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Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8995_low_12 (Length: 663)

Name: NF8995_low_12
Description: NF8995
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8995_low_12
NF8995_low_12
[»] chr3 (1 HSPs)
chr3 (17-656)||(113366-114012)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 518; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 518; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 114012 - 113366
Alignment:
Q  17 aagattaggatgagggagagaatgaatccgaaaatgacgtaggaagagcgtgttttgcgtagctatatatgggaggctttaaaaaggtcatgttatgttc 116  Q
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T  114012 aagattaggatgagggagagaatgaatccgaaaatgacgtaggaagagcgtgttttgcgtagctat----gcgaggctttaaaaaggtcatgttatgttc 113917  T
Q  117 acatgtt----------------agttacacttacttatcaatagtaaaaaattgttctaaaatgagtattgttttatattttccttttaatttgtttta 200  Q
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T  113916 acatgtttactatactaataactagttacacttacttatcaatagtaaaaaattgttctaaaatgagtattgttttatattttcattttaatttgtttta 113817  T
Q  201 ttaaattctacctcaaattaatattataggtatcacttgcaagtttgttatacacttgctcataacaaatgtttatgatacactattatgcatttatata 300  Q
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T  113816 ttaaattctacctcaaattaatattataggtatcacttgcaagtttgttatacacttgctcataacaaatgtttatgatacactattatgcatttatata 113717  T
Q  301 tgatagttgttaacacaatgtaatgatttataaggataatattataaaattgttacacacttatttatttactattttctaaatttttatgatagaaaat 400  Q
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T  113716 tgatagttgttaacacaatg-----atttataaggataatattataaaattgttacacacttatttatttactattttctaaatttttatgatagaaaat 113622  T
Q  401 ttaattgtgacattgatataggatcaaatttgtaacatttaccatttatccaacacaactacgtggtaaagtataattacttcatcttagagaaatatgt 500  Q
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T  113621 ctaattgtaacattgatataggatcgaatttgtaacatttaccatttctccagcacaactacgtggtaaagtataattacttcatcttagagaaatatgt 113522  T
Q  501 gaccggattgtatctatgcgggtgacatctaaataagtttcttcatattcaacttcataatttcgtttgcaatcttcaatcacgagtcttactttaaaat 600  Q
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T  113521 gatcagattgtatctatgcgggtgacatctgaataagtttcttcatattcaacttcataatttcgtttgcaatcttcagtcacgagtcttgctttaaaat 113422  T
Q  601 ttccccaccactctattaaacattctctttagttttgtaatactactcaacaccaa 656  Q
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T  113421 ttccccaccactctattaaacattctctttagttttgtaatactactcaacaccaa 113366  T

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