078395 - 25078013
Alignment:
Q  1 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaataca-caatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa-aagcacca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |    
T  25078395 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaacac-a 25078297  T
Q  99 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatac 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  25078296 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac 25078197  T
Q  196 aaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctcta 295  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  25078196 aagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctcttta 25078097  T
Q  296 caaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  25078096 caaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc-ccctttgatttcccaag 25078013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 25136364 - 25135982
Alignment:
Q  1 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaataca-caatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa-aagcacca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |    
T  25136364 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaacac-a 25136266  T
Q  99 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatac 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  25136265 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac 25136166  T
Q  196 aaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctcta 295  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  25136165 aagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctcttta 25136066  T
Q  296 caaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  25136065 caaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc-ccctttgatttcccaag 25135982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 40380365 - 40379985
Alignment:
Q  1 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaataca-caatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa-aagcacca 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  || |||||||||||||||    |||||||||||||||||| || ||| |    
T  40380365 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagggaagaagaaaacaataaacac-a 40380267  T
Q  99 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatac 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  40380266 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgaactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac 40380167  T
Q  196 aaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctcta 295  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  40380166 aagaggttacaagaaattagtttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctctcta 40380069  T
Q  296 caaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  40380068 caaggtgtttcccatgttttcaacccgagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc-ccctttgatttcccaag 40379985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 40382576 - 40382196
Alignment:
Q  1 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaataca-caatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa-aagcacca 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  || |||||||||||||||    |||||||||||||||||| || ||| |    
T  40382576 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagggaagaagaaaacaataaacac-a 40382478  T
Q  99 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatac 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  40382477 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgaactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac 40382378  T
Q  196 aaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctcta 295  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  40382377 aagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaacttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctctcta 40382280  T
Q  296 caaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  40382279 caaggtgtttcccatgttttcaacccgagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc-ccctttgatttcccaag 40382196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 380
Target Start/End: Original strand, 9789119 - 9789500
Alignment:
Q  1 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaa 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||    
T  9789119 caacaaaacagcacctagatctaatctaggaaagaagtgaaaaacacaatacacaagcacaagataaacggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaa 9789218  T
Q  101 gagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  9789219 gagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaa 9789318  T
Q  200 g-gttacaagaaattag-cttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctaca 297  Q
    | |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  9789319 gagttacaagaaattagatttgacaagttcacaaggaac-aaccttaatttctaccctttttccaatctcaccaagacactcaatgattttcactcacca 9789417  T
Q  298 aggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9789418 aggtgtttcccatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagagttactccctttgatttcccaag 9789500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 16544685 - 16544302
Alignment:
Q  1 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaa---aggagagggaagaagaaaacaa-aagcac 96  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |  |   || |||||||||||   |||||||||||||||||||||| || |||    
T  16544685 caacaaaacaccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaacaaagcaactaaacacaagataaacaaaggagagggaagaagaaaacaataaacac 16544586  T
Q  97 caaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggat 193  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  16544585 -aaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggat 16544487  T
Q  194 acaaaaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctct 292  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  16544486 acaagaggttatgagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgatt--ctct 16544389  T
Q  293 ctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  16544388 ctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc-ccctttgatttcccaag 16544302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 16546907 - 16546524
Alignment:
Q  1 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaa---aggagagggaagaagaaaacaa-aagcac 96  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |  |   || |||||||||||   |||||||||||||||||||||| || |||    
T  16546907 caacaaaacaccacctaaatccaatctaggaaacaagtgtgaaacaaagcaactaaacacaagataaacaaaggagagggaagaagaaaacaataaacac 16546808  T
Q  97 caaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggat 193  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  16546807 -aaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggat 16546709  T
Q  194 acaaaaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctct 292  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  16546708 acaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcctaatctcaccaagacactcaatgatt--ctct 16546611  T
Q  293 ctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  16546610 ctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc-ccctttgatttcccaag 16546524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 380
Target Start/End: Original strand, 18441539 - 18441924
Alignment:
Q  1 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaa----cacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcac 96  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||  |||    
T  18441539 caacaaaacagcacctagatctaatctaggaaagaagtgaaaaaaaaacacaatacacaagcacaagataaacggagagggaagaggaaaacaaagacac 18441638  T
Q  97 caaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatac 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  18441639 caaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatac 18441738  T
Q  196 aaaag-gttacaagaaattag-cttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctc 293  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18441739 aaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaaggaac-aaccctaatttctaccctttttccaatctcaccaagacactcaatgattttcactc 18441837  T
Q  294 tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
      |||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18441838 accaaggtgtttcccatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagagttactccctttgatttcccaag 18441924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 7 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 16409743 - 16409367
Alignment:
Q  7 aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagat 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || || || |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  16409743 aacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcataaaacacaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaagagat 16409644  T
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  16409643 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagagtt 16409544  T
Q  204 acaagaaattag-cttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtg 302  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  16409543 acaagaaattagatttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttccaatctcaccaagacactcaatgattttcactcaccaaggtg 16409445  T
Q  303 tttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    ||| ||||||||  ||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16409444 tttaccatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagagttactccctttgatttcccaag 16409367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 7 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 26178150 - 26177775
Alignment:
Q  7 aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagat 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| || || || |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  26178150 aacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcataaaacacaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaagagat 26178051  T
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  26178050 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagagtt 26177951  T
Q  204 acaagaaattag-cttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtg 302  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  26177950 acaagaaattagatttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttt-ccaatctcaccaagacactcaatgattttcactcaccaaggtg 26177853  T
Q  303 tttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    ||| ||||||||  ||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26177852 tttaccatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagagttactccctttgatttcccaag 26177775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 405 - 668
Target Start/End: Original strand, 22536590 - 22536853
Alignment:
Q  405 tcaaatctgcacaagaacactttatactagcctccctctgaagcaatcacgtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatac 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||  |||||||| || |||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  22536590 tcaaatctgcacaagaacactttatactagccttcctctgttgaaatcgtgtcacgatctgtgtaccacccaagaaacgaccagtccttatcaaggatac 22536689  T
Q  505 ttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttccca-aatcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacga 603  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22536690 ttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccacaattgtgccacgattttgcaccctgcaacctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacga 22536789  T
Q  604 tgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaacaa 668  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22536790 tgccacaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagac-aatctcaacaa 22536853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 7 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 26171030 - 26170666
Alignment:
Q  7 aacaccacctagatctaatctaggaaacaag-tgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagat 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||  ||| || || || |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  26171030 aacaacacctagatctaatctaggaatcaaaatgaaaagcataaaacacaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaagagat 26170931  T
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggtta 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||           ||||    
T  26170930 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaag----------agtta 26170841  T
Q  205 caagaaattag-cttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgt 303  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  26170840 caagaaattagatttgacaagttcacaaagaac-aatcctaatttctaccctttt-ccaatctcaccaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgt 26170743  T
Q  304 ttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    || ||||||||  ||||||||||||  || ||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26170742 ttaccatgtttcccaacccaagagaagctgtaatcaaag-actctaaaccctagagttactccctttgatttcccaag 26170666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 473 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 29720161 - 29719965
Alignment:
Q  473 cccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagttt-cacgatcgtgtcacgatttccca-aatcgtgtcacgattttgcaccctgcaa 570  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||     
T  29720161 cccaaggtatgaccagtccttatcatggaaacttaacgagcaagtttgcacaatcgtgtcacgatttcccacaatcgtgtcacgatttggcaccctgcag 29720062  T
Q  571 tctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 667  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29720061 actagctcacggcaccacgaaatcgtgtcacgatgccaaattcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 29719965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 455 - 668
Target Start/End: Original strand, 24136271 - 24136485
Alignment:
Q  455 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcac 553  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24136271 gtcacgatttgcgtacgtcccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttgaaaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgtcac 24136370  T
Q  554 gattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaa 653  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  24136371 gatttggcaccctgcaaactagctcacggcatcacgaaattgtgtcacgatgccaaattcgtgtcacgatttctgtgttcttccagaccacaaatttgaa 24136470  T
Q  654 gacaaatctcaacaa 668  Q
      ||||| |||||||    
T  24136471 accaaatatcaacaa 24136485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 30182852 - 30182474
Alignment:
Q  7 aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagat 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||   |||||||  |||||||||  |    
T  30182852 aacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaaacacaagcacaagataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaaaga--t 30182757  T
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggtt 203  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||| |||| ||||    
T  30182756 tgttcatccagttcggtccaaacttgacatactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt-ccaaagagatagaaaagggtt 30182658  T
Q  204 acaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctct 294  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||     
T  30182657 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccatttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 30182559  T
Q  295 acaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
     |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  30182558 ccaaggtgtttgcaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaatccctaaagttgcttcctttgatttcccaag 30182474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 455 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 10593055 - 10592844
Alignment:
Q  455 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgattt-cccaaatcgtgtcac 553  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  10593055 gtcacgatctgcgtaccaccgaagaaacgaccagtccttatcacggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgattttcccaaatcgtgccac 10592956  T
Q  554 gattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaa 653  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10592955 gattttgcaccctgcaacctatctcacggcacccggaa-tcgtgtcacgataccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaa 10592857  T
Q  654 gacaaatctcaaca 667  Q
    ||| ||||||||||    
T  10592856 gac-aatctcaaca 10592844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 455 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 40379890 - 40379676
Alignment:
Q  455 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacga-tttcccaaatcgtgtcac 553  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40379890 gtcacgatttgcgtccgtcccaaggaacgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgattttcccaaatcgtgtcac 40379791  T
Q  554 gattttgcaccctgcaa-tctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttga 652  Q
    || ||||||||||||||  ||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40379790 gaatttgcaccctgcaaccctagctcacggcacctc-caatcgtgtcacgattccaaaatcgtggcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttga 40379692  T
Q  653 agacaaatctcaacaat 669  Q
    |||| ||||||||||||    
T  40379691 agac-aatctcaacaat 40379676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 7 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 25413024 - 25412647
Alignment:
Q  7 aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagat 105  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| ||| | || || |||||  ||||| || |||||||||||||||  ||||   |||||||  |||||||||  |    
T  25413024 aacagcacctatatctaatctaggaatcaaagagaaaagcacaaaccacaagcaaaagataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaaaga--t 25412929  T
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggtt 203  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  25412928 tgttcacccagttcagtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagggtt 25412830  T
Q  204 acaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctcta 295  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||      
T  25412829 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 25412731  T
Q  296 caaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||| |  ||||||||||||||||    
T  25412730 caaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaaccctaatgttgcctcctttgatttcccaag 25412647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 455 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 16546428 - 16546216
Alignment:
Q  455 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacga-tttcccaaatcgtgtcac 553  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16546428 gtcacgatttgcgtccgtcccaaggaacgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgattttcccaaatcgtgtcac 16546329  T
Q  554 gattttgcaccctgcaa-tctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttga 652  Q
    || ||||||||||||||  ||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16546328 gaatttgcaccctgcaaccctagctcacggcacctc-caatcgtgtcacgattccaaaatcgtggcacgatttccctgttcttccaaaccacaaatttga 16546230  T
Q  653 agacaaatctcaaca 667  Q
    |||| ||||||||||    
T  16546229 agac-aatctcaaca 16546216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 455 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 40382101 - 40381889
Alignment:
Q  455 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacga-tttcccaaatcgtgtcac 553  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40382101 gtcacgatttgcgtccgtcccaaggaacgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgattttcccaaatcgtgtcac 40382002  T
Q  554 gattttgcaccctgcaa-tctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttga 652  Q
    || ||||||||||||||  ||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40382001 gaatttgcaccctgcaaccctagctcacggcacctc-caatcgtgtcacgattccaaaatcgtggcacgatttccctgttctttcagaccacaaatttga 40381903  T
Q  653 agacaaatctcaaca 667  Q
    |||| ||||||||||    
T  40381902 agac-aatctcaaca 40381889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 483 - 667
Target Start/End: Original strand, 9789624 - 9789809
Alignment:
Q  483 gaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttccca-aatcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacg 581  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  9789624 gaccagtccttatcatggaaacttaacgagcaagttttcaaatcgtgtcacgatttcccacaatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaaccagctcacg 9789723  T
Q  582 gcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 667  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9789724 gcatcacgaaatcgtgtcacgatgccaaattcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 9789809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 7 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 13343324 - 13342946
Alignment:
Q  7 aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagat 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||||  ||||| || || ||||||||||||  ||||   |||||||  || ||||||  |    
T  13343324 aacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaccacaagcaaaatataaaaggagag--aagagagaaacaaacacatcaaaga--t 13343229  T
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaagg-tt 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||   |||| ||||||||||| ||    
T  13343228 tgttcacccagttcggtccaaacatgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt--caaagagatacaaaaggatt 13343131  T
Q  204 acaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctc 293  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||    
T  13343130 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc 13343032  T
Q  294 tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
      |||||||||| | ||||||  |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  13343031 accaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcagag-accctaaaccctaaagttgcttcctttgatttcccaag 13342946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 473 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 26177661 - 26177466
Alignment:
Q  473 cccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaat 571  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||     
T  26177661 cccaaggtacgaccagtccttatcatggaaacttaacgagcaagtttgcaaatcgtgtcacgatttcccatgatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaa 26177562  T
Q  572 ctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 667  Q
    | ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26177561 ccagctcacggcatcacgaaatcgtgtcacgatgccaaattcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagccaaatctcaaca 26177466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 455 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 16544206 - 16543994
Alignment:
Q  455 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacga-tttcccaaatcgtgtcac 553  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16544206 gtcacgatttgcgtccgtcccaaggaacgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgattttcccaaatcgtgtcac 16544107  T
Q  554 gattttgcaccctgcaa-tctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttga 652  Q
    || ||||||||||| ||  ||||||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16544106 gaatttgcaccctgtaaccctagctcacagcacctc-caatcgtgtcacgattccaaaatcgtggcacgatttccctgttcttccaaaccacaaatttga 16544008  T
Q  653 agacaaatctcaaca 667  Q
    |||| ||||||||||    
T  16544007 agac-aatctcaaca 16543994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 483 - 667
Target Start/End: Original strand, 18442048 - 18442233
Alignment:
Q  483 gaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttccca-aatcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacg 581  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  18442048 gaccagtccttatcatggaaacttaacgagcaagtttgcaaatcgtgtcacgatttcccacaatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaaccagctcacg 18442147  T
Q  582 gcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 667  Q
    ||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18442148 gcatcatgaaatcgtgtcacgatgccaaattcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 18442233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 380
Target Start/End: Original strand, 36073947 - 36074327
Alignment:
Q  7 aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagat 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||||  ||||| || || ||||||||||||  ||||   |||||||  |||||||||  |    
T  36073947 aacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaatcacaagcaaaacataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaaaga--t 36074042  T
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 203  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||   |||| |||||||||| |||    
T  36074043 tgttcatccagttcggtccaaacttgacctactttggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt--caaagagatacaaaagagtt 36074140  T
Q  204 acaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc----ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctc 291  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||    |||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |    
T  36074141 acaagaaattagctttgacaagttcgcaaagaac-aaccctaatttctacccttttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcac 36074239  T
Q  292 tctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    ||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  36074240 tcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagttgcttcctttgatttcccaag 36074327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 489 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 29722332 - 29722152
Alignment:
Q  489 tccttatcaaggatacttaacgagcaagttt-cacgatcgtgtcacgatttccca-aatcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcacc 586  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||| |||||    
T  29722332 tccttatcatggaaacttaacgagcaagtttgcacaatcgtgtcacgatttcccacaatcgtgtcacgatttggcaccatgcagactagctcacagcacc 29722233  T
Q  587 ccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 667  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29722232 acgaaatcgtgtcacgatgccaaattcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 29722152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 455 - 654
Target Start/End: Original strand, 27450198 - 27450397
Alignment:
Q  455 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcac 553  Q
    ||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  27450198 gtcacgatttgcgtctgacccaaggta-gaccagtccttatcagggatacttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccac 27450296  T
Q  554 gattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaa 653  Q
    ||||| ||  ||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27450297 gatttggcgtcctgcaaactagctcacggccccttgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaa 27450396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 455 - 667
Target Start/End: Original strand, 29751532 - 29751724
Alignment:
Q  455 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaaatcgtgtcacg 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                    ||||||||||||    
T  29751532 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcac--------------------aatcgtgtcacg 29751611  T
Q  555 attttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29751612 atttggcaccctgcaacctagctcacggcaccacgaaatcgtgtcgtgatgccaaattcatgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 29751711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 482 - 654
Target Start/End: Original strand, 30631763 - 30631936
Alignment:
Q  482 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaaa-tcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcac 580  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||| || ||||||    
T  30631763 tgaccagtccttatcagagatacttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaaaatcgtgtcacgatttggcgtcctgcaaactggctcac 30631862  T
Q  581 ggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30631863 ggcacctcgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaag 30631936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 455 - 654
Target Start/End: Original strand, 27445355 - 27445554
Alignment:
Q  455 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcac 553  Q
    ||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  27445355 gtcacgatttgcgtctgacccaaggta-gaccagtccttatcagggatacttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccac 27445453  T
Q  554 gattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaa 653  Q
    ||||| ||  ||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  27445454 gatttggcgtcctgcaaactagctcacggccccttgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttctagaccacaaatttgaa 27445553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 455 - 654
Target Start/End: Original strand, 43599106 - 43599306
Alignment:
Q  455 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcac 553  Q
    ||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  43599106 gtcacgatttgcgtctgacccaaggta-gaccagtccttatcagggatacttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccac 43599204  T
Q  554 gattttgcaccctgcaatctagctcacggcacccc-gaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttga 652  Q
    ||||| ||  ||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43599205 gatttggcgtcctgcaaactagctcacggcccccttgaaatcgtgtcacgacgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttga 43599304  T
Q  653 ag 654  Q
    ||    
T  43599305 ag 43599306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 455 - 654
Target Start/End: Original strand, 43604598 - 43604798
Alignment:
Q  455 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcac 553  Q
    ||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  43604598 gtcacgatttgcgtctgacccaaggta-gaccagtccttatcagggatacttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccac 43604696  T
