View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8985_low_8 (Length: 715)

Name: NF8985_low_8
Description: NF8985
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8985_low_8
NF8985_low_8
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (14-697)||(36742-37426)
[»] chr6 (31 HSPs)
chr6 (16-682)||(18013971-18014656)
chr6 (14-389)||(29482590-29482967)
chr6 (44-344)||(15349496-15349799)
chr6 (45-344)||(14910636-14910936)
chr6 (43-344)||(15369492-15369796)
chr6 (22-344)||(18736007-18736331)
chr6 (44-344)||(15318847-15319149)
chr6 (14-344)||(23574393-23574724)
chr6 (44-344)||(29094885-29095188)
chr6 (15-213)||(7968495-7968694)
chr6 (15-344)||(4409196-4409528)
chr6 (14-213)||(19860052-19860252)
chr6 (71-344)||(3876374-3876649)
chr6 (14-277)||(12738494-12738759)
chr6 (66-344)||(15119590-15119869)
chr6 (44-338)||(18728950-18729246)
chr6 (44-344)||(8306089-8306390)
chr6 (14-315)||(18258492-18258795)
chr6 (245-389)||(23524252-23524396)
chr6 (141-345)||(21508506-21508712)
chr6 (98-344)||(17756886-17757134)
chr6 (79-193)||(23524128-23524243)
chr6 (15-208)||(24438567-24438760)
chr6 (250-342)||(19857705-19857797)
chr6 (15-107)||(18043340-18043432)
chr6 (312-389)||(12738776-12738853)
chr6 (245-342)||(18043510-18043607)
chr6 (22-243)||(14480002-14480223)
chr6 (50-107)||(19885778-19885835)
chr6 (295-344)||(27965006-27965055)
chr6 (45-88)||(6109542-6109585)
[»] chr8 (16 HSPs)
chr8 (22-440)||(11709375-11709806)
chr8 (44-343)||(24060587-24060888)
chr8 (15-343)||(32008884-32009213)
chr8 (66-341)||(18573889-18574166)
chr8 (44-344)||(41280677-41280980)
chr8 (15-344)||(18040357-18040680)
chr8 (14-345)||(7454520-7454867)
chr8 (44-389)||(33273346-33273677)
chr8 (15-398)||(2085566-2085942)
chr8 (14-344)||(7999649-7999979)
chr8 (44-389)||(25820745-25821092)
chr8 (15-299)||(24033762-24034051)
chr8 (38-193)||(10532810-10532966)
chr8 (15-344)||(22609363-22609692)
chr8 (543-685)||(11709805-11709947)
chr8 (327-386)||(14349411-14349470)
[»] chr7 (18 HSPs)
chr7 (44-427)||(2249776-2250162)
chr7 (74-424)||(38612616-38612973)
chr7 (44-389)||(18153157-18153504)
chr7 (15-402)||(9548770-9549168)
chr7 (14-344)||(29164848-29165178)
chr7 (45-344)||(20093566-20093866)
chr7 (17-344)||(30770057-30770384)
chr7 (15-320)||(21802450-21802757)
chr7 (165-389)||(21801668-21801894)
chr7 (44-344)||(7595379-7595684)
chr7 (44-331)||(47295564-47295852)
chr7 (45-344)||(21592744-21593047)
chr7 (66-344)||(22705650-22705929)
chr7 (81-344)||(30764849-30765114)
chr7 (15-118)||(22703896-22703999)
chr7 (44-207)||(28794036-28794198)
chr7 (44-213)||(18185653-18185823)
chr7 (44-87)||(6445103-6445146)
[»] chr2 (19 HSPs)
chr2 (15-389)||(23755642-23756018)
chr2 (17-344)||(19092723-19093051)
chr2 (15-344)||(3770260-3770591)
chr2 (44-344)||(25133793-25134104)
chr2 (44-233)||(42534103-42534293)
chr2 (44-344)||(3105233-3105535)
chr2 (14-231)||(23929796-23930014)
chr2 (44-208)||(41266201-41266366)
chr2 (66-344)||(26154851-26155131)
chr2 (291-385)||(26159056-26159149)
chr2 (66-193)||(29568366-29568493)
chr2 (66-344)||(22452689-22452968)
chr2 (44-344)||(27347198-27347499)
chr2 (245-344)||(23932911-23933010)
chr2 (15-94)||(26159154-26159233)
chr2 (44-89)||(12094119-12094164)
chr2 (333-386)||(18720457-18720510)
chr2 (44-117)||(23150744-23150816)
chr2 (44-117)||(23562001-23562073)
[»] chr4 (23 HSPs)
chr4 (44-427)||(45313176-45313558)
chr4 (44-427)||(26780601-26780986)
chr4 (14-346)||(9901569-9901902)
chr4 (44-344)||(10985583-10985883)
chr4 (44-410)||(8082073-8082441)
chr4 (92-389)||(16396090-16396389)
chr4 (15-389)||(3268334-3268710)
chr4 (22-344)||(12885287-12885610)
chr4 (22-281)||(49402699-49402961)
chr4 (15-233)||(3270546-3270765)
chr4 (44-344)||(25239723-25240025)
chr4 (44-344)||(28891937-28892243)
chr4 (44-344)||(13861342-13861644)
chr4 (14-344)||(12217560-12217885)
chr4 (44-344)||(21332413-21332715)
chr4 (294-389)||(18284439-18284534)
chr4 (45-261)||(17282442-17282660)
chr4 (44-193)||(15455469-15455619)
chr4 (184-324)||(26778753-26778894)
chr4 (44-157)||(34845515-34845628)
chr4 (290-344)||(3270773-3270827)
chr4 (44-87)||(41285865-41285908)
chr4 (350-396)||(34845350-34845396)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (44-427)||(2615-3000)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (38-389)||(16140-16493)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (15-398)||(151106-151490)
[»] chr5 (22 HSPs)
chr5 (14-344)||(28067893-28068224)
chr5 (165-403)||(24095343-24095582)
chr5 (44-389)||(20899420-20899767)
chr5 (15-345)||(5931190-5931522)
chr5 (87-329)||(19329808-19330052)
chr5 (44-233)||(15620172-15620362)
chr5 (44-344)||(23495377-23495678)
chr5 (44-233)||(42792510-42792700)
chr5 (14-334)||(41037524-41037855)
chr5 (15-345)||(8244511-8244847)
chr5 (14-213)||(22922639-22922839)
chr5 (44-346)||(38608296-38608610)
chr5 (44-213)||(5590698-5590868)
chr5 (44-344)||(36712519-36712820)
chr5 (14-193)||(22922062-22922242)
chr5 (135-345)||(22510101-22510313)
chr5 (44-339)||(33622365-33622664)
chr5 (327-389)||(31477200-31477262)
chr5 (301-342)||(5589312-5589353)
chr5 (165-345)||(13537880-13538061)
chr5 (43-88)||(18953561-18953606)
chr5 (326-383)||(18953828-18953884)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (73-389)||(242731-243048)
scaffold0008 (44-344)||(253342-253644)
[»] chr1 (14 HSPs)
chr1 (44-389)||(8995263-8995608)
chr1 (15-342)||(19441982-19442310)
chr1 (14-231)||(8990744-8990962)
chr1 (44-389)||(21817556-21817909)
chr1 (44-342)||(38621832-38622132)
chr1 (15-344)||(19967288-19967618)
chr1 (44-344)||(9858996-9859302)
chr1 (44-344)||(24973756-24974057)
chr1 (159-344)||(33028938-33029124)
chr1 (165-344)||(21815425-21815605)
chr1 (44-156)||(22186045-22186157)
chr1 (44-118)||(21815620-21815694)
chr1 (165-342)||(49472354-49472531)
chr1 (170-233)||(30894069-30894132)
[»] scaffold0002 (2 HSPs)
scaffold0002 (48-383)||(380794-381131)
scaffold0002 (14-344)||(391458-391791)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (44-389)||(68702-69049)
scaffold0042 (44-226)||(74874-75057)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (66-349)||(12374-12656)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (44-389)||(29880-30228)
[»] scaffold0280 (1 HSPs)
scaffold0280 (22-344)||(909-1233)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (15-233)||(47396-47615)
scaffold0034 (245-389)||(56183-56326)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (14-345)||(4064-4397)
[»] chr3 (17 HSPs)
chr3 (14-346)||(16852876-16853209)
chr3 (14-342)||(22915051-22915379)
chr3 (14-315)||(16914705-16915008)
chr3 (44-391)||(3558943-3559289)
chr3 (86-344)||(19790346-19790606)
chr3 (17-113)||(22006495-22006590)
chr3 (17-113)||(22014012-22014107)
chr3 (91-344)||(44635823-44636079)
chr3 (327-396)||(3786831-3786900)
chr3 (335-396)||(3824539-3824600)
chr3 (334-389)||(11578618-11578673)
chr3 (44-157)||(3786562-3786674)
chr3 (44-157)||(3824255-3824367)
chr3 (186-233)||(8733556-8733603)
chr3 (186-233)||(9085797-9085844)
chr3 (293-344)||(31530488-31530539)
chr3 (14-90)||(19773385-19773462)
[»] scaffold0265 (3 HSPs)
scaffold0265 (44-389)||(14900-15253)
scaffold0265 (165-344)||(17204-17384)
scaffold0265 (44-118)||(17115-17189)
[»] scaffold0989 (1 HSPs)
scaffold0989 (15-232)||(1503-1721)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (48-389)||(54428-54770)
[»] scaffold0058 (3 HSPs)
scaffold0058 (16-208)||(1609-1803)
scaffold0058 (14-157)||(15364-15507)
scaffold0058 (290-389)||(15694-15793)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (44-345)||(10740-11043)
[»] scaffold0063 (2 HSPs)
scaffold0063 (44-342)||(36651-36950)
scaffold0063 (44-391)||(49065-49397)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (44-157)||(20342-20455)
[»] scaffold0362 (1 HSPs)
scaffold0362 (44-213)||(7351-7520)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (44-153)||(86424-86533)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (127-344)||(9246-9461)
[»] scaffold0299 (1 HSPs)
scaffold0299 (15-118)||(19150-19253)
[»] scaffold1272 (1 HSPs)
scaffold1272 (245-344)||(1975-2074)
[»] scaffold0321 (1 HSPs)
scaffold0321 (301-344)||(18264-18307)
[»] scaffold0233 (1 HSPs)
scaffold0233 (335-389)||(21875-21929)


Alignment Details
Target: scaffold0013 (Bit Score: 529; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 529; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 37426 - 36742
Alignment:
Q  14 cagagagagagggttaagagggaaagattaattctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggc 113  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37426 cagagagtgagggttaagagggagagattgattctatcttgcggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgcagagccgttgtgatggc 37327  T
Q  114 acaccaggctctagcggttatgaaattgtgggaagtgtaaccgcggagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtct 213  Q
    || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  37326 acgccaggctctggcggttatgaaatcgtgggaagtgtaaccgcagagagattattgcaggaacatgcagagagacgttgcggtttgtttgaatcggtct 37227  T
Q  214 tgcttgctccgtgcacccccgtcgcggagaaggg-tgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaat 312  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37226 tgcttgctctgtgcacccctgtcgcggagaaggggtgtgtcgcaagtaacactgccaaacgtggtattttagatttggattgtattgagcctaagtaaat 37127  T
Q  313 gggccaaagctccttttggccggtccagaacattagtcccccaagtcgttgctcttggtgaagagtgatgacttaagggtgagcatgttttactgctcat 412  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37126 gggtcaaagctccttttgaccggtccagaacaatagtcccccaagtcgttgctcttggtgaagagtgatgacttaagggtgagcatgttttactgctcgt 37027  T
Q  413 aaacggtcaaagaagggagatttactctggtattcatcagatgaataaagagaaggttttgagttcgcctctatgttttgaagcttcctctgcattccgt 512  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37026 aaacggtcaaagaagggagatttgctctagtattcatcagatgaataaagagaaggttttgagttcgcctctatgttttgaagcttcctctgcattccgt 36927  T
Q  513 ggtagagaccgttggttctaatggaattaccttgcaaggtcgagctgtggagacgtgtgagaacaccttgaacttgggtacagtttgtcttgaatagcta 612  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||| ||||| |    
T  36926 ggtagagaccattggttctaatggaattaccttgcaaggtcgagttgtggagacgtgtgagaacgccttgaacttgggtatggttcgtcttggatagcaa 36827  T
Q  613 taacacttatgagaatcgggagagcgtatgtagggacgcgctcgctattccccgaatgtttttgtttcatagccggacatgttcg 697  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  36826 taacacttatgagaattgggagagcgtgtgttgggacgcgctcgctattccccgaatgtttttgtttcatagccagacaggttcg 36742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 31)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 16 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 18014656 - 18013971
Alignment:
Q  16 gagagagagggttaagagggaaagattaattctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcac 115  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  18014656 gagagtgagggttaagaggaagagattgattctaccttggggactgctatgagtcccctacatatagaggtggagggctgcagagccgttgtaatggcac 18014557  T
Q  116 accaggctctagcggttatgaaattgtgggaagtgtaaccgcg-gagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtctt 214  Q
    |||  ||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||| |||  | || |||  ||| |||||||| ||||||    
T  18014556 acctagctctggcggttacgaaatcgtgggaagtctaaccaccagagagattattgcgggaacgtacagtcaaacattgtggttcgtttgaactggtctt 18014457  T
Q  215 gcttgctccgtgcacccccgtcgcggagaaggg-tgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaatg 313  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||| |||||| | |||||||||||| | ||||  | || || | |    | | ||||||||||||||||||||||||    
T  18014456 gctcgctccgtgcacccccctcgcggggaaggggtttgtcgcaagtaatattgccacatgtagtgtctggtctgtggattgtattgagcctaagtaaatg 18014357  T
Q  314 ggccaaagctccttttggccggtccagaacattagtcccccaagtcgttgctcttggtgaagagtgatgacttaagggtgagcatgttttactgctcata 413  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| | |  ||||||||||||||| ||    
T  18014356 ggccaaagctcattttggccggtccagattagtagccccccaagtcgttgcttttgttgaagactgatgacttaagagcggacatgttttactgctcgta 18014257  T
Q  414 aacggtcaaagaagggagatttactctggtattcatcagatgaataaagagaaggttttgagttcgcctctatgttttgaagcttcctctgcattccgtg 513  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||||||||||||  | |||| |||    
T  18014256 aacggtcaaagaagggagatttgctttggtattcatcggatgaataaagagaagg-tttaagctcacctctatgttttgaagcttccttggtattctgtg 18014158  T
Q  514 gtagagaccgttggttctaatggaattaccttgcaa------------------ggtcgagctgtggagacgtgtgagaacaccttgaacttgggtacag 595  Q
    ||||| ||| |||||||| || ||||||||| ||||                  ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| || || || |    
T  18014157 gtagataccattggttcttattgaattacctcgcaagttcaccactagagagtgggtggagctgttgagacgtgtgagaactccttgaattttggaaccg 18014058  T
Q  596 tttgtcttgaatagctataacacttatgagaatcgggagagcgtatgtagggacgcgctcgctattccccgaatgtttttgtttcat 682  Q
    || |||||| |||||||| | ||||| |||||| ||  || ||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  18014057 ttcgtcttggatagctatgatacttaagagaattggacgaacgtgtgtagggacgcgctcgctattccccgagcatttttgtttcat 18013971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 389
Target Start/End: Original strand, 29482590 - 29482967
Alignment:
Q  14 cagagagagagggttaagagggaaagattaattctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggc 113  Q
    ||||||| | ||||| ||||| | ||||  ||||||||||||||||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  29482590 cagagagtgggggtttagaggaagagatagattctaccttggggactactatgagtcccctatttatagaggtggagggctgtagagtcgttgtaatggc 29482689  T
Q  114 acaccaggctctagcggttatgaaattgtgggaagtgtaaccgcg-gagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtc 212  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||| |||| | | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  | | |||||||||||||    
T  29482690 acacctggttctagcggttacgaaatcgtgggaagtataactgtgagagagtttattgcgggaacatgcagagagacgttgtggctcgtttgaaccggtc 29482789  T
Q  213 ttgcttgctccgtgcacccccgtcgcggagaa-gggtgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaa 311  Q
    | ||| |||||||||| | |  |   ||| || |||||||||||||||||   |||| |||||||  |||  | ||| |||||| ||| |||| ||||||    
T  29482790 tcgctcgctccgtgcagcactttgtgggaaaaggggtgtgtcgcaagtaatgttgccaaacgtggcgtttgggctttggattgtgttgggcctgagtaaa 29482889  T
Q  312 tgggccaaagctccttttggccggtccagaacattagtcccccaagtcgttgctcttggtgaagagtgatgacttaag 389  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  29482890 tgggccaaagatccttttggcctttccagaacagtagccccccaagtcgttgctcttgatgaagagtaatgacttaag 29482967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 44 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 15349799 - 15349496
Alignment:
Q  44 attctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcacaccaggctctagcggttatgaaattgtg 143  Q
    ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||| ||||| |||    
T  15349799 attctacgttggggactgctaagagtcccctatatatagaggtggagggctgcagagccgttgtgatagcacacctgggtctggcggttacgaaatcgtg 15349700  T
Q  144 ggaagtgtaaccgcg-gagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttg-tttgaaccggtcttgcttgctccgtgcacccccgtcgcg-g 240  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||  ||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||      
T  15349699 ggaagtgtaaccgcgagagagattattgtgggaacgtgcaaagagatgttgtggttcgttttgaaccggtcttgcatgctctgtgcaccccctccgcgat 15349600  T
Q  241 agaagggtgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaatgggccaaagctccttttggccggtccag 340  Q
     ||||||||||| |||||||| | |||| ||| |||| ||| |  ||| |||||||| | ||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  15349599 ggaagggtgtgttgcaagtaatattgccaaacatggtgtttgatctttggattgtatcgggcctaagtaaacgggcctaagatccttttgaccggtccag 15349500  T
Q  341 aaca 344  Q
    ||||    
T  15349499 aaca 15349496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 45 - 344
Target Start/End: Original strand, 14910636 - 14910936
Alignment:
Q  45 ttctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcacaccaggctctagcggttatgaaattgtgg 144  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||   ||||| || |||| ||||||||||    
T  14910636 ttctaccttggggactgcagtgagtcccctatatatagaggtggagggctgcaaagccgttgtaatggcacacatcgctctggcagttacgaaattgtgg 14910735  T
Q  145 gaagtgtaaccg-cggagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtcttgcttgctccgtgcacccccgtcgcggaga 243  Q
    |||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |   ||  |    
T  14910736 gaagtgtaaccgccatagagtttattgcgggaacgtgcagagagacgttgtggttcgtttgaaccggtcttgctcgctccgtgcacccccatttggggaa 14910835  T
Q  244 agggtgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaatgggccaaagctccttttggccggtccagaac 343  Q
     ||||||||||||| |||   |||| || ||||| |||    ||| |||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  14910836 ggggtgtgtcgcaaataatgttgccaaatgtggtgtttggactttggattctattgtgcctaagtaaatgggcaaaaggtccttttggccggtccagaac 14910935  T
Q  344 a 344  Q
    |    
T  14910936 a 14910936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 43 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 15369796 - 15369492
Alignment:
Q  43 aattctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcacaccaggctctagcggttatgaaattgt 142  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  | ||| ||||||| ||||||||    
T  15369796 aattctaccttggggactgctaagagtcctctatatatagaggtggagggctgtagagtcgttatgatggtacacctaggtctggcggttacgaaattgt 15369697  T
Q  143 gggaagtgtaaccg-cggagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttg-tttgaaccggtcttgcttgctccgtgcacccccgtcgcgg 240  Q
     ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| | |||||||||||||||  |||||| |||||| || |||||     
T  15369696 aggaagtgtaaccgccagacagattattgcgggaacgtgcaaagagaagttgtggttcgttttgaaccggtcttgtatgctccttgcaccgccttcgcga 15369597  T
Q  241 a-gaagggtgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaatgggccaaagctccttttggccggtcca 339  Q
    | ||||||||||| ||||| || | |||| |||||||| ||| || ||| |||| ||||| || |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||    
T  15369596 aggaagggtgtgttgcaaggaatattgccaaacgtggtgtttgagctttggattatattgggcttaagtaaatgcgcctaagatccttttggccggtcca 15369497  T
Q  340 gaaca 344  Q
    |||||    
T  15369496 gaaca 15369492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 22 - 344
Target Start/End: Original strand, 18736007 - 18736331
Alignment:
Q  22 gagggttaagagggaaagattaattctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcacaccagg 121  Q
    ||||||| ||||| | |||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||    
T  18736007 gagggtttagaggaagagataaattctagcttggggactgctatgagtcccctatttatagaggtggagggctgctgagccgttgtaatggcacacctgg 18736106  T
Q  122 ctctagcggttatgaaattgtgggaagtgtaaccg-cggagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtcttgcttgc 220  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| ||| || | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  | | |||||||||  ||| ||| ||    
T  18736107 ctctggcggttacgaaattgtgggaagtctaatcgccagagagtttattgcgggaacgtgtagagagacgttgtggctcgtttgaaccaatctcgctcgc 18736206  T
Q  221 tccgtgcacccccgtcgc-ggagaagggtgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaatgggccaa 319  Q
    ||||||||||||  | || ||| | |||| | | ||||||||   |||| |||||||| |||  | ||| |||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  18736207 tccgtgcacccctcttgcgggaaaggggtatattgcaagtaagtttgccaaacgtggtgtttgggctttggatattattgggcctaagtaaatgggccaa 18736306  T
Q  320 agctccttttggccggtccagaaca 344  Q
    |  ||||||||||||||||||||||    
T  18736307 aaatccttttggccggtccagaaca 18736331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 44 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 15319149 - 15318847
Alignment:
Q  44 attctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcacaccaggctctagcggttatgaaattgtg 143  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||  | ||| ||||||| ||||| |||    
T  15319149 attctaccttggggactgctaagagttccctatatatagaggtggagggctgcagagtcgttgtgatggtacacctaggtctggcggttacgaaatcgtg 15319050  T
Q  144 ggaagtgtaaccgc-ggagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttg-tttgaaccggtcttgcttgctccgtgcacccccgtcgc-gg 240  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||  ||| | ||||||| |||||||| ||||||||  |||||  ||||       
T  15319049 ggaagtgtaaccgctagagagattattgcaggaacgtgcaaagagaagttgtggttcgttttgaactggtcttgcatgctccgtaaacccctttcgcaat 15318950  T
Q  241 agaagggtgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaatgggccaaagctccttttggccggtccag 340  Q
     |||||||||||||||||||| | |||  |||||||| ||| || ||| |||||||||| || ||||| ||| |||| ||| ||||  ||||||||||||    
T  15318949 ggaagggtgtgtcgcaagtaatattgcaaaacgtggtgtttgag-tttggattgtattgggcttaagtcaataggcctaagatcctgctggccggtccag 15318851  T
Q  341 aaca 344  Q
    ||||    
T  15318850 aaca 15318847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 344
Target Start/End: Original strand, 23574393 - 23574724
Alignment:
Q  14 cagagagagagggttaagagggaaagattaattctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggc 113  Q
    ||||||| ||||||| ||||| | ||||  ||||||||||| |||||||   ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  23574393 cagagagtgagggtttagaggaagagatagattctaccttgtggactgctttgagtcccctatttatagaggtagagggctgcagagccgttgtaatggc 23574492  T
Q  114 acaccaggctctagcggttatgaaattgtgggaagtgtaacc-gcggagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtc 212  Q
    ||||  |||||| || |||| ||| | |||| ||||||||||  | ||||| |||||||| |||| || ||||||||||||  ||| ||||||||| |||    
T  23574493 acacttggctctggctgttacgaagtcgtggaaagtgtaaccaccagagagtttattgcgagaacatgtagagagacgttgtggttcgtttgaaccagtc 23574592  T
Q  213 ttgcttgctccgtgcacccccgtcgcggagaagggtgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaat 312  Q
    | | | ||||||||||| ||| |   ||| | |||||| || ||||||||  || | |||||||| |||  | ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  23574593 tcgttcgctccgtgcacgcccttgtgggaaaggggtgtatcacaagtaactttgtcaaacgtggtgtttgggctttggattgtattgggcctaagtaaat 23574692  T
Q  313 gggccaaagctccttttggccggtccagaaca 344  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  23574693 gggccaaaggtccttttgggcggtccagaaca 23574724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 44 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 29095188 - 29094885
Alignment:
Q  44 attctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcacaccaggctctagcggttatgaaattgtg 143  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||   ||||  |||||| ||||| |||    
T  29095188 attctaccttggggactgcattgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgtaatggcacacctaactctgacggttacgaaatcgtg 29095089  T
Q  144 ggaagtgtaaccg-cggagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtcttgcttgctccgtgca-cccccgtcgcgga 241  Q
    ||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||| | ||||||||||  ||| ||||||||||||||   | | |||||||| ||||| |||||      
T  29095088 ggaagtgtaaccgcctgtgagtttattgcgggaacgtggaaagagacgttggggttcgtttgaaccggtctctttcgttccgtgcaccccccctcgcgtg 29094989  T
Q  242 gaa-gggtgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaatgggccaaagctccttttggccggtccag 340  Q
    ||| ||||||||||| |||||   |||| |||||||| |||  | ||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  29094988 gaaggggtgtgtcgcgagtaattttgccaaacgtggtgtttgggctttggatggtattgggcctaagtgaatgggccaaagatctttttggtcggtccag 29094889  T
Q  341 aaca 344  Q
    ||||    
T  29094888 aaca 29094885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 7968694 - 7968495
Alignment:
Q  15 agagagagagggttaagagggaaagattaattctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggca 114  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  7968694 agagagtgagggttaagaggaaaagatagattctgccttggggactgcattgagtcccctatatatagaggtggagggctgcagagctgttgtaatggca 7968595  T
Q  115 caccaggctctagcggttatgaaattgtgggaagtgtaaccgcg-gagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtct 213  Q
    |||| | |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||  | | | |||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||    
T  7968594 cacctgactctggcggttacgaaattgtggaaagtgtaaccgccagggggtttattgtgggaacgtgcagagagacgttgtggttcgtttgaaccagtct 7968495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 344
Target Start/End: Original strand, 4409196 - 4409528
Alignment:
Q  15 agagagagagggttaagagggaaagattaattctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggca 114  Q
    |||||| ||||||| ||||| | ||||  |||||||||||||||||||   || ||| |||| |||||||||||||||||| | |||||||   ||||||    
T  4409196 agagagtgagggtttagaggaagagatagattctaccttggggactgcattgaatcctctatttatagaggtggagggctgcaaagccgttacaatggca 4409295  T
Q  115 caccaggctctagcggttatgaaattgtgggaagtgtaaccgcg-gagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtct 213  Q
    ||||  ||||| |||||||  |||| ||| |||||||||||||  | | | |||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||| ||||    
T  4409296 caccttgctctggcggttacaaaatcgtgagaagtgtaaccgctagggcgtttattgcgggaacgtgcatagagacgttgtggttcgtttgaaccagtct 4409395  T
Q  214 tgcttgctccgtgcacccccgtcgcg-gagaagggtgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattg-tattgagcctaagtaaa 311  Q
       | ||||||||||||||| | ||| || | ||||||||| ||||||||  || | |||||||| |||| |  ||||| || ||||| |||||||||||    
T  4409396 ctttcgctccgtgcaccccccttgcgtgaaaggggtgtgtcacaagtaactttgtcaaacgtggtgttttgggctttgaatgatattgggcctaagtaaa 4409495  T
