View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8986_low_74 (Length: 353)

Name: NF8986_low_74
Description: NF8986
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8986_low_74
NF8986_low_74
[»] chr1 (116 HSPs)
chr1 (1-353)||(13214997-13215353)
chr1 (1-353)||(51749955-51750306)
chr1 (1-353)||(38925495-38925843)
chr1 (1-353)||(10399842-10400193)
chr1 (1-353)||(15823462-15823813)
chr1 (2-353)||(16428569-16428921)
chr1 (1-353)||(41646836-41647187)
chr1 (1-353)||(6822931-6823281)
chr1 (1-349)||(13761753-13762099)
chr1 (1-353)||(39462435-39462786)
chr1 (29-353)||(50078834-50079158)
chr1 (1-353)||(28840594-28840946)
chr1 (7-353)||(14097983-14098329)
chr1 (5-353)||(20302379-20302725)
chr1 (5-349)||(28842413-28842757)
chr1 (28-353)||(12302519-12302848)
chr1 (29-353)||(2617460-2617783)
chr1 (5-353)||(3579631-3579979)
chr1 (29-353)||(17186141-17186465)
chr1 (1-353)||(51752281-51752630)
chr1 (30-353)||(18307054-18307376)
chr1 (28-353)||(9241099-9241424)
chr1 (1-353)||(28207082-28207431)
chr1 (28-353)||(17324650-17324974)
chr1 (29-353)||(50307560-50307884)
chr1 (29-353)||(11457489-11457812)
chr1 (29-353)||(18839531-18839855)
chr1 (3-353)||(16226085-16226434)
chr1 (30-353)||(25251288-25251611)
chr1 (31-353)||(15294848-15295183)
chr1 (29-353)||(50076686-50077009)
chr1 (69-353)||(25127856-25128140)
chr1 (28-353)||(6995714-6996038)
chr1 (28-353)||(24325599-24325930)
chr1 (28-353)||(47906207-47906537)
chr1 (18-353)||(20291390-20291723)
chr1 (31-353)||(39932017-39932341)
chr1 (28-353)||(28998267-28998591)
chr1 (28-353)||(29003983-29004307)
chr1 (50-353)||(31425029-31425335)
chr1 (29-349)||(31489859-31490175)
chr1 (1-353)||(47451564-47451909)
chr1 (28-353)||(31735535-31735863)
chr1 (1-284)||(6823800-6824091)
chr1 (28-353)||(2510339-2510666)
chr1 (28-353)||(6756470-6756795)
chr1 (3-353)||(47179627-47179979)
chr1 (30-353)||(17318838-17319154)
chr1 (31-328)||(21948227-21948526)
chr1 (28-309)||(31422930-31423212)
chr1 (29-353)||(17324009-17324331)
chr1 (28-353)||(27336954-27337280)
chr1 (28-353)||(27339145-27339472)
chr1 (69-349)||(4131393-4131676)
chr1 (29-353)||(50248584-50248909)
chr1 (3-281)||(47177276-47177559)
chr1 (28-353)||(2949246-2949569)
chr1 (28-353)||(9463258-9463588)
chr1 (78-351)||(40133937-40134210)
chr1 (28-353)||(9459431-9459761)
chr1 (29-353)||(14183604-14183923)
chr1 (28-353)||(8347285-8347607)
chr1 (77-353)||(46431720-46431996)
chr1 (28-299)||(48665114-48665392)
chr1 (3-353)||(42922151-42922499)
chr1 (28-341)||(15669419-15669729)
chr1 (76-353)||(16432396-16432663)
chr1 (28-353)||(49495224-49495537)
chr1 (28-339)||(18800600-18800907)
chr1 (152-353)||(25248565-25248766)
chr1 (2-341)||(8349077-8349414)
chr1 (165-353)||(6115116-6115304)
chr1 (170-353)||(16429042-16429225)
chr1 (35-341)||(13125483-13125787)
chr1 (1-306)||(30790461-30790759)
chr1 (3-353)||(27916415-27916765)
chr1 (1-125)||(16231517-16231641)
chr1 (164-353)||(16561545-16561736)
chr1 (152-353)||(16231630-16231830)
chr1 (35-274)||(26520205-26520449)
chr1 (167-341)||(30738653-30738830)
chr1 (182-353)||(23785936-23786106)
chr1 (177-353)||(51757623-51757797)
chr1 (167-343)||(155788-155963)
chr1 (167-341)||(26613265-26613440)
chr1 (30-124)||(25248756-25248850)
chr1 (108-306)||(28279292-28279487)
chr1 (226-353)||(23816027-23816153)
chr1 (167-314)||(14353047-14353193)
chr1 (171-324)||(43104245-43104400)
chr1 (261-353)||(15916566-15916659)
chr1 (85-229)||(26332699-26332836)
chr1 (1-67)||(23783467-23783533)
chr1 (35-160)||(13127837-13127959)
chr1 (3-100)||(26613503-26613603)
chr1 (167-231)||(26332624-26332688)
chr1 (167-277)||(49959129-49959241)
chr1 (181-230)||(14997039-14997088)
chr1 (167-341)||(21353373-21353545)
chr1 (1-41)||(49687456-49687496)
chr1 (62-101)||(6115344-6115383)
chr1 (272-339)||(13127715-13127782)
chr1 (2-80)||(16431017-16431096)
chr1 (167-230)||(4144817-4144882)
chr1 (300-353)||(13358787-13358840)
chr1 (167-220)||(2232580-2232635)
chr1 (29-101)||(30738890-30738963)
chr1 (28-57)||(43104102-43104131)
chr1 (28-57)||(46432037-46432066)
chr1 (4-57)||(49958963-49959016)
chr1 (167-220)||(2401365-2401420)
chr1 (194-230)||(3091240-3091276)
chr1 (167-220)||(9526449-9526504)
chr1 (167-220)||(25134054-25134109)
chr1 (280-340)||(32261337-32261397)
chr1 (167-306)||(46783126-46783268)
[»] chr3 (147 HSPs)
chr3 (1-353)||(11170300-11170651)
chr3 (28-353)||(4308291-4308615)
chr3 (1-353)||(3859424-3859774)
chr3 (1-353)||(38889935-38890287)
chr3 (1-353)||(45882835-45883187)
chr3 (1-349)||(18162560-18162907)
chr3 (28-353)||(1313333-1313656)
chr3 (1-353)||(18099180-18099531)
chr3 (29-353)||(3314608-3314932)
chr3 (1-353)||(5191549-5191898)
chr3 (1-353)||(10956037-10956388)
chr3 (1-353)||(18096910-18097262)
chr3 (1-350)||(32264050-32264404)
chr3 (28-353)||(53917674-53917998)
chr3 (29-353)||(1626693-1627016)
chr3 (1-353)||(10958333-10958684)
chr3 (1-353)||(22114315-22114666)
chr3 (6-345)||(28761446-28761784)
chr3 (1-353)||(15780756-15781126)
chr3 (1-353)||(24979603-24979955)
chr3 (28-353)||(51727017-51727340)
chr3 (29-353)||(43423473-43423796)
chr3 (1-353)||(10084399-10084754)
chr3 (28-353)||(43228214-43228538)
chr3 (1-353)||(48361681-48362031)
chr3 (28-345)||(53915514-53915830)
chr3 (1-353)||(6063456-6063809)
chr3 (28-353)||(27101191-27101519)
chr3 (30-353)||(43421425-43421747)
chr3 (1-281)||(6065876-6066158)
chr3 (29-350)||(28102015-28102335)
chr3 (28-353)||(43226009-43226332)
chr3 (1-353)||(26720444-26720794)
chr3 (28-353)||(51943294-51943617)
chr3 (29-353)||(5926774-5927097)
chr3 (35-306)||(6561740-6562012)
chr3 (5-353)||(10191320-10191670)
chr3 (1-353)||(5522637-5522976)
chr3 (1-270)||(35777317-35777587)
chr3 (1-353)||(50493895-50494246)
chr3 (29-352)||(880462-880785)
chr3 (28-349)||(25533357-25533685)
chr3 (28-353)||(4103906-4104233)
chr3 (28-353)||(9604617-9604946)
chr3 (5-353)||(12267985-12268323)
chr3 (69-353)||(42990268-42990551)
chr3 (29-353)||(47148905-47149233)
chr3 (29-353)||(53468463-53468788)
chr3 (69-353)||(30005805-30006088)
chr3 (29-353)||(36011751-36012074)
chr3 (28-353)||(35917954-35918283)
chr3 (28-299)||(39715393-39715663)
chr3 (28-353)||(746674-747004)
chr3 (28-353)||(458203-458531)
chr3 (30-353)||(51674776-51675087)
chr3 (28-353)||(455826-456154)
chr3 (29-353)||(889783-890104)
chr3 (1-353)||(25388794-25389152)
chr3 (1-353)||(32218991-32219332)
chr3 (29-259)||(28100144-28100374)
chr3 (3-353)||(23633357-23633700)
chr3 (2-281)||(38210265-38210547)
chr3 (69-353)||(10621540-10621823)
chr3 (29-346)||(54691591-54691906)
chr3 (109-353)||(1321483-1321726)
chr3 (29-341)||(31151271-31151579)
chr3 (28-353)||(53597164-53597485)
chr3 (69-327)||(29956650-29956907)
chr3 (1-173)||(11163046-11163218)
chr3 (28-353)||(42992205-42992517)
chr3 (29-311)||(54884081-54884360)
chr3 (29-353)||(53591119-53591430)
chr3 (28-353)||(13420195-13420506)
chr3 (68-353)||(4666488-4666761)
chr3 (29-259)||(28180948-28181176)
chr3 (95-353)||(28413042-28413299)
chr3 (118-353)||(6484372-6484607)
chr3 (76-353)||(561784-562058)
chr3 (35-353)||(36871310-36871624)
chr3 (112-353)||(17795269-17795506)
chr3 (112-353)||(19103709-19103946)
chr3 (112-350)||(25635391-25635626)
chr3 (30-287)||(23636952-23637205)
chr3 (156-353)||(25688170-25688367)
chr3 (127-353)||(7606598-7606822)
chr3 (1-209)||(24177175-24177380)
chr3 (29-253)||(28137415-28137628)
chr3 (144-353)||(6231840-6232047)
chr3 (30-353)||(27635668-27635959)
chr3 (70-197)||(41849117-41849244)
chr3 (28-291)||(1673898-1674158)
chr3 (1-105)||(1321337-1321441)
chr3 (30-158)||(6231374-6231502)
chr3 (166-353)||(5886261-5886445)
chr3 (166-353)||(5899734-5899918)
chr3 (29-159)||(47701798-47701928)
chr3 (169-350)||(11168165-11168345)
chr3 (183-353)||(3306839-3307007)
chr3 (235-353)||(47701681-47701798)
chr3 (28-224)||(4560422-4560599)
chr3 (167-341)||(1620483-1620657)
chr3 (248-353)||(25634030-25634135)
chr3 (30-141)||(3306724-3306835)
chr3 (167-311)||(14634493-14634638)
chr3 (211-353)||(24181486-24181629)
chr3 (1-83)||(53896475-53896557)
chr3 (84-306)||(13419864-13420081)
chr3 (1-77)||(6719396-6719472)
chr3 (85-341)||(7768554-7768806)
chr3 (112-209)||(25633930-25634024)
chr3 (1-62)||(5886181-5886242)
chr3 (193-341)||(11007545-11007684)
chr3 (1-59)||(13893289-13893347)
chr3 (1-62)||(5899656-5899717)
chr3 (167-341)||(29913980-29914152)
chr3 (3-200)||(1618824-1619018)
chr3 (28-93)||(6484308-6484373)
chr3 (300-353)||(35919125-35919178)
chr3 (300-353)||(41849253-41849306)
chr3 (85-353)||(27420634-27420899)
chr3 (1-57)||(46966940-46966996)
chr3 (181-230)||(7418063-7418112)
chr3 (167-245)||(11073007-11073085)
chr3 (167-220)||(6303293-6303348)
chr3 (167-220)||(10094218-10094273)
chr3 (167-220)||(10100235-10100290)
chr3 (167-220)||(10201098-10201153)
chr3 (167-220)||(10208144-10208199)
chr3 (167-245)||(11066652-11066732)
chr3 (167-220)||(16462186-16462241)
chr3 (167-220)||(22626128-22626183)
chr3 (167-220)||(27544256-27544311)
chr3 (30-207)||(31021300-31021479)
chr3 (167-220)||(47883026-47883081)
chr3 (313-353)||(53894067-53894107)
chr3 (149-192)||(7606830-7606873)
chr3 (195-230)||(13893475-13893510)
chr3 (28-67)||(25690651-25690690)
chr3 (3-57)||(26762863-26762917)
chr3 (261-302)||(4560352-4560393)
chr3 (28-57)||(10621847-10621876)
chr3 (185-230)||(27762120-27762165)
chr3 (28-57)||(42990205-42990234)
chr3 (167-220)||(20031462-20031517)
chr3 (28-64)||(27101558-27101594)
chr3 (167-220)||(47878315-47878370)
chr3 (167-220)||(54193209-54193264)
[»] chr6 (95 HSPs)
chr6 (1-353)||(32279948-32280299)
chr6 (1-353)||(9019877-9020228)
chr6 (1-353)||(11983041-11983392)
chr6 (29-353)||(13057173-13057497)
chr6 (3-353)||(14507188-14507536)
chr6 (1-345)||(15532702-15533044)
chr6 (28-353)||(28241333-28241657)
chr6 (29-353)||(13039733-13040057)
chr6 (1-349)||(15541156-15541503)
chr6 (28-350)||(3390357-3390679)
chr6 (28-353)||(1230261-1230585)
chr6 (1-322)||(15530166-15530485)
chr6 (31-353)||(3631951-3632271)
chr6 (36-353)||(14458779-14459093)
chr6 (29-353)||(3629877-3630199)
chr6 (29-353)||(25477253-25477584)
chr6 (1-350)||(30728839-30729191)
chr6 (1-353)||(4816243-4816608)
chr6 (28-353)||(12195527-12195851)
chr6 (29-353)||(24338460-24338783)
chr6 (28-353)||(30967176-30967503)
chr6 (1-258)||(19227514-19227771)
chr6 (1-353)||(20915368-20915721)
chr6 (29-353)||(3233742-3234065)
chr6 (34-353)||(19704579-19704905)
chr6 (28-353)||(2628898-2629226)
chr6 (28-353)||(30034615-30034943)
chr6 (29-353)||(12161570-12161889)
chr6 (28-353)||(26932574-26932906)
chr6 (28-341)||(3027876-3028186)
chr6 (69-353)||(26065005-26065283)
chr6 (69-353)||(26084974-26085252)
chr6 (62-353)||(15719666-15719946)
chr6 (29-306)||(22490618-22490896)
chr6 (1-174)||(1072067-1072240)
chr6 (170-353)||(1069730-1069913)
chr6 (29-353)||(14466312-14466626)
chr6 (2-353)||(16455436-16455786)
chr6 (35-304)||(17012029-17012294)
chr6 (29-177)||(32447502-32447651)
chr6 (1-141)||(8995430-8995570)
chr6 (3-353)||(19696394-19696744)
chr6 (166-353)||(12186083-12186271)
chr6 (149-353)||(5273228-5273431)
chr6 (116-353)||(15367101-15367334)
chr6 (36-178)||(13870608-13870749)
chr6 (85-353)||(22857964-22858228)
chr6 (28-158)||(17852520-17852650)
chr6 (182-353)||(26066136-26066306)
chr6 (182-353)||(26068407-26068577)
chr6 (165-353)||(26945258-26945448)
chr6 (111-326)||(20526871-20527081)
chr6 (182-353)||(29754721-29754891)
chr6 (182-353)||(33308989-33309158)
chr6 (249-353)||(15346546-15346649)
chr6 (182-353)||(33311258-33311427)
chr6 (167-311)||(25078611-25078755)
chr6 (168-341)||(28037750-28037927)
chr6 (6-188)||(15346347-15346517)
chr6 (181-340)||(12911471-12911630)
chr6 (181-340)||(12937219-12937377)
chr6 (29-142)||(10584105-10584213)
chr6 (1-73)||(26068590-26068662)
chr6 (3-73)||(26066319-26066389)
chr6 (182-291)||(7542456-7542566)
chr6 (282-353)||(10584227-10584298)
chr6 (3-101)||(12186330-12186431)
chr6 (225-341)||(30445698-30445815)
chr6 (167-242)||(11138423-11138499)
chr6 (1-77)||(29754983-29755059)
chr6 (246-326)||(25465630-25465709)
chr6 (249-306)||(28078254-28078310)
chr6 (1-62)||(33308905-33308966)
chr6 (1-62)||(33311174-33311235)
chr6 (194-353)||(11262600-11262762)
chr6 (167-281)||(24542756-24542873)
chr6 (255-311)||(3833481-3833538)
chr6 (167-220)||(3577658-3577713)
chr6 (101-160)||(4595046-4595102)
chr6 (167-220)||(13878710-13878765)
chr6 (167-220)||(13883458-13883513)
chr6 (167-220)||(16785902-16785957)
chr6 (28-72)||(18318004-18318048)
chr6 (167-220)||(26887368-26887423)
chr6 (167-220)||(31248858-31248913)
chr6 (167-220)||(35201470-35201525)
chr6 (3-101)||(12911710-12911812)
chr6 (3-101)||(12937457-12937559)
chr6 (167-230)||(19701996-19702061)
chr6 (104-209)||(6843186-6843287)
chr6 (194-230)||(5165949-5165985)
chr6 (167-220)||(13467607-13467662)
chr6 (167-220)||(17036038-17036093)
chr6 (167-220)||(17694995-17695050)
chr6 (185-245)||(22351972-22352031)
[»] chr4 (128 HSPs)
chr4 (1-353)||(22802746-22803097)
chr4 (1-349)||(48486289-48486636)
chr4 (1-353)||(24880421-24880773)
chr4 (1-353)||(22800874-22801225)
chr4 (5-353)||(40091427-40091774)
chr4 (5-353)||(24878963-24879311)
chr4 (1-353)||(24888766-24889117)
chr4 (28-353)||(40637071-40637395)
chr4 (1-353)||(5198390-5198741)
chr4 (1-353)||(47274697-47275046)
chr4 (1-353)||(11434925-11435275)
chr4 (1-353)||(22044403-22044753)
chr4 (1-353)||(22046698-22047048)
chr4 (1-353)||(9148221-9148573)
chr4 (28-353)||(36378289-36378614)
chr4 (1-353)||(36919596-36919950)
chr4 (1-353)||(51015216-51015566)
chr4 (30-353)||(33415500-33415821)
chr4 (29-353)||(12395857-12396180)
chr4 (29-353)||(12400819-12401142)
chr4 (28-353)||(14633317-14633639)
chr4 (1-353)||(37089384-37089737)
chr4 (28-353)||(8631431-8631759)
chr4 (1-353)||(36921505-36921858)
chr4 (28-353)||(16453306-16453631)
chr4 (1-353)||(18847123-18847473)
chr4 (28-353)||(47868398-47868722)
chr4 (28-350)||(14787444-14787769)
chr4 (30-350)||(37313080-37313400)
chr4 (33-353)||(41997494-41997813)
chr4 (1-353)||(38409169-38409525)
chr4 (1-353)||(9176486-9176837)
chr4 (29-353)||(38928189-38928513)
chr4 (3-353)||(619460-619808)
chr4 (1-353)||(7941289-7941644)
chr4 (1-299)||(5637530-5637832)
chr4 (1-353)||(9174158-9174509)
chr4 (1-353)||(16934155-16934506)
chr4 (1-353)||(31849611-31849962)
chr4 (28-353)||(24348211-24348539)
chr4 (28-353)||(6764836-6765165)
chr4 (28-353)||(44599850-44600174)
chr4 (1-353)||(16931801-16932152)
chr4 (35-353)||(19322701-19323016)
chr4 (29-350)||(19095880-19096201)
chr4 (28-353)||(2484885-2485209)
chr4 (29-348)||(18409364-18409681)
chr4 (1-353)||(11006249-11006604)
chr4 (28-353)||(17662257-17662574)
chr4 (30-353)||(56030443-56030762)
chr4 (1-353)||(11008580-11008933)
chr4 (1-299)||(3824635-3824936)
chr4 (1-340)||(8756276-8756613)
chr4 (29-341)||(18537498-18537806)
chr4 (30-345)||(13543953-13544272)
chr4 (69-353)||(18709176-18709458)
chr4 (1-287)||(52942536-52942810)
chr4 (28-353)||(22132404-22132735)
chr4 (107-353)||(36380425-36380671)
chr4 (69-353)||(22780385-22780668)
chr4 (69-353)||(22782750-22783033)
chr4 (29-259)||(3937314-3937543)
chr4 (69-353)||(22134630-22134909)
chr4 (104-353)||(26085989-26086236)
chr4 (28-353)||(47210764-47211082)
chr4 (28-353)||(53405124-53405454)
chr4 (29-339)||(18534858-18535164)
chr4 (29-249)||(6132871-6133090)
chr4 (145-353)||(16455355-16455563)
chr4 (114-350)||(27499128-27499360)
chr4 (111-353)||(38890236-38890476)
chr4 (29-192)||(38270158-38270321)
chr4 (3-353)||(15032559-15032898)
chr4 (29-192)||(24446756-24446914)
chr4 (182-353)||(13547305-13547475)
chr4 (119-353)||(30136640-30136871)
chr4 (3-324)||(40998990-40999308)
chr4 (173-353)||(2891433-2891613)
chr4 (30-339)||(28453686-28453990)
chr4 (166-353)||(12102221-12102410)
chr4 (28-167)||(5100994-5101133)
chr4 (208-353)||(4215483-4215627)
chr4 (166-329)||(31983563-31983727)
chr4 (35-328)||(9863712-9864006)
chr4 (29-141)||(2891314-2891427)
chr4 (2-341)||(25357607-25357951)
chr4 (85-306)||(47150952-47151167)
chr4 (170-353)||(3982187-3982374)
chr4 (85-328)||(9022362-9022602)
chr4 (226-353)||(5635488-5635614)
chr4 (167-353)||(16185846-16186035)
chr4 (36-339)||(10112876-10113177)
chr4 (226-353)||(11437558-11437683)
chr4 (247-353)||(5101145-5101249)
chr4 (167-291)||(54906722-54906848)
chr4 (28-101)||(16186099-16186173)
chr4 (111-226)||(10114412-10114522)
chr4 (181-328)||(5336818-5336965)
chr4 (29-101)||(12102088-12102162)
chr4 (251-329)||(24446677-24446754)
chr4 (279-353)||(47563009-47563082)
chr4 (28-100)||(16455284-16455356)
chr4 (136-238)||(38208809-38208911)
chr4 (3-57)||(52043737-52043791)
chr4 (167-230)||(55822248-55822313)
chr4 (299-353)||(14789440-14789496)
chr4 (181-230)||(16638826-16638875)
chr4 (1-58)||(22780687-22780744)
chr4 (1-58)||(22783052-22783109)
chr4 (167-245)||(25699732-25699811)
chr4 (269-353)||(26557823-26557907)
chr4 (167-220)||(7050401-7050456)
chr4 (167-220)||(11853532-11853587)
chr4 (167-220)||(36771379-36771434)
chr4 (167-223)||(4874620-4874678)
chr4 (167-341)||(31300407-31300580)
chr4 (167-230)||(4570077-4570142)
chr4 (167-230)||(4884857-4884922)
chr4 (291-353)||(6133096-6133158)
chr4 (272-353)||(10114558-10114639)
chr4 (167-230)||(16489332-16489397)
chr4 (28-58)||(22134936-22134966)
chr4 (185-245)||(4556179-4556238)
chr4 (167-220)||(8529250-8529305)
chr4 (167-220)||(13072125-13072180)
chr4 (167-220)||(15831124-15831179)
chr4 (167-220)||(18586949-18587004)
chr4 (182-230)||(29609605-29609653)
[»] chr2 (95 HSPs)
chr2 (1-353)||(40032065-40032421)
chr2 (1-353)||(19502023-19502374)
chr2 (1-353)||(27104691-27105040)
chr2 (1-353)||(6264160-6264508)
chr2 (1-353)||(42064407-42064758)
chr2 (1-353)||(6258829-6259178)
chr2 (1-353)||(19504358-19504708)
chr2 (5-353)||(22287348-22287695)
chr2 (1-353)||(13910057-13910407)
chr2 (1-353)||(21520705-21521058)
chr2 (29-353)||(19007560-19007883)
chr2 (28-353)||(42923521-42923847)
chr2 (29-344)||(28196557-28196871)
chr2 (28-350)||(45279999-45280321)
chr2 (28-353)||(42452702-42453023)
chr2 (1-353)||(24162235-24162575)
chr2 (29-349)||(17849037-17849356)
chr2 (28-353)||(23452249-23452577)
chr2 (1-353)||(43623592-43623931)
chr2 (29-352)||(31732789-31733100)
chr2 (29-353)||(14837193-14837511)
chr2 (29-353)||(44289079-44289403)
chr2 (29-353)||(11739571-11739895)
chr2 (30-287)||(15539552-15539809)
chr2 (37-353)||(34979589-34979906)
chr2 (32-353)||(3022086-3022415)
chr2 (69-342)||(45239000-45239271)
chr2 (29-349)||(17848365-17848679)
chr2 (28-353)||(22874061-22874374)
chr2 (1-341)||(18800338-18800665)
chr2 (28-353)||(35215598-35215932)
chr2 (69-353)||(35217975-35218258)
chr2 (29-337)||(11578136-11578439)
chr2 (1-180)||(22407593-22407772)
chr2 (119-353)||(28459202-28459435)
chr2 (30-353)||(20146619-20146941)
chr2 (29-206)||(22163106-22163282)
chr2 (69-209)||(38020162-38020302)
chr2 (28-341)||(17897270-17897578)
chr2 (1-353)||(35107192-35107539)
chr2 (159-353)||(5375358-5375550)
chr2 (28-353)||(37962953-37963263)
chr2 (28-164)||(5377629-5377769)
chr2 (165-341)||(40699429-40699606)
chr2 (226-353)||(22407466-22407592)
chr2 (182-353)||(36558876-36559046)
chr2 (182-353)||(36561153-36561323)
chr2 (181-311)||(20589762-20589893)
chr2 (119-291)||(27136198-27136368)
chr2 (182-353)||(45332193-45332363)
chr2 (85-306)||(43139356-43139571)
chr2 (3-341)||(35028473-35028807)
chr2 (30-123)||(38020064-38020157)
chr2 (249-348)||(23870956-23871054)
chr2 (246-349)||(22707767-22707871)
chr2 (166-311)||(15693958-15694106)
chr2 (235-353)||(7462959-7463077)
chr2 (152-251)||(38414194-38414291)
chr2 (168-226)||(27583477-27583535)
chr2 (167-328)||(33603977-33604140)
chr2 (2-100)||(12342673-12342772)
chr2 (167-341)||(17921754-17921927)
chr2 (1-72)||(36559067-36559138)
chr2 (1-72)||(36561344-36561415)
chr2 (17-72)||(45332384-45332439)
chr2 (205-306)||(13828401-13828503)
chr2 (275-353)||(22163034-22163111)
chr2 (166-242)||(26345661-26345738)
chr2 (1-57)||(28462593-28462649)
chr2 (167-245)||(28458948-28459028)
chr2 (29-124)||(38414281-38414365)
chr2 (4-59)||(45156946-45157001)
chr2 (30-72)||(20147040-20147082)
chr2 (279-341)||(39287262-39287324)
chr2 (181-230)||(2740940-2740989)
chr2 (167-242)||(7502975-7503052)
chr2 (167-341)||(39686966-39687139)
chr2 (181-245)||(2736204-2736267)
chr2 (167-220)||(17462419-17462474)
chr2 (167-341)||(17943520-17943692)
chr2 (167-220)||(20054909-20054964)
chr2 (167-220)||(22712660-22712715)
chr2 (167-220)||(22717369-22717424)
chr2 (167-291)||(30720686-30720811)
chr2 (167-220)||(38190980-38191035)
chr2 (167-220)||(45567392-45567447)
chr2 (167-341)||(27517664-27517838)
chr2 (3-77)||(40699203-40699278)
chr2 (167-230)||(39680028-39680093)
chr2 (85-126)||(41304627-41304667)
chr2 (167-220)||(17932617-17932672)
chr2 (167-220)||(20050166-20050221)
chr2 (29-57)||(20589581-20589609)
chr2 (3-55)||(33603818-33603870)
chr2 (167-245)||(34575229-34575308)
[»] chr7 (119 HSPs)
chr7 (7-353)||(31435058-31435404)
chr7 (1-353)||(35555-35906)
chr7 (1-353)||(44490-44841)
chr7 (29-353)||(20137121-20137444)
chr7 (1-350)||(27306245-27306592)
chr7 (28-353)||(13099486-13099812)
chr7 (1-353)||(1049308-1049658)
chr7 (1-353)||(40836755-40837105)
chr7 (1-353)||(3878497-3878854)
chr7 (28-353)||(42331009-42331335)
chr7 (29-353)||(44724533-44724856)
chr7 (29-353)||(24748548-24748872)
chr7 (35-353)||(24258423-24258744)
chr7 (29-353)||(21679981-21680304)
chr7 (28-353)||(38393935-38394263)
chr7 (29-353)||(39145998-39146322)
chr7 (28-353)||(443548-443873)
chr7 (29-311)||(25276095-25276377)
chr7 (29-353)||(11355212-11355535)
chr7 (28-353)||(48457602-48457930)
chr7 (3-353)||(25542459-25542805)
chr7 (29-346)||(27832651-27832969)
chr7 (31-353)||(7470034-7470359)
chr7 (29-353)||(21678020-21678343)
chr7 (28-353)||(40946277-40946605)
chr7 (29-353)||(4295946-4296271)
chr7 (28-353)||(20299407-20299737)
chr7 (29-353)||(9680768-9681097)
chr7 (30-353)||(37412137-37412462)
chr7 (5-353)||(31155923-31156271)
chr7 (31-353)||(20625990-20626315)
chr7 (31-353)||(20629881-20630206)
chr7 (31-353)||(20642300-20642625)
chr7 (28-353)||(20297311-20297639)
chr7 (62-353)||(21592155-21592445)
chr7 (31-353)||(7471992-7472317)
chr7 (28-325)||(22828672-22828969)
chr7 (28-353)||(28487502-28487830)
chr7 (28-352)||(18345490-18345817)
chr7 (28-353)||(3035670-3036001)
chr7 (69-353)||(1849975-1850258)
chr7 (30-353)||(21990106-21990427)
chr7 (1-268)||(26804499-26804765)
chr7 (29-345)||(42223110-42223427)
chr7 (30-350)||(9679009-9679333)
chr7 (28-353)||(7349285-7349615)
chr7 (3-325)||(7188470-7188789)
chr7 (28-353)||(28485515-28485842)
chr7 (13-306)||(22251604-22251893)
chr7 (69-353)||(1046937-1047219)
chr7 (28-299)||(11757177-11757454)
chr7 (28-353)||(43253529-43253860)
chr7 (31-353)||(24817364-24817682)
chr7 (28-353)||(7351664-7351994)
chr7 (7-192)||(18567545-18567730)
chr7 (3-328)||(20091584-20091903)
chr7 (145-353)||(7092225-7092431)
chr7 (104-353)||(24813509-24813755)
chr7 (145-349)||(7094476-7094678)
chr7 (1-222)||(22392399-22392608)
chr7 (30-353)||(24465503-24465814)
chr7 (28-353)||(6332179-6332499)
chr7 (144-353)||(38396704-38396911)
chr7 (235-350)||(22393882-22393997)
chr7 (85-353)||(11081522-11081788)
chr7 (182-353)||(2935375-2935545)
chr7 (208-349)||(26295580-26295721)
chr7 (85-303)||(6048885-6049098)
chr7 (167-353)||(16297033-16297222)
chr7 (182-353)||(9027206-9027375)
chr7 (182-353)||(22108174-22108343)
chr7 (182-353)||(40549934-40550103)
chr7 (182-353)||(1606487-1606656)
chr7 (182-353)||(22137185-22137354)
chr7 (182-353)||(40552212-40552381)
chr7 (205-311)||(6348912-6349018)
chr7 (31-124)||(7094662-7094759)
chr7 (31-124)||(7092414-7092512)
chr7 (75-136)||(38396316-38396377)
chr7 (170-337)||(40281411-40281572)
chr7 (28-77)||(1606423-1606472)
chr7 (249-353)||(6046668-6046772)
chr7 (194-341)||(6067223-6067370)
chr7 (29-245)||(26210500-26210711)
chr7 (1-72)||(22108087-22108158)
chr7 (1-72)||(22137098-22137169)
chr7 (1-72)||(40549847-40549918)
chr7 (1-72)||(40552125-40552196)
chr7 (35-160)||(6348778-6348903)
chr7 (1-72)||(9027396-9027467)
chr7 (1-71)||(2935279-2935349)
chr7 (104-223)||(11084409-11084523)
chr7 (261-310)||(22280393-22280442)
chr7 (145-223)||(12310157-12310234)
chr7 (167-341)||(25357030-25357202)
chr7 (30-97)||(3677235-3677301)
chr7 (167-230)||(21369625-21369690)
chr7 (28-152)||(30906264-30906386)
chr7 (1-55)||(45366472-45366526)
chr7 (166-220)||(2120881-2120937)
chr7 (28-72)||(1849918-1849962)
chr7 (313-353)||(11759364-11759404)
chr7 (167-341)||(25351336-25351508)
chr7 (167-341)||(25410113-25410287)
chr7 (1-58)||(1047238-1047295)
chr7 (167-341)||(7069763-7069936)
chr7 (167-220)||(3320194-3320249)
chr7 (167-220)||(3324942-3324997)
chr7 (167-220)||(7074770-7074825)
chr7 (167-220)||(8378648-8378703)
chr7 (167-220)||(15541139-15541194)
chr7 (167-220)||(25405376-25405431)
chr7 (167-220)||(42006646-42006701)
chr7 (28-57)||(38396239-38396268)
chr7 (321-353)||(4253540-4253572)
chr7 (167-220)||(30246953-30247008)
chr7 (3-55)||(42006493-42006545)
chr7 (167-220)||(44144010-44144065)
chr7 (167-220)||(44512669-44512724)
[»] chr5 (114 HSPs)
chr5 (1-353)||(4236545-4236896)
chr5 (1-353)||(25921485-25921836)
chr5 (1-353)||(2818347-2818699)
chr5 (1-353)||(38882021-38882372)
chr5 (1-349)||(21947943-21948289)
chr5 (1-353)||(2174835-2175185)
chr5 (31-353)||(18511224-18511547)
chr5 (28-353)||(40221465-40221790)
chr5 (28-353)||(10529111-10529435)
chr5 (29-353)||(17072827-17073151)
chr5 (1-353)||(6756410-6756759)
chr5 (29-353)||(31472624-31472948)
chr5 (1-353)||(31542651-31543001)
chr5 (1-353)||(31544996-31545347)
chr5 (28-353)||(39854427-39854750)
chr5 (3-353)||(16776075-16776424)
chr5 (29-353)||(1189619-1189949)
chr5 (28-353)||(37705792-37706116)
chr5 (69-345)||(16092219-16092495)
chr5 (28-353)||(18596590-18596913)
chr5 (31-353)||(18509330-18509652)
chr5 (29-353)||(695833-696145)
chr5 (28-353)||(18468950-18469276)
chr5 (1-353)||(31179383-31179734)
chr5 (69-353)||(25804009-25804291)
chr5 (29-353)||(25904047-25904370)
chr5 (30-353)||(18466625-18466951)
chr5 (29-353)||(24126800-24127123)
chr5 (1-345)||(36402348-36402690)
chr5 (32-353)||(10474335-10474655)
chr5 (1-299)||(31466044-31466341)
chr5 (69-353)||(34477065-34477349)
chr5 (69-353)||(34479430-34479714)
chr5 (29-243)||(20042994-20043208)
chr5 (29-306)||(34530724-34531001)
chr5 (2-349)||(12555939-12556285)
chr5 (28-353)||(27912473-27912803)
chr5 (28-353)||(26097676-26097998)
chr5 (69-353)||(6745053-6745335)
chr5 (37-353)||(2954368-2954683)
chr5 (29-353)||(39398005-39398327)
chr5 (28-353)||(6747247-6747571)
chr5 (28-353)||(27910388-27910717)
chr5 (1-353)||(21684464-21684824)
chr5 (36-353)||(17818504-17818817)
chr5 (29-244)||(20044954-20045169)
chr5 (34-353)||(6661196-6661512)
chr5 (69-353)||(15552229-15552512)
chr5 (107-353)||(658368-658610)
chr5 (28-224)||(26098391-26098587)
chr5 (36-353)||(21288715-21289028)
chr5 (28-353)||(10586782-10587099)
chr5 (163-353)||(20505855-20506042)
chr5 (29-353)||(36208524-36208843)
chr5 (1-167)||(20507659-20507825)
chr5 (30-327)||(9020167-9020460)
chr5 (152-353)||(41585756-41585956)
chr5 (85-353)||(17413177-17413441)
chr5 (72-353)||(20053834-20054104)
chr5 (147-353)||(2723964-2724160)
chr5 (164-353)||(39798126-39798314)
chr5 (152-353)||(4410090-4410289)
chr5 (182-353)||(10749797-10749967)
chr5 (28-125)||(4410000-4410101)
chr5 (182-353)||(3373149-3373319)
chr5 (167-341)||(15143547-15143722)
chr5 (182-353)||(38960144-38960313)
chr5 (2-243)||(42770690-42770924)
chr5 (182-341)||(10757274-10757431)
chr5 (182-353)||(15354587-15354756)
chr5 (182-353)||(23665141-23665310)
chr5 (182-353)||(23793277-23793446)
chr5 (85-328)||(2144599-2144840)
chr5 (85-245)||(4754159-4754313)
chr5 (182-353)||(15356863-15357032)
chr5 (211-299)||(42770936-42771024)
chr5 (215-341)||(15445291-15445417)
chr5 (185-341)||(4897828-4897985)
chr5 (28-124)||(41585946-41586042)
chr5 (198-353)||(23741871-23742023)
chr5 (1-55)||(39798004-39798058)
chr5 (302-353)||(20043206-20043257)
chr5 (1-72)||(23665054-23665125)
chr5 (1-72)||(23793462-23793533)
chr5 (4-223)||(29748260-29748485)
chr5 (136-301)||(34033630-34033797)
chr5 (28-73)||(3373332-3373377)
chr5 (1-69)||(15354777-15354845)
chr5 (1-69)||(15357053-15357121)
chr5 (1-72)||(23667329-23667400)
chr5 (1-72)||(38960334-38960405)
chr5 (1-66)||(10757180-10757245)
chr5 (28-72)||(23742057-23742101)
chr5 (1-57)||(34477379-34477435)
chr5 (167-229)||(10627347-10627411)
chr5 (273-353)||(26098300-26098380)
chr5 (85-311)||(35430172-35430406)
chr5 (1-57)||(34479740-34479796)
chr5 (2-65)||(10749704-10749767)
chr5 (262-317)||(20045217-20045272)
chr5 (167-230)||(2298135-2298200)
chr5 (167-245)||(26406593-26406672)
chr5 (167-245)||(35385572-35385651)
chr5 (167-220)||(1170794-1170849)
chr5 (136-245)||(15224888-15224997)
chr5 (167-224)||(31782597-31782656)
chr5 (182-245)||(32520534-32520598)
chr5 (3-57)||(2144899-2144954)
chr5 (167-217)||(16093438-16093489)
chr5 (29-79)||(2723911-2723961)
chr5 (28-57)||(15552178-15552207)
chr5 (28-57)||(25803959-25803988)
chr5 (167-220)||(25452478-25452533)
chr5 (167-220)||(28786387-28786442)
[»] chr8 (82 HSPs)
chr8 (1-328)||(14807723-14808049)
chr8 (1-353)||(4423990-4424341)
chr8 (5-353)||(15072686-15073034)
chr8 (1-349)||(15067953-15068300)
chr8 (1-353)||(27829269-27829619)
chr8 (1-353)||(28251579-28251930)
chr8 (6-353)||(14419202-14419549)
chr8 (28-353)||(27911014-27911336)
chr8 (28-353)||(27957433-27957755)
chr8 (1-353)||(18810680-18811030)
chr8 (1-353)||(27826958-27827308)
chr8 (6-349)||(13858500-13858842)
chr8 (29-350)||(27106912-27107232)
chr8 (28-353)||(32339304-32339632)
chr8 (1-353)||(44720815-44721166)
chr8 (29-353)||(30480515-30480838)
chr8 (30-353)||(36865538-36865860)
chr8 (29-353)||(25952521-25952844)
chr8 (29-353)||(5372188-5372512)
chr8 (28-353)||(41384744-41385067)
chr8 (28-353)||(15809214-15809541)
chr8 (28-353)||(1225165-1225490)
chr8 (29-275)||(14477276-14477522)
chr8 (28-353)||(3874005-3874333)
chr8 (38-353)||(608735-609057)
chr8 (28-353)||(28283233-28283561)
chr8 (28-353)||(22684665-22685002)
chr8 (28-353)||(41382672-41382985)
chr8 (1-353)||(18812865-18813204)
chr8 (29-353)||(33541422-33541723)
chr8 (28-353)||(24873193-24873523)
chr8 (3-353)||(15185726-15186072)
chr8 (29-353)||(21482322-21482634)
chr8 (77-353)||(43079650-43079925)
chr8 (69-353)||(43082013-43082296)
chr8 (28-353)||(43530123-43530438)
chr8 (119-349)||(15956051-15956277)
chr8 (62-353)||(21480547-21480826)
chr8 (3-353)||(31162186-31162536)
chr8 (28-206)||(26775200-26775378)
chr8 (29-224)||(5622878-5623073)
chr8 (62-353)||(3005642-3005929)
chr8 (29-192)||(35872555-35872713)
chr8 (5-129)||(3886153-3886277)
chr8 (5-140)||(12517248-12517385)
chr8 (164-336)||(31035252-31035424)
chr8 (1-209)||(2468261-2468461)
chr8 (167-341)||(31578301-31578476)
chr8 (85-296)||(31573794-31574000)
chr8 (152-299)||(181622-181771)
chr8 (62-244)||(37214320-37214512)
chr8 (28-124)||(181536-181632)
chr8 (234-349)||(2468145-2468260)
chr8 (2-201)||(31035041-31035238)
chr8 (167-353)||(6376124-6376313)
chr8 (167-341)||(17847661-17847830)
chr8 (269-341)||(16833789-16833861)
chr8 (2-57)||(17847501-17847556)
chr8 (127-328)||(3895920-3896121)
chr8 (167-324)||(13985121-13985278)
chr8 (251-329)||(35872476-35872553)
chr8 (167-245)||(30423195-30423275)
chr8 (167-230)||(17799558-17799623)
chr8 (167-341)||(28327891-28328064)
chr8 (28-72)||(6375988-6376032)
chr8 (167-220)||(9021251-9021306)
chr8 (167-220)||(16752666-16752721)
chr8 (167-220)||(16757411-16757466)
chr8 (167-220)||(28895485-28895540)
chr8 (1-57)||(43079558-43079614)
chr8 (1-57)||(43081930-43081986)
chr8 (272-326)||(14419732-14419786)
chr8 (249-341)||(33020925-33021018)
chr8 (167-223)||(13985954-13986011)
chr8 (85-157)||(13986030-13986098)
chr8 (6-54)||(31574054-31574100)
chr8 (167-245)||(33839042-33839120)
chr8 (167-220)||(590777-590832)
chr8 (167-220)||(4812631-4812686)
chr8 (167-220)||(28332614-28332669)
chr8 (167-220)||(29554929-29554984)
chr8 (167-220)||(33032637-33032692)
[»] scaffold0339 (1 HSPs)
scaffold0339 (1-353)||(3922-4271)
[»] scaffold0131 (2 HSPs)
scaffold0131 (1-353)||(14944-15295)
scaffold0131 (41-353)||(14394-14707)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (1-353)||(69304-69658)
scaffold0025 (1-184)||(73203-73390)
scaffold0025 (139-191)||(73160-73211)
[»] scaffold0250 (1 HSPs)
scaffold0250 (1-353)||(2805-3155)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (28-353)||(41495-41819)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (28-353)||(183653-183975)
scaffold0005 (28-350)||(51961-52286)
scaffold0005 (299-350)||(50234-50287)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (31-350)||(79140-79458)
[»] scaffold0472 (1 HSPs)
scaffold0472 (1-353)||(6124-6475)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (28-353)||(11485-11809)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (29-348)||(79812-80130)
scaffold0004 (167-220)||(188386-188441)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (29-346)||(85184-85500)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (1-353)||(29086-29446)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (69-353)||(34-317)
[»] scaffold0224 (1 HSPs)
scaffold0224 (3-353)||(15832-16180)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (30-353)||(16661-16981)
[»] scaffold0511 (1 HSPs)
scaffold0511 (28-328)||(1988-2292)
[»] scaffold0468 (1 HSPs)
scaffold0468 (38-341)||(1666-1958)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (29-256)||(35593-35819)
scaffold0011 (299-353)||(35816-35870)
[»] scaffold0370 (1 HSPs)
scaffold0370 (145-353)||(1465-1671)
[»] scaffold0552 (1 HSPs)
scaffold0552 (28-141)||(1054-1167)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (35-353)||(4773-5089)
[»] scaffold0140 (4 HSPs)
scaffold0140 (182-353)||(22222-22391)
scaffold0140 (182-353)||(24497-24666)
scaffold0140 (1-72)||(22135-22206)
scaffold0140 (1-72)||(24410-24481)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (181-341)||(57452-57614)
[»] scaffold0891 (1 HSPs)
scaffold0891 (313-353)||(4691-4731)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (167-220)||(224802-224857)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (167-220)||(16308-16363)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 116)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 13214997 - 13215353
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13214997 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaattttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 13215096  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13215097 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgag 13215196  T
Q  201 tctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgata----tctcttttgtaaagttattcat 296  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||| ||| ||||    
T  13215197 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatttttctcttttgtaaatttactcat 13215296  T
Q  297 cattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13215297 cattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 13215353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 51749955 - 51750306
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51749955 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 51750054  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  51750055 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 51750154  T
Q  201 tctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |    
T  51750155 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-t 51750253  T
Q  301 atagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||| | || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  51750254 atagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 51750306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 38925843 - 38925495
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  38925843 gcagatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagagttcagaa 38925744  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38925743 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgag 38925644  T
Q  201 tctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||       
T  38925643 tctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--- 38925547  T
Q  301 atagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38925546 atagtaaaacggagggctgctctctccc-cagactaggtcaatttggaccgaa 38925495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 10400193 - 10399842
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10400193 gcagatttgttccaaattttaagcgaaactttttctataaatatagaccttgtatcagagcaaactgggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 10400094  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgag 200  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  10400093 tgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 10399994  T
Q  201 tctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |    
T  10399993 tctcttggttacgggaagagattgggactttcggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-t 10399895  T
Q  301 atagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||| | || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10399894 atagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 10399842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 15823462 - 15823813
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15823462 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaacttagagataaagggggctgaaacaagggtttagaa 15823561  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||    
T  15823562 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaatattgag 15823661  T
Q  201 tctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| |    
T  15823662 tctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctattgtaacgttactcatca-t 15823760  T
Q  301 atagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||| |||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  15823761 atagtggaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttagaccgaa 15823813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 2 - 353
Target Start/End: Original strand, 16428569 - 16428921
Alignment:
Q  2 cagatttgttccaaattt-taagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||||||||| || ||| |||| || |||||||||||||||||||   || ||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16428569 cagatttgttcgaattttataagggatacttttactataaatataggttttatatcagagcaaaccattagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 16428668  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16428669 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgacaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgag 16428768  T
Q  201 tctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  16428769 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatt 16428868  T
Q  301 atagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
     |||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  16428869 ttagtgaaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaa 16428921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 41646836 - 41647187
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41646836 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaataagggtttagaa 41646935  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| | |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  41646936 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacacttggtttttatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 41647035  T
Q  201 tctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatt 300  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| |    
T  41647036 tcacttggttacgggaagagattgcgactttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatca-t 41647134  T
Q  301 atagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  41647135 atagtgaaacggagggctgctctctccatcagactatgtcaatttggaccgaa 41647187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 6822931 - 6823281
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6822931 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactatttatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 6823030  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  6823031 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaa-actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaatactattaggattgag 6823129  T
Q  201 tctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatt 300  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | |||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| | || |||||| |    
T  6823130 tctcttggttatgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgatactcatca-t 6823228  T
Q  301 atagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||| | || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6823229 atagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 6823281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 13761753 - 13762099
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13761753 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagagggctgaaacaagggtttagaa 13761852  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgag 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  13761853 aggcaacaacataactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgggggttgattcaacttggaaaacactattaggattgag 13761952  T
Q  201 tctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||| |    
T  13761953 tctcttggttacgggaagagtctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-t 13762050  T
Q  301 atagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggac 349  Q
    |||||| | || |||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13762051 atagtggaccggagggcttctctctcccccagactaggtcaatttggac 13762099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 39462435 - 39462786
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  39462435 gcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagaaggctgaaacaaaggtttagaa 39462534  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgag 200  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  39462535 atgcaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggtttttagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 39462634  T
Q  201 tctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  39462635 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagaattattcttgtaaccctttgatatctcttttgaaaagttattcatca-t 39462733  T
Q  301 atagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39462734 atagtgaaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 39462786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 29 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 50079158 - 50078834
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||    
T  50079158 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacagcaacaaaactagggtttgcata 50079059  T
Q  129 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  |||    
T  50079058 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagatttggac 50078959  T
Q  229 tttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctccc 328  Q
    ||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | || |||||||||||    
T  50078958 tttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtggaacagatggctgctctctccc 50078859  T
Q  329 acagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  50078858 ccagactaggtcaatttggaccgaa 50078834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 28840594 - 28840946
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttag 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||||    
T  28840594 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagatacagggggatgaaacaagggtttag 28840693  T
Q  99 aaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattg 198  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  28840694 aaaggaaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 28840793  T
Q  199 agtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatca 298  Q
    ||||||||||||||||||||||  || |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||    
T  28840794 agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca 28840892  T
Q  299 ttatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
     ||||||| | || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28840893 -tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 28840946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 7 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 14098329 - 14097983
Alignment:
Q  7 ttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaa 106  Q
    |||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  14098329 ttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcaaactaaactttgagatagaggggactgaaacaatggtttaaaaaggcaa 14098230  T
Q  107 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctctt 206  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14098229 ctacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctctt 14098130  T
Q  207 ggttacgggaagagatt-gagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaa-gttattcatcattatag 304  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  14098129 ggttacgggaagagattagag-ctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgttactcatca-tatag 14098032  T
Q  305 tgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14098031 tgaaacggagggctgctctctcccacaaactaggtcaatttggaccgaa 14097983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 5 - 353
Target Start/End: Original strand, 20302379 - 20302725
Alignment:
Q  5 atttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggc 104  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20302379 atttgttccaaattttaagtgaaacttttattataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggc 20302478  T
Q  105 aacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  20302479 aacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctc 20302578  T
Q  205 ttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatag 304  Q
    ||||||| ||||||||| |  |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| | || ||||||  ||||    
T  20302579 ttggttatgggaagagactaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgatactcatcag-atag 20302676  T
Q  305 tgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    || | || |||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20302677 tggatcggaggactactctctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 20302725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 5 - 349
Target Start/End: Original strand, 28842413 - 28842757
Alignment:
Q  5 atttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaag 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28842413 atttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatataaaccttgtatcagagcaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaag 28842512  T
Q  103 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtc 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  28842513 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtc 28842612  T
Q  203 tcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattat 302  Q
    | ||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||| |||    
T  28842613 tattggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tat 28842710  T
Q  303 agtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggac 349  Q
    |||| |||| |||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28842711 agtggaacggagggctaatctctcccccagactaggtcaatttggac 28842757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 12302848 - 12302519
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12302848 acttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtt 12302749  T
Q  123 tgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagat 222  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12302748 tgtatagagtttgtctcttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagat 12302649  T
Q  223 tgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctc 322  Q
    || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  12302648 tgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttataactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctc 12302550  T
Q  323 tctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  12302549 tctcccccagattaggtcaatttggaccgaa 12302519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 29 - 353
Target Start/End: Original strand, 2617460 - 2617783
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2617460 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaggaggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 2617559  T
Q  129 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 228  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  2617560 gagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 2617659  T
Q  229 tttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctccc 328  Q
    ||| | ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||| | || |||| |||||||||||    
T  2617660 tttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccc 2617758  T
Q  329 acagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  2617759 tcagactaggtcaatttggaccgaa 2617783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 5 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 3579979 - 3579631
Alignment:
Q  5 atttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggggg--ctgaaacaagggtttagaaag 102  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  3579979 atttgttccaaattttaagcgatacttttactttaaatatagaccttgtatcagcgtaaaatttgagatagagggggggctgaaacaagggttcagaaag 3579880  T
Q  103 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtc 202  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||    
T  3579879 gcagcaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacacaattaggattgagtc 3579780  T
Q  203 tcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattat 302  Q
    ||||| |||||| ||||||||| | |||| | || ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |    
T  3579779 tcttgattacggaaagagattggggctttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat--t 3579682  T
Q  303 agtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||||||| | | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  3579681 agtgaaacggatgattgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaa 3579631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 29 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 17186465 - 17186141
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17186465 cttttaatataaatatagattttgtatcagagcaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 17186366  T
Q  129 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 228  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  17186365 gagtttgtctcttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatcaggattgagtctcttggttacgggaagagatttgaac 17186266  T
Q  229 tttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctccc 328  Q
    ||| | |||||||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| || | |||||||||||    
T  17186265 tttgggtagaattagaagggagacttattcttgtaacccattaatatctcttttgtaaagttactcatcattataatggaacggagtgctgctctctccc 17186166  T
Q  329 acagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  17186165 ccagactaggtcaatttggaccgaa 17186141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 51752281 - 51752630
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  51752281 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagagtttagaa 51752380  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgag 200  Q
    ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  51752381 aggtaacaacaaaattagggcttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgtgaaacactatta-gattgag 51752479  T
Q  201 tctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| | || ||| |||     
T  51752480 tctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgatactcaccat- 51752577  T
Q  301 atagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||| |  | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  51752578 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 51752630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 30 - 353
Target Start/End: Original strand, 18307054 - 18307376
Alignment:
Q  30 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 129  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18307054 ttttgctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtataa 18307153  T
Q  130 agtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagact 229  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  18307154 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggct 18307253  T
Q  230 ttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctccca 329  Q
    || | |||||||||| | |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||     
T  18307254 ttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtgacgcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggatggctgctctctccc- 18307352  T
Q  330 cagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  18307353 cagactaggtcaatttggaccgaa 18307376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 9241424 - 9241099
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 126  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| || |||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9241424 acttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttaagatagaggggggctgaaacaagg-tttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 9241326  T
Q  127 tagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgag 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  9241325 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacattattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggg 9241226  T
Q  227 actttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctc 326  Q
     |||| | |||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  9241225 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctc 9241126  T
Q  327 ccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    || || |||||||||||||||||||||    
T  9241125 ccccatactaggtcaatttggaccgaa 9241099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 28207431 - 28207082
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28207431 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 28207332  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgag 200  Q
    || |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  28207331 agacaacaacaaaactagggtttgtgtaaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagagtttattcaccttgggaaacactattaggattgtg 28207232  T
Q  201 tctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatt 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | ||||  ||| ||||| | ||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||       
T  28207231 tctcttggttacaggaagagattggggctttgaatataattacgcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatc--- 28207135  T
Q  301 atagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28207134 atagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 28207082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 17324974 - 17324650
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | || || |||| |  ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  17324974 acttttactataaatatagaccttgaaccagagtaaacctgaagatacagggggctaaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactggggtttgtat 17324875  T
Q  128 agagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 227  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17324874 agagtttgtctctatggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggga 17324775  T
Q  228 ctttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcc 327  Q
    |||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  17324774 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcc 17324676  T
Q  328 cacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  17324675 cccagactaggtcaatttggaccgaa 17324650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 29 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 50307884 - 50307560
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  50307884 cttttactataaatataagctttgtatcaaagtaaaccttgagatatatggggctgaaaaaagggtttagaaaggcaataacaaaactagggtttgtata 50307785  T
Q  129 gagtttgtctctt-ggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 227  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  50307784 gagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggg 50307685  T
Q  228 ctttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcc 327  Q
    |||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  50307684 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcc 50307586  T
Q  328 cacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  50307585 cccagactaggtcaatttggaccgaa 50307560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 29 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 11457812 - 11457489
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11457812 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaatggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 11457713  T
Q  129 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 228  Q
    |||||||  |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |      
T  11457712 gagtttgattcttggcaacaattactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgcgaagagattggggg 11457613  T
Q  229 tttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctccc 328  Q
    ||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | |  |||||||||||    
T  11457612 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggatgtctgctctctccc 11457514  T
Q  329 acagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  11457513 ccagactaggtcaatttggaccgaa 11457489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 29 - 353
Target Start/End: Original strand, 18839531 - 18839855
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |  | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18839531 cttttactataaatatagacattgtattattgtaaaccatgagatagagggggctgaaacaagggtttagataggcaacaacaaaactagggtttgtata 18839630  T
Q  129 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 228  Q
    |||||| |||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  18839631 gagtttatctctttggaacaaacagtagggttttagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagaatgagac 18839730  T
Q  229 tttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctccc 328  Q
    ||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||    
T  18839731 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagagggctgctctttccc 18839830  T
Q  329 acagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
     || |||||||||||||||||||||    
T  18839831 ccatactaggtcaatttggaccgaa 18839855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 3 - 353
Target Start/End: Original strand, 16226085 - 16226434
Alignment:
Q  3 agatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaag 102  Q
    ||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||     
T  16226085 agatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggggtctaaaacaagggtttagaaaa 16226184  T
Q  103 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattg-agt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  16226185 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 16226284  T
Q  202 ctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatta 301  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| |  | ||||||| |    
T  16226285 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcat-a 16226382  T
Q  302 tagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||| |  | |||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  16226383 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaa 16226434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 30 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 25251611 - 25251288
Alignment:
Q  30 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 129  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  25251611 ttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaaaggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtataa 25251512  T
Q  130 agtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagact 229  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  25251511 cgtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctctcggttacgggaagagattgggact 25251412  T
Q  230 ttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctccca 329  Q
    || | |||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||     
T  25251411 ttgggtagaattaggcggaaaacttattcttgtaacccattgatatatcttttgtaaggttacttatcattatagtgaaacagagggttgctctctcccc 25251312  T
Q  330 cagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
     | |||||||||||||||||||||    
T  25251311 aatactaggtcaatttggaccgaa 25251288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 31 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 15295183 - 15294848
Alignment:
Q  31 tttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--------------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaact 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||              ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15295183 tttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagagagagagagatagagagggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaact 15295084  T
Q  117 agggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacggga 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15295083 agggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 15294984  T
Q  217 agagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaaggg 316  Q
    |||| ||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||| || ||||    
T  15294983 agaggttgggactttgggtagaattaggtgggagatttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaatcggaggg 15294885  T
Q  317 ttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15294884 ctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 15294848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 29 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 50077009 - 50076686
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  50077009 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaaagggctgaaacaaggatttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 50076910  T
Q  129 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 228  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  50076909 aagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggaa 50076810  T
Q  229 tttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctccc 328  Q
    ||| | |||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | |  |||||||||||    
T  50076809 tttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccc 50076710  T
Q  329 acagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
     ||||||| ||||||||||||||||    
T  50076709 -cagactatgtcaatttggaccgaa 50076686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 69 - 353
Target Start/End: Original strand, 25127856 - 25128140
Alignment:
Q  69 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggtt 168  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25127856 gagatagaggggcctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtgtcttggaaacaaacactagggtttgagggtt 25127955  T
Q  169 gattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaaccca 268  Q
    |||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||  ||    
T  25127956 gattcaccttgtgaaacactatttggattgagtctcttggttacgggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaattca 25128055  T
Q  269 ttgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| | || |||||||||||| ||||||||    
T  25128056 ttgatatctcttttgtaaggttactcatcattatattgaaacggagggctgctctctctcccatactaggtcaattaggaccgaa 25128140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 6996038 - 6995714
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||| || |||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6996038 acttttattataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggggccgaaacaacggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 6995939  T
Q  128 agagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 227  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  6995938 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattgggg 6995839  T
Q  228 ctttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcc 327  Q
    |||| | |||||||||| |||| |||| |||| ||||| |||||| ||||||||| ||| |||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  6995838 ctttgggtagaattaggcgggatactttttcttgtaactcattgacatctcttttataacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcc 6995740  T
Q  328 cacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
      ||||||||||||||||||||||||    
T  6995739 tccagactaggtcaatttggaccgaa 6995714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Original strand, 24325599 - 24325930
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagg 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24325599 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagagagatagagggggctgaaacaagggtt-agaaaggcaacaacaaaactagg 24325697  T
Q  120 gtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaaga 219  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24325698 gtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 24325797  T
Q  220 gattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttg 319  Q
    |  || |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||| |||| || ||    
T  24325798 ggctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatca-tatagtgaatcgaatggctg 24325896  T
Q  320 ctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  24325897 ctctctcccccagactaagtcaattttgaccgaa 24325930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Original strand, 47906207 - 47906537
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  47906207 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactatggt 47906306  T
Q  122 ttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaga 221  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47906307 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaga 47906406  T
Q  222 ttgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgct 321  Q
    ||| | |||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||| || |||| ||||    
T  47906407 ttggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgct 47906505  T
Q  322 ctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  47906506 ctctcccccagacttggtcaatttggaccgaa 47906537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 18 - 353
Target Start/End: Original strand, 20291390 - 20291723
Alignment:
Q  18 tttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaacta 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20291390 tttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtattagagcaaattttgagatagagggagatgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaacta 20291489  T
Q  118 gggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaa 217  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  20291490 gggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaagttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaa 20291589  T
Q  218 gagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggt 317  Q
    |||| |  |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| | |  |||||| ||||||| | || |||||    
T  20291590 gagactaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgattctcatca-tatagtggatcggagggt 20291687  T
Q  318 tgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    || |||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  20291688 tgttctctcccccacactagatcaatttggaccgaa 20291723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 31 - 353
Target Start/End: Original strand, 39932017 - 39932341
Alignment:
Q  31 tttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39932017 tttactataaatatagaccttgtatgagacaaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 39932116  T
Q  129 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 228  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39932117 gagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattaaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagagactgagac 39932216  T
Q  229 tttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctc-tcc 327  Q
    ||| | |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| ||||||| |||| |||| ||||||| |||    
T  39932217 tttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatca-tatagtggaacggagggctgctctcttcc 39932315  T
Q  328 cacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    | || |||||||||||||||||||||    
T  39932316 cccatactaggtcaatttggaccgaa 39932341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 28998591 - 28998267
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  28998591 acttttactataaatatagactttgaatcagagtaaactttgagatagaggaggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtat 28998492  T
Q  128 agagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 227  Q
    ||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |     
T  28998491 agagtttgtcttttgcgaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgggg 28998392  T
Q  228 ctttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcc 327  Q
    |||| | |||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||| || |||| |||||| ||| |||||||  ||||||| |||||||    
T  28998391 ctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgcaacgttactcatca-tatggtgaaactgagggttgttctctcc 28998293  T
Q  328 cacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  28998292 cccagactaggtcaatttggaccgaa 28998267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 29004307 - 29003983
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  29004307 acttttactataaatatagactttgaatcagagtaaactttgagatagaggaggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtat 29004208  T
Q  128 agagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 227  Q
    ||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |     
T  29004207 agagtttgtcttttgcgaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgggg 29004108  T
Q  228 ctttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcc 327  Q
    |||| | |||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||| || |||| |||||| ||| |||||||  ||||||| |||||||    
T  29004107 ctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgcaacgttactcatca-tatggtgaaactgagggttgttctctcc 29004009  T
Q  328 cacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  29004008 cccagactaggtcaatttggaccgaa 29003983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 50 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 31425335 - 31425029
Alignment:
Q  50 ttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctt-ggaaaca 148  Q
    ||||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||    
T  31425335 ttgtatcaatgtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtatctttggcaaca 31425236  T
Q  149 aacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagt---ctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggt 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||     
T  31425235 aacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtgatctcttggttacggaaagagattgggactttgggtagaattaggc 31425136  T
Q  246 gggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaattt 345  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||| || |||||||||||||    
T  31425135 gggaggcttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggaaggctgctctctccc-catactaggtcaattt 31425037  T
Q  346 ggaccgaa 353  Q
    ||||||||    
T  31425036 ggaccgaa 31425029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 29 - 349
Target Start/End: Original strand, 31489859 - 31490175
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |  | |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31489859 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtata 31489958  T
Q  129 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 228  Q
    |  |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  31489959 g--tttgtctctttggaacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatttcttggttacgggaagagattgagac 31490056  T
Q  229 tttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctccc 328  Q
    ||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||||| |||    
T  31490057 tttggatagaattaggcggaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttattcatca-tatggtgaaacggagggctgctctc-ccc 31490154  T
Q  329 acagactaggtcaatttggac 349  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  31490155 ccagactaggtcaatttggac 31490175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 47451564 - 47451909
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  47451564 gcagatttgttccaaatattaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggcttaaacaagggtttggaa 47451663  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgag 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |         ||| |||||||    
T  47451664 tggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattag------tgtttaggattgag 47451757  T
Q  201 tctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||| | || ||||||| |||| |||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||| |    
T  47451758 tctcttggttacgggaagagattggggctttgggtaaaattaggcgggaaactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-t 47451856  T
Q  301 atagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  47451857 atagtgaaacgaatgactgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaa 47451909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 31735863 - 31735535
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttga----gatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31735863 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgaatgagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 31735764  T
Q  124 gtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt 223  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  |    
T  31735763 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaaggttgagtctcttggttacgggaagaggct 31735664  T
Q  224 gagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctct 323  Q
    | |||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| | || |||||| ||||||| | || |||| ||||||    
T  31735663 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatttctcttttgtaacgatactcatca-tatagtggatcggagggctgctct 31735565  T
Q  324 ctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31735564 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 31735535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 6823800 - 6824091
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggg-gctgaaacaagggtttaga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6823800 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactatttatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaggggggctgaaacaagggtttaga 6823899  T
Q  100 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattga 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  6823900 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattacgattga 6823999  T
Q  200 gtctctt-------ggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgt 284  Q
     ||||||       |||||||||||||||||| | |||| | |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  6824000 atctcttggttacgggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcggcagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 6824091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 2510666 - 2510339
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  2510666 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttataaaggcaaccacaaaactagggttt 2510567  T
Q  124 gtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt 223  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2510566 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctttggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagagatt 2510467  T
Q  224 gagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctct 323  Q
      |||||| | ||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| | || ||||||    
T  2510466 tggactttgggtagaattagg-cagagacttattcttgtaacccattgatttctctcttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggatggctgctct 2510369  T
Q  324 ctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2510368 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 2510339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Original strand, 6756470 - 6756795
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||   | |||| |||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6756470 acttttgctataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgaaatagaggggactgaaacaagggcttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 6756569  T
Q  128 agagtttgtctc-ttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgag 226  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||| ||||| |||||||||| |    
T  6756570 agagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag--tcttgattacgagaagagattggg 6756667  T
Q  227 actttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctct- 325  Q
    ||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |  ||||||||     
T  6756668 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggaagactgctctctc 6756767  T
Q  326 cccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  6756768 cccccagactaggtcagtttggaccgaa 6756795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 3 - 353
Target Start/End: Original strand, 47179627 - 47179979
Alignment:
Q  3 agatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttag 98  Q
    ||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||    
T  47179627 agatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttag 47179726  T
Q  99 aaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattg 198  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  47179727 aaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 47179826  T
Q  199 -agtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatc 297  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| |  | |||||    
T  47179827 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatc 47179925  T
Q  298 attatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    || |||||| |  | |||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  47179926 at-atagtggattggagggctgctctctccc-cagactaggtcagattggaccgaa 47179979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 30 - 353
Target Start/End: Original strand, 17318838 - 17319154
Alignment:
Q  30 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 129  Q
    |||||||||||||||||   |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17318838 ttttactataaatataggttttgtatcatagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtttag 17318937  T
Q  130 agtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagact 229  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||      | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  17318938 agtttgtctcttggcaacaaacactagggttggaaggttgattcaccttgggaaac------aggattgagtctcttggttacgggaacagattgggact 17319031  T
Q  230 ttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctccca 329  Q
    || | |||||||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||     
T  17319032 ttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacttattgatatctcttttgttaagttactcatcattatagtaaaacggagggctgctctctccc- 17319130  T
Q  330 cagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  17319131 tagactaggtcaatttggaccgaa 17319154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 31 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 21948526 - 21948227
Alignment:
Q  31 tttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21948526 tttactataaatatagaccttgtatcatactaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 21948427  T
Q  127 tagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgag 226  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   || |    
T  21948426 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagacgctggg 21948328  T
Q  227 actttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctc 326  Q
    ||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||| |||| |||||||||    
T  21948327 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctc 21948229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 28 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 31423212 - 31422930
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31423212 acttttactataaatataagcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatat 31423113  T
Q  128 agagtttgtctctt-ggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgag 226  Q
    |||||||||||||| || |  ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31423112 agagtttgtctctttggcattaaacactagggtttgaaagttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaagagattgag 31423013  T
Q  227 actttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaa 309  Q
    ||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  31423012 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgacatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaa 31422930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 29 - 353
Target Start/End: Original strand, 17324009 - 17324331
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| | || |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||  | ||| ||||    
T  17324009 cttttattataaatatagactttgtattagagtaaaccttgagatagagagggctaaaacaagggttcagaaaggccacaacaaaact--gatttttata 17324106  T
Q  129 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||  ||    
T  17324107 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgaatatgggaagagattggaac 17324206  T
Q  229 tttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctccc 328  Q
    ||| | || ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || || ||||||||    
T  17324207 tttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttattcatcattatagtgaaacggaaggctggtctctccc 17324306  T
Q  329 acagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
       ||||||||||||||||||||||    
T  17324307 catgactaggtcaatttggaccgaa 17324331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 27337280 - 27336954
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27337280 acttttactataaatatagaccttgtattaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 27337181  T
Q  124 gtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt 223  Q
     |||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |    
T  27337180 ttataga-tttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgggtctcttggttacgggaagaggct 27337082  T
Q  224 gagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctct 323  Q
    | |||||| | || ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||| ||||||| | || |||| ||||||    
T  27337081 gtgactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctct 27336984  T
Q  324 ctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27336983 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 27336954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 27339472 - 27339145
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||||||    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27339472 acttttactataaatatagaccttgtattaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggcttagaaaggcaacaataaaactagggttt 27339373  T
Q  124 gtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt 223  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  27339372 gtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaatactattacgattgagtctcttagttacgggaagaggct 27339273  T
Q  224 gagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctct 323  Q
    |||||||| | |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||| ||||||| | || |||| || |||    
T  27339272 gagactttgggtagaattaggcgggcgacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgatct 27339175  T
Q  324 ctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27339174 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 27339145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 69 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 4131676 - 4131393
Alignment:
Q  69 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggtt 168  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  4131676 gagatagagggggctgaaacaaggatttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 4131577  T
Q  169 gattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaaccca 268  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  || |||||| | |||||||||| | || ||||||||| ||||||||    
T  4131576 gatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgagaaacttattcttgtaaccca 4131478  T
Q  269 ttgata----tctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggac 349  Q
    ||||||    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4131477 ttgatatctttctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggac 4131393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 29 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 50248909 - 50248584
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| | ||| ||||    
T  50248909 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggagctgaaacaaaggtttaaaaagacaacaacaaaactatgatttatata 50248810  T
Q  129 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 228  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  50248809 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagatcgagac 50248710  T
Q  229 tttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttg--ctctctc 326  Q
    ||| | |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||  | |||||  |||||||    
T  50248709 tttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgacatctcttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacagatggttgttctctctc 50248611  T
Q  327 ccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||  ||||||||||||||||| |||||    
T  50248610 ccctagactaggtcaatttggtccgaa 50248584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 3 - 281
Target Start/End: Original strand, 47177276 - 47177559
Alignment:
Q  3 agatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttag 98  Q
    ||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||    
T  47177276 agatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttag 47177375  T
Q  99 aaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgat-t 197  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||      
T  47177376 aaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatgg 47177475  T
Q  198 gagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttt 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  47177476 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 47177559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 2949569 - 2949246
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    |||||||| |||||||||||  ||| |||  || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||    
T  2949569 acttttacaataaatatagatattgaatccgagaaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtat 2949470  T
Q  128 agagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 227  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||| |     
T  2949469 agagtttgtctcttgggaacaaacactaggggttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgtttacgagaatagattgggg 2949370  T
Q  228 ctttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcc 327  Q
    |||| | |||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||  |||| ||||||||||    
T  2949369 ctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcc 2949271  T
Q  328 cacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    | | ||||||||||||||||||||||    
T  2949270 c-ccgactaggtcaatttggaccgaa 2949246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 9463588 - 9463258
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9463588 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 9463489  T
Q  122 ttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagag 220  Q
    |||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9463488 ttgtatagagtttgtctcttaggagaaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagag 9463389  T
Q  221 attgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgc 320  Q
    ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||| | || |||||| ||||||| |  | |||| |||    
T  9463388 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttatccttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgc 9463291  T
Q  321 tctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  9463290 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaa 9463258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 78 - 351
Target Start/End: Original strand, 40133937 - 40134210
Alignment:
Q  78 ggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcacct 177  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40133937 ggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaacgaaggtttgtatagaatttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacct 40134036  T
Q  178 tggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatct 277  Q
    ||| ||| |||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| | || ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  40134037 tgggaaatactactaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgaggttttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatct 40134136  T
Q  278 cttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccg 351  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  40134137 cttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggatggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccg 40134210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 9459761 - 9459431
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9459761 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagtcaacaacaaaactagggt 9459662  T
Q  122 ttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagag 220  Q
    |||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9459661 ttgtatagagtttgtctcttaggagaaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagag 9459562  T
