View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8993_high_2 (Length: 544)

Name: NF8993_high_2
Description: NF8993
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8993_high_2
NF8993_high_2
[»] chr8 (13 HSPs)
chr8 (69-530)||(6350654-6351115)
chr8 (75-511)||(6287140-6287558)
chr8 (230-531)||(6361700-6362001)
chr8 (230-526)||(6273026-6273322)
chr8 (167-530)||(7457490-7457856)
chr8 (229-499)||(6330366-6330636)
chr8 (235-527)||(6319910-6320202)
chr8 (230-530)||(7469958-7470258)
chr8 (130-531)||(6422626-6423033)
chr8 (232-491)||(6389459-6389718)
chr8 (232-482)||(6408708-6408958)
chr8 (13-70)||(6350546-6350603)
chr8 (208-472)||(6368453-6368717)
[»] chr2 (1 HSPs)
chr2 (233-310)||(42691749-42691826)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 458; Significance: 0; HSPs: 13)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 458; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 69 - 530
Target Start/End: Original strand, 6350654 - 6351115
Alignment:
Q  69 tgttacaaggtacaaacagacacaataattcttattgatgtaaagtaaaacattaacaataaaacaaacatacataataacatgatcgtaagtaggaagt 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6350654 tgttacaaggtacaaacagacacaataattcttattgatgtaaagtaaaacattaacaataaaacaaacatacataataacatgatcgtaagtaggaagt 6350753  T
Q  169 gagggaatggaattccttcacatctgttattcaaagcagcaacacaacaaccatgatccactttagatggagatactattaggaatgcctcggcaagtca 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6350754 gagggaatggaattccttcacatctgttattcaaagcagcaacacaacaaccatgatccactttagatggagatactattaggaatgcctcggcaagtca 6350853  T
Q  269 atccttcctcactagaaggataaagtagagtatatggcatcttcactggtccgtaccgatttctcaatgtctcatcattgttcctttgagttagtttctg 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6350854 atccttcctcactagaaggataaagtagagtatatggcatcttcactggtccgtaccgatttctcaatgtctcatcattgttcctttgagtgagtttctg 6350953  T
Q  369 ttcaatttcagccaacttctttccaaacctcttgaaggcttcttttggttgtgaatctgaagtccaattgtcaccttcaattctatctccaaggtattgc 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6350954 ttcaatttcagccaacttctttccaaacctcttgaaggcttcttttggttgtgaatctgaagtccaattgtcaccttcaattctatctccaaggtattgc 6351053  T
Q  469 tcatcagaagcatgccttgacaagacctctataatggtcaagtcagtaagtgtatcattctt 530  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6351054 tcatcagaagcatgccttgacaagacctctataatggtcaagtcagtaagtgtatcattctt 6351115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 75 - 511
Target Start/End: Original strand, 6287140 - 6287558
Alignment:
Q  75 aaggtacaaacagacacaataattcttattgatgtaaagtaaaacattaacaataaaacaaacatacataataacatgatcgtaagtaggaagtgaggga 174  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||                   |||||| ||||||||    
T  6287140 aaggtacaaaaagacacaatagttcttattgattttaagtaaaacattaacaataaaacaaccatag------------------gtaggaggtgaggga 6287221  T
Q  175 atggaattccttcacatctgttattcaaagcagcaacacaacaaccatgatccactttagatggagatactattaggaatgcctcggcaagtcaatcctt 274  Q
    || ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  6287222 atagaattccgtctcgtctgttattcaaagcagcaacacaataaccatgacccaatttagatggagatactattgggaatgcctctgcaagtcaatcctt 6287321  T
Q  275 cctcactagaaggataaagtagagtatatggcatcttcactggtccgtaccgatttctcaatgtctcatcattgttcctttgagttagtttctgttcaat 374  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| |  |||||    
