View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9015_low_29 (Length: 352)

Name: NF9015_low_29
Description: NF9015
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9015_low_29
NF9015_low_29
[»] chr4 (38 HSPs)
chr4 (53-188)||(17982851-17982986)
chr4 (221-333)||(33091638-33091750)
chr4 (221-333)||(37206612-37206724)
chr4 (228-333)||(23755603-23755708)
chr4 (221-333)||(19088526-19088638)
chr4 (221-333)||(41878044-41878156)
chr4 (221-333)||(44957542-44957654)
chr4 (221-333)||(44991463-44991575)
chr4 (221-334)||(23755984-23756097)
chr4 (221-333)||(8592122-8592234)
chr4 (221-333)||(30683713-30683825)
chr4 (221-333)||(38339645-38339757)
chr4 (221-333)||(46849854-46849966)
chr4 (221-333)||(50508642-50508754)
chr4 (221-333)||(50768974-50769086)
chr4 (221-333)||(53995119-53995231)
chr4 (221-333)||(1433456-1433568)
chr4 (221-333)||(14985484-14985596)
chr4 (225-333)||(15477830-15477938)
chr4 (221-333)||(24898342-24898454)
chr4 (221-330)||(12817959-12818068)
chr4 (221-330)||(21763369-21763478)
chr4 (221-330)||(42855527-42855636)
chr4 (221-333)||(16037979-16038091)
chr4 (221-333)||(19508598-19508710)
chr4 (221-333)||(25181997-25182109)
chr4 (221-333)||(43734471-43734583)
chr4 (221-333)||(53751087-53751199)
chr4 (221-330)||(623867-623976)
chr4 (232-333)||(6505721-6505822)
chr4 (221-330)||(43566566-43566675)
chr4 (221-333)||(6712116-6712228)
chr4 (221-333)||(41752001-41752113)
chr4 (221-333)||(39448673-39448785)
chr4 (221-333)||(52557272-52557384)
chr4 (228-333)||(36122618-36122723)
chr4 (221-333)||(53259323-53259435)
chr4 (284-333)||(8398215-8398264)
[»] chr2 (22 HSPs)
chr2 (53-188)||(2996595-2996730)
chr2 (221-333)||(2148071-2148183)
chr2 (221-333)||(15744610-15744722)
chr2 (221-333)||(19815889-19816001)
chr2 (221-333)||(26181885-26181997)
chr2 (221-333)||(8174070-8174182)
chr2 (221-333)||(13193141-13193253)
chr2 (221-333)||(19847504-19847615)
chr2 (221-333)||(24372152-24372264)
chr2 (221-333)||(29472395-29472507)
chr2 (221-333)||(34735528-34735640)
chr2 (221-333)||(15405941-15406053)
chr2 (221-333)||(16305178-16305290)
chr2 (221-333)||(7469319-7469431)
chr2 (221-333)||(41474235-41474347)
chr2 (221-333)||(7496165-7496276)
chr2 (221-333)||(36713741-36713850)
chr2 (220-312)||(38332856-38332948)
chr2 (221-310)||(24138714-24138803)
chr2 (221-333)||(10992004-10992116)
chr2 (221-333)||(17052211-17052319)
chr2 (221-308)||(12860577-12860664)
[»] chr6 (26 HSPs)
chr6 (72-195)||(32221294-32221417)
chr6 (221-333)||(5310979-5311091)
chr6 (221-333)||(7270782-7270894)
chr6 (221-333)||(5639358-5639470)
chr6 (221-333)||(2517155-2517267)
chr6 (221-333)||(7270106-7270218)
chr6 (221-332)||(34890797-34890908)
chr6 (221-333)||(5937998-5938110)
chr6 (221-333)||(32993200-32993312)
chr6 (221-333)||(34994565-34994677)
chr6 (222-333)||(3423355-3423466)
chr6 (220-333)||(31247268-31247381)
chr6 (221-333)||(9046239-9046351)
chr6 (221-325)||(18053109-18053213)
chr6 (221-321)||(26600510-26600610)
chr6 (221-319)||(24744481-24744579)
chr6 (220-333)||(31237898-31238011)
chr6 (221-333)||(21856740-21856852)
chr6 (221-333)||(25176842-25176954)
chr6 (221-333)||(35167675-35167789)
chr6 (221-333)||(26957115-26957227)
chr6 (221-333)||(6236106-6236218)
chr6 (221-328)||(6137568-6137675)
chr6 (221-333)||(32753330-32753438)
chr6 (221-310)||(21540185-21540274)
chr6 (221-253)||(6532345-6532377)
[»] chr3 (37 HSPs)
chr3 (221-333)||(54752316-54752428)
chr3 (221-333)||(8474031-8474143)
chr3 (221-333)||(26318367-26318479)
chr3 (221-333)||(42591937-42592049)
chr3 (221-333)||(51509304-51509416)
chr3 (221-333)||(10506133-10506245)
chr3 (221-333)||(22151998-22152110)
chr3 (226-333)||(41835111-41835218)
chr3 (221-333)||(11256256-11256368)
chr3 (221-333)||(32633250-32633362)
chr3 (221-329)||(54108091-54108199)
chr3 (221-333)||(12203736-12203848)
chr3 (221-333)||(21969782-21969894)
chr3 (221-333)||(21992218-21992330)
chr3 (221-333)||(22201769-22201881)
chr3 (221-333)||(29818330-29818442)
chr3 (233-333)||(46152778-46152878)
chr3 (221-332)||(47669412-47669523)
chr3 (221-330)||(39951510-39951619)
chr3 (221-333)||(5900608-5900720)
chr3 (221-333)||(15986388-15986499)
chr3 (221-333)||(16931759-16931871)
chr3 (221-333)||(39241511-39241623)
chr3 (231-333)||(53716456-53716558)
chr3 (221-333)||(18464609-18464721)
chr3 (221-333)||(39664369-39664481)
chr3 (221-333)||(44893893-44894005)
chr3 (221-333)||(47303204-47303315)
chr3 (221-333)||(1994354-1994465)
chr3 (221-333)||(27801642-27801754)
chr3 (228-333)||(21568905-21569010)
chr3 (221-333)||(4757679-4757790)
chr3 (221-333)||(4773395-4773507)
chr3 (221-333)||(24428720-24428832)
chr3 (235-333)||(19883406-19883505)
chr3 (283-333)||(28986345-28986395)
chr3 (229-267)||(28986393-28986431)
[»] chr7 (27 HSPs)
chr7 (221-333)||(48626248-48626360)
chr7 (221-333)||(7579057-7579169)
chr7 (221-333)||(19681680-19681792)
chr7 (221-333)||(44332704-44332816)
chr7 (232-335)||(35146881-35146984)
chr7 (223-333)||(31638128-31638238)
chr7 (221-330)||(17359334-17359443)
chr7 (221-333)||(34037096-34037208)
chr7 (221-333)||(41453190-41453302)
chr7 (221-333)||(43247568-43247680)
chr7 (221-332)||(33716741-33716852)
chr7 (221-333)||(6356918-6357030)
chr7 (224-333)||(8542655-8542764)
chr7 (221-330)||(21391378-21391487)
chr7 (221-333)||(41191867-41191982)
chr7 (221-333)||(8937034-8937146)
chr7 (221-333)||(28297972-28298084)
chr7 (221-333)||(36423522-36423634)
chr7 (221-333)||(10526464-10526575)
chr7 (221-330)||(28286305-28286414)
chr7 (221-333)||(41751803-41751915)
chr7 (221-333)||(40673192-40673302)
chr7 (221-333)||(6356438-6356550)
chr7 (271-330)||(17363437-17363496)
chr7 (221-330)||(1114207-1114307)
chr7 (271-333)||(17750120-17750182)
chr7 (288-320)||(43247742-43247774)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (221-333)||(349226-349338)
scaffold0003 (220-321)||(113518-113619)
[»] chr8 (25 HSPs)
chr8 (221-333)||(45276781-45276893)
chr8 (221-333)||(15048552-15048664)
chr8 (221-333)||(27473256-27473368)
chr8 (221-333)||(38588740-38588852)
chr8 (221-333)||(1432284-1432396)
chr8 (221-333)||(15871806-15871918)
chr8 (221-333)||(33295869-33295981)
chr8 (221-333)||(11707935-11708047)
chr8 (229-328)||(40048216-40048315)
chr8 (221-333)||(5152719-5152831)
chr8 (221-333)||(7535018-7535130)
chr8 (221-333)||(7949565-7949676)
chr8 (221-320)||(27669569-27669668)
chr8 (221-316)||(45077405-45077500)
chr8 (225-333)||(37569499-37569608)
chr8 (221-330)||(44594789-44594898)
chr8 (221-333)||(5435085-5435197)
chr8 (224-333)||(1870089-1870200)
chr8 (238-333)||(34470714-34470809)
chr8 (221-333)||(1646692-1646804)
chr8 (221-333)||(1651757-1651869)
chr8 (221-333)||(1740133-1740245)
chr8 (235-333)||(24659381-24659479)
chr8 (221-294)||(11173858-11173931)
chr8 (221-333)||(18298425-18298526)
[»] chr5 (15 HSPs)
chr5 (221-333)||(36440385-36440497)
chr5 (221-333)||(32288262-32288374)
chr5 (221-333)||(2183096-2183208)
chr5 (221-333)||(35569965-35570077)
chr5 (221-333)||(34264533-34264645)
chr5 (230-333)||(37424447-37424550)
chr5 (233-333)||(16860605-16860705)
chr5 (221-333)||(24040270-24040384)
chr5 (220-333)||(27186025-27186138)
chr5 (221-333)||(9989476-9989588)
chr5 (233-331)||(16860490-16860588)
chr5 (221-333)||(29199137-29199249)
chr5 (221-333)||(38958909-38959021)
chr5 (221-311)||(25567195-25567285)
chr5 (221-333)||(11316111-11316219)
[»] chr1 (31 HSPs)
chr1 (221-333)||(37284913-37285025)
chr1 (221-332)||(12127239-12127350)
chr1 (223-333)||(26707381-26707491)
chr1 (221-333)||(9006376-9006488)
chr1 (221-333)||(20306155-20306267)
chr1 (221-333)||(27400609-27400721)
chr1 (221-333)||(49140328-49140440)
chr1 (221-333)||(1762859-1762971)
chr1 (221-333)||(12481244-12481356)
chr1 (221-333)||(37304181-37304293)
chr1 (221-333)||(45052874-45052986)
chr1 (222-333)||(27547854-27547965)
chr1 (224-333)||(44322816-44322925)
chr1 (221-333)||(16024050-16024162)
chr1 (221-333)||(37576334-37576446)
chr1 (221-333)||(2064396-2064508)
chr1 (221-333)||(6797992-6798104)
chr1 (221-333)||(35612267-35612379)
chr1 (221-333)||(37585878-37585990)
chr1 (221-327)||(31703767-31703873)
chr1 (221-333)||(3089495-3089607)
chr1 (221-333)||(8762584-8762696)
chr1 (221-333)||(25995937-25996049)
chr1 (221-333)||(49643856-49643968)
chr1 (219-333)||(4697067-4697181)
chr1 (220-329)||(38127861-38127970)
chr1 (221-333)||(23476526-23476638)
chr1 (221-310)||(4330045-4330134)
chr1 (221-330)||(39486390-39486490)
chr1 (221-263)||(45843372-45843414)
chr1 (62-110)||(3250747-3250794)
[»] scaffold0340 (1 HSPs)
scaffold0340 (221-333)||(18426-18538)
[»] scaffold0221 (1 HSPs)
scaffold0221 (221-333)||(8581-8693)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (221-333)||(50661-50773)
[»] scaffold0182 (1 HSPs)
scaffold0182 (221-333)||(19861-19973)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (221-333)||(82043-82155)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (221-332)||(45909-46020)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (221-333)||(20904-21015)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (221-333)||(15601-15713)
[»] scaffold0186 (1 HSPs)
scaffold0186 (221-333)||(24315-24427)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (221-333)||(14320-14432)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (221-333)||(72915-73026)
[»] scaffold0115 (1 HSPs)
scaffold0115 (221-333)||(21664-21776)
[»] scaffold0246 (1 HSPs)
scaffold0246 (221-331)||(6151-6258)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 128; Significance: 4e-66; HSPs: 38)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 53 - 188
Target Start/End: Original strand, 17982851 - 17982986
Alignment:
Q  53 atcaagaaggagatctattgggcatgtaatcaaccaactaatttatgattttcgtgttagatatcttttttagggaataactattgttgataatggagaa 152  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17982851 atcaggaaggagatctattgggcatgtaatcaaccaactaatttatgattttcgtgttagatatcttttttagggaataactattgttgataatggagaa 17982950  T
Q  153 aacataagattattctttgaaacaagagaaaagcat 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17982951 aacataagattattctttgaaacaagggaaaagcat 17982986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 33091750 - 33091638
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33091750 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 33091651  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  33091650 tggttcatatgta 33091638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 37206724 - 37206612
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  37206724 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattctttgttaaggtattatgattaaatagtggctgatattattggtaactttta 37206625  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  37206624 tggttcatatgta 37206612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 228 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 23755708 - 23755603
Alignment:
Q  228 ggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttca 327  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23755708 ggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaattgttatggttca 23755609  T
Q  328 tatgta 333  Q
    ||||||    
T  23755608 tatgta 23755603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 19088638 - 19088526
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19088638 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcttattccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 19088539  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  19088538 tggttcatatgta 19088526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 41878156 - 41878044
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41878156 ttatgtgggtcctccaactttatttattagtatcattttggtcatattatttgttaaggtattatgattaaatattgactgatattattggtaactgtta 41878057  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  41878056 tggttcatatgta 41878044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Original strand, 44957542 - 44957654
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44957542 ttatgtggatcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgccttgataatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 44957641  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  44957642 tggttcatatgta 44957654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 44991575 - 44991463
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44991575 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 44991476  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  44991475 tggttcatatgta 44991463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 221 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 23756097 - 23755984
