View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8973_low_4 (Length: 648)

Name: NF8973_low_4
Description: NF8973
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8973_low_4
NF8973_low_4
[»] chr1 (121 HSPs)
chr1 (36-635)||(21714426-21715026)
chr1 (12-635)||(42864830-42865451)
chr1 (20-635)||(6151728-6152347)
chr1 (12-635)||(22830997-22831622)
chr1 (15-636)||(18181743-18182357)
chr1 (16-635)||(21787665-21788281)
chr1 (148-635)||(20091229-20091713)
chr1 (12-635)||(21022509-21023138)
chr1 (36-635)||(22468339-22468939)
chr1 (12-635)||(3472545-3473159)
chr1 (163-635)||(22449037-22449503)
chr1 (12-206)||(22432402-22432597)
chr1 (12-635)||(8761252-8761866)
chr1 (13-635)||(17678218-17678822)
chr1 (523-635)||(22131206-22131320)
chr1 (12-229)||(21305582-21305790)
chr1 (12-220)||(36818938-36819137)
chr1 (523-635)||(48603148-48603262)
chr1 (33-323)||(45489394-45489674)
chr1 (12-220)||(16080074-16080273)
chr1 (144-219)||(12647147-12647222)
chr1 (12-220)||(24782730-24782929)
chr1 (12-326)||(45309996-45310301)
chr1 (144-305)||(33797725-33797886)
chr1 (12-381)||(18393593-18393952)
chr1 (144-219)||(46975745-46975820)
chr1 (208-376)||(48603652-48603820)
chr1 (144-219)||(18882645-18882720)
chr1 (342-635)||(50210163-50210455)
chr1 (144-218)||(23819052-23819126)
chr1 (144-229)||(19212135-19212220)
chr1 (338-635)||(34509663-34509955)
chr1 (34-215)||(33049739-33049911)
chr1 (144-218)||(20228562-20228636)
chr1 (135-216)||(20138364-20138445)
chr1 (157-216)||(21615718-21615777)
chr1 (454-629)||(27250785-27250961)
chr1 (157-218)||(16375223-16375284)
chr1 (157-218)||(21407635-21407696)
chr1 (157-218)||(52639821-52639882)
chr1 (342-634)||(22532153-22532440)
chr1 (454-634)||(20847210-20847391)
chr1 (439-634)||(20135065-20135267)
chr1 (134-210)||(21438081-21438157)
chr1 (134-210)||(23763498-23763574)
chr1 (573-636)||(3705243-3705306)
chr1 (573-636)||(45489920-45489981)
chr1 (12-126)||(3704716-3704831)
chr1 (558-635)||(21161606-21161684)
chr1 (456-595)||(24783150-24783290)
chr1 (32-76)||(21754474-21754518)
chr1 (461-619)||(31612209-31612368)
chr1 (573-636)||(45310545-45310606)
chr1 (560-634)||(20916111-20916185)
chr1 (466-590)||(13212974-13213098)
chr1 (558-634)||(21477525-21477602)
chr1 (36-89)||(43697786-43697839)
chr1 (162-202)||(21162078-21162118)
chr1 (36-76)||(22355827-22355867)
chr1 (36-76)||(22357513-22357553)
chr1 (36-76)||(22921509-22921549)
chr1 (573-624)||(33050193-33050242)
chr1 (36-76)||(52927623-52927663)
chr1 (574-636)||(18394143-18394203)
chr1 (13-72)||(20228440-20228499)
chr1 (33-76)||(38801041-38801084)
chr1 (560-634)||(38801550-38801624)
chr1 (461-515)||(13988867-13988921)
chr1 (454-512)||(20454609-20454667)
chr1 (456-595)||(21313044-21313184)
chr1 (461-515)||(21923398-21923452)
chr1 (461-515)||(23593842-23593896)
chr1 (38-76)||(27250384-27250422)
chr1 (461-515)||(29298138-29298192)
chr1 (461-515)||(29776689-29776743)
chr1 (466-515)||(21342097-21342146)
chr1 (466-515)||(21346962-21347011)
chr1 (466-515)||(21707168-21707217)
chr1 (466-515)||(21711710-21711759)
chr1 (35-72)||(23818952-23818989)
chr1 (148-200)||(433322-433374)
chr1 (36-76)||(20248716-20248756)
chr1 (165-201)||(20918916-20918952)
chr1 (36-76)||(21301180-21301220)
chr1 (12-72)||(21615853-21615913)
chr1 (165-205)||(21754346-21754386)
chr1 (36-76)||(22238068-22238108)
chr1 (36-72)||(33681452-33681488)
chr1 (468-515)||(433013-433060)
chr1 (36-91)||(433431-433486)
chr1 (163-210)||(19063807-19063854)
chr1 (163-210)||(19105040-19105087)
chr1 (163-210)||(19111697-19111744)
chr1 (461-512)||(21840771-21840822)
chr1 (468-590)||(16361837-16361965)
chr1 (461-515)||(21475194-21475248)
chr1 (36-74)||(22354214-22354252)
chr1 (165-199)||(33681325-33681359)
chr1 (454-606)||(45574943-45575096)
chr1 (35-76)||(12647281-12647322)
chr1 (466-515)||(15860121-15860170)
chr1 (35-76)||(18882779-18882820)
chr1 (35-76)||(19212279-19212320)
chr1 (35-76)||(20138495-20138536)
chr1 (163-208)||(20524987-20525032)
chr1 (31-76)||(20846867-20846912)
chr1 (27-76)||(21162167-21162216)
chr1 (470-515)||(22123184-22123229)
chr1 (35-76)||(33797945-33797986)
chr1 (365-402)||(35261053-35261090)
chr1 (35-72)||(46975883-46975920)
chr1 (163-219)||(1011001-1011057)
chr1 (558-590)||(14295712-14295744)
chr1 (558-606)||(16275567-16275614)
chr1 (31-79)||(16759162-16759210)
chr1 (165-201)||(20637164-20637200)
chr1 (461-501)||(21026698-21026738)
chr1 (558-590)||(21840687-21840719)
chr1 (36-76)||(22532708-22532748)
chr1 (36-76)||(34510219-34510259)
chr1 (148-200)||(50209967-50210019)
[»] scaffold0004 (3 HSPs)
scaffold0004 (36-635)||(69674-70272)
scaffold0004 (12-220)||(10214-10413)
scaffold0004 (134-210)||(58161-58237)
[»] chr7 (188 HSPs)
chr7 (36-635)||(18154479-18155078)
chr7 (36-635)||(19649127-19649726)
chr7 (12-635)||(9703142-9703767)
chr7 (31-631)||(24054348-24054950)
chr7 (12-635)||(12321361-12321979)
chr7 (12-377)||(17137682-17138046)
chr7 (12-635)||(14429764-14430379)
chr7 (12-377)||(12187150-12187514)
chr7 (12-305)||(11880459-11880753)
chr7 (12-229)||(10508701-10508919)
chr7 (439-635)||(17138101-17138298)
chr7 (12-315)||(2760324-2760628)
chr7 (13-181)||(15211759-15211928)
chr7 (444-635)||(12186898-12187090)
chr7 (188-635)||(3271703-3272143)
chr7 (454-635)||(32216604-32216786)
chr7 (426-635)||(39267927-39268136)
chr7 (12-392)||(11312755-11313124)
chr7 (12-220)||(15580968-15581168)
chr7 (506-629)||(2760026-2760149)
chr7 (12-220)||(12318404-12318603)
chr7 (144-220)||(48593209-48593285)
chr7 (144-219)||(6801490-6801565)
chr7 (12-229)||(13635099-13635307)
chr7 (12-392)||(15604902-15605271)
chr7 (144-219)||(16438787-16438862)
chr7 (144-229)||(18811-18896)
chr7 (144-220)||(11987489-11987565)
chr7 (144-218)||(13149433-13149507)
chr7 (144-218)||(15728603-15728677)
chr7 (145-219)||(18557249-18557323)
chr7 (12-215)||(9445788-9445982)
chr7 (441-595)||(14932777-14932932)
chr7 (441-595)||(15356212-15356367)
chr7 (441-595)||(15360326-15360481)
chr7 (144-220)||(9593622-9593698)
chr7 (144-220)||(9644585-9644661)
chr7 (12-126)||(3272173-3272288)
chr7 (144-219)||(13462039-13462114)
chr7 (144-219)||(14217192-14217267)
chr7 (12-219)||(26292673-26292871)
chr7 (523-635)||(15211334-15211449)
chr7 (144-219)||(16724384-16724459)
chr7 (144-219)||(17701398-17701473)
chr7 (544-635)||(18301920-18302011)
chr7 (454-635)||(38227363-38227546)
chr7 (144-219)||(8917704-8917779)
chr7 (466-634)||(9509073-9509242)
chr7 (12-217)||(42205394-42205590)
chr7 (157-218)||(12718948-12719009)
chr7 (157-218)||(12723859-12723920)
chr7 (157-218)||(16906966-16907027)
chr7 (157-218)||(18279683-18279744)
chr7 (157-218)||(18283646-18283707)
chr7 (12-215)||(20569226-20569420)
chr7 (157-218)||(12715144-12715205)
chr7 (157-218)||(16114521-16114582)
chr7 (157-218)||(16117674-16117735)
chr7 (134-210)||(11262615-11262691)
chr7 (134-210)||(11548010-11548086)
chr7 (134-210)||(11554606-11554682)
chr7 (134-210)||(12692782-12692858)
chr7 (134-210)||(14953484-14953560)
chr7 (144-216)||(16275772-16275844)
chr7 (573-636)||(9446336-9446399)
chr7 (157-208)||(35151894-35151945)
chr7 (573-636)||(42203872-42203934)
chr7 (454-634)||(12698715-12698896)
chr7 (558-634)||(13032642-13032719)
chr7 (461-619)||(44116405-44116564)
chr7 (32-76)||(11995696-11995740)
chr7 (134-210)||(14959450-14959526)
chr7 (134-210)||(25038953-25039029)
chr7 (466-634)||(34200669-34200839)
chr7 (466-634)||(16386316-16386485)
chr7 (13-181)||(16583550-16583709)
chr7 (366-515)||(3564337-3564481)
chr7 (558-635)||(14258142-14258222)
chr7 (454-590)||(18456468-18456604)
chr7 (31-76)||(28504938-28504983)
chr7 (563-634)||(26211879-26211950)
chr7 (32-76)||(27847482-27847526)
chr7 (32-76)||(40443816-40443860)
chr7 (456-595)||(2832499-2832639)
chr7 (456-595)||(9751812-9751952)
chr7 (34-76)||(15754527-15754569)
chr7 (461-606)||(3386245-3386388)
chr7 (456-634)||(10588920-10589102)
chr7 (31-76)||(16385895-16385940)
chr7 (32-73)||(34201225-34201266)
chr7 (36-76)||(810771-810811)
chr7 (152-200)||(15143795-15143843)
chr7 (562-629)||(15755053-15755120)
chr7 (12-72)||(17701275-17701335)
chr7 (36-76)||(18006080-18006120)
chr7 (165-205)||(18302489-18302529)
chr7 (36-87)||(12756359-12756410)
chr7 (36-87)||(17061602-17061653)
chr7 (466-619)||(20110452-20110606)
chr7 (466-538)||(67729-67798)
chr7 (461-515)||(456322-456376)
chr7 (461-515)||(11393394-11393448)
chr7 (461-515)||(11972497-11972551)
chr7 (461-515)||(14949229-14949283)
chr7 (461-515)||(15376820-15376874)
chr7 (461-515)||(16213685-16213739)
chr7 (461-515)||(16232521-16232575)
chr7 (461-515)||(16410060-16410114)
chr7 (465-515)||(17062026-17062076)
chr7 (461-515)||(18430713-18430767)
chr7 (461-515)||(18640273-18640327)
chr7 (461-515)||(20385230-20385284)
chr7 (461-515)||(21189702-21189756)
chr7 (461-519)||(24275168-24275226)
chr7 (461-515)||(24702239-24702293)
chr7 (461-515)||(24704689-24704743)
chr7 (560-629)||(27847993-27848062)
chr7 (466-595)||(28505366-28505496)
chr7 (461-515)||(32125492-32125546)
chr7 (461-515)||(41522918-41522972)
chr7 (461-515)||(41525380-41525434)
chr7 (466-538)||(47831791-47831860)
chr7 (35-76)||(8917838-8917879)
chr7 (558-634)||(10063979-10064056)
chr7 (562-634)||(11996193-11996265)
chr7 (35-72)||(13462177-13462214)
chr7 (466-515)||(13869347-13869396)
chr7 (507-595)||(15580617-15580705)
chr7 (573-629)||(20569773-20569827)
chr7 (31-76)||(26212424-26212469)
chr7 (182-219)||(39722544-39722581)
chr7 (12-72)||(48593085-48593146)
chr7 (454-517)||(811186-811250)
chr7 (36-76)||(2831948-2831988)
chr7 (163-211)||(4318317-4318365)
chr7 (36-76)||(9509628-9509668)
chr7 (36-76)||(9751192-9751232)
chr7 (36-76)||(12699271-12699311)
chr7 (466-590)||(13831300-13831423)
chr7 (12-72)||(16724261-16724321)
chr7 (165-201)||(28505071-28505107)
chr7 (12-72)||(35152021-35152081)
chr7 (36-76)||(38227919-38227959)
chr7 (36-76)||(44014613-44014653)
chr7 (148-200)||(44116820-44116872)
chr7 (36-76)||(47832247-47832287)
chr7 (165-204)||(2832075-2832114)
chr7 (36-79)||(16219358-16219401)
chr7 (576-634)||(16579458-16579517)
chr7 (576-634)||(16586146-16586205)
chr7 (466-517)||(18005648-18005699)
chr7 (165-204)||(39267416-39267455)
chr7 (149-200)||(40443703-40443754)
chr7 (466-517)||(44014180-44014231)
chr7 (368-515)||(48273393-48273534)
chr7 (163-305)||(70537-70679)
chr7 (163-305)||(74646-74788)
chr7 (31-73)||(9389332-9389374)
chr7 (454-500)||(13647344-13647390)
chr7 (160-210)||(18531531-18531581)
chr7 (461-515)||(27216861-27216915)
chr7 (560-606)||(40443304-40443349)
chr7 (35-72)||(11043-11080)
chr7 (35-72)||(18711-18748)
chr7 (35-72)||(6801628-6801665)
chr7 (35-76)||(9593757-9593798)
chr7 (35-76)||(9644720-9644761)
chr7 (35-76)||(11987624-11987665)
chr7 (165-202)||(11995800-11995837)
chr7 (35-76)||(13149566-13149607)
chr7 (461-595)||(14152048-14152183)
chr7 (35-76)||(15728736-15728777)
chr7 (35-72)||(16275907-16275944)
chr7 (151-200)||(38227795-38227844)
chr7 (163-219)||(33385-33441)
chr7 (165-201)||(68060-68096)
chr7 (36-76)||(68185-68225)
chr7 (165-205)||(810900-810940)
chr7 (36-76)||(3564006-3564046)
chr7 (165-201)||(9389466-9389502)
chr7 (165-201)||(9751320-9751356)
chr7 (562-606)||(13647237-13647280)
chr7 (558-590)||(15082085-15082117)
chr7 (461-501)||(15144100-15144140)
chr7 (558-590)||(16213551-16213583)
chr7 (36-76)||(18302617-18302657)
chr7 (165-201)||(34201098-34201134)
chr7 (36-76)||(39267288-39267328)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (36-632)||(36337-36934)
[»] scaffold0031 (5 HSPs)
scaffold0031 (12-635)||(65412-66035)
scaffold0031 (12-392)||(53672-54041)
scaffold0031 (558-635)||(128634-128712)
scaffold0031 (456-595)||(53481-53621)
scaffold0031 (37-87)||(20069-20119)
[»] chr6 (181 HSPs)
chr6 (36-635)||(19862858-19863456)
chr6 (12-635)||(25641802-25642424)
chr6 (31-635)||(22438679-22439283)
chr6 (31-635)||(22432129-22432733)
chr6 (150-635)||(19873000-19873483)
chr6 (12-635)||(21739641-21740268)
chr6 (148-635)||(22334647-22335134)
chr6 (12-635)||(18906990-18907609)
chr6 (148-635)||(15894185-15894675)
chr6 (12-322)||(21834509-21834820)
chr6 (12-635)||(18180374-18180989)
chr6 (12-305)||(16523022-16523316)
chr6 (12-289)||(15041169-15041447)
chr6 (438-635)||(15041590-15041788)
chr6 (46-226)||(22059396-22059577)
chr6 (40-289)||(16924526-16924776)
chr6 (12-392)||(17804304-17804673)
chr6 (12-220)||(22429660-22429859)
chr6 (456-635)||(16523441-16523620)
chr6 (40-281)||(16964957-16965199)
chr6 (439-629)||(21766578-21766771)
chr6 (12-200)||(22405685-22405873)
chr6 (12-629)||(20907611-20908215)
chr6 (514-635)||(31164956-31165078)
chr6 (12-296)||(27553237-27553512)
chr6 (12-219)||(23657050-23657248)
chr6 (19-218)||(27567246-27567436)
chr6 (156-289)||(31164611-31164744)
chr6 (13-215)||(19790410-19790603)
chr6 (36-305)||(27415596-27415856)
chr6 (144-219)||(12496586-12496661)
chr6 (509-635)||(18692022-18692148)
chr6 (506-635)||(22074311-22074440)
chr6 (144-219)||(5616567-5616642)
chr6 (144-219)||(12706966-12707041)
chr6 (144-218)||(1587484-1587558)
chr6 (155-219)||(16741484-16741548)
chr6 (147-219)||(19663046-19663118)
chr6 (144-215)||(22592557-22592628)
chr6 (12-229)||(25766798-25767006)
chr6 (40-289)||(16929242-16929487)
chr6 (455-635)||(16965366-16965549)
chr6 (144-219)||(1644983-1645058)
chr6 (144-215)||(20803306-20803377)
chr6 (342-635)||(29060422-29060711)
chr6 (135-305)||(14472462-14472632)
chr6 (144-216)||(21702568-21702640)
chr6 (573-629)||(21830615-21830671)
chr6 (144-219)||(18955516-18955591)
chr6 (157-393)||(22863052-22863286)
chr6 (157-211)||(25135438-25135492)
chr6 (157-218)||(8244140-8244201)
chr6 (157-218)||(11567142-11567203)
chr6 (157-218)||(19870870-19870931)
chr6 (157-218)||(23395348-23395409)
chr6 (573-636)||(27553749-27553812)
chr6 (573-636)||(27567787-27567850)
chr6 (144-218)||(9482046-9482120)
chr6 (454-634)||(20361016-20361198)
chr6 (157-218)||(12618610-12618671)
chr6 (451-634)||(17287849-17288033)
chr6 (522-624)||(22408417-22408517)
chr6 (157-218)||(23990200-23990261)
chr6 (134-218)||(18917009-18917093)
chr6 (558-635)||(4738710-4738788)
chr6 (466-634)||(20638351-20638521)
chr6 (558-634)||(22805632-22805709)
chr6 (12-72)||(20803182-20803242)
chr6 (466-635)||(19303608-19303778)
chr6 (466-634)||(22780295-22780464)
chr6 (466-635)||(25629423-25629593)
chr6 (465-634)||(28496538-28496709)
chr6 (465-634)||(29808949-29809120)
chr6 (558-635)||(4185974-4186052)
chr6 (558-635)||(4186257-4186335)
chr6 (455-604)||(16929646-16929798)
chr6 (438-512)||(19848035-19848109)
chr6 (558-635)||(31155550-31155628)
chr6 (558-634)||(19773883-19773960)
chr6 (461-606)||(25754721-25754864)
chr6 (32-76)||(1561742-1561786)
chr6 (32-76)||(16920282-16920326)
chr6 (573-636)||(19790956-19791017)
chr6 (454-635)||(20076583-20076765)
chr6 (36-87)||(18821472-18821523)
chr6 (573-624)||(23657588-23657638)
chr6 (159-210)||(25928584-25928635)
chr6 (438-512)||(23992434-23992508)
chr6 (562-634)||(1561186-1561258)
chr6 (461-606)||(3852124-3852267)
chr6 (342-633)||(18409777-18410067)
chr6 (32-73)||(22831933-22831974)
chr6 (562-634)||(35245469-35245541)
chr6 (12-76)||(1645117-1645181)
chr6 (12-72)||(9481923-9481983)
chr6 (149-201)||(18821575-18821627)
chr6 (36-84)||(20594204-20594252)
chr6 (36-76)||(20637936-20637976)
chr6 (455-515)||(25656630-25656690)
chr6 (165-204)||(21939695-21939734)
chr6 (151-277)||(25603143-25603269)
chr6 (461-515)||(2291287-2291341)
chr6 (461-515)||(8055030-8055084)
chr6 (461-515)||(12742318-12742372)
chr6 (456-595)||(17804113-17804253)
chr6 (461-515)||(18334699-18334753)
chr6 (461-515)||(19005047-19005101)
chr6 (461-515)||(19859026-19859080)
chr6 (461-515)||(22782228-22782282)
chr6 (461-515)||(24422548-24422602)
chr6 (461-515)||(25714421-25714475)
chr6 (461-515)||(26924747-26924801)
chr6 (461-515)||(33861795-33861849)
chr6 (461-515)||(33864279-33864333)
chr6 (160-210)||(34369742-34369792)
chr6 (27-76)||(4667846-4667895)
chr6 (27-76)||(4674693-4674742)
chr6 (454-515)||(16496248-16496309)
chr6 (35-76)||(20360612-20360653)
chr6 (466-515)||(27333286-27333335)
chr6 (466-515)||(27394026-27394075)
chr6 (148-205)||(29808638-29808695)
chr6 (461-590)||(30676817-30676952)
chr6 (27-76)||(31155031-31155080)
chr6 (12-72)||(5616444-5616504)
chr6 (12-76)||(12707100-12707164)
chr6 (36-76)||(15894072-15894112)
chr6 (12-76)||(16741619-16741683)
chr6 (36-76)||(17287438-17287478)
chr6 (36-76)||(19303183-19303223)
chr6 (36-76)||(19652634-19652674)
chr6 (469-635)||(20593656-20593823)
chr6 (12-72)||(21702703-21702763)
chr6 (36-76)||(22779869-22779909)
chr6 (558-629)||(25603550-25603622)
chr6 (36-76)||(25611365-25611405)
chr6 (558-629)||(25611888-25611960)
chr6 (342-402)||(25629305-25629364)
chr6 (36-76)||(25644761-25644801)
chr6 (165-205)||(28496244-28496284)
chr6 (12-68)||(29096123-29096179)
chr6 (456-515)||(1595550-1595609)
chr6 (27-74)||(4185456-4185503)
chr6 (163-210)||(16372146-16372193)
chr6 (36-91)||(18409469-18409524)
chr6 (36-87)||(18457142-18457193)
chr6 (149-200)||(20360716-20360767)
chr6 (163-210)||(22331727-22331774)
chr6 (37-76)||(22334525-22334564)
chr6 (135-210)||(22759139-22759213)
chr6 (151-277)||(25611481-25611607)
chr6 (456-590)||(25688428-25688562)
chr6 (162-201)||(31155166-31155205)
chr6 (461-515)||(1541018-1541072)
chr6 (461-515)||(20556999-20557053)
chr6 (560-629)||(22831392-22831461)
chr6 (162-200)||(25629123-25629161)
chr6 (163-209)||(34298395-34298441)
chr6 (35-72)||(1587384-1587421)
chr6 (35-72)||(2684994-2685031)
chr6 (27-76)||(4189395-4189444)
chr6 (35-76)||(12496720-12496761)
chr6 (35-76)||(19663180-19663221)
chr6 (12-61)||(25135302-25135351)
chr6 (461-590)||(34963293-34963428)
chr6 (165-201)||(4185594-4185630)
chr6 (165-201)||(4667984-4668020)
chr6 (562-629)||(11185402-11185469)
chr6 (32-76)||(11185930-11185974)
chr6 (558-590)||(16448728-16448760)
chr6 (313-399)||(18821766-18821851)
chr6 (342-402)||(19303491-19303550)
chr6 (558-590)||(19848161-19848193)
chr6 (36-76)||(21939822-21939862)
chr6 (165-201)||(22080508-22080544)
chr6 (558-590)||(22782153-22782185)
chr6 (558-590)||(23992350-23992382)
chr6 (36-76)||(25956263-25956303)
chr6 (36-76)||(28496115-28496155)
chr6 (40-76)||(29060979-29061015)
chr6 (36-76)||(29808525-29808565)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (31-635)||(19860-20464)
[»] chr2 (134 HSPs)
chr2 (12-635)||(22740579-22741201)
chr2 (12-635)||(22758334-22758956)
chr2 (12-635)||(22798745-22799364)
chr2 (36-498)||(23038048-23038511)
chr2 (12-635)||(24673447-24674076)
chr2 (15-635)||(23019328-23019944)
chr2 (12-377)||(40621827-40622191)
chr2 (12-635)||(25963336-25963952)
chr2 (12-629)||(37524570-37525164)
chr2 (12-315)||(45677774-45678078)
chr2 (12-365)||(21917935-21918288)
chr2 (12-629)||(22811553-22812143)
chr2 (36-250)||(23100873-23101088)
chr2 (439-629)||(40622251-40622442)
chr2 (252-402)||(23103256-23103406)
chr2 (347-635)||(45678074-45678366)
chr2 (46-226)||(44369952-44370133)
chr2 (12-629)||(21318265-21318869)
chr2 (12-323)||(24174985-24175287)
chr2 (144-636)||(25961287-25961772)
chr2 (13-119)||(24658032-24658139)
chr2 (12-305)||(24716160-24716444)
chr2 (411-635)||(24680064-24680292)
chr2 (12-381)||(40428592-40428952)
chr2 (434-636)||(24716564-24716766)
chr2 (12-218)||(21327196-21327393)
chr2 (144-219)||(22460943-22461018)
chr2 (12-323)||(24654967-24655270)
chr2 (466-622)||(21916166-21916322)
chr2 (12-229)||(24735671-24735879)
chr2 (144-218)||(15477883-15477957)
chr2 (134-219)||(18855204-18855289)
chr2 (134-219)||(23187353-23187438)
chr2 (134-219)||(23598616-23598701)
chr2 (12-215)||(24870173-24870367)
chr2 (144-218)||(61094-61168)
chr2 (144-218)||(19928255-19928329)
chr2 (456-629)||(21327625-21327800)
chr2 (454-635)||(23060395-23060578)
chr2 (144-229)||(19688509-19688594)
chr2 (157-218)||(12901278-12901339)
chr2 (157-218)||(24649636-24649697)
chr2 (157-218)||(27379198-27379259)
chr2 (157-218)||(27383244-27383305)
chr2 (157-218)||(27602076-27602137)
chr2 (573-636)||(24174676-24174739)
chr2 (573-636)||(24655516-24655579)
chr2 (157-216)||(26125484-26125543)
chr2 (157-216)||(41667230-41667289)
chr2 (157-218)||(24628244-24628305)
chr2 (157-218)||(41530775-41530836)
chr2 (454-635)||(8946539-8946722)
chr2 (438-634)||(22731274-22731471)
chr2 (454-634)||(23654442-23654624)
chr2 (573-635)||(40428340-40428402)
chr2 (461-590)||(23130789-23130917)
chr2 (461-590)||(23133256-23133384)
chr2 (461-590)||(34402629-34402757)
chr2 (573-637)||(24869755-24869819)
chr2 (466-634)||(22738247-22738416)
chr2 (561-633)||(22337008-22337081)
chr2 (32-76)||(28291940-28291984)
chr2 (454-626)||(23076333-23076507)
chr2 (560-634)||(23103558-23103631)
chr2 (438-512)||(25616192-25616266)
chr2 (454-634)||(38170-38352)
chr2 (558-634)||(21900614-21900691)
chr2 (454-515)||(22105413-22105474)
chr2 (454-515)||(23285869-23285930)
chr2 (32-76)||(37765-37809)
chr2 (32-76)||(20309533-20309577)
chr2 (157-205)||(24503402-24503450)
chr2 (36-76)||(25176281-25176321)
chr2 (12-72)||(27263667-27263727)
chr2 (461-619)||(28576996-28577154)
chr2 (12-126)||(10327218-10327333)
chr2 (560-634)||(20308992-20309066)
chr2 (135-210)||(21139015-21139090)
chr2 (456-515)||(23040247-23040306)
chr2 (560-634)||(23072112-23072186)
chr2 (466-619)||(24529641-24529795)
chr2 (36-87)||(32451571-32451622)
chr2 (461-515)||(571398-571452)
chr2 (461-515)||(6725996-6726050)
chr2 (461-515)||(18808944-18808998)
chr2 (461-515)||(22337119-22337173)
chr2 (461-515)||(23135591-23135645)
chr2 (461-515)||(23709639-23709693)
chr2 (461-515)||(23712120-23712174)
chr2 (461-515)||(26505380-26505434)
chr2 (461-515)||(26507858-26507912)
chr2 (461-515)||(39682314-39682368)
chr2 (466-515)||(298883-298932)
chr2 (36-73)||(23286292-23286329)
chr2 (461-619)||(24367670-24367829)
chr2 (466-515)||(38967375-38967424)
chr2 (461-514)||(43137301-43137354)
chr2 (466-515)||(45029966-45030015)
chr2 (36-76)||(298457-298497)
chr2 (461-513)||(21155167-21155219)
chr2 (36-76)||(22133859-22133899)
chr2 (36-76)||(22737822-22737862)
chr2 (165-201)||(23071733-23071769)
chr2 (12-76)||(23187487-23187551)
chr2 (12-76)||(23598750-23598814)
chr2 (36-76)||(23654052-23654092)
chr2 (36-76)||(23660461-23660501)
chr2 (461-513)||(24643057-24643109)
chr2 (12-72)||(26125619-26125679)
chr2 (36-76)||(27754014-27754054)
chr2 (466-590)||(32215033-32215163)
chr2 (135-210)||(24640705-24640779)
chr2 (466-517)||(25175852-25175903)
chr2 (163-210)||(27197172-27197219)
chr2 (149-200)||(32451685-32451736)
chr2 (12-62)||(61241-61291)
chr2 (165-199)||(22133986-22134020)
chr2 (454-590)||(23659952-23660088)
chr2 (456-595)||(24735319-24735459)
chr2 (188-218)||(27263552-27263582)
chr2 (466-515)||(7679589-7679638)
chr2 (465-517)||(18786970-18787020)
chr2 (35-72)||(19928155-19928192)
chr2 (35-72)||(22460843-22460880)
chr2 (466-515)||(32039610-32039659)
chr2 (35-72)||(41667365-41667402)
chr2 (165-201)||(37888-37924)
chr2 (163-219)||(10101417-10101473)
chr2 (36-76)||(22730875-22730915)
chr2 (558-590)||(25616108-25616140)
chr2 (149-197)||(27753892-27753940)
chr2 (165-201)||(31756231-31756267)
chr2 (558-606)||(38967285-38967332)
chr2 (558-606)||(43137210-43137257)
[»] chr8 (157 HSPs)
chr8 (12-635)||(17353556-17354180)
chr8 (15-635)||(19898974-19899592)
chr8 (12-635)||(21168340-21168971)
chr8 (12-635)||(16184600-16185228)
chr8 (12-635)||(19982972-19983595)
chr8 (12-635)||(24755594-24756221)
chr8 (12-635)||(23776452-23777073)
chr8 (12-635)||(377149-377778)
chr8 (12-635)||(20465658-20466279)
chr8 (12-635)||(30642910-30643529)
chr8 (12-635)||(19259221-19259829)
chr8 (172-635)||(21161838-21162298)
chr8 (12-629)||(15611088-15611690)
chr8 (12-629)||(15602636-15603238)
chr8 (13-629)||(16409875-16410478)
chr8 (12-629)||(17926333-17926936)
chr8 (12-309)||(19976647-19976947)
chr8 (32-377)||(21389091-21389436)
chr8 (12-629)||(22010298-22010896)
chr8 (41-317)||(21395630-21395907)
chr8 (41-317)||(21790123-21790400)
chr8 (12-219)||(20856044-20856252)
chr8 (12-635)||(16860956-16861561)
chr8 (12-187)||(16411888-16412064)
chr8 (523-635)||(44384970-44385085)
chr8 (13-112)||(21161735-21161835)
chr8 (12-322)||(39094571-39094872)
chr8 (134-219)||(24433980-24434065)
chr8 (144-219)||(15538726-15538801)
chr8 (134-219)||(15532166-15532251)
chr8 (12-229)||(16231105-16231313)
chr8 (132-219)||(17828324-17828411)
chr8 (12-229)||(22028825-22029033)
chr8 (144-229)||(23834441-23834526)
chr8 (454-634)||(18879287-18879466)
chr8 (146-218)||(23846770-23846842)
chr8 (144-219)||(30308507-30308582)
chr8 (144-218)||(22113481-22113555)
chr8 (144-218)||(22134984-22135058)
chr8 (134-219)||(18619756-18619841)
chr8 (454-634)||(23406263-23406444)
chr8 (144-218)||(22166134-22166208)
chr8 (144-217)||(22045138-22045211)
chr8 (454-634)||(18818465-18818646)
chr8 (454-634)||(21919056-21919237)
chr8 (157-218)||(43252092-43252153)
chr8 (13-73)||(25362770-25362830)
chr8 (157-216)||(17055155-17055214)
chr8 (454-635)||(28649100-28649286)
chr8 (157-216)||(32598959-32599018)
chr8 (157-216)||(32605491-32605550)
chr8 (134-210)||(20527736-20527812)
chr8 (439-633)||(23648432-23648633)
chr8 (469-634)||(21255106-21255272)
chr8 (454-634)||(31971140-31971322)
chr8 (573-618)||(20856602-20856647)
chr8 (157-218)||(21972350-21972411)
chr8 (157-218)||(21976435-21976496)
chr8 (454-635)||(7372661-7372843)
chr8 (454-632)||(21923984-21924162)
chr8 (560-634)||(5866437-5866511)
chr8 (560-634)||(16199807-16199881)
chr8 (469-634)||(21249268-21249434)
chr8 (454-635)||(22626618-22626801)
chr8 (560-634)||(45131159-45131233)
chr8 (466-634)||(17140800-17140969)
chr8 (438-512)||(18678142-18678216)
chr8 (573-635)||(39095102-39095164)
chr8 (157-218)||(19278050-19278110)
chr8 (32-76)||(5865915-5865959)
chr8 (12-68)||(22057768-22057824)
chr8 (461-618)||(41598086-41598243)
chr8 (560-634)||(21389613-21389687)
chr8 (560-634)||(21396143-21396217)
chr8 (466-634)||(21490878-21491048)
chr8 (560-634)||(21778939-21779013)
chr8 (560-634)||(21790636-21790710)
chr8 (13-72)||(23252393-23252452)
chr8 (466-619)||(45290807-45290961)
chr8 (466-634)||(20536092-20536261)
chr8 (34-84)||(21249812-21249862)
chr8 (34-84)||(21255650-21255700)
chr8 (438-512)||(32121739-32121813)
chr8 (466-546)||(38855319-38855396)
chr8 (473-590)||(4483208-4483324)
chr8 (461-619)||(6759158-6759316)
chr8 (342-590)||(16092292-16092534)
chr8 (31-76)||(17141352-17141397)
chr8 (32-76)||(16199296-16199340)
chr8 (12-76)||(18619890-18619954)
chr8 (12-76)||(22045270-22045334)
chr8 (32-76)||(45130669-45130713)
chr8 (149-200)||(21918756-21918807)
chr8 (466-619)||(26225359-26225513)
chr8 (461-515)||(1484403-1484457)
chr8 (461-515)||(4542480-4542534)
chr8 (461-515)||(5853399-5853453)
chr8 (466-538)||(6520352-6520421)
chr8 (461-515)||(14409551-14409605)
chr8 (461-515)||(19896266-19896320)
chr8 (461-515)||(20046302-20046356)
chr8 (461-515)||(20403228-20403282)
chr8 (461-515)||(22001754-22001808)
chr8 (558-634)||(13508246-13508323)
chr8 (165-202)||(21249695-21249732)
chr8 (31-76)||(21491431-21491476)
chr8 (35-76)||(31971683-31971724)
chr8 (165-201)||(5866047-5866083)
chr8 (36-76)||(7373188-7373228)
chr8 (558-629)||(13597778-13597850)
chr8 (165-201)||(17141228-17141264)
chr8 (36-76)||(18818052-18818092)
chr8 (36-76)||(18878879-18878919)
chr8 (36-76)||(20536647-20536687)
chr8 (36-76)||(21918652-21918692)
chr8 (36-76)||(22627174-22627214)
chr8 (36-76)||(23406820-23406860)
chr8 (36-76)||(26355340-26355380)
chr8 (36-76)||(28648686-28648726)
chr8 (12-72)||(30308384-30308444)
chr8 (36-76)||(38854893-38854933)
chr8 (31-79)||(39834268-39834316)
chr8 (148-200)||(41598499-41598551)
chr8 (36-76)||(41598623-41598663)
chr8 (461-512)||(16413423-16413474)
chr8 (163-210)||(19905783-19905830)
chr8 (466-517)||(21285599-21285650)
chr8 (36-83)||(21414869-21414916)
chr8 (149-196)||(25362896-25362943)
chr8 (466-619)||(26219613-26219767)
chr8 (13-72)||(32599094-32599153)
chr8 (13-72)||(32605626-32605685)
chr8 (36-74)||(6759698-6759736)
chr8 (461-515)||(15203338-15203392)
chr8 (36-74)||(16091983-16092021)
chr8 (35-73)||(23648995-23649033)
chr8 (454-500)||(45131052-45131098)
chr8 (465-517)||(983473-983523)
chr8 (36-73)||(6520810-6520847)
chr8 (35-76)||(15532300-15532341)
chr8 (35-76)||(15538860-15538901)
chr8 (466-515)||(19937118-19937167)
chr8 (165-202)||(21255533-21255570)
chr8 (36-73)||(21923570-21923607)
chr8 (35-72)||(22113381-22113418)
chr8 (35-72)||(22134884-22134921)
chr8 (35-72)||(22166034-22166071)
chr8 (35-76)||(23834585-23834626)
chr8 (35-72)||(24433890-24433927)
chr8 (12-72)||(17055019-17055079)
chr8 (36-76)||(21674144-21674184)
chr8 (342-402)||(22875176-22875235)
chr8 (148-200)||(22875380-22875432)
chr8 (558-590)||(22965629-22965661)
chr8 (35-63)||(23844567-23844595)
chr8 (558-590)||(32121655-32121687)
chr8 (165-201)||(39834146-39834182)
[»] scaffold0101 (3 HSPs)
scaffold0101 (12-635)||(8576-9200)
scaffold0101 (466-513)||(1393-1440)
scaffold0101 (558-590)||(1482-1514)
[»] scaffold0043 (2 HSPs)
scaffold0043 (12-635)||(18116-18740)
scaffold0043 (147-218)||(76927-76998)
[»] chr4 (170 HSPs)
chr4 (12-635)||(13569381-13570012)
chr4 (12-635)||(44675511-44676132)
chr4 (12-635)||(23843357-23843979)
chr4 (12-635)||(12569894-12570521)
chr4 (12-635)||(15093654-15094273)
chr4 (12-635)||(15121422-15122038)
chr4 (12-629)||(16356572-16357182)
chr4 (12-629)||(16487697-16488308)
chr4 (12-369)||(15124773-15125130)
chr4 (193-629)||(16348466-16348894)
chr4 (12-170)||(16348311-16348470)
chr4 (507-635)||(15125150-15125279)
chr4 (12-229)||(36133592-36133800)
chr4 (523-635)||(17048435-17048549)
chr4 (12-305)||(11250191-11250474)
chr4 (426-635)||(13813046-13813255)
chr4 (12-319)||(16351478-16351776)
chr4 (144-217)||(19757354-19757427)
chr4 (144-217)||(19782379-19782452)
chr4 (134-219)||(45938425-45938510)
chr4 (12-381)||(15352936-15353295)
chr4 (144-219)||(17152240-17152315)
chr4 (144-219)||(23139548-23139623)
chr4 (144-219)||(26243418-26243493)
chr4 (136-217)||(16678334-16678415)
chr4 (523-635)||(631105-631217)
chr4 (144-220)||(1951514-1951590)
chr4 (134-218)||(9556809-9556893)
chr4 (132-215)||(3413078-3413161)
chr4 (144-219)||(18237170-18237245)
chr4 (454-634)||(7893586-7893768)
chr4 (15-215)||(25555798-25555989)
chr4 (134-211)||(16243143-16243220)
chr4 (144-218)||(18222131-18222205)
chr4 (12-76)||(17047702-17047766)
chr4 (157-229)||(43255927-43255999)
chr4 (144-218)||(2015057-2015131)
chr4 (134-219)||(9530711-9530796)
chr4 (510-635)||(12423569-12423696)
chr4 (454-635)||(16270291-16270474)
chr4 (132-218)||(4561074-4561160)
chr4 (454-634)||(12902641-12902822)
chr4 (157-219)||(27534303-27534365)
chr4 (144-218)||(28569197-28569271)
chr4 (157-218)||(5756703-5756764)
chr4 (134-215)||(18602488-18602569)
chr4 (157-218)||(33742657-33742718)
chr4 (454-634)||(7798658-7798839)
chr4 (573-636)||(15353485-15353548)
chr4 (342-634)||(16377473-16377758)
chr4 (454-634)||(3096177-3096358)
chr4 (132-206)||(18609080-18609154)
chr4 (506-624)||(5339080-5339202)
chr4 (134-210)||(23838720-23838796)
chr4 (157-216)||(14708400-14708459)
chr4 (157-216)||(42997216-42997275)
chr4 (466-634)||(15551701-15551870)
chr4 (466-634)||(22636319-22636488)
chr4 (157-210)||(14679249-14679302)
chr4 (157-210)||(14685458-14685511)
chr4 (134-210)||(41385488-41385564)
chr4 (560-634)||(14053464-14053538)
chr4 (573-636)||(16352029-16352092)
chr4 (560-634)||(23374516-23374590)
chr4 (456-595)||(20157517-20157657)
chr4 (461-606)||(51463975-51464118)
chr4 (32-76)||(14052951-14052995)
chr4 (134-210)||(35614226-35614301)
chr4 (454-586)||(52873423-52873555)
chr4 (15-76)||(2015190-2015251)
chr4 (454-515)||(6899895-6899956)
chr4 (454-515)||(7088881-7088942)
chr4 (461-606)||(12610862-12611005)
chr4 (458-515)||(18239523-18239580)
chr4 (576-624)||(25555371-25555417)
chr4 (11-72)||(27534441-27534502)
chr4 (12-72)||(3413212-3413272)
chr4 (248-376)||(5338837-5338964)
chr4 (36-76)||(12774437-12774477)
chr4 (32-76)||(15552252-15552296)
chr4 (165-205)||(22633983-22634023)
chr4 (36-76)||(24029180-24029220)
chr4 (461-619)||(44615185-44615343)
chr4 (165-204)||(3332197-3332236)
chr4 (36-87)||(6190861-6190912)
chr4 (149-200)||(7089191-7089242)
chr4 (165-204)||(13812579-13812618)
chr4 (461-590)||(14280242-14280371)
chr4 (466-619)||(15355437-15355591)
chr4 (558-632)||(16240130-16240205)
chr4 (149-200)||(17047828-17047879)
chr4 (165-204)||(24029053-24029092)
chr4 (466-634)||(44052713-44052882)
chr4 (461-515)||(12414-12468)
chr4 (461-515)||(1837616-1837670)
chr4 (461-515)||(7641289-7641343)
chr4 (461-515)||(15118459-15118513)
chr4 (12-62)||(16678219-16678269)
chr4 (461-515)||(18215381-18215435)
chr4 (461-515)||(23803372-23803426)
chr4 (466-538)||(39706356-39706425)
chr4 (461-515)||(44773194-44773248)
chr4 (461-515)||(44928987-44929041)
chr4 (461-515)||(50222446-50222500)
chr4 (461-515)||(52312511-52312565)
chr4 (576-636)||(11250741-11250799)
chr4 (36-73)||(13844981-13845018)
chr4 (27-76)||(16597084-16597133)
chr4 (35-72)||(18602398-18602435)
chr4 (35-72)||(18608992-18609029)
chr4 (466-515)||(19242700-19242749)
chr4 (466-515)||(44102215-44102264)
chr4 (12-72)||(1951391-1951451)
chr4 (36-76)||(3097071-3097111)
chr4 (165-205)||(12774309-12774349)
chr4 (342-402)||(14038760-14038819)
chr4 (36-76)||(14039088-14039128)
chr4 (12-72)||(14708264-14708324)
chr4 (12-72)||(16243030-16243090)
chr4 (163-392)||(17810379-17810606)
chr4 (12-76)||(18237304-18237368)
chr4 (448-500)||(22353852-22353904)
chr4 (36-76)||(39705930-39705970)
chr4 (36-76)||(44102648-44102688)
chr4 (36-76)||(44928565-44928605)
chr4 (149-200)||(3096957-3097008)
chr4 (466-517)||(12774009-12774060)
chr4 (596-635)||(13813292-13813331)
chr4 (596-635)||(13813381-13813420)
chr4 (162-201)||(15190631-15190670)
chr4 (32-63)||(17053483-17053514)
chr4 (461-512)||(19618279-19618330)
chr4 (165-204)||(20157060-20157099)
chr4 (36-87)||(21814945-21814996)
chr4 (36-87)||(21815274-21815325)
chr4 (36-87)||(21818367-21818418)
chr4 (165-200)||(44102525-44102560)
chr4 (165-200)||(44928694-44928729)
chr4 (461-515)||(3515008-3515062)
chr4 (558-619)||(14038555-14038617)
chr4 (461-515)||(54798817-54798871)
chr4 (466-515)||(8574935-8574984)
chr4 (558-619)||(8575027-8575088)
chr4 (157-206)||(12522375-12522424)
chr4 (36-73)||(13812451-13812488)
chr4 (461-514)||(14038653-14038706)
chr4 (31-76)||(15099789-15099834)
chr4 (35-72)||(18222031-18222068)
chr4 (35-72)||(23139686-23139723)
chr4 (35-72)||(26243318-26243355)
chr4 (35-72)||(28569097-28569134)
chr4 (35-72)||(43255813-43255850)
chr4 (36-73)||(44053271-44053308)
chr4 (35-72)||(45938563-45938600)
chr4 (36-76)||(7089305-7089345)
chr4 (36-76)||(7799136-7799176)
chr4 (165-201)||(8846688-8846724)
chr4 (36-72)||(8846818-8846854)
chr4 (466-517)||(12288278-12288327)
chr4 (36-76)||(12903185-12903224)
chr4 (165-201)||(15099664-15099700)
chr4 (558-606)||(15369931-15369978)
chr4 (36-76)||(16239634-16239674)
chr4 (35-63)||(17152140-17152168)
chr4 (558-590)||(18215478-18215510)
chr4 (558-590)||(19618382-19618414)
chr4 (160-200)||(21815068-21815108)
chr4 (160-200)||(21818490-21818530)
chr4 (522-595)||(22634528-22634603)
chr4 (12-72)||(42997080-42997140)
[»] chr5 (169 HSPs)
chr5 (12-635)||(23201239-23201869)
chr5 (36-635)||(26703955-26704542)
chr5 (36-635)||(26973688-26974275)
chr5 (12-635)||(23500964-23501592)
chr5 (12-635)||(14079029-14079648)
chr5 (15-635)||(23511979-23512604)
chr5 (13-402)||(37724013-37724403)
chr5 (13-635)||(21366286-21366901)
chr5 (12-377)||(22032452-22032816)
chr5 (12-377)||(18769623-18769987)
chr5 (12-629)||(20805435-20806047)
chr5 (165-635)||(21873133-21873595)
chr5 (94-377)||(23572215-23572496)
chr5 (12-211)||(21887124-21887324)
chr5 (13-215)||(31342399-31342602)
chr5 (444-629)||(22032208-22032394)
chr5 (439-635)||(18770042-18770241)
chr5 (12-323)||(12028195-12028496)
chr5 (434-636)||(1859012-1859214)
chr5 (12-229)||(17410715-17410923)
chr5 (147-635)||(23451224-23451707)
chr5 (12-219)||(17918781-17918979)
chr5 (36-229)||(20910454-20910638)
chr5 (12-215)||(24222170-24222364)
chr5 (144-219)||(21340520-21340595)
chr5 (144-219)||(26665884-26665959)
chr5 (144-219)||(26937481-26937556)
chr5 (144-305)||(18356519-18356680)
chr5 (439-629)||(20766857-20767050)
chr5 (147-315)||(23463044-23463212)
chr5 (144-219)||(16674430-16674505)
chr5 (144-219)||(20232828-20232903)
chr5 (35-220)||(23535242-23535418)
chr5 (12-220)||(1858606-1858805)
chr5 (134-215)||(17718182-17718263)
chr5 (147-315)||(23458783-23458951)
chr5 (144-219)||(18774482-18774557)
chr5 (144-219)||(24532801-24532876)
chr5 (144-219)||(42805698-42805773)
chr5 (144-218)||(25229159-25229233)
chr5 (144-218)||(25293315-25293389)
chr5 (12-219)||(26680868-26681066)
chr5 (12-219)||(26952475-26952673)
chr5 (434-635)||(23458468-23458673)
chr5 (434-635)||(23462729-23462934)
chr5 (439-635)||(23571956-23572160)
chr5 (144-218)||(21884942-21885016)
chr5 (454-635)||(24493451-24493634)
chr5 (144-218)||(4036499-4036573)
chr5 (156-218)||(26172743-26172805)
chr5 (144-208)||(18784336-18784400)
chr5 (134-218)||(19472462-19472546)
chr5 (454-632)||(21997590-21997769)
chr5 (156-219)||(123070-123133)
chr5 (560-635)||(22107776-22107851)
chr5 (466-635)||(25421414-25421585)
chr5 (455-634)||(23390553-23390733)
chr5 (157-218)||(20296127-20296188)
chr5 (469-635)||(23439857-23440027)
chr5 (342-632)||(1096352-1096638)
chr5 (12-126)||(22760026-22760141)
chr5 (144-219)||(26742499-26742574)
chr5 (338-627)||(24529111-24529395)
chr5 (342-635)||(9077835-9078123)
chr5 (454-632)||(13025196-13025376)
chr5 (454-632)||(13095380-13095560)
chr5 (134-210)||(21295006-21295082)
chr5 (134-210)||(25535275-25535351)
chr5 (573-636)||(24221753-24221816)
chr5 (454-626)||(8286899-8287073)
chr5 (560-636)||(22757006-22757080)
chr5 (12-61)||(23572510-23572559)
chr5 (569-629)||(31342033-31342091)
chr5 (461-590)||(39363311-39363439)
chr5 (573-636)||(12028742-12028803)
chr5 (175-219)||(22757414-22757458)
chr5 (36-91)||(21871213-21871268)
chr5 (36-91)||(21875493-21875548)
chr5 (573-635)||(17919320-17919382)
chr5 (466-634)||(19660903-19661072)
chr5 (454-634)||(21293025-21293206)
chr5 (454-634)||(21808445-21808626)
chr5 (456-595)||(24767603-24767743)
chr5 (558-635)||(25431277-25431355)
chr5 (157-210)||(15441720-15441773)
chr5 (31-76)||(19660474-19660519)
chr5 (558-634)||(22074904-22074980)
chr5 (32-76)||(21292619-21292663)
chr5 (573-636)||(26680460-26680521)
chr5 (573-636)||(26952067-26952128)
chr5 (163-210)||(23337060-23337107)
chr5 (36-91)||(25431818-25431873)
chr5 (560-634)||(37723787-37723861)
chr5 (461-515)||(2154721-2154775)
chr5 (468-619)||(10775790-10775942)
chr5 (438-512)||(17517241-17517315)
chr5 (36-76)||(1096906-1096946)
chr5 (36-76)||(21565983-21566023)
chr5 (36-76)||(22075447-22075487)
chr5 (36-76)||(22959175-22959215)
chr5 (12-72)||(26742376-26742436)
chr5 (165-204)||(22119963-22120002)
chr5 (454-619)||(22412083-22412249)
chr5 (36-91)||(25421956-25422011)
chr5 (573-635)||(123480-123542)
chr5 (461-515)||(264875-264929)
chr5 (461-515)||(10733047-10733101)
chr5 (461-515)||(11581306-11581360)
chr5 (461-515)||(20909013-20909067)
chr5 (461-515)||(20918055-20918109)
chr5 (461-515)||(29329935-29329989)
chr5 (461-515)||(39245137-39245191)
chr5 (36-73)||(19669342-19669379)
chr5 (466-515)||(21329565-21329614)
chr5 (454-515)||(21729120-21729181)
chr5 (466-515)||(23064512-23064561)
chr5 (461-590)||(31060995-31061123)
chr5 (466-515)||(36154892-36154941)
chr5 (466-515)||(38619435-38619484)
chr5 (35-75)||(8286494-8286534)
chr5 (165-201)||(19660608-19660644)
chr5 (466-606)||(20806854-20806992)
chr5 (36-76)||(21329137-21329177)
chr5 (454-517)||(21565544-21565608)
chr5 (36-76)||(21985789-21985829)
chr5 (12-76)||(22107002-22107066)
chr5 (12-76)||(22119811-22119875)
chr5 (36-76)||(23390138-23390178)
chr5 (134-210)||(24554820-24554896)
chr5 (12-72)||(25229036-25229096)
chr5 (12-72)||(25293192-25293252)
chr5 (36-87)||(11580887-11580938)
chr5 (165-200)||(11581016-11581051)
chr5 (163-210)||(14359591-14359638)
chr5 (149-200)||(22107129-22107180)
chr5 (466-517)||(22959600-22959651)
chr5 (165-204)||(24767107-24767146)
chr5 (188-219)||(33409506-33409537)
chr5 (466-590)||(36314505-36314630)
chr5 (163-305)||(15236552-15236694)
chr5 (461-515)||(29345981-29346035)
chr5 (461-515)||(42245472-42245526)
chr5 (35-72)||(4036636-4036673)
chr5 (35-76)||(16674564-16674605)
chr5 (35-72)||(17718092-17718129)
chr5 (35-72)||(18356743-18356780)
chr5 (35-72)||(18784463-18784500)
chr5 (35-72)||(21340420-21340457)
chr5 (35-72)||(21482894-21482931)
chr5 (35-72)||(21884842-21884879)
chr5 (35-72)||(24532701-24532738)
chr5 (35-76)||(26172876-26172917)
chr5 (35-72)||(26665784-26665821)
chr5 (35-72)||(26937381-26937418)
chr5 (35-72)||(33409622-33409659)
chr5 (35-72)||(42805836-42805873)
chr5 (165-201)||(5888946-5888982)
chr5 (558-590)||(14048011-14048043)
chr5 (558-590)||(17517367-17517399)
chr5 (558-590)||(18418529-18418561)
chr5 (35-63)||(20232955-20232983)
chr5 (461-501)||(20902116-20902156)
chr5 (36-76)||(21498659-21498699)
chr5 (165-201)||(21565858-21565894)
chr5 (165-201)||(22959304-22959340)
chr5 (558-590)||(24067036-24067068)
chr5 (36-76)||(24529660-24529700)
chr5 (40-76)||(24766983-24767019)
chr5 (165-201)||(25744035-25744071)
[»] scaffold0297 (3 HSPs)
scaffold0297 (12-635)||(15298-15916)
scaffold0297 (444-635)||(10568-10758)
scaffold0297 (12-124)||(10440-10553)
[»] scaffold0671 (1 HSPs)
scaffold0671 (12-635)||(5974-6603)
[»] chr3 (207 HSPs)
chr3 (36-635)||(23408308-23408907)
chr3 (12-635)||(14878124-14878754)
chr3 (12-635)||(16369279-16369907)
chr3 (12-603)||(15060196-15060791)
chr3 (12-635)||(15051388-15052015)
chr3 (12-635)||(23077097-23077715)
chr3 (12-635)||(856019-856635)
chr3 (13-538)||(17524794-17525298)
chr3 (292-635)||(15877947-15878288)
chr3 (12-635)||(18383536-18384152)
chr3 (12-635)||(23052696-23053326)
chr3 (12-629)||(12496143-12496754)
chr3 (12-635)||(322472-323088)
chr3 (12-629)||(11298148-11298761)
chr3 (12-635)||(19725531-19726138)
chr3 (12-267)||(12173029-12173285)
chr3 (36-291)||(15877471-15877727)
chr3 (53-635)||(11862673-11863247)
chr3 (12-636)||(12037572-12038189)
chr3 (16-305)||(26190632-26190922)
chr3 (15-586)||(11851510-11852067)
chr3 (155-489)||(16909768-16910105)
chr3 (311-635)||(12172675-12173003)
chr3 (13-167)||(321634-321789)
chr3 (12-326)||(1982440-1982745)
chr3 (12-392)||(326794-327163)
chr3 (12-323)||(11594769-11595070)
chr3 (540-635)||(16796199-16796294)
chr3 (12-229)||(7792976-7793184)
chr3 (12-229)||(15482930-15483138)
chr3 (12-392)||(20461130-20461499)
chr3 (12-213)||(3402585-3402777)
chr3 (134-219)||(1598223-1598308)
chr3 (144-219)||(17242250-17242325)
chr3 (144-219)||(38814662-38814737)
chr3 (16-220)||(15849719-15849914)
chr3 (467-635)||(26196500-26196669)
chr3 (34-323)||(11557037-11557316)
chr3 (144-220)||(16797807-16797883)
chr3 (145-219)||(15941658-15941732)
chr3 (12-220)||(31097184-31097383)
chr3 (12-219)||(42326222-42326420)
chr3 (544-635)||(15067562-15067654)
chr3 (144-220)||(16808634-16808710)
chr3 (134-219)||(3833952-3834037)
chr3 (12-218)||(16697071-16697268)
chr3 (144-219)||(11300264-11300339)
chr3 (523-624)||(12852662-12852763)
chr3 (144-220)||(2897576-2897652)
chr3 (342-635)||(11424713-11424997)
chr3 (12-218)||(16690498-16690695)
chr3 (134-210)||(20723288-20723364)
chr3 (157-218)||(7109981-7110042)
chr3 (157-218)||(7113916-7113977)
chr3 (145-218)||(11855015-11855088)
chr3 (157-218)||(22337002-22337063)
chr3 (157-218)||(27409409-27409470)
chr3 (439-634)||(12510934-12511137)
chr3 (461-634)||(17487740-17487914)
chr3 (461-634)||(17499222-17499396)
chr3 (343-632)||(25476336-25476620)
chr3 (573-636)||(11557562-11557625)
chr3 (454-634)||(20698491-20698673)
chr3 (454-634)||(23083417-23083598)
chr3 (342-590)||(14972783-14973025)
chr3 (157-218)||(15617656-15617717)
chr3 (157-218)||(22321947-22322008)
chr3 (583-635)||(11849195-11849247)
chr3 (12-76)||(17674194-17674258)
chr3 (134-210)||(24188064-24188140)
chr3 (573-636)||(1982988-1983051)
chr3 (466-634)||(13442158-13442327)
chr3 (175-381)||(3389719-3389924)
chr3 (451-619)||(24153261-24153430)
chr3 (466-637)||(43840813-43840985)
chr3 (466-632)||(26686773-26686940)
chr3 (157-218)||(28950007-28950068)
chr3 (134-219)||(55149256-55149341)
chr3 (573-629)||(3390114-3390169)
chr3 (573-636)||(11595316-11595377)
chr3 (32-84)||(13209966-13210018)
chr3 (36-126)||(3389600-3389691)
chr3 (454-635)||(18438416-18438599)
chr3 (456-595)||(2897873-2898012)
chr3 (456-629)||(3403014-3403189)
chr3 (454-634)||(12399093-12399274)
chr3 (432-595)||(14665320-14665484)
chr3 (432-595)||(14668476-14668640)
chr3 (562-634)||(13210493-13210565)
chr3 (256-376)||(14179570-14179690)
chr3 (439-512)||(46822272-46822345)
chr3 (461-590)||(55476418-55476546)
chr3 (12-76)||(12399634-12399698)
chr3 (32-76)||(14179761-14179805)
chr3 (573-636)||(42325820-42325881)
chr3 (342-502)||(42386427-42386581)
chr3 (160-210)||(839533-839583)
chr3 (558-634)||(14576990-14577067)
chr3 (455-634)||(14572475-14572653)
chr3 (165-210)||(28350935-28350980)
chr3 (438-632)||(30029718-30029921)
chr3 (461-619)||(38961998-38962157)
chr3 (36-76)||(12933952-12933992)
chr3 (36-76)||(17247928-17247968)
chr3 (36-84)||(26687318-26687366)
chr3 (461-619)||(28848718-28848876)
chr3 (461-619)||(29172690-29172849)
chr3 (36-76)||(49389286-49389326)
chr3 (165-204)||(12340064-12340103)
chr3 (36-75)||(17247162-17247201)
chr3 (466-635)||(40213788-40213958)
chr3 (36-87)||(53070341-53070392)
chr3 (461-515)||(6469241-6469295)
chr3 (461-515)||(7781454-7781508)
chr3 (461-515)||(9707714-9707768)
chr3 (466-538)||(14234471-14234540)
chr3 (461-515)||(15977516-15977570)
chr3 (32-74)||(16809826-16809868)
chr3 (144-190)||(16862933-16862979)
chr3 (461-515)||(17463179-17463233)
chr3 (461-515)||(17737237-17737291)
chr3 (31-73)||(20698084-20698126)
chr3 (466-604)||(28194607-28194743)
chr3 (461-515)||(34159327-34159381)
chr3 (461-515)||(45607014-45607068)
chr3 (461-515)||(55500943-55500997)
chr3 (35-76)||(3834086-3834127)
chr3 (466-515)||(8499519-8499568)
chr3 (458-515)||(10247827-10247884)
chr3 (466-515)||(10556986-10557035)
chr3 (466-515)||(12119837-12119886)
chr3 (461-590)||(12567480-12567615)
chr3 (466-515)||(15412430-15412479)
chr3 (461-514)||(16282918-16282971)
chr3 (466-515)||(17672627-17672676)
chr3 (558-634)||(23274570-23274647)
chr3 (558-634)||(24340884-24340961)
chr3 (466-515)||(27165251-27165300)
chr3 (466-515)||(36166599-36166648)
chr3 (466-515)||(45577950-45577999)
chr3 (36-76)||(1644325-1644365)
chr3 (165-205)||(1644453-1644493)
chr3 (36-76)||(4588457-4588497)
chr3 (36-76)||(11424405-11424445)
chr3 (36-76)||(12171759-12171799)
chr3 (36-76)||(12340191-12340231)
chr3 (165-205)||(12852134-12852174)
chr3 (165-205)||(13210098-13210138)
chr3 (36-76)||(14666044-14666084)
chr3 (36-76)||(14669199-14669239)
chr3 (36-76)||(14735557-14735597)
chr3 (36-76)||(14973293-14973333)
chr3 (36-72)||(15471367-15471403)
chr3 (36-76)||(16104219-16104259)
chr3 (148-200)||(17248040-17248092)
chr3 (36-76)||(18438973-18439013)
chr3 (36-76)||(23083003-23083043)
chr3 (36-72)||(25476027-25476063)
chr3 (165-205)||(32307979-32308019)
chr3 (36-76)||(32308107-32308147)
chr3 (466-514)||(41123892-41123940)
chr3 (165-205)||(49667854-49667894)
chr3 (135-210)||(10326140-10326215)
chr3 (466-517)||(12174327-12174378)
chr3 (461-512)||(13544029-13544080)
chr3 (165-204)||(14665917-14665956)
chr3 (165-204)||(14669072-14669111)
chr3 (165-204)||(14735430-14735469)
chr3 (466-517)||(16097330-16097381)
chr3 (149-200)||(20698192-20698243)
chr3 (149-200)||(26687201-26687252)
chr3 (165-200)||(30030153-30030188)
chr3 (461-515)||(8899095-8899149)
chr3 (38-76)||(9513349-9513387)
chr3 (38-76)||(9521324-9521362)
chr3 (163-305)||(11165301-11165443)
chr3 (454-515)||(13210382-13210444)
chr3 (461-515)||(16454388-16454442)
chr3 (163-305)||(30066141-30066283)
chr3 (461-515)||(50242823-50242877)
chr3 (31-76)||(1465046-1465091)
chr3 (35-72)||(1598133-1598170)
chr3 (31-76)||(2050838-2050883)
chr3 (157-202)||(7986001-7986046)
chr3 (35-76)||(14573027-14573068)
chr3 (35-72)||(15941557-15941594)
chr3 (36-73)||(16097772-16097809)
chr3 (35-72)||(16797707-16797744)
chr3 (149-190)||(16809724-16809765)
chr3 (35-76)||(17242384-17242425)
chr3 (11-76)||(22322080-22322145)
chr3 (11-76)||(22337135-22337200)
chr3 (35-72)||(38814800-38814837)
chr3 (466-515)||(44494810-44494859)
chr3 (595-634)||(10542638-10542678)
chr3 (165-205)||(12934081-12934121)
chr3 (558-590)||(13543945-13543977)
chr3 (36-76)||(14234929-14234969)
chr3 (36-76)||(14576475-14576515)
chr3 (154-210)||(16333460-16333516)
chr3 (37-73)||(30030270-30030306)
chr3 (36-76)||(40213363-40213403)
chr3 (342-402)||(40213671-40213730)
chr3 (562-606)||(43550689-43550732)
chr3 (36-76)||(43842617-43842657)
chr3 (558-590)||(46822188-46822220)
chr3 (456-500)||(53070755-53070799)
[»] scaffold0261 (4 HSPs)
scaffold0261 (7-635)||(1219-1845)
scaffold0261 (466-606)||(15576-15714)
scaffold0261 (165-201)||(15973-16009)
scaffold0261 (31-76)||(16097-16142)
[»] scaffold0081 (3 HSPs)
scaffold0081 (12-635)||(14542-15171)
scaffold0081 (12-635)||(23558-24189)
scaffold0081 (12-635)||(38982-39613)
[»] scaffold0174 (1 HSPs)
scaffold0174 (12-635)||(18072-18692)
[»] scaffold0042 (8 HSPs)
scaffold0042 (12-635)||(34529-35156)
scaffold0042 (25-248)||(41185-41409)
scaffold0042 (144-219)||(64131-64206)
scaffold0042 (144-219)||(76015-76090)
scaffold0042 (454-501)||(24359-24406)
scaffold0042 (35-72)||(64269-64306)
scaffold0042 (35-72)||(76153-76190)
scaffold0042 (36-76)||(23944-23984)
[»] scaffold0096 (2 HSPs)
scaffold0096 (12-635)||(15968-16586)
scaffold0096 (571-634)||(20892-20956)
[»] scaffold0056 (4 HSPs)
scaffold0056 (12-635)||(13696-14325)
scaffold0056 (342-635)||(17165-17459)
scaffold0056 (39-87)||(79007-79055)
scaffold0056 (35-76)||(16856-16897)
[»] scaffold0158 (2 HSPs)
scaffold0158 (12-635)||(2712-3339)
scaffold0158 (12-635)||(6378-7005)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (12-635)||(1760-2376)
[»] scaffold0198 (2 HSPs)
scaffold0198 (261-635)||(23723-24094)
scaffold0198 (36-206)||(26706-26877)
[»] scaffold0149 (5 HSPs)
scaffold0149 (65-635)||(3621-4188)
scaffold0149 (65-635)||(8052-8619)
scaffold0149 (12-50)||(4181-4219)
scaffold0149 (12-50)||(8612-8650)
scaffold0149 (461-501)||(29947-29987)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (12-635)||(46346-46966)
[»] scaffold0111 (2 HSPs)
scaffold0111 (45-621)||(32337-32901)
scaffold0111 (157-218)||(8778-8839)
[»] scaffold0102 (4 HSPs)
scaffold0102 (36-601)||(48103-48664)
scaffold0102 (31-76)||(19705-19750)
scaffold0102 (466-517)||(19266-19317)
scaffold0102 (165-199)||(19582-19616)
[»] scaffold0425 (1 HSPs)
scaffold0425 (12-635)||(38-657)
[»] scaffold0080 (4 HSPs)
scaffold0080 (12-538)||(18275-18796)
scaffold0080 (544-635)||(18860-18952)
scaffold0080 (454-635)||(39796-39978)
scaffold0080 (36-91)||(40335-40390)
[»] scaffold0311 (2 HSPs)
scaffold0311 (12-538)||(6697-7226)
scaffold0311 (544-635)||(7274-7367)
[»] scaffold0393 (1 HSPs)
scaffold0393 (12-635)||(1374-1990)
[»] scaffold0021 (5 HSPs)
scaffold0021 (36-629)||(174655-175243)
scaffold0021 (466-634)||(121650-121819)
scaffold0021 (37-74)||(63002-63039)
scaffold0021 (36-76)||(125021-125061)
scaffold0021 (149-200)||(124899-124950)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (12-489)||(4552-5034)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (12-635)||(4309-4927)
[»] scaffold0210 (4 HSPs)
scaffold0210 (12-377)||(21425-21789)
scaffold0210 (12-377)||(29317-29681)
scaffold0210 (439-635)||(21844-22042)
scaffold0210 (439-635)||(29736-29934)
[»] scaffold0023 (10 HSPs)
scaffold0023 (12-635)||(38119-38717)
scaffold0023 (14-402)||(23288-23675)
scaffold0023 (466-634)||(119759-119928)
scaffold0023 (461-512)||(17547-17598)
scaffold0023 (461-515)||(44455-44509)
scaffold0023 (461-515)||(94412-94466)
scaffold0023 (466-546)||(100353-100427)
scaffold0023 (36-76)||(39651-39691)
scaffold0023 (466-517)||(101501-101552)
scaffold0023 (36-76)||(101833-101873)
[»] scaffold0615 (1 HSPs)
scaffold0615 (12-629)||(1703-2315)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (13-524)||(26819-27322)
[»] scaffold1296 (1 HSPs)
scaffold1296 (13-629)||(282-889)
[»] scaffold0555 (3 HSPs)
scaffold0555 (148-577)||(518-945)
scaffold0555 (32-74)||(1020-1062)
scaffold0555 (36-76)||(10210-10250)
[»] scaffold0029 (4 HSPs)
scaffold0029 (12-377)||(12894-13258)
scaffold0029 (439-635)||(12641-12839)
scaffold0029 (157-218)||(61378-61439)
scaffold0029 (157-211)||(65294-65348)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (12-629)||(780-1393)
[»] scaffold0114 (6 HSPs)
scaffold0114 (13-377)||(7426-7789)
scaffold0114 (439-635)||(7174-7371)
scaffold0114 (32-76)||(32914-32958)
scaffold0114 (562-634)||(15629-15701)
scaffold0114 (32-76)||(15114-15158)
scaffold0114 (454-515)||(15519-15580)
[»] scaffold0412 (1 HSPs)
scaffold0412 (15-629)||(6038-6636)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (12-270)||(15642-15901)
[»] scaffold0037 (4 HSPs)
scaffold0037 (12-402)||(21188-21578)
scaffold0037 (507-635)||(21633-21761)
scaffold0037 (461-606)||(81983-82127)
scaffold0037 (165-202)||(80102-80139)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (340-635)||(7755-8054)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (12-635)||(1710-2325)
scaffold0104 (12-635)||(9393-10007)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (12-635)||(16740-17348)
[»] scaffold1895 (1 HSPs)
scaffold1895 (12-360)||(867-1195)
[»] scaffold0020 (4 HSPs)
scaffold0020 (441-632)||(178781-178972)
scaffold0020 (36-189)||(178974-179128)
scaffold0020 (36-84)||(15472-15520)
scaffold0020 (466-538)||(15845-15914)
[»] scaffold0008 (3 HSPs)
scaffold0008 (12-635)||(30364-30980)
scaffold0008 (157-216)||(2157-2216)
scaffold0008 (12-72)||(2292-2352)
[»] scaffold0761 (2 HSPs)
scaffold0761 (12-564)||(5928-6473)
scaffold0761 (461-513)||(4300-4352)
[»] scaffold0476 (2 HSPs)
scaffold0476 (13-635)||(5473-6081)
scaffold0476 (13-635)||(6668-7276)
[»] scaffold0346 (2 HSPs)
scaffold0346 (104-635)||(14968-15490)
scaffold0346 (31-72)||(17361-17402)
[»] scaffold1326 (1 HSPs)
scaffold1326 (12-635)||(1119-1718)
[»] scaffold0017 (8 HSPs)
scaffold0017 (27-213)||(190915-191102)
scaffold0017 (27-277)||(192618-192869)
scaffold0017 (144-218)||(56376-56450)
scaffold0017 (523-635)||(193099-193214)
scaffold0017 (426-635)||(19760-19972)
scaffold0017 (426-635)||(15238-15450)
scaffold0017 (12-93)||(14943-15024)
scaffold0017 (32-93)||(19485-19546)
[»] scaffold0280 (2 HSPs)
scaffold0280 (12-376)||(18921-19275)
scaffold0280 (506-635)||(19391-19525)
[»] scaffold0327 (3 HSPs)
scaffold0327 (12-326)||(461-766)
scaffold0327 (426-635)||(168-378)
scaffold0327 (342-402)||(3480-3539)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (12-326)||(502-807)
[»] scaffold0109 (6 HSPs)
scaffold0109 (12-326)||(45289-45594)
scaffold0109 (145-219)||(7222-7296)
scaffold0109 (157-218)||(11068-11129)
scaffold0109 (157-218)||(38585-38646)
scaffold0109 (12-72)||(10932-10992)
scaffold0109 (35-72)||(38472-38509)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (277-632)||(4690-5041)
[»] scaffold0064 (3 HSPs)
scaffold0064 (12-138)||(64282-64409)
scaffold0064 (560-628)||(46885-46953)
scaffold0064 (32-73)||(47417-47458)
[»] scaffold0079 (2 HSPs)
scaffold0079 (193-629)||(43967-44395)
scaffold0079 (12-170)||(44391-44550)
[»] scaffold0003 (10 HSPs)
scaffold0003 (144-636)||(413803-414288)
scaffold0003 (36-305)||(71505-71765)
scaffold0003 (144-220)||(96883-96959)
scaffold0003 (134-219)||(139988-140073)
scaffold0003 (461-590)||(158557-158686)
scaffold0003 (558-635)||(340107-340185)
scaffold0003 (13-76)||(140122-140185)
scaffold0003 (12-76)||(97018-97083)
scaffold0003 (36-76)||(339593-339633)
scaffold0003 (148-200)||(339705-339757)
[»] scaffold0228 (13 HSPs)
scaffold0228 (12-229)||(18262-18470)
scaffold0228 (558-635)||(4392-4469)
scaffold0228 (558-635)||(11974-12051)
scaffold0228 (558-635)||(21926-22003)
scaffold0228 (36-76)||(4947-4987)
scaffold0228 (36-76)||(12529-12569)
scaffold0228 (36-76)||(22481-22521)
scaffold0228 (342-402)||(4619-4678)
scaffold0228 (148-200)||(4822-4874)
scaffold0228 (342-402)||(12201-12260)
scaffold0228 (148-200)||(12404-12456)
scaffold0228 (342-402)||(22153-22212)
scaffold0228 (148-200)||(22356-22408)
[»] scaffold0273 (2 HSPs)
scaffold0273 (464-635)||(10374-10546)
scaffold0273 (37-76)||(9081-9120)
[»] scaffold0036 (4 HSPs)
scaffold0036 (12-392)||(66045-66414)
scaffold0036 (573-635)||(68755-68817)
scaffold0036 (12-178)||(71186-71343)
scaffold0036 (456-595)||(66465-66605)
[»] scaffold0484 (2 HSPs)
scaffold0484 (523-629)||(554-662)
scaffold0484 (12-76)||(1342-1406)
[»] scaffold0044 (5 HSPs)
scaffold0044 (12-229)||(19456-19664)
scaffold0044 (13-229)||(13172-13379)
scaffold0044 (136-216)||(62541-62621)
scaffold0044 (461-515)||(40401-40455)
scaffold0044 (12-72)||(62676-62736)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (434-627)||(73802-73995)
scaffold0022 (466-515)||(116431-116480)
scaffold0022 (558-590)||(116355-116387)
[»] scaffold1220 (2 HSPs)
scaffold1220 (12-315)||(1984-2277)
scaffold1220 (506-629)||(1685-1810)
[»] scaffold0171 (2 HSPs)
scaffold0171 (12-219)||(35140-35338)
scaffold0171 (558-629)||(32049-32121)
[»] scaffold0184 (2 HSPs)
scaffold0184 (12-381)||(3854-4213)
scaffold0184 (573-635)||(4403-4463)
[»] scaffold0124 (4 HSPs)
scaffold0124 (259-635)||(42510-42871)
scaffold0124 (525-624)||(24949-25048)
scaffold0124 (165-205)||(24421-24461)
scaffold0124 (13-49)||(42869-42905)
[»] scaffold0001 (6 HSPs)
scaffold0001 (12-229)||(173558-173766)
scaffold0001 (15-636)||(422163-422771)
scaffold0001 (36-76)||(161124-161164)
scaffold0001 (461-519)||(501081-501139)
scaffold0001 (466-590)||(85692-85816)
scaffold0001 (465-516)||(160687-160738)
[»] scaffold0120 (7 HSPs)
scaffold0120 (12-219)||(19647-19845)
scaffold0120 (466-635)||(15996-16166)
scaffold0120 (461-635)||(33019-33194)
scaffold0120 (461-635)||(45811-45986)
scaffold0120 (461-515)||(17392-17446)
scaffold0120 (36-73)||(32601-32638)
scaffold0120 (36-73)||(46367-46404)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (12-326)||(191946-192251)
[»] scaffold0070 (3 HSPs)
scaffold0070 (144-219)||(10181-10256)
scaffold0070 (41-91)||(4947-4997)
scaffold0070 (35-76)||(10315-10356)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (144-229)||(228126-228211)
[»] scaffold1461 (2 HSPs)
scaffold1461 (144-219)||(207-282)
scaffold1461 (35-76)||(341-382)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (36-229)||(15072-15256)
[»] scaffold0013 (3 HSPs)
scaffold0013 (134-220)||(2416-2502)
scaffold0013 (157-210)||(9627-9680)
scaffold0013 (13-62)||(2304-2353)
[»] scaffold0439 (4 HSPs)
scaffold0439 (12-219)||(2065-2263)
scaffold0439 (12-219)||(9925-10123)
scaffold0439 (573-636)||(2614-2677)
scaffold0439 (573-636)||(10474-10537)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (144-229)||(13240-13325)
[»] scaffold0168 (2 HSPs)
scaffold0168 (144-229)||(3283-3368)
scaffold0168 (12-63)||(3160-3211)
[»] scaffold0639 (2 HSPs)
scaffold0639 (430-629)||(8370-8568)
scaffold0639 (36-76)||(8914-8954)
[»] scaffold0193 (4 HSPs)
scaffold0193 (144-216)||(9701-9773)
scaffold0193 (454-634)||(13096-13276)
scaffold0193 (35-76)||(9832-9873)
scaffold0193 (36-76)||(13639-13679)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (144-219)||(24721-24796)
scaffold0012 (12-72)||(24598-24658)
[»] scaffold0550 (2 HSPs)
scaffold0550 (507-636)||(7351-7479)
scaffold0550 (262-323)||(7656-7717)
[»] scaffold0410 (2 HSPs)
scaffold0410 (134-219)||(11658-11743)
scaffold0410 (574-629)||(2054-2107)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (146-219)||(36583-36656)
scaffold0132 (36-72)||(36721-36757)
[»] scaffold1552 (2 HSPs)
scaffold1552 (132-215)||(635-718)
scaffold1552 (13-76)||(765-828)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (342-635)||(3136-3428)
[»] scaffold0130 (3 HSPs)
scaffold0130 (144-219)||(5753-5828)
scaffold0130 (558-635)||(27758-27836)
scaffold0130 (342-402)||(27942-28001)
[»] scaffold0010 (5 HSPs)
scaffold0010 (144-219)||(23494-23569)
scaffold0010 (134-210)||(242344-242420)
scaffold0010 (165-201)||(130221-130257)
scaffold0010 (36-76)||(130346-130386)
scaffold0010 (35-76)||(23628-23669)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (144-218)||(9613-9687)
[»] scaffold0292 (4 HSPs)
scaffold0292 (466-635)||(227-396)
scaffold0292 (454-634)||(3354-3535)
scaffold0292 (36-76)||(781-821)
scaffold0292 (149-200)||(3784-3835)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (342-635)||(3101-3388)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (449-635)||(280941-281133)
[»] scaffold0145 (5 HSPs)
scaffold0145 (342-635)||(38643-38931)
scaffold0145 (454-635)||(32824-33007)
scaffold0145 (558-635)||(32358-32436)
scaffold0145 (461-515)||(9750-9804)
scaffold0145 (151-200)||(39075-39124)
[»] scaffold0011 (6 HSPs)
scaffold0011 (454-634)||(51797-51978)
scaffold0011 (466-634)||(168046-168215)
scaffold0011 (36-76)||(167632-167672)
scaffold0011 (36-76)||(52351-52391)
scaffold0011 (149-200)||(52226-52277)
scaffold0011 (149-200)||(167735-167786)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (342-635)||(39360-39647)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (342-635)||(75165-75452)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (467-634)||(8598-8766)
[»] scaffold0165 (6 HSPs)
scaffold0165 (12-76)||(3909-3973)
scaffold0165 (12-76)||(7973-8037)
scaffold0165 (560-635)||(3397-3472)
scaffold0165 (560-635)||(7461-7536)
scaffold0165 (149-200)||(3795-3846)
scaffold0165 (149-200)||(7859-7910)
[»] scaffold0142 (5 HSPs)
scaffold0142 (523-635)||(7942-8054)
scaffold0142 (461-591)||(16709-16839)
scaffold0142 (36-87)||(17208-17259)
scaffold0142 (165-205)||(7541-7581)
scaffold0142 (165-200)||(17095-17130)
[»] scaffold1048 (1 HSPs)
scaffold1048 (12-126)||(1798-1913)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (36-106)||(36034-36105)
[»] scaffold0546 (3 HSPs)
scaffold0546 (145-219)||(6011-6085)
scaffold0546 (157-218)||(2178-2239)
scaffold0546 (12-72)||(2315-2375)
[»] scaffold0289 (1 HSPs)
scaffold0289 (573-635)||(2447-2509)
[»] scaffold0284 (2 HSPs)
scaffold0284 (144-218)||(18633-18707)
scaffold0284 (12-76)||(18766-18830)
[»] scaffold0016 (4 HSPs)
scaffold0016 (455-634)||(1735-1915)
scaffold0016 (165-204)||(207289-207328)
scaffold0016 (35-76)||(207160-207201)
scaffold0016 (36-76)||(2290-2330)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (157-218)||(4867-4928)
[»] scaffold0342 (2 HSPs)
scaffold0342 (12-219)||(6900-7098)
scaffold0342 (573-635)||(7448-7510)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (444-593)||(29479-29629)
[»] scaffold0637 (2 HSPs)
scaffold0637 (144-219)||(8849-8924)
scaffold0637 (573-636)||(8439-8500)
[»] scaffold0371 (2 HSPs)
scaffold0371 (157-216)||(15618-15677)
scaffold0371 (12-72)||(15759-15819)
[»] scaffold1842 (3 HSPs)
scaffold1842 (466-634)||(1116-1285)
scaffold1842 (36-76)||(702-742)
scaffold1842 (149-200)||(805-856)
[»] scaffold0113 (3 HSPs)
scaffold0113 (454-634)||(31951-32132)
scaffold0113 (32-76)||(32492-32536)
scaffold0113 (149-200)||(32378-32429)
[»] scaffold0028 (8 HSPs)
scaffold0028 (157-218)||(58484-58545)
scaffold0028 (36-76)||(133092-133132)
scaffold0028 (461-619)||(136577-136735)
scaffold0028 (461-619)||(139046-139204)
scaffold0028 (461-619)||(143984-144142)
scaffold0028 (165-205)||(132963-133003)
scaffold0028 (461-619)||(141515-141673)
scaffold0028 (461-515)||(134212-134266)
[»] scaffold0395 (2 HSPs)
scaffold0395 (454-635)||(4889-5071)
scaffold0395 (36-76)||(604-644)
[»] scaffold0175 (6 HSPs)
scaffold0175 (466-627)||(164-326)
scaffold0175 (32-76)||(34559-34603)
scaffold0175 (36-76)||(13531-13571)
scaffold0175 (149-200)||(13406-13457)
scaffold0175 (466-634)||(34007-34176)
scaffold0175 (165-199)||(34437-34471)
[»] scaffold0334 (2 HSPs)
scaffold0334 (144-211)||(18113-18180)
scaffold0334 (35-72)||(18013-18050)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (157-216)||(16429-16488)
scaffold0034 (36-87)||(51526-51577)
[»] scaffold0358 (5 HSPs)
scaffold0358 (466-634)||(4596-4765)
scaffold0358 (36-76)||(364-404)
scaffold0358 (36-76)||(5140-5180)
scaffold0358 (149-197)||(253-301)
scaffold0358 (149-197)||(5029-5077)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (157-210)||(29973-30026)
scaffold0138 (36-76)||(13379-13419)
[»] scaffold0046 (5 HSPs)
scaffold0046 (466-629)||(28302-28467)
scaffold0046 (466-629)||(4440-4605)
scaffold0046 (562-634)||(1880-1952)
scaffold0046 (466-542)||(11272-11345)
scaffold0046 (466-515)||(2001-2050)
[»] scaffold0026 (6 HSPs)
scaffold0026 (342-635)||(25778-26066)
scaffold0026 (342-635)||(39740-40028)
scaffold0026 (165-201)||(59273-59309)
scaffold0026 (36-91)||(39573-39628)
scaffold0026 (162-198)||(40173-40209)
scaffold0026 (36-76)||(40295-40335)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (573-636)||(205240-205301)
[»] scaffold0598 (2 HSPs)
scaffold0598 (560-634)||(1212-1286)
scaffold0598 (32-76)||(701-745)
[»] scaffold0490 (2 HSPs)
scaffold0490 (560-634)||(1836-1910)
scaffold0490 (32-76)||(2380-2424)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (560-634)||(1173-1247)
scaffold0106 (454-619)||(15294-15460)
scaffold0106 (32-76)||(16086-16130)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (573-635)||(27300-27362)
[»] scaffold0166 (3 HSPs)
scaffold0166 (456-595)||(10100-10240)
scaffold0166 (165-204)||(9604-9643)
scaffold0166 (40-76)||(9480-9516)
[»] scaffold0122 (5 HSPs)
scaffold0122 (342-512)||(26015-26179)
scaffold0122 (35-76)||(25706-25747)
scaffold0122 (368-515)||(44682-44824)
scaffold0122 (559-619)||(44868-44929)
scaffold0122 (342-386)||(33445-33488)
[»] scaffold0456 (2 HSPs)
scaffold0456 (562-634)||(10589-10661)
scaffold0456 (32-76)||(10075-10119)
[»] scaffold0427 (4 HSPs)
scaffold0427 (562-634)||(13380-13452)
scaffold0427 (32-76)||(13923-13967)
scaffold0427 (454-501)||(13515-13562)
scaffold0427 (165-201)||(13808-13844)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (157-210)||(10464-10517)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (562-634)||(11609-11681)
scaffold0235 (40-76)||(11170-11206)
[»] scaffold0233 (1 HSPs)
scaffold0233 (157-210)||(14306-14359)
[»] scaffold0423 (1 HSPs)
scaffold0423 (32-76)||(10910-10954)
[»] scaffold0647 (2 HSPs)
scaffold0647 (466-634)||(6192-6361)
scaffold0647 (35-76)||(5762-5803)
[»] scaffold0451 (1 HSPs)
scaffold0451 (12-63)||(11430-11481)
[»] scaffold0403 (3 HSPs)
scaffold0403 (560-634)||(4733-4807)
scaffold0403 (31-84)||(5268-5321)
scaffold0403 (454-515)||(4853-4914)
[»] scaffold0192 (2 HSPs)
scaffold0192 (36-90)||(10335-10389)
scaffold0192 (165-205)||(10221-10261)
[»] scaffold0161 (3 HSPs)
scaffold0161 (560-629)||(2563-2632)
scaffold0161 (31-76)||(2082-2127)
scaffold0161 (165-201)||(2215-2251)
[»] scaffold0405 (2 HSPs)
scaffold0405 (12-77)||(9322-9387)
scaffold0405 (193-229)||(9467-9503)
[»] scaffold0150 (2 HSPs)
scaffold0150 (31-76)||(32522-32567)
scaffold0150 (165-205)||(32393-32433)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (31-76)||(21329-21374)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (441-595)||(29013-29168)
[»] scaffold1137 (2 HSPs)
scaffold1137 (32-72)||(1939-1979)
scaffold1137 (165-205)||(2072-2112)
[»] scaffold0876 (1 HSPs)
scaffold0876 (36-76)||(2727-2767)
[»] scaffold0810 (1 HSPs)
scaffold0810 (36-76)||(3371-3411)
[»] scaffold0718 (2 HSPs)
scaffold0718 (32-76)||(4780-4824)
scaffold0718 (560-634)||(5291-5365)
[»] scaffold0556 (1 HSPs)
scaffold0556 (36-76)||(7250-7290)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (36-76)||(13250-13290)
[»] scaffold0333 (4 HSPs)
scaffold0333 (36-84)||(7044-7092)
scaffold0333 (36-84)||(14424-14472)
scaffold0333 (466-538)||(6595-6664)
scaffold0333 (466-538)||(13975-14044)
[»] scaffold0413 (2 HSPs)
scaffold0413 (36-87)||(15257-15308)
scaffold0413 (148-200)||(15369-15421)
[»] scaffold0347 (1 HSPs)
scaffold0347 (165-204)||(340-379)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (33-76)||(7038-7081)
[»] scaffold0185 (1 HSPs)
scaffold0185 (573-635)||(33431-33494)
[»] scaffold0075 (2 HSPs)
scaffold0075 (165-204)||(8064-8103)
scaffold0075 (36-76)||(7936-7976)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (560-634)||(51466-51540)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (468-619)||(4110-4262)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (15-61)||(6443-6489)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (466-538)||(1102-1171)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (461-515)||(13393-13447)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (461-515)||(20748-20802)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (466-538)||(6191-6260)
[»] scaffold0231 (2 HSPs)
scaffold0231 (461-515)||(22887-22941)
scaffold0231 (36-76)||(23321-23361)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (461-515)||(37822-37876)
[»] scaffold0475 (2 HSPs)
scaffold0475 (27-76)||(9515-9564)
scaffold0475 (165-201)||(9390-9426)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (31-76)||(28917-28962)
[»] scaffold0125 (3 HSPs)
scaffold0125 (31-76)||(45426-45471)
scaffold0125 (466-517)||(45860-45911)
scaffold0125 (165-201)||(45561-45597)
[»] scaffold0627 (1 HSPs)
scaffold0627 (36-76)||(343-383)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (36-76)||(17650-17690)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (36-76)||(16707-16747)
[»] scaffold0305 (2 HSPs)
scaffold0305 (149-201)||(20716-20768)
scaffold0305 (36-76)||(20842-20882)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (36-76)||(6032-6072)
[»] scaffold0217 (3 HSPs)
scaffold0217 (36-76)||(16241-16281)
scaffold0217 (165-200)||(16371-16406)
scaffold0217 (461-590)||(16663-16792)
[»] scaffold0211 (2 HSPs)
scaffold0211 (36-76)||(28451-28491)
scaffold0211 (165-205)||(28580-28620)
[»] scaffold0207 (2 HSPs)
scaffold0207 (36-76)||(2286-2326)
scaffold0207 (466-517)||(2713-2764)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (36-76)||(10597-10637)
[»] scaffold1984 (3 HSPs)
scaffold1984 (466-517)||(131-182)
scaffold1984 (165-200)||(445-480)
scaffold1984 (36-84)||(561-609)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (466-517)||(1084-1135)
[»] scaffold0454 (2 HSPs)
scaffold0454 (461-512)||(10777-10828)
scaffold0454 (558-590)||(10693-10725)
[»] scaffold0363 (2 HSPs)
scaffold0363 (461-512)||(9246-9297)
scaffold0363 (558-590)||(9162-9194)
[»] scaffold0221 (2 HSPs)
scaffold0221 (165-204)||(12579-12618)
scaffold0221 (36-76)||(12451-12491)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (461-515)||(107-161)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (461-515)||(4695-4749)
[»] scaffold0586 (1 HSPs)
scaffold0586 (41-83)||(2285-2327)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (461-515)||(13948-14002)
[»] scaffold0116 (2 HSPs)
scaffold0116 (46-76)||(43436-43466)
scaffold0116 (46-76)||(47356-47386)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (160-210)||(36994-37044)
[»] scaffold0839 (2 HSPs)
scaffold0839 (27-76)||(1711-1759)
scaffold0839 (167-200)||(1850-1883)
[»] scaffold0621 (1 HSPs)
scaffold0621 (466-515)||(6539-6588)
[»] scaffold0285 (1 HSPs)
scaffold0285 (35-72)||(12169-12206)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (157-206)||(24741-24790)
[»] scaffold2044 (1 HSPs)
scaffold2044 (36-72)||(1098-1134)
[»] scaffold1873 (1 HSPs)
scaffold1873 (522-595)||(1172-1247)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (165-205)||(2573-2613)
[»] scaffold0525 (1 HSPs)
scaffold0525 (163-219)||(3648-3704)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (36-76)||(18600-18640)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (36-76)||(20551-20591)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 513; Significance: 0; HSPs: 121)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 513; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 36 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 21715026 - 21714426
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttagaataagattgaacctggtttagctt 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |    
T  21715026 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcttattaaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggtttaacct 21714927  T
Q  135 agaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatagcgc 234  Q
    |||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||    
T  21714926 agaacaacctttgttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgc 21714827  T
Q  235 gatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatatgtgaagttgttatgagatgttag 334  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  21714826 gatctgtgtcgcatgatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgagatgttag 21714727  T
Q  335 tgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttttatttgatatcgttatatgatgtt 434  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21714726 tgttgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttttatttgatatcgttatatgatgtc 21714627  T
Q  435 atactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattg 534  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21714626 atactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatgttgaacctccaaattattg 21714527  T
Q  535 gataaataagagatgatgattgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21714526 gataaataagagatgatgattgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacg 21714427  T
Q  635 a 635  Q
    |    
T  21714426 a 21714426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 409; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 635
Target Start/End: Original strand, 42864830 - 42865451
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  42864830 cagagagcatgtagaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagttgtttattaatgattaaatgataacttaga 42864929  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42864930 atgagattgaacctggtttagcttagaacaacattagttgggaatctggctagtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 42865029  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||     
T  42865030 actgagtgcaagtgaggatgttgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatc 42865129  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttt 410  Q
    ||||||| |||||||| | |||| || ||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    |||    
T  42865130 tgtgaagctgttatgaaaggttaatgttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgagttatgaatgagtgattgagatgttgc----ttt 42865225  T
Q  411 tatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaaga 510  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||| | | ||||||| ||| | ||||  ||||||||    
T  42865226 tatttgatatcgttatgtgatgtcatactgttgttgcaatctgcatatgttgctattgttatttaactatgttgcatgagtcgatataagatgatcaaga 42865325  T
Q  511 tgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatg-tttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcat 609  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42865326 tgatgttgaacctccaaattattggatacataagagatgatgattaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcatacatatgttgggggctcat 42865425  T
Q  610 gccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    
T  42865426 gccctggagcttagtactcaacacga 42865451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 6152347 - 6151728
Alignment:
Q  20 atgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttagaataagatt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  6152347 atgttgaattctgtatttttgacctttgagttgaaccttagttgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattaaatgataacttagaataggatt 6152248  T
Q  119 gaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6152247 gaacctggtttagcttagaacaattttagttgggattctggcttgtactcgccgtggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgaatg 6152148  T
Q  219 caagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatatgtgaagt 318  Q
    || || |||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||||||||| || ||||| |||||| |||||||     
T  6152147 catgttaggatgttgcgatctgtgtcgcatgaattgattagggatggactcttaggtagtaatgtgacctatataggatgttaattgcaatctgtgaagc 6152048  T
Q  319 tgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaa---tta-tgaatgaatgattgagatgttgcttgtttttatt 414  Q
    |||||||| ||||||  ||||  ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||| || | |||| || ||||    
T  6152047 tgttatgaaatgtta-agctgtttataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatgttagtgaatgaatgattgagttgatacttgcttctatt 6151949  T
Q  415 tgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgat 514  Q
    ||||||  ||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||| | | ||||||| ||  |  |||  ||| ||||||||    
T  6151948 tgatatatttatatgatgtcataatgttgttgtgatctgcccgtgctgctattgttatttaactacgttgcatgagtctatacaagatgattaagatgat 6151849  T
Q  515 gttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatg-tttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccc 613  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6151848 gttgaa-ctccaaattattggatatatatgagatgatgattaagatgttttaagagattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccc 6151750  T
Q  614 tggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  6151749 tggagctttgtactcaccacga 6151728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 12 - 635
Target Start/End: Original strand, 22830997 - 22831622
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  22830997 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattagatgatgacttaga 22831096  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22831097 gtgagattgaacctggtttagcttagaacaactttagttgagaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttcctga 22831196  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    ||||||||||| |||| ||   |||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||| |||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||     
T  22831197 actgagtgcaattgagaatgttgcgatctgtgtcgcatgacttgtttagggatggactcttaggtagtaatgtgacctatataggatgttaattgcaatc 22831296  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaa----ttatgaatgaatgattgagatgttgcttg 406  Q
    ||||||| |||||||| ||||||  ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    | |||||||||||| |||| || | ||||    
T  22831297 tgtgaagctgttatgaaatgtta--gctgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatgttaatgaatgaatgactgagttgatacttg 22831394  T
Q  407 tttttatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatc 506  Q
     || ||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||| | | ||||||| ||  |  |||  |||     
T  22831395 cttctatttgatatctttatatgatttcataatgttgttgtgatcttcccgtgctgctattgttatttaactatgttgcatgagtctatacaagatgatt 22831494  T
Q  507 aagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatg-tttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc 605  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||  |||  |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22831495 aagatgatg-tgaa-ctccaaattattggatatatatgagatgaatattaagatgttttaggagattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc 22831592  T
Q  606 tcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22831593 tcatgccctggagctttgtactcaccacga 22831622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 15 - 636
Target Start/End: Original strand, 18181743 - 18182357
Alignment:
Q  15 agagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttagaata 113  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||      
T  18181743 agagcatgtcgaattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaatgattagatgatgacttagaacg 18181842  T
Q  114 agattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaact 213  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18181843 ggattgaacctggtttagcttagaacaactttagttggaattctggcttgtactcgctatggcgagcagatgctctcgccttgcgagcacttccagaact 18181942  T
Q  214 gagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatatgt 313  Q
    |||||||||| |||||   |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||  |||    
T  18181943 gagtgcaagttaggatgttgcgatctgtgtcgcataaattgattagggatggactcttaggtagtaatgtgacttgtataagaagttaactgcaaactgt 18182042  T
Q  314 gaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttttat 413  Q
    |||| |||||||||||| ||  | ||  ||| |||||||  |||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||  |||||||| |||   | |     
T  18182043 gaagctgttatgagatgcta-agttgtttataatgtgattcaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg-ttgaaataaa 18182140  T
Q  414 ttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatga 513  Q
    |||||||     ||||| ||||| |||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||  |  |||  ||| |||||||    
T  18182141 ttgatat-----tatgaagttatgctgttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatga 18182235  T
Q  514 tgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccc 613  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18182236 tgttgaa-ctccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgtttaagagatcaagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccc 18182334  T
Q  614 tggagctttgtactcaacacgaa 636  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  18182335 tggagctttgtactcaccacgaa 18182357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 16 - 635
Target Start/End: Original strand, 21787665 - 21788281
Alignment:
Q  16 gagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttagaataa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |    
T  21787665 gagcatgttgaattctgtatttttgacttgtgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttaataaagattatatgataacttagaatga 21787764  T
Q  115 gattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactg 214  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21787765 gattgaacctggtttagcttataacaacattagttgggaatctggctcgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcactttcagaactg 21787864  T
Q  215 agtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatatgtg 314  Q
    |||||||||||| |    |||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  21787865 agtgcaagtgagaaatttgcgacctgtgtcgcataacttgtttagagatggacccttgggtagtaatgtaacctatataagaagttaactgcaatctatg 21787964  T
Q  315 aagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttttatt 414  Q
     || |||||||| |||||  || ||| |||||||| |||||||| |||  |||||||||| |  ||| | ||||||||| |||||||| |    |  | |    
T  21787965 cagctgttatgaaatgttgatgttgattatgatgttatataatg-ttatgtgcattacttaagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaat 21788063  T
Q  415 tgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgat 514  Q
    ||||||     || || || || |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||  | ||||  ||  ||||||||    
T  21788064 tgatat-----tacgaagtcatgctgttgttgtgatctgcctatgctgctatggttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgaataagatgat 21788158  T
Q  515 gttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatg--tttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgcc 612  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  21788159 gttgaacctccaaattattggatacataagagatgatgattaagatgtttttaagagatcgagtctatgcattagcatacatatgttgggggctcatacc 21788258  T
Q  613 ctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    ||||||||| ||||||| |||||    
T  21788259 ctggagcttagtactcaccacga 21788281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 148 - 635
Target Start/End: Original strand, 20091229 - 20091713
Alignment:
Q  148 ttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgca 247  Q
    ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  20091229 ttgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagatgttctcacctcgcgagcacttccagaactgagtgcaaatgaggatattgcgatctgtgtcgca 20091328  T
Q  248 tgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatatgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgat 347  Q
    | | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||| || ||||||||||    
T  20091329 taatttgatttgagatggacccttgggtagtaatgagacctatttaagaagttaactgcaatctgtgaagctgttacgtgatgttaatgttgaatatgat 20091428  T
Q  348 gtgatataatgtttaa-ttgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttttatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttg 446  Q
    ||| | ||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||| | |||| | |||| |||||    
T  20091429 gtgtt-taatgattaaattgcacgacttgaattatgaatgaatgattgagatgttg-ttgttt--atttgatattgttatgtaatgtcaaactgctgttg 20091524  T
Q  447 taatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagag 546  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20091525 taatctgtctatgctgctattgttatttaacctagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagag 20091624  T
Q  547 atgatgattgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20091625 atgatgtttttgatgtttaagaagtcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacga 20091713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 12 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 21023138 - 21022509
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  21023138 cagagagcatgttgaattctgtaattttgacttttgagttgaaccttaaatgcttttgagtgccaaaagatgtttattaaagattagatgatgacttaga 21023039  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21023038 atgagattgaacctggtttagcttagaacaaccttagttgggattctggctcgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 21022939  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    ||| ||| | |||||| ||  || ||||||||| || ||| |||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||     
T  21022938 actcagtactagtgagaatgtcgtgatctgtgttgcttgatttgattaaggatggacccttaggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatc 21022839  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaa----ttatgaatgaatgattgagatgttgcttg 406  Q
    ||||||| | ||||||  |||||  ||||| ||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||    | || |||| ||||||||| || | ||||    
T  21022838 tgtgaagctattatgaactgtta-agctgattataatgtgaattaatgattaattgcattacttgaaatattaattaatggatgattgagttgatacttg 21022740  T
Q  407 tttttatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatc 506  Q
     || |||||||| || ||||||||||| ||| | ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| | | ||||||| ||  |  |||  |||     
T  21022739 cttctatttgatgtctttatatgatgtcataattttgttgtgatctgcctgtgctgctattgttatttaactatgttgcatgagtctatacaagatgatt 21022640  T
Q  507 aagatgatgttgaacctccaaattattgg--ataaataagagatgatga-ttgtgatg-tttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttggg 602  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| |||||||| | ||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21022639 aagatgatgttgaa-ctccaaattattggatatatatatgagatgataatttaagatgttttaagagattgagtccatgcattagcatacatttgtt-gg 21022542  T
Q  603 ggctcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| |||||    
T  21022541 ggctcatgccctagagctttgtcctcaccacga 21022509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 36 - 635
Target Start/End: Original strand, 22468339 - 22468939
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttagaataagattgaacctggtttagctt 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||    
T  22468339 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcctattaaagattaaatgataacttagaaagagattgaaccaggtttaactt 22468438  T
Q  135 agaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatagcgc 234  Q
    |||||| | |||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  22468439 agaacaacattagttgggaatctggcttgtactcgacatgaagagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgagggtattgc 22468538  T
Q  235 gatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatatgtgaagttgttatgagatgt--t 332  Q
    ||| |||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||  | ||| |  ||| ||||||| |||| | ||||||  |    
T  22468539 gatatgtgtcgcataattcgattagagatggacccttgggtagtattgagaccttttgaagttggtaattataatctgtgaagctgtt-taagatgtgct 22468637  T
Q  333 agtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttttatttgatatcgttatatgatg 432  Q
      || | | ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||  ||| | ||||| ||| |||||||| |   ||  | |||||||     |||||||    
T  22468638 gatg-taattatgatgtgatataatg-ttatgtgcattacttgagatattattgaataattaagatgttgttgaattgcaattgatat-----tatgatg 22468730  T
Q  433 ttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaa---cctccaaat 529  Q
    | || ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||| ||| |||||| || ||||     |||||||    
T  22468731 tcatgctgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatgaagatgttccaaat 22468830  T
Q  530 tattgga-taaataagagat--gatgattgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtac 626  Q
    | ||||| || ||| ||| |    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22468831 ttttggactatatacgaggttgtttgattaagatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatatatttgttgggggctcatgccctggagcttagtac 22468930  T
Q  627 tcaacacga 635  Q
     ||||||||    
T  22468931 ccaacacga 22468939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 635
Target Start/End: Original strand, 3472545 - 3473159
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||| ||| ||||| | |||||    
T  3472545 cagagagcatgttgaatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgctataagatgtttattaaagattagatgatgatttaga 3472644  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3472645 atgagattgaacctggtttagcttagaacaacttaagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 3472744  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    ||||| |||||   |||||   ||||||||| |||||  || ||||||| | ||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||  | |||     
T  3472745 actgaatgcaaaataggatgttgcgatctgtttcgcacaaactgattagggttggactcttaggtagtaatgtgacctat-taagatgttaatgggaatc 3472843  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttt 410  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||  | ||  |   ||||||| ||||| |||| || |||||||||| |||   ||||||||  |||||||| |||   |    
T  3472844 tgtgaagctgttatgaaatgcta-agttgtttgaaatgtgatttaatgattaaatgaattacttgaaatattgttgaatgatcaagatgttg-ttgaagt 3472941  T
Q  411 tatttgatatcgttatatgatgtt-atactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaag 509  Q
     |||||||||     ||||| ||| ||||   | |||| ||||   |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||  |  |||  ||| |||    
T  3472942 gatttgatat-----tatgaagttaatac---tcttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaag 3473033  T
Q  510 atgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatgtttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctca 608  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||  ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3473034 ttgatgttgaa-ctccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctca 3473132  T
Q  609 tgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||    
T  3473133 taccctggagctttgtcctcaccacga 3473159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 163 - 635
Target Start/End: Original strand, 22449037 - 22449503
Alignment:
Q  163 gtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagaga 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||   | |||||| || || ||||||||||||  |    
T  22449037 gtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaaatgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaa 22449136  T
Q  263 tggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatatgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgttta 362  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||  | ||| ||| ||||||| ||||| |||    
T  22449137 tggacccttaggtagtaatgtgacatatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaactgtta-agttgattataatgtgatttaatgatta 22449235  T
Q  363 attgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttttatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctg 462  Q
    ||| ||||||||||| ||| | ||||||||  |||||||| |||       |||||||     |||||  |||| || ||||||| ||||   |||||||    
T  22449236 atttcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg-ttgaaaagtattgatat-----tatgaaattatgctcttgttgtgatctgattatgctg 22449329  T
Q  463 ctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatg- 561  Q
    ||| | ||||||||| ||| ||||||| ||  |  |||  ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||  ||||     
T  22449330 ctactattatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatgctgaa-ctccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgt 22449428  T
Q  562 tttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22449429 tttaagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacga 22449503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 206
Target Start/End: Original strand, 22432402 - 22432597
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  22432402 cagagagcatgttgaattaagtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattagatgatgacttaga 22432501  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttc 206  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22432502 acaagattgaatctggtttagcttagaacaactttagttgggattctggcctgtcctcgccatggcgagcagatgctttcgcctcgcgagcacttc 22432597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 635
Target Start/End: Original strand, 8761252 - 8761866
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||||||||| |||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| || |||||||| ||| | ||| | |||||    
T  8761252 cagagagcatgttggatttcgtaatttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctttagacgtgtattaaagattagaggatgatttaga 8761351  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8761352 acaagattgaacctggattagcttagaacaactttagttgaaaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgaacacttccaga 8761451  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    |||||||||   |||| |   || || ||| || || || |||| ||||  ||||| | || ||||||| ||| |||||||||||| ||||| || |||     
T  8761452 actgagtgcttttgagaacgtcgtgacctgagttgcttggattggttaggaatggaactttaggtagtagtgaaacctatataagatgttaaatgaaatc 8761551  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttt 410  Q
    ||||||| ||||||||  | |||  ||| | ||||||||||| || || |||||||||||||||||  ||| | ||||| ||  |||||||| |||   |    
T  8761552 tgtgaagctgttatgaactatta-agctaattatgatgtgatttattgattaattgcattacttgagatattattgaataatcaagatgttg-ttgaaat 8761649  T
Q  411 tatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaaga 510  Q
     | ||||||      ||||| |||||  ||||||||| |||| | | ||||| |||||||||||||| | | |||||||    |||||       |||||    
T  8761650 gaattgata----attatgaagttatgttgttgttgtgatctgcttgtgctgttattgttatttaactatgatgcatga----gtcta-----tacaaga 8761736  T
Q  511 tgatgttgaacctccaaattattggataaata-agagatgatgattgtgatgt---ttaaga-gatcgagtccatgcattagcat-acatttgttggggg 604  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  |||  |||||| | |||  |||||   |||||| ||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  8761737 tgatgttgaa-ctccaaattattggatgtatattgagatgtttattaagatgttgattaagatgattgagtccatgcattagcataacatatgttggggg 8761835  T
Q  605 ctcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  8761836 ctcatgccctggagccttgtcctcaccacga 8761866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 635
Target Start/End: Original strand, 17678218 - 17678822
Alignment:
Q  13 agagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttagaa 111  Q
    |||||||||||||||||   || ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||| | ||||| ||| ||||| | ||||||    
T  17678218 agagagcatgttgaatttcataatttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgttcactaaagattagatgatgatttagaa 17678317  T
Q  112 taagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaa 211  Q
     ||||| ||||||||          || | |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17678318 caagatggaacctgg----------aataaccattgttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaa 17678407  T
Q  212 ctgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatat 311  Q
    |||||||||  |||| ||  || || ||| || |  ||||||||||||  ||||| | || ||||||| | |||| ||| ||||| |||||||| ||| |    
T  17678408 ctgagtgcatttgagaatgtcgtgacctgagttgattgaattgattaggaatggaactttaggtagtagtaagacatatttaagatgttaactgaaatct 17678507  T
Q  312 gtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgttttt 411  Q
    || | | |||| |||  |||||  | ||  | | |||| || ||||| |||| ||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||| |||   |     
T  17678508 gtaaggctgtt-tgaactgttaa-gttgtttgtaatgttatttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgattaagatgttg-ttgaaatg 17678604  T
Q  412 atttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagat 511  Q
    | ||| | |     ||||| || ||| ||||||||| ||||   ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||  ||  |||||    
T  17678605 aattgttgt-----tatgaagt-ataatgttgttgtgatctgattatgctgcttttgttatttaaccaagttgcatgagtcgttataagatgaataagat 17678698  T
Q  512 gatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatgtttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatg 610  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||| |||||  ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17678699 gatgttgaac-tccaaattattggatgtatatgagatgttgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatatgttgggggctcatg 17678797  T
Q  611 ccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||    
T  17678798 ccctggagccttgtcctcaccacga 17678822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 523 - 635
Target Start/End: Original strand, 22131206 - 22131320
Alignment:
Q  523 tccaaattattgga-taa-ataagagatgatgattgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagct 620  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22131206 tccaaattattggactaatataagagatgatgattatgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagct 22131305  T
Q  621 ttgtactcaacacga 635  Q
    ||||||||| |||||    
T  22131306 ttgtactcaccacga 22131320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21305790 - 21305582
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||  || |||||| ||||| ||| | ||| | |||||    
T  21305790 cagagagcatgtcgagttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtttactaaagattagaggatgatttaga 21305691  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    | ||||||||||||||          |||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21305690 acaagattgaacctgg----------aacaaccttagttgggaatctggcttgtacttgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 21305601  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggat 229  Q
    ||||||||||  |||||||    
T  21305600 actgagtgcatttgaggat 21305582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 220
Target Start/End: Original strand, 36818938 - 36819137
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||  || ||  |||||||| ||| | ||| | |||||    
T  36818938 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttaaatgcctttgagtacctttaggtgcctattaaagattagaggatgatttaga 36819037  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    | ||||||||||||||          |||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36819038 acaagattgaacctgg----------aacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 36819127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 523 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 48603262 - 48603148
Alignment:
Q  523 tccaaattattgga-taa-ataagagatgatgattgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagct 620  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48603262 tccaaattattggactaatataagagatgatgattatgatgtttaagagattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagct 48603163  T
Q  621 ttgtactcaacacga 635  Q
    ||||||||| |||||    
T  48603162 ttgtactcaccacga 48603148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 33 - 323
Target Start/End: Original strand, 45489394 - 45489674
Alignment:
Q  33 tatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttagaataagattgaacctggtttag 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||| ||||| ||| | ||| | |||||| ||||||||||||||         
T  45489394 tatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtttactaaagattagaggatgatttagaacaagattgaacctgg----- 45489488  T
Q  132 cttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatag 231  Q
         |||| | |||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||  ||      
T  45489489 -----aacaaccttagttggaaatctggcgagtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcttttgataatgt 45489583  T
Q  232 cgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatatgtgaagttgtta 323  Q
    || || ||| || | |||||||||||||  ||||| | || ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||  |  |||||||||||||    
T  45489584 cgtgacctgagttgaatgaattgattaggaatgga-cattaggtagtaatgaaacctatttaagatgttaactgagacctgtgaagttgtta 45489674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 220
Target Start/End: Original strand, 16080074 - 16080273
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||| |||  || ||| || || || ||| | |||   |||||    
T  16080074 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaacattggatgcctttgagtacctttaggtgtctactatagattagaggatgttttaga 16080173  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    | ||||||||||||||          |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16080174 acaagattgaacctgg----------aacagccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 16080263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 144 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 12647222 - 12647147
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12647222 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 12647147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 220
Target Start/End: Original strand, 24782730 - 24782929
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||||||| ||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||| ||| | ||| | ||| | |||||    
T  24782730 cagagagcatgtcgaattttgagtttttaacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtttactaatgattagaggatgagttaga 24782829  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    | ||||||||||||||          |||| | |||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24782830 acaagattgaacctgg----------aacaaccttagttggaaatctggcaagtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttctaga 24782919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 326
Target Start/End: Original strand, 45309996 - 45310301
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||  |||||| || ||||| ||| | ||| | |||||    
T  45309996 cagagagcatgttgattttcgtattttggacttttgagttgaactttagatgcttttgagtacctttagatgtctactaaagattagaggatgatttaga 45310095  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    | ||||||||||||||          |||| |  ||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45310096 acaagattgaacctgg----------aacaaccgtagttggaaacctggcctgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcactttcaga 45310185  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    |||||||||   ||||  |  || || ||| || |  ||||||||||||  ||||| | || |||||||||| | ||||| ||||| ||||||||  ||     
T  45310186 actgagtgcttttgagattgtcgtgacctgagttgattgaattgattaggaatggaactttaggtagtaatgtggcctatttaagatgttaactgagatc 45310285  T
Q  311 tgtgaagttgttatga 326  Q
    ||||||| ||||||||    
T  45310286 tgtgaagctgttatga 45310301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 144 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 33797886 - 33797725
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgt 243  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||   | || ||| ||    
T  33797886 ttagttgggaatttggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagt 33797787  T
Q  244 cgcatgaattgatta-gagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactg 305  Q
     || || ||| |||| |||| ||| |||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  33797786 tgcttggattaattaggaga-ggaaccttaggtactaatgagacctatttaagatgttaactg 33797725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 381
Target Start/End: Original strand, 18393593 - 18393952
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||  |||||| || ||||| ||| | ||| | |||||    
T  18393593 cagagagcatgttgattttcgtattttggacttttgagttgaactttagatgcttttgagtacctttagatgtctactaaagattagaggatgatttaga 18393692  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    | |||||||||||||          ||||| |  ||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||    
T  18393693 acaagattgaacctg----------gaacaaccgtagttggaaacctggcctgtactcgccatggcgagcagttgctctcgcctcgcgagcacttataga 18393782  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    || ||||||   ||||  |  || || ||| || |  ||||||||||||  ||||| | || |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||  ||     
T  18393783 acggagtgcttttgagattgtcgtgacctgagttgattgaattgattaggaatggaactttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatc 18393882  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattat 381  Q
    ||||||| ||||||||  |||||  ||||  | | ||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  18393883 tgtgaagctgttatgaattgtta-agctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgatttat 18393952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 144 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 46975820 - 46975745
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 219  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46975820 ttagttgggattctttcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 46975745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 208 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 48603820 - 48603652
Alignment:
Q  208 agaactgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgca 307  Q
    |||||||||||||||| |||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||||| |  |    
T  48603820 agaactgagtgcaagttaggatgttgcgatctgtgttgcatgaattgattagagatggacccctaggtagtattgtgacctatataagaagttaattata 48603721  T
Q  308 atatgtgaagttg-ttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttga 376  Q
    || ||||||| || ||| ||  ||||  || ||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  48603720 atctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttta-tgcattacttga 48603652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 144 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 18882720 - 18882645
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 219  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18882720 ttagttgggattttggcttgtactcgccatggcgagcagatgctcttgcctcgcgagcacttcaagaactgagtgc 18882645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 342 - 635
Target Start/End: Original strand, 50210163 - 50210455
Alignment:
Q  342 tatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttttatttgatatcgttatatgatgttatactgt 441  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |   ||  |||||||||  |||| | |||||     ||    
T  50210163 tatgatgtgatataatgttaaac-gcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgtt-----gt 50210256  T
Q  442 tgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacct-ccaaattattggataa- 539  Q
    | |||||  || |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||   | |||||||||||||| |     
T  50210257 ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgatgtttccaaattattggattat 50210356  T
Q  540 ataagagatgatg--attgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    ||||||| |  |   |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  50210357 ataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcattgtactcaacacga 50210455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 144 - 218
Target Start/End: Original strand, 23819052 - 23819126
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 218  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23819052 ttagtaggaattctggcttgtactcgccatggcgagctgatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 23819126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 144 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 19212220 - 19212135
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggat 229  Q
    ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  19212220 ttagttgagaatctggcttgtactcaccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaaaactgagtgcatttgaggat 19212135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 338 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 34509955 - 34509663
Alignment:
Q  338 tgaatatgatgtgatataatgtt-taattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttttatttgatatcgttatatgatgttat 436  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||  |||||||| || ||| |||||||| |   ||  |||||||||| |||| | |||        
T  34509955 tgaatatgatgtgatataatgttataa--gcattacttgagatatgaatgtataattaagatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatg---- 34509862  T
Q  437 actgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgga 536  Q
     ||||| |||||  || |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||   ||  ||||||||||||||    
T  34509861 -ctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg---aagttccaaattattgga 34509766  T
Q  537 taa-ataagagatgat-gattgt-gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaaca 632  Q
    | | ||||||| |  | ||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||    
T  34509765 ttatataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcattgtactcaaca 34509666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 34 - 215
Target Start/End: Original strand, 33049739 - 33049911
Alignment:
Q  34 atttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttagaataagattgaacctggtttagc 132  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||   ||||||||| ||||| ||| | ||| | |||||||||||||||||||||          
T  33049739 attttggactttttagttgaaccttagatgcttttgagtacccttagatgtttactaaagattagaggatgatttagaataagattgaacctgg------ 33049832  T
Q  133 ttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactga 215  Q
        |||| | |||||||| | ||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33049833 ----aacaaccttagttggaaatctggcaagtaatcgccatggcaagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactga 33049911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 144 - 218
Target Start/End: Original strand, 20228562 - 20228636
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 218  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  20228562 ttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcaaatgctctcgcctcgcgagcacatccagaattgagtg 20228636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 135 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 20138445 - 20138364
Alignment:
Q  135 agaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgag 216  Q
    |||||| | |||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20138445 agaacaaccttagttgggaatctgacttgtactcgtcatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgag 20138364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 157 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 21615777 - 21615718
Alignment:
Q  157 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21615777 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgag 21615718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 454 - 629
Target Start/End: Original strand, 27250785 - 27250961
Alignment:
Q  454 cctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgga-taa-ataagagatgat 551  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||| ||    |||||||||||||| ||| |||||||||  |    
T  27250785 cctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt---tccaaattattggactaatataagagattgt 27250881  T
Q  552 g--attgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactca 629  Q
       |||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  | ||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  27250882 cgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattcattgataggggcttgatgccctggagctttgtactca 27250961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 157 - 218
Target Start/End: Original strand, 16375223 - 16375284
Alignment:
Q  157 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 218  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16375223 tggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 16375284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 157 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 21407696 - 21407635
Alignment:
Q  157 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 218  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21407696 tggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 21407635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 157 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 52639882 - 52639821
Alignment:
Q  157 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 218  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  52639882 tggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 52639821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 342 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 22532440 - 22532153
Alignment:
Q  342 tatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttttatttgatatcgttatatgatgttatactgt 441  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |   ||  | | |||||     ||| |||| || ||||    
T  22532440 tatgatgtgatataatgtt-atgtgcattacttgaattatgaatgaatatttaagatgttgttgaattgcaatggatat-----tattatgtcatgctgt 22532347  T
Q  442 tgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataa-a 540  Q
    | |||||  || |||||| |||| |||||||||||| ||  ||||||| | ||||||||| ||| ||||||||| ||    ||||||||||||||| | |    
T  22532346 ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaaattgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt---tccaaattattggattata 22532250  T
Q  541 taagagatgatg--attgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
    |||||| |  |   |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  22532249 taagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacg 22532153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 454 - 634
Target Start/End: Original strand, 20847210 - 20847391
Alignment:
Q  454 cctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatg- 552  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||| ||    ||||||||||||||  ||||  ||| | ||     
T  20847210 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt---tccaaattattggactaatataagaggttgt 20847306  T
Q  553 ---attgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
       |||  | |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  20847307 cgaattaagttgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattca-ttgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacg 20847391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 439 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 20135267 - 20135065
Alignment:
Q  439 tgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaaga---tgatgttgaacctccaaattattgg 535  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| || |||||||| ||| ||||   ||||| |||   |||||||||||||    
T  20135267 tgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttgtttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattgg 20135168  T
Q  536 a-taaataagagatgat--gattgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaac 631  Q
    | || ||||||| |  |   |||  |||||||||||| |||||||||||||| |||||    | ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||    
T  20135167 actatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcatcagcatttcatagttgggggcttgatgccctggagctttatactcaac 20135068  T
Q  632 acg 634  Q
    |||    
T  20135067 acg 20135065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 134 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 21438157 - 21438081
Alignment:
Q  134 tagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    ||||||| | ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21438157 tagaacaacattagttgggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccaga 21438081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 134 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 23763574 - 23763498
Alignment:
Q  134 tagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    ||||||| | ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23763574 tagaacaacattagttgggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccaga 23763498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 573 - 636
Target Start/End: Original strand, 3705243 - 3705306
Alignment:
Q  573 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacgaa 636  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||    
T  3705243 gagtccatgcattagcatacttttgttgggggctcatgccctggagctttctcctcaccacgaa 3705306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 573 - 636
Target Start/End: Original strand, 45489920 - 45489981
Alignment:
Q  573 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacgaa 636  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  45489920 gagtccatgcattagcatac--ttgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcaccacgaa 45489981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 126
Target Start/End: Original strand, 3704716 - 3704831
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    ||||||||||||||||||  || |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||  || ||| |||||||| ||| | ||| | |||||    
T  3704716 cagagagcatgttgaatttcgtgttttggacttttgagttgatccttagatgcttttgagtacctttagttgtgtattaaagattagaggatgatttaga 3704815  T
Q  111 ataagattgaacctgg 126  Q
    | ||||||||||||||    
T  3704816 acaagattgaacctgg 3704831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 558 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 21161684 - 21161606
Alignment:
Q  558 gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctca-tgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||| |||||    
T  21161684 gatgtttaagatgtcaagtccatgcattagcatacatttgttgggggcttactgctccggagctttgtactcaccacga 21161606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 456 - 595
Target Start/End: Original strand, 24783150 - 24783290
Alignment:
Q  456 tatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagaga--tgatga 553  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |  ||||  ||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||  ||||||||  ||||||    
T  24783150 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctgaataagatgattaagatgatgatgaa-atccaaattattggatgtataagagatttgatga 24783248  T
Q  554 ttgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatt 595  Q
    ||  ||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  24783249 ttaagatgtttagatgattgagttcatgcattagcatacatt 24783290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 32 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 21754518 - 21754474
Alignment:
Q  32 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21754518 gtatttttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcct 21754474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 461 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 31612368 - 31612209
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgga-taaataagag-atgatga-ttgt 557  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||   ||||  |||||||||||||| || |||||||  ||  || ||      
T  31612368 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga---tgaagttccaaattattggattatataagagtttgtcgatttaa 31612272  T
Q  558 gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagc 619  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||| | ||||||||||||    
T  31612271 gatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 31612209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 573 - 636
Target Start/End: Original strand, 45310545 - 45310606
Alignment:
Q  573 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacgaa 636  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  45310545 gagtccatgcactagcatac--ttgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcaccacgaa 45310606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 560 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 20916185 - 20916111
Alignment:
Q  560 tgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  20916185 tgtttaagaggttgagtccatgcattagcattca-ttgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacg 20916111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 466 - 590
Target Start/End: Original strand, 13212974 - 13213098
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgga-taaataagagat-gatg-attgtgatgt 562  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||    |||||||||||||| ||  |||||| | | || |||  |||||    
T  13212974 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg---ttccaaattattggactatttaagaggtcgttgaattaagatgt 13213070  T
Q  563 ttaagagatcgagtccatgcattagcat 590  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13213071 ttaagaggtcgagtccatgcattagcat 13213098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 558 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 21477602 - 21477525
Alignment:
Q  558 gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  21477602 gatgtttaagaagtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacg 21477525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 43697839 - 43697786
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttatt 89  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||    
T  43697839 ttttgacttttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctatt 43697786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 21162118 - 21162078
Alignment:
Q  162 tgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagca 202  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21162118 tgtactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagca 21162078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Original strand, 22355827 - 22355867
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22355827 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 22355867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Original strand, 22357513 - 22357553
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22357513 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 22357553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Original strand, 22921509 - 22921549
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22921509 ttttgacctttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 22921549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 573 - 624
Target Start/End: Original strand, 33050193 - 33050242
Alignment:
Q  573 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgt 624  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33050193 gagtccatgtattagcatac--ttgttgggggctcatgccctggagctttgt 33050242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Original strand, 52927623 - 52927663
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  52927623 ttttgacttttgagttgacccttagatgtttttgagtgcct 52927663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 574 - 636
Target Start/End: Original strand, 18394143 - 18394203
Alignment:
Q  574 agtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacgaa 636  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||    
T  18394143 agtccatgcattagcatac--ttgttgggggctcatgctctggaactttgtcctcaccacgaa 18394203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 72
Target Start/End: Original strand, 20228440 - 20228499
Alignment:
Q  13 agagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 72  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  20228440 agagagcatgtcgaattctgagtttttgacttttgagatgaaccttagatgcctttgagt 20228499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 33 - 76
Target Start/End: Original strand, 38801041 - 38801084
Alignment:
Q  33 tatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  38801041 tatttttgacttttgagttgaactttagatgtctttgagtgcct 38801084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 560 - 634
Target Start/End: Original strand, 38801550 - 38801624
Alignment:
Q  560 tgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| || | ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  38801550 tgtttaagaggtcgagtccatgcataagcattca-tagttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacg 38801624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 13988921 - 13988867
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  13988921 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 13988867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 454 - 512
Target Start/End: Original strand, 20454609 - 20454667
Alignment:
Q  454 cctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatg 512  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  20454609 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 20454667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 456 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 21313184 - 21313044
Alignment:
Q  456 tatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagat--gatga 553  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| || |  ||||   || || |||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||  |||||    
T  21313184 tatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaaaatgatgatgaac-tccaaattattggatgtataagagatttgatga 21313086  T
Q  554 ttgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatt 595  Q
    ||  |||||||    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  21313085 ttaagatgttttgttgatagagtccatgcattagcatacatt 21313044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Original strand, 21923398 - 21923452
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  21923398 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 21923452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Original strand, 23593842 - 23593896
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  23593842 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 23593896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 76
Target Start/End: Original strand, 27250384 - 27250422
Alignment:
Q  38 ttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27250384 ttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 27250422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 29298192 - 29298138
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  29298192 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 29298138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 29776743 - 29776689
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  29776743 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 29776689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 466 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 21342146 - 21342097
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  21342146 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 21342097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 466 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 21347011 - 21346962
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  21347011 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 21346962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 466 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 21707217 - 21707168
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  21707217 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 21707168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 466 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 21711759 - 21711710
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  21711759 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 21711710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 35 - 72
Target Start/End: Original strand, 23818952 - 23818989
Alignment:
Q  35 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23818952 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 23818989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 148 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 433374 - 433322
Alignment:
Q  148 ttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 200  Q
    |||||| |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  433374 ttgggaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 433322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 20248756 - 20248716
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  20248756 ttttgacttttgagttgatccatagatgtttttgagtgcct 20248716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 20918952 - 20918916
Alignment:
Q  165 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagc 201  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20918952 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagc 20918916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Original strand, 21301180 - 21301220
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  21301180 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 21301220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 12 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 21615913 - 21615853
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 72  Q
    ||||||||||||||| ||  |  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  21615913 cagagagcatgttgattttcgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 21615853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 165 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 21754386 - 21754346
Alignment:
Q  165 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcactt 205  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  21754386 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtactt 21754346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 22238108 - 22238068
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  22238108 ttttgacttttgagttgatccttagatatttttgagtgcct 22238068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 33681488 - 33681452
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 72  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33681488 ttttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagt 33681452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 468 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 433060 - 433013
Alignment:
Q  468 gttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  433060 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 433013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 433486 - 433431
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaa 91  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || || |||| ||||||    
T  433486 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtctattaa 433431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 19063854 - 19063807
Alignment:
Q  163 gtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||    
T  19063854 gtactcgccatggcgagtaggaactctcgcctcgcgagcacttccaga 19063807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 19105087 - 19105040
Alignment:
Q  163 gtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||    
T  19105087 gtactcgccatggcgagtaggaactctcgcctcgcgagcacttccaga 19105040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 19111744 - 19111697
Alignment:
Q  163 gtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||    
T  19111744 gtactcgccatggcgagtaggaactctcgcctcgcgagcacttccaga 19111697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 461 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 21840822 - 21840771
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatg 512  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  21840822 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 21840771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 468 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 16361965 - 16361837
Alignment:
Q  468 gttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatg---atgttgaacctccaaattattgga-taaataagagat-gatga-ttgtgatg 561  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||   ||| |||   |||||||||||||| ||  |||||| | | ||| ||  ||||    
T  16361965 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaagaggtcgttgaattaagatg 16361866  T
Q  562 tttaagagatcgagtccatgcattagcat 590  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16361865 tttaagaggtcgagtccatgcattagcat 16361837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Original strand, 21475194 - 21475248
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||||    
T  21475194 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatg 21475248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 36 - 74
Target Start/End: Original strand, 22354214 - 22354252
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgc 74  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  22354214 ttttgacttttgagttgaaccttatatgcttttgagtgc 22354252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 165 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 33681359 - 33681325
Alignment:
Q  165 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcga 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33681359 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcga 33681325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 454 - 606
Target Start/End: Original strand, 45574943 - 45575096
Alignment:
Q  454 cctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatg- 552  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  | | || |||||| ||    ||||||||||||||| ||||  ||| | ||     
T  45574943 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt---tccaaattattggattaatataagaggttgt 45575039  T
Q  553 ---attgtgatgttt-aagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggct 606  Q
       |||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  45575040 cgaattaagatgttttaagaggtcgagtccatgcattagcattca-ttgttgggggct 45575096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 12647322 - 12647281
Alignment:
Q  35 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||    
T  12647322 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacct 12647281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 466 - 515
Target Start/End: Original strand, 15860121 - 15860170
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||    
T  15860121 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatg 15860170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 18882820 - 18882779
Alignment:
Q  35 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||    
T  18882820 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacct 18882779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 19212320 - 19212279
Alignment:
Q  35 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||    
T  19212320 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacct 19212279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 20138536 - 20138495
Alignment:
Q  35 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||    
T  20138536 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacct 20138495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 208
Target Start/End: Original strand, 20524987 - 20525032
Alignment:
Q  163 gtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttcca 208  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||    
T  20524987 gtactcgccatggcgagtaggaactctcgcctcgcgagcacttcca 20525032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 76
Target Start/End: Original strand, 20846867 - 20846912
Alignment:
Q  31 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||| ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  20846867 tgtaattttgacctttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 20846912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 21162216 - 21162167
Alignment:
Q  27 attctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  21162216 attctgtgtttttgacttttgagatgacccttaaatgcttttgagtgcct 21162167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 470 - 515
Target Start/End: Original strand, 22123184 - 22123229
Alignment:
Q  470 tatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  22123184 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtagattaagatgatg 22123229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 33797986 - 33797945
Alignment:
Q  35 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||    
T  33797986 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacct 33797945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 365 - 402
Target Start/End: Original strand, 35261053 - 35261090
Alignment:
Q  365 tgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttg 402  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  35261053 tgcattacttgaattatgtatgaatgtttgagatgttg 35261090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 46975920 - 46975883
Alignment:
Q  35 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 72  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  46975920 ttttttacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 46975883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 163 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 1011057 - 1011001
Alignment:
Q  163 gtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 219  Q
    ||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  1011057 gtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacatccagaattgagtgc 1011001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 558 - 590
Target Start/End: Original strand, 14295712 - 14295744
Alignment:
Q  558 gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcat 590  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14295712 gatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcat 14295744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 558 - 606
Target Start/End: Original strand, 16275567 - 16275614
Alignment:
Q  558 gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggct 606  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  16275567 gatgtttaagaagtcgagtccatgcattagcattc-tttgttgggggct 16275614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 31 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 16759210 - 16759162
Alignment:
Q  31 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaa 79  Q
    |||| |||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16759210 tgtagttttgacccttaagtcgaaccttagatgtttttgagtgcctaaa 16759162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 20637200 - 20637164
Alignment:
Q  165 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagc 201  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  20637200 actcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagc 20637164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 461 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 21026738 - 21026698
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagt 501  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  21026738 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 21026698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 558 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 21840719 - 21840687
Alignment:
Q  558 gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcat 590  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21840719 gatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcat 21840687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 22532748 - 22532708
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  22532748 ttttgacttttgatttgatccttagatgcttttgagtgcct 22532708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 34510259 - 34510219
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||    
T  34510259 ttttgacttttgagttgattcttagatgcttttgagtgcct 34510219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 148 - 200
Target Start/End: Original strand, 50209967 - 50210019
Alignment:
Q  148 ttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 200  Q
    |||| |||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  50209967 ttggaattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 50210019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 473; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 473; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 36 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 70272 - 69674
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttagaataagattgaacctggtttagctt 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |    
T  70272 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgtatattaaagattaaatgataacttagaacgagattgaacctggtttaacct 70173  T
Q  135 agaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatagcgc 234  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  70172 agaacagcctttgttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatattgc 70073  T
Q  235 gatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatatgtgaagttgttatgagatgttag 334  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  70072 gatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgagatgttag 69973  T
Q  335 tgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttttatttgatatcgttatatgatgtt 434  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||     
T  69972 tgttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgc-tgttttta-ttgatatcgttatgtgatgtc 69875  T
Q  435 atactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattg 534  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  69874 atactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatgttgaacctccaaattattg 69775  T
Q  535 gataaataagagatgatgattgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  69774 gataaataagagatgatgattatgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacg 69675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 220
Target Start/End: Original strand, 10214 - 10413
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||  || ||| || ||||| ||| | ||| | |||||    
T  10214 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactaaagattagaggatgatttaga 10313  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    | ||||||||||||||          |||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10314 acaagattgaacctgg----------aacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttcaaga 10403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 134 - 210
Target Start/End: Original strand, 58161 - 58237
Alignment:
Q  134 tagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    ||||||| | ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  58161 tagaacaacattagttgggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccaga 58237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 465; Significance: 0; HSPs: 188)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 465; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 36 - 635
Target Start/End: Original strand, 18154479 - 18155078
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttagaataagattgaacctggtttagctt 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | |    
T  18154479 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcttattaaagattaaatgataacttagaatgagattgaacttggtttaacct 18154578  T
Q  135 agaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatagcgc 234  Q
    |||||| |  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||    
T  18154579 agaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgagggaaatgc 18154678  T
Q  235 gatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatatgtgaagttgttatgagatgttag 334  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  18154679 gatctgtgtcgcatgatttgattaaagatggaccattgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatatgtgaagctgttatgagatgttaa 18154778  T
Q  335 tgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttttatttgatatcgttatatgatgtt 434  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||     
T  18154779 tgttgaatatgatgcgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttg-ttttatttgatatcgttatgtgatgtc 18154877  T
Q  435 atactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattg 534  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18154878 atactgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgaagttgaacctccaaattattg 18154977  T
Q  535 gataaataagagatgatgattgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18154978 gataaataagagatgatgattgagatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatatgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacg 18155077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 421; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 36 - 635
Target Start/End: Original strand, 19649127 - 19649726
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttagaataagattgaacctggtttagctt 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |    
T  19649127 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcctattaaatattaaatgataacttagaatgagattgaacctggtttaacct 19649226  T
Q  135 agaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatagcgc 234  Q
    |||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||    
T  19649227 agaacaacctttgttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgtctcgcgagcacttccagaaccgagtgtaagtgaggatattgc 19649326  T
Q  235 gatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatatgtgaagttgttatgagatgttag 334  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||  |||| | ||||||||    
T  19649327 gatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtattgagacctaaattagaagttaactgcaatctgtgaagcagttaagtgatgttag 19649426  T
Q  335 tgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttttatttgatatcgttatatgatgtt 434  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||     
T  19649427 tgttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgc-tgtttttatttgatattgttatgtgatgtc 19649525  T
Q  435 atactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattg 534  Q
    ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19649526 atattgttgttgtaatctgtctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatgttgaacctccaaattattg 19649625  T
Q  535 gataaataagagatgatgattgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19649626 gataaataagagatgatgattatgatatttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacg 19649725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 418; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 9703767 - 9703142
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  9703767 cagagagcatgtagaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaaggtggttattaaagattaaatgataacttaga 9703668  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9703667 atgagattgaacctggtttagcttagaacaacattagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 9703568  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  9703567 actgagtgcaagtgaggatattgcgatccgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtattaatgtgacctatataagaagttaactgcaatc 9703468  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttt 410  Q
    ||||||| |||||||| |||||| || ||| |||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||    
T  9703467 tgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgattatgatgtgagattacgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgatgcatacttt 9703368  T
Q  411 tatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaaga 510  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| | | ||||||| | | | ||||  ||||||||    
T  9703367 tatttgatatcgttatgtgatgtcatactgttgttgcaatctgcctatgctgttattgttatttaactatgttgcatgagttgatataagatgatcaaga 9703268  T
Q  511 tgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatg-tttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcat 609  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9703267 tgatgttcaacctccaaattattggatacataagagatgatgattaatatgttttaagagatcgagtccatgcattagcatacatatgttgggggctcat 9703168  T
Q  610 gccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    
T  9703167 gccctggagcttagtactcaacacga 9703142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 31 - 631
Target Start/End: Complemental strand, 24054950 - 24054348
Alignment:
Q  31 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttagaataagattgaacctggttt 129  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  24054950 tgtagttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgtatattaaagattaaatgataacttagaacgagattgaacctagttt 24054851  T
Q  130 agcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggat 229  Q
    | | ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  24054850 aacctagaacaacttttgttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgtcttgcgagcacttccagaactgagtgaaagtgagaat 24054751  T
Q  230 agcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatatgtgaagttgttatgagat 329  Q
    |  |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  24054750 attgcgatctgtgtcgcataattcgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataaggagttaactgcaatctgtgaagctgttatgagat 24054651  T
Q  330 gttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttttatttgata-tcgttatat 428  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||| |||    
T  24054650 gttagtgttgattatgatgtgatatgatgtttaaatacattacttgaattatgaatgaaagattgagatgatgcttgcttttaattgatattcgttgtat 24054551  T
Q  429 gatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaa 528  Q
     |||| | ||| |||||||||  |  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || || ||||  ||||||   |||||||||||||||||    
T  24054550 aatgtcacactattgttgtaacttgtctatgctgctattgttaattaaccaagttgcatgagtcagtataagatgatcaaagagatgttgaacctccaaa 24054451  T
Q  529 ttattggataaataagagatgatgattgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactc 628  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24054450 ttattggataaataagagatgatgattgtgatgtttaagtgatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactc 24054351  T
Q  629 aac 631  Q
    |||    
T  24054350 aac 24054348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 12 - 635
Target Start/End: Original strand, 12321361 - 12321979
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||    
T  12321361 cagagagcatgtcgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagacgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattagatgataacctaga 12321460  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12321461 atgagattgaacctgatttagcttagaacaactttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 12321560  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    ||||||||||| |||| ||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||     
T  12321561 actgagtgcaaatgagaatgtagcgatctgtgtcgcatgaattgattagggatggactcttaggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatc 12321660  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttt 410  Q
    ||||||  ||||||||  |||||  | ||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| |  |||||||  |||||||| |||   |    
T  12321661 tgtgaaactgttatgaactgtta-agttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattatggaatgatcaagatgttg-ttgaaat 12321758  T
Q  411 tatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaaga 510  Q
     | |||||||     ||||| ||||| |||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||  |  |||  ||| ||||    
T  12321759 gaattgatat-----tatgaagttatgctgttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactacgttgcatgagtctatacaagatgattaaga 12321853  T
Q  511 tgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatg-tttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctca 608  Q
     |||||| || ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||  |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12321854 agatgtt-aaactccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctca 12321952  T
Q  609 tgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  12321953 tgccctggagctttgtactcaccacga 12321979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 12 - 377
Target Start/End: Original strand, 17137682 - 17138046
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  17137682 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattagatgatgacttaga 17137781  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17137782 atgagattgaacctggtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 17137881  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    |||||||||||||||| ||   | ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17137882 actgagtgcaagtgagaatgttgtgatctgtgttgcttgaattgattagggatggacccttaggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatc 17137981  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaa 377  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||    
T  17137982 tgtgaagctgatatgagatgtttgtgttgaatatgatgtattataatgttta--tgcattacttgaa 17138046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 12 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 14430379 - 14429764
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||| | |||||    
T  14430379 cagagagcatgttgaattctgtaattttgacttttgagttaaaccttagatgcttttgagtgccttgagatgtttattaaagattagatgatgatttaga 14430280  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14430279 atgagattgaacctggtttagcttagaacaacttaagttggaattttggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 14430180  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    ||||| ||||||| || ||   ||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||  ||     
T  14430179 actgaatgcaagttagtatgttgcgatctgtttcgcataaattgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatc 14430080  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttt 410  Q
    ||||||| || |||||  |||||  ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||  ||||||||  ||   |    
T  14430079 tgtgaagctgctatgaactgtta-agctgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg-atgaaat 14429982  T
Q  411 tatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaaga 510  Q
     | |||||||      |||| | |||||||||||||| ||||   ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| ||  |  |||  ||| ||||    
T  14429981 gaattgatat-----gatgaag-tatactgttgttgtgatctgattatgcggctattgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaaga 14429888  T
Q  511 tgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatgtttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcat 609  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||  ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  14429887 tgatgttgaa-ctccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcataca-ttgttgggggcttat 14429790  T
Q  610 gccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  14429789 gccctggagctttgtactcaccacga 14429764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 12 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 12187514 - 12187150
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12187514 cagagaacatgttgaattctgtagttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattaaatgataacttaga 12187415  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12187414 atgagattgaacctgatttagcttagaacaattttagttgggattctggcttgtactcgccgtggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 12187315  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    |||||||||||||||| |||  | ||| | ||| || ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12187314 actgagtgcaagtgagaatatagtgatatatgttgcttgaattgattagagatggaccattaggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatc 12187215  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaa 377  Q
    ||||||| || || |||||||| | | ||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||    
T  12187214 tgtgaagctgataagagatgtttgagttgaatatgatgtattataatgttta--tgcattacttgaa 12187150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 12 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 11880753 - 11880459
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  11880753 cagagagcatgtagaattctgtacttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaatgattaaatgataacttaga 11880654  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11880653 atgagattgaacctggtttagcttagaacaacattagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgtgagcacttccaga 11880554  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactg 305  Q
    |||||||||||||||||||   ||||| |||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  11880553 actgagtgcaagtgaggatgttgcgatatgtgtcgcataatttgatttgagatggacccttgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactg 11880459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 12 - 229
Target Start/End: Original strand, 10508701 - 10508919
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  10508701 cagagagcatgtagaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcctattaaagattaaatgataacttaga 10508800  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    || |||||||||||| |||| |||| |||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10508801 atgagattgaacctgatttaacttataacaacattagttgggaatctggctggtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 10508900  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggat 229  Q
    |||||||||||||||||||    
T  10508901 actgagtgcaagtgaggat 10508919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 439 - 635
Target Start/End: Original strand, 17138101 - 17138298
Alignment:
Q  439 tgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggata 538  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| | ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17138101 tgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatgttgaacctccaaattattggata 17138200  T
Q  539 aataagagatgatgattgtgatg-tttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
     ||| ||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17138201 tatatgagatgatgattaagatgttttaagagattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacga 17138298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 2760628 - 2760324
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||| | |||||    
T  2760628 cagagagcatgttgaatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttaataaagattagatgatgatttaga 2760529  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    |  ||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||| | | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2760528 acgagattgaacctggtttagcttcgaacaactggagttggaaatatggcttgtactcgtcatggcgagaagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 2760429  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    ||||||||||| ||||  |   | || ||| || || ||||||||||||  ||||| | || ||||||| | |||| ||| ||||| |||||||| |||     
T  2760428 actgagtgcaattgagattgttgtgacctgagttgcttgaattgattaggaatggaactttaggtagtagtaagacatatttaagatgttaactgaaatc 2760329  T
Q  311 tgtga 315  Q
    |||||    
T  2760328 tgtga 2760324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 13 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 15211928 - 15211759
Alignment:
Q  13 agagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttagaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||    
T  15211928 agagagcatgttgaattctgtactcttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttataaatgattaaatgataacttagaa 15211829  T
Q  112 taagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagca 181  Q
    | |||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15211828 tgagattgaacctggtttagctcagattaactttagttgggattctagcttgtactcgccatggcgagca 15211759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 444 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 12187090 - 12186898
Alignment:
Q  444 ttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataa 543  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| | ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  12187090 ttgtaatctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatgttgaacctccaaattattggatatatat 12186991  T
Q  544 gagatgatgattgtgatg-tttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  12186990 gagatgatgattaagatgttttaagagattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagctttgtactcaccacga 12186898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 188 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 3272143 - 3271703
Alignment:
Q  188 ctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacc 287  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||   |||| ||   | || ||| || |  ||||||||||||  ||||| | || ||||||| |||||||    
T  3272143 ctcgcctcacgagcacttccagaactgagtgcttttgagaatgttgtgacctgagttgattgaattgattaggaatggaacattaggtagtagtgagacc 3272044  T
Q  288 tatataagaagttaactgcaatatgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatga 387  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||  | |||  ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||| || | |||    
T  3272043 tatataagatgttaaatgaaatatgtgaagctgttatgaactattaa-gctgattatgatgtgatttactgattaattgcattacttgaat-attattga 3271946  T
Q  388 atgattgagatgttgcttgtttttatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcat 487  Q
    || ||  |||||||| | |   | | ||||||      ||||| ||||| |||||||||| ||||   ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  3271945 ataatcaagatgttg-tagaaatgaattgataat----tatgaagttatgctgttgttgtgatctgattatgctgcttttgttatttaaccaagttgcat 3271851  T
Q  488 gaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatgtttaagaga-tcgagtccatgcatta 586  Q
    || ||  | ||||  ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||  ||||||| ||| | | ||||||||||||||    
T  3271850 gagtcattataagatgaataagatgatgttgaac-tccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttagataattgagtccatgcatta 3271752  T
Q  587 gcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  3271751 gcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcaccacga 3271703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 454 - 635
Target Start/End: Original strand, 32216604 - 32216786
Alignment:
Q  454 cctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatga 553  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | | ||||||| | | | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  32216604 cctatgctgctattattatttaactatgttgcatgagttgatataagatgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggttacataagagatgatga 32216703  T
Q  554 ttgtgatgttt-aagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  32216704 ttaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcatacatatgttgggggctcatgccctggagcttagtacttaacacga 32216786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 426 - 635
Target Start/End: Original strand, 39267927 - 39268136
Alignment:
Q  426 tatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctcc 525  Q
    ||||| ||| || |||||| |||||||   |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||  |  |||  ||||||||||||||||||| |||    
T  39267927 tatgaagttttaatgttgtggtaatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgatcaagatgatgttgaac-tcc 39268025  T
Q  526 aaattattggataaataagagatgatgattgtgatgtttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgt 624  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||||  ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39268026 aaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttagatgatagagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgt 39268125  T
Q  625 actcaacacga 635  Q
     |||| |||||    
T  39268126 cctcaccacga 39268136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 11313124 - 11312755
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||  || ||| || ||||| ||| | ||| | || ||    
T  11313124 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactaaagattagaggatgattttga 11313025  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    | ||||||||||||||          |||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11313024 aaaagattgaacctgg----------aacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgggagcacttccaga 11312935  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    ||||||||||  |||||||   | || ||| || || || |||||||||  | ||| | || |||| ||||||||||||| |||||  |||||||  |      
T  11312934 actgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaac 11312835  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgat 392  Q
    ||||||| | |||||| ||| ||    ||| ||| ||||||| || || || ||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  11312834 tgtgaagctattatgaaatgcta--agtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgat 11312755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 15581168 - 15580968
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||| ||||| ||| | |||   |||||    
T  15581168 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtttactaaagattagaggatgttttaga 15581069  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    | ||||||||||||||          |||| | |||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15581068 acaagattgaacctgga---------aacaaccttagttggaaatctggcaagtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaaa 15580978  T
Q  211 actgagtgca 220  Q
    ||||||||||    
T  15580977 actgagtgca 15580968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 506 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 2760149 - 2760026
Alignment:
Q  506 caagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatgtttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttggggg 604  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||  ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2760149 caagatgatgttgaac-tccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttggggg 2760051  T
Q  605 ctcatgccctggagctttgtactca 629  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  2760050 ctcatgccctggagctttgtactca 2760026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 12318603 - 12318404
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||  || |||||| ||||| ||| | | | | |||||    
T  12318603 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaacattagatgcttttgagtacctttaggtgtttactaaagattagagggtgatttaga 12318504  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    | ||| ||||||||||          |||| | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12318503 acaaggttgaacctgg----------aacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgctatggcgagcagatgctcttgcctcgcgagcacttccaga 12318414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 144 - 220
Target Start/End: Original strand, 48593209 - 48593285
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 220  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48593209 ttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 48593285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 144 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 6801565 - 6801490
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 219  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6801565 ttagttgggattttggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 6801490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 229
Target Start/End: Original strand, 13635099 - 13635307
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||   || ||| || ||||  ||| |  || | ||| |    
T  13635099 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacccttaggtgtctactaaaaattagagaatgatttata 13635198  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    | ||||||||||||||          |||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13635199 acaagattgaacctgg----------aacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgaacagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 13635288  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggat 229  Q
    ||||||||||  |||||||    
T  13635289 actgagtgcatttgaggat 13635307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 392
Target Start/End: Original strand, 15604902 - 15605271
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  || |||||| ||||  ||| | ||| | |||||    
T  15604902 cagagagcatgtcgaattctgagcttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtttactaaatattagaggatgatttaga 15605001  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    | ||||||||||||||          |||| | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||    
T  15605002 acaagattgaacctgg----------aacaaccttagttgagaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctcttgcctcgtgaccacttctaga 15605091  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    ||||||||||  ||||||    | || | | || || || |||||||||  | ||| | || |||| ||||||||||||| |||||  |||||||  |      
T  15605092 actgagtgcatttgaggactttgagacccgagttgcttggattgattaggaaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaac 15605191  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgat 392  Q
    ||||||| | |||||| ||||||    ||| ||| ||||||| || || || ||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  15605192 tgtgaagctattatgaaatgtta--agtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgat 15605271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 144 - 219
Target Start/End: Original strand, 16438787 - 16438862
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16438787 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttcctgaactgagtgc 16438862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 144 - 229
Target Start/End: Original strand, 18811 - 18896
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggat 229  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  18811 ttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctcttgcctcgcgagcacttccagaactgagtgctattgaggat 18896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 144 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 11987565 - 11987489
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 220  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11987565 ttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcaaatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 11987489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 144 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 13149507 - 13149433
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 218  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13149507 ttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 13149433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 144 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 15728677 - 15728603
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 218  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15728677 ttagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagctgatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 15728603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 145 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 18557323 - 18557249
Alignment:
Q  145 tagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 219  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18557323 tagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgc 18557249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 215
Target Start/End: Original strand, 9445788 - 9445982
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||  ||||||||| ||||| ||| | | | | |||||    
T  9445788 cagagagcatgttgattttcgtattttggacttttgagttgaaccttagatgctttcgagtagctttagatgtttactaaagattagaggttgatttaga 9445887  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    | ||||||||||||||          |||| | |||||||| | |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9445888 acaagattgaacctgg----------aacaaccttagttggaaatctggaaagtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 9445977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 441 - 595
Target Start/End: Original strand, 14932777 - 14932932
Alignment:
Q  441 ttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaa 540  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||| || |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |    
T  14932777 ttgttgtaatctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatgttgaa-ctccaaattattggatgta 14932875  T
Q  541 taagaga--tgatgattgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatt 595  Q
    |||||||  ||||||||  |||||||    ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  14932876 taagagatttgatgattaagatgttttgttgatagagttcatgcattagcatacatt 14932932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 441 - 595
Target Start/End: Original strand, 15356212 - 15356367
Alignment:
Q  441 ttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaa 540  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||| || |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |    
T  15356212 ttgttgtaatctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatgttgaa-ctccaaattattggatgta 15356310  T
Q  541 taagaga--tgatgattgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatt 595  Q
    |||||||  ||||||||  |||||||    ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  15356311 taagagatttgatgattaagatgttttgttgatagagttcatgcattagcatacatt 15356367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 441 - 595
Target Start/End: Original strand, 15360326 - 15360481
Alignment:
Q  441 ttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaa 540  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||| || |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |    
T  15360326 ttgttgtaatctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatgttgaa-ctccaaattattggatgta 15360424  T
Q  541 taagaga--tgatgattgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatt 595  Q
    |||||||  ||||||||  |||||||    ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  15360425 taagagatttgatgattaagatgttttgttgatagagttcatgcattagcatacatt 15360481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 144 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 9593698 - 9593622
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 220  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9593698 ttagttggaaatctggcttgtactcgccatagcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 9593622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 144 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 9644661 - 9644585
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 220  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9644661 ttagttggaaatctggcttgtactcgccatagcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 9644585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 3272288 - 3272173
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||| | ||| | |||||    
T  3272288 cagagagcatgttgaatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttaataaagattagaggatgatttaga 3272189  T
Q  111 ataagattgaacctgg 126  Q
    | ||||||||||||||    
T  3272188 acaagattgaacctgg 3272173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 144 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 13462114 - 13462039
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 219  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13462114 ttagttggaattctggcttgtactcaccatggcgagctgatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 13462039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 144 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 14217267 - 14217192
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 219  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14217267 ttagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagctgatgctctcacctcgcgagcacttccagaactgagtgc 14217192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 26292871 - 26292673
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||  || ||  || ||  | ||| |  || | |||||    
T  26292871 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatttaga 26292772  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    || |||||||||||||          |||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26292771 atgagattgaacctgg----------aacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcaaatgctctcgcctcgcgagcacatccaga 26292682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 523 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 15211449 - 15211334
Alignment:
Q  523 tccaaattattgga-taa-ataagagatgatgattgtgatgttt-aagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagc 619  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  15211449 tccaaattattggactaatataagagatgatgattaagatgttttaagagttagagtccatgcattagcatacataagttgggggcttatgccctggagc 15211350  T
Q  620 tttgtactcaacacga 635  Q
    |||||||||| |||||    
T  15211349 tttgtactcaccacga 15211334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 144 - 219
Target Start/End: Original strand, 16724384 - 16724459
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 219  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16724384 ttagttggaattctggcttgaactcgccatggcgagctgatgctctcgcctcgcgagcactttcagaactgagtgc 16724459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 144 - 219
Target Start/End: Original strand, 17701398 - 17701473
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 219  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17701398 ttagttggaattctggcttgaactcgccatggcgagctgatgctctcgcctcgcgagcactttcagaactgagtgc 17701473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 544 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 18302011 - 18301920
Alignment:
Q  544 gagatgatgattgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    ||||||||||||  ||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  18302011 gagatgatgattaagatgtttagatgatagagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcaccacga 18301920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 454 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 38227546 - 38227363
Alignment:
Q  454 cctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataa-ataagagatgatg 552  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||    ||||||||||||||| | ||||||| |  |     
T  38227546 cctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtagatgaagatgatgatgtt--tccaaattattggattatataagaggttgtc 38227449  T
Q  553 a--ttgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |  ||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38227448 aaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagaatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacga 38227363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 144 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 8917779 - 8917704
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 219  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8917779 ttagtaggaattctggcttgtactcgcaatggcgagctgatgctcttgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 8917704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 466 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 9509242 - 9509073
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataa-ataagagatgatg--attgtgatgt 562  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||    ||||||||||||||| | ||||||| |  |   |||  |||||    
T  9509242 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt---tccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgt 9509146  T
Q  563 ttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  9509145 ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacg 9509073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 12 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 42205590 - 42205394
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||| ||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||  || || ||| | ||| | |||||    
T  42205590 cagagagcttgtcgaattttataattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgttttctatagattagaggatgatttaga 42205491  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    | ||||||||||||||          |||| |  ||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||    
T  42205490 acaagattgaacctgg----------aacaaccatagttggaattctggcaagtacgcgccatggcgagcagttgctctcgcctcgcggacacttccaga 42205401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 157 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 12719009 - 12718948
Alignment:
Q  157 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 218  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12719009 tggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 12718948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 157 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 12723920 - 12723859
Alignment:
Q  157 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 218  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12723920 tggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 12723859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 157 - 218
Target Start/End: Original strand, 16906966 - 16907027
Alignment:
Q  157 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 218  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16906966 tggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 16907027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 157 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 18279744 - 18279683
Alignment:
Q  157 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 218  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18279744 tggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 18279683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 157 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 18283707 - 18283646
Alignment:
Q  157 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 218  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18283707 tggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 18283646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 215
Target Start/End: Original strand, 20569226 - 20569420
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||  ||||||||||||||| || |||| |||||||| |||  |||||| || ||||| ||| | ||| | |||||    
T  20569226 cagagagcatgttgattttcgtattttgaacttttgagttgaacttttgatgcttttgagtacctttagatgtctactaaagattataggatgatttaga 20569325  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    |  |||||||||||||          |||| | |||||||  | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20569326 actagattgaacctgg----------aacaaccttagttgaaaatctggcaagtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttctaga 20569415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 157 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 12715205 - 12715144
Alignment:
Q  157 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 218  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12715205 tggcttgtactcgccacggcgagcagatgctcttgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 12715144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 157 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 16114582 - 16114521
Alignment:
Q  157 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 218  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16114582 tggcttgtactcgccacggcgagcaaatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 16114521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 157 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 16117735 - 16117674
Alignment:
Q  157 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 218  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16117735 tggcttgtactcgccacggcgagcaaatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 16117674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 134 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 11262691 - 11262615
Alignment:
Q  134 tagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    ||||||| | ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11262691 tagaacaacattagttgggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccaga 11262615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 134 - 210
Target Start/End: Original strand, 11548010 - 11548086
Alignment:
Q  134 tagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    ||||||| | ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11548010 tagaacaacattagttgggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccaga 11548086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 134 - 210
Target Start/End: Original strand, 11554606 - 11554682
Alignment:
Q  134 tagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    ||||||| | ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11554606 tagaacaacattagttgggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccaga 11554682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 134 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 12692858 - 12692782
Alignment:
Q  134 tagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    ||||||| | ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12692858 tagaacaacattagttgggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccaga 12692782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 134 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 14953560 - 14953484
Alignment:
Q  134 tagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    ||||||| | ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14953560 tagaacaacattagttgggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccaga 14953484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 144 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 16275844 - 16275772
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgag 216  Q
    ||||||||||   ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16275844 ttagttgggaagttggcttgtacttgccatggcgaacagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgag 16275772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 573 - 636
Target Start/End: Original strand, 9446336 - 9446399
Alignment:
Q  573 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacgaa 636  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  9446336 gagtccatgcattagcatacttttgtcgggggctcatgccctggagctttgtcctcaccacgaa 9446399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 157 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 35151945 - 35151894
Alignment:
Q  157 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttcca 208  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35151945 tggcttgtactcgccatggtgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttcca 35151894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 573 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 42203934 - 42203872
Alignment:
Q  573 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacgaa 636  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  42203934 gagtccatgcattagcatac-tttgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcaccacgaa 42203872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 454 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 12698896 - 12698715
Alignment:
Q  454 cctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgga-taaataaga-gatgat 551  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||    |||||||||||||| || |||| | | || |    
T  12698896 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg---ttccaaattattggattatataaaaggttgtt 12698800  T
Q  552 g-attgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
    | |||  ||||| |||||| | ||||||||||||||||||    ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  12698799 gaattaagatgtctaagaggttgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgtcctggagctttgtactcaacacg 12698715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 558 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 13032719 - 13032642
Alignment:
Q  558 gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  13032719 gatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacg 13032642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 461 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 44116564 - 44116405
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgga-taaataagagatgat--gattgt 557  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||   ||||  |||||||||||||| || ||||||| |  |   |||      
T  44116564 tgctgttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga---tgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaa 44116468  T
Q  558 gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagc 619  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||| | ||||||||||||    
T  44116467 gatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 44116405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 32 - 76
Target Start/End: Original strand, 11995696 - 11995740
Alignment:
Q  32 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11995696 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 11995740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 134 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 14959526 - 14959450
Alignment:
Q  134 tagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    ||||||| | ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  14959526 tagaacaacattagttgggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcactttcaga 14959450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 134 - 210
Target Start/End: Original strand, 25038953 - 25039029
Alignment:
Q  134 tagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    ||||||| | ||||||||||   ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25038953 tagaacaacattagttgggaagttggcttgtactcgccatggtgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccaga 25039029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 466 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 34200839 - 34200669
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatg----attgtgatg 561  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||| ||    ||||||||||||||| ||||  ||| | ||    |||  | ||    
T  34200839 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt---tccaaattattggattaatataagaggttgtcgaattaagttg 34200743  T
Q  562 ttt-aagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  34200742 ttttaagaggtcgagtccatgcattagcattca-ttgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacg 34200669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 466 - 634
Target Start/End: Original strand, 16386316 - 16386485
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatg----attgtgatg 561  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||| ||    ||||||||||||||  ||||  ||| | ||    |||  | ||    
T  16386316 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt---tccaaattattggactaatataagaggttgtcgaattaagttg 16386412  T
Q  562 tttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  16386413 tttaagaggtcgagtccatgcattagcattca-ttgttgggggcttgatgccctggagctttttactcaccacg 16386485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 16583709 - 16583550
Alignment:
Q  13 agagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttagaa 111  Q
    ||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||  || ||| || ||||| ||| |  || | ||||||    
T  16583709 agagagcatgtcgaattatgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactaaagattagagaatgatttagaa 16583610  T
Q  112 taagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagca 181  Q
     |||||||||||||          ||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16583609 caagattgaacctg----------gaacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagca 16583550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 366 - 515
Target Start/End: Original strand, 3564337 - 3564481
Alignment:
Q  366 gcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttttatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgcta 465  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |   ||  |||||||||  |||| | |||||     ||| |||||  || |||||| ||||     
T  3564337 gcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgtt-----gtttttgtatactgcctatgttgctg 3564431  T
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  3564432 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 3564481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 558 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 14258222 - 14258142
Alignment:
Q  558 gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcata-catttgttgggggc--tcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14258222 gatgtttaagaggtcgagtccatacattagcatttcatttgttggggggcatgatgccctggagctttgtactcaacacga 14258142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 454 - 590
Target Start/End: Original strand, 18456468 - 18456604
Alignment:
Q  454 cctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgga-taaataaga-gatgat 551  Q
    |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||   ||||  |||||||||||||| || |||||| | ||      
T  18456468 cctatgttgctatcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga---tgaagttccaaattattggattatataagaggttgtc 18456564  T
Q  552 ga-ttgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcat 590  Q
    || ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18456565 gatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcat 18456604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 76
Target Start/End: Original strand, 28504938 - 28504983
Alignment:
Q  31 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28504938 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 28504983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 563 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 26211950 - 26211879
Alignment:
Q  563 ttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  26211950 ttaagaggtcgagtccatgcattagcattca-ttgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacg 26211879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 32 - 76
Target Start/End: Original strand, 27847482 - 27847526
Alignment:
Q  32 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27847482 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 27847526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 32 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 40443860 - 40443816
Alignment:
Q  32 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40443860 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 40443816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 456 - 595
Target Start/End: Original strand, 2832499 - 2832639
Alignment:
Q  456 tatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagaga--tgatga 553  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||  | ||||  ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||  ||||||    
T  2832499 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatgaa-ctccaaattattggatttataagagatttgatga 2832597  T
Q  554 ttgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatt 595  Q
    ||  |||||||    ||| ||||| || ||||||||||||||    
T  2832598 ttaagatgttttgttgatagagtctatacattagcatacatt 2832639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 456 - 595
Target Start/End: Original strand, 9751812 - 9751952
Alignment:
Q  456 tatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagaga--tgatga 553  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||  |  |||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |  ||||||    
T  9751812 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatgttgaa-ctccaaattattggatgtataagatatttgatga 9751910  T
Q  554 ttgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatt 595  Q
    ||  |||||||    ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  9751911 ttaagatgttttgttgatagagttcatgcattagcatacatt 9751952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 76
Target Start/End: Original strand, 15754527 - 15754569
Alignment:
Q  34 atttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15754527 atttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 15754569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 461 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 3386388 - 3386245
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgga-taaataagagatgatga-ttgtg 558  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||   ||||  |||||||||||||| || | ||||| ||  || ||  |    
T  3386388 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga---tgaagttccaaattattggattatacaagagttgtcgatttaag 3386292  T
Q  559 atgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggct 606  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||||||||| | |||||||||||||    
T  3386291 atgtttaagaagtcgagttcatgcattagcattc-tttgttgggggct 3386245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 456 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 10589102 - 10588920
Alignment:
Q  456 tatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatg--- 552  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |   ||||||||| ||    ||||||||||||||| ||||  ||| | ||       
T  10589102 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgtcgaagatgatgatgt---tccaaattattggattaatataagaggttgtcg 10589006  T
Q  553 -attgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatt---tgttgggggctc-atgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
     |||  |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||   |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  10589005 aattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcag-cattcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacg 10588920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 76
Target Start/End: Original strand, 16385895 - 16385940
Alignment:
Q  31 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16385895 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 16385940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 34201266 - 34201225
Alignment:
Q  32 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtg 73  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34201266 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtg 34201225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Original strand, 810771 - 810811
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  810771 ttttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcct 810811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 200
Target Start/End: Original strand, 15143795 - 15143843
Alignment:
Q  152 gattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 200  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15143795 gattctgacctgtactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 15143843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 562 - 629
Target Start/End: Original strand, 15755053 - 15755120
Alignment:
Q  562 tttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactca 629  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  15755053 tttaagaggtcgaatccatgcattagcattca-ttgttgggggcttgatgccctggagctttgtactca 15755120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 72
Target Start/End: Original strand, 17701275 - 17701335
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 72  Q
    ||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  17701275 cagagagcatgtcaaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 17701335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 18006120 - 18006080
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18006120 ttttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcct 18006080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 18302529 - 18302489
Alignment:
Q  165 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcactt 205  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18302529 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcactt 18302489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 36 - 87
Target Start/End: Original strand, 12756359 - 12756410
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgttta 87  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||    
T  12756359 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgttta 12756410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 36 - 87
Target Start/End: Original strand, 17061602 - 17061653
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgttta 87  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||    
T  17061602 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgttta 17061653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 466 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 20110606 - 20110452
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgga-taaataaga-gatgatga-ttgtgatgt 562  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||   ||||  |||||||||||||| || |||||| | ||  || ||  |||||    
T  20110606 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga---tgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgt 20110510  T
Q  563 ttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagc 619  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||    ||||||||||| | ||||||||||||    
T  20110509 ttaagaggtcgagtccatgcattatcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 20110452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 466 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 67798 - 67729
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggata 538  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||    ||||||||||||||||    
T  67798 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg---ttccaaattattggata 67729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 456376 - 456322
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  456376 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 456322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Original strand, 11393394 - 11393448
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  11393394 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 11393448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 11972551 - 11972497
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  11972551 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 11972497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Original strand, 14949229 - 14949283
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  14949229 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 14949283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Original strand, 15376820 - 15376874
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  15376820 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 15376874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 16213739 - 16213685
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  16213739 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 16213685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 16232575 - 16232521
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  16232575 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 16232521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 16410114 - 16410060
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  16410114 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 16410060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 465 - 515
Target Start/End: Original strand, 17062026 - 17062076
Alignment:
Q  465 attgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  17062026 attgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 17062076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 18430767 - 18430713
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  18430767 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 18430713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 18640327 - 18640273
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  18640327 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 18640273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Original strand, 20385230 - 20385284
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  20385230 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 20385284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Original strand, 21189702 - 21189756
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  21189702 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 21189756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 24275226 - 24275168
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttga 519  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||    
T  24275226 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgttga 24275168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 24702293 - 24702239
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  24702293 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 24702239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 24704743 - 24704689
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  24704743 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 24704689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 560 - 629
Target Start/End: Original strand, 27847993 - 27848062
Alignment:
Q  560 tgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactca 629  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  27847993 tgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattca-tagttgggggcttgatgccctgaagctttgtactca 27848062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 466 - 595
Target Start/End: Original strand, 28505366 - 28505496
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatg----attgtgatg 561  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||| ||    ||||||||||||||| ||||  ||| | ||    |||  | ||    
T  28505366 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaagatgatgatg---ttccaaattattggattaatataagaggttgtcgaattaagttg 28505462  T
Q  562 tttaagagatcgagtccatgcattagcatacatt 595  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  28505463 tttaagaggtcgagtccatgcattagcattcatt 28505496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 32125546 - 32125492
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  32125546 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 32125492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 41522972 - 41522918
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  41522972 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 41522918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 41525434 - 41525380
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  41525434 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 41525380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 466 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 47831860 - 47831791
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggata 538  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||    ||||||||||||||||    
T  47831860 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg---ttccaaattattggata 47831791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 35 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 8917879 - 8917838
Alignment:
Q  35 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  8917879 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacct 8917838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 558 - 634
Target Start/End: Original strand, 10063979 - 10064056
Alignment:
Q  558 gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||     |||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  10063979 gatgtttaagaagtcgagtccatgcattagcatttcagtgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacg 10064056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 562 - 634
Target Start/End: Original strand, 11996193 - 11996265
Alignment:
Q  562 tttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  11996193 tttaagaggttgagtccatgcattagcattca-ttgttgggggcttgatgctctggagctttgtactcaccacg 11996265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 35 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 13462214 - 13462177
Alignment:
Q  35 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13462214 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 13462177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 466 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 13869396 - 13869347
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  13869396 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 13869347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 507 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 15580705 - 15580617
Alignment:
Q  507 aagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagat-gatgattgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatt 595  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||  || |||||| |||||||  ||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||    
T  15580705 aagatgatgatgaac-tccaaattattggatgtatgagagattgatgattaagatgtttagatgattgagtccatgcattagcatacatt 15580617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 573 - 629
Target Start/End: Original strand, 20569773 - 20569827
Alignment:
Q  573 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactca 629  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  20569773 gagttcatgcattagcata--tttgttgggggctcatgccttggagctttgtcctca 20569827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 31 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 26212469 - 26212424
Alignment:
Q  31 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  26212469 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcct 26212424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 182 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 39722581 - 39722544
Alignment:
Q  182 gatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39722581 gatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtgc 39722544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 12 - 72
Target Start/End: Original strand, 48593085 - 48593146
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttt-tgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 72  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  48593085 cagagagcatgtcgaattctgagttttttgacttttgagttgaaccttggatgtctttgagt 48593146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 454 - 517
Target Start/End: Original strand, 811186 - 811250
Alignment:
Q  454 cctatgctgctatt-gttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgtt 517  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||    
T  811186 cctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgtt 811250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Original strand, 2831948 - 2831988
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  2831948 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcct 2831988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 163 - 211
Target Start/End: Original strand, 4318317 - 4318365
Alignment:
Q  163 gtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaa 211  Q
    ||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  4318317 gtactcgccatggcgagtaggaactctcgcctcgcgagcacttccagaa 4318365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 9509668 - 9509628
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  9509668 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 9509628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Original strand, 9751192 - 9751232
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  9751192 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcct 9751232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 12699311 - 12699271
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  12699311 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 12699271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 466 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 13831423 - 13831300
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgga-taaataagagatgatga-ttgtgatgtt 563  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||   ||||  |||||||||||||| || | ||||| ||  || ||  ||||||    
T  13831423 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgattaagatga---tgaagttccaaattattggattatacaagagttgtcgatttaagatgtt 13831327  T
Q  564 taagagatcgagtccatgcattagcat 590  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||    
T  13831326 taagaagtcgagtccatgcattagcat 13831300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 12 - 72
Target Start/End: Original strand, 16724261 - 16724321
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 72  Q
    ||||||||||||  ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  16724261 cagagagcatgtcaaattctaagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 16724321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Original strand, 28505071 - 28505107
Alignment:
Q  165 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagc 201  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28505071 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagc 28505107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 12 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 35152081 - 35152021
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 72  Q
    ||||||||||||||| ||  |  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  35152081 cagagagcatgttgattttcgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 35152021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 38227959 - 38227919
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  38227959 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 38227919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 44014653 - 44014613
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  44014653 ttttgacttttgagttgatacttagatgtttttgagtgcct 44014613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 148 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 44116872 - 44116820
Alignment:
Q  148 ttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 200  Q
    |||||| |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44116872 ttgggaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 44116820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 47832287 - 47832247
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47832287 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 47832247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 204
Target Start/End: Original strand, 2832075 - 2832114
Alignment:
Q  165 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcact 204  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2832075 actcaccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcact 2832114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 79
Target Start/End: Original strand, 16219358 - 16219401
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaa 79  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16219358 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgtctaaa 16219401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 576 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 16579517 - 16579458
Alignment:
Q  576 tccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
    |||||||||||||||    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  16579517 tccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacg 16579458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #150
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 576 - 634
Target Start/End: Original strand, 16586146 - 16586205
Alignment:
Q  576 tccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
    |||||||||||||||    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  16586146 tccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacg 16586205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #151
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 466 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 18005699 - 18005648
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgtt 517  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||    
T  18005699 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgtt 18005648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #152
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 204
Target Start/End: Original strand, 39267416 - 39267455
Alignment:
Q  165 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcact 204  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  39267416 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgggagcact 39267455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #153
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 40443754 - 40443703
Alignment:
Q  149 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 200  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  40443754 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 40443703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #154
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 466 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 44014231 - 44014180
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgtt 517  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||    
T  44014231 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgtt 44014180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #155
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 368 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 48273534 - 48273393
Alignment:
Q  368 attacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttttatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctatt 467  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||| |   ||  |||||||||     ||| |||| || ||||| |||||  || ||| || |||| ||    
T  48273534 attacttgaattatgaatgtat-attgagatgttgttgacttgcatttgatat-----tattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt 48273441  T
Q  468 gttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||    
T  48273440 gttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatgatg 48273393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #156
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 163 - 305
Target Start/End: Original strand, 70537 - 70679
Alignment:
Q  163 gtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagaga 262  Q
    ||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||   ||||||    | || ||| ||||  ||| | ||||||  |    
T  70537 gtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacatccagaattgagtgcttttgaggaatttgagacctgagtcgtttgattggattaggaa 70636  T
Q  263 tggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactg 305  Q
    |||| | || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  70637 tggaactttaggtagtaatgagacctatctaagatgttaactg 70679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #157
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 163 - 305
Target Start/End: Original strand, 74646 - 74788
Alignment:
Q  163 gtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagaga 262  Q
    ||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||   ||||||    | || ||| ||||  ||| | ||||||  |    
T  74646 gtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacatccagaattgagtgcttttgaggaatttgagacctgagtcgtttgattggattaggaa 74745  T
Q  263 tggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactg 305  Q
    |||| | || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  74746 tggaactttaggtagtaatgagacctatctaagatgttaactg 74788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #158
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 31 - 73
Target Start/End: Original strand, 9389332 - 9389374
Alignment:
Q  31 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtg 73  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  9389332 tgtacttttgacttttaagttgaaccttggatgtttttgagtg 9389374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #159
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 454 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 13647390 - 13647344
Alignment:
Q  454 cctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaag 500  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  13647390 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 13647344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #160
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 160 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 18531581 - 18531531
Alignment:
Q  160 cttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    |||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||||||||||    
T  18531581 cttgtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacttccaga 18531531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #161
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 27216915 - 27216861
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||||    
T  27216915 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatg 27216861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #162
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 560 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 40443349 - 40443304
Alignment:
Q  560 tgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggct 606  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  40443349 tgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattca-ttgttgggggct 40443304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #163
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 72
Target Start/End: Original strand, 11043 - 11080
Alignment:
Q  35 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  11043 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 11080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #164
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 72
Target Start/End: Original strand, 18711 - 18748
Alignment:
Q  35 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  18711 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 18748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #165
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 6801665 - 6801628
Alignment:
Q  35 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  6801665 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 6801628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #166
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 9593798 - 9593757
Alignment:
Q  35 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||    
T  9593798 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacct 9593757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #167
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 9644761 - 9644720
Alignment:
Q  35 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||    
T  9644761 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacct 9644720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #168
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 11987665 - 11987624
Alignment:
Q  35 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||    
T  11987665 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacct 11987624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #169
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 202
Target Start/End: Original strand, 11995800 - 11995837
Alignment:
Q  165 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagca 202  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  11995800 actcgccatggcaagcagaggctctcgcctcgcgagca 11995837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #170
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 13149607 - 13149566
Alignment:
Q  35 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||    
T  13149607 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacct 13149566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #171
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 595
Target Start/End: Original strand, 14152048 - 14152183
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagat--gatgattgtg 558  Q
    ||||||||||| ||||| ||| ||||||| || |  ||||   || || |||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||  |||||||  |    
T  14152048 tgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaaaatgatgatgaac-tccaaattattggatgtataagagatttgatgattaag 14152146  T
Q  559 atgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatt 595  Q
    ||||||    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  14152147 atgttttgttgatagagtccatgcattagcatacatt 14152183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #172
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 15728777 - 15728736
Alignment:
Q  35 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||    
T  15728777 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacct 15728736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #173
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 16275944 - 16275907
Alignment:
Q  35 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  16275944 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 16275907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #174
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 38227844 - 38227795
Alignment:
Q  151 ggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 200  Q
    |||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  38227844 ggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 38227795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #175
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 163 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 33441 - 33385
Alignment:
Q  163 gtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 219  Q
    ||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  33441 gtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacatccagaattgagtgc 33385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #176
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 68096 - 68060
Alignment:
Q  165 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagc 201  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  68096 actcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagc 68060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #177
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 68225 - 68185
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  68225 ttttgacttttgagttgatccttaaatgttttcgagtgcct 68185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #178
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 165 - 205
Target Start/End: Original strand, 810900 - 810940
Alignment:
Q  165 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcactt 205  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  810900 actcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtactt 810940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #179
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Original strand, 3564006 - 3564046
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||    
T  3564006 ttttgacttttgagttgattcttagatgcttttgagtgcct 3564046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #180
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Original strand, 9389466 - 9389502
Alignment:
Q  165 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagc 201  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  9389466 actcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagc 9389502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #181
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Original strand, 9751320 - 9751356
Alignment:
Q  165 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagc 201  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  9751320 actcgccatggtgagcagaggctctcgcctcgcgagc 9751356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #182
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 562 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 13647280 - 13647237
Alignment:
Q  562 tttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggct 606  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  13647280 tttaagaggtcgagtccatgcattagcattca-ttgttgggggct 13647237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #183
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 558 - 590
Target Start/End: Original strand, 15082085 - 15082117
Alignment:
Q  558 gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcat 590  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15082085 gatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcat 15082117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #184
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 461 - 501
Target Start/End: Original strand, 15144100 - 15144140
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagt 501  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  15144100 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 15144140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #185
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 558 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 16213583 - 16213551
Alignment:
Q  558 gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcat 590  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16213583 gatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcat 16213551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #186
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 18302657 - 18302617
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  18302657 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcccttgagtgcct 18302617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #187
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 34201134 - 34201098
Alignment:
Q  165 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagc 201  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  34201134 actcgccatggcgagcagaggctcttgcctcgcgagc 34201098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #188
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Original strand, 39267288 - 39267328
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  39267288 ttttgacttttgagttgaaccttatatgcctttgagtgcct 39267328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 458; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 458; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 36 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 36934 - 36337
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttagaataagattgaacctggtttagctt 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  36934 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcttattaaagattatatgataacttagaatgagattgaacctggtttaactt 36835  T
Q  135 agaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatagcgc 234  Q
    |||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |   |    
T  36834 agaacaacctttgttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttctagaactgagtgcaagtgaggaaaatac 36735  T
Q  235 gatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatatgtgaagttgttatgagatgttag 334  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  36734 gatctgtgtcgcatgatttgtttagagaaggacccttgggtagtaatgagacctatttaagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgagatgttag 36635  T
Q  335 tgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttttatttgatatcgttatatgatgtt 434  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||     
T  36634 tgttgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaactatgaatgaatgattgagatgttgcgtgtttatatttgatatcgttatatgatgtc 36535  T
Q  435 atactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattg 534  Q
    ||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36534 atattgttgttgtaatttgcctatgctactattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatgttgaacctccaaattattg 36435  T
Q  535 gataaataagagatgatgattgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaaca 632  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36434 gataaataagagatgatgattgtgatgtttaagaggttgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaaca 36337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 445; Significance: 0; HSPs: 5)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 445; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 635
Target Start/End: Original strand, 65412 - 66035
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    ||||||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  65412 cagagagcatgtaagattttgtagttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatatttattaaagattaaatgataacttaga 65511  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    | |||||||||||||||||| | ||||||| | || ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  65512 acaagattgaacctggtttaacctagaacaacctttgttggggatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgtgagcacttccaga 65611  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  65612 actgagtgcaagtgaggatattgcgatctttgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaacc 65711  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttt 410  Q
    |||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  65712 tgtgatcctgttatgagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattaattgaattatgaatgaatgattgagatgatgcttg-ttt 65810  T
Q  411 tatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaaga 510  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||  |||  ||||||||    
T  65811 tatttgatatccttatatgatgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtaggtaaaagatgatcaaga 65910  T
Q  511 tgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatg 610  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  65911 tgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattatgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatg 66010  T
Q  611 ccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  66011 ccctggagctttgaactcaacacga 66035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 54041 - 53672
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||  || ||| || ||||| ||| | ||| | |||||    
T  54041 cagagagcatgttgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactaaagattagaggatgatttaga 53942  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    | ||||||||||||||          |||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53941 acaagattgaacctgg----------aacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 53852  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    ||||||||||  |||||||   | || ||| || || || |||||||||  | ||| | || |||| ||||||||||||| |||||  |||||||  |      
T  53851 actgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaac 53752  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgat 392  Q
    ||||||| | |||||| ||| ||    ||| ||| ||||||| || || || ||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  53751 tgtgaagctattatgaaatgcta--agtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgat 53672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 558 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 128712 - 128634
Alignment:
Q  558 gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  128712 gatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacga 128634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 456 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 53621 - 53481
Alignment:
Q  456 tatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagat--gatga 553  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| || |  ||||   || || |||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||  |||||    
T  53621 tatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaaaatgatgatgaac-tccaaattattggatgtataagagatttgatga 53523  T
Q  554 ttgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatt 595  Q
    ||  |||||||    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  53522 ttaagatgttttgttgatagagtccatgcattagcatacatt 53481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 37 - 87
Target Start/End: Original strand, 20069 - 20119
Alignment:
Q  37 tttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgttta 87  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| || |||||||    
T  20069 tttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagttcctgaacatgttta 20119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 441; Significance: 0; HSPs: 181)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 441; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 36 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 19863456 - 19862858
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttagaataagattgaacctggtttagctt 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |    
T  19863456 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcctattaaagattaaatgataacttagaatgagattgaaccttgtttaacct 19863357  T
Q  135 agaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatagcgc 234  Q
    |||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||    
T  19863356 agaacaacctttgttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtaaggatattgc 19863257  T
Q  235 gatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatatgtgaagttgttatgagatgttag 334  Q
    |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  19863256 gatctgtgtcacatcatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgagatgttag 19863157  T
Q  335 tgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttttatttgatatcgttatatgatgtt 434  Q
    || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||     
T  19863156 tgttgaatgtgatgtgatataatgattaattgcattacttgaaatatgaatgaatgattgagatgttgc-tgttttta-ttgatatcgttatgtgatgtc 19863059  T
Q  435 atactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattg 534  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19863058 atactgttgttgtaatcttcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatgttgaacctccaaattattg 19862959  T
Q  535 gataaataagagatgatgattgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19862958 gataaataagagatgatgattatgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacataagttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacg 19862859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 421; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 635
Target Start/End: Original strand, 25641802 - 25642424
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    ||||||||||||   ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  25641802 cagagagcatgtaagattttgtagtttggacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgtatattaaagattaaatgataacttaga 25641901  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    |  ||||||||||| ||||| | ||||||| | || ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25641902 acgagattgaacctagtttaacatagaacaacctttgttgggaatctggcttgaactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 25642001  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25642002 actgagtgcaagtgaggatattgcgaactgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatc 25642101  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttt 410  Q
    | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  25642102 tttgaagttgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattacttgaattatgaatgaatgattaagatgttg-ttgtttt 25642200  T
Q  411 tatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaaga 510  Q
    || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| | ||||  ||||||||    
T  25642201 ta-ttgatatcgttatgtgatgtcatactgttgttgtaatctgtctatgctgctattgttatttaacctagttgcatgagtcgatataagatgatcaaga 25642299  T
Q  511 tgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatg 610  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25642300 tgatgttgaacttccaaattattggataaataagagatgatgattaagatgtttaagagatcaagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatg 25642399  T
Q  611 ccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  25642400 ccctggagctttgtactcaacacga 25642424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 390; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 31 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 22439283 - 22438679
Alignment:
Q  31 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttagaataagattgaacctggttt 129  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||    
T  22439283 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgtatattaaagcttaaatgataacttataacgagattgaacctagttt 22439184  T
Q  130 agcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggat 229  Q
    | | ||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  22439183 aacctagaacaacttttgtagggaatctggcttgtactcgccatagcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccacaactgagtgcaagtgagaat 22439084  T
Q  230 agcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatatgtgaagttgttatgagat 329  Q
    |  |||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  22439083 attgcgatctgtgtcgcataattcgatttgagatggacccttgggtagtaatgagatctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgagat 22438984  T
Q  330 gttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttttatttgatatcgttatatg 429  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| | |||| ||||| ||||||||| ||| ||    
T  22438983 gttagtgttgattatgatgtgatataaagtttaattacattacttgaattacgaatgaatgattaagatgatacttgcttttacttgatatcg-tatgtg 22438885  T
Q  430 atgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaat 529  Q
    |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  22438884 atgtcatactgttgttgtaaactgcctatgctgctattgttaattaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatgttgaacctccaaat 22438785  T
Q  530 tattggataaataagagatgatgattgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactca 629  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  22438784 tattgtataaataagagatgatgattatgatgtttaagagatcgagtccatgcatttgcatacatttgttgggggctcatgctctggaactttgtactca 22438685  T
Q  630 acacga 635  Q
    ||||||    
T  22438684 acacga 22438679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 382; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 31 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 22432733 - 22432129
Alignment:
Q  31 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttagaataagattgaacctggttt 129  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  22432733 tgtagttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcatgaagatgtatattaaagattaaatgataacttagaacgagattgaacctagttt 22432634  T
Q  130 agcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggat 229  Q
    | | | ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  22432633 aaccttgaacaacttttgttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagttagtat 22432534  T
Q  230 agcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatatgtgaagttgttatgagat 329  Q
    |  |||||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  22432533 attgcgatctgtgtctcattatttgatttgagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagat 22432434  T
Q  330 gttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttttatttgatatcgttatatg 429  Q
    || |||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |  ||| ||||| ||||||||  ||| ||    
T  22432433 gtcagtgttgattatgatgtgatatattgtttaattacattacttgaattacaaatgaatgattgagatgatatttgcttttacttgatatc-atatgtg 22432335  T
Q  430 atgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaat 529  Q
    |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  22432334 atgtcatactgttgttgtaaactgcctatgctgctattgttaattaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatgttgaacctccaaat 22432235  T
Q  530 tattggataaataagagatgatgattgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactca 629  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  22432234 tattgtataaataagagatgatgattatgatgtttaagagatcgagtccatgcatttgcatacatttgttgggggctcatgctctggaactttgtactca 22432135  T
Q  630 acacga 635  Q
    ||||||    
T  22432134 acacga 22432129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 150 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 19873483 - 19873000
Alignment:
Q  150 gggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatg 249  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||     
T  19873483 gggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtaaggatattgcgatctgtgtcgcatc 19873384  T
Q  250 aattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatatgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgt 349  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  19873383 attttattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgagatgttagtgttgaatgtgatgt 19873284  T
Q  350 gatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttttatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaa 449  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  19873283 gatataatgattaattgcattacttgaaatatgaatgaatgattgagatgttgc-tattttta-ttgatatcgttatgtgatgtcatactgttgttgtaa 19873186  T
Q  450 tctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatg 549  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19873185 tctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatgttaaaccttcaaattattggataaataagagatg 19873086  T
Q  550 atgattgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19873085 atgattatgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacataatttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacga 19873000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 12 - 635
Target Start/End: Original strand, 21739641 - 21740268
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |||||||    
T  21739641 cagagagcatgttgaattctgtttttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttactaaagattagatgatgacttaga 21739740  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21739741 gtgagattgaacctggtttagcttagaacaacattagttgggaatctggcttgtactcgccatggtgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 21739840  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    ||||||| ||| |||| ||   |||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||| ||| |||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||     
T  21739841 actgagtacaattgagaatgttgcgatctgtgtcacatgagttgtttagggatggactcttaggtagtaatgtgacctatataggatgttaattgcaatc 21739940  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaa----ttatgaatgaatgattgagatgttgcttg 406  Q
    ||||||| |||||||| ||||||  ||||  ||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||    | ||||||||||||||||| || | ||||    
T  21739941 tgtgaagctgttatgaaatgtta-agctggttataatgtgacttaatgattaattgcattacttgaaatgttaatgaatgaatgattgagttgatacttg 21740039  T
Q  407 tttttatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatc 506  Q
      | ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||  || ||||||||||||||||| | | |||| || ||  |  |||  |||     
T  21740040 catctatttgatatctttatatgatgtcataatgttgttgtgatctgcccgtgttgctattgttatttaactatgttgcacgagtctatacaagatgatt 21740139  T
Q  507 aagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatg-tttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc 605  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||  |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21740140 aagatgatgttgaa-ctccaaattattggatatatatgagatgaagattaagatgttttaggagattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc 21740238  T
Q  606 tcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21740239 tcatgccctggagctttgtactcaccacga 21740268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 148 - 635
Target Start/End: Original strand, 22334647 - 22335134
Alignment:
Q  148 ttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgca 247  Q
    ||||||||||| | |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  22334647 ttgggattctgacctaaactcgccatggtgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgaatgcaagtgaggatattgcgatctgtgtcgca 22334746  T
Q  248 tgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatatgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgat 347  Q
    | | |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| | | || |||| || ||    
T  22334747 taatttgattagagttggacccctgggtagcaatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtaaagctgttatgagatataaatggtgaacataat 22334846  T
Q  348 gtgatataatg-tttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttttatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttg 446  Q
    ||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||| || ||||||||| | |||||| ||| || |||||    
T  22334847 gtgatttaatgattaaattgcactacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgct--gatttgttcgatatcgttgtgtgatgtcatattgctgttg 22334944  T
Q  447 taa-tctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataaga 545  Q
    ||| |||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22334945 taattctgtctatgctgctattgttatttaacctagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggatgaataaga 22335044  T
Q  546 gatgatgattgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22335045 gatgatgattaagatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtacgcaacacga 22335134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 12 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 18907609 - 18906990
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataact-tag 109  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||| |||| |||||||  |||    
T  18907609 cagagagcatgtcgaattctgtattttttacctttgagttgaaccttagatgtttttgagtaccttcagatgtgtattaaagattaactgataaccctag 18907510  T
Q  110 aataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccag 209  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18907509 aatgagattgaacctggcttagcttagaacaactttagttggaaatctggcttgatttcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccag 18907410  T
Q  210 aactgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaat 309  Q
    ||| |||||||| |||| ||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  18907409 aacagagtgcaaatgagaatgttgcgatctgtgtcgcatgaattgattagggatggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgcaat 18907310  T
Q  310 atgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgttt 409  Q
    |||||||| ||||||||  |||||  | | | ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||  |||||||| |||       
T  18907309 atgtgaagctgttatgaactgtta-agttcattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg-ttgaaa 18907212  T
Q  410 ttatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaag 509  Q
    | | |||||||     ||||| ||||| |||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |  |||  ||| |||    
T  18907211 tgaattgatat-----tatgaagttatgctgttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagctgcatgagtctatacaagatgattaag 18907117  T
Q  510 atgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatg-tttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc 607  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||  |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18907116 atgatgttgaa-ctccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc 18907018  T
Q  608 atgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||    
T  18907017 atgccctggagctttgtactcaccacga 18906990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 148 - 635
Target Start/End: Original strand, 15894185 - 15894675
Alignment:
Q  148 ttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgca 247  Q
    ||||||||||| | || |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    |||  ||||||||||    
T  15894185 ttgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagagtctctcacctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgagaactttgcgtcctgtgtcgca 15894284  T
Q  248 tgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatatgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgat 347  Q
    | | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||  | ||| ||| ||    
T  15894285 taacttgtttagagatggacccttgggtagtaatgtgacctatataggatgttaactacaatctgtgaagctgttatgaaatgttaa-gttgattataat 15894383  T
Q  348 gtgatataatgtttaattgcattacttgaatt----atgaatgaatgattgagatgttgcttgtttttatttgatatcgttatatgatgttatactgttg 443  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| |    ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  15894384 gtgatttaatgattaattgcattacttgaaatgttaatgaatgaatgattgagttgatgcttgattttatttgatatctttatatgatgtcataatgttg 15894483  T
Q  444 ttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataa 543  Q
    |||| |||| | |||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||  | ||||  ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  15894484 ttgtgatctgcttatgctgctattgttatttaactatgatgcatgagtctatataagatgattaagatgatgttgaa-ctccaacttattggatatataa 15894582  T
Q  544 gagatgatgattgtgatg-tttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  15894583 gagatgatgattaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcatacatatgttgggggcttatgccctagagcttagtacacaacacga 15894675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 322
Target Start/End: Original strand, 21834509 - 21834820
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| | |||||    
T  21834509 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaaaatgtttattaaagattagatgatgatttaga 21834608  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    |  |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21834609 acgagattgaacctgatttagcttagaacaactttagttggaattctggcttgtaatcaccatggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 21834708  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    ||||| ||||||| |||||   ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||  ||||||| ||||| |||||||| |||     
T  21834709 actgaatgcaagttaggatgttgcgatctgtttcgcataaattgattagggatggacccttcagtagtaatctgacctatttaagatgttaactgaaatc 21834808  T
Q  311 tgtgaagttgtt 322  Q
    ||||||| ||||    
T  21834809 tgtgaagctgtt 21834820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 12 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 18180989 - 18180374
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    ||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||| | |||||    
T  18180989 cagagagcatgttgaatttcgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagaggatgatttaga 18180890  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18180889 atgagagtgaacctggtttagcatagaacaacttgagttggaaatctggcttgtactcgccatggagagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 18180790  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    ||||| ||||  |||| ||  || || ||| || |  ||||||||||||  ||||| | || ||||||| | |||| ||| ||||| |||||||| |||     
T  18180789 actgaatgcatttgagaatgtcgtgacctgagttgattgaattgattaggaatggaactttaggtagtagtaagacatatttaagatgttaactgaaatc 18180690  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttt 410  Q
    ||| | | |||| | |  |||||  | ||  | | ||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||| |||   |    
T  18180689 tgtaaggctgtt-tcaactgtta-agttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgattaagatgttg-ttgaaat 18180593  T
Q  411 tatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaaga 510  Q
     | ||| | |     ||||| | |||| ||||||||| ||||   ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||  | ||||  ||  ||||    
T  18180592 gaattgttgt-----tatgaag-tataatgttgttgtgatctgattatgctgcttttgttatttaaccaagttgcatgagtcattataagatgaataaga 18180499  T
Q  511 tgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatgtttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcat 609  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||| |||||  ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18180498 tgatgttgaa-ctccaaattattggatgtatatgagatgttgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatatgttgggggctcat 18180400  T
Q  610 gccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||||||| |||| |||| |||||    
T  18180399 gccctggagccttgtcctcaccacga 18180374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 12 - 305
Target Start/End: Original strand, 16523022 - 16523316
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| ||| || || | |||||    
T  16523022 cagagagcatgttgaattctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagcgccttaagatgtttattaaagattagataatgatttaga 16523121  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    |  |||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16523122 acgagattgaatctggtttagcttagaacaacttaagttggaattctagcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 16523221  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactg 305  Q
    ||||| ||||||| || ||   ||||||||| |||||| |||||||||| | |||| |||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  16523222 actgaatgcaagttagtatgttgcgatctgtttcgcataaattgattagggttggatccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactg 16523316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 12 - 289
Target Start/End: Original strand, 15041169 - 15041447
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  15041169 cagagagcatgttgaattttgtaattttgacttttgagttataccttagatgtttttgagtgcctgaagatgtttaataaaggttagatgataacttaga 15041268  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    || ||||||||||||| ||| | ||||||| || | ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  15041269 atgagattgaacctggattaacctagaacaactattgttgggaatctgacttgtactcgccatgacgagcagatgctctcgcctcgcaaccacttccaga 15041368  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagaccta 289  Q
    | ||||||||||||||  || |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15041369 attgagtgcaagtgagtttaacgcgatctgtatcgcatgttttgattagagatggacccctgggtagtaatgagaccta 15041447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 438 - 635
Target Start/End: Original strand, 15041590 - 15041788
Alignment:
Q  438 ctgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgg-a 536  Q
    |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||  | ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15041590 ctgttgttgtgatctgcctatgctactattgttatttaactaagttgcatgagtctttataagatgaacaagatgatgttgaacctccaaattattggta 15041689  T
Q  537 taaataagagatgatgattgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    || | ||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  15041690 tataaaagagttgatgattgagatttttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacga 15041788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 46 - 226
Target Start/End: Original strand, 22059396 - 22059577
Alignment:
Q  46 tgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttagaataagattgaacctggtttagcttagaacagctt 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||| || || | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  22059396 tgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcatattaaagattagataatgatttagaacaagattgaacctggtttagcttagaacaacat 22059495  T
Q  145 tagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgag 226  Q
    ||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  22059496 taggttgaattctggcttgtacttgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcaagcacttctagaactgagtgcaattgag 22059577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 40 - 289
Target Start/End: Original strand, 16924526 - 16924776
Alignment:
Q  40 gacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagt-taaatgataacttagaataagattgaacctggtttagcttagaa 138  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||| ||| |||||  |  |||||||||||| | ||||||| |||||| ||| | |||||    
T  16924526 gactttttagttgaaccttagatgcctttgagttcctgaagatgcttaataaagaattgatgataacttaggacaagattggacctggattaacctagaa 16924625  T
Q  139 cagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatagcgcgatc 238  Q
     |      ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||    
T  16924626 taatcaatgttggaagtctggcctgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgagtttaatgcgatc 16924725  T
Q  239 tgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagaccta 289  Q
    |||||||||||  ||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||    
T  16924726 tgtgtcgcatgctttgattaggagtggacccctgggtagtaatgagaccta 16924776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 12 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 17804673 - 17804304
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||  || ||| || ||||| ||| | ||| | |||||    
T  17804673 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactaaagattagaggatgatttaga 17804574  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    | ||||||||||||||          |||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17804573 acaagattgaacctgg----------aacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 17804484  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    ||||||||||  |||||||   | || ||| || || || |||||||||  | ||| | || |||| ||||||||||||| |||||  |||||||  |      
T  17804483 actgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaac 17804384  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgat 392  Q
    ||||||| | |||||| ||| ||    ||| ||| ||||||| || || || ||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  17804383 tgtgaagctattatgaaatgcta--agtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgat 17804304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 220
Target Start/End: Original strand, 22429660 - 22429859
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  || ||| || ||||| ||| | ||| | |||||    
T  22429660 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcttctgagtgcctttaggtgtctactaaagattagaggatgatttaga 22429759  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    | ||||||||||||||          |||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22429760 acaagattgaacctgg----------aacaaccttagctgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 22429849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 456 - 635
Target Start/End: Original strand, 16523441 - 16523620
Alignment:
Q  456 tatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgatt 555  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||  |  |||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  16523441 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatgttgaac-tccaaattattggatgtatatgagatgatgatt 16523539  T
Q  556 gtgatgtttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
      ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  16523540 aagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggcttatgccctggagctttgtactcaccacga 16523620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 40 - 281
Target Start/End: Original strand, 16964957 - 16965199
Alignment:
Q  40 gacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag--ttaaatgataacttagaataagattgaacctggtttagcttaga 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||| |||||  || || |||||||||| |  |||||| |||||| ||| | ||||    
T  16964957 gacttttgagttgaaccttagatggctttgagtgcctgaagatgcttaataaagaattgaa-gataacttaggacgagattggacctggattaacctaga 16965055  T
Q  138 acagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatagcgcgat 237  Q
    |||      ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||  | |||    
T  16965056 acaatcaatgttggaagtctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcacgagcacttccagaacttagtgcaagtgagtttaatgtgat 16965155  T
Q  238 ctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaat 281  Q
    ||||||||||||  ||||||||   ||||||| |||||||||||    
T  16965156 ctgtgtcgcatgctttgattaggagtggacccctgggtagtaat 16965199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 439 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 21766771 - 21766578
Alignment:
Q  439 tgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggata 538  Q
    ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||  | ||||  ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21766771 tgttgttgtgatctgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggata 21766672  T
Q  539 a--ataagagatgatgattgtgatgtttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactca 629  Q
       ||| ||||||||||||  ||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21766671 tgtatatgagatgatgattaagatgttttagatgattgagcccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagttttgtactca 21766578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 200
Target Start/End: Original strand, 22405685 - 22405873
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||| ||||| ||  ||||| | |||||    
T  22405685 cagagagcatgttgaatttcgtaattt-gacttttgagttgaaccttagatgctttagagtgccttgagatgtttaataaagattggatgatgatttaga 22405783  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 200  Q
    |  ||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22405784 acgagattgaaccttgtttagcttagaacaacttgagatggaaatctgggttgtactcgccatggcgagcagatgctttcgcctcgcgag 22405873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 629
Target Start/End: Original strand, 20907611 - 20908215
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| | |||  |||||| ||||| || ||| | ||| |||||||    
T  20907611 cagagagcatgttgattttcgtattttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgaatacctttagatgtgtattatagattagaggatgacttaga 20907710  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    | ||||||||||||          |||||| |  ||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20907711 acaagattgaacct----------agaacaaccatagttggaaatctggcaagtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcacgagcacttccaga 20907800  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    |||||||||   |||| ||     || ||| || |  || |||| ||||  ||||| | || ||||||||||| |||||| ||||| |||||||  |||     
T  20907801 actgagtgcttttgagaatgttatgacctgagttgtttggattggttaggaatggaactttaggtagtaatgaaacctatttaagatgttaactagaatc 20907900  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttt 410  Q
    || |||||||||| ||  |||||  | ||  | | ||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||   ||||||||  |||||||| |||   |    
T  20907901 tgggaagttgttaagaattgtta-agttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaattattcttgaatgatcaagatgttg-ttgaaat 20907998  T
Q  411 tatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaaga 510  Q
     | ||| | |     |||||  ||||  ||||||||| ||||   |||||||||  ||||||||||| ||| ||||||| ||  |  | |  ||| ||||    
T  20907999 gaattgttgt-----tatgaaattatgatgttgttgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgagtctatacatgatgattaaga 20908093  T
Q  511 tgatgttgaacctccaaattattggataaata-agagatgatgattgtga-tgtttaaga--gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggct 606  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  |||  |||||| |||||  || ||||| |||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20908094 tgatgttgaa-ctccaaattattggatgtatattgagatgttgattaagattgttttagattgatagagtccatgcattagcatacttttgttgggggct 20908192  T
Q  607 catgccctggagctttgtactca 629  Q
    |||||||||||||||||| ||||    
T  20908193 catgccctggagctttgtcctca 20908215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 514 - 635
Target Start/End: Original strand, 31164956 - 31165078
Alignment:
Q  514 tgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatgttt--aagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgc 611  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |  | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31164956 tgttgaacctccaaattactggatatataagagatgattaacgagatgtttttaagagatcgagtccatgcattagcatacatt-gttgggggctcatgc 31165054  T
Q  612 cctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  31165055 cctggagcttagtactcaacacga 31165078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 296
Target Start/End: Original strand, 27553237 - 27553512
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||| ||||| ||| | ||| | |||||    
T  27553237 cagagagcatgttgattttcgtatttcggacttttgagttgaaccttggatgtttttgagtacctttagatgtttactaaagattagaggatgatttaga 27553336  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    | ||||||||||||||          |||| | |||||||| | ||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27553337 acaagattgaacctgg----------aacaaccttagttggaaatctggcaagtacacaccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 27553426  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataaga 296  Q
    |||||||||   |||  ||  || || ||| || | |||||||||||||  ||||| | || ||||||||||| |||||| |||||    
T  27553427 actgagtgcttttgataatgtcgtgacctgagttgaatgaattgattaggaatggaacattaggtagtaatgaaacctatttaaga 27553512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Original strand, 23657050 - 23657248
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||  |||||| || | ||| ||| ||||| | |||||    
T  23657050 cagagagcatgttgattttcgtattttggacttttgagttgaactttagatgcttttgagtacctttagatgtctacttaagattagatgatgatttaga 23657149  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    | ||||||||||||||          |||| |  ||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23657150 acaagattgaacctgg----------aacaaccgtagttggaaacctggcctgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 23657239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 218
Target Start/End: Original strand, 27567246 - 27567436
Alignment:
Q  19 catgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttagaataagat 117  Q
    |||||||| || |||||||| ||| |||||||||||||||| ||| |||||||| |||  ||||||||| ||||| ||| | ||| | |||||| |||||    
T  27567246 catgttgatttttgtattttggacgtttgagttgaaccttatatgcttttgagtacctttagatgtttactaaagattagaggatgatttagaacaagat 27567345  T
Q  118 tgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagt 217  Q
    |||||||||          |||| | |||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27567346 tgaacctgg----------aacaaccttagttggaaatctggcaagtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagt 27567435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 156 - 289
Target Start/End: Original strand, 31164611 - 31164744
Alignment:
Q  156 ctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattga 255  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||| || |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||  |||| ||||||||||||  ||||    
T  31164611 ctggcttgtactcgccatggtgagcatatgcccttgcctcgcgagtacttccagaattgagtgcaagtgagtttaatgcgacctgtgtcgcatgttttga 31164710  T
Q  256 ttagagatggacccttgggtagtaatgagaccta 289  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  31164711 ttagagatggacccctgggtagtagtgagaccta 31164744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 215
Target Start/End: Original strand, 19790410 - 19790603
Alignment:
Q  13 agagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttagaa 111  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||  |||||| |||||||| ||| | ||| ||||||||    
T  19790410 agagagcatgttgattttcgtattttggactttttagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtgtattaaagattagaggatgacttagaa 19790509  T
Q  112 taagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaa 211  Q
     |||||||||||||          ||||| |  ||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19790510 caagattgaacctg----------gaacaaccatagttggaaatctggcaagtactcgccatggcgagcagatgctcttgcctcgcgagcacttccagaa 19790599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 36 - 305
Target Start/End: Original strand, 27415596 - 27415856
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttagaataagattgaacctggtttagctt 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || ||| || || |  ||| | ||| | |||||| ||||||||||||||            
T  27415596 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtctttgagtacctttaggtgtctactagatattagaggattaattagaacaagattgaacctgg-------- 27415687  T
Q  135 agaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatagcgc 234  Q
      |||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||   |     
T  27415688 --aacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcggatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtgcatttgaggattttga 27415785  T
Q  235 gatctgtgtcgcatgaattgatta-gagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactg 305  Q
    || ||| || || || |||||||| |||| ||| |||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  27415786 gacctgagttgcttggattgattaggaga-ggaaccttaggtactaatgagacctatttaagatgttaactg 27415856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 144 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 12496661 - 12496586
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12496661 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtgc 12496586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 509 - 635
Target Start/End: Original strand, 18692022 - 18692148
Alignment:
Q  509 gatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatgtttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc 607  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||  ||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  18692022 gatgatgttgaac-tccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttagatgattgagttcatgcattagcatacatttgttgggggctt 18692120  T
Q  608 atgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||    
T  18692121 atgccctggagctttgtactcaccacga 18692148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 506 - 635
Target Start/End: Original strand, 22074311 - 22074440
Alignment:
Q  506 caagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatgtttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttggggg 604  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||  ||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22074311 caagatgatgttgaac-tccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttagatgattgagtgcatgcattagcatacatttgttggggg 22074409  T
Q  605 ctcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  22074410 ctcatgccctggagccttgtcctcaccacga 22074440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 144 - 219
Target Start/End: Original strand, 5616567 - 5616642
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 219  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5616567 ttagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagctgatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 5616642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 144 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 12707041 - 12706966
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 219  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12707041 ttagttgggaatctggcttgtacttgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 12706966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 144 - 218
Target Start/End: Original strand, 1587484 - 1587558
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 218  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1587484 ttagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagctgatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 1587558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 155 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 16741548 - 16741484
Alignment:
Q  155 tctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16741548 tctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 16741484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 147 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 19663118 - 19663046
Alignment:
Q  147 gttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19663118 gttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctatcgcctcgcgagcacttccaaaactgagtgc 19663046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 144 - 215
Target Start/End: Original strand, 22592557 - 22592628
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactga 215  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22592557 ttagttgaaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactga 22592628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 229
Target Start/End: Original strand, 25766798 - 25767006
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    ||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||   || ||| || ||||| ||| | |||   |||||    
T  25766798 cagagagcatgtcaaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtaccattaggtgtctactaaagattagaggatgttttaga 25766897  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    ||||||||||||||||          |||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||    
T  25766898 ataagattgaacctgg----------aacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcacgagccattctaga 25766987  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggat 229  Q
    ||||| ||||  |||||||    
T  25766988 actgattgcatttgaggat 25767006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 40 - 289
Target Start/End: Original strand, 16929242 - 16929487
Alignment:
Q  40 gacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagt-taaatgataacttagaataagattgaacctggtttagcttagaa 138  Q
    |||||||||||| |||||||||||  || |||||||| |||||| ||| |||||  |  |||||||||| | || |||||| |||||| ||| | |||||    
T  16929242 gacttttgagttaaaccttagatgcctt-gagtgcctgaagatgcttaataaagaattgatgataacttgggatgagattggacctggattaacctagaa 16929340  T
Q  139 cagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatagcgcgatc 238  Q
    ||  |   ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||    |||  ||  ||||||    
T  16929341 caattaatgttggaagtctggcctgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcactttgaaaactgagtgc----gagtttaatgcgatc 16929436  T
Q  239 tgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagaccta 289  Q
    |||||||||||  ||||||||   ||||||| | ||||||||||| |||||    
T  16929437 tgtgtcgcatgctttgattaggagtggacccctcggtagtaatgataccta 16929487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 455 - 635
Target Start/End: Original strand, 16965366 - 16965549
Alignment:
Q  455 ctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacct---ccaaattattggataaataagagatgat 551  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| || || ||||  ||| |||| | ||||||   |   ||||||||||||| |||||  |||||||    
T  16965366 ctatgctgctactgttaattaaccaagttgcatgagtcagtttaagatgattaagacgttgttgatgatgttccaaattattggacaaatataagatgat 16965465  T
Q  552 gattgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || |||||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  16965466 aattgagatgtttaagagatcgagtccatgcattagtattcatatgatgggggcttatgctctggagcttagtactcaccacga 16965549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 144 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 1645058 - 1644983
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 219  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  1645058 ttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcaaatgctctcgcctcgcgagcacatccagaattgagtgc 1644983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 144 - 215
Target Start/End: Original strand, 20803306 - 20803377
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactga 215  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20803306 ttagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagctgatgctctcgcctcgcgagcacttccataactga 20803377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 342 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 29060711 - 29060422
Alignment:
Q  342 tatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttttatttgatatcgttatatgatgttatactgt 441  Q
    ||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |   ||  |||||||||  |||| | |||||     ||    
T  29060711 tatgatgagatataatgtt-atgtgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgtt-----gt 29060618  T
Q  442 tgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataa-a 540  Q
    | |||||  || |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||| ||    ||||||||||||||| | |    
T  29060617 ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagctgatgaagatgatgatgtt--tccaaattattggattata 29060520  T
Q  541 taagagatgatg--attgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||| |  |   |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29060519 taagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacga 29060422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 135 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 14472632 - 14472462
Alignment:
Q  135 agaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatagcgc 234  Q
    |||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||   ||||||    |     
T  14472632 agaacaaccttagttgggaatttggcttgtactcgccatggcgagcatatgctctcgcctcgcgagcacatccagaattgagtgcttttgaggaatttga 14472533  T
Q  235 gatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactg 305  Q
    || ||| ||||  ||||| ||||||  ||||| | || |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  14472532 gacctgagtcgtttgaatggattaggaatggaactttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactg 14472462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 144 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 21702640 - 21702568
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgag 216  Q
    |||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21702640 ttagttggaaatttggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgag 21702568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 573 - 629
Target Start/End: Original strand, 21830615 - 21830671
Alignment:
Q  573 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactca 629  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21830615 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactca 21830671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 144 - 219
Target Start/End: Original strand, 18955516 - 18955591
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 219  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  18955516 ttagttgggaatctggcttgtactcgccatgacgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttctcgaattgagtgc 18955591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 157 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 22863286 - 22863052
Alignment:
Q  157 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgat 256  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||    | || ||| ||||  ||| | |||    
T  22863286 tggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtgcttttgaggaatttgagacctgagtcgtttgattggat 22863187  T
Q  257 tagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatatgtgaagttgttatgagatg-ttagtgctgaatatgatgtgatata 355  Q
    |||  ||||| | || |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||  || ||||||| |||  ||| ||| | |||| |   ||| ||||||| ||    
T  22863186 taggaatggaactttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctgtattgaaatgctaagtgtt---tataatgtgattta 22863090  T
Q  356 atgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgatt 393  Q
     || || ||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  22863089 ttgattgattgcattacttgaattattattgaatgatt 22863052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 157 - 211
Target Start/End: Original strand, 25135438 - 25135492
Alignment:
Q  157 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaa 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25135438 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaa 25135492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 157 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 8244201 - 8244140
Alignment:
Q  157 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 218  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8244201 tggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 8244140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 157 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 11567203 - 11567142
Alignment:
Q  157 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 218  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11567203 tggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 11567142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 157 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 19870931 - 19870870
Alignment:
Q  157 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 218  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19870931 tggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 19870870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 157 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 23395409 - 23395348
Alignment:
Q  157 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 218  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23395409 tggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 23395348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 573 - 636
Target Start/End: Original strand, 27553749 - 27553812
Alignment:
Q  573 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacgaa 636  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  27553749 gagtccatgcattagcatacttttgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcaccacgaa 27553812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 573 - 636
Target Start/End: Original strand, 27567787 - 27567850
Alignment:
Q  573 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacgaa 636  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  27567787 gagtccatgcattagcatacttttgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcaccacgaa 27567850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 144 - 218
Target Start/End: Original strand, 9482046 - 9482120
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 218  Q
    ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9482046 ttagttgggaacctggcttgtacttgccatgacgagcatatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 9482120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 454 - 634
Target Start/End: Original strand, 20361016 - 20361198
Alignment:
Q  454 cctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatg- 552  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||| || |||||| ||    ||||||||||||||| ||||  ||| | ||     
T  20361016 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgatgaaaatgatgatgt---tccaaattattggattaatataagaggttgt 20361112  T
Q  553 ---attgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
       |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  20361113 cgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttatactcaacacg 20361198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 157 - 218
Target Start/End: Original strand, 12618610 - 12618671
Alignment:
Q  157 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 218  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12618610 tggcttgtactcgccacggtgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 12618671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 451 - 634
Target Start/End: Original strand, 17287849 - 17288033
Alignment:
Q  451 ctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgga-taaataaga-gat 548  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||    |||||||||||||| || |||||| | |    
T  17287849 ctacctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg---ttccaaattattggattatataagaggtt 17287945  T
Q  549 gatg-attgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
    |  | |||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||    |||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  17287946 gccgaattaagatgcttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgtgggcttgatgccctgaagctttgtactcaacacg 17288033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 522 - 624
Target Start/End: Original strand, 22408417 - 22408517
Alignment:
Q  522 ctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatgtttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagct 620  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||||| |    ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22408417 ctccaaattattggatgtatatgagatgattaa---gatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgtcctggagct 22408513  T
Q  621 ttgt 624  Q
    ||||    
T  22408514 ttgt 22408517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 157 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 23990261 - 23990200
Alignment:
Q  157 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 218  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23990261 tggcttgtactcgccacgacgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 23990200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 134 - 218
Target Start/End: Original strand, 18917009 - 18917093
Alignment:
Q  134 tagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 218  Q
    ||||||| | |||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  18917009 tagaacaaccttagttggaaatttggcttgtactcgccacggcgagcagatgttctcgcctcgcgagcacttctagaattgagtg 18917093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 558 - 635
Target Start/End: Original strand, 4738710 - 4738788
Alignment:
Q  558 gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctca-tgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||| |||||    
T  4738710 gatgtctaagaggtcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggcttactgctccggagctttgtactcaccacga 4738788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 466 - 634
Target Start/End: Original strand, 20638351 - 20638521
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatg----attgtgatg 561  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||| ||    ||||||||||||||| ||||  ||| | ||    |||  ||||    
T  20638351 ttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt---tccaaattattggattaatataagaggttgttgaattaagatg 20638447  T
Q  562 tttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||| | | |||||||||||||||||||| ||||    
T  20638448 tttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgacgccctggagctttgtactcaccacg 20638521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 558 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 22805709 - 22805632
Alignment:
Q  558 gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  22805709 gatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacg 22805632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 12 - 72
Target Start/End: Original strand, 20803182 - 20803242
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 72  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  20803182 cagagagcatgttgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 20803242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 466 - 635
Target Start/End: Original strand, 19303608 - 19303778
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataa-ataagagatgat-gattgt-gatgt 562  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||| ||    ||||||||||||||| | ||||||| |  | ||||   |||||    
T  19303608 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaagatgatgatgt---tccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgt 19303704  T
Q  563 ttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||    ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  19303705 ttaagaggtcgagtccatgcattagtatttcattgttgggggcttgatgccctggagccttgtactcaacacga 19303778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 466 - 634
Target Start/End: Original strand, 22780295 - 22780464
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataa-ataagagatgatg--attgtgatgt 562  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||| ||    ||||||||||||||| | ||||||| |  |   |||  |||||    
T  22780295 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt---tccaaattattggattatataagaggtagtcgaattaagatgt 22780391  T
Q  563 ttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||| | || || |||||||||||||||||||||    
T  22780392 ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgataccttggagctttgtactcaacacg 22780464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 466 - 635
Target Start/End: Original strand, 25629423 - 25629593
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataa-ataagagatgat-gattgt-gatgt 562  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||    ||||||||||||||| | ||||||  |  | ||||   |||||    
T  25629423 ttgtaatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt---tccaaattattggattatataagaagttttcgatttaagatgt 25629519  T
Q  563 ttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  25629520 ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagccttgtactcaacacga 25629593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 465 - 634
Target Start/End: Original strand, 28496538 - 28496709
Alignment:
Q  465 attgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataa-ataagagatgatg--attgtgatg 561  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||   | ||||||||| ||    ||||||||||||||| | ||||||| |  |   |||  ||||    
T  28496538 attgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatgatgtt--tccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatg 28496635  T
Q  562 tttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  28496636 tttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttggaggcttgatgccctggagctttgtactcaacacg 28496709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 465 - 634
Target Start/End: Original strand, 29808949 - 29809120
Alignment:
Q  465 attgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataa-ataagagatgatg--attgtgatg 561  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||   | ||||||||| ||    ||||||||||||||| | ||||||| |  |   |||  ||||    
T  29808949 attgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatgatgtt--tccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatg 29809046  T
Q  562 tttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  29809047 tttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttggaggcttgatgccctggagctttgtactcaacacg 29809120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 558 - 635
Target Start/End: Original strand, 4185974 - 4186052
Alignment:
Q  558 gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctca-tgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| | || |||||||||||| |||||    
T  4185974 gatgtttaagaggtcgagtccatgcattatcatacatttgttgggggcttactgctccggggctttgtactcaccacga 4186052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 558 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 4186335 - 4186257
Alignment:
Q  558 gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctca-tgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||| |||||    
T  4186335 gatgtttaagaggtcgaggtcatgcattagcatacatttgttgggggcttactgctccggagctttgtactcaccacga 4186257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 455 - 604
Target Start/End: Original strand, 16929646 - 16929798
Alignment:
Q  455 ctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacct---ccaaattattggataaataagagatgat 551  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| || || ||||  ||| |||| | ||||||   |   |||||||||| || |||||  |||||||    
T  16929646 ctatgctgctactgttaattaaccaagttgcatgagtcagtttaagatgattaagacgttgttgatgatgttccaaattattagacaaatataagatgat 16929745  T
Q  552 gattgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttggggg 604  Q
     |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||    
T  16929746 aattgagatgttaaagagatcgagtccatgcattagcattcatatgatggggg 16929798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 438 - 512
Target Start/End: Original strand, 19848035 - 19848109
Alignment:
Q  438 ctgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatg 512  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||| ||| ||||||    
T  19848035 ctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 19848109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 558 - 635
Target Start/End: Original strand, 31155550 - 31155628
Alignment:
Q  558 gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctca-tgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| | ||||||||||||||| |||||    
T  31155550 gatgtttaagatgtcgagtccatgcattagcatacatatgttgggggcttactgctccggagctttgtactcaccacga 31155628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 558 - 634
Target Start/End: Original strand, 19773883 - 19773960
Alignment:
Q  558 gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  19773883 gatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacg 19773960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 25754864 - 25754721
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgga-taaataagagatgatga-ttgtg 558  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||   ||||  |||||||||||||| || | ||||| ||  || ||  |    
T  25754864 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga---tgaagttccaaattattggattatacaagagttgtcgatttaag 25754768  T
Q  559 atgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggct 606  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  25754767 atgtttaagaagtcgagtccatgcattagcattc-tttgttgggggct 25754721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 32 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 1561786 - 1561742
Alignment:
Q  32 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1561786 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 1561742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 32 - 76
Target Start/End: Original strand, 16920282 - 16920326
Alignment:
Q  32 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16920282 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 16920326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 573 - 636
Target Start/End: Original strand, 19790956 - 19791017
Alignment:
Q  573 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacgaa 636  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  19790956 gagttcatgcattagcatac--ttgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcaccacgaa 19791017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 454 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 20076765 - 20076583
Alignment:
Q  454 cctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgga-taaataagagatgatg 552  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||    |||||||||||||| || ||||||| |  |     
T  20076765 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg---ttccaaattattggattatataagaggttgtt 20076669  T
Q  553 attgt--gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
     || |  |||||||||||  | ||||||||||||||||||    ||||||||||| | |||||||||||| || | ||||||||||    
T  20076668 gttctaagatgtttaagattttgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagccttatgctcaacacga 20076583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 87
Target Start/End: Original strand, 18821472 - 18821523
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgttta 87  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||    
T  18821472 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgttta 18821523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 573 - 624
Target Start/End: Original strand, 23657588 - 23657638
Alignment:
Q  573 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgt 624  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23657588 gagtccatgcattagcatacctt-gttgggggctcatgccctggagctttgt 23657638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 25928635 - 25928584
Alignment:
Q  159 gcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25928635 gcttgaactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccaga 25928584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 438 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 23992508 - 23992434
Alignment:
Q  438 ctgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatg 512  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| || |||||||| ||| ||||||    
T  23992508 ctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttagctaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 23992434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 562 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 1561258 - 1561186
Alignment:
Q  562 tttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  1561258 tttaagaggtcgaatccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacg 1561186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 461 - 606
Target Start/End: Original strand, 3852124 - 3852267
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgga-taaataagagatgatga-ttgtg 558  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||   ||||  |||||||||||||| || | ||||| ||  || ||  |    
T  3852124 tgctgttgttattaaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga---tgaagttccaaattattggattatacaagagttgtcgatttaag 3852220  T
Q  559 atgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggct 606  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  3852221 atgtttaagaagtcgagtccatgcattagcattc-tttgttgggggct 3852267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 342 - 633
Target Start/End: Original strand, 18409777 - 18410067
Alignment:
Q  342 tatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttttatttgatatcgttatatgatgttatactgt 441  Q
    |||||||||||||||||||  || | |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |   ||  |||||||||     ||| |||| ||  |||    
T  18409777 tatgatgtgatataatgttatat-gtattatttgaattatgaatggatgattgagatgttgttgacttgcatttgatat-----tattatgtcatgttgt 18409870  T
Q  442 tgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttga-acctccaaattattgga-taa 539  Q
    | | |||  || ||| || |||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||    |||||||||||||| ||     
T  18409871 tttcgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgatgtttccaaattattggattat 18409970  T
Q  540 ataagagatgat--gattgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacac 633  Q
    ||||||| |  |   |||  |||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||    
T  18409971 ataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagttcatgcattatcatttcattgttgggggcttgatgccctggagccttgtactccacac 18410067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 22831974 - 22831933
Alignment:
Q  32 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtg 73  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22831974 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtg 22831933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 562 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 35245541 - 35245469
Alignment:
Q  562 tttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  35245541 tttaagaggtcgagtctatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacg 35245469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 1645181 - 1645117
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||    
T  1645181 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttatatgcctttgagtacct 1645117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 72
Target Start/End: Original strand, 9481923 - 9481983
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 72  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||    
T  9481923 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgagttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 9481983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 149 - 201
Target Start/End: Original strand, 18821575 - 18821627
Alignment:
Q  149 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagc 201  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18821575 tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagc 18821627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 20594252 - 20594204
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgt 84  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20594252 tttttacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctaaacatgt 20594204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Original strand, 20637936 - 20637976
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20637936 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 20637976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 455 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 25656690 - 25656630
Alignment:
Q  455 ctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  25656690 ctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 25656630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 165 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 21939734 - 21939695
Alignment:
Q  165 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcact 204  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21939734 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcact 21939695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 151 - 277
Target Start/End: Original strand, 25603143 - 25603269
Alignment:
Q  151 ggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca-agtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatg 249  Q
    |||||||| |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||   || ||||| |||||||  |||||||    |||||||||||||||||    
T  25603143 ggattctgacttgaactcaccatggcgagcagaggctctcgcctcgtgagctagtctagaacagagtgcattgtgagga-cttgcgatctgtgtcgcatg 25603241  T
Q  250 aattgattagagatggacccttgggtag 277  Q
    | ||| |||||| || ||| ||||||||    
T  25603242 agttgcttagagttgaacctttgggtag 25603269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Original strand, 2291287 - 2291341
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  2291287 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 2291341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 8055084 - 8055030
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  8055084 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 8055030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 12742372 - 12742318
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  12742372 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 12742318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 456 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 17804253 - 17804113
Alignment:
Q  456 tatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagat--gatga 553  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| || |  ||||   || || |||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||  |||||    
T  17804253 tatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaaaatgatgatgaac-tccaaattattggatgtataagagatttgatga 17804155  T
Q  554 ttgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatt 595  Q
    ||  |||||||    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  17804154 ttaagatgttttgttgatagagtccatgcattagcatacatt 17804113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Original strand, 18334699 - 18334753
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  18334699 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 18334753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 19005101 - 19005047
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  19005101 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 19005047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Original strand, 19859026 - 19859080
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  19859026 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 19859080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 22782282 - 22782228
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  22782282 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 22782228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 24422602 - 24422548
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  24422602 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 24422548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 25714475 - 25714421
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  25714475 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 25714421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Original strand, 26924747 - 26924801
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  26924747 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 26924801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 33861849 - 33861795
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  33861849 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 33861795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 33864333 - 33864279
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  33864333 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 33864279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 210
Target Start/End: Original strand, 34369742 - 34369792
Alignment:
Q  160 cttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    |||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||||    
T  34369742 cttgtactcgccatggcgagtatgtactctcgcctcgcgagcacttccaga 34369792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #116
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 27 - 76
Target Start/End: Original strand, 4667846 - 4667895
Alignment:
Q  27 attctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  4667846 attctgtgtttttgacttttgagatgacccttagatgcttttgagtgcct 4667895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #117
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 27 - 76
Target Start/End: Original strand, 4674693 - 4674742
Alignment:
Q  27 attctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  4674693 attctgtgtttttgacttttgagatgacccttagatgcttttgagtgcct 4674742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #118
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 454 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 16496309 - 16496248
Alignment:
Q  454 cctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | | |||||||||    
T  16496309 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 16496248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #119
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 35 - 76
Target Start/End: Original strand, 20360612 - 20360653
Alignment:
Q  35 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20360612 tttttgacttttcagttgatccttagatgtttttgagtgcct 20360653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #120
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 466 - 515
Target Start/End: Original strand, 27333286 - 27333335
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  27333286 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 27333335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #121
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 466 - 515
Target Start/End: Original strand, 27394026 - 27394075
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  27394026 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 27394075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #122
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 148 - 205
Target Start/End: Original strand, 29808638 - 29808695
Alignment:
Q  148 ttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcactt 205  Q
    |||||| |||| | || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  29808638 ttgggaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtactt 29808695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #123
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 461 - 590
Target Start/End: Original strand, 30676817 - 30676952
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaaga---tgatgttgaacctccaaattattgga-taaataagagat-gatg-at 554  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||   ||||| |||   |||||||||||||| ||  |||||| | | || ||    
T  30676817 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaagaggtcgttgaat 30676916  T
Q  555 tgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcat 590  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30676917 taagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcat 30676952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #124
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 27 - 76
Target Start/End: Original strand, 31155031 - 31155080
Alignment:
Q  27 attctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  31155031 attctgtttttttgacttttgagatgacccttagatgcttttgagtgcct 31155080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #125
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 12 - 72
Target Start/End: Original strand, 5616444 - 5616504
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 72  Q
    ||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  5616444 cagagagcaagttgttttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 5616504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #126
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 12 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 12707164 - 12707100
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||   |||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||    
T  12707164 cagagagcatgttattttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacct 12707100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #127
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Original strand, 15894072 - 15894112
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  15894072 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcct 15894112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #128
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 12 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 16741683 - 16741619
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||| |  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||    
T  16741683 cagagagcatgtcgttttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacct 16741619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #129
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Original strand, 17287438 - 17287478
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  17287438 ttttgacttttgagttgacccttagatgcttttgagtgcct 17287478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #130
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Original strand, 19303183 - 19303223
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  19303183 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 19303223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #131
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 19652674 - 19652634
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  19652674 ttttgacttttgagttgatccttaaatgtttttgagtgcct 19652634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #132
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 469 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 20593823 - 20593656
Alignment:
Q  469 ttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataa-ataagagatgat-gattgt-gatgttta 565  Q
    |||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||    ||||||||||||||| | ||||||| |  | ||||   ||||||||    
T  20593823 ttatttaactgagctgcatgattcggtctaagttgatgaagatgatgatgt---tccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgttta 20593727  T
Q  566 agagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||| | ||||||||||||||||||    ||| ||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  20593726 agaggttgagtccatgcattagcatttcattgctgggggcttgatgccctggagccttgtgctcaacacga 20593656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #133
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 12 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 21702763 - 21702703
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 72  Q
    ||||||||||||||| ||  |  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  21702763 cagagagcatgttgattttcgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 21702703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #134
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Original strand, 22779869 - 22779909
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  22779869 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 22779909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #135
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 558 - 629
Target Start/End: Original strand, 25603550 - 25603622
Alignment:
Q  558 gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactca 629  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||    |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  25603550 gatgtttaagaggtcgtgtccatgcattagcatttcattgttgagggcttgatgccctggagctttgtactca 25603622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #136
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Original strand, 25611365 - 25611405
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  25611365 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcct 25611405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #137
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 558 - 629
Target Start/End: Original strand, 25611888 - 25611960
Alignment:
Q  558 gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactca 629  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  25611888 gatgtttaagaggtcgtgtccatgcattaggatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactca 25611960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #138
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 342 - 402
Target Start/End: Original strand, 25629305 - 25629364
Alignment:
Q  342 tatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttg 402  Q
    |||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  25629305 tatgatgtgatataatgttatac-gcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttg 25629364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #139
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 25644801 - 25644761
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25644801 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 25644761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #140
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 165 - 205
Target Start/End: Original strand, 28496244 - 28496284
Alignment:
Q  165 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcactt 205  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  28496244 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtactt 28496284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #141
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 12 - 68
Target Start/End: Original strand, 29096123 - 29096179
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgttttt 68  Q
    |||||||| ||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  29096123 cagagagcttgtcgaattttgtaattttgacttctgagttgaaccttagatgctttt 29096179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #142
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 456 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 1595609 - 1595550
Alignment:
Q  456 tatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||    
T  1595609 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 1595550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #143
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 74
Target Start/End: Original strand, 4185456 - 4185503
Alignment:
Q  27 attctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgc 74  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  4185456 attctgtgtttttgacttttgagatgacccttagatgcttttgagtgc 4185503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #144
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 16372193 - 16372146
Alignment:
Q  163 gtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||    
T  16372193 gtactcgccatggcgagtaggaactctcgcctcgcgagcacttccaga 16372146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #145
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 91
Target Start/End: Original strand, 18409469 - 18409524
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaa 91  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||| ||||||    
T  18409469 ttttgacctttgagttgatccttagatgcttttgagtgccttaacatgtctattaa 18409524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #146
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 18457193 - 18457142
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgttta 87  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||    
T  18457193 ttttaacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgttta 18457142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #147
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 200
Target Start/End: Original strand, 20360716 - 20360767
Alignment:
Q  149 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 200  Q
    |||||||||| | || |||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  20360716 tgggattctgacctgaactcgccatggcgagctgaggctctcgcctcgcgag 20360767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #148
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22331774 - 22331727
Alignment:
Q  163 gtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||    
T  22331774 gtactcgccatggcgagtaggaactctcgcctcgcgagcacttccaga 22331727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #149
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 76
Target Start/End: Original strand, 22334525 - 22334564
Alignment:
Q  37 tttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  22334525 tttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcct 22334564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #150
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22759213 - 22759139
Alignment:
Q  135 agaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    ||||||||||||||| || || || || ||||| ||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||    
T  22759213 agaacagctttagtttggttt-tgtctggtacttgccatggcgagtaggaactctcgcctcgcgagcacttccaga 22759139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #151
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 277
Target Start/End: Original strand, 25611481 - 25611607
Alignment:
Q  151 ggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca-agtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatg 249  Q
    |||||||| | || ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||   || ||||| |||||||  |||||||    |||||||||||||||||    
T  25611481 ggattctgacctgaactcgccatggagagcagaggctctcgcctcgcgagctagtctagaacagagtgcattgtgagga-cttgcgatctgtgtcgcatg 25611579  T
Q  250 aattgattagagatggacccttgggtag 277  Q
    | ||  |||||| || ||| ||||||||    
T  25611580 agttacttagagttgaacctttgggtag 25611607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #152
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 456 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 25688562 - 25688428
Alignment:
Q  456 tatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataa-ataagagatgat-ga 553  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||| |||  |    ||||||||||||||| | ||||||| | || ||    
T  25688562 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagataatgaggt---tccaaattattggattatataagaggttatcga 25688466  T
Q  554 ttgt-gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcat 590  Q
    ||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25688465 tttacgatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcat 25688428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #153
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 162 - 201
Target Start/End: Original strand, 31155166 - 31155205
Alignment:
Q  162 tgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagc 201  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31155166 tgtactctccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagc 31155205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #154
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Original strand, 1541018 - 1541072
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||    
T  1541018 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatg 1541072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #155
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Original strand, 20556999 - 20557053
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||||    
T  20556999 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatg 20557053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #156
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 560 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 22831461 - 22831392
Alignment:
Q  560 tgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtactca 629  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  22831461 tgtttaagaggtcgagtccatacattagcattcata-gttgggggcttgattccctggagctttgtactca 22831392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #157
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 162 - 200
Target Start/End: Original strand, 25629123 - 25629161
Alignment:
Q  162 tgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 200  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25629123 tgtactcgccgtggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 25629161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #158
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 163 - 209
Target Start/End: Original strand, 34298395 - 34298441
Alignment:
Q  163 gtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccag 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  34298395 gtactcgccatggcgagtagataatctcgcctcgcaagcacttccag 34298441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #159
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 72
Target Start/End: Original strand, 1587384 - 1587421
Alignment:
Q  35 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  1587384 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 1587421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #160
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 72
Target Start/End: Original strand, 2684994 - 2685031
Alignment:
Q  35 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  2684994 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 2685031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #161
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 4189444 - 4189395
Alignment:
Q  27 attctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  4189444 attctgtgttttttacttttgagatgacccttagatgcttttgagtgcct 4189395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #162
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 12496761 - 12496720
Alignment:
Q  35 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||    
T  12496761 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcatttgagtacct 12496720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #163
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 19663221 - 19663180
Alignment:
Q  35 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||    
T  19663221 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacct 19663180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #164
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 61
Target Start/End: Original strand, 25135302 - 25135351
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttaga 61  Q
    ||||||||||||||| ||  |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  25135302 cagagagcatgttgattttcgagtttttgacttttgagttgaaccttaga 25135351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #165
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 34963428 - 34963293
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatg---atgttgaacctccaaattattgga-taaataagagat-gatga-t 554  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||   ||| |||   |||||||||||||| ||  |||||| | | ||| |    
T  34963428 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaagaggtcgttgaat 34963329  T
Q  555 tgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcat 590  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34963328 taagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcat 34963293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #166
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Original strand, 4185594 - 4185630
Alignment:
Q  165 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagc 201  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  4185594 actcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagc 4185630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #167
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Original strand, 4667984 - 4668020
Alignment:
Q  165 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagc 201  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  4667984 actcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagc 4668020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #168
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 562 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 11185469 - 11185402
Alignment:
Q  562 tttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactca 629  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||| | ||||||||||  ||||||||||    
T  11185469 tttaagaggtcgagtccatgcattagcattca-tagttgggggcttgatgccctggatttttgtactca 11185402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #169
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 32 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 11185974 - 11185930
Alignment:
Q  32 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  11185974 gtatatttgatttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcct 11185930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #170
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 558 - 590
Target Start/End: Original strand, 16448728 - 16448760
Alignment:
Q  558 gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcat 590  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16448728 gatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcat 16448760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #171
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 313 - 399
Target Start/End: Original strand, 18821766 - 18821851
Alignment:
Q  313 tgaagttgttatgagatgttagtgctgaat-atgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatg 399  Q
    ||||| ||||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||| ||   |||||||||||| | | ||||||| |||||||||    
T  18821766 tgaagctgttatgagatgttaatgttgatttatgatgtgatataatgtata--cgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatg 18821851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #172
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 342 - 402
Target Start/End: Original strand, 19303491 - 19303550
Alignment:
Q  342 tatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttg 402  Q
    ||||||||||||||||||| |  | ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  19303491 tatgatgtgatataatgtt-atgtacattacttgaaatatgaatgtataattgagatgttg 19303550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #173
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 558 - 590
Target Start/End: Original strand, 19848161 - 19848193
Alignment:
Q  558 gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcat 590  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19848161 gatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcat 19848193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #174
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 21939862 - 21939822
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  21939862 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcccttgagtgcct 21939822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #175
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Original strand, 22080508 - 22080544
Alignment:
Q  165 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagc 201  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  22080508 actcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagc 22080544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #176
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 558 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 22782185 - 22782153
Alignment:
Q  558 gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcat 590  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22782185 gatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcat 22782153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #177
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 558 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 23992382 - 23992350
Alignment:
Q  558 gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcat 590  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23992382 gatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcat 23992350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #178
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Original strand, 25956263 - 25956303
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  25956263 ttttgacttttaagttgaatcttagatatttttgagtgcct 25956303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #179
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Original strand, 28496115 - 28496155
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  28496115 ttttaacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 28496155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #180
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 40 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 29061015 - 29060979
Alignment:
Q  40 gacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  29061015 gacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 29060979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #181
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Original strand, 29808525 - 29808565
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  29808525 ttttaacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 29808565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 438; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 438; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 31 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 20464 - 19860
Alignment:
Q  31 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttagaataagattgaacctggttt 129  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20464 tgtagttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctggagatgcctattaaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttt 20365  T
Q  130 agcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggat 229  Q
    | | ||||||| | || ||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20364 aacctagaacaacctttgttgggaatctgagttgtactcgtcatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggat 20265  T
Q  230 agcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatatgtgaagttgttatgagat 329  Q
    |  |  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  20264 aatgtaatctgtgtcgcatgatttgattagggatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaacctgtgaagctgttatgagat 20165  T
Q  330 gttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttttatttgatatcgttatatg 429  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  20164 gttagtgttgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgatgcttg-ttttatttgatattgttatatg 20066  T
Q  430 atgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaat 529  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  20065 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctactattgttatttaatcaagctgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatgttgaacctccaaat 19966  T
Q  530 tattggataaataagagatgatgattgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactca 629  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19965 tattggataaataagagataatgattatgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagttttgtactca 19866  T
Q  630 acacga 635  Q
    ||||||    
T  19865 acacga 19860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 429; Significance: 0; HSPs: 134)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 429; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 635
Target Start/End: Original strand, 22740579 - 22741201
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    ||||||||||||   ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  22740579 cagagagcatgtaagattatgtagtttggacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgtatattaaagattaaatgataacttaga 22740678  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    |  ||||||||||| ||||| | ||||||| | || ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22740679 acgagattgaacctagtttaacatagaacaacctttgttgggaatctggcttgaactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 22740778  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22740779 actgagtgcaagtgaggatattgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatc 22740878  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttt 410  Q
    | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  22740879 tttgaagttgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattacttgaattatgaatgaatgattaagatgttg-ttgtttt 22740977  T
Q  411 tatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaaga 510  Q
    || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| | ||||  ||||||||    
T  22740978 ta-ttgatatcgttatgtgatgtcatactgttgttgtaatctgtctatgctgctattgttatttaacctagttgcatgagtcgatataagatgatcaaga 22741076  T
Q  511 tgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatg 610  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22741077 tgatgttgaacttccaaattattggataaataagagatgatgattaagatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatg 22741176  T
Q  611 ccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  22741177 ccctggagctttgtactcaacacga 22741201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 397; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 635
Target Start/End: Original strand, 22758334 - 22758956
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    ||||||||||||   ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  22758334 cagagagcatgtaagattatgtagtttggacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgtatattaaagattacatgataacttaga 22758433  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    | ||| || ||||| ||||| | ||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  22758434 acaagcttcaacctagtttaacctagaacaacctttgttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgtgagcactttcaga 22758533  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  22758534 actgagtgcaagtgaggatattgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaaattaactgcaatc 22758633  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttt 410  Q
    | ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22758634 tatgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgc-tgtttt 22758732  T
Q  411 tatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaaga 510  Q
    || || |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | || ||||||| ||| | ||||  ||||||||    
T  22758733 ta-ttaatattgttatgtgatgtcatactgttgttgtaatctgtctatgctgctattgttatttaaactagttgcatgagtcgatataagatgatcaaga 22758831  T
Q  511 tgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatg 610  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22758832 tgatgttgaacatccaaattattggataaataagagatgatgattaagatgtataagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatg 22758931  T
Q  611 ccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  22758932 ccctagagctttgtactcaacacga 22758956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 635
Target Start/End: Original strand, 22798745 - 22799364
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||| |||||||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  22798745 cagaaagcatgtctaattctatacttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattagatgataacttaga 22798844  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22798845 acgagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 22798944  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    ||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  22798945 actaagtgcaagttaggatattgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagaagttaactgcaatt 22799044  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttt 410  Q