Q  312 tgggccaaagctccttttggccggtccagaaca 344  Q
    |||||||||  |||||||||||| || ||||||    
T  4409496 tgggccaaatgtccttttggccgatcgagaaca 4409528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 19860252 - 19860052
Alignment:
Q  14 cagagagagagggttaagagggaaagattaattctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggc 113  Q
    ||||||| || |||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||     
T  19860252 cagagagtgacggtttagaggaatagataaattctaccttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggctgcggagccgttgtaatggg 19860153  T
Q  114 acaccaggctctagcggttatgaaattgtgggaagtgtaacc-gcggagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtc 212  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||  | |||||||||||| |||||| ||  |||||||||||| ||| ||||||||| |||    
T  19860152 acacctggctctggcggttacgaaatcgtgggaagtgtaaccaccagagagattattgtgggaacatgttgagagacgttgcggttcgtttgaaccagtc 19860053  T
Q  213 t 213  Q
    |    
T  19860052 t 19860052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 71 - 344
Target Start/End: Original strand, 3876374 - 3876649
Alignment:
Q  71 ccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcacaccaggctctagcggttatgaaattgtgggaagtgtaaccg-cggagagattatt 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||    ||| ||||||| ||||| || |||||||||| || | |||||||||||    
T  3876374 ccctatatatagaggtggagggctgcagagccgttgtgaagacacacctaagtctggcggttacgaaatcgtaggaagtgtaatcgtcagagagattatt 3876473  T
Q  170 gcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtcttgcttgctccgtgcacccccgtcgcggagaa-gggtgtgtcgcaagtaacactgcc 268  Q
    |||||||  |||| |||||||||| || |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||   ||||    
T  3876474 gcgggaatatgcaaagagacgttgtagctcatttgaaccgatcttgcttgctccgtgcacccccttcgcggagaaggggtatgtcacaagtaagtttgcc 3876573  T
Q  269 taacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaatgggccaaagctccttttggccggtccagaaca 344  Q
     ||||||   |||  | ||  || ||| ||| |||||| ||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||    
T  3876574 aaacgtgaagtttgggcttgggactgtgttgggcctaaataaatggacctaaagtccttttggccggtccagaaca 3876649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 277
Target Start/End: Original strand, 12738494 - 12738759
Alignment:
Q  14 cagagagagagggttaagagggaaagattaattctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggc 113  Q
    ||||||| | ||||| ||||| | ||||  ||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  12738494 cagagagtgggggtttagaggaagagatagattctacctaggggactgctatgagtcccctatttatagaggtggagggttgcagagccgttgtaatggc 12738593  T
Q  114 acaccaggctctagcggttatgaaattgtgggaagtgtaaccgc-ggagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtc 212  Q
    ||| | |||| |  || ||| ||||| ||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||  |||    
T  12738594 acatctggctatgacgattacgaaatcgtgggaagtgtaacctctagagagtttattgcgggaacgtgcagagagacgttgtggttcgtttgaactagtc 12738693  T
Q  213 ttgcttgctccgtgcacccccgtcg-cggagaagggtgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggt 277  Q
    ||| | ||||||| ||||||| | |  ||| | |||||||||||| |||||  |||| ||||||||    
T  12738694 ttgttcgctccgtacaccccccttgtgggaaaggggtgtgtcgcaggtaactttgccaaacgtggt 12738759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 15119869 - 15119590
Alignment:
Q  66 gagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcacaccaggctctagcggttatgaaattgtgggaagtgtaaccgc-ggagaga 164  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | || ||||||  ||| |||||||||| |||||| |||||||  |||| ||||||||| |||||||  |||||     
T  15119869 gagtcccctatttatagaggtggagagttgcagagccagtgtaatggcacacctggctctggcggttacaaaatcgtgggaagtataaccgctagagagt 15119770  T
Q  165 ttattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtcttgcttgctccgtgcacccccgtcgcggagaa-gggtgtgtcgcaagtaaca 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||   |  ||| |||||||||| | | |  ||| |||||||||  |||||||     
T  15119769 ttattgcgggaacgtgcagagagacgttgtggttcgtttgaacctgtctctttcactctgtgcaccccccttgtgtggaaggggtgtgtcataagtaact 15119670  T
Q  264 ctgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaatgggccaaagctccttttggccggtccagaaca 344  Q
     || | |||||||| |||  | | | |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  15119669 ttgtcaaacgtggtgtttgggctctggattgtattgggcctaagtaaatgggcc-aaggtccttttggccggtccagaaca 15119590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 44 - 338
Target Start/End: Original strand, 18728950 - 18729246
Alignment:
Q  44 attctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcacaccaggctctagcggttatgaaattgtg 143  Q
    ||||||||||| ||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||| |||| ||||| |||||| |||| ||  |||| |||    
T  18728950 attctaccttgaggactgttatgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagacattgtaatggaacacctggctctggcgggtacaaaatcgtg 18729049  T
Q  144 ggaagtgtaaccg-cggagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtcttgcttgctccgtgcacccccgtcgcggag 242  Q
    ||||||||||||| |  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||  | |  ||||||||||||| | | ||||||||||||| | | ||||      
T  18729050 ggaagtgtaaccgccatagagtttattgcggaaacgtgcagagagacgttgtggctcctttgaaccggtctcgttcgctccgtgcaccctccttgcggga 18729149  T
Q  243 aag-ggtgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaatgggccaaagctccttttggccggtcc 338  Q
    ||| |||||||  |||||||   || | |||||||| |||  | ||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  18729150 aagcggtgtgttacaagtaagtttgtcaaacgtggtgtttgggttttggatagtattaggcctaagtaaatgggccaaagatccttttggcctgtcc 18729246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 44 - 344
Target Start/End: Original strand, 8306089 - 8306390
Alignment:
Q  44 attctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcacaccaggctctagcggttatgaaattgtg 143  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||  ||    
T  8306089 attctaccttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcagagccgttgtaatggcacacctgactctagcagttatgaaatcatg 8306188  T
Q  144 ggaagtgtaaccg-cggagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtcttgcttgctccgtgcacccccgtcgcggag 242  Q
    | ||||||||||| | ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||    | ||||||||| ||||   | |||| ||||||| || |  | ||     
T  8306189 gaaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacctacagagagacgttgtgactcgtttgaaccagtctctttcgctctgtgcacctccttgtctgaa 8306288  T
Q  243 aagggtgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaatgggccaaagctccttttggccggtccagaa 342  Q
    | |||  ||| |||||||||  || | |||||| | |||  | ||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  8306289 agggggatgttgcaagtaactttgtcaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaagtatatgggccaaatgtccttttgaccggtccagaa 8306388  T
Q  343 ca 344  Q
    ||    
T  8306389 ca 8306390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 18258795 - 18258492
Alignment:
Q  14 cagagagagagggttaagagggaaagattaattctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggc 113  Q
    ||||||| ||||||| ||||  ||| ||  |||||||||||| |||||    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||    
T  18258795 cagagagtgagggtttagagaaaaatatagattctaccttggagactgttgtgagtcccctatttatagaggtagagggctgtagagccgttgtagtggc 18258696  T
Q  114 acaccaggctctagcggttatgaaattgtgggaagtgtaaccgc-ggagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtc 212  Q
    ||||| ||||||   ||||| |||||||||||||||||||| ||   |||| |||||||||||| |||| |||||||||||  |||  ||||||||||||    
T  18258695 acacctggctctgatggttacgaaattgtgggaagtgtaactgctaaagagtttattgcgggaatgtgcggagagacgttgtggttcctttgaaccggtc 18258596  T
Q  213 ttgcttgctccgtgcacccccgtcgcggag-aagggtgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaa 311  Q
    |  || ||| ||||||||||| | | |||| |||||| ||  ||||||||   |||  ||| |||| |||  | ||| |||||||||| |||||||||||    
T  18258595 tcactcgcttcgtgcaccccctttgtggagaaagggtatgctgcaagtaagtttgcaaaacatggtgtttgggctttggattgtattgggcctaagtaaa 18258496  T
Q  312 tggg 315  Q
    ||||    
T  18258495 tggg 18258492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 245 - 389
Target Start/End: Original strand, 23524252 - 23524396
Alignment:
Q  245 gggtgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaatgggccaaagctccttttggccggtccagaaca 344  Q
    ||||||||||||||||||  |||  |||||||| |||  | ||| | ||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  23524252 gggtgtgtcgcaagtaactttgcaaaacgtggtgtttgggctttgggttgtattgtacctaagtaaatgggccaaaggtccctttggccggtccagaaca 23524351  T
Q  345 ttagtcccccaagtcgttgctcttggtgaagagtgatgacttaag 389  Q
     ||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  23524352 gtagccccccaagttgttgctcctgatgaagagtgatgacttaag 23524396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 141 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 21508712 - 21508506
Alignment:
Q  141 gtgggaagtgtaaccgcgg-agagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtcttgcttgctccgtgcacccccgtcgcg 239  Q
    |||||||||||||||||   |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||  ||| | ||||||| ||||   | ||||||||||||||| | ||     
T  21508712 gtgggaagtgtaaccgccatagagtttattgcaggaacgtgcagagagacgctgtggttcgattgaaccagtctctttcgctccgtgcaccccccttgca 21508613  T
Q  240 gagaa-gggtgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaatgggccaaagctccttttggccggtcc 338  Q
      ||| |||||||| |||||||||  || | |||||||| ||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||    
T  21508612 tggaaggggtgtgttgcaagtaactttgtcaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgggcctaagtaaatgggccaaaggtccctttggccgatcc 21508513  T
Q  339 agaacat 345  Q
    |||||||    
T  21508512 agaacat 21508506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 98 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 17757134 - 17756886
Alignment:
Q  98 gagccgttgtgatggcacaccaggctctagcggttatgaaattgtgggaagtgtaaccgcg-gagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcag 196  Q
    |||||||||| ||||||||||   ||||  ||||||  |||| |||||||||||||||||  | ||| |||||| ||||||||| | ||||||||||  |    
T  17757134 gagccgttgtaatggcacaccttactctgacggttacaaaatcgtgggaagtgtaaccgcctgtgagtttattgtgggaacgtggaaagagacgttgggg 17757035  T
Q  197 tttgtttgaaccggtcttgcttgctccgtgcacccccgtcgcggagaaggg-tgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgt 295  Q
    || |||||||||  ||||  | | ||||||||||||| |||||  |||||| |||||||| |||||   |||| |||||||| |||  | ||| ||||||    
T  17757034 ttcgtttgaaccaatctttttcgttccgtgcacccccctcgcgtggaaggggtgtgtcgcgagtaattttgccaaacgtggtgtttgggctttcgattgt 17756935  T
Q  296 attgagcctaagtaaatgggccaaagctccttttggccggtccagaaca 344  Q
    |||  ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||||    
T  17756934 attaggcctaagtaaatgtgtcaaagatccttttggccggtcccgaaca 17756886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 79 - 193
Target Start/End: Original strand, 23524128 - 23524243
Alignment:
Q  79 atagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcacaccaggctctagcggttatgaaattgtgggaagtgtaacc-gcggagagattattgcgggaac 177  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||  |  |||| |||||||||||||    
T  23524128 atagacgtggagggctgcagagccattgtaatggcacacctggctctggcggttaagaaatcgtggaaagtgtaaccatcaaagagtttattgcgggaac 23524227  T
Q  178 gtgcagagagacgttg 193  Q
    ||||||||||| ||||    
T  23524228 gtgcagagagaagttg 23524243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 15 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 24438760 - 24438567
Alignment:
Q  15 agagagagagggttaagagggaaagattaattctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggca 114  Q
    |||||| ||||||| ||||| | ||||  ||| ||||||||| |||||   ||||||||||| ||||||||| ||||  || |||| |||||| ||| ||    
T  24438760 agagagtgagggtttagaggaagagatagattataccttggg-actgctgtgagtcccctatttatagaggtagaggattgcagagtcgttgtaatgaca 24438662  T
Q  115 caccaggctctagcggttatgaaattgtgggaagtgtaaccg-cggagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaacc 208  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| |  |||| | ||||| |||||||||| ||||||| ||  ||| |||||||||    
T  24438661 cacctggctcttgcggttacgaaatcgtgggaagtgtaaccgccatagagttgattgcaggaacgtgcaaagagacgatgtggttcgtttgaacc 24438567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 250 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 19857797 - 19857705
Alignment:
Q  250 tgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaatgggccaaagctccttttggccggtccagaa 342  Q
    |||||||| ||||  |||| |||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  19857797 tgtcgcaactaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgagcctaagtaaatgcgccaaaggtccttttggtcggtccagaa 19857705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 107
Target Start/End: Original strand, 18043340 - 18043432
Alignment:
Q  15 agagagagagggttaagagggaaagattaattctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgt 107  Q
    |||||| ||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||    |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||    
T  18043340 agagagtgagggtttagaggaagagataaattctaccttggggactgcatttagtcccctatttatagaggtggagggctgcaaagccgttgt 18043432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 389
Target Start/End: Original strand, 12738776 - 12738853
Alignment:
Q  312 tgggccaaagctccttttggccggtccagaacattagtcccccaagtcgttgctcttggtgaagagtgatgacttaag 389  Q
    |||||||||  || ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  12738776 tgggccaaatgtcattttggccgatccagaacagtagccccccaagtcattgctcttgatgaagagtgataacttaag 12738853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 342
Target Start/End: Original strand, 18043510 - 18043607
Alignment:
Q  245 gggtgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaatgggccaaagctccttttggccggtccagaa 342  Q
    |||||| |||||||||||  |||| |||||| | |||  | |||  || |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18043510 gggtgtatcgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttgaatggtattgggcctaagtaaatgggccaaaggtccttttggccggtccagaa 18043607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 243
Target Start/End: Original strand, 14480002 - 14480223
Alignment:
Q  22 gagggttaagagggaaagattaattctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcacaccagg 121  Q
    ||||||| |||||||| |||  ||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||  |||||  ||||| |||||| |||| |||||||||  |     
T  14480002 gagggtttagagggaa-gatagattctacctaggggactgttaagagtcccctatatataccggtgggtggctgcagagccattgtaatggcacacgtgt 14480100  T
Q  122 ctctagcggttatgaaattgtgggaagtgtaaccg-cggagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtcttgcttgc 220  Q
     ||  || |||| ||||| |||| || |||||||| ||||||||   |  ||||||||||   |||| |||||||||| |||||||| |||||   ||||    
T  14480101 gtccggcagttacgaaatcgtggaaaatgtaaccgtcggagagaaactcacgggaacgtgggaagaggcgttgcagttcgtttgaactggtctcttttgc 14480200  T
Q  221 tccgtgcacccccgtcgcggaga 243  Q
    |  |||||||| | |||||||||    
T  14480201 tttgtgcacccacatcgcggaga 14480223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 107
Target Start/End: Original strand, 19885778 - 19885835
Alignment:
Q  50 ccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgt 107  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  19885778 ccttggggactgcaaagagtcccctttatatagaggcggatggctgcagagccgttgt 19885835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 344
Target Start/End: Original strand, 27965006 - 27965055
Alignment:
Q  295 tattgagcctaagtaaatgggccaaagctccttttggccggtccagaaca 344  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  27965006 tattgggcctaagtaaatgggccaaagatccttttggctggtccaaaaca 27965055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 6109585 - 6109542
Alignment:
Q  45 ttctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtgg 88  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  6109585 ttctaccttggggactgcgaggagtcccctttatatagaggtgg 6109542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 184; Significance: 3e-99; HSPs: 16)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 22 - 440
Target Start/End: Original strand, 11709375 - 11709806
Alignment:
Q  22 gagggttaagagggaaagattaattctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcacaccagg 121  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||||  |||||||   ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  11709375 gagggttaagagggagagatcgattctacctttcggactgctgagagtcccctatatatagaggtggagggttgcagagccgttgtaatggcacaccagg 11709474  T
Q  122 ctctagcggttatgaaattgtgggaagtgtaaccg-cggagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtcttgcttgc 220  Q
    |||| ||  ||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||      
T  11709475 ctctggcatttacgaaatcgtgggaagtgtaaccgccagagagattattgtgggaacgtgcagagagacgttgtggttcgtttgaaccgatcttgcttat 11709574  T
Q  221 tccgtgca------------cccccgtcgcggagaa-gggtgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaag 307  Q
    ||||||||            ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| | || | ||||||||||||  | ||| |||||||||| |||||||    
T  11709575 tccgtgcacccccccccccccccccctcgcggtgaaggggtgtgtcgcaagtaatattgtcaaacgtggtatttgggctttggattgtattgggcctaag 11709674  T
Q  308 taaatgggccaaagctccttttggccggtccagaacattagtcccccaagtcgttgctcttggtgaagagtgatgacttaagggtgagcatgttttactg 407  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||    
T  11709675 taaatgggccaaagatccttttggccggtccagaatagtag-cccccaagtcgttgttcttggtgaagagtgatgacttaagggcgaccatgttttgctg 11709773  T
Q  408 ctcataaacggtcaaagaagggagatttactct 440  Q
    ||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  11709774 ctcgtaaacggttaaagaagagagatttgctct 11709806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 44 - 343
Target Start/End: Original strand, 24060587 - 24060888
Alignment:
Q  44 attctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcacaccaggctctagcggttatgaaattgtg 143  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||     
T  24060587 attctaccttggagactgctaagagtcccttatatatagaggtggagggctgcagagccgttgtgatggcacaccaggctctggcggttacaaaatcgta 24060686  T
Q  144 ggaagtgtaaccg-cggagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtcttgcttgctccgtgcacccccgtcgcggag 242  Q
    ||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |    
T  24060687 ggaagtgtaactgccagagagattattgcaggaacatgcagagagatgttgtggttcgttagaaccggtcttgcttgctccgtgcacctccctcgcgggg 24060786  T
Q  243 aa-gggtgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaatgggccaaagctccttttggccggtccaga 341  Q
    || |||||||||||||||||   | |||||||||||||||    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24060787 aaggggtgtgtcgcaagtaatgtttcctaacgtggtatttcgactttggattgtattgggcctaagtaaatgggccaaagctccttttgaccggtccaga 24060886  T
Q  342 ac 343  Q
    ||    
T  24060887 ac 24060888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 32009213 - 32008884
Alignment:
Q  15 agagagagagggttaagagggaaagattaattctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggca 114  Q
    |||||| ||||||| ||||| | ||||  ||| ||||||||||| | |   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32009213 agagagtgagggtttagaggaagagatagattttaccttggggagtactttgagtcccctatttatagaggtggagggctgtagagccgttgtaatggca 32009114  T
Q  115 caccaggctctagcggttatgaaattgtgggaagtgtaaccgc-ggagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtct 213  Q
    |||| | |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||| ||||    
T  32009113 cacctgactctggcggttacgaaatcgtgggaagtgtaatcgctagagagattattgcgggaacgtgcagagagacgctgtggttcgtttgaaccagtct 32009014  T
Q  214 tgcttgctccgtgcacccccgt-cgcggagaagggtgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaat 312  Q
       | ||||||||||||||| |  | ||| | ||||||||| ||||||||  || | |||||||| |||  | ||| |||||||||| ||||||||| ||    
T  32009013 ctttcgctccgtgcacccccttgtgagga-aggggtgtgtcacaagtaactttgtcaaacgtggtgtttgggctttcgattgtattgggcctaagtatat 32008915  T
Q  313 gggccaaagctccttttggccggtccagaac 343  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  32008914 gggtcaaaggtccttttggccggtccagaac 32008884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 66 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 18574166 - 18573889
Alignment:
Q  66 gagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcacaccaggctctagcggttatgaaattgtgggaagtgtaaccg-cggagaga 164  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||     
T  18574166 gagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgtaatggcacacctggctctggcggttacgaaatcgtgggaagtgtaaccgccagagagt 18574067  T
Q  165 ttattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtcttgcttgctccgtgcacccccgtcgcggagaaggg-tgtgtcgcaagtaaca 263  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||  |||   ||||||| ||||||||| | | |  |||||| |||||||||||||||     
T  18574066 ttattgtgggaacgtgcagagagacgttgtggttcgtttgaaccactctcttttgctccatgcaccccccttgtgtggaagggatgtgtcgcaagtaact 18573967  T
Q  264 ctgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaatgggccaaagctccttttggccggtccaga 341  Q
     |||| |||||||| |||  | |||  ||||||||  |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  18573966 ttgccaaacgtggtgtttgggctttgcattgtattaggcctaagtaaatggaccaaaaatccttttggccggtccaga 18573889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 44 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 41280980 - 41280677
Alignment:
Q  44 attctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcacaccaggctctagcggttatgaaattgtg 143  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| | |||| | |||||  |||| |||    
T  41280980 attctaccttggggactgttatgagtcccctatttatagaggtggaggactgcagagccgttgtaatggcacacctgactctgggggttacaaaatcgtg 41280881  T
Q  144 ggaagtgtaaccg-cggagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtcttgcttgctccgtgcaccccc----gtcgc 238  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||    || ||    
T  41280880 ggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtgcagagag-cgttgtggctcgtttgaaccggtcttgctcgctccgtgcacccccccttgt-gc 41280783  T
Q  239 ggagaagggtgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaatgggccaaagctccttttggccggtcc 338  Q
    | |   |||||||||||||||||   |||| ||| |||| |||  | ||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  41280782 gaaagggggtgtgtcgcaagtaatgttgccaaacatggtgtttgggctttggattgtgttgggcctaagtaaatgggtcaaaggtccttttgtccggtcc 41280683  T
Q  339 agaaca 344  Q
    ||||||    
T  41280682 agaaca 41280677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 18040680 - 18040357
Alignment:
Q  15 agagagagagggttaagagggaaagattaattctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggca 114  Q
    |||||| || |||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  18040680 agagagtgaaggtttagaggaagagattgattctaccttggggactgctt-gagtcccctatttatagaggtggagagctgcagagccgttgtaatggca 18040582  T
Q  115 caccaggctctagcggttatgaaattgtgggaagtgtaaccg-cggagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtct 213  Q
    |||| ||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||    
T  18040581 cacctggctctgacggttacgaaatcgtgggaagtgtaaccgccatagagtttattgcgggaacgtgcagagagacgttgtggttcgtttgaaccagtct 18040482  T
Q  214 tgcttgctccgtgcacccccgtcgcggagaa-gggtgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaat 312  Q
       | ||||||||||||| | | | |  ||| ||||||||| ||||||||  |||      |||| |||  | ||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  18040481 ctttcgctccgtgcacccaccttgtgtggaaggggtgtgtcacaagtaactttgc------tggtgtttgggctttggattatattg-gcctaagtaaat 18040389  T
Q  313 gggccaaagctccttttggccggtccagaaca 344  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18040388 gggccaaaggtccttttggccggtccagaaca 18040357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 7454867 - 7454520
Alignment:
Q  14 cagagagagagggttaagagggaaagattaattctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggc 113  Q
    ||||||| ||||||| | ||| | ||||  |||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  7454867 cagagagtgagggtttacaggaagagatagattctaacttggggactgctatgagtcccctatttatagaggtggaaggctgcagagccgttgtaatggc 7454768  T
Q  114 acaccaggctctagcggttatgaaattgtgggaagtgtaaccg-cggagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtc 212  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| |  |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||  | | || ||||||||||    
T  7454767 acacctggctctggcggttacgaaatcgtgggaagtgtaaccgtcatagagtttattgtgggaacgtgcatagagacgttgtggctcgtatgaaccggtc 7454668  T
Q  213 ttgcttgctccgtgcacccccgtc--------------gcggagaa-gggtgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtat 297  Q
    | ||| |||||||||||||||  |              |||||||| |||||||| ||||||||   |||| |||||||  |||  | ||| |||||| |    
T  7454667 tcgctcgctccgtgcacccccccccccccccccccccggcggagaaggggtgtgttgcaagtaagtttgccaaacgtggagtttgggctttggattgtgt 7454568  T
Q  298 tgagcctaagtaaatgggccaaagctccttttggccggtccagaacat 345  Q
    || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7454567 tgggcctaagtaaataggccaaagatccttttggccggtccagaacat 7454520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 44 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 33273677 - 33273346
Alignment:
Q  44 attctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcacaccaggctctagcggttatgaaattgtg 143  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||  || ||                |||    
