View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8986_low_26 (Length: 574)

Name: NF8986_low_26
Description: NF8986
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8986_low_26
NF8986_low_26
[»] chr3 (14 HSPs)
chr3 (26-557)||(10038631-10039162)
chr3 (14-557)||(10110579-10111132)
chr3 (26-557)||(13530030-13530571)
chr3 (14-557)||(10000386-10000939)
chr3 (14-557)||(10968469-10969021)
chr3 (14-557)||(50410151-50410700)
chr3 (14-557)||(32750-33303)
chr3 (14-557)||(10237535-10238086)
chr3 (25-557)||(11368637-11369171)
chr3 (16-445)||(11362239-11362681)
chr3 (331-557)||(52918332-52918558)
chr3 (14-290)||(52918045-52918330)
chr3 (14-202)||(46913050-46913238)
chr3 (14-181)||(47692948-47693115)
[»] chr5 (16 HSPs)
chr5 (14-557)||(37261294-37261835)
chr5 (14-557)||(25542480-25543033)
chr5 (14-557)||(14192498-14193052)
chr5 (26-557)||(17871325-17871865)
chr5 (14-557)||(27881063-27881616)
chr5 (26-557)||(3689968-3690509)
chr5 (26-557)||(3876278-3876819)
chr5 (14-555)||(39883162-39883713)
chr5 (14-557)||(37372915-37373468)
chr5 (14-557)||(8428272-8428814)
chr5 (236-557)||(30346316-30346637)
chr5 (246-557)||(10025199-10025510)
chr5 (236-557)||(24629640-24629954)
chr5 (14-161)||(24629954-24630101)
chr5 (14-161)||(30346637-30346784)
chr5 (14-161)||(10025042-10025189)
[»] scaffold0356 (1 HSPs)
scaffold0356 (14-557)||(17564-18109)
[»] chr7 (9 HSPs)
chr7 (14-557)||(5828242-5828795)
chr7 (26-557)||(21069749-21070290)
chr7 (14-557)||(9000832-9001385)
chr7 (26-557)||(22843795-22844335)
chr7 (14-557)||(7036699-7037252)
chr7 (14-557)||(12780835-12781389)
chr7 (236-557)||(42232210-42232532)
chr7 (14-456)||(12785777-12786218)
chr7 (14-161)||(42232063-42232210)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (27-557)||(186546-187086)
[»] chr2 (14 HSPs)
chr2 (26-557)||(24245816-24246357)
chr2 (14-557)||(24268757-24269310)
chr2 (14-557)||(27192468-27193021)
chr2 (26-557)||(27509365-27509906)
chr2 (14-557)||(27842282-27842835)
chr2 (14-557)||(21395349-21395902)
chr2 (14-464)||(17683609-17684069)
chr2 (239-557)||(35609867-35610185)
chr2 (14-456)||(28665971-28666412)
chr2 (14-456)||(37824805-37825246)
chr2 (14-456)||(41919972-41920413)
chr2 (14-202)||(35609664-35609852)
chr2 (353-498)||(3642920-3643065)
chr2 (507-557)||(41919884-41919934)
[»] chr1 (12 HSPs)
chr1 (14-555)||(36207194-36207745)
chr1 (14-557)||(16042004-16042557)
chr1 (14-557)||(2329148-2329698)
chr1 (14-557)||(2452804-2453357)
chr1 (14-557)||(48775022-48775575)
chr1 (17-557)||(37389839-37390389)
chr1 (14-557)||(6310681-6311235)
chr1 (26-411)||(18148679-18149074)
chr1 (155-512)||(48233498-48233865)
chr1 (236-557)||(52500795-52501109)
chr1 (14-202)||(48238529-48238717)
chr1 (14-161)||(52500648-52500795)
[»] chr6 (10 HSPs)
chr6 (14-557)||(2201866-2202419)
chr6 (26-557)||(30881318-30881858)
chr6 (14-464)||(10187523-10187983)
chr6 (14-512)||(18344104-18344612)
chr6 (14-401)||(15333622-15334019)
chr6 (271-557)||(12517520-12517806)
chr6 (16-325)||(29639947-29640266)
chr6 (16-325)||(31510118-31510437)
chr6 (14-169)||(12517367-12517522)
chr6 (333-475)||(18814054-18814196)
[»] scaffold0262 (1 HSPs)
scaffold0262 (17-557)||(18988-19537)
[»] chr8 (7 HSPs)
chr8 (14-557)||(21113431-21113984)
chr8 (14-557)||(25218252-25218805)
chr8 (14-557)||(25208734-25209272)
chr8 (14-557)||(7821817-7822370)
chr8 (14-423)||(30307156-30307575)
chr8 (26-202)||(31978579-31978755)
chr8 (427-557)||(30325877-30326007)
[»] chr4 (9 HSPs)
chr4 (14-537)||(1860656-1861189)
chr4 (14-557)||(35855886-35856439)
chr4 (14-557)||(49710152-49710704)
chr4 (14-498)||(38518075-38518569)
chr4 (120-557)||(13337320-13337767)
chr4 (14-456)||(49786627-49787068)
chr4 (236-557)||(55558810-55559131)
chr4 (202-512)||(617956-618266)
chr4 (14-161)||(55559131-55559278)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (14-557)||(321023-321576)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (18-557)||(182794-183343)
scaffold0003 (16-557)||(165511-166065)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (14-557)||(4947-5499)
[»] scaffold0073 (3 HSPs)
scaffold0073 (14-557)||(31912-32464)
scaffold0073 (275-557)||(1-283)
scaffold0073 (14-238)||(19436-19670)
[»] scaffold0550 (1 HSPs)
scaffold0550 (14-556)||(260-812)
[»] scaffold1139 (1 HSPs)
scaffold1139 (26-557)||(991-1549)
[»] scaffold0118 (2 HSPs)
scaffold0118 (236-557)||(28406-28727)
scaffold0118 (14-161)||(28727-28874)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (14-456)||(48735-49176)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (206-453)||(39937-40184)
scaffold0107 (484-557)||(42434-42507)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (359-557)||(13964-14162)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (42-230)||(16691-16889)
[»] scaffold0888 (1 HSPs)
scaffold0888 (26-126)||(30-130)
[»] scaffold1424 (1 HSPs)
scaffold1424 (14-90)||(1627-1703)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 416; Significance: 0; HSPs: 14)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 416; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 557
Target Start/End: Original strand, 10038631 - 10039162
Alignment:
Q  26 ttttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaa 125  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10038631 ttttcacccgatcgacaaacagaatgagagcttaaataatatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaattgaatcaa 10038730  T
Q  126 gtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaagacatcaacggatttgttgtgtcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  10038731 gtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaattgggatacacaaagacatcaacagatttgttgtgtct 10038830  T
Q  226 gatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattag 325  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10038831 gatataagcaaatcttcgaaaatttataccttcgtttcaccattctcatctaaagcgtcgttgccgtcttcaattgagagtatccacttgccaaaattag 10038930  T
Q  326 caatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataagtccatatctttgatgaattgat 425  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10038931 caatttcttcttgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacaataagcctcaacacattacaataagcccatatctttgatgaattgat 10039030  T
Q  426 tgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggaccacatgaaatagcttcctgaaatcaccacctaaatctcttgtcattccacgaaaaggtcta 525  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||| |||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  10039031 tgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcagacaacatgcaatatcttcttgaaatcaccacataaaactattgtcattccaccaaaaggtcta 10039130  T
Q  526 aactcgtttaggggatcattcttggacatgat 557  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  10039131 aactcgtttaagggatcattcctagacatgat 10039162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 557
Target Start/End: Original strand, 10110579 - 10111132
Alignment:
Q  14 tggacatcatatttttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 113  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  10110579 tggacatcagaattttcacccgatcaacaaacataatcaaagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgct 10110678  T
Q  114 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------a 203  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||          |    
T  10110679 caactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgagatacacaaagtctgtaagtga 10110778  T
Q  204 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 303  Q
    ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| |     
T  10110779 catcaacagatttgttgcgtctgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcctccgaagcgttgttgccgtctccaattcat 10110878  T
Q  304 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataag 403  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  10110879 agtatccacttgccaaaattagcaatttctttctgctctgtaggtaccaaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcattaacacattaaaataag 10110978  T
Q  404 tccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggaccacatgaaatagcttcctgaaatcaccacctaaatctct 503  Q
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| || ||||||||||||||||||| || |    
T  10110979 ctcatatctttgatgaattgattgatgcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacaggcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactat 10111078  T
Q  504 tgtcattccacgaaaaggtctaaactcgtttaggggatcattcttggacatgat 557  Q
    ||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10111079 tgtcattccatcaaatggtttaaactcgtttagggaatcattcttggacatgat 10111132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 26 - 557
Target Start/End: Original strand, 13530030 - 13530571
Alignment:
Q  26 ttttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaa 125  Q
    |||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||    
T  13530030 ttttcacctgatcgacaagcagaaccagagcttaaatactctttctcttcacctggactcagtgacatcatatattcgttaaaatgctcaactgaatgaa 13530129  T
Q  126 gtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acatcaacggatt 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||          |||||||||||||    
T  13530130 gtgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtgacatcaacggatt 13530229  T
Q  216 tgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatg 315  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||||| |||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||  || ||    
T  13530230 tgttgtgtctgatatgaccaaatcttctagaatttctaccttcatttcaccattctcacctgatgcgtcgttgccgtctccaattgagagtatatacttg 13530329  T
Q  316 ccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataagtccatatctttg 415  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||    
T  13530330 ccaaaattagcaatttattcctgctctacaggtaccgaagatgcactcaatctcatattaacagtaagcctctacacattacaataagcccatatctgtg 13530429  T
Q  416 atgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggaccacatgaaatagcttcctgaaatcaccacctaaatctcttgtcattccacg 515  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| | |||| || ||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||      
T  13530430 atgaattgattgaggcatcaacaatatcgtgcctcgttcctttttggacaacaggcaatatctgcctgaaatcaccagctaaaactactgtcattccatc 13530529  T
Q  516 aaaaggtctaaactcgtttaggggatcattcttggacatgat 557  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13530530 gaaaggtctaaactcgtttaggggatcattcttggacatgat 13530571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 14 - 557
Target Start/End: Original strand, 10000386 - 10000939
Alignment:
Q  14 tggacatcatatttttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 113  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  10000386 tggacatcagaattttcacccgatcaacaaacataatcaaagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgct 10000485  T
Q  114 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaagac--------- 204  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||| |             
T  10000486 caactgaatcaagcgttggtgcgagtattcctctttcttggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgagatacacaaagtctgtaagtga 10000585  T
Q  205 -atcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 303  Q
     |||||| |||||||||  || ||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| |     
T  10000586 tatcaacagatttgttgcatctgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcctccgaagcgttgttgccgtctccaattcat 10000685  T
Q  304 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataag 403  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  10000686 agtatccacttgccaaaattaacaatttctttctactctgcaggtaccaaagatgcacccaatctcatattaacagtaagccttaacacattaaaataag 10000785  T
Q  404 tccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggaccacatgaaatagcttcctgaaatcaccacctaaatctct 503  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || | || ||||||||| ||||||||| || |    
T  10000786 cccatatctttgatgaattgattgatgcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacaggcaacatctgcctgaaatccccacctaaaactat 10000885  T
Q  504 tgtcattccacgaaaaggtctaaactcgtttaggggatcattcttggacatgat 557  Q
    ||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10000886 tgtcattccatcaaatggtttaaactcgtttagggaatcattcttggacatgat 10000939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 14 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 10969021 - 10968469
Alignment:
Q  14 tggacatcatatttttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 113  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  10969021 tggacatcagaattttcacccgatcgacaaacaaaataagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgct 10968922  T
Q  114 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaagac--------- 204  Q
     |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||| |             
T  10968921 aaactgaatcaagcgttggtgcgagtattccccttgcttagaaaaatagcaggtcacgaagtttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtgg 10968822  T
Q  205 -atcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 303  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  10968821 catcaacggatttgttgtgtccgatatcagcaaatct-cagaaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccatctccaattgag 10968723  T
Q  304 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataag 403  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10968722 agtgtccacttgccaaaattagcaatttcttcctgctctataggtactgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataaa 10968623  T
Q  404 tccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggaccacatgaaatagcttcctgaaatcaccacctaaatctct 503  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||   |||| || ||||||||||||| ||||| ||      
T  10968622 cccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctccctcgatccgtttcggactacagacaatatctgcctgaaatcaccatctaaaactac 10968523  T
Q  504 tgtcattccacgaaaaggtctaaactcgtttaggggatcattcttggacatgat 557  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10968522 tgtcattccaccaaaaggtctaaaatcgtttaggggatcattcttggacctgat 10968469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 14 - 557
Target Start/End: Original strand, 50410151 - 50410700
Alignment:
Q  14 tggacatcatatttttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 113  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||    
T  50410151 tggacatcagaattttcacccgatcgacaaagagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatatttgttaacatgct 50410250  T
Q  114 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------a 203  Q
    | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||          |    
T  50410251 cgactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttgaaaaaatagtgggtcgccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtga 50410350  T
Q  204 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 303  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||    |||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  50410351 catcagcggatttgttgtgtccgatatgagaaaatcttcaggaattt----cttcatttcaccattctcatccaaagcgtcgttaccgtctctaattgag 50410446  T
Q  304 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataag 403  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  50410447 agtatccacttgccaaaattagcaatttattcctgctctacaggtaccgaagatgcactcaatctcatattaacagtaagcctcaacacattagaataag 50410546  T
Q  404 tccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggaccacatgaaatagcttcctgaaatcaccacctaaatctct 503  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||| ||| | | || || ||||||||||||||||||| ||      
T  50410547 ccaatatctttgatgaattgattgaggcatcaaaaatatcgtgcctcgttgctttacggacaacaggcagtatctgcctgaaatcaccacctaaaactac 50410646  T
Q  504 tgtcattccacgaaaaggtctaaactcgtttaggggatcattcttggacatgat 557  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50410647 tgtcattccacgaaaaggtataaactcgtttaggggatcattcttggacatgat 50410700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 14 - 557
Target Start/End: Original strand, 32750 - 33303
Alignment:
Q  14 tggacatcatatttttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 113  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||    
T  32750 tggacatcagaattttcacccgatctaaaaatagaatcagaggttaaatactctttctcttcacttggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgct 32849  T
Q  114 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------a 203  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||          |    
T  32850 caactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagttggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacaaagtccataagtga 32949  T
Q  204 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 303  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||| |||||||    
T  32950 catcaacggatttgttgtgtttgatatcagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattgtcacccgaagcattgttgccgtctctaattgag 33049  T
Q  304 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataag 403  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33050 agtatccacttgcaaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataag 33149  T
Q  404 tccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggaccacatgaaatagcttcctgaaatcaccacctaaatctct 503  Q
     |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| || ||||||||  |||||| ||||| |||| || ||| ||||||||||||||| || |    
T  33150 cccatatctttgacgaattgaccgaggcatcaacaatatccggcgtcgttcctcctcggacaacatgcaatatctgcctaaaatcaccacctaaaactat 33249  T
Q  504 tgtcattccacgaaaaggtctaaactcgtttaggggatcattcttggacatgat 557  Q
    ||||||||||| ||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33250 tgtcattccaccaaaaggtttaagtgcgtttaggggatcattcttggacatgat 33303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 14 - 557
Target Start/End: Original strand, 10237535 - 10238086
Alignment:
Q  14 tggacatcatatttttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 113  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||    
T  10237535 tggacatcagaattttcacccgatcaacaaacataatcaaagcttaa-tactctttctcttcacctggaatcagtaacatcatatattcgttaacatgct 10237633  T
Q  114 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------a 203  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||          |    
T  10237634 caactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttgaaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgagatacacaaagtctgtaagtga 10237733  T
Q  204 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 303  Q
    ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||| |  ||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  10237734 catcaacagatttgttgcgtctgatatgagcaattcttcaggaatttctaccgttatttcaccattccc-tccgaagcgttgttgccgtctccaattcag 10237832  T
Q  304 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataag 403  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  10237833 agtatccacttgccaaaattagcaatttctttctgctcagcaggtaccaaagatgcatccaatcttatattaacagtaagccttaacacattaaaataag 10237932  T
Q  404 tccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggaccacatgaaatagcttcctgaaatcaccacctaaatctct 503  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| || ||||||||||||||||||| || |    
T  10237933 cccatatctttgatgaattgattgatgcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacaagcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactat 10238032  T
Q  504 tgtcattccacgaaaaggtctaaactcgtttaggggatcattcttggacatgat 557  Q
    ||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  10238033 tgtcattccatcaaatggtttaaactcgtttagggaatcattcctggacatgat 10238086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 25 - 557
Target Start/End: Original strand, 11368637 - 11369171
Alignment:
Q  25 tttttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatca 124  Q
    |||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  11368637 tttttcacccaatcgacaaattgaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcactgacatcatatattcgttaacatgctcaaccgaatca 11368736  T
Q  125 agtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaat-agcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acatcaacgga 213  Q
    || ||||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||  ||||| ||||||          |||||||||||    
T  11368737 agcgttggtgcgagtattcccttttcttggaaaaaagagcgggtcaccaatgttatcattcaaatcgggatatacaaagtctatgagtgacatcaacgga 11368836  T
Q  214 tttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccaca 313  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||| |||||         |||| | |||||||||||| ||||||||     
T  11368837 tttgttgtgtcggatatgagcaaatcttcgggaatttctacattcatttcaccattctcatc---------gttgtcctctccaattgagggtatccact 11368927  T
Q  314 tgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataagtccatatctt 413  Q