Q  221 attgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgc 320  Q
    ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||| | || |||||| ||||||| |  | |||| |||    
T  9459561 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttatccttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgc 9459464  T
Q  321 tctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  9459463 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaa 9459431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 29 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 14183923 - 14183604
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||   |||||||||||||||||    
T  14183923 cttttactataaatatagaccatgtatcagagtaaaccttgagatagagagggctgaaacaagggtttagaatg-caacac--aaactagggtttgtata 14183827  T
Q  129 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 228  Q
    ||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |     
T  14183826 gaggttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttggaaaacactattataattgagtctcttggttacgggaagagattagaat 14183730  T
Q  229 tttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctccc 328  Q
    ||| | |||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | || |||||||||||    
T  14183729 tttgggtagaattaggcggaagacttattcttgcaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctccc 14183630  T
Q  329 acagactaggtca-atttggaccgaa 353  Q
     ||||||||||||  |||||||||||    
T  14183629 ccagactaggtcagttttggaccgaa 14183604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 8347607 - 8347285
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 126  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  8347607 acttttactataaa-atagaccttgtatcagatgtaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgta 8347510  T
Q  127 tagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgag 226  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||||||| | ||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  8347509 tagagattg-ctcttggcaacaaacaccaaggtt--agggttgattcaccttaggaaacactattatgattgagtctcttgatcacgggaagagattgag 8347413  T
Q  227 actttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctc 326  Q
    |||||   |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||| |||||| ||    
T  8347412 actttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcattattatagtggaacggagggatgctctttc 8347313  T
Q  327 ccacagactaggtca-atttggaccgaa 353  Q
    ||  |||||||||||  |||||||||||    
T  8347312 ccctagactaggtcagttttggaccgaa 8347285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 77 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 46431996 - 46431720
Alignment:
Q  77 gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcacc 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46431996 gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaagtagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacc 46431897  T
Q  177 ttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatc 276  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  46431896 ttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggatgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttc 46431797  T
Q  277 tcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctct--cccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    || ||||||| | || |||||| ||||||| | || |||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  46431796 tc-tttgtaacgatactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccccagactaggtcaatttggaccgaa 46431720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 28 - 299
Target Start/End: Original strand, 48665114 - 48665392
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggc------tgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| || ||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48665114 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttaagatagagggggagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 48665213  T
Q  122 ttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggtta-cgggaagag 220  Q
    || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  48665214 ttatatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttaccgggaagag 48665313  T
Q  221 attgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcat 299  Q
      || |||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  48665314 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat 48665392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 3 - 353
Target Start/End: Original strand, 42922151 - 42922499
Alignment:
Q  3 agatttgttccaaattt-taagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 101  Q
    ||||||||||||||||| | || || ||||||||||||||||||||  |||||||| || |||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||     
T  42922151 agatttgttccaaatttatgagggatacttttactataaatatagattttgtatcagagtaaaccttaagatagagggggttgaaataagggtttagaa- 42922249  T
Q  102 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagt 201  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||    
T  42922250 gtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcctagcaacaaacactagggtt-gagg-ttgattcaccttgcgaaaaactattaggattgagt 42922346  T
Q  202 ctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatta 301  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42922347 ctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatta 42922446  T
Q  302 tagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaat-ttggaccgaa 353  Q
     |||| |||| |||  |||||||| || | |||||||||| | ||||||||||    
T  42922447 gagtggaacggaggactgctctctgcccccgactaggtcagtgttggaccgaa 42922499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 28 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 15669729 - 15669419
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 125  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| || | | |||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||| | | |||| || ||||| ||||||||||    
T  15669729 acttttactataaatacagaccttgtagcagatgtaaacattgggatagagggggctgaaaactagggtttggga-ggcagca-caaaagtagggtttgt 15669632  T
Q  126 atagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattga 225  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15669631 ataaagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattga 15669535  T
Q  226 gactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctct 325  Q
    |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||| |||| | || ||||||||    
T  15669534 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctctcgtaaagctactcatcattatagtggaacggatggctgctctct 15669435  T
Q  326 cccacagactaggtca 341  Q
    |||  |||||||||||    
T  15669434 ccccgagactaggtca 15669419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 76 - 353
Target Start/End: Original strand, 16432396 - 16432663
Alignment:
Q  76 agggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcac 175  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16432396 agggggcagaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt-----------gtctcttggcgacaaacactagggtttgagggttgattcac 16432484  T
Q  176 cttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatat 275  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||| | |||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  16432485 cttgggaaacattattaggattgaatctcttggttatgggaagagattgaaactttgggtagaattatgcgggacaattattcttgtaacccattgatat 16432584  T
Q  276 ctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccac-agactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  ||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  16432585 ctcttttgtaatgttactcatcattatagtgaaacggcggactgctctctcccccaagactaggtcaatttggaccgaa 16432663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 49495537 - 49495224
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||          ||||||||||||| ||    
T  49495537 acttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttataaatc--------aaactagggtttgcat 49495446  T
Q  128 agagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 227  Q
    | |||||| ||||||| ||||||||||| ||||   | ||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||| ||||| |||| ||||||||| |     
T  49495445 atagtttg-ctcttggcaacaaacactatggtt---gagttgattcaccttgggaaacactaataaaattgagtcttttggtcacggtaagagattgggg 49495350  T
Q  228 ctttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcc 327  Q
    |||| | |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||    
T  49495349 ctttgggtagaattaggcgggagactcattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacgaagggcttatctctcc 49495250  T
Q  328 cacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |  |||||| |||||||| |||||||    
T  49495249 ccaagactatgtcaatttagaccgaa 49495224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 28 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 18800907 - 18800600
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||    
T  18800907 acttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatacaaggggctgaaacaaaggtttagaa-gtcaacaagaaaactacggtttgtat 18800809  T
Q  128 agagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 227  Q
    |||||||| |||||||  ||||| ||||||||| |  |||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||   |    
T  18800808 agagtttg-ctcttggccacaaatactagggttgg--ggttgattcaccctgagaaacactattaggattgagtctctaggtcacgggtagagatttgaa 18800712  T
Q  228 ctttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcc 327  Q
    |||| | |||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||   ||||||||||    
T  18800711 ctttgggtagaattaggcgggacacttattcttgtatcccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaagcggagaactgctctctcc 18800612  T
Q  328 cacagactaggt 339  Q
    | || |||||||    
T  18800611 cccaaactaggt 18800600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 152 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 25248766 - 25248565
Alignment:
Q  152 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggaga 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  25248766 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctctcggttacaggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggaga 25248667  T
Q  252 cttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccg 351  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| |||  ||||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  25248666 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcataattatagtgaaacggaggactgctccctcccctagactaggtcaatttggaccg 25248567  T
Q  352 aa 353  Q
    ||    
T  25248566 aa 25248565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 8349414 - 8349077
Alignment:
Q  2 cagatttgttccaaattt-taagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttaga 99  Q
    |||||||||||||| ||| | || || | ||||| |||||||||||| ||||||| | | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8349414 cagatttgttccaattttatgagggataattttattataaatatagatcttgtattagatgcaaaccttgagatagagagggctgaaacaagggtttaga 8349315  T
Q  100 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattga 199  Q
    | | |||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |  |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  8349314 a-gtcaacaagaaaattaaggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggtttattcaccttgggaaacactattaggattga 8349219  T
Q  200 gtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcat 299  Q
    || |  |||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||    
T  8349218 gtttgatggtcacgggaagagattaggactttaggtagaattaggcgggtgacttattcttgtaactcattggtatctcttttgttaagttactcatcat 8349119  T
Q  300 tatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtca 341  Q
    ||||||| ||   ||||||| ||||||||  |||||| ||||    
T  8349118 tatagtggaatagagggttgttctctccccaagactatgtca 8349077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 165 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 6115304 - 6115116
Alignment:
Q  165 ggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaa 264  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||||||||| ||||    
T  6115304 ggttgattcaccttgaaaaacactattaggattgagtctcttggtcacatgaagagattgagactttgggtagaattaggcgggggacttattcttgtaa 6115205  T
Q  265 cccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6115204 ccaattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtgaaacggaatgctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 6115116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 170 - 353
Target Start/End: Original strand, 16429042 - 16429225
Alignment:
Q  170 attcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccat 269  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| | |||||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  16429042 attcaacttgggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagagattgggaatttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccat 16429141  T
Q  270 tgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16429142 tgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagcgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 16429225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 35 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 13125787 - 13125483
Alignment:
Q  35 ctataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg-tatagagtt 133  Q
    ||||||||| | ||||||||||| || |||  |||||| | |||||||||||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  13125787 ctataaatagaaaccttgtatcagagtaaaacttgagagaaagggggctgaaacaagggttaagaa-gccaacaaggaaactagggtttggtatagagtt 13125689  T
Q  134 tgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttag 233  Q
    || |||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||| || ||| ||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||| |    
T  13125688 tg-ctcttggcgacaaacactagggtt-gagg-ttgattcacattgggaaacgctgttaggattgaggctcttggtcaagggaagagattgggactttgg 13125592  T
Q  234 atagaattaggtggga-gacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacag 332  Q
     |||||||||||  || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || ||||||||| ||| |      
T  13125591 gtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagagttgctctccccccctt 13125492  T
Q  333 actaggtca 341  Q
    |||||||||    
T  13125491 actaggtca 13125483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 30790759 - 30790461
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttaga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||    
T  30790759 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttaga 30790660  T
Q  100 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattga 199  Q
    ||  |||  |  ||||||||||||   ||||| || |||||  ||   | |||||||||||    |||||||| ||||||| ||||||| ||| ||| ||    
T  30790659 aa--caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-ga 30790569  T
Q  200 gtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtg-ggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatca 298  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||||||||   |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30790568 gtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca 30790469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 3 - 353
Target Start/End: Original strand, 27916415 - 27916765
Alignment:
Q  3 agatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctg--aaacaagggtttaga 99  Q
    ||||||||||||| |||  || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||||| | || | ||    |||||||||||||||    
T  27916415 agatttgttccaattttggagggatacttttactataaatatagacattgtatcaaatgtaaactgtgagaaacagagagccagaaaacaagggtttaga 27916514  T
Q  100 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattga 199  Q
    | | || ||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  27916515 a-gccagcaagaaaactagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttggaa--ttgattcaccttggaaaacactattagaattga 27916608  T
Q  200 gtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattagg-tgggagacttattctagtaacc--cattgatatctcttttgtaaagttattcat 296  Q
    |||||||||| ||  |||||||||| |||||| | | |||||||| | | ||||| |||||  |||||  | |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  27916609 gtctcttggtcacatgaagagattgtgactttgggtggaattaggtttgaagactaattcttttaaccttctttgatatctc-tttgtaaagttactcat 27916707  T
Q  297 cattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaat-ttggaccgaa 353  Q
    | |||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  27916708 cgttatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaa 27916765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Original strand, 16231517 - 16231641
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16231517 gcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtctagaa 16231616  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgt 125  Q
    | ||||||| |||||||||||||||    
T  16231617 aagcaacaagaaaactagggtttgt 16231641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 164 - 353
Target Start/End: Original strand, 16561545 - 16561736
Alignment:
Q  164 gggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtggga-gacttattctagt 262  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||  |||| || ||||||||||||| | ||||| |||||  || |||||||||| ||    
T  16561545 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggccacggaaatagattgagactttgggtagaaataggtttgaagacttattcttgt 16561644  T
Q  263 aacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaat-ttggaccgaa 353  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  16561645 aaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattacagtggaacaaagggttgctctctcccatagactaggtcagtattggaccgaa 16561736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 152 - 353
Target Start/End: Original strand, 16231630 - 16231830
Alignment:
Q  152 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggag 250  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| |||||    
T  16231630 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagcctttgggtagaattaggcgggag 16231729  T
Q  251 acttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggacc 350  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| |  | ||||||| |||||| |  | |||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  16231730 acttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggacc 16231827  T
Q  351 gaa 353  Q
    |||    
T  16231828 gaa 16231830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 35 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 26520449 - 26520205
Alignment:
Q  35 ctataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggggg-ctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagt 132  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  26520449 ctataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagaggggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagt 26520351  T
Q  133 ttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttg------gttacgggaagagattgag 226  Q
    ||| ||||||| ||||||||||| | || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      || |||||||||||||| |    
T  26520350 ttg-ctcttggcaacaaacactaagatt-gagg-ttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggtcacagtcacgggaagagattggg 26520254  T
Q  227 actttagatagaattagg-tgggagacttattctagtaacccattgata 274  Q
    ||||| | |||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  26520253 actttgggtagaattaggtttggaaacttattcttgtaacccattgata 26520205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 167 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 30738830 - 30738653
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattagg-tgggagacttattctagtaac 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||| || ||| | |||||||||| | | ||||||||||| |||||    
T  30738830 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcataggaagagattgggattttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 30738731  T
Q  266 ccattgatatctcttttgtaaagttattcatc--attatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtca 341  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||| ||||||||| | || |||||||||    
T  30738730 cctttgatgtctcttttgtaaagttactcatcatattatagtgaaacggagggatgctctctcacccatactaggtca 30738653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 182 - 353
Target Start/End: Original strand, 23785936 - 23786106
Alignment:
Q  182 aaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctctt 280  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| |    
T  23785936 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-t 23786034  T
Q  281 ttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||| |||| ||||||  |||||| | || |||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  23786035 ttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaa 23786106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 177 - 353
Target Start/End: Original strand, 51757623 - 51757797
Alignment:
Q  177 ttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatc 276  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||| ||    
T  51757623 ttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctatcgatttc 51757722  T
Q  277 tcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||| |||| | || ||| ||| |||||| |  | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  51757723 tcttt-gtaacgatactcaccat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 51757797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 167 - 343
Target Start/End: Original strand, 155788 - 155963
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattagg-tgggagacttattctagtaac 265  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| | | ||| | ||||| |||||    
T  155788 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggtcacgggaagagattgggactttggatagaattaggtttgaagagtaattcttgtaac 155887  T
Q  266 ccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaat 343  Q
    |  ||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| | || ||||||||||| || |||||||||||    
T  155888 cttttgttatctc-tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctccc-caaactaggtcaat 155963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 167 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 26613440 - 26613265
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattagg-tgggagacttattctagtaac 265  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||| || ||||||||||||| |||| | |||||||||| | | ||||||||||| |||||    
T  26613440 ttgattcaccttgggaaacactattcggattgagtcacttggtcacaggaagagattgaggctttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 26613341  T
Q  266 ccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtca 341  Q
    || ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||  || | | ||||||||| |||| |||||||    
T  26613340 cctttgatatctcttttggaaagttactaatcattatagtggaacagagagcttctctctcccccagattaggtca 26613265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 30 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 25248850 - 25248756
Alignment:
Q  30 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 124  Q
    |||| ||| |||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25248850 tttttctagaaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 25248756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 108 - 306
Target Start/End: Original strand, 28279292 - 28279487
Alignment:
Q  108 aacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgga-aaacactattatgattgagtctctt 206  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||  |||||||||||||||| |  | ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||  ||||    
T  28279292 aacaaaattagggtttgta--gagtttg-ctcttgacaacaaacactagggttgg--gattgattccccttggagaaacactattaggattgagcttctt 28279386  T
Q  207 ggttacgggaagagattgagactttagatagaattagg-tgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagt 305  Q
    ||| |||||||||||||| |||||| | |||||||||| | | ||||| ||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28279387 ggtcacgggaagagattgggacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaactcattggcatctcttttgtaaagttactcatcattatagt 28279486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 226 - 353
Target Start/End: Original strand, 23816027 - 23816153
Alignment:
Q  226 gactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctct 325  Q
    |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||| || | || |||| ||||||||    
T  23816027 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tataatggatcggagggatgctctct 23816125  T
Q  326 cccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||    
T  23816126 cccccatactaggtcaatttggaccgaa 23816153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 167 - 314
Target Start/End: Original strand, 14353047 - 14353193
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttgga-aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt-gagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaa 264  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||| | |||||||||||  || ||| ||||| ||||    
T  14353047 ttgattcaccttggagaaacactattaggatttagtctcttggtcacggaaagagattcgagactttgggtagaattaggtttgaaact-attcttgtaa 14353145  T
Q  265 cccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaag 314  Q
    ||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14353146 ccctttgaaatct--tttgtaaagttattcatcattatagtggaacgaag 14353193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 171 - 324
Target Start/End: Original strand, 43104245 - 43104400
Alignment:
Q  171 ttcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtggga-gacttatt-ctagtaaccca 268  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| || |||||| ||||| ||||| | |||||||||||  || || || || || |||||||     
T  43104245 ttcaccttggaaaacactattagaattgagtcttttggtcacaggaagacattgaaactttgggtagaattaggtttgaagatttttttcttgtaaccct 43104344  T
Q  269 ttgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctc 324  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || | |||||||    
T  43104345 ttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagagatgctctc 43104400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Original strand, 15916566 - 15916659
Alignment:
Q  261 gtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaa-tttggaccgaa 353  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  15916566 gtaacccattgatatctcttttataaagttactcgtcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaattttggaccgaa 15916659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 85 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 26332836 - 26332699
Alignment:
Q  85 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaa 184  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| || |||||||||||| | |||    
T  26332836 aaacaagggtttagaa-gccaaca-caaaaatagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagg-tttg-ggtttgattcaccttcggaaa 26332744  T
Q  185 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagact 229  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| |||  || |||||||||||    
T  26332743 cactattaggatttagtctcttggtcacgaaaatagattgagact 26332699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Original strand, 23783467 - 23783533
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactt 67  Q
    |||||||||||  | |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23783467 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactt 23783533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 35 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 13127959 - 13127837
Alignment:
Q  35 ctataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 134  Q
    ||||||||||| ||||||||||  || |||| || ||| |||||||  |||||||||||||||| ||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  13127959 ctataaatataaaccttgtatcggagtaaacctttagagagaggggt-tgaaacaagggtttag-aagccaacaagaaaagtagggtttatatagagttt 13127862  T
Q  135 gtctcttggaaacaaacactagggtt 160  Q
      || |||| ||||||||||||||||    
T  13127861 -ccttttggcaacaaacactagggtt 13127837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 26613603 - 26613503
Alignment:
Q  3 agatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt--gagatagagggggctg-aaacaagggtttaga 99  Q
    ||||||||||||| |||| || ||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26613603 agatttgttccaatttttgagggattcttttgctataaatatagaccttgtatcagatgaaaccttgagagatagagggggctgaaaacaagggtttaga 26613504  T
Q  100 a 100  Q
    |    
T  26613503 a 26613503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 26332688 - 26332624
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagacttt 231  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  26332688 ttgattcaccttcggaaacactattaggatttagtctcttggtcacgagaagagattgagacttt 26332624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 277
Target Start/End: Original strand, 49959129 - 49959241
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttgga-aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt-gagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaa 264  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| | | ||||||||| |||||||| |||| ||||||||  || ||| |||||  |||    
T  49959129 ttgattcaccttggagaaacactattaggaatgagtctcttggtcatgagaagagattcgagactttggataaaattaggtttgaaactgattcttttaa 49959228  T
Q  265 cccattgatatct 277  Q
    ||| |||||||||    
T  49959229 ccctttgatatct 49959241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 230
Target Start/End: Original strand, 14997039 - 14997088
Alignment:
Q  181 aaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactt 230  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14997039 aaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagagattgagactt 14997088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 167 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 21353545 - 21353373
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttggaaaac--actattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattagg-tgggagacttattctagta 263  Q
    ||||||||||||| | |||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || ||| || | |||||||||| | | ||||| ||||| |||    
T  21353545 ttgattcaccttgaacaacgcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 21353447  T
Q  264 acccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtca 341  Q
    || ||   ||||||| |||||||||  | |||||||||||||| | || || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  21353446 actca---atatctc-tttgtaaagaaactcatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 21353373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Original strand, 49687456 - 49687496
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaa 41  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49687456 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaa 49687496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 6115383 - 6115344
Alignment:
Q  62 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 101  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6115383 aaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 6115344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 272 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 13127782 - 13127715
Alignment:
Q  272 atatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggt 339  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| || | ||||||||||  ||||||||||    
T  13127782 atatctcttttgtaaagttactcatcattatagtagaacggagagctgctctctcctccagactaggt 13127715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 80
Target Start/End: Original strand, 16431017 - 16431096
Alignment:
Q  2 cagatttgttccaaattt-taagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggg 80  Q
    |||||||||||||| ||| | || || |||||||||||||||||||   |||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  16431017 cagatttgttccaattttatgagggatacttttactataaatataggttttgtatcagagcaaaccttgagatagagggg 16431096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 4144882 - 4144817
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttgga--aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactt 230  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  4144882 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactgggactt 4144817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 300 - 353
Target Start/End: Original strand, 13358787 - 13358840
Alignment:
Q  300 tatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||||| | || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13358787 tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 13358840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 220
Target Start/End: Original strand, 2232580 - 2232635
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttgga--aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 220  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  2232580 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 2232635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 30738963 - 30738890
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaa 101  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||| |  |||| |||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||    
T  30738963 cttttactataaacatagtccttgtatcagatgaaaccttgagatacaggtgactgaaaacaagggtttagaaa 30738890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 57
Target Start/End: Original strand, 43104102 - 43104131
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatca 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43104102 acttttactataaatatagaccttgtatca 43104131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 46432066 - 46432037
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatca 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46432066 acttttactataaatatagaccttgtatca 46432037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 57
Target Start/End: Original strand, 49958963 - 49959016
Alignment:
Q  4 gatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatca 57  Q
    |||||||||||||||||  | ||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  49958963 gatttgttccaaattttgtgggatgcttttgctataaatatagaccttgtatca 49959016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 167 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 2401420 - 2401365
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttggaaaa--cactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 220  Q
    ||||||||||||| | ||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  2401420 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 2401365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 194 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 3091276 - 3091240
Alignment:
Q  194 gattgagtctcttggttacgggaagagattgagactt 230  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  3091276 gattgagtctcttggtaacaggaagagattgagactt 3091240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 167 - 220
Target Start/End: Original strand, 9526449 - 9526504
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttggaaaa--cactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 220  Q
    ||||||||||||| | ||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  9526449 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 9526504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 167 - 220
Target Start/End: Original strand, 25134054 - 25134109
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttggaaaa--cactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 220  Q
    ||||||||||||| | ||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  25134054 ttgattcaccttgaacaaatcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 25134109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 280 - 340
Target Start/End: Original strand, 32261337 - 32261397
Alignment:
Q  280 tttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtc 340  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||| || |||| |||| ||| |||| ||||||    
T  32261337 tttgtaaagttattcatcattttagtggaacggagagttgttctcccccccagagtaggtc 32261397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 167 - 306
Target Start/End: Original strand, 46783126 - 46783268
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttggaaaa--cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgaga-ctttagatagaattaggtggga-gacttattctagt 262  Q
    ||||||||||||| | ||  |||| ||| ||| ||| |||||||| ||  ||||||||| ||| |||| | |||||||||||  || |||| ||||| ||    
T  46783126 ttgattcaccttgaacaaagcactgttaggatagagactcttggtcacatgaagagattcagaactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgt 46783225  T
Q  263 aacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtg 306  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||    
T  46783226 aaccctttgatatct-ttttgtaaagaaactcatcattatagtg 46783268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 147)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 11170300 - 11170651
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11170300 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 11170399  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  11170400 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgcggattgattcaccttgggaaacactattaggattgag 11170499  T
Q  201 tctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatt 300  Q
    | ||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |    
T  11170500 tgtcttggttacgggaagaggctgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-t 11170598  T
Q  301 atagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  11170599 atagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgggccgaa 11170651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 4308615 - 4308291
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4308615 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 4308516  T
Q  128 agagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 227  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  4308515 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttggga 4308416  T
Q  228 ctttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcc 327  Q
    |||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  4308415 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcc 4308317  T
Q  328 cacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |  |||||||||||||||||||||||    
T  4308316 cctagactaggtcaatttggaccgaa 4308291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 3859424 - 3859774
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3859424 gcagatttgtttcaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 3859523  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  3859524 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 3859623  T
Q  201 tctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||   || |||||| |    
T  3859624 tctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatttctc-tttgtaacaatactcatca-t 3859721  T
Q  301 atagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||| | || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3859722 atagtggatcgtagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 3859774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 38889935 - 38890287
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggttt 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  38889935 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtat---agcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggttt 38890031  T
Q  97 agaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgat 196  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  38890032 agaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggat 38890131  T
Q  197 tgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcat 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  38890132 tgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcat 38890231  T
Q  297 cattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    || ||||||| | || |||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  38890232 ca-tatagtggatcggagggctgctctctcccctatactaggtcaatttggaccgaa 38890287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 45882835 - 45883187
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45882835 gcagatttgttgaaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaactatgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 45882934  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  45882935 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagattttgtctctttggaacaaacaataaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 45883034  T
Q  201 tctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatt 300  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| |    
T  45883035 tctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatca-t 45883133  T
Q  301 atagtgaaacgaagggttgctctctcccac-agactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||| |||| |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  45883134 atagtggaacggagggctgctctctccccctagactaggtcaatttggaccgaa 45883187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 18162560 - 18162907
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaa-agcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttaga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  18162560 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcatgagtaaacttggagatagaggga--tgaaacaagggtttaga 18162657  T
Q  100 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  18162658 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttttgaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattga 18162757  T
Q  200 gtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaa-gttattcatca 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||    
T  18162758 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatttattttgtaaacgttactcatca 18162857  T
Q  299 ttatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggac 349  Q
     |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18162858 -tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggac 18162907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Original strand, 1313333 - 1313656
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  1313333 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagg-tttacaatggcaacaacaaaactagggtttgtat 1313431  T
Q  128 agagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 227  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  1313432 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagagattggga 1313531  T
Q  228 ctttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcc 327  Q
    |||| | |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  1313532 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcc 1313630  T
Q  328 cacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  1313631 cccagactaggtcaatttggaccgaa 1313656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 18099531 - 18099180
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt-gagatagagggggctgaaacaagggtttaga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18099531 gcagatttgttccaaattttaagcgagacttttactataa-tatagaccttgtatcagagtaaacttgagagatagagggggctgaaacaagggtttaga 18099433  T
Q  100 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattga 199  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  18099432 atggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 18099333  T
Q  200 gtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcat 299  Q
    |||||||||||||||||||||  || |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||     
T  18099332 gtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacattactcatca- 18099234  T
Q  300 tatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||||| |||| |||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  18099233 tatagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatatggaccgaa 18099180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 29 - 353
Target Start/End: Original strand, 3314608 - 3314932
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3314608 cttttactataaatatagatattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtata 3314707  T
Q  129 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 228  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | |    
T  3314708 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggggc 3314807  T
Q  229 tttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctccc 328  Q
    ||| | || ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  3314808 tttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaattattcatcattatagtgaaacggagggctgctctctccc 3314907  T
Q  329 acagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
     || |||||||||||||||||||||    
T  3314908 ccaaactaggtcaatttggaccgaa 3314932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 5191549 - 5191898
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5191549 gcagatttgttccaaattttaagggaaacttttactataaatatagaccttgtatctaagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 5191648  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  5191649 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 5191748  T
Q  201 tctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||| | |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||| | || |||||| |    
T  5191749 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactcattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatca-t 5191846  T
Q  301 atagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||| | |  |||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5191847 atagtggatcagagggctgttctctccc-cagactaggtcaatttggaccgaa 5191898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 10956388 - 10956037
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||| || |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10956388 gcagatttgttccaaattttaagcaatttttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaacatgaagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 10956289  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgag 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  10956288 tggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacattattaggattgag 10956189  T
Q  201 tctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||| |    
T  10956188 tctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcatca-t 10956090  T
Q  301 atagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||| |||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  10956089 atagtggaacggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaa 10956037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 18097262 - 18096910
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt-gagatagagggggctgaaacaagggtttaga 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18097262 gcagatttgtttcaaattttaagcgagacttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaacttgagagatagagggggctcaaacaagggtttaga 18097163  T
Q  100 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattga 199  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  18097162 atggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 18097063  T
Q  200 gtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcat 299  Q
    |||||||||||||||||||||  || |||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||| || ||||||||| |||| ||||||     
T  18097062 gtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatttcccttttgtaacgttactcatca- 18096964  T
Q  300 tatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||||| |||| || | |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  18096963 tatagtggaacggagagctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaa 18096910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 32264404 - 32264050
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagca----aactttgagatagagggggctgaaacaagggttt 96  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32264404 gcagatttgtttcaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaattaactttgagatagagggggctcaaacaagggttt 32264305  T
Q  97 agaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgat 196  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  32264304 agaaaggcaacaacaaaactaaagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggat 32264205  T
Q  197 tgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttattca 295  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||  ||||| | |||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  32264204 tgagtctcttggttatgggaagaggctggaactttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttttgtaaagttactca 32264105  T
Q  296 tcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggacc 350  Q
    ||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  32264104 tcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtctatttggacc 32264050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 53917998 - 53917674
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  53917998 acttttactataaatatagaccttgaatcagattaaaccttgagatggagggggctgaaacaatggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtat 53917899  T
Q  128 agagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 227  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  53917898 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggga 53917799  T
Q  228 ctttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcc 327  Q
     ||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  53917798 ttttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcc 53917700  T
Q  328 cacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    | ||||||||||||  ||||||||||    
T  53917699 cccagactaggtcagattggaccgaa 53917674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 29 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 1627016 - 1626693
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1627016 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 1626917  T
Q  129 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 228  Q
    |||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  1626916 gagtttatctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacggggagagattgggac 1626817  T
Q  229 tttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctccc 328  Q
    ||| | |||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||| |    
T  1626816 tttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcgc 1626718  T
Q  329 acagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
     ||||||||||| ||||||||||||    
T  1626717 ccagactaggtcgatttggaccgaa 1626693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 10958684 - 10958333
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||| || |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10958684 gcagatttgttccaaattttaagcaatttttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaacataaagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 10958585  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgag 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  10958584 tggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 10958485  T
Q  201 tctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatt 300  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||| || ||| |    
T  10958484 tctcttggttatgggaagaggctgacactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcttca-t 10958386  T
Q  301 atagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10958385 atagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 10958333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 22114666 - 22114315
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22114666 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagaaggggctgaaacaagggtttagaa 22114567  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgag 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  22114566 aggcaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 22114467  T
Q  201 tctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||  || || ||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |    
T  22114466 tctcttggttacgggaagaggctgggattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-t 22114368  T
Q  301 atagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||| |||| || |||| || |||||||| || || | || |||||||||||||    
T  22114367 ataatgaatcggagggatgatctctcccccaaacaaagtaaatttggaccgaa 22114315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 6 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 28761784 - 28761446
Alignment:
Q  6 tttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggca 105  Q
    |||||||||| || | || || ||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  28761784 tttgttccaatttatgagggatacttttactataaatatagactttgcatcagagtaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaaagaca 28761685  T
Q  106 acaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctct 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28761684 acaacaaaactagggtttgtatatagtttg-ctcttggcaacaaacacaagggtttgagagttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctct 28761586  T
Q  206 tggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagt 305  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28761585 tggttacaggaagatattgagactttaggtagaattaggcgggatacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagt 28761486  T
Q  306 gaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaattt 345  Q
    |||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28761485 gaaacggaggactgctctctcccccagactaggtcaattt 28761446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 15780756 - 15781126
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15780756 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 15780855  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt-----------tgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacacta 189  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15780856 tggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacacta 15780955  T
Q  190 ttatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgata----tctcttttgta 285  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||    
T  15780956 ttacgattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttcggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatatttctcttttgta 15781055  T
Q  286 aagttattcatcattatagtgaaacgaaggg---ttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  15781056 aagttatttatcattatagtggaacgaagggcgcctgctctctcccccacactaggtcaatttggaccgaa 15781126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 24979603 - 24979955
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24979603 gcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatataccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 24979702  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgag 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  24979703 agacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaatactattaggattgag 24979802  T
Q  201 tctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaa-gttattcatcat 299  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||| |||||  ||| |||||| ||||||||| |||| ||||||     
T  24979803 tctcttggttacggaaagagattgagactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacaaattaatatcttttttgtaaacgttactcatca- 24979901  T
Q  300 tatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||||||||| | || ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  24979902 tatagtgaaacggatggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggatcgaa 24979955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 51727340 - 51727017
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  51727340 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtatgtat 51727241  T
Q  128 agagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 227  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||    
T  51727240 agagtttgtctctttggaacaaacact-gggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggtaagaggctgaga 51727142  T
Q  228 ctttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcc 327  Q
    |||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||| | || ||||||||||    
T  51727141 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggatggctgctctctcc 51727043  T
Q  328 cacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  51727042 cccagactaggtcaatttggaccgaa 51727017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 29 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 43423796 - 43423473
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43423796 cttttactataaatatagacattgtatcactgtaaaccttgagaaagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 43423697  T
Q  129 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  43423696 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggc 43423597  T
Q  229 tttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctccc 328  Q
    ||| | |||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||  || | |||||||||||    
T  43423596 tttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaactgagagctgctctctccc 43423498  T
Q  329 acagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
      |||||||||||||||||||||||    
T  43423497 tgagactaggtcaatttggaccgaa 43423473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 10084754 - 10084399
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggttt 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    |||||||||||| |||||||||||    
T  10084754 gcagatttgttccaaattttaagcgatgcttttactataaatatagaccttgtatcggagcaaactttgagagagatagagggggctggaacaagggttt 10084655  T
Q  97 agaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgat 196  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  10084654 agaaaggcaataacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggat 10084555  T
Q  197 tgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcat 296  Q
     |||||||||||||||||||||||  || |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  10084554 cgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccgttgatttctcttttgtaacgttactcat 10084455  T
Q  297 cattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    || ||||||| | || |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  10084454 ca-tatagtggatcggagggctgctctctccccaagactaggtcaatttggaccgaa 10084399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Original strand, 43228214 - 43228538
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43228214 actttcactataaatatagacattgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagcgtttgtat 43228313  T
Q  128 agagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 227  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||    
T  43228314 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 43228413  T
Q  228 ctttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcc 327  Q
    |||| | ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||| | || |||| ||||||||||    
T  43228414 ctttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcc 43228512  T
Q  328 cacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  43228513 cccagactaggtcaatttggaccgaa 43228538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 48362031 - 48361681
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  48362031 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaactttgagatacagggggctgaaacaagg-tttagaa 48361933  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgag 200  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  48361932 tgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaaaactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgag 48361833  T
Q  201 tctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatt 300  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | |||| | |||||||||| || |||||| |||| ||||| |||||| |||||||||| || |||| |||| | |    
T  48361832 tctcttagttacgggaagagattggggcttttggtagaattaggcggaagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgcaacgttactcat-aat 48361734  T
Q  301 atagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||| ||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  48361733 atagtaaaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggatcgaa 48361681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 28 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 53915830 - 53915514
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  53915830 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttaagatagagggggctgaaacaagggtttaggatgacaacaacaaaactagggtttgtat 53915731  T
Q  128 agagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 227  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  53915730 agattttgtctcttgggaacaaacactagggtttgatggttgatttaccttgtgaaacattattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggga 53915631  T
Q  228 ctttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcc 327  Q
    |||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  53915630 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaatgttactcatcatt-tagtgaaacggagggctgctctctcc 53915532  T
Q  328 cacagactaggtcaattt 345  Q
    | ||||||||||||||||    
T  53915531 cccagactaggtcaattt 53915514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 6063809 - 6063456
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttag 98  Q
    ||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  6063809 gcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttag 6063710  T
Q  99 aaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  6063709 aaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcttttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 6063610  T
Q  199 -agtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatc 297  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| |  | |||||    
T  6063609 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatc 6063511  T
Q  298 attatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    || |||||| |  | |||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  6063510 at-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaa 6063456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 27101519 - 27101191
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaact----ttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 123  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27101519 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaattgagatagagatagaggaggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 27101420  T
Q  124 gtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt 223  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  27101419 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagaat 27101320  T
Q  224 gagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctct 323  Q
    | |||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||| |||| | || ||||||    
T  27101319 gggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgcaacgttactcatca-tatagtggaacggatggctgctct 27101221  T
Q  324 ctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  27101220 ctcccccagaataggtcaatttggaccgaa 27101191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 30 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 43421747 - 43421425
Alignment:
Q  30 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 129  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43421747 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaaggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 43421648  T
Q  130 agtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagact 229  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |  |    
T  43421647 tgtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaaaagattggggat 43421548  T
Q  230 ttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctccca 329  Q
    || | |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||  | || |||||||||||     
T  43421547 ttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacagatggctgctctctcccc 43421449  T
Q  330 cagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  43421448 cagactaggtcaatttggaccgaa 43421425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 6066158 - 6065876
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggggg-ctgaaacaagggtttaga 99  Q
    ||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6066158 gcagatttgttacagattttaagcagaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggggggctgaaacaagggtttaga 6066059  T
Q  100 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgatt-g 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |    
T  6066058 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagattttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgg 6065959  T
Q  199 agtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttt 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  6065958 agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 6065876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 29 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 28102335 - 28102015
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||  | |||||| | || || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28102335 cttttactataaatataagcgttgtattagagtaacccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 28102236  T
Q  129 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  28102235 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacgctattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggc 28102136  T
Q  229 tttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctccc 328  Q
    ||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||| | || |||||||||||    
T  28102135 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttacttatca-tatagtggaacggatggctgctctctccc 28102037  T
Q  329 acagactaggtcaatttggacc 350  Q
      |  |||||||||||||||||    
T  28102036 caaagctaggtcaatttggacc 28102015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Original strand, 43226009 - 43226332
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  43226009 actttcactataaatatagacattgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactacg-tttgtat 43226107  T
Q  128 agagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 227  Q
    |||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||    
T  43226108 agagtttgtctcgttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 43226207  T
Q  228 ctttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcc 327  Q
    |||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||| | || |||| ||||||||||    
T  43226208 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcc 43226306  T
Q  328 cacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |  |||||||||||||||||||||||    
T  43226307 cctagactaggtcaatttggaccgaa 43226332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 26720444 - 26720794
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26720444 gcagatttgttccaaattttaagcaatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaataagggtttagaa 26720543  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||| |||||||    
T  26720544 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggtta-actattaggattgag 26720642  T
Q  201 tctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatt 300  Q
    | ||||||||||||||||||  || |||||| | |||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| | || |||||| |    
T  26720643 tttcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttttaaccctttgatttctcttttgtaacgatactcatca-t 26720741  T
Q  301 atagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||| |||| | |  |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  26720742 atagtggaacggatgactgctctctcccctagattaggtcaatttggaccgaa 26720794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Original strand, 51943294 - 51943617
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51943294 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatagagggtgctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 51943393  T
Q  128 agagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 227  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |     
T  51943394 agagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattgggg 51943493  T
Q  228 ctttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcc 327  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||  |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| | || ||||||||||    
T  51943494 ctttaggtagaattaggcgggagactt-ttcttgtaactcattgacgtctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggatggctgctctctcc 51943591  T
Q  328 cacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    | || |||||||||||||||||||||    
T  51943592 cccatactaggtcaatttggaccgaa 51943617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 29 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 5927097 - 5926774
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||   | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  5927097 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagagggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagagtttgtata 5926998  T
Q  129 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 228  Q
    |||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5926997 gagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcgccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 5926898  T
Q  229 tttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctccc 328  Q
    ||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||| |||| ||||||| | |  |||||||||||    
T  5926897 ttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatttatatatcttttgtaaggttactcatca-tataatgaaacggatgactgctctctccc 5926799  T
Q  329 acagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  5926798 gcagactaggtcaatttggaccgaa 5926774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 35 - 306
Target Start/End: Original strand, 6561740 - 6562012
Alignment:
Q  35 ctataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6561740 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 6561839  T
Q  135 gtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttaga 234  Q
    ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |     
T  6561840 gtctctttggaacaaacactggggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttggg 6561939  T
Q  235 tagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttattcatcattatagtg 306  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||    
T  6561940 tagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctctttttgtaaggtaactcatcattatagtg 6562012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 5 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 10191670 - 10191320
Alignment:
Q  5 atttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagataga----gggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||    |||||||| |||||||||||||||    
T  10191670 atttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcggagcaaactttgagagagataaagggggctggaacaagggtttagaa 10191571  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgag 200  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||    
T  10191570 aggcaataacaaaactagggtttttatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatcgag 10191471  T
Q  201 tctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatt 300  Q
    |||||||||||| |||||||  || |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||| |||| |||||| |    
T  10191470 tctcttggttacaggaagaggctg-gactttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccgttcatttctcttttgtaacgttactcatca-t 10191373  T
Q  301 atagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||| | || |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  10191372 atagtggatcggagggctgctctctccctaagactaggtcaatttggaccgaa 10191320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 5522976 - 5522637
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5522976 gcagatttgtttcaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 5522877  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||           ||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  5522876 aggcaacaacaaaactagggtttgt-----------ctcttcggaacaaacactcgggtttgtgggttgatttaccttgggaaacactattaggattgag 5522788  T
Q  201 tctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| | || |||||| |    
T  5522787 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatca-t 5522690  T
Q  301 atagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||| | || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5522689 atagtggatcggagggctgctctctcccgcagactaggtcaatttggaccgaa 5522637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Original strand, 35777317 - 35777587
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35777317 gcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagacattgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 35777416  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgatt-ga 199  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||    
T  35777417 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 35777516  T
Q  200 gtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccatt 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  35777517 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcatt 35777587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 50493895 - 50494246
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||||||||| || |||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50493895 gcagatttgttacagattttaagcaggactttcactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 50493994  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattg-a 199  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  50493995 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 50494094  T
Q  200 gtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcat 299  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| |  | |||||||    
T  50494095 gtctcttggttacgggaagggattgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcat 50494193  T
Q  300 tatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
     |||||| |  | |||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  50494194 -atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaa 50494246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 29 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 880785 - 880462
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  880785 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggggtctgaaacaagagtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtata 880686  T
Q  129 gagtttgtctctt-ggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 227  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |     
T  880685 gagttcgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagcattgagtctcttggttacggaaagagattgggg 880586  T
Q  228 ctttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcc 327  Q
    |||| | |||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| | |||| ||||||||||    
T  880585 ctttgggtagaattagacgggagagttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtaaaatggagggctgctctctcc 880487  T
Q  328 cacagactaggtcaatttggaccga 352  Q
    |  ||||||||||||||||||||||    
T  880486 cctagactaggtcaatttggaccga 880462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 28 - 349
Target Start/End: Original strand, 25533357 - 25533685
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagg 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25533357 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagg 25533456  T
Q  120 gtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaaga 219  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  25533457 gtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaaga 25533556  T
Q  220 gattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttg 319  Q
    |  ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||| | || |||| ||    
T  25533557 ggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctg 25533655  T
Q  320 ctctctcccacagactaggtcaatttggac 349  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  25533656 ctctctcccctagactaggtcaatttggac 25533685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 4104233 - 4103906
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4104233 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 4104134  T
Q  124 gtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt 223  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |    
T  4104133 gtatagagcttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 4104034  T
Q  224 gagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctct 323  Q
    | |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| | || |||||| ||||||| | || |||| |||| |    
T  4104033 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatca-tatagtggatcggagggctgctat 4103936  T
Q  324 ctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4103935 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 4103906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 9604946 - 9604617
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  9604946 actttcactataaatatagaccttgtattagagaaaactctgagagagagatagagggggctgaaacaagg-tttagaaaggcaacaacaaaactaggat 9604848  T
Q  122 ttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaga 221  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||     
T  9604847 ttgtatagagtttgtctctttgaaagaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagg 9604748  T
Q  222 ttgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgct 321  Q
    |||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||| | || |||| ||||    
T  9604747 ttgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgct 9604649  T
Q  322 ctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  9604648 ctctcccccagactaggtcaatttagaccgaa 9604617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 5 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 12268323 - 12267985
Alignment:
Q  5 atttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggc 104  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |    
T  12268323 atttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaacttgtatcagagtaaactttgagatagagggagctgaaacaagagtttagaaagac 12268224  T
Q  105 aacaacaaaa-ctagggtttgtatagagtttgtctctt-ggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtc 202  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  12268223 aacaacaaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttcggaaacactattaggattgagtc 12268124  T
Q  203 tcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattat 302  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||           ||||||||||| |||| |||||| |||    
T  12268123 tcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa-----------ctcttttgtaacgttactcatca-tat 12268036  T
Q  303 agtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  12268035 agtgaaacagagggctgctctctcccccaaactagatcaatttggaccgaa 12267985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 69 - 353
Target Start/End: Original strand, 42990268 - 42990551
Alignment:
Q  69 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggtt 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||    
T  42990268 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattaggttttgagggtt 42990367  T
Q  169 gattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaaccca 268  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  42990368 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactca 42990467  T
Q  269 ttgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||| |||||||||||| |||| |||||| ||| ||||| || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42990468 ttgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatggtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 42990551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 29 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 47149233 - 47148905
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatca-aagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | | |  | ||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47149233 cttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaggccttgagggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 47149134  T
Q  124 gtatagagtttgtctc-ttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagat 222  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47149133 gtatagagtttgtctctttggaaacaaacactgggatttgatggttgattcaccttgg-aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagat 47149035  T
Q  223 tgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctc 322  Q
    || | |||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||  |||  |||||    
T  47149034 tgggtctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtatcgttactcatca-tatagtgaaacagaggactgctc 47148936  T
Q  323 tctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| |||||    
T  47148935 tctcccccagactatgtcaatttggcccgaa 47148905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 29 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 53468788 - 53468463
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  53468788 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaacctttagataaagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaaccagg-tttgtata 53468690  T
Q  129 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 228  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||    
T  53468689 gagtttgtctctttggaagaaacactagggtttgagcattgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacggggagagattgggac 53468590  T
Q  229 tttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctct--ctc 326  Q
    ||| | || ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||  | |    
T  53468589 tttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctacccc 53468490  T
Q  327 ccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||    
T  53468489 ccagacactaggtcaatttggaccgaa 53468463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 69 - 353
Target Start/End: Original strand, 30005805 - 30006088
Alignment:
Q  69 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggtt 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  30005805 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 30005904  T
Q  169 gattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaaccca 268  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||  || |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  30005905 gattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactca 30006004  T
Q  269 ttgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||    
T  30006005 ttgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccctagattagatcaatttggaccgaa 30006088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 29 - 353
Target Start/End: Original strand, 36011751 - 36012074
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |  | |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  36011751 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagataaagggggctgaaacaaggatttagaaagacaacaacgaaactaaggtttgtata 36011850  T
Q  129 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 228  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| |||    
T  36011851 gagtttgtctctttagaacaaacactatggtttgagggttgattcacgttgggaaacactattaggattgaatatcttggttacgggaagagattgtgac 36011950  T
Q  229 tttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctccc 328  Q
    ||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||  |||| |||||||| |     
T  36011951 tttgggtagaattagttgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacagagggctgctctcttct 36012049  T
Q  329 acagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  36012050 tcagactaggtcaatttggaccgaa 36012074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 35918283 - 35917954
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35918283 actttcactataaatatagaccttgtatcatagcaaattttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 35918184  T
Q  128 agagtttgtctc-ttggaa-----acaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaga 221  Q
    |||||||||||| ||||||     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  35918183 agagtttgtctctttggaacaaacacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgcgaaacactattagaattgagtctcttggttacgagaagaga 35918084  T
Q  222 ttgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgct 321  Q
     || || ||| | ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | ||||||| |||| || | ||||    
T  35918083 ctgggaatttgggtagaaataggagggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatta-tatagtggaacggagagctgct 35917985  T
Q  322 ctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  35917984 ctctccctcagact-ggtcaatttagaccgaa 35917954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 28 - 299
Target Start/End: Original strand, 39715393 - 39715663
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  39715393 acttttgctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggg-ctgaaataagggtttagagaggcaacaccaaaactagggtttgtat 39715491  T
Q  128 agagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 227  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  39715492 agagtttgtctatttgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggga 39715591  T
Q  228 ctttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcat 299  Q
    |||| | |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39715592 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgcaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 39715663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Original strand, 746674 - 747004
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  746674 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 746773  T
Q  122 ttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgatt-gagtctcttggttacgggaagag 220  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  746774 ttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 746873  T
Q  221 attgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgc 320  Q
    |||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||| ||||||| | || |||  |||    
T  746874 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggaggactgc 746971  T
Q  321 tctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  746972 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaa 747004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Original strand, 458203 - 458531
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||| ||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  458203 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaaccttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 458302  T
Q  124 gtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagat 222  Q
    |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  458303 gtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagat 458402  T
Q  223 tgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctc 322  Q
    || |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| |  | ||||||| |||||| |  | |||| |||||    
T  458403 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctc 458500  T
Q  323 tctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  458501 tctcccccagactaggtcaggttggaccgaa 458531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 30 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 51675087 - 51674776
Alignment:
Q  30 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 129  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||        
T  51675087 ttttactataaatatagacgttgtatcaatgtaaacgttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactaaggtttgt---- 51674992  T
Q  130 agtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagact 229  Q
           | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| || |    
T  51674991 -------ccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattgggatt 51674899  T
Q  230 ttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctccca 329  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| ||||| | |||| |||||||||||     
T  51674898 ttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaatgttactcatca-tatactgaaatggagggctgctctctcccc 51674800  T
Q  330 cagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    || || ||||||||||||||||||    
T  51674799 cataccaggtcaatttggaccgaa 51674776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Original strand, 455826 - 456154
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||| ||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  455826 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaaccttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 455925  T
Q  124 gtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagat 222  Q
    |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  455926 gtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagat 456025  T
Q  223 tgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctc 322  Q
    || |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| |  | ||||||| |||||| |  | |||| |||||    
T  456026 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctc 456123  T
Q  323 tctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||| |||||||||||   ||||||||||    
T  456124 tctcccccagactaggtcgggttggaccgaa 456154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 29 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 890104 - 889783
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||  | |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||    
T  890104 cttttactataaatatagatattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggaagctgaaacaagggtttagaatggcaacaa--aacctagggtttgtata 890007  T
Q  129 gagtttgtctctt-ggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 227  Q
    |||||||||| || || |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |     
T  890006 gagtttgtctatttggcaacaaacactggggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag-ttgggg 889908  T