T  33273677 attctaccttggggactcctatgagtcccctatttatagaggtggagggttgcagagccgttgtaatggcacacttggttc----------------gtg 33273594  T
Q  144 ggaagtgtaaccgcgg-agagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtcttgcttgctccgtgcacccccgtcgcgg-a 241  Q
    ||||||||||||||   |||  |||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||| |||||  |||||||| | |||| |    
T  33273593 ggaagtgtaaccgccatagaacttattgcgggaacgtgcagagagacgttgtggctcgtttgaaccggtcttgctcgctcctcgcaccccccttgcggga 33273494  T
Q  242 gaagggtgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaatgggccaaagctccttttggccggtccaga 341  Q
    |||| |||||| ||||||||   |||| |||||||| |||  | ||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |    
T  33273493 gaagagtgtgttgcaagtaaatttgccaaacgtggtgtttgggctttggatagtattaggcctaagtaaatgggccaaagatccttttggtcggtccata 33273394  T
Q  342 acattagtcccccaagtcgttgctcttggtgaagagtgatgacttaag 389  Q
    ||| ||| ||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||    
T  33273393 acagtagccccgcaagtcgttactcttgataaagagtgatgacttaag 33273346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 2085942 - 2085566
Alignment:
Q  15 agagagagagggttaagagggaaagattaattctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggca 114  Q
    |||||| ||||||| ||||| | ||||  |||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  2085942 agagagtgagggtttagaggaagagatagattctaccttggggactgcattgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagaaccgttgtaatggca 2085843  T
Q  115 caccaggctctagcggttatgaaattgtgggaagtgtaaccg-cggagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtct 213  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||  | | |   | ||||||||||||| ||||||||||| |||  ||| ||||||||  ||||    
T  2085842 cacctggctctggcggttacgaaatcgtgggaagtgtaattgccaggtcgtttattgcgggaacatgcagagagacattgtggttcgtttgaactagtct 2085743  T
Q  214 tgcttgctccgtgcacccccgtcgcggagaa-gggtgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaat 312  Q
       | |||||||| |||||| | ||   ||| |||||||| |||||||||  | || |||||||| |||  | |||  |||| |||| ||||||||||||    
T  2085742 ctttcgctccgtgtaccccccttgcttggaaggggtgtgttgcaagtaacttttccaaacgtggtgtttaggctttgaattgcattgggcctaagtaaat 2085643  T
Q  313 gggccaaagctccttttggccggtccagaacattagtcccccaagtcgttgctcttggtgaagagtgatgacttaagggtgagcat 398  Q
    |         |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||    
T  2085642 g---------tccttttggccggtccagaatagtagccccccaagtcgttgctcttgatgaagagcgatgacttaagtgcgagcat 2085566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 344
Target Start/End: Original strand, 7999649 - 7999979
Alignment:
Q  14 cagagagagagggttaagagggaaagattaattctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggc 113  Q
    ||||||| ||||||| ||||| | ||||  ||||||||||||||||||||  ||||| ||| | |||||||||||||| ||| ||  ||||||| ||| |    
T  7999649 cagagagtgagggtttagaggaagagatagattctaccttggggactgccgtgagtctcctgtttatagaggtggaggactgcag--ccgttgtaatgac 7999746  T
Q  114 acaccaggctctagcggttatgaaattgtgggaagtgtaaccgcg-gagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtc 212  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||| ||||| |||    
T  7999747 acacctggctctggcggttacgaaatcgtgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacatgcagagagacgttgtggttcgttggaaccagtc 7999846  T
Q  213 ttgcttgctccgtgcacccccgtcgcggagaa-gggtgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaa 311  Q
    |   | ||||||||||| | | | | |  ||| |||||||||||||||||   |||| |||| ||| ||   | | | |||||||||| |||||||||||    
T  7999847 tctgtcgctccgtgcactcgccttgtgtggaaggggtgtgtcgcaagtaattttgccaaacgcggtgttcgggttgtggattgtattgggcctaagtaaa 7999946  T
Q  312 tgggccaaagctccttttggccggtccagaaca 344  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  7999947 tgggccaaatgtccttttggccggtccagaaca 7999979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 44 - 389
Target Start/End: Original strand, 25820745 - 25821092
Alignment:
Q  44 attctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcacaccaggctctagcggttatgaaattgtg 143  Q
    |||||||| ||||||||||   ||||||||||| | |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||   ||||  |||||| ||||| |||    
T  25820745 attctaccatggggactgcattgagtcccctatttttagaggtggagggctgcaaagccgttgtaatggcacaccttactctgacggttacgaaatcgtg 25820844  T
Q  144 ggaagtgtaaccgcg-gagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtcttgcttgctccgtgcacccccgtcgcggag 242  Q
    ||||||||||||||  | ||| ||||||| |||||||| | ||||||||||  ||| ||||||| ||||     | | | ||||||||||| || |   |    
T  25820845 ggaagtgtaaccgcctgtgagtttattgctggaacgtggaaagagacgttggggttcgtttgaatcggttcctttcgtttcgtgcacccccctcacacgg 25820944  T
Q  243 aagg-gtgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaatgggccaaagctccttttggccggtccaga 341  Q
    |||| || |||||| |||||   |||| |||||||| |||  | ||| ||| |||||  ||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  25820945 aaggtgtttgtcgcgagtaattttgccaaacgtggtgtttgggctttggatggtattcggcccaaataaattggccaaagatccttttggccggtccaga 25821044  T
Q  342 acattagtcccccaagtcgttgctcttggtgaagagtgatgacttaag 389  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25821045 acagtagccccccaagtcgttgctcttgatgaagagtgatgacttaag 25821092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 299
Target Start/End: Original strand, 24033762 - 24034051
Alignment:
Q  15 agagagagagggttaagagggaaagattaattctaccttggggactgccacgagtccccta--tata-tagaggtggagggctgtagagccgttgtgatg 111  Q
    |||||| || |||| ||||| | ||||  ||||||| ||||||||||| | ||||||||||  |||| || |||||||||| || ||||||||||| |||    
T  24033762 agagagtgaaggtttagaggaagagatagattctacattggggactgctatgagtcccctagttataatataggtggagggttgcagagccgttgtaatg 24033861  T
Q  112 gcacaccaggctctagcggttatgaaattgtgggaagtgtaaccgcg-gagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccgg 210  Q
    ||||||  | || | ||||||| ||||| |||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||| |    
T  24033862 gcacacttgactttggcggttacgaaatcgtggaaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtgcagagagacattgtggttcgtttgaaccag 24033961  T
Q  211 tcttgcttgctccgtgcacccccgtcg-cggagaagggtgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattg 299  Q
    ||| | || |||||||||||||| | |  ||| | ||||||| ||||||||||  |||| |||||||| |||  ||||| ||||||||||    
T  24033962 tctcgttttctccgtgcaccccccttgtgggaaaggggtgtgacgcaagtaactttgccgaacgtggtgtttaggatttggattgtattg 24034051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 10532966 - 10532810
Alignment:
Q  38 agattaattctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcacaccaggctctagcggttatgaa 137  Q
    |||| |||||||||||||||||| |    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||| |||    
T  10532966 agataaattctaccttggggactccattaagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgtaatggcacacctgactctggcggttacgaa 10532867  T
Q  138 attgtgggaagtgtaaccgcg-gagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttg 193  Q
    || |||| ||||||||||||  | | | ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  10532866 atcgtggaaagtgtaaccgccagggtgtttattgcaggaacgtggagagagacgttg 10532810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 22609692 - 22609363
Alignment:
Q  15 agagagagagggttaagagggaaagattaattctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatgg-- 112  Q
    |||||| |||||||  |||| | ||||| |||||| ||| |||| ||  | |||||||  |||||||||||||||||| || |||| |||||||||||      
T  22609692 agagagtgagggttttgaggaagagattgattctatctttgggattgttaagagtccc--atatatagaggtggagggttgcagagtcgttgtgatggta 22609595  T
Q  113 cacaccaggctctagcggttatgaaattgtgggaagtgtaaccg-cggagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggt 211  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||||| ||| || ||||||||| | ||||| |||||||| |||| ||||||||||  | |  ||| |||||||||  |    
T  22609594 cacacctggctctggcggttacgaaatcgtgagatgtgtaaccgacagagagtttattgcgtgaacatgcagagagatatcgtggttcgtttgaaccaat 22609495  T
Q  212 cttgcttgctccgtgcacccccgtcgcggagaaggg-tgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaa 310  Q
    || ||| ||||||||||||||| |||| | |||||| ||||| |||| |||   || | ||| |||| |||  | ||| || ||||||| ||||||||||    
T  22609494 ctcgctcgctccgtgcaccccc-tcgcagggaagggatgtgttgcaaataatgttgtcaaacatggtgtttgggctttgga-tgtattgggcctaagtaa 22609397  T
Q  311 atgggccaaagctccttttggccggtccagaaca 344  Q
    ||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  22609396 atggatcaaagatccttttggtcggtccagaaca 22609363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 543 - 685
Target Start/End: Original strand, 11709805 - 11709947
Alignment:
Q  543 cttgcaaggtcgagctgtggagacgtgtgagaacaccttgaacttgggtacagtttgtcttgaatagctataacacttatgagaatcgggagagcgtatg 642  Q
    ||||| || ||||||||| ||||| |||||| || ||||| | || || || ||| |||||| |||||||||| |||||||||||| |||  ||||| ||    
T  11709805 cttgcgagatcgagctgttgagacatgtgaggacgccttggatttaggaaccgttcgtcttggatagctataatacttatgagaattgggcaagcgtgtg 11709904  T
Q  643 tagggacgcgctcgctattccccgaatgtttttgtttcatagc 685  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||   |||||||||||||||    
T  11709905 tagggatgcgctcgctattccctgagcatttttgtttcatagc 11709947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 327 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 14349470 - 14349411
Alignment:
Q  327 tttggccggtccagaacattagtcccccaagtcgttgctcttggtgaagagtgatgactt 386  Q
    ||||||| ||||| |||| ||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  14349470 tttggccagtccaaaacagtagccctccaagtcgttgctcttgataaagagtgatgactt 14349411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 183; Significance: 1e-98; HSPs: 18)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 44 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 2250162 - 2249776
Alignment:
Q  44 attctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcacaccaggctctagcggttatgaaattgtg 143  Q
    ||||||| ||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||  |||| |||    
T  2250162 attctacattggggtttgctatgagtcccctatatatagaggtggagggttgcagagccgttgtaatggcacaccaggctttggcggttacaaaatcgtg 2250063  T
Q  144 ggaagtgtaaccgcg-gagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtcttgcttgctccgtgcacccccgtcgcggag 242  Q
    |||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| |    
T  2250062 ggaattgtaaccgctagagatattattgcgggaacgtgcagagagacgttgtggttcgtttgaaccagtcttgcttgctccgtgcaccccccttgcgggg 2249963  T
Q  243 aaggg-tgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaatgggccaaagctccttttggccggtccaga 341  Q
    ||||| ||||||||||||||   |||| |||||||||||| || |||  ||||||||| |  ||||||||| || |||||||||||||||  ||||||||    
T  2249962 aaggggtgtgtcgcaagtaatgttgccaaacgtggtatttgagctttgaattgtattgggaataagtaaataggtcaaagctccttttggttggtccaga 2249863  T
Q  342 acattagtccccc-aagtcgttgctcttggtgaagagtgatgacttaagggtgagcatgttttactgctcataaacggtcaaagaag 427  Q
    ||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  2249862 acagtagcccccccaagtcgttgctcttggcgaagagtgatgacttaagggcgggcatgttttcctgctcgtaaacggtcaaagaag 2249776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 74 - 424
Target Start/End: Original strand, 38612616 - 38612973
Alignment:
Q  74 tatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcacaccaggctctagcggttatgaaattgtgggaagtgtaaccgcg-gagagattattgcg 172  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||| |    
T  38612616 tatatatagaggtggagatctgcagagccgttgtaatggtacaccaggctctggcggttacaaaatcgtgggaagtgtaactgccagagagattattgtg 38612715  T
Q  173 ggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtcttgcttgctccgtgcacccccgtcgcggagaaggg-tgtgtcgcaagtaacactgcctaa 271  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||  |||||| ||| | ||||||||   |||| ||    
T  38612716 ggaacgtgcagagggacgttgtggttcgtttgaaccggccctgcttgctccgtgcaaccccctcgcgaggaaggggtgttttgcaagtaatgttgccaaa 38612815  T
Q  272 cgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaatgggccaaagctccttttggccggtccagaacat----tagtcccccaagtcgttgctct 367  Q
    |||||| |||  | |||  || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||     ||| |||||||| |||||||||    
T  38612816 cgtggtgtttgggctttgaatagtattgagcctaagtaaatgggtcaaagctccttttgaccagtccagaacagacagtagccccccaagccgttgctct 38612915  T
Q  368 t-ggtgaagagtgatgacttaagggtgagcatgttttactgctcataaacggtcaaag 424  Q
    | || |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38612916 ttggcgaagagtgatgacttaagggcgggcatgttttgctgctcataaacggtcaaag 38612973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 44 - 389
Target Start/End: Original strand, 18153157 - 18153504
Alignment:
Q  44 attctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcacaccaggctctagcggttatgaaattgtg 143  Q
    ||||||||||||||| |||   ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||| |   ||||  |||||| ||||| |||    
T  18153157 attctaccttggggaatgcattgagtcccctatttatagaggtggagggctgccgagtcgttgtaatggcacagcttactctgacggttacgaaatggtg 18153256  T
Q  144 ggaagtgtaaccgcg-gagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtcttgcttgctccgtgcacccccgtcgcggag 242  Q
    ||||||||||||||  | ||| |||||| ||||||||| | ||||||||||  ||| ||||||||| ||||   ||| ||||||||||||| |||||  |    
T  18153257 ggaagtgtaaccgcctgcgagtttattgtgggaacgtggaaagagacgttggggttcgtttgaaccagtctcttttgttccgtgcacccccctcgcgtgg 18153356  T
Q  243 aaggg-tgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaatgggccaaagctccttttggccggtccaga 341  Q
    ||||| |||||||| |||||   |||| ||| |||| |||  | |||  | ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18153357 aaggggtgtgtcgcgagtaattttgccaaacatggtgtttgggctttgtagtgtattgggcctaagtaaatgggccaaagatccttttggccggtccaga 18153456  T
Q  342 acattagtcccccaagtcgttgctcttggtgaagagtgatgacttaag 389  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  18153457 acaatagtcccccaagtcgttgctcttgataaagagtaatgacttaag 18153504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 9549168 - 9548770
Alignment:
Q  15 agagagagagggttaagagggaaagattaattctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggca 114  Q
    |||||| ||||||| ||||| | ||||  ||| ||||||||||||| |   ||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||   ||||    
T  9549168 agagagtgagggtttagaggaagagatagattttaccttggggactactttgagtcccctttttataaaggtggagggctgcagagccgttgtagaggca 9549069  T
Q  115 caccaggctctagcggttatgaaattgtgggaagtgtaaccg-cggagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtct 213  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||| ||||    
T  9549068 cacctggctctagcggttacgaaatcgtgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtgcagagagacgttgtgtttcgtttgaaccagtct 9548969  T
Q  214 tgcttgctccgtgcacccccgtc----------gcggagaagggtgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcc 303  Q
     ||||||||| ||| |||||  |          | | | | ||||||||||||||||||  | || |||||||  |||  | ||| |||||||||| | |    
T  9548968 cgcttgctccatgccccccccccccccccttgtgggtaaaggggtgtgtcgcaagtaactataccaaacgtggcgtttgggctttggattgtattgggac 9548869  T
Q  304 taagtaaatgggccaaagctccttttggccggtccagaacattagtcccccaagtcgttgctcttggtgaagagtgatgacttaagggtgagcatgttt 402  Q
    || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| | | ||||||||    
T  9548868 tacgtaaatgggccaaacatccttttggccggtccagaacagtagccccccaagtcgttgctcttgatgacgagtgataacttaagtgcgggcatgttt 9548770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 344
Target Start/End: Original strand, 29164848 - 29165178
Alignment:
Q  14 cagagagagagggttaagagggaaagattaattctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggc 113  Q
    ||||||| ||||||| ||||| | ||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |    
T  29164848 cagagagtgagggtttagaggaagagatagattctaccttggggactgctatgagtcccctatttatagaggtggacggctgcagagccgttgtaatgac 29164947  T
Q  114 acaccaggctctagcggttatgaaattgtgggaagtgtaaccgc-ggagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtc 212  Q
    ||||| | ||||||  |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||    
T  29164948 acacctgactctagaagttacgaaatcgtgggaagtgtaactgctagagagtttattgcgggaacgtgcagagagacgttgtggttcgtttgaaccagtc 29165047  T
Q  213 ttgcttgctccgtgcacccccgtcgcggagaagggtgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaat 312  Q
    | | | ||||||||||||||| |   ||| | ||||||||| ||||||||  |||| |||||||| |||  | ||| | |||||||| |||||| |||||    
T  29165048 tcgttcgctccgtgcacccccttgtgggaaaggggtgtgtcacaagtaactttgccaaacgtggtgtttgggctttgggttgtattgggcctaaataaat 29165147  T
Q  313 gggccaaagctccttttggccggtccagaaca 344  Q
    ||| ||||  | | ||||||||||||||||||    
T  29165148 gggtcaaatgt-cgtttggccggtccagaaca 29165178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 45 - 344
Target Start/End: Original strand, 20093566 - 20093866
Alignment:
Q  45 ttctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcacaccaggctctagcggttatgaaattgtgg 144  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||    
T  20093566 ttctaccttggggactgccgtgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgtaatggcacacctggccctagcggttacgaaatcgtgg 20093665  T
Q  145 gaagtgtaacc-gcggagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtcttgcttgctccgtgcacccccgt-cgcggag 242  Q
    |||||||||||  |  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||   | ||||||||||||| | |  | |||     
T  20093666 gaagtgtaaccaccaaagagcttattgcgggaatgtgcagagagacgttgtggttcgtttgaaccagtctctgtcgctccgtgcaccctcttgtgtgga- 20093764  T
Q  243 aagggtgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaatgggccaaagctccttttggccggtccagaa 342  Q
    | |||| ||| |||||||||  || | |||||||| |||    ||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||    
T  20093765 aggggtttgttgcaagtaactttgacaaacgtggtgtttggactttggattgtattggacctaagtaaatgggtcaaagatccttttggccgattcagaa 20093864  T
Q  343 ca 344  Q
    ||    
T  20093865 ca 20093866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 17 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 30770384 - 30770057
Alignment:
Q  17 agagagagggttaagagggaaagattaattctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcaca 116  Q
    |||| ||||||| ||||| | ||||  |||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||    
T  30770384 agagtgagggtttagaggaagagatagattctaccttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagtgctgcagagccgttgtaatggcaca 30770285  T
Q  117 ccaggctctagcggttatgaaattgtgggaagtgtaaccg-cggagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtcttg 215  Q
    || |||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||| | |  |||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||| |||       
T  30770284 cctggctctggcggttacgaaatcgtggaaagtgtaactgccaaagagtttattgcgggaacgtgtagagagacgttg-tgttcgtttgaaccagtccct 30770186  T
Q  216 cttgctccgtgcacccccgt-cgcggagaagggtgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaatgg 314  Q
     | ||||||||||||||| |  | ||| | ||||||||||||||||||   | | |||||| | |||  | |||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  30770185 ttcgctccgtgcacccccttgtgtgga-aggggtgtgtcgcaagtaacttcgtcaaacgtgatgtttgggctttgaattgtattgggcctaagtaaatgg 30770087  T
Q  315 gccaaagctccttttggccggtccagaaca 344  Q
      ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30770086 ttcaaaggtccttttggccggtccagaaca 30770057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 320
Target Start/End: Original strand, 21802450 - 21802757
Alignment:
Q  15 agagagagagggttaagagggaaagattaattctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggca 114  Q
    |||||| ||||||| ||||| | ||||  |||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||    
T  21802450 agagagtgagggtttagaggaagagatagattctaccttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggttgagggctacagagccgttgtaatggca 21802549  T
Q  115 caccaggctctagcggttatgaaattgtgggaagtgtaaccgcg-gagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtct 213  Q
    |||| |||||| | ||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||  ||| || |||||| ||||    
T  21802550 cacctggctctggtggttacgaaatcgtaggaagtgtaacagcgagagagtttattgcgagaacctgcagagagacgttgtggttcgtctgaaccagtct 21802649  T
Q  214 tgcttgctccgtgcacccccgtcgcggagaagg-gtgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaat 312  Q
       | ||||||||||||||| | |||  ||||| |||||| | |||||||  || | |||||||| ||| || ||| |||||||||  ||||||||||||    
T  21802650 ccttcgctccgtgcaccccccttgcgtggaaggcgtgtgttgaaagtaactttgacaaacgtggtgtttgagctttagattgtattcggcctaagtaaat 21802749  T
Q  313 gggccaaa 320  Q
    | ||||||    
T  21802750 gagccaaa 21802757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 165 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 21801894 - 21801668
Alignment:
Q  165 ttattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtcttgcttgctccgtgcacccccgtcgc-ggagaagggtgtgtcgcaagtaaca 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||| ||||| | ||||||| | || ||||| | |||||| ||||||||      
T  21801894 ttattgcgggaacgtgcagagagacgttgtggttcgtttgaatcggtcttgctcgctccttacaccccccttgcaggagaggagtgtgttgcaagtaagt 21801795  T
Q  264 ctgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaatgggccaaagctccttttggccggtccagaacattag-tcccccaagtcgtt 362  Q
     | || |||||||| |||  | ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||    
T  21801794 tttccaaacgtggtgtttgggttttagatagtattgggcctaagtaaatgggccaaagatccttttggccggtccagaatagtagcccccccaagtcgtt 21801695  T
Q  363 gctcttggtgaagagtgatgacttaag 389  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||    
T  21801694 gctcttgataaagagtgatgacttaag 21801668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 44 - 344
Target Start/End: Original strand, 7595379 - 7595684
Alignment:
Q  44 attctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcacaccaggctctagcggttatgaaattgtg 143  Q
    |||||||||||||  ||| || || |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||| ||| || |  |||| ||||| |||    
T  7595379 attctaccttgggt-ctgtcatgattcccctatttatagaggtggagggctgcaaagccgttgtaatagcacacctggcgctggatgttacgaaatcgtg 7595477  T
Q  144 ggaagtgtaaccgcg-gagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtcttgcttgctccgtgcacccccgtc----gc 238  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |    |     
T  7595478 ggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtgcagagagacattgtggttcgtttgaaccggtctcgctcgctccgtgcacccccccctcctgt 7595577  T
Q  239 ggagaa-gggtgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaatgggccaaagctccttttggccggtc 337  Q
    || ||| |||||||| ||||||||   |||| | |||||| ||| || |||  ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  7595578 ggggaaggggtgtgttgcaagtaagtttgccaagcgtggtgtttaagctttgaattgtattgggcctgagtaaatgggccaaagatccttttgaccggtc 7595677  T
Q  338 cagaaca 344  Q
    || ||||    
T  7595678 caaaaca 7595684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 44 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 47295852 - 47295564
Alignment:
Q  44 attctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcacaccaggctctagcggttatgaaattgtg 143  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||   ||||  |||||| ||||| |||    
T  47295852 attctaccttggggactgcattgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgtaatggcacaccttactctgacggttacgaaatcgtg 47295753  T
Q  144 ggaagtgtaaccgc-ggagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtcttgcttgctccgtgcacccccgtcgcggag 242  Q
    |||||||||| |||  | ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||  ||| ||||||||| ||||   | | ||||||||||||| |||||  |    
T  47295752 ggaagtgtaaacgcttgtgagtttattgcgggaaggtggagagagacgttggggttcgtttgaaccagtctccttcgttccgtgcaccccc-tcgcgtgg 47295654  T
Q  243 aa-gggtgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaatgggccaaagctccttttgg 331  Q
    || ||||||||||| |||||   | || |||||||| |||  | |||  | |||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  47295653 aatgggtgtgtcgcgagtaatttttccaaacgtggtgtttgggctttgtagtgtattggacctaagtaaatgggtcaaagatccttttgg 47295564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 45 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 21593047 - 21592744
Alignment:
Q  45 ttctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcacaccaggctctagcggttatgaaattgtgg 144  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||   ||||  ||||||  |||| ||||    
T  21593047 ttctaccttggggactgcattgagtcccctatttatagaggtggagggctgctgagccgttgtaatggcacaccttactctgacggttacaaaatcgtgg 21592948  T
Q  145 gaagtgtaaccg-cggagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtcttgcttgctccgtgca--cccccgtcgcgga 241  Q
    |||||||||||| | |  || ||||| |||||||||| | ||||||||||  ||| ||||||||| ||||   | | ||||||||  ||||| |||||      
T  21592947 gaagtgtaaccgtctgttagcttattacgggaacgtggaaagagacgttggggttcgtttgaaccagtctctttcgttccgtgcacccccccctcgcgtg 21592848  T
Q  242 gaa-gggtgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaatgggccaaagctccttttggccggtccag 340  Q
    ||| ||||||||||| |||||    ||| ||| |||| |||    ||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  21592847 gaaggggtgtgtcgcgagtaatttagccaaacatggtgtttggactttggatggtattgggcctaagtgaatgggccaaagattcttttggccggtccag 21592748  T
Q  341 aaca 344  Q
    ||||    
T  21592747 aaca 21592744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Original strand, 22705650 - 22705929
Alignment:
Q  66 gagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcacaccaggctctagcggttatgaaattgtgggaagtgtaaccgcggagaga- 164  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||| | |||||     
T  22705650 gagtcccgtatttatagaggtggaggactgcagagccattgtaatggcacacctggctctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccg-gtagagaa 22705748  T