    ||||||||||| || ||||||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11368928 tgccaaaattatcagtttcttccttctctgcaggtcccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataagtccatatctt 11369027  T
Q  414 tgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggaccacatgaaatagcttcctgaaatcaccacctaaatctcttgtcattcca 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||  | |||||||||||||| |||| ||  ||||||||||    
T  11369028 tgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacagacaatatatgcctgaaatcaccacttaaaactactgtcattcca 11369127  T
Q  514 cgaaaaggtctaaactcgtttaggggatcattcttggacatgat 557  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  11369128 ccaaaaggtctaaactcgtataggggatcattcttggatatgat 11369171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 16 - 445
Target Start/End: Original strand, 11362239 - 11362681
Alignment:
Q  16 gacatcatatttttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatac-tatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctc 114  Q
    ||||||| | ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  11362239 gacatcagacttttcgcccgatcgacaaactgaatcagagcttaaaaaaatctttctcttcacctggaatcactgacatcatatattcgttaacatgctc 11362338  T
Q  115 aactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------ac 204  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||  ||||| ||||||          ||    
T  11362339 aaccgaatcaagcgttggtgcgagtattcccttttcttggaaaaatagtgggtcaccaatgttatcatttaaatcgggatatacaaagtctattagtgac 11362438  T
Q  205 atcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgaga 304  Q
    ||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||   ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11362439 atcaacgaatttgttgtatcggatatgagtaaatcttcgggaatttcccccttcatttcaccattctcattcgaagcgtcgttgtcgtctccaattgaga 11362538  T
Q  305 gtat--ccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataa 402  Q
    ||||  |||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11362539 gtatatccacttgccaaaattagcagtttattcttgctctgcaggtcccgaagatgcacccaatctcatattaactgtaagcctcaacacattacaataa 11362638  T
Q  403 gtccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcct 445  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11362639 gcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcct 11362681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 331 - 557
Target Start/End: Original strand, 52918332 - 52918558
Alignment:
Q  331 tcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataagtccatatctttgatgaattgattgagg 430  Q
    ||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  52918332 tcttcctactctacaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataagctcgtatctttgatgaattgattgagg 52918431  T
Q  431 catcaacaatatcctgcctcgttccttttcggaccacatgaaatagcttcctgaaatcaccacctaaatctcttgtcattccacgaaaaggtctaaactc 530  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||     
T  52918432 catcaacaatatcctccctcgatccttttcggactacatgcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtctaaactt 52918531  T
Q  531 gtttaggggatcattcttggacatgat 557  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  52918532 gtttaggggatcattcttggacatgat 52918558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 290
Target Start/End: Original strand, 52918045 - 52918330
Alignment:
Q  14 tggacatcatatttttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 113  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  52918045 tggacatcagaattttcacccgatcgacaaacaaaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgct 52918144  T
Q  114 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaa----------ga 203  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||          |     
T  52918145 caactgaatcaagcgttggtgcgggtattcccctttcttggaaaaatagcgagtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacgaagtctataagtgg 52918244  T
Q  204 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgcc 290  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||   ||||||| || | ||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  52918245 catcaacagatttgttgtgtccggtaacggcaaatc-tcaggaatttctaccttcatttcaccattcccatccgaagcgtcgttgcc 52918330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 202
Target Start/End: Original strand, 46913050 - 46913238
Alignment:
Q  14 tggacatcatatttttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 113  Q
    ||||||||| | ||| | ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||    
T  46913050 tggacatcagaatttccccccgatcgacaaacataatcaaagcttaaatactatttttcttcacctggaattggtgacatcatatattcgttaacatgct 46913149  T
Q  114 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag 202  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  46913150 caactgaatcaagcgttggtgcgagtattctcctttcttggaaaaatagcgggtcgccaaagttatcattcaaatcgggatacacaaag 46913238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 181
Target Start/End: Original strand, 47692948 - 47693115
Alignment:
Q  14 tggacatcatatttttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 113  Q
    ||||||||| | |||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  47692948 tggacatcagaattttcgtccgatcgacaaacagaatcagaggttaaatactctttctcttcacctggaattagtgacatcatgtattcgttaacatgct 47693047  T
Q  114 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatca 181  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||    
T  47693048 caactgaatcaagcgttggtgcgaggattcccctttcttgggaaaattgtgggtcaccaaggttatca 47693115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 409; Significance: 0; HSPs: 16)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 409; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 557
Target Start/End: Original strand, 37261294 - 37261835
Alignment:
Q  14 tggacatcatatttttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 113  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37261294 tggacatcaaaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 37261393  T
Q  114 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaagacatcaacgga 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  37261394 caactgaatcaagtgttggcgcaagtattcccctttcttgaaaaaataacgggtcattaaggttatcattcaaattgggatacacaaagacatcaacgg- 37261492  T
Q  214 tttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccaca 313  Q
     ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  37261493 -ttgttgtgtccaatataagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattctcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccact 37261591  T
Q  314 tgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataagtccatatctt 413  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  37261592 tgccaaaattagcaatttcttcttgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataagctcatatctt 37261691  T
Q  414 tgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggaccacatgaaatagcttcctgaaatcaccacctaaatctcttgtcattcca 513  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||| ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||    
T  37261692 tgatgaattgatcgagacatcaacaatatcctgcctcgttccttttcagacaacaggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtcattcca 37261791  T
Q  514 cgaaaaggtctaaactcgtttaggggatcattcttggacatgat 557  Q
    |  |||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||    
T  37261792 ccgaaaggtctaaactcgtttaaaggatcattcctagacatgat 37261835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 25543033 - 25542480
Alignment:
Q  14 tggacatcatatttttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 113  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  25543033 tggacatcataattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgct 25542934  T
Q  114 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------a 203  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||          |    
T  25542933 caactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtga 25542834  T
Q  204 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 303  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25542833 catcaacatatttgttgtgtccgatatgagaaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatccgaagcgttgttgccgtctccaattgag 25542734  T
Q  304 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataag 403  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25542733 agtatccacttgccaaagttagcaatttctttctgctttgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataag 25542634  T
Q  404 tccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggaccacatgaaatagcttcctgaaatcaccacctaaatctct 503  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||   |||| || ||||||||||||||||||| ||      
T  25542633 cccatatctttgatgaattgattgatgcatcaacaatattctgccacgttccttttcggacaacagacaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactac 25542534  T
Q  504 tgtcattccacgaaaaggtctaaactcgtttaggggatcattcttggacatgat 557  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25542533 tgtcattccaccaaatggtttaaactcgtttaggggatcattcttggacatgat 25542480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 14193052 - 14192498
Alignment:
Q  14 tggacatcatatttttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 113  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  14193052 tggacatcagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgct 14192953  T
Q  114 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------a 203  Q
    ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||          |    
T  14192952 caactgaattaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcggatcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtga 14192853  T
Q  204 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 303  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  14192852 catcaacagatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcagaaatttctaccttcatttcaccattctgatccgaaacttcgttgccgtctccaattgag 14192753  T
Q  304 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataag 403  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14192752 agtatccacttgtcaaaattagcaatttcttcctactctacaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattataataag 14192653  T
Q  404 tccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggaccacatgaaatagcttcctgaaatcaccacctaaatctct 503  Q
     |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||  | ||||||||||||||||||| |       
T  14192652 cccatatctttaatgaattaattggggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcgggcaacatgcaatatatgcctgaaatcaccacctaaaacaac 14192553  T
Q  504 tgtcattccacgaaaaggtctaaactcgttta-ggggatcattcttggacatgat 557  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14192552 tgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtttagggggatcattcttggacatgat 14192498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 17871865 - 17871325
Alignment:
Q  26 ttttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaa 125  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  17871865 ttttcacccgatcgacaaacagaaccagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgctcaacagaatcaa 17871766  T
Q  126 gtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acatcaacggatt 215  Q
    | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||   ||||||||| |          |||||||||||||    
T  17871765 gcgttggtgcgagtatttccctttcttggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcatttaaatcgagatacacaatgtctataagtgacatcaacggatt 17871666  T
Q  216 tgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatg 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||  ||    
T  17871665 tgttgtgtccgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccatct-catccgaagcgccgttgccttctctaattgagagtatccatttg 17871567  T
Q  316 ccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataagtccatatctttg 415  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  17871566 ccaaaattagcaatttattcctgctctgcaggtaccaaagatgcacccaatcccatattaacagtaagcctcaacacattacaataagctcatatctttg 17871467  T
Q  416 atgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggaccacatgaaatagcttcctgaaatcaccacctaaatctcttgtcattccacg 515  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||| || ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||     
T  17871466 atgaactgattgaggcatcaacaatatcatgcctcgttccttttcggatgacatgcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaacttttgtctttccacc 17871367  T
Q  516 aaaaggtctaaactcgtttaggggatcattcttggacatgat 557  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17871366 aaaaggtctaaactcgtttaggggatcattcttggacatgat 17871325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 14 - 557
Target Start/End: Original strand, 27881063 - 27881616
Alignment:
Q  14 tggacatcatatttttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 113  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||    
T  27881063 tggacatcataattttcacccgatctacaaatagaatcagagcttaaatactctttctcttcacttggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgct 27881162  T
Q  114 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------a 203  Q
    || |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||          |    
T  27881163 cagctgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagttggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacaaagtctataagtga 27881262  T
Q  204 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 303  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | | ||| ||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27881263 catcaacggatttgttgggtccgatatcagcaaatcttcaggagtttctacctttatttcaccattgtcatccgaagcatcgttgccgtctccaattgag 27881362  T
Q  304 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataag 403  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27881363 agtatccacttgccaaaattagcaatttctacctgctctgcatgtaccgaagatgcacccaatctcatattaacggtaagcctcaacacattacaataag 27881462  T
Q  404 tccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggaccacatgaaatagcttcctgaaatcaccacctaaatctct 503  Q
     ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||| ||||| |||| || ||| ||||||||||||||| ||      
T  27881463 cccatatctttgatgaattgaccgaggcatcaacaatatccggccttgttcctcctcggacaacatgcaatatctgcctaaaatcaccacctaaaactac 27881562  T
Q  504 tgtcattccacgaaaaggtctaaactcgtttaggggatcattcttggacatgat 557  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27881563 tgtcattccaccaaaaggtttaagcgcgtttaggggatcattcttggacatgat 27881616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 26 - 557
Target Start/End: Original strand, 3689968 - 3690509
Alignment:
Q  26 ttttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaa 125  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  3689968 ttttcgcccgatcgacaaactgaatcagagcttaaatactctttctctccacttggaatcactgacatcatatattcgttaacatgctcaaccgaatcaa 3690067  T
Q  126 gtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acatcaacggatt 215  Q
    | ||||| |||||||||| | ||||||| ||||| || ||||||| || ||||||||||||||  ||||| ||||||          ||||||||| |||    
T  3690068 gcgttggtgcgagtattcacttttcttgaaaaaagagtgggtcaccaatgttatcattcaaatcgggatatacaaagtccattagtgacatcaacgaatt 3690167  T
Q  216 tgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatg 315  Q
    |||||| || |||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3690168 tgttgtatcggatatgagcaaatctttgggaatttctaccttcatttcaccattctcattcgaagtgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacttg 3690267  T
Q  316 ccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataagtccatatctttg 415  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3690268 ccaaaattagcagtttcttcctgctctgcaggtcccgaagatgcacccaatctcatattaactgtaagcctcaacacattacaataagcccatatctttg 3690367  T
Q  416 atgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggaccacatgaaatagcttcctgaaatcaccacctaaatctcttgtcattccacg 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||| || ||||||||||||||||||| ||  | |||||||||     
T  3690368 atgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacagacaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactactatcattccacc 3690467  T
Q  516 aaaaggtctaaactcgtttaggggatcattcttggacatgat 557  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3690468 aaaaggtctaaactcgtttaggggatcattcttggatatgat 3690509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 26 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 3876819 - 3876278
Alignment:
Q  26 ttttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaa 125  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  3876819 ttttcgcccgatcgacaaactgaatcagagcttaaatactctttctctccacttggaatcactgacatcatatattcgttaacatgctcaaccgaatcaa 3876720  T
Q  126 gtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acatcaacggatt 215  Q
    | ||||| |||||||||| | ||||||| ||||| || ||||| | || ||||||||||||||  ||||| ||||||          ||||||||| |||    
T  3876719 gcgttggtgcgagtattcacttttcttgaaaaaagagtgggtccccaatgttatcattcaaatcgggatatacaaagtccattagtgacatcaacgaatt 3876620  T
Q  216 tgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatg 315  Q
    |||||| || |||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3876619 tgttgtatcggatatgagcaaatctttgggaatttctaccttcatttcaccattctcattcgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacttg 3876520  T
Q  316 ccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataagtccatatctttg 415  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3876519 ccaaaattagcagtttcttcctgctctgcaggtcccgaagatgcacccaatctcatattaactgtaagcctcaacacattacaataagcccatatctttg 3876420  T
Q  416 atgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggaccacatgaaatagcttcctgaaatcaccacctaaatctcttgtcattccacg 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||| || ||||||||||||||||||| ||  | |||||||||     
T  3876419 atgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacagacaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactactatcattccacc 3876320  T
Q  516 aaaaggtctaaactcgtttaggggatcattcttggacatgat 557  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3876319 aaaaggtctaaactcgtttaggggatcattcttggatatgat 3876278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 14 - 555
Target Start/End: Original strand, 39883162 - 39883713
Alignment:
Q  14 tggacatcatatttttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 113  Q
    ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||| |||| |||||    
T  39883162 tggacatcataattgtcacccgatctacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacttggaatcaacgacatcataaattcgttaacatgct 39883261  T
Q  114 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------a 203  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||          |    
T  39883262 caactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggcaaaatagctgggcaccaaggttatcattcagatcgggatacacaaagtctataagtga 39883361  T
Q  204 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||| | ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39883362 catcaacggatttgttgtgtccgatatcagcaaatctttaggaatatctaccttcatttcaccattctcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 39883461  T
Q  304 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataag 403  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39883462 agtatccacttgccaaaattagcaatttcttcatgctctgcatgtaccgaagctgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacatattacaataag 39883561  T
Q  404 tccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggaccacatgaaatagcttcctgaaatcaccacctaaatctct 503  Q
     | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||| ||| | |||| || |||||||||||||| |||| ||      
T  39883562 ccaatatctttgacgaattgactgaggcatcaacaatatccggcctcgttcctcctaggacaacaggcaatatctgcctgaaatcaccacgtaaaactac 39883661  T
Q  504 tgtcattccacgaaaaggtctaaactcgtttaggggatcattcttggacatg 555  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  39883662 tgtcattccaccaaaaggtttaagcgcgtttaggggatcattcttggacatg 39883713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 14 - 557
Target Start/End: Original strand, 37372915 - 37373468
Alignment:
Q  14 tggacatcatatttttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 113  Q
    ||||||||| | || |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||||    
T  37372915 tggacatcagaattatcacccgatctaaaaatagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcataaattggttaacatgct 37373014  T
Q  114 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------a 203  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||          |    
T  37373015 caactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttcgaaaaatagttggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacaaagtctataagtga 37373114  T