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23756097 ttatgtggatcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgttttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgtta 23755998  T
Q  321 tggttcatatgtaa 334  Q
    ||||||||||||||    
T  23755997 tggttcatatgtaa 23755984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Original strand, 8592122 - 8592234
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8592122 ttatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaaggtattatgattaaatagtgacggatattattggtaactgtta 8592221  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  8592222 tggttcatatgta 8592234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 30683825 - 30683713
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  30683825 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgacttatattattggcaactgtta 30683726  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  30683725 tggttcatatgta 30683713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Original strand, 38339645 - 38339757
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  38339645 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgacacatattattggtaactgtta 38339744  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  38339745 tggttcatatgta 38339757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 46849966 - 46849854
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  46849966 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttattccttgttaagatattatgattaaatagtgaccgatattattggtaactgtta 46849867  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  46849866 tggttcatatgta 46849854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 50508754 - 50508642
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50508754 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtattattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactaatattattggtaactgtta 50508655  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  50508654 tggttcatatgta 50508642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Original strand, 50768974 - 50769086
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50768974 ttatgtggatcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 50769073  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  50769074 tggttcatatgta 50769086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 53995231 - 53995119
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  53995231 ttatgtgggtcctctaactttatttattaatatcattttggtcctattccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgata 53995132  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  53995131 tggttcatatgta 53995119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 1433568 - 1433456
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1433568 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttatggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactatta 1433469  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  1433468 tggttcatatgta 1433456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Original strand, 14985484 - 14985596
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14985484 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatgccttgttaaagtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactctta 14985583  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    ||| |||||||||    
T  14985584 tggctcatatgta 14985596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 225 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 15477938 - 15477830
Alignment:
Q  225 gtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggt 324  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15477938 gtgggtcctctaactttgtttattagtatcattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactcatattattggtaactgttatggt 15477839  T
Q  325 tcatatgta 333  Q
    |||||||||    
T  15477838 tcatatgta 15477830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Original strand, 24898342 - 24898454
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24898342 ttatgtgcgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcacatgtcttgttaatgtattatgattaaatagtgactaatattattggtaactgtta 24898441  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  24898442 tggttcatatgta 24898454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 221 - 330
Target Start/End: Original strand, 12817959 - 12818068
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||    
T  12817959 ttatgtgggtcctgtaactttatttatcagtatcattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgacggatattattgttaaatgtta 12818058  T
Q  321 tggttcatat 330  Q
    ||||||||||    
T  12818059 tggttcatat 12818068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 221 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 21763478 - 21763369
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21763478 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgtttttatttcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 21763379  T
Q  321 tggttcatat 330  Q
    ||||||||||    
T  21763378 tggttcatat 21763369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 221 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 42855636 - 42855527
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  42855636 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctattcctcgttaaggtattatgattaaataatgactgatattattggtaactgttg 42855537  T
Q  321 tggttcatat 330  Q
    ||||||||||    
T  42855536 tggttcatat 42855527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 16038091 - 16037979
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  16038091 ttatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaaggtattatgattaagtagtgacggatattattggtaattgtta 16037992  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  16037991 tggttcatatgta 16037979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 19508710 - 19508598
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  19508710 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatgattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaacagtgactgatattattagtaactgtta 19508611  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    ||||||| |||||    
T  19508610 tggttcacatgta 19508598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 25182109 - 25181997
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25182109 ttatgtgggtcctctaactttatttattaacatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattggtaactgtta 25182010  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  25182009 tggttcatatgta 25181997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 43734583 - 43734471
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43734583 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaaatattatgattaaatagtgactgatattatttgtaactgtta 43734484  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    ||||| |||||||    
T  43734483 tggtttatatgta 43734471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 53751199 - 53751087
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  53751199 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtataattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgacttatattattggtaactgtta 53751100  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    || ||||||||||    
T  53751099 tgattcatatgta 53751087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 221 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 623976 - 623867
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  623976 ttatgtggatcctctaactttatttattagcatcattttggtcttattccttgttaagatattatgattaaatagtgacagatattattggtaactgtta 623877  T
Q  321 tggttcatat 330  Q
    ||||||||||    
T  623876 tggttcatat 623867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 232 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 6505822 - 6505721
Alignment:
Q  232 ctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcatatg 331  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6505822 ctctaattttatttattagtatcattttggtcctatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcatatg 6505723  T
Q  332 ta 333  Q
    ||    
T  6505722 ta 6505721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 221 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 43566675 - 43566566
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||   ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43566675 ttatgtgggtcctcaaactttatttattagtatcattttggtcctatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgattgatattattggtaactgtta 43566576  T
Q  321 tggttcatat 330  Q
    ||||||||||    
T  43566575 tggttcatat 43566566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Original strand, 6712116 - 6712228
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | | || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6712116 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctgtgccttattaagatattatgattaaatagtgactgatattattggtaaatgtta 6712215  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  6712216 tggttcatatgta 6712228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 41752113 - 41752001
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| |||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41752113 ttatgtgggtcctctaattttatttattaatatcattttgatcatatgccttgctaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 41752014  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    || ||||||||||    
T  41752013 tgattcatatgta 41752001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 39448785 - 39448673
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||    
T  39448785 ttatctgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgacaaatattattggtaactctta 39448686  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  39448685 tggttcatatgta 39448673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 52557384 - 52557272
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  52557384 ttatgtggatcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtaactgatattattggtaattgtta 52557285  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |  ||||||||||    
T  52557284 taattcatatgta 52557272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 228 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 36122723 - 36122618
Alignment:
Q  228 ggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttca 327  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  36122723 ggtcctctaactatatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaaggtattatgactaaatagtgattgatattattggtagctgatatggttca 36122624  T
Q  328 tatgta 333  Q
    ||||||    
T  36122623 tatgta 36122618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 53259435 - 53259323
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| | |||    
T  53259435 ttatgtgagtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaacaatgagtgatattattggtaattatta 53259336  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  53259335 tggttcatatgta 53259323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 284 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 8398264 - 8398215
Alignment:
Q  284 atgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcatatgta 333  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  8398264 atgactaaatagtgactgatattattgataactattatggtttatatgta 8398215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 128; Significance: 4e-66; HSPs: 22)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 53 - 188
Target Start/End: Original strand, 2996595 - 2996730
Alignment:
Q  53 atcaagaaggagatctattgggcatgtaatcaaccaactaatttatgattttcgtgttagatatcttttttagggaataactattgttgataatggagaa 152  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2996595 atcaggaaggagatctattgggcatgtaatcaaccaactaatttatgattttcgtgttagatatcttttttagggaataactattgttgataatggagaa 2996694  T
Q  153 aacataagattattctttgaaacaagagaaaagcat 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2996695 aacataagattattctttgaaacaagggaaaagcat 2996730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 2148183 - 2148071
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2148183 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 2148084  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  2148083 tggttcatatgta 2148071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Original strand, 15744610 - 15744722
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15744610 ttatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtcatattccttgttaaggtattatgattaaatagtgacggatattattggtaactgtta 15744709  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  15744710 tggttcatatgta 15744722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 19816001 - 19815889
