View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8972_high_4 (Length: 480)

Name: NF8972_high_4
Description: NF8972
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8972_high_4
NF8972_high_4
[»] chr7 (17 HSPs)
chr7 (19-475)||(2691067-2691523)
chr7 (19-468)||(2135791-2136239)
chr7 (19-468)||(2099156-2099605)
chr7 (19-468)||(2244899-2245348)
chr7 (19-468)||(2066344-2066778)
chr7 (19-366)||(2057048-2057398)
chr7 (19-256)||(2073451-2073688)
chr7 (19-256)||(2139040-2139277)
chr7 (286-468)||(2126683-2126865)
chr7 (19-256)||(2114547-2114784)
chr7 (19-256)||(2126437-2126674)
chr7 (286-468)||(2073697-2073879)
chr7 (289-468)||(2114796-2114975)
chr7 (295-468)||(2139298-2139471)
chr7 (63-252)||(1696158-1696347)
chr7 (363-468)||(2057556-2057661)
chr7 (364-468)||(1695942-1696046)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 381; Significance: 0; HSPs: 17)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 2691523 - 2691067
Alignment:
Q  19 tgagatttggattatatctcaaatctagaactttcaagtttggaagatgaaatattccaactggaaattcaccatacaaatccgaattgtagagcgatag 118  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  2691523 tgagattttgattatatctcaaatctagaactttcaagtttggaagatgaaatactccaactggaaattcaccatacaaatccgaattgtatagagatag 2691424  T
Q  119 ttctttcaatgatgttaaatttgtgagtgtgtctggtaaagtagataaaattgtcacatcactaagaaaaaggatctcaagttttgtggagtttttaatt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2691423 ttctttcaatgatgttaaatttgtgagtgtgtctggtaaagtagatgaaattgtcacatcactaagaaaaaggatctcaagttttgtggaatttttaatt 2691324  T
Q  219 atgcttttgaggctggacaatttgagttgcaacagattaactgcactacctttaggacttgctatatctctgaagcctagatcaagagaccgcaacttgg 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  2691323 atgcttttgaggctggacaatttgagttgcaacagattaactgcactacctttaggacttgctatatctcttaagcctagatcaagagactgcagcttgg 2691224  T
Q  319 acaactgtgaaacttgtgatggaatttctccagacaataagctcagagaaaggttcagatattttagttgtgaaagcttacctatcttagacgggatttg 418  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||     
T  2691223 acaactgtgaaatttgtggtggaatttctccagagaataagctaagagaaaggttcagaaattttagttgcgaaagcatacctatcttggacgggatttt 2691124  T
Q  419 agagtaattgaagttattatcagaaagatcaagaactcgaaggtgcacaacacgaaa 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2691123 agagtaattgaagttattatcagaaagatcaagaactcgaaggtgcacaagacgaaa 2691067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 19 - 468
Target Start/End: Original strand, 2135791 - 2136239
Alignment:
Q  19 tgagatttggattatatctcaaatctagaactttcaagtttggaagatgaaatattccaactggaaattcaccatacaaatccgaattgtagagcgatag 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || |||||||| || |||||    
T  2135791 tgagatttggattatatctcaaatctagaagttccaagtttggaagatgaaatactccaactggaaatgcaccatacaattcagaattgtaaagagatag 2135890  T
Q  119 ttctttcaatgatgttaaatttgtgagtgtgtctggtaaagtagataaaattgtcacatcactaagaaaaaggatctcaagttttgtggagtttttaatt 218  Q
    || ||| | ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| || |||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  2135891 ttttttta-tgaagttagattcgtgagtgtgtctggtaaagtagatgaaatagttacaaaactaagaaaaaggatctcaatttttgttgagttttgaatt 2135989  T
Q  219 atgcttttgaggctggacaatttgagttgcaacagattaactgcactacctttaggacttgctatatctctgaagcctagatcaagagaccgcaacttgg 318  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||||||||| |||   || |||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  2135990 atgcttctgagactagacaatttgagttgcaacaaattggatgtactacctttaggacgtactatagctctgaaacctagatcaagagacaacaacttgg 2136089  T
Q  319 acaactgtgaaacttgtgatggaatttctccagacaataagctcagagaaaggttcagatattttagttgtgaaagcttacctatcttagacgggatttg 418  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||     
T  2136090 acaactgggaaacttgtcgtggaatttctccagaaaataagttaagagaaaggttcaaaaattttagttgtgaaagctcacctatcttggtagggatttt 2136189  T
