View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9018_low_4 (Length: 575)

Name: NF9018_low_4
Description: NF9018
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9018_low_4
NF9018_low_4
[»] chr6 (18 HSPs)
chr6 (10-556)||(13930704-13931250)
chr6 (156-513)||(14020982-14021336)
chr6 (153-502)||(13894381-13894731)
chr6 (212-501)||(14106024-14106315)
chr6 (153-513)||(14108774-14109132)
chr6 (316-518)||(14083063-14083265)
chr6 (192-398)||(14023895-14024103)
chr6 (338-513)||(13474371-13474547)
chr6 (402-502)||(13876520-13876621)
chr6 (253-513)||(13910159-13910423)
chr6 (169-374)||(13876313-13876520)
chr6 (404-502)||(13864005-13864104)
chr6 (384-484)||(14013600-14013700)
chr6 (435-501)||(14023814-14023880)
chr6 (82-159)||(14109147-14109222)
chr6 (153-230)||(14045993-14046070)
chr6 (257-316)||(14013714-14013773)
chr6 (72-137)||(14021376-14021439)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 543; Significance: 0; HSPs: 18)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 543; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 13931250 - 13930704
Alignment:
Q  10 attattcttcgtcatattgtgttaacacttaatctattatatagggtggcagaatactgtgcatctttactgaagggtactcgatagttcgttggtggtg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13931250 attattcttcgtcatattgtgttaacacttaatctattatatagggtggcagaatactgtgcatctttactgaagggtactcgatagttcgttggtggtg 13931151  T
Q  110 gatcagtttaaggtctgtgcagtaaaagtcctactctagaaagatgaatggtttatgatttatttgcattgtaactattcggagatgatttctccttgct 209  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13931150 gatcagattaaggtctgtgcagtaaaagtcctactctagaaagatgaatggtttatgatttatttgcattgtaactattcggagatgatttctccttgct 13931051  T
Q  210 cccaacatgtctcaaaacactatttttctttaatatacaatctggacgtgcaaacgacaccctgttttacacatccggattgtgtaatccggacaaattt 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13931050 cccaacatgtctcaaaacactatttttctttaatatacaatctggacgtgcaaacgacaccctgttttacacatccggattgtgtaatccggacaaattt 13930951  T
Q  310 agtgttttgagagacgttgaggggagaggagaaacaatccactaggaaatagattgttggggtgtatctttgtaatatgtggttatgtcatttttctctt 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13930950 agtgttttgagagacgttgaggggagaggagaaacaatccactaggaaatagattgttggggtgtatctttgtaatatgtggttatgtcatttttctctt 13930851  T
Q  410 atgtattagtctcttgttgaattgagttgtaacttgcactaccttttgtattctctgtcatttatttatgcaataaacatttgtgaagtattcaacgagt 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13930850 atgtattagtctcttgttgaattgagttgtaacttgcactaccttttgtattctctgtcatttatttatgcaataaacatttgtgaagtattcaacgagt 13930751  T
Q  510 aaaagttaccttttgtactctctttataatagttcttagttctcaca 556  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13930750 aaaagttaccttttgtactctctttataatagttcttagttctcaca 13930704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 156 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 14021336 - 14020982
Alignment:
Q  156 aatggtttatgatttatttgcattgtaactattcggagatgatttctccttgctcccaacatgtctcaaaacactatttttcttt--aatatacaatctg 253  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| | |  | | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||   ||| |||  | |||||||||      
T  14021336 aatggtttgtgaattatttgcattgtaaatctaggaacatgatttctcctcgctcctaacatgtctcaaaacactcggtttgttttgattatacaatcca 14021237  T
Q  254 gacgtgcaaacgacaccctgttttacacatccggattgtgtaatccggacaaatttagtgttttgagagacgttgaggggagaggagaaacaatccacta 353  Q
    ||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||         |||||| ||||| ||  || ||||||| |||  |||    
T  14021236 gacatgcaaaagacaccttgttttacacatctggattgtgtaatcgggacaaatt---------gagagatgttgatggccgaagagaaactatcttcta 14021146  T
Q  354 ggaaatagattgttggggtgtatctttgtaatatgtggttatgtcatttttctcttatgtattagtctcttgttgaattgagttgtaacttgcactacct 453  Q
    | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  14021145 gcaaatagatttttggggtgtctctttgtaatatgtggttatgtcatttatctcttatgtaatagtctcttgttgaattgagttgcaacttgcaatacct 14021046  T
Q  454 tttgt----attctctgtcatttatttatgcaataaacatttgtgaagtattcaacgagtaaaa 513  Q
    |||||    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||| || |||||||    