    ||||||| |||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||| |  ||| | ||||||||| |||||||| |    |     
T  22799045 tgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataatg-ttatgtgccttacttaagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatg 22799143  T
Q  411 tatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaaga 510  Q
     | |||||||     ||||| || ||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||  | ||||  ||  ||||    
T  22799144 aaattgatat-----tatgaagtcatgatgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgaataaga 22799238  T
Q  511 tgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatg-tttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcat 609  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22799239 tgatgttgaatctccaaattattggatacataagagatgatgattaagatgttttaagagaccgagtccatgcattagcatacatatgttgggggctcat 22799338  T
Q  610 gccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    
T  22799339 gccctggagcttagtactcaacacga 22799364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 36 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 23038511 - 23038048
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttagaataagattgaacctggtttagctt 134  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |    
T  23038511 ttttgacttttgagatgaaccttagatgttgttgagtgcctgaagatgcttattaaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggtttaagct 23038412  T
Q  135 agaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatagcgc 234  Q
    |||||| |  | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||    
T  23038411 agaacaaccattgttgggaatctggcttgtacccgccatggcgagcagatgctctcgcctcgtgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaattgc 23038312  T
Q  235 gatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatatgtgaagttgttatgagatgttag 334  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  23038311 gatctgtgtcgcatgatttgattagagatggacccttgggtagtattgagacctatataagaagttatctgcaatctgtgaagctcttatgagatgttag 23038212  T
Q  335 tgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttttatttgatatcgttatatgatgtt 434  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23038211 tgttaaatatgatgtgatataatgtttaattgaattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttttatttgatatcgttatatgatgtc 23038112  T
Q  435 atactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtcta 498  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  23038111 atactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtccgtcta 23038048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 12 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 24674076 - 24673447
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  24674076 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttaagtgccttaagatgtttattgaagattaaatgataacctaga 24673977  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24673976 atgagattgaacctggtttagcttagaacaacattagttgggaatctggcttgtaatcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaca 24673877  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    ||||| ||||||| |||||   |||||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||  ||||||||| |||||||||| || ||||| ||| ||     
T  24673876 actgaatgcaagttaggatgttgcgatctgtgtcgcataaattgattagggttggactcttaagtagtaatgtgacctatataggatgttaattgcgatc 24673777  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaa----ttatgaatgaatgattgagatgttgcttg 406  Q
    ||||||| | |||||| ||||||  ||||| |||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||    | ||||||||||||||||| || | ||||    
T  24673776 tgtgaagctattatgaaatgtta-agctgattatactgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatgttaatgaatgaatgattgagttgatacttg 24673678  T
Q  407 tttttatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatc 506  Q
     || ||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||| |||| | | |||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||  |||  |||     
T  24673677 cttctatttgatatctttatatgatgtcataatgttattgtgatctgcttgtgctgctattgttatttaaccatgttgcatgagtctgtacaagatgatt 24673578  T
Q  507 aagatgatgttgaacctccaaattattgg--ataaataagagatgatgattgtgatg-tttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggg 603  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24673577 aagatgatgttgaa-ctccaaattattggatatatatatgagatgatgattaagatgttttaagagattgagtccatgcattagcatacatttgttgggg 24673479  T
Q  604 gctcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24673478 gctcatgccctggagctttgtactcaccacga 24673447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 15 - 635
Target Start/End: Original strand, 23019328 - 23019944
Alignment:
Q  15 agagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttagaata 113  Q
    ||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |     
T  23019328 agagcttgtagatttctgtatgtttgacttttgagttgaaccttcgatgtgtttgagtgcctaaagatgtttattaaagattagatgatgacttagagtg 23019427  T
Q  114 agattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaact 213  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23019428 agattgaacctggtctaggttagaacaactttagttgggaatctggcttgtacttgccatggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaact 23019527  T
Q  214 gagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatatgt 313  Q
    |||||||||| ||||||  |||||||||||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||    
T  23019528 gagtgcaagtcaggatattgcgatctgtgtcgcataatttaattagagttggacccttgggtagtaatgtgacctatataagaagttatttgcaatttgt 23019627  T
Q  314 gaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttttat 413  Q
    |||| | |||||| |||||| || ||||||||||||||||||| | |||  |||||||||| |  ||| | ||||||||| |||||||| |    |  |     
T  23019628 gaagcttttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataacg-ttatgtgcattacttaagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaa 23019726  T
Q  414 ttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatga 513  Q
    |||||||     ||||| || ||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |  |||| ||  | ||||  ||| |||||||    
T  23019727 ttgatat-----tatgaagtcatgttgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttttatgagtcaatataagatgattaagatga 23019821  T
Q  514 tgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatg-tttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgcc 612  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23019822 tgtcgaacctccaaattattggatatataagagatgatgattaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcatacatatgttgggggctcatgcc 23019921  T
Q  613 ctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  23019922 ctggagcttagtactcaacacga 23019944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 12 - 377
Target Start/End: Original strand, 40621827 - 40622191
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  40621827 cagagagcatgttgaattctatatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgtctaaggatgcatattaaagattaaatgataacttaga 40621926  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    |  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40621927 acgagattgaacctggtatagcttagaacaactttagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 40622026  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  40622027 actgagtgcaagtgaggatattgcgatctgtttcgcatattttgtttagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatc 40622126  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaa 377  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||  |||||||||||  |||||||||||||    
T  40622127 tgtgaagctgttatgagatgtttgtgttgattatgatgtattataatgttta--tgcattacttgaa 40622191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 12 - 635
Target Start/End: Original strand, 25963336 - 25963952
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| | |||||    
T  25963336 cagagagcatgttgaattctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgatttaga 25963435  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25963436 atgagattgaacctggtttagcttagaacaacttaagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 25963535  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    | ||| ||||||| || ||   ||||||||| || ||| | |||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||| || |||     
T  25963536 attgaatgcaagttagtatgttgcgatctgtttctcataagttgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaattgaaatc 25963635  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttt 410  Q
    ||||||| |||| |||  || ||  | ||  | | ||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||| | ||||||||  |||||||| |||   |    
T  25963636 tgtgaagctgtt-tgaactgcta-agttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg-ttgaaat 25963732  T
Q  411 tatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaaga 510  Q
     | |||||||     |||||  |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||  | ||||  ||  ||||    
T  25963733 gaattgatat-----tatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttattgaactaagttgcatgagtcattataagatgaataaga 25963827  T
Q  511 tgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatgtttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcat 609  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||  ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25963828 tgatgttgaa-ctccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcat 25963926  T
Q  610 gccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  25963927 gccctggagctttgtactcaccacga 25963952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 12 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 37525164 - 37524570
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| | |||||    
T  37525164 cagagagcatgttgaattctgtaattttgacttttgagttaaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgatttaga 37525065  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37525064 acgagattgaacctggtttagcttagaacaacttaagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 37524965  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    ||||| ||||||| || ||   ||||||||| || ||| | |||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||| || | |     
T  37524964 actgaatgcaagttagtatgttgcgatctgtttcacataagttgattaaggttggacccttaggtagtaatgtgacctat-taagatgttaattgaagtc 37524866  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttt 410  Q
    ||||||| || |||||  |||||| ||||| ||| ||||||       ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||  |||||||  |||   |    
T  37524865 tgtgaagctgctatgaactgttag-gctgattataatgtga-------tttaattgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgtt-attgaaat 37524775  T
Q  411 tatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaaga 510  Q
     | ||| | |     ||||| |||| | ||||| ||| ||||   ||||||||| |||||||||||||||| |||||||    |||||       |||||    
T  37524774 gaattgttgt-----tatgaagttacaatgttgatgtgatctgattatgctgcttttgttatttaaccaagttgcatga----gtcta-----tacaaga 37524689  T
Q  511 tgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatgtttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcat 609  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||  ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37524688 tgatgttgaa-ctccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcat 37524590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 12 - 315
Target Start/End: Original strand, 45677774 - 45678078
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  45677774 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgattattaaagattagatgatgacttaga 45677873  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45677874 gtgagattgaacctggtttagcttagaacaactttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgtgagcacttccaga 45677973  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    ||||||||||| |||| ||   | |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||     
T  45677974 actgagtgcaattgagaatgttgtgatctgtgtcgcatgagttgattagggatggactcttaggtagtaatgtgacctatataggatgttaattgcaatc 45678073  T
Q  311 tgtga 315  Q
    |||||    
T  45678074 tgtga 45678078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 12 - 365
Target Start/End: Original strand, 21917935 - 21918288
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  21917935 cagagagcatgttgaattctgtaattttgacttttgagtttaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttaga 21918034  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    |  ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21918035 actagattgaacctggtttagctttgaacaaccttagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 21918134  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    ||||| ||||||| |||||   ||||||||| |||||| |||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||     
T  21918135 actgaatgcaagttaggatgttgcgatctgtttcgcataaattgattatggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatc 21918234  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaatt 365  Q
    ||||||| || |||||  |||||  ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||    
T  21918235 tgtgaagctgctatgaactgtta-agctgattataatgtgatttaatgattaatt 21918288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 12 - 629
Target Start/End: Original strand, 22811553 - 22812143
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| | |||||    
T  22811553 cagagagcatgttaaattttgtaattttgacttttgagttgaaccttaggtgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgatttaga 22811652  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||                      ||||||||||||||||||    
T  22811653 acgagattgaacctggtttagcttagaacaaccttagttgggattctggcttgtactcgc----------------------ctcgcgagcacttccaga 22811730  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    ||||||||||||| |||||   ||||||||| |  ||| |||||||||| | |||||| || |||||||||| ||||||| ||||| ||||| || |||     
T  22811731 actgagtgcaagttaggatgttgcgatctgt-tttcataaattgattagtgttggacctttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaagtgaaatc 22811829  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatg-tttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgttt 409  Q
    ||||||| || |||||  | |||  | ||| ||| ||||||| ||||| || ||||||||||| |||| ||| | ||||||||  |||||||| |||       
T  22811830 tgtgaagctgctatgaactatta-agttgattataatgtgatttaatgattaaattgcattacctgaagtattattgaatgatcaagatgttg-ttgaaa 22811927  T
Q  410 ttatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaag 509  Q
    | | |||||||      |||| |||||| ||||||||| || |   |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||  |  |||  ||| |||    
T  22811928 tgaattgatat-----gatgaagttataatgttgttgtgatttgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaag 22812022  T
Q  510 atgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatg-tttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc 607  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||  ||| ||||||||||||  |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22812023 atgatgttgaa-cgccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc 22812121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 36 - 250
Target Start/End: Original strand, 23100873 - 23101088
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttagaataagattgaacctggtttagctt 134  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |    
T  23100873 ttttgacttttgagttgaacctcagatgtttttaagtgcctgaagatgcttattaaaaattaaatgataacttagaatgagattgaacctggtttaacct 23100972  T
Q  135 agaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatagcgc 234  Q
    |||||| |    ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||    
T  23100973 agaacaaccactgttgggaatctagcttgtaatcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaaaactgagtgcaagtgaggataatgc 23101072  T
Q  235 gatctgtgtcgcatga 250  Q
    ||||| ||||||||||    
T  23101073 gatctatgtcgcatga 23101088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 439 - 629
Target Start/End: Original strand, 40622251 - 40622442
Alignment:
Q  439 tgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggata 538  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| | ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40622251 tgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatgttgaacctccaaattattggata 40622350  T
Q  539 aataagagatgatgattgtgatg-tttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactca 629  Q
     ||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40622351 tatatgagatgatgattaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgtgggctcatgcccttgagctttgtactca 40622442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 252 - 402
Target Start/End: Original strand, 23103256 - 23103406
Alignment:
Q  252 ttgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatatgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtga 351  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  23103256 ttgattagagatggaccctttggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgagatgttagtgttggatttgatgtga 23103355  T
Q  352 tataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttg 402  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23103356 tataatgtttaattgcatgacttgaattatgaatgaatgattgagatgttg 23103406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 347 - 635
Target Start/End: Original strand, 45678074 - 45678366
Alignment:
Q  347 tgtgatataatgtttaattgcattacttgaatt----atgaatgaatgattgagatgttgcttgtttttatttgatatcgttatatgatgttatactgtt 442  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||| |    ||||||||||||||||| || | |||| || ||||||||| | ||||||||||| ||| ||||    
T  45678074 tgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatgttaatgaatgaatgattgagttgatacttgcttctatttgatacctttatatgatgtcataatgtt 45678173  T
Q  443 gttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaata 542  Q
    ||||| || | ||  |||||||||||||||||||| | | ||||||| ||  |  |||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | |||    
T  45678174 gttgtgatttgcccgtgctgctattgttatttaactatgttgcatgagtccatacaagatgattaagatgatgttgaac-tccaaattattggaaatata 45678272  T
Q  543 agagatgatgattgtgatgtttaag-agatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
     ||||||||||||  ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45678273 tgagatgatgattaagatgttttaggagattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacga 45678366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 46 - 226
Target Start/End: Original strand, 44369952 - 44370133
Alignment:
Q  46 tgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttagaataagattgaacctggtttagcttagaacagctt 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||| || || | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  44369952 tgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcatattaaagattagataatgatttagaacaagattgaacctggtttagcttagaacaacat 44370051  T
Q  145 tagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgag 226  Q
    ||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  44370052 taggttgaattctggcttgtacttgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcaagcacttctagaactgagtgcaattgag 44370133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 12 - 629
Target Start/End: Original strand, 21318265 - 21318869
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||| ||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||| | ||||| ||| | ||| |||||||    
T  21318265 cagagatcatgtcgaaatctgtatttttgaccttcgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgttcagtaaagattagaggatgacttaga 21318364  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    | ||||| ||||||||          |||| | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  21318365 acaagatggaacctgg----------aacaaccttagttcgaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgcactcgcctcgcgagcactcccaga 21318454  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    ||| |||| |  |||| ||  || || ||| || |  |||||||| |||  ||||| | ||  |||||| |||||| ||| ||||| ||||| || | ||    
T  21318455 actaagtgtatttgagaatgtcgtgacctgagttgattgaattgactaggaatggaactttaagtagtagtgagacatatttaagatgttaagtgaatta 21318554  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttt 410  Q
    ||||||| || |||||  | |||  ||||  ||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||   ||||| ||  |||||||| | |   |    
T  21318555 tgtgaagctgctatgaactatta-agctgtttatgatgtgatttattgattaattgcattacttgagatattgttgaataatcaagatgttg-tagaaat 21318652  T
Q  411 tatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaaga 510  Q
     | ||||||      ||||| ||||| ||| |||||| ||||   ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||  |  |||  ||   |||    
T  21318653 gaattgata----attatgaagttatgctgctgttgtgatctgattatgctgcttttgttatttaaccaagttgcatgagtctatacaagatgaatgaga 21318748  T
Q  511 tgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgat-tgtgatg-tttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc 607  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||  |||  |||||||||| |  |||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21318749 tgttgttgaa-ctccaaattattggatgtatataagatgatgatctaagatgttttaagatgaatgagtccatgcattagcatacatatgttgggggctc 21318847  T
Q  608 atgccctggagctttgtactca 629  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  21318848 atgccctggagctttgtactca 21318869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 24175287 - 24174985
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||| ||||| ||| | ||| | |||||    
T  24175287 cagagagcatgttgattttcgtattttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtttactaaagattagaggatgatttaga 24175188  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    | ||||||||||||||          |||| | |||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24175187 acaagattgaacctgg----------aacaaccttagttggaaatctggcaagtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 24175098  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    ||||| |||   |||  ||  || || ||| || | |||||||||||||  ||||| | || ||||||||||| |||||| ||||| |||| | | |||     
T  24175097 actgaatgcttttgataatgtcgtgacctgagttgaatgaattgattaggaatggaacattaggtagtaatgaaacctatttaagatgttagccggaatc 24174998  T
Q  311 tgtgaagttgtta 323  Q
    |||||||||||||    
T  24174997 tgtgaagttgtta 24174985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 144 - 636
Target Start/End: Original strand, 25961287 - 25961772
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgt 243  Q
    |||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||  | | || || ||| ||    
T  25961287 ttagttggaaatctggcaagtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgaatgcttttgataaaatcgtgacctgagt 25961386  T
Q  244 cgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatatgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaata 343  Q
     | |||||||||||||  ||||| | || ||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||  |||||  | ||  |     
T  25961387 tgaatgaattgattaggaatggaacattaggtagtaatgaaacctatttaagatgttagctgcaatatgtgaatttgttatgaactgtta-agttg-ttg 25961484  T
Q  344 tgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttttatttgatatcgtt-atatgatgttatactgtt 442  Q
    | ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||   ||||||||  ||||||||     ||  |  ||| || |||  ||||| |||||| ||||    
T  25961485 taatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaattattcttgaatgatctagatgttg-----ttgaaaatga-attgttgttatgaagttataatgtt 25961578  T
Q  443 gttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaata 542  Q
    ||||| ||||   ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||  |  |||  ||  |||||| ||||| | ||||||||||||||||  |||    
T  25961579 gttgtgatctgattatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc-attaaagatgaataagatgttgttg-agctccaaattattggattcata 25961676  T
Q  543 -agagatgatgattgtgatgtttaaga--gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacgaa 636  Q
      |||||| |||||  ||||||| |||  ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  25961677 ttgagatg-tgattaagatgttttagattgattgagtcaatgcattagcatacttttgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcaccacgaa 25961772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 24658139 - 24658032
Alignment:
Q  13 agagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttagaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  24658139 agagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaatgattaaatgataacttagaa 24658040  T
Q  112 taagattg 119  Q
    | ||||||    
T  24658039 tgagattg 24658032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 305
Target Start/End: Original strand, 24716160 - 24716444
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    ||||||||||||||||||  ||| | | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||| ||||| |    
T  24716160 cagagagcatgttgaatttcgtaatctggacttttgagatgaaccttagatgtttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagaggatgacttaaa 24716259  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    |  |||||||||||||  || |  |           ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24716260 acgagattgaacctggaataaccaat----------gttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttctaga 24716349  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactg 305  Q
     | |||||||| |||| ||   | || ||| || || ||||||||||||  ||||| | || ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  24716350 gccgagtgcaattgagaatgttgagacctgagttgcttgaattgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctatttaagatgttaactg 24716444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 411 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 24680292 - 24680064
Alignment:
Q  411 tatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaaga 510  Q
    ||||||||||| |||| |||||| ||| | || |||| |||| | | |||||||||||||||||||||| | ||| ||| || ||  |||  ||| ||||    
T  24680292 tatttgatatctttatctgatgtcataatattattgtgatctgcttgtgctgctattgttatttaaccatgttgcttgagtctgtacaagatgattaaga 24680193  T
Q  511 tgatgttgaacctccaaattattggataaataa----gagatgatgattgtgatgttt-aagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc 605  Q
    || |||||||| || ||||||||||||| |||     ||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24680192 tggtgttgaacttc-aaattattggatatatatatatgagatgatgattaagatgttttaagagattgagtcaatgcattagcatacatttgttgggggc 24680094  T
Q  606 tcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24680093 tcatgccctggagctttgtactcaccacga 24680064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 40428952 - 40428592
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    ||||||||||||||| ||  || |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||| |||||||| ||| | ||| |||||||    
T  40428952 cagagagcatgttgattttcgtgttttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtgtattaaagattagaggatgacttaga 40428853  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccag- 209  Q
    |  |||||||||| ||          |||| | |||||||| | ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  40428852 acgagattgaacccgg----------aacaaccttagttggaaatctggcaagtacttgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 40428763  T
Q  210 aactgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaat 309  Q
    ||||||||||   |||| ||  || || ||| || | ||||||||| |||  ||||| | | ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||  ||    
T  40428762 aactgagtgcttttgagaatgtcgtgacctgagttgaatgaattgagtaggaatggaacttagggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagat 40428663  T
Q  310 atgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattat 381  Q
     ||||||| ||||||||  |||||  ||||  | | ||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  40428662 ctgtgaagctgttatgaattgtta-agctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgatttat 40428592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 434 - 636
Target Start/End: Original strand, 24716564 - 24716766
Alignment:
Q  434 tatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattatt 533  Q
    |||| ||||||||| ||||   ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||  | ||||  ||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  24716564 tataatgttgttgtgatctgattatgctgcttttgttatttaaccaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatgttgaac-tccaaattatt 24716662  T
Q  534 ggataaataagagatgatgattgtgatgt-ttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaaca 632  Q
    ||||  ||| ||||||||||||  ||||  ||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  24716663 ggatgtatatgagatgatgattaagatgggttaaatgattgagtccatgcattaacatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcacca 24716762  T
Q  633 cgaa 636  Q
    ||||    
T  24716763 cgaa 24716766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 12 - 218
Target Start/End: Original strand, 21327196 - 21327393
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||| | ||||| ||| | ||| |||||||    
T  21327196 cagagagcatgtcgaaatctgtatttttgaccttcgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgttcactaaagattagaggatgacttaga 21327295  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    | ||||| ||||||||          |||  | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  21327296 acaagatggaacctgg----------aacgaccttagttcgaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgcactcgcctcgcgagcactcccaga 21327385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 144 - 219
Target Start/End: Original strand, 22460943 - 22461018
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22460943 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 22461018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 323
Target Start/End: Original strand, 24654967 - 24655270
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctg-tatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttag 109  Q
    |||||||||||| ||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   | ||| |||||||| ||| | ||| ||||||    
T  24654967 cagagagcatgtcgaattttcctattttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctttcgttgtgtattaaagattagaggatgacttag 24655066  T
Q  110 aataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccag 209  Q
    || ||||||||||||||          |||| |  ||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24655067 aacaagattgaacctgg----------aacaaccatagttggaaatctggcaagtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccag 24655156  T
Q  210 aactgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaat 309  Q
    |||||| |||   |||  |   || || ||| || | |||||||||||||  ||||| | || ||||||||||| |||||| ||||| |||| | | |||    
T  24655157 aactgaatgcttttgataaagtcgtgacctgagttgaatgaattgattaggaatggaacattaggtagtaatgaaacctatttaagatgttagccggaat 24655256  T
Q  310 atgtgaagttgtta 323  Q
     |||||||||||||    
T  24655257 ctgtgaagttgtta 24655270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 466 - 622
Target Start/End: Original strand, 21916166 - 21916322
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatgttta 565  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| ||  |  |||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||  |||||||     
T  21916166 ttgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatgttgaac-tccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgtttt 21916264  T
Q  566 aga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagcttt 622  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21916265 agatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagcttt 21916322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 24735879 - 24735671
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||  || ||| || ||||| ||| | ||| | ||| |    
T  24735879 cagagagcatgtcgaattatgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttcagtacctttaggtgtctactaaagattagaggatgatttata 24735780  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    | ||||||||||||||          |||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24735779 acaagattgaacctgg----------aacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggtgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 24735690  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggat 229  Q
    ||||| ||||  |||||||    
T  24735689 actgattgcatttgaggat 24735671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 144 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 15477957 - 15477883
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 218  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15477957 ttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 15477883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 134 - 219
Target Start/End: Original strand, 18855204 - 18855289
Alignment:
Q  134 tagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 219  Q
    ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18855204 tagaacaaccttagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcatatgctctcgcctcgtgagcacttccagaactgagtgc 18855289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 134 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 23187438 - 23187353
Alignment:
Q  134 tagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 219  Q
    ||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23187438 tagaacaaccttagttggaattctggcttatactcgccatggcgagctgatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 23187353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 134 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 23598701 - 23598616
Alignment:
Q  134 tagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 219  Q
    ||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23598701 tagaacaaccttagttggaattctggcttatactcgccatggcgagctgatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 23598616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 24870367 - 24870173
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||| |||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||| |||||||| ||| | ||| | |||||    
T  24870367 cagagagcgtgttgattttcgtattttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtgtattaaagattagaggatgatttaga 24870268  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    | ||||||||||||          |||||| |  ||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  24870267 acaagattgaacct----------agaacaaccatagttggaaatctggcaagtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcatgagcacttccaga 24870178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 144 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 61168 - 61094
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 218  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  61168 ttagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagctgatgctcccgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 61094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 144 - 218
Target Start/End: Original strand, 19928255 - 19928329
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 218  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19928255 ttagtcgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 19928329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 456 - 629
Target Start/End: Original strand, 21327625 - 21327800
Alignment:
Q  456 tatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgat- 554  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||  |  |||  ||  |||||| |||||||| |||||||||||||||  |||  ||||||||||     
T  21327625 tatgctgcttttgttatttaaccaagttgcatgagtctatacaagatgaataagatgttgttgaac-tccaaattattggatgtatataagatgatgatc 21327723  T
Q  555 tgtgatgttt-aaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactca 629  Q
    |  ||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21327724 taagatgttttaagatgaatgagtccatgcattagcatacatatgttgggggctcatgccctggagctttgtactca 21327800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 454 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 23060578 - 23060395
Alignment:
Q  454 cctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataa-ataagagatgatg 552  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||    ||||||||||||||| | ||||||| |  |     
T  23060578 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtt--tccaaattattggattatataagaggttgtc 23060481  T
Q  553 --attgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
      |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23060480 gaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacga 23060395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 144 - 229
Target Start/End: Original strand, 19688509 - 19688594
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggat 229  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  19688509 ttagttggaaatctggcttgtactcgccatgacaagcagatgctctcgcatcgcgagcacttccagaactgagtgcatttgaggat 19688594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 157 - 218
Target Start/End: Original strand, 12901278 - 12901339
Alignment:
Q  157 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 218  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12901278 tggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 12901339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 157 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 24649697 - 24649636
Alignment:
Q  157 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 218  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24649697 tggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 24649636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 157 - 218
Target Start/End: Original strand, 27379198 - 27379259
Alignment:
Q  157 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 218  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27379198 tggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 27379259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 157 - 218
Target Start/End: Original strand, 27383244 - 27383305
Alignment:
Q  157 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 218  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27383244 tggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 27383305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 157 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 27602137 - 27602076
Alignment:
Q  157 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 218  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27602137 tggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 27602076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 573 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 24174739 - 24174676
Alignment:
Q  573 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacgaa 636  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  24174739 gagtccatgcattagcatacttttgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcaccacgaa 24174676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 573 - 636
Target Start/End: Original strand, 24655516 - 24655579
Alignment:
Q  573 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacgaa 636  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  24655516 gagtccatgcattagcatacttttgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcaccacgaa 24655579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 157 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 26125543 - 26125484
Alignment:
Q  157 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  26125543 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcaagcacttccagaattgag 26125484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 157 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 41667289 - 41667230
Alignment:
Q  157 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  41667289 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcaagcacttccagaattgag 41667230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 157 - 218
Target Start/End: Original strand, 24628244 - 24628305
Alignment:
Q  157 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 218  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  24628244 tggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcactttcagaattgagtg 24628305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 157 - 218
Target Start/End: Original strand, 41530775 - 41530836
Alignment:
Q  157 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 218  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41530775 tggcatgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 41530836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 454 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 8946722 - 8946539
Alignment:
Q  454 cctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgga-taaataagagatgat- 551  Q
    |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||    |||||||||||||| || ||||||| |  |     
T  8946722 cctatgttgctattgttatctaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg--tttccaaattattggattatataagaggttgtc 8946625  T
Q  552 -gattgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
      |||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||    ||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8946624 gaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattaacatttcattgttagggacttgatgccctggagctttgtactcaacacga 8946539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 438 - 634
Target Start/End: Original strand, 22731274 - 22731471
Alignment:
Q  438 ctgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgga- 536  Q
    ||||| |||||| || |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||| ||    ||||||||||||||     
T  22731274 ctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatgatgatg---ttccaaattattggat 22731370  T
Q  537 taaataaga-gatgatg-attgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacac 633  Q
    || |||||| | || || ||   ||||| ||| || ||||||||||||||||||||    ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||    
T  22731371 tatataagaggttgttgaataaagatgtctaacaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgattccctggagctttgtactcaacac 22731470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 454 - 634
Target Start/End: Original strand, 23654442 - 23654624
Alignment:
Q  454 cctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatg- 552  Q
    ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||| ||    ||||||||||||||  ||||  ||| | ||     
T  23654442 cctatgctgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt---tccaaattattggactaatataagaggttgt 23654538  T
Q  553 ---attgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
       |||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||  | |||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  23654539 cgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcactagcattcattgttggggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacg 23654624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 573 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 40428402 - 40428340
Alignment:
Q  573 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||    
T  40428402 gagtccatgcattagcatacatatgttgggggctcatgccctggagcttagtcctcaccacga 40428340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 461 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 23130917 - 23130789
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgga-taaataaga-gatgatgattgtg 558  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||   ||||  |||||||||||||| || |||||| | ||  ||||  |    
T  23130917 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga---tgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgattaag 23130821  T
Q  559 atgtttaagagatcgagtccatgcattagcat 590  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23130820 atgtttaagaggtcgagtccatgcattagcat 23130789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 461 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 23133384 - 23133256
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgga-taaataaga-gatgatgattgtg 558  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||   ||||  |||||||||||||| || |||||| | ||  ||||  |    
T  23133384 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga---tgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgattaag 23133288  T
Q  559 atgtttaagagatcgagtccatgcattagcat 590  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23133287 atgtttaagaggtcgagtccatgcattagcat 23133256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 461 - 590
Target Start/End: Original strand, 34402629 - 34402757
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgga-taaataaga-gatgatgattgtg 558  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||   ||||  |||||||||||||| || |||||| | ||  ||||  |    
T  34402629 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga---tgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgattaag 34402725  T
Q  559 atgtttaagagatcgagtccatgcattagcat 590  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34402726 atgtttaagaggtcgagtccatgcattagcat 34402757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 573 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 24869819 - 24869755
Alignment:
Q  573 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacgaaa 637  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  24869819 gagtccatggattagcatacttttgttaggggctcatgccctggagctttgtcctcaccacgaaa 24869755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 466 - 634
Target Start/End: Original strand, 22738247 - 22738416
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgga-taaataaga-gatgatg-attgtgatgt 562  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||    |||||||||||||| || |||||| | || || |||  |||||    
T  22738247 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatgatg---ttccaaattattggattatataagaggttgttgaattaagatgt 22738343  T
Q  563 ttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
     ||| || |||  |||||||||||||||    ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||    
T  22738344 ctaaaaggtcggatccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctctgtactcaacacg 22738416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 561 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 22337081 - 22337008
Alignment:
Q  561 gtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtactcaacac 633  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  22337081 gtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacac 22337008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 32 - 76
Target Start/End: Original strand, 28291940 - 28291984
Alignment:
Q  32 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28291940 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 28291984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 454 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 23076507 - 23076333
Alignment:
Q  454 cctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgga-taaataagagatgat- 551  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||    |||||||||||||| || ||||||| |  |     
T  23076507 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtggatgaagatgatgatg--tttccaaattattggattatataagaggttgtc 23076410  T
Q  552 -gattgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtac 626  Q
      |||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||    ||||||||||| | |||||||| | ||||||||    
T  23076409 gaattaagatgtttaagaggccgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctgaacctttgtac 23076333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 560 - 634
Target Start/End: Original strand, 23103558 - 23103631
Alignment:
Q  560 tgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  || |||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  23103558 tgtttaagaggtcgagtccatgcattagcactca-ttgttggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacg 23103631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 438 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 25616266 - 25616192
Alignment:
Q  438 ctgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatg 512  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| || |||||||| ||| ||||||    
T  25616266 ctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgtaatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 25616192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 454 - 634
Target Start/End: Original strand, 38170 - 38352
Alignment:
Q  454 cctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgga-taa-ataagagatgat 551  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||| ||    |||||||||||||| ||| ||||||| |  |    
T  38170 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt---tccaaattattggactaatataagaggttgt 38266  T
Q  552 -ga--ttgtgatgttt-aagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
     ||  || || ||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  38267 cgaatttatgttgttttaagaggtggagtccatgcattagcattcatt-gttggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacg 38352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 558 - 634
Target Start/End: Original strand, 21900614 - 21900691
Alignment:
Q  558 gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  21900614 gatgtttaagaggtcaagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacg 21900691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 454 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 22105474 - 22105413
Alignment:
Q  454 cctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  22105474 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 22105413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 454 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 23285930 - 23285869
Alignment:
Q  454 cctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  23285930 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 23285869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 76
Target Start/End: Original strand, 37765 - 37809
Alignment:
Q  32 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  37765 gtatttttgacttttgagtggaaccttagatgcttttgagtgcct 37809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 20309577 - 20309533
Alignment:
Q  32 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  20309577 gtatttttgacttttgagttgaaccttatatgcttttgagtgcct 20309533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 24503450 - 24503402
Alignment:
Q  157 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcactt 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||    
T  24503450 tggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcccgagcactt 24503402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 25176321 - 25176281
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25176321 ttttgacctttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 25176281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 27263727 - 27263667
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 72  Q
    ||||||||| ||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27263727 cagagagcaagttgttttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 27263667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 28577154 - 28576996
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgga-taaataag-agatgatga-ttgt 557  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||   ||||  |||||||||||||| || ||||| || || ||| ||      
T  28577154 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga---tgaagttccaaattattggattatataagaagttgttgatttaa 28577058  T
Q  558 gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagc 619  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||| | ||||||||||||    
T  28577057 gatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 28576996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 12 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 10327333 - 10327218
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||| | |  || ||| |||||||| ||| | ||| | |||||    
T  10327333 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttccattcttttgagtacatttaggtgtctattaaagattagaggatgatttaga 10327234  T
Q  111 ataagattgaacctgg 126  Q
    | ||||||||||||||    
T  10327233 acaagattgaacctgg 10327218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 560 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 20309066 - 20308992
Alignment:
Q  560 tgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  20309066 tgtttaagatgtcgagtccatgcattagcattcata-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacg 20308992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 210
Target Start/End: Original strand, 21139015 - 21139090
Alignment:
Q  135 agaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    ||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||| |     ||||||||||||||||||||||||    
T  21139015 agaacagctttagtttggaacctgtcttgtactcgccatggcgagtaagaattctcgcctcgcgagcacttccaga 21139090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 456 - 515
Target Start/End: Original strand, 23040247 - 23040306
Alignment:
Q  456 tatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  23040247 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 23040306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 560 - 634
Target Start/End: Original strand, 23072112 - 23072186
Alignment:
Q  560 tgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||| || |||||||||||||| ||||    
T  23072112 tgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattca-ttgttgggggcttgatgctctagagctttgtactcaccacg 23072186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 466 - 619
Target Start/End: Original strand, 24529641 - 24529795
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataa-ataagagatgat-gattgt-gatgt 562  Q
    |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||   ||  ||||||||||||||| | ||||||| |  | ||||   |||||    
T  24529641 ttgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg---aagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgt 24529737  T
Q  563 ttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagc 619  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||| | ||||||||||||    
T  24529738 ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 24529795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 36 - 87
Target Start/End: Original strand, 32451571 - 32451622
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgttta 87  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||    
T  32451571 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgttta 32451622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 571452 - 571398
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  571452 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 571398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 6726050 - 6725996
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  6726050 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 6725996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 18808998 - 18808944
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  18808998 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 18808944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 22337173 - 22337119
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  22337173 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 22337119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 23135645 - 23135591
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  23135645 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 23135591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Original strand, 23709639 - 23709693
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  23709639 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 23709693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Original strand, 23712120 - 23712174
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  23712120 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 23712174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 26505434 - 26505380
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  26505434 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 26505380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 26507912 - 26507858
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  26507912 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 26507858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 39682368 - 39682314
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  39682368 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 39682314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 466 - 515
Target Start/End: Original strand, 298883 - 298932
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  298883 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 298932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 36 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 23286329 - 23286292
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtg 73  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23286329 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtg 23286292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 461 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 24367829 - 24367670
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgga-taaataaga-gatgatga-ttgt 557  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||   ||||  |||||||||||||| || |||||| | ||  || ||      
T  24367829 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaaatga---tgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaa 24367733  T
Q  558 gatgtttaagagatcgagtccatgcattagca-tacatttgttgggggc-tcatgccctggagc 619  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||| | ||||||||||||    
T  24367732 gatgtttaagaggtcgagtccatgcattaacattaca-ttgttgggggcttgatgccctggagc 24367670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 466 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 38967424 - 38967375
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  38967424 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 38967375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 461 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 43137354 - 43137301
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgat 514  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  43137354 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 43137301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 466 - 515
Target Start/End: Original strand, 45029966 - 45030015
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  45029966 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 45030015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Original strand, 298457 - 298497
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  298457 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 298497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 461 - 513
Target Start/End: Original strand, 21155167 - 21155219
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatga 513  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  21155167 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 21155219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Original strand, 22133859 - 22133899
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  22133859 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 22133899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Original strand, 22737822 - 22737862
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  22737822 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 22737862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Original strand, 23071733 - 23071769
Alignment:
Q  165 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagc 201  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23071733 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagc 23071769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 12 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 23187551 - 23187487
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    ||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||    
T  23187551 cagagagcaagttgttttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacct 23187487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 12 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 23598814 - 23598750
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    ||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||    
T  23598814 cagagagcaagttgttttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacct 23598750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Original strand, 23654052 - 23654092
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  23654052 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgactgcct 23654092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 23660501 - 23660461
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  23660501 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 23660461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 461 - 513
Target Start/End: Original strand, 24643057 - 24643109
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatga 513  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  24643057 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 24643109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 12 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 26125679 - 26125619
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 72  Q
    ||||||||||||||| ||  |  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  26125679 cagagagcatgttgattttcgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 26125619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 27754054 - 27754014
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  27754054 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 27754014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 466 - 590
Target Start/End: Original strand, 32215033 - 32215163
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaaga---tgatgttgaacctccaaattattgga-taaataagagat-gatg-attgtga 559  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||   ||||| |||   |||||||||||||| ||  |||||| | | || |||  ||    
T  32215033 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaagaggtcgttgaattaaga 32215132  T
Q  560 tgtttaagagatcgagtccatgcattagcat 590  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32215133 tgtttaagaggtcgagtccatgcattagcat 32215163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 210
Target Start/End: Original strand, 24640705 - 24640779
Alignment:
Q  135 agaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    ||||||||||||||| || || || || ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||| ||||||    
T  24640705 agaacagctttagtttggttt-tgtctggtactcgccatggcgagtaggaactctcgcctcgcgagcacctccaga 24640779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 466 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 25175903 - 25175852
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgtt 517  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||    
T  25175903 ttgttatttaactaagctgcatgaatctgtctaagttgatgatgatgatgtt 25175852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 27197219 - 27197172
Alignment:
Q  163 gtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||    
T  27197219 gtactcgccatggcgagtaggaactctcgcctcgcgagcacttccaga 27197172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 200
Target Start/End: Original strand, 32451685 - 32451736
Alignment:
Q  149 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 200  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  32451685 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 32451736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 12 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 61291 - 61241
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagat 62  Q
    ||||||||| ||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  61291 cagagagcaagttgttttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagat 61241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 165 - 199
Target Start/End: Original strand, 22133986 - 22134020
Alignment:
Q  165 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcga 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22133986 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcga 22134020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 454 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 23660088 - 23659952
Alignment:
Q  454 cctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataa-ataagagatgatg 552  Q
    |||||| |||| ||||| |||||| ||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||    ||||||||||||||| | ||||||| |  |     
T  23660088 cctatgttgctgttgttgtttaactaagatacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt---tccaaattattggattatataagaggttgtc 23659992  T
Q  553 --attgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcat 590  Q
      |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23659991 gaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcat 23659952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 456 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 24735459 - 24735319
Alignment:
Q  456 tatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagat--gatga 553  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| || |  ||||   || ||  ||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||  |||||    
T  24735459 tatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaaagtgatgatgaac-tccaaattattggatgtataagagatttgatga 24735361  T
Q  554 ttgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatt 595  Q
    ||  |||||||    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  24735360 ttaagatgttttgttgatagagtccatgcattagcatacatt 24735319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 188 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 27263582 - 27263552
Alignment:
Q  188 ctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27263582 ctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 27263552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 466 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 7679638 - 7679589
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||    
T  7679638 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 7679589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 465 - 517
Target Start/End: Original strand, 18786970 - 18787020
Alignment:
Q  465 attgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgtt 517  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||    
T  18786970 attgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagatgatgtt 18787020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 72
Target Start/End: Original strand, 19928155 - 19928192
Alignment:
Q  35 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  19928155 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 19928192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 72
Target Start/End: Original strand, 22460843 - 22460880
Alignment:
Q  35 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  22460843 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 22460880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 466 - 515
Target Start/End: Original strand, 32039610 - 32039659
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||    
T  32039610 ttgttatttaactaagctgcatgagccggtctaagttgattaagatgatg 32039659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 41667402 - 41667365
Alignment:
Q  35 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  41667402 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 41667365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Original strand, 37888 - 37924
Alignment:
Q  165 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagc 201  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  37888 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagc 37924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #128
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 163 - 219
Target Start/End: Original strand, 10101417 - 10101473
Alignment:
Q  163 gtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 219  Q
    ||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  10101417 gtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacatccagaattgagtgc 10101473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #129
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Original strand, 22730875 - 22730915
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  22730875 ttttaacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 22730915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #130
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 558 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 25616140 - 25616108
Alignment:
Q  558 gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcat 590  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25616140 gatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcat 25616108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #131
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 149 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 27753940 - 27753892
Alignment:
Q  149 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgc 197  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  27753940 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgc 27753892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #132
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 31756267 - 31756231
Alignment:
Q  165 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagc 201  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  31756267 actcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagc 31756231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #133
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 558 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 38967332 - 38967285
Alignment:
Q  558 gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggct 606  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  38967332 gatgtttaagaagtcgagtccatgcattagcattc-tttgttgggggct 38967285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #134
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 558 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 43137257 - 43137210
Alignment:
Q  558 gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggct 606  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  43137257 gatgtttaagaagtcgagtccatgcattagcattc-tttgttgggggct 43137210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 425; Significance: 0; HSPs: 157)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 425; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 635
Target Start/End: Original strand, 17353556 - 17354180
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||| |||||||||||||| ||    
T  17353556 cagagagcatgtagaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtccctgaagatgcctattaaagattaaatgataactttga 17353655  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    |  ||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17353656 acgagattgaacctagtttaacctagaacagcttttgttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttgcaga 17353755  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||     
T  17353756 actgagtgcaagtgaggatattgcgatttgtgtcgcataattcgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatc 17353855  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttt 410  Q
    ||||||| |||||||| |||||  || |||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||     
T  17353856 tgtgaagctgttatgaaatgtttatgttgaatatgatgtgagatgatgtttgatttcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgatgcttgcttg 17353955  T
Q  411 tatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaaga 510  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||  ||||||||    
T  17353956 tatttgatatcgttatatgatgtcataatgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaaga 17354055  T
Q  511 tgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatg 610  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17354056 tgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattatgatgtttaagaaatcgagtccatgcattagcatacatttgttaggggctcatg 17354155  T
Q  611 ccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  17354156 ccctagagctttgtactcaacacga 17354180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 402; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 19899592 - 19898974
Alignment:
Q  15 agagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttagaata 113  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||     
T  19899592 agagcatgtagaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaatgattaaatgataacttagaatg 19899493  T
Q  114 agattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaact 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19899492 agattgaacctggtttagcttagaacaacattagttgggaatctggctagtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaact 19899393  T
Q  214 gagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatatgt 313  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  19899392 gagtgcaagtgaggatgttgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgacctatttaagaagttaactgcaatctgt 19899293  T
Q  314 gaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttttat 413  Q
    |||| |||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||    ||||||    
T  19899292 gaagctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatttaatgattaatttcattacttgagttatgaatgagtgattgaaatgttgc----ttttat 19899197  T
Q  414 ttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatga 513  Q
    |||||||||| || |||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||| | | ||||  |||||||| ||    
T  19899196 ttgatatcgtcatgtgatgtcatactattgttgcaatctgcctatgctgctattgatatttaactatgttgcatgaattgatataagatgatcaagacga 19899097  T
Q  514 tgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatg-tttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgcc 612  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19899096 tgttgaacctccaaattattggatacctaagagatgatgattaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcatacatatgttgggggctcatgcc 19898997  T
Q  613 ctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  19898996 ctggagcttagtactcaacacga 19898974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 635
Target Start/End: Original strand, 21168340 - 21168971
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  21168340 cagagagcaggttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagaagtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattagatgataacttaga 21168439  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  21168440 atgagattgaacctggtttagctttgaacaactttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcaagcacttcctga 21168539  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
     ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||     
T  21168540 tctgagtgcaagtgaggatgttgcgatctgtgtcgcatagtttgattagagatggacctttgggtagtaatataacctatacaagaagttaactgcaatc 21168639  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaa----ttatgaatgaatgattgagatgttgcttg 406  Q
    ||||||| |||||||| |||||| || |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||    | |||||||||||||||||||| ||||||    
T  21168640 tgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtaagatgatgtttaattgcattacttgaaatgttaatgaatgaatgattgagatgatgcttg 21168739  T
Q  407 tttttatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatc 506  Q
     |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||| ||  | ||||  ||      
T  21168740 cttttatttgatatctttatatgatgtcataatgttgttgtgatctgcctatgctgttattattatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgaat 21168839  T
Q  507 aagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatg-tttaagagatcgag--tccatgcattagcatacatttgttgggg 603  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21168840 aagatgatgttgaacctccaaattattggatacataagagatgatgattaagatgttttaagagatcgagtttccatgcattagcatacatatgttgggg 21168939  T
Q  604 gctcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21168940 gctcatgccctggagcttagtactcaacacga 21168971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 16185228 - 16184600
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16185228 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccatagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattaaatgataacttaga 16185129  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16185128 atgagattgaacctggtttggcttagaacaactttagttgagaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 16185029  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    ||||| ||||||| |||||   |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||     
T  16185028 actgaatgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatc 16184929  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaa----ttatgaatgaatgattgagatgttgcttg 406  Q
    ||||||| || |||||||||||| || ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||    | || ||||||||||||||||| ||||||    
T  16184928 tgtgaagctgatatgagatgttaatgttgattataatgtgatttaatgtttaattgcattgcttgaaatgttaataaatgaatgattgagatgatgcttg 16184829  T
Q  407 tttttatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatc 506  Q
     |||||||| |||||  || ||||||| ||| ||||||||| || | | ||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||  | ||||  |||     
T  16184828 cttttatttaatatctctacatgatgtgataatgttgttgtgatatgcttatgctgctattgttgtttaaccaacttgcatgattctatataagatgatt 16184729  T
Q  507 aagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatg-tttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc 605  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16184728 aagatgatgttgaa-ctccaaattattggatacataagagatgatgattaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcatacatatgttgggggc 16184630  T
Q  606 tcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  16184629 ttatgccctggagcttagtactcaacacga 16184600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 19983595 - 19982972
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttg--acttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataactta 108  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  19983595 cagagagcatgtagaattctgtattttttttacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaatgattaaatgataactta 19983496  T
Q  109 gaataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttcca 208  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19983495 gaatgggattgaacctggtttagcttagaacaacattagttgggaatctgactagtactcgccatggtgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttcca 19983396  T
Q  209 gaactgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaa 308  Q
     |||||||||||| |||||||   |||||||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  19983395 aaactgagtgcaaatgaggatgttgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggaaccctgggtagtaatgtgacctatttaagaagttaactgcaa 19983296  T
Q  309 tatgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtt 408  Q
    | ||||||| |||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||    |    
T  19983295 tctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatttaatgattaattgcattacttgagttatgaatgagtgattgaaatgttgc----t 19983200  T
Q  409 tttatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaa 508  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| | | ||||    ||||    
T  19983199 tttatttgatatcgttatgtgatgtcatactgttgttgcaatctgcctatgctgctattgttatttaactatgttgcatgaattgatataagattgtcaa 19983100  T
Q  509 gatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatg-tttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc 607  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19983099 gacgatgttgaacctccaaattattagatacataaaagatgatgattaagatgttttaagagattgagtccatgcattagcatacatatgttgggggctc 19983000  T
Q  608 atgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  19982999 atgccctggagcttagtagtcaacacga 19982972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 24756221 - 24755594
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||| ||||| |||||||    
T  24756221 cagagagcatgtaggattctgtattttttacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatattaaataaagattagatgatgacttaga 24756122  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24756121 gtgagattgaacctggtttagcttagaacaactttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 24756022  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    |||||||||||||||| |    |||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||     
T  24756021 actgagtgcaagtgagaactttgcgacctgtgtcgcataacttgtttagagatggacccttgggtagtaatgtgacctatataggatgttaactgcaatc 24755922  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaa----ttatgaatgaatgattgagatgttgcttg 406  Q
    ||||||| |||||||| ||||||  | ||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    | ||||||||||||||||| || ||||||    
T  24755921 tgtgaagctgttatgaaatgtta-agttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatgttaatgaatgaatgattgagttgatgcttg 24755823  T
Q  407 tttttatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatc 506  Q
     ||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||  | ||||  |||     
T  24755822 atttaatttgatatctttatatgatgtcataatgttgttgtgatctgcttatgctgctattgttatttaactatgatgcatgagtctatataagatgatt 24755723  T
Q  507 aagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatg-tttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc 605  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24755722 aagatgatgttgaa-ctccaaattattggatacataagagatgatgattaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcatacatatgttgggggc 24755624  T
Q  606 tcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  24755623 ttatgccctggagcttagtactcaacacga 24755594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 12 - 635
Target Start/End: Original strand, 23776452 - 23777073
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaacctt-agatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttag 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  23776452 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaacctttagatgtttttgagtgcctaaagatgattattaaagattaaatgataacttag 23776551  T
Q  110 aataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccag 209  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23776552 aatgagattgaacctggtttagcttagaacaactttagttgggaatctggcttgtactcgctatcgcgagcagatgctctcgcctcgcgagcactttcag 23776651  T
Q  210 aactgagtgcaagtgaggatagcgcg-atctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaa 308  Q
    |||||||||||||  ||||||  ||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23776652 aactgagtgcaagctaggatattgcgaatctgtgtcgcataatttggttagagatggacacttaggtagtaatgtgacctatataagaagttaactgcaa 23776751  T
Q  309 tatgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtt 408  Q
    | ||||||| |||||||| |||||  || |||||||||||| |||||||| |||  |||||||||| |  ||| | ||||||||| |||||||| |        
T  23776752 tttgtgaagctgttatgaaatgttgatgttgaatatgatgttatataatg-ttatgtgcattacttaagatattattgaatgattaagatgttgttgaaa 23776850  T
Q  409 tttatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaa 508  Q
    |  | |||||||     || || || || ||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||  | ||||  ||  ||    
T  23776851 tgaaattgatat-----taagaagtcatgctgatgttgtgatctgcctatgctgctatagttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgaataa 23776945  T
Q  509 gatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatg-tttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc 607  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23776946 gatgatgttgaacctccaaattattggatacataagagatgatgattgagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcatacatatgttgggggctc 23777045  T
Q  608 atgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  23777046 atgccctggagcttagtactcaacacga 23777073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 12 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 377778 - 377149
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||    
T  377778 cagagagcatgtcgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttgttaaagattaaattataacttaga 377679  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  377678 atgagattgaacctggtttagcttagaataactttagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgtctcgcgagcacttccaga 377579  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    ||||||||| | |||| ||  || ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||     
T  377578 actgagtgctaatgagaatgtcgtgatctgtgttgcttgaattgattagggatggacccttaggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatc 377479  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttga----attatgaatgaatgattgagatgttgcttg 406  Q
    ||||||| |||||||| ||||||  |||||  || ||||||| ||||| |||||||||||||||||     | ||||||||||||||||| || ||||||    
T  377478 tgtgaagctgttatgaaatgtta-agctgatcataatgtgatttaatgattaattgcattacttgagatgttaatgaatgaatgattgagttgatgcttg 377380  T
Q  407 tttttatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatc 506  Q
     || ||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||| | | ||||||| |   |  |||  |||     
T  377379 cttctatttgatatctttacatgatgtcataatgttgttgtgatctgcttgtgctgctattgttatttaactatgttgcatgagtatatacaagatgatt 377280  T
Q  507 aagatgatgttgaacctccaaattattgg--ataaataagagatgatgattgtgatg-tttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggg 603  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||  |||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  377279 aagatgatgttgaa-ctccaaattattggatatatatatgagatgatgattaagatgttttaagagattgagtccatccatttgcatacatttgttgggg 377181  T
Q  604 gctcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  377180 gctcatgccctggagctttgtactcaccacga 377149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 12 - 635
Target Start/End: Original strand, 20465658 - 20466279
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||    
T  20465658 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgttaattaaagattagatgatgacttaga 20465757  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20465758 acgagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcggatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 20465857  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    |||||||||||||||| ||  || | ||||||| || |||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||     
T  20465858 actgagtgcaagtgagaatgtcgtgttctgtgttgcttgaattgattagggacggacccttaggtagtaatgtgacctatataagaggttaactgcaatc 20465957  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttt 410  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||  | ||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||  |||||||| |||   |    
T  20465958 tgtgaagctgttatgaaatgcta-agttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg-ttgaaat 20466055  T
Q  411 tatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatc--ggtctaagtcgatcaa 508  Q
     | |||||||     ||||| |||||  ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||    | ||||  ||| ||    
T  20466056 gaattgatat-----tatgaagttatgttgttgttgtgatctgcctatactgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatatataagatgattaa 20466150  T
Q  509 gatgatgttgaacctccaaattattgg--ataaataagagatgatgattgtgatg-tttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc 605  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||  |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20466151 gatgatgttgaa-ctccaaattattggatatatataagagatgattattaagatgttttaagagattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc 20466249  T
Q  606 tcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20466250 tcatgccctggagctttgtactcaccacga 20466279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 12 - 635
Target Start/End: Original strand, 30642910 - 30643529
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||    
T  30642910 cagagagcatgtcgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattagatgatgatttaga 30643009  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30643010 acgagattgaacctggtttagcttagaacaactttagttgaaaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctcttgcctcgcgagcacttccaga 30643109  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    | ||| ||||||| |||||   ||||||||| |||||  |||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||     
T  30643110 attgaatgcaagttaggatgttgcgatctgtttcgcacaaattgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgcaatc 30643209  T
Q  311 tgtg-aagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgttt 409  Q
    |||| ||| ||||| ||  |||||  | ||| ||| || |||| ||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||  |||||||| |||       
T  30643210 tgtgaaagctgttacgaactgtta-agttgattataatatgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg-ttgaaa 30643307  T
Q  410 ttatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaag 509  Q
    | | |||||||     ||||| |||||  ||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||  |  |||  ||| |||    
T  30643308 tgaattgatat-----tatgaagttatgttgttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctattcaagatgattaag 30643402  T
Q  510 atgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatg-tttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc 607  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||  |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30643403 atgatgttgaa-ctccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc 30643501  T
Q  608 atgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||    
T  30643502 atgccctggaactttgtactcaccacga 30643529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 12 - 635
Target Start/End: Original strand, 19259221 - 19259829
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  19259221 cagagagcatgttgaattcttgaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttt-gagtgcctaaagatgtttattaaagattaaatgatgacttaga 19259319  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19259320 atgagattaaacctggtttagcttagaacaaccttagttggaattctggcttgtattcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 19259419  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    ||||||||||||| || |            |||||       ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||     
T  19259420 actgagtgcaagttagaa------------tgtcg-------tgattagggatggacccttaggtagtaatgtgacctatacaagatgttaactgcaatc 19259500  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttga----attatgaatgaatgattgagatgttgcttg 406  Q
    ||||||| | ||||||  |||||  | ||| ||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||||     | ||||||||||||||||| || ||||||    
T  19259501 tgtgaagctattatgaactgtta-agttgattataatgtgatttaatgattaatttcattacttgagatgttaatgaatgaatgattgagttgatgcttg 19259599  T
Q  407 tttttatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatc 506  Q
     ||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||| | || | |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||  | ||||  ||      
T  19259600 cttttatttgatatccctatatgatgtcataatgttgttgtgaactgcttatgctactattgttatttaaccaagttgcatgagtcattgtaagatgaat 19259699  T
Q  507 aagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatg-tttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc 605  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||  |||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19259700 aagatgatgttgtacctccaaattattggatatatatgagatgataattaagatgttttaatagattgagtccatgcagtagcatacatttgttgggggc 19259799  T
Q  606 tcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    ||||||||| || |||| | |||| |||||    
T  19259800 tcatgccctagaactttttcctcaccacga 19259829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 172 - 635
Target Start/End: Original strand, 21161838 - 21162298
Alignment:
Q  172 atggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggaccctt 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||   ||||||||||||||||| ||    
T  21161838 atggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatgttgcgatctgtgtcgtatagtttgattagagatggaccttt 21161937  T
Q  272 gggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatatgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcatta 371  Q
    ||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| || ||||||||||||          ||||||||||||    
T  21161938 gggtagtaatataacctatacaagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgt----------ttaattgcatta 21162027  T
Q  372 cttgaatt----atgaatgaatgattgagatgttgcttgtttttatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctatt 467  Q
    |||||| |    || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  21162028 cttgaaatgttaataaatgaatgattgagatgatgcttgcttttatttgatatctttatatgatgtcataatgttgttgtgatctgcctatgctgttatt 21162127  T
Q  468 gttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatg-tttaa 566  Q
     ||||||||| ||| ||||||| ||  | ||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||| |||||    
T  21162128 attatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgaataagatgatgttgaacctccaaattattggatacttaagagatgatgattaagatgttttaa 21162227  T
Q  567 gagatcgag--tccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21162228 gagatcgagtttccatgcattagcatacatatgttgggggctcatgccctggagcttagtactcaacacga 21162298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 12 - 629
Target Start/End: Original strand, 15611088 - 15611690
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| | |||||    
T  15611088 cagagagcatgttgaattctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgatttaga 15611187  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15611188 acaagattgaacctggtttagcttagaacaacttaagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 15611287  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    ||| | ||||||| || ||   ||||||||| |||||| | |||||||| | |||||||||  ||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||     
T  15611288 acttaatgcaagttagtatgttgcgatctgtttcgcataagttgattagggttggacccttaagtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatc 15611387  T
Q  311 tgtgaagttgttatgaga-tgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgttt 409  Q
    ||||||| |||| ||| | |  ||  | ||  | | ||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||| | ||||||||  |||||||| |||       
T  15611388 tgtgaagctgtt-tgaaactacta-agttgtctgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg-ttgaaa 15611484  T
Q  410 ttatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaag 509  Q
    | | |||||||     |||||  || | |||||| ||| ||||   ||||||| | |||||||||||||||| |||||||    |||||       ||||    
T  15611485 tgaattgatat-----tatgaaattttgctgttgatgtgatctgattatgctggttttgttatttaaccaagttgcatga----gtcta-----tacaag 15611570  T
Q  510 atgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatgtttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctca 608  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||  ||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15611571 atgatgttgaa-ctccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgtcttagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctca 15611669  T
Q  609 tgccctggagctttgtactca 629  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  15611670 tgccctggagctttgtactca 15611690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 12 - 629
Target Start/End: Original strand, 15602636 - 15603238
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| | |||||    
T  15602636 cagagagcatgttgaattctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgatttaga 15602735  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15602736 acaagattgaacctggtttagcttagaacaacttaagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 15602835  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    ||| | ||||||| || ||   ||||||||| |||||| | |||||||| | |||||||||  ||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||     
T  15602836 acttaatgcaagttagtatgttgcgatctgtttcgcataagttgattagggttggacccttaagtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatc 15602935  T
Q  311 tgtgaagttgttatgaga-tgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgttt 409  Q
    ||||||| |||| ||| | || ||  | ||  | | ||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||| | ||||||||  |||||||| |||       
T  15602936 tgtgaagctgtt-tgaaactgcta-agttgtctgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg-ttgaaa 15603032  T
Q  410 ttatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaag 509  Q
    | | | |||||     |||||  || | |||||| ||| ||||   ||||||||| |||||||||||||||| |||||||    |||||       ||||    
T  15603033 tgaatcgatat-----tatgaaattttgctgttgatgtgatctgattatgctgcttttgttatttaaccaagttgcatga----gtcta-----tacaag 15603118  T
Q  510 atgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatgtttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctca 608  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||  ||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15603119 atgatgttgaa-ctccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgtcttagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctca 15603217  T
Q  609 tgccctggagctttgtactca 629  Q
    |||||||||| ||| ||||||    
T  15603218 tgccctggagatttctactca 15603238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 13 - 629
Target Start/End: Original strand, 16409875 - 16410478
Alignment:
Q  13 agagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttagaa 111  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||    
T  16409875 agagagcatgttgaatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgatttagaa 16409974  T
Q  112 taagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaa 211  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||    
T  16409975 tgagattgaacctggtttagcttagaataactttagttggaattctggcttgaactcgccatggcgagcagatgctctcgcttggcgagcaccttcagaa 16410074  T
Q  212 ctgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatat 311  Q
    |||| ||||| | |||||   |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||  ||||||| |||||    
T  16410075 ctgaatgcaaattaggatgttgcgatctgtgtcgcacaaattgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatattaactgaaatat 16410174  T
Q  312 gtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgttttt 411  Q
    |||| | |||| |||  || ||  | ||  | | ||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||| | ||||||||  |||||||| |||   |     
T  16410175 gtgaggctgtt-tgaactgcta-agttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg-ttgaaatg 16410271  T
Q  412 atttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagat 511  Q
    | ||| |||     |||||  |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||  | |         |||||    
T  16410272 aattggtat-----tatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttcactaagttgcatgagtcattat---------aagat 16410357  T
Q  512 gatgttgaacctccaaattattggata--aataagagatgatgattgtgatgtttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctca 608  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||   ||| ||||||||||||  |||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16410358 gatgttgaatatccaaattattggatatgtatatgagatgatgattaagatggtttagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctca 16410457  T
Q  609 tgccctggagctttgtactca 629  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  16410458 tgccctggagctttgtactca 16410478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 12 - 629
Target Start/End: Original strand, 17926333 - 17926936
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| | |||||    
T  17926333 cagagagcatgttgaattctgta-------cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgatttaga 17926425  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    |  ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17926426 acgagattgaacctggtttatcttagaacaacttaagttggaattatggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcactcccaga 17926525  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    ||||| ||||| | || ||   ||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||| || |||     
T  17926526 actgaatgcaaattagtatgttgcgatctgtttcgcataaattgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaattgaaatc 17926625  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttt 410  Q
    ||||||| |||| |||  || ||  | ||  | | ||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||| | ||||||||  |||||||| |||   |    
T  17926626 tgtgaagctgtt-tgaactgcta-agttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg-ttgaaat 17926722  T
Q  411 tatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaaga 510  Q
     | |||||||     | |||  |||| |||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||  | ||||  ||  ||||    
T  17926723 gaattgatat-----tgtgaaattatgctgttgttttgatctgcctatgctactattgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataaga 17926817  T
Q  511 tgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatgtttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcat 609  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||  ||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17926818 tgatgttgaa-ctccaaattattggatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagtatacatttgttgggggctcat 17926916  T
Q  610 gccctggagctttgtactca 629  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  17926917 gccctggagctttgtactca 17926936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 12 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 19976947 - 19976647
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttg--acttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataactta 108  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  19976947 cagagagcatgtagaattttgtattttttttacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaatgattaaatgataactta 19976848  T
Q  109 gaataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttcca 208  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19976847 gaatgggattgaacctggtttagcttagaacaacattagttgggaatctgactagtactcgcaatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttcca 19976748  T
Q  209 gaactgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaa 308  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| | ||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  19976747 gaactgagtgcaagtgaggatgttgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggaaccctaggtagtaatgtgacctatttaagaagttaactgcaa 19976648  T
Q  309 t 309  Q
    |    
T  19976647 t 19976647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 32 - 377
Target Start/End: Original strand, 21389091 - 21389436
Alignment:
Q  32 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttagaataagattgaacctggttta 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21389091 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattatatgataacttagaatgagattgaacctggttta 21389190  T
Q  131 gcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggata 230  Q
     ||||||||| |  | ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21389191 acttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggtgagcagatgctctcgcttcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaa 21389290  T
Q  231 gcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatatgtgaagttg-ttatgagat 329  Q
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||  || || ||    
T  21389291 atgcgatctgtgtcgcatgatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagaccaatatatgaagttaattgtaatatgtgaagctgaataagatat 21389390  T
Q  330 gttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaa 377  Q
    |||  || ||| ||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  21389391 gttgttgttgattatgaagtgttataatgttta--tgcattacttgaa 21389436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 12 - 629
Target Start/End: Original strand, 22010298 - 22010896
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||| | |||||    
T  22010298 cagagagcatgttgaattctgtatttttgactttttagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttaataaagattagatgatgatttaga 22010397  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22010398 acgagattgaacctggtttagcttagaacaacttgagttggaaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 22010497  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    ||||||||||| |||| ||   | || ||| || || ||||||||||||  ||||| | || ||||||| | |||| ||| ||||| |||||||| |||     
T  22010498 actgagtgcaattgagaatgttgtgacctgagttgcttgaattgattaggaatggaactttaggtagtagtaagacatatttaagatgttaactgaaatc 22010597  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttt 410  Q
    ||||| |||||| |||  || ||  | ||  | | ||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||   ||||||||  ||||||||            
T  22010598 tgtgaggttgtt-tgaactgcta-agttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatattcttgaatgatctagatgttg-------- 22010687  T
Q  411 tatttgatatcgtt-atatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaag 509  Q
     |  ||| || |||  ||||| ||||||  |||||||| ||||   ||||||||| |||||||||||||||| |||||||    |||||       ||||    
T  22010688 -aaatga-attgttgttatgaagttataaagttgttgtgatctgattatgctgcttttgttatttaaccaagttgcatga----gtcta-----tacaag 22010776  T
Q  510 atgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatgtttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctca 608  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||  ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22010777 atgatgttgaa-ctccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttaggggctca 22010875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 41 - 317
Target Start/End: Original strand, 21395630 - 21395907
Alignment:
Q  41 acttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttagaataagattgaacctggtttagcttagaac 139  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  21395630 acttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattatatgataacttagaatgagattgaacctgggttaacttagaac 21395729  T
Q  140 agctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatagcgcgatct 239  Q
    | |  | ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||    
T  21395730 aaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcaagcagatgctctcgcctcgcgagcacgtccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgcgatct 21395829  T
Q  240 gtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatatgtgaag 317  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  21395830 gtgtcgcatgatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaag 21395907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 41 - 317
Target Start/End: Original strand, 21790123 - 21790400
Alignment:
Q  41 acttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttagaataagattgaacctggtttagcttagaac 139  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  21790123 acttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattatatgataacttagaatgagattgaacctgggttaacttagaac 21790222  T
Q  140 agctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatagcgcgatct 239  Q
    | |  | ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||    
T  21790223 aaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcaagcagatgctctcgcctcgcgagcacgtccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgcgatct 21790322  T
Q  240 gtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatatgtgaag 317  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  21790323 gtgtcgcatgatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaag 21790400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Original strand, 20856044 - 20856252
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    ||||||||||||||||||  ||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||  ||||||| ||| ||||| | ||| |    
T  20856044 cagagagcatgttgaatttcgtgattttgaattttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctttagatgtccattaaagattagatgatgatttaaa 20856143  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20856144 acaagattgaacctggtttagcttagaacaaccttagttgcaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 20856243  T
Q  211 actgagtgc 219  Q
    |||||||||    
T  20856244 actgagtgc 20856252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 635
Target Start/End: Original strand, 16860956 - 16861561
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  16860956 cagagagcatgttgaatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttaga 16861055  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    | ||||||||||||||  ||      | ||  |||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16861056 acaagattgaacctggaata------acca--ttt--ttggaattcttgcttgtactcgccatggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 16861145  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    ||||||||||  |||| ||  || || ||| || |  ||||| ||||||  ||||| | || ||||||| |||||| ||| ||||| |||| ||| |||     
T  16861146 actgagtgcatttgagaatgtcgtgacctgagttgattgaatcgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacatatttaagaggttagctgaaatc 16861245  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttt 410  Q
    ||| | | |||| |||  |||||  | ||  | | ||||||| ||||| |||| | ||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||| |||   |    
T  16861246 tgtaaggctgtt-tgaactgtta-agttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatacattacttgaaatattattgaatgattaagatgttg-ttgaaat 16861342  T
Q  411 tatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaaga 510  Q
     | ||| | |     |||||   |||| ||||||||| ||||   ||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||  | ||||  ||  ||||    
T  16861343 gaattgttgt-----tatga-aatataatgttgttgtgatctgattatgctgcttttgttatttaaccgagttgcatgagtcattataagatgaataaga 16861436  T
Q  511 tgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatg-tttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcat 609  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||| |||||  |||| |||| | ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||    
T  16861437 tgatgttgaa-ctccaaattattggatgtatatgagatgttgattaagatgttttaggtgattgagtccatgcattaacatacatatgttgggggcacat 16861535  T
Q  610 gccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||||||| |||| |||| |||||    
T  16861536 gccctggagccttgtcctcaccacga 16861561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 187
Target Start/End: Original strand, 16411888 - 16412064
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||  |||     
T  16411888 cagagagcatgttgaattttgtaattttgacttttgagttgaaccttaaatgtttttgagtgccttaagatgtgtattaaagattaaatgataatgtagg 16411987  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgct 187  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16411988 atcagattgaacctagtttagcttagaacaaccttaggtggaattctggcttgaactcgccatggcgagcagatgct 16412064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 523 - 635
Target Start/End: Original strand, 44384970 - 44385085
Alignment:
Q  523 tccaaattattgga-taa-ataagagatgatgattgtgatgtttaagagat-cgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagc 619  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44384970 tccaaattattggactaatataagagatgatgattgtgatgtttaagagattcgagtccatgcattagcattcatttgttgggggctcatgccctggagc 44385069  T
Q  620 tttgtactcaacacga 635  Q
    |||||||||| |||||    
T  44385070 tttgtactcaccacga 44385085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 112
Target Start/End: Original strand, 21161735 - 21161835
Alignment:
Q  13 agagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttagaa 111  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  21161735 agagagcaggttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagaagtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattagatgataacttagaa 21161834  T
Q  112 t 112  Q
    |    
T  21161835 t 21161835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 322
Target Start/End: Original strand, 39094571 - 39094872
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    ||||||||||||||| ||  || |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||| |||||||| ||| | ||| |||||||    
T  39094571 cagagagcatgttgattttcgtgttttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtgtattaaagattagaggatgacttaga 39094670  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    |  |||||||||| |           |||| | |||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39094671 acgagattgaacccga----------aacaaccttagttggaaatctggcaagtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 39094760  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    |||||||||   |||| ||  || || ||| || | ||||||||| |||| ||||| | |  |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||  ||     
T  39094761 actgagtgcttttgagaatgtcgtgacctgagttgaatgaattgagtagaaatggaacttaaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatt 39094860  T
Q  311 tgtgaagttgtt 322  Q
    ||| ||||||||    
T  39094861 tgttaagttgtt 39094872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 134 - 219
Target Start/End: Original strand, 24433980 - 24434065
Alignment:
Q  134 tagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 219  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24433980 tagaacaaccttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 24434065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 144 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 15538801 - 15538726
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15538801 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 15538726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 134 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 15532251 - 15532166
Alignment:
Q  134 tagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 219  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15532251 tagaacaaccttagttgggattctggcttgtactcgccatgccgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 15532166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 229
Target Start/End: Original strand, 16231105 - 16231313
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||   || ||| || ||||| ||| |  || | |||||    
T  16231105 cagagagcatgtcgaattctgagttttcgacttttgatttgaaccttagatgtctttgagtacccttaggtgtctactaaagattagagaatgatttaga 16231204  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    | ||||||||||||||          |||| | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16231205 acaagattgaacctgg----------aacaaccttagttgagaatctggcttgtactcgccatggcgagaagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 16231294  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggat 229  Q
    ||||||||||  |||||||    
T  16231295 actgagtgcatttgaggat 16231313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 132 - 219
Target Start/End: Original strand, 17828324 - 17828411
Alignment:
Q  132 cttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 219  Q
    ||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17828324 cttagaacatccttagttgttattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 17828411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22029033 - 22028825
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |  ||| || ||  | ||| |  || | |||||    
T  22029033 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttaagtgtctactattgattagagaatgatttaga 22028934  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    | || |||||||||||          |||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22028933 acaacattgaacctgg----------aacaaccttagttgggaatctggctagtactcgccatggcaagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 22028844  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggat 229  Q
    ||||||||||  |||||||    
T  22028843 actgagtgcatttgaggat 22028825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 144 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 23834526 - 23834441
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggat 229  Q
    ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  23834526 ttagttgagaatctggcttgtactcgcgatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcatttgaggat 23834441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 454 - 634
Target Start/End: Original strand, 18879287 - 18879466
Alignment:
Q  454 cctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgga-taaataagagatgatg 552  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||    |||||||||||||| || ||||||| |  |     
T  18879287 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg---ttccaaattattggattatataagaggttgtc 18879383  T
Q  553 attgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
    |||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  18879384 attaagatgtttaagaggtcgagttcatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacg 18879466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 146 - 218
Target Start/End: Original strand, 23846770 - 23846842
Alignment:
Q  146 agttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 218  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23846770 agttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 23846842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 144 - 219
Target Start/End: Original strand, 30308507 - 30308582
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 219  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30308507 ttagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagctaatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 30308582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 144 - 218
Target Start/End: Original strand, 22113481 - 22113555
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 218  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22113481 ttagttgggaagctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 22113555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 144 - 218
Target Start/End: Original strand, 22134984 - 22135058
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 218  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22134984 ttagttgggaagctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 22135058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 134 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 18619841 - 18619756
Alignment:
Q  134 tagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 219  Q
    ||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18619841 tagaacaaccttacttggaattctggcttgtactcgtcatggcgagctgatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 18619756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 454 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 23406444 - 23406263
Alignment:
Q  454 cctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataa-ataagagatgatg 552  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||    ||||||||||||||| | ||||||| |  |     
T  23406444 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt---tccaaattattggattatataagaggttgtc 23406348  T
Q  553 --attgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
      |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  23406347 gaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacg 23406263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 144 - 218
Target Start/End: Original strand, 22166134 - 22166208
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 218  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  22166134 ttagttgggaagctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcaagcacttccagaattgagtg 22166208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 144 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 22045211 - 22045138
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagt 217  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22045211 ttagttgggaatctggcttgtacttgtcatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagacctgagt 22045138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 454 - 634
Target Start/End: Original strand, 18818465 - 18818646
Alignment:
Q  454 cctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataa-ataagagatgatg 552  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||    ||||||||||||||| | ||||||| |  |     
T  18818465 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt---tccaaattattggattatataagaggttgtc 18818561  T
Q  553 --attgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttggggg-ctcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
      |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  18818562 gaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggattgatgccctggagctttgtactcaacacg 18818646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 454 - 634
Target Start/End: Original strand, 21919056 - 21919237
Alignment:
Q  454 cctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatg- 552  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||| ||    ||||||||||||||| ||||  ||| | ||     
T  21919056 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt---tccaaattattggattaatataagaggttgt 21919152  T
Q  553 ---attgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
       |||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  21919153 cgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattca-ttgttgcgggcttgatgccctggagctttgtactcaccacg 21919237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 157 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 43252153 - 43252092
Alignment:
Q  157 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 218  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43252153 tggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 43252092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 73
Target Start/End: Original strand, 25362770 - 25362830
Alignment:
Q  13 agagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtg 73  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  25362770 agagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtg 25362830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 157 - 216
Target Start/End: Original strand, 17055155 - 17055214
Alignment:
Q  157 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgag 216  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17055155 tggcttgtagtcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgag 17055214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 454 - 635
Target Start/End: Original strand, 28649100 - 28649286
Alignment:
Q  454 cctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacct-ccaaattattggataa-ataagagatgat 551  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||   | |||||||||||||| | ||||||| |  |    
T  28649100 cctatgttgcttttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgatgtttccaaattattggattatataagaggttgt 28649199  T
Q  552 g--attgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
       |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  28649200 cgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccttggagccttgtactcaacacga 28649286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 157 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 32599018 - 32598959
Alignment:
Q  157 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  32599018 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgccttgcgagcacttccagaattgag 32598959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 157 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 32605550 - 32605491
Alignment:
Q  157 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  32605550 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgccttgcgagcacttccagaattgag 32605491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 134 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 20527812 - 20527736
Alignment:
Q  134 tagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    ||||||| | ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20527812 tagaacaacattagttgggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccaga 20527736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 439 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 23648633 - 23648432
Alignment:
Q  439 tgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaaga---tgatgttgaacctccaaattattgg 535  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||| || |||||||| ||| ||||   ||||| |||   |||||||||||||    
T  23648633 tgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattgg 23648534  T
Q  536 a-taaataagagatgat--gattgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaac 631  Q
    | || ||||||| |  |   |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||      ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  23648533 actatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcacagttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaac 23648434  T
Q  632 ac 633  Q
    ||    
T  23648433 ac 23648432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 469 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 21255272 - 21255106
Alignment:
Q  469 ttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatg----attgtgatgttt 564  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||| ||    ||||||||||||||| ||||  ||| | ||    |||  | |||||    
T  21255272 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt---tccaaattattggattaatataagaggttgtcgaattaagttgttt 21255176  T
Q  565 aagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  21255175 aagaggtcgagtccatgcattagcattca-ttgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacg 21255106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 454 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 31971322 - 31971140
Alignment:
Q  454 cctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatg- 552  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||| ||    ||||||||||||||  ||||  ||| | ||     
T  31971322 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt---tccaaattattggactaatataagaggttgt 31971226  T
Q  553 ---attgtgatgttt-aagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
       |||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  31971225 cgaattaagttgttttaagagatcgagtccatgcattagcattca-ttgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacg 31971140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 573 - 618
Target Start/End: Original strand, 20856602 - 20856647
Alignment:
Q  573 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggag 618  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20856602 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggag 20856647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 157 - 218
Target Start/End: Original strand, 21972350 - 21972411
Alignment:
Q  157 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 218  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  21972350 tggcctgtactcgccacggcgagcagatgctctcgccccgcgagcacttccagaattgagtg 21972411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 157 - 218
Target Start/End: Original strand, 21976435 - 21976496
Alignment:
Q  157 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 218  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  21976435 tggcctgtactcgccacggcgagcagatgctctcgccccgcgagcacttccagaattgagtg 21976496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 454 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 7372843 - 7372661
Alignment:
Q  454 cctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgga-taaataagagatgat- 551  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||    |||||||||||||| || ||||||| |  |     
T  7372843 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg---ttccaaattattggattatataagaggttgtc 7372747  T
Q  552 -gattgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
      |||  |||||||||||| | |||||||||||| | |||    ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  7372746 gaattaagatgtttaagaggttgagtccatgcatcaacatttcattgttgggggcttgatgcactggagctttgtactcaacacga 7372661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 454 - 632
Target Start/End: Original strand, 21923984 - 21924162
Alignment:
Q  454 cctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgga-taaataagagatgat- 551  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||    |||||||||||||| ||  |||||| |  |     
T  21923984 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg---ttccaaattattggattatgtaagaggttgtc 21924080  T
Q  552 -gattgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaaca 632  Q
      |||  |||||||||||| || |||||||||||||||||    |||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||    
T  21924081 gaattaagatgtttaagaggtcaagtccatgcattagcatttcattgttggggcttaatgccctggagctttgtacgcaaca 21924162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 560 - 634
Target Start/End: Original strand, 5866437 - 5866511
Alignment:
Q  560 tgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  5866437 tgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattca-ttgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacg 5866511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 560 - 634
Target Start/End: Original strand, 16199807 - 16199881
Alignment:
Q  560 tgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  16199807 tgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattca-ttgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacg 16199881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 469 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 21249434 - 21249268
Alignment:
Q  469 ttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatg----attgtgatgttt 564  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||| ||    ||||||||||||||| ||||  ||| | ||    |||  | |||||    
T  21249434 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt---tccaaattattggattaatataagaggttgtcgaattaagttgttt 21249338  T
Q  565 aagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
    |||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  21249337 aagaggccgagtccatgcattagcattca-ttgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacg 21249268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 454 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 22626801 - 22626618
Alignment:
Q  454 cctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgga-taaataagagatgat- 551  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||    | |||||||||||| || ||||||| |  |     
T  22626801 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg--ttttcaaattattggattatataagaggttgtc 22626704  T
Q  552 -gattgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
      |||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||    ||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  22626703 gaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattaacatttcattgttggaggcttgatgccctggagccttgtactcaacacga 22626618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 560 - 634
Target Start/End: Original strand, 45131159 - 45131233
Alignment:
Q  560 tgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  45131159 tgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattca-ttgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacg 45131233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 466 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 17140969 - 17140800
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatg----attgtgatg 561  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||| ||    ||||||||||||||| ||||  ||| | ||    |||  | ||    
T  17140969 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt---tccaaattattggattaatataagaggttgtcgaattaagttg 17140873  T
Q  562 tttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| || |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  17140872 tttaagaggtcgagtccatacattagtattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacg 17140800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 438 - 512
Target Start/End: Original strand, 18678142 - 18678216
Alignment:
Q  438 ctgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatg 512  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||| ||| ||||||    
T  18678142 ctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 18678216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 573 - 635
Target Start/End: Original strand, 39095102 - 39095164
Alignment:
Q  573 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||    
T  39095102 gagtctatgcattagcatacatatgttgggggctcatgccctggagcttagtcctcaccacga 39095164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 218
Target Start/End: Original strand, 19278050 - 19278110
Alignment:
Q  157 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 218  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  19278050 tggcttgtact-gccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcactttcagaattgagtg 19278110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 32 - 76
Target Start/End: Original strand, 5865915 - 5865959
Alignment:
Q  32 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5865915 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 5865959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 12 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 22057824 - 22057768
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgttttt 68  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22057824 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgctttt 22057768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 461 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 41598243 - 41598086
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataa-ataagagatgatgattgt-- 557  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||   ||  ||||||||||||||| | ||||||| |  | | | |      
T  41598243 tgctgttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg---aagttccaaattattggattatataagaggttgtcaatttaa 41598147  T
Q  558 gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggag 618  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||||    
T  41598146 gatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattca-ttgttgggggcttgatgccctggag 41598086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 560 - 634
Target Start/End: Original strand, 21389613 - 21389687
Alignment:
Q  560 tgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  21389613 tgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattca-tagttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacg 21389687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 560 - 634
Target Start/End: Original strand, 21396143 - 21396217
Alignment:
Q  560 tgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  21396143 tgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattca-tagttgggggctttatgccctggagctttgtactcaccacg 21396217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 466 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 21491048 - 21490878
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatg----attgtgatg 561  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||| ||    |||||||||||| || ||||  ||| | ||    |||  ||||    
T  21491048 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt---tccaaattattgaattaatataagaggttgtcgaattaagatg 21490952  T
Q  562 ttt-aagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  21490951 ttttaagaggtcgagtccatgcattagcattc-gttgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacg 21490878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 560 - 634
Target Start/End: Original strand, 21778939 - 21779013
Alignment:
Q  560 tgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  21778939 tgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattca-tagttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacg 21779013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 560 - 634
Target Start/End: Original strand, 21790636 - 21790710
Alignment:
Q  560 tgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  21790636 tgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattca-tagttgggggctttatgccctggagctttgtactcaccacg 21790710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 72
Target Start/End: Original strand, 23252393 - 23252452
Alignment:
Q  13 agagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 72  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  23252393 agagagcatgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 23252452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 466 - 619
Target Start/End: Original strand, 45290807 - 45290961
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgga-taaataaga-gatgatga-ttgtgatgt 562  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||   |||||||||  |||||||||||||| || |||||| | ||  || ||  |||||    
T  45290807 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa---gatgttgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgt 45290903  T
Q  563 ttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagc 619  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||| | ||||||||||||    
T  45290904 ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 45290961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 466 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 20536261 - 20536092
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgga-taaataagaga-tgatg-attgtgatgt 562  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||    |||||||||||| | || |||||||| || || |||  |||||    
T  20536261 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg---ttccaaattattgaattatataagagattgttgaattaagatgt 20536165  T
Q  563 ttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttggggg-ctcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
     |||||| || |||||||||||||||||    ||||||||||  | ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  20536164 ctaagaggtctagtccatgcattagcatttcattgttgggggtttgatgccctagagctttgtactcaccacg 20536092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 21249862 - 21249812
Alignment:
Q  34 atttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgt 84  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  21249862 atttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcccaaacatgt 21249812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 21255700 - 21255650
Alignment:
Q  34 atttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgt 84  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  21255700 atttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcccaaacatgt 21255650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 438 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 32121813 - 32121739
Alignment:
Q  438 ctgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatg 512  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||  ||||||| ||| ||||||    
T  32121813 ctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattctaagttgattaagatg 32121739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 466 - 546
Target Start/End: Original strand, 38855319 - 38855396
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagag 546  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||    |||||||||||||||| |||||||    
T  38855319 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg---ttccaaattattggatatataagag 38855396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 473 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 4483324 - 4483208
Alignment:
Q  473 ttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataa-ataagagatgat-gattgtgatgtttaagaga 570  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||   ||  ||||||||||||||| | ||||||| |  | ||||  ||||||||||||     
T  4483324 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg---aagttccaaattattggattatataagaggttgtcgattaagatgtttaagagg 4483228  T
Q  571 tcgagtccatgcattagcat 590  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  4483227 tcgagtccatgcattagcat 4483208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 461 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 6759316 - 6759158
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgga-taaataaga-gatgatga-ttgt 557  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||    |||||||||||||| || |||||| | ||  || ||      
T  6759316 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg----tccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaa 6759221  T
Q  558 gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagc 619  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||    ||||||||||| | ||||||||||||    
T  6759220 gatgtttaagaggttgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 6759158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 342 - 590
Target Start/End: Original strand, 16092292 - 16092534
Alignment:
Q  342 tatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttttatttgatatcgttatatgatgttatactgt 441  Q
    |||||||||||||||||||  |  ||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||| |   ||  |||||||||     ||| |||| || ||||    
T  16092292 tatgatgtgatataatgttatac-gcattacttaaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatat-----tattatgtcatgctgt 16092385  T
Q  442 tgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataa-a 540  Q
    | |||||  || ||| || |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||    |||||| |||||||| | |    
T  16092386 ttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt---tccaaactattggattata 16092482  T
Q  541 taagagatgat-gattgt-gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcat 590  Q
    |||||| |  | ||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16092483 taagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcat 16092534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 17141397 - 17141352
Alignment:
Q  31 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17141397 tgtattttttacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 17141352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 76
Target Start/End: Original strand, 16199296 - 16199340
Alignment:
Q  32 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  16199296 gtatttttgacttttgagttgaaccttggatgcttttgagtgcct 16199340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 18619954 - 18619890
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    ||||||||| ||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  18619954 cagagagcaagttgttttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacct 18619890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 22045334 - 22045270
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||    
T  22045334 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagttgaaccttagatgcctttgagtacct 22045270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 76
Target Start/End: Original strand, 45130669 - 45130713
Alignment:
Q  32 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  45130669 gtatttttgacttttgaattgaaccttagatgcttttgagtgcct 45130713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 149 - 200
Target Start/End: Original strand, 21918756 - 21918807
Alignment:
Q  149 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 200  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21918756 tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 21918807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 466 - 619
Target Start/End: Original strand, 26225359 - 26225513
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgga-taaataaga-gatgatga-ttgtgatgt 562  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||   ||||  |||||| ||||||| || |||||| | ||  || ||  |||||    
T  26225359 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga---tgaagttccaaagtattggattatataagaggttgtcgatttaagatgt 26225455  T
Q  563 ttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagc 619  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||| | ||||||||||||    
T  26225456 ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 26225513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 1484457 - 1484403
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  1484457 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 1484403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Original strand, 4542480 - 4542534
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  4542480 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 4542534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Original strand, 5853399 - 5853453
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  5853399 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 5853453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 466 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 6520421 - 6520352
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggata 538  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||    ||||||||||||||||    
T  6520421 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg---ttccaaattattggata 6520352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Original strand, 14409551 - 14409605
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  14409551 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 14409605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 19896320 - 19896266
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  19896320 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 19896266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Original strand, 20046302 - 20046356
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  20046302 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 20046356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 20403282 - 20403228
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  20403282 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 20403228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 22001808 - 22001754
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  22001808 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 22001754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 558 - 634
Target Start/End: Original strand, 13508246 - 13508323
Alignment:
Q  558 gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||     |||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  13508246 gatgtttaagaagtcgagtccatgcattagcatttcagtgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacg 13508323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 165 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 21249732 - 21249695
Alignment:
Q  165 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagca 202  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21249732 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagca 21249695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 31 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 21491476 - 21491431
Alignment:
Q  31 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21491476 tgtaattttgacttttaagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 21491431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 35 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 31971724 - 31971683
Alignment:
Q  35 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  31971724 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgtgtgcct 31971683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Original strand, 5866047 - 5866083
Alignment:
Q  165 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagc 201  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5866047 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagc 5866083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 7373228 - 7373188
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  7373228 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 7373188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 558 - 629
Target Start/End: Original strand, 13597778 - 13597850
Alignment:
Q  558 gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactca 629  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||     |||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  13597778 gatgtttaagaagtcgagtccatgcattagcatttcagtgttgggggcttgatgccctggagctttgtactca 13597850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 17141264 - 17141228
Alignment:
Q  165 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagc 201  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17141264 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagc 17141228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Original strand, 18818052 - 18818092
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  18818052 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 18818092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Original strand, 18878879 - 18878919
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  18878879 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 18878919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 20536687 - 20536647
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20536687 ttttgactttcgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 20536647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Original strand, 21918652 - 21918692
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  21918652 ttttgacttttgagttgaaccttagatgctttggagtgcct 21918692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 22627214 - 22627174
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  22627214 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 22627174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 23406860 - 23406820
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  23406860 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 23406820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Original strand, 26355340 - 26355380
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  26355340 ttttgacttttgagttgatccttaaatgtttttgagtgcct 26355380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Original strand, 28648686 - 28648726
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  28648686 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 28648726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 12 - 72
Target Start/End: Original strand, 30308384 - 30308444
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 72  Q
    ||||||||| ||||  |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30308384 cagagagcaagttgttttctgagtttttgatttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 30308444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Original strand, 38854893 - 38854933
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38854893 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 38854933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 39834316 - 39834268
Alignment:
Q  31 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaa 79  Q
    |||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39834316 tgtagttttgacctttaagtcgaaccttagatgtttttgagtgcctaaa 39834268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #123
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 148 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 41598551 - 41598499
Alignment:
Q  148 ttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 200  Q
    |||||| |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41598551 ttgggaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 41598499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #124
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 41598663 - 41598623
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  41598663 ttttgacttttgagttgacccttagatgcttttgagtgcct 41598623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #125
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 461 - 512
Target Start/End: Original strand, 16413423 - 16413474
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatg 512  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  16413423 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 16413474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #126
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 19905830 - 19905783
Alignment:
Q  163 gtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||    
T  19905830 gtactcgccatggcgagtaggaactctcgcctcgcgagcacttccaga 19905783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #127
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 466 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 21285650 - 21285599
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgtt 517  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||    
T  21285650 ttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagaagatgtt 21285599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #128
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 83
Target Start/End: Original strand, 21414869 - 21414916
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatg 83  Q
    |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21414869 tttttactttttagtggaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatg 21414916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #129
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 196
Target Start/End: Original strand, 25362896 - 25362943
Alignment:
Q  149 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcg 196  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25362896 tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcg 25362943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #130
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 466 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 26219767 - 26219613
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataa-ataagagatgat-gattgt-gatgt 562  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||   ||  |||||| |||||||| | ||||||| |  | ||||   |||||    
T  26219767 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattatgatgatg---aagttccaaagtattggattatataagaggttgtcgatttaagatgt 26219671  T
Q  563 ttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagc 619  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||| | ||||||||||||    
T  26219670 ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 26219613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #131
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 32599153 - 32599094
Alignment:
Q  13 agagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 72  Q
    |||||||||||||| ||  |  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  32599153 agagagcatgttgattttcgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 32599094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #132
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 32605685 - 32605626
Alignment:
Q  13 agagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 72  Q
    |||||||||||||| ||  |  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  32605685 agagagcatgttgattttcgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 32605626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #133
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 36 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 6759736 - 6759698
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgc 74  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  6759736 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgc 6759698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #134
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Original strand, 15203338 - 15203392
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||    
T  15203338 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgctctaagttgattaagatgatg 15203392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #135
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 36 - 74
Target Start/End: Original strand, 16091983 - 16092021
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgc 74  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  16091983 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgc 16092021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #136
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 35 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 23649033 - 23648995
Alignment:
Q  35 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtg 73  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  23649033 tttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtg 23648995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #137
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 454 - 500
Target Start/End: Original strand, 45131052 - 45131098
Alignment:
Q  454 cctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaag 500  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  45131052 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 45131098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #138
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 465 - 517
Target Start/End: Original strand, 983473 - 983523
Alignment:
Q  465 attgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgtt 517  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||    
T  983473 attgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagatgatgtt 983523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #139
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 6520847 - 6520810
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtg 73  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6520847 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtg 6520810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #140
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 15532341 - 15532300
Alignment:
Q  35 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||    
T  15532341 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacct 15532300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #141
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 15538901 - 15538860
Alignment:
Q  35 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||    
T  15538901 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacct 15538860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #142
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 466 - 515
Target Start/End: Original strand, 19937118 - 19937167
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||    
T  19937118 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatg 19937167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #143
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 21255570 - 21255533
Alignment:
Q  165 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagca 202  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  21255570 actcgccatggcgagcagcggctctcgcctcgcgagca 21255533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #144
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 73
Target Start/End: Original strand, 21923570 - 21923607
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtg 73  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  21923570 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtg 21923607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #145
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 72
Target Start/End: Original strand, 22113381 - 22113418
Alignment:
Q  35 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  22113381 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 22113418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #146
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 72
Target Start/End: Original strand, 22134884 - 22134921
Alignment:
Q  35 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  22134884 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 22134921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #147
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 72
Target Start/End: Original strand, 22166034 - 22166071
Alignment:
Q  35 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  22166034 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 22166071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #148
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 23834626 - 23834585
Alignment:
Q  35 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||    
T  23834626 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacct 23834585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #149
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 72
Target Start/End: Original strand, 24433890 - 24433927
Alignment:
Q  35 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  24433890 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 24433927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #150
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 12 - 72
Target Start/End: Original strand, 17055019 - 17055079
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 72  Q
    ||||||||||||||| ||  |  ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  17055019 cagagagcatgttgattttcgagtttttgacttttgagttgaactttagatgcctttgagt 17055079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #151
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 21674184 - 21674144
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  21674184 ttttgacttttgagttgatccttggacgtttttgagtgcct 21674144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #152
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 342 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 22875235 - 22875176
Alignment:
Q  342 tatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttg 402  Q
    |||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  22875235 tatgatgtgatataatgttatac-gcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttg 22875176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #153
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 148 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 22875432 - 22875380
Alignment:
Q  148 ttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 200  Q
    |||||| |||| | || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  22875432 ttgggaatctgacctgaactcgccatgacgagcagaggctctcgcctcgcgag 22875380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #154
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 558 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 22965661 - 22965629
Alignment:
Q  558 gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcat 590  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22965661 gatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcat 22965629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #155
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 35 - 63
Target Start/End: Original strand, 23844567 - 23844595
Alignment:
Q  35 tttttgacttttgagttgaaccttagatg 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23844567 tttttgacttttgagttgaaccttagatg 23844595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #156
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 558 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 32121687 - 32121655
Alignment:
Q  558 gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcat 590  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32121687 gatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcat 32121655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #157
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 39834182 - 39834146
Alignment:
Q  165 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagc 201  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  39834182 actcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagc 39834146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 421; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 421; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 635
Target Start/End: Original strand, 8576 - 9200
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  8576 cagagagcatgtaaaattcggtatttttgacctttgagttgaaccttagatgtttttgagtccctgaagatgcctattaaagattaaatgataacttaga 8675  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    |  ||||||||||| ||||| | ||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8676 acgagattgaacctagtttaacctagaacaacatttgttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 8775  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  8776 actgagtgcaagtgaggatattgcgacctgtgtcgcataattcgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgtaatc 8875  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttt 410  Q
    ||||||| |||||||| |||||  || |||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||     
T  8876 tgtgaagctgttatgaaatgttgatgttgaatatgatgtgagatgatgtttgatttcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgatgcttgcttg 8975  T
Q  411 tatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaaga 510  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| | ||||  ||||||||    
T  8976 tatttgatatcgttatatgatgtcataatgttgttgtaatctgcctatgctgctattattatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaaga 9075  T
Q  511 tgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatg 610  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9076 tgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattatgatgtttaagaaatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatg 9175  T
Q  611 ccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  9176 ccctggagctttgtactcaacacga 9200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 466 - 513
Target Start/End: Original strand, 1393 - 1440
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatga 513  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  1393 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 1440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 558 - 590
Target Start/End: Original strand, 1482 - 1514
Alignment:
Q  558 gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcat 590  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1482 gatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcat 1514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 421; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 421; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 18740 - 18116
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18740 cagagagcatgtagaataccgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattaaatgataacttaga 18641  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  18640 atgagattgaacctggtttagcttagaacatcattagtttggaatctggcttgtactcgccatggcgagcaaatgctctcgcctcacgagcgcttccaga 18541  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  18540 actgagtgcaagtgaggatattgcgatatgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgacctatataagaagttaactgcaatc 18441  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttt 410  Q
    ||||||| |||||||| |||||| || ||| |||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||    
T  18440 tgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgattatgatgtgagattacgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgatgcatacttt 18341  T
Q  411 tatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaaga 510  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| | | ||||||| ||| | ||||  ||||||||    
T  18340 tatttgatatcgttatgtgatgtcatactgttgttgcaatctgcctatgctgctattgttaattaactatgttgcatgagtcgatataagatgatcaaga 18241  T
Q  511 tgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatg 610  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18240 tgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattatgatgtttaagaagtcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcata 18141  T
Q  611 ccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||    
T  18140 ccctggagcttagtactgaacacga 18116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 147 - 218
Target Start/End: Original strand, 76927 - 76998
Alignment:
Q  147 gttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 218  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  76927 gttgggaagctggcttgtactcgccatggcaagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 76998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 417; Significance: 0; HSPs: 170)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 417; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 13570012 - 13569381
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  13570012 cagagagcatgtagaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaaggtggttattaaagattaaatgataacttaga 13569913  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13569912 atgagattgaacctggtttagcttagaacaacattagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 13569813  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  13569812 actgagtgcaagtgaggatattgcgatccgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtattaatgtgacctatataagaagttaactgcaatc 13569713  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgc------t 404  Q
    ||||||| |||||||| |||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||      |    
T  13569712 tgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgagatgatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgatgcttacttt 13569613  T
Q  405 tgtttttatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcga 504  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| | | ||||||| | | | ||||  ||    
T  13569612 tatttttatttgatatcgttatgtgatgtcatactgttgttgcaatctgcctatgctgttattgttatttaactatgttgcatgagttgatataagatga 13569513  T
Q  505 tcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatg-tttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggg 603  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13569512 tcaagatgatgttcaacctccaaattattggatacataagagatgatgattaatatgttttaagagatcgagtccatgcattagcatacatatgttgggg 13569413  T
Q  604 gctcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13569412 gctcatgccctggagcttagtactcaacacga 13569381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 389; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 44676132 - 44675511
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  44676132 cagagagcatgtagaattctatatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaatgattaaatgataacttaga 44676033  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44676032 atgagattgaacctggtttagcttagaacaacattagttgggaatctggctagtactccccatggcgagcagatgctctcacctcgcgagcacttccaga 44675933  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||     
T  44675932 actgagtgcaagtgaggatgttgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctaggtagtaatgtgacctatttaagaagttaactgcaatc 44675833  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttt 410  Q
    ||||||| |||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |    |||    
T  44675832 tgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatttaatgattaattgcattacttgagttatgaatgagtgattgaaatgttac----ttt 44675737  T
Q  411 tatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaaga 510  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||| | | ||||  ||||||||    
T  44675736 tatttgatatcgttatgtgatgtcatactgttgttgcaatatgcctatactgctattgttatttaactatgttgcatgaatagatataagatgatcaaga 44675637  T
Q  511 tgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatg-tttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcat 609  Q
     |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44675636 cgatgttgaacctccaaattactggatacataagagatgatgattaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcatacatatgttgggggctcat 44675537  T
Q  610 gccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    
T  44675536 gccctggagcttagtactcaacacga 44675511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 378; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 23843979 - 23843357
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||    
T  23843979 cagagagcatgtagaattctgtacttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgttcattaatgattaaatgataacttgga 23843880  T
Q  111 ataagatt-gaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccag 209  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23843879 atgagatttgaacctggtttagcttagaacaacattagttgaaaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccag 23843780  T
Q  210 aactgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaat 309  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  23843779 aactgagtgcaagtgaggatgttgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtggtaatgtgacctatataagatgttaactgcaat 23843680  T
Q  310 atgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgttt 409  Q
     ||||||| |||||||| |||||| || ||| ||| ||||| | ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    ||    
T  23843679 ctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgattataatgtgttttaatgattaattgtattacttgagttatgaatgagtgattgagatgttgc----tt 23843584  T
Q  410 ttatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaag 509  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||| | ||||  ||||||     
T  23843583 ttatttgatatcgttatgtgatgtcatactgttgtttcaatctgtctatgctgctattgttatttaactatgttgcatgagtcgatataagatgatcaaa 23843484  T
Q  510 atgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatg-tttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctca 608  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23843483 atgatgttgaacctccaaattattggatacataagagatgatgattaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcatacatatgttgggggctca 23843384  T
Q  609 tgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  23843383 tgccctggagcttagtactcaacacga 23843357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 12570521 - 12569894
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  12570521 cagagagcatgtagaattctgtatttttgacttgtgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatatttattaaagattagatgatgacttaga 12570422  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12570421 gtgagattgaacctggtttagcttagaacaactttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 12570322  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    |||||||||||||||| |    |||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||     
T  12570321 actgagtgcaagtgagaactttgcgacctgtgtcgcataacttgtttagagatggacccttgggtagtaatgtgacctatataggatgttaactgcaatc 12570222  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaa----ttatgaatgaatgattgagatgttgcttg 406  Q
    ||||||| |||||||| ||||||  | ||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    | ||||||||||||||||| || ||||||    
T  12570221 tgtgaagctgttatgaaatgtta-agttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatgttaatgaatgaatgattgagttgatgcttg 12570123  T
Q  407 tttttatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatc 506  Q
     |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||  | ||||  |||     
T  12570122 attttatttgatatctttatatgatgtcataatgttgttgtgatctgcttatgctgctattgttatttaactatgatgcatgagtctatataagatgatt 12570023  T
Q  507 aagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatg-tttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc 605  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12570022 aagatgatgttgaa-ctccaaattattggatatataagagatgatgattaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcatacatatgttgggggc 12569924  T
Q  606 tcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    | || ||||||||||| |||||||||||||    
T  12569923 ttataccctggagcttagtactcaacacga 12569894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 15094273 - 15093654
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||    
T  15094273 cagaaagcatgtagaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattagatgataacttgga 15094174  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15094173 atgagattgaacctggtatagcttagaacaactttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagctgatgctctcgcctcgcgagcacttccaaa 15094074  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  15094073 actgagtgcaagttaggatattgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttggttagtaatgtgacctatataagaagttaactgcaatc 15093974  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttt 410  Q
    | ||||| |||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |  ||| | ||||||||| | ||||||      |     
T  15093973 tctgaagctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataatg-ttatgtgcattacttaatatattattgaatgattaatatgttgtagaaatg 15093875  T
Q  411 tatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaaga 510  Q
     | |||||||     ||||| || || |||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||  |  |||  ||| ||||    
T  15093874 aaattgatat-----tatgaagtcatgctgttgttgtgatctttctatgctgctattgttctttaactaagttgcatgagtcaatacaagatgattaaga 15093780  T
Q  511 tgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatg-tttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcat 609  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15093779 tgatgttgaacctccaaattattggatatataagagatgatgattaagatgtttttagagatcgagtccatgcattagcatacatatgttgggggctcat 15093680  T
Q  610 gccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    
T  15093679 gccctggagcttagtactcaacacga 15093654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 12 - 635
Target Start/End: Original strand, 15121422 - 15122038
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  15121422 cagagagcatgttgaattatgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattagatgatgacttaga 15121521  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15121522 gtgagattgaacctggtttagcttagaacaactttagttgggaatctggcttgtactcgccatggtgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 15121621  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    | |||||||||||||| |    ||||||||||||| || | ||| ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15121622 attgagtgcaagtgagaactttgcgatctgtgtcgaataacttgtttagacatggaccattaggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatc 15121721  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttt 410  Q
    ||||| | || ||||||||||| | | ||| ||||||||  |||||||||||  |||||||||||||   | | || ||   | ||||||||  ||  ||    
T  15121722 tgtgaggctgatatgagatgtttgagttgattatgatgtattataatgttta--tgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttg-atgaatt 15121818  T
Q  411 tatttgatatcgttat-atgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaag 509  Q
     | |||||||  |||| |||||       | |||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||| | ||||  ||| |||    
T  15121819 gaattgatataattatcatgat-------tattgttgtaatctgcctatgctgatattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaag 15121911  T
Q  510 atgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatg-tttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctca 608  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15121912 atgatgttgaacctccaaattattggatatatatgagatgatgattaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctca 15122011  T
Q  609 tgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  15122012 tgccctggagctttgtactcaccacga 15122038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 12 - 629
Target Start/End: Original strand, 16356572 - 16357182
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| | |||||    
T  16356572 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgatttaga 16356671  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16356672 acgagattgaacctggtttagcttagaacaacttaagctggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 16356771  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    ||||| ||||||| || ||   ||||||||| |||||| | |||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||     
T  16356772 actgaatgcaagttagtatgttgcgatctgtttcgcataagttgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatc 16356871  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttt 410  Q
    ||||||| |||| |||  || ||  | |   | | ||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||| | ||||||||  |||||||| | |   |    
T  16356872 tgtgaagctgtt-tgaactgcta-agttttttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg-tggaaat 16356968  T
Q  411 tatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaaga 510  Q
     | |||||||     |||||  |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||  | ||||  ||  ||||    
T  16356969 gaattgatat-----tatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataaga 16357063  T
Q  511 tgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatgtttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcat 609  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||  ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16357064 tgatgttgaa-ctccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcat 16357162  T
Q  610 gccctggagctttgtactca 629  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  16357163 gccctggagctttgtactca 16357182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 12 - 629
Target Start/End: Original strand, 16487697 - 16488308
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||    
T  16487697 cagagagcatgtcgaattctgtatttttgacttttgagttaaaccttagatgcctttgggtgcctaaagatgtttattaaagattagatgatgatttaga 16487796  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16487797 acgagattgaacctgttttagcttagaaccactttagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 16487896  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    ||||| ||||||| |||||   ||||||||| |||||| | |||||| | ||||||||||| |||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||  ||     
T  16487897 actgaatgcaagttaggatgttgcgatctgtttcgcataagttgatttgggatggacccttaggtagtaatgtgtcctatttaagatgttaattgagatc 16487996  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttt 410  Q
    ||||||| |  |||||  |||||  ||||| ||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||| | ||||||||  |||||||| |||        
T  16487997 tgtgaagctactatgaactgtta-agctgattataatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg-ttgaaaa 16488094  T
Q  411 tatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaaga 510  Q
     | |||||||     ||||| ||||| ||| | |||| ||||   |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||  |  |||  ||| ||||    
T  16488095 gaattgatat-----tatgaagttatgctgcttttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaaga 16488189  T
Q  511 tgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatg-tttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctca 608  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||  |||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  16488190 tgatgttgaa-ctccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtacatgcattagcatacattcgtt-ggggctca 16488287  T
Q  609 tgccctggagctttgtactca 629  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  16488288 tgccctggagctttgtactca 16488308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 12 - 369
Target Start/End: Original strand, 15124773 - 15125130
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    ||||||||||||  || |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  15124773 cagagagcatgtataactctgtacttttgacctttgagtcgaaccttagatatttttgagtgcctgaagatgcctattaaagattaaatgataacttaga 15124872  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15124873 acgagattgaacctggtttagcttagaacaacattagttgggaatctggcttgtactcgccatggcaagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 15124972  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    ||||||||||||||||||||   |||| |||||||||| | ||| |||||| ||||||| |||||||||| | ||||| | ||| | ||||||||||||     
T  15124973 actgagtgcaagtgaggatatttcgatatgtgtcgcataatttgtttagagttggacccctgggtagtaaagtgacctttttaa-atgttaactgcaatc 15125071  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcat 369  Q
    ||||||| |||||||| |||||| || ||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  15125072 tgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgattataatgtgatttaatgattaattgcat 15125130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 193 - 629
Target Start/End: Original strand, 16348466 - 16348894
Alignment:
Q  193 ctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatat 292  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||   ||||||||| |||||| | |||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||| |    
T  16348466 ctcgcgagcatttccagaactgaatgcaagttagtatgttgcgatctgtttcgcataagttgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctattt 16348565  T
Q  293 aagaagttaactgcaatatgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgat 392  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||| | || | |  || ||  | ||  | | ||||||| ||||| |||| |||||||||| || ||| | ||||| ||    
T  16348566 aagatgttaactgaaatctgtgaagctttt-taaactgctaa-gttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttaaaatattattgaattat 16348663  T
Q  393 tgagatgttgcttgtttttatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatc 492  Q
      |||||||| | |   | | |||||||     |||||  |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||    
T  16348664 caagatgttg-tggaaatgaattgatat-----tatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 16348757  T
Q  493 ggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatgtttaaga-gatcgagtccatgcattagcata 591  Q
      | ||||  ||  ||||||||||||||| || ||||||||||||  ||| ||||||||||||  ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  16348758 attataagatgaataagatgatgttgaac-tctaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcata 16348856  T
Q  592 catttgttgggggctcatgccctggagctttgtactca 629  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16348857 catttgttgggggctcatgccctggagctttgtactca 16348894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 170
Target Start/End: Original strand, 16348311 - 16348470
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||| | |||||    
T  16348311 cagagagcatgttgaattctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatatttattaaagattagatgatgatttaga 16348410  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgc 170  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  16348411 acgagattgaacctggtttagcttagaacaacttaagctggaattctggcttgtactcgc 16348470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 507 - 635
Target Start/End: Original strand, 15125150 - 15125279
Alignment:
Q  507 aagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatgttt-aagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc 605  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15125150 aagatgatgtcgaacctccaaattattggatacataagagatgatgattaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcatacatatgttgggggc 15125249  T
Q  606 tcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  15125250 tcattccctggagcttagtactcaacacga 15125279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 229
Target Start/End: Original strand, 36133592 - 36133800
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||  || ||  |  ||||| ||| | ||| |||||||    
T  36133592 cagagagcatgttgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctgctaaagattagaggatgacttaga 36133691  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    | ||||||||||||||          |||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36133692 acaagattgaacctgg----------aacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 36133781  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggat 229  Q
    ||||||||||  |||||||    
T  36133782 actgagtgcatttgaggat 36133800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 523 - 635
Target Start/End: Original strand, 17048435 - 17048549
Alignment:
Q  523 tccaaattattgga-taa-ataagagatgatgattgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagct 620  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17048435 tccaaattattggactaatataagagatgatgattatgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagct 17048534  T
Q  621 ttgtactcaacacga 635  Q
    ||||||||| |||||    
T  17048535 ttgtactcaccacga 17048549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 305
Target Start/End: Original strand, 11250191 - 11250474
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||| ||||| ||| | ||| | |||||    
T  11250191 cagagagcatgttgattttcgtattttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtttactaaagattagaggatgatttaga 11250290  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    | ||||||||||||||          |||| | |||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11250291 acaagattgaacctgg----------aacaaccttagttggaaatctggcaagtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 11250380  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactg 305  Q
    |||||||||   |||  ||  || || ||| || | |||||||||||||  ||||| | || ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  11250381 actgagtgcttttgataatgtcgtgacctgagttgaatgaattgattaggaatgga-cattaggtagtaatgaaacctatttaagatgttaactg 11250474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 426 - 635
Target Start/End: Original strand, 13813046 - 13813255
Alignment:
Q  426 tatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctcc 525  Q
    ||||| ||| || |||||| |||||||   |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||  |  |||  ||| ||||||||||||||| |||    
T  13813046 tatgaagttttaatgttgtggtaatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatgttgaac-tcc 13813144  T
Q  526 aaattattggataaataagagatgatgattgtgatgtttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgt 624  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||||  ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13813145 aaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttagatgatagagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctgaagctttgt 13813244  T
Q  625 actcaacacga 635  Q
     |||| |||||    
T  13813245 cctcaccacga 13813255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 319
Target Start/End: Original strand, 16351478 - 16351776
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||| |||||||| ||| | ||| | |||||    
T  16351478 cagagagcatgttgattttcgtattttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtgtattaaagattagaggatgatttaga 16351577  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    | ||||||||||||||          || | | |||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16351578 acaagattgaacctgg----------aataaccttagttggaaatctggcaagtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 16351667  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    ||||| |||   |||  | | || || ||| || | |||||||||||||  ||||| | || ||||||||||| |||||| ||||| |||| | | |||     
T  16351668 actgaatgcttttgataaaatcgtgacctgagttgaatgaattgattaggaatggaacattaggtagtaatgaaacctatttaagatgttagccggaatt 16351767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 144 - 217
Target Start/End: Original strand, 19757354 - 19757427
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19757354 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagt 19757427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 144 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 19782452 - 19782379
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19782452 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagt 19782379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 134 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 45938510 - 45938425
Alignment:
Q  134 tagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 219  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45938510 tagaacaaccttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactaagtgc 45938425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 381
Target Start/End: Original strand, 15352936 - 15353295
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    ||||||||||||||| ||   |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||  || | | |||||||| ||  | ||| |||||||    
T  15352936 cagagagcatgttgattttcatattttggacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttagttatgtattaaagatttgaggatgacttaga 15353035  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    | ||||||||||||||          |||| |  ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15353036 acaagattgaacctgg----------aacaaccatagttggaaacctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 15353125  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    |||||||||   |||| ||     || ||| || |  || |||| ||||  ||||| | || ||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||     
T  15353126 actgagtgcttttgagaatgttatgacctgagttgtttggattggttaggaatggaactttaggtagtaatgaaacctatctaagatgttaactggaatt 15353225  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattat 381  Q
    ||||||| ||||||||  |||||  ||||  | | ||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  15353226 tgtgaagctgttatgaattgtta-agctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgatttat 15353295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 144 - 219
Target Start/End: Original strand, 17152240 - 17152315
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17152240 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgttctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 17152315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 144 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 23139623 - 23139548
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23139623 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcggatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 23139548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 144 - 219
Target Start/End: Original strand, 26243418 - 26243493
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26243418 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcaagcacttccagaactgagtgc 26243493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 136 - 217
Target Start/End: Original strand, 16678334 - 16678415
Alignment:
Q  136 gaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagt 217  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16678334 gaacaactttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaaaactgagt 16678415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 523 - 635
Target Start/End: Original strand, 631105 - 631217
Alignment:
Q  523 tccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagcttt 622  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| |||  ||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  631105 tccaaattattggatatatatgagatgataattaagatgtttagatgatagagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagcttt 631204  T
Q  623 gtactcaacacga 635  Q
    || |||| |||||    
T  631205 gtcctcaccacga 631217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 144 - 220
Target Start/End: Original strand, 1951514 - 1951590
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 220  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1951514 ttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcttcgcgagcacttccagaactgagtgca 1951590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 134 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 9556893 - 9556809
Alignment:
Q  134 tagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 218  Q
    ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9556893 tagaacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 9556809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 132 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 3413161 - 3413078
Alignment:
Q  132 cttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactga 215  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3413161 cttagaacaaccttagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagctgatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactga 3413078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 144 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 18237245 - 18237170
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 219  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18237245 ttagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagctgatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 18237170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 454 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 7893768 - 7893586
Alignment:
Q  454 cctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataa-ataagagatgatg 552  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||    ||||||||||||||| | ||||||| |  |     
T  7893768 cctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagatgatgatgtt--tccaaattattggattatataagaggttgtc 7893671  T
Q  553 --attgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
      |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  7893670 gaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacg 7893586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 25555989 - 25555798
Alignment:
Q  15 agagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttagaata 113  Q
    |||||||||||| ||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||  |||||| |||||||| ||| | ||| |||||||| |    
T  25555989 agagcatgttgattttcgtattttggactttttagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtgtattaaagattagaggatgacttagaaca 25555890  T
Q  114 agattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaact 213  Q
    |||||||||||||          ||||    ||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25555889 agattgaacctgg----------aacaatcatagttggaaatctggcaagtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcacgagcacttccagaact 25555800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 134 - 211
Target Start/End: Original strand, 16243143 - 16243220
Alignment:
Q  134 tagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaa 211  Q
    ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16243143 tagaacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaa 16243220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 144 - 218
Target Start/End: Original strand, 18222131 - 18222205
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 218  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18222131 ttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagctgatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 18222205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 76
Target Start/End: Original strand, 17047702 - 17047766
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17047702 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtctttgagtgcct 17047766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 157 - 229
Target Start/End: Original strand, 43255927 - 43255999
Alignment:
Q  157 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggat 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  43255927 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcatttgaggat 43255999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 144 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 2015131 - 2015057
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 218  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2015131 ttagttgggaatctggcttgtactcgccatggtgagcagacgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 2015057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 134 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 9530796 - 9530711
Alignment:
Q  134 tagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 219  Q
    ||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9530796 tagaacaaccttagttggaattctggcttatactcgccatggcgagatgatgctctcacctcgcgagcacttccagaactgagtgc 9530711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 510 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 12423696 - 12423569
Alignment:
Q  510 atgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatgttta-aga--gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggct 606  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||  |||||||  |||  ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  12423696 atgatgttgaac-tccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgtttttagattgattgagtccatgcgttaacatacatttgttgggggct 12423598  T
Q  607 catgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  12423597 catgccctggagctttgtcctcaccacga 12423569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 454 - 635
Target Start/End: Original strand, 16270291 - 16270474
Alignment:
Q  454 cctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataa-ataagagatgatg 552  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||| ||    ||||||||||||||| | ||||||| |  |     
T  16270291 cctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatgatgatgtt--tccaaattattggattatataagaggttgtc 16270388  T
Q  553 --attgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
      |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  16270389 gaattaagatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttggactcaacacga 16270474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 132 - 218
Target Start/End: Original strand, 4561074 - 4561160
Alignment:
Q  132 cttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 218  Q
    ||||||||| | |||||||| |   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4561074 cttagaacaaccttagttggaaagttggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 4561160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 454 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 12902822 - 12902641
Alignment:
Q  454 cctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatg- 552  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||| ||    ||||||||||||||  ||||  ||| | ||     
T  12902822 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt---tccaaattattggactaatataagaggttgt 12902726  T
Q  553 ---attgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
       |||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  12902725 cgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattca-ttgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacg 12902641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 157 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 27534365 - 27534303
Alignment:
Q  157 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  27534365 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacatccagaattgagtgc 27534303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 144 - 218
Target Start/End: Original strand, 28569197 - 28569271
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 218  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  28569197 ttagttgggaagctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcttcgtgagcacttccagaattgagtg 28569271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 157 - 218
Target Start/End: Original strand, 5756703 - 5756764
Alignment:
Q  157 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 218  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5756703 tggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 5756764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 134 - 215
Target Start/End: Original strand, 18602488 - 18602569
Alignment:
Q  134 tagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactga 215  Q
    ||||||| | || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18602488 tagaacaaccttggttggaattctagcttgtactcgccatggcgagctgatgctctcgcctcgcgagcacttccaaaactga 18602569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 157 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 33742718 - 33742657
Alignment:
Q  157 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 218  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33742718 tggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 33742657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 454 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 7798839 - 7798658
Alignment:
Q  454 cctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataa-ataagagatgatg 552  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||    || |||||||||||| | ||||||| |  |     
T  7798839 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt---tctaaattattggattatataagaggttgtc 7798743  T
Q  553 --attgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
      |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  7798742 gaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgctctggagctttgtactcaacacg 7798658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 573 - 636
Target Start/End: Original strand, 15353485 - 15353548
Alignment:
Q  573 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacgaa 636  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  15353485 gagtccatgcattagcatacttttgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcaccacgaa 15353548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 342 - 634
Target Start/End: Original strand, 16377473 - 16377758
Alignment:
Q  342 tatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttttatttgatatcgttatatgatgttatactgt 441  Q
    |||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |   ||  |||||||||     ||| |||| || ||||    
T  16377473 tatgatgtgatataatgttatac-gcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatat-----tattatgtcatgctgt 16377566  T
Q  442 tgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaa- 540  Q
    |  ||||  || |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||   ||  ||||||||||||||| |      
T  16377567 t--tgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagataatg---aagttccaaattattggattatg 16377661  T
Q  541 taagagatgat-gattgt-gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
    |||||| |  | ||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  16377662 taagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctgaagctttgtactcaacacg 16377758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 454 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 3096358 - 3096177
Alignment:
Q  454 cctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatg- 552  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||| ||    ||||||||||| ||  ||||  ||| | ||     
T  3096358 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt---tccaaattattagaataatataagaggttgt 3096262  T
Q  553 ---attgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
       |||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  3096261 cgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattca-ttgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacg 3096177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 132 - 206
Target Start/End: Original strand, 18609080 - 18609154
Alignment:
Q  132 cttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttc 206  Q
    ||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  18609080 cttagaacaaccttggttggaattctggcttgtactcgccatggcgagctggtgctctcgcctcgcgagcacttc 18609154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 506 - 624
Target Start/End: Original strand, 5339080 - 5339202
Alignment:
Q  506 caagatgatgttgaacctccaaattattggataaataa-gagatgatgattgtgatgtt---taaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttg 600  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||  |||||| |||||   |||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5339080 caagatgatgttgaac-tccaaattattggatgtatattgagatgttgattaaaatgttgattaagatgatcgagtccatgcattagcatacatatgttg 5339178  T
Q  601 ggggctcatgccctggagctttgt 624  Q
    ||||||||||||||||||| ||||    
T  5339179 ggggctcatgccctggagccttgt 5339202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 134 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 23838796 - 23838720
Alignment:
Q  134 tagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    ||||||| | ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23838796 tagaacaacattagttgggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccaga 23838720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 157 - 216
Target Start/End: Original strand, 14708400 - 14708459
Alignment:
Q  157 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  14708400 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcatttcctgaattgag 14708459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 157 - 216
Target Start/End: Original strand, 42997216 - 42997275
Alignment:
Q  157 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgag 216  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42997216 tggctcgtactcgccatggcgaacagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgag 42997275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 466 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 15551870 - 15551701
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatg----attgtgatg 561  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||| ||    ||||||||||||||| ||||  ||| | ||    |||  | ||    
T  15551870 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt---tccaaattattggattaatataagaggttgtcgaattaagttg 15551774  T
Q  562 tttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  15551773 tttaataggtcgagtccatgcattagcattca-ttgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacg 15551701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 466 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 22636488 - 22636319
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataa-ataagagat-gatga-ttgtgatgt 562  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |     ||||||||||||||| | ||||||| | | ||| ||  |||||    
T  22636488 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgattt---tccaaattattggattatataagaggttgttgaattaagatgt 22636392  T
Q  563 ttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||    
T  22636391 ctaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtgctcaacacg 22636319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 157 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 14679302 - 14679249
Alignment:
Q  157 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14679302 tggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccaga 14679249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 157 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 14685511 - 14685458
Alignment:
Q  157 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14685511 tggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccaga 14685458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 134 - 210
Target Start/End: Original strand, 41385488 - 41385564
Alignment:
Q  134 tagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    ||||||| | ||||||||||   | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41385488 tagaacaacattagttgggaagttcgcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccaga 41385564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 560 - 634
Target Start/End: Original strand, 14053464 - 14053538
Alignment:
Q  560 tgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  14053464 tgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattca-ttgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacg 14053538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 573 - 636
Target Start/End: Original strand, 16352029 - 16352092
Alignment:
Q  573 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacgaa 636  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  16352029 gagtccatgcattagcatacttctgttgggggctcatgccttggagctttgtcctcaccacgaa 16352092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 560 - 634
Target Start/End: Original strand, 23374516 - 23374590
Alignment:
Q  560 tgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  23374516 tgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattca-ttgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacg 23374590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 456 - 595
Target Start/End: Original strand, 20157517 - 20157657
Alignment:
Q  456 tatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagat--gatga 553  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||  | ||||| ||| |||| |||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||  |||||    
T  20157517 tatgctgctattgttatttaactaatttgcatgagtctatataagttgattaagacgatgatgaac-tccaaattattggatgtataagagatttgatga 20157615  T
Q  554 ttgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatt 595  Q
    ||  |||||||    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  20157616 ttaagatgttttgttgatagagtccatgcattagcatacatt 20157657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 606
Target Start/End: Original strand, 51463975 - 51464118
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgga-taaataagagatgatga-ttgtg 558  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||   ||||  |||||||||||||| || | ||||| ||  || ||  |    
T  51463975 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga---tgaagttccaaattattggattatacaagagttgtcgatttaag 51464071  T
Q  559 atgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggct 606  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  51464072 atgtttaagaagtcgagtccatgcattagcattc-tttgttgggggct 51464118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 32 - 76
Target Start/End: Original strand, 14052951 - 14052995
Alignment:
Q  32 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14052951 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 14052995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 134 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 35614301 - 35614226
Alignment:
Q  134 tagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    ||||||| |||||||| || || || || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35614301 tagaacaactttagtttggttt-tgtctggtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccaga 35614226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 454 - 586
Target Start/End: Original strand, 52873423 - 52873555
Alignment:
Q  454 cctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgga-taaataagagatgat- 551  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||    |||||||||||||| || ||||||| |  |     
T  52873423 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg---ttccaaattattggattatataagaggttgtc 52873519  T
Q  552 -gattgtgatgtttaagagatcgagtccatgcatta 586  Q
      |||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  52873520 gaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcatta 52873555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 15 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 2015251 - 2015190
Alignment:
Q  15 agagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||    
T  2015251 agagcatgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacct 2015190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 454 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 6899956 - 6899895
Alignment:
Q  454 cctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  6899956 cctatgttgctattgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 6899895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 454 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 7088942 - 7088881
Alignment:
Q  454 cctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  7088942 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 7088881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 461 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 12611005 - 12610862
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgga-taaataagagatgatga-ttgtg 558  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||   ||||  |||||||||||||| || | || || ||  || ||  |    
T  12611005 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga---tgaagttccaaattattggattatacaatagttgtcgatttaag 12610909  T
Q  559 atgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggct 606  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  12610908 atgtttaagaagtcgagtccatgcattagcattc-tttgttgggggct 12610862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 458 - 515
Target Start/End: Original strand, 18239523 - 18239580
Alignment:
Q  458 tgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  18239523 tgctgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 18239580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 576 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 25555417 - 25555371
Alignment:
Q  576 tccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgt 624  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25555417 tccatgcattagcatac--ttgttgggggctcatgccctggagctttgt 25555371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 27534502 - 27534441
Alignment:
Q  11 gcagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 72  Q
    ||||||||||||||  ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27534502 gcagagagcatgttagattttgtaatttcgacttttgagttgaaccttagatgtctttgagt 27534441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 3413272 - 3413212
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 72  Q
    ||||||||| ||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3413272 cagagagcaagttgttttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 3413212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 376
Target Start/End: Original strand, 5338837 - 5338964
Alignment:
Q  248 tgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatatgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgat 347  Q
    ||||||||||||  ||||| | || ||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||| || |||| ||||||||    |||  ||||| ||||||    
T  5338837 tgaattgattaggaatggaacattaggtagtagtgagacctatataagatgttaaatgaaatctgagaagctgttatgaaccatta-agctgattatgat 5338935  T
Q  348 gtgatataatgtttaattgcattacttga 376  Q
    ||||| || || |||||||||||||||||    
T  5338936 gtgatttattgattaattgcattacttga 5338964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 12774477 - 12774437
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12774477 ttttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcct 12774437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 15552296 - 15552252
Alignment:
Q  32 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  15552296 gtatttttgacttttgagttgaaccttatatgcttttgagtgcct 15552252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 205
Target Start/End: Original strand, 22633983 - 22634023
Alignment:
Q  165 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcactt 205  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22633983 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcactt 22634023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 24029220 - 24029180
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24029220 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtctttgagtgcct 24029180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 44615343 - 44615185
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgga-taaataaga-gatgatga-ttgt 557  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||   ||||  |||||||||||||| || |||||| | || ||| ||      
T  44615343 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga---tgaagttccaaattattggattatataagaggttgttgatttaa 44615247  T
Q  558 gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagc 619  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||| | ||||||||||||    
T  44615246 gatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 44615185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 165 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 3332236 - 3332197
Alignment:
Q  165 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcact 204  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3332236 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcact 3332197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 36 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 6190912 - 6190861
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgttta 87  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||    
T  6190912 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgttta 6190861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 149 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 7089242 - 7089191
Alignment:
Q  149 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 200  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7089242 tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 7089191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 165 - 204
Target Start/End: Original strand, 13812579 - 13812618
Alignment:
Q  165 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcact 204  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13812579 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcact 13812618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 461 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 14280371 - 14280242
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgga-taaataagagatgatga--ttgt 557  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||   ||||  |||||||||||||| || | ||||| |  | |  ||      
T  14280371 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga---tgaagttccaaattattggattatacaagagtttgtcaatttaa 14280275  T
Q  558 gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcat 590  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14280274 gatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcat 14280242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 466 - 619
Target Start/End: Original strand, 15355437 - 15355591
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgga-taaataagagat-gatga-ttgtgatgt 562  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||   |||||||||  |||||||||||||| || ||||||| | |  || ||  || ||    
T  15355437 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa---gatgttgaagttccaaattattggattatataagaggtagtcgatttaagaagt 15355533  T
Q  563 ttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagc 619  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||| | ||||||||||||    
T  15355534 ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 15355591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 558 - 632
Target Start/End: Original strand, 16240130 - 16240205
Alignment:
Q  558 gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaaca 632  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||    ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  16240130 gatgtttaacaggtcgagtccatgcattagcatttcattgatgggggcttgatgccctggagctttgtactcaaca 16240205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 149 - 200
Target Start/End: Original strand, 17047828 - 17047879
Alignment:
Q  149 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 200  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17047828 tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 17047879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 165 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 24029092 - 24029053
Alignment:
Q  165 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcact 204  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24029092 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcact 24029053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 466 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 44052882 - 44052713
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataa-ataagagatgatg--attgtgatgt 562  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||| ||    ||||||||||||||| | ||||||| |  |   |||  |||||    
T  44052882 ttgttatttaactgagctgcatgagtcggcctaagttgatgaagatgatgatgt---tccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgt 44052786  T
Q  563 ttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
    ||||||| |||| || | ||||||||||    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  44052785 ttaagaggtcgaatctacgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacg 44052713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Original strand, 12414 - 12468
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  12414 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 12468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Original strand, 1837616 - 1837670
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  1837616 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 1837670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Original strand, 7641289 - 7641343
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  7641289 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 7641343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Original strand, 15118459 - 15118513
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  15118459 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 15118513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 62
Target Start/End: Original strand, 16678219 - 16678269
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagat 62  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  16678219 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaatcttagat 16678269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Original strand, 18215381 - 18215435
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  18215381 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 18215435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Original strand, 23803372 - 23803426
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  23803372 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 23803426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 466 - 538
Target Start/End: Original strand, 39706356 - 39706425
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggata 538  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||    ||||||||||||||||    
T  39706356 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg---ttccaaattattggata 39706425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Original strand, 44773194 - 44773248
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  44773194 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 44773248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Original strand, 44928987 - 44929041
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  44928987 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 44929041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Original strand, 50222446 - 50222500
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  50222446 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 50222500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 52312565 - 52312511
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  52312565 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 52312511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 576 - 636
Target Start/End: Original strand, 11250741 - 11250799
Alignment:
Q  576 tccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacgaa 636  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  11250741 tccatgcattagcatac--ttgttgggggatcatgccctggagttttgtcctcaccacgaa 11250799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 36 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 13845018 - 13844981
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtg 73  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13845018 ttttgacttttaagttgaaccttagatgtttttgagtg 13844981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 27 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 16597133 - 16597084
Alignment:
Q  27 attctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  16597133 attctgtaattttgatttttgaattgaaccttagatgcttttgagtgcct 16597084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 35 - 72
Target Start/End: Original strand, 18602398 - 18602435
Alignment:
Q  35 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18602398 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 18602435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 35 - 72
Target Start/End: Original strand, 18608992 - 18609029
Alignment:
Q  35 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18608992 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 18609029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 466 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 19242749 - 19242700
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  19242749 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 19242700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 466 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 44102264 - 44102215
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  44102264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 44102215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 12 - 72
Target Start/End: Original strand, 1951391 - 1951451
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 72  Q
    |||||||||||| |  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  1951391 cagagagcatgtcgttttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 1951451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 3097111 - 3097071
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  3097111 ttttgacttttgagttaaaccttagatgttttcgagtgcct 3097071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 165 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 12774349 - 12774309
Alignment:
Q  165 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcactt 205  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  12774349 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtactt 12774309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 342 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 14038819 - 14038760
Alignment:
Q  342 tatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttg 402  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  14038819 tatgatgtgatataatgtt-atgtgcattacttgaaatatgaatgtataattgagatgttg 14038760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 14039128 - 14039088
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  14039128 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 14039088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 12 - 72
Target Start/End: Original strand, 14708264 - 14708324
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 72  Q
    ||||||||||||||| ||  |  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  14708264 cagagagcatgttgattttcgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 14708324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 12 - 72
Target Start/End: Original strand, 16243030 - 16243090
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 72  Q
    |||| ||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  16243030 cagatagcatgtcgaattatgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 16243090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 163 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 17810606 - 17810379
Alignment:
Q  163 gtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagaga 262  Q
    ||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||   ||||||    | || ||| ||||  ||||| ||||||  |    
T  17810606 gtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacatccagaattgagtgcttttgaggaatttgagacctgagtcgtttgaatggattaggaa 17810507  T
Q  263 tggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatatgtgaagttgttatgagatgtt-agtgctgaatatgatgtgatataatgttt 361  Q
    |||| | || |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||  || ||||||| | |  ||| ||||| |||| |   ||| ||||||| || || ||    
T  17810506 tggaactttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgttaagtgtt---tataatgtgatttattgatt 17810410  T
Q  362 aattgcattacttgaattatgaatgaatgat 392  Q
     ||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  17810409 gattgcattacttgaattattattgaatgat 17810379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 12 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 18237368 - 18237304
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    ||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||    
T  18237368 cagagagcaagttgttttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacct 18237304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 448 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 22353904 - 22353852
Alignment:
Q  448 aatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaag 500  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  22353904 aatctgcctatgctgctgttgttatttacctaagctgcatgagtcggtctaag 22353852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Original strand, 39705930 - 39705970
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39705930 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 39705970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 44102688 - 44102648
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  44102688 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 44102648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Original strand, 44928565 - 44928605
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  44928565 ttttgacttttgagttgatccttatatgtttttgagtgcct 44928605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 3097008 - 3096957
Alignment:
Q  149 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 200  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  3097008 tgggattctgacctgaactcgccaaggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 3096957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 466 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 12774060 - 12774009
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgtt 517  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||    
T  12774060 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgtt 12774009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 596 - 635
Target Start/End: Original strand, 13813292 - 13813331
Alignment:
Q  596 tgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  13813292 tgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcaccacga 13813331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 596 - 635
Target Start/End: Original strand, 13813381 - 13813420
Alignment:
Q  596 tgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  13813381 tgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcaccacga 13813420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 162 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 15190670 - 15190631
Alignment:
Q  162 tgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagc 201  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  15190670 tgtactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagc 15190631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 17053514 - 17053483
Alignment:
Q  32 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatg 63  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17053514 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatg 17053483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 461 - 512
Target Start/End: Original strand, 19618279 - 19618330
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatg 512  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  19618279 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 19618330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 204
Target Start/End: Original strand, 20157060 - 20157099
Alignment:
Q  165 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcact 204  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  20157060 actcgccatggcgtgcagaggctctcgcctcgcgagcact 20157099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 87
Target Start/End: Original strand, 21814945 - 21814996
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgttta 87  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || || |||||||    
T  21814945 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgtctgaacatgttta 21814996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 87
Target Start/End: Original strand, 21815274 - 21815325
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgttta 87  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || || |||||||    
T  21815274 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgtctgaacatgttta 21815325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 87
Target Start/End: Original strand, 21818367 - 21818418
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgttta 87  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || || |||||||    
T  21818367 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgtctgaacatgttta 21818418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 44102560 - 44102525
Alignment:
Q  165 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44102560 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 44102525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 200
Target Start/End: Original strand, 44928694 - 44928729
Alignment:
Q  165 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44928694 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 44928729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 3515062 - 3515008
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  3515062 tgctgttgttttttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 3515008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 558 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 14038617 - 14038555
Alignment:
Q  558 gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagc 619  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||| | ||||||||||||    
T  14038617 gatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 14038555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Original strand, 54798817 - 54798871
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  54798817 tgctgttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 54798871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 466 - 515
Target Start/End: Original strand, 8574935 - 8574984
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  || |||||||||    
T  8574935 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttaattaagatgatg 8574984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 558 - 619
Target Start/End: Original strand, 8575027 - 8575088
Alignment:
Q  558 gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagc 619  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    |||||||||  | ||||||||||||    
T  8575027 gatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttggggcttgatgccctggagc 8575088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 12522424 - 12522375
Alignment:
Q  157 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttc 206  Q
    |||||||||||||||||||  || |||| ||||| |||||||||||||||    
T  12522424 tggcttgtactcgccatggaaagtagatactctcacctcgcgagcacttc 12522375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 73
Target Start/End: Original strand, 13812451 - 13812488
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtg 73  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  13812451 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtg 13812488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 14038706 - 14038653
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgat 514  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||    
T  14038706 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgat 14038653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 15099834 - 15099789
Alignment:
Q  31 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15099834 tgtagttttgacctttaagtcgaaccttagatgtttttgagtgcct 15099789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 72
Target Start/End: Original strand, 18222031 - 18222068
Alignment:
Q  35 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  18222031 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 18222068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 23139723 - 23139686
Alignment:
Q  35 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  23139723 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 23139686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 72
Target Start/End: Original strand, 26243318 - 26243355
Alignment:
Q  35 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  26243318 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 26243355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 72
Target Start/End: Original strand, 28569097 - 28569134
Alignment:
Q  35 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  28569097 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 28569134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 72
Target Start/End: Original strand, 43255813 - 43255850
Alignment:
Q  35 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  43255813 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 43255850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 44053308 - 44053271
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtg 73  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  44053308 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtg 44053271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 45938600 - 45938563
Alignment:
Q  35 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  45938600 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 45938563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #155
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 7089345 - 7089305
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  7089345 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctatgagtgcct 7089305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #156
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 7799176 - 7799136
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  7799176 ttttgacttctgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 7799136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #157
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 8846724 - 8846688
Alignment:
Q  165 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagc 201  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  8846724 actcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagc 8846688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #158
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 36 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 8846854 - 8846818
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 72  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  8846854 ttttgacttttgagttgattcttagatgtttttgagt 8846818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #159
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 466 - 517
Target Start/End: Original strand, 12288278 - 12288327
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgtt 517  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||    
T  12288278 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagatgatgtt 12288327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #160
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 12903224 - 12903185
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  12903224 ttttgacttttgagttgaaccttagatg-ctttgagtgcct 12903185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #161
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 15099700 - 15099664
Alignment:
Q  165 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagc 201  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  15099700 actcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagc 15099664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #162
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 558 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 15369978 - 15369931
Alignment:
Q  558 gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggct 606  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  15369978 gatgtttaagaagtcgagtccatgcattagcattc-tttgttgggggct 15369931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #163
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Original strand, 16239634 - 16239674
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  16239634 ttttgacttttgagttgctccttagatgcttttgagtgcct 16239674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #164
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 35 - 63
Target Start/End: Original strand, 17152140 - 17152168
Alignment:
Q  35 tttttgacttttgagttgaaccttagatg 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17152140 tttttgacttttgagttgaaccttagatg 17152168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #165
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 558 - 590
Target Start/End: Original strand, 18215478 - 18215510
Alignment:
Q  558 gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcat 590  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18215478 gatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcat 18215510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #166
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 558 - 590
Target Start/End: Original strand, 19618382 - 19618414
Alignment:
Q  558 gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcat 590  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19618382 gatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcat 19618414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #167
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 160 - 200
Target Start/End: Original strand, 21815068 - 21815108
Alignment:
Q  160 cttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 200  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  21815068 cttgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 21815108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #168
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 160 - 200
Target Start/End: Original strand, 21818490 - 21818530
Alignment:
Q  160 cttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 200  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  21818490 cttgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 21818530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #169
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 522 - 595
Target Start/End: Original strand, 22634528 - 22634603
Alignment:
Q  522 ctccaaattattggataaataagagat--gatgattgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatt 595  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||  |||||||    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  22634528 ctccaaattattggatgtataagagatttgatgattaagatgttttgttgatagagtccatgcattagcatacatt 22634603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #170
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 12 - 72
Target Start/End: Original strand, 42997080 - 42997140
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 72  Q
    ||||||||||||||| ||  |  |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  42997080 cagagagcatgttgattttcgagtttttgacttttgagttgaaacttagatgcctttgagt 42997140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 410; Significance: 0; HSPs: 169)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 410; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 23201869 - 23201239
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||| |    
T  23201869 cagagagcatgtagaattctgtacttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcctattaaagattaaatgataacttata 23201770  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  23201769 atgagattgaacctggtttagcttataacaacattagttgggaatctggcctgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttttaga 23201670  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttggg-tagtaatgagacctatataagaagttaactgcaat 309  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23201669 actgagtgcaagtgaggatattgcgatctgtgtcgcataatttgtttagagatggacccttggggtagtaatgagacctatagaagaagttaactgcaat 23201570  T
Q  310 atgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaatt----atgaatgaatgattgagatgttgctt 405  Q
     ||||||| ||||||||  ||||| || ||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||||| |||||    
T  23201569 ctgtgaagctgttatgaattgttaatgttgaatatgacgtgagatgatgtttaattgcattacttgaaatgttaatgaatgaatgattgagatgatgctt 23201470  T
Q  406 gtttttatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgat 505  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||  ||     
T  23201469 gcttttatttgatatcgttatatgatgtcataatgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgaa 23201370  T
Q  506 caagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatg-tttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttggggg 604  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23201369 caagatgatgttgaacctccaaattattggatacataagagatgatgattatgatgttttaagagatcgagtccatgcattagcatacatatgttggggg 23201270  T
Q  605 ctcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23201269 ctcatgccctggagctttgtactcaacacga 23201239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 408; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 36 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 26704542 - 26703955
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttagaataagattgaacctggtttagctt 134  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |    
T  26704542 ttttgacttttgagttgaaccctagatatttttgagtgcctgaagatgcttattaaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggtttaacct 26704443  T
Q  135 agaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatagcgc 234  Q
    |||||| |  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  |     
T  26704442 agaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctttcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtaaggaaaatgt 26704343  T
Q  235 gatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatatgtgaagttgttatgagatgttag 334  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  26704342 gatctgtgtcgcatgatttgattagggatggacccttgggtagtaatgagacatatataagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgagatgttag 26704243  T
Q  335 tgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttttatttgatatcgttatatgatgtt 434  Q
    || ||||||| ||||           ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||     
T  26704242 tgttgaatataatgt-----------taattgcattacttgaactatgaatgaatgattgagatgctgctg--ttttatttgatatcgttatatgatgtc 26704156  T
Q  435 atactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattg 534  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26704155 atactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctctaaattattg 26704056  T
Q  535 gataaataagagatgatgattgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26704055 gataaataagagatgatgattgtgatgtttaagagattgagtccatgcattagcatagatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacg 26703956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 408; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 36 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 26974275 - 26973688
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttagaataagattgaacctggtttagctt 134  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |    
T  26974275 ttttgacttttgagttgaaccctagatatttttgagtgcctgaagatgcttattaaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggtttaacct 26974176  T
Q  135 agaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatagcgc 234  Q
    |||||| |  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  |     
T  26974175 agaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctttcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtaaggaaaatgt 26974076  T
Q  235 gatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatatgtgaagttgttatgagatgttag 334  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  26974075 gatctgtgtcgcatgatttgattagggatggacccttgggtagtaatgagacatatataagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgagatgttag 26973976  T
Q  335 tgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttttatttgatatcgttatatgatgtt 434  Q
    || ||||||| ||||           ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||     
T  26973975 tgttgaatataatgt-----------taattgcattacttgaactatgaatgaatgattgagatgctgctg--ttttatttgatatcgttatatgatgtc 26973889  T
Q  435 atactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattg 534  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26973888 atactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctctaaattattg 26973789  T
Q  535 gataaataagagatgatgattgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26973788 gataaataagagatgatgattgtgatgtttaagagattgagtccatgcattagcatagatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacg 26973689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 388; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 635
Target Start/End: Original strand, 23500964 - 23501592
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||| ||||||    
T  23500964 cagagagcatgtagaattctgtattcctaacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcttattaaatattaaatgatagcttaga 23501063  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
       ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23501064 ccgagattgaacctggtttagcttagaacaacattagttgggaatcttgcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcacctcgcgagcacttccaga 23501163  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    |||||||| ||||||| ||   ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  23501164 actgagtgaaagtgagaatgttgcgatctgtgtcgtataagttgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgcaatc 23501263  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaa----ttatgaatgaatgattgagatgttgcttg 406  Q
    ||||||| ||||||||  ||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    | |||||||||||||||||||| ||||||    
T  23501264 tgtgaagctgttatgaattgttaatgttgaatatgatgtgagatgatgtttaattgcattacttgaaatgttaatgaatgaatgattgagatgatgcttg 23501363  T
Q  407 tttttatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatc 506  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||  ||||    
T  23501364 cttttatttgatatcgttatatgatgtcataatgttgatgtattctgcctgtgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatc 23501463  T
Q  507 aagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggct 606  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23501464 aagatgatgttgaacttccaaaatattggataaatacgagatgatgtttatgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggct 23501563  T
Q  607 catgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23501564 catgccctggagcttagtactcaacacga 23501592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 14079648 - 14079029
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | || ||||||||||||||    
T  14079648 cagagagcatgtagaattctgtatttttgacttttgagttcaaccttagatgtttttgagtgcctaaatatgttaattaatgatttaatgataacttaga 14079549  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  14079548 atgagattgaacctggtttagcttagaacaacattagttgggaatctggctagtactcgccatggcgagcaaatgctctcgcctcgcgagcacttctaga 14079449  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||     
T  14079448 actgagtgcaagtgaggatgttgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatttaagaagttaactgcaatc 14079349  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttt 410  Q
    ||||||| | |||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||     || |||    
T  14079348 tgtgaagctcttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatttaatgattaattgcattacttgagttatgaatgagtgattgaaatg-----tgcttt 14079254  T
Q  411 tatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaaga 510  Q
    || ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| | | ||||  ||| ||||    
T  14079253 taattgatatcgttatgtgatgtcatactgttgttgcaatctgcctatgctgctattgttatttaactatgttgcatgaattgatataagatgattaaga 14079154  T
Q  511 tgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatg-tttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcat 609  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14079153 tgatgttgaacctcc-aattattggatacataagagatgatgattaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcatacatgtgttgggggctcat 14079055  T
Q  610 gccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||    
T  14079054 gccctagagcttagtactcaacacga 14079029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 23512604 - 23511979
Alignment:
Q  15 agagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttagaata 113  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |     
T  23512604 agagcatgttgaattctgtattttcgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattagatgatgacttagagtg 23512505  T
Q  114 agattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaact 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23512504 agattgaacctggtttagcttagaacaactttagttgaaaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaact 23512405  T
Q  214 gagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatatgt 313  Q
    ||||||| || |||||   |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||| | |    
T  23512404 gagtgcatgttaggatgttgcgatctgtgtcgcataatttgattagaggtggacccttgggtagtattatgacctatataagaagtttactgcaatcttt 23512305  T
Q  314 gaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaa-----ttatgaatgaatgattgagatgttgcttgtt 408  Q
    |||| | |||| | |||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||     | |||||||||||||||||||| |||||| |    
T  23512304 gaagatcttataaaatgttaatgttgaatatgatgtaatatgatgtttaattgcattacttgaaaatgttaatgaatgaatgattgagatgatgcttgct 23512205  T
Q  409 tttatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaa 508  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||  | ||||  ||  ||    
T  23512204 tttatttgatatctttatacgatgtcataatgttgatgcgatctgcctatgctgctattgttatttaactaaagtgcatgagtcattataagatgaataa 23512105  T
Q  509 gatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatgtt--taagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggct 606  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||   ||||    
T  23512104 gatgatgttgaacctccaaattattggatacataagagatgatgattaagatgtttataagagatcgagctcatgcattagcatacatatgtt---ggct 23512008  T
Q  607 catgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
     |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  23512007 tatgccctggagcttagtactcaccacga 23511979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 13 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 37724403 - 37724013
Alignment:
Q  13 agagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttagaa 111  Q
    |||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  37724403 agagagcatgtaagattctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcctattaaagattaaatgataacttagaa 37724304  T
Q  112 taagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaa 211  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37724303 tgagattgaacctggtttaacttagaacaacatttgttgggaatctggctggtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaa 37724204  T
Q  212 ctgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatat 311  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37724203 ctgagtgcaagtgaggagattgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttcggtagtattgagacctatataagaagttaactgcaatct 37724104  T
Q  312 gtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttg 402  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37724103 gtgaagctgttttgagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttg 37724013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 13 - 635
Target Start/End: Original strand, 21366286 - 21366901
Alignment:
Q  13 agagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttagaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||    
T  21366286 agagagcatgttgaattctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgatttagaa 21366385  T
Q  112 taagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaa 211  Q
      |||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21366386 cgagattgaacctgatttagcttagaacaacttaagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaa 21366485  T
Q  212 ctgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatat 311  Q
    |||| ||||||| || ||   ||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||  || |    
T  21366486 ctgaatgcaagttagtatgttgcgatctgtttcgcataaattgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatct 21366585  T
Q  312 gtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgttttt 411  Q
    |||||| || |||||  |||||  ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||  ||||||||  ||   |     
T  21366586 gtgaagctgctatgaactgtta-agctgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg-atgaaatg 21366683  T
Q  412 atttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagat 511  Q
    | |||||||      |||| | |||| ||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||  |  |||  ||| |||||    
T  21366684 aattgatat-----gatgaag-tataatgttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagat 21366777  T
Q  512 gatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatgtttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatg 610  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||  ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21366778 gatgttgaa-ctccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggcttatg 21366876  T
Q  611 ccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    ||||||||||||||||||| |||||    
T  21366877 ccctggagctttgtactcaccacga 21366901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 12 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 22032816 - 22032452
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22032816 cagagaacacgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattaaatgataacttaga 22032717  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22032716 atgagattgaacctggtttagcttagaacaattttagttgggattctggcttgtactcgccgtggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 22032617  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    |||||||||||||||| ||   | ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22032616 actgagtgcaagtgagaatgttgtgatatgtgttgcttgaattgattagagatggacccttaggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatc 22032517  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaa 377  Q
    ||||||| || || |||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||    
T  22032516 tgtgaagctgatacgagatgtttgtgttgaatatgatgtattataatgttta--tgcattacttgaa 22032452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 12 - 377
Target Start/End: Original strand, 18769623 - 18769987
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18769623 cagagaacatgttgaattctgtatttttgacttttaagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattaaatgataacttaga 18769722  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18769723 atgagattgaacctggtttagcttagaacaattttagttaggattctggcttgtactcgccgtggcgagcagatgctctcgcgtcgcgagcacttccaga 18769822  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    |||||| ||||||||| ||   | ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18769823 actgagcgcaagtgagaatgtagtgatctgtgttgcttgaattgattagggatggacccttaggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatc 18769922  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaa 377  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||    
T  18769923 tgtgaagctgatatgagatgtttgtgttgaatatgatgtattataatgttta--tgcattacttgaa 18769987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 12 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 20806047 - 20805435
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| | |||||    
T  20806047 cagagagcatgttgaattctgtaattttgacttttgagttgaaccttatatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgatttaga 20805948  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20805947 acgagattgaacctggtttagcttagaacaacttgagttggaaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttctaga 20805848  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    ||||| ||||| | |||||   |||||||||||||||  |||||||||| | | ||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||     
T  20805847 actgaatgcaaattaggatgttgcgatctgtgtcgcacaaattgattagggtttgacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatc 20805748  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatg-ttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgttt 409  Q
    ||||| | |||| |||  || | |||  |   ||  ||||||| ||||| |||| ||||||||||||| | | | ||||||||  |||||||| |||       
T  20805747 tgtgaggctgtt-tgaactgctaagttattggta--atgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatgttattgaatgatctagatgttg-ttg-aa 20805653  T
Q  410 ttatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaag 509  Q
    | | |||||||     |||||  ||||  |||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||  | ||||  ||  |||    
T  20805652 tgaattgatat-----tatgaaattattttgttcttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataag 20805558  T
Q  510 atgatgttgaacctccaaattattggata--aataagagatgatgattgtgatgtttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggct 606  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||   ||| ||||||||||||  ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20805557 atgatgttgaacatccaaattattggatatgtatatgagatgatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatatgttgggggct 20805458  T
Q  607 catgccctggagctttgtactca 629  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  20805457 catgcccttgagctttgtactca 20805435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 165 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 21873595 - 21873133
Alignment:
Q  165 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatg 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||| | |||||||||||||    
T  21873595 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttacagaactgagtgcaagttaggatattgagatctgtgtcgcataatttgattagagatg 21873496  T
Q  265 gacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatatgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaat 364  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |||      
T  21873495 aacccttgggtagtaatgtgacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataatg-ttatg 21873397  T
Q  365 tgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttttatttgatatcgtta-tatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgc 463  Q
    |||||||||| |  ||| | |||||| || ||||||||         |  ||| || | || ||||| || || ||| |||||||  || ||||||||||    
T  21873396 tgcattacttaagatattattgaatggttaagatgttg---------aaatgagattgatattatgaagtcatgctgatgttgtatcctgcctatgctgc 21873306  T
Q  464 tattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatg-t 562  Q
    | |||||||||||| ||| ||||||| ||  | ||||  ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||   ||| |    
T  21873305 ttttgttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgaataagatgatgttgaccctccaaattattggatacatatgagatgatcattaacatgtt 21873206  T
Q  563 ttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21873205 ttaagagatcgagtccatgcattagcatacatatgttgggggctcatgccctggagcttagtactcaacacga 21873133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 94 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 23572496 - 23572215
Alignment:
Q  94 ttaaatgataacttagaataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcc 193  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23572496 ttaaatgataacttagaatgagattgaacctggtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactccccatggcgagcagatgctctcgcc 23572397  T
Q  194 tcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatata 293  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||   | |||||  || || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23572396 tcgcgcgcacttccagaactgagtgcaagtgagaatgttgtgatctaagttgcttgaattgattagggatggacccttaggtagtaatgagacctatata 23572297  T
Q  294 agaagttaactgcaatatgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaa 377  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | | ||| ||||||||  |||||||||||  |||||||||||||    
T  23572296 agaagttaactgcaatttgtgaagttgatatgagatgtttgagttgattatgatgtattataatgttta--tgcattacttgaa 23572215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 12 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 21887324 - 21887124
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21887324 cagagagcatgttgaattctgtacttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattaaatgataacttaga 21887225  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    || ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21887224 atgagaatgaacctgctttagcttagaacaactttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttacaga 21887125  T
Q  211 a 211  Q
    |    
T  21887124 a 21887124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 31342602 - 31342399
Alignment:
Q  13 agagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttagaa 111  Q
    |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||| |||||    
T  31342602 agagagcatgtcaaattctgtgtttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttatagaagattaaatgataacctagaa 31342503  T
Q  112 taagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaa 211  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||   |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31342502 tgagattgaacctggcttagcttagaacaaccttagttggagatctgggctgaactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaa 31342403  T
Q  212 ctga 215  Q
    ||||    
T  31342402 ctga 31342399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 444 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 22032394 - 22032208
Alignment:
Q  444 ttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataa 543  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| | ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  22032394 ttgtaatctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatgttgaacctccaaattattggatatatat 22032295  T
Q  544 gagatgatgattgtgatg-tttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactca 629  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22032294 gagatgatgattaagatgttttaagagattgagtccatgcattagcatacatttgttgagggctcatgccctggagctttgtactca 22032208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 439 - 635
Target Start/End: Original strand, 18770042 - 18770241
Alignment:
Q  439 tgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggata 538  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||| ||||||| ||| | ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18770042 tgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttattcgaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatgttgaacctccaaattattggata 18770141  T
Q  539 aataa--gagatgatgattgtgatgttt-aagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
     |||   ||||||||||||  ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18770142 tatagatgagatgatgattaagatgttttaagagactgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacga 18770241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 323
Target Start/End: Original strand, 12028195 - 12028496
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||| |||||||| ||| | ||| | |||||    
T  12028195 cagagagcatgttgattttcgtattttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtctattaaagattagaggatgatttaga 12028294  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    | ||||||||||||||          |||| | |||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12028295 acaagattgaacctgg----------aacaaccttagttggaaatctggcaagtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 12028384  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    |||||||||   |||  ||  || || ||| || | |||||||||||||  ||||| | || ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||  |      
T  12028385 actgagtgcttttgataatgtcgtgacctgagttgaatgaattgattaggaatgga-cattaggtagtaatgaaacctatttaagatgttaactgagacc 12028483  T
Q  311 tgtgaagttgtta 323  Q
    |||||||||||||    
T  12028484 tgtgaagttgtta 12028496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 434 - 636
Target Start/End: Original strand, 1859012 - 1859214
Alignment:
Q  434 tatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattatt 533  Q
    |||| ||||||||| ||||   ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||  | ||||  ||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  1859012 tataatgttgttgtgatctgattatgctgcttttgttatttaaccaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatgttgaac-tccaaattatt 1859110  T
Q  534 ggataaataagagatgatgattgtgatgtttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaaca 632  Q
    ||||  ||| ||||||||||||  ||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  1859111 ggatgtatatgagatgatgattaagatgttttagttgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcacca 1859210  T
Q  633 cgaa 636  Q
    ||||    
T  1859211 cgaa 1859214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 17410923 - 17410715
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |  || |||| |||  || ||| || ||||| ||| ||||| | |||||    
T  17410923 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagacgccttggagtacctttaggtgtctactaaagattagatgatgatttaga 17410824  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    | ||||||||||||||          |||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17410823 acaagattgaacctgg----------aacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 17410734  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggat 229  Q
    ||||||||||  |||||||    
T  17410733 actgagtgcacttgaggat 17410715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 147 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 23451707 - 23451224
Alignment:
Q  147 gttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgc 246  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||   | || ||| || |     
T  23451707 gttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcaagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgagacctgagttgt 23451608  T
Q  247 atgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatatgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatga 346  Q
     ||||||||||||  ||||| | || ||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| | |||| |||  || ||  | ||  | | |    
T  23451607 ttgaattgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaggctgtt-tgaactgcta-agttgtttgtaa 23451510  T
Q  347 tgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttttatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttg 446  Q
     ||||| ||| | |||| ||||||||||||| ||| | |||||||||  ||||||| |||     | ||||| |     ||||| | |||| ||||||||    
T  23451509 agtgatttaacgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgattatgatgttg-ttgaaaagaattgatgt-----tatgaag-tataatgttgttg 23451417  T
Q  447 taatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaata-aga 545  Q
    | ||||   ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||  | ||||  ||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||  ||    
T  23451416 tgatctgattatgctgcttttgttatttaaccaagttgcatgagtcattataagatgaataagataatgttgaa-ctccaaattattggatgtatattga 23451318  T
Q  546 gatgatgattgtgatgt---ttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||| |||||  |||||   |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||    
T  23451317 gatgttgattaagatgttgattaagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagctttgtcctcaccacga 23451224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Original strand, 17918781 - 17918979
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||| |||||||| ||| | ||| | |||||    
T  17918781 cagagagcttgtcgaattttgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctttagttgtgtattaaagattagaggatgatttaga 17918880  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    | ||||||||| ||||          |||| | |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17918881 acaagattgaaactgg----------aacaaccttagttggaaacctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 17918970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 36 - 229
Target Start/End: Original strand, 20910454 - 20910638
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttagaataagattgaacctggtttagctt 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || ||| || ||||| ||| | ||| | |||||| ||||||||||||||            
T  20910454 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtctttgagtacctttaggtgtctactaaagattagaggatgaattagaacaagattgaacctgg-------- 20910545  T
Q  135 agaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggat 229  Q
      |||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  20910546 --aacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcatttgaggat 20910638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 24222364 - 24222170
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||| |||||||| ||| | ||| | |||||    
T  24222364 cagagagcatgttgattttcgtattttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtgtattaaagattagaggatgatttaga 24222265  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    | ||||||||||||||          |||| |  ||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24222264 acaagattgaacctgg----------aacaaccatagttggaaatctggcaagtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 24222175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 144 - 219
Target Start/End: Original strand, 21340520 - 21340595
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21340520 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 21340595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 144 - 219
Target Start/End: Original strand, 26665884 - 26665959
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26665884 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 26665959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 144 - 219
Target Start/End: Original strand, 26937481 - 26937556
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26937481 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 26937556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 144 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 18356680 - 18356519
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgt 243  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||   | || ||| ||    
T  18356680 ttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagt 18356581  T
Q  244 cgcatgaattgatta-gagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactg 305  Q
     || || |||||||| |||| ||| |||| | || ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  18356580 tgcttggattgattaggaga-ggaaccttagatactaatgagacctatttaagatgttaactg 18356519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 439 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 20767050 - 20766857
Alignment:
Q  439 tgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggata 538  Q
    ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||  | ||||  ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20767050 tgttgttgtgatttgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggata 20766951  T
Q  539 a--ataagagatgatgattgtgatgtttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactca 629  Q
       ||| ||||||||||||  ||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  20766950 tgtatatgagatgatgattaagatgttttaaatgattgagtccatgcattagcatacatatgttgggggttcatgccctatagctttgtactca 20766857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 147 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 23463212 - 23463044
Alignment:
Q  147 gttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgc 246  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||   | || ||| || |     
T  23463212 gttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcaagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgagacctgagttgt 23463113  T
Q  247 atgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatatgtga 315  Q
     ||||||||||||  ||||| | || ||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||    
T  23463112 ttgaattgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctatttaagatgttaactgaaatctgtga 23463044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 144 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 16674505 - 16674430
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 219  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16674505 ttagttgggattctagcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 16674430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 144 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 20232903 - 20232828
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 219  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20232903 ttagttaggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 20232828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 35 - 220
Target Start/End: Original strand, 23535242 - 23535418
Alignment:
Q  35 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttagaataagattgaacctggtttagct 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||  || ||| || ||||| ||| | ||| | ||||||  |||||||||||||           
T  23535242 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactaaagattagaggatgatttagaacgagattgaacctgg------- 23535334  T
Q  134 tagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 220  Q
       |||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23535335 ---aacaaccttagttgggaatctgacttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 23535418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 220
Target Start/End: Original strand, 1858606 - 1858805
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||| || | ||||| ||| | ||| |||||||    
T  1858606 cagagagcatgttgaatttcgtaatttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatattcactaaagattagaagatgacttaga 1858705  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    | ||||||||||||||  || |  |           ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1858706 acaagattgaacctggaataaccaat----------gttggaattctggattgtactcgccatggcgagcagatgctcttgcctcgcgagcacttccaga 1858795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 134 - 215
Target Start/End: Original strand, 17718182 - 17718263
Alignment:
Q  134 tagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactga 215  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17718182 tagaacaaccttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagctgatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactga 17718263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 147 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 23458951 - 23458783
Alignment:
Q  147 gttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgc 246  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||| ||   | || ||| || |     
T  23458951 gttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcaagcacttcaagaactgagtgcatttgagaatgttgagacctgagttgt 23458852  T
Q  247 atgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatatgtga 315  Q
     ||||||||||||  ||||| | || ||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||    
T  23458851 ttgaattgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctatttaagatgttaactgaaatctgtga 23458783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 144 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 18774557 - 18774482
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18774557 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagctgatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgggtgc 18774482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 144 - 219
Target Start/End: Original strand, 24532801 - 24532876
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  24532801 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttttagaactgagtgc 24532876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 144 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 42805773 - 42805698
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 219  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42805773 ttagttggaattctggcttgtactcgtcatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 42805698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 144 - 218
Target Start/End: Original strand, 25229159 - 25229233
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 218  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25229159 ttagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagctgatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 25229233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 144 - 218
Target Start/End: Original strand, 25293315 - 25293389
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 218  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25293315 ttagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagctgatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 25293389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 26681066 - 26680868
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    ||||||| ||||||| ||   |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||| || ||||| ||| | ||| | |||||    
T  26681066 cagagagtatgttgattttcatattttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtctactaaagattagaggatgatttaga 26680967  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    | |||| |||||||||          |||| | |||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26680966 acaagaatgaacctgg----------aacaaccttagttggaaatctggcaagtactcgccatggcgagcagacgctctcgcctcgcgagcacttccaga 26680877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 26952673 - 26952475
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    ||||||| ||||||| ||   |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||| || ||||| ||| | ||| | |||||    
T  26952673 cagagagtatgttgattttcatattttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtctactaaagattagaggatgatttaga 26952574  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    | |||| |||||||||          |||| | |||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26952573 acaagaatgaacctgg----------aacaaccttagttggaaatctggcaagtactcgccatggcgagcagacgctctcgcctcgcgagcacttccaga 26952484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 434 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 23458673 - 23458468
Alignment:
Q  434 tatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattatt 533  Q
    |||| ||||||||| ||||   |||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||  | ||||  ||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  23458673 tatagtgttgttgtgatctgattatgcttcttttgttatttaaccaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatgttgaac-tccaaattatt 23458575  T
Q  534 ggataaataa-gagatgatgattgtgatgtt---taaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactc 628  Q
    ||||  |||  |||||| ||| |  ||||||   ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23458574 ggatgtatattgagatgttgactaagatgttgattaagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtcctc 23458475  T
Q  629 aacacga 635  Q
    | |||||    
T  23458474 accacga 23458468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 434 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 23462934 - 23462729
Alignment:
Q  434 tatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattatt 533  Q
    |||| ||||||||| ||||   |||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||  | ||||  ||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  23462934 tatagtgttgttgtgatctgattatgcttcttttgttatttaaccaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatgttgaac-tccaaattatt 23462836  T
Q  534 ggataaataa-gagatgatgattgtgatgtt---taaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactc 628  Q
    ||||  |||  |||||| ||| |  ||||||   ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23462835 ggatgtatattgagatgttgactaagatgttgattaagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtcctc 23462736  T
Q  629 aacacga 635  Q
    | |||||    
T  23462735 accacga 23462729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 439 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 23572160 - 23571956
Alignment:
Q  439 tgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggata 538  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||| ||  | ||||  ||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  23572160 tgttgttgtgatctgcctatgctgttattgttattgaactaagttgcatgagtccatataagatgattaagatgatgttcaat-tccaaattattggata 23572062  T
Q  539 aataa--------gagatgatgattgtgatgttt-aagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactca 629  Q
     |||         || |||||||||   |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23572061 tatatatatatatgacatgatgattaaaatgttttaagagattgagtccatgcattagcatacatttgtttggggctcatgccctggagctttgtactca 23571962  T
Q  630 acacga 635  Q
     |||||    
T  23571961 ccacga 23571956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 144 - 218
Target Start/End: Original strand, 21884942 - 21885016
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 218  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21884942 ttagttgggaagctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 21885016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 454 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 24493634 - 24493451
Alignment:
Q  454 cctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataa-ataagagatgatg 552  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||    ||||||||||||||| | ||||||| |  |     
T  24493634 cctatgttgctattgttacttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtt--tccaaattattggattatataagaggttgtc 24493537  T
Q  553 --attgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
      | |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24493536 gaaataagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacga 24493451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 144 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 4036573 - 4036499
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 218  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4036573 ttagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagttgatgctttcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 4036499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 156 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 26172805 - 26172743
Alignment:
Q  156 ctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26172805 ctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 26172743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 144 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 18784400 - 18784336
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttcca 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  18784400 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagctgatgctctcgcctcgcgagcacgtcca 18784336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 134 - 218
Target Start/End: Original strand, 19472462 - 19472546
Alignment:
Q  134 tagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 218  Q
    ||||||| | |||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19472462 tagaacaaccttagttggaaagctggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 19472546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 454 - 632
Target Start/End: Original strand, 21997590 - 21997769
Alignment:
Q  454 cctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataa-ataagagatgat- 551  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||    ||||||||||||||| | ||||||| |  |     
T  21997590 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt---tccaaattattggattatataagaggttgtc 21997686  T
Q  552 gattgt-gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaaca 632  Q
    ||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  21997687 gatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaaca 21997769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 156 - 219
Target Start/End: Original strand, 123070 - 123133
Alignment:
Q  156 ctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 219  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  123070 ctggcctgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtgc 123133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 560 - 635
Target Start/End: Original strand, 22107776 - 22107851
Alignment:
Q  560 tgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22107776 tgtttaagaagtcgagtctatgcattaacatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacga 22107851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 466 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 25421585 - 25421414
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataa-ataagagatgatg--attgtgatgt 562  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||    ||||| ||||||||| | ||||||| |  |   ||| ||||||    
T  25421585 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtt--tccaatttattggattatataagaggttgtcgaattatgatgt 25421488  T
Q  563 ttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25421487 ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggctttatgccctggagctttgtactcaacacga 25421414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 455 - 634
Target Start/End: Original strand, 23390553 - 23390733
Alignment:
Q  455 ctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataa-ataagagatgatg- 552  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||    ||||||||||||||| | ||||||| |  |      
T  23390553 ctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt---tccaaattattggattatataagaggttgtcg 23390649  T
Q  553 -attgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
     |||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  23390650 aattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattaacatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacg 23390733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 157 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 20296188 - 20296127
Alignment:
Q  157 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 218  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20296188 tggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 20296127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 469 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 23440027 - 23439857
Alignment:
Q  469 ttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataa-gagatgatgattgtgatgtt---t 564  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||  | ||||  ||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||  |||||| |||||  ||||||   |    
T  23440027 ttatttaaccaagttgcatgagtcattataagatgaataagataatgttgaac-tccaaattattggatgtatattgagatgttgattaagatgttgatt 23439929  T
Q  565 aaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||    
T  23439928 aagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagctttgtcctcaccacga 23439857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 342 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 1096638 - 1096352
Alignment:
Q  342 tatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttttatttgatatcgttatatgatgttatactgt 441  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| |  |||  |||||||||     ||| |||||||  |||    
T  1096638 tatgatgtgatataatgttatat-gcattacttgaattatgaatgtatatgtgagatgttgttgatttgcatttgatat-----tattatgttatgttgt 1096545  T
Q  442 tgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataa-a 540  Q
    | ||| |  |||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| || ||    ||||||||||||||| | |    
T  1096544 ttttgcatactacctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgttgatgtt--tccaaattattggattata 1096447  T
Q  541 taagagatgatg--attgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaaca 632  Q
    |||||| |  |   |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||    
T  1096446 taagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagccttgtgctcaaca 1096352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 12 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 22760141 - 22760026
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||| || ||||| ||| | ||| | |||||    
T  22760141 cagagagcatgttgatttccgtattttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtgtactaaagattagaggatgatttaga 22760042  T
Q  111 ataagattgaacctgg 126  Q
    | ||||||||||||||    
T  22760041 acaagattgaacctgg 22760026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 144 - 219
Target Start/End: Original strand, 26742499 - 26742574
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 219  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  26742499 ttagttggaaatctggcttgtactcgccatggcgagctgatgctctcgcctcgcgaccattttcagaactgagtgc 26742574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 338 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 24529395 - 24529111
Alignment:
Q  338 tgaatatgatgtgatataatgtt-taattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttttatttgatatcgttatatgatgttat 436  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||  |||||||| || ||| |||||||| |   ||  |||||||||| |||| | |||||      
T  24529395 tgaatatgatgtgatataatgttataa--gcattacttgagatatgaatgtataattaagatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgtt-- 24529300  T
Q  437 actgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgga 536  Q
       ||| |||||  || |||||| || | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||   ||  ||||||||||||||    
T  24529299 ---gtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg---aagttccaaattattgga 24529206  T
Q  537 taa-ataagagatgat-gattgt-gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtact 627  Q
    | | ||||||| |  | ||||   |||||||||||| | ||||||||||||||||||    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  24529205 ttatataagagtttgtcgatttaagatgtttaagaggttgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtact 24529111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 342 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 9078123 - 9077835
Alignment:
Q  342 tatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttttatttgatatcgttatatgatgttatactgt 441  Q
    |||||||||||||||||||  |  ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |   ||  | |||||||     ||| |||| || ||||    
T  9078123 tatgatgtgatataatgttatac-gcattacttgagttatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcacttgatat-----tattatgtcatgctgt 9078030  T
Q  442 tgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgga-taaa 540  Q
    | | |||  || |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||  || |||||||| ||| ||||||||| ||    |||||||||||||| || |    
T  9078029 tttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgggtcagtctaagttgatgaagatgatgatg---ttccaaattattggattata 9077933  T
Q  541 taagagatgatgattgt--gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||| |  |  || |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  9077932 taagaggttgttgttctaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagccttgtactcaacacga 9077835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 454 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 13025376 - 13025196
Alignment:
Q  454 cctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgga-taaataagagatgat- 551  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||    |||||||||||||| || ||||||| |  |     
T  13025376 cctatgttgctattgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg--tttccaaattattggattatataagaggttgtc 13025279  T
Q  552 -gattgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaaca 632  Q
      |||  |||||||||||| || |||||||||||||||||     |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  13025278 gaattaagatgtttaagaggtcaagtccatgcattagcatttcactgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaaca 13025196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 454 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 13095560 - 13095380
Alignment:
Q  454 cctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgga-taaataagagatgat- 551  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||    |||||||||||||| || ||||||| |  |     
T  13095560 cctatgttgctattgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg--tttccaaattattggattatataagaggttgtc 13095463  T
Q  552 -gattgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaaca 632  Q
      |||  |||||||||||| || |||||||||||||||||     |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  13095462 gaattaagatgtttaagaggtcaagtccatgcattagcatttcactgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaaca 13095380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 134 - 210
Target Start/End: Original strand, 21295006 - 21295082
Alignment:
Q  134 tagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    ||||||| | ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21295006 tagaacaacattagttgggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccaga 21295082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 134 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 25535351 - 25535275
Alignment:
Q  134 tagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    ||||||| | ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25535351 tagaacaacattagttgggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccaga 25535275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 573 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 24221816 - 24221753
Alignment:
Q  573 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacgaa 636  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  24221816 gagtccatgcattaacatacttttgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcaccacgaa 24221753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 454 - 626
Target Start/End: Original strand, 8286899 - 8287073
Alignment:
Q  454 cctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatg- 552  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||    ||||||||| ||||  ||||  ||  | ||     
T  8286899 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt---tccaaattactggactaatataagtggttgt 8286995  T
Q  553 ---attgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtac 626  Q
       ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  8286996 cgaattatgatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtac 8287073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 560 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 22757080 - 22757006
Alignment:
Q  560 tgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacgaa 636  Q
    ||||| || ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  22757080 tgttttagtgattgagtccatgcattagcatac--ttgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcaccacgaa 22757006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 23572559 - 23572510
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttaga 61  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23572559 cagagagcatgtcgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttaga 23572510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 569 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 31342091 - 31342033
Alignment:
Q  569 gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactca 629  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31342091 gatcgagtccatgcattagcatac--ttgttgggggctcatgccctggagctttgtcctca 31342033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 461 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 39363439 - 39363311
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgga-taaataaga-gatgatgattgtg 558  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||   ||||  |||||||||||||| || |||||| | ||  ||||  |    
T  39363439 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga---tgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgattaag 39363343  T
Q  559 atgtttaagagatcgagtccatgcattagcat 590  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39363342 atgtttaagaggtcgagtccatgcattagcat 39363311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 573 - 636
Target Start/End: Original strand, 12028742 - 12028803
Alignment:
Q  573 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacgaa 636  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  12028742 gagtccatgcattagcatac--ttgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcaccacgaa 12028803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 175 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 22757458 - 22757414
Alignment:
Q  175 gcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22757458 gcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 22757414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 91
Target Start/End: Original strand, 21871213 - 21871268
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaa 91  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  21871213 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttattaa 21871268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 91
Target Start/End: Original strand, 21875493 - 21875548
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaa 91  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  21875493 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttattaa 21875548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 573 - 635
Target Start/End: Original strand, 17919320 - 17919382
Alignment:
Q  573 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||    
T  17919320 gagtccatgcattagcattcatatgttgggggctcatgccctggagcttagtcctcaccacga 17919382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 466 - 634
Target Start/End: Original strand, 19660903 - 19661072
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatg----attgtgatg 561  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||| ||    ||||||||||||||| ||||  ||| | ||    |||  | ||    
T  19660903 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt---tccaaattattggattaatataagaggttgtcgaattaagttg 19660999  T
Q  562 tttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  19661000 tttaagaggttgagtccatgcattagcattca-ttgttgggggcttgatgccatggagctttgtactcaccacg 19661072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 454 - 634
Target Start/End: Original strand, 21293025 - 21293206
Alignment:
Q  454 cctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatg- 552  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | | ||||||||| ||    ||||||||||||||  |||   ||| | ||     
T  21293025 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatgatgatgt---tccaaattattggactaatttaagaggttgt 21293121  T
Q  553 ---attgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
       |||  | |||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  21293122 cgaattaagttgtttaagaggtcgagtccatgaattagcattca-ttgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacg 21293206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 454 - 634
Target Start/End: Original strand, 21808445 - 21808626
Alignment:
Q  454 cctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatg- 552  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||| ||    ||||||||||||||  ||||  ||| | ||     
T  21808445 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt---tccaaattattggactaatataagaggttgt 21808541  T
Q  553 ---attgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
       |||  | |||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  21808542 cgaattaagttgtttaagaggtcgagtccatgcattagccttca-ttgttgggggcttgatgccttggagctttgtactcaccacg 21808626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 456 - 595
Target Start/End: Original strand, 24767603 - 24767743
Alignment:
Q  456 tatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagaga--tgatga 553  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||  | ||||  ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||  ||||||    
T  24767603 tatgctgctattgttatttaactaagttgcataaatctatataagatgattaagatgatgatgaa-ctccaaattattggatgtataagagatttgatga 24767701  T
Q  554 ttgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatt 595  Q
    ||  |||||||    ||| || ||||||||||||||||||||    
T  24767702 ttaagatgttttgttgatagaatccatgcattagcatacatt 24767743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 558 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 25431355 - 25431277
Alignment:
Q  558 gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25431355 gatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatggcctggagctttgtactcaacacga 25431277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 210
Target Start/End: Original strand, 15441720 - 15441773
Alignment:
Q  157 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15441720 tggcttgaactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccaga 15441773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 76
Target Start/End: Original strand, 19660474 - 19660519
Alignment:
Q  31 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19660474 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 19660519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 558 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 22074980 - 22074904
Alignment:
Q  558 gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  22074980 gatgcttaagaggtcgagtccatgcattagcattca-ttgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacg 22074904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 32 - 76
Target Start/End: Original strand, 21292619 - 21292663
Alignment:
Q  32 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21292619 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 21292663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 573 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 26680521 - 26680460
Alignment:
Q  573 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacgaa 636  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  26680521 gagtccatgcattatcatac--ttgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcaccacgaa 26680460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 573 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 26952128 - 26952067
Alignment:
Q  573 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacgaa 636  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  26952128 gagtccatgcattatcatac--ttgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcaccacgaa 26952067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 210
Target Start/End: Original strand, 23337060 - 23337107
Alignment:
Q  163 gtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23337060 gtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccaga 23337107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 25431873 - 25431818
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaa 91  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  25431873 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttattaa 25431818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 560 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 37723861 - 37723787
Alignment:
Q  560 tgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  37723861 tgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattca-tagttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacg 37723787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Original strand, 2154721 - 2154775
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  2154721 tgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 2154775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 468 - 619
Target Start/End: Original strand, 10775790 - 10775942
Alignment:
Q  468 gttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgga-taaataaga-gatgatga-ttgtgatgttt 564  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||   ||||  |||||||||||||| || |||||| | ||  || ||  |||||||    
T  10775790 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga---tgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgttt 10775886  T
Q  565 aagagatcgagtccatgcattagca-tacatttgttgggggc-tcatgccctggagc 619  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||    
T  10775887 aagaggtcgagtccatgcattagcattaca-ttgttgggggcttgatgccctggagc 10775942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 438 - 512
Target Start/End: Original strand, 17517241 - 17517315
Alignment:
Q  438 ctgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatg 512  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| || |||||||| ||| ||||||    
T  17517241 ctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttattaaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 17517315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 1096946 - 1096906
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1096946 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 1096906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 21566023 - 21565983
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21566023 ttttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcct 21565983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 22075487 - 22075447
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22075487 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 22075447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Original strand, 22959175 - 22959215
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22959175 ttttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcct 22959215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 72
Target Start/End: Original strand, 26742376 - 26742436
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 72  Q
    ||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  26742376 cagagagcatgtaaaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 26742436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 165 - 204
Target Start/End: Original strand, 22119963 - 22120002
Alignment:
Q  165 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcact 204  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22119963 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcact 22120002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 454 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 22412249 - 22412083
Alignment:
Q  454 cctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataa-ataagagatgat- 551  Q
    |||||| || ||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||   ||  ||||||||||||||| | ||||||| |  |     
T  22412249 cctatgttgttatcgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaagatgatg---aagttccaaattattggattatataagaggttgtc 22412153  T
Q  552 gattgt-gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagc 619  Q
    ||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||| | ||||||||||||    
T  22412152 gatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 22412083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 36 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 25422011 - 25421956
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaa 91  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||| ||||||    
T  25422011 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctattaa 25421956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 573 - 635
Target Start/End: Original strand, 123480 - 123542
Alignment:
Q  573 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||    
T  123480 gagtccatgcattagcaatgatatgttgggggctcatgccctggagcttagtcctcaccacga 123542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Original strand, 264875 - 264929
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  264875 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 264929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Original strand, 10733047 - 10733101
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  10733047 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 10733101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Original strand, 11581306 - 11581360
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  11581306 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 11581360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 20909067 - 20909013
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  20909067 tgcttttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 20909013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Original strand, 20918055 - 20918109
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  20918055 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 20918109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 29329989 - 29329935
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  29329989 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 29329935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 39245191 - 39245137
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  39245191 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 39245137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 36 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 19669379 - 19669342
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtg 73  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19669379 ttttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtg 19669342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 466 - 515
Target Start/End: Original strand, 21329565 - 21329614
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  21329565 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 21329614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 454 - 515
Target Start/End: Original strand, 21729120 - 21729181
Alignment:
Q  454 cctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | | |||||||||    
T  21729120 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 21729181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 466 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 23064561 - 23064512
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  23064561 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 23064512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 461 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 31061123 - 31060995
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgga-taaataagagatgatga-ttgtg 558  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||   ||||  |||||||||||||| || | ||||| ||  || ||  |    
T  31061123 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatga---tgaagttccaaattattggattatacaagagttgtcgatttaag 31061027  T
Q  559 atgtttaagagatcgagtccatgcattagcat 590  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  31061026 atgtttaagaagtcgagtccatgcattagcat 31060995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 466 - 515
Target Start/End: Original strand, 36154892 - 36154941
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  36154892 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 36154941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 466 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 38619484 - 38619435
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  38619484 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 38619435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 35 - 75
Target Start/End: Original strand, 8286494 - 8286534
Alignment:
Q  35 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcc 75  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  8286494 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcatttgagtgcc 8286534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Original strand, 19660608 - 19660644
Alignment:
Q  165 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagc 201  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19660608 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagc 19660644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 466 - 606
Target Start/End: Original strand, 20806854 - 20806992
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataa-ataagagatgatgattgt-gatgtt 563  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||   ||  ||||||||||||||| | | ||||| ||  ||||   ||||||    
T  20806854 ttgttatttaattaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatgatg---aatttccaaattattggattatacaagagttgtcgatttaagatgtt 20806950  T
Q  564 taagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggct 606  Q
    |||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  20806951 taagaattcgagtccatgcattagcattc-tttgttgggggct 20806992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Original strand, 21329137 - 21329177
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21329137 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 21329177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 454 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 21565608 - 21565544
Alignment:
Q  454 cctatgctgctatt-gttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgtt 517  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||    
T  21565608 cctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgtt 21565544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Original strand, 21985789 - 21985829
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  21985789 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 21985829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 12 - 76
Target Start/End: Original strand, 22107002 - 22107066
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||   ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  22107002 cagagagcatgcaaaatttcgtatttttgacttttgagttgaactttagatgcgtttgagtgcct 22107066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 12 - 76
Target Start/End: Original strand, 22119811 - 22119875
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||   |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  22119811 cagagagcatgcaaaattttgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcct 22119875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Original strand, 23390138 - 23390178
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  23390138 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 23390178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 134 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 24554896 - 24554820
Alignment:
Q  134 tagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    ||||||| | ||||||||||   ||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  24554896 tagaacaacattagttgggaagttggctagtactcgcaatggcgagtagatactctcgccttacgagcacttccaga 24554820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 12 - 72
Target Start/End: Original strand, 25229036 - 25229096
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 72  Q
    ||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  25229036 cagagagcaagttgttttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 25229096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 12 - 72
Target Start/End: Original strand, 25293192 - 25293252
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 72  Q
    ||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  25293192 cagagagcaagttgttttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 25293252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 87
Target Start/End: Original strand, 11580887 - 11580938
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgttta 87  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| || |||||||    
T  11580887 ttttgacttttgagttgatccttagaagcttttgagtgcctgaacatgttta 11580938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #133
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 200
Target Start/End: Original strand, 11581016 - 11581051
Alignment:
Q  165 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11581016 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 11581051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #134
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 210
Target Start/End: Original strand, 14359591 - 14359638
Alignment:
Q  163 gtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||    
T  14359591 gtactcgccatggcgagtaggaactctcgcctcgcgagcacttccaga 14359638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #135
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 200
Target Start/End: Original strand, 22107129 - 22107180
Alignment:
Q  149 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 200  Q
    |||||||||| | || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22107129 tgggattctgacctgaactcaccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 22107180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #136
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 466 - 517
Target Start/End: Original strand, 22959600 - 22959651
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgtt 517  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||    
T  22959600 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgtt 22959651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #137
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 204
Target Start/End: Original strand, 24767107 - 24767146
Alignment:
Q  165 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcact 204  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24767107 actcgtcatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcact 24767146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #138
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 33409537 - 33409506
Alignment:
Q  188 ctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33409537 ctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 33409506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #139
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 466 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 36314630 - 36314505
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaata--agagat-gatga-ttgtgatg 561  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  | | ||||||||| ||    ||||||||||||||| ||||  |||| | | ||| ||  ||||    
T  36314630 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt---tccaaattattggattaatataagaggtcgttgaattaagatg 36314534  T
Q  562 tttaagagatcgagtccatgcattagcat 590  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36314533 tttaagaggtcgagtccatgcattagcat 36314505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #140
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 163 - 305
Target Start/End: Original strand, 15236552 - 15236694
Alignment:
Q  163 gtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagaga 262  Q
    ||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||   ||||||    | || ||| ||||  ||| | ||||||  |    
T  15236552 gtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacatccagaattgagtgcttttgaggaatttgagacctgagtcgtttgattggattaggaa 15236651  T
Q  263 tggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactg 305  Q
    |||| |||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  15236652 tggaacctttggtactaatgagacctatctaagatgttaactg 15236694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #141
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 29346035 - 29345981
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  29346035 tgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 29345981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #142
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Original strand, 42245472 - 42245526
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  42245472 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 42245526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #143
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 4036673 - 4036636
Alignment:
Q  35 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  4036673 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 4036636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #144
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 16674605 - 16674564
Alignment:
Q  35 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||    
T  16674605 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacct 16674564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #145
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 72
Target Start/End: Original strand, 17718092 - 17718129
Alignment:
Q  35 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  17718092 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 17718129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #146
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 18356780 - 18356743
Alignment:
Q  35 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  18356780 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 18356743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #147
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 18784500 - 18784463
Alignment:
Q  35 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  18784500 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 18784463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #148
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 72
Target Start/End: Original strand, 21340420 - 21340457
Alignment:
Q  35 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  21340420 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 21340457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #149
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 21482931 - 21482894
Alignment:
Q  35 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  21482931 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 21482894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #150
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 72
Target Start/End: Original strand, 21884842 - 21884879
Alignment:
Q  35 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  21884842 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 21884879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #151
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 72
Target Start/End: Original strand, 24532701 - 24532738
Alignment:
Q  35 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  24532701 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 24532738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #152
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 26172917 - 26172876
Alignment:
Q  35 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||    
T  26172917 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacct 26172876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #153
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 72
Target Start/End: Original strand, 26665784 - 26665821
Alignment:
Q  35 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  26665784 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 26665821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #154
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 72
Target Start/End: Original strand, 26937381 - 26937418
Alignment:
Q  35 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  26937381 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 26937418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #155
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 33409659 - 33409622
Alignment:
Q  35 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  33409659 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 33409622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #156
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 42805873 - 42805836
Alignment:
Q  35 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  42805873 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 42805836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #157
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Original strand, 5888946 - 5888982
Alignment:
Q  165 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagc 201  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  5888946 actcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagc 5888982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #158
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 558 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 14048043 - 14048011
Alignment:
Q  558 gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcat 590  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14048043 gatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcat 14048011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #159
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 558 - 590
Target Start/End: Original strand, 17517367 - 17517399
Alignment:
Q  558 gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcat 590  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17517367 gatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcat 17517399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #160
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 558 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 18418561 - 18418529
Alignment:
Q  558 gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcat 590  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18418561 gatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcat 18418529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #161
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 35 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 20232983 - 20232955
Alignment:
Q  35 tttttgacttttgagttgaaccttagatg 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20232983 tttttgacttttgagttgaaccttagatg 20232955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #162
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 461 - 501
Target Start/End: Original strand, 20902116 - 20902156
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagt 501  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  20902116 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 20902156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #163
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Original strand, 21498659 - 21498699
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21498659 ttttgacctttaagttgaaccttggatgtttttgagtgcct 21498699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #164
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 21565894 - 21565858
Alignment:
Q  165 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagc 201  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  21565894 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgtgagc 21565858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #165
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Original strand, 22959304 - 22959340
Alignment:
Q  165 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagc 201  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  22959304 actcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagc 22959340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #166
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 558 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 24067068 - 24067036
Alignment:
Q  558 gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcat 590  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24067068 gatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcat 24067036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #167
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 24529700 - 24529660
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  24529700 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttcagtgcct 24529660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #168
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 40 - 76
Target Start/End: Original strand, 24766983 - 24767019
Alignment:
Q  40 gacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  24766983 gacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcct 24767019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #169
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 25744071 - 25744035
Alignment:
Q  165 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagc 201  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  25744071 actcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagc 25744035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 405; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 405; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 635
Target Start/End: Original strand, 15298 - 15916
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  15298 cagagagcatgtagaattctgtattttttacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcttaaagatgtctattaaagattaaatgataacttaga 15397  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    |  |||||||||||          |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  15398 acgagattgaacct----------agaacaacttttgttgggaatctggcttgtactcgccatggcaagcagatgctctcgcctcgcgatcacttctaga 15487  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    ||| ||||||||||||||||  | |||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15488 acttagtgcaagtgaggatattgtgatctgtgtcgcttaatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatc 15587  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttt 410  Q
    ||||||| |||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||     
T  15588 tgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgagataatgattaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgatgcttgctta 15687  T
Q  411 tatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatc----tacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatc 506  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||  ||||    
T  15688 tatttgatatcgttatatgatgtcataatgttgttgtaatctgcgtagctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatc 15787  T
Q  507 aagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggct 606  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15788 aagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattatgatgtttaagagatcaagtccatgcattagcatacatttgttgcgggct 15887  T
Q  607 catgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15888 catgccctggagctttgtactcaacacga 15916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 444 - 635
Target Start/End: Original strand, 10568 - 10758
Alignment:
Q  444 ttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataa 543  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10568 ttgtaatctgcctatgttgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatgttgaacctccaaat-attggataaataa 10666  T
Q  544 gagatgatgattgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10667 gagatgatgattatgatgtttaagagatcgagtccatgcattaggatacatttgttgggggctcatgccctagagctttgtactcaacacga 10758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 124
Target Start/End: Original strand, 10440 - 10553
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||| |||||||| ||||||||    
T  10440 cagagagcatgtagaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcttgaagatgcctattaaagattaaatgaaaacttaga 10539  T
Q  111 ataagattgaacct 124  Q
    |  |||||||||||    
T  10540 acgagattgaacct 10553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0671 (Bit Score: 401; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0671
Description:

Target: scaffold0671; HSP #1
Raw Score: 401; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 6603 - 5974
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6603 cagagagcatgttgaattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagttcctaaatttgtttattaaagattaaatgataacttaga 6504  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6503 atgagattgaacctggtttagcttagaacaactttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctctcctcgcgagcacttccaga 6404  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    |||| ||||||||||||||   |||||||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||     
T  6403 actgtgtgcaagtgaggatgttgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggatccctgggtagtaaagaaacctatacaagaagttaactgcaatc 6304  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaa----ttatgaatgaatgattgagatgttgcttg 406  Q
    ||||||| |||||||| |||||| || |||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||||    | |||||||||||||||||||| ||||||    
T  6303 tgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtaagatgatgtttaattgcatttcttgaaatgttaatgaatgaatgattgagatgatgcttg 6204  T
Q  407 tttttatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatc 506  Q
     |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  | ||||  |||     
T  6203 cttttatttgatatctttatatgatgtcataatgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcaatataagatgatt 6104  T
Q  507 aagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatg-tttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc 605  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6103 aagatgatgttgaacctccaaattattggatacataagagatgatgattaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcatacatatgttgggggc 6004  T
Q  606 tcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6003 tcatgccctggagcttagtactcaacacga 5974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 393; Significance: 0; HSPs: 207)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 36 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 23408907 - 23408308
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttagaataagattgaacctggtttagctt 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |    
T  23408907 ttttgacttttgagttgaaccttagatattat-gagtgcctgaagatgcctattaaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggtttaacct 23408809  T
Q  135 agaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatagcgc 234  Q
    |||||| |  | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  23408808 agaacaaccattgttgggaatcttgcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaacttagtgcaagtgaggatattgc 23408709  T
Q  235 gatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatatgtgaagttgttatgagatgttag 334  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  23408708 gatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtattgttacctattttagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgagatgttag 23408609  T
Q  335 tgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttttatttgatatcgttatatgatgtt 434  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||     
T  23408608 tgttgaatatgatgtgatataatgtttaattacattacttgaattatgaatgaatgattgagatgatgcttgcttttaattgatatcgttgtatgatgtc 23408509  T
Q  435 atactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattg 534  Q
    |  |||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| || || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23408508 acgctgttgttgtaatctgtctatgttgctattgttaattaaccaagttgcatgagtcagtataagatgatcaagatgatgttgaacctccaaattattg 23408409  T
Q  535 gataaataagagatgatgattgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23408408 gataaataagagatgatgattttgatgtttaagagatcgagttcatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctagagctttgtactcaacacg 23408309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 635
Target Start/End: Original strand, 14878124 - 14878754
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  14878124 cagagagcatgtcgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttatatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattagatgatgacttaga 14878223  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
     | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  14878224 gtgagattgaacctggtttagcttagaataactttagttggaattctggctcgtactcgccatggcgagcagatgttctcgcctcgagagcacttccaga 14878323  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatgga-cccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaat 309  Q
    || |||||| | ||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  14878324 accgagtgcgattgaggatattgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggaccccctaggtagtaatgtgacttatataagaagttaactgcaat 14878423  T
Q  310 atgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaa----ttatgaatgaatgattgagatgttgctt 405  Q
     ||||||| | |||||| |||||| || |||||||||||| | || | ||||||||||||||||||||    | |||||||||||||||||||| |||||    
T  14878424 ctgtgaagctattatgaaatgttaatgttgaatatgatgtaagatgaagtttaattgcattacttgaaatgttaatgaatgaatgattgagatgatgctt 14878523  T
Q  406 gtttttatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgat 505  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||  | ||||  ||     
T  14878524 gcttttatttgatatccttatatgatgtcataatgttgttgcaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgaa 14878623  T
Q  506 caagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatg-tttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttggggg 604  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  14878624 taagatgatgttgaatctccaaattattggatacataagagatgatgattaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcatacatatgtaggggg 14878723  T
Q  605 ctcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  14878724 ctcatgccctggagattagtactcaccacga 14878754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 16369907 - 16369279
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16369907 cagagagcatgttgaattctgtaattttgacctttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcataaagatgtttattaaagattaaatgataacttaga 16369808  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16369807 ataagattgaacctggtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctttcgcctcgcgagcacttccaga 16369708  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    |||||||||||||||| ||  || ||| ||||| || |||||||||||| |||  |||||| |||||||||| || |||||||||| ||||||| |||||    
T  16369707 actgagtgcaagtgagaatgtcgtgatatgtgttgcttgaattgattagggatacacccttaggtagtaatgtgatctatataagatgttaactccaata 16369608  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttga----attatgaatgaatgattgagatgttgcttg 406  Q
    ||||||| ||||||||  |||||  | ||| ||| ||||||| ||||  |||||| ||||||||||     | ||||||||||||||||| || ||||||    
T  16369607 tgtgaagctgttatgaactgtta-agttgattataatgtgatttaatcattaatttcattacttgagatgttaatgaatgaatgattgagttgatgcttg 16369509  T
Q  407 tttttatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatc 506  Q
     ||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||  | ||||  ||      
T  16369508 cttttatttgatatccctatatgatgtcataatgttgttgtgaactgcctatgctgctattgttacttaaccaagttgcatgagtcattgtaagatgaat 16369409  T
Q  507 aagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatg-tttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc 605  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16369408 aagatgatgttgaacctccaaattattggatatatatgagatgatgattaagatgttttaagagattgagtccatgcattagcatacatttgttgggagc 16369309  T
Q  606 tcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||    
T  16369308 ttatgccctggagctttgtactcaccacga 16369279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 15060791 - 15060196
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15060791 cagagagcatgttgaattctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattaaatgataacttaga 15060692  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15060691 atgagattgaacctggtttagcttagaacaaccttagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagg 15060592  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    ||||| ||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| | ||||||||||     
T  15060591 actgattgcaagttaggatgttgcgatctgtgtcgcatgaattgattagggatggacccttaggtagtattgtgacctatataagatggtaactgcaatc 15060492  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttga----attatgaatgaatgattgagatgttgcttg 406  Q
    ||||||| | ||||||  |||||  | ||| ||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||||     | ||||||||||||||||| || ||||||    
T  15060491 tgtgaagctattatgaactgtta-agttgattataatgtgatttaatgattaatttcattacttgagatgttaatgaatgaatgattgagttgatgcttg 15060393  T
Q  407 tttttatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatc 506  Q
     ||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  | ||||  ||      
T  15060392 cttttatttgatatccctatatgatgtcataatgttgttgtgaactgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcattgtaagatgaat 15060293  T
Q  507 aagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatg-tttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggg 603  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15060292 aagatgatgttgaa-ctccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaagagattgagtccatgcattagcatacatttgttgggg 15060196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 12 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 15052015 - 15051388
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  15052015 cagagagcatgttgaattctgtaattttaacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattaaattataacttaga 15051916  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  15051915 atgagattgaacctggattagcttagaacaaccttagtcggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttctagg 15051816  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    ||||| ||||||| |||||   | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||     
T  15051815 actgaatgcaagttaggatgttgtgatctgtgtcgcatgaattgattagggatggacccttaggtagtattgtgacctatataagatgttaactgcaatt 15051716  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttga----attatgaatgaatgattgagatgttgcttg 406  Q
    ||||||| | ||||||  |||||  | ||| ||| ||||||| ||||| |||||| |||||| |||     | ||||||||||||||||| || ||||||    
T  15051715 tgtgaagctattatgaactgtta-agttgattataatgtgatttaatgattaatttcattacctgagatgttaatgaatgaatgattgagttgatgcttg 15051617  T
Q  407 tttttatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatc 506  Q
     |||||||||||||   |||||||||| ||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  | ||||  ||      
T  15051616 attttatttgatattcctatatgatgtcataatgttgttgtgaactgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcattgtaagatgaat 15051517  T
Q  507 aagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatg-tttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc 605  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15051516 aagatgatcttgaa-ctccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaagagattgagtccatgcattagcatacatttgttggggcc 15051418  T
Q  606 tcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15051417 tcatgccctggagctttgtactcaccacga 15051388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 12 - 635
Target Start/End: Original strand, 23077097 - 23077715
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||  |||    
T  23077097 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttggatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacacaga 23077196  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
     | ||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23077197 gtgagattgaacctagtttagcttagaacaacttaggttggaattctagcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 23077296  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    || || | ||| |||||||   |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||     
T  23077297 accgatttcaattgaggattttgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttaggtagtaatgagacctatatgagaagtttactgtaatt 23077396  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaa----ttatgaatgaatgattgagatgttgcttg 406  Q
    ||||||| |||||||| |||||         |||| || | ||| ||||||||||||||||||||||    | |||||||||||||||||||| || |||    
T  23077397 tgtgaagctgttatgaaatgtt---------tatgttg-gttatgatgtttaattgcattacttgaaatgttaatgaatgaatgattgagatgatgtttg 23077486  T
Q  407 tttttatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatc 506  Q
      ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||  | ||||  |||     
T  23077487 -ctttatttgatatccttatatgatgtcataatgttgttgtgatctgcctatgttgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtctatataagatgatt 23077585  T
Q  507 aagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatg--tttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttggggg 604  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  23077586 aagatgatgttgaa-ctccaaattagtggatatataagagatgatgattgagatgtttttaagagatcgagtccattcattagcatacatatgttggggg 23077684  T
Q  605 ctcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23077685 ctcatgccctggagcttagtactcaacacga 23077715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 12 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 856635 - 856019
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  856635 cagagaacatgttgaattctgtatttttgactttttagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattaaatgataacttaga 856536  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  856535 atgagattgaacctgttttagcttagaacaattttagttggtattctggcttgtactcgctttggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 856436  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    |||||||||||||||| ||   | ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  856435 actgagtgcaagtgagaatgttgtgatctgtgttgcttgaattgattagggatggacccttaggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatc 856336  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttt 410  Q
    ||||||| |  ||||||||||| |||  |||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||   | | || ||   | |||||||| |||  ||    
T  856335 tgtgaagcttatatgagatgtttgtgtcgaatatgatgtattataatgttta--tgtattacttgaagattaattgtatacataagatgttg-ttgaatt 856239  T
Q  411 tatttgatatcgttat-atgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaag 509  Q
     | ||| |||  |||| |||||       |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||| | ||||  ||| |||    
T  856238 gaattggtataattatcatgat-------tgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttattcaactaagttgcatgagtcgatataagatgattaag 856146  T
Q  510 atgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatg-tttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctca 608  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  856145 atgatgtttatcctccaaattattggatatatatgagatgatgattaagatgttttaagagattgagtccatgcattaacatacatttgttggaggctca 856046  T
Q  609 tgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  856045 tgccctggagctttgtactcaccacga 856019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 13 - 538
Target Start/End: Original strand, 17524794 - 17525298
Alignment:
Q  13 agagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttagaa 111  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  17524794 agagagcatgtagaattcagtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaaggtggttattaaagattaaatgataaattagaa 17524893  T
Q  112 taagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaa 211  Q
    | |||||||||||||||||| ||| |||| | ||||| |||| |||||||||||                      || |||||||||||||||||| ||    
T  17524894 tgagattgaacctggtttagtttaaaacaacattagtagggaatctggcttgta----------------------cttgcctcgcgagcacttccaaaa 17524971  T
Q  212 ctgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatat 311  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  17524972 ctgagtgcaagtgaggatattgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgacctatataagaagttaactgcaatct 17525071  T
Q  312 gtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgttttt 411  Q
    |||||| |||||||| |||||| || |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||    
T  17525072 gtgaagctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgagatgacgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgatgcatactttt 17525171  T
Q  412 atttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagat 511  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||| | ||||  |||||| ||    
T  17525172 atttgatatcgttatgtgatgtcatactgttgttgcactctgcctatgctgctattgttatttaactatgttgcatgagtcgatataagatgatcaaaat 17525271  T
Q  512 gatgttgaacctccaaattattggata 538  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  17525272 gatgttgaacctccaaattattggata 17525298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 292 - 635
Target Start/End: Original strand, 15877947 - 15878288
Alignment:
Q  292 taagaagttaactgcaatatgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatga 391  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15877947 taagaagttaactgcaatctgtgatgttgttatgagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgattaatttcattacttgaattatgaatgaatga 15878046  T
Q  392 ttgagatgttgcttgtttttatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaat 491  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  15878047 ttgagatgttgct-gtttttatt-gatatcgttatgtgatgtcatattgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagt 15878144  T
Q  492 cggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcata 591  Q
    |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15878145 cggtataagatgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattatgatgtttaagagatcgagttcatgcattagcata 15878244  T
Q  592 catttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15878245 catttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacga 15878288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 12 - 635
Target Start/End: Original strand, 18383536 - 18384152
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| | |||||    
T  18383536 cagagagcatgttgaattctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgatttaga 18383635  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18383636 atgagattgaacctggtttagcttagaacaacttaagttggaattttggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttcaaga 18383735  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    ||||| ||||||| || ||   ||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||  ||     
T  18383736 actgaatgcaagttagtatgttgcgatctgtttcgcataaattgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatc 18383835  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttt 410  Q
     |||||| ||||||||  |||||  ||||| | | ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||  ||||||||  ||   |    
T  18383836 agtgaagctgttatgaactgtta-agctgattttaatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg-atgaaat 18383933  T
Q  411 tatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaaga 510  Q
     | |||||||      |||| | |||| ||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||  |  |||  ||| ||||    
T  18383934 gaattgatat-----gatgaag-tataatgttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaaga 18384027  T
Q  511 tgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatgtttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcat 609  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||  ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18384028 tgatgttgaa-ctccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggcttat 18384126  T
Q  610 gccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  18384127 gccctggagctttgtactcaccacga 18384152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 12 - 635
Target Start/End: Original strand, 23052696 - 23053326
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||  ||| |||   |||||||    
T  23052696 cagagagcatgttgaattttgtgattttgacctgtgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgatgatgcatattaaatattagatggagacttaga 23052795  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    || |||||||| || ||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23052796 atgagattgaaactagttaagcttagaacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttgcaga 23052895  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    | ||| |||||||||||||    ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| || || ||| | |||| |     
T  23052896 attgaatgcaagtgaggatgttacgacctgtgtcgcataacttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgatctatttaggatgtttaatgcagtt 23052995  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaatt-----atgaatgaatgattgagatgttgctt 405  Q
    ||||||| | |||||| || |||  | ||  ||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||| |     |||||||||||||||||||| |||||    
T  23052996 tgtgaagctattatgaaattttaa-gttgtttataatgtgatttaattattaattgcattacttgaaatgattaatgaatgaatgattgagatgatgctt 23053094  T
Q  406 gtttttatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgat 505  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||  | ||||  |||    
T  23053095 gcttttatttgatatctttatatgatgtcataatgttgttgtgatctgcttatgctgctattgttatttaactatgttgcatgagtctatataagatgat 23053194  T
Q  506 caagatgatgttgaacctccaaattattgga--taaataagagatgatgattgtgatg-tttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttggg 602  Q
     ||||| |||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23053195 taagataatgttgaa-ctccaaattattggatgtatataagagatgatgattaagatgttttaagagattgagtccatgcattagcatacatatgttggg 23053293  T
Q  603 ggctcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    || ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  23053294 ggatcatgccttggagcttagtactcaacacga 23053326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 12 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 12496754 - 12496143
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| | |||||    
T  12496754 cagagagcatgttgaattctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgatttaga 12496655  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12496654 acgagattgaacctggtttagcttagaacaacttaagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 12496555  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    ||||| ||||||| || ||   ||||||||| |||||| | |||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||     
T  12496554 actgaatgcaagttagtatgttgcgatctgtttcgcataagttgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatc 12496455  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttt 410  Q
    ||||||| |||| |||  || ||  | ||  | | ||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||| | ||||||||  |||||||| | |   |    
T  12496454 tgtgaagctgtt-tgaactgcta-agttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg-tagaaat 12496358  T
Q  411 tatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaaga 510  Q
     | ||||||      ||||| ||||| |||||||||| ||||   ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||  | ||||  ||  ||||    
T  12496357 gaattgata----attatgaagttatgctgttgttgtgatctgattatgctgcttttgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataaga 12496262  T
Q  511 tgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatgtttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcat 609  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||  |||  || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12496261 tgatgttgaa-ctccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagattatttagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcat 12496163  T
Q  610 gccctggagctttgtactca 629  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  12496162 gccctggagctttttactca 12496143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 12 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 323088 - 322472
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||| ||||| | |||||    
T  323088 cagagagcatgttgaattctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcgttaagatgtttattaaagattagatgatgatttaga 322989  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  322988 acgagattgaacctggtttagcttagaacaacttaagttggaattctggcttgtactcaccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 322889  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    ||| | ||||||| || ||   ||||||| | |||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||   ||     
T  322888 actaaatgcaagttagtatgttgcgatctatttcgcataaattgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactaagatc 322789  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttt 410  Q
    ||||||| ||||||||  |||||  ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||  ||||||||  ||   |    
T  322788 tgtgaagctgttatgaagtgtta-agctgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg-atgaaat 322691  T
Q  411 tatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaaga 510  Q
     | |||||||      |||| | |||| | ||||||| ||||   ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| ||  |  |||  ||| | ||    
T  322690 gaattgatat-----gatgaag-tataatattgttgtgatctgattatgccgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattatga 322597  T
Q  511 tgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatgtttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcat 609  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||| || |||||||||  ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  322596 tgatgttgaa-ctccaaattattggatgcatatgacatgatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggcttat 322498  T
Q  610 gccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||    
T  322497 gccctgaagctttgtactcaccacga 322472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 12 - 629
Target Start/End: Original strand, 11298148 - 11298761
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||| | | |||||    
T  11298148 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctttagatgtttattaaagattagatgctgatttaga 11298247  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11298248 acaagattgaacctggtttagcttagaacaacttgagttggaaatctggcttgtactcgccatggcgatcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 11298347  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    | ||| ||||| | || ||   ||||||||| || ||| | |||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||  ||||||| |||     
T  11298348 attgaatgcaatttagtatgttgcgatctgtttctcataatttgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatattaactgaaatt 11298447  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttt 410  Q
    ||||| | |||| |||  || ||  | ||  | | ||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||| | ||||||||  |||||||| |||   |    
T  11298448 tgtgaggctgtt-tgaactgcta-agttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg-ttgaaat 11298544  T
Q  411 tatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaaga 510  Q
     | |||||||     |||||  ||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||  | ||||  ||  ||||    
T  11298545 gaattgatat-----tatgaaattatgttgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataaga 11298639  T
Q  511 tgatgttgaacctccaaattattggata--aataagagatgatgattgtgatgtttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc 607  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||   ||| ||||||||||||  ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  11298640 tgatgttgaacatccaaattattggatatgtatatgagatgatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatctgttgggggttc 11298739  T
Q  608 atgccctggagctttgtactca 629  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  11298740 atgccctggagctttgtactca 11298761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 12 - 635
Target Start/End: Original strand, 19725531 - 19726138
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| |||||||| | ||||| ||| ||||| |  ||||    
T  19725531 cagagagcatgttgaatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttaaatgcttttgtgtgccttaagatgttgaataaagattagatgatgatctaga 19725630  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19725631 acgagattgaacctggtttagcttagaacaaccttagttgggattctgacttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 19725730  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    ||||| | ||||| |||||   ||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||| || ||||| || ||||| |||     
T  19725731 actgaatacaagttaggatgttgcgatctgtttcgcataaattgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacccatttaagatgtcaactgaaatc 19725830  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttt 410  Q
    ||||||  || |||||  |||||  ||||| ||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||| | ||||||||  |||||||| |||   |    
T  19725831 tgtgaaactgctatgaactgtta-agctgattataatgtgatttaatgattaattacattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg-ttgaaat 19725928  T
Q  411 tatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaaga 510  Q
     | |||||||     ||||| || || |||||| ||| ||||   |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||  | |         ||||    
T  19725929 gaattgatat-----tatga-gtcatgctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattat---------aaga 19726013  T
Q  511 tgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatgtttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcat 609  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||| |||||  ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  19726014 tgatgttgaa-ctccaaattattggatgtatatgagatgttgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgcgggttcat 19726112  T
Q  610 gccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  19726113 gccctggagctttgtactcaccacga 19726138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 12173285 - 12173029
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  12173285 cagagagcatgtcgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattagatgatgacttaga 12173186  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12173185 atgagattgaacctggtttagcttagaacaactttagttggtattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 12173086  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggac 267  Q
    ||||| ||||||| |||||   || ||||||||||||| |||||||||  |||||||    
T  12173085 actgaatgcaagttaggatgttgctatctgtgtcgcataaattgattaaggatggac 12173029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 36 - 291
Target Start/End: Original strand, 15877471 - 15877727
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttagaataagattgaacctggtttagctt 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| | |    
T  15877471 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcctattaaagattaaatgataacttaggacgagattgaacctggtttaacct 15877570  T
Q  135 agaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatagcgc 234  Q
    |||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  15877571 agaacaacctttgttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatattgc 15877670  T
Q  235 gatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctata 291  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15877671 gatcagtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctata 15877727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 53 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 11863247 - 11862673
Alignment:
Q  53 aaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttagaataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgg 151  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||| | ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  11863247 aaccttagatgcttttgagtgccttaagat-tttattaaagattagatgatgatttagaacgagattgaacctggtt-agcttagaactactttagttgg 11863150  T
Q  152 gattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaa 251  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| || ||||||||||| |||||   ||||||||| ||| || ||    
T  11863149 aattctggcttgaactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgtaagtacttccaaaattgagtgcaagttaggatgttgcgatctgtttcgtataaa 11863050  T
Q  252 ttgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatatgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtga 351  Q
    ||||||||   ||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||| ||||  || ||| ||||||| || |||||  |||||  ||||| ||||||||||    
T  11863049 ttgattaggattggacccttaggtattaatgtgacctatttaagatgttatttgaaatctgtgaagctgctatgaactgtta-agctgattatgatgtga 11862951  T
Q  352 tataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttttatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatc 451  Q
    | ||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||||   |||||||| |||   | | |||||||     ||||| |||||| | || | || |||    
T  11862950 tttaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatgaccaagatgttg-ttgaaatgaattgatat-----tatgaagttataatattttggtgatc 11862857  T
Q  452 tacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgat 551  Q
    |   |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||  |  |||  ||| ||||||||||||   ||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  11862856 tgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctttacaagatgattaagatgatgttg-tgctccaaattattggatgtatatgagatgat 11862758  T
Q  552 gattgtgatgtttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    ||||  ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11862757 gattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacga 11862673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 12 - 636
Target Start/End: Original strand, 12037572 - 12038189
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||||||||| |||  ||  ||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||| ||||  |||||||    
T  12037572 cagagagcatgttggatttcgtgattttgacatgtgagttaaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcatattaaagattagatgaagacttaga 12037671  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    || ||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12037672 atgagattgaacctggttaagctttgaacaacattagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagccgatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 12037771  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattga-ttagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaat 309  Q
    ||||||||||| |||| ||  || || ||| || || |||||||| ||||| |||||||| || |||| || | || |||| || || ||| | || |||    
T  12037772 actgagtgcaattgagaatgtcgtgacctgagttgcttgaattgatttaga-atggacccctgagtagcaacgtgatctatttaggatgtttaatgaaat 12037870  T
Q  310 atgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgttt 409  Q
     ||||||    || ||| ||||||  | ||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||| | ||||||||  |||||||| |||       
T  12037871 ctgtgaaaccattttgaaatgtta-agttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgagatattattgaatgatcaagatgttg-ttgaaa 12037968  T
Q  410 ttatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaag 509  Q
    | | ||| | |     |||||  ||||| ||||||||| ||||   ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| |   | ||||  ||| |||    
T  12037969 tgaattgttgt-----tatgaaattataatgttgttgtgatctgattatgctgct-ttgttatttaactaagttgcatgagtttatataagatgattaag 12038062  T
Q  510 atgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatgtttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctca 608  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||  ||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12038063 atgatgttgaa-ctccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttatatgatagagtccatgcattagcatacatttgttgggggctca 12038161  T
Q  609 tgccctggagctttgtactcaacacgaa 636  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  12038162 tgccctggagctttgtcctcaccacgaa 12038189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 16 - 305
Target Start/End: Original strand, 26190632 - 26190922
Alignment:
Q  16 gagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagttaa-atgataacttagaataa 114  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| | |||||||| ||    
T  26190632 gagcatgttgaattatgtgtttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagataagatgctgacttagaacaa 26190731  T
Q  115 gattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactg 214  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26190732 gattgaacctggtttagcttataacaacttgagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactg 26190831  T
Q  215 agtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactg 305  Q
    ||||||| |||| ||  |  || ||| || || || |||||||||  ||||| | || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  26190832 agtgcaattgagaatgtcatgacctgagttgcttggattgattaggaatggaactttaggtagtaatgagacctatttaagatgttaactg 26190922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 15 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 11852067 - 11851510
Alignment:
Q  15 agagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttagaata 113  Q
    |||||||||||||||  ||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||| | ||||||      
T  11852067 agagcatgttgaatttcgtaattttaacttttcagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagat-tttattaaagattagatgatgatttagaacg 11851969  T
Q  114 agattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaact 213  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  11851968 agattgaacctggtt-agcttataacaactttagttggaattctggcttgaactcgccatggcgatcagatgctctcgcctcgtaagcacttccagaact 11851870  T
Q  214 gagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatatgt 313  Q
     ||||||||| |||||   ||||||||| ||| || ||||||||||   |||||||||       |||| ||||||| ||||| |||| ||| ||| |||    
T  11851869 aagtgcaagttaggatgttgcgatctgtttcgtataaattgattaggattggaccctt------aaatgtgacctatttaagatgttatctgaaatttgt 11851776  T
Q  314 gaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttttat 413  Q
    |||| || |||||  |||||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||||   |||||||| |||   | |     
T  11851775 gaagctgctatgaactgtta-agctgattatgatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatgaacaagatgttg-ttgaaatgaa 11851678  T
Q  414 ttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatga 513  Q
    |||||||     ||||| |||||| ||||||||| |||||  |||||| |||| |||||||||| ||| ||||||| ||  |  |||  ||| |||||||    
T  11851677 ttgatat-----tatgaagttataatgttgttgtgatctaattatgctactatcgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatga 11851583  T
Q  514 tgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatgtttaaga-gatcgagtccatgcatta 586  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||  ||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  11851582 tgttgaa-ctccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcatta 11851510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 155 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 16910105 - 16909768
Alignment:
Q  155 tctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |  ||||||||| || |||||||    
T  16910105 tctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttctagaactgagtgcaagtgagaatgtcatgatctgtgttgcttgaattg 16910006  T
Q  255 attagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatatgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatat 354  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||| | ||||||  |||||  | ||| ||| ||||||| |    
T  16910005 attagggatggacccttaggtagtaatgtgacctatacaagatgttaactgcaatctgtgaagcttttatgaattgtta-agttgattataatgtgattt 16909907  T
Q  355 aatgtttaattgcattacttga----attatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttttatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaat 450  Q
    |||| ||||||  |||||||||     | ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||| |     
T  16909906 aatgattaattttattacttgagatgttaatgaatgaatgattgagttgatgcttgcttttatttgatatccctatatgatgtcataatgttgttgtgaa 16909807  T
Q  451 ctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatga 489  Q
    || | |||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  16909806 ctgcttatgctactattgttatttaaccaagttgcatga 16909768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 311 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 12173003 - 12172675
Alignment:
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaatt----atgaatgaatgattgagatgttgcttg 406  Q
    ||||||| |||||||| ||||||  ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| |    ||||||||||||||||| || | ||||    
T  12173003 tgtgaagctgttatgaaatgttaa-gctgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatgttaatgaatgaatgattgagttggtacttg 12172905  T
Q  407 tttttatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatc 506  Q
     |||||||||||||| ||| ||||||| ||  ||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||  | ||||  |||     
T  12172904 cttttatttgatatctttacatgatgtcatgatgttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgatt 12172805  T
Q  507 aagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatgttt-aagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc 605  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12172804 atgatgatgttgaacctccaaattattggatatatatgagatgatgattaagatgttttaagagattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc 12172705  T
Q  606 tcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  12172704 tcatgccctgtagctttgtactcaccacga 12172675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 167
Target Start/End: Original strand, 321634 - 321789
Alignment:
Q  13 agagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaa-gttaaatgataacttagaa 111  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  321634 agagagcatgtagaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaaggttaaatgataacttagaa 321733  T
Q  112 taagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtact 167  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| || ||||||    
T  321734 tgagattgaacctggtttagcttagaacaacattagttgggaatctagcctgtact 321789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 326
Target Start/End: Original strand, 1982440 - 1982745
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||| ||| | ||| | |||||    
T  1982440 cagagagcatgttgattttcgtattttggacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtacctttagatgtttactaaagattagaggatgatttaga 1982539  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    | ||||||||||||||          |||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1982540 acaagattgaacctgg----------aacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcaaatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 1982629  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    ||||||| ||  |||| |    | || ||| || |  || |||| ||||  ||||| |||| |||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||    
T  1982630 actgagtacatttgagaagtttgagacctgagttgtttggattggttaggaatggagccttaggtagtaatgtgacctaattaagatgttaactgcaata 1982729  T
Q  311 tgtgaagttgttatga 326  Q
    ||||||||||||||||    
T  1982730 tgtgaagttgttatga 1982745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 392
Target Start/End: Original strand, 326794 - 327163
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||  || ||| || ||||| ||| | ||| | |||||    
T  326794 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactaaagattagaggatgatttaga 326893  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    | ||||||||||||||          |||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  326894 acaagattgaacctgg----------aacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 326983  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    |||||||||   |||||||   | || ||| || || || |||||||||| | ||| |||| |||| ||||||||||||| |||||  |||||||  |      
T  326984 actgagtgcttttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattagaaaaggaaccttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaac 327083  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgat 392  Q
    ||||||| | |||||| ||| ||    ||| ||| ||||||| || || || ||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  327084 tgtgaagctattatgaaatgcta--agtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgat 327163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 323
Target Start/End: Original strand, 11594769 - 11595070
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||| ||||| ||| | ||| | |||||    
T  11594769 cagagagcatgttgattttcgtattttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtttactaaagattagaggatgatttaga 11594868  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    | ||||||||||||||          |||| | |||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11594869 acaagattgaacctgg----------aacaaccttagttggaaatctggcaagtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 11594958  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    |||||||||   |||  ||  || || ||| || | |||||||||||||  ||||| | || ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||  |      
T  11594959 actgagtgcttttgataatgtcgtgacctgagttgaatgaattgattaggaatgga-cattaggtagtaatgaaacctatttaagatgttaactgagacc 11595057  T
Q  311 tgtgaagttgtta 323  Q
    |||||||||||||    
T  11595058 tgtgaagttgtta 11595070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 540 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 16796294 - 16796199
Alignment:
Q  540 ataagagatgatgattgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16796294 ataagagatgatgattatgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacga 16796199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 229
Target Start/End: Original strand, 7792976 - 7793184
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||  || ||| || ||||| ||| | ||| | |||||    
T  7792976 cagagagcatgtcgaattatgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactaaagattagaggatgatttaga 7793075  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    | ||||||||||||||          |||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7793076 acaagattgaacctgg----------aacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctcttgcctcgcgagcacttccaga 7793165  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggat 229  Q
    ||||||||||  |||||||    
T  7793166 actgagtgcatttgaggat 7793184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 15483138 - 15482930
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||  || ||| || ||||| ||| |  || | |||||    
T  15483138 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactaaagattagagaatgatttaga 15483039  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    | ||||||||||||||          |||| | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15483038 acaagattgaacctgg----------aacaaccttagtttggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 15482949  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggat 229  Q
    ||||||||||  |||||||    
T  15482948 actgagtgcatttgaggat 15482930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 392
Target Start/End: Original strand, 20461130 - 20461499
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagttaa-atgataacttaga 110  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||  || ||| || ||||| | | | ||| | |||||    
T  20461130 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactaaagatcagaggatgatttaga 20461229  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    | ||||||||||||||          |||| | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20461230 acaagattgaacctgg----------aacaaccttagttaggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 20461319  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    ||||||||||  | |||||   | || ||| || || || |||||||||  | ||| | || |||| ||||||||||||| |||||  |||||||  |      
T  20461320 actgagtgcatttaaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaac 20461419  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgat 392  Q
    ||||||| | |||||| ||| ||    ||| ||| ||||||| || || || ||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  20461420 tgtgaagctattatgaaatgcta--agtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgat 20461499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 213
Target Start/End: Original strand, 3402585 - 3402777
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||| |||||||| ||| | ||| |||||||    
T  3402585 cagagagcttgtcgaattttgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctttagttgtgtattaaagattagaggatgacttaga 3402684  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    | |||||||||||||          ||||| |  ||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3402685 acaagattgaacctg----------gaacaaccgtagttggaaatctggcaagtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 3402774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 134 - 219
Target Start/End: Original strand, 1598223 - 1598308
Alignment:
Q  134 tagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 219  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1598223 tagaacaaccttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 1598308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 144 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 17242325 - 17242250
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17242325 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 17242250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 144 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 38814737 - 38814662
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38814737 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 38814662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 16 - 220
Target Start/End: Original strand, 15849719 - 15849914
Alignment:
Q  16 gagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttagaataa 114  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||  || ||  || ||| | ||| | ||| | |||||| ||    
T  15849719 gagcatgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactaatgattagaggatgatttagaacaa 15849818  T
Q  115 gattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactg 214  Q
    ||||||||||||          |||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15849819 gattgaacctgg----------aacaaccttggttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactg 15849908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 467 - 635
Target Start/End: Original strand, 26196500 - 26196669
Alignment:
Q  467 tgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatgttt-a 565  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||  | ||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||  ||||||| |    
T  26196500 tgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgttgaac-tccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgtttta 26196598  T
Q  566 aga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  26196599 agatgattgagttcatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcaccacga 26196669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 34 - 323
Target Start/End: Original strand, 11557037 - 11557316
Alignment:
Q  34 atttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttagaataagattgaacctggtttagc 132  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||| ||| | ||| | |||||| |||||||||||||           
T  11557037 attttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacccatagatgtttattaaagattagaggatgatttagaacaagattgaacctg------- 11557129  T
Q  133 ttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatagc 232  Q
        | || | |||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||  ||  |    
T  11557130 ----agcaaccttagttggaaatctggcaagtactcgccatggcgagcatatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgaatgcttttgataatgtc 11557225  T
Q  233 gcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatatgtgaagttgtta 323  Q
    | || ||| || | |||||||||||||  ||||| | || ||||||||||| |||||| ||||  |||| ||| ||| |||||||||||||    
T  11557226 gtgacctgagttgaatgaattgattaggaatggaactttaggtagtaatgaaacctatttaaggtgttagctggaatctgtgaagttgtta 11557316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 144 - 220
Target Start/End: Original strand, 16797807 - 16797883
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 220  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16797807 ttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 16797883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 145 - 219
Target Start/End: Original strand, 15941658 - 15941732
Alignment:
Q  145 tagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 219  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15941658 tagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 15941732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 220
Target Start/End: Original strand, 31097184 - 31097383
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||  || ||  || ||||| ||| |  || | |||||    
T  31097184 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactaaagattagagaatgatttaga 31097283  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    | ||||||||||||||          |||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  31097284 acaagattgaacctgg----------aacgaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctaccgcctcgcgagcacttccaga 31097373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 42326420 - 42326222
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    ||||||| ||||||| ||  || |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| |||   |||||||| ||||| ||| | ||| | |||||    
T  42326420 cagagagaatgttgattttcgtgttttggacttttgagttgaaccttagaagcttttgagtacctttcgatgtttactaaagattagaggatgatttaga 42326321  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    | ||||||||||||||          |||| | |||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42326320 acaagattgaacctgg----------aacaaccttagttggaaatctggcaagtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 42326231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 544 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 15067654 - 15067562
Alignment:
Q  544 gagatgatgattgtgatgttt-aagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15067654 gagatgatgattaagatgttttaagagattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacga 15067562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 144 - 220
Target Start/End: Original strand, 16808634 - 16808710
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 220  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16808634 ttagttgggaagctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 16808710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 134 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 3834037 - 3833952
Alignment:
Q  134 tagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 219  Q
    ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  3834037 tagaacaaccttggttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagatttgagtgc 3833952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 16697268 - 16697071
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaa-agttaaatgataacttaga 110  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||  || ||  || ||| | ||| | ||| | |||||    
T  16697268 cagagagcatgttgattttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgactactaacaattagaggatgatttaga 16697169  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    || ||| |||||||||          |||| | |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16697168 atgagactgaacctgg----------aacaaccttagttggaaagctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 16697079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 144 - 219
Target Start/End: Original strand, 11300264 - 11300339
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 219  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  11300264 ttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacatccagaattgagtgc 11300339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 523 - 624
Target Start/End: Original strand, 12852662 - 12852763
Alignment:
Q  523 tccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagcttt 622  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||||||  ||||||||   ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12852662 tccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgtttagatgatagagtcaatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagcttt 12852761  T
Q  623 gt 624  Q
    ||    
T  12852762 gt 12852763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 144 - 220
Target Start/End: Original strand, 2897576 - 2897652
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 220  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2897576 ttagttgggaatctggcttgtactcgacatgacgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaacttagtgca 2897652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 342 - 635
Target Start/End: Original strand, 11424713 - 11424997
Alignment:
Q  342 tatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttttatttgatatcgttatatgatgttatactgt 441  Q
    |||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||  |  |||| ||||| ||||| | |||     ||||    
T  11424713 tatgatgtgatataatgttatac-gcattacttgaattatgaatgcataattgagatgttgatt--tgctatt-gatattgttatgtcatg-----ctgt 11424803  T
Q  442 tgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataa-a 540  Q
    | |||||  || |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||| ||    ||||||||||||||| | |    
T  11424804 t-ttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt---tccaaattattggattata 11424899  T
Q  541 taagagatgatg--attgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||| |  |   |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11424900 taagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacga 11424997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 12 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 16690695 - 16690498
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||  || ||  || ||| | |||   ||| | |||||    
T  16690695 cagagagcatgttgattttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgactactaacgattaggggatgatttaga 16690596  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    || ||| |||||||||          |||| | |||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16690595 atgagactgaacctgg----------aacaaccttagttggaaagctggcttttactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 16690506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 134 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 20723364 - 20723288
Alignment:
Q  134 tagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    ||||||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20723364 tagaacaacattagttgggaagctggcttgtactcgccatggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 20723288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 157 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 7110042 - 7109981
Alignment:
Q  157 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 218  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7110042 tggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 7109981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 157 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 7113977 - 7113916
Alignment:
Q  157 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 218  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7113977 tggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 7113916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 145 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 11855088 - 11855015
Alignment:
Q  145 tagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 218  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  11855088 tagttgggaagctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcacctcgcgagcaaatccagaactgagtg 11855015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 157 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 22337063 - 22337002
Alignment:
Q  157 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 218  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22337063 tggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 22337002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 157 - 218
Target Start/End: Original strand, 27409409 - 27409470
Alignment:
Q  157 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 218  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27409409 tggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 27409470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 439 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 12511137 - 12510934
Alignment:
Q  439 tgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgtt---gaacctccaaattattgg 535  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||  ||||||| ||| |||||| || |   ||   |||||||||||||    
T  12511137 tgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattctaagttgattaagatgttgataatgatgttccaaattattgg 12511038  T
Q  536 ataaataagagatgatg----attgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaa 630  Q
    || ||||  ||| | ||    |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||     
T  12511037 attaatataagaggttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcac 12510938  T
Q  631 cacg 634  Q
    ||||    
T  12510937 cacg 12510934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 461 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 17487914 - 17487740
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataa-ataagagatgatg--attgt 557  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||    ||||||||||||||| | ||||||| |  |   |||      
T  17487914 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt---tccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaa 17487818  T
Q  558 gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  17487817 gatgtttaagaggtcgagtccatgcattaacatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacg 17487740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 461 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 17499396 - 17499222
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataa-ataagagatgatg--attgt 557  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||    ||||||||||||||| | ||||||| |  |   |||      
T  17499396 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt---tccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaa 17499300  T
Q  558 gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  17499299 gatgtttaagaggtcgagtccatgcattaacatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacg 17499222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 343 - 632
Target Start/End: Original strand, 25476336 - 25476620
Alignment:
Q  343 atgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttttatttgatatcgttatatgatgttatactgtt 442  Q
    |||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |   ||  |||||||||     ||| |||| || |||||    
T  25476336 atgatgtgatataatgtt-atgcgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatat-----tattatgtcatgctgtt 25476429  T
Q  443 gttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataa-at 541  Q
     |||||  |||||| || |||| ||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||    ||||||||||||||| | ||    
T  25476430 tttgtatactacctgtgttgctgttgttttttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt---tccaaattattggattatat 25476526  T
Q  542 aagagatgatg--attgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttggggg-ctcatgccctggagctttgtactcaaca 632  Q
    ||||| |  |   |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  25476527 aagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggtttgatgccctggagctttgtactcaaca 25476620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 573 - 636
Target Start/End: Original strand, 11557562 - 11557625
Alignment:
Q  573 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacgaa 636  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  11557562 gagtccatgcattagcatacttttgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcaccacgaa 11557625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 454 - 634
Target Start/End: Original strand, 20698491 - 20698673
Alignment:
Q  454 cctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatg- 552  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||    ||||||||||||||| ||||  ||| | ||     
T  20698491 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg---ttccaaattattggattaatataagaggttgt 20698587  T
Q  553 ---attgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
       |||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||    ||||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||    
T  20698588 cgaattaagatgtttaagaagtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgattccctggagctttgtactcaccacg 20698673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 454 - 634
Target Start/End: Original strand, 23083417 - 23083598
Alignment:
Q  454 cctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgga-taaataaga-gatgat 551  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||    |||||||||||||| || |||||| | ||      
T  23083417 cctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg---ttccaaattattggattatataagaggttgtc 23083513  T
Q  552 ga-ttgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttggggg-ctcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
    || ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  23083514 gatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggtttgatgccttggagttttgtactcaacacg 23083598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 342 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 14973025 - 14972783
Alignment:
Q  342 tatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttttatttgatatcgttatatgatgttatactgt 441  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| |  |||  |||||||||     ||| |||| || ||||    
T  14973025 tatgatgtgatataatgttatat-gcattacttgaattatgaatgtatatatgagatgttgttgatttgcatttgatat-----tattatgtcatgctgt 14972932  T
Q  442 tgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgga-taaa 540  Q
    | |||||  || ||| || |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||    |||||||||||||| || |    
T  14972931 ttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg---ttccaaattattggattata 14972835  T
Q  541 taaga-gatgatga-ttgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcat 590  Q
    ||||| | ||  || ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14972834 taagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcat 14972783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 157 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 15617717 - 15617656
Alignment:
Q  157 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 218  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15617717 tggcttgtactcgccacggcgagcagatgctcttgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 15617656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 157 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 22322008 - 22321947
Alignment:
Q  157 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 218  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  22322008 tggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaaaattgagtg 22321947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 583 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 11849247 - 11849195
Alignment:
Q  583 attagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11849247 attagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacga 11849195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 76
Target Start/End: Original strand, 17674194 - 17674258
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17674194 cagagagcatgttgaatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 17674258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 134 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 24188140 - 24188064
Alignment:
Q  134 tagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    ||||||| | ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24188140 tagaacaacattagttgggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccaga 24188064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 573 - 636
Target Start/End: Original strand, 1982988 - 1983051
Alignment:
Q  573 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacgaa 636  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||    
T  1982988 gagtccatgcattagcatacttttgttgggggctcatgccctggagctatgtcctcaccacgaa 1983051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 466 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 13442327 - 13442158
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgga-taaataagagatgat--gattgtgatgt 562  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||    |||||||||||||| || ||||||| |  |   |||  |||||    
T  13442327 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg---ttccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgt 13442231  T
Q  563 ttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  13442230 ttaagaggtcgagtccatgcattaatatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacg 13442158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 175 - 381
Target Start/End: Original strand, 3389719 - 3389924
Alignment:
Q  175 gcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttggg 274  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||   |||| ||  || || ||| || | ||||||||| |||  ||||| | || ||    
T  3389719 gcgagcagatgctctcgccttgcgagcacttccagaactaagtgcttttgagaatgtcgtgacctgagttgaatgaattgagtaggaatggaactttagg 3389818  T
Q  275 tagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatatgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattactt 374  Q
    |||||||| ||||||| ||||| ||||||||  |  ||||||| ||||||||  |||||  ||||  | | ||||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  3389819 tagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagacctgtgaagctgttatgaattgtta-agctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactt 3389917  T
Q  375 gaattat 381  Q
    || ||||    
T  3389918 gatttat 3389924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 451 - 619
Target Start/End: Original strand, 24153261 - 24153430
Alignment:
Q  451 ctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgga-taaataaga-gat 548  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||   ||||  |||||||||||||| || |||||| | |    
T  24153261 ctacctatgttgctatcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga---tgaagttccaaattattggattatataagaggtt 24153357  T
Q  549 gatga-ttgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagc 619  Q
    |  || ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||| | ||||||||||||    
T  24153358 gtcgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 24153430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 466 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 43840985 - 43840813
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataa-ataagagatgatg--attgtgatgt 562  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||| ||| ||    ||||||||||||||| | ||||||| |  |   |||  |||||    
T  43840985 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgatgaagataatgatgt---tccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgt 43840889  T
Q  563 ttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtactcaacacgaaa 637  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43840888 ttaagaggtcgagtccatgcattaacatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacgaaa 43840813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 466 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 26686940 - 26686773
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgga-taaataagagatgatg--attgtgatgt 562  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||| ||    |||||||||||||| || ||||||| |  |   |||  |||||    
T  26686940 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaagaagatgatgatgt---tccaaattattggactatataagaggttgtcgaattaagatgt 26686844  T
Q  563 ttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaaca 632  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||    
T  26686843 ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctagagctttgtactcaaca 26686773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 157 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 28950068 - 28950007
Alignment:
Q  157 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 218  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  28950068 tggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgccccgtgagcacttccagaattgagtg 28950007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 134 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 55149341 - 55149256
Alignment:
Q  134 tagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 219  Q
    ||||||| | ||||||||||   ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  55149341 tagaacaacattagttgggaagttggattgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagatttgagtgc 55149256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 573 - 629
Target Start/End: Original strand, 3390114 - 3390169
Alignment:
Q  573 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactca 629  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3390114 gagtccatgcattagcatac-tttgttgggggctcatgccctggagctttgtcctca 3390169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 573 - 636
Target Start/End: Original strand, 11595316 - 11595377
Alignment:
Q  573 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacgaa 636  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  11595316 gagtccatgcattagcatac--ttgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcaccacgaa 11595377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 32 - 84
Target Start/End: Original strand, 13209966 - 13210018
Alignment:
Q  32 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgt 84  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  13209966 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaacatgt 13210018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 126
Target Start/End: Original strand, 3389600 - 3389691
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttagaataagattgaacctgg 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||| |||||||| ||| | ||| || ||||| ||||||||||||||    
T  3389600 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctttagttgtgtattaaagattagaggatgacatagaacaagattgaacctgg 3389691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 454 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 18438599 - 18438416
Alignment:
Q  454 cctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataa-ataagagatgatg 552  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||    | ||||||||||||| | ||||||| |  |     
T  18438599 cctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtt--ttcaaattattggattatataagaggttgtc 18438502  T
Q  553 --attgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
      |||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||    ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18438501 gaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattaacatttcattgttggaggcttgatgccctggagctttgtactcaacacga 18438416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 456 - 595
Target Start/End: Original strand, 2897873 - 2898012
Alignment:
Q  456 tatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagaga--tgatga 553  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |  ||||   |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||  ||| ||    
T  2897873 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctgaataagataatcaagttgatgatgaa-ctccaaattattggatgtataagagatttgaaga 2897971  T
Q  554 ttgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatt 595  Q
    ||  |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  2897972 ttaagatgtttaa-tgatagagtccatgcattagcatacatt 2898012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 456 - 629
Target Start/End: Original strand, 3403014 - 3403189
Alignment:
Q  456 tatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataa-gagatgatgat 554  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||  | ||||  ||  |||||| |||||| | ||||||||| |||||  |||  |||||| ||||    
T  3403014 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgttgttgagc-tccaaattagtggatgcatattgagatgttgat 3403112  T
Q  555 tgtgat-gtttaaga--gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactca 629  Q
    |  ||| |||| |||  ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3403113 taagattgttttagattgattgagtccatgcattaacatac-tttgttgggggctcatgccctggagctttgtcctca 3403189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 454 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 12399274 - 12399093
Alignment:
Q  454 cctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatg- 552  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||| ||    ||||||||||||||  ||||  ||| | ||     
T  12399274 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt---tccaaattattggactaatataagaggttgt 12399178  T
Q  553 ---attgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
       |||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| | ||||||||||||  |||||||| ||||    
T  12399177 caaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattca-ttgttggtggcttgatgccctggagcactgtactcaccacg 12399093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 432 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 14665484 - 14665320
Alignment:
Q  432 gttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaatta 531  Q
    |||||||||||| ||| ||||   |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||  | ||||  ||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  14665484 gttatactgttgatgtgatctgattatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatgaa-ctccaaatta 14665386  T
Q  532 ttggataaataagaga--tgatgattgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatt 595  Q
    ||||||  ||||||||  ||||||||  ||| |||    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  14665385 ttggatgtataagagatttgatgattaagatattttgttgatagagtccatgcattagcatacatt 14665320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 432 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 14668640 - 14668476
Alignment:
Q  432 gttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaatta 531  Q
    |||||||||||| ||| ||||   |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||  | ||||  ||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  14668640 gttatactgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatgaa-ctccaaatta 14668542  T
Q  532 ttggataaataagaga--tgatgattgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatt 595  Q
    ||||||  ||||||||  ||||||||   ||||||    ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  14668541 ttggatgtataagagatttgatgattaaaatgttttgttgatagagtccatgcattaacatacatt 14668476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 562 - 634
Target Start/End: Original strand, 13210493 - 13210565
Alignment:
Q  562 tttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  13210493 tttaagaggtcgagtccatgcattagcattca-ttgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacg 13210565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 14179690 - 14179570
Alignment:
Q  256 ttagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatatgtgaagttg-ttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatat 354  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| |  ||| ||||||| || ||| ||  ||||  || ||| |||||||||||||    
T  14179690 ttagagatggacccctgggtagtattgtgacctatataagaagttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatat 14179591  T
Q  355 aatgtttaattgcattacttga 376  Q
    ||||||| | ||||||||||||    
T  14179590 aatgtttta-tgcattacttga 14179570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 439 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 46822345 - 46822272
Alignment:
Q  439 tgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatg 512  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||| ||| ||||||    
T  46822345 tgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 46822272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 55476546 - 55476418
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgga-taaataaga-gatgatgattgtg 558  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||   ||||  |||||||||||||| || |||||| | ||  ||||  |    
T  55476546 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga---tgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgattaag 55476450  T
Q  559 atgtttaagagatcgagtccatgcattagcat 590  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  55476449 atgtttaagaggtcgagtctatgcattagcat 55476418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 12 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 12399698 - 12399634
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    ||||||||||| |  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12399698 cagagagcatgctagattttgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 12399634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 32 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 14179805 - 14179761
Alignment:
Q  32 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14179805 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 14179761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 573 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 42325881 - 42325820
Alignment:
Q  573 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacgaa 636  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  42325881 gagtccatgcattagcatac--ttgttgggggctcataccctggagctttgtcctcaccacgaa 42325820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 42386581 - 42386427
Alignment:
Q  342 tatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttttatttgatatcgttatatgatgttatactgt 441  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| |   ||  ||||||||| |||     |||| || ||||    
T  42386581 tatgatgtgatataatgttatat-gcattgcttgaattatgaatgaatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattgtt-----atgtcatgctgt 42386488  T
Q  442 tgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtc 502  Q
    | |||||  || |||||| |||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  42386487 ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaaactgcatgagtcggtctaagtc 42386427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 839583 - 839533
Alignment:
Q  160 cttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  839583 cttgaactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccaga 839533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 558 - 634
Target Start/End: Original strand, 14576990 - 14577067
Alignment:
Q  558 gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcata-catttgttgggggctc-atgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  14576990 gatgtttaagaggtcgagtccatgcatttgcatttcattt-ttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacg 14577067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 455 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 14572653 - 14572475
Alignment:
Q  455 ctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgga--taaataaga-gatgat 551  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||   | ||||||||    ||||||||||||||  ||  ||||| |||| |    
T  14572653 ctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat---gttgatgttg---ttccaaattattggacttacttaagaggatgtt 14572560  T
Q  552 g-attgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
    |  ||  |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  14572559 gttttaagatgtttaagaggtcgagtctatgcatttgcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacg 14572475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 165 - 210
Target Start/End: Original strand, 28350935 - 28350980
Alignment:
Q  165 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28350935 actcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccaga 28350980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 438 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 30029921 - 30029718
Alignment:
Q  438 ctgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaaga---tgatgttgaacctccaaattattg 534  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| || |||||||| ||   |||   ||||| |||   ||||||||||||    
T  30029921 ctgttgttgtaatctgtctatgctgctattgttattaaactaagttgcatgagtcagtctaagttgaatgagatgttgatgatgatgttccaaattattg 30029822  T
Q  535 ga-taaataagagat-gatg-attgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagca-tacat-ttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactc 628  Q
    || || | ||||| | | || |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||  || ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  30029821 gactatacaagaggtcgttgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcatagtgatgggggcttgatgccctggagctttgtactc 30029722  T
Q  629 aaca 632  Q
    ||||    
T  30029721 aaca 30029718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 461 - 619
Target Start/End: Original strand, 38961998 - 38962157
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataa-ataagagatgat-gattgt- 557  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||   ||  ||||||||||||||| | ||||||| |  | ||||       
T  38961998 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaaatgatg---aagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaa 38962094  T
Q  558 gatgtttaagagatcgagtccatgcattagca-tacatttgttgggggc-tcatgccctggagc 619  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||    
T  38962095 gatgtttaagagatcgagtctatgcattagcattaca-ttgttgggggcttgatgccctggagc 38962157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Original strand, 12933952 - 12933992
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12933952 ttttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcct 12933992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Original strand, 17247928 - 17247968
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17247928 ttttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcct 17247968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 26687366 - 26687318
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgt 84  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  26687366 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctaaacatgt 26687318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 619
Target Start/End: Original strand, 28848718 - 28848876
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgga-taaataaga-gatgatga-ttgt 557  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||   ||||  |||||||||||||| || |||||| | || ||| ||      
T  28848718 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga---tgaagttccaaattattggattatataagaggttgttgatttaa 28848814  T
Q  558 gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagc 619  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||| | ||||||||||||    
T  28848815 gatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 28848876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 619
Target Start/End: Original strand, 29172690 - 29172849
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgga-taaataaga-gatgatga-ttgt 557  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||   ||||  | |||||||||||| || |||||| | ||  || ||      
T  29172690 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga---tgaagtttcaaattattggattatataagaggttgtcgatttaa 29172786  T
Q  558 gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagc 619  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||| | ||||||||||||    
T  29172787 gatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 29172849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Original strand, 49389286 - 49389326
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  49389286 ttttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcct 49389326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 165 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 12340103 - 12340064
Alignment:
Q  165 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcact 204  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12340103 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcact 12340064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 36 - 75
Target Start/End: Original strand, 17247162 - 17247201
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcc 75  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17247162 ttttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcc 17247201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 466 - 635
Target Start/End: Original strand, 40213788 - 40213958
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgga-taaataaga-gatgatga-ttgtgatgt 562  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||   ||||  |||||||||||||| || |||||| | ||  || ||  |||||    
T  40213788 ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaagatga---tgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgt 40213884  T
Q  563 ttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    |||| |  ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40213885 ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgtggatggcttgatgtcctggagctttgtactcaacacga 40213958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 36 - 87
Target Start/End: Original strand, 53070341 - 53070392
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgttta 87  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||    
T  53070341 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgttta 53070392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Original strand, 6469241 - 6469295
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  6469241 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 6469295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Original strand, 7781454 - 7781508
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  7781454 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 7781508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Original strand, 9707714 - 9707768
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  9707714 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 9707768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 466 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 14234540 - 14234471
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggata 538  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| ||    ||||||||||||||||    
T  14234540 ttgttatttaactaagctgcatgaatcagtctaagttgattaagatgatgatg---ttccaaattattggata 14234471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 15977570 - 15977516
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  15977570 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 15977516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 16809868 - 16809826
Alignment:
Q  32 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgc 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  16809868 gtatttttgacttttgagttgaaccttaaatgcttttgagtgc 16809826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 190
Target Start/End: Original strand, 16862933 - 16862979
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctc 190  Q
    |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16862933 ttagttggggatttggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctc 16862979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 17463233 - 17463179
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  17463233 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 17463179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 17737291 - 17737237
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  17737291 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 17737237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 73
Target Start/End: Original strand, 20698084 - 20698126
Alignment:
Q  31 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtg 73  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20698084 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtg 20698126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 466 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 28194743 - 28194607
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgga-taaataagagatgatga-ttgtgatgtt 563  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||   |||   |||||||||||||| || | ||||| ||  || ||  ||||||    
T  28194743 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga---tgaggttccaaattattggattatacaagagttgtcgatttaagatgtt 28194647  T
Q  564 taagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttggggg 604  Q
    |||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  28194646 taagaagtcgagtccatgcattagcattc-tttgttggggg 28194607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 34159381 - 34159327
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  34159381 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 34159327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Original strand, 45607014 - 45607068
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  45607014 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 45607068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 55500997 - 55500943
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  55500997 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 55500943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 35 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 3834127 - 3834086
Alignment:
Q  35 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  3834127 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtctttgagtacct 3834086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 466 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 8499568 - 8499519
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  8499568 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 8499519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 458 - 515
Target Start/End: Original strand, 10247827 - 10247884
Alignment:
Q  458 tgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  10247827 tgctgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 10247884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 466 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 10557035 - 10556986
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  10557035 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 10556986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 466 - 515
Target Start/End: Original strand, 12119837 - 12119886
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  12119837 ttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 12119886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 461 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 12567615 - 12567480
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgt---tgaacctccaaattattgga-taaataagagat-gatg-at 554  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||   |||   |||||||||||||| ||  |||||| | | || ||    
T  12567615 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgtttatgatgttccaaattattggactatttaagaggtcgttgaat 12567516  T
Q  555 tgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcat 590  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12567515 taagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcat 12567480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 466 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 15412479 - 15412430
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  15412479 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 15412430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 461 - 514
Target Start/End: Original strand, 16282918 - 16282971
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgat 514  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  16282918 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 16282971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 466 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 17672676 - 17672627
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  17672676 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 17672627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 558 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 23274647 - 23274570
Alignment:
Q  558 gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||     |||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  23274647 gatgtttaagaagtcgagtccatgcattagcatttcagtgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacg 23274570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 558 - 634
Target Start/End: Original strand, 24340884 - 24340961
Alignment:
Q  558 gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||     |||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  24340884 gatgtttaagaagtcgagtccatgcattagcatttcagtgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacg 24340961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 466 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 27165300 - 27165251
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  27165300 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 27165251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 466 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 36166648 - 36166599
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  36166648 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 36166599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 466 - 515
Target Start/End: Original strand, 45577950 - 45577999
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  45577950 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 45577999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Original strand, 1644325 - 1644365
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  1644325 ttttgacttttgagttgatccttggatgtttttgagtgcct 1644365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 165 - 205
Target Start/End: Original strand, 1644453 - 1644493
Alignment:
Q  165 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcactt 205  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  1644453 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtactt 1644493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Original strand, 4588457 - 4588497
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  4588457 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcct 4588497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Original strand, 11424405 - 11424445
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  11424405 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 11424445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Original strand, 12171759 - 12171799
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12171759 ttttgactttttagttgatccttagatgtttttgagtgcct 12171799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 12340231 - 12340191
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  12340231 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcct 12340191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 165 - 205
Target Start/End: Original strand, 12852134 - 12852174
Alignment:
Q  165 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcactt 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  12852134 actcgccatggcgagcagaggctcttgcctcgcgagcactt 12852174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 165 - 205
Target Start/End: Original strand, 13210098 - 13210138
Alignment:
Q  165 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcactt 205  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  13210098 actcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcactt 13210138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 14666084 - 14666044
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  14666084 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtcgttgagtgcct 14666044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 14669239 - 14669199
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  14669239 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtcgttgagtgcct 14669199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 14735597 - 14735557
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  14735597 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtcgttgagtgcct 14735557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 14973333 - 14973293
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  14973333 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 14973293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 15471403 - 15471367
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 72  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15471403 ttttgacctttgagttgaaccttagatgtttttgagt 15471367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 16104259 - 16104219
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  16104259 ttttgacttttgagttgatccttagatgtttctgagtgcct 16104219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 148 - 200
Target Start/End: Original strand, 17248040 - 17248092
Alignment:
Q  148 ttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 200  Q
    |||||| |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17248040 ttgggaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 17248092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 18439013 - 18438973
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  18439013 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 18438973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Original strand, 23083003 - 23083043
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  23083003 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 23083043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 72
Target Start/End: Original strand, 25476027 - 25476063
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 72  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25476027 ttttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagt 25476063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 165 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 32308019 - 32307979
Alignment:
Q  165 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcactt 205  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  32308019 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtactt 32307979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 32308147 - 32308107
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  32308147 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 32308107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 466 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 41123940 - 41123892
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgat 514  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  41123940 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 41123892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 165 - 205
Target Start/End: Original strand, 49667854 - 49667894
Alignment:
Q  165 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcactt 205  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  49667854 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtactt 49667894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 10326215 - 10326140
Alignment:
Q  135 agaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    ||||||||||||||| || || || || ||||||||||||||||| ||   | ||||||||| |||||||||||||    
T  10326215 agaacagctttagtttggtttttgtctggtactcgccatggcgagtaggaaccctcgcctcgtgagcacttccaga 10326140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 466 - 517
Target Start/End: Original strand, 12174327 - 12174378
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgtt 517  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||    
T  12174327 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgtt 12174378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 461 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 13544080 - 13544029
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatg 512  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  13544080 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 13544029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 14665956 - 14665917
Alignment:
Q  165 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcact 204  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14665956 actcgcaatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcact 14665917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 14669111 - 14669072
Alignment:
Q  165 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcact 204  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  14669111 actcgccatggcgagcagaggctctcacctcgcgagcact 14669072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 14735469 - 14735430
Alignment:
Q  165 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcact 204  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14735469 actcgcaatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcact 14735430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 466 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 16097381 - 16097330
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgtt 517  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||    
T  16097381 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgtt 16097330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 200
Target Start/End: Original strand, 20698192 - 20698243
Alignment:
Q  149 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 200  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  20698192 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 20698243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 26687252 - 26687201
Alignment:
Q  149 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 200  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  26687252 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 26687201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 30030188 - 30030153
Alignment:
Q  165 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30030188 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 30030153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 8899149 - 8899095
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||    
T  8899149 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgattaagatgatg 8899095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 9513387 - 9513349
Alignment:
Q  38 ttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  9513387 ttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 9513349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 9521362 - 9521324
Alignment:
Q  38 ttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  9521362 ttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 9521324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 163 - 305
Target Start/End: Original strand, 11165301 - 11165443
Alignment:
Q  163 gtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagaga 262  Q
    ||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||   ||||||    | || ||| ||||  ||||| ||||||  |    
T  11165301 gtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacatccagaattgagtgcttttgaggaatttgagacctgagtcgtttgaatggattaggaa 11165400  T
Q  263 tggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactg 305  Q
    |||| | || |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  11165401 tggaactttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactg 11165443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #177
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 454 - 515
Target Start/End: Original strand, 13210382 - 13210444
Alignment:
Q  454 cctatgctgctatt-gttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | | |||||||||    
T  13210382 cctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 13210444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #178
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Original strand, 16454388 - 16454442
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  16454388 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 16454442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #179
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 163 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 30066283 - 30066141
Alignment:
Q  163 gtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagaga 262  Q
    ||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||   ||||||    | || ||| ||||  ||||| ||||||  |    
T  30066283 gtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacatccagaattgagtgcttttgaggaatttgagacctgagtcgtttgaatggattaggaa 30066184  T
Q  263 tggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactg 305  Q
    |||| | || |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  30066183 tggaactttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactg 30066141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #180
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 50242877 - 50242823
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||    
T  50242877 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaaatgatg 50242823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #181
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 76
Target Start/End: Original strand, 1465046 - 1465091
Alignment:
Q  31 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1465046 tgtagttttgacctttaagtcgaaccttagatgtttttgagtgcct 1465091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #182
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 72
Target Start/End: Original strand, 1598133 - 1598170
Alignment:
Q  35 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  1598133 tttttgacttttgagttgaaccttagatacttttgagt 1598170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #183
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 76
Target Start/End: Original strand, 2050838 - 2050883
Alignment:
Q  31 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||| |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2050838 tgtagttttgacccttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 2050883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #184
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 7986046 - 7986001
Alignment:
Q  157 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagca 202  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||||||    
T  7986046 tggcttgaactcgccatggcgagtaggtactctcgcctcgcgagca 7986001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #185
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 14573068 - 14573027
Alignment:
Q  35 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  14573068 tttttgacttttgagttgatccttagatgcctttgagtgcct 14573027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #186
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 72
Target Start/End: Original strand, 15941557 - 15941594
Alignment:
Q  35 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  15941557 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 15941594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #187
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 16097809 - 16097772
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtg 73  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  16097809 ttttgacttttgagttgatccttaaatgtttttgagtg 16097772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #188
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 72
Target Start/End: Original strand, 16797707 - 16797744
Alignment:
Q  35 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  16797707 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 16797744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #189
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 149 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 16809765 - 16809724
Alignment:
Q  149 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctc 190  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  16809765 tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagatgctctc 16809724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #190
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 17242425 - 17242384
Alignment:
Q  35 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||    
T  17242425 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacct 17242384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #191
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 22322145 - 22322080
Alignment:
Q  11 gcagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    ||||||||||||||  ||| ||| ||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  22322145 gcagagagcatgttagattttgtgttttgaccttttgagttgaaccttagatgtctttgagtacct 22322080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #192
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 22337200 - 22337135
Alignment:
Q  11 gcagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    ||||||||||||||  ||| ||| ||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  22337200 gcagagagcatgttagattttgtgttttgaccttttgagttgaaccttagatgtctttgagtacct 22337135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #193
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 38814837 - 38814800
Alignment:
Q  35 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  38814837 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 38814800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #194
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 466 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 44494859 - 44494810
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||    
T  44494859 ttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatg 44494810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #195
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 595 - 634
Target Start/End: Original strand, 10542638 - 10542678
Alignment:
Q  595 ttgttgggggctc-atgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  10542638 ttgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacg 10542678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #196
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 165 - 205
Target Start/End: Original strand, 12934081 - 12934121
Alignment:
Q  165 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcactt 205  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  12934081 actcgccatggcgagcagagactctcgcctcgcgagtactt 12934121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #197
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 558 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 13543977 - 13543945
Alignment:
Q  558 gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcat 590  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13543977 gatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcat 13543945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #198
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 14234969 - 14234929
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14234969 ttttgacctttaagttgaaccttagatttttttgagtgcct 14234929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #199
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Original strand, 14576475 - 14576515
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  14576475 ttttgacttttgagttgatccttagatgcctttgagtgcct 14576515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #200
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 154 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 16333516 - 16333460
Alignment:
Q  154 ttctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| ||   | |||||||||||||||||||||||    
T  16333516 ttctgtctggtactcgccatggcgagtaggaaccctcgcctcgcgagcacttccaga 16333460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #201
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 30030306 - 30030270
Alignment:
Q  37 tttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtg 73  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  30030306 tttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtg 30030270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #202
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Original strand, 40213363 - 40213403
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  40213363 ttttgacttttgagttgatcattagatgcttttgagtgcct 40213403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #203
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 342 - 402
Target Start/End: Original strand, 40213671 - 40213730
Alignment:
Q  342 tatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttg 402  Q
    |||||||||||||||||||  |  |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||    
T  40213671 tatgatgtgatataatgttatac-gcattacttggattatgaatgtataattgagatgttg 40213730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #204
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 562 - 606
Target Start/End: Original strand, 43550689 - 43550732
Alignment:
Q  562 tttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggct 606  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  43550689 tttaagaggtcgagtccatgcattagcattca-ttgttgggggct 43550732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #205
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 43842657 - 43842617
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  43842657 ttttgactttttagttgatccttagatgcttttgagtgcct 43842617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #206
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 558 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 46822220 - 46822188
Alignment:
Q  558 gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcat 590  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  46822220 gatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcat 46822188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #207
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 456 - 500
Target Start/End: Original strand, 53070755 - 53070799
Alignment:
Q  456 tatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaag 500  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  53070755 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 53070799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 392; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 392; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 1845 - 1219
Alignment:
Q  7 aggagcagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataac 105  Q
    |||| ||||||||||||   |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  1845 aggaccagagagcatgtaagatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgtttattaaagattaaaggataac 1746  T
Q  106 ttagaataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcactt 205  Q
    ||||||  | ||||||||||||| | | ||||||| | || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1745 ttagaaagacattgaacctggttaaacctagaacaacctttgttgggagtctggcttgtactcgtcatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcactt 1646  T
Q  206 ccagaactgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactg 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  1645 ccagaactgagtgcaagtgaggatattgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtattgagacctatataagaagttaaatg 1546  T
Q  306 caatatgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgctt 405  Q
    |||| |  |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||    
T  1545 caatctacgaagctgttattagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgaga---tgatt 1449  T
Q  406 gtttttatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgat 505  Q
    | |||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||| ||| | ||||  |||    
T  1448 gcttttatttgatatcgttgcatgatgtcataatgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttacttaaacaagttgcatgagtcgatataagatgat 1349  T
Q  506 caagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc 605  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1348 caagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattttgatttttaagatatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc 1249  T
Q  606 tcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  1248 tcatgttctggagctttgtactcaacacga 1219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 466 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 15714 - 15576
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgga-taaataagagatgatga-ttgtgatgtt 563  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||| |||||||   ||||  |||||||||||||| || | ||||| ||  || ||  ||||||    
T  15714 ttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatga---tgaagttccaaattattggattatacaagagttgtcgatttaagatgtt 15618  T
Q  564 taagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggct 606  Q
    |||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  15617 taagaattcgagtccatggattagcattc-tttgttgggggct 15576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 16009 - 15973
Alignment:
Q  165 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagc 201  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16009 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagc 15973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 16142 - 16097
Alignment:
Q  31 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  16142 tgtaattttgactttagagttgatccttagatgcttttgagtgcct 16097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 378; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 378; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 15171 - 14542
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagttaa-atgataacttaga 110  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  15171 cagagagcatgttgaattctattttttttacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagataagatgataacttaga 15072  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
      | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15071 cga-gattgaacctggtttagcttagaacaactttagatgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 14973  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    ||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||| | |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  14972 actgagtgccagtgaggatactgcaatctgtgtcgcataatttgattagagatggactcctgggtagtaatgaaacctatacaagaagttaactgcaatc 14873  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaa----ttatgaatgaatgattgagatgttgcttg 406  Q
    ||||||| |||||||| |||||| || |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||    | |||||||||||||||||||| ||||||    
T  14872 tgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtaagatgatgtttaattgcattacttgaaatgttaatgaatgaatgattgagatgatgcttg 14773  T
Q  407 tttttatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatc 506  Q
     |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||  | ||||  |||     
T  14772 cttttatttgatatctttatatgatgtcataatgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgtatgagtcaatataagatgatt 14673  T
Q  507 aagatgatg-ttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatg-tttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttggggg 604  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14672 aagatgatgtttgaacctccaaattatttgatacataagggatgatgattaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcatacatatgttggggg 14573  T
Q  605 ctcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14572 ctcatgccctggagcttagtactcaacacga 14542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 24189 - 23558
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttg---acttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataactt 107  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  24189 cagagagcatgttgaattctgtttttttttttacttttgagttaaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattagatgataactt 24090  T
Q  108 agaataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttcc 207  Q
    |||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24089 agacga-gattgaacctggtttagcttagaacaactttagttgggagtctggcttgtactttccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttcc 23991  T
Q  208 agaactgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgca 307  Q
    |||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||| | ||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  23990 agaactgagtgccagtgaggatactgcaatctgtgtcgcataatttgataagagatggacacctgggtagtaatgaaacctatacaagaagttaactgca 23891  T
Q  308 atatgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaa----ttatgaatgaatgattgagatgttgc 403  Q
    || ||||||| |||||||| |||||| || |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||    | |||||||||||||||||||| |||    
T  23890 atctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtaagatgatgtttaattgcattacttgaaatgttaatgaatgaatgattgagatgatgc 23791  T
Q  404 ttgtttttatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcg 503  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||  | ||||  |    
T  23790 ttgcttttatttgatatctttatatgatgtcataatgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgtatgagtcaatataagatg 23691  T
Q  504 atcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatg-tttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttggg 602  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23690 attaagatgatgttgagcctccaaattattggatacataagagatgatgattaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcatacatatgttggg 23591  T
Q  603 ggctcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23590 ggctcatgccctggagcttagtactcaacacga 23558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 39613 - 38982
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttg---acttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataactt 107  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  39613 cagagagcatgttgaattctgtttttttttttacttttgagttaaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattagatgataactt 39514  T
Q  108 agaataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttcc 207  Q
    |||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39513 agacga-gattgaacctggtttagcttagaacaactttagttgggagtctggcttgtactttccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttcc 39415  T
Q  208 agaactgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgca 307  Q
    |||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||| | ||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  39414 agaactgagtgccagtgaggatactgcaatctgtgtcgcataatttgataagagatggacacctgggtagtaatgaaacctatacaagaagttaactgca 39315  T
Q  308 atatgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaa----ttatgaatgaatgattgagatgttgc 403  Q
    || ||||||| |||||||| |||||| || |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||    | |||||||||||||||||||| |||    
T  39314 atctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtaagatgatgtttaattgcattacttgaaatgttaatgaatgaatgattgagatgatgc 39215  T
Q  404 ttgtttttatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcg 503  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||  | ||||  |    
T  39214 ttgcttttatttgatatctttatatgatgtcataatgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgtatgagtcaatataagatg 39115  T
Q  504 atcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatg-tttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttggg 602  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39114 attaagatgatgttgagcctccaaattattggatacataagagatgatgattaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcatacatatgttggg 39015  T
Q  603 ggctcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39014 ggctcatgccctggagcttagtactcaacacga 38982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174 (Bit Score: 358; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0174
Description:

Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 635
Target Start/End: Original strand, 18072 - 18692
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaa-agttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  18072 cagagagcatgtagaattctataattttgactttagagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaataatttaatgataacttaga 18171  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    || | ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18172 atgaaattgaacctggtttagcttagaataacattagttgggaatctggctagtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 18271  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||     
T  18272 actgagtgcaagtgaggatattgcgatttgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatttaagaagttaactacaatc 18371  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttt 410  Q
    ||||||| |||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||     || |||    
T  18372 tgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatttaacgaataattgcattacttgagttatgaatgaatgattgaaatg-----tgcttt 18466  T
Q  411 tatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaaga 510  Q
    ||||||||||||||||  | ||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| | | ||||||||| | | ||||  ||| ||||    
T  18467 tatttgatatcgttatgagttgtcatactgttgttgcaatctgcctatgctgttattgttatttaactatgttgcatgaattgatataagatgataaaga 18566  T
Q  511 tgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatg-tttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcat 609  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18567 agatgttgaacctccaaattattggatacataagagatgaagattaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcatacatatgttgggggctcat 18666  T
Q  610 gccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||    
T  18667 gccctagagcttagtactcaacacga 18692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 341; Significance: 0; HSPs: 8)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 635
Target Start/End: Original strand, 34529 - 35156
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||| ||||| |||||||    
T  34529 cagagagcatgtagaattctgtatttttgacttgtgagttgaaccttagatgtttttgagtgccttaagattttttttaaagattagatgatgacttaga 34628  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34629 gtgagattgaacctggtttagcttagaacaactttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 34728  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    |||||||||||||||| | |  |||| || |||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||     
T  34729 actgagtgcaagtgagaacattgcgacctttgtcacataacttgtttagagatggacccttgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatc 34828  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaa----ttatgaatgaatgattgagatgttgcttg 406  Q
    ||||||| ||||||||  |||||  | ||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    | ||||||||||||||||| || ||||||    
T  34829 tgtgaagctgttatgaattgtta-agttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatgttaatgaatgaatgattgagttgatgcttg 34927  T
Q  407 tttttatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatc 506  Q
     |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||  | |||   |||     
T  34928 attttatttgatatctttatatgatgtgataatgttgttgtgatctgcttatgctgctattgttatttaactatgatgcatgagtctatataaaatgatt 35027  T
Q  507 aagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatg-tttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc 605  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35028 aagatgatgttgaa-ctccaaattattggatacataagagatgatgattaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcatacatatgttgggggc 35126  T
Q  606 tcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  35127 ttatgccctggagcttagtactcaacacga 35156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 25 - 248
Target Start/End: Original strand, 41185 - 41409
Alignment:
Q  25 gaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttagaataagattgaacc 123  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||| | ||||||||||    
T  41185 gaattctgtatttttgacttgtgagttgaaccttagatgattttgagtgcctaaagatatttattaaagattagatgatgacttagagtgagattgaacc 41284  T
Q  124 tggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagt 223  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||  ||||||||||||||||    
T  41285 tagtttagcttagaacaactttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctttcacctcgtgagcacttttagaactgagtgcaagt 41384  T
Q  224 gaggatagcgcgatctgtgtcgcat 248  Q
    ||| |    ||||||||||||||||    
T  41385 gagaactttgcgatctgtgtcgcat 41409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #3
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 144 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 64206 - 64131
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  64206 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 64131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #4
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 144 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 76090 - 76015
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 219  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  76090 ttagttaggattttggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 76015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 454 - 501
Target Start/End: Original strand, 24359 - 24406
Alignment:
Q  454 cctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagt 501  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  24359 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 24406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 64306 - 64269
Alignment:
Q  35 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  64306 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 64269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 76190 - 76153
Alignment:
Q  35 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  76190 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 76153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #8
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Original strand, 23944 - 23984
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  23944 ttttgacttttgagttgatccttagattcttttgagtgcct 23984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 322; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 635
Target Start/End: Original strand, 15968 - 16586
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  15968 cagagagcatgttgaattctgtattttttacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattaaatgatagtttaga 16067  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||| | || || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16068 atgagattgaaccaggtttagcttagaacaacattggtagggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgccctcgcctcgcgagcacttccaga 16167  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    | ||||||||||||||| |   |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||     
T  16168 attgagtgcaagtgaggttgttgcgatctgtgtcgcataatttgattagaggtggacccttgggtagtaatatgacctatataagaagttaactgcaatc 16267  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttt 410  Q
    ||||||| |||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |  ||| | ||||||||| |||||||| |||   |    
T  16268 tgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataatg-ttatgtgcattacttaagatattattgaatgattaagatgttg-ttgaaat 16365  T
Q  411 tatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaaga 510  Q
    || |||||||     ||||| || ||  ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||  | ||||  || ||| |    
T  16366 taattgatat-----tatgaagtcatgatgttgttgtgatatgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgaacaata 16460  T
Q  511 tgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatg-tttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcat 609  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  16461 tgatgttgaatctctaaattattggatacataagagatgatgattatgacgttttaagagatcgagtccatgcattagcatacatatgttgggggatcat 16560  T
Q  610 gccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    
T  16561 gccctggagcttagtactcaacacga 16586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 571 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 20956 - 20892
Alignment:
Q  571 tcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
    ||||||||||||||||||||    ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  20956 tcgagtccatgcattagcatttcattgttggggccttgatgccctggagctttgtactcaacacg 20892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 308; Significance: 1e-173; HSPs: 4)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 12 - 635
Target Start/End: Original strand, 13696 - 14325
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||| |    
T  13696 cagagagcatgtagaattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagaggtttttgagtgcctaaagatatttattaaagattagatgatgacttata 13795  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
     | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13796 gtgagattgaacctggtttagcttagaccaactttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 13895  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    |||||||||||||||| |    |||| ||||||||||| | ||  ||||||| |||||||||||||||||   |||||||||| || |||||||| |||     
T  13896 actgagtgcaagtgagaactttgcgacctgtgtcgcataacttatttagagaaggacccttgggtagtaaaatgacctatataggatgttaactgaaatc 13995  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaa----ttatgaatgaatgattgagatgttgcttg 406  Q
    ||||||| |||||||| ||||||  | ||| ||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||    | ||||||||||||||||| || ||||||    
T  13996 tgtgaagctgttatgaaatgtta-agttgattataatgtgatttaatgattaattgaattacttgaaatgttaatgaatgaatgattgagttgatgcttg 14094  T
Q  407 tttttatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatc 506  Q
     ||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||  | ||||  |||     
T  14095 atttaatttgatatctttatatgatgtcataatgttgttgtgatctgcttatgctgctattgttatttaactatgatgcatgagtctatataagatgatt 14194  T
Q  507 aagatgatgttgaacctccaaattattgg--ataaataagagatgatgattgtgatg-tttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggg 603  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14195 aagatgatgttgaa-ctccaaattattggatatatataagagatgatgattaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcatacatatgttgggg 14293  T
Q  604 gctcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  14294 gcttatgccctggagcttagtactcaacacga 14325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 342 - 635
Target Start/End: Original strand, 17165 - 17459
Alignment:
Q  342 tatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttttatttgatatcgttatatgatgttatactgt 441  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |   ||  |||||||||     ||| |||| || ||||    
T  17165 tatgatgtgatataatgttaaac-gcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatat-----tattatgtcatgctgt 17258  T
Q  442 tgtt--gtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttga-acctccaaattattggata 538  Q
    | ||  |||  || |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||    |||||||||||||||     
T  17259 ttttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgatgtttccaaattattggat- 17357  T
Q  539 aataagagatgatg----attgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacac 633  Q
     ||| |||| | ||    |||  |||||||| ||| | ||||||||||||||||||    ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  17358 tatatgagaggttgtcgaattaagatgtttacgaggttgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggaggtttgtactcaacac 17457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 39 - 87
Target Start/End: Original strand, 79007 - 79055
Alignment:
Q  39 tgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgttta 87  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||    
T  79007 tgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcatgaacatgttta 79055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 76
Target Start/End: Original strand, 16856 - 16897
Alignment:
Q  35 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  16856 tttttgactttcgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 16897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 305; Significance: 1e-171; HSPs: 2)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 12 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 3339 - 2712
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  3339 cagagagcatgttgaatcctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattaaatgataacctaga 3240  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3239 atgagattgcacctggtttagcttagaacaacttaagttggaattctggcttgtacttgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 3140  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    ||||| ||||||  |||||   | |||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||| ||||||| || |||||||||| || ||||| ||||||     
T  3139 actgaatgcaagataggatgttgtgatctgtgtcgcataaattgattagggttggactcttaggtagtagtgtgacctatataggatgttaattgcaatc 3040  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaa----ttatgaatgaatgattgagatgttgcttg 406  Q
    ||||||| |||||||| ||||||  ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    | ||||||||||||||||| || | ||||    
T  3039 tgtgaagctgttatgaaatgtta-agctgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatgttaatgaatgaatgattgagttgatacttg 2941  T
Q  407 tttttatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatc 506  Q
     || ||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||| |||| | | |||||||||||||||||||| | | ||||||| ||  |  |||  |||     
T  2940 cttctatttgatatctttatatgatgtcataaagttgttgtgatctgcttgtgctgctattgttatttaactatgttgcatgagtctatacaagatgatt 2841  T
Q  507 aagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatg-tttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc 605  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2840 aagatgatgttgaa-ctccaaattattggatatatatgagatgatgattaagatgttttaagtgattgagtccatgcattaccatacatttgttgggggc 2742  T
Q  606 tcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  2741 tcatgcccttgagctttgtactcaccacga 2712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 12 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 7005 - 6378
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  7005 cagagagcatgttgaattttgtttttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattaaatgataacctaga 6906  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6905 atgagattgcacctggtttagcttagaacaacttaagttggaattctggcttgtactttccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 6806  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    ||||| ||||||  |||||   | |||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||| ||||||| || |||||||||| || ||||| ||||||     
T  6805 actgaatgcaagataggatgttgtgatctgtgtcgcataaattgattagggttggactcttaggtagtagtgtgacctatataggatgttaattgcaatc 6706  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaa----ttatgaatgaatgattgagatgttgcttg 406  Q
    ||||||| |||||||| ||||||  ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    | ||||||||||||||||| || | ||||    
T  6705 tgtgaagctgttatgaaatgtta-agctgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatgttaatgaatgaatgattgagttgatacttg 6607  T
Q  407 tttttatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatc 506  Q
     || ||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||| |||| | | |||||||||||||||||||| | | ||||||| ||  |  |||  |||     
T  6606 cttctatttgatatctttatatgatgtcataaagttgttgtgatctgcttgtgctgctattgttatttaactatgttgcatgagtctatacaagatgatt 6507  T
Q  507 aagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatg-tttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc 605  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6506 aagatgatgttgaa-ctccaaattattggatatatatgagatgatgattaagatgttttaagggattgagtccatgcattaccatacatttgttgggggc 6408  T
Q  606 tcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6407 tcatgccctggagctttgtactcaccacga 6378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 302; Significance: 1e-169; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 12 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 2376 - 1760
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||    
T  2376 cagagaacatgttgaattctgtatttttgacctttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattaaatgagaacctaga 2277  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2276 ctgagattgaacctggtttagcttagaacaattttagttgggattctggcttgtactcgccgtggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttcgaga 2177  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    |||||||||||||||| ||     ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2176 actgagtgcaagtgagaatgttatgatctgtgttgcttgaattgattagggatggacccttaggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatc 2077  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttt 410  Q
    ||||||| || ||||||||||| | | || |||||||||  |||||||||||  |||||||||||||  || | || ||   | ||||||||  ||  ||    
T  2076 tgtgaagctgatatgagatgtttgcgttggatatgatgtattataatgttta--tgcattacttgaagaataattgtatacataagatgttg-atgaatt 1980  T
Q  411 tatttgatatcgttat-atgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaag 509  Q
     | ||| |||  |||| |||||       |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| | ||||  ||| |||    
T  1979 gaattggtataattatcatgat-------tgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaag 1887  T
Q  510 atgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatg-tttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctca 608  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1886 atgatgttgaacctccaaaatattggatatatatgagatgatgattaagatgttttaagagattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctca 1787  T
Q  609 tgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  1786 tgccctggagctttgtactcaccacga 1760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 300; Significance: 1e-168; HSPs: 2)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 261 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 24094 - 23723
Alignment:
Q  261 gatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatatgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtt 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24094 gatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctgttaagagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgtt 23995  T
Q  361 taattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttttatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgc 460  Q
     |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||     
T  23994 -aatttcattacttgaactatgaatgaatgattgagatgttgctg--ttttatttgatattgttatatgatgtcatactgttgttgtaatctgcctatgg 23898  T
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgat 560  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23897 tgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgat 23798  T
Q  561 gtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23797 gtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccatggagctttgtactcaacacga 23723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 36 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 26877 - 26706
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttagaataagattgaacctggtttagctt 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |    
T  26877 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcttattaaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggtttaacct 26778  T
Q  135 agaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttc 206  Q
    |||||| |  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26777 agaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttc 26706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 296; Significance: 1e-166; HSPs: 5)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 65 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 4188 - 3621
Alignment:
Q  65 ttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttagaataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttg 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||||    
T  4188 ttttgagtgcctaaagatgtttattaatgattaaatgatagcttagaatgagattgaacctggtttagcttagaacaacattagttgggaatctagcttg 4089  T
Q  164 tactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagat 263  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  4088 tactcgccatggcgagtaaatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatgttgcgatctgtatcgcat-atttgattagagat 3990  T
Q  264 ggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatatgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaa 363  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| || ||| ||| ||||||| ||||| ||||    
T  3989 ggacccttgggtagtaatgtgacctatataagatattaattgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgattataatgtgatttaatgattaa 3890  T
Q  364 ttgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttttatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgc 463  Q
    ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||  |||||||||    
T  3889 ttgcattacttgagttatgaataagtgattgagatgttgc----ttttatttgatatcgttatgtgatgtcatactgttgttgcaatctgtctatgctgc 3794  T
Q  464 tattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatg-t 562  Q
    |||||||| ||||| |   || |  | | | | ||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||| |    
T  3793 tattgttaattaactattttgtacaagttgatataagatgatcaagatgattctgaacctccaaattactggatatataagagatgatgattaagatgtt 3694  T
Q  563 ttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3693 ttaagagatcgagtccatgcattagtatacatatgttaggggctcatgccctggagcttagtactcaacacga 3621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 65 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 8619 - 8052
Alignment:
Q  65 ttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttagaataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttg 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||||    
T  8619 ttttgagtgcctaaagatgtttattaatgattaaatgatagcttagaatgagattgaacctggtttagcttagaacaacattagttgggaatctagcttg 8520  T
Q  164 tactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagat 263  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  8519 tactcgccatggcgagtaaatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatgttgcgatctgtatcgcat-atttgattagagat 8421  T
Q  264 ggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatatgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaa 363  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| || ||| ||| ||||||| ||||| ||||    
T  8420 ggacccttgggtagtaatgtgacctatataagatattaattgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgattataatgtgatttaatgattaa 8321  T
Q  364 ttgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttttatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgc 463  Q
    ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||  |||||||||    
T  8320 ttgcattacttgagttatgaataagtgattgagatgttgc----ttttatttgatatcgttatgtgatgtcatactgttgttgcaatctgtctatgctgc 8225  T
Q  464 tattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatg-t 562  Q
    |||||||| ||||| |   || |  | | | | ||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||| |    
T  8224 tattgttaattaactattttgtacaagttgatataagatgatcaagatgattctgaacctccaaattactggatatataagagatgatgattaagatgtt 8125  T
Q  563 ttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8124 ttaagagatcgagtccatgcattagtatacatatgttaggggctcatgccctggagcttagtactcaacacga 8052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 12 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 4219 - 4181
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagt 50  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  4219 cagagagcatgtagaattctgtacttttgacttttgagt 4181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 12 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 8650 - 8612
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagt 50  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  8650 cagagagcatgtagaattctgtacttttgacttttgagt 8612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 461 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 29987 - 29947
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagt 501  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  29987 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 29947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 12 - 635
Target Start/End: Original strand, 46346 - 46966
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  46346 cagagagcatgttgaattatgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattagatgatgacttaga 46445  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
     | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  46446 gtgagattgaacttggtttagcttagaacaactttagttaggaatctggcttgtactcgccatggtgaccaaatgctctctcctcgcgagcacttccaga 46545  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    ||||||||||||| |||||   |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  46546 actgagtgcaagttaggatgttgcgatctgtgtcgcataaattgattagggatggactcttaggtagtaatgtgacctatataagaagttaactgcaatc 46645  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttt 410  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||  | ||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||  |||||||| | |   |    
T  46646 tgtgaagctgttatgaaatgcta-agttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg-tggaaat 46743  T
Q  411 tatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaaga 510  Q
     | |||||||     ||||| ||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||  | |||| |||  ||||    
T  46744 gaattgatat-----tatgaagttatgctattgttgtgatctgcctatgctgctattgttatgtaactaagttgcatgagtcattataagacgaataaga 46838  T
Q  511 tgatgttgaacctccaaattattgg--ataaataagagatgatgattgtgatg-tttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc 607  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||  |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  46839 tgatgttgaacatccaaattattggatatatatatgagatgatgattaagatgttttatgagattgagtccatgcattagcatacatttgttaggggctc 46938  T
Q  608 atgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||    
T  46939 atgccctggagctttgtactcaccacga 46966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 286; Significance: 1e-160; HSPs: 2)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 45 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 32901 - 32337
Alignment:
Q  45 ttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttagaataagattgaacctggtttagcttagaacagct 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |     
T  32901 ttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcctattaaagattaaatgataacttagaacgagattgaacctggtttagcttagaacaaca 32802  T
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgt 243  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32801 ttagttgggaatctggcttgtactcgacatgttgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatatcgcgatctgtgt 32702  T
Q  244 cgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatatgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaata 343  Q
    ||||| | ||| |||||| ||||||| |||||||||| | ||||| | ||| | ||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| || ||| ||    
T  32701 cgcataatttgtttagagttggacccctgggtagtaaagtgacct-tttaaaatgttaattgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgatta 32603  T
Q  344 tgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttttatttgatatcgttatatgatgttatactgttg 443  Q
    | ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||      
T  32602 taatgtgatttaatgattaattgcattacttgagttatgaatgaatgattgagatgttgc----ttttatttgatatcgttatgtgatgtcatactgtca 32507  T
Q  444 ttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataa 543  Q
    ||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||| | | ||||||| | | | |         |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  32506 ttgcaatctgcctaagctgctattgttaattaactatgttgcatgagttgatat---------aagatgatgtcgaacctccaaattattggatacataa 32416  T
Q  544 gagatgatgattgtgatg-tttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctt 621  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  32415 gagatgatgattaagatgttttaagagatcgagtccatgcattatcatacatatgttgggggctcatgccctgaagctt 32337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 157 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 8839 - 8778
Alignment:
Q  157 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8839 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 8778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 4)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 36 - 601
Target Start/End: Original strand, 48103 - 48664
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttagaataagattgaacctggtttagctt 134  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |    
T  48103 ttttgacttttgagatgaaccttagatgtttttgagtgtctgaagatgtatattaaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggtttaacct 48202  T
Q  135 agaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatagcgc 234  Q
    |||||| |  | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||    
T  48203 agaacaaccattgttaggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtaagaatattgc 48302  T
Q  235 gatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatatgtgaagttgttatgagatgttag 334  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||     
T  48303 gatctgtgtcacataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaaatgcaatatgtgaagctgttgtgtgatgttaa 48402  T
Q  335 tgctgaatatgatgtgatataat-gtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttttatttgatatcgttatatgatgt 433  Q
     | ||||||||| ||||| ||||  || |||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||       || |||||||| ||||| | || |    
T  48403 agttgaatatgacgtgatttaataattaaattgcaccacttgaattatgaatgaatgattgaaatgttg-------ttgtttgatattgttatgtaatat 48495  T
Q  434 tatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaag-tcgatcaagatgatgttgaacctccaaattat 532  Q
     ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||| | |||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  48496 catactgttgttgtgatctgtctatgctgctattgttatttaacctagttgcatgtgtcgatataagatgaatcaagatgatgttgaatctccaaattat 48595  T
Q  533 tggataaataagagatgatgattgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgg 601  Q
    ||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48596 tggatgaataagagatgatgtttacgatgtttaagaagtcgagtccatgcattagcatacatatgttgg 48664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 31 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 19750 - 19705
Alignment:
Q  31 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19750 tgtaattttgacttctgagttgatccttagatgtttttgagtgcct 19705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 466 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 19317 - 19266
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgtt 517  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||    
T  19317 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgtt 19266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 165 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 19616 - 19582
Alignment:
Q  165 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcga 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19616 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcga 19582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0425 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 1)
Name: scaffold0425
Description:

Target: scaffold0425; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 12 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 657 - 38
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||| | ||| |||||||    
T  657 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccctagatgcttttgagtgcataaagatgtttattaatggttagacgatgacttaga 558  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||    
T  557 acgagattgaacctggtttagcttagaacaactttagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagtagatgctctctcctcgcaagcacttctaga 458  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    ||||||||||||| ||||||    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||| |||||| | |||     
T  457 actgagtgcaagttaggatatttggatctgtgtcgcataaattgattagggatggacccttaggtagtaatgtgacctaattaagatgttaacggaaatc 358  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttt 410  Q
    ||||||| ||||||||  |||||  | ||| ||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||| | ||||||||  |||||||| |     |    
T  357 tgtgaagctgttatgaactgtta-agttgattataatgtgatttaatgactaattgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaaat 259  T
Q  411 tatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaaga 510  Q
     | |||||||     ||||| |||||  ||||| ||| ||||   |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||  | ||||  ||| ||||    
T  258 gaattgatat-----tatgaagttatgttgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaaga 164  T
Q  511 tgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatg-tttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctca 608  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||  |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  163 tgatgttgaa-ctccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctca 65  T
Q  609 tgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  64 tgccctggagctttgtactcaccacga 38  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 4)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Original strand, 18275 - 18796
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18275 cagagagcatgtcgaattctgcattttttacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctaaagatgtttattaaagattaaatgataacttaga 18374  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18375 atgagattgaacctggtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 18474  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    |||||||||||||||| ||  || | ||||||| || | |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18475 actgagtgcaagtgagaatgtcgtgttctgtgttgcttcaattgatttgggatggacccttaggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatc 18574  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttt 410  Q
    ||||||| |||||||| ||| || || ||| ||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||| | ||||||||  |||||||| |||        
T  18575 tgtgaagctgttatgaaatggta-tgttgattataatgtgatttaatgattaattccattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg-ttgaaac 18672  T
Q  411 tatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatc--ggtctaagtcgatcaa 508  Q
     | |||||||     ||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||    | ||||  ||| ||    
T  18673 gaattgatat-----tatgaagttattctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatatataagatgattaa 18767  T
Q  509 gatgatgttgaacctccaaattattggata 538  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18768 gatgatgttgaa-ctccaaattattggata 18796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 544 - 635
Target Start/End: Original strand, 18860 - 18952
Alignment:
Q  544 gagatgatgattgtgatgttt-aagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18860 gagatgatgattaagatgttttaagagattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacga 18952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 454 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 39978 - 39796
Alignment:
Q  454 cctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataa-ataagagatgatg 552  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||| ||    ||||||||||||||| | ||||||| |  |     
T  39978 cctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt---tccaaattattggattatataagaggttgtc 39882  T
Q  553 --attgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
      |||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||    ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39881 gaattaagatgtttaagaggtcgggtccatgcattagcatttcattgttggggacttgatgccctggagctttgtactcaacacga 39796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 40390 - 40335
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaa 91  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  40390 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttattaa 40335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 2)
Name: scaffold0311
Description:

Target: scaffold0311; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 12 - 538
Target Start/End: Original strand, 6697 - 7226
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | ||||| ||| ||||| |||||||    
T  6697 cagagagcatgtcgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagataataaataaagattagatgatgacttaga 6796  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6797 gtgagattgaacctggtttagcttagaacaactttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 6896  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    ||||||||||| |||| ||   |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||     
T  6897 actgagtgcaattgagaatgttgcgatctgtgtcgcatgagttgattagggatgggcccttaggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatc 6996  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttga----attatgaatgaatgattgagatgttgcttg 406  Q
    ||||||| |||||||| ||||||  ||||| ||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||     | ||||||||||||||||| || |  |||    
T  6997 tgtgaagctgttatgaaatgtta-agctgattataatgagatttaatgattaattgcattacttgagatgttaatgaatgaatgattgagttgatatttg 7095  T
Q  407 tttttatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatc 506  Q
      | ||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| | |  |||||| ||  |  |||  |||     
T  7096 cctctatttgatatctttgtatgatgtcataatgttgttgtgatctgcctgtgctgctattgttatttaactatgtcgcatgagtctatacaagatgatt 7195  T
Q  507 aagatgatgttgaacctccaaattattggata 538  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  7196 aagatgatgttgaa-ttccaaattattggata 7226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 544 - 635
Target Start/End: Original strand, 7274 - 7367
Alignment:
Q  544 gagatgatgattgtgatgttt-aaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  7274 gagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtaatcaccacga 7367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 250; Significance: 1e-138; HSPs: 1)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 12 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 1990 - 1374
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| | |||||    
T  1990 cagagagcatgttgaattctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgatttaga 1891  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1890 acgagattgaacctggtttagcttagaacaacttaagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 1791  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    ||||| ||||||| || ||   ||||||||| | |||| |||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||  ||     
T  1790 actgaatgcaagttagtatgttgcgatctgttttgcataaattgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatc 1691  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttt 410  Q
    ||||||| || |||||  |||||  ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||  ||||||||  ||   |    
T  1690 tgtgaagctgctatgaactgtta-agctgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg-atgaaat 1593  T
Q  411 tatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaaga 510  Q
     | |||||||      |||| | ||||  |||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||  |  |||  ||| ||||    
T  1592 gaattgatat-----gatgaag-tataaagttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaaga 1499  T
Q  511 tgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatgtttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcat 609  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||  ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1498 tgatgttgaa-ctccaaattattggatgtatatgaggtgatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggcttat 1400  T
Q  610 gccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  1399 gccctggagctttgtactcaccacga 1374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 250; Significance: 1e-138; HSPs: 5)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 36 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 175243 - 174655
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttagaataagattgaacctggtttagctt 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |    
T  175243 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctggagatgcctattagagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggtttaacct 175144  T
Q  135 agaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatagcgc 234  Q
    |||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |  ||    
T  175143 agaacaacctttgttgggaatctggcttgtactcgccattgcgagcagatgctctcacctcgcgagcacttccagaaccgagtccaagtgaggaaaatgc 175044  T
Q  235 gatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatatgtgaagttgttatgagatgttag 334  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  175043 gatctgtgtcgcatgatttgattagagatggaccctttggtagtaatgagacctatataagaagttaactgaaatctgtgaagctattatgagatgttag 174944  T
Q  335 tgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttttatttgatatcgttatatgatgtt 434  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||  |||||||||      || ||||     
T  174943 tgttgaatatgacgtgatataatgtttagttgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgttgaattgaatttgatat-----aatcatgtc 174849  T
Q  435 atactgttgttgtaatctacctatgctgct-attgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattatt 533  Q
    |   || |||||||  || |||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  | | ||| ||||| ||   ||||||||||||    
T  174848 a---tgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagttgatgatg---ctccaaattatt 174755  T
Q  534 gga-taaa-taagagatgat--gattgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactc 628  Q
    ||| |||| |||||| | ||   |||  | |||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  174754 ggactaaattaagaggttatcgaattaagttgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattca-tagttgggggcttgatgccctggagctttgtactc 174656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 466 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 121819 - 121650
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataa-ataagagatgatg--attgtgatgt 562  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||    ||||||||||||||| | ||||||| |  |   |||   ||||    
T  121819 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt---tccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaatatgt 121723  T
Q  563 ttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  121722 ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacg 121650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 63039 - 63002
Alignment:
Q  37 tttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgc 74  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  63039 tttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgc 63002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 125061 - 125021
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  125061 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 125021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 124950 - 124899
Alignment:
Q  149 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 200  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  124950 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 124899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 12 - 489
Target Start/End: Original strand, 4552 - 5034
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  4552 cagagcgcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatatttttgaatgcctaaagatgtttattaaagattagatgatgacttaga 4651  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
     | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  4652 gtgagattgaaccgggtttagcttagaacaactttagttggaattctggcttgtactcgtcatggtgagaagatgctctcgcctcgcgagcatttccaaa 4751  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    || |||||||| |||||| |  ||||| |||||||||| | ||||| |||| ||||| ||||||||| | |  ||||||||||||||||| ||||||||     
T  4752 accgagtgcaattgaggacattgcgatttgtgtcgcataatttgatcagaggtggactcttgggtagcattatgacctatataagaagtttactgcaatc 4851  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaa----ttatgaatgaatgattgagatgttgcttg 406  Q
    ||||||| |||||||| |||||| || |||||||||||| | || ||||||| | ||| ||||||||    | |||||||||||||||||||| ||||||    
T  4852 tgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtaagatgatgtttattggcaatacttgaaatgttaatgaatgaatgattgagatgatgcttg 4951  T
Q  407 tttttatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatga 489  Q
     |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  4952 cttttatttgatatccttatatgatgtcataatgttgttgtgatctccctatgttgctgttgttatttaaccaagttgcatga 5034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 12 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 4927 - 4309
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    ||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  4927 cagagagcatgtgaagttctgtaattttgacttttgagttgaaccttaaatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattagatgatgacttaga 4828  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4827 acaagattgaacctggtttagcttagaacaactttatttgggattctagcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 4728  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    ||||||| |||||||| ||   | || |||||| |  ||||||||||||  ||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||      
T  4727 actgagttcaagtgagaatgttgtgaactgtgttgtttgaattgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctatataagaagttaactgtaaac 4628  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttt 410  Q
    ||||||  | |||||| ||| ||  | ||| ||| ||||||| || || |||||||||||||||||| ||| |  |||||||  |||||||| |||   |    
T  4627 tgtgaaactattatgaaatgcta-agttgattataatgtgatttattgattaattgcattacttgaaatattatcgaatgatcaagatgttg-ttgaaat 4530  T
Q  411 tatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaaga 510  Q
     | |||||||     |||||  |||| |||||||||| ||||   |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||  |  |||  ||| ||||    
T  4529 gaattgatat-----tatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgctgccattgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaaga 4435  T
Q  511 tgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatgtt-taaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctca 608  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||  |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4434 tgatgttgaa-ctccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttataagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctca 4336  T
Q  609 tgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  4335 tgccctggagctttgtactcaccacga 4309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 240; Significance: 1e-132; HSPs: 4)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 12 - 377
Target Start/End: Original strand, 21425 - 21789
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||| |||||||||||||||||    
T  21425 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcatagtaaagattaaatgataacttaga 21524  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    |  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21525 acgagattgaatctggtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 21624  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    |||||||||||||||| ||   | ||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  21625 actgagtgcaagtgagaatgttgtgatctgtgttgcttgaattggttagggatggacccttaggtagtaatgagacctatataagatgttaactgcaatc 21724  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaa 377  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| ||| || |||||  |||||||||||  |||||||||||||    
T  21725 tgtgaagctgttatgagatgtttgtgttgattaagatgtattataatgttta--tgcattacttgaa 21789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 12 - 377
Target Start/End: Original strand, 29317 - 29681
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||| |||||||||||||||||    
T  29317 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcatagtaaagattaaatgataacttaga 29416  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    |  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29417 acgagattgaatctggtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 29516  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    |||||||||||||||| ||   | ||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  29517 actgagtgcaagtgagaatgttgtgatctgtgttgcttgaattggttagggatggacccttaggtagtaatgagacctatataagatgttaactgcaatc 29616  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaa 377  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| ||| || |||||  |||||||||||  |||||||||||||    
T  29617 tgtgaagctgttatgagatgtttgtgttgattaagatgtattataatgttta--tgcattacttgaa 29681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #3
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 439 - 635
Target Start/End: Original strand, 21844 - 22042
Alignment:
Q  439 tgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggata 538  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21844 tgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatgttgaacctccaaattattggata 21943  T
Q  539 aataagagatgatgattgtgatg-tttaagagatcgagtccatgcattagca-tacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
     ||| ||||||||||||  |||| |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21944 tatatgagatgatgattaagatgttttaagagattgagcccatgcattagcattacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacga 22042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 439 - 635
Target Start/End: Original strand, 29736 - 29934
Alignment:
Q  439 tgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggata 538  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29736 tgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatgttgaacctccaaattattggata 29835  T
Q  539 aataagagatgatgattgtgatg-tttaagagatcgagtccatgcattagca-tacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
     ||| ||||||||||||  |||| |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29836 tatatgagatgatgattaagatgttttaagagattgagcccatgcattagcattacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacga 29934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 10)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 12 - 635
Target Start/End: Original strand, 38119 - 38717
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  38119 cagaaagcatgttgaattctgtacttttgacttttgagttgaaccatatatgtttttgagtacctaaagatgtttattaaagattacatgatgacttaga 38218  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
     | ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||                     ||||||||||||    
T  38219 gtgagattgaacatagtttagcttagaacaactttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcg---------------------agcacttccaga 38297  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    ||| |||||||||||| |    |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||     
T  38298 actaagtgcaagtgagaactttgcgatctgtgtcgcataatttgattagagttggacccttgggtagtaatgtgacctatataagaagttagttgcaatc 38397  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttt 410  Q
    ||||||| |||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||| |  ||| | ||||||||| |||||||| |    |     
T  38398 tgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataacgtt-atgtgcattacttaagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatg 38496  T
Q  411 tatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaaga 510  Q
     | |||||||     || || || ||  ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||  | ||||  ||| ||||    
T  38497 aaattgatat-----taagaagtcatgttgttgttgtgatctgtctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgattaaga 38591  T
Q  511 tgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatgttt-aagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcat 609  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38592 tgatgttgaacctccaaattattggatttataagagatgatgattaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcatacatatgttgggggctcat 38691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 14 - 402
Target Start/End: Original strand, 23288 - 23675
Alignment:
Q  14 gagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttagaat 112  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |    
T  23288 gagagcatgttgaattctgtacttttgacttttgagttgaaccatagatattttttagtacctaaagatgtttattaaagattagatgatgacttagagt 23387  T
Q  113 aagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaac 212  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23388 gagattgaacctggtttagcttagaacaactttagttgggaatctggcttgttctcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttctagaac 23487  T
Q  213 tgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatatg 312  Q
    |||||||||||||| |    ||||||| |||||||| | |||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| ||    
T  23488 tgagtgcaagtgagaactttgcgatctttgtcgcataatttgattaatgttggacccttgggtagtaatgtgacctata-aagaagttagttgcaatctg 23586  T
Q  313 tgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttg 402  Q
    ||||| |||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| | |||  |||||||||| |  ||| | ||||||||| ||||||||    
T  23587 tgaagctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataacg-ttatgtgcattacttaagatattattgaatgattaagatgttg 23675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 466 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 119928 - 119759
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatg----attgtgatg 561  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||| ||    ||||||||||||||| ||||  ||| | ||    |||  | ||    
T  119928 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt---tccaaattattggattaatataagaggttgtcgaattaagttg 119832  T
Q  562 tttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||| | ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  119831 tttaagaggtcgagtccatgcattagcattca-ttgttgagggcttgatgccctggagctctgtactcaccacg 119759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 461 - 512
Target Start/End: Original strand, 17547 - 17598
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatg 512  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  17547 tgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 17598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 44509 - 44455
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  44509 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 44455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 94466 - 94412
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  94466 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 94412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 466 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 100427 - 100353
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagag 546  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||      |||||||||||||||| |||||||    
T  100427 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt------tccaaattattggatatataagag 100353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #8
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Original strand, 39651 - 39691
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  39651 ttttgacttttgagttgatccttagatgttttcgagtgcct 39691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #9
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 466 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 101552 - 101501
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgtt 517  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||    
T  101552 ttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgatgtt 101501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #10
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 101873 - 101833
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  101873 tttttacttttgagttgatccttagaagtttttgagtgcct 101833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 1)
Name: scaffold0615
Description:

Target: scaffold0615; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 12 - 629
Target Start/End: Original strand, 1703 - 2315
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||| | |||||    
T  1703 cagagagcatgtcgaattttgtaattttgacctttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtgtattaaagattagatgatgatttaga 1802  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1803 acgagattgaacctggtttagcttagaacaactttagttggaattctagcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 1902  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    ||||||||||| |||| ||   | |||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||  ||||||| ||||    
T  1903 actgagtgcaaatgagaatgttgtgatctgtgtcgcatgaatcgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatattaactgaaata 2002  T
Q  311 tgtgaagttgttatg-agatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgttt 409  Q
    ||||||| ||||||| | ||| ||  | ||  | | |||| || ||||| |||| ||||||||||||| | | | ||||||||  |||||||| |||       
T  2003 tgtgaagctgttatgaaaatgcta-agttgtttgtaatgtaatttaatgattaaatgcattacttgaaatttcattgaatgatcaagatgttg-ttgaaa 2100  T
Q  410 ttatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaag 509  Q
    |   |||||||     ||||| |||||  ||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||  |  |||  ||  |||    
T  2101 tggattgatat-----tatgaagttatgttgttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcaataaaagatgaataag 2195  T
Q  510 atgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatgtttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctca 608  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||  ||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2196 atgatgttgaa-ctccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgtattagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctca 2294  T
Q  609 tgccctggagctttgtactca 629  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  2295 tgccctggagctttgtactca 2315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 13 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 27322 - 26819
Alignment:
Q  13 agagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttagaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  27322 agagagcatgttgaattctgtattttttacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcatattaaagattaaatgataacttagaa 27223  T
Q  112 taagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaa 211  Q
      ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||    
T  27222 cgagatttaacctggtatagcttagaacaactttagttggaattctggcttgtattcgccatggcgagcagatgctcttgcctcgcaagcatttccagaa 27123  T
Q  212 ctgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatat 311  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  27122 ctgagtgcaagtgaggatattgcgatctgtttcgaatattttgtttagagatggacccttgggtagtaatgagacatatataagaagttaactgcaatct 27023  T
Q  312 gtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgttttt 411  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||  |||||||||||  |||||||||||||  ||   || ||   | ||||||||  ||  ||     
T  27022 gtgaagctgttatgagatgtttgtgttgattatgatgtattataatgttta--tgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttg-atgaattg 26926  T
Q  412 atttgatatcgttat-atgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaaga 510  Q
    | |||||||  |||| |||||       |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||  ||| || |    
T  26925 aattgatataattatcatgat-------tgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagatgcatgagtcgatataagatgattaaaa 26833  T
Q  511 tgatgttgaacctc 524  Q
    ||||||||||||||    
T  26832 tgatgttgaacctc 26819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1296 (Bit Score: 225; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold1296
Description:

Target: scaffold1296; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 13 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 889 - 282
Alignment:
Q  13 agagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttagaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||| | ||||||    
T  889 agagagcatgttgaattctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctaatgatgtttattaaagattagatgatgatttagaa 790  T
Q  112 taagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaa 211  Q
      |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  789 cgagattgaacctggtttagtttagaacaacttgagttggaaatctggcttgtactcgccatggtgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaa 690  T
Q  212 ctgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatat 311  Q
    |||| ||||||| |||||   ||||||||| |||||| | |||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||  || |    
T  689 ctgaatgcaagttaggatgttgcgatctgtttcgcataagttgatttgggatggacccttaggtagtaatgcgacctatttaagatgttaattgagatct 590  T
Q  312 gtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgttttt 411  Q
    |||||| |  |||||  |||||  ||||| ||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||| | ||||||||  |||||| | |||         
T  589 gtgaagctactatgaactgtta-agctgattataatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgtcg-ttgaaaag 492  T
Q  412 atttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagat 511  Q
    | |||||||     ||||| ||||| ||| |||||| ||||   |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||  |  |||  ||| |||||    
T  491 aattgatat-----tatgaagttatgctgctgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagat 397  T
Q  512 gatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatgtttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatg 610  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||   |||||||  ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  396 gatgttgaa-ctccaaattattggatgtatatga---gatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatg 301  T
Q  611 ccctggagctttgtactca 629  Q
    |||||||||||||||||||    
T  300 ccctggagctttgtactca 282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 220; Significance: 1e-120; HSPs: 3)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 148 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 945 - 518
Alignment:
Q  148 ttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgca 247  Q
    ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||    
T  945 ttgggattctgccctgaactcgccatggcgagcagatgttctcgcctcgtgagcacttccagaactgagtgtaaatgaggatattgcgatctgtgtcgca 846  T
Q  248 tgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatatgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgat 347  Q
    | | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||| || ||||||||||    
T  845 taatttgattagagatggacccttcggtagtaatgagacctatttaagaagttaactgcaatctgtgaagctgttacgtgatgttaatgttgaatatgat 746  T
Q  348 gtgatataatg-tttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttttatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttg 446  Q
    | ||| ||||| || ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||| | |||| | |||| |||||    
T  745 gcgatttaatgattaaattgcactacttgaattataaatgaatgattgagatgttg-ttg--tttatttgatattgttatgtaatgtcaaactgctgttg 649  T
Q  447 taatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagag 546  Q
    ||||||  |||| || ||||| |||||||||| || ||||||| ||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  648 taatctgtctatcctactattattatttaacctagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagag 549  T
Q  547 atgatgattgtgatgtttaagagatcgagtc 577  Q
    |||||| || ||||||||||||  |||||||    
T  548 atgatgtttatgatgtttaagaagtcgagtc 518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 1062 - 1020
Alignment:
Q  32 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgc 74  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1062 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtctttgagtgc 1020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Original strand, 10210 - 10250
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10210 ttttgacctttgagatgaaccttagatgtttttgagtgcct 10250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 220; Significance: 1e-120; HSPs: 4)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 12 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 13258 - 12894
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  13258 cagagagcatgttgaattatgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattaaatgataacataga 13159  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13158 atgagattgaacctggtttagcttagaataactttagttgggattatggctcgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 13059  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    ||||||||||| |||| ||   | ||| || || || |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13058 actgagtgcaaatgagaatgttgtgatatgagttgcttgaattgattatggatggacccttaggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatt 12959  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaa 377  Q
    ||||||| |  ||||||||||| | | ||| ||||||||  |||||||||||  |||||||||||||    
T  12958 tgtgaagctaatatgagatgttggagttgattatgatgtattataatgttta--tgcattacttgaa 12894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 439 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 12839 - 12641
Alignment:
Q  439 tgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggata 538  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||| ||  | ||||  ||| ||||||||||| ||  |||||||  |||||||    
T  12839 tgttgttgtgatctgcctatgctgttattgttattgaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgttaaat-tccaaatcgttggata 12741  T
Q  539 aataa--gagatgatgattgtgatgttt-aagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
     |||   ||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12740 tatatatgagatgatgattaagatgttttaagagattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacga 12641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 157 - 218
Target Start/End: Original strand, 61378 - 61439
Alignment:
Q  157 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 218  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  61378 tggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 61439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 157 - 211
Target Start/End: Original strand, 65294 - 65348
Alignment:
Q  157 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaa 211  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  65294 tggcttgtattcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaa 65348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 12 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 1393 - 780
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||| | |||||    
T  1393 cagagagcatgtcgaattctataattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtctattaaagattagatgatgatttaga 1294  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  1293 atgagattgaacctgatttagcttagaacaacttgagttggaaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgttctcgcctcgcgagcacttctaga 1194  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    ||||| ||||| | |||||   |||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||  ||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||     
T  1193 actgaatgcaaattaggatgttgcgatctgtgtcgcacaaattgattagggttggacccttaagtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatc 1094  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttt 410  Q
    ||||| | |||| |||  || ||  | ||  | | ||||||| ||| | |||| ||||||||||||| ||| | ||||||||  |||||||| |||   |    
T  1093 tgtgaggctgtt-tgacctgcta-agttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg-ttgaaat 997  T
Q  411 tatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaaga 510  Q
     | |||||||     |||||  |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||  | ||||  ||  ||||    
T  996 gaattgatat-----tatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttattgaactaagttgcatgagtcattataagatgaataaga 902  T
Q  511 tgatgttgaacctccaaattattggata--aataagagatgatgattgtgatgtttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc 607  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||    || ||||||||||||  ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  901 tgatgttgaacatccaaattattggatatgtgtatgagatgatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc 802  T
Q  608 atgccctggagctttgtactca 629  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  801 atgccctggagctttgtactca 780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 6)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 13 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 7789 - 7426
Alignment:
Q  13 agagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttagaa 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  7789 agagaacatgttgaattctgtatttttgacctttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattaaatgataacttagac 7690  T
Q  112 taagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaa 211  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7689 tgagattgaacctggtttagcttggaacaattttagttgggattctggcttggactcgccgtggcgagcaaatgctctcgcctcgcgagcacttccaaaa 7590  T
Q  212 ctgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatat 311  Q
    ||||||||||||||| ||   | ||| ||| | || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7589 ctgagtgcaagtgagaatgtagtgatttgtattgcttgaattgattagggatggacccttaggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatct 7490  T
Q  312 gtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaa 377  Q
     ||||  || ||||||||||| | | ||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||    
T  7489 atgaaactgatatgagatgtttgcgttgaatatgatgtattataatgttta--tgcattacttgaa 7426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 439 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 7371 - 7174
Alignment:
Q  439 tgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggata 538  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| | ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7371 tgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatttaagatgattaagatgatgttgaacctccaaattattggata 7272  T
Q  539 aataagagatgatgattgtgatg-tttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
     ||| ||||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7271 tatatgagatgatgattaagatgttttaagagattgagtccatgcattagcatacatttgttttgggttcatgccctggagctttgtactcaccacga 7174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 76
Target Start/End: Original strand, 32914 - 32958
Alignment:
Q  32 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  32914 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgaatgcct 32958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 562 - 634
Target Start/End: Original strand, 15629 - 15701
Alignment:
Q  562 tttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  15629 tttaagaggtctagtccatgcattaacattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacg 15701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 76
Target Start/End: Original strand, 15114 - 15158
Alignment:
Q  32 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  15114 gtatttttgacttttaagttgaaccgtagatgcttttgagtgcct 15158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 454 - 515
Target Start/End: Original strand, 15519 - 15580
Alignment:
Q  454 cctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | | |||||||||    
T  15519 cctatgttgctcttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatg 15580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412 (Bit Score: 213; Significance: 1e-116; HSPs: 1)
Name: scaffold0412
Description:

Target: scaffold0412; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 15 - 629
Target Start/End: Original strand, 6038 - 6636
Alignment:
Q  15 agagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttagaata 113  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||     
T  6038 agagcatgttgaattctgtacttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttcagatgtttattaaagattagatgatgatttagaatg 6137  T
Q  114 agattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaact 213  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6138 agattgaacttggtttagcttagaacaacttaagttggaattttggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaact 6237  T
Q  214 gagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatatgt 313  Q
    || ||||||| ||||||  ||||| ||| |||||| | |||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  6238 gaatgcaagttaggatattgcgatttgtttcgcataagttgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatatgt 6337  T
Q  314 gaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttttat 413  Q
    |||| |||| |||  || ||    ||  | | ||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| ||| | ||||||||  |||||||| |||   | |     
T  6338 gaagctgtt-tgaactgcta-acttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttg-ttgaaatgaa 6434  T
Q  414 ttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatga 513  Q
    |||||||     |||||  |||| || ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||  | |         |||||||    
T  6435 ttgatat-----tatgaaattatgctattgttgtgatcttcctatgctgctattgttatttaactatgttgcatgagtcattat---------aagatga 6520  T
Q  514 tgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatgtttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgcc 612  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||  ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6521 tgttgaa-ctccaaattattggatgtatatgagataatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggcttatgcc 6619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 208; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 12 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 15901 - 15642
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  15901 cagagagcatgtagaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaaggtggttattaaagattaaatgataacttaga 15802  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15801 atgagattgaacctggtttagcttagaacaacattagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 15702  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggaccct 270  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  15701 actgagtgcaagtgaggatattgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggaccct 15642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 4)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 402
Target Start/End: Original strand, 21188 - 21578
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||| | |||||||||||  |||     
T  21188 cagagagcatgtcgaattctatattttttacttttgagttgaaccttagatgttttttagtaccttaagatgtgtattaaggattaaatgataatgtagg 21287  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    || |||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21288 atgagattgaacctggtttagcttagagcaaccttagttggaattctggcttgtactcgccgtggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 21387  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    ||||| ||||||| |||||   ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||     
T  21388 actgaatgcaagttaggatgttgcgatctgtttcgcataaattgattagggatggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatt 21487  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttg 402  Q
    ||||||| || |||||  |||||  ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||| | ||||||||  ||||||||    
T  21488 tgtgaagctgctatgaactgtta-agctgattataatgtgatttaatgattaattgtattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg 21578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 507 - 635
Target Start/End: Original strand, 21633 - 21761
Alignment:
Q  507 aagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatgtttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc 605  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||  ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21633 aagatgatgttgaac-tccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc 21731  T
Q  606 tcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21732 tcatgccctggagctttgtactcaccacga 21761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 461 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 82127 - 81983
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgga-taaataagagatgatga-ttgtg 558  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||   |   |||||||||||||| || | ||||| ||  || ||  |    
T  82127 tgctgttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg--aaggttccaaattattggattatacaagagttgtcgatttaag 82030  T
Q  559 atgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggct 606  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  82029 atgtttaagaagtcgagtccatgcattagcattc-tttgttgggggct 81983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 202
Target Start/End: Original strand, 80102 - 80139
Alignment:
Q  165 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagca 202  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  80102 actcgacatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagca 80139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 340 - 635
Target Start/End: Original strand, 7755 - 8054
Alignment:
Q  340 aatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaatt----atgaatgaatgattgagatgttgcttgtttttatttgatatcgttatatgatgtta 435  Q
    |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| |    |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| || |    
T  7755 aatatgatgtgagatgatgattaattgcattacttgaaatgttaatgaatgactgattgagatgatgcttgcttttatttgatatcgttacatgacgtca 7854  T
Q  436 tactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgg 535  Q
    || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | | ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7855 taatgttgttgtaatctgcctaggctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatatgagatgatcaagatgatgttgaacttccaaattattgg 7954  T
Q  536 ataaataagagatgatgattgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7955 ataaataagagatgatgattatgatgtttaagagatcgagtccatgcattaacatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacga 8054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 12 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 2325 - 1710
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||| | ||| |    
T  2325 cagagaacatgttgaattctgtatgtt-gacttttgagttgaaccttagatgcttttaagtgccttaagatgtttaataaagattagatgatgatttaaa 2227  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    |  ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2226 acgagattgaacctggtttatcttagaacaacttgagttggaaatctgacttgtactcgccatggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccata 2127  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    ||||| | |||||  ||||   ||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||| ||||| |||||| | |||     
T  2126 actgaatacaagttgggatgttgcgatctgtttcgcacaaattgattagagttggacccttagggagtaatgtgacctatttaagatgttaaccgaaatc 2027  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttt 410  Q
    ||||||  |||| |||  || ||  | ||  | | ||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||| | ||||||||  |||||||| |||   |    
T  2026 tgtgaaactgtt-tgaactgcta-agttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg-ttgaaat 1930  T
Q  411 tatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaaga 510  Q
     | |||||||     |||||  |||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||  | ||||  ||  ||||    
T  1929 gaattgatat-----tatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgccattgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataaga 1835  T
Q  511 tgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgat-gtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcat 609  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||| |||||  ||| |||||   ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1834 tgatgttgaa-ctccaaattattggatgtatatgagatgttgattaagatagtttagatgattgagtctatgcattagcatacatttgttgggggctcat 1736  T
Q  610 gccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  1735 gccctggagctttgtactcaccacga 1710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 12 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 10007 - 9393
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||| | ||| |    
T  10007 cagagaacatgttgaattctgtatgtt-gacttttgagttgaaccttagatgcttttaagtgccttaagatgtttaataaagattagatgatgatttaaa 9909  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    |  ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9908 acgagattgaacctggtttatcttagaacaacttgagttggaaatctgacttgtactcgccatggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccata 9809  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    ||||| | |||||  ||||   ||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||| ||||| |||||| | |||     
T  9808 actgaatacaagttgggatgttgcgatctgtttcgcacaaattgattagagttggacccttagggagtaatgtgacctatttaagatgttaaccgaaatc 9709  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttt 410  Q
    ||||||  |||| |||  || ||  | ||  | | ||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||| | ||||||||  |||||||| |||   |    
T  9708 tgtgaaactgtt-tgaactgcta-agttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg-ttgaaat 9612  T
Q  411 tatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaaga 510  Q
     | |||||||     ||||| ||||| |||||| ||| ||||   |||| || |||||||||||||| ||| ||||||| ||  | ||||  ||  ||||    
T  9611 gaattgatat-----tatga-gttatgctgttgatgtgatctgattatgttgttattgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataaga 9518  T
Q  511 tgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgat-gtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcat 609  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||| |||||  ||| |||||   ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9517 tgatgttgaa-ctccaaattattggatgtatatgagatgttgattaagatagtttagatgattgagtctatgcattagcatacatttgttgggggctcat 9419  T
Q  610 gccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  9418 gccctggagctttgtactcaccacga 9393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 176; Significance: 2e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 12 - 635
Target Start/End: Original strand, 16740 - 17348
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||| |||||||    
T  16740 cagagagcatgtagaattctgtgtttttgacttttgagttgaagcttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaatattagatgatgacttaga 16839  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16840 acaagattgaacttggtttagcttagaacaaccttagttgggaatctggcatgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttcaaga 16939  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    || |||||||  |||| ||  || || ||| || || ||||||||||||  ||||| | || ||||||| |||||||||         ||||||| | |     
T  16940 accgagtgcatttgagaatgccgtgacctgagttgcttgaattgattaggaatggaactttaggtagtagtgagaccta---------ttaactgaattc 17030  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttt 410  Q
    | ||||| | |||| |  ||| |||  ||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||| |  |||||||| | |   |    
T  17031 tatgaagctattataaactgtaagt--tgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatgttcaagatgttgttggaaat 17128  T
Q  411 tatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaaga 510  Q
     | |||||||     ||||| ||||| |||||| ||| ||||   |||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||  |  |||  ||| ||||    
T  17129 gaattgatat-----tatgaagttatgctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttccatgagtctatacaagatgattaaga 17223  T
Q  511 tgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatgtt-taaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctca 608  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |    
T  17224 tgatgttgaa-ctccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttataagatgatcgagtccatgcattagcatacaattgtt-ggggctaa 17321  T
Q  609 tgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||||||||||  |||||| |||||    
T  17322 tgccctggagcttcatactcaccacga 17348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1895 (Bit Score: 174; Significance: 3e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold1895
Description:

Target: scaffold1895; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 12 - 360
Target Start/End: Original strand, 867 - 1195
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  867 cagagagcatgtagaattatgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcctattaaagattaaatgataacttaga 966  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||                     |||||||||||    
T  967 atgagattgaacctagtttagcttagaacaacattagttgggaatctggctagtactcgccatggcga---------------------gcacttccaga 1045  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||     
T  1046 actgagtgcaagtgaggatattgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggatccttgggtagtaatatgacctatataagaagttaactgcaatc 1145  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtt 360  Q
     |||||| |||||||| || ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  1146 agtgaagctgttatgaaatattaatgttgaatatgatgtgatataatgtt 1195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 172; Significance: 4e-92; HSPs: 4)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 441 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 178972 - 178781
Alignment:
Q  441 ttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaa 540  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  178972 ttgttgtaatatgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaa 178873  T
Q  541 taagagatgatgattgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaaca 632  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  178872 taagagatgatgattgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcataccctggagctttgtacttaaca 178781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 36 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 179128 - 178974
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttagaataagattgaacctggtttagctt 134  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  179128 ttttgacttttgagttggaccttagatgtttttcagtgcctgaagatgcttattaaagattaaatgataacttagaataagattgaacctggtttaactt 179029  T
Q  135 agaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctct 189  Q
    |||||| |  | ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  179028 agaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccatggctagcagatgctct 178974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 84
Target Start/End: Original strand, 15472 - 15520
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgt 84  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15472 ttttaacttttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaacatgt 15520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 466 - 538
Target Start/End: Original strand, 15845 - 15914
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggata 538  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||    ||||||||||||||||    
T  15845 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg---ttccaaattattggata 15914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 172; Significance: 4e-92; HSPs: 3)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 12 - 635
Target Start/End: Original strand, 30364 - 30980
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||| ||| ||||| | |||||    
T  30364 cagagagcatgttgaatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatctttaataaagattagatgatgatttaga 30463  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30464 acgagattgaacctggtttagcttagaacaactggagttggaaatctggcttatactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttacaga 30563  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    ||||||||||  |||| ||   | || ||| || || ||||||||||||  ||||| | || ||||||  |||||||||| ||||| |||||||| |||     
T  30564 actgagtgcatttgagaatgttgtgacctgagttgcttgaattgattaggaatggaactttaggtagttgtgagacctatttaagatgttaactgaaatc 30663  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttt 410  Q
    ||| ||||||||   |  | | |||  ||  | | ||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||| | ||||||||  |||||| | |||   |    
T  30664 tgtaaagttgtttgaacttctaagt--tgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgataaagatgtag-ttgaaat 30760  T
Q  411 tatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaaga 510  Q
     | ||| | |     ||||| | |||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||  | ||||  ||  ||||    
T  30761 gaattgttgt-----tatgaag-tataatgttgttgtgatccgattatgctgcttttgttatttaaccaagttgcatgagtcattataagatgaataaga 30854  T
Q  511 tgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatg-tttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctca 608  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||  |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30855 tgatgttgaa-ctccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctca 30953  T
Q  609 tgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||    
T  30954 tgccctggagctttgtcctcaccacga 30980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 157 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 2216 - 2157
Alignment:
Q  157 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2216 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgag 2157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 2352 - 2292
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 72  Q
    ||||||||||||||| ||  |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2352 cagagagcatgttgattttcgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgtctttgagt 2292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 170; Significance: 7e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 12 - 564
Target Start/End: Original strand, 5928 - 6473
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    ||||||||||||||||||   |  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||| ||||  |||||||    
T  5928 cagagagcatgttgaatttcatgattttgacctgtgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcatattaaagattagatgaagacttaga 6027  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
     | ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6028 ttgagattgaacctggttaagcttagaacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 6127  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    | ||| |||||||||||||   ||||  |||||||||| | |||||||||||||||||| |  ||||||||| || |||| || || ||||| ||||||     
T  6128 attgaatgcaagtgaggatgttgcgacttgtgtcgcataacttgattagagatggacccctaagtagtaatgtgatctatttaggatgttaaatgcaatc 6227  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttt 410  Q
    ||||||| | |||||| ||||||  | ||  |||  |||||| ||||  |||||||||||||||||| ||| | ||||||||  ||| |||| |||   |    
T  6228 tgtgaagctattatgaaatgtta-agttgtttatattgtgatttaattattaattgcattacttgaaatattattgaatgatcaagaagttg-ttgaaat 6325  T
Q  411 tatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaaga 510  Q
     | |||||||     ||||| |||||  ||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||  |  |||  ||| ||||    
T  6326 gaattgatat-----tatgaagttatgatgttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaaga 6420  T
Q  511 tgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatgttt 564  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||  |||||||    
T  6421 tgatgttgaa-ctccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttt 6473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 461 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 4352 - 4300
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatga 513  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  4352 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 4300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 153; Significance: 9e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 6081 - 5473
Alignment:
Q  13 agagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttagaa 111  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  6081 agagagcatgtcgaattctgtgtttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaa 5982  T
Q  112 taagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaa 211  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5981 caagattgaacctggtttagcttcgaacaaccttagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccataa 5882  T
Q  212 ctgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatat 311  Q
    |||| ||||| | | |||     || ||| || || || |||||||||  ||||  | || |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||  || |    
T  5881 ctgaatgcaaattaagatgttaagacctgagttgcttggattgattaggaatgggactttaggtagtaatgtgacctat-taagatgttaactgagatct 5783  T
Q  312 gtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgttttt 411  Q
     ||||| ||||||||  |||||  ||||| ||| |||||||  ||||  ||||||||||||||||  ||| | ||||||||  |||||||| |     |     
T  5782 ttgaagctgttatgaattgtta-agctgattataatgtgattaaatgaataattgcattacttgagatattattgaatgatcaagatgttgttgaaaatg 5684  T
Q  412 atttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcga-tcaaga 510  Q
    | |||||||     |||||   ||| |||||||||| ||||   |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||  |  | |  || | ||||    
T  5683 aattgatat-----tatga-actatgctgttgttgtgatctgattatgctgctactgttatttaactaagttgcatgagtctatacatgatgagttaaga 5590  T
Q  511 tgatgttgaacctccaaattattggataaata-agagatgatgattgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcat 609  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  |||  |||||| |||||  |||        ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5589 tgatgttgaa-ctccaaattattggatgtatattgagatgttgattaagat--------gattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcat 5499  T
Q  610 gccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||| ||| |||| |||| |||||    
T  5498 gccctgtagccttgtcctcaccacga 5473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 7276 - 6668
Alignment:
Q  13 agagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttagaa 111  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  7276 agagagcatgtcgaattctgtgtttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaa 7177  T
Q  112 taagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaa 211  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7176 caagattgaacctggtttagctttgaacaactttagttgtaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccataa 7077  T
Q  212 ctgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatat 311  Q
    |||| ||||| | | |||     || ||| || || || |||||||||  ||||  | || |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||  || |    
T  7076 ctgaatgcaaattaagatgttaagacctgagttgcttggattgattaggaatgggactttaggtagtaatgtgacctat-taagatgttaactgagatct 6978  T
Q  312 gtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgttttt 411  Q
     ||||| ||||||||  |||||  ||||| ||| |||||||  ||||  ||||||||||||||||  ||| | ||||||||  |||||||| |     |     
T  6977 ttgaagctgttatgaattgtta-agctgattataatgtgattaaatgaataattgcattacttgagatattattgaatgatcaagatgttgttgaaaatg 6879  T
Q  412 atttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcga-tcaaga 510  Q
    | |||||||     |||||   ||| |||||||||| ||||   |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||  |  | |  || | ||||    
T  6878 aattgatat-----tatga-actatgctgttgttgtgatctgattatgctgctactgttatttaactaagttgcatgagtctatacatgatgagttaaga 6785  T
Q  511 tgatgttgaacctccaaattattggataaata-agagatgatgattgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcat 609  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  |||  |||||| |||||  |||        ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6784 tgatgttgaa-ctccaaattattggatgtatattgagatgttgattaagat--------gattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcat 6694  T
Q  610 gccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||| ||| |||| |||| |||||    
T  6693 gccctgtagccttgtcctcaccacga 6668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346 (Bit Score: 151; Significance: 1e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0346
Description:

Target: scaffold0346; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 104 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 15490 - 14968
Alignment:
Q  104 acttagaataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcac 203  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15490 acttagaacaagattgaacctggtttagcttagaacaactttagttgaaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcac 15391  T
Q  204 ttccagaactgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaac 303  Q
    || ||||||||||||||  |||| ||     || ||| || || | |||||||| |  ||||| | || ||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  15390 tttcagaactgagtgcatttgagaatgttttgacctgagttgctttaattgatttggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataagatgttaac 15291  T
Q  304 tgcaatatgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgc 403  Q
    |||||| ||||||| |||||| | | ||||  | ||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||  ||||||||     
T  15290 tgcaatctgtgaagctgttataaaaagtta-agttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg- 15193  T
Q  404 ttgtttttatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcg 503  Q
    |||   | | |||||||     ||||| ||||| ||| |||||| ||||   ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |   |  |||  |    
T  15192 ttgaaatgaattgatat-----tatgaagttatgctg-tgttgtgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatgagtgtatacaagatg 15099  T
Q  504 atcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgat-gtttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgg 601  Q
    || |||||||||||||| |||||| ||||||| |  ||| ||||||||||||  |||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15098 attaagatgatgttgaa-ctccaacttattgggtgtatatgagatgatgattaagatattttaagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgg 15000  T
Q  602 gggctcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  14999 gggctca--ccctggagctttgtactcaccacga 14968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 31 - 72
Target Start/End: Original strand, 17361 - 17402
Alignment:
Q  31 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 72  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17361 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 17402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1326 (Bit Score: 128; Significance: 8e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold1326
Description:

Target: scaffold1326; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 12 - 635
Target Start/End: Original strand, 1119 - 1718
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||| | |||||||    
T  1119 cagagagcatgtcgaattctgtagttttgacttgtgagttgaactttagatgcttttgagtgcctttagatgtttattaaagattagatgttgacttaga 1218  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    | |||||||||| |||          || | |  | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1219 acaagattgaacttgg----------aataaccattgttggaattctggcttgtactcgccatagcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 1308  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    ||| |||||||||||| ||   | || ||| || || || ||||| |||  ||||| | || | |||||||| ||||||| ||||| ||||||||  ||     
T  1309 actaagtgcaagtgagaatgatgagacctgagttgcttggattgactaggaatggaactttagttagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatc 1408  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttt 410  Q
    ||||||| ||||||||  |||||  ||||| ||| ||||||  ||| |  ||||||||||||||||| ||| | ||||||||  |||||||| |||   |    
T  1409 tgtgaagctgttatgaattgtta-agctgattataatgtgacttaacgaataattgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg-ttgaaat 1506  T
Q  411 tatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaaga 510  Q
     | ||| | |     ||||| |||||| ||||||||| ||||   ||||||||| | |||||||||| ||| |||||||    |||||       |||||    
T  1507 gaattgttgt-----tatgaagttataatgttgttgtgatctgattatgctgctttggttatttaactaagttgcatga----gtcta-----tacaaga 1592  T
Q  511 tgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatgtttaaga--gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctca 608  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||  ||  ||||||||||||  ||||||| |||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1593 tgatattgaa-ctccaaattattggatttatgtgagatgatgattaagatgttttagattgattgagtccatacattagcatacatttgttgggggctca 1691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 128; Significance: 8e-66; HSPs: 8)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 27 - 213
Target Start/End: Original strand, 190915 - 191102
Alignment:
Q  27 attctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttagaataagattgaacctg 125  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  190915 attctgtgtttttgacttttgagttcaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttagaaatgattaaatgataacttagaatgagattgaacctg 191014  T
Q  126 gtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaact 213  Q
    ||||| | |||||||   || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  191015 gtttaacctagaacaaaatttgttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaact 191102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 27 - 277
Target Start/End: Original strand, 192618 - 192869
Alignment:
Q  27 attctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttagaataagattgaacctg 125  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  192618 attctgtgtttttgacttttgagttcaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttagaaatgattaaatgataacttagattgagattgaacctg 192717  T
Q  126 gtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca-agtg 224  Q
    ||||| | |||||||   || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||  |||    
T  192718 gtttaacctagaacaaactttgttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagtacttccagatctaagtgcattgtg 192817  T
Q  225 aggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtag 277  Q
    ||| | | ||||| ||| |||||||| ||| |||||| || ||| ||||||||    
T  192818 aggtttg-gcgatatgtttcgcatgagttgcttagagttgaacctttgggtag 192869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 144 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 56450 - 56376
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 218  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56450 ttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 56376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #4
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 523 - 635
Target Start/End: Original strand, 193099 - 193214
Alignment:
Q  523 tccaaattattgga-taa-ataagagatgatgattgtgatg-tttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagc 619  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||| ||||| || | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  193099 tccaaattattggactaatataagagatgatgattaagatgctttaacagttagagtccatgcattagcatacatatgttgggggctcatgccctggagc 193198  T
Q  620 tttgtactcaacacga 635  Q
    |||||||||| |||||    
T  193199 tttgtactcaccacga 193214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #5
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 426 - 635
Target Start/End: Original strand, 19760 - 19972
Alignment:
Q  426 tatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctcc 525  Q
    ||||| |||||| ||||||||| ||||   ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||  | ||||  ||  |||||| |||||| | |||    
T  19760 tatgaagttataatgttgttgtgatctgaatatgctgcttttgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgttgttgagc-tcc 19858  T
Q  526 aaattattggataaataa-gagatgatgattgtgat-gtttaaga--gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctt 621  Q
    ||||||||||||  |||  |||||| |||||  ||| |||| |||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  19859 aaattattggatgcatattgagatgttgattaagattgttttagatcgattgagtccatgcattagcatacatatgttgggggctcatgccatggagctt 19958  T
Q  622 tgtactcaacacga 635  Q
     || |||| |||||    
T  19959 agtcctcaccacga 19972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #6
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 426 - 635
Target Start/End: Original strand, 15238 - 15450
Alignment:
Q  426 tatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctcc 525  Q
    ||||| |||||| ||||||||| ||||   |||| |||| |||||||||||| ||| ||||||| ||  | ||||  ||  |||||| |||||| | |||    
T  15238 tatgaagttataatgttgttgtgatctgaatatgatgcttttgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgttgttgagc-tcc 15336  T
Q  526 aaattattggataaataa-gagatgatgattgtgat-gtttaaga--gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctt 621  Q
    ||||||||||||  |||  |||||| |||||  ||| |||| |||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  15337 aaattattggatgcatattgagatgttgattaagattgttttagatcgattgagtccatgcattagcatacatatgttgggggctcatgccatggagctt 15436  T
Q  622 tgtactcaacacga 635  Q
     || |||| |||||    
T  15437 agtcctcaccacga 15450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #7
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 93
Target Start/End: Original strand, 14943 - 15024
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag 93  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||| ||||||||    
T  14943 cagagagcatgttgattttcgtattttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtgtattaaag 15024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #8
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 93
Target Start/End: Original strand, 19485 - 19546
Alignment:
Q  32 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag 93  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||| ||||||||    
T  19485 gtattttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtgtattaaag 19546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 115; Significance: 4e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 12 - 376
Target Start/End: Original strand, 18921 - 19275
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| | ||||| ||| ||||| |||||||    
T  18921 cagagagcatgtcgaatcttgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctttagatgttcactaaagattagatgatgacttaga 19020  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    | ||||||||||||||          || | |  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19021 acaagattgaacctgg----------aataaccattgttggaattctggcttgtactcgccatggcgagaagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 19110  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    ||||||||||  |||| ||  || || ||| || |  ||||||||||||  ||||| | || ||||||| |||||||||||||||| ||||| || |||     
T  19111 actgagtgcatttgagaatgtcgtgacctgagttgattgaattgattaggaatggaacattaggtagtagtgagacctatataagatgttaaatgaaatc 19210  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttga 376  Q
    ||||||| ||||||||  | |||  ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  19211 tgtgaagctgttatgaactatta-agctgattatgatgtgatttattgattaattgcattacttga 19275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 506 - 635
Target Start/End: Original strand, 19391 - 19525
Alignment:
Q  506 caagatgatgttgaacctccaaattattggataaataa-gagatgatgattgtgatgtt---taaga-gatcgagtccatgcattagcata-catttgtt 599  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||  |||||| | |||  ||||||   ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  19391 caagatgatgttgaac-tccaaattattggatgtatattgagatgtttattaagatgttgattaagatgattgagtccatgcattagcataacatatgtt 19489  T
Q  600 gggggctcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| |||| |||||    
T  19490 gggggctcatgccctagagccttgtcctcaccacga 19525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 109; Significance: 2e-54; HSPs: 3)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 766 - 461
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||| |||||||    
T  766 cagagagcatgttgaaatctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttaataaagattagatgatgacttaga 667  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    | |||||||||||||          ||| | |  | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  666 acaagattgaacctg----------gaataaccattgttggaattctagcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 577  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    ||||| ||||| | | |||     || ||  || || ||||||||||||  ||||  | || |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||  ||     
T  576 actgaatgcaaattaagatgttaagacctcagttgcttgaattgattaggaatgggactttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatc 477  T
Q  311 tgtgaagttgttatga 326  Q
    ||||||| ||||||||    
T  476 tgtgaagctgttatga 461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 426 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 378 - 168
Alignment:
Q  426 tatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctcc 525  Q
    ||||| |||||| ||||||||| ||||   ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||  | ||||  ||| ||||||||||||||| |||    
T  378 tatgaagttatattgttgttgtgatctgattatgctgcttttgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgttgaac-tcc 280  T
Q  526 aaattattggataaataagagatgatgattgtgatgttt-aaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttg 623  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||||  ||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  279 aaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgaaagagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttg 180  T
Q  624 tactcaacacga 635  Q
    | |||| |||||    
T  179 tcctcaccacga 168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 342 - 402
Target Start/End: Original strand, 3480 - 3539
Alignment:
Q  342 tatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttg 402  Q
    |||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  3480 tatgatgtgatataatgttatac-gcattacttgaattatgagtgtataattgagatgttg 3539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 105; Significance: 4e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 807 - 502
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||| | ||||| ||| | ||| |||||||    
T  807 cagagagcatgttgaatttcgtaatttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgttcactaaagattagaggatgacttaga 708  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    | |||||||||||||           || | |  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  707 acaagattgaacctga----------aataaccattgttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 618  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    ||||||||||  |||| ||  || || ||| || |  ||||||||||||  ||||| | || ||||||| |||||||||||||||| ||||| || |||     
T  617 actgagtgcatttgagaatgtcgtgacctgagttgattgaattgattaggaatggaacattaggtagtagtgagacctatataagatgttaaatgaaatc 518  T
Q  311 tgtgaagttgttatga 326  Q
    ||||||||||||||||    
T  517 tgtgaagttgttatga 502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 101; Significance: 1e-49; HSPs: 6)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 45594 - 45289
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||| | ||||| ||| | ||| |||||||    
T  45594 cagagagcatgttgaatttcgtaatttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgttcactaaagattagaggatgacttaga 45495  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    | |||||||||||||           || | |  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45494 acaagattgaacctga----------aataaccattgttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 45405  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    ||||||||||  |||| ||  || || ||| || |  ||||||||||||  ||||| |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||| || |||     
T  45404 actgagtgcatttgagaatgtcgtgacctgagttgattgaattgattaggaatggaacaataggtagtagtgagacctatataagatgttaaatgaaatc 45305  T
Q  311 tgtgaagttgttatga 326  Q
    ||||||||||||||||    
T  45304 tgtgaagttgttatga 45289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 145 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 7296 - 7222
Alignment:
Q  145 tagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 219  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7296 tagttggaattttggcttgtactcgctttggcgagctgatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 7222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 157 - 218
Target Start/End: Original strand, 11068 - 11129
Alignment:
Q  157 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 218  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  11068 tggcttgtactcaccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaaaattgagtg 11129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 157 - 218
Target Start/End: Original strand, 38585 - 38646
Alignment:
Q  157 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  38585 tggcttgtactcgccatggcgagcagatcctctcgcctcgtgagcacttcaagaattgagtg 38646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 12 - 72
Target Start/End: Original strand, 10932 - 10992
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 72  Q
    ||||||||||||||| ||  |  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  10932 cagagagcatgttgattttcgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 10992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 72
Target Start/End: Original strand, 38472 - 38509
Alignment:
Q  35 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  38472 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 38509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 100; Significance: 4e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 277 - 632
Target Start/End: Original strand, 4690 - 5041
Alignment:
Q  277 gtaatgagacctatataagaagttaactgcaatatgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttga 376  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||| ||| |  |  ||||||| |    
T  4690 gtaatgtgacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctgt-atgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataacgtt-atgtatattacttaa 4787  T
Q  377 attatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttttatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaa 476  Q
      ||| | ||||||||| |||||||| |    |  | |||||||     ||||| || |  |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  4788 gatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatat-----tatgaagtcaagctgttgttgtgatctgcctatgctgctattattatttaa 4882  T
Q  477 ccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgg--ataaataagagatgatgattgtgatg-tttaagagatcg 573  Q
    | ||| ||||||| ||  | ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  4883 ctaagttgcatgagtcaatataagatgattaagatgatgttgaacctccaaattattggatatatataagagatgatgattaagatgttttaagagatcg 4982  T
Q  574 agtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaaca 632  Q
    |||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||    
T  4983 agtccatgcaatagcatagatatgttgggggcttatgccctaaagcttagtactcaaca 5041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 100; Significance: 4e-49; HSPs: 3)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 138
Target Start/End: Original strand, 64282 - 64409
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  64282 cagagagcatgttgaattatgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattaaatgataacataga 64381  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaa 138  Q
    || |||||||||||||||||||||||||    
T  64382 atgagattgaacctggtttagcttagaa 64409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 560 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 46953 - 46885
Alignment:
Q  560 tgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactc 628  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  46953 tgttcaagaggtcgagtccatgcattagcattca-ttgttgggggcttgatgccctagagctttgtactc 46885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 32 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 47458 - 47417
Alignment:
Q  32 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtg 73  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47458 gtattgttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtg 47417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 98; Significance: 6e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 193 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 44395 - 43967
Alignment:
Q  193 ctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatat 292  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||   ||||||| | |||||| | |||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||| |    
T  44395 ctcgcgagcatttccagaactgaatgcaagttagtatgttgcgatctttttcgcataagttgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctattt 44296  T
Q  293 aagaagttaactgcaatatgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgat 392  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||| | || | |  || ||  | ||  | | ||||||| ||||| |||| |||||||||| || ||| | ||||| ||    
T  44295 aagatgttaactgaaatctgtgaagct-ttttaaactgcta-agttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttaaaatattattgaattat 44198  T
Q  393 tgagatgttgcttgtttttatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatc 492  Q
      |||||||| | |   | | |||||||     |||||  |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||    
T  44197 caagatgttg-tggaaatgaattgatat-----tatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 44104  T
Q  493 ggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatgtttaaga-gatcgagtccatgcattagcata 591  Q
      | ||||  ||  |||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||  ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  44103 attataagatgaataagatgatgttgaa-ctctaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcata 44005  T
Q  592 catttgttgggggctcatgccctggagctttgtactca 629  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44004 catttgttgggggctcatgccctggagctttgtactca 43967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 12 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 44550 - 44391
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||| | |||||    
T  44550 cagagagcatgttgaattttgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatatttattaaagattagatgatgatttaga 44451  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgc 170  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  44450 acgagattgaacctggtttagcttagaacaacttaagctggaattctggcttgtactcgc 44391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 98; Significance: 6e-48; HSPs: 10)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 144 - 636
Target Start/End: Original strand, 413803 - 414288
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgt 243  Q
    |||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||     || ||| ||    
T  413803 ttagttggaaatctggcaagtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgaatgtaattgagaatgttatgacctgagt 413902  T
Q  244 cgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatatgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaata 343  Q
     || || |||| ||||  ||||| |||| |||||||| || || ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||  |||||  | ||  |     
T  413903 tgcttggattggttaggaatggaaccttaggtagtaaagaaacatatataagatgttaactggaatctgtgaagttgttaagaactgttaa-gttgtttg 414001  T
Q  344 tgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttttatttgatatcgttatatgatgttatactgttg 443  Q
    | ||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||   ||||||||  |||||||| |||     | ||| | |     |||||  ||||| |||||    
T  414002 taatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaattattcttgaatgatctagatgttg-ttgaaacgaattgttgt-----tatgaaattataatgttg 414095  T
Q  444 ttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataa 543  Q
    |||| ||||   ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||  ||  |  | |  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||     
T  414096 ttgtgatctgattatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgcgtctatacatgatgattaagatgatgttgaac-tccaaattattggatgtatat 414194  T
Q  544 gagatgatgattgtgatgtttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacgaa 636  Q
    ||||||||||||   |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  414195 gagatgatgattaaaatgttttagatgatagagtccatgcattagcatacttttgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcaccacgaa 414288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 36 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 71765 - 71505
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttagaataagattgaacctggtttagctt 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || ||| || || |  ||| | ||| | |||||| ||||||||||||||            
T  71765 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtctttgagtacctttaggtgtctactagatattagaggattaattagaacaagattgaacctgg-------- 71674  T
Q  135 agaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatagcgc 234  Q
      |||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||   |     
T  71673 --aacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagctgatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtgcatttgaggattttga 71576  T
Q  235 gatctgtgtcgcatgaattgatta-gagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactg 305  Q
    || ||| || || || |||||||| |||| ||| |||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  71575 gacctgagttgcttggattgattaggaga-ggaaccttaggtactaatgagacctatttaagatgttaactg 71505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 144 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 96959 - 96883
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 220  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  96959 ttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 96883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #4
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 134 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 140073 - 139988
Alignment:
Q  134 tagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 219  Q
    ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  140073 tagaacaaccttagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcatatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 139988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #5
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 461 - 590
Target Start/End: Original strand, 158557 - 158686
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgga-taaataaga-gatgatga-ttgt 557  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||   ||||  |||||||||||||| || |||||| | || ||| ||      
T  158557 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga---tgaagttccaaattattggattatataagaggttgttgatttaa 158653  T
Q  558 gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcat 590  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  158654 gatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcat 158686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #6
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 558 - 635
Target Start/End: Original strand, 340107 - 340185
Alignment:
Q  558 gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  340107 gatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagccttgtactcaacacga 340185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #7
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 140185 - 140122
Alignment:
Q  13 agagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||    
T  140185 agagagcaagttgttttctgggtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacct 140122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #8
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 97083 - 97018
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgac-ttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||| |||    
T  97083 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgaccttttgagttgaacctcagatgcctttgagtacct 97018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #9
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Original strand, 339593 - 339633
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  339593 ttttgacttttgagttgatccttaaatgcttttgagtgcct 339633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #10
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 148 - 200
Target Start/End: Original strand, 339705 - 339757
Alignment:
Q  148 ttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 200  Q
    |||||| |||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  339705 ttgggaatctgacatgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 339757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 96; Significance: 9e-47; HSPs: 13)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 12 - 229
Target Start/End: Original strand, 18262 - 18470
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    ||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||| ||| |  || | |||||    
T  18262 cagagagcatgtcaaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctttaggtgtctattaaagattagagaatgatttaga 18361  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    | ||||||||||||          |||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18362 acaagattgaacct----------agaacaaccttatttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 18451  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggat 229  Q
    ||||||||||  |||||||    
T  18452 actgagtgcatttgaggat 18470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 558 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 4469 - 4392
Alignment:
Q  558 gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||    
T  4469 gatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctt-tactcaacacga 4392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 558 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 12051 - 11974
Alignment:
Q  558 gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||    
T  12051 gatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctt-tactcaacacga 11974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 558 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 22003 - 21926
Alignment:
Q  558 gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||    
T  22003 gatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctt-tactcaacacga 21926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 4987 - 4947
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  4987 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 4947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #6
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 12569 - 12529
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  12569 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 12529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #7
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 22521 - 22481
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  22521 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 22481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #8
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 342 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 4678 - 4619
Alignment:
Q  342 tatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttg 402  Q
    |||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  4678 tatgatgtgatataatgttatac-gcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttg 4619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #9
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 148 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 4874 - 4822
Alignment:
Q  148 ttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 200  Q
    |||||| |||| | || ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  4874 ttgggaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcttcgcgag 4822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #10
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 342 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 12260 - 12201
Alignment:
Q  342 tatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttg 402  Q
    |||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  12260 tatgatgtgatataatgttatac-gcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttg 12201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #11
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 148 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 12456 - 12404
Alignment:
Q  148 ttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 200  Q
    |||||| |||| | || ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  12456 ttgggaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcttcgcgag 12404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #12
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 342 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 22212 - 22153
Alignment:
Q  342 tatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttg 402  Q
    |||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  22212 tatgatgtgatataatgttatac-gcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttg 22153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #13
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 148 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 22408 - 22356
Alignment:
Q  148 ttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 200  Q
    |||||| |||| | || ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  22408 ttgggaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcttcgcgag 22356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 464 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 10546 - 10374
Alignment:
Q  464 tattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatgtt 563  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||| | | ||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||  ||||||    
T  10546 tattgttatttaactatgttgcatgaattgatataagatgatcaagacgatgttgaacctccaaattcttggatacctaagagatgacgattaagatgtt 10447  T
Q  564 t-aagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  10446 ttaagagatcgagtccatgcattagcatacatatgttgggtgctcatgcccttgagcttagtactcaacacga 10374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 76
Target Start/End: Original strand, 9081 - 9120
Alignment:
Q  37 tttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9081 tttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 9120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 88; Significance: 6e-42; HSPs: 4)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 392
Target Start/End: Original strand, 66045 - 66414
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||  || ||| || || || ||| | ||| | |||||    
T  66045 cagagagcatgtcgaattctaagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctaatatagattagaggatgatttaga 66144  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    | ||||||||||||||          |||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  66145 acaagattgaacctgg----------aacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 66234  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    ||||||||||  |||||||   | || ||| || || || |||||||||  | ||| | || |||| ||||||||||||| |||||  |||||||  |      
T  66235 actgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaac 66334  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgat 392  Q
    ||||||| | |||||| ||| ||    ||| ||| ||||||| || || || ||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  66335 tgtgaagctattatgaaatgcta--agtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgat 66414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 573 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 68817 - 68755
Alignment:
Q  573 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||    
T  68817 gagtccatgcattagcattcatatgttgggggctcatgccctggagcttagtcctcaccacga 68755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Original strand, 71186 - 71343
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||  || ||| || || || ||| | ||| | |||||    
T  71186 cagagagcatgtcgaattctaagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctaatatagattagaggatgatttaga 71285  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcga 178  Q
    | |||||||||||||          ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  71286 acaagattgaacctg----------gaacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcga 71343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 456 - 595
Target Start/End: Original strand, 66465 - 66605
Alignment:
Q  456 tatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagat--gatga 553  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| || |  ||||   || || |||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||  |||||    
T  66465 tatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaaaatgatgatgaac-tccaaattattggatgtataagagatttgatga 66563  T
Q  554 ttgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatt 595  Q
    ||  |||||||    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  66564 ttaagatgttttgttgatagagtccatgcattagcatacatt 66605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 85; Significance: 3e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 523 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 662 - 554
Alignment:
Q  523 tccaaattattgga-taa-ataagagatgatgattgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagct 620  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  662 tccaaattattggactaatataagagatgatgattatgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcaggccctggagct 563  T
Q  621 ttgtactca 629  Q
    |||||||||    
T  562 ttgtactca 554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 12 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 1406 - 1342
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  1406 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcct 1342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 5)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 19664 - 19456
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||  || ||| || ||||| ||| |  || | |||||    
T  19664 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatacctttgagtacctttaggtgtctactaaagattagagaatgatttaga 19565  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    | ||||||||||||||          |||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19564 acaagattgaacctgg----------aacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 19475  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggat 229  Q
    ||||||||||  |||||||    
T  19474 actgagtgcatatgaggat 19456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 13379 - 13172
Alignment:
Q  13 agagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttagaa 111  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||   ||||||| | |  || ||| || ||||| ||| |  || | ||||||    
T  13379 agagagcatgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccatagatacctttgagtacgtttaggtgtctactaaagattagagaatgatttagaa 13280  T
Q  112 taagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaa 211  Q
     ||||||||||||||          |||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13279 caagattgaacctgg----------aacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaa 13190  T
Q  212 ctgagtgcaagtgaggat 229  Q
    | |||||||  |||||||    
T  13189 ccgagtgcatatgaggat 13172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 136 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 62621 - 62541
Alignment:
Q  136 gaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgag 216  Q
    ||||||| |||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  62621 gaacagccttagttggaaagttggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagtacttccagaattgag 62541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 40455 - 40401
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||    
T  40455 tgctgttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatgatg 40401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 12 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 62736 - 62676
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 72  Q
    ||||||||||||||| ||  |  ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  62736 cagagagcatgttgattttcgagtttttgacttttgagttaaaccttagatgcctttgagt 62676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 83; Significance: 5e-39; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 434 - 627
Target Start/End: Original strand, 73802 - 73995
Alignment:
Q  434 tatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattatt 533  Q
    |||| ||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||  |  |||  ||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  73802 tataatgttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatgttgaaa-tccaaattatt 73900  T
Q  534 ggataaataagagatgatgattgtgatgtttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtact 627  Q
    ||||  ||| ||||||||||||  ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  73901 ggatgtatatgagatgatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggcttatgccctggagctttgtact 73995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 466 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 116480 - 116431
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  116480 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 116431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 558 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 116387 - 116355
Alignment:
Q  558 gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcat 590  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  116387 gatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcat 116355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1220 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold1220
Description:

Target: scaffold1220; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 2277 - 1984
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||| ||||||| ||| | ||| |||||||    
T  2277 cagagagcatgttgaatttcgtaatttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgttcattaaagattagaggatgacttaga 2178  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    | ||||||||||| ||          || | |  | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2177 acaagattgaacccgg----------aataaccattgttggaat-ctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 2089  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    ||||||||||  |||| ||  || |  | | || |  |||||| |||||  ||||| | || ||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||    
T  2088 actgagtgcatttgagaatgtcgtgccccgagttgattgaatttattaggaatggaacattaggtagtagtgagacctatataagatgttaaatgaaata 1989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1220; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 506 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 1810 - 1685
Alignment:
Q  506 caagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatgttta-aga--gatcgagtccatgcattagcatacatttgttggg 602  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||| ||||||||||||  |||||||  |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1810 caagatgatgttgaac-tccaaattattagatgtatatgagatgatgattaggatgtttttagattgattgagtccatgcattagcatacatttgttggg 1712  T
Q  603 ggctcatgccctggagctttgtactca 629  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||    
T  1711 ggctcatgccctggagctttgtcctca 1685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Original strand, 35140 - 35338
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||| || ||||| ||| | ||| | |||||    
T  35140 cagagagcttgtcgaattttgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtataataaagattagaggatgatttaga 35239  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    | ||||||||||||||          |||| | |||||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35240 acaagattgaacctgg----------aacaaccttagttggaaacctggcttgtactcgccatggcgaggagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 35329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 558 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 32121 - 32049
Alignment:
Q  558 gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactca 629  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  32121 gatgtttaagaggtcaagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactca 32049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 381
Target Start/End: Original strand, 3854 - 4213
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||  |||||| || ||||| ||| | ||| | |||||    
T  3854 cagagagcatgttgattttcgtattttggacttttgagttgaactttagatgcttttgagtacctttagatgtctactaaagattagaggatgatttaga 3953  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    | ||||||||||||||          |||| |  ||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3954 acaagattgaacctgg----------aacaaccgtagttggaaacctggcctgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 4043  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    |||||||||   ||||  |  || ||  || || |  ||||||||||||  ||||| | || |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||  |||    
T  4044 actgagtgcttttgagattgccgtgacttgagttgattgaattgattaggaatggaactttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagata 4143  T
Q  311 tgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattat 381  Q
    ||||||  ||||||||  |||||  ||||  | | ||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  4144 tgtgaatctgttatgaattgtta-agctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgatttat 4213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 573 - 635
Target Start/End: Original strand, 4403 - 4463
Alignment:
Q  573 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||    
T  4403 gagtccatgcattagcatac--ttgttgggggctcatgccctgaagctttgtcctcaccacga 4463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 4)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 259 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 42871 - 42510
Alignment:
Q  259 gagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatatgtgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatg 358  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||  || ||||||| ||||||||  |||||  ||||| | | ||||||| |||||    
T  42871 gagatggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatctgtgaagctgttatgaactgttaa-gctgattctaatgtgatttaatg 42773  T
Q  359 tttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttttatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctat 458  Q
     |||| ||||||||||||| ||| | ||||||||  ||||||||       | | |||||||     ||||| ||||   ||||||||| ||||   |||    
T  42772 attaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgaaa----tgaattgatat-----tatgaagttaa--tgttgttgtgatctgattat 42684  T
Q  459 gctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtg 558  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||  |  |||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||| |    |    
T  42683 gctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatgttgaac-tccaaattattggatgtatatgagatgattaa---g 42588  T
Q  559 atgtttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  42587 atgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggatcatgccctggaggtttgtactcaccacga 42510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 525 - 624
Target Start/End: Original strand, 24949 - 25048
Alignment:
Q  525 caaattattggataaataagagatgatgattgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgt 624  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||||  ||||||||   ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24949 caaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgtttagatgatagagtccttgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgt 25048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 205
Target Start/End: Original strand, 24421 - 24461
Alignment:
Q  165 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcactt 205  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24421 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcactt 24461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 42905 - 42869
Alignment:
Q  13 agagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgag 49  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  42905 agagagcatgtcgaattctgtattcttgacttttgag 42869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 6)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 173766 - 173558
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||  || ||| || ||| | ||| | ||| | ||| |    
T  173766 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgactttttagttgaaccttagatgtctttgagtacctttaggtgtctactaatgattagaggatgatttata 173667  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    || |||||||||||||          |||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  173666 atgagattgaacctgg----------aacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccata 173577  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggat 229  Q
    ||||||||||  |||||||    
T  173576 actgagtgcatttgaggat 173558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 636
Target Start/End: Original strand, 422163 - 422771
Alignment:
Q  15 agagcatgttgaattctgtatttttga-cttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttagaat 112  Q
    ||||| ||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||| | ||||| ||| | ||| ||||||||     
T  422163 agagcttgtcgaattttgtaattttgaacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgttaaataaagattagaggatgacttagaac 422262  T
Q  113 aagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaac 212  Q
    ||||||||||||||          ||||    ||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  422263 aagattgaacctgg----------aacaaacatagttggaaatctggcaagtactcgccatggcgagcagatgctctcagctcgcgagcacttccagaac 422352  T
Q  213 tgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatatg 312  Q
     ||||||   |||||||     |||||| || |  || |||| ||||  ||||| | || ||||||||||| |||||| ||||| |||||||  ||| ||    
T  422353 agagtgcttttgaggatgtaatgatctgagttgtttggattggttaggaatggaactttaggtagtaatgaaacctatttaagatgttaactagaatctg 422452  T
Q  313 tgaagttgttatgagatgttagtgctgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgttttta 412  Q
    ||||||||||| ||  | |||  | ||  | | ||||||| ||| |  ||| |||||||||||||||||   ||||||||  |||||||| |||   | |    
T  422453 tgaagttgttaagaactattaa-gttgtttgtaatgtgatttaacgactaaatgcattacttgaattattcttgaatgatctagatgttg-ttgaaatga 422550  T
Q  413 tttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatg 512  Q
     ||| | |     |||||  ||||  ||||||||| |||||  |||||||||  ||||||||||| ||| ||||||| ||  |  | |  ||| ||||||    
T  422551 attgttgt-----tatgaaattatgatgttgttgtgatctaattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgagtctatacatgatgattaagatg 422645  T
Q  513 atgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatg-tttaaga--gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcat 609  Q
    ||||||||| |||||||||||||||  | | ||||||||||||  |||| ||| |||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  422646 atgttgaac-tccaaattattggatgtaaatgagatgatgattaagatggttttagattgattgagtccatgcattagcatacttttgttgggggcttat 422744  T
Q  610 gccctggagctttgtactcaacacgaa 636  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  422745 gccctggagctttgtcctcaccacgaa 422771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 161164 - 161124
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  161164 ttttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcct 161124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 501139 - 501081
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttga 519  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||    
T  501139 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgttga 501081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 466 - 590
Target Start/End: Original strand, 85692 - 85816
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgga-taaataaga-gatgatga-ttgtgatgt 562  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||   ||||  |||||||||||||| || |||||| | || ||| ||  |||||    
T  85692 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatga---tgaagttccaaattattggattatataagaggttgttgatttaagatgt 85788  T
Q  563 ttaagagatcgagtccatgcattagcat 590  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  85789 ttaagaagtcgagtccatgcattagcat 85816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #6
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 465 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 160738 - 160687
Alignment:
Q  465 attgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgt 516  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||    
T  160738 attgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 160687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 78; Significance: 5e-36; HSPs: 7)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Original strand, 19647 - 19845
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | |  || ||| || ||||| ||| |  || | |||||    
T  19647 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacatttaggtgtctactaaagattagagaatgatttaga 19746  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    | ||||||||||||||          |||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19747 acaagattgaacctgg----------aacaaccttagttgggaatctggcttgtacttgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 19836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 466 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 16166 - 15996
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataa-ataagagatgatg--attgtgatgt 562  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||    ||||||||||||||| | ||||||| |  |   |||  |||||    
T  16166 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt---tccaaattattggattatataagaggttttcgaattaagatgt 16070  T
Q  563 ttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16069 ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaaaacga 15996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 635
Target Start/End: Original strand, 33019 - 33194
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataa-ataagagatgatgattgt-- 557  Q
    |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||    ||||||||||||||| | ||||||| |  |  || |      
T  33019 tgctgttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt---tccaaattattggattatataagaggttgttgttctaa 33115  T
Q  558 gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||    ||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  33116 gatgtttaagaggttgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagccttgtgctcaacacga 33194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 45986 - 45811
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataa-ataagagatgatgattgt-- 557  Q
    |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||    ||||||||||||||| | ||||||| |  |  || |      
T  45986 tgctgttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt---tccaaattattggattatataagaggttgttgttctaa 45890  T
Q  558 gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||    ||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  45889 gatgtttaagaggttgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagccttgtgctcaacacga 45811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Original strand, 17392 - 17446
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  17392 tgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 17446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 73
Target Start/End: Original strand, 32601 - 32638
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtg 73  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  32601 ttttgacttttgagtcgaaccttagatgcttttgagtg 32638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 46404 - 46367
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtg 73  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  46404 ttttgacttttgagtcgaaccttagatgcttttgagtg 46367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 12 - 326
Target Start/End: Original strand, 191946 - 192251
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||| |||||||| ||| |  || |||||||    
T  191946 cagagagcatgttgattttcgtattttggacttttgagttgaaccttagatgttttcgagtacctttagatgtgtattaaagattagagaatgacttaga 192045  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    | |||||||||||||          ||||| |     |||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  192046 acaagattgaacctg----------gaacaaccagtattggaattctggcttgtactcgccgtggcgagctgatgctctcgcctcgtgagcacttccaga 192135  T
Q  211 actgagtgcaagtgaggatagcgcgatctgtgtcgcatgaattgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaata 310  Q
    | |||||||   |||| ||  || || ||| || | |||| |||| |||  ||||| | | ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||  ||     
T  192136 attgagtgcttttgagaatgtcgtgacctgagttgaatgatttgagtaggaatggaacttagggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatc 192235  T
Q  311 tgtgaagttgttatga 326  Q
    ||||||||||||||||    
T  192236 tgtgaagttgttatga 192251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 76; Significance: 8e-35; HSPs: 3)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 144 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 10256 - 10181
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10256 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 10181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 4997 - 4947
Alignment:
Q  41 acttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaa 91  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  4997 acttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaacatgtctattaa 4947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 10356 - 10315
Alignment:
Q  35 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||    
T  10356 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacct 10315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 144 - 229
Target Start/End: Original strand, 228126 - 228211
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggat 229  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  228126 ttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcatttgaggat 228211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1461 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold1461
Description:

Target: scaffold1461; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 144 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 282 - 207
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 219  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  282 ttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1461; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 382 - 341
Alignment:
Q  35 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||    
T  382 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacct 341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 36 - 229
Target Start/End: Original strand, 15072 - 15256
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttagaataagattgaacctggtttagctt 134  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||  || ||| || ||||| ||| | ||| | |||||| ||||||||||||||            
T  15072 ttttcacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactaaagattagaggatgaattagaacaagattgaacctgg-------- 15163  T
Q  135 agaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggat 229  Q
      |||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  15164 --aacaaccttagttgggaatctggcttgtactcaccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcatttgaggat 15256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 71; Significance: 8e-32; HSPs: 3)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 134 - 220
Target Start/End: Original strand, 2416 - 2502
Alignment:
Q  134 tagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 220  Q
    ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2416 tagaacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtgca 2502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 9680 - 9627
Alignment:
Q  157 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9680 tggcctgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccaga 9627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 62
Target Start/End: Original strand, 2304 - 2353
Alignment:
Q  13 agagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagat 62  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2304 agagagcatgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagat 2353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 4)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Original strand, 2065 - 2263
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||| ||| ||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||  || ||| |||||||| ||| | ||| ||||||     
T  2065 cagacagcttgtcgaattttgtaattttgacttttgcgttgaaccttagatgcttttgagtacctttagttgtgtattaaagattagaggatgacttagt 2164  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    | ||||||||||||||          |||| |  ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2165 acaagattgaacctgg----------aacaaccgtagttggaaacctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 2254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Original strand, 9925 - 10123
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||| ||| ||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||  || ||| |||||||| ||| | ||| ||||||     
T  9925 cagacagcttgtcgaattttgtaattttgacttttgcgttgaaccttagatgcttttgagtacctttagttgtgtattaaagattagaggatgacttagt 10024  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    | ||||||||||||||          |||| |  ||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10025 acaagattgaacctgg----------aacaaccgtagttggaaacttggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 10114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 573 - 636
Target Start/End: Original strand, 2614 - 2677
Alignment:
Q  573 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacgaa 636  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  2614 gagtccatgcattagcatacttttgttgggggctcatgccttggagctttgtcctcaccacgaa 2677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439; HSP #4
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 573 - 636
Target Start/End: Original strand, 10474 - 10537
Alignment:
Q  573 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacgaa 636  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  10474 gagtccatgcattagcatacttttgttgggggctcatgccttggagctttgtcctcaccacgaa 10537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 144 - 229
Target Start/End: Original strand, 13240 - 13325
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggat 229  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  13240 ttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctctcctcgcgagcacttccagaactgagtgcatttgaggat 13325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 144 - 229
Target Start/End: Original strand, 3283 - 3368
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggat 229  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  3283 ttagttggaaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcatttgaggat 3368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 63
Target Start/End: Original strand, 3160 - 3211
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatg 63  Q
    |||||||||||| |  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3160 cagagagcatgtcgttttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatg 3211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 430 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 8568 - 8370
Alignment:
Q  430 atgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaat 529  Q
    |||| |||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||    |||||||    
T  8568 atgtcatactgtttttgtatactacctatgttgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg---ttccaaat 8472  T
Q  530 tattgga-taaataaga-gatgatgattgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtac 626  Q
    ||||||| || |||||| | ||  ||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||| | |||||||||| ||||||||    
T  8471 tattggattatataagaggttgtcgattaagatttttaagaggtcgagtccatgcattagcattca-tagttgggggcttgatgccctggatctttgtac 8373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 8954 - 8914
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  8954 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 8914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 4)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 144 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 9773 - 9701
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9773 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctcttgcctcgcgagcacttccagaactgag 9701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 454 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 13276 - 13096
Alignment:
Q  454 cctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataa-ataagagatgatg 552  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||| ||    ||||||||||||||| | ||||||| |  |     
T  13276 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt---tccaaattattggattatataagaggttgtc 13180  T
Q  553 --attgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
      |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||    |||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  13179 gaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacg 13096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 9873 - 9832
Alignment:
Q  35 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||    
T  9873 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacct 9832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 13679 - 13639
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  13679 ttttgacttttgagttgatccttatatgcttttgagtgcct 13639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 68; Significance: 5e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 144 - 219
Target Start/End: Original strand, 24721 - 24796
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 219  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24721 ttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagacgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 24796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 12 - 72
Target Start/End: Original strand, 24598 - 24658
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 72  Q
    |||||||||||| |  |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  24598 cagagagcatgtcgttttctgagtttttaacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 24658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 507 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 7479 - 7351
Alignment:
Q  507 aagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatgtttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc 605  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||  ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7479 aagatgatgttgaac-tccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgttttagatgatagagtccatgcattagcatac-tttgttgggggc 7382  T
Q  606 tcatgccctggagctttgtactcaacacgaa 636  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  7381 tcatgccctagagctttgtcctcaccacgaa 7351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 7717 - 7656
Alignment:
Q  262 atggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatatgtgaagttgtta 323  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  7717 atggaaccttaggtagtaatgaaacctatataagatgttaactggaatctgtgaagttgtta 7656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 66; Significance: 8e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 134 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 11743 - 11658
Alignment:
Q  134 tagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 219  Q
    ||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11743 tagaacaaccttagttggggatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccataactgagtgc 11658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 574 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 2107 - 2054
Alignment:
Q  574 agtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactca 629  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2107 agtccatgcattagcatac--ttgttgggggctcatgccctggagctttgtcctca 2054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 66; Significance: 8e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 146 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 36656 - 36583
Alignment:
Q  146 agttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 219  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36656 agttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttctagaactgagtgc 36583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 36 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 36757 - 36721
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  36757 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 36721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1552 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold1552
Description:

Target: scaffold1552; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 132 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 718 - 635
Alignment:
Q  132 cttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactga 215  Q
    ||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  718 cttagaacaacctttgttggaattctggcttgtactcgccatggcgagctgatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactga 635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1552; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 828 - 765
Alignment:
Q  13 agagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||| ||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  828 agagagcaagttgttttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacct 765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 342 - 635
Target Start/End: Original strand, 3136 - 3428
Alignment:
Q  342 tatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttttatttgatatcgttatatgatgttatactgt 441  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |   ||  |||||||||  |||||| |||     ||||    
T  3136 tatgatgtgatataatgttaaac-gcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgaattacatttgatattattatatcatg-----ctgt 3229  T
Q  442 tgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacct-ccaaattattggataa- 539  Q
    | |||||  || |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||   | |||||||||||||| |     
T  3230 ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgatgtttccaaattattggattat 3329  T
Q  540 ataagagatgatg--attgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    ||||||| |  |   |||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3330 ataagaggttgtcgaattaagatatttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctagagctttgtactcaacacga 3428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 3)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 144 - 219
Target Start/End: Original strand, 5753 - 5828
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 219  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5753 ttagttggaattccggcttgtactcgccatggcgagctgatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 5828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 558 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 27836 - 27758
Alignment:
Q  558 gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||    ||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  27836 gatgtttaagaagtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagccttgtactaaacacga 27758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 342 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 28001 - 27942
Alignment:
Q  342 tatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttg 402  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  28001 tatgatgtgatataatgttatat-gcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttg 27942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 5)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 144 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 23569 - 23494
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 219  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23569 ttagttgagaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccataactgagtgc 23494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 134 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 242420 - 242344
Alignment:
Q  134 tagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    ||||||| | ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  242420 tagaacaacattagttgggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccaga 242344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 130257 - 130221
Alignment:
Q  165 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagc 201  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  130257 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagc 130221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 130386 - 130346
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  130386 ttttgacttttgagttgatcctttgatgtttttgagtgcct 130346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 23669 - 23628
Alignment:
Q  35 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||    
T  23669 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacct 23628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 63; Significance: 5e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 144 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 9687 - 9613
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 218  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9687 ttagttgggaatctggcttgtactcaccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 9613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 63; Significance: 5e-27; HSPs: 4)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 466 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 396 - 227
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgga-taaataagagatgatga-ttgtgatgtt 563  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||    ||||||||||| || || ||||||| ||  || ||  ||||||    
T  396 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgataaagatgatgatgt---tccaaattattagactatataagaggtgtcgaattaagatgtt 300  T
Q  564 taagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  299 taagaggtcgagtccatgcattagcatttctttgttgggggcttgatgccctggagctttgcactcaacacga 227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 454 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 3535 - 3354
Alignment:
Q  454 cctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataa-ataagagat-gat 551  Q
    |||||| |||| | |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||    ||||||||||||||| | ||||||| | | |    
T  3535 cctatgttgctttagttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt---tccaaattattggattatataagaggttgtt 3439  T
Q  552 ga-ttgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagca-tacatttgttgggggct-catgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
    || ||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  3438 gaattaagatgtctaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattt-ttgggggctagatgccctagagatttgtactcaacacg 3354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 821 - 781
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  821 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 3835 - 3784
Alignment:
Q  149 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 200  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  3835 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 3784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 61; Significance: 7e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 342 - 635
Target Start/End: Original strand, 3101 - 3388
Alignment:
Q  342 tatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttttatttgatatcgttatatgatgttatactgt 441  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |   ||  |||||||||  |||| | |||||     ||    
T  3101 tatgatgtgatataatgttatat-gcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgtt-----gt 3194  T
Q  442 tgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataa-a 540  Q
    | |||||  || |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||    ||||||||||||||| | |    
T  3195 t-ttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt---tccaaattattggattata 3290  T
Q  541 taagagatgatgattgt--gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||| |  |  || |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  3291 taagaggttgttgttctaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagccttgtactcaacacga 3388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 61; Significance: 7e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 449 - 635
Target Start/End: Original strand, 280941 - 281133
Alignment:
Q  449 atctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaata------ 542  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||| | |  |||||| ||  |  |||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||          
T  280941 atctgcctgtgctgctattgttatttaactatgtcgcatgagtctatacaagatgattaagatgatgttgaac-tccaaattattggatatatatatata 281039  T
Q  543 -agagatgatgattgtgatgttt-aagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
     | | |||||||||  ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  281040 tatatatgatgattaagatgttttaaga-attgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacga 281133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 60; Significance: 3e-25; HSPs: 5)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 342 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 38931 - 38643
Alignment:
Q  342 tatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttttatttgatatcgttatatgatgttatactgt 441  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||| | |||||  || |||||||| || |||  |||||||||     ||| |||| || ||||    
T  38931 tatgatgtgatataatgtt-atgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgtttatttgcatttgatat-----tattatgtcatgctgt 38838  T
Q  442 tgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataa-a 540  Q
    | |||||  || |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||    ||||||||||||||| | |    
T  38837 t-ttgtatactgcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgactcggtctaagttgatgaagatgatgatgtt--tccaaattattggattata 38741  T
Q  541 taagagatgatg--attgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||| |  |   |||  |||||||||||| || |||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38740 taagaggttgtcgaattaagatgtttaagagttctagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacga 38643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 454 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 33007 - 32824
Alignment:
Q  454 cctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataa-ataagagatgatg 552  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||| ||    ||||||||||||||| | ||||||| |  |     
T  33007 cctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatgatgatgtt--tccaaattattggattatataagaggttgtc 32910  T
Q  553 --attgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
      |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  32909 gaattaagatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttggactcaacacga 32824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 558 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 32436 - 32358
Alignment:
Q  558 gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  32436 gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttggactcaacacga 32358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 9804 - 9750
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  9804 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 9750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 39124 - 39075
Alignment:
Q  151 ggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 200  Q
    |||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  39124 ggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 39075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 60; Significance: 3e-25; HSPs: 6)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 454 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 51978 - 51797
Alignment:
Q  454 cctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataa-ataagagatgatg 552  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||    ||||||||||||||| | ||||||| |  |     
T  51978 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt---tccaaattattggattatataagaggttttt 51882  T
Q  553 attgt--gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
     || |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  51881 gttttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacg 51797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 466 - 634
Target Start/End: Original strand, 168046 - 168215
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatg----attgtgatg 561  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||| ||    ||||||||||||||  ||||  ||| | ||    |||  ||||    
T  168046 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt---tccaaattattggactaatataagaggttgtcgaattaagatg 168142  T
Q  562 tttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  168143 tttaagaggtcgagtccatgcattagcattca-ttgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacg 168215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Original strand, 167632 - 167672
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  167632 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 167672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 52391 - 52351
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  52391 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 52351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 52277 - 52226
Alignment:
Q  149 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 200  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  52277 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 52226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #6
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 200
Target Start/End: Original strand, 167735 - 167786
Alignment:
Q  149 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 200  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  167735 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 167786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 59; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 342 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 39647 - 39360
Alignment:
Q  342 tatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttttatttgatatcgttatatgatgttatactgt 441  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |   ||  |||||||||     ||| |||| || ||||    
T  39647 tatgatgtgatataatgtt-atgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatat-----tattatgtcatgctgt 39554  T
Q  442 tgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataa-a 540  Q
    | |||||  || |||||| || | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||| |     ||||||||||||||| | |    
T  39553 t-ttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagacgatgatctt--tccaaattattggattata 39457  T
Q  541 taagagatgatg--attgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||| |  |   |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39456 taagaggttgtccaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttaattgttggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacga 39360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 59; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 342 - 635
Target Start/End: Original strand, 75165 - 75452
Alignment:
Q  342 tatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttttatttgatatcgttatatgatgttatactgt 441  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |   ||  |||||||||     ||| |||| || ||||    
T  75165 tatgatgtgatataatgtt-atgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatat-----tattatgtcatgctgt 75258  T
Q  442 tgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataa-a 540  Q
    | |||||  || |||||| || | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||| |     ||||||||||||||| | |    
T  75259 t-ttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagacgatgatctt--tccaaattattggattata 75355  T
Q  541 taagagatgatg--attgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||| |  |   |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  75356 taagaggttgtccaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttaattgttggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacga 75452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 58; Significance: 5e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 467 - 634
Target Start/End: Original strand, 8598 - 8766
Alignment:
Q  467 tgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataa-ataagagat-gatga-ttgtgatgtt 563  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||    ||||||||||||||| | ||||||| | | ||| ||  ||||||    
T  8598 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt---tccaaattattggattatataagaggttgttgaattaagatgtt 8694  T
Q  564 taagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  8695 taagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacg 8766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 6)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 12 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 3973 - 3909
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  3973 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgactttgagtgcct 3909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 12 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 8037 - 7973
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  8037 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgactttgagtgcct 7973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 560 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 3472 - 3397
Alignment:
Q  560 tgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  3472 tgtttaagaagtcaagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctgaagctttgtactcaccacga 3397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #4
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 560 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 7536 - 7461
Alignment:
Q  560 tgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  7536 tgtttaagaagtctagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctgaagctttgtactcaccacga 7461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 3846 - 3795
Alignment:
Q  149 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 200  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  3846 tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgtctcgcgag 3795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #6
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 7910 - 7859
Alignment:
Q  149 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 200  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  7910 tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgtctcgcgag 7859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 5)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 523 - 635
Target Start/End: Original strand, 7942 - 8054
Alignment:
Q  523 tccaaattattggataaataagagatgatgattgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagcttt 622  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||||||  ||||||||   ||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7942 tccaaattattggatgtatatgagatgatgattaagatgtttagatgatagagtccctacattagcatacattcgttgggggctcatgccctggagcttt 8041  T
Q  623 gtactcaacacga 635  Q
    || |||| |||||    
T  8042 gtcctcaccacga 8054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 591
Target Start/End: Complemental strand, 16839 - 16709
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgga-taaataagagatgat-ga-ttgt 557  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||   ||||  |||||||||||||| || | ||||| || | || ||      
T  16839 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga---tgaagttccaaattattggattatacaagagttggtcgatttaa 16743  T
Q  558 gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcata 591  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16742 gatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcata 16709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 36 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 17259 - 17208
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgttta 87  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||    
T  17259 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgttta 17208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 165 - 205
Target Start/End: Original strand, 7541 - 7581
Alignment:
Q  165 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcactt 205  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  7541 actcgccatggcaagcagaggctctcgcctcgcgagcactt 7581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 17130 - 17095
Alignment:
Q  165 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17130 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 17095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1048 (Bit Score: 56; Significance: 7e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold1048
Description:

Target: scaffold1048; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 12 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 1913 - 1798
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||| | ||  | |||||    
T  1913 cagagagcatgttgattttcgtattttggacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtacctttagatgtttattaaagattagaggaggatttaga 1814  T
Q  111 ataagattgaacctgg 126  Q
    | ||||||||||||||    
T  1813 acaagattgaacctgg 1798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 56; Significance: 7e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 36 - 106
Target Start/End: Original strand, 36034 - 36105
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataact 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  36034 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcttattaaagattaaatgataact 36105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 55; Significance: 3e-22; HSPs: 3)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 145 - 219
Target Start/End: Original strand, 6011 - 6085
Alignment:
Q  145 tagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 219  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6011 tagttggaattttggcttgtactcgctttggcgagctgatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 6085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 157 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 2239 - 2178
Alignment:
Q  157 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 218  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  2239 tggcttgtactcaccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaaaattgagtg 2178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 12 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 2375 - 2315
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 72  Q
    ||||||||||||||| ||  |  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  2375 cagagagcatgttgattttcgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 2315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0289 (Bit Score: 55; Significance: 3e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0289
Description:

Target: scaffold0289; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 573 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 2509 - 2447
Alignment:
Q  573 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  2509 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcaccacga 2447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0284 (Bit Score: 55; Significance: 3e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0284
Description:

Target: scaffold0284; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 144 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 18707 - 18633
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 218  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18707 ttagttgggaatctggcttgaactcgctaaggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 18633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0284; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 18830 - 18766
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||    
T  18830 cagagagcatgtcgaattatgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacct 18766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 55; Significance: 3e-22; HSPs: 4)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 455 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 1915 - 1735
Alignment:
Q  455 ctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataa-ataagagatgatg- 552  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||    ||||||||||||||| | ||||||| |  |      
T  1915 ctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt---tccaaattattggattatataagaggttgtcg 1819  T
Q  553 -attgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
     |||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  1818 aattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattaacatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacg 1735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 165 - 204
Target Start/End: Original strand, 207289 - 207328
Alignment:
Q  165 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcact 204  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  207289 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcact 207328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 35 - 76
Target Start/End: Original strand, 207160 - 207201
Alignment:
Q  35 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  207160 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcct 207201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 2330 - 2290
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  2330 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 2290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 157 - 218
Target Start/End: Original strand, 4867 - 4928
Alignment:
Q  157 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 218  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4867 tggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 4928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Original strand, 6900 - 7098
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag-ttaaatgataacttaga 110  Q
    |||||||| ||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||  || || ||| | ||| | |||||    
T  6900 cagagagcttgtcgaattttgtaattttgactttcgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtttgctatagattagaggatgatttaga 6999  T
Q  111 ataagattgaacctggtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    | ||||||||||||||          || | |  | | ||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7000 acaagattgaacctgg----------aataaccatggatggaaatctggcaagtactcgccatggcgagcagatgctcttgcctcgcgagcacttccaga 7089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 573 - 635
Target Start/End: Original strand, 7448 - 7510
Alignment:
Q  573 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||    
T  7448 gagtccatgcattagcattaatatgttgggggctcatgccctgaagcttagtcctcaccacga 7510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 444 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 29629 - 29479
Alignment:
Q  444 ttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataa 543  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||   ||||| || |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||    
T  29629 ttgtaatctacctatgctactattgttatttaactaagtcacatgagtcagtctaagttgattaagatgatgttgaa-ctccaaattattggatgtataa 29531  T
Q  544 g--agatgatgattgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcataca 593  Q
    |  | |||||||||  |||||||    ||| ||||| |||||||||||||||    
T  29530 gtaatatgatgattaagatgttttgttgatagagtctatgcattagcataca 29479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0637 (Bit Score: 52; Significance: 2e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0637
Description:

Target: scaffold0637; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 144 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 8924 - 8849
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 219  Q
    |||||||| | ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8924 ttagttggaaatctggcaagtactcgccatggcgaggagatgctctcgcctcgcgagcatttccagaactgagtgc 8849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0637; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 573 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 8500 - 8439
Alignment:
Q  573 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacgaa 636  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||    
T  8500 gagtccatgcattagcatac--ttgttgggggctcatgccctggagctttttcctcaccacgaa 8439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371 (Bit Score: 52; Significance: 2e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0371
Description:

Target: scaffold0371; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 157 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 15677 - 15618
Alignment:
Q  157 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgag 216  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15677 tggcttgtactcgcaatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgag 15618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 12 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 15819 - 15759
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 72  Q
    ||||||||||||||| ||  |  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  15819 cagagagcatgttgattttcgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 15759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 51; Significance: 7e-20; HSPs: 3)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 466 - 634
Target Start/End: Original strand, 1116 - 1285
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatg----attgtgatg 561  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||| ||    ||||||||||||||  ||||  ||| | ||    |||  ||||    
T  1116 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt---tccaaattattggactaatataagaggttgtcgaattaagatg 1212  T
Q  562 tttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  1213 tttaagaggtcgagtccatgcattagcattca-ttgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacg 1285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Original strand, 702 - 742
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  702 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 200
Target Start/End: Original strand, 805 - 856
Alignment:
Q  149 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 200  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  805 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 51; Significance: 7e-20; HSPs: 3)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 454 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 32132 - 31951
Alignment:
Q  454 cctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatg- 552  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||| ||    ||||||||||||||  ||||  ||| | ||     
T  32132 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt---tccaaattattggactaatataagaggttgt 32036  T
Q  553 ---attgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
       |||  | |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  32035 cgaattaagttgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattca-ttgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacg 31951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 32 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 32536 - 32492
Alignment:
Q  32 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32536 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 32492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 32429 - 32378
Alignment:
Q  149 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 200  Q
    |||||||||| |||| ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  32429 tgggattctgacttgaacttgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 32378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 50; Significance: 3e-19; HSPs: 8)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 157 - 218
Target Start/End: Original strand, 58484 - 58545
Alignment:
Q  157 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 218  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  58484 tggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttctagaattgagtg 58545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 133132 - 133092
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  133132 ttttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcct 133092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 136735 - 136577
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgga-taaataaga-gatgatga-ttgt 557  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||   ||||  |||||||||||||| || |||||| | || ||| ||      
T  136735 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga---tgaagttccaaattattggattatataagaggttgttgatttaa 136639  T
Q  558 gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagc 619  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||| | ||||||||||||    
T  136638 gatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 136577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 139204 - 139046
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgga-taaataaga-gatgatga-ttgt 557  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||   ||||  |||||||||||||| || |||||| | || ||| ||      
T  139204 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga---tgaagttccaaattattggattatataagaggttgttgatttaa 139108  T
Q  558 gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagc 619  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||| | ||||||||||||    
T  139107 gatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 139046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 144142 - 143984
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgga-taaataaga-gatgatga-ttgt 557  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||   ||||  |||||||||||||| || |||||| | || ||| ||      
T  144142 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga---tgaagttccaaattattggattatataagaggttgttgatttaa 144046  T
Q  558 gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagc 619  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||| | ||||||||||||    
T  144045 gatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 143984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 165 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 133003 - 132963
Alignment:
Q  165 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcactt 205  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  133003 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtactt 132963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 461 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 141673 - 141515
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgga-taaataaga-gatgatga-ttgt 557  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||   ||||  |||||||||||||| || |||||| | || ||| ||      
T  141673 tgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaagatga---tgaagttccaaattattggattatataagaggttgttgatttaa 141577  T
Q  558 gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagc 619  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||| | ||||||||||||    
T  141576 gatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 141515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #8
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 134266 - 134212
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||    
T  134266 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatgatg 134212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 49; Significance: 1e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 454 - 635
Target Start/End: Original strand, 4889 - 5071
Alignment:
Q  454 cctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataa-ataagagatgatg 552  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||| ||| ||||||||| ||    ||||||||||||||| | ||||||| |  |     
T  4889 cctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt---tccaaattattggattatataagaggttgtc 4985  T
Q  553 --attgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
      |||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4986 gaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattaacatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacga 5071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Original strand, 604 - 644
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  604 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 49; Significance: 1e-18; HSPs: 6)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 466 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 326 - 164
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataa-ataagagatgatg--attgtgatgt 562  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||    ||||||||||||||| | ||||||| |  |   |||  |||||    
T  326 ttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagataatgatgt---tccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgt 230  T
Q  563 ttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtact 627  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  229 ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtact 164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 32 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 34603 - 34559
Alignment:
Q  32 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34603 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 34559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 13571 - 13531
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  13571 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 13531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 13457 - 13406
Alignment:
Q  149 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 200  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  13457 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 13406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 466 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 34176 - 34007
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatg----attgtgatg 561  Q
    |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| | | ||||||||| ||    ||||||||||||||| ||||  ||| | ||    |||  | ||    
T  34176 ttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt---tccaaattattggattaatataagaggttgtcgaattaagttg 34080  T
Q  562 tttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
     ||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| | ||||||||||| ||||    
T  34079 cttaagaggtcgagtctatgcattagcattca-ttgttgggggcttgatgccctgcaactttgtactcaccacg 34007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #6
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 165 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 34471 - 34437
Alignment:
Q  165 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcga 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34471 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcga 34437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 48; Significance: 4e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 144 - 211
Target Start/End: Original strand, 18113 - 18180
Alignment:
Q  144 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaa 211  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18113 ttagttaggaatctggcttgtactcgctatggcgagctgatgctctcacctcgcgagcacttccagaa 18180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 72
Target Start/End: Original strand, 18013 - 18050
Alignment:
Q  35 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  18013 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 18050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 48; Significance: 4e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 157 - 216
Target Start/End: Original strand, 16429 - 16488
Alignment:
Q  157 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  16429 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgcactcgcctcgcaagcacttccagaattgag 16488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 36 - 87
Target Start/End: Original strand, 51526 - 51577
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgttta 87  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||    
T  51526 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgttta 51577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 47; Significance: 2e-17; HSPs: 5)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 466 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 4765 - 4596
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataa-ataagagatgatg--attgtgatgt 562  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||| ||    ||||||||||||||| | ||||||| |  |   |||  |||||    
T  4765 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgtt--tccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgt 4668  T
Q  563 ttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  4667 ttaagaggtcgagtccatgcattagcattca-ttgttaggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacg 4596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 404 - 364
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  404 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 5180 - 5140
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5180 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 5140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 149 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 301 - 253
Alignment:
Q  149 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgc 197  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  301 tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgc 253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 149 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 5077 - 5029
Alignment:
Q  149 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgc 197  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5077 tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgc 5029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 46; Significance: 7e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 157 - 210
Target Start/End: Original strand, 29973 - 30026
Alignment:
Q  157 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29973 tggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccaga 30026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 13419 - 13379
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13419 ttttgacctttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 13379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 46; Significance: 7e-17; HSPs: 5)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 466 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 28467 - 28302
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatg----attgtgatg 561  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||    |||||| |||||||  ||||  ||| | ||    |||  ||||    
T  28467 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt---tccaaactattggactaatataagaggttgtcgaattaagatg 28371  T
Q  562 tttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactca 629  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  28370 tttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactca 28302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 466 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 4605 - 4440
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagagatgatg----attgtgatg 561  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||| ||    ||||||||||||||| ||||  ||| | ||    |||  ||||    
T  4605 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt---tccaaattattggattaatataagaggttgtcgaattaagatg 4509  T
Q  562 ttta-agagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtactca 629  Q
    |||  |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  4508 tttttagaggtcgagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactca 4440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 562 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 1952 - 1880
Alignment:
Q  562 tttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  1952 tttaagaggtcgagtctatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacg 1880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 466 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 11345 - 11272
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaata 542  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||| ||    ||||||||||||||| ||||    
T  11345 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg---ttccaaattattggattaata 11272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 466 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 2050 - 2001
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | | |||||||||    
T  2050 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 2001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 45; Significance: 3e-16; HSPs: 6)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 342 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 26066 - 25778
Alignment:
Q  342 tatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttttatttgatatcgttatatgatgttatactgt 441  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| | |||||  ||||||||||| ||  ||  |||||||||  |||| | ||| |||         
T  26066 tatgatgtgatataatgttaaat-gcattacttgaagtataattgaatatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgatatt---- 25972  T
Q  442 tgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataa-a 540  Q
      |||||  || |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||| ||    ||||||||||||||| | |    
T  25971 --ttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgatgaagataatgatgtt--tccaaattattggattata 25876  T
Q  541 taagagatgatg--attgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||| |  |   |||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||    ||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  25875 taagaggttgtcgaattaagatgtataagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttggaggcttgatgccctggagctttgtactaaacacga 25778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 342 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 40028 - 39740
Alignment:
Q  342 tatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttttatttgatatcgttatatgatgttatactgt 441  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| | |||||  ||||||||||| ||  ||  |||||||||  |||| | ||| |||         
T  40028 tatgatgtgatataatgttaaat-gcattacttgaagtataattgaatatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgatatt---- 39934  T
Q  442 tgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataa-a 540  Q
      |||||  || |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||| ||| ||||||||| ||    ||||||||||||||| | |    
T  39933 --ttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagcttcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgtt--tccaaattattggattata 39838  T
Q  541 taagagatgatg--attgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||| |  |   |||  | | |||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  39837 taagaggttgtcgaattaagttttttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgataccctggagctttgtactcaacacga 39740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Original strand, 59273 - 59309
Alignment:
Q  165 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagc 201  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  59273 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagc 59309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 91
Target Start/End: Original strand, 39573 - 39628
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaa 91  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| || |||| ||||||    
T  39573 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtacctgaacatgtctattaa 39628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 162 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 40209 - 40173
Alignment:
Q  162 tgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcg 198  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  40209 tgtactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcg 40173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #6
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 40335 - 40295
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||    
T  40335 ttttgacttttgagttgatccgtagatgcttttgagtgcct 40295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 45; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 573 - 636
Target Start/End: Original strand, 205240 - 205301
Alignment:
Q  573 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacgaa 636  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  205240 gagtccatgcattagcatac--ttgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcaccacgaa 205301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 560 - 634
Target Start/End: Original strand, 1212 - 1286
Alignment:
Q  560 tgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  1212 tgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattca-ttgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacg 1286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 32 - 76
Target Start/End: Original strand, 701 - 745
Alignment:
Q  32 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  701 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 560 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 1910 - 1836
Alignment:
Q  560 tgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  1910 tgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattca-ttgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacg 1836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 2424 - 2380
Alignment:
Q  32 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  2424 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcct 2380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 560 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 1247 - 1173
Alignment:
Q  560 tgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1247 tgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattca-tagttgggggcttcatgccctggagctttgtactcaccacg 1173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 454 - 619
Target Start/End: Original strand, 15294 - 15460
Alignment:
Q  454 cctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgga-taaataagag-atgat 551  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||| |||||||   ||||  |||||||||||||| || |||||||  ||      
T  15294 cctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctacgttgattaagatga---tgaagttccaaattattggattatataagagtttgtc 15390  T
Q  552 ga-ttgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagc 619  Q
    || ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||| | ||||||||||||    
T  15391 gatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 15460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 16130 - 16086
Alignment:
Q  32 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  16130 gtatttttgacttttgaattgaaccatagatgcttttgagtgcct 16086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 573 - 635
Target Start/End: Original strand, 27300 - 27362
Alignment:
Q  573 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||    
T  27300 gagtccatgcattagcattcatatgttgggggctcatgccctggagcttagtcctcaccacga 27362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000004; HSPs: 3)
Name: scaffold0166
Description:

Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 456 - 595
Target Start/End: Original strand, 10100 - 10240
Alignment:
Q  456 tatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaataagaga--tgatga 553  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||  | ||||  ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||  ||||||    
T  10100 tatgctgctattgttatttaactaagttgcataaatctatataagatgattaagatgatgatgaa-ctccaaattattggatgtataagagatttgatga 10198  T
Q  554 ttgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatt 595  Q
    ||  |||||||    ||| || ||||||||||||||||||||    
T  10199 ttaagatgttttgttgatagaatccatgcattagcatacatt 10240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 204
Target Start/End: Original strand, 9604 - 9643
Alignment:
Q  165 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcact 204  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9604 actcgtcatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcact 9643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 40 - 76
Target Start/End: Original strand, 9480 - 9516
Alignment:
Q  40 gacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  9480 gacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcct 9516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000004; HSPs: 5)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 342 - 512
Target Start/End: Original strand, 26015 - 26179
Alignment:
Q  342 tatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttttatttgatatcgttatatgatgttatactgt 441  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||| |   ||  |||||||||     ||| |||| || ||||    
T  26015 tatgatgtgatataatgttaaac-gcattacttgaattatgaatgtatacttgagacgttgttgaattacatttgatat-----tattatgtcatgctgt 26108  T
Q  442 tgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatg 512  Q
    | |||||  || |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  26109 ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 26179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 35 - 76
Target Start/End: Original strand, 25706 - 25747
Alignment:
Q  35 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  25706 tttttgacttttgagttgatccttagatggttttgagtgcct 25747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 368 - 515
Target Start/End: Original strand, 44682 - 44824
Alignment:
Q  368 attacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttttatttgatatcgttatatgatgttatactgttgttgtaatctacctatgctgctatt 467  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |   ||  |||||||||     ||| |||| || ||||| |||||  || ||| || |||| ||    
T  44682 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatat-----tattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt 44776  T
Q  468 gttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||    
T  44777 gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 44824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 559 - 619
Target Start/End: Original strand, 44868 - 44929
Alignment:
Q  559 atgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagc 619  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||| | ||||||||||||    
T  44868 atgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 44929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 342 - 386
Target Start/End: Original strand, 33445 - 33488
Alignment:
Q  342 tatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatg 386  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  33445 tatgatgtgatataatgttaaac-gcattacttgaattatgaatg 33488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 562 - 634
Target Start/End: Original strand, 10589 - 10661
Alignment:
Q  562 tttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  10589 tttaagaggtcgagtccatgcattagcattca-ttgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacg 10661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 76
Target Start/End: Original strand, 10075 - 10119
Alignment:
Q  32 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  10075 gtatttttgacttttgaattgaaccttagatgcttttgagtgcct 10119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 4)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 562 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 13452 - 13380
Alignment:
Q  562 tttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  13452 tttaagaggtcgagtccatgcattagcattca-ttgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacg 13380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 32 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 13967 - 13923
Alignment:
Q  32 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13967 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 13923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 454 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 13562 - 13515
Alignment:
Q  454 cctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagt 501  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  13562 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 13515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 13844 - 13808
Alignment:
Q  165 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagc 201  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  13844 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagc 13808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 10517 - 10464
Alignment:
Q  157 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10517 tggcttgaactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccaga 10464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 562 - 634
Target Start/End: Original strand, 11609 - 11681
Alignment:
Q  562 tttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  11609 tttaagaggtcgagtccatgcattagcattca-ttgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacg 11681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 40 - 76
Target Start/End: Original strand, 11170 - 11206
Alignment:
Q  40 gacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  11170 gacttttgagttgaaccttagattcttttgagtgcct 11206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0233 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0233
Description:

Target: scaffold0233; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 210
Target Start/End: Original strand, 14306 - 14359
Alignment:
Q  157 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14306 tggcttgaactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccaga 14359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0423 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0423
Description:

Target: scaffold0423; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 32 - 76
Target Start/End: Original strand, 10910 - 10954
Alignment:
Q  32 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10910 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 10954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 466 - 634
Target Start/End: Original strand, 6192 - 6361
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgga-taaataagagatgat--gattgtgatgt 562  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||    |||||||| ||||| || ||||||| |  |   |||  |||||    
T  6192 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg---ttccaaatttttggattatataagaggttgtcaaattaagatgt 6288  T
Q  563 ttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||    ||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  6289 ttaagaggtcgagtctatgcattagcatttcattgttggaggcttgatgccctgaagctttgtactcaacacg 6361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 76
Target Start/End: Original strand, 5762 - 5803
Alignment:
Q  35 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  5762 ttttttacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 5803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0451 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0451
Description:

Target: scaffold0451; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 63
Target Start/End: Original strand, 11430 - 11481
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatg 63  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11430 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatg 11481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 560 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 4807 - 4733
Alignment:
Q  560 tgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  4807 tgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattca-ttgttgggggcttgatgccctggagttttgtactcaccacg 4733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 5321 - 5268
Alignment:
Q  31 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgt 84  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  5321 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcatgaagatgt 5268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 454 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 4914 - 4853
Alignment:
Q  454 cctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||||| |||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||||| | | |||||||||    
T  4914 cctatgttgctgttgttatttaactaatctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 4853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 10389 - 10335
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttatta 90  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| |||||    
T  10389 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctaaacatgtctatta 10335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 10261 - 10221
Alignment:
Q  165 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcactt 205  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10261 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcactt 10221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 560 - 629
Target Start/End: Original strand, 2563 - 2632
Alignment:
Q  560 tgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactca 629  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  2563 tgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattca-ttgttgggggcttgatgccctagagctttgtactca 2632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 31 - 76
Target Start/End: Original strand, 2082 - 2127
Alignment:
Q  31 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2082 tgtaattttgactgttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 2127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Original strand, 2215 - 2251
Alignment:
Q  165 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagc 201  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2215 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagc 2251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 12 - 77
Target Start/End: Original strand, 9322 - 9387
Alignment:
Q  12 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgccta 77  Q
    |||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  9322 cagagagcatgtcgaattttgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtaccta 9387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 193 - 229
Target Start/End: Original strand, 9467 - 9503
Alignment:
Q  193 ctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggat 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  9467 ctcgcgagcacttccagaactgagtgcatttgaggat 9503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 32567 - 32522
Alignment:
Q  31 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32567 tgtaattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcct 32522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 165 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 32433 - 32393
Alignment:
Q  165 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcactt 205  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  32433 actcgccatggcgagcagaggctctcacctcgcgagtactt 32393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 21374 - 21329
Alignment:
Q  31 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21374 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgttttttagtgcct 21329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 441 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 29168 - 29013
Alignment:
Q  441 ttgttgtaatctacctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataaa 540  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||  |  | |  ||| ||| ||||| ||||  |||||||||||||||  |    
T  29168 ttgttgtaatctacctatgctactattgttatttaactaagatgcatgagtctatacatgatgattaagttgatgatgaa-ttccaaattattggatgta 29070  T
Q  541 taa--gagatgatgattgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatt 595  Q
    |||  || |||||||||  |||||||    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  29069 taagtgatatgatgattaagatgttttgttgatagagtccatgcattagcatacatt 29013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1137 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold1137
Description:

Target: scaffold1137; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 72
Target Start/End: Original strand, 1939 - 1979
Alignment:
Q  32 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 72  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1939 gtatttttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagt 1979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1137; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 165 - 205
Target Start/End: Original strand, 2072 - 2112
Alignment:
Q  165 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcactt 205  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  2072 actcgccatggcaagcagaggctctcgcctcgcgagtactt 2112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Original strand, 2727 - 2767
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2727 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 2767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0810 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0810
Description:

Target: scaffold0810; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 3411 - 3371
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3411 ttttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcct 3371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 76
Target Start/End: Original strand, 4780 - 4824
Alignment:
Q  32 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  4780 gtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcct 4824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 560 - 634
Target Start/End: Original strand, 5291 - 5365
Alignment:
Q  560 tgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||| || | ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  5291 tgtttaagaggtcgagtccatgcattaacattca-tagttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacg 5365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 7290 - 7250
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7290 ttttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcct 7250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Original strand, 13250 - 13290
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13250 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 13290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 4)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 7092 - 7044
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgt 84  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7092 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaacatgt 7044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 14472 - 14424
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgt 84  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14472 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaacatgt 14424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 466 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 6664 - 6595
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggata 538  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||    ||||||||||||||||    
T  6664 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg---ttccaaattattggata 6595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 466 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 14044 - 13975
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggata 538  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||    ||||||||||||||||    
T  14044 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg---ttccaaattattggata 13975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 36 - 87
Target Start/End: Original strand, 15257 - 15308
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgttta 87  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||    
T  15257 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaatatgttta 15308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 148 - 200
Target Start/End: Original strand, 15369 - 15421
Alignment:
Q  148 ttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 200  Q
    |||||| |||| | || ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  15369 ttgggaatctgacctgaactcgccatagcgagcagaggctctcgcctcgcgag 15421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0347
Description:

Target: scaffold0347; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 165 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 379 - 340
Alignment:
Q  165 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcact 204  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  379 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcact 340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 33 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 7081 - 7038
Alignment:
Q  33 tatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  7081 tatttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcct 7038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0185
Description:

Target: scaffold0185; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 573 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 33494 - 33431
Alignment:
Q  573 gagtccatgcattagcata-catttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacga 635  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  33494 gagtccatgcattagcataacatatgttgcgggctcatgccctggagccttgtcctcaccacga 33431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 165 - 204
Target Start/End: Original strand, 8064 - 8103
Alignment:
Q  165 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcact 204  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8064 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcact 8103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Original strand, 7936 - 7976
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  7936 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcct 7976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 560 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 51540 - 51466
Alignment:
Q  560 tgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctca-tgccctggagctttgtactcaacacg 634  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| | || |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  51540 tgtttaagaggtcgagtccatgcatgagcattc-ttagttgggggcttaatgccctggagctttgtactcaccacg 51466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 468 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 4262 - 4110
Alignment:
Q  468 gttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataa-ataagagatgat-gattgt-gatgttt 564  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||   ||  ||||||||||||||| | ||||||| |  | ||||   |||||||    
T  4262 gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg---aagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgttt 4166  T
Q  565 aagagatcgagtccatgcattagca-tacatttgttgggggc-tcatgccctggagc 619  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||    
T  4165 aagaggtcgagtccatgcattagcattaca-ttgttgggggcttgatgccctggagc 4110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 6489 - 6443
Alignment:
Q  15 agagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttaga 61  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  6489 agagcatgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttaga 6443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 466 - 538
Target Start/End: Original strand, 1102 - 1171
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggata 538  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||    ||||||||||||||||    
T  1102 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg---ttccaaattattggata 1171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 13447 - 13393
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  13447 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 13393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 20802 - 20748
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  20802 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 20748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 466 - 538
Target Start/End: Original strand, 6191 - 6260
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggata 538  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||    ||||||||||||||||    
T  6191 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg---ttccaaattattggata 6260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 22941 - 22887
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  22941 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 22887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 23361 - 23321
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  23361 ttttgacttttgagttgatccttagatgcctttgagtgcct 23321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 37876 - 37822
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  37876 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 37822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0475 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0475
Description:

Target: scaffold0475; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 27 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 9564 - 9515
Alignment:
Q  27 attctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  9564 attctgtgtttttgacttttgagatgacccttagatgcttttgagtgcct 9515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0475; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 9426 - 9390
Alignment:
Q  165 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagc 201  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  9426 actcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagc 9390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 31 - 76
Target Start/End: Original strand, 28917 - 28962
Alignment:
Q  31 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28917 tgtaattttgacttttgggttgaaccttagatgcttttgagtgcct 28962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000009; HSPs: 3)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 31 - 76
Target Start/End: Original strand, 45426 - 45471
Alignment:
Q  31 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45426 tgtaatttttacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcct 45471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 466 - 517
Target Start/End: Original strand, 45860 - 45911
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgtt 517  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||    
T  45860 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgtt 45911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Original strand, 45561 - 45597
Alignment:
Q  165 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagc 201  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  45561 actcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagc 45597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0627 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0627
Description:

Target: scaffold0627; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 383 - 343
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  383 ttttgacttttgagttgatccttatatgtttttgagtgcct 343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Original strand, 17650 - 17690
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  17650 ttttgacttttgagttaaaccttagatgcttttgagtgcct 17690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 16747 - 16707
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16747 ttttgacttttaagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 16707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 149 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 20768 - 20716
Alignment:
Q  149 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagc 201  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  20768 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagc 20716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 20882 - 20842
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  20882 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 20842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 6072 - 6032
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6072 ttttgactttttagttgatccttagatgtttttgagtgcct 6032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 3)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Original strand, 16241 - 16281
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  16241 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 16281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 200
Target Start/End: Original strand, 16371 - 16406
Alignment:
Q  165 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16371 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 16406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 461 - 590
Target Start/End: Original strand, 16663 - 16792
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggataa-ataagagatgat-gattgt- 557  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||| ||    | ||||||||||||| | ||||||| |  | ||||       
T  16663 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgatgaagatgatgatgt---ttcaaattattggattatataagaggttgtcgatttaa 16759  T
Q  558 gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcat 590  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16760 gatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcat 16792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Original strand, 28451 - 28491
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  28451 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 28491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 165 - 205
Target Start/End: Original strand, 28580 - 28620
Alignment:
Q  165 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcactt 205  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  28580 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtactt 28620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Original strand, 2286 - 2326
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  2286 ttttgacttttgagttgatccttaaatgtttttgagtgcct 2326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 466 - 517
Target Start/End: Original strand, 2713 - 2764
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgtt 517  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||    
T  2713 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgtt 2764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 10637 - 10597
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  10637 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 10597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 3)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 466 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 182 - 131
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgtt 517  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||    
T  182 ttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgatgtt 131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 480 - 445
Alignment:
Q  165 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  480 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 36 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 609 - 561
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgt 84  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  609 ttttgacttttgaattgatccttagacttttttgagtgcctaaacatgt 561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 466 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 1135 - 1084
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatgtt 517  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||    
T  1135 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagaagatgtt 1084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 461 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 10828 - 10777
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatg 512  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  10828 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 10777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 558 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 10725 - 10693
Alignment:
Q  558 gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcat 590  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10725 gatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcat 10693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 461 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 9297 - 9246
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatg 512  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  9297 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 9246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 558 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 9194 - 9162
Alignment:
Q  558 gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcat 590  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9194 gatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcat 9162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0221 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0221
Description:

Target: scaffold0221; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 204
Target Start/End: Original strand, 12579 - 12618
Alignment:
Q  165 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcact 204  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  12579 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcaagcact 12618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0221; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Original strand, 12451 - 12491
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  12451 ttttgacttttgagatgaaccttagatgcctttgagtgcct 12491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 161 - 107
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||    
T  161 tgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatgatg 107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 4749 - 4695
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||    
T  4749 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaggatgatg 4695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0586 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0586
Description:

Target: scaffold0586; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 41 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 2327 - 2285
Alignment:
Q  41 acttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatg 83  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2327 actttttagtggaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatg 2285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 461 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 14002 - 13948
Alignment:
Q  461 tgctattgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  14002 tgctgttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 13948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 46 - 76
Target Start/End: Original strand, 43436 - 43466
Alignment:
Q  46 tgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43436 tgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 43466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 46 - 76
Target Start/End: Original strand, 47356 - 47386
Alignment:
Q  46 tgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47356 tgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 47386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 160 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 37044 - 36994
Alignment:
Q  160 cttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 210  Q
    |||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||    
T  37044 cttgtactcgccttggcgagtaggaactctcgcctcgcgagcacttccaga 36994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0839 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0839
Description:

Target: scaffold0839; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 76
Target Start/End: Original strand, 1711 - 1759
Alignment:
Q  27 attctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  1711 attctgtgattttgacttttgagttgatccttagatg-ttttgagtgcct 1759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0839; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 200
Target Start/End: Original strand, 1850 - 1883
Alignment:
Q  167 tcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1850 tcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 1883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 466 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 6588 - 6539
Alignment:
Q  466 ttgttatttaaccaagctgcatgaatcggtctaagtcgatcaagatgatg 515  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||    
T  6588 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 6539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0285 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0285
Description:

Target: scaffold0285; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 12206 - 12169
Alignment:
Q  35 tttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  12206 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 12169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 206
Target Start/End: Original strand, 24741 - 24790
Alignment:
Q  157 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttc 206  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||| |||||||    
T  24741 tggcttgtactcgccatggtgagtaggtactctcgcctcgcgggcacttc 24790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2044 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000009; HSPs: 1)
Name: scaffold2044
Description:

Target: scaffold2044; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 36 - 72
Target Start/End: Original strand, 1098 - 1134
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 72  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  1098 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 1134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1873 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000009; HSPs: 1)
Name: scaffold1873
Description:

Target: scaffold1873; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 522 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 1247 - 1172
Alignment:
Q  522 ctccaaattattggataaataagagat--gatgattgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatt 595  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||  |||||||    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  1247 ctccaaattattggatgtataagagatttgatgattaagatgttttgttgatagagtccatgcattagcatacatt 1172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 165 - 205
Target Start/End: Original strand, 2573 - 2613
Alignment:
Q  165 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcactt 205  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  2573 actcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtactt 2613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 163 - 219
Target Start/End: Original strand, 3648 - 3704
Alignment:
Q  163 gtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 219  Q
    ||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  3648 gtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacatccagaattgagtgc 3704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Original strand, 18600 - 18640
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  18600 ttttgacttttgagatgatccttagatgcttttgagtgcct 18640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 20591 - 20551
Alignment:
Q  36 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 76  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  20591 ttttgacttctgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 20551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University