Q  228 ctttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcc 327  Q
    |||| | ||||||||||  ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| || | |||||    
T  889907 ctttgggtagaattaggcaggagagttattcttgtaacccactgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgatttctcc 889809  T
Q  328 cacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  889808 cgcagactaggtcaatttggaccgaa 889783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 25388794 - 25389152
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt---------gagatagagggggctgaaacaag 91  Q
    ||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  || |  ||          |||| |||| | |||||||||||    
T  25388794 gcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcag-gctattttgagagagagagagagagagagagctgaaacaag 25388892  T
Q  92 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactatt 191  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25388893 ggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg-aaacactatt 25388991  T
Q  192 atgatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagtt 290  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||    
T  25388992 aggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacatattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgtt 25389090  T
Q  291 attcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    | |||||| ||||||| | || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25389091 actcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 25389152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 32218991 - 32219332
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||| | |||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32218991 gcagatttgttccaaattttaagtaatactttcagtataaatatagaccttgtatctgactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggttcagaa 32219090  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgag 200  Q
    ||||||||||||||||||           |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  32219091 aggcaacaacaaaactag-----------agtttgtctctttgtaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactatcaggattgag 32219179  T
Q  201 tctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaa-gttattcatcat 299  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||| |  ||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||     
T  32219180 tctcttggttgcgggaagagattgggactttgggcagaattaggcggaagacttatttttgtaacccattgatatcttttttgtaaacgttactcatca- 32219278  T
Q  300 tatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||||||||| | || ||||||||| | ||||||| | ||||||||||||||    
T  32219279 tatagtgaaacggatggctgctctctctcccagactatgccaatttggaccgaa 32219332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 29 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 28100374 - 28100144
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28100374 cttttactataaatataagcgttgtatcagagtaacccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 28100275  T
Q  129 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 228  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | |    
T  28100274 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacgctattaggattgagtcttttggttacgggaagagattggggc 28100175  T
Q  229 tttagatagaattaggtgggagacttattct 259  Q
    ||| | |||||||||| ||||||||||||||    
T  28100174 tttgggtagaattaggcgggagacttattct 28100144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 3 - 353
Target Start/End: Original strand, 23633357 - 23633700
Alignment:
Q  3 agatttgttccaaattt-taagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 101  Q
    ||||||||||||| ||| | || || ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||     
T  23633357 agatttgttccaattttatgagggatacttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagagggctaaaacaaggatttagaa- 23633455  T
Q  102 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagt 201  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |  |||||||| |||  || ||||||||||| ||||||||    
T  23633456 gccaacaagaaaactagggtttgtatagtgtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgatttacc--gggaaacactattaggattgagt 23633550  T
Q  202 ctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatta 301  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  23633551 ctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccgatgatatctc-tttgtaaagttactcatcatta 23633649  T
Q  302 tagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  23633650 tagtgaaaaggagggctgctctctccc-cagactaggtcaatttagaccgaa 23633700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 281
Target Start/End: Original strand, 38210265 - 38210547
Alignment:
Q  2 cagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt---gagatagagggggctgaaacaagggtttag 98  Q
    |||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||  || |  ||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38210265 cagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatataggccttgtatcag-gctattttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttag 38210363  T
Q  99 aaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgatt- 197  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||     
T  38210364 aaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 38210463  T
Q  198 gagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttt 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  38210464 gagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttt 38210547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 69 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 10621823 - 10621540
Alignment:
Q  69 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggtt 168  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||    
T  10621823 gagatagagggtgctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 10621724  T
Q  169 gattcaccttggaaaacactattatgatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaaccc 267  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  10621723 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 10621624  T
Q  268 attgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||| |||| ||||||| | || |||||| ||||||| |  | |||| ||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||    
T  10621623 attgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactagctcagattggaccgaa 10621540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 29 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 54691906 - 54691591
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| || |||| || |||||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  54691906 cttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttaagatagaggggg-taaaacaaggttttagaaaggcgacaacaaaactagggtttgtata 54691808  T
Q  129 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | | ||||||| |||||||||||  | |    
T  54691807 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaattttttggttatgggaagagattagggc 54691708  T
Q  229 tttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctccc 328  Q
    |||   | |||||||| |||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  54691707 tttgagttgaattaggcgggagacttattcttgtatttcattgatatctcttttgtaacgttacccatca-tatagttaaacggagggctgctctctccc 54691609  T
Q  329 acagactaggtcaatttg 346  Q
      |||||| |||||||||    
T  54691608 ctagactatgtcaatttg 54691591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 109 - 353
Target Start/End: Original strand, 1321483 - 1321726
Alignment:
Q  109 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttgg 208  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  1321483 acaaaactcgggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 1321582  T
Q  209 ttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaa 308  Q
    |||| |||||||  || |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||| |    
T  1321583 ttacaggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 1321681  T
Q  309 acgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
     || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1321682 tcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 1321726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 29 - 341
Target Start/End: Original strand, 31151271 - 31151579
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | | |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  31151271 cttttactataaatatagactttgtatcagatgtaaacctcgagatagagggggctgaaaacaagggtttagaaat-caacaagaaaactagggtttgta 31151369  T
Q  127 tagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgag 226  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| |    
T  31151370 tagagtttg-ctcttggcaacaaacaccagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaaaagattggg 31151466  T
Q  227 actttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctc 326  Q
    ||||| | |||||||||| ||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||| |||| |||||||||    
T  31151467 actttgggtagaattaggcgggtgacttattcttgtaaccc--tgatatctcttttgtaaagttactcattgttatagtggaacggagggctgctctctc 31151564  T
Q  327 ccacagactaggtca 341  Q
    || ||||||||||||    
T  31151565 ccccagactaggtca 31151579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Original strand, 53597164 - 53597485
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| || | |||||| |||||||||| ||||||    
T  53597164 acttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagagggga-tgaaacaagggtttataa-gtcaacaagaaaactaggggttgtat 53597261  T
Q  128 agagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 227  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | | ||| |||||||||    
T  53597262 agagttt-tctcttggcaacaaacactagggttgaag--ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcatgagaatagattgaga 53597358  T
Q  228 ctttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcc 327  Q
     |||   ||||||||||   |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||    
T  53597359 ttttgagtagaattaggcaagagacttattcttgtaacccgttgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggagggttgctctctcc 53597458  T
Q  328 cacagactaggtcaat-ttggaccgaa 353  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||    
T  53597459 cacaaactaggtcagtattggaccgaa 53597485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 69 - 327
Target Start/End: Original strand, 29956650 - 29956907
Alignment:
Q  69 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggtt 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||    
T  29956650 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaattcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattaggttttgagggtt 29956749  T
Q  169 gattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaaccca 268  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||  || |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  29956750 gattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactca 29956849  T
Q  269 ttgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcc 327  Q
    ||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  29956850 ttgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcc 29956907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Original strand, 11163046 - 11163218
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11163046 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttacgataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 11163145  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattc 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || |||||||    
T  11163146 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtggattgattc 11163218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Original strand, 42992205 - 42992517
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 123  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42992205 acttttactataaatatataccttgtatcatgctaaactttaagagagatagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggttt 42992304  T
Q  124 gtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt 223  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  42992305 gtatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagagt 42992404  T
Q  224 gagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctct 323  Q
    | |||||| | |||               ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||  ||| ||||||    
T  42992405 g-gactttgggtag---------------ttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttagtcatca-tatagtgaatcggggggctgctct 42992487  T
Q  324 ctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42992488 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 42992517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 29 - 311
Target Start/End: Original strand, 54884081 - 54884360
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    ||||||| ||||||||| || ||| ||||  | |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||      
T  54884081 cttttaccataaatataaacattggatcattgtaaaccttgagatagagggagctcgaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagaatttgta-- 54884178  T
Q  129 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 228  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||    
T  54884179 gagtttgtttctttggaacaaacactagggtttgatggttgattcatcttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacagaaagagattgaaac 54884278  T
Q  229 tttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacg 311  Q
    |||  ||||||||||| |||||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  54884279 tttgaatagaattaggagggagacttatt-ttgtaatctattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacg 54884360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 29 - 353
Target Start/End: Original strand, 53591119 - 53591430
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |  | |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||         
T  53591119 cttttactataaatatagacattgtataagtgtaaaccttgagatagaggaggctgaaacaagagtttagaaagacaacaacaaaactagggttt----- 53591213  T
Q  129 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 228  Q
          |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||| ||| |||||  ||     
T  53591214 ------gtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattcgaattgagtctcttggttacgagaatagatttggat 53591307  T
Q  229 tttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctccc 328  Q
    ||| | |||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  53591308 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttctaatccattgatatctcatttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacgaagggatgctctctccc 53591406  T
Q  329 acagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
     ||||||||||||||||||| ||||    
T  53591407 -cagactaggtcaatttggatcgaa 53591430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 13420506 - 13420195
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||          ||  ||||||||||||||||    
T  13420506 acttttactataaatataggttttgtatcaaagcaaaccttgagatataggaggctgaaacaagggttta----------aatcaaactagggtttgtat 13420417  T
Q  128 agagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 227  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||   | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13420416 agagttt-tctctaggcaacaaacactagggtt---gagttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgaga 13420321  T
Q  228 ctttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcc 327  Q
    |||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||| || | |||||||||     
T  13420320 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcattattataatggaacggagagctgctctctca 13420221  T
Q  328 cacagactaggtca-atttggaccgaa 353  Q
    | ||||||||||||  |||||||||||    
T  13420220 c-cagactaggtcagttttggaccgaa 13420195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 68 - 353
Target Start/End: Original strand, 4666488 - 4666761
Alignment:
Q  68 tgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggt 167  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||           ||||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  4666488 tgagatagagggggctgaaagaagggtctagtaagacaacaacaaaaatagggttt-----------gtctcttgacaacagacactagggtttgagggt 4666576  T
Q  168 tgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggaga--cttattctagtaac 265  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||  |||||||| ||||     
T  4666577 tgattcatcttgggaaacactattatgattgagtctctaggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagatccttattcttgtaat 4666676  T
Q  266 ccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||   || ||||||||||||||||||||||||    
T  4666677 ccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctct---ccccagactaggtcaatttggaccgaa 4666761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 29 - 259
Target Start/End: Original strand, 28180948 - 28181176
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28180948 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaata--ggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 28181045  T
Q  129 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 228  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  28181046 gagtttgtctctttggaacaaacactgggatttgagggttgattcactttgggaaacaccattaggattgagtctattggttacgggaagagattgggac 28181145  T
Q  229 tttagatagaattaggtgggagacttattct 259  Q
    ||| |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  28181146 tttggatagaattaggcgggagacgtattct 28181176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 95 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 28413299 - 28413042
Alignment:
Q  95 ttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatg 194  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  28413299 ttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagg 28413200  T
Q  195 attga-gtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttatt 293  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| |  | |    
T  28413199 attgaagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaact 28413101  T
Q  294 catcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||| |||||| |  | |||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  28413100 catcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaa 28413042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 118 - 353
Target Start/End: Original strand, 6484372 - 6484607
Alignment:
Q  118 gggtttgtatagagtttgtctctt-ggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacggga 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  6484372 gggtttgtgtagagtttgtctcttcggcaacaaataccggggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggtttgagtctcttggttacggga 6484471  T
Q  217 agagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaaggg 316  Q
    |||||||| |  ||| | |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  6484472 agagattggggttttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaacccattgatatcttttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggaggg 6484570  T
Q  317 ttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6484571 ctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 6484607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 76 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 562058 - 561784
Alignment:
Q  76 agggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcac 175  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    |||||||||||    
T  562058 agggggttgaaacaagggtttagaa-gtcaacatgaaa-ctagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacaaacactagggttca--ggttgattcac 561964  T
Q  176 cttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatat 275  Q
     |||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  561963 attgggaaacactattaggatttagtctcttggtcacgtgaagagattgagactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaagtcattgatat 561864  T
Q  276 ctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctccc-acagactaggtca-atttggaccgaa 353  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||    
T  561863 cttttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgaagggctgctctctccctccagactaggtcagttttggaccgaa 561784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 35 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 36871624 - 36871310
Alignment:
Q  35 ctataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 134  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||| | | |  || ||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  36871624 ctataaatataaaccttgtatcatagtaaacctagggggag-gggggctgaaacaagggtttacaa-gccaacaagaaaactagggcttgtatagagttt 36871527  T
Q  135 gtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttaga 234  Q
    | ||||||| ||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| |     
T  36871526 g-ctcttggcaacaaacaccagggtt--aggattgattcaccttggaaaacactgttaagattgagtctcttggtcacggaaagagattgggactttggg 36871430  T
Q  235 tagaattagg-tgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacaga 333  Q
    |||||||||| | | ||||||||||| | ||||| ||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||    
T  36871429 tagaattaggtttgaagacttattcttgcaaccctttgttatctc-tttgtaaagttaatcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccaga 36871331  T
Q  334 ctaggtcaat-ttggaccgaa 353  Q
    |||||||| | ||||||||||    
T  36871330 ctaggtcagtattggaccgaa 36871310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 112 - 353
Target Start/End: Original strand, 17795269 - 17795506
Alignment:
Q  112 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggtta 211  Q
    ||||||| || ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||   |||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |    
T  17795269 aaactagagtctgtatagagtttg-cttttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcactttgggaaaaactattaggattgagtctcttggtca 17795364  T
Q  212 cgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacg 311  Q
    ||| ||||||||||| |||| | |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  17795365 cggaaagagattgaggctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataatgaaacg 17795464  T
Q  312 aagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
     | || |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  17795465 gaaggctgctctctcccctagactaggtcaatttgaaccgaa 17795506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 112 - 353
Target Start/End: Original strand, 19103709 - 19103946
Alignment:
Q  112 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggtta 211  Q
    ||||||| || ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||   |||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |    
T  19103709 aaactagagtctgtatagagtttg-cttttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcactttgggaaaaactattaggattgagtctcttggtca 19103804  T
Q  212 cgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacg 311  Q
    ||| ||||||||||| |||| | |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  19103805 cggaaagagattgaggctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataatgaaacg 19103904  T
Q  312 aagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
     | || |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  19103905 gaaggctgctctctcccctagactaggtcaatttgaaccgaa 19103946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 112 - 350
Target Start/End: Original strand, 25635391 - 25635626
Alignment:
Q  112 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggtta 211  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| |  | ||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |    
T  25635391 aaactagggtttgtatatagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattggttcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggtca 25635487  T
Q  212 cgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacg 311  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||     
T  25635488 cgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctattttgtaaagttactcatcattatggtgaaaca 25635587  T
Q  312 aagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggacc 350  Q
     ||||||||||||||||   | ||||| |||||||||||    
T  25635588 gagggttgctctctcccctcggctaggccaatttggacc 25635626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 30 - 287
Target Start/End: Original strand, 23636952 - 23637205
Alignment:
Q  30 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 129  Q
    ||||| |||||||||| || |||||||| || |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||    
T  23636952 ttttaatataaatatatactttgtatcagagtaaaccttgagatagaggaggctaaaacaagggtttagaa-gccaacaagaaaactagggtttgtatag 23637050  T
Q  130 agtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagact 229  Q
    ||| || ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||||| | | ||||||| |||  ||||    
T  23637051 agtctg-ctcttggcaacaaacactagggtttg--ggttgatttaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgttcatgggaagatattaggact 23637147  T
Q  230 ttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaa 287  Q
    || | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  23637148 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttataaa 23637205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 156 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 25688367 - 25688170
Alignment:
Q  156 gggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagactta 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  || |||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  25688367 gggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactta 25688268  T
Q  256 ttctagtaacccattgatatctcttttgtaaa-gttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25688267 ttcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgttacgcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 25688170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 127 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 7606822 - 7606598
Alignment:
Q  127 tagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgag 226  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |    
T  7606822 tagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 7606723  T
Q  227 actttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctc 326  Q
    ||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||  ||||||| |||| || ||| ||||||| | || |||| |||||||||    
T  7606722 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatttct-atttgtaacgttactcgtca-tatagtggatcggagggctgctctctc 7606625  T
Q  327 ccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  7606624 ccccagactaggtcaatttggaccgaa 7606598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 24177175 - 24177380
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttaga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||     
T  24177175 gcagatttgttccaaattttaagggatacttttattataaatatagaccttgtatcatagtaaacattgagctagagggggctgaaaacaagagtttag- 24177273  T
Q  100 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattga 199  Q
    | | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24177274 atgtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt--ggggttgattcaccttggaaaacactattaggattga 24177370  T
Q  200 gtctcttggt 209  Q
    ||||||||||    
T  24177371 gtctcttggt 24177380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 29 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 28137628 - 28137415
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              
T  28137628 cttttactataaatatatgcgttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactag---------- 28137539  T
Q  129 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 228  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| | |    
T  28137538 -agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggatgaagtctcttggttacgggaagagattggggc 28137440  T
Q  229 tttagatagaattaggtgggagact 253  Q
    ||| | |||||||||| || |||||    
T  28137439 tttgggtagaattaggcggaagact 28137415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 144 - 353
Target Start/End: Original strand, 6231840 - 6232047
Alignment:
Q  144 aaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattag 243  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||||    
T  6231840 aaacacaccctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagtgttgagtctcttggttacgggaagagattggga-tttgggtagaattag 6231938  T
Q  244 gtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaat 343  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| |||| |||| |||| |||||| | || |||||||||    
T  6231939 gcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagctactcatcattacagtg-aacggagggctgctgtctccccccgattaggtcaat 6232037  T
Q  344 ttggaccgaa 353  Q
    ||||||||||    
T  6232038 ttggaccgaa 6232047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 30 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 27635959 - 27635668
Alignment:
Q  30 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 129  Q
    |||||||| |||||||||||||| || | || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  27635959 ttttactacaaatatagaccttgaattagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgcaaacaacaaaactagggtttgtatag 27635860  T
Q  130 agtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagact 229  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||                   ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||            ||    
T  27635859 agtttgtctcttgggaacaaacactaggg-------------------tgggaaacaatattaagattgagtctcttggttacggg------------ct 27635791  T
Q  230 ttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctccca 329  Q
    || | || ||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||     
T  27635790 ttgggtaaaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 27635692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 70 - 197
Target Start/End: Original strand, 41849117 - 41849244
Alignment:
Q  70 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttg 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41849117 agatagagggggctgaaacaagggtttagaataacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttg 41849216  T
Q  170 attcaccttggaaaacactattatgatt 197  Q
    ||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  41849217 attcaccttgggaaactctattaggatt 41849244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 28 - 291
Target Start/End: Original strand, 1673898 - 1674158
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaac-aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 125  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||  ||||| |  ||||||  |||||||||||| |  ||||| |||||||| ||||||    
T  1673898 acttttactataaatatagaacttgtatcaaaagtaaaccttgatgtagagagt-ctgaaaataagggtttagaa-gttaacaagaaaactagtgtttgt 1673995  T
Q  126 atagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattga 225  Q
    ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||     
T  1673996 atatagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt--aggattgattcaccatgggaaacactattaggattgagtctcttgatcacgggaagagattgg 1674092  T
Q  226 gactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagtta 291  Q
    |||||| | ||||| |||  |||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  1674093 gactttgggtagaaatagacgggagacttattcgtgtaaccctttgatatgtcttttgtaaagtta 1674158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 1321337 - 1321441
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1321337 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagactttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 1321436  T
Q  101 aggca 105  Q
    |||||    
T  1321437 aggca 1321441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 30 - 158
Target Start/End: Original strand, 6231374 - 6231502
Alignment:
Q  30 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 129  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  | |||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6231374 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaatcttgagatagagcgggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 6231473  T
Q  130 agtttgtctcttggaaacaaacactaggg 158  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6231474 agtttgtctcttggcaacaaacactaggg 6231502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 166 - 353
Target Start/End: Original strand, 5886261 - 5886445
Alignment:
Q  166 gttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaac 265  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  5886261 gttgattcaccttggaaa-cactattagggttgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 5886359  T
Q  266 ccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||||| | || |||| || |||| |||||| ||||||| | || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5886360 ccattgatttgtc-tttgaaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 5886445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 166 - 353
Target Start/End: Original strand, 5899734 - 5899918
Alignment:
Q  166 gttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaac 265  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  5899734 gttgattcaccttggaaa-cactattagggttgagtctcttggttacgggaagtgattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 5899832  T
Q  266 ccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||||| |||| |||| || |||| |||||| ||||||| | || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5899833 ccattgatttctc-tttgcaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 5899918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 29 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 47701928 - 47701798
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47701928 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 47701829  T
Q  129 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggt 159  Q
    |||||||||| || | ||||||||| |||||    
T  47701828 gagtttgtctatttggaacaaacaccagggt 47701798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 169 - 350
Target Start/End: Original strand, 11168165 - 11168345
Alignment:
Q  169 gattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaaccca 268  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  || || ||| | |||||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  11168165 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtgtcttggttacgggaagaggctgggaatttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaaccca 11168264  T
Q  269 ttgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggacc 350  Q
    ||||| |||||||||||| |||| | |||| |||| || |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11168265 ttgatttctcttttgtaacgttacttatca-tatattggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggacc 11168345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 183 - 353
Target Start/End: Original strand, 3306839 - 3307007
Alignment:
Q  183 aacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctctttt 282  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||    ||| | |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3306839 aacactattaggattgagtctcttggttacagaaagatattggagttttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaacccattgatatctctttt 3306938  T
Q  283 gtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  3306939 gtaaagttactcatcattatagtgaaaaggatggttgctctctcc--tagactaggtcaatttggaccgaa 3307007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 235 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 47701798 - 47701681
Alignment:
Q  235 tagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagac 334  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||     
T  47701798 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagat 47701700  T
Q  335 taggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  47701699 taggtcaatttggatcgaa 47701681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 28 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 4560599 - 4560422
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||| ||||||| |||||||  ||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||             
T  4560599 actttcactataagtatagactatgtatcatagtaaacattgagatagagggggctgaaacaatggtttataaaggtaacaacaaaactag--------- 4560509  T
Q  128 agagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattg 224  Q
      |||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  4560508 --agtttgtctct--------aacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagcctgttggttaccggaagagattg 4560422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 167 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 1620657 - 1620483
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattagg-tgggagacttattctagtaac 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||||| | | || ||  |||| |||||    
T  1620657 ttgattcaccttggaaaacactattaggattaggtcttttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaaggctagttcttgtaac 1620558  T
Q  266 ccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtca 341  Q
    || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||| |||| |||||||||||  |||||||||||    
T  1620557 cctttgatatctc-tttgtaaacttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtca 1620483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 248 - 353
Target Start/End: Original strand, 25634030 - 25634135
Alignment:
Q  248 gagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttgg 347  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||| |||||||     
T  25634030 gagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacgaatggctgctctctccaccagactaggacaatttgc 25634129  T
Q  348 accgaa 353  Q
    ||||||    
T  25634130 accgaa 25634135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 30 - 141
Target Start/End: Original strand, 3306724 - 3306835
Alignment:
Q  30 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 129  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||    
T  3306724 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaacctagagatatagggggctgaaacaagggtttagaaatacaacaacaaaactaggatttgaatag 3306823  T
Q  130 agtttgtctctt 141  Q
    ||||||||||||    
T  3306824 agtttgtctctt 3306835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 167 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 14634638 - 14634493
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattagg-tgggagacttattctagtaac 265  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||||| | ||| |||||| | | ||||| ||||| ||||     
T  14634638 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgtgtctcttagtcacgagaagagattgagactttgggtagcattaggtttgaagactgattcttgtaaa 14634539  T
Q  266 ccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacg 311  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  14634538 cctttgatatctcttttgtaaagttactcatcataatagtggaacg 14634493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 211 - 353
Target Start/End: Original strand, 24181486 - 24181629
Alignment:
Q  211 acgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaac 310  Q
    ||||||| |||||| |||||| | |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  24181486 acgggaaaagattgggactttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtggaac 24181585  T
Q  311 gaagggttgctctctcccacagactaggtca-atttggaccgaa 353  Q
    | | |  ||||||||||  || |||||||||  |||||||||||    
T  24181586 ggatgactgctctctcctccaaactaggtcagttttggaccgaa 24181629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 53896557 - 53896475
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggct 83  Q
    ||||||||||| || |||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53896557 gcagatttgttacagattttaagcaggactttcactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggct 53896475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 84 - 306
Target Start/End: Original strand, 13419864 - 13420081
Alignment:
Q  84 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaa 183  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||| |  | |||||||||||||| ||    
T  13419864 gaaacaaaggttta-aaagccaacaagaaaactagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaa 13419957  T
Q  184 acactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattagg-tgggagacttattctagtaac-ccattgatatctcttt 281  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||| |||| |||||||| | | ||| | ||||||| || ||| ||| | ||| | |||||    |||||||||| ||    
T  13419958 acactattaggatcaagtctcttggtcacggaaagagattcaaattttgggtagaatttggttggaagaataatttttgtaacatttttgatatctc-tt 13420056  T
Q  282 tgtaaagttattcatcattatagtg 306  Q
    |||||||||| ||||||||||||||    
T  13420057 tgtaaagttactcatcattatagtg 13420081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 6719472 - 6719396
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag 77  Q
    ||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  6719472 gcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagag 6719396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 85 - 341
Target Start/End: Original strand, 7768554 - 7768806
Alignment:
Q  85 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaaca--ctagggtttgagggttgattcaccttggaa 182  Q
    |||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||| ||| ||   ||||||| ||||||||  ||| |||| |||  ||||||||||||||||    
T  7768554 aaacaagggtttagaa-gccaacatcaaaactaaggtttgtagagaatt---ctcttggcaacaaacaaactaaggtt-gaga-ttgattcaccttggaa 7768647  T
Q  183 aacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattagg-tgggagacttattctagtaacccattgatatctcttt 281  Q
    |||||||||| |||||||||||||| | |||||   | ||||  |||||   |||||||||| | | ||||| ||||| ||||||  || ||||  | ||    
T  7768648 aacactattaggattgagtctcttgctcacgggctaaaattggaactttgagtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccttttaatat-acctt 7768746  T
Q  282 tgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtca 341  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||| || |||||||||    
T  7768747 tgtaaagttactcattattatagtggaacgaagggttactccctcccccatactaggtca 7768806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 112 - 209
Target Start/End: Original strand, 25633930 - 25634024
Alignment:
Q  112 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |  | |||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  25633930 aaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggctgg--gattgattcaccttgggagacattattaggattgagtctcttggt 25634024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 5886181 - 5886242
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagca 62  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  5886181 gcagatttgttacagattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttttatcagagca 5886242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 193 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 11007684 - 11007545
Alignment:
Q  193 tgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttat 292  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||||||||         | |||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||     
T  11007684 tgattgagtctcttggtcacaggaagagattgagactttgggtagaattagg---------ttttcttgtaactctttgacatctcttttgtaaagttac 11007594  T
Q  293 tcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtca 341  Q
    |||||||||||||| || |  ||| | |||||||||  |||||||||||    
T  11007593 tcatcattatagtggaatggggggctcctctctcccctagactaggtca 11007545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Original strand, 13893289 - 13893347
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaa 59  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13893289 gcagatttgttccaaattttaagggttacttttactataaatatagacattgtatcaaa 13893347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 5899656 - 5899717
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagca 62  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  5899656 gcagatttgttacagattttaagcgagacttttactataaatatagaccttttatcagagca 5899717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 29914152 - 29913980
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttggaaaa--cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtggga-gacttattctagta 263  Q
    ||||||||||||| | ||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || |||||  | |||||||||||  || |||| ||||| |||    
T  29914152 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttggg-tagaattaggtttgaagactgattcttgta 29914054  T
Q  264 acccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtca 341  Q
    || ||   |||||||||| ||||||  | |||||||||||||| | ||||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  29914053 actca---atatctcttt-gtaaagaaactcatcattatagtggatcgaagagctgctctctcccccagactaggtca 29913980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 1619018 - 1618824
Alignment:
Q  3 agatttgttccaaattt-taagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt--gagatagagggggctg-aaacaagggtttag 98  Q
    ||||||||||||| ||| | || || ||||| ||||||||||||||||||||| || || |||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  1619018 agatttgttccaattttatgagggatactttgactataaatatagaccttgtaccatagtaaaccttgagagacagagggggctgaaaacaagggtttag 1618919  T
Q  99 aaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaac---aaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatga 195  Q
    |||   |||||| |||||||||||  ||||||| || |||||   ||||   | |||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1618918 aaa-caaacaac-aaactagggtt--tatagagatt-tctct---aaacgggagacactagggtt--gggattgattcaccttggaaaacactattatga 1618829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 93
Target Start/End: Original strand, 6484308 - 6484373
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaaggg 93  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6484308 acttttgctataaatataggcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaaggg 6484373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 300 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 35919178 - 35919125
Alignment:
Q  300 tatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35919178 tatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 35919125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 300 - 353
Target Start/End: Original strand, 41849253 - 41849306
Alignment:
Q  300 tatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41849253 tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 41849306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 85 - 353
Target Start/End: Original strand, 27420634 - 27420899
Alignment:
Q  85 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgga-aa 183  Q
    ||||||||||||   ||| || |||||||| ||||||||||| ||| |||   |||||| ||||||||||| |||| |  | |||||||||  |||| ||    
T  27420634 aaacaagggttttagaagccagcaacaaaattagggtttgtagagaattt---tcttggcaacaaacactatggttgg--gattgattcacgctggagaa 27420728  T
Q  184 acactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt-gagactttagatagaattaggtggga-gacttattctagtaacccattgatatctcttt 281  Q
    | |||||||  | | ||||||||||| ||||||||||||| |||  ||| | || ||||||||  || |||| ||||| ||||||| |||  ||||  ||    
T  27420729 atactattagaactcagtctcttggtcacgggaagagattcgaggttttcggtataattaggtttgaagactgattcttgtaaccctttggaatct--tt 27420826  T
Q  282 tgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtca-atttggaccgaa 353  Q
    |||||||||| ||||||||||| || |||  || ||||||||||||| || | |||||||  |||||||||||    
T  27420827 tgtaaagttactcatcattataatggaacatagagttgctctctcccccatagtaggtcagttttggaccgaa 27420899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 46966996 - 46966940
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatca 57  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| || ||||||||    
T  46966996 gcagatttgttccaaattttaagggttacttttactataaatataaacattgtatca 46966940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 230
Target Start/End: Original strand, 7418063 - 7418112
Alignment:
Q  181 aaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactt 230  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  7418063 aaaacaccattatgattgagtctattggtcacgggaagagattgggactt 7418112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 167 - 245
Target Start/End: Original strand, 11073007 - 11073085
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttgga-aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaga-ttgagactttagatagaattaggt 245  Q
    |||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  11073007 ttgattcaccttcgagaaacact--tatgattgagtctcttggtcacgagaagagatttgggactttaggtagaattaggt 11073085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 220
Target Start/End: Original strand, 6303293 - 6303348
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttgga--aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 220  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  6303293 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 6303348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 10094273 - 10094218
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttgga--aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 220  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  10094273 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 10094218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 10100290 - 10100235
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttgga--aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 220  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  10100290 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 10100235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 10201153 - 10201098
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttgga--aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 220  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  10201153 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 10201098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 10208199 - 10208144
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttgga--aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 220  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  10208199 ttgattcaccttgaacaaaacactattacgattgagtctcttggtcacgggaagag 10208144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 245
Target Start/End: Original strand, 11066652 - 11066732
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttgga-aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt-gagactttagatagaattaggt 245  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||| | ||||||||||||| | |||||| | |||||||||||    
T  11066652 ttgattcaccttggagaaacactattaggattgaatcttttgatcacgggaagagattcgggactttgggtagaattaggt 11066732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 220
Target Start/End: Original strand, 16462186 - 16462241
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttgga--aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 220  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16462186 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 16462241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 22626183 - 22626128
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttgga--aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 220  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22626183 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 22626128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 220
Target Start/End: Original strand, 27544256 - 27544311
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttgga--aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 220  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  27544256 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 27544311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 31021479 - 31021300
Alignment:
Q  30 ttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagag------ggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||       | | | ||||| |||||||| ||| ||||   ||||||||||||    
T  31021479 ttttactataaatatagaccttgtatcaaatgtaaaccttgagagagagaaagaaagagttaaaacatgggtttag-aagccaaccctaaaactagggtt 31021381  T
Q  123 tgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgga-aaacactattatgattgagtctcttg 207  Q
    ||  ||||||||| | || |  ||||||||||||||||   || ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  31021380 tg--tagagtttg-ccctagtcaacaaacactagggtt--gggattgattcaccttggagaaacactattaggattgagtctcttg 31021300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 47883081 - 47883026
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttgga--aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 220  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  47883081 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 47883026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 313 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 53894107 - 53894067
Alignment:
Q  313 agggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  53894107 agggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 53894067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 149 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 7606873 - 7606830
Alignment:
Q  149 aacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactatta 192  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7606873 aacagtaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 7606830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 195 - 230
Target Start/End: Original strand, 13893475 - 13893510
Alignment:
Q  195 attgagtctcttggttacgggaagagattgagactt 230  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13893475 attgagtctcttggtcacgggaagagattgagactt 13893510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 28 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 25690690 - 25690651
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactt 67  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25690690 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactt 25690651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 57
Target Start/End: Original strand, 26762863 - 26762917
Alignment:
Q  3 agatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatca 57  Q
    ||||||||||||| |||| || ||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26762863 agatttgttccaattttttagggatgcttttactataaatataaaccttgtatca 26762917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 4560393 - 4560352
Alignment:
Q  261 gtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattat 302  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  4560393 gtaacccattaatatctcttttgcaaagttactcatcattat 4560352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 10621876 - 10621847
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatca 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621876 acttttactataaatatagaccttgtatca 10621847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 27762165 - 27762120
Alignment:
Q  185 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactt 230  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||    
T  27762165 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggttgggactt 27762120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 57
Target Start/End: Original strand, 42990205 - 42990234
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatca 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42990205 acttttactataaatatagaccttgtatca 42990234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 167 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 20031517 - 20031462
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttggaaaa--cactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 220  Q
    ||||||||||||| | ||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  20031517 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 20031462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 28 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 27101594 - 27101558
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaa 64  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27101594 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaa 27101558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 167 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 47878370 - 47878315
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttggaaaa--cactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 220  Q
    ||||||||||||| | ||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  47878370 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 47878315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 167 - 220
Target Start/End: Original strand, 54193209 - 54193264
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttggaaaa--cactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 220  Q
    ||||||||||||| | ||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  54193209 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 54193264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 95)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 32279948 - 32280299
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  32279948 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttcctatatatatagaccttgtatcatagtaaacttggagatagagggg-ctgaaacaagggtttaaaa 32280046  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgag 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  32280047 aggcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 32280146  T
Q  201 tctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  32280147 tctcttggttacgggaagagattgggacttcaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcgtt 32280246  T
Q  301 atagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32280247 atagtaaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 32280299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 9019877 - 9020228
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9019877 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactgagagatagagggggctaaaacaagggtttagaa 9019976  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  9019977 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaatcactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 9020076  T
Q  201 tctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatt 300  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  9020077 tctcttggttataggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-t 9020175  T
Q  301 atagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  9020176 atagtgaaacggggggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaa 9020228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 11983392 - 11983041
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  11983392 gcagatttgtttcaaattttaaacgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaaaggcttagaa 11983293  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  11983292 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 11983193  T
Q  201 tctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |    
T  11983192 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-t 11983094  T
Q  301 atagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||| | || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11983093 atagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 11983041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 29 - 353
Target Start/End: Original strand, 13057173 - 13057497
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13057173 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaagaacaaaactagggtttgtata 13057272  T
Q  129 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13057273 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattgggac 13057372  T
Q  229 tttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctccc 328  Q
    ||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  13057373 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctactctctccc 13057472  T
Q  329 acagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
     || |||||||||||||||||||||    
T  13057473 ccaaactaggtcaatttggaccgaa 13057497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 3 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 14507536 - 14507188
Alignment:
Q  3 agatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaag 102  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14507536 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtattagagcaaactttgagatagagggggctaaaacaagggtttagaaag 14507437  T
Q  103 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtc 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  14507436 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 14507337  T
Q  203 tcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattat 302  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||| | |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| | || | |||| |||    
T  14507336 tcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatacttatca-tat 14507239  T
Q  303 agtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||| || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14507238 agtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 14507188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 15533044 - 15532702
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15533044 gcagatttgttccaaattttaagttatacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 15532945  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgag 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15532944 aggtaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtttctttggaacaaacaatagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgag 15532845  T
Q  201 tctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatt 300  Q
    ||||||||| | |||||||||||| |||||| | |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  15532844 tctcttggtcatgggaagagattgggacttttggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-t 15532746  T
Q  301 atagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaattt 345  Q
    ||||||||||| |||| |||||| ||||  |||||||||||||||    
T  15532745 atagtgaaacggagggctgctctatccc-tagactaggtcaattt 15532702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 28241657 - 28241333
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28241657 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 28241558  T
Q  128 agagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 227  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||    
T  28241557 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 28241458  T
Q  228 ctttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcc 327  Q
    |||| | |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||| || |||| ||||||||||    
T  28241457 ctttcggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctctctcc 28241359  T
Q  328 cacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    | |||||||||| |||||||||||||    
T  28241358 cccagactaggtgaatttggaccgaa 28241333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 29 - 353
Target Start/End: Original strand, 13039733 - 13040057
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||  | |||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  13039733 cttttactataaatatagatattgtatcagtgtaaaccttgagatataggaggctgaaacaagggtttagaaaggcaagaacaaaacttgggtttgtata 13039832  T
Q  129 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13039833 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattgagac 13039932  T
Q  229 tttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctccc 328  Q
    |||   |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  13039933 tttgcgtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctccc 13040032  T
Q  329 acagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
      ||||||||||||||| |||||||    
T  13040033 ctagactaggtcaatttagaccgaa 13040057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 15541503 - 15541156
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15541503 gcagatttgttccaaattttaagttacacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 15541404  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgag 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||    
T  15541403 aggcaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagaattgag 15541304  T
Q  201 tctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatt 300  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| |||||| | ||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15541303 tctcttggtcacgagaagagattgggactttgggtaggattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatca-t 15541205  T
Q  301 atagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggac 349  Q
    ||||||||||  |  | ||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  15541204 atagtgaaacagaaagctgctctctcctccagactaggttaatttggac 15541156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 28 - 350
Target Start/End: Original strand, 3390357 - 3390679
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3390357 acttttactataaatatagacattgtatcagtataaaccttgagatagacggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 3390456  T
Q  128 agagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 227  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |     
T  3390457 agagtttttctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacagaaagagattgggg 3390556  T
Q  228 ctttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcc 327  Q
    |||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  3390557 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattacagtgaaacggagggctgctctctcc 3390656  T
Q  328 cacagactaggtcaatttggacc 350  Q
    | || ||||||||||||||||||    
T  3390657 cccatactaggtcaatttggacc 3390679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 1230585 - 1230261
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1230585 actttcactataaatatagaccttgtatcatagcaaactttgagatagagagggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 1230486  T
Q  128 agagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 227  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||  || ||    
T  1230485 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgactctcttggttattggaagaggctggga 1230386  T
Q  228 ctttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcc 327  Q
    |||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||| | || ||||||||||    
T  1230385 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggatggctgctctctcc 1230287  T
Q  328 cacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  1230286 cccagactaggtcaatttggaccgaa 1230261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 15530485 - 15530166
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  15530485 gcaggtttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactgggagatagagggggctgaagcaagggcttagaa 15530386  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgag 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  15530385 tggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 15530286  T
Q  201 tctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| |    
T  15530285 tctcttggttacgggaagagattgaggctttgggttgaattaggcgggagacttattcttgtaa-ccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-t 15530188  T
Q  301 atagtgaaacgaagggttgctc 322  Q
    |||||| |||| |||| |||||    
T  15530187 atagtggaacggagggctgctc 15530166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 31 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 3632271 - 3631951
Alignment:
Q  31 tttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtataga 130  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3632271 tttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggagttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtataga 3632172  T
Q  131 gtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactt 230  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  3632171 gtttgtctcttggcaacaaacactagggtttaagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctctttgttacggaaagagattgggactt 3632072  T
Q  231 tagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccac 330  Q
    | | ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| |||  |    
T  3632071 tgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctgtcc--c 3631974  T
Q  331 agactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  3631973 agactaggtcaatttggaccgaa 3631951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 36 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 14459093 - 14458779
Alignment:
Q  36 tataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttg 135  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14459093 tataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttg 14458994  T
Q  136 tctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagat 235  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||| | |    
T  14458993 tctcttgggaacaaacactagggtttgagggctgatt--ccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggt 14458896  T
Q  236 agaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagact 335  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||| | |  |||| ||||||||||| ||||||    
T  14458895 agaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagact 14458797  T
Q  336 aggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||||||||||||||||    
T  14458796 aggtcaatttggaccgaa 14458779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 29 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 3630199 - 3629877
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3630199 cttttactataaatatagacattgtatcaatgtaaaacttgagatagagggggctgaaacatcggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 3630100  T
Q  129 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 228  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | |    
T  3630099 gagtttgtctcttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagagattggggc 3630000  T
Q  229 tttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctccc 328  Q
    ||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || | |||||||||||  |||| |||||||||||    
T  3629999 tttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactaat-aatatagtgaaactgagggctgctctctccc 3629901  T
Q  329 acagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
     || |||||||||||||||||||||    
T  3629900 -catactaggtcaatttggaccgaa 3629877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 29 - 353
Target Start/End: Original strand, 25477253 - 25477584
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25477253 cttttactgtaaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatata 25477352  T
Q  129 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| | |    
T  25477353 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagattggggc 25477452  T
Q  229 tttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaa-------agttattcatcattatagtgaaacgaagggttgct 321  Q
    ||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||        |||| ||||||||||||||||||  |||| ||||    
T  25477453 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcgttactcatcattatagtgaaacagagggctgct 25477552  T
Q  322 ctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  25477553 ctctcccccatactaggtcaatttggaccgaa 25477584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 30729191 - 30728839
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  30729191 gcagatttgttccaaattttaagcggtacttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtatcgaa 30729092  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgag 200  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||     
T  30729091 agacaacaacaaaacttgggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggatttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgac 30728992  T
Q  201 tctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgata----tctcttttgtaaagttattcat 296  Q
    ||||||||||||||||||||  || | |||| | |||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||    ||||||||||||||||| ||||    
T  30728991 tctcttggttacgggaagaggctggggctttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaactcattgatatctttctcttttgtaaagttactcat 30728892  T
Q  297 cattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggacc 350  Q
     ||||||||| |||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30728891 -attatagtggaacggaaggctgctctctcccgcagactaggtcaatttggacc 30728839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 4816608 - 4816243
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--------------tagagggggctgaa 86  Q
    ||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||              ||||||||||||||    
T  4816608 gcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagagagagagatagagggggctgaa 4816509  T
Q  87 acaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaaca 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4816508 acaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaaca 4816409  T
Q  187 ctattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaa 286  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  4816408 ctattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaa 4816309  T
Q  287 agttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
     | || |||||| ||||||| |  | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4816308 cggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 4816243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 12195851 - 12195527
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12195851 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 12195752  T
Q  128 agagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgag 226  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  12195751 agagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 12195652  T
Q  227 actttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctc 326  Q
    |||||   ||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| |  | ||||||| |||||| |  | |||| |||||||||    
T  12195651 actttgagtagaattaatcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctc 12195554  T
Q  327 ccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    || ||||||||||||  ||||||||||    
T  12195553 ccccagactaggtcagattggaccgaa 12195527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 29 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 24338783 - 24338460
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24338783 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgcata 24338684  T
Q  129 gagtttgtctcttggaaacaaacactaggg-tttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 227  Q
     ||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||| |||    
T  24338683 aagtttgtgtcttagcaacaaacactaggggtttgagggttgatttaccttggaaaacactattaagattgagtcttttggttatggaaagagattaaga 24338584  T
Q  228 ctttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcc 327  Q
    |||| | |||||||||   | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||    
T  24338583 ctttgggtagaattagtcagaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctg--ctctcc 24338486  T
Q  328 cacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||    
T  24338485 cccagactatgtcaatttggaccgaa 24338460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Original strand, 30967176 - 30967503
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagc-aaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  30967176 acttttactataaatatagaccttgtat--aggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactatggtt 30967273  T
Q  123 tgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagat 222  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      
T  30967274 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 30967373  T
Q  223 tgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctc 322  Q
    ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||| | || || | |||||    
T  30967374 tgaaactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagagctgctc 30967472  T
Q  323 tctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  30967473 tctcccccaaactaggtcaatttggaccgaa 30967503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 19227771 - 19227514
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  19227771 gcagatttgttccaaattttaagggaaacttttactataaatatagatcttgtatcagagcaaactttgagataaagggggctcaaacaagggtttagaa 19227672  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  19227671 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctttttggatcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 19227572  T
Q  201 tctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattc 258  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||    
T  19227571 tctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattc 19227514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 20915721 - 20915368
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt---gagatagagggggctgaaacaagggttta 97  Q
    ||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  || || ||    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20915721 gcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcag-gctaaattgagagagatagagggggctgaaacaagggttta 20915623  T
Q  98 gaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgatt 197  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  20915622 gaaaggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 20915523  T
Q  198 -gagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcat 296  Q
     |||||||||||||||| |||||||||| |||||  | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| | || ||||    
T  20915522 ggagtctcttggttacgagaagagattgggacttcgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcat 20915424  T
Q  297 cattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    || ||||||| |  | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20915423 ca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 20915368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 29 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 3234065 - 3233742
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  3234065 cttttactataaatatagac-ttgtatcagtgtaaaccttaagatagagggggctgaaacaaggatttagaaagacaacaacaaaactaaggtttgtata 3233967  T
Q  129 gagtttgtctctt-ggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 227  Q
     |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3233966 tagtttgtctctttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagg 3233867  T
Q  228 ctttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcc 327  Q
    |||| | |||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||| ||| |  |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  3233866 ctttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactca-ccgtatagtgaaacggagggctgctctctcc 3233768  T
Q  328 cacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    | || ||||||||||||| |||||||    
T  3233767 cccacactaggtcaattttgaccgaa 3233742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 34 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 19704905 - 19704579
Alignment:
Q  34 actataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag------ggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19704905 actataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagagatggagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 19704806  T
Q  128 agagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgatt-gagtctcttggttacgggaagagattgag 226  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19704805 agagtttgtctcttaggagcaaacactagagtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 19704706  T
Q  227 actttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctct-tttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctct 325  Q
    ||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| | || |||||| ||||||| |  | |||| ||||||||    
T  19704705 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctctttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctct 19704607  T
Q  326 cccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19704606 cccccagactaggtcaatttggaccgaa 19704579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 2629226 - 2628898
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag-----ggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| ||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2629226 acttttactataaatatagaccttgtatcatgttaaactttgagagagagatagaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 2629127  T
Q  123 tgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagat 222  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2629126 tgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactaggttttaagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagat 2629027  T
Q  223 tgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctc 322  Q
    || |||||| | |||||||||| ||   | ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| | || |||||| ||||||| | || |||| |||||    
T  2629026 tgggactttgggtagaattaggcggagaatttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggatcggagggctgctc 2628929  T
Q  323 tctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2628928 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 2628898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 30034943 - 30034615
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  30034943 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttaagagagatagagggagctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagagttt 30034844  T
Q  124 gtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt 223  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||  |    
T  30034843 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcaattggttaagggaagaggct 30034744  T
Q  224 gagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctct 323  Q
    | |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||| | | || |||| ||||||    
T  30034743 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagcggatcggagggctgctct 30034645  T
Q  324 ctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  30034644 ctcccccagactgggtcaatttggaccgaa 30034615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 29 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 12161889 - 12161570
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12161889 cttttactttaaatatagacattgtatcattgtaaaccttgagataaagggg-ctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtata 12161791  T
Q  129 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 228  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12161790 gagtttgtctctgg--aacaaacactagggtttgagggttgtttcacgttgggaaacactattaagatcgagtctattggttacgggaagagattgagac 12161693  T
Q  229 tttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctccc 328  Q
    ||||| || ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| ||| | | || || ||||||||    
T  12161692 tttaggtataattaagtgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatca-tatagtaaaatggatggctgttctctccc 12161594  T
Q  329 acagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
      | ||||||| |||||||||||||    
T  12161593 -taaactaggttaatttggaccgaa 12161570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 26932906 - 26932574
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagg 119  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||        ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  26932906 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagagagatagagggggttgaaacaagggcttagaaaagcaataacaaaactagg 26932807  T
Q  120 gtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaag 218  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  26932806 gtttgtatagagtttgtctcttagaagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaag 26932707  T
Q  219 agattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggtt 318  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| |  | ||||||| |||||| |  | ||||||    
T  26932706 agattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcat-atagtggattggagggtt 26932609  T
Q  319 gctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  26932608 gctctctcccccagactaggtcagattggaccgaa 26932574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 28 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 3028186 - 3027876
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| | |||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  3028186 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaaccatgagataaaaggggctgaaaacaagggtttggaa-ggcaaca-caaaactagggtttgta 3028089  T
Q  127 tagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgag 226  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  3028088 tagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgtgaagagattgag 3027992  T
Q  227 actttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctct- 325  Q
    |||||   ||||||||||  ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| |||||| |     
T  3027991 actttgagtagaattaggctggagatttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctttc 3027892  T
Q  326 cccacagactaggtca 341  Q
    ||| ||||||||||||    
T  3027891 cccccagactaggtca 3027876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 69 - 353
Target Start/End: Original strand, 26065005 - 26065283
Alignment:
Q  69 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggtt 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||||||    
T  26065005 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttg---gaaacactagggtttgagggtt 26065101  T
Q  169 gattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaaccca 268  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  26065102 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 26065201  T
Q  269 ttgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||  |||| ||||||| |||| || | | ||||||| | || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26065202 ttgacttctc-tttgtaacgttactcgtta-tatagtggatcggagggctgctctctccc-cagactaggtcaatttggaccgaa 26065283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 69 - 353
Target Start/End: Original strand, 26084974 - 26085252
Alignment:
Q  69 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggtt 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||||||    
T  26084974 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttg---gaaacactagggtttgagggtt 26085070  T
Q  169 gattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaaccca 268  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  26085071 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 26085170  T
Q  269 ttgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||  |||| ||||||| |||| || | | ||||||| | || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26085171 ttgacttctc-tttgtaacgttactcgtta-tatagtggatcggagggctgctctctccc-cagactaggtcaatttggaccgaa 26085252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 62 - 353
Target Start/End: Original strand, 15719666 - 15719946
Alignment:
Q  62 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggttt 161  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||     
T  15719666 aaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatc--------aaactagggtttgtatagagtttg-cttttggcaacaaacactagggtt- 15719755  T
Q  162 gagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctag 261  Q
      | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||| |    
T  15719756 --gagttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttg 15719853  T
Q  262 taacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctct-cccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||    
T  15719854 taacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagagttgctctttccccccatactaggtcaatttggaccgaa 15719946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 29 - 306
Target Start/End: Original strand, 22490618 - 22490896
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggttta-gaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| || |  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22490618 cttttaccataaatatagacattgaattagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttttgaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 22490717  T
Q  128 agagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 227  Q
    | |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||    || |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  22490718 atagtttgcctctttggaacaaacactagggtttgaggaggtatacaccttgcgaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattggga 22490817  T
Q  228 ctttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtg 306  Q
    |||| | |||||||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  22490818 ctttgggtagaattatgcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaagattactcatcattatagtg 22490896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 1072240 - 1072067
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  1072240 gcagatttgttccaaattttaagcaatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaactttgagatagaaggagctgaaacaagggtttagaa 1072141  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattca 174  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||    
T  1072140 aggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgagttgattca 1072067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 170 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 1069913 - 1069730
Alignment:
Q  170 attcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccat 269  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  1069913 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 1069814  T
Q  270 tgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  1069813 tgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagagaaacggagggctgctctcttccccatactaggtcaatttggaccgaa 1069730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 29 - 353
Target Start/End: Original strand, 14466312 - 14466626
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| | |  |||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||              
T  14466312 cttttactatagatatagactttgtattagaataaaccttgagatagagagggttgaaacaagagtttagaaagacaacagcaaaactag---------- 14466401  T