Q  554 gattttgcaccctgcaatctagctcacggcacccc-gaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttga 652  Q
    ||||| ||  ||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43604697 gatttggcgtcctgcaaactagctcacggcccccttgaaatcgtgtcacgacgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttga 43604796  T
Q  653 ag 654  Q
    ||    
T  43604797 ag 43604798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 455 - 654
Target Start/End: Original strand, 43610090 - 43610290
Alignment:
Q  455 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcac 553  Q
    ||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  43610090 gtcacgatttgcgtctgacccaaggta-gaccagtccttatcagggatacttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccac 43610188  T
Q  554 gattttgcaccctgcaatctagctcacggcacccc-gaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttga 652  Q
    ||||| ||  ||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43610189 gatttggcgtcctgcaaactagctcacggcccccttgaaatcgtgtcacgacgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttga 43610288  T
Q  653 ag 654  Q
    ||    
T  43610289 ag 43610290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 455 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 25077918 - 25077713
Alignment:
Q  455 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttccca-aatcgtgtcac 553  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  25077918 gtcacgatttgcgtccgtcccaaggaacgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttctggatcgtgtcacgatttcccacaatcgtgacac 25077819  T
Q  554 gattttgcaccc-tgcaatc-tagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttg 651  Q
    ||||| |||||| | ||| | |||||||||||||| | || ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25077818 gattt-gcacccctacaaccctagctcacggcacctccaa-tcgcgtcacgatcccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttg 25077721  T
Q  652 aagacaaa 659  Q
    ||||||||    
T  25077720 aagacaaa 25077713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 455 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 25135887 - 25135682
Alignment:
Q  455 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttccca-aatcgtgtcac 553  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  25135887 gtcacgatttgcgtccgtcccaaggaacgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttctggatcgtgtcacgatttcccacaatcgtgacac 25135788  T
Q  554 gattttgcaccc-tgcaatc-tagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttg 651  Q
    ||||| |||||| | ||| | |||||||||||||| | || ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25135787 gattt-gcacccctacaaccctagctcacggcacctccaa-tcgcgtcacgatcccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttg 25135690  T
Q  652 aagacaaa 659  Q
    ||||||||    
T  25135689 aagacaaa 25135682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 13240016 - 13239674
Alignment:
Q  7 aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagaga 104  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||| || |||| || |||||||||||||||  ||||   |||||||  ||||||| |      
T  13240016 aacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaaacacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaaaaa-- 13239921  T
Q  105 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gt 202  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||    
T  13239920 ttgttcacccagttcggtccaaatttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagagt 13239822  T
Q  203 tacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctc 293  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||       |||||||||||||||||||| |||    
T  13239821 tacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaa-aaaccctaatttctaccattttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc 13239723  T
Q  294 tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaaga 342  Q
      |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  13239722 accaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaaga 13239674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 473 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 16407836 - 16407641
Alignment:
Q  473 cccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaat 571  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||    |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||||||     
T  16407836 cccaaggtacgaccggtccttatcatggaaacttaacgagcaagtttgcaaatcgtgtcacgattcctcaagatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaa 16407737  T
Q  572 ctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 667  Q
    | ||||||||||| | | |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16407736 ccagctcacggcatcacaaaatcgtgtcacgatgtcaaattcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaaatctcaaca 16407641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 455 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 1456849 - 1456650
Alignment:
Q  455 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcac 553  Q
    |||||||||||| |   |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  1456849 gtcacgatttgcatctgacccaaggta-gacaagtccttatcagggatacttaacaagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccac 1456751  T
Q  554 gattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaa 653  Q
    ||||| ||  |||| || |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1456750 gatttggcgtcctgtaaactagctcacggccccttgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaa 1456651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 543 - 667
Target Start/End: Original strand, 29752266 - 29752390
Alignment:
Q  543 aatcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagacc 642  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29752266 aatcgtgccacgatttggcaccctgcaacctagctcacggcagcacgaaatcgtgtcacgatgccaaattcgtgtcacgatttccctgttcttccagacc 29752365  T
Q  643 acaaatttgaagacaaatctcaaca 667  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  29752366 acaaatttgaagacaaatctcaaca 29752390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 473 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 26170552 - 26170357
Alignment:
Q  473 cccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaat 571  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    ||  |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||     
T  26170552 cccaaggtacgaccagtccttatcatggaaacttaacgagcaagtttgcaaattatgtcacgatttcccacgatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaa 26170453  T
Q  572 ctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 667  Q
    | ||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||    
T  26170452 ccagctcacggcatcacaaaatcgtgtcacgataccaaattcgtgtcacgatttccctgttcttccataccataaatttgaagccaaaactcaaca 26170357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 7 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 32637088 - 32636709
Alignment:
Q  7 aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaata-cacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagaga 104  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||| |||| |||| ||| | ||||| ||||||||||| ||||  ||||||   |||||||  |||||||||      
T  32637088 aacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaaactcaaaatcacaagcacaagataaagggag--ggaagagagaaacaaacacaccaaaga-- 32636993  T
Q  105 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggt 202  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||    
T  32636992 ttgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttac-aaagagatacaaatgggt 32636895  T
Q  203 tacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcacc-------aagacactcaatgattttctctc 293  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||       ||||||||||||||||||| |||    
T  32636894 tacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccataatttctacccattttcccaatctcaccaatgaataagacactcaatgattttcactc 32636796  T
Q  294 -tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
       |||||||||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||| ||||    
T  32636795 acccaaggtgtttacaatgtttcactacccaagaga-actctaatcaaag-acccttaaccctaaagttacctcctttgatttctcaag 32636709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 473 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 16409272 - 16409077
Alignment:
Q  473 cccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaat 571  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    |||||||||||||| | ||| |||||||||| |||| ||||| |||||     
T  16409272 cccaatgtacgaccagtccttatcatggaaacttaacgagcaagtttgcaaatcgtgtcacgattcctcaagatcgtgtcacaatttggcaccttgcaaa 16409173  T
Q  572 ctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 667  Q
    | |||||||| || | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16409172 ccagctcacgacatcacaaaatcgtgtcacgatgccaaattcgtgtcacgatttctctgttctttcagaccacaaatttgaagccaaatctcaaca 16409077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 489 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 29402728 - 29402562
Alignment:
Q  489 tccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccc 587  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||  ||||||| |||||||| |||  |     
T  29402728 tccttatcagtgatacttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaaactagctcatggccact 29402629  T
Q  588 cgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29402628 tgaaatcgtgccacgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaag 29402562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 102 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 37439313 - 37439161
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  37439313 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaag 37439215  T
Q  201 -gttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc 253  Q
     |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  37439214 agttacaagaaattaactttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacc 37439161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 106 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 213633 - 213465
Alignment:
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  213633 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactatggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 213535  T
Q  204 acaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 272  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  213534 acaagaaattagctttaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 213465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 102 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 13488374 - 13488088
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 199  Q
    ||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||      
T  13488374 agattattgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctcggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 13488277  T
Q  200 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 290  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||       ||||||||||||| ||||||     
T  13488276 ggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatcttaccaatgaacaagacactcaataattttca 13488178  T
Q  291 ctc-tacaaggtgtttcccatgtttt-caacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |||   |||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  13488177 ctcacccaaggtgtttacaatgttttccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaag 13488088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 482 - 654
Target Start/End: Original strand, 15045095 - 15045267
Alignment:
Q  482 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcac 580  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||  ||||||| || ||||||    
T  15045095 tgaccagtccttatcagtgatacttaatgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaaactggctcac 15045194  T
Q  581 ggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
    |||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  15045195 ggcatctc-aaatcgtgtcacgattccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaactacaaatttgaag 15045267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 542 - 667
Target Start/End: Original strand, 15465000 - 15465125
Alignment:
Q  542 aaatcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagac 641  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  15465000 aaatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaaccagctcacggcatcacaaaatcgtgtcacgataccaaattcgtgtcacgatttctctgttctttcagac 15465099  T
Q  642 cacaaatttgaagacaaatctcaaca 667  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||    
T  15465100 cacaaatttgaagccaaatctcaaca 15465125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 482 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 28807261 - 28807088
Alignment:
Q  482 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctag-ctca 579  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || | ||||    
T  28807261 tgaccagtccttatcagagatacttaaccaacaagtttctggatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcaccctgcaaacttggctca 28807162  T
Q  580 cggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
    ||||| | | | |||||||||||||  |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||    
T  28807161 cggcatctc-agatcgtgtcacgattgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccagaccataaatttgaag 28807088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 106 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 40147428 - 40147261
Alignment:
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 203  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| | |||    
T  40147428 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagtt 40147331  T
Q  204 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 272  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40147330 acaagaaattagcttcaacaagctcacgaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 40147261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 503 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 9352972 - 9352807
Alignment:
Q  503 acttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttccca-aatcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcac 601  Q
    ||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||  |||||||||| | |||||||||||   | ||||||||||||    
T  9352972 acttaaccagcaagtttgaaaatcgtgtcacgatttcacagaatcgtgccacgatttgacaccctgcaaaccagctcacggcattacaaaatcgtgtcac 9352873  T
Q  602 gatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 667  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9352872 gatgccacaatcgcgtcacgatttctctgttctttcaaaccacaaatttgaagccaaatctcaaca 9352807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 104 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 28278485 - 28278316
Alignment:
Q  104 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-agg 201  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||  ||    
T  28278485 attgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttac-aaagagatacaaatggg 28278388  T
Q  202 ttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 272  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28278387 ttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccataatttctacccattttcccaatctcaccaa 28278316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 102 - 380
Target Start/End: Original strand, 42428427 - 42428713
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 199  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | || || ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||      
T  42428427 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 42428524  T
Q  200 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 290  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||     
T  42428525 ggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaa-aaaccataatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 42428623  T
Q  291 ctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt-tctccctttgatttcccaag 380  Q
    |||   |||||||||| | || |||  |||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  42428624 ctcacccaaggtgtttacaatatttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accttcaaccctaaagttatct-cctttgatttcccaag 42428713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 380
Target Start/End: Original strand, 30682827 - 30683203
Alignment:
Q  7 aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaa-tacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagaga 104  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||| | ||||| || |||||||||||||||   ||| |||  ||||  |||||||||      
T  30682827 aacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaattcacaagcaaaagataaaaggagagaagagaggaa--caaacacaccaaaga-- 30682922  T
Q  105 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagag--ttcttacaaaagggatacaaaa-g 200  Q
    ||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||  |||||||| |    
T  30682923 ttgttgacc-agttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtattcttac-aaagaaatacaaaagg 30683019  T
Q  201 gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctc 291  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||| |    ||||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |    
T  30683020 gttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaag----aaccctaatttctaccctttttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcac 30683115  T
Q  292 tctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    ||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| | || |  ||| ||||||||||||    
T  30683116 tcaccaaggtgtttacaatgtttcgcaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaaattacctcctctgatttcccaag 30683203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 542 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 36931968 - 36931843
Alignment:
Q  542 aaatcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagac 641  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| || | | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  36931968 aaatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaaccagctcacgacatcacaaaatcgtgccacgatgccaaattcgtgtcacgatttctctgttcttccaaac 36931869  T
Q  642 cacaaatttgaagacaaatctcaaca 667  Q
    |||||||||||||  |||||||||||    
T  36931868 cacaaatttgaagcgaaatctcaaca 36931843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 106 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 31183138 - 31182858
Alignment:
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggtta 204  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| | || || |||||| |  |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  31183138 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagatagatctctccaatccagtatcaatgagttcttacaaa-gggatacaaatggtta 31183041  T
Q  205 caagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctctac 296  Q
    |||||||||| |||  ||||  |||||| |||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||       |||||||||||||||||||| |||  |    
T  31183040 caagaaattaacttaaacaaactcacaaagaac-aatcctaatttctacccattttccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 31182942  T
Q  297 -aaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
     ||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  31182941 taaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaag 31182858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 143 - 380
Target Start/End: Original strand, 39468587 - 39468832
Alignment:
Q  143 ggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaac 240  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||    
T  39468587 ggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aac 39468684  T
Q  241 cctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatac 330  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||    
T  39468685 cctaatttctacccattttcccaatctcactaatgaacaagacactcaatgattttcactcactcaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-ac 39468783  T
Q  331 tctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |||||| |||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  39468784 tctaatgaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaag 39468832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 455 - 604
Target Start/End: Original strand, 43592661 - 43592811
Alignment:
Q  455 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcac 553  Q
    ||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  43592661 gtcacgatttgcgtctgacccaaggta-gaccagtccttatcagggatacttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccac 43592759  T
Q  554 gattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccc-cgaaatcgtgtcacgat 604  Q
    ||||| ||  ||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  43592760 gatttggcgtcctgcaaactagctcacggcccccttgaaatcgtgtcacgat 43592811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 102 - 380
Target Start/End: Original strand, 28750652 - 28750938
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 199  Q
    ||||| || ||||| |||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||      
T  28750652 agattattgacccaattcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaa-agatacaaatg 28750749  T
Q  200 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 290  Q
    ||||||| ||||||| |||  |||| |||| || |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||     
T  28750750 ggttacaggaaattaacttcaacaatttcataaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 28750848  T
Q  291 ctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  28750849 ctcacccaaggtgttttcaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaag 28750938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 106 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 5058212 - 5058047
Alignment:
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 203  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  || |    
T  5058212 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggat 5058115  T
Q  204 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 272  Q
    |||||||| ||||||  ||||| |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5058114 acaagaaaatagcttcaacaagctcaca--gaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 5058047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 102 - 342
Target Start/End: Original strand, 8565943 - 8566192
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgag-gagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 199  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||      
T  8565943 agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatctgggtgagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-agagggatacaaatg 8566040  T
Q  200 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 290  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||       ||||||||||||||||||||     
T  8566041 ggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaagttctacccattttctcaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttca 8566139  T
Q  291 ctc-tacaaggtgtttcccatgttttc-aacccaagagatactctaatcaaaga 342  Q
    |||   |||||||||| | |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  8566140 ctcacccaaggtgtttacaatgtttccgaacccaagaga-actctaatcaaaga 8566192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 85 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 33831866 - 33831565
Alignment:
Q  85 aaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttctta 183  Q
    |||||||| |||||||||  ||||| ||||||||| |||||| ||||||||| | || || ||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||    
T  33831866 aaacaaaaacaccaaaga--ttgttgacccagttcagtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctcttcaatccactatcaatgagttctta 33831770  T
Q  184 caaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caag 273  Q
    | |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||        |||    
T  33831769 c-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccatttttccaatctcacaaatgaataag 33831672  T
Q  274 acactcaatgattttctctc-tacaaggtgtttcccatgtttt-caacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttga 371  Q
    |||||||||||||||| |||   |||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| | ||    |||||||    
T  33831671 acactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgttttccaacccaagaga-actctaatcaaag-acccttaaccctaaaattaactcctttga 33831574  T
Q  372 tttcccaag 380  Q
    |||||||||    
T  33831573 tttcccaag 33831565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 102 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 533940 - 533655
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 199  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | || || ||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||      
T  533940 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctttccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 533843  T
Q  200 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 290  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||| |||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||| |||||||||||     
T  533842 ggttacaaaaaattagcttcaacaagctcacaaag-accaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacacgcaatgattttca 533744  T
Q  291 ctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaa 379  Q
    |||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||| |||| |  |||||||||||||||    
T  533743 ctcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-acccccaaccctaaagttacctcctttgatttcccaa 533655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 450 - 604
Target Start/End: Original strand, 31180633 - 31180787
Alignment:
Q  450 atcacgtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgt 548  Q
    |||| ||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||   |||||||||||||||||||| |||||    
T  31180633 atcatgtcacgatttgcgtctgacccaaggt-tgaccagtccttatcagtgatacttaacgagaaagtctctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgt 31180731  T
Q  549 gtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgat 604  Q
    | |||||||| ||  ||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  31180732 gccacgatttggcgtcctgcaaactagctcacgacaccttgaaatcgtgtcacgat 31180787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 106 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 16452247 - 16451966
Alignment:
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 203  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||   |||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  16452247 tgtttacccagttcggtccaa-cttgacctactctgggggagagatttatctctccaatccactatgaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 16452150  T
Q  204 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctc-------accaagacactcaatgattttctctct 294  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| || ||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||       | ||||||||||||||||| || ||      
T  16452149 acaagaaattagcttcaacaagctcagaaagaacaaa-cttaatttctacccatttttccaatctcatcaatgaacaagacactcaatgattgtcactta 16452051  T
Q  295 acaaggtgtttcccatgttttc-aacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
     |||||||||| | |||||| | ||||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  16452050 ccaaggtgtttacaatgtttccgaacccaagaga-actctaatcaaag-atcctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaag 16451966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 108 - 272
Target Start/End: Original strand, 27637615 - 27637781
Alignment:
Q  108 ttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa--ggtta 204  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||  |||||    
T  27637615 ttcacccagttcggtccaacaatgacctactctgcaggagagattgatctctccaatccactat-aatgagttcttac-aaagagatacaaaatgggtta 27637712  T
Q  205 caagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 272  Q
    ||||||||||| ||  ||||| ||| || |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  27637713 caagaaattagtttaaacaagctcataaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 27637781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 484 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 37556308 - 37556131
Alignment:
Q  484 accagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctag-ctcacg 581  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||  | || |  || || | ||||||    
T  37556308 accagtccttatcagagatacttaaccagcaagtttctagatcgtgtcacaatttcccaagatcgtgccacgatttgcctccatcaaaacttggctcacg 37556209  T
Q  582 gcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaat 660  Q
    ||| | | | |||||||||||||  | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37556208 gcatctc-agatcgtgtcacgattaccaaatcgtgtcacgattactctgttcttccagaccacaaatttgaagccaaat 37556131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 484 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 37561130 - 37560953
Alignment:
Q  484 accagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatc-tagctcacg 581  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  | || |  || | | |||||||    
T  37561130 accagtccttatcagagatacttaaccagcaagtttctggatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttgcctccatcaaaacttggctcacg 37561031  T
Q  582 gcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaat 660  Q
    ||| | | | |||||||||||||    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37561030 gcatctc-agatcgtgtcacgattatcaaatcgtgtcacgattactctgttcttccagaccacaaatttgaagccaaat 37560953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 102 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 538196 - 537910
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 199  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||||||||| | || || ||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||      
T  538196 agattgttgatccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatctactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 538099  T
