View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8973_low_59 (Length: 259)

Name: NF8973_low_59
Description: NF8973
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8973_low_59
NF8973_low_59
[»] chr3 (29 HSPs)
chr3 (2-245)||(17524951-17525194)
chr3 (1-245)||(23408509-23408753)
chr3 (1-245)||(14878303-14878552)
chr3 (1-160)||(23077276-23077435)
chr3 (1-160)||(856297-856456)
chr3 (1-245)||(15060365-15060612)
chr3 (1-245)||(16909823-16910070)
chr3 (1-102)||(15877626-15877727)
chr3 (1-162)||(15051676-15051836)
chr3 (1-245)||(16369481-16369728)
chr3 (103-245)||(15877947-15878087)
chr3 (1-133)||(12496443-12496575)
chr3 (1-245)||(23052875-23053123)
chr3 (1-137)||(322773-322909)
chr3 (1-137)||(18383715-18383851)
chr3 (1-209)||(19725710-19725917)
chr3 (1-133)||(11298327-11298459)
chr3 (67-133)||(14179624-14179690)
chr3 (25-162)||(11862951-11863087)
chr3 (1-78)||(12173029-12173106)
chr3 (1-115)||(26190807-26190921)
chr3 (1-137)||(326963-327099)
chr3 (73-137)||(1982681-1982745)
chr3 (1-137)||(3389734-3389870)
chr3 (1-37)||(12037751-12037787)
chr3 (1-40)||(15482930-15482969)
chr3 (2-40)||(7793146-7793184)
chr3 (1-37)||(15849884-15849920)
chr3 (109-172)||(18438686-18438750)
[»] chr7 (15 HSPs)
chr7 (1-245)||(9703344-9703588)
chr7 (1-245)||(18154634-18154877)
chr7 (7-231)||(24054560-24054784)
chr7 (4-245)||(19649285-19649525)
chr7 (1-160)||(17137861-17138020)
chr7 (1-160)||(12187176-12187335)
chr7 (1-115)||(11880460-11880574)
chr7 (1-162)||(12321540-12321700)
chr7 (1-137)||(14430064-14430200)
chr7 (1-133)||(2760317-2760449)
chr7 (1-137)||(3272005-3272141)
chr7 (1-40)||(10508880-10508919)
chr7 (1-40)||(13635268-13635307)
chr7 (1-40)||(18557239-18557278)
chr7 (2-40)||(18858-18896)
[»] chr4 (13 HSPs)
chr4 (1-245)||(13569583-13569833)
chr4 (1-245)||(23843559-23843799)
chr4 (3-245)||(44675713-44675951)
chr4 (1-172)||(15093923-15094094)
chr4 (1-245)||(12570095-12570342)
chr4 (1-162)||(15124952-15125112)
chr4 (1-160)||(15121601-15121760)
chr4 (1-133)||(16356751-16356883)
chr4 (4-130)||(16348466-16348592)
chr4 (1-130)||(16487876-16488005)
chr4 (1-40)||(43255960-43255999)
chr4 (1-40)||(36133761-36133800)
chr4 (110-151)||(6190636-6190677)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (1-245)||(15467-15711)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (1-245)||(8755-8999)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (1-245)||(18317-18561)
[»] chr1 (19 HSPs)
chr1 (1-245)||(21714627-21714871)
chr1 (1-245)||(42865009-42865249)
chr1 (3-245)||(20091273-20091512)
chr1 (1-160)||(21787840-21787999)
chr1 (1-141)||(18181919-18182059)
chr1 (1-209)||(22449064-22449271)
chr1 (1-144)||(22831176-22831319)
chr1 (1-145)||(6152032-6152176)
chr1 (1-137)||(21022823-21022959)
chr1 (1-133)||(22468494-22468626)
chr1 (19-133)||(48603706-48603820)
chr1 (1-137)||(3472724-3472859)
chr1 (63-137)||(18393824-18393898)
chr1 (1-137)||(45310165-45310301)
chr1 (1-40)||(21305582-21305621)
chr1 (1-40)||(33797801-33797840)
chr1 (1-30)||(3704863-3704892)
chr1 (1-37)||(17678386-17678422)
chr1 (1-37)||(36819107-36819143)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (1-245)||(69875-70117)
[»] chr8 (26 HSPs)
chr8 (1-245)||(17353735-17353979)
chr8 (1-245)||(19899176-19899416)
chr8 (1-245)||(19983174-19983414)
chr8 (1-245)||(21168519-21168767)
chr8 (1-232)||(16184814-16185049)
chr8 (1-245)||(21161856-21162094)
chr8 (1-245)||(24755795-24756042)
chr8 (1-160)||(23776632-23776792)
chr8 (1-131)||(21395780-21395910)
chr8 (1-131)||(21790273-21790403)
chr8 (1-120)||(19976647-19976766)
chr8 (4-145)||(377455-377596)
chr8 (1-209)||(20465837-20466044)
chr8 (5-131)||(21389254-21389380)
chr8 (2-127)||(30643090-30643215)
chr8 (1-133)||(15602815-15602947)
chr8 (1-133)||(15611267-15611399)
chr8 (1-133)||(17926505-17926637)
chr8 (64-245)||(19259443-19259627)
chr8 (7-133)||(16410059-16410185)
chr8 (1-126)||(22010477-22010602)
chr8 (1-115)||(39094740-39094854)
chr8 (1-40)||(16231274-16231313)
chr8 (1-40)||(22028825-22028864)
chr8 (1-40)||(23834441-23834480)
chr8 (1-37)||(16861125-16861161)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (1-245)||(20061-20304)
[»] chr2 (17 HSPs)
chr2 (1-245)||(22740758-22741000)
chr2 (1-245)||(23038112-23038356)
chr2 (1-209)||(22758513-22758721)
chr2 (1-172)||(22798924-22799095)
chr2 (1-160)||(40622006-40622165)
chr2 (1-162)||(23019504-23019665)
chr2 (60-209)||(23103253-23103402)
chr2 (1-126)||(45677953-45678078)
chr2 (1-137)||(21918114-21918250)
chr2 (1-245)||(24673650-24673897)
chr2 (1-137)||(22811710-22811845)
chr2 (1-133)||(25963515-25963647)
chr2 (1-137)||(37524850-37524985)
chr2 (1-137)||(40428646-40428783)
chr2 (1-65)||(23101028-23101092)
chr2 (1-133)||(24716329-24716461)
chr2 (110-151)||(32451835-32451876)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (1-245)||(65591-65834)
scaffold0031 (1-40)||(53833-53872)
[»] chr6 (18 HSPs)
chr6 (1-245)||(25641981-25642223)
chr6 (1-245)||(19863059-19863301)
chr6 (1-245)||(22438880-22439123)
chr6 (1-245)||(19873201-19873443)
chr6 (1-245)||(22432330-22432573)
chr6 (1-209)||(22334689-22334898)
chr6 (3-245)||(15894229-15894474)
chr6 (1-137)||(18907293-18907429)
chr6 (1-145)||(21739820-21739964)
chr6 (1-133)||(21834688-21834820)
chr6 (1-131)||(16523201-16523331)
chr6 (1-100)||(16924677-16924776)
chr6 (2-100)||(31164646-31164744)
chr6 (1-133)||(15041348-15041480)
chr6 (1-92)||(16965108-16965199)
chr6 (1-40)||(17804465-17804504)
chr6 (7-47)||(22408110-22408150)
chr6 (1-37)||(22429829-22429865)
[»] chr5 (22 HSPs)
chr5 (3-245)||(23501145-23501391)
chr5 (1-245)||(23201441-23201690)
chr5 (1-209)||(37724017-37724225)
chr5 (1-245)||(14079230-14079469)
chr5 (1-172)||(21873399-21873570)
chr5 (1-237)||(23512187-23512428)
chr5 (1-160)||(26704228-26704387)
chr5 (1-160)||(26973961-26974120)
chr5 (1-160)||(22032478-22032637)
chr5 (5-160)||(18769806-18769961)
chr5 (1-160)||(23572241-23572400)
chr5 (1-137)||(21366464-21366600)
chr5 (1-133)||(20805736-20805868)
chr5 (1-133)||(23451532-23451664)
chr5 (1-133)||(23463037-23463169)
chr5 (1-40)||(17410715-17410754)
chr5 (1-40)||(18356595-18356634)
chr5 (1-40)||(20910599-20910638)
chr5 (179-245)||(26704156-26704220)
chr5 (179-245)||(26973889-26973953)
chr5 (84-133)||(20767158-20767207)
chr5 (109-172)||(24529372-24529436)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (1-235)||(1430-1661)
[»] scaffold0081 (3 HSPs)
scaffold0081 (1-245)||(14745-14993)
scaffold0081 (1-245)||(23760-24008)
scaffold0081 (1-245)||(39184-39432)
[»] scaffold0671 (1 HSPs)
scaffold0671 (3-245)||(6176-6422)
[»] scaffold0174 (1 HSPs)
scaffold0174 (1-238)||(18251-18483)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (1-245)||(36535-36779)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (1-245)||(4731-4979)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (3-209)||(174880-175086)
[»] scaffold0149 (2 HSPs)
scaffold0149 (1-245)||(3823-4062)
scaffold0149 (1-245)||(8254-8493)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (1-172)||(16147-16318)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (1-245)||(661-903)
[»] scaffold1895 (1 HSPs)
scaffold1895 (7-172)||(1031-1196)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (1-245)||(32516-32755)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (1-203)||(48258-48461)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (7-162)||(38283-38438)
scaffold0023 (1-162)||(23465-23625)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (1-244)||(34708-34954)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (2-160)||(26985-27143)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (3-209)||(46527-46732)
[»] scaffold0311 (1 HSPs)
scaffold0311 (1-145)||(6876-7020)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (72-245)||(23924-24094)
[»] scaffold0210 (2 HSPs)
scaffold0210 (1-160)||(21604-21763)
scaffold0210 (1-160)||(29496-29655)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (1-160)||(2038-2197)
[»] scaffold0158 (2 HSPs)
scaffold0158 (1-245)||(2913-3160)
scaffold0158 (1-245)||(6579-6826)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (1-245)||(13875-14122)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (1-209)||(18454-18661)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (1-209)||(21367-21574)
[»] scaffold0615 (1 HSPs)
scaffold0615 (1-137)||(1882-2018)
[»] scaffold0425 (1 HSPs)
scaffold0425 (3-162)||(318-476)
[»] scaffold0114 (1 HSPs)
scaffold0114 (1-160)||(7452-7611)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (1-160)||(12920-13079)
[»] scaffold0412 (1 HSPs)
scaffold0412 (1-133)||(6214-6346)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (1-81)||(15642-15722)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (1-145)||(6107-6251)
[»] scaffold0393 (1 HSPs)
scaffold0393 (1-137)||(1675-1811)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (1-133)||(1082-1214)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (88-162)||(4690-4763)
[»] scaffold1296 (1 HSPs)
scaffold1296 (1-130)||(582-711)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (4-130)||(44269-44395)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (1-133)||(2015-2147)
scaffold0104 (1-133)||(9697-9829)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (1-162)||(4588-4748)
[»] scaffold0346 (1 HSPs)
scaffold0346 (1-209)||(15197-15404)
[»] scaffold0280 (1 HSPs)
scaffold0280 (1-137)||(19090-19226)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (70-137)||(42804-42871)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (151-236)||(7755-7844)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (1-137)||(502-638)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (1-137)||(45289-45425)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (1-137)||(192115-192251)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (84-137)||(461-514)
[»] scaffold1326 (1 HSPs)
scaffold1326 (1-137)||(1288-1424)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (1-133)||(30543-30675)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (1-40)||(18431-18470)
[»] scaffold0168 (1 HSPs)
scaffold0168 (1-40)||(3329-3368)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (1-40)||(15217-15256)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (1-40)||(13172-13211)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (1-40)||(66214-66253)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (1-40)||(228172-228211)
[»] scaffold0017 (2 HSPs)
scaffold0017 (83-137)||(15090-15144)
scaffold0017 (83-137)||(19612-19666)
[»] scaffold0550 (1 HSPs)
scaffold0550 (73-134)||(7656-7717)
[»] scaffold0439 (2 HSPs)
scaffold0439 (1-30)||(2234-2263)
scaffold0439 (1-30)||(10094-10123)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (3-40)||(13288-13325)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (110-151)||(51790-51831)
[»] scaffold1220 (1 HSPs)
scaffold1220 (1-37)||(2073-2109)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (4-40)||(9467-9503)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (1-37)||(16919-16955)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 29)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 245
Target Start/End: Original strand, 17524951 - 17525194
Alignment:
Q  2 gcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgacctat 101  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17524951 gcctcgcgagcacttccaaaactgagtgcaagtgaggatattgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgacctat 17525050  T
Q  102 ataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgagatgatgttaaattatattacttgaattatgaatgaatg 201  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  17525051 ataagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgagatgacgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatg 17525150  T
Q  202 atcgagattatgcttgcttttatttgatatcgttatgtgatgtc 245  Q
    || ||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17525151 attgagatgatgcatacttttatttgatatcgttatgtgatgtc 17525194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 23408753 - 23408509
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  23408753 cgcctcgcgagcacttccagaacttagtgcaagtgaggatattgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtattgttaccta 23408654  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgagatgatgttaaattatattacttgaattatgaatgaat 200  Q
    | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23408653 ttttagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgtttaattacattacttgaattatgaatgaat 23408554  T
Q  201 gatcgagattatgcttgcttttatttgatatcgttatgtgatgtc 245  Q
    ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  23408553 gattgagatgatgcttgcttttaattgatatcgttgtatgatgtc 23408509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 14878303 - 14878552
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggaccct-tgggtagtaatgtgacct 99  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |    
T  14878303 cgcctcgagagcacttccagaaccgagtgcgattgaggatattgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggaccccctaggtagtaatgtgactt 14878402  T
Q  100 atataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgagatgatgttaaattatattacttgaa----ttatgaa 195  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||  ||||||||||    | |||||    
T  14878403 atataagaagttaactgcaatctgtgaagctattatgaaatgttaatgttgaatatgatgtaagatgaagtttaattgcattacttgaaatgttaatgaa 14878502  T
Q  196 tgaatgatcgagattatgcttgcttttatttgatatcgttatgtgatgtc 245  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  14878503 tgaatgattgagatgatgcttgcttttatttgatatccttatatgatgtc 14878552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 23077276 - 23077435
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  23077276 cgcctcgcgagcacttccagaaccgatttcaattgaggattttgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttaggtagtaatgagaccta 23077375  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgt 160  Q
    ||| ||||||| |||  ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||    
T  23077376 tatgagaagtttactgtaatttgtgaagctgttatgaaatgtttatgttggttatgatgt 23077435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 856456 - 856297
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || ||||||||||||| || | | |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  856456 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgagaatgttgtgatctgtgttgcttgaattgattagggatggacccttaggtagtaatgagaccta 856357  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgt 160  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||  ||| |||||||||||    
T  856356 tataagaagttaactgcaatctgtgaagcttatatgagatgtttgtgtcgaatatgatgt 856297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 15060612 - 15060365
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||| | ||||| ||| |||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  15060612 cgcctcgcgagcacttccaggactgattgcaagttaggatgttgcgatctgtgtcgcatgaattgattagggatggacccttaggtagtattgtgaccta 15060513  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgagatgatgttaaattatattacttga----attatgaat 196  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||  |||||| ||||| ||| ||||||  | ||| | ||||  |||||||||     | ||||||    
T  15060512 tataagatggtaactgcaatctgtgaagctattatgaactgttaa-gttgattataatgtgatttaatgattaatttcattacttgagatgttaatgaat 15060414  T
Q  197 gaatgatcgagattatgcttgcttttatttgatatcgttatgtgatgtc 245  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  15060413 gaatgattgagttgatgcttgcttttatttgatatccctatatgatgtc 15060365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 16910070 - 16909823
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| || |  |||||||||| || | | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16910070 cgcctcgcgagcacttctagaactgagtgcaagtgagaatgtcatgatctgtgttgcttgaattgattagggatggacccttaggtagtaatgtgaccta 16909971  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgagatgatgttaaattatattacttga----attatgaat 196  Q
    || |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||| ||||| ||| ||||||  | ||| | |||| ||||||||||     | ||||||    
T  16909970 tacaagatgttaactgcaatctgtgaagcttttatgaattgttaa-gttgattataatgtgatttaatgattaattttattacttgagatgttaatgaat 16909872  T
Q  197 gaatgatcgagattatgcttgcttttatttgatatcgttatgtgatgtc 245  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  16909871 gaatgattgagttgatgcttgcttttatttgatatccctatatgatgtc 16909823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 15877626 - 15877727
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15877626 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatattgcgatcagtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagaccta 15877725  T
Q  101 ta 102  Q
    ||    
T  15877726 ta 15877727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 15051836 - 15051676
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||| || || || ||||| | ||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  15051836 cgcctcgcgagcacttctaggactgaatgcaagttaggatgttgtgatctgtgtcgcatgaattgattagggatggacccttaggtagtattgtgaccta 15051737  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtga 162  Q
    ||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||||| ||| ||||||    
T  15051736 tataagatgttaactgcaatttgtgaagctattatgaactgttaa-gttgattataatgtga 15051676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 16369728 - 16369481
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || | ||||| ||||| || | | |||||||| |||  |||||| ||||||||||||| |||    
T  16369728 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgagaatgtcgtgatatgtgttgcttgaattgattagggatacacccttaggtagtaatgtgatcta 16369629  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgagatgatgttaaattatattacttga----attatgaat 196  Q
    ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||| ||||| ||| ||||||  | ||  | ||||  |||||||||     | ||||||    
T  16369628 tataagatgttaactccaatatgtgaagctgttatgaactgttaa-gttgattataatgtgatttaatcattaatttcattacttgagatgttaatgaat 16369530  T
Q  197 gaatgatcgagattatgcttgcttttatttgatatcgttatgtgatgtc 245  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  16369529 gaatgattgagttgatgcttgcttttatttgatatccctatatgatgtc 16369481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 103 - 245