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19816001 ttatgtgggtcctctgactttatttattagtatcattttgctcatattccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 19815902  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  19815901 tggttcatatgta 19815889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 26181997 - 26181885
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26181997 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagtaactgtta 26181898  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  26181897 tggttcatatgta 26181885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 8174182 - 8174070
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8174182 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgtttttattccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaattgtta 8174083  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  8174082 tggttcatatgta 8174070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Original strand, 13193141 - 13193253
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  13193141 ttatgttggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaataatgactcatattattggtaactgtta 13193240  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  13193241 tggttcatatgta 13193253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 19847615 - 19847504
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19847615 ttatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtcatattccttgttaa-gaattatgattaaatagtgaccgatattattggtaactgtta 19847517  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  19847516 tggttcatatgta 19847504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 24372264 - 24372152
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  24372264 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctattcctttttaaagtattatgattaaattgtgactgatattattggtaactgttt 24372165  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  24372164 tggttcatatgta 24372152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Original strand, 29472395 - 29472507
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29472395 ttatgtgagtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaattgtta 29472494  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    | |||||||||||    
T  29472495 tagttcatatgta 29472507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 34735640 - 34735528
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  34735640 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctattccttgttaaggtattaggattaaatagtgactgatataattgataactgtta 34735541  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  34735540 tggttcatatgta 34735528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 15406053 - 15405941
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||   ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15406053 ttatgtgagtcctctaactttatttattagtattattttggtcatatgtcttgttaaggtattatgattaaacagtgactgatattattggtaactgtta 15405954  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  15405953 tggttcatatgta 15405941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Original strand, 16305178 - 16305290
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||   |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16305178 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgtcttgttaagatattatgattaaatagtgattgatattattggtaactgtta 16305277  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  16305278 tggttcatatgta 16305290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Original strand, 7469319 - 7469431
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||    
T  7469319 ttatgtgggtcctctaactttatttactagtatcattttggtcctattccttgttaaggtattatgattaaatagttagtgatattattgttaaccgtta 7469418  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  7469419 tggttcatatgta 7469431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Original strand, 41474235 - 41474347
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || ||| | ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41474235 ttatgtgggtcatctaactttatttattagtatcattttgatcctatgccttgttaaggtattataattaaatagtgactgatagtattggtaactgtta 41474334  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  41474335 tggttcatatgta 41474347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 7496276 - 7496165
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7496276 ttatgtgggttctctaactttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaa-gaattatgagtaaatagtgaccgatattattggtaactgtta 7496178  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  7496177 tggttcatatgta 7496165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Original strand, 36713741 - 36713850
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||  ||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36713741 ttatgtgggtcctctaactttatttattagt--cattttggttctatgccttgttaaggtattatgattaa-tagtgactgatattattggtaactgtta 36713837  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  36713838 tggttcatatgta 36713850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 220 - 312
Target Start/End: Original strand, 38332856 - 38332948
Alignment:
Q  220 tttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38332856 tttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatgccttgttaagatattatgattaaatagtgactgatattattggt 38332948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 221 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 24138803 - 24138714
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattg 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24138803 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatgccttgttaagatattatgattaaatagtgactgatattattg 24138714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Original strand, 10992004 - 10992116
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||   ||| |||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||    
T  10992004 ttatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtcctatgtcttgctaagatattatgattaaatagtgacaaatattattggtaactctta 10992103  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  10992104 tggttcatatgta 10992116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Original strand, 17052211 - 17052319
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||      ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  17052211 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttaac----gttaaggtattatgattaaataatgactgatattatagataactgtta 17052306  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  17052307 tggttcatatgta 17052319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 221 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 12860664 - 12860577
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattat 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  12860664 ttatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaaggtattatgattaaatagtgacgggtattat 12860577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 26)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 72 - 195
Target Start/End: Original strand, 32221294 - 32221417
Alignment:
Q  72 gggcatgtaatcaaccaactaatttatgattttcgtgttagatatcttttttagggaataactattgttgataatggagaaaacataagattattctttg 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32221294 gggcatgtaatcaaccaactaatttatgattttcgtgttagatatcttttttagggaacaactgttgttgataatggagaaaacataagattattctttg 32221393  T
Q  172 aaacaagagaaaagcattgtctat 195  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||    
T  32221394 aaacaagggaaaagcattgcctat 32221417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Original strand, 5310979 - 5311091
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5310979 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcattgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactatta 5311078  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  5311079 tggttcatatgta 5311091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Original strand, 7270782 - 7270894
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7270782 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 7270881  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  7270882 tggttcatatgta 7270894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 5639470 - 5639358
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5639470 ttatgtgggttctctaactttatttattagtatcattttggtcatattccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaattgtta 5639371  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  5639370 tggttcatatgta 5639358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Original strand, 2517155 - 2517267
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  2517155 ttatgtgggtcctccaactttatttataagaatcattttggtcatattctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattagtggtaattgtta 2517254  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  2517255 tggttcatatgta 2517267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Original strand, 7270106 - 7270218
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  7270106 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaaagtattatgattaaatagtgactgatattgttgataactgtta 7270205  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  7270206 tggttcatatgta 7270218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 221 - 332
Target Start/End: Original strand, 34890797 - 34890908
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34890797 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaaagtattatgattaaataatgactgatattattggtaactgtta 34890896  T
Q  321 tggttcatatgt 332  Q
    || |||||||||    
T  34890897 tgattcatatgt 34890908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 5938110 - 5937998
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5938110 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggttctatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactatta 5938011  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  5938010 tggttcatatgta 5937998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 32993312 - 32993200
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32993312 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtgttatgattaaataatgactgatattattggtaactgtta 32993213  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  32993212 tggttcatatgta 32993200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 34994677 - 34994565
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34994677 ttatgcgggtcctctaacttgatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 34994578  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  34994577 tggttcatatgta 34994565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 222 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 3423466 - 3423355
Alignment:
Q  222 tatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttat 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3423466 tatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattacgattaaatagtgaccgatattattggtaactgttat 3423367  T
Q  322 ggttcatatgta 333  Q
    ||||||||||||    
T  3423366 ggttcatatgta 3423355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 220 - 333
Target Start/End: Original strand, 31247268 - 31247381
Alignment:
Q  220 tttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtt 319  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||    
T  31247268 tttatgtgagtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatattccttgttaaggtattatgattaaataatgacagatattattggtaactatt 31247367  T
Q  320 atggttcatatgta 333  Q
    ||||||||||||||    
T  31247368 atggttcatatgta 31247381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Original strand, 9046239 - 9046351
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9046239 ttatgtgggtcctctaaatttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaagctattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 9046338  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    || ||||||||||    
T  9046339 tgattcatatgta 9046351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 221 - 325
Target Start/End: Original strand, 18053109 - 18053213
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18053109 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaattgtta 18053208  T
Q  321 tggtt 325  Q
    |||||    
T  18053209 tggtt 18053213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 221 - 321
Target Start/End: Original strand, 26600510 - 26600610
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26600510 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattccttattaaggtattatgattaaatagtgaccgatattattggtaactgtta 26600609  T
Q  321 t 321  Q