Q  129 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggttt-gagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 227  Q
     ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  14466402 -agtttgtctattggcaacaaacactagggttttgaggattgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattggga 14466500  T
Q  228 ctttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcc 327  Q
     |||   |||||||||| | ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | |  |||| | |||    
T  14466501 gtttgagtagaattaggcgagagacatattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttattcatcattatagtgaaccggatgactgctgtttcc 14466600  T
Q  328 cacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    | || |||||||||||||||||||||    
T  14466601 cccatactaggtcaatttggaccgaa 14466626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 16455786 - 16455436
Alignment:
Q  2 cagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaa-caagggtttag 98  Q
    |||||||||||||| |||| || || || ||||||||||||||| ||||||||||   | |||| ||||||  ||||| |  |||||| |||||||||||    
T  16455786 cagatttgttccaatttttcagggatacctttactataaatatataccttgtatcggtgtaaaccttgagaggtagagagt-ctgaaaacaagggtttag 16455688  T
Q  99 aaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattg 198  Q
    || | |||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||    |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||     
T  16455687 aa-gtcaacacaaaaactagggtttgtacagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgt--ggttgattcaccttgggaaacactgttaggatta 16455592  T
Q  199 agtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatca 298  Q
    ||||||||| | |||| ||||||||| |||||| | |||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  16455591 agtctcttgctcacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaaattactcatca 16455492  T
Q  299 ttatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaat-ttggaccgaa 353  Q
    |||||||| |||| |||| ||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||    
T  16455491 ttatagtggaacggagggctgctctctcccccatactaggtcagtattggaccgaa 16455436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 35 - 304
Target Start/End: Original strand, 17012029 - 17012294
Alignment:
Q  35 ctataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaa-acaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 133  Q
    ||||||||||||||||||||||  || |||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  17012029 ctataaatatagaccttgtatcggagtaaaccttgagatagaggggtctgaataaaagggtttagaa-gtaaacaacaaa-ctagggtttgtataaagtt 17012126  T
Q  134 tgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttag 233  Q
    || ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||   ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||| |    
T  17012127 tg-ctcttggcaacaaacactagggtt-gagg-ttgattcaccttctgaaacaatattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattgatgcttttg 17012223  T
Q  234 atagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatag 304  Q
     |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  17012224 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcatcgttatag 17012294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 29 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 32447651 - 32447502
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32447651 cttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 32447552  T
Q  129 gagtttgtctcttggaaacaaacactag-ggtttgagggttgattcacct 177  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  32447551 gagtttgtctcttggcaacaaacactagagttttgagggttgattcacct 32447502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Original strand, 8995430 - 8995570
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8995430 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactgagagatagagggggctaaaacaagggtttagaa 8995529  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctt 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8995530 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctt 8995570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 353
Target Start/End: Original strand, 19696394 - 19696744
Alignment:
Q  3 agatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggg--ggctgaaa-caagggtttaga 99  Q
    ||||||||||||| |||| |  ||  |||||||||||||||||||||||||||   |  |||| |||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||    
T  19696394 agatttgttccaatttttgaaggattcttttactataaatatagaccttgtatatgatgaaaccttgagagagagggagggctgaaaacaagggtttaga 19696493  T
Q  100 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattga 199  Q
    ||   |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||  |   |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  19696494 aaca-aacaacaaat-tagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaatcactagggttcaaa--ttgattcaccttgggaaacactgttaggattga 19696588  T
Q  200 gtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtggga-gacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatca 298  Q
    ||||||| || || | |||||||||||||||| | |||||||||||  || |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19696589 gtctctttgtcactgaaagagattgagactttggttagaattaggtttgaagacttattcttgtaatcctttgatatctcttttgtaaagttattcatca 19696688  T
Q  299 ttatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaat-ttggaccgaa 353  Q
    |||||||| |||  |  | ||||||||| | |||||||||||| | ||||||||||    
T  19696689 ttatagtggaacagatagctgctctctctcccagactaggtcagtattggaccgaa 19696744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 166 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 12186271 - 12186083
Alignment:
Q  166 gttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtg-ggagacttattctagtaa 264  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | || ||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  12186271 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgttcacgggaagagattgagactttgggtacaattaggtttggagacttattcttgtaa 12186172  T
Q  265 cccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| |||||||| || | ||||||||||||||| ||||||    
T  12186171 ctcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctgcctcggactaggtcaatttgaaccgaa 12186083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 149 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 5273431 - 5273228
Alignment:
Q  149 aacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgg 247  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||    
T  5273431 aacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgg 5273332  T
Q  248 gagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttgg 347  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| |  | ||||| |||||||| |  | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5273331 gagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatc-ttatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgg 5273234  T
Q  348 accgaa 353  Q
    ||||||    
T  5273233 accgaa 5273228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 116 - 353
Target Start/End: Original strand, 15367101 - 15367334
Alignment:
Q  116 tagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacggg 215  Q
    ||||| |||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||  ||||    
T  15367101 taggggttgtattgtgtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactcttaggattgagtctcttcgtcgcggg 15367196  T
Q  216 aagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagg 315  Q
    |||||||||| ||||| | || |||||   |||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | |    
T  15367197 aagagattgaaactttgggtaaaattaatcgggagacttattcttgtaacccattaatatctctattgtaaagttattcatca-tatagtgaaacggaag 15367295  T
Q  316 gttgctctctc-ccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  15367296 gctgctctctctccccagactaggtcaatttggaccgaa 15367334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 36 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 13870749 - 13870608
Alignment:
Q  36 tataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttg 135  Q
    ||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  13870749 tataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagatagagggg-ctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatataaagtttg 13870651  T
Q  136 tctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 178  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13870650 tctcttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcacctt 13870608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 85 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 22858228 - 22857964
Alignment:
Q  85 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaa 184  Q
    |||||||||||||||| |  ||||  ||||||||||||||||  || ||| |||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||    
T  22858228 aaacaagggtttagaa-gctaacacaaaaactagggtttgta--gaattt-tctcttggtaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcaccttgggaaa 22858135  T
Q  185 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattagg-tgggagacttattctagtaaccc-attgatatctctttt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||| ||||| | | ||||| ||||| |||||||  ||||||| || |||    
T  22858134 cactattatgattgagtctcttggtcacaagaagagattgagactttaggtagatttaggtttgaagactaattcttgtaacccttttgatatatc-ttt 22858036  T
Q  283 gtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaat-ttggaccgaa 353  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||| | || ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  22858035 gtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaa 22857964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 158
Target Start/End: Original strand, 17852520 - 17852650
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||    
T  17852520 acttttactataaatatagactttgaatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtat 17852619  T
Q  128 agagtttgtctcttggaaacaaacactaggg 158  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  17852620 agagtttgtctctttcgaacaaacactaggg 17852650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 182 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 26066306 - 26066136
Alignment:
Q  182 aaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctctt 280  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| |    
T  26066306 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-t 26066208  T
Q  281 ttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||| |||| | ||||  |||||| | || |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  26066207 ttgtaacgttacttatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaa 26066136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 182 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 26068577 - 26068407
Alignment:
Q  182 aaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctctt 280  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |    
T  26068577 aaacactattaggattggagtctcttgcttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-t 26068479  T
Q  281 ttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||| |||  ||||||  |||||| | || |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  26068478 ttgtaacgttgctcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaa 26068407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 165 - 353
Target Start/End: Original strand, 26945258 - 26945448
Alignment:
Q  165 ggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattagg-tgggagacttattctagta 263  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||||| | | ||||||||| | |||    
T  26945258 ggttgagtcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgtagacttatttttgta 26945357  T
Q  264 acccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtca-atttggaccgaa 353  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||  |||||| ||| |||| || ||||  |||||||||||    
T  26945358 actcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtagaacgaagggcagctctcccccccagattatgtcaggtttggaccgaa 26945448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 111 - 326
Target Start/End: Original strand, 20526871 - 20527081
Alignment:
Q  111 aaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggtt 210  Q
    |||||||||| |||||  ||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  20526871 aaaactaggggttgta--gagtttg-ctcttgacaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtc 20526965  T
Q  211 acgggaagagattgagactttagatagaattagg-tgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaa 309  Q
    ||  ||||||||| ||||||| | |||||||||| | | ||||| ||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20526966 acaagaagagattaagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccttttgatatctc-tttgtaaagttattcatcattatagtggaa 20527064  T
Q  310 cgaagggttgctctctc 326  Q
    || || | |||||||||    
T  20527065 cggagagctgctctctc 20527081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 182 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 29754891 - 29754721
Alignment:
Q  182 aaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctctt 280  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||| |    
T  29754891 aaacactattaggattggagtctcttggttacggaaagagattgggactttaggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctc-t 29754793  T
Q  281 ttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||| |||| ||||||  |||||| | || |||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  29754792 ttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaa 29754721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 182 - 353
Target Start/End: Original strand, 33308989 - 33309158
Alignment:
Q  182 aaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctctt 280  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |||| |    
T  33308989 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatttctc-t 33309086  T
Q  281 ttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||| |||| ||||||  |||||| | || |||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  33309087 ttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaa 33309158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 249 - 353
Target Start/End: Original strand, 15346546 - 15346649
Alignment:
Q  249 agacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttgga 348  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |  | ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15346546 agacttattcttgtaacccattgatatctctattgtaaagttattcatca-tatagtgaaacggaaagctgctctctcccccagactaggtcaatttgga 15346644  T
Q  349 ccgaa 353  Q
    |||||    
T  15346645 ccgaa 15346649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 182 - 353
Target Start/End: Original strand, 33311258 - 33311427
Alignment:
Q  182 aaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctctt 280  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |||| |    
T  33311258 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatttctc-t 33311355  T
Q  281 ttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||| |||| ||||||  |||||| | || |||| |||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  33311356 ttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctttctcccccagactaggtcagattggaccgaa 33311427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 167 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 25078755 - 25078611
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtggga-gacttattctagtaac 265  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| || || |||||||||||  || |||||||||| |||||    
T  25078755 ttgattcaccttggtaaacaccgttaagattgagtctcttggtcacggaaagagattgagatttaag-tagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 25078657  T
Q  266 ccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacg 311  Q
    || ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||    
T  25078656 cctttgatatctcttttgtaaagttactcgtcattacagtggaacg 25078611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 168 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 28037927 - 28037750
Alignment:
Q  168 tgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggaga-cttattctagtaacc 266  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||| | |||| || ||||||||||||| | |||||||||||   | | |||||||| ||||||    
T  28037927 tgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtcccttgttcacggaaatagattgagactttgggtagaattaggtttaaaatcttattcttgtaacc 28037828  T
Q  267 cattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaa---acgaagggttgctctctcccacagactaggtca 341  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |   ||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  28037827 ctttgatatctcttttgtaaagttactcatcataatagtggacggacgaaaggctgctctctcccccagtctaggtca 28037750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 188
Target Start/End: Original strand, 15346347 - 15346517
Alignment:
Q  6 tttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggca 105  Q
    |||||||||| || | || || ||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||          
T  15346347 tttgttccaatttatgagggatacttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaccaagggtttaga------ 15346440  T
Q  106 acaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacact 188  Q
      |   ||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||    
T  15346441 --attcaaactagggtttgtataaaatttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacact 15346517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 181 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 12911630 - 12911471
Alignment:
Q  181 aaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtggga-gacttattctagtaacccattgatatctct 279  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| || |||  || ||||||||||||| | |||| ||||||  || | || ||||| ||||||  || ||||||||    
T  12911630 aaaacactattaagattgagtctcttagtcacgataatagattgagacttttggtagagttaggtttgaaggctaattcttgtaaccatttaatatctct 12911531  T
Q  280 tttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtc 340  Q
    || ||||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  12911530 tt-gtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtc 12911471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 181 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 12937377 - 12937219
Alignment:
Q  181 aaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtggga-gacttattctagtaacccattgatatctct 279  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| || ||| ||| ||||||| ||||| | |||||||||||  || | || ||||| ||||||  || ||||||||    
T  12937377 aaaacactattaagattgagtctcttagtcacgagaatagattgaaacttttggtagaattaggtttgaaggctaattcttgtaaccatttaatatctct 12937278  T
Q  280 tttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtc 340  Q
    || ||||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  12937277 tt-gtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccc-cagactaggtc 12937219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 29 - 142
Target Start/End: Original strand, 10584105 - 10584213
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||||||||||     |||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  10584105 cttttactataaatataaacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggg-----aaacaaaggtttataaaagcaacaacaaaactagagtttgtata 10584199  T
Q  129 gagtttgtctcttg 142  Q
    ||||||||||||||    
T  10584200 gagtttgtctcttg 10584213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 26068662 - 26068590
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagat 73  Q
    ||||||||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26068662 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagat 26068590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 3 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 26066389 - 26066319
Alignment:
Q  3 agatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagat 73  Q
    ||||||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26066389 agatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagat 26066319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 182 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 7542566 - 7542456
Alignment:
Q  182 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaga-ttgagactttagatagaattagg-tgggagacttattctagtaacccattgatatctct 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||| |||||||||||| | | ||||| ||| | ||||||| ||||||||||     
T  7542566 aaacactattatgattgagtctcttggtcacgggaagagatttgggaatttggatagaattaggtttgaagactaatttttgtaaccctttgatatctc- 7542468  T
Q  280 tttgtaaagtta 291  Q
    ||||||||||||    
T  7542467 tttgtaaagtta 7542456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 282 - 353
Target Start/End: Original strand, 10584227 - 10584298
Alignment:
Q  282 tgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  10584227 tgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgaa 10584298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 3 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 12186431 - 12186330
Alignment:
Q  3 agatttgttccaaattttaagcgaa-acttttactataaatatagaccttgtatca-aagcaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttaga 99  Q
    ||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| | | |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  12186431 agatttgttccaattttttagcgattacttttactataaatataaaccttgtatcacatgtaaaccttgagatagaaggggctgaaaacaagggtttaga 12186332  T
Q  100 aa 101  Q
    ||    
T  12186331 aa 12186330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 225 - 341
Target Start/End: Original strand, 30445698 - 30445815
Alignment:
Q  225 agactttagatagaattaggtggga-gacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctct 323  Q
    ||||||| | |||||||||||  || |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||   ||||||    
T  30445698 agactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactgctct 30445797  T
Q  324 ctcccacagactaggtca 341  Q
    ||||  || |||||||||    
T  30445798 ctccaccatactaggtca 30445815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 167 - 242
Target Start/End: Original strand, 11138423 - 11138499
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttgga-aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaatta 242  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  11138423 ttgattcaccttggagaaacactattaggattgagtcacttggtcacgggaagagatggggactttaggtagaatta 11138499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 29755059 - 29754983
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag 77  Q
    |||||||||||  | |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  29755059 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactctgagagagag 29754983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 246 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 25465709 - 25465630
Alignment:
Q  246 gggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctc 326  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||  |||||||||    
T  25465709 gggagacttattcttgtacccctttgatatctcttt-gtaaagttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctc 25465630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 249 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 28078310 - 28078254
Alignment:
Q  249 agacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtg 306  Q
    ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28078310 agacttattcttgtaacct-ttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtg 28078254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 33308905 - 33308966
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagca 62  Q
    |||||||||||  | |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33308905 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagca 33308966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 33311174 - 33311235
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagca 62  Q
    |||||||||||  | |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33311174 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagca 33311235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 353
Target Start/End: Original strand, 11262600 - 11262762
Alignment:
Q  194 gattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattagg-tgggagacttattctagtaa---cccattgatatctcttttgtaaagt 289  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||| | | ||||| |||||  |||   ||  |||||||||| |||||||||     
T  11262600 gattgagtctcttggtcacaggaagagattgaga-tttaggtagaattaggtttgaagactaattcttataacctccttttgatatctc-tttgtaaaga 11262697  T
Q  290 tattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaat-ttggaccgaa 353  Q
     | ||||||||||| || |||| ||   ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  11262698 aactcatcattatattgtaacggagaactgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaa 11262762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 24542873 - 24542756
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttgga--aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattga-gactttagatagaattaggtgggagacttattctagta 263  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| ||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||   | | | ||||| |||    
T  24542873 ttgattcaccttgaataaaacacttttaggatagagtctcatggttacgagaagagattcatgactttggatagaattaggtttaaaattgattcttgta 24542774  T
Q  264 acccattgatatctcttt 281  Q
    |||| |||||||||||||    
T  24542773 accctttgatatctcttt 24542756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 255 - 311
Target Start/End: Original strand, 3833481 - 3833538
Alignment:
Q  255 attctagtaacccattgatatctcttttgtaaagtt-attcatcattatagtgaaacg 311  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  3833481 attcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttaactcatcattatagtggaacg 3833538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 3577713 - 3577658
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttgga--aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 220  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  3577713 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 3577658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 160
Target Start/End: Original strand, 4595046 - 4595102
Alignment:
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtt 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  4595046 aggcaacaacaaaactagggtttg--tagagttt-tcacttggcaacaaacactagggtt 4595102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 220
Target Start/End: Original strand, 13878710 - 13878765
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttgga--aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 220  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  13878710 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 13878765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 220
Target Start/End: Original strand, 13883458 - 13883513
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttgga--aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 220  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  13883458 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 13883513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 220
Target Start/End: Original strand, 16785902 - 16785957
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttgga--aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 220  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16785902 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 16785957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 72
Target Start/End: Original strand, 18318004 - 18318048
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 72  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  18318004 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgaga 18318048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 26887423 - 26887368
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttgga--aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 220  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  26887423 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 26887368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 31248913 - 31248858
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttgga--aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 220  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  31248913 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 31248858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 35201525 - 35201470
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttgga--aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 220  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  35201525 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 35201470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 12911812 - 12911710
Alignment:
Q  3 agatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaa--tatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagag-ggggctgaaacaagggtttag 98  Q
    |||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||   |||| |||||||| || ||||||||||  |||||||||    
T  12911812 agatttattccaaatttttagggatacttttactataaatatatagacattgtatcaaatataaaccttgagatacagaggggctgaaaacagggtttag 12911713  T
Q  99 aaa 101  Q
    |||    
T  12911712 aaa 12911710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 12937559 - 12937457
Alignment:
Q  3 agatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaa--tatagaccttgtatca-aagcaaactttgagatagag-ggggctgaaacaagggtttag 98  Q
    |||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||  ||||||| |||||||| | | |||| |||||||| || ||||||||||  |||||||||    
T  12937559 agatttattccaaatttttagggatacttttactataaatatatagacattgtatcagatgtaaaccttgagatacagaggggctgaaaacagggtttag 12937460  T
Q  99 aaa 101  Q
    |||    
T  12937459 aaa 12937457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 19702061 - 19701996
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttggaaaa--cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactt 230  Q
    ||||||||||||| | ||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  19702061 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagactt 19701996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 209
Target Start/End: Original strand, 6843186 - 6843287
Alignment:
Q  104 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgga-aaacactattatgattgagtc 202  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||| |||   |||||| ||||||||||||||||  ||| |||| |||||||| | | |||| |||| |||||||||    
T  6843186 caacaataaaactatggtttgtagagaattt---tcttggcaacaaacactagggtt--aggattgaatcaccttgaacacacaccattaggattgagtc 6843280  T
Q  203 tcttggt 209  Q
    |||||||    
T  6843281 tcttggt 6843287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 194 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 5165985 - 5165949
Alignment:
Q  194 gattgagtctcttggttacgggaagagattgagactt 230  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  5165985 gattgagtctcttggtcacgggaagagattgggactt 5165949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 167 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 13467662 - 13467607
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttggaaaa--cactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 220  Q
    ||||||||||||| | ||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  13467662 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 13467607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 167 - 220
Target Start/End: Original strand, 17036038 - 17036093
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttggaaaa--cactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 220  Q
    ||||||||||||| | ||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  17036038 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 17036093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 167 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 17695050 - 17694995
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttggaaaa--cactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 220  Q
    ||||||||||||| | ||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  17695050 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 17694995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 185 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 22352031 - 22351972
Alignment:
Q  185 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggt 245  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||| | |||||||||||    
T  22352031 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgaga-tttgggtagaattaggt 22351972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 128)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 22803097 - 22802746
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22803097 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 22802998  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgag 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  22802997 tggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 22802898  T
Q  201 tctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |    
T  22802897 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaatgttactcatca-t 22802799  T
Q  301 atagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  22802798 atagtggaacggagggtttctctctcccccagactaggtcaatttgaaccgaa 22802746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 48486289 - 48486636
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48486289 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 48486388  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgag 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  48486389 tggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 48486488  T
Q  201 tctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||| |    
T  48486489 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgaaatctcttttgtaacgttactcatca-t 48486587  T
Q  301 atagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggac 349  Q
    ||||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48486588 atagtgaaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggac 48486636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 24880421 - 24880773
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  24880421 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcggagtaaacttggagatagagggggcgtaaactagggtttagaa 24880520  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  24880521 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttggttcaccttgggaaacactattaggattgag 24880620  T
Q  201 tctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaa-gttattcatcat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||     
T  24880621 tctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgttacgcatca- 24880719  T
Q  300 tatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24880720 tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 24880773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 22801225 - 22800874
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22801225 gcagatttgtttcaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 22801126  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgag 200  Q
     | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22801125 tgacaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgag 22801026  T
Q  201 tctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatt 300  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |    
T  22801025 tctcttgattacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-t 22800927  T
Q  301 atagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||| |||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22800926 atagtggaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 22800874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 5 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 40091774 - 40091427
Alignment:
Q  5 atttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggc 104  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  40091774 atttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagac 40091675  T
Q  105 aacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctc 204  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40091674 aacaacaaaactagggattgtttagagtttgtctctttggaacaaacactatggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctc 40091575  T
Q  205 ttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatag 304  Q
    ||||||||||||||||  || |||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  40091574 ttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaatgttactcatca-tatag 40091476  T
Q  305 tgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||||  |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  40091475 tgaaacagagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaa 40091427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 5 - 353
Target Start/End: Original strand, 24878963 - 24879311
Alignment:
Q  5 atttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggc 104  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  24878963 atttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatccgagtaaacttggagatagagggggctgaaactagggtttagaaagac 24879062  T
Q  105 aacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  24879063 aacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacaccagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctc 24879162  T
Q  205 ttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaa-gttattcatcattata 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||| ||||    
T  24879163 ttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgatacacatca-tata 24879261  T
Q  304 gtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24879262 gtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 24879311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 24888766 - 24889117
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24888766 gcagatttgttccaaattttaagcaatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttagagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 24888865  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgag 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  24888866 aggcaacaacaaaactagggattgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggctttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 24888965  T
Q  201 tctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||| |  |||||| | |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| |    
T  24888966 tctcttggttacgggaagagactaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcatgtaacccattgatatctcttttgtaacgttacttatca-t 24889064  T
Q  301 atagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24889065 atagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 24889117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Original strand, 40637071 - 40637395
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40637071 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 40637170  T
Q  128 agagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 227  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40637171 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatcgagtctcttggttacgggaagagattgaga 40637270  T
Q  228 ctttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcc 327  Q
    |||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||| | || ||||||||||    
T  40637271 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggatggctgctctctcc 40637369  T
Q  328 cacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  40637370 cccagactaggtcaatttggaccgaa 40637395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 5198390 - 5198741
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5198390 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 5198489  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgag 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  5198490 aggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcactttgggaaacactattaggattgag 5198589  T
Q  201 tctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatt 300  Q
    ||| |||||||||||||||||||| | ||||   |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |    
T  5198590 tcttttggttacgggaagagattggggctttgtgtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatca-t 5198688  T
Q  301 atagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||| |  | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5198689 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 5198741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 47274697 - 47275046
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47274697 gcagatttgtttcaaattttaagcaatacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 47274796  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  47274797 aggcaacaacaaaactagggtttgtata-agtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgag 47274895  T
Q  201 tctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatt 300  Q
    |||||||||||||||||||   || |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  47274896 tctcttggttacgggaagaagctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-t 47274994  T
Q  301 atagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47274995 atagtgaaacggagggctgctctctccc-cagactaggtcaatttggaccgaa 47275046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 11434925 - 11435275
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11434925 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 11435024  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  11435025 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 11435124  T
Q  201 tctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatt 300  Q
    |||| ||||||| |||||||  |  |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||| |    
T  11435125 tctcctggttaccggaagagtctaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-t 11435222  T
Q  301 atagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||| | || |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  11435223 atagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaa 11435275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 22044753 - 22044403
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22044753 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatataggccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 22044654  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||    
T  22044653 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattccccttgggaaacactattaggattgag 22044554  T
Q  201 tctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||| | |||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||| |    
T  22044553 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-t 22044456  T
Q  301 atagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||| | || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22044455 atagtggatcggagggctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaa 22044403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 22047048 - 22046698
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22047048 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatataggccttgtatcggagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 22046949  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  22046948 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcttttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 22046849  T
Q  201 tctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||| |    
T  22046848 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-t 22046751  T
Q  301 atagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||| | || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22046750 atagtggatcggagggctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaa 22046698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 9148221 - 9148573
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttag 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  9148221 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatataggccttgtatcagagcaaactttgagagatagagggggctgaagcaagggtttag 9148320  T
Q  99 aaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattg 198  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  9148321 aaaggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 9148420  T
Q  199 agtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatca 298  Q
    ||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||    
T  9148421 agtctcttggttacgggaagaggctgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca 9148519  T
Q  299 ttatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
     ||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  9148520 -tatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaa 9148573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Original strand, 36378289 - 36378614
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36378289 acttttactataaatatagactttgtatcagaataaaccttgagatagacggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 36378388  T
Q  128 agagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 227  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  36378389 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctcttagttacgggaagagattggga 36378488  T
Q  228 ctttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcc 327  Q
    |||| | |||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  36378489 ctttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctcttgtgaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcc 36378588  T
Q  328 cacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  36378589 cccagactaggtcaatttggaccgaa 36378614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 36919950 - 36919596
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttga--gatagagggggctgaaacaagggtttag 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  36919950 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgatagatatagggggctgaaacaagggtttag 36919851  T
Q  99 aaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctt-ggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgatt 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  36919850 aaaggcaacaacaaaactagggtttggataaagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 36919751  T
Q  198 gagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatc 297  Q
    |||||||||||||||||||||||  || |||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36919750 gagtctcttggttacgggaagaggctgggacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacgttattcatc 36919651  T
Q  298 attatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    | ||||||| ||   | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  36919650 a-tatagtggaatagatggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaa 36919596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 51015216 - 51015566
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51015216 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagactttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 51015315  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  51015316 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagtgtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 51015415  T
Q  201 tctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||   || |||||||     
T  51015416 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacaatactcatcat- 51015513  T
Q  301 atagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||| | || |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  51015514 atagtggatcggaggtctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaa 51015566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 30 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 33415821 - 33415500
Alignment:
Q  30 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 129  Q
    |||||||| |||||||| | |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33415821 ttttactacaaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtatag 33415722  T
Q  130 agtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagact 229  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33415721 agtttgtctcttggaa-caaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagatcgagtctcttggttacgggaagagattgaggct 33415623  T
Q  230 ttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctccca 329  Q
    || | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||     
T  33415622 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccct 33415524  T
Q  330 cagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  33415523 caggctaggtcaatttggaccgaa 33415500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 29 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 12396180 - 12395857
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || | |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12396180 cttttactataaatatagacattgtataaatgtaaaccttgagatagatggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 12396081  T
Q  129 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 228  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12396080 gagtttgtctctagccaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtgac 12395981  T
Q  229 tttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctccc 328  Q
    ||| | |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  12395980 tttgggtagaattaggcgggagacttattgttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacggggggctgctctctccc 12395882  T
Q  329 acagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  12395881 ccagactaggtcaatttggaccgaa 12395857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 29 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 12401142 - 12400819
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || | |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12401142 cttttactataaatatagacattgtataaatgtaaaccttgagatagatggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 12401043  T
Q  129 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 228  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12401042 gagtttgtctctggccaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattgtgac 12400943  T
Q  229 tttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctccc 328  Q
    ||| | |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  12400942 tttgggtagaattaggcgggagacttattgttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacggggggctgctctctccc 12400844  T
Q  329 acagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  12400843 ccagactaggtcaatttggaccgaa 12400819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Original strand, 14633317 - 14633639
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14633317 actttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaaggg-ctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtat 14633415  T
Q  128 agagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 227  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  14633416 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttac-ggaagagattggga 14633514  T
Q  228 ctttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcc 327  Q
    |||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  14633515 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcc 14633613  T
Q  328 cacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  14633614 ctcagactaggtcaatttggaccgaa 14633639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 37089737 - 37089384
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt---gagatagagggggctgaaacaagggttta 97  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37089737 gcagatttgttccaaattttaagcaaaacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaacttgagagagatagagggggctgaaacaagggttta 37089638  T
Q  98 gaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgatt 197  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  37089637 gaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 37089538  T
Q  198 gagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatc 297  Q
    |||||||||| ||||||||||||  || |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||    
T  37089537 gagtctcttgattacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatc 37089439  T
Q  298 attatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    | ||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37089438 a-tatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 37089384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 8631759 - 8631431
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 123  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8631759 actttcactataaatatagactttgtatcaaagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 8631660  T
Q  124 gtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt 223  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |    
T  8631659 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 8631560  T
Q  224 gagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctct 323  Q
    | |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||| | || |||| ||||||    
T  8631559 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctct 8631461  T
Q  324 ctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8631460 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 8631431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 36921858 - 36921505
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttag 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  36921858 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttacaataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagagatagaggggg-tgaaacaagggcttag 36921760  T
Q  99 aaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctt-ggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgatt 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  36921759 aaaggcaacaacaaaactagggtttgtatatagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 36921660  T
Q  198 gagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatc 297  Q
    |||||||||||||||||||||||  || |||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  36921659 gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacgttactcatc 36921560  T
Q  298 attatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    | ||||||| |||| | || ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  36921559 a-tatagtggaacggatggctgctctctcccccagactagttaaatttggaccgaa 36921505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Original strand, 16453306 - 16453631
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||     
T  16453306 acttttgctataaatataggctttgtatcagagcaaaccgagagatagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagagtttgtac 16453405  T
Q  128 agagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 227  Q
    | |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  16453406 aaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggga 16453505  T
Q  228 ctttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcc 327  Q
    |||| | ||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  16453506 ctttgggtagtattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagatggttgctctctcc 16453605  T
Q  328 cacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  16453606 cccagactaggtcaatttggaccgaa 16453631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 18847123 - 18847473
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18847123 gcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaaaacaaactttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaa 18847222  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgatt-ga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||    
T  18847223 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagagtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagcattgga 18847322  T
Q  200 gtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| | || ||||||     
T  18847323 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca- 18847420  T
Q  300 tatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||||| |  | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18847421 tatagtggattggagggctgctctctccc-cagactaggtcaatttggaccgaa 18847473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Original strand, 47868398 - 47868722
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47868398 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagagggctgaaagaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 47868497  T
Q  128 agagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 227  Q
    |||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  47868498 agagtttgtctccttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgaga 47868597  T
Q  228 ctttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcc 327  Q
    |||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| ||||||| |||| | || ||||||||||    
T  47868598 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatca-tatagtggaacggatggctgctctctcc 47868696  T
Q  328 cacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    | || |||||||||||||||||||||    
T  47868697 cccatactaggtcaatttggaccgaa 47868722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 28 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 14787769 - 14787444
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14787769 acttttactataaatatagaccttgtatcatactaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgt 14787670  T
Q  126 atagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattga 225  Q
    ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14787669 atagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgt 14787570  T
Q  226 gactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttg--ctct 323  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| |||| ||  ||||    
T  14787569 gactttggatagaattaggtgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctct 14787471  T
Q  324 ctcccacagactaggtcaatttggacc 350  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||    
T  14787470 ctcccccagactaggtcaatttggacc 14787444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 30 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 37313400 - 37313080
Alignment:
Q  30 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 129  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  37313400 ttttactataaatataggttttgtatcaaagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatag 37313301  T
Q  130 agtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagact 229  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |    
T  37313300 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagagttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgggatt 37313201  T
Q  230 ttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctccca 329  Q
    || | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||     
T  37313200 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctttcccc 37313101  T
Q  330 cagactaggtcaatttggacc 350  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  37313100 cagactatgtcaatttggacc 37313080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 33 - 353
Target Start/End: Original strand, 41997494 - 41997813
Alignment:
Q  33 tactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagt 132  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  41997494 tactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagtgttcagaaaggaaacaacaaaactagagtttgtatagagt 41997593  T
Q  133 ttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagacttta 232  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||     
T  41997594 ttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaaaagattgagattttg 41997693  T
Q  233 gatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacag 332  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||| |||    
T  41997694 ggtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccctttaatatctcttttgtaaagttactcatcatcatagtgaaacggagggccgctctctccc-cag 41997792  T
Q  333 actaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  41997793 actaggttaatttggaccgaa 41997813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 38409169 - 38409525
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggt 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||      |||||||||||||||||| |||    
T  38409169 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagggagatagagggggctgaaacaatggt 38409268  T
Q  95 ttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatg 194  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  38409269 ttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagg 38409368  T
Q  195 attgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||| | ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| | || ||    
T  38409369 attgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactc 38409467  T
Q  295 atcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||| ||||||| | || |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  38409468 atca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaa 38409525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 9176837 - 9176486
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||||||||| ||  |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9176837 gcagatttgttacagtttttaagcaagacatttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 9176738  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgatt-ga 199  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||    
T  9176737 aagcaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 9176638  T
Q  200 gtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| | || ||||||     
T  9176637 gtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca- 9176540  T
Q  300 tatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||||| |  | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9176539 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 9176486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 29 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 38928513 - 38928189
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38928513 cttttactataaatataggctttgtattagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 38928414  T
Q  129 gagtttgtctctt-ggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 227  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |     
T  38928413 gagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggg 38928314  T
Q  228 ctttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcc 327  Q
    |||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  38928313 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtaaaacggagggctgctctctcc 38928215  T
Q  328 cacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  38928214 cccagactaggtcaatttggaccgaa 38928189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 3 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 619808 - 619460
Alignment:
Q  3 agatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaag 102  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  619808 agattttttccaaattttaaacgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttataaag 619709  T
Q  103 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtc 202  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| |     
T  619708 acaacaacaaaactagggtttgcatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgactg 619609  T
Q  203 tcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattat 302  Q
    ||||||||| |||||||||||| | |||| | |||||||||| |||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||    
T  619608 tcttggttaagggaagagattgggtctttgggtagaattaggcgggaaaattattcttataacccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tat 619510  T
Q  303 agtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||||||| | |  ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  619509 agtgaaacggatgactgctctctccc-ctaactaggtcaatttggaccgaa 619460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 7941289 - 7941644
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaac--tttgagatagagggggctgaaacaagggtttag 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7941289 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagacgttgtatcagagcaaaccgggagagatagagggggctgaaacaagggtttag 7941388  T
Q  99 aaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaa--cactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgat 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  7941389 aaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttacgagcaaatgcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggat 7941488  T
Q  197 tgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcat 296  Q
    |||||||||||||||| |||||||  || |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||    
T  7941489 tgagtctcttggttacaggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcat 7941588  T
Q  297 cattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    || ||||||| |  | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7941589 ca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 7941644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 5637832 - 5637530
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggttt 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    ||||||||||||||||||| ||||    
T  5637832 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtataagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagagttt 5637733  T
Q  97 agaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  5637732 agaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggat 5637633  T
Q  197 tgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||||| | ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  5637632 tgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcat 5637533  T
Q  297 cat 299  Q
    |||    
T  5637532 cat 5637530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 9174509 - 9174158
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||||||||| ||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9174509 gcagatttgttacagtttttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 9174410  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattg-a 199  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  9174409 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggttcgtgagttgattcaccttgggaaacactattaggattgaa 9174310  T
Q  200 gtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||| | || ||||||     
T  9174309 gtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaactcattgatttctc-tttgtaacggtactcatca- 9174212  T
Q  300 tatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||||| |  | |||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  9174211 tatagtggattggagggctgttctctgccccagactaggtcaatttggaccgaa 9174158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 16934506 - 16934155
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16934506 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgatacaagggtttagaa 16934407  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattg-a 199  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |    
T  16934406 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattgga 16934307  T
Q  200 gtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| |  | |||||||    
T  16934306 gtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcat 16934208  T
Q  300 tatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
     |||||| |  | |||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  16934207 -atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaa 16934155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 31849962 - 31849611
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31849962 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactagaaatataggtcttgtatcagagcaaactaggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 31849863  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacact-agggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  31849862 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 31849763  T
Q  200 gtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcat 299  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||||||| | |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| | || ||||||     
T  31849762 gtctcttgcttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatca- 31849665  T
Q  300 tatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||||| | || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  31849664 tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgaaccgaa 31849611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Original strand, 24348211 - 24348539
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24348211 acttttactataaatatagaccttgtatcaagctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaggttt 24348310  T
Q  124 gtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt 223  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |    
T  24348311 gtatagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 24348410  T
Q  224 gagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctct 323  Q
    | |||||| | |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||| | || |||| ||||||    
T  24348411 gggactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctct 24348509  T
Q  324 ctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  24348510 ctcccccatactaggtcaatttggaccgaa 24348539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Original strand, 6764836 - 6765165
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6764836 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 6764935  T
Q  128 agagtttgtctcttg-----gaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagat 222  Q
    ||||||||||||||      | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||      
T  6764936 agagtttgtctctttagtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggttatgggaagaggc 6765035  T
Q  223 tgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctc 322  Q
    || |||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||| |  | |||| |||||    
T  6765036 tgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggattggagggctgctc 6765134  T
Q  323 tctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6765135 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 6765165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 44600174 - 44599850
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44600174 acttttactataaatatagaccttgtattaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 44600075  T
Q  128 agagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgag 226  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  44600074 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 44599975  T
Q  227 actttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctc 326  Q
    ||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||| |  | ||||||| |||||| |  | |||| |||||||||    
T  44599974 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctc 44599877  T
Q  327 ccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    || ||||||||||||  ||||||||||    
T  44599876 ccccagactaggtcagattggaccgaa 44599850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 16932152 - 16931801
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16932152 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatataaaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgatacaagggtttagaa 16932053  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattg-a 199  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |    
T  16932052 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtctgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattgga 16931953  T
Q  200 gtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| |  | |||||||    
T  16931952 gtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcat 16931854  T
Q  300 tatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
     |||||| |  | |||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  16931853 -atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaa 16931801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 35 - 353
Target Start/End: Original strand, 19322701 - 19323016
Alignment:
Q  35 ctataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 134  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19322701 ctataaatatagatcttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggatgaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtatagagttt 19322799  T
Q  135 gtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttaga 234  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |     
T  19322800 g-ctcttggcaacaaacactagggtttg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttggg 19322896  T
Q  235 tagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagac 334  Q
    |||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||    
T  19322897 tagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggatgctctctcccccagac 19322996  T
Q  335 taggtca-atttggaccgaa 353  Q
    |||||||  |||||||||||    
T  19322997 taggtcagttttggaccgaa 19323016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 29 - 350
Target Start/End: Original strand, 19095880 - 19096201
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||    
T  19095880 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtata 19095979  T
Q  129 gagtttgtctc-ttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt-gag 226  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19095980 gagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgtgaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattagag 19096079  T
Q  227 actttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctc 326  Q
     |||| | |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||||||||| || | |||||||||    
T  19096080 -ctttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttacttatca-tatagtgaaacggagagctgctctctc 19096177  T
Q  327 ccacagactaggtcaatttggacc 350  Q
    || |||||||||||||||||||||    
T  19096178 ccccagactaggtcaatttggacc 19096201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 2485209 - 2484885
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagataga-gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 126  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2485209 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagctagaagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 2485110  T
Q  127 tagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgag 226  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |    
T  2485109 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttctgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 2485010  T
Q  227 actttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctc 326  Q
    ||||| | ||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||| ||||||| | || |||| |||||||||    
T  2485009 actttgggtagagataggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctc 2484912  T
Q  327 ccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  2484911 ccccagactaggtcaatttggaccgaa 2484885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 29 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 18409681 - 18409364
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||  | ||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18409681 cttttactataaatatagaatttgtatcagtgtaaacaatgagatagagagg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 18409583  T
Q  129 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 228  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  18409582 gagtttgtcacttggcaacaaacactagggtttgagggttgattaaccttcgggaacactattaggattgagtctcttagttataggaagagattgagac 18409483  T
Q  229 tttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctccc 328  Q
    ||| | |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||  || |||||||||||||    
T  18409482 ttttggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgt-aagttacccatcattatagtgaaacagagagttgctctctccc 18409384  T
Q  329 acagactaggtcaatttgga 348  Q
     |||||||||||||||||||    
T  18409383 tcagactaggtcaatttgga 18409364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 11006604 - 11006249
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt-----gagatagagggggctgaaacaagggtt 95  Q
    ||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | | |  ||      |||||||||||||||||||||||||||    
T  11006604 gcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaga-ctattttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtt 11006506  T
Q  96 tagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatga 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  11006505 tagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagga 11006406  T
Q  196 tt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattc 294  Q
    || |||||||||||||||||||||||  || |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| | || ||    
T  11006405 ttggagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaatggtactc 11006307  T
Q  295 atcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||| ||||||| | || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11006306 atca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 11006249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 17662574 - 17662257
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17662574 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 17662475  T
Q  124 gtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt 223  Q
    ||           ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  17662474 gt-----------ctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagact 17662386  T
Q  224 gagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctct 323  Q
    | |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||| | || |||| ||||||    
T  17662385 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctct 17662287  T
Q  324 ctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17662286 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 17662257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 30 - 353
Target Start/End: Original strand, 56030443 - 56030762
Alignment:
Q  30 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 129  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| || |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  56030443 ttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatag 56030542  T
Q  130 agtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagact 229  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||   ||    
T  56030543 agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggttacgggaagagattggagct 56030642  T
Q  230 ttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctccca 329  Q
    || | |||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||||     ||||||| |||| |||||||||||     
T  56030643 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatttcttttgtaacgttattcatcata----tgaaacggagggctgctctctcccc 56030738  T
Q  330 cagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  56030739 tagactaggtcaatttggaccgaa 56030762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 11008933 - 11008580
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt-----gagatagagggggctgaaacaagggtt 95  Q
    ||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  || |  ||      |||||||||||||||||||||||||||    
T  11008933 gcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcag-gctattttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtt 11008835  T
Q  96 tagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatga 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  11008834 tagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagga 11008735  T
Q  196 tt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattc 294  Q
    || |||||||||||||||||||||||  || |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||| | || ||    
T  11008734 ttggagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttc---tttgtaatggtactc 11008638  T
Q  295 atcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||| ||||||| |  | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11008637 atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 11008580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 3824936 - 3824635
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaa-ctttgaga----tagagggggctgaaacaagggtt 95  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || |   ||||||||    |||||||||||||||||  ||||    
T  3824936 gcagatttgttccaaattttaagcaatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtatttctttgagagagatagagggggctgaaaca--ggtt 3824839  T
Q  96 tagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatga 195  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  3824838 tagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagga 3824739  T
Q  196 ttgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattca 295  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  || |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||    
T  3824738 ttgagtctattggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactca 3824639  T
Q  296 tcat 299  Q
    ||||    
T  3824638 tcat 3824635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 8756613 - 8756276
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttaga 99  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  8756613 gcagatttgttccaaattataaacgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagaaggggctgaaaacaagggtttaga 8756514  T
Q  100 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattga 199  Q
    | | |||||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  8756513 a-gtcaacaagaaaattaggatttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactactaggattga 8756418  T
Q  200 gtctctt-ggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatca 298  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||   |||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  8756417 gtctctttggtcacgggaagagattgagactttgagtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactaatca 8756318  T
Q  299 ttatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtc 340  Q
    |||||||| |||| | |||||||||||||  |||||||||||    
T  8756317 ttatagtggaacggatggttgctctctcctccagactaggtc 8756276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 29 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 18537806 - 18537498
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||    
T  18537806 cttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaacattgagatagagggggctgaaaacaagggtttagaaaca-aacaacaaa-ctagggtttgtat 18537709  T
Q  128 agagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 227  Q
    |||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |  |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18537708 agagtttg-ctcttggcaacaaccactagggttgg--ggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgaga 18537612  T
Q  228 ctttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcc 327  Q
    |||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  18537611 cttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcc 18537512  T
Q  328 cacagactaggtca 341  Q
    | || | |||||||    
T  18537511 cccataataggtca 18537498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 30 - 345
Target Start/End: Original strand, 13543953 - 13544272
Alignment:
Q  30 ttttactataaatatagaccttgtatca-aagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 124  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||||    |||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  13543953 ttttactataaatatagatcttgtatcagatgtaaactttgagagagatagagggggctgaaacaaggatctagaatgacaacaacaaaactagggtttg 13544052  T
Q  125 tatagagtttgtctc-ttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt 223  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13544053 tatagagtttgtctctttggcaacaaacacta-ggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 13544151  T
Q  224 gagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctct 323  Q
    | |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||   ||||||    
T  13544152 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagtactgctct 13544250  T
Q  324 ctcccacagactaggtcaattt 345  Q
    ||  | ||||||||||||||||    
T  13544251 ctttcccagactaggtcaattt 13544272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 69 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 18709458 - 18709176
Alignment:
Q  69 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggtt 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||    
T  18709458 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgagtt 18709359  T
Q  169 gattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaaccca 268  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18709358 gattcaccttgggaaacactattagggttgagtctcttggttacgggaagagattgcgactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccca 18709259  T
Q  269 ttgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||| |||| ||||||| |  | |||||| ||||||| |  | |||  ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  18709258 ttgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggaggactgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaa 18709176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 52942810 - 52942536
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtat--caaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttag 98  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||  || |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52942810 gcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatatcagactaaactttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttag 52942712  T
Q  99 aaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  52942711 aaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattg 52942612  T
Q  199 agtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaa 287  Q
    |||||||||||||||||             ||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  52942611 agtctcttggttacggg-------------tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaa 52942536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 22132735 - 22132404
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag---------ggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| ||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22132735 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagagagatagaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaacttg 22132636  T
Q  119 ggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaag 218  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22132635 ggtttgtatagagtttgtctcttcgaa-caaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaag 22132537  T
Q  219 agattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggtt 318  Q
    ||  || |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| | || |||||| ||||||| |  | |||| |    
T  22132536 aggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggct 22132439  T
Q  319 gctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  22132438 gctctctcccctatactaggtcaatttggaccgaa 22132404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 107 - 353
Target Start/End: Original strand, 36380425 - 36380671
Alignment:
Q  107 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctctt 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  36380425 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaaaaaccattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtatctt 36380524  T
Q  207 ggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtg 306  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36380525 ggttaccggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatatcttttgtaaagttactcatcattatagtg 36380624  T
Q  307 aaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
     |||  || | ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  36380625 gaactgagtgctgctctctcccccagactaggtcaatttggagcgaa 36380671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 69 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 22780668 - 22780385
Alignment:
Q  69 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggtt 168  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||    
T  22780668 gagatagagggggctgaaacaggggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 22780569  T
Q  169 gattcaccttggaaaacactattatgatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaaccc 267  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  22780568 gattcaccttgggaaacactgttaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 22780469  T
Q  268 attgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||| |||| ||||||| | || |||||| ||||||| |  | |||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  22780468 attgatttctc-tttgtaacgatactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaa 22780385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 69 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 22783033 - 22782750
Alignment:
Q  69 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggtt 168  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||    
T  22783033 gagatagagggggctgaaacaggggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 22782934  T
Q  169 gattcaccttggaaaacactattatgatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaaccc 267  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  22782933 gattcaccttgggaaacactgttaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 22782834  T