Q  204 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 303  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37373115 catcaacggatttgttatgtctgatatcagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattgtcacccgaagcatcgttgccgtctccaattgag 37373214  T
Q  304 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataag 403  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37373215 agtatccacttgcaaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataag 37373314  T
Q  404 tccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggaccacatgaaatagcttcctgaaatcaccacctaaatctct 503  Q
     |||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||| | |||| || | | ||||||||||||||| ||      
T  37373315 cccatatctttgacgaattgaccgacgcatcaacaatatccggcctcgttcctcctcagacaacaggcaatatctgcttaaaatcaccacctaaaactac 37373414  T
Q  504 tgtcattccacgaaaaggtctaaactcgtttaggggatcattcttggacatgat 557  Q
    ||| ||||||| ||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37373415 tgtgattccaccaaaaggtttaagtgcgtttaggggatcattcttggacatgat 37373468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 14 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 8428814 - 8428272
Alignment:
Q  14 tggacatcatatttttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 113  Q
    ||||||||| | | ||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||    
T  8428814 tggacatcagaatattcacccgatctaaaaatagaatcagaggttaaatactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgct 8428715  T
Q  114 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------a 203  Q
    ||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||          |    
T  8428714 caattgaatcaagcgtgggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagttggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacaaagtctataagtga 8428615  T
Q  204 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 303  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8428614 catcaacggatttgttgtgtctgatatcagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattgtcacccgaagcatcgttgccgtctccaattgag 8428515  T
Q  304 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataag 403  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||           || ||||||||| |||||||||||||    
T  8428514 agtatccacttgcaaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcatccaat-----------agcaagcctcaaaacattacaataag 8428426  T
Q  404 tccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggaccacatgaaatagcttcctgaaatcaccacctaaatctct 503  Q
     |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||  |||||| ||| | |||| || ||| ||||||||||||||| ||      
T  8428425 cccatatctttgacgaattgaccgaggcatcaacaatatctggcctcgttcctcctcggacaacaggcaatatctgcctaaaatcaccacctaaaactac 8428326  T
Q  504 tgtcattccacgaaaaggtctaaactcgtttaggggatcattcttggacatgat 557  Q
    || |||||||| ||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8428325 tgccattccaccaaaaggtttaagtgcgtttaggggatcattcttggacatgat 8428272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 236 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 30346637 - 30346316
Alignment:
Q  236 aatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttc 335  Q
    ||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  30346637 aatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatccgaagcgttgttgccgtctccaattcagagtatccacttgccaaaattagcaatttcttt 30346538  T
Q  336 ctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataagtccatatctttgatgaattgattgaggcatca 435  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30346537 ctgctctgcaggtaccaaagatgcacccaatctcatattaacagtaagtcttaacacattaaaataagcacatatctttgatgaattgattgatgcatca 30346438  T
Q  436 acaatatcctgcctcgttccttttcggaccacatgaaatagcttcctgaaatcaccacctaaatctcttgtcattccacgaaaaggtctaaactcgttta 535  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||| ||||||||||||| || |||||||||||| |||  || ||||||||||||    
T  30346437 acaatatcctgcctcgttccttttcggacaacatgcaatatctgcctgacatcaccacctaaaactattgtcattccaccaaatagtttaaactcgttta 30346338  T
Q  536 ggggatcattcttggacatgat 557  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  30346337 ggggatcaatcttggacatgat 30346316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 246 - 557
Target Start/End: Original strand, 10025199 - 10025510
Alignment:
Q  246 aatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgca 345  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10025199 aatttctaccttcatttcaccattctcatccgaagcgttgttaccgtctctaattcagagtatccacttgccaaaattagcaatttctttctgctctgca 10025298  T
Q  346 cgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataagtccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcct 445  Q
     ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  10025299 ggtaccaaagatgcacccagtctcatattaacagtaagtctcaacacatcaaaataagcacatatctttgatgaattgattgatgcatcaacaatatatt 10025398  T
Q  446 gcctcgttccttttcggaccacatgaaatagcttcctgaaatcaccacctaaatctcttgtcattccacgaaaaggtctaaactcgtttaggggatcatt 545  Q
    |||||||||||||||||||  || | |||| || ||| | ||||||||||||| || |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  10025399 gcctcgttccttttcggacagcaggcaatatctgcctaatatcaccacctaaaactattgtcattccaccaaatggtttaaactcgtttaggggatcatt 10025498  T
Q  546 cttggacatgat 557  Q
    ||||||||||||    
T  10025499 cttggacatgat 10025510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 236 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 24629954 - 24629640
Alignment:
Q  236 aatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttc 335  Q
    ||||||| | ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||       ||||     
T  24629954 aatcttcaggaatttctaccttcatttaaccattctcatccgaagcgttgttgtcgtctccaattcagagtatccacttgccgaaatt-------tcttt 24629862  T
Q  336 ctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataagtccatatctttgatgaattgattgaggcatca 435  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24629861 ctgctctgcaggtaccaaagatgcacccaatctcatattaacagtaagtctcaacacattaaaataagcacatatctttgatgaattgattgatgcatca 24629762  T
Q  436 acaatatcctgcctcgttccttttcggaccacatgaaatagcttcctgaaatcaccacctaaatctcttgtcattccacgaaaaggtctaaactcgttta 535  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  24629761 acaatatcctgcctcgttccttttcggacaacatgcaatatctgcctgatatcaccacctaaaactattgtcattccaccaaatggtttaaactcgttta 24629662  T
Q  536 ggggatcattcttggacatgat 557  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  24629661 ggggatcattcttggacatgat 24629640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 24630101 - 24629954
Alignment:
Q  14 tggacatcatatttttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 113  Q
    ||||||||| | ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |    
T  24630101 tggacatcagaattttcacccgagcgacaaacagaatcagagtttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgtt 24630002  T
Q  114 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaata 161  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24630001 caactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaata 24629954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 30346784 - 30346637
Alignment:
Q  14 tggacatcatatttttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 113  Q
    ||||||||| | ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |    
T  30346784 tggacatcagaattttcacccgagcgacaaacagaatcagagtttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgtt 30346685  T
Q  114 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaata 161  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30346684 caacttaatcaagtgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaata 30346637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Original strand, 10025042 - 10025189
Alignment:
Q  14 tggacatcatatttttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 113  Q
    ||||||||| | ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||| |    
T  10025042 tggacatcagaattttcacccgagcgacaaacagaatcagagtttaaatactctttctcttcacttggaatcaatgacatcatatattcgttaacatgtt 10025141  T
Q  114 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaata 161  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10025142 caactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaata 10025189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0356 (Bit Score: 353; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0356
Description:

Target: scaffold0356; HSP #1
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 18109 - 17564
Alignment:
Q  14 tggacatcatatttttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  18109 tggacatcataattttcacccgatcggcaaacagaatcaaagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgct 18010  T
Q  114 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------a 203  Q
    ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||       ||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||          |    
T  18009 caactaaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttg-------agcggatcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtga 17917  T
Q  204 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  17916 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcaggaacttctaccttcatttcaccattctcatccgaagcttcgttgctgtctccaattgag 17817  T
Q  304 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataag 403  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17816 agtatccacttgctaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaa-aag 17718  T
Q  404 tccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggaccacatgaaatagcttcctgaaatcaccacctaaatctct 503  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  17717 cccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacatgcaatagctgcctgaaatcaccacataaaactct 17618  T
Q  504 tgtcattccacgaaaaggtctaaactcgtttaggggatcattcttggacatgat 557  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17617 tgtcattccacggaaaggtctaaactcgtttaggggatcattcttggacatgat 17564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 347; Significance: 0; HSPs: 9)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 5828795 - 5828242
Alignment:
Q  14 tggacatcatatttttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 113  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  5828795 tggacatcataattttcacccgatctacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgct 5828696  T
Q  114 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------a 203  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||          |    
T  5828695 caactgagtcaagtgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgagatacacaaagtctataagtga 5828596  T
Q  204 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 303  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||    
T  5828595 catcaaaagatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgttgttgccgtctccaattcag 5828496  T
Q  304 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataag 403  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||     
T  5828495 agtatccacttgccaaaattagcaatttctttctgctctgcaggtaccgaagatgcactcaatctcatattaatagtaagcctcaacacattaaaataaa 5828396  T
Q  404 tccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggaccacatgaaatagcttcctgaaatcaccacctaaatctct 503  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| || ||||||||||||||||||| ||      
T  5828395 cccatatctttgatgaattgattgatgcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacaggcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactaa 5828296  T
Q  504 tgtcattccacgaaaaggtctaaactcgtttaggggatcattcttggacatgat 557  Q
    | ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5828295 tatcattccaccaaatggtttaaactcgtttaggggatcattcttggacatgat 5828242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 21070290 - 21069749
Alignment:
Q  26 ttttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaa 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  21070290 ttttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcaccaggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgctcaactgaatcaa 21070191  T
Q  126 gtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acatcaacggatt 215  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||  ||||||||||||          |||||||||||||    
T  21070190 gcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcaggttaccaaggttatcattcagatcgggatacacaaagtctataagtgacatcaacggatt 21070091  T
Q  216 tgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatg 315  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21070090 tgttgtgtctgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatccgaaacgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacttg 21069991  T
Q  316 ccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataagtccatatctttg 415  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||     
T  21069990 tcaaaattagcaatttctttctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcgatacattacaataaacccatatcttta 21069891  T
Q  416 atgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggaccacatgaaatagcttcctgaaatcaccacctaaatctcttgtcattccacg 515  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| || ||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||     
T  21069890 atgaattgattgatgcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacaggcaatatctacctgaaatcaccacctaaaactactgtgattccacc 21069791  T
Q  516 aaaaggtctaaactcgtttaggggatcattcttggacatgat 557  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21069790 aaatggtctaaactcgtttaggggatcattcttggacatgat 21069749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 14 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 9001385 - 9000832
Alignment:
Q  14 tggacatcatatttttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 113  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||| |||||    
T  9001385 tggacatcagaattttcacccgatctacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctagaatcagcgacatcataaattcgttaacatgct 9001286  T
Q  114 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------a 203  Q
    ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||| ||  ||||| ||||||          |    
T  9001285 caactgaatcaagcgttagtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagttggtcaccaaggttatcaatcagatcgggataaacaaagtctataagaga 9001186  T
Q  204 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||   ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  9001185 catcaacggatttgttgtgtccgatatcaacaaatcttcaagaatttctaccttcatttcaccattctcatccgaagcatcgttgccgtatccaattgag 9001086  T
Q  304 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataag 403  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9001085 agtatccacttgccaaaattagcaatttcttcctgctatgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataag 9000986  T
Q  404 tccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggaccacatgaaatagcttcctgaaatcaccacctaaatctct 503  Q
     |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| | | | |||| || ||| ||||||| ||||||| ||      
T  9000985 cccatatctttgacgaattgactgaggcatcaacaatatccggcctcgttcctcctcggacaataggcaatatctgcctaaaatcacaacctaaaactac 9000886  T
Q  504 tgtcattccacgaaaaggtctaaactcgtttaggggatcattcttggacatgat 557  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9000885 tgtcattccaccaaaaggtttaagcgcgtttaggggatcattcttggacatgat 9000832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 26 - 557
Target Start/End: Original strand, 22843795 - 22844335
Alignment:
Q  26 ttttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaa 125  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  22843795 ttttcacccgatcgacaaacagaaacagaacttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgctcaacagaatcaa 22843894  T
Q  126 gtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acatcaacggatt 215  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||   ||||||||| |          |||||||| ||||    
T  22843895 gcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcaggtcaccaaggttatcatttaaatcgagatacacaatgtctataagtgacatcaacagatt 22843994  T
Q  216 tgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatg 315  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   ||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||  ||    
T  22843995 tgttgtgtcagatatgagcaaatcttcaagaatttctaccttcatttcaccatct-catccgaagcgacgttgccttctctaattaagagtatccaattg 22844093  T
Q  316 ccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataagtccatatctttg 415  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  22844094 ccaaaattagcaatttattcctgctctacaggtaccaaagatgcacccaatcccatattaacagtaagcctcaacacattacaataagctcatatctttg 22844193  T
Q  416 atgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggaccacatgaaatagcttcctgaaatcaccacctaaatctcttgtcattccacg 515  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||| || | ||||||||||||||||| || ||||| ||||||     
T  22844194 atgaactgattgaggcatcaacaatatcatgcctcgttccttttcggatgacatgcaatatctgcatgaaatcaccacctaaaacttttgtctttccacc 22844293  T
Q  516 aaaaggtctaaactcgtttaggggatcattcttggacatgat 557  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22844294 aaaaggtctaaactcgtttaggggatcattcttggacatgat 22844335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 14 - 557
Target Start/End: Original strand, 7036699 - 7037252
Alignment:
Q  14 tggacatcatatttttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 113  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||    
T  7036699 tggacatcagaattttcacccgatctaaaaatagaatcagaggttaaatactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgct 7036798  T
Q  114 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------a 203  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||          |    
T  7036799 caactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaagtagttggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacaaagtctataagtga 7036898  T
Q  204 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 303  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7036899 catcaacggatttgttgtgtctgatatcagcgaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattgtcacccgaagcatcgttgccgtctccaattgag 7036998  T
Q  304 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataag 403  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7036999 agtatccacttgcaaaaattagcaatttcttcttgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataag 7037098  T
Q  404 tccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggaccacatgaaatagcttcctgaaatcaccacctaaatctct 503  Q
     | |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| ||| | |||| || ||| ||||||||||||||| ||      
T  7037099 cctatatctttgacgaattgaccgaggcatcaacaatatccggcctcgttcctcctcggacaacaggcaatatctgcctaaaatcaccacctaaaactac 7037198  T
Q  504 tgtcattccacgaaaaggtctaaactcgtttaggggatcattcttggacatgat 557  Q
    ||||||||||| ||||||| |||   |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  7037199 tgtcattccaccaaaaggtttaagtgcgtttaagggatcattcttgaacatgat 7037252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 14 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 12781389 - 12780835
Alignment:
Q  14 tggacatcatatttttcacccgatca-acaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgc 112  Q
    ||||||||| | |||||||||||||  | ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||    
T  12781389 tggacatcagaattttcacccgatctcaaaaatagaatcagaggttaaatactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgc 12781290  T
Q  113 tcaactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag---------- 202  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||              
T  12781289 tcaactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagttggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacaaagtctataagtg 12781190  T
Q  203 acatcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattga 302  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||| || ||| |||||||||||||    
T  12781189 acatcaacggatttgttgtgtcttatatcagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattgtcacccgaagcatcattgtcgtctccaattga 12781090  T
Q  303 gagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataa 402  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12781089 gagtatccacttgcaaaaattagcaatttcttcttgctctacaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataa 12780990  T
Q  403 gtccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggaccacatgaaatagcttcctgaaatcaccacctaaatctc 502  Q
    |  ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||  | |||| ||| | || | || ||| ||||||||||||||| ||     
T  12780989 gctcatatctttgacgaattgaccgaggcatcaacaatatccggcctcgttcctccttggactacaggcaacatctgcctaaaatcaccacctaaaacta 12780890  T