    |    
T  26600610 t 26600610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 221 - 319
Target Start/End: Original strand, 24744481 - 24744579
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtt 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24744481 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatttcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtt 24744579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 220 - 333
Target Start/End: Original strand, 31237898 - 31238011
Alignment:
Q  220 tttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtt 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||    
T  31237898 tttatgtgggtcctctaactttatttattagtattattttgatcatgttccttgttaaggtattatgattaaataatgacagatattattgttaactgtt 31237997  T
Q  320 atggttcatatgta 333  Q
    ||||||||||||||    
T  31237998 atggttcatatgta 31238011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 21856852 - 21856740
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||    
T  21856852 ttatatgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtcttattccttgttaaggtattatgattaaacagtgacggatattattgataactgtta 21856753  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  21856752 tggttcatatgta 21856740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 25176954 - 25176842
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  25176954 ttatgtggggcctctaactttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacaaatattattggtaactgtta 25176855  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  25176854 tggttcatatgta 25176842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 35167789 - 35167675
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattat--gattaaatagtgactgatattattggtaactgt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || || ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35167789 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttagtcctaatccttgttaaggtattatatgattaaatagtgactgatattaatggtaactgt 35167690  T
Q  319 tatggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||||    
T  35167689 tatggttcatatgta 35167675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Original strand, 26957115 - 26957227
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26957115 ttatgggggtcctctagctttatttattagtatcattttggtcctatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaagtgtta 26957214  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    || ||||||||||    
T  26957215 tgattcatatgta 26957227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 6236218 - 6236106
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| | |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6236218 ttatgtgaatcctctaacttcatttattagtatcatcttggtcctatgccttgttaagatattatgattaaatagtgaccgatattattggtaactgtta 6236119  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  6236118 tggttcatatgta 6236106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 221 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 6137675 - 6137568
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   | |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  6137675 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatatctcgttaagatattatgattaaatagtgagtgatattatttgtaattgtta 6137576  T
Q  321 tggttcat 328  Q
    || |||||    
T  6137575 tgtttcat 6137568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Original strand, 32753330 - 32753438
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |    |||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32753330 ttatgtgggtcctctaactgtatttattagtataa----ggtcctatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaagtgtta 32753425  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    || ||||||||||    
T  32753426 tgattcatatgta 32753438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 221 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 21540274 - 21540185
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattg 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||| | |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21540274 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcctatgccttgttaagatattatgattaaatagtgattgatattattg 21540185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 221 - 253
Target Start/End: Original strand, 6532345 - 6532377
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtat 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6532345 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtat 6532377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 37)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Original strand, 54752316 - 54752428
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54752316 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 54752415  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  54752416 tggttcatatgta 54752428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 8474143 - 8474031
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8474143 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgtta 8474044  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  8474043 tggttcatatgta 8474031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 26318479 - 26318367
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26318479 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattctttgttaaggtattatgattaaatagtgactaatattattggtaactgtta 26318380  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  26318379 tggttcatatgta 26318367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Original strand, 42591937 - 42592049
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42591937 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 42592036  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  42592037 tggttcatatgta 42592049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 51509416 - 51509304
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51509416 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 51509317  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  51509316 tggttcatatgta 51509304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 10506245 - 10506133
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10506245 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaattgtta 10506146  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  10506145 tggttcatatgta 10506133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Original strand, 22151998 - 22152110
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22151998 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctattcattgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactatta 22152097  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  22152098 tggttcatatgta 22152110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 226 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 41835218 - 41835111
Alignment:
Q  226 tgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggtt 325  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41835218 tgggtcatctaactttatttattagtatcattttggtcatattccttgttaatgtattttgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggtt 41835119  T
Q  326 catatgta 333  Q
    ||||||||    
T  41835118 catatgta 41835111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Original strand, 11256256 - 11256368
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11256256 ttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 11256355  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  11256356 tggttcatatgta 11256368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 32633362 - 32633250
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32633362 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatttcttgttaagatattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 32633263  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    || ||||||||||    
T  32633262 tgattcatatgta 32633250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 221 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 54108199 - 54108091
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54108199 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 54108100  T
Q  321 tggttcata 329  Q
    |||||||||    
T  54108099 tggttcata 54108091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 12203848 - 12203736
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12203848 ttatgtgggacctctaactttatttattagtatcattttggtaatatgttttgttaaggtattatgattaaacagtgactgatattattggtaactgtta 12203749  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  12203748 tggttcatatgta 12203736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Original strand, 21969782 - 21969894
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21969782 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcgttttggtcttattccttgttaaggtattatgtttaaatagtgactgatattattggtaactatta 21969881  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  21969882 tggttcatatgta 21969894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Original strand, 21992218 - 21992330
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21992218 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcgttttggtcttattccttgttaaggtattatgtttaaatagtgactgatattattggtaactatta 21992317  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  21992318 tggttcatatgta 21992330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Original strand, 22201769 - 22201881
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  22201769 ttatgtgagtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactaatattattggtaactatta 22201868  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  22201869 tggttcatatgta 22201881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Original strand, 29818330 - 29818442
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29818330 ttatatggatcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgttttattaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 29818429  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  29818430 tggttcatatgta 29818442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 233 - 333
Target Start/End: Original strand, 46152778 - 46152878
Alignment:
Q  233 tctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcatatgt 332  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46152778 tctaactttatttattagtatcattttggtcatattccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaacggttatggttcatatgt 46152877  T
Q  333 a 333  Q
    |    
T  46152878 a 46152878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 221 - 332
Target Start/End: Original strand, 47669412 - 47669523
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  47669412 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattccttgttaagatattatgattaaatagtgatagatattattgataactgtta 47669511  T
Q  321 tggttcatatgt 332  Q
    ||||||||||||    
T  47669512 tggttcatatgt 47669523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 221 - 330
Target Start/End: Original strand, 39951510 - 39951619
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39951510 ttatgtgggtcctttaactttatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaagatattatgattaaatagtgactgatattattgataactgtta 39951609  T
Q  321 tggttcatat 330  Q
    ||||||||||    
T  39951610 tggttcatat 39951619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 5900720 - 5900608
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  5900720 ttatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaaggtattatgattaaatagtgacggatatttttggtaattgtta 5900621  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  5900620 tggttcatatgta 5900608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Original strand, 15986388 - 15986499
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15986388 ttatgtgggttctctaactttatttattagtatcattttggtcctattcgt-gttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactatta 15986486  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  15986487 tggttcatatgta 15986499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Original strand, 16931759 - 16931871
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  16931759 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgtcttgttaaggtattaagattaaatagttactgatattattggtagctgtta 16931858  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  16931859 tggttcatatgta 16931871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Original strand, 39241511 - 39241623
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  39241511 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataattgtta 39241610  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  39241611 tggttcatatgta 39241623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 231 - 333
