View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9015_low_17 (Length: 422)

Name: NF9015_low_17
Description: NF9015
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9015_low_17
NF9015_low_17
[»] chr2 (29 HSPs)
chr2 (1-393)||(14634405-14634800)
chr2 (1-199)||(28569070-28569274)
chr2 (53-313)||(41303827-41304077)
chr2 (9-265)||(6263069-6263332)
chr2 (340-401)||(39483494-39483555)
chr2 (39-265)||(21519272-21519503)
chr2 (183-308)||(13829025-13829151)
chr2 (341-394)||(35892748-35892801)
chr2 (40-292)||(42018409-42018661)
chr2 (226-274)||(36559768-36559816)
chr2 (9-138)||(36559889-36560021)
chr2 (9-265)||(31733796-31734057)
chr2 (9-138)||(35216714-35216847)
chr2 (340-394)||(13828838-13828892)
chr2 (39-87)||(16604651-16604699)
chr2 (346-394)||(17943161-17943209)
chr2 (346-394)||(28462845-28462893)
chr2 (180-246)||(37048279-37048345)
chr2 (226-263)||(19502970-19503007)
chr2 (226-263)||(35216604-35216641)
chr2 (341-394)||(39686582-39686635)
chr2 (346-394)||(2740545-2740593)
chr2 (342-393)||(19345012-19345064)
chr2 (346-394)||(20050555-20050603)
chr2 (346-394)||(22713027-22713075)
chr2 (39-87)||(27894186-27894234)
chr2 (346-394)||(30262292-30262340)
chr2 (346-394)||(30478617-30478665)
chr2 (341-393)||(31056694-31056746)
[»] chr7 (52 HSPs)
chr7 (1-399)||(48490771-48491183)
chr7 (1-407)||(47674520-47674939)
chr7 (29-393)||(18390564-18390944)
chr7 (29-393)||(6592923-6593306)
chr7 (1-199)||(6047915-6048115)
chr7 (36-246)||(26214190-26214402)
chr7 (39-161)||(44726062-44726185)
chr7 (340-393)||(9189444-9189497)
chr7 (64-246)||(44011447-44011632)
chr7 (129-246)||(4509794-4509913)
chr7 (129-246)||(4511636-4511755)
chr7 (53-265)||(24815945-24816159)
chr7 (226-274)||(22136420-22136468)
chr7 (226-274)||(40551447-40551495)
chr7 (9-138)||(7093205-7093338)
chr7 (9-138)||(28486675-28486808)
chr7 (39-265)||(38395428-38395659)
chr7 (220-274)||(21679388-21679442)
chr7 (9-138)||(22136215-22136347)
chr7 (9-138)||(40551242-40551374)
chr7 (226-274)||(43856-43904)
chr7 (226-274)||(1047912-1047960)
chr7 (226-274)||(28486881-28486929)
chr7 (9-138)||(1048033-1048166)
chr7 (340-394)||(4509412-4509466)
chr7 (340-394)||(4511254-4511308)
chr7 (340-393)||(16880662-16880716)
chr7 (1-87)||(4509986-4510073)
chr7 (1-87)||(4511828-4511915)
chr7 (346-399)||(6048384-6048437)
chr7 (346-399)||(26214625-26214678)
chr7 (226-263)||(31156920-31156957)
chr7 (104-195)||(6430901-6430993)
chr7 (9-138)||(9679768-9679899)
chr7 (39-138)||(20298423-20298523)
chr7 (226-274)||(20298596-20298644)
chr7 (341-393)||(21983869-21983921)
chr7 (346-394)||(25409754-25409802)
chr7 (346-394)||(30246593-30246641)
chr7 (225-263)||(7350287-7350325)
chr7 (340-393)||(12397494-12397548)
chr7 (340-393)||(20000336-20000390)
chr7 (340-393)||(21640425-21640479)
chr7 (340-393)||(24265621-24265675)
chr7 (341-394)||(3320581-3320634)
chr7 (341-394)||(7074386-7074439)
chr7 (341-394)||(25404992-25405045)
chr7 (39-80)||(38281327-38281368)
chr7 (341-390)||(38281765-38281814)
chr7 (39-138)||(43683-43783)
chr7 (1-82)||(6430767-6430849)
chr7 (226-262)||(7093096-7093132)
[»] chr8 (30 HSPs)
chr8 (1-398)||(34254895-34255307)
chr8 (1-399)||(4732996-4733409)
chr8 (1-399)||(41365402-41365814)
chr8 (3-313)||(31574434-31574749)
chr8 (53-313)||(17849089-17849349)
chr8 (39-198)||(42436230-42436377)
chr8 (104-194)||(40220644-40220735)
chr8 (337-399)||(42435794-42435856)
chr8 (135-313)||(29797045-29797221)
chr8 (226-269)||(27828648-27828691)
chr8 (9-138)||(18812165-18812297)
chr8 (341-394)||(16753053-16753106)
chr8 (340-393)||(19751833-19751886)
chr8 (53-265)||(41383855-41384072)
chr8 (9-138)||(43081059-43081191)
chr8 (226-263)||(43081264-43081301)
chr8 (217-265)||(21481848-21481896)
chr8 (346-394)||(25684247-25684295)
chr8 (253-300)||(5645997-5646044)
chr8 (340-393)||(10688562-10688616)
chr8 (340-393)||(33037231-33037285)
chr8 (340-394)||(40220209-40220263)
chr8 (341-394)||(4813019-4813072)
chr8 (340-393)||(10014684-10014737)
chr8 (39-108)||(27828475-27828544)
chr8 (1-87)||(40220782-40220869)
chr8 (9-108)||(15071915-15072017)
chr8 (341-393)||(26402624-26402676)
chr8 (346-394)||(28895104-28895152)
chr8 (342-393)||(35741124-35741176)
[»] chr3 (59 HSPs)
chr3 (1-407)||(29812236-29812654)
chr3 (48-399)||(5258711-5259076)
chr3 (48-399)||(9634886-9635252)
chr3 (48-393)||(23198532-23198892)
chr3 (48-393)||(6717925-6718286)
chr3 (48-399)||(7763683-7764035)
chr3 (48-393)||(10057661-10058025)
chr3 (48-393)||(10059883-10060247)
chr3 (48-393)||(10062105-10062469)
chr3 (48-393)||(10064327-10064691)
chr3 (48-393)||(10066549-10066913)
chr3 (48-393)||(4599109-4599471)
chr3 (48-393)||(10210614-10210976)
chr3 (54-292)||(15824366-15824602)
chr3 (183-393)||(37407810-37408034)
chr3 (1-202)||(32892455-32892658)
chr3 (270-399)||(40734871-40735011)
chr3 (296-407)||(44331038-44331160)
chr3 (337-399)||(43402594-43402656)
chr3 (53-269)||(28100918-28101139)
chr3 (9-138)||(4309251-4309384)
chr3 (9-269)||(28138151-28138419)
chr3 (340-393)||(37466899-37466952)
chr3 (104-195)||(43403032-43403125)
chr3 (226-274)||(4309135-4309183)
chr3 (9-115)||(42991379-42991488)
chr3 (340-393)||(4386446-4386499)
chr3 (39-116)||(27422083-27422160)
chr3 (3-86)||(1619605-1619691)
chr3 (226-274)||(10956972-10957020)
chr3 (226-274)||(43227667-43227715)
chr3 (226-265)||(11169688-11169727)
chr3 (9-138)||(457288-457420)
chr3 (70-171)||(890919-891021)
chr3 (340-393)||(6794164-6794218)
chr3 (226-263)||(6064428-6064465)
chr3 (220-265)||(42991579-42991624)
chr3 (226-262)||(457493-457529)
chr3 (9-171)||(3315762-3315927)
chr3 (346-394)||(10595542-10595590)
chr3 (346-394)||(10901349-10901397)
chr3 (226-262)||(35918815-35918851)
chr3 (346-394)||(54192848-54192896)
chr3 (9-138)||(6064538-6064671)
chr3 (36-87)||(43403172-43403223)
chr3 (226-265)||(43422385-43422424)
chr3 (340-393)||(1306606-1306660)
chr3 (340-393)||(2676518-2676572)
chr3 (340-393)||(3327786-3327840)
chr3 (340-393)||(8512829-8512883)
chr3 (67-256)||(23634904-23635099)
chr3 (340-393)||(28503263-28503317)
chr3 (340-393)||(32476074-32476128)
chr3 (341-394)||(10094599-10094652)
chr3 (341-394)||(10201485-10201538)
chr3 (220-265)||(53916588-53916633)
chr3 (9-108)||(5898793-5898895)
chr3 (55-138)||(43422515-43422599)
chr3 (346-394)||(47878682-47878730)
[»] chr4 (44 HSPs)
chr4 (1-399)||(12740123-12740534)
chr4 (1-399)||(12748329-12748740)
chr4 (1-407)||(34570982-34571399)
chr4 (48-393)||(8394834-8395189)
chr4 (1-240)||(54881950-54882191)
chr4 (48-393)||(5137508-5137873)
chr4 (29-332)||(7124103-7124412)
chr4 (1-303)||(26559034-26559339)
chr4 (53-313)||(10114044-10114306)
chr4 (53-246)||(36770653-36770849)
chr4 (9-265)||(14788347-14788611)
chr4 (340-399)||(3778168-3778227)
chr4 (53-265)||(16454507-16454724)
chr4 (9-148)||(47563910-47564053)
chr4 (9-167)||(22133298-22133459)
chr4 (9-265)||(22801686-22801950)
chr4 (9-265)||(24879667-24879930)
chr4 (53-265)||(36379427-36379645)
chr4 (39-263)||(12401673-12401902)
chr4 (9-108)||(9175248-9175350)
chr4 (340-399)||(6742834-6742893)
chr4 (226-265)||(16932781-16932820)
chr4 (66-148)||(18535877-18535960)
chr4 (226-265)||(22133214-22133253)
chr4 (226-308)||(18535716-18535797)
chr4 (341-393)||(7124434-7124487)
chr4 (6-90)||(12399576-12399663)
chr4 (226-263)||(22781372-22781409)
chr4 (76-246)||(47565833-47566005)
chr4 (346-394)||(4569674-4569722)
chr4 (230-274)||(9175094-9175138)
chr4 (340-399)||(16628290-16628350)
chr4 (226-274)||(22045339-22045387)
chr4 (220-263)||(12396731-12396774)
chr4 (340-393)||(9228630-9228684)
chr4 (227-261)||(11007205-11007239)
chr4 (9-138)||(11007313-11007445)
chr4 (9-138)||(22781482-22781614)
chr4 (341-399)||(22132982-22133036)
chr4 (220-265)||(47564130-47564175)
chr4 (341-393)||(3792432-3792484)
chr4 (346-394)||(4884482-4884530)
chr4 (339-399)||(14788016-14788075)
chr4 (9-108)||(22045489-22045591)
[»] chr5 (35 HSPs)
chr5 (36-399)||(13487427-13487802)
chr5 (37-393)||(535138-535500)
chr5 (48-393)||(42426827-42427185)
chr5 (48-335)||(26174194-26174483)
chr5 (48-393)||(16408714-16409075)
chr5 (48-393)||(16545856-16546214)
chr5 (48-393)||(29721787-29722150)
chr5 (40-393)||(40381524-40381887)
chr5 (9-199)||(13295014-13295207)
chr5 (226-269)||(10756501-10756544)
chr5 (9-138)||(15355594-15355726)
chr5 (9-265)||(18510328-18510592)
chr5 (9-138)||(23666449-23666581)
chr5 (9-261)||(27911533-27911793)
chr5 (9-138)||(34478164-34478296)
chr5 (120-169)||(32608817-32608866)
chr5 (39-138)||(6746506-6746606)
chr5 (9-138)||(31544135-31544268)
chr5 (9-138)||(10756296-10756428)
chr5 (9-95)||(13693987-13694075)
chr5 (226-263)||(34478054-34478091)
chr5 (226-274)||(15355476-15355524)
chr5 (226-274)||(23666650-23666698)
chr5 (226-264)||(18468330-18468368)
chr5 (340-393)||(27445568-27445622)
chr5 (340-393)||(28807020-28807074)
chr5 (340-393)||(31401290-31401344)
chr5 (340-393)||(37560891-37560945)
chr5 (340-393)||(43592856-43592910)
chr5 (340-393)||(43625650-43625704)
chr5 (220-265)||(659339-659384)
chr5 (222-263)||(6746675-6746716)
chr5 (222-263)||(31544337-31544378)
chr5 (346-394)||(25452097-25452145)
chr5 (342-393)||(33768774-33768826)
[»] chr1 (42 HSPs)
chr1 (1-393)||(776439-776845)
chr1 (1-335)||(28221517-28221854)
chr1 (1-334)||(50167815-50168152)
chr1 (1-313)||(13548170-13548484)
chr1 (1-302)||(28221921-28222225)
chr1 (1-195)||(28242951-28243147)
chr1 (36-153)||(31658543-31658661)
chr1 (1-210)||(31928865-31929075)
chr1 (247-399)||(31658658-31658821)
chr1 (2-313)||(13126273-13126587)
chr1 (112-246)||(19753446-19753583)
chr1 (67-265)||(31423950-31424151)
chr1 (340-393)||(47102278-47102331)
chr1 (340-400)||(13599019-13599079)
chr1 (9-265)||(14098839-14099103)
chr1 (100-169)||(41139222-41139291)
chr1 (226-274)||(51751645-51751693)
chr1 (39-138)||(16227603-16227702)
chr1 (226-265)||(16227775-16227814)
chr1 (67-265)||(16430108-16430312)
chr1 (226-265)||(27337762-27337801)
chr1 (226-265)||(28841965-28842004)
chr1 (9-138)||(47178764-47178897)
chr1 (9-138)||(51751439-51751572)
chr1 (226-263)||(47178970-47179007)
chr1 (340-393)||(50167739-50167792)
chr1 (9-171)||(6996685-6996850)
chr1 (9-108)||(31736587-31736689)
chr1 (226-265)||(20301739-20301778)
chr1 (9-138)||(28202406-28202539)
chr1 (10-108)||(28841760-28841861)
chr1 (226-265)||(31736444-31736483)
chr1 (340-393)||(25444536-25444590)
chr1 (340-393)||(41391187-41391241)
chr1 (341-394)||(4498964-4499017)
chr1 (341-394)||(9526063-9526116)
chr1 (1-87)||(19753304-19753391)
chr1 (220-265)||(25249566-25249611)
chr1 (341-394)||(31928447-31928500)
chr1 (341-390)||(47703333-47703382)
chr1 (346-394)||(2393813-2393861)
chr1 (279-335)||(8347896-8347951)
[»] scaffold1908 (1 HSPs)
scaffold1908 (36-378)||(765-1120)
[»] scaffold0491 (1 HSPs)
scaffold0491 (52-393)||(9310-9666)
[»] chr6 (37 HSPs)
chr6 (79-399)||(5407512-5407846)
chr6 (79-399)||(5411837-5412171)
chr6 (48-393)||(16652354-16652714)
chr6 (48-393)||(16554092-16554452)
chr6 (48-393)||(16630648-16631008)
chr6 (79-399)||(5406744-5407077)
chr6 (79-399)||(5411069-5411402)
chr6 (48-393)||(34166300-34166664)
chr6 (248-393)||(16568485-16568630)
chr6 (1-150)||(16568332-16568482)
chr6 (85-258)||(10456160-10456333)
chr6 (1-164)||(11137500-11137665)
chr6 (48-244)||(30444765-30444963)
chr6 (64-199)||(24543467-24543600)
chr6 (53-171)||(15533649-15533768)
chr6 (113-165)||(17758814-17758866)
chr6 (340-404)||(24435392-24435456)
chr6 (39-171)||(3630956-3631088)
chr6 (39-87)||(22615107-22615155)
chr6 (39-138)||(26067142-26067241)
chr6 (341-399)||(11138106-11138164)
chr6 (9-138)||(33310291-33310423)
chr6 (227-272)||(30729571-30729616)
chr6 (226-263)||(33310496-33310533)
chr6 (341-394)||(35209091-35209144)
chr6 (39-138)||(3395446-3395546)
chr6 (153-247)||(22615253-22615348)
chr6 (340-399)||(28038251-28038310)
chr6 (340-393)||(11857569-11857623)
chr6 (340-393)||(14741870-14741924)
chr6 (185-246)||(28078325-28078387)
chr6 (220-265)||(3630838-3630883)
chr6 (341-394)||(13883074-13883127)
chr6 (341-394)||(22344793-22344846)
chr6 (226-263)||(26067032-26067069)
chr6 (341-394)||(31249244-31249297)
chr6 (341-394)||(35201856-35201909)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (9-265)||(51119-51383)
scaffold0005 (339-399)||(51655-51714)
[»] scaffold1674 (2 HSPs)
scaffold1674 (9-138)||(532-665)
scaffold1674 (226-274)||(411-459)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (9-196)||(34995-35187)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (340-400)||(6304-6364)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (1-148)||(23009-23157)
[»] scaffold0140 (2 HSPs)
scaffold0140 (9-138)||(23529-23662)
scaffold0140 (226-274)||(23731-23779)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (120-308)||(4000-4189)
[»] scaffold0025 (2 HSPs)
scaffold0025 (226-265)||(70160-70199)
scaffold0025 (9-138)||(70272-70405)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (340-393)||(1683-1737)
[»] scaffold0197 (2 HSPs)
scaffold0197 (340-393)||(13728-13782)
scaffold0197 (340-393)||(18607-18661)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (341-390)||(32779-32828)
[»] scaffold1899 (1 HSPs)
scaffold1899 (55-138)||(1075-1159)
[»] scaffold1764 (1 HSPs)
scaffold1764 (346-394)||(1059-1107)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 29)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 14634800 - 14634405
Alignment:
Q  1 aacctttaaggtggagttacaaggttaaaagcatagtgtgtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccggg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||     
T  14634800 aacctttaaggtggagttacaaggttaaaagcatagtgtgtacgcaattggaagttggggtagagaaatctcaacttgaggtggagttagtgacaccgga 14634701  T
Q  101 aatggtacaattatgg-gggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcaagaggacgga-ggcgtttcggggtttgaagaatgtatg 198  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||| ||||    
T  14634700 aatggtacgactatggagggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgagaattcttcaagaggacggaaggcattccagggtttgaagaatatatg 14634601  T
Q  199 gtgttgcttgtgtgattacctaaaa-gaccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagcggaagacgttccgtagttgaagagggtttagtgt 297  Q
    | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||     
T  14634600 gcgttgcttatgtgattacctaaaaagaccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagacgttccgtggttgaagagggtttggtgc 14634501  T
Q  298 atacttgtggagctactttgtgtagttggatgcaagggggattggtggttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaaggtggagaa 393  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  14634500 agacttgtggagctacttggtgtagttggatgcaagggggattggtggctgatggttaaagtgacatcatcgccaattagaagtcaaggtggagaa 14634405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 28569274 - 28569070
Alignment:
Q  1 aacctttaaggtggagttacaaggttaaaagcatagtg--tgtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccg 98  Q
    ||||||| ||||||| || |||||| |||  |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||     
T  28569274 aacctttgaggtggatttgcaaggtgaaagccatagtgggtgtacgcatttggaagttgaggtagagaaagctcagcttaaggtggagttgatgacacct 28569175  T
Q  99 ggaa---tggtacaattatgggggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcaagaggacgg-aggcgtttcggggtttgaagaatg 194  Q
    ||||   |||||| | ||||| | ||| ||||| ||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||||| || |||| || ||||||||||||||||    
T  28569174 ggaatattggtacgactatggagacctagggtgctattctctagttgtgagcaaggtaattcttcaagaggatggaaggcattccggggtttgaagaatg 28569075  T
Q  195 tatgg 199  Q
    |||||    
T  28569074 tatgg 28569070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 53 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 41304077 - 41303827
Alignment:
Q  53 agttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtacaattatgggggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtg 152  Q
    |||||||||||||| |||  | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| |  |||||||| || |||||||||||||||| | |    
T  41304077 agttgaggtagagatagcatagcttgaggtggaattgatgacatcgggaatggtacaactatggagatcttgggtgctaggctctagttgtgagcaaggg 41303978  T
Q  153 aattcttcaagaggac-ggaggcgtttcggggtttgaagaatgtatggtgttgcttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattggatgcaaggtgat 251  Q
    ||||||||||||||||   ||   || ||||||||||| ||||||||     || ||      || ||||||||||||||||||||||| |||| | |||    
T  41303977 aattcttcaagaggacaaaagaaattccggggtttgaataatgtatg-----gcatg------tatctaaaagaccaagggtgattggaagcaatgagat 41303889  T
Q  252 attcaaggaagcggaagacgttccgtagttgaagagggtttagtgtatacttgtggagctac 313  Q
     |||| | |||||| |||| ||||||  || |||||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  41303888 cttcacgaaagcgggagacattccgtgattaaagagggtttggtgtattcttgtggaactac 41303827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 6263332 - 6263069
Alignment:
Q  9 aggtggagttacaaggttaaaagcatagtg---tgtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatgg 105  Q
    |||||||||| ||||||| ||  |||||||   |||||||| |||  ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  6263332 aggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcttgaggtggagttgaacacaccggtaatgg 6263233  T
Q  106 tacaattatgg-gggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcaagaggac-ggaggcgtttcggggtttgaagaatgtatggtgtt 203  Q
    ||| | ||||| || ||||||||| ||||||||||  ||||||| | || ||||||| || ||| | || | ||  || | ||||||||||||| |        
T  6263232 tacgactatggaggaccttgggtgctatgctctag--gtgagcaagggatttcttcatgaagacagaagacattctggaggttgaagaatgtatagcacg 6263135  T
Q  204 gcttgtgtgattacc----taaaagaccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagcgg 265  Q
    ||||| | |||||||     ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6263134 gcttgcgggattaccctaaaaaaaggccaagtgtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgg 6263069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 340 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 39483555 - 39483494
Alignment:
Q  340 tggtggttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaaggtggagaatgttgttt 401  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39483555 tggtggttgatggttaaattgacatcaccaccaattagaagtcaaggtggagaatgttgttt 39483494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 39 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 21519503 - 21519272
Alignment:
Q  39 tgtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtacaattatgg-gggccttgggtgttatgctct 137  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||| | ||||| || ||||||||| ||||||||    
T  21519503 tgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatggaggaccttgggtgctatgctct 21519404  T
Q  138 agttgtgagcatgtgaattcttcaagaggacgg-aggcgtttcggggtttgaagaatgtatggtgttgcttgtgtgattacct----aaaagaccaaggg 232  Q
    | | ||||||| | || ||||||| || ||||| |||| || ||| | ||||||||| ||| |    ||||| | ||||| ||    ||||| |||||||    
T  21519403 a-tggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattccggaggttgaagaatatatagcacggcttgcgggattatcttaaaaaaaggccaaggg 21519305  T
Q  233 tgattggatgcaaggtgatattcaaggaagcgg 265  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  21519304 tgattggatgcaaggagaccttcaaggaagcgg 21519272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 13829151 - 13829025
Alignment:
Q  183 gtttgaagaatgtatggtgttgcttgtgtgattacc-taaaagaccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagcggaagacgttccgtagtt 281  Q
    ||||||||||||||| |  | |||||||  |||||| |||||||  |||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||| | ||| ||||||| |||    
T  13829151 gtttgaagaatgtatagcatggcttgtggcattaccctaaaagagtaagggtgattggatacaagaagatcttcaaggaagcaggagatgttccgtggtt 13829052  T
Q  282 gaagagggtttagtgtatacttgtgga 308  Q
    ||||||| | | |||||||||||||||    
T  13829051 gaagaggttatggtgtatacttgtgga 13829025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 341 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 35892801 - 35892748
Alignment:
Q  341 ggtggttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaaggtggagaat 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  35892801 ggtggttgatggttaaagtgacatcatcatcggtttgaaggcaaggtggagaat 35892748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 42018661 - 42018409
Alignment:
Q  40 gtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtacaattatgggggccttgggtgttatgctctag 139  Q
    ||||||| || ||||||||||||   ||| |||| ||||||||| ||| |||||||| |  ||| |||  | ||||| | ||||  ||| ||||||||||    
T  42018661 gtacgcatttagaagttgaggtaataaaaactcagcttgaggtgaagtggatgacactga-aatagtatgactatggagacctttagtggtatgctctag 42018563  T
Q  140 ttgtgagcatgtgaattcttcaagaggacgg-aggcgtttcggggtttgaagaatgtatggtgttgcttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattg 238  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||| || |||| || | ||  ||||||||||||||   |  ||| |  |||||||||||||||||||||| |||     
T  42018562 ttgtgagcaggggaattcttcaagaggatggaaggcattccaggagttgaagaatgtatgacatgactttttagattacctaaaagaccaagggtaatta 42018463  T
Q  239 gatgcaaggtgatattcaaggaagcggaagacgttccgtagttgaagagggttt 292  Q
    |||||| |  ||| |||||| || |   ||| |||||| |||||||||||||||    
T  42018462 gatgcatgaagatcttcaagaaaacatgagatgttccgcagttgaagagggttt 42018409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 36559816 - 36559768
Alignment:
Q  226 ccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagcggaagacgttc 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  36559816 ccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcggaagatgttc 36559768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 9 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 36560021 - 36559889
Alignment:
Q  9 aggtggagttacaaggttaaaagcatagtg---tgtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatgg 105  Q
    |||||||||| ||||||| ||  |||||||   |||||||| |||  ||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  36560021 aggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatgg 36559922  T
Q  106 tacaattatgggggccttgggtgttatgctcta 138  Q
    ||| | ||||  | ||||||||| |||||||||    
T  36559921 tacgactatgaagaccttgggtgctatgctcta 36559889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 31734057 - 31733796
Alignment:
Q  9 aggtggagttacaaggttaaaagcatagtg---tgtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatgg 105  Q
    |||||||||| ||||||| ||  |||||||   |||||||| |||  ||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||  ||| ||| |||||    
T  31734057 aggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacactcagcttgaggtggagttgaacacatcggtaatgg 31733958  T
Q  106 tacaattatgg-gggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcaagaggacg-gaggcgtttcggggtttgaagaatgtatggtgtt 203  Q
    ||| | |||||  | ||||||||| ||||||||| | ||||||| |||| ||||||| || ||||  || | || ||| | ||||||||||||| |        
T  31733957 tacgactatggaagaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagtgatttcttcatgaagacgaaagacattccggaggttgaagaatgtatagcacg 31733859  T
Q  204 gcttgtgtgatta-cctaaaagaccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagcgg 265  Q
     ||||   ||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  31733858 acttgctagattaccctaaaaagccaaaggtgattggatgcaaggagatcttcaaggaagcgg 31733796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 9 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 35216847 - 35216714
Alignment:
Q  9 aggtggagttacaaggttaaaagcatagtg---tgtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatgg 105  Q
    |||||||||| ||||||| ||  |||||||   |||||||| |||  ||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  35216847 aggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatgg 35216748  T
Q  106 tacaattatg-ggggccttgggtgttatgctcta 138  Q
    ||| | ||||  || ||||||||| |||||||||    
T  35216747 tacgactatgaaggaccttgggtgctatgctcta 35216714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 13828892 - 13828838
Alignment:
Q  340 tggtggttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaaggtggagaat 394  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||  ||||||||||||||||    
T  13828892 tggtggttgatggttaaattgacatcatcacaaatttagagtcaaggtggagaat 13828838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 87
Target Start/End: Original strand, 16604651 - 16604699
Alignment:
Q  39 tgtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagt 87  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  16604651 tgtacacatttggaagttgaggtggagaaagctcaacttcaggtggagt 16604699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 346 - 394
Target Start/End: Original strand, 17943161 - 17943209
Alignment:
Q  346 ttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaaggtggagaat 394  Q
    |||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  17943161 ttgatggttaaactgacatcatcactgatttgaagtcaaggtggagaat 17943209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 346 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 28462893 - 28462845
Alignment:
Q  346 ttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaaggtggagaat 394  Q
    |||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  28462893 ttgatggttaaattgacatcatcactgatttgaagtcaaggtggagaat 28462845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 37048345 - 37048279
Alignment:
Q  180 ggggtttgaagaatgtatggtgttgcttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattggatgcaag 246  Q
    |||| |||||||| ||||||  | |||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  37048345 gggggttgaagaaggtatggaatggcttatgggattacctaaaagaccaagggtaattggaggcaag 37048279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 19503007 - 19502970
Alignment:
Q  226 ccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagc 263  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  19503007 ccaagggtgattggatgcaagatgatcttcaaggaagc 19502970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 35216641 - 35216604
Alignment:
Q  226 ccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagc 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  35216641 ccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaatgaagc 35216604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 341 - 394
Target Start/End: Original strand, 39686582 - 39686635
Alignment:
Q  341 ggtggttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaaggtggagaat 394  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  39686582 ggtgattgatggttaaactggcatcatcactgatttgaagtcaaggtggagaat 39686635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 346 - 394
Target Start/End: Original strand, 2740545 - 2740593
Alignment:
Q  346 ttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaaggtggagaat 394  Q
    |||||||||||| || ||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  2740545 ttgatggttaaactggcatcatcactgatttgaagtcaaggtggagaat 2740593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 19345064 - 19345012
Alignment:
Q  342 gtggttgatggttaaagtgacatcatcatc-aatttgaagtcaaggtggagaa 393  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || | |||| |||||||||||||||||    
T  19345064 gtggttgatggttaaattgacatcaccaccaaattagaagtcaaggtggagaa 19345012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 346 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 20050603 - 20050555
Alignment:
Q  346 ttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaaggtggagaat 394  Q
    |||||||||||| || ||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  20050603 ttgatggttaaattggcatcatcactgatttgaagtcaaggtggagaat 20050555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 346 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 22713075 - 22713027
Alignment:
Q  346 ttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaaggtggagaat 394  Q
    |||||||||||| || ||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  22713075 ttgatggttaaattggcatcatcactgatttgaagtcaaggtggagaat 22713027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 39 - 87
Target Start/End: Original strand, 27894186 - 27894234
Alignment:
Q  39 tgtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagt 87  Q
    |||||| | |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  27894186 tgtacggatttggaatttgagatatagaaagctcaacttgaggtggagt 27894234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 346 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 30262340 - 30262292
Alignment:
Q  346 ttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaaggtggagaat 394  Q
    |||||||||||| || |||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  30262340 ttgatggttaaattggcatcatcattgatttgaagtcgaggtggagaat 30262292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 346 - 394
Target Start/End: Original strand, 30478617 - 30478665
Alignment:
Q  346 ttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaaggtggagaat 394  Q
    |||||||||||| || ||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  30478617 ttgatggttaaattggcatcatcactgatttgaagtcaaggtggagaat 30478665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 341 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 31056746 - 31056694
Alignment:
Q  341 ggtggttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaaggtggagaa 393  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||  |||||||||||||||    
T  31056746 ggtggttgatgattaaattgacatcaccaccaatttagagtcaaggtggagaa 31056694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 52)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 399
Target Start/End: Original strand, 48490771 - 48491183
Alignment:
Q  1 aacctttaaggtggagttacaaggttaaaagcatagtgtgt--acgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccg 98  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||  |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48490771 aacctttgaggtggagttgcaaggtgaag-gcatagtgtgtgtacgcatttggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagtagatgacaccg 48490869  T
Q  99 ggaatggtacaattatgggggccttgggtgtt-atgctctagttgtgagcatgtgaattcttcaagaggacgga-ggcgtttcggggtttgaagaatgta 196  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| || || |||||||||||||||    
T  48490870 ggaatggtacaactatggaggccttgggtgtttatgctctagttgtgagcatgtaaattcttcatgaggacggaaggcattccgaggtttgaagaatgta 48490969  T
Q  197 tggtgttgcttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagcggaagacgttccgtagttgaagagggtttagtg 296  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  48490970 tgatgtggcttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaagaagcgggagacgttccgtggttgaagagggtttggtg 48491069  T
Q  297 tatacttgtggagctactttgtgtagttggatgcaag-----------ggggattggtggttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaag 385  Q
    || || ||||||||||||| |||||||||||||||||           ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48491070 tagacctgtggagctacttggtgtagttggatgcaagggaaaagaaaagggaattggtggttgatggttaaagtggcatcatcatcaatttgaagtcaag 48491169  T
Q  386 gtggagaatgttgt 399  Q
    ||||||||||||||    
T  48491170 gtggagaatgttgt 48491183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 47674939 - 47674520
Alignment:
Q  1 aacctttaaggtggagttacaaggttaaaagcatagtgtgt--acgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccg 98  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  47674939 aacctttaaggtggagttgcaaggtgaag-gcatagtgtgtgtacgcatttggaagttgaggtagagaaagctcaacttaaggtggagttgatgacacct 47674841  T
Q  99 ggaatggtacaattatgggggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcaagaggacggagg-cgtttcggggtttgaagaatgtat 197  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | || | |||||||||||||||||    
T  47674840 ggaatggtacaactatggtggccttgagtgatatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaagacattccagggtttgaagaatgtat 47674741  T
Q  198 ggtgttgcttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagcggaagacgttccgtagttgaagagggtttagtgt 297  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  47674740 ggtgtggcttgtgtgattacctaaaagatcaagggtgatcggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagacgttccgtggttgaagagggtttggtgt 47674641  T
Q  298 atacttgtggagctactttgtgtagttggatgcaag----------ggggattggtggttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaaggt 387  Q
    | |||| ||||||||||| |||||||||||||||||          |   ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  47674640 agacttatggagctacttggtgtagttggatgcaaggaaaagaaaagataattagtggttggtggttaaagtggcatcatcatcaatttgaagtcaaggt 47674541  T
Q  388 ggag-aatgttgtttttgcct 407  Q
    |||| |||||||| |||||||    
T  47674540 ggagaaatgttgtatttgcct 47674520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 29 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 18390944 - 18390564
Alignment:
Q  29 aagcatagtg--tgtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtacaattatgggggccttggg 126  Q
    ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||   ||||| ||| |||||    
T  18390944 aagcatagtggatgtacgcatttggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttggtgactccgggaatggtacggctatggaggctttggg 18390845  T
Q  127 tgtt-atgctctagttgtgagcatg----tgaattcttcaagaggacgga-ggcgtttcggggtttgaagaatgtatggtgttgcttgtgtgattaccta 220  Q
     ||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||| ||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  18390844 agtttatgctctagttgtgagcatgcatgtgaattcttcatgaggacggatggtattccggggtttgaagaatgtatggggtggcttgtgtgattaccta 18390745  T
Q  221 aaagaccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagcggaagacgttccgtagttgaagagggtttagtgtatacttgtggagctactttgtgt 320  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| |||| ||||    
T  18390744 aaagaccaaaggtgatcggatgcaaggtgatcttcaaggaggcgggagacgttccgtagttgaagatggtttggtgaagacttgtggagcaacttggtgt 18390645  T
Q  321 --agttggatgcaagg-----gggattggtggttgatggttaaagtgacatcatcatc-aatttgaagtcaaggtggagaa 393  Q
      ||||||||||||||     |  |  |||||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  18390644 agagttggatgcaagggaaaagaaaggggtggttgatggttaaagtggcatcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaa 18390564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 29 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 6593306 - 6592923
Alignment:
Q  29 aagcatagtg--tgtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtacaattatgggggccttggg 126  Q
    ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||| ||| |||||    
T  6593306 aagcatagtggatgtacgcatttggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttggtgactccgggaatggtacggttatggaggctttggg 6593207  T
Q  127 tgtt-atgctctagttgtgagcatgtgaattcttcaagaggacgga-ggcgtttcggggtttgaagaatgtatggtgttgcttgtgtgattacctaaaag 224  Q
     ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  6593206 agtttatgctctagttgtgagcatgtggattcttcatgaggacggatggtcttccggggtttgaagaatgtatggggtggcttgtgtgattacctaaaag 6593107  T
Q  225 accaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagcggaagacgttccgtagttgaagagggttt-------agtgtatacttgtggagctactttg 317  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||       | || | ||||||||||| |||| |    
T  6593106 gccaagggtgatcggatgcaaggtgatcttcgaggaggcgggagacgttccgtggttgaagatggtttggtaaaaaatgaagacttgtggagcaacttgg 6593007  T
Q  318 tgt--agttggatgcaagg-----gggattggtggttgatggttaaagtgacatcatcatc-aatttgaagtcaaggtggagaa 393  Q
    |||  ||||||||||||||     |  |  |||||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  6593006 tgtagagttggatgcaagggaaaagaaaggggtggttgatggttaaagtggcatcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaa 6592923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 6047915 - 6048115
Alignment:
Q  1 aacctttaaggtggagttacaaggttaaaagcatagtgtg--tacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccg 98  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| |||  |||||||||  |||  | |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  6047915 aacctttgaggtggagttgcaaggtgaaagacatagtgtgcgtacttatttggaagttgaggtagagaaatgtcagcttgaggtggagttgatgacatcg 6048014  T
Q  99 ggaatggtacaattatgggggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcaagaggacg-gaggcgtttcggggtttgaagaatgtat 197  Q
     ||||||||||| ||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| ||    
T  6048015 agaatggtacaactat-gggaccttgggtgctaggctctagttgtgagcaaggaaattcttcaagaggacgaaaggcatttcggggtttgaagaatgcat 6048113  T
Q  198 gg 199  Q
    ||    
T  6048114 gg 6048115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 36 - 246
Target Start/End: Original strand, 26214190 - 26214402
Alignment:
Q  36 gtgtgtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtacaattatgggggccttgggtgttatgct 135  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||| | ||| | ||||| | ||||||||| ||  ||    
T  26214190 gtgtgtacgcatttggaagttgaggtagataaagctcagcttgaggtggagttggtgacactaggaacgatacgactatggagaccttgggtgctagact 26214289  T
Q  136 ctagttgtgagcatgtgaattcttcaagaggacggagg-cgtttcggggtttgaagaatgtatggtgttgcttgtgtgattacc-taaaagaccaagggt 233  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| | | || ||  |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||  ||||||| ||||||    
T  26214290 ctagttgtgagcaagggaattcttcaagaagacggaagacattccgtagtttgaagaatgtatggcttggcttgtgggattaccagaaaagacgaagggt 26214389  T
Q  234 gattggatgcaag 246  Q
     |||||| |||||    
T  26214390 aattggaggcaag 26214402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 161
Target Start/End: Original strand, 44726062 - 44726185
Alignment:
Q  39 tgtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtacaattatgg-gggccttgggtgttatgctct 137  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||    
T  44726062 tgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatggaggaccttgggtgttatgctct 44726161  T
Q  138 agttgtgagcatgtgaattcttca 161  Q
    ||| ||||||| | || |||||||    
T  44726162 agtggtgagcaagggatttcttca 44726185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 340 - 393
Target Start/End: Original strand, 9189444 - 9189497
Alignment:
Q  340 tggtggttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaaggtggagaa 393  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9189444 tggtggttgatggttaaactgacatcatcatcaattagaagtcaaggtggagaa 9189497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 64 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 44011632 - 44011447
Alignment:
Q  64 agaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtacaattatggggg-ccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcaa 162  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||  ||||||| |||||||| | ||||| |  ||||||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||     
T  44011632 agaaagctctgcttgaggtggagtcgaacacaccggaaatggtacgactatggagaaccttgggtgctatgctgtagttgtgagcaagggaattcttcat 44011533  T
Q  163 gaggacgg-aggcgtttcggggtttgaagaatgtatggtgttgcttgtgtgattacc-taaaagaccaagggtgattggatgcaag 246  Q
    || || || |||  || ||| | |||||||||||||    | ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44011532 gaagatggaaggtattccggaggttgaagaatgtataacatggcttgtgggattaccataaaagatcaagggtgattggatgcaag 44011447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 129 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 4509913 - 4509794
Alignment:
Q  129 ttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcaagaggac-ggaggcgtttcggggtttgaagaatgtatggtgttgcttgtgtgattacc-taaaagac 226  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||| |||||||||| |||||||||||||  || ||||||  ||||||  |||||||    
T  4509913 ttatgttctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaagacagaaggcatttcggggttggaagaatgtatggcattacttgtggaattaccggaaaagac 4509814  T
Q  227 caagggtgattggatgcaag 246  Q
    ||| ||| |||||| |||||    
T  4509813 caatggtaattggaggcaag 4509794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 129 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 4511755 - 4511636
Alignment:
Q  129 ttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcaagaggac-ggaggcgtttcggggtttgaagaatgtatggtgttgcttgtgtgattacc-taaaagac 226  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||| |||||||||| |||||||||||||  || ||||||  ||||||  |||||||    
T  4511755 ttatgttctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaagacagaaggcatttcggggttggaagaatgtatggcattacttgtggaattaccggaaaagac 4511656  T
Q  227 caagggtgattggatgcaag 246  Q
    ||| ||| |||||| |||||    
T  4511655 caatggtaattggaggcaag 4511636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 53 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 24816159 - 24815945
Alignment:
Q  53 agttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtacaattatgg-gggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgt 151  Q
    |||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||| | || || || ||| ||||| ||||||||||| ||||||| |     
T  24816159 agttgaagtagagtacgctcagcttgaggtggagttgaacacaccgagaatggtacgactacggtggacctcgggtgctatgctctagtggtgagcaag- 24816061  T
Q  152 gaattcttcaagaggacgg-aggcgtttcggggtttgaagaatgtatggtgttgcttgtgtgatta-cctaaaagaccaagggtgattggatgcaaggtg 249  Q
    | |||||||| || || || |||  |||||| | ||||||||||||| |  | ||||| | ||||| |||||||| |||||| |||||||||| |||| |    
T  24816060 ggattcttcatgaagaaggaaggtatttcggaggttgaagaatgtatagcatagcttgcgggattaccctaaaaggccaaggttgattggatgaaaggag 24815961  T
Q  250 atattcaaggaagcgg 265  Q
    || |||| ||||||||    
T  24815960 atcttcatggaagcgg 24815945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 274
Target Start/End: Original strand, 22136420 - 22136468
Alignment:
Q  226 ccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagcggaagacgttc 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  22136420 ccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcggaagatgttc 22136468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 274
Target Start/End: Original strand, 40551447 - 40551495
Alignment:
Q  226 ccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagcggaagacgttc 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  40551447 ccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcggaagatgttc 40551495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 7093338 - 7093205
Alignment:
Q  9 aggtggagttacaaggttaaaagcatagtg---tgtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatgg 105  Q
    |||||||||| ||||||| ||  |||||||   |||||||| |||  ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  7093338 aggtggagtttcaaggttgaagacatagtgagatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcaacgtgaggtggagttgaacacaccggtaatgg 7093239  T
Q  106 tacaattatg-ggggccttgggtgttatgctcta 138  Q
    ||| | ||||  || ||||||||| |||||||||    
T  7093238 tacgactatgaaggaccttgggtgctatgctcta 7093205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 138
Target Start/End: Original strand, 28486675 - 28486808
Alignment:
Q  9 aggtggagttacaaggttaaaagcatagtg---tgtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatgg 105  Q
    |||||||||| ||||||| ||  |||||||   |||||||| |||  ||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  28486675 aggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatgg 28486774  T
Q  106 tacaattatgg-gggccttgggtgttatgctcta 138  Q
    ||| | ||||| || ||||||||| |||||||||    
T  28486775 tacgactatggaggaccttgggtgctatgctcta 28486808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 265
Target Start/End: Original strand, 38395428 - 38395659
Alignment:
Q  39 tgtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtacaattatgg-gggccttgggtgttatgctct 137  Q
    |||||||| |||  ||||||||||| | | ||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||| | ||||| || ||||||||| ||||||||    
T  38395428 tgtacgcatttgctagttgaggtagggtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatggaggaccttgggtgctatgctct 38395527  T
Q  138 agttgtgagcatgtgaattcttcaagaggacgg-aggcgtttcggggtttgaagaatgtatggtgttgcttgtgtgattacc----taaaagaccaaggg 232  Q
    | | ||||||| | || ||||||| || ||||| |||| || ||| | ||||||||||||| |    ||||||| |||||||     ||||| |||||      
T  38395528 a-tggtgagcaagcgatttcttcatgaagacggaaggcattccggaggttgaagaatgtatagcacggcttgtgggattaccctaaaaaaaggccaagca 38395626  T
Q  233 tgattggatgcaaggtgatattcaaggaagcgg 265  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  38395627 tgattggatgcaaggagaccttcaaggaagcgg 38395659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 220 - 274
Target Start/End: Original strand, 21679388 - 21679442
Alignment:
Q  220 aaaagaccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagcggaagacgttc 274  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  21679388 aaaaggccaagggtgattggatgcaaggtgaccttcaaggaagcggaagatgttc 21679442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 9 - 138
Target Start/End: Original strand, 22136215 - 22136347
Alignment:
Q  9 aggtggagttacaaggttaaaagcatagtg---tgtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatgg 105  Q
    |||||||||| ||||||| ||  |||||||   |||||||| |||  ||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  22136215 aggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatgg 22136314  T
Q  106 tacaattatgggggccttgggtgttatgctcta 138  Q
    ||| | ||||  | ||||||||| |||||||||    
T  22136315 tacgactatgaagaccttgggtgctatgctcta 22136347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 9 - 138
Target Start/End: Original strand, 40551242 - 40551374
Alignment:
Q  9 aggtggagttacaaggttaaaagcatagtg---tgtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatgg 105  Q
    |||||||||| ||||||| ||  |||||||   |||||||| |||  ||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  40551242 aggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatgg 40551341  T
Q  106 tacaattatgggggccttgggtgttatgctcta 138  Q
    ||| | ||||  | ||||||||| |||||||||    
T  40551342 tacgactatgaagaccttgggtgctatgctcta 40551374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 274
Target Start/End: Original strand, 43856 - 43904
Alignment:
Q  226 ccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagcggaagacgttc 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  43856 ccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgttc 43904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 1047960 - 1047912
Alignment:
Q  226 ccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagcggaagacgttc 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  1047960 ccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgttc 1047912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 274
Target Start/End: Original strand, 28486881 - 28486929
Alignment:
Q  226 ccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagcggaagacgttc 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  28486881 ccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgttc 28486929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 9 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 1048166 - 1048033
Alignment:
Q  9 aggtggagttacaaggttaaaagcatagtg---tgtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatgg 105  Q
    |||||||||| ||||||| ||  |||||||   |||||||| |||  ||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  1048166 aggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatgg 1048067  T
Q  106 tacaattatg-ggggccttgggtgttatgctcta 138  Q
    ||| | ||||  || ||||||||| |||||||||    
T  1048066 tacgactatgaaggaccttgggtgctatgctcta 1048033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 4509466 - 4509412
Alignment:
Q  340 tggtggttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaaggtggagaat 394  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  4509466 tggtggttgatggttaaattaacatcatcatcattttagagtcaaggtggagaat 4509412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 4511308 - 4511254
Alignment:
Q  340 tggtggttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaaggtggagaat 394  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  4511308 tggtggttgatggttaaattaacatcatcatcattttagagtcaaggtggagaat 4511254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 16880716 - 16880662
Alignment:
Q  340 tggtggttgatggttaaagtgacatcatcatcaattt-gaagtcaaggtggagaa 393  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  16880716 tggtggttgatggttaaattgacatcaccaccaatttagaagtcaaggtggagaa 16880662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 4510073 - 4509986
Alignment:
Q  1 aacctttaaggtggagttacaaggttaaaagcatagt--gtgtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagt 87  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||| ||| |||  ||||||||  ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  4510073 aacctttgaggtggagttgcaaggt-aaaggcagagtatgtgtacgcgtttggaagttgaggtgcagaaatctcaacttgaggtggagt 4509986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 4511915 - 4511828
Alignment:
Q  1 aacctttaaggtggagttacaaggttaaaagcatagt--gtgtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagt 87  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||| ||| |||  ||||||||  ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  4511915 aacctttgaggtggagttgcaaggt-aaaggcagagtatgtgtacgcgtttggaagttgaggtgcagaaatctcaacttgaggtggagt 4511828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 346 - 399
Target Start/End: Original strand, 6048384 - 6048437
Alignment:
Q  346 ttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaaggtggagaatgttgt 399  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||    
T  6048384 ttgatggttaaattgacatcatcataaatttagagtcaaggtggagaacgttgt 6048437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 346 - 399
Target Start/End: Original strand, 26214625 - 26214678
Alignment:
Q  346 ttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaaggtggagaatgttgt 399  Q
    |||||||||||| || |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  26214625 ttgatggttaaattggcatcattatcaatttagagtcaaggtggagaatgttgt 26214678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 226 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 31156957 - 31156920
Alignment:
Q  226 ccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagc 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31156957 ccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagc 31156920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 195
Target Start/End: Original strand, 6430901 - 6430993
Alignment:
Q  104 ggtacaattatgggggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcaagaggacgg-aggcgtttcggggtttgaagaatgt 195  Q
    ||||||| ||||| ||||||||   |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||| || | ||||| || |||||||||||    
T  6430901 ggtacaactatggaggccttggtgtttatgctctagtagcgagcatgtgaattcttcatgagcacggaagacatttcgagggttgaagaatgt 6430993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 138
Target Start/End: Original strand, 9679768 - 9679899
Alignment:
Q  9 aggtggagttacaaggttaaaagcatagtg---tgtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatgg 105  Q
    |||||||||| ||||||| ||  |||||||   |||||||| |||  ||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  9679768 aggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttga--acaccggtaatgg 9679865  T
Q  106 tacaattatgg-gggccttgggtgttatgctcta 138  Q
    |||   ||||| || ||||||||| |||||||||    
T  9679866 tactgctatggaggaccttgggtgctatgctcta 9679899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 138
Target Start/End: Original strand, 20298423 - 20298523
Alignment:
Q  39 tgtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtacaattatgg-gggccttgggtgttatgctct 137  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||| | ||||| |  ||||||||| ||||||||    
T  20298423 tgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatggagaaccttgggtgctatgctct 20298522  T
Q  138 a 138  Q
    |    
T  20298523 a 20298523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 274
Target Start/End: Original strand, 20298596 - 20298644
Alignment:
Q  226 ccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagcggaagacgttc 274  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  20298596 ccaagagtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgttc 20298644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 341 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 21983921 - 21983869
Alignment:
Q  341 ggtggttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaaggtggagaa 393  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  21983921 ggtggttgatggttaaactaacatcaccaacaattagaagtcaaggtggagaa 21983869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 346 - 394
Target Start/End: Original strand, 25409754 - 25409802
Alignment:
Q  346 ttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaaggtggagaat 394  Q
    |||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  25409754 ttgatggttaaattgacatcatcactgatttgaagtcaaggtggagaat 25409802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 346 - 394
Target Start/End: Original strand, 30246593 - 30246641
Alignment:
Q  346 ttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaaggtggagaat 394  Q
    |||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  30246593 ttgatggttaaattgacatcatcactgatttgaagtcaaggtggagaat 30246641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 7350325 - 7350287
Alignment:
Q  225 accaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagc 263  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7350325 accaagagtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagc 7350287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 340 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 12397548 - 12397494
Alignment:
Q  340 tggtggttgatggttaaagtgacatcatcatc-aatttgaagtcaaggtggagaa 393  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || | |||| |||||||||||||||||    
T  12397548 tggtggttgatggttaaactgacatcaccaccaaattagaagtcaaggtggagaa 12397494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 340 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 20000390 - 20000336
Alignment:
Q  340 tggtggttgatggttaaagtgacatcatcatc-aatttgaagtcaaggtggagaa 393  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || | |||| |||||||||||||||||    
T  20000390 tggtggttgatggttaaattgacatcaccaccaaattagaagtcaaggtggagaa 20000336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 340 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 21640479 - 21640425
Alignment:
Q  340 tggtggttgatggttaaagtgacatcatcatc-aatttgaagtcaaggtggagaa 393  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || | |||| |||||||||||||||||    
T  21640479 tggtggttgatggttaaactgacatcaccaccaaattagaagtcaaggtggagaa 21640425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 340 - 393
Target Start/End: Original strand, 24265621 - 24265675
Alignment:
Q  340 tggtggttgatggttaaagtgacatcatcatc-aatttgaagtcaaggtggagaa 393  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || | |||| |||||||||||||||||    
T  24265621 tggtggttgatggttaaattgacatcaccaccaaattagaagtcaaggtggagaa 24265675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 341 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 3320634 - 3320581
Alignment:
Q  341 ggtggttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaaggtggagaat 394  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  3320634 ggtgattgatggttaaactggcatcatcactgatttgaagtcaaggtggagaat 3320581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 341 - 394
Target Start/End: Original strand, 7074386 - 7074439
Alignment:
Q  341 ggtggttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaaggtggagaat 394  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  7074386 ggtgattgatggttaaactggcatcatcactgatttgaagtcaaggtggagaat 7074439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 341 - 394
Target Start/End: Original strand, 25404992 - 25405045
Alignment:
Q  341 ggtggttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaaggtggagaat 394  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  25404992 ggtgattgatggttaaactggcatcatcactgatttgaagtcaaggtggagaat 25405045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 80
Target Start/End: Original strand, 38281327 - 38281368
Alignment:
Q  39 tgtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgag 80  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38281327 tgtacacatttggaagttgaggtggagaaagctcaacttgag 38281368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 341 - 390
Target Start/End: Original strand, 38281765 - 38281814
Alignment:
Q  341 ggtggttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaaggtgga 390  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||| |||||||||    
T  38281765 ggtggttgatggttaaagtggcatcatcattgatttaaagacaaggtgga 38281814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 39 - 138
Target Start/End: Original strand, 43683 - 43783
Alignment:
Q  39 tgtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtacaattatg-ggggccttgggtgttatgctct 137  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||| | ||||| | |||| |||||||||  ||||||| |||||||| | ||||  || ||||||||| ||||||||    
T  43683 tgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgagatggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaaggaccttgggtgctatgctct 43782  T
Q  138 a 138  Q
    |    
T  43783 a 43783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 6430767 - 6430849
Alignment:
Q  1 aacctttaaggtggagttacaaggttaaaagcatagtgtgt--acgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggt 82  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||  |||||||||||  ||||  |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  6430767 aacctttgaggtggagttgcaaggtgaag-gcatagtgtgtgtacgcgtttggaagttgaggtggagaaatctcagcttgaggt 6430849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 226 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 7093132 - 7093096
Alignment:
Q  226 ccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaag 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  7093132 ccaagggtgattggatgcaaggtgaccttcaaggaag 7093096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 238; Significance: 1e-131; HSPs: 30)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 34255307 - 34254895
Alignment:
Q  1 aacctttaaggtggagttacaaggttaaaagcatagtgt--gtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccg 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  || ||||||||   |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34255307 aacctttgaggtggagttacaaggtggaa-gcatagtggaagtactcatttggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccg 34255209  T
Q  99 ggaatggtacaattatgggggccttgggtgtt-atgctctagttgtgagcatgtgaattcttcaagaggacgga-ggcgtttcggggtttgaagaatgta 196  Q
    |||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  || ||||||||||||||||||    
T  34255208 ggaatggtacgactatggaggccttgggtgtttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaaggtattccggggtttgaagaatgta 34255109  T
Q  197 tggtgttgcttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagcggaagacgttccgtagttgaagagggtttagtg 296  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||    
T  34255108 tggtgtggcttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgatcggatgcaaggtgatcttcgaggaagcgggagacgttccgtggttgaagatggtttggtg 34255009  T
Q  297 tatacttgtggagctactttgtgtagttggatgca------------agggggattggtggttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaa 384  Q