Q  200 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 290  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||| || | |||| |||||||||||| |||||||||||||||       |||||||| |||||||||||     
T  538098 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagagc-aaccttaatttctacccattttcccaatctcactaatgaacaagacacgcaatgattttca 538000  T
Q  291 ctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |||   |||||||||| | ||||||  ||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |  |||||||||| |||||    
T  537999 ctcacccaaggtgtttacgatgtttcccaagccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgattttccaag 537910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 482 - 667
Target Start/End: Original strand, 2785777 - 2785963
Alignment:
Q  482 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatc-tagctca 579  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  || |||| | | |||||    
T  2785777 tgaccagtccttatcagagatacttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctca 2785876  T
Q  580 cggca-ccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 667  Q
    ||||| | |||  |||||||||||||  | |||||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  2785877 cggcatctccg--atcgtgtcacgattgccaaatcgcgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaatttgaagccaattttcaaca 2785963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 482 - 667
Target Start/End: Original strand, 33768586 - 33768772
Alignment:
Q  482 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatc-tagctca 579  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  || |||| | | |||||    
T  33768586 tgaccagtccttatcagagatacttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctca 33768685  T
Q  580 cggca-ccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 667  Q
    ||||| | |||  |||||||||||||  | |||||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  33768686 cggcatctccg--atcgtgtcacgattgccaaatcgcgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaatttgaagccaattttcaaca 33768772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 482 - 667
Target Start/End: Original strand, 33791718 - 33791904
Alignment:
Q  482 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatc-tagctca 579  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  || |||| | | |||||    
T  33791718 tgaccagtccttatcagagatacttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctca 33791817  T
Q  580 cggca-ccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 667  Q
    ||||| | |||  |||||||||||||  | |||||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  33791818 cggcatctccg--atcgtgtcacgattgccaaatcgcgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaatttgaagccaattttcaaca 33791904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 102 - 380
Target Start/End: Original strand, 42426232 - 42426518
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 199  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||| || | || ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||      
T  42426232 agattgttgacctagttcagtccaa-cttgacctaatcagggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 42426329  T
Q  200 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 290  Q
    |||| ||||||||||||||  |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||       ||||||||||||| ||||||     
T  42426330 ggttgcaagaaattagcttcaacaatttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaataattttca 42426428  T
Q  291 ctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |||   |||||||||| | ||||||  ||| | |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  42426429 ctcacccaaggtgtttacaatgtttcccaatctaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaag 42426518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 155 - 272
Target Start/End: Original strand, 13695740 - 13695859
Alignment:
Q  155 ctctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctac 252  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||||   |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||||||||||| |||    
T  13695740 ctctctaatccactattaatgagttctttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttgtac 13695839  T
Q  253 ccttttcccaatctcaccaa 272  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  13695840 ccttttcccaatctctccaa 13695859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 475 - 584
Target Start/End: Original strand, 38219837 - 38219947
Alignment:
Q  475 caaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatct 573  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| |     
T  38219837 caaggtacgaccagtccttatcatggaaacttaacaagcaagtttgaaaatcgtgtcacaatttcccaagatcgtgtcacgatttggcaccctacaaacc 38219936  T
Q  574 agctcacggca 584  Q
    |||||||||||    
T  38219937 agctcacggca 38219947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 106 - 376
Target Start/End: Original strand, 3075659 - 3075937
Alignment:
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 203  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||| || |||||||||||  ||||||||  ||||    
T  3075659 tgttcacccaatttggtccaa-cttgacctactatgagggagagattgatctctccaattcactatcaacgaattcttacaaaa-agatacaaatgggtt 3075756  T
Q  204 acaagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctc- 293  Q
    |||||||||||| || | |||| |||||| ||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||       | |||||||||||||||||| |||     
T  3075757 acaagaaattagattcagcaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacctattttctcaatctcacaaatgaacgagacactcaatgattttcactca 3075855  T
Q  294 tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcc 376  Q
    |  ||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||    
T  3075856 tcaaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actttaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttcc 3075937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 455 - 538
Target Start/End: Original strand, 35388084 - 35388169
Alignment:
Q  455 gtcacgatttg--cgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgattt 538  Q
    |||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||    
T  35388084 gtcacgatttgaacgtacgtcccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttgaaaatcgtgtcacaattt 35388169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 102 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 38747176 - 38747009
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 199  Q
    ||||| || |||||||| ||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||| || | |||| ||||||||      
T  38747176 agattattgacccagtttggtccaa-cttgacctgatctgagggagagattgatctctccaatcctctatcaatgagtt-tttccaaagagatacaaatg 38747079  T
Q  200 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctca 268  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38747078 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctca 38747009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 106 - 258
Target Start/End: Original strand, 16640941 - 16641091
Alignment:
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 203  Q
    |||| ||||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||   ||||||||| |||| |||||||||| |||    
T  16640941 tgtttacccagttcggcccta-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatca---agttcttac-aaagagatacaaaagagtt 16641035  T
Q  204 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccctttt 258  Q
    |  |||||| |||||  ||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  16641036 atcagaaatcagcttcaacaagctcacaaagaacaaacactaatttctaccatttt 16641091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 155 - 269
Target Start/End: Original strand, 9049392 - 9049506
Alignment:
Q  155 ctctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac 252  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||  ||||||| ||||||||||     
T  9049392 ctctccaatccactgtcaatgagttcttac-aaagagatacaaaatggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaa-aaacaaacactaatttctat 9049489  T
Q  253 ccttttcccaatctcac 269  Q
    | ||||||||| |||||    
T  9049490 cattttcccaaactcac 9049506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 27015690 - 27015531
Alignment:
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggtta 204  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||  || | |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| || |     
T  27015690 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctattttggaggagagattgatctgtacaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggt- 27015594  T
Q  205 caagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 272  Q
          ||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  27015593 ------attagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacctattttcccaatctcaccaa 27015531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 482 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 31396675 - 31396488
Alignment:
Q  482 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatct-agctca 579  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||| | ||||| ||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  || |||| || ||||||    
T  31396675 tgaccagtccttatcagagaaacttaaccaacaagtgtctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtggcacgattttgcttccagcaaacttagctca 31396576  T
Q  580 cggcacc-ccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaacaa 668  Q
    | ||  | ||||  ||||||||||||  | |||||||| ||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||| ||| | |||||||    
T  31396575 ctgcctctccga--tcgtgtcacgattgccaaatcgtgacacgattcctctgttctcccaaaccacaaatttgaagccaattttcaacaa 31396488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Original strand, 35388196 - 35388246
Alignment:
Q  617 tcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 667  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35388196 tcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagtcaaatctcaaca 35388246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 316933 - 316769
Alignment:
Q  104 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaagg- 201  Q
    |||||| ||| ||||||||||||   ||||||||||| | ||||||||||  | |||| ||||| |||||| ||||||||   |||| |||||||||||     
T  316933 attgtttaccaagttcggtccaacaatgacctactctaggggagagattgatccctccgatccattatcaatgagttctttacaaagagatacaaaagga 316834  T
Q  202 ttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatct 266  Q
    |||||||||||||||||  ||||| || | | ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  316833 ttacaagaaattagcttcaacaagctctccaagaacaaa-cctaatttctacctttttctcaatct 316769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 19806534 - 19806454
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttctt 182  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19806534 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaggagttctt 19806454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 609 - 654
Target Start/End: Original strand, 31180773 - 31180818
Alignment:
Q  609 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31180773 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaag 31180818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 609 - 654
Target Start/End: Original strand, 43592797 - 43592842
Alignment:
Q  609 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43592797 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaag 43592842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 609 - 668
Target Start/End: Original strand, 14520796 - 14520855
Alignment:
Q  609 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaacaa 668  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||    
T  14520796 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaagccaattttcaacaa 14520855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 482 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 31401532 - 31401346
Alignment:
Q  482 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatc-tagctca 579  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||  ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||  || |||| | |||||||    
T  31401532 tgaccagtccttatcagagaaacttaagcagcaagtttctgaatcatgtcacgatttcccaagatcgtggcacgattttgcttccagcaaacttagctca 31401433  T
Q  580 c-ggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 667  Q
    | | | | |||  |||||||||||||  | |||||||| ||||||| | || |||| ||| ||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  31401432 ctgcctctccg--atcgtgtcacgattgccaaatcgtgacacgattcctctattctcccaaaccacaaatttgaagccaattttcaaca 31401346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 218
Target Start/End: Original strand, 33906028 - 33906144
Alignment:
Q  104 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaagg- 201  Q
    |||||| |||||| |||||||||  |||||||||||| | | ||||||||  || ||||||| |||||||| ||||||||   |||| |||||||||||     
T  33906028 attgtttacccagctcggtccaacattgacctactctagggaagagattgatctttccaatctactatcaatgagttctttacaaagagatacaaaagga 33906127  T
Q  202 ttacaagaaattagctt 218  Q
    ||||||||| |||||||    
T  33906128 ttacaagaagttagctt 33906144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 524 - 558
Target Start/End: Original strand, 43592636 - 43592670
Alignment:
Q  524 atcgtgtcacgatttcccaaatcgtgtcacgattt 558  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43592636 atcgtgtcacgatttcccaaatcgtgtcacgattt 43592670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 524 - 558
Target Start/End: Original strand, 43599081 - 43599115
Alignment:
Q  524 atcgtgtcacgatttcccaaatcgtgtcacgattt 558  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43599081 atcgtgtcacgatttcccaaatcgtgtcacgattt 43599115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 524 - 558
Target Start/End: Original strand, 43604573 - 43604607
Alignment:
Q  524 atcgtgtcacgatttcccaaatcgtgtcacgattt 558  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43604573 atcgtgtcacgatttcccaaatcgtgtcacgattt 43604607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 524 - 558
Target Start/End: Original strand, 43610065 - 43610099
Alignment:
Q  524 atcgtgtcacgatttcccaaatcgtgtcacgattt 558  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43610065 atcgtgtcacgatttcccaaatcgtgtcacgattt 43610099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 380
Target Start/End: Original strand, 42309973 - 42310218
Alignment:
Q  143 ggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaac 240  Q
    ||||||||||  ||| | |||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| |||||| || ||||     
T  42309973 ggagagattgatctcgctaatccactatcaataagttcttac-aaagagatacaaaagagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagatcaaa- 42310070  T
Q  241 cctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctcta--caaggtgtttcccatgtttt-caacccaagagata 329  Q
    | | ||||||||||  |||| |||||||||       |||||||||||||||||||| || ||  |||  ||||| | ||||||| ||||| |||||| |    
T  42310071 cttgatttctacccaatttctcaatctcaccaatgagcaagacactcaatgattttcact-tacccaaaatgtttacaatgttttccaaccaaagaga-a 42310168  T
Q  330 ctctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    | |||||||||| ||| ||||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  42310169 ccctaatcaaag-accataaaccctaaagttacctcctttgatttcccaag 42310218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 524 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 10593080 - 10593048
Alignment:
Q  524 atcgtgtcacgatttcccaaatcgtgtcacgat 556  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10593080 atcgtgtcacgatttcccaaatcgtgtcacgat 10593048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 218
Target Start/End: Original strand, 10054867 - 10054929
Alignment:
Q  156 tctccaatccactatcaaagagttc-ttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagctt 218  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  10054867 tctccaatacactatcaatgagttcattacaaa-gagatacaaaaggttataagaaattagctt 10054929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 609 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 11916502 - 11916452
Alignment:
Q  609 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaa 659  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  11916502 aaattgtgtcacgatttctctgttctttcaaaccacaaatttgaagccaaa 11916452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 524 - 558
Target Start/End: Original strand, 27445330 - 27445364
Alignment:
Q  524 atcgtgtcacgatttcccaaatcgtgtcacgattt 558  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27445330 atcgtgccacgatttcccaaatcgtgtcacgattt 27445364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 524 - 558
Target Start/End: Original strand, 27450173 - 27450207
Alignment:
Q  524 atcgtgtcacgatttcccaaatcgtgtcacgattt 558  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27450173 atcgtgccacgatttcccaaatcgtgtcacgattt 27450207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 524 - 558
Target Start/End: Original strand, 29751507 - 29751541
Alignment:
Q  524 atcgtgtcacgatttcccaaatcgtgtcacgattt 558  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29751507 atcgtgtcacgattttccaaatcgtgtcacgattt 29751541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 106 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 42927058 - 42926977
Alignment:
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgag-gagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaa 187  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||    ||| ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  42927058 tgtttacccagttcggtccaa-cttgacctactatgagagagagatttatttcttcaatccactgtcaatgagttcttacaaa 42926977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 609 - 650
Target Start/End: Complemental strand, 12083708 - 12083667
Alignment:
Q  609 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaattt 650  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  12083708 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccataaattt 12083667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 331; Significance: 0; HSPs: 107)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 8393669 - 8392982
Alignment:
Q  1 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaataca-caatcacaagataaaa-ggagagggaagaagaaaacaa-aagcacc 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  || ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || |||     
T  8393669 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaatggagagggaagaagaaaacaataaacac- 8393571  T
Q  98 aaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatac 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8393570 aaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac 8393471  T
Q  196 aaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctcta 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  8393470 aaaaggttacaagaaattagcttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgatt--ctctcta 8393373  T
Q  296 caaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaagnnnnnnnnnnnnnnn 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |                   
T  8393372 caaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccataaaccctagagcttc-ccctttgatttcccaggtctctctcttccaac 8393274  T
Q  396 nnnnnnnnntcaaatctgcacaagaacactttatactagcctccctctgaagcaatcacgtcacgatt--------------------tgcgtacaaccc 475  Q
             ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||  |||||||||                    ||||||| ||||    
T  8393273 cctctctcttcaaatctgcacaagaacactttatactagccttcctctgttgaaatcgtgtcacgatttcccaaatcgtgtcacgatctgcgtaccaccc 8393174  T
Q  476 aaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacga-tttcccaaatcgtgtcacgattttgca-ccctgcaa-tc 572  Q
    |||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||  |    
T  8393173 aagaaaagaccagtccttatcacggatacttaacgagcaagtttctggatcgtgtcacgattttcccaaatcgtgccacga-tttgcacccctgcaaccc 8393075  T
Q  573 tagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 667  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8393074 tagctcacggca-tccgaaatcgtgtcacgataccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagac-aatctcaaca 8392982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 8395878 - 8395191
Alignment:
Q  1 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaataca-caatcacaagataaaa-ggagagggaagaagaaaacaa-aagcacc 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  || ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || |||     
T  8395878 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaatggagagggaagaagaaaacaataaacac- 8395780  T
Q  98 aaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatac 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8395779 aaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac 8395680  T
Q  196 aaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctcta 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  8395679 aaaaggttacaagaaattagcttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgatt--ctctcta 8395582  T
Q  296 caaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaagnnnnnnnnnnnnnnn 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||                   
T  8395581 caaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc-ccctttgatttcccaagtctctctcttccaac 8395483  T
Q  396 nnnnnnnnntcaaatctgcacaagaacactttatactagcctccctctgaagcaatcacgtcacgatt--------------------tgcgtacaaccc 475  Q
             ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||  |||||||||                    ||||||| ||||    
T  8395482 cctctctcttcaaatctgcacaagaacactttatactagccttcctctgttgaaatcgtgtcacgatttcccaaatcgtgtcacgatctgcgtaccaccc 8395383  T
Q  476 aaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacga-tttcccaaatcgtgtcacgattttgca-ccctgcaa-tc 572  Q
    |||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||  |    
T  8395382 aagaaacgaccagtccttatcacggatacttaacgagcaagtttctggattgtgtcacgattttcccaaatcgtgctacga-tttgcacccctgcaaccc 8395284  T
Q  573 tagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 667  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8395283 tagctcacggca-tccgaaatcgtgtcacgataccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagac-aatctcaaca 8395191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 7125176 - 7124794
Alignment:
Q  1 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaataca-caatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa-aagcacca 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  || |||||||||||||||    |||||||||||||||||| || ||| |    
T  7125176 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagggaagaagaaaacaataaacac-a 7125078  T
Q  99 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatac 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  7125077 aagagattgttcacccagttcggtctttgcttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac 7124978  T
Q  196 aaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctcta 295  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  7124977 aagaggttacaagaaattagtttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctcttta 7124878  T
Q  296 caaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  7124877 caaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc-ccctttgatttcccaag 7124794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 7122957 - 7122575
Alignment:
Q  1 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaataca-caatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa-aagcacca 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  || |||||||||||||||    |||||||||||||||||| || ||| |    
T  7122957 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagggaagaagaaaacaataaacac-a 7122859  T
Q  99 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatac 195  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  7122858 aagaaattgttcacccagttcggtctttgcttgacctactatggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac 7122759  T
Q  196 aaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctcta 295  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  7122758 aagaggttacaagaaattagtttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctcttta 7122659  T
Q  296 caaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  7122658 caaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc-ccctttgatttcccaag 7122575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 5138565 - 5138183
Alignment:
Q  1 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaat-cacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaa-aagcac 96  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |  |  |||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||    
T  5138565 caacaaaacatcac-tagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacaaagcaaccaaaacacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacac 5138467  T
Q  97 caaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggat 193  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  5138466 -aaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaat 5138368  T
Q  194 acaaaaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctct 292  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  5138367 acaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgatt--ctct 5138270  T
Q  293 ctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  5138269 ctacaaggtatttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc-ccctttgatttcccaag 5138183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 5136340 - 5135957
Alignment:
Q  1 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaat-cacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaa-aagcac 96  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |  |  |||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||    
T  5136340 caacaaaacatcac-tagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacaaagcaaccaaaacacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacac 5136242  T
Q  97 caaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggat 193  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  5136241 -aaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaat 5136143  T
Q  194 acaaaaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctct 292  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  5136142 acaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctct 5136045  T
Q  293 ctacaaggtgtttcccatg-ttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  5136044 ctacaaggtatttcccatgtttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc-ccctttgatttcccaag 5135957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 380
Target Start/End: Original strand, 31495203 - 31495593
Alignment:
Q  1 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaagga--------gagggaagaagaaaacaaa 91  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || || || |||||| |||||||||||||||        ||||||||| |||||||||    
T  31495203 caacaaaacagcacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcataaaacacaagcacaagataaaaggataaaaggagagggaagaggaaaacaaa 31495302  T
Q  92 agcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagg 190  Q
      |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||     
T  31495303 gacaccaa-gagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatcaactatcaatgagttcttacaaaaga 31495401  T
Q  191 gatacaaaagg--ttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattt 287  Q
    ||||||||| |  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31495402 gatacaaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaatcc-taatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattt 31495500  T
Q  288 tctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31495501 tctctcttcaaggtgtttcccatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-actataaaccctagagttactccctttgatttcccaag 31495593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 7 - 380
Target Start/End: Original strand, 13992195 - 13992569
Alignment:
Q  7 aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaa-gataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagaga 104  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||| |||| || |||||  ||||| || || ||||||||| ||| |||||   |||||||  |||||||||      
T  13992195 aacagcacctagatctaatctaggtatcaaagtgaaaagcacaaatcacaagcaaaaagataaaagg-gagagaagagagaaacaaacacaccaaaga-- 13992291  T
Q  105 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gt 202  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||| ||    
T  13992292 ttgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaagag--atacaaaagagt 13992389  T
Q  203 tacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccctttt--cccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaag 299  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||    
T  13992390 tacaagaaattagatttgacaagttcacaaagaacaa-ccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttcactcaccaag 13992488  T
Q  300 gtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  13992489 gtgtttacaatgtttcccaacccaagagagactctaatcaaag-accctaaaccctaaagttgctacctttgatttcccaag 13992569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 477 - 654
Target Start/End: Original strand, 24742387 - 24742565
Alignment:
Q  477 aggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctag 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||  ||||||| ||||    
T  24742387 aggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaaactag 24742486  T
Q  576 ctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24742487 ctcacggcacctcgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaag 24742565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 380
Target Start/End: Original strand, 29999719 - 30000088
Alignment:
Q  12 cacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttc 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||  ||||| || |||| ||||||||||  ||||   |||||||  ||||||      |||||    
T  29999719 cacctagatctaatctaggaatcaaagagaaaaacacaaaccacaagcaaaagacaaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaa------tgttc 29999810  T