Target Start/End: Original strand, 15877947 - 15878087
Alignment:
Q  103 taagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgagatgatgttaaattatattacttgaattatgaatgaatga 202  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  15877947 taagaagttaactgcaatctgtgatgttgttatgagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgattaatttcattacttgaattatgaatgaatga 15878046  T
Q  203 tcgagattatgcttgcttttatttgatatcgttatgtgatgtc 245  Q
    | |||||  ||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  15878047 ttgagatgttgc-tgttttta-ttgatatcgttatgtgatgtc 15878087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 12496575 - 12496443
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| | || || ||| ||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||    
T  12496575 cgcctcgcgagcacttccagaactgaatgcaagttagtatgttgcgatctgtttcgcataagttgattagggttggacccttaggtagtaatgtgaccta 12496476  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgtt 133  Q
    | ||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  12496475 tttaagatgttaactgaaatctgtgaagctgtt 12496443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 23052875 - 23053123
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    |||||||||||||||| |||||  || ||||| ||||||| ||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  23052875 cgcctcgcgagcacttgcagaattgaatgcaagtgaggatgttacgacctgtgtcgcataacttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgatcta 23052974  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgagatgatgttaaattatattacttgaa-----ttatgaa 195  Q
    | || || ||| | | || | ||||||||| |||||| || |||| ||||  ||| ||||||  | ||  | ||||  ||||||||||     | |||||    
T  23052975 tttaggatgtttaatgcagtttgtgaagctattatgaaattttaa-gttgtttataatgtgatttaattattaattgcattacttgaaatgattaatgaa 23053073  T
Q  196 tgaatgatcgagattatgcttgcttttatttgatatcgttatgtgatgtc 245  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  23053074 tgaatgattgagatgatgcttgcttttatttgatatctttatatgatgtc 23053123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 322909 - 322773
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||| | || || ||| ||||| | |||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||    
T  322909 cgcctcgcgagcacttccagaactaaatgcaagttagtatgttgcgatctatttcgcataaattgattagggttggacccttaggtagtaatgtgaccta 322810  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatga 137  Q
    | ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  322809 tttaagatgttaactaagatctgtgaagctgttatga 322773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 18383715 - 18383851
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || ||||| | || || ||| ||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||    
T  18383715 cgcctcgcgagcacttcaagaactgaatgcaagttagtatgttgcgatctgtttcgcataaattgattagggttggacccttaggtagtaatgtgaccta 18383814  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatga 137  Q
    | ||||| |||||||   ||| |||||||||||||||    
T  18383815 tttaagatgttaactgagatcagtgaagctgttatga 18383851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 19725710 - 19725917
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | ||| | ||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |    
T  19725710 cgcctcgcgagcacttccagaactgaatacaagttaggatgttgcgatctgtttcgcataaattgattagggttggacccttaggtagtaatgtgaccca 19725809  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgagatgatgttaaattatattacttgaattatgaatgaat 200  Q
    | ||||| || ||||  |||||||||| ||| |||||  |||||| | ||| ||| ||||||  | ||| | ||||| |||||||||| ||| | |||||    
T  19725810 tttaagatgtcaactgaaatctgtgaaactgctatgaactgttaa-gctgattataatgtgatttaatgattaattacattacttgaaatattattgaat 19725908  T
Q  201 gatcgagat 209  Q
    |||| ||||    
T  19725909 gatcaagat 19725917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 11298327 - 11298459
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||||| || || ||| ||||||| || |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||    
T  11298327 cgcctcgcgagcacttccagaattgaatgcaatttagtatgttgcgatctgtttctcataatttgattagggttggacccttaggtagtaatgtgaccta 11298426  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgtt 133  Q
    | |||||  ||||||  ||| ||||| ||||||    
T  11298427 tttaagatattaactgaaatttgtgaggctgtt 11298459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 67 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 14179690 - 14179624
Alignment:
Q  67 ttagagatggacccttgggtagtaatgtgacctatataagaagttaactacaatctgtgaagctgtt 133  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  14179690 ttagagatggacccctgggtagtattgtgacctatataagaagttaattataatctgtgaagctgtt 14179624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 11863087 - 11862951
Alignment:
Q  25 gagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgacctatataagaagttaactacaatctgt 124  Q
    |||||||| | ||||| ||| ||||||| ||| |||| ||||||||   ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||  |  |||||||    
T  11863087 gagtgcaagttaggatgttgcgatctgtttcgtataaattgattaggattggacccttaggtattaatgtgacctatttaagatgttatttgaaatctgt 11862988  T
Q  125 gaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtga 162  Q
    ||||||| |||||  |||||| | ||| ||||||||||    
T  11862987 gaagctgctatgaactgttaa-gctgattatgatgtga 11862951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 12173106 - 12173029
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggac 78  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||| |||  ||||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  12173106 cgcctcgcgagcacttccagaactgaatgcaagttaggatgttgctatctgtgtcgcataaattgattaaggatggac 12173029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Original strand, 26190807 - 26190921
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |  ||| ||| || || |   ||||||||  ||||| | || |||||||||| ||||||    
T  26190807 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaattgagaatgtcatgacctgagttgcttggattgattaggaatggaactttaggtagtaatgagaccta 26190906  T
Q  101 tataagaagttaact 115  Q
    | ||||| |||||||    
T  26190907 tttaagatgttaact 26190921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 326963 - 327099
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||| || ||| || || |   ||||||||| | ||| |||| |||| ||||| ||||||    
T  326963 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcttttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattagaaaaggaaccttaggtactaatgagaccta 327062  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatga 137  Q
    | |||||  ||||||   | |||||||||| ||||||    
T  327063 tttaagatattaactgagaactgtgaagctattatga 327099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 137
Target Start/End: Original strand, 1982681 - 1982745
Alignment:
Q  73 atggacccttgggtagtaatgtgacctatataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatga 137  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  1982681 atggagccttaggtagtaatgtgacctaattaagatgttaactgcaatatgtgaagttgttatga 1982745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 3389734 - 3389870
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||  ||||| || | |||| ||| || | || | |||| |||  ||||| | || |||||||||||||||||    
T  3389734 cgccttgcgagcacttccagaactaagtgcttttgagaatgtcgtgacctgagttgaatgaattgagtaggaatggaactttaggtagtaatgtgaccta 3389833  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatga 137  Q
    | ||||| |||||||   | |||||||||||||||||    
T  3389834 tttaagatgttaactgagacctgtgaagctgttatga 3389870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Original strand, 12037751 - 12037787
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgag 37  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12037751 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaattgag 12037787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 15482969 - 15482930
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggat 40  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  15482969 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcatttgaggat 15482930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 40
Target Start/End: Original strand, 7793146 - 7793184
Alignment:
Q  2 gcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggat 40  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  7793146 gcctcgcgagcacttccagaactgagtgcatttgaggat 7793184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Original strand, 15849884 - 15849920
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgag 37  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  15849884 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcatttgag 15849920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 109 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 18438750 - 18438686
Alignment:
Q  109 gttaactacaatctgtgaagctgtt-atgagatgttaatgttgaatatgatgtgagatgatgtta 172  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||    
T  18438750 gttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgtta 18438686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 15)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 9703588 - 9703344
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9703588 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatattgcgatccgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtattaatgtgaccta 9703489  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgagatgatgttaaattatattacttgaattatgaatgaat 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  9703488 tataagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgattatgatgtgagattacgtttaattgcattacttgaattatgaatgaat 9703389  T
Q  201 gatcgagattatgcttgcttttatttgatatcgttatgtgatgtc 245  Q
    ||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9703388 gattgagatgatgcatacttttatttgatatcgttatgtgatgtc 9703344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 18154634 - 18154877
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  | || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  18154634 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgagggaaatgcgatctgtgtcgcatgatttgattaaagatggaccattgggtagtaatgagaccta 18154733  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgagatgatgttaaattatattacttgaattatgaatgaat 200  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  18154734 tataagaagttaactgcaatatgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgcgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaat 18154833  T
Q  201 gatcgagattatgcttgcttttatttgatatcgttatgtgatgtc 245  Q
    ||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18154834 gattgagatgttgcttg-ttttatttgatatcgttatgtgatgtc 18154877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 7 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 24054784 - 24054560
Alignment:
Q  7 gcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgacctatataag 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24054784 gcgagcacttccagaactgagtgaaagtgagaatattgcgatctgtgtcgcataattcgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataag 24054685  T
Q  107 aagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgagatgatgttaaattatattacttgaattatgaatgaatgatcga 206  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  24054684 gagttaactgcaatctgtgaagctgttatgagatgttagtgttgattatgatgtgatatgatgtttaaatacattacttgaattatgaatgaaagattga 24054585  T
Q  207 gattatgcttgcttttatttgatat 231  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||    
T  24054584 gatgatgcttgcttttaattgatat 24054560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 245
Target Start/End: Original strand, 19649285 - 19649525
Alignment:
Q  4 ctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgacctatat 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||    
T  19649285 ctcgcgagcacttccagaaccgagtgtaagtgaggatattgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtattgagacctaaat 19649384  T
Q  104 aagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgagatgatgttaaattatattacttgaattatgaatgaatgat 203  Q
     ||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||| || ||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  19649385 tagaagttaactgcaatctgtgaagcagttaagtgatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattacttgaattatgaatgaatgat 19649484  T
Q  204 cgagattatgcttgcttttatttgatatcgttatgtgatgtc 245  Q
     |||||  ||| || ||||||||||||| |||||||||||||    
T  19649485 tgagatgttgc-tgtttttatttgatattgttatgtgatgtc 19649525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 17137861 - 17138020
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || ||||||||||||| || | | |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  17137861 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgagaatgttgtgatctgtgttgcttgaattgattagggatggacccttaggtagtaatgagaccta 17137960  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgt 160  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  17137961 tataagaagttaactgcaatctgtgaagctgatatgagatgtttgtgttgaatatgatgt 17138020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 12187335 - 12187176
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||| | ||| || | | ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  12187335 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgagaatatagtgatatatgttgcttgaattgattagagatggaccattaggtagtaatgagaccta 12187236  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgt 160  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||   ||||||||||||||    
T  12187235 tataagaagttaactgcaatctgtgaagctgataagagatgtttgagttgaatatgatgt 12187176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 11880574 - 11880460
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11880574 cgcctcgtgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatgttgcgatatgtgtcgcataatttgatttgagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 11880475  T
Q  101 tataagaagttaact 115  Q
    ||||||| |||||||    
T  11880474 tataagatgttaact 11880460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 12321540 - 12321700
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || | | |||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  12321540 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaaatgagaatgtagcgatctgtgtcgcatgaattgattagggatggactcttaggtagtaatgtgaccta 12321639  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtga 162  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||| ||||| ||| ||||||    
T  12321640 tataagatgttaactgcaatctgtgaaactgttatgaactgttaa-gttgattataatgtga 12321700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 14430200 - 14430064
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| | || || ||| ||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||    
T  14430200 cgcctcgcgagcacttccagaactgaatgcaagttagtatgttgcgatctgtttcgcataaattgattagggttggacccttaggtagtaatgtgaccta 14430101  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatga 137  Q
    | ||||| |||||||   ||||||||||||| |||||    
T  14430100 tttaagatgttaactgagatctgtgaagctgctatga 14430064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 2760449 - 2760317
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||| ||| || || | | ||||||||  ||||| | || ||||||| |  ||| ||    
T  2760449 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaattgagattgttgtgacctgagttgcttgaattgattaggaatggaactttaggtagtagtaagacata 2760350  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgtt 133  Q
    | ||||| |||||||  ||||||||| ||||||    
T  2760349 tttaagatgttaactgaaatctgtgaggctgtt 2760317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 3272141 - 3272005
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| || |||||| ||| || |  | | ||||||||  ||||| | || ||||||| || ||||||    
T  3272141 cgcctcacgagcacttccagaactgagtgcttttgagaatgttgtgacctgagttgattgaattgattaggaatggaacattaggtagtagtgagaccta 3272042  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatga 137  Q
    ||||||| ||||| |  ||| ||||||||||||||||    
T  3272041 tataagatgttaaatgaaatatgtgaagctgttatga 3272005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Original strand, 10508880 - 10508919
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggat 40  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  10508880 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggat 10508919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Original strand, 13635268 - 13635307
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggat 40  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  13635268 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcatttgaggat 13635307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 18557278 - 18557239
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggat 40  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  18557278 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcttttgaggat 18557239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 40
Target Start/End: Original strand, 18858 - 18896
Alignment:
Q  2 gcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggat 40  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  18858 gcctcgcgagcacttccagaactgagtgctattgaggat 18896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 176; Significance: 7e-95; HSPs: 13)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 13569833 - 13569583
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13569833 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatattgcgatccgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtattaatgtgaccta 13569734  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgagatgatgttaaattatattacttgaattatgaatgaat 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  13569733 tataagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgagatgatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaat 13569634  T
Q  201 gatcgagattatgcttgc------ttttatttgatatcgttatgtgatgtc 245  Q
    ||| ||||| |||||| |      |||||||||||||||||||||||||||    
T  13569633 gattgagatgatgcttacttttatttttatttgatatcgttatgtgatgtc 13569583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 23843799 - 23843559
