View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8999_low_1 (Length: 843)

Name: NF8999_low_1
Description: NF8999
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8999_low_1
NF8999_low_1
[»] chr8 (46 HSPs)
chr8 (365-825)||(23147044-23147498)
chr8 (4-355)||(11383635-11383987)
chr8 (4-355)||(42435158-42435510)
chr8 (7-364)||(40221384-40221743)
chr8 (4-355)||(44353444-44353794)
chr8 (4-307)||(40328476-40328780)
chr8 (4-185)||(4283342-4283525)
chr8 (147-347)||(22976191-22976389)
chr8 (224-355)||(4283195-4283326)
chr8 (59-354)||(40585374-40585669)
chr8 (143-358)||(2999828-3000043)
chr8 (4-158)||(18655246-18655401)
chr8 (99-339)||(3846083-3846321)
chr8 (114-308)||(9633816-9634007)
chr8 (235-347)||(20686456-20686568)
chr8 (5-62)||(10930367-10930424)
chr8 (51-294)||(10020150-10020398)
chr8 (139-317)||(40535539-40535714)
chr8 (5-159)||(33655472-33655628)
chr8 (155-302)||(11136843-11136989)
chr8 (4-61)||(18141764-18141822)
chr8 (47-159)||(10240004-10240113)
chr8 (4-59)||(8965858-8965914)
chr8 (4-61)||(4731602-4731659)
chr8 (4-61)||(30291549-30291607)
chr8 (4-61)||(43036367-43036424)
chr8 (4-63)||(5689213-5689272)
chr8 (6-61)||(41365016-41365071)
chr8 (35-159)||(10101351-10101475)
chr8 (4-50)||(27811232-27811279)
chr8 (6-60)||(41366783-41366837)
chr8 (4-61)||(4743370-4743427)
chr8 (4-61)||(15212730-15212787)
chr8 (4-61)||(33352094-33352151)
chr8 (4-63)||(1345538-1345597)
chr8 (4-50)||(4162454-4162501)
chr8 (5-63)||(40321022-40321080)
chr8 (4-61)||(1746386-1746442)
chr8 (4-61)||(6598916-6598973)
chr8 (4-61)||(6674369-6674426)
chr8 (4-61)||(17982597-17982653)
chr8 (4-61)||(31218201-31218257)
chr8 (4-61)||(44303798-44303854)
chr8 (5-61)||(18106246-18106302)
chr8 (4-61)||(19491866-19491922)
chr8 (4-61)||(30143286-30143341)
[»] chr3 (55 HSPs)
chr3 (461-828)||(30033748-30034106)
chr3 (4-356)||(6095766-6096119)
chr3 (4-357)||(54593351-54593705)
chr3 (4-356)||(34490861-34491213)
chr3 (7-355)||(49199640-49199990)
chr3 (4-355)||(30235774-30236126)
chr3 (4-354)||(46860120-46860475)
chr3 (4-358)||(41819690-41820043)
chr3 (4-356)||(40912986-40913344)
chr3 (7-364)||(4569591-4569950)
chr3 (4-355)||(47303901-47304252)
chr3 (5-355)||(55302133-55302484)
chr3 (4-354)||(43401969-43402308)
chr3 (4-354)||(43403912-43404251)
chr3 (23-364)||(36018490-36018833)
chr3 (4-364)||(5434045-5434407)
chr3 (131-355)||(28074266-28074488)
chr3 (51-308)||(1683184-1683440)
chr3 (53-335)||(34795538-34795819)
chr3 (5-355)||(35138874-35139233)
chr3 (143-364)||(26323821-26324041)
chr3 (363-469)||(30034473-30034581)
chr3 (4-92)||(31340368-31340456)
chr3 (5-145)||(26323242-26323385)
chr3 (20-364)||(39127199-39127531)
chr3 (47-217)||(20937444-20937613)
chr3 (4-60)||(46173311-46173367)
chr3 (108-364)||(36796047-36796307)
chr3 (4-62)||(9666634-9666693)
chr3 (296-355)||(31340501-31340560)
chr3 (4-61)||(29196554-29196612)
chr3 (4-61)||(44700645-44700703)
chr3 (208-263)||(31340448-31340503)
chr3 (4-61)||(5236623-5236680)
chr3 (4-61)||(9581227-9581284)
chr3 (4-61)||(40734442-40734499)
chr3 (4-61)||(44331489-44331546)
chr3 (4-61)||(19684056-19684113)
chr3 (4-61)||(22835169-22835226)
chr3 (8-61)||(29682303-29682356)
chr3 (5-61)||(31314389-31314445)
chr3 (5-61)||(39153529-39153585)
chr3 (4-50)||(16498984-16499031)
chr3 (4-50)||(23410496-23410543)
chr3 (4-50)||(40735337-40735384)
chr3 (224-294)||(50432938-50433006)
chr3 (4-50)||(51398768-51398815)
chr3 (4-50)||(53921670-53921717)
chr3 (4-61)||(760791-760848)
chr3 (4-61)||(5258312-5258368)
chr3 (4-61)||(23392076-23392133)
chr3 (4-61)||(29810812-29810869)
chr3 (4-61)||(45095109-45095165)
chr3 (193-258)||(1737247-1737311)
chr3 (7-59)||(32891049-32891101)
[»] chr6 (23 HSPs)
chr6 (4-355)||(21593315-21593665)
chr6 (1-354)||(5043278-5043631)
chr6 (4-364)||(3808876-3809237)
chr6 (4-352)||(2973106-2973456)
chr6 (4-355)||(17762636-17762991)
chr6 (4-355)||(26830291-26830643)
chr6 (7-364)||(22424997-22425354)
chr6 (4-306)||(603247-603550)
chr6 (111-364)||(25072825-25073076)
chr6 (140-336)||(26800438-26800633)
chr6 (91-297)||(17757789-17757998)
chr6 (25-176)||(5740978-5741131)
chr6 (5-114)||(25073457-25073568)
chr6 (37-159)||(11660452-11660574)
chr6 (4-61)||(9183198-9183255)
chr6 (4-61)||(28137575-28137632)
chr6 (8-63)||(4045364-4045420)
chr6 (5-61)||(26954453-26954509)
chr6 (4-61)||(2171698-2171754)
chr6 (4-61)||(3039070-3039127)
chr6 (4-61)||(5406366-5406422)
chr6 (4-61)||(5410691-5410747)
chr6 (10-50)||(16567160-16567201)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (4-355)||(6977-7328)
[»] chr5 (39 HSPs)
chr5 (4-355)||(40146910-40147262)
chr5 (4-355)||(213117-213466)
chr5 (4-355)||(38746654-38747006)
chr5 (14-346)||(27015190-27015523)
chr5 (4-347)||(5057705-5058048)
chr5 (4-355)||(28277964-28278317)
chr5 (4-364)||(27637780-27638142)
chr5 (25-347)||(4160291-4160611)
chr5 (47-347)||(316422-316720)
chr5 (25-355)||(35615820-35616149)
chr5 (167-355)||(16642210-16642396)
chr5 (47-353)||(14689622-14689925)
chr5 (12-299)||(33906202-33906491)
chr5 (162-353)||(30802592-30802782)
chr5 (4-164)||(16641107-16641269)
chr5 (169-355)||(30792889-30793073)
chr5 (160-364)||(10055031-10055235)
chr5 (57-260)||(21205873-21206076)
chr5 (34-127)||(8019464-8019557)
chr5 (289-364)||(33906584-33906659)
chr5 (4-50)||(8566113-8566160)
chr5 (4-50)||(42428597-42428644)
chr5 (4-61)||(533713-533770)
chr5 (4-61)||(5887583-5887640)
chr5 (4-61)||(28750822-28750879)
chr5 (4-61)||(31182917-31182974)
chr5 (4-61)||(39468716-39468773)
chr5 (7-60)||(42926838-42926891)
chr5 (4-60)||(42426402-42426458)
chr5 (4-50)||(13488157-13488204)
chr5 (4-50)||(32636778-32636825)
chr5 (4-50)||(33831634-33831681)
chr5 (20-132)||(10700832-10700945)
chr5 (4-61)||(13239696-13239752)
chr5 (4-61)||(13343005-13343061)
chr5 (4-61)||(19806328-19806384)
chr5 (4-61)||(25412706-25412762)
chr5 (4-61)||(36074212-36074268)
chr5 (4-60)||(537970-538026)
[»] chr7 (55 HSPs)
chr7 (4-355)||(6431620-6431972)
chr7 (4-355)||(34310883-34311236)
chr7 (4-358)||(2389928-2390283)
chr7 (8-355)||(4512561-4512908)
chr7 (4-360)||(3258639-3258996)
chr7 (4-347)||(2361139-2361482)
chr7 (7-363)||(29608382-29608735)
chr7 (4-355)||(6360079-6360431)
chr7 (4-355)||(48599501-48599843)
chr7 (8-355)||(4508877-4509216)
chr7 (8-355)||(4510719-4511058)
chr7 (4-355)||(22269623-22269974)
chr7 (8-347)||(22328568-22328911)
chr7 (199-364)||(32358199-32358364)
chr7 (4-221)||(8359484-8359703)
chr7 (99-347)||(5116291-5116539)
chr7 (264-355)||(30814414-30814505)
chr7 (201-296)||(22552804-22552897)
chr7 (5-159)||(1360321-1360478)
chr7 (4-61)||(36146575-36146633)
chr7 (4-61)||(4538707-4538764)
chr7 (4-61)||(24526064-24526121)
chr7 (4-61)||(31733136-31733193)
chr7 (4-61)||(43864188-43864245)
chr7 (4-61)||(47676303-47676360)
chr7 (34-159)||(23794024-23794149)
chr7 (4-50)||(14070000-14070047)
chr7 (4-50)||(14380028-14380075)
chr7 (4-50)||(31105560-31105607)
chr7 (4-50)||(47674110-47674157)
chr7 (4-61)||(1113601-1113658)
chr7 (4-61)||(2761469-2761526)
chr7 (4-61)||(4586105-4586162)
chr7 (4-61)||(8153286-8153343)
chr7 (4-61)||(12098026-12098083)
chr7 (4-61)||(27347761-27347818)
chr7 (4-49)||(30024899-30024945)
chr7 (4-61)||(38671389-38671446)
chr7 (4-61)||(41649177-41649234)
chr7 (104-158)||(43363683-43363737)
chr7 (4-61)||(48491523-48491580)
chr7 (4-63)||(23554982-23555040)
chr7 (4-47)||(31518752-31518796)
chr7 (4-61)||(4178719-4178775)
chr7 (4-61)||(4253696-4253754)
chr7 (4-61)||(5514176-5514234)
chr7 (4-61)||(18126588-18126645)
chr7 (4-61)||(24514928-24514984)
chr7 (4-61)||(29990999-29991055)
chr7 (4-61)||(35853859-35853915)
chr7 (4-61)||(41317601-41317658)
chr7 (4-61)||(48408747-48408803)
chr7 (4-61)||(48489375-48489432)
chr7 (4-60)||(25767125-25767180)
chr7 (4-60)||(26417261-26417317)
[»] chr2 (36 HSPs)
chr2 (4-355)||(1631899-1632251)
chr2 (4-358)||(42288277-42288631)
chr2 (4-355)||(45726579-45726930)
chr2 (4-355)||(35447051-35447403)
chr2 (4-346)||(17450249-17450592)
chr2 (4-364)||(24397704-24398056)
chr2 (9-359)||(33647813-33648166)
chr2 (145-355)||(7450950-7451158)
chr2 (51-364)||(42261826-42262138)
chr2 (51-352)||(30218250-30218550)
chr2 (199-346)||(40935543-40935690)
chr2 (57-159)||(43730992-43731093)
chr2 (4-61)||(723911-723968)
chr2 (4-61)||(11690445-11690502)
chr2 (4-61)||(13121712-13121770)
chr2 (4-61)||(14633993-14634050)
chr2 (4-61)||(24885605-24885662)
chr2 (4-61)||(29867813-29867870)
chr2 (4-61)||(34139938-34139995)
chr2 (4-61)||(36773506-36773563)
chr2 (4-61)||(42362296-42362353)
chr2 (4-63)||(33162617-33162676)
chr2 (4-50)||(17057536-17057583)
chr2 (4-50)||(17085519-17085566)
chr2 (4-50)||(36318176-36318223)
chr2 (8-61)||(11049493-11049547)
chr2 (4-61)||(11067249-11067306)
chr2 (4-61)||(11151758-11151815)
chr2 (4-61)||(12123751-12123809)
chr2 (4-61)||(39284829-39284886)
chr2 (4-61)||(2334585-2334641)
chr2 (4-61)||(4503300-4503356)
chr2 (4-61)||(5723422-5723478)
chr2 (198-260)||(24197643-24197704)
chr2 (4-61)||(38312184-38312241)
chr2 (4-61)||(45099699-45099755)
[»] chr1 (59 HSPs)
chr1 (4-347)||(11348355-11348699)
chr1 (4-364)||(29135888-29136248)
chr1 (4-364)||(34603216-34603577)
chr1 (4-360)||(7482398-7482755)
chr1 (4-364)||(37033240-37033597)
chr1 (4-355)||(13547256-13547608)
chr1 (4-355)||(13549167-13549519)
chr1 (4-346)||(37167955-37168298)
chr1 (4-355)||(42298142-42298494)
chr1 (4-355)||(37879078-37879430)
chr1 (4-358)||(47114818-47115172)
chr1 (4-355)||(193261-193612)
chr1 (4-355)||(47255507-47255853)
chr1 (9-358)||(28242034-28242385)
chr1 (54-364)||(34602557-34602867)
chr1 (4-355)||(19754140-19754495)
chr1 (4-355)||(19752335-19752686)
chr1 (25-364)||(41135460-41135800)
chr1 (5-364)||(6808086-6808446)
chr1 (4-222)||(31925874-31926092)
chr1 (48-309)||(16216709-16216966)
chr1 (47-300)||(22079039-22079278)
chr1 (99-352)||(9109665-9109918)
chr1 (20-157)||(25651931-25652070)
chr1 (236-355)||(31928208-31928319)
chr1 (51-265)||(3331283-3331505)
chr1 (75-246)||(12318720-12318890)
chr1 (7-61)||(928147-928202)
chr1 (4-61)||(197075-197132)
chr1 (4-61)||(3847288-3847345)
chr1 (4-61)||(10925167-10925224)
chr1 (4-61)||(28265721-28265778)
chr1 (4-61)||(50167342-50167399)
chr1 (4-60)||(1833467-1833523)
chr1 (7-63)||(15820249-15820305)
chr1 (4-59)||(13138141-13138196)
chr1 (4-50)||(31659192-31659239)
chr1 (4-50)||(37503721-37503768)
chr1 (4-50)||(46064872-46064919)
chr1 (4-61)||(834334-834391)
chr1 (4-61)||(44455104-44455161)
chr1 (4-61)||(50169377-50169434)
chr1 (85-125)||(6068471-6068512)
chr1 (4-50)||(4552804-4552851)
chr1 (4-50)||(8550954-8551001)
chr1 (48-118)||(10157501-10157571)
chr1 (4-50)||(13659503-13659550)
chr1 (4-62)||(44650330-44650389)
chr1 (4-61)||(3189275-3189331)
chr1 (4-61)||(3198092-3198148)
chr1 (4-61)||(3206931-3206987)
chr1 (144-222)||(4535783-4535861)
chr1 (4-61)||(28223588-28223645)
chr1 (193-301)||(28318116-28318225)
chr1 (4-45)||(49918309-49918351)
chr1 (48-160)||(33775756-33775866)
chr1 (106-265)||(38746988-38747144)
chr1 (4-60)||(40122365-40122421)
chr1 (4-61)||(41360859-41360915)
[»] chr4 (72 HSPs)
chr4 (8-364)||(50262869-50263226)
chr4 (4-347)||(54882677-54883021)
chr4 (4-355)||(8665056-8665409)
chr4 (4-357)||(35662089-35662442)
chr4 (4-355)||(50674013-50674365)
chr4 (10-358)||(12073039-12073387)
chr4 (6-355)||(6655605-6655955)
chr4 (4-353)||(46703152-46703501)
chr4 (23-354)||(379028-379360)
chr4 (4-355)||(55085531-55085885)
chr4 (7-356)||(41964064-41964413)
chr4 (48-355)||(26363914-26364222)
chr4 (5-355)||(33989511-33989862)
chr4 (4-355)||(2209357-2209714)
chr4 (4-355)||(27417132-27417470)
chr4 (4-281)||(8647861-8648140)
chr4 (108-355)||(40630633-40630879)
chr4 (110-355)||(46569821-46570065)
chr4 (5-180)||(12119362-12119538)
chr4 (219-355)||(8653249-8653385)
chr4 (5-309)||(33089594-33089878)
chr4 (59-344)||(3785750-3786034)
chr4 (5-364)||(22882919-22883281)
chr4 (5-364)||(22934583-22934945)
chr4 (8-364)||(26699616-26699976)
chr4 (214-352)||(10071537-10071675)
chr4 (51-355)||(35370553-35370857)
chr4 (4-355)||(35369608-35369954)
chr4 (160-348)||(38811404-38811591)
chr4 (4-97)||(40632353-40632446)
chr4 (214-312)||(10071963-10072061)
chr4 (47-301)||(41961110-41961368)
chr4 (77-302)||(34112314-34112539)
chr4 (8-86)||(41639345-41639423)
chr4 (224-355)||(47514889-47515021)
chr4 (5-67)||(21688186-21688248)
chr4 (48-355)||(25723433-25723735)
chr4 (47-346)||(22629105-22629399)
chr4 (249-347)||(32091226-32091326)
chr4 (4-61)||(52467521-52467579)
chr4 (8-61)||(41639207-41639260)
chr4 (47-158)||(32091324-32091435)
chr4 (4-61)||(5429623-5429680)
chr4 (4-61)||(5871764-5871821)
chr4 (4-61)||(13009598-13009655)
chr4 (4-61)||(26175803-26175860)
chr4 (4-61)||(37229889-37229947)
chr4 (4-61)||(48142986-48143043)
chr4 (4-61)||(52095529-52095586)
chr4 (4-60)||(12745603-12745659)
chr4 (4-63)||(36463556-36463615)
chr4 (7-61)||(24969055-24969110)
chr4 (4-50)||(36994478-36994525)
chr4 (4-50)||(48893809-48893856)
chr4 (4-61)||(4587902-4587959)
chr4 (4-61)||(6542348-6542405)
chr4 (4-61)||(47038576-47038633)
chr4 (4-61)||(52082824-52082881)
chr4 (4-61)||(54200073-54200130)
chr4 (4-60)||(5208009-5208066)
chr4 (4-59)||(31474096-31474151)
chr4 (4-50)||(51337018-51337065)
chr4 (20-71)||(52065530-52065581)
chr4 (235-301)||(6719289-6719355)
chr4 (4-61)||(12739717-12739774)
chr4 (4-61)||(12747923-12747980)
chr4 (4-61)||(29056301-29056359)
chr4 (4-61)||(29254438-29254495)
chr4 (4-61)||(34570581-34570638)
chr4 (4-61)||(37740570-37740626)
chr4 (4-61)||(56178804-56178860)
chr4 (4-44)||(3913408-3913449)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (4-364)||(80450-80811)
[»] scaffold0286 (1 HSPs)
scaffold0286 (4-355)||(11207-11558)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (4-347)||(18170-18511)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (51-364)||(490661-490973)
[»] scaffold0197 (1 HSPs)
scaffold0197 (31-352)||(1591-1922)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (25-76)||(24981-25032)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (4-50)||(149264-149311)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (4-61)||(114547-114603)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 291; Significance: 1e-163; HSPs: 46)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 365 - 825
Target Start/End: Original strand, 23147044 - 23147498
Alignment:
Q  365 gagtgatgctatttggtacagaagttttagatgcggatttcaacgaatgcacgtgcaaaaacttatc--tccctctcccacgtgctggtttttattaaaa 462  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||           ||||    
T  23147044 gagtgatgctatttggtacagaagttttatgtgcggatttcaacgaatgcacgtgcaaaaacttatccctctctctcccacgtgc-----------aaaa 23147132  T
Q  463 atcaatatatcaaagaataatacaactcgtgtatagtaaaaatcacaactaaaccattatcatcttcacagaccttccaccatttccatgtcaaacattc 562  Q
    || ||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23147133 attaatatatcaaagaataatacaacccatgtacaataaaaatcacatctaaagcattttcatcttcacagaccttccaccatttccatgtcaaacattc 23147232  T
Q  563 ttttaattactcaataagataggacgatggactctaaatgcattgtgtttgatgtatgaaatacccaacctgttctaattttcatttgt---taattaac 659  Q
    ||||||||||||||| | ||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||   ||||||||    
T  23147233 ttttaattactcaatgacataagaagattgactctaaatgcattgtgtttgatgtatgaaatacccaacgtgttcttattttcatttgttaataattaac 23147332  T
Q  660 gtgaaaaatattgataagaggtatctaattaaaattcgagagaagcttgatgcctaaattaagttcaaaactttgttcgaaataattaggtaaatttgct 759  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||| |||||||||     
T  23147333 gtgaaaaatattgatatgaggtatctaattaaaattcgagagaagcttgatgcctaaattaaattcataactttgttccatataattagataaatttgcc 23147432  T
Q  760 cctaatagttacttttcctccaacaatggaggtggttgtgattgtgaaggccatgaattgaatttt 825  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23147433 cctaatagttactcttcctccaacaatggaggcggttgtgattgttaaggccatgaattgaatttt 23147498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 4 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 11383987 - 11383635
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-ttt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  11383987 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattatttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagccttt 11383888  T
Q  103 gatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctcc 201  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||| ||| |||| |  || ||||| |||    
T  11383887 gatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactttccacttatgtatttcccaaccccatgaatct-tcc 11383789  T
Q  202 ccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttag 301  Q
     |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11383788 tcaaaaggcaccaacccttttcacaatagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttag 11383689  T
Q  302 tatctaaaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagctt 355  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11383688 tatctaaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagctt 11383635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 4 - 355
Target Start/End: Original strand, 42435158 - 42435510
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-ttt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||    
T  42435158 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttaccaactctagaatctaaccctcaaaagagaaccaacccttagccttt 42435257  T
Q  103 gatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctcc 201  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||| |||| |  || ||||| |||    
T  42435258 gatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaagactctccattcatatgtttcccaaccccatgaatct-tcc 42435356  T
Q  202 ccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttag 301  Q
    ||||||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42435357 ccaaaagtcaccaacctttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttag 42435456  T
Q  302 tatctaaaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagctt 355  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42435457 tatctaaaaccctaaaagtttcctcctttggtttccatgagattcaccaagctt 42435510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 7 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 40221743 - 40221384
Alignment:
Q  7 gaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgat 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  40221743 gaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacctttagcctttgat 40221644  T
Q  106 ttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctcccca 204  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |  || ||||| ||||||    
T  40221643 ttcactaaggatcttctcttttggttttacaagactcacctaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatct-tcccca 40221545  T
Q  205 aaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttagtat 304  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| | | ||||||| |||| |||| || |||||||||||    
T  40221544 aaaggcactaacccctttcccaagagccccctattttggttctcgaagattcacatcttgaagttctaaacctcatccaaagaccttccacctttagtat 40221445  T
Q  305 ctaaaaccctaaaggtt-ccctcctttggtttccatgagattcatcaagctttttcaacaa 364  Q
    | ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  40221444 caaaaaccctaaaagttcccctcctatggtttccatgagattcaccaagcttactcaacaa 40221384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 4 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 44353794 - 44353444
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-tt 101  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  44353794 aatgaacaagatactcaatgatttttactcacccaatgtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctt 44353695  T
Q  102 tgatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctc 200  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| |  || ||||| ||    
T  44353694 tgatttcactaagaatcttttcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcaccgatgactctccactcatgtgttttccaaccccatgaatct-tc 44353596  T
Q  201 cccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaaccttta 300  Q
     ||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||   |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  44353595 tccaaaaggcaccaaccctcttcacaagagccccctcttttagttctccaagattc---tcttgaagttttaaacctcacccaaagaccctcaaccttta 44353499  T
Q  301 gtatctaaaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagctt 355  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44353498 gtatctaaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagctt 44353444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 40328780 - 40328476
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-cttt 102  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  40328780 aatgaacaagacattcatgattttcactctcccaagatgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcatagccttt 40328681  T
Q  103 gatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctcc 201  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||  |  || ||||| |||    
T  40328680 gatttcactaaagatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctacactcatgtgtttcccatccccatgaatct-tcc 40328582  T
Q  202 ccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttag 301  Q
    | ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  40328581 ctaaaaggcaccaacccttttcccaagaaccccctcttttggttctccaagattcacatcatgaagctttgaacctcacccaaagaccctaaatctttag 40328482  T
Q  302 tatcta 307  Q
    ||||||    
T  40328481 tatcta 40328476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 4 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 4283525 - 4283342
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-cttt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  4283525 aatgaacaagacactcatgattttcactctcctaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagccttt 4283426  T
Q  103 gatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaa 185  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||| ||||    
T  4283425 gatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcaaccaagtttctcacaaaagactttccactcatgtgtttcccaa 4283342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 147 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 22976389 - 22976191
Alignment:
Q  147 agttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctccccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttc 246  Q
    ||||||||||||  |||||  ||||||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  22976389 agttgctcacaatagactcttcactcatgtgttttc-aaccccatgaatct-tccccaaaaggcaccaaccctttttccaagagcctcctcttttggttc 22976292  T
Q  247 ttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattc 346  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| | |||||||    
T  22976291 tccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaactctaaaagttcactcctttggtttcgaagagattc 22976192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 224 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 4283326 - 4283195
Alignment:
Q  224 ccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaggttcc 323  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  4283326 ccaaaagccccctcttttggttctccaagatccacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttct 4283227  T
Q  324 ctcctttggtttccatgagattcatcaagctt 355  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4283226 ctcctttggtttccatgagattcaccaagctt 4283195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 59 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 40585669 - 40585374
Alignment:
Q  59 aactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcaca 157  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| | |||||||| |||||||||    
T  40585669 aactttagaatcta-cccccaaaagagaaccaacccttagtctttgatttcctaaggatcttctcttttggtctaccaatactcacccaaattgctcaca 40585571  T
Q  158 aatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctccccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattca 257  Q
    || ||||| ||  | |||||||||| || |  || |||||||| ||||||| ||  |||||| |    |||||||| |||||||| ||||  || |||||    
T  40585570 aa-gactctcctttgatgtgttttcaaaccccatgaatctctcaccaaaagacatcaaccctctccaaaagagcccactcttttgattctcaaatattca 40585472  T
Q  258 catcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttagtatctaaa-accctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagct 354  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||   ||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  40585471 catcttgaagctttgaacctcaaccaaagactcttaacctttagtatctaaatactctaaaagttatttcctttggttttcatgagattaatcaagct 40585374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 143 - 358
Target Start/End: Original strand, 2999828 - 3000043
Alignment:
Q  143 cccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctccccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttg 242  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||  ||  |  || ||||| |||||||||| ||| |||| | |  |||||| ||||||||||||    
T  2999828 cccaagttgctcacaattgactctctactcatgtgtttctcatccccatgaatctttccccaaaagacaccaaccatatc-ccaagaaccccctcttttg 2999926  T
Q  243 gttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttagtatctaaa-accctaaaggttccctcctttggtttccatga 341  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  2999927 gttctccaagattcacatcttgaagctttgaacatcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaattccctaaaagttctctcctttggtttctatga 3000026  T
Q  342 gattcatcaagcttttt 358  Q
    |||||| |||| |||||    
T  3000027 gattcaccaaggttttt 3000043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 18655401 - 18655246
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-cttt 102  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||| ||||    
T  18655401 aatgaacaaaacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcctaagtctagaatctaa-ccccaaaagagtatcaacccttagccttt 18655303  T
Q  103 gatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaa 158  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  18655302 gatttcactaaggatcttctcttttgatttcacaagactcaccgaagttgctcacaa 18655246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 99 - 339
Target Start/End: Original strand, 3846083 - 3846321
Alignment:
Q  99 ctttgatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctc 198  Q
    ||||||||||| || |||| ||||||||||| ||  |||| | |||||| ||||||||||| || ||  | ||||||||||| |||| |  || ||||||    
T  3846083 ctttgatttccaaaagatcgtctcttttggtatccaaagatttacccaatttgctcacaaa-gaatcttctctcatgtgtttcccaaccccatgaatctc 3846181  T
Q  199 tccccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctt 298  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||| |||  ||||||||||||    
T  3846182 tccccaaaagacaccaactctttt-ccaagagctct-tcttttggttcttcaagattcacattatgaacctttgaatctcactcaagaaccctcaacctt 3846279  T
Q  299 tagtatctaa-aaccctaaaggttccctcctttggtttccat 339  Q
    |||| || ||  ||||| || |||  ||||||||||||||||    
T  3846280 tagtttcaaagtaccctgaaagttttctcctttggtttccat 3846321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 114 - 308
Target Start/End: Original strand, 9633816 - 9634007
Alignment:
Q  114 gatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctccccaaaaggcacg 213  Q
    ||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||| |||| |  |||||||||| ||||||||| ||     
T  9633816 gatcttctcgtttggtttcctaagattcacccaagttgctcacaaatgactctcatcttatgtgtttaccaaccccattaatctct-cccaaaaggtacc 9633914  T
Q  214 aacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttagtatctaa 308  Q
    |||| ||||  ||||||| || ||||||| || |||||||||||||| | ||  ||||||| ||||||||| |||  || ||||||||| |||||    
T  9633915 aaccttttt--caagagcgccatcttttgattattcaagattcacatttggacactttgaatctcacccaaagacgttcgacctttagtttctaa 9634007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 235 - 347
Target Start/End: Original strand, 20686456 - 20686568
Alignment:
Q  235 ctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttagtatctaa-aaccctaaaggttccctcctttggt 333  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||| ||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||    
T  20686456 ctcttttggttatccaagattcacatcttgaagctttgaacttca-ccaaagatcctcaacatttagtatctaagtaccctgaaagttccctcctttggt 20686554  T
Q  334 ttccatgagattca 347  Q
    ||| ||||||||||    
T  20686555 ttcaatgagattca 20686568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 62
Target Start/End: Original strand, 10930367 - 10930424
Alignment:
Q  5 atgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaact 62  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  10930367 atgaacaagacactcatgattttcactctcccaaaatgtttacaattgtttcccaact 10930424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 10020398 - 10020150
Alignment:
Q  51 tgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-tttgatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagt 149  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  |  |||| ||||| ||||    
T  10020398 tgtttcccaactctagaatccaaccca-aaaaga-aacaaacccttagcctttgatttcctaaggatctcctcttttggtaccctaagattcacctaagt 10020301  T
Q  150 tgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaa------tca--aattaatctctccccaaaagg-cacgaacccttttaccaagagccccctcttt 240  Q
    || ||||||  |||||  | |||||||||||| |||      | |  ||| |||||||||| |||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  10020300 tgttcacaa--gactcttctctcatgtgtttttcaactttcctaagcaatgaatctctcccaaaaatgacacgaaccctttc-ccaagagccccctcttt 10020204  T
Q  241 tggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaa 294  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||   |||||| |||||| || |||||||||    
T  10020203 tggttctctaagattcacatattgatcatttgaatctcacctaaagaccctcaa 10020150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 139 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 40535714 - 40535539
Alignment:
Q  139 gtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctccccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctct 238  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||| || ||  | |  ||||||||||  ||||| |||  ||||| ||||||||    
T  40535714 gtcacctaagttgctcacaa-tgactcttctctcatgtgttttccaatcacatgaacttttatccaaaaggcatcaaccc-tttctcaagaaccccctct 40535617  T
Q  239 tttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttagtatctaaa-accctaaa 317  Q
    |||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||||  ||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  40535616 tttggttctaaaagatccacaacttgaaactttgaac--cacccaaagaccatcaatctttagtatctaaataccctaaa 40535539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 159
Target Start/End: Original strand, 33655472 - 33655628
Alignment:
Q  5 atgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaa-ttgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-tt 101  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||  ||||| ||||| ||| || ||| ||||||||| ||| ||||||   ||||||||||||| |||| | ||    
T  33655472 atgaacaagacactcaatgattt-cactcatccaagatgttttcaaattattttccaactctaaaatttaacccttgaaagagaaccaacccttaacctt 33655570  T
Q  102 tgatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaa 159  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | ||  |||| |||||||| |||||||||||    
T  33655571 tgattttctaaggatcttctcttttgttctcctaagattcacccaaattgctcacaaa 33655628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 11136989 - 11136843
Alignment:
Q  155 acaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctccccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagat 254  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| | | ||| || ||||||||||||||||   |||  ||| |||||||||| ||||||| ||||| ||| ||    
T  11136989 acaaatgactctccactcatgtgttttcctacccaatgaacctctccccaaaaggcatcgaccaattt-ccaagagccctctcttttagttctccaaaat 11136891  T
Q  255 tcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttagt 302  Q
    ||| || | ||   |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  11136890 tcatatttggacaatttgaatctcacccaaagacccccaacctttagt 11136843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 18141822 - 18141764
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  18141822 aatgaacaagacactcaatgattttcactcgcccaaggtgtttacaaatgtttcccaac 18141764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 10240113 - 10240004
Alignment:
Q  47 caattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagctttgatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcaccca 146  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||| |||| ||    ||||| ||| |||    
T  10240113 caattgtttcccaaatctagaatctaacccc--aaagagaaccaactcttagc-ctgattttttaaggatcttcttttttagtagtccaagattcatcca 10240017  T
Q  147 agttgctcacaaa 159  Q
