View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9005_low_112 (Length: 333)

Name: NF9005_low_112
Description: NF9005
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9005_low_112
NF9005_low_112
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (144-326)||(163600-163782)
[»] chr3 (58 HSPs)
chr3 (146-322)||(16840238-16840415)
chr3 (144-326)||(11912291-11912473)
chr3 (192-326)||(51608602-51608736)
chr3 (144-277)||(12853396-12853528)
chr3 (144-277)||(13435732-13435864)
chr3 (144-275)||(16795419-16795549)
chr3 (144-277)||(8928900-8929032)
chr3 (144-277)||(10834974-10835106)
chr3 (252-326)||(2249264-2249338)
chr3 (144-270)||(11301698-11301823)
chr3 (144-277)||(3801884-3802016)
chr3 (144-277)||(14764828-14764960)
chr3 (144-277)||(23372576-23372708)
chr3 (144-277)||(51299447-51299579)
chr3 (144-277)||(54519511-54519643)
chr3 (252-326)||(45221010-45221084)
chr3 (144-277)||(41048-41180)
chr3 (144-277)||(9532172-9532304)
chr3 (144-277)||(29545971-29546103)
chr3 (252-312)||(14648318-14648378)
chr3 (272-322)||(16840452-16840502)
chr3 (144-277)||(18899364-18899499)
chr3 (196-277)||(17348812-17348892)
chr3 (144-232)||(5219805-5219893)
chr3 (144-232)||(14664383-14664471)
chr3 (144-232)||(14667547-14667635)
chr3 (144-232)||(19774156-19774244)
chr3 (252-326)||(5841123-5841197)
chr3 (144-232)||(7108196-7108284)
chr3 (144-232)||(7112131-7112219)
chr3 (144-232)||(11068571-11068659)
chr3 (144-232)||(11167126-11167214)
chr3 (144-232)||(11853664-11853752)
chr3 (144-232)||(22320087-22320175)
chr3 (144-232)||(22335142-22335230)
chr3 (144-232)||(28948419-28948507)
chr3 (144-232)||(55021334-55021422)
chr3 (144-277)||(20249882-20250009)
chr3 (144-177)||(4590193-4590226)
chr3 (144-177)||(8491765-8491798)
chr3 (144-177)||(12304187-12304220)
chr3 (144-177)||(14670039-14670072)
chr3 (144-177)||(14681563-14681596)
chr3 (144-177)||(17318542-17318575)
chr3 (144-232)||(18933388-18933477)
chr3 (144-209)||(23173278-23173343)
chr3 (144-232)||(30064342-30064431)
chr3 (144-232)||(4108822-4108910)
chr3 (144-232)||(4112671-4112759)
chr3 (144-232)||(14497906-14497993)
chr3 (144-232)||(15616135-15616223)
chr3 (144-270)||(12337177-12337302)
chr3 (144-209)||(15463859-15463924)
chr3 (144-177)||(38312890-38312923)
chr3 (158-222)||(15555606-15555670)
chr3 (144-232)||(15963455-15963543)
chr3 (144-232)||(15967379-15967467)
chr3 (144-232)||(15971303-15971391)
[»] scaffold0599 (1 HSPs)
scaffold0599 (144-326)||(3985-4167)
[»] chr6 (33 HSPs)
chr6 (144-326)||(34297805-34297987)
chr6 (144-326)||(1254019-1254205)
chr6 (144-307)||(25737775-25737938)
chr6 (144-275)||(23537897-23538027)
chr6 (144-270)||(22075423-22075548)
chr6 (144-277)||(4475709-4475841)
chr6 (144-277)||(12941135-12941267)
chr6 (256-324)||(9622964-9623032)
chr6 (144-270)||(27555461-27555585)
chr6 (144-277)||(23955283-23955415)
chr6 (252-312)||(7429398-7429458)
chr6 (252-312)||(14594709-14594769)
chr6 (144-270)||(27416560-27416685)
chr6 (144-277)||(27222746-27222878)
chr6 (144-273)||(28290927-28291055)
chr6 (144-232)||(14470839-14470927)
chr6 (144-227)||(23400640-23400724)
chr6 (252-326)||(28707816-28707890)
chr6 (146-232)||(31479497-31479583)
chr6 (144-232)||(8242370-8242458)
chr6 (144-232)||(11565359-11565447)
chr6 (144-232)||(11716973-11717061)
chr6 (144-232)||(12620366-12620454)
chr6 (146-209)||(2076267-2076330)
chr6 (144-177)||(18918613-18918646)
chr6 (144-232)||(16758673-16758761)
chr6 (144-232)||(23393599-23393687)
chr6 (144-232)||(23413507-23413595)
chr6 (144-217)||(19869160-19869233)
chr6 (144-231)||(16622796-16622881)
chr6 (144-232)||(22861713-22861801)
chr6 (211-275)||(23537819-23537883)
chr6 (144-232)||(23988261-23988349)
[»] chr5 (25 HSPs)
chr5 (144-326)||(36459412-36459594)
chr5 (144-277)||(22120624-22120756)
chr5 (144-277)||(38146451-38146583)
chr5 (252-326)||(19075846-19075920)
chr5 (252-326)||(31253258-31253332)
chr5 (182-277)||(22108519-22108613)
chr5 (144-277)||(19510376-19510508)
chr5 (144-277)||(22338926-22339058)
chr5 (144-277)||(23113435-23113567)
chr5 (144-277)||(28372114-28372246)
chr5 (144-277)||(33473964-33474096)
chr5 (144-261)||(37600041-37600157)
chr5 (144-277)||(41878684-41878816)
chr5 (252-312)||(43243807-43243867)
chr5 (146-277)||(22335396-22335526)
chr5 (144-232)||(15238150-15238238)
chr5 (144-232)||(20912285-20912373)
chr5 (144-242)||(18354745-18354843)
chr5 (144-189)||(22749162-22749207)
chr5 (147-232)||(24768598-24768683)
chr5 (144-232)||(10751775-10751863)
chr5 (144-232)||(19474205-19474293)
chr5 (144-232)||(20294472-20294560)
chr5 (144-232)||(40727432-40727519)
chr5 (144-217)||(11219528-11219601)
[»] chr7 (46 HSPs)
chr7 (144-326)||(15212912-15213094)
chr7 (144-277)||(834078-834210)
chr7 (144-277)||(1199258-1199390)
chr7 (144-277)||(13891544-13891676)
chr7 (144-277)||(838166-838298)
chr7 (144-277)||(1203346-1203478)
chr7 (144-277)||(13891927-13892059)
chr7 (144-277)||(16110008-16110140)
chr7 (144-277)||(10607353-10607485)
chr7 (144-277)||(39268346-39268478)
chr7 (144-276)||(16582336-16582467)
chr7 (144-277)||(18871211-18871343)
chr7 (144-277)||(7520248-7520381)
chr7 (147-277)||(15166164-15166293)
chr7 (144-277)||(11660196-11660328)
chr7 (144-277)||(14420701-14420833)
chr7 (144-277)||(146414-146546)
chr7 (144-277)||(10897929-10898061)
chr7 (144-277)||(41283559-41283691)
chr7 (249-325)||(16185474-16185550)
chr7 (144-275)||(9752540-9752670)
chr7 (144-277)||(16004918-16005050)
chr7 (144-277)||(18606249-18606384)
chr7 (144-209)||(25928404-25928469)
chr7 (144-232)||(39721153-39721242)
chr7 (144-232)||(18424193-18424281)
chr7 (147-230)||(11302267-11302350)
chr7 (252-326)||(11394926-11395000)
chr7 (144-232)||(15083183-15083272)
chr7 (144-232)||(31683-31771)
chr7 (144-232)||(72404-72492)
chr7 (144-232)||(76513-76601)
chr7 (144-232)||(12706155-12706243)
chr7 (144-232)||(12713498-12713586)
chr7 (144-232)||(12722156-12722244)
chr7 (144-232)||(16908542-16908630)
chr7 (144-232)||(18277952-18278040)
chr7 (144-232)||(18281916-18282004)
chr7 (196-275)||(9752676-9752754)
chr7 (144-177)||(20486755-20486788)
chr7 (144-232)||(26291114-26291203)
chr7 (144-232)||(2531365-2531452)
chr7 (144-232)||(2833514-2833602)
chr7 (144-232)||(12717245-12717333)
chr7 (144-232)||(45171533-45171621)
chr7 (144-209)||(13919445-13919510)
[»] chr8 (34 HSPs)
chr8 (147-326)||(42560917-42561096)
chr8 (144-229)||(21328527-21328612)
chr8 (144-277)||(27942718-27942850)
chr8 (249-326)||(21968045-21968122)
chr8 (249-326)||(21980885-21980962)
chr8 (249-326)||(21985868-21985945)
chr8 (144-277)||(23427740-23427872)
chr8 (252-326)||(44494271-44494345)
chr8 (252-326)||(11252129-11252204)
chr8 (147-272)||(8729645-8729769)
chr8 (144-277)||(11774210-11774342)
chr8 (249-326)||(22009249-22009326)
chr8 (144-277)||(363182-363314)
chr8 (144-277)||(8415009-8415141)
chr8 (144-232)||(21409858-21409947)
chr8 (144-232)||(21804350-21804439)
chr8 (144-209)||(23913246-23913311)
chr8 (269-326)||(34950043-34950100)
chr8 (144-232)||(14399125-14399213)
chr8 (144-232)||(21829493-21829581)
chr8 (144-232)||(21974216-21974304)
chr8 (144-232)||(43250160-43250248)
chr8 (249-291)||(22000831-22000873)
chr8 (144-222)||(44385866-44385944)
chr8 (144-177)||(21386172-21386205)
chr8 (144-232)||(18864137-18864225)
chr8 (144-232)||(21978326-21978414)
chr8 (144-232)||(22110559-22110647)
chr8 (144-177)||(21968025-21968058)
chr8 (144-177)||(21980865-21980898)
chr8 (144-177)||(21985848-21985881)
chr8 (144-177)||(22000811-22000844)
chr8 (144-177)||(22009229-22009262)
chr8 (144-232)||(30941597-30941685)
[»] chr1 (21 HSPs)
chr1 (146-277)||(29533801-29533931)
chr1 (144-277)||(22132131-22132263)
chr1 (252-326)||(11944951-11945025)
chr1 (147-277)||(20439188-20439317)
chr1 (252-326)||(43631040-43631114)
chr1 (144-277)||(32648981-32649113)
chr1 (252-326)||(20032223-20032297)
chr1 (144-277)||(16370839-16370971)
chr1 (144-232)||(41389697-41389785)
chr1 (249-325)||(11810002-11810078)
chr1 (144-232)||(33795991-33796079)
chr1 (144-232)||(20230171-20230260)
chr1 (144-232)||(39245203-39245289)
chr1 (144-232)||(39248758-39248844)
chr1 (144-209)||(41801311-41801376)
chr1 (144-232)||(1009220-1009308)
chr1 (144-232)||(1926828-1926916)
chr1 (144-232)||(16376848-16376936)
chr1 (144-232)||(20925842-20925930)
chr1 (144-232)||(52634226-52634314)
chr1 (144-177)||(21406266-21406299)
[»] chr4 (33 HSPs)
chr4 (144-277)||(17052478-17052610)
chr4 (144-277)||(30145697-30145829)
chr4 (144-275)||(22634959-22635089)
chr4 (144-277)||(13813865-13813997)
chr4 (144-275)||(24048417-24048547)
chr4 (144-270)||(20163931-20164056)
chr4 (252-326)||(37839239-37839313)
chr4 (252-326)||(42597968-42598042)
chr4 (144-277)||(15533133-15533265)
chr4 (144-277)||(18211518-18211650)
chr4 (144-275)||(13818353-13818483)
chr4 (144-277)||(28384765-28384897)
chr4 (144-277)||(36036866-36036998)
chr4 (144-270)||(20158480-20158605)
chr4 (196-277)||(13818489-13818569)
chr4 (144-269)||(20161156-20161280)
chr4 (144-277)||(12422863-12422989)
chr4 (144-277)||(49549115-49549248)
chr4 (144-209)||(631780-631845)
chr4 (144-232)||(15223504-15223592)
chr4 (182-277)||(24048539-24048633)
chr4 (144-232)||(4562806-4562894)
chr4 (144-232)||(5758488-5758576)
chr4 (144-232)||(9555027-9555115)
chr4 (144-232)||(14759024-14759112)
chr4 (144-232)||(14955792-14955880)
chr4 (144-232)||(33740794-33740882)
chr4 (144-177)||(10711838-10711871)
chr4 (144-177)||(10925608-10925641)
chr4 (144-232)||(23996999-23997086)
chr4 (144-176)||(27532766-27532798)
chr4 (144-227)||(17807017-17807100)
chr4 (147-209)||(14047299-14047361)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (147-277)||(37568-37697)
scaffold0124 (144-277)||(25600-25732)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (144-277)||(18737-18869)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (144-277)||(33851-33983)
scaffold0080 (144-177)||(28485-28518)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (144-277)||(224175-224307)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (147-277)||(8775-8904)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (144-277)||(109515-109647)
[»] chr2 (21 HSPs)
chr2 (144-277)||(9240588-9240720)
chr2 (144-277)||(10686279-10686411)
chr2 (144-277)||(19663590-19663722)
chr2 (144-277)||(20260171-20260303)
chr2 (144-275)||(21074540-21074670)
chr2 (144-277)||(37378950-37379082)
chr2 (144-277)||(6481698-6481830)
chr2 (144-277)||(6485165-6485297)
chr2 (144-232)||(27600329-27600417)
chr2 (144-209)||(9783975-9784040)
chr2 (144-232)||(10103329-10103417)
chr2 (144-232)||(12902639-12902727)
chr2 (144-232)||(24630080-24630168)
chr2 (144-232)||(24645109-24645197)
chr2 (144-232)||(24647052-24647140)
chr2 (144-232)||(24647885-24647973)
chr2 (144-232)||(27381026-27381114)
chr2 (144-232)||(27384996-27385084)
chr2 (144-232)||(30346690-30346778)
chr2 (144-232)||(31343875-31343963)
chr2 (144-232)||(41532475-41532563)
[»] scaffold0544 (2 HSPs)
scaffold0544 (144-277)||(3549-3681)
scaffold0544 (182-277)||(3-97)
[»] scaffold1852 (1 HSPs)
scaffold1852 (144-270)||(853-978)
[»] scaffold0337 (1 HSPs)
scaffold0337 (144-277)||(10854-10987)
[»] scaffold1427 (1 HSPs)
scaffold1427 (144-277)||(114-246)
[»] scaffold0842 (1 HSPs)
scaffold0842 (144-277)||(5156-5288)
[»] scaffold2015 (1 HSPs)
scaffold2015 (252-312)||(487-547)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (252-326)||(34011-34085)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (144-270)||(70676-70801)
[»] scaffold0410 (1 HSPs)
scaffold0410 (144-232)||(14802-14890)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (144-270)||(11698-11823)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (144-209)||(74364-74429)
[»] scaffold0525 (1 HSPs)
scaffold0525 (144-232)||(5563-5651)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (270-326)||(173282-173338)
[»] scaffold1873 (1 HSPs)
scaffold1873 (196-275)||(607-685)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (156-270)||(115390-115502)
[»] scaffold0166 (1 HSPs)
scaffold0166 (147-232)||(11095-11180)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (144-208)||(6993-7057)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (144-232)||(11009-11097)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (144-232)||(60358-60446)
[»] scaffold0299 (1 HSPs)
scaffold0299 (144-270)||(5746-5871)
[»] scaffold0380 (1 HSPs)
scaffold0380 (144-177)||(3987-4020)
[»] scaffold0200 (1 HSPs)
scaffold0200 (144-177)||(10780-10813)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (144-177)||(23970-24003)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (144-177)||(37235-37268)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (144-177)||(62872-62905)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (144-232)||(15607-15695)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (144-232)||(68588-68676)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (144-177)||(37230-37263)
[»] scaffold0815 (1 HSPs)
scaffold0815 (252-292)||(1-41)
[»] scaffold0486 (1 HSPs)
scaffold0486 (144-232)||(8535-8623)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (144-232)||(6353-6440)