    || ||||||||||| |||| |||||||||||||||            |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34255008 tagacttgtggagcaacttggtgtagttggatgcaagggaaaagaaaagggagattggtggttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaa 34254909  T
Q  385 ggtggagaatgttg 398  Q
    ||||||||||||||    
T  34254908 ggtggagaatgttg 34254895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 399
Target Start/End: Original strand, 4732996 - 4733409
Alignment:
Q  1 aacctttaaggtggagttacaaggttaaaagcatagtgtgt--acgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccg 98  Q
    ||||||| |||||||||| |||||   ||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4732996 aacctttgaggtggagttgcaagggagaaagcatagtgtgtgtacgcatttggaaattgaggtagagaaatctcaacttgaggtggagttgatgacaccg 4733095  T
Q  99 ggaatggtacaattatgggggccttgggtgtt-atgctctagttgtgagcatgtgaattcttcaagaggacggagg-cgtttcggggtttgaagaatgta 196  Q
      |||||||| | ||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| | | | | || | ||||||||||||||||    
T  4733096 aaaatggtacgactatggaggtcttgggtgtttatgctctagttgtgtgcatgtgaatgcttcatgaggatgaaagtcattcccgggtttgaagaatgta 4733195  T
Q  197 tggtgttgcttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagcggaagacgttccgtagttgaagagggtttagtg 296  Q
    |||   || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||    
T  4733196 tggcagtgtttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgatcggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagacgttccgtggttaaagagggtttggtg 4733295  T
Q  297 tatacttgtggagctactttgtgtagttggat-----------gcaagggggattggtggttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaag 385  Q
    || ||||||| |||||||| ||||||||||||           | || ||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  4733296 tagacttgtgaagctacttggtgtagttggatgtcagggaaaagaaaagggaattggtggttgaaggttaatgtggcatcatcatcaatttgaagccaag 4733395  T
Q  386 gtggagaatgttgt 399  Q
    ||||||||||||||    
T  4733396 gtggagaatgttgt 4733409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 41365814 - 41365402
Alignment:
Q  1 aacctttaaggtggagttacaaggttaaaagcatagtgtgt--acgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccg 98  Q
    ||||||| |||||||||| |||||  ||| |||||||||||  | ||| ||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41365814 aacctttgaggtggagttgcaaggcaaaaggcatagtgtgtgtatgcatttggaagttgag------aaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccg 41365721  T
Q  99 ggaatggtacaattatgggggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttca---agaggacggagg-cgtttcggggtttgaagaatg 194  Q
    |||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||| |||||| | | || | | ||||||||||||    
T  41365720 ggaatggtatgactatggaggccttgggtgctatgctctagttgtgagcatgggaattcttcatgaagaagacggaagacattccagagtttgaagaatg 41365621  T
Q  195 tatggtgttgcttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagcggaagacgttccgtagttgaagagggtttag 294  Q
    |||||| |  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||| | ||| |||||||  ||||||| ||||| |    
T  41365620 tatggtatgactagtgtgattacctaaaagaccaagagtgattggatgcacgatgatcttcaaggaagcaggagatgttccgtgtttgaagaaggtttgg 41365521  T
Q  295 tgtatacttgtggagctacttt-gtgtagttggatgcaag-------------ggggattggtggttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaag 380  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||             ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41365520 tgtatacttgtggagctactttggtgtagttggatgcaaggaagaaagaaaaaggggattggtgattgatggttaaagtggcatcatcatcaatttgaag 41365421  T
Q  381 tcaaggtggagaatgttgt 399  Q
     ||||||||||||||||||    
T  41365420 gcaaggtggagaatgttgt 41365402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 31574749 - 31574434
Alignment:
Q  3 cctttaaggtggagttacaaggttaaaagcatagtg--tgtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccggg 100  Q
    ||||| |||||||||| |||||| |||  ||| |||  |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  31574749 cctttgaggtggagtttcaaggtgaaagtcattgtggatgtacgcatttgctagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagtttatgacatcggg 31574650  T
Q  101 aatggtacaattatgggggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcaagaggac-ggaggcgtttcggggtttgaagaatgtatgg 199  Q
    |||| ||| | ||||| | ||||||||| |||||||||||| |||| | | |||||||||| || ||| | |||| || ||  |||||||||||||||      
T  31574649 aatgatacgactatggagaccttgggtgctatgctctagttatgagaaagggaattcttcatgaagacagaaggcattccgaagtttgaagaatgtataa 31574550  T
Q  200 tgttgcttgtgtgattacc-taaaagaccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagcggaagacgttccgtagttgaagagggtt-tagtgt 297  Q
      | || |||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||  ||| ||||||||||||| | ||||    
T  31574549 catggcatgtgggattacctttaaagaacaagggtgattggatgcaaggagatcttcaaggaagcaggagacgtctcgtggttgaagagggttatggtgt 31574450  T
Q  298 atacttgtggagctac 313  Q
    ||||||| ||| ||||    
T  31574449 atacttgcggaactac 31574434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 53 - 313
Target Start/End: Original strand, 17849089 - 17849349
Alignment:
Q  53 agttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtacaattatgggggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtg 152  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||  |  |||  | ||||| | ||||||||| || ||||||||||| |||| | |    
T  17849089 agttgaggtagagaaagctcaccttgaggtggagttgatgacattggacaaagtatgactatggagaccttgggtgctaggctctagttgttagcaagag 17849188  T
Q  153 aattcttcaagaggacgga-ggcgtttcggggtttgaagaatgtatggtgttgcttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattggatgcaaggtgat 251  Q
    |||||||||| | |||||| ||| ||||||  |||||||||||||||   |  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  17849189 aattcttcaaaaagacggaaggcatttcggattttgaagaatgtatgacatgacttgtgtgattatctaaaagaccaaggatgattggatacaaggtgat 17849288  T
Q  252 attcaaggaagcggaagacgttccgtagttgaagagggtttagtgtatacttgtggagctac 313  Q
     |||||||||| |  |||| ||  || |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  17849289 cttcaaggaagtgtgagac-tttagtggttgaagagggtttggtgtagacttgtggaactac 17849349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 39 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 42436377 - 42436230
Alignment:
Q  39 tgtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtacaattatgggggccttgggtgttatgctcta 138  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||             ||||||||||||||||||||    
T  42436377 tgtacgcatttgaaagttgaggtagagaaagctcgatttgaggtggagttgatgacacagagaatgg-------------gccttgggtgttatgctcta 42436291  T
Q  139 gttgtgagcatgtgaattcttcaagaggacg-gaggcgtttcggggtttgaagaatgtatg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||  |||||||||||||||||||    
T  42436290 gttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacgaaaggcattgtggggtttgaagaatgtatg 42436230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 104 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 40220735 - 40220644
Alignment:
Q  104 ggtacaattatgggggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcaagaggacg-gaggcgtttcggggtttgaagaatg 194  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||| ||||||||||    
T  40220735 ggtacaactatggaggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcaagagtacgaaaggcatttcgggggttgaagaatg 40220644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 337 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 42435856 - 42435794
Alignment:
Q  337 gattggtggttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaaggtggagaatgttgt 399  Q
    |||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42435856 gattggtgattgatggttaaagtggtctcatcatcaatttgaaggcaaggtggagaatgttgt 42435794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 29797221 - 29797045
Alignment:
Q  135 tctagttgtgagcatgtgaattcttcaagaggacgga-ggcgtttcggggtttgaagaatgtatggtgttgcttgtgtgattacctaaaagaccaagggt 233  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| ||||| ||| | ||| ||  ||||||||| ||||||||||  |  |||||| |||||||||||||||||| |||    
T  29797221 tctagttgtgagcaaggaaattctttaagagcacgaaaggctttatggggtttgaggaatgtatggaatgacttgtgggattacctaaaagaccaatggt 29797122  T
Q  234 gattggatgcaaggtgatattcaaggaagcggaagacgttccgtagttgaagagggtttagtgtatacttgtggagctac 313  Q
     |||| ||||||||  || ||||||    ||||||||||||| | |||||||||||| | ||||| ||||| ||| ||||    
T  29797121 aattgcatgcaaggaaatcttcaag---acggaagacgttccatggttgaagagggtatggtgtagacttgcggaactac 29797045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 269
Target Start/End: Original strand, 27828648 - 27828691
Alignment:
Q  226 ccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagcggaaga 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27828648 ccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcggaaga 27828691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 9 - 138
Target Start/End: Original strand, 18812165 - 18812297
Alignment:
Q  9 aggtggagttacaaggttaaaagcatagtg---tgtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatgg 105  Q
    |||||||||| ||||||| ||  |||||||   |||||||| |||  ||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  18812165 aggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatgg 18812264  T
Q  106 tacaattatgggggccttgggtgttatgctcta 138  Q
    ||| | ||||  | ||||||||| |||||||||    
T  18812265 tacgactatgaagaccttgggtgctatgctcta 18812297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 341 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 16753106 - 16753053
Alignment:
Q  341 ggtggttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaaggtggagaat 394  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  16753106 ggtgattgatggttaaactgacatcatcactaatttgaagtcaaggtggagaat 16753053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 393
Target Start/End: Original strand, 19751833 - 19751886
Alignment:
Q  340 tggtggttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaaggtggagaa 393  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  19751833 tggtggttgatggttaaactgacatcgtcaccaattagaagtcaaggtggagaa 19751886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 265
Target Start/End: Original strand, 41383855 - 41384072
Alignment:
Q  53 agttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtacaattatgg-gggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgt 151  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||   ||||| || |||||| || ||||||||| | ||||||| |     
T  41383855 agttgaggtagagtacgctcatcttgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacggctatggaggaccttggatgctatgctcta-tggtgagcaagg 41383953  T
Q  152 gaattcttcaagaggacgg-aggcgtttcggggtttgaagaatgtatggtgttgcttgtgtgattacc----taaaagaccaagggtgattggatgcaag 246  Q
    || ||||||| || ||||| |||| || ||| | ||||||||||||| |    ||||| | |||||||     ||||| |||||||| ||| ||||||||    
T  41383954 gatttcttcatgaagacggaaggcattccggaggttgaagaatgtatagcacggcttgcgggattaccctaaaaaaaggccaagggttatttgatgcaag 41384053  T
Q  247 gtgatattcaaggaagcgg 265  Q
    ||||  |||||||||||||    
T  41384054 gtgaccttcaaggaagcgg 41384072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 138
Target Start/End: Original strand, 43081059 - 43081191
Alignment:
Q  9 aggtggagttacaaggttaaaagcatagtg---tgtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatgg 105  Q
    |||||||||| ||||||| ||  |||||||   |||||||| ||   ||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  43081059 aggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatgg 43081158  T
Q  106 tacaattatgggggccttgggtgttatgctcta 138  Q
    ||| | ||||  | ||||||||| |||||||||    
T  43081159 tacgactatgaagaccttgggtgctatgctcta 43081191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 226 - 263
Target Start/End: Original strand, 43081264 - 43081301
Alignment:
Q  226 ccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagc 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43081264 ccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagc 43081301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 265
Target Start/End: Original strand, 21481848 - 21481896
Alignment:
Q  217 cctaaaagaccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagcgg 265  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  21481848 cctaaaaagccaagggtgattggatgcaaggagatcttcaaggaagcgg 21481896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 346 - 394
Target Start/End: Original strand, 25684247 - 25684295
Alignment:
Q  346 ttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaaggtggagaat 394  Q
    |||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  25684247 ttgatggttaaaatgacatcatcactgatttgaagtcaaggtggagaat 25684295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 253 - 300
Target Start/End: Original strand, 5645997 - 5646044
Alignment:
Q  253 ttcaaggaagcggaagacgttccgtagttgaagagggtttagtgtata 300  Q
    ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||    
T  5645997 ttcaaggaagcgggagacgttctgtggttgaagagggtttggtgtata 5646044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 340 - 393
Target Start/End: Original strand, 10688562 - 10688616
Alignment:
Q  340 tggtggttgatggttaaagtgacatcatcatc-aatttgaagtcaaggtggagaa 393  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || | |||| |||||||||||||||||    
T  10688562 tggtggttgatggttaaactgacatcaccaccaaattagaagtcaaggtggagaa 10688616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 340 - 393
Target Start/End: Original strand, 33037231 - 33037285
Alignment:
Q  340 tggtggttgatggttaaagtgacatcatcatc-aatttgaagtcaaggtggagaa 393  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || | |||| |||||||||||||||||    
T  33037231 tggtggttgatggttaaactgacatcaccaccaaattagaagtcaaggtggagaa 33037285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 340 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 40220263 - 40220209
Alignment:
Q  340 tggtggttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaaggtggagaat 394  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  40220263 tggtggttgatggttaaattagcatcatcatcattttagagtcaaggtggagaat 40220209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 341 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 4813072 - 4813019
Alignment:
Q  341 ggtggttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaaggtggagaat 394  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  4813072 ggtgattgatggttaaactggcatcatcactgatttgaagtcaaggtggagaat 4813019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 340 - 393
Target Start/End: Original strand, 10014684 - 10014737
Alignment:
Q  340 tggtggttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaaggtggagaa 393  Q
    |||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  10014684 tggtggttcattgttaaagtggcatcatcatcattttagagtcaaggtggagaa 10014737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 108
Target Start/End: Original strand, 27828475 - 27828544
Alignment:
Q  39 tgtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtac 108  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  27828475 tgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtac 27828544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 40220869 - 40220782
Alignment:
Q  1 aacctttaaggtggagttacaaggttaaaagcata--gtgtgtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagt 87  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||  |||||  ||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||    
T  40220869 aacctttgaggtggagttgcaaggtgaag-gcataacgtgtgtacgcgtttggaagttgaggtggagaaatctcagtttgaggtggagt 40220782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 9 - 108
Target Start/End: Original strand, 15071915 - 15072017
Alignment:
Q  9 aggtggagttacaaggttaaaagcatagtg---tgtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatgg 105  Q
    |||||||||| ||||||| ||  |||||||   |||||||| |||  ||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||  |||| || |||||    
T  15071915 aggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacactggtaatgg 15072014  T
Q  106 tac 108  Q
    |||    
T  15072015 tac 15072017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 341 - 393
Target Start/End: Original strand, 26402624 - 26402676
Alignment:
Q  341 ggtggttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaaggtggagaa 393  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| || ||||||  |||||||||||||||    
T  26402624 ggtggttgatggttaaatttacatcaccaccaatttagagtcaaggtggagaa 26402676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 346 - 394
Target Start/End: Original strand, 28895104 - 28895152
Alignment:
Q  346 ttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaaggtggagaat 394  Q
    |||||||||||| ||| |||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  28895104 ttgatggttaaactgatatcatcactgatttgaagtcaaggtggagaat 28895152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 35741176 - 35741124
Alignment:
Q  342 gtggttgatggttaaagtgacatcatcatc-aatttgaagtcaaggtggagaa 393  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || | |||| |||||||||||||||||    
T  35741176 gtggttgatggttaaattgacatcaccaccaaattagaagtcaaggtggagaa 35741124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 233; Significance: 1e-128; HSPs: 59)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 407
Target Start/End: Original strand, 29812236 - 29812654
Alignment:
Q  1 aacctttaaggtggagttacaaggttaaaagcatagtgtgt--acgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccg 98  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||  |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29812236 aacctttgaggtggagttgcaaggtgaag-gcatagtgtgtgtacgcatttggaagttgaggtagagaaagctcaacttaaggtggagttgatgacaccg 29812334  T
Q  99 ggaatggtacaattatgggggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcaagaggacgga-ggcgtttcggggtttgaagaatgtat 197  Q
    |||||||||||| |||||  |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||| ||  ||||||||||||||||||    
T  29812335 ggaatggtacaactatggatgccttgagtgctatgctctagttgtgagcttgtgaattcttcatgagaacggaaggcattctggggtttgaagaatgtat 29812434  T
Q  198 ggtgttgcttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagcggaagacgttccgtagttgaagagggtttagtgt 297  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||| ||||    
T  29812435 ggtgtagcttgtgtggttacctaaaagaccaagcgtgatcggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgttccggggttgaagagggtttggtgt 29812534  T
Q  298 atacttgtggagctactttgtgtagttggatgcaagg---------gggattggtggttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaaggtg 388  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29812535 agacttgtggagctacttggtgtagttggatgcaaggaaaagaaaagggattggtggttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaaggtg 29812634  T
Q  389 gag-aatgttgtttttgcct 407  Q
    ||| |||||||| |||||||    
T  29812635 gagaaatgttgtatttgcct 29812654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 48 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 5259076 - 5258711
Alignment:
Q  48 ttggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtacaattatgggggccttgggtgtt-atgctctagttgtgag 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  5259076 ttggaagttgaggtagagaaagctcaacttaaggtggagttgatgacaccgggaatggtacgactatggaggctttgggtgtttatgctctagttgtgag 5258977  T
Q  147 catgtgaattcttcaagaggacgga-ggcgtttcggggtttgaagaatgtatggtgttgcttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattggatgcaa 245  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5258976 catgtgaattcttcatgaggacggaaggtattccggggtttgaagaatgtatggtgtggcttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgatcggatgcaa 5258877  T
Q  246 ggtgatattcaaggaagcggaagacgttccgtagttgaagagggtttagtgtatacttgtggagctactttgtgtagttggatgc------------aag 333  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||| || |||||| || |            |||    
T  5258876 ggtgatcttcgaggaagcgggagacgtttcgtggttgaagagggtttgatgtagacttgtggagcaacttggtatagttgaattcaagggaaaagaaaag 5258777  T
Q  334 ggggattggtggttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaaggtggagaatgttgt 399  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5258776 ggagattggtggttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaaggtggagaatgttgt 5258711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 48 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 9635252 - 9634886
Alignment:
Q  48 ttggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtacaattatgggggccttgggtg-ttatgctctagttgtgag 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  9635252 ttggaagttgaggtagagaaagctcaacttaaggtggagttgatgacaccgggaatggtacgactatggaggccttggttgtttatgctctagttgtgag 9635153  T
Q  147 catgtgaattcttcaagaggacgg-aggcgtttcggggtttgaagaatgtatggtgttgcttgtgtgattacctaaaagaccaa-gggtgattggatgca 244  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  9635152 catgtgaattcttcatgaggatggaaggcattccggggtttgaagaatgtatgatgtagcttgtgtgattacctaaaagaccaaggggtgatcggatgca 9635053  T
Q  245 aggtgatattcaaggaagcggaagacgttccgtagttgaagagggtttagtgtatacttgtggagctactttgtgtagttggatgc------------aa 332  Q
    ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||            ||    
T  9635052 aggtgatcttcgaggaagcgggagacgttccgtggttgaagaggatttggtgtagacttgtggagcaacttggtgtagttgggtgcaagtgaaaagaaaa 9634953  T
Q  333 gggggattggtggttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaaggtggagaatgttgt 399  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9634952 gggagattggtggttgatggttaaagtgacatcatcatcagtttgaagtcaaggtggagaatgttgt 9634886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 48 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 23198892 - 23198532
Alignment:
Q  48 ttggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtacaattatgggggccttgggtgtt-atgctctagttgtgag 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  23198892 ttggaagttgaggtagagaaagctcaacttaaggtggagttgatgacatcgggaatggtatgactatggaggctttgggtgtttatgctctagttgtgag 23198793  T
Q  147 catgtgaattcttcaagaggacgga-ggcgtttcggggtttgaagaatgtatggtgttgcttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattggatgcaa 245  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  23198792 catgtgaattcttcatgaggacggaaggcattccggggtttgaagaatgtatggtgtggcttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgatcggatacaa 23198693  T
Q  246 ggtgatattcaaggaagcggaagacgttccgtagttgaagagggtttagtgtatacttgtggagctactttgtgtagttggatgc------------aag 333  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||| | |||| || |||||| ||||            |||    
T  23198692 ggtgatcttcgaggaagcagaagacgttccgtggttgaagatggtttggtgtagacttgtggaacaacttggtatagttgaatgcaagggaaaagcaaag 23198593  T
Q  334 ggggattggtggttgatggttaaagtgacatcatcatc-aatttgaagtcaaggtggagaa 393  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||| || | |||| |||||||||||||||||    
T  23198592 ggagattggtggttgatggttaaattgacatcaccaacaaattagaagtcaaggtggagaa 23198532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 48 - 393
Target Start/End: Original strand, 6717925 - 6718286
Alignment:
Q  48 ttggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccggg-aatggtacaattatgggggccttgggtgtt-atgctctagttgtga 145  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  6717925 ttggaagttgaggtagagaaagttcaacttgaggtggagttgatgacaccggggaatggtatgactatggaggctttgggagtttatgctctagttgtga 6718024  T
Q  146 gcatgtgaattcttcaagaggacgg-aggcgtttcggggtttgaagaatgtatggtgttgcttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattggatgca 244  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||  || | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6718025 gcatgtgaattcttcatgaggacgggaggtattccagggtttgaagaatgtatggggtggcttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgatcggatgca 6718124  T
Q  245 aggtgatattcaaggaagcggaagacgttccgtagttgaagagggtttagtgtatacttgtggagctactttgtgtagttggatgcaagg---------- 334  Q
    ||||||| ||| |||| |||| ||||||| ||| |||||||| || || ||| | ||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||              
T  6718125 aggtgatcttcgaggaggcgggagacgtttcgtggttgaagatggcttggtgaagacttgtggagcaacttggtagagttggatgcaagggaaaagaatg 6718224  T
Q  335 --gggattggtggttgatggttaaagtgacatcatcatc-aatttgaagtcaaggtggagaa 393  Q
      | |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  6718225 gtgagattggtggttgatggttaaagtggcatcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaa 6718286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 48 - 399
Target Start/End: Original strand, 7763683 - 7764035
Alignment:
Q  48 ttggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtacaattatgggggccttgggtg-ttatgctctagttgtgag 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  7763683 ttggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagtttgtgacaccgagaatggtacgactatggaggccttgggtgtttatgctctaggtgtgag 7763782  T
Q  147 catgtgaattcttcaagaggacgg-aggcgtttcggggtttgaagaatgtatggtgttgcttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattggatgcaa 245  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| || | ||  |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||              |||||||||||||    
T  7763783 catatgaattcttcatgaggacggaagacattctggggtttgaagaatgtatgacgttgcttgtgcgattacc--------------tgattggatgcaa 7763868  T
Q  246 ggtgatattcaaggaagcggaagacgttccgtagttgaagagggtttagtgtatacttgtggagctactttgtgtagttggatgc-------------aa 332  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||             ||    
T  7763869 ggtgatcttcgaggaagcgggagacgttccgtggttgaagatggtttggtgtagacttgtggagcaacttggtgtagttggatgcaagggaaaaagaaaa 7763968  T
Q  333 gggggattggtggttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaaggtggagaatgttgt 399  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7763969 gggagattggtggttgatggttaaagtggcatcatcatcaatttgaagtcaaggtggaaaatgttgt 7764035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 48 - 393
Target Start/End: Original strand, 10057661 - 10058025
Alignment:
Q  48 ttggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtacaattatgggggccttgggtgtt-atgctctagttgtgag 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||   ||||| ||| ||||| ||| |||||||||| |||||    
T  10057661 ttggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttggtgactccggaaatggtacggctatggaggctttgggagtttatgctctagtggtgag 10057760  T
Q  147 catgtgaattcttcaagaggacgga-ggcgtttcggggtttgaagaatgtatggtgttgcttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattggatgcaa 245  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  10057761 catgtggattcttcatgaggacggatggtattccggggtttgaagaatgtatggggtggcttgtgtgattgcctaaaaggccaagggtgatcggatgcaa 10057860  T
Q  246 ggtgatattcaaggaagcggaagacgttccgtagttgaagagggttt-------agtgtatacttgtggagctactttgtgt--agttggatgcaaggg- 335  Q
    |||||| ||| |||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||       | || | ||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||     
T  10057861 ggtgatcttcgaggaggcgggagacgttccgtggttgaagatggtttggtgaaaaatgaagacttgtggagcaacttggtgtagagttggatgcaaggga 10057960  T
Q  336 ------ggattggtggttgatggttaaagtgacatcatcatc-aatttgaagtcaaggtggagaa 393  Q
           |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  10057961 aaaggaagattggtggttgatggttaaagtggcatcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaa 10058025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 48 - 393
Target Start/End: Original strand, 10059883 - 10060247
Alignment:
Q  48 ttggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtacaattatgggggccttgggtgtt-atgctctagttgtgag 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||   ||||| ||| ||||| ||| |||||||||| |||||    
T  10059883 ttggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttggtgactccggaaatggtacggctatggaggctttgggagtttatgctctagtggtgag 10059982  T
Q  147 catgtgaattcttcaagaggacgga-ggcgtttcggggtttgaagaatgtatggtgttgcttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattggatgcaa 245  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  10059983 catgtggattcttcatgaggacggatggtattccggggtttgaagaatgtatggggtggcttgtgtgattgcctaaaaggccaagggtgatcggatgcaa 10060082  T
Q  246 ggtgatattcaaggaagcggaagacgttccgtagttgaagagggttt-------agtgtatacttgtggagctactttgtgt--agttggatgcaaggg- 335  Q
    |||||| ||| |||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||       | || | ||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||     
T  10060083 ggtgatcttcgaggaggcgggagacgttccgtggttgaagatggtttggtgaaaaatgaagacttgtggagcaacttggtgtagagttggatgcaaggga 10060182  T
Q  336 ------ggattggtggttgatggttaaagtgacatcatcatc-aatttgaagtcaaggtggagaa 393  Q
           |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  10060183 aaaggaagattggtggttgatggttaaagtggcatcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaa 10060247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 48 - 393
Target Start/End: Original strand, 10062105 - 10062469
Alignment:
Q  48 ttggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtacaattatgggggccttgggtgtt-atgctctagttgtgag 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||   ||||| ||| ||||| ||| |||||||||| |||||    
T  10062105 ttggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttggtgactccggaaatggtacggctatggaggctttgggagtttatgctctagtggtgag 10062204  T
Q  147 catgtgaattcttcaagaggacgga-ggcgtttcggggtttgaagaatgtatggtgttgcttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattggatgcaa 245  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  10062205 catgtggattcttcatgaggacggatggtattccggggtttgaagaatgtatggggtggcttgtgtgattgcctaaaaggccaagggtgatcggatgcaa 10062304  T
Q  246 ggtgatattcaaggaagcggaagacgttccgtagttgaagagggttt-------agtgtatacttgtggagctactttgtgt--agttggatgcaaggg- 335  Q
    |||||| ||| |||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||       | || | ||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||     