T  6287322 cctcactagaaggataaagcaaagtatatggcatcttcactggtccataacgattcctcagtgtctcatcgttgttcctttgagtgagttttttctcaat 6287421  T
Q  375 ttcagccaacttctttccaaacctcttgaaggcttcttttggttgtgaatctgaagtccaattgtcaccttcaattctatctccaaggtattgctcatca 474  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  6287422 ttcagccagcttctttccaaacctcttgaaagcctcttttggttgtgaatcagaagtccaattatcaccttcaattctctgtccaaggtattgttcatca 6287521  T
Q  475 gaagcatgccttgacaagacctctataatggtcaagt 511  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||    
T  6287522 gaagcatgtcttgacaagacttctataacagtcaagt 6287558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 230 - 531
Target Start/End: Original strand, 6361700 - 6362001
Alignment:
Q  230 tttagatggagatactattaggaatgcctcggcaagtcaatccttcctcactagaaggataaagtagagtatatggcatcttcactggtccgtaccgatt 329  Q
    ||||||| |||| ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||  |||||    
T  6361700 tttagatagagacactgttgggaatgcctctgcaagtcaatccttcctcactagaaggataaagcagagtgtaaggcatcttcactggtccgttacgatt 6361799  T
Q  330 tctcaatgtctcatcattgttcctttgagttagtttctgttcaatttcagccaacttctttccaaacctcttgaaggcttcttttggttgtgaatctgaa 429  Q
     |||| |||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||| |||    
T  6361800 cctcagtgtctcatcattgttcctttgaatgagtttttgctcaatttcagccaacttctttccaaacctcttaaaggactcttttggctgtgaatcagaa 6361899  T
Q  430 gtccaattgtcaccttcaattctatctccaaggtattgctcatcagaagcatgccttgacaagacctctataatggtcaagtcagtaagtgtatcattct 529  Q
    |||||    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6361900 gtccagagatcaccttcaattctctctccaaggtattgctcatcagaagcatgccttgacaagacttctataatggtcaagtcagtaagagtatcattct 6361999  T
Q  530 tg 531  Q
    ||    
T  6362000 tg 6362001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 230 - 526
Target Start/End: Original strand, 6273026 - 6273322
Alignment:
Q  230 tttagatggagatactattaggaatgcctcggcaagtcaatccttcctcactagaaggataaagtagagtatatggcatcttcactggtccgtaccgatt 329  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  6273026 tttagatggagatactgttaggaatgcctctgcaagtcaatccttcctcactagaaggataaagcaaagtatacggcatcttcactggtccatatcgatt 6273125  T
Q  330 tctcaatgtctcatcattgttcctttgagttagtttctgttcaatttcagccaacttctttccaaacctcttgaaggcttcttttggttgtgaatctgaa 429  Q
     || |  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || |||||||| || |||  |||||||||||| |||    
T  6273126 ccttagagtctcatcattgttcctttgagtgagtttttgttcaatttcagccaactttgttccgaatctcttgaaagcctctaatggttgtgaatcagaa 6273225  T
Q  430 gtccaattgtcaccttcaattctatctccaaggtattgctcatcagaagcatgccttgacaagacctctataatggtcaagtcagtaagtgtatcat 526  Q
    ||||||   |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  6273226 gtccaaagatcaccttcaattctctgtccaaggtattgttcatcagaagcatgtcttgacaagacctctataatggtcaagtcagttagtgtgtcat 6273322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 167 - 530
Target Start/End: Original strand, 7457490 - 7457856
Alignment:
Q  167 gtgagggaatggaattccttcacatctgttattcaaagcagcaacacaacaaccatgatc-cacttt--agatggagatactattaggaatgcctcggca 263  Q
    |||||||||| | |||||||| ||||  ||||| |||||| |||||||||||| | |||  || |||  ||||||||| ||| || |||||||||| | |    
T  7457490 gtgagggaattggattccttctcatcgattatttaaagcaacaacacaacaacgacgatgacattttttagatggagacactgttgggaatgcctctgga 7457589  T
