View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8991_low_3 (Length: 1030)

Name: NF8991_low_3
Description: NF8991
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8991_low_3
NF8991_low_3
[»] chr8 (11 HSPs)
chr8 (1-1012)||(7037349-7038360)
chr8 (1-1012)||(7031640-7032666)
chr8 (698-1007)||(7073673-7073982)
chr8 (609-1012)||(7024883-7025286)
chr8 (1-287)||(7024256-7024542)
chr8 (1-284)||(7074348-7074631)
chr8 (434-572)||(7074093-7074231)
chr8 (439-590)||(7024732-7024883)
chr8 (307-368)||(7024547-7024608)
chr8 (848-965)||(7067344-7067461)
chr8 (118-210)||(7067850-7067942)
[»] chr4 (2 HSPs)
chr4 (846-902)||(3965225-3965281)
chr4 (846-902)||(4017032-4017088)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 940; Significance: 0; HSPs: 11)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 940; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 1012
Target Start/End: Original strand, 7037349 - 7038360
Alignment:
Q  1 atggcaatcagattatctgaaattaaggagctgcagttaagccctcgtgtatttgccaagatgagcaaattgaaatttttggatatttacactaaggagt 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |    
T  7037349 atggctatcagattatctgaaattaaggagctgcatttaagccctcgtgtatttgctaagatgagcaaattgaaatttttggatatttacactaatgttt 7037448  T
Q  101 ctaaaaatgaaggacgtttgactcttcctcgagggcttgaatttttgcctaacgaactgagatatcttcgttgggagtattaccctttggaatccttacc 200  Q
    || | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7037449 cttataatgaaggatgtttgtctcttcctcgagggcttgaatttttgcctaacgaactgagatatcttcgttgggagtattaccctttggaatccttacc 7037548  T
Q  201 atccaagttttctgcagaaaaccttgttagattgagcttgccttatagccgattgaagaaactttggcatggagtgaaggtaagtaacactatatatagt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7037549 atccaagttttctgcagaaaaccttgttagattgagcttgccttatagccgattgaagaaactttggcatggagtgaaggtaagtaacactatatatagt 7037648  T
Q  301 ctaaagtatatttttagtctagtgacttatggttcccgaaaaacttgtcgcattttgatcctttattataactaaaaacgtgtcaacatcattctaaagc 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7037649 ctaaagtatatttttagtctagtgacttatggttcccgaaaaacttgtcgcattttgatcctttattataactaaaaacgtgtcaacatcattctaaagc 7037748  T
Q  401 caactctgtcggtcagagagcctctgtattaacttttagttgcaagttaaatgtgcttcaatagttgaaagcaattattcctactcccaaaattcaagag 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7037749 caactctgtcggtcagagagcctctgtatgaacttttagttgcaagttaaatgtgcttcaatagttgaaagcaattattcctactcccaaaattcaagag 7037848  T
Q  501 tttctttatatgctctctgactcgtgtagttcactacaaataaagatcaaaggtgacacgtatttagaaatgaaggatcaatataagacccataaaaggg 600  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7037849 tttctttatatgctctctgactcgtgtagttcgctacaaataaagatcaaaggtgacacgtatttagaaatgaaggatcaatataagacccataaaaggg 7037948  T
Q  601 attcaaagcaaaaatgatattttgaaggacctaagacatatttaaacaatatatattccaacataagcacttagttaaatccagattcaattggctgaca 700  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7037949 attcaaagcaaaaatgatattttgaaggacctaagacatatttaaacaatatatattccaacataagcacttagttaaatccagattcaattggctgaca 7038048  T
Q  701 agtcttgtcttgattggttctaaatgaaacaggatcttgtgaatttgaatgtccttatactccattcatccacactcctaacagagctaccagacttttc 800  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7038049 agtcttgtcttgattggttctaaatgaaacaggatcttgtgaatttgaatgtccttatactccattcatccacactcctaacagagctaccagacttttc 7038148  T
Q  801 aaaggccacaagtctcgcagtcttggacctccaattctgtgtagggttgactagtgttcatccatctgttttctctctcaaaaatcttgagaaattggat 900  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7038149 aaaggccacaagtctcgcagtcttggacctccaattctgtgtagggttgactagtgttcatccatctgttttctctctcaaaaatcttgagaaactggat 7038248  T
Q  901 ctgagtggatgcagttccctgaaaagccttcaaagcaatactcatttaagttcccttagttatctctccctctacaactgcacagcactgaaggaattct 1000  Q
     |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7038249 ttgagtggatgcatttcccttacaagccttcaaagcaatactcatttaagttcccttagttatctctccctctacaactgcacagcactgaaggaattct 7038348  T
Q  1001 cggtgacttcaa 1012  Q
    | ||||||||||    