Q  165 -ttattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtcttgcttgctccgtgcacccccgtcgcggagaa-gggtgtgtcgcaagtaac 262  Q
     ||||||| |||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||  ||||   | ||||||||||||| | | ||   ||| |||||||| |||||||||    
T  22705749 tttattgcaggaacgtgcagagaaacgttgtggttcgtttgaactagtctctttcgctccgtgcacccgccttgcatggaaggggtgtgttgcaagtaac 22705848  T
Q  263 actgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaatgggccaaagctccttttggccggtccagaaca 344  Q
      || | |||||||| ||  |  ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||| ||||||    
T  22705849 tttgtcaaacgtggtgttgga-ctttggattgtattgggcctaagtaaatgggtcaaatgtccttttgaccggtctagaaca 22705929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 81 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 30765114 - 30764849
Alignment:
Q  81 agaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcacaccaggctctagcggttatgaaattgtgggaagtgtaaccgcg-gagagattattgcgggaacgt 179  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||  | ||   ||| || ||||| |||||||||||||||||  |||| || |||||||||| ||    
T  30765114 agaggtggagggctgcagagctgttgtagtggcacacctaggtccgacgggtacgaaatcgtgggaagtgtaaccgccagagaaataattgcgggaatgt 30765015  T
Q  180 gcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtcttgcttgctccgtgcacccccgtcgcggagaaggg-tgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggta 278  Q
    ||| |||||| |||  ||| | ||||||| ||| ||||||||| |||||| ||| |||||| |||||| | ||||||||||||   |||| |||||||      
T  30765014 gcaaagagacattgtggttcgcttgaaccagtcctgcttgctctgtgcactcccctcgcggtgaaggggtatgtcgcaagtaaatttgccaaacgtggag 30764915  T
Q  279 ttttagattttgattgtattgagcctaagtaaatgggcc-aaagctccttttggccggtccagaaca 344  Q
    ||| || ||  ||||||||||  ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  30764914 tttaagcttgggattgtattggacctaagtaaatggacctaaagc-ccttttggccgatccagaaca 30764849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 118
Target Start/End: Original strand, 22703896 - 22703999
Alignment:
Q  15 agagagagagggttaagagggaaagattaattctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggca 114  Q
    |||||| ||||||| |||||   ||||  |||||||||||||||||||   ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  22703896 agagagtgagggtttagaggacgagatagattctaccttggggactgctgtgagtcccatatttatagaggtggagggctgcagagccgttgtaatggca 22703995  T
Q  115 cacc 118  Q
    ||||    
T  22703996 cacc 22703999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 44 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 28794198 - 28794036
Alignment:
Q  44 attctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcacaccaggctctagcggttatgaaattgtg 143  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| |||||   ||||| | ||||||||| |||||||||  |  |||  |||||| ||||| |||    
T  28794198 attctaccttggggactgttaagagtcccctatatataaaggtgagtggctgcatagccgttgtaatggcacacgtgtgtctgacggttacgaaatcgtg 28794099  T
Q  144 ggaagtgtaaccg-cggagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaac 207  Q
    ||||||||||||| | ||||||  ||| ||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||    
T  28794098 ggaagtgtaaccgccagagaga-gatt-cgggaacgtgtgaagagacgttgcagttcgtttgaac 28794036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 213
Target Start/End: Original strand, 18185653 - 18185823
Alignment:
Q  44 attctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcacaccaggctctagcggttatgaaattgtg 143  Q
    |||||||  ||||||||||   |||||||||||  ||| | ||||||||||| ||||||||| | | ||||||||   ||||  |||||| ||||| | |    
T  18185653 attctacgctggggactgcattgagtcccctattaataaatgtggagggctgcagagccgttttaacggcacaccttactctgacggttacgaaatcgcg 18185752  T
Q  144 ggaagtgtaaccgc-ggagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtct 213  Q
    ||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| || | ||||||||||  ||| ||||||||| ||||    
T  18185753 ggaagtgtaaccgcttgcgagtttattgcgggaacatggaaagagacgttggggttcgtttgaaccagtct 18185823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 87
Target Start/End: Original strand, 6445103 - 6445146
Alignment:
Q  44 attctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtg 87  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  6445103 attctaccttggggactgcaaagagtcccctttatatagaggtg 6445146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 161; Significance: 2e-85; HSPs: 19)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 15 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 23756018 - 23755642
Alignment:
Q  15 agagagagagggttaagagggaaagattaattctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggca 114  Q
    |||||| ||||||| ||||| | ||||  ||||||||||||||||||    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  23756018 agagagtgagggtttagaggaagagatagattctaccttggggactgttgtgagtcccctatttatagaggtggaaggctgtagagccgttgtaatggca 23755919  T
Q  115 caccaggctctagcggttatgaaattgtgggaagtgtaaccg-cggagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtct 213  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||| |||     
T  23755918 cacctggctctagcggttacgaaatcgtgggaagtgtaaccgccatagagtttattgcgggaacgtgcagagagacgttgtggttcttttgaaccagtca 23755819  T
Q  214 tgcttgctccgtgcacccccgtcgcggagaa-gggtgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaat 312  Q
       | ||||||||||||||| | ||   ||| |||||||| |||||||||  | || ||| |||| |||  | ||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  23755818 ctttcgctccgtgcaccccccttgcttggaaggggtgtgttgcaagtaactttaccaaacatggtgtttgggctttggattgtattgggcctaggtaaat 23755719  T
Q  313 gggccaaagctccttttggccggtccagaacattagtcccccaagtcgttgctcttggtgaagagtgatgacttaag 389  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23755718 gggccaaaggtccttttggccggtccagaacattagccccccaagtcgttgctcttgatgaagagtgatgacttaag 23755642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 344
Target Start/End: Original strand, 19092723 - 19093051
Alignment:
Q  17 agagagagggttaagagggaaagattaattctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcaca 116  Q
    |||||||||||| ||||| | |||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  19092723 agagagagggtttagaggaagagataaatcctaccttggggactgctatgagtcccctatatatagaggtggggggctgcagagccgttgtaatgacaca 19092822  T
Q  117 ccaggctctagcggttatgaaattgtgggaagtgtaaccg-cggagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtcttg 215  Q
    |||| |||| ||||||  ||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||  ||||||    
T  19092823 ccagactctcgcggtttcgaacttgtgggaagtgtaaccgccagagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgtggttcgtttgaactagtcttg 19092922  T
Q  216 cttgctccgtgcacccccgtcgcggagaaggg-tgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaatgg 314  Q
     | ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||   | || ||| |||| |||  | |||  ||  ||||| ||||||||||||||    
T  19092923 ttcgctccgtgcaccccc-tcgtggagaagggatgtgtcgcaagtaatgttaccaaacatggtgtttgggctttgaataatattgggcctaagtaaatgg 19093021  T
Q  315 gccaaagctccttttggccggtccagaaca 344  Q
      |||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  19093022 atcaaatctccttttgtccgatccagaaca 19093051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 15 - 344
Target Start/End: Original strand, 3770260 - 3770591
Alignment:
Q  15 agagagagagggttaagagggaaagattaattctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggca 114  Q
    |||||| ||||||| | ||| | ||||  ||||||||||||||||||    || |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  3770260 agagagtgagggtttaaaggaagagatagattctaccttggggactgttgtgaatcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgtaatggca 3770359  T
Q  115 caccaggctctagcggttatgaaattgtgggaagtgtaaccgc-ggagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtct 213  Q
    |||| |||||| |||||||  |||| |||| ||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||    
T  3770360 cacctggctctggcggttacaaaatcgtggaaagtgtaaccgctagagagtttattgcggaaacgtgcagagagacgttgaggttcgtttgaaccagtct 3770459  T
Q  214 tgcttgctccgtgcacccccgtcgcggagaa-gggtgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaat 312  Q
      || ||||| ||||||||| | | |  ||| |||||||| |||||||||  |||| |||||||| |||  | |||  ||||||||| ||||||||||||    
T  3770460 ctctcgctccatgcaccccccttgagtggaaggggtgtgttgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgggctttgaattgtattgggcctaagtaaat 3770559  T
Q  313 gggccaaagctccttttggccggtccagaaca 344  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3770560 gggccaaaggtccttttggccggtccagaaca 3770591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 44 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 25134104 - 25133793
Alignment:
Q  44 attctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcacaccaggctctagcggttatgaaattgtg 143  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||    
T  25134104 attctaccttagggactgctatgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgtagtggcacacctggctctggcggttacgaaatcgtg 25134005  T
Q  144 ggaagtgtaaccg-cggagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtcttgcttgctccgtgcacccccgtcgc---- 238  Q
    | ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||  | |        
T  25134004 gtaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtgcaaagagacgttgtggttcgtttgaaccagtctcgcttgctccgtgcaccccccaccccccc 25133905  T
Q  239 ------ggagaagggtgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaatgggccaaagctccttttggc 332  Q
          ||| | ||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||  | ||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||| || |||||||    
T  25133904 cttttaggaaaggggtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgggctttggattgtaatgggcctaagtaaatgggtcaaagatctttttggc 25133805  T
Q  333 cggtccagaaca 344  Q
    | ||||||||||    
T  25133804 ccgtccagaaca 25133793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 44 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 42534293 - 42534103
Alignment:
Q  44 attctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcacaccaggctctagcggttatgaaattgtg 143  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||| ||||| |||    
T  42534293 attctaccttggggactgctatgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgtaatggcacatctggctctggcggttacgaaatcgtg 42534194  T
Q  144 ggaagtgtaaccg-cggagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtcttgcttgctccgtgcaccccc 233  Q
    ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  42534193 ggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtgcagagagacgttgtggctcgtttgaacaggtctcgctcgctacgtgcaccccc 42534103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 44 - 344
Target Start/End: Original strand, 3105233 - 3105535
Alignment:
Q  44 attctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcacaccaggctctagcggttatgaaattgtg 143  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||   ||||   ||||||||||| |||    
T  3105233 attctaccttggggactgctatgagtcccatatttatagaggtggaggattgtagagccgttgtaatgacacacctaactctcatggttatgaaatcgtg 3105332  T
Q  144 ggaagtgtaaccg-cggagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtcttgcttgctccgtgcacccccgtcgcggag 242  Q
    ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||| ||| |||| |||||| ||| |   |||     
T  3105333 ggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtgcagagagacgttgtggctcgtttgaaccggtctcgctcgctctgtgcactcccttgtgggaa 3105432  T
Q  243 a-agggtgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaatgggccaaagctccttttggccggtccaga 341  Q
    |  |||||||||||||||||   || | |||||||| |||  | ||| |||||| ||| |||||||||||||| | |||| ||||||||||| |||||||    
T  3105433 agggggtgtgtcgcaagtaatgttgtcaaacgtggtgtttgggctttggattgtgttgggcctaagtaaatggactaaaggtccttttggccagtccaga 3105532  T
Q  342 aca 344  Q
    |||    
T  3105533 aca 3105535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 231
Target Start/End: Original strand, 23929796 - 23930014
Alignment:
Q  14 cagagagagagggttaagagggaaagattaattctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggc 113  Q
    ||||||| ||||||| ||||| | || |  ||| |||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  23929796 cagagagtgagggtttagaggaagagttagattttaccttggggactgcagtgagtcccctatataaagaggtggagggctgcagagccgttgtaatggc 23929895  T
Q  114 acaccaggctctagcggttatgaaattgtgggaagtgtaaccg-cggagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtc 212  Q
    ||||| |||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||  |||  ||||||||||||    
T  23929896 acacctggctctggcggttacggaatcgtgggaagtgtaaccgccggagagtttattgtgggaacgtgcagagagacattgtggttcatttgaaccggtc 23929995  T
Q  213 ttgcttgctccgtgcaccc 231  Q
    | ||| |||||||||||||    
T  23929996 tcgctcgctccgtgcaccc 23930014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 44 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 41266366 - 41266201
Alignment:
Q  44 attctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcacaccaggctctagcggttatgaaattgtg 143  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| || || |||    
T  41266366 attctaccttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgtaatggcacacctggctctggcggttacgatatcgtg 41266267  T
Q  144 ggaagtgtaaccg-cggagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaacc 208  Q
     |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  41266266 agaagtgtaaccgcccgagagtttattgcgggaacgtgcagagagacgttgtggttcgtttgaacc 41266201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 26155131 - 26154851
Alignment:
Q  66 gagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcacaccaggctctagcggttatgaaattgtgggaagtgtaaccg-cggagaga 164  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||||| |||| | | ||||| ||||| |||||||||||||||| | ||| |     
T  26155131 gagtcccctatttatagaggtggagggctgcatagccgttataatggcacacctggctatggtggttacgaaatcgtgggaagtgtaaccgccagagcgt 26155032  T
Q  165 ttattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtcttgcttgctccgtgcacccccgtcgcggagaaggg-tgtgtcgcaagtaaca 263  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||  ||| ||||||||   |||   | ||||||||||||||| | | |  |||||| |||||||||||||||     
T  26155031 ttattgcgggaacgtacaaagagatgttgtggttcgtttgaactaatctctttcgctccgtgcaccccccttgtgtggaagggatgtgtcgcaagtaact 26154932  T
Q  264 ctgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaatgggccaaagctccttttggccggtccagaaca 344  Q
     |||| |||||||| ||| |  |||  ||| |||||  |||||||||||||| ||||  |||||||| | | |||||||||    
T  26154931 ttgccaaacgtggtgtttgaactttaaattatattggacctaagtaaatgggtcaaaagtccttttgactgatccagaaca 26154851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 291 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 26159149 - 26159056
Alignment:
Q  291 attgtattgagcctaagtaaatgggccaaagctccttttggccggtccagaacattagtcccccaagtcgttgctcttggtgaagagtgatgact 385  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26159149 attgtattgggcctaagtaaatgagccaaaagtccttttggccggtccagaacagtag-cccccaagtcgttgctcttgatgaagagtgatgact 26159056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 66 - 193
Target Start/End: Original strand, 29568366 - 29568493
Alignment:
Q  66 gagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcacaccaggctctagcggttatgaaattgtgggaagtgtaaccgc-ggagaga 164  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||     
T  29568366 gagtccccaatttatagaggtggagggctacagagccgttgtaatggtacacctggctctggcggttacgaaatcgtgggaagtgtaaccgctagagagt 29568465  T
Q  165 ttattgcgggaacgtgcagagagacgttg 193  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  29568466 ttattgc-ggaacgtgtagagagacgttg 29568493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 22452968 - 22452689
Alignment:
Q  66 gagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcacaccaggctctagcggttatgaaattgtgggaagt---gtaaccgcg-gag 161  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||| |||| |||||||||  |  ||| | ||||| ||||| ||||| |||   ||||||||  |||    
T  22452968 gagtcccctaaatatagaggtgggtggctgcagagccattgtaatggcacacgtgtgtctggtggttacgaaatagtggggagtatagtaaccgccagag 22452869  T
Q  162 agattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtcttgcttgctccgtgcacccccgtcgcggagaagggtgtgtcgcaagtaa 261  Q
    |||||    ||||||| | |  |||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| || |||||    
T  22452868 agattca--cgggaacatacgaagagacgttgcagttcatttgaactggtctcgcttgctccgtgcactcccctcgcggggaagggtgtgttgcgagtaa 22452771  T
Q  262 cactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaatgggccaaagctccttttggccggtccagaaca 344  Q
       || | ||||||||| ||| | ||| |||| ||||||||||||| ||||||||| | | |||||||  |||||||||||||    
T  22452770 tgttgtcaaacgtggta-tttgggtttggattatattgagcctaagcaaatgggcctaggatccttttaaccggtccagaaca 22452689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 44 - 344
Target Start/End: Original strand, 27347198 - 27347499
Alignment:
Q  44 attctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcacaccaggctctagcggttatgaaattgtg 143  Q
    |||||||||||||||||||   || |||||||| |||||| ||||||||||  | ||||||||| ||||||||||   | ||  |||||| |||||  ||    
T  27347198 attctaccttggggactgcattgaatcccctatgtatagacgtggagggctacaaagccgttgtaatggcacacctaacactgacggttacgaaatcatg 27347297  T
Q  144 ggaagtgtaaccgcgga-gagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtcttgcttgctccgtgcaccccc-gtcgcgga 241  Q
    ||||||||||| ||  | ||| |||||||||||||||| | ||||||||||  ||| ||||||||| ||||   | | |  ||||||||||  ||  |||    
T  27347298 ggaagtgtaactgcctatgagtttattgcgggaacgtggaaagagacgttggggttcgtttgaaccagtctctttcgttatgtgcaccccctctcatgga 27347397  T
Q  242 gaagggtgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaatgggccaaagctccttttggccggtccaga 341  Q
     | ||||||||||| |||||   |||| |||||| | |||  | ||| ||| |||||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  27347398 -aggggtgtgtcgcgagtaattttgccaaacgtgatgtttgggctttggatggtattgggcttaagtaaatgggccaaagatccttttgaccggtccaga 27347496  T
Q  342 aca 344  Q
    |||    
T  27347497 aca 27347499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 344
Target Start/End: Original strand, 23932911 - 23933010
Alignment:
Q  245 gggtgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaatgggccaaagctccttttggccggtccagaaca 344  Q
    |||||||||||||||||   || |  ||||||| |||  | ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  23932911 gggtgtgtcgcaagtaatgttgtcagacgtggtgtttgggctttggattgtattaggcctaagtaaatgggccaaagatccttttggccggtctagaaca 23933010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 15 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 26159233 - 26159154
Alignment:
Q  15 agagagagagggttaagagggaaagattaattctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggct 94  Q
    |||||| ||||||| ||||| | ||||  ||||||||||||| |||||   ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26159233 agagagtgagggtttagaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggct 26159154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 89
Target Start/End: Original strand, 12094119 - 12094164
Alignment:
Q  44 attctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtgga 89  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  12094119 attctaccttagggactgcgaggagtcccctttatatagaggtgga 12094164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 333 - 386
Target Start/End: Original strand, 18720457 - 18720510
Alignment:
Q  333 cggtccagaacattagtcccccaagtcgttgctcttggtgaagagtgatgactt 386  Q
    ||||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  18720457 cggtctagaatagtagccccccaagtcgttgctcttggataagagtgatgactt 18720510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 117
Target Start/End: Original strand, 23150744 - 23150816
Alignment:
Q  44 attctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcacac 117  Q
    ||||||||||||||||| | | |||| |||| |||||||||||||  |  |||||||||||||| |||||||||    
T  23150744 attctaccttggggactacgaggagtaccctttatatagaggtgggtgtatgtagagccgttgt-atggcacac 23150816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 117
Target Start/End: Original strand, 23562001 - 23562073
Alignment:
Q  44 attctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcacac 117  Q
    ||||||||||||||||| | | |||| |||| |||||||||||||  |  |||||||||||||| |||||||||    
T  23562001 attctaccttggggactacgaggagtaccctttatatagaggtgggtgtatgtagagccgttgt-atggcacac 23562073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 159; Significance: 3e-84; HSPs: 23)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 44 - 427
Target Start/End: Original strand, 45313176 - 45313558
Alignment:
Q  44 attctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcacaccaggctctagcggttatgaaattgtg 143  Q
    ||||||||||||||||||  | |||| |||| ||||||||||| ||||| || | | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||    
T  45313176 attctaccttggggactgttatgagttccct-tatatagaggtagagggttgcaaatccgttgtaatggcacaccaggctctggcggttacgaaatcgtg 45313274  T
Q  144 ggaagtgtaaccg-cggagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtc-ttgcttgctccgtgcacccccgtcgcgga 241  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  45313275 ggaagtgtaaccgccagagagattattg-gggaacgtgcagagagacgttgtagttcgtttgaaccagtctttgctcgctccgtgcaccctc-tcgcgga 45313372  T
Q  242 gaa-gggtgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaatgggccaaagctccttttggccggtccag 340  Q
    ||| |||||||||||||||||   |||| ||| ||||  ||  | |||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  45313373 gaaggggtgtgtcgcaagtaatgttgccaaacatggtgcttgggctttgaattgtattgggcctaagtaaatgggtcaaagttccttttggccggtccag 45313472  T
Q  341 aacattagtcccccaagtcgttgctcttggtgaagagtgatgacttaagggtgagcatgttttactgctcataaacggtcaaagaag 427  Q
    |||| ||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  45313473 aacagtagcccctcaagttgttgctcttgatgaagagtgatgacttaagggcgggcatg-attactgctcgtaaacggtcaaagaag 45313558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 44 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 26780986 - 26780601
Alignment:
Q  44 attctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcacaccaggctctagcggttatgaaattgtg 143  Q
    ||||||||||||||||||  | || ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||| | ||||| ||||  |||    
T  26780986 attctaccttggggactgttatgactcccctatacagagaggtggagggctgcagagccgttgtaatgacacaccagactctggtggttacgaaaacgtg 26780887  T
Q  144 ggaagtgtaaccgcg-gagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtcttgcttgctccgtgcacccccgtcgcggag 242  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||| |||| |||| |  |||| | ||||||| || | |||    
T  26780886 ggaagtgtaaccgccagagagattattgcgggaacgtgcagagaaacgttgtggttcgtttgagccggccttgttctctccctacacccccctcacagag 26780787  T
Q  243 aaggg-tgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaatgggccaaagctccttttggccggtccaga 341  Q
    ||||| ||||| ||||||||   |||| |||||||| |||  | |||  || |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26780786 aaggggtgtgtagcaagtaatgttgccaaacgtggtgtttgggctttgaatagtattgggcctatgtaaatgggccaaaactccttttggccggtccaga 26780687  T
Q  342 acattagtcccccaagtcgttgctcttggtgaagagtgatgacttaagggtgagcatgttttactgctcataaacggtcaaagaag 427  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||| |||||||||||    
T  26780686 acaatagccccccaagtcgttgctcttgataaagagtgatgacttaagggtgggcatgttttgctgttcgtaaagggtcaaagaag 26780601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 9901902 - 9901569
Alignment:
Q  14 cagagagagagggttaagagggaaagattaattctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggc 113  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | ||   |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  9901902 cagagagtgagggttaagagggagatatcggttctaccttgaggactgctaagagtcccctatatatagaggtggagggttgcagagccgttgtaatggc 9901803  T
Q  114 acaccaggctctagcggttatgaaattgtgggaagtgtaaccgc-ggagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtc 212  Q
    ||||| ||||||  |||||| ||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||  ||||||||| ||    
T  9901802 acacctggctctgacggttacgaaatcgtgggacgtgtaaccgctagagagattattgcgggaatgtccagagagacgttgtggttcatttgaaccgatc 9901703  T
Q  213 ttgcttgctccgtgcacccccgtcgcggagaag-ggtgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaa 311  Q
    | ||| ||||||||||||||| | || | |||| |||||||||||||||| | |||| |||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  9901702 tagctcgctccgtgcaccccc-ttgcagggaagaggtgtgtcgcaagtaatattgccaaacgtgatatttgcgcttttgattgtattgagcctaagtaaa 9901604  T
Q  312 tgggccaaagctccttttggccggtccagaacatt 346  Q
    |||||  |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  9901603 tgggcataagctccttttgaccgatccagaacatt 9901569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 44 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 10985883 - 10985583
Alignment:
Q  44 attctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcacaccaggctctagcggttatgaaattgtg 143  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||    
T  10985883 attctaccttggg-actgccgtgagtcccctatttatagaggtggatggctgcagagccgttgtaatggcacacctggctctcgcggttacgaaatcgtg 10985785  T
Q  144 ggaagtgtaaccg-cggagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtcttgcttgctccgtgcacccccgtcgcggag 242  Q
    ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||| | | |||| |||||||||| |   ||      
T  10985784 ggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtgcagagagacgttgtggttcgtttgaaccagtctcgttcgctctgtgcacccccttgtgggga 10985685  T