Q  419 agagtaattgaagttattatcagaaagatcaagaactcgaaggtgcacaa 468  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2136190 agagtaattgaagttattatcagatagatcaagaactcgaaggtgcacaa 2136239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 19 - 468
Target Start/End: Original strand, 2099156 - 2099605
Alignment:
Q  19 tgagatttggattatatctcaaatctagaactttcaagtttggaagatgaaatattccaactggaaattcaccatacaaatccgaattgtagagcgatag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||| |||||  | |||||||| || |||||||| || |||||    
T  2099156 tgagatttggattatatctcaaatccagaagttccaagtttggaagatgaaatactccaaccggaaacgctccatacaattcagaattgtatagagatag 2099255  T
Q  119 ttctttcaatgatgttaaatttgtgagtgtgtctggtaaagtagataaaattgtcacatcactaagaaaaaggatctcaagttttgtggagtttttaatt 218  Q
    | ||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  2099256 tgctttcaacgaagttagatttgtgagtgtctctggtaaagtagatgaaattgtcacaaaactaagaaaaaggatctcaatttttgttgagttttgaatt 2099355  T
Q  219 atgcttttgaggctggacaatttgagttgcaacagattaactgcactacctttaggacttgctatatctctgaagcctagatcaagagaccgcaacttgg 318  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||||||||| |||   || |||||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||| |    
T  2099356 atgcttctgagactagacaatttgagttgcaacaaattggatgtactacctttaggatgtactatagctctgtagcctagatcaagagacaacaactttg 2099455  T
Q  319 acaactgtgaaacttgtgatggaatttctccagacaataagctcagagaaaggttcagatattttagttgtgaaagcttacctatcttagacgggatttg 418  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |    
T  2099456 acaactgtgaaacatgtggtggaatttctccagaaaataagctaagggaaaggttcagatgttttaattgtgaaagctgacctatcttggacgggattgg 2099555  T
Q  419 agagtaattgaagttattatcagaaagatcaagaactcgaaggtgcacaa 468  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2099556 agagtaattgaagtcattgtcagaaagatcaagaactcgaaggtgtacaa 2099605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 19 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 2245348 - 2244899
Alignment:
Q  19 tgagatttggattatatctcaaatctagaactttcaagtttggaagatgaaatattccaactggaaattcaccatacaaatccgaattgtagagcgatag 118  Q
    ||||||||| |||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| || |||||||| || || ||    
T  2245348 tgagatttgaattatatcccaaatccagaagttccaagtttggaagatgaaatactccaactggaaactctccatacaattcagaattgtatagagacag 2245249  T
Q  119 ttctttcaatgatgttaaatttgtgagtgtgtctggtaaagtagataaaattgtcacatcactaagaaaaaggatctcaagttttgtggagtttttaatt 218  Q
    | ||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  2245248 tgctttcaacgaagttagatttgtgagtgtgtctggtaaagtagatgaaatagtcacataactaagaaaaaggatctcaatttttgttgagttttgaatt 2245149  T
Q  219 atgcttttgaggctggacaatttgagttgcaacagattaactgcactacctttaggacttgctatatctctgaagcctagatcaagagaccgcaacttgg 318  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||||||||| |||   || |||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  2245148 atgcttctgagactagacaatttgagttgcaacaaattggatgtactacctttaggacgtactatagctctgaaacctagatcaagagacaacaacttgg 2245049  T
Q  319 acaactgtgaaacttgtgatggaatttctccagacaataagctcagagaaaggttcagatattttagttgtgaaagcttacctatcttagacgggatttg 418  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||| || |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  2245048 acaactgtgaaaattgttgtggaatttctcctgaaaataagctaatagaaaggtttagatattttagttgtgaaagctcacctatcttggacgggatttg 2244949  T
Q  419 agagtaattgaagttattatcagaaagatcaagaactcgaaggtgcacaa 468  Q
    ||||||||||||||  || ||| |||||||||| | ||||||||| ||||    
T  2244948 agagtaattgaagtcgttgtcaaaaagatcaagtaatcgaaggtgtacaa 2244899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 19 - 468
Target Start/End: Original strand, 2066344 - 2066778
Alignment:
Q  19 tgagatttggattatatctcaaatctagaactttcaagtttggaagatgaaatattccaactggaaattcaccatacaaatccgaattgtagagcgatag 118  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| |||  || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||||  || |||||    
T  2066344 tgagatttagattaaatctcaaatccagatattccaagtttggaagatgaaatactccaacaggaaattcaccatacaattcagaattgtgtagagatag 2066443  T
Q  119 ttctttcaatgatgttaaatttgtgagtgtgtctggtaaagtagataaaattgtcacatcactaagaaaaaggatctcaagttttgtggagtttttaatt 218  Q
    || ||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  2066444 ttttttcaatgaagttagatttgcgagtgtatctggtaaagtagatgaaattgttacataactaagaaaaagggtctcaagttttgttgagttttgaatt 2066543  T
Q  219 atgcttttgaggctggacaatttgagttgcaacagattaactgcactacctttaggacttgctatatctctgaagcctagatcaagagaccgcaacttgg 318  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| |               || |  || || |  ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  2066544 atgcttttgagactggataatttgagttgcagcagattca---------------gattgtctgtagccatgaagcctagatcaagagacaacaacttgg 2066628  T
Q  319 acaactgtgaaacttgtgatggaatttctccagacaataagctcagagaaaggttcagatattttagttgtgaaagcttacctatcttagacgggatttg 418  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  2066629 acagctgtgaaacttgtggtggaatttctccggaaaataaactacgagaaaggttcagaaattttagttgtgaaagcttacctatcttggatgggatttg 2066728  T
Q  419 agagtaattgaagttattatcagaaagatcaagaactcgaaggtgcacaa 468  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2066729 agagtaattgaagtcattgtcggaaagatcaagaactcgaaggtgcacaa 2066778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 366
Target Start/End: Original strand, 2057048 - 2057398
Alignment:
Q  19 tgagatttggattatatctcaaatctagaactttcaagtttggaagatgaaatattccaactggaaattcaccatacaaatccgaattgtagagcgatag 118  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||||| || |||||    
T  2057048 tgagattttgattatatcccaaatccagaagttccaagtttggaagacgaaatactccaacaggaaattcaccatacaattcagaattgtaaagagatag 2057147  T
Q  119 ttctttcaatgatgttaaatttgtgagtgtgtctggtaaagtagataaaattgtcacatcactaagaaaaaggatctcaagttttgtggagtttttaatt 218  Q
    || |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||| | |||  | ||| ||||||| ||||||| ||||    
T  2057148 ttttttcaacgaagttagatttgtgagtgtgtctggtaaagtagatgaaatagtcacaaaactaagtagaagagtttcatgttttgttgagttttgaatt 2057247  T
Q  219 atgcttttgaggctggacaatttgagttgcaacagattaactgcactacctttaggacttgctatatctctgaagcct---agatcaagagaccgcaact 315  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||   || |||||||||||||  | ||| | |||| ||||||   |||||||||||  |||||     
T  2057248 atgcttttgaggctggacaattttaattgcaacagattggatgtactacctttaggatgtactacagctctaaagcctccaagatcaagagagagcaaca 2057347  T
Q  316 tggacaactgtgaaacttgtgatggaatttctccagacaataagctcagag 366  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||    
T  2057348 tgaacaactgtgaaacttgtggtggaatttctctagaaaataagctaagag 2057398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 256
Target Start/End: Original strand, 2073451 - 2073688
Alignment:
Q  19 tgagatttggattatatctcaaatctagaactttcaagtttggaagatgaaatattccaactggaaattcaccatacaaatccgaattgtagagcgatag 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||||| || || ||    
T  2073451 tgagatttggattagatctcaaatccagaacttccaagtttggaagatgaaatactccaacaggaaattcaccatacaattcagaattgtatagagacag 2073550  T
Q  119 ttctttcaatgatgttaaatttgtgagtgtgtctggtaaagtagataaaattgtcacatcactaagaaaaaggatctcaagttttgtggagtttttaatt 218  Q
    | |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||  ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  2073551 tgctttcaatgaagttagatttgtgagtgtatctggtaaattagatgaaattgttacagaactaagataaagggtctcaagttttgttgagttttgaatt 2073650  T
Q  219 atgcttttgaggctggacaatttgagttgcaacagatt 256  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  2073651 atgcttttgagactggataatttgagttgcagcagatt 2073688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 256