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23843799 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatgttgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtggtaatgtgaccta 23843700  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgagatgatgttaaattatattacttgaattatgaatgaat 200  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||   | ||| | |||| |||||||||| |||||||||| |    
T  23843699 tataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgattataatgtgttttaatgattaattgtattacttgagttatgaatgagt 23843600  T
Q  201 gatcgagattatgcttgcttttatttgatatcgttatgtgatgtc 245  Q
    ||| |||||     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23843599 gattgagat----gttgcttttatttgatatcgttatgtgatgtc 23843559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 3 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 44675951 - 44675713
Alignment:
Q  3 cctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgacctata 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||     
T  44675951 cctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatgttgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctaggtagtaatgtgacctatt 44675852  T
Q  103 taagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgagatgatgttaaattatattacttgaattatgaatgaatga 202  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||| | ||||  ||||||||| |||||||||| |||    
T  44675851 taagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatttaatgattaattgcattacttgagttatgaatgagtga 44675752  T
Q  203 tcgagattatgcttgcttttatttgatatcgttatgtgatgtc 245  Q
    | || ||     || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44675751 ttgaaat----gttacttttatttgatatcgttatgtgatgtc 44675713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 15094094 - 15093923
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15094094 cgcctcgcgagcacttccaaaactgagtgcaagttaggatattgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttggttagtaatgtgaccta 15093995  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgagatgatgtta 172  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  15093994 tataagaagttaactgcaatctctgaagctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataatgtta 15093923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 12570342 - 12570095
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |  ||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12570342 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgagaactttgcgacctgtgtcgcataacttgtttagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 12570243  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgagatgatgttaaattatattacttgaa----ttatgaat 196  Q
    |||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||  | ||| | ||||  ||||||||||    | ||||||    
T  12570242 tataggatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaa-gttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatgttaatgaat 12570144  T
Q  197 gaatgatcgagattatgcttgcttttatttgatatcgttatgtgatgtc 245  Q
    ||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||    
T  12570143 gaatgattgagttgatgcttgattttatttgatatctttatatgatgtc 12570095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 15124952 - 15125112
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||||     
T  15124952 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatatttcgatatgtgtcgcataatttgtttagagttggacccctgggtagtaaagtgacctt 15125051  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtga 162  Q
    | ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||    
T  15125052 tttaa-atgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgattataatgtga 15125112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 15121601 - 15121760
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| |  ||| ||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||| || |||||||||| ||||||    
T  15121601 cgcctcgcgagcacttccagaattgagtgcaagtgagaactttgcgatctgtgtcgaataacttgtttagacatggaccattaggtagtaatgagaccta 15121700  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgt 160  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||   ||||| ||||||||    
T  15121701 tataagaagttaactgcaatctgtgaggctgatatgagatgtttgagttgattatgatgt 15121760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 16356751 - 16356883
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| | || || ||| ||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||    
T  16356751 cgcctcgcgagcacttccagaactgaatgcaagttagtatgttgcgatctgtttcgcataagttgattagggttggacccttaggtagtaatgtgaccta 16356850  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgtt 133  Q
    | ||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  16356851 tttaagatgttaactgaaatctgtgaagctgtt 16356883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 130
Target Start/End: Original strand, 16348466 - 16348592
Alignment:
Q  4 ctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgacctatat 103  Q
    |||||||||| ||||||||| || ||||| | || || ||| ||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  16348466 ctcgcgagcatttccagaactgaatgcaagttagtatgttgcgatctgtttcgcataagttgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctattt 16348565  T
Q  104 aagaagttaactacaatctgtgaagct 130  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||    
T  16348566 aagatgttaactgaaatctgtgaagct 16348592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 16487876 - 16488005
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||| ||| ||||||| |||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  16487876 cgcctcgcgagcacttccagaactgaatgcaagttaggatgttgcgatctgtttcgcataagttgatttgggatggacccttaggtagtaatgtgtccta 16487975  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagct 130  Q
    | ||||| ||||| |   ||||||||||||    
T  16487976 tttaagatgttaattgagatctgtgaagct 16488005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Original strand, 43255960 - 43255999
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggat 40  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43255960 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcatttgaggat 43255999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Original strand, 36133761 - 36133800
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggat 40  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  36133761 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcatttgaggat 36133800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 110 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 6190677 - 6190636
Alignment:
Q  110 ttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttga 151  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6190677 ttaattacaattcgtgaagctgttatgagatgttaatgttga 6190636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 173; Significance: 4e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 15467 - 15711
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    |||||||||| |||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15467 cgcctcgcgatcacttctagaacttagtgcaagtgaggatattgtgatctgtgtcgcttaatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagaccta 15566  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgagatgatgttaaattatattacttgaattatgaatgaat 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  15567 tataagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgagataatgattaattgcattacttgaattatgaatgaat 15666  T
Q  201 gatcgagattatgcttgcttttatttgatatcgttatgtgatgtc 245  Q
    ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  15667 gattgagatgatgcttgcttatatttgatatcgttatatgatgtc 15711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 173; Significance: 4e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 8755 - 8999
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8755 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatattgcgacctgtgtcgcataattcgattagagatggacccttgggtagtaatgagaccta 8854  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgagatgatgttaaattatattacttgaattatgaatgaat 200  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||    
T  8855 tataagaagttaactgtaatctgtgaagctgttatgaaatgttgatgttgaatatgatgtgagatgatgtttgatttcattacttgaattatgaatgaat 8954  T
Q  201 gatcgagattatgcttgcttttatttgatatcgttatgtgatgtc 245  Q
    ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  8955 gattgagatgatgcttgcttgtatttgatatcgttatatgatgtc 8999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 173; Significance: 4e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 18561 - 18317
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    |||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18561 cgcctcacgagcgcttccagaactgagtgcaagtgaggatattgcgatatgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 18462  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgagatgatgttaaattatattacttgaattatgaatgaat 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  18461 tataagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgattatgatgtgagattacgtttaattgcattacttgaattatgaatgaat 18362  T
Q  201 gatcgagattatgcttgcttttatttgatatcgttatgtgatgtc 245  Q
    ||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18361 gattgagatgatgcatacttttatttgatatcgttatgtgatgtc 18317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 19)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 21714871 - 21714627
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21714871 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagaccta 21714772  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgagatgatgttaaattatattacttgaattatgaatgaat 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  21714771 tataagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaat 21714672  T
Q  201 gatcgagattatgcttgcttttatttgatatcgttatgtgatgtc 245  Q
    ||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  21714671 gattgagatgttgcttgtttttatttgatatcgttatatgatgtc 21714627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 42865009 - 42865249
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42865009 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatgttgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 42865108  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgagatgatgttaaattatattacttgaattatgaatgaat 200  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||  | ||| | ||||  ||||||||| |||||||||| |    
T  42865109 tataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaaggttaatgttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgagttatgaatgagt 42865208  T
Q  201 gatcgagattatgcttgcttttatttgatatcgttatgtgatgtc 245  Q
    ||| |||||     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42865209 gattgagat----gttgcttttatttgatatcgttatgtgatgtc 42865249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 245
Target Start/End: Original strand, 20091273 - 20091512
Alignment:
Q  3 cctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgacctata 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  20091273 cctcgcgagcacttccagaactgagtgcaaatgaggatattgcgatctgtgtcgcataatttgatttgagatggacccttgggtagtaatgagacctatt 20091372  T
Q  103 taagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgagatgatg-ttaaattatattacttgaattatgaatgaatg 201  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||   | ||| |||||||  |  ||||||||||||||||||||    
T  20091373 taagaagttaactgcaatctgtgaagctgttacgtgatgttaatgttgaatatgatgtg-tttaatgattaaattgcacgacttgaattatgaatgaatg 20091471  T
Q  202 atcgagattatgcttgcttttatttgatatcgttatgtgatgtc 245  Q
    || |||||  || |||  |||||||||||| ||||||| |||||    
T  20091472 attgagatgttg-ttg--tttatttgatattgttatgtaatgtc 20091512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 21787840 - 21787999
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |  ||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21787840 cgcctcgcgagcactttcagaactgagtgcaagtgagaaatttgcgacctgtgtcgcataacttgtttagagatggacccttgggtagtaatgtaaccta 21787939  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgt 160  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  21787940 tataagaagttaactgcaatctatgcagctgttatgaaatgttgatgttgattatgatgt 21787999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Original strand, 18181919 - 18182059
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |     
T  18181919 cgccttgcgagcacttccagaactgagtgcaagttaggatgttgcgatctgtgtcgcataaattgattagggatggactcttaggtagtaatgtgacttg 18182018  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatg 141  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  18182019 tataagaagttaactgcaaactgtgaagctgttatgagatg 18182059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 22449064 - 22449271
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || |||||||||| || || | | ||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||    
T  22449064 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaaatgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatggacccttaggtagtaatgtgacata 22449163  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgagatgatgttaaattatattacttgaattatgaatgaat 200  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||| ||||||  | ||| | ||||  |||||||||| ||| | |||||    
T  22449164 tataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaactgttaa-gttgattataatgtgatttaatgattaatttcattacttgaaatattattgaat 22449262  T
Q  201 gatcgagat 209  Q
    |||| ||||    
T  22449263 gatcaagat 22449271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Original strand, 22831176 - 22831319
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||||| | ||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  22831176 cgcctcgcgagcacttcctgaactgagtgcaattgagaatgttgcgatctgtgtcgcatgacttgtttagggatggactcttaggtagtaatgtgaccta 22831275  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgtta 144  Q
    |||| || ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22831276 tataggatgttaattgcaatctgtgaagctgttatgaaatgtta 22831319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 6152176 - 6152032
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||  | ||||| ||| |||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  6152176 cgcctcgcgagcacttccagaactgaatgcatgttaggatgttgcgatctgtgtcgcatgaattgattagggatggactcttaggtagtaatgtgaccta 6152077  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaa 145  Q
    |||| || ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6152076 tataggatgttaattgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaa 6152032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 21022959 - 21022823
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| | | |||| || | ||||||||||| || | |||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21022959 cgcctcgcgagcacttccagaactcagtactagtgagaatgtcgtgatctgtgttgcttgatttgattaaggatggacccttaggtagtaatgtgaccta 21022860  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatga 137  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  21022859 tataagatgttaactgcaatctgtgaagctattatga 21022823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 22468494 - 22468626
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||     
T  22468494 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgagggtattgcgatatgtgtcgcataattcgattagagatggacccttgggtagtattgagacctt 22468593  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgtt 133  Q
    |  |||  | ||| || ||||||||||||||||    
T  22468594 ttgaagttggtaattataatctgtgaagctgtt 22468626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 48603820 - 48603706
Alignment:
Q  19 agaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgacctatataagaagttaactaca 118  Q
    ||||| |||||||| | ||||| ||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| || |    
T  48603820 agaactgagtgcaagttaggatgttgcgatctgtgttgcatgaattgattagagatggacccctaggtagtattgtgacctatataagaagttaattata 48603721  T
Q  119 atctgtgaagctgtt 133  Q
    |||||||||||||||    
T  48603720 atctgtgaagctgtt 48603706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 3472724 - 3472859
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||   ||||| ||| ||||||| ||||| ||  ||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  3472724 cgcctcgcgagcacttccagaactgaatgcaaaataggatgttgcgatctgtttcgcacaaactgattagggttggactcttaggtagtaatgtgaccta 3472823  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatga 137  Q
    | ||||| |||||    ||||||||||||||||||||    
T  3472824 t-taagatgttaatgggaatctgtgaagctgttatga 3472859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 63 - 137
Target Start/End: Original strand, 18393824 - 18393898
Alignment:
Q  63 ttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgacctatataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatga 137  Q
    ||||||||  ||||| | || |||||||||||||||||| ||||| |||||||   |||||||||||||||||||    
T  18393824 ttgattaggaatggaactttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatctgtgaagctgttatga 18393898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 45310165 - 45310301
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||  | | |||| ||| || |  | | ||||||||  ||||| | || |||||||||||| ||||    
T  45310165 cgcctcgcgagcactttcagaactgagtgcttttgagattgtcgtgacctgagttgattgaattgattaggaatggaactttaggtagtaatgtggccta 45310264  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatga 137  Q
    | ||||| |||||||   |||||||||||||||||||    
T  45310265 tttaagatgttaactgagatctgtgaagctgttatga 45310301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 21305621 - 21305582
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggat 40  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  21305621 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcatttgaggat 21305582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 33797840 - 33797801
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggat 40  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  33797840 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcatttgaggat 33797801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 30
Target Start/End: Original strand, 3704863 - 3704892
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgc 30  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3704863 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgc 3704892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Original strand, 17678386 - 17678422
