View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8981_low_271 (Length: 246)

Name: NF8981_low_271
Description: NF8981
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8981_low_271
NF8981_low_271
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (14-229)||(123369-123584)
scaffold0029 (186-228)||(77391-77433)
[»] chr7 (39 HSPs)
chr7 (14-229)||(9582893-9583108)
chr7 (14-229)||(16119849-16120064)
chr7 (14-225)||(23515067-23515278)
chr7 (14-229)||(14551098-14551314)
chr7 (14-229)||(8717865-8718080)
chr7 (14-229)||(13673856-13674071)
chr7 (14-229)||(18593352-18593567)
chr7 (14-229)||(18618117-18618332)
chr7 (21-229)||(4312564-4312772)
chr7 (21-229)||(538755-538964)
chr7 (21-229)||(12567020-12567229)
chr7 (22-229)||(12548805-12549012)
chr7 (21-229)||(8780936-8781146)
chr7 (21-227)||(9003958-9004165)
chr7 (21-229)||(20108375-20108584)
chr7 (22-228)||(48801777-48801983)
chr7 (24-229)||(9264939-9265145)
chr7 (21-229)||(13657873-13658081)
chr7 (21-229)||(11921307-11921512)
chr7 (21-229)||(16532100-16532311)
chr7 (21-229)||(16633351-16633562)
chr7 (21-229)||(16465616-16465821)
chr7 (173-229)||(825783-825839)
chr7 (173-229)||(4461242-4461298)
chr7 (173-229)||(14221718-14221774)
chr7 (173-229)||(15916776-15916832)
chr7 (173-229)||(18287761-18287817)
chr7 (173-229)||(27291496-27291552)
chr7 (166-229)||(15206584-15206647)
chr7 (171-229)||(5397273-5397331)
chr7 (180-229)||(15065935-15065984)
chr7 (176-229)||(9194544-9194597)
chr7 (173-225)||(6713072-6713124)
chr7 (173-228)||(4791383-4791438)
chr7 (173-228)||(15348532-15348587)
chr7 (173-213)||(15522517-15522557)
chr7 (186-228)||(15940731-15940773)
chr7 (21-102)||(15065779-15065858)
chr7 (21-102)||(18287612-18287691)
[»] chr6 (30 HSPs)
chr6 (14-229)||(15699555-15699770)
chr6 (14-229)||(22165549-22165764)
chr6 (14-229)||(22243812-22244027)
chr6 (14-229)||(22061503-22061718)
chr6 (21-229)||(24855245-24855453)
chr6 (14-229)||(22767116-22767331)
chr6 (14-229)||(20170242-20170458)
chr6 (21-229)||(18448140-18448349)
chr6 (21-229)||(23023093-23023302)
chr6 (21-225)||(20107784-20107989)
chr6 (21-229)||(25625691-25625899)
chr6 (24-229)||(2181063-2181269)
chr6 (29-229)||(18854026-18854226)
chr6 (21-229)||(21560554-21560762)
chr6 (21-229)||(25631269-25631477)
chr6 (22-229)||(29595697-29595904)
chr6 (21-229)||(25963248-25963457)
chr6 (21-229)||(25967895-25968104)
chr6 (26-229)||(30671807-30672011)
chr6 (21-149)||(19585622-19585750)
chr6 (15-118)||(20016339-20016443)
chr6 (166-229)||(18184874-18184937)
chr6 (172-229)||(35270971-35271028)
chr6 (166-229)||(18731868-18731931)
chr6 (166-229)||(20218981-20219044)
chr6 (166-229)||(22113006-22113069)
chr6 (173-229)||(11204004-11204060)
chr6 (173-225)||(23517835-23517887)
chr6 (173-229)||(29686601-29686657)
chr6 (21-61)||(29686449-29686489)
[»] chr4 (24 HSPs)
chr4 (14-229)||(11496614-11496829)
chr4 (14-229)||(13822913-13823128)
chr4 (20-229)||(42709731-42709940)
chr4 (15-229)||(15254349-15254563)
chr4 (22-229)||(10630758-10630965)
chr4 (21-229)||(3354646-3354855)
chr4 (22-229)||(18291945-18292153)
chr4 (21-229)||(18081459-18081669)
chr4 (22-229)||(17484910-17485118)
chr4 (21-229)||(45234232-45234441)
chr4 (22-229)||(38426745-38426938)
chr4 (22-229)||(56580539-56580748)
chr4 (24-99)||(8092559-8092634)
chr4 (166-229)||(14653998-14654061)
chr4 (173-227)||(15865647-15865701)
chr4 (173-229)||(10650547-10650603)
chr4 (173-229)||(15260109-15260165)
chr4 (173-229)||(16682913-16682969)
chr4 (178-229)||(15409534-15409585)
chr4 (173-229)||(9488878-9488934)
chr4 (169-229)||(8092427-8092487)
chr4 (180-228)||(17296250-17296298)
chr4 (23-102)||(15260235-15260312)
chr4 (21-61)||(12515042-12515081)
[»] chr3 (52 HSPs)
chr3 (14-229)||(10602472-10602687)
chr3 (14-229)||(13504881-13505096)
chr3 (14-229)||(11947407-11947622)
chr3 (14-229)||(16448760-16448975)
chr3 (14-229)||(7600355-7600570)
chr3 (14-229)||(15556942-15557157)
chr3 (14-229)||(9360971-9361186)
chr3 (14-229)||(16373565-16373780)
chr3 (14-229)||(12187076-12187291)
chr3 (14-229)||(37942378-37942593)
chr3 (22-228)||(12193491-12193697)
chr3 (14-225)||(6814868-6815079)
chr3 (14-229)||(10147011-10147226)
chr3 (14-229)||(15645001-15645216)
chr3 (14-229)||(10160173-10160388)
chr3 (14-228)||(13187418-13187632)
chr3 (22-228)||(3245589-3245795)
chr3 (22-229)||(2721305-2721511)
chr3 (21-229)||(4382751-4382961)
chr3 (22-229)||(13001425-13001634)
chr3 (21-229)||(13097711-13097919)
chr3 (21-229)||(10546936-10547148)
chr3 (21-229)||(20156515-20156722)
chr3 (21-229)||(1992803-1993011)
chr3 (21-229)||(13690608-13690816)
chr3 (21-229)||(11398215-11398424)
chr3 (21-229)||(14348588-14348797)
chr3 (24-229)||(22637702-22637908)
chr3 (22-229)||(3279191-3279399)
chr3 (24-229)||(17387839-17388045)
chr3 (21-229)||(12160207-12160416)
chr3 (14-112)||(16655798-16655897)
chr3 (14-221)||(17045697-17045902)
chr3 (14-221)||(17047857-17048062)
chr3 (173-229)||(27356728-27356784)
chr3 (172-229)||(13601220-13601277)
chr3 (173-229)||(3339226-3339282)
chr3 (173-229)||(12776534-12776590)
chr3 (173-229)||(13136210-13136266)
chr3 (173-229)||(20584262-20584318)
chr3 (178-229)||(15946773-15946824)
chr3 (171-229)||(14445768-14445826)
chr3 (173-229)||(15619283-15619339)
chr3 (173-229)||(13195458-13195514)
chr3 (174-229)||(8686387-8686442)
chr3 (166-229)||(20225754-20225817)
chr3 (178-229)||(13068306-13068357)
chr3 (198-229)||(2005499-2005530)
chr3 (14-61)||(13601062-13601108)
chr3 (21-102)||(12776660-12776739)
chr3 (21-102)||(15946619-15946698)
chr3 (173-229)||(16703307-16703363)
[»] chr2 (35 HSPs)
chr2 (14-229)||(22665062-22665277)
chr2 (14-229)||(117543-117758)
chr2 (14-229)||(22044660-22044875)
chr2 (14-229)||(25357511-25357726)
chr2 (14-229)||(16775651-16775866)
chr2 (21-229)||(11615-11823)
chr2 (14-229)||(17590407-17590622)
chr2 (14-229)||(24795285-24795500)
chr2 (14-229)||(27627580-27627796)
chr2 (21-229)||(25144757-25144966)
chr2 (22-229)||(5500265-5500473)
chr2 (21-229)||(25804267-25804475)
chr2 (22-229)||(23798922-23799129)
chr2 (23-224)||(25370890-25371091)
chr2 (21-229)||(23643950-23644160)
chr2 (21-149)||(24502168-24502297)
chr2 (75-229)||(24178193-24178348)
chr2 (173-229)||(23159385-23159441)
chr2 (173-229)||(23570642-23570698)
chr2 (173-229)||(27631655-27631711)
chr2 (173-229)||(27768816-27768872)
chr2 (178-229)||(24171510-24171561)
chr2 (166-229)||(24506802-24506865)
chr2 (173-229)||(23257570-23257625)
chr2 (173-225)||(24321328-24321380)
chr2 (166-229)||(25337651-25337714)
chr2 (168-210)||(23648123-23648165)
chr2 (21-102)||(27631506-27631585)
chr2 (183-228)||(29955868-29955913)
chr2 (184-228)||(19805618-19805662)
chr2 (180-228)||(21512567-21512615)
chr2 (173-228)||(24019068-24019123)
chr2 (186-228)||(17334606-17334648)
chr2 (21-61)||(15532753-15532792)
chr2 (21-61)||(24019228-24019267)
[»] chr1 (16 HSPs)
chr1 (14-229)||(27046874-27047089)
chr1 (14-229)||(17094601-17094816)
chr1 (14-229)||(21798662-21798878)
chr1 (14-229)||(20237456-20237671)
chr1 (24-225)||(8653126-8653327)
chr1 (21-229)||(52938621-52938830)
chr1 (21-229)||(3989944-3990154)
chr1 (28-229)||(19364043-19364244)
chr1 (141-229)||(14070632-14070720)
chr1 (171-225)||(19875648-19875702)
chr1 (166-229)||(21784472-21784535)
chr1 (166-229)||(4027832-4027895)
chr1 (173-226)||(16382578-16382631)
chr1 (166-229)||(8947515-8947578)
chr1 (22-102)||(21784598-21784677)
chr1 (186-228)||(18478234-18478276)
[»] chr5 (31 HSPs)
chr5 (14-229)||(20595831-20596046)
chr5 (14-229)||(20602117-20602332)
chr5 (14-229)||(20608408-20608623)
chr5 (14-229)||(15735534-15735749)
chr5 (14-229)||(23748051-23748266)
chr5 (14-204)||(23710701-23710892)
chr5 (21-229)||(24940540-24940749)
chr5 (14-229)||(18072900-18073115)
chr5 (14-229)||(24953174-24953389)
chr5 (22-211)||(20622170-20622359)
chr5 (14-229)||(20790714-20790929)
chr5 (21-229)||(23600636-23600845)
chr5 (21-229)||(24219752-24219961)
chr5 (21-225)||(20444843-20445048)
chr5 (35-229)||(21387410-21387605)
chr5 (25-229)||(20916456-20916660)
chr5 (21-99)||(22948518-22948596)
chr5 (22-145)||(20575510-20575633)
chr5 (173-229)||(22317513-22317569)
chr5 (173-229)||(25006808-25006864)
chr5 (173-229)||(30759655-30759711)
chr5 (166-229)||(18484212-18484275)
chr5 (179-229)||(25116171-25116221)
chr5 (173-229)||(26847803-26847859)
chr5 (184-229)||(25175261-25175306)
chr5 (173-225)||(22855723-22855775)
chr5 (184-228)||(27270563-27270607)
chr5 (21-102)||(22317639-22317719)
chr5 (180-228)||(17412736-17412784)
chr5 (21-102)||(22855572-22855651)
chr5 (22-102)||(25006934-25007012)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (14-229)||(15678-15893)
[»] chr8 (29 HSPs)
chr8 (14-229)||(21382093-21382309)
chr8 (14-229)||(21098794-21099009)
chr8 (14-229)||(21104115-21104330)
chr8 (14-229)||(23911441-23911655)
chr8 (14-229)||(8314467-8314683)
chr8 (14-229)||(8322846-8323062)
chr8 (21-229)||(21843524-21843733)
chr8 (21-229)||(21939996-21940206)
chr8 (21-229)||(20038981-20039189)
chr8 (22-229)||(23454945-23455154)
chr8 (22-229)||(17620755-17620961)
chr8 (21-229)||(16418620-16418830)
chr8 (50-229)||(24034049-24034230)
chr8 (22-218)||(14352181-14352378)
chr8 (40-229)||(21538573-21538765)
chr8 (118-229)||(20712537-20712649)
chr8 (173-229)||(11346953-11347009)
chr8 (173-229)||(19767684-19767740)
chr8 (173-229)||(22370102-22370158)
chr8 (178-229)||(20002279-20002330)
chr8 (173-229)||(22033555-22033611)
chr8 (173-229)||(22099655-22099711)
chr8 (173-229)||(22102552-22102608)
chr8 (178-229)||(21831181-21831232)
chr8 (21-90)||(20712470-20712539)
chr8 (178-229)||(22817755-22817806)
chr8 (180-228)||(18572977-18573025)
chr8 (186-228)||(19902174-19902216)
chr8 (21-102)||(22102403-22102482)
[»] scaffold0404 (2 HSPs)
scaffold0404 (14-229)||(1038-1253)
scaffold0404 (156-229)||(3451-3524)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (14-229)||(615-831)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (21-229)||(220-428)
[»] scaffold0825 (1 HSPs)
scaffold0825 (24-229)||(2852-3058)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (21-229)||(251870-252079)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (29-229)||(11064-11264)
[»] scaffold0506 (1 HSPs)
scaffold0506 (21-229)||(2287-2496)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (21-229)||(831-1041)
[»] scaffold0315 (1 HSPs)
scaffold0315 (22-229)||(14662-14869)
[»] scaffold0773 (1 HSPs)
scaffold0773 (24-229)||(482-687)
[»] scaffold0679 (1 HSPs)
scaffold0679 (21-229)||(7941-8149)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (22-229)||(120954-121162)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (71-229)||(164403-164562)
scaffold0011 (166-228)||(172254-172316)
scaffold0011 (166-229)||(161995-162058)
[»] scaffold0974 (1 HSPs)
scaffold0974 (21-229)||(1108-1318)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (21-229)||(58628-58838)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (21-229)||(97726-97936)
[»] scaffold0328 (1 HSPs)
scaffold0328 (21-229)||(510-718)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (111-229)||(10206-10325)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (24-229)||(13002-13207)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (24-229)||(35104-35307)
[»] scaffold0582 (1 HSPs)
scaffold0582 (82-229)||(8720-8869)
[»] scaffold0059 (1 HSPs)
scaffold0059 (68-227)||(12450-12609)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (68-227)||(232789-232948)
[»] scaffold0512 (1 HSPs)
scaffold0512 (21-229)||(5090-5295)
[»] scaffold0096 (2 HSPs)
scaffold0096 (128-229)||(38508-38610)
scaffold0096 (49-99)||(38625-38675)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (166-229)||(42237-42300)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (166-229)||(50506-50569)
scaffold0035 (186-228)||(88361-88403)
[»] scaffold0861 (1 HSPs)
scaffold0861 (171-229)||(912-970)
[»] scaffold0566 (2 HSPs)
scaffold0566 (173-229)||(2762-2818)
scaffold0566 (21-102)||(2612-2692)
[»] scaffold1095 (1 HSPs)
scaffold1095 (21-88)||(2859-2926)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (178-229)||(12743-12794)
[»] scaffold0258 (1 HSPs)
scaffold0258 (166-225)||(22159-22218)
[»] scaffold0384 (1 HSPs)
scaffold0384 (173-229)||(10720-10776)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (173-229)||(54849-54905)
[»] scaffold1225 (1 HSPs)
scaffold1225 (166-229)||(1839-1902)
[»] scaffold0116 (2 HSPs)
scaffold0116 (166-229)||(37743-37806)
scaffold0116 (22-102)||(37869-37948)
[»] scaffold0094 (2 HSPs)
scaffold0094 (173-228)||(1193-1248)
scaffold0094 (21-61)||(1041-1080)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (23-225)||(37722-37922)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (166-229)||(22756-22818)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (166-229)||(45228-45291)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (179-229)||(72572-72622)
scaffold0037 (179-229)||(84762-84812)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (184-229)||(18218-18263)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (173-213)||(83174-83214)
[»] scaffold0226 (1 HSPs)
scaffold0226 (186-226)||(3251-3291)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (21-61)||(5830-5869)