Q  243 aagggtgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaatgggccaaagctccttttggccggtccagaa 342  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||| |||||||| ||| |  ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  10985684 aagggtgtgtcacaagtaactttgccaaacgtggtgtttgacctttggattgtattgggcctaagtaaatgggccaaaggtccttttgcccggtccagaa 10985585  T
Q  343 ca 344  Q
    ||    
T  10985584 ca 10985583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 44 - 410
Target Start/End: Original strand, 8082073 - 8082441
Alignment:
Q  44 attctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcacaccaggctctagcggttatgaaattgtg 143  Q
    ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| |||||||||| || || | | |||| ||||| |||    
T  8082073 attctacattggggactgctaagagtcccctatatatagaggtggaggactgcagagccattgtaatggcacacctgggtccaacagttacgaaatcgtg 8082172  T
Q  144 ggaagtgtaaccgcg-gagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtcttgcttgctccgtgcacccccgtcgcggag 242  Q
    | ||||||||||||  |||| || |||||||||||||||| | ||| |||   | | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||     
T  8082173 gaaagtgtaaccgccagagaaataattgcgggaacgtgcaaatagatgttatggctcgtttgaaccggtcctgcttgctccgtgcacccccttcgcggaa 8082272  T
Q  243 aaggg-tgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaatgggccaaagctccttttggccggtccaga 341  Q
    ||||| |  |||||||||||   |||  |||||||| |||  | ||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||| |||||||||    
T  8082273 aaggggtaagtcgcaagtaatgttgcaaaacgtggtgtttgggctttggattgtattgggcctaagtgaatgggcctaagatccttttggacggtccaga 8082372  T
Q  342 acattagtcccccaagtcgttgctcttggtgaagagtgatgacttaagggtgagcatgttttactgctc 410  Q
    ||| ||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||    
T  8082373 acagtagccccttaagtcgttgctcttgatgaagagtgatgacttaagggcggacatgatttactgctc 8082441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 92 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 16396389 - 16396090
Alignment:
Q  92 gctgtagagccgttgtgatggcacaccaggctctagcggttatgaaattgtgggaagtgtaaccgcg-gagagattattgcgggaacgtgcagagagacg 190  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||| | |||| ||| ||| |||||  ||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||| |||||||||    
T  16396389 gctgcagagccgttgtagtggcacacctgactctggcgattaggaaatcatgggaagtgtaaccgccagagtgtttattgcgggaacgtgtagagagacg 16396290  T
Q  191 ttgcagtttgtttgaaccggtcttgcttgctccgtgcacccccgtcgcggagaaggg-tgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagatttt 289  Q
    |||  ||| | ||||||| |||| ||||||||||||||||||| | | ||  ||||| |||||||||||||||  |||| |||||||| |||| | |||     
T  16396289 ttgtggttcgcttgaaccagtctcgcttgctccgtgcaccccccttgtgggaaaggggtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgttttggctttg 16396190  T
Q  290 gattgtattgagcctaagtaaatgggccaaagctccttttggccggtccagaacattagtcccccaagtcgttgctcttggtgaagagtgatgacttaag 389  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16396189 gattgtattgggcctaagtaaatgggccaaagatccttttggccggtccagaacagtagccccccaagccgttgctcttgatgaagagtgatgacttaag 16396090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 15 - 389
Target Start/End: Original strand, 3268334 - 3268710
Alignment:
Q  15 agagagagagggttaagagggaaagattaattctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggca 114  Q
    |||||| ||||||| ||||||| ||||  |||||||||||| |||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||    
T  3268334 agagagtgagggtttagagggagagatagattctaccttggagacttccgtgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccattgtaatgaca 3268433  T
Q  115 caccaggctctagcggttatgaaattgtgggaagtgtaaccg-cggagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtct 213  Q
    |||| |||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||    
T  3268434 cacctggctctggcggttacgtaatcgtgggaagtgtaaccgccatagagtttattgcgggaacgtgcagagagacgttgtggttcgtttgaaccagtct 3268533  T
Q  214 tgcttgctccgtgcacccccgtcgcggagaa-gggtgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaat 312  Q
       | ||||||||||||||| | | |  ||| ||||||||| |||||||   |||| ||   ||| |||  | | | |||||| ||||||||||||||||    
T  3268534 ctgtcgctccgtgcaccccccttgtgtggaaggggtgtgtcacaagtaattttgccaaaatcggtgtttgggctgtggattgttttgagcctaagtaaat 3268633  T
Q  313 gggccaaagctccttttggccggtccagaacattagtcccccaagtcgttgctcttggtgaagagtgatgacttaag 389  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| |  ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  3268634 gggccaaaggtccttttggccggtcccgaacagtagccgtccaagtcgttgctcttaatgaagagtgaagacttaag 3268710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 22 - 344
Target Start/End: Original strand, 12885287 - 12885610
Alignment:
Q  22 gagggttaagagggaaagattaattctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcacaccagg 121  Q
    ||||||| ||||| | ||||  ||||||||||||||||||    ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||    
T  12885287 gagggtttagaggaagagatagattctaccttggggactgttgtgagtcccctatttataaaggtggagggctgcagagccattgtaatggcacacctgg 12885386  T
Q  122 ctctagcggttatgaaattgtgggaagtgtaaccg-cggagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtcttgcttgc 220  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||| ||||   | ||    
T  12885387 ctctggcggttacgaaatcgtgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtgcaaagagacgttgtggttcgtttgaaccagtctctttcgc 12885486  T
Q  221 tccgtgcacccccgtcgcggagaa-gggtgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaatgggccaa 319  Q
    ||| ||||||||| | |||| ||| |||| ||| |||||||||  |||| |||||||| |||  | ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  12885487 tccatgcaccccc-ttgcggggaaggggtatgttgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgggttttggattgtattgggcctaagtaaatgggtcaa 12885585  T
Q  320 agctccttttggccggtccagaaca 344  Q
    |  ||||||||||||||||| ||||    
T  12885586 aagtccttttggccggtccaaaaca 12885610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 22 - 281
Target Start/End: Original strand, 49402699 - 49402961
Alignment:
Q  22 gagggttaagagggaaagattaattctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcacaccagg 121  Q
    ||||| ||||||||| | ||  ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  49402699 gagggataagagggagatatatattctactttggggactgctatgagtcccctatatatagaggtggagggctgcagagccgttgtaatggcacaccagg 49402798  T
Q  122 ctctagcggttatgaaattgtgggaagtgtaaccg-cggagagattattgcgggaacgtgc--agagagacgttgcagtttgtttgaaccggtcttgctt 218  Q
    |||| ||||||| || || |||| ||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  49402799 ctctggcggttacgagatcgtggaaagtgtaaccgccatagagattattgcggaaacgtgcagagagagacgttgtagtccgtttgaaccggtcttgctt 49402898  T
Q  219 gctccgtgcacccccgtcgcggagaa-gggtgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattt 281  Q
    |||| |||||||||| |||| | ||| |||||||||| ||||||  ||||| || |||||||||    
T  49402899 gctctgtgcaccccc-tcgcagggaaggggtgtgtcgtaagtaatgctgccaaaagtggtattt 49402961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 233
Target Start/End: Original strand, 3270546 - 3270765
Alignment:
Q  15 agagagagagggttaagagggaaagattaattctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggca 114  Q
    |||||| ||||||| ||||||| ||||  || |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  3270546 agagagtgagggtttagagggagagatagatcctaccttggggactgccgtgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgtaatggca 3270645  T
Q  115 caccaggctctagcggttatgaaattgtgggaagtgtaaccgc-ggagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtct 213  Q
    |||| |||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| || |||||||||  ||| ||||||||| ||||    
T  3270646 cacctggctctggtggttacgaaatcgtgggaagtgtaaccgctagagagtttattgcgggaacgtgtagtgagacgttgtggttcgtttgaaccagtct 3270745  T
Q  214 tgcttgctccgtgcaccccc 233  Q
       |||||||||||||||||    
T  3270746 ctgttgctccgtgcaccccc 3270765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 44 - 344
Target Start/End: Original strand, 25239723 - 25240025
Alignment:
Q  44 attctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcacaccaggctctagcggttatgaaattgtg 143  Q
    |||||||||||||||||||    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||   ||||  |||||| |||||||||    
T  25239723 attctaccttggggactgcatttagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgtaatggcacaccttactctgacggttacgaaattgtg 25239822  T
Q  144 ggaagtgtaaccg-cggagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtcttgcttgctccgtgcacccccgtcgcg-ga 241  Q
    ||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||| | |||||| |||  ||| ||||||||| ||||   | | ||||||||||||| ||||| ||    
T  25239823 ggaagtgtaaccgcctgtgagtttattgcgggaacgtggaaagagactttggggttcgtttgaaccagtctctttcgttccgtgcacccccctcgcgtga 25239922  T
Q  242 gaagggtgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaatgggccaaagctccttttggccggtccaga 341  Q
     |  |||||||||| |||||   || | |||||||| |||  | ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25239923 aagaggtgtgtcgcgagtaattttgtcaaacgtggtgtttaggctttggagtgtattgggcctaagtaaatgggccaaagatccttttggccggtccaga 25240022  T
Q  342 aca 344  Q
    |||    
T  25240023 aca 25240025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 44 - 344
Target Start/End: Original strand, 28891937 - 28892243
Alignment:
Q  44 attctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcacaccaggctc----tagcggttatgaaat 139  Q
    |||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||| | || ||    | || |||  |||||    
T  28891937 attctaccttggggactcttaagagtcccctatatatagaggtggagagctgcatagccgttgtaatggcacatctgggtccggttggcagttgcgaaat 28892036  T
Q  140 tgtgggaagtgtaaccgcg-gagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtcttgcttgctccgtgcacccccgtcgc 238  Q
     ||||||||||||||| |  |||| || |||| || |||||||| ||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  28892037 cgtgggaagtgtaaccaccagagaaataattgtggaaacgtgcaaagagacgttgtggttcgtttgaacaggtcttgcttgctccgtgcactcccttcgc 28892136  T
Q  239 ggagaa-gggtgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaatgggccaaagctccttttggccggtc 337  Q
    |||||| |||| ||||||||||||   || | |||||||| ||| |  ||| |||||||||| |||||| ||||||| || ||| |||||||| ||||||    
T  28892137 ggagaaggggtatgtcgcaagtaatgttggcaaacgtggtgtttgaactttagattgtattgggcctaaataaatggacctaagatccttttgaccggtc 28892236  T
Q  338 cagaaca 344  Q
    |||||||    
T  28892237 cagaaca 28892243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 44 - 344
Target Start/End: Original strand, 13861342 - 13861644
Alignment:
Q  44 attctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcacaccaggctctagcggttatgaaattgtg 143  Q
    |||||||||||||||||||   |||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||   ||||| | |||| ||||| |||    
T  13861342 attctaccttggggactgcattgagttccctatttatagaggtggagggctgcaaagccgttgtaatggcacaccttactctaacagttacgaaatcgtg 13861441  T
Q  144 ggaagtgtaaccg-cggagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtcttgcttgctccgtgcacccccgtcgcggag 242  Q
    ||||||||||| | | | ||| |||||||||||||||| | ||||||||||  ||| |||||||||||| |   | | ||||||||||||| |||||  |    
T  13861442 ggaagtgtaactgcctgtgagtttattgcgggaacgtggaaagagacgttggggttcgtttgaaccggtatctttcgttccgtgcacccccctcgcgtgg 13861541  T
Q  243 aa-gggtgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaatgggccaaagctccttttggccggtccaga 341  Q
    || ||||||||||| |||||   | ||  ||||||| |||  | ||| ||| |||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||    
T  13861542 aaggggtgtgtcgcgagtaattttaccagacgtggtgtttgggctttggatggtattgggcctaagtaaatgagtcaaagatccttttggccggtccaga 13861641  T
Q  342 aca 344  Q
    |||    
T  13861642 aca 13861644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 344
Target Start/End: Original strand, 12217560 - 12217885
Alignment:
Q  14 cagagagagagggttaagagggaaagattaattctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggc 113  Q
    ||||||| | ||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||          
T  12217560 cagagagtgcgggtttagagggagagatagattctaccttggggactgtcgtgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgt------ 12217653  T
Q  114 acaccaggctctagcggttatgaaattgtgggaagtgtaaccg-cggagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtc 212  Q
    | ||| |||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||    
T  12217654 aaacctggctctggcggttacgaaatcgtaggaagtgtaaccgccagagagtttattgcaggaacgtgcagagagacgttgtggttcgtttgaaccagtc 12217753  T
Q  213 ttgcttgctccgtgcacccccgt-cgcggagaagggtgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaa 311  Q
    |   | ||||||||||||||| |  | ||| | |||||||| ||||||||   |||  |||| ||| |||  | | | |||||||||  | |||||||||    
T  12217754 tctgtcgctccgtgcacccccatgtgtgga-aggggtgtgttgcaagtaattttgctaaacgcggtgtttgggctgtggattgtattaggactaagtaaa 12217852  T
Q  312 tgggccaaagctccttttggccggtccagaaca 344  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  12217853 tgggccaaaggtccttttggccagtccagaaca 12217885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 44 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 21332715 - 21332413
Alignment:
Q  44 attctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcacaccaggctctagcggttatgaaattgtg 143  Q
    ||||||||||||  |||||   ||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||| ||| ||| |||||  ||    
T  21332715 attctaccttggaaactgctttgagtcccctatttacagaggtggagggctgcagagccgttgtagtggcacacctggctctggcgcttacgaaatcatg 21332616  T
Q  144 ggaagtgtaaccg-cggagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtcttgcttgctccgtgcacccccgt-cgcgga 241  Q
    |||||| |||||| | || || |||||| ||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||| ||||   | |||| |||||||||| |  | |||    
T  21332615 ggaagtataaccgccagaaagtttattgtgggaacgtgtagagagacgttgtggttcgtttgaaccagtctctttcgctctgtgcacccccttgtgtgga 21332516  T
Q  242 gaagggtgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttg-attgtattgagcctaagtaaatgggccaaagctccttttggccggtccag 340  Q
     | ||||||||||||||||||  |||| ||||| ||  ||| || |||| |||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||    
T  21332515 aaggggtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtagt-gtttggactttgaattgtattggacctaagtaaatgggccaaagatcattttggccgatctag 21332417  T
Q  341 aaca 344  Q
    ||||    
T  21332416 aaca 21332413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 294 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 18284534 - 18284439
Alignment:
Q  294 gtattgagcctaagtaaatgggccaaagctccttttggccggtccagaacattagtcccccaagtcgttgctcttggtgaagagtgatgacttaag 389  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18284534 gtattgggcctaattaaatgggccaaagatccttttggccggtccataacagtagccccccaagtcgttgctcttgatgaagagtgatgacttaag 18284439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 45 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 17282660 - 17282442
Alignment:
Q  45 ttctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcacaccaggctctagcggttatgaaattgtgg 144  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||   ||||  |||||| ||| | ||||    
T  17282660 ttctaccttggggactgcattgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgtaatggcacaccttactctgacggttacgaattcgtgg 17282561  T
Q  145 gaagtgtaaccgc-ggagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtcttgcttgctccgtgcacccccgtcgcggaga 243  Q
    |||||||||||||  | | | |||||||||||||||| | ||||||||||  ||| ||| ||||| ||||   | | ||||||||||||| |||||  ||    
T  17282560 gaagtgtaaccgcttgtgggtttattgcgggaacgtggaaagagacgttggggttcgttagaaccagtctctttcgttccgtgcacccccctcgcgtgga 17282461  T
Q  244 a-gggtgtgtcgcaagtaa 261  Q
    | ||||||||||| |||||    
T  17282460 aggggtgtgtcgcgagtaa 17282442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 44 - 193
Target Start/End: Original strand, 15455469 - 15455619
Alignment:
Q  44 attctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcacaccaggctctagcggttatgaaattgtg 143  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||   ||||||||||||||||||| || | || |||||||| |||||||| |  | | |||||||||||||  ||    
T  15455469 attctaccttggggactgctaagagtcttatatatatagaggtggagggatgcaaagtcgttgtgaaggcacacctgtgtttggcggttatgaaataatg 15455568  T
Q  144 ggaagtgtaaccgc-ggagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttg 193  Q
    |||||||||| |||  |||| || ||||| | |||||||| ||||||||||    
T  15455569 ggaagtgtaaacgcaagagaaataattgcagaaacgtgcaaagagacgttg 15455619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 184 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 26778894 - 26778753
Alignment:
Q  184 agagacgttgcagtttgtttgaaccggtcttgcttgctccgtgcacccccgtcgcggagaa-gggtgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtatttt 282  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||||| | |||  |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||   || | ||| |||| |||     
T  26778894 agagacgttgtggttcgtttgaaccggtcttgttcgctatgtgcacccccctcgcggagaaggggtgggtcgcaagtaatgttgtcaaacatggtgtttg 26778795  T
Q  283 agattttgattgtattgagcctaagtaaatgggccaaagctc 324  Q
    || |||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26778794 agctttgaatagtattgagcctaagtaaatgagccaaagctc 26778753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 44 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 34845628 - 34845515
Alignment:
Q  44 attctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcacaccaggctctagcggttatgaaattgtg 143  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||  |  || |||| |||||| |||||||||  |  |||  |||||| ||||| |||    
T  34845628 attctaccttggggactgcgaggagccccctttatatagaggtgggtgaatgcagagtcgttgtaatggcacacatgtgtctgacggttacgaaatcgtg 34845529  T
Q  144 ggaagtgtaaccgc 157  Q
    ||||||||||||||    
T  34845528 ggaagtgtaaccgc 34845515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 290 - 344
Target Start/End: Original strand, 3270773 - 3270827
Alignment:
Q  290 gattgtattgagcctaagtaaatgggccaaagctccttttggccggtccagaaca 344  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||    
T  3270773 gattgtattgggcctaagtaaatgggccaaaagtccttttgaccggtccaaaaca 3270827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 41285908 - 41285865
Alignment:
Q  44 attctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtg 87  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  41285908 attctaccttggggactgcgaagagtcccctttatatagaggtg 41285865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 350 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 34845396 - 34845350
Alignment:
Q  350 cccccaagtcgttgctcttggtgaagagtgatgacttaagggtgagc 396  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  34845396 cccccaagtcgtggctattggtaaagagtgatgacttaagagtgagc 34845350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 145; Significance: 6e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 44 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 3000 - 2615
Alignment:
Q  44 attctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcacaccaggctctagcggttatgaaattgtg 143  Q
    |||||||||| |||||||  | ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||    
T  3000 attctaccttcgggactgttatgagtccc-tatatatagaggtggagagctgcagagctgttgtaatggcacaccaggctctggcggttacgaaatcgtg 2902  T
Q  144 ggaagtgtaaccgc-ggagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtcttgcttgctccgtgca--cccccgtcgcgg 240  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||| |||   || |||||||||||||||| | ||||||||||  ||||| |||| |    
T  2901 ggaagtgtaaccgctagagagattattactggaacgtgcagagagacattgtgtttcgtttgaaccggtcttgttcgctccgtgcacccccccctcgcag 2802  T
Q  241 agaaggg-tgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaatgggccaaagctccttttggccggtcca 339  Q
    ||||||| ||||| ||||||||   |||| ||  |||| |||  | |||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2801 agaagggttgtgtagcaagtaatgttgccaaagatggtgtttgggctttgaattgtattaggcctatgtaaatgggccaaagctccttttggtcggtcca 2702  T
Q  340 gaacattagtcccccaagtcgttgctcttggtgaagagtgatgacttaagggtgagcatgttttactgctcataaacggtcaaagaag 427  Q
     |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  2701 aaacagtagccccccaagtcgttgctcttgatgaagagtaatgacttaagggcgggcatg-tttgctgctcgtaaacggtcaaggaag 2615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 130; Significance: 5e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 38 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 16493 - 16140
Alignment:
Q  38 agattaattctaccttgggg-actgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcacaccaggctctagcggttatga 136  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||   ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||| |||||| |||||||  |    
T  16493 agataaattctaccttgggggactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccattgtaatggtacacctggctctggcggttacaa 16394  T
Q  137 aattgtgggaagtgtaacc-gcggagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtcttgcttgctccgtgcacccccgt 235  Q
    ||| |||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||| ||||   | ||||||||||||||| |    
T  16393 aatcgtgggaagtgtaaccaccagagagtttattgcgggaacgtgcagagagatgttgtggttcgtttgaaccagtctcattcgctccgtgcaccccctt 16294  T
Q  236 cgcggagaagggtgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaatgggccaaagctccttttggccgg 335  Q
       ||| | |||||||||||| |||||  | || ||| | || |||  | ||| | |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| |    
T  16293 gtgggaaaggggtgtgtcgcatgtaacttttccaaacatagtgtttgggctttgggttgtattgggcctaagtaaatggaccaaaggtccttttggccag 16194  T
Q  336 tccagaacattagtcccccaagtcgttgctcttggtgaagagtgatgacttaag 389  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  16193 tccagaacagtagtcccccaagtcgttgctcttgaagaagagtgatgacttaag 16140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 129; Significance: 2e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 15 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 151490 - 151106
Alignment:
Q  15 agagagagagggttaagagggaaagattaattctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggca 114  Q
    |||||| ||||||| | ||| | ||||  |||||||||| |||| |||   ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |    
T  151490 agagagtgagggtttaaaggaagagatagattctaccttagggaatgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgtagtggaa 151391  T
Q  115 caccaggctctagcggttatgaaattgtgggaagtgtaaccgcggagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtctt 214  Q
     ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||  | ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||  ||| ||||||| ||||||     
T  151390 gacctggctctagcggttacgaaatcgtgggaagtgaaacgccagagagtttattgcaggaacgtacagagagacgttgtggttcgtttgaatcggtctc 151291  T
Q  215 gcttgctccgtgcacccccgtcgcggagaa-gggtgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaatg 313  Q
    ||| ||||||||||||||| | | || ||| |||| ||  ||||||||   |||| ||||| || |||  | ||| |||||||||  |||||||||||||    
T  151290 gctcgctccgtgcaccccctttgtggggaaggggtatgctgcaagtaagtttgccaaacgtagtgtttgggctttggattgtattaggcctaagtaaatg 151191  T
Q  314 ggccaaagctccttttggccggtccagaacattagtcccccaagtcgttgctcttggtgaagagtgatgacttaagggtgagcat 398  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  151190 ggccaaagatccttttggccggtccagtacagtagccccccaaattgttgctcttgatgaagagtgatgacttaagtgcgagcat 151106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 129; Significance: 2e-66; HSPs: 22)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 28068224 - 28067893
Alignment:
Q  14 cagagagagagggttaagagggaaagattaattctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggc 113  Q
    ||||||| ||||||| ||||| | |||   |||||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  28068224 cagagagtgagggtttagaggaagagagagattctaccttagggactgctatgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgtaatggc 28068125  T
Q  114 acaccaggctctagcggttatgaaattgtgggaagtgtaaccg-cggagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtc 212  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  | | ||||||||| |||    
T  28068124 acacctggctctggcggttacgaaatcgtgggaagtgtaaccgccggagagtttattgcaggaacgtgcagagagacgttgaggctcgtttgaaccagtc 28068025  T
Q  213 ttgcttgctccgtgcacccccgtcgcggagaagggtgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagatttt-gattgtattgagcctaagtaaa 311  Q
    | ||| ||||||||||||||| | ||||| ||||  |||| ||||||||   |||| ||||||||  ||  | |||| |||||||||| || |||||||     
T  28068024 tcgctcgctccgtgcaccccc-ttgcggaaaaggaggtgttgcaagtaagtttgccaaacgtggtgcttgtgcttttggattgtattgggcgtaagtaag 28067926  T
Q  312 tgggccaaagctccttttggccggtccagaaca 344  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28067925 tgggtcaaagatccttttggccggtccagaaca 28067893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 165 - 403
Target Start/End: Original strand, 24095343 - 24095582
Alignment:
Q  165 ttattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtcttgcttgctccgtgcacccccgtcgcggagaaggg-tgtgtcgcaagtaaca 263  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||  || ||| |||| ||||||||||     
T  24095343 ttattgcgggaacgtgcaaagagacgttggggtttgtttgaaccggtctcgcttgctccgtgcatccccctcgcgcggacggggtgtgccgcaagtaacg 24095442  T
Q  264 ctgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaatgggccaaagctccttttggccggtccagaacattagtcccccaagtcgttg 363  Q
     |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  24095443 ttgccaaacgtggtatttgggctttggattgtattgggcctaagtagatgggccaaaactccttttggccggtccagaacagtagccccccaagtcgttg 24095542  T