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgag 37  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  17678386 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcatttgag 17678422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Original strand, 36819107 - 36819143
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgag 37  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  36819107 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcatttgag 36819143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 70117 - 69875
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  70117 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatattgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagaccta 70018  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgagatgatgttaaattatattacttgaattatgaatgaat 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| | ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  70017 tataagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattacttgaattatgaatgaat 69918  T
Q  201 gatcgagattatgcttgcttttatttgatatcgttatgtgatgtc 245  Q
    ||| |||||  ||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  69917 gattgagatgttgc-tgttttta-ttgatatcgttatgtgatgtc 69875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 26)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 17353735 - 17353979
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17353735 cgcctcgcgagcacttgcagaactgagtgcaagtgaggatattgcgatttgtgtcgcataattcgattagagatggacccttgggtagtaatgagaccta 17353834  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgagatgatgttaaattatattacttgaattatgaatgaat 200  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||    
T  17353835 tataagaagttaattgtaatctgtgaagctgttatgaaatgtttatgttgaatatgatgtgagatgatgtttgatttcattacttgaattatgaatgaat 17353934  T
Q  201 gatcgagattatgcttgcttttatttgatatcgttatgtgatgtc 245  Q
    ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  17353935 gattgagatgatgcttgcttgtatttgatatcgttatatgatgtc 17353979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 19899416 - 19899176
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19899416 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatgttgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 19899317  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgagatgatgttaaattatattacttgaattatgaatgaat 200  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||| | ||||  ||||||||| |||||||||| |    
T  19899316 tttaagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatttaatgattaatttcattacttgagttatgaatgagt 19899217  T
Q  201 gatcgagattatgcttgcttttatttgatatcgttatgtgatgtc 245  Q
    ||| || ||     |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19899216 gattgaaat----gttgcttttatttgatatcgtcatgtgatgtc 19899176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 19983414 - 19983174
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  19983414 cgcctcgcgagcacttccaaaactgagtgcaaatgaggatgttgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggaaccctgggtagtaatgtgaccta 19983315  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgagatgatgttaaattatattacttgaattatgaatgaat 200  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||| | ||||  ||||||||| |||||||||| |    
T  19983314 tttaagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatttaatgattaattgcattacttgagttatgaatgagt 19983215  T
Q  201 gatcgagattatgcttgcttttatttgatatcgttatgtgatgtc 245  Q
    ||| || ||     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19983214 gattgaaat----gttgcttttatttgatatcgttatgtgatgtc 19983174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 21168519 - 21168767
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    |||||||| ||||||||| || | |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||    
T  21168519 cgcctcgcaagcacttcctgatctgagtgcaagtgaggatgttgcgatctgtgtcgcatagtttgattagagatggacctttgggtagtaatataaccta 21168618  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgagatgatgttaaattatattacttgaa----ttatgaat 196  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||    | ||||||    
T  21168619 tacaagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtaagatgatgtttaattgcattacttgaaatgttaatgaat 21168718  T
Q  197 gaatgatcgagattatgcttgcttttatttgatatcgttatgtgatgtc 245  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  21168719 gaatgattgagatgatgcttgcttttatttgatatctttatatgatgtc 21168767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 16185049 - 16184814
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16185049 cgcctcgcgagcacttccagaactgaatgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgaccta 16184950  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgagatgatgttaaattatattacttgaa----ttatgaat 196  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||  | ||||| ||||  ||| ||||||    | || |||    
T  16184949 tataagatgttaactgcaatctgtgaagctgatatgagatgttaatgttgattataatgtgatttaatgtttaattgcattgcttgaaatgttaataaat 16184850  T
Q  197 gaatgatcgagattatgcttgcttttatttgatatc 232  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||    
T  16184849 gaatgattgagatgatgcttgcttttatttaatatc 16184814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 21161856 - 21162094
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||    
T  21161856 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatgttgcgatctgtgtcgtatagtttgattagagatggacctttgggtagtaatataaccta 21161955  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgagatgatgttaaattatattacttgaa----ttatgaat 196  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||          |||||||| ||||  ||||||||||    | || |||    
T  21161956 tacaagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgaat----------atgatgtttaattgcattacttgaaatgttaataaat 21162045  T
Q  197 gaatgatcgagattatgcttgcttttatttgatatcgttatgtgatgtc 245  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  21162046 gaatgattgagatgatgcttgcttttatttgatatctttatatgatgtc 21162094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 24756042 - 24755795
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |  ||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24756042 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgagaactttgcgacctgtgtcgcataacttgtttagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 24755943  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgagatgatgttaaattatattacttgaa----ttatgaat 196  Q
    |||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||  | ||| | ||||  ||||||||||    | ||||||    
T  24755942 tataggatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaa-gttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatgttaatgaat 24755844  T
Q  197 gaatgatcgagattatgcttgcttttatttgatatcgttatgtgatgtc 245  Q
    ||||||| ||| | ||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||    
T  24755843 gaatgattgagttgatgcttgatttaatttgatatctttatatgatgtc 24755795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 23776632 - 23776792
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtga-tctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgacct 99  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||   ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  23776632 cgcctcgcgagcactttcagaactgagtgcaagctaggatattgcgaatctgtgtcgcataatttggttagagatggacacttaggtagtaatgtgacct 23776731  T
Q  100 atataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgt 160  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  23776732 atataagaagttaactgcaatttgtgaagctgttatgaaatgttgatgttgaatatgatgt 23776792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 21395780 - 21395910
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21395780 cgcctcgcgagcacgtccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagaccta 21395879  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctg 131  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  21395880 tataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 21395910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 21790273 - 21790403
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21790273 cgcctcgcgagcacgtccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagaccta 21790372  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctg 131  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  21790373 tataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 21790403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 19976766 - 19976647
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||    
T  19976766 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatgttgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggaaccctaggtagtaatgtgaccta 19976667  T
Q  101 tataagaagttaactacaat 120  Q
    | ||||||||||||| ||||    
T  19976666 tttaagaagttaactgcaat 19976647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 377596 - 377455
Alignment:
Q  4 ctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgacctatat 103  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| | |||| || | ||||||||||| || | | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  377596 ctcgcgagcacttccagaactgagtgctaatgagaatgtcgtgatctgtgttgcttgaattgattagggatggacccttaggtagtaatgtgacctatat 377497  T
Q  104 aagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaa 145  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  377496 aagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaa 377455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 20465837 - 20466044
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || | ||| ||||||| || | | |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  20465837 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgagaatgtcgtgttctgtgttgcttgaattgattagggacggacccttaggtagtaatgtgaccta 20465936  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgagatgatgttaaattatattacttgaattatgaatgaat 200  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||| ||||||  | ||| | ||||  |||||||||| ||| | |||||    
T  20465937 tataagaggttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgctaa-gttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattgaat 20466035  T
Q  201 gatcgagat 209  Q
    |||| ||||    
T  20466036 gatcaagat 20466044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 131
Target Start/End: Original strand, 21389254 - 21389380
Alignment:
Q  5 tcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgacctatata 104  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  21389254 tcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagaccaatata 21389353  T
Q  105 agaagttaactacaatctgtgaagctg 131  Q
     |||||||| |  ||| ||||||||||    
T  21389354 tgaagttaattgtaatatgtgaagctg 21389380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 127
Target Start/End: Original strand, 30643090 - 30643215
Alignment:
Q  2 gcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgacctat 101  Q
    |||||||||||||||||||||  || ||||| | ||||| ||| ||||||| ||||| || |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30643090 gcctcgcgagcacttccagaattgaatgcaagttaggatgttgcgatctgtttcgcacaaattgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctat 30643189  T
Q  102 ataagaagttaactacaatctgtgaa 127  Q
     ||||| ||||||| |||||||||||    
T  30643190 ttaagatgttaactgcaatctgtgaa 30643215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 15602815 - 15602947
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||| | || || ||| ||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||    
T  15602815 cgcctcgcgagcacttccagaacttaatgcaagttagtatgttgcgatctgtttcgcataagttgattagggttggacccttaagtagtaatgtgaccta 15602914  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgtt 133  Q
    | ||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  15602915 tttaagatgttaactgaaatctgtgaagctgtt 15602947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 15611267 - 15611399
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||| | || || ||| ||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||    
T  15611267 cgcctcgcgagcacttccagaacttaatgcaagttagtatgttgcgatctgtttcgcataagttgattagggttggacccttaagtagtaatgtgaccta 15611366  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgtt 133  Q
    | ||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  15611367 tttaagatgttaactgaaatctgtgaagctgtt 15611399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 17926505 - 17926637
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || ||||| | || || ||| ||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||    
T  17926505 cgcctcgcgagcactcccagaactgaatgcaaattagtatgttgcgatctgtttcgcataaattgattagggttggacccttaggtagtaatgtgaccta 17926604  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgtt 133  Q
    | ||||| ||||| |  ||||||||||||||||    
T  17926605 tttaagatgttaattgaaatctgtgaagctgtt 17926637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 64 - 245
Target Start/End: Original strand, 19259443 - 19259627
Alignment:
Q  64 tgattagagatggacccttgggtagtaatgtgacctatataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgag 163  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||| ||||| ||| ||||||     
T  19259443 tgattagggatggacccttaggtagtaatgtgacctatacaagatgttaactgcaatctgtgaagctattatgaactgttaa-gttgattataatgtgat 19259541  T
Q  164 atgatgttaaattatattacttga----attatgaatgaatgatcgagattatgcttgcttttatttgatatcgttatgtgatgtc 245  Q
     | ||| | ||||  |||||||||     | ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  19259542 ttaatgattaatttcattacttgagatgttaatgaatgaatgattgagttgatgcttgcttttatttgatatccctatatgatgtc 19259627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 16410059 - 16410185
Alignment:
Q  7 gcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgacctatataag 106  Q
    |||||||| | |||||| || ||||| | ||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  16410059 gcgagcaccttcagaactgaatgcaaattaggatgttgcgatctgtgtcgcacaaattgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaag 16410158  T
Q  107 aagttaactacaatctgtgaagctgtt 133  Q
    |  ||||||  ||| ||||| ||||||    
T  16410159 atattaactgaaatatgtgaggctgtt 16410185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 22010477 - 22010602
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| ||| || || | | ||||||||  ||||| | || ||||||| |  ||| ||    
T  22010477 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaattgagaatgttgtgacctgagttgcttgaattgattaggaatggaactttaggtagtagtaagacata 22010576  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtga 126  Q
    | ||||| |||||||  |||||||||    
T  22010577 tttaagatgttaactgaaatctgtga 22010602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Original strand, 39094740 - 39094854
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| || | |||| ||| || | || | |||| |||| ||||| | |  |||||||||||||||||    
T  39094740 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcttttgagaatgtcgtgacctgagttgaatgaattgagtagaaatggaacttaaggtagtaatgtgaccta 39094839  T
Q  101 tataagaagttaact 115  Q
    | ||||| |||||||    
T  39094840 tttaagatgttaact 39094854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Original strand, 16231274 - 16231313
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggat 40  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  16231274 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcatttgaggat 16231313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 22028864 - 22028825
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggat 40  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  22028864 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcatttgaggat 22028825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 23834480 - 23834441
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggat 40  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  23834480 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcatttgaggat 23834441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Original strand, 16861125 - 16861161
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgag 37  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  16861125 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcatttgag 16861161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 161; Significance: 6e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 20304 - 20061
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20304 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggataatgtaatctgtgtcgcatgatttgattagggatggacccttgggtagtaatgagaccta 20205  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgagatgatgttaaattatattacttgaattatgaatgaat 200  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  20204 tataagaagttaactgcaacctgtgaagctgttatgagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaat 20105  T
Q  201 gatcgagattatgcttgcttttatttgatatcgttatgtgatgtc 245  Q
    ||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  20104 gattgagatgatgcttg-ttttatttgatattgttatatgatgtc 20061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 17)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 22740758 - 22741000
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22740758 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatattgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagaccta 22740857  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgagatgatgttaaattatattacttgaattatgaatgaat 200  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  22740858 tataagaagttaactgcaatctttgaagttgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattacttgaattatgaatgaat 22740957  T
Q  201 gatcgagattatgcttgcttttatttgatatcgttatgtgatgtc 245  Q
    |||  ||||  || ||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  22740958 gattaagatgttg-ttgttttta-ttgatatcgttatgtgatgtc 22741000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 23038356 - 23038112