Q  503 ttgtcattccacgaaaaggtctaaactcgtttaggggatcattcttggacatgat 557  Q
    |||||||||||| ||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12780889 ttgtcattccaccaaaaggtttaagtgcgtttaggggatcattcttggacatgat 12780835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 236 - 557
Target Start/End: Original strand, 42232210 - 42232532
Alignment:
Q  236 aatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttc 335  Q
    ||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  42232210 aatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatccgaaccgttgttgccgtctccaattcagagtatccacttgccaaaattagcaatttcttt 42232309  T
Q  336 ctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataagtccatatctttgatgaattgattgaggcatca 435  Q
    || ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42232310 ctactctgcaggtaccaaagatgcacccaatctcatattaacagtaagtctcaacacattaaaataagcacatatctttgatgaattgattgatgcatca 42232409  T
Q  436 acaatatcctgcctcgttccttttcggaccacatgaaatagcttcctgaaatcaccacct-aaatctcttgtcattccacgaaaaggtctaaactcgttt 534  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | |||| || ||||| |||||||||| ||| || |||||||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  42232410 acaatatactgcctcgttccttttcggacaacaggcaatatctgcctgatatcaccacctaaaaactattgtcattccaccaaatggtttaaactcgttt 42232509  T
Q  535 aggggatcattcttggacatgat 557  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  42232510 aggggatcattcttggacatgat 42232532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 14 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 12786218 - 12785777
Alignment:
Q  14 tggacatcatatttttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 113  Q
    ||||||||| | |||||||| |||| | ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||| |||||    
T  12786218 tggacatcagaattttcacctgatctaaaaatagaatcagaggttaaatactctttctcttcacctagaatcagcgacatcataaattcgttaacatgct 12786119  T
Q  114 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------a 203  Q
    ||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||  ||||||||| ||          |    
T  12786118 caattgaatcaagcgtgggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagttggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacagagtctataagtga 12786019  T
Q  204 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 303  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12786018 catcaacggatttgttgtgtttgatatcagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattgtcacccgaagcatcgttgccgtctccaattgag 12785919  T
Q  304 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataag 403  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | |||           || ||||||||| |||||||||||||    
T  12785918 agtatccacttgcaaaaattagcaatttcttcctgctctgtaggtaccgaagatgcatccaat-----------agcaagcctcaaaacattacaataag 12785830  T
Q  404 tccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttcct 456  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  || ||||||||    
T  12785829 tccatatctttgacgaattgaccgaggcatcaacaatatctggcatcgttcct 12785777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Original strand, 42232063 - 42232210
Alignment:
Q  14 tggacatcatatttttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 113  Q
    ||||||||| | ||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |    
T  42232063 tggacatcagaattttcacccgagcgacaaacaaaatcagagtttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgtt 42232162  T
Q  114 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaata 161  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  42232163 caactgaatcaagcgttggtgagagtattcccctttcttggaaaaata 42232210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 342; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 557
Target Start/End: Original strand, 186546 - 187086
Alignment:
Q  27 tttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaag 126  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  186546 tttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgctcagctgaatcaag 186645  T
Q  127 tgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acatcaacggattt 216  Q
     ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||          |||||||| |||||    
T  186646 cgttggtgcgagtattcccctttattggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtgacatcaacagattt 186745  T
Q  217 gttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgc 316  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  186746 gttgtgtacgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatccgaagcgttgttgccgtctccaattgagagtatccacttgc 186845  T
Q  317 caaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataagtccatatctttga 416  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  186846 caaaattagcaatttctttctgctctgcaagtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaggccttaaaacattacaataagcccatatctttga 186945  T
Q  417 tgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggaccacatgaaatagcttcctgaaatcaccacctaaatctcttgtcattccacga 516  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| || | ||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |    
T  186946 tgaattgattggtgcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacaggcaatatctgcttgaaatcaccacctaaaactactgtcattccacca 187045  T
Q  517 aaaggtctaaactcgtttaggggatcattcttggacatgat 557  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  187046 aatggtttaaactcgtttaggggatcattcttggacatgat 187086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 332; Significance: 0; HSPs: 14)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 557
Target Start/End: Original strand, 24245816 - 24246357
Alignment:
Q  26 ttttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaa 125  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  24245816 ttttcacccgatcgacaaacagaatcagatcttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgctcaactgaatcaa 24245915  T
Q  126 gtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acatcaacggatt 215  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| |          ||||| |||||||    
T  24245916 gcgttggtgcgagtattcccctttcttgaaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaggtctataagtgacatccacggatt 24246015  T
Q  216 tgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatg 315  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24246016 tgttgtgtccgttatgagcaaatctttaggaatttctaccttcatttcaccattctcatccaaagcgtcgttgccgtctccaattgagagaatccacatg 24246115  T
Q  316 ccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataagtccatatctttg 415  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24246116 ccaacattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagattcacc-aatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataagcccatatctttg 24246214  T
Q  416 atgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttcc-ttttcggaccacatgaaatagcttcctgaaatcaccacctaaatctcttgtcattccac 514  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||| |||| || ||| ||||||||||||||| ||  | | |||||||    
T  24246215 atgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcatcattcctttttcggacaacatgcaatatctgccttaaatcaccacctaaaactactatgattccac 24246314  T
Q  515 gaaaaggtctaaactcgtttaggggatcattcttggacatgat 557  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24246315 caaaaggtctaaactcatttaggggatcattcttggacatgat 24246357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 24269310 - 24268757
Alignment:
Q  14 tggacatcatatttttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 113  Q
    ||||||||| | ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |    
T  24269310 tggacatcagaattttcacccgagcgacaaacagaatcagagtttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgtt 24269211  T
Q  114 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------a 203  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||          |    
T  24269210 caactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgagatacacaaagtctataagtga 24269111  T
Q  204 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 303  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  24269110 catcaacagatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatccgaagcgttgttgccgtctccaattcag 24269011  T
Q  304 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataag 403  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  24269010 agtatccacttgccaaaattagcaatttctttctgctctgcaggtaccaaagatgcacccaatcgcatattaacaataagcgtcaacacattaaaataag 24268911  T
Q  404 tccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggaccacatgaaatagcttcctgaaatcaccacctaaatctct 503  Q
      ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| || ||||| ||||||||||||| || |    
T  24268910 cacatatctgtgatgaattgattgatgcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacaggcaatatctgcctgatatcaccacctaaaactat 24268811  T
Q  504 tgtcattccacgaaaaggtctaaactcgtttaggggatcattcttggacatgat 557  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24268810 tgtcattccaccaaatggtttaaacttgtttaggggatcattcttggacatgat 24268757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 557
Target Start/End: Original strand, 27192468 - 27193021
Alignment:
Q  14 tggacatcatatttttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 113  Q
    ||||||||| |  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  27192468 tggacatcaaaaatttcacccgatcgacaaatagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctagaatcagcgacatcatatattcgttaacatgct 27192567  T
Q  114 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------a 203  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||          |    
T  27192568 caactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagagggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtga 27192667  T
Q  204 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 303  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||    
T  27192668 catcaacagatttgttgtgtccgatatgagcaaatctttaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtcaccagttgag 27192767  T
Q  304 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataag 403  Q
    ||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||| || ||| | |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||    
T  27192768 agtatccacttgtcaaaattatgaatttcttcctgctctacaggtatcaaagatgcacccaatctcatattaacaatcagcctcaacaaattacaataag 27192867  T
Q  404 tccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggaccacatgaaatagcttcctgaaatcaccacctaaatctct 503  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| || ||||||||||||||||||| || |    
T  27192868 cccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacaggcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactat 27192967  T
Q  504 tgtcattccacgaaaaggtctaaactcgtttaggggatcattcttggacatgat 557  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27192968 tgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtttaggggatcattcttgtacatgat 27193021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 557
Target Start/End: Original strand, 27509365 - 27509906
Alignment:
Q  26 ttttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaa 125  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  27509365 ttttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgctcaactgaatcaa 27509464  T
Q  126 gtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaagac----------atcaacggatt 215  Q
    | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |          ||||||| |||    
T  27509465 gcgttgatgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcaggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtgatatcaacgaatt 27509564  T
Q  216 tgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatg 315  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  | ||||| ||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||    
T  27509565 tgttgtgtccgacatgagcaaatctttaggaatttctaccttcatctcaccattctcatctgaagcgtcgttgctgtctccaattgagagtatctacttg 27509664  T
Q  316 ccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataagtccatatctttg 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  27509665 ccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtagcaaagatgcacccaatcttatattaacagtaagcctcaatacattacaataagcccatatctttg 27509764  T
Q  416 atgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggaccacatgaaatagcttcctgaaatcaccacctaaatctcttgtcattccacg 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| | |||| || ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||     
T  27509765 atgaattgattgaggcatcaacaatatcctgtctcgttcctttttggacaacaggcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactactgtcattccacc 27509864  T
Q  516 aaaaggtctaaactcgtttaggggatcattcttggacatgat 557  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27509865 aaaatgtctaaactcatttaggggatcattcttggacatgat 27509906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 557
Target Start/End: Original strand, 27842282 - 27842835
Alignment:
Q  14 tggacatcatatttttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 113  Q
    ||||||||| |  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  27842282 tggacatcaaaaatttcacccgatcgacaaatagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctagaatcagcgacatcatatattcgttaacatgct 27842381  T
Q  114 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------a 203  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||          |    
T  27842382 caactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagagggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtga 27842481  T
Q  204 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 303  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||    
T  27842482 catcaacagatttgttgtgtccgatatgagcaaatctttaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtcaccagttgag 27842581  T
Q  304 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataag 403  Q
    ||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||| || ||| | |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||    
T  27842582 agtatccacttgtcaaaattatgaatttcttcctgctctacaggtatcaaagatgcacccaatctcatattaacaatcagcctcaacaaattacaataag 27842681  T
Q  404 tccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggaccacatgaaatagcttcctgaaatcaccacctaaatctct 503  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| || ||||||||||||||||||| || |    
T  27842682 cccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacaggcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactat 27842781  T
Q  504 tgtcattccacgaaaaggtctaaactcgtttaggggatcattcttggacatgat 557  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27842782 tgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtttaggggatcattcttgtacatgat 27842835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 14 - 557
Target Start/End: Original strand, 21395349 - 21395902
Alignment:
Q  14 tggacatcatatttttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 113  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||    
T  21395349 tggacatcagaattttcacccgatctacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgct 21395448  T
Q  114 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------a 203  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||  ||||| ||||||          |    
T  21395449 caactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagttggtcaccaaggttatcattcagatcgggatatacaaagtctataagcga 21395548  T
Q  204 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21395549 catcaacggatttgttgtgtccgatatcagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatccgaagcatcgttgccgtctccaattgag 21395648  T
Q  304 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataag 403  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21395649 agtatccacttgccgaaattagcaatttcttcctgatctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataag 21395748  T
Q  404 tccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggaccacatgaaatagcttcctgaaatcaccacctaaatctct 503  Q
     ||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| ||| | |||| || ||| ||||||||||||||| ||      
T  21395749 cccataactttgacgaattgacggaggcatcaacaatatccggcctcgttcctcctcggacaacaggcaatatctgcctaaaatcaccacctaaaactac 21395848  T
Q  504 tgtcattccacgaaaaggtctaaactcgtttaggggatcattcttggacatgat 557  Q
     |||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21395849 ggtcattccaccaaaaggtttaagcgcgtttaggggatcattcttggacatgat 21395902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 14 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 17684069 - 17683609
Alignment:
Q  14 tggacatcatatttttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 113  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  17684069 tggacatcaaaattttcacccgatcgacaaacaaaatcatagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgct 17683970  T
Q  114 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------a 203  Q
    ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||          |    
T  17683969 caattgaatcaagcgttggagcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtga 17683870  T
Q  204 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 303  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| | ||||| ||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17683869 catcaacggatttgttgtgtccaatatgagcgaatattcaggaatttctaccttcattttaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 17683770  T
Q  304 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataag 403  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  17683769 agtatccacttgcaaaaattagcaatttcttcctgctctacaggtatcgaagatgcacccaatctcatattaacaataagccttaacacattacaataag 17683670  T
Q  404 tccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggac 464  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17683669 ctcatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggac 17683609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 239 - 557
Target Start/End: Original strand, 35609867 - 35610185
Alignment:
Q  239 cttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctg 338  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35609867 cttcagaaatttctaccttcatttcaccattctgatccgaaacttcgttgccgtctccaattgagagtatccacttgccaaaattagcaatttcttcctg 35609966  T
Q  339 ctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataagtccatatctttgatgaattgattgaggcatcaaca 438  Q
    ||||  | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  35609967 ctctaaaggtaccgaagatgcacccaatgtcatattaacagtaagcctcaacacattataataagtccatatctttaatgaattgattggggcatcaaca 35610066  T
Q  439 atatcctgcctcgttccttttcggaccacatgaaatagcttcctgaaatcaccacctaaatctcttgtcattccacgaaaaggtctaaactcgtttaggg 538  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||  | ||||||||||||||||||| |   |||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  35610067 atatcctgcctcgttccttttcgggcaacaggcaatatatgcctgaaatcaccacctaaaacaactgtcattctaccaaaaggtctaaactcgtttaggg 35610166  T
Q  539 gatcattcttggacatgat 557  Q
    |||||||||||||||||||    
T  35610167 gatcattcttggacatgat 35610185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 14 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 28666412 - 28665971
Alignment:
Q  14 tggacatcatatttttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 113  Q
    ||||||||| | |||||||| |||| | ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||| |||||    
T  28666412 tggacatcagaattttcacctgatctaaaaatagaatcagaggttaaatactctttctcttcacctagaatcagcgacatcataaattcgttaacatgct 28666313  T
Q  114 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------a 203  Q
    ||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||  ||||||||| ||          |    
T  28666312 caattgaatcaagcgtgggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagttggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacagagtctataagtga 28666213  T
Q  204 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 303  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28666212 catcaacggatttgttgtgtttgatatcagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattgtcacccgaagcatcgttgccgtctccaattgag 28666113  T
Q  304 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataag 403  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | |||           || ||||||||| |||||||||||||    
T  28666112 agtatccacttgcaaaaattagcaatttcttcctgctctgtaggtaccgaagatgcatccaat-----------agcaagcctcaaaacattacaataag 28666024  T
Q  404 tccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttcct 456  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  || ||||||||    
T  28666023 tccatatctttgacgaattgaccgaggcatcaacaatatctggcatcgttcct 28665971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 14 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 37825246 - 37824805