Q  264 agtcaatccttcctcactagaaggataaagtagagtatatggcatcttcactggtccgtaccgatttctcaatgtctcatcattgttcctttgagttagt 363  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |  ||||| |||| |||||||||||||||||||||| | ||     
T  7457590 agtcaatccttcctcactagtaggataaagcagtgtatatggcatcttcacaggtccatttcgattcctcagtgtctcatcattgttcctttgaatgagg 7457689  T
Q  364 ttctgttcaatttcagccaacttctttccaaacctcttgaaggcttcttttggttgtgaatctgaagtccaattgtcaccttcaattctatctccaaggt 463  Q
    || |  || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||    |||||||||||||| ||||||||||    
T  7457690 tttttctcgatttcagccaacttctttccaaacttcttgtaggcctgttttggttgtgaatcagaagtccagagatcaccttcaattctctctccaaggt 7457789  T
Q  464 attgctcatcagaagcatgccttgacaagacctctataatggtcaagtcagtaagtgtatcattctt 530  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||    
T  7457790 attgttcatcagaagcatgccttgacaagacctctaagatggtcaagttagtaagggtatcattctt 7457856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 229 - 499
Target Start/End: Original strand, 6330366 - 6330636
Alignment:
Q  229 ctttagatggagatactattaggaatgcctcggcaagtcaatccttcctcactagaaggataaagtagagtatatggcatcttcactggtccgtaccgat 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| || |    
T  6330366 ctttagatggagatactattaggaatgcctctgcaagtcaatcctttctcactagaaggataaagcagagtgtatggcatattcacaggcccgtatcggt 6330465  T
Q  329 ttctcaatgtctcatcattgttcctttgagttagtttctgttcaatttcagccaacttctttccaaacctcttgaaggcttcttttggttgtgaatctga 428  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| | | || ||    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||    
T  6330466 ttctcaatgactcatcattgttcctttcaatgagctttacctcaatttcagccaacttccttccaaacctcttgaaagcttctaatggctgtgaatctga 6330565  T
Q  429 agtccaattgtcaccttcaattctatctccaaggtattgctcatcagaagcatgccttgacaagacctcta 499  Q
    |||||||   || |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6330566 agtccaaacctcgccttcatttctctgtccaaggtattgctcatcagaagcatgccttgataagacctcta 6330636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 235 - 527
Target Start/End: Original strand, 6319910 - 6320202
Alignment:
Q  235 atggagatactattaggaatgcctcggcaagtcaatccttcctcactagaaggataaagtagagtatatggcatcttcactggtccgtaccgatttctca 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| || |||||||    
T  6319910 atggagatactattaggaatgcctctgccagtcaatccttcctcactagaaggataaagcagagtgtatggcatcttcacaggcccgtatcggtttctca 6320009  T
Q  335 atgtctcatcattgttcctttgagttagtttctgttcaatttcagccaacttctttccaaacctcttgaaggcttcttttggttgtgaatctgaagtcca 434  Q
    ||| |||||||||||||||||   | || ||    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||  |||||||    
T  6320010 atgactcatcattgttccttttgatgagctttgcctcaatttcagccaacttccttccaaacctcttgaaagcttctaatggctgtgaatcaaaagtcca 6320109  T
Q  435 attgtcaccttcaattctatctccaaggtattgctcatcagaagcatgccttgacaagacctctataatggtcaagtcagtaagtgtatcatt 527  Q
    |   ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||| || ||||||||    
T  6320110 agcctcaccttcatttctctgtccaaggtattgctcatcagaagcatgccttgacaagacctctatgattgtaaggtcagttagggtatcatt 6320202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 230 - 530
Target Start/End: Original strand, 7469958 - 7470258
Alignment:
Q  230 tttagatggagatactattaggaatgcctcggcaagtcaatccttcctcactagaaggataaagtagagtatatggcatcttcactggtccgtaccgatt 329  Q