T  14021045 tttgtattaattctctgtaatttattcatgcaataaacattgttgaagtattctacaagtaaaa 14020982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 153 - 502
Target Start/End: Original strand, 13894381 - 13894731
Alignment:
Q  153 atgaatggtttatgatttatttgcattgtaactattcggagatgatttctccttgctcccaacatgtctcaaaacactatttttctttaatatacaatct 252  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |    |||||| ||||| | |   ||||||||||| ||||||||||||||||| | || | |||      
T  13894381 atgaatgttttatgaattatttgcattgtaactctagtaagatgacttctcatcgtctccaacatgtcttaaaacactatttttcttgattacaaaattc 13894480  T
Q  253 ggacgtgcaaacgacaccctgttttacacatccggattgtgtaatccggacaaatttagtgttttgagagacgttgaggggagaggagaaacaatccact 352  Q
    |||| |||||| ||||  |  |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||  |    
T  13894481 ggacttgcaaaagacaatccattttacacgtccggattgagtaattcggacaaattgtgtgttttgagagatgttgaggggcgaggagaaactatcctat 13894580  T
Q  353 aggaaatagattgttggggtgtatctttgtaatatgtggttatgtcatttttctcttatgtattagtctcttgttgaattgag-ttgtaacttgcactac 451  Q
    |  |||||||||| ||||||| || ||| |||||| |||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||| | |    
T  13894581 aataaatagattgatggggtgcatatttttaatatatggtcatgtcatttctcttttatgtactagtctcttgttgaatggagtttgcaacttgcaattc 13894680  T
Q  452 cttttgtattctctgtcatttatttatgcaataaacatttgtgaagtattc 502  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13894681 cttttgtattctctgtaatttatttatgcaataaacattggtgaagtattc 13894731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 212 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 14106315 - 14106024
Alignment:
Q  212 caacatgtctcaaaacact--atttttctttaatatacaatctggacgtgcaaacgacaccctgttttacacatccggattgtgtaatccggacaaattt 309  Q
    |||||| |||| |||||||  |||| |||||| |||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||     
T  14106315 caacatatctcgaaacactgaatttatctttattatacaatctagacgtgcaattgacaccttgttttacacatccaaattgtgtaacccagacaaattc 14106216  T
Q  310 agtgttttgagagacgttgaggggagaggagaaacaatccactaggaaatagattgttggggtgtatctttgtaatatgtggttatgtcatttttctctt 409  Q
    ||| |||||||||| ||| ||||  |||||| | |||||| ||||  ||||||||| ||| || | |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  14106215 agtattttgagagatgttaagggccgaggagcagcaatcctctagcgaatagattggtggagtatctctttgtaatatatggttatgtcgtttatctctt 14106116  T
Q  410 atgtattagtctcttgttgaattgagttgtaacttgcactaccttttgtattctctgtcatttatttatgcaataaacatttgtgaagtatt 501  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  14106115 atgtactagtctgtcgttgaattgagttgcaacttgcaatgccttttgtattctctgtaatttattcatgcaataaacattggtggagtatt 14106024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 153 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 14109132 - 14108774
Alignment:
Q  153 atgaatggtttatgatttatttgcattgtaactattcggagatgatttctccttgctcccaacatgtctcaaaacact--atttttctttaatatacaat 250  Q
    ||||||| ||| ||| |||||||| |||||||| |    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||   ||||||||    
T  14109132 atgaatgatttgtgaattatttgctttgtaactctagaaagatgatttctccttgctcccaacatgtctcaaaacactcaatttgtcttgtttatacaat 14109033  T
Q  251 ctggacgtgcaaacgacaccctgttttacacatccggattgtgtaatccggacaaatttagtgttttgagagacgttgaggggagaggagaaacaatcca 350  Q
    | ||||||||||| |||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||         |||||| ||||| ||   | ||||||| |||      
T  14109032 ccggacgtgcaaaagacaccttattttagacatctggattctgtaatccggacaaatt---------gagagatgttgatggcttaagagaaactatctt 14108942  T
Q  351 ctaggaaatagattgtt-ggggtgtatctttgtaatatgtggttatgtcatttttctcttatgtattagt---ctcttgttgaattgagttgtaacttgc 446  Q
    || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||   ||||||||||||||||||| |||||||    
T  14108941 cttggaaatagattgttcggggtgtctctttgtaatatgtggttatgtcatttattgcttatgtaatagtgatctcttgttgaattgagttgcaacttgc 14108842  T
Q  447 actaccttttgta-ttctctgtcatttatttatgcaataaacatttgtgaagtattcaacgagtaaaa 513  Q
    | ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| || |||||||    
T  14108841 aataccttttgtatttctctgtaatttattcatgcaataaacttcggtgaagtattctacaagtaaaa 14108774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 316 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 14083265 - 14083063