Q  268 attgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||| |||| ||||||| | || |||||| ||||||| |  | |||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  22782833 attgatttctc-tttgtaacgatactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaa 22782750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 29 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 3937543 - 3937314
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  3937543 cttttactataaatatagacttt-tatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaactagagtttgtata 3937445  T
Q  129 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 228  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  3937444 gagtttgtttcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattggaattgagtctcttggttacaggaagagattgaggc 3937345  T
Q  229 tttagatagaattaggtgggagacttattct 259  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  3937344 tttgggtagaattaggtgggagacttattct 3937314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 69 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 22134909 - 22134630
Alignment:
Q  69 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggtt 168  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  22134909 gagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttc-aaacaaacactagggtttgtgggtt 22134812  T
Q  169 gattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaaccca 268  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||  || ||| || | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  22134811 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaaaaggctgggacattgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 22134712  T
Q  269 ttgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||| |||| ||||||| | || |||||| ||||||| |  | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22134711 ttgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctccc-cagactaggtcaatttggaccgaa 22134630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 104 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 26086236 - 26085989
Alignment:
Q  104 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtct 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  26086236 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 26086137  T
Q  204 cttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattata 303  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||| | || |||||| ||||    
T  26086136 cttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgttttctc-tttgtaacgatactcatca-tata 26086039  T
Q  304 gtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||| | || | || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26086038 gtggatcggaaggctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaa 26085989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 47211082 - 47210764
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47211082 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 47210983  T
Q  122 ttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaga 221  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |            |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||     
T  47210982 ttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtg------------ttgggaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagagg 47210895  T
Q  222 ttgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgct 321  Q
     || |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| ||||||| | || |||| ||||    
T  47210894 ctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatca-tatagtggatcggagggctgct 47210796  T
Q  322 ctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  47210795 ctctcccccaaactagatcaatttggaccgaa 47210764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Original strand, 53405124 - 53405454
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagataga---gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| |||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53405124 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 53405223  T
Q  125 tatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattg 224  Q
    |||||||||||||||||   |||||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||    
T  53405224 tatagagtttgtctctttagaacaaa-actaggttttgagggttgattcaccttgagaaacactattaagattgagtctcttggttacggaaagaggctg 53405322  T
Q  225 agactttagatagaattaggtgggaga------cttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggtt 318  Q
    ||||||||| |||||||| | ||||||      |||||||| ||||||||||||| ||||||||| || | || |||||| ||||||| |||  || | |    
T  53405323 agactttaggtagaattaagcgggagacttattcttattcttgtaacccattgatttctcttttgaaacgatactcatca-tatagtggaacagagagct 53405421  T
Q  319 gctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  53405422 g--ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 53405454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 29 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 18535164 - 18534858
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||||| |||||||||||||| |  ||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||   ||||||||| |||||||||||||    
T  18535164 cttttacaataaatatagacctcgattcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaagtgtttaaaaaca-aacaacaaa-ctagggtttgtat 18535067  T
Q  128 agagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 227  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  18535066 agagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattgaga 18534970  T
Q  228 ctttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcc 327  Q
    |||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| |||| |||| ||||||| ||    
T  18534969 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaactactcataattatagtggaacggaggggtgctctcccc 18534870  T
Q  328 cacagactaggt 339  Q
    | ||||||||||    
T  18534869 cccagactaggt 18534858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 29 - 249
Target Start/End: Original strand, 6132871 - 6133090
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||   | |||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6132871 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaacattgagatagaggaggctgaa-caagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttgtata 6132969  T
Q  129 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 228  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6132970 gagtttgtctattggcaacaaacactagggtttgagggttgagtcaccctgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 6133069  T
Q  229 tttagatagaattaggtggga 249  Q
    ||| | |||||||||| ||||    
T  6133070 tttgggtagaattaggcggga 6133090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 145 - 353
Target Start/End: Original strand, 16455355 - 16455563
Alignment:
Q  145 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattagg 244  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  16455355 aacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattagg 16455454  T
Q  245 tgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatt 344  Q
     |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||| | |  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  16455455 cgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcgtcattatagtgaaacggatgactgctctctcccccagactaggtcaatt 16455554  T
Q  345 tggaccgaa 353  Q
    |||||||||    
T  16455555 tggaccgaa 16455563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 114 - 350
Target Start/End: Original strand, 27499128 - 27499360
Alignment:
Q  114 actagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacg 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  27499128 actagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcatcctgagaaacactattaggattgagtctattggttacg 27499227  T
Q  214 ggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaa 313  Q
      ||||||||||| |||| | || ||||||| |||||||||||| | ||||||   | ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  27499228 ataagagattgaggctttgggtataattaggcgggagacttatttttgtaacc---taatatctcttttgtaaggttactcatcattatattgaaacgaa 27499324  T
Q  314 gggttgctctctcccacagactaggtcaatttggacc 350  Q
    ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  27499325 gggctgctctttccc-cagactaggtcaatttggacc 27499360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 111 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 38890476 - 38890236
Alignment:
Q  111 aaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggtt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |  ||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||| |     
T  38890476 aaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacattagggttgg--ggttgattcatattgggaaacactattaggattgagtctcttgatc 38890380  T
Q  211 acgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaac 310  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  38890379 acgggaagagattgagactttgggtagaattagaagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaac 38890280  T
Q  311 gaagggttgctctctcccacagactaggtca-atttggaccgaa 353  Q
      |||| |||||||||||  ||| |||||||  |||||||||||    
T  38890279 agagggctgctctctccccaagattaggtcagttttggaccgaa 38890236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 29 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 38270321 - 38270158
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  38270321 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaagaggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgta 38270222  T
Q  129 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactatta 192  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38270221 gagtttgtcttttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactatta 38270158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 3 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 15032898 - 15032559
Alignment:
Q  3 agatttgttccaaattt-taagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 101  Q
    ||||||||||||| ||| | || || ||||||||||||||||||||| | ||| || || |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  15032898 agatttgttccaattttatgagggatacttttactataaatatagacttggtaccagagtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaa- 15032800  T
Q  102 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagt 201  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||          ||||| ||||||||  || | ||||||||||| ||||||||    
T  15032799 gtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctctttgcaacaaa----------tgagg-ttgattcatatttggaaacactattaggattgagt 15032712  T
Q  202 ctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatta 301  Q
    |||||||  ||| ||| |||||  |||||| | |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15032711 ctcttggacacgagaaaagatttggacttttggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatta 15032612  T
Q  302 tagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaat-ttggaccgaa 353  Q
     |||| ||||||| | ||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||    
T  15032611 cagtggaacgaagagctgctctctcccccaaactaggtcagtattggaccgaa 15032559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 29 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 24446914 - 24446756
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||    
T  24446914 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaac-----tagggtttgtata 24446820  T
Q  129 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactatta 192  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24446819 gagtttgtctcttggaaacgaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 24446756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 182 - 353
Target Start/End: Original strand, 13547305 - 13547475
Alignment:
Q  182 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttt 281  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  13547305 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatatcttt 13547404  T
Q  282 tgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  13547405 tgtaaagttactcatca-tatagtgaaatggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggatcgaa 13547475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 119 - 353
Target Start/End: Original strand, 30136640 - 30136871
Alignment:
Q  119 ggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaag 218  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  30136640 ggtttgtatagagttta-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactactatgattgggtctcttggtcacgagaag 30136736  T
Q  219 agattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggtt 318  Q
    | |||| |||||| | |||||||||| || ||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | || |    
T  30136737 aaattgtgactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtgactcatcgatatctcttttgtaaagttaatcatcattatagtgaaacagatggct 30136836  T
Q  319 gctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||||||   | |||||||||||||||||||||    
T  30136837 gctctctcctcaatactaggtcaatttggaccgaa 30136871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 3 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 40999308 - 40998990
Alignment:
Q  3 agatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||| ||||| ||||| || |||| ||||| ||||| |  |||||| ||||||||||||      
T  40999308 agatttgttccaaattttaagggttatttttactataaatataaaccttatatcagagtaaaccttgaggtagagagt-ctgaaaacaagggtttagac- 40999211  T
Q  102 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagt 201  Q
    | |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| || |||  ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  40999210 gtcaacaagaaaactaggggttgtatagagtttg-ctcttgacaacaaacactaggatt-gaga-ttgattcacctaggaaaacattattaggattgagt 40999114  T
Q  202 ctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtg-ggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatt 300  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||  |||||||   | | ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  40999113 ctcttggtcacgggaagagatcgagactttgggtagaattaggtttggagactgtgttttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcgtt 40999014  T
Q  301 atagtgaaacgaagggttgctctc 324  Q
    |||||| |||  |||| |||||||    
T  40999013 atagtggaacagagggatgctctc 40998990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 173 - 353
Target Start/End: Original strand, 2891433 - 2891613
Alignment:
Q  173 caccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattga 272  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||    
T  2891433 caccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcaggagacttgttcttgtaacccattga 2891532  T
Q  273 tatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  | |  ||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||    
T  2891533 tatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagatgactgctctctcccccagactagtacaacttggaccgaa 2891613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 30 - 339
Target Start/End: Original strand, 28453686 - 28453990
Alignment:
Q  30 ttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |  ||| ||||| ||||| |  |||||| ||||||||||||| | |||||  |||||||||||||| |     
T  28453686 ttttactataaatatagaccttgtatcagatgtgaaccttgaggtagagagt-ctgaaaacaagggtttagaa-gccaacactaaaactagggtttgca- 28453782  T
Q  128 agagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 227  Q
     ||||||| ||||||| || ||||||||||||| |  | |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  28453783 -gagtttg-ctcttggcaagaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggttacgggaagagatttgga 28453878  T
Q  228 ctttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcc 327  Q
    | || | ||||||||||| | ||||| ||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||   | ||||||||    
T  28453879 ccttgggtagaattaggttgaagactaattcttgtaaacttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactactctctcc 28453978  T
Q  328 cacagactaggt 339  Q
    | ||||||||||    
T  28453979 cccagactaggt 28453990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 166 - 353
Target Start/End: Original strand, 12102221 - 12102410
Alignment:
Q  166 gttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtg-ggagacttattctagtaa 264  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||| ||||||  ||||| | |||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  12102221 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtatcttggtcatgggaaaagattggaactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaa 12102320  T
Q  265 cccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtca-atttggaccgaa 353  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| || |||||||||  |||||||||||    
T  12102321 cccactgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccatactaggtcagttttggaccgaa 12102410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 5100994 - 5101133
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||  | |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  5100994 acttttactataaatatagaccttgaatcagggtaaaccttgagatagaggggactgaaacaaaggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtat 5101093  T
Q  128 agagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggt 167  Q
    |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  5101094 agagtttgtcactttggaacaaacactagggtttgagggt 5101133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 208 - 353
Target Start/End: Original strand, 4215483 - 4215627
Alignment:
Q  208 gttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtga 307  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||     
T  4215483 gttacgggaagaggttgtgacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgg 4215581  T
Q  308 aacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4215582 aacggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 4215627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 166 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 31983727 - 31983563
Alignment:
Q  166 gttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattagg-tgggagacttattctagtaa 264  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||| | | ||||||||| | ||||    
T  31983727 gttgattcaccttgggaaacactattaagattaagtctcttggtcatgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagacttatttttgtaa 31983628  T
Q  265 cccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctccca 329  Q
    ||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  31983627 ccctttgatatcttttttgtaaaattactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccca 31983563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 35 - 328
Target Start/End: Original strand, 9863712 - 9864006
Alignment:
Q  35 ctataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatag-agggggctgaaa--caagggtttagaaaggcaacaacaaaa-ctagggtttgtataga 130  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||| || | |||||||  ||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||  ||    
T  9863712 ctataaatatagaccttgtatcagatgaaaccttgagatagtagagagctgaaaaacaagggtttagaa-gccaaaaacaaaaactagggtttgta--ga 9863808  T
Q  131 gtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactt 230  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| |||| |  | |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  9863809 gtttgt-tcttggcaacaaacactaaggttgg--gtttgattcaccttgggaaaccctattaggattgagtcttttggtcacgggaagagattgagactt 9863905  T
Q  231 tagatagaatt-aggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagtta---ttcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctc 326  Q
    | | ||||||| || | | ||||| ||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||    |||||||||||||| |||| || | |||||||||    
T  9863906 tgggtagaattaagtttgaagactaattcttgtaaccttttgatatctc-tttgtaaagttactcatcatcattatagtggaacggagagctgctctctc 9864004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 29 - 141
Target Start/End: Original strand, 2891314 - 2891427
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgta-tcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||  | |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2891314 cttttactataaatatagacattgtaatcagtgtaaaccttaagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 2891413  T
Q  128 agagtttgtctctt 141  Q
    ||||||||||||||    
T  2891414 agagtttgtctctt 2891427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 341
Target Start/End: Original strand, 25357607 - 25357951
Alignment:
Q  2 cagatttgttccaaatttta--agcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag-----ggggctgaaa-caaggg 93  Q
    |||||||||||||| |||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||     |||||||||| ||||||    
T  25357607 cagatttgttccaa-ttttacgagggatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaaccttgagagagagtgagaggggctgaaaacaaggg 25357705  T
Q  94 tttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtt-tgagggttgattcaccttggaaaacactatta 192  Q
    ||||||||   ||||||||| |||||||||  | |||| || |||||  |    | ||||||||||| |||   |||||||||||||| ||| |||||||    
T  25357706 tttagaaaca-aacaacaaa-ctagggttt--agagagatt-tctctaagtgggagacactagggttgtga---ttgattcaccttgggaaatactatta 25357797  T
Q  193 tgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagata----gaattaggtggga-gacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaa 287  Q
     |||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||    |||||| ||  || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  25357798 ggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttggatatatagaattaagtttgaagacttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaa 25357897  T
Q  288 gttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtca 341  Q
    |||| |||||||||||||  |||| |  | |||||||||||  |||||||||||    
T  25357898 gttactcatcattatagtagaacggatagctgctctctcccctagactaggtca 25357951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 85 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 47151167 - 47150952
Alignment:
Q  85 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaa 184  Q
    |||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||  |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||  |   |||||||||||||| |||    
T  47151167 aaacaagggtttagaa-gccaaca-caaaactaaggttt--atagagtttg-ctcttggtaaccaacactagggttgaaa--ttgattcaccttgggaaa 47151075  T
Q  185 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattagg-tgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttg 283  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||| | |||||||||| | | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||     
T  47151074 cactgttaggattgagtctcttggtcacatgaagagattgagaatttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaccctttgatatctcttttc 47150975  T
Q  284 taaagttattcatcattatagtg 306  Q
    |||||||  ||||||||||||||    
T  47150974 taaagttgctcatcattatagtg 47150952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 170 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 3982374 - 3982187
Alignment:
Q  170 attcaccttgga-aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt-gagactttagatagaattaggtggga-gacttattctagtaacc 266  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||| | |||||||| ||  || |||| ||||| |||||     
T  3982374 attcaccttggagaaacactattaggattgagtttcttggtcacgggaagagatttgggactttgggtagaattaagtttgaagactgattcttgtaaca 3982275  T
Q  267 cattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaat-ttggaccgaa 353  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||    
T  3982274 ctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccctcatactaggtcactattggaccgaa 3982187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 85 - 328
Target Start/End: Original strand, 9022362 - 9022602
Alignment:
Q  85 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgga-aa 183  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||| ||   ||||||| ||||||||||| |||| |  | ||||||||||||||| ||    
T  9022362 aaacaagggtttagaa-gtcaacatcaaaactagggtttgtagagaatt---ctcttggcaacaaacactatggttgg--gattgattcaccttggagaa 9022455  T
Q  184 acactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtggga-gacttattctagtaaccc--attgatatctctt 280  Q
    ||| ||||| ||| || | ||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||  || |||| ||||| ||||||   |||||||||||||    
T  9022456 acagtattaggatagaatttcttggtcacgggaagagattgagactttgggttgaattaggtttgaagactaattcttgtaacctctattgatatctctt 9022555  T
Q  281 ttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctccc 328  Q
    | ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  9022556 t-gtaaagttactcatcattatagtggaacaaagggctgctctctccc 9022602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 226 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 5635614 - 5635488
Alignment:
Q  226 gactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctct 325  Q
    |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||| | || |||| ||||||||    
T  5635614 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctct 5635516  T
Q  326 cccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5635515 cccccagactaggtcaatttggaccgaa 5635488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 167 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 16186035 - 16185846
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttgga--aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtggga-gacttattctagta 263  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| | |||||||||||  || |||||||||| | |    
T  16186035 ttgattcaccttgaacaaaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattggaactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgca 16185936  T
Q  264 acccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtca-atttggaccgaa 353  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||  |||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  16185935 accctttgatatatcttt-gtaaagttactcatcattatagtggaacagagggctgctctctcccccagactaggtcagttttggaccgaa 16185846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 36 - 339
Target Start/End: Original strand, 10112876 - 10113177
Alignment:
Q  36 tataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 133  Q
    ||||||||||||| |||||||| | | |||| | |||| |||||| | ||||| ||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||  |||||    
T  10112876 tataaatatagacattgtatcagatgtaaacctcgagagagagggagttgaaaacaagggtttagaa-gccaacacaaaaactagggtttgta--gagtt 10112972  T
Q  134 tgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttac-gggaagagattgagacttta 232  Q
    || ||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||     
T  10112973 tg-ctcttggcaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcaccttaggaaacactattatgattgagtctcttggtcacggggaagagattaggactttg 10113069  T
Q  233 gatagaattag-gtgggagacttattctagtaacc-cattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccac 330  Q
    | |||||||||  | | ||||| ||||| ||||||   |||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||| || | || | |||||||||||      
T  10113070 ggtagaattagatttgaagactaattcttgtaacctttttgatatctc-tttgtaatgttactaatcattatagtggaatggagagctgctctctcccca 10113168  T
Q  331 agactaggt 339  Q
    |||||||||    
T  10113169 agactaggt 10113177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 226 - 353
Target Start/End: Original strand, 11437558 - 11437683
Alignment:
Q  226 gactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctct 325  Q
    |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||| ||||||| | || |||| ||||||||    
T  11437558 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctct 11437655  T
Q  326 cccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||    
T  11437656 cccctagactaggtcaatttggaccgaa 11437683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 247 - 353
Target Start/End: Original strand, 5101145 - 5101249
Alignment:
Q  247 ggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttg 346  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  5101145 ggagacttattcttgtaacccattgatatgtcttttgtaaatttactcatca-tatagtaaaacggagggctgctatctccc-cagactaggtcaatttg 5101242  T
Q  347 gaccgaa 353  Q
    |||||||    
T  5101243 gaccgaa 5101249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 167 - 291
Target Start/End: Original strand, 54906722 - 54906848
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttgga-aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt-gagactttagatagaattagg-tgggagacttattctagta 263  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||| |||||||||| | | ||||| ||||| |||    
T  54906722 ttgattcaccatggagaaacactattagaattgagtctcttggtcactggaagagattcaagactttaggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 54906821  T
Q  264 acccattgatatctcttttgtaaagtta 291  Q
    || | |||||||||| ||||||||||||    
T  54906822 actctttgatatctc-tttgtaaagtta 54906848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 16186173 - 16186099
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggct-gaaacaagggtttagaaa 101  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  16186173 acttttactataaatataaaccttgtatcagagtaaaccttgagagagagggggctaaaaacaagggtttagaaa 16186099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 111 - 226
Target Start/End: Original strand, 10114412 - 10114522
Alignment:
Q  111 aaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggtt 210  Q
    ||||||||||||||||  |||| || ||||||| |||||||||||||||| |  | ||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||     
T  10114412 aaaactagggtttgta--gagtctg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcactttaggaaacactattaggattgagtctcttggtc 10114506  T
Q  211 acgggaagagattgag 226  Q
    |||  |||||||||||    
T  10114507 acgataagagattgag 10114522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 5336965 - 5336818
Alignment:
Q  181 aaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattagg-tgggagacttattctagtaacccattgatatctct 279  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || | |||||||||| | | ||||| ||||| |||| ||  | ||||||||    
T  5336965 aaaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctcttatatctct 5336867  T
Q  280 tttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctccc 328  Q
    ||   ||||  |||||||||||||||| |||| || | |||||||||||    
T  5336866 ttgtaaaagaaattcatcattatagtggaacggagagctgctctctccc 5336818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 101
Target Start/End: Original strand, 12102088 - 12102162
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagataga-gggggctg-aaacaagggtttagaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  12102088 cttttactataaatatagatcttgtatcagataaaaccttgagatagaggggggctgaaaacaagggtttagaaa 12102162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 251 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 24446754 - 24446677
Alignment:
Q  251 acttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctccca 329  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  24446754 acttatttttgtaagccattgatatctcttttgtaacattactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccca 24446677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 279 - 353
Target Start/End: Original strand, 47563009 - 47563082
Alignment:
Q  279 ttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  47563009 ttttgtaaggttactcatc-ttatagtgaaacggagggctgctctctccccttgactaggtcaatttggaccgaa 47563082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 28 - 100
Target Start/End: Original strand, 16455284 - 16455356
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||| |||| ||||||| | |||||||| |||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16455284 acttttgctattaatataggctttgtatcagagcaaaccgagagataaagggggctgaaacaagggtttagaa 16455356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 136 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 38208911 - 38208809
Alignment:
Q  136 tctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgga-aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt-gagactttag 233  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||  ||||||||| ||||||||||    
T  38208911 tctcttggcaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcatcttggagaaacactattaagattgagtcttttggtcacaagaagagattcgagactttag 38208814  T
Q  234 ataga 238  Q
     ||||    
T  38208813 gtaga 38208809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 52043791 - 52043737
Alignment:
Q  3 agatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatca 57  Q
    ||||||||||||| |||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  52043791 agatttgttccaattttttagggatgcttttactataaatatagaccttgtatca 52043737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 230
Target Start/End: Original strand, 55822248 - 55822313
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttgga--aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactt 230  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  55822248 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagactt 55822313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 299 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 14789496 - 14789440
Alignment:
Q  299 ttatagtgaaacgaagggttgctctctc--ccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  14789496 ttatagtgaaacggagggctgctctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 14789440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 230
Target Start/End: Original strand, 16638826 - 16638875
Alignment:
Q  181 aaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactt 230  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  16638826 aaaacactgttaggattgagtctcttggtcacaggaagagattgagactt 16638875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 22780744 - 22780687
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaa 58  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22780744 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatataaaccttgtatcaa 22780687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 22783109 - 22783052
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaa 58  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22783109 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatataaaccttgtatcaa 22783052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 167 - 245
Target Start/End: Original strand, 25699732 - 25699811
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttggaaaa--cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggt 245  Q
    ||||||||||||| | ||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | |||||||||||    
T  25699732 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactgggacttt-ggtagaattaggt 25699811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 269 - 353
Target Start/End: Original strand, 26557823 - 26557907
Alignment:
Q  269 ttgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaat-ttggaccgaa 353  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||| || | ||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||    
T  26557823 ttgatatctcttt-gtaaagttactcatcgttatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaagtcagtattggaccgaa 26557907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 7050456 - 7050401
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttgga--aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 220  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  7050456 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 7050401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 220
Target Start/End: Original strand, 11853532 - 11853587
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttgga--aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 220  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  11853532 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 11853587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 220
Target Start/End: Original strand, 36771379 - 36771434
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttgga--aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 220  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  36771379 ttgattcaccttgaacaaaacactattatgattgagtctcttggtcatgggaagag 36771434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 4874678 - 4874620
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttgg--aaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt 223  Q
    |||||||||||||   |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  4874678 ttgattcaccttgatcaaaacactattaagatagagtctcttggtcacgggaagagatt 4874620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 167 - 341
Target Start/End: Original strand, 31300407 - 31300580
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttggaaaa--cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattagg-tgggagacttattctagta 263  Q
    ||||||||||||| | ||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || ||| || | |||||||||| | | ||||| ||||| |||    
T  31300407 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 31300505  T
Q  264 acccattgatatctcttttgtaaagttattc--atcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtca 341  Q
    || ||   ||||||| |||||||||  | ||  |||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  31300506 actca---atatctc-tttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagggctgctctctccc-cagactaggtca 31300580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 230
Target Start/End: Original strand, 4570077 - 4570142
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttgga--aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactt 230  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||| |||||    
T  4570077 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggatcgagtctcttggtcacgggaagaggttgggactt 4570142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 230
Target Start/End: Original strand, 4884857 - 4884922
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttggaaaa--cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactt 230  Q
    ||||||||||||| | ||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  4884857 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagactt 4884922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 291 - 353
Target Start/End: Original strand, 6133096 - 6133158
Alignment:
Q  291 attcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||||||||||||| |||| | |  ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  6133096 attcatcattatagtggaacggatgactgctctctcacccagactaggtcaatttggatcgaa 6133158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 272 - 353
Target Start/End: Original strand, 10114558 - 10114639
Alignment:
Q  272 atatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaat-ttggaccgaa 353  Q
    |||||||||| ||||| | | |||||||||||||  ||||||| | ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  10114558 atatctcttt-gtaaattaactcatcattatagttgaacgaagagctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaa 10114639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 230
Target Start/End: Original strand, 16489332 - 16489397
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttggaaaa--cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactt 230  Q
    ||||||||||||| | ||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  16489332 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactgggactt 16489397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 22134966 - 22134936
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaa 58  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22134966 acttttactataaatatagaccttgtatcaa 22134936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 185 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 4556238 - 4556179
Alignment:
Q  185 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggt 245  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || |||||| | |||||||||||    
T  4556238 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttt-ggtagaattaggt 4556179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 167 - 220
Target Start/End: Original strand, 8529250 - 8529305
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttggaaaa--cactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 220  Q
    ||||||||||||| | ||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  8529250 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 8529305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 167 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 13072180 - 13072125
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttggaaaa--cactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 220  Q
    ||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  13072180 ttgattcaccttgaacaaatcactattatgattgagtctcttggtcactggaagag 13072125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 167 - 220
Target Start/End: Original strand, 15831124 - 15831179
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttggaaaa--cactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 220  Q
    ||||||||||||| | ||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  15831124 ttgattcaccttgaacaaatcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 15831179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 167 - 220
Target Start/End: Original strand, 18586949 - 18587004
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttggaaaa--cactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 220  Q
    ||||||||||||| | ||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  18586949 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 18587004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 182 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 29609653 - 29609605
Alignment:
Q  182 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactt 230  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||    
T  29609653 aaacactattagaattgagtctcttgatcacggcaagagattgagactt 29609605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 248; Significance: 1e-137; HSPs: 95)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 40032421 - 40032065
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40032421 gcagatttgttccaagttttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 40032322  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  40032321 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 40032222  T
Q  201 tctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgata----tctcttttgtaaagttattcat 296  Q
    |||||||||||| ||||||| ||  |||||| | |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||| ||||||| ||||    
T  40032221 tctcttggttacaggaagaggttaggactttgggtagaattaggcgtgagacttattcttgtaacccattgatatctttctcttttgcaaagttactcat 40032122  T
Q  297 cattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40032121 cattatagtgaaacggagggccgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaa 40032065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 19502374 - 19502023
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  19502374 gcagatttgatccaaattttaagggaaaattttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagataaagggggctgaaacaagagtttagaa 19502275  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  19502274 aggcaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 19502175  T
Q  201 tctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |    
T  19502174 tctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatca-t 19502076  T
Q  301 atagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19502075 atagtggatcgaagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 19502023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 27104691 - 27105040
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27104691 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagaaaactttgagatagagggggctgaaacaagggttcagaa 27104790  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  27104791 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgaaacaaa-actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 27104889  T
Q  201 tctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||  ||| |||||| |    
T  27104890 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacattactcatca-t 27104987  T
Q  301 atagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||| | || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27104988 atagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 27105040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 6264508 - 6264160
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6264508 gcagatttgttccaaattttaagcgatatttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaaaggtttagaa 6264409  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgag 200  Q
    |||||||||||||    |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||    
T  6264408 aggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtctctttggtacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattaag 6264313  T
Q  201 tctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatt 300  Q
    |||||||||||||  || |||||| | |||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6264312 tctcttggttacgataaaagattggggctttggatagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatt 6264213  T
Q  301 atagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6264212 atagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 6264160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 42064407 - 42064758
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42064407 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggagctgaaacaagggtttagaa 42064506  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  42064507 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 42064606  T
Q  201 tctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||   || |||||| |    
T  42064607 tctcttggttacgggaagaggctgagactttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaatactcatca-t 42064704  T
Q  301 atagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtc-aatttggaccgaa 353  Q
    |||||| | || |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  42064705 atagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaaatttggaccgaa 42064758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 6259178 - 6258829
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||    
T  6259178 gcagacttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtattagactaaactttgagatagaggaggatgaaacaagagtttagaa 6259079  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgag 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  6259078 aggcaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctatttggaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 6258979  T
Q  201 tctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatt 300  Q
    ||||||||||||||||  |||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  6258978 tctcttggttacggga--agattggggctttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcattatt 6258881  T
Q  301 atagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  6258880 atagtgaaacggagggctgctctctccc-catactaggtcaatttggaccgaa 6258829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 19504708 - 19504358
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19504708 gcagatttgttccaaattttaagggaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 19504609  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  19504608 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacacaagggtttgttggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 19504509  T
Q  201 tctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatt 300  Q
    |||||||||||| |||||||  || |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |    
T  19504508 tctcttggttac-ggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatca-t 19504411  T
Q  301 atagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||| | || |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19504410 atagtggatcggagggctgctatctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 19504358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 5 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 22287695 - 22287348
Alignment:
Q  5 atttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggc 104  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22287695 atttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtattaaagtaaactttgagatatagggggctgaaacaagggtttagaaaggc 22287596  T
Q  105 aacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||    
T  22287595 aacaacaaaactagggtttgtatagagtctgtctctttggaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacggtattaggattgagtctc 22287496  T
Q  205 ttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatag 304  Q
    || |||||||||||||||||| ||||  | ||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  22287495 ttagttacgggaagagattgacacttcgggtagaattgggcgggagacttattcttgtaacccgttgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatag 22287397  T
Q  305 tgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||| | |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  22287396 tgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaa 22287348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 13910407 - 13910057
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13910407 gcagatttgttccaaattttaagggaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 13910308  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  13910307 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcaccttgggaaacaatattaggattgag 13910208  T
Q  201 tctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||   || |||||| |    
T  13910207 tctcttggttacgggaagagactggaactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaatactcatca-t 13910110  T
Q  301 atagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||| | |  | || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13910109 atagtggatcagatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 13910057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 21521058 - 21520705
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttag 98  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  21521058 gcagatttgttccaaaatttaagcgatacttttactataaatataaaccttgtatcagactaaactttgagagatagatggggctgaaacaagggtttag 21520959  T
Q  99 aaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattg 198  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  21520958 aaaggcaacaacaaaactagggcttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattg 21520859  T
Q  199 agtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatca 298  Q
    |||||||||||||| |||||||  |  |||||| | |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  21520858 agtctcttggttacaggaagaggctaggactttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatca 21520759  T
Q  299 ttatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
     |||||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21520758 -tatagtgaaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 21520705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 29 - 353
Target Start/End: Original strand, 19007560 - 19007883
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  19007560 cttttactataaatataggctttgtatcatagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattatggtttgtata 19007659  T
Q  129 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 228  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||| | |    
T  19007660 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtttcttggttatgggaagagattggggc 19007759  T
Q  229 tttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctccc 328  Q
    ||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19007760 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacgaagggctgctctctccc 19007858  T
Q  329 acagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  19007859 ccagactaggtcaatttggaccgaa 19007883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 42923847 - 42923521
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  42923847 acttttactataaatatagaccttgaatcatagtaaaccttgagagatagaggaggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactaggatttgt 42923748  T
Q  126 atagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattga 225  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  42923747 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattgg 42923648  T
Q  226 gactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctct 325  Q
    | |||| | |||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| |||| ||||||||    
T  42923647 ggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttactcgtca-tatagtgaaacggagggctgctctct 42923549  T
Q  326 cccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||  | |||||||||||||||||||||    
T  42923548 cccctatactaggtcaatttggaccgaa 42923521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 29 - 344
Target Start/End: Original strand, 28196557 - 28196871
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28196557 cttttactataaatatatgctttgtatcagagtaaacattgagatagagggggctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 28196656  T
Q  129 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  28196657 gagtttgtctcttggcaacaaacattagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattgaggc 28196756  T
Q  229 tttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctccc 328  Q
    ||| | |||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  28196757 tttgggtagaattaggcggaagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacattactcatca-tatagtgaaacgaatggctgctctctccc 28196855  T
Q  329 acagactaggtcaatt 344  Q
     |||||||||||||||    
T  28196856 ccagactaggtcaatt 28196871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 28 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 45280321 - 45279999
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaag-gcaacaacaaaactagggtttgta 126  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  45280321 actttcactataaatatataccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaagcaacaacaaaactagggtttgta 45280222  T
Q  127 tagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgag 226  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |    
T  45280221 tagagtttgtctctttggaacaaacactaggtttagagggttgattcaccttgggatacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 45280122  T
Q  227 actttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctc 326  Q
    ||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||| | || |||| |||||||||    
T  45280121 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctc 45280023  T
Q  327 ccacagactaggtcaatttggacc 350  Q
    || |||||||||||||||||||||    
T  45280022 ccccagactaggtcaatttggacc 45279999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Original strand, 42452702 - 42453023
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42452702 acttttattataaatatagacattgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtat 42452801  T
Q  128 agagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 227  Q
    | |||||||||||  | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  42452802 aaagtttgtctct--gtaacaaacactagagtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgaga 42452899  T
Q  228 ctttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcc 327  Q
    |||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||| | || |||| ||||||||||    
T  42452900 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcc 42452998  T
Q  328 cacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  42452999 c-cagactaggtcaatttggaccgaa 42453023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 24162575 - 24162235
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24162575 gcagatttgtttcaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 24162476  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  24162475 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaagattgag 24162376  T
Q  201 tctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatt 300  Q
    |||||||||| |          || |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| | || |||||| |    
T  24162375 tctcttggttgc----------tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaatgctactcatca-t 24162288  T
Q  301 atagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||| |  | | || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  24162287 atagtggattggatggctgctctctcccccggactaggtcaatttggaccgaa 24162235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 29 - 349
Target Start/End: Original strand, 17849037 - 17849356
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||    
T  17849037 cttttactataaatataaacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagataacaacaaaactagagttcgtata 17849136  T
Q  129 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 228  Q
    ||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17849137 gagtttgcctctttggaagaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaagattgagtctcttggttacggtaagagattgagac 17849236  T
Q  229 tttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctccc 328  Q
    ||| | |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  17849237 tttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacg-ggggctgctctctccc 17849335  T
Q  329 acagactaggtcaatttggac 349  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  17849336 acatactaggtcaatttggac 17849356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 23452577 - 23452249
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23452577 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 23452478  T
Q  124 gtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt 223  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |    
T  23452477 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 23452378  T
Q  224 gagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctct 323  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| ||||||| |  | |||| ||||||    
T  23452377 gggactttggatagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatca-tatagtggattggagggctgctct 23452279  T
Q  324 ctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23452278 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 23452249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 43623931 - 43623592
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  43623931 gcagatttgttccaaattttaagcaatacttttactataaaaatagaccttgtatcagagtaaactgggagatagaggggggtgaaacaatggtttagaa 43623832  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  43623831 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctc------------actaggttttgagggttgattcaccttgggaaacaatattaggattgag 43623744  T
Q  201 tctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |    
T  43623743 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-t 43623645  T
Q  301 atagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||| |||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  43623644 atagtggaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaa 43623592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 29 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 31733100 - 31732789
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31733100 cttttactataaatatagactttgtaacagagtaaacattgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtata 31733001  T
Q  129 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 228  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||            ||| |||    
T  31733000 gagtttgtctcttggcaacaaacactaaggtttgagggttgattcacgttgggaaacactgttaggattgagtctcttggt------------ttgggac 31732913  T
Q  229 tttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctccc 328  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||  |||||||||||    
T  31732912 tttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattattgtgaaacggaggactgctctctccc 31732813  T
Q  329 acagactaggtcaatttggaccga 352  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  31732812 ccagactaggtcaatttggaccga 31732789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 29 - 353
Target Start/End: Original strand, 14837193 - 14837511
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  14837193 cttttactgtaaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggagctgaaacaagggttaaaaaagacaacaacaaaactagggtttgtaca 14837292  T
Q  129 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 228  Q
     |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||      ||||||||||||||||    
T  14837293 tagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------gggaagagattgagac 14837386  T
Q  229 tttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctccc 328  Q
    ||||  |||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||    
T  14837387 tttaagtagaattaggcgggggacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggatggatgctctctccc 14837486  T
Q  329 acagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  14837487 ccagactaggtcaatttggaccgaa 14837511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 29 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 44289403 - 44289079
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||| ||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44289403 cttttactataaatataggttttgtatcatagcaaaccttgatatagaggggactaaaacaaaggtttaggaaggcaacaacaaaactagagtttgtata 44289304  T
Q  129 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 228  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  44289303 gagtctgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcacttggttacgggaagagattgggac 44289204  T
Q  229 tttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctccc 328  Q
    ||  | |||||||| |||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||    
T  44289203 ttagggtagaattaagtggaaaacttattcttgtaacccgttgatatctcttttgtaagattactcatcattatagtgaaacagatggttgctctttccc 44289104  T
Q  329 acagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
     || |||||||||||||||||||||    
T  44289103 ccaaactaggtcaatttggaccgaa 44289079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 29 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 11739895 - 11739571
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |  | |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  11739895 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctggaacaagggtttagaaagacaacaacaaaattagggtttgtatg 11739796  T
Q  129 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 228  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||| |||    
T  11739795 gagtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgattctcttggttataggaagagattgggac 11739696  T
Q  229 tttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctccc 328  Q
    ||| | |||||||||| |||||| ||||||| | || |||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||| | |  |||||||||||    
T  11739695 tttgggtagaattaggcgggagaattattcttggaatccattgatatctcttttgaaaggttactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccc 11739596  T
Q  329 acagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  11739595 ccagactaggtcaatttggaccgaa 11739571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 30 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 15539809 - 15539552
Alignment:
Q  30 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 129  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15539809 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatatagggggttgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtatag 15539710  T
Q  130 agtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagact 229  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15539709 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgattctcttggttacgggaagagattgagact 15539610  T
Q  230 ttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaa 287  Q
    || | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  15539609 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatatcttttgtaaa 15539552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 37 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 34979906 - 34979589
Alignment:
Q  37 ataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 136  Q
    |||||||||||| |||||| |  | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  34979906 ataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagcgtttagaaaggtaacaaaaaaactagggtttgtataaagtttgt 34979807  T
Q  137 ctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagata 236  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||    
T  34979806 ctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattcggactttcggta 34979707  T
Q  237 gaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctct-ctcccacagact 335  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||| | |||| | ||| || |||    
T  34979706 gaattaggcgggagacttattcttgtaatccatttatatctcttttgtaaggttcctcatcattatagtggaacgaagggctactctccccccccaaact 34979607  T
Q  336 aggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  34979606 aggtcaatttggatcgaa 34979589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 32 - 353
Target Start/End: Original strand, 3022086 - 3022415
Alignment:
Q  32 ttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagag 131  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3022086 ttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatataggaggctgaaacaagggtttataaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagag 3022185  T
Q  132 tttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagacttt 231  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  3022186 tttgtctcttggcaacaaacactacggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttaccggaagagattgaggtttt 3022285  T
Q  232 agatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatca---------ttatagtgaaacgaagggttgctc 322  Q
    || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||         ||||| ||||||  | || |||||    
T  3022286 aggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctc-tttataaagttactcatcattatcatcgttataatgaaacagatggctgctc 3022384  T
Q  323 tctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3022385 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 3022415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 69 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 45239271 - 45239000
Alignment:
Q  69 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggtt 168  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45239271 gagatagagggggctgaaacaatgatttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagactttctct-ttggcaacaaacactagggtttgagggtt 45239173  T
Q  169 gattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaaccca 268  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| | |||||||| | |||| ||||||||| ||||||||    
T  45239172 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggtttttggtagaattaagcgggatacttattcttgtaaccca 45239073  T
Q  269 ttgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaa 342  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  45239072 ttgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaa 45239000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 29 - 349
Target Start/End: Original strand, 17848365 - 17848679
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||  | || | ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17848365 cttttactataaatataggctttgtatca--gtaatccttgagatagagggggctcaaacgagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 17848462  T
Q  129 gagtttgtctctt-ggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 227  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17848463 gagtttgtctctttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcactttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagg 17848562  T
Q  228 ctttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcc 327  Q
    |||| | ||||   ||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| | |  ||||||||||    
T  17848563 ctttgggtaga---aggcgggagacttattcttgtaa-ccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggatgactgctctctcc 17848657  T
Q  328 cacagactaggtcaatttggac 349  Q
    | || |||||||||||||||||    
T  17848658 cccatactaggtcaatttggac 17848679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Original strand, 22874061 - 22874374
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    |||||| ||||||||| || | |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||    
T  22874061 acttttgctataaatacaggctttgtatcagagcaaacctggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatc--------aaactagggtttgtat 22874152  T
Q  128 agagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 227  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||     
T  22874153 agagtttg-ctcttggcaacaaacactatggtt---gggttgattcaccttggaaaacagtattaggattgagtctcttagtcacgggaagagattgagg 22874248  T
Q  228 ctttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcc 327  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || | ||||||||||    
T  22874249 ctttcggtagaattaggtgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaactgagagctgctctctcc 22874348  T
Q  328 cacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    | || |||||||||||||||||||||    
T  22874349 ctcatactaggtcaatttggaccgaa 22874374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 18800665 - 18800338
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18800665 gcagatttgttccaaattttaaacgatacttttactataaatatagaccttgtatcagggtaaacatggagatatagggggctgaaacaagggtttagaa 18800566  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgag 200  Q
    |          || ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  18800565 atc--------aagctagggtttgtatagaggttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 18800478  T
Q  201 tctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatt 300  Q
    ||||||||| || ||||||||||| | |||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  18800477 tctcttggtcacaggaagagattggggctttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcgtcatt 18800378  T
Q  301 atagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtca 341  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||    
T  18800377 atagtgaaacggagggctactctctccc-cagaccaggtca 18800338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 35215932 - 35215598
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----------gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaacta 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35215932 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaacta 35215833  T
Q  118 gggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgatt-gagtctcttggttacggga 216  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  35215832 gggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacggga 35215733  T
Q  217 agagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaaggg 316  Q
    |||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||| |  | |||||| ||||||| |  | ||||    
T  35215732 agagtttgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaactcattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggaggg 35215635  T
Q  317 ttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
     ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  35215634 ctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaa 35215598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 69 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 35218258 - 35217975
Alignment:
Q  69 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggtt 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||    
T  35218258 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 35218159  T
Q  169 gattcaccttggaaaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaaccc 267  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35218158 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccc 35218059  T
Q  268 attgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
     ||||| ||||||| |||| |  | ||||||| |||||| |  | |||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  35218058 gttgatttctcttt-gtaacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaa 35217975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 11578439 - 11578136
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  | |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  11578439 cttttactataaatatagaccttatatcagggtaaatcttgagatagagtgggctgaaacaagggtttagaa-gtcaacaaaaaaactagggtttgtata 11578341  T
Q  129 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 228  Q
    || ||| |||||||| |||||||  ||||||| |  ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  11578340 gaatttttctcttggcaacaaac--tagggttgg--ggttgattcacctcgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggac 11578245  T
Q  229 tttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctccc 328  Q
    ||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  |||| |||| |||||| ||||    
T  11578244 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtcgaacggagggctgctctttccc 11578145  T
Q  329 acagactag 337  Q
     ||||||||    
T  11578144 ccagactag 11578136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 22407772 - 22407593
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  22407772 gcagatttgttcaaaattttaagcaatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactgtgagatatagggtgctgaaacaagggtttagaa 22407673  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22407672 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg 22407593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 119 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 28459435 - 28459202
Alignment:
Q  119 ggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaag 218  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28459435 ggtttgtatagagcttgtctcttggcaacaaaaactaggatttgagggtggattcaccttggcaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaag 28459336  T
Q  219 agattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggtt 318  Q
    || ||| | ||| || || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |    
T  28459335 agtttggggcttcaggtataattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttttaaagttactcatcattatagtgaaacggagggct 28459236  T
Q  319 gctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
     |||||| ||  |||||||||||||||||| ||||    
T  28459235 tctctctacc-tagactaggtcaatttggatcgaa 28459202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 30 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 20146941 - 20146619
Alignment:
Q  30 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||  ||||| |     |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  20146941 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaaccttaagaggtagagagtttgaaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtat 20146843  T
Q  128 agagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 227  Q
    |||||||| | ||||| ||||||||||| |||| |  | |||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  20146842 agagtttgcc-cttggcaacaaacactatggttgg--gattgattcaccttgggaaacaatagtaggattgagtctcttggtcacgggaaaagattgaga 20146746  T
Q  228 ctttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcc 327  Q
     ||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  20146745 ttttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcc 20146646  T
Q  328 cacagactaggtcaat-ttggaccgaa 353  Q
    | ||||||| |||| | ||||||||||    
T  20146645 ctcagactaagtcagtattggaccgaa 20146619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 22163282 - 22163106
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22163282 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaactttgagatagagggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaacactagggtttgtata 22163183  T
Q  129 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctctt 206  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  22163182 gagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactatta-ggttgagtctctt 22163106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 69 - 209
Target Start/End: Original strand, 38020162 - 38020302
Alignment:
Q  69 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggtt 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38020162 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggtt 38020261  T
Q  169 gattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggt 209  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38020262 gattcaccatggtaaacactattaggattgagtctcttggt 38020302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 28 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 17897578 - 17897270
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctga-aacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | | |||  ||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  17897578 acttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaacttgaggtagagagt-ctgagaacaagggtttagaa-gtcaacaataaaactagggtttgt 17897481  T
Q  126 atagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattga 225  Q
    |||||||||| ||||| | |||||||||||||  |||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | | ||| |||||||    
T  17897480 atagagtttg-ctcttcgcaacaaacactagg--ttgaga-ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcatgagaaaagattga 17897385  T
Q  226 gactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctct 325  Q
    || |||   |||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||| | || ||||||||    
T  17897384 gattttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccctttgatatctattttgtaaagttactcatcattatagtagaacggatggctgctctct 17897285  T
Q  326 cccacagactaggtca 341  Q
    ||| ||||||||||||    
T  17897284 ccc-cagactaggtca 17897270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 35107192 - 35107539
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttaga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||| |||| | | || ||| |||| ||||||     
T  35107192 gcagatttgttccaaattttaagggatacttttactataaatatagacattgtatcatagtaaaccttgaggtaga-gagtctaaaaccaagagtttag- 35107289  T
Q  100 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattga 199  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||   ||||||   || |||||||||||||  ||||| ||||| ||||||    
T  35107290 aagtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaac---agggtt--gggattgattcaccttgagaaacattattaggattga 35107383  T
Q  200 gtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattag--gtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatc 297  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||||   | | ||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  35107384 gtctcttggtcacgggaagagattgtgactttgggtagaattagattttgaagacttattcttgtaa-cctttgttatctcttttgtaatgttactcatc 35107482  T
Q  298 attatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaat-ttggaccgaa 353  Q
    ||||||||| |||| | ||||| |||||  | |||||||||||| | ||||||||||    
T  35107483 attatagtggaacggatggttgttctctttcccagactaggtcagtattggaccgaa 35107539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 159 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 5375550 - 5375358
Alignment:
Q  159 tttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattc 258  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||| | ||||||||||  ||||||||||||    
T  5375550 tttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cggagacttattc 5375452  T
Q  259 tagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5375451 ttgtaacccattgatatctcttttgtaacattactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 5375358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 37963263 - 37962953
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||| |    
T  37963263 acttttactataaatatagactttgtataagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatc--------aaactagggtttgtgt 37963172  T
Q  128 agagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 227  Q
    | |||||| ||||||  ||||||||| | ||||   | |||||||| |||| ||||||| ||||  |||||||||||||||| ||  ||||||||||||     
T  37963171 atagtttg-ctcttgacaacaaacaccatggtt---gtgttgattccccttagaaaacattattgagattgagtctcttggtcacctgaagagattgagg 37963076  T
Q  228 ctttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcc 327  Q
    |||| | |||||||||  | |||||||||||| |||| ||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||  || ||||||     
T  37963075 ctttgggtagaattagacgagagacttattcttgtaatccattgat---ttttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacagtggactgatctctct 37962979  T
Q  328 cacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    | || ||||||| |||||||||||||    
T  37962978 cccacactaggttaatttggaccgaa 37962953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 28 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 5377769 - 5377629
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 123  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5377769 actttcactataaatatagaccttgtttcagagcaaactttgagagagatagaggggactgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaggttt 5377670  T
Q  124 gtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgag 164  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  5377669 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgag 5377629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 165 - 341
Target Start/End: Original strand, 40699429 - 40699606
Alignment:
Q  165 ggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattagg-tgggagacttattctagta 263  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| | |||||||||| | | ||||||||| | |||    
T  40699429 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagacttatttttgta 40699528  T
Q  264 acccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtca 341  Q
    | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  40699529 atcctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagggatgctctttcccccagactaggtca 40699606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 226 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 22407592 - 22407466
Alignment:
Q  226 gactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctct 325  Q
    |||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||    
T  22407592 gacttttggtagaattaggggggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctct 22407494  T
Q  326 cccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22407493 cccccagactaggtcaatttggaccgaa 22407466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 182 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 36559046 - 36558876
Alignment:
Q  182 aaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctctt 280  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| |    
T  36559046 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-t 36558948  T
Q  281 ttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||| |||| ||||||  |||||| | || |||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  36558947 ttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaa 36558876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 182 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 36561323 - 36561153
Alignment:
Q  182 aaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctctt 280  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| |    
T  36561323 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-t 36561225  T
Q  281 ttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||| |||| ||||||  |||||| | || |||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  36561224 ttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaa 36561153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 181 - 311
Target Start/End: Original strand, 20589762 - 20589893
Alignment:
Q  181 aaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattagg-tgggagacttattctagtaacccattgatatctct 279  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  20589762 aaaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttggagacttattcttttaacccattgatatctct 20589861  T
Q  280 tttgtaaagttattcatcattatagtgaaacg 311  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| ||||    
T  20589862 tttgtgaagttactcatcattatagtgtaacg 20589893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 119 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 27136368 - 27136198
Alignment:
Q  119 ggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaag 218  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| |||    
T  27136368 ggtttatatagagcttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcatcttggaaaacactattaggattgaatctcttggtcacggaaag 27136272  T
Q  219 agattgagactttagatagaattagg-tgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagtta 291  Q
    | |||| ||||||   |||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27136271 aaattgggactttgagtagaattaggtttggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagtta 27136198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 182 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 45332363 - 45332193
Alignment:
Q  182 aaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctctt 280  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| | |||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| |||| |    
T  45332363 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattaggactttgggtagaattaggcgggagacttattattgtaacccattgatttctc-t 45332265  T
Q  281 ttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||||| || |||||| |||||||||  | |||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  45332264 ttgtaaaggtactcatca-tatagtgaattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaa 45332193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 85 - 306
Target Start/End: Original strand, 43139356 - 43139571
Alignment:
Q  85 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaa 184  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||| ||||| |||    
T  43139356 aaacaagggtttagaa-gccaacacaaaaacttgggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcatcttgggaaa 43139449  T
Q  185 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggt-gggagacttattctagtaacccattgatatctcttttg 283  Q
    || ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    ||||| ||| | ||||||  ||||| |||| ||||    
T  43139450 cattattaggattgagtctcttggtcacgggaagatattgagactttaggtagaattaggtctaaagactaattattgtaaccttttgatttctc-tttg 43139548  T
Q  284 taaagttattcatcattatagtg 306  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  43139549 taaagttactcatcattatagtg 43139571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 3 - 341
Target Start/End: Original strand, 35028473 - 35028807
Alignment:
Q  3 agatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaaca-agggtttagaa 100  Q
    ||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||| | | |||| ||||  ||||| |  | |||| | |||||||||||    
T  35028473 agatttgttccaattttttagggatacttttactataaatatagacattgtatcagatgtaaaccttgaattagagagc-cggaaaaacagggtttagaa 35028571  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgag 200  Q
       |||||| |||| | |||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  35028572 tc-caacaataaaatttgggtttgta--gagtttg-ctcttggtaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcgcattggaaaacactattatgattgag 35028665  T
Q  201 tctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaatta-ggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcat 299  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||| ||||| | |||||||| | | | | ||| ||||| ||||||  || ||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  35028666 tctcttgatcacgagaagagattgacactttgggtagaattatgtttgaatactaattcttgtaaccttttaatatctcttttctaaaattactcatcat 35028765  T
Q  300 tatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtca 341  Q
    |  |||| |||| || | ||||||||||| |  |||||||||    
T  35028766 tgcagtggaacggagagctgctctctcccccttactaggtca 35028807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 30 - 123
Target Start/End: Original strand, 38020064 - 38020157
Alignment:
Q  30 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 123  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||   | |||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38020064 ttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaacctggagatagagggggttggaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 38020157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 249 - 348
Target Start/End: Original strand, 23870956 - 23871054
Alignment:
Q  249 agacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttgga 348  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  23870956 agacttattcttgtaacccattaatatctctttagtaaggttactcatcat-atagtgaaacggagggttgctctctcccttagattaggtcaatttgga 23871054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 246 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 22707871 - 22707767
Alignment:
Q  246 gggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttg--ctctctcccacagactaggtcaat 343  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||  |||| ||  ||||||||  ||||||||||||||    
T  22707871 gggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctctcctccagactaggtcaat 22707773  T
Q  344 ttggac 349  Q
    ||||||    
T  22707772 ttggac 22707767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 166 - 311
Target Start/End: Original strand, 15693958 - 15694106
Alignment:
Q  166 gttgattcaccttgga-aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt-gagactttagatagaattaggtggga-gacttattctagt 262  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| |||  ||||||||||| || |||||||||| | |||||| | |||||||||||  || |||| ||||| ||    
T  15693958 gttgattcaccgtggagaaacactattaggataaagtctcttggtcacaggaagagatttgggactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgt 15694057  T
Q  263 aacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacg 311  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  15694058 aaccttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattttagtggaacg 15694106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 235 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 7463077 - 7462959
Alignment:
Q  235 tagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagac 334  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||  ||| | ||||||| | || |||| ||||||||||| |||||    
T  7463077 tagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttacccatta-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagac 7462979  T