Q  111 acccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaag 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  29999811 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaaagatacaaaagagttacaag 29999910  T
Q  209 aaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctctacaagg 300  Q
    |||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||| ||||||| |||  |||||    
T  29999911 aaattagctttgacatgttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaacgattttcactcaccaagg 30000009  T
Q  301 tgtttcccatgttttc-aacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt-tctccctttgatttcccaag 380  Q
    ||||| | |||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  30000010 tgtttacaatgtttccaaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagttgtct-cctttgatttcccaag 30000088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 483 - 667
Target Start/End: Original strand, 31495717 - 31495902
Alignment:
Q  483 gaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttccca-aatcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacg 581  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  31495717 gaccagtccttatcatggaaacttaacgagcaagtttgcaaatcgtgtcacgatttcccacaatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaaccagctcacg 31495816  T
Q  582 gcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 667  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31495817 gcatcacgaaatcgtgtcacgatgccaaattcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 31495902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 7 - 380
Target Start/End: Original strand, 56178540 - 56178919
Alignment:
Q  7 aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagaga 104  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  || |||| || ||||| || |||| || |||||||||||||||  ||||   |||||||  |||||||||      
T  56178540 aacaacacctagatctaatctaggaatgaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaaaga-- 56178635  T
Q  105 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggt 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||    
T  56178636 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagggt 56178734  T
Q  203 tacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctc 293  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||    
T  56178735 tacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc 56178833  T
Q  294 tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
      |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  56178834 accaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accttcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaag 56178919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 475 - 667
Target Start/End: Original strand, 13992686 - 13992879
Alignment:
Q  475 caaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaaa-tcgtgtcacgattttgcaccctgcaatct 573  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |     
T  13992686 caaggtatgaccagtccttatcatgaaaacttaacgagcaagtttgaaaatcgtgtcacgatttcccaaaatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaacc 13992785  T
Q  574 agctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 667  Q
    |||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13992786 agctcacgacatcacgaaatcgtgtcacgatgccaaattcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaaatctcaaca 13992879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 455 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 7122479 - 7122274
Alignment:
Q  455 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttccca-aatcgtgtcac 553  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  7122479 gtcacgatttgcgtccgtcccaaggaacgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttctggatcgtgtcacgatttcccacaatcgtgccac 7122380  T
Q  554 gattttgcaccc-tgcaatc-tagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttg 651  Q
    ||||| |||||| ||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7122379 gattt-gcacccctgcaaccctagctcacggcatcc-gaaatcgtgtcacgatcccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccacaccacaaatttg 7122282  T
Q  652 aagacaaa 659  Q
    ||||||||    
T  7122281 aagacaaa 7122274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 455 - 654
Target Start/End: Original strand, 51520839 - 51521038
Alignment:
Q  455 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcac 553  Q
    ||||||||||||||   |||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||| |||||| |||    
T  51520839 gtcacgatttgcgtctgacccaaggta-gatcagtccttatcagggatacttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcatgatttcccaagatcgtgccac 51520937  T
Q  554 gattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaa 653  Q
    ||||| ||  ||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  51520938 gatttggcgtcctgcaaactagctcacggccccttgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaa 51521037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 483 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 7124673 - 7124496
Alignment:
Q  483 gaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttccca-aatcgtgtcacgattttgcaccc-tgcaatc-tagctca 579  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||||| | |||||||    
T  7124673 gaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttctggatcgtgtcacgatttcccacaatcgtgccacgattt-gcacccctgcaaccctagctca 7124575  T
Q  580 cggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaa 659  Q
    ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7124574 cggcatcc-gaaatcgtgtcacgatcccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccacaccacaaatttgaagacaaa 7124496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 475 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 28468170 - 28467977
Alignment:
Q  475 caaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatct 573  Q
    ||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |     
T  28468170 caaggtacgaccagtccttatcatagaaacttaacgagcaagtttgaaaatcgtgtcacgattttccaagatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaacc 28468071  T
Q  574 agctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 667  Q
    ||||||||||| | | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28468070 agctcacggcatcacaaaatcgtgttacgatgccaaattcgtgtcacgatttctctgttcttccataccacaaatttgaagccaaatctcaaca 28467977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 455 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 56141723 - 56141523
Alignment:
Q  455 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcac 553  Q
    |||||||||||| |   |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  56141723 gtcacgatttgcatctgacccaaggta-gaccagtccttatcagggatacttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccac 56141625  T
Q  554 gattttg-caccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttga 652  Q
    ||||||| |  ||||||| |||||||||| | || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  56141624 gattttggcgtcctgcaaactagctcacgacccctccaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttga 56141525  T
Q  653 ag 654  Q
    ||    
T  56141524 ag 56141523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 472 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 9224093 - 9223911
Alignment:
Q  472 acccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaa 570  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||  |||||||    
T  9224093 acccaaggta-gacaagtccttatcagtgatacttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaa 9223995  T
Q  571 tctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
     ||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9223994 actagctcacggccacttgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaag 9223911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 104 - 380
Target Start/End: Original strand, 52095361 - 52095645
Alignment:
Q  104 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-agg 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||  ||    
T  52095361 attgttcacccagttcggtccaaacttg-cctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaaagatttcttac-aaagagatacaaatggg 52095458  T
Q  202 ttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctct 292  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||||| ||    
T  52095459 ttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 52095557  T
Q  293 c-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  52095558 cacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-tccctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaag 52095645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 406 - 604
Target Start/End: Original strand, 29760995 - 29761196
Alignment:
Q  406 caaatctgcacaagaacac--tttatactagcctccctctgaagcaatcacgtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggata 503  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||||| || ||||||||| ||||  | |||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29760995 caaatctgcacaagaacacaatatatactagtcttcctctgaagaaatcgtgccacgatttgcgtccgtaccaaggtatgaccagtccttatcaaggata 29761094  T
Q  504 cttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacg 602  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29761095 cttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaaactagctcacggcacctcgaaatcgtgtcacg 29761194  T
Q  603 at 604  Q
    ||    
T  29761195 at 29761196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 7 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 48143312 - 48142927
Alignment:
Q  7 aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaa----cacaata-cacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||    ||||| | ||||| || |||||||||||||||  ||||   |||||||  |||||||    
T  48143312 aacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaaaaagcacaaaatcacaagcaaaagataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaaa 48143215  T
Q  101 gagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa 199  Q
    ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||   ||| |||||||||    
T  48143214 ga--ttgttcacccagtttggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctta-tgaagagatacaaaa 48143118  T
Q  200 -ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc--cttttcccaatctcac-------caagacactcaatgatttt 288  Q
     |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||       |||||||||||||||||||    
T  48143117 gggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacctttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgatttt 48143019  T
Q  289 ctctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    | |||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  48143018 cactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaag 48142927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 472 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 9228880 - 9228698
Alignment:
Q  472 acccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaa 570  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||  |||||||    
T  9228880 acccaaggta-gacaagtccttatcagtgatacttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaa 9228782  T
Q  571 tctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
     | ||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9228781 acgagctcacggccacttgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaag 9228698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 455 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 5135862 - 5135648
Alignment:
Q  455 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttccc--aaatcgtgtca 552  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||  |||||||| ||    
T  5135862 gtcacgatttgcgtccgtcccaaggaacgaccggtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcttgatcgtgtcacgattttcccaaaatcgtgaca 5135763  T
Q  553 cgattttgcaccc-tgcaatc-tagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaattt 650  Q
    |||||| |||||| ||||| | || ||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  5135762 cgattt-gcacccctgcaaccctaactcacggcatcc-gaaatcgcgtcacgataccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccaagccacaaattt 5135665  T
Q  651 gaagacaaatctcaacaa 668  Q
    |||||| |||||||||||    
T  5135664 gaagac-aatctcaacaa 5135648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 482 - 654
Target Start/End: Original strand, 5733061 - 5733235
Alignment:
Q  482 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagct-ca 579  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||| || ||| ||    
T  5733061 tgaccagtccttatcagtgatacttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgtcacgatttggcgtcctgcaaacttgcttca 5733160  T
Q  580 cggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  5733161 cggcaccacgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcatgatttctctgttctttcagaccacaaatttgaag 5733235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 455 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 5138088 - 5137875
Alignment:
Q  455 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttccc--aaatcgtgtca 552  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||  |||||||| ||    
T  5138088 gtcacgatttgcgtccgtcccaaggaacgaccggtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcttgatcgtgtcacgattttcccaaaatcgtgaca 5137989  T
Q  553 cgattttgcaccc-tgcaatc-tagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaattt 650  Q
    |||||| |||||| ||||| | || ||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  5137988 cgattt-gcacccctgcaaccctaactcacggcatcc-gaaatcgcgtcacgataccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccaagccacaaattt 5137891  T
Q  651 gaagacaaatctcaaca 667  Q
    |||||| ||||||||||    
T  5137890 gaagac-aatctcaaca 5137875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 482 - 671
Target Start/End: Original strand, 3814421 - 3814609
Alignment:
Q  482 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaaatcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacg 581  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  | ||||| || ||| |||    
T  3814421 tgaccagtccttatcagtgatacttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaaatcgtgacacgatttggcgtcttgcaaacttgcttacg 3814520  T
Q  582 gcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaacaataa 671  Q
    |   |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  3814521 gtcacttgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaag-ccaatatcaacaataa 3814609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 7 - 380
Target Start/End: Original strand, 5369986 - 5370369
Alignment:
Q  7 aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagaga 104  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||| || |||| || |||||||||||||||  ||||   |||||||  || ||||||      
T  5369986 aacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagag--aagagataaacaaacacatcaaaga-- 5370081  T
Q  105 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggt 202  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| | ||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||    
T  5370082 ttgttcactcagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctctagtccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagggt 5370180  T
Q  203 tacaagaaattagc--ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc----cttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttc 289  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||     |||| ||||||||||       ||||||||||||||||||||    
T  5370181 tacaagaaattagcttttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacctcttttttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttc 5370279  T
Q  290 tctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt-tctccctttgatttcccaag 380  Q
     |||  ||| |||||| | ||||||  || ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||    
T  5370280 actcaccaaagtgtttacaatgtttcccagcccaagaga-actataatcaaag-accctaaaccctaaagttgtct-cctttgatttctcaag 5370369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 102 - 380
Target Start/End: Original strand, 9927455 - 9927740
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 199  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||      
T  9927455 agattgttgactcagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 9927552  T
Q  200 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcacc-------aagacactcaatgattttct 290  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||       |||||||||| ||||||||     
T  9927553 ggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaataagacactcagtgattttca 9927651  T
Q  291 ctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  9927652 ctcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actttaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaag 9927740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 482 - 654
Target Start/End: Original strand, 18856124 - 18856297
Alignment:
Q  482 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctag-ctca 579  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| || |||| || | ||||    
T  18856124 tgaccagtccttatcagtgatacttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcttgccacgattttgcatccagcaaacttggctca 18856223  T
Q  580 cggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
    ||||||| | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18856224 cggcacctccaa-tcgtgtcacgattccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaag 18856297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 99 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 2209889 - 2209717
Alignment:
Q  99 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaa 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  2209889 aagagattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaa 2209791  T
Q  198 aa--ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctca 268  Q
    ||  |||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2209790 aatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaa-aaaccctaatttctacccattttcccaatctca 2209717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 482 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 45347502 - 45347329
Alignment:
Q  482 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctag-ctca 579  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||| || | ||||    
T  45347502 tgaccagtccttatcagtgatacttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcatccagcaaacttggctca 45347403  T
Q  580 cggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
    ||||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  45347402 cggcatctctaa-tcgtgtcacgattccaaaatcgtgtcacgatttctttgttcttccagaccacaaatttgaag 45347329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 472 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 18712449 - 18712295
Alignment:
Q  472 acccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaa 570  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||  |||||||    
T  18712449 acccaaggt-tgacaagtccttatcagtgatacttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaa 18712351  T
Q  571 tctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttc 626  Q
     ||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18712350 actagctcacggccacttgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttc 18712295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 542 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 31985252 - 31985126
Alignment:
Q  542 aaatcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagac 641  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| | | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||     
T  31985252 aaatcgtgtcacgatttggcaccctgctaactagctcacggtatcacaaaatcgtgtcacgatgccaaattcgtgtcacgatttctctgttctttcagat 31985153  T
Q  642 cacaaatttgaagacaaatctcaacaa 668  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  31985152 cacaaatttgaagccaaatctcaacaa 31985126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 102 - 380
Target Start/End: Original strand, 12739547 - 12739833
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 199  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||  ||||||||      
T  12739547 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcatac-aaatagatacaaatg 12739644  T
Q  200 ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttcta-cccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 290  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||       |||||||||||||||||| |     
T  12739645 ggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctatccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgatttcca 12739743  T
Q  291 ctctac-aaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |||  | ||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||| ||||    
T  12739744 ctcacctaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttctcaag 12739833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 109 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 41964580 - 41964415
Alignment:
Q  109 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa--ggttac 205  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||    
T  41964580 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagggatacaaaatgggttac 41964483  T
Q  206 aagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 272  Q
    || ||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  41964482 aataaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatttcaccaa 41964415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 104 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 37740794 - 37740511
Alignment:
Q  104 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-agg 201  Q
    |||||| || ||||||||||||| ||||||| | |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||    
T  37740794 attgttgacacagttcggtccaa-cttgaccaaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatggg 37740697  T
Q  202 ttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctct 292  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||       ||||||||||| |||||||| ||    
T  37740696 ttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttataccctttttccaaatctcaccaatgaacaagacactcagtgattttcact 37740598  T
Q  293 ctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| | || |  ||||||||||||||||    
T  37740597 caccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaacttacctcctttgatttcccaag 37740511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 102 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 5429850 - 5429564
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 199  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||      
T  5429850 agattgttgacccagttcggtccaa-cttaacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaatagatacaaatg 5429753  T
Q  200 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 290  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||     
T  5429752 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacgaagaa-taaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 5429654  T
Q  291 ctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  5429653 ctcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacttcctttgatttcccaag 5429564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 380
Target Start/End: Original strand, 34570318 - 34570697
Alignment:
Q  7 aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagaga 104  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||| || ||||| || |||| || |||||||||||||||   ||| |||  ||||  |||||||||      
T  34570318 aacaacacctagatctaatctaagaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagagaagagaggaa--caaacacaccaaaga-- 34570413  T
Q  105 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaa-aaggt 202  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||| ||||| |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||   |||    
T  34570414 ttgttgacccagttcgatccaa-cttaacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaattgggt 34570511  T
Q  203 tacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctc 293  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||    
T  34570512 tacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacctattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc 34570610  T
Q  294 -tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
       |||| ||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| || | |  ||||||||||||||||    
T  34570611 acccaagatgttttcaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagctacctcctttgatttcccaag 34570697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 102 - 377
Target Start/End: Original strand, 47038408 - 47038689
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 200  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||  |||||||| |    
T  47038408 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtccttac-aaacagatacaaatg 47038505  T
Q  201 gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctct 292  Q
     |||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||       |||||||||||||||||||| ||    
T  47038506 attacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 47038604  T
Q  293 c-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttccc 377  Q
    |   ||||||||||   ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||    |||||||||||||    
T  47038605 cacccaaggtgtttataatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttaactcctttgatttccc 47038689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 102 - 272
Target Start/End: Original strand, 36463386 - 36463557
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 199  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||      
T  36463386 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactgtcaaagagttcttac-aaagagatacaaatg 36463483  T
Q  200 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttcta-cccttttcccaatctcaccaa 272  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  36463484 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaac-agccctaatttctatccattttcccaatctcaccaa 36463557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 106 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 40632612 - 40632445
Alignment:
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 203  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  40632612 tgtttacccagttcggtccaa-cttgacttactttagaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaataggtt 40632515  T
Q  204 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 272  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40632514 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aactctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 40632445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 102 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 5871991 - 5871705
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 199  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||      
T  5871991 agattgttgacccagttcggtc-aaacttgacctaatctgggggagagattgatctctctaatccactatcaaagagttcttgc-aaagtgataaaaatg 5871894  T
Q  200 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 290  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||       ||||||||||||||||||||     
T  5871893 ggttacaagaaatttgcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 5871795  T
Q  291 ctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  5871794 ctcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-acccataaccctaaagttacctcctttgatttcccaag 5871705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 102 - 380
Target Start/End: Original strand, 26175633 - 26175919
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 199  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||      
T  26175633 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 26175730  T
Q  200 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 290  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||     
T  26175731 ggttacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctccccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 26175829  T
Q  291 ctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |||   |||||||||| | ||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||| ||| ||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  26175830 ctcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaacaga-actttaatcaaag-accctcaactctaaagttacctcctttgatttcccaag 26175919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 99 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 26364410 - 26364236
Alignment:
Q  99 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaa 197  Q
    |||| |||||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||| || ||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||    
T  26364410 aagaaattgttgacccagttcagtc-aaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactattaatgagttcttac-aaagagatacaa 26364313  T
Q  198 aag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 272  Q
    | | ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26364312 atgagttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 26364236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 668 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 44882193 - 44882117
Alignment:
Q  668 ataaatgataccaatactcctcactgaggtggcacatttattcaatacacataaagctcacctcttggatgatgtcc 744  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44882193 ataaatgataccactactcctcactgaggtggcacatttattcaatacacataaagctcacctcttggatgacgtcc 44882117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 102 - 270
Target Start/End: Original strand, 46147388 - 46147557
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 200  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | || || ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |    
T  46147388 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatgtctccaatccactatcaaagagttcttac-aaagagatacaaatg 46147485  T
Q  201 -gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcacc 270  Q
     ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  46147486 agttacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcacc 46147557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 106 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 46703669 - 46703500
Alignment:
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa--ggt 202  Q
    |||||||||| ||||||||||   |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||  |||    
T  46703669 tgttcacccaattcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactataaatgagttcttac-aaagagatacaaaatgggt 46703571  T
Q  203 tacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcaccaa 272  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  46703570 tacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaa 46703500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 106 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 12073560 - 12073392
Alignment:
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 203  Q
    |||||||| ||||||||||||   |||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| | |||    
T  12073560 tgttcacctagttcggtccaacaatgacctactctggaagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagtt 12073462  T
Q  204 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 272  Q
    |||| ||||||||||  ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12073461 acaataaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 12073392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 99 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 12119714 - 12119540
Alignment:
Q  99 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa 198  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||   |||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||   |||| ||||||||    
T  12119714 aagaaattgttcacctagttcggtccaacaatgacctactcttgggagagattgatctctccaatccactataaatgagttctttacaaagagatacaaa 12119615  T
Q  199 a-ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcacc 270  Q
    | |||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||    
T  12119614 agggttacaagaaattagcttcaaaaagttcacaaagaacaaaccataatttctactcttttttccaatctcacc 12119540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 102 - 253
Target Start/End: Original strand, 12743922 - 12744073
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 199  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | || || ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||      
T  12743922 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 12744019  T
Q  200 ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc 253  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  12744020 ggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacc 12744073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 102 - 253
Target Start/End: Original strand, 12745311 - 12745462
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 199  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | || || ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||      
T  12745311 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 12745408  T
Q  200 ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc 253  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  12745409 ggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacc 12745462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 106 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 41639593 - 41639426
Alignment:
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 203  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||| |||  ||||||||  ||||    
T  41639593 tgttcactcagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcgatgagttcttac-aaatagatacaaatgggtt 41639496  T
Q  204 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 272  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  41639495 acaagaaattagcttcaaaaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatcttaccaa 41639426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 106 - 272
Target Start/End: Original strand, 37229722 - 37229890
Alignment:
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaa-agggatacaaaaggtt 203  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||  ||| ||| ||||    
T  37229722 tgtttacctagttcggtccaa-cttgacctactatgagggagagattgatctctccaatccactataaatgagttcttacaaagagatataaaaagggtt 37229820  T
Q  204 acaagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 272  Q
    |||| ||||| |||| | |||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37229821 acaacaaatttgctttaacaagctcacaaagaacacaccctaatttctaccattttcccaatctcaccaa 37229890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 102 - 272
Target Start/End: Original strand, 48893635 - 48893810
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 200  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |    
T  48893635 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttac-aaagagatacaaatg 48893732  T
Q  201 -gttacaagaaattagctt-gacaagttc----acaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 272  Q
     ||||||||||||||||||  ||||| ||    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  48893733 agttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaacaatgaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 48893810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 99 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 54883194 - 54883020
Alignment:
Q  99 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaa 197  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  54883194 aagaaattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctggaggagagattgatccctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaa 54883097  T
Q  198 a-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 272  Q
    |  |||||||||||||||||||  ||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  54883096 atgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaaaaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 54883020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 36994693 - 36994524
Alignment:
Q  104 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-agg 201  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||| | || || ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||    
T  36994693 attgttgacccagttcggtccaa-cttgatctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagggatacaaatggg 36994596  T
Q  202 ttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 272  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36994595 ttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccttaatttctacccattttcccaatctcaccaa 36994524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 106 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 379548 - 379383
Alignment:
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 203  Q
    |||||| ||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  379548 tgttcatccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaattagttcttac-aaagcgatacaaatgggtt 379450  T
Q  204 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 269  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  379449 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttctcaatctcac 379383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 106 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 6656123 - 6655975
Alignment:
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 203  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| | |||    
T  6656123 tgttcacccaattcggtccaa-cttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagtt 6656026  T
Q  204 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc 254  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  6656025 acaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccttaatttctaccc 6655975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 143 - 380
Target Start/End: Original strand, 12747794 - 12748039
Alignment:
Q  143 ggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaac 240  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||  ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||    
T  12747794 ggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcatac-aaatagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aac 12747891  T
Q  241 cctaatttcta-cccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctctac-aaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatac 330  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||       |||||||||||||||||| | |||  | ||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||    
T  12747892 cctaatttctatccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgatttccactcacctaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-ac 12747990  T
Q  331 tctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||| ||||    
T  12747991 tctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttctcaag 12748039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 102 - 380
Target Start/End: Original strand, 52082660 - 52082940
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 199  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||  |||       |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||      
T  52082660 agattgttcacccaaatcggtctaaacttgacctactctggaggagagaatgatctc-------cactatcaaagatttcttac-aaagagatacaaatg 52082751  T
Q  200 ggttacaagaaattag-cttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 290  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||       ||||||| ||||||||||||     
T  52082752 ggttacaagaaattagttttgacaagttcacaaagaac-aaccctagtttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacagtcaatgattttca 52082850  T
Q  291 ctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  52082851 ctcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaag 52082940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 104 - 376
Target Start/End: Original strand, 54199906 - 54200185
Alignment:
Q  104 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-agg 201  Q
    |||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||| || ||||| ||  ||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||    
T  54199906 attgttgacccagttcg-tccaa-cttgacctaatctgggggagagaatgatctctctaattcactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatggg 54200002  T
Q  202 ttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctct 292  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||||| ||    
T  54200003 ttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 54200101  T
Q  293 c-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcc 376  Q
    |   ||| |||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||    
T  54200102 cacccaatgtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttcc 54200185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 106 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 8648306 - 8648139
Alignment:
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 203  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  8648306 tgttcacccagtttggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccaatatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 8648209  T
Q  204 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttcta-cccttttcccaatctcaccaa 272  Q
    | |||||||||||||  ||||  ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  8648208 ataagaaattagcttcaacaaactcacaatgaac-aaccctaatttctatccattttcccattctcaccaa 8648139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 126 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 8665556 - 8665408
Alignment:
Q  126 aacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gaca 222  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||    
T  8665556 aacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaaca 8665458  T
Q  223 agttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 272  Q
    || || ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  8665457 agctctcaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccattctcaccaa 8665408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 102 - 272
Target Start/End: Original strand, 45687179 - 45687351
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 200  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| || | || ||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||| |    
T  45687179 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacataatatggaggagagatagatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaatagatacaaatg 45687276  T
Q  201 -gttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 272  Q
     |||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  45687277 agttataagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaaacctaatttcttcccattttcccaatctcaccaa 45687351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 106 - 272
Target Start/End: Original strand, 6542180 - 6542349
Alignment:
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaagg-tt 203  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| |     
T  6542180 tgtttacccagttcggtccaa-cttgacctaccctgggggagagattgatctctccaatccactatcaacgagttcttac-aaagagatacaaaaggcta 6542277  T
Q  204 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc--cttttcccaatctcaccaa 272  Q
    |||||||||||| ||  ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||   ||||||||||||| ||||    
T  6542278 acaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaatcctaatttctaccattttttcccaatctccccaa 6542349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 102 - 289
Target Start/End: Original strand, 52467351 - 52467546
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 199  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||      
T  52467351 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctcggggagagattgatctctccaatccactatcaaaaagttattac-aaagtgatacaaatg 52467448  T
Q  200 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttc 289  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||       ||||||||||||||||||||    
T  52467449 ggttacaagatattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaacctcacaaatgaacaagacactcaatgattttc 52467546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 106 - 265
Target Start/End: Original strand, 5207843 - 5208003
Alignment:
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgag-gagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaa-agggatacaaaaggtt 203  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||  ||||    
T  5207843 tgtttacccaattcagtccaaa-ttgacctactctgggagagagattgatctttccaatccactatcaatgagttcttacaaatagatatacaag-ggtt 5207940  T
Q  204 acaagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatc 265  Q
     ||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5207941 gcaataaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaaccctaatttctaccctttttccaatc 5208003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 102 - 272
Target Start/End: Original strand, 27416962 - 27417133
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 199  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||      
T  27416962 agattgttgactcagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttac-aaagagatacaaatg 27417059  T
Q  200 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcaccaa 272  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  27417060 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacacattttaccaatctcaccaa 27417133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 106 - 218
Target Start/End: Original strand, 50673848 - 50673960
Alignment:
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 203  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| | |||    
T  50673848 tgttcacctagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagtt 50673945  T
Q  204 acaagaaattagctt 218  Q
    |||||||||||||||    
T  50673946 acaagaaattagctt 50673960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 99 - 268
Target Start/End: Original strand, 50262694 - 50262865
Alignment:
Q  99 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaa 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||| ||||||   ||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  50262694 aagagattgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggaaagattgatatctccaatcaactatcaatgagttcttac-aaagagatacaa 50262792  T
Q  198 a-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttcta-cccttttcccaatctca 268  Q
    |  |||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| |||| ||||||| | || ||||||||||||||    
T  50262793 atgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccgtaatttcgatccattttcccaatctca 50262865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 143 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 4588089 - 4587958
Alignment:
Q  143 ggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaac 240  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| | |||| |||||||     
T  4588089 ggagagattgttctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagcttacaaagaacaaat 4587991  T
Q  241 cctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 272  Q
    | |||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  4587990 cttaatttctaccttttttcccaatttcaccaa 4587958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 551 - 654
Target Start/End: Original strand, 18860406 - 18860509
Alignment:
Q  551 cacgattttgcaccctgcaatctag-ctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatt 649  Q
    |||||||||||| || |||| || | ||||||||||| | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18860406 cacgattttgcatccagcaaacttggctcacggcacctccaa-tcgtgtcacgattccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatt 18860504  T
Q  650 tgaag 654  Q
    |||||    
T  18860505 tgaag 18860509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 145 - 253
Target Start/End: Original strand, 12744087 - 12744195
Alignment:
Q  145 agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccc 242  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  12744087 agagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccc 12744184  T
Q  243 taatttctacc 253  Q
    |||||||||||    
T  12744185 taatttctacc 12744195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 145 - 272
Target Start/End: Original strand, 12745476 - 12745604
Alignment:
Q  145 agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattag-cttgacaagttcacaatgaacaaaccc 242  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||    
T  12745476 agagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagttttgacaagttcacaaagaac-aaccc 12745573  T
Q  243 taatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 272  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  12745574 taatttctacccattttcctaatctcgccaa 12745604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 114 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 35662600 - 35662441
Alignment:
Q  114 cagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaa 211  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||    
T  35662600 cagttcggtccaa-cttgacctactcttgaggagatattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagttacaagaaa 35662503  T
Q  212 ttagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 272  Q
    |||||||  ||||  ||| || |||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  35662502 ttagcttcaacaaactcataaagaac-aaccctaatttctacccattttttcaatctcaccaa 35662441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 542 - 668
Target Start/End: Original strand, 5148177 - 5148303
Alignment:
Q  542 aaatcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagac 641  Q
    |||||||| |||||||   |||||||||| |||||||||| ||   | ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| || |||||||| ||    
T  5148177 aaatcgtgccacgattggtcaccctgcaaactagctcacgacattgcaaaatcgtgtcacggtgataaaatcgtgtcacgatttctctattcttccaaac 5148276  T
Q  642 cacaaatttgaagacaaatctcaacaa 668  Q
    ||||||||||||| ||| | |||||||    
T  5148277 cacaaatttgaagccaattttcaacaa 5148303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 106 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 31474318 - 31474150
Alignment:
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctga-ggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 203  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||   |||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||| | |||    
T  31474318 tgtttacccagttcggtccaa-cttgatctactctggtggagagatttatctctccaatcaactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagtt 31474221  T
Q  204 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 272  Q
    |||||||||||||||  ||||  ||| || ||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  31474220 acaagaaattagcttcaacaaactcaaaaagaacaagacctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 31474150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 111 - 257
Target Start/End: Original strand, 26699447 - 26699596
Alignment:
Q  111 acccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaag 208  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||| |  ||||||||  |||||||||||| ||| || ||||||||   |||| |||||||||| ||||||||    
T  26699447 acccagttcggtccaacaatgacctactctgggatagagattgatctctccaatccattataaatgagttctttacaaagagatacaaaagagttacaag 26699546  T
Q  209 aaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttt 257  Q
    |||||||||| | |||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  26699547 aaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatctatacccttt 26699596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 482 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 45356983 - 45356861
Alignment:
Q  482 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatc-tagctca 579  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||| | | |||||    
T  45356983 tgaccagtccttatcagtgatacttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcatccagcaaacttggctca 45356884  T
Q  580 cggcaccccgaaatcgtgtcacga 603  Q
    ||||| | | ||||||||||||||    
T  45356883 cggcatctc-aaatcgtgtcacga 45356861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 29254758 - 29254580
Alignment:
Q  7 aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagaga 104  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||| || |||| || |||||||| ||||||   ||| |||  ||||  |||||||||      
T  29254758 aacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaaacacaaaaccacaagcaaaagataaatggagagaatagaggaa--caaacacaccaaaga-- 29254663  T
Q  105 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgag-gagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaa 187  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | || | |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29254662 ttgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggagagagattgatctctccaatccactatcaacgagttcttacaaa 29254580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 609 - 670
Target Start/End: Original strand, 29761182 - 29761242
Alignment:
Q  609 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaacaata 670  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  29761182 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaag-caaatatcaacaata 29761242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 155 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 24969230 - 24969112
Alignment:
Q  155 ctctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac 252  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||  |||||||||||    
T  24969230 ctctccaatccactatcaattagttcttac-aaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-tctaatttctac 24969133  T
Q  253 cc-ttttcccaatctcaccaa 272  Q
    || |||| |||||||||||||    
T  24969132 ccatttttccaatctcaccaa 24969112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 683 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 44864299 - 44864243
Alignment:
Q  683 actcctcactgaggtggcacatttattcaatacacataaagctcacctcttggatga 739  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44864299 actcctcactcaggtaacacatttattcaatacacataaagctcacctcttggatga 44864243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 51337231 - 51337000
Alignment:
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggtt 203  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||  ||||||||||  ||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  51337231 tgtttacccagttcggtcc-aacttgacctaatgtgtgggagagattgatctctctaatacactatcaatgagttctta-aaaagagatacaaaagggtt 51337134  T
Q  204 acaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaa-ccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa-------gacactcaatgattttctctc- 293  Q
    | || |||||| ||| | ||| |||||| ||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||       ||||||||||||||||| |||     
T  51337133 ataataaattatctt-aaaagctcacaaagaacaaatccgtaatttctaccctttttctcaatctcaccaatgaacaggacactcaatgattttcactca 51337035  T
Q  294 tacaaggtgtttcccatgtttt-caacccaagaga 327  Q
      |||||||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  51337034 cccaaggtgtttacaatgttttccaacccaagaga 51337000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 607 - 667
Target Start/End: Original strand, 5143807 - 5143867
Alignment:
Q  607 caaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 667  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  5143807 caaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaagccaattttcaaca 5143867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 606 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 8689097 - 8689049
Alignment:
Q  606 ccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  8689097 ccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaag 8689049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 687 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 44850040 - 44849988
Alignment:
Q  687 ctcactgaggtggcacatttattcaatacacataaagctcacctcttggatga 739  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44850040 ctcaccgaggtgatacatttattcaatacacataaagctcacctcttggatga 44849988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 3913618 - 3913424
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-ag 200  Q
    |||||||| |||||||||| | ||| ||| || ||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||  |    
T  3913618 agattgttgacccagttcgatacaa-ctttacatactctagggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagatatacaaatgg 3913521  T
Q  201 gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttc 289  Q
    |||| |||||||||||||  ||||  |||||| |||| | | ||||||||||| | |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||    
T  3913520 gttaaaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-agctctaatttctactcattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttc 3913424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 102 - 198
Target Start/End: Original strand, 13009441 - 13009536
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa 198  Q
    |||||||| || |||||||||| || ||||||||| | || ||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  13009441 agattgttgacacagttcggtctaa-cttgacctaatttggaggagagatcgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagggatacaaa 13009536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 609 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 16628403 - 16628358
Alignment:
Q  609 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  16628403 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaag 16628358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 609 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 38151968 - 38151923
Alignment:
Q  609 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  38151968 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaag 38151923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 610 - 654
Target Start/End: Original strand, 3778116 - 3778160
Alignment:
Q  610 aatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  3778116 aatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaag 3778160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 270 - 309
Target Start/End: Original strand, 35369614 - 35369653
Alignment:
Q  270 caagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttccca 309  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35369614 caagacactcaatgattttcactctacaaggtgtttccca 35369653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 608 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 5268750 - 5268704
Alignment:
Q  608 aaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  5268750 aaaatcctgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaag 5268704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 130 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 33989989 - 33989899
Alignment:
Q  130 tgacctactctga-ggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagctt 218  Q
    ||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||| || ||||| ||   |||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33989989 tgacctactctggtggagagattgatctctccaatccactattaacgagttatttacaaagagatacaaaaggattacaagaaattagctt 33989899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 609 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 6742946 - 6742901
Alignment:
Q  609 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  6742946 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccataaatttgaag 6742901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 609 - 654
Target Start/End: Original strand, 10047932 - 10047977
Alignment:
Q  609 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  10047932 aaatcgtgtcacgatttatctgttcttccaaaccacaaatttgaag 10047977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 609 - 650
Target Start/End: Complemental strand, 16622824 - 16622783
Alignment:
Q  609 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaattt 650  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  16622824 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaattt 16622783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 200 - 268