Alignment Details
Target: scaffold0001 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 144 - 326
Target Start/End: Original strand, 163600 - 163782
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  163600 acttgatgagggttatgttaagttgataacttgttccttattcatgttttggtaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 163699  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagtactaaggggatgttaagaagaaatattattgagtggatttgatgatgtc 326  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  163700 tggatagttgttaagttgtcttctattcatgagtactaaggggatgttaagaagaattattattgagtggatttgatgatgtc 163782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 58)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 146 - 322
Target Start/End: Original strand, 16840238 - 16840415
Alignment:
Q  146 ttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttgatg 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16840238 ttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccttattcatgtattgctaatgagattcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttgatg 16840337  T
Q  246 tatagttgttaagttgtcttctattcatgagtactaaggggatgttaagaagaaatatta-ttgagtggatttgatga 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  16840338 tatagttgttaagttgtcttctattcatgagtactaaggggatgttaagaagaattattatttgagtggatttgatga 16840415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 144 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 11912473 - 11912291
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11912473 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccttattcatgtattgctaatgagatggttgatgaataattattgttatgaattgataacgttga 11912374  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagtactaaggggatgttaagaagaaatattattgagtggatttgatgatgtc 326  Q
    || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  11912373 tgcatagtggctaagttgtcttctattcatgagtactaaggggatgttaagaagaattattattgggtggatttgatgatgtc 11912291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 192 - 326
Target Start/End: Original strand, 51608602 - 51608736
Alignment:
Q  192 ttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttgatgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagtactaaggggatgtt 291  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51608602 ttgctaatgagatggttgatgaataattattgttatgaattgataacgttgatgcatagtggctaagttgtcttctattcatgagtactaaggggatgtt 51608701  T
Q  292 aagaagaaatattattgagtggatttgatgatgtc 326  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  51608702 aagaagaattattattgggtggatttgatgatgtc 51608736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 144 - 277
Target Start/End: Original strand, 12853396 - 12853528
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||  ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| | ||| |    
T  12853396 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgtt-a 12853494  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagt 277  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12853495 cgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagt 12853528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 144 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 13435864 - 13435732
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||  |||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||| | ||| |    
T  13435864 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgtt-a 13435766  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagt 277  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13435765 cgtatagttgttaagttgtcttcaattcatgagt 13435732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 144 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 16795549 - 16795419
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||  ||| |||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||| | ||| |    
T  16795549 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagacgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgtt-a 16795451  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctattcatga 275  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16795450 cgtatagttgctaagttgtcttctattcatga 16795419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 144 - 277
Target Start/End: Original strand, 8928900 - 8929032
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    ||||||||   ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| | ||| |    
T  8928900 acttgatggtggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatggactgctaatgagatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgtt-a 8928998  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagt 277  Q
      |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8928999 catatagttgctaagttgtcttctattcatgagt 8929032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 144 - 277
Target Start/End: Original strand, 10834974 - 10835106
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||  || ||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||| |||| | ||| |    
T  10834974 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaatttctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgtt-a 10835072  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagt 277  Q
     ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  10835073 cgtatagttgctaagttgtcttctatttatgagt 10835106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 252 - 326
Target Start/End: Original strand, 2249264 - 2249338
Alignment:
Q  252 tgttaagttgtcttctattcatgagtactaaggggatgttaagaagaaatattattgagtggatttgatgatgtc 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||    
T  2249264 tgttaagttgtcttctattcatgagcactaaggggatgttaagaagaagaattattgagtgtatatgatgatgtc 2249338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 144 - 270
Target Start/End: Original strand, 11301698 - 11301823
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||  ||| |||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||| | ||| |    
T  11301698 acttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattattatgaattgatgatgtt-a 11301796  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctatt 270  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||    
T  11301797 cgtatagttgctaagttgtcttctatt 11301823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 144 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 3802016 - 3801884
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||  |||||||||  ||| ||| |||||||||||| ||||| | |||| | ||| |    
T  3802016 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatggaatgatgatgtt-a 3801918  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagt 277  Q
     ||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  3801917 cgtatagttgctaagttgtcctctattcatgagt 3801884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 144 - 277
Target Start/End: Original strand, 14764828 - 14764960
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||  |||||||||  ||| ||| |||||||||||| ||||||| |||| | ||| |    
T  14764828 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgtt-a 14764926  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagt 277  Q
      |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  14764927 catatagttgctaagttgtcctctattcatgagt 14764960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 144 - 277
Target Start/End: Original strand, 23372576 - 23372708
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    ||||||||  |||||||||  ||| ||| |||||||||||| ||||||| |||| | ||| |    
T  23372576 acttgatgattgttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgtt-a 23372674  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagt 277  Q
     ||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  23372675 cgtatagttgctaagttgtcctctattcatgagt 23372708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 144 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 51299579 - 51299447
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    ||||||||  |||||||||  ||| ||| |||||||||||| ||||||| |||| | ||| |    
T  51299579 acttgatgattgttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgtt-a 51299481  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagt 277  Q
     ||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  51299480 cgtatagttgctaagttgtcctctattcatgagt 51299447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 144 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 54519643 - 54519511
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||  |||||||||  ||| ||| |||||||||||| ||||| | |||| | ||| |    
T  54519643 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatggaatgatgatgtt-a 54519545  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagt 277  Q
     ||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  54519544 cgtatagttgctaagttgtcatctattcatgagt 54519511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 252 - 326
Target Start/End: Original strand, 45221010 - 45221084
Alignment:
Q  252 tgttaagttgtcttctattcatgagtactaaggggatgttaagaagaaatattattgagtggatttgatgatgtc 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  45221010 tgttaagttgtcttctattcatgagcactacggggatgttaaggagaattattattgagtgtatatgatgatgtc 45221084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 144 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 41180 - 41048
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    ||||||||  |||||||||  ||| |||  ||||||||||| ||||||| |||| | ||| |    
T  41180 acttgatgagggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgaggaataattattattatgaaatgatgatgtt-a 41082  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagt 277  Q
     ||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  41081 cgtatagttgctaagttgtcctctattcatgagt 41048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 144 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 9532304 - 9532172
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||  ||| |||||  ||| ||| |||||||||||| ||||||| |||| | ||| |    
T  9532304 acttgatgatggttatgttgagttgataagttgtcttttattcatgaattgttaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgtt-a 9532206  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagt 277  Q
     ||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  9532205 cgtatagttgctaagttgtcctctattcatgagt 9532172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 144 - 277
Target Start/End: Original strand, 29545971 - 29546103
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    || |||||  |||||||||  | | ||| |||||||||||| ||||||| |||| | ||| |    
T  29545971 acttgatgatggttgtgttaagttgataagttgtcttttagtcatgaattgctaatggaaggtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgtt-a 29546069  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagt 277  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  29546070 tgtatagttgttaagttgtactctattcatgagt 29546103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Original strand, 14648318 - 14648378
Alignment:
Q  252 tgttaagttgtcttctattcatgagtactaaggggatgttaagaagaaatattattgagtg 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14648318 tgttaagttgtcttctattcatgagcattaaggggatgttaagaagaattattattgagtg 14648378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 272 - 322
Target Start/End: Original strand, 16840452 - 16840502
Alignment:
Q  272 atgagtactaaggggatgttaagaagaaatattattgagtggatttgatga 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16840452 atgagtactaaggggatgttaagaagaattattattgagtggatttgatga 16840502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 18899499 - 18899364
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgc---taatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgt 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||  ||||   |||||  ||| ||| |||||||||||| ||||||| |||| | ||    
T  18899499 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaataatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 18899400  T
Q  241 tgatgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagt 277  Q
    | | ||||||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  18899399 t-acgtatagttgctgagttgtcctctattcatgagt 18899364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 196 - 277
Target Start/End: Original strand, 17348812 - 17348892
Alignment:
Q  196 taatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttgatgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagt 277  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||| | ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17348812 taatgagatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgtt-acgtatagttgctaagttgtcttctattcatgagt 17348892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 5219893 - 5219805
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||  ||| |||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||    
T  5219893 acttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagacgtttgatgaataattattattatgaatt 5219805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 14664471 - 14664383
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||  ||| |||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||    
T  14664471 acttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttctattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattatatttatgaatt 14664383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 14667635 - 14667547
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||  ||| |||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||    
T  14667635 acttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttctattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattatatttatgaatt 14667547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 19774244 - 19774156
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||   || |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  19774244 acttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaatt 19774156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 252 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 5841197 - 5841123
Alignment:
Q  252 tgttaagttgtcttctattcatgagtactaaggggatgttaagaagaaatattattgagtggatttgatgatgtc 326  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||| |||| ||||||||| || || ||||||||||    
T  5841197 tgttaagttgacttctattcatgagcactaagagaatgttaaggagaattattattgaatgtatctgatgatgtc 5841123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 7108284 - 7108196
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    |||| |||  ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  7108284 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaatt 7108196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 7112219 - 7112131
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    |||| |||  ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  7112219 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaatt 7112131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 11068659 - 11068571
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    |||| |||  ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  11068659 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaatt 11068571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Original strand, 11167126 - 11167214
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    |||| |||  ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  11167126 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaatt 11167214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 11853752 - 11853664
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    |||||| |  ||| |||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||    
T  11853752 acttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcacgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattattatgaatt 11853664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 22320175 - 22320087
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    |||| |||  ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  22320175 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaatt 22320087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 22335230 - 22335142
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    |||| |||  ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  22335230 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaatt 22335142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 28948507 - 28948419
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    |||| |||  ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  28948507 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaatt 28948419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 55021422 - 55021334
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    |||| |||  ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  55021422 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaatt 55021334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 277
Target Start/End: Original strand, 20249882 - 20250009
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||  |||||||||  ||  | | ||||||| |||| ||||||| |||      |||    
T  20249882 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatattcgatgaataactattattatgaaatga------tga 20249975  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagt 277  Q
    ||| |||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  20249976 tgtttagttgctaagttgtcctatattcatgagt 20250009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 144 - 177
Target Start/End: Original strand, 4590193 - 4590226
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgt 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4590193 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgt 4590226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 144 - 177
Target Start/End: Original strand, 8491765 - 8491798
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgt 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8491765 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgt 8491798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 144 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 12304220 - 12304187
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgt 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12304220 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgt 12304187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 144 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 14670072 - 14670039
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgt 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14670072 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgt 14670039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 144 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 14681596 - 14681563
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgt 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14681596 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgt 14681563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 144 - 177
Target Start/End: Original strand, 17318542 - 17318575
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgt 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17318542 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgt 17318575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Original strand, 18933388 - 18933477
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgtt-aagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    ||||||||  ||  |||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||    
T  18933388 acttgatgatggttatgttaaagttgataagttgtattttattcatgaattaataatgagatgtttgacgaataattattattatgaatt 18933477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 144 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23173343 - 23173278
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttg 209  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    ||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  23173343 acttgatgatagttatgttaagttgataagttgtcttctattcatgagttgttaatgagatgcttg 23173278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 30064431 - 30064342
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaa-gttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    ||||||||  ||  |||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||    
T  30064431 acttgatgatggttatgttaaagttgataagttgtcttttattcatgaattaataatgagatgtttgacgaataattattattatgaatt 30064342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Original strand, 4108822 - 4108910
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    |||| |||  ||| |||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||    
T  4108822 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatatttgatgaataattattattatgaatt 4108910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Original strand, 4112671 - 4112759
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    |||| |||  ||| |||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||    
T  4112671 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatatttgatgaataattattattatgaatt 4112759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 14497993 - 14497906
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    |||| |||  ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  14497993 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatg-ttgatgaataattattattatgaatt 14497906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 15616223 - 15616135
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||    |||| |||  ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  15616223 acttgaagatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaatt 15616135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 144 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 12337302 - 12337177
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaat-gagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttg 242  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||    ||||||||  ||| |||| |||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||| | |||     
T  12337302 acttgatgatgtttatgttaaattgata-gttgtcttttattcatgaattgataattgagatgtttgatgaataagtattattatgaattgatgatgtt- 12337205  T
Q  243 atgtatagttgttaagttgtcttctatt 270  Q
    | ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  12337204 acgtagagttgctaagttgtcttctatt 12337177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15463924 - 15463859
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttg 209  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    ||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  15463924 acttgatgacgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgcttg 15463859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 177
Target Start/End: Original strand, 38312890 - 38312923
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgt 177  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38312890 acttgatgatggttatgttaagtttataagttgt 38312923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 158 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 15555670 - 15555606
Alignment:
Q  158 atgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattatt 222  Q
    ||||||||||| ||||||||   |||||||||  |||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  15555670 atgttaagttgttaagttgtcttatattcatgagttgctaatgagatgtttgatgaagaattatt 15555606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 15963543 - 15963455
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||||    ||||||||  ||| |||||||||| ||| ||||||| |||| ||| |||||    
T  15963543 acttgatgatgtttatgttaaattaataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattattacgaatt 15963455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 15967467 - 15967379
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||||    ||||||||  ||| |||||||||| ||| ||||||| |||| ||| |||||    
T  15967467 acttgatgatgtttatgttaaattaataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattattacgaatt 15967379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 15971391 - 15971303
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||||    ||||||||  ||| |||||||||| ||| ||||||| |||| ||| |||||    
T  15971391 acttgatgatgtttatgttaaattaataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattattacgaatt 15971303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0599
Description:

Target: scaffold0599; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 144 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 4167 - 3985
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4167 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccttattcatgtattgctaatgagatggttgatgaataattattgttatgaattgataacgttga 4068  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagtactaaggggatgttaagaagaaatattattgagtggatttgatgatgtc 326  Q
    || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  4067 tgcatagtggctaagttgtcttctattcatgagtactaaggggatgttaagaagaattattattgggtggatttgatgatgtc 3985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 33)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 144 - 326
Target Start/End: Original strand, 34297805 - 34297987
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34297805 acttgctgatggttatgttaagttgataagttgttccttattcatgtattgctaatgagatggttgatgaataattattgttatgaattgataacgttga 34297904  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagtactaaggggatgttaagaagaaatattattgagtggatttgatgatgtc 326  Q
    || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  34297905 tgcatagtggctaagttgtcttctattcatgagtactaaggcgatgttaagaagaattattattgggtggatttgatgatgtc 34297987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 144 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 1254205 - 1254019
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1254205 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccttattcatgtattgttaatgagatggttgatgaataattattgttatgaattgataacgttga 1254106  T
Q  244 tg----tatagttgttaagttgtcttctattcatgagtactaaggggatgttaagaagaaatattattgagtggatttgatgatgtc 326  Q
    ||    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  1254105 tgcatatatagtggctaagttgtcttctattcatgagtactaaggggatgttaagaagaattattattgggtggatttgatgatgtc 1254019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 144 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 25737938 - 25737775
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  25737938 acttgatgatgattatgctaagttgataagttgtcccttattcatgtattgctaatgagatgcttgctgaataattactgttatgaattgataatgttga 25737839  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagtactaaggggatgttaagaagaaatattatt 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||    
T  25737838 tgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagggctaaggggatgttatgaagaattattatt 25737775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 144 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 23538027 - 23537897
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||  ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| | ||| |    
T  23538027 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcccttattcgtgaattgttaatgagatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgttta 23537928  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctattcatga 275  Q
    | |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  23537927 t-tatagttgctaagttgtcttttattcatga 23537897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 144 - 270
Target Start/End: Original strand, 22075423 - 22075548
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||  ||| |||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||| | ||| |    
T  22075423 acttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattattatgaattgatgatgtt-a 22075521  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctatt 270  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||    
T  22075522 cgtatagttgctaagttgtcttctatt 22075548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 144 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 4475841 - 4475709
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    ||||||||  |||||||||  ||| ||| |||||||||||| ||||||| |||| | ||| |    
T  4475841 acttgatgattgttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgtt-a 4475743  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagt 277  Q
     ||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  4475742 cgtatagttgctaagttgtcctctattcatgagt 4475709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 144 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 12941267 - 12941135
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||  ||||| |||  ||| ||| |||||||||||| ||||||| |||| | ||| |    
T  12941267 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctgatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgtt-a 12941169  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagt 277  Q
     ||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  12941168 cgtatagttgctaagttgtcctctattcatgagt 12941135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 256 - 324
Target Start/End: Original strand, 9622964 - 9623032
Alignment:
Q  256 aagttgtcttctattcatgagtactaaggggatgttaagaagaaatattattgagtggatttgatgatg 324  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  9622964 aagttgtcttctattcatgagcactaaggggatgttaagaagaattattattgagtgtatatgatgatg 9623032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 144 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 27555585 - 27555461
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    ||||||||  ||| |||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||| | ||| |    
T  27555585 acttgatgatgtttatgttaagttgata-gttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattattatgaattgatgatgtt-a 27555488  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctatt 270  Q
     ||||||||||||||||||||||||||    
T  27555487 cgtatagttgttaagttgtcttctatt 27555461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 144 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 23955415 - 23955283
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    ||||||||  ||| |||||  ||| ||| |||||||||||| ||||||| |||| | ||| |    
T  23955415 acttgatgagggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgttaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgtt-a 23955317  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagt 277  Q
     ||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  23955316 cgtatagttgctaagttgtcctctattcatgagt 23955283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 7429458 - 7429398
Alignment:
Q  252 tgttaagttgtcttctattcatgagtactaaggggatgttaagaagaaatattattgagtg 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7429458 tgttaagttgtcttctattcatgagcattaaggggatgttaagaagaattattattgagtg 7429398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Original strand, 14594709 - 14594769
Alignment:
Q  252 tgttaagttgtcttctattcatgagtactaaggggatgttaagaagaaatattattgagtg 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14594709 tgttaagttgtcttctattcatgagcattaaggggatgttaagaagaattattattgagtg 14594769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 144 - 270
Target Start/End: Original strand, 27416560 - 27416685
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    ||||||||  ||| |||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||| | ||| |    
T  27416560 acttgatgatgtttatgttaagttgataggttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattattatgaattgatgatgtt-a 27416658  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctatt 270  Q
     ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  27416659 cgtataattgctaagttgtcttctatt 27416685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 27222878 - 27222746
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||  |||||||||  ||| | | ||||||| |||| ||||||| |||| | ||| |    
T  27222878 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttcgatgaataactattattatgaaatgatgatgtt-a 27222780  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagt 277  Q
     ||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  27222779 cgtatagttgctaagttgtcctatattcatgagt 27222746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 273
Target Start/End: Original strand, 28290927 - 28291055
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||   ||||||||   ||| ||| |||||||||||| ||||||| |||| | ||| |    
T  28290927 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcataaattgctaattgaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgtt-a 28291025  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctattcat 273  Q
     ||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  28291026 cgtatagttgctaagttgtcctctattcat 28291055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 14470927 - 14470839
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||    ||||||||  ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  14470927 acttgatgatgtttatgttaggttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaatt 14470839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 23400724 - 23400640
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaa-gttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttat 227  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||  ||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  23400724 acttgatgatggttatgttaaagttgataagttgtcctttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattat 23400640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 252 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 28707890 - 28707816
Alignment:
Q  252 tgttaagttgtcttctattcatgagtactaaggggatgttaagaagaaatattattgagtggatttgatgatgtc 326  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||| |||| ||||||||| || || ||||||||||    
T  28707890 tgttaagttgacttctattcatgagcactaagagaatgttaaggagaattattattgaatgtatctgatgatgtc 28707816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 146 - 232
Target Start/End: Original strand, 31479497 - 31479583
Alignment:
Q  146 ttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||   || |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  31479497 ttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaatt 31479583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 8242458 - 8242370
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    |||| |||  ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  8242458 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaatt 8242370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 11565447 - 11565359
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    |||| |||  ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  11565447 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaatt 11565359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Original strand, 11716973 - 11717061
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    |||| |||  ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  11716973 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaatt 11717061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Original strand, 12620366 - 12620454
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    |||| |||  ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  12620366 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaatt 12620454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 146 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 2076330 - 2076267
Alignment:
Q  146 ttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttg 209  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  2076330 ttgatgatgattatgttaagttgataagttgttttttattcatgaattgataatgagatgcttg 2076267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 144 - 177
Target Start/End: Original strand, 18918613 - 18918646
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgt 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18918613 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgt 18918646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 16758761 - 16758673
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    |||| |||  ||| || ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  16758761 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgatagtgagatgtttgatgaataattattattatgaatt 16758673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 23393687 - 23393599
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    ||||||||  ||| |||||||||| ||| ||||||| |||| ||| |||||    
T  23393687 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattattacgaatt 23393599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 23413595 - 23413507
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    ||||||||  ||| |||||||||| ||| ||||||| |||| ||| |||||    
T  23413595 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattattacgaatt 23413507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 19869233 - 19869160
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataa 217  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    ||||||||  ||| |||||||||| ||| |||||||    
T  19869233 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataa 19869160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 144 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16622881 - 16622796
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaat 231  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||   ||||||||   || |||||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||    
T  16622881 acttgatgatgtttatgttaagttgataagttctt--ttattcatgaaatgataatgagatgtttgatgaatgattatcattatgaat 16622796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 22861801 - 22861713
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||    |||| |||  ||| |||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||    
T  22861801 acttggtgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattatgattatgaatt 22861713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 211 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 23537883 - 23537819
Alignment:
Q  211 tgaataattattgttatgaattgataacgttgatgtatagttgttaagttgtcttctattcatga 275  Q
    |||||| ||||| ||||||| |||| ||||| | | ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  23537883 tgaatatttattattatgaactgatgacgtttacgaatagttgctaagttgtcttcaattcatga 23537819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 23988349 - 23988261
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||    |||| |||  ||| |||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  23988349 acttgatgatgtttatattaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgaaatgtttgatgaataattattattatgaatt 23988261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 25)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 144 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 36459594 - 36459412
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36459594 acttaatgatgattatgttaagttgataagttgttccttattcatgttttgctaatgagatggttgatgaataattattgttatgaattgataacgttga 36459495  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagtactaaggggatgttaagaagaaatattattgagtggatttgatgatgtc 326  Q
    || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  36459494 tgcatagtggctaagttgtcttctattcatgagtactaaggggatgttaagaaaaattattattgggtggatttgatgatgtc 36459412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 144 - 277
Target Start/End: Original strand, 22120624 - 22120756
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||  ||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||| | ||| |    
T  22120624 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgtt-a 22120722  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagt 277  Q
     ||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  22120723 cgtatagttgctaagttgatttctattcatgagt 22120756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 144 - 277
Target Start/End: Original strand, 38146451 - 38146583
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||  |||||||||  ||| ||| |||||||||||| ||||||| |||| | ||| |    
T  38146451 acttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgtt-a 38146549  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagt 277  Q
     ||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  38146550 cgtatagttgctaagttgtcctctattcatgagt 38146583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 252 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 19075920 - 19075846
Alignment:
Q  252 tgttaagttgtcttctattcatgagtactaaggggatgttaagaagaaatattattgagtggatttgatgatgtc 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| || || ||||||||||    
T  19075920 tgttaagttgtcttctattcatgagcactaaggggatgttaaggagaattattattgaatgtatatgatgatgtc 19075846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 252 - 326
Target Start/End: Original strand, 31253258 - 31253332
Alignment:
Q  252 tgttaagttgtcttctattcatgagtactaaggggatgttaagaagaaatattattgagtggatttgatgatgtc 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| || ||||||||||    
T  31253258 tgttaagttgtcttctattcatgagcactaaggggatgttaaggagaattatcattgagtgtatatgatgatgtc 31253332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 182 - 277
Target Start/End: Original strand, 22108519 - 22108613
Alignment:
Q  182 tattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttgatgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagt 277  Q
    ||||||||  ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| | ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22108519 tattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgtt-acgtatagttgctaagttgtcttctattcatgagt 22108613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 19510508 - 19510376
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||    ||||||||  |||||||||  | | ||| |||||||||||| ||||||| |||| | ||| |    
T  19510508 acttgatgatggttatgttaagttgataggttgtcttttattcatgaattgctaatggaacgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgtt-a 19510410  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagt 277  Q
      |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  19510409 catatagttgctaagttgtcctctattcatgagt 19510376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 22339058 - 22338926
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    ||||||||  |||||||||  ||| ||| |||||||||||| ||||||| | || | ||| |    
T  22339058 acttgatgatggttatgttacgttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaataatgatgtt-a 22338960  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagt 277  Q
     ||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  22338959 cgtatagttgctaagttgtcccctattcatgagt 22338926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 277
Target Start/End: Original strand, 23113435 - 23113567
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||    ||||||||  |||||||||  ||| ||| |||||||||||| ||||| | |||| | ||| |    
T  23113435 acttgatgatgattgtgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatggaatgatgatgtt-a 23113533  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagt 277  Q
     ||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  23113534 cgtatagttgctaagttgtcctctattcatgagt 23113567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 277
Target Start/End: Original strand, 28372114 - 28372246
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||  |||||||||  ||| ||| |||||||||||| ||||||| |||| | | | |    
T  28372114 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatg-tca 28372212  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagt 277  Q
     ||||||||| |||||||||   |||||||||||    
T  28372213 cgtatagttgctaagttgtcccatattcatgagt 28372246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 277
Target Start/End: Original strand, 33473964 - 33474096
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    ||||||||  ||| |||||  ||| ||| |||||||||||| ||||||| |||| | ||| |    
T  33473964 acttgatgagggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgttaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgtt-a 33474062  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagt 277  Q
     ||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  33474063 cgtatagttgctaagttgtcctttattcatgagt 33474096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 261
Target Start/End: Original strand, 37600041 - 37600157
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||  |||||||||  ||| ||| |||||||||||| ||||||| |||| | ||| |    
T  37600041 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgtt-a 37600139  T
Q  244 tgtatagttgttaagttg 261  Q
     ||||||||| |||||||    
T  37600140 cgtatagttgctaagttg 37600157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 277
Target Start/End: Original strand, 41878684 - 41878816
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    |||| |||  |||||||||  ||| ||| |||||||||||| ||||| | |||| | ||| |    
T  41878684 acttgatgatagttatgttaagttgataagttgtcttttatttatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatggaatgatgatgtt-a 41878782  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagt 277  Q
     ||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  41878783 cgtatagttgctaagttgtcctctattcatgagt 41878816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Original strand, 43243807 - 43243867
Alignment:
Q  252 tgttaagttgtcttctattcatgagtactaaggggatgttaagaagaaatattattgagtg 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  43243807 tgttaagttgtcttctattcatgagcattaaggggatgttaagaagaattattattaagtg 43243867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 146 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 22335526 - 22335396
Alignment:
Q  146 ttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttgatg 245  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||    ||||||||  |||||||||  ||| ||| |||||||||||| ||||||| | || | ||| | |    
T  22335526 ttgatgatggttatgttacgttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaataatgatgtt-acg 22335428  T
Q  246 tatagttgttaagttgtcttctattcatgagt 277  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  22335427 tatagttgctaagttgtcccctattcatgagt 22335396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Original strand, 15238150 - 15238238
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||   || |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  15238150 acttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaatt 15238238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Original strand, 20912285 - 20912373
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||    ||||||||   || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  20912285 acttgatgatgtgtatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgagatgtttgatgaataattattgttatgaatt 20912373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 144 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 18354843 - 18354745
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttg 242  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    ||||||||  ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||| || ||||||    
T  18354843 acttgatgatgtttatgttaagttgataaattgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattataaattaatgacgttg 18354745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 22749207 - 22749162
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatg 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  22749207 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcctatattcatg 22749162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 232