Alignment:
Q  14 tggacatcatatttttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 113  Q
    ||||||||| | |||||||| |||| | ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||| |||||    
T  37825246 tggacatcagaattttcacctgatctaaaaatagaatcagaggttaaatactctttctcttcacctagaatcagcgacatcataaattcgttaacatgct 37825147  T
Q  114 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------a 203  Q
    ||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| | ||  ||||||||| ||          |    
T  37825146 caattgaatcaagcgtgggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagttggtcaccaaggttatcatttagatcgggatacacagagtctataagtga 37825047  T
Q  204 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 303  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37825046 catcaacggatttgttgtgtttgatatcagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattgtcacccgaagcatcgttgccgtctccaattgag 37824947  T
Q  304 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataag 403  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | |||           || ||||||||| |||||||||||||    
T  37824946 agtatccacttgcaaaaattagcaatttcttcctgctctgtaggtaccgaagatgcatccaat-----------agcaagcctcaaaacattacaataag 37824858  T
Q  404 tccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttcct 456  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  || ||||||||    
T  37824857 tccatatctttgacgaattgaccgaggcatcaacaatatctggcatcgttcct 37824805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 14 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 41920413 - 41919972
Alignment:
Q  14 tggacatcatatttttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 113  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||| |||||    
T  41920413 tggacatcagaattttcacccgatctaaaaatagaatcagaggttaaatactctttatcttcacctggaatcaacgacatcataaattcgttaacatgct 41920314  T
Q  114 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------a 203  Q
     || ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||          |    
T  41920313 taattgaatcaagcgtgggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagttggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacaaagtctataagtga 41920214  T
Q  204 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 303  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41920213 catcaacggatttgttgtgtctgatatcagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattgtcacccgaagcatcgttgccgtctccaattgag 41920114  T
Q  304 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataag 403  Q
    ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| | |||           || ||||||||| |||||||||||||    
T  41920113 agtatccacttgcaaaaattatcaatttcttcctgctctacaggtaccaaagatgcatccaat-----------agcaagcctcaaaacattacaataag 41920025  T
Q  404 tccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttcct 456  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||   |||||||||||    
T  41920024 tccatatctttgacgaattgaccgaggcatcaacaatatatggcctcgttcct 41919972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 202
Target Start/End: Original strand, 35609664 - 35609852
Alignment:
Q  14 tggacatcatatttttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 113  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||    
T  35609664 tggacatcagaattttcactcgatcgacaaacataatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatact 35609763  T
Q  114 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag 202  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  | ||||||||||    
T  35609764 caactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcaccaatgttatcattcaaatcggaatacacaaag 35609852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 353 - 498
Target Start/End: Original strand, 3642920 - 3643065
Alignment:
Q  353 aagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataagtccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgt 452  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3642920 aagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacaaattacaataagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgt 3643019  T
Q  453 tccttttcggaccacatgaaatagcttcctgaaatcaccacctaaa 498  Q
    |||||||||| | ||| | |||| || |||||||||||||||||||    
T  3643020 tccttttcgggcaacaggcaatatctacctgaaatcaccacctaaa 3643065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 507 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 41919934 - 41919884
Alignment:
Q  507 cattccacgaaaaggtctaaactcgtttaggggatcattcttggacatgat 557  Q
    |||||||| ||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41919934 cattccaccaaaaggtttaagtgcgtttaggggatcattcttggacatgat 41919884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 329; Significance: 0; HSPs: 12)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 555
Target Start/End: Original strand, 36207194 - 36207745
Alignment:
Q  14 tggacatcatatttttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 113  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  36207194 tggacatcataattttcacccgatcgacaaacataatcaaagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgct 36207293  T
Q  114 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------a 203  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||          |    
T  36207294 caactgaatcaattgttggggcgagtattcccctttcttgaaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtga 36207393  T
Q  204 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 303  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || | ||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36207394 catcaacggatttgttgtgtcggatatgagaaaatcatcaggaatttctaccttcaattcaccattctcatccgaagcgtcgttgccgtcttcaattgag 36207493  T
Q  304 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataag 403  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  36207494 agtatccacttgccaaaattatcaatttcttcctgctttgcaggtaccgaagatgaacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataaa 36207593  T
Q  404 tccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggaccacatgaaatagcttcctgaaatcaccacctaaatctct 503  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| ||| | |||| ||  |||||||||||||||||| ||      
T  36207594 ctcatatctttgatgaattgattgaggcatcaataatatcctgcctctttccttttcagacaacaggcaatatctgtctgaaatcaccacctaaaactac 36207693  T
Q  504 tgtcattccacgaaaaggtctaaactcgtttaggggatcattcttggacatg 555  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  36207694 tgtcattccaccaaaaggtctaaactcatttaagggatcattcttggacatg 36207745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 557
Target Start/End: Original strand, 16042004 - 16042557
Alignment:
Q  14 tggacatcatatttttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 113  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||    
T  16042004 tggacatcagaattttcacccgatctacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacttggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgct 16042103  T
Q  114 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------a 203  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||          |    
T  16042104 caactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggcaaaatagctgggcaccaaggttatcattcagattgggatacacaaagtctataagcga 16042203  T
Q  204 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16042204 catcaacggatttgttgtgtccgatatcagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 16042303  T
Q  304 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataag 403  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16042304 agtatccacttgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcatgtaccgaagctgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataag 16042403  T
Q  404 tccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggaccacatgaaatagcttcctgaaatcaccacctaaatctct 503  Q
     | |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||| ||| | |||| || |||||||||||||| |||| ||      
T  16042404 ccaatatctttgacgaattaactgaggcatcaacaatatccggcctcgttcctcctaggacaacaggcaatatctgcctgaaatcaccacgtaaaactac 16042503  T
Q  504 tgtcattccacgaaaaggtctaaactcgtttaggggatcattcttggacatgat 557  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16042504 tgtcattccaccaaaaggtttaagcgcgtttaggggatcattcttggacatgat 16042557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 557
Target Start/End: Original strand, 2329148 - 2329698
Alignment:
Q  14 tggacatcatatttttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 113  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  2329148 tggacatcagaattttcacccgatcgacaaagagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgct 2329247  T
Q  114 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacac-------aaagacat 206  Q
    | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||  ||||||||       |  |||||    
T  2329248 cgactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttgaaaaaatagtggatcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacgtctataagtgacat 2329347  T
Q  207 caacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2329348 caacggatttgttgtgtccgatatgagaaaatcttcaggaatttctaccttcattttaccattctcatccgaagcgtcgttgccgtctctaattgagagt 2329447  T
Q  307 atccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataagtcc 406  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  2329448 atccacttgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaacgaagaggcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacatattacaataagccc 2329547  T
Q  407 atatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggaccacatgaaatagcttcctgaaatcaccacctaaatctcttgt 506  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||  ||||| ||| | | || || ||||||||||||||||||| |   | |    
T  2329548 atatctttgatgaattgattaaggcattaacaatatcgtgcctcgttgcttcacggacaacaggtagtatctgcctgaaatcaccacctaaaaccactat 2329647  T
Q  507 cattccacgaaaaggtctaaactcgtttaggggatcattcttggacatgat 557  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2329648 cattccacgaaaaggtctaaacttgtttaggggatcattcttggacatgat 2329698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 14 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 2453357 - 2452804
Alignment:
Q  14 tggacatcatatttttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 113  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  2453357 tggacatcagaattttcacccgatcgacaaatagaatcagagcctaaatactctttctcttcacctggaattagtgacatcatatattcgttaacatgct 2453258  T
Q  114 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------a 203  Q
    ||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | || |||||||          |    
T  2453257 caactcaataaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcggaattcacaaagtctataagtga 2453158  T
Q  204 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 303  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  2453157 catcaacggatttgttgtgttcgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatttgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 2453058  T
Q  304 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataag 403  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  2453057 agtatccacttgtcaaaattagcaatttcttcatgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcgacacattacaatatg 2452958  T
Q  404 tccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggaccacatgaaatagcttcctgaaatcaccacctaaatctct 503  Q
     | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |   | |||| |||||||||||||||||||||| ||      
T  2452957 cctatatctttgatgaattgattgaagcatcaacaatatcctgcctcgatccttttcggacaatgggcaatatcttcctgaaatcaccacctaaaactac 2452858  T
Q  504 tgtcattccacgaaaaggtctaaactcgtttaggggatcattcttggacatgat 557  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  2452857 tgtcattccaccaaaagttctaaactcgtttaaggggtcattcttggacatgat 2452804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 14 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 48775575 - 48775022
Alignment:
Q  14 tggacatcatatttttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 113  Q
    ||||||||| | ||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||    
T  48775575 tggacatcagactttttgcccgatcgacaaactgaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcatttacatcatatattcgttaacatgct 48775476  T
Q  114 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------a 203  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||| |||  ||||| ||||||          |    
T  48775475 caaccgaatcaagcgttggtgcgagtattcccttttcttggaaaaagagcaggtcaccaatgttatcattctaatcgggatatacaaagtgtattagtga 48775376  T
Q  204 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 303  Q
    |||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  48775375 catcaaagaatttgttgtgtcggatatgagcaaatcttcgggaatttctaccttcatttcaccattctcattcgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 48775276  T
Q  304 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataag 403  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| | || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48775275 agtatccacttgccaaaattagcagtttctttctgctctgtaggtcccgaagatgcacccaatctgatattaacagtaagcctcaacacattacaataag 48775176  T
Q  404 tccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggaccacatgaaatagcttcctgaaatcaccacctaaatctct 503  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||  |  |||||||||||||||||| ||      
T  48775175 cccatatatttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacatacaatatttgtctgaaatcaccacctaaaactac 48775076  T
Q  504 tgtcattccacgaaaaggtctaaactcgtttaggggatcattcttggacatgat 557  Q
     |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  48775075 cgtcattcctccaaaaggtctaaactcgtttaagggatcattcttggatatgat 48775022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 17 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 37390389 - 37389839
Alignment:
Q  17 acatcatatttttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaa 116  Q
    |||||| | ||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  37390389 acatcagaattttcacccgatctaaaaatagaatcagaggttaaatactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgctcaa 37390290  T
Q  117 ctgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acat 206  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||          ||||    
T  37390289 ctgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagttggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacaaagtctataagtgacat 37390190  T
Q  207 caacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagt 306  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |    
T  37390189 caacggatttgttgtgtctgatatcagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattgtcacccgaagcatctttgccgtctccaattgagaat 37390090  T
Q  307 atccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataagtcc 406  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37390089 atccacttgcaaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaatagtaagcctcaacacattacaataagccc 37389990  T
Q  407 atatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggaccacatgaaatagcttcctgaaatcaccacctaaatctcttgt 506  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| ||| | |||| || ||| ||||||||||||||| || ||||    
T  37389989 atatctttgacgaattgaccgaggcatcaacaatatccagcctcgttcctcctcggacaacaggcaatatctgcctaaaatcaccacctaaaactattgt 37389890  T
Q  507 cattccacgaaaaggtctaaactcgtttaggggatcattcttggacatgat 557  Q
    |||||||| ||||||| |||   |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  37389889 cattccaccaaaaggtttaagtgcgtttaagggatcattcttggccatgat 37389839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 14 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 6311235 - 6310681
Alignment:
Q  14 tggacatcatatttttcacccgatca-acaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgc 112  Q
    ||||||||| | |||||||||||||  | ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||    
T  6311235 tggacatcagaattttcacccgatctcaaaaatagaatcagaggttaaatactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgc 6311136  T
Q  113 tcaactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag---------- 202  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||              
T  6311135 tcaactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagttggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacaaagtctataagtg 6311036  T
Q  203 acatcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattga 302  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  6311035 acatcaacggatttgttgtgtctgatatcagcgaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattgtcacccgaagcatcgttgccgtctccaatgga 6310936  T
Q  303 gagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataa 402  Q
    || ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6310935 gactatccacttgcaaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataa 6310836  T
Q  403 gtccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggaccacatgaaatagcttcctgaaatcaccacctaaatctc 502  Q
    | |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  ||||| |||||  |||||| |||   |||| || ||| ||||||||||||||| ||     
T  6310835 gcccatatctttgacgaattgaccgaggcatcaacaatatcaggcctcattcctcctcggacaacagacaatatctgcctaaaatcaccacctaaaacta 6310736  T
Q  503 ttgtcattccacgaaaaggtctaaactcgtttaggggatcattcttggacatgat 557  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6310735 ttgtcgttccaccaaaaggtttaagtgcgtttaggggatcattcttggacatgat 6310681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 26 - 411
Target Start/End: Original strand, 18148679 - 18149074
Alignment:
Q  26 ttttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaa 125  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  18148679 ttttcatccgatcgacaaacagaataagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgctcaaatgaatcaa 18148778  T
Q  126 gtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acatcaacggatt 215  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||          |||||||| ||||    
T  18148779 gcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaattgagatacacaaagtcgataagtgacatcaacagatt 18148878  T
Q  216 tgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatg 315  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||| |||||||||| || | ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  18148879 tgttgtgtccgatatgagaaaatcttcataaatttctaccttcatttcaccattctccttcgaagcgttattgccgtctccaattcagagtatccacttg 18148978  T
Q  316 ccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataagtccatatc 411  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  18148979 ccaaaattagcaatttctttctgctctgcaggtaccaaagatgcacccaatctcatattaacagtaagccttaacacattaaaataagtccatatc 18149074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 155 - 512
Target Start/End: Original strand, 48233498 - 48233865
Alignment:
Q  155 aaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acatcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcgg 244  Q
    |||||||| ||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||          |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |    
T  48233498 aaaaatagagggtcgccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtgacatcagcggatttgttgtgttcgatatgagtaaatcttcag 48233597  T
Q  245 aaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgc 344  Q
     ||||| ||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48233598 gaatttctaccttcatttccccattctcatctgaagcgtcgttgtcgtctcaagttgagagtattcacttgtcaaaattaggaatttcttcctgctctgc 48233697  T
Q  345 acgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataagtccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcc 444  Q
    | ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48233698 aggtaccaaagatgcacccaatctcatatcaacagtaagcctcaacaaattacaataaacacatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcc 48233797  T
Q  445 tgcctcgttccttttcggaccacatgaaatagcttcctgaaatcaccacctaaatctcttgtcattcc 512  Q
    || ||||||||||||||||| ||| | |||| || ||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  48233798 tgtctcgttccttttcggacaacaggcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactattgtcattcc 48233865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 236 - 557
Target Start/End: Original strand, 52500795 - 52501109
Alignment:
Q  236 aatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttc 335  Q
    ||||||| | ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||       ||||     
T  52500795 aatcttcaggaatttctaccttcatttaaccattctcatccgaagcgttgttgtcgtctccaattcagagtatccacttgccgaaatt-------tcttt 52500887  T
