View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9026_low_54 (Length: 297)

Name: NF9026_low_54
Description: NF9026
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9026_low_54
NF9026_low_54
[»] chr7 (55 HSPs)
chr7 (23-283)||(19613802-19614062)
chr7 (41-283)||(11387308-11387550)
chr7 (23-283)||(19148338-19148598)
chr7 (23-283)||(20747737-20747997)
chr7 (23-283)||(14263106-14263366)
chr7 (23-283)||(15101465-15101725)
chr7 (23-267)||(16071157-16071401)
chr7 (23-267)||(11305125-11305369)
chr7 (23-267)||(26117467-26117711)
chr7 (23-270)||(13022497-13022744)
chr7 (44-282)||(12205683-12205921)
chr7 (23-267)||(16949334-16949578)
chr7 (23-267)||(268-513)
chr7 (23-267)||(49153444-49153688)
chr7 (26-267)||(12457783-12458024)
chr7 (23-267)||(13967530-13967774)
chr7 (44-283)||(11236118-11236357)
chr7 (44-246)||(8708768-8708970)
chr7 (44-246)||(18550663-18550865)
chr7 (44-260)||(14333545-14333761)
chr7 (44-260)||(44790256-44790472)
chr7 (44-283)||(15159962-15160201)
chr7 (23-267)||(14285238-14285482)
chr7 (44-246)||(8199791-8199993)
chr7 (44-270)||(11771146-11771372)
chr7 (23-260)||(14955703-14955940)
chr7 (44-260)||(10872144-10872360)
chr7 (23-267)||(15341574-15341818)
chr7 (23-282)||(13666665-13666924)
chr7 (29-260)||(23202503-23202734)
chr7 (29-260)||(23508630-23508861)
chr7 (29-260)||(12688649-12688881)
chr7 (23-267)||(18052815-18053059)
chr7 (23-283)||(23504732-23504992)
chr7 (44-283)||(13687190-13687429)
chr7 (55-214)||(15147801-15147960)
chr7 (50-282)||(320948-321180)
chr7 (29-260)||(18178891-18179122)
chr7 (29-210)||(16208-16389)
chr7 (45-270)||(15204758-15204983)
chr7 (65-271)||(15625692-15625898)
chr7 (29-209)||(14212874-14213054)
chr7 (45-214)||(9597252-9597421)
chr7 (168-267)||(12456845-12456944)
chr7 (45-260)||(11552008-11552223)
chr7 (44-173)||(14040931-14041060)
chr7 (44-173)||(14350961-14351090)
chr7 (20-135)||(40027-40142)
chr7 (47-184)||(7825125-7825262)
chr7 (71-184)||(13455972-13456085)
chr7 (47-184)||(27106682-27106819)
chr7 (47-184)||(27171506-27171643)
chr7 (101-283)||(14434818-14435000)
chr7 (71-184)||(14937572-14937685)
chr7 (71-184)||(15365165-15365278)
[»] scaffold0076 (3 HSPs)
scaffold0076 (23-283)||(32555-32815)
scaffold0076 (23-267)||(55778-56022)
scaffold0076 (47-184)||(41525-41662)
[»] scaffold0028 (5 HSPs)
scaffold0028 (23-283)||(49392-49652)
scaffold0028 (47-260)||(44342-44555)
scaffold0028 (45-260)||(9665-9880)
scaffold0028 (45-214)||(16173-16342)
scaffold0028 (71-184)||(105499-105612)
[»] chr5 (55 HSPs)
chr5 (23-283)||(21679835-21680095)
chr5 (23-282)||(20822505-20822764)
chr5 (23-282)||(28893999-28894258)
chr5 (23-282)||(28915470-28915729)
chr5 (23-282)||(28922825-28923084)
chr5 (23-282)||(22463003-22463262)
chr5 (23-267)||(24619352-24619596)
chr5 (23-267)||(24715583-24715827)
chr5 (23-267)||(24748611-24748855)
chr5 (57-282)||(20774811-20775036)
chr5 (23-267)||(14886048-14886292)
chr5 (23-231)||(28930738-28930946)
chr5 (23-273)||(23079146-23079396)
chr5 (23-267)||(24797454-24797698)
chr5 (44-267)||(21563051-21563274)
chr5 (23-267)||(37542438-37542682)
chr5 (23-267)||(25849142-25849386)
chr5 (23-282)||(22234977-22235236)
chr5 (26-267)||(20343349-20343590)
chr5 (44-283)||(14998817-14999056)
chr5 (83-270)||(21830878-21831065)
chr5 (140-283)||(21889933-21890076)
chr5 (44-283)||(27684478-27684717)
chr5 (44-246)||(16357608-16357810)
chr5 (44-214)||(23472366-23472536)
chr5 (44-246)||(34567600-34567802)
chr5 (44-260)||(22331965-22332181)
chr5 (44-260)||(27519499-27519714)
chr5 (44-267)||(27667568-27667791)
chr5 (29-267)||(22503746-22503984)
chr5 (44-283)||(29475151-29475390)
chr5 (50-202)||(25427583-25427735)
chr5 (38-246)||(26737799-26738007)
chr5 (44-260)||(27611446-27611662)
chr5 (44-260)||(40709872-40710088)
chr5 (29-260)||(37290559-37290790)
chr5 (47-260)||(21408230-21408443)
chr5 (44-260)||(22135760-22135976)
chr5 (44-219)||(20467176-20467351)
chr5 (29-267)||(19771045-19771283)
chr5 (45-267)||(23574814-23575036)
chr5 (29-209)||(18776939-18777119)
chr5 (44-283)||(23441279-23441518)
chr5 (29-171)||(41772023-41772165)
chr5 (29-126)||(21497150-21497247)
chr5 (51-283)||(17268419-17268651)
chr5 (53-193)||(21338384-21338524)
chr5 (38-142)||(21872122-21872226)
chr5 (38-142)||(21876402-21876506)
chr5 (45-267)||(21882034-21882256)
chr5 (23-109)||(846-933)
chr5 (47-184)||(21936269-21936406)
chr5 (47-184)||(27012234-27012371)
chr5 (110-267)||(23517611-23517768)
chr5 (47-184)||(24582360-24582497)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (23-283)||(24179-24439)
scaffold0090 (23-283)||(20017-20277)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (15-283)||(6555-6823)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (23-283)||(113727-113987)
scaffold0029 (29-260)||(108695-108926)
scaffold0029 (194-279)||(95051-95136)
[»] chr3 (63 HSPs)
chr3 (23-283)||(13971223-13971483)
chr3 (23-283)||(14087439-14087699)
chr3 (23-283)||(10419148-10419408)
chr3 (23-259)||(17187164-17187400)
chr3 (23-267)||(14574705-14574949)
chr3 (23-267)||(47124726-47124970)
chr3 (23-283)||(16827306-16827566)
chr3 (23-267)||(17493412-17493656)
chr3 (23-267)||(28755100-28755344)
chr3 (23-267)||(31694289-31694533)
chr3 (23-276)||(16337615-16337868)
chr3 (23-267)||(31939685-31939929)
chr3 (23-282)||(12359630-12359889)
chr3 (23-282)||(13319605-13319864)
chr3 (44-282)||(15228416-15228654)
chr3 (44-282)||(15234284-15234522)
chr3 (23-283)||(16835613-16835873)
chr3 (26-267)||(16328766-16329007)
chr3 (23-267)||(11960272-11960516)
chr3 (44-260)||(15588527-15588743)
chr3 (44-260)||(20061189-20061405)
chr3 (44-246)||(16636566-16636768)
chr3 (44-246)||(43163890-43164092)
chr3 (44-260)||(5424065-5424281)
chr3 (44-260)||(10006379-10006595)
chr3 (44-252)||(48426234-48426442)
chr3 (20-258)||(14580053-14580291)
chr3 (45-183)||(16491317-16491455)
chr3 (44-260)||(15340048-15340264)
chr3 (44-260)||(15401652-15401868)
chr3 (47-246)||(15347383-15347582)
chr3 (44-270)||(15724069-15724295)
chr3 (44-260)||(10906989-10907205)
chr3 (44-260)||(13253469-13253685)
chr3 (44-267)||(15260402-15260625)
chr3 (29-267)||(53384138-53384376)
chr3 (29-246)||(6601529-6601746)
chr3 (50-183)||(17490706-17490839)
chr3 (23-283)||(44778013-44778273)
chr3 (27-270)||(18133453-18133696)
chr3 (20-209)||(16692994-16693183)
chr3 (23-267)||(41178304-41178548)
chr3 (23-153)||(12179234-12179364)
chr3 (138-267)||(11302991-11303120)
chr3 (23-283)||(13942790-13943050)
chr3 (45-214)||(14125730-14125899)
chr3 (23-260)||(16411396-16411633)
chr3 (38-246)||(12499041-12499249)
chr3 (23-283)||(16380031-16380291)
chr3 (51-258)||(15014898-15015105)
chr3 (45-258)||(14875635-14875848)
chr3 (45-214)||(16806083-16806252)
chr3 (81-246)||(16755757-16755922)
chr3 (83-267)||(4679220-4679404)
chr3 (128-246)||(26791618-26791736)
chr3 (44-177)||(15062580-15062713)
chr3 (47-184)||(30138671-30138808)
chr3 (47-184)||(30148222-30148359)
chr3 (47-184)||(8273537-8273674)
chr3 (47-184)||(13966482-13966619)
chr3 (71-184)||(15610968-15611081)
chr3 (47-184)||(16741841-16741978)
chr3 (71-184)||(18750809-18750922)
[»] chr6 (51 HSPs)
chr6 (15-283)||(19880299-19880567)
chr6 (23-283)||(18795691-18795951)
chr6 (15-272)||(34644598-34644855)
chr6 (44-283)||(21563173-21563412)
chr6 (44-283)||(21569032-21569271)
chr6 (23-283)||(15460337-15460597)
chr6 (23-270)||(21472615-21472862)
chr6 (23-282)||(19454422-19454681)
chr6 (23-270)||(8761953-8762200)
chr6 (29-273)||(5296232-5296476)
chr6 (44-270)||(19488313-19488539)
chr6 (23-267)||(10467869-10468113)
chr6 (23-267)||(24365429-24365673)
chr6 (23-270)||(14378937-14379184)
chr6 (23-270)||(14380487-14380734)
chr6 (44-282)||(15897096-15897334)
chr6 (45-282)||(20636343-20636580)
chr6 (44-267)||(22443284-22443507)
chr6 (44-246)||(16625758-16625960)
chr6 (29-267)||(27188453-27188691)
chr6 (29-267)||(27260549-27260787)
chr6 (44-246)||(29590961-29591163)
chr6 (44-267)||(22434886-22435109)
chr6 (44-282)||(22761496-22761734)
chr6 (44-270)||(23079483-23079709)
chr6 (29-210)||(25113626-25113807)
chr6 (125-270)||(25769205-25769350)
chr6 (44-252)||(24312209-24312417)
chr6 (44-231)||(2873844-2874031)
chr6 (24-267)||(19436019-19436262)
chr6 (23-184)||(28281833-28281994)
chr6 (50-202)||(18406991-18407143)
chr6 (47-177)||(16926684-16926814)
chr6 (29-267)||(28262223-28262461)
chr6 (29-267)||(28340972-28341210)
chr6 (47-260)||(1542128-1542341)
chr6 (41-177)||(19865794-19865930)
chr6 (47-214)||(18449580-18449747)
chr6 (50-209)||(25608908-25609067)
chr6 (47-177)||(16962489-16962619)
chr6 (47-260)||(5838263-5838476)
chr6 (58-195)||(22077745-22077882)
chr6 (41-270)||(18966333-18966559)
chr6 (45-214)||(27564863-27565032)
chr6 (44-258)||(18196774-18196980)
chr6 (47-184)||(16381417-16381554)
chr6 (47-184)||(18836952-18837089)
chr6 (107-195)||(27330537-27330625)
chr6 (107-195)||(27391277-27391365)
chr6 (47-184)||(16649013-16649150)
chr6 (71-184)||(21928305-21928418)
[»] chr1 (34 HSPs)
chr1 (23-283)||(20060899-20061159)
chr1 (23-282)||(20855707-20855966)
chr1 (23-259)||(23197193-23197429)
chr1 (23-282)||(19855458-19855717)
chr1 (23-267)||(19662084-19662328)
chr1 (23-267)||(24098550-24098794)
chr1 (23-272)||(20834847-20835096)
chr1 (23-267)||(31538944-31539188)
chr1 (23-267)||(37678248-37678492)
chr1 (23-282)||(20939010-20939269)
chr1 (44-258)||(16373707-16373921)
chr1 (23-267)||(20295580-20295824)
chr1 (23-231)||(21952113-21952321)
chr1 (44-260)||(51332461-51332677)
chr1 (45-183)||(431085-431223)
chr1 (44-270)||(22110187-22110413)
chr1 (44-270)||(22114036-22114262)
chr1 (53-282)||(21750093-21750322)
chr1 (44-260)||(21831478-21831694)
chr1 (44-246)||(21838139-21838341)
chr1 (23-151)||(21744499-21744627)
chr1 (47-246)||(33390000-33390199)
chr1 (44-246)||(16349564-16349766)
chr1 (29-231)||(41352615-41352817)
chr1 (44-267)||(19759841-19760064)
chr1 (23-260)||(19107543-19107780)
chr1 (20-209)||(21234675-21234864)
chr1 (45-202)||(22361213-22361370)
chr1 (44-246)||(21025362-21025564)
chr1 (50-214)||(16077630-16077794)
chr1 (29-209)||(17043968-17044148)
chr1 (44-123)||(24793585-24793664)
chr1 (47-184)||(20830363-20830500)
chr1 (138-214)||(50619306-50619382)
[»] chr2 (38 HSPs)
chr2 (45-283)||(23099455-23099693)
chr2 (26-283)||(27209590-27209847)
chr2 (23-270)||(23277557-23277804)
chr2 (23-259)||(31831450-31831686)
chr2 (23-267)||(1064535-1064779)
chr2 (44-267)||(23111520-23111743)
chr2 (23-267)||(20829043-20829287)
chr2 (23-267)||(24949374-24949618)
chr2 (23-267)||(23294719-23294963)
chr2 (44-283)||(41607821-41608060)
chr2 (44-246)||(16923694-16923896)
chr2 (44-246)||(16982957-16983159)
chr2 (44-246)||(17064522-17064724)
chr2 (44-282)||(24710803-24711041)
chr2 (44-246)||(27372074-27372276)
chr2 (44-260)||(16926151-16926367)
chr2 (44-260)||(16999791-17000007)
chr2 (44-260)||(27218807-27219023)
chr2 (23-270)||(19651465-19651712)
chr2 (44-214)||(44385005-44385175)
chr2 (44-260)||(10869641-10869857)
chr2 (47-237)||(45533159-45533349)
chr2 (20-260)||(21144453-21144693)
chr2 (50-202)||(23067240-23067391)
chr2 (44-270)||(22324292-22324518)
chr2 (23-283)||(12575121-12575381)
chr2 (44-260)||(24263161-24263377)
chr2 (45-183)||(23107167-23107305)
chr2 (47-260)||(30011623-30011834)
chr2 (45-260)||(24876186-24876401)
chr2 (47-237)||(30210357-30210546)
chr2 (51-214)||(24676326-24676489)
chr2 (23-184)||(27788608-27788768)
chr2 (53-214)||(21324711-21324872)
chr2 (41-214)||(24706915-24707088)
chr2 (242-283)||(27364713-27364754)
chr2 (71-184)||(12639696-12639809)
chr2 (23-131)||(17967179-17967287)
[»] scaffold0682 (1 HSPs)
scaffold0682 (23-283)||(1051-1311)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (23-281)||(68540-68798)
scaffold0034 (23-272)||(3831-4080)
scaffold0034 (23-283)||(12786-13039)
[»] chr4 (40 HSPs)
chr4 (23-281)||(27901525-27901783)
chr4 (23-283)||(15002239-15002499)
chr4 (23-267)||(29452412-29452656)
chr4 (38-280)||(15413916-15414158)
chr4 (23-267)||(3263669-3263913)
chr4 (44-243)||(15320313-15320512)
chr4 (44-269)||(8707071-8707296)
chr4 (24-267)||(11206107-11206350)
chr4 (23-267)||(15247077-15247321)
chr4 (23-267)||(15357995-15358239)
chr4 (23-267)||(33224076-33224320)
chr4 (137-267)||(15078788-15078918)
chr4 (24-258)||(16148873-16149107)
chr4 (24-258)||(16153019-16153253)
chr4 (44-268)||(14695265-14695489)
chr4 (15-267)||(44660733-44660985)
chr4 (44-260)||(8052259-8052475)
chr4 (44-260)||(12477760-12477976)
chr4 (44-260)||(19777429-19777645)
chr4 (23-267)||(20892135-20892379)
chr4 (23-178)||(15071601-15071756)
chr4 (44-246)||(8387586-8387788)
chr4 (44-246)||(29038040-29038242)
chr4 (29-260)||(40474200-40474431)
chr4 (24-282)||(1648153-1648411)
chr4 (29-246)||(23956921-23957138)
chr4 (44-260)||(14302614-14302830)
chr4 (45-260)||(12524836-12525051)
chr4 (53-270)||(14850011-14850228)
chr4 (44-260)||(18298365-18298581)
chr4 (44-183)||(15146521-15146660)
chr4 (44-260)||(14681727-14681943)
chr4 (23-201)||(14160689-14160867)
chr4 (29-267)||(27712489-27712727)
chr4 (29-246)||(18226067-18226284)
chr4 (23-184)||(51605667-51605828)
chr4 (41-214)||(16354078-16354251)
chr4 (44-209)||(18614460-18614625)
chr4 (89-231)||(9292024-9292166)
chr4 (47-184)||(14998552-14998689)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (23-267)||(2208-2452)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (38-267)||(10977-11206)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (23-283)||(5598-5858)
[»] chr8 (54 HSPs)
chr8 (23-267)||(20984865-20985109)
chr8 (23-270)||(19852627-19852874)
chr8 (23-270)||(19858663-19858910)
chr8 (44-283)||(21841620-21841859)
chr8 (23-270)||(22372147-22372394)
chr8 (24-283)||(23656130-23656389)
chr8 (23-267)||(14566361-14566605)
chr8 (23-270)||(20009239-20009485)
chr8 (23-267)||(6604877-6605121)
chr8 (44-258)||(20395471-20395685)
chr8 (23-267)||(31415789-31416036)
chr8 (23-267)||(29302744-29302988)
chr8 (44-267)||(20389318-20389541)
chr8 (50-267)||(6680330-6680547)
chr8 (23-267)||(16270542-16270786)
chr8 (41-270)||(22376790-22377019)
chr8 (41-270)||(22382965-22383194)
chr8 (44-260)||(20017602-20017818)
chr8 (23-267)||(20974974-20975213)
chr8 (44-258)||(23886252-23886466)
chr8 (23-267)||(12305977-12306221)
chr8 (51-182)||(21921082-21921213)
chr8 (45-183)||(21252247-21252385)
chr8 (23-231)||(21324587-21324794)
chr8 (44-260)||(22128297-22128513)
chr8 (96-267)||(803064-803235)
chr8 (44-246)||(18857817-18858019)
chr8 (44-270)||(22119513-22119739)
chr8 (44-260)||(17673362-17673578)
chr8 (15-267)||(22052082-22052334)
chr8 (29-231)||(19483388-19483590)
chr8 (45-267)||(19979186-19979408)
chr8 (45-183)||(21393205-21393343)
chr8 (45-183)||(21787699-21787837)
chr8 (44-260)||(19113916-19114132)
chr8 (45-177)||(21043754-21043886)
chr8 (20-209)||(15534660-15534849)
chr8 (29-246)||(30312468-30312685)
chr8 (50-214)||(23651313-23651477)
chr8 (45-267)||(21165878-21166100)
chr8 (23-267)||(27355766-27355999)
chr8 (29-214)||(22041131-22041316)
chr8 (23-184)||(31570160-31570321)
chr8 (44-266)||(22247772-22247978)
chr8 (50-267)||(1267457-1267674)
chr8 (29-209)||(32601421-32601601)
chr8 (20-135)||(19869044-19869159)
chr8 (47-141)||(22623378-22623472)
chr8 (31-120)||(22132367-22132456)
chr8 (29-132)||(23452722-23452825)
chr8 (206-260)||(22623492-22623546)
chr8 (164-270)||(22988412-22988518)
chr8 (47-184)||(16876437-16876574)
chr8 (71-231)||(21849703-21849863)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (23-273)||(15290-15540)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (44-270)||(27705-27931)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (23-283)||(47912-48172)
scaffold0053 (23-282)||(56725-56984)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (23-283)||(29225-29485)
scaffold0026 (50-202)||(30194-30346)
scaffold0026 (23-93)||(50168-50238)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (23-282)||(111-370)
[»] scaffold0600 (1 HSPs)
scaffold0600 (23-283)||(4944-5204)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (23-267)||(89323-89567)
scaffold0001 (23-267)||(90001-90245)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (20-267)||(40882-41129)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (44-283)||(50774-51013)
[»] scaffold2112 (1 HSPs)
scaffold2112 (23-283)||(146-406)
[»] scaffold1288 (1 HSPs)
scaffold1288 (23-283)||(1732-1992)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (47-283)||(48272-48508)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (44-260)||(5988-6206)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (38-283)||(1037-1282)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (47-283)||(5918-6154)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (23-283)||(430-690)
scaffold0120 (45-202)||(7269-7426)
scaffold0120 (45-183)||(13326-13464)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (23-272)||(13379-13628)
scaffold0124 (71-231)||(6734-6894)
[»] scaffold0304 (1 HSPs)
scaffold0304 (23-267)||(2363-2607)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (23-267)||(43967-44211)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (23-267)||(41211-41455)
scaffold0010 (23-267)||(46277-46521)
scaffold0010 (51-270)||(3095-3314)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (23-281)||(3346-3604)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (23-272)||(149749-149997)
scaffold0011 (23-282)||(194582-194841)
scaffold0011 (51-214)||(25439-25602)
[»] scaffold1830 (1 HSPs)
scaffold1830 (23-267)||(185-429)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (23-267)||(851-1095)
[»] scaffold0149 (2 HSPs)
scaffold0149 (79-283)||(6264-6468)
scaffold0149 (79-283)||(10695-10899)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (23-283)||(32579-32839)
[»] scaffold0865 (1 HSPs)
scaffold0865 (23-270)||(3150-3397)
[»] scaffold0298 (3 HSPs)
scaffold0298 (23-270)||(10935-11182)
scaffold0298 (23-270)||(14705-14952)
scaffold0298 (23-267)||(21167-21411)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (15-282)||(2225-2492)
scaffold0222 (23-270)||(8241-8488)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (23-270)||(30163-30410)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (24-267)||(24755-24998)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (44-282)||(9707-9945)
[»] scaffold1061 (1 HSPs)
scaffold1061 (23-267)||(2772-3016)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (23-267)||(42101-42345)
[»] scaffold0004 (3 HSPs)
scaffold0004 (44-252)||(202367-202575)
scaffold0004 (23-273)||(323882-324132)
scaffold0004 (44-202)||(118475-118633)
[»] scaffold2094 (1 HSPs)
scaffold2094 (84-267)||(1-184)
[»] scaffold0058 (3 HSPs)
scaffold0058 (23-282)||(20289-20548)
scaffold0058 (122-260)||(58191-58329)
scaffold0058 (47-100)||(58093-58146)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (44-270)||(18114-18340)
[»] scaffold0089 (2 HSPs)
scaffold0089 (44-270)||(10618-10844)
scaffold0089 (23-267)||(15591-15835)
[»] scaffold0518 (1 HSPs)
scaffold0518 (65-282)||(11902-12119)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (38-267)||(177155-177384)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (23-283)||(18517-18777)
[»] scaffold0139 (4 HSPs)
scaffold0139 (23-283)||(28385-28645)
scaffold0139 (23-283)||(34638-34898)
scaffold0139 (82-192)||(95-205)
scaffold0139 (215-267)||(219-271)
[»] scaffold0067 (4 HSPs)
scaffold0067 (23-267)||(27809-28052)
scaffold0067 (23-282)||(51058-51317)
scaffold0067 (23-282)||(60092-60351)
scaffold0067 (23-282)||(66480-66739)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (23-267)||(249797-250041)
[»] scaffold1646 (1 HSPs)
scaffold1646 (20-270)||(505-755)
[»] scaffold0035 (3 HSPs)
scaffold0035 (23-259)||(3943-4177)
scaffold0035 (50-237)||(43012-43199)
scaffold0035 (137-239)||(38420-38522)
[»] scaffold0348 (2 HSPs)
scaffold0348 (99-283)||(16448-16632)
scaffold0348 (27-120)||(10771-10864)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (23-271)||(10335-10583)
scaffold0235 (23-271)||(20549-20797)
[»] scaffold0232 (1 HSPs)
scaffold0232 (23-283)||(566-824)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (23-267)||(20578-20822)
scaffold0104 (23-267)||(23398-23642)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (23-267)||(100440-100684)
scaffold0020 (95-214)||(181436-181555)
[»] scaffold0708 (1 HSPs)
scaffold0708 (23-270)||(7023-7270)
[»] scaffold0114 (3 HSPs)
scaffold0114 (23-270)||(45698-45945)
scaffold0114 (45-171)||(19241-19367)
scaffold0114 (23-282)||(21069-21315)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (23-270)||(4330-4577)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (44-270)||(13649-13875)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (44-270)||(218316-218542)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (41-270)||(15378-15607)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (71-280)||(39685-39894)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (23-267)||(6116-6360)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (23-270)||(5214-5461)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (23-282)||(13177-13436)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (41-270)||(5052-5281)
scaffold0270 (41-270)||(12182-12411)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (23-224)||(108857-109058)
scaffold0031 (44-183)||(62930-63069)
[»] scaffold0180 (2 HSPs)
scaffold0180 (23-231)||(12405-12613)
scaffold0180 (44-184)||(31652-31792)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (44-282)||(16876-17114)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (44-246)||(16082-16284)
scaffold0040 (53-184)||(112396-112527)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (44-270)||(23978-24197)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (20-260)||(8588-8828)
[»] scaffold1715 (1 HSPs)
scaffold1715 (23-267)||(142-390)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (44-270)||(23084-23310)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (44-260)||(8130-8346)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (62-270)||(5212-5420)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (24-264)||(32198-32438)
[»] scaffold0697 (1 HSPs)
scaffold0697 (53-184)||(7561-7692)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (44-270)||(6790-7016)
[»] scaffold0319 (2 HSPs)
scaffold0319 (45-202)||(15-172)
scaffold0319 (45-202)||(2518-2675)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (44-260)||(29470-29686)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (23-267)||(28117-28361)
[»] scaffold0647 (2 HSPs)
scaffold0647 (44-267)||(2092-2315)
scaffold0647 (53-117)||(8567-8631)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (44-271)||(9915-10142)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (44-214)||(10206-10376)
[»] scaffold0403 (2 HSPs)
scaffold0403 (45-183)||(7640-7778)
scaffold0403 (198-283)||(3959-4044)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (45-183)||(7317-7455)
scaffold0358 (70-184)||(3534-3648)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (44-202)||(16903-17061)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (45-183)||(14111-14249)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (47-237)||(85421-85611)
[»] scaffold0081 (3 HSPs)
scaffold0081 (45-282)||(50601-50838)
scaffold0081 (45-177)||(19876-20008)
scaffold0081 (45-177)||(35300-35432)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (23-267)||(80710-80954)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (45-184)||(7231-7370)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (45-184)||(25845-25983)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (44-214)||(102470-102640)
[»] scaffold0742 (1 HSPs)
scaffold0742 (23-267)||(6397-6641)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (41-213)||(277726-277898)
scaffold0005 (24-267)||(261492-261735)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (50-177)||(38853-38980)
[»] scaffold0156 (2 HSPs)
scaffold0156 (24-142)||(35422-35540)
scaffold0156 (149-283)||(28393-28527)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (45-270)||(8547-8772)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (53-214)||(7995-8156)
[»] scaffold1373 (1 HSPs)
scaffold1373 (23-211)||(1712-1900)
[»] scaffold0621 (1 HSPs)
scaffold0621 (45-184)||(2703-2842)
[»] scaffold0501 (1 HSPs)
scaffold0501 (51-214)||(3431-3594)
[»] scaffold0261 (2 HSPs)
scaffold0261 (23-182)||(14178-14336)
scaffold0261 (23-182)||(22357-22515)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (44-183)||(24735-24874)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (45-214)||(2130-2299)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (70-202)||(6470-6602)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (45-267)||(4253-4475)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (41-283)||(79390-79632)
[»] scaffold0145 (1 HSPs)
scaffold0145 (50-183)||(39825-39958)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (23-267)||(11664-11908)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (44-204)||(4359-4519)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (44-219)||(115804-115979)
[»] scaffold0023 (4 HSPs)
scaffold0023 (80-183)||(131374-131477)
scaffold0023 (44-198)||(3355-3509)
scaffold0023 (45-176)||(28268-28399)
scaffold0023 (47-260)||(59946-60157)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (44-214)||(26211-26381)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (23-201)||(96414-96592)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (45-214)||(1655-1824)
scaffold0044 (45-214)||(15395-15564)
[»] scaffold1602 (1 HSPs)
scaffold1602 (44-184)||(966-1106)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (23-283)||(7182-7442)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (45-177)||(38720-38852)
scaffold0042 (20-260)||(66596-66836)
[»] scaffold0017 (3 HSPs)
scaffold0017 (29-209)||(57259-57439)
scaffold0017 (44-231)||(196377-196564)
scaffold0017 (45-117)||(18967-19039)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (44-219)||(13980-14155)
[»] scaffold0730 (1 HSPs)
scaffold0730 (105-267)||(4552-4714)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (29-209)||(39621-39801)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (29-209)||(32457-32637)
scaffold0109 (29-197)||(9850-10018)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (140-267)||(27445-27572)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (128-270)||(17862-18003)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (29-197)||(3289-3457)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (107-283)||(48168-48344)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (98-184)||(963-1049)
[»] scaffold0077 (2 HSPs)
scaffold0077 (171-259)||(20467-20555)
scaffold0077 (47-184)||(16466-16603)
[»] scaffold0048 (1 HSPs)
scaffold0048 (53-120)||(12900-12967)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (44-120)||(23972-24048)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (47-184)||(2777-2914)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (71-184)||(729-842)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (47-184)||(24661-24798)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (47-184)||(14175-14312)
[»] scaffold0160 (1 HSPs)
scaffold0160 (47-184)||(8532-8669)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (47-108)||(340-401)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (47-184)||(45612-45749)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (23-199)||(8424-8600)
[»] scaffold0567 (1 HSPs)
scaffold0567 (89-184)||(10561-10656)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (47-184)||(6441-6578)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (47-184)||(2854-2991)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (47-184)||(25229-25366)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (47-184)||(25093-25230)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 55)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 23 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 19614062 - 19613802
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19614062 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 19613963  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19613962 tacacatgtcggccatgatggtaaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 19613863  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 283  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19613862 tatgatgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 19613802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 41 - 283
Target Start/End: Original strand, 11387308 - 11387550
Alignment:
Q  41 ttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatga 140  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  11387308 ttattgaaggattatgattttggattgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgtagatgctttgagtaggaagacgttgcacatgtcggctatga 11387407  T
Q  141 tggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatag 240  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  11387408 tggtaaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgtgaattgtcacctcagagtgtgaagttgggtatgttgaagatcaatag 11387507  T
Q  241 tgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 283  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11387508 tgatttcttgaatagtatcagagaagcgcaacaagttgatgtc 11387550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 23 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 19148598 - 19148338
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| | ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19148598 cagagaagatggcttgagttgttgaaggactatgattttggattgaattatcatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgt 19148499  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||| ||| ||||    
T  19148498 tgcacatgtctgctatgatggtaaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgggtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtacagatggg 19148399  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 283  Q
    |||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  19148398 tatgctgaaaattaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacagcaagttgatgtc 19148338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 23 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 20747997 - 20747737
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| | ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20747997 cagagaagatggcttgagttgttgaaggactatgattttggattgaattatcatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgt 20747898  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||| ||| ||||    
T  20747897 tgcacatgtctgctatgatggtaaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgggtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtacagatggg 20747798  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 283  Q
    |||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  20747797 tatgctgaaaattaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacagcaagttgatgtc 20747737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 23 - 283
Target Start/End: Original strand, 14263106 - 14263366
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| | ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14263106 cagagaagatggcttgagttgttgaaggactatgattttgggttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgt 14263205  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    ||||||||||  | || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||| | ||||||||    
T  14263206 tacacatgtctactataatggtaaaggagtttgagttacttgaacagtttagagacttaagtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtttacagttggg 14263305  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 283  Q
    |||| |||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  14263306 tatgctgaagattaatagtgatttcttgagtagtatcagagaagcacaacaagttgatgtc 14263366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 23 - 283
Target Start/End: Original strand, 15101465 - 15101725
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  15101465 cagagaagatggctagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctctgagcaggaagacgt 15101564  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| || |||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||||||    
T  15101565 tgcatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgtcacctcagagtgtacagttggg 15101664  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 283  Q
    ||||||||| || || ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||    
T  15101665 tatgttgaagattaacagtgatttcttgaatagtatccgagaagcacaacaagtggatgtc 15101725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Original strand, 16071157 - 16071401
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||| |    
T  16071157 cagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccattctggtaaagctaatgtggttgtagatgctttgagcaggaagacat 16071256  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||    
T  16071257 tgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttactagaacagtttagagacttgagtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtacagttggg 16071356  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
    |||| |||| || |||||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  16071357 tatgctgaagattaatagtaatttcttgaatagtatccgagaagc 16071401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Original strand, 11305125 - 11305369
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| || |    
T  11305125 cagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggctaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaactt 11305224  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| ||  ||||||||||||| ||||| ||| | |||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  11305225 tgcacatgtctgctttgatggtgaaggagtttgaattgttagaacagttcagagacatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttggg 11305324  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     |||||||||||  ||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  11305325 aatgttgaaaattgatagtgatttcttgaacagtatccgagaagc 11305369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Original strand, 26117467 - 26117711
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||| || || ||||||||||| ||||| || |    
T  26117467 cagaggagatggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatccgggttaagccaatgttgtggctgatgctttgagcaggaaaactt 26117566  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||| |||||||||| || |||||||||  ||||||| | || |||||    
T  26117567 tgcacatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgctagaacatttcagagacatgagtcttgtctgtgaattgtcattccagagtatacatttggg 26117666  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     |||||||||||  ||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  26117667 aatgttgaaaattgatagtgacttcttgaacagtatccgagaagc 26117711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 23 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 13022744 - 13022497
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |    
T  13022744 cagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccaccctggtaaagccaatgtggttgctgatgcgttgagcaggaaaacat 13022645  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    |||| ||||| ||  ||||||| |  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| | || |||||    
T  13022644 tacatatgtctgctttgatggtaagagaatttgatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtttgtgaattgtcacctcagagtatacaattggg 13022545  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgca 270  Q
     ||| |||| || |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  13022544 gatgctgaagattaatagtaatttcttgaatagtatccgagaagcgca 13022497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Original strand, 12205683 - 12205921
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||| ||||||||| | || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || || || || |||||||    
T  12205683 ttgaaggactatgattttagtttaaattatcatccgggtaaagccaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatatcagctatgatgg 12205782  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||| | |||||||||||||| ||||| |||||    
T  12205783 ttaaagaatttgagttgcttggtcagtttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcacctcaaagtgtgaaattgggtatgttgaagatcaacagtga 12205882  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgt 282  Q
     || ||||||||||| | |||||| ||  ||||||||||    
T  12205883 gtttttgaatagtattaaagaagcacaggaggttgatgt 12205921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Original strand, 16949334 - 16949578
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    ||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |    
T  16949334 cagagaaggtggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaaaccaatgtggttgctgatgcgttgagcaggaagacat 16949433  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||| |||||| | ||||||||    
T  16949434 tgcatatgtctgctctgatggtgaaggaatttgaattgctagaacagtttagggacttgagtcttgtctgtgaattgacacctcagagtatacagttggg 16949533  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     ||| |||  || |||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  16949534 gatgctgaggattaatagtgacttctagaatagtatctgagaagc 16949578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Original strand, 268 - 513
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgc-agatgctttgagtaggaagacg 121  Q
    ||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| | |||| ||| | ||||||||     
T  268 cagagaagatggttagaactgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgttgttgctaaatgcgttgcgcaggaagaca 367  T
Q  122 ttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgg 221  Q
    || || ||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |  || ||| |||| |||||| | |||||||    
T  368 ttgcatatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgctagaacagtttagagacttgagtcttgtctatgagttgacacctcagagtattcagttgg 467  T
Q  222 gtatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
    | ||| |||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  468 ggatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagc 513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 49153688 - 49153444
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| || |    
T  49153688 cagaggaggtggttagagttactgaaagattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgcggacgctttgagtaggaaaactt 49153589  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| ||  ||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  49153588 tgcacatgtctgctttgatggtgaaggagttcgaattgctagaacagttcagagacatgagccttgtctgtgaatggtcaccccagagtattcagttggg 49153489  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     |||||||||||  ||||| | || ||||| |||||| |||||||    
T  49153488 aatgttgaaaattgatagtaactttttgaacagtatccgagaagc 49153444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 26 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 12458024 - 12457783
Alignment:
Q  26 aggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttac 125  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || || || |    
T  12458024 aggagatggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtagttgctgatgctttgagcagaaaaacattgc 12457925  T
Q  126 acatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtat 225  Q
    | ||||| ||  ||||| | || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||| |  ||||||| ||    
T  12457924 atatgtctgctttgatgataaaagaatttgagttgctggagcaatttagagacttgagtcttgtccgtgaattgtcacctcagagtatatagttggggat 12457825  T
Q  226 gttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
    | |||| ||  ||||||| |||||||| |||||  |||||||    
T  12457824 gctgaagattgatagtgatttcttgaacagtattcgagaagc 12457783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Original strand, 13967530 - 13967774
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |   |||| || |    
T  13967530 cagaggaggtggttagagttattgaaggattatgattttggcttaaattaccatcctggtaaggccaatgttgttgctgatgctttaacccggaaaactt 13967629  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| ||  |||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||  ||||| | ||||||||    
T  13967630 tgcacatgtctgctttgatggtgaaagaatttgaattgttagaacagttcagagacatgagtcttgtctgtgaattgtcaccttagagtatacagttggg 13967729  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     ||| |||| ||  ||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  13967730 gatgctgaagattgatagtgacttcttgaacagtatccgagaagc 13967774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 11236118 - 11236357
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || |||||||    
T  11236118 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 11236217  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | |  || || || ||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||||||| |  |||||||| |||||||  |||||||    
T  11236218 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaaaattgatagtga 11236317  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 283  Q
    |||| |||| |||||||  ||||||||   ||||||||||    
T  11236318 attcctgaaaagtatcaaggaagcgcagagggttgatgtc 11236357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 44 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 8708970 - 8708768
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  8708970 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacgttgcatatgtccgccatgatgg 8708871  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | |  || || |||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||||||| |  |||||||| |||| ||  |||||||    
T  8708870 tcagagagttcgagttgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtga 8708771  T
Q  244 att 246  Q
    |||    
T  8708770 att 8708768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 44 - 246
Target Start/End: Original strand, 18550663 - 18550865
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  18550663 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacgttgcatatgtccgccatgatgg 18550762  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | |  || || |||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||||||| |  |||||||| |||| ||  |||||||    
T  18550763 tcagagagttcgagttgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtga 18550862  T
Q  244 att 246  Q
    |||    
T  18550863 att 18550865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 44 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 14333761 - 14333545
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||    
T  14333761 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 14333662  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | |  || || || ||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||| |||| ||  |||||||    
T  14333661 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaattgggtatgctgaagattgatagtga 14333562  T
Q  244 attcttgaatagtatca 260  Q
    |||  |||| |||||||    
T  14333561 atttctgaaaagtatca 14333545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 44 - 260
Target Start/End: Original strand, 44790256 - 44790472
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||    
T  44790256 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 44790355  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | || || || || ||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| || |||||| |  |||||||| |||| ||  |||||||    
T  44790356 tcaaagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtga 44790455  T
Q  244 attcttgaatagtatca 260  Q
    |||  |||| |||||||    
T  44790456 atttctgaaaagtatca 44790472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 15159962 - 15160201
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||    
T  15159962 ttgaaagattatgactttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 15160061  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | |  || || || ||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| |||||||||    |||||||| |||| ||  |||||||    
T  15160062 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgagactgggtatgctgaagattgatagtga 15160161  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 283  Q
    |||| |||| |||||||  ||||||||  | |||||||||    
T  15160162 attcctgaaaagtatcaaggaagcgcagaaagttgatgtc 15160201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Original strand, 14285238 - 14285482
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||| | || || |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||      
T  14285238 cagaggagatggttagagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatcctggtaaagctaacgtagttgctgatgcgttgagcaggaagacac 14285337  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| || || || || ||||| || |||||| | ||||||||    
T  14285338 tgcatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgatttgctggaacagtttagagacatgagcctggtatgtgagttgtcgcctcagagtatacagttggg 14285437  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     ||| |||| || |||||||| ||||||  ||||||  |||||||    
T  14285438 catgctgaagattaatagtgatttcttgggtagtattcgagaagc 14285482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 44 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 8199993 - 8199791
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||    
T  8199993 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 8199894  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | |  || || || ||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||||||| |  |||||||| |||| ||  |||||||    
T  8199893 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtga 8199794  T
Q  244 att 246  Q
    |||    
T  8199793 att 8199791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 44 - 270
Target Start/End: Original strand, 11771146 - 11771372
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||| ||| || ||||| || |||||||    
T  11771146 ttgaaagactatgattttgggttgaactatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagatgttgcatatgtccgctatgatgg 11771245  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | || ||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||  | || ||||| |||||||| ||||||||| |  |||| ||| |||| ||  |||||||    
T  11771246 taaaagaaattgaattgcttgaacaatttagagatttgagcttagtctgcgagttgtcacctcagagtgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtga 11771345  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagcgca 270  Q
    |||  |||| ||||| | |||||||||    
T  11771346 atttctgaaaagtattaaagaagcgca 11771372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 14955940 - 14955703
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||| ||| | || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  14955940 cagaggaggtggcttgaattgttgaaggattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacat 14955841  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| || |||||||| |  || || ||||| ||||||||||| |||||  ||||| | |||||||||| ||||||  |||||||| |  ||||    
T  14955840 tgcatatgtccgctatgatggttagagagttcgagttacttgaacagttcagagatatgagtttggtttgcgaatggtcaccttagagtgtgaaactggg 14955741  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatca 260  Q
     ||| |||| ||  ||||||||||  |||| |||||||    
T  14955740 aatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 14955703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 44 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 10872360 - 10872144
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||    
T  10872360 ttgaaagattatgactttgggttggattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 10872261  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | |  || || || |||||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||| | |||| ||||||||| | |||| |||| |||| ||  |||||||    
T  10872260 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatttgagtttggtttgtgaatggacacctcagagtgtgaaattggatatgctgaagattgatagtga 10872161  T
Q  244 attcttgaatagtatca 260  Q
    |||  |||| |||||||    
T  10872160 atttctgaaaagtatca 10872144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 15341818 - 15341574
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | ||||| || || |||||| ||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||     
T  15341818 cagaggagatggcttgagttgttaaaagattattattttggtttgaattaccatcctggtaaagctaatgtagttgctgatgcattgagcaggaagacgc 15341719  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| || |||||| | || |||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||| || || || |||||  | |||||| | ||||||||    
T  15341718 tgcatatgtctgctatgatgataaaagaatttgatttgctggaacagtttagggacatgagtctggtatgtgagttgtcgactcagagtatacagttggg 15341619  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     ||| |||| || |||||||| ||||||| ||||||| |||||||    
T  15341618 catgctgaagattaatagtgatttcttgagtagtatccgagaagc 15341574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 13666924 - 13666665
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||| || |||||  |||||||||| || |||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  13666924 cagaggaggtggttagagctgttgaaggattatgattttagtttgaattaccatcctagtaaagccaacgtggttgcaaatgccttgagtaggaaaacgt 13666825  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  ||||||| ||  ||||||| ||| | || |||||||||||||||||  |||| || |||||| |||| || ||||| ||||||||    
T  13666824 tgcatatgtctgctttgatggtaaaataatttgatttgttagagcagtttagagacttgagctttgtctgtgaattgacacctcaaagtgttcagttggg 13666725  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgt 282  Q
     ||| |||| || || ||| | ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || |||||    
T  13666724 gatgctgaagattaacagttatttcttgaatagcatccgagaagcacaacaagtagatgt 13666665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 29 - 260
Target Start/End: Original strand, 23202503 - 23202734
Alignment:
Q  29 agatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacaca 128  Q
    |||||| |||||||  |||| |||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||| || || |    
T  23202503 agatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaatcatcatccgggtaaagctaatgatgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcata 23202602  T
Q  129 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgtt 228  Q
    |||| ||||||||||| |  || || ||||| ||||||||||| |||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||||||| |  |||||||| |    
T  23202603 tgtccgccatgatggtcagagagttcgagttacttgaacagttcagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgct 23202702  T
Q  229 gaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatca 260  Q
    ||| ||  ||||||||||  |||| |||||||    
T  23202703 gaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 23202734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 29 - 260
Target Start/End: Original strand, 23508630 - 23508861
Alignment:
Q  29 agatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacaca 128  Q
    |||||| |||||||  |||| |||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||| || || |    
T  23508630 agatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaatcatcatccgggtaaagctaatgatgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcata 23508729  T
Q  129 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgtt 228  Q
    |||| ||||||||||| |  || || ||||| ||||||||||| |||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||||||| |  |||||||| |    
T  23508730 tgtccgccatgatggtcagagagttcgagttacttgaacagttcagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgct 23508829  T
Q  229 gaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatca 260  Q
    ||| ||  ||||||||||  |||| |||||||    
T  23508830 gaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 23508861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 29 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 12688881 - 12688649
Alignment:
Q  29 agatggttagagttattgaaggatt-atgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacac 127  Q
    |||||| |||| || |||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||     
T  12688881 agatggctagaattgttgaaggatttatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcat 12688782  T
Q  128 atgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgt 227  Q
    ||||| || |||||||| |  || || ||||| ||||||||||| |||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||||||| |  |||| |||     
T  12688781 atgtccgctatgatggttagagagttcgagttacttgaacagttcagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggaatgc 12688682  T
Q  228 tgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatca 260  Q
    |||| ||  ||||||||||  |||| |||||||    
T  12688681 tgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 12688649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Original strand, 18052815 - 18053059
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | ||| | || || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||      
T  18052815 cagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggcaaagctaatgtagtcgcggatgctttgagtaggaagacac 18052914  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| || |||||| |||| |||||||| ||  | ||||||||||||||| ||||| | ||||| || ||||| || || ||||| ||||||||    
T  18052915 tccatatgtctgctatgatgatgaaagaatttgatttattggaacagtttagagacatgagtttggtttgtgagttgtcgcctcaaagtgtacagttggg 18053014  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     ||| | || || || ||||| ||  ||| ||||||| |||||||    
T  18053015 gatgctaaagattaacagtgattttctgagtagtatccgagaagc 18053059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 283
Target Start/End: Original strand, 23504732 - 23504992
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | ||| | || || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||     
T  23504732 cagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggcaaagctaatgtagtcgctgatgcattgagtaggaagacgc 23504831  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| || |||||| | || |||||||| || || ||||||||||||||| ||||| | || || || ||||| || || || || ||||||||    
T  23504832 tgcatatgtctgctatgatgataaaagaatttgatttactggaacagtttagagacatgagtttggtatgtgagttgtcgcctcaaagcgtacagttggg 23504931  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 283  Q
     ||| | || || || || || ||| ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||    
T  23504932 gatgctaaagattaacagcgatttcctgaatagtatccgagaagcacaacaagtggatgtc 23504992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 13687429 - 13687190
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||    
T  13687429 ttgaaagattatgactttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcatatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 13687330  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | |  || || || ||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||  |||||| |||||||||    |||||||| |||| ||  |||||||    
T  13687329 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaaaggtcacctcagagtgtgagactgggtatgctgaagattgatagtga 13687230  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 283  Q
    |||  | || |||||||  ||||||||  | |||||||||    
T  13687229 atttctaaaaagtatcaaggaagcgcagaaagttgatgtc 13687190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 55 - 214
Target Start/End: Original strand, 15147801 - 15147960
Alignment:
Q  55 tgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaattt 154  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || |||||||| | ||| ||     
T  15147801 tgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagactttgcatatgtctgctatgatggttagggagttc 15147900  T
Q  155 gagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtg 214  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||  | ||||| |||| |||||| |||||||||    
T  15147901 gagttgcttgaacagtttagtgatttgagcttagtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 15147960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 50 - 282
Target Start/End: Original strand, 320948 - 321180
Alignment:
Q  50 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 149  Q
    |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| || |||||||||||||    
T  320948 gattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtccgctatgatggtgaagg 321047  T
Q  150 aatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtgaattctt 249  Q
    | || |||||||| ||  |||| ||||| |||||| | || ||  |||||||| |  |||||||| |||| || ||| |||| ||  ||||||| |||||    
T  321048 agttcgagttgctggagtagttcagagatttgagtttggtatgttaattgtcatctaagagtgtgaagttagggatgctgaagattgatagtgatttctt 321147  T
Q  250 gaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgt 282  Q
    ||| ||||| | |||||| ||| | ||||||||    
T  321148 gaagagtattaaagaagcacaaaaagttgatgt 321180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 29 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 18179122 - 18178891
Alignment:
Q  29 agatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacaca 128  Q
    |||||| |||||||  |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |    
T  18179122 agatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcata 18179023  T
Q  129 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgtt 228  Q
    |||| ||||||||||| |  || || || || |||||||| || |||||  ||||| | ||||| |||| |||||| ||||| ||| |  |||||||| |    
T  18179022 tgtccgccatgatggtcagagagttcgaattacttgaacatttcagagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagcgtgaaactgggtatgct 18178923  T
Q  229 gaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatca 260  Q
    ||| ||  ||||||||||  |||| |||||||    
T  18178922 gaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 18178891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 29 - 210
Target Start/End: Original strand, 16208 - 16389
Alignment:
Q  29 agatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacaca 128  Q
    |||||| |||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || |    
T  16208 agatggctagaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagcaggaagacattgcata 16307  T
Q  129 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagag 210  Q
    |||| ||  ||||||| |  || |||||||| ||||||||||| ||||| |||||| | ||||| |||| |||||| |||||    
T  16308 tgtccgctttgatggttagagagtttgagttacttgaacagttcagagatttgagtttagtttgtgaatggtcacctcagag 16389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 45 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 15204983 - 15204758
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||    
T  15204983 tgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaacgttgttgcagatgccttaagtaggaaaactttacatatgtctgctatgatggt 15204884  T
Q  145 gaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtgaa 244  Q
     || || || ||| |||| ||| ||||||||||| ||||| | || |||||| |||| || || ||| |  || | || ||| |||| ||  ||||||||    
T  15204883 taaagagttggagctgctcgaatagtttagagacctgagtttagtctgcgaactgtcgcctcatagtataaagctaggaatgctgaagattgatagtgaa 15204784  T
Q  245 ttcttgaatagtatcagagaagcgca 270  Q
    |||||||| ||||| | |||||||||    
T  15204783 ttcttgaacagtattaaagaagcgca 15204758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 65 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 15625898 - 15625692
Alignment:
Q  65 ttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttg 164  Q
    ||||| |||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||| ||  |||| ||||| || |||||||| || || || ||| |||| |    
T  15625898 ttgaattatcatccaggtaaagataatgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactctacatatgtctgctatgatggttaaagagttggagctgctcg 15625799  T
Q  165 aacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagaga 264  Q
    |||||||||||||  ||||||| || || ||||||||||| |||| |||| |||| || ||| |||| ||  ||||||||||  | |||||||| | |||    
T  15625798 aacagtttagagatctgagtctagtctgtgaattgtcacctcagattgtgaagttaggaatgctgaagattgatagtgaatttctcaatagtattaaaga 15625699  T
Q  265 agcgcaa 271  Q
    |||||||    
T  15625698 agcgcaa 15625692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 29 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 14213054 - 14212874
Alignment:
Q  29 agatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacaca 128  Q
    |||||| |||||||  |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||| || || |    
T  14213054 agatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaattttgttgcagatgctttgagcaggaagacattgcata 14212955  T
Q  129 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccaga 209  Q
    |||| ||  ||||||| |  || |||||||| |||||||| || ||||| |||||  | ||||| |||| |||||| ||||    
T  14212954 tgtccgctttgatggttagagagtttgagttacttgaacaattcagagatttgagcttggtttgtgaatggtcacctcaga 14212874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 45 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 9597421 - 9597252
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| | |||||| || || ||||| ||  |||||||    
T  9597421 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagcatgaagacattgcatatgtccgctttgatggt 9597322  T
Q  145 gaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtg 214  Q
     |  || || || || |||||||||||||||||  ||||| | ||||| |||| |||||| |||||||||    
T  9597321 tagagagttcgaattacttgaacagtttagagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 9597252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 168 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 12456944 - 12456845
Alignment:
Q  168 agtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||| |||| |||||||| |||||||| ||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  12456944 agtttagagacttgagccttgtttgtgagttgacacctcagagtgttcagttggggatgctgaagattaataatgatttcttgaatagtatccgagaagc 12456845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 45 - 260
Target Start/End: Original strand, 11552008 - 11552223
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||| |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||  ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  11552008 tgaaggattataactttggtttgaattatcatctaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaaaaagacattgcatatgtccgctatgatggt 11552107  T
Q  145 gaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtgaa 244  Q
     |  || || |||||  |||||||||| ||| |  ||||| | |||||| ||| ||||||  |||||||| | ||||| ||| |||| ||  ||||||||    
T  11552108 tagagagttcgagttagttgaacagttcagatatatgagtttggtttgcaaatggtcaccttagagtgtgaaattgggaatgctgaagattgatagtgaa 11552207  T
Q  245 ttcttgaatagtatca 260  Q
    ||  |||| |||||||    
T  11552208 tttctgaaaagtatca 11552223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 14041060 - 14040931
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| | || |||| |||||||||| ||||| |||| |||||| || ||||||||||| || || ||| | || |||||||    
T  14041060 ttgaaagattatgattttgagttaagctgtcattcgggtaaagctaatgttgttgtagatgccttaagtaggaagacattgcatatgcccgctatgatgg 14040961  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagttta 173  Q
    | || || || |||||| | ||||||||||    
T  14040960 taaaagagttcgagttgttggaacagttta 14040931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 14351090 - 14350961
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| | || |||| |||||||||| ||||| |||| |||||| || ||||||||||| || || ||| | || |||||||    
T  14351090 ttgaaagattatgattttgagttaagctgtcattcgggtaaagctaatgttgttgtagatgccttaagtaggaagacattgcatatgcccgctatgatgg 14350991  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagttta 173  Q
    | || || || |||||| | ||||||||||    
T  14350990 taaaagagttcgagttgttggaacagttta 14350961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 135
Target Start/End: Original strand, 40027 - 40142
Alignment:
Q  20 agacagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaaga 119  Q
    |||||| |||||||||| || || || ||||| ||||||||||   |||  |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||||||||||     
T  40027 agacagcggagatggttggaattcttaaaggactatgattttgaactgagttatcatccaggaaaggccaatgtagtagctgatgccttgagtaggaagt 40126  T
Q  120 cgttacacatgtcggc 135  Q
    | || |||||||||||    
T  40127 ccttgcacatgtcggc 40142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 47 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 7825262 - 7825125
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 146  Q
    ||||||| |||||||  |||||  |||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| ||  ||||||| |    
T  7825262 aaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggtta 7825163  T
Q  147 aggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagt 184  Q
    | || || || ||| |||| |||||| |||||||||||    
T  7825162 aagagttggaattgattgagcagtttcgagacttgagt 7825125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 71 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 13456085 - 13455972
Alignment:
Q  71 tatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagt 170  Q
    |||||||| || || || ||||| ||||  |||||||||||||||||||| || || ||||| ||  ||||||| || || || |||||| |||| ||||    
T  13456085 tatcatcccggaaaggcgaatgttgttgttgatgctttgagtaggaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggagttgattgagcagt 13455986  T
Q  171 ttagagacttgagt 184  Q
    ||||||| ||||||    
T  13455985 ttagagatttgagt 13455972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 47 - 184
Target Start/End: Original strand, 27106682 - 27106819
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 146  Q
    ||||||| |||||||  |||||  |||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| ||  ||||||| |    
T  27106682 aaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggtta 27106781  T
Q  147 aggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagt 184  Q
    | || || || ||| |||| |||||| |||||||||||    
T  27106782 aagagttggaattgattgagcagtttcgagacttgagt 27106819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 47 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 27171643 - 27171506
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 146  Q
    ||||||| |||||||  |||||  |||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| ||  ||||||| |    
T  27171643 aaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggtta 27171544  T
Q  147 aggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagt 184  Q
    | || || || ||| |||| |||||| |||||||||||    
T  27171543 aagagttggaattgattgagcagtttcgagacttgagt 27171506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 101 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 14435000 - 14434818
Alignment:
Q  101 gatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgt 200  Q
    ||||| ||||| ||||||||  | || ||||| || |||||| | || |||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| | || || || ||||    
T  14435000 gatgcgttgagcaggaagacactgcatatgtctgctatgatgataaaagaatttgatttgctggaatagtttagagacatgagtttggtatgtgagttgt 14434901  T
Q  201 caccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 283  Q
    | || || ||  | |||||||| ||| |||| || || ||||| ||| ||| ||||||| ||||||| || ||||| ||||||    
T  14434900 cgcctcaaagcatacagttgggcatgctgaagattaacagtgatttcctgagtagtatccgagaagcacagcaggtggatgtc 14434818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 14937685 - 14937572
Alignment:
Q  71 tatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagt 170  Q
    |||||||| || || || ||||| ||||  |||||||||||||| ||||| || || ||||| ||  ||||||| || ||||| || ||| |||| ||||    
T  14937685 tatcatcctggaaaggcgaatgttgttgttgatgctttgagtagaaagactttgcaaatgtctgctttgatggttaaagaattggaattgattgagcagt 14937586  T
Q  171 ttagagacttgagt 184  Q
    || |||||||||||    
T  14937585 ttcgagacttgagt 14937572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 15365278 - 15365165
Alignment:
Q  71 tatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagt 170  Q
    |||||||| || || || ||||| ||||  |||||||||||||| ||||| || || ||||| ||  ||||||| || ||||| || ||| |||| ||||    
T  15365278 tatcatcctggaaaggcgaatgttgttgttgatgctttgagtagaaagactttgcaaatgtctgctttgatggttaaagaattggaattgattgagcagt 15365179  T
Q  171 ttagagacttgagt 184  Q
    || |||||||||||    
T  15365178 ttcgagacttgagt 15365165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 3)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 23 - 283
Target Start/End: Original strand, 32555 - 32815
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32555 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 32654  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32655 tacacatgtcggccatgatggtaaaggaattcgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 32754  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 283  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32755 tatgatgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 32815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Original strand, 55778 - 56022
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  55778 cagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttcaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaagacat 55877  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| | ||||||||    
T  55878 tgcatatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgctagaacagtttagagacttgagtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtatacagttggg 55977  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     ||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  55978 gatgctgaaaattaatagtaatttcttgaatagtatccgagaagc 56022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 47 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 41662 - 41525
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 146  Q
    ||||||| |||||||  |||||  |||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| ||  ||||||| |    
T  41662 aaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggtta 41563  T
Q  147 aggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagt 184  Q
    | || || || ||| |||| |||||| |||||||||||    
T  41562 aagagttggaattgattgagcagtttcgagacttgagt 41525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 5)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 23 - 283
Target Start/End: Original strand, 49392 - 49652
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49392 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcattcgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 49491  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49492 tacacatgtcggccatgatggtaaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 49591  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 283  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49592 tatgtagaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 49652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 47 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 44555 - 44342
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 146  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| || || ||||| || |||||||| |    
T  44555 aaggattacgactttggtttgaattaccatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtcggaagacattgcatatgtccgctatgatggtta 44456  T
Q  147 aggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtgaatt 246  Q
      || || ||||| || |||||||| |||||  ||||| | ||||| |||| |||||| ||||||||| |  |||||||| |||| ||  ||||||| ||    
T  44455 gagagttcgagttactcgaacagttcagagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgagtt 44356  T
Q  247 cttgaatagtatca 260  Q
    | |||| |||||||    
T  44355 cctgaagagtatca 44342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 45 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 9880 - 9665
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||| || ||||||||    
T  9880 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctagtgttgttgcagatgccttaagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggt 9781  T
Q  145 gaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtgaa 244  Q
     |  || || || || ||||||||||| |||||  ||||| | |||||||||| ||||||  |||||||| |  | |||||| |||| ||  ||||||||    
T  9780 cagagagttcgaattacttgaacagttcagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctgagagtgtgaaactaggtatgctgaagattgatagtgaa 9681  T
Q  245 ttcttgaatagtatca 260  Q
    ||  |||| |||||||    
T  9680 tttctgaaaagtatca 9665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 45 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 16342 - 16173
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| || || |||||  | ||||||||    
T  16342 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagttggaagacattgcatatgtcttctatgatggt 16243  T
Q  145 gaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtg 214  Q
     |  || || || || ||||||||||| |||||   |||| | |||||||||| ||||||  ||||||||    
T  16242 cagagagttcgaattacttgaacagttcagagataagagtttggtttgcgaatggtcacctgagagtgtg 16173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 184
Target Start/End: Original strand, 105499 - 105612
Alignment:
Q  71 tatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagt 170  Q
    |||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| ||  ||||||| || || || || ||| |||| ||||    
T  105499 tatcatcccgggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggatttggttgagcagt 105598  T
Q  171 ttagagacttgagt 184  Q
    || |||||||||||    
T  105599 ttcgagacttgagt 105612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 55)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 23 - 283
Target Start/End: Original strand, 21679835 - 21680095
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21679835 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 21679934  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21679935 tacacatgtcggccatgatggtaaaggaattcgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 21680034  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 283  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21680035 tatgatgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 21680095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 23 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 20822764 - 20822505
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  20822764 cagaggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacat 20822665  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || || || || ||| | || ||||||||||||||    
T  20822664 tgcacatgtcggccttgatggtaaaggaattcgaattgcttgaacagtttagagacttaagtctagtgtgtgagttatcatctcaaagtgtgcagttggg 20822565  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgt 282  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  20822564 tatgttgaagatcaatagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgt 20822505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 23 - 282
Target Start/End: Original strand, 28893999 - 28894258
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  28893999 cagaggagatggcttgagttattaaaggattatgattttggtttgaactaccatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagacat 28894098  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||| ||| | || ||||| ||||||||    
T  28894099 tgcacatgtcggccttgatggtaaaggaattcgagttgcttgaacagtttagggacttgagtctagtgtgtgaattatcatctcaaagtgtacagttggg 28894198  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgt 282  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  28894199 tatgttgaagatcaatagtggtttcttggatagtgtcagagaagcacaacaagttgatgt 28894258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 23 - 282
Target Start/End: Original strand, 28915470 - 28915729
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  28915470 cagaggagatggcttgagttattaaaggattatgattttggtttgaactaccatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagacat 28915569  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||| ||| | || ||||| ||||||||    
T  28915570 tgcacatgtcggccttgatggtaaaggaattcgagttgcttgaacagtttagggacttgagtctagtgtgtgaattatcatctcaaagtgtacagttggg 28915669  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgt 282  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  28915670 tatgttgaagatcaatagtggtttcttggatagtgtcagagaagcacaacaagttgatgt 28915729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 23 - 282
Target Start/End: Original strand, 28922825 - 28923084
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  28922825 cagaggagatggcttgagttattaaaggattatgattttggtttgaactaccatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagacat 28922924  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||| ||| | || ||||| ||||||||    
T  28922925 tgcacatgtcggccttgatggtaaaggaattcgagttgcttgaacagtttagggacttgagtctagtgtgtgaattatcatctcaaagtgtacagttggg 28923024  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgt 282  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  28923025 tatgttgaagatcaatagtggtttcttggatagtgtcagagaagcacaacaagttgatgt 28923084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 23 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 22463262 - 22463003
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22463262 cagaggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagttaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacgt 22463163  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| || || ||||||||| | || ||||||||||||||    
T  22463162 tgcacatgtcggccttaatggtaaaggagtttgaattgctcgaacagtttagggatttaagtctcgtgtgtgaattgtcatctcaaagtgtgcagttggg 22463063  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgt 282  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  22463062 tatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgt 22463003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Original strand, 24619352 - 24619596
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  24619352 cagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttgacttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgt 24619451  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    |||||||||| || |||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| |||| ||| || ||| |||| |||||||| ||||||||    
T  24619452 tacacatgtctgctatgatggtaaaggaattcgaattactggaacagtttagagacttgagccttggttgtgagttggcacctcagagtgttcagttggg 24619551  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     ||| |||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  24619552 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagc 24619596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Original strand, 24715583 - 24715827
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  24715583 cagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttgacttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgt 24715682  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    |||||||||| || |||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| |||| ||| || ||| |||| |||||||| ||||||||    
T  24715683 tacacatgtctgctatgatggtaaaggaattcgaattactggaacagtttagagacttgagccttggttgtgagttggcacctcagagtgttcagttggg 24715782  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     ||| |||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  24715783 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagc 24715827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Original strand, 24748611 - 24748855
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  24748611 cagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttgacttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgt 24748710  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    |||||||||| || |||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| |||| ||| || ||| |||| |||||||| ||||||||    
T  24748711 tacacatgtctgctatgatggtaaaggaattcgaattactggaacagtttagagacttgagccttggttgtgagttggcacctcagagtgttcagttggg 24748810  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     ||| |||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  24748811 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagc 24748855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 57 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 20775036 - 20774811
Alignment:
Q  57 attttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttga 156  Q
    ||||||| |||||||| ||||| | |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||| ||    
T  20775036 attttggcttgaactaccatccagataaagctaaagtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaaaggaattcga 20774937  T
Q  157 gttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagt 256  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||    
T  20774936 gttgcttgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaattatcatctcaaagtgtgcagttgggtatgttgaagatcaatagtgatttcttgggtagt 20774837  T
Q  257 atcagagaagcgcaacaggttgatgt 282  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  20774836 atcagagaagcacaacaagttgatgt 20774811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Original strand, 14886048 - 14886292
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  14886048 cagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaacgt 14886147  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| ||  |||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||  |||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  14886148 tgcacatgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttcagagatatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttggg 14886247  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     |||||||||||  ||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  14886248 aatgttgaaaattgatagtgatttcttgaacagtatccgagaagc 14886292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 231
Target Start/End: Original strand, 28930738 - 28930946
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  28930738 cagaggagatggcttgagttattaaaggattatgattttggtttgaactaccatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagacat 28930837  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||| ||| | || ||||| ||||||||    
T  28930838 tgcacatgtcggccttgatggtaaaggaattcgagttgcttgaacagtttagggacttgagtctagtgtgtgaattatcatctcaaagtgtacagttggg 28930937  T
Q  223 tatgttgaa 231  Q
    |||||||||    
T  28930938 tatgttgaa 28930946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 23 - 273
Target Start/End: Original strand, 23079146 - 23079396