    |||| ||||||||    
T  10240016 agttactcacaaa 10240004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 59
Target Start/End: Original strand, 8965858 - 8965914
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttccca 59  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  8965858 aatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaaatgtttccca 8965914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 4731659 - 4731602
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  4731659 aatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 4731602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 30291607 - 30291549
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  30291607 aatgaacaagacactcaatgattttcaatcacccaaggtgtttacaaatgtttcccaac 30291549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 43036424 - 43036367
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  43036424 aatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 43036367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 5689272 - 5689213
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactc 63  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  5689272 aatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttccaaactc 5689213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 61
Target Start/End: Original strand, 41365016 - 41365071
Alignment:
Q  6 tgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  41365016 tgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 41365071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 35 - 159
Target Start/End: Original strand, 10101351 - 10101475
Alignment:
Q  35 ccaaggtgtttacaa-ttgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttcctaaggatcttctcttttggtttc 132  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||||| ||| |   |||||| ||||| |||||||||  ||||||||| |||||||| | ||    
T  10101351 ccaaggtgtttacaaattatttcctaacactagaatctaaccccaaaacgt--accaacccttagactttgatttaataaggatctcctcttttgatctc 10101448  T
Q  133 acaagagtcacccaagttgctcacaaa 159  Q
      |||| ||| ||||||||||||||||    
T  10101449 ctaagattcatccaagttgctcacaaa 10101475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 27811279 - 27811232
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaat 50  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27811279 aatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 27811232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 6 - 60
Target Start/End: Original strand, 41366783 - 41366837
Alignment:
Q  6 tgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaa 60  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  41366783 tgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaa 41366837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Original strand, 4743370 - 4743427
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  4743370 aatgaacaagacactcaatgattttcgctcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 4743427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 15212787 - 15212730
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  15212787 aatgaacaagacattcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 15212730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 33352151 - 33352094
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  33352151 aatgaacaagacactcaatgattttcaatcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 33352094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 63
Target Start/End: Original strand, 1345538 - 1345597
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactc 63  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||    
T  1345538 aatgaacaagacattcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tatttcccaactc 1345597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 4162501 - 4162454
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaat 50  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  4162501 aatgaacaagacactcaatgattttcactcgctcaaggtgtttacaat 4162454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 40321080 - 40321022
Alignment:
Q  5 atgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactc 63  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  40321080 atgaacaagacactcaatgattttcagtcactcaaggtgtttacaa-tgtttcccaactc 40321022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Original strand, 1746386 - 1746442
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  1746386 aatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 1746442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 6598973 - 6598916
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  6598973 aatgaacaagacacttaatgattttcactcactcaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 6598916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 6674426 - 6674369
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  6674426 aatgaacaagacacttaatgattttcactcactcaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 6674369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 17982653 - 17982597
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  17982653 aatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 17982597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 31218257 - 31218201
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  31218257 aatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 31218201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 44303854 - 44303798
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  44303854 aatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 44303798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 61
Target Start/End: Original strand, 18106246 - 18106302
Alignment:
Q  5 atgaacaagacactcatga-ttttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  18106246 atgaacaagacactcaacaattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 18106302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Original strand, 19491866 - 19491922
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||    
T  19491866 aatgaacaagacactcaatattttcactcacccaagatgtttacga-tgtttcccaac 19491922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 30143341 - 30143286
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  30143341 aatgaacaagacaca-atgattttcactcacccaatgtgtttacaa-tgtttcccaac 30143286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 55)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 461 - 828
Target Start/End: Complemental strand, 30034106 - 30033748
Alignment:
Q  461 aaatcaatatatcaaagaataatacaactcgtgtatagtaaaaatcacaactaaaccattatcatcttcacagaccttccaccatttccatgtcaaacat 560  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30034106 aaatcaatatatcaaagaataatacaacccgtgtacagtaaaaatcacaactaaaccattatcatcttcacagaccttccaccatttccatctcaaacat 30034007  T
Q  561 tcttttaattactcaataagataggacgatggactctaaatgcattgtgtttgatgtatgaaatacccaacctgttctaattttcatttgttaattaacg 660  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||| |||||||||||||||||||||    
T  30034006 tcttttaattactcaatgagataagacgatggactctaaatgcattgtgtttgatgtatgaaatac--------ttcttattttcatttgttaattaacg 30033915  T
Q  661 tgaaaaatattgataagaggtatctaattaaaattcgagagaagcttgatgcctaaattaagttcaaaactttgttcgaaataattaggtaaatttgctc 760  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  30033914 tgaaaa-tattgataggaggtatctaattaaaattcgagagaagcttgatgcctaaattaaattcagaactttgttccaaataattagataaatttgctc 30033816  T
Q  761 ctaatagttacttttcctccaacaatggaggtggttgtgattgtgaaggccatgaattgaattttctg 828  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30033815 ctaatagttactcttcctccaacaatggaggtggttgtgattgtgaaggtcatgaattgaattttctg 30033748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 247; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 4 - 356
Target Start/End: Original strand, 6095766 - 6096119
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-ttt 102  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||    
T  6095766 aatgaataagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacctttagcattt 6095865  T
Q  103 gatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctcc 201  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |  || ||||| |||    
T  6095866 gatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatct-tcc 6095964  T
Q  202 ccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttag 301  Q
    ||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6095965 ccaaaaggcaccaacccttttcaaaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttag 6096064  T
Q  302 tatctaaaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagcttt 356  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||    
T  6096065 tatctaaaaccctaaaagttctctcctctgatttccatgagattcaccaagcttt 6096119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 4 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 54593705 - 54593351
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-ttt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||    
T  54593705 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaac-aacccttagccttt 54593607  T
Q  103 gatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctcc 201  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |  || ||||| |||    
T  54593606 gatttcactaaggatcttctattttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttttccatccccatgaatct-tcc 54593508  T
Q  202 ccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttag 301  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  54593507 ccaaaaggtaccaacccttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaggaccctcaacctttag 54593408  T
Q  302 tatcta-aaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagctttt 357  Q
    |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  54593407 tatctacataccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagctttt 54593351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 4 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 34491213 - 34490861
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-cttt 102  Q
    |||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  34491213 aatgaataacacactca-gaatttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagccttt 34491115  T
Q  103 gatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctcc 201  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    || ||||| ||     
T  34491114 gatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttttcaactccatgaatct-tct 34491016  T
Q  202 ccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttag 301  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34491015 ccaaaaggcaccaacccttttcacaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttag 34490916  T
Q  302 tatctaaaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagcttt 356  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34490915 tatctaaaaccctaaaagttctctcctttggtttccatgagattcaccaagcttt 34490861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 7 - 355
Target Start/End: Original strand, 49199640 - 49199990
Alignment:
Q  7 gaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-tttgat 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  49199640 gaacaagacactcatgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaaccattagcctttgat 49199739  T
Q  106 ttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtca-cccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctcccc 203  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| |  || ||||| |||||    
T  49199740 ttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcaacccaagttgctcacaaaagactctccactcatatgtttcccaaccccatgaatct-tcccc 49199838  T
Q  204 aaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttagta 303  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  49199839 aaaaggcaccaacccttttcacaatagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaaactttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagta 49199938  T
Q  304 tctaaaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagctt 355  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  49199939 tctaaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagctt 49199990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 4 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 30236126 - 30235774
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagcttt- 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||     
T  30236126 aatgaacaagacactcatgattttcactatcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaatcattagccttc 30236027  T
Q  103 gatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctcc 201  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |  || ||| | |||    
T  30236026 gatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaacttgctcacaaatgactctccactcttgtgttttccaaccccatgaatat-tcc 30235928  T
Q  202 ccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttag 301  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30235927 ccaaaaggcaccaacccttttcacaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttag 30235828  T
Q  302 tatctaaaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagctt 355  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  30235827 tatctaaaaccctaaaagttctctcctttggtttcattgagattcaccaagctt 30235774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 4 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 46860475 - 46860120
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactcatg--attttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaac--tcttag- 98  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||     
T  46860475 aatgaacaagacactcattgaattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttctcaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaaccctcttagt 46860376  T
Q  99 ctttgatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctc 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |  || |||||     
T  46860375 ctttgatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccatccctatgaatct- 46860277  T
Q  199 tccccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctt 298  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46860276 tccccaaaaggcaccaacccttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcatgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctt 46860177  T
Q  299 tagtatcta-aaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagct 354  Q
    ||||||||| | |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  46860176 tagtatctacataccctaaaagttctctcatttggtttccatgagattcaccaagct 46860120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 4 - 358
Target Start/End: Original strand, 41819690 - 41820043
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactcatga-ttttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagcttt 102  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  41819690 aatgaacaagacactcatgaattttcactctcccaaggtgtttacaattatttcccaactctagaatctaaccgctaaaagagaaccaacccttagcttt 41819789  T
Q  103 gatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctccc 202  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| |  || ||  ||| ||    
T  41819790 gatttcataaagatcttctcttttggtttcataagactcactcaagttgctcacaaatgagtctccactcatgtgtttcccaaccccatgaa--tcttcc 41819887  T
Q  203 caaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttagt 302  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41819888 caaaaggcaccaacccttttcccaagagccccctcttttggttctctaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagt 41819987  T
Q  303 atctaaaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagcttttt 358  Q
    |||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41819988 atctaaaaacctaaaagttatctcctttggtttccatgagattcaccaagcttttt 41820043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 4 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 40913344 - 40912986
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactcatgattttcac----tctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc 99  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  40913344 aatgaacaagacactcataattttcacgtactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttaac 40913245  T
Q  100 -tttgatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatct 197  Q
     ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |  || |||||    
T  40913244 ctttaatttcactaaggatcttctcttttgctttcacaagactcacccaatttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatct 40913145  T
Q  198 ctccccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacct 297  Q
       || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  40913144 tctccaaaaaggcaccaacccttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacattttgaagctttgaacctcacccaaagaccctaaacct 40913045  T
Q  298 ttagtatctaaaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagcttt 356  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40913044 ttagtatctaaaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttt 40912986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 7 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 4569950 - 4569591
Alignment:
Q  7 gaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-tttga 104  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  4569950 gaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttga 4569851  T
Q  105 tttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctcccc 203  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |  || ||||| |||||    
T  4569850 tttcactaaagatcatctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatct-tcccc 4569752  T
Q  204 aaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttagta 303  Q
    || ||||||   ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4569751 aataggcacacccccttttcccaagagccccctcttttgattctccaagatttacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagta 4569652  T
Q  304 tctaaaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagctttttcaacaa 364  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  4569651 tctaaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttactcaacaa 4569591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 4 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 47304252 - 47303901
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagcttt- 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||     
T  47304252 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccagggtgtttaaaattgttttccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagttttt 47304153  T
Q  103 gatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctcc 201  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||| |  || ||||| |||    
T  47304152 gatttcactaaggatattctcttttggttttacaagactcacctaagttgctcacaaaa-actctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatct-tcc 47304055  T
Q  202 ccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttag 301  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  47304054 ccaaaaggcaccaacccttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaacatttag 47303955  T
Q  302 tatctaaaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagctt 355  Q
    ||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  47303954 tatctaaaaccataaaagttctctcctttgatttccatgagattcaccaagctt 47303901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 5 - 355
Target Start/End: Original strand, 55302133 - 55302484
Alignment:
Q  5 atgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| | ||| |||||    
T  55302133 atgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtatttacaattgtttcccaactctataatctaacctacaaaagagaaccaacccctagcctttg 55302232  T
Q  104 atttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctccc 202  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |  || ||| | | ||    
T  55302233 atttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaagaatctccactcatgtgttttccaacctcatgaat-ttttcc 55302331  T
Q  203 caaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttagt 302  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  55302332 caaaaggcaccaacccttttcccaagagctccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcatccaaagaccctcaacttttagt 55302431  T
Q  303 atctaaaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagctt 355  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  55302432 atctaaaaccctaaaagtttcctcctttggtttcaatgaaattcaccaagctt 55302484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 4 - 354
Target Start/End: Original strand, 43401969 - 43402308
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-ttt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||            |||||||||||| | |||| |||    
T  43401969 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaatcgtttcccaactctagaa------------aagagaaccaacccatagccttt 43402056  T
Q  103 gatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctcc 201  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||| |  || ||||| |||    
T  43402057 gatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagacttacccaagttgttcacaaatgattctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatct-tcc 43402155  T
Q  202 ccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttag 301  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43402156 ccaaaaggcaccaacccttttctcaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttag 43402255  T
Q  302 tatctaaaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagct 354  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  43402256 tatctaaaaccctaaaagttccctcctttggtttccataagattcaccaagct 43402308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 4 - 354
Target Start/End: Original strand, 43403912 - 43404251
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-ttt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||            |||||||||||| | |||| |||    
T  43403912 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactttagaa------------aagagaaccaacccatagccttt 43403999  T
Q  103 gatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctcc 201  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |  || ||||| |||    
T  43404000 gatttcactaaggatcttctcttttagtttcacaagactcacccaagttgctcccaaatgactctccactcatgtgttttccaaccccatgaatct-tcc 43404098  T
Q  202 ccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttag 301  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  43404099 ccaaaaggcaccaacccttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaaactttgaacctcacccaaagaccctcaacttttag 43404198  T
Q  302 tatctaaaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagct 354  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  43404199 tatctaaaaccctaaaagttccctcatttggtttccatgagattcaccaagct 43404251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 23 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 36018833 - 36018490
Alignment:
Q  23 attttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttc-ctaaggatcttc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  36018833 attttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaaaccccaaaagagaaccaatccatagcctttgatttcactaaggatcttc 36018734  T
Q  121 tcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctccccaaaaggcacgaaccctt 220  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||  |  ||  |||| |||||||||||||| |||||||    
T  36018733 tcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaatgactctccattcatgtgtttcccatccccatggatct-tccccaaaaggcaccaaccctt 36018635  T
Q  221 ttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttagtatcta-aaaccctaaagg 319  Q
    || |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | ||||| || |    
T  36018634 ttcccaaaagctccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcatccaaagaccctcaacctttagtatctacataccctgaaag 36018535  T
Q  320 ttccctcctttggtttccatgagattcatcaagctttttcaacaa 364  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  36018534 ttctctcctttggtttccatgagattcaccaagcttatccaacaa 36018490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 172; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 364
Target Start/End: Original strand, 5434045 - 5434407
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctt 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||   |||| |||    
T  5434045 aatgaacaagacactcaatgattttcactcacc-aaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaatcaatctttagtctt 5434143  T
Q  102 tgatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctcc 201  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| | || |  || |||||||||    
T  5434144 tgattacataaggatcttctcttttggtttcccaagactcacccaacttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcctaaccccatgaatctctcc 5434243  T
Q  202 ccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttag 301  Q
    | ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||| | ||| |||||| ||| ||| |    
T  5434244 ctaaaaaacactaacccttttcccaagagccccctcttttggttctataagatttacatcttgaagctttaaacctccctcaaagacccttaacttttgg 5434343  T
Q  302 tatctaaa-accctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagctttttcaacaa 364  Q
    |||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  5434344 tatctaaatatcctaaaagttccctcctttgatttccatgagattcaccaagcttactcaacaa 5434407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 131 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 28074488 - 28074266
Alignment:
Q  131 tcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctccccaaaaggcacgaacccttttaccaagag 230  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||| |||  ||||| |||||||||||||| |||  |  || ||||| ||||||||| |||| |||  |||  |||||||    
T  28074488 tcacaagactcacctaagtttctctcaatagactctccactcatgtgtttcccatccccatgaatct-tccccaaaacgcaccaactatttc-ccaagag 28074391  T
Q  231 ccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaggttccctccttt 330  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  28074390 ccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaaactttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtttcctccttt 28074291  T
Q  331 ggtttccatgagattcatcaagctt 355  Q
    ||||||||||||||||| |||||||    
T  28074290 ggtttccatgagattcaccaagctt 28074266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 51 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 1683440 - 1683184
Alignment:
Q  51 tgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-tttgatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagt 149  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  1683440 tgtttcccaactctagattctaacccc-aaaagataaccaacccttagcctttgattttctaaggatcttctcttttggtctcacaagactcaccaaagt 1683342  T
Q  150 tgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctccccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttc 249  Q
    |||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| |  || ||||||| ||||||| |||| ||||| ||| | || | ||  ||||||||||||| |    
T  1683341 tgctcataaatgattatccactcatgtgttttccaaccccatgaatctcttcccaaaatgcaccaaccc-tttccgaaaaaccttctcttttggttctcc 1683243  T
Q  250 aagattcacatcttgaagc-tttgaacctcacccaatgaccctcaacctttagtatctaa 308  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  1683242 aagattcacat-ttgaaacatttgaatctcacccaaagaccctcaacctttagtttctaa 1683184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 53 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 34795819 - 34795538
Alignment:
Q  53 tttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-tttgatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttg 151  Q
    |||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||     
T  34795819 tttcccaactttagaatttaaccac-aaaagagaaccatcccttagcctttgattttctaaggatcttctcttttggtctcccaagactcacccaagttt 34795721  T
Q  152 ctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctccccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaa 251  Q
    || |||||  |||| ||  | |||||| | |||| |  || ||||||||| ||||||||| ||| ||| |  || ||| ||||||||| ||||||| |||    
T  34795720 cttacaaaa-actctcctttgatgtgtatcccaaccccatgaatctctcctcaaaaggcatgaaacctctc-cctagaaccccctcttctggttctccaa 34795623  T
Q  252 gattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttagtatctaaa-accctaaaggttccctcctttggttt 335  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||    
T  34795622 gattcagatcttgaagctttgaacatcacccaacgaccatcaacctttagtatctaaataccctaaaagatctctcctttggttt 34795538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 5 - 355
Target Start/End: Original strand, 35138874 - 35139233
Alignment:
Q  5 atgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgttt-acaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagcttt 102  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||| ||||||| |||||||||  ||| |||||||||    
T  35138874 atgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgtttcacaattgtttcc-aactttaaaatttaacccc-aaaagagaattaacccttagcttt 35138971  T
Q  103 g--atttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctc 200  Q
       |||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||  ||||||||||| ||| ||||| |   | || |||||||||| |  || ||||||||    
T  35138972 tttatttcctaaggatcttctattttggtctcccaagactcattcaagttgctcataaa-gactctcatttgatttgttttccaacctcatgaatctctc 35139070  T
Q  201 cccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccc-cctcttttggttcttcaagattc-------acatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctc 292  Q
    | |||||||||  ||||| ||| | |||| |||   |||||||||||| ||||||||       ||||||| ||| ||||||||||| | || |||||||    
T  35139071 ctcaaaaggcatcaaccc-tttccgaagaacccatttcttttggttctccaagattcacatcttacatcttaaagttttgaacctcatctaaagaccctc 35139169  T
Q  293 aacctttagtatctaaa-accctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagctt 355  Q
    ||| ||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  35139170 aacgtttagtatctaaatacccaaaaagtaccctcctttggtttccatgaaattcaccaagctt 35139233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 143 - 364
Target Start/End: Original strand, 26323821 - 26324041
Alignment:
Q  143 cccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctccccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttg 242  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||  | ||||||||  ||| |  || ||||||| |  |||| |||| ||||||||  |||| ||||| ||||||||    
T  26323821 cccaagttgctcacaaa-gactctcctttgatgtgtttctcaaccccatgaatctctgctgaaaatgcaccaaccctttc-ccaatagccctctcttttg 26323918  T
Q  243 gttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttagtatctaaa-accctaaaggttccctcctttggtttccatga 341  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  26323919 attcttcaagatttacatcttgaagctttgaacttcacccaatgaccctcaacctttagtatctaaatatcttaaaagtttcctcctttggtttccatga 26324018  T
Q  342 gattcatcaagctttttcaacaa 364  Q
    |||||| ||| |||  |||||||    
T  26324019 gattcaccaaacttactcaacaa 26324041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 363 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 30034581 - 30034473
Alignment:
Q  363 aagagtgatgctatttggtacagaagttttagatgc-ggatttcaacgaatgcacgtgcaaaaacttatctccctctcccacgtgctggt-ttttattaa 460  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  30034581 aagagtgatgctatttggtatggaagttttatgtgccggatttcaacgaatgcacgtgcaaaaacttatctccctctcccacatgctggttttttattaa 30034482  T
Q  461 aaatcaata 469  Q
    |||||||||    
T  30034481 aaatcaata 30034473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 92
Target Start/End: Original strand, 31340368 - 31340456
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaac 92  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  31340368 aatgaacaaaacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccctaaaagggcaccaac 31340456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 145
Target Start/End: Original strand, 26323242 - 26323385
Alignment:
Q  5 atgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttac-aattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-tt 101  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||||| | |||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||    
T  26323242 atgaacaagacacttaatgatgttcactcactcaaggtgtttcccaattgtttcccaactctaaaatctaaccctcaaaagagaaccaacccttagcttt 26323341  T
Q  102 tgatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcaccc 145  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||| ||||||    
T  26323342 tgatttcctaaggatattcttttttggtctcccaagactcaccc 26323385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 39127531 - 39127199