Alignment:
Q  316 ttgagagacgttgaggggagaggagaaacaatccactaggaaatagattgttggggtgtatctttgtaatatgtggttatgtcatttttctcttatgtat 415  Q
    |||||||| ||||| ||  || ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||     
T  14083265 ttgagagatgttgatggccgaagagaaaccatcttctaggaaatagattgttggggtgtcactttgtaatatgtggttatgtcttttatcttttatgtaa 14083166  T
Q  416 tagtctcttgttgaattgagttgtaacttgcactaccttttgtattctctgtcatttatttatgcaataaacatttgtgaagtattcaacgagtaaaagt 515  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||| || ||||||| |    
T  14083165 tagtctcttgttgaattgagttgcaacatgcagtaccttttgtattctctgtaatttatttatgcaataaacaatgatgaagtattctacaagtaaaaat 14083066  T
Q  516 tac 518  Q
    |||    
T  14083065 tac 14083063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 192 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 14024103 - 14023895
Alignment:
Q  192 agatgatttctccttgctcccaacatgtctcaaaacactatttttctttaa--tatacaatctggacgtgcaaacgacaccctgttttacacatccggat 289  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||| | ||| | ||   || |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||    
T  14024103 agatgatttctccttgcccccaatatgtctcaaagaactttatttgtgtagattacacaatcaggatgtgcaaaagacaccctgttttacacgtcgggat 14024004  T
Q  290 tgtgtaatccggacaaatttagtgttttgagagacgttgaggggagaggagaaacaatccactaggaaatagattgttggggtgtatctttgtaatatgt 389  Q
    |||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||| ||||  ||||||||| ||| || | |||||||||||| |    
T  14024003 tgtgtaattcagacaaattgagtgttttgagagatgttgagggccgaggagaagcaatcctctagcgaatagattggtggagtatctctttgtaatatat 14023904  T
Q  390 ggttatgtc 398  Q
    |||||||||    
T  14023903 ggttatgtc 14023895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 338 - 513
Target Start/End: Original strand, 13474371 - 13474547
Alignment:
Q  338 gagaaacaatccactaggaaatagattgttggggtgtatctttgtaatatgtggttatgtcatttttctcttatgtattagtctcttgttgaattgagtt 437  Q
    ||||||| |||  |||| ||||||||||||||  ||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  13474371 gagaaactatcttctagaaaatagattgttggaatgtgtttttgtaatatgtgattatgtcatttatctcttatgttatagtctcttgttgaatcgagtt 13474470  T
Q  438 gtaacttgcactaccttttgtattctctgtcatttatt--tatgcaataaacatttgtgaagtattcaacgagtaaaa 513  Q
    | |||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||  |||||| || |||||||    
T  13474471 g-aacttgcaatagattttgtattctctgtaatttattcatatgcaataaacattggtggtgtattctacaagtaaaa 13474547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 402 - 502
Target Start/End: Original strand, 13876520 - 13876621
Alignment:
Q  402 tttctcttatgtattagtctcttgttgaattgagtt-gtaacttgcactaccttttgtattctctgtcatttatttatgcaataaacatttgtgaagtat 500  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| |  |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  13876520 tttctcttatgtagtagtctcttgttgaattgagtttgcaacttgcaatttcttttgtattctgtgtaatttatttatgccataaacattggtgaagtat 13876619  T
Q  501 tc 502  Q
    ||    
T  13876620 tc 13876621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 253 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 13910423 - 13910159
Alignment:
Q  253 ggacgtgcaaacgacaccctgttttacacatccggattgtgtaatccggacaaatttagtgttttgagagacgttgaggggagaggagaaacaatccact 352  Q
    ||||||||||  || |||||| ||||||| || ||||| ||||||| | | ||||| ||||||||||  || |||||||   |||||||||   ||| ||    
T  13910423 ggacgtgcaacagaaaccctgatttacacgtctggattttgtaatcggtaaaaattaagtgttttgaacga-gttgaggttggaggagaaagtttcctct 13910325  T
Q  353 aggaaatagattgttggggtgtatctttgtaatatg-----tggttatgtcatttttctcttatgtattagtctcttgttgaattgagttgtaacttgca 447  Q
    ||| |||||| || |||| | | ||||||||||||      || |||||| |||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||     
T  13910324 agggaatagaatggtgggctttctctttgtaatataatatatgattatgttatttatctctcatgtatcagtctcatgttgaattgagttgtaacttgcg 13910225  T
Q  448 ctaccttttgtattctctgtcatttatttatgcaataaacatttgtgaagtattcaacgagtaaaa 513  Q