Target Start/End: Original strand, 48142473 - 48142542
Alignment:
Q  200 ggttacaagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctca 268  Q
    |||||||||||| |||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  48142473 ggttacaagaaactagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttctatcatgttcccaatctca 48142542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 270 - 380
Target Start/End: Original strand, 13009604 - 13009714
Alignment:
Q  270 caagacactcaatgattttctctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccct 367  Q
    |||||||||||||||||||| |||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |  | |    
T  13009604 caagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-acccttaaccctaaagttacctcat 13009701  T
Q  368 ttgatttcccaag 380  Q
    |||||||||||||    
T  13009702 ttgatttcccaag 13009714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 41639353 - 41639263
Alignment:
Q  184 caaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 272  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||||||||||  | ||||| |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  41639353 caaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaaaaagtttacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatcttaccaa 41639263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 200 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 1983309 - 1983252
Alignment:
Q  200 ggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccctttt 258  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| | ||||||||| ||||||    
T  1983309 ggttacaagaaattagcttg-caagctcacaaagaacaaaacataatttctatcctttt 1983252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 186 - 267
Target Start/End: Original strand, 44967910 - 44967992
Alignment:
Q  186 aaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctc 267  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||| | |||| || | | || |||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  44967910 aaagagatacaaatggttacaagaaattggcttcagcaagctctccaagagcaaaacctaatttctaccattttcccaatctc 44967992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 609 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 36314761 - 36314716
Alignment:
Q  609 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| | |||||||||||||||    
T  36314761 aaatcgtgtcacgatttctctattcttcgaaaccacaaatttgaag 36314716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 609 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 36328970 - 36328925
Alignment:
Q  609 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| | |||||||||||||||    
T  36328970 aaatcgtgtcacgatttctctattcttcgaaaccacaaatttgaag 36328925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 609 - 654
Target Start/End: Original strand, 54867745 - 54867790
Alignment:
Q  609 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  54867745 aaatcgtgtcacgacttctctattcttccaaaccacaaatttgaag 54867790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 323; Significance: 0; HSPs: 72)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 6266964 - 6266583
Alignment:
Q  1 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaag-caccaa 99  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6266964 caacaaaacaacacctagatctaatctaggaaagaagtgaaaaacacaatacacaagcacaagataaacggagagggaagaagaaaacaaaagacaccaa 6266865  T
Q  100 agagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa 198  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6266864 -gagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa 6266766  T
Q  199 aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctaca 297  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6266765 aggttacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctaca 6266666  T
Q  298 aggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6266665 aggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgctccctttgatttcccaag 6266583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 380
Target Start/End: Original strand, 12647280 - 12647660
Alignment:
Q  1 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaataca-caatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa-aagcacca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |    
T  12647280 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaacac-a 12647378  T
Q  99 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatac 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  12647379 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac 12647478  T
Q  196 aaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctcta 295  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  12647479 aagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctctcta 12647576  T
Q  296 caaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  12647577 caaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc-ccctttgatttcccaag 12647660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 292
Target Start/End: Original strand, 13655923 - 13656220
Alignment:
Q  1 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaataca-caatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaa-aagcac 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||    
T  13655923 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaacaaacac 13656022  T
Q  97 caaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggata 194  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13656023 caaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggata 13656122  T
Q  195 caaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctct 292  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13656123 caagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctct 13656220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 7 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 32289832 - 32289457
Alignment:
Q  7 aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagat 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || || || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||    
T  32289832 aacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcataaaacacaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaggacaccaaagagat 32289733  T
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  32289732 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctctaatttactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagagtt 32289633  T
Q  204 acaagaaattag-cttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtg 302  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  32289632 acaagaaattagatttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttt-ccaatctcaccaagacactcaatgattttcactcaccaaggtg 32289535  T
Q  303 tttcccatgttttc-aacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    ||| |||||||| | |||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32289534 tttaccatgtttccaaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagagttactccctttgatttcccaag 32289457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 7 - 380
Target Start/End: Original strand, 4484232 - 4484614
Alignment:
Q  7 aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagat 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || || ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |    
T  4484232 aacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcaaaaaccacaagcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaaaga--t 4484329  T
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggtt 203  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  4484330 tgttcacccagttctgtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagggtt 4484429  T
Q  204 acaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttt--tcccaatctcac------caagacactcaatgattttctctct 294  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||      |||||||||||||||||| | |||     
T  4484430 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttctcccaatttcaccaagaacaagacactcaatgatttacactca 4484528  T
Q  295 acaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
     |||||||||| | ||||||  ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4484529 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-accctaaaccctagagttactccctttgatttcccaag 4484614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 7 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 30833612 - 30833230
Alignment:
Q  7 aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagat 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||  |    
T  30833612 aacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaaccacaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaaga--t 30833515  T
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggtt 203  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  30833514 tgttcacccagttcagtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagggtt 30833415  T
Q  204 acaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttt--tcccaatctcac------caagacactcaatgattttctctct 294  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||      |||||||||||||||||| | |||     
T  30833414 acaagaaattaactttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaagaacaagacactcaatgatttacactca 30833316  T
Q  295 acaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
     ||| |||||| | ||||||  |||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30833315 ccaaagtgtttacaatgtttcccaacccaagataagctctaatcaaa-aaccctaaaccctagagttactccctttgatttcccaag 30833230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 7 - 380
Target Start/End: Original strand, 4503037 - 4503415
Alignment:
Q  7 aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagat 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||   |||||||  |||||||||  |    
T  4503037 aacagcacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaaacacaagcacaagataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaaaga--t 4503132  T
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||   |||| |||||||||| |||    
T  4503133 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt--caaagagatacaaaagagtt 4503230  T
Q  204 acaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc--cttttcccaatctc-------accaagacactcaatgattttctctc 293  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||   |||||||||||||       | |||||||||||||||||||| |||    
T  4503231 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttttcccaatctctccaatgaacaagacactcaatgattttcactc 4503329  T
Q  294 tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
      |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  4503330 accaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaagaa-cctaaaccctaaagttgcttcctttgatttcccaag 4503415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 45100018 - 45099640
Alignment:
Q  7 aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagat 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||||  ||||| || || ||||||||||||  ||||   |||||||  |||||||||  |    
T  45100018 aacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaatcacaagcaaaatataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaaaga--t 45099923  T
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||   |||| |||||||||| |||    
T  45099922 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt--caaagagatacaaaagagtt 45099825  T
Q  204 acaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctc 293  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||    
T  45099824 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc 45099726  T
Q  294 tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
      |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  45099725 accaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagttgcttcctttgatttcccaag 45099640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 455 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 9296074 - 9295874
Alignment:
Q  455 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcac 553  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  9296074 gtcacgatttgcgtccgacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaatgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccac 9295975  T
Q  554 gattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaa 653  Q
    ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9295974 gatttggcatcctgcaaactagctcacggcaccttgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaa 9295875  T
Q  654 g 654  Q
    |    
T  9295874 g 9295874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 455 - 654
Target Start/End: Original strand, 14291913 - 14292113
Alignment:
Q  455 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcac 553  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  14291913 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcagtggtacttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccac 14292012  T
Q  554 gattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaa 653  Q
    ||||| ||  ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14292013 gatttggcgtcctgcaaactagctcacggcacctcgagatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaa 14292112  T
Q  654 g 654  Q
    |    
T  14292113 g 14292113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 455 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 11098599 - 11098399
Alignment:
Q  455 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcac 553  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  11098599 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtttgaccagtccttatcagtgatacttaacgagcaagtttctaaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccac 11098500  T
Q  554 gattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaa 653  Q
    ||||| ||  ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11098499 gatttggcgtcctgcaaactagctcacggcaccttgaaatcgtgtcactatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaa 11098400  T
Q  654 g 654  Q
    |    
T  11098399 g 11098399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 7 - 380
Target Start/End: Original strand, 36205569 - 36205946
Alignment:
Q  7 aacaccacctagatctaatctaggaaac-aagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagat 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | |||||| || || ||  ||||| || || |||||||||||  |||||   |||||||  ||||||  ||||    
T  36205569 aacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcagaaaccacaagcaaaatataaaaggaga--gaagagagaaacaaacacaccaa--agat 36205664  T
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| || |||| ||||||||   |||| |||||||||| |||    
T  36205665 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggatagattgaactctccaatccgctgtcaatgagttctt--caaagagatacaaaagagtt 36205762  T
Q  204 acaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctct 294  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||     
T  36205763 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccatttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 36205861  T
Q  295 acaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
     |||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  36205862 ccaaggtgtttaccatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagttgcttcctttgatttcccaag 36205946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 380
Target Start/End: Original strand, 5723160 - 5723537
Alignment:
Q  7 aacaccacctagatctaatctaggaaacaagt-gagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagat 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||   || || |||||  ||||| || |||||||||||||||   |||   |||||||  |||||||||  |    
T  5723160 aacaacacctagatctaatctaggaatcaaaaagaaaagcacaaaccacaagcaaaagataaaaggagagaatagag--aaacaaacacaccaaaga--t 5723255  T
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatac-aaaaggtt 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  5723256 tgttcacccagttcggtccaaacttaacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaaaggtt 5723354  T
Q  204 acaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctcta 295  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| |||||||||       |||||||||||||||||||| |||      
T  5723355 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aagcctaatttctacccttttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 5723453  T
Q  296 caaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  5723454 caaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accccaaaccctaaagttgcctcctttgatttcccaag 5723537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 475 - 668
Target Start/End: Original strand, 25410073 - 25410267
Alignment:
Q  475 caaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatct 573  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |     
T  25410073 caaggtacgaccattccttatcaaggatacttaacgagcaagtttgaaaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaacc 25410172  T
Q  574 agctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaacaa 668  Q
    | ||||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  25410173 atctcacggcatcacaaaatcgtgtcacgatgccaaattcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaaaactcaacaa 25410267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 455 - 668
Target Start/End: Original strand, 12647755 - 12647968
Alignment:
Q  455 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttccca-aatcgtgtcac 553  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  12647755 gtcacgatttgcgtccgtcccaaggaacgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttatggatcgtgtcacgatttcccacaatcgtgccac 12647854  T
Q  554 gattttgcaccc-tgcaatc-tagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttg 651  Q
    ||||| |||||| ||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12647855 gattt-gcacccctgcaaccctagctcacggcatcc-gaaatcgtgtcacgatcccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttg 12647952  T
Q  652 aagacaaatctcaacaa 668  Q
    ||||| |||||||||||    
T  12647953 aagac-aatctcaacaa 12647968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 380
Target Start/End: Original strand, 36987979 - 36988358
Alignment:
Q  7 aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagaga 104  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||||  | |||| || |||||||||||||||  ||||   |||||||  |||||||||      
T  36987979 aacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaagccacaagcaaaagataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaaaga-- 36988074  T
Q  105 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gt 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||    
T  36988075 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagagt 36988173  T
Q  203 tacaagaaattag-cttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctc 293  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||       |||||||||||||||||||| |||    
T  36988174 tacaagaaattagttttgacaagctcacatagaac-aaccctaatttctacccttttttccaatcccaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc 36988272  T
Q  294 tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
      |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  36988273 accaaggtgtttactatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaag 36988358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 475 - 668
Target Start/End: Original strand, 3492184 - 3492378
Alignment:
Q  475 caaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatct 573  Q
    ||||||| |||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |     
T  3492184 caaggtacgacctgtccttatcctggaaacttaacgagcaagtttcagaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaacc 3492283  T
Q  574 agctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaacaa 668  Q
    ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3492284 agctcacggcatcacaaaatcgtgtcacgatgccaaattcgtgtcacaatttctctgttctttcagaccacaaatttgaagccaaatctcaacaa 3492378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 475 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 30833114 - 30832921
Alignment:
Q  475 caaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatct 573  Q
    ||||||| |||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |     
T  30833114 caaggtacgacctgtccttatcctggaaacttaacgagcaagtttgaaaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaacc 30833015  T
Q  574 agctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 667  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30833014 agctcacggcatcacgaaatcgtgtcacgatgtcaaattcatgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaaatctcaaca 30832921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 473 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 32289343 - 32289148
Alignment:
Q  473 cccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaat 571  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    |||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||| |||||||||||     
T  32289343 cccaaggtacgaccagtccttatcatggaaacttaacgagcaagttttcaaatcgtgtcacgattcctcaagatcgtgtcaagatttggcaccctgcaaa 32289244  T
Q  572 ctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 667  Q
    | ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32289243 ccagctcacggcatcacaaaatcgtgtcacgatgccaaattcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaaatctcaaca 32289148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 483 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 6266459 - 6266274
Alignment:
Q  483 gaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttccca-aatcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacg 581  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  6266459 gaccattccttatcatggaaacttaacgagtaagtttgcaaatcgtgtcacgatttcccacaatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaaccagctcacg 6266360  T
Q  582 gcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 667  Q
    ||| | |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6266359 gcatcacgaaattgtgtcacgatgtcaaattcgtgtcacgatttccatgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 6266274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 102 - 380
Target Start/End: Original strand, 2334414 - 2334700
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  2334414 agattgttcccccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaag 2334512  T
Q  201 -gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 290  Q
     ||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||     
T  2334513 agttactagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aacccttatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 2334611  T
Q  291 ctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  2334612 ctcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaa-taccctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaag 2334700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 473 - 668
Target Start/End: Original strand, 4484728 - 4484924
Alignment:
Q  473 cccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaat 571  Q
    ||||||||| |||||||||||||||  || |||||||||||||||||    |||||||||||||| |  || ||||||||||||||| |||||||||||     
T  4484728 cccaaggtacgaccagtccttatcatagaaacttaacgagcaagtttgcaaatcgtgtcacgattccttaagatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaa 4484827  T
Q  572 ctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaacaa 668  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  4484828 ctagctcacggcatcatgaaatcgtgtcacgatgccaaattcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagtaaaatctcaacaa 4484924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 272
Target Start/End: Original strand, 6594908 - 6595175
Alignment:
Q  7 aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagaga 104  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||| |||| || ||||| || |||| || ||||||||||| ||| |||||   |||||||  |||||||||      
T  6594908 aacagcacctagatctaatctagaaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaaagg-gagagaagagagaaacaaacacaccaaaga-- 6595004  T
Q  105 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggt 202  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||| |||    
T  6595005 ttgttcactcagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaacgagttcttac-aaagagattcaaaagggt 6595103  T
Q  203 tacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc--cttttcccaatctcaccaa 272  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||   |||||| |||||||||||    
T  6595104 tacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttttcctaatctcaccaa 6595175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 475 - 667
Target Start/End: Original strand, 40739264 - 40739457
Alignment:
Q  475 caaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatct 573  Q
    ||||||| |||| |||||||||  | | ||||||||||||||||| |  || ||||||| ||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||||| |     
T  40739264 caaggtacgacctgtccttatcctgaaaacttaacgagcaagtttgaaaattgtgtcacaattccacaagatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaacc 40739363  T
Q  574 agctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 667  Q
    |||||||||||   | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40739364 agctcacggcataacaaaatcgtgtcacgatgccaaattcgtgtcacgatttgtctgttcttccagaccacaaatttgaagccaaatctcaaca 40739457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 29868133 - 29867791
Alignment:
Q  7 aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagaga 104  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||| |||| |||| ||| || |||| ||||||||||| ||||||  ||||   |||||||  || ||||||      
T  29868133 aacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaaactcaaaaccacaagcacaagataaacggagag--aagagagaaacaaacacatcaaaga-- 29868038  T
Q  105 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggt 202  Q
    || || |||||||||||||||| ||||||||| | || || ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||    
T  29868037 ttattgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttac-aaagagatacaaatgggt 29867940  T
Q  203 tacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctc 293  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||    
T  29867939 tacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc 29867841  T
Q  294 -tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaaga 342  Q
       |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  29867840 acccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaaga 29867791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 487 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 39811657 - 39811489
Alignment:
Q  487 agtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcac 585  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||  ||||||| || ||| ||||       
T  39811657 agtccttatcagtgatacttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaaacttgcttacggtca 39811558  T
Q  586 cccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39811557 cttgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaag 39811489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 102 - 342
Target Start/End: Original strand, 34139767 - 34140017
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggataca-aaa 199  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |      
T  34139767 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagggatacatatg 34139865  T
Q  200 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 290  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||       ||||||||||||||||||||     
T  34139866 ggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttca 34139964  T
Q  291 ctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaaga 342  Q
    |||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  34139965 ctcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaaga 34140017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 106 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 45727096 - 45726929
Alignment:
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 203  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  45727096 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaataggtt 45726999  T
Q  204 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 272  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45726998 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aactctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 45726929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 102 - 380
Target Start/End: Original strand, 723741 - 724027
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 199  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||      
T  723741 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagggatacaaatg 723838  T
Q  200 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 290  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||       ||||||||||||||||||||     
T  723839 ggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccagttttccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttca 723937  T
Q  291 ctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |||   |||||||||| | ||||||  |||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  723938 ctcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaaaaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaag 724027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 102 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 38312411 - 38312126
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 199  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||      
T  38312411 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacataatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagatcttac-aaagagatacaaatg 38312314  T
Q  200 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 290  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||     
T  38312313 ggttacaagaaattagtttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 38312215  T
