View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8986_low_63 (Length: 419)

Name: NF8986_low_63
Description: NF8986
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8986_low_63
NF8986_low_63
[»] chr7 (1 HSPs)
chr7 (18-412)||(29835987-29836383)
[»] chr3 (16 HSPs)
chr3 (133-343)||(11149282-11149492)
chr3 (119-343)||(11131454-11131678)
chr3 (119-343)||(10888723-10888947)
chr3 (141-364)||(10434451-10434674)
chr3 (119-349)||(8860703-8860933)
chr3 (141-350)||(10364219-10364428)
chr3 (141-350)||(10580040-10580249)
chr3 (141-260)||(10195112-10195231)
chr3 (141-260)||(10376356-10376475)
chr3 (141-350)||(10088229-10088438)
chr3 (297-346)||(13160575-13160624)
chr3 (297-346)||(13170626-13170675)
chr3 (297-346)||(13289260-13289309)
chr3 (297-346)||(13332499-13332548)
chr3 (294-354)||(10031583-10031643)
chr3 (297-337)||(13343684-13343724)
[»] chr6 (1 HSPs)
chr6 (93-348)||(31680162-31680417)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (141-350)||(50226-50435)
[»] scaffold0002 (2 HSPs)
scaffold0002 (297-346)||(136313-136362)
scaffold0002 (297-346)||(146364-146413)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 344; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 412
Target Start/End: Original strand, 29835987 - 29836383
Alignment:
Q  18 ttaccttgctttcttaattcaactttcaccaaaacagctctactctggaatnnnnnnnnnn--tgtttgcaacaggtggtgcctttctctccgctcctat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29835987 ttaccttgctttcttaattcaactttcaccaaaacagctctcctctggaataaaaaaaaaaaatgtttgcaacaggtggtgcctttctctccgctcctat 29836086  T
Q  116 tgtaaccatgatggacaaactaacctcaacagagtttcaagattacgtcaacaacatgaagctgaatcactctctcttgaagcagttgcaaacaacactt 215  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29836087 tttaaccatgatggacaaactaacctcaacagagtttcaagattacgtcaacaacatgaagctgaatcactctctcttgaagcagttgcaaacaacactt 29836186  T
Q  216 ctcactcttgaagcggtgctagttgatgcagagatgaagcagatccatgatccggctgtccgagaatggcttaatgatttaaaagatgcaatctatgata 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29836187 ctcactcttgaagcggtgctagttgatgcagagaggaagcagatccatgatccggctgtccgagaatggcttaatgatttaaaagatgcaatctatgata 29836286  T
Q  316 cagaggatttgctgaaccaaattagttacgattccatacaatccaaggtcacaaatcaggtgctgaacttcctttcatctcttttttctaacaccaa 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29836287 cagaggatttgctgaaccaaattagttacgattccatacaatccaaggtcacaaatcaggtgctgaacttcctttcatctcttttttctaacaccaa 29836383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 16)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 133 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 11149492 - 11149282
Alignment:
Q  133 aactaacctcaacagagtttcaagattacgtcaacaacatgaagctgaatcactctctcttgaagcagttgcaaacaacacttctcactcttgaagcggt 232  Q
    ||||||| ||||| |||||||  |||| | |||||||||  |||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||   |||| |||| ||    
T  11149492 aactaacttcaactgagtttcgtgatttcatcaacaacaaaaagctgaatgtctcactcttgaagcagttacaaacaacactgctggttcttcaagctgt 11149393  T
Q  233 gctagttgatgcagagatgaagcagatccatgatccggctgtccgagaatggcttaatgatttaaaagatgcaatctatgatacagaggatttgctgaac 332  Q