T  10062305 ggtgatcttcgaggaggcgggagacgttccgtggttgaagatggtttggtgaaaaatgaagacttgtggagcaacttggtgtagagttggatgcaaggga 10062404  T
Q  336 ------ggattggtggttgatggttaaagtgacatcatcatc-aatttgaagtcaaggtggagaa 393  Q
           |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  10062405 aaaggaagattggtggttgatggttaaagtggcatcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaa 10062469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 48 - 393
Target Start/End: Original strand, 10064327 - 10064691
Alignment:
Q  48 ttggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtacaattatgggggccttgggtgtt-atgctctagttgtgag 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||   ||||| ||| ||||| ||| |||||||||| |||||    
T  10064327 ttggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttggtgactccggaaatggtacggctatggaggctttgggagtttatgctctagtggtgag 10064426  T
Q  147 catgtgaattcttcaagaggacgga-ggcgtttcggggtttgaagaatgtatggtgttgcttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattggatgcaa 245  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  10064427 catgtggattcttcatgaggacggatggtattccggggtttgaagaatgtatggggtggcttgtgtgattgcctaaaaggccaagggtgatcggatgcaa 10064526  T
Q  246 ggtgatattcaaggaagcggaagacgttccgtagttgaagagggttt-------agtgtatacttgtggagctactttgtgt--agttggatgcaaggg- 335  Q
    |||||| ||| |||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||       | || | ||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||     
T  10064527 ggtgatcttcgaggaggcgggagacgttccgtggttgaagatggtttggtgaaaaatgaagacttgtggagcaacttggtgtagagttggatgcaaggga 10064626  T
Q  336 ------ggattggtggttgatggttaaagtgacatcatcatc-aatttgaagtcaaggtggagaa 393  Q
           |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  10064627 aaaggaagattggtggttgatggttaaagtggcatcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaa 10064691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 48 - 393
Target Start/End: Original strand, 10066549 - 10066913
Alignment:
Q  48 ttggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtacaattatgggggccttgggtgtt-atgctctagttgtgag 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||   ||||| ||| ||||| ||| |||||||||| |||||    
T  10066549 ttggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttggtgactccggaaatggtacggctatggaggctttgggagtttatgctctagtggtgag 10066648  T
Q  147 catgtgaattcttcaagaggacgga-ggcgtttcggggtttgaagaatgtatggtgttgcttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattggatgcaa 245  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  10066649 catgtggattcttcatgaggacggatggtattccggggtttgaagaatgtatggggtggcttgtgtgattgcctaaaaggccaagggtgatcggatgcaa 10066748  T
Q  246 ggtgatattcaaggaagcggaagacgttccgtagttgaagagggttt-------agtgtatacttgtggagctactttgtgt--agttggatgcaaggg- 335  Q
    |||||| ||| |||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||       | || | ||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||     
T  10066749 ggtgatcttcgaggaggcgggagacgttccgtggttgaagatggtttggtgaaaaatgaagacttgtggagcaacttggtgtagagttggatgcaaggga 10066848  T
Q  336 ------ggattggtggttgatggttaaagtgacatcatcatc-aatttgaagtcaaggtggagaa 393  Q
           |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  10066849 aaaggaagattggtggttgatggttaaagtggcatcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaa 10066913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 48 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 4599471 - 4599109
Alignment:
Q  48 ttggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtacaattatgggggccttgggtgtt-atgctctagttgtgag 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||   ||||| ||| ||||| ||| |||||||||| |||||    
T  4599471 ttggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttggtgactccgggaatggtacggctatggaggctttgggagtttatgctctagtggtgag 4599372  T
Q  147 catgtgaattcttcaagaggacgga-ggcgtttcggggtttgaagaatgtatggtgttgcttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattggatgcaa 245  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  4599371 catgtgaattcttcatgaggacggatggtattccggggtttgaagaatgtatggggtggcttgtgtgattgcctaaaaggccaagggtgatcggatgcaa 4599272  T
Q  246 ggtgatattcaaggaagcggaagacgttccgtagttgaagagggtttagt-------gtatacttgtggagctactttgtgt--agttggatgcaagggg 336  Q
    |||||| ||| |||| |||| |||||||| || |||||||| ||||| ||       | | ||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||     
T  4599271 ggtgatcttcgaggaggcgggagacgttctgtggttgaagatggtttggtgaaaaaggaagacttgtggagcaacttggtgtagagttggatgcaaggga 4599172  T
Q  337 ga-----ttggtggttgatggttaaagtgacatcatcatc-aatttgaagtcaaggtggagaa 393  Q
     |       |||||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  4599171 aaagaagggggtggttgatggttaaagtggcatcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaa 4599109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 48 - 393
Target Start/End: Original strand, 10210614 - 10210976
Alignment:
Q  48 ttggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtacaattatgggggccttgggtgtt-atgctctagttgtgag 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||   ||||| ||| ||||| ||| |||||||||| |||||    
T  10210614 ttggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttggtgactccaagaatggtacggctatggaggctttgggagtttatgctctagtggtgag 10210713  T
Q  147 catgtgaattcttcaagaggacgga-ggcgtttcggggtttgaagaatgtatggtgttgcttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattggatgcaa 245  Q
    |||||| |||||||| |||||| || ||  || ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  10210714 catgtggattcttcatgaggacagatggtattccggggtttgaagaatgtatggagtggcttgtgtgattgcctaaaaggccaagggtgatcggatgcaa 10210813  T
Q  246 ggtgatattcaaggaagcggaagacgttccgtagttgaagagggttt-------agtgtatacttgtggagctactttgtgt--agttggatgcaagggg 336  Q
    |||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||       | || | ||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||     
T  10210814 ggtgatcttcaaggaggcgggagacgttccgtggttgaagatggtttggtgaaaaatgaagacttgtggagcaacttggtgtagagttggatgcaaggga 10210913  T
Q  337 ga-----ttggtggttgatggttaaagtgacatcatcatc-aatttgaagtcaaggtggagaa 393  Q
     |       |||||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  10210914 aaagaagggggtggttgatggttaaagtggcatcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaa 10210976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 54 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 15824602 - 15824366
Alignment:
Q  54 gttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtacaattatgggggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtga 153  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||   ||||||||||||||||||| ||||||||| |||   | |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  15824602 gttgaggtagagaaatctcatcttg---tggagttgatgacaccgggcatggtacaactattaagaccttaggtgttatgctctagttgcgagcaagtga 15824506  T
Q  154 attcttcaagaggacggaggcgtttcgg-ggtttgaagaatgtatggtgttgcttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattggatgcaaggtgata 252  Q
    |||||||||||||||||| |   ||| | |||||||||||||||| |  |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15824505 attcttcaagaggacggaagtcattctgaggtttgaagaatgtatagcatgacttgtgtgattacctaaaacaccaagggtgattggatgcaaggtgata 15824406  T
Q  253 ttcaaggaagcggaagacgttccgtagttgaagagggttt 292  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15824405 ttcaaggaagcgggagacgttccgtggttgaagagggttt 15824366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 183 - 393
Target Start/End: Original strand, 37407810 - 37408034
Alignment:
Q  183 gtttgaagaatgtatggtgttgcttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagcggaagacgttccgtagttg 282  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  37407810 gtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgatcggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagacgttccgtggttg 37407909  T
Q  283 aagagggtttagtgtatacttgtggagctactttgtgtagttggatgcaag--------------ggggattggtggttgatggttaaagtgacatcatc 368  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||| | | || |||||||||||||||||              || ||||| ||| |||||||||||||| |||||||    
T  37407910 aagatggtttggtgtagacttgtggaacaatttggtgtagttggatgcaagggaaaaagaaaagaggagattgatggctgatggttaaagtggcatcatc 37408009  T
Q  369 atcaatttgaagtcaaggtggagaa 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  37408010 atcaatttgaagtcaaggtggagaa 37408034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 32892455 - 32892658
Alignment:
Q  1 aacctttaaggtggagttacaaggttaaaagcatagtgt--gtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccg 98  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||| |||| ||||  ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  32892455 aacctttgaggtggagttgcaaggtgaaa-gcatggtgtgtgtacgcatttgaaagttgaggcagagaaagctcaacttgaggtggagttagtgacaccg 32892553  T
Q  99 ggaatggtacaattatgggggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcaagaggacgg-aggcgtttcggggtttgaagaatgtat 197  Q
      |||||||||| ||||| |  ||||||||||| ||||||||| ||||||    |||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||    
T  32892554 aaaatggtacaactatggagatcttgggtgttaggctctagttttgagcaaagaaattcttcaagaggacggaaggcctttcgaagtttgaagaatgtat 32892653  T
Q  198 ggtgt 202  Q
     ||||    
T  32892654 agtgt 32892658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 270 - 399
Target Start/End: Original strand, 40734871 - 40735011
Alignment:
Q  270 cgttccgtagttgaagagggtttagtgtatacttgtggagctactttgtgtagttggatgcaaggg-----------ggattggtggttgatggttaaag 358  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||            ||||||||| |||||||||||||    
T  40734871 cgttccgtggttgaagatggtttcgtgtatacttgtggagctacttggtgtagttggatgcaaggaaaagaaaaagaggattggtgattgatggttaaag 40734970  T
Q  359 tgacatcatcatcaatttgaagtcaaggtggagaatgttgt 399  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40734971 tggcatcatcatcaatttgaagtcaaggtggagaatgttgt 40735011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 296 - 407
Target Start/End: Original strand, 44331038 - 44331160
Alignment:
Q  296 gtatacttgtggagctactttgtgtagttggatgcaagggg-----------gattggtggttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaa 384  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44331038 gtatacttgtggagctacttggtgtagttggatacaagggaaaagaaaaggagattggtggttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaa 44331137  T
Q  385 ggtggagaatgttgtttttgcct 407  Q
    ||||||||||| ||||| |||||    
T  44331138 ggtggagaatgctgtttatgcct 44331160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 337 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 43402656 - 43402594
Alignment:
Q  337 gattggtggttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaaggtggagaatgttgt 399  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43402656 gattggtggttgatggttaaagtggcatcatcttcaatttgaaggcaaggtggagaatgttgt 43402594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 53 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 28101139 - 28100918
Alignment:
Q  53 agttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtacaattatg-ggggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgt 151  Q
    |||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||| | ||||  || ||||||||||||||||||| | ||||||| |     
T  28101139 agttaaggtagagtacgctcagcttgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaaggaccttgggtgttatgctcta-tggtgagcaagg 28101041  T
Q  152 gaattcttcaagaggacgg-aggcgtttcggggtttgaagaatgtatggtgttgcttgtgtgattacc----taaaagaccaagggtgattggatgcaag 246  Q
    || ||||||| || ||||| |||| |||||| | ||||||||||||| |     |||| | |||||||     ||||| |||||||||||||||||||||    
T  28101040 gatttcttcatgaagacggaaggcatttcggaggttgaagaatgtatagcacgacttgcgggattaccctaaaaaaaggccaagggtgattggatgcaag 28100941  T
Q  247 gtgatattcaaggaagcggaaga 269  Q
    | ||  |||||||||| ||||||    
T  28100940 gagactttcaaggaagtggaaga 28100918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 4309384 - 4309251
Alignment:
Q  9 aggtggagttacaaggttaaaagcatagtg---tgtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatgg 105  Q
    |||||||||| ||||||| ||  |||||||   |||||||| |||  ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  4309384 aggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcaacgtgaggtggagttgaacacaccggtaatgg 4309285  T
Q  106 tacaattatg-ggggccttgggtgttatgctcta 138  Q
    ||||| ||||  || ||||||||| |||||||||    
T  4309284 tacaactatgaaggaccttgggtgctatgctcta 4309251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 28138419 - 28138151
Alignment:
Q  9 aggtggagttacaaggttaaaagcatagtg---tgtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatgg 105  Q
    |||||||||| ||||||| ||  |||||||   |||||||| |||  ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  28138419 aggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcttgaggtggagttgaacacaccggtaatgg 28138320  T
Q  106 tacaattatgg-gggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcaagaggacg-gaggcgtttcggggtttgaagaatgtatggtgtt 203  Q
    ||| | |||||  | ||||||||| ||||||||| | | ||||| | || ||||||| || ||||  |||| || ||| | ||||||||||||| | |      
T  28138319 tacgactatggatgaccttgggtgctatgctcta-tggcgagcaagggatttcttcatgaagacgaaaggcattccggaggttgaagaatgtatagcgca 28138221  T
Q  204 gcttgtgtgattacc----taaaagaccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagcggaaga 269  Q
     |||| | |||||||     ||||| ||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||||    
T  28138220 acttgcgggattaccctaaaaaaaggccaagggtgattggaagcaaggagactttcaaggaagcggaaga 28138151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 340 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 37466952 - 37466899
Alignment:
Q  340 tggtggttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaaggtggagaa 393  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  37466952 tggtggttgatggttaaactgacatcatcaccaattagaagtcaaggtggagaa 37466899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 43403125 - 43403032
Alignment:
Q  104 ggtacaattatgggggccttgggtgtt-atgctctagttgtgagcatgtgaattcttcaagaggacgg-aggcgtttcggggtttgaagaatgt 195  Q
    ||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| |||| || ||||| |||||||||||    
T  43403125 ggtacaactatggaggctttgggtgtttatgctctagtagcgagcatgtgaattcttcatgaggacggaaggcattccgggggttgaagaatgt 43403032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 4309183 - 4309135
Alignment:
Q  226 ccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagcggaagacgttc 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  4309183 ccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagcgggagatgttc 4309135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 115
Target Start/End: Original strand, 42991379 - 42991488
Alignment:
Q  9 aggtggagttacaaggttaaaagcatagtg---tgtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatgg 105  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||   |||||||| |||  ||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  42991379 aggtggagtttcaaggttaaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatgg 42991478  T
Q  106 tacaattatg 115  Q
    ||||| ||||    
T  42991479 tacaactatg 42991488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 393
Target Start/End: Original strand, 4386446 - 4386499
Alignment:
Q  340 tggtggttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaaggtggagaa 393  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||    
T  4386446 tggtggttgatggttaaattgacatcatcaccaatttagagtcaaggtggagaa 4386499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 116
Target Start/End: Original strand, 27422083 - 27422160
Alignment:
Q  39 tgtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtacaattatgg 116  Q
    ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| | |||||| |||| |||||    
T  27422083 tgtacacaaatggaagttgagctagagaaagctcagcttaaggtggagttgatggcactgagaatggaacaactatgg 27422160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 1619691 - 1619605
Alignment:
Q  3 cctttaaggtggagttacaaggttaaaagcatagtg---tgtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggag 86  Q
    ||||| |||||||||| |||||| |||  ||| |||   |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  1619691 ccttttaggtggagtttcaaggtgaaagacatggtgggatgtacgcatttggaagttgaggtagagaaagttcagcttgaggtggag 1619605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 10957020 - 10956972
Alignment:
Q  226 ccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagcggaagacgttc 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  10957020 ccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgttc 10956972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 274
Target Start/End: Original strand, 43227667 - 43227715
Alignment:
Q  226 ccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagcggaagacgttc 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  43227667 ccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgttc 43227715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 265
Target Start/End: Original strand, 11169688 - 11169727
Alignment:
Q  226 ccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagcgg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11169688 ccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgg 11169727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 138
Target Start/End: Original strand, 457288 - 457420
Alignment:
Q  9 aggtggagttacaaggttaaaagcatagtg---tgtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatgg 105  Q
    |||||||||| ||||||| ||  |||||||   |||| ||| |||  ||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  457288 aggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtatgcatttgccagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatgg 457387  T
Q  106 tacaattatgggggccttgggtgttatgctcta 138  Q
    ||| | ||||  | ||||||||| |||||||||    
T  457388 tacgactatgaagaccttgggtgctatgctcta 457420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 891021 - 890919
Alignment:
Q  70 ctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtacaattatggggg-ccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcaagaggac 168  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||| | ||||| |  ||||||||| ||||||||||| ||||||| | || ||||||| || |||    
T  891021 ctcagcttgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatggagtaccttgggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagac 890922  T
Q  169 gga 171  Q
    |||    
T  890921 gga 890919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 393
Target Start/End: Original strand, 6794164 - 6794218
Alignment:
Q  340 tggtggttgatggttaaagtgacatcatcatca-atttgaagtcaaggtggagaa 393  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  6794164 tggtggttgatggttaaactgacatcatcaccacattagaagtcaaggtggagaa 6794218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 226 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 6064465 - 6064428
Alignment:
Q  226 ccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagc 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6064465 ccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagc 6064428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 220 - 265
Target Start/End: Original strand, 42991579 - 42991624
Alignment:
Q  220 aaaagaccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagcgg 265  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  42991579 aaaaggccaagggtgattggatacaaggtgatcttcaaggaagcgg 42991624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 262
Target Start/End: Original strand, 457493 - 457529
Alignment:
Q  226 ccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaag 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  457493 ccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaag 457529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 171
Target Start/End: Original strand, 3315762 - 3315927
Alignment:
Q  9 aggtggagttacaaggttaaaagcatagtg---tgtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatgg 105  Q
    |||||||||| ||||||| ||  |||||||   |||||||| |||  ||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||| |  ||||||| |||||    
T  3315762 aggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcttgagctggagtttaaaacaccggtaatgg 3315861  T
Q  106 tacaattatgg-gggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcaagaggacgga 171  Q
    ||  | ||||| || ||||||||| ||||||||| | ||||||| | || ||||||| || ||||||    
T  3315862 tatgactatggaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaagacgga 3315927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 346 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 10595590 - 10595542
Alignment:
Q  346 ttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaaggtggagaat 394  Q
    |||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  10595590 ttgatggttaaattgacatcatcactgatttgaagtcaaggtggagaat 10595542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 346 - 394
Target Start/End: Original strand, 10901349 - 10901397
Alignment:
Q  346 ttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaaggtggagaat 394  Q
    |||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  10901349 ttgatggttaaactgacatcatcactgatttgaagtcaaggtggagaat 10901397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 35918851 - 35918815
Alignment:
Q  226 ccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaag 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35918851 ccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaag 35918815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 346 - 394
Target Start/End: Original strand, 54192848 - 54192896
Alignment:
Q  346 ttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaaggtggagaat 394  Q
    |||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  54192848 ttgatggttaaactgacatcatcactgatttgaagtcaaggtggagaat 54192896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 9 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 6064671 - 6064538
Alignment:
Q  9 aggtggagttacaaggttaaaagcatagtg---tgtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatgg 105  Q
    |||||||||| ||||||| ||  |||||||   |||||||| |||  ||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||  |||| || |||||    
T  6064671 aggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacactggtaatgg 6064572  T
Q  106 tacaattatg-ggggccttgggtgttatgctcta 138  Q
    ||| | ||||  || ||||||||| |||||||||    
T  6064571 tacgactatgaaggaccttgggtgctatgctcta 6064538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 36 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 43403223 - 43403172
Alignment:
Q  36 gtgtgtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagt 87  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  43403223 gtgtgtacgcgtttggaagttgaggtggagaaatctcagcttgaggtggagt 43403172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 226 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 43422424 - 43422385
Alignment:
Q  226 ccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagcgg 265  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  43422424 ccaagggtgattggatgctaggtgatcttcaaggaagcgg 43422385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 340 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 1306660 - 1306606
Alignment:
Q  340 tggtggttgatggttaaagtgacatcatcatc-aatttgaagtcaaggtggagaa 393  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || | |||| |||||||||||||||||    
T  1306660 tggtggttgatggttaaattgacatcaccaccaaattagaagtcaaggtggagaa 1306606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 340 - 393
Target Start/End: Original strand, 2676518 - 2676572
Alignment:
Q  340 tggtggttgatggttaaagtgacatcatcatc-aatttgaagtcaaggtggagaa 393  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || | |||| |||||||||||||||||    
T  2676518 tggtggttgatggttaaattgacatcaccaccaaattagaagtcaaggtggagaa 2676572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 340 - 393
Target Start/End: Original strand, 3327786 - 3327840
Alignment:
Q  340 tggtggttgatggttaaagtgacatcatcatc-aatttgaagtcaaggtggagaa 393  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || | |||| |||||||||||||||||    
T  3327786 tggtggttgatggttaaactgacatcaccaccaaattagaagtcaaggtggagaa 3327840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 340 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 8512883 - 8512829
Alignment:
Q  340 tggtggttgatggttaaagtgacatcatcatc-aatttgaagtcaaggtggagaa 393  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || | |||| |||||||||||||||||    
T  8512883 tggtggttgatggttaaattgacatcaccaccaaattagaagtcaaggtggagaa 8512829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 67 - 256
Target Start/End: Original strand, 23634904 - 23635099
Alignment:
Q  67 aagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtacaattatgg-gggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcaagag 165  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| | ||||||||   ||||| || |||| |||||||||||||| | ||||||| | || ||||||| ||     
T  23634904 aagctcagcttgaggtggagttgaacacaccagtaatggtacggctatggaggaccttcggtgttatgctctactggtgagcaagggatttcttcatgaa 23635003  T
Q  166 gacgg-aggcgtttcggggtttgaagaatgtatggtgttgcttgtgtgattacc----taaaagaccaagggtgattggatgcaaggtgatattca 256  Q
    ||||| |||| || ||  | ||||||||||||| |    ||||| | |||||||     ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  23635004 gacggaaggcattccgaaggttgaagaatgtatagcacggcttgcgggattaccctaaaaaaaggccaagggtgattggatacaaggtgatcttca 23635099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 340 - 393
Target Start/End: Original strand, 28503263 - 28503317
Alignment:
Q  340 tggtggttgatggttaaagtgacatcatcatc-aatttgaagtcaaggtggagaa 393  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || | |||| |||||||||||||||||    
T  28503263 tggtggttgatggttaaactgacatcaccaccaaattagaagtcaaggtggagaa 28503317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 340 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 32476128 - 32476074
Alignment:
Q  340 tggtggttgatggttaaagtgacatcatcatc-aatttgaagtcaaggtggagaa 393  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || | |||| |||||||||||||||||    
T  32476128 tggtggttgatggttaaattgacatcaccaccaaattagaagtcaaggtggagaa 32476074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 341 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 10094652 - 10094599
Alignment:
Q  341 ggtggttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaaggtggagaat 394  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  10094652 ggtgattgatggttaaactggcatcatcactgatttgaagtcaaggtggagaat 10094599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 341 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 10201538 - 10201485
Alignment:
Q  341 ggtggttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaaggtggagaat 394  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  10201538 ggtgattgatggttaaactggcatcatcactgatttgaagtcaaggtggagaat 10201485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 220 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 53916633 - 53916588
Alignment:
Q  220 aaaagaccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagcgg 265  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  53916633 aaaaggccaacggtgattggatgcaaggtaatcttcaaggaagcgg 53916588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 9 - 108
Target Start/End: Original strand, 5898793 - 5898895
Alignment:
Q  9 aggtggagttacaaggttaaaagcatagtg---tgtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatgg 105  Q
    |||||||||| ||||||| ||  |||||||   |||||||| |||  ||||||||||||| |  |||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  5898793 aggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacactcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatgg 5898892  T
Q  106 tac 108  Q
    |||    
T  5898893 tac 5898895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 55 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 43422599 - 43422515
Alignment:
Q  55 ttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtacaattatgg-gggccttgggtgttatgctcta 138  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||  | |||||||  | ||||| || ||||||||| |||||||||    
T  43422599 ttgaggtagagtacgctcaacttgaggtggagttgaacacactagtaatggtaagactatggaggaccttgggtgctatgctcta 43422515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 346 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 47878730 - 47878682
Alignment:
Q  346 ttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaaggtggagaat 394  Q
    |||||||||||| || ||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  47878730 ttgatggttaaattggcatcatcactgatttgaagtcaaggtggagaat 47878682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 44)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 12740534 - 12740123
Alignment:
Q  1 aacctttaaggtggagttacaaggttaaaagcatagtgtgt--acgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccg 98  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||  || |||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  12740534 aacctttgaggtggagttgcaaggtggaa-gcatagtgtgtgtactcatttggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtagagttgatgataccg 12740436  T
Q  99 ggaatggtacaattatgggggccttgggtgtt-atgctctagttgtgagcatgtgaattcttcaagaggacggagg-cgtttcggggtttgaagaatgta 196  Q
    | |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| | | || ||||||||||||||||||    
T  12740435 gaaatggtacaactatggaggccttgggtgtttatgctctagttgtaagcacgtgaattcttcatgaggacggaagacattccggggtttgaagaatgta 12740336  T