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  23038356 cgcctcgtgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaattgcgatctgtgtcgcatgatttgattagagatggacccttgggtagtattgagaccta 23038257  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgagatgatgttaaattatattacttgaattatgaatgaat 200  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  23038256 tataagaagttatctgcaatctgtgaagctcttatgagatgttagtgttaaatatgatgtgatataatgtttaattgaattacttgaattatgaatgaat 23038157  T
Q  201 gatcgagattatgcttgcttttatttgatatcgttatgtgatgtc 245  Q
    ||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  23038156 gattgagatgttgcttgtttttatttgatatcgttatatgatgtc 23038112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 22758513 - 22758721
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22758513 cgcctcgtgagcactttcagaactgagtgcaagtgaggatattgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagaccta 22758612  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgagatgatgttaaattatattacttgaattatgaatgaat 200  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  22758613 tataagaaattaactgcaatctatgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattacttgaattatgaatgaat 22758712  T
Q  201 gatcgagat 209  Q
    ||| |||||    
T  22758713 gattgagat 22758721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Original strand, 22798924 - 22799095
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22798924 cgcctcgcgagcacttccagaactaagtgcaagttaggatattgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgaccta 22799023  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgagatgatgtta 172  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  22799024 tataagaagttaactgcaatttgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataatgtta 22799095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 40622006 - 40622165
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40622006 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatattgcgatctgtttcgcatattttgtttagagatggacccttgggtagtaatgagaccta 40622105  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgt 160  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  40622106 tataagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgagatgtttgtgttgattatgatgt 40622165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 23019504 - 23019665
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23019504 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtcaggatattgcgatctgtgtcgcataatttaattagagttggacccttgggtagtaatgtgaccta 23019603  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtga 162  Q
    ||||||||||||  | |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23019604 tataagaagttatttgcaatttgtgaagcttttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtga 23019665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 60 - 209
Target Start/End: Original strand, 23103253 - 23103402
Alignment:
Q  60 aatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgacctatataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  23103253 aatttgattagagatggaccctttggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgagatgttagtgttggatttgatg 23103352  T
Q  160 tgagatgatgttaaattatattacttgaattatgaatgaatgatcgagat 209  Q
    ||| || ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  23103353 tgatataatgtttaattgcatgacttgaattatgaatgaatgattgagat 23103402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 45677953 - 45678078
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  45677953 cgcctcgtgagcacttccagaactgagtgcaattgagaatgttgtgatctgtgtcgcatgagttgattagggatggactcttaggtagtaatgtgaccta 45678052  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtga 126  Q
    |||| || ||||| | ||||||||||    
T  45678053 tataggatgttaattgcaatctgtga 45678078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 21918114 - 21918250
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||    
T  21918114 cgcctcgcgagcacttccagaactgaatgcaagttaggatgttgcgatctgtttcgcataaattgattatggttggacccttaggtagtaatgtgaccta 21918213  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatga 137  Q
    | ||||| |||||||  |||||||||||||| |||||    
T  21918214 tttaagatgttaactgaaatctgtgaagctgctatga 21918250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 24673897 - 24673650
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || ||||| | ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||  ||||||||||||||||    
T  24673897 cgcctcgcgagcacttccacaactgaatgcaagttaggatgttgcgatctgtgtcgcataaattgattagggttggactcttaagtagtaatgtgaccta 24673798  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgagatgatgttaaattatattacttgaa----ttatgaat 196  Q
    |||| || ||||| | | |||||||||||| |||||| ||||||| | ||| |||  |||||  | ||| | ||||  ||||||||||    | ||||||    
T  24673797 tataggatgttaattgcgatctgtgaagctattatgaaatgttaa-gctgattatactgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatgttaatgaat 24673699  T
Q  197 gaatgatcgagattatgcttgcttttatttgatatcgttatgtgatgtc 245  Q
    ||||||| ||| | || ||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  24673698 gaatgattgagttgatacttgcttctatttgatatctttatatgatgtc 24673650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 22811710 - 22811845
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||| ||||||| |  ||||| |||||||| | |||||| || |||||||||||||||||    
T  22811710 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagttaggatgttgcgatctgtttt-cataaattgattagtgttggacctttaggtagtaatgtgaccta 22811808  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatga 137  Q
    | ||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||    
T  22811809 tttaagatgttaagtgaaatctgtgaagctgctatga 22811845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 25963515 - 25963647
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||| | || || ||| ||||||| || ||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||    
T  25963515 cgcctcgcgagcacttccagaattgaatgcaagttagtatgttgcgatctgtttctcataagttgattagggttggacccttaggtagtaatgtgaccta 25963614  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgtt 133  Q
    | ||||| ||||| |  ||||||||||||||||    
T  25963615 tttaagatgttaattgaaatctgtgaagctgtt 25963647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 37524985 - 37524850
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| | || || ||| ||||||| || ||||| |||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||    
T  37524985 cgcctcgcgagcacttccagaactgaatgcaagttagtatgttgcgatctgtttcacataagttgattaaggttggacccttaggtagtaatgtgaccta 37524886  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatga 137  Q
    | ||||| ||||| |  | |||||||||||| |||||    
T  37524885 t-taagatgttaattgaagtctgtgaagctgctatga 37524850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 40428783 - 40428646
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaacc-gagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgacct 99  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||  ||||| || | |||| ||| || | || | |||| |||  ||||| | | |||||||||||||||||    
T  40428783 cgcctcgcgagcacttccagaaactgagtgcttttgagaatgtcgtgacctgagttgaatgaattgagtaggaatggaacttagggtagtaatgtgacct 40428684  T
Q  100 atataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatga 137  Q
    || ||||| |||||||   |||||||||||||||||||    
T  40428683 atttaagatgttaactgagatctgtgaagctgttatga 40428646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Original strand, 23101028 - 23101092
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttg 65  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  23101028 cgcctcgcgagcacttccaaaactgagtgcaagtgaggataatgcgatctatgtcgcatgatttg 23101092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 24716329 - 24716461
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || ||| || ||| || || | | ||||||||  ||||| | || ||||||| || ||||||    
T  24716329 cgcctcgcgagcacttctagagccgagtgcaattgagaatgttgagacctgagttgcttgaattgattaggaatggaactttaggtagtagtgagaccta 24716428  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgtt 133  Q
    | ||||| |||||||  || |||||| ||||||    
T  24716429 tttaagatgttaactgaaacctgtgaggctgtt 24716461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 110 - 151
Target Start/End: Original strand, 32451835 - 32451876
Alignment:
Q  110 ttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttga 151  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32451835 ttaattacaatttgtgaagctgttatgggatgttaatgttga 32451876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 153; Significance: 4e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 65591 - 65834
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  65591 cgcctcgtgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatattgcgatctttgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagaccta 65690  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgagatgatgttaaattatattacttgaattatgaatgaat 200  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||  |||| |||||||||||||||||    
T  65691 tataagaagttaactgcaacctgtgatcctgttatgagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattaattgaattatgaatgaat 65790  T
Q  201 gatcgagattatgcttgcttttatttgatatcgttatgtgatgtc 245  Q
    ||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||    
T  65791 gattgagatgatgcttg-ttttatttgatatccttatatgatgtc 65834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 53872 - 53833
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggat 40  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  53872 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcatttgaggat 53833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 153; Significance: 4e-81; HSPs: 18)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 25641981 - 25642223
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25641981 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatattgcgaactgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagaccta 25642080  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgagatgatgttaaattatattacttgaattatgaatgaat 200  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  25642081 tataagaagttaactgcaatctttgaagttgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattacttgaattatgaatgaat 25642180  T
Q  201 gatcgagattatgcttgcttttatttgatatcgttatgtgatgtc 245  Q
    |||  ||||  || ||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  25642181 gattaagatgttg-ttgttttta-ttgatatcgttatgtgatgtc 25642223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 19863301 - 19863059
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19863301 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtaaggatattgcgatctgtgtcacatcatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagaccta 19863202  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgagatgatgttaaattatattacttgaattatgaatgaat 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||| | ||||  |||||||||| |||||||||||    
T  19863201 tataagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgagatgttagtgttgaatgtgatgtgatataatgattaattgcattacttgaaatatgaatgaat 19863102  T
Q  201 gatcgagattatgcttgcttttatttgatatcgttatgtgatgtc 245  Q
    ||| |||||  ||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  19863101 gattgagatgttgc-tgttttta-ttgatatcgttatgtgatgtc 19863059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 22439123 - 22438880
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || |||    
T  22439123 cgcctcgcgagcacttccacaactgagtgcaagtgagaatattgcgatctgtgtcgcataattcgatttgagatggacccttgggtagtaatgagatcta 22439024  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgagatgatgttaaattatattacttgaattatgaatgaat 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || | ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  22439023 tataagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgagatgttagtgttgattatgatgtgatataaagtttaattacattacttgaattacgaatgaat 22438924  T
Q  201 gatcgagattatgcttgcttttatttgatatcgttatgtgatgtc 245  Q
    |||  |||| || |||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  22438923 gattaagatgatacttgcttttacttgatatcg-tatgtgatgtc 22438880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 19873443 - 19873201
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19873443 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtaaggatattgcgatctgtgtcgcatcattttattagagatggacccttgggtagtaatgagaccta 19873344  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgagatgatgttaaattatattacttgaattatgaatgaat 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||| | ||||  |||||||||| |||||||||||    
T  19873343 tataagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgagatgttagtgttgaatgtgatgtgatataatgattaattgcattacttgaaatatgaatgaat 19873244  T
Q  201 gatcgagattatgcttgcttttatttgatatcgttatgtgatgtc 245  Q
    ||| |||||  ||||   ||||  |||||||||||||||||||||    
T  19873243 gattgagatgttgct--atttttattgatatcgttatgtgatgtc 19873201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 22432573 - 22432330
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22432573 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagttagtatattgcgatctgtgtctcattatttgatttgagatggacccttgggtagtaatgagaccta 22432474  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgagatgatgttaaattatattacttgaattatgaatgaat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| ||  |||| ||||| |||||||||||||  |||||||    
T  22432473 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgtcagtgttgattatgatgtgatatattgtttaattacattacttgaattacaaatgaat 22432374  T
Q  201 gatcgagattatgcttgcttttatttgatatcgttatgtgatgtc 245  Q
    ||| ||||| ||  ||||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  22432373 gattgagatgatatttgcttttacttgatatc-atatgtgatgtc 22432330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 22334689 - 22334898
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||    
T  22334689 cgcctcgcgagcacttccagaactgaatgcaagtgaggatattgcgatctgtgtcgcataatttgattagagttggacccctgggtagcaatgagaccta 22334788  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgagatgatg-ttaaattatattacttgaattatgaatgaa 199  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||| |||| || ||||||  | ||| |||||||  | |||||||||||||||||||    
T  22334789 tataagaagttaactgcaatctgtaaagctgttatgagatataaatggtgaacataatgtgatttaatgattaaattgcactacttgaattatgaatgaa 22334888  T
Q  200 tgatcgagat 209  Q
    |||| |||||    
T  22334889 tgattgagat 22334898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 3 - 245
Target Start/End: Original strand, 15894229 - 15894474
Alignment:
Q  3 cctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgacctata 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |  ||| |  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15894229 cctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgagaactttgcgtcctgtgtcgcataacttgtttagagatggacccttgggtagtaatgtgacctata 15894328  T
Q  103 taagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgagatgatgttaaattatattacttgaa----ttatgaatga 198  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||  | ||| | ||||  ||||||||||    | ||||||||    
T  15894329 taggatgttaactacaatctgtgaagctgttatgaaatgttaa-gttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatgttaatgaatga 15894427  T
Q  199 atgatcgagattatgcttgcttttatttgatatcgttatgtgatgtc 245  Q
    ||||| ||| | ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||    
T  15894428 atgattgagttgatgcttgattttatttgatatctttatatgatgtc 15894474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 18907429 - 18907293
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || ||| |||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18907429 cgcctcgcgagcacttccagaacagagtgcaaatgagaatgttgcgatctgtgtcgcatgaattgattagggatggacccttaggtagtaatgtgaccta 18907330  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatga 137  Q
    | ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  18907329 tttaagatgttaactgcaatatgtgaagctgttatga 18907293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 21739820 - 21739964
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || ||| |||||||||| ||| | ||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  21739820 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtacaattgagaatgttgcgatctgtgtcacatgagttgtttagggatggactcttaggtagtaatgtgaccta 21739919  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaa 145  Q
    |||| || ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21739920 tataggatgttaattgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaa 21739964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 21834688 - 21834820
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||| |||||||    
T  21834688 cgcctcgcgagcacttccagaactgaatgcaagttaggatgttgcgatctgtttcgcataaattgattagggatggacccttcagtagtaatctgaccta 21834787  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgtt 133  Q
    | ||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  21834788 tttaagatgttaactgaaatctgtgaagctgtt 21834820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 16523201 - 16523331
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| | || || ||| ||||||| |||||||| |||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||    
T  16523201 cgcctcgcgagcacttccagaactgaatgcaagttagtatgttgcgatctgtttcgcataaattgattagggttggatccttaggtagtaatgtgaccta 16523300  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctg 131  Q
    | ||||| |||||||   |||||||||||||    
T  16523301 tttaagatgttaactgagatctgtgaagctg 16523331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Original strand, 16924677 - 16924776
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  || || ||||||||||||||  |||||||||   ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  16924677 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgagtttaatgcgatctgtgtcgcatgctttgattaggagtggacccctgggtagtaatgagaccta 16924776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 100
Target Start/End: Original strand, 31164646 - 31164744
Alignment:
Q  2 gcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||  || || || |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  31164646 gcctcgcgagtacttccagaattgagtgcaagtgagtttaatgcgacctgtgtcgcatgttttgattagagatggacccctgggtagtagtgagaccta 31164744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 15041348 - 15041480