Alignment:
Q  20 atgattttcactctcccaaggtgtttac-aattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-tttgatttcctaaggatc 117  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| |     
T  39127531 atgattttcactcttccaaggtattttccaattgtttccaaactctagaatttaaccac-aaaagagaactaacccttagcctttgatttcctaagggta 39127433  T
Q  118 ttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctccccaaaaggcacgaacc 217  Q
    |||||||||||| || ||||           |||| |||||| |||||     | |||||||| |||| |  || |||||||||| ||||||||| |||     
T  39127432 ttctcttttggtctctcaag-----------ttgcccacaaa-gactcatatttgatgtgtttcccaacctcatgaatctctcccaaaaaggcaccaact 39127345  T
Q  218 cttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttagtatctaaa-accctaa 316  Q
    || || ||||||| ||||| |||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||  |||||||||||| |||| |||||||    
T  39127344 ctctt-ccaagagtcccctattttagttctctaagattcatatcttgaagctttgaacctca-ccaaaggccccaaacctttagtatgtaaataccctaa 39127247  T
Q  317 aggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagctttttcaacaa 364  Q
    | |||| |||| ||| |||||||||||||||  ||||||  |||||||    
T  39127246 aagttctctccgttgatttccatgagattcactaagcttactcaacaa 39127199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 47 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 20937613 - 20937444
Alignment:
Q  47 caattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-tttgatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcaccc 145  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  20937613 caattatttctcaactctagaatcta-ctcccaaaagagaaccaacctttatcctttgatttcctaagaatcttctcttttggtctcccaagaatcaccc 20937515  T
Q  146 aagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctccccaaaaggcacgaacc 217  Q
    |||||  ||||||| |||||||   | ||||||||| ||| || || ||||||||| |||||||||| ||||    
T  20937514 aagtttgtcacaaa-gactcccttttgatgtgtttttcaaccacatgaatctctcctcaaaaggcaccaacc 20937444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 46173367 - 46173311
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaa 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46173367 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaa 46173311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 108 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 36796307 - 36796047
Alignment:
Q  108 cctaaggatcttctcttttggtttcac-aagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctccccaaa 206  Q
    ||||||||||| | |||||||||||   |||| |||||||||||||| || |||||||| |||||| ||||| | || | |   | ||||||||||||||    
T  36796307 cctaaggatctacacttttggtttccttaagattcacccaagttgctaaccaatgactctccactcttgtgtctcccgaccccgtgaatctctccccaaa 36796208  T
Q  207 aggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaaga----ttcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttagt 302  Q
    |   ||  ||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||| |    || ||||||||||||||||||||||| | || |||| ||||||||||||    
T  36796207 atcaaccgaccttttt-caaagagtcccctcttttggttcttcaaaagaggtttacatcttgaagctttgaacctcatctaaagaccttcaacctttagt 36796109  T
Q  303 atctaa-aaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagctttttcaacaa 364  Q
     |||||   ||||||| |||  |||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  36796108 ttctaagttccctaaaagttatctcctttgatttccatgagattc-tcaagttctttcaacaa 36796047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 62
Target Start/End: Original strand, 9666634 - 9666693
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaact 62  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9666634 aatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaaatgtttcccaact 9666693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Original strand, 31340501 - 31340560
Alignment:
Q  296 ctttagtatctaaaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagctt 355  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  31340501 ctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttggtttccataagattcaccaagctt 31340560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Original strand, 29196554 - 29196612
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  29196554 aatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaaatgtttcccaac 29196612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Original strand, 44700645 - 44700703
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  44700645 aatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaaatgtttcccaac 44700703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 263
Target Start/End: Original strand, 31340448 - 31340503
Alignment:
Q  208 ggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatctt 263  Q
    ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31340448 ggcaccaaccattttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatctt 31340503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Original strand, 5236623 - 5236680
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  5236623 aatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 5236680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 9581284 - 9581227
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  9581284 aatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 9581227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 40734499 - 40734442
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  40734499 aatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 40734442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 44331546 - 44331489
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  44331546 aatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 44331489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Original strand, 19684056 - 19684113
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  19684056 aatgaacaagacattcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 19684113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Original strand, 22835169 - 22835226
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  22835169 aatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgattacaa-tgtttcccaac 22835226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 29682356 - 29682303
Alignment:
Q  8 aacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  29682356 aacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 29682303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 31314445 - 31314389
Alignment:
Q  5 atgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  31314445 atgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaagtgtttacaa-tgtttcccaac 31314389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 61
Target Start/End: Original strand, 39153529 - 39153585
Alignment:
Q  5 atgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  39153529 atgaacaagacactcaatgattttcattcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 39153585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 16499031 - 16498984
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaat 50  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  16499031 aatgaacaagacactcaatgattttcactaccccaaggtgtttacaat 16498984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 50
Target Start/End: Original strand, 23410496 - 23410543
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaat 50  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  23410496 aatgaacaagacactcaatgattttcactcactcaaggtgtttacaat 23410543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 40735384 - 40735337
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaat 50  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  40735384 aatgaacaagacactcaatgattttcacttttccaaggtgtttacaat 40735337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 224 - 294
Target Start/End: Original strand, 50432938 - 50433006
Alignment:
Q  224 ccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaa 294  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||  ||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  50432938 ccaatagccccctcttttggttc--caagattcacctcttgaccctttgaatctcactcaaagaccctcaa 50433006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 51398815 - 51398768
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaat 50  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  51398815 aatgaacaagacactcaatgattttcactcatccaaggtgtttacaat 51398768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 50
Target Start/End: Original strand, 53921670 - 53921717
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaat 50  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  53921670 aatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtttttacaat 53921717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 760848 - 760791
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||    
T  760848 aatgaacaagacactcaatgattttcactcatccaaggtgtttataa-tgtttcccaac 760791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Original strand, 5258312 - 5258368
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  5258312 aatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 5258368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Original strand, 23392076 - 23392133
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    |||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  23392076 aatgaaaaagacactaaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 23392133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 29810869 - 29810812
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    |||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  29810869 aatgaataagacattcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 29810812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 45095165 - 45095109
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  45095165 aatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 45095109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 193 - 258
Target Start/End: Original strand, 1737247 - 1737311
Alignment:
Q  193 aatctctccccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcac 258  Q
    |||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||  ||||||||||    
T  1737247 aatccctccacaaaagacacgaaccctttt-ccaagagtccgctcttttggttccccaagattcac 1737311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 32891101 - 32891049
Alignment:
Q  7 gaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttccca 59  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  32891101 gaacaagacactcaatgatttttactcacccaaggtgtttacaa-tgtttccca 32891049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 23)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 4 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 21593665 - 21593315
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagctttg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21593665 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagctttg 21593566  T
Q  104 atttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctcccc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |  || ||||| || ||    
T  21593565 atttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcaaaaatgactctccactcatgtgttttccaaccccatgaatct-tctcc 21593467  T
Q  204 aaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttagta 303  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  21593466 aaaaggcaccaaccctttccccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttaaatctttgaacctcacccaaagaccctcaacatttagta 21593367  T
Q  304 tctaaaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagctt 355  Q
    |||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21593366 tctaaaaccctaaaagttctaacctttggtttccatgagattcaccaagctt 21593315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 5043631 - 5043278
Alignment:
Q  1 acgaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-c 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5043631 acgaatgaacaagacactcatgattttcactctcacaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagcc 5043532  T
Q  100 tttgatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctc 198  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |  || ||  ||    
T  5043531 tttgattccactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaaattgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaa--tc 5043434  T
Q  199 tccccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctt 298  Q
    | |||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  5043433 ttcccaaaaggcaccaacccttttcccaagagccctctcttttggttctccaagattctcatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaatctt 5043334  T
Q  299 tagtatctaaaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagct 354  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  5043333 tagtatctaaaaccctaaaagttccctcctttgatttccatgagattcaccaagct 5043278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 4 - 364
Target Start/End: Original strand, 3808876 - 3809237
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-ttt 102  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||    
T  3808876 aatgaacaagacacttgtgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaa-agaaccaacccttagccttt 3808974  T
Q  103 gatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctcc 201  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |  || ||||| ||     
T  3808975 gatttcactaaggattttctcttttggttttacaagactcacccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatct-tct 3809073  T
Q  202 ccaaaaggcacgaacccttttaccaagagcccc-ctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaaccttta 300  Q
    |||||||| || |||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3809074 ccaaaaggaaccaacccttttcacaagagcccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaaccttta 3809173  T
Q  301 gtatctaaaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagctttttcaacaa 364  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  3809174 gtatctaaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgctcaacaa 3809237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 4 - 352
Target Start/End: Original strand, 2973106 - 2973456
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-ttt 102  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  2973106 aatgaacacgacacttatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaatccctaaaagagaaccaacccttagccttt 2973205  T
Q  103 gatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctcc 201  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||| |||| |  || ||||| |||    
T  2973206 gatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgttcacaaatgactctgcattcatgtgtttcccaaccccatgaatct-tcc 2973304  T
Q  202 ccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttag 301  Q
    | |||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  2973305 caaaaaagcaccaacccttttcacaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaacctttag 2973404  T
Q  302 tatcta-aaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaag 352  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2973405 tatctacaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaag 2973456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 4 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 17762991 - 17762636
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactcatga-ttttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctt 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  17762991 aatgaacaagacactcatgaattttcactctctcaaagtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctt 17762892  T
Q  102 tgatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatct-ct 199  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||| |  || |||||       
T  17762891 tgatttcactaaggatcttctctttttgtttcacaagactcacccaagttgctcccaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatctaac 17762792  T
Q  200 ccccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaaccttt 299  Q
    ||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||||||    
T  17762791 ccccaaaaggcaccaaaccttttcacaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagccttgaacttcacccaaagatcctcaaccttt 17762692  T
Q  300 agtatctaaaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagctt 355  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  17762691 agtatctaaaaccctaaaagttctctccttttgtttccatgagattcaccaagctt 17762636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 4 - 355
Target Start/End: Original strand, 26830291 - 26830643
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-ttt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  26830291 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagccttt 26830390  T
Q  103 gatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctcc 201  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||| |||| |  || ||||| ||     
T  26830391 gatttcactaagaatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaatgactctgcgctcatctgtttcccaaccccatgaatct-tct 26830489  T
Q  202 ccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttag 301  Q
    ||||||||||| |||| |||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||| |||||||| ||||||     
T  26830490 ccaaaaggcaccaacctttttcccaagagactcctcttttggttctccaagattcacatcttgaagttttaaaccttactcaaagaccctcagcctttat 26830589  T
Q  302 tatctaaaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagctt 355  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26830590 tatctaaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagctt 26830643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 7 - 364
Target Start/End: Original strand, 22424997 - 22425354
Alignment:
Q  7 gaacaagacactcatga-ttttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagctttgat 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  22424997 gaacaagacactcatgaattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccc-aaaagagaaccaacccttagctttgat 22425095  T
Q  106 ttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctccccaa 205  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||  |||||||||  ||| |||||||||  ||| |  || ||||| |||||||    
T  22425096 ttcctaaggatattctcttttggtttcacaagactaaccgaagttgctcttaaatgactcttcacccatgtgtttcacaaccccatgaatct-tccccaa 22425194  T
Q  206 aaggcacgaacccttttaccaagag--ccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttagta 303  Q
    || |||| ||||||| | |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  22425195 aatgcaccaacccttatcccaagaggcccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctctgaaccacacccaaagaccctcaacctttagta 22425294  T
Q  304 tctaaaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagctttttcaacaa 364  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  22425295 tctaaaaccctaaa-gttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttatccaacaa 22425354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 4 - 306
Target Start/End: Original strand, 603247 - 603550
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-cttt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||    
T  603247 aatgaacaagacactcatgattttcactatcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaaccattagccttt 603346  T
Q  103 gatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctcc 201  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||| |  || ||||| ||     
T  603347 gatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaggacactccactcatgtgtttcccaaccccatgaatct-tct 603445  T
Q  202 ccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttag 301  Q
    ||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||     
T  603446 ccaaaaggcaccaaccctttcctcaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcatccaaagaccctcaacctttac 603545  T
Q  302 tatct 306  Q
    |||||    
T  603546 tatct 603550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 111 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 25073076 - 25072825
Alignment:
Q  111 aaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctccccaaaaggc 210  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||   | ||||||| | || ||| ||||| ||  | |||||||| | || |  || ||||||| ||||| ||||    
T  25073076 aaggatcttctcttttggtttcccaagacctatccaagtttcacataaa-gactctcctttgatgtgtttccaaaccctatgaatctcttcccaagaggc 25072978  T
Q  211 acgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttagtatctaaa- 309  Q
    || | ||||||| |||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  25072977 acaatccctttt-ccaagagccccc-ctttgggttctcaaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaat 25072880  T
Q  310 accctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagctttttcaacaa 364  Q
    |||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  25072879 accctaaaagttcacttctttgatttccatgagattcatcaagcttactcaacaa 25072825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 140 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 26800633 - 26800438
Alignment:
Q  140 tcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctccccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctctt 239  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||| ||| ||  || ||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||    
T  26800633 tcacccaagttgctctcaatagactctccactcatgtgtttccca-tcccatgaatct-tccccaaaaggcaccaacctttttcccaagagccccctctt 26800536  T
Q  240 ttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttagtatcta-aaaccctaaaggttccctcctttggtttc 336  Q
    |||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| |||  |||||||||||||    
T  26800535 ttggttatccatgatccacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctacataccctaaaagttttctcctttggtttc 26800438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 91 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 17757998 - 17757789
Alignment:
Q  91 actcttagc-tttgatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatca 188  Q
    ||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |     
T  17757998 actcttagcctttgatttcactgatgatcttctctttttgtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccc 17757899  T
Q  189 aattaatct-ctccccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatga 287  Q
     || |||||   |||||||| |||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||    
T  17757898 catgaatctaacccccaaaatgcaccaacccttttcacaagagccccctattttggttctccaacattcacatcttcaagctttgaatctcacccaaaga 17757799  T
Q  288 ccctcaacct 297  Q
    || |||||||    
T  17757798 ccatcaacct 17757789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 25 - 176
Target Start/End: Original strand, 5740978 - 5741131
Alignment:
Q  25 tttcactctcccaaggtgtttac-aattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-tttgatttcctaaggatcttctc 122  Q
    |||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||   ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |    
T  5740978 tttcactcaccgaaggtgttttccaattgttttccaactttagaatctaaccccccaaaagtaaccaacccttagcctttgatttactaaggatcttcac 5741077  T
Q  123 ttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgt 176  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||    
T  5741078 tttttgtttctcaagattcacccaaattgctcacaaaagactcccttctcatgt 5741131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 5 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 25073568 - 25073457
Alignment:
Q  5 atgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttac-aattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctt 101  Q
    |||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||    
T  25073568 atgaacaagatactcaatgattt-cactcacccaagatgtttcccaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaatcaacccttagcctt 25073470  T
Q  102 tgatttcctaagg 114  Q
    | |||||||||||    
T  25073469 taatttcctaagg 25073457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 11660574 - 11660452
Alignment:
Q  37 aaggtgtttacaa-ttgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttcctaaggatcttctcttttggtttcac 134  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||  |||||||| ||||| |||||| |||||| || | | |||||||||| || |    
T  11660574 aaggtgtttacaaattgtttccgaactctagaatctaacccc--aaaatgaaccaacccttagcctttgaattcctatggttatcctcttttggtctccc 11660477  T
Q  135 aagagtcacccaagttgctcacaaa 159  Q
    |||| ||| |||| |||||||||||    
T  11660476 aagattcatccaaattgctcacaaa 11660452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Original strand, 9183198 - 9183255
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  9183198 aatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 9183255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Original strand, 28137575 - 28137632
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  28137575 aatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 28137632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 4045420 - 4045364
Alignment:
Q  8 aacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactc 63  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  4045420 aacaagacactcaatgattttcactcaccctaggtgtttacaaatgtttcccaactc 4045364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 61
Target Start/End: Original strand, 26954453 - 26954509
Alignment:
Q  5 atgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  26954453 atgaacaagacactcaatgattttcactccccaaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 26954509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Original strand, 2171698 - 2171754
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  2171698 aatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 2171754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Original strand, 3039070 - 3039127
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  3039070 aatgaacaagacattcaatgattttcactcactcaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 3039127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Original strand, 5406366 - 5406422
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  5406366 aatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 5406422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Original strand, 5410691 - 5410747
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  5410691 aatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 5410747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 16567201 - 16567160
Alignment:
Q  10 caagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaat 50  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16567201 caagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 16567160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 4 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 7328 - 6977
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-ttt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  7328 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcc-agctctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagccttt 7230  T
Q  103 gatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctcc 201  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |  || ||||| |||    
T  7229 gattttactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttttccaaccccatgaatct-tcc 7131  T
Q  202 ccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttag 301  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7130 ccaaaaggcaccaacccttttcacaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttag 7031  T
Q  302 tatctaaaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagctt 355  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7030 tatctaaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagctt 6977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 39)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 4 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 40147262 - 40146910
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-ttt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  40147262 aatgaacaagacactcatgatttccactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagccttt 40147163  T
Q  103 gatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctcc 201  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |  || ||||| |||    
T  40147162 gatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatct-tcc 40147064  T
Q  202 ccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttag 301  Q
    ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40147063 ccaaaaggcaccaaccattttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttag 40146964  T
Q  302 tatctaaaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagctt 355  Q
    |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40146963 tatctaaaaccctaaaagtttcatcctttggtttccatgagattcaccaagctt 40146910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 4 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 213466 - 213117
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-ttt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||| |||    
T  213466 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaacc----cttagccttt 213371  T
Q  103 gatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctcc 201  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |  || ||||| ||     
T  213370 gatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatct-tct 213272  T
Q  202 ccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttc-aagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaaccttta 300  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  213271 ccaaaaggcaccaacccttttcccaagagccccctcttttggttctcccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaaccttta 213172  T
Q  301 gtatctaaaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagctt 355  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  213171 gtatctaaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcatcaagctt 213117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 4 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 38747006 - 38746654
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-ttt 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  38747006 aatgaacaagatactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagccttt 38746907  T
Q  103 gatttcc-taaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctcc 201  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |||| |  || ||||| |||    
T  38746906 gatttcaataaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcgcaaatgactctccactcacgtgtttcccaaccccatgaatct-tcc 38746808  T
Q  202 ccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttag 301  Q
    ||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38746807 ccaaaaggcaccaacccttttcttaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaaactttgaacctcacccaaagaccctcaacctttag 38746708  T
Q  302 tatctaaaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagctt 355  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38746707 tatctaaaaccctaaaagttctctcctttggtttccatgagattcaccaagctt 38746654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 14 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 27015523 - 27015190
Alignment:
Q  14 acactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-tttgatttc-cta 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    
T  27015523 acactcatgattttcactctcccaagatgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacta 27015424  T
Q  112 aggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctccccaaaaggca 211  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |  || | ||| |||||||||||||    
T  27015423 aggatcttctcttttggttttacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgattct-tccccaaaaggca 27015325  T
Q  212 cgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttagtatctaaaac 311  Q
    | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27015324 ccaacccttttcacaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgatcctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaac 27015225  T
Q  312 cctaaaggttccctcctttggtttccatgagattc 346  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  27015224 cctaaaagttccctcctttgatttccattagattc 27015190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 4 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 5058048 - 5057705
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-ttt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  5058048 aatgaacaagacactcatgattttcactcttccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagccttt 5057949  T