    ||| | |||||| ||   |||||||||| |  |||| ||||||  | |||||||| |||| || |||||||| |||| |||| | ||||||||||||||     
T  11149392 gctggatgatgctgatgagaagcagatcaacaatcctgctgtcaaacaatggcttgatgacttgaaagatgctatctttgatgccgaggatttgctgaat 11149293  T
Q  333 caaattagtta 343  Q
    |||||||||||    
T  11149292 caaattagtta 11149282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 119 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 11131678 - 11131454
Alignment:
Q  119 aaccatgatggacaaactaacctcaacagagtttcaagattacgtcaacaacatgaagctgaatcactctctcttgaagcagttgcaaacaacacttctc 218  Q
    ||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||  |||| | |||||||||  |||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||     
T  11131678 aaccatgcttgacaaactaacttcaactgagtttcgtgatttcatcaacaacaaaaagctgaatgtctcactcttgaagcagttacaaacaacactgctg 11131579  T
Q  219 actcttgaagcggtgctagttgatgcagagatgaagcagatccatgatccggctgtccgagaatggcttaatgatttaaaagatgcaatctatgatacag 318  Q
      |||| |||| ||||| | |||||| |||  |||||||||| |  | |  ||||||  | ||||| || |||| || |||||||| |||| |||| | |    
T  11131578 gttcttcaagctgtgctggatgatgctgaggagaagcagatcaacaaccgtgctgtcaaaaaatgggttgatgacttgaaagatgctatctttgatgcgg 11131479  T
Q  319 aggatttgctgaaccaaattagtta 343  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  11131478 aggatttgctgaatcaaattagtta 11131454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 119 - 343
Target Start/End: Original strand, 10888723 - 10888947
Alignment:
Q  119 aaccatgatggacaaactaacctcaacagagtttcaagattacgtcaacaacatgaagctgaatcactctctcttgaagcagttgcaaacaacacttctc 218  Q
    ||||||| | ||| ||||||| ||||| |||||||  |||| | |||||||||  |||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| || ||     
T  10888723 aaccatgcttgaccaactaacttcaactgagtttcgtgatttcatcaacaacaaaaagctgaatgtctcactcttgaagcagttacaaacaacgctgctg 10888822  T
Q  219 actcttgaagcggtgctagttgatgcagagatgaagcagatccatgatccggctgtccgagaatggcttaatgatttaaaagatgcaatctatgatacag 318  Q
      |||| |||| ||||| | |||||| |||  |||||||||| |  | |  ||||||  | |||||||| |||| || ||||||||  ||| |||| | |    
T  10888823 gttcttcaagctgtgctggatgatgctgaggagaagcagatcaacaaccgtgctgtcaaacaatggcttgatgacttgaaagatgctgtctttgatgcgg 10888922  T
Q  319 aggatttgctgaaccaaattagtta 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  10888923 aggatttgctgaaccaaattagtta 10888947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 141 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 10434674 - 10434451
Alignment:
Q  141 tcaacagagtttcaagattacgtcaacaacatgaagctgaatcactctctcttgaagcagttgcaaacaacacttctcactcttgaagcggtgctagttg 240  Q
    |||| ||||||||  |||||| |||| ||||  ||||| ||| |||| ||||||| |||| || |||||||||||||||||||| |||  ||||| | ||    
T  10434674 tcaaaagagtttcgtgattacatcaaaaacaccaagctcaatgactcactcttgaggcagctgaaaacaacacttctcactcttcaagttgtgctggatg 10434575  T
Q  241 atgcagagatgaagcagatccatgatccggctgtccgagaatggcttaatgatttaaaagatgcaatctatgatacagaggatttgctgaaccaaattag 340  Q
    ||||||||  |||||||||| |  | || ||||||  | |||||||| |||| || ||||||||  ||| |||| | ||||| ||||| ||| |||| ||    
T  10434574 atgcagaggagaagcagatcaacaaacctgctgtcaaacaatggcttgatgacttgaaagatgctgtctttgatgccgaggacttgctcaacgaaatcag 10434475  T