Q  197 tggtgttgcttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagcggaagacgttccgtagttgaagagggtttagtg 296  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||    
T  12740335 tggtgtggcttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagacgttccgtggttgaagatggtttggtg 12740236  T
Q  297 tatacttgtggagctactttgtgtagttggatgcaag----------ggggattggtggttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaagg 386  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||          |||||||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  12740235 tatacttgtggagctacttggtgtagttggatgcaaggaaaagaaaaggggattactggttgatggctaaagtggcatcattatcaatttgaagtcaagg 12740136  T
Q  387 tggagaatgttgt 399  Q
    |||||||||||||    
T  12740135 tggagaatgttgt 12740123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 12748740 - 12748329
Alignment:
Q  1 aacctttaaggtggagttacaaggttaaaagcatagtgtgt--acgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccg 98  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||  || |||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  12748740 aacctttgaggtggagttgcaaggtggaa-gcatagtgtgtgtactcatttggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtagagttgatgataccg 12748642  T
Q  99 ggaatggtacaattatgggggccttgggtgtt-atgctctagttgtgagcatgtgaattcttcaagaggacggagg-cgtttcggggtttgaagaatgta 196  Q
    | |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| | | || ||||||||||||||||||    
T  12748641 gaaatggtacaactatggaggccttgggtgtttatgctctagttgtaagcacgtgaattcttcatgaggacggaagacattccggggtttgaagaatgta 12748542  T
Q  197 tggtgttgcttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagcggaagacgttccgtagttgaagagggtttagtg 296  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||    
T  12748541 tggtgtggcttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagacgttccgtggttgaagatggtttggtg 12748442  T
Q  297 tatacttgtggagctactttgtgtagttggatgcaag----------ggggattggtggttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaagg 386  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||          |||||||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  12748441 tatacttgtggagctacttggtgtagttggatgcaaggaaaagaaaaggggattactggttgatggctaaagtggcatcattatcaatttgaagtcaagg 12748342  T
Q  387 tggagaatgttgt 399  Q
    |||||||||||||    
T  12748341 tggagaatgttgt 12748329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 34571399 - 34570982
Alignment:
Q  1 aacctttaaggtggagttacaaggttaaaagcatagtgt--gtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccg 98  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| || | ||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34571399 aacctttgaggtggagttgcaaggtgaaga-catagtgtatgtacgcatttggaagttgaggtata---agctcaacttgaggtggagttggtgacaccg 34571304  T
Q  99 ggaatggtacaattatgggggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcaagaggacgga-ggcgtttcggggtttgaagaatgtat 197  Q
     ||||| ||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||| |||||    
T  34571303 agaatgatacaactatgaaggccttgggtgctatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaaggcattccggggtttgaagactgtat 34571204  T
Q  198 ggtgttgcttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagcggaagacgttccgtagttgaagagggtttagtgt 297  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||    
T  34571203 ggtctggcttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagacattccgtggttgaagagggtttggtgt 34571104  T
Q  298 atacttgtggagctactttgtgtagttggatgcaaggg----------gg--attggtggttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaag 385  Q
    | |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||          ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  34571103 agacttatggagctacttggtgtagttggatgcaagggaaaagaaaaaggaaattggtggttgatggttaaagtggcatcatcatcaatttgaagttaag 34571004  T
Q  386 gtggagaatgttgtttttgcct 407  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  34571003 gtggagaatgttgtttttgcct 34570982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 48 - 393
Target Start/End: Original strand, 8394834 - 8395189
Alignment:
Q  48 ttggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtacaattatgggggccttgggtgt-tatgctctagttgtgag 146  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  8394834 ttggaagttgaggtagcgaaagctcaacttgaggtggagttggtgactccgggaatggtacgactatggaggctttgggagtgtatgctctagttgtgag 8394933  T
Q  147 catgtgaattcttcaagaggacgga-ggcgtttcggggtttgaagaatgtatggtgttgcttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattggatgcaa 245  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  8394934 catatgaattcttcatgaggacggatggtattccggggtttgaagaatgtatggggtggcttgtgtgattacctaaaagaccaaaggtgatcggatgcaa 8395033  T
Q  246 ggtgatattcaaggaagcggaagacgttccgtagttgaagagggtttagtgtatacttgtggagctactttgtgt--agttggatgcaagg-----ggga 338  Q
    |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| || || ||| | ||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||     |  |    
T  8395034 ggtgatcttcaaggaggcgggagacgttccgtagttgaagatggcttggtgaagacttgtggagcaacttggtgtagagttggatgcaagggaaaagaaa 8395133  T
Q  339 ttggtggttgatggttaaagtgacatcatcatc-aatttgaagtcaaggtggagaa 393  Q
      |||||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  8395134 ggggtggttgatggttaaagtggcatcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaa 8395189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 54881950 - 54882191
Alignment:
Q  1 aacctttaaggtggagttacaaggttaaaagcatagtgtgt--acgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccg 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||  || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  54881950 aacctttaaggtggagtgacaaggtgaaa-gcatagtgtgtgtacacatttggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttagtgacaccg 54882048  T
Q  99 ggaatggtacaattatgggggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcaagaggac-ggaggcgtttcggggtttgaagaatgtat 197  Q
     ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || | ||| |||||||||||||    
T  54882049 agaatggtacgactatggaggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcaagagtacgggaggcattcccggggttgaagaatgtat 54882148  T
Q  198 ggtgttgcttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattgga 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  54882149 ggtgttgcttgtgtgattacctaaaagaccaagggtaattgga 54882191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 48 - 393
Target Start/End: Original strand, 5137508 - 5137873
Alignment:
Q  48 ttggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtacaattatgggggccttgggtgtt-atgctctagttgtgag 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||   ||||| ||| ||||| ||| |||||||||| |||||    
T  5137508 ttggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttggtgactccgggaatggtacggctatggaggctttgggagtttatgctctagtggtgag 5137607  T
Q  147 catgtgaattcttcaagaggacgga-ggcgtttcggggtttgaagaatgtatggtgttgcttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattggatgcaa 245  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  5137608 catgtggattcttcatgaggacggatggtattccggggtttgaagaatgtatggagtggcttgtgtgattgcctaaaaggccaagggtgatcggatgcaa 5137707  T
Q  246 ggtgatattcaaggaagcggaagacgttccgtagttgaagagggttt-------agtgtatacttgtggagctactttgtgt--agttggatgcaaggg- 335  Q
    |||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||       | || | ||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||     
T  5137708 ggtgatcttcaaggaggcgggagacgttccgtggttgaagatggtttggtgaaaaatgaagacttgtggagcaacttggtgtagagttggatgcaaggga 5137807  T
Q  336 -------ggattggtggttgatggttaaagtgacatcatcatc-aatttgaagtcaaggtggagaa 393  Q
            |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  5137808 aaaaggaagattggtggttgatggttaaagtggcatcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaa 5137873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 29 - 332
Target Start/End: Original strand, 7124103 - 7124412
Alignment:
Q  29 aagcatagtg--tgtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtacaattatgggggccttggg 126  Q
    ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||   | ||| ||| |||||    
T  7124103 aagcatagtggatgtacgcatttggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgctaactccgggaatggtacggctgtggaggctttggg 7124202  T
Q  127 tgtt-atgctctagttgtgagcatgtgaattcttcaagaggacgga-ggcgtttcggggtttgaagaatgtatggtgttgcttgtgtgattacctaaaag 224  Q
     ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||| ||  |||||||| || ||||||||    
T  7124203 agtttatgctctagtggtgagcatgtggattcttcatgaggacggaaggtattccggggtttgaagaatgtatggggtgacttgtgtgcttgcctaaaag 7124302  T
Q  225 accaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagcggaagacgttccgtagttgaagagggtttagtgtatacttgtggagctactttgtgt--ag 322  Q
    | || ||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| |||| ||||  ||    
T  7124303 atcacgggtgatcggatgcaaggtgatcttcgaggaggcgggagacgttccgtagttgaagatggtttggtgaagacttgtggagcaacttagtgtagag 7124402  T
Q  323 ttggatgcaa 332  Q
    ||||||||||    
T  7124403 ttggatgcaa 7124412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 26559034 - 26559339
Alignment:
Q  1 aacctttaaggtggagttacaaggttaaaagcatagtg--tgtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccg 98  Q
    ||||||| |||||||||| ||| || |||  |||||||  || ||||| ||| ||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||||||     
T  26559034 aacctttgaggtggagtttcaaagtgaaagtcatagtggatgcacgcatttgcaagttgatgtagagaaagctcatcgtaaggtggagttgatgacacca 26559133  T
Q  99 ggaatggtacaattatgggggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcaagaggac-ggaggcgtttcggggtttgaagaatgtat 197  Q
      |||||||||| ||||| | ||||||||| || ||||||||||| ||||    |||| || |||| ||  |||||| |||  | |||||||| ||||||    
T  26559134 taaatggtacaactatggagaccttgggtgctaggctctagttgttagcaacataatttttgaagaagataggaggcatttatgagtttgaagtatgtat 26559233  T
Q  198 ggtgttgcttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagcggaagacgttccgtagttgaagagggtttagtgt 297  Q
    ||  |  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||| || |||||||||| ||| ||||    
T  26559234 ggcatgacttgtgtgattatctaaaagatcaagggtgattggatgcaaggagatcttcacggaagcgggagacgttctgtggttgaagaggatttggtgt 26559333  T
Q  298 atactt 303  Q
    ||||||    
T  26559334 atactt 26559339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 53 - 313
Target Start/End: Original strand, 10114044 - 10114306
Alignment:
Q  53 agttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtacaattatgggggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtg 152  Q
    ||||||||| || || ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||   |    
T  10114044 agttgaggttgacaacgctcagcttgaggtggagttaaacacaccgggaatggtacgactatggagaccttgggtgttattctttagttgtgagcaatgg 10114143  T
Q  153 aattcttcaagaggacggagg-cgtttcggggtttgaagaatgtatggtgttgcttgtgtgattacc-taaaagaccaagggtgattggatgcaaggtga 250  Q
    ||||||||| || |||  | | | || ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| |||| ||    
T  10114144 aattcttcatgaagacataagacattccggagtttgaagaatgtatggcatggcttgtgggattgccctaaaataccaagggtgattggatggaaggaga 10114243  T
Q  251 tattcaaggaagcggaagacgttccgtagttgaagagggtttagtgtatacttgtggagctac 313  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | | || |||||||||||| ||||    
T  10114244 tcttcaaggaagcgggagacgttccgtggttgaagaggttatggtatatacttgtggaactac 10114306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 53 - 246
Target Start/End: Original strand, 36770653 - 36770849
Alignment:
Q  53 agttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtacaattatggggg-ccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgt 151  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||  | ||||  ||||||||   ||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||| |     
T  36770653 agttgaggtagagtaagcttagcttgaggtggagttgaacagaccgataatggtacggctatggagaaccttgggtgctatgctctagttgtgagcaagg 36770752  T
Q  152 gaattcttcaagaggacgg-aggcgtttcggggtttgaagaatgtatggtgttgcttgtgtgatta-cctaaaagaccaagggtgattggatgcaag 246  Q
    |||||||||| || ||||| |||| || ||| | |||||||||||||    | ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36770753 gaattcttcatgaagacggaaggcattccggaggttgaagaatgtataacatggcttgtgggattaccctaaaagaccaaggttgattggatgcaag 36770849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 14788611 - 14788347
Alignment:
Q  9 aggtggagttacaaggttaaaagcatagtg---tgtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatgg 105  Q
    |||||||||| ||||||| ||  |||||||   ||||| || |||  ||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  14788611 aggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacacatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatgg 14788512  T
Q  106 tacaattatgggggcc-ttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcaagaggacgga-ggcgtttcggggtttgaagaatgtatggtgtt 203  Q
    |||   ||||| || | ||||||| ||||||||| | ||||||| | || ||||||| || |||||| |||||| ||| | ||||||||||||| |        
T  14788511 tacggctatggaggacgttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcacgaagacggaaggcgttccggaggttgaagaatgtatagcacg 14788413  T
Q  204 gcttgtgtgattacct----aaaagaccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagcgg 265  Q
    ||||| | |||||||     ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14788412 gcttgcgggattaccctaaaaaaaggccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgg 14788347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 340 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 3778227 - 3778168
Alignment:
Q  340 tggtggttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaaggtggagaatgttgt 399  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3778227 tggtggttgatggttaaattgacatcaccaccaattagaagtcaaggtggagaatgttgt 3778168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 265
Target Start/End: Original strand, 16454507 - 16454724
Alignment:
Q  53 agttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtacaattatggggg-ccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgt 151  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||| | ||||| |  ||||||||| ||| | ||| | ||||||| |     
T  16454507 agttgaggtagagtacgctcagcttgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatggagtaccttgggtgctatacgcta-tggtgagcaagg 16454605  T
Q  152 gaattcttcaagaggacgga-ggcgtttcggggtttgaagaatgtatggtgttgcttgtgtgattacct----aaaagaccaagggtgattggatgcaag 246  Q
    || ||||||| || |||||| ||| ||  || | ||||||||||||| |    ||||| | |||||||     ||||| |||||||||||||||||||||    
T  16454606 gatttcttcatgaagacggaaggcattctggaggttgaagaatgtatagcacggcttgcgggattaccctaaaaaaaggccaagggtgattggatgcaag 16454705  T
Q  247 gtgatattcaaggaagcgg 265  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  16454706 gtgatcttcaaggaagcgg 16454724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 148
Target Start/End: Original strand, 47563910 - 47564053
Alignment:
Q  9 aggtggagttacaaggttaaaagcatagtg---tgtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatgg 105  Q
    |||||||||| ||||||| ||  |||||||   |||||||| |||  ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||  ||||||  |||||    
T  47563910 aggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcttgaggtggagttgaacacaccgataatgg 47564009  T
Q  106 tacaattatgg-gggccttgggtgttatgctctagttgtgagca 148  Q
    ||| | |||||  | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  47564010 tacgactatggacgaccttgggtgctatgctctagtggtgagca 47564053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 9 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 22133459 - 22133298
Alignment:
Q  9 aggtggagttacaaggttaaaagcatagtg---tgtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatgg 105  Q
    |||||||||| ||||||| ||  |||||||   |||||||| |||  ||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  22133459 aggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatgg 22133360  T
Q  106 tacaattatgg-gggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcaagagga 167  Q
    ||| | ||||| || ||||||||| ||||||||| | ||||||| | || ||||||| |||||    
T  22133359 tacgactatggaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgagga 22133298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 9 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 22801950 - 22801686
Alignment:
Q  9 aggtggagttacaaggttaaaagcatagtg---tgtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatgg 105  Q
    |||||||||| ||||||| ||  |||||||   ||||| || |||  ||||||||||||  | ||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  22801950 aggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacacatttgctagttgaggtagaatacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatgg 22801851  T
Q  106 tacaattatgg-gggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcaagaggacgg-aggcgtttcggggtttgaagaatgtatggtgtt 203  Q
    ||| | ||||| || ||||||||| ||||||||| | ||||||| | || ||||||| || ||||| |||| || ||| | ||||||||||||| |        
T  22801850 tacgactatggaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattccggaggttgaagaatgtatagcacg 22801752  T
Q  204 gcttgtgtgattacc----taaaagaccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagcgg 265  Q
    ||||| | |||||||     ||||| ||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||    
T  22801751 gcttgcgggattaccctaaaaaaaggccaagggtgattggatgcaaggaaaccttcaaggaagcgg 22801686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 9 - 265
Target Start/End: Original strand, 24879667 - 24879930
Alignment:
Q  9 aggtggagttacaaggttaaaagcatagtg---tgtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatgg 105  Q
    |||||||||| ||||||| ||  |||||||   |||||||| |||  |||| |||||||| | ||||| |  |||||||||||||  ||||||| |||||    
T  24879667 aggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttaaggtagagtacgctcagcgagaggtggagttgaacacaccggtaatgg 24879766  T
Q  106 tacaattatgg-gggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcaagaggacgg-aggcgtttcggggtttgaagaatgtatggtgtt 203  Q
    ||| | ||||| || ||||||||| ||||||||| | ||||||| | || ||||||| || ||||| | || || ||| | ||||||||||||| |        
T  24879767 tacgactatggaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaatgcattccggaggttgaagaatgtatagcacg 24879865  T
Q  204 gcttgtgtgattacc----taaaagaccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagcgg 265  Q
    ||||| | |||||||     ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  24879866 gcttgcgggattaccgtaaaaaaaggccaagggtgattggatgcaaggtaatattc-aggaagcgg 24879930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 53 - 265
Target Start/End: Original strand, 36379427 - 36379645
Alignment:
Q  53 agttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtacaattatgg-gggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgt 151  Q
    ||||||||||||| | |||||  ||||||||||||| |  |||||||||||||||| | ||||| || |||||| || ||||||||||| |||||||  |    
T  36379427 agttgaggtagagtacgctcagtttgaggtggagttaaacacaccgggaatggtacgactatggaggaccttggatgctatgctctagtggtgagca-at 36379525  T
Q  152 gaa-ttcttcaagaggacgg-aggcgtttcggggtttgaagaatgtatggtgttgcttgtgtgattacc----taaaagaccaagggtgattggatgcaa 245  Q
    ||| ||||||| ||  |||| |||| || | | | ||||||||||||| |    ||||| | |||||||     ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  36379526 gaatttcttcatgaaaacggaaggcattccagagattgaagaatgtatagcacggcttgcgggattaccctaaaaaaaggccaagggtgattgaatgcaa 36379625  T
Q  246 ggtgatattcaaggaagcgg 265  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  36379626 ggtgatcttcaaggaagcgg 36379645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 12401902 - 12401673
Alignment:
Q  39 tgtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtacaattatgg-gggccttgggtgttatgctct 137  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||   |||||| |||||||||  ||||| || ||||||||| ||||||||    
T  12401902 tgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcttgaggtggagttgaactcaccggtaatggtacagctatggaggaccttgggtgctatgctct 12401803  T
Q  138 agttgtgagcatgtgaattcttcaagaggac-ggaggcgtttcggggtttgaagaatgtatggtgttgcttgtgtgattacc----taaaagaccaaggg 232  Q
    | | ||||||| | || ||||||| || ||| | |||  || ||| | ||||||||||||| |     |||| | |||||||     ||||| |||||||    
T  12401802 a-tggtgagcaagggatttcttcatgaagacagaaggaattccggaggttgaagaatgtatagcacgacttgcgggattaccctaaaaaaaggccaaggg 12401704  T
Q  233 tgattggatgcaaggtgatattcaaggaagc 263  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  12401703 tgattggatgtaaggtgatcttcaaggaagc 12401673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 9175350 - 9175248
Alignment:
Q  9 aggtggagttacaaggttaaaagcatagtg---tgtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatgg 105  Q
    |||||||||| ||||||| ||  |||||||   |||||||| |||  ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  9175350 aggtggagtttcaaggttgaagacatagtgagatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcaacgtgaggtggagttgaacacaccggtaatgg 9175251  T
Q  106 tac 108  Q
    |||    
T  9175250 tac 9175248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 340 - 399
Target Start/End: Original strand, 6742834 - 6742893
Alignment:
Q  340 tggtggttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaaggtggagaatgttgt 399  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  6742834 tggtggatgatggttaaaatgacatcaccacaaattagaagtcaaggtggagaatgttgt 6742893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 16932820 - 16932781
Alignment:
Q  226 ccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagcgg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16932820 ccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgg 16932781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 66 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 18535960 - 18535877
Alignment:
Q  66 aaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtacaattatgg-gggccttgggtgttatgctctagttgtgagca 148  Q
    |||||||| |||||||||||||| |  ||||| |||||||||| | ||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  18535960 aaagctcagcttgaggtggagtttaacacaccaggaatggtacgactatggaggaccttgggtgctatgctctagtggtgagca 18535877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 22133253 - 22133214
Alignment:
Q  226 ccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagcgg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22133253 ccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgg 22133214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 18535797 - 18535716
Alignment:
Q  226 ccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagcggaagacgttccgtagttgaagagggtttagtgtatacttgtgga 308  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||| || |||| |||||||||| | | ||| |||||||||||    
T  18535797 ccaagggtgattggatgcaaggagatcttcaaggaagtgggagatgtcccgt-gttgaagaggttatggtggatacttgtgga 18535716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 341 - 393
Target Start/End: Original strand, 7124434 - 7124487
Alignment:
Q  341 ggtggttgatggttaaagtgacatcatcatc-aatttgaagtcaaggtggagaa 393  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  7124434 ggtggttgatggttaaagtggcatcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaa 7124487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 6 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 12399663 - 12399576
Alignment:
Q  6 ttaaggtggagttacaaggttaaaagcatagtg---tgtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttga 90  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||  |||||||   |||||||| |||  ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  12399663 ttaaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcttgaggtggagttga 12399576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 226 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 22781409 - 22781372
Alignment:
Q  226 ccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagc 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22781409 ccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagc 22781372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 76 - 246
Target Start/End: Original strand, 47565833 - 47566005
Alignment:
Q  76 ttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtacaattatggggg-ccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcaagaggacgga-gg 173  Q
    |||||||| ||||||   ||||||||||||||  | ||||| |  ||||| ||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||| || |||||| ||    
T  47565833 ttgaggtgaagttgaactcaccgggaatggtatgactatggagaaccttgagtgatatgctcta-ttgtgagcaagggaattcttcatgaagacggaagg 47565931  T
Q  174 cgtttcggggtttgaagaatgtatggtgttgcttgtgtgattacc-taaaagaccaagggtgattggatgcaag 246  Q
    | ||  || | |||||| |||||| |  | ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47565932 cattctggaggttgaaggatgtatagcatggcttgtgggattaccctaaaagaccaatggtgattggatgcaag 47566005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 346 - 394
Target Start/End: Original strand, 4569674 - 4569722
Alignment:
Q  346 ttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaaggtggagaat 394  Q
    |||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  4569674 ttgatggttaaattggcatcatcactaatttgaagtcaaggtggagaat 4569722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 230 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 9175138 - 9175094
Alignment:
Q  230 gggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagcggaagacgttc 274  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  9175138 gggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgttc 9175094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 399
Target Start/End: Original strand, 16628290 - 16628350
Alignment:
Q  340 tggtggttgatggttaaagtgacatcatcatc-aatttgaagtcaaggtggagaatgttgt 399  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || | |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  16628290 tggtggttgatggttaaattgacatcaccaccaaattagaagtcgaggtggagaatgttgt 16628350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 22045387 - 22045339
Alignment:
Q  226 ccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagcggaagacgttc 274  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  22045387 ccaagggtgattgaatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgttc 22045339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 220 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 12396774 - 12396731
Alignment:
Q  220 aaaagaccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagc 263  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  12396774 aaaaggccaagggtgattggatgtaaggtgatcttcaaggaagc 12396731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 340 - 393
Target Start/End: Original strand, 9228630 - 9228684
Alignment:
Q  340 tggtggttgatggttaaagtgacatcatcatc-aatttgaagtcaaggtggagaa 393  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || | |||| |||||||||||||||||    
T  9228630 tggtggttgatggttaaactgacatcaccaccaaattagaagtcaaggtggagaa 9228684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 227 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 11007239 - 11007205
Alignment:
Q  227 caagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaa 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11007239 caagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaa 11007205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 9 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 11007445 - 11007313
Alignment:
Q  9 aggtggagttacaaggttaaaagcatagtg---tgtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatgg 105  Q
    |||||||||| ||||||| ||  |||||||   |||||||| ||   ||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  11007445 aggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcattttctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatgg 11007346  T
Q  106 tacaattatgggggccttgggtgttatgctcta 138  Q
    ||| | ||||    ||||||||| |||||||||    
T  11007345 tacgactatgaaaaccttgggtgctatgctcta 11007313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 9 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 22781614 - 22781482
Alignment:
Q  9 aggtggagttacaaggttaaaagcatagtg---tgtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatgg 105  Q
    |||||||||| ||||||| ||  |||||||   ||||| || |||  ||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||  |||| || |||||    
T  22781614 aggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacacatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacactggtaatgg 22781515  T
Q  106 tacaattatgggggccttgggtgttatgctcta 138  Q
    ||| | ||||  | ||||||||| |||||||||    
T  22781514 tacgactatgaagaccttgggtgctatgctcta 22781482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 341 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 22133036 - 22132982
Alignment:
Q  341 ggtggttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaaggtggagaatgttgt 399  Q
    ||||||||||||||    |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  22133036 ggtggttgatggtt----tgacatcatcacaaatttggagtcaaggtggagaatgttgt 22132982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 220 - 265
Target Start/End: Original strand, 47564130 - 47564175
Alignment:
Q  220 aaaagaccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagcgg 265  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||    
T  47564130 aaaaggccaagggtgattggatgcaaggaaattttcaaggaagcgg 47564175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 341 - 393
Target Start/End: Original strand, 3792432 - 3792484
Alignment:
Q  341 ggtggttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaaggtggagaa 393  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||  |||||||||||||||    
T  3792432 ggtggttgatggttaaattgacatcaccactaatttagagtcaaggtggagaa 3792484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 346 - 394