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    |||||||| | |||||||||||  |||||||| ||||  ||  | ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  15041348 cgcctcgcaaccacttccagaattgagtgcaagtgagtttaacgcgatctgtatcgcatgttttgattagagatggacccctgggtagtaatgagaccta 15041447  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgtt 133  Q
       | || ||||  |||||||||| ||||||||    
T  15041448 atgatgatgttagatacaatctgtaaagctgtt 15041480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Original strand, 16965108 - 16965199
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaat 92  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||  || |||||||||||||||||  |||||||||   ||||||| |||||||||||    
T  16965108 cgcctcacgagcacttccagaacttagtgcaagtgagtttaatgtgatctgtgtcgcatgctttgattaggagtggacccctgggtagtaat 16965199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 17804504 - 17804465
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggat 40  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  17804504 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcatttgaggat 17804465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 47
Target Start/End: Original strand, 22408110 - 22408150
Alignment:
Q  7 gcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtga 47  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  22408110 gcgagcacttccagaactgagtgcaattgagaatgttgtga 22408150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Original strand, 22429829 - 22429865
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgag 37  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  22429829 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcatttgag 22429865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 22)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 3 - 245
Target Start/End: Original strand, 23501145 - 23501391
Alignment:
Q  3 cctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgacctata 102  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||| || ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23501145 cctcgcgagcacttccagaactgagtgaaagtgagaatgttgcgatctgtgtcgtataagttgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctata 23501244  T
Q  103 taagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgagatgatgttaaattatattacttgaa----ttatgaatga 198  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||    | ||||||||    
T  23501245 taagaagttaattgcaatctgtgaagctgttatgaattgttaatgttgaatatgatgtgagatgatgtttaattgcattacttgaaatgttaatgaatga 23501344  T
Q  199 atgatcgagattatgcttgcttttatttgatatcgttatgtgatgtc 245  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23501345 atgattgagatgatgcttgcttttatttgatatcgttatatgatgtc 23501391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 23201690 - 23201441
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttggg-tagtaatgtgacct 99  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  23201690 cgcctcgcgagcacttttagaactgagtgcaagtgaggatattgcgatctgtgtcgcataatttgtttagagatggacccttggggtagtaatgagacct 23201591  T
Q  100 atataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgagatgatgttaaattatattacttgaa----ttatgaa 195  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||    | |||||    
T  23201590 atagaagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgaattgttaatgttgaatatgacgtgagatgatgtttaattgcattacttgaaatgttaatgaa 23201491  T
Q  196 tgaatgatcgagattatgcttgcttttatttgatatcgttatgtgatgtc 245  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23201490 tgaatgattgagatgatgcttgcttttatttgatatcgttatatgatgtc 23201441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 37724225 - 37724017
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  37724225 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggagattgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttcggtagtattgagaccta 37724126  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgagatgatgttaaattatattacttgaattatgaatgaat 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  37724125 tataagaagttaactgcaatctgtgaagctgttttgagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaat 37724026  T
Q  201 gatcgagat 209  Q
    ||| |||||    
T  37724025 gattgagat 37724017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 14079469 - 14079230
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14079469 cgcctcgcgagcacttctagaactgagtgcaagtgaggatgttgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgaccta 14079370  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgagatgatgttaaattatattacttgaattatgaatgaat 200  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||| | ||||  ||||||||| |||||||||| |    
T  14079369 tttaagaagttaactgcaatctgtgaagctcttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatttaatgattaattgcattacttgagttatgaatgagt 14079270  T
Q  201 gatcgagattatgcttgcttttatttgatatcgttatgtgatgtc 245  Q
    ||| || ||      |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14079269 gattgaaat-----gtgcttttaattgatatcgttatgtgatgtc 14079230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 21873570 - 21873399
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21873570 cgcctcgcgagcacttacagaactgagtgcaagttaggatattgagatctgtgtcgcataatttgattagagatgaacccttgggtagtaatgtgaccta 21873471  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgagatgatgtta 172  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  21873470 tataagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataatgtta 21873399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 23512428 - 23512187
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||    
T  23512428 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcatgttaggatgttgcgatctgtgtcgcataatttgattagaggtggacccttgggtagtattatgaccta 23512329  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgagatgatgttaaattatattacttgaa-----ttatgaa 195  Q
    ||||||||||| ||| |||||| ||||| | |||| | |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||  ||||||||||     | |||||    
T  23512328 tataagaagtttactgcaatctttgaagatcttataaaatgttaatgttgaatatgatgtaatatgatgtttaattgcattacttgaaaatgttaatgaa 23512229  T
Q  196 tgaatgatcgagattatgcttgcttttatttgatatcgttat 237  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  23512228 tgaatgattgagatgatgcttgcttttatttgatatctttat 23512187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 26704387 - 26704228
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  26704387 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtaaggaaaatgtgatctgtgtcgcatgatttgattagggatggacccttgggtagtaatgagacata 26704288  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgt 160  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  26704287 tataagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgagatgttagtgttgaatataatgt 26704228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 26974120 - 26973961
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  26974120 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtaaggaaaatgtgatctgtgtcgcatgatttgattagggatggacccttgggtagtaatgagacata 26974021  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgt 160  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  26974020 tataagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgagatgttagtgttgaatataatgt 26973961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 22032637 - 22032478
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || ||||||| ||||| || | | |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  22032637 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgagaatgttgtgatatgtgttgcttgaattgattagagatggacccttaggtagtaatgagaccta 22032538  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgt 160  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||    
T  22032537 tataagaagttaactgcaatctgtgaagctgatacgagatgtttgtgttgaatatgatgt 22032478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 5 - 160
Target Start/End: Original strand, 18769806 - 18769961
Alignment:
Q  5 tcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgacctatata 104  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||| |||| || | ||||||||||| || | | |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  18769806 tcgcgagcacttccagaactgagcgcaagtgagaatgtagtgatctgtgttgcttgaattgattagggatggacccttaggtagtaatgagacctatata 18769905  T
Q  105 agaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgt 160  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  18769906 agaagttaactgcaatctgtgaagctgatatgagatgtttgtgttgaatatgatgt 18769961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 23572400 - 23572241
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| || |||||||||  || || | | |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  23572400 cgcctcgcgcgcacttccagaactgagtgcaagtgagaatgttgtgatctaagttgcttgaattgattagggatggacccttaggtagtaatgagaccta 23572301  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgt 160  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||   ||||| ||||||||    
T  23572300 tataagaagttaactgcaatttgtgaagttgatatgagatgtttgagttgattatgatgt 23572241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 21366464 - 21366600
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| | || || ||| ||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||    
T  21366464 cgcctcgcgagcacttccagaactgaatgcaagttagtatgttgcgatctgtttcgcataaattgattagggttggacccttaggtagtaatgtgaccta 21366563  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatga 137  Q
    | ||||| |||||||   ||||||||||||| |||||    
T  21366564 tttaagatgttaactgagatctgtgaagctgctatga 21366600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 20805868 - 20805736
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || ||||| | ||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||    
T  20805868 cgcctcgcgagcacttctagaactgaatgcaaattaggatgttgcgatctgtgtcgcacaaattgattagggtttgacccttaggtagtaatgtgaccta 20805769  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgtt 133  Q
    | ||||| |||||||  ||||||||| ||||||    
T  20805768 tttaagatgttaactgaaatctgtgaggctgtt 20805736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 23451664 - 23451532
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| || ||| || ||| || |  | | ||||||||  ||||| | || ||||||| || ||||||    
T  23451664 cgcctcgcaagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgagacctgagttgtttgaattgattaggaatggaactttaggtagtagtgagaccta 23451565  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgtt 133  Q
    | ||||| |||||||  ||||||||| ||||||    
T  23451564 tttaagatgttaactgaaatctgtgaggctgtt 23451532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 23463169 - 23463037
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| || ||| || ||| || |  | | ||||||||  ||||| | || ||||||| || ||||||    
T  23463169 cgcctcgcaagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgagacctgagttgtttgaattgattaggaatggaactttaggtagtagtgagaccta 23463070  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgtt 133  Q
    | ||||| |||||||  ||||||||| ||||||    
T  23463069 tttaagatgttaactgaaatctgtgaggctgtt 23463037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 17410754 - 17410715
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggat 40  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  17410754 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcacttgaggat 17410715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 18356634 - 18356595
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggat 40  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  18356634 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcatttgaggat 18356595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Original strand, 20910599 - 20910638
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggat 40  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  20910599 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcatttgaggat 20910638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 179 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 26704220 - 26704156
Alignment:
Q  179 attacttgaattatgaatgaatgatcgagattatgcttgcttttatttgatatcgttatgtgatgtc 245  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||   ||||||||||||||||||| |||||||    
T  26704220 attacttgaactatgaatgaatgattgagatgctgctg--ttttatttgatatcgttatatgatgtc 26704156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 179 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 26973953 - 26973889
Alignment:
Q  179 attacttgaattatgaatgaatgatcgagattatgcttgcttttatttgatatcgttatgtgatgtc 245  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||   ||||||||||||||||||| |||||||    
T  26973953 attacttgaactatgaatgaatgattgagatgctgctg--ttttatttgatatcgttatatgatgtc 26973889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 84 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 20767207 - 20767158
Alignment:
Q  84 ggtagtaatgtgacctatataagaagttaactacaatctgtgaagctgtt 133  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||| ||||||    
T  20767207 ggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaggctgtt 20767158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 109 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 24529436 - 24529372
Alignment:
Q  109 gttaactacaatctgtgaagctgtt-atgagatgttaatgttgaatatgatgtgagatgatgtta 172  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||    
T  24529436 gttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgtta 24529372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 1661 - 1430
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  1661 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatattgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtattgagaccta 1562  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgagatgatgttaaattatattacttgaattatgaatgaat 200  Q
    ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||| | ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  1561 tataagaagttaaatgcaatctacgaagctgttattagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattacttgaattatgaatgaat 1462  T
Q  201 gatcgagattatgcttgcttttatttgatatcgtt 235  Q
    ||| |||   ||| |||||||||||||||||||||    
T  1461 gattgag---atgattgcttttatttgatatcgtt 1430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 144; Significance: 8e-76; HSPs: 3)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 14993 - 14745
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||||    
T  14993 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgccagtgaggatactgcaatctgtgtcgcataatttgattagagatggactcctgggtagtaatgaaaccta 14894  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgagatgatgttaaattatattacttgaa----ttatgaat 196  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||    | ||||||    
T  14893 tacaagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtaagatgatgtttaattgcattacttgaaatgttaatgaat 14794  T
Q  197 gaatgatcgagattatgcttgcttttatttgatatcgttatgtgatgtc 245  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  14793 gaatgattgagatgatgcttgcttttatttgatatctttatatgatgtc 14745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 24008 - 23760
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||  |||||    
T  24008 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgccagtgaggatactgcaatctgtgtcgcataatttgataagagatggacacctgggtagtaatgaaaccta 23909  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgagatgatgttaaattatattacttgaa----ttatgaat 196  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||    | ||||||    
T  23908 tacaagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtaagatgatgtttaattgcattacttgaaatgttaatgaat 23809  T
Q  197 gaatgatcgagattatgcttgcttttatttgatatcgttatgtgatgtc 245  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  23808 gaatgattgagatgatgcttgcttttatttgatatctttatatgatgtc 23760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 39432 - 39184
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||  |||||    
T  39432 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgccagtgaggatactgcaatctgtgtcgcataatttgataagagatggacacctgggtagtaatgaaaccta 39333  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgagatgatgttaaattatattacttgaa----ttatgaat 196  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||    | ||||||    
T  39332 tacaagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtaagatgatgtttaattgcattacttgaaatgttaatgaat 39233  T
Q  197 gaatgatcgagattatgcttgcttttatttgatatcgttatgtgatgtc 245  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  39232 gaatgattgagatgatgcttgcttttatttgatatctttatatgatgtc 39184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0671 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0671
Description:

Target: scaffold0671; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 3 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 6422 - 6176
Alignment:
Q  3 cctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgacctata 102  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |  |||||||    
T  6422 cctcgcgagcacttccagaactgtgtgcaagtgaggatgttgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggatccctgggtagtaaagaaacctata 6323  T
Q  103 taagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgagatgatgttaaattatattacttgaa----ttatgaatga 198  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| ||||||    | ||||||||    
T  6322 caagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtaagatgatgtttaattgcatttcttgaaatgttaatgaatga 6223  T
Q  199 atgatcgagattatgcttgcttttatttgatatcgttatgtgatgtc 245  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  6222 atgattgagatgatgcttgcttttatttgatatctttatatgatgtc 6176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0174
Description:

Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 18251 - 18483
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18251 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatattgcgatttgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgaccta 18350  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgagatgatgttaaattatattacttgaattatgaatgaat 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | | |   ||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  18351 tttaagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatttaacgaataattgcattacttgagttatgaatgaat 18450  T
Q  201 gatcgagattatgcttgcttttatttgatatcgttatg 238  Q