Q  336 ctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataagtccatatctttgatgaattgattgaggcatca 435  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  52500888 ctgctctgcaggtaccaaagatgcacccaatctcatattaacagtaagtctcaacacattaaaataagcacatatctttgatgaattgattgatgcatca 52500987  T
Q  436 acaatatcctgcctcgttccttttcggaccacatgaaatagcttcctgaaatcaccacctaaatctcttgtcattccacgaaaaggtctaaactcgttta 535  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  52500988 acaatatcctgcctcgttccttttcggacaacatgcaatatctgcctgatatcaccacctaaaactattgtcattccaccaaatggtttaaactcgttta 52501087  T
Q  536 ggggatcattcttggacatgat 557  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  52501088 ggggatcattcttggacatgat 52501109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 48238717 - 48238529
Alignment:
Q  14 tggacatcatatttttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 113  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  48238717 tggacatcaaagttttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcgcctggaatcagcgacatcatatattcgttaacatgct 48238618  T
Q  114 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag 202  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  48238617 caactgaatcaagcgttggtgcgagtattcctctttcttggaaaaatagagggtcgccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaag 48238529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Original strand, 52500648 - 52500795
Alignment:
Q  14 tggacatcatatttttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 113  Q
    ||||||||| | ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |    
T  52500648 tggacatcagaattttcacccgagcgacaaacagaatcagagtttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgtt 52500747  T
Q  114 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaata 161  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  52500748 caactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaata 52500795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 327; Significance: 0; HSPs: 10)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 2202419 - 2201866
Alignment:
Q  14 tggacatcatatttttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 113  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |    
T  2202419 tggacatcagaattttcacccgatcgacaaatagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgtt 2202320  T
Q  114 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------a 203  Q
    | ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||          |    
T  2202319 ctactgaattaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtga 2202220  T
Q  204 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 303  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  2202219 catcaacggatttattgtgttcgatatgagcaaatcttcgggaatttctacattcatttcaccattctcatttgaagcgtcgttgccttctccaattgag 2202120  T
Q  304 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataag 403  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  2202119 agtatccacttgccaaaattagcaatttcttcatgctctgcaagtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcgacacattacaatatg 2202020  T
Q  404 tccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggaccacatgaaatagcttcctgaaatcaccacctaaatctct 503  Q
     | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |   | |||| || |||||| |||||||||||| ||      
T  2202019 cctatatctttgatgaattgatcgaggcatcaacaatatcctgcctcgatccttttcggacaatgggcaatatctgcctgaagtcaccacctaaaactac 2201920  T
Q  504 tgtcattccacgaaaaggtctaaactcgtttaggggatcattcttggacatgat 557  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2201919 tgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtttagggggtcattcttggacatgat 2201866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 557
Target Start/End: Original strand, 30881318 - 30881858
Alignment:
Q  26 ttttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaa 125  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  30881318 ttttcacccgatcgacaaacagaaccagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgctcaacagaatcaa 30881417  T
Q  126 gtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acatcaacggatt 215  Q
    | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||   ||||||||| |          |||||||||||||    
T  30881418 gcgttggtgcgagtatttccctttcttggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcatttaaatcgagatacacaatgtctataagtgacatcaacggatt 30881517  T
Q  216 tgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatg 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||  ||    
T  30881518 tgttgtgtccgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccatct-catccgaagcgccgttgccttctctaattgagagtatccatttg 30881616  T
Q  316 ccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataagtccatatctttg 415  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  30881617 ccaaaattagcaatttattcctgctctgcaggtaccaaagatgcacccaatcccatattaacagtaagcctcaacacattacaataagctcatatctttg 30881716  T
Q  416 atgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggaccacatgaaatagcttcctgaaatcaccacctaaatctcttgtcattccacg 515  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||| || ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||     
T  30881717 atgaactgattgaggcatcaacaatatcatgcctcgttccttttcggatgacatgcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaacttttgtctttccacc 30881816  T
Q  516 aaaaggtctaaactcgtttaggggatcattcttggacatgat 557  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30881817 aaaaggtctaaactcgtttaggggatcattcttggacatgat 30881858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 14 - 464
Target Start/End: Original strand, 10187523 - 10187983
Alignment:
Q  14 tggacatcatatttttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 113  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  10187523 tggacatcaaaattttcacccgatcgacaaacagaatcatagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgct 10187622  T
Q  114 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------a 203  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||          |    
T  10187623 caattgaatcaagtgttggagcgagtattcccttttcttggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtga 10187722  T
Q  204 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 303  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| | ||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10187723 catcaacggattttttgtgtccaatatgagcaaatattcaggaatttctaccttcattttaccattctcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 10187822  T
Q  304 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataag 403  Q
    || |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10187823 agcatccacgtgcgaaaattagcaatttcttcctgctctacaggtatcgaagatgcacccaatctcatattaacaataagcctcaacacattacaataag 10187922  T
Q  404 tccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggac 464  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10187923 ctcatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgtctcgttccttttcggac 10187983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 14 - 512
Target Start/End: Original strand, 18344104 - 18344612
Alignment:
Q  14 tggacatcatatttttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 113  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | || |||||    
T  18344104 tggacatcaaaattttcacccgatcgacaaatagaatcaaagcttaaatactctttctcttcgcctggaatcagcgacatcatatattcgtcaacatgct 18344203  T
Q  114 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------a 203  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||          |    
T  18344204 caactgaatcaagcgttggtgcaagtattcccctttcttggaaaaatagatggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtga 18344303  T
Q  204 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 303  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||| ||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  18344304 catgaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcactattctcatctgaagcttcgttgtcgtctccaattgag 18344403  T
Q  304 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataag 403  Q
    ||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |  |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18344404 agtattcacttgtcaaaattaggaatttcttcctgctctgtagataccaaagatgcactcaatctcatattaacagtaagcctcaacaaattacaataag 18344503  T
Q  404 tccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggaccacatgaaatagcttcctgaaatcaccacctaaatctct 503  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||||| || |    
T  18344504 cccatatctttgataaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacatgcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactat 18344603  T
Q  504 tgtcattcc 512  Q
    |||||||||    
T  18344604 tgtcattcc 18344612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 14 - 401
Target Start/End: Original strand, 15333622 - 15334019
Alignment:
Q  14 tggacatcatatttttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 113  Q
    ||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||    
T  15333622 tggacatcagaattttcacctgatctacaaacagaatcagagcctaaatactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgct 15333721  T
Q  114 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------a 203  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||          |    
T  15333722 caactgaatcaagtgttggtgcgagtattcccatttgttggaaaaatagctggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacaaagtctattagtga 15333821  T
Q  204 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 303  Q
    ||||||||||||||||  || |||||| | ||||||||| | ||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15333822 catcaacggatttgttacgtacgatatcaacaaatcttcaggaatttctaccttcatttcactattctcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 15333921  T
Q  304 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaata 401  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15333922 agtatccacttgccaaaattagcaatttcttcttgctctgcaggtatcgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcttcaacacattacaata 15334019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 271 - 557
Target Start/End: Original strand, 12517520 - 12517806
Alignment:
Q  271 tcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctca 370  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||||    
T  12517520 tcatccgaagtgtcgttgtcgtctccaattgagagtatccacttgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggaacagaagatgcacccaatctca 12517619  T
Q  371 tattaacagtaagcctcaacacattacaataagtccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggaccacatg 470  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| ||| |    
T  12517620 tattaacagtaagcttcaacacattacaataagcccatatctttgacgaattaactgaggcatcaacaatatccggcctcgttcctcctcggacaacagg 12517719  T
Q  471 aaatagcttcctgaaatcaccacctaaatctcttgtcattccacgaaaaggtctaaactcgtttaggggatcattcttggacatgat 557  Q
     |||| || ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12517720 caatatctgcctgaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtttaagcgcgtttagaggatcattcttggacatgat 12517806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 16 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 29640266 - 29639947
Alignment:
Q  16 gacatcatatttttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctca 115  Q
    ||||||| | ||||||||||||| | ||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||    
T  29640266 gacatcagaattttcacccgatctaaaaatagaattagaggttaaatactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgctca 29640167  T
Q  116 actgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaa----------gaca 205  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||          ||||    
T  29640166 actgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagttggtcaccaaggttatcattcagatcaggatacacaaagtctataagtgaca 29640067  T
Q  206 tcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagag 305  Q
    ||||| |||||||||||   ||||| ||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29640066 tcaacagatttgttgtggttgatatcagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattgtcacccgaagcatcgttgccgtctccaattgagag 29639967  T
Q  306 tatccacatgccaaaattag 325  Q
    ||||||| ||| ||||||||    
T  29639966 tatccacttgcaaaaattag 29639947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 16 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 31510437 - 31510118
Alignment:
Q  16 gacatcatatttttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctca 115  Q
    ||||||| | ||||||||||||| | ||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||    
T  31510437 gacatcagaattttcacccgatctaaaaatagaattagaggttaaatactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgctca 31510338  T
Q  116 actgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaa----------gaca 205  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||          ||||    
T  31510337 actgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttgaaaaaatagttggtcaccaaggttatcattcagattaggatacacaaagtctataagtgaca 31510238  T
Q  206 tcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagag 305  Q
    ||||| |||||||||||   ||||| ||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  31510237 tcaacagatttgttgtggttgatatcagcaaatcttaagaaatttctaccttcatttcaccattgtcacccgaaacatcgttgccgtctccaattgagag 31510138  T
Q  306 tatccacatgccaaaattag 325  Q
    ||||||| ||| ||||||||    
T  31510137 tatccacttgcaaaaattag 31510118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 169
Target Start/End: Original strand, 12517367 - 12517522
Alignment:
Q  14 tggacatcatatttttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 113  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||    
T  12517367 tggacatcagaattttcaccccatcatcaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgct 12517466  T
Q  114 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtca 169  Q
    ||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12517467 caactgaatcaagcgttggtgcaaatattcccctttcttggaaaaatagctggtca 12517522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 333 - 475
Target Start/End: Original strand, 18814054 - 18814196
Alignment:
Q  333 ttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataagtccatatctttgatgaattgattgaggca 432  Q
    |||||||||| || ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |    
T  18814054 ttcctgctctacaggtaccaacgatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataagctcatatctttgatgaattgattaaggga 18814153  T
Q  433 tcaacaatatcctgcctcgttccttttcggaccacatgaaata 475  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  18814154 tcaacaatatcatgtctcgttccttttcggacaacatgcaata 18814196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0262 (Bit Score: 320; Significance: 1e-180; HSPs: 1)
Name: scaffold0262
Description:

Target: scaffold0262; HSP #1
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 17 - 557
Target Start/End: Original strand, 18988 - 19537
Alignment:
Q  17 acatcatatttttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaa 116  Q
    |||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  18988 acatcagaattttcactcgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgctcaa 19087  T
Q  117 ctgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acat 206  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||          ||||    
T  19088 ctgaatcaagcgttggtgcgagtattccccttttttggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcaagatacacaaagtctataagtgacat 19187  T
Q  207 caacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagt 306  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||    
T  19188 caacatatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcagaaatttctaccttcatttcatcattctcatccgaagcgttgttgccgtctccaattcaaagt 19287  T
Q  307 atccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataagtcc 406  Q
    |||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  19288 atccccttgccaaa-ttagcaatttctttctgctctgcaggtatcaaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattaaaataagccc 19386  T
Q  407 atatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggaccacatgaaatagcttcctgaaatcaccacctaaatctcttgt 506  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||| || |||||||| |||||||||| || ||||    
T  19387 atatctttgatgaattgattgatgcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacagacaatatctgcctgaaattaccacctaaaactattgt 19486  T
Q  507 cattccacgaaaaggtctaaactcgtttaggggatcattcttggacatgat 557  Q
    |||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19487 cattccaccaaatgatttaaactcgtttaggggatcattcttggacatgat 19537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 319; Significance: 1e-180; HSPs: 7)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 14 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 21113984 - 21113431
Alignment:
Q  14 tggacatcatatttttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 113  Q
    ||||||||| | ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |    
T  21113984 tggacatcagaattttcacccgagcgacaaacagaatcagagtttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgtt 21113885  T
Q  114 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------a 203  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||          |    
T  21113884 caactgaatcaagcgttggtgcaagtattccccttttttggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcaagatacacaaagtctataagtga 21113785  T
Q  204 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 303  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  21113784 catcaacagatttgttgtgtccgatataagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatccgaagcgttgttgccgtctccaattcag 21113685  T
Q  304 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataag 403  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  21113684 agtatccacttgccaaaattagcaatttctttctgctctgcaggtaccaaagatgcacccaatcgcatattaacagtaagcgtcaacacattaaaataag 21113585  T
Q  404 tccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggaccacatgaaatagcttcctgaaatcaccacctaaatctct 503  Q
      ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| || ||||| ||||||||||||| || |    
T  21113584 cacatatctgtgatgaattgattgatgcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacaggcaatatctgcctgatatcaccacctaaaactat 21113485  T
Q  504 tgtcattccacgaaaaggtctaaactcgtttaggggatcattcttggacatgat 557  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21113484 tgtcattccaccaaatggtttaaacttgtttaggggatcattcttggacatgat 21113431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 14 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 25218805 - 25218252
Alignment:
Q  14 tggacatcatatttttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 113  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||    
T  25218805 tggacatcagaattttcacccgatctacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgct 25218706  T
Q  114 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------a 203  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||          |    
T  25218705 caactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagttggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacaaagtctataagtga 25218606  T
Q  204 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 303  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25218605 catcaacggatttgttgtgtctgatatcagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattgtcacccgaagcatcgttgccgtctccaattgag 25218506  T
Q  304 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataag 403  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25218505 agtatccacttgcaaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataag 25218406  T
Q  404 tccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggaccacatgaaatagcttcctgaaatcaccacctaaatctct 503  Q
     |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| ||| | |||| || ||| ||||||||||||||| ||      
T  25218405 cccatatctttgacgaattgaccgaggcatcaacaatatccggcctcgttcctcctcggacaacaggcaatatctgcctaaaatcaccacctaaaactac 25218306  T
Q  504 tgtcattccacgaaaaggtctaaactcgtttaggggatcattcttggacatgat 557  Q
    ||||||||||| ||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25218305 tgtcattccaccaaaaggtttaagtgcgtttaggggatcattcttggacatgat 25218252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 14 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 25209272 - 25208734
Alignment:
Q  14 tggacatcatatttttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 113  Q
    ||||||||| | ||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||    
T  25209272 tggacatcagaattttcgcccgatctaaaaatagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgct 25209173  T