Target Start/End: Original strand, 4884482 - 4884530
Alignment:
Q  346 ttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaaggtggagaat 394  Q
    |||||||||||| |||||||||||   |||||||||||| |||||||||    
T  4884482 ttgatggttaaaatgacatcatcactgatttgaagtcaatgtggagaat 4884530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 339 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 14788075 - 14788016
Alignment:
Q  339 ttggtggttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaaggtggagaatgttgt 399  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||   |||||  |||||||||||||||||||||    
T  14788075 ttggtggttgatg-ttaaattgacatcatcgctaatttagagtcaaggtggagaatgttgt 14788016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 9 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 22045591 - 22045489
Alignment:
Q  9 aggtggagttacaaggttaaaagcatagtg---tgtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatgg 105  Q
    |||||||||| ||||||| ||  |||||||   |||||||| |||  ||||||| ||||| | ||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  22045591 aggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgagatagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatgg 22045492  T
Q  106 tac 108  Q
    |||    
T  22045491 tac 22045489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 218; Significance: 1e-119; HSPs: 35)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 36 - 399
Target Start/End: Original strand, 13487427 - 13487802
Alignment:
Q  36 gtgtgtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtacaattatgggggccttgggtgttatgct 135  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  13487427 gtgtgtacgcattcggaagttgaggtagagaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggaggccttgggtgttatgct 13487526  T
Q  136 ctagttgtgagcatgtgaattcttcaagaggacgga-ggcgtttcggggtttgaagaatgtatggtgttgcttgtgtgattacctaaaagaccaagggtg 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13487527 ctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaaggcattccggggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgattacctaaaagaccaagggtg 13487626  T
Q  235 attggatgcaaggtgatattcaaggaagcggaagacgttccgtagttgaagagggtttagtgtatacttgtggagctactttgtgtagttggatgcaagg 334  Q
    ||||  ||||||||||| |||||| ||| || ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |    
T  13487627 attgagtgcaaggtgatcttcaagaaagtgggagacgttccatggttgaagagggtttggtgtatacttgtggagctacttggtgtacttggatgcaaag 13487726  T
Q  335 g-----------ggattggtggttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaaggtggagaatgttgt 399  Q
    |            |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13487727 gaaaagaaaagaagattggtggttgatggttaaagtggcatcatcatcaatttgaagtcaaggtggagaatgttgt 13487802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 37 - 393
Target Start/End: Original strand, 535138 - 535500
Alignment:
Q  37 tgtgtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtacaattatgggggccttgggtgtt-atgct 135  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||    
T  535138 tgtgtacgcatttggaagttgaggtagagaaagctcaacttaaggtggagttgaggatatcgggaatggtacaactatggaggccttgggtgtttatgct 535237  T
Q  136 ctagttgtgagcatgtgaattcttcaagaggacgga-ggcgtttcggggtttgaagaatgtatggtgttgcttgtgtgattacctaaaagaccaagggtg 234  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  535238 ctagttatgagcatgtgaattcttcatggggacggaaggcattccggggtttgaagaatgtatggtgtggcttgtgtgattacctaaaagaccaagggtg 535337  T
Q  235 attggatgcaaggtgatattcaaggaagcggaagacgttccgtagttgaagagggtttagtgtatacttgtggagctactttgtgtagttggatgcaagg 334  Q
    ||| ||||||| ||||| ||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  535338 attagatgcaatgtgatcttcgaggaagtgggagacgttccgtggttgaagagggtttggtgtatacttgtggagctacttggtgtagttggatggaagg 535437  T
Q  335 ----gggattggtggttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaaggtggagaa 393  Q
        || |   | | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  535438 aaaaggaaaaagggattggtggttaaagtggcatcatcatcaatttgaaggcaaggtggagaa 535500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 48 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 42427185 - 42426827
Alignment:
Q  48 ttggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtacaattatgggggccttgggtgtt-atgctctagttgtgag 146  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  42427185 ttggaagttgaggaagagaaagctcaacttgaggtggagtggatgacaccgagaatggtacaactatggaggccttgggtgtttatgctctagctgtgag 42427086  T
Q  147 catgtgaattcttcaagaggacgga-ggcgtttcggggtttgaagaatgtatggtgttgcttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattggatgcaa 245  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||| ||  |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42427085 catgtgaattcttcatgatgacggaaggcattctggggtttgaagaatatatgatgtggcttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattggatgcaa 42426986  T
Q  246 ggtgatattcaaggaagcggaagacgttccgtagttgaagagggtttagtgtatacttgtggagctactttgtgtagttggatgcaagg----------- 334  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||||||               
T  42426985 ggtgatcttcaaggaaacgggagacgttccgtggttgaagagggtttggtgtagacttgtgaagctacttggtgtagatggatgcaagggaaaagaaaaa 42426886  T
Q  335 gggattggtggttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaaggtggagaa 393  Q
    || |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42426885 ggaattggtggttgatacttaaagtggcatcatcatcaatttgaattcaaggtggagaa 42426827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 48 - 335
Target Start/End: Original strand, 26174194 - 26174483
Alignment:
Q  48 ttggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtacaattatgggggccttgggtgtt-atgctctagttgtgag 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  26174194 ttggaagttgaggtagagaaagctcaacttaaggtggagttgatgacaccgggaatggtatgactatggaggctttgggagtttatgctctagttgtgag 26174293  T
Q  147 catgtgaattcttcaagaggacgga-ggcgtttcggggtttgaagaatgtatggtgttgcttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattggatgcaa 245  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26174294 catgtgaattcttcatgaggacggaaggtattccggggtttgaagaatgtatggtgtggcttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgatcggatgcaa 26174393  T
Q  246 ggtgatattcaaggaagcggaagacgttccgtagttgaagagggtttagtgtatacttgtggagctactttgtgtagttggatgcaaggg 335  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||| || |||||| |||||||||    
T  26174394 ggtgatcttcgaggaagcgggagacgttccgtggttgaagatggtttggtgtagacttgtggagcaacttggtatagttgaatgcaaggg 26174483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 48 - 393
Target Start/End: Original strand, 16408714 - 16409075
Alignment:
Q  48 ttggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtacaattatgggggccttgggtgtt-atgctctagttgtgag 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| | | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  16408714 ttggaagttgaggtagagaaagctcaacttaaggtggagttgatgacaccgggaatggtatgactatggagactttgggtgtttatgctctagttgtgag 16408813  T
Q  147 catgtgaattcttcaagaggacgga-ggcgtttcggggtttgaagaatgtatggtgttgcttgtgtgattacctaaaa-gaccaagggtgattggatgca 244  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||   | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  16408814 catgtgaattcttcatgaggacggaaggtactccggggtttgaagaatgtatggtgtggcttgtgtgattacctaaaaagaccaagggtgatcggatgca 16408913  T
Q  245 aggtgatattcaaggaagcggaagacgttccgtagttgaagagggtttagtgtatacttgtggagctactttgtgtagttggatgc------------aa 332  Q
    ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||| |||||  |||||||||| |||| || |||||| ||||            ||    
T  16408914 aggtgatcttcgaggaagcgggagacgttccgtggttgaaggtggtttggtgtagtcttgtggagcaacttggtatagttgaatgcaagggaaaagaaaa 16409013  T
Q  333 gggggattggtggttgatggttaaagtgacatcatcatc-aatttgaagtcaaggtggagaa 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||    
T  16409014 gggggattggtggttgatggttaaagtgacatcaccaccaaattagaagtcaaggtggagaa 16409075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 48 - 393
Target Start/End: Original strand, 16545856 - 16546214
Alignment:
Q  48 ttggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtacaattatgggggccttgggtgtt-atgctctagttgtgag 146  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||    
T  16545856 ttggaagttgaggtagcgaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtacggctatgggggctttgggagtttatgctctagtggtgag 16545955  T
Q  147 catgtgaattcttcaagaggacgga-ggcgtttcggggtttgaagaatgtatggtgttgcttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattggatgcaa 245  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||  || ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  16545956 catgtgaattcttcatgaggacggaaggtattccggggtttgaagaatgtttggggtggcttgtgtgattgcctaaaagaccaaaggtgatcggatgcaa 16546055  T
Q  246 ggtgatattcaaggaagcggaagacgttccgtagttgaagagggtttagtgtatacttgtggagctactttgtgt--agttggatgcaaggg-------- 335  Q
    |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||            
T  16546056 ggtgatcttcaaggaggcgggagacgttccgtagttgaagatggtttggtgaagacttgtggagcaacttggtgtagagttggatgcaagggaaaaaaga 16546155  T
Q  336 ggattggtggttgatggttaaagtgacatcatcatc-aatttgaagtcaaggtggagaa 393  Q
      |  |||||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  16546156 aaaggggtggttgatggttaaagtggcatcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaa 16546214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 48 - 393
Target Start/End: Original strand, 29721787 - 29722150
Alignment:
Q  48 ttggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaa-tggtacaattatgggggccttgggtgtt--atgctctagttgtg 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  | ||||| ||| ||||| |||  ||||||||||||||    
T  29721787 ttggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccggaaaatggtatgactatggaggctttgggagttttatgctctagttgtg 29721886  T
Q  145 agcatgtgaattcttcaagaggacgga-ggcgtttcggggtttgaagaatgtatggtgttgcttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattggatgc 243  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  29721887 agcatgcgaattcttcatgaggacggaaggtattccggggtttgaagaatgtatggggtggcttgtgtgattacctaaaacaccaagggtgatcggatgc 29721986  T
Q  244 aaggtgatattcaaggaagcggaagacgttccgtagttgaagagggtttagtgtatacttgtggagctactttgtgtagttggatgcaa----------- 332  Q
    |||||||| ||| ||||  ||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||  |||||||||| |||| || |||||||||||||               
T  29721987 aaggtgatcttcgaggagacgggagacgttccgtggttgaagatggtttggtgtagtcttgtggagcaacttggtatagttggatgcaagggaaaacaaa 29722086  T
Q  333 --gggggattggtggttgatggttaaagtgacatcatcatc-aatttgaagtcaaggtggagaa 393  Q
      ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  29722087 aggggagattggtggttgatggttaaagtggcatcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaa 29722150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 40 - 393
Target Start/End: Original strand, 40381524 - 40381887
Alignment:
Q  40 gtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtacaattatgggggccttgggtgtt-atgctcta 138  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| |||   ||||| ||| ||||| ||| ||||||||    
T  40381524 gtacgcatttggaagttgaggcagagaaagctcaacttgaggtggagttggtaactccgggaatgttacggctatggaggctttgggagtttatgctcta 40381623  T
Q  139 gttgtgagcatgtgaattcttcaagaggacgga-ggcgtttcggggtttgaagaatgtatggtgttgcttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgatt 237  Q
    || ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  40381624 gtggtgagcatgtggattcttcatgaggacggaaggtattccggggtttgaagaatgtatggggtgacttgtgtgattgcctaaaagaccaagggtgatc 40381723  T
Q  238 ggatgcaaggtgatattcaaggaagcggaagacgttccgtagttgaagagggtttagtgtatacttgtggagctactttgtgt--agttggatgcaagg- 334  Q
    |||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||     
T  40381724 ggatgcaaggtgatcttcgaggaggcgggagacgttccgtagttgaagatggtttggtgaagacttgtggagcaacttggtgtagagttggatgcaaggg 40381823  T
Q  335 ----gggattggtggttgatggttaaagtgacatcatcatc-aatttgaagtcaaggtggagaa 393  Q
        |  |  |||||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  40381824 aaaagaaaggggtggttgatggttaaagtggcatcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaa 40381887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 199
Target Start/End: Original strand, 13295014 - 13295207
Alignment:
Q  9 aggtggagttacaaggttaaaagcatagtgt--gtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggt 106  Q
    |||||||||| |||||| |||  |||||||   |||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||   ||||||    
T  13295014 aggtggagttgcaaggtgaaagacatagtggaagtactcatttggaagttgaggtagagaaagctcagcttgaggtggagatgatgacaccaaaaatggt 13295113  T
Q  107 acaattatgggggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcaagaggacgga-ggcgtttcggggtttgaagaatgtatgg 199  Q
    || | ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||  |||| ||||||||| | | | |||||| ||||||| |||||||||    
T  13295114 acgactatggagaccttgggtgctatgctctagttgtgagcaagggagctctttaagaggacgaacgacatttcggagtttgaaaaatgtatgg 13295207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 269
Target Start/End: Original strand, 10756501 - 10756544
Alignment:
Q  226 ccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagcggaaga 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10756501 ccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcggaaga 10756544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 9 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 15355726 - 15355594
Alignment:
Q  9 aggtggagttacaaggttaaaagcatagtg---tgtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatgg 105  Q
    |||||||||| ||||||| ||  |||||||   |||||||| |||  ||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  15355726 aggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatgg 15355627  T
Q  106 tacaattatgggggccttgggtgttatgctcta 138  Q
    ||| | ||||  | ||||||||| |||||||||    
T  15355626 tacgactatgaagaccttgggtgctatgctcta 15355594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 9 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 18510592 - 18510328
Alignment:
Q  9 aggtggagttacaaggttaaaagcatagtg---tgtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatgg 105  Q
    |||||||||| ||||||| ||  |||||||   |||||||| |||  ||||||||||||| |  ||||   ||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  18510592 aggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtactctcagtgtgaggtggagttgaacacaccggtaatgg 18510493  T
Q  106 tacaattatgg-gggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcaagaggacgg-aggcgtttcggggtttgaagaatgtatggtgtt 203  Q
    ||| | ||||| || ||||||||| ||||||||| | ||||||| | || ||||||| || ||||| |||| || ||| | || |||||||||| |        
T  18510492 tacgactatggaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattccggaggttaaagaatgtatagcacg 18510394  T
Q  204 gcttgtgtgattacc----taaaagaccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagcgg 265  Q
    ||||| | |||||||     ||||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  18510393 gcttgcgggattaccctaaaaaaaggccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaagcgg 18510328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 9 - 138
Target Start/End: Original strand, 23666449 - 23666581
Alignment:
Q  9 aggtggagttacaaggttaaaagcatagtg---tgtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatgg 105  Q
    |||||||||| ||||||| ||  |||||||   |||||||| |||  ||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  23666449 aggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatgg 23666548  T
Q  106 tacaattatgggggccttgggtgttatgctcta 138  Q
    ||| | ||||  | ||||||||| |||||||||    
T  23666549 tacgactatgaagaccttgggtgctatgctcta 23666581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 9 - 261
Target Start/End: Original strand, 27911533 - 27911793
Alignment:
Q  9 aggtggagttacaaggttaaaagcatagtg---tgtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatgg 105  Q
    |||||||||| ||||||| ||  |||||||   |||||||| |||  |||| |||||||| | ||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  27911533 aggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttaaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatgg 27911632  T
Q  106 tacaattatgg-gggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcaagaggacgg-aggcgtttcggggtttgaagaatgtatggtgtt 203  Q
    ||| | ||||| || ||||||||| ||||||||| | ||||||| | || ||||||| || ||||| |||| ||  || | ||||||||||||| |        
T  27911633 tacgactatggaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattctggaggttgaagaatgtatagcacg 27911731  T
Q  204 gcttgtgtgattacc----taaaagaccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaa 261  Q
    ||||| | |||||||     ||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  27911732 gcttgcgggattaccctaaaaaaaggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggaa 27911793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 9 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 34478296 - 34478164
Alignment:
Q  9 aggtggagttacaaggttaaaagcatagtg---tgtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatgg 105  Q
    |||||||||| ||||||| ||  |||||||   |||||||| |||  ||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  34478296 aggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatgg 34478197  T
Q  106 tacaattatgggggccttgggtgttatgctcta 138  Q
    ||| | ||||  | ||||||||| |||||||||    
T  34478196 tacgactatgaagaccttgggtgctatgctcta 34478164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 169
Target Start/End: Original strand, 32608817 - 32608866
Alignment:
Q  120 ccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcaagaggacg 169  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  32608817 ccttgggtgttatgctctatttgtgagcaagagaattcttcaagaggacg 32608866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 138
Target Start/End: Original strand, 6746506 - 6746606
Alignment:
Q  39 tgtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtacaattatgg-gggccttgggtgttatgctct 137  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||| | ||||| || ||||||||| ||||||||    
T  6746506 tgtacgcatttgctagttgaggtagagtatgctcaccgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatggaggaccttgggtgctatgctct 6746605  T
Q  138 a 138  Q
    |    
T  6746606 a 6746606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 9 - 138
Target Start/End: Original strand, 31544135 - 31544268
Alignment:
Q  9 aggtggagttacaaggttaaaagcatagtg---tgtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatgg 105  Q
    |||||||||| ||||||| ||  |||||||   |||||||| |||  ||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  31544135 aggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatgg 31544234  T
Q  106 tacaattatg-ggggccttgggtgttatgctcta 138  Q
    ||| | ||||  || ||||||||| |||||||||    
T  31544235 tacgactatgaaggaccttgggtgctatgctcta 31544268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 138
Target Start/End: Original strand, 10756296 - 10756428
Alignment:
Q  9 aggtggagttacaaggttaaaagcatagtg---tgtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatgg 105  Q
    |||||||||| ||||||| ||  |||||||   |||||||| |||  ||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||   |||||| |||||    
T  10756296 aggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtatgctcagcgtgaggtggagttgaactcaccggtaatgg 10756395  T
Q  106 tacaattatgggggccttgggtgttatgctcta 138  Q
    ||| | ||||  | ||||||||| |||||||||    
T  10756396 tacgactatgaagaccttgggtgctatgctcta 10756428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 9 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 13694075 - 13693987
Alignment:
Q  9 aggtggagttacaaggttaaaagcatagtg--tgtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgaca 95  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||||  | || ||| || ||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  13694075 aggtggagttacaaggtgaaagtcatagtggatttatgcattttgaattttaggtagagaaagctcaacttgaggtagagttggtgaca 13693987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 226 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 34478091 - 34478054
Alignment:
Q  226 ccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagc 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34478091 ccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagc 34478054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 15355524 - 15355476
Alignment:
Q  226 ccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagcggaagacgttc 274  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  15355524 ccaagagtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgttc 15355476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 274
Target Start/End: Original strand, 23666650 - 23666698
Alignment:
Q  226 ccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagcggaagacgttc 274  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  23666650 ccaagagtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgttc 23666698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 264
Target Start/End: Original strand, 18468330 - 18468368
Alignment:
Q  226 ccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagcg 264  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  18468330 ccaagggtgattagatgcaaggtgatcttcaaggaagcg 18468368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 340 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 27445622 - 27445568
Alignment:
Q  340 tggtggttgatggttaaagtgacatcatcatc-aatttgaagtcaaggtggagaa 393  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || | |||| |||||||||||||||||    
T  27445622 tggtggttgatggttaaactgacatcaccaccaaattagaagtcaaggtggagaa 27445568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 340 - 393
Target Start/End: Original strand, 28807020 - 28807074
Alignment:
Q  340 tggtggttgatggttaaagtgacatcatcatc-aatttgaagtcaaggtggagaa 393  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || | |||| |||||||||||||||||    
T  28807020 tggtggttgatggttaaactgacatcaccaccaaattagaagtcaaggtggagaa 28807074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 340 - 393
Target Start/End: Original strand, 31401290 - 31401344
Alignment:
Q  340 tggtggttgatggttaaagtgacatcatcatc-aatttgaagtcaaggtggagaa 393  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || | |||| |||||||||||||||||    
T  31401290 tggtggttgatggttaaattgacatcaccaccaaattagaagtcaaggtggagaa 31401344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 340 - 393
Target Start/End: Original strand, 37560891 - 37560945
Alignment:
Q  340 tggtggttgatggttaaagtgacatcatcatc-aatttgaagtcaaggtggagaa 393  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || | |||| |||||||||||||||||    
T  37560891 tggtggttgatggttaaattgacatcaccaccaaattagaagtcaaggtggagaa 37560945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 340 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 43592910 - 43592856
Alignment:
Q  340 tggtggttgatggttaaagtgacatcatcatc-aatttgaagtcaaggtggagaa 393  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || | |||| |||||||||||||||||    
T  43592910 tggtggttgatggttaaactgacatcaccaccaaattagaagtcaaggtggagaa 43592856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 340 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 43625704 - 43625650
Alignment:
Q  340 tggtggttgatggttaaagtgacatcatcatc-aatttgaagtcaaggtggagaa 393  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || | |||| |||||||||||||||||    
T  43625704 tggtggttgatggttaaactgacatcaccaccaaattagaagtcaaggtggagaa 43625650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 220 - 265
Target Start/End: Original strand, 659339 - 659384
Alignment:
Q  220 aaaagaccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagcgg 265  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  659339 aaaaggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggaagcgg 659384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 222 - 263
Target Start/End: Original strand, 6746675 - 6746716
Alignment:
Q  222 aagaccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagc 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  6746675 aagaccaagggtgattggatgcaaggtgaccttcaaagaagc 6746716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 222 - 263
Target Start/End: Original strand, 31544337 - 31544378
Alignment:
Q  222 aagaccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagc 263  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  31544337 aagaccaatggtgattggatgcaaggagatcttcaaggaagc 31544378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 346 - 394
Target Start/End: Original strand, 25452097 - 25452145
Alignment:
Q  346 ttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaaggtggagaat 394  Q
    |||||||||||| || ||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  25452097 ttgatggttaaattggcatcatcactgatttgaagtcaaggtggagaat 25452145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 33768826 - 33768774
Alignment:
Q  342 gtggttgatggttaaagtgacatcatcatc-aatttgaagtcaaggtggagaa 393  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || | |||| |||||||||||||||||    
T  33768826 gtggttgatggttaaattgacatcaccaccaaattagaagtcaaggtggagaa 33768774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 42)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 393
Target Start/End: Original strand, 776439 - 776845
Alignment:
Q  1 aacctttaaggtggagttacaaggttaaaagcatagtgtgta--cgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccg 98  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||  ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  776439 aacctttgaggtggagttgcaaggtgaag-gcatagtgtgtatacgcatttggaagttgaggtagataaagctcaacttgaggtggagttgataacaccg 776537  T
Q  99 ggaatggtacaattatgggggccttgggtgtt-atgctctagttgtgagcatgtgaattcttcaagaggacgga-ggcgtttcggggtttgaagaatgta 196  Q
    | |||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||    
T  776538 gaaatggtaccactatggaggccttgggtgtttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaaggcattccggggtttgaagactgta 776637  T
Q  197 tggtgttgcttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagcggaagacgttccgtagttgaagagggtttagtg 296  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| |||    
T  776638 tggtgtggcttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagacgttccgtggttgaagagattttggtg 776737  T
Q  297 tatacttgtggagctactttgtgtagttggatgcaag-----------ggggattggtggttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaag 385  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||           || || ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||  |||||||    
T  776738 tagacttgtggagctacttggtgtagttggatgcaaggaaatgcaaaaggagaatggtggttgatggttaaagttccatcaccatcaatttagagtcaag 776837  T
Q  386 gtggagaa 393  Q
    ||||||||    
T  776838 gtggagaa 776845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 28221854 - 28221517
Alignment:
Q  1 aacctttaaggtggagttacaaggttaaaagcatagtgtgt--acgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccg 98  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||  |||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28221854 aacctttgaggtggagttgcaaggtgaag-gcatagtgtgtgtatgcatttggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccg 28221756  T
Q  99 ggaatggtacaattatgggggccttgggtgtt-atgctctagttgtgagcatgtgaattcttcaagaggacgga-ggcgtttcggggtttgaagaatgta 196  Q
    ||||||||| || ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| || ||||||||||| ||||||    
T  28221755 ggaatggtataactatggaggcctttggtgtttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacagaaggcattacggggtttgaataatgta 28221656  T
Q  197 tggtgttgcttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagcggaagacgttccgtagttgaagagggtttagtg 296  Q
    | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||    
T  28221655 ttgtgtgacttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagacgttccgtggttaaagagggtttggtg 28221556  T
Q  297 tatacttgtggagctactttgtgtagttggatgcaaggg 335  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28221555 tatacttgtggagctacttggtgtagttggatgcaaggg 28221517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 50168152 - 50167815
Alignment:
Q  1 aacctttaaggtggagttacaaggttaaaagcatagtgtgt--acgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccg 98  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||  |||||||||||  || || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50168152 aacctttgaggtggagttgcaaggtgaag-gcatagtgtgtgtacacatttggaagttgaggtagagaaaactcaacttgaggtggagttgatgacaccg 50168054  T
Q  99 ggaatggtacaattatgggggccttgggtgtt-atgctctagttgtgagcatgtgaattcttcaagaggacgga-ggcgtttcggggtttgaagaatgta 196  Q
    | |||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| || ||||||||||| ||||||    
T  50168053 gaaatggtacgactatggaggccttgggtgtttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacgaaaggcattccggggtttgaaaaatgta 50167954  T
Q  197 tggtgttgcttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagcggaagacgttccgtagttgaagag-ggtttagt 295  Q
    || | | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||   ||| ||    
T  50167953 tgatatggcttgtgtgattacctaaaagaccaagggttattggatgcaaggtgatattcaaggaagcgggagacgttccgtggttgaagagatttttggt 50167854  T
Q  296 gtatacttgtggagctactttgtgtagttggatgcaagg 334  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  50167853 gtagacttgtggagctacttggtgtagttggatgcaagg 50167815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 13548484 - 13548170
Alignment:
Q  1 aacctttaaggtggagttacaaggttaaaagcatagtgtgt--acgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccg 98  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||  |||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13548484 aacctttgaggtggagttgcaaggtgaag-gcatagtgtgtgtacgcatttggaagttaaggtagagaaagctcaacttaaggtggagttgatgacaccg 13548386  T
Q  99 ggaatggtacaattatgggggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcaagaggacgg-aggcgtttcggggtttgaagaatgtat 197  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||||    
T  13548385 ggaatggtacaactatggaggccttgagtgctatgttctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaaggcattccggggtttgaagaatgtat 13548286  T
Q  198 ggtgttgcttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagcggaagacgttccgtagttgaagagggtttagtgt 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| | | ||||    
T  13548285 ggtgtggcttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgatcggatgcaagatgatcttcaaggaagcgggagacgttccatggttgaagaggttatggtgt 13548186  T
Q  298 atacttgtggagctac 313  Q
    |  |||||||| ||||    
T  13548185 aggcttgtggaactac 13548170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 28222225 - 28221921
Alignment:
Q  1 aacctttaaggtggagttacaaggttaaaagcatagtgtgt--acgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccg 98  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||  |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28222225 aacctttgaggtggagttgcaaggtgaag-gcatagtgtgtgtacgcatttggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccg 28222127  T
Q  99 ggaatggtacaattatgggggccttgggtgtt-atgctctagttgtgagcatgtgaattcttcaagaggacggaggcgtttc-ggggtttgaagaatgta 196  Q
    ||||||||| || ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||  ||| |||||||||| ||||||    
T  28222126 ggaatggtataactatggaggccttaggtgtttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacagaagccattccggggtttgaataatgta 28222027  T
Q  197 tggtgttgcttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagcggaagacgttccgtagttgaagagggtttagtg 296  Q
    | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||| | ||| |||||||||| |||    
T  28222026 tagtgtgacttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagtgggagacgttccatggttaaagagggtttggtg 28221927  T
Q  297 tatact 302  Q
    ||||||    
T  28221926 tatact 28221921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 28242951 - 28243147
Alignment:
Q  1 aacctttaaggtggagttacaaggttaaaagcatagtgtgt--acgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccg 98  Q
    ||||||| |||||||||  |||||| ||| |||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  28242951 aacctttgaggtggagtggcaaggtgaaa-gcatagtgtgtgtacacatttggaagttgaggtagagaaagctcaactagaggtggagttagtgacaccg 28243049  T
Q  99 ggaatggtacaattatgggggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcaagaggacgg-aggcgtttcggggtttgaagaatgt 195  Q
    |||||||||| | ||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| | || || || ||||||||||||||    
T  28243050 ggaatggtacgactatggaggtattgggtgttatgctctatttgtgagcatgtgaattctccatgaggacggaaagcattccgtggtttgaagaatgt 28243147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 36 - 153
Target Start/End: Original strand, 31658543 - 31658661
Alignment:
Q  36 gtgtgtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtacaattatgggggccttgggtg-ttatgc 134  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||    
T  31658543 gtgtgtaagcatttggacgttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtacgactatggaggccttgggtgtttatgc 31658642  T
Q  135 tctagttgtgagcatgtga 153  Q
    |||||||||||||||||||    
T  31658643 tctagttgtgagcatgtga 31658661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 31929075 - 31928865
Alignment:
Q  1 aacctttaaggtggagttacaaggttaaaagcatagtgtgt--acgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccg 98  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||  |||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||     
T  31929075 aacctttgaggtggagttgcaaggtgaat-gcatagtgtgtgtacg-atttggaagttgaggtagagaaagttcgacttgaggtggagttggtgacacca 31928978  T
Q  99 ggaatggtacaattatgggggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcaagaggacg-gaggcgtttcggggtttgaagaatgtat 197  Q
    |||||||||| | ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  || | |||||||| ||||||||||| |    
T  31928977 ggaatggtacgactatggagaccttgggtgatatgctctagttgtgagcaagagaattcttcaagaggacgaaagacatttcgggggttgaagaatgttt 31928878  T
Q  198 ggtgttgcttgtg 210  Q
    ||  |||||||||    
T  31928877 ggcattgcttgtg 31928865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 247 - 399
Target Start/End: Original strand, 31658658 - 31658821
Alignment:
Q  247 gtgatattcaaggaagcggaagacgttccgtagttgaagagggtttagtgtatacttgtggagctactttgtgtagttggatgcaagg-----------g 335  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| || |||||||| ||||||||||||||||||           |    
T  31658658 gtgatcttcaaggaagcaggagacgttccgtggttgaagagggtttggtgtagacttctgaagctacttggtgtagttggatgcaaggaaaagaaaaggg 31658757  T
Q  336 ggattggtggttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaaggtggagaatgttgt 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  31658758 ggattggtggttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaaggcaaggtggataatgttgt 31658821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 13126587 - 13126273
Alignment:
Q  2 acctttaaggtggagttacaaggttaaaagcatagtg---tgtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccg 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||  |||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||| |    
T  13126587 acctttaaggtggagtttcaaggtggaagacatagtgggatgtacgcatttggaagttgaggtagagaaagctcagctagaggtggagttgaacacactg 13126488  T
Q  99 ggaatggtacaattat-gggggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcaagaggac-ggaggcgtttcggggtttgaagaatgta 196  Q
      |||||||| | ||| | || ||||  ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| || |||   |||| || ||  |||||||||| |||    
T  13126487 aaaatggtacgactatagaggacctt--gtgttatgctctagttgtgagcaaggaaattcttcatgaagacaaaaggcattccgaagtttgaagaaagta 13126390  T
Q  197 tggtgttgcttgtgtgattac-ctaaaagaccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagcggaagacgttccgtagttgaagagggtttagt 295  Q
    | |  | ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| || ||| ||||||| |||||||||| | | ||    
T  13126389 tagcatggcttgtgggattacgctaaaaaaccaagggtgattagatgcaaggagatcttcaaggaag-gggagatgttccgtggttgaagaggttatggt 13126291  T
Q  296 gtatacttgtggagctac 313  Q
    ||| ||||||||| ||||    
T  13126290 gtagacttgtggaactac 13126273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 112 - 246
Target Start/End: Original strand, 19753446 - 19753583
Alignment:
Q  112 tatgggggccttgggtg-ttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcaagaggacgg-aggcgtttcggggtttgaagaatgtatggtgttgcttgt 209  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  19753446 tatggaggccttgggtgcttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaaggcatttcggggtttgaagaatgtatggcgttacttgt 19753545  T
Q  210 gtgattacc-taaaagaccaagggtgattggatgcaag 246  Q
    |  ||||||  |||||||||| ||| |||||| |||||    
T  19753546 ggaattaccggaaaagaccaatggtaattggaggcaag 19753583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 67 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 31424151 - 31423950
Alignment:
Q  67 aagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtacaattatggggg-ccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcaagag 165  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||| |||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||| | || ||||||| ||     
T  31424151 aagctcagcttgaggtggagttgaacacaccggtaatagtacgactatgggggaccttgggtgctatgctctag--gtgagcaagggatttcttcatgaa 31424054  T
Q  166 gacgga-ggcgtttcggggtttgaagaatgtatggtgttgcttgtgtgattacct---aaaagaccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaa 261  Q
    |||||| ||| || ||| | ||||||||||||| |    ||||| | |||||||    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31424053 gacggaaggcattccggaggttgaagaatgtattgcacggcttgcgggattaccctaaaaaaggccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaa 31423954  T
Q  262 gcgg 265  Q
    ||||    
T  31423953 gcgg 31423950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 340 - 393
Target Start/End: Original strand, 47102278 - 47102331
Alignment:
Q  340 tggtggttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaaggtggagaa 393  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  47102278 tggtggttgatggttaaattgacatcatcaccaattagaagtcaaggtggagaa 47102331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 340 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 13599079 - 13599019
Alignment:
Q  340 tggtggttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaaggtggagaatgttgtt 400  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13599079 tggtggttgctggttaaattgacatcaccaccaattagaagtcaaggtggagaatgttgtt 13599019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 9 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 14099103 - 14098839
Alignment:
Q  9 aggtggagttacaaggttaaaagcatagtg---tgtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatgg 105  Q
    |||||||||| ||||||| ||  |||||||   ||||| || |||  |||||||| |||| | ||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  14099103 aggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacacatttgctagttgaggcagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatgg 14099004  T
Q  106 tacaattatggggg-ccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcaagaggacgga-ggcgtttcggggtttgaagaatgtatggtgtt 203  Q
    ||    ||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||| | || ||||||| || |||||| ||| ||  || | ||||||||||||| |  |     
T  14099003 tatgtctatggaggaccttgggtgttatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattctggaggttgaagaatgtatagcatg 14098905  T
Q  204 gcttgtgtgattacct----aaaagaccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagcgg 265  Q
    ||||| | |||||||     ||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  14098904 gcttgcgggattaccctaaaaaaaggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggaagcgg 14098839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 169
Target Start/End: Original strand, 41139222 - 41139291
Alignment:
Q  100 gaatggtacaattatgggggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcaagaggacg 169  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  41139222 gaatggtacaactatggagaccttgcgtgttatgctctaactgtgagcaagagaattcttcaagaggacg 41139291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 274
Target Start/End: Original strand, 51751645 - 51751693
Alignment:
Q  226 ccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagcggaagacgttc 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  51751645 ccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgttc 51751693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 39 - 138
Target Start/End: Original strand, 16227603 - 16227702
Alignment:
Q  39 tgtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtacaattatgggggccttgggtgttatgctcta 138  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||| | ||||  | ||||||||| |||||||||    
T  16227603 tgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaagaccttgggtgctatgctcta 16227702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 265
Target Start/End: Original strand, 16227775 - 16227814
Alignment:
Q  226 ccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagcgg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16227775 ccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgg 16227814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 67 - 265
Target Start/End: Original strand, 16430108 - 16430312
Alignment:
Q  67 aagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtacaattatggggg-ccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcaagag 165  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  ||||| | ||||||||   ||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||| | || ||||||| ||     
T  16430108 aagctcagcttaaggtggagttgaacacaccagtaatggtacggctatggaggaccttggatgttatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaa 16430207  T
Q  166 gacgga-ggcgtttcggggtttgaagaatgtatggtgttgcttgtgtgattacct----aaaagaccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaagga 260  Q
    |||||| ||| || ||  | ||| ||||||||| |    ||||| | |||||||     ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  16430208 gacggaaggcattccgaaggttggagaatgtatagcacggcttgcgggattaccctaaaaaaaggccaagggtgattggatgcaaggagatcttcaagga 16430307  T
Q  261 agcgg 265  Q
    |||||    
T  16430308 agcgg 16430312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 27337801 - 27337762
Alignment:
Q  226 ccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagcgg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27337801 ccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgg 27337762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 265
Target Start/End: Original strand, 28841965 - 28842004
Alignment:
Q  226 ccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagcgg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28841965 ccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgg 28842004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 9 - 138
Target Start/End: Original strand, 47178764 - 47178897
Alignment:
Q  9 aggtggagttacaaggttaaaagcatagtg---tgtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatgg 105  Q
    |||||||||| ||||||| ||  |||||||   |||||||| |||  ||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  47178764 aggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatgg 47178863  T
Q  106 tacaattatg-ggggccttgggtgttatgctcta 138  Q
    ||| | ||||  || ||||||||| |||||||||    
T  47178864 tacgactatgaaggaccttgggtgctatgctcta 47178897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 9 - 138
Target Start/End: Original strand, 51751439 - 51751572
Alignment:
Q  9 aggtggagttacaaggttaaaagcatagtg---tgtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatgg 105  Q
    |||||||||| ||||||| ||  |||||||   |||||||| |||  ||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  51751439 aggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatgg 51751538  T
Q  106 tacaattatg-ggggccttgggtgttatgctcta 138  Q
    ||| | ||||  || ||||||||| |||||||||    
T  51751539 tacgactatgaaggaccttgggtgctatgctcta 51751572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 226 - 263
Target Start/End: Original strand, 47178970 - 47179007
Alignment:
Q  226 ccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagc 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47178970 ccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagc 47179007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 340 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 50167792 - 50167739
Alignment:
Q  340 tggtggttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaaggtggagaa 393  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  50167792 tggtggttgatggttaaagtttcatcaccatcaatttagagtcaaggtggagaa 50167739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 171
Target Start/End: Original strand, 6996685 - 6996850
Alignment:
Q  9 aggtggagttacaaggttaaaagcatagtg---tgtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatgg 105  Q
    |||||||||| ||||||| ||  |||||||   |||||||| |||  ||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||  ||| ||| |||||    
T  6996685 aggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacatcggtaatgg 6996784  T
Q  106 tacaattatgg-gggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcaagaggacgga 171  Q
    |||   ||||| || ||||||||| ||||||||| | ||||||| | || ||||||| || ||||||    
T  6996785 tacggctatggaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaagacgga 6996850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 31736689 - 31736587
Alignment:
Q  9 aggtggagttacaaggttaaaagcatagtg---tgtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatgg 105  Q
    |||||||||| ||||||| ||  |||||||   |||||||| |||  ||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  31736689 aggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatgg 31736590  T
Q  106 tac 108  Q
    |||    
T  31736589 tac 31736587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 226 - 265
Target Start/End: Original strand, 20301739 - 20301778
Alignment:
Q  226 ccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagcgg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  20301739 ccaagggtgattggatgcaaggtgatctttaaggaagcgg 20301778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 9 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 28202539 - 28202406
Alignment:
Q  9 aggtggagttacaaggttaaaagcatagtg---tgtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatgg 105  Q
    |||||||||| ||||||| ||  |||||||   ||| |||| |||  ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||  ||| ||| |||||    
T  28202539 aggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgttcgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcttgaggtggagttgaacacatcggtaatgg 28202440  T
Q  106 tacaattatgg-gggccttgggtgttatgctcta 138  Q
     || | ||||| || ||||||||| |||||||||    
T  28202439 cacgactatggaggaccttgggtgctatgctcta 28202406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 108
Target Start/End: Original strand, 28841760 - 28841861
Alignment:
Q  10 ggtggagttacaaggttaaaagcatagtg---tgtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggt 106  Q
    ||||||||| ||||||| ||  |||||||   |||||||| |||  ||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  28841760 ggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggt 28841859  T
Q  107 ac 108  Q
    ||    
T  28841860 ac 28841861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 226 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 31736483 - 31736444
Alignment:
Q  226 ccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagcgg 265  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  31736483 ccaagggtgataggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgg 31736444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 340 - 393
Target Start/End: Original strand, 25444536 - 25444590
Alignment:
Q  340 tggtggttgatggttaaagtgacatcatcatc-aatttgaagtcaaggtggagaa 393  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || | |||| |||||||||||||||||    
T  25444536 tggtggttgatggttaaactgacatcaccaccaaattagaagtcaaggtggagaa 25444590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 340 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 41391241 - 41391187
Alignment:
Q  340 tggtggttgatggttaaagtgacatcatcatc-aatttgaagtcaaggtggagaa 393  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || | |||| |||||||||||||||||    
T  41391241 tggtggttgatggttaaactgacatcaccaccaaattagaagtcaaggtggagaa 41391187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 341 - 394
Target Start/End: Original strand, 4498964 - 4499017
Alignment:
Q  341 ggtggttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaaggtggagaat 394  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  4498964 ggtgattgatggtcagagtgacatcatcatcaatttaaaggcaaggcggagaat 4499017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 341 - 394
Target Start/End: Original strand, 9526063 - 9526116
Alignment:
Q  341 ggtggttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaaggtggagaat 394  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  9526063 ggtgattgatggttaaactggcatcatcactgatttgaagtcaaggtggagaat 9526116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Original strand, 19753304 - 19753391
Alignment:
Q  1 aacctttaaggtggagttacaaggttaaaagcatagt--gtgtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagt 87  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||  |||||||  ||||||||  |||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||    
T  19753304 aaccttttaggtggagttgcaaggtgaag-gcatagtatgtgtacgcgtttggaagttgaggtggagaaatatcagcttgaggtggagt 19753391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 220 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 25249611 - 25249566
Alignment:
Q  220 aaaagaccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagcgg 265  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  25249611 aaaaggccaagggtgattggatgcaagatgatcttcaaagaagcgg 25249566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 341 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 31928500 - 31928447
Alignment:
Q  341 ggtggttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaaggtggagaat 394  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||  ||||||||||||||||    
T  31928500 ggtggttgatggttaaattggcatcaccataaatttagagtcaaggtggagaat 31928447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 341 - 390
Target Start/End: Original strand, 47703333 - 47703382
Alignment:
Q  341 ggtggttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaaggtgga 390  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||  ||||||||||||    
T  47703333 ggtggttgatggttaaattgacatcaccaccaatttagagtcaaggtgga 47703382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 346 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 2393861 - 2393813
Alignment:
Q  346 ttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaaggtggagaat 394  Q
    |||||||||||| || ||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  2393861 ttgatggttaaattggcatcatcactgatttgaagtcaaggtggagaat 2393813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 279 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 8347951 - 8347896
Alignment:
Q  279 gttgaagagggtttagtgtatacttgtggagctactttgtgtagttggatgcaaggg 335  Q
    |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  8347951 gttgaagagg-tttggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaagcaaggg 8347896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1908 (Bit Score: 182; Significance: 3e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold1908
Description:

Target: scaffold1908; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 36 - 378
Target Start/End: Original strand, 765 - 1120
Alignment:
Q  36 gtgtgtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtacaattatgggggccttgggtgtt-atgc 134  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || |||||||||| ||||    
T  765 gtgtgtacgcatatggaagttgaggtagagaaagctcaacttaaggtggagttgttgacaccgagactggtacaactatggaggtcttgggtgtttatgc 864  T
Q  135 tctagttgtgagcatgtgaattcttcaagaggacgga-ggcgtttcggggtttgaagaatgtatggtgttgcttgtgtgattacctaaaagaccaagggt 233  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  865 tctagttttgagcatgtgaattcttcatgaggacggaaggcgctccggggtttgaagaatgtatggtgtggcttgtgtgattacctaaaagaccaagggt 964  T
Q  234 gattggatgcaaggtgatattcaaggaagcggaagacgttccgtagttgaagagggtttagtgtatacttgtggagctactttgtgtagttggatgcaag 333  Q
     |||| |  ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| || ||| | ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  965 aattgaaaacaaggtgatcttcaaggaaacgggagacgttccgtggttgaagtggatttggggtacacttgtggagctacttggtgtagatggatgcaag 1064  T
Q  334 g-----------gggattggtggttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttga 378  Q
    |           |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1065 gaaaagaaaaatgggattggtggttgatggttaaagtggcatcatcatcaatttga 1120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491 (Bit Score: 176; Significance: 1e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0491
Description:

Target: scaffold0491; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 52 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 9666 - 9310
Alignment:
Q  52 aagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtacaattatgggggccttgggtgtt-atgctctagttgtgagcatg 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  | ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9666 aagttgaggtagagaaagctcaacttgatgtggagttgatgacaccgagaatggtatgactatggaggctttgggtgtttatgctctagttgtgagcatg 9567  T
Q  151 tgaattcttcaagaggacgga-ggcgtttcggggtttgaagaatgtatggtgttgcttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattggatgcaaggtg 249  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  9566 tgaattcttcatgaggacggaaggtatttcggggtttgaagaatgtattgtgtggcttgtgtgattacctaaaagatcaagggtgatcggatgcaaggtg 9467  T
Q  250 atattcaaggaagcggaagacgttccgtagttgaagagggtttagtgtatacttgtggagctactttgtgtagttggatgc------------aaggggg 337  Q
    ||  || ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||  |||||||||| |||| || |||||| ||||            |||||||    
T  9466 atcctcgaggaagcgggagacgttccgtggttgaagatggtttggtgtagtcttgtggagcaacttggtatagttgaatgcaagggaaaagaaaaggggg 9367  T
Q  338 attggtggttgatggttaaagtgacatcatcatc-aatttgaagtcaaggtggagaa 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||    
T  9366 attggtggttgatggttaaagtgacatcaccatcaaattagaagtcaaggtggagaa 9310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 169; Significance: 2e-90; HSPs: 37)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 79 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 5407846 - 5407512
Alignment:
Q  79 aggtggagttgatgacaccgggaatggtacaattatgggggccttgggtgtt-atgctctagttgtgagcatgtgaattcttcaagaggacgga-ggcgt 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||| |    
T  5407846 aggtggagttgatgacaccgggaatggtacaactatggaggccttgggtatttatgctctagttgtgagcatgtaaactcttcatgaggacggaaggcat 5407747  T
Q  177 ttcggggtttgaagaatgtatggtgttgcttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagcggaagacgttccg 276  Q
    | |  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||    
T  5407746 tccaaggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgatcggatgcaaggtgatcttcggggaagcgggagacgttccg 5407647  T
Q  277 tagttgaagagggtttagtgtatacttgtggagctactttgtgtagttggatgcaaggg---------gg---attggtggttgatggttaaagtgacat 364  Q
    | |||||||| ||||| ||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||         ||   |||||||| |||||||||||||| |||    
T  5407646 tggttgaagatggtttggtgtagacttgtggagtaacttggtgtagttggatgcaagggaaaagaaaagggatattggtggatgatggttaaagtggcat 5407547  T
Q  365 catcatcaatttgaagtcaaggtggagaatgttgt 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5407546 catcatcaatttgaagtcaaggtggagaatgttgt 5407512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 79 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 5412171 - 5411837
Alignment:
Q  79 aggtggagttgatgacaccgggaatggtacaattatgggggccttgggtgtt-atgctctagttgtgagcatgtgaattcttcaagaggacgga-ggcgt 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||| |    
T  5412171 aggtggagttgatgacaccgggaatggtacaactatggaggccttgggtatttatgctctagttgtgagcatgtaaactcttcatgaggacggaaggcat 5412072  T
Q  177 ttcggggtttgaagaatgtatggtgttgcttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagcggaagacgttccg 276  Q
    | |  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||    
T  5412071 tccaaggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgatcggatgcaaggtgatcttcggggaagcgggagacgttccg 5411972  T
Q  277 tagttgaagagggtttagtgtatacttgtggagctactttgtgtagttggatgcaaggg---------gg---attggtggttgatggttaaagtgacat 364  Q
    | |||||||| ||||| ||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||         ||   |||||||| |||||||||||||| |||    
T  5411971 tggttgaagatggtttggtgtagacttgtggagtaacttggtgtagttggatgcaagggaaaagaaaagggatattggtggatgatggttaaagtggcat 5411872  T
Q  365 catcatcaatttgaagtcaaggtggagaatgttgt 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5411871 catcatcaatttgaagtcaaggtggagaatgttgt 5411837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 48 - 393
Target Start/End: Original strand, 16652354 - 16652714
Alignment:
Q  48 ttggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtacaattatgggggccttgggtgtt-atgctctagttgtgag 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||| ||| |||||| |||||    
T  16652354 ttggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtacgactatggaggctttgggagtttatgttctagtggtgag 16652453  T
Q  147 catgtgaattcttcaagaggacgga-ggcgtttcggggtttgaagaatgtatggtgttgcttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattggatgcaa 245  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  16652454 catgtgaattcttcatgaggacggaaggtattccggggtttgaagaatgtatggggaggcttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgatcggatgtaa 16652553  T
Q  246 ggtgatattcaaggaagcggaagacgttccgtagttgaagagggtttagtgtatacttgtggagctactttgtgtagttggatgc------------aag 333  Q
    |||||| ||| |||| |||| ||||||||||| |||||||| || || ||| | ||||||||||| |||| ||  ||||||||||            |||    
T  16652554 ggtgatcttcgaggaggcgggagacgttccgtggttgaagatggcttggtgaagacttgtggagcaacttggtagagttggatgcaagggaaaagaaaag 16652653  T
Q  334 ggggattggtggttgatggttaaagtgacatcatcatc-aatttgaagtcaaggtggagaa 393  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  16652654 ggagattggtggttgatggttaaagtggcatcatcaccaaatttgaagtcaaggtggagaa 16652714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 48 - 393
Target Start/End: Original strand, 16554092 - 16554452
Alignment:
Q  48 ttggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtacaattatgggggccttgggtgtt-atgctctagttgtgag 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||| ||||| ||| ||| |||||| |||||    
T  16554092 ttggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtatgactatggaggctttgggagtttatgttctagtggtgag 16554191  T
Q  147 catgtgaattcttcaagaggacgga-ggcgtttcggggtttgaagaatgtatggtgttgcttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattggatgcaa 245  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16554192 catgtgaattcttcatgaggacggaaggtattccggggtttgaagaatgtatggggaggcttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgatcggatgcaa 16554291  T