    ||||||| |||| ||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||| |  |||||    
T  7469958 tttagatagagacactgttgggaatgcctctggaagtcaatccttcctcactagtaggataaagcagtgtatatgacatcttcacaggtccatttcgatt 7470057  T
Q  330 tctcaatgtctcatcattgttcctttgagttagtttctgttcaatttcagccaacttctttccaaacctcttgaaggcttcttttggttgtgaatctgaa 429  Q
     |||| |||||||||||||||||||||| | || || |  |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| | |||||| |||||||| |||    
T  7470058 cctcagtgtctcatcattgttcctttgaatgaggtttttctcaatttcagacaacttctttccaaacttcttgtaggcctgttttggctgtgaatcagaa 7470157  T
Q  430 gtccaattgtcaccttcaattctatctccaaggtattgctcatcagaagcatgccttgacaagacctctataatggtcaagtcagtaagtgtatcattct 529  Q
    |||||    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  7470158 gtccagagatcaccttcaattctctctccaaggtattgttcatcagaagcatgccttgacaagacctctaagatggtcaagttagtaagggtatcattct 7470257  T
Q  530 t 530  Q
    |    
T  7470258 t 7470258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 130 - 531
Target Start/End: Original strand, 6422626 - 6423033
Alignment:
Q  130 aaacaaacatacataataacatgatcgtaagtaggaag-tgagggaatggaattccttcacatctgttattcaaagcagcaa----cacaacaa-ccatg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||||||| | |||||||| ||||  ||||||| |||| |||    |||||||| |||||    
T  6422626 aaacaaacatacataataacatgaccatacataggaggatgagggaattggattccttctcatcaattattcatagcaacaaacaacacaacaaaccatg 6422725  T
Q  224 atccactttagatggagatactattaggaatgcctcggcaagtcaatccttcctcactagaaggataaagtagagtatatggcatcttcactggtccgta 323  Q
    |     | |||||||| | ||| || |||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||    
T  6422726 acattttctagatggaaacactgttgggaatgcctctgaaagtcaatccttcttcactagaaggataaagcagagtgtatggcatcttcacaggcccgta 6422825  T
Q  324 ccgatttctcaatgtctcatcattgttcctttgagttagtttctgttcaatttcagccaacttctttccaaacctcttgaaggcttcttttggttgtgaa 423  Q
     || |||||||||| ||| |||  |||||||| |  ||| || |  |||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||| |||||||| |||| |    
T  6422826 tcggtttctcaatgactcgtcagcgttccttttaactagcttttcctcaatttcagccaacttccttgcaaacttcttgtaggcctcttttggctgtgca 6422925  T
Q  424 tctgaagtccaattgtcaccttcaattctatctccaaggtattgctcatcagaagcatgccttgacaagacctctataatggtcaagtcagtaagtgtat 523  Q
    || |||||||||   |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | ||| ||||| ||||    
T  6422926 tcagaagtccaaagatcaccttcgattctctccccaaggtattgctcatcagaagcatgccttgacaagacttcaataatggtaaggtctgtaagggtat 6423025  T
Q  524 cattcttg 531  Q
    || |||||    
T  6423026 cactcttg 6423033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 232 - 491
Target Start/End: Original strand, 6389459 - 6389718
Alignment:
Q  232 tagatggagatactattaggaatgcctcggcaagtcaatccttcctcactagaaggataaagtagagtatatggcatcttcactggtccgtaccgatttc 331  Q
    |||||||||| ||| || |||||||||| | |||||||||||  |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||| || | ||  ||||    
T  6389459 tagatggagacactgttgggaatgcctctgaaagtcaatcctggctcacttgaaggatagagcacagtgtatggcatcttcactggcccattcctgtttc 6389558  T
Q  332 tcaatgtctcatcattgttcctttgagttagtttctgttcaatttcagccaacttctttccaaacctcttgaaggcttcttttggttgtgaatctgaagt 431  Q
    ||||||  ||||| |||||||||| | | || || || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||| | ||||||  ||||    
T  6389559 tcaatgattcatcgttgttcctttcaatgagcttttgctcaatttcagccaacttctttccaaacttcttgaaggcctctactggctctgaatcgtaagt 6389658  T