     ||||||||||||||||| | ||| |   || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  13910224 ataccttttgtattctctataattcaagcatacaataaacattggtgaagtattctacaagtaaaa 13910159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 169 - 374
Target Start/End: Original strand, 13876313 - 13876520
Alignment:
Q  169 ttatttgcattgtaactattcggagatgatttctccttgctcccaacatgtctcaaaacact--atttttctttaatatacaatctggacgtgcaaacga 266  Q
    ||||||||||||||||| |    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||  |||| |||| | || | ||| ||||| |||||| ||    
T  13876313 ttatttgcattgtaactctagtaagatgatttcttcttacctccaacatgtctcaaaacacttgatttgtcttgattacaaaatttggacttgcaaaaga 13876412  T
Q  267 caccctgttttacacatccggattgtgtaatccggacaaatttagtgttttgagagacgttgaggggagaggagaaacaatccactaggaaatagattgt 366  Q
    |||||| |||||||| |||| ||| ||||||  |||||||||  ||||||| | ||| ||| ||||| |||||||||| ||||  |  |||||||||||     
T  13876413 caccctattttacacgtccgtattttgtaatttggacaaattgtgtgttttaatagatgttaaggggcgaggagaaactatcctatcagaaatagattga 13876512  T
Q  367 tggggtgt 374  Q
    ||||||||    
T  13876513 tggggtgt 13876520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 404 - 502
Target Start/End: Original strand, 13864005 - 13864104
Alignment:
Q  404 tctcttatgtattagtctcttgttgaattgagtt-gtaacttgcactaccttttgtattctctgtcatttatttatgcaataaacatttgtgaagtattc 502  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||    ||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  13864005 tctcttatgtagtagtctcttgttgaattgagtttgcaacttgcaagttcttttctattctgtgtaatttatttatgccataaacattggtgaagtattc 13864104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 384 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 14013700 - 14013600
Alignment:
Q  384 atatgtggttatgtcatttttctcttatgtattagtctcttgttgaattgagttgtaacttgcactaccttttgtattctctgtcatttatttatgcaat 483  Q
    |||| |||||||||||||| || | ||||||||||| |||  ||||||||||||| | | |||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  14013700 atatatggttatgtcatttatcacatatgtattagtttctacttgaattgagttgcagcatgcaataccatttgtattctctgtattttatttatgcaat 14013601  T
Q  484 a 484  Q
    |    
T  14013600 a 14013600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 435 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 14023880 - 14023814
Alignment:
Q  435 gttgtaacttgcactaccttttgtattctctgtcatttatttatgcaataaacatttgtgaagtatt 501  Q
    |||| |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  14023880 gttgcaacttgcaatgccttttgtattctctgtaatttattcatgcaataaacattgatgaagtatt 14023814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 14109222 - 14109147
Alignment:
Q  82 aagggtactcgatagttcgttggtggtggatcagtttaaggtctgtgcagtaaaagtcctactctagaaagatgaatg 159  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||||  ||||||  |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||    
T  14109222 aagggtactcgatagtgcgttcgtggtgaatcaaattaagg--tgtgcagtcaaagacctactctaggaagatgaatg 14109147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 153 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 14046070 - 14045993
Alignment:
Q  153 atgaatggtttatgatttatttgcattgtaactattcggagatgatttctccttgctcccaacatgtctcaaaacact 230  Q
    ||||||||||| ||| || |||||||||||| | |  | | |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  14046070 atgaatggtttgtgaattgtttgcattgtaaatctaggaacatgatttctcctcgctcccaacatgtttcaaaacact 14045993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 257 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 14013773 - 14013714
Alignment:
Q  257 gtgcaaacgacaccctgttttacacatccggattgtgtaatccggacaaatttagtgttt 316  Q
    ||||||| |||| || ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  14013773 gtgcaaaagacatcccgttttacatgtccggattgtgtaatccagacaaattgagtgttt 14013714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 72 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 14021439 - 14021376
Alignment:
Q  72 atctttactgaagggtactcgatagttcgttggtggtggatcagtttaaggtctgtgcagtaaaag 137  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||  |||||||| ||||    
T  14021439 atcttcactaaagggtactcgatagtgcgttggtggtgaatcagattaagg--tgtgcagtcaaag 14021376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University