Target Start/End: Original strand, 24768598 - 24768683
Alignment:
Q  147 tgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||  ||| |||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||    
T  24768598 tgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattaatattatgaatt 24768683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 10751863 - 10751775
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    |||||| |   || |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  10751863 acttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcaagaaatgataatgagatggttgatgaataattattattatgaatt 10751775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Original strand, 19474205 - 19474293
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    |||| |||  ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  19474205 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaatt 19474293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 20294560 - 20294472
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    |||| |||  ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  20294560 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaatt 20294472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Original strand, 40727432 - 40727519
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    ||||||||  ||| ||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  40727432 acttgatgatg-ttatgttaagttgataagttatcttttattcatgaattgataaagagatgtttgatgaataattattattatgaatt 40727519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 11219601 - 11219528
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataa 217  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    ||||||||  ||| |||||||||| ||| |||||||    
T  11219601 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataa 11219528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 46)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 144 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 15213094 - 15212912
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15213094 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccttattcatgtattgctaatgagatggttgatgaataattattgttatgaattgataacgttga 15212995  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagtactaaggggatgttaagaagaaatattattgagtggatttgatgatgtc 326  Q
    || ||| | | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  15212994 tgcataatggctaagttgtcctcaattcatgagtactaaggggatgttaagaagaattattattgggtggatttgatgatgtc 15212912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 144 - 277
Target Start/End: Original strand, 834078 - 834210
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||  |||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||| | ||| |    
T  834078 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgtt-a 834176  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagt 277  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  834177 cgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagt 834210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 144 - 277
Target Start/End: Original strand, 1199258 - 1199390
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||  |||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||| | ||| |    
T  1199258 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgtt-a 1199356  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagt 277  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1199357 cgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagt 1199390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 144 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 13891676 - 13891544
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| | ||| |    
T  13891676 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgagatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgtt-a 13891578  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagt 277  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13891577 cgtatagttgctaagttgtcttctattcatgagt 13891544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 144 - 277
Target Start/End: Original strand, 838166 - 838298
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||  |||||||| | ||| ||| |||||||||||| |||||||||||| | ||| |    
T  838166 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaataaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgtt-a 838264  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagt 277  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  838265 cgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagt 838298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 144 - 277
Target Start/End: Original strand, 1203346 - 1203478
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||  |||||||| | ||| ||| |||||||||||| |||||||||||| | ||| |    
T  1203346 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaataaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgtt-a 1203444  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagt 277  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1203445 cgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagt 1203478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 144 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 13892059 - 13891927
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    | | ||||  |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| | ||| |    
T  13892059 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttttgcatgaattgctaatgagatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgtt-a 13891961  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagt 277  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13891960 cgtatagttgctaagttgtcttctattcatgagt 13891927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 144 - 277
Target Start/End: Original strand, 16110008 - 16110140
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |    ||||||||  |||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||| | ||| |    
T  16110008 acttgatgatggttatgttaagttgataagttatcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgtt-a 16110106  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagt 277  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16110107 cgtatagttgttaacttgtcttctattcatgagt 16110140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 144 - 277
Target Start/End: Original strand, 10607353 - 10607485
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    || |||||  ||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||| | ||| |    
T  10607353 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttagtcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgtt-a 10607451  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagt 277  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10607452 cgtatagttgctaagttgtcttctattcatgagt 10607485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 144 - 277
Target Start/End: Original strand, 39268346 - 39268478
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||  ||  |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| | ||| |    
T  39268346 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgccttttattcatgaatttataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgtt-a 39268444  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagt 277  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39268445 cgtatagttgataagttgtcttctattcatgagt 39268478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 144 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 16582467 - 16582336
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    | ||||||  ||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||| | ||| |    
T  16582467 acttgatgatggttatgataagttgataagttgtctttttttcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgtt-a 16582369  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctattcatgag 276  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16582368 tgtatagttgctaagttgtcttctattcatgag 16582336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 144 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 18871343 - 18871211
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||  |||||||||  ||| ||| |||||||||||| ||||||| |||| | ||| |    
T  18871343 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgtt-a 18871245  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagt 277  Q
     ||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  18871244 cgtatagttgctaagttgtcctctattcatgagt 18871211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 144 - 277
Target Start/End: Original strand, 7520248 - 7520381
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaat-aattattgttatgaattgataacgttg 242  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||  ||| |||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||| |||| | |||     
T  7520248 acttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgtt- 7520346  T
Q  243 atgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagt 277  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7520347 acgtatagttgctaagttgtcttctattcatgagt 7520381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 15166293 - 15166164
Alignment:
Q  147 tgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttgatgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||  |||||||||  ||| ||| |||||||||||| ||||||| |||| | ||||  ||    
T  15166293 tgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgttg-cgt 15166195  T
Q  247 atagttgttaagttgtcttctattcatgagt 277  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  15166194 atagttgctaagttgtcctctattcatgagt 15166164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 144 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 11660328 - 11660196
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    ||||||||  |||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||| | || | ||| |    
T  11660328 acttgatgatggttatgttaagttggtaagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaaattatgatgtt-a 11660230  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagt 277  Q
     ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  11660229 cgtataattgctaagttgtcttctattcatgagt 11660196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 144 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 14420833 - 14420701
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||  |||||||||  ||| ||| |||||||||||| ||||||| |||| | ||| |    
T  14420833 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgtt-a 14420735  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagt 277  Q
     ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||    
T  14420734 cgtataattgctaagttgtcctctattcatgagt 14420701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 144 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 146546 - 146414
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    || |||||  |||||||||  ||| ||| |||||||||||| ||||||| |||| | ||| |    
T  146546 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttctactcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgtt-a 146448  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagt 277  Q
     ||||||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  146447 cgtatagttgctaagctgtcctctattcatgagt 146414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 144 - 277
Target Start/End: Original strand, 10897929 - 10898061
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||  |||||||||  ||| ||  |||||||||||| ||||||| |||| | ||| |    
T  10897929 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttatgaataattattattatgaaatgatgatgtt-a 10898027  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagt 277  Q
     | ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  10898028 cgcatagttgctaagttgtcctctattcatgagt 10898061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 144 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 41283691 - 41283559
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    ||||||||  |||||||||  ||| ||| |||| ||||||| ||||||| |||| | ||| |    
T  41283691 acttgatgagggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaaaaattattattatgaaatgatgatgtt-a 41283593  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagt 277  Q
     ||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  41283592 cgtatagttgctaagttgtcctctattcatgagt 41283559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 249 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 16185550 - 16185474
Alignment:
Q  249 agttgttaagttgtcttctattcatgagtactaaggggatgttaagaagaaatattattgagtggatttgatgatgt 325  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||    
T  16185550 agttgataagtcgtcttctattcatgagcactaaggggatgttaagaagaattaatattgagtgtatatgatgatgt 16185474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 144 - 275
Target Start/End: Original strand, 9752540 - 9752670
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||     ||||||||  ||  |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| | ||| |    
T  9752540 acttggtgatggttatgttaagttgataagttgccttttattcatgaatttataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgtt-a 9752638  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctattcatga 275  Q
     ||||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  9752639 cgtatagttgataagttgtcttttatccatga 9752670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 16005050 - 16004918
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||  |||||||||  ||| | | ||||||| |||| ||||||| |||| | ||| |    
T  16005050 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttcgatgaataactattattatgaaatgatgatgtt-a 16004952  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagt 277  Q
     ||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  16004951 cgtatagttgctaagttgtcctatattcatgagt 16004918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 18606384 - 18606249
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttat---gaattgataacgt 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||  |||||||||  ||| ||| |||||||||||| ||||   ||| |||| | ||    
T  18606384 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattattatgaaatgatgatgt 18606285  T
Q  241 tgatgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagt 277  Q
    | |  |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  18606284 t-acatatagttgctaagttgtcctctattcatgagt 18606249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 209
Target Start/End: Original strand, 25928404 - 25928469
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttg 209  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  25928404 actttatgatggttatgttaagttgataagttgttttttattcatgaattgctaatgagatgcttg 25928469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 39721242 - 39721153
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaa-gttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    ||||||||  ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  39721242 acttgatgatggttatgttaaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaatt 39721153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 18424281 - 18424193
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||   || |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  18424281 acttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgagatggttgatgaataattattattatgaatt 18424193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 11302350 - 11302267
Alignment:
Q  147 tgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaa 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||  ||||||||  ||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  11302350 tgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgtaatgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaa 11302267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 252 - 326
Target Start/End: Original strand, 11394926 - 11395000
Alignment:
Q  252 tgttaagttgtcttctattcatgagtactaaggggatgttaagaagaaatattattgagtggatttgatgatgtc 326  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||| |||| ||||||||| || || ||||||||||    
T  11394926 tgttaagttgacttctattcatgagcactaagagaatgttaaggagaattattattgaatgtatctgatgatgtc 11395000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 15083272 - 15083183
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaag-ttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    ||||||||  ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  15083272 acttgatgatggttatgttaaaattgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaatt 15083183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 31771 - 31683
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    |||| |||  ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  31771 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaatt 31683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Original strand, 72404 - 72492
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    |||| |||  ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  72404 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaatt 72492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Original strand, 76513 - 76601
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    |||| |||  ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  76513 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaatt 76601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Original strand, 12706155 - 12706243
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    |||| |||  ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  12706155 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaatt 12706243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 12713586 - 12713498
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    |||| |||  ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  12713586 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaatt 12713498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 12722244 - 12722156
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    |||| |||  ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  12722244 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaatt 12722156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Original strand, 16908542 - 16908630
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    |||| |||  ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  16908542 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaatt 16908630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 18278040 - 18277952
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    |||| |||  ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  18278040 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattgatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaatt 18277952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 18282004 - 18281916
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    |||| |||  ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  18282004 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattgatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaatt 18281916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 196 - 275
Target Start/End: Original strand, 9752676 - 9752754
Alignment:
Q  196 taatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttgatgtatagttgttaagttgtcttctattcatga 275  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| | ||| | ||||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  9752676 taatgagatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgtt-acgtatagttgataagttatcttttattcatga 9752754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 144 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 20486788 - 20486755
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgt 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20486788 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgt 20486755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 26291203 - 26291114
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaa-gttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    ||||||||  ||  |||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||    
T  26291203 acttgatgatggttatgttaaagttgataagttgtcttttattcatgaattaataatgagatgtttgacgaataattattattatgaatt 26291114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Original strand, 2531365 - 2531452
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||  ||| ||| |||||| ||  |||||||||||| |||||||||    
T  2531365 acttgatgatg-ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataaagagatgttttatgaataattattattatgaatt 2531452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Original strand, 2833514 - 2833602
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||   || |||||||||| |   |||||||||||| |||||||||    
T  2833514 acttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgagatgttcaatgaataattattattatgaatt 2833602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 12717333 - 12717245
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||    |||| |||  ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  12717333 acttgctgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaatt 12717245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Original strand, 45171533 - 45171621
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    ||||||||  ||| |||||||||| ||| ||||||| |||| ||| |||||    
T  45171533 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattattacgaatt 45171621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 209
Target Start/End: Original strand, 13919445 - 13919510
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttg 209  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    ||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  13919445 acttgatgacgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgcttg 13919510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 34)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 147 - 326
Target Start/End: Original strand, 42560917 - 42561096
Alignment:
Q  147 tgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttgatgt 246  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  42560917 tgatggtggttatgttaagttgacaagttgttccttattcatgcattgctaatgagatggttgatgaataattattgttatgaattgataacgttgatgc 42561016  T
Q  247 atagttgttaagttgtcttctattcatgagtactaaggggatgttaagaagaaatattattgagtggatttgatgatgtc 326  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  42561017 atagtggctaagttgtcttctattcatgagtactaaggggatgttaagaagaattattattgggtggatttgatgatgtc 42561096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 144 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21328612 - 21328527
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatga 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21328612 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccttattcatgtattgctaatgagatgcttgttgaataattattgttatga 21328527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 144 - 277
Target Start/End: Original strand, 27942718 - 27942850