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||  |||| ||||| ||||| || |    
T  23079146 cagaggagatggttagagctgttgaatgattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgctaatgcgttgagcaggaaaacat 23079245  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    |||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||| |  |||||||    
T  23079246 tacatatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgctagaacagtttagagacttgagccttgtttgtgaattgtcacttcagagtatatagttggg 23079345  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaaca 273  Q
     |||||||| || || ||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  23079346 gatgttgaagattaacagtaatttcttgaatagtatctgagaagctcaaca 23079396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Original strand, 24797454 - 24797698
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| |    
T  24797454 cagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggtagctgatgctttgagtaggaagactt 24797553  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| ||  |||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||  |||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  24797554 tgcacatgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttcagagatatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttggg 24797653  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     |||||||||||  |||| || |||||||| |||||| |||||||    
T  24797654 aatgttgaaaattgatagggatttcttgaacagtatccgagaagc 24797698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 44 - 267
Target Start/End: Original strand, 21563051 - 21563274
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||  || |||||||    
T  21563051 ttgaaggactatgattttagtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtatgctatgatgg 21563150  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||| ||  |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  21563151 ttaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagacctgagtctcgtttgtgagttgtcgccttagagtgtgaagttgggtatgttgaagatcaacagtga 21563250  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     |||||||| ||||||| ||||||    
T  21563251 gttcttgaacagtatcaaagaagc 21563274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Original strand, 37542438 - 37542682
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||| || |    
T  37542438 cagaggaggtggttagagttattgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgacgctttaagtaggaaaactt 37542537  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | ||| |||| ||  ||||||||||||| ||||| ||| | |||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  37542538 tgcacgtgtctgctttgatggtgaaggagtttgaattgttagaacagttcagagacatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttggg 37542637  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     |||||||||||  ||||| | ||||| || |||||| |||||||    
T  37542638 aatgttgaaaattgatagtaacttcttaaacagtatccgagaagc 37542682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 25849386 - 25849142
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |    
T  25849386 cagaggagatggttagagttactgaaagattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagcaggaaaactt 25849287  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| ||  |||||||||| |||||||| ||||| ||| |||| |||||| |||||||||| || ||||||||| | |||||| | ||||||||    
T  25849286 tgcacatgtctgctttgatggtgaaagaatttgaattgctagaatagttcagagacatgagtcttgtctgtgaattgtcatctcagagtatacagttggg 25849187  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     ||| | || ||  ||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  25849186 gatgctaaagattgatagtgacttcttgaacagtatccgagaagc 25849142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 282
Target Start/End: Original strand, 22234977 - 22235236
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  22234977 cagaggagatggttggagctgttgaaggactatgaatttggcttgaattaccatcttggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaacgt 22235076  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  |||||||||| |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||| |||||| | ||||||||    
T  22235077 tgcatatgtctgctttgatggtgaaagaatttgatttgttagagcagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtattcagttggg 22235176  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgt 282  Q
     ||| | || || || ||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||    
T  22235177 gatgctaaagattaacagtgatttcttgaataatatccgagaagcgcagcaggtagatgt 22235236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 26 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 20343590 - 20343349
Alignment:
Q  26 aggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttac 125  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || |    
T  20343590 aggaggtggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagcaggaaaactttgc 20343491  T
Q  126 acatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtat 225  Q
    ||||||| ||  ||||| |||| |||||||| ||| | |||||||| |||||| |||||||||| |  ||||||||| | |||||| | |||||||| ||    
T  20343490 acatgtctgctttgatgatgaaagaatttgaattgttagaacagttcagagacatgagtcttgtctatgaattgtcatctcagagtatacagttggggat 20343391  T
Q  226 gttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
    | |||| ||  ||||||| |||||||| |||||  |||||||    
T  20343390 gctgaagattgatagtgatttcttgaacagtattcgagaagc 20343349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 14998817 - 14999056
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || |||||||    
T  14998817 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 14998916  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | |  || || || ||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||||||| |  |||||||| |||| ||  |||||||    
T  14998917 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattcatagtga 14999016  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 283  Q
    |||| |||| |||||||  ||||||||  | |||||||||    
T  14999017 attcctgaaaagtatcaaggaagcgcagaaagttgatgtc 14999056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 83 - 270
Target Start/End: Original strand, 21830878 - 21831065
Alignment:
Q  83 aaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttga 182  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||  || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21830878 aaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtttgctatgatggttaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagacctga 21830977  T
Q  183 gtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgca 270  Q
    |||| ||||| || ||||| ||  |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| | ||| | |||||||||    
T  21830978 gtctcgtttgtgagttgtcgcctaagagtgtgaagttgggtatgttgaagatcaacagtgagttcttgaacaatattaaagaagcgca 21831065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 140 - 283
Target Start/End: Original strand, 21889933 - 21890076
Alignment:
Q  140 atggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaata 239  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  21889933 atggtaaaggagtttgagttgctagagaagtttagagacttgagtcttgtttatgagttgtcacctcagagtgtacagttgggtatgttgaagatcaata 21890032  T
Q  240 gtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 283  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  21890033 gtgatttcttgaacagtatcagagaagcacaacaagttgatgtc 21890076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 27684478 - 27684717
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || |||||||    
T  27684478 ttgaaagattatgactttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 27684577  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | |  || || || ||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||||||| |  |||||||| |||| ||  |||||||    
T  27684578 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtga 27684677  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 283  Q
    |||| |||| |||||||  ||||||||  | |||||||||    
T  27684678 attcctgaaaagtatcaaggaagcgcagaaagttgatgtc 27684717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 44 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 16357810 - 16357608
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||    
T  16357810 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 16357711  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | |  || || || ||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||||||| |  |||||||| |||| ||  |||||||    
T  16357710 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtga 16357611  T
Q  244 att 246  Q
    |||    
T  16357610 att 16357608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 44 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 23472536 - 23472366
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| || |||||||    
T  23472536 ttgaaggattatgattttgggttaaattatcatctaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatgg 23472437  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtg 214  Q
    | || || || ||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||| ||||||| |||||||||    
T  23472436 taaaagagttcgagttgcttgaacagtttagagatttgagtttagtctgcgaaatgtcacctcagagtgtg 23472366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 44 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 34567802 - 34567600
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||    
T  34567802 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 34567703  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | |  || || || ||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||||||| |  |||||||| |||| ||  |||||||    
T  34567702 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtga 34567603  T
Q  244 att 246  Q
    |||    
T  34567602 att 34567600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 44 - 260
Target Start/End: Original strand, 22331965 - 22332181
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || |||||||    
T  22331965 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 22332064  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | |  || || || ||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||||||| |  |||||||| |||| ||  |||||||    
T  22332065 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtga 22332164  T
Q  244 attcttgaatagtatca 260  Q
    |||| |||| |||||||    
T  22332165 attcctgaaaagtatca 22332181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 44 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 27519714 - 27519499
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||    
T  27519714 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 27519615  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | |  || || || ||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||||||| |  |||||||| |||| ||  |||||||    
T  27519614 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtg-aactgggtatgctgaagattgatagtga 27519516  T
Q  244 attcttgaatagtatca 260  Q
    |||  |||| |||||||    
T  27519515 atttctgaaaagtatca 27519499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 44 - 267
Target Start/End: Original strand, 27667568 - 27667791
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||    
T  27667568 ttgaaagattatgactttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 27667667  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | |  || || || |||||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||| | |||| ||||||||| | ||||||||| |||| ||  |||||||    
T  27667668 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatttgagtttggtttgtgaatggacacctcagagtgtgaaattgggtatgctgaagattgatagtga 27667767  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
    |||  |||| || |||| ||||||    
T  27667768 atttctgaaaagcatcaaagaagc 27667791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 29 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 22503984 - 22503746
Alignment:
Q  29 agatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacaca 128  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || || |    
T  22503984 agatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgcattgagcaggaaaacattgcata 22503885  T
Q  129 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgtt 228  Q
    |||| ||  | ||||| || ||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| || || || |||||||| |||||| | |||||||| ||| |    
T  22503884 tgtctgctttaatggtaaaagaattcgagttgttagaacagtttagagacttgagtctagtctgtgagttgtcacctcagagtatacagttggggatgct 22503785  T
Q  229 gaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
    ||| ||  ||||| | |||||||| |||||| |||||||    
T  22503784 gaagattgatagtaatttcttgaacagtatccgagaagc 22503746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 29475151 - 29475390
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || |||||||    
T  29475151 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 29475250  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | |  || || || |||||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||||||| |  |||||||| |||| ||  |||||||    
T  29475251 tcagagagttcgaattgcttgaacagattagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtga 29475350  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 283  Q
    |||  |||| |||||||  ||||||||  | |||||||||    
T  29475351 atttctgaaaagtatcaaggaagcgcagaaagttgatgtc 29475390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 50 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 25427735 - 25427583
Alignment:
Q  50 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 149  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||    
T  25427735 gattatgattttgagttgagctatcatccgtgtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaagg 25427636  T
Q  150 aatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtca 202  Q
    | || ||||||||||||||||| ||| | |||||| | ||||| ||| |||||    
T  25427635 agttcgagttgcttgaacagttcagaaatttgagtttagtttgtgaaatgtca 25427583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 38 - 246
Target Start/End: Original strand, 26737799 - 26738007
Alignment:
Q  38 gagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggcca 137  Q
    ||||| ||||| || ||||||||| | ||||| ||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || |    
T  26737799 gagttgttgaaagactatgattttagtttgaattatcatccaagtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtccgcta 26737898  T
Q  138 tgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaa 237  Q
    ||||||| || || || |||||| | || ||||||||||| |||||| | || |||||||||||||| ||||||||| || |||| ||| |||| ||  |    
T  26737899 tgatggtaaaagagttcgagttgttggagcagtttagagatttgagtttagtctgcgaattgtcacctcagagtgtgaagctgggaatgctgaagattga 26737998  T
Q  238 tagtgaatt 246  Q
    |||||||||    
T  26737999 tagtgaatt 26738007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 27611662 - 27611446
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||    
T  27611662 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 27611563  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | |  || || ||  | |||||||||||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||| |||| ||  |||| ||    
T  27611562 tcagagagttcgaactacttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaattgggtatgctgaagattgatagcga 27611463  T
Q  244 attcttgaatagtatca 260  Q
    |||  |||| |||||||    
T  27611462 atttctgaaaagtatca 27611446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 40710088 - 40709872
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||    
T  40710088 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 40709989  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | |  || || || ||||||||||||||  ||||  ||||| | ||||| |||| |||||| ||||| ||| |  ||||||||||||| ||  |||||||    
T  40709988 tcagagagttcgaattgcttgaacagttccgagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagcgtgaaactgggtatgttgaagattgatagtga 40709889  T
Q  244 attcttgaatagtatca 260  Q
    |||  |||| |||||||    
T  40709888 atttctgaaaagtatca 40709872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 29 - 260
Target Start/End: Original strand, 37290559 - 37290790
Alignment:
Q  29 agatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacaca 128  Q
    |||||| |||| || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |    
T  37290559 agatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcata 37290658  T
Q  129 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgtt 228  Q
    |||| || |||||||| |  ||||| || ||||||||||||||||||||  ||||| | ||||| |||| |||| |  |||||||| |  |||||||| |    
T  37290659 tgtccgctatgatggtcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgtgaatggtcatcttagagtgtgaaactgggtatgct 37290758  T
Q  229 gaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatca 260  Q
    ||| ||  ||||||||||  |||| |||||||    
T  37290759 gaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 37290790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 47 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 21408443 - 21408230
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 146  Q
    ||||||||||| || || ||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||| |||| |||||||| || ||||| ||||| || |||||||| |    
T  21408443 aaggattatgaattcggattgaattaccatccgggtaaggctaatgttgttgcagatactttaagtaggaaaacattacatatgtctgctatgatggtta 21408344  T
Q  147 aggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtgaatt 246  Q
    | || || ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||| |||| || |||||| |  | ||||| ||||| || ||||| | ||||||    
T  21408343 aagagttggagttgcttgaacagttcagagacttgagtttggtttgtgaagtgtcgccgcagagtctaaaattgggaatgtttaatatcaacattgaatt 21408244  T
Q  247 cttgaatagtatca 260  Q
     || ||||||||||    
T  21408243 ttttaatagtatca 21408230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 44 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 22135976 - 22135760
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || |||||||    
T  22135976 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 22135877  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    |    || ||  | ||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||| ||||||  |||||||| |  |||||||| |||| ||  |||||||    
T  22135876 tcggagagttcaaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcaccttagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtga 22135777  T
Q  244 attcttgaatagtatca 260  Q
    |||  |||| |||||||    
T  22135776 atttctgaaaagtatca 22135760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 44 - 219
Target Start/End: Original strand, 20467176 - 20467351
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||  |||| ||||| || ||||||     
T  20467176 ttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttaagtcggaaaactctacatatgtccgctatgatga 20467275  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagtt 219  Q
    | || || || ||| |||| ||||||||||||||| ||||| | ||||| || |||||||| ||||| ||| ||||    
T  20467276 tcaaagagttagagctgctcgaacagtttagagacctgagtttagtttgtgagttgtcacctcagagcgtgaagtt 20467351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 29 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 19771283 - 19771045
Alignment:
Q  29 agatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacaca 128  Q
    |||||| |||||||  | |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || |    
T  19771283 agatggctagagttgctaaaggattacgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttgagtaggaagacattgcata 19771184  T
Q  129 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgtt 228  Q
    |||| ||||||||||| |  || || ||||| ||||||||||| |||||  ||||| | ||||| |||| | |||| ||||| ||| |  |||||||| |    
T  19771183 tgtccgccatgatggtcagagagttcgagttacttgaacagttcagagatatgagtttggtttgtgaatggacacctcagagcgtgaaactgggtatgct 19771084  T
Q  229 gaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
    ||| ||  ||||||||||  |||| || |||| ||||||    
T  19771083 gaagattgatagtgaatttctgaaaagcatcaaagaagc 19771045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 45 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 23575036 - 23574814
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| || ||||||||    
T  23575036 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaaggcattgcatatgtccgctatgatggt 23574937  T
Q  145 gaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtgaa 244  Q
     |  || || || ||||||||||||||||||||  ||||  | ||||| || | |||||| ||||||||| |  |||| ||| |||| ||  ||||||||    
T  23574936 tagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagcttagtttgtgagtggtcacctcagagtgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaa 23574837  T
Q  245 ttcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
    ||| |||| ||||||| ||||||    
T  23574836 ttcctgaagagtatcaaagaagc 23574814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 29 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18777119 - 18776939
Alignment:
Q  29 agatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacaca 128  Q
    |||||| |||||||  |||| |||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |    
T  18777119 agatggctagagttgctgaaagattatgattttggtttgaattatcatctaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacattgcata 18777020  T
Q  129 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccaga 209  Q
    |||| ||  ||||||| |  || || ||||| ||||||||||| ||||| |||||| | ||||| |||| |||||| ||||    
T  18777019 tgtctgctttgatggtcagagagttcgagttacttgaacagttcagagatttgagtttagtttgtgaatggtcacctcaga 18776939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 23441518 - 23441279
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || |||||||    
T  23441518 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaaactaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 23441419  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | |  || || || || ||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||| | |||| ||||||||| |  |||| ||| |||| ||  |||||||    
T  23441418 ttagagagttcgaattacttgaacagtttagagatttgagtttagtttgtgaatggacacctcagagtgtgaaagtgggaatgctgaagattgatagtga 23441319  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 283  Q
    |||  |||| ||||| | ||| || ||| | |||||||||    
T  23441318 atttatgaagagtattaaagaggcacaaaaagttgatgtc 23441279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 29 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 41772165 - 41772023
Alignment:
Q  29 agatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacaca 128  Q
    |||||| |||||||  | ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |    
T  41772165 agatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcata 41772066  T
Q  129 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtt 171  Q
    |||| ||||||||||| |  || || ||||| |||||||||||    
T  41772065 tgtccgccatgatggtcagagagttcgagttacttgaacagtt 41772023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 29 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 21497247 - 21497150
Alignment:
Q  29 agatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttaca 126  Q
    |||||| | ||||| ||| |||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21497247 agatggcttgagttgttggaggactatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgctttgagcaggaagacgttaca 21497150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 51 - 283
Target Start/End: Original strand, 17268419 - 17268651
Alignment:
Q  51 attatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagga 150  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||  | || ||||| || |||||| | || ||    
T  17268419 attatgattttgggttgaattaccatccgggaaaagctaatgtagtcgctgatgcattgagtaggaagacactgcatatgtctgctatgatgataaaaga 17268518  T
Q  151 atttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtgaattcttg 250  Q
    ||| || ||||| ||||||||||||||| ||||| | || || || ||||| || || || || |||||||| ||| | || || || ||||| ||  ||    
T  17268519 attcgatttgctggaacagtttagagacatgagtttggtatgtgagttgtcgcctcaaagcgtacagttggggatgctaaagattaacagtgattttctg 17268618  T
Q  251 aatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 283  Q
    | ||||||| ||||||| || ||||| ||||||    
T  17268619 agtagtatccgagaagcacagcaggtggatgtc 17268651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 53 - 193
Target Start/End: Original strand, 21338384 - 21338524
Alignment:
Q  53 tatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaat 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||| | | || ||||| || |||||||| || ||      
T  21338384 tatgattttgggttgaactatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaaatgctttgagcaggaagatgctgcatatgtcagctatgatggttaaagagc 21338483  T
Q  153 ttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgc 193  Q
    | |||||||| |||||||||| ||| |||||| | ||||||    
T  21338484 tcgagttgctggaacagtttaaagatttgagtttagtttgc 21338524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 38 - 142
Target Start/End: Original strand, 21872122 - 21872226
Alignment:
Q  38 gagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggcca 137  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||  | |||||||| |||||||| || |    
T  21872122 gagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgagtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagctgaaagacgttgcacatgtctgcta 21872221  T
Q  138 tgatg 142  Q
    |||||    
T  21872222 tgatg 21872226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 38 - 142
Target Start/End: Original strand, 21876402 - 21876506
Alignment:
Q  38 gagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggcca 137  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||  | |||||||| |||||||| || |    
T  21876402 gagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgagtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagctgaaagacgttgcacatgtctgcta 21876501  T
Q  138 tgatg 142  Q
    |||||    
T  21876502 tgatg 21876506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 45 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 21882256 - 21882034
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||  |||||||| ||||| ||||  ||||| |||||||||||||| ||  | ||||| || ||||||||    
T  21882256 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatctaggtaaagctaatgttgttgttgatgccttgagtaggaagacattgaatatgtccgctatgatggt 21882157  T
Q  145 gaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtgaa 244  Q
     |  || |||||||||||||||||||||| |||  |||| || ||||| || | |||||| ||||||||| |  || | ||| |||| ||  ||||||||    
T  21882156 tagagagtttgagttgcttgaacagtttacagatatgagcctagtttgtgagtggtcacctcagagtgtgaaactgtgaatgctgaagattgatagtgaa 21882057  T
Q  245 ttcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
    ||  |||| ||||||| ||||||    
T  21882056 tttctgaagagtatcaaagaagc 21882034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 109
Target Start/End: Original strand, 846 - 933
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgc-agatgctttg 109  Q
    |||||||||||| | ||||| || || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  846 cagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcaagatgctttg 933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 47 - 184
Target Start/End: Original strand, 21936269 - 21936406
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 146  Q
    ||||||| |||||||  |||||  |||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| ||  ||||||| |    
T  21936269 aaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggtta 21936368  T
Q  147 aggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagt 184  Q
    | || || || ||| |||| |||||| |||||||||||    
T  21936369 aagagttggaattgattgagcagtttcgagacttgagt 21936406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 47 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 27012371 - 27012234
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 146  Q
    ||||||| |||||||  |||||  |||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| ||  ||||||| |    
T  27012371 aaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggtta 27012272  T
Q  147 aggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagt 184  Q
    | || || || ||| |||| |||||| |||||||||||    
T  27012271 aagagttggaattgattgagcagtttcgagacttgagt 27012234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 23517768 - 23517611
Alignment:
Q  110 agtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccaga 209  Q
    ||||||||||| || || ||||| || |||||||| |  || || |||||||||||||||||||||||  ||||  | ||||| || |  ||||| ||||    
T  23517768 agtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggttagagagttcgagttgcttgaacagtttagagatatgagcttagtttgtgagtgatcacctcaga 23517669  T
Q  210 gtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
    ||||| |  |||| ||| |||| ||  ||||||||||  |||| ||||||| ||||||    
T  23517668 gtgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatttctgaagagtatcaaagaagc 23517611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 24582497 - 24582360
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 146  Q
    ||||||| |||||||  |||||  |||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| ||  ||||||| |    
T  24582497 aaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggtta 24582398  T
Q  147 aggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagt 184  Q
    | || || || ||| |||| |||||| |||| ||||||    
T  24582397 aagagttggaattgattgagcagtttcgagatttgagt 24582360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 23 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 24439 - 24179
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  24439 cagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttacagatgctttgagcaggaagacgt 24340  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24339 tacacatgtcggctatgatggtaaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 24240  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24239 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 24179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 23 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 20277 - 20017
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  20277 cagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttacagatgctttgagcaggaagacgt 20178  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20177 tacacatgtcggctatgatggtaaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtctggtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 20078  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 283  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20077 tatgctgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 20017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 233; Significance: 1e-129; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 15 - 283
Target Start/End: Original strand, 6555 - 6823
Alignment:
Q  15 acatcagacagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtag 114  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6555 acatgagacagaggagatggttggagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcggatgctttgagtag 6654  T
Q  115 gaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  6655 gaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagatttgagtcttgtttgtgagttgtcgccccagagtgtg 6754  T
Q  215 cagttgggtatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6755 cagttgggtatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 6823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 233; Significance: 1e-129; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 23 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 113987 - 113727
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  113987 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaacgccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 113888  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  113887 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagatttgagccttgtttgtgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 113788  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 283  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  113787 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 113727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 29 - 260
Target Start/End: Original strand, 108695 - 108926
Alignment:
Q  29 agatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacaca 128  Q
    ||||| ||||||||  | ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |    
T  108695 agatgattagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcata 108794  T
Q  129 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgtt 228  Q
    |||| || |||||||| |  || || ||||| ||||||||||| |||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||| ||| |  |||||||| |    
T  108795 tgtctgctatgatggtcagagagttcgagttacttgaacagttcagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagcgtgaaactgggtatgct 108894  T
Q  229 gaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatca 260  Q
    ||| ||  ||||||||||  |||| |||||||    
T  108895 gaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 108926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 194 - 279
Target Start/End: Original strand, 95051 - 95136
Alignment:
Q  194 gaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttga 279  Q
    ||||||||| | || ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  95051 gaattgtcatcgcaaagtgtacagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagcatcagagaagcacaacaagttga 95136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 233; Significance: 1e-129; HSPs: 63)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 23 - 283
Target Start/End: Original strand, 13971223 - 13971483
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13971223 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgactttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtaggaagacgt 13971322  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13971323 tacacatgtcggccatgatggtaaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 13971422  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  13971423 tatgttaaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcaaataagcgcaacaggttgatgtc 13971483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 23 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 14087699 - 14087439
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14087699 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttaaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacat 14087600  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  14087599 tacacatgtcggccatgatggtaaaggaattcgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgagaagttggg 14087500  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 283  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14087499 tatgatgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 14087439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 23 - 283
Target Start/End: Original strand, 10419148 - 10419408
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  10419148 cagaggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggtttgaactatcatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacat 10419247  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||| ||| | || ||||||||||||||    
T  10419248 tgcacatgtcggccttgatggtaaaggagttcgagttgcttgaacagtttagggacttgagtctagtgtgtgaattatcatctcaaagtgtgcagttggg 10419347  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 283  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  10419348 tatgttgaagatcaatagtgacttcttgaatagtatcagagaagcacaacgagttgatgtc 10419408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 23 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 17187400 - 17187164
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| | |    
T  17187400 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttagtttgaactatcacccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaaggcat 17187301  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||  |||| |||||||||||||||||    
T  17187300 tgcatatgtcggctatgatggtaaaggaatttgagttgcttgaacagttcagagacttgagtctggtttgtgaattaacacctcagagtgtgcagttggg 17187201  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatc 259  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||    
T  17187200 tatgttgaaaattaacagtgatttcttgagtagtatc 17187164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 14574949 - 14574705
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| | ||||| || ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14574949 cagagaagatggcttgagttgttaaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgt 14574850  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| || |||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  14574849 tgcatatgtctgctatgatggtaaatgaatttgatttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtttgcgagttgtcacctcagagtgtgcagttggg 14574750  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
    |||| |||| || |||||||| ||||||| ||||||| |||||||    
T  14574749 tatgctgaagattaatagtgatttcttgagtagtatccgagaagc 14574705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 47124970 - 47124726
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  47124970 cagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaacgt 47124871  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| ||  |||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||  |||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  47124870 tgcacatgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttcagagatatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttggg 47124771  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     |||||||||||  ||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  47124770 aatgttgaaaattgatagtgatttcttgaacagtatccgagaagc 47124726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 23 - 283
Target Start/End: Original strand, 16827306 - 16827566
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| | || || |||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16827306 cagagaagatggcttgacttgttgaaggattatgattttagtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtgtttgcagatgctttgagcaggaagacgt 16827405  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| || |||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||||| | || || |||||||| ||| |||| ||||||||    
T  16827406 tgcacatgtctgctatgatggtaaaagagtttgagttgctagaccattttagagacttgagtcttatctgtgagttgtcacctcagggtgtacagttggg 16827505  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 283  Q
    |||| |||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||||    
T  16827506 tatgctgaagattaatagtgatttcttgaacagtatcagagaagcacatcaagttgatgtc 16827566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 17493656 - 17493412
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    ||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  17493656 cagagaagatggttaaagctgttgaaggattatgattttggtttgagttaccatccgggtaaagccaacgtggttgcagatgccttgaggaggaagacgt 17493557  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| || ||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||| |||||||| || |||||    
T  17493556 tgcatatgtctgctatgatggtgagagaatttgatttgctagaacagtttagagacttgagtcgtgtctgtgaattgacacctcagagtgtacatttggg 17493457  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     ||| |||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  17493456 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagc 17493412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 28755344 - 28755100
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  28755344 cagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggtttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgcggatgctttgagtaggaaaacgt 28755245  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| ||  |||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||  |||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  28755244 tgcacatgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttcagagatatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttggg 28755145  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     |||||||| ||  ||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  28755144 aatgttgaagattgatagtgacttcttgaacagtatccgagaagc 28755100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Original strand, 31694289 - 31694533
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||| ||||| ||| | |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  31694289 cagaggaggtggttggagctgttgaaggattatgactttggtttgaattaacatcctggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaaaacgc 31694388  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||| || |||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  31694389 tgcatatgtctgctttgatggtgaaagaatttgatttgctagaacagtttagagacttgaaccttgtctgtgaattgacacctcagagtgttcagttggg 31694488  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     ||| |||| || |||||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  31694489 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtattcgagaagc 31694533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 23 - 276
Target Start/End: Original strand, 16337615 - 16337868
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |    
T  16337615 cagaggagatggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccgatgtggttgctgatgcattgagcaggaaaacat 16337714  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    |||| ||||| ||  |||||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| | ||||||||    
T  16337715 tacatatgtctgctttgatggtgaaggaattcgaattgttagaacagtttagagacttgagtctggtatgtgaattgtcacctcagagtatacagttggg 16337814  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggt 276  Q
     |||||||  ||  ||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  16337815 aatgttgaggattgatagtgatttcttgaacagtatcagagaagctcagcaggt 16337868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 31939929 - 31939685
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||| ||||| ||| | |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  31939929 cagaggaggtggttggagctgttgaaggattatgactttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaaaacgc 31939830  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||  || |||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  31939829 tgcatatgtctgctttgatggtgaaagaatttgatttgctagaacagtttagagactcgagccttgcctgtgaattgacacctcagagtgttcagttggg 31939730  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     ||| |||| || |||||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  31939729 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtattcgagaagc 31939685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 23 - 282
Target Start/End: Original strand, 12359630 - 12359889
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| |||||||    
T  12359630 cagagaagatggatagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagattccttgagtagaaagacgt 12359729  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  ||||||||||  ||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  12359730 tgcatatgtctgctttgatggtgaaataatttgatttgttagagcagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtgtacagttggg 12359829  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgt 282  Q
     ||| |||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||    
T  12359830 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcacaacaagtagatgt 12359889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 23 - 282
Target Start/End: Original strand, 13319605 - 13319864
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||  |||| ||||| |||||||| |    
T  13319605 cagaggagatggttagagctgttgaaggattatgactttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcgaatgcgttgagcaggaagacct 13319704  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    |||| ||||| ||  ||||||| |  |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||| | |||| |||    
T  13319705 tacatatgtctgcactgatggtaagagaatttgatttgctagaacagtttaaagacttgagccttgtttgtgaattgtcacctcaaagtattcagtcggg 13319804  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgt 282  Q
     |||||||| || || ||||| ||||||||||||||| | ||||| || ||||| |||||    
T  13319805 gatgttgaagattaacagtgatttcttgaatagtatccgtgaagctcagcaggtagatgt 13319864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 15228654 - 15228416
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||| ||||||||| | || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| || || ||||| || ||||| |    
T  15228654 ttgaaggactatgattttagtttaaattatcatccgggtaaagccaatgttgttgcagatgctttcagcaggaagactttgcatatgtcagctatgatag 15228555  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || |||||| | || |||||| | |||||||||||||| ||||| |||||    
T  15228554 ttaaagattttgagttgcttgagcaatttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcaactcaaagtgtgaaattgggtatgttgaagatcaacagtga 15228455  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgt 282  Q
     |||||||||||||| | |||||| ||  ||||||||||    
T  15228454 gttcttgaatagtattaaagaagcacagaaggttgatgt 15228416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 15234522 - 15234284
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||| ||||||||| | || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| || || ||||| || ||||| |    
T  15234522 ttgaaggactatgattttagtttaaattatcatccgggtaaagccaatgttgttgcagatgctttcagcaggaagactttgcatatgtcagctatgatag 15234423  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || |||||| | || |||||| | |||||||||||||| ||||| |||||    
T  15234422 ttaaagattttgagttgcttgagcaatttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcaactcaaagtgtgaaattgggtatgttgaagatcaacagtga 15234323  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgt 282  Q
     |||||||||||||| | |||||| ||  ||||||||||    
T  15234322 gttcttgaatagtattaaagaagcacagaaggttgatgt 15234284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 283
Target Start/End: Original strand, 16835613 - 16835873
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | ||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |    
T  16835613 cagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctgataaagccaatgtagttgcggatgcgttgagcagaaagactt 16835712  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| ||  | ||||| |  |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| || || ||| ||||  ||||||| ||||||||    
T  16835713 tgcacatgtctgcattaatggtaagagaatttgatttgctggaacagtttagagacatgagtcttgtgtgtgagttgacaccgaagagtgttcagttggg 16835812  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 283  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||| ||||||| || ||||| ||||||    
T  16835813 tatgttgaaaattaacagtgatttcttgagtagtatccgagaagcacagcaggtggatgtc 16835873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 26 - 267
Target Start/End: Original strand, 16328766 - 16329007
Alignment:
Q  26 aggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttac 125  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||    
T  16328766 aggagatggttagagttactgaaggattacgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgcattgagcaggaaaacattac 16328865  T
Q  126 acatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtat 225  Q
    | ||||| ||  | ||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| | |||||| | |||||||| ||    
T  16328866 atatgtctgctttaatggtaaaagaatttgagttgttggaacagtttagagacttgagtcttgtctgtgaactgtcatctcagagtatacagttggggat 16328965  T
Q  226 gttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
      |||| ||  ||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  16328966 aatgaagattgatagtgatttcttgaacagtatccgagaagc 16329007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Original strand, 11960272 - 11960516
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||| ||||| || |||||  |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |    
T  11960272 cagaggagattgttagaactactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctagtaaggccaatgtggttgctgatgcattgaggaggaaaacat 11960371  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||| | ||||||||    
T  11960372 tgcatatgtctgctttgatggtaaaggaatttgagttgctagagcagtttagggacttgagtcttgtctgtgaattgtcacctcagagtatacagttggg 11960471  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     ||| |||  ||  ||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  11960472 gatgatgaggattgatagtgatttcttgaacagtatccgagaagc 11960516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 44 - 260
Target Start/End: Original strand, 15588527 - 15588743
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||    
T  15588527 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 15588626  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | |  || || || ||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||||||| |  |||||||| |||| ||  |||||||    
T  15588627 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtga 15588726  T
Q  244 attcttgaatagtatca 260  Q
    |||  |||| |||||||    
T  15588727 atttctgaaaagtatca 15588743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 44 - 260
Target Start/End: Original strand, 20061189 - 20061405
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||    
T  20061189 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 20061288  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | |  || || || ||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||||||| |  |||||||| |||| ||  |||||||    
T  20061289 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtga 20061388  T
Q  244 attcttgaatagtatca 260  Q
    |||  |||| |||||||    
T  20061389 atttctgaaaagtatca 20061405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 44 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 16636768 - 16636566
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||    
T  16636768 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 16636669  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | |  || || || ||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||||||| |  |||||||| |||| ||  |||||||    
T  16636668 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtga 16636569  T
Q  244 att 246  Q
    |||    
T  16636568 att 16636566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 44 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 43164092 - 43163890
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||    
T  43164092 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 43163993  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | |  || || || ||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||||||| |  |||||||| |||| ||  |||||||    
T  43163992 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtga 43163893  T
Q  244 att 246  Q
    |||    
T  43163892 att 43163890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 44 - 260
Target Start/End: Original strand, 5424065 - 5424281
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||    
T  5424065 ttgaaagattatgactttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 5424164  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | |  || || || |||||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||| | |||| ||||||||| | ||||||||| |||| ||  |||||||    
T  5424165 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatttgagtttggtttgtgaatggacacctcagagtgtgaaattgggtatgctgaagattgatagtga 5424264  T
Q  244 attcttgaatagtatca 260  Q
    |||  |||| |||||||    
T  5424265 atttctgaaaagtatca 5424281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 44 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 10006595 - 10006379
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||    
T  10006595 ttgaaggattatgacttcggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 10006496  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | |  || || || ||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||||||| |  |||||||| |||| ||  |||||||    
T  10006495 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtga 10006396  T
Q  244 attcttgaatagtatca 260  Q
    |||  |||| |||||||    
T  10006395 atttctgaaaagtatca 10006379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 44 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 48426442 - 48426234
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||    
T  48426442 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 48426343  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | |  || || || ||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||||||| |  |||||||| | || ||  |||||||    
T  48426342 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctcaagattgatagtga 48426243  T
Q  244 attcttgaa 252  Q
    ||| |||||    
T  48426242 atttttgaa 48426234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 258
Target Start/End: Original strand, 14580053 - 14580291
Alignment:
Q  20 agacagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaaga 119  Q
    |||||||| |||||| | ||||| || || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  14580053 agacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaaga 14580152  T
Q  120 cgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagtt 219  Q
      ||||||||||| || |||||||| || || || ||||||||||||||||| ||||| |||||| | || || ||| ||||| | ||||||||  || |    
T  14580153 atttacacatgtccgctatgatggtaaaagagttcgagttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtctgtgaaatgtcatctcagagtgttaagct 14580252  T
Q  220 gggtatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtat 258  Q
     || |||||||| ||  ||| |||||| ||||| |||||    
T  14580253 aggaatgttgaagattgataatgaatttttgaaaagtat 14580291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 45 - 183
Target Start/End: Original strand, 16491317 - 16491455
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||||||||    
T  16491317 tgaaggattatgattttgggttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgaagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggt 16491416  T
Q  145 gaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgag 183  Q
     || || || ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  16491417 aaaagagttcgagttgcttgaacagttcagagatttgag 16491455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 44 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 15340264 - 15340048
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || |||||||    
T  15340264 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgctgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 15340165  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | |  || || || ||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||||||| |  |||||||| |||| ||  |||||||    
T  15340164 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtga 15340065  T
Q  244 attcttgaatagtatca 260  Q
    |||| |||| |||||||    
T  15340064 attcctgaaaagtatca 15340048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 44 - 260
Target Start/End: Original strand, 15401652 - 15401868
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || |||||||    
T  15401652 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 15401751  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | |  || || || || |||||||||||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||||||| |  |||||||| |||| ||  |||||||    
T  15401752 tcagagagttcgaatttcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtga 15401851  T
Q  244 attcttgaatagtatca 260  Q
    |||| |||| |||||||    
T  15401852 attcctgaaaagtatca 15401868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 47 - 246
Target Start/End: Original strand, 15347383 - 15347582
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 146  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||  || || ||||| ||||||||||| |    
T  15347383 aaggattacgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagaaattgcatatgtccgccatgatggtca 15347482  T
Q  147 aggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtgaatt 246  Q
      || || ||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||| |||||| ||||||||| |  |||||||| |||| ||  ||||||||||    
T  15347483 gagagttcgagttacttgaacagtttagagatttgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatt 15347582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 44 - 270
Target Start/End: Original strand, 15724069 - 15724295
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||| || || ||||| || |||||||    
T  15724069 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgtagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 15724168  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | |  || || || ||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||||||| |  |||||||| |||| ||  |||||||    
T  15724169 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtga 15724268  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagcgca 270  Q
    |||  |||| |||||||  ||||||||    
T  15724269 atttctgaaaagtatcaaggaagcgca 15724295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 10907205 - 10906989
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||    
T  10907205 ttgaaggattatgacttcggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 10907106  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | |  || || || ||||| ||||||||||||||  || || | |||||||||| |||||| ||||||||| |  |||||||| |||| ||  |||||||    
T  10907105 tcagagagttcgaattgctagaacagtttagagatatgtgtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtga 10907006  T
Q  244 attcttgaatagtatca 260  Q
    |||  |||| |||||||    
T  10907005 atttctgaaaagtatca 10906989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 13253685 - 13253469
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||    
T  13253685 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 13253586  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | |  || || || ||||||||||||||||||||  |||||   |||||||||| |||||| ||||||||| |  |||||||| ||||  |  |||||||    
T  13253585 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagttcggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaaggttgatagtga 13253486  T
Q  244 attcttgaatagtatca 260  Q
    |||  |||| |||||||    
T  13253485 atttctgaaaagtatca 13253469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 15260625 - 15260402
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| || |||||||| || || || ||||| || |||||||    
T  15260625 ttgaaagattatgattttgagttgaattaccatccgggtaaggctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaaaactttgcatatgtccgctatgatgg 15260526  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | || || |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||| | || |||||| || | || ||| |||| ||  |||||||    
T  15260525 taaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagatttgagtttagtttgcgagttgtcatctcaaagtgtgaagctaggaatgctgaagattgatagtga 15260426  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
    |||  |||| ||||| | ||||||    
T  15260425 atttatgaaaagtattaaagaagc 15260402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 29 - 267
Target Start/End: Original strand, 53384138 - 53384376
Alignment:
Q  29 agatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacaca 128  Q
    |||||| |||||||  | ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| || || |    
T  53384138 agatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattaacatccgggtaaagctaatgttattgcagatgccttgagtaggaagacattgcata 53384237  T
Q  129 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgtt 228  Q
    |||| ||||||||||| |  || |||||||| |||||||||||  ||||  ||||| | ||||| |||| |||||| ||||||||| |  |||||||| |    
T  53384238 tgtccgccatgatggtcagagagtttgagttacttgaacagttccgagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgct 53384337  T
Q  229 gaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
    ||| ||  ||||||||||  |||| || |||| ||||||    
T  53384338 gaagatggatagtgaatttctgaaaagcatcaaagaagc 53384376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 6601746 - 6601529
Alignment:
Q  29 agatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacaca 128  Q
    |||||| |||||||  | ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |    
T  6601746 agatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcata 6601647  T
Q  129 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgtt 228  Q
    |||| ||||||||||| |  || || ||||| |||||||||||  ||||  ||||| | ||||| |||| | |||| ||||||||| |  |||||||| |    
T  6601646 tgtccgccatgatggtcagagagttcgagttacttgaacagttccgagatatgagtttggtttgtgaatggacacctcagagtgtgaaactgggtatgct 6601547  T
Q  229 gaaaatcaatagtgaatt 246  Q
    ||| ||  ||||||||||    
T  6601546 gaagattgatagtgaatt 6601529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 50 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 17490839 - 17490706
Alignment:
Q  50 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 149  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| |||     
T  17490839 gattatgattttgagttgagctatcatcctggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaagt 17490740  T
Q  150 aatttgagttgcttgaacagtttagagacttgag 183  Q
    | || ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  17490739 agttcgagttgcttgaacagttcagagatttgag 17490706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 44778273 - 44778013
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | ||| | || || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||      
T  44778273 cagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggcaaagctaatgtagtcgctgatgcattgagtaggaagacac 44778174  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| || |||||| |||| |||||||| || || ||||||||||||||| ||||| | || || || ||||| || |||||  | ||||||||    
T  44778173 tgcatatgtctgctatgatgatgaaagaatttgatttactggaacagtttagagacatgagtttggtgtgtgagttgtcgcctcagagcatacagttggg 44778074  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 283  Q
     ||| | || || || ||||| ||| ||||||||||| | |||||||| || || ||||||    
T  44778073 gatgctaaagattaacagtgatttcctgaatagtatccgggaagcgcagcaagtggatgtc 44778013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 27 - 270
Target Start/End: Original strand, 18133453 - 18133696
Alignment:
Q  27 ggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttaca 126  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||| ||||| |||||| || | || |||||||| ||||| ||    
T  18133453 ggaggtggttagagctgttgaaggattatgattttggcatgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcatataccttaagtaggaaaacgttgca 18133552  T
Q  127 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatg 226  Q
     ||||| ||  ||||||| || |||||||| ||| | || | ||||||||||||||| || || || |||||| |||| || ||||| |||||||  |||    
T  18133553 tatgtctgctttgatggtaaaagaatttgatttgttagagccgtttagagacttgagcctcgtctgtgaattgacacctcatagtgttcagttggcgatg 18133652  T
Q  227 ttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgca 270  Q
     | || || || ||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  18133653 ctaaagattaacagtgatttcttgaataatatccgagaagcgca 18133696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 20 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16693183 - 16692994
Alignment:
Q  20 agacagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaaga 119  Q
    |||||| | |||||| |||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  16693183 agacagcgtagatggatagaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgcgttgagcaggaaga 16693084  T
Q  120 cgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccaga 209  Q
    | || || ||||| ||| ||||||| |  || || ||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||    
T  16693083 cattgcatatgtctgccttgatggttagagagttcgagttacttgaacagttcagagacttgagtttagtttgcgaatggtcacctcaga 16692994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 41178548 - 41178304
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | ||| | || || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||      
T  41178548 cagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggaaaagctaatgtagtcgcggatgcgttgagtaggaagacac 41178449  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| || |||||| |||| |||||||| ||  | ||||||||||||||| ||||| | ||||| || ||||| || || ||||| ||||||||    
T  41178448 tccatatgtctgctatgatgatgaaagaatttgatttattggaacagtttagagacatgagtttggtttgtgagttgtcgcctcaaagtgtacagttggg 41178349  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     ||| | || || || ||||| ||  ||| ||||||| |||||||    
T  41178348 gatgctaaagattaacagtgattttctgagtagtatccgagaagc 41178304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 12179364 - 12179234
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  12179364 cagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccagccgggcaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaaaacgt 12179265  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatt 153  Q
    | || ||||| || ||||||||||| |||||    
T  12179264 tgcatatgtctgctatgatggtgaaagaatt 12179234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 138 - 267
Target Start/End: Original strand, 11302991 - 11303120
Alignment:
Q  138 tgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaa 237  Q
    |||||||||| ||||||||  |||| || ||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||| |||||||| |||||||| ||| |||| || ||    
T  11302991 tgatggtgaaagaatttgatctgctagagcagtttagagatttgagtcttgtctgtgaattgacacctcagagtgtacagttggggatgctgaagattaa 11303090  T
Q  238 tagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  11303091 cagtgatttcttgaatagtatccgagaagc 11303120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 23 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 13943050 - 13942790
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | ||| | || || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||      
T  13943050 cagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggaaaagctaatgtagtcgctgatgcattgagcaggaagacac 13942951  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| || |||||| | || ||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||| | || || || |||||  | || || || ||||||||    
T  13942950 tgcatatgtctgctatgatgataaaagaattcgatttgctggaacagtttagagacatgagtttggtatgtgagttgtcgtctcaaagcgtacagttggg 13942851  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 283  Q
     ||| | || || || ||||| ||| ||||||||||| | ||||| ||||| || ||||||    
T  13942850 gatgctaaagattaacagtgatttcctgaatagtatccgggaagcacaacaagtggatgtc 13942790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 45 - 214
Target Start/End: Original strand, 14125730 - 14125899
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||| || ||||||||    
T  14125730 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagcaggaagacattgcatatgtccgctatgatggt 14125829  T
Q  145 gaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtg 214  Q
     |  || || || || ||||||| |||||||||  ||||| | ||||| |||| |||||| |||||||||    
T  14125830 tagagagttcgaattacttgaaccgtttagagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 14125899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 260
Target Start/End: Original strand, 16411396 - 16411633
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| |||| ||  |||| ||||| || ||||| ||||| |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| |    
T  16411396 cagagaagatggctagaattgctgaaagattacgactttggtttgaattatcatctaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacat 16411495  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| || |||||||| |  || || ||||| ||||||||||| || ||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||| ||| |  ||||    
T  16411496 tgcatatgtccgctatgatggtcagagagttcgagttacttgaacagttcagggatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagcgtgaaactggg 16411595  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatca 260  Q
    |||| |||| ||  ||||||||||  |||| |||||||    
T  16411596 tatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 16411633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 38 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 12499249 - 12499041
Alignment:
Q  38 gagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggcca 137  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||  |||||||| || || ||||||||||  |||||||||||||| || || ||||| || |    
T  12499249 gagttattgaaagattatgactttggtttgaattatcatctaggtaaagctaacgtcgttgcagatggcttgagtaggaagacattgcatatgtccgcta 12499150  T
Q  138 tgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaa 237  Q
    ||||||| |  || || || || |||||||||||||||||  ||||| | ||||| || | |||||| || |||||| |  |||| |||||||| ||  |    
T  12499149 tgatggttagagagttcgatttacttgaacagtttagagatatgagtttggtttgtgagtggtcacctcaaagtgtgaaactgggaatgttgaagattga 12499050  T
Q  238 tagtgaatt 246  Q
    |||||||||    
T  12499049 tagtgaatt 12499041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 23 - 283
Target Start/End: Original strand, 16380031 - 16380291
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | ||||| || || |||||||||||||| ||||| || |||||  | ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||      
T  16380031 cagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctagcaaagctaacgtagttgctgatgcattgagcaggaagacac 16380130  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| || |||||| | || |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| | || || || ||||| || || ||  | ||||||||    
T  16380131 tgcatatgtctgctatgatgataaaagaatttgatttgctggaacagtttagagacatgagtttggtatgtgagttgtcgcctcaaagcatacagttggg 16380230  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 283  Q
     ||| | || || || ||||| ||  ||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  16380231 catgctaaagattaacagtgattttctgagtagtatccgagaagcacaacaggtggatgtc 16380291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 51 - 258
Target Start/End: Original strand, 15014898 - 15015105
Alignment:
Q  51 attatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagga 150  Q
    ||||||||||  ||||||| || ||||||||||| || ||||| ||| || ||||||| |||||||| || ||||| ||||| || |||||||| |  ||    
T  15014898 attatgatttcaggttgaattaccatccgggtaaggctaatgttgttacaaatgctttaagtaggaaaacattacatatgtctgctatgatggttagaga 15014997  T
Q  151 atttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtgaattcttg 250  Q
     ||  | |||||||||||||| | |||||||||| | ||||| ||| |||| |  ||||||||| | || || ||| |||| ||||| |||||||| |||    
T  15014998 gttgcatttgcttgaacagttcaaagacttgagtttagtttgtgaagtgtcgcagcagagtgtgaaattagggatgctgaagatcaacagtgaatttttg 15015097  T
Q  251 aatagtat 258  Q
    ||||||||    
T  15015098 aatagtat 15015105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 45 - 258
Target Start/End: Original strand, 14875635 - 14875848
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||| |||||||| ||||  ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || |||||  | ||||| ||    
T  14875635 tgaaagattatgactttgatttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacattgcatatgtccactatgatagt 14875734  T
Q  145 gaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtgaa 244  Q
     |  || || |||||||||||| ||||||||||  ||||  | ||||| || | |||||| ||||||||| |  |||| ||| |||||||  ||||||||    
T  14875735 tagagagttcgagttgcttgaatagtttagagatatgagcttagtttgtgagtggtcacctcagagtgtgaaactgggaatgctgaaaattgatagtgaa 14875834  T
Q  245 ttcttgaatagtat 258  Q
    || ||||| |||||    
T  14875835 tttttgaaaagtat 14875848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 45 - 214
Target Start/End: Original strand, 16806083 - 16806252
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||| |||||||| ||||  ||||| |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||  |||||||    
T  16806083 tgaaagattatgactttgctttgaattatcatctaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacattgcatatgtccgctttgatggt 16806182  T
Q  145 gaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtg 214  Q
     |  || || ||||| ||||||||||| || || |||||| | ||||| |||| |||||| |||||||||    
T  16806183 tagagagttcgagttacttgaacagttcagggatttgagtttagtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 16806252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 81 - 246
Target Start/End: Original strand, 16755757 - 16755922
Alignment:
Q  81 gtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagactt 180  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |  || || ||||| |||||||||||  ||||  |    
T  16755757 gtaaagcgaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgagttacttgaacagttccgagatat 16755856  T
Q  181 gagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtgaatt 246  Q
    |||| | ||||| |||| | |||| ||||||||| |  |||||||| |||| ||  ||||||||||    
T  16755857 gagtttggtttgtgaatggacacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatt 16755922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 4679404 - 4679220
Alignment:
Q  83 aaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttga 182  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||  | || ||||| || |||||| |||| |||||||| ||  | ||||||||||||||| |||    
T  4679404 aaagctaatgtagtcgcggatgcattgagtaggaagacactccatatgtctgctatgatgatgaaagaatttgatttattggaacagtttagagacatga 4679305  T
Q  183 gtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
    || | ||||| || ||||| || || ||||| |||||||| ||| | || || || ||||| ||  ||| ||||||| |||||||    
T  4679304 gtttggtttgtgagttgtcgcctcaaagtgtacagttggggatgctaaagattaacagtgattttctgagtagtatccgagaagc 4679220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 128 - 246
Target Start/End: Original strand, 26791618 - 26791736
Alignment:
Q  128 atgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgt 227  Q
    ||||| ||||||||||| |  || || || ||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||||||| |  ||||||||     
T  26791618 atgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgc 26791717  T
Q  228 tgaaaatcaatagtgaatt 246  Q
    |||| ||  ||||||||||    
T  26791718 tgaagattgatagtgaatt 26791736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 15062713 - 15062580
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||  | |||||| ||||| || | |||||| || ||||||||||| || || ||||| || |||||||    
T  15062713 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatcaagttaaagctaatgttgtggtagatgccttaagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 15062614  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagaga 177  Q
    | |  || || || ||||||||||||||||||||    
T  15062613 ttagagagttcgaattgcttgaacagtttagaga 15062580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 47 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 30138808 - 30138671
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 146  Q
    ||||||| |||||||  |||||  |||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| ||  ||||||| |    
T  30138808 aaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggtta 30138709  T
Q  147 aggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagt 184  Q
    | || || || ||| |||| |||||| |||||||||||    
T  30138708 aagagttggaattgattgagcagtttcgagacttgagt 30138671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 47 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 30148359 - 30148222
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 146  Q
    ||||||| |||||||  |||||  |||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| ||  ||||||| |    
T  30148359 aaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggtta 30148260  T
Q  147 aggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagt 184  Q
    | || || || ||| |||| |||||| |||||||||||    
T  30148259 aagagttggaattgattgagcagtttcgagacttgagt 30148222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 184
Target Start/End: Original strand, 8273537 - 8273674
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 146  Q
    ||||||| |||||||  |||||  |||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| ||  ||||||| |    
T  8273537 aaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggtta 8273636  T
Q  147 aggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagt 184  Q
    | || || || ||| |||| |||||| |||| ||||||    
T  8273637 aagagttggaattgattgagcagtttcgagatttgagt 8273674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 184
Target Start/End: Original strand, 13966482 - 13966619
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 146  Q
    ||||||| |||||||  |||||  |||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| ||  ||||||| |    
T  13966482 aaggattttgatttttagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggtta 13966581  T
Q  147 aggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagt 184  Q
    | || ||||| ||| ||||  ||||| |||| ||||||    
T  13966582 aagagtttgaattgattgagaagtttcgagatttgagt 13966619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 15611081 - 15610968
Alignment:
Q  71 tatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagt 170  Q
    |||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||  || || ||||| ||  ||||||| || || || || ||| |||| ||||    
T  15611081 tatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtaggaagattttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaattgattgagcagt 15610982  T
Q  171 ttagagacttgagt 184  Q
    || |||||||||||    
T  15610981 ttcgagacttgagt 15610968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 184
Target Start/End: Original strand, 16741841 - 16741978
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 146  Q
    ||||||| |||||||  |||||  |||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| ||  ||||||| |    
T  16741841 aaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggtta 16741940  T
Q  147 aggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagt 184  Q
    | || || || ||| |||| ||| || |||||||||||    
T  16741941 aagagttggaattgattgagcagcttcgagacttgagt 16741978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 18750922 - 18750809
Alignment:
Q  71 tatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagt 170  Q
    |||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| ||  ||||||| || || || || ||| |||| ||||    
T  18750922 tatcatccagggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaattgattgagcagt 18750823  T
Q  171 ttagagacttgagt 184  Q
    || |||||||||||    
T  18750822 ttcgagacttgagt 18750809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 51)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 15 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 19880567 - 19880299
Alignment:
Q  15 acatcagacagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtag 114  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19880567 acatgagacagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaacgtagttgcagatgctttgagtag 19880468  T
Q  115 gaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtg 214  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19880467 aaagacgttgcacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagccttgtttgtgaattgtcaccccagagtgtg 19880368  T
Q  215 cagttgggtatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 283  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19880367 cagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgagtagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 19880299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 23 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 18795951 - 18795691
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18795951 cagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 18795852  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    |||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18795851 tacacatgtcggctttaatggtaaaggaatttgagttgcttgaatagtttagagacttgagtcttgtttgtgaattgtcacctcagagtgtgcagttggg 18795752  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18795751 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 18795691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Original strand, 34644598 - 34644855
Alignment:
Q  15 acatcagacagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtag 114  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  34644598 acatgagacagaggagatggctagagttattgaaggattatgagtttgggttgaactatcatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgccttgagtag 34644697  T
Q  115 gaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtg 214  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34644698 aaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagatttgagccttgtttgcgagttgtcaccccagagtgtg 34644797  T
Q  215 cagttgggtatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaac 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  34644798 cagttgggtatgttgaaaatcaatagtgaattcttggatagtattagagaagcgcaac 34644855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 21563173 - 21563412
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  21563173 ttgaaggattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttgcacatgtcggctatgatgg 21563272  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21563273 taaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgtgaattgtcacctcagagtgtgcagctgggtatgttgaaaatcaatagtga 21563372  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 283  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21563373 tttcttgaaaagtatcagagaagcgcaacaagttgatgtc 21563412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 21569032 - 21569271
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  21569032 ttgaaggattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttgcacatgtcggctatgatgg 21569131  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21569132 taaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgtgaattgtcacctcagagtgtgcagctgggtatgttgaaaatcaatagtga 21569231  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 283  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21569232 tttcttgaaaagtatcagagaagcgcaacaagttgatgtc 21569271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 23 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 15460597 - 15460337