T  7038349 cagtgacttcaa 7038360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 443; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 1012
Target Start/End: Original strand, 7031640 - 7032666
Alignment:
Q  1 atggcaatcagattatctgaaattaaggagctgcagttaagccctcgtgtatttgccaagatgagcaaattgaaatttttggatatttacactaaggagt 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |    
T  7031640 atggccatcagattatctgaaattaaggagctgcacttaagccctcgtgtatttgcgaagatgagcaaattgaaatttttggatatttacaccaacggat 7031739  T
Q  101 ctaaaaatgaaggacgtttgactcttcctcgagggcttgaatttttgcctaacgaactgagatatcttcgttgggagtattaccctttggaatccttacc 200  Q
    || | ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7031740 ctcagaatgaaggaaggttgtctcttcctcgagggcttgaatttttgcctaacgaactgagatatcttcgttgggagtattaccctttggaatccttacc 7031839  T
Q  201 atccaagttttctgcagaaaaccttgttagattgagcttgccttatagccgattgaagaaactttggcatggagtgaaggtaagtaacactatatatagt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  7031840 atccaagttttctgcagaaaaccttgttagattgagcttgccttatagccgattgaaaaaactttggaatggagtgaaggtaagtaa---tatatatagt 7031936  T
Q  301 ctaaagtatatttttagtctagtgacttatggttcccgaaaaacttgtcgcattttgatcctttattataactaaaaacgtgtcaacatcattctaaagc 400  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||  ||||||   ||| | |||||||||||| ||| ||| |||  |||    
T  7031937 ctaaaatatatttttagtctagtcacttttggttccccaaaaacttgtcacattcggatcct---ttaaatctaaaaacgtgtaaacttcagtctgtagc 7032033  T
Q  401 caactctgtcggtcagagagcctctg-------tattaacttttagttgcaagttaaatgtgcttcaatagttgaaagcaattattcctactcccaaaat 493  Q
     ||||  || ||||| ||||||  ||       ||| || |||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||   |||||||    
T  7032034 taacttggtgggtcaaagagccagtgtaaaacctatcaaattttagttccaagttaaatgtgcttgaatgattgaaagcaattatttctatcaccaaaat 7032133  T
Q  494 tcaagagtttctttatatgctctctgactc-------gtgtagttcactacaaataaagatcaaag-gtgacacgtatttagaaatgaaggatcaatata 585  Q
    ||||  | || ||||||| |||||||||||        || ||||| ||| ||||||||| |||||  ||||||  ||||||||||||| || | |||||    
T  7032134 tcaattgcttttttatatcctctctgactcacgtagtttgcagttcgctagaaataaagaccaaagcttgacacacatttagaaatgaaagaccgatata 7032233  T
Q  586 agacccataaa----agggattcaaagcaaaaatgatattttgaaggacctaagacatatttaaaca--atatatattccaacataagcacttagttaaa 679  Q
     ||| |  |||    ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||| |  ||| ||    
T  7032234 ggactcgaaaaaattagggattaaaagcaaaaatgatatttttaagtaccaaagacatgtttaaacaatatatatattccagcataagcattctgtt-aa 7032332  T
Q  680 tccagattcaattggctgacaagtcttgtcttgattggttctaaatgaaacaggatcttgtgaatttgaatgtccttatactccattcatccacactcct 779  Q
    | ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||    
T  7032333 ttcagattcaattggctcacaaatcttgtcttggttggttctaaatgtaacaggatattgtgaatttgaatgtccttatactctcgtcatccacattcct 7032432  T
Q  780 aacagagctaccagacttttcaaaggccacaagtctcgcagtcttggacctccaattctgtgtagggttgactagtgttcatccatctgttttctctctc 879  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||  |  |||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||    
T  7032433 aacagaactaccagacttttcaaaggccgcaagtcttgaagttataaacctccgactctgtgtagggttgactagtgtccatccatctgttt--tgtctc 7032530  T
Q  880 aaaaatcttgagaaattggatctgagtggatgcagttccctgaaaagccttcaaagcaat---actcatttaagttcccttagttatctctccctctaca 976  Q
    ||||| ||  || || |||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||   || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7032531 aaaaagctcaaggaactggatctgagtggatgcatttcccttacgagccttcaaagcaatgacacccatttaagttcccttaggtatctctccctctaca 7032630  T
Q  977 actgcacagcactgaaggaattctcggtgacttcaa 1012  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||||| ||||    
T  7032631 actgcacatcagtgaaggaattctcagtgacctcaa 7032666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 242; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 698 - 1007
Target Start/End: Complemental strand, 7073982 - 7073673
Alignment:
Q  698 acaagtcttgtcttgattggttctaaatgaaacaggatcttgtgaatttgaatgtccttatactccattcatccacactcctaacagagctaccagactt 797  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  7073982 acaattcttgtcttggttggttataaatgtaacaggatattgtgaatttgaatgtccttatactctcttcatccgcacttctaacggagctaccagactt 7073883  T
Q  798 ttcaaaggccacaagtctcgcagtcttggacctccaattctgtgtagggttgactagtgttcatccatctgttttctctctcaaaaatcttgagaaattg 897  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7073882 ttcaaaggccacaaatcttgcagtattggacctccaatcttgtgtagggttgactagtgtccatccatctgttttctctctcaaaaatcttgagaaattg 7073783  T
Q  898 gatctgagtggatgcagttccctgaaaagccttcaaagcaatactcatttaagttcccttagttatctctccctctacaactgcacagcactgaaggaat 997  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7073782 gatctgagtggatgcagttccctgaaaagccttcaaagcaatactcatttaagttcccttagttatctctccctctacaactgcacagcactgaaggaat 7073683  T
Q  998 tctcggtgac 1007  Q
    |||| |||||    
T  7073682 tctcagtgac 7073673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 609 - 1012
Target Start/End: Original strand, 7024883 - 7025286
Alignment:
Q  609 caaaaatgatattttgaaggacctaagacatatttaaacaatatatattccaacataagcacttagttaaatccagattcaattggctgacaagtcttgt 708  Q
    |||||||||||||| ||| |||  || |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||   | ||||||  |||||||||||| | ||| || ||||    
T  7024883 caaaaatgatatttcgaacgactaaaaacatatttaaactatatatattccagcattagcatgcaattaaatttagattcaattggttcacatgttttgt 7024982  T
Q  709 cttgattggttctaaatgaaacaggatcttgtgaatttgaatgtccttatactccattcatccacactcctaacagagctaccagacttttcaaaggcca 808  Q
     |||  |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  7024983 gttggctaattctaaatggaacaggatcttgtgaatttgaatgaccttatactccattcatccacacttttaacagagctaccagatctttcaaaggcca 7025082  T
Q  809 caagtctcgcagtcttggacctccaattctgtgtagggttgactagtgttcatccatctgttttctctctcaaaaatcttgagaaattggatctgagtgg 908  Q
    ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||    
T  7025083 caagtcttgcagtaatggacctccaattctgtgtagggttgactagtgtccatccatctgttttctctctgaaaaagcttaagaaactggatctgagtgg 7025182  T
Q  909 atgcagttccctgaaaagccttcaaagcaatactcatttaagttcccttagttatctctccctctacaactgcacagcactgaaggaattctcggtgact 1008  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||||||||| || ||||  ||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||     
T  7025183 atgcatttcccttacaagccttcaaagcaatacccaattaatctcccttagtgatctctccctctacaattgtacatcactgaaggaattctcagtgacc 7025282  T
Q  1009 tcaa 1012  Q
    ||||    
T  7025283 tcaa 7025286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 7024256 - 7024542
Alignment:
Q  1 atggcaatcagattatctgaaattaaggagctgcagttaagccctcgtgtatttgccaagatgagcaaattgaaatttttggatatttacactaaggagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  7024256 atggcaatcagattatctgaaattaaggagctgcagttaagccctcaagtatttgccaagacgagcaaattgaaatttttggatatttacaccaagaggt 7024355  T
Q  101 ctaaaaatgaaggacgtttgactcttcctcgagggcttgaatttttgcctaacgaactgagatatcttcgttgggagtattaccctttggaatccttacc 200  Q
    || ||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  7024356 ctcaaaatgaagggagtttgtctcttcctggagggcttgagttcttgcctaatgaattgagatatcttcgttgggagtactaccctttgaaatccttgcc 7024455  T
Q  201 atccaagttttctgcagaaaaccttgttagattgagcttgccttatagccgattgaagaaactttggcatggagtgaaggtaagtaa 287  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7024456 atccatgttttctgctgaaaaccttattacattgtgcttgccatatagccgattgaataaactttggcatggagagaaggtaagtaa 7024542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 7074631 - 7074348
Alignment:
Q  1 atggcaatcagattatctgaaattaaggagctgcagttaagccctcgtgtatttgccaagatgagcaaattgaaatttttggatatttacactaaggagt 100  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||    
T  7074631 atggccatcagactatctgaaattaaggagctggagttgagccctcaagcatttgccaagatgagcaaattgaaatttttggatatttatacaaaggggt 7074532  T
Q  101 ctaaaaatgaaggacgtttgactcttcctcgagggcttgaatttttgcctaacgaactgagatatcttcgttgggagtattaccctttggaatccttacc 200  Q
    || ||||||||||  ||||| ||||||||| |||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  7074531 ctcaaaatgaagggagtttgtctcttcctcaagggctcgaatccttgcctaatgaactgagatatcttcgttgggagtattaccctttggaattcttgcc 7074432  T