Q  114 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaagacatcaacgga 213  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| || | |  |||   |  ||||||||||||    
T  25209172 caactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagttggtcaccaaggttatcattaaagtct--ata---agtgacatcaacgga 25209078  T
Q  214 tttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccaca 313  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||     
T  25209077 tttgttgtgtctgacatcagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattgtcacccgaagcatcgttgtcgtctccaattgagagtatccact 25208978  T
Q  314 tgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataagtccatatctt 413  Q
    ||| |||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  25208977 tgcaaaaattagtaatttcgtcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacattaagcctcaacacattacaataagctcatatctt 25208878  T
Q  414 tgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggaccacatgaaatagcttcctgaaatcaccacctaaatctcttgtcattcca 513  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||  ||| | |||| || ||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  25208877 tgacgaattgaccgaggcatcaacaatatccggcctcgttcctcctcggaaaacaggcaatatctgcctaaaatcaccacctaaaactactgtcattcca 25208778  T
Q  514 cgaaaaggtctaaactcgtttaggggatcattcttggacatgat 557  Q
    | ||||||| |||     ||||||||||||||||||||||||||    
T  25208777 ccaaaaggtttaagtgtctttaggggatcattcttggacatgat 25208734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 14 - 557
Target Start/End: Original strand, 7821817 - 7822370
Alignment:
Q  14 tggacatcatatttttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 113  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| |||| |||||    
T  7821817 tggacatcagaattttcacccgatctaaaaatagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctgaaatcagcgacatcataaattcgttaacatgct 7821916  T
Q  114 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------a 203  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||  | ||||||||||          |    
T  7821917 caactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagttggtcaccaaggttatcattcagatcggaatacacaaagtctataagtga 7822016  T
Q  204 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 303  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  7822017 catcaacggatttgttgtgtttgatatcagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattgtcacccgaagcatcgttgtcgtctccaattgag 7822116  T
Q  304 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataag 403  Q
    ||||||||| | | |||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7822117 agtatccacttacaaaaattcgcaatttcttcctgctctacaggtaccgaagatgcactcaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataag 7822216  T
Q  404 tccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggaccacatgaaatagcttcctgaaatcaccacctaaatctct 503  Q
      ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||  | |||||||||||  |||||| | | | |||| || ||| ||||||||||||||| ||      
T  7822217 ctcatatctttgacgaattgaccgaggcatcaacaataatcggcctcgttcctcctcggacaataggcaatatctgcctaaaatcaccacctaaaactac 7822316  T
Q  504 tgtcattccacgaaaaggtctaaactcgtttaggggatcattcttggacatgat 557  Q
    ||||||||||| ||||||| |||    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  7822317 tgtcattccaccaaaaggtttaagtgtgtttaggggatcatttttggacatgat 7822370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 14 - 423
Target Start/End: Original strand, 30307156 - 30307575
Alignment:
Q  14 tggacatcatatttttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 113  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||    
T  30307156 tggacatcagaattttcacccgatctaaaaatagaatcggagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgct 30307255  T
Q  114 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------a 203  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||          |    
T  30307256 caactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagttggtcaccaaggttatcgttcagatcgggatacacaaagtctataagtga 30307355  T
Q  204 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||| ||| |||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  30307356 catcaacggatttgttgtgtccgatatcagcaaatcttcaggaatttctacattcatttcaccattgtcacccgaagcatcgttgtcgtctccaattgag 30307455  T
Q  304 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataag 403  Q
    |||||| || ||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30307456 agtatctacttgcaaaaattagcaatttcttcccactctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataag 30307555  T
Q  404 tccatatctttgatgaattg 423  Q
     |||||||||||| ||||||    
T  30307556 cccatatctttgacgaattg 30307575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 26 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 31978755 - 31978579
Alignment:
Q  26 ttttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaa 125  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  || | |||||||||||||||||    
T  31978755 ttttcccccgatctacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaatttgttgacatgctcaactgaatcaa 31978656  T
Q  126 gtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag 202  Q
    | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  31978655 gcgttgatgcgagtattcccctttcttggaaaaatagctggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacaaag 31978579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 427 - 557
Target Start/End: Original strand, 30325877 - 30326007
Alignment:
Q  427 gaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggaccacatgaaatagcttcctgaaatcaccacctaaatctcttgtcattccacgaaaaggtctaa 526  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| | | | |||| || ||| ||||||| ||||||| ||  ||||||||||| ||||||| |||    
T  30325877 gaggcatcaacaatatccggcctcgttcctcctcggacaataggcaatatctgcctaaaatcacaacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtttaa 30325976  T
Q  527 actcgtttaggggatcattcttggacatgat 557  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30325977 gtgcgtttaggggatcattcttggacatgat 30326007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 319; Significance: 1e-180; HSPs: 9)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 14 - 537
Target Start/End: Original strand, 1860656 - 1861189
Alignment:
Q  14 tggacatcatatttttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 113  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  1860656 tggacatcagaattttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacccagaatcagtgacatcatatattcgttaacatgct 1860755  T
Q  114 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------a 203  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||          |    
T  1860756 caactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgagatacacaaagtctataagtga 1860855  T
Q  204 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 303  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||    
T  1860856 catcaacagatttgttgtgtccgatatgagcaaatctttaggaatttctaccttcatttcaccattctcatccgaagcgttgttgtcgtctccaattcag 1860955  T
Q  304 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataag 403  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1860956 agtatccacttgccaaaattagcaatttctttctgctctgcaggtaccaaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattaaaataag 1861055  T
Q  404 tccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggaccacatgaaatagcttcctgaaatcaccacctaaatctct 503  Q
     |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||  | |||||||||||||||| |  || |    
T  1861056 cccatatctttaatgaattgattgatgcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacaggcaatatttgcctgaaatcaccaccttacactat 1861155  T
Q  504 tgtcattccacgaaaaggtctaaactcgtttagg 537  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  1861156 tgtcattccaccaaatggtttaaactcgtttagg 1861189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 14 - 557
Target Start/End: Original strand, 35855886 - 35856439
Alignment:
Q  14 tggacatcatatttttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 113  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||    
T  35855886 tggacatcagaattttcacccgatctaaaaatagaatcagaggttaaatactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgct 35855985  T
Q  114 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------a 203  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||          |    
T  35855986 caactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagttggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacaaagtctataagtga 35856085  T
Q  204 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 303  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35856086 catcaacggatttgttgtgtctgatatcagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattgtcacccgaagcatcgttgccgtctccaattgag 35856185  T
Q  304 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataag 403  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35856186 agtatccacttgcaaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataag 35856285  T
Q  404 tccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggaccacatgaaatagcttcctgaaatcaccacctaaatctct 503  Q
     |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| ||| | |||| || ||| ||||||||||||||| ||      
T  35856286 cccatatctttgacgaattgaccgaggcatcaacaatatccggcctcgttcctcctcggacaacaggcaatatctgcctaaaatcaccacctaaaactac 35856385  T
Q  504 tgtcattccacgaaaaggtctaaactcgtttaggggatcattcttggacatgat 557  Q
    ||||||||||| ||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35856386 tgtcattccaccaaaaggtttaagtgcgtttaggggatcattcttggacatgat 35856439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 14 - 557
Target Start/End: Original strand, 49710152 - 49710704
Alignment:
Q  14 tggacatcatatttttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 113  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||    
T  49710152 tggacatcagaattttcacccgatctacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgct 49710251  T
Q  114 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------a 203  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||          |    
T  49710252 caactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagctggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacaaagtctataagtga 49710351  T
Q  204 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 303  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  49710352 catcaa-ggatttgttgtgtccgatatcagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattttcatccgaagcatcgttgccgtgtccaattgag 49710450  T
Q  304 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataag 403  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49710451 agtatccacttgccaaaattagcaatttctttctgttctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataag 49710550  T
Q  404 tccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggaccacatgaaatagcttcctgaaatcaccacctaaatctct 503  Q
      ||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||  ||| || ||| | |||| || ||| ||||||||||||||| || |    
T  49710551 ctcatatctttaacgaattgacggaggcatcaacaatatctggcctcgttcctcctcgaacaacaggcaatatctgcctaaaatcaccacctaaaactat 49710650  T
Q  504 tgtcattccacgaaaaggtctaaactcgtttaggggatcattcttggacatgat 557  Q
    |||||||||||  |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  49710651 tgtcattccaccgaaaggtttaagcgcgtttaggggatcattcttggacatgat 49710704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 14 - 498
Target Start/End: Original strand, 38518075 - 38518569
Alignment:
Q  14 tggacatcatatttttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 113  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||    
T  38518075 tggacatcagaattttcacccgatctaaaaatagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgct 38518174  T
Q  114 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------a 203  Q
    ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| | ||  ||||||||||||          |    
T  38518175 caattgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagttggtcaccaaggttatcatttagatcgggatacacaaagtctataagtga 38518274  T
Q  204 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 303  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||    
T  38518275 catcaacggatttgttgtgtctgatatcagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattgtcacccaaagcatcgttgccgtctccaattgag 38518374  T
Q  304 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataag 403  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38518375 agtatccacttgcaaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataag 38518474  T
Q  404 tccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggaccacatgaaatagcttcctgaaatcaccacctaaa 498  Q
     |||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||| | |||||||||  || ||| |||   |||| || ||| |||||||||||||||    
T  38518475 cccatatctttgacgaattgaccgaggcattaacaatatccggtctcgttcctcctcagacaacagttaatatctgcctaaaatcaccacctaaa 38518569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 120 - 557
Target Start/End: Original strand, 13337320 - 13337767
Alignment:
Q  120 aatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acatcaa 209  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||   |||||||||||          |||| ||    
T  13337320 aatcaagcgttgatgcgagtattcccctttcttggaaaaatagttggtcaccaaggttatcattcaaatcgagatacacaaagtctataagtgacataaa 13337419  T
Q  210 cggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatc 309  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  13337420 cggatttgttgtgtccgatatcagcaaatcttcatgaatttctaccttcatttcaccattgtcacccgaagcatcgttgtcgtctccaattgagagtatc 13337519  T
Q  310 cacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataagtccata 409  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||    
T  13337520 cacttgcaaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaaacctcaacacattacaataatatcata 13337619  T
Q  410 tctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggaccacatgaaatagcttcctgaaatcaccacctaaatctcttgtcat 509  Q
    ||||||| |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| ||| | |||| || ||| ||||||||||||||| ||  ||||||    
T  13337620 tctttgacgaattgaccgaggcatcaacaatatccggcctcgttcctcctcggacaacaggcaatatctgcctaaaatcaccacctaaaactactgtcat 13337719  T
Q  510 tccacgaaaaggtctaaactcgtttaggggatcattcttggacatgat 557  Q
    ||||| ||||||| |||    |||||||||||||||||||||||||||    
T  13337720 tccaccaaaaggtttaagtgtgtttaggggatcattcttggacatgat 13337767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 14 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 49787068 - 49786627
Alignment:
Q  14 tggacatcatatttttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 113  Q
    ||||||||| | |||||||| |||| | ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  49787068 tggacatcagaattttcacctgatctaaaaatagaatcagaggttaaatactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaattcgttaatatgct 49786969  T
Q  114 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------a 203  Q
    ||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||  ||||||||| ||          |    
T  49786968 caattgaatcaagcgtgggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagttggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacagagtctataagtga 49786869  T
Q  204 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 303  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  49786868 catcaacggatttgttgtgtctgatatcagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattgtcacccgaagcatcgttgccgtctccaattgag 49786769  T
Q  304 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataag 403  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | |||           || ||||||||| |||||||||||||    
T  49786768 agtatccacttgcaaaaattagcaatttcttcctgctctgtaggtaccgaagatgcatccaat-----------agcaagcctcaaaacattacaataag 49786680  T
Q  404 tccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttcct 456  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  || ||||||||    
T  49786679 tccatatctttgacgaattgaccgaggcatcaacaatatctggcatcgttcct 49786627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 236 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 55559131 - 55558810
Alignment:
Q  236 aatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttc 335  Q
    ||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  55559131 aatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgttgttgccgtctccaattcagagtatccacttgccaaaattagcaatttcttt 55559032  T
Q  336 ctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataagtccatatctttgatgaattgattgaggcatca 435  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  55559031 ctgctctgcaggtaccaaagatgcacccaatctcatattaacagtaagtctcaacacattaaaataagcacatatctttgatgaattgattgatgcatca 55558932  T
Q  436 acaatatcctgcctcgttccttttcggaccacatgaaatagcttcctgaaatcaccacctaaatctcttgtcattccacgaaaaggtctaaactcgttta 535  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | |||| || ||||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  55558931 acaatatactgcctcgttccttttcggacaacaggcaatatctgcctgatatcaccacctaaaactattgtcattccaccaaatggtttaaactcgttta 55558832  T
Q  536 ggggatcattcttggacatgat 557  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  55558831 ggggatcatttttggacatgat 55558810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 202 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 618266 - 617956
Alignment:
Q  202 gacatcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattg 301  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  618266 gacatgaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcttcgttgtcgtctccaattg 618167  T
Q  302 agagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaata 401  Q
    ||||||| ||| ||  |||||||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  618166 agagtattcacttgttaaaattaggaatttcttcctgctctgcagataccaaagatgcactcaatctcatattaacagttagcctcaacaaattacaata 618067  T
Q  402 agtccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggaccacatgaaatagcttcctgaaatcaccacctaaatct 501  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| |||| || | ||||||||||||||||| ||    
T  618066 agcctatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcatgcctcgttccttttcagacaacatgcaatatctgcttgaaatcaccacctaaagct 617967  T
Q  502 cttgtcattcc 512  Q
     ||||||||||    
T  617966 attgtcattcc 617956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 55559278 - 55559131
Alignment:
Q  14 tggacatcatatttttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 113  Q
    ||||||||| | ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |    
T  55559278 tggacatcagaattttcacccgagcgacaaacagaatcagagtttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgtt 55559179  T
Q  114 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaata 161  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  55559178 caactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaata 55559131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 315; Significance: 1e-177; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 14 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 321576 - 321023
Alignment:
Q  14 tggacatcatatttttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 113  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||| |||| |||| |||||    
T  321576 tggacatcagaattttcacccgatctacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctgaaatcagcgatatcataaattcgttaacatgct 321477  T
Q  114 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------a 203  Q
    |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||  ||||||| ||||          |    
T  321476 caactgaatcaagcattggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagttggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacaaaaagtctataagtga 321377  T
Q  204 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 303  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||| |  |||||||||| |||||||    
T  321376 catcaacggatttgttttgtccgatatcagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattatcaaccgaagcataattgccgtctcaaattgag 321277  T
Q  304 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataag 403  Q
    | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  321276 aatatccacttgcaaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaaaagtaagcctcaacacattacaataag 321177  T
Q  404 tccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggaccacatgaaatagcttcctgaaatcaccacctaaatctct 503  Q
     ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||| || ||||||||||||||||||| ||||    
T  321176 cccatatcgttgatgaattgattaaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacagacaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactct 321077  T