Q  291 ctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaa 379  Q
    |||  ||||||||| | | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |  |||||||||||||||    
T  38312214 ctcacacaaggtgtatacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaagaa-cctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaa 38312126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 102 - 380
Target Start/End: Original strand, 14633822 - 14634109
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 199  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||      
T  14633822 agattgttgactcagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatctatgagttcttacaaaagggatacaaatg 14633920  T
Q  200 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 290  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||       ||||||||||||||||||||     
T  14633921 ggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aatcctaatttctacccattttaccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttca 14634019  T
Q  291 ctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |||   |||||||||| | ||||||  |||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||| ||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  14634020 ctcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaaaaga-actctaatcaaa-aaccctcaactctaaagttacctcctttgatttcccaag 14634109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 126 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 42362500 - 42362237
Alignment:
Q  126 aacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gaca 222  Q
    ||||||||||| |||| || |||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||    
T  42362500 aacttgacctaatctgggggagagatagatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaaca 42362402  T
Q  223 agttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctc-tacaaggtgtttcccatgtt 313  Q
    || |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||   |||||||||| | |||||    
T  42362401 agctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtt 42362303  T
Q  314 t-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  42362302 tcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaag 42362237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 102 - 380
Target Start/End: Original strand, 11151588 - 11151874
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 199  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||      
T  11151588 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagaggttgatctctccaatccactatctaagagttcttac-aaagtgatacaaatg 11151685  T
Q  200 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 290  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||       ||||| ||||||||||||||     
T  11151686 ggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-tctaatttctacccattttcccaatttcaccaatgaacaagagactcaatgattttca 11151784  T
Q  291 ctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  11151785 ctcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaag 11151874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 102 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 11690672 - 11690386
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 199  Q
    |||||||| | |||||||||||||| |||||| || | || || |||| |||  ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||      
T  11690672 agattgttgatccagttcggtccaa-cttgacgtaatatgggggagaggttgatctctccaatccactatcaacgatttcttac-aaagggatacaaatg 11690575  T
Q  200 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 290  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||     
T  11690574 ggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttca 11690476  T
Q  291 ctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  11690475 ctcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actataatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaag 11690386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 106 - 272
Target Start/End: Original strand, 35446885 - 35447052
Alignment:
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 203  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  35446885 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagagtgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 35446982  T
Q  204 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 272  Q
    |||||||||||| ||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  35446983 acaagaaattagattcaacaagatcacaaagaac-aaccctaatttctaccaattttaccaatctcaccaa 35447052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 102 - 272
Target Start/End: Original strand, 36318006 - 36318177
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 199  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||      
T  36318006 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctactctaagggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 36318103  T
Q  200 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 272  Q
    |||||||| ||||||| ||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  36318104 ggttacaataaattagtttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 36318177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 102 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 36773733 - 36773562
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 200  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||| || ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |    
T  36773733 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacataatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttac-aaagagatacaaatg 36773636  T
Q  201 -gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 272  Q
     ||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  36773635 agttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttattcccattttcccaatctcaccaa 36773562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 106 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 26353351 - 26353184
Alignment:
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 203  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||| |||    
T  26353351 tgtttacccggttcggtccaa-cttgacctactctaagggagagagtgatctctccaatccactatcaatgagtacttacaaaaag-atacaaaagtgtt 26353254  T
Q  204 acaagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 272  Q
    ||||||||||||||| | |||  |||||| ||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  26353253 acaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaaccttaatttctacacttttttcaatctcaccaa 26353184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 543 - 671
Target Start/End: Original strand, 32247229 - 32247356
Alignment:
Q  543 aatcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctag-ctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagac 641  Q
    ||||||| |||||||||||| || |||| || | ||||||||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32247229 aatcgtgccacgattttgcatccagcaaacttggctcacggcatctc-aaatcgtgtcacgattccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagac 32247327  T
Q  642 cacaaatttgaagacaaatctcaacaataa 671  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  32247328 cacaaatttgaag-ccaatatcaacaataa 32247356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 589 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 44310548 - 44310483
Alignment:
Q  589 gaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44310548 gaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaag 44310483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 108 - 272
Target Start/End: Original strand, 1631735 - 1631900
Alignment:
Q  108 ttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttac 205  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||||    
T  1631735 ttcactcagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatttctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttac 1631832  T
Q  206 aagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 272  Q
    |||| ||||||||  ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  1631833 aagatattagcttcaacaagctcacaaagaac-aatcctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 1631900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 106 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 33648340 - 33648176
Alignment:
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaagg-tt 203  Q
    |||| ||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||   ||||  |||||||||| ||    
T  33648340 tgtttacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccgctatcaatgagttctttacaaagaaatacaaaagggtt 33648241  T
Q  204 acaagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctc 267  Q
    ||| ||||||||||| | |||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  33648240 acaggaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttttaccattttctcaatctc 33648176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 102 - 342
Target Start/End: Original strand, 17057366 - 17057615
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 200  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |    
T  17057366 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctagtctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 17057463  T
Q  201 -gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 290  Q
     ||||||| ||||||||||  ||||| |  ||| |||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||       ||||||||||||||||||||     
T  17057464 agttacaaaaaattagcttcaacaagcttgcaaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 17057562  T
Q  291 ctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaaga 342  Q
    |||   |||||||||| | || |||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  17057563 ctcacccaaggtgtttacaatatttcccaacccaagaga-actctaatcaaaga 17057615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 102 - 342
Target Start/End: Original strand, 17085349 - 17085598
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 200  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |    
T  17085349 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctagtctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 17085446  T
Q  201 -gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 290  Q
     ||||||| ||||||||||  ||||| |  ||| |||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||       ||||||||||||||||||||     
T  17085447 agttacaaaaaattagcttcaacaagcttgcaaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 17085545  T
Q  291 ctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaaga 342  Q
    |||   |||||||||| | || |||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  17085546 ctcacccaaggtgtttacaatatttcccaacccaagaga-actctaatcaaaga 17085598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 104 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 24398228 - 24398055
Alignment:
Q  104 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-gg 201  Q
    |||||||| ||||||||||||||   ||||||||| || || ||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||   |||| ||||||||| ||    
T  24398228 attgttcagccagttcggtccaacaatgacctactatgggggagagattgatctctccaatccattatcaatgagttctttacaaagagatacaaaaggg 24398129  T
Q  202 ttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccctt--ttcccaatctcaccaa 272  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  24398128 ttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccttaacttctaccctttcttcacaatctcaccaa 24398055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 111 - 272
Target Start/End: Original strand, 42288117 - 42288278
Alignment:
Q  111 acccagttcggtccaaacttgacctactctgaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaaga 209  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||  |||||||  |||||||| |    
T  42288117 acccagttcggtccaa-cttgacctaatctggggagagattgatctctccaatccattatcaatgagctcttac-aaagaaatacaaatgggttacaata 42288214  T
Q  210 aattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 272  Q
    |||||||||  ||||| |||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42288215 aattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccttaatttctacccattttcccaatctcaccaa 42288278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 102 - 272
Target Start/End: Original strand, 33162447 - 33162618
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 199  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||      
T  33162447 agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatctaggggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttcttac-agagagatacaaatg 33162544  T
Q  200 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 272  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  33162545 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcctaatttcaccaa 33162618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 141 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 13121899 - 13121769
Alignment:
Q  141 gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaa 239  Q
    ||||||||||||   ||| |||||||||||||| |||||  |||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||| | |||| |||||| |||||||    
T  13121899 gaggagagattgatttcttcaatccactatcaatgagtttctacaaa-gagatacaaa-ggttacaagaaattatcttcaacaagctcacaaagaacaaa 13121802  T
Q  240 ccctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 272  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  13121801 ccctaatttctaccattttcccagtctcaccaa 13121769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 102 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 17450748 - 17450671
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttc 180  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  17450748 agattgttcacctagttcggtccaa-cttgacctactctgtggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc 17450671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 106 - 218
Target Start/End: Original strand, 17490149 - 17490261
Alignment:
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 203  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||| |||    
T  17490149 tgtttacccagttcggtccaaa-ttgacctactctaggggagagattgatctctacaatccactatcaatgagttcttac-aaagagttacaaaagagtt 17490246  T
Q  204 acaagaaattagctt 218  Q
    |||||||||||||||    
T  17490247 acaagaaattagctt 17490261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 482 - 667
Target Start/End: Original strand, 19344824 - 19345010
Alignment:
Q  482 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatc-tagctca 579  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||  || |||| | | |||||    
T  19344824 tgaccagtccttatcagagatacttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccatgattttgcttccagcaaacttggctca 19344923  T
Q  580 cggca-ccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 667  Q
    ||||| | |||  ||||| |||||||  | |||||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  19344924 cggcatctccg--atcgtatcacgattgccaaatcgcgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaatttgaagccaattttcaaca 19345010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 155 - 272
Target Start/End: Original strand, 7815323 - 7815441
Alignment:
Q  155 ctctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac 252  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| |   || ||||||||||||||||| ||    
T  7815323 ctctccaatccactataaatgagttcttac-aaagagatacaaaagagttacaagaaattagcttcaacaagcttctaaagaacaaaccctaatttcaac 7815421  T
Q  253 ccttttcccaatctcaccaa 272  Q
    | ||||| ||||||||||||    
T  7815422 ctttttctcaatctcaccaa 7815441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 482 - 653
Target Start/End: Original strand, 19349682 - 19349854
Alignment:
Q  482 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatc-tagctca 579  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  || |||| | | |||||    
T  19349682 tgaccagtccttatcagagatacttaaccaacaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctca 19349781  T
Q  580 cggca-ccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaa 653  Q
    ||||| | |||  |||||||||||||  | |||| | | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  19349782 cggcatctccg--atcgtgtcacgattgccaaattgcgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaatttgaa 19349854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 102 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 11067476 - 11067305
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 199  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||  |||| ||||||| ||| || |||||||||| |||| ||||||||      
T  11067476 agattgttgaccgagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctcttcaatccattataaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 11067379  T
Q  200 ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 272  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||| | || ||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  11067378 ggttacaagaaattagctttgacaagctcacaaagtac-aacactaatttctacccatttttccaatttcaccaa 11067305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 607 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 28258729 - 28258668
Alignment:
Q  607 caaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaacaa 668  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  28258729 caaaatcgtgtcacgatttctctgtttttccaaaccacaaatttgaagccaaatttcaacaa 28258668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 7451284 - 7451173
Alignment:
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 203  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||| |  ||    
T  7451284 tgttcacccagttcg-tccaa-cttgacctactgtagaggagagattgatctctgcaatccactatcaatgagttattac-aaagagatacaaatgaatt 7451188  T
Q  204 acaagaaattagctt 218  Q
    |||||||||||||||    
T  7451187 acaagaaattagctt 7451173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 39285007 - 39284930
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagtt 179  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  39285007 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt 39284930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 609 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 8389681 - 8389636
Alignment:
Q  609 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  8389681 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaag 8389636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 464 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 28258853 - 28258713
Alignment:
Q  464 tgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaaa-tcgtgtcacgattttgca 562  Q
    ||||||| |||||||||| |||||  |||||||  | | ||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||| |||| | ||| ||||||||  ||    
T  28258853 tgcgtacgacccaaggtacgaccaa-ccttatcctgaaaacttaaccagcaagtttgaaaatcgtgtcacgatttcacaaaattgtgccacgatttgaca 28258755  T
Q  563 ccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgat 604  Q
    |||||||| | |||||||||||   | |||||||||||||||    
T  28258754 ccctgcaaaccagctcacggcattacaaaatcgtgtcacgat 28258713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 607 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 36757477 - 36757430
Alignment:
Q  607 caaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  36757477 caaaatcgtgtcacgatttttctgttcttccaaaccacaaatttgaag 36757430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 609 - 671
Target Start/End: Complemental strand, 33528155 - 33528093
Alignment:
Q  609 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaacaataa 671  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |  |||||||||    
T  33528155 aaattgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaagccaattaacaacaataa 33528093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 39284920 - 39284770
Alignment:
Q  238 aaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa-------gacactcaatgattttctctctac-aaggtgtttcccatgttttc-aacccaagaga 327  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||       || |||||||||||||| |||  | ||||||||| | |||||| | |||||||||||    
T  39284920 aaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagatactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 39284821  T
Q  328 tactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
     |||||||||||||| |||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  39284820 -actctaatcaaaga-ccctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaag 39284770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 609 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 10706783 - 10706738
Alignment:
Q  609 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  10706783 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaacaacaaatttgaag 10706738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 609 - 654
Target Start/End: Original strand, 21630511 - 21630556
Alignment:
Q  609 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  21630511 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaactacaaatttgaag 21630556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 609 - 654
Target Start/End: Original strand, 39483443 - 39483488
Alignment:
Q  609 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  39483443 aaatcgtgtcacaatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaag 39483488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 143 - 268
Target Start/End: Original strand, 14202450 - 14202569
Alignment:
Q  143 ggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaacc 241  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||       ||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||| |    
T  14202450 ggagagattgatctctccaatctactatcaatgagttcttacaaa--ggatga-----gttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-c 14202541  T
Q  242 ctaatttctaccc-ttttcccaatctca 268  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||    
T  14202542 ataatttctacccattttcccaatctca 14202569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 613 - 669
Target Start/End: Original strand, 33118696 - 33118752
Alignment:
Q  613 cgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaacaat 669  Q
    |||||||||||||| || |||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33118696 cgtgtcacgatttctctattctcccaaaacacaaatttgaagacaaatttcaacaat 33118752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 129 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 42412162 - 42412118
Alignment:
Q  129 ttgacctactctgaggagagattgtactctccaatccactatcaa 173  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  42412162 ttgacctactctggggagagattgatctctccaatccactatcaa 42412118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 615 - 654
Target Start/End: Original strand, 20522794 - 20522833
Alignment:
Q  615 tgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  20522794 tgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaag 20522833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 28672088 - 28671989
Alignment:
Q  117 ttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaatta 214  Q
    ||||||||||   |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||  ||||||||   |||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  28672088 ttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactgtcagtgagttctttgtaaagagatacaaaacggtaacaagaaatta 28671989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 524 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 7450902 - 7450869
Alignment:
Q  524 atcgtgtcacgatttcccaaatcgtgtcacgatt 557  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7450902 atcgtgtcacgttttcccaaatcgtgtcacgatt 7450869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 609 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 23078002 - 23077957
Alignment:
Q  609 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || |||||||    
T  23078002 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccaaaattttgaag 23077957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0565 (Bit Score: 278; Significance: 1e-155; HSPs: 2)
Name: scaffold0565
Description:

Target: scaffold0565; HSP #1
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 380
Target Start/End: Original strand, 2498 - 2878
Alignment:
Q  1 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaataca-caatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa-aagcacca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |    
T  2498 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaa 2597  T
Q  99 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatac 195  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  2598 aa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac 2696  T
Q  196 aaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctcta 295  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  2697 aagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctctcta 2794  T
Q  296 caaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  2795 caaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc-ccctttgatttcccaag 2878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0565; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 455 - 667
Target Start/End: Original strand, 2973 - 3185
Alignment:
Q  455 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttccca-aatcgtgtcac 553  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  2973 gtcacgatttgcgtccgtcccaaggaacgaccagtccttatcaagaatacttaacgagcaagtttctggatcgtgtcacgatttcccacaatcgtgccac 3072  T
Q  554 gattttgcaccc-tgcaatc-tagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttg 651  Q
    ||||| |||||| ||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3073 gattt-gcacccctgcaaccctagctcacggcatcc-gaaatcgtgtcacgatcccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttg 3170  T
Q  652 aagacaaatctcaaca 667  Q
    ||||| ||||||||||    
T  3171 aagac-aatctcaaca 3185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0674 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 2)
Name: scaffold0674
Description:

Target: scaffold0674; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 380
Target Start/End: Original strand, 3620 - 4000
Alignment:
Q  1 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaataca-caatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa-aagcacca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |    
T  3620 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaacac-a 3718  T
Q  99 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatac 195  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  3719 aagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac 3818  T
Q  196 aaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctcta 295  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  3819 aagaggttacaagaaattagcttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctctcta 3916  T
Q  296 caaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  3917 caaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc-ccctttgatttcccaag 4000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0674; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 455 - 667
Target Start/End: Original strand, 4098 - 4310
Alignment:
Q  455 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttccca-aatcgtgtcac 553  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  4098 gtcacgatttgcgtccgtcccaaggaacgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttctggatcgtgtcacgatttcccacaatcgtgccac 4197  T
Q  554 gattttgcaccc-tgcaatc-tagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttg 651  Q
    ||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4198 gattt-gcacccctgcaaccctagctcacggcaccta-aaatcgtgtcacgattccaaaatcgtggcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttg 4295  T
Q  652 aagacaaatctcaaca 667  Q
    ||||| ||||||||||    
T  4296 aagac-aatctcaaca 4310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0137 (Bit Score: 250; Significance: 1e-138; HSPs: 2)
Name: scaffold0137
Description:

Target: scaffold0137; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 6549 - 6167
Alignment:
Q  1 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaataca-caatcacaagataaaa---ggagagggaagaagaaaacaaaagcac 96  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| | |||    
T  6549 caacaatacaccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaaacaaggagagggaagaagaaaacaataacac 6450  T
Q  97 caaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggat 193  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  6449 -aaagagattggtcacccagttcggtccaaacttaacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggat 6351  T
Q  194 acaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctc 293  Q
    ||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  6350 acaagggcttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctctc 6253  T
Q  294 tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  6252 tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgc-ccctttgatttcccaag 6167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0137; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 455 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 6072 - 5859
Alignment:
Q  455 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgattt--cccaaatcgtgtca 552  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||| ||    
T  6072 gtcacgatttgcgtccgtcccaaggaacgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgattttgccacaatcgtgaca 5973  T
Q  553 cgattttgcaccctgcaa-tctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttg 651  Q
    ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| |  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5972 cgaatttgcaccctgcaaccctagctcacggcacctc-caatcgtgtcacgactccaaaatcgtggcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttg 5874  T
Q  652 aagacaaatctcaaca 667  Q
    ||||| ||||||||||    
T  5873 aagac-aatctcaaca 5859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 4)
Name: scaffold0491
Description:

Target: scaffold0491; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 7 - 380