Target Start/End: Original strand, 2139040 - 2139277
Alignment:
Q  19 tgagatttggattatatctcaaatctagaactttcaagtttggaagatgaaatattccaactggaaattcaccatacaaatccgaattgtagagcgatag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||||  || | |||    
T  2139040 tgagatttggattatatctcaaatccagatattccaagtttggaagatgaaatactccaacaggaaattcaccatacaattcagaattgtgtagagttag 2139139  T
Q  119 ttctttcaatgatgttaaatttgtgagtgtgtctggtaaagtagataaaattgtcacatcactaagaaaaaggatctcaagttttgtggagtttttaatt 218  Q
    || ||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  2139140 ttttttcaatgaagttagatttgcgagtgtatctggtaaagtagatgaaattgttacataactaagaaaaagggtctcaagttttgttgagttttgaatt 2139239  T
Q  219 atgcttttgaggctggacaatttgagttgcaacagatt 256  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  2139240 atgcttttgagactggataatttgagttgcagcagatt 2139277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 286 - 468
Target Start/End: Original strand, 2126683 - 2126865
Alignment:
Q  286 ctctgaagcctagatcaagagaccgcaacttggacaactgtgaaacttgtgatggaatttctccagacaataagctcagagaaaggttcagatattttag 385  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| |||||     
T  2126683 ctctgaagcctagatcaagagacaacaacttggacaactgtgaaacttgtggtggaatttctccagaaaagaagctcagggaaaggttcagatgttttaa 2126782  T
Q  386 ttgtgaaagcttacctatcttagacgggatttgagagtaattgaagttattatcagaaagatcaagaactcgaaggtgcacaa 468  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2126783 ttgtgaaagctcacctatcttggatgggatttgagagtaattgaagtcattgtcagaaagatcaagaactcgaaggtgcacaa 2126865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 19 - 256
Target Start/End: Original strand, 2114547 - 2114784
Alignment:
Q  19 tgagatttggattatatctcaaatctagaactttcaagtttggaagatgaaatattccaactggaaattcaccatacaaatccgaattgtagagcgatag 118  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||  || |||||||| || |||||    
T  2114547 tgagatttggattatatcccaaatccaaaattttcaagtttggaagatgtaatactccaactggaaattcgccatacagctcagaattgtaaagagatag 2114646  T
Q  119 ttctttcaatgatgttaaatttgtgagtgtgtctggtaaagtagataaaattgtcacatcactaagaaaaaggatctcaagttttgtggagtttttaatt 218  Q
    || |||||| || |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  2114647 ttttttcaacgaagttagatttgtgagtgtgtttggtaaagtagatgaaatagtcacaaaactaagaaaaaggatctcgagttttgttgagttttgaatt 2114746  T
Q  219 atgcttttgaggctggacaatttgagttgcaacagatt 256  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  2114747 atgcttttgagaatggacaatttgagttgcagcagatt 2114784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 19 - 256
Target Start/End: Original strand, 2126437 - 2126674
Alignment:
Q  19 tgagatttggattatatctcaaatctagaactttcaagtttggaagatgaaatattccaactggaaattcaccatacaaatccgaattgtagagcgatag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| || |||||||| || || ||    
T  2126437 tgagatttggattatatctcaaatccagaagttccaagtttggaagatgaaatactccaactggaaactctccatacaattcagaattgtatagagacag 2126536  T
Q  119 ttctttcaatgatgttaaatttgtgagtgtgtctggtaaagtagataaaattgtcacatcactaagaaaaaggatctcaagttttgtggagtttttaatt 218  Q
    | ||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||  |||| ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  2126537 tgctttcaacgaagttagatttgtgagtgtatctggtaaagtagatgaaattgttacatgactaagatgaagggtctcaagttttgttgagttttgaatt 2126636  T
Q  219 atgcttttgaggctggacaatttgagttgcaacagatt 256  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  2126637 atgcttttgagactggataatttgagttgcagcagatt 2126674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 286 - 468
Target Start/End: Original strand, 2073697 - 2073879
Alignment:
Q  286 ctctgaagcctagatcaagagaccgcaacttggacaactgtgaaacttgtgatggaatttctccagacaataagctcagagaaaggttcagatattttag 385  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||| |||||     