Target Start/End: Original strand, 53716456 - 53716558
Alignment:
Q  231 cctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcatat 330  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53716456 cctctaactttatttattagtatcattttggtcctatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcatat 53716555  T
Q  331 gta 333  Q
    |||    
T  53716556 gta 53716558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Original strand, 18464609 - 18464721
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    |||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18464609 ttatgtaggtcctatagctttatttattagtatcattttggtcatatgcattgttaaggtattatggttaaatagtgactgatattattggtaactgtta 18464708  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||| ||||||    
T  18464709 tggttcctatgta 18464721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 39664481 - 39664369
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  39664481 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggttctatgccttgttaaggtattatgattaaataatgactgatattattggtaaatgtta 39664382  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    | |||||||||||    
T  39664381 tagttcatatgta 39664369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Original strand, 44893893 - 44894005
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  44893893 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgtcttgttaagatattatgatcaaatagtgactgatatcattggtaattgtta 44893992  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  44893993 tggttcatatgta 44894005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 47303315 - 47303204
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47303315 ttatgtgggtcctctaactttatttatta-tatcattttgatcatatgccttattaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 47303217  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    || ||||||||||    
T  47303216 tgattcatatgta 47303204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 1994465 - 1994354
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  1994465 ttatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaa-gaattatgattaaatagtgagcgatattattgataactgtta 1994367  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  1994366 tggttcatatgta 1994354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Original strand, 27801642 - 27801754
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  27801642 ttatgtggatcctctaactttatttattaatatcattttggttctatgccttgttaaagtattatgattaaatagtgactgatattattgataattgtta 27801741  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  27801742 tggttcatatgta 27801754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 228 - 333
Target Start/End: Original strand, 21568905 - 21569010
Alignment:
Q  228 ggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttca 327  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  21568905 ggtcctctaaccttatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaagatattatgattaaatagtgactaatattattggtaactataatggttca 21569004  T
Q  328 tatgta 333  Q
    ||||||    
T  21569005 tatgta 21569010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 4757790 - 4757679
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||| ||| ||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4757790 ttatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattttggttctattccttgataa-gaattatgatcaaatagtgaccgatattattggtaactgtta 4757692  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  4757691 tggttcatatgta 4757679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Original strand, 4773395 - 4773507
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||   | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4773395 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatattattggtaattgtta 4773494  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    || ||||| ||||    
T  4773495 tgtttcatttgta 4773507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Original strand, 24428720 - 24428832
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| || ||| | || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24428720 ttatgtggatcctctaacttaatttattagtatcattttgctcctatgccttcttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactatta 24428819  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    || ||||||||||    
T  24428820 tgcttcatatgta 24428832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 235 - 333
Target Start/End: Original strand, 19883406 - 19883505
Alignment:
Q  235 taactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatatt-attggtaactgttatggttcatatgta 333  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  ||    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  19883406 taactttatttattagtatcattttggttctaagtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattaattggtaaatgttatggttcatatgta 19883505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 283 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 28986395 - 28986345
Alignment:
Q  283 tatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28986395 tatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcatatgta 28986345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 28986431 - 28986393
Alignment:
Q  229 gtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatat 267  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28986431 gtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatat 28986393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 27)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 48626360 - 48626248
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48626360 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 48626261  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  48626260 tggttcatatgta 48626248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 7579169 - 7579057
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7579169 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttattccttgttaaggtattatgattaaatagtgattgatattattggtaactgtta 7579070  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  7579069 tggttcatatgta 7579057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 19681792 - 19681680
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19681792 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatttcttgttaatgcattatgattaaatattgactgatattattggtaactgtta 19681693  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  19681692 tggttcatatgta 19681680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 44332816 - 44332704
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44332816 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 44332717  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  44332716 tggttcatatgta 44332704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 232 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 35146984 - 35146881
Alignment:
Q  232 ctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcatatg 331  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35146984 ctctaactttatttatcaatatcattttggtcatattccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcatatg 35146885  T
Q  332 taag 335  Q
    ||||    
T  35146884 taag 35146881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 223 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 31638238 - 31638128
Alignment:
Q  223 atgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatg 322  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31638238 atgtggatcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatg 31638139  T
Q  323 gttcatatgta 333  Q
    |||||||||||    
T  31638138 gttcatatgta 31638128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 221 - 330
Target Start/End: Original strand, 17359334 - 17359443
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17359334 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatttcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 17359433  T
Q  321 tggttcatat 330  Q
    ||||||||||    
T  17359434 tggttcatat 17359443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 34037208 - 34037096
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34037208 ttatgtgggtcctctaactttatttattaatatcattttggtcatattttttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattatttgtaactgtta 34037109  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    || ||||||||||    
T  34037108 tgattcatatgta 34037096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 41453302 - 41453190
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41453302 ttatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaaggtattatgattaaatagtgacggatattattggtaactgtta 41453203  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  41453202 tggttcatatgta 41453190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Original strand, 43247568 - 43247680
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  43247568 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgcattgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattactggtaactggta 43247667  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  43247668 tggttcatatgta 43247680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 221 - 332
Target Start/End: Original strand, 33716741 - 33716852
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||   ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33716741 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatgtcttgttaaggtattatgattaaataatgactgatattattggtaactgtta 33716840  T
Q  321 tggttcatatgt 332  Q
    ||||||||||||    
T  33716841 tggttcatatgt 33716852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Original strand, 6356918 - 6357030
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  6356918 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggttctattccttgttaaggtattatgattaaacagtgattgatattattgataactgtta 6357017  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  6357018 tggttcatatgta 6357030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 224 - 333
Target Start/End: Original strand, 8542655 - 8542764
Alignment:
Q  224 tgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatgg 323  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  8542655 tgtgggtcttctaactttatttattagcatcattttggtcatattccttgttaaggtattatgattaaatattgacggatattactggtaactgttatgg 8542754  T
Q  324 ttcatatgta 333  Q
    ||||||||||    
T  8542755 ttcatatgta 8542764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 221 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 21391487 - 21391378
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| || ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21391487 ttatgtggatcatctaactttatttattagtatcattttgatcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 21391388  T
Q  321 tggttcatat 330  Q
    ||||||||||    
T  21391387 tggttcatat 21391378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 41191982 - 41191867
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatat---tattggtaactg 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||     
T  41191982 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatttcttattaaggtattatgattaaatagtgactgatattattattggtaacta 41191883  T
Q  318 ttatggttcatatgta 333  Q
    ||||||||||||||||    
T  41191882 ttatggttcatatgta 41191867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 8937146 - 8937034
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  8937146 ttatgtgggttctctaactttatttattaatatcatgttggtcatattccttgttaaggtattgtgattaaatagtgattgatattattggtaactgttt 8937047  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  8937046 tggttcatatgta 8937034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Original strand, 28297972 - 28298084
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||    
T  28297972 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgactagttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattaataactttta 28298071  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  28298072 tggttcatatgta 28298084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Original strand, 36423522 - 36423634
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | | ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  36423522 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatacctggttaaggtattatgatcaaatagtgactgatactatcggtaactgtta 36423621  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  36423622 tggttcatatgta 36423634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Original strand, 10526464 - 10526575