    ||| || ||      |||||||||||||||||||||||    
T  18451 gattgaaat-----gtgcttttatttgatatcgttatg 18483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 36779 - 36535
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| | |  |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  36779 cgcctcgcgagcacttctagaactgagtgcaagtgaggaaaatacgatctgtgtcgcatgatttgtttagagaaggacccttgggtagtaatgagaccta 36680  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgagatgatgttaaattatattacttgaattatgaatgaat 200  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||  |||||||||| |||||||||||    
T  36679 tttaagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaactatgaatgaat 36580  T
Q  201 gatcgagattatgcttgcttttatttgatatcgttatgtgatgtc 245  Q
    ||| |||||  ||| || || |||||||||||||||| |||||||    
T  36579 gattgagatgttgcgtgtttatatttgatatcgttatatgatgtc 36535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 4731 - 4979
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| | | |||||||    
T  4731 cgcctcgcgagcatttccaaaaccgagtgcaattgaggacattgcgatttgtgtcgcataatttgatcagaggtggactcttgggtagcattatgaccta 4830  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgagatgatgttaaattatattacttgaa----ttatgaat 196  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| | |   | ||||||||    | ||||||    
T  4831 tataagaagtttactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtaagatgatgtttattggcaatacttgaaatgttaatgaat 4930  T
Q  197 gaatgatcgagattatgcttgcttttatttgatatcgttatgtgatgtc 245  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  4931 gaatgattgagatgatgcttgcttttatttgatatccttatatgatgtc 4979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 3 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 175086 - 174880
Alignment:
Q  3 cctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgacctata 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  175086 cctcgcgagcacttccagaaccgagtccaagtgaggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttgattagagatggaccctttggtagtaatgagacctata 174987  T
Q  103 taagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgagatgatgttaaattatattacttgaattatgaatgaatga 202  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  174986 taagaagttaactgaaatctgtgaagctattatgagatgttagtgttgaatatgacgtgatataatgtttagttgcattacttgaattatgaatgaatga 174887  T
Q  203 tcgagat 209  Q
    | |||||    
T  174886 ttgagat 174880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 124; Significance: 7e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 4062 - 3823
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4062 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatgttgcgatctgtatcgcata-tttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 3964  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgagatgatgttaaattatattacttgaattatgaatgaat 200  Q
    |||||||  |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||  | ||| | ||||  ||||||||| |||||||| | |    
T  3963 tataagatattaattgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgagttatgaataagt 3864  T
Q  201 gatcgagattatgcttgcttttatttgatatcgttatgtgatgtc 245  Q
    ||| |||||     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3863 gattgagat----gttgcttttatttgatatcgttatgtgatgtc 3823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 8493 - 8254
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8493 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatgttgcgatctgtatcgcata-tttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 8395  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgagatgatgttaaattatattacttgaattatgaatgaat 200  Q
    |||||||  |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||  | ||| | ||||  ||||||||| |||||||| | |    
T  8394 tataagatattaattgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgagttatgaataagt 8295  T
Q  201 gatcgagattatgcttgcttttatttgatatcgttatgtgatgtc 245  Q
    ||| |||||     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8294 gattgagat----gttgcttttatttgatatcgttatgtgatgtc 8254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 124; Significance: 7e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Original strand, 16147 - 16318
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  16147 cgcctcgcgagcacttccagaattgagtgcaagtgaggttgttgcgatctgtgtcgcataatttgattagaggtggacccttgggtagtaatatgaccta 16246  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgagatgatgtta 172  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  16247 tataagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataatgtta 16318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 903 - 661
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  903 cgcctcgtgagcacttccagaactgagtgtaaatgaggatattgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttcggtagtaatgagaccta 804  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgagatgatg-ttaaattatattacttgaattatgaatgaa 199  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||  | ||| |||||||  | |||||||||||| ||||||    
T  803 tttaagaagttaactgcaatctgtgaagctgttacgtgatgttaatgttgaatatgatgcgatttaatgattaaattgcactacttgaattataaatgaa 704  T
Q  200 tgatcgagattatgcttgcttttatttgatatcgttatgtgatgtc 245  Q
    |||| |||||  || |||  |||||||||||| ||||||| |||||    
T  703 tgattgagatgttg-ttg--tttatttgatattgttatgtaatgtc 661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1895 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold1895
Description:

Target: scaffold1895; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 172
Target Start/End: Original strand, 1031 - 1196
Alignment:
Q  7 gcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgacctatataag 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  1031 gcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatattgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggatccttgggtagtaatatgacctatataag 1130  T
Q  107 aagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgagatgatgtta 172  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  1131 aagttaactgcaatcagtgaagctgttatgaaatattaatgttgaatatgatgtgatataatgtta 1196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 32755 - 32516
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||||     
T  32755 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatatcgcgatctgtgtcgcataatttgtttagagttggacccctgggtagtaaagtgacct- 32657  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgagatgatgttaaattatattacttgaattatgaatgaat 200  Q
    | ||| | ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||  | ||| | ||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  32656 tttaaaatgttaattgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgagttatgaatgaat 32557  T
Q  201 gatcgagattatgcttgcttttatttgatatcgttatgtgatgtc 245  Q
    ||| |||||     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32556 gattgagat----gttgcttttatttgatatcgttatgtgatgtc 32516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 48258 - 48461
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48258 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtaagaatattgcgatctgtgtcacataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagaccta 48357  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgagatgat-gttaaattatattacttgaattatgaatgaa 199  Q
    ||||||||||||| | |||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||  | ||  |||||||  |  ||||||||||||||||||    
T  48358 tataagaagttaaatgcaatatgtgaagctgttgtgtgatgttaaagttgaatatgacgtgatttaataattaaattgcaccacttgaattatgaatgaa 48457  T
Q  200 tgat 203  Q
    ||||    
T  48458 tgat 48461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 7 - 162
Target Start/End: Original strand, 38283 - 38438
Alignment:
Q  7 gcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgacctatataag 106  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38283 gcgagcacttccagaactaagtgcaagtgagaactttgcgatctgtgtcgcataatttgattagagttggacccttgggtagtaatgtgacctatataag 38382  T
Q  107 aagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtga 162  Q
    ||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38383 aagttagttgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtga 38438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 23465 - 23625
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |  ||| ||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  23465 cgcctcgcgagcacttctagaactgagtgcaagtgagaactttgcgatctttgtcgcataatttgattaatgttggacccttgggtagtaatgtgaccta 23564  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtga 162  Q
    || |||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23565 ta-aagaagttagttgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtga 23625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 34708 - 34954
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | |||| || || |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34708 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgagaacattgcgacctttgtcacataacttgtttagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 34807  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgagatgatgttaaattatattacttgaa----ttatgaat 196  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||| ||||||  | ||| | ||||  ||||||||||    | ||||||    
T  34808 tataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaattgttaa-gttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatgttaatgaat 34906  T
Q  197 gaatgatcgagattatgcttgcttttatttgatatcgttatgtgatgt 244  Q
    ||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  34907 gaatgattgagttgatgcttgattttatttgatatctttatatgatgt 34954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 99; Significance: 6e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 27143 - 26985
Alignment:
Q  2 gcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgacctat 101  Q
    ||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  27143 gcctcgcaagcatttccagaactgagtgcaagtgaggatattgcgatctgtttcgaatattttgtttagagatggacccttgggtagtaatgagacatat 27044  T
Q  102 ataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgt 160  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  27043 ataagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgagatgtttgtgttgattatgatgt 26985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 99; Significance: 6e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 209
Target Start/End: Original strand, 46527 - 46732
Alignment:
Q  3 cctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgacctata 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  46527 cctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagttaggatgttgcgatctgtgtcgcataaattgattagggatggactcttaggtagtaatgtgacctata 46626  T
Q  103 taagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgagatgatgttaaattatattacttgaattatgaatgaatga 202  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||| ||||||  | ||| | ||||  |||||||||| ||| | |||||||    
T  46627 taagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgctaa-gttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatga 46725  T
Q  203 tcgagat 209  Q
    || ||||    
T  46726 tcaagat 46732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311 (Bit Score: 97; Significance: 9e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0311
Description:

Target: scaffold0311; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 6876 - 7020
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  6876 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaattgagaatgttgcgatctgtgtcgcatgagttgattagggatgggcccttaggtagtaatgtgaccta 6975  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaa 145  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6976 tataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaa 7020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 72 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 24094 - 23924
Alignment:
Q  72 gatggacccttgggtagtaatgtgacctatataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgagatgatgtt 171  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  24094 gatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctgttaagagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgtt 23995  T
Q  172 aaattatattacttgaattatgaatgaatgatcgagattatgcttgcttttatttgatatcgttatgtgatgtc 245  Q
     ||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||   ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  23994 -aatttcattacttgaactatgaatgaatgattgagatgttgct--gttttatttgatattgttatatgatgtc 23924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 21604 - 21763
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || ||||||||||||| || | | ||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  21604 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgagaatgttgtgatctgtgttgcttgaattggttagggatggacccttaggtagtaatgagaccta 21703  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgt 160  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||    
T  21704 tataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgagatgtttgtgttgattaagatgt 21763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 29496 - 29655
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || ||||||||||||| || | | ||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  29496 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgagaatgttgtgatctgtgttgcttgaattggttagggatggacccttaggtagtaatgagaccta 29595  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgt 160  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||    
T  29596 tataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgagatgtttgtgttgattaagatgt 29655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 2197 - 2038
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| || || |||||||||| || | | |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  2197 cgcctcgcgagcacttcgagaactgagtgcaagtgagaatgttatgatctgtgttgcttgaattgattagggatggacccttaggtagtaatgagaccta 2098  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgt 160  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||   |||| |||||||||    
T  2097 tataagaagttaactgcaatctgtgaagctgatatgagatgtttgcgttggatatgatgt 2038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 3160 - 2913
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||   ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  3160 cgcctcgcgagcacttccagaactgaatgcaagataggatgttgtgatctgtgtcgcataaattgattagggttggactcttaggtagtagtgtgaccta 3061  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgagatgatgttaaattatattacttgaa----ttatgaat 196  Q
    |||| || ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||| ||||||  | ||| | ||||  ||||||||||    | ||||||    
T  3060 tataggatgttaattgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaa-gctgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatgttaatgaat 2962  T
Q  197 gaatgatcgagattatgcttgcttttatttgatatcgttatgtgatgtc 245  Q
    ||||||| ||| | || ||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  2961 gaatgattgagttgatacttgcttctatttgatatctttatatgatgtc 2913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 6826 - 6579
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||   ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  6826 cgcctcgcgagcacttccagaactgaatgcaagataggatgttgtgatctgtgtcgcataaattgattagggttggactcttaggtagtagtgtgaccta 6727  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgagatgatgttaaattatattacttgaa----ttatgaat 196  Q
    |||| || ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||| ||||||  | ||| | ||||  ||||||||||    | ||||||    
T  6726 tataggatgttaattgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaa-gctgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatgttaatgaat 6628  T
Q  197 gaatgatcgagattatgcttgcttttatttgatatcgttatgtgatgtc 245  Q
    ||||||| ||| | || ||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  6627 gaatgattgagttgatacttgcttctatttgatatctttatatgatgtc 6579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 13875 - 14122
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |  ||| || ||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  13875 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgagaactttgcgacctgtgtcgcataacttatttagagaaggacccttgggtagtaaaatgaccta 13974  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgagatgatgttaaattatattacttgaa----ttatgaat 196  Q
    |||| || |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||  | ||| | ||||  ||||||||||    | ||||||    
T  13975 tataggatgttaactgaaatctgtgaagctgttatgaaatgttaa-gttgattataatgtgatttaatgattaattgaattacttgaaatgttaatgaat 14073  T
Q  197 gaatgatcgagattatgcttgcttttatttgatatcgttatgtgatgtc 245  Q
    ||||||| ||| | ||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||    
T  14074 gaatgattgagttgatgcttgatttaatttgatatctttatatgatgtc 14122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 18454 - 18661
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || | ||| ||||||| || | | |||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  18454 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgagaatgtcgtgttctgtgttgcttcaattgatttgggatggacccttaggtagtaatgagaccta 18553  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgagatgatgttaaattatattacttgaattatgaatgaat 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||| ||||||  | ||| | ||||  |||||||||| ||| | |||||    
T  18554 tataagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatggt-atgttgattataatgtgatttaatgattaattccattacttgaaatattattgaat 18652  T
Q  201 gatcgagat 209  Q
    |||| ||||    
T  18653 gatcaagat 18661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 77; Significance: 8e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 21367 - 21574
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21367 cgcctcgcgagcacttccagaactgaatgcaagttaggatgttgcgatctgtttcgcataaattgattagggatggacccttaggtagtaatgtgaccta 21466  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgagatgatgttaaattatattacttgaattatgaatgaat 200  Q
    | ||||| |||||||  ||| |||||||||| |||||  |||||| | ||| ||| ||||||  | ||| | |||| ||||||||||| ||| | |||||    
T  21467 tttaagatgttaactgaaatttgtgaagctgctatgaactgttaa-gctgattataatgtgatttaatgattaattgtattacttgaaatattattgaat 21565  T