Q  504 tgtcattccacgaaaaggtctaaactcgtttaggggatcattcttggacatgat 557  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  321076 tgtcattccaccaaaaggtctaaagttgtttaggggatcattcttggacatgat 321023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 311; Significance: 1e-175; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 18 - 557
Target Start/End: Original strand, 182794 - 183343
Alignment:
Q  18 catcatatttttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaac 117  Q
    ||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  182794 catcagatttttcgcccgatcgacaaactgaatcagagcttaaatactctttctcttcacttggaatcactgacatcatatattcgttaacatgctcaac 182893  T
Q  118 tgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acatc 207  Q
     |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| || | ||||||||||||  ||||| ||||||          |||||    
T  182894 cgaatcaagcgttggtgcgagtattcccttttcttggaaaaagagtgggtcaccaatgatatcattcaaatcgggatatacaaagtctattagtgacatc 182993  T
Q  208 aacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagta 307  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  182994 aacgaatttgttgtatcggatatgagcaaatcttcgggaatttctaccttcatttcaccattctcattcgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagta 183093  T
Q  308 tccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataagtcca 407  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  183094 tccacttgccaaaattagcagtttcttcctgctctgcaggtcccgaagatgcacccaatatcatattaactgtaagcctcaacacattacaataaggcca 183193  T
Q  408 tatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggaccacatgaaatagcttcctgaaatcaccacctaaatctcttgtc 507  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||   |||| || ||||||||||||||||||| ||  | ||    
T  183194 tatctttgatgaattgattgatgcatcaacaatatcctgcctcattccttttcggacaacagacaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactactatc 183293  T
Q  508 attccacgaaaaggtctaaactcgtttaggggatcattcttggacatgat 557  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  183294 attccaccaaaaggtctaaactcgtttaggggatcattcttggatatgat 183343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 16 - 557
Target Start/End: Original strand, 165511 - 166065
Alignment:
Q  16 gacatcatatttttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatac-tatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctc 114  Q
    ||||||| | ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  165511 gacatcagacttttcgcccgatcgacaaactgaatcagagcttaaaaaaatctttctcttcacctggaatcactgacatcatatattcgttaacatgctc 165610  T
Q  115 aactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------ac 204  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||  ||||| ||||||          ||    
T  165611 aaccgaatcaagcgttggtgcgagtattcccttttcttggaaaaatagtgggtcaccaatgttatcatttaaatcgggatatacaaagtctattagtgac 165710  T
Q  205 atcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgaga 304  Q
    ||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||   ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  165711 atcaacgaatttgttgtatcggatatgagtaaatcttcgggaatttcccccttcatttcaccattctcattcgaagcgtcgttgtcgtctccaattgaga 165810  T
Q  305 gtat--ccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataa 402  Q
    ||||  |||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  165811 gtatatccacttgccaaaattagcagtttattcttgctctgcaggtcccgaagatgcacccaatctcatattaactgtaagcctcaacacattacaataa 165910  T
Q  403 gtccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggaccacatgaaatagcttcctgaaatcaccacctaaatctc 502  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||| || ||||||||||||||||||| ||     
T  165911 gcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacagacaatatctgcctgaaatcaccacctaaaacta 166010  T
Q  503 ttgtcattccacgaaaaggtctaaactcgtttaggggatcattcttggacatgat 557  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  166011 ctatcattccaccaaaaggtctaaactcgtttaggtgatcattcttggatatgat 166065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 14 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 5499 - 4947
Alignment:
Q  14 tggacatcatatttttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 113  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  5499 tggacatcagaattttcacccgatcgacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctgaaatcagtgacatcatatattcgttaacatgct 5400  T
Q  114 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------a 203  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||          |    
T  5399 caactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaa-tagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgagatacacaaagtctataagtga 5301  T
Q  204 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 303  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||  |||| ||||||||| | ||    
T  5300 catcaatagatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgctgttgtcgtctccaagtcag 5201  T
Q  304 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataag 403  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5200 agtatccacttgccaaaattagcaatttctttctgctttgcaggtatcaaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattaaaataag 5101  T
Q  404 tccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggaccacatgaaatagcttcctgaaatcaccacctaaatctct 503  Q
      ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | | | |||| || ||| ||||||||| ||||| || |    
T  5100 cacatatcttttatgaattgattgatgcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcgaacaataggcaatatctgcctaaaatcaccatctaaaactat 5001  T
Q  504 tgtcattccacgaaaaggtctaaactcgtttaggggatcattcttggacatgat 557  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5000 tgtcattccaccaaatggtttaaactcgtttaggggatcattcttggacatgat 4947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 3)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 14 - 557
Target Start/End: Original strand, 31912 - 32464
Alignment:
Q  14 tggacatcatatttttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 113  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||| |||||    
T  31912 tggacatcagaattttcacccgatctacaaacagaatcagagtttaaatactctttctcttcacctggaatcagcaacatcataaattcgttaacatgct 32011  T
Q  114 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------a 203  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||          |    
T  32012 caactgaatcaagcgttggtgcaagtat-cccctttcttggaaaaatagctggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacaaagtctataagtga 32110  T
Q  204 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  32111 catcaacggatttgttgtgtccgatatcagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatccgaagcatcgttgccgtatccaattgag 32210  T
Q  304 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataag 403  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32211 agtatccacttgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataag 32310  T
Q  404 tccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggaccacatgaaatagcttcctgaaatcaccacctaaatctct 503  Q
      ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||| ||| | |||| || ||||||||||||||||||| ||      
T  32311 cacatatctttgacgaattgactgaggcatcaacaatatctggcctcgttcctcgtcggacaacaggcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactac 32410  T
Q  504 tgtcattccacgaaaaggtctaaactcgtttaggggatcattcttggacatgat 557  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| | |||||| |||||| | ||||||||||||    
T  32411 tgtcattccaccaaaaggtttaagcgcgtttacgggatcgtgcttggacatgat 32464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 275 - 557
Target Start/End: Original strand, 1 - 283
Alignment:
Q  275 ccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatatt 374  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  1 ccgaagcatcgttgccgtctccaattgagagtatccacttgcaaaaattagcaatttcttcttgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatatt 100  T
Q  375 aacagtaagcctcaacacattacaataagtccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggaccacatgaaat 474  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||| |||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||  | | | |||    
T  101 aacagtaagcctcaaaacattacaataagccaatatatttgacgaattgaccgagacatcaacaatatccggcctcgttcctcctcggaaaaaaggcaat 200  T
Q  475 agcttcctgaaatcaccacctaaatctcttgtcattccacgaaaaggtctaaactcgtttaggggatcattcttggacatgat 557  Q
    | || ||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||| |||   |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  201 atctgcctaaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtttaagtgcgtttaagggatcattcttgaacatgat 283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 238
Target Start/End: Original strand, 19436 - 19670
Alignment:
Q  14 tggacatcatatttttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 113  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  || | |||||    
T  19436 tggacatcagaattttcacccgatctacaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaatttgttgacatgct 19535  T
Q  114 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaa----------ga 203  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||          ||    
T  19536 caactgaatcaagcgttgatgcgagtattcccctttcttggaaaaatagctggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacaaagtttataagtga 19635  T
Q  204 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaat 238  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  19636 catcaacagatttgttgtgtccgatatcagcaaat 19670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 302; Significance: 1e-169; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 14 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 812 - 260
Alignment:
Q  14 tggacatcatatttttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 113  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||    
T  812 tggacatcagaattttcacccaatctacaaacagaatcagaggttaaatactctttcttttcacctggaatcagcgacatcataaattcattaacatgct 713  T
Q  114 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------a 203  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||  ||||||||||||          |    
T  712 caactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttattggaaaaatagctggtcaccaaggttatcatttagatcgggatacacaaagtttataagtga 613  T
Q  204 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 303  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  612 catcaacgggtttgttgtgtctgatatcagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcatcattctcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 513  T
Q  304 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataag 403  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  512 agtatccacttgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaatagtaagcctcaacacattacaataag 413  T
Q  404 tccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggaccacatgaaatagcttcctgaaatcaccacctaaatctct 503  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||| |||   |||| || ||||||||||||||||||| ||      
T  412 cccatatctttgacgaattgattgaggcatcaacaatatccggccttgttcctcctcggacaacagacaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactac 313  T
Q  504 tgtcattccacgaaaaggtctaaactcgtttaggggatcattcttggacatga 556  Q
      ||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  312 cttcattccaccaaaaggtttaagcgcgtttaggggatcatgcttggacatga 260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1139 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 1)
Name: scaffold1139
Description:

Target: scaffold1139; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 26 - 557
Target Start/End: Original strand, 991 - 1549
Alignment:
Q  26 ttttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaa 125  Q
    ||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| ||    
T  991 ttttcgcccgattgacaaacaaaatcagagcttaaatactctttctcttcacttggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgctcgactgaattaa 1090  T
Q  126 gtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acatcaacggatt 215  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||          |||||||||||||    
T  1091 gcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtgacatcaacggatt 1190  T
Q  216 tgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatg 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  1191 tgttgtgtccgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatccgaagagtcgttgtcgtctccaattgagagtatccacttg 1290  T
Q  316 ccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataagtccatatctttg 415  Q
    |||||||||| |||||||||||||| | || ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  1291 ccaaaattagaaatttcttcctgctatacatgtacctaagatgcacccaatcccatattaacagtaagcctcaacacattacaataagctcatatctttg 1390  T
Q  416 atgaattgattgaggcatcaacaata-----------------tcctgcctcgttccttttcggaccacatgaaatagcttcctgaaatcaccacctaaa 498  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||                 |||| ||||| || ||||||| | ||| | |||| || | |||||||||||||||||    
T  1391 atgaattgattgatgcataaataatatcatgcctcaatctttttcctacctcgatctttttcgggcaacaggcaatatctacttgaaatcaccacctaaa 1490  T
Q  499 tctcttgtcattccacgaaaaggtctaaactcgtttaggggatcattcttggacatgat 557  Q
     ||  | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1491 actactatcattccaccaaaaggtctaaactcgtttaggggatcattattggacatgat 1549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 2)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 236 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 28727 - 28406
Alignment:
Q  236 aatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttc 335  Q
    ||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  28727 aatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatccgaagcgttgttgctgtcttcaattcagagtatccacttgccaaaattagcaatttcttt 28628  T
Q  336 ctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataagtccatatctttgatgaattgattgaggcatca 435  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28627 ctgctctgcaggtaccaaagatgcatccaatctcatattaacagtaagtctcaactcattaaaataagcacatatctttgatgaattgattgatgcatca 28528  T
Q  436 acaatatcctgcctcgttccttttcggaccacatgaaatagcttcctgaaatcaccacctaaatctcttgtcattccacgaaaaggtctaaactcgttta 535  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||| |||||||||| || || |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  28527 acaatatcctgcctcgttccttttcggacaacatgcaatatctgcctgatatcaccaccttaaactattgtcattccaccaaatggtttaaactcgttta 28428  T
Q  536 ggggatcattcttggacatgat 557  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  28427 ggggatcattcttggacatgat 28406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 28874 - 28727
Alignment:
Q  14 tggacatcatatttttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 113  Q
    ||||||||| | ||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |    
T  28874 tggacatcaaaattttcacccaagcgacaaacagaatcagagtttaaatactttttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgtt 28775  T
Q  114 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaata 161  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28774 caactgaatcaagcgttggtgcgagtattcccctttcttggaaaaata 28727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 188; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 14 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 49176 - 48735
Alignment:
Q  14 tggacatcatatttttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgct 113  Q
    ||||||||| | |||||||| |||| | ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||| |||||    
T  49176 tggacatcagaattttcacctgatctaaaaatagaatcagaggttaaatactctttctcttcacctagaatcagcgacatcataaattcgttaacatgct 49077  T
Q  114 caactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------a 203  Q
    ||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||  ||||||||| ||          |    
T  49076 caattgaatcaagcgtgggtgcgagtattcccctttcttggaaaaatagttggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacagagtctataagtga 48977  T
Q  204 catcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgag 303  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  48976 catcaacggatttgttgtgtttgatatcagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattgtcacccgaagcatcgttgccgtctccaattgag 48877  T
Q  304 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataag 403  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | |||           || ||||||||| |||||||||||||    
T  48876 agtatccacttgcaaaaattagcaatttcttcctgctctgtaggtaccgaagatgcatccaat-----------agcaagcctcaaaacattacaataag 48788  T
Q  404 tccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttcct 456  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  || ||||||||    
T  48787 tccatatctttgacgaattgaccgaggcatcaacaatatctggcatcgttcct 48735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 206 - 453
Target Start/End: Original strand, 39937 - 40184
Alignment:
Q  206 tcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagag 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  39937 tcaacggatttgttgtgtccgatatcagcaaatcttcaagaatttctacctttatttcaccattctcatccgaagcatcgttgccatctccaattgagag 40036  T
Q  306 tatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataagtc 405  Q
    ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  40037 tattcacttgccaaagttagcaatttcttcctgctctgtaggtaccgaagatgcacacaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataagcc 40136  T
Q  406 catatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgtt 453  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40137 catatctttgacgaattgactgaggcatcaacaatatccggcctcgtt 40184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 484 - 557
Target Start/End: Original strand, 42434 - 42507
Alignment:
Q  484 aaatcaccacctaaatctcttgtcattccacgaaaaggtctaaactcgtttaggggatcattcttggacatgat 557  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42434 aaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtttaagcacgtttaggggatcattcttggacatgat 42507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 123; Significance: 6e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 359 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 14162 - 13964
Alignment:
Q  359 cacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataagtccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttt 458  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14162 cacccaatctcatattaatagtaagcctcaacatattaaaataagcccatatatttgatgaattgattgatgcatcaacaatatcttgcctcgttccttt 14063  T
Q  459 tcggaccacatgaaatagcttcctgaaatcaccacctaaatctcttgtcattccacgaaaaggtctaaactcgtttaggggatcattcttggacatgat 557  Q
    |||||| ||| | |||| || ||||||||||||||||||| || || ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14062 tcggacaacaggcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactattatcattccaccaaatggtttaaactcgtttaggggatcattcttggacatgat 13964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 42 - 230
Target Start/End: Original strand, 16691 - 16889
Alignment:
Q  42 aaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcgagtat 141  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||| || ||| ||| ||| ||| ||||| ||||||||    
T  16691 aaacagaatcatagcttaaaaactctttctcttcacctagaatcagtgaaatcatatatgcgttaacatactccactaaattaagcgttggtgcgagtat 16790  T
Q  142 tcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaa----------gacatcaacggatttgttgtgtccgatat 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16791 tcccctttcttggaaaaatagcgggtcaccaaagttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtgacatcaacggatttgttgtgtccgatat 16889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0888 (Bit Score: 61; Significance: 6e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0888
Description:

Target: scaffold0888; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 26 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 130 - 30
Alignment:
Q  26 ttttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaa 125  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  130 ttttcacccgatcgacatacaaaatcagagcttaaatactctttctcgccacctgaaatcagtgacatcgtatattcgttaacatgctcaactgaatcaa 31  T
Q  126 g 126  Q
    |    
T  30 g 30  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1424 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1424
Description:

Target: scaffold1424; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 90
Target Start/End: Original strand, 1627 - 1703
Alignment:
Q  14 tggacatcatatttttcacccgatcaacaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtga 90  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  1627 tggacatcaaaattttcacccgatcgataaacataatcagagtttaaatacgctttctcttcacctggaatcagtga 1703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University