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || |  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10526464 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccaatgc-ctgttaaggtattatgattaaatattgactgatattattggtaactgtta 10526562  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    || ||||||||||    
T  10526563 tgtttcatatgta 10526575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 221 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 28286414 - 28286305
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |    
T  28286414 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggaactattccttcttaaggtattatgattaaatagtgaccgatattattggcaactgtaa 28286315  T
Q  321 tggttcatat 330  Q
    ||||||||||    
T  28286314 tggttcatat 28286305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Original strand, 41751803 - 41751915
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||   |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41751803 ttatgtggatcttctaactttatttattagtattattttggtcctatgtcttgttaagttattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 41751902  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    || ||||||||||    
T  41751903 tgattcatatgta 41751915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 40673302 - 40673192
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||| | ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40673302 ttatgtgggtcctctaactttatttattagta--attttagtcatatgccttgttaaagtattagaattaaatagtgactgatattattggtaagtgtta 40673205  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    || ||||||||||    
T  40673204 tgattcatatgta 40673192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Original strand, 6356438 - 6356550
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||   | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6356438 ttatatgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatattattggtaattgtta 6356537  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    || ||||| ||||    
T  6356538 tgtttcatttgta 6356550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 271 - 330
Target Start/End: Original strand, 17363437 - 17363496
Alignment:
Q  271 ttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcatat 330  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17363437 ttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcatat 17363496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 221 - 330
Target Start/End: Original strand, 1114207 - 1114307
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| ||||| |         ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  1114207 ttatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattgtggtcctattcct---------attatgattaaatagtgacgggtattattggtaactgtta 1114297  T
Q  321 tggttcatat 330  Q
    ||||||||||    
T  1114298 tggttcatat 1114307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 271 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 17750182 - 17750120
Alignment:
Q  271 ttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcatatgta 333  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  17750182 ttgttaaggtattatgattaaataatgactgatattattgataacttttatagttcatatgta 17750120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 288 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 43247774 - 43247742
Alignment:
Q  288 ttaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43247774 ttaaatagtgacttatattattggtaactgtta 43247742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Original strand, 349226 - 349338
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  349226 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattccttgttaaggtattatgattaaatattgactgatattattggtaactgtta 349325  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  349326 tggttcatatgta 349338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 220 - 321
Target Start/End: Original strand, 113518 - 113619
Alignment:
Q  220 tttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtt 319  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  113518 tttatgtggctcctctaactttatttattagtatcattttggttctatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgctaattgtt 113617  T
Q  320 at 321  Q
    ||    
T  113618 at 113619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 25)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 45276893 - 45276781
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  45276893 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattccttgttaaagtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactatta 45276794  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  45276793 tggttcatatgta 45276781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Original strand, 15048552 - 15048664
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  15048552 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattatttgttaaggtattatgattaaataatgattgatattattggtaactgtta 15048651  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  15048652 tggttcatatgta 15048664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 27473368 - 27473256
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27473368 ttatgtaggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttattccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 27473269  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  27473268 tggttcatatgta 27473256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Original strand, 38588740 - 38588852
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38588740 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 38588839  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  38588840 tggttcatatgta 38588852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Original strand, 1432284 - 1432396
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1432284 ttatttgggtcctctaactttatttattaatatcattttgatcatatgccttgttaatgtattatgtttaaatagtgactgatattattggtaactgtta 1432383  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  1432384 tggttcatatgta 1432396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 15871918 - 15871806
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15871918 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 15871819  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||| ||||    
T  15871818 tggttcatgtgta 15871806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 33295981 - 33295869
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33295981 ttatgtgagtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatattccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgtta 33295882  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    || ||||||||||    
T  33295881 tgattcatatgta 33295869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 11708047 - 11707935
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || |||  |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11708047 ttatgtgggtcatctaactttatttattagtatcattttgatcttatgttttgttaaggtattatgattaaataatgactgatattattggtaactgtta 11707948  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  11707947 tggttcatatgta 11707935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 229 - 328
Target Start/End: Original strand, 40048216 - 40048315
Alignment:
Q  229 gtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcat 328  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  40048216 gtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcattgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataaccgttatggttcat 40048315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 5152831 - 5152719
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | || |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  5152831 ttatatgggtcctctaactttatttactagtatcattttggtcatatgccttcttaaggtattatgattaaatagtgacaaatattattggtaactgtta 5152732  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  5152731 tggttcatatgta 5152719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 7535130 - 7535018
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  7535130 ttatgtgagtcctctagctttatttattagtatcattttggtcttattcctcgttaacgtattatgattaaataatgactgatattatttgtaactgtta 7535031  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  7535030 tggttcatatgta 7535018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Original strand, 7949565 - 7949676
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  7949565 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactg-ta 7949663  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    | |||||||||||    
T  7949664 ttgttcatatgta 7949676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 221 - 320
Target Start/End: Original strand, 27669569 - 27669668
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27669569 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatataccttgttaaattattatgattaaatagtgactgatgttattggtaactgtta 27669668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 221 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 45077500 - 45077405
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaact 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45077500 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaact 45077405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 225 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 37569608 - 37569499
Alignment:
Q  225 gtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgatt-aaatagtgactgatattattggtaactgttatgg 323  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37569608 gtgggttctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgtcttgttaaggtattatgattaaaatagtgactgatatgattggtaactgttatgg 37569509  T
Q  324 ttcatatgta 333  Q
    ||||||||||    
T  37569508 ttcatatgta 37569499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 221 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 44594898 - 44594789
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44594898 ttatgtggatcctctaactttatttattagtattattttggttctatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 44594799  T
Q  321 tggttcatat 330  Q
    ||||||||||    
T  44594798 tggttcatat 44594789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 5435197 - 5435085
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  5435197 ttatgtgggtcatctaactttatttattagtatcattttggtcatatgcctagttaaggtattataattaaataatgacaaatattattggtaactgtta 5435098  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  5435097 tggttcatatgta 5435085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 224 - 333
Target Start/End: Original strand, 1870089 - 1870200
Alignment:
Q  224 tgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattat--gattaaatagtgactgatattattggtaactgttat 321  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  1870089 tgtgggtcccctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttattaatgtattatatgattaaatagtgactgatattattagtaaccgttat 1870188  T
Q  322 ggttcatatgta 333  Q
    ||||||||||||    
T  1870189 ggttcatatgta 1870200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 238 - 333
Target Start/End: Original strand, 34470714 - 34470809
Alignment:
Q  238 ctttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcatatgta 333  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  34470714 ctttatttattagtatcattttgatcatattccttgttaaggtattatgattaaatagtgacagatattattggtaactgttatgattcttatgta 34470809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 1646804 - 1646692
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |    
T  1646804 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatattatgggtaattgtaa 1646705  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    || ||||| ||||    
T  1646704 tgtttcatttgta 1646692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 1651869 - 1651757
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||   | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  1651869 ttatgtgggtcctctaactttatttgttagtatcattttggtcatatatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatattattggtaattctta 1651770  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    || ||||| ||||    
T  1651769 tgtttcatttgta 1651757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 1740245 - 1740133
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||   | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  1740245 ttatgtgggtcctctaactttatttgttagtatcattttggtcatatatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatattattggtaattctta 1740146  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    || ||||| ||||    
T  1740145 tgtttcatttgta 1740133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 235 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 24659479 - 24659381