Q  364 ctcttggtgaagagtgatgacttaagggtgagcatgtttt 403  Q
    |||||  |||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  24095543 ctctttatgaagactgatgacttaagggcgggcatgtttt 24095582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 44 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 20899767 - 20899420
Alignment:
Q  44 attctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcacaccaggctctagcggttatgaaattgtg 143  Q
    |||| ||||||||||||||   ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||   ||||  |||||| ||||| |||    
T  20899767 attcaaccttggggactgcattgagtcccctatttataaaggtggagggctgcagattcgttgtaatggcacacctaactctgacggttacgaaatcgtg 20899668  T
Q  144 ggaagtgtaaccgcg-gagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtcttgcttgctccgtgcacccccgtcgcggag 242  Q
    ||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||| | ||||||||||  ||| ||||||||| ||||   | | ||||||||||||| |||||  |    
T  20899667 ggaagtgtaaccgcctgtgagtttattgcgggaacgtggaaagagacgttggggttcgtttgaaccagtctctttcgttccgtgcacccccctcgcgtgg 20899568  T
Q  243 aaggg-tgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaatgggccaaagctccttttggccggtccaga 341  Q
    ||||| |||||||| |||||   | || |||||||| |||  | ||| ||| ||| || || ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  20899567 aaggggtgtgtcgcgagtaatttttccaaacgtggtgtttgggctttggatggtactgggcttaagtgaatgggccaaagatccttttggctggtccaga 20899468  T
Q  342 acattagtcccccaagtcgttgctcttggtgaagagtgatgacttaag 389  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20899467 acagtagccccccaagtcgttgctcttgatgaagagtgatgacttaag 20899420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 345
Target Start/End: Original strand, 5931190 - 5931522
Alignment:
Q  15 agagagagagggttaagagggaaagattaattctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggca 114  Q
    |||||| ||||||| ||||||| ||||  |||||| ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||    
T  5931190 agagagtgagggtttagagggagagatagattctatcttggggactgtcgtgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgtaatgaca 5931289  T
Q  115 caccaggctctagcggttatgaaattgtgggaagtgtaaccg-cggagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtct 213  Q
    |||| || ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||  ||| ||||||||| ||||    
T  5931290 cacctggttctggcggttatgaaatcgtgggaagtgcaaccgccagagagtttattgcgggaatgtgtagagagacgttgtggttcgtttgaaccagtct 5931389  T
Q  214 tgcttgctccgtgcacccccgtcgcggagaa-gggtgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaat 312  Q
       | ||||||||||||||| | | |  ||| ||||||||| |||||||   |||| |||| | | |||  | | | |||||||||| ||||||||||||    
T  5931390 ctatcgctccgtgcaccccccttgtgtggaaggggtgtgtcacaagtaattttgccaaacgcgatgtttgggttgtggattgtattgggcctaagtaaat 5931489  T
Q  313 gggccaaagctccttttggccggtccagaacat 345  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||| |||||    
T  5931490 gggccaaaggtacttttggccagtccataacat 5931522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 87 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 19330052 - 19329808
Alignment:
Q  87 ggagggctgtagagccgttgtgatggcacaccaggctctagcggttatgaaattgtgggaagtgtaaccgcg-gagagattattgcgggaacgtgcagag 185  Q
    ||||||||  |||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  19330052 ggagggctacagagccattgtaatggcacaccaagctctggcggttacgaaatcgtgggaagtgtaaccgccagagagattattgcgggaacatgcagag 19329953  T
Q  186 agacgttgcagtttgtttgaaccggtcttgcttgctccgtgcacccccgtcgcggagaaggg-tgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttag 284  Q
      ||||||  | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | |||||| ||| ||||||||||   |||| ||||||||||||  |    
T  19329952 taacgttgtggctcgtttgaaccggtcttgctttctccgtgcacccccctcgcagggaagggatgtctcgcaagtaatgttgccaaacgtggtatttggg 19329853  T
Q  285 attttgattgtattgagcctaagtaaatgggccaaagctcctttt 329  Q
     |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19329852 ctttgaattgtattgggcctaagtaaatgggccaaagctcttttt 19329808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 44 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15620362 - 15620172
Alignment:
Q  44 attctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcacaccaggctctagcggttatgaaattgtg 143  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||  |||||| |||||||||    
T  15620362 attctaccttggggactgctatgagtcccctatttatagaggtgaagggctgtagagctgttgtaatggcacacttggctctgacggttacgaaattgtg 15620263  T
Q  144 ggaagtgtaaccg-cggagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtcttgcttgctccgtgcaccccc 233  Q
    ||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  | | ||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||    
T  15620262 ggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcagagagacgttgtggctcgtttgaacccgtctcgctcgctccgtacaccccc 15620172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 44 - 344
Target Start/End: Original strand, 23495377 - 23495678
Alignment:
Q  44 attctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcacaccaggctctagcggttatgaaattgtg 143  Q
    ||||||| |||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||   ||||  |||||| ||||| |||    
T  23495377 attctacattggggactgcattgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgtaatggcacacctaactctgacggttacgaaatcgtg 23495476  T
Q  144 ggaagtgtaaccg-cggagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtcttgcttgctccgtgcacccccgt-cgcgga 241  Q
    ||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||| | ||||||||||  ||| ||||||||||||||   | | ||||||||||||| | || |||    
T  23495477 ggaagtgtaaccgtctgtgagtttattgcgggaacgtggaaagagacgttggggttcgtttgaaccggtctctttcgttccgtgcacccccttgcgtgga 23495576  T
Q  242 gaagggtgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaatgggccaaagctccttttggccggtccaga 341  Q
     | ||||||||||| |||||   |||  |||||||| |||  | ||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |    
T  23495577 -aggggtgtgtcgcgagtaattttgcaaaacgtggtgtttgggctttggatgatattgagcctaagtaaatgggtcaaagatccttttgcccggtccaaa 23495675  T
Q  342 aca 344  Q
    |||    
T  23495676 aca 23495678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 44 - 233
Target Start/End: Original strand, 42792510 - 42792700
Alignment:
Q  44 attctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcacaccaggctctagcggttatgaaattgtg 143  Q
    ||||||||||||||| ||  | ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||    
T  42792510 attctaccttggggattgttatgagtcccctagttatagaggtggagggctgcagagcagttgtagtggcacacctggctctggcggttacgaaatcgtg 42792609  T
Q  144 ggaagtgtaaccgc-ggagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtcttgcttgctccgtgcaccccc 233  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  42792610 ggaagtgtaaccgctagagagtttattgcgggaacgtgcagagatacgttgtgactcgtttgaaccggtctcgcttgctctgtgcaccccc 42792700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 41037855 - 41037524
Alignment:
Q  14 cagagagagagggttaagagggaaagattaattctaccttggggactgccacgagtcccctatatataga---------ggtggagggctgtagagccgt 104  Q
    ||||||| ||||||| ||||| | ||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||         ||||||||||||  |||||||    
T  41037855 cagagagtgagggtttagaggaagagatatattctaccttggggactgctatgagtcccctatttatagaatttatagaggtggagggctgcggagccgt 41037756  T
Q  105 tgtgatggcacaccaggctctagcggttatgaaattgtgggaagtgtaaccg-cggagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgttt 203  Q
    ||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||   |||  |||    
T  41037755 tgtaatggcacacctggctctggcggttacgaaatcgtgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgtgaacgtgcagacagatgttatcgttcattt 41037656  T
Q  204 gaaccggtcttgcttgctccgtgcacccccgtcg-cggagaagggtgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagc 302  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||||||| | | |||| |  ||||||| ||||||||   |||| | ||| || |||  | ||| ||||||||||||     
T  41037655 gaaccagtctcgcttgcttcgtgcaccccccttgccggaaagtggtgtgttgcaagtaagtttgccaaccgtagtgtttgggctttggattgtattgagt 41037556  T
Q  303 ctaagtaaatgggccaaagctccttttggccg 334  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  41037555 ctaagtaaatgggtcataggtccttttggccg 41037524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 345
Target Start/End: Original strand, 8244511 - 8244847
Alignment:
Q  15 agagagagagggttaagagggaaagattaattctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggca 114  Q
    |||||| |||||||  |||| | ||||  ||||||||||| ||||||    ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||    
T  8244511 agagagtgagggttttgaggaagagatagattctaccttgaggactgatgtgagtcccttatttatagaggtggagggctgcagagtcgt-gtgatggca 8244609  T
Q  115 cacca------ggctctagcggttatgaaattgtgggaagtgtaaccgcg-gagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaac 207  Q
    || ||      |||||| ||||||| ||||| |||| |||||||| |||  ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||    
T  8244610 catcattacatggctctggcggttacgaaatcgtggaaagtgtaatcgctagagagtttattgggggaacgtgcaaagagacgttgtggttcgtttgaac 8244709  T
Q  208 cggtcttgcttgctccgtgcacccccgtcgcggagaaggg-tgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttg-attgtattgagccta 305  Q
    | ||||   | ||||||||||||||| | |||  |||||| ||||| ||||||||| | ||| || | ||| ||| ||| |||| |||||||| ||||||    
T  8244710 cagtctctttcgctccgtgcaccccctt-gcgtggaaggggtgtgttgcaagtaactcagccaaatgcggtgttt-agactttggattgtattaagccta 8244807  T
Q  306 agtaaatgggccaaagctccttttggccggtccagaacat 345  Q
    ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  8244808 agtaaatgggctaaaattccttttggccggtccagaacat 8244847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 22922839 - 22922639
Alignment:
Q  14 cagagagagagggttaagagggaaagattaattctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggc 113  Q
    ||||||| ||||||| ||||| | ||||  ||||||||||||||| ||  | ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||  || |    
T  22922839 cagagagtgagggtttagaggaagagatagattctaccttggggattgttatgagtcccctatttatagaggtggagggctacagagccgttgtagtgac 22922740  T
Q  114 acaccaggctctagcggttatgaaattgtgggaagtgtaaccg-cggagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtc 212  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||| | ||| | |||||||| ||||  ||| |||||||| ||||    
T  22922739 acacctggctctagcggttacgaaatcgtgggaagtgtaaccgccagagagtttattgctgaaacatacagagagaggttgtggttcgtttgaacaggtc 22922640  T
Q  213 t 213  Q
    |    
T  22922639 t 22922639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 44 - 346
Target Start/End: Original strand, 38608296 - 38608610
Alignment:
Q  44 attctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcacaccaggctctagcggttatgaaattgtg 143  Q
    |||||||||| ||||||||   ||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||| ||||| |||    
T  38608296 attctaccttagggactgcattgagtcccctatttatagaggtggaggtctacagagccgttgtggaggcacacctggctctggcggttacgaaatcgtg 38608395  T
Q  144 ggaagtgtaaccg-cggagagattattgcgggaacgtgcag---------agagacgttgcagtttgtttgaaccggtcttgcttgctccgtgcaccccc 233  Q
    ||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||         |||||||| | |||| |||||||||||||||  ||| | |||||||||||    
T  38608396 ggaagtgtaaccgccaaagagtttattgcgggaacgtgcagaatatgcaaagagacgtcgtagttcgtttgaaccggtcttatttgattcgtgcaccccc 38608495  T
Q  234 gtcgcggaga-agggtgtgtcgcaagtaacact--gcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaatgggccaaagctccttttg 330  Q
     ||||| |||  ||||||  ||| |||||   |  ||| ||| |||  ||| |  |||  |||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  38608496 -tcgcgtagagggggtgtaccgcgagtaaagtttagccaaacatggagtttgaactttgaattgtattgaacctaagtaaatgagtcaaaggtccttttg 38608594  T
Q  331 gccggtccagaacatt 346  Q
    ||||||||||||||||    
T  38608595 gccggtccagaacatt 38608610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 44 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 5590868 - 5590698
Alignment:
Q  44 attctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcacaccaggctctagcggttatgaaattgtg 143  Q
    |||||||||||||||||||   || |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||   ||||  |||||| |||||||||    
T  5590868 attctaccttggggactgcattgaatcccctatttatagaggtggagggcagcagagccgttgtaatggcacaccttactctgacggttacgaaattgtg 5590769  T
Q  144 ggaagtgtaaccg-cggagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtct 213  Q
    ||||||||||||| | | ||| |||||||||||| ||| | ||||||||||  ||| ||||||||| ||||    
T  5590768 ggaagtgtaaccgcctgcgagtttattgcgggaatgtggaaagagacgttggggttcgtttgaaccagtct 5590698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 44 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 36712820 - 36712519
Alignment:
Q  44 attctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcacaccaggctctagcggttatgaaattgtg 143  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||   ||||  |||||| ||||| |||    
T  36712820 attctaccttggggactgcattgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgtaatggcacacctaactctgacggttacgaaatcgtg 36712721  T
Q  144 ggaagtgtaacc-gcggagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtcttgcttgctccgtgcacccccgtcgcggag 242  Q
    | ||||||||||  | | ||  |||||||| ||||||| | ||||||||||  ||| ||||||||  ||||   | | ||||||||||||| | |||  |    
T  36712720 gaaagtgtaaccacctgcgattttattgcgagaacgtggaaagagacgttggggttcgtttgaactagtctctttcgttccgtgcaccccc-tagcgtgg 36712622  T
Q  243 aa-gggtgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaatgggccaaagctccttttggccggtccaga 341  Q
    || |||||||||||  ||||   |||| |||||||| |||  | ||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||| |||    
T  36712621 aaggggtgtgtcgcgggtaattttgccaaacgtggtgtttaggctttggagtgtattgggcctaagtaaatgggtcaaagatccttttagccagtctaga 36712522  T
Q  342 aca 344  Q
    |||    
T  36712521 aca 36712519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 22922242 - 22922062
Alignment:
Q  14 cagagagagagggttaagagggaaagattaattctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggc 113  Q
    ||||||| ||||||| ||||| | ||||  ||||||||||||| ||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||  || |    
T  22922242 cagagagtgagggtttagaggaagagatagattctaccttgggaactgttatgagtcccctatttatagaggtggagggctacagagccgttgtagtgac 22922143  T
Q  114 acaccaggctctagcggttatgaaattgtgggaagtgtaaccg-cggagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttg 193  Q
    ||||| |||||| | |||||  |||| |||||||||||||||| | || || ||||| | | ||||| |||||||||||||    
T  22922142 acacctggctctggtggttacaaaatcgtgggaagtgtaaccgccagaaagtttattcctgaaacgtacagagagacgttg 22922062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 135 - 345
Target Start/End: Original strand, 22510101 - 22510313
Alignment:
Q  135 gaaattgtgggaagtgtaaccgcg-gagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtcttgcttgctccgtgcaccccc 233  Q
    ||||| |||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| || | |||||||||| |||| |||| |||| ||||   | | ||||||||||| |    
T  22510101 gaaatcgtgggaagtgtaaccgcctgtgagtttattgcgggaacatggaaagagacgttggagttcgttttaaccagtctctttcgttccgtgcacccac 22510200  T
Q  234 gtcgcggagaaggg-tgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaatgggccaaagctccttttggc 332  Q
     |||||  |||||| ||||||||  ||||   |  | |||||||| ||| |  |||  | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22510201 ctcgcgtggaaggggtgtgtcgcgggtaattttatcaaacgtggtgtttgaactttatagtgtattgggcctaagtaaatgggccaaagatccttttggc 22510300  T
Q  333 cggtccagaacat 345  Q
    |||||||||||||    
T  22510301 cggtccagaacat 22510313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 44 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 33622664 - 33622365
Alignment:
Q  44 attctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcacaccaggctct---agcggttatgaaatt 140  Q
    |||||| ||| ||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||   ||||    | ||||| |||||     
T  33622664 attctatcttagggactgcattgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgtaattacacaccttactctgacggtggttacgaaatc 33622565  T
Q  141 gtgggaagtgtaaccg-cggagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtcttgcttgctccgtgcacccccgtcgcg 239  Q
     ||||||||||||||| | | ||| ||||||| |||||||  | ||||||||||  ||| |||| |||| ||||   | | || |||||||||| || ||    
T  33622564 ctgggaagtgtaaccgcctgtgagtttattgctggaacgtagaaagagacgttggggttcgtttaaaccagtctctttcgttctgtgcaccccc-tcacg 33622466  T
Q  240 gagaa-gggtgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaatgggccaaagctccttttggccggtcc 338  Q
      ||| ||||||||||| |||||   |||| ||| || | |||  | ||| |||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  33622465 tggaaggggtgtgtcgcgagtaattttgccaaacatgatgtttgggctttggattgtattgggcttaagtaaatgggtcaaagatccttttggccggtcc 33622366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 327 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 31477262 - 31477200
Alignment:
Q  327 tttggccggtccagaacattagtcccccaagtcgttgctcttggtgaagagtgatgacttaag 389  Q
    |||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  31477262 tttgaccggtccagaacagtagccccccaaatcgttgctcttgcctaagagtgatgacttaag 31477200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 301 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 5589353 - 5589312
Alignment:
Q  301 gcctaagtaaatgggccaaagctccttttggccggtccagaa 342  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  5589353 gcctaagtaaatgggccaaagatccttttgaccggtccagaa 5589312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 345
Target Start/End: Original strand, 13537880 - 13538061
Alignment:
Q  165 ttattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtcttgcttgctccgtgcacccccgtcgcggagaaggg-tgtgtcgcaagtaaca 263  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||  |||  |||||||| ||||   | | ||||| ||||||| |||||  |||||| |||||||| |||||      
T  13537880 ttattgcgggaacgtggaaagagacgttggggttcatttgaaccagtctctttcgttccgtacacccccctcgcgtggaaggggtgtgtcgcgagtaatt 13537979  T
Q  264 ctgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaatgggccaaagctccttttggccggtccagaacat 345  Q
     |||| |||||| | |||  | ||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||  | ||||||  |||||||||||||    
T  13537980 ttgccaaacgtgatgtttgggctttggatggtattgggcctaagtaaatggaccaaatattcttttgatcggtccagaacat 13538061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 88
Target Start/End: Original strand, 18953561 - 18953606
Alignment:
Q  43 aattctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtgg 88  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  18953561 aattctaccttggggactgcgaagagtcccctttatatagaggtgg 18953606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 326 - 383
Target Start/End: Original strand, 18953828 - 18953884
Alignment:
Q  326 ttttggccggtccagaacattagtcccccaagtcgttgctcttggtgaagagtgatga 383  Q
    |||| ||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  18953828 ttttagccggtccaaaacagtag-cccccaagttgttgctcttggtaaagagtgatga 18953884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 127; Significance: 3e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 73 - 389
Target Start/End: Original strand, 242731 - 243048
Alignment:
Q  73 ctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcacaccaggctctagcggttatgaaattgtgggaagtgtaaccg-cggagagattattgc 171  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| | ||| |||||||||||||| | |  |||| |||||||    
T  242731 ctatatatagaggtggagggcggcagagccgttgtaatggcacacctggctcttgcggttacgtaatcgtgggaagtgtaactgccaaagagtttattgc 242830  T
Q  172 gggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtcttgcttgctccgtgcacccccgtcgcggagaa-gggtgtgtcgcaagtaacactgccta 270  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | |  ||| ||| |||||||||||||||||   |||| |    
T  242831 gggaacgtgcaaagagacgttgtggttcgtttgaaccggtcttgctcgctccgtgcacccgcctatcggggaaggggtgtgtcgcaagtaatgttgccaa 242930  T
Q  271 acgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaatgggccaaagctccttttggccggtccagaacattagtcccccaagtcgttgctcttgg 370  Q
    || |||| |||  | ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||| ||||||||||     
T  242931 acttggtgtttgggctttagattgtattgggcctaagtaaatgggacaaaggtccttttggccggtacagaagagtag-cccccaagttgttgctcttga 243029  T
Q  371 tgaagagtgatgacttaag 389  Q
     ||| ||||||||||||||    
T  243030 cgaatagtgatgacttaag 243048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 44 - 344
Target Start/End: Original strand, 253342 - 253644
Alignment:
Q  44 attctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcacaccaggctctagcggttatgaaattgtg 143  Q
    ||||||||||||||||||    |||||||||||||||| ||||||| ||||| | || |||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||    
T  253342 attctaccttggggactgtagtgagtcccctatatataaaggtggacggctgcaaagtcgttgtaatggcacacctggctctggcggttacgaaatcgtg 253441  T
Q  144 ggaagtgtaaccg-cggagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtcttgcttgctccgtgcacccccgtcgcggag 242  Q
    ||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||  ||||||||||||||||   |||||||||| ||| || ||| |    
T  253442 ggaagtgtaactgccagagagtttattgcgggaacgtgcagagagatgttgtggttcatttgaaccggtcttgcactctccgtgcactcccctctcgggg 253541  T
Q  243 aa-gggtgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaatgggccaaagctccttttggccggtccaga 341  Q
    || |||||||||||| ||||   |||| |||||||| |||  ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||| |    
T  253542 aaggggtgtgtcgcacgtaatgttgccaaacgtggtgtttgggatttggattgtattgggcctaagaaaatgggccaaaggttcttttggcctgtccaaa 253641  T
Q  342 aca 344  Q
    |||    
T  253642 aca 253644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 124; Significance: 2e-63; HSPs: 14)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 44 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 8995608 - 8995263
Alignment:
Q  44 attctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcacaccaggctctagcggttatgaaattgtg 143  Q
    ||||||||||||||| |||   ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||   || ||||||  ||||||||||||| ||||| |||    
T  8995608 attctaccttggggaatgcagtgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgat-tgacacacctagctctagcggttacgaaatcgtg 8995510  T
Q  144 ggaagtgtaaccgcgg-agagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtcttgcttgctccgtgcacccccgtcgcggag 242  Q
    ||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||| |||||||||||  | ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||      
T  8995509 ggaagtgtaaccgccatagagtttattgcgggaacgtgctgagagacgttgtggcttgcttgaaccggtctcgctcgctccgtgcaccccc-tcgtggga 8995411  T
Q  243 aaggg-tgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaatgggccaaagctccttttggccggtccaga 341  Q
    ||||| | ||||||||||||   || | |||||||| |||  | ||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |    
T  8995410 aaggggtatgtcgcaagtaatgttgtcaaacgtggtgtttaggctttagatagtattgggtctaagtaaatgggccaaaggtccttttggtcggtccaaa 8995311  T
Q  342 acattagtcccccaagtcgttgctcttggtgaagagtgatgacttaag 389  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  8995310 acagtagccccccaagtcgctgctcttgatgaagagcgatgacttaag 8995263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 19442310 - 19441982
Alignment:
Q  15 agagagagagggttaagagggaaagattaattctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggca 114  Q
    |||||| ||||||| ||||| | ||||  |||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||| ||| ||    
T  19442310 agagagtgagggtttagaggaagagatagattctaccttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagtgctgcaaagccgttgtaatgaca 19442211  T
Q  115 caccaggctctagcggttatgaaattgtgggaagtgtaaccg-cggagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtct 213  Q
    || | | |||| ||||||| ||||| | ||||||| |||||| | ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||  ||| | ||||||| ||||    
T  19442210 catctgactctggcggttacgaaatcgggggaagtataaccgccagagagtttattgtgggaacgtgtagagagacgttgtggttcgattgaaccagtct 19442111  T
Q  214 tgcttgctccgtgcacccccgt-cgcggagaagggtgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaat 312  Q
       | ||||||  ||||||| |  | ||| | ||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||| || ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  19442110 ctttcgctccgcacacccccttgtgtgga-aggggtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagttttggattgtattgggcctaagtaaat 19442012  T
Q  313 gggccaaagctccttttggccggtccagaa 342  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19442011 gggccaaaggtccttttggccggtccagaa 19441982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 8990962 - 8990744
Alignment:
Q  14 cagagagagagggttaagagggaaagattaattctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggc 113  Q
    ||||||| ||||||| ||||| | || |  |||||||| ||||||||||   ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8990962 cagagagtgagggtttagaggaagagttagattctaccgtggggactgcagtgagtcccctatttacagaggtggagggctgtagagccgttgtaatggc 8990863  T
Q  114 acaccaggctctagcggttatgaaattgtgggaagtgtaaccg-cggagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtc 212  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | | ||||| |||||| | ||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||    
T  8990862 acacctggctctagcggttacgaaatcgtgggaagtgtaactgtcagagagtttattgtgagaacgtgcagagagacgttgtggcttgcttgaaccggtc 8990763  T
Q  213 ttgcttgctccgtgcaccc 231  Q
    | |||  ||||||||||||    
T  8990762 tcgctcactccgtgcaccc 8990744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 44 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 21817909 - 21817556