Q  201 atccaagttttctgcagaaaaccttgttagattgagcttgccttatagccgattgaagaaactttggcatggagtgaaggtaag 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  7074431 atccaagttttctgcagaaaaccttgttatattgaacctgccttatagccgattgaaaaaactttggcatggagcgaaggtaag 7074348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 434 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 7074231 - 7074093
Alignment:
Q  434 ttttagttgcaagttaaatgtgcttcaatagttgaaagcaattattcctactcccaaaattcaagagtttctttatatgctctctgactcgtgtagttca 533  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||  | |||||||||||||||||| | ||||||      
T  7074231 ttttagttggaagttaaatgtgcttgaagggttgaaagcaattatttctaccaccaaaattcaatagcatttttatatgctctctgactggcgtagtttg 7074132  T
Q  534 ctacaaataaagatcaaaggtgacacgtatttagaaatg 572  Q
    ||| ||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||    
T  7074131 ctataaataaagaccaaagttgatacatatttagaaatg 7074093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 439 - 590
Target Start/End: Original strand, 7024732 - 7024883
Alignment:
Q  439 gttgcaagttaaatgtgcttcaatagttgaaagcaattattcctactcccaaaattcaagagtttctttatatgctctctgactcgtgtagttcactaca 538  Q
    |||| |||||||||||| || ||| |||||||| ||| ||| ||||  |||| |||||  || || || ||||||||||||||| | ||||||  ||| |    
T  7024732 gttgtaagttaaatgtggttgaatggttgaaagaaatgatttctacctccaagattcagtagctttttcatatgctctctgactggcgtagttggctata 7024831  T
Q  539 aataaagatcaaaggtgacacgtatttagaaatgaaggatcaatataagacc 590  Q
    || |||||  |||| |||| | ||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  7024832 aacaaagactaaagttgactcatatttagaaataaaggaccaatatgagacc 7024883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 307 - 368
Target Start/End: Original strand, 7024547 - 7024608
Alignment:
Q  307 tatatttttagtctagtgacttatggttcccgaaaaacttgtcgcattttgatcctttatta 368  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  7024547 tatatttttagtctaggcacttttggttcccaaaaaatttgtcacattttgatccttaatta 7024608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 848 - 965
Target Start/End: Complemental strand, 7067461 - 7067344
Alignment:
Q  848 tgactagtgttcatccatctgttttctctctcaaaaatcttgagaaattggatctgagtggatgcagttccctgaaaagccttcaaagcaatactcattt 947  Q
    |||||||| | || |||||||| || ||||| || || |||||||||||||||||  |||||||   |||||| | ||||||  ||||||| | ||||||    
T  7067461 tgactagtatacacccatctgtattttctctgaacaagcttgagaaattggatctaggtggatgtttttccctcacaagcctcaaaagcaacattcattt 7067362  T
Q  948 aagttcccttagttatct 965  Q
    ||| |||||| |||||||    
T  7067361 aagctcccttcgttatct 7067344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 118 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 7067942 - 7067850
Alignment:
Q  118 ttgactcttcctcgagggcttgaatttttgcctaacgaactgagatatcttcgttgggagtattaccctttggaatccttaccatccaagttt 210  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||| ||||||  | ||||| ||||||||||||||||  |||||||| || || || |||||||| ||||||    
T  7067942 ttgaatcttcctcaagggcttaaatctttgccagatgaactcagatatcttcgttgggcatattaccccttagagtctttaccatctaagttt 7067850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 41; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 2)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 846 - 902
Target Start/End: Original strand, 3965225 - 3965281
Alignment:
Q  846 gttgactagtgttcatccatctgttttctctctcaaaaatcttgagaaattggatct 902  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  3965225 gttgactagtgtgcatccatctattttctctctagaaaatcttgagaaattggatct 3965281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 846 - 902
Target Start/End: Complemental strand, 4017088 - 4017032
Alignment:
Q  846 gttgactagtgttcatccatctgttttctctctcaaaaatcttgagaaattggatct 902  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| |||||  |||| |||||||||||||||||    
T  4017088 gttgactagtgtgcatccatctattttgtctcttgaaaagcttgagaaattggatct 4017032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University