T  2073697 ctctgaagcctagatcaagagacaacaacttggacaactgtgaaacttgtggtggaatttctccagaaaagaagctcagggaaagtttcagatgttttaa 2073796  T
Q  386 ttgtgaaagcttacctatcttagacgggatttgagagtaattgaagttattatcagaaagatcaagaactcgaaggtgcacaa 468  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2073797 ttgtgaaagctcacctatcttggatgggatttgagagtaattgaagtcattgtcagaaagatcaagaactcgaaggtgcacaa 2073879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 289 - 468
Target Start/End: Original strand, 2114796 - 2114975
Alignment:
Q  289 tgaagcctagatcaagagaccgcaacttggacaactgtgaaacttgtgatggaatttctccagacaataagctcagagaaaggttcagatattttagttg 388  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  2114796 tgaagcctagatcaagagacaacaacttagacaactgtgaaacttgtggtggaatttctccggaaaataaactacgagaaaggttcagaaattttagttg 2114895  T
Q  389 tgaaagcttacctatcttagacgggatttgagagtaattgaagttattatcagaaagatcaagaactcgaaggtgcacaa 468  Q
    ||||||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2114896 tgaaagctcgcctatcttggatgggatttgagagtaattgaagtcattgtcagaaagatcaagaactcgaaggtgcacaa 2114975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 295 - 468
Target Start/End: Original strand, 2139298 - 2139471
Alignment:
Q  295 ctagatcaagagaccgcaacttggacaactgtgaaacttgtgatggaatttctccagacaataagctcagagaaaggttcagatattttagttgtgaaag 394  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2139298 ctagatcaagagacaacaacttggacaactgtgaaacttgtggtggaatttctccggaaaataaactacgagaaaggttcagaaattttagttgtgaaag 2139397  T
Q  395 cttacctatcttagacgggatttgagagtaattgaagttattatcagaaagatcaagaactcgaaggtgcacaa 468  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2139398 cttacctatcttggatggaatttgagagtaattgaagtcattgtcagaaagatcaagaactcgaagatgcacaa 2139471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 63 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 1696347 - 1696158
Alignment:
Q  63 agatgaaatattccaactggaaattcaccatacaaatccgaattgtagagcgatagttctttcaatgatgttaaatttgtgagtgtgtctggtaaagtag 162  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| || |||||| ||||||| || |||| ||||| ||||||||  |||||||| |    
T  1696347 agatgaaaaattccaactggaaattcaccatacaattcacaattgtaaagagatagtactttcaacgaagttagatttgagagtgtgttcggtaaagttg 1696248  T
Q  163 ataaaattgtcacatcactaagaaaaaggatctcaagttttgtggagtttttaattatgcttttgaggctggacaatttgagttgcaaca 252  Q
    || |||| ||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||  |||||| ||| |||||| |||| || ||||||| ||| |||||||    
T  1696247 atgaaatagtcacataactaagataaagtatctcgagttttgtcaagttttgaatgatgcttctgagactagacaattcgagctgcaaca 1696158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 363 - 468
Target Start/End: Original strand, 2057556 - 2057661
Alignment:
Q  363 agagaaaggttcagatattttagttgtgaaagcttacctatcttagacgggatttgagagtaattgaagttattatcagaaagatcaagaactcgaaggt 462  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  2057556 agagaaaggttcagaaattttagtcgtggaagctcacctatcttagacgggattttggagtaattgaagtcattgtcagaaagatcaagaacttgaaggt 2057655  T
Q  463 gcacaa 468  Q
    ||||||    
T  2057656 gcacaa 2057661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 364 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 1696046 - 1695942
Alignment:
Q  364 gagaaaggttcagatattttagttgtgaaagcttacctatcttagacgggatttgagagtaattgaagttattatcagaaagatcaagaactcgaaggtg 463  Q
    |||||||||| | ||||||||  || |||||||  |||||| |||| |||||| ||||||| ||||| | |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  1696046 gagaaaggtttaaatattttatctgcgaaagctcgcctatcctagatgggattcgagagtatttgaaatcattatctgcaagatcaagaactcgaaggtg 1695947  T
Q  464 cacaa 468  Q
    |||||    
T  1695946 cacaa 1695942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University