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||    ||||||||  |||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||| | ||| |    
T  27942718 acttgatgatggttatgataagttaataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgtt-a 27942816  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagt 277  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27942817 cgtatagttgttaagttgtcctctattcatgagt 27942850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 249 - 326
Target Start/End: Original strand, 21968045 - 21968122
Alignment:
Q  249 agttgttaagttgtcttctattcatgagtactaaggggatgttaagaagaaatattattgagtggatttgatgatgtc 326  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  21968045 agttgataagttgtcttctattcatgagcactaaggggatgttaagaagaattattattgagtgtatatgatgatgtc 21968122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 249 - 326
Target Start/End: Original strand, 21980885 - 21980962
Alignment:
Q  249 agttgttaagttgtcttctattcatgagtactaaggggatgttaagaagaaatattattgagtggatttgatgatgtc 326  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  21980885 agttgataagttgtcttctattcatgagcactaaggggatgttaagaagaattattattgagtgtatatgatgatgtc 21980962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 249 - 326
Target Start/End: Original strand, 21985868 - 21985945
Alignment:
Q  249 agttgttaagttgtcttctattcatgagtactaaggggatgttaagaagaaatattattgagtggatttgatgatgtc 326  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  21985868 agttgataagttgtcttctattcatgagcactaaggggatgttaagaagaattattattgagtgtatatgatgatgtc 21985945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 144 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 23427872 - 23427740
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||  ||| |||||| ||| ||| |||||||||||| |||| ||||||| | ||| |    
T  23427872 acttaatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaaatgtttgatgaataattattattataaattgatgatgtt-a 23427774  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagt 277  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23427773 cgtatagttgctaagttgtcttctattcatgagt 23427740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 252 - 326
Target Start/End: Original strand, 44494271 - 44494345
Alignment:
Q  252 tgttaagttgtcttctattcatgagtactaaggggatgttaagaagaaatattattgagtggatttgatgatgtc 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||| || ||||||||||    
T  44494271 tgttaagttgtcttctattcatgagcactaaggggatgttaagaataattattattgagtgtatatgatgatgtc 44494345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 252 - 326
Target Start/End: Original strand, 11252129 - 11252204
Alignment:
Q  252 tgttaagttgtcttctatt-catgagtactaaggggatgttaagaagaaatattattgagtggatttgatgatgtc 326  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  11252129 tgttaagttgtcttctatttcatgagcactaaggggatgttaagaagaattattattgagtgtatatgatgatgtc 11252204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 147 - 272
Target Start/End: Original strand, 8729645 - 8729769
Alignment:
Q  147 tgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttgatgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||  |||||||||  ||| ||| |||||||||||| ||||||| |||| | ||| | ||    
T  8729645 tgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgtt-acgt 8729743  T
Q  247 atagttgttaagttgtcttctattca 272  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  8729744 atagttgctaagttgtcctctattca 8729769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 144 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 11774342 - 11774210
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    ||||||||  ||| |||||  ||| ||| |||||||||||| ||||||| |||| | ||| |    
T  11774342 acttgatgagggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgttaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgtt-a 11774244  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagt 277  Q
     ||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  11774243 cgtatagttgataagttgtcctctattcatgagt 11774210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 249 - 326
Target Start/End: Original strand, 22009249 - 22009326
Alignment:
Q  249 agttgttaagttgtcttctattcatgagtactaaggggatgttaagaagaaatattattgagtggatttgatgatgtc 326  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||    
T  22009249 agttgataagttgtgttctattcatgagcactaaggggatgttaagaagaattattattaagtgtatatgatgatgtc 22009326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 363314 - 363182
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||    ||||||||  |||||||||  ||| ||| |||||||||||| ||||| | |||| | ||| |    
T  363314 acttgttgatggttatgttaagatgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatggaatgatgatgtt-a 363216  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagt 277  Q
     ||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  363215 cgtatagttgctaagttgtcctctattcatgagt 363182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 277
Target Start/End: Original strand, 8415009 - 8415141
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    ||||||| | |||||| |||||||||||||||||    ||||||||  |||||||||  ||| ||| |||||||||||| ||||||| |||| | ||| |    
T  8415009 acttgattagggttattttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgtt-a 8415107  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagt 277  Q
     ||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  8415108 cgtatagttgctaagttgtcctctattcatgagt 8415141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 21409947 - 21409858
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaa-gttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    |||| |||  ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  21409947 acttgatgatggttatgttaaagttgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaatt 21409858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 21804439 - 21804350
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaa-gttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    |||| |||  ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  21804439 acttgatgatggttatgttaaagttgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaatt 21804350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23913311 - 23913246
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttg 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  23913311 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgcttg 23913246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 269 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 34950100 - 34950043
Alignment:
Q  269 ttcatgagtactaaggggatgttaagaagaaatattattgagtggatttgatgatgtc 326  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  34950100 ttcatgagcactaatgggatgttaagaagaattattattgagtgtatatgatgatgtc 34950043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Original strand, 14399125 - 14399213
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||  ||| |||||||||| ||| ||||||| |||| ||| |||||    
T  14399125 acttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattattacgaatt 14399213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Original strand, 21829493 - 21829581
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    |||| |||  ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  21829493 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaatt 21829581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Original strand, 21974216 - 21974304
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    |||| |||  ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  21974216 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaatt 21974304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 43250248 - 43250160
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    |||| |||  ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  43250248 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaatt 43250160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 291
Target Start/End: Original strand, 22000831 - 22000873
Alignment:
Q  249 agttgttaagttgtcttctattcatgagtactaaggggatgtt 291  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22000831 agttgataagttgtcttctattcatgagcactaaggggatgtt 22000873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 222
Target Start/End: Original strand, 44385866 - 44385944
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattatt 222  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    ||||||||  ||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  44385866 acttgatgatgattatgttaacttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattatt 44385944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 144 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 21386205 - 21386172
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgt 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21386205 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgt 21386172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Original strand, 18864137 - 18864225
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    ||||||||  ||| |||||||||| ||| ||||||| |||| ||| |||||    
T  18864137 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattattacgaatt 18864225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Original strand, 21978326 - 21978414
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    |||| |||  ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  21978326 acttgatgatgtttatgttatattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaatt 21978414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 22110647 - 22110559
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    |||| |||  ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  22110647 acttgatgatttttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaatt 22110559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 177
Target Start/End: Original strand, 21968025 - 21968058
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgt 177  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21968025 acttgatgagggttatgttaagttgataagttgt 21968058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 177
Target Start/End: Original strand, 21980865 - 21980898
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgt 177  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21980865 acttgatgagggttatgttaagttgataagttgt 21980898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 177
Target Start/End: Original strand, 21985848 - 21985881
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgt 177  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21985848 acttgatgagggttatgttaagttgataagttgt 21985881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 177
Target Start/End: Original strand, 22000811 - 22000844
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgt 177  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22000811 acttgatgagggttatgttaagttgataagttgt 22000844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 177
Target Start/End: Original strand, 22009229 - 22009262
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgt 177  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22009229 acttgatgagggttatgttaagttgataagttgt 22009262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Original strand, 30941597 - 30941685
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    |||||||   ||| |||||||||| ||| ||||||| |||| ||| |||||    
T  30941597 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattcataaattgataatgagatgtttgatgaataagtattattacgaatt 30941685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 21)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 146 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 29533931 - 29533801
Alignment:
Q  146 ttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttgatg 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||  |||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||| | ||| | |    
T  29533931 ttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgtt-acg 29533833  T
Q  246 tatagttgttaagttgtcttctattcatgagt 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29533832 tatagttgttaagttgtcttctattcatgagt 29533801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 144 - 277
Target Start/End: Original strand, 22132131 - 22132263
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||  ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| | ||| |    
T  22132131 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgtt-a 22132229  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagt 277  Q
     |||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  22132230 cgtatagatgctaagttgtcttccattcatgagt 22132263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 252 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 11945025 - 11944951
Alignment:
Q  252 tgttaagttgtcttctattcatgagtactaaggggatgttaagaagaaatattattgagtggatttgatgatgtc 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  11945025 tgttaagttgtcttctattcatgagcactaaggggatgttaaggagaattattattgagtgtatatgatgatgtc 11944951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 277
Target Start/End: Original strand, 20439188 - 20439317
Alignment:
Q  147 tgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttgatgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||||||  ||| ||| |||||||||||| ||||| | |||| | ||| | ||    
T  20439188 tgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgtattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatggaatgatgatgtt-acgt 20439286  T
Q  247 atagttgttaagttgtcttctattcatgagt 277  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  20439287 atagttgctaagttgtcctctattcatgagt 20439317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 252 - 326
Target Start/End: Original strand, 43631040 - 43631114
Alignment:
Q  252 tgttaagttgtcttctattcatgagtactaaggggatgttaagaagaaatattattgagtggatttgatgatgtc 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  43631040 tgttaagttgtcttctattcatgagcactaaggggatgttaaggagaattattattgagtgtatatgatgatgtc 43631114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 144 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 32649113 - 32648981
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    ||||||||  |||||||||  ||| ||| |||||||||||| ||||||| |||| | ||| |    
T  32649113 acttgatgattgttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgtt-a 32649015  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagt 277  Q
     ||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  32649014 cgtatagttgctaagttgtcctctattcatgagt 32648981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 252 - 326
Target Start/End: Original strand, 20032223 - 20032297
Alignment:
Q  252 tgttaagttgtcttctattcatgagtactaaggggatgttaagaagaaatattattgagtggatttgatgatgtc 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| || || |||||||    
T  20032223 tgttaagttgtcttctattcatgagcattaaggggatgttaagaagaattattattgagtgcatatggtgatgtc 20032297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 144 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 16370971 - 16370839
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||  |||||||||  ||| | | ||||||| |||| ||||||| |||| | ||| |    
T  16370971 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttcgatgaataactattattatgaaatgatgatgtt-a 16370873  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagt 277  Q
     ||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  16370872 cgtatagttgctaagttgtcttatattcatgagt 16370839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Original strand, 41389697 - 41389785
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||   || |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  41389697 acttgatgatgtttatgttaagttgataagttgttttttattcatgaaatgataatgagatggttgatgaataattattattatgaatt 41389785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 249 - 325
Target Start/End: Original strand, 11810002 - 11810078
Alignment:
Q  249 agttgttaagttgtcttctattcatgagtactaaggggatgttaagaagaaatattattgagtggatttgatgatgt 325  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||    
T  11810002 agttgataagtcgtcttctattcacgagcattaaggggatgttaagaagaattaatattgagtgtatatgatgatgt 11810078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 33796079 - 33795991
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||  ||| |||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  33796079 acttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgatatgtttgatgaataattattattatgaatt 33795991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Original strand, 20230171 - 20230260
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaa-gttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    ||||||||  ||  |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  20230171 acttgatgatggttatgttaaagttgataagttgtcttttattcatgaattaataatgagatgtttgatgaataattattattatgaatt 20230260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Original strand, 39245203 - 39245289
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||   ||||||||   || |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  39245203 acttgatgatgtttatgttaagttgataagttctt--ttattcatgaaatgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaatt 39245289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Original strand, 39248758 - 39248844
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||   ||||||||   || |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  39248758 acttgatgatgtttatgttaagttgataagttctt--ttattcatgaaatgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaatt 39248844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 209
Target Start/End: Original strand, 41801311 - 41801376
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttg 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  41801311 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgcttg 41801376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 1009308 - 1009220
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    |||| |||  ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  1009308 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaatt 1009220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Original strand, 1926828 - 1926916
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    |||| |||  ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  1926828 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaatt 1926916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Original strand, 16376848 - 16376936
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    |||| |||  ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  16376848 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaatt 16376936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Original strand, 20925842 - 20925930
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    |||| |||  ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  20925842 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaatt 20925930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 52634314 - 52634226
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||   |||| |||  ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  52634314 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttattttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaatt 52634226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 144 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 21406299 - 21406266
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgt 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21406299 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgt 21406266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 33)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 144 - 277
Target Start/End: Original strand, 17052478 - 17052610
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||  ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| | ||| |    
T  17052478 acttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgtt-a 17052576  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagt 277  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17052577 cgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagt 17052610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 144 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 30145829 - 30145697
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||  |||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||| | ||| |    
T  30145829 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgtt-a 30145731  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagt 277  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30145730 cgtatagttgataagttgtcttctattcatgagt 30145697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 144 - 275
Target Start/End: Original strand, 22634959 - 22635089
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||  ||  |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| | ||| |    
T  22634959 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaatttataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgtt-a 22635057  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctattcatga 275  Q
     ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  22635058 cgtatagttgataagttgtcttttattcatga 22635089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 144 - 277
Target Start/End: Original strand, 13813865 - 13813997
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||     | ||||||  ||  |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| | ||| |    
T  13813865 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgccttttgttcatgaatttataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgtt-a 13813963  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagt 277  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13813964 cgtatagttgataagttgtcttctattcatgagt 13813997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 144 - 275
Target Start/End: Original strand, 24048417 - 24048547
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||  |||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||| |||| | ||| |    
T  24048417 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgtt-a 24048515  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctattcatga 275  Q
      |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  24048516 catatagttgctaagttgtcttttattcatga 24048547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 144 - 270
Target Start/End: Original strand, 20163931 - 20164056
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||  ||| |||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||| | ||| |    
T  20163931 acttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattattatgaattgatgatgtt-a 20164029  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctatt 270  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||    
T  20164030 cgtatagttgctaagttgtcttctatt 20164056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 252 - 326
Target Start/End: Original strand, 37839239 - 37839313
Alignment:
Q  252 tgttaagttgtcttctattcatgagtactaaggggatgttaagaagaaatattattgagtggatttgatgatgtc 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  37839239 tgttaagttgtcttctattcatgagcactaaggggatgttaaggagaattattattgagtgtatatgatgatgtc 37839313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 252 - 326
Target Start/End: Original strand, 42597968 - 42598042
Alignment:
Q  252 tgttaagttgtcttctattcatgagtactaaggggatgttaagaagaaatattattgagtggatttgatgatgtc 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  42597968 tgttaagttgtcttctattcatgagcactaaggggatgttaaggagaattattattgagtgtatatgatgatgtc 42598042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 144 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 15533265 - 15533133
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||  |||||||||  ||| ||| |||||||||||| ||||||| |||| | ||| |    
T  15533265 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgtt-a 15533167  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagt 277  Q
     ||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  15533166 cgtatagttgctaagttgtcccctattcatgagt 15533133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 144 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 18211650 - 18211518
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||  |||||||||  ||| ||| |||||||||||| ||||||| |||| | ||| |    
T  18211650 acttgatgatggttatgttgagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgtt-a 18211552  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagt 277  Q
     ||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  18211551 cgtatagttgctaagttgtcctctattcatgagt 18211518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 144 - 275
Target Start/End: Original strand, 13818353 - 13818483
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||  ||  |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| | ||| |    
T  13818353 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgcattttattcatgaatttataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgtt-a 13818451  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctattcatga 275  Q
     ||||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  13818452 cgtatagttgataagttgtcttttatccatga 13818483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 144 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 28384897 - 28384765
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    ||||||||  |||||||||  ||| |||  ||||||||||| ||||||| |||| | ||| |    
T  28384897 acttgatgagggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgaggaataattattattatgaaatgatgatgtt-a 28384799  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagt 277  Q
     ||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  28384798 cgtatagttgctaagttgtcctctattcatgagt 28384765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 144 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 36036998 - 36036866
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||  |||||||||  ||| ||  |||||||||||| ||||||| |||| | ||| |    
T  36036998 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttcatgaataattattattatgaaatgatgatgtt-a 36036900  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagt 277  Q
     | ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  36036899 cggatagttgctaagttgtcctctattcatgagt 36036866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 144 - 270
Target Start/End: Original strand, 20158480 - 20158605
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||  ||| |||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||| | ||| |    
T  20158480 acttgatgatgcttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattattatgaattgatgatgtt-a 20158578  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctatt 270  Q
      |||||||| ||| ||||||||||||    
T  20158579 cttatagttgctaacttgtcttctatt 20158605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 196 - 277
Target Start/End: Original strand, 13818489 - 13818569
Alignment:
Q  196 taatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttgatgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagt 277  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| | ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13818489 taatgagatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgtt-acgtatagttgataagttgtcttctattcatgagt 13818569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 269
Target Start/End: Original strand, 20161156 - 20161280
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    |||||| |  ||| |||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||| | ||| |    
T  20161156 acttgataatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcaagaattgataatgagatgtttgatgaataagtattattatgaattgatgatgtt-a 20161254  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctat 269  Q
     ||||||||| |||||||||||||||    
T  20161255 cgtatagttgctaagttgtcttctat 20161280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 12422989 - 12422863
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    ||||||||  ||| |||||||||| ||| ||||||||||||      | ||||| | ||| |    
T  12422989 acttgatgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattatt------atttgatgatgtt-a 12422897  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagt 277  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12422896 cgtatagttgctaagttgtcttctattcatgagt 12422863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 277
Target Start/End: Original strand, 49549115 - 49549248
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataa-gttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttg 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||    ||||||||  |||||||||  ||| ||| |||||||||||| ||||| | |||| | |||     
T  49549115 acttgatgatggttatgttaagttgataccgttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatggaatgatgatgtt- 49549213  T
Q  243 atgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagt 277  Q
    | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  49549214 acgtatagttgctaagttgtcatctattcatgagt 49549248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 209
Target Start/End: Original strand, 631780 - 631845
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttg 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  631780 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtattctattcatgagttgctaatgagatgcttg 631845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 15223592 - 15223504
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||   || |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  15223592 acttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgagatggttgatgaataattattattatgaatt 15223504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 182 - 277
Target Start/End: Original strand, 24048539 - 24048633
Alignment:
Q  182 tattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttgatgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagt 277  Q
    ||||||||  ||| |||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||| |||| | ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24048539 tattcatgaattgttaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgtt-acgtatagttgctaagttgtcttctattcatgagt 24048633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Original strand, 4562806 - 4562894
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    |||| |||  ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  4562806 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaatt 4562894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Original strand, 5758488 - 5758576
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    |||| |||  ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  5758488 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaatt 5758576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 9555115 - 9555027
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    |||| |||  ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  9555115 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaatt 9555027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Original strand, 14759024 - 14759112
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    |||| |||  ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  14759024 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaatt 14759112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Original strand, 14955792 - 14955880
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    |||| |||  ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  14955792 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaatt 14955880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 33740882 - 33740794
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    |||| |||  ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  33740882 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaatt 33740794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 144 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 10711871 - 10711838
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgt 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10711871 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgt 10711838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 144 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 10925641 - 10925608
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgt 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10925641 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgt 10925608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Original strand, 23996999 - 23997086
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    ||||||||  ||| |||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||    
T  23996999 acttgatgatggttatg-taagttgataagttctcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataatcattattatgaatt 23997086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 27532798 - 27532766
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttg 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27532798 acttgatgatggttatgttaagttgataagttg 27532766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 144 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 17807100 - 17807017
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttat 227  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    |||| |||  ||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  17807100 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattat 17807017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 14047361 - 14047299
Alignment:
Q  147 tgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttg 209  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  14047361 tgatgatgattatgttaagttgataagttgtattttattcatgagttgttaatgagatgcttg 14047299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 147 - 277
Target Start/End: Original strand, 37568 - 37697
Alignment:
Q  147 tgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttgatgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||    ||||||||| |||||||||  ||| ||| |||||||||||| |||||||||||| | ||| | ||    
T  37568 tgatgatggttatgttaagttgatacgttgtcttttattcatgtattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgtt-acgt 37666  T
Q  247 atagttgttaagttgtcttctattcatgagt 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37667 atagttgttaagttgtcttctattcatgagt 37697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 144 - 277
Target Start/End: Original strand, 25600 - 25732
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||  ||| ||||| |||| ||| |||||||||||| |||||||||||| | ||| |    
T  25600 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgtgatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgtt-a 25698  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagt 277  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25699 cgtatagttgttaagttgtctcctattcatgagt 25732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 62; Significance: 9e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 144 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 18869 - 18737
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||  ||| |||||||||| ||| ||||||||| || |||| ||||||| | ||| |    
T  18869 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcatttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattgttattataaattgatgatgtt-a 18771  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagt 277  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18770 cgtatagttgctaagttgtcttctattcatgagt 18737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 62; Significance: 9e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 144 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 33983 - 33851
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    ||||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| | ||| |    
T  33983 acttgatgatcgttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgagatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgtt-a 33885  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagt 277  Q
     ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  33884 cgtatagttgctaagttgtcttatatccatgagt 33851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 28518 - 28485
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgt 177  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28518 acttgatgatcgttatgttaagttgataagttgt 28485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 62; Significance: 9e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 144 - 277
Target Start/End: Original strand, 224175 - 224307
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||  |||||||||  ||| ||| |||||||||||| ||||||| |||| | ||| |    
T  224175 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgtt-a 224273  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagt 277  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  224274 cgtatagttgctaagttgtcttctattcatgagt 224307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 147 - 277
Target Start/End: Original strand, 8775 - 8904
Alignment:
Q  147 tgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttgatgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||  ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||| || |||| | ||| | ||    
T  8775 tgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattataaaatgatgatgtt-acgt 8873  T
Q  247 atagttgttaagttgtcttctattcatgagt 277  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8874 atagttgctaagttgtcttctattcatgagt 8904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 144 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 109647 - 109515
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||  |||||||||  ||| ||| |||||||||||| ||||||| |||| | ||| |    
T  109647 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgtt-a 109549  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagt 277  Q
     ||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  109548 cgtatagttgctaagttgtcctctattcatgagt 109515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 21)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 144 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 9240720 - 9240588
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||  |||||||||  ||| ||| |||||||||||| ||||||| |||| | ||| |    
T  9240720 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgtt-a 9240622  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagt 277  Q
     ||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  9240621 cgtatagttgctaagttgtcctctattcatgagt 9240588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 144 - 277
Target Start/End: Original strand, 10686279 - 10686411
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||  |||||||||  ||| ||| |||||||||||| ||||||| |||| | ||| |    
T  10686279 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgtt-a 10686377  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagt 277  Q
      |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  10686378 catatagttgctaagttgtcctctattcatgagt 10686411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 144 - 277
Target Start/End: Original strand, 19663590 - 19663722
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||  |||||||||  ||| ||| |||||||||||| ||||||| |||| | ||| |    
T  19663590 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgtt-a 19663688  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagt 277  Q
     ||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  19663689 cgtatagttgctaagttgtcccctattcatgagt 19663722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 144 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 20260303 - 20260171
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||  |||||||||  ||| ||| |||||||||||| ||||||| |||| | ||| |    
T  20260303 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgtt-a 20260205  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagt 277  Q
     ||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  20260204 cgtatagttgctaagttgtcccctattcatgagt 20260171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 144 - 275
Target Start/End: Original strand, 21074540 - 21074670
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||  |||||||  | ||| ||| |||||||||||| ||||||| |||| | ||| |    
T  21074540 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaaaaaaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgtt-a 21074638  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctattcatga 275  Q
     ||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  21074639 cgtatagttgctaagttgttttctattcatga 21074670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 144 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 37379082 - 37378950
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    ||||||||  |||||||||  ||| ||| |||| ||||||| ||||||| |||| | ||| |    
T  37379082 acttgatgagggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaaaaattattattatgaaatgatgatgtt-a 37378984  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagt 277  Q
     ||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  37378983 cgtatagttgctaagttgtcctctattcatgagt 37378950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 6481830 - 6481698
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||    ||||||||  |||||||||  | | ||| |||||||||||| ||||||| |||| | ||| |    
T  6481830 acttgatgatggttatgttaagttgataggttgtcttttattcatgaattgctaatggaacgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgtt-a 6481732  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagt 277  Q
      |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  6481731 catatagttgctaagttgtcctctattcatgagt 6481698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 6485297 - 6485165
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||    ||||||||  |||||||||  | | ||| |||||||||||| ||||||| |||| | ||| |    
T  6485297 acttgatgatggttatgttaagttgataggttgtcttttattcatgaattgctaatggaacgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgtt-a 6485199  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagt 277  Q
      |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  6485198 catatagttgctaagttgtcctctattcatgagt 6485165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 27600417 - 27600329
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    |||| |||  ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  27600417 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattgttatgaatt 27600329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 9784040 - 9783975
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttg 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  9784040 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgcttg 9783975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Original strand, 10103329 - 10103417
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    |||| |||  ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  10103329 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaatt 10103417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Original strand, 12902639 - 12902727
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    |||| |||  ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  12902639 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaatt 12902727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Original strand, 24630080 - 24630168
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    |||| |||  ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  24630080 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaatt 24630168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 24645197 - 24645109
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    |||| |||  ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  24645197 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattggtaatgagatgtttgatgaataattattattatgaatt 24645109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 24647140 - 24647052
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    |||| |||  ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  24647140 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattggtaatgagatgtttgatgaataattattattatgaatt 24647052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 24647973 - 24647885
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    |||| |||  ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  24647973 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattggtaatgagatgtttgatgaataattattattatgaatt 24647885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Original strand, 27381026 - 27381114
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    |||| |||  ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  27381026 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaatt 27381114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Original strand, 27384996 - 27385084
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    |||| |||  ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  27384996 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaatt 27385084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Original strand, 30346690 - 30346778
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    |||| |||  ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  30346690 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaatt 30346778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 31343963 - 31343875
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| |||    ||||||||  ||| ||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  31343963 acttgatgatgtatatgttaagttgataagctgtcttttattcatgaattgataaagagatgtttgatgaataattattattatgaatt 31343875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Original strand, 41532475 - 41532563
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    ||||||||  ||| |||||||||| ||| ||||||| |||| ||| |||||    
T  41532475 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattattacgaatt 41532563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0544
Description:

Target: scaffold0544; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 144 - 277
Target Start/End: Original strand, 3549 - 3681
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    ||||||||  |||||||||  ||| ||| |||||||||||| ||||||| |||| | ||| |    
T  3549 acttgatgattgttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgtt-a 3647  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagt 277  Q
     ||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  3648 cgtatagttgctaagttgtcctctattcatgagt 3681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 182 - 277
Target Start/End: Original strand, 3 - 97
Alignment:
Q  182 tattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttgatgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagt 277  Q
    ||||||||  |||||||||  ||| ||| |||||||||||| ||||||| |||| | ||| | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  3 tattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgtt-acgtatagttgctaagttgtcctctattcatgagt 97  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1852 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold1852
Description:

Target: scaffold1852; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 144 - 270
Target Start/End: Original strand, 853 - 978
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||  ||| |||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||| | ||| |    
T  853 acttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattattatgaattgatgatgtt-a 951  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctatt 270  Q
     ||||||||  ||||||||||||||||    
T  952 cgtatagtttctaagttgtcttctatt 978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0337
Description:

Target: scaffold0337; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 144 - 277
Target Start/End: Original strand, 10854 - 10987
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattga-taacgttg 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||  |||||||||  ||| ||| |||||||||||| ||||||| ||| | | |||     
T  10854 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgattgatgtt- 10952  T
Q  243 atgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagt 277  Q
    | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  10953 acgtatagttgctaagttgtcctctattcatgagt 10987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1427 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1427
Description:

Target: scaffold1427; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 144 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 246 - 114
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||  |||||||||  ||| ||| |||||||||||| ||||| | |||| | ||| |    
T  246 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgtaatgatgatgtt-a 148  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagt 277  Q
     |||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  147 cgtattgttgctaagttgtcctctattcatgagt 114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0842 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0842
Description:

Target: scaffold0842; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 144 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 5288 - 5156
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||   ||||||||  ||| ||| |||||||||||| | |||||||||| | ||| |    
T  5288 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtctattattcatgaaatgctaatggaatgtttgatgaataattattatgatgaattgatgatgtt-a 5190  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctattcatgagt 277  Q
      |||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  5189 catatagttgttaagttgccttctatacatgagt 5156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2015 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold2015
Description:

Target: scaffold2015; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Original strand, 487 - 547
Alignment:
Q  252 tgttaagttgtcttctattcatgagtactaaggggatgttaagaagaaatattattgagtg 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  487 tgttaagttgtcttctattcatgagcattaaggggatgttaagaagaattattattgagtg 547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 252 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 34085 - 34011
Alignment:
Q  252 tgttaagttgtcttctattcatgagtactaaggggatgttaagaagaaatattattgagtggatttgatgatgtc 326  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  34085 tgttaggttgtctgctattcatgagcattaaggggatgttaagaagaattattattgagtgtatatgatgatgtc 34011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 144 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 70801 - 70676
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    ||||||||  ||| |||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||| | ||| |    
T  70801 acttgatgatgtttatgttaagttgataggttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattattatgaattgatgatgtt-a 70703  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctatt 270  Q
     ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  70702 cgtataattgctaagttgtcttctatt 70676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 14890 - 14802
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||  ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  14890 acttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaatt 14802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 11823 - 11698
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttga 243  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    ||| ||||  ||| |||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||| | ||| |    
T  11823 acttgatgatgcttatgttaagttgatatgttgtcttttatacatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattattatgaattgatgatgtt-a 11725  T
Q  244 tgtatagttgttaagttgtcttctatt 270  Q
     |||||||||  |||||||||||||||    
T  11724 cgtatagttgcgaagttgtcttctatt 11698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 209
Target Start/End: Original strand, 74364 - 74429
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttg 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  74364 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgagttgctaatgagatgcttg 74429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Original strand, 5563 - 5651
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||  ||| |||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||    
T  5563 acttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattgttattatgaatt 5651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 270 - 326
Target Start/End: Original strand, 173282 - 173338
Alignment:
Q  270 tcatgagtactaaggggatgttaagaagaaatattattgagtggatttgatgatgtc 326  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  173282 tcatgagcactaaggggatgttaagaagaattattattgagtgtatatgatgatgtc 173338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1873 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1873
Description:

Target: scaffold1873; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 685 - 607
Alignment:
Q  196 taatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttgatgtatagttgttaagttgtcttctattcatga 275  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| | ||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  685 taatgagatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgtt-acgtatagttgataagttgtcttttattcatga 607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 270
Target Start/End: Original strand, 115390 - 115502
Alignment:
Q  156 ttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttgatgtatagttgtt 255  Q
    |||||||||||||||| |||||    ||||||||  ||| |||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||| | ||| | ||||||||| |    
T  115390 ttatgttaagttgata-gttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtatttttatgaattgatgatgtt-acgtatagttgct 115487  T
Q  256 aagttgtcttctatt 270  Q
    |||||||||||||||    
T  115488 aagttgtcttctatt 115502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0166
Description:

Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 232
Target Start/End: Original strand, 11095 - 11180
Alignment:
Q  147 tgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||  ||| |||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||    
T  11095 tgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattaatattatgaatt 11180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 208
Target Start/End: Original strand, 6993 - 7057
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgctt 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||  ||| |||||||||||||    
T  6993 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgctt 7057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 11097 - 11009
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    |||| |||  ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  11097 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaatt 11009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Original strand, 60358 - 60446
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    |||| |||  ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  60358 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaatt 60446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0299 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0299
Description:

Target: scaffold0299; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 5871 - 5746
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaat-gagatgcttgctgaataattattgttatgaattgataacgttg 242  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    ||||||||  ||| |||| |||| | ||| ||||||| |||| |||||||||||| | |||     
T  5871 acttgatgatgtttatgttaagttgata-gttgtcttttattcatgaattgataattgagacgtttgatgaataagtattattatgaattgatgatgtt- 5774  T
Q  243 atgtatagttgttaagttgtcttctatt 270  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  5773 acgtatagttgctaagttgtcttctatt 5746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0380 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0380
Description:

Target: scaffold0380; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 144 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 4020 - 3987
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgt 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4020 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgt 3987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0200
Description:

Target: scaffold0200; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 144 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 10813 - 10780
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgt 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10813 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgt 10780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 144 - 177
Target Start/End: Original strand, 23970 - 24003
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgt 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23970 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgt 24003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 144 - 177
Target Start/End: Original strand, 37235 - 37268
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgt 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37235 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgt 37268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 144 - 177
Target Start/End: Original strand, 62872 - 62905
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgt 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  62872 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgt 62905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Original strand, 15607 - 15695
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    ||||||||  ||| |||||||||| ||| ||||||| |||| ||| |||||    
T  15607 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattattacgaatt 15695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Original strand, 68588 - 68676
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    |||||||| || ||||||||| ||||||||||||    |||| |||  ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  68588 acttgatggtgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaatt 68676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 177
Target Start/End: Original strand, 37230 - 37263
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgt 177  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37230 acttgatgatggttatgttaagtcgataagttgt 37263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0815 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0815
Description:

Target: scaffold0815; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 252 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 41 - 1
Alignment:
Q  252 tgttaagttgtcttctattcatgagtactaaggggatgtta 292  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  41 tgttaagctgtcttctattcatgagcactaaggagatgtta 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0486 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0486
Description:

Target: scaffold0486; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 8623 - 8535
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||    ||||||||   || |||||||||| ||| ||||| |||||| |||| ||||    
T  8623 acttgatgatgtttatgttaagttaataagttgtcttttattcatgaaatgataatgagatgtttgatgaatgattattattattaatt 8535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Original strand, 6353 - 6440
Alignment:
Q  144 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccatattcatgttttgctaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaatt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    |||| |||  ||| |||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||    
T  6353 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatg-ttgatgaataactattattatgaatt 6440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University