Q  103 gatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctcc 201  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  || ||||| |||    
T  5057948 gattttactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgttttccaaccccatgaatct-tcc 5057850  T
Q  202 ccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttag 301  Q
    ||||||||||| |||| |||| |||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  5057849 ccaaaaggcaccaacctttttcccaaaagcccc-tcttttggttctcaaagattcacatcttgaagctttgatcctcacccaaagaccctcaacctttag 5057751  T
Q  302 tatctaaaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattca 347  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5057750 tatctaaaaccctaaaagttctctcctttggtttccatgagattca 5057705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 4 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 28278317 - 28277964
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-ttt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||    
T  28278317 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaatgtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccctaaaagagagccaacccttagcattt 28278218  T
Q  103 gatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctcc 201  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||| |||| |  || ||||| |||    
T  28278217 gatttcactaacaatcttctcttttgatttcacaagactcacccaagttgctcacaatagtctctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatct-tcc 28278119  T
Q  202 ccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccc-tcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaaccttta 300  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  28278118 ccaaaaggcaccaacccttttcccaagagcccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcatccaaagaccctcaaccttta 28278019  T
Q  301 gtatctaaaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagctt 355  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  28278018 gtatctaaaaccctaaaagtttcctcctttagtttccttgagattcaccaagctt 28277964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 4 - 364
Target Start/End: Original strand, 27637780 - 27638142
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactcatga-ttttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctt 101  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| |||    
T  27637780 aatgaacaagacactcatgaattttcactcttccaaggtgttcacaattgtttcccaactctagcatctaacccccaaaagagaacaaacttttagtctt 27637879  T
Q  102 tgatttc-ctaaggatct--tctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctc 198  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||| | || |  || ||  ||    
T  27637880 tgatttcactaaggatcttctctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcataaaagactcttcactcatgtgtttcctaaccccatgaa--tc 27637977  T
Q  199 tccccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctt 298  Q
    | ||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  27637978 ttcccaaaatgcaccaacccttttcccaagagctccctcttttggttctccaagattcacatcttgaa-ctttgaacctcacccaaagattctcaacctt 27638076  T
Q  299 tagtatctaaaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagctttttcaacaa 364  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  27638077 tagtatctaaaaccttaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcctttttaacaa 27638142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 25 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 4160611 - 4160291
Alignment:
Q  25 tttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-tttgatttcctaaggatcttctct 123  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  4160611 tttcactcaaccaatgtgtttacaattgtttctcaactct-gaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttaattacctaaggatcttctct 4160513  T
Q  124 tttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctccccaaaaggcacgaaccctttta 223  Q
    ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||| || |||| |  || |||||||||||||||| |||  |||| | |     
T  4160512 tttggtttcccaagattcaccctagttgctcacaaatgactctccacttacgtg-ttcccaaccctatgaatctctccccaaaagacacttaccc-tctc 4160415  T
Q  224 ccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttagtatctaaa-accctaaaggttc 322  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||| || |||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  4160414 ccaagagccccctcttttagttctccaggattcacttctttaaactttgaacatcacccaa-aaccctcaaactttagtatctaaataccctaaatgttc 4160316  T
Q  323 cctcctttggtttccatgagattca 347  Q
     ||| ||||||||||||||||||||    
T  4160315 tctcatttggtttccatgagattca 4160291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 47 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 316720 - 316422
Alignment:
Q  47 caattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-tttgatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcaccc 145  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||| |||||     
T  316720 caattgttttccaactttaaaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttccta-ggattttctcttttggtctcccaagattcacc- 316623  T
Q  146 aagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctccccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggtt 245  Q
    |||||||||||||| ||||| |   | |||||||| |||| |  || |||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||| |||||||||    
T  316622 aagttgctcacaaa-gactctcttttgatgtgtttcccaaccttatgaatctctccccaaaaggcaccaaccctctc-ccaagagcccccccttttggtt 316525  T
Q  246 cttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttagtatctaa-aaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagat 344  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||  |||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  316524 ctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaagtacaataaaagttctctcctttagtttccatgagat 316425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 25 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 35616149 - 35615820
Alignment:
Q  25 tttcactctcccaaggtgtttac-aattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagctttgatttcctaaggatcttctct 123  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||   |||||||||| | | ||||||| ||    
T  35616149 tttcactcacccaaggtgtttcctaattgtttccaaactctagaatctaaccac-aaaagagaatcaactctagcctttgatttcttgatgatcttcgct 35616051  T
Q  124 tttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctccccaaaaggcacgaaccctttta 223  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||| | ||||| |||||  |  | ||||||||  |||    || |||||||||||||||||||  | ||||||      
T  35616050 tttggtttcccaagactcaccaaagttgattacaaa-gactcttcttttatgtgtttctcaactccatgaatctctccccaaaaggcatcacccctttc- 35615953  T
Q  224 ccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttagtatctaaa-accctaaaggttc 322  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||     
T  35615952 ccaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcactcaaagaccctcaacctttagtatctaaatactctaaaagttt 35615853  T
Q  323 cctcctttggtttccatgagattcatcaagctt 355  Q
      || ||||||||| | |||||||| |||||||    
T  35615852 tttcatttggtttcaaggagattcaccaagctt 35615820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 167 - 355
Target Start/End: Original strand, 16642210 - 16642396
Alignment:
Q  167 ccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctccccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaa 266  Q
    |||||||||||||| | || |  || ||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16642210 ccactcatgtgtttcctaaccccatgaatctgtccccaaaaggcaccaaccctttc-ccaagagccc--tcttttggttcttcaagattcacttcttgaa 16642306  T
Q  267 gctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttagtatctaaa-accctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagctt 355  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16642307 gctttgaacctcacccaaagaccatcaacctttagtatctaaataccctaaaagtgctctcctttggtttccatgagattcaccaagctt 16642396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 47 - 353
Target Start/End: Original strand, 14689622 - 14689925
Alignment:
Q  47 caattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-tttgatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcaccc 145  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||| | | |     
T  14689622 caattgtttcacaactctagaatctatcccc-aaaagagaaccaacccctagcctttgattttctaaggatcttttcttttggtgtcccaagacttatct 14689720  T
Q  146 aagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctccccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggtt 245  Q
    ||||||||||||||| |||| ||  | |||||||| ||| ||  |  |||||||||  ||||||||| |||||||| || |||| |||| ||||||||||    
T  14689721 aagttgctcacaaat-actctccttttatgtgtttcccattctcacgaatctctcc--aaaaggcaccaaccctttcac-aagaaccccttcttttggtt 14689816  T
Q  246 cttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttagtatctaaa-accctaaaggttccctcctttggtttccatgagat 344  Q
    || ||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||| |||||| | ||||||||  ||||||| |||  ||||||| |||||||||||||    
T  14689817 ctccaaaattcacatcttgaaactttgaacatcactcaaagacccttaaccttcactatctaaatgccctaaaagttttctcctttagtttccatgagat 14689916  T
Q  345 tcatcaagc 353  Q
    ||| |||||    
T  14689917 tcaccaagc 14689925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 12 - 299
Target Start/End: Original strand, 33906202 - 33906491
Alignment:
Q  12 agacactca-tgattttcactctcccaaggtgttta-caattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaac-caactc-ttagc-tttgatt 106  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||  || ||||||| |||||||||||| || ||||| ||| ||||| | | || ||||| |||||||    
T  33906202 agacactcaatgatgttcactctcgcaaggtgtttctcatttgtttcacaactctagaatatatccccccaaa-agaacgccagtcattagcctttgatt 33906300  T
Q  107 tcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctccccaaa 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || | ||| ||  | ||||||||  ||| |  || ||||||||||||||    
T  33906301 tcctaaggatcttctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcactaa-gtctctcctttgatgtgtttctcaaccccatgaatctctccccaaa 33906399  T
Q  207 aggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaaccttt 299  Q
    |||||| |||||| |  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  33906400 aggcaccaaccctctc-ccaagagcccccttttttggttctacaagattcacattttgaggcttcgaacctcactcaaagaccctcaaccttt 33906491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 162 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 30802782 - 30802592
Alignment:
Q  162 actccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctccccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatc 261  Q
    |||| |||||||||||||||| || |  || |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||  |||||  |||||    
T  30802782 actctccactcatgtgttttctaaccccatgaatctctccccaaaaggcacaaaccctttc-ccaagagcctcctcttttggttctctaagata-acatc 30802685  T
Q  262 ttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttagtatctaaa-accctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagc 353  Q
     ||||||||||||||||||| || ||||||||||||  | |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  30802684 atgaagctttgaacctcacctaaagaccctcaacctagaatatctaaataccctaaaagttccctcatttggtttccatgagattcaccaagc 30802592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 164
Target Start/End: Original strand, 16641107 - 16641269
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctt 101  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||    
T  16641107 aatgaacaagacacttaatgaatttcactcactcaaggtgtttacaaatgttccccaactctagaatctaatccccaaaagagaaccaacctttagcctt 16641206  T
Q  102 tgatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgact 164  Q
    ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||    
T  16641207 tgattttttaagtatcttctcttttggtttcacaagactcaccaaagttgttcacaattgact 16641269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 169 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 30793073 - 30792889
Alignment:
Q  169 actcatgtgttttccaatcaaattaatctctccccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagc 268  Q
    |||||||||||| |||| |  || ||| |||||||||||||||| |||| |||| |||| |||| | | |||||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  30793073 actcatgtgtttcccaaccccatgaatatctccccaaaaggcaccaacc-ttttcccaa-agccacatattttggttctccaagata-acatcttgaagc 30792977  T
Q  269 tttgaacctcacccaatgaccctcaacctttagtatctaa-aaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagctt 355  Q
    ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  30792976 tttgaacatcacctaaagaccctcaacctttagtatctaattaccctaaaagtttactcatttggtttccatgagattcaccaagctt 30792889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 160 - 364
Target Start/End: Original strand, 10055031 - 10055235
Alignment:
Q  160 tgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctccccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcaca 259  Q
    |||||| | |||||||||||| |||| |   | |||||||||||| ||||||| || |||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  10055031 tgactctctactcatgtgtttcccaaccccgtgaatctctccccataaggcaccaaacctttc-ccaagagccctctcttttggttctccaagattcaca 10055129  T
Q  260 tcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttagtatctaa-aaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagcttttt 358  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  ||| |||| |||||||||| ||  || ||||| ||||| || |||| |||| |||||||||| ||| |||  |    
T  10055130 tcttgaagctttgaatctcacccaaaaaccttcaatctttagtatccaagtactctaaatgttccatcatttgatttctatgagattcaccaaacttact 10055229  T
Q  359 caacaa 364  Q
    ||||||    
T  10055230 caacaa 10055235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 57 - 260
Target Start/End: Original strand, 21205873 - 21206076
Alignment:
Q  57 ccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctca 155  Q
    ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||  || | |||||||| || || |    
T  21205873 ccaactccataatctaaccctcaaaagagaaccaatccttagtctttgatttcataaggttcttcacttttagtttcctaaaattcacccaaatttctga 21205972  T
Q  156 caaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctccccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagatt 255  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| |  || || ||||||  ||||| ||| ||||| ||| | |||| |||| ||||||||||||  ||||||    
T  21205973 caaatgactcctcactcatgtgtttcccaaccctatgaacctctccgaaaaagacaccaaccc-tttccaaagaaccccatcttttggttctctaagatt 21206071  T
Q  256 cacat 260  Q
    |||||    
T  21206072 cacat 21206076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 8019557 - 8019464
Alignment:
Q  34 cccaaggtgtttac-aattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttcctaaggatcttctcttttg 127  Q
    |||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  8019557 cccaaggtgtttcctaattatttcccaactatagaatctaacccccaaaa-ataaccaac-cttagcctttgattttctaaggatcttcacttttg 8019464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 289 - 364
Target Start/End: Original strand, 33906584 - 33906659
Alignment:
Q  289 cctcaacctttagtatctaaa-accctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagctttttcaacaa 364  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| |||| || |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  33906584 cctcaacctttaatatctaaataccctaaaagttctcttctttggtttc-atgagattcaccaagcttgttcaacaa 33906659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 50
Target Start/End: Original strand, 8566113 - 8566160
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaat 50  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8566113 aatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 8566160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 50
Target Start/End: Original strand, 42428597 - 42428644
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaat 50  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42428597 aatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 42428644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 533770 - 533713
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  533770 aatgaacaagacacgcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 533713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Original strand, 5887583 - 5887640
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  5887583 aatgaacaagacattcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 5887640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Original strand, 28750822 - 28750879
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  28750822 aatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgttttcaa-tgtttcccaac 28750879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 31182974 - 31182917
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  31182974 aatgaacaagacactcaatgattttcactcacctaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 31182917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Original strand, 39468716 - 39468773
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  39468716 aatgaacaagacactcaatgattttcactcactcaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 39468773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 42926891 - 42926838
Alignment:
Q  7 gaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaa 60  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  42926891 gaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaa 42926838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Original strand, 42426402 - 42426458
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaa 60  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  42426402 aatgaacaagacactcaataattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaa 42426458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 13488204 - 13488157
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaat 50  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  13488204 aatgaacaagacactcaataattttcactcacccaaggtgtttacaat 13488157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 32636825 - 32636778
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaat 50  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32636825 aatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 32636778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 33831681 - 33831634
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaat 50  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33831681 aatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 33831634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 20 - 132
Target Start/End: Original strand, 10700832 - 10700945
Alignment:
Q  20 atgattttcactctcccaaggtgtttac-aattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttcctaaggatc 117  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| | ||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||   |||||  ||||| |||| ||||||| ||||||    
T  10700832 atgattttcacgcacccaaggtgtttcctaattgtttcccatttttagaatctagcccccaaaag-tcaccaaaccttagccttttatttcctgaggatc 10700930  T
Q  118 ttctcttttggtttc 132  Q
    ||| | |||||||||    
T  10700931 ttcacgtttggtttc 10700945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 13239752 - 13239696
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  13239752 aatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 13239696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 13343061 - 13343005
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  13343061 aatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 13343005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 19806384 - 19806328
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  19806384 aatgaacaagacactcaatgattt-cactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 19806328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 25412762 - 25412706
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  25412762 aatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 25412706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Original strand, 36074212 - 36074268
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  36074212 aatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 36074268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 538026 - 537970
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaa 60  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  538026 aatgaacaagacacgcaatgattttcactcacccaaggtgtttacga-tgtttcccaa 537970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 250; Significance: 1e-138; HSPs: 55)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 4 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 6431972 - 6431620
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-ttt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||    
T  6431972 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaatgtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaaccctcaaaagagaaccaacccttagcattt 6431873  T
Q  103 gatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctcc 201  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |  || ||||| |||    
T  6431872 gatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctacactcatgtgttttccaaccccatgaatct-tcc 6431774  T
Q  202 ccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttag 301  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6431773 ccaaaaggcaccaaccctttccccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagttttgaacctcacccaaagaccctcaacctttag 6431674  T
Q  302 tatctaaaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagctt 355  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  6431673 tatctaaaaccctaaaagttccctcctttggtttctatgagattcaccaagctt 6431620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 4 - 355
Target Start/End: Original strand, 34310883 - 34311236
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-cttt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||    
T  34310883 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattatttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacctttagccttt 34310982  T
Q  103 gatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctcc 201  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |  || || || |||    
T  34310983 gatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttttccatccccatgaacct-tcc 34311081  T
Q  202 ccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttag 301  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34311082 ccaaaaggcaccaacccttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaggaccctcaacctttag 34311181  T
Q  302 tatcta-aaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagctt 355  Q
    |||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34311182 tatctacataccctaaaagttccttcctttggtttccatgagattcaccaagctt 34311236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 4 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 2390283 - 2389928
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-ttt 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  2390283 aatgaacaagacacttatgattttcgctctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagccttt 2390184  T
Q  103 gatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctcc 201  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |  || ||||| |||    
T  2390183 gatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactatccactcatgtgttttccaaccccatgaatct-tcc 2390085  T
Q  202 ccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttag 301  Q
    ||||||| ||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2390084 ccaaaagccaccaacccttttcgcaatagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttag 2389985  T
Q  302 tatctaaaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagcttttt 358  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  2389984 tatctaaaaccctaaaagtttcctcctttggtttccatgagattcaccaagtttttt 2389928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 8 - 355
Target Start/End: Original strand, 4512561 - 4512908
Alignment:
Q  8 aacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-tttgatt 106  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  4512561 aacaaggcactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatataacccccaaaagagaactaacccttagcctttgatt 4512660  T
Q  107 tc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctccccaa 205  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | || |  || ||||| |||||||    
T  4512661 tcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttccaaaccccatgaatct-tccccaa 4512759  T
Q  206 aaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttagtatc 305  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  4512760 aaggcaccaaccctttc-ccaagagccccctcttttggttctctaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagaatc 4512858  T
Q  306 taaaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagctt 355  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4512859 taaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagctt 4512908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 4 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 3258996 - 3258639
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactcatga-ttttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagcttt 102  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||    
T  3258996 aatgaacaagacactcatgaattttcactttcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaatgagaaccaacccttaggttt 3258897  T
Q  103 gatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctccc 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||| |||  |  || ||||| ||||    
T  3258896 gatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctaataaaagactctccactcatatgtttcccatccccatgaatct-tccc 3258798  T
Q  203 caaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttagt 302  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3258797 caaaaggcaccaacccttttcccaagagccccatctttttgttctccaagattcacatcatgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagt 3258698  T
Q  303 atcta-aaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagctttttca 360  Q
    ||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  3258697 atctacataccctaaaagttccctcctctggtttccatgagattcaccaagttttttca 3258639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 4 - 347
Target Start/End: Original strand, 2361139 - 2361482
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-ttt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||    
T  2361139 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacctc-aaaagagaaccaacccttagccttt 2361237  T
Q  103 gatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctcc 201  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |  || ||||  |||    
T  2361238 gatttcactaaggatcttctcttttggtttcataagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatca-tcc 2361336  T
Q  202 ccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttag 301  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||    
T  2361337 ccaaaaggcaccaacccttttcacaagagccccctcttttgattcttcaagattcacatcttgaaggattgaatctcacccaaagaccctcaatctttag 2361436  T
Q  302 tatctaaaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattca 347  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2361437 tatctaaaatcctaaaagttccctcctttggtttccatgagattca 2361482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 7 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 29608735 - 29608382
Alignment:
Q  7 gaacaagacactcatgat-tttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-tttga 104  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  29608735 gaacaagacactcatgaagtttcgctctctcaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttga 29608636  T
Q  105 tttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctcccc 203  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |  || ||||      |    
T  29608635 tttcactaagaatcttctattttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatc------c 29608542  T
Q  204 aaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttagta 303  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29608541 aaaaggcaccaacccttttcacaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagttttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagta 29608442  T
Q  304 tctaaaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagctttttcaaca 363  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  29608441 tctaaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagctttatcaaca 29608382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 4 - 355
Target Start/End: Original strand, 6360079 - 6360431
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-cttt 102  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  6360079 aatgaacaagtcactcatgattttcattctcccaaggtgtttaaaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagccttt 6360178  T
Q  103 gatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctcc 201  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    || ||||| ||     
T  6360179 gatttcactaaggatcttctcttttgatttcacaagactcacccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttttcaactccatgaatct-tct 6360277  T
Q  202 ccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttag 301  Q
     |||||||||| |  ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||     
T  6360278 tcaaaaggcaccattccttttctcaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttaa 6360377  T
Q  302 tatctaaaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagctt 355  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6360378 tatctaaaaccctaaaagttctctcctttggtttccatgagattcaccaagctt 6360431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 4 - 355
Target Start/End: Original strand, 48599501 - 48599843
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-cttt 102  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  48599501 aatgaacaagacaatcatgattttcactcctccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatataacccccaaaagagaaccaacccttagccttt 48599600  T
Q  103 gatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctcc 201  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||| |  || ||||| |||    
T  48599601 gatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctctactcatgttttttccaaccccatgaatct-tcc 48599699  T
Q  202 ccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttag 301  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48599700 ccaaaaggcaccaacccttttcacaagagccccctcttttgg----------ttcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttag 48599789  T
Q  302 tatctaaaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagctt 355  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  48599790 tatctaaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagctt 48599843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 8 - 355
Target Start/End: Original strand, 4508877 - 4509216
Alignment:
Q  8 aacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatt 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  4508877 aacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccataaaagagaaccaatccttagcctttgatt 4508976  T
Q  107 tc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctccccaa 205  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |  || ||||| |||||||    
T  4508977 tcactaaggatcttatcttttggtttcacaagactcaccaaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatct-tccccaa 4509075  T
Q  206 aaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttagtatc 305  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  4509076 aaggcaccaaccc-tttcccaagagctccctcttttggttc--------tcacatcttgaagctttgaacctcacccaaaaaccctcaacctttagtatc 4509166  T
Q  306 taaaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagctt 355  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  4509167 taaaaccctaaaagttccatcctttggtttccatgagattaaccaagctt 4509216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 8 - 355
Target Start/End: Original strand, 4510719 - 4511058
Alignment:
Q  8 aacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatt 106  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||   |||| ||||||||    
T  4510719 aacaaggcactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccataaaagagaaccaatcgttagcctttgatt 4510818  T
Q  107 tc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctccccaa 205  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |  || ||||| |||||||    
T  4510819 tcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcaccaaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatct-tccccaa 4510917  T