Alignment:
Q  44 attctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcacaccaggctctagcggttatgaaattgtg 143  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||| |||| ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||   ||||  |||||| ||||| |||    
T  21817909 attctaccttggggactgcattgagtcccctatttataaaggtggatggccgcagagccgttgtaatggcacacctaactctgacggttacgaaatcgtg 21817810  T
Q  144 ggaagtgtaaccgcg-gagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtcttgcttgctccgtgcacccccg------tc 236  Q
    ||||||||||| ||  | ||| |||||||||||||||| | ||||||| ||  ||| |||||||||| |||   | | |||||||||||||       ||    
T  21817809 ggaagtgtaacagcctgtgagtttattgcgggaacgtggaaagagacgctggggttcgtttgaaccgatctctttcgttccgtgcacccccccccccctc 21817710  T
Q  237 gcggagaaggg-tgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaatgggccaaagctccttttggccgg 335  Q
     ||  |||||| |||||||| |||||   |||| |||||||| |||  | ||| ||| ||| || |||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  21817709 acgtggaaggggtgtgtcgcgagtaattttgccaaacgtggtgtttgggctttggatagtactgggcctaagtgaatgggccaaagatccttttggccgg 21817610  T
Q  336 tccagaacattagtcccccaagtcgttgctcttggtgaagagtgatgacttaag 389  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21817609 tccaggacagtagccccccaagtcgttgctcttgatgaagagtgatgacttaag 21817556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 44 - 342
Target Start/End: Original strand, 38621832 - 38622132
Alignment:
Q  44 attctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcacaccaggctctagcggttatgaaattgtg 143  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||   |||||| | ||||| ||||| |||    
T  38621832 attctaccttggggactgcagtgagtcccttatatatagaggtggagggctgcagagccgttgtaatggcacatttggctctggtggttacgaaatcgtg 38621931  T
Q  144 ggaagtgtaaccg-cggagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtcttgcttgctccgtgcacccccgtcgcggag 242  Q
    | ||||||||| | |  | |  |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||| ||| ||| |||||||| |||||| |||||| |    
T  38621932 gaaagtgtaactgccaaacaatttattgcgggaacgtgcagagagacgttgtggttcgttttaaccgatctcgctcgctccgtggacccccctcgcgggg 38622031  T
Q  243 aa-gggtgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaatgggccaaagctccttttggccggtccaga 341  Q
    || |||| ||||||||||||    ||  |||||| | ||| || ||| |||||||||| |||||||||||| || ||||  |||||||| ||||||||||    
T  38622032 aaggggtatgtcgcaagtaatgtcgctaaacgtgatgtttgagctttggattgtattgggcctaagtaaataggtcaaaagtccttttgtccggtccaga 38622131  T
Q  342 a 342  Q
    |    
T  38622132 a 38622132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 19967618 - 19967288
Alignment:
Q  15 agagagagagggttaagagggaaagattaattctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggca 114  Q
    |||||| ||||||| ||||| | ||||  |||||||||| ||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||| || | | ||||||| ||| ||    
T  19967618 agagagtgagggtttagaggaagagatggattctaccttagggactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggttgcataaccgttgtaatgaca 19967519  T
Q  115 caccaggctctagcggttatgaaattgtgggaagtgtaaccg-cggagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtct 213  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||| |||||  ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||    
T  19967518 cacctggctctggcggttacgaaatcgtgggtggtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtgcagagagacgttgtggttcgtttgaaccagtct 19967419  T
Q  214 tgcttgctccgtgcacccccgt-cgcggagaagggtgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaat 312  Q
       | ||||||||||||||| |  | ||| | |||||||||||| |||||  || | |||||||| |||    ||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  19967418 ctttcgctccgtgcacccccttatgtgga-aggggtgtgtcgcaggtaactttgtcaaacgtggtgtttggactttggatcgtattgggcctaagtaaat 19967320  T
Q  313 gggccaaagctccttttggccggtccagaaca 344  Q
    ||  ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  19967319 ggatcaaaggtccttttgaccggtccagaaca 19967288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 44 - 344
Target Start/End: Original strand, 9858996 - 9859302
Alignment:
Q  44 attctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcacac-ca---ggctctagcggttatgaaat 139  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| ||   ||||||  |||||| |||||    
T  9858996 attctaccttggggactgctatgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgtggttgcacacacacttggctctgacggttacgaaat 9859095  T
Q  140 tgtgggaagtgtaaccgcgga-gagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtcttgcttgctccgtgcacccccgtcgc 238  Q
     |||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||  ||||  || |||| |||||||||| | ||    
T  9859096 cgtgggaagtgtaaccgccaaagagtttattgcgggaacgtgcagagagacgttgtggttcgtttgaacgagtctcactcgctctgtgcaccccccttgc 9859195  T
Q  239 -ggagaagggtgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagatttt-gattgtattgagcctaagtaaatgggccaaagctccttttggccggt 336  Q
     ||| | |||||||| ||||||||   |||| ||||||||  ||| |||||| |||||||||  | |||||| |||  | ||||| ||||||||||||||    
T  9859196 aggaaaggggtgtgttgcaagtaagtttgccaaacgtggt-gtttggattttggattgtattaggtctaagtcaataagtcaaagatccttttggccggt 9859294  T
Q  337 ccagaaca 344  Q
    ||||||||    
T  9859295 ccagaaca 9859302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 44 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 24974057 - 24973756
Alignment:
Q  44 attctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcacaccaggctctagcggttatgaaattgtg 143  Q
    |||||||||||| ||||||   ||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||||   ||||  |||||| ||||| |||    
T  24974057 attctaccttggtgactgcattgagtcccctatttatagagttagagggctgcagagccgttgtaatggcacacctaactctgacggttacgaaatcgtg 24973958  T
Q  144 ggaagtgtaaccg-cggagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtcttgcttgctccgtgcacccccgtcgcggag 242  Q
    ||||||||||||| | | ||| |||||| ||||| ||  | ||||||||||  ||| ||||||||||||||   | | || |||||||||| | ||   |    
T  24973957 ggaagtgtaaccgcctgtgagtttattgtgggaatgttgaaagagacgttgaggttcgtttgaaccggtctctttcgttctgtgcaccccc-ttgcttgg 24973859  T
Q  243 aaggg-tgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaatgggccaaagctccttttggccggtccaga 341  Q
    ||||| ||||||||||||||   |||  |||||||| |||  | ||| |||  ||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| |    
T  24973858 aagggatgtgtcgcaagtaattttgcaaaacgtggtgtttgggctttggatgatattgggcctaagtaaatggaccaaagaaccttttggccggtccata 24973759  T
Q  342 aca 344  Q
    |||    
T  24973758 aca 24973756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 159 - 344
Target Start/End: Original strand, 33028938 - 33029124
Alignment:
Q  159 gagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgttt-gaaccggtcttgcttgctccgtgcacccccgtcgcggagaaggg-tgtgtcgca 256  Q
    |||||||||||||| |||||| || ||||||||||  |||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||| || ||| |||||| |||||||||    
T  33028938 gagagattattgcgagaacgtacatagagacgttgtggtttgttttgaaccggtcccgcttgctccgttcaccccc-tcacggggaaggggtgtgtcgca 33029036  T
Q  257 agtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaatgggccaaagctccttttggccggtccagaaca 344  Q
    ||||| |  | | |||||||| |||  | ||| |||| ||||| |||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  33029037 agtaatatagtcaaacgtggtgtttgggctttggattatattgtgcctaagtaattgagccaaaactcattttggccggtccagaaca 33029124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 165 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 21815605 - 21815425
Alignment:
Q  165 ttattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtcttgcttgctccgtgcacccccgtcgcggagaaggg-tgtgtcgcaagtaaca 263  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||  ||| ||||||||| ||||   | | ||||||||||||| |||||  |||||| |||||| | |||||      
T  21815605 ttattgcgggaacgtggaaagagacgttggggttcgtttgaaccagtctctttcgttccgtgcacccccctcgcgtggaaggggtgtgtcacgagtaatt 21815506  T
Q  264 ctgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaatgggccaaagctccttttggccggtccagaaca 344  Q
     |||| |||||||| |||  ||||| ||| ||| || |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  21815505 ttgccaaacgtggtgtttgggatttggatggtactgggcctaagtgaatgggccaaagattcttttggccggtccagaaca 21815425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 44 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 22186157 - 22186045
Alignment:
Q  44 attctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcacaccaggctctagcggttatgaaattgtg 143  Q
    |||||||||||||||||||    |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||   |||   ||||||  |||| |||    
T  22186157 attctaccttggggactgctttaagtcccctatttatagaggtggatggctgcagagccgttgtaatggcacaccttactcggacggttacaaaatcgtg 22186058  T
Q  144 ggaagtgtaaccg 156  Q
    |||||||||||||    
T  22186057 ggaagtgtaaccg 22186045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 21815694 - 21815620
Alignment:
Q  44 attctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcacacc 118  Q
    |||||||||||| ||||||   ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  21815694 attctaccttggagactgcattgagtcccatatttatagaggtggagggctgcagagctgttgtaatggcacacc 21815620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 342
Target Start/End: Original strand, 49472354 - 49472531
Alignment:
Q  165 ttattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtcttgcttgctccgtgcacccccgtcgcg-gagaagggtgtgtcgcaagtaaca 263  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||  |||  |||||||||||||   | | ||||||||||||| ||||| | || |||||| |||| |||||      
T  49472354 ttattgcgggaacgtggaaagagacgttggggttcatttgaaccggtctctttcgttccgtgcaccccc-tcgcgtgggaggggtgtttcgcgagtaatt 49472452  T
Q  264 ctgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaatgggccaaagctccttttggccggtccagaa 342  Q
     || | |||| ||| |||    ||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  49472453 ttgtcaaacgcggtgtttggactttggatggtattgggcctaagtaaatgggtcaaagatccttttgcccggtccagaa 49472531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 233
Target Start/End: Original strand, 30894069 - 30894132
Alignment:
Q  170 gcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtcttgcttgctccgtgcaccccc 233  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||   |||||||||||||||||    
T  30894069 gcgggaacgtgtgaagagacgttgcagtttgtttgaacatgtctcatttgctccgtgcaccccc 30894132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 122; Significance: 3e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 48 - 383
Target Start/End: Original strand, 380794 - 381131
Alignment:
Q  48 taccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcacaccaggctctagcggttatgaaattgtgggaa 147  Q
    |||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||| ||||||||| |||    
T  380794 taccatggggactgctatgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgtaatggcacacctggctctggaggttacgaaattgtgagaa 380893  T
Q  148 gtgtaaccg-cggagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtcttgcttgctccgtgcacccccgtcgc-ggagaag 245  Q
    ||||||||| | ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| | || ||| | |    
T  380894 gtgtaaccgccagagactttattgcgggaacgtgtagagagacgttgtggttcgtttgaaccagtctcgctcgctccgtgcaccccccttgcaggaaagg 380993  T
Q  246 ggtgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaatgggccaaagctccttttggccggtccagaacat 345  Q
    ||||||  ||||||||   |||| | | |||| |||  | ||| |||||||||| || ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||     
T  380994 ggtgtggtgcaagtaagtttgccaaccatggtgtttgggctttggattgtattgggcgtaagtaaatgggccacatgtccttttggccggtccataacag 381093  T
Q  346 tagtcccccaagtcgttgctcttggtgaagagtgatga 383  Q
    ||  ||| |||||||||||||||| | |||||||||||    
T  381094 taacccctcaagtcgttgctcttgataaagagtgatga 381131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 344
Target Start/End: Original strand, 391458 - 391791
Alignment:
Q  14 cagagagagagggttaagagggaaagattaattctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggc 113  Q
    ||||||| ||||||| ||||| | ||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  391458 cagagagtgagggtttagaggaagagatagattctaccttggggactgctatgagtcccctatttatagaggtggagggttgcagagccgttgtaatggc 391557  T
Q  114 acaccaggctctagcggttatgaaattgtgggaagtgtaaccgcg-gagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtc 212  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||  |||    
T  391558 acacctggctctggcggttacgaaattatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacctgcagagagacgttgtggttcgtttgaactagtc 391657  T
Q  213 ttgcttgctccgtgcacccccg-tcgcggagaaggg-tgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaa 310  Q
    | ||| |||||||||||||||  | ||||  ||||| ||||| ||||||||   |||| | |||||| |||  | ||| ||||||||||  |||||||||    
T  391658 tcgctcgctccgtgcacccccccttgcgggaaaggggtgtgttgcaagtaagtttgccaaccgtggtgtttggggtttggattgtattggacctaagtaa 391757  T
Q  311 atgggccaaagctccttttggccggtccagaaca 344  Q
    |||| ||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  391758 atggaccacaggtccttttggtcggtccagaaca 391791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 120; Significance: 5e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 44 - 389
Target Start/End: Original strand, 68702 - 69049
Alignment:
Q  44 attctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcacaccaggctctagcggttatgaaattgtg 143  Q
    ||||||||||||| |||||   ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||  ||| | ||||||| ||||| |||    
T  68702 attctaccttgggcactgcggtgagtcccctatttatagaggtggagggctgcaaagccgttgtaatgacacaccttgctttggcggttacgaaatcgtg 68801  T
Q  144 ggaagtgtaaccgc-ggagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtcttgcttgctccgtgcacccccgtcgcggag 242  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||   ||||||||||  | | ||||||||  |||| | ||||||||||||||||| |||| |||    
T  68802 ggaagtgtaaccgctagagagtttattgcgggaacgtgggaagagacgttgtggctcgtttgaactagtctcggttgctccgtgcacccccctcgcagag 68901  T
Q  243 aa-gggtgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaatgggccaaagctccttttggccggtccaga 341  Q
    || |||||||||||||||||   |||  |||||||  | |  | |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  68902 aaggggtgtgtcgcaagtaatgttgcaaaacgtggagtctgggctttgaattgtattgggcctaagtaaatgggccaaagatccttttggccggttcaga 69001  T
Q  342 acattagtcccccaagtcgttgctcttggtgaagagtgatgacttaag 389  Q
    ||| ||| |||| ||||| | |||||||  ||||||||||||||||||    
T  69002 acagtagccccctaagtcatcgctcttgacgaagagtgatgacttaag 69049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 44 - 226
Target Start/End: Original strand, 74874 - 75057
Alignment:
Q  44 attctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcacaccaggctctagcggttatgaaattgtg 143  Q
    ||||||||||||||| |||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||| ||     
T  74874 attctaccttggggaatgcggtgagtcccctatttatagaggtggagggctgtagagccgttgtaatggcacacctggctctggcagttatgaaatcgtc 74973  T
Q  144 ggaagtgtaaccg-cggagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtcttgcttgctccgtg 226  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||  | | ||||||||| |||| | ||||||||||    
T  74974 ggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtgcggagacacgttgtggctcgtttgaaccagtctcggttgctccgtg 75057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 115; Significance: 5e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 66 - 349
Target Start/End: Original strand, 12374 - 12656
Alignment:
Q  66 gagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcacaccaggctctagcggttatgaaattgtgggaagtgtaaccgc-ggagaga 164  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||  ||||||||||||||||  ||||||    
T  12374 gagtcccctatatatagaggtgaagggctgcagagccgttgtaatggcacaccaggctctggcggttacaaaatcatgggaagtgtaaccgctagagaga 12473  T
Q  165 ttattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtcttgcttgctccgtgcacccccgtcgcggagaa-gggtgtgtcgcaagtaaca 263  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||  | |  ||| ||||||||||| | |||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||      
T  12474 ttattgcgggaacgtgc--acagacgttgtggctcatttaaaccggtcttgttcgctctgtgcatcccc-tcgcggagaatgggtgtgtcgcaagtaatg 12570  T
Q  264 ctgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaatgggccaaagctccttttggccggtccagaacattagt 349  Q
     |||  |||||||| |||  | |||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12571 ttgcaaaacgtggtgtttgggctttgaattgtattaggcctaagtaaatgggccaaagctccttttggccggtccagaacaatagt 12656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 113; Significance: 8e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 44 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 30228 - 29880
Alignment:
Q  44 attctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcacaccaggctctagcggttatgaaattgtg 143  Q
    |||||||||| ||||||||   ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||| | || ||||| |||||| | ||||| |||||||||    
T  30228 attctaccttagggactgctgtgagtcccgtatttatagaggtggagggctgcagagccattgtaacggaacacctggctctggtggttacgaaattgtg 30129  T
Q  144 ggaagtgtaacc-gcggagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtcttgcttgctccgtgcacccccgtcgcggag 242  Q
    ||||||||||||  | ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||| ||||   | |||||||||||| || | ||   |    
T  30128 ggaagtgtaacctccagagattttattgcgggaacgtgtagagagacgttgtggttcgtttgaaccagtctctttcgctccgtgcacctcccttgcatgg 30029  T
Q  243 aa-gggtgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaatgggccaaagctccttttggccggtccaga 341  Q
    || |||||||| ||| |||||  |||| |||||| | |||  | ||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30028 aaggggtgtgttgcatgtaactttgccaaacgtgctgtttgggctttggattgtgttgggcctaattaaatgggccaaaggtccttttggccggtccaga 29929  T
Q  342 acattag-tcccccaagtcgttgctcttggtgaagagtgatgacttaag 389  Q
    ||| |||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  29928 acagtagcccccccaagtcgttcctcttgatgaagagtgatgacttaag 29880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 105; Significance: 4e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 22 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 1233 - 909
Alignment:
Q  22 gagggttaagagggaaagattaattctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcacaccagg 121  Q
    ||||||| ||||| | ||||  ||||||| |||| ||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||| ||||| ||    
T  1233 gagggtttagaggaagagatagattctacgttggagactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggctacatagccgttgtaatggaacacctgg 1134  T
Q  122 ctctagcggttatgaaattgtgggaagtgtaaccgcgg-agagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtcttgcttgc 220  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||   |||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||  ||| ||||||||| |||| ||| ||    
T  1133 ctctagcgattacgaaatcgtgggaagtgtaaccgccatagagtttattgcaggaacatgcagagaaacgttgtggttcgtttgaaccagtctcgctcgc 1034  T
Q  221 tccgtgcacccccgtcgcggagaaggg-tgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaatgggccaa 319  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| | ||  ||||||||   |||  |||||||| |||  | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  1033 tccgtgcacccccttcgtggagaaggggtatgctgcaagtaagtttgctaaacgtggtgtttgggctttggattgtattggacctaagtaaatgggccaa 934  T
Q  320 agctccttttggccggtccagaaca 344  Q
    || |||||||| |||||||||||||    
T  933 aggtccttttgaccggtccagaaca 909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 104; Significance: 2e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 47615 - 47396
Alignment:
Q  15 agagagagagggttaagagggaaagattaattctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggca 114  Q
    |||||| ||||||| ||||| | ||||  |||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  47615 agagagtgagggtttagaggaagagatagattctaccttggggactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgtaatggca 47516  T
Q  115 caccaggctctagcggttatgaaattgtgggaagtgtaaccg-cggagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtct 213  Q
    |||  |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||    
T  47515 cacttggctctggcggttacaaaattgtgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtgcagagagacgttgtggttcgtttgaaccagtct 47416  T
Q  214 tgcttgctccgtgcaccccc 233  Q
       | |||||||||||||||    
T  47415 ctttcgctccgtgcaccccc 47396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 245 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 56326 - 56183
Alignment:
Q  245 gggtgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaatgggccaaagctccttttggccggtccagaaca 344  Q
    ||||||||||||||||||   ||| |||||||| |||  | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | | |||||||| |    
T  56326 gggtgtgtcgcaagtaacttcgccaaacgtggtgtttgggctttggattgtattgggcctaagtaaatgggccaaaggtcctttttgtcagtccagaata 56227  T
Q  345 ttagtcccccaagtcgttgctcttggtgaagagtgatgacttaag 389  Q
     ||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  56226 gtag-cccccaagtcgttgctcttaatgaagagtaatgacttaag 56183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 102; Significance: 3e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 4397 - 4064
Alignment:
Q  14 cagagagagagggttaagagggaaagattaattctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggc 113  Q
    ||||||| ||||||| ||||| | ||||  |||||  |||||||||||    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||    
T  4397 cagagagtgagggtttagaggaagagatagattctctcttggggactgatgtgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgtagtggc 4298  T
Q  114 acaccaggctctagcggttatgaaattgtgggaagtgtaaccgcg-gagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtc 212  Q
    ||||| |||||| | ||||| ||||| |||||| ||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||    
T  4297 acacctggctctggtggttacgaaatcgtgggatgtgtaactgcgagagagtttattgcgagaacgtgcagatagacgttgtggttcgtttgaaccggtc 4198  T
Q  213 ttgcttgctccgtgcacccccgtcgcggagaaggg-tgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaa 311  Q
      ||| |||||||| |||||| ||| ||||||||| | ||  ||||||||   |||| |||||||| |||    ||| |||||||||   ||||||||||    
T  4197 ccgctcgctccgtgaacccccttcgtggagaaggggtatgctgcaagtaagtttgccaaacgtggtgtttggactttggattgtatttgacctaagtaaa 4098  T
Q  312 tgggccaaagctccttttggccggtccagaacat 345  Q
    || ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  4097 tgagccaaatatccttttggccggtccagaacat 4064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 99; Significance: 2e-48; HSPs: 17)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 16853209 - 16852876
Alignment:
Q  14 cagagagagagggttaagagggaaagattaattctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggc 113  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||  |   ||||| |||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||| | |   ||||| |||||    
T  16853209 cagagagcgagggtttagagggaagaaaagattctcccttggggactgcattgagtcccctatttatagaggtggagggctgcaaatatgttgtaatggc 16853110  T
Q  114 acaccaggctctagcggttatgaaattgtgggaagtgtaaccg-cggagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtc 212  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||     
T  16853109 acacctggctctggcggttacgaaatcgtgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcggtaacgtgcagagagacgttgtggcttgtttgaaccggtg 16853010  T
Q  213 ttgcttgctccgtgcacccccgtcgcggagaag-ggtgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaa 311  Q
    |  || |||||||| ||| || |||| |||| | |||| ||||||||| |   | || ||||||| |||| || ||| |||||||||| |||||||| ||    
T  16853009 tcactcgctccgtgtacctccctcgcagagaggtggtgcgtcgcaagtgatgttaccaaacgtggaatttgagctttggattgtattgggcctaagt-aa 16852911  T
Q  312 tgggccaaagctccttttggccggtccagaacatt 346  Q
    ||| |||||   |||||||||||||||||||||||    
T  16852910 tggtccaaaaacccttttggccggtccagaacatt 16852876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 342
Target Start/End: Original strand, 22915051 - 22915379
Alignment:
Q  14 cagagagagagggttaagagggaaagattaattctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggc 113  Q
    ||||||| ||||||| ||||| | ||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||     
T  22915051 cagagagtgagggtttagaggaagagatagattctaccttggggactgctatgagtcccctatttataaaggtggagagctgcagagccgttgtaatggt 22915150  T
Q  114 acaccaggctctagcggttatgaaattgtgggaagtgtaaccgc-ggagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtc 212  Q
    ||||  |||||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||   || ||||||||  |||    
T  22915151 acacttggctccggcggttatgaaatcgtgggaagtgtaacagctagagagtttattgcgggaacgtgaagagagacgttgtgattcgtttgaactagtc 22915250  T
Q  213 ttgcttgctccgtgcacccccgtcgcggagaagggtgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaat 312  Q
    | ||| ||||||||||||||   || |||   |||||||| ||||||||   || | |||||||| |||  | ||  |||||||||| ||||||||||||    
T  22915251 tcgctcgctccgtgcaccccttgcg-ggaagggggtgtgttgcaagtaaacttgtcaaacgtggtgtttgcgcttcagattgtattgggcctaagtaaat 22915349  T
Q  313 gggccaaagctccttttggccggtccagaa 342  Q
    | ||||||  |||||||| |||||| ||||    
T  22915350 gagccaaatgtccttttgaccggtcaagaa 22915379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 315
Target Start/End: Original strand, 16914705 - 16915008
Alignment:
Q  14 cagagagagagggttaagagggaaagattaattctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggc 113  Q
    ||||||| |||||||  |||| | ||||  ||||| | ||||||||||  | ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  16914705 cagagagtgagggttttgaggaagagatagattctgctttggggactgttaagagccctctatatatagaggtggagggctgcagagccattgtaatggc 16914804  T