Q  201 gatcgagat 209  Q
    |||| ||||    
T  21566 gatcaagat 21574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0615
Description:

Target: scaffold0615; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 1882 - 2018
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||| | | |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||    
T  1882 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaaatgagaatgttgtgatctgtgtcgcatgaatcgattagggttggacccttaggtagtaatgtgaccta 1981  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatga 137  Q
    | |||||  ||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  1982 tttaagatattaactgaaatatgtgaagctgttatga 2018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0425 (Bit Score: 72; Significance: 8e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0425
Description:

Target: scaffold0425; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 476 - 318
Alignment:
Q  3 cctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgacctata 102  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||||| | ||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||      
T  476 cctcgcaagcacttctagaactgagtgcaagttaggatatttggatctgtgtcgcataaattgattagggatggacccttaggtagtaatgtgacctaat 377  T
Q  103 taagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtga 162  Q
    ||||| ||||||   ||||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||| ||||||    
T  376 taagatgttaacggaaatctgtgaagctgttatgaactgttaa-gttgattataatgtga 318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 72; Significance: 8e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 7611 - 7452
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| || | ||||| ||| | || | | |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  7611 cgcctcgcgagcacttccaaaactgagtgcaagtgagaatgtagtgatttgtattgcttgaattgattagggatggacccttaggtagtaatgagaccta 7512  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgt 160  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||   ||||||||||||||    
T  7511 tataagaagttaactgcaatctatgaaactgatatgagatgtttgcgttgaatatgatgt 7452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 72; Significance: 8e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 13079 - 12920
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || ||||||| || || || | | |||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  13079 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaaatgagaatgttgtgatatgagttgcttgaattgattatggatggacccttaggtagtaatgagaccta 12980  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgt 160  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||   ||||| ||||||||    
T  12979 tataagaagttaactgcaatttgtgaagctaatatgagatgttggagttgattatgatgt 12920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0412
Description:

Target: scaffold0412; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 6214 - 6346
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||    
T  6214 cgcctcgcgagcacttccagaactgaatgcaagttaggatattgcgatttgtttcgcataagttgattagggttggacccttaggtagtaatgtgaccta 6313  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgtt 133  Q
    | ||||| |||||||  ||| ||||||||||||    
T  6314 tttaagatgttaactgaaatatgtgaagctgtt 6346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 15722 - 15642
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggaccct 81  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15722 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatattgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggaccct 15642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 6107 - 6251
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||| ||| ||  |||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||    
T  6107 cgcctcgcgagcacttccagaattgaatgcaagtgaggatgttgcgacttgtgtcgcataacttgattagagatggacccctaagtagtaatgtgatcta 6206  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaa 145  Q
    | || || ||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||    
T  6207 tttaggatgttaaatgcaatctgtgaagctattatgaaatgttaa 6251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 1811 - 1675
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| | || || ||| ||||||| | |||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||    
T  1811 cgcctcgcgagcacttccagaactgaatgcaagttagtatgttgcgatctgttttgcataaattgattagggttggacccttaggtagtaatgtgaccta 1712  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatga 137  Q
    | ||||| |||||||   ||||||||||||| |||||    
T  1711 tttaagatgttaactgagatctgtgaagctgctatga 1675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 1214 - 1082
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || ||||| | ||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||    
T  1214 cgcctcgcgagcacttctagaactgaatgcaaattaggatgttgcgatctgtgtcgcacaaattgattagggttggacccttaagtagtaatgtgaccta 1115  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgtt 133  Q
    | ||||| |||||||  ||||||||| ||||||    
T  1114 tttaagatgttaactgaaatctgtgaggctgtt 1082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 88 - 162
Target Start/End: Original strand, 4690 - 4763
Alignment:
Q  88 gtaatgtgacctatataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtga 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4690 gtaatgtgacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctg-tatgaaatgttaatgttgaatatgatgtga 4763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1296 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold1296
Description:

Target: scaffold1296; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 711 - 582
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||| ||| ||||||| |||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  711 cgcctcgcgagcacttccagaactgaatgcaagttaggatgttgcgatctgtttcgcataagttgatttgggatggacccttaggtagtaatgcgaccta 612  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagct 130  Q
    | ||||| ||||| |   ||||||||||||    
T  611 tttaagatgttaattgagatctgtgaagct 582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 44395 - 44269
Alignment:
Q  4 ctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgacctatat 103  Q
    |||||||||| ||||||||| || ||||| | || || ||| ||||| | |||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  44395 ctcgcgagcatttccagaactgaatgcaagttagtatgttgcgatctttttcgcataagttgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctattt 44296  T
Q  104 aagaagttaactacaatctgtgaagct 130  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||    
T  44295 aagatgttaactgaaatctgtgaagct 44269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 2147 - 2015
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || | ||| |  |||| ||| ||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  2147 cgcctcgcgagcacttccataactgaatacaagttgggatgttgcgatctgtttcgcacaaattgattagagttggacccttagggagtaatgtgaccta 2048  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgtt 133  Q
    | ||||| ||||||   |||||||||| |||||    
T  2047 tttaagatgttaaccgaaatctgtgaaactgtt 2015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 9829 - 9697
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || | ||| |  |||| ||| ||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  9829 cgcctcgcgagcacttccataactgaatacaagttgggatgttgcgatctgtttcgcacaaattgattagagttggacccttagggagtaatgtgaccta 9730  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgtt 133  Q
    | ||||| ||||||   |||||||||| |||||    
T  9729 tttaagatgttaaccgaaatctgtgaaactgtt 9697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 4748 - 4588
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| || |||||| |||||| |  | | ||||||||  ||||| | || ||||||| || ||||||    
T  4748 cgcctcgcgagcacttccagaactgagttcaagtgagaatgttgtgaactgtgttgtttgaattgattaggaatggaactttaggtagtagtgagaccta 4649  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtga 162  Q
    |||||||||||||||  || ||||||| || |||||| ||| ||| ||||| ||| ||||||    
T  4648 tataagaagttaactgtaaactgtgaaactattatgaaatgctaa-gttgattataatgtga 4588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0346
Description:

Target: scaffold0346; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15404 - 15197
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| || || ||| ||| || || | | |||||| |  ||||| | || ||||||| || |||||     
T  15404 cgcctcgcgagcactttcagaactgagtgcatttgagaatgttttgacctgagttgctttaattgatttggaatggaactttaggtagtagtgagacctt 15305  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgagatgatgttaaattatattacttgaattatgaatgaat 200  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||| ||||| ||| ||||||  | ||| | ||||  |||||||||| ||| | |||||    
T  15304 tataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttataaaaagttaa-gttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattgaat 15206  T
Q  201 gatcgagat 209  Q
    |||| ||||    
T  15205 gatcaagat 15197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 19090 - 19226
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || | |||| ||| || |  | | ||||||||  ||||| | || ||||||| || ||||||    
T  19090 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgtcgtgacctgagttgattgaattgattaggaatggaacattaggtagtagtgagaccta 19189  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatga 137  Q
    ||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  19190 tataagatgttaaatgaaatctgtgaagctgttatga 19226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 70 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 42871 - 42804
Alignment:
Q  70 gagatggacccttgggtagtaatgtgacctatataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatga 137  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||   |||||||||||||||||||    
T  42871 gagatggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatctgtgaagctgttatga 42804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 236
Target Start/End: Original strand, 7755 - 7844
Alignment:
Q  151 aatatgatgtgagatgatgttaaattatattacttgaatt----atgaatgaatgatcgagattatgcttgcttttatttgatatcgtta 236  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||| |    |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7755 aatatgatgtgagatgatgattaattgcattacttgaaatgttaatgaatgactgattgagatgatgcttgcttttatttgatatcgtta 7844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 638 - 502
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || | |||| ||| || |  | | ||||||||  ||||| | || ||||||| || ||||||    
T  638 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgtcgtgacctgagttgattgaattgattaggaatggaacattaggtagtagtgagaccta 539  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatga 137  Q
    ||||||| ||||| |  ||||||||||| ||||||||    
T  538 tataagatgttaaatgaaatctgtgaagttgttatga 502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 45425 - 45289
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || | |||| ||| || |  | | ||||||||  ||||| |  | ||||||| || ||||||    
T  45425 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgtcgtgacctgagttgattgaattgattaggaatggaacaataggtagtagtgagaccta 45326  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatga 137  Q
    ||||||| ||||| |  ||||||||||| ||||||||    
T  45325 tataagatgttaaatgaaatctgtgaagttgttatga 45289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 192115 - 192251
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||  ||||| || | |||| ||| || | || |||||| |||  ||||| | | ||||||||||||||||||    
T  192115 cgcctcgtgagcacttccagaattgagtgcttttgagaatgtcgtgacctgagttgaatgatttgagtaggaatggaacttagggtagtaatgtgaccta 192214  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatga 137  Q
    | ||||| |||||||   |||||||||| ||||||||    
T  192215 tttaagatgttaactgagatctgtgaagttgttatga 192251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 514 - 461
Alignment:
Q  84 ggtagtaatgtgacctatataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatga 137  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||   |||||||||||||||||||    
T  514 ggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatctgtgaagctgttatga 461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1326 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1326
Description:

Target: scaffold1326; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 1288 - 1424
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||  || || ||| || || |   |||| |||  ||||| | || | |||||||||||||||    
T  1288 cgcctcgcgagcacttccagaactaagtgcaagtgagaatgatgagacctgagttgcttggattgactaggaatggaactttagttagtaatgtgaccta 1387  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatga 137  Q
    | ||||| |||||||   |||||||||||||||||||    
T  1388 tttaagatgttaactgagatctgtgaagctgttatga 1424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 30543 - 30675
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggatattgtgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgaccta 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| || |||||| ||| || || | | ||||||||  ||||| | || ||||||  || ||||||    
T  30543 cgcctcgcgagcacttacagaactgagtgcatttgagaatgttgtgacctgagttgcttgaattgattaggaatggaactttaggtagttgtgagaccta 30642  T
Q  101 tataagaagttaactacaatctgtgaagctgtt 133  Q
    | ||||| |||||||  ||||||| ||| ||||    
T  30643 tttaagatgttaactgaaatctgtaaagttgtt 30675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Original strand, 18431 - 18470
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggat 40  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  18431 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcatttgaggat 18470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Original strand, 3329 - 3368
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggat 40  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  3329 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcatttgaggat 3368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Original strand, 15217 - 15256
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggat 40  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  15217 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcatttgaggat 15256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 13211 - 13172
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggat 40  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  13211 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcatatgaggat 13172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Original strand, 66214 - 66253
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggat 40  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  66214 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcatttgaggat 66253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Original strand, 228172 - 228211
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggat 40  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  228172 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcatttgaggat 228211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 137
Target Start/End: Original strand, 15090 - 15144
Alignment:
Q  83 gggtagtaatgtgacctatataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatga 137  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||||||   |||||||||||||||||||    
T  15090 gggtagtaatgtgacctacttaagatgttaactgagatctgtgaagctgttatga 15144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 137
Target Start/End: Original strand, 19612 - 19666
Alignment:
Q  83 gggtagtaatgtgacctatataagaagttaactacaatctgtgaagctgttatga 137  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||||||   |||||||||||||||||||    
T  19612 gggtagtaatgtgacctacttaagatgttaactgagatctgtgaagctgttatga 19666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 73 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 7717 - 7656
Alignment:
Q  73 atggacccttgggtagtaatgtgacctatataagaagttaactacaatctgtgaagctgtta 134  Q
    ||||| |||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||    
T  7717 atggaaccttaggtagtaatgaaacctatataagatgttaactggaatctgtgaagttgtta 7656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 30
Target Start/End: Original strand, 2234 - 2263
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgc 30  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2234 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgc 2263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 30
Target Start/End: Original strand, 10094 - 10123
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgc 30  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10094 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgc 10123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 3 - 40
Target Start/End: Original strand, 13288 - 13325
Alignment:
Q  3 cctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggat 40  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  13288 cctcgcgagcacttccagaactgagtgcatttgaggat 13325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 110 - 151
Target Start/End: Original strand, 51790 - 51831
Alignment:
Q  110 ttaactacaatctgtgaagctgttatgagatgttaatgttga 151  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51790 ttaattacaatttgtgaagctgttatgagatattaatgttga 51831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1220 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1220
Description:

Target: scaffold1220; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 2109 - 2073
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgag 37  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  2109 cgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcatttgag 2073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 40
Target Start/End: Original strand, 9467 - 9503
Alignment:
Q  4 ctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgaggat 40  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  9467 ctcgcgagcacttccagaactgagtgcatttgaggat 9503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Original strand, 16919 - 16955
Alignment:
Q  1 cgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgcaattgag 37  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  16919 cgcctcgcgagcacttcaagaaccgagtgcatttgag 16955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University