Q  206 aaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttagtatc 305  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  4510918 aaggcaccaaccc-tttcccaagagctccctcttttggttc--------tcacatcttgaagctttgaacctcacccaaaaaccctcaacctttagtatc 4511008  T
Q  306 taaaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagctt 355  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  4511009 taaaaccctaaaagttccatcctttggtttccatgagattaaccaagctt 4511058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 180; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 4 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 22269974 - 22269623
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactcatga-ttttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagctt- 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |     
T  22269974 aatgaacaagacactcatgaattttcactctcccaaggtgtttagaattgtttcc-aactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccatagccta 22269876  T
Q  102 tgatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctc 200  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||  ||||| |||||||||||||| ||   |  || ||||| ||    
T  22269875 tgatttcactaaggatcttctattttggtttcacaagactcacccaagtttctctcaatagactctccactcatgtgtttcccctccccatgaatct-tc 22269777  T
Q  201 cccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaaccttta 300  Q
    |||||||||||| ||| | ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  22269776 cccaaaaggcaccaactc-tttcccaagag-cccctcttttggttctccaagattcacatcttgtagctttgaacctcacccaaagaccctcaaacttta 22269679  T
Q  301 gtatcta-aaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagctt 355  Q
    ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22269678 gtatctacataccctaaatgttccctcctttggtttccatgagattcaccaagctt 22269623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 8 - 347
Target Start/End: Original strand, 22328568 - 22328911
Alignment:
Q  8 aacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaaccccc-aaaagagaaccaactcttagcttt-ga 104  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||    
T  22328568 aacaagacactcaatgattttcattccctcaaggtgtttacaattgtttcccaactttaggatctaaccccccaaaagagaaccaacccttagcttttga 22328667  T
Q  105 tttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctcccca 204  Q
    || | ||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||| |  || ||||||||||||    
T  22328668 ttacataaggatattctcttttagtttcccaagattcacccaagttgctcacaaatgactctctactcatgtttttcccaaccctatgaatctctcccca 22328767  T
Q  205 aaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttagtat 304  Q
    |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||| || ||||||||||||||||    
T  22328768 aaaggcaccaactcttttcctaagagccccctcttttggttctccaagatttacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaacctttagtat 22328867  T
Q  305 ctaaa-accctaaaggttccctcctttggtttccatgagattca 347  Q
    ||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  22328868 ctaaataccctaaaagttttctcctttggtttccatgagattca 22328911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 199 - 364
Target Start/End: Original strand, 32358199 - 32358364
Alignment:
Q  199 tccccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctt 298  Q
    |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32358199 tccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctt 32358298  T
Q  299 tagtatctaaaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagctttttcaacaa 364  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32358299 tagtatctaaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagctttttcaacaa 32358364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 4 - 221
Target Start/End: Original strand, 8359484 - 8359703
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatct-aacccccaaaagagaaccaactcttag-ctt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||    
T  8359484 aatgaacaagacactcatgattttcactctctcaaggtgtttacaattgttttccaactcaagaatctaaacccccaaaaaataaccaactcttagcctt 8359583  T
Q  102 tgatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctc 200  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |  || ||||| ||    
T  8359584 tgatttcactaaggattttctcttttggtttcacaagactcatccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatct-tc 8359682  T
Q  201 cccaaaaggcacgaacccttt 221  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  8359683 cccaaaaggcaccaacccttt 8359703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 99 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 5116539 - 5116291
Alignment:
Q  99 ctttgatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctc 198  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||  ||||||||||| | |   | | |||||| |||||| ||| ||||||    
T  5116539 ctttgatttcctgaggatcttctcttttggttacccaagactcacctaagtttatcacaaatgaccctcatttgaagtgtttaccaatccaatgaatctc 5116440  T
Q  199 tccccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctt 298  Q
    || |||||||||||  ||||| |  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  5116439 tctccaaaaggcaccgaccctctc-ccaagagccccctcttttggttctcaaagattcacatcttgaagttttgaacatcacctaaagaccctcaacctt 5116341  T
Q  299 tagtatctaaa-accctaaaggttccctcctttggtttccatgagattca 347  Q
    |||||| |||| |||||||| || |||||||||||| |||||||||||||    
T  5116340 tagtatttaaataccctaaaagtcccctcctttggtatccatgagattca 5116291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 264 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 30814505 - 30814414
Alignment:
Q  264 gaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagctt 355  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30814505 gaagctttgaacctcacccaaagaccctcaaccttaagtatctaaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagctt 30814414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 201 - 296
Target Start/End: Original strand, 22552804 - 22552897
Alignment:
Q  201 cccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacc 296  Q
    |||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||  |||| || ||||||||| |||||||||||    
T  22552804 cccaaaaggcaccaaccgttt--ccaagagccccctcttttggttctctaagattcacattttgaccctttaaatctcacccaaagaccctcaacc 22552897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 159
Target Start/End: Original strand, 1360321 - 1360478
Alignment:
Q  5 atgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttac-aattgtttcccaactctagaatctaa-cccccaaaagagaaccaactctta-gct 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||| ||||| || ||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||  ||    
T  1360321 atgaacaagagactcaatgattt-cactcaccaaaggtgtttcccaattgtttttcaactctagaatctaaccccccaaaagagaaccaatccatatcct 1360419  T
Q  101 ttgatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaa 159  Q
    ||||||||| ||  || ||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||| ||||    
T  1360420 ttgatttcccaaaaatattctcttttggttttccaagactcactcaagttgctcgcaaa 1360478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Original strand, 36146575 - 36146633
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  36146575 aatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaaatgtttcccaac 36146633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Original strand, 4538707 - 4538764
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  4538707 aatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatt-tttcccaac 4538764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Original strand, 24526064 - 24526121
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  24526064 aatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 24526121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Original strand, 31733136 - 31733193
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  31733136 aatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 31733193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 43864245 - 43864188
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  43864245 aatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 43864188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Original strand, 47676303 - 47676360
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactcat-gattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  47676303 aatgaacaagacactcattgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 47676360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 159
Target Start/End: Original strand, 23794024 - 23794149
Alignment:
Q  34 cccaaggtgtttacaa-ttgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-tttgatttcctaaggatcttctcttttggttt 131  Q
    ||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| | ||| ||  ||||||  ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  23794024 cccaatgtgtttacaaattgtttttcaactctagaatctaaccacaaaatga--accaaccattagcctttgattttctaaggatctcctcttttggtct 23794121  T
Q  132 cacaagagtcacccaagttgctcacaaa 159  Q
    |  | || |||||||| |||||||||||    
T  23794122 cttacgattcacccaaattgctcacaaa 23794149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 50
Target Start/End: Original strand, 14070000 - 14070047
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaat 50  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14070000 aatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 14070047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 50
Target Start/End: Original strand, 14380028 - 14380075
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaat 50  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14380028 aatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 14380075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 50
Target Start/End: Original strand, 31105560 - 31105607
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaat 50  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31105560 aatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 31105607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 50
Target Start/End: Original strand, 47674110 - 47674157
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaat 50  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  47674110 aatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 47674157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 1113658 - 1113601
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||    
T  1113658 aatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaagttgtttacaa-tgtttcccaac 1113601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Original strand, 2761469 - 2761526
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  2761469 aatgaacaagacactcgatgattttcactcacccaatgtgtttacaa-tgtttcccaac 2761526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 4586162 - 4586105
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  4586162 aatgaacaagacactcaatgatttacactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 4586105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 8153343 - 8153286
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  8153343 aatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaatgtgtttacaa-tgtttcccaac 8153286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Original strand, 12098026 - 12098083
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||    
T  12098026 aatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaagatgtttacaa-tgtttcccaac 12098083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 27347818 - 27347761
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  27347818 aatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaatgtgtttacaa-tgtttcccaac 27347761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 49
Target Start/End: Original strand, 30024899 - 30024945
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaa 49  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30024899 aatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa 30024945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Original strand, 38671389 - 38671446
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  38671389 aatgaacaagacactcaatgattttcgctcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 38671446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Original strand, 41649177 - 41649234
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  41649177 aatgaacaagacactcaatgattttcacttacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 41649234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 158
Target Start/End: Original strand, 43363683 - 43363737
Alignment:
Q  104 atttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaa 158  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||    
T  43363683 atttcctaaagatcttctcttttggtctctcaagattcacccaaattgctcacaa 43363737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 48491580 - 48491523
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  48491580 aatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaagtgtttacaa-tgtttcccaac 48491523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 23555040 - 23554982
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactc 63  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23555040 aatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaactc 23554982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 31518796 - 31518752
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttac 47  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31518796 aatgaacaagacactcgatgattttcactcacccaaggtgtttac 31518752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 4178775 - 4178719
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  4178775 aatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 4178719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Original strand, 4253696 - 4253754
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||||    
T  4253696 aatgaacaagaaactcaatgattttcactcacctaaggtgtttacaaatgttttccaac 4253754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Original strand, 5514176 - 5514234
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||    
T  5514176 aatgaacaagaaactcaatgattttcactcatcgaaggtgtttacaagtgtttcccaac 5514234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 18126645 - 18126588
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||    
T  18126645 aatgaacaaaacactcaatgattttcactcacccaagttgtttacaa-tgtttcccaac 18126588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Original strand, 24514928 - 24514984
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  24514928 aatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 24514984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 29991055 - 29990999
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  29991055 aatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 29990999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 35853915 - 35853859
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  35853915 aatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 35853859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Original strand, 41317601 - 41317658
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  41317601 aatgaacaagagactcaatgattttcactcatccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 41317658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 48408803 - 48408747
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  48408803 aatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 48408747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 48489432 - 48489375
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  48489432 aatgaacaagacatttaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 48489375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Original strand, 25767125 - 25767180
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaa 60  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  25767125 aatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaa 25767180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 26417317 - 26417261
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaa 60  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| | | |||||||||||||| ||||||||||    
T  26417317 aatgaacaagacactcaatgattttcacccgctcaaggtgtttacaa-tgtttcccaa 26417261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 250; Significance: 1e-138; HSPs: 36)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 4 - 355
Target Start/End: Original strand, 1631899 - 1632251
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-ttt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  1631899 aatgaacaagacactcatgattttcactctctcaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagccttt 1631998  T
Q  103 gatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctcc 201  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |  || ||||| |||    
T  1631999 gatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatct-tcc 1632097  T
Q  202 ccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttag 301  Q
    ||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  1632098 ccaaaagacaccaacccttttcacaagagccccctcttttggttccccaagattcacatcttgaagctttgaacctcactcaaagaccctcaacctttag 1632197  T
Q  302 tatctaaaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagctt 355  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1632198 tatctaaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagctt 1632251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 4 - 358
Target Start/End: Original strand, 42288277 - 42288631
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-cttt 102  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  42288277 aatgcacaagacactcgtgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaaacccgaaaagagaaccaacccttagccttt 42288376  T
Q  103 gatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctcc 201  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |  || ||  ||| |    
T  42288377 gatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaa--tcttc 42288474  T
Q  202 ccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttag 301  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42288475 ccaaaaggcaccaacccttttcccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagttttgaacctcacccaaagaccctcaacctttag 42288574  T
Q  302 tatctaaaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagcttttt 358  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  42288575 tatctaaaaccctaaaagttctctcatttggtttccatgagattcacctagcttttt 42288631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 4 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 45726930 - 45726579
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-ttt 102  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  45726930 aatgaataagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcctaaccctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagccttt 45726831  T
Q  103 gatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctcc 201  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | || |  || ||||| |||    
T  45726830 gatttcactaaggatcttctcttttggtttcacatgactcacccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttccaaaccccatgaatct-tcc 45726732  T
Q  202 ccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttag 301  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  45726731 ccaaaaggcaccaaccctttc-ccaagagctccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagactctcaacctttag 45726633  T
Q  302 tatctaaaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagctt 355  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  45726632 tatctaaaaccctaaaagttccctcatttggtttccatgagattcaccaagctt 45726579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 4 - 355
Target Start/End: Original strand, 35447051 - 35447403
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-cttt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  35447051 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagccttt 35447150  T
Q  103 gatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctcc 201  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |  || ||||| | |    
T  35447151 gatttcactaagtatcttctcttttggttttacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatct-ttc 35447249  T
Q  202 ccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttct-tcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaaccttta 300  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||    
T  35447250 ccaaaaggcaccaacccttttcacaagag-cccctcttttggttctctcaagactcacatcttgaagctttgaacctcacacaaatactctcaaccttta 35447348  T
Q  301 gtatctaaaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagctt 355  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35447349 gtatctaaaaccctaaaagttctctcctttggtttccatgagattcaccaagctt 35447403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 17450592 - 17450249
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-tt 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| |||||| ||    
T  17450592 aatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttgcaaatgtttgccaactctagaatccaacccccaatagagaatcaacccttagcctt 17450493  T
Q  102 tgatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccc-cactcatgtgttttccaatcaaattaatctctc 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||  | ||||||||||| |||  |  || ||||| ||    
T  17450492 tgatttcctaatgatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagtttctcacaattgactccttcgctcatgtgtttcccatccccatgaatctttc 17450393  T
Q  201 cccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaaccttta 300  Q
     | ||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  17450392 ac-aaagggcaccaaccctttc-ccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcactcaaagaccctcaaccttta 17450295  T
Q  301 gtatctaaaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattc 346  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17450294 gtatctaaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattc 17450249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 4 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 24398056 - 24397704
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactcat-gattttcactctcccaa-ggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagctt 101  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||| ||||||||    
T  24398056 aatgaacaagacactcattgattttcactcttccaaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaa---gaaccaacccttagctt 24397960  T
Q  102 tgatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctcc 201  Q
    ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||  |  || | |||||||    
T  24397959 tgactttctaaggatattctcttttggtttcacaagactaacccaaattggtcacaaatgactctccactcatgtgtttaccagcccgatgagtctctcc 24397860  T
Q  202 ccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttag 301  Q
    | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  24397859 ctaaaaggcaccaacccttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacattttgaagctttgaacctcacacaaagaccgtcaacctttag 24397760  T
Q  302 tatctaaa-accctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagctttttcaacaa 364  Q
    |||||||| |||||||| |        |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  24397759 tatctaaataccctaaaag--------tttggtttccatgagattcaccaagcttttccaacaa 24397704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 9 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 33648166 - 33647813
Alignment:
Q  9 acaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgttt-acaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagctttgatt 106  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||  || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||| |||||||||    
T  33648166 acaagacactcaattattttcactctcccaagatgttttacggttatgtcccaactctagaatctaacccccaaaagataattaaccctt-gctttgatt 33648068  T
Q  107 tcc-taaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctccccaa 205  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| | |||| || || |||| ||| ||||||||||| | |||||| |||||||||| |   | ||||||||| |||    
T  33648067 tccctaaggatcttctcttttggttttataagactcgcctaagtagctaacaaatgactctctactcatatgttttccaacctcgtgaatctctcctcaa 33647968  T
Q  206 aaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttagtatc 305  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  33647967 aaggcaccaacccttttcccaagagcctcctcttttgattctccaagattcacatcttgaaactttgaacctcacccaaagaccttcaacctttagtatc 33647868  T
Q  306 taaa-accctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagctttttc 359  Q
    |||| || ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  33647867 taaatactctaaaagttctctcctttggtttccatgaaattcaccaagctttttc 33647813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 145 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 7451158 - 7450950
Alignment:
Q  145 caagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctccccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggt 244  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  || ||||| || ||||||| ||  ||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  7451158 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgttttccaaccccataaatct-tctccaaaagtcatcaaccctttaccaaagagccccctcttttggt 7451060  T
Q  245 tcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagat 344  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  7451059 tctccaagattcacatcctgaagctttgaacctcacccaaagacgc-caacctttagtatctaaaaccctaaaagttccctccttttgtttccatgagat 7450961  T
Q  345 tcatcaagctt 355  Q
    ||| |||||||    
T  7450960 tcaccaagctt 7450950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 51 - 364
Target Start/End: Original strand, 42261826 - 42262138
Alignment:
Q  51 tgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagcttt-gatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagt 149  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||  | ||||||| |||||||||| ||| | |||||||||| ||  |||| || |||||||    
T  42261826 tgtttcccaactctagattctaacccctaaaag-gaaccaatccgtagcttttgatttcctaatgatatactcttttggtctcgtaagactcgcccaagt 42261924  T
Q  150 tgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctccccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttc 249  Q
    |||||| |||  |||| ||  | |||||||| ||||||  || |||||||| || |||||||| |||||| |  | ||||||||||| |||||||||| |    
T  42261925 tgctcataaaa-actctcctttgatgtgtttcccaatcccatgaatctctcacctaaaggcaccaaccctctc-caaagagcccccttttttggttctcc 42262022  T
Q  250 aagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttagtatcta-aaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcat 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||     
T  42262023 aagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctacataccctaaaagctccctcctttggttctcatgagattcac 42262122  T
Q  349 caagctttttcaacaa 364  Q
    |||||||  |||||||    
T  42262123 caagcttgctcaacaa 42262138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 51 - 352
Target Start/End: Original strand, 30218250 - 30218550
Alignment:
Q  51 tgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-tttgatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagt 149  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  30218250 tgtttcccaactctagagcctaacccccaaaagagaaccaatatttagcttttgatttcctaaggatc-ccccttttggtttcgcaagactcactcaagt 30218348  T
Q  150 tgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctccccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttc 249  Q
    |||||||||| || || ||  |  ||||||| |||| |  || |||||||||||||||||||| ||| | | | |||  ||||| |  |||||||| | |    
T  30218349 tgctcacaaa-gattctcctttggtgtgtttcccaaccccatgaatctctccccaaaaggcactaactc-tctcccataagccctcatttttggttgtcc 30218446  T
Q  250 aagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttagtatctaaa-accctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcat 348  Q
    ||||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||| | |||||     
T  30218447 aagattcacattttgatgttttgaacctcacccaaagaccctcaacatatagtatctaaataccctaaaagttccctcctttgagttccataatattcac 30218546  T
Q  349 caag 352  Q
    ||||    
T  30218547 caag 30218550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 199 - 346
Target Start/End: Original strand, 40935543 - 40935690
Alignment:
Q  199 tccccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctt 298  Q
    ||||||| |||||| ||||||||  ||||||||| | |||||||||||| | |||||||||| | ||  ||||||| ||| ||||| | |||||||||||    
T  40935543 tccccaataggcaccaaccctttc-ccaagagcctcatcttttggttctcctagattcacatttggacactttgaatctctcccaaaggccctcaacctt 40935641  T
Q  299 tagtatctaa-aaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattc 346  Q
    |||| |||||   ||||||| | || |||||||||||||||||||||||    
T  40935642 tagtttctaagttccctaaacggtctctcctttggtttccatgagattc 40935690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 57 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 43731093 - 43730992
Alignment:
Q  57 ccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctca 155  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||  |||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  43731093 ccaactctagaatttaacccc-aaaaga-aaccaacctttagactttgatttcctacggatattctattttggtttcccaagattcacccaaattgctca 43730996  T
Q  156 caaa 159  Q
    ||||    
T  43730995 caaa 43730992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Original strand, 723911 - 723968
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  723911 aatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 723968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 11690502 - 11690445
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  11690502 aatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 11690445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 13121770 - 13121712
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  13121770 aatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaatgtgtttacaaatgtttcccaac 13121712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Original strand, 14633993 - 14634050
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  14633993 aatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 14634050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 24885662 - 24885605
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  24885662 aatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 24885605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 29867870 - 29867813
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  29867870 aatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 29867813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Original strand, 34139938 - 34139995
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  34139938 aatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 34139995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 36773563 - 36773506
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  36773563 aatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 36773506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 42362353 - 42362296
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  42362353 aatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 42362296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 63
Target Start/End: Original strand, 33162617 - 33162676
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactc 63  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33162617 aatgaacaagacactcgatgattttcaatcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaactc 33162676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 50
Target Start/End: Original strand, 17057536 - 17057583
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaat 50  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17057536 aatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 17057583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 50
Target Start/End: Original strand, 17085519 - 17085566
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaat 50  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17085519 aatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 17085566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 50
Target Start/End: Original strand, 36318176 - 36318223
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaat 50  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36318176 aatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 36318223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 11049547 - 11049493