Q  114 acaccaggctctagcggttatgaaattgtgggaagtgtaacc-gcggagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtc 212  Q
    |||    | ||| ||||||| ||||| |||||| |||||||| |  |||| || |||||||||||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||    
T  16914805 acagatcggtctggcggttacgaaatcgtgggaggtgtaaccagtagagaaataattgcgggaacgtgcaaagagacgttgcggctcgtttgaaccggtc 16914904  T
Q  213 ttgcttgctccgtgcacccccgtcgcggaga-agggtgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaa 311  Q
     | |||||||||| ||||||| || ||||||  |||| ||||||||||||   | || |||||||| |||  |  |  |||||||||| |||||||||||    
T  16914905 cttcttgctccgttcacccccctcacggagagggggtatgtcgcaagtaagttttccaaacgtggtgtttgggtatgggattgtattgggcctaagtaaa 16915004  T
Q  312 tggg 315  Q
    ||||    
T  16915005 tggg 16915008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 44 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 3559289 - 3558943
Alignment:
Q  44 attctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcacaccaggctctagcggttatgaaattgtg 143  Q
    ||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||| ||||  ||   |   || || |||| ||||| |||    
T  3559289 attctaccttgggaactgttaagagtcccctatatatagagatgggtggctgcagagccgttgtaatggttcatgtgttcct-gcagttacgaaatcgtg 3559191  T
Q  144 ggaagtgtaaccgcg---gagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtcttgcttgctccgtgcacccccgtcgcgg 240  Q
    | |||||||||| |    ||||||||  ||||||||| |||  ||||| ||||||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||    
T  3559190 gaaagtgtaacctccaaagagagatt--tgcgggaacatgcgaagagatgttgcagttcgtttgaaccggtctcgtttgctctgtgcaccccc-tcgcgg 3559094  T
Q  241 agaaggg-tgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaatgggccaaagctccttttggccggtcca 339  Q
     |||||| ||||| || |||||   |||| || | |||||||  | ||  |||  ||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||| | ||||||||    
T  3559093 ggaaggggtgtgttgcgagtaatgttgccaaatgcggtatttgggcttg-gataatattgagactatgtaaatgggcctaagatcctttcgaccggtcca 3558995  T
Q  340 gaacattagtcccccaagtcgttgctcttggtgaagagtgatgacttaaggg 391  Q
     |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3558994 aaacactagccccccaagtcgttgctcttggcgaagagtgatgacttaaggg 3558943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 86 - 344
Target Start/End: Original strand, 19790346 - 19790606
Alignment:
Q  86 tggagggctgtagagccgttgtgatggcacaccaggctctagcggttatgaaattgtgggaagtgtaaccg-cggagagattattgcgggaacgtgcaga 184  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||    
T  19790346 tggagggctgcagagccgttgtaatggcacacctgactctgacggttacgaaatcgtgggaagtgtaaccgtcagagagtttattgtgggaacgtgcaga 19790445  T
Q  185 gagacgttgcagtttgtttgaaccggtcttgcttgctccgtgcacccccgtcg-cggagaagggtgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtatttta 283  Q
    |||||||||  ||| ||||||||| ||||   | |||| |||||||||| | | | |  | ||| ||||||||||||||  | || |||  ||| |||      
T  19790446 gagacgttgtggttcgtttgaaccagtctctttcgctctgtgcaccccccttgtctggaaggggcgtgtcgcaagtaactttaccaaacacggtgtttgg 19790545  T
Q  284 gattttgattgtattgagcctaagtaaatgggccaaagctccttttggccggtccagaaca 344  Q
    | ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||    
T  19790546 gttttggatggtattgggcctaagtaaatgggccaatgatccttttggccagtccataaca 19790606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 113
Target Start/End: Original strand, 22006495 - 22006590
Alignment:
Q  17 agagagagggttaagagggaaagattaattctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggc 113  Q
    |||| |||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  22006495 agagtgagggttaagaggggaagaaga-ttctaccttggggactgctacgagtcccttatatatagaggtggagggctgcagagtcgttgtaatggc 22006590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 113
Target Start/End: Original strand, 22014012 - 22014107
Alignment:
Q  17 agagagagggttaagagggaaagattaattctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggc 113  Q
    |||| |||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  22014012 agagtgagggttaagaggggaagaaga-ttctaccttggggactgctacgagtcccttatatatagaggtggagggctgcagagtcgttgtaatggc 22014107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 91 - 344
Target Start/End: Original strand, 44635823 - 44636079
Alignment:
Q  91 ggctgtagagccgttgtgatggcacaccaggctctagcggttatgaaattgtgggaagtgtaaccgcg-gagagattattgcgggaacgtgcagagagac 189  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||  |  ||   |||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||   | ||||||||||||  ||||||    
T  44635823 ggctgcagagccgttgtaatggcacacgtgagtccgtcggttacgaaatcgtgggaagtgtaaccgccagagagagattcgcgggaacgtgcgaagagac 44635922  T
Q  190 gttgcagtttgtttgaaccggtcttgcttgctccgtgcacccccgtcgcggagaag-ggtgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattt 288  Q
    |||| |||| ||||||||  |||| ||||||||||| || |||| |||||| |||| ||||||| || |||||   || | ||| |||||||| |  |||    
T  44635923 gttgtagttcgtttgaactagtctcgcttgctccgtacatccccttcgcggggaagcggtgtgttgcgagtaatgttgtcaaacatggtatttgaccttt 44636022  T
Q  289 tga-ttgtattgagcctaagtaaatgggccaaagctccttttggccggtccagaaca 344  Q
     || |||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||| |||||| ||||||    
T  44636023 cgatttgtattgagcctaagtaaatgggcctaatgttcttttgaccggtctagaaca 44636079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 327 - 396
Target Start/End: Original strand, 3786831 - 3786900
Alignment:
Q  327 tttggccggtccagaacattagtcccccaagtcgttgctcttggtgaagagtgatgacttaagggtgagc 396  Q
    |||| ||||| || |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  3786831 tttgaccggtacataacagtagccccccaagtcgttgctcttggtaaagagtgatgacttaaggttgagc 3786900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 335 - 396
Target Start/End: Original strand, 3824539 - 3824600
Alignment:
Q  335 gtccagaacattagtcccccaagtcgttgctcttggtgaagagtgatgacttaagggtgagc 396  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  3824539 gtccataacattagccctccaagtcgttgctcttggtaaagagtgatgacttaaggttgagc 3824600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 334 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 11578673 - 11578618
Alignment:
Q  334 ggtccagaacattagtcccccaagtcgttgctcttggtgaagagtgatgacttaag 389  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11578673 ggtctagaacagtagtcccctaagtcgttgctcttggcgaagagtgatgacttaag 11578618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 44 - 157
Target Start/End: Original strand, 3786562 - 3786674
Alignment:
Q  44 attctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcacaccaggctctagcggttatgaaattgtg 143  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||  |  || ||||||||| | | |||||||  |  ||  ||||||| |||||||||    
T  3786562 attctaccttggggactgcgaggagtcccctttatatagaggtgggtgtttgcagagccgttat-acggcacacatgtgtcccgcggttacgaaattgtg 3786660  T
Q  144 ggaagtgtaaccgc 157  Q
    ||||||||||||||    
T  3786661 ggaagtgtaaccgc 3786674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 157
Target Start/End: Original strand, 3824255 - 3824367
Alignment:
Q  44 attctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcacaccaggctctagcggttatgaaattgtg 143  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||  |  || ||||||||| | | |||||||  |  ||  ||||||| ||||||||     
T  3824255 attctaccttggggactgcgaggagtcccctttatatagaggtgggtgtttgcagagccgttat-acggcacacatgtgtcccgcggttaggaaattgtt 3824353  T
Q  144 ggaagtgtaaccgc 157  Q
    ||||||||||||||    
T  3824354 ggaagtgtaaccgc 3824367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 233
Target Start/End: Original strand, 8733556 - 8733603
Alignment:
Q  186 agacgttgcagtttgtttgaaccggtcttgcttgctccgtgcaccccc 233  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  8733556 agacgttgtagttcgtttgaactggtcttgtttgctccgtgcaccccc 8733603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 233
Target Start/End: Original strand, 9085797 - 9085844
Alignment:
Q  186 agacgttgcagtttgtttgaaccggtcttgcttgctccgtgcaccccc 233  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  9085797 agacgttgtagttcgtttgaactggtcttgtttgctccgtgcaccccc 9085844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 293 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 31530539 - 31530488
Alignment:
Q  293 tgtattgagcctaagtaaatgggccaaagctccttttggccggtccagaaca 344  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  31530539 tgtattgggtctaagtaaatgggtcaaagattcttttggccggtccagaaca 31530488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 90
Target Start/End: Original strand, 19773385 - 19773462
Alignment:
Q  14 cagagagagagggttaagagggaa-agattaattctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggag 90  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||| ||||  |||||||||||||||||||   ||||| ||||| |||||||||||||    
T  19773385 cagagagtgagggtttagaaggaagagatagattctaccttggggactgctgtgagtctcctatttatagaggtggag 19773462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0265 (Bit Score: 95; Significance: 4e-46; HSPs: 3)
Name: scaffold0265
Description:

Target: scaffold0265; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 44 - 389
Target Start/End: Original strand, 14900 - 15253
Alignment:
Q  44 attctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcacaccaggctctagcggttatgaaattgtg 143  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||| |||| ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||   ||||  |||||| ||||| |||    
T  14900 attctaccttggggactgcattgagtcccctatttataaaggtggatggccgcagagccgttgtaatggcacacctaactctgacggttacgaaatcgtg 14999  T
Q  144 ggaagtgtaaccgcg-gagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtcttgcttgctccgtgcacccccg------tc 236  Q
    ||||||||||| ||  | ||| |||||||||||||||| | ||||||| ||  ||| |||||||||| |||   | | |||||||||||||       ||    
T  15000 ggaagtgtaacagcctgtgagtttattgcgggaacgtggaaagagacgctggggttcgtttgaaccgatctctttcgttccgtgcacccccccccccctc 15099  T
Q  237 gcggagaaggg-tgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaatgggccaaagctccttttggccgg 335  Q
     ||  |||||| |||||||| |||||   |||| |||||||| |||  | ||| ||| ||| || |||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  15100 acgtggaaggggtgtgtcgcgagtaattttgccaaacgtggtgtttgggctttggatagtactgggcctaagtgaatgggccaaagatccttttggccgg 15199  T
Q  336 tccagaacattagtcccccaagtcgttgctcttggtgaagagtgatgacttaag 389  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15200 tccaggacagtagccccccaagtcgttgctcttgatgaagagtgatgacttaag 15253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0265; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 165 - 344
Target Start/End: Original strand, 17204 - 17384
Alignment:
Q  165 ttattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtcttgcttgctccgtgcacccccgtcgcggagaaggg-tgtgtcgcaagtaaca 263  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||  ||| ||||||||| ||||   | | ||||||||||||| |||||  |||||| |||||| | |||||      
T  17204 ttattgcgggaacgtggaaagagacgttggggttcgtttgaaccagtctctttcgttccgtgcacccccctcgcgtggaaggggtgtgtcacgagtaatt 17303  T
Q  264 ctgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaatgggccaaagctccttttggccggtccagaaca 344  Q
     |||| |||||||| |||  ||||| ||| ||| || |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  17304 ttgccaaacgtggtgtttgggatttggatggtactgggcctaagtgaatgggccaaagattcttttggccggtccagaaca 17384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0265; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 118
Target Start/End: Original strand, 17115 - 17189
Alignment:
Q  44 attctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcacacc 118  Q
    |||||||||||| ||||||   ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  17115 attctaccttggagactgcattgagtcccatatttatagaggtggagggctgcagagctgttgtaatggcacacc 17189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0989 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0989
Description:

Target: scaffold0989; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 1721 - 1503
Alignment:
Q  15 agagagagagggttaagagggaaagattaattctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggca 114  Q
    |||||| ||||||| ||||| | ||||  |||||||||||||||||||   |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  1721 agagagtgagggtttagaggaagagatagattctaccttggggactgctttgagtgccctatttatagaggtggacggctgtagagctgttgtaatggca 1622  T
Q  115 caccaggctctagcggttatgaaattgtgggaagtgtaaccg-cggagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtct 213  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||  ||| ||||||||| ||||    
T  1621 cacctggctctagcagttataaaatcgtgagaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtgtagagagatgttgtggttcgtttgaaccagtct 1522  T
Q  214 tgcttgctccgtgcacccc 232  Q
       | ||||||||||||||    
T  1521 ctttcgctccgtgcacccc 1503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 84; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 48 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 54770 - 54428
Alignment:
Q  48 taccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcacaccaggctctagcggttatgaaattgtgggaa 147  Q
    |||||| ||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||   ||||  |||||| |||||  ||||||    
T  54770 tacctttgggactgcattgagtcccctatttatagaggtggagggctgcatagccgttgtaatggtacaccttactctgacggttacgaaatcatgggaa 54671  T
Q  148 gtgtaacc-gcggagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtcttgcttgctccgtgcacccccgtcgcggagaagg 246  Q
    ||||||||  | | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||   || ||||||||| ||||   | | ||||||| ||||| |||||  || ||    
T  54670 gtgtaaccacctgtgagtttattgcgggaacgtggagagagacgttgggtttcgtttgaaccagtctccttcgttccgtgcgcccccctcgcgtggaggg 54571  T
Q  247 gtgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttg-attgtattgagcctaagtaaatgggccaaagctccttttggccggtccagaacat 345  Q
    ||||||| | |||||   |||| ||||||| ||||| |  |||| | ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  54570 gtgtgtctcgagtaattttgccaaacgtgg-attttgggctttgtagtgtattgggtctaagtaaatgggccaaagatccttttggccggtccagaacag 54472  T
Q  346 tagtcccccaagtcgttgctcttggtgaagagtgatgacttaag 389  Q
    |   |||||||||||||| ||||| | |||| | ||||||||||    
T  54471 tttccccccaagtcgttgttcttgataaagattaatgacttaag 54428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 75; Significance: 4e-34; HSPs: 3)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Original strand, 1609 - 1803
Alignment:
Q  16 gagagagagggttaagagggaaagattaattctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcac 115  Q
    ||||| ||||||| ||||| | ||||  ||||||| ||||||||||    ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||     
T  1609 gagagtgagggtttagaggaagagatagattctacattggggactgttgtgagtcccctatttatagaggtggatggctgcagagccgttgtaatggcat 1708  T
Q  116 accaggctctagcggttatgaaattgtgggaagtgtaaccg-cggagag-attattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaacc 208  Q
    ||  |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  1709 acttggctctggcggttacgaaatcgtgggaagtgtaaccgccagagagttttattgcgggaacgtgcagagagacgttgtggttcgtttgaacc 1803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Original strand, 15364 - 15507
Alignment:
Q  14 cagagagagagggttaagagggaaagattaattctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggc 113  Q
    ||||||| ||||||| ||||| | ||||  ||||||||  ||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  15364 cagagagtgagggtttagaggaagagatagattctaccgcggggactgttatgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcaatggc 15463  T
Q  114 acaccaggctctagcggttatgaaattgtgggaagtgtaaccgc 157  Q
    |  || | |||| |||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  15464 atgcctgactctggcggttactaaatcgtgggaagtgtaaccgc 15507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 389
Target Start/End: Original strand, 15694 - 15793
Alignment:
Q  290 gattgtattgagcctaagtaaatgggccaaagctccttttggccggtccagaacattagtcccccaagtcgttgctcttggtgaagagtgatgacttaag 389  Q
    |||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| ||| ||||||  |||| ||| | || ||||| || |||||| | |||||||||||||||||    
T  15694 gattgtattgggcctaaataaataggccaaagatccttctggtcggtcctaaacagtagccacctaagtcattactcttgataaagagtgatgacttaag 15793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 44 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 11043 - 10740
Alignment:
Q  44 attctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcacaccaggctctagcggttatgaaattgtg 143  Q
    ||||| ||||||||||| |   |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||  |||||| |||||  ||    
T  11043 attctcccttggggactccattgagtccactatttataaaggtggagggctgtagagccgttgtaatggcacacctaactctgacggttacgaaatcatg 10944  T
Q  144 ggaagtgtaaccg-cggagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtcttgcttgctccgtgcacccccgtcgcggag 242  Q
    ||||||||||||| | | ||| ||||||||||||| || | ||||||||||   ||  |||||||||||||   | | ||| ||||| ||| ||||   |    
T  10943 ggaagtgtaaccgcctgtgagtttattgcgggaacatggaaagagacgttgggtttcttttgaaccggtctctttcgttccttgcactcccctcgcatgg 10844  T
Q  243 aa-gggtgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaatgggccaaagctccttttggccggtccaga 341  Q
    || ||||||||||| |||||   |||| |||||||| |||  | ||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  10843 aaggggtgtgtcgcgagtaattttgccaaacgtggtgtttgggctttggatggtattgggcctaagtgaatgggccaaagatccttttggccgatccaga 10744  T
Q  342 acat 345  Q
    ||||    
T  10743 acat 10740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 62; Significance: 2e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 44 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 36950 - 36651
Alignment:
Q  44 attctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcacaccaggctctagcggttatgaaattgtg 143  Q
    |||||||||| | |||||  | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||  |  ||   |||||| |||||||||    
T  36950 attctaccttagagactgttaagagtcccctatatatagaggtgggtggctgtagagccgttgtaatggcacacgtgtgtccgacggttacgaaattgtg 36851  T
Q  144 ggaagtgtaaccgc---ggagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtcttgcttgctccgtgcacccccgtcgcgg 240  Q
    |||||||||||| |    |||||||  |||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||| | |  ||||||    
T  36850 ggaagtgtaacctccaaagagagat--ttgcgggaacttgcgaagagacgttgcagttcgtttgaactgttctcgcttgctctgtgcatctcgttcgcgg 36753  T
Q  241 agaa-gggtgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaatgggccaaagctccttttggccggtcca 339  Q
     ||| |||||||| || |||||   |||| ||||||||| ||| |  || ||||||||||  |||||| ||||||| | ||| |||||||  | ||||||    
T  36752 ggaaggggtgtgttgcgagtaatgttgccaaacgtggta-tttgggcttggattgtattggacctaagaaaatgggactaagatccttttaactggtcca 36654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 44 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 49397 - 49065
Alignment:
Q  44 attctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcacaccaggctctagcggttatgaaattgtg 143  Q
    |||||||||| ||||| |  | |||||||||||||||||||||||  || || ||||||||||| ||||||||   |  || |  ||||| ||||| |||    
T  49397 attctaccttagggacagttaagagtcccctatatatagaggtgggtggatgcagagccgttgtaatggcacatgtgtgtccaatggttacgaaatcgtg 49298  T
Q  144 ggaagtgtaaccgcggagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtcttgcttgctccgtgcacccccgt-cgcggag 242  Q
    |||||||||||||| ||||||   |  |||||| ||||  |||||||||||| ||  ||||||| | ||| ||||||||||||||||||| | ||||| |    
T  49297 ggaagtgtaaccgcagagagagattcacgggaaagtgcgaagagacgttgcaattcctttgaactgatctcgcttgctccgtgcaccccccttcgcgggg 49198  T
Q  243 aaggg-tgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaatgggccaaagctccttttggccggtccaga 341  Q
    ||||| ||||| |  |||||   |||| ||||||||||||| | ||  |||||||||| |||||||               |||||||| ||  ||||||    
T  49197 aaggggtgtgttgtgagtaatgttgccaaacgtggtattttggcttc-gattgtattgggcctaaga--------------tccttttgacc--tccaga 49115  T
Q  342 acattagtcccccaagtcgttgctcttggtgaagagtgatgacttaaggg 391  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  49114 acagtagccccccaagtcgttgctcttggcgaagagtgatgacttaaggg 49065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 58; Significance: 5e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 20455 - 20342
Alignment:
Q  44 attctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcacaccaggctctagcggttatgaaattgtg 143  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||  || || ||||||||  ||||||||    
T  20455 attctaccttggggactgttaagagtcccctatttttagaggtggagggctgcagagccgttgtaatggtacacttgggtcaagcggttacaaaattgtg 20356  T
Q  144 ggaagtgtaaccgc 157  Q
    ||||||||||||||    
T  20355 ggaagtgtaaccgc 20342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0362 (Bit Score: 51; Significance: 7e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0362
Description:

Target: scaffold0362; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 44 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 7520 - 7351
Alignment:
Q  44 attctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcacaccaggctctagcggttatgaaattgtg 143  Q
    ||||||||||||||| |||   ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||   |||| |  |||| ||||| ||     
T  7520 attctaccttggggattgcattgagtcccctatttatagaggtggagggctgcaaagccgttgtaatggcacaccttactct-gacgttacgaaatcgtt 7422  T
Q  144 ggaagtgtaaccg-cggagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtct 213  Q
    ||||||||||| | | | ||| |||||||||||||||| | ||||||||||  ||| ||||||||| ||||    
T  7421 ggaagtgtaactgcctgtgagtttattgcgggaacgtggaaagagacgttggggttcgtttgaaccagtct 7351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 50; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 86533 - 86424
Alignment:
Q  44 attctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggcacaccaggctctagcggttatgaaattgtg 143  Q
    |||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || | || |||||| ||||||||| ||||||| ||| ||| ||||| |||    
T  86533 attctatcttcgggactgctatgagtcccctatatatagaggtggagggttgcaaagtcgttgtaatggcacactaggctctggcgattacgaaatcgtg 86434  T
Q  144 ggaagtgtaa 153  Q
    | ||||||||    
T  86433 gaaagtgtaa 86424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 48; Significance: 5e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 127 - 344
Target Start/End: Original strand, 9246 - 9461
Alignment:
Q  127 gcggttatgaaattgtgggaagtgtaa-ccgcg-gagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgcagtttgtttgaaccggtcttgcttgctccg 224  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||    || ||||||    
T  9246 gcggttacgaaattgtgggaagtgtaaaccgctagagagtttattgcaggaacgtgcagagagacgttgtggttcgtttgaaccagt----ctcgctccg 9341  T
Q  225 tgcacccccgtcgc-ggagaagggtgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaatgggccaaagct 323  Q
    ||||||  | |||| ||| | |||||||||||||||||   |||| |||||||| |||  | |||  || ||||||  || |||||||||||||||| ||    
T  9342 tgcacctgc-tcgcgggaaaggggtgtgtcgcaagtaattttgccaaacgtggtgtttgggctttgaatagtattggacccaagtaaatgggccaaaact 9440  T
Q  324 ccttttggccggtccagaaca 344  Q
    ||| | |||||||||| ||||    
T  9441 cctctaggccggtccataaca 9461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0299 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0299
Description:

Target: scaffold0299; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 118
Target Start/End: Original strand, 19150 - 19253
Alignment:
Q  15 agagagagagggttaagagggaaagattaattctaccttggggactgccacgagtcccctatatatagaggtggagggctgtagagccgttgtgatggca 114  Q
    |||||| |||| || ||||| | ||||  |||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| | ||||    
T  19150 agagagtgaggatttagaggaagagatagattctaccttggggactgcagtgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccattgtaacggca 19249  T
Q  115 cacc 118  Q
    ||||    
T  19250 cacc 19253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1272 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1272
Description:

Target: scaffold1272; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 344
Target Start/End: Original strand, 1975 - 2074
Alignment:
Q  245 gggtgtgtcgcaagtaacactgcctaacgtggtattttagattttgattgtattgagcctaagtaaatgggccaaagctccttttggccggtccagaaca 344  Q
    |||||||||||||||||   |||| |||||||| |||  | |||  || ||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1975 gggtgtgtcgcaagtaattttgccaaacgtggtgtttgggctttgaatagtattggacccaagtaaatgggccaaaactccttttggccggtccagaaca 2074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0321 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0321
Description:

Target: scaffold0321; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 301 - 344
Target Start/End: Original strand, 18264 - 18307
Alignment:
Q  301 gcctaagtaaatgggccaaagctccttttggccggtccagaaca 344  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  18264 gcctaagtaaatgggccaaaggtccttttggccggtccaaaaca 18307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0233 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0233
Description:

Target: scaffold0233; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 335 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 21929 - 21875
Alignment:
Q  335 gtccagaacattagtcccccaagtcgttgctcttggtgaagagtgatgacttaag 389  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  21929 gtccagaacagtagccccccaagtcgtggctcttggtaaagagtgatgatttaag 21875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University