Q  341 ttacgattccatacaatccaaggt 364  Q
    ||| |||||| | | |||||||||    
T  10434474 ttatgattcccttcgatccaaggt 10434451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 119 - 349
Target Start/End: Original strand, 8860703 - 8860933
Alignment:
Q  119 aaccatgatggacaaactaacctcaacagagtttcaagattacgtcaacaacatgaagctgaatcactctctcttgaagcagttgcaaacaacacttctc 218  Q
    ||||||| | ||| ||||||| ||||| |||||||  |||| | |||||||||  ||||||||   ||| |||||||||||||| ||| |||| || ||     
T  8860703 aaccatgcttgaccaactaacttcaaccgagtttcgtgatttcatcaacaacagaaagctgaacgtctcactcttgaagcagttacaagcaacgctgctg 8860802  T
Q  219 actcttgaagcggtgctagttgatgcagagatgaagcagatccatgatccggctgtccgagaatggcttaatgatttaaaagatgcaatctatgatacag 318  Q
      |||| |||| ||||| | ||||||||||  |||||||||| |  |||  ||||||  | |||||||| |||| || ||||||||  ||| |||| | |    
T  8860803 gttcttcaagctgtgctggatgatgcagaggagaagcagatcaacaatcgtgctgtcaaacaatggcttgatgacttgaaagatgctctctttgatgctg 8860902  T
Q  319 aggatttgctgaaccaaattagttacgattc 349  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  8860903 aggatttgctcaaccaaatcagttatgattc 8860933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 10364428 - 10364219
Alignment:
Q  141 tcaacagagtttcaagattacgtcaacaacatgaagctgaatcactctctcttgaagcagttgcaaacaacacttctcactcttgaagcggtgctagttg 240  Q
    |||||||||||||  |||||| |||| ||||  || || ||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |||  ||||| | ||    
T  10364428 tcaacagagtttcttgattacatcaaaaacaccaaactcaatgactcactcttgaggcagttacaaacaacactgctcactcttcaagttgtgctggatg 10364329  T
Q  241 atgcagagatgaagcagatccatgatccggctgtccgagaatggcttaatgatttaaaagatgcaatctatgatacagaggatttgctgaaccaaattag 340  Q
    | |||||   |||||||||| |  |||| ||||||  | |||||||| |||  || ||||||||  ||| |||| | |||||||||||  || |||| ||    
T  10364328 acgcagaagagaagcagatcaacaatcctgctgtcaaacaatggcttgatggcttgaaagatgctgtctttgatgccgaggatttgcttcacgaaatcag 10364229  T
Q  341 ttacgattcc 350  Q
    ||| ||||||    
T  10364228 ttatgattcc 10364219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 350
Target Start/End: Original strand, 10580040 - 10580249
Alignment:
Q  141 tcaacagagtttcaagattacgtcaacaacatgaagctgaatcactctctcttgaagcagttgcaaacaacacttctcactcttgaagcggtgctagttg 240  Q
    ||||| |||||||  |||||| |||| ||||  ||||| |||  ||| ||||||| |||| |  |||||||||| ||||||||| |||  ||||| | ||    
T  10580040 tcaactgagtttcttgattacatcaaaaacactaagctcaatgtctcactcttgaggcagcttaaaacaacactgctcactcttcaagttgtgctggatg 10580139  T
Q  241 atgcagagatgaagcagatccatgatccggctgtccgagaatggcttaatgatttaaaagatgcaatctatgatacagaggatttgctgaaccaaattag 340  Q
    ||||||||  |||||||||| || |||| ||||||  |  ||||||| |||| || |||||||| |||  |||| | ||||| ||||| ||  |||| ||    
T  10580140 atgcagaggagaagcagatcaataatcctgctgtcaaactatggcttgatgacttgaaagatgctatcattgatgctgaggacttgctcaatgaaatcag 10580239  T
Q  341 ttacgattcc 350  Q
    ||||||||||    
T  10580240 ttacgattcc 10580249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 141 - 260
Target Start/End: Original strand, 10195112 - 10195231
Alignment:
Q  141 tcaacagagtttcaagattacgtcaacaacatgaagctgaatcactctctcttgaagcagttgcaaacaacacttctcactcttgaagcggtgctagttg 240  Q