Alignment Details
Target: scaffold0029 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 123369 - 123584
Alignment:
Q  14 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  123369 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 123468  T
Q  114 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  123469 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 123568  T
Q  214 gtgggggagtttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  123569 gtgggggagtttgatg 123584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 77433 - 77391
Alignment:
Q  186 ttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 228  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  77433 ttgcttgaggacaagcaatggttcaagtgtaggggagtttgat 77391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 39)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 9582893 - 9583108
Alignment:
Q  14 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9582893 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 9582992  T
Q  114 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9582993 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 9583092  T
Q  214 gtgggggagtttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  9583093 gtgggggagtttgatg 9583108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16120064 - 16119849
Alignment:
Q  14 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16120064 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 16119965  T
Q  114 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16119964 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgtttgtgctactatgtatatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 16119865  T
Q  214 gtgggggagtttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  16119864 gtgggggagtttgatg 16119849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 14 - 225
Target Start/End: Original strand, 23515067 - 23515278
Alignment:
Q  14 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23515067 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 23515166  T
Q  114 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23515167 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataattgtttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 23515266  T
Q  214 gtgggggagttt 225  Q
    ||||||||||||    
T  23515267 gtgggggagttt 23515278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 14551098 - 14551314
Alignment:
Q  14 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaa-attacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaa 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14551098 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaa 14551197  T
Q  113 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 212  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14551198 gcccttgaggggacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataaccgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 14551297  T
Q  213 tgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||||||||||||||||    
T  14551298 tgtgggggagtttgatg 14551314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 8717865 - 8718080
Alignment:
Q  14 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8717865 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaacacttgagtttgtgattagtgtacacttgggatttaag 8717964  T
Q  114 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8717965 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactattggtgctactatgtttatgcattttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 8718064  T
Q  214 gtgggggagtttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  8718065 gtgggggagtttgatg 8718080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 13673856 - 13674071
Alignment:
Q  14 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13673856 tggacttcacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggtagaaaaaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 13673955  T
Q  114 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13673956 cccttgaggagacatgtgctttaattaaattgtcatttgatttaactgttgatgctactacgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 13674055  T
Q  214 gtgggggagtttgatg 229  Q
     |||||||||||||||    
T  13674056 atgggggagtttgatg 13674071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 18593567 - 18593352
Alignment:
Q  14 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  18593567 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggtagaataaagattccaagaaatacttgagtttgtaattagtgtacattttggatttaag 18593468  T
Q  114 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 213  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18593467 cccttgaggagacatgtactttaatttaattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 18593368  T
Q  214 gtgggggagtttgatg 229  Q
     |||||||||||||||    
T  18593367 atgggggagtttgatg 18593352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 18618117 - 18618332
Alignment:
Q  14 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  18618117 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggtagaataaagattccaagaaatacttgagtttgtaattagtgtacattttggatttaag 18618216  T
Q  114 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 213  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18618217 cccttgaggagacatgtactttaatttaattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 18618316  T
Q  214 gtgggggagtttgatg 229  Q
     |||||||||||||||    
T  18618317 atgggggagtttgatg 18618332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 229
Target Start/End: Original strand, 4312564 - 4312772
Alignment:
Q  21 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||||| ||||    
T  4312564 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttga 4312663  T
Q  121 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 220  Q
    ||||||||  | ||||||||||||||||| |||||    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4312664 ggagacataagttttaattgaattgtcatatgataatcttgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 4312763  T
Q  221 agtttgatg 229  Q
    |||||||||    
T  4312764 agtttgatg 4312772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 538964 - 538755
Alignment:
Q  21 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaa-tgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||  ||| || |||||     
T  538964 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaaaaaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattaaaacccttc 538865  T
Q  120 aggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 219  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  538864 aggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 538765  T
Q  220 gagtttgatg 229  Q
    ||||||||||    
T  538764 gagtttgatg 538755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 229
Target Start/End: Original strand, 12567020 - 12567229
Alignment:
Q  21 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||||    
T  12567020 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgtttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattgaagcccttga 12567119  T
Q  121 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactg-ttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 219  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||  | || || || |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12567120 ggagacatgagttttaattaaattgtcatatgataatattgttttgttctaccatgtttatgcattttgcttgaggacaagcaaaaattcaagtgtgggg 12567219  T
Q  220 gagtttgatg 229  Q
    ||||||||||    
T  12567220 gagtttgatg 12567229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 22 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 12549012 - 12548805
Alignment:
Q  22 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 121  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||  ||| |||||||||||    
T  12549012 acacacacactcacttgaagcttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtggacgcttgaaattgaagcccttgag 12548913  T
Q  122 gagacatgtgctttaattgaattgtcatttgat-ataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 220  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||||| |||| |||    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12548912 gagacatgt-atttaattaaattgtcatatgataatattattttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgttgggg 12548814  T
Q  221 agtttgatg 229  Q
    |||||||||    
T  12548813 agtttgatg 12548805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 21 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 8781146 - 8780936
Alignment:
Q  21 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 120  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||  ||||| ||||    
T  8781146 cacacacacactaccttgaaacttgattgttgggttgaataaaggttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacacttgaaataaaagcctttga 8781047  T
Q  121 ggagacat--gtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 218  Q
    ||||||||  ||  ||||||||||||||||| || ||    ||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8781046 ggagacataagttttttaattgaattgtcatatgttaatcttgtttatgctgctatgtttatgccttttgtttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 8780947  T
Q  219 ggagtttgatg 229  Q
    |||||||||||    
T  8780946 ggagtttgatg 8780936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 21 - 227
Target Start/End: Original strand, 9003958 - 9004165
Alignment:
Q  21 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 120  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||   |||  ||  ||||| ||||    
T  9003958 cacacatacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagatcacaagaaatgcttgagtttgtaattagtgtatgcttgaaataaaagcctttga 9004057  T
Q  121 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactg-ttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 219  Q
    ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||| |  || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9004058 ggagacataagttttaattgaattgtcatatgataaacttgttttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaaacaaagattcaagtgtgggg 9004157  T
Q  220 gagtttga 227  Q
    ||||||||    
T  9004158 gagtttga 9004165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 229
Target Start/End: Original strand, 20108375 - 20108584
Alignment:
Q  21 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||  ||  ||||| ||||    
T  20108375 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtatgcttgaaataaaagcctttga 20108474  T
Q  121 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactg-ttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 219  Q
    ||||||||  | |||||||||||| |||| |||||    || ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  20108475 ggagacatcagttttaattgaattctcatatgataaccttgttttatgctactatgtttatgtcttttgcttgaggacaataaaagattcaagtgtgggg 20108574  T
Q  220 gagtttgatg 229  Q
    ||||||||||    
T  20108575 gagtttgatg 20108584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 22 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 48801983 - 48801777
Alignment:
Q  22 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 121  Q
    ||||||| ||||||||   ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||| |||||    
T  48801983 acacacatactcactttttacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgtttgaaattaaagcctttgag 48801884  T
Q  122 gagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataa-ct--gttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 218  Q
    |||||||| | ||| |||||||||||||   |||||| ||   ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  48801883 gagacatgagttttgattgaattgtcat---atataatcttgtttattgctactatgtgtatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtggg 48801787  T
Q  219 ggagtttgat 228  Q
    ||||||||||    
T  48801786 ggagtttgat 48801777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 24 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 9265145 - 9264939
Alignment:
Q  24 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 123  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||| | |||||||    
T  9265145 acacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagtctttgagga 9265046  T
Q  124 gacatgtg-ctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 222  Q
    |||||  |  ||| ||||||||||||| || ||    || |  |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9265045 gacataagttttttattgaattgtcatatgttaatcttgcttatgctgctatgtttatgccttttgtttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 9264946  T
Q  223 tttgatg 229  Q
    |||||||    
T  9264945 tttgatg 9264939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 229
Target Start/End: Original strand, 13657873 - 13658081
Alignment:
Q  21 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 120  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |   |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||| ||||    
T  13657873 cacacacacactcatttgaaacttgattgttgggtggaaaagggattacaaagaatgcttgagtttgtgattagtgtacacttgaaattaaagcctttga 13657972  T
Q  121 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 220  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||||||||    ||    ||||   ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13657973 ggagatatgtgttttaattaaattgtcatgaagtaatcttgtttacgctaccatgttgatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 13658072  T
Q  221 agtttgatg 229  Q
    |||||||||    
T  13658073 agtttgatg 13658081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 11921512 - 11921307
Alignment:
Q  21 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttg 119  Q
    |||||||||||||||||   ||| ||| ||||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||  ||  ||||| |||    
T  11921512 cacacacacactcacttaggactagattgttgggttgaaaaaggattataagaaatgcttgcgtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctttg 11921413  T
Q  120 aggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 219  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||| |||   || ||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11921412 aggagacgtgtgctttaatgtaattgtcatgtga---aaatgtta-tgctaccatgtttatgacttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 11921317  T
Q  220 gagtttgatg 229  Q
    ||||||||||    
T  11921316 gagtttgatg 11921307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 229
Target Start/End: Original strand, 16532100 - 16532311
Alignment:
Q  21 cacacacacactcacttgaaacttgatcg-ttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaa-gccctt 118  Q
    |||||||||||||| || | ||||||| | |||||||||| |||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  || | | | || ||| ||    
T  16532100 cacacacacactcaattaagacttgattgattgggttgaaaaaaggttataagaaatacttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaatgccttt 16532199  T
Q  119 gaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 217  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |    | ||   |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16532200 gaggagacatgtgctttaatgtaattgtcatatgaaaatgttattttatgctaccatgtttatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgg 16532299  T
Q  218 gggagtttgatg 229  Q
    ||||||||||||    
T  16532300 gggagtttgatg 16532311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16633562 - 16633351
Alignment:
Q  21 cacacacacactcacttgaaacttgatcg-ttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaa-gccctt 118  Q
    |||||||||||||| || | ||||||| | |||||||||| |||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  || | | | || ||| ||    
T  16633562 cacacacacactcaattaagacttgattgattgggttgaaaaaaggttataagaaatacttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaatgccttt 16633463  T
Q  119 gaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 217  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |    | ||   |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16633462 gaggagacatgtgctttaatgtaattgtcatatgaaaatgttattttatgctaccatgtttatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgg 16633363  T
Q  218 gggagtttgatg 229  Q
    ||||||||||||    
T  16633362 gggagtttgatg 16633351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16465821 - 16465616
Alignment:
Q  21 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagccctt- 118  Q
    |||||||||||||||||   ||| ||  | ||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||||| ||     
T  16465821 cacacacacactcacttaggactagactgatgggttgaaaaaggattataagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctttt 16465722  T
Q  119 gaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 218  Q
    |||||||| |||| ||||||  | |||||||  || ||    |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16465721 gaggagacgtgtgttttaatgtatttgtcatgagaaat----gtta-tgctactatgtttatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 16465627  T
Q  219 ggagtttgatg 229  Q
    |||||||||||    
T  16465626 ggagtttgatg 16465616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 173 - 229
Target Start/End: Original strand, 825783 - 825839
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  825783 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 825839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 173 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 4461298 - 4461242
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4461298 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 4461242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 173 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14221774 - 14221718
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14221774 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 14221718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 173 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 15916832 - 15916776
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15916832 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 15916776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 173 - 229
Target Start/End: Original strand, 18287761 - 18287817
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18287761 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 18287817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 173 - 229
Target Start/End: Original strand, 27291496 - 27291552
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27291496 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 27291552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 166 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 15206647 - 15206584
Alignment:
Q  166 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15206647 tgctgctatgtctatgcctttttcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 15206584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 171 - 229
Target Start/End: Original strand, 5397273 - 5397331
Alignment:
Q  171 ctatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5397273 ctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtaggggagtttgatg 5397331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 180 - 229
Target Start/End: Original strand, 15065935 - 15065984
Alignment:
Q  180 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15065935 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 15065984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 176 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 9194597 - 9194544
Alignment:
Q  176 tttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9194597 tttatgccttttgcttgaggacaaacaaagattcaagtatgggggagtttgatg 9194544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 173 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 6713124 - 6713072
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagttt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  6713124 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtataggggagttt 6713072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 173 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 4791438 - 4791383
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 228  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4791438 atgtctatgcattctgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgat 4791383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 173 - 228
Target Start/End: Original strand, 15348532 - 15348587
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 228  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  15348532 atgtttatgccttttacttgaggacaaacaaagattcaagtttggggaagtttgat 15348587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 173 - 213
Target Start/End: Original strand, 15522517 - 15522557
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 213  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15522517 atgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagt 15522557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 228
Target Start/End: Original strand, 15940731 - 15940773
Alignment:
Q  186 ttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 228  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  15940731 ttgcttgaggacaagcaacggttcaagtgtaggggagtttgat 15940773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 102
Target Start/End: Original strand, 15065779 - 15065858
Alignment:
Q  21 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatt 102  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| | || |||||||||||   ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  15065779 cacacacacactcacttgagatttgtt-gtcgggttgaataagt-ttacaaggaatgcttgaagttgtgattagtgtacatt 15065858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 102
Target Start/End: Original strand, 18287612 - 18287691
Alignment:
Q  21 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatt 102  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| | || |||||||||||   ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  18287612 cacacagacactcacttgaaatttgtt-gtcgggttgaataagt-ttacaaggaatgcttgaagttgtgattagtgtacatt 18287691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 30)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 15699555 - 15699770
Alignment:
Q  14 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15699555 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 15699654  T
Q  114 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15699655 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 15699754  T
Q  214 gtgggggagtttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  15699755 gtgggggagtttgatg 15699770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22165764 - 22165549
Alignment:
Q  14 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22165764 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 22165665  T
Q  114 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22165664 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 22165565  T
Q  214 gtgggggagtttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  22165564 gtgggggagtttgatg 22165549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 22243812 - 22244027
Alignment:
Q  14 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22243812 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 22243911  T
Q  114 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22243912 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 22244011  T
Q  214 gtgggggagtttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  22244012 gtgggggagtttgatg 22244027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22061718 - 22061503
Alignment:
Q  14 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22061718 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 22061619  T
Q  114 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22061618 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 22061519  T
Q  214 gtgggggagtttgatg 229  Q
     |||||||||||||||    
T  22061518 atgggggagtttgatg 22061503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 21 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 24855453 - 24855245
Alignment:
Q  21 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattt-gggatttaagcccttg 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24855453 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaagcccttg 24855354  T
Q  120 aggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 219  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24855353 aggagacatgtgctttaatt-aattgtcatttgatttaactattgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggg 24855255  T
Q  220 gagtttgatg 229  Q
    ||||||||||    
T  24855254 gagtttgatg 24855245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22767331 - 22767116
Alignment:
Q  14 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattt-gggatttaa 112  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22767331 tggacttcacacacactctcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaa 22767232  T
Q  113 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22767231 gcccttgaggagacatgtgctttaatt-aattgtcatttgatttaactgttgatgttactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 22767133  T
Q  213 tgtgggggagtttgatg 229  Q
    | |||||||||||||||    
T  22767132 tatgggggagtttgatg 22767116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 20170242 - 20170458
Alignment:
Q  14 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaa 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20170242 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaa 20170341  T
Q  113 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatat-aactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20170342 gcccttgaggagacatgtgctttaatt-aattgtcatttgatttaaactattgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaa 20170440  T
Q  212 gtgtgggggagtttgatg 229  Q
    || |||||||||||||||    
T  20170441 gtatgggggagtttgatg 20170458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 229
Target Start/End: Original strand, 18448140 - 18448349
Alignment:
Q  21 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 120  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||||    
T  18448140 cacacacacagtcacttgaaacttgactgttgggatgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattaaagcccttga 18448239  T
Q  121 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactg-ttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 219  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | || || ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18448240 ggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgttttgtgctaccaagtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 18448339  T
Q  220 gagtttgatg 229  Q
    ||||||||||    
T  18448340 gagtttgatg 18448349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 229
Target Start/End: Original strand, 23023093 - 23023302
Alignment:
Q  21 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 120  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||||    
T  23023093 cacacgcacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattaaagcccttga 23023192  T
Q  121 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgt-tggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 219  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | ||| |  |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23023193 ggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttatgctaccatgtttaagacttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 23023292  T
Q  220 gagtttgatg 229  Q
    ||||||||||    
T  23023293 gagtttgatg 23023302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 20107989 - 20107784
Alignment:
Q  21 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||||| ||||    
T  20107989 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaatgaaagcctttga 20107890  T
Q  121 ggagacatgtgcttt-aattgaattgtcatttgatataac-tgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 218  Q
    ||||||||  | ||| |||||||||||||| || | || | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20107889 ggagacataagttttcaattgaattgtcatatg-tttatcttgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 20107791  T
Q  219 ggagttt 225  Q
    |||||||    
T  20107790 ggagttt 20107784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 229
Target Start/End: Original strand, 25625691 - 25625899
Alignment:
Q  21 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| |||||||| |    
T  25625691 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattaaagcccttaa 25625790  T
Q  121 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 220  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||  | ||||  |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  25625791 ggagacatatgttttaattaaattgtcatatgataatattgtttatgctaccatgtttacaccttttgcttgaggacaagcaaaaattcaagtatggggg 25625890  T
Q  221 agtttgatg 229  Q
    |||||||||    
T  25625891 agtttgatg 25625899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 24 - 229
Target Start/End: Original strand, 2181063 - 2181269
Alignment:
Q  24 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 123  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |  | |  |||||||||||||||||    
T  2181063 acacacactcacttgaaacttggttgttgagttgaataaggattacgagaaatgcttaagtttgtgattaatgtgcgctcgaaatttaagcccttgagga 2181162  T
Q  124 gacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttg-gtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 222  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2181163 gacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgttttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 2181262  T
Q  223 tttgatg 229  Q
    |||||||    
T  2181263 tttgatg 2181269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 29 - 229
Target Start/End: Original strand, 18854026 - 18854226
Alignment:
Q  29 cactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacat 128  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |  ||| ||||||||||||||||||    
T  18854026 cactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgctggaaattaaagcccttgaggagacat 18854125  T
Q  129 gtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 228  Q
    |||  |||||| ||||||||| |||||  | ||||  |||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  18854126 gtgtattaattaaattgtcatatgataatattgtttatgctaccatatttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtatgggggagtttgat 18854225  T
Q  229 g 229  Q
    |    
T  18854226 g 18854226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21560762 - 21560554
Alignment:
Q  21 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 120  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||| ||||    
T  21560762 cacacacacactcatttgaaacttgattgttgggttgaaaaaggattacaaagaatgcttgagtttgtgattagtgtacacttgaaattaaagcctttga 21560663  T
Q  121 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 220  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| |||    ||    ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21560662 ggagacatgtgttttaattaaattgacatgaagtaatcttgtttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatggggg 21560563  T
Q  221 agtttgatg 229  Q
    |||||||||    
T  21560562 agtttgatg 21560554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 25631477 - 25631269
Alignment:
Q  21 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||| ||||    
T  25631477 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattaaagcctttga 25631378  T
Q  121 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataa-ct--gttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 217  Q
     |||| ||  | |||||||||||||||||   |||||| ||   ||  |||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  25631377 agagatataagttttaattgaattgtcat---atataatcttgtttattgctaccatgtttatgcatttttcctgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 25631281  T
Q  218 gggagtttgatg 229  Q
    ||||||||||||    
T  25631280 gggagtttgatg 25631269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 22 - 229
Target Start/End: Original strand, 29595697 - 29595904
Alignment:
Q  22 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 121  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| |||  ||| ||||||||| |    
T  29595697 acacacacagtcatttgaaacttgattattgggttgaaaaaggattacaagaaatgtttgagttttttattagtgtacacttgaaattaaagcccttggg 29595796  T
Q  122 gagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 221  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||    | ||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29595797 gagacatgtgttttaattaaatcgtcatgtgataatcttatttatgctaccatgtttatgctttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgaggga 29595896  T
Q  222 gtttgatg 229  Q
    ||||||||    
T  29595897 gtttgatg 29595904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 229
Target Start/End: Original strand, 25963248 - 25963457
Alignment:
Q  21 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 120  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||   |||  ||  ||||| ||||    
T  25963248 cacacacacactcacttagaacttgattgttgggttgaataaagattaaaggaaatgcttgagtttgtgattagtgtatgcttgaaataaaagcctttga 25963347  T
Q  121 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataact-gttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 219  Q
    |||||||     ||||||||||||||||| || ||   || | |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25963348 ggagacacaaattttaattgaattgtcatatgttaagtcttgcttatgctactatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 25963447  T
Q  220 gagtttgatg 229  Q
    ||||||||||    
T  25963448 gagtttgatg 25963457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 229
Target Start/End: Original strand, 25967895 - 25968104
Alignment:
Q  21 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 120  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||   |||  ||  ||||| ||||    
T  25967895 cacacacacactcacttagaacttgattgttgggttgaataaagattaaaggaaatgcttgagtttgtgattagtgtatgcttgaaataaaagcctttga 25967994  T
Q  121 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataact-gttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 219  Q
    |||||||     ||||||||||||||||| || ||   || | |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25967995 ggagacacaaattttaattgaattgtcatatgttaagtcttgcttatgctactatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 25968094  T
Q  220 gagtttgatg 229  Q
    ||||||||||    
T  25968095 gagtttgatg 25968104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 30672011 - 30671807
Alignment:
Q  26 acacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggaga 125  Q
    ||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||||| ||| ||| |    
T  30672011 acacactcaattagaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttggggaaa 30671912  T
Q  126 catgtgctttaattgaattgtcatttgatataact-gttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtt 224  Q
    ||     ||||||||||||||||| || ||   || | |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30671911 cacaaattttaattgaattgtcatatgttaagtcttgcttatgctactatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtt 30671812  T
Q  225 tgatg 229  Q
    |||||    
T  30671811 tgatg 30671807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 19585750 - 19585622
Alignment:
Q  21 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 120  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||  ||||| || |    
T  19585750 cacatacacactcacttaaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgtgtttgtgattagtgtacgtttgaaataaaagcctttta 19585651  T
Q  121 ggagacatgtgctttaattgaattgtcat 149  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  19585650 ggagacatgagttttaattgtattgtcat 19585622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 20016443 - 20016339
Alignment:
Q  15 ggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaag 113  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  20016443 ggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttggatagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgcaattagtgtacattttgggatttaag 20016344  T
Q  114 ccctt 118  Q
    |||||    
T  20016343 ccctt 20016339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 166 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 18184937 - 18184874
Alignment:
Q  166 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18184937 tgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 18184874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 172 - 229
Target Start/End: Original strand, 35270971 - 35271028
Alignment:
Q  172 tatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35270971 tatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggtgtttgatg 35271028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 166 - 229
Target Start/End: Original strand, 18731868 - 18731931
Alignment:
Q  166 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  18731868 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggacaagctaagattcaagtgtggaggagtttgatg 18731931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 166 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20219044 - 20218981
Alignment:
Q  166 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20219044 tgctgctatgtttatgccttttgcttgaagagaagcaaagattcatgtgtgggggagtttgatg 20218981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 166 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22113069 - 22113006
Alignment:
Q  166 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22113069 tgctgctatgtttatgccttttgcttgaagagaagcaaagattcatgtgtgggggagtttgatg 22113006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 173 - 229
Target Start/End: Original strand, 11204004 - 11204060
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  11204004 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaatatttaagtgtgggggagtttgatg 11204060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 23517887 - 23517835
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagttt 225  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  23517887 atgtgtatgccttttgcttgaggataagcaaagattcaagtatgggggagttt 23517835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 229
Target Start/End: Original strand, 29686601 - 29686657
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  29686601 atgtttatgcctcttgcttgaggacaagaaaagattcaagtatgggagagtttgatg 29686657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 61
Target Start/End: Original strand, 29686449 - 29686489
Alignment:
Q  21 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaata 61  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  29686449 cacacacacactcacttgagacttgattgttgggttgaata 29686489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 24)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 11496829 - 11496614
Alignment:
Q  14 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11496829 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 11496730  T
Q  114 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11496729 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 11496630  T
Q  214 gtgggggagtttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  11496629 gtgggggagtttgatg 11496614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 13822913 - 13823128
Alignment:
Q  14 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13822913 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 13823012  T
Q  114 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13823013 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 13823112  T
Q  214 gtgggggagtttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  13823113 gtgggggagtttgatg 13823128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 20 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 42709940 - 42709731
Alignment:
Q  20 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42709940 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgagatttaagcccttg 42709841  T
Q  120 aggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42709840 aggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 42709741  T
Q  220 gagtttgatg 229  Q
    ||||||||||    
T  42709740 gagtttgatg 42709731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 15 - 229
Target Start/End: Original strand, 15254349 - 15254563
Alignment:
Q  15 ggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagc 114  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  15254349 ggacttcacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattttggatttaaac 15254448  T
Q  115 ccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtg 214  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| |||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15254449 ccttaaggagacatgtgctttaatcgaattgtcatttgataaaattgtttgtgcaactacgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtg 15254548  T
Q  215 tgggggagtttgatg 229  Q
    |||||||||||||||    
T  15254549 tgggggagtttgatg 15254563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 22 - 229
Target Start/End: Original strand, 10630758 - 10630965
Alignment:
Q  22 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||    
T  10630758 acacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgag 10630857  T
Q  122 gagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgt-tggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 220  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |  ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10630858 gagacatgtgctttaattaaattgtcatatgata-atatgtcttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 10630956  T
Q  221 agtttgatg 229  Q
    |||||||||    
T  10630957 agtttgatg 10630965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 229
Target Start/End: Original strand, 3354646 - 3354855
Alignment:
Q  21 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||||    
T  3354646 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattgaagcccttga 3354745  T
Q  121 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactg-ttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 219  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | || || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  3354746 ggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgttttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaactattcaagtgtgggg 3354845  T
Q  220 gagtttgatg 229  Q
    ||||||||||    
T  3354846 gagtttgatg 3354855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 22 - 229
Target Start/End: Original strand, 18291945 - 18292153
Alignment:
Q  22 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 121  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||  ||| |||||||||||    
T  18291945 acacacacgctcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgactttgtgattagtgtacgcttgaaattgaagcccttgag 18292044  T
Q  122 gagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactg-ttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 220  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | || || ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18292045 gagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgttttgtgctaccatgtttatgcctttttcttgtggacaagcaaagattcaagtgtggggg 18292144  T
Q  221 agtttgatg 229  Q
    |||||||||    
T  18292145 agtttgatg 18292153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 21 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 18081669 - 18081459
Alignment:
Q  21 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttg 119  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||||| |||    
T  18081669 cacacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaggattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctttg 18081570  T
Q  120 aggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 218  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||    ||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18081569 aggagacatgtgctttgatttaattgtcatatgataatgttgttctatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 18081470  T
Q  219 ggagtttgatg 229  Q
    |||||||||||    
T  18081469 ggagtttgatg 18081459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 22 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 17485118 - 17484910
Alignment:
Q  22 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  |||||| ||||    
T  17485118 acacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggattataagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcccctgag 17485019  T
Q  122 gagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactg-ttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 220  Q
    |||||||  | ||||||| ||||||||| |||||    || ||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17485018 gagacataagttttaattaaattgtcatgtgataatcttgttttatgctaccatatttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 17484919  T
Q  221 agtttgatg 229  Q
    |||||||||    
T  17484918 agtttgatg 17484910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 45234441 - 45234232
Alignment:
Q  21 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||  ||  ||||| ||||    
T  45234441 cacacacacactcacttgaaacttgatagttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattactgtacgcttgaaataaaagcctttga 45234342  T
Q  121 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactg-ttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 219  Q
    ||||||||  | ||||||| ||||||||| |||||    || ||  ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45234341 ggagacattagttttaatttaattgtcatatgataatcttgttttatgccaccatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtctgggg 45234242  T
Q  220 gagtttgatg 229  Q
    ||||||||||    
T  45234241 gagtttgatg 45234232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 22 - 229
Target Start/End: Original strand, 38426745 - 38426938
Alignment:
Q  22 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| |||||||||||    
T  38426745 acacacacactcacttgaaacttgattgttggcttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattaaagcccttgag 38426844  T
Q  122 gagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 221  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||             || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38426845 gagacatgtgttttaattaaattgtcatatgata------------atatta--tttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 38426930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 22 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 56580748 - 56580539
Alignment:
Q  22 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttga 120  Q
    |||||||||||||||| | |||||||   ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||||| ||||    
T  56580748 acacacacactcacttaagacttgatttatgggttgaaaaatgattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctttga 56580649  T
Q  121 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 219  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||    | ||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56580648 ggagacatgtgctttaatttaattgtcagatgataatgttattttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 56580549  T
Q  220 gagtttgatg 229  Q
    ||||||||||    
T  56580548 gagtttgatg 56580539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 24 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 8092634 - 8092559
Alignment:
Q  24 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtac 99  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8092634 acacacactcacttagaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtac 8092559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 166 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14654061 - 14653998
Alignment:
Q  166 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14654061 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 14653998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 173 - 227
Target Start/End: Original strand, 15865647 - 15865701
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttga 227  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15865647 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttga 15865701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 173 - 229
Target Start/End: Original strand, 10650547 - 10650603
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10650547 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 10650603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 173 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 15260165 - 15260109
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15260165 atgtctatgccttttgcttgaggaaaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 15260109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 173 - 229
Target Start/End: Original strand, 16682913 - 16682969
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16682913 atgtctatgccttttgcttgatgacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 16682969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 178 - 229
Target Start/End: Original strand, 15409534 - 15409585
Alignment:
Q  178 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15409534 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattctagtgtgggggagtttgatg 15409585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 173 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 9488934 - 9488878
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  9488934 atgttcatgccttttgcttgaggacaagcaaagattgaagtatgggggagtttgatg 9488878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 8092487 - 8092427
Alignment:
Q  169 tactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  8092487 tactatgtttatgtctttttcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggaaagtttgatg 8092427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 17296298 - 17296250
Alignment:
Q  180 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  17296298 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagcatgggggagtttgat 17296250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 23 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 15260312 - 15260235
Alignment:
Q  23 cacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||   ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  15260312 cacacacactcacttgaaatttgtt-gtcgggttgaataagt-ttacaaggaatgcttgaagttgtgattagtgtacatt 15260235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 61
Target Start/End: Original strand, 12515042 - 12515081
Alignment:
Q  21 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaata 61  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  12515042 cacacacacactcacttgaaacttg-ttgttgggttgaata 12515081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 52)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 10602687 - 10602472
Alignment:
Q  14 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10602687 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 10602588  T
Q  114 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10602587 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 10602488  T
Q  214 gtgggggagtttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  10602487 gtgggggagtttgatg 10602472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 13505096 - 13504881
Alignment:
Q  14 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13505096 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 13504997  T
Q  114 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13504996 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaattgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 13504897  T
Q  214 gtgggggagtttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  13504896 gtgggggagtttgatg 13504881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 11947407 - 11947622
Alignment:
Q  14 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 113  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11947407 tggacttcacacacacactcatttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 11947506  T
Q  114 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11947507 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaattgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagtaaagattcaagt 11947606  T
Q  214 gtgggggagtttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  11947607 gtgggggagtttgatg 11947622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16448975 - 16448760
Alignment:
Q  14 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16448975 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgaatttgtgattagtgtacatttggaatttaag 16448876  T
Q  114 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16448875 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaattgtttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 16448776  T
Q  214 gtgggggagtttgatg 229  Q
     |||||||||||||||    
T  16448775 atgggggagtttgatg 16448760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 7600355 - 7600570
Alignment:
Q  14 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7600355 tggacttcacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 7600454  T
Q  114 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7600455 cccttgaggagacatgtgctttaattaaattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 7600554  T
Q  214 gtgggggagtttgatg 229  Q
     |||||||||||||||    
T  7600555 atgggggagtttgatg 7600570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 15557157 - 15556942
Alignment:
Q  14 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 113  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15557157 tggacttcatacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaagatttcaagaaatgcttaagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 15557058  T
Q  114 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15557057 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgaattaactattgatgctactatgtttatgcctttttcttgaggacaagcaaagattcaagt 15556958  T
Q  214 gtgggggagtttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  15556957 gtgggggagtttgatg 15556942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 9361186 - 9360971
Alignment:
Q  14 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9361186 tggacttcacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgaatttgtgattagtgtacatttggaatttaag 9361087  T
Q  114 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 213  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9361086 cccttgaggagacatgtcctttaatcgaattgtcatttgataaaattgtttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 9360987  T
Q  214 gtgggggagtttgatg 229  Q
     |||||||||||||||    
T  9360986 atgggggagtttgatg 9360971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16373780 - 16373565
Alignment:
Q  14 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattt-gggatttaa 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16373780 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaa 16373681  T
Q  113 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16373680 gcccttgaggagacatgtgctttaatt-aattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 16373582  T
Q  213 tgtgggggagtttgatg 229  Q
    | |||||||||||||||    
T  16373581 tatgggggagtttgatg 16373565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 12187291 - 12187076
Alignment:
Q  14 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattt-gggatttaa 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12187291 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaa 12187192  T
Q  113 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12187191 gcccttgaggagacatgtgctttaatt-aattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 12187093  T
Q  213 tgtgggggagtttgatg 229  Q
    | |||||||||||||||    
T  12187092 tatgggggagtttgatg 12187076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 37942378 - 37942593
Alignment:
Q  14 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattt-gggatttaa 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37942378 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaggaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaa 37942477  T
Q  113 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37942478 gcccttgaggagacatgtgctttaatt-aattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 37942576  T
Q  213 tgtgggggagtttgatg 229  Q
    | |||||||||||||||    
T  37942577 tatgggggagtttgatg 37942593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 22 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 12193697 - 12193491
Alignment:
Q  22 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattt-gggatttaagcccttga 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12193697 acacacacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaagcccttga 12193598  T
Q  121 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 220  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  12193597 ggagacatgtgctttaatt-aattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaggtatggggg 12193499  T
Q  221 agtttgat 228  Q
    ||||||||    
T  12193498 agtttgat 12193491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 225
Target Start/End: Original strand, 6814868 - 6815079
Alignment:
Q  14 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaa 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  6814868 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttat 6814967  T
Q  113 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6814968 gcccttgaggagacatgtgctttaatt-aactgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 6815066  T
Q  213 tgtgggggagttt 225  Q
    | || ||||||||    
T  6815067 tatgagggagttt 6815079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 10147011 - 10147226
Alignment:
Q  14 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaa 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10147011 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaa 10147110  T
Q  113 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10147111 gcccttgaggagacatgtgctttaatt-aactgtcatttgatttaactattgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagactcaag 10147209  T
Q  213 tgtgggggagtttgatg 229  Q
    | |||||||||||||||    
T  10147210 tatgggggagtttgatg 10147226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 15645001 - 15645216
Alignment:
Q  14 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattt-gggatttaa 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15645001 tggacttcacacacacactcacttgaaacttaattgttgggtagaataaagatttcaagaaacacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaa 15645100  T
Q  113 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15645101 gcccttgaggagacatgtgctttaattga-ttgtcatttgatttaactattgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 15645199  T
Q  213 tgtgggggagtttgatg 229  Q
    | |||||||||||||||    
T  15645200 tatgggggagtttgatg 15645216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 10160388 - 10160173
Alignment:
Q  14 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattt-gggatttaa 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  10160388 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggattaaa 10160289  T
Q  113 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10160288 gcccttgaggagacatgtgctttaatt-aactgtcattcgatttaactattgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 10160190  T
Q  213 tgtgggggagtttgatg 229  Q
    | |||||||||||||||    
T  10160189 tatgggggagtttgatg 10160173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 13187632 - 13187418
Alignment:
Q  14 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattt-gggatttaa 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  13187632 tggacttcacacacacactcacttgaaactcgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggattaaa 13187533  T
Q  113 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13187532 gcccttgaggagacatgtgctttaatt-aactgtcatttgatttaactattgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 13187434  T
Q  213 tgtgggggagtttgat 228  Q
    | ||||||||||||||    
T  13187433 tatgggggagtttgat 13187418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 22 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 3245795 - 3245589
Alignment:
Q  22 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 121  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||||| |||||    
T  3245795 acacacatactcacttgagacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttgag 3245696  T
Q  122 gagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 221  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||| |||||    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3245695 gagacataagttttaattgaattgtcatatgataatcttgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 3245596  T
Q  222 gtttgat 228  Q
    |||||||    
T  3245595 gtttgat 3245589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 22 - 229
Target Start/End: Original strand, 2721305 - 2721511
Alignment:
Q  22 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||   |  ||||| |||||    
T  2721305 acacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaattaaaagcctttgag 2721404  T
Q  122 gagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 221  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||| | |||    ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2721405 gagacataagttttaattgaattgtcatattataatcttgtttatgctgctatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgt-gggga 2721503  T
Q  222 gtttgatg 229  Q
    ||||||||    
T  2721504 gtttgatg 2721511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 21 - 229
Target Start/End: Original strand, 4382751 - 4382961
Alignment:
Q  21 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttg 119  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||||| |||    
T  4382751 cacacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaggattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctttg 4382850  T
Q  120 aggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 218  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||    ||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4382851 aggagacatgtgctttgatttaattgtcatatgataatgttgttctatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 4382950  T
Q  219 ggagtttgatg 229  Q
    |||||||||||    
T  4382951 ggagtttgatg 4382961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 22 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 13001634 - 13001425
Alignment:
Q  22 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttga 120  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||||| ||||    
T  13001634 acacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaggattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctttga 13001535  T
Q  121 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 219  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||    ||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13001534 ggagacatgtgctttgatttaattgtcatatgataatgttgttttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 13001435  T
Q  220 gagtttgatg 229  Q
    ||||||||||    
T  13001434 gagtttgatg 13001425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 229
Target Start/End: Original strand, 13097711 - 13097919
Alignment:
Q  21 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||| ||||    
T  13097711 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaaaaaggattacaaagaatgcttgagtttgtgattagtgtacacttgaaattaaagcctttga 13097810  T
Q  121 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 220  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||    ||    ||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13097811 ggagacatgtgttttaattaaattgtcatgaagtaatcttgtttatgctaccatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaaatgtggggg 13097910  T
Q  221 agtttgatg 229  Q
    |||||||||    
T  13097911 agtttgatg 13097919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 10547148 - 10546936
Alignment:
Q  21 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaa--attacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagccct 117  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||||| |    
T  10547148 cacacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaaaggattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctt 10547049  T
Q  118 tgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgata-taactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtg 216  Q
    |||||||||||||||||  | | ||||||||| ||||| || |  ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10547048 tgaggagacatgtgcttcgaattaattgtcatatgataatatcgttttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtg 10546949  T
Q  217 ggggagtttgatg 229  Q
    |||||||||||||    
T  10546948 ggggagtttgatg 10546936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20156722 - 20156515
Alignment:
Q  21 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 120  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||  ||  ||||| ||||    
T  20156722 cacacacacactcacttgagacttgattgttgggttgaataaagtttacaagaaatgcttgagcttgtgattagtgtaaaattgaaataaaagcctttga 20156623  T
Q  121 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataac-tgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 219  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||||| |||| || | ||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20156622 ggagacatgagttttaatttaattgtcatatgat-tatcttgtttatgctaccatgtttatgcattttgcttgaggacaagc-aagattcaagtgtgggg 20156525  T
Q  220 gagtttgatg 229  Q
    ||||||||||    
T  20156524 gagtttgatg 20156515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 229
Target Start/End: Original strand, 1992803 - 1993011
Alignment:
Q  21 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 120  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||||| ||||    
T  1992803 cacacacacactcacttgaaatttgattgttgagttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttga 1992902  T
Q  121 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 220  Q
    ||||||||  | ||||||| ||||||||| |||||    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | | |    
T  1992903 ggagacataagttttaatttaattgtcatatgataatcttgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgagcataagcaaagattcaagtgggagag 1993002  T
Q  221 agtttgatg 229  Q
    |||||||||    
T  1993003 agtttgatg 1993011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 229
Target Start/End: Original strand, 13690608 - 13690816
Alignment:
Q  21 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 120  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||| ||||| ||||    
T  13690608 cacacacacactcatttgaaacttgattgttgggttgaaaaaggattacaaagaatgcttgagtttgtgattagtggacacttgaaattaaagcctttga 13690707  T
Q  121 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 220  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||   |||    ||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  13690708 ggagacatgtgttttaattaaattgtcatgaaataatcttgtttatgctaccatgtttatgccttttgcttgatgacaactaaagattcaagtgtggggg 13690807  T
Q  221 agtttgatg 229  Q
    |||||||||    
T  13690808 agtttgatg 13690816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 229
Target Start/End: Original strand, 11398215 - 11398424
Alignment:
Q  21 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||   ||  ||||| ||||    
T  11398215 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttatgattagtgtacgctttaaataaaagcctttga 11398314  T
Q  121 ggagacatgtgcttt-aattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 219  Q
     |||||||  | ||| |||||||||||| | || ||    ||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11398315 agagacataagttttcaattgaattgtcgtatgttaatcttgtttatgctgctatatttatgccttttgcttgaggacaagcaaatattcaagtgtgggg 11398414  T
Q  220 gagtttgatg 229  Q
    ||||||||||    