Alignment:
Q  235 taactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcatatgta 333  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| | | | || |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||    
T  24659479 taactttatttattagtatcattttggtcctctgccttattaaggtattctgattaaatagtgactgatattattactaactgttatagttaatatgta 24659381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 221 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 11173931 - 11173858
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaata 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||| ||||||||| ||||||||| ||||||    
T  11173931 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcatttgggttctatgctttgttaaggtattatgaataaata 11173858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 18298526 - 18298425
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||           | |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  18298526 ttatgtgagtcctctaactttatttattagtatcattttaatcat-----------aggtattatgattaaatagtgacaaatattattagtaactgtta 18298438  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    || ||||||||||    
T  18298437 tgattcatatgta 18298425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 15)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 36440497 - 36440385
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36440497 ttatatgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcattgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 36440398  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  36440397 tggttcatatgta 36440385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 32288374 - 32288262
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32288374 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtattattttggtcatatgccttgttaaagtattatgattaaatagtgattgatattattggtaactgtta 32288275  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  32288274 tggttcatatgta 32288262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Original strand, 2183096 - 2183208
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2183096 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatatcttgttaaagtattatgattaaatagtgactaatattattggtaactgtta 2183195  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    ||||| |||||||    
T  2183196 tggtttatatgta 2183208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 35570077 - 35569965
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35570077 ttatgtgagtcctctaactttatttattagtatcatttcggtcttattccttgttaagttattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 35569978  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  35569977 tggttcatatgta 35569965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 34264645 - 34264533
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34264645 ttatgtgggtcctctaactttatttattaatatcattttggttctatgccttgttaagatattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 34264546  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  34264545 tggttcatatgta 34264533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 230 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 37424550 - 37424447
Alignment:
Q  230 tcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcata 329  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37424550 tcctctaactttatttattaatatcattttggtcctattttttgttaagatattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcata 37424451  T
Q  330 tgta 333  Q
    ||||    
T  37424450 tgta 37424447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 233 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 16860705 - 16860605
Alignment:
Q  233 tctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcatatgt 332  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16860705 tctaactttatttattagtatcattttggtcttatgtcttgttaatgtattatgattaattagtgactgatattattggtaactgttatggttcatatgt 16860606  T
Q  333 a 333  Q
    |    
T  16860605 a 16860605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 24040384 - 24040270
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcat--tttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgt 318  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24040384 ttatgtgggtcttctaactttatttattagtatcatattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactat 24040285  T
Q  319 tatggttcatatgta 333  Q
    ||| |||||||||||    
T  24040284 tattgttcatatgta 24040270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 220 - 333
Target Start/End: Original strand, 27186025 - 27186138
Alignment:
Q  220 tttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtt 319  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  27186025 tttatgtgggtcctctaattttattaattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgaatggtattattggtaattgtt 27186124  T
Q  320 atggttcatatgta 333  Q
    ||||||||||||||    
T  27186125 atggttcatatgta 27186138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Original strand, 9989476 - 9989588
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||   || |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||    
T  9989476 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatgtcttattaaggtattatgattaaacagtgactaatattattggtaattgtta 9989575  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  9989576 tggttcatatgta 9989588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 233 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 16860588 - 16860490
Alignment:
Q  233 tctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcatatg 331  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||   ||   |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16860588 tctaactttatttattagtatcattttggttccatgtcttgttaagatattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcatatg 16860490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 29199249 - 29199137
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    |||||||| || |||||| |||||||| |||||||||||  |  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  29199249 ttatgtggatcttctaacattatttattagtatcattttaattctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatgttattgataactgtta 29199150  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    || ||||||||||    
T  29199149 tgattcatatgta 29199137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 38959021 - 38958909
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||   | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38959021 ttatgtgagtcctctaactttatttataagtatcattttggtcttatatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatattattggtaattgtta 38958922  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
     | ||||| ||||    
T  38958921 cgtttcatttgta 38958909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 221 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 25567285 - 25567195
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattgg 311  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25567285 ttatgtgagtcctctaactttatttattagtattattttagtcatatgccttgttaaagtattatgattaaatagtgactaatattattgg 25567195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Original strand, 11316111 - 11316219
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    | ||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  11316111 ttatgtaggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatg---tcttaaca-attatgattaaatattgacttatattattggtaactgtta 11316206  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  11316207 tggttcatatgta 11316219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 31)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 37285025 - 37284913
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37285025 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 37284926  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  37284925 tggttcatatgta 37284913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 221 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 12127350 - 12127239
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12127350 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattccttgttaaggtattatgattaaatagtgattgatattattggtaactgtta 12127251  T
Q  321 tggttcatatgt 332  Q
    ||||||||||||    
T  12127250 tggttcatatgt 12127239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 223 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 26707491 - 26707381
Alignment:
Q  223 atgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatg 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26707491 atgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatg 26707392  T
Q  323 gttcatatgta 333  Q
    |||||||||||    
T  26707391 gttcatatgta 26707381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 9006488 - 9006376
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9006488 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatgccttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 9006389  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    | |||||||||||    
T  9006388 tagttcatatgta 9006376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Original strand, 20306155 - 20306267
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20306155 ttatgtgagtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 20306254  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  20306255 tggttcatatgta 20306267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 27400721 - 27400609
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27400721 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttagtcttatgccttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 27400622  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  27400621 tggttcatatgta 27400609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 49140440 - 49140328
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49140440 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggttatattccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 49140341  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    || ||||||||||    
T  49140340 tgattcatatgta 49140328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 1762971 - 1762859
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1762971 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaaagtgttctgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 1762872  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  1762871 tggttcatatgta 1762859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 12481356 - 12481244
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12481356 ttatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaaggtattatgattaaatagtgacggatattattggtaactgtta 12481257  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  12481256 tggttcatatgta 12481244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Original strand, 37304181 - 37304293
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37304181 ttatgagggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactaatattattggtaactgtta 37304280  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  37304281 tggttcatatgta 37304293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 45052986 - 45052874
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45052986 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 45052887  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    ||||| |||||||    
T  45052886 tggtttatatgta 45052874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 222 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 27547965 - 27547854
Alignment:
Q  222 tatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttat 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27547965 tatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtactatgctttgttaaagtattatgattaaatagtgactgatactattggtaactgttat 27547866  T
Q  322 ggttcatatgta 333  Q
    ||||||||||||    
T  27547865 ggttcatatgta 27547854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 224 - 333
Target Start/End: Original strand, 44322816 - 44322925
Alignment:
Q  224 tgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatgg 323  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44322816 tgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatgccttgttaaggtattatgattaaattgtgactgatattattggtaactgttatgg 44322915  T
Q  324 ttcatatgta 333  Q
    ||||||||||    
T  44322916 ttcatatgta 44322925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Original strand, 16024050 - 16024162