    |||||||||||||  |||||| |||| ||||  ||| |||||  ||| ||||||| |||| || |||||||||| ||||||||| |||  ||||| | ||    
T  10195112 tcaacagagtttcgtgattacatcaaaaacaccaagttgaatgtctcactcttgaggcagctgaaaacaacactgctcactcttcaagttgtgctggatg 10195211  T
Q  241 atgcagagatgaagcagatc 260  Q
    |||| |||  ||||||||||    
T  10195212 atgcggaggagaagcagatc 10195231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 141 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 10376475 - 10376356
Alignment:
Q  141 tcaacagagtttcaagattacgtcaacaacatgaagctgaatcactctctcttgaagcagttgcaaacaacacttctcactcttgaagcggtgctagttg 240  Q
    |||||||||||||  |||||| |||| ||||  || || |||  ||| ||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||| |||  ||||| | ||    
T  10376475 tcaacagagtttcttgattacatcaaaaacaccaaactcaatgtctcactcttgaggcagttaaaaacaacactgctcactcttcaagttgtgctggatg 10376376  T
Q  241 atgcagagatgaagcagatc 260  Q
    ||||||||  ||||||||||    
T  10376375 atgcagaggagaagcagatc 10376356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 350
Target Start/End: Original strand, 10088229 - 10088438
Alignment:
Q  141 tcaacagagtttcaagattacgtcaacaacatgaagctgaatcactctctcttgaagcagttgcaaacaacacttctcactcttgaagcggtgctagttg 240  Q
    |||||||||||||  |||||| |||| ||||  ||| |||||  ||| |||| || |||| || |||||||||| ||||||||| |||  ||||| | ||    
T  10088229 tcaacagagtttcgtgattacatcaaaaacaccaagttgaatgtctcactctcgaggcagctgaaaacaacactgctcactcttcaagttgtgctggatg 10088328  T
Q  241 atgcagagatgaagcagatccatgatccggctgtccgagaatggcttaatgatttaaaagatgcaatctatgatacagaggatttgctgaaccaaattag 340  Q
    |||| |||  |||||||||| |  |||| ||||||  |  ||||||| |||| || ||||||||  ||| |||| | ||||| ||||| | | |||| ||    
T  10088329 atgcggaggagaagcagatcaacaatcctgctgtcaaactatggcttgatgacttgaaagatgctgtctttgatgctgaggacttgctcagcgaaatcag 10088428  T
Q  341 ttacgattcc 350  Q
    ||| ||||||    
T  10088429 ttatgattcc 10088438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 346
Target Start/End: Original strand, 13160575 - 13160624
Alignment:
Q  297 aaagatgcaatctatgatacagaggatttgctgaaccaaattagttacga 346  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  13160575 aaagatgcaatctatgatgctgaggatttgcttaaccaaatcaattacga 13160624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 346
Target Start/End: Original strand, 13170626 - 13170675
Alignment:
Q  297 aaagatgcaatctatgatacagaggatttgctgaaccaaattagttacga 346  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  13170626 aaagatgcaatctatgatgctgaggatttgcttaaccaaatcaattacga 13170675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 346
Target Start/End: Original strand, 13289260 - 13289309
Alignment:
Q  297 aaagatgcaatctatgatacagaggatttgctgaaccaaattagttacga 346  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  13289260 aaagatgcaatctatgatgctgaggatttgcttaaccaaatcaattacga 13289309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 346
Target Start/End: Original strand, 13332499 - 13332548
Alignment:
Q  297 aaagatgcaatctatgatacagaggatttgctgaaccaaattagttacga 346  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  13332499 aaagatgcaatctatgatgctgaggatttgcttaaccaaatcaattacga 13332548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 294 - 354