Alignment:
Q  8 aacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  11049547 aacaagacactcaatgattttcacttacccaaggtgtttacaaatgtttcccaac 11049493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 11067306 - 11067249
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  11067306 aatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 11067249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Original strand, 11151758 - 11151815
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  11151758 aatgaacaagagactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 11151815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Original strand, 12123751 - 12123809
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||    
T  12123751 aatgaacaagacactcgatgattttcactcatccaaggtgtttataaatgtttcccaac 12123809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 39284886 - 39284829
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  39284886 aatgaacaagatactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 39284829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Original strand, 2334585 - 2334641
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  2334585 aatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 2334641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Original strand, 4503300 - 4503356
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  4503300 aatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 4503356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Original strand, 5723422 - 5723478
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  5723422 aatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 5723478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 198 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 24197704 - 24197643
Alignment:
Q  198 ctccccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacat 260  Q
    ||||||||||||||| |||||| |  ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  24197704 ctccccaaaaggcaccaaccctctc-ccaagagtcccctcttttggttccccaagattcacat 24197643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 38312241 - 38312184
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||    
T  38312241 aatgaacaagacactcaatgattttcactcacacaaggtgtatacaa-tgtttcccaac 38312184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 45099755 - 45099699
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  45099755 aatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 45099699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 250; Significance: 1e-138; HSPs: 59)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 4 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 11348699 - 11348355
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-ttt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  11348699 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagccttt 11348600  T
Q  103 gatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctcc 201  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  || ||||| ||     
T  11348599 gatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgttttccaaccccatgaatct-tct 11348501  T
Q  202 ccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttag 301  Q
    ||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  11348500 ccaaaaggcaccagaccttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaaactttgaacctcacccaaagaccctcaacccttag 11348401  T
Q  302 tatctaaaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattca 347  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11348400 tatctaaaaccctaaaagttccatcctttggtttccatgagattca 11348355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 247; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 4 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 29136248 - 29135888
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-ttt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||    
T  29136248 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcacaactctagaatctaacccccaaaagagaactaacccttagccttt 29136149  T
Q  103 gatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctcc 201  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||||| |  || ||||| |||    
T  29136148 gatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaaaactctccactcatgt-ttttccaaccccatgaatct-tcc 29136051  T
Q  202 ccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttag 301  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  29136050 ccaaaaggcaccaacccttttcccaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcactcaaagaccctcaacctttag 29135951  T
Q  302 tatctaaaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagctttttcaacaa 364  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  29135950 tatctaaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttactcaacaa 29135888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 247; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 4 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 34603577 - 34603216
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactcatga-ttttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-tt 101  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||    
T  34603577 aatgaacaagacactcatgaattttcactttcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacctccaaaagagaaccaacccttagcctt 34603478  T
Q  102 tgatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctcc 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| |  || ||||| |||    
T  34603477 tgatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagacttttcactcatgtgttttccaaccccatgaatct-tcc 34603379  T
Q  202 ccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttag 301  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||     
T  34603378 ccaaaaggcaccaacccttttcccaagagctccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacatcacccaaagaccttcaacctttaa 34603279  T
Q  302 tatctaaaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagctttttcaacaa 364  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  34603278 tatctaaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttttccaacaa 34603216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 4 - 360
Target Start/End: Original strand, 7482398 - 7482755
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactcatga-ttttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagcttt 102  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7482398 aatgaacaatacactcatgaattttcactttcccaaggtgtttacaattgcttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcttt 7482497  T
Q  103 gatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctccc 202  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |  || ||||| ||||    
T  7482498 gatttcctaaggatcttctctttttgtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatct-tccc 7482596  T
Q  203 caaaaggcacgaacccttttaccaagag-ccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttag 301  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  7482597 caaaaggcaccaacccttttcccaagagcccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaaccgttag 7482696  T
Q  302 tatctaaaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagctttttca 360  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  7482697 tatctaaaaccctaaaagtttcctcctttggtttccatgagattcaccaaacttattca 7482755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 4 - 364
Target Start/End: Original strand, 37033240 - 37033597
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-cttt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||    
T  37033240 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaaccccaaaaagagaaccaacccatagccttt 37033339  T
Q  103 gatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctcc 201  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |  || ||||| |||    
T  37033340 gatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaacctcatgaatct-tcc 37033438  T
Q  202 ccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttag 301  Q
     |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37033439 tcaaaaggcaccaacccttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttag 37033538  T
Q  302 tatctaaaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagctttttcaacaa 364  Q
        |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  |||||||    
T  37033539 ----taaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcacccagcttactcaacaa 37033597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 4 - 355
Target Start/End: Original strand, 13547256 - 13547608
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-ttt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  13547256 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaaatctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagccttt 13547355  T
Q  103 gatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctcc 201  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |  || ||| | |||    
T  13547356 gatttcactaagtatcttctcttttggtttcacaagattcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttttccaaccccatgaattt-tcc 13547454  T
Q  202 ccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttag 301  Q
     ||||||||||  ||||||||  ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13547455 tcaaaaggcaccgacccttttcacaagagctccctcttttggttatccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttag 13547554  T
Q  302 tatctaaaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagctt 355  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13547555 tatctaaaactctaaaagttctctcctttggtttccatgagattcaccaagctt 13547608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 4 - 355
Target Start/End: Original strand, 13549167 - 13549519
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-ttt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  13549167 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaaatctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagccttt 13549266  T
Q  103 gatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctcc 201  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |  || ||| | |||    
T  13549267 gatttcactaagtatcttctcttttggtttcacaagattcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttttccaaccccatgaattt-tcc 13549365  T
Q  202 ccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttag 301  Q
     ||||||||||  ||||||||  ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13549366 tcaaaaggcaccgacccttttcacaagagctccctcttttggttatccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttag 13549465  T
Q  302 tatctaaaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagctt 355  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13549466 tatctaaaactctaaaagttctctcctttggtttccatgagattcaccaagctt 13549519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 4 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 37168298 - 37167955
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-ttt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||    
T  37168298 aatgaacaagacactcatgattttcactctctcaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaatcaacctttagccttt 37168199  T
Q  103 gatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctcc 201  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |  || ||||| |||    
T  37168198 gatttcactaaggatcttctcttttagtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatct-tcc 37168100  T
Q  202 ccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttag 301  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  37168099 ccaaaaggcaccaacccttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaaaaccctcaacctttag 37168000  T
Q  302 tatctaaaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattc 346  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37167999 tatctaaaactgtaaaagttccctcctttgatttccatgagattc 37167955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 4 - 355
Target Start/End: Original strand, 42298142 - 42298494
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-ttt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  42298142 aatgaacaagacactcatgatttttactctcccaaggtgtttacaattgtttcacaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagccttt 42298241  T
Q  103 gatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctcc 201  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| |  || ||||| ||     
T  42298242 gatttcacttaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcgcaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatct-tct 42298340  T
Q  202 ccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttag 301  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42298341 ccaaaaggcaccaacccttttcacaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttag 42298440  T
Q  302 tatctaaaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagctt 355  Q
    |||||||||||||||| ||| | ||||||||||   ||| |||||| |||||||    
T  42298441 tatctaaaaccctaaaagtttcatcctttggttgttatgggattcaccaagctt 42298494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 4 - 355
Target Start/End: Original strand, 37879078 - 37879430
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-ttt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||    
T  37879078 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaatccttagccttt 37879177  T
Q  103 gatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctcc 201  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |  || ||| | |||    
T  37879178 gatttcactaaggatcttctcttttgatttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaattt-tcc 37879276  T
Q  202 ccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttag 301  Q
    ||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  37879277 ccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctctttttgttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagatcctcaacatttag 37879376  T
Q  302 tatctaaaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagctt 355  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  37879377 tatctaaaaccctaacagttccttcctttgatttccatgagattcaccaagctt 37879430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 4 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 47115172 - 47114818
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-cttt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  47115172 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaagatgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagccttt 47115073  T
Q  103 gatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctcc 201  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||| |  || ||  ||| |    
T  47115072 gatttcattaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccattcatgtgtttcccaaccccatgaa--tcttc 47114975  T
Q  202 ccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttag 301  Q
    |||||||| || |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||     
T  47114974 ccaaaaggtaccaaccctgttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacagcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaatctttaa 47114875  T
Q  302 tatctaaaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagcttttt 358  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  47114874 tatctaaagccttaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaaacttttt 47114818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 4 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 193612 - 193261
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-cttt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  193612 aatgaacaagacactcatgattttcaccctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagccttt 193513  T
Q  103 gatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctcc 201  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| |||| |  || ||  ||| |    
T  193512 gatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcatccaagttgctcacaaaagactcttcacacatgtgtttcccaaccccatgaa--tcttc 193415  T
Q  202 ccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttag 301  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||     
T  193414 ccaaaaggcaccaaccttttccccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcatgaagctttgaacctcaccgaaagaccctcaacctttaa 193315  T
Q  302 tatctaaaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagctt 355  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  193314 tatctaaaaccctaaaagttatctcctttggtttccatgagattcaccaagctt 193261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 4 - 355
Target Start/End: Original strand, 47255507 - 47255853
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-cttt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  47255507 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggcatttacaattatttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagtcttt 47255606  T
Q  103 gatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctcc 201  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||| |  || ||||| |||    
T  47255607 gatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactca-ctaagttgctcacaaaagactctccaatcatgtgtttcccaa-cccatgaatct-tcc 47255703  T
Q  202 ccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttag 301  Q
    |||||||||    ||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47255704 ccaaaaggc----accattttcccaagagccccatcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttag 47255799  T
Q  302 tatctaaaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagctt 355  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47255800 tatctaaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagctt 47255853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 9 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 28242385 - 28242034
Alignment:
Q  9 acaagacactcatga-ttttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatt 106  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  28242385 acaagacactcaagaattttcactctcccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaacccctaaaagagaaccaacccatagcctttgatt 28242286  T
Q  107 tc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctccccaa 205  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |  || ||  ||| |||||    
T  28242285 tcactaaggatattctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccttatgaa--tcttcccaa 28242188  T
Q  206 aaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttagtatc 305  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28242187 aaggcaccaacccttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacattttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatc 28242088  T
Q  306 ta-aaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagcttttt 358  Q
    || | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  28242087 tacataccctaaaagttccctcctttggttttcatgagattcaccaaacttttt 28242034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 54 - 364
Target Start/End: Original strand, 34602557 - 34602867
Alignment:
Q  54 ttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-tttgatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgc 152  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34602557 ttcccaactctagaatctaacctccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgc 34602656  T
Q  153 tcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctccccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaag 252  Q
    ||||||| ||||   |||||||||||||||||| |  || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  34602657 tcacaaaagacttttcactcatgtgttttccaaccccatgaatct-tccccaaaaggcaccaacccttttaccaagagctccctcttttggttctccaag 34602755  T
Q  253 attcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaag 352  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34602756 attcacatcttgaagctttgaacatcacccaaagaccttcaacctttaatatctaaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaag 34602855  T
Q  353 ctttttcaacaa 364  Q
    ||||| ||||||    
T  34602856 cttttccaacaa 34602867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 4 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 19754495 - 19754140
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-ttt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||    
T  19754495 aatgaacaagacactcatgattttcactctctcaaggtgtttacgaatgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaaccattatccttt 19754396  T
Q  103 gatttcc----taaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctc 198  Q
    ||||||     ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |  || |||||     
T  19754395 gatttcacttataaggattttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatct- 19754297  T
Q  199 tccccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctt 298  Q
    |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| |||||| | ||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  19754296 tccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagccccctctcttggttttccaagattcaaatcatggtgctttgaacctcacccaaagacccttaacctt 19754197  T
Q  299 tagtatctaaaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagctt 355  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19754196 tagtatctagaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagctt 19754140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 19752686 - 19752335
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-ttt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||    
T  19752686 aatgaacaagacactcatgattttcactctctcaaggtgtttacgattatttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaatcattagccttt 19752587  T
Q  103 gatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctcc 201  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||   ||| ||||| |||    
T  19752586 gatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcatctaagttgctcacaaaatactctccactcatgtgtttcccaactcaatgaatct-tcc 19752488  T
Q  202 ccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttag 301  Q
    ||||||||||| |||| ||| |  ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  19752487 ccaaaaggcaccaaccttttcat-aagagccccatcttttggttctccaagattcacattatgacgcttagaacctcacccaaagaccttcaacctttag 19752389  T
Q  302 tatctaaaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagctt 355  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  19752388 tatctaaaaccctaaaaattccctcatttggttttcatgagattcaccaagctt 19752335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 25 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 41135800 - 41135460
Alignment:
Q  25 tttcactctcccaaggtgttta-caattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-tttgatttcctaaggatcttctc 122  Q
    |||| ||| ||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||| || |||||||||    
T  41135800 tttccctcacccaaggtgtttttcaaatgtttctcaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaatccttagcctttaatttccaaatgatcttctc 41135701  T
Q  123 ttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctccccaaaaggcacgaaccctttt 222  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||  | |||||||| |||| |  || |||||||||| ||||||||| |||||| |     
T  41135700 ttttggtttcctaagactcacccaagtttctcacaaa-gactctcctttgatgtgtttcccaaccccatgaatctctccctaaaaggcaccaaccctctc 41135602  T
Q  223 accaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttagtatctaaa-accctaaaggtt 321  Q
     |||| | |  |||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||  ||    
T  41135601 -ccaaaatcttcctcttttggttctccaagatccacatcttgaaggtttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaatacattaaaattt 41135503  T
Q  322 ccctcctttggtttccatgagattcatcaagctttttcaacaa 364  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  41135502 ccctcctttggtttccatgagattaaccaagcttattcaacaa 41135460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 5 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 6808446 - 6808086
Alignment:
Q  5 atgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-cttt 102  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| | | |||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||  |  | ||||    
T  6808446 atgaacaagacactcaataattttcactctcccaaagtgtttcccaatgtttctcaactctagaatctaacctcgaaa-gagaaccaaccttccgtcttt 6808348  T
Q  103 gatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctccc 202  Q
    |||| | ||| ||||||||||||||||||  ||  | |||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |  || ||||||| ||    
T  6808347 gattacataatgatcttctcttttggttttccattactcaccctagttgctcacaaatgactcttcattcatgtgttttccaaccccatgaatctcttcc 6808248  T
Q  203 caaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatga-ccctcaacctttag 301  Q
    |||||| ||| ||  || |  ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  6808247 caaaagacacaaaatctct--ccaagagcccaatcttttggttctccaagattcacatcttgaagttttgaacctcacctaaagacccctcaacctttag 6808150  T
Q  302 tatct-aaaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagctttttcaacaa 364  Q
    ||||| ||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  6808149 tatctaaaaaatctaaaagtttcctcctttggtttccatgagattcaccaagcttactcaacaa 6808086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 4 - 222
Target Start/End: Original strand, 31925874 - 31926092
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-ttt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||    
T  31925874 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaactgcttcc-aactctagaatctaacccccaaaagagaaccaaccattagccttt 31925972  T
Q  103 gatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctcc 201  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||| |||| |  || ||||| |||    
T  31925973 gatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagtctcacccaagttgctcacaaaagattctccactcacgtgtttcccaaacccatgaatct-tcc 31926071  T
Q  202 ccaaaaggcacgaaccctttt 222  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  31926072 ccaaaaggcaccaaccctttt 31926092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 48 - 309
Target Start/End: Original strand, 16216709 - 16216966
Alignment:
Q  48 aattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-tttgatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcaccca 146  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||   |||   ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||   ||  ||| | |||| ||    
T  16216709 aattgtttctcaactctagaatctaaccct--aaactaaaccaactcgtagcctttgatttcctaaggatcttctcttttaagttttcaaaattcactca 16216806  T
Q  147 agttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctccccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttc 246  Q
    |||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||| || || ||| |||  |||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  16216807 agttgctcacaa-tgactctcctctcatgtgtttgccaa-cacatgaatttctatccaaaatgcaccaaccctttt-cgaagagccccctcttttggttc 16216903  T
Q  247 ttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttagtatctaaa 309  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||||  |||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  16216904 ttcaagatatacatcttgaacctttgaatatcacccaaagacccttaacctttagtttctaaa 16216966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 47 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 22079278 - 22079039
Alignment:
Q  47 caattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-tttgatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcaccc 145  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||| |||| ||||| | |||||||||  ||||| |||||     
T  22079278 caattgtttctcaactctagaatctaacccccaaaagagaacaatc-cttagcctttgatttcataagcatcttatattttggtttgccaagactcacct 22079180  T
Q  146 aagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctccccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggtt 245  Q
    |||||||||||||| ||||| ||  | |||||||| ||||            ||||||||| | ||| ||||||    ||||  ||||||||||||||||    
T  22079179 aagttgctcacaaa-gactctcccttgatgtgtttcccaa------------ctccccaaacgacaccaaccctcac-ccaattgccccctcttttggtt 22079094  T
Q  246 cttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaaccttta 300  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  22079093 ctttaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaaacttta 22079039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 99 - 352
Target Start/End: Original strand, 9109665 - 9109918
Alignment:
Q  99 ctttgatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctc 198  Q
    |||||||| ||| | |||||||| ||||| |||| ||||| ||| |||| ||||||||||| ||||| |   | |||||| | |||| |  || ||||||    
T  9109665 ctttgattacctcatgatcttctattttgatttcccaagactcatccaaattgctcacaaaagactctcatttgatgtgtctcccaacctcatgaatctc 9109764  T
Q  199 tccccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctt 298  Q
    |||||||||| ||  |||||| |  ||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  9109765 tccccaaaagacatcaaccctctc-ccatgagtccccttttttggttctccaagattcacatcttgaagttttgaacctcacccaaataccctcaacctt 9109863  T
Q  299 tagtatcta-aaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaag 352  Q
    |||||| || | |||| ||| ||| | || |||| ||||||||| ||||| ||||    
T  9109864 tagtatttatataccccaaaagtttcatcatttgatttccatgacattcaccaag 9109918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 25652070 - 25651931
Alignment:
Q  20 atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaaccccc-aaaagagaaccaactcttagc-tttgatttcctaaggatc 117  Q
    ||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |  ||||||||||||| |||||   |||||||| |||||||||    
T  25652070 atgattttcacacacttaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaccttcataaaagagaaccaattcttaatatttgattttctaaggatc 25651971  T
Q  118 ttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcaca 157  Q
    ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  25651970 ttcacttttgctttcccaagattcacccaagttgctcaca 25651931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 236 - 355
Target Start/End: Original strand, 31928208 - 31928319
Alignment:
Q  236 tcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaggttccctcctttggttt 335  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||    
T  31928208 tcttttggttttctaagattcacatcttgaagctttgaacctcatccaaagactctcaacctttagtatctaaaa--------gttccctcctttggttt 31928299  T
Q  336 ccatgagattcatcaagctt 355  Q
    |||||| ||||| |||||||    
T  31928300 ccatgaaattcaccaagctt 31928319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 51 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 3331505 - 3331283
Alignment:
Q  51 tgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-tttgatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagt 149  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  |  |||| ||||| ||||    
T  3331505 tgtttcccaactctagaatccaacccc-aaaaga-aacaaacccttagcctttgatttcctaaggatctcctcttttggtaccctaagattcacctaagt 3331408  T
Q  150 tgctcacaaatgactcc----ccactcatgtgttttccaa------tca--aattaatctctccccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctc 237  Q
    ||||| |||  |||||     || ||||||||||| ||||      | |  ||| |||||||||| ||| | ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  3331407 tgctcgcaa--gactctacctcctctcatgtgtttcccaactttcctaagcaatgaatctctcccaaaacgacacgaaccctttc-ccaagagccccctc 3331311  T
Q  238 ttttggttcttcaagattcacatcttga 265  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  3331310 ttttggttctctaagattcacatcttga 3331283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 75 - 246
Target Start/End: Original strand, 12318720 - 12318890
Alignment:
Q  75 ccccaaaagagaaccaactcttagc-tttgatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactca 173  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| || ||| |||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||  | |    
T  12318720 cccccaaagagaaccaacccttagcctttgatttccaaaagattttctattttggtctcccaagactcacccaagttgctcataaa-aactctcctttga 12318818  T
Q  174 tgtgttttccaatcaaattaatctctccccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttc 246  Q
    |||||||  |||||  || ||  |||||||||||||||| ||||| | | |||||||||| ||| ||||||||    
T  12318819 tgtgtttctcaatcctatgaacttctccccaaaaggcaccaaccc-tctcccaagagccctctcatttggttc 12318890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 61
Target Start/End: Original strand, 928147 - 928202
Alignment:
Q  7 gaacaagacactcat-gattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  928147 gaacaagacactcattgattttcactcacccaaggtgtttacaaatgtttcccaac 928202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Original strand, 197075 - 197132