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16024050 ttatgagggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgccttgttgaggtattatgattaaatagtgactaatattattggtaactgtta 16024149  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  16024150 tggttcatatgta 16024162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Original strand, 37576334 - 37576446
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37576334 ttatgtgggtcctctaactttatttataagtatcattttggtcctattccttgttaaggtattaggattaaatagtgaccgatattattggtaactgtta 37576433  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    || ||||||||||    
T  37576434 tgattcatatgta 37576446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 2064508 - 2064396
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||   ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  2064508 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactactattattggtaactgtta 2064409  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  2064408 tggttcatatgta 2064396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 6798104 - 6797992
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  6798104 ttatgagggtcctctaattttatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactaatattattggtaattgtta 6798005  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  6798004 tggttcatatgta 6797992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 35612379 - 35612267
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35612379 ttatgttggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaaatgtta 35612280  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    || ||||||||||    
T  35612279 tgattcatatgta 35612267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 37585990 - 37585878
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||   |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37585990 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtattattttggtcatatgtcttgttaagatattatgattaaatagtgactgatattattagtaactgtta 37585891  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  37585890 tggttcatatgta 37585878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 221 - 327
Target Start/End: Original strand, 31703767 - 31703873
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31703767 ttatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattttggttctattccttgttaaggtattatgattaaatagtgacggatattattggtaactgtta 31703866  T
Q  321 tggttca 327  Q
    |||||||    
T  31703867 tggttca 31703873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Original strand, 3089495 - 3089607
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3089495 ttatgtggatcctataactttatttattagtatcattttggtcatatgtcttgttaaagtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgtta 3089594  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    || ||||||||||    
T  3089595 tgattcatatgta 3089607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 8762696 - 8762584
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  8762696 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgtcttgttaaggtattatgaataaatagtaactgatattattggtaaatgtta 8762597  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    | |||||||||||    
T  8762596 tagttcatatgta 8762584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Original strand, 25995937 - 25996049
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25995937 ttatgtggatcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatgccttgttaaggtaatatgattaaatagtggctgatattattggtaactgtta 25996036  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    || ||||||||||    
T  25996037 tgattcatatgta 25996049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 49643968 - 49643856
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || ||| | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  49643968 ttatgtgggttctctaactttatttattagtatcattttgatcctatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgagtgatattattggtaactgcta 49643869  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  49643868 tggttcatatgta 49643856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 219 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 4697181 - 4697067
Alignment:
Q  219 atttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgt 318  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4697181 atttatttcggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcctatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgt 4697082  T
Q  319 tatggttcatatgta 333  Q
    |||| ||||||||||    
T  4697081 tatgattcatatgta 4697067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 220 - 329
Target Start/End: Original strand, 38127861 - 38127970
Alignment:
Q  220 tttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtt 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  38127861 tttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttattaaggtattatgattaaatagtgaatgatattattagtaactgtt 38127960  T
Q  320 atggttcata 329  Q
    || |||||||    
T  38127961 atagttcata 38127970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 23476638 - 23476526
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||   ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  23476638 ttatgtgagtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgattgatattattgataattgtta 23476539  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  23476538 tggttcatatgta 23476526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 221 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 4330134 - 4330045
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattg 310  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  4330134 ttatgtgggtcttctaactttatttattagtatcattttaatcatattccttgttaaggtattatggttaaatagtggctgatatcattg 4330045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 221 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 39486490 - 39486390
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |         |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||    
T  39486490 ttatatgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatgc---------gtattatgattaaatagtgattgatattattagtaactatta 39486400  T
Q  321 tggttcatat 330  Q
    ||||||||||    
T  39486399 tggttcatat 39486390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 221 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 45843414 - 45843372
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtc 263  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||    
T  45843414 ttatgtgggtcctctagctttttttattagtatcattttggtc 45843372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 62 - 110
Target Start/End: Original strand, 3250747 - 3250794
Alignment:
Q  62 gagatctattgggcatgtaatcaaccaactaatttatgattttcgtgtt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||    
T  3250747 gagatctattgggcatgtaatcaa-caactagtttatggttttcttgtt 3250794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0340 (Bit Score: 89; Significance: 8e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0340
Description:

Target: scaffold0340; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Original strand, 18426 - 18538
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18426 ttatgtgggtcctctaattttatttattagtatcattttggtcatatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 18525  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  18526 tggttcatatgta 18538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0221 (Bit Score: 89; Significance: 8e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0221
Description:

Target: scaffold0221; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Original strand, 8581 - 8693
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8581 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 8680  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||| ||||    
T  8681 tggttcatgtgta 8693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 89; Significance: 8e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 50773 - 50661
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50773 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 50674  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||| ||||||    
T  50673 tggttcttatgta 50661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0182 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0182
Description:

Target: scaffold0182; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Original strand, 19861 - 19973
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  19861 ttatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtcatattccttgttaaggttttatgattaaatagtgacggatattattgataactgtta 19960  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  19961 tggttcatatgta 19973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 82155 - 82043
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  82155 ttatgtgggtcctctaactttatttattaatatcattttggtcctatttcttgttaagatattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 82056  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  82055 tggttcatatgta 82043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 84; Significance: 7e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 221 - 332
Target Start/End: Original strand, 45909 - 46020
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45909 ttatgtgggtcctctaactttacttattagtttcattttggtcatattccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 46008  T
Q  321 tggttcatatgt 332  Q
    || || ||||||    
T  46009 tgatttatatgt 46020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Original strand, 20904 - 21015
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20904 ttatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaa-gaattatgattaaatagtgaccgatattattggtaactgtta 21002  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  21003 tggttcatatgta 21015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Original strand, 15601 - 15713
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15601 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcatttttgtcctatgccttgttaagatattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 15700  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||| ||||||    
T  15701 tggttcgtatgta 15713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0186
Description:

Target: scaffold0186; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Original strand, 24315 - 24427
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| | ||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24315 ttatgtgggtcctctaactttatttattaacatcattttggtcctgttccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattggtaactgtta 24414  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  24415 tggttcatatgta 24427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 14432 - 14320
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||    
T  14432 ttatctgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgacaaatattattggtaactctta 14333  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  14332 tggttcatatgta 14320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Original strand, 72915 - 73026
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  72915 ttatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtcttattccttgttaa-gaattatgattaaatagtgaccaatattattggtaactgtta 73013  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    |||||||||||||    
T  73014 tggttcatatgta 73026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0115 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0115
Description:

Target: scaffold0115; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Original strand, 21664 - 21776
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||   | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21664 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctcgttaaaatattatgattaaatagtgactgatattattggtaattgtta 21763  T
Q  321 tggttcatatgta 333  Q
    || ||||| ||||    
T  21764 tgtttcatttgta 21776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0246 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0246
Description:

Target: scaffold0246; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 221 - 331
Target Start/End: Original strand, 6151 - 6258
Alignment:
Q  221 ttatgtgggtcctctaactttatttatcagtatcattttggtcatattctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtta 320  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||    
T  6151 ttatgtggatcctctaactttatttat---tatcattttgatcatatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataattatta 6247  T
Q  321 tggttcatatg 331  Q
    || ||| ||||    
T  6248 tgtttcttatg 6258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University