Target Start/End: Original strand, 10031583 - 10031643
Alignment:
Q  294 ttaaaagatgcaatctatgatacagaggatttgctgaaccaaattagttacgattccatac 354  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||| || ||| || ||||||    
T  10031583 ttaaaagatgcaatctatgatgctgaggatttgctcaatcaaatcagctacaatgccatac 10031643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 297 - 337
Target Start/End: Original strand, 13343684 - 13343724
Alignment:
Q  297 aaagatgcaatctatgatacagaggatttgctgaaccaaat 337  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  13343684 aaagatgcaatctatgatgctgaggatttgcttaaccaaat 13343724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 31680417 - 31680162
Alignment:
Q  93 ggtgcctttctctccgctcctattgtaaccatgatggacaaactaacctcaacagagtttcaagattacgtcaacaacatgaagctgaatcactctctct 192  Q
    ||||| |||||||| ||| || ||  ||| || |||||||  ||||| ||| ||||||||| | ||| | ||||||||| |||||||||    || || |    
T  31680417 ggtgcatttctctctgcttctgttcaaacaataatggacaggctaacatcaccagagtttcgaaatttcatcaacaacaagaagctgaacttatcacttt 31680318  T
Q  193 tgaagcagttgcaaacaacacttctcactcttgaagcggtgctagttgatgcagagatgaagcagatccatgatccggctgtccgagaatggcttaatga 292  Q
    ||||||| ||  | |||||||||||||||||| | || || || | |||||| |||| |||||||||| |  |||   |||||  | |||||||| ||||    
T  31680317 tgaagcatttagagacaacacttctcactcttcatgctgttcttgatgatgctgagaagaagcagatcaacaatcttcctgtcaaacaatggcttgatga 31680218  T
Q  293 tttaaaagatgcaatctatgatacagaggatttgctgaaccaaattagttacgatt 348  Q
     || ||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||| || ||||| ||||    
T  31680217 gttgaaagatgcaatatatgatgctgaggatttgctcaaccagatcagttatgatt 31680162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 50435 - 50226
Alignment:
Q  141 tcaacagagtttcaagattacgtcaacaacatgaagctgaatcactctctcttgaagcagttgcaaacaacacttctcactcttgaagcggtgctagttg 240  Q
    |||||||||||||  |||||| |||| ||||  ||||| |||  ||| ||||||| |||| || |||||||||||||||||||| |||  ||||| | ||    
T  50435 tcaacagagtttcttgattacatcaaaaacactaagctcaatgtctcactcttgaggcagctgaaaacaacacttctcactcttcaagttgtgctggatg 50336  T
Q  241 atgcagagatgaagcagatccatgatccggctgtccgagaatggcttaatgatttaaaagatgcaatctatgatacagaggatttgctgaaccaaattag 340  Q
    |||| |||  |||||||||| |  |||| ||||||  |  ||||||| |||| || ||||||||  ||| |||| | ||||| ||||| | | |||| ||    
T  50335 atgctgaggagaagcagatcaacaatcctgctgtcaaactatggcttgatgacttgaaagatgctgtctttgatgctgaggacttgctcagcgaaatcag 50236  T
Q  341 ttacgattcc 350  Q
    ||| ||||||    
T  50235 ttatgattcc 50226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 136362 - 136313
Alignment:
Q  297 aaagatgcaatctatgatacagaggatttgctgaaccaaattagttacga 346  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  136362 aaagatgcaatctatgatgctgaggatttgcttaaccaaatcaattacga 136313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 146413 - 146364
Alignment:
Q  297 aaagatgcaatctatgatacagaggatttgctgaaccaaattagttacga 346  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  146413 aaagatgcaatctatgatgctgaggatttgcttaaccaaatcaattacga 146364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University