Q  335 taggtcaa-tttggaccgaa 353  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  7462978 taggtcaattttggaccgaa 7462959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 152 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 38414291 - 38414194
Alignment:
Q  152 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggaga 251  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || |||| |||||| |||||| | |||||||||| ||||||    
T  38414291 actagggtttgagg-ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcac-ggaaaagattgggacttttggtagaattaggcgggaga 38414194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 168 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 27583535 - 27583477
Alignment:
Q  168 tgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgag 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27583535 tgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgag 27583477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 167 - 328
Target Start/End: Original strand, 33603977 - 33604140
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttgga--aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattagg-tgggagacttattctagta 263  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||  ||||||||| | | ||||| |||||  ||    
T  33603977 ttgattcaccttgaacaaaacactattataattgagtcttttggtcatgggaagtgattgagactttaggaagaattaggtttgaagactaattcttcta 33604076  T
Q  264 acccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctccc 328  Q
    |||  ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||| |||| | |  |||||||||||    
T  33604077 accttttgatatatc-tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccc 33604140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 12342772 - 12342673
Alignment:
Q  2 cagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaac-aagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||    || |||||||||||||||||| || |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12342772 cagatttgttccaatttttttaggatacttttactataaatatacacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaaagggtttagaa 12342673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 167 - 341
Target Start/End: Original strand, 17921754 - 17921927
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttgga-aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt-gagactttagatagaattagg-tgggagacttattctagta 263  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| | |||||||||| |   | ||| ||||| | |    
T  17921754 ttgattcaccttgaagaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattcgggactttgggtagaattaggttttaaaactgattcttgca 17921853  T
Q  264 acccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtca 341  Q
    |||| |||||   |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| |||| |||||||| || ||||||||||||    
T  17921854 accctttgat---tctttcataaagttagtcatcattatagtggaacggagggctgctctctacc-cagactaggtca 17921927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 36559138 - 36559067
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 72  Q
    |||||||||||  | |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36559138 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggaga 36559067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 36561415 - 36561344
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 72  Q
    |||||||||||  | |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36561415 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggaga 36561344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 45332439 - 45332384
Alignment:
Q  17 ttttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 72  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45332439 ttttaagcagaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggaga 45332384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 13828503 - 13828401
Alignment:
Q  205 ttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtggga-gacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattata 303  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||| ||  || |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||    
T  13828503 ttggtcacgggaagagattcagactttgggtagaattatgtttgaagacttattcttgtagccctttgatatctcttttgtaaaattactcataattata 13828404  T
Q  304 gtg 306  Q
    |||    
T  13828403 gtg 13828401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 22163111 - 22163034
Alignment:
Q  275 tctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  22163111 tctcttttgtaacgttactcatcat-atagtgaaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggatcgaa 22163034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 166 - 242
Target Start/End: Original strand, 26345661 - 26345738
Alignment:
Q  166 gttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt-gagactttagatagaatta 242  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| | ||||||||    
T  26345661 gttgattcaccttagcaaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagattcgagactttgggtagaatta 26345738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 28462649 - 28462593
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatca 57  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28462649 gcagatttgttccaaattttaagggttacttttactataaatataaaccttgtatca 28462593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 28459028 - 28458948
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttgga--aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggt 245  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| |||| |||||| | |||||||||||    
T  28459028 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagatattgggactttgggtagaattaggt 28458948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 29 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 38414365 - 38414281
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 124  Q
    |||||||||||||||||| | |||||     | |||| ||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38414365 cttttactataaatataggctttgta-----gtaaaccttgagatagagggggctgaaac------ttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 38414281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 59
Target Start/End: Original strand, 45156946 - 45157001
Alignment:
Q  4 gatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaa 59  Q
    ||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45156946 gatttgttccaaattttgagggatgcttttactataaatatagaccttatatcaaa 45157001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 20147082 - 20147040
Alignment:
Q  30 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  20147082 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaaccttgaga 20147040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 279 - 341
Target Start/End: Original strand, 39287262 - 39287324
Alignment:
Q  279 ttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtca 341  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| || |||||||||    
T  39287262 ttttgtaaaattactcatcattatagtggaacgaagagctgctctctccctcatactaggtca 39287324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 230
Target Start/End: Original strand, 2740940 - 2740989
Alignment:
Q  181 aaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactt 230  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||    
T  2740940 aaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggttgggactt 2740989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 167 - 242
Target Start/End: Original strand, 7502975 - 7503052
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttgga-aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaga-ttgagactttagatagaatta 242  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  7502975 ttgatccaccttggagaaacactattaggattgagtatcttggtcaagggaagagatttgagactttgggtagaatta 7503052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 167 - 341
Target Start/End: Original strand, 39686966 - 39687139
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttgga--aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattagg-tgggagacttattctagta 263  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || ||| || | |||||||||| | | ||||| ||||| | |    
T  39686966 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaa 39687064  T
Q  264 acccattgatatctcttttgtaaagttattca-tcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtca 341  Q
    || |||   |||||| |||||||||  | ||| ||||||||||| |||| || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  39687065 actcat---tatctc-tttgtaaagaaactcattcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 39687139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 245
Target Start/End: Original strand, 2736204 - 2736267
Alignment:
Q  181 aaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggt 245  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || |||||| | |||||||||||    
T  2736204 aaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttt-ggtagaattaggt 2736267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 220
Target Start/End: Original strand, 17462419 - 17462474
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttgga--aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 220  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  17462419 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 17462474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 341
Target Start/End: Original strand, 17943520 - 17943692
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttggaaaa--cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattagg-tgggagacttattctagta 263  Q
    ||||||||||||| | ||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || ||| || | |||||||||| | | ||||| ||||| |||    
T  17943520 ttgattcaccttgaacaaatcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgta 17943618  T
Q  264 acccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtca 341  Q
    || ||   ||||||| |||||||||  | |||||||||||||| | |  || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  17943619 actca---atatctc-tttgtaaagaaactcatcattatagtggatcagagagctgctctctcccccagactaggtca 17943692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 20054964 - 20054909
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttgga--aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 220  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  20054964 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 20054909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 22712715 - 22712660
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttgga--aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 220  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22712715 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 22712660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 22717424 - 22717369
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttgga--aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 220  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22717424 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 22717369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 30720811 - 30720686
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttgga-aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt-gagactttagatagaattagg-tgggagacttattctagta 263  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| |  ||| ||||||||| | |||||| | |||||||||| | | ||||| ||||| |||    
T  30720811 ttgattcatcttggagaaacactattaggattgagtctctttggcacgagaagagattcgtgactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgta 30720712  T
Q  264 acccattgatatctcttttgtaaagtta 291  Q
    |||| |||| |  |||||||||||||||    
T  30720711 accctttgaaa--tcttttgtaaagtta 30720686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 220
Target Start/End: Original strand, 38190980 - 38191035
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttgga--aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 220  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  38190980 ttgattcaccttgaacaaaacactattaagattgagtctcttggtcacgggaagag 38191035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 220
Target Start/End: Original strand, 45567392 - 45567447
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttgga--aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 220  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  45567392 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 45567447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 167 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 27517838 - 27517664
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttggaaaa--cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattagg-tgggagacttattctagta 263  Q
    ||||||||||||| | ||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || ||| || | |||||||||| | | ||||| ||||| |||    
T  27517838 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 27517740  T
Q  264 acccattgatatctcttttgtaaagttattc--atcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtca 341  Q
    || ||   ||||||| |||||||||  | ||  |||||||||||| |||| || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  27517739 actca---atatctc-tttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 27517664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 77
Target Start/End: Original strand, 40699203 - 40699278
Alignment:
Q  3 agatttgttccaaattt-taagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag 77  Q
    ||||||||||||| ||| | || || ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| |||||| ||||    
T  40699203 agatttgttccaattttctgagggatacttttactataaatatagaccttgcatcagagtaaaccttgagagagag 40699278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 230
Target Start/End: Original strand, 39680028 - 39680093
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttgga--aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactt 230  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||    
T  39680028 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagaggctgagactt 39680093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 41304667 - 41304627
Alignment:
Q  85 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 126  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  41304667 aaacaagggtttagaa-gccaacaacaaaactagggtttgta 41304627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 167 - 220
Target Start/End: Original strand, 17932617 - 17932672
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttggaaaa--cactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 220  Q
    ||||||||||||| | ||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  17932617 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 17932672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 167 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 20050221 - 20050166
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttgga--aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 220  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||    
T  20050221 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagag 20050166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 57
Target Start/End: Original strand, 20589581 - 20589609
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatca 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20589581 cttttactataaatatagaccttgtatca 20589609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 55
Target Start/End: Original strand, 33603818 - 33603870
Alignment:
Q  3 agatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtat 55  Q
    ||||||||||||| || | || || |||||||||||||||||| |||||||||    
T  33603818 agatttgttccaatttgttagggatacttttactataaatataaaccttgtat 33603870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 167 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 34575308 - 34575229
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttgga-aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt-gagactttagatagaattaggt 245  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||| ||||| | |||||| | |||||||||||    
T  34575308 ttgattcaccttggagaaacactattaggatggagtctcttggtctcgggaa-agattcgggactttgggtagaattaggt 34575229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 119)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 7 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 31435404 - 31435058
Alignment:
Q  7 ttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaa 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31435404 ttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaa 31435305  T
Q  107 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctctt 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  31435304 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt 31435205  T
Q  207 ggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtg 306  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31435204 ggttacgggaagaggctggaactttgggtagaattaggtggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtg 31435105  T
Q  307 aaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
     |||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  31435104 gaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttgtaccgaa 31435058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 35555 - 35906
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35555 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggttcagaa 35654  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgag 200  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35655 agacaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgag 35754  T
Q  201 tctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |    
T  35755 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-t 35853  T
Q  301 atagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||| |||| || | |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  35854 atagtggaacggagagctgctttctcccctagactaggtcaatttggaccgaa 35906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 44490 - 44841
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44490 gcagatttgtaccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 44589  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  44590 aggcaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttaggaaacactattatgattgag 44689  T
Q  201 tctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatt 300  Q
    ||| |||||||||||||||| ||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |    
T  44690 tcttttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattatgtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-t 44788  T
Q  301 atagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||| |||| |  | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44789 atagtggaacggatagctgctttctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 44841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 29 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 20137444 - 20137121
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||| | | |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20137444 cttttactataaatattggctttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtata 20137345  T
Q  129 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  20137344 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttgattacgggaagagattgggac 20137245  T
Q  229 tttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctccc 328  Q
    ||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  20137244 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctccc 20137145  T
Q  329 acagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  20137144 -cagactaggtcaatttggaccgaa 20137121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 27306592 - 27306245
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27306592 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 27306493  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  27306492 aggcaacaacaaaactagggttt-tatagagtttgtctctttggaacaaaaactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 27306394  T
Q  201 tctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||| | || ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |    
T  27306393 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgcaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-t 27306295  T
Q  301 atagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggacc 350  Q
    |||||| |||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  27306294 atagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggacc 27306245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 13099812 - 13099486
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13099812 acttttactataaatatagaccttgaatcaaagtaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtat 13099713  T
Q  128 agagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 227  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  13099712 agagtttgtctctttggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattgggg 13099613  T
Q  228 ctttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctc 326  Q
    |||| | |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  13099612 ctttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctc 13099513  T
Q  327 ccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  13099512 ccccagactaggtcaatttggaccgaa 13099486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 1049658 - 1049308
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1049658 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtattagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 1049559  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  1049558 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaataaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatcaggattgag 1049459  T
Q  201 tctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| | || |||||| |    
T  1049458 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatca-t 1049361  T
Q  301 atagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||| |  | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1049360 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 1049308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 40837105 - 40836755
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  40837105 gcagatttgttccaaattttaagggaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaatttggagattgagggggctgaaagaagggtttagaa 40837006  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  40837005 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 40836906  T
Q  201 tctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| | || |||||| |    
T  40836905 tctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatca-t 40836808  T
Q  301 atagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||| | || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40836807 atagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 40836755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 3878497 - 3878854
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaat----atagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggt 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  3878497 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaattaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggt 3878596  T
Q  95 ttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatg 194  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  3878597 ttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacgctagggcttgtgggttgattcaccttggtaaacactattagg 3878696  T
Q  195 attgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||    
T  3878697 attgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactc 3878796  T
Q  295 atcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||| ||||||| | || |||| ||||||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  3878797 atca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactatgttaatttggaccgaa 3878854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 42331335 - 42331009
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  42331335 acttttactataaatatagactttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactaaggtttgtat 42331236  T
Q  128 agagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggtt--acgggaagagattga 225  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  42331235 agagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacacgggaagagattga 42331136  T
Q  226 gactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctct 325  Q
    |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||| |  |||||    
T  42331135 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatta-tatagtgaaacggagggctattctct 42331037  T
Q  326 cccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  42331036 cccccagattaggtcaatttggaccgaa 42331009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 29 - 353
Target Start/End: Original strand, 44724533 - 44724856
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44724533 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaacctggagatatagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 44724632  T
Q  129 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 228  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  || |||    
T  44724633 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagaggctgggac 44724732  T
Q  229 tttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctccc 328  Q
    ||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  44724733 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctccc 44724831  T
Q  329 acagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  44724832 ccagactaggtcaatttggaccgaa 44724856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 29 - 353
Target Start/End: Original strand, 24748548 - 24748872
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||  | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  24748548 cttttattataaatatagacattgtatcagtgtaaactttgacttagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaataaaactagggtttgtata 24748647  T
Q  129 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 228  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  24748648 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattacgattgagtctcttggttccgggaagagattgggac 24748747  T
Q  229 tttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctccc 328  Q
    ||| | ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||     
T  24748748 tttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcct 24748847  T
Q  329 acagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
     |||| |||||||||||||||||||    
T  24748848 ccagattaggtcaatttggaccgaa 24748872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 35 - 353
Target Start/End: Original strand, 24258423 - 24258744
Alignment:
Q  35 ctataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 134  Q
    ||||||||||||   |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24258423 ctataaatataggttttgtatcagagtaaacattgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagttt 24258522  T
Q  135 gtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttaga 234  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||    
T  24258523 gtctcttggcaacaaacactatggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaaaagattgagactttgga 24258622  T
Q  235 tagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatc---attatagtgaaacgaagggttgctctctcccaca 331  Q
    |||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||| |||| |||| |||||||||   ||    
T  24258623 tagaattaggcggaaaacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattattatagtggaacggagggctgctctctctttca 24258722  T
Q  332 gactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  24258723 gactaggtcaatttggaccgaa 24258744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 29 - 353
Target Start/End: Original strand, 21679981 - 21680304
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21679981 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 21680080  T
Q  129 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  21680081 gagtttgtctcttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttaccggaagagattgggac 21680180  T
Q  229 tttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctccc 328  Q
    ||| | |||||||||  |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||  || | |||||||||||    
T  21680181 tttgggtagaattagacgggagatttattcttgtaacccaatgatatctcttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacagagagctgctctctccc 21680279  T
Q  329 acagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
     |||||||||| |||||||||||||    
T  21680280 ccagactaggtgaatttggaccgaa 21680304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Original strand, 38393935 - 38394263
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38393935 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 38394034  T
Q  124 gtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt 223  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |    
T  38394035 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 38394134  T
Q  224 gagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctct 323  Q
    | |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||| | || |||| ||||||    
T  38394135 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctct 38394233  T
Q  324 ctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38394234 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 38394263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 29 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 39146322 - 39145998
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||  | |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  39146322 cttttactataaatatagacactgtatcagtgtaaaccttgagatggagggggctgaaacaagggtttagatagacaacaacaaaactagggtttgtata 39146223  T
Q  129 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 228  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  39146222 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattggaac 39146123  T
Q  229 tttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctccc 328  Q
    ||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  ||| |||||| | ||    
T  39146122 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggggggctgctcttttcc 39146023  T
Q  329 acagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
      | |||||||||||||| ||||||    
T  39146022 ctaaactaggtcaatttgtaccgaa 39145998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Original strand, 443548 - 443873
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  443548 acttttactataaatatagactttgaatcagagtaaaccttgagatagagggagctaaaacaatggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtat 443647  T
Q  128 agagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 227  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  443648 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgattacgggaagagattggga 443747  T
Q  228 ctttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctct-c 326  Q
    |||| | |||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  443748 ctttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatctcttttataacgttactcatca-tatagtgaaacgaagggctgctctctcc 443846  T
Q  327 ccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    || | ||||||||||||||||||||||    
T  443847 cccccgactaggtcaatttggaccgaa 443873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 29 - 311
Target Start/End: Original strand, 25276095 - 25276377
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25276095 cttttactataaatatatgctttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctaaaacaataatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 25276194  T
Q  129 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25276195 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 25276294  T
Q  229 tttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacg 311  Q
    ||| | |||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  25276295 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacg 25276377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 29 - 353
Target Start/End: Original strand, 11355212 - 11355535
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11355212 cttttactataaatataggctttgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 11355311  T
Q  129 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 228  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11355312 gagtttgtctcttggcaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagac 11355411  T
Q  229 tttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctccc 328  Q
    ||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||  |||||| ||||||| |||  || | |||||||||||    
T  11355412 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatcttttttgtaacgtttctcatca-tatagtggaacagagagctgctctctccc 11355510  T
Q  329 acagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
      |||||| ||||||||||||||||    
T  11355511 ctagactatgtcaatttggaccgaa 11355535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Original strand, 48457602 - 48457930
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48457602 actttcactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 48457701  T
Q  124 gtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt 223  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |    
T  48457702 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttcattcacctagggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 48457801  T
Q  224 gagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctct 323  Q
    | |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||| |||| ||||||    
T  48457802 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 48457900  T
Q  324 ctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48457901 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 48457930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 3 - 353
Target Start/End: Original strand, 25542459 - 25542805
Alignment:
Q  3 agatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaag 102  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  25542459 agatttattccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggg-ctgaaacaaaggtttagaaag 25542557  T
Q  103 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtc 202  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  25542558 gtaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaaaaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg-aaagactattaggattgagtc 25542656  T
Q  203 tcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattat 302  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||| | |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||| |||    
T  25542657 tcttggttacaggaagagactgggactttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tat 25542754  T
Q  303 agtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||| | || || | |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  25542755 agtggatcggagagctgctctctcccctagactaggttaatttggaccgaa 25542805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 29 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 27832969 - 27832651
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggg-gctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||||||||||||||||    ||||||| ||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  27832969 cttttactataaatataggttgtgtatcagagcaaaccttgtgatagagtggagctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacagaactaaggtttgtat 27832870  T
Q  128 agagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 227  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27832869 agagtttgtctcttggcaacatacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 27832770  T
Q  228 ctttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcc 327  Q
    |||| | || ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | |||| | ||||||||    
T  27832769 ctttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttctgtaaagttactcatcattatagtgaaatggagggcttctctctcc 27832670  T
Q  328 cacagactaggtcaatttg 346  Q
    | |||||||||||||||||    
T  27832669 cccagactaggtcaatttg 27832651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 31 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 7470359 - 7470034
Alignment:
Q  31 tttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7470359 tttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 7470260  T
Q  127 tagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgag 226  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  7470259 tagagattgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgtgaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgag 7470160  T
Q  227 actttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctc 326  Q
    ||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||| | || |||| ||||| |||    
T  7470159 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctccctc 7470061  T
Q  327 ccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  7470060 ccccagactaggtcaatttggaccgaa 7470034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 29 - 353
Target Start/End: Original strand, 21678020 - 21678343
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21678020 cttttactataaatatagatattgtatcaatgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacatcaaaactagggtttgtata 21678119  T
Q  129 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||    
T  21678120 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagatattgggac 21678219  T
Q  229 tttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctccc 328  Q
    ||| | ||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||| |||||||||||   ||| |||||||||||    
T  21678220 tttgggtagcattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatatcttttgtaaggttacttatca-tatagtgaaacagtgggctgctctctccc 21678318  T
Q  329 acagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
      ||||||||| |||||||||||||    
T  21678319 ctagactaggttaatttggaccgaa 21678343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Original strand, 40946277 - 40946605
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagat----agagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 123  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40946277 actttcactataaatataaaccttgtttcatagcaaactttgagagggacagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 40946376  T
Q  124 gtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt 223  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  40946377 gtatagagtttgtctcttagaaacaaacactagggtttgtgggttgatttactttggaaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagaggct 40946476  T
Q  224 gagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctct 323  Q
    | |||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||| | ||||||| ||||||    
T  40946477 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcgaagggctgctct 40946575  T
Q  324 ctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40946576 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 40946605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 29 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 4296271 - 4295946
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagacctt-gtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  4296271 cttttactataaatatagacatttgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtat 4296172  T
Q  128 agagtttgtctctt-ggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgag 226  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4296171 agagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 4296072  T
Q  227 actttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctc 326  Q
    ||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||  |||| |||| ||||    
T  4296071 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctatctc 4295973  T
Q  327 ccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    || || |||||||||||||||||||||    
T  4295972 ccccatactaggtcaatttggaccgaa 4295946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Original strand, 20299407 - 20299737
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaa-gggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    |||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  20299407 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaaggggtttagaatgacaacaacaaaactagggtt 20299506  T
Q  123 tgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactaggg-tttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaga 221  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  20299507 tgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagg 20299606  T
Q  222 ttgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgct 321  Q
     || |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||| | || |||||||||    
T  20299607 ctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggttgct 20299705  T
Q  322 ctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20299706 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 20299737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 29 - 353
Target Start/End: Original strand, 9680768 - 9681097
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  9680768 cttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagagagatagagggggttgaaacaagggtttagaagggcaacaacaaaactatggttt 9680867  T
Q  124 gtatagagtttgtctctt-ggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagat 222  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9680868 gtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagat 9680967  T
Q  223 tgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctc 322  Q
    ||||||||| | |||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| | |||| |||||    
T  9680968 tgagactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatatcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaatggagggctgctc 9681066  T
Q  323 tctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  9681067 tctcccccagactaggtcaatttggatcgaa 9681097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 30 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 37412462 - 37412137
Alignment:
Q  30 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || |||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37412462 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatatagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatag 37412363  T
Q  130 agtttgtctcttg-gaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 228  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || |||    
T  37412362 agtttgtctctttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagactgggac 37412263  T
Q  229 tttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcc 327  Q
    ||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| |||| | || ||||||||||    
T  37412262 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcc 37412163  T
Q  328 cacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |  ||||| |||||||||||||||||    
T  37412162 cctagactgggtcaatttggaccgaa 37412137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 5 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 31156271 - 31155923
Alignment:
Q  5 atttgttccaaattt-taagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagg 103  Q
    ||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31156271 atttgttccaaatttatgagctatacttttactataaatatagagcttgtatcaaggcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagg 31156172  T
Q  104 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattg-agtc 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  31156171 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactaggatttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 31156072  T
Q  203 tcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattat 302  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| | || ||||| | ||    
T  31156071 tcttgggtacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacggtactcatcct-at 31155974  T
Q  303 agtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||| |  | |||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  31155973 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaa 31155923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 31 - 353
Target Start/End: Original strand, 20625990 - 20626315
Alignment:
Q  31 tttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 126  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20625990 tttattataaatatagaccttctatcagactaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 20626089  T
Q  127 tagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgag 226  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |    
T  20626090 tagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 20626189  T
Q  227 actttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctc 326  Q
    ||||| | ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||| | || |||| |||||||||    
T  20626190 actttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctc 20626288  T
Q  327 ccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  20626289 ccccagactaggtcaatttggaccgaa 20626315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 31 - 353
Target Start/End: Original strand, 20629881 - 20630206
Alignment:
Q  31 tttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 126  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20629881 tttattataaatatagaccttctatcagactaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 20629980  T
Q  127 tagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgag 226  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |    
T  20629981 tagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 20630080  T
Q  227 actttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctc 326  Q
    ||||| | ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||| | || |||| |||||||||    
T  20630081 actttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctc 20630179  T
Q  327 ccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  20630180 ccccagactaggtcaatttggaccgaa 20630206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 31 - 353
Target Start/End: Original strand, 20642300 - 20642625
Alignment:
Q  31 tttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 126  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20642300 tttattataaatatagaccttctatcagactaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 20642399  T
Q  127 tagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgag 226  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |    
T  20642400 tagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 20642499  T
Q  227 actttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctc 326  Q
    ||||| | ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||| | || |||| |||||||||    
T  20642500 actttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctc 20642598  T
Q  327 ccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  20642599 ccccagactaggtcaatttggaccgaa 20642625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Original strand, 20297311 - 20297639
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 123  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||    |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  20297311 acttttactaaaaatatggaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaataaaactagggttt 20297410  T
Q  124 gtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt 223  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20297411 gtatagagtttgtctcttgggaacaaacagtagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt 20297510  T
Q  224 gagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctct 323  Q
    | | |||| | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| ||||||| |  | |||| ||||||    
T  20297511 ggggctttgggtagaaataggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatca-tatagtggattggagggctgctct 20297609  T
Q  324 ctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20297610 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 20297639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 62 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 21592445 - 21592155
Alignment:
Q  62 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggttt 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  21592445 aaactttgagatagagggggctgaaacaaaggtttagaaatgcaacaacaaaagtaggatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggttt 21592346  T
Q  162 gagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctag 261  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |    
T  21592345 gagggttgattcaccttggcaagcactattaggatttagtctcttggttacgcgaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttg 21592246  T
Q  262 taacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  21592245 taactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaa 21592155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 31 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 7472317 - 7471992
Alignment:
Q  31 tttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7472317 tttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgta 7472218  T
Q  127 tagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgag 226  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||      
T  7472217 tagagattgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgga 7472118  T
Q  227 actttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctc 326  Q
    ||||| | |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||| | || | || |||||||||    
T  7472117 actttgggtagaattaggcgggacacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctctc 7472019  T
Q  327 ccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  7472018 ccccagactaggtcaatttggaccgaa 7471992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 28 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 22828969 - 22828672
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22828969 acttttactataaatataggctttgtatccgagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtat 22828870  T
Q  128 agagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 227  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22828869 agagtttatctcttgaaaacaaacactagagtttgatggttgattcagattagaaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattgaga 22828770  T
Q  228 ctttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctct 325  Q
    |||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||| ||||||||    
T  22828769 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaattactcattattatagtgaaacagagggctgctctct 22828672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Original strand, 28487502 - 28487830
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 123  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  28487502 acttttcctataaatatagaccatgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagagttt 28487601  T
Q  124 gtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt 223  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28487602 gtatagagtttgtctcttcgaaactaacactagggttcgtgggttgattcacctttggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagatt 28487701  T
Q  224 gagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctct 323  Q
    | | |||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||| |  |||||||||||    
T  28487702 ggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaatcagagggttgctct 28487800  T
Q  324 ctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28487801 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 28487830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 28 - 352
Target Start/End: Original strand, 18345490 - 18345817
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgag----atagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18345490 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctgaactttgagggagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 18345589  T
Q  124 gtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt 223  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  18345590 gtatagagtttgtctctttgcaacaaatactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagaggct 18345689  T
Q  224 gagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctct 323  Q
    |||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| ||||||| | || |||| || |||    
T  18345690 gagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatca-tatagtggatcggagggctgttct 18345788  T
Q  324 ctcccacagactaggtcaatttggaccga 352  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18345789 ctcccccagactaggtcaatttggaccga 18345817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Original strand, 3035670 - 3036001
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3035670 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 3035769  T
Q  124 gtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaaga---g 220  Q
     ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |    
T  3035770 ttatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaagag 3035869  T
Q  221 attgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgc 320  Q
      || |||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || | || |||||| ||||||| |  | |||| |||    
T  3035870 gctgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgcaacgatactcatca-tatagtggattggagggctgc 3035968  T
Q  321 tctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3035969 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 3036001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 69 - 353
Target Start/End: Original strand, 1849975 - 1850258
Alignment:
Q  69 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggtt 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  1849975 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgtgggtt 1850074  T
Q  169 gattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaaccca 268  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||  || ||||||   |||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  1850075 gattcaccttggaaaacactattaggattgagtttcttgcttacgggaagaggctgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 1850174  T
Q  269 ttgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||| | || |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  1850175 ttgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaa 1850258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 30 - 353
Target Start/End: Original strand, 21990106 - 21990427
Alignment:
Q  30 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || |||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||    
T  21990106 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactatgatttgtatag 21990204  T
Q  130 agtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagact 229  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21990205 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaagagattgaggct 21990304  T
Q  230 ttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctccca 329  Q
    ||   |||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||  |||| |||||||||||     
T  21990305 ttgagtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacagagggctgctctctcccc 21990403  T
Q  330 cagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  21990404 aagactaggtcaatttggaccgaa 21990427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 26804499 - 26804765
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26804499 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtg----agtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 26804594  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacac---tagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgatt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  26804595 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagtagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 26804694  T
Q  198 gagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaaccca 268  Q
     ||||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  26804695 tagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 26804765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 29 - 345
Target Start/End: Original strand, 42223110 - 42223427
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagg-gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| || |||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42223110 cttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagatagatgtgggatgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtat 42223209  T
Q  128 agagtttgtctctt-ggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgag 226  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||      
T  42223210 agagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 42223309  T
Q  227 actttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctc 326  Q
     |||| |||||||||||| || | ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| | | || |||||||||    
T  42223310 gctttggatagaattaggcggaaaacttattcttgaaacctattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaatggatggctgctctctc 42223408  T
Q  327 ccacagactaggtcaattt 345  Q
    || || |||||||||||||    
T  42223409 ccccatactaggtcaattt 42223427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 30 - 350
Target Start/End: Original strand, 9679009 - 9679333
Alignment:
Q  30 ttttactataaatatagaccttgtatca-aagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 124  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||||    |||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  9679009 ttttactataaatatagatcttgtatcagatgtaaactttgagagagatagagggggctgaaacaaggatctagaatgacaacaacaaaactagggtttg 9679108  T
Q  125 tatagagtttgtctc-ttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt 223  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9679109 tatagagtttgtctctttggcaacaaacacta-ggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 9679207  T
Q  224 gagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctct 323  Q
    | |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||   ||||||    
T  9679208 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagtactgctct 9679306  T
Q  324 ctcccacagactaggtcaatttggacc 350  Q
    ||  | |||||||||||||||||||||    
T  9679307 ctttcccagactaggtcaatttggacc 9679333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 7349615 - 7349285
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||      ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7349615 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaggggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 7349516  T
Q  122 ttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagag 220  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7349515 ttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 7349416  T
Q  221 attgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgc 320  Q
    ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| |  | ||||||| |||||| |  | |||| |||    
T  7349415 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgc 7349318  T
Q  321 tctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  7349317 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaa 7349285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 3 - 325
Target Start/End: Original strand, 7188470 - 7188789
Alignment:
Q  3 agatttgttccaaattt-taagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 101  Q
    ||||||||||||| ||| | || || ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7188470 agatttgttccaattttatgagggatacttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa- 7188568  T
Q  102 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagt 201  Q
    | |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7188569 gtcaacaataaaaatagggtttgtatagggtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagt 7188665  T
Q  202 ctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatta 301  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7188666 ctcttggtcacgggaatagattgagactttgggtagaattaagcgggagacttatttttataacccattgatatttcttttgtaaagttattcatcatta 7188765  T
Q  302 tagtgaaacgaagggttgctctct 325  Q
    ||||| |||| | || ||||||||    
T  7188766 tagtggaacggaaggctgctctct 7188789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Original strand, 28485515 - 28485842
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28485515 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagaaggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 28485614  T
Q  124 gtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt 223  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28485615 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgcgggttgattcacctttggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagatt 28485714  T
Q  224 gagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctct 323  Q
    | | ||||   || ||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||| |||| |  |||||||||||    
T  28485715 ggggctttgagtataattaggcgggagatttattcttgtaatccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tataatgaatcagagggttgctct 28485813  T
Q  324 ctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||    
T  28485814 ct-cctcagactaggtcaatttggaccgaa 28485842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 13 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 22251893 - 22251604
Alignment:
Q  13 caaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaa 112  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22251893 caaattttaagcgacacttttactataaatataaaccttgaatcagagtaaactttgagatagaggaggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaa 22251794  T
Q  113 aactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttac 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |        || |||||||||||||||||||    
T  22251793 aactagagtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttggga--------taggattgagtctcttggttac 22251702  T
Q  213 gggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgata----tctcttttgtaaagttattcatcattatagtg 306  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22251701 gggaagagattgaggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctttctcttttgtaaagttactcatcattatagtg 22251604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 69 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 1047219 - 1046937
Alignment:
Q  69 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggtt 168  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  1047219 gagatagagggggctgaaacaggggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 1047120  T
Q  169 gattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaaccca 268  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  1047119 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 1047020  T
Q  269 ttgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||| |||| ||||||| | || |||||| ||||||| |  | |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  1047019 ttgatttctc-tttgtaacgatactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccacactaggtcaatttggaccgaa 1046937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 28 - 299
Target Start/End: Original strand, 11757177 - 11757454
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaa-gggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    |||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  11757177 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaaggggtttagaatgacaacaacaaaactagggtt 11757276  T
Q  123 tgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactaggg-tttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaga 221  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  11757277 tgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagg 11757376  T
Q  222 ttgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcat 299  Q
     || |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||    
T  11757377 ctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 11757454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 43253860 - 43253529
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggg--------ggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagg 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| |||| |        ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  43253860 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagagagaaagagggctgaaacaaggttttagaatgacaacaacaaaactagg 43253761  T
Q  120 gtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaaga 219  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  43253760 gtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagg-tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgattacggaaaga 43253662  T
Q  220 gattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttg 319  Q
    |  ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||| | |  |||| ||    
T  43253661 ggctgagactttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctg 43253563  T
Q  320 ctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  43253562 ctctctccctcagactaggtcaatttagaccgaa 43253529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 31 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 24817682 - 24817364
Alignment:
Q  31 tttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 129  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| | | |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| | |||||||||||||||||    
T  24817682 tttaatataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaa-gtcaacaagagaactagggtttgtatag 24817585  T
Q  130 agtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagact 229  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24817584 agtttg-ctctttgcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttggaaagcagtattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagact 24817489  T
Q  230 ttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctccca 329  Q
    || | |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | || |||||||||||     
T  24817488 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatgtctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccc 24817389  T
Q  330 cagactaggtca-atttggaccgaa 353  Q
    || |||||||||  |||||||||||    
T  24817388 catactaggtcagttttggaccgaa 24817364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 7351994 - 7351664
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 121  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||    |||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7351994 acttttactataaatataaaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggct 7351895  T
Q  122 ttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagag 220  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7351894 ttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 7351795  T
Q  221 attgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgc 320  Q
    |||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| |  | ||||||| |||||| |  | |||| |||    
T  7351794 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgc 7351697  T
Q  321 tctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||||| || |||||||||  ||||||||||    
T  7351696 tctctcccccatactaggtcagattggaccgaa 7351664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Original strand, 18567545 - 18567730
Alignment:
Q  7 ttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaa 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18567545 ttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaa 18567644  T
Q  107 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactatta 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18567645 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 18567730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 3 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 20091903 - 20091584
Alignment:
Q  3 agatttgttccaaattt-taagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaa 100  Q
    ||||||||||||| ||| | || || ||||||||||||||||||||| || ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |    
T  20091903 agatttgttccaattttatgagggatacttttactataaatatagactttttatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaagggtttcgga 20091804  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgag 200  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| | ||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |     
T  20091803 -ggcaaca-caaaactagggtttgtatagagtttg-ctattggcaacaaagattagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattaaa 20091709  T
Q  201 tctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatt 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||       
T  20091708 tctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatc--- 20091612  T
Q  301 atagtgaaacgaagggttgctctctccc 328  Q
    |||||| |||| |||| |||||||||||    
T  20091611 atagtggaacggagggctgctctctccc 20091584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 145 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 7092431 - 7092225
Alignment:
Q  145 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattagg 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||    
T  7092431 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattagg 7092332  T
Q  245 tgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatt 344  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  7092331 cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctctctccc-cagactaggtcaatt 7092234  T
Q  345 tggaccgaa 353  Q
    |||||||||    
T  7092233 tggaccgaa 7092225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 104 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 24813755 - 24813509
Alignment:
Q  104 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtct 203  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||   ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  24813755 caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaagaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaagcactattaggattgagtct 24813660  T
Q  204 cttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattata 303  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  24813659 cttggtgacgggaagtgattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatttatatctcctttgtaaagttactcatcattata 24813560  T
Q  304 gtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtca-atttggaccgaa 353  Q
    ||| | || | || |||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  24813559 gtggagcggatggctgctttctcccccagactaggtcagttttggaccgaa 24813509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 145 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 7094678 - 7094476
Alignment:
Q  145 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattagg 244  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| | |||| | ||||||||||    
T  7094678 aacaaaca-tagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttaattacgggaagagattggggctttgggtagaattagg 7094580  T
Q  245 tgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatt 344  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  7094579 cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatt 7094481  T
Q  345 tggac 349  Q
    |||||    
T  7094480 tggac 7094476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 22392399 - 22392608
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  22392399 gcagatttgttccaaattgtaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttata- 22392497  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgag 200  Q
           ||  ||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  22392498 -------aatcaaactagggtttgtatagaatttg-ctattggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 22392586  T
Q  201 tctcttggttacgggaagagat 222  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  22392587 tctcttggtcacgggaagagat 22392608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 30 - 353
Target Start/End: Original strand, 24465503 - 24465814
Alignment:
Q  30 ttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| | | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||    
T  24465503 ttttactatagatatagactttgtatcagatgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatc--------aaactagggtttgtata 24465594  T
Q  129 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 228  Q
    | ||||| ||||||| ||||||||||||||||  |   |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  24465595 gcgtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgaa---ttgattcaccttgggaaacaatattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggac 24465690  T
Q  229 tttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctccc 328  Q
    ||| | ||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||||   |  |||||||||||    
T  24465691 tttgggtagaattaggtgggagatttattcttttaactcattgatatgtcttttgtaaag-tactcatcattataatgaaacgggtgactgctctctccc 24465789  T
Q  329 acagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
     |||||||| ||||| || ||||||    
T  24465790 ccagactagatcaatatgaaccgaa 24465814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Original strand, 6332179 - 6332499
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaggca-acaacaaaactagggtttgt 125  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| || || ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||  || |||||| | |||||||||      
T  6332179 acttttactataaatataaaacttgtatcagagtaacctt-gagagagagggggctggaaacaagggtttataaa--catacaacaga-ctagggttt-- 6332272  T
Q  126 atagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattga 225  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||||||||| || |||  ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  6332273 atagagttta-ctcttggcaacaaacactaggatt-gaga-ttgattcagtttggaaaacactattaagattgagtctcttggtcacaagaagagattga 6332369  T
Q  226 gactttagatagaattagg-tgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctc 324  Q
    |||||||| |||||||||| | | ||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | |  || ||||    
T  6332370 gactttaggtagaattaggcttgaagacttattcttgtaaccctttaatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggaagactgttctc 6332469  T
Q  325 tcccacagactaggtcaat-ttggaccgaa 353  Q
    ||||  ||||||||||| | ||||||||||    
T  6332470 tcccctagactaggtcagtattggaccgaa 6332499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 144 - 353
Target Start/End: Original strand, 38396704 - 38396911
Alignment:
Q  144 aaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattag 243  Q
    ||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| | |||||||||    
T  38396704 aaacacaccctaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactgttaggatcgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattag 38396803  T
Q  244 gtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaat 343  Q
    | |||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||  ||| |||||| ||||||| | || |||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  38396804 gcgggagacttatttttgtaacccattgatttctc-tttgtaactttactcatca-tatagtggatcggagggcttctctctccctcagactaggtcaat 38396901  T
Q  344 ttggaccgaa 353  Q
    ||||||||||    
T  38396902 ttggaccgaa 38396911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 235 - 350
Target Start/End: Original strand, 22393882 - 22393997
Alignment:
Q  235 tagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagac 334  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||    
T  22393882 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggttgttctctcccctagac 22393981  T
Q  335 taggtcaatttggacc 350  Q
    ||||||||||||||||    
T  22393982 taggtcaatttggacc 22393997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 85 - 353
Target Start/End: Original strand, 11081522 - 11081788
Alignment:
Q  85 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaa 184  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| ||   ||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||| |||| |||    
T  11081522 aaacaagggtttagaa-gccaacaacaaaactagggtttgtagagaatt---ctcttggcaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcactttgggaaa 11081615  T
Q  185 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattagg-tgggagacttattctagtaaccc--attgatatctcttt 281  Q
    |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||  || |||   || ||||||| | | ||||| ||||| |||||||   ||||||||||||     
T  11081616 cactattaggattgagtctcttgatcacgggaagagattaggattttgtgtaaaattaggtttgaagactaattcttgtaaccctttttgatatctcttg 11081715  T
Q  282 tgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaat-ttggaccgaa 353  Q
    |||||||||| ||||| ||| | || |||| | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  11081716 tgtaaagttactcatctttaaaatggaacggatggttgctctctcccccagactaggtcaatattggaccgaa 11081788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 182 - 353
Target Start/End: Original strand, 2935375 - 2935545
Alignment:
Q  182 aaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctctt 280  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| |    
T  2935375 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-t 2935473  T
Q  281 ttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||| |||| ||||||  |||||| | || |||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  2935474 ttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaa 2935545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 208 - 349
Target Start/End: Original strand, 26295580 - 26295721
Alignment:
Q  208 gttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtga 307  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||| | |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26295580 gttacaggaagcgattgtgactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtga 26295679  T
Q  308 aacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggac 349  Q
    |||  | |  ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  26295680 aacagatgactgctctctcctccagactaggtcaatttggac 26295721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 85 - 303
Target Start/End: Original strand, 6048885 - 6049098
Alignment:
Q  85 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgga-aa 183  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||| ||   ||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||||| | ||    
T  6048885 aaacaagggtttagaa-gccaacatcaaaactagggtttgtaaagaatt---ctcttggcaacaaacactagg-tttg-ggattgattcaccttgaagaa 6048978  T
Q  184 acactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattagg-tgggagacttattctagtaacccattgatatctctttt 282  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| | | |||| ||||||  |||||| |||||||| | |||    
T  6048979 acactattaggattgaatctcttggtcacgagaagatattgagactttggatagaattaggtttgaagacgtattcttataaccctttgatatc-ccttt 6049077  T
Q  283 gtaaagttattcatcattata 303  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  6049078 gtaaagttactcatcattata 6049098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 167 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 16297222 - 16297033
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattag-gtgggagacttattctagtaac 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||  | | ||| | ||||| |||||    
T  16297222 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagatttgaagattgattcttgtaac 16297123  T
Q  266 cc-attgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaat-ttggaccgaa 353  Q
    ||  || |||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||| || | |||||||||||  |||||| |||| | ||||||||||    
T  16297122 ccttttaatatctcttttgcaaagttactcatcattatagtagaacggagagctgctctctcccctagactatgtcagtattggaccgaa 16297033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 182 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 9027375 - 9027206
Alignment:
Q  182 aaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctctt 280  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |||| |    
T  9027375 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatttctc-t 9027278  T
Q  281 ttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||| |||| ||||||  |||||| |  | |||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  9027277 ttgtaacgttactcatca-aatagtggataggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaa 9027206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 182 - 353
Target Start/End: Original strand, 22108174 - 22108343
Alignment:
Q  182 aaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctctt 280  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||| |||| |    
T  22108174 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctc-t 22108271  T
Q  281 ttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||| |||| ||||||  |||||| | || |||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  22108272 ttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaa 22108343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 182 - 353
Target Start/End: Original strand, 40549934 - 40550103
Alignment:
Q  182 aaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctctt 280  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||| |||| |    
T  40549934 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctc-t 40550031  T
Q  281 ttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||| |||| ||||||  |||||| | || |||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  40550032 ttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaa 40550103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 182 - 353
Target Start/End: Original strand, 1606487 - 1606656
Alignment:
Q  182 aaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctctt 280  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |||| |    
T  1606487 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatttctc-t 1606584  T
Q  281 ttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||| |||| ||||||  |||||| | || |||| ||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||    
T  1606585 ttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactagatcagattggaccgaa 1606656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 182 - 353
Target Start/End: Original strand, 22137185 - 22137354
Alignment:
Q  182 aaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctctt 280  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||| |||| |    
T  22137185 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctc-t 22137282  T
Q  281 ttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||| |||| ||||||  |||||| | || |||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  22137283 ttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaa 22137354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 182 - 353
Target Start/End: Original strand, 40552212 - 40552381
Alignment:
Q  182 aaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctctt 280  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||| |||| |    
T  40552212 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctc-t 40552309  T
Q  281 ttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||| |||| ||||||  |||||| | || |||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  40552310 ttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaa 40552381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 205 - 311
Target Start/End: Original strand, 6348912 - 6349018
Alignment:
Q  205 ttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatag 304  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||    
T  6348912 ttggtcacgggaaaagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattattgtaacccattgatatctcttttgtaaaattactcatcattacag 6349011  T
Q  305 tgaaacg 311  Q
    || ||||    
T  6349012 tggaacg 6349018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 31 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 7094759 - 7094662
Alignment:
Q  31 tttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 124  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  7094759 tttattataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaacatagggtttg 7094662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 31 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 7092512 - 7092414
Alignment:
Q  31 tttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa-actagggtttg 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||    
T  7092512 tttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagatggagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaacactagggtttg 7092414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 75 - 136
Target Start/End: Original strand, 38396316 - 38396377
Alignment:
Q  75 gagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38396316 gagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagtgtttgt 38396377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 170 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 40281572 - 40281411
Alignment:
Q  170 attcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattagg-tgggagacttattctagtaaccca 268  Q
    ||||||||||| ||||||  ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||| | | ||||||||||| |||||||     
T  40281572 attcaccttgggaaacaccgttaggattgagtctgttggtcacgggaagagattgagacttttggtggaattaggtttgaagacttattcttgtaaccct 40281473  T
Q  269 ttgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactag 337  Q
    ||||       |||||||||||| ||||| || | ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  40281472 ttga-------tttgtaaagttactcatcgttgttgtggaacgaagggatgctctctcccccagactag 40281411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 77
Target Start/End: Original strand, 1606423 - 1606472
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1606423 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag 1606472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 249 - 353
Target Start/End: Original strand, 6046668 - 6046772
Alignment:
Q  249 agacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaat-ttgg 347  Q
    ||||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || |||| | ||||||||||| |||||||||||| | ||||    
T  6046668 agacttattcttgtaaacctttgatatctcttt-gtaaagttactcatcattatagtggaatgaagagctgctctctcccccagactaggtcagtattgg 6046766  T
Q  348 accgaa 353  Q
    ||||||    
T  6046767 accgaa 6046772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 194 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 6067370 - 6067223
Alignment:
Q  194 gattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattagg-tgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttat 292  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||||| ||||| |||| ||  ||||||||||||   ||||  |     
T  6067370 gatttagtctcttggtcacgggaagagattgagacttt-gatagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctctgatatctctttgtaaaaggaac 6067272  T
Q  293 tcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtca 341  Q
    || |||||||||||||||| || | ||||||||||| || |||||||||    
T  6067271 tcgtcattatagtgaaacggagagctgctctctcccccatactaggtca 6067223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 29 - 245
Target Start/End: Original strand, 26210500 - 26210711
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||| || |||||  ||||||||| |||||||   ||||  |||||||||||||||||     
T  26210500 cttttagtataaatatagaacttgtatcaaatgtaaaccttgagagag-gggggaggaaacaaggttttagaatc-caacctcaaaactagggtttgtag 26210597  T
Q  128 agagtttgtctcttggaaacaaacactagggtt-tgagggttgattcaccttgga-aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt-g 224  Q
    ||| ||   ||||||| ||||| |||||||||| |||   ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| |    
T  26210598 agaatt---ctcttggcaacaa-cactagggttgtga---ttgattcaccttggagaaatactattaggattgagtctcttggtaacggaaagagattcg 26210690  T
Q  225 agactttagatagaattaggt 245  Q
     |||||| | |||||||||||    
T  26210691 ggactttcggtagaattaggt 26210711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 22108087 - 22108158
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 72  Q
    |||||||||||  | |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22108087 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 22108158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 22137098 - 22137169
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 72  Q
    |||||||||||  | |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22137098 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 22137169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 40549847 - 40549918
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 72  Q
    |||||||||||  | |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40549847 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 40549918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 40552125 - 40552196
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 72  Q
    |||||||||||  | |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40552125 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 40552196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 35 - 160
Target Start/End: Original strand, 6348778 - 6348903
Alignment:
Q  35 ctataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagt 132  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | | |||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||| |  || || ||||||||||||||||| ||||    
T  6348778 ctataaatataaaccttgtatcagatgtaaacattgagatagagaggactgaaaacaagggtttagaa-gtaaaaaagaaaactagggtttgtatcgagt 6348876  T
Q  133 ttgtctcttggaaacaaacactagggtt 160  Q
    ||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  6348877 ttg-ctcttggcaacaaacattagggtt 6348903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 9027467 - 9027396
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 72  Q
    |||||||||||  | |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9027467 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggaga 9027396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Original strand, 2935279 - 2935349