Q  246 ggtgatattcaaggaagcggaagacgttccgtagttgaagagggtttagtgtatacttgtggagctactttgtgtagttggatgc------------aag 333  Q
    |||||| ||| |||| |||| ||||||||||| |||||||| || || ||| | ||||||||||| |||| ||  ||||||||||            |||    
T  16554292 ggtgatcttcgaggaggcgggagacgttccgtggttgaagatggcttggtgaagacttgtggagcaacttggtagagttggatgcaagggaaaagaaaag 16554391  T
Q  334 ggggattggtggttgatggttaaagtgacatcatcatc-aatttgaagtcaaggtggagaa 393  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||| |||||||||||||||||    
T  16554392 ggagattggtggttgatggttaaagtggcatcatcgccaaattagaagtcaaggtggagaa 16554452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 48 - 393
Target Start/End: Original strand, 16630648 - 16631008
Alignment:
Q  48 ttggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtacaattatgggggccttgggtgtt-atgctctagttgtgag 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||| ||||| ||| ||| |||||| |||||    
T  16630648 ttggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtatgactatggaggctttgggagtttatgttctagtggtgag 16630747  T
Q  147 catgtgaattcttcaagaggacgga-ggcgtttcggggtttgaagaatgtatggtgttgcttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattggatgcaa 245  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16630748 catgtgaattcttcatgaggacggaaggtattccggggtttgaagaatgtatggggaggcttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgatcggatgcaa 16630847  T
Q  246 ggtgatattcaaggaagcggaagacgttccgtagttgaagagggtttagtgtatacttgtggagctactttgtgtagttggatgc------------aag 333  Q
    |||||| ||| |||| |||| ||||||||||| |||||||| || || ||| | ||||||||||| |||| ||  ||||||||||            |||    
T  16630848 ggtgatcttcgaggaggcgggagacgttccgtggttgaagatggcttggtgaagacttgtggagcaacttggtagagttggatgcaagggaaaagaaaag 16630947  T
Q  334 ggggattggtggttgatggttaaagtgacatcatcatc-aatttgaagtcaaggtggagaa 393  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||| |||||||||||||||||    
T  16630948 ggagattggtggttgatggttaaagtggcatcatcgccaaattagaagtcaaggtggagaa 16631008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 79 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 5407077 - 5406744
Alignment:
Q  79 aggtggagttgatgacaccgggaatggtacaattatgggggccttgggtgtt-atgctctagttgtgagcatgtgaattcttcaagaggacggaggcgtt 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| || |||||| |||||||||||||| || |||||| |||   | |||| ||    
T  5407077 aggtggagttgatgacaccgggaatggtacgactatggaggccttgggtatttatgctccagttgtgagcatgttaactcttcatgagacagaaggcatt 5406978  T
Q  178 tcggggtttgaagaatgtatggtgttgcttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagcggaagacgttccgt 277  Q
     |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||| |||  |||||||| |||||||||||    
T  5406977 ccggggtttgaagaatgcatgatgtggcttgtgtgattacctaaaagaccaatggtgatcagaagcaaggtgatcttcggggaagcgggagacgttccgt 5406878  T
Q  278 agttgaagagggtttagtgtatacttgtggagctactttgtgtagttggatgc------------aagggggattggtggttgatggttaaagtgacatc 365  Q
     |||||||| ||||| ||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||            ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5406877 ggttgaagatggtttggtgtagacttgtgaagcaacttggtgtagttggatgcaagcgaaaagaaaagggagattggtggttgatggttaaagtggcatc 5406778  T
Q  366 atcatcaatttgaagtcaaggtggagaatgttgt 399  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5406777 atcatcaatttcaagtcaaggtggagaatgttgt 5406744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 79 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 5411402 - 5411069
Alignment:
Q  79 aggtggagttgatgacaccgggaatggtacaattatgggggccttgggtgtt-atgctctagttgtgagcatgtgaattcttcaagaggacggaggcgtt 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| || |||||| |||||||||||||| || |||||| |||   | |||| ||    
T  5411402 aggtggagttgatgacaccgggaatggtacgactatggaggccttgggtatttatgctccagttgtgagcatgttaactcttcatgagacagaaggcatt 5411303  T
Q  178 tcggggtttgaagaatgtatggtgttgcttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagcggaagacgttccgt 277  Q
     |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||| |||  |||||||| |||||||||||    
T  5411302 ccggggtttgaagaatgcatgatgtggcttgtgtgattacctaaaagaccaatggtgatcagaagcaaggtgatcttcggggaagcgggagacgttccgt 5411203  T
Q  278 agttgaagagggtttagtgtatacttgtggagctactttgtgtagttggatgc------------aagggggattggtggttgatggttaaagtgacatc 365  Q
     |||||||| ||||| ||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||            ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5411202 ggttgaagatggtttggtgtagacttgtgaagcaacttggtgtagttggatgcaagcgaaaagaaaagggagattggtggttgatggttaaagtggcatc 5411103  T
Q  366 atcatcaatttgaagtcaaggtggagaatgttgt 399  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5411102 atcatcaatttcaagtcaaggtggagaatgttgt 5411069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 48 - 393
Target Start/End: Original strand, 34166300 - 34166664
Alignment:
Q  48 ttggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtacaattatgggggccttgggtgtt-atgctctagttgtgag 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||   ||||| ||| ||||| ||| |||||||||| |||||    
T  34166300 ttggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttggtgactccggaaatggtacggctatggaggctttgggagtttatgctctagtggtgag 34166399  T
Q  147 catgtgaattcttcaagaggacgga-ggcgtttcggggtttgaagaatgtatggtgttgcttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattggatgcaa 245  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  34166400 catgtggattcttcatgaggacggatggtattccggggtttgaagaatgtatggggtggcttgtgtgattgcctaaaaggccaagggtgatcggatgcaa 34166499  T
Q  246 ggtgatattcaaggaagcggaagacgttccgtagttgaagagggttt-------agtgtatacttgtggagctactttgtgt--agttggatgcaaggg- 335  Q
    |||||| ||| |||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||       | || | ||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||     
T  34166500 ggtgatcttcgaggaggcgggagacgttccgtggttgaagatggtttggtgaaaaatgaagacttgtggagcaacttggtgtagagttggatgcaaggga 34166599  T
Q  336 ------ggattggtggttgatggttaaagtgacatcatcatc-aatttgaagtcaaggtggagaa 393  Q
           |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  34166600 aaaggaagattggtggttgatggttaaagtggcatcatcaccaaattagaagtcaaggtggagaa 34166664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 248 - 393
Target Start/End: Original strand, 16568485 - 16568630
Alignment:
Q  248 tgatattcaaggaagcggaagacgttccgtagttgaagagggtttagtgtatacttgtggagctactttgtgtagttggatgcaagggggattggtggtt 347  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16568485 tgatcttcaaggaagcgggagacgttccgtggttgaagagggtttggtgtatacttgtggagctacttggtgtagttggatgcaagggggattggtggtt 16568584  T
Q  348 gatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaaggtggagaa 393  Q
    || |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  16568585 gacggttaaagtggcatcatcaccaattagaagtcaaggcggagaa 16568630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 16568332 - 16568482
Alignment:
Q  1 aacctttaaggtggagttacaaggttaaaagcatagtgtgt--acgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccg 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||  ||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16568332 aacctttgaggtggagttacaaggtggaa-gcatagtgtgtgtactaatttggaagttgaggtagagaaatctcaacttgaggtggagttggtgacaccg 16568430  T
Q  99 ggaatggtacaattatgggggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatg 150  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16568431 ggaatggtacaactatggagaccttgggagttatgctctagttgtgagcatg 16568482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 85 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 10456333 - 10456160
Alignment:
Q  85 agttgatgacaccgggaatggtacaattatgggggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcaagaggacgg-aggcgtttcgggg 183  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | ||||| | | |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| || | ||| | |     
T  10456333 agttgatgacaccgg-aatggtacgactatggagactttggatgttatgctctagttgtgagcaagggaattcttcaagagaacggaagacattttgtga 10456235  T
Q  184 tttgaagaatgtatggtgttgcttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaag 258  Q
     |||||||||||||||     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  10456234 gttgaagaatgtatggcacaacttgtgggattacctaaaagaccaagggtgattggatgtaaggagatattcaag 10456160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 11137500 - 11137665
Alignment:
Q  1 aacctttaaggtggagttacaaggttaaaagcatagtg--tgtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccg 98  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| |||  |||||||  |||||||  |||  |||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| ||    
T  11137500 aacctttgaggtggagtttcaaggtgaaagtcatagtggatgtacgcgtttgctagttcaggtagagaaaactcagcttgtggtggagttgatgacatcg 11137599  T
Q  99 ggaatggtacaattatgggggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcaaga 164  Q
    |||||||||| |  |||| | ||||||||| || |||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  11137600 ggaatggtacgacgatggagaccttgggtgctaggctctagttgtgagcaagagaattcttcaaga 11137665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 48 - 244
Target Start/End: Original strand, 30444765 - 30444963
Alignment:
Q  48 ttggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtacaattatgggggccttgggtgttatgctctagttgtgagc 147  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | |  | |||||| | ||||| | | ||||||| ||  ||||||||||||||    
T  30444765 ttggaacttgaggtagagaaaggtcagcttgaggtggagttgatgacgctgatagtggtacgactatggagacattgggtgctagtctctagttgtgagc 30444864  T
Q  148 atgtgaattcttcaagaggac-ggaggcgtttcggggtttgaagaatgtatggtgttgcttgtgtgattacc-taaaagaccaagggtgattggatgca 244  Q
    | | ||||||||||||||||| | |||| ||  ||||||||||||||||||||  |  |||||| |||||||  |||||| |||| || ||||||||||    
T  30444865 aagagaattcttcaagaggacagaaggcattcaggggtttgaagaatgtatggcatgacttgtgggattaccaaaaaagaacaagagtaattggatgca 30444963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 64 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 24543600 - 24543467
Alignment:
Q  64 agaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtacaattatgggggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcaag 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| | ||||||||  || ||||  |||||||||| | || |||||||||    
T  24543600 agaaagctcaacttgaggtggagttgatgacactggaaatggtacaactatggagaccttgggttctaggctc--gttgtgagcaagggagttcttcaag 24543503  T
Q  164 aggacggaggcgtttcggggtttgaagaatgtatgg 199  Q
    |||||| | |   |||||| |||||| |||||||||    
T  24543502 aggacgaaaggcattcgggatttgaaaaatgtatgg 24543467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 53 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 15533768 - 15533649
Alignment:
Q  53 agttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtacaattatgg-gggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgt 151  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||| | ||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||| |     
T  15533768 agttgaggtagagtacgctcagcttgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatggaggaccttgagtgttatgctctagtggtgagcacgg 15533669  T
Q  152 gaattcttcaagaggacgga 171  Q
    || ||||||| || ||||||    
T  15533668 gatttcttcatgaagacgga 15533649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 113 - 165
Target Start/End: Original strand, 17758814 - 17758866
Alignment:
Q  113 atgggggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcaagag 165  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17758814 atggaggccttgggtgttatgcactagttgtgagtatgtgaattcttcaagag 17758866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 340 - 404
Target Start/End: Original strand, 24435392 - 24435456
Alignment:
Q  340 tggtggttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaaggtggagaatgttgtttttg 404  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  24435392 tggtggttgatggttatattgacatcatcaccaattataagtcaaggtggagaatgttgtatttg 24435456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 3631088 - 3630956
Alignment:
Q  39 tgtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtacaattatgg-gggccttgggtgttatgctct 137  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||  | | ||| || ||||||||| ||||||||    
T  3631088 tgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcaacttgaggtggagttgaacacaccggtaatggtatgactttggaggaccttgggtgctatgctct 3630989  T
Q  138 agttgtgagcatgtgaattcttcaagaggacgga 171  Q
    | | ||||||| | || ||||||| || ||||||    
T  3630988 a-tggtgagcaagggatttcttcatgaagacgga 3630956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 87
Target Start/End: Original strand, 22615107 - 22615155
Alignment:
Q  39 tgtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagt 87  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22615107 tgtacgcatttggaaggtgaggtagtgaaagctcaacttgaggtggagt 22615155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 39 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 26067241 - 26067142
Alignment:
Q  39 tgtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtacaattatgggggccttgggtgttatgctcta 138  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||| | ||||  | ||||||||| |||||||||    
T  26067241 tgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaagaccttgggtgctatgctcta 26067142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 341 - 399
Target Start/End: Original strand, 11138106 - 11138164
Alignment:
Q  341 ggtggttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaaggtggagaatgttgt 399  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||    
T  11138106 ggtggttgatggttaaattgacatcatcacaaatttagagttaaggtggagaatgttgt 11138164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 138
Target Start/End: Original strand, 33310291 - 33310423
Alignment:
Q  9 aggtggagttacaaggttaaaagcatagtg---tgtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatgg 105  Q
    |||||||||| ||||||| ||  |||||||   |||||||| |||  ||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  33310291 aggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatgg 33310390  T
Q  106 tacaattatgggggccttgggtgttatgctcta 138  Q
    ||| | ||||  | ||||||||| || ||||||    
T  33310391 tacgactatgaagaccttgggtgctaggctcta 33310423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 227 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 30729616 - 30729571
Alignment:
Q  227 caagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagcggaagacgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  30729616 caagggtgattggatgcaaggtaatcttcaaggaagcgggagacgt 30729571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 226 - 263
Target Start/End: Original strand, 33310496 - 33310533
Alignment:
Q  226 ccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagc 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33310496 ccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagc 33310533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 341 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 35209144 - 35209091
Alignment:
Q  341 ggtggttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaaggtggagaat 394  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  35209144 ggtgattgatggttaaactgacatcatcactgatttgaagtcaaggtggagaat 35209091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 138
Target Start/End: Original strand, 3395446 - 3395546
Alignment:
Q  39 tgtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtacaattatgg-gggccttgggtgttatgctct 137  Q
    |||||||| |||  ||||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||| | ||||| || ||||||||| ||||||||    
T  3395446 tgtacgcatttgctagttgagctagagtaccctcagcttgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatggaggaccttgggtgctatgctct 3395545  T
Q  138 a 138  Q
    |    
T  3395546 a 3395546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 153 - 247
Target Start/End: Original strand, 22615253 - 22615348
Alignment:
Q  153 aattcttcaagaggacggagg-cgtttcggggtttgaagaatgtatggtgttgcttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattggatgcaagg 247  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||| |  ||| || ||||| |||||| |||||| || ||| |||||||||    
T  22615253 aattcttaaagaggacggaagacgttttgggggttgaagaatgtatggtatgacttatgggattagctaaaataccaagcgtaattcgatgcaagg 22615348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 340 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 28038310 - 28038251
Alignment:
Q  340 tggtggttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaaggtggagaatgttgt 399  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  28038310 tggtggttgatggttaaattggtatcatcactaatttaaagtcaaggtggagattgttgt 28038251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 340 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 11857623 - 11857569
Alignment:
Q  340 tggtggttgatggttaaagtgacatcatcatc-aatttgaagtcaaggtggagaa 393  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || | |||| |||||||||||||||||    
T  11857623 tggtggttgatggttaaactgacatcaccaccaaattagaagtcaaggtggagaa 11857569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 340 - 393
Target Start/End: Original strand, 14741870 - 14741924
Alignment:
Q  340 tggtggttgatggttaaagtgacatcatcatc-aatttgaagtcaaggtggagaa 393  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || | |||| |||||||||||||||||    
T  14741870 tggtggttgatggttaaactgacatcaccaccaaattagaagtcaaggtggagaa 14741924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 185 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 28078387 - 28078325
Alignment:
Q  185 ttgaagaatgtatggtgttgcttgtgtgatta-cctaaaagaccaagggtgattggatgcaag 246  Q
    ||||||||||||| | ||  |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28078387 ttgaagaatgtatagcgtgacttgtgggattatcctgaaagaccaagggtgattggatgcaag 28078325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 220 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 3630883 - 3630838
Alignment:
Q  220 aaaagaccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagcgg 265  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  3630883 aaaaggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggaagcgg 3630838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 341 - 394
Target Start/End: Original strand, 13883074 - 13883127
Alignment:
Q  341 ggtggttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaaggtggagaat 394  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  13883074 ggtgattgatggttaaactggcatcatcactgatttgaagtcaaggtggagaat 13883127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 341 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 22344846 - 22344793
Alignment:
Q  341 ggtggttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaaggtggagaat 394  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  22344846 ggtgtttgatggttaaattggcatcatcactgatttgaagtcaaggtggagaat 22344793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 26067069 - 26067032
Alignment:
Q  226 ccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagc 263  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26067069 ccaagagtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagc 26067032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 341 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 31249297 - 31249244
Alignment:
Q  341 ggtggttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaaggtggagaat 394  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  31249297 ggtgattgatggttaaactggcatcatcactgatttgaagtcaaggtggagaat 31249244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 341 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 35201909 - 35201856
Alignment:
Q  341 ggtggttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaaggtggagaat 394  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  35201909 ggtgattgatggttaaactggcatcatcactgatttgaagtcaaggtggagaat 35201856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 265
Target Start/End: Original strand, 51119 - 51383
Alignment:
Q  9 aggtggagttacaaggttaaaagcatagtg---tgtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatgg 105  Q
    |||||||||| ||||||| ||  |||||||   ||||| || |||  ||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  51119 aggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacacatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatgg 51218  T
Q  106 tacaattatgggggcc-ttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcaagaggacgga-ggcgtttcggggtttgaagaatgtatggtgtt 203  Q
    |||   ||||| || | ||||||| ||||||||| | ||||||| | || ||||||| || |||||| |||||| ||| | ||||||||||||| |        
T  51219 tacggctatggaggacgttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcacgaagacggaaggcgttccggaggttgaagaatgtatagcacg 51317  T
Q  204 gcttgtgtgattacct----aaaagaccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagcgg 265  Q
    ||||| | |||||||     ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  51318 gcttgcgggattaccctaaaaaaaggccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgg 51383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 339 - 399
Target Start/End: Original strand, 51655 - 51714
Alignment:
Q  339 ttggtggttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaaggtggagaatgttgt 399  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||   |||||  |||||||||||||||||||||    
T  51655 ttggtggttgatg-ttaaattgacatcatcgctaatttagagtcaaggtggagaatgttgt 51714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1674 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold1674
Description:

Target: scaffold1674; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 665 - 532
Alignment:
Q  9 aggtggagttacaaggttaaaagcatagtg---tgtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatgg 105  Q
    |||||||||| ||||||| ||  |||||||   |||||||| |||  ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  665 aggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcaacgtgaggtggagttgaacacaccggtaatgg 566  T
Q  106 tacaattatg-ggggccttgggtgttatgctcta 138  Q
    ||||| ||||  || ||||||||| |||||||||    
T  565 tacaactatgaaggaccttgggtgctatgctcta 532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1674; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 226 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 459 - 411
Alignment:
Q  226 ccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagcggaagacgttc 274  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||    
T  459 ccaatggtgattggatgcaaggtggtcttcaaggaagcgggagatgttc 411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 196
Target Start/End: Original strand, 34995 - 35187
Alignment:
Q  9 aggtggagttacaaggttaaaagcatagtg---tgtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatgg 105  Q
    |||||||||| ||||||| ||  |||||||   |||||||| |||  ||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||  ||| ||| |||||    
T  34995 aggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacatcggtaatgg 35094  T
Q  106 tacaattatgg-gggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcaagaggacgg-aggcgtttcggggtttgaagaatgta 196  Q
    ||| | ||||| || ||||| ||| ||||||||||| ||||||| | || ||||||| || ||||| |||| || ||| | ||||||||||||    
T  35095 tacgactatggaggaccttgagtgctatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattccggaggttgaagaatgta 35187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 340 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 6364 - 6304
Alignment:
Q  340 tggtggttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaaggtggagaatgttgtt 400  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6364 tggtggttgctggttaaattgacatcaccaccaattagaagtcaaggtggagaatgttgtt 6304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 23157 - 23009
Alignment:
Q  1 aacctttaaggtggagttacaaggttaaaagcatagtg--tgtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccg 98  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||  |||| ||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||   ||| |||||||||  | |||||     
T  23157 aacctttaaggtggagttgcaaggtgaaagacataatggatgtacgcatttggaagttgaggtggagaaagctcggattgcggtggagttagttacacc- 23059  T
Q  99 ggaatggtacaattatgggggccttgggtgttatgctctagttgtgagca 148  Q
    | |||||||  | ||||| |  |||||||  |||||||||||||||||||    
T  23058 gaaatggtatgactatggagatcttgggtactatgctctagttgtgagca 23009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 9 - 138
Target Start/End: Original strand, 23529 - 23662
Alignment:
Q  9 aggtggagttacaaggttaaaagcatagtg---tgtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatgg 105  Q
    |||||||||| ||||||| ||  |||||||   |||||||| |||  ||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  23529 aggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagcacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatgg 23628  T
Q  106 tacaattatg-ggggccttgggtgttatgctcta 138  Q
    ||| | ||||  || ||||||||| |||||||||    
T  23629 tacgactatgaaggaccttgggtgctatgctcta 23662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 274
Target Start/End: Original strand, 23731 - 23779
Alignment:
Q  226 ccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagcggaagacgttc 274  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  23731 ccaagagtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgttc 23779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 308
Target Start/End: Original strand, 4000 - 4189
Alignment:
Q  120 ccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcaagaggacgga-ggcgtttcggggtttgaagaatgtatggtgttgcttgtgtgattacc 218  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| | || ||||||| || |||||| ||| || |   ||||||||||||||| |     |||| | |||||||    
T  4000 ccttgggtgatatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattccaaagtttgaagaatgtatagcacgacttgcgggattacc 4099  T
Q  219 -taaaagaccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagcggaagacgttccgtagttgaagagggtttagtgtatacttgtgga 308  Q
     |||||  ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||| || | || |||||||||| | | ||| |||||||||||    
T  4100 ctaaaaagccaagggtgattggatgtaaggagatcttcaaggaagcgggagatgtcctgt-gttgaagaggttatggtggatacttgtgga 4189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 226 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 70199 - 70160
Alignment:
Q  226 ccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagcgg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  70199 ccaagggtgattggatgcaaggtgaccttcaaggaagcgg 70160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 9 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 70405 - 70272
Alignment:
Q  9 aggtggagttacaaggttaaaagcatagtg---tgtacgcaattggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatgg 105  Q
    |||||||||| ||||||| ||  |||||||   |||||||| |||  ||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||  |||| || |||||    
T  70405 aggtggagtttcaaggttgaagacatagtgagatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcatcgtgaggtggagttgaacacactggtaatgg 70306  T
Q  106 tacaattatgg-gggccttgggtgttatgctcta 138  Q
    ||| | |||||  | ||||||||| |||||||||    
T  70305 tacgactatggaagaccttgggtgctatgctcta 70272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 340 - 393
Target Start/End: Original strand, 1683 - 1737
Alignment:
Q  340 tggtggttgatggttaaagtgacatcatcatc-aatttgaagtcaaggtggagaa 393  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || | |||| |||||||||||||||||    
T  1683 tggtggttgatggttaaattgacatcaccaccaaattagaagtcaaggtggagaa 1737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 340 - 393
Target Start/End: Original strand, 13728 - 13782
Alignment:
Q  340 tggtggttgatggttaaagtgacatcatcatc-aatttgaagtcaaggtggagaa 393  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || | |||| |||||||||||||||||    
T  13728 tggtggttgatggttaaattgacatcaccaccaaattagaagtcaaggtggagaa 13782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 340 - 393
Target Start/End: Original strand, 18607 - 18661
Alignment:
Q  340 tggtggttgatggttaaagtgacatcatcatc-aatttgaagtcaaggtggagaa 393  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || | |||| |||||||||||||||||    
T  18607 tggtggttgatggttaaattgacatcaccaccaaattagaagtcaaggtggagaa 18661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 341 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 32828 - 32779
Alignment:
Q  341 ggtggttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaaggtgga 390  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||| |||||    
T  32828 ggtggttgatggttaaattgacatcatcacctatttaaagtcaaagtgga 32779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1899 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1899
Description:

Target: scaffold1899; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 55 - 138
Target Start/End: Original strand, 1075 - 1159
Alignment:
Q  55 ttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtacaattatg-ggggccttgggtgttatgctcta 138  Q
    ||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||| | ||||  || ||||||||| |||||||||    
T  1075 ttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaaggaccttgggtgctatgctcta 1159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1764 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1764
Description:

Target: scaffold1764; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 346 - 394
Target Start/End: Original strand, 1059 - 1107
Alignment:
Q  346 ttgatggttaaagtgacatcatcatcaatttgaagtcaaggtggagaat 394  Q
    |||||||||||| || ||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  1059 ttgatggttaaattggcatcatcactgatttgaagtcaaggtggagaat 1107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University