Q  432 ccaattgtcaccttcaattctatctccaaggtattgctcatcagaagcatgccttgacaa 491  Q
    ||||   |||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||    
T  6389659 ccaaagatcaccttcgattctgtgtccaatgtattgctcatcagaaacatgtgttgacaa 6389718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 232 - 482
Target Start/End: Original strand, 6408708 - 6408958
Alignment:
Q  232 tagatggagatactattaggaatgcctcggcaagtcaatccttcctcactagaaggataaagtagagtatatggcatcttcactggtccgtaccgatttc 331  Q
    |||||||||| ||| || |||||||||| | |||||||||||  |||||| |||||||| || | ||| |||||||||||||| || || | ||  ||||    
T  6408708 tagatggagacactgttgggaatgcctctgaaagtcaatcctggctcacttgaaggatagagcacagtgtatggcatcttcacaggcccattcctgtttc 6408807  T
Q  332 tcaatgtctcatcattgttcctttgagttagtttctgttcaatttcagccaacttctttccaaacctcttgaaggcttcttttggttgtgaatctgaagt 431  Q
    ||||||  ||||| |||||||||| | | || || || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||| | ||||||  ||||    
T  6408808 tcaatgattcatcgttgttcctttcaatgagcttttgctcaatttcagccaacttctttccaaacttcttgaaggcctctactggctctgaatcgtaagt 6408907  T
Q  432 ccaattgtcaccttcaattctatctccaaggtattgctcatcagaagcatg 482  Q
    ||||   |||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  6408908 ccaaagatcaccttcgattctgtgtccaatgtattgctcatcagaaacatg 6408958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 70
Target Start/End: Original strand, 6350546 - 6350603
Alignment:
Q  13 cagagagaattgaggaaaaactcaattgataccatatttgaaccatatgagacaattg 70  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6350546 cagagagaattgaggaaaaactcagttgataccatatttgaaccatatgagacaattg 6350603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 208 - 472
Target Start/End: Original strand, 6368453 - 6368717
Alignment:
Q  208 caacacaacaaccatgatccactttagatggagatactattaggaatgcctcggcaagtcaatccttcctcactagaaggataaagtagagtatatggca 307  Q
    |||||||||||||||| |    |||||||||||| ||| || ||||| |||| || ||||||||||    |||| ||||||||||| ||||| ||||| |    
T  6368453 caacacaacaaccatggtgttttttagatggagacactgttgggaatccctctgccagtcaatcctggtccactggaaggataaagaagagtgtatggaa 6368552  T
Q  308 tcttcactggtccgtaccgatttctcaatgtctcatcattgttcctttgagttagtttctgttcaatttcagccaacttctttccaaacctcttgaaggc 407  Q
     |||||| || || ||||  ||| |||||| ||||| ||||||||||||| | |  |  |  |||||||||  ||| |||||| ||||| | ||| ||||    
T  6368553 acttcacaggcccatacctgtttttcaatgactcattattgttcctttgaatgaactcttcctcaatttcaatcaatttctttgcaaactttttgtaggc 6368652  T
Q  408 ttcttttggttgtgaatctgaagtccaattgtcaccttcaattctatctccaaggtattgctcat 472  Q
    ||||  ||| | || ||| |||||||||   ||||||||| |||| | ||||||||||| |||||    
T  6368653 ttctactggctttggatcagaagtccaaagatcaccttcagttctttgtccaaggtattcctcat 6368717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000008; HSPs: 1)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 233 - 310
Target Start/End: Original strand, 42691749 - 42691826
Alignment:
Q  233 agatggagatactattaggaatgcctcggcaagtcaatccttcctcactagaaggataaagtagagtatatggcatct 310  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||   |||| | |||||||||||||||||||| ||| | |||||| |||||||    
T  42691749 agatagagatactattaggaattcctctaaaagttagtccttcctcactagaaggatgaagcaaagtataaggcatct 42691826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University