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgag 71  Q
    |||||||||||  | |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2935279 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactctgag 2935349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 104 - 223
Target Start/End: Original strand, 11084409 - 11084523
Alignment:
Q  104 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtct 203  Q
    |||||| |||||||||||||||| | | ||   ||||||| |||||||| ||||||| |||  |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  11084409 caacaagaaaactagggtttgtagaaaatt---ctcttggcaacaaacaatagggtt-gaga-ttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtct 11084503  T
Q  204 cttggttacgggaagagatt 223  Q
    |||||| ||| |||||||||    
T  11084504 cttggtcacgagaagagatt 11084523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 261 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22280442 - 22280393
Alignment:
Q  261 gtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaac 310  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22280442 gtaacccgttgatatctcttttgtaaagttattgatcattatagtgaaac 22280393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 12310234 - 12310157
Alignment:
Q  145 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgga-aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt 223  Q
    |||||||||||||||| |  | ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12310234 aacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgaacaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagatt 12310157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 341
Target Start/End: Original strand, 25357030 - 25357202
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttgga--aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattagg-tgggagacttattctagta 263  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || ||| || | |||||||||| | | ||||| ||||| |||    
T  25357030 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 25357128  T
Q  264 acccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtca 341  Q
    || ||   ||||||| |||||||||  | |||||||||||||| | ||||| | || |||||||| ||||||||||||    
T  25357129 actca---atatctc-tttgtaaagaaactcatcattatagtggatcgaagagatgatctctcccccagactaggtca 25357202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 97
Target Start/End: Original strand, 3677235 - 3677301
Alignment:
Q  30 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggttta 97  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3677235 ttttactataaatatagatcttgaatcagagtaaacttggagataga-ggggctgaaacaagggttta 3677301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 167 - 230
Target Start/End: Original strand, 21369625 - 21369690
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttgga--aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactt 230  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  21369625 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgggactt 21369690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 28 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 30906386 - 30906264
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 126  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| | || |||  |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||  |||  |  ||||||| |||||||    
T  30906386 acttttgctataaatatagaccttgtataagagtaaatcttgagatagagggggctgaaaacaagaatttagaaa--caaataacaaactagagtttgta 30906289  T
Q  127 tagagtttgtctcttggaaacaaaca 152  Q
    ||||||||| ||||| | ||||||||    
T  30906288 tagagtttg-ctcttagcaacaaaca 30906264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Original strand, 45366472 - 45366526
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtat 55  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  45366472 gcagatttgttccaaattttaagggttacttttactataaatataaaccttgtat 45366526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 220
Target Start/End: Original strand, 2120881 - 2120937
Alignment:
Q  166 gttgattcaccttgga--aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 220  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  2120881 gttgattcaccttggacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 2120937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 28 - 72
Target Start/End: Original strand, 1849918 - 1849962
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  1849918 acttttactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgaga 1849962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 313 - 353
Target Start/End: Original strand, 11759364 - 11759404
Alignment:
Q  313 agggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11759364 agggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 11759404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 167 - 341
Target Start/End: Original strand, 25351336 - 25351508
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttgga--aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattagg-tgggagacttattctagta 263  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || ||| || | |||||||||| | | ||||| ||||| |||    
T  25351336 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 25351434  T
Q  264 acccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtca 341  Q
    || ||   ||||||| |||||||||  | |||||||||||||| | || || | || |||||||| ||||||||||||    
T  25351435 actca---atatctc-tttgtaaagaaactcatcattatagtggatcggagagctgttctctcccccagactaggtca 25351508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 341
Target Start/End: Original strand, 25410113 - 25410287
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttgga--aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattagg-tgggagacttattctagta 263  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || ||| || | |||||||||| | | ||||| ||||| |||    
T  25410113 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 25410211  T
Q  264 acccattgatatctcttttgtaaagttattc--atcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtca 341  Q
    || ||   ||||||| |||||||||  | ||  |||||||||||| |||| || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  25410212 actca---atatctc-tttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 25410287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 1047295 - 1047238
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaa 58  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1047295 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatataaaccttgtatcaa 1047238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 167 - 341
Target Start/End: Original strand, 7069763 - 7069936
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttgga--aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattagg-tgggagacttattctagta 263  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || ||| || | |||||||||| | | ||||| ||||| | |    
T  7069763 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaa 7069861  T
Q  264 acccattgatatctcttttgtaaagttattca-tcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtca 341  Q
    || |||   |||||| |||||||||  | ||| ||||||||||| | ||||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  7069862 actcat---tatctc-tttgtaaagaaactcattcattatagtggatcgaagagctgctctctcccccagactaggtca 7069936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 3320249 - 3320194
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttgga--aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 220  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  3320249 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 3320194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 3324997 - 3324942
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttgga--aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 220  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  3324997 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 3324942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 220
Target Start/End: Original strand, 7074770 - 7074825
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttgga--aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 220  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  7074770 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 7074825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 8378703 - 8378648
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttgga--aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 220  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  8378703 ttgattcaccttgaacaaaacactattaagattgagtctcttggtcacgggaagag 8378648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 15541194 - 15541139
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttgga--aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 220  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  15541194 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 15541139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 220
Target Start/End: Original strand, 25405376 - 25405431
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttgga--aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 220  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  25405376 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 25405431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 220
Target Start/End: Original strand, 42006646 - 42006701
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttgga--aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 220  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  42006646 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 42006701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 57
Target Start/End: Original strand, 38396239 - 38396268
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatca 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38396239 acttttactataaatatagaccttgtatca 38396268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 321 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 4253572 - 4253540
Alignment:
Q  321 tctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4253572 tctctcccacagagtaggtcaatttggaccgaa 4253540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 167 - 220
Target Start/End: Original strand, 30246953 - 30247008
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttggaaaa--cactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 220  Q
    ||||||||||||| | ||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  30246953 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 30247008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 55
Target Start/End: Original strand, 42006493 - 42006545
Alignment:
Q  3 agatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtat 55  Q
    |||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  42006493 agatttgttccatattttaagggttacttttactataaatataaaccgtgtat 42006545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 167 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 44144065 - 44144010
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttggaaaa--cactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 220  Q
    ||||||||||||| | ||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  44144065 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 44144010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 167 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 44512724 - 44512669
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttggaaaa--cactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 220  Q
    ||||||||||||| | ||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  44512724 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 44512669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 114)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 4236545 - 4236896
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  4236545 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagataaagggggctgaaacaagagtttagaa 4236644  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4236645 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgag 4236744  T
Q  201 tctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |    
T  4236745 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-t 4236843  T
Q  301 atagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||| | || |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  4236844 atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaa 4236896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 25921836 - 25921485
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25921836 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 25921737  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgag 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  25921736 agacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgtgaaacactattaggattgag 25921637  T
Q  201 tctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||| | | |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |    
T  25921636 tctcttggttacgggaagaggctgggactctgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-t 25921538  T
Q  301 atagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||| |||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25921537 atagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 25921485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 2818699 - 2818347
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2818699 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 2818600  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgaggg-ttgattcaccttggaaaacactattatgattga 199  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2818599 aggtaacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtttgattcaccttggaaaacactattacgattga 2818500  T
Q  200 gtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcat 299  Q
    |||||||||||||||||| ||  || |||||| | |||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||||     
T  2818499 gtctcttggttacgggaaaaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca- 2818401  T
Q  300 tatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2818400 tatagtgaaacggaggactgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 2818347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 38882021 - 38882372
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggg-gctgaaacaagggtttaga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38882021 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagaggggggctgaaacaagggtttaga 38882120  T
Q  100 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattga 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  38882121 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 38882220  T
Q  200 gtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcat 299  Q
    |||||||||||||||||||||  || |||||| | ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||     
T  38882221 gtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca- 38882318  T
Q  300 tatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||||| | || |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  38882319 tatagtggatcggagggctgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgaa 38882372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 21947943 - 21948289
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21947943 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaattttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaa 21948041  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgag 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  21948042 agacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 21948141  T
Q  201 tctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatt 300  Q
    ||||||||||| ||||||||  || |||||| | | |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| |    
T  21948142 tctcttggttatgggaagaggctgggactttgggtggaattaggcgggagacttattcttgtaaccccttgatatctcttttgtaacgttactcatca-t 21948240  T
Q  301 atagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggac 349  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21948241 atagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggac 21948289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 2174835 - 2175185
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2174835 gcagatttgttccaaattttaagcgatgcttttactataaatacaggccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 2174934  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2174935 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattatgattgag 2175034  T
Q  201 tctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||| | |||| |    
T  2175035 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttacttatca-t 2175132  T
Q  301 atagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||| | || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2175133 atagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 2175185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 31 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 18511547 - 18511224
Alignment:
Q  31 tttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  18511547 tttaatataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtata 18511448  T
Q  129 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18511447 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 18511348  T
Q  229 tttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctccc 328  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  18511347 tttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccc 18511249  T
Q  329 acagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
      |||||||||||||||||||||||    
T  18511248 ctagactaggtcaatttggaccgaa 18511224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Original strand, 40221465 - 40221790
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40221465 acttttactataaatatagacattgactcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtat 40221564  T
Q  128 agagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 227  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  40221565 agagtttgtctctttggaacaaacactaggatttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggga 40221664  T
Q  228 ctttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcc 327  Q
    |||| | |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | || ||||||||||    
T  40221665 cttttggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcc 40221764  T
Q  328 cacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  40221765 cccagactaggtcaatttggaccgaa 40221790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 10529435 - 10529111
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  10529435 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagtgggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttttat 10529336  T
Q  128 agagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 227  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  10529335 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggg 10529236  T
Q  228 ctttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcc 327  Q
    |||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||| || | || ||||||||||    
T  10529235 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaatcggaaggctgctctctcc 10529137  T
Q  328 cacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  10529136 cccagactaggtcaatttggaccgaa 10529111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 29 - 353
Target Start/End: Original strand, 17072827 - 17073151
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17072827 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 17072926  T
Q  129 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 228  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| | |    
T  17072927 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttaggggaagagattggggc 17073026  T
Q  229 tttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctccc 328  Q
    ||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  17073027 tttcgatagaattaggcggaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtaaaacggagggctgctctctccc 17073126  T
Q  329 acagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
     |||||| |||||||||||||||||    
T  17073127 ccagactcggtcaatttggaccgaa 17073151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 6756410 - 6756759
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  6756410 gcagatttattccaaattttaagttatacttttactattaatatagatcttgtatcatattaaactttgagatagagggagctgaaacaatggtttagaa 6756509  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgag 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||    
T  6756510 aggcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattctccttgggaaacactattaggattgag 6756609  T
Q  201 tctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatt 300  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||| ||||  |||||||    
T  6756610 tatcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa--cattgatatcttttttgtaaggttacacatcatt 6756707  T
Q  301 atagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  6756708 atagtgaaacg-agggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaa 6756759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 29 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 31472948 - 31472624
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| |  | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31472948 cttttactataaatatggacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 31472849  T
Q  129 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 228  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  31472848 gagtttgtctcttgggaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggac 31472749  T
Q  229 tttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctccc 328  Q
    ||| | |||||||||| ||||  | | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31472748 ttttggtagaattaggcgggatgcatcttcttctaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggttgctctctccc 31472649  T
Q  329 acagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
     || |||||||||||||||||||||    
T  31472648 ccatactaggtcaatttggaccgaa 31472624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 31542651 - 31543001
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31542651 gcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 31542750  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattg-a 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  31542751 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 31542850  T
Q  200 gtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||   || |||||||    
T  31542851 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattctcg-aacccattgatttctcttt-gtaacagtactcatcat 31542948  T
Q  300 tatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
     |||||| |  | |||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  31542949 -atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaa 31543001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 31544996 - 31545347
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31544996 gcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaa 31545095  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgatt-ga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||    
T  31545096 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattaga 31545195  T
Q  200 gtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcat 299  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||   || |||||||    
T  31545196 gtctcttggttacgggaagaaattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacagtactcatcat 31545294  T
Q  300 tatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
     |||||| |  | |||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  31545295 -atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaa 31545347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Original strand, 39854427 - 39854750
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39854427 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 39854525  T
Q  128 agagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 227  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||  |    
T  39854526 agagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcatggttacgggaagagactggaa 39854625  T
Q  228 ctttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcc 327  Q
    |||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||| | || |||| ||||||||||    
T  39854626 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgctactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcc 39854724  T
Q  328 cacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    | |||||||| |||||||||||||||    
T  39854725 cccagactagatcaatttggaccgaa 39854750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 3 - 353
Target Start/End: Original strand, 16776075 - 16776424
Alignment:
Q  3 agatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaa-tatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16776075 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaaatatagaccttgtatctgagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttacaaa 16776174  T
Q  102 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  16776175 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaataaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 16776274  T
Q  202 ctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatta 301  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||| | |||| ||    
T  16776275 ctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa-ccattgatttctcttttgtaacgttacttatca-ta 16776372  T
Q  302 tagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||| | || |||| |||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  16776373 tagtggatcggagggctgctatctcccccagactatgccaatttggaccgaa 16776424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 29 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 1189949 - 1189619
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1189949 cttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagagagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactacggttt 1189850  T
Q  124 gtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt 223  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1189849 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcactttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacaggaagagatt 1189750  T
Q  224 gagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctct 323  Q
    |||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||| |||| ||||||    
T  1189749 gagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaggttactcataattatagtggaacggagggatgctct 1189650  T
Q  324 ctcc-cacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  1189649 ctcctcccagactaggtcaatttggaccgaa 1189619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 37706116 - 37705792
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  37706116 acttttgctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaaggcaacgacaaatctagggtttgtat 37706017  T
Q  128 agagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 227  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |     
T  37706016 agactttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattaggg 37705917  T
Q  228 ctttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcc 327  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| || |  |||||||    
T  37705916 ttttggatagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatggctattctctcc 37705818  T
Q  328 cacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  37705817 cccagactaggtcaatttggaccgaa 37705792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 69 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 16092495 - 16092219
Alignment:
Q  69 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggtt 168  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  16092495 gagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtctgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggtt 16092396  T
Q  169 gattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaaccca 268  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  16092395 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 16092296  T
Q  269 ttgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaattt 345  Q
    |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  16092295 ttgagatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggttgctctctcctctagactaggtcaattt 16092219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Original strand, 18596590 - 18596913
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18596590 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttgggatagagggggctgaaacaagggtata--aagacaacaacaaaactagggtttgtat 18596687  T
Q  128 agagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 227  Q
    |||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18596688 agagtttgtctctttggaacaaacaatatggtttgagggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttacgggaagagattggga 18596787  T
Q  228 ctttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcc 327  Q
    ||||   |||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | || ||||||||||    
T  18596788 ctttgagtagaattaggcgggagacttatttttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcc 18596887  T
Q  328 cacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
      ||||||||||||||||||||||||    
T  18596888 tccagactaggtcaatttggaccgaa 18596913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 31 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 18509652 - 18509330
Alignment:
Q  31 tttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag-ggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  18509652 tttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagagatagaggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatag 18509553  T
Q  130 agtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagact 229  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  18509552 agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagaatgggact 18509453  T
Q  230 ttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctccca 329  Q
    || | |||||||| | |||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||     
T  18509452 ttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaactcgttgatatctattttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggtgggctgctctctcccc 18509354  T
Q  330 cagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
     |||||||||||||||| ||||||    
T  18509353 tagactaggtcaatttgaaccgaa 18509330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 29 - 353
Target Start/End: Original strand, 695833 - 696145
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| |  | |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  695833 cttttactatgaatatagacattgtatgagtgtaaaccttgagataaagggggatgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat- 695931  T
Q  129 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 228  Q
              ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  695932 ----------ctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaa-cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 696020  T
Q  229 tttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctccc 328  Q
    ||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  696021 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacggagggctgctctctccc 696120  T
Q  329 acagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
     ||||| ||||||||||||||||||    
T  696121 ccagacaaggtcaatttggaccgaa 696145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Original strand, 18468950 - 18469276
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18468950 acttttactataaatatagaccttgtatcatgataaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 18469049  T
Q  124 gtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt 223  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |    
T  18469050 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 18469149  T
Q  224 gagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctct 323  Q
    | |||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| | ||||| ||||||| | ||||||    
T  18469150 gggactttaggtagaattaggcgggagactttttcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatca-tctagtggaacgaagagctgctct 18469248  T
Q  324 ctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  18469249 ctcc--cagactaggtcaatttggaccgaa 18469276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 31179734 - 31179383
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||  | |||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31179734 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagacattgtatcaaagcaaactttgagatagagggagctgaaacaagggtttagaa 31179635  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattg-a 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  31179634 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 31179535  T
Q  200 gtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||||||| |||| |  | |||||||    
T  31179534 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattcatttctcttt-gtaacgaaactcatcat 31179436  T
Q  300 tatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
     |||||| |  | |||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  31179435 -atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaa 31179383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 69 - 353
Target Start/End: Original strand, 25804009 - 25804291
Alignment:
Q  69 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggtt 168  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25804009 gagatagagggggctcaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggtt 25804108  T
Q  169 gattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaaccca 268  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  25804109 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 25804208  T
Q  269 ttgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25804209 ttgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctccc-cagactaggtcaatttggaccgaa 25804291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 29 - 353
Target Start/End: Original strand, 25904047 - 25904370
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  25904047 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggattgtata 25904146  T
Q  129 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 228  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | |    
T  25904147 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattagggc 25904246  T
Q  229 tttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctccc 328  Q
    |||   || ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| |||| | |||| |||||||||||| | |  |||||||||||    
T  25904247 tttgagtataattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctctattgtaacgttacttatca-tatagtgaaacggatgactgctctctccc 25904345  T
Q  329 acagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  25904346 ccagactaggtcaatttggaccgaa 25904370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 30 - 353
Target Start/End: Original strand, 18466625 - 18466951
Alignment:
Q  30 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18466625 ttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgg 18466724  T
Q  126 atagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattga 225  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||     
T  18466725 atagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagaggctgg 18466824  T
Q  226 gactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctct 325  Q
    |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||| || |||| || | ||||||||    
T  18466825 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatca-tataatggaacggagagctgctctct 18466923  T
Q  326 cccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18466924 cccccagactaggtcaatttggaccgaa 18466951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 29 - 353
Target Start/End: Original strand, 24126800 - 24127123
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||  | |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24126800 cttttactataaatatagacattatatcagtgtaaaccttgagatagatggggctgaaacaagagtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 24126899  T
Q  129 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 228  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24126900 gagtttgtctcttgtcaacaaatactagggtttgaagattgattgaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattgggac 24126999  T
Q  229 tttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctccc 328  Q
    ||| | |||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  24127000 tttgggtagaattaggcgatagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccc 24127098  T
Q  329 acagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  24127099 ccagactaggtcaatttggaccgaa 24127123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 36402690 - 36402348
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36402690 gcagatttgttc-aaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttatatcagagtaaacgttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 36402592  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgag 200  Q
     | |||  || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||     
T  36402591 tgacaatcacgaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaatactattaggattgaa 36402492  T
Q  201 tctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatt 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||  ||||| | || |||||||  ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| |    
T  36402491 tctcttggttacgggaggagattggaactttgggtaaaattaggctggagacttattattgtaatccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-t 36402393  T
Q  301 atagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaattt 345  Q
    ||||||||||  | |  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36402392 atagtgaaacagatgtctgctctctcccccagactaggtcaattt 36402348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 32 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 10474655 - 10474335
Alignment:
Q  32 ttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagag 131  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10474655 ttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgaaatagagggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaatctagggtttgtatagag 10474556  T
Q  132 tttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagacttt 231  Q
    |||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  10474555 tttgtctctttggaacaaacactggggtttgagggttgatacaccttgggaaacactattaagattgaatctcttggttacaggaagagattgggacttt 10474456  T
Q  232 agatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccaca 331  Q
       |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| |||||||||||| | || ||||||||||| ||    
T  10474455 gagtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttctaaggttactcatca-tatagtgaaacggatggctgctctctccccca 10474357  T
Q  332 gactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  10474356 tactaggtcaatttggaccgaa 10474335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 31466341 - 31466044
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||    
T  31466341 gcagatttgttccaaattttaagcgacacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagataaaaggggctgaaacaaaggtttaaaa 31466242  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgag 200  Q
    | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||    
T  31466241 aagtaacgacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacaccagggtttgacggttgattcaccttgagaaacagtattaggattgag 31466142  T
Q  201 tctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| | |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  31466141 tctcttggttacgggaagagatttggactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatatctattttgtaaagttactcatcat 31466044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 69 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 34477349 - 34477065
Alignment:
Q  69 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggtt 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  34477349 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 34477250  T
Q  169 gattcaccttggaaaacactattatgatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattagg-tgggagacttattctagtaacc 266  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  34477249 gattcaccttgggaaacactattatgattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacc 34477150  T
Q  267 cattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||||| |||| ||||||| |||| |||||| ||||||| | || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34477149 cattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 34477065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 69 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 34479714 - 34479430
Alignment:
Q  69 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggtt 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  34479714 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 34479615  T
Q  169 gattcaccttggaaaacactattatgatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattagg-tgggagacttattctagtaacc 266  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  34479614 gattcaccttgggaaacactattatgattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacc 34479515  T
Q  267 cattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||||| |||| ||||||| |||| |||||| ||||||| | || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34479514 cattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 34479430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 29 - 243
Target Start/End: Original strand, 20042994 - 20043208
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20042994 cttttactataaatataggctttgtatcatagcaaaccttgagatagagggggctgaaacaagtgtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 20043093  T
Q  129 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20043094 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 20043193  T
Q  229 tttagatagaattag 243  Q
    ||| |||||||||||    
T  20043194 tttggatagaattag 20043208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 29 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 34531001 - 34530724
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34531001 cttttactgtaaatatagactttgaatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagtgtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtata 34530902  T
Q  129 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 228  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||    
T  34530901 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggctacgggaagagattaggac 34530802  T
Q  229 tttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtg 306  Q
    |||   |||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  34530801 tttgagtagaattaggcgggagatttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttgctcatcattatagtg 34530724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 2 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 12556285 - 12555939
Alignment:
Q  2 cagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 101  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  12556285 cagatttgtttcaaaatttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaataagggtttagaat 12556186  T
Q  102 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagt 201  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  12556185 gacaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgtgt 12556086  T
Q  202 ctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttattcatcatt 300  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || ||| | |||||||||    ||||||| |||| ||||| |||||| ||||| |||||||| |||| ||||| ||    
T  12556085 ctcttggctacgggaagagattg-gagttttggtagaattagacaagagactttttcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatc-tt 12555988  T
Q  301 atagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggac 349  Q
    | || |||||| |||| |||| |||||| || ||||| |||||||||||    
T  12555987 aaagcgaaacggagggctgctatctcccccatactagttcaatttggac 12555939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Original strand, 27912473 - 27912803
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||      ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27912473 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggtgctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 27912572  T
Q  122 ttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaga 221  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||     
T  27912573 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaataataggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagg 27912672  T
Q  222 ttgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgct 321  Q
     ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| ||||||| |||  ||   ||||    
T  27912673 ctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatca-tatagtggaacagagaactgct 27912771  T
Q  322 ctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27912772 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 27912803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Original strand, 26097676 - 26097998
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  26097676 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttggat 26097775  T
Q  128 agagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 227  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |   || ||    
T  26097776 agagtttgtctctttggaacaaacactagggttagagggttgattcaccttgg-aaacactattaggaatgagtctcttggttacgggaaaatgctggga 26097874  T
Q  228 ctttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcc 327  Q
    |||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| ||| |  || ||||||||||    
T  26097875 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaac-agaggctgctctctcc 26097972  T
Q  328 cacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
      ||||||||||||||||| ||||||    
T  26097973 tccagactaggtcaatttgaaccgaa 26097998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 69 - 353
Target Start/End: Original strand, 6745053 - 6745335
Alignment:
Q  69 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggtt 168  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  6745053 gagataaagggggctgaaacaagtgtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagg-tttgagggtt 6745151  T
Q  169 gattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaaccca 268  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  6745152 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 6745251  T
Q  269 ttgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||| | || |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  6745252 ttgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagacaaggtcaatttggaccgaa 6745335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 37 - 353
Target Start/End: Original strand, 2954368 - 2954683
Alignment:
Q  37 ataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 136  Q
    |||||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| || | |||||    
T  2954368 ataaatataggctttgtatcagtgtaaactttgagatagaggagtatgaaacaagggtttagaaagacagcaacaaaactagggtttgtgtataatttgt 2954467  T
Q  137 ctctt-ggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagat 235  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | |    
T  2954468 ctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcactttggaaaacactattaggattgagtctcttagttacgagaagagattgagactttgggt 2954567  T
Q  236 agaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagact 335  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| || |||| ||||||||||| || |||    
T  2954568 agaattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatctc-tttgtaaagttactcatca-tatagtgaagcggagggatgctctctcccccaaact 2954665  T
Q  336 aggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||||||| |||||||    
T  2954666 aggtcaattttgaccgaa 2954683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 29 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 39398327 - 39398005
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |   | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39398327 cttttactataaatataaacattgtaccggtgtaaaccttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 39398229  T
Q  129 gagtttgtctctt-ggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 227  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  39398228 gagtttgtctctttggcaacaaacactagg-tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattggaa 39398130  T
Q  228 ctttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcc 327  Q
    |||| | ||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||   || | |||||| ||||| | || ||||||||||    
T  39398129 ctttgggtagaattaggcagtagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtgacgttaccaatta-tatagtaaaacggatggctgctctctcc 39398031  T
Q  328 cacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  39398030 cacagactaggtcaatttggaccgaa 39398005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Original strand, 6747247 - 6747571
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt--gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 125  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  6747247 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaagagaaagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagagtttgt 6747346  T
Q  126 atagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattga 225  Q
    ||| | |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  6747347 ataaaatttgtctctttgaaacaaacactagg-tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagactgg 6747445  T
Q  226 gactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctct 325  Q
    |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||| |||| || ||| ||||||| | || |||| ||||||||    
T  6747446 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttct-ttttgtaacgttactcgtca-tatagtggatcggagggctgctctct 6747543  T
Q  326 cccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||    
T  6747544 ctctcagactaggtcaatttggaccgaa 6747571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Original strand, 27910388 - 27910717
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag------ggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| ||||      ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  27910388 acttttactataaatatagaccttgtatcaggttaaactttgagagagagatagcgggggctgaaacaagg-tttaaaaaggcaacaacaaaactagggt 27910486  T
Q  122 ttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaga 221  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||     
T  27910487 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagagg 27910586  T
Q  222 ttgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgct 321  Q
     || |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||| || |||| || | ||||    
T  27910587 ctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatca-tataatggaacggagagctgct 27910685  T
Q  322 ctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  27910686 ctctcccccagattaggtcaatttggaccgaa 27910717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 21684824 - 21684464
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----------tagagggggctgaaacaa 90  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||          ||||||||||||||||||    
T  21684824 gcagatttgttacaaattttaagcaaaacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagagagatagagggggctgaaacaa 21684725  T
Q  91 gggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactat 190  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||| |||||| | |||||||    
T  21684724 gggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcgccttgggatacactat 21684625  T
Q  191 tatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagtt 290  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||   ||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||   |    
T  21684624 taggattgagtctcttggttacgggaagaggttggggctttgagtagaattaggcaggagacttattcttgtaactcattgatttctc-tttgtaacaat 21684526  T
Q  291 attcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    | |||||| ||||||| | || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21684525 actcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 21684464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 36 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 17818817 - 17818504
Alignment:
Q  36 tataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttg 135  Q
    ||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  17818817 tataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagaaagagggg-ctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagttcg 17818719  T
Q  136 tctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagat 235  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |    
T  17818718 tctctttggaacaaacactagggtttgatggttgatttaccttgggaaacactattaagactgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggt 17818619  T
Q  236 agaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagact 335  Q
    ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||  |||| |  |||||||| || |||    
T  17818618 agaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tacagtggaacagagggct--tctctcccccaaact 17818522  T
Q  336 aggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||||||||||||||||    
T  17818521 aggtcaatttggaccgaa 17818504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 29 - 244
Target Start/End: Original strand, 20044954 - 20045169
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  20044954 cttttactataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagacagagggggctgaaacaagggtttaggaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 20045053  T
Q  129 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  20045054 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttccgggaagagattgggac 20045153  T
Q  229 tttagatagaattagg 244  Q
    ||| | ||||||||||    
T  20045154 tttgggtagaattagg 20045169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 34 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 6661512 - 6661196
Alignment:
Q  34 actataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 133  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  6661512 actataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagagagggttgaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaattagggtatgtatagagtt 6661414  T
Q  134 tgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttag 233  Q
    ||| |||||| |||||||||||| ||| |  |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| |    
T  6661413 tgt-tcttggcaacaaacactagagttgg--ggttgattcaccatgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaaattgagattttgg 6661317  T
Q  234 atagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacaga 333  Q
     || |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||| | |  ||||||||||| ||||    
T  6661316 gtacaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttgctcataattatagtggaacggatgactgctctctccctcaga 6661217  T
Q  334 ctaggtca-atttggaccgaa 353  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  6661216 ctaggtcagatttggaccgaa 6661196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 69 - 353
Target Start/End: Original strand, 15552229 - 15552512
Alignment:
Q  69 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggtt 168  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | | |||||||||||||||| |||||    
T  15552229 gagatagaggggactgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 15552328  T
Q  169 gattcaccttggaaaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaaccc 267  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  15552329 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttgattacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 15552428  T
Q  268 attgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||| ||||||| |||| |  | ||||||| |||||| |  | |||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  15552429 attgatttctcttt-gtaacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaa 15552512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 107 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 658610 - 658368
Alignment:
Q  107 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctctt 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||    
T  658610 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggatcgagtctctt 658511  T
Q  207 ggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtg 306  Q
    ||||||||||||||  || |||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  658510 ggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtg 658412  T
Q  307 aaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||| | || ||||||   || ||||||||||||||||||||||||    
T  658411 aaacggatggctgctct---ccccagactaggtcaatttggaccgaa 658368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 28 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 26098587 - 26098391
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  26098587 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatagagggggctgaaataagggtttagaatggcaacaagaagactagggtttgtat 26098488  T
Q  128 agagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattg 224  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26098487 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgacaaacactattatgattgagtctcttggttacggaaagagattg 26098391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 36 - 353
Target Start/End: Original strand, 21288715 - 21289028
Alignment:
Q  36 tataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttg 135  Q
    ||||||||||||||||| || | || |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  21288715 tataaatatagaccttgaattagagtaaaccttgagatagagggggttgaaataagggtttagaatagcaacaataaaaatagggtttgtatagagtttg 21288814  T
Q  136 tctcttggaaacaaacac------tagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagact 229  Q
    |||||| | |||||||||      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||    
T  21288815 tctctttggaacaaacactagggttagggtttgagggttgattcacctt-gaaaacactattaggattgagtatcttggttacgggaagagattaggact 21288913  T
Q  230 ttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctccca 329  Q
    || |||||||||| | |||||| || |||| ||||| ||        |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||     
T  21288914 ttggatagaattaagcgggagattttttcttgtaactca--------tcttttgtaacgttactcatc-ttatagtgaaacggagggctgctctctcccc 21289004  T
Q  330 cagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  21289005 cagactaggtcaatttagaccgaa 21289028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Original strand, 10586782 - 10587099
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag---ggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||          
T  10586782 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagaggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactag------ 10586875  T
Q  125 tatagagtttgtctctt-ggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt 223  Q
         |||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  10586876 -----agtttgtctctttgggaacaaacgatagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattcagtctcttgcttacggaaagagatt 10586970  T
Q  224 gagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctct 323  Q
    |||||||| | ||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||| ||||||| | || |||| ||||||    
T  10586971 gagactttgggtagaattaggcaggagacttattcttttaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctct 10587068  T
Q  324 ct-cccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10587069 ctccccccagactaggtcaatttggaccgaa 10587099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 163 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 20506042 - 20505855
Alignment:
Q  163 agggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagt 262  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||    
T  20506042 agggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgt 20505943  T
Q  263 aacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| |||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20505942 aacacattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctg--ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 20505855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 29 - 353
Target Start/End: Original strand, 36208524 - 36208843
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| ||||||||| ||     
T  36208524 cttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaagggtttagaaaca-aacaacaaa-ctagggttt-tag 36208620  T
Q  128 agagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 227  Q
    |||| || |||||  |    | | |||||||||   |  |||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36208621 agagatt-tctctaagcgggagaaactagggttgttg--ttgattcaccttgggaaacattactaagattgagtctcttggtaacgggaagagattgaga 36208717  T
Q  228 ctttagatagaattaggtggg-agacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctc 326  Q
    |||| | |||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||| ||    
T  36208718 ctttgggtagaattaggtttgtagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggcgggctgctctttc 36208817  T
Q  327 ccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    || || |||||||||||||||||||||    
T  36208818 cc-catactaggtcaatttggaccgaa 36208843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 20507825 - 20507659
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20507825 gcagatttgttccaagatttaagcgatacttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 20507726  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggt 167  Q
    ||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||    
T  20507725 aggcaacaaaaaaattaaggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacacaagggtttaagggt 20507659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 30 - 327
Target Start/End: Original strand, 9020167 - 9020460
Alignment:
Q  30 ttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| | | |||| ||| | ||||||| ||||||| ||||||||| | | ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  9020167 ttttactataaatacataccttgtatcagatgtaaaccttgtgctagagggagctgaaaacaagggtttggga-ggcaaca-caaaagtagggtttgtat 9020264  T
Q  128 agagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 227  Q
    ||||||   ||||||| ||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||       
T  9020265 agagttg--ctcttggcaacaaacactagggttgaag--ttgattcaccttggaaaacactattaagattgagtttcttggtcacgggaagagattggag 9020360  T
Q  228 ctttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcc 327  Q
    |||| | |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | || | || ||||||||||    
T  9020361 ctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggatcggatggctgctctctcc 9020460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 152 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 41585956 - 41585756
Alignment:
Q  152 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggaga 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| | ||||||||||  |||||    
T  41585956 actagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactagtaggattgagtctcttggctacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcaggaga 41585857  T
Q  252 cttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccg 351  Q
    |||||| | ||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  41585856 cttatttttgtaagtcattgatatctcttttgtaatgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccg 41585758  T
Q  352 aa 353  Q
    ||    
T  41585757 aa 41585756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 85 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 17413441 - 17413177
Alignment:
Q  85 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaa 184  Q
    |||||||||||||||| |||| ||  ||||||| ||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||| |  | |||||||||||||| |||    
T  17413441 aaacaagggtttagaa-ggcagcactaaaactatggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaa 17413348  T
Q  185 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattagg-tgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttg 283  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| | | | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  17413347 cactattaggattgagtctcttggtcaagggaagagattgagactttaggtagaattaggtttgaaaacttattcttgtaaccctttgatatctcttttg 17413248  T
Q  284 taaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaat-ttggaccgaa 353  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||  |||| ||||||||||| |||| | ||||| | ||||||||||    
T  17413247 taaagttactcatcattatagtggaacagagggatgctctctcccccagagttggtcagtgttggaccgaa 17413177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 72 - 353
Target Start/End: Original strand, 20053834 - 20054104
Alignment:
Q  72 atagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgat 171  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| |||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||    
T  20053834 atagagggcgctgaaacaagggtttagaa-ggcaacacaaaaactagagtttatataaagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt-gagg-ttgat 20053929  T
Q  172 tcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattg 271  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||       ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||   |    
T  20053930 tcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtt-----tggagattgggactttaagtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccc---g 20054021  T
Q  272 atatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtca-atttggaccgaa 353  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| | || ||||||||||  || |||||||||  |||||||||||    
T  20054022 atatctcttttgtaaagttactcatcattatagtagaacggaaggctgctctctcctccatactaggtcagttttggaccgaa 20054104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 147 - 353
Target Start/End: Original strand, 2723964 - 2724160
Alignment:
Q  147 caaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtg 246  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||| |    
T  2723964 caaacactagggtttgagggatgattcaccttgggaaacaccattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg---------tagaattaggcg 2724054  T
Q  247 ggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttg 346  Q
    || || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2724055 ggtgatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaagattactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttg 2724153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 164 - 353
Target Start/End: Original strand, 39798126 - 39798314
Alignment:
Q  164 gggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagta 263  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||| |||||||||||||| |||    
T  39798126 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 39798225  T
Q  264 acccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||||||| |||||||| ||| | || |||||  ||||||| | || |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  39798226 acccattgatttctcttttataatgatactcatc-gtatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaagtcaatttggatcgaa 39798314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 152 - 353
Target Start/End: Original strand, 4410090 - 4410289
Alignment:
Q  152 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggaga 251  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||| | |||||||||| ||||||    
T  4410090 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggaga 4410189  T
Q  252 cttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccg 351  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||||| |||| | || ||||||| |||||| |  | || | ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  4410190 cttattcttgtaacctattgatttctcttt-gtaacgatactcatcat-atagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcagattggaccg 4410287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 182 - 353
Target Start/End: Original strand, 10749797 - 10749967
Alignment:
Q  182 aaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctctt 280  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| |    
T  10749797 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-t 10749895  T
Q  281 ttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||| |||| ||||||  |||||| | || |||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  10749896 ttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaa 10749967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 125
Target Start/End: Original strand, 4410000 - 4410101
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 123  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4410000 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 4410099  T
Q  124 gt 125  Q
    ||    
T  4410100 gt 4410101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 182 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 3373319 - 3373149
Alignment:
Q  182 aaacactattatgattga-gtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctctt 280  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  3373319 aaacactattaggattgaagtctcttagttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 3373220  T
Q  281 ttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    | |||| |  | ||||||| |||||| |  | |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  3373219 t-gtaacgaaactcatcat-atagtggattggagggttgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaa 3373149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 167 - 341
Target Start/End: Original strand, 15143547 - 15143722
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtggga-gacttattctagtaac 265  Q
    |||||||||||| | || |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||  || ||| | |||||||||||  || |||||||||| |||||    
T  15143547 ttgattcacctttggaagcactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagatttggattttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 15143646  T
Q  266 ccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtca 341  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  | | |||| ||||||  |||||||||||    
T  15143647 cctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggggagctgctttctcccctagactaggtca 15143722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 182 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 38960313 - 38960144
Alignment:
Q  182 aaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctctt 280  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||| |||| |    
T  38960313 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagacgggagac-tattcttgtaacccattgatttctc-t 38960216  T
Q  281 ttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||| |||| ||||||  |||||| | || |||| ||||||||||| || |||||||||  ||||||||||    
T  38960215 ttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactaggtcagattggaccgaa 38960144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 2 - 243
Target Start/End: Original strand, 42770690 - 42770924
Alignment:
Q  2 cagatttgttccaaattt-taagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttaga 99  Q
    |||||||||||||| ||| | || || |||||||||||||||||| || ||||||| | | |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||    
T  42770690 cagatttgttccaattttatgagggatacttttactataaatataaactttgtatcga-gtaaaccttgagatagaggggactgaaaacaagggtttgga 42770788  T
Q  100 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattga 199  Q
    | ||||||| ||||| |||| ||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||| |  |||| ||||||| ||| ||||  ||||| || |||    
T  42770789 a-ggcaaca-caaaattagg-tttatatagaatttg-ctcttggcaacaaacactaaggttgg--ggttcattcaccatgggaaac--tattaggactga 42770880  T
Q  200 gtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattag 243  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  42770881 gtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattag 42770924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 182 - 341
Target Start/End: Original strand, 10757274 - 10757431
Alignment:
Q  182 aaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctctt 280  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | || |    
T  10757274 aaacactattaggattggagtctcttggttacgg-aagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttttc-t 10757371  T
Q  281 ttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtca 341  Q
    |||||| |||| ||||||  |||||| | || |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  10757372 ttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtca 10757431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 182 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 15354756 - 15354587
Alignment:
Q  182 aaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctctt 280  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||| |||| |    
T  15354756 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctc-t 15354659  T
Q  281 ttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||| |||| |||| |  |||||| | || |||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  15354658 ttgtaacgttactcatta-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaa 15354587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 182 - 353
Target Start/End: Original strand, 23665141 - 23665310
Alignment:
Q  182 aaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctctt 280  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||| |||| |    
T  23665141 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctc-t 23665238  T
Q  281 ttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||| |||| ||||||  |||||| | || |||| |||||||| || ||||||||||||  ||||||||||    
T  23665239 ttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcagattggaccgaa 23665310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 182 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 23793446 - 23793277
Alignment:
Q  182 aaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctctt 280  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||| |||| |    
T  23793446 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctc-t 23793349  T
Q  281 ttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||| |||| ||||||  |||||| | || |||| |||||||| || ||||||||||||  ||||||||||    
T  23793348 ttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcagattggaccgaa 23793277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 85 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 2144840 - 2144599
Alignment:
Q  85 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaa-acactagggtttgagggttgattcaccttgga-a 182  Q
    |||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |  | ||||||||||||||| |    
T  2144840 aaacaagggtttagaa-gccaacactaaaactagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaacacactagggttgg--gattgattcaccttggaga 2144747  T
Q  183 aacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattga-gactttagatagaattagg-tgggagacttattctagtaacc-cattgatatctct 279  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||| | |||||| | | |||||||| | | ||||| ||||| ||||||   || |||||||     
T  2144746 aacactattaggatggagtctcttggtcgcgggaagagattcaggactttgggtggaattaggtttgaagactaattcttgtaaccttttttatatctc- 2144648  T
Q  280 tttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctccc 328  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  2144647 tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccc 2144599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 85 - 245
Target Start/End: Original strand, 4754159 - 4754313
Alignment:
Q  85 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaa 184  Q
    ||||||||||||| |||| |||||  || |||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||    
T  4754159 aaacaagggttta-aaagccaacacaaacactagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcaccttgaaaaa 4754252  T
Q  185 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggt 245  Q
    ||||||||  |||||| |||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  4754253 cactattagaattgagcctcttggtcactggaagagattgtgactttggatagaattaggt 4754313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 182 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 15357032 - 15356863
Alignment:
Q  182 aaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctctt 280  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||| |||| |    
T  15357032 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctc-t 15356935  T
Q  281 ttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||| |||| |||| |  |||||| | || |||| ||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||    
T  15356934 ttgtaacgttactcatta-aatagtggatcggagggctgctctctcccccggactaggtcagattggaccgaa 15356863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 211 - 299
Target Start/End: Original strand, 42770936 - 42771024
Alignment:
Q  211 acgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcat 299  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42770936 acgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacctattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 42771024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 215 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 15445417 - 15445291
Alignment:
Q  215 gaagagattgagactttagatagaattaggtggga-gacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaa 313  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||  || || | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  15445417 gaagagattgagactttgagtagaattaggtttgaagaatgattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgaa 15445318  T
Q  314 gggttgctctctcccacagactaggtca 341  Q
    ||| |||||||| || ||||||||||||    
T  15445317 gggctgctctcttcc-cagactaggtca 15445291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 185 - 341
Target Start/End: Original strand, 4897828 - 4897985
Alignment:
Q  185 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattagg-tgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttg 283  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||||| | | ||||| ||||| ||||||  ||||||||||| |||    
T  4897828 cactgttaggattgagtatcttggtcacgggaagagattgtgactttgggtagaattaggcttgaagactgattcttgtaaccatttgatatctctattg 4897927  T
Q  284 taaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtca 341  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||   ||| |||| |||||| || |||||||||    
T  4897928 taaagttactcatcattatagcggaacagtgggctgctttctcccccatactaggtca 4897985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 41586042 - 41585946
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 124  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||    
T  41586042 acttttactataaatataggttttgtatcagagtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaataacaagaacaaaactagggtttg 41585946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 198 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 23742023 - 23741871
Alignment:
Q  198 gagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatc 297  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| | |||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||    
T  23742023 gagtctcttgattacgagaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatc 23741926  T
Q  298 attatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |  |||||| | || |||| |||||||| || ||||||||||||  ||||||||||    
T  23741925 aa-atagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcagattggaccgaa 23741871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Original strand, 39798004 - 39798058
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtat 55  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39798004 gcagatttgttccaaattttaagcaaaacttttactataaatatagaccttgtat 39798058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 302 - 353
Target Start/End: Original strand, 20043206 - 20043257
Alignment:
Q  302 tagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20043206 tagtgaaacgaatggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 20043257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 23665054 - 23665125
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 72  Q
    |||||||||||  | |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23665054 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 23665125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 23793533 - 23793462
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 72  Q
    |||||||||||  | |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23793533 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 23793462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Original strand, 29748260 - 29748485
Alignment:
Q  4 gatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctg----------aaacaagg 92  Q
    ||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||| ||||| |  |           ||||||||    
T  29748260 gatttgttccaaattttgagggatgcttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaacttttagagagaggcgagtagagagccagaaaacaagg 29748359  T
Q  93 gtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgga-aaacactatt 191  Q
    |||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||| ||   ||||||| |||||||| |||||||  ||| |||||||  |||||| |||||||| |    
T  29748360 gtttagaa-gccaacaagaaaactagggtttgtagagaatt---ctcttggcaacaaacagtagggtt--aggattgattcgtcttggagaaacactaat 29748453  T
Q  192 atgattgagtctcttggttacgggaagagatt 223  Q
    | |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  29748454 aggattgagtctcttggtcacgggaatagatt 29748485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 136 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 34033797 - 34033630
Alignment:
Q  136 tctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgga-aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattga-gactttag 233  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| |  | |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| | || ||| |    
T  34033797 tctcttggcaacaaacactagcgttgg--gattgatttaccttggagaaacactattaggattgagtctcttggtcgcgggaagagattcaggattttgg 34033700  T
Q  234 atagaatt-aggtgggagacttattctagtaacccatt-gatatctcttttgtaaagttattcatcatta 301  Q
     ||||||| || | | |||||| || | ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34033699 gtagaattaagtttgaagacttgttatggtaaccccttcgatatctcttttgtaaagttactcatcatta 34033630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 3373377 - 3373332
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagat 73  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3373377 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagat 3373332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 15354845 - 15354777
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttg 69  Q
    |||||||||||  | |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15354845 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttg 15354777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 15357121 - 15357053
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttg 69  Q
    |||||||||||  | |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357121 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttg 15357053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 23667329 - 23667400
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 72  Q
    |||||||||||  | |||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23667329 gcagatttgttatagattttaagcatgactttaactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 23667400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 38960405 - 38960334
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 72  Q
    |||||||||||  | |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38960405 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggaga 38960334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 66
Target Start/End: Original strand, 10757180 - 10757245
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaact 66  Q
    |||||||||||  | |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10757180 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaact 10757245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 23742101 - 23742057
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23742101 acttttactataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgaga 23742057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 34477435 - 34477379
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatca 57  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34477435 gcagatttgttacagattttaagcgagacttttactataaaaatagaccttgtatca 34477379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 229
Target Start/End: Original strand, 10627347 - 10627411
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttgga--aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagact 229  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10627347 ttgattcaccttgaacaaaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagact 10627411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 273 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 26098380 - 26098300
Alignment:
Q  273 tatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccac-agactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||| |||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||||||    
T  26098380 tatctcttttgtaacgttactcatcat-atggtgaaacggagggctgctctctccccccatactaggtcaatttggaccgaa 26098300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 311
Target Start/End: Original strand, 35430172 - 35430406
Alignment:
Q  85 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttg---------agggttgattcac 175  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||   || |||||||| || |||||||||||||||         |   |||||||||    
T  35430172 aaacaagggtttagaa-gtcaacatcaaaactagggtttgtacag---ttttctcttggcaataaacactagggtttggattgaatcaccattgattcac 35430267  T
Q  176 cttgga-aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt-gagactttagatagaattagg-tgggagacttattctagtaa-cccattg 271  Q
    |||||| |||||||||||  |||||||||||||||   ||||||||||| | | |||| | |||||||||| | | ||||| ||||| ||||  |  |||    
T  35430268 cttggagaaacactattacaattgagtctcttggtctagggaagagattcgggtctttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaattcttttg 35430367  T
Q  272 atatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacg 311  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  35430368 atatctc-tttgtaaagttactcatcattatagtggaacg 35430406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 34479796 - 34479740
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatca 57  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  34479796 gcagatttgttacagattttaagcgagacctttactataaaaatagaccttgtatca 34479740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 65
Target Start/End: Original strand, 10749704 - 10749767
Alignment:
Q  2 cagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaac 65  Q
    ||||||||||  | |||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10749704 cagatttgttatagattttaagcaggacttttagtataaatatagaccttgtatcaaagcaaac 10749767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 262 - 317
Target Start/End: Original strand, 20045217 - 20045272
Alignment:
Q  262 taacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggt 317  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||||| |||||    
T  20045217 taacccattgatatcttttttgtaaagttacttatcattatagagaaacggagggt 20045272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 2298200 - 2298135
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttgga--aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactt 230  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  2298200 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagactt 2298135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 167 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 26406672 - 26406593
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttgga--aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggt 245  Q
    ||||||||||||| |  ||||| | ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  26406672 ttgattcaccttgaacaaaacattgttaggattgagtctcttggtcacaggaagagattgagacttgag-tagaattaggt 26406593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 167 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 35385651 - 35385572
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttgga--aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggt 245  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || |||||| | |||||||||||    
T  35385651 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttt-ggtagaattaggt 35385572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 220
Target Start/End: Original strand, 1170794 - 1170849
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttgga--aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 220  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  1170794 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 1170849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 15224997 - 15224888
Alignment:
Q  136 tctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgga-aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt-gagactttag 233  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  | | ||||||||||||| | ||||||||||| |||  ||||| ||||| | ||||||||||| |||||||| |    
T  15224997 tctcttggcaacaaacactagggtt--atgattgattcaccttgaagaaacactattaggataaagtcttttggtcatgggaagagattcgagactttgg 15224900  T
Q  234 atagaattaggt 245  Q
     || ||||||||    
T  15224899 gtaaaattaggt 15224888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 31782656 - 31782597