T  11398415 gagtttgatg 11398424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14348797 - 14348588
Alignment:
Q  21 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 120  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||||| ||||    
T  14348797 cacacacacactcacttagaacttgattgtttggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttga 14348698  T
Q  121 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataac-tgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 219  Q
    |||||||   | ||||||||||||||||| || ||   | || |  || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14348697 ggagacacaagttttaattgaattgtcatatgttaagtcttgcttatgttaccatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 14348598  T
Q  220 gagtttgatg 229  Q
    ||||||||||    
T  14348597 gagtttgatg 14348588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 24 - 229
Target Start/End: Original strand, 22637702 - 22637908
Alignment:
Q  24 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 123  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||  ||  ||| | |||||||    
T  22637702 acacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaattgcttaagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagtctttgagga 22637801  T
Q  124 gacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactg-ttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 222  Q
    | |||  | ||||||||||||||||| |||||    || ||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  22637802 ggcataagttttaattgaattgtcatatgataatcttgttttatgctaccatgttgatgccttttgcttgagcacaagtaaagattcaagtgtaggggag 22637901  T
Q  223 tttgatg 229  Q
    |||||||    
T  22637902 tttgatg 22637908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 22 - 229
Target Start/End: Original strand, 3279191 - 3279399
Alignment:
Q  22 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 121  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||  ||  ||| | |||||    
T  3279191 acacacacactcacttagaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgttcgagtttgtgattagtgtacacttgaaataaaagtctttgag 3279290  T
Q  122 gagacatgtgctttaattgaattgtcatttgat-ataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 220  Q
    ||||||   | ||||||| ||||||||| || | |  | ||||  || | |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3279291 gagacacaagttttaatttaattgtcatatgttaagtattgtttatgttgctatgtctatgccttttgcttgaggacaaacaaagattcaagtgtggggg 3279390  T
Q  221 agtttgatg 229  Q
    |||||||||    
T  3279391 agtttgatg 3279399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 24 - 229
Target Start/End: Original strand, 17387839 - 17388045
Alignment:
Q  24 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 123  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||    |||  ||  ||||| |||||||    
T  17387839 acacacactcactttaaacttgattgttgggttgaataaagatttcaagaattgcttgagtttgtgattagtgtgtgcttgaaataaaagcctttgagga 17387938  T
Q  124 gacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactg-ttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 222  Q
    || ||  | ||||||||||||||||  |||||    || ||  |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17387939 gatataagttttaattgaattgtcacatgataatcttgttttatgctaccatgttgatgccttttgcttaaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 17388038  T
Q  223 tttgatg 229  Q
    |||||||    
T  17388039 tttgatg 17388045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 12160416 - 12160207
Alignment:
Q  21 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttg 119  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||  ||  || |  |||    
T  12160416 cacacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaa-aagaattacaagaaatgcttgagttttttattagtgtactctttgaaataaaaacatttg 12160318  T
Q  120 aggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 218  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    | ||   ||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12160317 aggagacatgttctttaatttaattgtcatatgataatgttattttatgccaccatgtttatgcattttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 12160218  T
Q  219 ggagtttgatg 229  Q
    |||||||||||    
T  12160217 ggagtttgatg 12160207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 112
Target Start/End: Original strand, 16655798 - 16655897
Alignment:
Q  14 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaa 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16655798 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaa 16655897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 221
Target Start/End: Original strand, 17045697 - 17045902
Alignment:
Q  14 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||    | ||||| ||| |||||  |||||||||||||||| |||  ||  |||    
T  17045697 tggacttcacacacacactcacttggaatttgtt-gttgggttgaataggt-tcacaaggaatacttgaagttgtgattagtgtacacttgaaata-aag 17045793  T
Q  114 cccttgaggagacatgtgcttt-aattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 212  Q
    || ||||||||||||  | ||| |||||||||||||| || ||    ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17045794 cctttgaggagacataagtttttaattgaattgtcatatgttaatcttgtttatgctactatttttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 17045893  T
Q  213 tgtggggga 221  Q
    |||||||||    
T  17045894 tgtggggga 17045902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 221
Target Start/End: Original strand, 17047857 - 17048062
Alignment:
Q  14 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||    | ||||| ||| |||||  |||||||||||||||| |||  ||  |||    
T  17047857 tggacttcacacacacactcacttggaatttgtt-gttgggttgaataggt-tcacaaggaatacttgaagttgtgattagtgtacacttgaaata-aag 17047953  T
Q  114 cccttgaggagacatgtgcttt-aattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 212  Q
    || ||||||||||||  | ||| |||||||||||||| || ||    ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17047954 cctttgaggagacataagtttttaattgaattgtcatatgttaatcttgtttatgctactatttttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 17048053  T
Q  213 tgtggggga 221  Q
    |||||||||    
T  17048054 tgtggggga 17048062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 173 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 27356784 - 27356728
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27356784 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 27356728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 172 - 229
Target Start/End: Original strand, 13601220 - 13601277
Alignment:
Q  172 tatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13601220 tatgtttatgccttttgcttgagaacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 13601277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 173 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 3339282 - 3339226
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3339282 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 3339226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 173 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 12776590 - 12776534
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12776590 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 12776534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 173 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 13136266 - 13136210
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13136266 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 13136210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 173 - 229
Target Start/End: Original strand, 20584262 - 20584318
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20584262 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 20584318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 178 - 229
Target Start/End: Original strand, 15946773 - 15946824
Alignment:
Q  178 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15946773 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 15946824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 171 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14445826 - 14445768
Alignment:
Q  171 ctatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14445826 ctatgtctatgccttttgctttaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 14445768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 173 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 15619339 - 15619283
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15619339 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggcagtttgatg 15619283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 173 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 13195514 - 13195458
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13195514 atgtctatgcattttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgtgggagtttgatg 13195458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 174 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 8686442 - 8686387
Alignment:
Q  174 tgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8686442 tgtttatgctttttgtttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 8686387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 166 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20225817 - 20225754
Alignment:
Q  166 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  20225817 tgctgctatgtttatgtcttttgcttgaggacaaacaaagatttaagtatgggggagtttgatg 20225754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 178 - 229
Target Start/End: Original strand, 13068306 - 13068357
Alignment:
Q  178 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13068306 tatgtcttttggttgaggacaagtaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 13068357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 198 - 229
Target Start/End: Original strand, 2005499 - 2005530
Alignment:
Q  198 aagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2005499 aagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 2005530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 61
Target Start/End: Original strand, 13601062 - 13601108
Alignment:
Q  14 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaata 61  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  13601062 tggacttcacacacacactcacttgaaacttg-ttgttgggttgaata 13601108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 12776739 - 12776660
Alignment:
Q  21 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||  | ||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  12776739 cacacacacactcacttgagacttg-ttgttgggttgaat-aagttcacaaggaatacttgaagttgtgattagtgtacatt 12776660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 102
Target Start/End: Original strand, 15946619 - 15946698
Alignment:
Q  21 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatt 102  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| | || |||||||||||   ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  15946619 cacacacacactcacttgagatttgtt-gtcgggttgaataagt-ttacaaggaatgcttgaagttgtgattagtgtacatt 15946698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 229
Target Start/End: Original strand, 16703307 - 16703363
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  16703307 atgtttataccttttgctttaggttaagcaaagattcaagcatggaggagtttgatg 16703363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 35)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 22665062 - 22665277
Alignment:
Q  14 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22665062 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 22665161  T
Q  114 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22665162 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 22665261  T
Q  214 gtgggggagtttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  22665262 gtgggggagtttgatg 22665277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 117543 - 117758
Alignment:
Q  14 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  117543 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 117642  T
Q  114 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  117643 cccttgaggagacatgtgctttaatcgaattgtcatttgataaaattgtttgagctactacgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaatatgcaagt 117742  T
Q  214 gtgggggagtttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  117743 gtgggggagtttgatg 117758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22044875 - 22044660
Alignment:
Q  14 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22044875 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 22044776  T
Q  114 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22044775 cccttgaggagacatgtgctttaattaaattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 22044676  T
Q  214 gtgggggagtttgatg 229  Q
     |||||||||||||||    
T  22044675 atgggggagtttgatg 22044660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 25357511 - 25357726
Alignment:
Q  14 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25357511 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 25357610  T
Q  114 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25357611 cccttgaggagacatgtgctttaattaaattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 25357710  T
Q  214 gtgggggagtttgatg 229  Q
     |||||||||||||||    
T  25357711 atgggggagtttgatg 25357726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 16775651 - 16775866
Alignment:
Q  14 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16775651 tggacttcacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 16775750  T
Q  114 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16775751 cccttgaggagacatgtgctttaatttaattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 16775850  T
Q  214 gtgggggagtttgatg 229  Q
     |||||||||||||||    
T  16775851 atgggggagtttgatg 16775866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 21 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 11823 - 11615
Alignment:
Q  21 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11823 cacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 11724  T
Q  121 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 220  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  11723 ggagatatgtgctttaatcgaattgtcatttgataaaattgtttgagctactacgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagaggcaagtgtggggg 11624  T
Q  221 agtttgatg 229  Q
    |||||||||    
T  11623 agtttgatg 11615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 17590407 - 17590622
Alignment:
Q  14 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 113  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17590407 tggacttcacatacacactcacttaaaacttgatcgttgggtagaatagagatttccagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 17590506  T
Q  114 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17590507 cccttgaggagacatgtgctttaatttaattgtcatttgatttaactgttgctgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 17590606  T
Q  214 gtgggggagtttgatg 229  Q
     |||||||||||||||    
T  17590607 atgggggagtttgatg 17590622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 24795500 - 24795285
Alignment:
Q  14 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24795500 tggacttcacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 24795401  T
Q  114 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24795400 cccttgaggagacatgtgctttaattaaattgtcatttgatttaactgctgatggtactacgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 24795301  T
Q  214 gtgggggagtttgatg 229  Q
     |||||||||||||||    
T  24795300 atgggggagtttgatg 24795285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 27627580 - 27627796
Alignment:
Q  14 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttg-ggatttaa 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  27627580 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattaatgtacattttaggatttaa 27627679  T
Q  113 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27627680 gcccttgaggagacatgtgctttaattaatttgtcatttgattcaactgtcgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 27627779  T
Q  213 tgtgggggagtttgatg 229  Q
    | |||||||||||||||    
T  27627780 tatgggggagtttgatg 27627796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 25144966 - 25144757
Alignment:
Q  21 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||||    
T  25144966 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattgaagcccttga 25144867  T
Q  121 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactg-ttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 219  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | || || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25144866 ggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgttttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 25144767  T
Q  220 gagtttgatg 229  Q
    ||||||||||    
T  25144766 gagtttgatg 25144757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 22 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 5500473 - 5500265
Alignment:
Q  22 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||   ||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| |||||||||||    
T  5500473 acacacacactcacttgaaacttgattgttgagttgaataaggtttacgtgaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattgaagcccttgag 5500374  T
Q  122 gagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactg-ttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 220  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | || || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5500373 gagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgttttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 5500274  T
Q  221 agtttgatg 229  Q
    |||||||||    
T  5500273 agtttgatg 5500265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 25804475 - 25804267
Alignment:
Q  21 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 120  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||   |  ||||| ||||    
T  25804475 cacacgcacactcacttgaaatttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgaatttgtgattagtgtacgcttgaattaaaagcctttga 25804376  T
Q  121 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 220  Q
    ||| ||||  | ||||||||||||||||| || ||    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25804375 ggatacataagttttaattgaattgtcatatgttaatcttgtttgtgctgctatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 25804276  T
Q  221 agtttgatg 229  Q
    |||||||||    
T  25804275 agtttgatg 25804267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 22 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 23799129 - 23798922
Alignment:
Q  22 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 121  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||||| |||||    
T  23799129 acacacacactcacttagaacttgattgttgggttgaataaaggatacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttgag 23799030  T
Q  122 gagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 221  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||||| ||  ||     ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  23799029 gagacatgagttttgattgaattgtcatatgtaatcttgttttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggataatcaaagattcaagtgtggggga 23798930  T
Q  222 gtttgatg 229  Q
    ||||||||    
T  23798929 gtttgatg 23798922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 25371091 - 25370890
Alignment:
Q  23 cacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgagg 122  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  |||  ||| ||||| ||||||    
T  25371091 cacacacactcacttagaacttgattgttgggttgaataaagattataagaaatgcttgagtttgtaattagtgtacgcttgaaattaaagcctttgagg 25370992  T
Q  123 agacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataa--ctg-ttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 219  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||||   ||||||  ||| ||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25370991 agacatgagttttgattgaattgtcat---atataatcctgtttattgttactatgtttatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 25370895  T
Q  220 gagtt 224  Q
    |||||    
T  25370894 gagtt 25370890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 229
Target Start/End: Original strand, 23643950 - 23644160
Alignment:
Q  21 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacat-ttgggatttaagcccttg 119  Q
    ||||||| ||| ||||| | ||||||| || |||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||  ||  ||||| |||    
T  23643950 cacacacgcacccacttaagacttgattgtagggttgaaaaaggattacaggaaatgcttgagtttgtgattagtgtactccttgaaataaaagcctttg 23644049  T
Q  120 aggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 218  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    | ||   |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23644050 aggagacacgtgctttaatttaattgtcatatgataatgttattttatgctaccatgtttatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 23644149  T
Q  219 ggagtttgatg 229  Q
    |||||||||||    
T  23644150 ggagtttgatg 23644160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 149
Target Start/End: Original strand, 24502168 - 24502297
Alignment:
Q  21 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||  ||||  ||||    
T  24502168 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgtttgaaataaaagcatttga 24502267  T
Q  121 ggagacatgtg-ctttaattgaattgtcat 149  Q
    ||||||||  |  |||||||||||||||||    
T  24502268 ggagacataagtttttaattgaattgtcat 24502297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 75 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 24178348 - 24178193
Alignment:
Q  75 atgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgcttt-aattgaattgtcatttgatataactgttggtgctacta 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||  ||||  ||||||||||||  | ||| |||| ||||||||| |||||    ||||  |||| |||    
T  24178348 atgcttgagtttgtgattagtgtacgtttgaaataaaagcttttgaggagacataagtttttaattaaattgtcatatgataatcttgtttatgctgcta 24178249  T
Q  174 tgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24178248 tgtttatgccttttgtttgaagacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 24178193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 173 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 23159441 - 23159385
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23159441 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 23159385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 173 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 23570698 - 23570642
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23570698 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 23570642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 173 - 229
Target Start/End: Original strand, 27631655 - 27631711
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27631655 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 27631711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 173 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 27768872 - 27768816
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27768872 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 27768816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 178 - 229
Target Start/End: Original strand, 24171510 - 24171561
Alignment:
Q  178 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24171510 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 24171561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 166 - 229
Target Start/End: Original strand, 24506802 - 24506865
Alignment:
Q  166 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24506802 tgctgctatgtttatgtcttttgcttgaggacaataaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 24506865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 173 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 23257625 - 23257570
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  23257625 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtat-ggggagtttgatg 23257570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 173 - 225
Target Start/End: Original strand, 24321328 - 24321380
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagttt 225  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24321328 atgtttacgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagttt 24321380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 166 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 25337714 - 25337651
Alignment:
Q  166 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  25337714 tgctgctatatttatgcctttttcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggaatttgatg 25337651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 168 - 210
Target Start/End: Original strand, 23648123 - 23648165
Alignment:
Q  168 ctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattca 210  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23648123 ctactatgtctatgcattttgcttgaggacaagcaaagattca 23648165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 102
Target Start/End: Original strand, 27631506 - 27631585
Alignment:
Q  21 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatt 102  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||   ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  27631506 cacacacacactcacttgaaatttgtt-gtcgggttgaataagt-ttacaaggaatgcttgaagttgtgattagtgtacatt 27631585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 228
Target Start/End: Original strand, 29955868 - 29955913
Alignment:
Q  183 cttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  29955868 cttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatcgggaagtttgat 29955913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19805662 - 19805618
Alignment:
Q  184 ttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 228  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  19805662 ttttgcttgaggacaagcaatggttctagtgtgggggagtttgat 19805618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21512615 - 21512567
Alignment:
Q  180 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||    
T  21512615 tgccttttgcttgaggacaagcaaggattcaagcatgggggaatttgat 21512567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 173 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 24019123 - 24019068
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 228  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  24019123 atgtttatgtcttttgtttgaggacaaaaaaagattcaagtatgggggaatttgat 24019068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 17334648 - 17334606
Alignment:
Q  186 ttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 228  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  17334648 ttgcttgaggacaatcaatggttcaagtgtgggggagtttgat 17334606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 61
Target Start/End: Original strand, 15532753 - 15532792
Alignment:
Q  21 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaata 61  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  15532753 cacacacacactcacttgaaacttg-ttgttgggttgaata 15532792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 24019267 - 24019228
Alignment:
Q  21 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaata 61  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  24019267 cacacacacactcacttgaaacttg-ttgttgggttgaata 24019228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 16)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 27046874 - 27047089
Alignment:
Q  14 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27046874 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 27046973  T
Q  114 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27046974 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggagctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 27047073  T
Q  214 gtgggggagtttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  27047074 gtgggggagtttgatg 27047089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 17094816 - 17094601
Alignment:
Q  14 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17094816 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaagatttcaagaaatgcttaagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 17094717  T
Q  114 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17094716 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgaattaactattgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 17094617  T
Q  214 gtgggggagtttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  17094616 gtgggggagtttgatg 17094601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21798878 - 21798662
Alignment:
Q  14 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21798878 tggacttcacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggtagaataaaaatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 21798779  T
Q  114 cccttgaggagacatgtgcttt-aattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 212  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21798778 cccttgaggagacatgtgctttaaatttaattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 21798679  T
Q  213 tgtgggggagtttgatg 229  Q
    | |||||||||||||||    
T  21798678 tatgggggagtttgatg 21798662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 20237456 - 20237671
Alignment:
Q  14 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 113  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20237456 tggacttcacacaaacactcacttaaagcttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtggttagtgtacatttgggatttaag 20237555  T
Q  114 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | || ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20237556 cccttgaggagacatgtgctttaatcgaattgtcatttgataaaattatttgtgctactgcatttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 20237655  T
Q  214 gtgggggagtttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  20237656 gtgggggagtttgatg 20237671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 24 - 225
Target Start/End: Original strand, 8653126 - 8653327
Alignment:
Q  24 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 123  Q
    |||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||| |||||||    
T  8653126 acacacacacacttagaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattaaagcctttgagga 8653225  T
Q  124 gacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataa-ct--gttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 220  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||   |||||| ||   ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8653226 gacatgagttttgattgaattgtcat---atataatcttgtttattgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 8653322  T
Q  221 agttt 225  Q
    |||||    
T  8653323 agttt 8653327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 52938830 - 52938621
Alignment:
Q  21 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 120  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||||| ||||    
T  52938830 cacacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaggattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactcttgaaataaaagcctttga 52938731  T
Q  121 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactg-ttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 219  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||    || ||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52938730 ggagacatgtgatttgatttaattgtcatatgataatgttgttttatgctaccatgattatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 52938631  T
Q  220 gagtttgatg 229  Q
    ||||||||||    
T  52938630 gagtttgatg 52938621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 229
Target Start/End: Original strand, 3989944 - 3990154
Alignment:
Q  21 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtac-atttgggatttaagcccttg 119  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||  ||  ||||| |||    
T  3989944 cacacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaggattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgcactctttgaaataaaagcctttg 3990043  T
Q  120 aggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactg-ttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 218  Q
    | |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||    || ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  3990044 acgagacatgtgctttgatttaattgtcatatgataatgttgttttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaaacaaagattcaagtatggg 3990143  T
Q  219 ggagtttgatg 229  Q
    |||||||||||    
T  3990144 ggagtttgatg 3990154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 229
Target Start/End: Original strand, 19364043 - 19364244
Alignment:
Q  28 acactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagaca 127  Q
    ||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||||| |||||||||||    
T  19364043 acactcacttagaactggattgttgggttgaataaagactacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttgaggagaca 19364142  T
Q  128 tgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttga 227  Q
    || | ||| ||||||||||||| ||  ||     ||  |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19364143 tgagttttgattgaattgtcatatgtaatcttgttttatgctgctatgtctatgcattttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttga 19364242  T
Q  228 tg 229  Q
    ||    
T  19364243 tg 19364244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 141 - 229
Target Start/End: Original strand, 14070632 - 14070720
Alignment:
Q  141 aattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14070632 aattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 14070720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 171 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 19875702 - 19875648
Alignment:
Q  171 ctatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagttt 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19875702 ctatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagttt 19875648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 166 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21784535 - 21784472
Alignment:
Q  166 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21784535 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaatattcaagtgtgggggagtttgatg 21784472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 166 - 229
Target Start/End: Original strand, 4027832 - 4027895
Alignment:
Q  166 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4027832 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggaaaagcaaagattcaagggtgggggagtttgatg 4027895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 173 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 16382631 - 16382578
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttg 226  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16382631 atgtttattccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttg 16382578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 166 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 8947578 - 8947515
Alignment:
Q  166 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8947578 tgctgctatgtctatgtcttttccttgaggacaagtaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 8947515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 22 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 21784677 - 21784598
Alignment:
Q  22 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatt 102  Q
    |||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||  | ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  21784677 acacacacactcacttaagacttgtt-gttgggttgaataaagttcacaagaaatacttgaagttgtgattagtgtacatt 21784598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 18478276 - 18478234
Alignment:
Q  186 ttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 228  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  18478276 ttgcttgaggacaagcaatggttcaagtgtaggggagtttgat 18478234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 31)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20596046 - 20595831
Alignment:
Q  14 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20596046 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 20595947  T
Q  114 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20595946 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataaccgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 20595847  T
Q  214 gtgggggagtttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  20595846 gtgggggagtttgatg 20595831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20602332 - 20602117
Alignment:
Q  14 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20602332 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 20602233  T
Q  114 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20602232 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataaccgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 20602133  T
Q  214 gtgggggagtttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  20602132 gtgggggagtttgatg 20602117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20608623 - 20608408
Alignment:
Q  14 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20608623 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 20608524  T
Q  114 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20608523 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataaccgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 20608424  T
Q  214 gtgggggagtttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  20608423 gtgggggagtttgatg 20608408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 15735534 - 15735749
Alignment:
Q  14 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15735534 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaacacttgagtttgtgattagtgtacacttgggatttaag 15735633  T
Q  114 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15735634 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 15735733  T
Q  214 gtgggggagtttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  15735734 gtgggggagtttgatg 15735749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 23748051 - 23748266
Alignment:
Q  14 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23748051 tggacttcacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 23748150  T
Q  114 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23748151 cccttgaggagacatgtgctttaatttaattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 23748250  T
Q  214 gtgggggagtttgatg 229  Q
     |||||||||||||||    
T  23748251 atgggggagtttgatg 23748266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 23710892 - 23710701
Alignment:
Q  14 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23710892 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 23710793  T
Q  114 cccttgaggagacatgtgctttaattg-aattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaa 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23710792 cccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaa 23710701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 21 - 229
Target Start/End: Original strand, 24940540 - 24940749
Alignment:
Q  21 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattt-gggatttaagcccttg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  24940540 cacacactcactcacttgaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtttacattttgggatttaagcccttg 24940639  T
Q  120 aggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 219  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24940640 aggagacatgtgctttaattaaattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggg 24940739  T
Q  220 gagtttgatg 229  Q
    ||||||||||    
T  24940740 gagtttgatg 24940749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 18072900 - 18073115
Alignment:
Q  14 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattt-gggatttaa 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18072900 tggacttcacacacacactcacttgaaacttaattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaa 18072999  T
Q  113 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18073000 gcccttgaggagacatgtgctttaattga-ttgtcatttgatttaactattgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 18073098  T
Q  213 tgtgggggagtttgatg 229  Q
    | |||||||||||||||    
T  18073099 tatgggggagtttgatg 18073115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 24953389 - 24953174
Alignment:
Q  14 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattt-gggatttaa 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24953389 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaa 24953290  T
Q  113 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24953289 gcccttgaggagacatgtgctttaatt-aattgtcatttgatttaactattgatgctactatgtttataccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 24953191  T
Q  213 tgtgggggagtttgatg 229  Q
    | |||||||||||||||    
T  24953190 tatgggggagtttgatg 24953174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 22 - 211
Target Start/End: Original strand, 20622170 - 20622359
Alignment:
Q  22 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 121  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20622170 acacacacactcacttaaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 20622269  T
Q  122 gagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaa 211  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20622270 gagacatgtgctttaattaaattgtcatttgatttaattgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaa 20622359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20790929 - 20790714
Alignment:
Q  14 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattt-gggatttaa 112  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  20790929 tggacttcacacacacactcgcttgaaacttgattgttaggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggattaaa 20790830  T
Q  113 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20790829 gcccttgaggagacatgtgctttaatt-aactgtcatttgatttaactattgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 20790731  T
Q  213 tgtgggggagtttgatg 229  Q
    | |||||||||||||||    
T  20790730 tatgggggagtttgatg 20790714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 23600845 - 23600636
Alignment:
Q  21 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||    
T  23600845 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttga 23600746  T
Q  121 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgt-tggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 219  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||  | ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23600745 ggagacatgtgttctaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 23600646  T
Q  220 gagtttgatg 229  Q
    || |||||||    
T  23600645 gaatttgatg 23600636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 229
Target Start/End: Original strand, 24219752 - 24219961
Alignment:
Q  21 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||||    
T  24219752 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattgaagcccttga 24219851  T
Q  121 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactg-ttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 219  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | || || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24219852 ggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgttttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagactcaagtgtgggg 24219951  T
Q  220 gagtttgatg 229  Q
    ||||||||||    
T  24219952 gagtttgatg 24219961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 20445048 - 20444843
Alignment:
Q  21 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||||    
T  20445048 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattgaagcccttga 20444949  T
Q  121 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgat-ataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 219  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||    || ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20444948 ggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattattttgtgctaccatatttatgccttttgcttgaggacaatcaaagattcaagtgtgggg 20444849  T
Q  220 gagttt 225  Q
    ||||||    
T  20444848 gagttt 20444843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 35 - 229
Target Start/End: Original strand, 21387410 - 21387605
Alignment:
Q  35 cttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctt 134  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||| | ||||||||||||  | ||    
T  21387410 cttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaatgaaagtctttgaggagacataagttt 21387509  T
Q  135 t-aattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    | |||||||||||||| || ||    |||  ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21387510 tcaattgaattgtcatatgttagtcttgtgtgtgctgctatgtttatgcatttttcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 21387605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20916660 - 20916456
Alignment:
Q  25 cacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggag 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||  ||  ||||| ||||||||    
T  20916660 cacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagttcgtgattagtgtacggttgaaataaaagcctttgaggag 20916561  T
Q  125 acatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtt 224  Q
    ||||| | ||| ||| ||||||| | ||  ||     ||  |||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| ||||||||    
T  20916560 acatgagttttgatttaattgtcctatgtaatcttattttatgcagctatgtctatgccttttgcttgaggacaaccaaaaattcatgtgtaggggagtt 20916461  T
Q  225 tgatg 229  Q
    |||||    
T  20916460 tgatg 20916456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 99
Target Start/End: Original strand, 22948518 - 22948596
Alignment:
Q  21 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtac 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22948518 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaaaaaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtac 22948596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 145
Target Start/End: Original strand, 20575510 - 20575633
Alignment:
Q  22 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 121  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||||| |||||    
T  20575510 acacacgcactcacttgaaacttgattgtcgggttgaataaagactacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttgag 20575609  T
Q  122 gagacatgtgctttaattgaattg 145  Q
    |||||||| | ||| |||||||||    
T  20575610 gagacatgagttttgattgaattg 20575633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 173 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22317569 - 22317513
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22317569 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 22317513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 173 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 25006864 - 25006808
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25006864 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 25006808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 173 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 30759711 - 30759655
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30759711 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 30759655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 166 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 18484275 - 18484212
Alignment:
Q  166 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18484275 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgttggggagtttgatg 18484212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 179 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 25116221 - 25116171
Alignment:
Q  179 atgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25116221 atgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 25116171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 173 - 229
Target Start/End: Original strand, 26847803 - 26847859
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26847803 atgtctatgccttttggttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 26847859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 184 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 25175306 - 25175261
Alignment:
Q  184 ttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175306 ttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 25175261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 173 - 225
Target Start/End: Original strand, 22855723 - 22855775
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagttt 225  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22855723 atgtctatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagttt 22855775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 228
Target Start/End: Original strand, 27270563 - 27270607
Alignment:
Q  184 ttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 228  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27270563 ttttgcttgaggacaagcaatgattcaagtgtgggggagtttgat 27270607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 22317719 - 22317639
Alignment:
Q  21 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatt 102  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||  | ||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  22317719 cacacacacactcacttaagacttgtt-gttgggttgaataaagttcacaaggaatacttgaagttgtgattagtgtacatt 22317639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 228
Target Start/End: Original strand, 17412736 - 17412784
Alignment:
Q  180 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 228  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  17412736 tgccttttgcttgacgacaaacaatgattcaagtatgggggagtttgat 17412784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 102
Target Start/End: Original strand, 22855572 - 22855651
Alignment:
Q  21 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatt 102  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||   ||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  22855572 cacacacacactcacttaagacttgtt-gttgggttgaataagt-ttacaaggaatacttgaagttgtgattagtgtacatt 22855651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 25007012 - 25006934
Alignment:
Q  22 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatt 102  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||   ||||||| |||||||||  || |||||||||||||||    
T  25007012 acacacacactcacttgaaatttgtt-gtcgggttgaataagt-ttacaaggaatgcttgaagttatgattagtgtacatt 25006934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 15678 - 15893
Alignment:
Q  14 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15678 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgagatttaag 15777  T
Q  114 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15778 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 15877  T
Q  214 gtgggggagtttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  15878 gtgggggagtttgatg 15893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 29)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 21382093 - 21382309
Alignment:
Q  14 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21382093 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 21382192  T
Q  114 cccttgaggagacatgtgctttaattg-aattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21382193 cccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 21382292  T
Q  213 tgtgggggagtttgatg 229  Q
    | |||||||||||||||    
T  21382293 tatgggggagtttgatg 21382309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21099009 - 21098794
Alignment:
Q  14 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21099009 tggacttcacacacacactcacttaaaacttgatcattgggttgaataaaaatgacaagaaatgcttgaatttgtgattagtgtacatttgggatttaag 21098910  T
Q  114 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21098909 cccttgaggagacatgtgctttaatcgaattgtcatttgataaaattgtttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 21098810  T
Q  214 gtgggggagtttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  21098809 gtgggggagtttgatg 21098794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21104330 - 21104115
Alignment:
Q  14 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21104330 tggacttcacacacacactcacttaaaacttgatcattgggttgaataaaaatgacaagaaatgcttgaatttgtgattagtgtacatttgggatttaag 21104231  T
Q  114 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21104230 cccttgaggagacatgtgctttaatcgaattgtcatttgataaaattgtttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 21104131  T
Q  214 gtgggggagtttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  21104130 gtgggggagtttgatg 21104115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 23911441 - 23911655
Alignment:
Q  14 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23911441 tggacttcacacacacactcacttgaaatttgatc-ttgggttgaataaaaattacaagaaatgtttaagtttgtgattagtgtacatctgggatttaag 23911539  T
Q  114 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23911540 cccttgaggagacatgtgctttaatcgaattgtcatttgatataactattggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 23911639  T
Q  214 gtgggggagtttgatg 229  Q
     |||||||||||||||    
T  23911640 atgggggagtttgatg 23911655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 8314467 - 8314683
Alignment:
Q  14 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8314467 tggacttcacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 8314566  T
Q  114 cccttgaggagacatgtgcttt-aattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 212  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8314567 cccttgaggagacatgtgctttaaatttaattgtcatttgatttaaatgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 8314666  T
Q  213 tgtgggggagtttgatg 229  Q
    | |||||||||||||||    
T  8314667 tatgggggagtttgatg 8314683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 8323062 - 8322846
Alignment:
Q  14 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattt-gggatttaa 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8323062 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaa 8322963  T
Q  113 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8322962 gcccttgaggagacatgtgctttaattaatttgtcatttgatttaactgtcgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 8322863  T
Q  213 tgtgggggagtttgatg 229  Q
    | || ||||||||||||    
T  8322862 tatgagggagtttgatg 8322846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21843733 - 21843524
Alignment:
Q  21 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||  ||||||||||||||    
T  21843733 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattactgtacgcttgaaatttaagcccttga 21843634  T
Q  121 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgt-tggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 219  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21843633 ggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 21843534  T
Q  220 gagtttgatg 229  Q
    ||||||||||    
T  21843533 gagtttgatg 21843524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21940206 - 21939996
Alignment:
Q  21 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttg 119  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||||| |||    
T  21940206 cacacacacactcacttcagacttgattgttgggttgaaaaaggattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaatgaaagcctttg 21940107  T
Q  120 aggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    | ||   |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21940106 aggagacatgtgctttaatttaattgtcatatgataatgttattttatgctaccatgtttatgccttttgcttgagaacaagcaaagattcaagtgtggg 21940007  T
Q  219 ggagtttgatg 229  Q
    |||||||||||    
T  21940006 ggagtttgatg 21939996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20039189 - 20038981
Alignment:
Q  21 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 120  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||    
T  20039189 cacacacacactcatttgaaacttgattgttgggttgaaaaaggattacaagaaatacttgagtttgtgattattgtacatttgaaattaaagcctttga 20039090  T
Q  121 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 220  Q
     |||||||||   ||| || || |||||| ||||     ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20039089 agagacatgtatcttagttaaaatgtcatgtgatgatcttgtttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 20038990  T
Q  221 agtttgatg 229  Q
    |||||||||    
T  20038989 agtttgatg 20038981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 22 - 229
Target Start/End: Original strand, 23454945 - 23455154
Alignment:
Q  22 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||  ||  ||||| |||||    
T  23454945 acacacacactcacttgaaacttgattgttggattgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtatgcttgaaatgaaagcctttgag 23455044  T
Q  122 gagacatgtgcttt-aattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgt-gggg 219  Q
    |||||||    ||| |||||||||||||| ||  |    ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23455045 gagacataaattttcaattgaattgtcatatgtgagtcttgtttatgctactatgtttatgccttttgctcgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 23455144  T
Q  220 gagtttgatg 229  Q
    ||||||||||    
T  23455145 gagtttgatg 23455154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 22 - 229
Target Start/End: Original strand, 17620755 - 17620961
Alignment:
Q  22 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||  |||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||| |||  ||| ||||| |||||    
T  17620755 acacacacactcacttgaaacttgattgttgg-ttgaaaaaggattacaaagaatgcttgagtttatgattagggtacacttgaaattaaagcctttgag 17620853  T
Q  122 gagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 221  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||    ||    ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17620854 gagacatgtgttttaattaaattgtcatgaagtaatcttgtttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaaaattcaagtgtggggga 17620953  T
Q  222 gtttgatg 229  Q
    ||||||||    
T  17620954 gtttgatg 17620961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16418830 - 16418620
Alignment:
Q  21 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttg 119  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||||| |||    
T  16418830 cacacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaggattataagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctttg 16418731  T
Q  120 aggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 218  Q
    |||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||    | ||   |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16418730 aggagacatgtgttttaatgtaattgtcatatgataatgttattttatgctaccatgtttatgccttttgcttgagaacaagcaaagattcaagtgtggg 16418631  T
Q  219 ggagtttgatg 229  Q
    |||||||||||    
T  16418630 ggagtttgatg 16418620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 50 - 229
Target Start/End: Original strand, 24034049 - 24034230
Alignment:
Q  50 ttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgcttt-aattgaattgtca 148  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||  ||| ||||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  24034049 ttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacgcttgaaattaaagcctttgaggagacataagttttcaattgaattgtca 24034148  T
Q  149 tttgata-taactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    | |  || |  |  ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24034149 tatattaatctcgtttattgctactatgtttatgccttttgcttgtggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 24034230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 22 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 14352378 - 14352181
Alignment:
Q  22 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 121  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| || ||||||||||  |||  ||  |||||   |||    
T  14352378 acacacacactcacttgagacttgattgttgggttgaataaagattacaaagaatgcttgagttagtaattagtgtacgcttgaaataaaagcctcggag 14352279  T
Q  122 gagacatgtgctttaa-ttgaattgtcatttgatataac-tgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 218  Q
    |||||||| | ||||| || ||||||||| | || || | ||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14352278 gagacatgagttttaattttaattgtcatataat-tatcttgtttatgctaccatgtttatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 14352181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 40 - 229
Target Start/End: Original strand, 21538573 - 21538765
Alignment:
Q  40 aacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatta--gtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaa 137  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||  ||||||  |||  ||| ||| | ||||||||||||  | |||||    
T  21538573 aacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaaccctggagtttgtgattatagtgtacgattgaaattaaagtctttgaggagacataagttttaa 21538672  T
Q  138 ttgaattgtcatttgatataactgttgg-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||||||||||| |||||    ||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  21538673 ttgaattgtcatatgataatcttgttttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaaaatttaagtgtgggggattttgatg 21538765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 118 - 229
Target Start/End: Original strand, 20712537 - 20712649
Alignment:
Q  118 tgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttg-gtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtg 216  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||    ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  20712537 tgaggagacatgtgctttgattaaattgtcatatgataatgttgttttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagatttaagtgta 20712636  T
Q  217 ggggagtttgatg 229  Q
    |||||||||||||    
T  20712637 ggggagtttgatg 20712649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 173 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 11347009 - 11346953
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11347009 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 11346953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 173 - 229
Target Start/End: Original strand, 19767684 - 19767740
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19767684 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 19767740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 173 - 229
Target Start/End: Original strand, 22370102 - 22370158
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22370102 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 22370158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 178 - 229
Target Start/End: Original strand, 20002279 - 20002330
Alignment:
Q  178 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20002279 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 20002330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 173 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22033611 - 22033555
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22033611 atgtctatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 22033555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 173 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22099711 - 22099655
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22099711 atgtctatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 22099655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 173 - 229
Target Start/End: Original strand, 22102552 - 22102608
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22102552 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtaggggagtttgatg 22102608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 178 - 229
Target Start/End: Original strand, 21831181 - 21831232
Alignment:
Q  178 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21831181 tatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 21831232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 90
Target Start/End: Original strand, 20712470 - 20712539
Alignment:
Q  21 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtga 90  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  20712470 cacacacacactcatttgagacttgattgttgggttgaaaaaagattacaagaaatgattgagtttgtga 20712539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 178 - 229
Target Start/End: Original strand, 22817755 - 22817806
Alignment:
Q  178 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22817755 tatgtcttttgcttgaggaaaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 22817806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 18573025 - 18572977
Alignment:
Q  180 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 228  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  18573025 tgccttttgcttaaggacaagaaaaaattcaagtatgggggagtttgat 18572977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19902216 - 19902174
Alignment:
Q  186 ttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 228  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  19902216 ttgcttgaggacaagcaacggttcaagtgtaggggagtttgat 19902174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 102
Target Start/End: Original strand, 22102403 - 22102482
Alignment:
Q  21 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatt 102  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| | || |||||||||||   ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  22102403 cacacacgcactcacttgaaatttgtt-gtcgggttgaataagt-ttacaaggaatgcttgaagttgtgattagtgtacatt 22102482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 160; Significance: 2e-85; HSPs: 2)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 1038 - 1253
Alignment:
Q  14 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 113  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1038 tggacttcacacatacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 1137  T
Q  114 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1138 cccttgaggagacatgtgctttaattaaattgtcatttgatttaactgctgatgctactacgtttatgccttttgcttgaggaaaagcaaagattcaagt 1237  T
Q  214 gtgggggagtttgatg 229  Q
     |||||||||||||||    
T  1238 atgggggagtttgatg 1253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 156 - 229
Target Start/End: Original strand, 3451 - 3524
Alignment:
Q  156 taactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3451 taactgctgatgctactacgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 3524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 831 - 615
Alignment:
Q  14 tggacatcacacacacactcacttgaaa-cttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaa 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  831 tggacttcacacacacactcacttaaaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaa 732  T
Q  113 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 212  Q
     ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| || |||| ||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  731 tcccttgaggagacttgtgctttaatcgaattgtgatttgataaaattgtttgtgctaccatatttatgctttttgctttaggacaagcaaagattcaag 632  T
Q  213 tgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||||||||||||||||    
T  631 tgtgggggagtttgatg 615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 229
Target Start/End: Original strand, 220 - 428
Alignment:
Q  21 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||   ||| ||||||||||    
T  220 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttcagtttgtgattagtgtacgctttaaattaaagcccttga 319  T
Q  121 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 220  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||||||  ||||  | ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  320 ggagacatgtattttaattaaattgtcatacgataatattgtttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatggggg 419  T
Q  221 agtttgatg 229  Q
    |||||||||    
T  420 agtttgatg 428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0825 (Bit Score: 119; Significance: 6e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0825
Description:

Target: scaffold0825; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 24 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 3058 - 2852
Alignment:
Q  24 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 123  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||| |||||||| ||||    
T  3058 acacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacacatgaaattaaagcccttaagga 2959  T
Q  124 gacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactg-ttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 222  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | || || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  2958 gacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgttttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgtgggag 2859  T
Q  223 tttgatg 229  Q
    |||||||    
T  2858 tttgatg 2852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 114; Significance: 6e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 252079 - 251870
Alignment:
Q  21 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 120  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||  ||| ||||||||||    
T  252079 cacacacacactcacttggaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgactagtgtacgcttgaaattaaagcccttga 251980  T
Q  121 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactg-ttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 219  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||  | || || ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  251979 ggagacatgtgttttaattaaattgtcaaatgataatattgttttgtgctaccatgtttatgccatttgcttgaggacaagtaaagattcaagtgtgggg 251880  T
Q  220 gagtttgatg 229  Q
    ||||||||||    
T  251879 gagtttgatg 251870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 29 - 229
Target Start/End: Original strand, 11064 - 11264
Alignment:
Q  29 cactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacat 128  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||   ||| ||||||||||||||||||    
T  11064 cactcacttgaaacttaatttttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttaaaattaaagcccttgaggagacat 11163  T
Q  129 gtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 228  Q
    ||| ||||||| ||||||||| |||||  | ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11164 gtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgat 11263  T
Q  229 g 229  Q
    |    
T  11264 g 11264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0506 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0506
Description:

Target: scaffold0506; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 2496 - 2287
Alignment:
Q  21 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 120  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||||| ||||    
T  2496 cacacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactcttgaaataaaagcctttga 2397  T
Q  121 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactg-ttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 219  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||    || ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2396 ggagacatgtgctttgatttaattgtcatatgataatgttgttttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggg 2297  T
Q  220 gagtttgatg 229  Q
    ||||||||||    
T  2296 gagtttgatg 2287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 107; Significance: 9e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 21 - 229
Target Start/End: Original strand, 831 - 1041
Alignment:
Q  21 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttg 119  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||||| |||    
T  831 cacacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaggattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctttg 930  T
Q  120 aggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactg-ttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    |  ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  931 aggagacatgtgctttaatttaattgtcatatgataatgttaatttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 1030  T
Q  219 ggagtttgatg 229  Q
    |||||||||||    
T  1031 ggagtttgatg 1041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 22 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14869 - 14662
Alignment:
Q  22 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||   ||||||||||||||||||||| ||| || |||||  |||  ||| |||||||||||    
T  14869 acacacacactcacttgaaacttgattgttgggtttcataaggtttacaagaaatgcttgagtttatgaataatgtacgcttgaaattaaagcccttgag 14770  T
Q  122 gagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 221  Q
    |||||||||| ||||||| |||| |||| |||||  | ||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14769 gagacatgtgttttaattaaattttcatatgataatattgtttatgctaccatgtttatgcctttttcttgaggacaagcaaagattcaagtatggggga 14670  T
Q  222 gtttgatg 229  Q
    ||||||||    
T  14669 gtttgatg 14662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0773 (Bit Score: 102; Significance: 9e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0773
Description:

Target: scaffold0773; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 24 - 229
Target Start/End: Original strand, 482 - 687
Alignment:
Q  24 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 123  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||  ||||  |||||||    
T  482 acacacactcatttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaaaaaatggttgagtttgtgattagtgtacacttgaaataaaagcttttgagga 581  T
Q  124 gacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagt 223  Q
    |||||    ||||||||||||||||| |||||    ||||  |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  582 gacattaattttaattgaattgtcatatgataatcttgtttatgctgctatgtttatacattttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagt 681  T
Q  224 ttgatg 229  Q
    ||||||    
T  682 ttgatg 687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0679 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0679
Description:

Target: scaffold0679; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 229
Target Start/End: Original strand, 7941 - 8149
Alignment:
Q  21 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 120  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||    
T  7941 cacacacacactcatttgaaacttgattgttgggttgaaaaaggattacaagaaatgctcgagtttgtgattagtgtacatttgaaattaaagcctttga 8040  T
Q  121 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 220  Q
     |||||||||| |||| || || |||||| | ||     ||||  ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8041 agagacatgtgttttagttaaaatgtcatgtaatgatcttgtttatgctaccgtgtttatgccttttgcttgaagacaagcaaagattcaagtgtggggg 8140  T
Q  221 agtttgatg 229  Q
    |||||||||    
T  8141 agtttgatg 8149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 22 - 229
Target Start/End: Original strand, 120954 - 121162
Alignment:
Q  22 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 121  Q
    |||||||||| |||||| |||||| | ||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||  ||| |||||||||||    
T  120954 acacacacacacacttggaacttggttgttgggttgaataaggtttacaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattaaagcccttgag 121053  T
Q  122 gagacatgtgctttaattgaattgtcat-ttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 220  Q
    |||||||||| || |||| ||||||||| |  | |||    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  121054 gagacatgtgtttcaattaaattgtcatataaaaatattattttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 121153  T
Q  221 agtttgatg 229  Q
    |||||||||    
T  121154 agtttgatg 121162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 71 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 164562 - 164403
Alignment:
Q  71 agaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttg-gtgct 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  ||   ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | ||||  |||||    
T  164562 agaaatgcttgagtttgtgattagtgtgcgctttaaattgaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgttttgtgct 164463  T
Q  170 actatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  164462 accatgtttatgccttttgcttgaggataagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 164403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 166 - 228
Target Start/End: Original strand, 172254 - 172316
Alignment:
Q  166 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  172254 tgctgctatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 172316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 166 - 229
Target Start/End: Original strand, 161995 - 162058
Alignment:
Q  166 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  161995 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 162058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0974 (Bit Score: 87; Significance: 8e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0974
Description:

Target: scaffold0974; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 229
Target Start/End: Original strand, 1108 - 1318
Alignment:
Q  21 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttg 119  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||  ||  ||||| |||    
T  1108 cacacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaggattataagaaatgcttgagtttgtgattaatgtactctttgaaataaaagcctttg 1207  T
Q  120 aggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 218  Q
    ||| ||||||||| |||||  ||||||||| |||||    | ||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1208 aggggacatgtgccttaatgtaattgtcatatgataatgttattttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 1307  T
Q  219 ggagtttgatg 229  Q
    |||||||||||    
T  1308 ggagtttgatg 1318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 87; Significance: 8e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 58838 - 58628
Alignment:
Q  21 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttg 119  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||||  |||    
T  58838 cacacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaggattataagaaatggttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcatttg 58739  T
Q  120 aggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 218  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||    | ||   |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  58738 aggagacatgtgctttaatgtaattgtcatatgataatgttattttatgctaccatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 58639  T
Q  219 ggagtttgatg 229  Q
    |||||||||||    
T  58638 ggagtttgatg 58628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 87; Significance: 8e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 97936 - 97726
Alignment:
Q  21 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttg 119  Q
    |||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||||  |||    
T  97936 cacacacatactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaggattataagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcatttg 97837  T
Q  120 aggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 218  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||    | ||   |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  97836 aggagacatgtgctttaatgtaattgtcatatgataatgttattttatgctaccatgtttatgccttttgctttaggacaagcaaagattcaagtgtggg 97737  T
Q  219 ggagtttgatg 229  Q
    |||||||||||    
T  97736 ggagtttgatg 97726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0328 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0328
Description:

Target: scaffold0328; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 718 - 510
Alignment:
Q  21 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 120  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||  ||||| ||||    
T  718 cacacacacactcacttagaacttgattgttgggttgaataaaggttacaagaaatgtttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttga 619  T
Q  121 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 220  Q
    ||||| ||  | ||| ||||||||||||| ||  ||     ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  618 ggagatataagttttgattgaattgtcatatgtaatcttgttttatgctactatatttatgccttttgcttgaggacaaacaaagattcaagtatggggg 519  T
Q  221 agtttgatg 229  Q
    |||||||||    
T  518 agtttgatg 510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 111 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 10325 - 10206
Alignment:
Q  111 aagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgt-tggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattc 209  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10325 aagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattc 10226  T
Q  210 aagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  10225 aagtttgggggagtttgatg 10206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 24 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 13207 - 13002
Alignment:
Q  24 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 123  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||   ||  ||  ||||| ||||| |    
T  13207 acacgcactcacttgaaacttgattcttgggtttaataaagattacaagaaatgcttgagtatggtattagtgtacgcatgaaataaaagcctttgagaa 13108  T
Q  124 gacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagt 223  Q
    |||||  | |||||||||||| | || |||||    || |  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13107 gacataagttttaattgaattattatatgataatcttggttatgctactatgtttatgcctcttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggcggagt 13008  T
Q  224 ttgatg 229  Q
    ||||||    
T  13007 ttgatg 13002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 24 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 35307 - 35104
Alignment:
Q  24 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaa------ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccct 117  Q
    ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||      |||| |  |||||||||||||||||||| |||||| |||  ||| ||||| |    
T  35307 acacacactcatttgaaacttcattgttgggttgaaaaaaaaaaaagattaccaagaatgcttgagtttgtgattactgtacacttgaaattaaagcctt 35208  T
Q  118 tgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 217  Q
      |||||||||||| |||| |||||||||||| |        ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35207 aaaggagacatgtgttttagttgaattgtcatct--------tgtttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaaggaaagattcaagtgtgg 35116  T
Q  218 gggagtttgatg 229  Q
    ||||||||||||    
T  35115 gggagtttgatg 35104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0582 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0582
Description:

Target: scaffold0582; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 82 - 229
Target Start/End: Original strand, 8720 - 8869
Alignment:
Q  82 agtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tgctactatgttta 179  Q
    ||||||||||||||||||  ||||  ||  ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||    ||||   |||||| |||||||    
T  8720 agtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctttgaggagacatgtgctttgatttaattgtcatatgataatgttgttttatgctaccatgttta 8819  T
Q  180 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8820 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 8869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 68 - 227
Target Start/End: Original strand, 12450 - 12609
Alignment:
Q  68 acaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataa--ctgttgg 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||  ||  ||| | |||||||||||||   ||| |||||||||||||   ||||||  |||||      
T  12450 acaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtatgcttgaaataaaagtctttgaggagacatgaattttgattgaattgtcat---atataatcctgttta 12546  T
Q  166 t-gctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttga 227  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12547 ttgctactatgtttatgcctttttcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttga 12609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 68 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 232948 - 232789
Alignment:
Q  68 acaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataa--ctgttgg 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||  ||  ||| | |||||||||||||   ||| |||||||||||||   ||||||  |||||      
T  232948 acaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtatgcttgaaataaaagtctttgaggagacatgaattttgattgaattgtcat---atataatcctgttta 232852  T
Q  166 t-gctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttga 227  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  232851 ttgctactatgtttatgcctttttcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttga 232789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0512 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0512
Description:

Target: scaffold0512; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 229
Target Start/End: Original strand, 5090 - 5295
Alignment:
Q  21 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 120  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||    | ||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||  | | | || || | ||    
T  5090 cacacacacactcacttgagactt-attgttgggttgaataggt-tcacaaggaatacttgaagttgtgattagtgtacatt--gaaatgaaaccttaga 5185  T
Q  121 ggagacatgtgctttaatt-gaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 219  Q
    ||||||||  ||||| ||| |||||||||| || |||   | ||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5186 ggagacataagcttttatttgaattgtcatatgttatcttttttattgctgctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 5285  T
Q  220 gagtttgatg 229  Q
    ||||||||||    
T  5286 gagtttgatg 5295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 128 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 38610 - 38508
Alignment:
Q  128 tgtgctttaattgaattgtcatttgata-taactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttg 226  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||||| ||  | || ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38610 tgtgttttaattaaattgtcatatgataatatttttttgtgctaccatgtttatgctttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttg 38511  T
Q  227 atg 229  Q
    |||    
T  38510 atg 38508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 49 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 38675 - 38625
Alignment:
Q  49 gttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtac 99  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38675 gttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattaatgtac 38625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 166 - 229
Target Start/End: Original strand, 42237 - 42300
Alignment:
Q  166 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42237 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 42300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 166 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 50569 - 50506
Alignment:
Q  166 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50569 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 50506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 88403 - 88361
Alignment:
Q  186 ttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 228  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  88403 ttgcttgaggacaagcaatggttcaagtgtaggggagtttgat 88361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0861 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0861
Description:

Target: scaffold0861; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 171 - 229
Target Start/End: Original strand, 912 - 970
Alignment:
Q  171 ctatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  912 ctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0566 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0566
Description:

Target: scaffold0566; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 173 - 229
Target Start/End: Original strand, 2762 - 2818
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2762 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 2818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0566; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 102
Target Start/End: Original strand, 2612 - 2692
Alignment:
Q  21 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatt 102  Q
    ||||||||||||||||| | || || | |||||||||||||||  | ||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  2612 cacacacacactcacttaagacatgtt-gttgggttgaataaagttcacaaggaatacttgaagttgtgattagtgtacatt 2692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1095 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold1095
Description:

Target: scaffold1095; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 88
Target Start/End: Original strand, 2859 - 2926
Alignment:
Q  21 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgt 88  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  2859 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgt 2926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 178 - 229
Target Start/End: Original strand, 12743 - 12794
Alignment:
Q  178 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12743 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 12794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0258 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0258
Description:

Target: scaffold0258; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 166 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22218 - 22159
Alignment:
Q  166 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagttt 225  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22218 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagttt 22159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0384 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0384
Description:

Target: scaffold0384; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 173 - 229
Target Start/End: Original strand, 10720 - 10776
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10720 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattaaagtgtgggggagtttgatg 10776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 173 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 54905 - 54849
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  54905 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagcgtgggggagtttgatg 54849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1225 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1225
Description:

Target: scaffold1225; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 166 - 229
Target Start/End: Original strand, 1839 - 1902
Alignment:
Q  166 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1839 tgctgctatatttatgccttttgcttgagaacaatcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 1902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 166 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 37806 - 37743
Alignment:
Q  166 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37806 tgctgctatgtctattccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggaatttgatg 37743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 22 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 37948 - 37869
Alignment:
Q  22 acacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatt 102  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||  | ||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  37948 acacacacactcacttaagacttgat-gttgggttgaataaagttcacaaggaatacttgaagttgtgattagtgtacatt 37869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0094 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0094
Description:

Target: scaffold0094; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 173 - 228
Target Start/End: Original strand, 1193 - 1248
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 228  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1193 atgtttatgccttttgcttgtggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgat 1248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0094; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 61
Target Start/End: Original strand, 1041 - 1080
Alignment:
Q  21 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaata 61  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  1041 cacacacacactcacttgaaacttg-ttgttgggttgaata 1080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 23 - 225
Target Start/End: Original strand, 37722 - 37922
Alignment:
Q  23 cacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgagg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    |  |||| ||| |||||  |||||||||||||||| |||  ||| ||||| ||||||    
T  37722 cacacacactcacttgaaacttgtt-gttgggttgaataggt-tcgcaaggaatacttgatgttgtgattagtgtacacttgaaatt-aagcctttgagg 37818  T
Q  123 agacatgtgcttt-aattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 221  Q
    ||||||  | ||| |||||||||||||| |  ||    ||||  || | ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  37819 agacataagattttaattgaattgtcatattttaattttgtttatgttgctatgtttatggcttttgcttgagggcaagaaaagattcaagtgtggggga 37918  T
Q  222 gttt 225  Q
    ||||    
T  37919 gttt 37922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 166 - 229
Target Start/End: Original strand, 22756 - 22818
Alignment:
Q  166 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22756 tgctgctatgtctatgccttt-gcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 22818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 166 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 45291 - 45228
Alignment:
Q  166 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45291 tgctgctatgtctatgtcttttgcttgagaacaagcaaagattcaggtgtgggggagtttgatg 45228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 72622 - 72572
Alignment:
Q  179 atgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  72622 atgccttttgcttgaggaaaagtaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 72572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 84812 - 84762
Alignment:
Q  179 atgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  84812 atgccttttgcttgaggaaaagtaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 84762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 184 - 229
Target Start/End: Original strand, 18218 - 18263
Alignment:
Q  184 ttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 229  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18218 tttttcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 18263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 173 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 83214 - 83174
Alignment:
Q  173 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  83214 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaatattcaagt 83174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0226 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0226
Description:

Target: scaffold0226; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 226
Target Start/End: Original strand, 3251 - 3291
Alignment:
Q  186 ttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttg 226  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  3251 ttgcttgaggacaagcaacggttcaagtgtaggggagtttg 3291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 5869 - 5830
Alignment:
Q  21 cacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaata 61  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  5869 cacacacacactcacttgaaacttg-ttgttgggttgaata 5830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University