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  197075 aatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 197132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Original strand, 3847288 - 3847345
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  3847288 aatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 3847345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 10925224 - 10925167
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  10925224 aatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 10925167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Original strand, 28265721 - 28265778
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  28265721 aatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 28265778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Original strand, 50167342 - 50167399
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  50167342 aatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 50167399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 1833523 - 1833467
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaa 60  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  1833523 aatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaa 1833467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 15820305 - 15820249
Alignment:
Q  7 gaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactc 63  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15820305 gaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaactc 15820249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 59
Target Start/End: Original strand, 13138141 - 13138196
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttccca 59  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  13138141 aatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttccca 13138196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 31659239 - 31659192
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaat 50  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31659239 aatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 31659192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 50
Target Start/End: Original strand, 37503721 - 37503768
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaat 50  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37503721 aatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 37503768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 46064919 - 46064872
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaat 50  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  46064919 aatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 46064872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Original strand, 834334 - 834391
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  834334 aatgaacaagacactcaatgattttcacgcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 834391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 44455161 - 44455104
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  44455161 aatgaacaagacactcaatggttttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 44455104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Original strand, 50169377 - 50169434
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  50169377 aatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtatttacaa-tgtttcccaac 50169434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 6068512 - 6068471
Alignment:
Q  85 gaaccaactcttagc-tttgatttcctaaggatcttctcttt 125  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6068512 gaaccaactcttagcctttgatttcctaaggatcttctcttt 6068471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 50
Target Start/End: Original strand, 4552804 - 4552851
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaat 50  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  4552804 aatgaacaagacactcaatgattttccctcacccaaggtgtttacaat 4552851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 50
Target Start/End: Original strand, 8550954 - 8551001
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaat 50  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  8550954 aatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaatgtgtttacaat 8551001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 48 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 10157571 - 10157501
Alignment:
Q  48 aattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttcctaaggatct 118  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  10157571 aattgtttttcaactttagaatctaaccccctaaat-gaaccaacccttagtctttgatttcctaaggatct 10157501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 50
Target Start/End: Original strand, 13659503 - 13659550
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaat 50  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  13659503 aatgaacaagacactcaatgattttcactaccccaaggtgtttacaat 13659550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 62
Target Start/End: Original strand, 44650330 - 44650389
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaact 62  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  44650330 aatgaacaagacactcaataattttcactcacccaaagtgtttacaaatgttttccaact 44650389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 3189331 - 3189275
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  3189331 aatgaacaagacactcagtgattttcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 3189275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 3198148 - 3198092
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  3198148 aatgaacaagacactcagtgattttcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 3198092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 3206987 - 3206931
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  3206987 aatgaacaagacactcagtgattttcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 3206931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 222
Target Start/End: Original strand, 4535783 - 4535861
Alignment:
Q  144 ccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctccccaaaaggcacgaaccctttt 222  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||| |  || ||||| | |||||||| ||| |||||||||    
T  4535783 ccaagttgctcacaaacgactatccactcatgtgtttttcaaccccatgaatctattcccaaaagacaccaaccctttt 4535861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Original strand, 28223588 - 28223645
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||    
T  28223588 aatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtcttcaa-tgtttcccaac 28223645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 193 - 301
Target Start/End: Original strand, 28318116 - 28318225
Alignment:
Q  193 aatctctccccaaaaggcacgaacccttttaccaagagcccc-ctcttttggttcttcaagattcacatcttga-agctttgaacctcacccaatgaccc 290  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||||| |||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||   ||||||| |||| |||| || ||    
T  28318116 aatctctccccaaaatgcactaaccc-tttcccaagaacccctctcttttggttatccaaaattcacatcttgacccctttgaaactcatccaaagatcc 28318214  T
Q  291 tcaacctttag 301  Q
    ||||| |||||    
T  28318215 tcaacttttag 28318225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 49918351 - 49918309
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgttt 45  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  49918351 aatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgttt 49918309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 48 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 33775866 - 33775756
Alignment:
Q  48 aattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcaccca 146  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || |||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||  ||||  |||||| || || ||||| || | ||    
T  33775866 aattgtttcccaattctagaatctaa-cctcaaaag-gaacaaactcttagtctttgattttctaa-aatctcatcttttagtctctcaagattcgctca 33775770  T
Q  147 agttgctcacaaat 160  Q
    ||||||||||||||    
T  33775769 agttgctcacaaat 33775756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 265
Target Start/End: Original strand, 38746988 - 38747144
Alignment:
Q  106 ttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactcc-ccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctcccca 204  Q
    ||||||||||||  |||||||| | || ||||| ||| |||| |||  ||||||||||||  ||  ||||||||||||||| |  || || ||||| |||    
T  38746988 ttcctaaggatc--ctcttttgatctcccaagattcaaccaatttgtccacaaatgactcaacctttcatgtgttttccaaccctatgaacctctctcca 38747085  T
Q  205 aaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttga 265  Q
    |||||||| |||||||||  |||||||||||  |||||||| |  |||||||| |||||||    
T  38747086 aaaggcaccaaccctttt-tcaagagccccc-gttttggttgtctaagattcatatcttga 38747144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Original strand, 40122365 - 40122421
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaa 60  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  40122365 aatgaacaagacattcaatgatttttactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaa 40122421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 41360915 - 41360859
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||    
T  41360915 aatgaacaagacactcaatattttcactcacccaagatgtttacga-tgtttcccaac 41360859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 72)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 8 - 364
Target Start/End: Original strand, 50262869 - 50263226
Alignment:
Q  8 aacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-tttgatt 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  50262869 aacaagacactcatgattttcactctcccaaggtatttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaaccattagcctttgatt 50262968  T
Q  107 tc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctccccaa 205  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |  || ||||| |||||||    
T  50262969 tcactaagggtcttctcttttggtttcacaagagtcaccgaggttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatct-tccccaa 50263067  T
Q  206 aaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttagtatc 305  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  50263068 aaggcaccaaccctttttccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagactctcaacctttagtgtc 50263167  T
Q  306 taaaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagctttttcaacaa 364  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  50263168 taaaaccctaaaagttccctcctttggttttcatgagattcaccaaactttttcaacaa 50263226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 4 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 54883021 - 54882677
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-ttt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  54883021 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagccttt 54882922  T
Q  103 gatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctcc 201  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||| |||| |  || ||||| ||     
T  54882921 gatttcactaaggatcttctcttttggtttcacgagactcacccaagtttctcacaaaagactctacactcatgtgtttcccaaccccatgaatct-tct 54882823  T
Q  202 ccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttag 301  Q
    ||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  54882822 ccaaaaggcaccaacccttttcataagagccccctcttttggttctccaagattcacattttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttag 54882723  T
Q  302 tatctaaaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattca 347  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  54882722 tatctaaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattca 54882677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 4 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 8665409 - 8665056
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactcatga-ttttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-tt 101  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | || | ||    
T  8665409 aatgaacaagacactcatgaattttcactcttccaaggtgtttacaattgtttcccaactccagaatctaacccccaaaagaaaaccaacacataacctt 8665310  T
Q  102 tgatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctc 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||| |  || ||||| ||    
T  8665309 tgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcctgtgtttcccaaccccatgaatct-tc 8665211  T
Q  201 cccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaaccttta 300  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8665210 cccaaaaggcaccaacccttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaaccttta 8665111  T
Q  301 gtatctaaaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagctt 355  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8665110 gtatctaaaaccctaaaagttctctcctttggtttccatgagattcaccaagctt 8665056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 4 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 35662442 - 35662089
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactcatgatttt-cactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagcttt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  35662442 aatgaacaagacactcatgatttttcacactctcaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacacccaaaagagaaccaacccttagcttt 35662343  T
Q  103 gatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctccc 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||| |  || ||||| ||||    
T  35662342 gatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaagaactctccattcatgtgttttccaaccccatgaatct-tccc 35662244  T
Q  203 caaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttagt 302  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  35662243 caaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttctccaagattcacatattgaagctttgaacctcacccaaagactctcaacctttagt 35662144  T
Q  303 atctaaaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagctttt 357  Q
    |||||||| |||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  35662143 atctaaaatcctaaaagttctctcatttggtgtccatgagattcaccaagttttt 35662089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 4 - 355
Target Start/End: Original strand, 50674013 - 50674365
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-ttt 102  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  50674013 aatgaacacgacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagccttt 50674112  T
Q  103 gatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctcc 201  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |  || ||||| |||    
T  50674113 gatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatctttcc 50674212  T
Q  202 ccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttag 301  Q
    | | ||||||| |||||||||    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||    
T  50674213 c-ataaggcaccaacccttttcattagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagacccttaacatttag 50674311  T
Q  302 tatctaaaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagctt 355  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  50674312 tatttaaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagctt 50674365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 12073387 - 12073039
Alignment:
Q  10 caagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-tttgatttc 108  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  12073387 caagacactcatgattttcacactcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcatttgatttc 12073288  T
Q  109 -ctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctccccaaaa 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |  || ||  ||| |||||||    
T  12073287 actaaggatcttctcttttggtttcataagactcacccaagttgctcacaaaagactcttcactcatgtgttttccaaccccatgaa--tcttcccaaaa 12073190  T
Q  208 ggcacgaaccc-ttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttagtatct 306  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12073189 ggcaccaaccctttttcccaagag-cccctcttttggttctccaagatttacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatct 12073091  T
Q  307 aaaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagcttttt 358  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12073090 aaaaccctaaaagttccatcctttggtttccatgagattcaccaagcttttt 12073039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 6 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 6655955 - 6655605
Alignment:
Q  6 tgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-tttga 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||| |||||    
T  6655955 tgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaaccccaaaaagagaaacaacctttagcctttga 6655856  T
Q  105 tttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctcccc 203  Q
    |||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |  || ||||| || ||    
T  6655855 ttttactaatgatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcagaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatct-tctcc 6655757  T
Q  204 aaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttagta 303  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6655756 aaaaggcaccaaccctttccccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttaaagttttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagta 6655657  T
Q  304 tctaaaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagctt 355  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  6655656 tctaaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagatttaccaagctt 6655605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 4 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 46703501 - 46703152
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactcatga-ttttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctt 101  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  46703501 aatgaacaagacactcatgaattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaacactataatctaacccccaaaagagaaccaacttttagcctt 46703402  T
Q  102 tgatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctcc 201  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||| ||| |||  |  || ||||| |||    
T  46703401 tgatttcctaaggattttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctgacaaaagactctccattcatgt-tttcccatccccatgaatct-tcc 46703304  T
Q  202 ccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttag 301  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46703303 ccaaaaggcaccaacccttttcccaagagccccctcttttgattctcgaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttag 46703204  T
Q  302 tatctaaaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagc 353  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46703203 tatctaaaaccctaaaagttctctcctttggtttccatgagattcaccaagc 46703152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 23 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 379360 - 379028
Alignment:
Q  23 attttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-tttgatttcctaaggatcttct 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  379360 attttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccacaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcctaaggatcttct 379261  T
Q  122 cttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctccccaaaaggcacgaacccttt 221  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||  || ||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  379260 cttttgatttcacaagactcacccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccattctcatgaatct-tccccaaaaggcaccgacccttt 379162  T
Q  222 taccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttagtatcta-aaaccctaaaggt 320  Q
    |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||    
T  379161 tcacaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcatgaagctttgaacctcacccaaagtccctcaacctttagtatctacaaatcctaaaagt 379062  T
Q  321 tccctcctttggtttccatgagattcatcaagct 354  Q
    || ||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  379061 tctctcctttggtttccacgagattcaccaagct 379028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 4 - 355
Target Start/End: Original strand, 55085531 - 55085885
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-tt 101  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||    
T  55085531 aatgaacaagacagtcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgtttccgaactctagaatctaacccccaaaggagaatcaacccttagcctt 55085630  T
Q  102 tgatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctc 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |  || ||||| ||    
T  55085631 tgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacacaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatct-tc 55085729  T
Q  201 cccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaa-gctttgaacctcacccaatgaccctcaaccttt 299  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  55085730 cccaaaaggcaccaaccctttccccaagagccccctcttttggttctccaagatttacatcttgaaagcttttaacctcacccaaagaccctcaaccttt 55085829  T
Q  300 agtatctaaaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagctt 355  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  55085830 agtatctaaaaccctaaaagttccctcctttggtttcattgagattcaccaagctt 55085885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 7 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 41964413 - 41964064
Alignment:
Q  7 gaacaagacactcatga-ttttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-tttga 104  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||    
T  41964413 gaacaagacactcatgaattttcactttcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccc-aaaagagaaccaacccttagcctttga 41964315  T
Q  105 tttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctcccc 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||| |  || ||||| ||||     
T  41964314 tttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctctactcatgtgtttcccaaccccatgaatctttccc- 41964216  T
Q  204 aaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttagta 303  Q
    |||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41964215 aaaag--actaacccttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcatgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagta 41964118  T
Q  304 tcta-aaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagcttt 356  Q
    |||| | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  41964117 tctacataccctaaaagttccctcctttgatttccatgagattcaccaaacttt 41964064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 48 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 26364222 - 26363914
Alignment:
Q  48 aattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-tttgatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcaccc 145  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26364222 aattgtttcccaactctaaaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcatttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcaccc 26364123  T
Q  146 aagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctccccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggtt 245  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |  || ||||| || ||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  26364122 aagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatct-tctccaaaaggccccaacccttttcacaagagccccctcttttggtt 26364024  T
Q  246 cttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagatt 345  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  26364023 ctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaaggccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttccctcccttggtttccatgagatt 26363924  T
Q  346 catcaagctt 355  Q
    || |||||||    
T  26363923 caccaagctt 26363914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 5 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 33989862 - 33989511
Alignment:
Q  5 atgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-ttt 102  Q
    |||||||| ||||||| | ||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  |||||| |||    
T  33989862 atgaacaaaacactcaataatttttactcaaccaaggtgtttacagttgtttcccaactctagaatctaacctccaaaagagaacaaatccttagccttt 33989763  T
Q  103 gatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctccc 202  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  || ||||||||||    
T  33989762 gattacctaaggatcttctcttttggtttcaaaagactcacccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaatcccatgaatctctccc 33989663  T
Q  203 caaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttagt 302  Q
     ||||||||| |||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  33989662 -aaaaggcaccaacc-ttctcccaagagccccctattttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaaactttagt 33989565  T
Q  303 atctaaa-accctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagctt 355  Q
    ||||||| |||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33989564 atctaaataccctaaaagttatctgctttggtttccatgagattcaccaagctt 33989511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 2209714 - 2209357
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-ttt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||    
T  2209714 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattatttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccatagccttt 2209615  T
Q  103 gatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaa-----tgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatc 196  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |  |       | || |     |||||| |||||||||||||| |||| |  || ||||    
T  2209614 gatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcgctgagaaccaacccatagcctttgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatc 2209515  T
Q  197 tctccccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacc 296  Q
    | |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  2209514 t-tccccaaaaggcaccaacccttttcccaagagtcccctcgtttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaatc 2209416  T
Q  297 tttagtatctaaaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagctt 355  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  2209415 tttagtatctaaaaccctaaaagttccctcatttgctttccatgagattcaccaagctt 2209357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 355
Target Start/End: Original strand, 27417132 - 27417470
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-cttt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  27417132 aatgaacaagacactcatgattttcactctccc----tgtttacaattgtttcaaaactcaagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagtcttt 27417227  T
Q  103 gatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctcc 201  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||          || ||||| |||||||||||||| |||| |  || ||||| |||    
T  27417228 gatttcactaaggatcttcttttttggttttacaagactcacccaa----------aaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatct-tcc 27417316  T
Q  202 ccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttag 301  Q
    ||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27417317 ccaaaagacaccaacccctttcccaagagccccttcttttggttctccaagattcacatcttaaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttag 27417416  T
Q  302 tatctaaaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagctt 355  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  27417417 tatctaaaaccctaaaagttccctcctttggttttcatgagattcaccaagctt 27417470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 8648140 - 8647861
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactcatga-ttttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-tt 101  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | || | ||    
T  8648140 aatgaacaagacactcatgaattttcactcttccaaggtgtttacagttgtttcctaactccagaatctaacccccaaaagagaaccaacacataacatt 8648041  T
Q  102 tgatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctc 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||| |  || ||||| ||    
T  8648040 tgatttcactaaggatcttctcttttgatttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcctgtgtttcccaaccccatgaatct-tc 8647942  T
Q  201 cccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacc 281  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8647941 cccaaaaggcaccaacccttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacc 8647861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 108 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 40630879 - 40630633
Alignment:
Q  108 cctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctccccaaaa 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |  || ||||| |||||||||    
T  40630879 cctaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatct-tccccaaaa 40630781  T
Q  208 ggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttagtatcta 307  Q
    ||||| |||||||||  ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40630780 ggcaccaacccttttcacaaaagctccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatcta 40630681  T
Q  308 aaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagctt 355  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40630680 aaaccctaaaagtttcatcctttggtttccatgagattcaccaagctt 40630633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 110 - 355
Target Start/End: Original strand, 46569821 - 46570065
Alignment:
Q  110 taaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctccccaaaagg 209  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||| ||||  |||||||| ||||| |||| |  || ||||| |||| ||||||    
T  46569821 taaggaccttctcttttggtttcataagattcacctaagttgttcacaaaagactttccactcatttgtttcccaaccccatgaatctttccc-aaaagg 46569919  T
Q  210 cacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttagtatctaaa 309  Q
    ||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| |||||||||||||    
T  46569920 caccaatccttttcacaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacctaaagaccttcaacatttagtatctaaa 46570019  T
Q  310 accctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagctt 355  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  46570020 accctaaaatttccctcctttggtttccatgagattcaccaagctt 46570065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 12119538 - 12119362
Alignment:
Q  5 atgaacaagacactcat-gattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagctttg 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |    
T  12119538 atgaacaagacactcattgattttcactctcccaaggtatttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttaacttcg 12119439  T
Q  104 atttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttt 180  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  12119438 atttcttaaggatcttctcttttggtttcacaagacacacccaaattgctcacaaatgattcaccactaatgtgttt 12119362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 219 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 8653385 - 8653249
Alignment:
Q  219 ttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaag 318  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8653385 ttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaa 8653286  T
Q  319 gttccctcctttggtttccatgagattcatcaagctt 355  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8653285 gttctctcctttggtttccatgagattcaccaagctt 8653249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 33089878 - 33089594
Alignment:
Q  5 atgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-cttt 102  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||          |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||    
T  33089878 atgaacaagacactcaatgattttcactcttccaaggt----------gtttcccaactctataatctaacctccaaaagagaaccaacctttagccttt 33089789  T
Q  103 gatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctccc 202  Q
    ||||| |||||||||||||||||||           ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | |  || |||||||| |    
T  33089788 gattttctaaggatcttctcttttg-----------gtctcccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttttcgaccccatgaatctctctc 33089700  T
Q  203 caaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttagt 302  Q
    |||||| ||| ||||| | | ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  33089699 caaaagacaccaaccc-tctcccaagagccccctcttttgattctccaagattcacatcttcaaactttgaacctcacccaaagaccctcaatctttagt 33089601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 59 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 3786034 - 3785750
Alignment:
Q  59 aactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-tttgatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcaca 157  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| || | ||| |||||||||    
T  3786034 aactctagaatcta-cccccaaaagagaaccaactcttagcctttgatttcctaaggatattctcttttggtctcccaagactcgcacaatttgctcaca 3785936  T
Q  158 aatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctccccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattca 257  Q
    || ||||| ||  | | |||||   | | |  || | ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3785935 aa-gactctcctttgaagtgttcctcgaccccataattctctcctcaaaaggcaccaaccctttt-ccaagagccccctcttttggttcttcaagattca 3785838  T
Q  258 catcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttagtatcta-aaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagat 344  Q
    ||||||||||||||||| ||| || || ||| |||||||||||||||| |   | |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  3785837 catcttgaagctttgaatctcgcctaaagactctcaacctttagtatccatgtatcctaaaagttccatcctttgatttccatgagat 3785750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 5 - 364
Target Start/End: Original strand, 22882919 - 22883281
Alignment:
Q  5 atgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttac-aattgtttcccaactctagaatctaaccccc-aaaagagaaccaactcttagc-t 100  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||| || ||| | |||  | |||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| | |    
T  22882919 atgaacaaggcactcaatgattttcactttctcaaagcgttacctaattgttttccaattctagaatctaaccccccaaaagagaaccaaccattatcct 22883018  T
Q  101 ttgatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctc 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||| || ||||| ||||||||||| ||||| |   | |||||||| | || |  || | ||||||    
T  22883019 ttgattttctaaggatcttctcttttggtctcctaagactcgcccaaattgctcacaaa-gactctcatttgatgtgtttcctaaccctatgagtctctc 22883117  T
Q  201 cccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaaccttta 300  Q
     |||||||| |  | |||| |  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |  |||||||||||    
T  22883118 tccaaaaggtatcagccctctc-ccaagagccccctctttttgttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcactcaaatagtctcaaccttta 22883216  T
Q  301 gtatctaaa-accctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagctttttcaacaa 364  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  22883217 gtatctaaataccctaaaatttccctcatttggtttccatgagattcaccaagcttactcaacaa 22883281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 5 - 364
Target Start/End: Original strand, 22934583 - 22934945
Alignment:
Q  5 atgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttac-aattgtttcccaactctagaatctaaccccc-aaaagagaaccaactcttagc-t 100  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||| || ||| | |||  | |||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| | |    
T  22934583 atgaacaaggcactcaatgattttcactttctcaaagcgttacctaattgttttccaattctagaatctaaccccccaaaagagaaccaaccattatcct 22934682  T
Q  101 ttgatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctc 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||| || ||||| ||||||||||| ||||| |   | |||||||| | || |  || | ||||||    
T  22934683 ttgattttctaaggatcttctcttttggtctcctaagactcgcccaaattgctcacaaa-gactctcatttgatgtgtttcctaaccctatgagtctctc 22934781  T
Q  201 cccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaaccttta 300  Q
     |||||||| |  | |||| |  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |  |||||||||||    
T  22934782 tccaaaaggtatcagccctctc-ccaagagccccctctttttgttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcactcaaatagtctcaaccttta 22934880  T
Q  301 gtatctaaa-accctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagctttttcaacaa 364  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  22934881 gtatctaaataccctaaaatttccctcatttggtttccatgagattcaccaagcttactcaacaa 22934945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 8 - 364
Target Start/End: Original strand, 26699616 - 26699976
Alignment:
Q  8 aacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-tttgat 105  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||  ||| | ||||||    
T  26699616 aacaagacattcaatgattttcactcacccaaagtgtttacaattgtttcccaactttataatctaacccctaaaagagaaccaacctttaacctttgat 26699715  T
Q  106 ttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctccccaa 205  Q
    | | ||| |||| |||||||| ||||   |||| ||| |  ||||| |||| ||||| || |||||||||| | | || | |  || ||||||| |  ||    
T  26699716 tacataaagatcatctcttttagttttctaagactcatctgagttgttcactaatgaatctccactcatgtatctcccgaccccatgaatctcttctgaa 26699815  T
Q  206 aaggcacgaacccttttaccaagagccccct-cttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttagtat 304  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| |||||| | ||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || | ||||||||||||||    
T  26699816 aaggcaccaaccctttttccaagatcccccttcatttggctctctaagattcacatcttgaagttttgaacctcaaccaaagatcttcaacctttagtat 26699915  T
Q  305 ctaaa-accctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagctttttcaacaa 364  Q
    |||||  ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||    
T  26699916 ctaaatgccctacaagttccctcatttggtttccatgagattcacaaagcttgctcaacaa 26699976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 214 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 10071675 - 10071537
Alignment:
Q  214 aacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttagtatctaaaaccc 313  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  10071675 aacccttttcacaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttaaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaacct 10071576  T
Q  314 taaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaag 352  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  10071575 taaaagttccctcctttgatttccatgagattcaccaag 10071537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 51 - 355
Target Start/End: Original strand, 35370553 - 35370857
Alignment:
Q  51 tgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-tttgatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagt 149  Q
    |||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||  ||||| |||||||||| || |||||||| ||||||| ||   ||| ||||||||||    
T  35370553 tgtttcccaattctataatctaactcc-aaaagagaaccaaccattagcctttgatttcccaaagatcttctattttggtatccatagactcacccaagt 35370651  T
Q  150 tgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctccccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctctttt-ggttctt 248  Q
    |||| ||||| ||||| ||  | |||| |||  ||| |  || |||||||  | |||||| || |||||| |  |||||| ||||||||||| ||||||     
T  35370652 tgcttacaaa-gactctcctttgatgtttttatcaacctcatgaatctctttcgaaaagggaccaaccctctc-ccaagaaccccctcttttaggttctc 35370749  T
Q  249 caagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttagtatctaaa-accctaaaggttccctcctttggtttccatgagattca 347  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35370750 caagattcacatcttaaagctttgaacctctcccaaagaccctcaacctttagtatctaaataccttaaaagttccctcctttgatttccatgagattca 35370849  T
Q  348 tcaagctt 355  Q
    ||||||||    
T  35370850 tcaagctt 35370857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 355
Target Start/End: Original strand, 35369608 - 35369954
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttac-aattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-t 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  35369608 aatgaacaagacactcaatgattttcactctac-aaggtgtttcccaattgtttcccaattctataatccaacccc-aaaagagaaccaacccttagcct 35369705  T
Q  101 ttgatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctc 200  Q
    |||||| || ||| ||||||| ||||| | ||   ||| |||||||||||||| ||||| ||||  |   | ||||||||   || |  || |||||||     
T  35369706 ttgattcccaaag-atcttctattttgctatccatagactcacccaagttgcttacaaa-gactatcttttgatgtgtttctaaacctcatgaatctctt 35369803  T
Q  201 cccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctctttt-ggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaaccttt 299  Q
     | |||||| || |||||| |  |||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35369804 tcgaaaagggaccaaccctctc-ccaagaaccccctcttttaggttctccaagattcacatcttaaatctttgaacctcacccaaagaccctcaaccttt 35369902  T
Q  300 agtatctaaaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagctt 355  Q
    ||||||||||    |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  35369903 agtatctaaa----taaaagttccctcctttaatttccatgagattcatcaagctt 35369954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 160 - 348
Target Start/End: Original strand, 38811404 - 38811591
Alignment:
Q  160 tgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctccccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcaca 259  Q
    |||||| ||||| |||||||| | || |  || ||||||||| |||||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  38811404 tgactctccacttatgtgtttcctaacctcatgaatctctccgcaaaagacaccaaccctttc-ccaagagcccc-tctttgggttctccaagattcaca 38811501  T
Q  260 tcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttagtatctaa-aaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcat 348  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38811502 tcttaaagctttgaacctcacccaaataccctcaacctttagtatctaagtaccctaaaagttccctcctttagtttccatgagattcat 38811591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 40632446 - 40632353
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactctta 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40632446 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttctcaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaaccctta 40632353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 214 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 10072061 - 10071963
Alignment:
Q  214 aacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttagtatctaaaacc 312  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10072061 aacccttttcacaagagccccctcttttagttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaacc 10071963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 47 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 41961368 - 41961110
Alignment:
Q  47 caattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-tttgatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcaccc 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||| ||||||    
T  41961368 caattgtttcccaactctagaatctaaccctcaaaagagaaccaacccttagcttttgatttcctaaggatattcttttttggtctcccaagactcaccc 41961269  T
Q  146 aa-----gttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctccccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttt 240  Q
    ||     |||||||||| | ||||| ||  | |||||||| |||| |  || ||||||||||||||| ||||  | |||| | || |||||||||| |||    
T  41961268 aagttacgttgctcacata-gactctcctttaatgtgtttcccaa-cccatgaatctctccccaaaaagcaccga-ccttctccctagagcccccttttt 41961172  T
Q  241 tggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctca-cccaatgaccctcaacctttag 301  Q
     |||||| |||||||||||| | ||  ||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||    
T  41961171 cggttctacaagattcacatttggacactttgaatctcaccccaaagaccctcaccctttag 41961110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 77 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 34112539 - 34112314
Alignment:
Q  77 ccaaaagagaaccaactcttagc-tttgatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatg 175  Q
    |||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||  ||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  34112539 ccaaaagagaaccaaactttagcctttgatttcctaaggatcttcagttttgtttttccaagattcatccaagttgctcacagatgactctccactcatg 34112440  T
Q  176 tgttttccaatcaaattaatctctccccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaac 275  Q
    |||||||||| |   | || ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| | ||||| |||| | |||||||||||  | ||   ||||||     
T  34112439 tgttttccaaccccgtgaacctctccccaaaaggcaccaaccctttt-ctaagagcctcgtctttaggttatccaagattcacaattggacattttgaat 34112341  T
Q  276 ctcacccaatgaccctcaacctttagt 302  Q
    ||||| ||| ||||||||| |||||||    
T  34112340 ctcacacaaagaccctcaatctttagt 34112314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 41639423 - 41639345
Alignment:
Q  8 aacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagaga 86  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41639423 aacaagacactcgtgattttcactctcctaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagaga 41639345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 224 - 355
Target Start/End: Original strand, 47514889 - 47515021
Alignment:
Q  224 ccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttagtatctaa-aaccctaaaggttc 322  Q
    ||||||| || ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||| | |||  |||||||| ||||    
T  47514889 ccaagagtccactcttttggttcaccaagattcatatcttgaagctttgaacttcacccgaagaccttcaacctttagtgtttaagtaccctaaaagttc 47514988  T
Q  323 cctcctttggtttccatgagattcatcaagctt 355  Q
     ||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  47514989 actcatttggtttccatgagattccacaagctt 47515021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 21688248 - 21688186
Alignment:
Q  5 atgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctaga 67  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21688248 atgaacaagacactcatgattttcactcccccaaggtgtttagaattgtttcccaactctaga 21688186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 48 - 355
Target Start/End: Original strand, 25723433 - 25723735
Alignment:
Q  48 aattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-ctttgatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcaccca 146  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    || || |||||||| | ||||| |||||||||| ||| |  ||| | ||||  |    
T  25723433 aattgttttccatctctagaatctaacacccaaaagagaacc----ctcagtctttgattacttaagggtcttctctttcggtctaccaaaactcactta 25723528  T
Q  147 agttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctccccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttc 246  Q
    ||||| ||||||| ||||| |   | |||||||| |||| |  |  || ||||| ||||||||||  |||| || | |||||||| ||||||||||||||    
T  25723529 agttgttcacaaa-gactctcttttgatgtgtttcccaaccccacgaagctctctccaaaaggcattaaccattat-ccaagagctccctcttttggttc 25723626  T
Q  247 ttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcac-ccaatgaccctcaacctttagtatctaa-aaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagat 344  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||  |||||| ||||||||  ||  |||||||  |||| ||| |||||||||||||| ||    
T  25723627 tccaagattcacattttgaagctttgaacctccctccaaaga--ctcaacatttagtattgaagtaccctaagagttcactcatttggtttccatgaaat 25723724  T
Q  345 tcatcaagctt 355  Q
    ||| |||||||    
T  25723725 tcaccaagctt 25723735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 47 - 346
Target Start/End: Original strand, 22629105 - 22629399
Alignment:
Q  47 caattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-tttgatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcaccc 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||     ||| | ||  ||  |||||| |||||||| ||||||||||| | | ||||| || ||||| |||| |    
T  22629105 caattgtttcccaactctagaatctaac-----aaaaaaaaaaaaaacttagcctttgattttctaaggatcttttatgttggtctcccaagattcactc 22629199  T
Q  146 aagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctccccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggtt 245  Q
    || ||||||| | || |||| || |||||||||||  ||| |  || ||| ||| |||||||||||| |||| |||| | || |  | ||| ||||||||    
T  22629200 aaattgctcagagat-actctcctctcatgtgtttctcaaccccataaatatcttcccaaaaggcactaaccatttttc-aatattctcctattttggtt 22629297  T
Q  246 cttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttagtatctaaa-accctaaaggttccctcctttggtttccatgagat 344  Q
    || ||||||||||||||||||  ||| || ||||||||  ||| || |||||||||| ||||||   |||||| |||| ||| ||||||||| |||||||    
T  22629298 ctccaagattcacatcttgaacttttaaatctcacccagagacactgaacctttagtttctaaatttcctaaaagttcactcatttggtttctatgagat 22629397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 249 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 32091326 - 32091226
Alignment:
Q  249 caagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttagtatctaaa--accctaaaggttccctcctttggtttccatgagattc 346  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| |||  ||| ||||  ||||||| ||| |||||||||| ||||    
T  32091326 caagattcacatcttgaagttttgaacctcactcaaagaccctcaacatttagtatccaaaataccttaaaaattccctcttttagtttccatgaaattc 32091227  T
Q  347 a 347  Q
    |    
T  32091226 a 32091226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Original strand, 52467521 - 52467579
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  52467521 aatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaaatgtttcccaac 52467579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 41639260 - 41639207
Alignment:
Q  8 aacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  41639260 aacaagacactcgtgattttcactctcctaaggtgtttacaattgttacccaac 41639207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 47 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 32091435 - 32091324
Alignment:
Q  47 caattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-tttgatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcaccc 145  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| | |||| || ||| | | ||||    
T  32091435 caattgtttccaaactttagaatcttaccccaaaaa-agaaccaacactttgcctttgatttcctaaggatcttctcctctggtctcccaaaacttaccc 32091337  T
Q  146 aagttgctcacaa 158  Q
    |||||| ||||||    
T  32091336 aagttgttcacaa 32091324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 5429680 - 5429623
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  5429680 aatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 5429623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 5871821 - 5871764
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  5871821 aatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 5871764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Original strand, 13009598 - 13009655
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  13009598 aatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 13009655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Original strand, 26175803 - 26175860
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  26175803 aatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 26175860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Original strand, 37229889 - 37229947
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactcat-gattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  37229889 aatgaacaagacactcattgattttcactcacccaaggtgtttacaaatgttttccaac 37229947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 48143043 - 48142986
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  48143043 aatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 48142986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Original strand, 52095529 - 52095586
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  52095529 aatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 52095586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Original strand, 12745603 - 12745659
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaa 60  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  12745603 aatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac-attgtttcccaa 12745659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 63
Target Start/End: Original strand, 36463556 - 36463615
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactc 63  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36463556 aatgaacaagacactcaatgaatttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaactc 36463615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 7 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 24969110 - 24969055
Alignment:
Q  7 gaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  24969110 gaacaagactctcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaaatgtttcccaac 24969055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 36994525 - 36994478
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaat 50  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36994525 aatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 36994478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 50
Target Start/End: Original strand, 48893809 - 48893856
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaat 50  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  48893809 aatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 48893856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 4587959 - 4587902
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  4587959 aatgaacatgacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 4587902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Original strand, 6542348 - 6542405
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  6542348 aatgaacaagacactcaataattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 6542405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Original strand, 47038576 - 47038633
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||    
T  47038576 aatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttataa-tgtttcccaac 47038633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Original strand, 52082824 - 52082881
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  52082824 aatgaacaagacagtcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 52082881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Original strand, 54200073 - 54200130
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  54200073 aatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaatgtgtttacaa-tgtttcccaac 54200130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Original strand, 5208009 - 5208066
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaa 60  Q
    |||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  5208009 aatgaacaagtcactaaatgattttcactcacccaaggtgtttacaaatgtttcccaa 5208066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 31474151 - 31474096
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttccca 59  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||    
T  31474151 aatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaagtgtttacaa-tgtttccca 31474096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 51337065 - 51337018
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaat 50  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51337065 aatgaacaggacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 51337018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 52065581 - 52065530
Alignment:
Q  20 atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatct 71  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||    
T  52065581 atgattttcactcacccaaggggttcacaattgtttcccaacccaagaatct 52065530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 235 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 6719355 - 6719289
Alignment:
Q  235 ctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttag 301  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |  ||| |||||||||||    
T  6719355 ctcttttagttttccaagattcacatcttgaacctttgaatctcaccctaaaaccttcaacctttag 6719289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Original strand, 12739717 - 12739774
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  12739717 aatgaacaagacactcaatgatttccactcacctaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 12739774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Original strand, 12747923 - 12747980
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  12747923 aatgaacaagacactcaatgatttccactcacctaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 12747980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 29056359 - 29056301
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  29056359 aatgaacaaaacactcaatgatttttactcacccaaggtgtttccaaatgtttcccaac 29056301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 29254495 - 29254438
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  29254495 aatgaacaagacactcaatgattttcattcacccaatgtgtttacaa-tgtttcccaac 29254438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Original strand, 34570581 - 34570638
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  34570581 aatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaagatgttttcaa-tgtttcccaac 34570638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 37740626 - 37740570
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  37740626 aatgaacaagacactcagtgattttcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 37740570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Original strand, 56178804 - 56178860
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  56178804 aatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 56178860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 3913449 - 3913408
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtt 44  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  3913449 aatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtt 3913408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 4 - 364
Target Start/End: Original strand, 80450 - 80811
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-ttt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||    
T  80450 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgttcacaattgtttcctaactctagaatctaacccccaaaatagaaccaacccttagccttt 80549  T
Q  103 gatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctcc 201  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||| |  || ||||| |||    
T  80550 gatttcactaaggatctactcttttagtttcccaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccgctcatgtgtttcccaaccccatgaatct-tcc 80648  T
Q  202 ccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttag 301  Q
    ||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  80649 ccaaaaggcaccaacccttttcataagagccccctcttttggttctccaagattcaaatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctctag 80748  T
Q  302 tatctaaaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagctttttcaacaa 364  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  80749 tatctaaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagattttccaacaa 80811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0286
Description:

Target: scaffold0286; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 4 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 11558 - 11207
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagc-tt 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||| ||    
T  11558 aatgaacaagacactcaatgattttcactcacc-aaggtgtttacaat-gtttcccaactctagaatctaaccccaaaaagagaaacaacctttagcctt 11461  T
Q  102 tgatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctc 200  Q
    ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |  || ||||| ||    
T  11460 tgattttactaatgatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcagaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatct-tc 11362  T
Q  201 cccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaaccttta 300  Q
     ||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11361 tccaaaaggcaccaaccctttccccaagagccccatcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaaccttta 11262  T
Q  301 gtatctaaaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcatcaagctt 355  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  11261 gtatctaaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagatttaccaagctt 11207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 198; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 4 - 347
Target Start/End: Original strand, 18170 - 18511
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttag-cttt 102  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  18170 aatgaacaaaacactcatgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcc-aactctataatctaacccc-aaaagagaaccaactcttagtcttt 18267  T
Q  103 gatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctcc 201  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || |  || |||||  ||    
T  18268 gatttcactaaggatcttctcttttggttttacaagactcactcaagttgctcacaaataactctccactcatgtgttttc-aacctcatgaatcttccc 18366  T
Q  202 ccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttag 301  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  18367 ccaaaaggcaccaacccttttcacaagagccccctctttttgttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagacccgcaacctttag 18466  T
Q  302 tatctaaaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattca 347  Q
    ||||||||| |||| | |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  18467 tatctaaaa-cctataagttttctcctttggtttccatgagattca 18511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 116; Significance: 1e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 51 - 364
Target Start/End: Original strand, 490661 - 490973
Alignment:
Q  51 tgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagcttt-gatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagagtcacccaagt 149  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||  | ||||||| |||||||||| ||| | |||||||||| ||  |||| || |||||||    
T  490661 tgtttcccaactctagattctaacccctaaaag-gaaccaatccgtagcttttgatttcctaatgatatactcttttggtctcgtaagactcgcccaagt 490759  T
Q  150 tgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctccccaaaaggcacgaacccttttaccaagagccccctcttttggttcttc 249  Q
    |||||| |||  |||| ||  | |||||||| ||||||  || |||||||| || |||||||| |||||| |  | ||||||||||| |||||||||| |    
T  490760 tgctcataaaa-actctcctttgatgtgtttcccaatcccatgaatctctcacctaaaggcaccaaccctctc-caaagagcccccttttttggttctcc 490857  T
Q  250 aagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttagtatcta-aaaccctaaaggttccctcctttggtttccatgagattcat 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||     
T  490858 aagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctacataccctaaaagctccctcctttggttctcatgagattcac 490957  T
Q  349 caagctttttcaacaa 364  Q
    |||||||  |||||||    
T  490958 caagcttgctcaacaa 490973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 108; Significance: 9e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 31 - 352
Target Start/End: Original strand, 1591 - 1922
Alignment:
Q  31 tctcccaaggtgtttac-aattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactctta----------gcttt-gatttcctaaggatct 118  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||          ||||| ||||||||||||||||    
T  1591 tctcccaaggtgttttctaattgtttcccaactctagaatctaacccc-aaaagagaaccaacacttataagttataagcttttgatttcctaaggatct 1689  T
Q  119 tctcttttggtttcacaagagtcacccaagttgctcacaaatgactccccactcatgtgttttccaatcaaattaatctctccccaaaaggcacgaaccc 218  Q
    ||||||||| | || ||||| || |||||||||||||||| |||||| |   | ||||||||  |||  | || ||||||||| |||||| ||| || ||    
T  1690 tctcttttgatctcccaagactcgcccaagttgctcacaa-tgactctcatatgatgtgtttctcaactacatgaatctctccacaaaagacaccaagcc 1788  T
Q  219 ttttaccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaatgaccctcaacctttagtatctaaa-accctaaa 317  Q
    |    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1789 tcgc-ccaagagtcccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttggagctcacccaaagaccttcaacctttagtatctaaataccctaaa 1887  T
Q  318 ggttccctcctttggtttccatgagattcatcaag 352  Q
     |||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||    
T  1888 agttctctcatttggtttccataaaattcaccaag 1922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 25 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 25032 - 24981
Alignment:
Q  25 tttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaaccc 76  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||    
T  25032 tttcactctcccaaggtgtttacaattgtttccaaacccaagaatctcaccc 24981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 50
Target Start/End: Original strand, 149264 - 149311
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaat 50  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  149264 aatgaacaagacactcaatgattttcactaccccaaggtgtttacaat 149311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 114603 - 114547
Alignment:
Q  4 aatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 61  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  114603 aatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 114547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University