Target Start/End: Original strand, 11063 - 11445
Alignment:
Q  7 aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagat 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||  |    
T  11063 aacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaaacacaaaccacaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaaga--t 11160  T
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggtt 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  11161 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaacgagttcttacaaaagagatacaaaagggtt 11260  T
Q  204 acaagaaattag-cttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttt--tcccaatctcac------caagacactcaatgattttctctct 294  Q
    ||||||||||||  || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||      |||||||||||||||||| | |||     
T  11261 acaagaaattagattttacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaagaacaagacactcaatgatttacactca 11359  T
Q  295 acaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
     |||||||||| | ||||||  ||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11360 ccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-accataaaccctagagttactccctttgatttcccaag 11445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 7 - 380
Target Start/End: Original strand, 8637 - 9019
Alignment:
Q  7 aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagat 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||||||  |    
T  8637 aacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaaccacaagcacaagataaaagaagagggaagaggaaaacaaagacaccaaaga--t 8734  T
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggtt 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  8735 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaacgagttcttacaaaagagatacaaaagggtt 8834  T
Q  204 acaagaaattag-cttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttt--tcccaatctcac------caagacactcaatgattttctctct 294  Q
    ||||||||||||  || | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||      |||||||||||||| ||| | |||     
T  8835 acaagaaattagattttataagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaagaacaagacactcaatggtttacactca 8933  T
Q  295 acaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
     |||||| ||| | ||||||  ||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8934 ccaaggtctttacaatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-accctaaagcctagagttactccctttgatttcccaag 9019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 407 - 667
Target Start/End: Original strand, 9045 - 9308
Alignment:
Q  407 aaatctgcacaagaacacttta-tactagcctccctctgaagcaatcacgtcacgatt--tgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggata 503  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||   ||||  |||||||||  |||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||| |    
T  9045 aaatctgcacaagaacacttaaatactagccttccactgataaaatcgtgtcacgattggtgcgtacgtcccaaggtacgaccagtccttatcatggaaa 9144  T
Q  504 cttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaaatcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacga 603  Q
    ||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  9145 cttaacgagcaagtttgcaaatcgtgtcacgatttcccaaatcatgtcacgatttggcaccctgcaaaccagctcacggcatcacgaaatcgtgtcacga 9244  T
Q  604 tgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 667  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9245 tgccaaattcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaaatctcaaca 9308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 464 - 671
Target Start/End: Original strand, 11550 - 11757
Alignment:
Q  464 tgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaaatcgtgtcacgattttgcac 563  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11550 tgcgtacgtcccaaggtacgaccagtccttatcatggaaacttaacgagcaagtttgcaaatcgtgtcacgatttcccaaatcgtgtcacgatttggcac 11649  T
Q  564 cctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctc 663  Q
    ||||||| | ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  11650 cctgcaaaccagctcacggcatcatgaaatcgtgtcacgatgccaaattcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaattttgaagccaaatctc 11749  T
Q  664 aacaataa 671  Q
    ||||||||    
T  11750 aacaataa 11757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 160; Significance: 7e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 7e-85
Query Start/End: Original strand, 7 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 434798 - 434418
Alignment:
Q  7 aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagat 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||   |||||||  ||||||| |  |    
T  434798 aacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaacacaagcacaagataaaagg-gagagaagagagaaacaaacacaccaaata--t 434702  T
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggtt 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  434701 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagggtt 434603  T
Q  204 acaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccctttt--cccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctc 293  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||       |||||||||||||||||||| |||    
T  434602 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttccccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc 434504  T
Q  294 tacaaggtgtttcccatgtttt-caacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
      |||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  434503 accaaggtatttaccatgttttccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagttgcttcctttgatttcccaag 434418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 135; Significance: 6e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 407 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 17695 - 17430
Alignment:
Q  407 aaatctgcacaagaacacttta-tactagcctccctctgaagcaatcacgtcacgatttg--cgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggata 503  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||   ||||  ||||||||| |  |||||  | ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  17695 aaatctgcacaagaacacttaaatactagccttccactgataaaatcgtgtcacgattggaacgtacgtcacaaggtacgaccaatccttatcaaggata 17596  T
Q  504 cttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacg 602  Q
    |||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  17595 cttaacgagcaagtttgaaaatcatgtcacgatttcccaagatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaaccagctcacggcatcacgaaatcgtgtcacg 17496  T
Q  603 atgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaacaa 668  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17495 atgccaaattcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaaatctcaacaa 17430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1519 (Bit Score: 133; Significance: 9e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold1519
Description:

Target: scaffold1519; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 7 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 1180 - 802
Alignment:
Q  7 aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaag-caccaaagaga 104  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| |||| || |||||  ||||| || |  ||||||||||||  ||||   ||||||||  |||||||||      
T  1180 aacaccacctagatctaatctaggtatcaaagtgaaaagcacaaaccacaagcaaagtataaaaggagag--aagagagaaacaaaacacaccaaaga-- 1085  T
Q  105 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggt 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||   |||| ||||||||| |||    
T  1084 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttgtt--caaagagatacaaaagggt 987  T
Q  203 tacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcac------caagacactcaatgattttctctc 293  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||      |||||||||||||||||||| |||    
T  986 tacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaagaacaagacactcaatgattttcactc 888  T
Q  294 tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
      |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  887 accaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagttgctgcctttgatttcccaag 802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1519; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 475 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 675 - 523
Alignment:
Q  475 caaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatct 573  Q
    ||||||| ||||||||| ||||  ||| ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  675 caaggtacgaccagtccctatcctggaaacttaacgagcaaatttgaaaatcgtgtcacgattcctcaagatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaact 576  T
Q  574 agctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttc 626  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  575 agctcacggcatcacgaaatcgtgtcacgatgccaaattcgtgtcacgatttc 523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286 (Bit Score: 124; Significance: 2e-63; HSPs: 3)
Name: scaffold0286
Description:

Target: scaffold0286; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 405 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 22205 - 21939
Alignment:
Q  405 tcaaatctgcacaagaacacttta-tactagcctccctctgaagcaatcacgtcacgatttg--cgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaagga 501  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||   ||||  ||||||||| |  |||||  | ||||||| |||| ||||||||||  ||    
T  22205 tcaaatctgcacaagaacacttaaatactagccttccactgataaaatcgtgtcacgattggtacgtacgtcacaaggtacgacctgtccttatcagtga 22106  T
Q  502 tacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtca 600  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22105 tacttaacgagcaagttttacaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgtcacgatttggcgtcctgcaaactagctcacggcacctcgaaatcgtgtca 22006  T
Q  601 cgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 667  Q
    |||||||||| || |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  22005 cgatgccaaattcatgtcccgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaaaccaaatctcaaca 21939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 51 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 11778 - 11508
Alignment:
Q  51 acacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagaga 149  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| |||||   |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11778 acacaagcacaagataaaagg-gagagaagagataaacaaatacaccaa-gagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagaga 11681  T
Q  150 ttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatt 247  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  11680 ttgaactctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatt 11583  T
Q  248 tctacc-cttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttt 314  Q
    ||||||  |||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||  |||||||||| | ||||||    
T  11582 tctaccatttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgttt 11508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 322 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 22286 - 22229
Alignment:
Q  322 aagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22286 aagagaaactctaatcaaaga-ccctaaaccctagagttgctccctttgatttcccaag 22229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 96; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 102 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 114774 - 114539
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 200  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  114774 agattgttcatccagttcggtctaaacttaacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaag 114676  T
Q  201 -gttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 290  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||     
T  114675 cgttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccttaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 114577  T
Q  291 ctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagaga 327  Q
    |||  |||||||||| | ||||||  ||||||||||||    
T  114576 ctcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 114539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1808 (Bit Score: 92; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold1808
Description:

Target: scaffold1808; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 139 - 1
Alignment:
Q  1 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa-aagcacca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||    
T  139 caacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaaca-ca 41  T
Q  99 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctact 138  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40 aagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctact 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355 (Bit Score: 90; Significance: 4e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0355
Description:

Target: scaffold0355; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 482 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 3522 - 3349
Alignment:
Q  482 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcac 580  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||  ||| ||| |||||||||    
T  3522 tgactagtccttatcattgatacttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtccttcaaactagctcac 3423  T
Q  581 ggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
    |||  |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  3422 ggccacttgaaatcgtgtcacgatgtcaaaatcgtgtcacgatttctcttttcttccagaccacaaatttgaag 3349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0464 (Bit Score: 87; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0464
Description:

Target: scaffold0464; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 482 - 654
Target Start/End: Original strand, 760 - 933
Alignment:
Q  482 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctag-ctca 579  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||| || | ||||    
T  760 tgaccagtccttatcagagatacttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcatccagcaaacttggctca 859  T
Q  580 cggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
    ||||||| | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  860 cggcacctccaa-tcgtgtcacgattccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccataccacaaatttgaag 933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135 (Bit Score: 84; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0135
Description:

Target: scaffold0135; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 472 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 34748 - 34566
Alignment:
Q  472 acccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaa 570  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||  | |||||    
T  34748 acccaaggta-gacaagtccttatcagtgatacttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcatgcaa 34650  T
Q  571 tctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
     | | || |||||  |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34649 acaaactaacggccacttgaaatagtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaag 34566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 82; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 542 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 8036 - 7911
Alignment:
Q  542 aaatcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagac 641  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  8036 aaatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaaccaactcacggcatcacaaaatcgtgtcacgatgccaaattcgtgtcacgatttctctgttctttcagac 7937  T
Q  642 cacaaatttgaagacaaatctcaaca 667  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||    
T  7936 cacaaatttgaagccaaatctcaaca 7911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 75; Significance: 4e-34; HSPs: 4)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 466 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 132953 - 132752
Alignment:
Q  466 cgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaaa-tcgtgtcacgattttgcacc 564  Q
    ||||| |||||||||| |||||  |||||||  | | ||||||| ||||||||| |  ||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||  |||     
T  132953 cgtacgacccaaggtacgaccaa-ccttatcctgaaaacttaaccagcaagtttgaaaatcatgtcacgattccacaaaatcgtgtcacgatttgacaca 132855  T
Q  565 ctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctca 664  Q
    |||||| | |||||||| || | | |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  132854 ctgcaaaccagctcacgacatcacaaaatcgtgccacgataccacaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaagacaaatctca 132755  T
Q  665 aca 667  Q
    |||    
T  132754 aca 132752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 102 - 380
Target Start/End: Original strand, 149094 - 149380
Alignment:
Q  102 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 199  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||      
T  149094 agattgttgacccagttcggtccaa-cttaacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatataaatg 149191  T
Q  200 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttcta-cccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 290  Q
    ||| |||||||||||||||  ||||| | ||||  ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||     
T  149192 ggtaacaagaaattagcttcaacaagcttacaaaaaac-aaccctaatttctatccgttttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttca 149290  T
Q  291 ct-ctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 380  Q
    || |  |||||||||| | |||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||   |||| |  ||||||||||||||||    
T  149291 ctaccccaaggtgtttacaatgtttctcaacctaagaga-actctaatcaaag-accctcaacccacaagttacctcctttgatttcccaag 149380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 609 - 654
Target Start/End: Original strand, 6252 - 6297
Alignment:
Q  609 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  6252 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaag 6297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 609 - 654
Target Start/End: Original strand, 3060 - 3105
Alignment:
Q  609 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  3060 aaatcgtgtcatgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaag 3105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 71; Significance: 9e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 106 - 272
Target Start/End: Original strand, 18004 - 18171
Alignment:
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 203  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||| | |||    
T  18004 tgttcacccagttcgatccaaacttgacctaccctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt-ttac-aaagagatacaaatgagtt 18101  T
Q  204 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 272  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  18102 acaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaac-aaccctaatttctaccaattttcccactctcaccaa 18171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 70; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 272
Target Start/End: Original strand, 20319 - 20583
Alignment:
Q  7 aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagaga 104  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| || |||| || |||||||| ||||||   ||| |||  ||||  ||||||| |      
T  20319 aacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaacacaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaa--caaacacaccaaaaa-- 20414  T
Q  105 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctgagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggt 202  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||    
T  20415 ttgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccaatatcaaagagttcttac-aaagagatacaaatgggt 20512  T
Q  203 tacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcaccaa 272  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||| |||||||||| | | ||||||||||||||||||    
T  20513 tacaagaaattagcttcaacaagttcacaaaaaacaaa-cctaatttctgctcattttcccaatctcaccaa 20583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 106 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 7494 - 7327
Alignment:
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-gaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 203  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  7494 tgttcacccagttcggtccaa-cttaacctactctagaggagagattgatctttccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 7397  T
Q  204 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 272  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| |||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  7396 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccttaatttctacccatttttccaatctcaccaa 7327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 590 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 6784 - 6750
Alignment:
Q  590 aaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatt 624  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6784 aaatcgtgccacgatgccaaaatcgtgtcacgatt 6750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0510 (Bit Score: 62; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0510
Description:

Target: scaffold0510; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 503 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 1248 - 1083
Alignment:
Q  503 acttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaaa-tcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcac 601  Q
    ||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||  |||||||||| | | ||||||  |   | ||||||||||||    
T  1248 acttaaccagcaagtttaaaaatcgtgtcacgatttcacaaaatcgtaccacgatttgacaccctgcaaaccaactcacgatattacaaaatcgtgtcac 1149  T
Q  602 gatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 667  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  1148 gatgccaaaatcgtgtcacgatttttctgttctttcaaaccacaaatttgaaggcaaatttcaaca 1083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1455 (Bit Score: 56; Significance: 8e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold1455
Description:

Target: scaffold1455; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 591 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 1784 - 1721
Alignment:
Q  591 aatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1784 aatcgtgtcacgattccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaag 1721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 55; Significance: 3e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 503 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 43599 - 43441
Alignment:
Q  503 acttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaaa-tcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcac 601  Q
    ||||||| ||||||||| |  ||| |||||||||||| |||| ||||  ||||||||  ||||||| || | |||||||| ||   | ||||||||||||    
T  43599 acttaaccagcaagtttgaaaatcatgtcacgatttcacaaaatcgtaccacgatttgacaccctgtaaaccagctcacgacattacaaaatcgtgtcac 43500  T
Q  602 gatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaat 660  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  43499 gatgccacaatcgtgtcacgatttctctattcttccaaaccataaatttgaagccaaat 43441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 607 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 36384 - 36322
Alignment:
Q  607 caaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaacaat 669  Q
    ||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  36384 caaaatcgtatcatgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaagccaattttcaacaat 36322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0665 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0665
Description:

Target: scaffold0665; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 472 - 604
Target Start/End: Original strand, 8098 - 8230
Alignment:
Q  472 acccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaa 570  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||  |||||||    
T  8098 acccaaggt-tgacaagtccttatcagtgatacttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgattttccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaa 8196  T
Q  571 tctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgat 604  Q
     ||||||||||||  |  ||||||||||||||||    
T  8197 actagctcacggccacttgaaatcgtgtcacgat 8230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0665; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 609 - 654
Target Start/End: Original strand, 8216 - 8261
Alignment:
Q  609 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8216 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaag 8261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 106 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 10656 - 10515
Alignment:
Q  106 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctg-aggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggtt 203  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  10656 tgtttacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccactatcaacgagttcttac-aaagagatacaaaatggtt 10559  T
Q  204 acaagaaattagcttgaca--agttcacaatgaacaaaccctaattt 248  Q
    |||| ||||||||   |||  || |||||| ||||||||||||||||    
T  10558 acaataaattagc---acaagagctcacaaagaacaaaccctaattt 10515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 51; Significance: 8e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 482 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 13969 - 13796
Alignment:
Q  482 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatc-tagctca 579  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  || |||| | |||||||    
T  13969 tgaccagtccttatcagagatacttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttagctca 13870  T
Q  580 cggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
    | || | ||   ||||||||||||   |||||||||| ||||||| | ||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  13869 ctgc-ctccctgatcgtgtcacgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttctcccaaaccactaatttgaag 13796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 481 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 18850 - 18663
Alignment:
Q  481 atgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatc-tagctc 578  Q
    |||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  || |||| | ||||||    
T  18850 atgaccagtctttatcagagatacttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtggcacgattttgcttccagcaaacttagctc 18751  T
Q  579 ac-ggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 667  Q
    || | | | |||  |||||||||||||  | |||||| | ||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  18750 actgcctctccg--atcgtgtcacgattgccaaatcgcgacacgattcctctgttctcccaaaccacaaatttgaagccaattttcaaca 18663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 51; Significance: 8e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 482 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 176635 - 176462
Alignment:
Q  482 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatc-tagctca 579  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  || |||| | |||||||    
T  176635 tgaccagtccttatcagagatacttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttagctca 176536  T
Q  580 cggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
    | || | ||   ||||||||||||   |||||||||| ||||||| | ||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  176535 ctgc-ctccctgatcgtgtcacgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttctcccaaaccactaatttgaag 176462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 50; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 473 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 1932 - 1751
Alignment:
Q  473 cccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaat 571  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  || ||||     
T  1932 cccaaggt-tgaccagtccttatcagagaaacttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaa 1834  T
Q  572 c-tagctcac-ggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
    | | |||||| | | |||||  |||||||||||||  | |||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  1833 cttggctcactgcctccccg--atcgtgtcacgattgccaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccactaatttgaag 1751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 50; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 473 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 148637 - 148456
Alignment:
Q  473 cccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaat 571  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  || ||||     
T  148637 cccaaggt-tgaccagtccttatcagagaaacttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaa 148539  T
Q  572 c-tagctcac-ggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 654  Q
    | | |||||| | | |||||  |||||||||||||  | |||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  148538 cttggctcactgcctccccg--atcgtgtcacgattgccaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccactaatttgaag 148456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 46; Significance: 8e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 607 - 668
Target Start/End: Original strand, 45744 - 45805
Alignment:
Q  607 caaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaacaa 668  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45744 caaaattgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaagccaaatctcaacaa 45805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 160 - 268
Target Start/End: Original strand, 80338 - 80447
Alignment:
Q  160 caatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-tt 256  Q
    |||| ||||||| | ||||||||||||||  ||||||||  |||| ||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||    
T  80338 caattcactatctatgagttcttacaaaa-agatacaaatgggttgcaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccatt 80435  T
Q  257 ttcccaatctca 268  Q
    ||||||||||||    
T  80436 ttcccaatctca 80447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University