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttgga--aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattg 224  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31782656 ttgattcaccttgaacaaaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattg 31782597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 245
Target Start/End: Original strand, 32520534 - 32520598
Alignment:
Q  182 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattga-gactttagatagaattaggt 245  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||| | |||||||||||    
T  32520534 aaacactattaagattgagtctctcgattacgggaagagattcatgactttgggtagaattaggt 32520598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 2144954 - 2144899
Alignment:
Q  3 agatttgttccaaat-tttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatca 57  Q
    ||||||||||||| | ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2144954 agatttgttccaattatttgagggatacttttactataaatatagaccttgtatca 2144899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 167 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 16093489 - 16093438
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttggaaaa-cactattatgattgagtctcttggttacgggaa 217  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  16093489 ttgattcaccttgaaaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaa 16093438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 79
Target Start/End: Original strand, 2723911 - 2723961
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggg 79  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||    
T  2723911 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggg 2723961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 57
Target Start/End: Original strand, 15552178 - 15552207
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatca 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15552178 acttttactataaatatagaccttgtatca 15552207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 57
Target Start/End: Original strand, 25803959 - 25803988
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatca 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25803959 acttttactataaatatagaccttgtatca 25803988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 167 - 220
Target Start/End: Original strand, 25452478 - 25452533
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttggaaaa--cactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 220  Q
    ||||||||||||| | ||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  25452478 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 25452533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 167 - 220
Target Start/End: Original strand, 28786387 - 28786442
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttggaaaa--cactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 220  Q
    ||||||||||||| | ||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  28786387 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 28786442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 82)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 14807723 - 14808049
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14807723 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 14807822  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  14807823 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 14807922  T
Q  201 tctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |    
T  14807923 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-t 14808021  T
Q  301 atagtgaaacgaagggttgctctctccc 328  Q
    |||||| |||| |||| |||||||||||    
T  14808022 atagtggaacggagggctgctctctccc 14808049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 4423990 - 4424341
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4423990 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatacagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaaggatttagaa 4424089  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  4424090 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcgcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccgtgggaaacactattaggattgag 4424189  T
Q  201 tctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||  ||| |||||| |    
T  4424190 tctcttggttacgggaagagattggagctttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttatcttttgtaacattactcatca-t 4424288  T
Q  301 atagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||| | |  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4424289 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 4424341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 5 - 353
Target Start/End: Original strand, 15072686 - 15073034
Alignment:
Q  5 atttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggc 104  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15072686 atttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggc 15072785  T
Q  105 aacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctc 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15072786 aacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggttttagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctc 15072885  T
Q  205 ttggttacgggaaga-gattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattata 303  Q
    ||||||||| ||||| | ||| |||||| | |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |    
T  15072886 ttggttacgagaagagggttgggactttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-taca 15072984  T
Q  304 gtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  15072985 gtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttagaccgaa 15073034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 15067953 - 15068300
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15067953 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatataaaccttgtatcaacctaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaa 15068052  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgag 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  15068053 aggcaacaacaaaaccagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttgggaaatactattaggattgag 15068152  T
Q  201 tctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatt 300  Q
    ||| |||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |    
T  15068153 tcttttggttacggaaagaggttgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-t 15068251  T
Q  301 atagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggac 349  Q
    ||| || |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15068252 ataatggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggac 15068300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 27829269 - 27829619
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27829269 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatataggccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 27829368  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  27829369 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 27829468  T
Q  201 tctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||| || | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||   || |||||| |    
T  27829469 tctcttggttacgggaagaggctgggaccttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaatactcatca-t 27829566  T
Q  301 atagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||| | || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27829567 atagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 27829619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 28251930 - 28251579
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  28251930 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaactttgagatagagtgggttgaaacaagggtttagaa 28251831  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgag 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  28251830 tggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 28251731  T
Q  201 tctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||| | || ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |    
T  28251730 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttataacccattgatttctcttttgtaatgttactcatca-t 28251632  T
Q  301 atagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||| | || |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  28251631 atagtggatcggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaa 28251579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 6 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 14419549 - 14419202
Alignment:
Q  6 tttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggca 105  Q
    |||||||||| || | || || ||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14419549 tttgttccaatttatgagtgatacttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggca 14419450  T
Q  106 acaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctct 205  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  14419449 acaaaaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggagcaaacattggggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctct 14419350  T
Q  206 tggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagt 305  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  14419349 tggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatgtcttttgtaaggttactcatcattatagt 14419250  T
Q  306 gaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||  | || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14419249 gaaacagatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 14419202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Original strand, 27911014 - 27911336
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27911014 acttttacaataaatattgacattgtatcaatgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa-ggcaacaacaaaactagggtttgtat 27911112  T
Q  128 agagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 227  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27911113 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggga 27911212  T
Q  228 ctttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcc 327  Q
    |||| | |||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  27911213 ctttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaactcattgatatctctattgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggttgctctctcc 27911311  T
Q  328 cacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||    
T  27911312 c-cagactaagtcaatttggaccgaa 27911336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Original strand, 27957433 - 27957755
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27957433 acttttacaataaatattgacattgtatcaatgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa-ggcaacaacaaaactagggtttgtat 27957531  T
Q  128 agagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 227  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27957532 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggga 27957631  T
Q  228 ctttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcc 327  Q
    |||| | |||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  27957632 ctttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaactcattgatatctctattgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggttgctctctcc 27957730  T
Q  328 cacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||    
T  27957731 c-cagactaagtcaatttggaccgaa 27957755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 18810680 - 18811030
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18810680 gcagatttgttacaaattttaagggaaacttttactataaatatagatcttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 18810779  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  18810780 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 18810879  T
Q  201 tctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatt 300  Q
    ||||||||||||||||| ||  || |||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||   || |||||||     
T  18810880 tctcttggttacgggaataggctgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacaatactcatcat- 18810977  T
Q  301 atagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||| |  | |||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  18810978 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcaatttgaaccgaa 18811030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 27826958 - 27827308
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27826958 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatataggccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 27827057  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  27827058 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 27827157  T
Q  201 tctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatt 300  Q
    |||||||||||| |||||||  || ||| || | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||   || |||||| |    
T  27827158 tctcttggttacaggaagaggctgggaccttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaatactcatca-t 27827255  T
Q  301 atagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||| | || |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  27827256 atagtggatcggagggctgctctctcccccagactaagtcaatttggaccgaa 27827308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 6 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 13858842 - 13858500
Alignment:
Q  6 tttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggca 105  Q
    |||||||||| || | || || ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13858842 tttgttccaatttatgagggatacttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggatgaaacaagggtttagaaaggca 13858743  T
Q  106 acaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctct 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  13858742 acaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgacaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttct 13858643  T
Q  206 tggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagt 305  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| | |||||||| | |||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13858642 tggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaagcgggagacttattcttgcagcccatt-atatctcttttgtaaagttactcatcattatagt 13858544  T
Q  306 gaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggac 349  Q
    |||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13858543 gaaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggac 13858500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 29 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 27107232 - 27106912
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27107232 cttttactataaatatagacattgtatcagtataaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 27107133  T
Q  129 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 228  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27107132 gagtttgtctcttcggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtgac 27107033  T
Q  229 tttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctccc 328  Q
    ||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||| |||| |||| |||||     
T  27107032 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatagatatctcttttgtagggttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctatctcct 27106934  T
Q  329 acagactaggtcaatttggacc 350  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  27106933 ccagactaggtcaatttggacc 27106912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Original strand, 32339304 - 32339632
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32339304 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 32339403  T
Q  124 gtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt 223  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32339404 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggtaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt 32339503  T
Q  224 gagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctct 323  Q
    | | |||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||| | || |||| ||||||    
T  32339504 ggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgatactcatca-tatagtggatcggagggctgctct 32339602  T
Q  324 ctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32339603 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 32339632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 44720815 - 44721166
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44720815 gcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttatatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 44720914  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg-aaaacactattatgattga 199  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  44720915 aggcaacaacaaaactatgttttgtatagagtctgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaaacactattaggattga 44721014  T
Q  200 gtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcat 299  Q
    |||||||||||||||||||||  || |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| | || |||||||    
T  44721015 gtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacggtactcatcat 44721113  T
Q  300 tatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
     |||||| |  | || | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44721114 -atagtggattggagagctgctctctcccgcagactaggtcaatttggaccgaa 44721166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 29 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 30480838 - 30480515
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |  | |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  30480838 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagaaggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaagtttgtata 30480739  T
Q  129 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 228  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  30480738 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgaggc 30480639  T
Q  229 tttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctccc 328  Q
    ||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| | | || |||||||||||    
T  30480638 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttagtcatca-tatagtgaaatggatggctgctctctccc 30480540  T
Q  329 acagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  30480539 ccagactaggtcaatttggaccgaa 30480515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 30 - 353
Target Start/End: Original strand, 36865538 - 36865860
Alignment:
Q  30 ttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| | | |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36865538 ttttactataaatatagacattgtatcagatgtaaaccttaagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 36865637  T
Q  129 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||   | ||||||||||||||  ||    
T  36865638 gagtttgtctcttggcaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctct---tcacgggaagagattggaac 36865734  T
Q  229 tttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctccc 328  Q
    ||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | |||||||||||    
T  36865735 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggaatgctgctctctccc 36865834  T
Q  329 ac-agactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
     | |||||||||||||||||||||||    
T  36865835 ccaagactaggtcaatttggaccgaa 36865860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 29 - 353
Target Start/End: Original strand, 25952521 - 25952844
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  25952521 cttttactataaatataagctttgtatcagaggaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaataaaattagggtt-gtata 25952619  T
Q  129 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 228  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  25952620 tagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacaatattaggattgagtctcttggttacgagaagaaattgagac 25952719  T
Q  229 tttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctccc 328  Q
     || | ||||||||||  | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  25952720 attgggtagaattaggcagaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccc 25952819  T
Q  329 acagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
     |||||||||| |||||||||||||    
T  25952820 ccagactaggtaaatttggaccgaa 25952844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 29 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 5372512 - 5372188
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||  | |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  5372512 cttttactataattatagacattgtatcagtgtaaatcttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttatata 5372414  T
Q  129 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  5372413 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattgggac 5372314  T
Q  229 tttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctct-cc 327  Q
    |||   || ||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||    
T  5372313 tttgagtataattaggcggcagacttattcttgtaactcattgatatcttttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggttactctctccc 5372214  T
Q  328 cacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  5372213 cccagactaggtcaatttggaccgaa 5372188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Original strand, 41384744 - 41385067
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  41384744 acttttactataaatatagaccttgaatcaaagtaaaaattgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtat 41384842  T
Q  128 agagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 227  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||       
T  41384843 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacaccattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggag 41384942  T
Q  228 ctttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcc 327  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||  |||| ||||||||||    
T  41384943 ctttaggtagaattaggtgggagaatttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcc 41385041  T
Q  328 cacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    | || |||||||||||||||||||||    
T  41385042 cccatactaggtcaatttggaccgaa 41385067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Original strand, 15809214 - 15809541
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15809214 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 15809313  T
Q  124 gtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt 223  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |    
T  15809314 gtatagagtttgtcttttgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaaact 15809412  T
Q  224 gagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctct 323  Q
      |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||| | |  |||| ||||||    
T  15809413 aggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctct 15809511  T
Q  324 ctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||    
T  15809512 cttccccagactaggtcaatttggaccgaa 15809541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Original strand, 1225165 - 1225490
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  1225165 acttttactataaatataggcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaa 1225264  T
Q  128 agagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 227  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  1225265 agagtttgtctctttggaacaaacactacggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggg 1225364  T
Q  228 ctttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctc 326  Q
    |||| | |||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||| | ||  ||||||||    
T  1225365 ctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggatggccgctctctc 1225463  T
Q  327 ccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    || || |||||||||||||||||||||    
T  1225464 cctcatactaggtcaatttggaccgaa 1225490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 29 - 275
Target Start/End: Original strand, 14477276 - 14477522
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14477276 cttttactataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 14477375  T
Q  129 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 228  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14477376 aagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacgctattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 14477475  T
Q  229 tttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatat 275  Q
    ||| | |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  14477476 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatat 14477522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Original strand, 3874005 - 3874333
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 123  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||    
T  3874005 acttttactataaatatagactttgtatcaggctaaactttgagagagatagcgggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactaaagttt 3874104  T
Q  124 gtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt 223  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  |    
T  3874105 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggttacgggaagaggct 3874204  T
Q  224 gagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctct 323  Q
    | |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||| | || |||| ||||||    
T  3874205 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctct 3874303  T
Q  324 ctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3874304 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 3874333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 38 - 353
Target Start/End: Original strand, 608735 - 609057
Alignment:
Q  38 taaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 129  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  608735 taaatatagaccttatatcatagcaaactttgagagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaattagggtttgtatag 608834  T
Q  130 agtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagact 229  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  || ||||    
T  608835 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgggact 608934  T
Q  230 ttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctccca 329  Q
    || | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||| | || |||| |||||||||||     
T  608935 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccc 609033  T
Q  330 cagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  609034 cagactaagtcaatttggaccgaa 609057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 28283561 - 28283233
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28283561 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggt 28283462  T
Q  122 ttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaga 221  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  28283461 ttgtatagagtttgactctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagaga 28283362  T
Q  222 ttgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgct 321  Q
    ||| | |||| | ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||| ||||||| | || |||| ||||    
T  28283361 ttggggctttgggtagaattaggtggtagacttattcttgcaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgct 28283264  T
Q  322 ctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28283263 ctctccc-cagactaggtcaatttggaccgaa 28283233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 22685002 - 22684665
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaacta 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||          |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22685002 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagagagagatagaggaggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaacta 22684903  T
Q  118 gggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaa 217  Q
    ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22684902 gggtttgtatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaa 22684803  T
Q  218 gagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaaccc---attgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaag 314  Q
    |||  || |||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||   |||||| ||||| |||||| |||| |||||| ||||||| |||| ||    
T  22684802 gaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccaatattgatttctctattgtaacgttactcatca-tatagtggaacggag 22684704  T
Q  315 ggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    || ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  22684703 ggctgctctctcccccagattaggtcaatttggaccgaa 22684665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Original strand, 41382672 - 41382985
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  41382672 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttgagatagatggggctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtat 41382771  T
Q  128 agagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 227  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  41382772 agaatttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgtttcac-----------ctattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgggg 41382860  T
Q  228 ctttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcc 327  Q
    |||| | |||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||  |||| ||||||||||    
T  41382861 ctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcc 41382959  T
Q  328 cacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  41382960 cccagactaggtcaatttggaccgaa 41382985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 18812865 - 18813204
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18812865 gcagatttgttacaaattttaagggaaacttttactataaatatagatcttgtatcagagcaaacttggagatagaggaggctgaaacaagggtttagaa 18812964  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgag 200  Q
    ||||||||||||||||||           |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  18812965 aggcaacaacaaaactag-----------agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 18813053  T
Q  201 tctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatt 300  Q
    |||||||| |||||||||||  || |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||   || |||||||     
T  18813054 tctcttgggtacgggaagaggctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacaatactcatcat- 18813151  T
Q  301 atagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||| |  | |||| ||||||||||| || | |||||||||||||||||||    
T  18813152 atagtggattggagggctgctctctcccccatattaggtcaatttggaccgaa 18813204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 29 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 33541723 - 33541422
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33541723 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaacattgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 33541624  T
Q  129 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 228  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  33541623 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtatcttggttacgggaagagattgggac 33541524  T
Q  229 tttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctccc 328  Q
    ||| | ||||||||||                      |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| | || |||||||||||    
T  33541523 ttttggtagaattagg----------------------cattgatatctcttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacggaaggctgctctctccc 33541447  T
Q  329 acagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  33541446 ccagactaggtcaatttggaccgaa 33541422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 24873523 - 24873193
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24873523 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 24873424  T
Q  122 ttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagag 220  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||    
T  24873423 ttgtatagagtttgtctcttgggagcaaacactagggtttgtgggttgattcacctttggaaacactattaggattggagtctcttggttacggaaagag 24873324  T
Q  221 attgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgc 320  Q
    |||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||| |  | ||||||| |||||| |  | |||| |||    
T  24873323 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccgattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgc 24873226  T
Q  321 tctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||||| || |||||||||  ||||||||||    
T  24873225 tctctcccccatactaggtcagattggaccgaa 24873193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 3 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 15186072 - 15185726
Alignment:
Q  3 agatttgttccaaattt-taagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 101  Q
    ||||||||||||| ||| | || || |||||||||||||||||| || |||||||| || |||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  15186072 agatttgttccaattttatgagggatacttttactataaatataaactttgtatcagagtaaaccttgagataaaggtgactgaaacaagggtttagaaa 15185973  T
Q  102 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagt 201  Q
    |  || |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  15185972 gaaaataacaaaactatggtttatataaagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgtaaaacactattagaattgagt 15185873  T
Q  202 --ctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcat 299  Q
      ||||||||||||||||||||       ||| | |||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  15185872 ctctcttggttacgggaagaga-------tttgggtagaattaggcgagagacctattcttgtaacccattgatatctcttttttaaggttactcatcat 15185780  T
Q  300 tatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||||||||| |||  || ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  15185779 tatagtgaaacggaggactgttctctcccctagactaggtcaatttggaccgaa 15185726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 29 - 353
Target Start/End: Original strand, 21482322 - 21482634
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||    
T  21482322 cttttactataaatatagaatttgtatcagagtaaactttgagatagagtggactgaaacaagggtttagaaatc--------aaactagggtttgtata 21482413  T
Q  129 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 228  Q
     |||||| ||||||| ||||||||||||||||   ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | |    
T  21482414 aagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgagtcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttatgggaagagattggggc 21482509  T
Q  229 tttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctccc 328  Q
    ||| | |||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| |||| |||||||||||    
T  21482510 tttgggtagaattaggcgagtgacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataaagaaacggagggctgctctctccc 21482609  T
Q  329 acagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
     || |||||||||||||||||||||    
T  21482610 ccaaactaggtcaatttggaccgaa 21482634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 77 - 353
Target Start/End: Original strand, 43079650 - 43079925
Alignment:
Q  77 gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcacc 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43079650 gggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacc 43079749  T
Q  177 ttggaaaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatat 275  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  43079750 ttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgattt 43079849  T
Q  276 ctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||| |||| |  | ||||||| |||||| |  | |||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  43079850 ctcttt-gtaacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaa 43079925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 69 - 353
Target Start/End: Original strand, 43082013 - 43082296
Alignment:
Q  69 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggtt 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  43082013 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 43082112  T
Q  169 gattcaccttggaaaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaaccc 267  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  43082113 gattcaccttgggaaacactatcaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaaccc 43082212  T
Q  268 attgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||| ||||||| |||| |  | ||||||| |||||| |  | |||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  43082213 attgatttctcttt-gtaacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaa 43082296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Original strand, 43530123 - 43530438
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||                 
T  43530123 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaac------------- 43530209  T
Q  124 gtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt 223  Q
    || ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  |    
T  43530210 gtgtagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctcggttacgggaagaggct 43530309  T
Q  224 gagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctct 323  Q
    | |||||| | |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| ||||||| | || |||| |||| |    
T  43530310 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcctgtaacccattgatttctcttttgtaacgctactcatca-tatagtggatcggagggctgctgt 43530408  T
Q  324 ctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  43530409 ctctcccagactaggtcaatttggaccgaa 43530438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 119 - 349
Target Start/End: Original strand, 15956051 - 15956277
Alignment:
Q  119 ggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaag 218  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||| ||||| ||||||||    
T  15956051 ggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactgttaggattgaatcttttggtcacgggaag 15956146  T
Q  219 agattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggtt 318  Q
    |||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  15956147 agattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggtt 15956246  T
Q  319 gctctctcccacagactaggtcaatttggac 349  Q
     ||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  15956247 tctctctccctcagattaggtcaatttggac 15956277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 62 - 353
Target Start/End: Original strand, 21480547 - 21480826
Alignment:
Q  62 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggttt 161  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||     
T  21480547 aaaccttgagatagatggggctgaaacaagggtttagaaatc--------aaactagggtttgtatggagtttg-ctcttggcaacaaacactaggttt- 21480636  T
Q  162 gagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctag 261  Q
      ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||| | |||||||||| ||| |||||||||| |    
T  21480637 --gggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaagatattggggtttttggtagaattaggcgggtgacttattcttg 21480734  T
Q  262 taacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  21480735 taacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaacgaa 21480826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 353
Target Start/End: Original strand, 31162186 - 31162536
Alignment:
Q  3 agatttgttccaaattt-taagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaa 100  Q
    ||||||||||||| ||| | || || |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||    
T  31162186 agatttgttccaattttatgagggatacttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaaccttgagaaagagggggctaaaaacaaaggtttagaa 31162285  T
Q  101 aggcaa-caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattga 199  Q
    |  ||| |||||||  ||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||  |||  |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  31162286 a--caagcaacaaat-tagtgtttgtataaagtttg-ctcttggcaacaaacactaacgtt--agggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 31162379  T
Q  200 gtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcat 299  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  31162380 gtctcttggtcaccggaagagattgggactttgggtagaattaggtggaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaaattactcatcat 31162479  T
Q  300 tatagtgaaacgaagggttgctctct--cccacagactaggtcaat-ttggaccgaa 353  Q
    ||||||| |||  |||| ||||||||  ||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  31162480 tatagtggaacagagggctgctctctcccccccagactaggtcagtattggaccgaa 31162536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Original strand, 26775200 - 26775378
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26775200 acttttactataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaatactagggtttgtat 26775299  T
Q  128 agagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctctt 206  Q
    | |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  26775300 atagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttggaaaacactattagaattgagtctctt 26775378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 29 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 5623073 - 5622878
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5623073 cttttactataaatataggttttgtatcagaataaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 5622974  T
Q  129 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattg 224  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5622973 gagtttgtctattgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatctttggaaacattatttggattgagtctcttgattacgggaagagattg 5622878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 62 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 3005929 - 3005642
Alignment:
Q  62 aaactttgagatagagggggct-gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtt 160  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||  |  ||||||| |||||||||||||||| |||||   |||||||| |||||||    
T  3005929 aaaccttgagatagagggggctggaaacaagggtttagaaa--caaataacaaactagagtttgtatagagtttg-ctcttaacaacaaacaatagggtt 3005833  T
Q  161 tgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattcta 260  Q
       || ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| | |||||||||| ||||||||||||||     
T  3005832 ---ggattgattcactttggaaaacactattagcattgagtctcttggtcacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattctt 3005736  T
Q  261 gtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtca-atttggaccgaa 353  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||    
T  3005735 gtaatccattgatatctcttttgtaaagttgctcatcattatagtggaacggaggggtgctctctcccccagaccaggtcagttttggaccgaa 3005642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 29 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 35872713 - 35872555
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||    
T  35872713 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaac-----tagggtttgtata 35872619  T
Q  129 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactatta 192  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35872618 gagtttgtctcttggaaacgaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 35872555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 5 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 3886277 - 3886153
Alignment:
Q  5 atttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggc 104  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3886277 atttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagactttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggc 3886178  T
Q  105 aacaacaaaactagggtttgtatag 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  3886177 aacaacaaaactagggtttgtatag 3886153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 5 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 12517385 - 12517248
Alignment:
Q  5 atttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaag 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12517385 atttgttccaaattttaagcgatacttttactatatatatataccttgtatcagagcaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaag 12517286  T
Q  103 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctct 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12517285 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctct 12517248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 164 - 336
Target Start/End: Original strand, 31035252 - 31035424
Alignment:
Q  164 gggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattagg-tgggagacttattctagt 262  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||||||||| ||    
T  31035252 gggttgattcaccttgggaaacaccgttatgattgagtctcttggtcacaggaagagattgagactttaggtagaattaggtttgaagacttattcttgt 31035351  T
Q  263 aacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagacta 336  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  31035352 aaccctttgatatctc-tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagacta 31035424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 2468461 - 2468261
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||     
T  2468461 gcagatttgttccaaatgttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggagctgaaacaaggatttaga- 2468363  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttg----tatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgat 196  Q
           ||  |||||| ||||||    ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||  ||    
T  2468362 -------aatcaaactacggtttgtatatatagagtttg-ctcttggcaacaaatactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactattagaat 2468274  T
Q  197 tgagtctcttggt 209  Q
    |||||||||||||    
T  2468273 tgagtctcttggt 2468261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 167 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 31578476 - 31578301
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattagg-tgggagacttattctagtaac 265  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| | |||||||||| | | ||||| ||||| |||||    
T  31578476 ttgattcaccttgggaaacactgttatgattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaac 31578377  T
Q  266 ccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtca 341  Q
    |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||   |||||||||||  |||||||||||    
T  31578376 cttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactgctctctcccctagactaggtca 31578301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 85 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 31574000 - 31573794
Alignment:
Q  85 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaa 184  Q
    |||||| ||||||||| | |||||  ||||||||| ||||||  |||||| |||||||| ||||||||||| |||| |  | |||||||||||||| |||    
T  31574000 aaacaaaggtttagaa-gccaacacgaaaactaggatttgta--gagttt-tctcttggcaacaaacactatggttgg--gattgattcaccttgggaaa 31573907  T
Q  185 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattagg-tgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttg 283  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| | | ||||| ||||| ||||  | |||||||||||||||    
T  31573906 cactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaattctttgatatctcttttg 31573807  T
Q  284 taaagttattcat 296  Q
    |||||||| ||||    
T  31573806 taaagttactcat 31573794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 152 - 299
Target Start/End: Original strand, 181622 - 181771
Alignment:
Q  152 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactatt-atgattgagtctcttggttacg--ggaagagattgagactttagatagaattaggtggg 248  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||| ||||||  |||||||| || |||||| | |||||||||| ||     
T  181622 actagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactatttaggattaagtctcttagttacgcgggaagagaatgggactttgggtagaattaggcgga 181721  T
Q  249 agacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcat 299  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  181722 agacttattcttgtaacccattgatatctc-tttgtaaagttactcatcat 181771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 62 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 37214512 - 37214320
Alignment:
Q  62 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaact-------------------agggtttgtatagagtttgtctcttg 142  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                   |||||||||||||||||||||||||     
T  37214512 aaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaacttggttacgggaagagattgagggtttgtatagagtttgtctcttt 37214413  T
Q  143 gaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaatta 242  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||         |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| | ||||||||    
T  37214412 ggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaac---------attgagtctcttggttacgggaagcgattggaactttgggtagaatta 37214322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 124
Target Start/End: Original strand, 181536 - 181632
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 124  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  181536 acttttactataaatatagactttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggcttagaatggcaacaataaaactagggtttg 181632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 234 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 2468260 - 2468145
Alignment:
Q  234 atagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacaga 333  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||| ||||||||| | ||||    
T  2468260 atagaattagacgggagacttattcttgtagcccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaatagagggctgctctctctcccaga 2468161  T
Q  334 ctaggtcaatttggac 349  Q
     |||||||||||||||    
T  2468160 ttaggtcaatttggac 2468145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 2 - 201
Target Start/End: Original strand, 31035041 - 31035238
Alignment:
Q  2 cagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgaga--tagagggggctgaaa-caagggttta 97  Q
    |||||||||||||| |||| || || | |||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||  ||||| |  |||||| ||| ||||||    
T  31035041 cagatttgttccaattttttag-gatatttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaactttgagaggtagagagt-ctgaaaacaatggttta 31035138  T
Q  98 gaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgatt 197  Q
    ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||   || |||||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  31035139 gaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt--gggattgattcaccttgggaaacaccattaggatt 31035234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 167 - 353
Target Start/End: Original strand, 6376124 - 6376313
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttgga--aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattagg-tgggagacttattctagta 263  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||  |||||||||| | | ||||| ||||| ||     
T  6376124 ttgattcaccttgaacaaaacactgttaagattgagtctcttggtcacatgaagagattgagactttatgtagaattaggtttgaagactaattcttgtt 6376223  T
Q  264 acccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaat-ttggaccgaa 353  Q
    |||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||  | || ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  6376224 accttttgatatctc-tttgtaaagttactcatcattatagtggaacagaaggctgctctctccctcagactaggtcagtattggaccgaa 6376313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 167 - 341
Target Start/End: Original strand, 17847661 - 17847830
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttgga--aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattagg-tgggagacttattctagta 263  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||| | | ||||| ||||| |||    
T  17847661 ttgattcaccttgaacgaaacactattaggattgaatctcttgatcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgta 17847760  T
Q  264 acccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtca 341  Q
    | || |||||||||||||||||||       |||||||||||| || | |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  17847761 a-cctttgatatctcttttgtaaa-------atcattatagtggaatggagggctgctctctcccccagactaggtca 17847830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 269 - 341
Target Start/End: Original strand, 16833789 - 16833861
Alignment:
Q  269 ttgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtca 341  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| ||||    
T  16833789 ttgatatctcttttgtaaagttactcaacattatagtggaacgaaaggctgctctctcccacagactaagtca 16833861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 57
Target Start/End: Original strand, 17847501 - 17847556
Alignment:
Q  2 cagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatca 57  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17847501 cagatttgttccaaattttgagggatacttttactataaatatagaccttgtatca 17847556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 127 - 328
Target Start/End: Original strand, 3895920 - 3896121
Alignment:
Q  127 tagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgga-aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattga 225  Q
    ||||||||| || |||| |||||||| ||||||| |  | ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||| ||||     
T  3895920 tagagtttg-cttttggcaacaaacaatagggttgg--gattgattcactttggagaaacactattgcgattgagtctcttcgtcacgggaagaaattgg 3896016  T
Q  226 gactttagatagaattaggtgggagactt-attctagtaacccat-tgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctct 323  Q
    ||||||   || ||||||||  || | || ||||| ||||| | | |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| | || ||||||    
T  3896017 gactttgagtataattaggtttgaaaattaattcttgtaactcttatgatatctcttttgtaaagttactcatcattaaagtagaacggatggctgctct 3896116  T
Q  324 ctccc 328  Q
    |||||    
T  3896117 ctccc 3896121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 13985278 - 13985121
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttggaaaa-cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt-gagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaa 264  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| | |||||| | |||||||||||  || ||| ||||| ||||    
T  13985278 ttgattcaccttgaaaaaacactattaggattgagtctcttggtcacaggaagagattcgggactttgggtagaattaggtttgaaactgattcttgtaa 13985179  T
Q  265 cccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctc 324  Q
    ||| |||  |||||  || ||||||||  | ||||||||||| |||  || |||||||||    
T  13985178 ccctttggaatctc--ttataaagttacccctcattatagtggaacagagagttgctctc 13985121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 251 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 35872553 - 35872476
Alignment:
Q  251 acttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctccca 329  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  35872553 acttatttttgtaagccattgatatctcttttgtaacattactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccca 35872476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 245
Target Start/End: Original strand, 30423195 - 30423275
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttgga--aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggt 245  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  30423195 ttgattcaccttgaacaaaacacttttaggattgagtctcttggtcgcgggaagagattggaactttggatagaattaggt 30423275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 17799623 - 17799558
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttgga--aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactt 230  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  17799623 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagactt 17799558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 167 - 341
Target Start/End: Original strand, 28327891 - 28328064
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttgga--aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattagg-tgggagacttattctagta 263  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || ||| || | |||||||||| | | ||||| ||||| | |    
T  28327891 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaa 28327989  T
Q  264 acccattgatatctcttttgtaaagttattca-tcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtca 341  Q
    || |||   |||||| |||||||||  | ||| ||||||||||| |||| || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  28327990 actcat---tatctc-tttgtaaagaaactcattcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 28328064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 72
Target Start/End: Original strand, 6375988 - 6376032
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  6375988 acttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaacattgaga 6376032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 9021306 - 9021251
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttgga--aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 220  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  9021306 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 9021251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 16752721 - 16752666
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttgga--aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 220  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16752721 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 16752666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 16757466 - 16757411
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttgga--aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 220  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16757466 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 16757411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 220
Target Start/End: Original strand, 28895485 - 28895540
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttgga--aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 220  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  28895485 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 28895540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 43079558 - 43079614
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatca 57  Q
    |||||||||||  | |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43079558 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatca 43079614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 43081930 - 43081986
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatca 57  Q
    |||||||||||  | |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43081930 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatca 43081986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 272 - 326
Target Start/End: Original strand, 14419732 - 14419786
Alignment:
Q  272 atatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctc 326  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| | || |||||||||    
T  14419732 atatctcttttgtaaggttactcatcattatagtaaaacggatggctgctctctc 14419786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 249 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 33021018 - 33020925
Alignment:
Q  249 agacttattctagtaacccattgatatctctt-ttgtaaagttattcatcattata-gtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtca 341  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||||||| | || ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||  | |||||||||||||||| |||||||    
T  33021018 agactgattcttgtaaccctttgatattttttgttgtaaagttactcatcattataagtgaa-cgaaaagctgctctctcccacagagtaggtca 33020925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 13986011 - 13985954
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttgga-aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt 223  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||  | |||||||||||||    
T  13986011 ttgattcaccttggagaaacactattaggattgagactcttaatcacgggaagagatt 13985954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 13986098 - 13986030
Alignment:
Q  85 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagg 157  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  13986098 aaacaagggtttagaa-gtcaacaacaaaactagaatttgta--gagttt-tctcttggaaacaaacattagg 13986030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 31574100 - 31574054
Alignment:
Q  6 tttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgta 54  Q
    ||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  31574100 tttgttccaaattttgagaga--cttttactataaatatagaccttgta 31574054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 33839120 - 33839042
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttgga-aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt-gagactttagatagaattaggt 245  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||  ||||||| | |||||||||||    
T  33839120 ttgattcaccttgaagaaacactattaggattgagtctcttggt--caggaagagattcaagactttgggtagaattaggt 33839042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 167 - 220
Target Start/End: Original strand, 590777 - 590832
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttggaaaa--cactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 220  Q
    ||||||||||||| | ||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  590777 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 590832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 167 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 4812686 - 4812631
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttgga--aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 220  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  4812686 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtcttttggtcacgggaagag 4812631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 167 - 220
Target Start/End: Original strand, 28332614 - 28332669
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttgga--aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 220  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  28332614 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagag 28332669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 167 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 29554984 - 29554929
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttggaaaa--cactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 220  Q
    ||||||||||||| | ||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  29554984 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 29554929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 167 - 220
Target Start/End: Original strand, 33032637 - 33032692
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttggaaaa--cactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 220  Q
    ||||||||||||| | ||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  33032637 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 33032692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0339 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 1)
Name: scaffold0339
Description:

Target: scaffold0339; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 3922 - 4271
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3922 gcagatttgtttcaaattttaagcaatacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 4021  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  4022 aggcaacaacaaaactagggtttgtata-agtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgag 4120  T
Q  201 tctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatt 300  Q
    |||||||||||||||||||   || |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  4121 tctcttggttacgggaagaagctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-t 4219  T
Q  301 atagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4220 atagtgaaacggagggctgctctctccc-cagactaggtcaatttggaccgaa 4271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 2)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 14944 - 15295
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  14944 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaatgatttagaa 15043  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  15044 aggcaacaacaaaactagggtttttataaagtttgtctctttggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 15143  T
Q  201 tctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatt 300  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  15144 tctcttggttacggaaagagattcagactttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-t 15242  T
Q  301 atagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||| |||| | || |||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  15243 atagtggaacggaaggctgctgtctcccccatgctaggtcaatttggaccgaa 15295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 41 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 14707 - 14394
Alignment:
Q  41 atatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtct 138  Q
    ||||||||||||| | | ||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14707 atatagaccttgttttagagcaaactttgagagatagagggggatgaaacaatggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtct 14608  T
Q  139 cttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagataga 238  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||    
T  14607 ctttgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtaga 14508  T
Q  239 attaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactagg 338  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||  ||||||||    
T  14507 attaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccctagactagg 14409  T
Q  339 tcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||||||||||||    
T  14408 tcaatttggaccgaa 14394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 69658 - 69304
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggttt 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  69658 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttacaataaatatagaccttatatcagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggttt 69559  T
Q  97 agaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  69558 agaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggat 69459  T
Q  197 tgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcat 296  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||    
T  69458 tgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcat 69360  T
Q  297 cattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    || ||||||| | || || | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  69359 ca-tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 69304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 73390 - 73203
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggttt 96  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  73390 gcagatttgttccaaattttaagagatacttttactataaatatagaccgtgtatcaaaggaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggttt 73291  T
Q  97 agaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaa 184  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  73290 agaaaggcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaa 73203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 73211 - 73160
Alignment:
Q  139 cttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactatt 191  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  73211 cttggaaa-aaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 73160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 2805 - 3155
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2805 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaacttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 2904  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2905 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgag 3004  T
Q  201 tctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatt 300  Q
    ||||||||||| ||||||||  |  |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| |  | |||||||     
T  3005 tctcttggttatgggaagaggcttggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcat- 3102  T
Q  301 atagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||| |  | |||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  3103 atagtggattggagggctgctatctccccgagactaggtcaatttggaccgaa 3155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 41819 - 41495
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41819 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 41720  T
Q  128 agagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 227  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||    
T  41719 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 41620  T
Q  228 ctttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcc 327  Q
    |||| | |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||| || |||| ||||||||||    
T  41619 ctttcggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctctctcc 41521  T
Q  328 cacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    | |||||||||| |||||||||||||    
T  41520 cccagactaggtgaatttggaccgaa 41495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 183975 - 183653
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  183975 actttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaaggg-ctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtat 183877  T
Q  128 agagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 227  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  183876 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttac-ggaagagattggga 183778  T
Q  228 ctttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcc 327  Q
    |||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  183777 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcc 183679  T
Q  328 cacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  183678 ctcagactaggtcaatttggaccgaa 183653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 28 - 350
Target Start/End: Original strand, 51961 - 52286
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  51961 acttttactataaatatagaccttgtatcatactaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgt 52060  T
Q  126 atagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattga 225  Q
    ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  52061 atagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgt 52160  T
Q  226 gactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttg--ctct 323  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| |||| ||  ||||    
T  52161 gactttggatagaattaggtgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctct 52259  T
Q  324 ctcccacagactaggtcaatttggacc 350  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||    
T  52260 ctcccccagactaggtcaatttggacc 52286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 299 - 350
Target Start/End: Original strand, 50234 - 50287
Alignment:
Q  299 ttatagtgaaacgaagggttgctctctc--ccacagactaggtcaatttggacc 350  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  50234 ttatagtgaaacggagggctgctctctctcccccagactaggtcaatttggacc 50287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 31 - 350
Target Start/End: Original strand, 79140 - 79458
Alignment:
Q  31 tttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtataga 130  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| || |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  79140 tttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaacttgagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtataga 79239  T
Q  131 gtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactt 230  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  79240 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagaatt 79339  T
Q  231 tagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccac 330  Q
    | | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||| |    
T  79340 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctccccc 79438  T
Q  331 agactaggtcaatttggacc 350  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  79439 agactaggtcaatttggacc 79458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 6124 - 6475
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 100  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6124 gcagatttgttacagtttttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 6223  T
Q  101 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattg-a 199  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  6224 aagcaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaa 6323  T
Q  200 gtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||     
T  6324 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca- 6421  T
Q  300 tatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
     |||||| | || |||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  6422 aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaa 6475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 11809 - 11485
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  11809 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatagagggggctgaaacagggatttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtat 11710  T
Q  128 agagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 227  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11709 agagtttgtctctttcgaacaaacactagggtttgagggttgattttccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggga 11610  T
Q  228 ctttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcc 327  Q
    |||| | |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||| |  | || | ||||||||||    
T  11609 ctttgggtagaattaggcgggatacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggattggagagctgctctctcc 11511  T
Q  328 cacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  11510 cccagactaggtcaatttggaccgaa 11485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 29 - 348
Target Start/End: Original strand, 79812 - 80130
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  79812 cttttactataaatatagtttttgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaataaaactagggtttgtata 79911  T
Q  129 gagtttgtctc-ttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 227  Q
    ||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |     
T  79912 gagtttgtctctttggcaacaaaaattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattgggg 80011  T
Q  228 ctttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcc 327  Q
    |||| | ||| ||||||  ||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  80012 ctttgggtag-attaggcaggagacttattcctgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcc 80109  T
Q  328 cacagactaggtcaatttgga 348  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  80110 cccagactaggtcaatttgga 80130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 188441 - 188386
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttgga--aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 220  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  188441 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 188386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 29 - 346
Target Start/End: Original strand, 85184 - 85500
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||| | ||  ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  85184 cttttactataaatataggctttgtatcaaagtaaaccttgagatagaagagga-gaaacaaggatttaaaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 85282  T
Q  129 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 228  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  85283 gagtttgtctcttagcaacaaacactaaagtttgagggttgattcaccttggaaaacactactaggattgagtcttttggttacgagaagagattgtgac 85382  T
Q  229 tttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctccc 328  Q
    |||   |||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| | |  |||||||||||    
T  85383 tttgagtagaatcagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttcgtaaagttactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccc 85482  T
Q  329 acagactaggtcaatttg 346  Q
     |||||||||||||||||    
T  85483 ccagactaggtcaatttg 85500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 29086 - 29446
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----------tagagggggctgaaacaa 90  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||          ||||||||||||||||||    
T  29086 gcagatttgttacaaattttaagcaaaacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagagagatagagggggctgaaacaa 29185  T
Q  91 gggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactat 190  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||| |||||| | |||||||    
T  29186 gggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcgccttgggatacactat 29285  T
Q  191 tatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagtt 290  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||   ||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||   |    
T  29286 taggattgagtctcttggttacgggaagaggttggggctttgagtagaattaggcaggagacttattcttgtaactcattgatttctc-tttgtaacaat 29384  T
Q  291 attcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    | |||||| ||||||| | || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29385 actcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 29446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 69 - 353
Target Start/End: Original strand, 34 - 317
Alignment:
Q  69 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggtt 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  34 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggtt 133  T
Q  169 gattcaccttggaaaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaaccc 267  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  134 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgtgaagagattgagactttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaaccc 233  T
Q  268 attgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||| ||||||| |||| |  | ||||||| |||||| |  | |||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  234 attgatttctcttt-gtaacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaa 317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0224 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0224
Description:

Target: scaffold0224; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 3 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 16180 - 15832
Alignment:
Q  3 agatttgttccaaattt-taagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 101  Q
    ||||||||||||||||| | || || ||||||||||||||||||||  |||||||| || |||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||     
T  16180 agatttgttccaaatttatgagggatacttttactataaatatagattttgtatcagagtaaaccttaagatagagggggttgaaataagggtttagaa- 16082  T
Q  102 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagt 201  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||    
T  16081 gtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcctagcaacaaacactagggtt-gagg-ttgattcaccttgcgaaaaactattaggattgagt 15985  T
Q  202 ctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatta 301  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15984 ctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatta 15885  T
Q  302 tagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaat-ttggaccgaa 353  Q
     |||| |||| |||  |||||||| || | |||||||||| | ||||||||||    
T  15884 gagtggaacggaggactgctctctgcccccgactaggtcagtgttggaccgaa 15832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 30 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 16981 - 16661
Alignment:
Q  30 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  16981 ttttaatataaatataaaccttgtatcagagtaaaccttgagatagaggaggctgaaaacaagggttt-gaaagacaaca-caaaactagggtttgtata 16884  T
Q  129 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 228  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||| |  | |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  16883 gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttaggaaacactattaggattgagtcacttggtgacgggaagagattgagac 16787  T
Q  229 tttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctccc 328  Q
    ||| | ||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||  ||||||||    
T  16786 tttgggtagaattaggccagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgggacaaagggtttatctctccc 16687  T
Q  329 acagactaggtca-atttggaccgaa 353  Q
     ||||| ||||||  |||||||||||    
T  16686 ccagaccaggtcagttttggaccgaa 16661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0511 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0511
Description:

Target: scaffold0511; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 28 - 328
Target Start/End: Original strand, 1988 - 2292
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||      || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1988 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagaaagatatagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 2087  T
Q  122 ttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaga 221  Q
    ||||| |||||||||||||| | || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||     
T  2088 ttgtacagagtttgtctcttcggaataaa-actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagg 2186  T
Q  222 ttgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgct 321  Q
     || |||||| | |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| || |||||||||||| |||  |||||| ||||||||| || |||| | ||    
T  2187 ctgggactttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaacccattaatttctcttttgtaacgttcctcatca-tatagtgaatcggagggctact 2285  T
Q  322 ctctccc 328  Q
    |||||||    
T  2286 ctctccc 2292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 138; Significance: 4e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 38 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 1958 - 1666
Alignment:
Q  38 taaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 136  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||      
T  1958 taaatatagaccttgtatcagatgtaaacctagagatagaggtggctgaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttc- 1861  T
Q  137 ctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagata 236  Q
            ||||||||||||||||    |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| | ||    
T  1860 --------aacaaacactagggttgt--ggttgattcaccttgggaaacacaattaggattgagtttcttggtcacgggaagagattgggactttgggta 1771  T
Q  237 gaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagacta 336  Q
    |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| || ||||    
T  1770 gaattaggcgggagagttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgtagggctgctctctcccccatacta 1671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 29 - 256
Target Start/End: Original strand, 35593 - 35819
Alignment:
Q  29 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 128  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||   |||||   | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35593 cttttactataaatatagacattgtatcagtacaaaccgggtgatagaggcg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 35691  T
Q  129 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 228  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  || |||    
T  35692 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcacctagggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagaggctgggac 35791  T
Q  229 tttagatagaattaggtgggagacttat 256  Q
    ||| | |||||||||| |||||||||||    
T  35792 tttgggtagaattaggcgggagacttat 35819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 299 - 353
Target Start/End: Original strand, 35816 - 35870
Alignment:
Q  299 ttatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||||| |||| |||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  35816 ttatagtggaacggagggctgctctcttccttagactaggtcaatttggaccgaa 35870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0370 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0370
Description:

Target: scaffold0370; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 145 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 1671 - 1465
Alignment:
Q  145 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattagg 244  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||| | ||||||||||    
T  1671 aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 1572  T
Q  245 tgggagacttattctagtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatt 344  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| | || |||||| ||||||| | || |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  1571 cgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatt 1474  T
Q  345 tggaccgaa 353  Q
    |||||||||    
T  1473 tggaccgaa 1465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0552 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0552
Description:

Target: scaffold0552; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 28 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 1167 - 1054
Alignment:
Q  28 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 127  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1167 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 1068  T
Q  128 agagtttgtctctt 141  Q
    ||||||||||||||    
T  1067 agagtttgtctctt 1054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 94; Significance: 8e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 35 - 353
Target Start/End: Original strand, 4773 - 5089
Alignment:
Q  35 ctataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaaggg-tttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 133  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||| || || ||||||| |  | ||||||| ||||||||| ||||| |||    
T  4773 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagaggggtctgaaaaaaaggatttagaa-gtaagcaacaaa-ctagggtttatatagcgtt 4870  T
Q  134 tgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttag 233  Q
    | |||||  | |||||||||||| ||| |||  ||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||| | | |||||||||||  |||| |    
T  4871 t-tctctcagcaacaaacactagagtt-gagt-ttgattcatgttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcatgagaagagattgaagcttttg 4967  T
Q  234 atagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacag 332  Q
     |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||  ||   |||||||| || |||    
T  4968 gtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctctttttgtaaagatactcatcattatagtggaacatagaactgctctctgccccag 5067  T
Q  333 actaggtcaat-ttggaccgaa 353  Q
    ||||||||| | ||||||||||    
T  5068 actaggtcagtattggaccgaa 5089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 4)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 182 - 353
Target Start/End: Original strand, 22222 - 22391
Alignment:
Q  182 aaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctctt 280  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| || |||| |||||| ||||| ||||||| |||| |    
T  22222 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaactcattgatttctc-t 22319  T
Q  281 ttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||| |||| ||||||  |||||| | || |||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  22320 ttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaa 22391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 182 - 353
Target Start/End: Original strand, 24497 - 24666
Alignment:
Q  182 aaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttagatagaattaggtgggagacttattctagtaacccattgatatctctt 280  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| || |||| |||||| ||||| ||||||| |||| |    
T  24497 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaactcattgatttctc-t 24594  T
Q  281 ttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||||| |||| ||||||  |||||| | || |||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  24595 ttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaa 24666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 22135 - 22206
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 72  Q
    |||||||||||  | |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22135 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggaga 22206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 24410 - 24481
Alignment:
Q  1 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 72  Q
    |||||||||||  | |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24410 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggaga 24481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 57614 - 57452
Alignment:
Q  181 aaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt-gagactttagatagaattaggtggga-gacttattctagtaacccattgatatctc 278  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||| |  |||||||||| | |||||| | | |||||||||  || ||  |||||| ||||||| |||||||||     
T  57614 aaaacactattaggattgaatctcttggtcattggaagagattcgggactttgggtggaattaggtttgaagatctattcttgtaaccctttgatatcta 57515  T
Q  279 ttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacgaagggttgctctctcccacagactaggtca 341  Q
    ||||||||||||| |||| | |||| || |||  || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  57514 ttttgtaaagttactcattaatataatggaacagagagctgctctctcccccagactaggtca 57452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0891 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0891
Description:

Target: scaffold0891; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 313 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 4731 - 4691
Alignment:
Q  313 agggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaa 353  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4731 agggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 4691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 220
Target Start/End: Original strand, 224802 - 224857
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttgga--aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 220  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  224802 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 224857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 167 - 220
Target Start/End: Original strand, 16308 - 16363
Alignment:
Q  167 ttgattcaccttggaaaa--cactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 220  Q
    ||||||||||||| | ||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16308 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 16363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University