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  15460597 cagaggagatggctagaattattaaaggattatgattttggtttgaactatcatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacat 15460498  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| | || |||||||| |||||    
T  15460497 tgcacatgtcggccttgatggtaaaggagttcgaattgcttgaacagtttagagacttgagtctagtgtgtgaattgtcatcgcaaagtgtgcatttggg 15460398  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 283  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||  |||||||||    
T  15460397 tatgctgaagatcaatagtgatttcttgagtagtatccgagaagcacaacgagttgatgtc 15460337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 23 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 21472862 - 21472615
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| | || || |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21472862 cagagaagatggcttgaattgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgt 21472763  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||    
T  21472762 tgcacatgtctgctatgatggtaaaagagtttgagttccttgaacaatttagagacttgagtcttgtttgcgagttgccacctcagagtgtgcagttggg 21472663  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgca 270  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||    
T  21472662 tatgttgaagatcaatagtgatttcttgaacagtattagggaagcgca 21472615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 23 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 19454681 - 19454422
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  19454681 cagaggaggtggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaagacat 19454582  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  |||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  19454581 tgcatatgtctgctttgatggtgaaagaatttgatttgctagagcaatttagagatttgagtcttgtctgtgaattgacacctcagagtgtgcagttggg 19454482  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgt 282  Q
     ||| |||| || || ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||    
T  19454481 gatgctgaagattaacagtgatttcttgaataatatcagagaagcacaacaagtggatgt 19454422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 270
Target Start/End: Original strand, 8761953 - 8762200
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||     
T  8761953 cagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaacgc 8762052  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  | |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  8762053 tgcatatgtctgctttaatggtgaaagaattcgatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtgttcagttggg 8762152  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgca 270  Q
     ||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  8762153 gatgctgaaaattaatagtgatttcctgaatagtatccgagaaccgca 8762200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 29 - 273
Target Start/End: Original strand, 5296232 - 5296476
Alignment:
Q  29 agatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacaca 128  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  5296232 agatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgttgatgcgttgagcaggaagacgttgcaca 5296331  T
Q  129 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgtt 228  Q
    |||| || |||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||| | || ||||| ||| |    
T  5296332 tgtctgctatgatggtaaaagaatttgagttgctagagcagtttagagacttgagccttgtttgtgagttatcacctcagagtatacaattggggatgct 5296431  T
Q  229 gaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaaca 273  Q
    || ||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5296432 gagaattaacagtgatttcttgaatagtatccgagaagcgcaaca 5296476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 44 - 270
Target Start/End: Original strand, 19488313 - 19488539
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||| || |||||||    
T  19488313 ttgaaggactatgattttggtttgaattatcatccaagtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacgttgaatatgtctgctatgatgg 19488412  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || || |||||| |||| ||||||||||| ||||  || ||    
T  19488413 ttaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcgcctcaaagtgtgaagttaggtatgttgaagatcagcagaga 19488512  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagcgca 270  Q
     |||||||||||||| | |||||||||    
T  19488513 gttcttgaatagtattaaagaagcgca 19488539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Original strand, 10467869 - 10468113
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || || |    
T  10467869 cagaggagatggttagagttactgaatgattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagcagaaaaacat 10467968  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  ||||| | || |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| | ||||||||    
T  10467969 tgcatatgtctgctttgatgataaaagaatttgagttgctggagcaatttagagacttgagtcttgtctgagaattgtcacctcagagtatacagttggg 10468068  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     ||| |||| ||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  10468069 gatgctgaagattgatagtgatttcttgaatagtatccgagaagc 10468113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 24365673 - 24365429
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || |    
T  24365673 cagaggagatggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaacgttgttgctgatgctttgagcaggaaaacct 24365574  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| ||  | ||||| || |||||||| ||| | |||||||| |||||| | |||||||| || ||||||||| | |||||| | ||||||||    
T  24365573 tgcacatgtctgctttaatggtaaaagaatttgaattgttagaacagttcagagacattagtcttgtctgtgaattgtcatctcagagtatacagttggg 24365474  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     |||||||||||  ||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  24365473 aatgttgaaaattgatagtgacttcttgaacagtatccgagaagc 24365429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 270
Target Start/End: Original strand, 14378937 - 14379184
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||     
T  14378937 cagaggaggtggttagagctgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttaagtaggaaaacgc 14379036  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||| | |||||||| ||||| || ||||| ||  |||| ||||| ||||||||||| || |||||| |||| |||||||| || |||||    
T  14379037 tgcatatgtctgccttaatggtgaaagaattcgatttgctagagtagttcagagatttgagtcttgtctgtgaattgacacctcagagtgttcaattggg 14379136  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgca 270  Q
     ||| | || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14379137 gatgctaaagattaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcgca 14379184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 270
Target Start/End: Original strand, 14380487 - 14380734
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||     
T  14380487 cagaggaggtggttagagctgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttaagtaggaaaacgc 14380586  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||| | |||||||| ||||| || ||||| ||  |||| ||||| ||||||||||| || |||||| |||| |||||||| || |||||    
T  14380587 tgcatatgtctgccttaatggtgaaagaattcgatttgctagagtagttcagagatttgagtcttgtctgtgaattgacacctcagagtgttcaattggg 14380686  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgca 270  Q
     ||| | || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14380687 gatgctaaagattaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcgca 14380734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 15897334 - 15897096
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||  |||| ||||| || ||||||     
T  15897334 ttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactctacatatgtccgcgatgatga 15897235  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | || || ||| ||||||| ||||||||| |||| || ||| |||| ||  |||||||    
T  15897234 tcaaagaatttgagttgcttgaacagtttagagatttgagcttagtctgtgaagtgtcacctcagagtgtgaagttaggaatgctgaagattgatagtga 15897135  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgt 282  Q
    ||||||||| ||||| | |||||| ||| | ||||||||    
T  15897134 attcttgaacagtattaaagaagcacaaaaagttgatgt 15897096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 45 - 282
Target Start/End: Original strand, 20636343 - 20636580
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  || ||||||||    
T  20636343 tgaaggactatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttacatatgttcgctatgatggt 20636442  T
Q  145 gaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtgaa 244  Q
     ||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||| ||| ||||| |  | |||||| || | || ||| |||| ||  ||| ||||    
T  20636443 aaaggagttcgagttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgtgaaatgtcatctgaaagtgtgaagctaggaatgctgaagattgataatgaa 20636542  T
Q  245 ttcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgt 282  Q
    ||  |||| ||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  20636543 tttctgaagagtattaaagaagcgcaaaaggttgatgt 20636580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 44 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 22443507 - 22443284
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || ||||| |    
T  22443507 ttgaaagattatgactttggtttgaactatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatag 22443408  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | |  || || ||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||| || | |||||| ||||||||| |  |||||||| |||| ||  |||||||    
T  22443407 ttagagagttcgagttgcttgaacagtttagagatttgagcttagtttgtgagtggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtga 22443308  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
    |||  |||| ||||||| ||||||    
T  22443307 atttctgaagagtatcaaagaagc 22443284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 44 - 246
Target Start/End: Original strand, 16625758 - 16625960
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||    
T  16625758 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 16625857  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | |  || || |||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||||||| |  |||||||| |||| ||  |||||||    
T  16625858 tcagagagttcgagttgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtga 16625957  T
Q  244 att 246  Q
    |||    
T  16625958 att 16625960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 29 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 27188691 - 27188453
Alignment:
Q  29 agatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacaca 128  Q
    |||||| |||||||  | ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  27188691 agatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacgttgcata 27188592  T
Q  129 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgtt 228  Q
    |||| ||||||||||| |  || |||||| | |||||||||||  ||||  ||||| | ||||| |||| |||||| ||||||||| | ||||||||| |    
T  27188591 tgtccgccatgatggtcagagagtttgagctacttgaacagttccgagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaattgggtatgct 27188492  T
Q  229 gaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
    ||| ||  ||||||||||  |||| || |||| ||||||    
T  27188491 gaagattgatagtgaatttctgaaaagcatcaaagaagc 27188453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 29 - 267
Target Start/End: Original strand, 27260549 - 27260787
Alignment:
Q  29 agatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacaca 128  Q
    |||||| |||||||  | ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  27260549 agatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacgttgcata 27260648  T
Q  129 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgtt 228  Q
    |||| ||||||||||| |  || |||||| | |||||||||||  ||||  ||||| | ||||| |||| |||||| ||||||||| | ||||||||| |    
T  27260649 tgtccgccatgatggtcagagagtttgagctacttgaacagttccgagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaattgggtatgct 27260748  T
Q  229 gaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
    ||| ||  ||||||||||  |||| || |||| ||||||    
T  27260749 gaagattgatagtgaatttctgaaaagcatcaaagaagc 27260787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 44 - 246
Target Start/End: Original strand, 29590961 - 29591163
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||    
T  29590961 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 29591060  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | |  || || || ||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||||||| |  |||||||| |||| ||  |||||||    
T  29591061 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtga 29591160  T
Q  244 att 246  Q
    |||    
T  29591161 att 29591163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 44 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 22435109 - 22434886
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || ||||| |    
T  22435109 ttgaaagattatgactttggtttgaactatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatag 22435010  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | |  || || ||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||| || | |||||| ||||||||| |  |||| ||| |||| ||  |||||||    
T  22435009 ttagagagttcgagttgcttgaacagtttagagatttgagcttagtttgtgagtggtcacctcagagtgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtga 22434910  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
    |||  |||| ||||||| ||||||    
T  22434909 atttctgaagagtatcaaagaagc 22434886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Original strand, 22761496 - 22761734
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||    
T  22761496 ttgaaggactatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgccatgatgg 22761595  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | ||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||| | ||||| ||| ||| | |  | |||||| || | || ||| |||| ||  ||| |||    
T  22761596 taaaggagttcgagttgcttgaacaattcagagatttgagtttagtttgtgaaatgttatctgaaagtgtgaagctaggaatgctgaagattgataatga 22761695  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgt 282  Q
    |||| |||| ||||| | |||||||||| | ||||||||    
T  22761696 attcctgaagagtattaaagaagcgcaaaaagttgatgt 22761734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 44 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 23079709 - 23079483
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| || |||||||    
T  23079709 ttgaaggattatgattttagtttaaactatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtctgctatgatgg 23079610  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | || || ||| | || || |||||||||||||| |||||| | || ||||| |||||| | |||||||||  | | || ||| |||||||  |||||||    
T  23079609 taaaagagtttaattttctggaacagtttagagatttgagtttagtctgcgagttgtcatctcagagtgtgaggctaggaatgctgaaaattgatagtga 23079510  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagcgca 270  Q
    |||  |||| ||||| | |||||||||    
T  23079509 atttctgaaaagtattaaagaagcgca 23079483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 29 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 25113807 - 25113626
Alignment:
Q  29 agatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacaca 128  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |    
T  25113807 agatggctagagttgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcata 25113708  T
Q  129 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagag 210  Q
    |||| || |||||||| |  || || ||||| ||||||||||| |||||  ||||| | |||||||||| |||||| |||||    
T  25113707 tgtccgctatgatggtcagagagttcgagttacttgaacagttcagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagag 25113626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 125 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 25769350 - 25769205
Alignment:
Q  125 cacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggta 224  Q
    |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| || || ||||| ||||||||||||| |||||    
T  25769350 cacatgtctgctatgatggtaaaagagtttgagtttcttgaacaatttagagacttgagtcttctttgtgagttatcacctcagagtgtgcagtagggta 25769251  T
Q  225 tgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgca 270  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||    
T  25769250 tgttgaagatcaatagtgatttcttaaacaatatcagggaagcgca 25769205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 44 - 252
Target Start/End: Original strand, 24312209 - 24312417
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||| ||||| | |||||||||||||| || || ||||| |||||||| |    
T  24312209 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgtttcagattccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgattg 24312308  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | |  || || || ||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||||||| |  |||||||| |||| ||  |||||||    
T  24312309 ttagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtga 24312408  T
Q  244 attcttgaa 252  Q
    ||| |||||    
T  24312409 atttttgaa 24312417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 44 - 231
Target Start/End: Original strand, 2873844 - 2874031
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| || || ||||| || |||||||    
T  2873844 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgtcgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 2873943  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaa 231  Q
    | |  || || || ||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||||||| |  |||||||| ||||    
T  2873944 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaa 2874031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 24 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 19436262 - 19436019
Alignment:
Q  24 agaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgtt 123  Q
    |||||| |||||||||| | |||||||| || |||||||| ||||| || |||||  ||||||||||||| |||||  |||| |||||  ||||||| ||    
T  19436262 agaggatatggttagagctgttgaaggactacgattttggtttgaattaccatcctagtaaagccaatgtggttgctaatgcgttgagccggaagacatt 19436163  T
Q  124 acacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggt 223  Q
     || ||||| ||  |||||||| ||||||| || ||||| || ||||| | ||| ||||||||||| || |||||| |||| |||||||| || ||  |     
T  19436162 gcatatgtctgctttgatggtggaggaattcgatttgctagagcagttcaaagatttgagtcttgtctgtgaattgacacctcagagtgttcaattcagg 19436063  T
Q  224 atgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
    ||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  19436062 atgctgaaaattcatagtgatttcttgaatagtatctgagaagc 19436019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 184
Target Start/End: Original strand, 28281833 - 28281994
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||      
T  28281833 cagaggagatggcttgagttgttaaaggattatgattttgggttgaattaccatccgggaaaagcaaatgtagtcgcggatgcattgagtaggaagacac 28281932  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagt 184  Q
    | || ||||| || |||||| |||| |||||||| ||  | ||||||||||||||| |||||    
T  28281933 tccatatgtctgctatgatgatgaaagaatttgatttattggaacagtttagagacatgagt 28281994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 50 - 202
Target Start/End: Original strand, 18406991 - 18407143
Alignment:
Q  50 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 149  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || || |||| ||| |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||    
T  18406991 gattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaacgttgttgtagacgctttgagcaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaagg 18407090  T
Q  150 aatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtca 202  Q
    | || ||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||| ||| |||||    
T  18407091 agttcgagttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgtgaaatgtca 18407143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 177
Target Start/End: Original strand, 16926684 - 16926814
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 146  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| | || |||||||| || |||||||| |    
T  16926684 aaggattatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgcattgagtaggaagtcattgcacatgtccgctatgatggtaa 16926783  T
Q  147 aggaatttgagttgcttgaacagtttagaga 177  Q
    | || || ||||| || ||||||||||||||    
T  16926784 aagagttcgagttactggaacagtttagaga 16926814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 29 - 267
Target Start/End: Original strand, 28262223 - 28262461
Alignment:
Q  29 agatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacaca 128  Q
    |||||| |||||||  | ||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |    
T  28262223 agatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttaaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcata 28262322  T
Q  129 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgtt 228  Q
    |||| ||||||||||| |  || || ||||| ||||||||||| |||||  ||||| | ||||| |||| ||| || ||||||||| |  |||||||| |    
T  28262323 tgtctgccatgatggtcagagagttcgagttacttgaacagttcagagatatgagtttggtttgtgaatggtcgcctcagagtgtgaaactgggtatgct 28262422  T
Q  229 gaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
    ||| ||  ||||||||||  |||| || |||| ||||||    
T  28262423 gaagattgatagtgaatttctgaaaagcatcaaagaagc 28262461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 29 - 267
Target Start/End: Original strand, 28340972 - 28341210
Alignment:
Q  29 agatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacaca 128  Q
    |||||| |||||||  | ||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |    
T  28340972 agatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttaaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcata 28341071  T
Q  129 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgtt 228  Q
    |||| ||||||||||| |  || || ||||| ||||||||||| |||||  ||||| | ||||| |||| ||| || ||||||||| |  |||||||| |    
T  28341072 tgtctgccatgatggtcagagagttcgagttacttgaacagttcagagatatgagtttggtttgtgaatggtcgcctcagagtgtgaaactgggtatgct 28341171  T
Q  229 gaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
    ||| ||  ||||||||||  |||| || |||| ||||||    
T  28341172 gaagattgatagtgaatttctgaaaagcatcaaagaagc 28341210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 260
Target Start/End: Original strand, 1542128 - 1542341
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 146  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| || || ||||| || |||||||| |    
T  1542128 aaggattacgactttggtttgaattaccatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtcggaagacattgcatatgtccgctatgatggtta 1542227  T
Q  147 aggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtgaatt 246  Q
      || || ||||| |||||||||||||||||  ||||| | ||||| |||| |||||| ||||||||| |  |||||||| |||| ||  ||||||| ||    
T  1542228 gagagttcgagttacttgaacagtttagagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgagtt 1542327  T
Q  247 cttgaatagtatca 260  Q
    | |||| |||||||    
T  1542328 cctgaagagtatca 1542341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 41 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 19865930 - 19865794
Alignment:
Q  41 ttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatga 140  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || ||||    
T  19865930 ttattgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgctgatgccttgagtaggaaaacgttgcatatgtctgctatga 19865831  T
Q  141 tggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagaga 177  Q
    |||| || || || ||| |||||||||||||||||||    
T  19865830 tggttaaagagttcgagctgcttgaacagtttagaga 19865794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 47 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 18449747 - 18449580
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 146  Q
    ||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |||||| ||||||| |||||||| || ||||| ||||| || |||||||| |    
T  18449747 aaggattataatttcgggttgaattaccatccgggtaaggctaatgttgttgcatatgctttaagtaggaaaacattacatatgtctgctatgatggtta 18449648  T
Q  147 aggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtg 214  Q
    | || || |||||||||| |||||| | |||||||||| | ||||| ||| |||| || |||||||||    
T  18449647 aagagttggagttgcttgcacagttcaaagacttgagtttggtttgtgaagtgtcgccgcagagtgtg 18449580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 50 - 209
Target Start/End: Original strand, 25608908 - 25609067
Alignment:
Q  50 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 149  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| || |||||||| |  |    
T  25608908 gattatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagacgccttgagtaggaagactttgcatatgtctgctatgatggttagag 25609007  T
Q  150 aatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccaga 209  Q
    | || |||||| | |||||||||||||| |||||| | ||||| |||| |||||| ||||    
T  25609008 agttcgagttgttggaacagtttagagatttgagtttagtttgtgaatggtcacctcaga 25609067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 47 - 177
Target Start/End: Original strand, 16962489 - 16962619
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 146  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||| | || |||||||| || |||||||| |    
T  16962489 aaggattatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttggagatgcattgagtaggaagtcattgcacatgtccgctatgatggtaa 16962588  T
Q  147 aggaatttgagttgcttgaacagtttagaga 177  Q
    | || || ||||| || ||||||||||||||    
T  16962589 aagagttcgagttactggaacagtttagaga 16962619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 260
Target Start/End: Original strand, 5838263 - 5838476
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 146  Q
    ||||| |||||||| |  |||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || |||||||| |    
T  5838263 aaggactatgatttcgaattgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagactttgcatatgtccgctatgatggtta 5838362  T
Q  147 aggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtgaatt 246  Q
      || || ||||| ||||| |||||||||||  ||||| | ||||| |||| |||||| || |||||| |  |||||||| |||| ||  ||||||| ||    
T  5838363 gagagttcgagttacttgagcagtttagagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcatagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgattt 5838462  T
Q  247 cttgaatagtatca 260  Q
      ||||||||||||    
T  5838463 tctgaatagtatca 5838476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 58 - 195
Target Start/End: Original strand, 22077745 - 22077882
Alignment:
Q  58 ttttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgag 157  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| || || ||||| || || ||| | ||||| || |||    
T  22077745 ttttgagttgagctatcatccgagtaaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgag 22077844  T
Q  158 ttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcga 195  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||    
T  22077845 ttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgcga 22077882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 41 - 270
Target Start/End: Original strand, 18966333 - 18966559
Alignment:
Q  41 ttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatga 140  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||| || || ||   ||||||||| |||||||| ||  |||| ||||| || ||||    
T  18966333 ttattgaaagattatgatttttggttgaattatcatctaggtaaagctaacgttgt---agatgctttaagtaggaaaactctacatatgtctgctatga 18966429  T
Q  141 tggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatag 240  Q
    |||  || || || ||| |||| ||||||||||||||| ||||| | || |  ||||||||||| ||||||||| |||| || ||| |||| ||  ||||    
T  18966430 tggctaaagagttggagctgctcgaacagtttagagacctgagtttagtctatgaattgtcacctcagagtgtgaagttaggaatgctgaagattgatag 18966529  T
Q  241 tgaattcttgaatagtatcagagaagcgca 270  Q
    ||||||  | |||||||| | |||||||||    
T  18966530 tgaatttctcaatagtattaaagaagcgca 18966559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 45 - 214
Target Start/End: Original strand, 27564863 - 27565032
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||  |||||||    
T  27564863 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagcaggaagacattgcatatgtccgctttgatggt 27564962  T
Q  145 gaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtg 214  Q
     |   | || || || |||||||||||||||||  ||||  | ||||| |||| |||||| |||||||||    
T  27564963 tagaaagttcgaattacttgaacagtttagagatatgagcttggtttgtgaatagtcacctcagagtgtg 27565032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 258
Target Start/End: Original strand, 18196774 - 18196980
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||| |||  |||||| || ||||||||||| ||||| ||||      || ||     
T  18196774 ttgaaagattatgattttgggttgaattatcattcaggtaaagctaatgttgttatagatgccttaagtaggaagactttacatatgt------tgttgt 18196867  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
     || |    ||||||| ||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||| | ||||||||| || | || ||| |||| ||  |||||||    
T  18196868 agatg--ccttgagttacttgaacaggttagagatttgagtttagtttgcgaattgtcatctcagagtgtgaagctaggaatgctgaagattgatagtga 18196965  T
Q  244 attcttgaatagtat 258  Q
     |||||||| |||||    
T  18196966 tttcttgaaaagtat 18196980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 47 - 184
Target Start/End: Original strand, 16381417 - 16381554
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 146  Q
    ||||||| |||||||  |||||  |||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| ||  ||||||| |    
T  16381417 aaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggtta 16381516  T
Q  147 aggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagt 184  Q
    | || || || ||| |||| |||||| |||||||||||    
T  16381517 aagagttggaattgattgagcagtttcgagacttgagt 16381554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 47 - 184
Target Start/End: Original strand, 18836952 - 18837089
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 146  Q
    ||||||| |||||||  |||||  |||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| ||  ||||||| |    
T  18836952 aaggattttgattttcagttgagttatcatcccgggaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggtta 18837051  T
Q  147 aggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagt 184  Q
    | || || || ||| |||| |||||| |||||||||||    
T  18837052 aagagttggaattgattgagcagtttcgagacttgagt 18837089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 195
Target Start/End: Original strand, 27330537 - 27330625
Alignment:
Q  107 ttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcga 195  Q
    |||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || |||||||||||| |||| | ||| ||||| || ||||||||    
T  27330537 ttgagtaggaagacttttcatatgtccgctatgatggtaaaggagttcgagttgcttgaatagttcaaagatttgagcctagtttgcga 27330625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 195
Target Start/End: Original strand, 27391277 - 27391365
Alignment:
Q  107 ttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcga 195  Q
    |||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || |||||||||||| |||| | ||| ||||| || ||||||||    
T  27391277 ttgagtaggaagacttttcatatgtccgctatgatggtaaaggagttcgagttgcttgaatagttcaaagatttgagcctagtttgcga 27391365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 184
Target Start/End: Original strand, 16649013 - 16649150
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 146  Q
    ||||||| |||||||  |||||  |||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| ||  ||||||| |    
T  16649013 aaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggtta 16649112  T
Q  147 aggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagt 184  Q
    | || || || ||| |||| |||||| |||| ||||||    
T  16649113 aagagttggaattgattgagcagtttcgagatttgagt 16649150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 21928418 - 21928305
Alignment:
Q  71 tatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagt 170  Q
    |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || ||||| ||  ||||||| || || ||||| ||| |||| ||||    
T  21928418 tatcatcccgggaaggcaaatgttgttgccgacgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagtttgaattgattgagcagt 21928319  T
Q  171 ttagagacttgagt 184  Q
    || |||||||||||    
T  21928318 ttcgagacttgagt 21928305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 34)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 23 - 283
Target Start/End: Original strand, 20060899 - 20061159
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||||||  | || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20060899 cagaggagatgacttgaattattaaaggattatgattttggcttgaactaccattcgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacgt 20060998  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||    
T  20060999 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgagcattttagagatttgagccttgtttgtgatttgttaccccagagtgtgcagttggg 20061098  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20061099 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacagattgatgtc 20061159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 23 - 282
Target Start/End: Original strand, 20855707 - 20855966
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20855707 cagaggagatggcttgagttattaaatgattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagttaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacgt 20855806  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||||||| | ||||| ||||| ||| | ||||| ||||||||||| || || ||||| || || ||||||||| | || ||||||||||||||    
T  20855807 tgcacatgtcggccttaatggtaaaggagttttaattgctcgaacagtttagggatttaagtctcgtgtgtgaattgtcatctcaaagtgtgcagttggg 20855906  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgt 282  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20855907 tatgctgaagatcaatagtgatttcttggatagtatcagagaagcgcaacaagttgatgt 20855966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 23 - 259
Target Start/End: Original strand, 23197193 - 23197429
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  23197193 cagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgctgatgcgttgagcaggaagacgt 23197292  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| || |||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  23197293 tgcacatgtctgctatgatggtaaaagaatttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgaattgacacctcagagtgtacagttggg 23197392  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatc 259  Q
     ||| |||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  23197393 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatc 23197429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 23 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 19855717 - 19855458
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  19855717 cagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaagacat 19855618  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  |||||||||| |||||||| || || || ||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  19855617 tgcatatgtctgctttgatggtgaaagaatttgatttactagagcagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtgtacagttggg 19855518  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgt 282  Q
     ||| |||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||    
T  19855517 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcacaacaagtggatgt 19855458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Original strand, 19662084 - 19662328
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  19662084 cagaggaggtggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagacat 19662183  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  |||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  19662184 tgcatatgtctgctttgatggtgaaagaatttgatttgctagagcagtttagagatttgagtcttgtttgtgaattgacaccccagagtgtacagttggg 19662283  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     ||| |||| || || | ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  19662284 gatgctgaagattaacaatgatttcttgaatagtatccgagaagc 19662328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Original strand, 24098550 - 24098794
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    ||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |    
T  24098550 cagagaagatggttagatcttttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgctgatgcgttgagcaggaagacat 24098649  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||| |||| |||||||| ||||||||    
T  24098650 tgcatatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgctagaacagtttagagacttgagccttgtctgtgagttgacacctcagagtgttcagttggg 24098749  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     ||| |||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  24098750 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagc 24098794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 23 - 272
Target Start/End: Original strand, 20834847 - 20835096
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||     
T  20834847 cagaggagatggttggagttgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaacgc 20834946  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  | |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||  |||| |||||||| ||||||||    
T  20834947 tgcatatgtctgctttaatggtgaaagaattcgatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtctgtgaattaacacctcagagtgttcagttggg 20835046  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaac 272  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  20835047 gatgctgaagattaataatgatttcttgaatagtatccgagaagcacaac 20835096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Original strand, 31538944 - 31539188
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  31538944 cagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaacgt 31539043  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | ||| |||| ||  |||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||  |||||||||| || ||||||||||| |||||| | ||||||||    
T  31539044 tgcacgtgtcagctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttcagagatatgagtcttgtctgtgaattgtcacctcagagtatacagttggg 31539143  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     |||||||||||  ||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  31539144 aatgttgaaaattgatagtgatttcttgaacagtatccgagaagc 31539188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 37678492 - 37678248
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  37678492 cagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggtttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgttgatgctttgagtaggaaaacgt 37678393  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| ||  |||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||  |||||||||| || ||||||||||| |||||| | ||||||||    
T  37678392 tgcacatgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttcagagatatgagtcttgtctgtgaattgtcacctcagagtatacagttggg 37678293  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     |||||||| ||  ||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  37678292 aatgttgaagattgatagtgacttcttgaacagtatccgagaagc 37678248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 282
Target Start/End: Original strand, 20939010 - 20939269
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||    
T  20939010 cagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttaaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaatgt 20939109  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  ||||||| || |||||||| ||| |  | ||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||| |||||||| || |||||    
T  20939110 tgcatatgtctgctttgatggtaaaagaatttgatttgttatagcagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtgtacaattggg 20939209  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgt 282  Q
     ||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||    
T  20939210 gatgctgaaaattaatagtaatttcttgaatagtatccgagaagcacaacaagtggatgt 20939269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 44 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 16373921 - 16373707
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||| || |||||||    
T  16373921 ttgaaagattatgattttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctgctatgatgg 16373822  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | ||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||| |||| |||||| ||||||||| || |||| ||| |||| ||  |||||||    
T  16373821 ttaaggagttcgagttgcttgaacagtttagagatctgagtttagtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaagctgggaatgctgaagattgatagtga 16373722  T
Q  244 attcttgaatagtat 258  Q
    ||||||||| |||||    
T  16373721 attcttgaaaagtat 16373707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 20295824 - 20295580
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |    
T  20295824 cagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccaccctggtaaggccaatgtagttgctgatgctttgagcaggaaaactt 20295725  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| ||  |||||| ||| |||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||| | || || ||||||||||| |||||| | ||||||||    
T  20295724 tgcacatgtctgctttgatggcgaaagaatttgaattgttagaatagtttagagacttgagtttggtctgtgaattgtcacctcagagtattcagttggg 20295625  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     ||| |||| ||  ||||| | |||||||| |||||| |||||||    
T  20295624 gatgctgaagattgatagtaatttcttgaacagtatccgagaagc 20295580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 21952321 - 21952113
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |    
T  21952321 cagaggagatggttagagttactgaaggattacgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgcgttgagcaggaagacat 21952222  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||| | |||||| | ||||||||    
T  21952221 tgcatatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgttagaacagtttagagacttgagccttgtctgtgaactgtcatctcagagtatacagttggg 21952122  T
Q  223 tatgttgaa 231  Q
     ||| ||||    
T  21952121 gatgctgaa 21952113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 44 - 260
Target Start/End: Original strand, 51332461 - 51332677
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||| || || ||||| || |||||||    
T  51332461 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgattaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 51332560  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | || || || || ||||||||||||||||||||  ||||| | ||||| |||| |||||| ||||||||| | ||||||||| |||| ||  |||||||    
T  51332561 tcaaagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaattgggtatgctgaagattgatagtga 51332660  T
Q  244 attcttgaatagtatca 260  Q
    |||| |||| |||||||    
T  51332661 attcctgaaaagtatca 51332677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 45 - 183
Target Start/End: Original strand, 431085 - 431223
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||||||||    
T  431085 tgaaggattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggt 431184  T
Q  145 gaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgag 183  Q
     || ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  431185 aaaagaattcgagttgcttgaacagttcagagatttgag 431223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 44 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 22110413 - 22110187
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||  | ||||||||||| || |||||||||||||| || |||||  | |||||||    
T  22110413 ttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaaatttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtcctctatgatgg 22110314  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | || || ||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || |||||| ||||||  ||||||||| || |||| ||| | || ||  |||||||    
T  22110313 taaaagagtttgagttgcttgaatagtttagagatttgagtttagtatgcgaaatgtcacatcagagtgtgaagctgggaatgctaaagattgatagtga 22110214  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagcgca 270  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||    
T  22110213 attcttgaacagtattaaagaagcgca 22110187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 44 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 22114262 - 22114036
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||  | ||||||||||| || |||||||||||||| || |||||  | |||||||    
T  22114262 ttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaaatttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtcctctatgatgg 22114163  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | || || ||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || |||||| ||||||  ||||||||| || |||| ||| | || ||  |||||||    
T  22114162 taaaagagtttgagttgcttgaatagtttagagatttgagtttagtatgcgaaatgtcacatcagagtgtgaagctgggaatgctaaagattgatagtga 22114063  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagcgca 270  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||    
T  22114062 attcttgaacagtattaaagaagcgca 22114036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 53 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 21750322 - 21750093
Alignment:
Q  53 tatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaat 152  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || || |    
T  21750322 tatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagacattgcatatgtcggccatgatggtaaaagagt 21750223  T
Q  153 ttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaa 252  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| |||||| | || || ||| ||||| |  |||||||| |||| || ||| |||| ||  ||| ||||||  ||||    
T  21750222 tcgagttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtatgtgaaatgtcatctgagagtgtgaagttagggatgctgaagattgataatgaatttctgaa 21750123  T
Q  253 tagtatcagagaagcgcaacaggttgatgt 282  Q
     ||||| | |||||| ||| | ||||||||    
T  21750122 gagtattaaagaagcacaaaaagttgatgt 21750093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 44 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 21831694 - 21831478
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || |||||||    
T  21831694 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 21831595  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | |  || || || ||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||||||| |  |||||||| |||| ||  |||||||    
T  21831594 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtga 21831495  T
Q  244 attcttgaatagtatca 260  Q
    |||| |||| |||||||    
T  21831494 attcctgaaaagtatca 21831478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 44 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 21838341 - 21838139
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||    
T  21838341 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 21838242  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | |  || || || ||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||||||| |  |||||||| |||| ||  |||||||    
T  21838241 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtga 21838142  T
Q  244 att 246  Q
    |||    
T  21838141 att 21838139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 151
Target Start/End: Original strand, 21744499 - 21744627
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21744499 cagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttgggttgaattaccatccgagtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagtaggaagacgt 21744598  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaa 151  Q
    | |||||||| || |||||||| ||||||    
T  21744599 tgcacatgtctgctatgatggtaaaggaa 21744627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 47 - 246
Target Start/End: Original strand, 33390000 - 33390199
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 146  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || |||||||| |    
T  33390000 aaggattacgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtca 33390099  T
Q  147 aggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtgaatt 246  Q
      || || || |||||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||| |||||| ||||||||| |  |||||||| |||| ||  ||||||||||    
T  33390100 gagagttcgaattgcttgaacagtttagagatttgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatt 33390199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 44 - 246
Target Start/End: Original strand, 16349564 - 16349766
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||    
T  16349564 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 16349663  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | |  || || || ||||||||||||||  ||||  ||||| | ||||| |||| |||||| ||||| ||| |  ||||||||||||| ||  |||||||    
T  16349664 tcagagagttcgaattgcttgaacagttccgagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagcgtgaaactgggtatgttgaagattgatagtga 16349763  T
Q  244 att 246  Q
    |||    
T  16349764 att 16349766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 29 - 231
Target Start/End: Original strand, 41352615 - 41352817
Alignment:
Q  29 agatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacaca 128  Q
    |||||| |||||||  | || |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |    
T  41352615 agatggctagagttgctaaaagattatgactttgggttgaattaccatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcata 41352714  T
Q  129 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgtt 228  Q
    |||| ||||||||||| |  || |||||||| |||||||||||  ||||  ||||| | ||||| |||| |||||| ||||||||| |  |||||||| |    
T  41352715 tgtccgccatgatggtcagagagtttgagttacttgaacagttccgagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgct 41352814  T
Q  229 gaa 231  Q
    |||    
T  41352815 gaa 41352817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 44 - 267
Target Start/End: Original strand, 19759841 - 19760064
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| ||  |||| ||||| || ||||||     
T  19759841 ttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggaaaagctaatgttgttgcagatgcgttaagtaggaaaactctacatatgtccgctatgatga 19759940  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    |  | ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| | || || ||| ||||||| ||||||||| |||| |  ||| |||| ||  |||||||    
T  19759941 tctaagaattggagctgcttgaacagtttagagatttgagtttagtctgtgaagtgtcacctcagagtgtgaagttagaaatgctgaagattgatagtga 19760040  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
    |||  |||||||||| | ||||||    
T  19760041 atttatgaatagtataaaagaagc 19760064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 19107780 - 19107543
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||| ||| | || || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  19107780 cagaggaggtggcttgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacat 19107681  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    |  | ||||| || |||||||| |  || || ||||| ||||||||||| |||||  ||||| | |||||||||| |||| | ||||||||| |  ||||    
T  19107680 tgtatatgtccgctatgatggttagagagttcgagttacttgaacagttcagagatatgagtttggtttgcgaatggtcatctcagagtgtgaaactggg 19107581  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatca 260  Q
     ||| |||| ||  ||||||||||  |||| |||||||    
T  19107580 aatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 19107543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 20 - 209
Target Start/End: Original strand, 21234675 - 21234864
Alignment:
Q  20 agacagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaaga 119  Q
    |||||| | |||||| |||||||  |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  21234675 agacagcgtagatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaaga 21234774  T
Q  120 cgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccaga 209  Q
    |||| || ||||| ||  ||||||| |  || || ||||| ||||||||||| ||||| |||||| | ||||| |||| |||||| ||||    
T  21234775 cgttgcatatgtccgctttgatggtcagagagttcgagttacttgaacagttcagagatttgagtttagtttgtgaatggtcacctcaga 21234864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 45 - 202
Target Start/End: Original strand, 22361213 - 22361370
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    ||||||| |||||||||| ||| | ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || || || || ||||||||    
T  22361213 tgaaggactatgattttgagttaagctatcattcgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatatctgctatgatggt 22361312  T
Q  145 gaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtca 202  Q
     ||  | || ||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||| ||| |||||    
T  22361313 aaaatagttcgagttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgtgaaatgtca 22361370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 44 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 21025564 - 21025362
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || |||||||    
T  21025564 ttgaaagattatgaatttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatggtgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 21025465  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | |  || || || ||||||||||||||||||||  ||||  | ||||| || | |||||| ||||||||| |  |||| ||| |||||||  |||||||    
T  21025464 ttagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagcttagtttgtgagtggtcacctcagagtgtgaaactgggaatgctgaaaattgatagtga 21025365  T
Q  244 att 246  Q
    |||    
T  21025364 att 21025362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 50 - 214
Target Start/End: Original strand, 16077630 - 16077794
Alignment:
Q  50 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 149  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||  ||||||| |  |    
T  16077630 gattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagttaatgttgttgcagatgccttgaggaggaagacattgcatatgtccgctttgatggttagag 16077729  T
Q  150 aatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtg 214  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||| | ||||| |||| |||||| |||||||||    
T  16077730 agtttgagttacttgaacagttcagagatttgagtttagtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 16077794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 29 - 209
Target Start/End: Original strand, 17043968 - 17044148
Alignment:
Q  29 agatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacaca 128  Q
    |||||| |||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| || || |    
T  17043968 agatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaacgttgttgcagatgccttgagcaggaagacattgcata 17044067  T
Q  129 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccaga 209  Q
    |||| ||  ||||||| |  || || ||||| |||||||| || ||||| |||||| | ||||  |||| |||||| ||||    
T  17044068 tgtccgctttgatggttagagagttcgagttacttgaacaattcagagatttgagtttggtttatgaatggtcacctcaga 17044148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 123
Target Start/End: Original strand, 24793585 - 24793664
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgtt 123  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  24793585 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcggatgccttgagtaggaaaacgtt 24793664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 47 - 184
Target Start/End: Original strand, 20830363 - 20830500
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 146  Q
    ||||||| |||||||  |||||  |||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| ||  ||||||| |    
T  20830363 aaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggtta 20830462  T
Q  147 aggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagt 184  Q
    | || || || ||| |||| |||||| |||||||||||    
T  20830463 aagagttggaattgattgagcagtttcgagacttgagt 20830500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 214
Target Start/End: Original strand, 50619306 - 50619382
Alignment:
Q  138 tgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtg 214  Q
    ||||||| || |||||||||| | | |||||||||||||| |||||| | || || ||||||||||| |||||||||    
T  50619306 tgatggtaaaagaatttgagtggttggaacagtttagagatttgagtttagtatgtgaattgtcacctcagagtgtg 50619382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 183; Significance: 5e-99; HSPs: 38)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 45 - 283
Target Start/End: Original strand, 23099455 - 23099693
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  23099455 tgaaggattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttgcacatgtcggctatgatggt 23099554  T
Q  145 gaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtgaa 244  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  23099555 aaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtctggtttgtgaattgtcacctcagagtgtgcagctgggtatgttgaaaatcaatagtgat 23099654  T
Q  245 ttcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 283  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23099655 ttcttgaaaagtatcagagaagcgcaacaagttgatgtc 23099693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 26 - 283
Target Start/End: Original strand, 27209590 - 27209847
Alignment:
Q  26 aggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttac 125  Q
    ||||||||| | |||||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| || |    
T  27209590 aggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagtcgcagatgcgttgagtagaaagacattgc 27209689  T
Q  126 acatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtat 225  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||||||| || ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || ||||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  27209690 acatgtccgccttgatggtaaaggaattcgaattgctcgaatagtttagagacttgagtctcgtatgtgaattatcatctcaaagtgtgcagttgggtat 27209789  T
Q  226 gttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 283  Q
    | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  27209790 gctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgtc 27209847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 23 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 23277804 - 23277557
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23277804 cagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagacgt 23277705  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| || |||||||| || ||||||||  ||||  | ||||||||||||||||||||||| || || ||| |||| |||||||| ||||||||    
T  23277704 tgcacatgtctgctatgatggtaaaagaatttgatctgctatagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgacacctcagagtgttcagttggg 23277605  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgca 270  Q
     ||  |||| || || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  23277604 gattctgaagattaacagtgacttcttgaatagtatccgagaagcgca 23277557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 31831686 - 31831450
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |    
T  31831686 cagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaactt 31831587  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||| ||||| ||| | |||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  31831586 tacacatgtctgctttgatggtgaaggagtttgaattgttagaacagttcagagacatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttggg 31831487  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatc 259  Q
     |||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||    
T  31831486 aatgttgaaaattgatagtgatttcttgaacagtatc 31831450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 1064779 - 1064535
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  1064779 cagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaacgt 1064680  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| ||  |||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||  |||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  1064679 tgcacatgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttcagagatatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttggg 1064580  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     |||||||||||  ||||||| |||||||| |||||  |||||||    
T  1064579 aatgttgaaaattgatagtgatttcttgaacagtattcgagaagc 1064535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 44 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 23111743 - 23111520
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||    
T  23111743 ttgaaggactatgattttagtttgaattatcatccaagtaaagccaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagacgttgcatatgtctgctatgatgg 23111644  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | || || ||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| || |||||||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  23111643 taaaagagttttagttgcttgaagagtttagagatctgagtcttgtttgtgagttgtcacctcagattgtgaagttgggtatgttgaagatcaacagtga 23111544  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
    ||||||||| ||||| | ||||||    
T  23111543 attcttgaacagtattaaagaagc 23111520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 20829287 - 20829043
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||| || ||||| ||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  20829287 cagagaagatggttagagttactgaaagattttgattttggcttgaattaccatcctggtgaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaacgt 20829188  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| ||  |||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||  |||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  20829187 tgcacatgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttcagagatatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttggg 20829088  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     |||||||||||  ||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  20829087 aatgttgaaaattgatagtgacttcttgaacagtatccgagaagc 20829043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 24949618 - 24949374
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  24949618 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttggtttgaattaccattctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaacgt 24949519  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| ||  |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||  |||||||| ||||||||    
T  24949518 tgcacatgtctgctttgatggtgaaagaatttgatttgttagaacagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacttcagagtgttcagttggg 24949419  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     ||| |||| || |  ||||| |||||  |||||||| |||||||    
T  24949418 gatgctgaagattatcagtgatttcttagatagtatccgagaagc 24949374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 23294963 - 23294719
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||| | || |||||||| ||||| ||||||||||    
T  23294963 cagaggagatggttggagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatttggtggcagatgcgttgagcaggaagacgt 23294864  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  | ||||| || |||||||| ||| |  | ||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||| |||||| |  |||||||    
T  23294863 tgcatatgtctgctttaatggtaaaagaatttgatttgttatagcagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtattaagttggg 23294764  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     ||| |||| || || ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  23294763 gatgctgaagattaacagtgatttcttgaatagtatccgagaagc 23294719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 41607821 - 41608060
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || |||||||    
T  41607821 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 41607920  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | |  || || || ||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||||||| |  |||||||| |||| ||  |||||||    
T  41607921 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtga 41608020  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 283  Q
    |||| |||| |||||||  ||||||||  | |||||||||    
T  41608021 attcctgaaaagtatcaaggaagcgcagaaagttgatgtc 41608060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 44 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 16923896 - 16923694
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||    
T  16923896 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 16923797  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | |  || || || ||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||||||| |  |||||||| |||| ||  |||||||    
T  16923796 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtga 16923697  T
Q  244 att 246  Q
    |||    
T  16923696 att 16923694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 44 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 16983159 - 16982957
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||    
T  16983159 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 16983060  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | |  || || || ||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||||||| |  |||||||| |||| ||  |||||||    
T  16983059 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtga 16982960  T
Q  244 att 246  Q
    |||    
T  16982959 att 16982957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 44 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 17064724 - 17064522
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||    
T  17064724 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 17064625  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | |  || || || ||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||||||| |  |||||||| |||| ||  |||||||    
T  17064624 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtga 17064525  T
Q  244 att 246  Q
    |||    
T  17064524 att 17064522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 24711041 - 24710803
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||    
T  24711041 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 24710942  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | |  || || || |||||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||| |||||| ||||||||| |  |||||||| |||| ||  |||||||    
T  24710941 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatttgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtga 24710842  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgt 282  Q
    |||  |||| |||||||  ||||| ||| | ||||||||    
T  24710841 atttctgaaaagtatcaaggaagcacaaaaagttgatgt 24710803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 44 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 27372276 - 27372074
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||    
T  27372276 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 27372177  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | |  || || |||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||||||| |  |||||||| |||| ||  |||||||    
T  27372176 tcagagagttcgagttgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtga 27372077  T
Q  244 att 246  Q
    |||    
T  27372076 att 27372074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 44 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 16926367 - 16926151
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||    
T  16926367 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 16926268  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | |  || || || ||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| || |||||| |  |||||||| |||| ||  |||||||    
T  16926267 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtga 16926168  T
Q  244 attcttgaatagtatca 260  Q
    |||  |||| |||||||    
T  16926167 atttctgaaaagtatca 16926151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 44 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 17000007 - 16999791
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||    
T  17000007 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 16999908  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | |  || || || ||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| || |||||| |  |||||||| |||| ||  |||||||    
T  16999907 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcaaagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtga 16999808  T
Q  244 attcttgaatagtatca 260  Q
    |||  |||| |||||||    
T  16999807 atttctgaaaagtatca 16999791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 44 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 27219023 - 27218807
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||    
T  27219023 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 27218924  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | |  || || || ||||||||| ||||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||| ||| |  ||||||||||||| ||  |||||||    
T  27218923 tcagagagttcgaattgcttgaatagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagcgtgaaactgggtatgttgaagattgatagtga 27218824  T
Q  244 attcttgaatagtatca 260  Q
    |||  |||| |||||||    
T  27218823 atttctgaaaagtatca 27218807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 270
Target Start/End: Original strand, 19651465 - 19651712
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||| ||||| || |||||  | ||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| |||     
T  19651465 cagaggagatggttagagctgttgaaagactatgattttggtttgaattaccatcctaggaaagctaatgtggttgcagatgccttaagtaggaaaacgc 19651564  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||    |||||||| ||||| || |||||  | ||||| ||||| ||||||||||| || |||||| |||| |||||||| || |||||    
T  19651565 tgcatatgtctgcttcaatggtgaaagaattcgatttgctatagcagttcagagatttgagtcttgtctgtgaattgacacctcagagtgttcaattggg 19651664  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgca 270  Q
     ||| |||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  19651665 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcgca 19651712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 44 - 214
Target Start/End: Original strand, 44385005 - 44385175
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||    
T  44385005 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 44385104  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtg 214  Q
    | |  || || || ||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| |||||||||    
T  44385105 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtg 44385175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 10869857 - 10869641
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||| |||||  |||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||    
T  10869857 ttgaaggattatgactttggtctgaattaccatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 10869758  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | |  || || || ||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||| ||| |  |||||||| |||| ||  |||||||    
T  10869757 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagagtgaaactgggtatgctgaagattgatagtga 10869658  T
Q  244 attcttgaatagtatca 260  Q
    |||  |||| |||||||    
T  10869657 atttctgaaaagtatca 10869641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 47 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 45533349 - 45533159
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 146  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| | ||||| || |||||||| |    
T  45533349 aaggattatgatttcgggttgaattaccatccgggtaaggctaatgttgttgcagatgctttaagtaggaaaacattaaatatgtctgctatgatggtta 45533250  T
Q  147 aggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaa 237  Q
      || || |||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||| ||| |||| || ||||||||| | ||||| |||||||| |||||    
T  45533249 gagagttggagttgcttgaatagttcagagacttgagtttggtttgtgaagtgtcgccacagagtgtgaaattggggatgttgaagatcaa 45533159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 260
Target Start/End: Original strand, 21144453 - 21144693
Alignment:
Q  20 agacagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaaga 119  Q
    |||||| | |||||| |||| ||  |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  21144453 agacagcgtagatggctagaattgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaaga 21144552  T
Q  120 cgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagtt 219  Q
    | || || ||||| || |||||||| |  || || ||||| ||||||||||| |||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||||||| |  |    
T  21144553 cattgcatatgtccgctatgatggtcagagagttcgagttacttgaacagttcagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaact 21144652  T
Q  220 gggtatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatca 260  Q
    ||||||| |||| ||  |||| |||||  |||| |||||||    
T  21144653 gggtatgctgaagattgatagcgaatttctgaaaagtatca 21144693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 50 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 23067391 - 23067240
Alignment:
Q  50 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 149  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| ||||    
T  23067391 gattatgattttgagttga-ctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagacgctttgagtagaaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaagg 23067293  T
Q  150 aatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtca 202  Q
    | || ||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||| ||| |||||    
T  23067292 agttcgagttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgtgaaatgtca 23067240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 44 - 270
Target Start/End: Original strand, 22324292 - 22324518
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||    
T  22324292 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 22324391  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | |  || || ||||| |||||||||||  ||||  ||||| | ||||| |||| |||||| ||||| ||| |  | |||||| |||| ||  |||||||    
T  22324392 tcagagagttcgagttacttgaacagttccgagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagcgtgaaactaggtatgctgaagattgatagtga 22324491  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagcgca 270  Q
    |||  |||| |||||||  ||||||||    
T  22324492 atttctgaacagtatcaaggaagcgca 22324518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 12575381 - 12575121
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | ||| | || || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||      
T  12575381 cagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggcaaagctaatgtagtcgcggatgcattgagtaggaagacac 12575282  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| || |||||| |||| |||||||| ||  | ||||||||||||||| ||||| | || || || ||||| || || || || ||||||||    
T  12575281 tgcatatgtctgctatgatgatgaaagaatttgatttattggaacagtttagagacatgagtttggtatgtgagttgtcgcctcaaagcgtacagttggg 12575182  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 283  Q
     ||| | || || || ||||| ||| ||||||| ||| ||||||| ||||| || ||||||    
T  12575181 gatgctaaagattaacagtgatttcctgaatagaatccgagaagcacaacaagtggatgtc 12575121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 44 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 24263377 - 24263161
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || ||||||     
T  24263377 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatga 24263278  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
      |  || || || ||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||| ||||||  |||||||| | ||||||||| |||| ||  |||||||    
T  24263277 ccagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcaccttagagtgtgaaattgggtatgctgaagattgatagtga 24263178  T
Q  244 attcttgaatagtatca 260  Q
    |||  |||| |||||||    
T  24263177 atttctgaaaagtatca 24263161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 45 - 183
Target Start/End: Original strand, 23107167 - 23107305
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||||||||    
T  23107167 tgaaagattatgattttgagttgagctatcatccgcgtaaagctaatgttgttacagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggt 23107266  T
Q  145 gaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgag 183  Q
     || || || ||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  23107267 aaaagagttcgagttacttgaacagttcagagatttgag 23107305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 260
Target Start/End: Original strand, 30011623 - 30011834
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 146  Q
    |||||||||||||| ||||| || || |||||| |||| || ||||| |||||||||| ||| |||||||| || |||||  |||| || |||||||| |    
T  30011623 aaggattatgatttcgggttaaattaccatccgagtaaggctaatgttgttgcagatgttttaagtaggaaaacattaca--tgtctgctatgatggtta 30011720  T
Q  147 aggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtgaatt 246  Q
      || || ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||| |||| || ||||||||| | ||||| |||||||| ||||| |  |||||    
T  30011721 gagagttggagttgcttgaacagttcagagacttgagtttggtttgtgaagtgtcgccacagagtgtgaaattggggatgttgaagatcaacaacgaatt 30011820  T
Q  247 cttgaatagtatca 260  Q
     ||| |||||||||    
T  30011821 tttggatagtatca 30011834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 45 - 260
Target Start/End: Original strand, 24876186 - 24876401
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || ||||||||    
T  24876186 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaagtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggt 24876285  T
Q  145 gaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtgaa 244  Q
     |  || || || || ||||||||||| |||||  ||||| | ||||||||||  ||||| ||||||||| |  |||||||| |||| ||  ||||||||    
T  24876286 cagagagttcgaattacttgaacagttcagagatatgagtttggtttgcgaatgatcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaa 24876385  T
Q  245 ttcttgaatagtatca 260  Q
    ||  |||| |||||||    
T  24876386 tttctgaaaagtatca 24876401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 47 - 237
Target Start/End: Original strand, 30210357 - 30210546
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 146  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||  || ||||| ||| |||||||||| |||||||| ||  |||| ||||| || |||||||| |    
T  30210357 aaggattatgatttcgggttgaattaccatccgggtatggctaatgttgttacagatgctttaagtaggaaaac-atacatatgtctgctatgatggtta 30210455  T
Q  147 aggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaa 237  Q
      || || ||||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||| ||| |||| || ||||||||| | ||||| |||||||| |||||    
T  30210456 gagagttggagttgctttaacagttcagagacttgagtttggtttgtgaagtgtcgccacagagtgtgaaattggggatgttgaagatcaa 30210546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 24676489 - 24676326
Alignment:
Q  51 attatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagga 150  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || |||||||| |  ||    
T  24676489 attatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggttagaga 24676390  T
Q  151 atttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtg 214  Q
     || ||||| |||||||||||||||||  ||||  | ||||| || | |||||| |||||||||    
T  24676389 gttcgagttacttgaacagtttagagatatgagcttggtttgtgagtggtcacctcagagtgtg 24676326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 27788768 - 27788608
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | ||| | || || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||      
T  27788768 cagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggaaaagctaatgtagtcgctgatgcattgagtaggaagacac 27788669  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagt 184  Q
    | || ||||| || |||||| |||| |||||||| ||  | ||||||||||||||| |||||    
T  27788668 t-catatgtctgctatgatgatgaaagaatttgatttattggaacagtttagagacatgagt 27788608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 53 - 214
Target Start/End: Original strand, 21324711 - 21324872
Alignment:
Q  53 tatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaat 152  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| |||| ||| || |||||||||||||| || || ||||| || |||||||| |  || |    
T  21324711 tatgactttggtttgaattatcatccaggtaaggctaatgttgttgtagacgccttgagtaggaagactttgcatatgtccgctatgatggttagagagt 21324810  T
Q  153 ttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtg 214  Q
    | ||||| |||||||||||||||||  ||||| | |||||||| | |||||| |||||||||    
T  21324811 tcgagttacttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgagtggtcacctcagagtgtg 21324872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 214
Target Start/End: Original strand, 24706915 - 24707088
Alignment:
Q  41 ttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatga 140  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| ||||  |||| || |||||  |||||||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||  |||    
T  24706915 ttattgaaagattatgactttggtttgaattattatccaagtaaggctaatgtttttgcagatgccttgagcaggaagacattgcatatgtccgcattga 24707014  T
Q  141 tggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtg 214  Q
    |||| |  || || ||||| |||||||||||||||||  ||||  | ||||| || | |||||| |||||||||    
T  24707015 tggttagagagttcgagttacttgaacagtttagagatatgagcttggtttgtgagtggtcacctcagagtgtg 24707088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 242 - 283
Target Start/End: Original strand, 27364713 - 27364754
Alignment:
Q  242 gaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 283  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27364713 gaattcttgaatagtatcaaagaagcgcaacaggttgatgtc 27364754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 71 - 184
Target Start/End: Original strand, 12639696 - 12639809
Alignment:
Q  71 tatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagt 170  Q
    |||||||| || || || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||  ||||||| || || || || ||| |||||||||    
T  12639696 tatcatcccggaaaggctaatgttgttgcagatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaattgattgaacagt 12639795  T
Q  171 ttagagacttgagt 184  Q
    || |||| ||||||    
T  12639796 ttcgagatttgagt 12639809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 131
Target Start/End: Original strand, 17967179 - 17967287
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    ||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||| |||||  |||| | || | ||  |||||||||| | |||||| |||||||||||| | |    
T  17967179 cagaggagatgtttggagtttttaaaggattatgattttgagttgagttatcttacgtgaaagaccaatgtagtagtagatgcattgagtaggaagtcct 17967278  T
Q  123 tacacatgt 131  Q
    | |||||||    
T  17967279 tgcacatgt 17967287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0682 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0682
Description:

Target: scaffold0682; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 23 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 1311 - 1051
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||||||  | |||||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  1311 cagaggagatgacttgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtagaaagacat 1212  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  1211 tgcacatgtcggccatgatggtgaaggaattcgaattgcttgaacagtttagagacttgagtctcgtttgtgaattgtcacctcaaagtgtgcagttggg 1112  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 283  Q
    ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  1111 tatattgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgtc 1051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 163; Significance: 4e-87; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 23 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 68798 - 68540
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  68798 cagaggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacat 68699  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  68698 tgcacatgtcggccatgatggtaaaggaattcgaatttcttgaacagtttagagacttgagtctcgtttgtgaattgtcacctcagagtgtacagttggg 68599  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatg 281  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  68598 tatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatg 68540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 23 - 272
Target Start/End: Original strand, 3831 - 4080
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  3831 cagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccacccgggtaaagctaatgtggttgcagatgccttgagtagcaagacgt 3930  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  |||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||| ||||||||    
T  3931 tgcatatgtctgctttgatggtgaaagaatttgagttgctagagcattttagagacttgagtcttgtttgtgaattgacaccttagagtgtacagttggg 4030  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaac 272  Q
     ||| |||| || || ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  4031 gatgctgaagattaacagtgatttcttgaatagtatccgagaagcacaac 4080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 283
Target Start/End: Original strand, 12786 - 13039
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  12786 cagaggagatggttggagctattgaaggattatgattttggcttgaattaccatcatggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaagacat 12885  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || |||||  |  ||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||       ||||||||| || || |||||||| |||||| | ||||||||    
T  12886 tgcatatgtctcctttgatggtgaagcaatttgaattgctagaactgttta-------gagtcttgtctgtgagttgtcacctcagagtatacagttggg 12978  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 283  Q
    |||| |||| || |||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||    
T  12979 tatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatacgagaagcacaacaagtggatgtc 13039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 151; Significance: 6e-80; HSPs: 40)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 23 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 27901783 - 27901525
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  27901783 cagaggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacat 27901684  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||  |||||||    
T  27901683 tgcacatgtcggccatgatggtaaaggaattcgaattacttgaacagtttagagacttgagtctcgtttgtgaattgtcacctcaaagtgtaaagttggg 27901584  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatg 281  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  27901583 tatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtataagagaagcacaacaagttgatg 27901525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 23 - 283
Target Start/End: Original strand, 15002239 - 15002499
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15002239 cagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgt 15002338  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||||||    
T  15002339 tgcacatgtcggctatgatggtaaaagagtttgagttgctatagcagtttagagactttagtcttgtctgtgagttgtcacctcagagtgtacagttggg 15002438  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 283  Q
    |||| |||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  15002439 tatgctgaagattaatagtgatttcttgaacagtatcagagaagcacaacaagatgatgtc 15002499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Original strand, 29452412 - 29452656
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  29452412 cagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaacgt 29452511  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||  |||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  29452512 tgcacatgtctgctttgatggtgaaggagtttgagttgttagaacagttcagagatatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttggg 29452611  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     |||||||||||  ||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  29452612 aatgttgaaaattgatagtgacttcttgaacagtatccgagaagc 29452656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 38 - 280
Target Start/End: Original strand, 15413916 - 15414158
Alignment:
Q  38 gagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggcca 137  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| || || ||||| || |    
T  15413916 gagttgttgaaagactatgattttggtttgaattatcatccgggtaaagccaatgttgttgcagatgctttaagcaggaagacattgcatatgtcagcta 15414015  T
Q  138 tgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaa 237  Q
    ||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  15414016 tgatggttaaagaatttgagttgctggagcattttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcacctcaaagtgtgaagttgggtatgttgaagatcaa 15414115  T
Q  238 tagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgat 280  Q
    |||||| |||||||||||||| | |||||| ||  ||||||||    
T  15414116 tagtgagttcttgaatagtattaaagaagcacagaaggttgat 15414158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Original strand, 3263669 - 3263913
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |    
T  3263669 cagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaactt 3263768  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| ||  |||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||  |||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  3263769 tgcacatgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttcagagatatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttggg 3263868  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     |||||||||||  ||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  3263869 aatgttgaaaattgatagtgatttcttgaacagtatccgagaagc 3263913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 44 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 15320512 - 15320313
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||||| || |||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||  ||||||    
T  15320512 ttgaaggattatgattttggtatgaattatcacccaggtaaagctaatgtgattgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctttgatgg 15320413  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  15320412 taaaggattttgagttgcttgagcagtttagagacttgagtctagtttatgagttgtcacctcagagtgtgtagttgggtatgttgaagatcaatagtga 15320313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 44 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 8707296 - 8707071
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||    
T  8707296 ttgaaggactatgattttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatgg 8707197  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || || |||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  8707196 ttagagagtttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcgcctcatagtgtgaagttgggtatgctgaagatcaacagtga 8707097  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagcgc 269  Q
     |||||||| | ||| | ||||||||    
T  8707096 gttcttgaacaatattaaagaagcgc 8707071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 24 - 267
Target Start/End: Original strand, 11206107 - 11206350
Alignment:
Q  24 agaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgtt 123  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||    
T  11206107 agaggaggtggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgttgttgctgatgctttgagcaggaaaacttt 11206206  T
Q  124 acacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggt 223  Q
     |||||||| ||  |||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||| | |||||| | ||||||||     
T  11206207 gcacatgtctgctttgatggtgaaagaatttgaattgttagaacagttcagagacatgagtcttgtctgtgaattgtcatctcagagtatacagttgggg 11206306  T
Q  224 atgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
    |||||||| ||  ||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  11206307 atgttgaagattgatagtgatttcttgaacagtatctgagaagc 11206350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 15247321 - 15247077
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| | ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  15247321 cagagaagatggcttgagttgttaaaggattatgactttggtttgaattaccattcgggtaaagctaatgtggttgcagatgttttgagcaggaagacgt 15247222  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |  || ||| |||  |||||||| ||||||||    
T  15247221 tgcacatgtctgctatgatggtaaaagaatttgatttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctatgagttgacacttcagagtgtacagttggg 15247122  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     ||| |||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  15247121 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagc 15247077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Original strand, 15357995 - 15358239
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    ||||| ||||||| |||| | ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  15357995 cagagaagatggtgagagctgttgaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaagacgt 15358094  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| || |||||||| ||||||||||| ||  |  | ||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||| || ||||| ||||| ||    
T  15358095 tgcatatgtctgctatgatggtaaaggaatttgatttaatatagcagcttagagacttgagtcttgtctgtgaattgacacctcatagtgtacagttagg 15358194  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     ||| |||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  15358195 gatgctgaagattaatagtgacttcttgaatagtatccgagaagc 15358239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 33224320 - 33224076
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    ||||| || ||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |    
T  33224320 cagagaaggtggttagagctgttgaaagattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgctgatgcgttgagcaggaagacat 33224221  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    |||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||| |||| |||||||| ||||||||    
T  33224220 tacatatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgttagaacagtttagggacttgagccttgtttgtgagttgacacctcagagtgttcagttggg 33224121  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     ||| |||  || |||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  33224120 gatgctgaggattaatagtgatttcttgaatagtacccgagaagc 33224076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 137 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 15078918 - 15078788
Alignment:
Q  137 atgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatca 236  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15078918 atgatggtaaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgtgagttgtcacctcaaagtgtgcagttgggtatgttgaagatca 15078819  T
Q  237 atagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15078818 atagtgaattcttgaatagtatcagggaagc 15078788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 24 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 16149107 - 16148873
Alignment:
Q  24 agaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgtt 123  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||| ||    
T  16149107 agaggagatggttagagttgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatacgttgagcaggaagacatt 16149008  T
Q  124 acacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggt 223  Q
     || ||||| ||| ||||||| || ||||| || ||| | || ||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||| |||||| | ||||||||     
T  16149007 gcatatgtccgccttgatggtaaaagaattcgatttgttagagcagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtatacagttgggg 16148908  T
Q  224 atgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtat 258  Q
    ||| |||| || |||||||| |||||||| |||||    
T  16148907 atgctgaagattaatagtgatttcttgaacagtat 16148873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 24 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 16153253 - 16153019
Alignment:
Q  24 agaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgtt 123  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||| ||    
T  16153253 agaggagatggttagagttgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatacgttgagcaggaagacatt 16153154  T
Q  124 acacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggt 223  Q
     || ||||| ||| ||||||| || ||||| || ||| | || ||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||| |||||| | ||||||||     
T  16153153 gcatatgtccgccttgatggtaaaagaattcgatttgttagagcagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtatacagttgggg 16153054  T
Q  224 atgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtat 258  Q
    ||| |||| || |||||||| |||||||| |||||    
T  16153053 atgctgaagattaatagtgatttcttgaacagtat 16153019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 44 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 14695489 - 14695265
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||| ||| || ||||| || ||||||     
T  14695489 ttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagaagttgcatatgtccgctatgatgt 14695390  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | || || |||||||||||| || | |||||||| |||||| | || |||||||||||||| ||||||||| || |||| ||| | || ||  |||||||    
T  14695389 taaaagagtttgagttgcttaaaaaatttagagatttgagtttagtctgcgaattgtcacctcagagtgtgaagctgggaatgctaaagattgatagtga 14695290  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagcg 268  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||    
T  14695289 attcttgaacagtatcaaagaagcg 14695265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 267
Target Start/End: Original strand, 44660733 - 44660985
Alignment:
Q  15 acatcagacagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtag 114  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |     
T  44660733 acatgagacagaggaggtggttagagttactgaaagattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaacgttgttgctgatgctttgagcaa 44660832  T
Q  115 gaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtg 214  Q
    ||| || || || ||||| ||  | ||||| ||||||||||| ||| | |||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||| | |||||| |     
T  44660833 gaaaactttgcatatgtctgctttaatggtaaaggaatttgaattgttagaacagttcagagacatgagtcttgtctgtgaattgtcatctcagagtata 44660932  T
Q  215 cagttgggtatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
    |||||||| |||||||||||  |||| || |||||||| |||||| |||||||    
T  44660933 cagttgggaatgttgaaaattgatagcgacttcttgaacagtatccgagaagc 44660985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 44 - 260
Target Start/End: Original strand, 8052259 - 8052475
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||    
T  8052259 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 8052358  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | |  || || || ||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||| |||| ||  |||||||    
T  8052359 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaattgggtatgctgaagattgatagtga 8052458  T
Q  244 attcttgaatagtatca 260  Q
    |||  |||| |||||||    
T  8052459 atttctgaaaagtatca 8052475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 44 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 12477976 - 12477760
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||    
T  12477976 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 12477877  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | |  || || || ||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||||||| |  |||||||| |||| ||  |||||||    
T  12477876 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtga 12477777  T
Q  244 attcttgaatagtatca 260  Q
    |||  |||| |||||||    
T  12477776 atttctgaaaagtatca 12477760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 44 - 260
Target Start/End: Original strand, 19777429 - 19777645
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||    
T  19777429 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 19777528  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | |  || || || ||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||||||| |  |||||||| |||| ||  |||||||    
T  19777529 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtga 19777628  T
Q  244 attcttgaatagtatca 260  Q
    |||  |||| |||||||    
T  19777629 atttctgaaaagtatca 19777645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 20892379 - 20892135
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |    
T  20892379 cagaggagatggttagagttactgaaggattacgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgcattgagcaggaaaacat 20892280  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  | ||||| || |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| | ||||||||    
T  20892279 tgcatatgtctgctttaatggtaaaagaatttgaattgttggaacagtttagagacttgagtctggtctgtgaattgtcacctcagagtatacagttggg 20892180  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     ||| |||| ||   |||| | |||||||| |||||| |||||||    
T  20892179 gatgctgaagattgttagtaatttcttgaacagtatccgagaagc 20892135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 15071756 - 15071601
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| | || ||||||||||| ||||||||| | || || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15071756 cagagaagatggcttgaattattgaaggactatgattttagtttaaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgctttgagcaggaagacgt 15071657  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagac 178  Q
    | |||||||| || |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||    
T  15071656 tgcacatgtctgctatgatggtaaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagac 15071601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 44 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 8387788 - 8387586
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||    
T  8387788 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 8387689  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | |  || || || ||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||||||| |  |||||||| |||| ||  |||||||    
T  8387688 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtga 8387589  T
Q  244 att 246  Q
    |||    
T  8387588 att 8387586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 44 - 246
Target Start/End: Original strand, 29038040 - 29038242
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||    
T  29038040 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 29038139  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | |  || || || ||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||||||| |  |||||||| |||| ||  |||||||    
T  29038140 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtga 29038239  T
Q  244 att 246  Q
    |||    
T  29038240 att 29038242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 29 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 40474431 - 40474200
Alignment:
Q  29 agatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacaca 128  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || |    
T  40474431 agatggctagacttactgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgccttaagtaggaagacattgcata 40474332  T
Q  129 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgtt 228  Q
    |||| || |||||||| || || || || ||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||||||| |  | |||||| |    
T  40474331 tgtccgctatgatggtcaaagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactaggtatgct 40474232  T
Q  229 gaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatca 260  Q
    ||||||  ||||||||||  |||| |||||||    
T  40474231 gaaaattgatagtgaatttctgaaaagtatca 40474200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 24 - 282
Target Start/End: Original strand, 1648153 - 1648411
Alignment:
Q  24 agaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgtt 123  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| || ||||| ||||| ||||| || || ||   ||| || ||||| || || ||||| |||||||||||||| ||    
T  1648153 agaggagatggttagagctgttgaaagactatgactttggtttgaattaccaccctaataaggctaatgttgtggcggatgcgttgagtaggaagacatt 1648252  T
Q  124 acacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggt 223  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || |||||||| || ||| |  | || ||     
T  1648253 gcacatgtcggccatgatggtaaaggaattcgaattgcttgaacagcttagagacttaagtttagtttgtgagttgtcacctcaaagtattaaatttggg 1648352  T
Q  224 atgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgt 282  Q
    ||| |||| || || ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  1648353 atgctgaagattaacagtgatttcttgaatagtatccgagaagctcaacaggtggatgt 1648411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 23957138 - 23956921
Alignment:
Q  29 agatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacaca 128  Q
    |||||| |||||||  | |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |    
T  23957138 agatggctagagttgctaaaggattacgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcata 23957039  T
Q  129 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgtt 228  Q
    |||| || |||||||| |  || || || |||||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||| |||||| ||||||||| |  |||||||| |    
T  23957038 tgtccgctatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatttgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgct 23956939  T
Q  229 gaaaatcaatagtgaatt 246  Q
    ||| ||  ||||||||||    
T  23956938 gaagattgatagtgaatt 23956921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 260
Target Start/End: Original strand, 14302614 - 14302830
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||| | |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||  || || ||||| || |||||||    
T  14302614 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcattcaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagatattgcatatgtccgctatgatgg 14302713  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | |  || || || || |||||||||||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||| |||| ||  |||||||    
T  14302714 tcagagagttcgaatttcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaattgggtatgctgaagattgatagtga 14302813  T
Q  244 attcttgaatagtatca 260  Q
    |||| |||| |||||||    
T  14302814 attcctgaaaagtatca 14302830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 45 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 12525051 - 12524836
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||  || ||||||||    
T  12525051 tgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgttcgctatgatggt 12524952  T
Q  145 gaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtgaa 244  Q
     |  || || ||||| ||||||||||| |||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||||||| |  |||||||| |||| ||  ||||||||    
T  12524951 tagagagttcgagttacttgaacagttcagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaa 12524852  T
Q  245 ttcttgaatagtatca 260  Q
    ||  |||| |||||||    
T  12524851 tttctgaaaagtatca 12524836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 53 - 270
Target Start/End: Original strand, 14850011 - 14850228
Alignment:
Q  53 tatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaat 152  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||  ||||||| || || |    
T  14850011 tatgattttgggtttaattatcatccaggtaaagctactgttgttgcagatgctttaagtaggaagacgttgcatatgtccgctgtgatggtaaaagagt 14850110  T
Q  153 ttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaa 252  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  ||||  | || ||||| |||||||| ||||||||  |  || | ||| | || ||  ||||||||||||||||    
T  14850111 ttgagttgcttgagcagtttagagatctgaggttagtctgcgagttgtcacctcagagtgtaaaactgtgaatgctaaagattgatagtgaattcttgaa 14850210  T
Q  253 tagtatcagagaagcgca 270  Q
     ||||||| |||||||||    
T  14850211 cagtatcaaagaagcgca 14850228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 44 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 18298581 - 18298365
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||    
T  18298581 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 18298482  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | |  || || || ||||||||||||||  ||||  ||||| | ||||| |||| |||||| ||||| ||| |  |||||||| |||| ||  |||||||    
T  18298481 tcagagagttcgaattgcttgaacagttccgagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagcgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtga 18298382  T
Q  244 attcttgaatagtatca 260  Q
    |||  |||| |||||||    
T  18298381 atttctgaaaagtatca 18298365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 44 - 183
Target Start/End: Original strand, 15146521 - 15146660
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| | ||||||||||||||| || ||||| || |||||||    
T  15146521 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgtagatgcctcgagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatgg 15146620  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgag 183  Q
    | || || |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15146621 ttaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagatttgag 15146660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 44 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 14681943 - 14681727
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| |   ||||||    
T  14681943 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgttttgatgg 14681844  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | |  || || ||||| ||||||||||| |||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||||||| |  |||| ||| |||| ||  |||||||    
T  14681843 ttagagagttcgagttacttgaacagttcagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtga 14681744  T
Q  244 attcttgaatagtatca 260  Q
    |||  |||| |||||||    
T  14681743 atttctgaaaagtatca 14681727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 14160867 - 14160689
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| | |||||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |    
T  14160867 cagagaagatggcttgagttactgaaggattttgattttggcttgaattatcatccgggtaaagcgaatgtcgtagctgatgccttaagtagaaagacct 14160768  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtc 201  Q
    | || ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| | |||||||| |||||| | || |||||||||||    
T  14160767 tgcatatgtccgctatgatggttaaggagtttgaattgctagaataatttagagatttgagtttggtctgcgaattgtc 14160689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 29 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 27712727 - 27712489
Alignment:
Q  29 agatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacaca 128  Q
    |||||| |||||||  | |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || |    
T  27712727 agatggctagagttgctaaaggattacgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttgagtaggaagacattgcata 27712628  T
Q  129 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgtt 228  Q
    |||| ||||||||||| |  || || ||||| ||||||||||| |||||  ||||| | ||||| |||| | |||| ||||| ||| |  |||||||| |    
T  27712627 tgtccgccatgatggtcagagagttcgagttacttgaacagttcagagatatgagtttggtttgtgaatggacacctcagagcgtgaaactgggtatgct 27712528  T
Q  229 gaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
    ||| ||  ||||||||||  |||| || |||| ||||||    
T  27712527 gaagattgatagtgaatttctgaaaagcatcaaagaagc 27712489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Original strand, 18226067 - 18226284
Alignment:
Q  29 agatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacaca 128  Q
    |||||| |||| || ||||| |||||||| | ||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || |    
T  18226067 agatggctagaattgttgaaagattatgactatggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagcaggaagacattgcata 18226166  T
Q  129 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgtt 228  Q
    |||| ||  ||||||| |   | |||||||| ||||||| ||| ||||| |||||| | ||||| |||| |||||| ||||||||| | ||||| ||| |    
T  18226167 tgtcagctttgatggttagaaagtttgagttacttgaacggttcagagatttgagtttagtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaattgggaatgct 18226266  T
Q  229 gaaaatcaatagtgaatt 246  Q
    ||| ||  ||||||||||    
T  18226267 gaagattgatagtgaatt 18226284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 23 - 184
Target Start/End: Original strand, 51605667 - 51605828
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | ||| | || || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||      
T  51605667 cagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggaaaagctaatgtagtcgcggatgcgttgagtaggaagacac 51605766  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagt 184  Q
    | || ||||| || |||||| |||| |||||||| ||  | ||||||||||||||| |||||    
T  51605767 tccatatgtctgctatgatgatgaaagaatttgatttattggaacagtttagagacatgagt 51605828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 41 - 214
Target Start/End: Original strand, 16354078 - 16354251
Alignment:
Q  41 ttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatga 140  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || ||||    
T  16354078 ttattgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatga 16354177  T
Q  141 tggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtg 214  Q
    |||| |  || || ||||| ||| | |||||||||||  ||||  | ||||| || | |||||| |||||||||    
T  16354178 tggttagagagttcgagttacttaagcagtttagagatatgagcttagtttgtgagtggtcacctcagagtgtg 16354251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 44 - 209
Target Start/End: Original strand, 18614460 - 18614625
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||| || || ||||| ||  ||||||    
T  18614460 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgctgatgccttgagcatgaagacattgcatatgtccgctttgatgg 18614559  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccaga 209  Q
    | |  || |||||||| |||||||| || ||||| |||||| |  |||| |||| |||||| ||||    
T  18614560 ttagagagtttgagttacttgaacaattcagagatttgagtttaatttgtgaatggtcacctcaga 18614625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 9292166 - 9292024
Alignment:
Q  89 aatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttg 188  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| ||  ||||||| || || || || ||| |||| |||||| ||||||||||| |||    
T  9292166 aatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaattggttgagcagtttcgagacttgagttttg 9292067  T
Q  189 tttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaa 231  Q
    || | || ||| ||||  |  |||||  |||||||||||||||    
T  9292066 ttagtgagttgacaccggatggtgtgaggttgggtatgttgaa 9292024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 14998689 - 14998552
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 146  Q
    ||||||| |||||||  |||||  |||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| ||  ||||||| |    
T  14998689 aaggattttgattttcagttgagttatcatcccgggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggtta 14998590  T
Q  147 aggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagt 184  Q
    | || || || ||| |||| |||||| || ||||||||    
T  14998589 aagagttggaattgattgagcagtttcgatacttgagt 14998552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Original strand, 2208 - 2452
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| | |    
T  2208 cagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttagtttgaactatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaaggcat 2307  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  2308 tgcatatgtcggcgttgatggtgaaagaatttgagttgcttgagcagttcagagacttgagtctggtttgtgaattgacacctcagagtgtgcagttggg 2407  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  2408 tatgttgaaaattaacagtgaattcttgagtagtatccgagaagc 2452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 146; Significance: 6e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 38 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 11206 - 10977
Alignment:
Q  38 gagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggcca 137  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |    
T  11206 gagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgcta 11107  T
Q  138 tgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaa 237  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  11106 tgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtttgtgagttgtcgcctcagagtgtgcagttgggtatgttgaagattaa 11007  T
Q  238 tagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11006 tagtgatttcttgaatagtatcagagaagc 10977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 23 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 5858 - 5598
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5858 cagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagaaggaagacgt 5759  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||    
T  5758 tgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtacagttggg 5659  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 283  Q
    |||| |||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||    
T  5658 tatgctgaagattaatagtgatttcttgaacagtatcagagaagcacaaaaagttgatgtc 5598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 54)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Original strand, 20984865 - 20985109
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| | ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  20984865 cagagaagatggcttgagttgttgaaggactatgattttgggttgaattaccatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcagaaagacgt 20984964  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  20984965 tgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctatagcagtttagagacttgagtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtgcagttggg 20985064  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  20985065 tatgttgaagatcaatagtgatttcttgaacagtatcagagaagc 20985109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 23 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 19852874 - 19852627
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| | || || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19852874 cagagaagatggcttgaattgttgaaggactatgattttggtttgaattatcaccccggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgt 19852775  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||    
T  19852774 tgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgcttgagcagtttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcacctcagagtgtacaattggg 19852675  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgca 270  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19852674 tatgttgaagattaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcgca 19852627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 23 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 19858910 - 19858663
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| | || || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19858910 cagagaagatggcttgaattgttgaaggactatgattttggtttgaattatcaccccggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgt 19858811  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||    
T  19858810 tgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgcttgagcagttcagagacttgagtctagtttgtgagttgtcacctcagagtgtacaattggg 19858711  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgca 270  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19858710 tatgttgaagattaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcgca 19858663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 21841859 - 21841620
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||||||  | ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  21841859 ttgaaggattatgatttctgtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttaaacatgtctgctatgatgg 21841760  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||    
T  21841759 taaaggagtttgagttgctagagcagtttagagacttaagtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtacagttgggtatgctgaagattaatagtga 21841660  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 283  Q
     |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  21841659 tttcttgaacagtatcagagaagcacaacaagttgatgtc 21841620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 23 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 22372394 - 22372147
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| | || ||||||||||| ||||||||| | || || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22372394 cagagaagatggcttgaattattgaaggactatgattttagtttaaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgctttgagcaggaagacgt 22372295  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    |||||| | |||||||||||||||||    
T  22372294 tgcacatgtctgctatgatggtaaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagacctgagtcttgtttgtttgttgtcatctcagagtgtgcagttggg 22372195  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgca 270  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  22372194 tatgttgaagatcaatagtgatttcttaaacagtatcagagaagcgca 22372147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 24 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 23656389 - 23656130
Alignment:
Q  24 agaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgtt 123  Q
    |||| |||||| | ||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  23656389 agagaagatggcttgagttgttaaaggattatgattttggtttgaattactatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaagacgtt 23656290  T
Q  124 acacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggt 223  Q
     || ||||| || |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||| | |||||||||    
T  23656289 gcatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgatttgctagaacagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgtcacctcagagtatacagttgggt 23656190  T
Q  224 atgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 283  Q
    ||| |||| || |||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||| || ||||||    
T  23656189 atgctgaagattaatagtgatttcttgagtagtatccgagaagcacaacaagtggatgtc 23656130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 14566605 - 14566361
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |    
T  14566605 cagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaactt 14566506  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| ||  ||||||||||||| ||||| ||| | |||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  14566505 tgcacatgtctgctttgatggtgaaggagtttgaattgttagaacagttcagagacatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttggg 14566406  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     |||||||||||  ||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  14566405 aatgttgaaaattgatagtgatttcttgaacagtatccgagaagc 14566361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 23 - 270
Target Start/End: Original strand, 20009239 - 20009485
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| | || || |||||||| | ||||||||| ||||| ||||| || |||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20009239 cagagaagatggcttgaattgttgaaggactgtgattttggtttgaattatcaccccggtaaa-ctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgt 20009337  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| || |||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||    
T  20009338 tgcacatgtctgctatgatggtaaaagagtttgagttgcttgaacagttcagagacttgagtctagtttgtgagttgtcacctcagagtgtgcaattggg 20009437  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgca 270  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||||| | ||||| |||||||||    
T  20009438 tatgttgaagattaatagtgatttcttgaacaatatcatagaagcgca 20009485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 6605121 - 6604877
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |    
T  6605121 cagagaagatggttagagttactgaaagattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaactt 6605022  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| ||  |||||||||| || || |||||| | |||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  6605021 tgcacatgtctgctttgatggtgaaagagttcgagttgttagaacagttcagagacatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttggg 6604922  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     |||||||| ||  ||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  6604921 aatgttgaagattgatagtgacttcttgaacagtatccgagaagc 6604877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 44 - 258
Target Start/End: Original strand, 20395471 - 20395685
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |  |||||||    
T  20395471 ttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactttacatatgtcagttatgatgg 20395570  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | || || || ||| |||| ||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||    
T  20395571 ttaaagagttggagctgctcgaacagtttagagacctgagtttagtttgtgaattgtcacctcagagtgtgaagttgggaatgttgaagattaatagtga 20395670  T
Q  244 attcttgaatagtat 258  Q
    ||| |||||||||||    
T  20395671 atttttgaatagtat 20395685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Original strand, 31415789 - 31416036
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    ||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||| |    
T  31415789 cagagaagatggttagaactgttgaaggattatgattttggcttgaattaccattctggtaaagccaatgtggttgctgacgcgttgagcaggaagacat 31415888  T
Q  123 tacacatgtcggcca---tgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagtt 219  Q
    | || ||||| ||     ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||  | || ||| |||| ||||||||||||||    
T  31415889 tgcatatgtctgctgctttgatggtgaaggaatttgaattgctagaacagtttagggacttgagtcttgtcagtgagttgacacctcagagtgtgcagtt 31415988  T
Q  220 gggtatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
    ||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31415989 ggggatgctgaagattaatagtgaattcttgaatagtatccgagaagc 31416036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Original strand, 29302744 - 29302988
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||| || |    
T  29302744 cagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaggctaatgtggttgcagatgcgttaagcaggaaaacat 29302843  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| | | ||||||    
T  29302844 tgcatatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgttggaacagtttagagacttgagtcttgtctgtgaattgtcacctcagagtatacggttggg 29302943  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     ||| |||| ||  ||||||| ||||| || |||||| |||||||    
T  29302944 gatgctgaagattgatagtgatttcttaaacagtatccgagaagc 29302988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 44 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 20389541 - 20389318
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||    
T  20389541 ttgaaggactatgattttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagattctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatgg 20389442  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | || || ||| | ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||| || ||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  20389441 ttaaagagttttatttgcttgaacagtttagggacttgagcctagtttgtgagttgtcgcctcagagtgtgaagttgagtatgttgaagatcaacagtga 20389342  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     |||||||| | ||||| ||||||    
T  20389341 gttcttgaacaatatcaaagaagc 20389318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 50 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 6680547 - 6680330
Alignment:
Q  50 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 149  Q
    |||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| ||  |||||||||| |    
T  6680547 gattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaactttgcacatgtctgctttgatggtgaaag 6680448  T
Q  150 aatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtgaattctt 249  Q
    | || |||||| | |||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||| |||||    
T  6680447 agttcgagttgttagaacagttcagagacatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttgggaatgttgaaaattgatagtgacttctt 6680348  T
Q  250 gaatagtatcagagaagc 267  Q
    ||| |||||| |||||||    
T  6680347 gaacagtatccgagaagc 6680330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Original strand, 16270542 - 16270786
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |    
T  16270542 cagaggagatggttagagttactaaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgcattgagcaggaaaacat 16270641  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||| | ||||||||    
T  16270642 tgcacatgtctgctttaatggtaaaagaattcgagttgttagaacagtttagagacttgagtcttgtctgtgaactgtcacctcagagtatacagttggg 16270741  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     ||| |||| ||  ||||| | |||||||| |||||| |||||||    
T  16270742 gatgctgaagattgatagtaatttcttgaacagtatccgagaagc 16270786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 41 - 270
Target Start/End: Original strand, 22376790 - 22377019
Alignment:
Q  41 ttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatga 140  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||   ||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |||| ||| || ||||| || ||||    
T  22376790 ttattgaaagattatgattttgggttgaattattatctaagtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtagaaagatgttgcatatgtccgctatga 22376889  T
Q  141 tggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatag 240  Q
    |||| || || ||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||| || || | ||| | || ||  ||||    
T  22376890 tggtaaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagatctgagtttagtttgtgaattgtcacctcagagtgtgaagctgtgaatgctaaagattgatag 22376989  T
Q  241 tgaattcttgaatagtatcagagaagcgca 270  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  22376990 tgaattcttgaacagtatcaaagaagcgca 22377019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 41 - 270
Target Start/End: Original strand, 22382965 - 22383194
Alignment:
Q  41 ttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatga 140  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||   ||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |||| ||| || ||||| || ||||    
T  22382965 ttattgaaagattatgattttgggttgaattattatctaagtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtagaaagatgttgcatatgtccgctatga 22383064  T
Q  141 tggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatag 240  Q
    |||| || || ||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||| || || | ||| | || ||  ||||    
T  22383065 tggtaaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagatctgagtttagtttgtgaattgtcacctcagagtgtgaagctgtgaatgctaaagattgatag 22383164  T
Q  241 tgaattcttgaatagtatcagagaagcgca 270  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  22383165 tgaattcttgaacagtatcaaagaagcgca 22383194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 44 - 260
Target Start/End: Original strand, 20017602 - 20017818
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||    
T  20017602 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 20017701  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | |  || || || ||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||| |||| ||  |||||||    
T  20017702 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaattgggtatgctgaagattgatagtga 20017801  T
Q  244 attcttgaatagtatca 260  Q
    |||  |||| |||||||    
T  20017802 atttctgaaaagtatca 20017818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Original strand, 20974974 - 20975213
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||     
T  20974974 cagaggagatggttagagctgttgaaggactacgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaacgc 20975073  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || |||||     || ||||||| |||||  | || || |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  20975074 tgcatatgtc-----tgctggtgaaagaattccattttctagaacagtttagagagttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtgttcagttggg 20975168  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     ||| |||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  20975169 gatgctgaagattaaaagtgatttcttgaatagtataagagaagc 20975213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 44 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 23886466 - 23886252
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||| |||||||||     
T  23886466 ttgaaagattatgattttgggttgaattatcatcctggtaaaactaatgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactctacacatgtccgccatgatga 23886367  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | || || || ||| |||||||||| |||||||| |||||| | || || ||||||||||| ||||||||| |||| || ||| |||| ||  |||||||    
T  23886366 tcaaagagttggagctgcttgaacaatttagagatttgagtttagtctgtgaattgtcacctcagagtgtgaagttaggaatgctgaagattgatagtga 23886267  T
Q  244 attcttgaatagtat 258  Q
    |||  ||||||||||    
T  23886266 atttctgaatagtat 23886252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 12306221 - 12305977
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||  | || || |    
T  12306221 cagaggagatggttatagttactaaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgcattgagctgtaaaacat 12306122  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  | ||||| || ||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| | ||||||||    
T  12306121 tgcatatgtctgctttaatggtaaaagaattcgagttgttagaacagtttagagacttgagtctagtctgtgaattgtcacctcagagtatacagttggg 12306022  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     |||||||| ||  ||||| | |||||||| |||||| |||||||    
T  12306021 gatgttgaagattgatagtaatttcttgaacagtatccgagaagc 12305977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 51 - 182
Target Start/End: Original strand, 21921082 - 21921213
Alignment:
Q  51 attatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagga 150  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||    
T  21921082 attatgattttgagttgaactatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagacttttcacatgtctgccatgatggtaaagga 21921181  T
Q  151 atttgagttgcttgaacagtttagagacttga 182  Q
     ||  ||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  21921182 gttcaagttgcttgaatagttcagagatttga 21921213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 45 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 21252385 - 21252247
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||||||||    
T  21252385 tgaaggattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggt 21252286  T
Q  145 gaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgag 183  Q
     || || || ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  21252285 aaaagagttcgagttgcttgaacagttcagagatttgag 21252247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 231
Target Start/End: Original strand, 21324587 - 21324794
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | ||||| || || ||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  21324587 cagaggagatggcttgagttgttaaaagattacgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaacgt 21324686  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | ||  |||| | | |||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||| ||||||||  |||||||    
T  21324687 tgcatgtgtctg-cttgatggtgaaagaatttgatttgctagagcagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtgtttagttggg 21324785  T
Q  223 tatgttgaa 231  Q
     ||| ||||    
T  21324786 gatgctgaa 21324794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 44 - 260
Target Start/End: Original strand, 22128297 - 22128513
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||    
T  22128297 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgtcttgagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatgg 22128396  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | |  || || || ||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||||||| |  |||||||| |||| ||  |||||||    
T  22128397 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtga 22128496  T
Q  244 attcttgaatagtatca 260  Q
    |||  |||| |||||||    
T  22128497 atttctgaaaagtatca 22128513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 96 - 267
Target Start/End: Original strand, 803064 - 803235
Alignment:
Q  96 ttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcga 195  Q
    |||| ||||||||||||||||| || || |||||||| ||  |||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||  |||||||||| || ||    
T  803064 ttgctgatgctttgagtaggaaaactttgcacatgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttcagagatatgagtcttgtctgtga 803163  T
Q  196 attgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  803164 attgtcaccccagagtatacagttgggaatgttgaaaattgatagtgacttcttgaacagtatccgagaagc 803235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 44 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 18858019 - 18857817
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || |||||||    
T  18858019 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgtcgttgcagatgccttgagtaggaagactttgcatatgtccgctatgatgg 18857920  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | |  || || || ||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||||||| |  |||||||| |||| ||  |||||||    
T  18857919 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtga 18857820  T
Q  244 att 246  Q
    |||    
T  18857819 att 18857817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 44 - 270
Target Start/End: Original strand, 22119513 - 22119739
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||    
T  22119513 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatggcttgagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatgg 22119612  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | |  || || || |||||||||||||||| |||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||||||| |  |||||||| |||| ||  |||||||    
T  22119613 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttaaagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtga 22119712  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagcgca 270  Q
    |||  |||| |||||||  ||||||||    
T  22119713 atttctgaaaagtatcaaggaagcgca 22119739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 260
Target Start/End: Original strand, 17673362 - 17673578
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||    
T  17673362 ttgaaagattatgactttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 17673461  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | |  || || || || |||||||||||||||||  ||||| | |||| ||||| |||||| ||||||||| |  |||||||| |||| ||  |||||||    
T  17673462 tcagagagttcgaattacttgaacagtttagagatatgagtttggtttccgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtga 17673561  T
Q  244 attcttgaatagtatca 260  Q
    |||  |||| |||||||    
T  17673562 atttctgaaaagtatca 17673578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 22052334 - 22052082
Alignment:
Q  15 acatcagacagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtag 114  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||    
T  22052334 acatgagacagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagctaacgtagttgctgatgcattgagcag 22052235  T
Q  115 gaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtg 214  Q
    ||||||  | || ||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| || || || ||||| || || ||  |     
T  22052234 gaagacactgcatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgatttgctggaacagtttagagacatgagtctggtatgtgagttgtcgcctcaaagcata 22052135  T
Q  215 cagttgggtatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     ||||||| ||| |||| || |||||||| ||||||  ||||||| |||||||    
T  22052134 tagttgggcatgctgaagattaatagtgatttcttgggtagtatccgagaagc 22052082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 29 - 231
Target Start/End: Original strand, 19483388 - 19483590
Alignment:
Q  29 agatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacaca 128  Q
    |||||| |||||||  | || |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |    
T  19483388 agatggctagagttgctaaaagattatgactttgggttgaattaccatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcata 19483487  T
Q  129 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgtt 228  Q
    |||| ||||||||||| |  || |||||||| |||||||||||  ||||  ||||| | ||||| |||| |||||| ||||||||| |  |||||||| |    
T  19483488 tgtccgccatgatggtcagagagtttgagttacttgaacagttccgagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgct 19483587  T
Q  229 gaa 231  Q
    |||    
T  19483588 gaa 19483590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 45 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 19979408 - 19979186
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||  ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  19979408 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtataaagacattgcatatgtccgctatgatggt 19979309  T
Q  145 gaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtgaa 244  Q
     |  || ||||||||||||||||||||||||||  ||||  | ||||| || | |||||| ||||||||| |  |||| ||| |||||||  ||||||||    
T  19979308 tagagagtttgagttgcttgaacagtttagagatatgagcttagtttgtgagtggtcacctcagagtgtgaaactgggaatgctgaaaattgatagtgaa 19979209  T
Q  245 ttcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
    || ||||| ||||||| ||||||    
T  19979208 tttttgaagagtatcaaagaagc 19979186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 45 - 183
Target Start/End: Original strand, 21393205 - 21393343
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || ||||||||    
T  21393205 tgaaagattctgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtatgaagaccttgcatatgtctgctatgatggt 21393304  T
Q  145 gaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgag 183  Q
     ||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  21393305 aaaggagttcgagttgcttgaacagttcagagatttgag 21393343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 45 - 183
Target Start/End: Original strand, 21787699 - 21787837
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || ||||||||    
T  21787699 tgaaagattctgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtatgaagaccttgcatatgtctgctatgatggt 21787798  T
Q  145 gaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgag 183  Q
     ||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  21787799 aaaggagttcgagttgcttgaacagttcagagatttgag 21787837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 44 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 19114132 - 19113916
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||    
T  19114132 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 19114033  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | |  || || || || |||||||||||  ||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||||||| |  |||||||| |||| ||  |||||||    
T  19114032 tcagagagttcgaattacttgaacagttccgagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtga 19113933  T
Q  244 attcttgaatagtatca 260  Q
    |||  |||| |||||||    
T  19113932 atttctgaaaagtatca 19113916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 45 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 21043886 - 21043754
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| || || ||||| || ||||||||    
T  21043886 tgaaggactatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctctgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggt 21043787  T
Q  145 gaaggaatttgagttgcttgaacagtttagaga 177  Q
    ||| || || ||||||||||||||||| |||||    
T  21043786 gaaagagttcgagttgcttgaacagttcagaga 21043754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 20 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15534849 - 15534660
Alignment:
Q  20 agacagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaaga 119  Q
    |||||| | |||||| |||||||  |||| |||||||| ||||| ||||| ||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  15534849 agacagcgtagatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaattatgatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaaga 15534750  T
Q  120 cgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccaga 209  Q
    | || |||||||| ||  ||||||| |  || || ||||| |||||||| |||||||| |||||| | |||||||||| |||||| ||||    
T  15534749 cattgcacatgtccgctttgatggttagagagttcgagttacttgaacaatttagagatttgagtttggtttgcgaatggtcacctcaga 15534660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Original strand, 30312468 - 30312685
Alignment:
Q  29 agatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacaca 128  Q
    |||||| |||||||  |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |    
T  30312468 agatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagacattgcata 30312567  T
Q  129 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgtt 228  Q
    |||| ||  ||||||| |  || || ||||| ||||||||||| ||||| |||||| | ||||| |||| |||||| ||||  ||| |  |||| ||| |    
T  30312568 tgtccgctttgatggttagagagttcgagttacttgaacagttcagagatttgagtttagtttgtgaatggtcacctcagaaagtgaaactgggaatgct 30312667  T
Q  229 gaaaatcaatagtgaatt 246  Q
    ||| || |||||||||||    
T  30312668 gaagattaatagtgaatt 30312685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 50 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 23651477 - 23651313
Alignment:
Q  50 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 149  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||| || |||||||| | ||    
T  23651477 gattatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctgctatgatggttaggg 23651378  T
Q  150 aatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtg 214  Q
    | || |||||| | |||||||||||||| |||||  | ||||| |||| |||||| |||||||||    
T  23651377 agttcgagttgttggaacagtttagagatttgagcttagtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 23651313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 45 - 267
Target Start/End: Original strand, 21165878 - 21166100
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||  |||||||    
T  21165878 tgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctttgatggt 21165977  T
Q  145 gaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtgaa 244  Q
     |  || || |||||||||||||||||||||||  ||||  | || || || | |||||| ||||||||| |  |||| ||| |||| ||  ||||||||    
T  21165978 tagagagttcgagttgcttgaacagtttagagatatgagcttagtgtgtgagtggtcacctcagagtgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaa 21166077  T
Q  245 ttcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
    ||  |||| ||||||| ||||||    
T  21166078 tttctgaagagtatcaaagaagc 21166100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 27355999 - 27355766
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||           || ||||| || |    
T  27355999 cagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttg-----------agcaggaaaacat 27355911  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||| || ||| ||||||| |||||| | ||||||||    
T  27355910 tgcacatgtctgctttaatggtgaaagaattcgagttgttagaacagtttagagacctgagtcttgtctgtgaactgtcacctcagagtatacagttggg 27355811  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     ||| |||| ||  ||||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  27355810 gatgctgaagattgatagtaatttcttgaatagtatccgagaagc 27355766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 29 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22041316 - 22041131
Alignment:
Q  29 agatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacaca 128  Q
    |||||| |||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |    
T  22041316 agatggctagaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagccaatgttgttgcggatgccttgagcaggaagacattgcata 22041217  T
Q  129 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtg 214  Q
    |||| ||  ||||||| |  || |||||||| ||||||||||| || || |||||| | ||||| |||| |||||| |||||||||    
T  22041216 tgtccgctttgatggttagagagtttgagttacttgaacagttcagtgatttgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 22041131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 184
Target Start/End: Original strand, 31570160 - 31570321
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | ||| | || || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||      
T  31570160 cagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggaaaagctaatgtagtcgcggatgcgttgagtaggaagacac 31570259  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagt 184  Q
    | || ||||| || |||||| |||| |||||||| || || ||||||||||||||| |||||    
T  31570260 ttcatatgtctgctatgatgatgaaagaatttgatttactggaacagtttagagacatgagt 31570321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 44 - 266
Target Start/End: Original strand, 22247772 - 22247978
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||            
T  22247772 ttgaaggattatgattttgggttgaattatcatccaagtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtccgc-------- 22247863  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
            | |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||  || |||||||||| ||||||||| || | || ||| | || ||  |||||||    
T  22247864 --------tatgagttgcttgaacagtttagagatttgagtttagtcggcaaattgtcacctcagagtgtgaagctaggaatgctaaagattgatagtga 22247955  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaag 266  Q
    ||||||||| ||||||| |||||    
T  22247956 attcttgaacagtatcaaagaag 22247978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 50 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 1267674 - 1267457
Alignment:
Q  50 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 149  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||  | || || || || |||||| | || |    
T  1267674 gattatgattttggtttgaattaccatctgggtaaagtcaatgtggttgcagatgcgttgaggaggaagacactgcatatatctgctatgatgataaaag 1267575  T
Q  150 aatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtgaattctt 249  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| || || || || ||||| || ||| | || || || ||| |||| || || ||||| |||||    
T  1267574 aatttgatttgctagagcagtttagagatttgagtctagtctgtgagttatcacctcaaagtatacaattagggatgctgaagattaacagtgatttctt 1267475  T
Q  250 gaatagtatcagagaagc 267  Q
    ||  |||||| |||||||    
T  1267474 gagcagtatccgagaagc 1267457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 29 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 32601601 - 32601421
Alignment:
Q  29 agatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacaca 128  Q
    |||||| |||| || ||||||||||| || ||||| |||||  ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || |    
T  32601601 agatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaatcatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagcaggaagacattgcata 32601502  T
Q  129 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccaga 209  Q
    |||| ||  ||||||| |  || || ||||| |||||||| || ||||| |||||| | ||||| |||| |||||| ||||    
T  32601501 tgtccgctttgatggttatagagttcgagttacttgaacaattcagagatttgagtttggtttgtgaatggtcacctcaga 32601421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 19869159 - 19869044
Alignment:
Q  20 agacagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaaga 119  Q
    |||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||   |||  |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||||||||||     
T  19869159 agacagcggagatggttggagttcttaaaggactatgattttgaactgagttatcatccagggaaggccaatgtagtagctgatgccttgagtaggaagt 19869060  T
Q  120 cgttacacatgtcggc 135  Q
    | || |||||||||||    
T  19869059 ccttgcacatgtcggc 19869044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 141
Target Start/End: Original strand, 22623378 - 22623472
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgat 141  Q
    |||||||||||||   |||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| || |||||    
T  22623378 aaggattatgattacaggttaaattaccatccgggtaaggctaatgttgttgcagatgctttaagtaggaaaacattacatatgtctgctatgat 22623472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 120
Target Start/End: Original strand, 22132367 - 22132456
Alignment:
Q  31 atggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagac 120  Q
    |||| |||||||  ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||  |||  |||||| ||||| ||||||||    
T  22132367 atggctagagttgctgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgatgttatagatgcgttgagcaggaagac 22132456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 29 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 23452825 - 23452722
Alignment:
Q  29 agatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacaca 128  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||| || || | |||||| ||  || ||||  ||||||||||| | |||||||    
T  23452825 agatggttggaattattgaaggattatgattttgagttgagttatcttccaggaaaggtcaatgtcgtaacatatgccatgagtaggaagtccttacaca 23452726  T
Q  129 tgtc 132  Q
    ||||    
T  23452725 tgtc 23452722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 206 - 260
Target Start/End: Original strand, 22623492 - 22623546
Alignment:
Q  206 cagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatca 260  Q
    ||||||||| | ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  22623492 cagagtgtgaaattgggaatgttgaagatcaacagtgaattcttgaacagtatca 22623546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 22988518 - 22988412
Alignment:
Q  164 gaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagag 263  Q
    ||||| |||||||| |||||| | || |||||||||||| | ||||||||  |||| || ||| |||| ||  ||||||||||| |||| ||||| | ||    
T  22988518 gaacaatttagagatttgagtttagtctgcgaattgtcatctcagagtgtaaagttaggaatgctgaagattgatagtgaattcctgaagagtattaaag 22988419  T
Q  264 aagcgca 270  Q
    |||||||    
T  22988418 aagcgca 22988412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 184
Target Start/End: Original strand, 16876437 - 16876574
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 146  Q
    ||||||| |||||||  |||||  |||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| ||  ||||||| |    
T  16876437 aaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggtta 16876536  T
Q  147 aggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagt 184  Q
    | || || || ||| |||| |||||| |||| ||||||    
T  16876537 aagagttggaattgattgagcagtttcgagatttgagt 16876574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 71 - 231
Target Start/End: Original strand, 21849703 - 21849863
Alignment:
Q  71 tatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagt 170  Q
    |||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| || || ||||| |   ||||||| || || || || ||| |||| || |    
T  21849703 tatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtaggacgactttgcatatgtctgatttgatggttaaagagttggaattgattgagcaat 21849802  T
Q  171 ttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaa 231  Q
    || ||||||||||| | ||| | || ||| ||||  || |||||| |||||||||||||||    
T  21849803 ttcgagacttgagtttggttagtgagttgacaccggagggtgtgcggttgggtatgttgaa 21849863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 139; Significance: 9e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 23 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 15540 - 15290
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  15540 cagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttgggttgaattaccatctgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagaggt 15441  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||||||    
T  15440 tgcatatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagaacagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgtcacctcagagtgtacagttggg 15341  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaaca 273  Q
    |||| |||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15340 tatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaaca 15290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 139; Significance: 9e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 44 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 27931 - 27705
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  27931 ttgaaggactatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgctttgagcaggaagacgtttcacatgtctgctatgatgg 27832  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | || || |||||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27831 taaaagagtttgagctacttgaacaatttagagacttcagtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtgcagttgggtatgttgaagatcaatagtga 27732  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagcgca 270  Q
     |||||||| |||||||||||||||||    
T  27731 tttcttgaacagtatcagagaagcgca 27705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 23 - 283
Target Start/End: Original strand, 47912 - 48172
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  47912 cagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggtcgcagatgctttgagcaggaagacgt 48011  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||  |||||||    
T  48012 tgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgttagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgtcacctcagagtgtatagttggg 48111  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 283  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| || || |||||||||    
T  48112 tatgttgaaaatcaatagtgatttcttgaacattatcagagaagcacagcaagttgatgtc 48172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 23 - 282
Target Start/End: Original strand, 56725 - 56984
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| | |||||||     
T  56725 cagaggagatggttagagctgttaaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaacgtagttgctgatgcgttgagcaagaagacgc 56824  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| || ||||||||  |||||  ||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||| | ||||||||    
T  56825 tgcacatgtctgctatgatggtataggaacatgatttgctagaacagtttagagagttgagccttgtttgtgagttgtcacctcagagtatacagttggg 56924  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgt 282  Q
     ||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  56925 aatgctgagaattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcgcaacaagtggatgt 56984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 23 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 29485 - 29225
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29485 cagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgt 29386  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| || |||||||| ||| | ||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||    
T  29385 tgcacatgtctgctatgatggtaaagaagtttgagttgctagagcagtttagagagttgattcttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtacagttggg 29286  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 283  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||||| || || |||||||||    
T  29285 tatgttgaagattaatagtgatttcttgaataatatcagagaagcacagcaagttgatgtc 29225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 50 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 30346 - 30194
Alignment:
Q  50 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 149  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||    
T  30346 gattatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgtttttgcagatgctttgagtaggaagacattgcatatgtctgctatgatggtaaagg 30247  T
Q  150 aatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtca 202  Q
    | || |||||| |||||||||| ||||| |||||| | ||||| ||| |||||    
T  30246 agttcgagttggttgaacagttcagagatttgagtttagtttgtgaaatgtca 30194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 23 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 50238 - 50168
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgt 93  Q
    ||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||    
T  50238 cagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgt 50168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 136; Significance: 6e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 23 - 282
Target Start/End: Original strand, 111 - 370
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||| ||||| || ||||| | |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  111 cagaggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggcttgaaataccatccagataaagctaaagtagttgcagatgcgttgagtaggaagacat 210  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  211 tgcacatgtcggccttgatggtaaaggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttaagtctcgtgtgtgaattgtcatctcagagtgtgcagttggg 310  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgt 282  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  311 tatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgt 370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0600 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0600
Description:

Target: scaffold0600; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 23 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 5204 - 4944
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  5204 cagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttaaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaagaagacgt 5105  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | ||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||| |    
T  5104 tgcacatttctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctggagcagtttagagacttgagtcttgtttgtgagttgtcacctcaaagtgtacagttgag 5005  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 283  Q
    |||| |||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  5004 tatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgtc 4944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Original strand, 89323 - 89567
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  89323 cagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgt 89422  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| || |||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||    
T  89423 tgcatatgtctgctatgatggtaaacgaatttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttatcacctcagagtgtacagttggg 89522  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  89523 tatgttgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagc 89567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Original strand, 90001 - 90245
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  90001 cagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgt 90100  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| || |||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||    
T  90101 tgcatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttatcacctcagagtgtacagttggg 90200  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  90201 tatgttgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagc 90245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 20 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 41129 - 40882
Alignment:
Q  20 agacagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaaga 119  Q
    |||||||| |||||| | |||||  | ||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  41129 agacagagaagatggcttgagttgctaaaggattatgattttggttttgattatcatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaga 41030  T
Q  120 cgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagtt 219  Q
    |||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||    
T  41029 cgttgcacatgtctgctatgatggtaaaagaatttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgtcacctcagagtgtacagtt 40930  T
Q  220 gggtatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  40929 gggtatgttgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagc 40882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 50774 - 51013
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||    
T  50774 ttgaaggattatgattttgggttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgtagatgctttgagcaggaaaacgttgcacatgtctgctatgatgg 50873  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||||| |||| |||| || ||||||||    
T  50874 taaaggagtttgagttgctagaacagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgtcacctcagagtgtacagttggctatgctgaagattaatagtga 50973  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 283  Q
     |||||||||||||| |||||||| || || |||||||||    
T  50974 tttcttgaatagtattagagaagcacatcaagttgatgtc 51013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2112 (Bit Score: 129; Significance: 9e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold2112
Description:

Target: scaffold2112; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 23 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 406 - 146
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| | || || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  406 cagagaagatggcttgaattgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatatggttgcagatgctttgagcaggaagacgt 307  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| || |||||||| ||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||    
T  306 tgcatatgtctgctatgatggtaaaggagtttgtgttgcttgaatagttcagagacttgagccttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtacagttggg 207  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 283  Q
    |||| |||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  206 tatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacagcaagttgatgtc 146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1288 (Bit Score: 129; Significance: 9e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold1288
Description:

Target: scaffold1288; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 23 - 283
Target Start/End: Original strand, 1732 - 1992
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1732 cagaggagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagcaaatgtggttgcagatgccttgagtaggaagacgt 1831  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | ||||||||  | |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || || ||| |||| ||||||||  |||||||    
T  1832 tgcacatgtctactatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgacacctcagagtgtaaagttggg 1931  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 283  Q
     ||| |||| || |||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  1932 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaacaatatcagagaagcacaacaagttgatgtc 1992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 129; Significance: 9e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 47 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 48508 - 48272
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 146  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||| |    
T  48508 aaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggtaa 48409  T
Q  147 aggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtgaatt 246  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || |||||||| ||    
T  48408 aggattttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttatcacctcagagtgtacagttgggtatgctgaagattaatagtgattt 48309  T
Q  247 cttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 283  Q
    ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  48308 cttgagtagtatcagagaagcacatcaggttgatgtc 48272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 44 - 260
Target Start/End: Original strand, 5988 - 6206
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgta--gttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgat 141  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  5988 ttgaaggactatgattttggtttgaattatcaccccggtaaagctaatgtacggttgcagatgctttgagtaggaagacgttgcacatgtctgctatgat 6087  T
Q  142 ggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagt 241  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6088 ggtaaaggagttggagttgcttgagcagtttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcacctcagagtgtgcagttgggtatgttgaagatcaatagt 6187  T
Q  242 gaattcttgaatagtatca 260  Q
    || |||||||| |||||||    
T  6188 gatttcttgaacagtatca 6206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 126; Significance: 5e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 38 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 1282 - 1037
Alignment:
Q  38 gagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggcca 137  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |    
T  1282 gagttgttaaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttacacatgtctacta 1183  T
Q  138 tgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaa 237  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || ||| |||  |||||||||||||||||||| || ||||| ||  ||||||| || |||||||||||||| || ||    
T  1182 tgatggtaaaggagtttgagtttctagaatagtaaagagacttgagtcttgtttgtgagttgtcgccttagagtgtacaattgggtatgttgaagattaa 1083  T
Q  238 tagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  1082 tagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgtc 1037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 47 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 6154 - 5918
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 146  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||  |  |||||||| |    
T  6154 aaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttgcacatgtttgttatgatggtaa 6055  T
Q  147 aggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtgaatt 246  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |  || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||    
T  6054 aggagtttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctatgagttgtcacctcagagtgtacagttgggtatgttgaagattaatagtgattt 5955  T
Q  247 cttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 283  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  5954 cttgaatagtatccgagaagcacaacaagttgatgtc 5918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 23 - 283
Target Start/End: Original strand, 430 - 690
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  430 cagaggagatgcttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaacgt 529  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  530 tgcacatgtctgctatgatggtgaaagaatttgatttgttagagcagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtgtacagttggg 629  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 283  Q
     ||| |||| || || ||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||| || ||||||    
T  630 gatgctgaagattaacagtgatttcttgaatagtatccgggaagcacaacaagtggatgtc 690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 45 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 7426 - 7269
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| || ||||||||    
T  7426 tgaaggactatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagacgctttgagtaggaagactttgcatatgtccgctatgatggt 7327  T
Q  145 gaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtca 202  Q
     || || || ||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||| ||| |||||    
T  7326 aaatgagttcgagttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgtgaaatgtca 7269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 45 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 13464 - 13326
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||||||||    
T  13464 tgaaggactatgattttgagttgagctatcatccgggtcaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagactttgcataagtctgccatgatggt 13365  T
Q  145 gaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgag 183  Q
     ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  13364 aaaggagttcgagttacttgaacagttcagagatttgag 13326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 23 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 13628 - 13379
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13628 cagagaagatggttagagctgttgaaagattatgattttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagacgt 13529  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| || | ||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| || || ||| ||||  ||||||| ||||||||    
T  13528 tgcacatgtctgctacgatggtgaaagaatttgatttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgacaccttagagtgtacagttggg 13429  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaac 272  Q
     ||| |||| || || ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  13428 gatgctgaagattaacagtgatttcttgaatagtatccgagaagcacaac 13379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 71 - 231
Target Start/End: Original strand, 6734 - 6894
Alignment:
Q  71 tatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagt 170  Q
    |||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||| | ||  ||||||| || || || || ||| |||| ||||    
T  6734 tatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgactgctttgatggttaaagagttggaattgattgagcagt 6833  T
Q  171 ttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaa 231  Q
    || ||||||||||| | ||| |||| ||| ||||  |  |||||  |||||||||||||||    
T  6834 ttcgagacttgagtttggttagcgagttgacacctgatggtgtgaggttgggtatgttgaa 6894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0304 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0304
Description:

Target: scaffold0304; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Original strand, 2363 - 2607
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2363 cagagaagatggctagagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtgaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgt 2462  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || || || |||||  ||||||| ||||||||    
T  2463 tgcatatgtctgctatgatggtaaaagagtttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttctcaccttagagtgtacagttggg 2562  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
    ||||||||| || ||| || | ||||||||||||||| |||||||    
T  2563 tatgttgaagattaattgtaatttcttgaatagtatccgagaagc 2607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 44211 - 43967
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||| |    
T  44211 cagagaagatggttagagcttttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgctaatgcgttgagtaggaagacat 44112  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| |||| |||||||| ||||||||    
T  44111 tgcatatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgctagaacattttagagacttgagccttgtttgtgagttgacacctcagagtgttcagttggg 44012  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     ||| |||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  44011 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagc 43967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Original strand, 41211 - 41455
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  41211 cagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaacgt 41310  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| ||  |||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||  |||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  41311 tgcacatgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttcagagatatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttggg 41410  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     |||||||||||  ||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  41411 aatgttgaaaattgatagtgacttcttgaacagtatccgagaagc 41455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Original strand, 46277 - 46521
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  46277 cagaggagatggttggagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtagttgcacatgccttgagtaggaaaacgt 46376  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  ||||||| || |||||||| ||| | || ||||||||||||||||  ||||| || |||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  46377 tgcatatgtctgctttgatggtaaaagaatttgatttgttagagcagtttagagacttgatccttgtctgtgaattgacacctcagagtgttcagttggg 46476  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     ||| |||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  46477 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagc 46521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 51 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 3314 - 3095
Alignment:
Q  51 attatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagga 150  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||| ||| | ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||  ||||||| || ||    
T  3314 attatgattgtgggttgaattattatccaggtaaagctaattttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtccgcattgatggtaaaaga 3215  T
Q  151 atttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtgaattcttg 250  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||| | || |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| | || ||  |||||||||||||     
T  3214 gtttgagttgcttgaacaatttagagatttgagtttagtctgcgaattgtcacctcagagtgtgaagttgggaatgctaaagattgatagtgaattctta 3115  T
Q  251 aatagtatcagagaagcgca 270  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  3114 aatagtatcaaagaagcgca 3095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 23 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 3604 - 3346
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | |||||  | ||||||||||||||||| || || || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3604 cagaggagatggcttgagttgctaaaggattatgattttggtttaaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgt 3505  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| || || ||||||||  |||||||  |||||||    
T  3504 tgcacatgtctgctattatggtaaaggagtttgagttgctagagcattttagagacttgagtcttgtctgtgagttgtcacctaagagtgtatagttggg 3405  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatg 281  Q
    |||| |||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||    
T  3404 tatgctgaagattaatagtgatttcttgaacagtatcagagaagcacagcaagttgatg 3346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 114; Significance: 8e-58; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 23 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 149997 - 149749
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  149997 cagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagc-aatgtggttgcagatgcgttgagcaggaagacat 149899  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    |  | ||||| ||  |||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| || || ||| |||| |||||||| ||||||||    
T  149898 tgaatatgtctgctttgatggtgaaagaatttgatttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgacacctcagagtgttcagttggg 149799  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaac 272  Q
     ||| |||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  149798 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcacaac 149749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 23 - 282
Target Start/End: Original strand, 194582 - 194841
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||   ||||| ||||||||||||||||    
T  194582 cagaggagatggttggaggtgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttattgatgccttgagtaggaagacgt 194681  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  |||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||    
T  194682 tgcatatgtctgctttgatggtgaaagaatttgagttgctagagtagtttagatacttgagtcttgtttgcgaattgacacctctgagtgtacagttggg 194781  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgt 282  Q
     ||| |||| || || ||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||| || |||||    
T  194782 gatgctgaagattaacagtgatttcttgaatagtattcgagaagcacaacaagtggatgt 194841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 51 - 214
Target Start/End: Original strand, 25439 - 25602
Alignment:
Q  51 attatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagga 150  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || ||||| || |||||||| || ||    
T  25439 attatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagttaatgttgttgcagatgccctaagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatggtaaaaga 25538  T
Q  151 atttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtg 214  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||| ||||||| |||||||||    
T  25539 gtttgagttgcttgaacagtttagagatttgagtttagtctgcgaaatgtcacctcagagtgtg 25602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1830 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold1830
Description:

Target: scaffold1830; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 429 - 185
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||    
T  429 cagaggagatggttagagctgttgaaggattatgatttttgtttgaattaccatccaggtaaagccaatgtggtagcagatgcgttgagcaggaagacgt 330  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| || |||||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||| || || ||| |||| |||||||| ||||| ||    
T  329 tgcatatgtctgctatgatggttaaagaattcgatttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgacacctcagagtgttcagtttgg 230  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  229 gatgttgaaaattaatagtgatttcctgaatagtatccgagaagc 185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Original strand, 851 - 1095
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||| || || || ||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  851 cagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttaaattaccattcggttaaagctaatgtggttgcagatgctttaagcaggaagacgt 950  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||| ||| || |||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||  ||| |||||||| ||||||||    
T  951 tgcacaagtctgctatgatggtaaatgactttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtttgtgagttgaaacctcagagtgtacagttggg 1050  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
    |||| |||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1051 tatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagc 1095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 79 - 283
Target Start/End: Original strand, 6264 - 6468
Alignment:
Q  79 gggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagac 178  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  6264 gggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttcctagaacagtttagagac 6363  T
Q  179 ttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttg 278  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  6364 ttgagtcttgtctgtgagttgtcacctcagagtgtccagttgggtatgttgaagaataatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcacaacaagttg 6463  T
Q  279 atgtc 283  Q
    |||||    
T  6464 atgtc 6468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 79 - 283
Target Start/End: Original strand, 10695 - 10899
Alignment:
Q  79 gggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagac 178  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  10695 gggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttcctagaacagtttagagac 10794  T
Q  179 ttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttg 278  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  10795 ttgagtcttgtctgtgagttgtcacctcagagtgtccagttgggtatgttgaagaataatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcacaacaagttg 10894  T
Q  279 atgtc 283  Q
    |||||    
T  10895 atgtc 10899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 23 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 32839 - 32579
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||| || |||| ||||| ||||    
T  32839 cagagaagatggctagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcggatactctgagcaggaaaacgt 32740  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| || |||||||| || |||||||||||||| |  | ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  32739 tgcatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgagttgctagcgcggtttagagatttgagtcttgtctgtgaattgtcacctcagagtgtacagttggg 32640  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 283  Q
    |||| |||| || |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||    
T  32639 tatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccaagaagcgcaacaagtggatgtc 32579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0865 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0865
Description:

Target: scaffold0865; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 23 - 270
Target Start/End: Original strand, 3150 - 3397
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| | ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || ||||  |||||| | |||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  3150 cagagaagatggcttgagttgttgaaagactatgattttggtttgaattaccatcttggtaaaactaatgtagtcgcggatgctttgagcaggaagacgt 3249  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| ||  |||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||    
T  3250 tgcacatgtctgctttgatagtgaaagagtttgagtttcttgaacaatttagagacttgagtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtgcaattggg 3349  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgca 270  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||    
T  3350 tatgttgaagatcaatagtgatttcttgaacagtatcaaggaagcgca 3397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 3)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 23 - 270
Target Start/End: Original strand, 10935 - 11182
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10935 cagagaagatggttagagctgttgaaagattatgattttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagacgt 11034  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| || | |||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| || || ||| |||| |||||||| ||||||||    
T  11035 tgcacatgtctgctacgatggtaaaagaatttgatttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgacacctcagagtgttcagttggg 11134  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgca 270  Q
     ||| |||| || || | ||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  11135 aatgctgaagattaacattgatttcttgaatagtattcgagaagcgca 11182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 23 - 270
Target Start/End: Original strand, 14705 - 14952
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14705 cagagaagatggttagagctgttgaaagattatgattttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagacgt 14804  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| || | |||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| || || ||| |||| |||||||| ||||||||    
T  14805 tgcacatgtctgctaagatggtaaaagaatttgatttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgacacctcagagtgttcagttggg 14904  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgca 270  Q
     ||| |||| || || | ||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  14905 aatgctgaagattaacattgatttcttgaatagtattcgagaagcgca 14952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 21411 - 21167
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||| || |||  ||| |||||||| || ||  || ||||  |||| | || |||||    
T  21411 cagagaagatggttagagctgttgaaagattatgattttggtttgaattaccatttggggaaagccaacgtggtgtcaaatgcgatgagcaagaggacgt 21312  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| || |  |||||||| ||||||||||| || || ||| |||| |||||||| ||||||||    
T  21311 tgcatatgtctgctatgatggtgaaagaatttgatttgctagagccatttagagaattgagtcttgtctgtgagttgacacctcagagtgttcagttggg 21212  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     ||| |||| || || | ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  21211 aatgctgaagattaacattgatttcttgaatagtatccgagaagc 21167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 282
Target Start/End: Original strand, 2225 - 2492
Alignment:
Q  15 acatcagacagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtag 114  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  2225 acatgagacagaggagatggttagagctgttgaaagattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgcgtag 2324  T
Q  115 gaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtg 214  Q
    ||| ||||| || |||||  | |||||||| || ||||| || ||||| || || |||||||||||||||||||| || || ||| |||| ||||||||     
T  2325 gaaaacgttgcatatgtctactatgatggtaaaagaattcgatttgctagagcaatttagagacttgagtcttgtgtgtgagttgacacctcagagtgtt 2424  T
Q  215 cagttgggtatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgt 282  Q
    |||||||| ||| |||| || || ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| || |||||    
T  2425 cagttggggatgctgaagattaacagtgatttcttgaacagtatccgagaagcgcaacaagtagatgt 2492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 23 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 8488 - 8241
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||| || ||||  |||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||    
T  8488 cagaggagatggttggagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcttggtaaagccaatgtggttgcagatgtcttgaataggaagacgt 8389  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || |||||  |  | |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  8388 tgcatatgtctactttaatggtgaaagaattcgatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtgttcagttggg 8289  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgca 270  Q
     ||| |||| || || ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  8288 gatgctgaagattaacagtgacttcttgaatagtattcgagaagcgca 8241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 23 - 270
Target Start/End: Original strand, 30163 - 30410
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| | ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || ||||  |||||| | |||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  30163 cagagaagatggcttgagttgttgaaagactatgattttggtttgaattaccatcttggtaaaactaatgtagtcgcggatgctttgagcaggaagacgt 30262  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| ||  |||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||    
T  30263 tgcacatgtctgctttgatagtgaaagagtttgagtttcttgaacaatttagagacttgagtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtgcaattggg 30362  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgca 270  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||    
T  30363 tatgttgaagatcaatagtgatttcttgaacagtatcaaggaagcgca 30410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 24 - 267
Target Start/End: Original strand, 24755 - 24998
Alignment:
Q  24 agaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgtt 123  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  24755 agagaagatggttagagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcagaaagacgtt 24854  T
Q  124 acacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggt 223  Q
     || ||||  ||  |||||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||| ||| ||||||| || |||||| ||||  ||||||| ||||||||     
T  24855 gcatatgtttgctttgatggtgaaagaattcgatttgctagagcagtttagagatttgtgtcttgtctgtgaattgacacctgagagtgtacagttgggg 24954  T
Q  224 atgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  24955 atgttgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagc 24998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 111; Significance: 5e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Original strand, 9707 - 9945
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||| ||||||| | || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| || ||  |||| || |||||||    
T  9707 ttgaaggattgtgattttagtttaaattatcatccgggtaaagccaatgttgttgcagatgctttaagcaggaagacattgcatttgtcagctatgatgg 9806  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  9807 ttaaagaatttgagttgcttgagcagtttaaagacttgagtctagtttgtgagttgtcacctcaaagtgtgaagttgggtatgttgaagatcaacagtga 9906  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgt 282  Q
     |||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||    
T  9907 gttcttggatagtattagagaagcacagaaggttgatgt 9945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1061 (Bit Score: 109; Significance: 7e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold1061
Description:

Target: scaffold1061; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 3016 - 2772
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||| | |||||||||||  |||| ||||||| ||    
T  3016 cagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatctgggtaaagccaatatggttgcagatgcgctgagcaggaagatgt 2917  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| || ||||||||||| ||||| || ||||| ||  |||||||||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  2916 tgcatatgtctgctatgatggtgaaagaattcgatttgctagagtagtttagagacttgagtcttgtctgtgaattgacacctcagagtgtacagttggg 2817  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     ||| |||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  2816 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagc 2772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 109; Significance: 7e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 42345 - 42101
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||     
T  42345 cagaggagatggttagagctgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatccaggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaacgc 42246  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  | |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||| |||||| | ||||||||    
T  42245 tgcatatgtctgctttaatggtgaaagaattcgatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtatacagttggg 42146  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     ||| |||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  42145 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagc 42101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 109; Significance: 7e-55; HSPs: 3)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 44 - 252
Target Start/End: Original strand, 202367 - 202575
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||    
T  202367 ttgaaggactatgattttggtttgaattatcatccaggtaaagcaaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacattgcatatgtcagctatgatgg 202466  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  202467 ttaaagagtttgagttgcttgaacattttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcgcctcagagtgtgaagttgggtatgttgaagatcaacagtga 202566  T
Q  244 attcttgaa 252  Q
     ||||||||    
T  202567 gttcttgaa 202575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 23 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 324132 - 323882
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  324132 cagaggagatggttagagctgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatcctagtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaagacgt 324033  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| ||  | ||||||||  ||||||| ||| | || ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  324032 tgcacatgtctgctttaatggtgaaataatttgatttgttagagcagtttagagacttgagccttgtttgtgaattgacacctcagagtgttcagttggg 323933  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaaca 273  Q
     ||| |||| || || | ||| |||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  323932 gatgctgaagattaacaatgatttcttgaagagtatccgagaagcacaaca 323882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 44 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 118633 - 118475
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||  |||| ||||| |  ||||||     
T  118633 ttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaacgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactctacatatgtccgttatgatga 118534  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtca 202  Q
    | || || || ||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  118533 tcaaagagttggagctgctcgaacagtttagagacttgagttttatttgtgaattgtca 118475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2094 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold2094
Description:

Target: scaffold2094; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 84 - 267
Target Start/End: Original strand, 1 - 184
Alignment:
Q  84 aagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgag 183  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||     
T  1 aagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgcttgagcagtttagagacgtgac 100  T
Q  184 tcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
    ||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  101 tctagtttgtgagttgtcacctcagagtgtgcagttgggtatgttgaagatcaatagtgatttcttgaacaatatcagagaagc 184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 3)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 23 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 20548 - 20289
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | ||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |    
T  20548 cagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcggatgcgttgagcaggaagacat 20449  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  |||||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| | ||||||||    
T  20448 tgcatatgtctgcgttgatggtgaaggaattcgatttactagaacaatttagagacttgagtcttgtttgtgaattgacacctcagagtattcagttggg 20349  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgt 282  Q
     ||| |||| || |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| || |||||    
T  20348 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaacagtatccgagaagcgcaacaagtggatgt 20289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 260
Target Start/End: Original strand, 58191 - 58329
Alignment:
Q  122 ttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgg 221  Q
    ||||| ||||| || |||||||| |  || || |||||||||||| |||| ||||| |||||| | ||||| ||| |||| || | ||||||| | || |    
T  58191 ttacatatgtctgctatgatggttagagagttggagttgcttgaatagttcagagatttgagtttggtttgtgaagtgtcgccacggagtgtgaaattag 58290  T
Q  222 gtatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatca 260  Q
    | |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  58291 gaatgttgatgatcaacagtgaattcttgaatagtatca 58329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 100
Target Start/End: Original strand, 58093 - 58146
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgca 100  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||    
T  58093 aaggattatgatttcgggttgaattaccatccgggtaaggctaatgttgttgca 58146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 44 - 270
Target Start/End: Original strand, 18114 - 18340
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| || |||||||    
T  18114 ttgaaggattgtgattttgggttgaattatcattcaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatgg 18213  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | || || |||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||| ||||||||| || |||| ||| | || ||  |||||||    
T  18214 taaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagatttgagtttagtctgcgaattgtcacctcagagtgtgaagctgggaatgctaaagattgatagtga 18313  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagcgca 270  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||    
T  18314 attcttgaatagtatcacaaaagcgca 18340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 44 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 10844 - 10618
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||  ||||||  ||||||| || || ||||| || |||||||    
T  10844 ttgaaggactgtgattttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatattttgagcgggaagacattgcatatgtcagctatgatgg 10745  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  10744 ttaaagaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcgcctcagagtgtgaagttgtgtatgttgaagatcaacagtga 10645  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagcgca 270  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||    
T  10644 attcttgaacagtattaaagaagcgca 10618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Original strand, 15591 - 15835
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  15591 cagaggaggtggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgttgttgctgatgctttgagcaggaagactt 15690  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  | ||||| || |||||||| ||| | |||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||| | |||||| |  |||||||    
T  15691 tgcatatgtctgctttaatggtaaaagaatttgaattgttagaacagttcagagacatgagtcttgtctgtgaattgtcatctcagagtatatagttggg 15790  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     | |||||||||  ||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  15791 aaggttgaaaattgataatgacttcttgaatagtatccgagaagc 15835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0518 (Bit Score: 106; Significance: 5e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0518
Description:

Target: scaffold0518; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 65 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 12119 - 11902
Alignment:
Q  65 ttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttg 164  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||  |  ||||||| || |||||||| ||||| |    
T  12119 ttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagaccttacatatgtctacgttgatggtaaaagaatttgatttgctag 12020  T
Q  165 aacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagaga 264  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  12019 aacagtttagtgacttgagccttgtttgtgaattgtcacctcagagtatacagttggggatgttgagaattaatagtgatttcttgaatagtatccgaga 11920  T
Q  265 agcgcaacaggttgatgt 282  Q
    ||||||||| || |||||    
T  11919 agcgcaacaagtggatgt 11902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 106; Significance: 5e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 38 - 267
Target Start/End: Original strand, 177155 - 177384
Alignment:
Q  38 gagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggcca 137  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| || |    
T  177155 gagttgttgaaagactatgactttggtttgaattatcatccaggtaaggctaatgtcgttgcagaagctttaagcaggaagacgttacatatgtctgcta 177254  T
Q  138 tgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaa 237  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  177255 tgatggttaaagaattagaattgctagaacagtttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcgcctcagagtgtgaagttgggtatgttgaagatcaa 177354  T
Q  238 tagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  177355 tagtgaattcttgaacagtattaaagaagc 177384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 18777 - 18517
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| | ||||| || ||||||||||||||||| || || || |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||| |    
T  18777 cagagaagatggcttgagttgttaaaggattatgattttggttttaattaccatccgggtaaagctaatgtcgttgtagatgctttgagcaggaagacat 18678  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | ||||| || || |||||||| || || ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || || |||||||  || ||||| ||||||||    
T  18677 ttcacatctctgctatgatggtaaaagagtttgagttgctagaatattttagagacttgagtcttgtctgtgagttgtcacttcaaagtgtacagttggg 18578  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 283  Q
    |||| ||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  18577 tatgctgaaggttaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacagcaagttgatgtc 18517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 4)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 28645 - 28385
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||      
T  28645 cagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaagacac 28546  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || || |  ||  ||||||||||  ||||||| ||||| ||  |||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  28545 tgcatatatgtgctttgatggtgaaataatttgatttgctagagtagtttagagatttgagtcttgtttgtgaattgacacctcagagtgtacagttggg 28446  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 283  Q
     ||| |||| || || | ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||    
T  28445 gatgctgaagattaacaatgatttcttgaatagtatccgagaagcacaacaagtggatgtc 28385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 34898 - 34638
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||      
T  34898 cagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaagacac 34799  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || || |  ||  ||||||||||  ||||||| ||||| ||  |||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  34798 tgcatatatgtgctttgatggtgaaataatttgatttgctagagtagtttagagatttgagtcttgtttgtgaattgacacctcagagtgtacagttggg 34699  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 283  Q
     ||| |||| || || | ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||    
T  34698 gatgctgaagattaacaatgatttcttgaatagtatccgagaagcacaacaagtggatgtc 34638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 82 - 192
Target Start/End: Original strand, 95 - 205
Alignment:
Q  82 taaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttg 181  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||  || |||||||| ||||| |||||||||||||||||  | | |||||||    
T  95 taaagctaatgtggttgcagatgctttaagcaggaagacgttgcacatgtttgctatgatggtaaaggagtttgagttgcttgaacaactcaaagacttg 194  T
Q  182 agtcttgtttg 192  Q
    |||||||||||    
T  195 agtcttgtttg 205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 215 - 267
Target Start/End: Original strand, 219 - 271
Alignment:
Q  215 cagttgggtatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
    |||||||||||| | || || |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  219 cagttgggtatgctaaagattaatagtgatttcttgaatagtattagagaagc 271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 4)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 28052 - 27809
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||| ||||||| |||| || |||||||    
T  28052 cagagaagatggctagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccaggtaaagctaatgtggttgtagatgctctgagcag-aagacgt 27954  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    |  | ||||| || |||||||| || |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||    
T  27953 tggatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgagttgctagagcagtttaaagacttgagtcttgtttgcgagttgtcaccttagagtgtacagttggg 27854  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
    ||||||||| || || | ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  27853 tatgttgaagattaacaatgatttcttgaatagtatccgagaagc 27809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 282
Target Start/End: Original strand, 51058 - 51317
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | ||||| || || |||||||||||||| ||||| || |||||  |||||| |||||| | ||| ||||| ||||  |||||||| |    
T  51058 cagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctagtaaaggcaatgtggctgcggatgcgttgatcaggaagacct 51157  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    |||| ||||| ||  |||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||    
T  51158 tacatatgtctgcgttgatggtgagagaatttgatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtttgtgaattgtcacctcagagtatacagttggg 51257  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgt 282  Q
     ||||||| ||| |||||||| ||| |||||| |||| | ||||| ||||| || |||||    
T  51258 gatgttgagaattaatagtgatttcctgaataatatccgtgaagcacaacaagtggatgt 51317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 282
Target Start/End: Original strand, 60092 - 60351
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | ||||| || || |||||||||||||| ||||| || |||||  |||||| |||||| | ||| ||||| ||||  |||||||| |    
T  60092 cagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctagtaaaggcaatgtggctgcggatgcgttgatcaggaagacct 60191  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    |||| ||||| ||  |||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||    
T  60192 tacatatgtctgcgttgatggtgagagaatttgatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtttgtgaattgtcacctcagagtatacagttggg 60291  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgt 282  Q
     ||||||| ||| |||||||| ||| |||||| |||| | ||||| ||||| || |||||    
T  60292 gatgttgagaattaatagtgatttcctgaataatatccgtgaagcacaacaagtggatgt 60351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #4
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 282
Target Start/End: Original strand, 66480 - 66739
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | ||||| || || |||||||||||||| ||||| || |||||  |||||| |||||| | ||| ||||| ||||  |||||||| |    
T  66480 cagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctagtaaaggcaatgtggctgcggatgcgttgatcaggaagacct 66579  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    |||| ||||| ||  |||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||    
T  66580 tacatatgtctgcgttgatggtgagagaatttgatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtttgtgaattgtcacctcagagtatacagttggg 66679  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgt 282  Q
     ||||||| ||| |||||||| ||| |||||| |||| | ||||| ||||| || |||||    
T  66680 gatgttgagaattaatagtgatttcctgaataatatccgtgaagcacaacaagtggatgt 66739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 250041 - 249797
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    ||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |    
T  250041 cagagaagatggttagagctgctgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgctgatgcgttgagcaggaaaacat 249942  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    |||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||| |||||||| |||||| |    
T  249941 tacatatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgctagaacagtttagagacttgagccttgtttgtgagttgacacctcagagtgttcagttgcg 249842  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  249841 gatgctgaagattaataatgatttcttgaatagcatccgagaagc 249797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1646 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold1646
Description:

Target: scaffold1646; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 20 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 755 - 505
Alignment:
Q  20 agacagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaaga 119  Q
    ||||||||||||||  | ||||| || || |||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  755 agacagaggagatgacttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccaccctggtaaagccaatgtggttgcggatgcgttgagcaggaaga 656  T
Q  120 cgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagtt 219  Q
    | ||||| ||||| ||  ||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||| | |||||    
T  655 ccttacatatgtctgcgttgatggtaaaagaatttgatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtttgtgagttgtcacctcagagtatacagtt 556  T
Q  220 gggtatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgca 270  Q
    ||| ||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  555 ggggatgctgagaattaatagtgatttcttgaatagtatccaagaagcgca 505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 3)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 23 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 4177 - 3943
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||| |||    
T  4177 cagagaagatggttagagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccaggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcatgaaggcgt 4078  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| || |||||||| || |||||  | ||||| || ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||  || ||||||||    
T  4077 tgcatatgtctgctatgatggtaaaagaattcaatttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgtcacctcaga--gtacagttggg 3980  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatc 259  Q
     ||| |||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  3979 aatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatc 3943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 50 - 237
Target Start/End: Original strand, 43012 - 43199
Alignment:
Q  50 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 149  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |  |||||||| || |    
T  43012 gattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgtcgttgcagatgctttaagtaggaaaacattacatatgtctgttatgatggttaaag 43111  T
Q  150 aatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaa 237  Q
    | || ||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||| | ||||| || |||||| | ||||| |||||||| |||||    
T  43112 agttggagtttcttgaacagttcagagacttgagtttggtttgtgaagtatcaccacaaagtgtgaaattgggaatgttgaagatcaa 43199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 239
Target Start/End: Original strand, 38420 - 38522
Alignment:
Q  137 atgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatca 236  Q
    |||||||| || || || |||||||||| |||||| |||||||||||| | ||||| ||| ||||||| ||||||||| | ||||| |||||||| ||||    
T  38420 atgatggttaaagagttggagttgcttgtacagttcagagacttgagtttggtttgtgaagtgtcaccacagagtgtgaaattgggaatgttgaagatca 38519  T
Q  237 ata 239  Q
    |||    
T  38520 ata 38522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 99 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 16632 - 16448
Alignment:
Q  99 cagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaatt 198  Q
    ||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||| | |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||    
T  16632 cagatgccttgagtagaaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggaattggaattgctcgaacagtttagagacttgagtctcgtgtgtgaatt 16533  T
Q  199 gtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 283  Q
    |||| | || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  16532 gtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtctcagagaagcacaacaagttgatgtc 16448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 27 - 120
Target Start/End: Original strand, 10771 - 10864
Alignment:
Q  27 ggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagac 120  Q
    |||||||| | ||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||  |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||    
T  10771 ggagatggcttgagttcttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcttggtaaagccaatgtggttgcggatgcgttaagcaggaagac 10864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 271
Target Start/End: Original strand, 10335 - 10583
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||     
T  10335 cagaggagatggttggagctgttgaaggattatgattttgggttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttacagatgccttgagtaggaaaacgc 10434  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  |  ||||||| |||||  | ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||| |||| ||| || |||||    
T  10435 tgcatatgtccgctttagtggtgaaagaattcaatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagattgttcaattggg 10534  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaa 271  Q
     ||| |||| || |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  10535 gatgctgaagattaatagtgatttcttaaatagtatccgagaagcgcaa 10583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 271
Target Start/End: Original strand, 20549 - 20797
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||     
T  20549 cagaggagatggttggagctgttgaaggattatgattttgggttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttacagatgccttgagtaggaaaacgc 20648  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  |  ||||||| |||||  | ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||| |||| ||| || |||||    
T  20649 tgcatatgtccgctttagtggtgaaagaattcaatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagattgttcaattggg 20748  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaa 271  Q
     ||| |||| || |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  20749 gatgctgaagattaatagtgatttcttaaatagtatccgagaagcgcaa 20797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0232 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0232
Description:

Target: scaffold0232; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 283
Target Start/End: Original strand, 566 - 824
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||| ||||| |||||||||||  | |||||||||||||    
T  566 cagaggagatggctagagctgttgaaagattatgattttggtttgaattaccatc-gggtaaagcaaatgtggttgcagatgccataagtaggaagacgt 664  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| || |||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| || || ||| |||| |||| ||| ||||||||    
T  665 tgcatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgatttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgacacctcagactgtacagttggg 764  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 283  Q
     ||| |||| || ||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||    
T  765 gatgatgaagattaat-gtgatttcttgaatagtatccgagaagcacaacaagtggatgtc 824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 20822 - 20578
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    ||||| || ||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||| |    
T  20822 cagagaaggtggttcgagctgttgaaagattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgttgatgcgttgagcaggaagacat 20723  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    |||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || |||||||| || ||| |||| |||||||| ||||||||    
T  20722 tacatatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgttagaacagtttagagacttaagccttgtttgtgagttgacacctcagagtgttcagttggg 20623  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     ||| |||  || |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  20622 gatgctgaggattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagc 20578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 23642 - 23398
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    ||||| || ||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||| |    
T  23642 cagagaaggtggttcgagctgttgaaagattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgatgatgcgttgagcaggaagacat 23543  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    |||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || |||||||| || ||| |||| |||||||| ||||||||    
T  23542 tacatatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgttagaacagtttagagacttaagccttgtttgtgagttgacacctcagagtgttcagttggg 23443  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     ||| |||  || |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  23442 gatgctgaggattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagc 23398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Original strand, 100440 - 100684
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||| ||||| || ||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  100440 cagaggagatggttagagctattgaaggactacaattttggtttgaattaccatcatggtaaagccaatgtggttgcagatgcattgagcaggaagacat 100539  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || |||||| ||||  ||||| | || |||||    
T  100540 tgcatatgtctgctttgatggtgaaggaattcgatttgctagagcagttcagagatttgagtcttgtctgtgaattgacaccttagagtattcaattggg 100639  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  100640 gatgctgaaaattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagc 100684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 95 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 181555 - 181436
Alignment:
Q  95 gttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcg 194  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| || || || ||||||||||||||||| ||||| |||||  | ||||| |    
T  181555 gttgcagatgccttgagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatggttaaagagttcgagttgcttgaacagttgagagatttgagcttagtttgtg 181456  T
Q  195 aattgtcaccccagagtgtg 214  Q
    ||| |||| | |||||||||    
T  181455 aatggtcatctcagagtgtg 181436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 270
Target Start/End: Original strand, 7023 - 7270
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |    
T  7023 cagaggagatggttagagatgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgctgatgcattgagcaggaaaacat 7122  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  | ||||| |  ||||| || ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||    
T  7123 tgcatatgtctgctttaatggtaagagaattggatttgctagaacagtttagagacctgagccttgtttgtgaattgtcacctcagagtatacagttggg 7222  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgca 270  Q
     |||||||| || || ||| | || |||||||||||| ||||||||||    
T  7223 gatgttgaagattaacagtaattttttgaatagtatccgagaagcgca 7270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 3)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 45945 - 45698
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | ||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||      
T  45945 cagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcggatgcgttaagcaggaagaccc 45846  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    |||| ||||| ||  ||||||| |  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||    
T  45845 tacatatgtctgcgttgatggtaagagaatttgatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtttgtgaattgtcacctcagagtatacagttggg 45746  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgca 270  Q
     ||| |||| || || ||| | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  45745 aatgctgaagattaacagtaatttcttgaatagtatccgagaagcgca 45698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 45 - 171
Target Start/End: Original strand, 19241 - 19367
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||||||||    
T  19241 tgaaggactatgattttgtgttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggt 19340  T
Q  145 gaaggaatttgagttgcttgaacagtt 171  Q
     || || ||  ||||||||||||||||    
T  19341 aaaagagttcaagttgcttgaacagtt 19367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 21315 - 21069
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | ||||| || || |||||||||||||| ||||| || |||||  ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |    
T  21315 cagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctagtaaagctaatgtggttgcggatgcgttgagcaggaagacct 21216  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    |||| ||||| ||  ||||||| |  ||||||||  | || |||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||             |||||    
T  21215 tacatatgtctgcgttgatggtaagagaatttgatcttctagaacagtttagagacttgagccttgtttctgagttgtcacc-------------ttggg 21129  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgt 282  Q
     ||| |||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  21128 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcgcaacaagtggatgt 21069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 270
Target Start/End: Original strand, 4330 - 4577
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | ||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |    
T  4330 cagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcggatgcgttgagcaggaagacct 4429  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    |||| ||||| ||  ||||||| || |||||||| || || ||| |||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||| | ||||||||    
T  4430 tacatatgtctgcattgatggtaaaagaatttgatttactagaatagtttagagacttgagccttgtttgtgagttgtcacctcagagtatacagttggg 4529  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgca 270  Q
     ||| ||| ||| |||||||| |||||||||| |||  ||||||||||    
T  4530 gatgctgagaattaatagtgatttcttgaataatattcgagaagcgca 4577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 44 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 13875 - 13649
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||| || |||||||| || || ||||| || || || ||||| ||||||||||    
T  13875 ttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaaactaatgttgtcgcagatgccttaagcaggaaaactttgcatatgtccgccatgatgg 13776  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | || || |||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||| ||||||||| || | || ||| | || ||| |||||||    
T  13775 taaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagatttgagtttagtctgcgaattgtcacctcagagtgtgaagctaggaatgctaaagatcgatagtga 13676  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagcgca 270  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  13675 attcttgaacagtatcaaagaagcgca 13649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 44 - 270
Target Start/End: Original strand, 218316 - 218542
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| | ||||||||||| || |||||||||||||| || |||||  | |||||||    
T  218316 ttgaaagattatgattttgggttgaactataatccaggtaaagctaattttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtccactatgatgg 218415  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | || || |||||||||||||| ||||||||||| |||||| | || | |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| | || ||  |||||||    
T  218416 taaaagagtttgagttgcttgagcagtttagagatttgagtttagtctacgaattgtcacctcagagtgtgaagttgggaatgctaaagattgatagtga 218515  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagcgca 270  Q
    ||||||||| | ||||| |||||||||    
T  218516 attcttgaacaatatcaaagaagcgca 218542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 94; Significance: 7e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 41 - 270
Target Start/End: Original strand, 15378 - 15607
Alignment:
Q  41 ttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatga 140  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || |||||  | ||||    
T  15378 ttattgaaagattatgattttgggttgaattatcatccatgtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtccactatga 15477  T
Q  141 tggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatag 240  Q
    |||| || || |||||||| ||||||| ||||||||| |||||| | |||||||| ||||| || ||||||||| ||||||| ||| | |  ||  ||||    
T  15478 tggtaaaagagtttgagttacttgaacggtttagagatttgagtttagtttgcgatttgtcccctcagagtgtgaagttgggaatgctaaggattgatag 15577  T
Q  241 tgaattcttgaatagtatcagagaagcgca 270  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  15578 tgaattcttgaacagtatcaaagaagcgca 15607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 94; Significance: 7e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 71 - 280
Target Start/End: Original strand, 39685 - 39894
Alignment:
Q  71 tatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagt 170  Q
    |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  39685 tatcatcaaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcatgaagacgttgcatatgtctgctatgatggttaaggagtttgagttgcttgaacaat 39784  T
Q  171 ttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgca 270  Q
    |||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||| || |||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||| ||||||| |||||| ||    
T  39785 ttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcgcctcagagtatgaagttgggtatgttgaagatcaacaatgagttcttgaacagtatcaaagaagcaca 39884  T
Q  271 acaggttgat 280  Q
    | | ||||||    
T  39885 aaaagttgat 39894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Original strand, 6116 - 6360
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||    
T  6116 cagagaagatggttagagatgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaatgt 6215  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  | |||||||| |||||| | ||| | || |||||||||||||| || ||||| || |||||| |||| | |||||| ||||||||    
T  6216 tgcatatgtctgctttaatggtgaaagaattttatttgttagagcagtttagagacttaagccttgtatgtgaattgacacctctgagtgtacagttggg 6315  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     ||| |||| || || ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  6316 gatgctgaagattaacagtgatttcttgaatagtatccgagaagc 6360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 270
Target Start/End: Original strand, 5214 - 5461
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||||||  | ||||| || || |||||||||||||| ||| | || ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |    
T  5214 cagaggagatgacttgagttgttaaaagattatgattttggtttggattaccatcttggtaaagccaatgtagttgcggatgcgttgaggaggaagacct 5313  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    |||| ||||| ||   ||||||    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||    
T  5314 tacatatgtctgcgtagatggtatgagaatttgatttgctagaacagtttagagacttgagtcttgtttgtgaattgtcacctcagagtatacagttggg 5413  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgca 270  Q
     ||| |||| || || ||| | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  5414 gatgctgaagattaacagtaatttcttgaatagtatccgagaagcgca 5461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 282
Target Start/End: Original strand, 13177 - 13436
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||| ||||| || ||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||     
T  13177 cagaggagatggttagagctgttgaaggactacgattttggtttgaattaccatcctgataaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaacgc 13276  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||  ||  | |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| ||||  ||||||| ||||||||    
T  13277 tgcatatgtttgctttaatggtgaaagaattcgatttgctagaacaatttagagacttgagccttgtctgtgaattgacaccttagagtgttcagttggg 13376  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgt 282  Q
     ||| ||||||| || ||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||    
T  13377 gatgctgaaaattaaaagtaatttcttgaatagtatccgagaagcacaacaagtggatgt 13436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 41 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 5281 - 5052
Alignment:
Q  41 ttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatga 140  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || |||||  | ||||    
T  5281 ttattgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaagtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtccactatga 5182  T
Q  141 tggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatag 240  Q
    |||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||| |||||| | || |||||||||||||| ||||||||| || |||| ||| |||| ||  ||||    
T  5181 tggtaaaaaagtttgagttgcttgaacaatttagagatttgagtttagtctgcgaattgtcacctcagagtgtgaagctgggaatgatgaagattgatag 5082  T
Q  241 tgaattcttgaatagtatcagagaagcgca 270  Q
    ||||||  |||| ||||| | |||||||||    
T  5081 tgaatttctgaaaagtattaaagaagcgca 5052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 41 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 12411 - 12182
Alignment:
Q  41 ttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatga 140  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || |||||  | ||||    
T  12411 ttattgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaagtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtccactatga 12312  T
Q  141 tggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatag 240  Q
    |||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||| |||||| | || |||||||||||||| ||||||||| || |||| ||| |||| ||  ||||    
T  12311 tggtaaaaaagtttgagttgcttgaacaatttagagatttgagtttagtctgcgaattgtcacctcagagtgtgaagctgggaatgatgaagattgatag 12212  T
Q  241 tgaattcttgaatagtatcagagaagcgca 270  Q
    ||||||  |||| ||||| | |||||||||    
T  12211 tgaatttctgaaaagtattaaagaagcgca 12182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 109058 - 108857
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| | ||| | |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  109058 cagagaagatggcttgagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaacatccgggtaaagctaatgtggttgtagatgctttgagcaggaagacgt 108959  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| || |||||||| || || |||||||| || ||  |||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| || ||||||||    
T  108958 tgcacatgtctgctatgatggtaaatgattttgagtttctagattagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgtcacctcagagcgtacagttggg 108859  T
Q  223 ta 224  Q
    ||    
T  108858 ta 108857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 44 - 183
Target Start/End: Original strand, 62930 - 63069
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||    
T  62930 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctactgttgttgcagatgtcttgagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatgg 63029  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgag 183  Q
    | || |  || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  63030 ttaaagtgttcgagttgcttgaacagtttagagatttgag 63069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 89; Significance: 6e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 231
Target Start/End: Original strand, 12405 - 12613
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||     
T  12405 cagaggagatggttagaactgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaagacgc 12504  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||    |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| |||||| | ||||||||    
T  12505 tgcatatgtctgcttgaatggtgaaagaattcgatttgctagaacagtttagagacttgagtcttgtctgtgaattgacacctcagagtattcagttggg 12604  T
Q  223 tatgttgaa 231  Q
     ||| ||||    
T  12605 gatgctgaa 12613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 44 - 184
Target Start/End: Original strand, 31652 - 31792
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||||||| | || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| || |||||||    
T  31652 ttgaaagattatgattttagtttaaactatcatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatgg 31751  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagt 184  Q
    | || || || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31752 taaaagagttcgagttgcttgaacagtttagagatttgagt 31792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Original strand, 16876 - 17114
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||  |||| ||||| || |||||||    
T  16876 ttgaaagattatgattttgagttgaattatcaaccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactctacatatgtccgctatgatgg 16975  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  | || || ||| ||||||| ||||||||| |||| || ||| |||| ||  ||| |||    
T  16976 tcaaggaatttgagttacttgaacagtttagagatttgagcttagtctgtgaagtgtcacctcagagtgtgaagttaggaatgctgaagattgataatga 17075  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgt 282  Q
    ||||||||| | ||| | |||||||||| | ||||||||    
T  17076 attcttgaacaatattaaagaagcgcaaaaagttgatgt 17114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 44 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 16284 - 16082
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||| || |||||||    
T  16284 ttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctgctatgatgg 16185  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | ||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||| | || ||||| |||||||| ||||||||  || |||| ||| |||| ||  |||||||    
T  16184 ttaaggagtttgagctgcttgaacagtttagagatttgagtttagtctgcgagttgtcacctcagagtgtaaagctgggaatgctgaagattgatagtga 16085  T
Q  244 att 246  Q
    |||    
T  16084 att 16082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 53 - 184
Target Start/End: Original strand, 112396 - 112527
Alignment:
Q  53 tatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaat 152  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| || || |||||| |||||||||| || || |    
T  112396 tatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgtagcagatgctttaagtaggaagacattgcatatgtcgaccatgatggtaaaagagt 112495  T
Q  153 ttgagttgcttgaacagtttagagacttgagt 184  Q
    | |||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  112496 tcgagttgttggaacagtttagagatttgagt 112527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 44 - 270
Target Start/End: Original strand, 23978 - 24197
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||       |||||||||||||||| || ||||| || |||||||    
T  23978 ttgaaggactatgattttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgca-------tgagtaggaagacgttgcatatgtctgctatgatgg 24070  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||  || ||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  24071 ttaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtctagtttgtgagatgtagcctcagagtgtgaagttgagtatgttgaagatcaacagtga 24170  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagcgca 270  Q
     |||||||| | ||| | |||||||||    
T  24171 gttcttgaacaatattaaagaagcgca 24197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 20 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 8828 - 8588
Alignment:
Q  20 agacagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaaga 119  Q
    |||||||| |||||| | || || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  8828 agacagagaagatggcttgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaaga 8729  T
Q  120 cgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagtt 219  Q
    | || || ||||| || ||||||||||  || || ||||| ||||||||||| |||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||||||| |  |    
T  8728 cattgcatatgtccgctatgatggtgagagagttcgagttacttgaacagttcagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaact 8629  T
Q  220 gggtatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatca 260  Q
    ||||||| |||| ||  ||||||||||  |||| |||||||    
T  8628 gggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaaaagtatca 8588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1715 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold1715
Description:

Target: scaffold1715; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 390 - 142
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |    
T  390 cagaggaggtggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgcattgagcaggaaaacat 291  T
Q  123 tacacat----gtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagt 218  Q
    | || ||    ||| ||  |||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||| | ||||    
T  290 tgcatatatatgtctgctttgatggtgaaggaattcgaattgctataacagtttagagacttgagtcttgtctgtgaactgtcacctcagagtatacagt 191  T
Q  219 tgggtatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
    |||| ||| |||| ||  || |||| |||||||| |||||| |||||||    
T  190 tggggatgctgaagatttattgtgatttcttgaacagtatccgagaagc 142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 44 - 270
Target Start/End: Original strand, 23084 - 23310
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||||||| || |||||||| |  ||||| |||||  | |||||||    
T  23084 ttgaaagactatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagttaatgtggttgcagatgccttaagtaggaaaattttacatatgtctcctatgatgg 23183  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | || || || ||| |||| ||| |||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||    
T  23184 ttaaagagttggagctgctcgaatagtttagacacttgagtttagtttgtgaattgtcacctcagagtgtgaagttgggaatgttgaagattaatagtga 23283  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagcgca 270  Q
    ||| || |||||||| | |||||||||    
T  23284 attttttaatagtattaaagaagcgca 23310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 44 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 8346 - 8130
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || |||||||    
T  8346 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 8247  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | |  || || || ||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||||||| |  |||||||| |||| ||  |||||||    
T  8246 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtga 8147  T
Q  244 attcttgaatagtatca 260  Q
    |||| |||| |||||||    
T  8146 attcctgaaaagtatca 8130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 62 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 5420 - 5212
Alignment:
Q  62 gggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgc 161  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| ||| | ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |  || ||||||||||    
T  5420 gggttgaattatcatccaggtaaagctaattttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttacatatgtccgctatgatggtaagagagtttgagttgc 5321  T
Q  162 ttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcag 261  Q
    ||||||||||||| || |||||| | || || ||||||||||| ||||||||| || || | ||| | || ||  |||||||||||||||| |||||||     
T  5320 ttgaacagtttagggatttgagtttagtctgtgaattgtcacctcagagtgtgaagctgagaatgctaaagattgatagtgaattcttgaacagtatcaa 5221  T
Q  262 agaagcgca 270  Q
    |||||||||    
T  5220 agaagcgca 5212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 24 - 264
Target Start/End: Original strand, 32198 - 32438
Alignment:
Q  24 agaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgtt 123  Q
    |||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||| || ||||  |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || || ||    
T  32198 agagaagatggttagagctgctgaaggattatgattttggcttgaattaccatcttggtaaagccaatgtggttgctgatgcgttgagcagcaaaacatt 32297  T
Q  124 acacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggt 223  Q
    ||| ||||| ||  |||||||||||||||| || ||| | ||| ||| |||||||||||| |||||||| || ||| |||| |||||||| ||||||||     
T  32298 acatatgtctgctttgatggtgaaggaattcgaattgttagaatagtctagagacttgagccttgtttgtgagttgacacctcagagtgttcagttgggg 32397  T
Q  224 atgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagaga 264  Q
    ||||||   || |||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  32398 atgttgcggattaatagtgatttcttgaacagtatccgaga 32438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0697 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0697
Description:

Target: scaffold0697; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 53 - 184
Target Start/End: Original strand, 7561 - 7692
Alignment:
Q  53 tatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaat 152  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || || |    
T  7561 tatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagacattgcatatgtcggccatgatggtaaaagagt 7660  T
Q  153 ttgagttgcttgaacagtttagagacttgagt 184  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  7661 tcgagttgcttgaacagttcagagatttgagt 7692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 79; Significance: 6e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 44 - 270
Target Start/End: Original strand, 6790 - 7016
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||  |||| ||||| || ||||||     
T  6790 ttgaaagactatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcattaagtaggaagactctacatatgtccgctatgatga 6889  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | || || || ||| |||||||||||||||||||||||||  | || |||||| |||||||  |||||||| |||| || ||| |||| ||   ||||||    
T  6890 tcaaagagttggagctgcttgaacagtttagagacttgagcttagtctgcgaagtgtcaccttagagtgtgaagttaggaatgatgaagattgttagtga 6989  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagcgca 270  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||    
T  6990 attcttgaacagtattaaagaagcgca 7016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0319
Description:

Target: scaffold0319; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 45 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 172 - 15
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||||||||    
T  172 tgaaggactatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggt 73  T
Q  145 gaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtca 202  Q
     ||||| || |||||||||||| |||| ||||| |||||| | ||||| ||| |||||    
T  72 aaaggagttcgagttgcttgaatagttcagagatttgagtttagtttgtgaaatgtca 15  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 45 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 2675 - 2518
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||||||||    
T  2675 tgaatgattttgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggt 2576  T
Q  145 gaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtca 202  Q
     ||||| || |||||||||||| |||| ||||| |||||| | ||||| ||| |||||    
T  2575 aaaggagttcgagttgcttgaatagttcagagatttgagtttagtttgtgaaatgtca 2518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 77; Significance: 9e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 44 - 260
Target Start/End: Original strand, 29470 - 29686
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||    
T  29470 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatgg 29569  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | || || || ||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||| || | |||| | ||||||||| |  |||  ||| |||| ||  |||||||    
T  29570 ttaaagagttcgagttgcttgaacagtttagagatttgagcttagtttgtgagtggtcatctcagagtgtgaaactggaaatgctgaagattgatagtga 29669  T
Q  244 attcttgaatagtatca 260  Q
    ||| ||||| |||||||    
T  29670 atttttgaaaagtatca 29686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 77; Significance: 9e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 28361 - 28117
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || ||||  ||||| |||||||| ||||  ||||| ||||| ||||| || |    
T  28361 cagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcatggtaaggccaatgtggttgttgatgcattgagcaggaaaacat 28262  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  | |||||||| |||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| | ||||||||    
T  28261 tgcatatgtctgctttaatggtgaaagaatttgaattgttagaaaagtttagagacttgagtcttgtctgtgaattgtcacctcagagtatacagttggg 28162  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     ||| |||||||  ||||| | |||||| | | |||| |||||||    
T  28161 gatgctgaaaattgatagtaatttcttggacaatatccgagaagc 28117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 44 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 2315 - 2092
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| || |||||||    
T  2315 ttgaaagattatgatttcgggctgaattatcatccaggtaaagctaatgttcttgcagatgctttaagtaggaaaactttacatatgtctgctatgatgg 2216  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | ||  | || ||| |||  ||||||||||  ||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||| || ||||||||    
T  2215 ttaaaaagttggagctgcacgaacagtttattgacctgagttttgtttgtgaattgtcacctcagagtgtcaagttgggaatgttgaagattaatagtga 2116  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
    ||| ||||| ||||| | ||||||    
T  2115 atttttgaacagtattaaagaagc 2092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 117
Target Start/End: Original strand, 8567 - 8631
Alignment:
Q  53 tatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaa 117  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  8567 tatgattttgagttgagctatcattcgggtaaagctaatgttgttgcaaatgctttgagtaggaa 8631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 44 - 271
Target Start/End: Original strand, 9915 - 10142
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||  || |||||||| ||  |||| ||||| || ||||||     
T  9915 ttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtatagccaatgttgttgcagatgaattaagtaggaaaactctacatatgtccgctatgatga 10014  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 243  Q
    | || ||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||| | || || ||| |||||||| |||||||| |||| || ||| |||| ||  |||||||    
T  10015 tcaaagaattggagctgcttgaacagttttgagatttgagtttagtctgtgaagtgtcaccctagagtgtgaagttaggaatgctgaagattgatagtga 10114  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagcgcaa 271  Q
    |||  |||||||||| | ||||||||||    
T  10115 atttctgaatagtattaaagaagcgcaa 10142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 44 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 10376 - 10206
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  10376 ttgaaagattatgattttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagactttacatatgtctgctatgatgg 10277  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtg 214  Q
    | ||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||| | || || ||  ||||||| |||||||||    
T  10276 ttaaggagttcgagttgcttgaacaatttagagatttgagtttagtctgtgaggtgtcacctcagagtgtg 10206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 45 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 7778 - 7640
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||||||||    
T  7778 tgaaagattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggt 7679  T
Q  145 gaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgag 183  Q
     || || || ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  7678 aaaagagttcgagttgcttgaacagttcagagatttgag 7640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 198 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 4044 - 3959
Alignment:
Q  198 tgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 283  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||    
T  4044 tgtcacctcagagtgtacaattgggtatgttgaagattaatagcgatttcttgaatagtatccgagaagcgcagcaagtggatgtc 3959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 45 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 7455 - 7317
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||||||||    
T  7455 tgaaggattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggt 7356  T
Q  145 gaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgag 183  Q
     || || || |||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  7355 aaaagagttcgagttgcttgaatagttcagagatttgag 7317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 70 - 184
Target Start/End: Original strand, 3534 - 3648
Alignment:
Q  70 ctatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacag 169  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||| | ||||||    
T  3534 ctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagactttgcatatgtccgctatgatggtaaaggagtttgaattgttagaacag 3633  T
Q  170 tttagagacttgagt 184  Q
    || ||||| ||||||    
T  3634 ttcagagatttgagt 3648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 44 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 17061 - 16903
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  17061 ttgaaagattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgtagcagatgctttgagtaggaagacattgcatatgtcggccatgatgg 16962  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtca 202  Q
    | || || ||||| ||  | |||||||||||||| |||||  | ||||||||| |||||    
T  16961 taaaagagtttgaattattggaacagtttagagatttgaggttagtttgcgaaatgtca 16903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 45 - 183
Target Start/End: Original strand, 14111 - 14249
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  | || ||||| || ||||||||    
T  14111 tgaaggattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccatgcatatgtctgctatgatggt 14210  T
Q  145 gaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgag 183  Q
     || || || ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  14211 aaaagagttcgagttgcttgaacagttcagagatttgag 14249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 237
Target Start/End: Original strand, 85421 - 85611
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 146  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||  | |||||  ||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| || |||||||| |    
T  85421 aaggattatgatttcgggttgaattaccatccgggtaagactaatgttattgcagatgctttaagtaggaaaacattacatatgtctgctatgatggtta 85520  T
Q  147 aggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaa 237  Q
      || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||| || ||||||||| | || || |||||||| |||||    
T  85521 gagagtttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtttggtttgtgaagtgtcgccgcagagtgtgaaattaggaatgttgaagatcaa 85611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 3)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 45 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 50838 - 50601
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||    
T  50838 tgaaggactacgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagactttgcacatgtccgctatgatggt 50739  T
Q  145 gaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtgaa 244  Q
     ||||| || ||||||||||||||||| | ||| |||||  | ||||| ||  ||||| |  |||||||| || | |||||| |||| ||  |||||| |    
T  50738 aaaggagttcgagttgcttgaacagttcaaagatttgagcttagtttgtgagatgtcatctaagagtgtgaagctaggtatgctgaagattgatagtgta 50639  T
Q  245 ttcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgt 282  Q
    ||  |||| ||||| | |||||||||| | ||||||||    
T  50638 tttctgaagagtattaaagaagcgcaaaaagttgatgt 50601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 45 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 20008 - 19876
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||| || || ||||| || ||||||||    
T  20008 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgtagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggt 19909  T
Q  145 gaaggaatttgagttgcttgaacagtttagaga 177  Q
     |  || || |||||||||||||||||||||||    
T  19908 tagagagttcgagttgcttgaacagtttagaga 19876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 45 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 35432 - 35300
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||| || || ||||| || ||||||||    
T  35432 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgtagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggt 35333  T
Q  145 gaaggaatttgagttgcttgaacagtttagaga 177  Q
     |  || || |||||||||||||||||||||||    
T  35332 tagagagttcgagttgcttgaacagtttagaga 35300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Original strand, 80710 - 80954
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | ||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||      
T  80710 cagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgctgatgcgttgagcaggaagacac 80809  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    |||| ||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| || || || ||||  || || ||  |  |||||||    
T  80810 tacatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgatttgctggaacagtttagagacatgagtctggtatgtgagttgtagcctcaaagaataaagttggg 80909  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     ||| |||| || |||||||| ||||||  ||||||| |||||||    
T  80910 catgctgaagattaatagtgatttcttgggtagtatccgagaagc 80954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 72; Significance: 9e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 45 - 184
Target Start/End: Original strand, 7231 - 7370
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||  |||| || ||||||||    
T  7231 tgaaggattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagacgctttgagtaggaagaccttgcatttgtctgctatgatggt 7330  T
Q  145 gaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagt 184  Q
     || || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  7331 aaaagagttcgagttgcttgaacagttcagagatttgagt 7370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 72; Significance: 9e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 45 - 184
Target Start/End: Original strand, 25845 - 25983
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  25845 tgaaggatta-gattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagacattgcatatgtcggccatgatggt 25943  T
Q  145 gaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagt 184  Q
     || || || |||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  25944 aaaagagttcgagttgttggaacagtttagagatttgagt 25983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 44 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 102640 - 102470
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||| || || ||| | ||||||||||    
T  102640 ttgaaagattatgattttggtttgaactatcatccaggtaaagctaattttgttgcagatgcattgagtaggaagactttgcatatgcccgccatgatgg 102541  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtg 214  Q
    | || || || ||||||||||||||||||| ||| |||||  | || || ||||||||| | |||||||||    
T  102540 taaaagagttcgagttgcttgaacagtttatagatttgagcttagtctgtgaattgtcatctcagagtgtg 102470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0742 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0742
Description:

Target: scaffold0742; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 6641 - 6397
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | ||| | || || |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||      
T  6641 cagaggagatggcttgaggttttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagctaacgtagttgctgatgcattgagcaggaagacac 6542  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||  || |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| || || || ||||| || |||||  | ||||||||    
T  6541 ttcatatgtatgctatgatggtaaaagaatttgatttgctggaacagtttagagacatgagtctggtatgtgagttgtcgcctcagagcatacagttggg 6442  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     ||| |||| || |||||||| ||||||  ||||||| |||||||    
T  6441 catgctgaagattaatagtgatttcttgggtagtatccgagaagc 6397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 41 - 213
Target Start/End: Original strand, 277726 - 277898
Alignment:
Q  41 ttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatga 140  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || ||||    
T  277726 ttattgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatga 277825  T
Q  141 tggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgt 213  Q
    |||| |  || || ||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||| || | |||||| ||||||||    
T  277826 tggttagagagttcgagttacttgaacagtttagagacatgagtttggtttgtgagtggtcacctcagagtgt 277898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 24 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 261735 - 261492
Alignment:
Q  24 agaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgtt 123  Q
    ||||||||||| | ||||| || || |||||||||||| | ||||| || ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||  |    
T  261735 agaggagatggcttgagttgttaaaagattatgatttttgtttgaattaccatccaggtaaagctaacgtagttgctgatgcgttgagcaggaagacact 261636  T
Q  124 acacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggt 223  Q
     || ||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||| || || || |||||  | |||||| | ||||||||     
T  261635 gcatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgatttgctggaacagtttagggacatgagtctggtatgtgagttgtcgactcagagtatacagttgggc 261536  T
Q  224 atgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
    ||| |||| || |||||||| ||||||  ||||||| |||||||    
T  261535 atgctgaagattaatagtgatttcttgggtagtatccgagaagc 261492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 50 - 177
Target Start/End: Original strand, 38853 - 38980
Alignment:
Q  50 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 149  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||  | ||||| || |||||||| ||||    
T  38853 gattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagacgctttgagtaggaagaccttggatatgtctgctatgatggtaaagg 38952  T
Q  150 aatttgagttgcttgaacagtttagaga 177  Q
    | || ||||||||||||||||| |||||    
T  38953 agttcgagttgcttgaacagttcagaga 38980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 67; Significance: 8e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 24 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 35540 - 35422
Alignment:
Q  24 agaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgtt 123  Q
    |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  35540 agagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagatgtt 35441  T
Q  124 acacatgtcggccatgatg 142  Q
     |||||||| || ||||||    
T  35440 gcacatgtctgctatgatg 35422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 149 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 28527 - 28393
Alignment:
Q  149 gaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtgaattct 248  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| || || ||| |||| |||||||| |||||||| ||| |||| || |||||||| ||||    
T  28527 gaatttgatttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgacacctcagagtgtacagttggggatgctgaagattaatagtgatttct 28428  T
Q  249 tgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 283  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||    
T  28427 tgaatagtatccgagaagcacaacaagtggatgtc 28393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 45 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 8772 - 8547
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || ||||||||    
T  8772 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggt 8673  T
Q  145 gaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtgaa 244  Q
     |  || || || || |||||||||||||||||  ||||| | |||||||||| ||||||  |||||||| |  |||||||| |||| ||  ||||||||    
T  8672 cagagagttcgaattacttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcaccttagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaa 8573  T
Q  245 ttcttgaatagtatcagagaagcgca 270  Q
     |  |||| |||||||  ||||||||    
T  8572 attctgaaaagtatcaaggaagcgca 8547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 53 - 214
Target Start/End: Original strand, 7995 - 8156
Alignment:
Q  53 tatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaat 152  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| || || || ||||||||||||||||| |  || |    
T  7995 tatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaaaacattgcatatgtcggccatgatggtaagagagt 8094  T
Q  153 ttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtg 214  Q
    | |||||| |||||||||||||||| |||||| | || || ||||||||| | |||||||||    
T  8095 tcgagttgtttgaacagtttagagatttgagtttagtatgtgaattgtcatctcagagtgtg 8156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1373 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold1373
Description:

Target: scaffold1373; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 211
Target Start/End: Original strand, 1712 - 1900
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |    
T  1712 cagaggagatggttatagttactgaaggattacgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgcattgagcaggaaaacat 1811  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagt 211  Q
    | || ||||| ||  | ||| | || ||||| || ||| | |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||    
T  1812 tgcatatgtctgctttaatgataaaagaattcgaattgttagaacagtttagagacttgagtcttgtctgtgaactgtcacctcagagt 1900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 45 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 2842 - 2703
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  2842 tgaaggactatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagttaatgttgttgcggatgctttgagtaggaagactttacatatgtctgctatgatggt 2743  T
Q  145 gaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagt 184  Q
     ||||| || ||||| ||||||||||| | ||| ||||||    
T  2742 aaaggagttcgagttacttgaacagttcaaagatttgagt 2703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0501 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0501
Description:

Target: scaffold0501; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 51 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 3594 - 3431
Alignment:
Q  51 attatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagga 150  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||| || ||||| || |||||||| || ||    
T  3594 attatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttacagatgcctcgagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatggttaaaga 3495  T
Q  151 atttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtg 214  Q
     || ||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||| || |||||| | |||||||||    
T  3494 gttcgagttgcttgaacagtttagagatttgagcttagtttgtgagttgtcatctcagagtgtg 3431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 182
Target Start/End: Original strand, 14178 - 14336
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| || || | |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14178 cagagaagatggctacagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccag-taaagacaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgt 14276  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttga 182  Q
    | || ||||| ||  ||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  14277 tgcatatgtctgctctgatggtaaaagaatttgagttgctagaccattttagagacttga 14336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 182
Target Start/End: Original strand, 22357 - 22515
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| || || | |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22357 cagagaagatggctacagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccag-taaagacaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgt 22455  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttga 182  Q
    | || ||||| ||  ||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  22456 tgcatatgtctgctctgatggtaaaagaatttgagttgctagaccattttagagacttga 22515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 44 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 24874 - 24735
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||| ||  ||||||    
T  24874 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttaagtaggaagactctacatatgtccgctttgatgg 24775  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgag 183  Q
    | || || || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24774 ttaaagagttcgagttgcttgaacagtttagagatttgag 24735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 62; Significance: 8e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 45 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 2299 - 2130
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  2299 tgaaagattatgattttgagttgagctatcatctaggtaaagctaatgttgtagcagatgctttgagtaggaagacattgcatatgtcggccatgatggt 2200  T
Q  145 gaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtg 214  Q
     || || ||||| ||| | |||| ||| |||||  ||||| | || || ||||||||| | |||||||||    
T  2199 aaaagagtttgaattgttggaacggttgagagatatgagtttagtatgtgaattgtcatctcagagtgtg 2130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 70 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 6602 - 6470
Alignment:
Q  70 ctatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacag 169  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  6602 ctatcattcgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtatgaagactttgcatatgtccgctatgatggtaaaggagttcgagttgcttgaacag 6503  T
Q  170 tttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtca 202  Q
    || ||||| |||||| | ||||| ||| |||||    
T  6502 ttcagagatttgagtttagtttgtgaaatgtca 6470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 45 - 267
Target Start/End: Original strand, 4253 - 4475
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||  | ||||| ||  |||||||    
T  4253 tgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgaatatgtccgctttgatggt 4352  T
Q  145 gaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtgaa 244  Q
     |  || || ||||||||| |||||||||||||  ||||  | ||||| || | |||||| ||||||||| || |||| ||| |||| ||  ||||||||    
T  4353 tagagagttcgagttgcttaaacagtttagagatatgagcttagtttgtgagtggtcacctcagagtgtgaagctgggaatgctgaagattgatagtgaa 4452  T
Q  245 ttcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
    ||  | || ||||||| ||||||    
T  4453 tttctaaagagtatcaaagaagc 4475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 41 - 283
Target Start/End: Original strand, 79390 - 79632
Alignment:
Q  41 ttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatga 140  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||||    
T  79390 ttattgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtagaaagacattgcatatgtccgccatga 79489  T
Q  141 tggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatag 240  Q
    |||| |  || || ||||| ||||| |||||||||||  ||||  | ||||| || | |||||| ||||||||| |  | || |||||||| ||  ||||    
T  79490 tggttagagagttcgagttacttgagcagtttagagatatgagcttagtttgtgagtggtcacctcagagtgtgaaactaggaatgttgaagattgatag 79589  T
Q  241 tgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 283  Q
    ||||||  |||| ||||| | ||| || ||| | |||||||||    
T  79590 tgaatttctgaagagtattaaagaggcacaaaaagttgatgtc 79632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 50 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 39958 - 39825
Alignment:
Q  50 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 149  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||  || ||||| ||||||| || || ||||| || |||||||| ||||    
T  39958 gattatgattttgagttgagctatcatccggttaaagctaatgttgttgcagacactctgagtgggaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaagg 39859  T
Q  150 aatttgagttgcttgaacagtttagagacttgag 183  Q
    | || ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  39858 agttcgagttgcttgaacagttcagagatttgag 39825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Original strand, 11664 - 11908
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | ||||| || || |||||||||||||| ||||| || |||||  ||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||      
T  11664 cagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctagtaaagctaacgtagttgctgatgcattgagcaggaagacac 11763  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| || |||||||| || ||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||| | || || ||  |||| || |||||  | | ||||||    
T  11764 tgcatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgatatgctggaacagtttagagacatgagtgtggtatgtgagctgtcgcctcagagcatacggttggg 11863  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     ||| |||| || |||||||| ||||||  ||||||| |||||||    
T  11864 catgctgaagattaatagtgatttcttgggtagtatccgagaagc 11908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 4519 - 4359
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||| ||||| ||||| ||| | || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  4519 ttgaaagattatgattttgggttgaattatcaaacggttaaagctaatgttgttgcggataccttaagtaggaagactttacatatgtctgctatgatgg 4420  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcacc 204  Q
    | ||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||  | || ||||| ||||||||    
T  4419 ttaaggagtttgagtttcttgaacaatttagggatttgagcttagtctgcgagttgtcacc 4359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 44 - 219
Target Start/End: Original strand, 115804 - 115979
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || || |||||||||||||| |||||||| ||  |||| ||||| || ||||||     
T  115804 ttgaaagattatgattttggattgaattatcatccaggtaaggctaacgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactctacatatgtccgctatgatga 115903  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagtt 219  Q
    | || ||  | ||| |||| ||||||||||||||| ||||| | || || ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  115904 tcaaagagctggagctgctcgaacagtttagagacctgagtttagtctgtgaattgtcacctcagagtgtgaagtt 115979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 4)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 80 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 131477 - 131374
Alignment:
Q  80 ggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagact 179  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || || || ||||||||||||||||| ||||| |    
T  131477 ggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgccatgatggtaaaagagttcgagttgcttgaacagttcagagatt 131378  T
Q  180 tgag 183  Q
    ||||    
T  131377 tgag 131374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Original strand, 3355 - 3509
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| ||||| |||||| | || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| || || || |||||  | |||||||    
T  3355 ttgaaagattacgattttagtttaaactatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaaaactttgcatatgtcttctatgatgg 3454  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaatt 198  Q
    | || || ||| | |||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||    
T  3455 ttaaagagttttaattgcttgaacagtttagagatttgagtttagtctgcgaatt 3509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 45 - 176
Target Start/End: Original strand, 28268 - 28399
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    ||||||||||||| ||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| | |||||| ||||||| || || ||||| || ||||||||    
T  28268 tgaaggattatgactttggtttcaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagattccttgagttggaagacattgcatatgtccgctatgatggt 28367  T
Q  145 gaaggaatttgagttgcttgaacagtttagag 176  Q
     |  || ||  |||| ||||||||||||||||    
T  28368 tagagagttctagtttcttgaacagtttagag 28399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 47 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 60157 - 59946
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 146  Q
    |||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |  ||||| |||||||||||||| | |||||| || ||||| ||||  |  |||||||| |    
T  60157 aaggattatgatttcggattgaattaccatccgggtaagggtaatgttgttgcagatgctttaaataggaaaacattacatatgtttgatatgatggtta 60058  T
Q  147 aggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtgaatt 246  Q
      || || |||||||||||||| || | ||| |||||| | ||||| ||| |||| ||  |||||||| | || || ||| |||| ||||| | ||||||    
T  60057 --gagttggagttgcttgaacaattcaaagatttgagtttggtttgtgaagtgtcgccgtagagtgtgaaattaggaatgctgaagatcaacaatgaatt 59960  T
Q  247 cttgaatagtatca 260  Q
      ||||||||||||    
T  59959 tctgaatagtatca 59946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 44 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 26381 - 26211
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || |||||||    
T  26381 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 26282  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtg 214  Q
    | |  || || ||||| ||| | |||||||||||  ||||| ||||||| || | |||||| |||| ||||    
T  26281 ttagagagttcgagttactttatcagtttagagatatgagttttgtttgtgattggtcacctcagattgtg 26211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 96592 - 96414
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | ||| | || || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||      
T  96592 cagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggaaaagctaatgtagtcgctgatgcattgagcaggaagacac 96493  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtc 201  Q
    | || ||||| || |||||| | || |||||||| || || ||||||||||||||| ||||| | ||||| || |||||    
T  96492 tgcatatgtctgctatgatgataaaagaatttgattttctggaacagtttagagacatgagtttggtttgtgagttgtc 96414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 45 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 1824 - 1655
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||  |||||||    
T  1824 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgttgatgccttgagcaggaagacattgcatatgtccgctttgatggt 1725  T
Q  145 gaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtg 214  Q
     |  || |||||||| ||||||||||| ||||| |||||| | ||||| |||| |||||| |||||||||    
T  1724 tagagagtttgagttacttgaacagttcagagatttgagtttagtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 1655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 45 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 15564 - 15395
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||  |||||||    
T  15564 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgttgatgccttgagcaggaagacattgcatatgtccgctttgatggt 15465  T
Q  145 gaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtg 214  Q
     |  || |||||||| ||||||||||| ||||| |||||| | ||||| |||| |||||| |||||||||    
T  15464 tagagagtttgagttacttgaacagttcagagatttgagtttagtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 15395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1602 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold1602
Description:

Target: scaffold1602; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 184
Target Start/End: Original strand, 966 - 1106
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| || |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||| | || |||||||| |||| ||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  966 ttgaaagactatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatcttgtagcagatgccttgaataggaagacattgcatatgtcggccatgatgg 1065  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagt 184  Q
    | || || || || ||| | |||||||||||||| ||||||    
T  1066 taaaagagttcgaattgttcgaacagtttagagatttgagt 1106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 23 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 7442 - 7182
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||| ||| | || || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  7442 cagaggaggtggcttgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtagtaagacat 7343  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || |||||  | |||||||| |  || || ||||| ||||| |||||||||||  ||||  | ||||| || | |||||| |||||| || |  ||||    
T  7342 tgcatatgtcctctatgatggttagagagttcgagttacttgatcagtttagagatatgagcttagtttgtgagtggtcacctcagagtctgaaactggg 7243  T
Q  223 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 283  Q
     ||| |||| ||  |||||||||| ||||| ||||| | ||| || ||| | |||||||||    
T  7242 aatgctgaagattgatagtgaatttttgaaaagtattaaagaggcacaaaaagttgatgtc 7182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 45 - 177
Target Start/End: Original strand, 38720 - 38852
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||| || || ||||| ||  |||||||    
T  38720 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgtgtaggaagacattgcatatgtccgctttgatggt 38819  T
Q  145 gaaggaatttgagttgcttgaacagtttagaga 177  Q
     |  || || |||||||||||||||||||||||    
T  38820 tagagagttcgagttgcttgaacagtttagaga 38852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 20 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 66836 - 66596
Alignment:
Q  20 agacagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaaga 119  Q
    |||||| | |||||| |||||||  |||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||    
T  66836 agacagcgtagatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaattaccatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaagaaga 66737  T
Q  120 cgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagtt 219  Q
    | || || ||||| ||  ||||||| |  || || ||||| ||| ||||||| ||||| |||||| | ||||| |||| ||||||  |||| ||| || |    
T  66736 cattgcatatgtccgctttgatggtcagagagttcgagttacttaaacagttcagagatttgagtttagtttgtgaatggtcaccttagagagtgaagct 66637  T
Q  220 gggtatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatca 260  Q
    ||| ||| |||| ||  ||||||||||  |||| |||||||    
T  66636 gggaatgctgaagattgatagtgaatttctgaagagtatca 66596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 29 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 57439 - 57259
Alignment:
Q  29 agatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacaca 128  Q
    |||||| |||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||| || || |    
T  57439 agatggctagaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgtagatgctttgagcaggaagacattgcata 57340  T
Q  129 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccaga 209  Q
    |||| ||  | ||||| |  || || ||||| ||||||||||| ||||| |||||| | ||||| |||| |||||| ||||    
T  57339 tgtccgcttttatggtcagagagttcgagtttcttgaacagttcagagatttgagtttggtttgtgaatggtcacctcaga 57259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 44 - 231
Target Start/End: Original strand, 196377 - 196564
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || |||||||||||||| || || ||||| ||  ||||||    
T  196377 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgtcgcggacgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctttgatgg 196476  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaa 231  Q
    | |  || || |||||||||||||| ||||||||  ||||| | ||||| || | |||||| ||||||||| |  |||| ||||||||    
T  196477 ttagagagttcgagttgcttgaacaatttagagatatgagtttagtttgtgagtggtcacctcagagtgtgaaactgggaatgttgaa 196564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 45 - 117
Target Start/End: Original strand, 18967 - 19039
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaa 117  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  18967 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagcaggaa 19039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 219
Target Start/End: Original strand, 13980 - 14155
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||  |||| ||||| || ||||||     
T  13980 ttgaaagattatggttttgggttgaattatcatcctagtaaagctaacgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactctacatatgtccgctatgatga 14079  T
Q  144 tgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagtt 219  Q
    | || || || ||| |||| |||||||||| |||| ||||| | ||||| || ||||||||  |||||||| ||||    
T  14080 tcaaagagttggagctgctcgaacagtttaaagacctgagtttagtttgtgagttgtcaccatagagtgtgaagtt 14155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0730 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0730
Description:

Target: scaffold0730; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 105 - 267
Target Start/End: Original strand, 4552 - 4714
Alignment:
Q  105 ctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcacc 204  Q
    |||| |||||||| || ||||| ||||| || |||||||| |  || || ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||| ||    
T  4552 ctttaagtaggaaaacattacatatgtctgctatgatggttagagagttggagttgcttgaacagttcagagacttgagtttggtttgcgaagtgtcgcc 4651  T
Q  205 ccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     ||||||||| | || || ||| ||||  || | |||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  4652 gcagagtgtgaaattaggaatgctgaaggtccacagtgaatttttgaatagtatcaaagaagc 4714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 29 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 39801 - 39621
Alignment:
Q  29 agatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacaca 128  Q
    |||||| |||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||  ||||||||||| || ||||| || || |    
T  39801 agatggctagaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgttgatgctttgagcagtaagacattgcata 39702  T
Q  129 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccaga 209  Q
    |||| ||  ||||||| |  || ||| |||| ||||||||||| ||||| |||||| | ||||| |||| |||||| ||||    
T  39701 tgtccgctttgatggtcagagagtttaagttacttgaacagttcagagatttgagtttagtttgtgaatggtcacctcaga 39621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 29 - 209
Target Start/End: Original strand, 32457 - 32637
Alignment:
Q  29 agatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacaca 128  Q
    |||||| |||||||  |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||| || |    
T  32457 agatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcagaaagacgttgcata 32556  T
Q  129 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccaga 209  Q
    ||||  |  ||||||| || || || ||||| |  ||||| || ||||| |||||| | ||||| |||| |||||| ||||    
T  32557 tgtccactttgatggtcaaagagttcgagttaccggaacaattcagagatttgagtttggtttgtgaatggtcacctcaga 32637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 29 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 10018 - 9850
Alignment:
Q  29 agatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacaca 128  Q
    |||||| |||||||  |||| |||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || || |    
T  10018 agatggctagagttgctgaaagattatgacttcggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgtggttgccgatgctttgagcaggaagacattgcata 9919  T
Q  129 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaat 197  Q
    |||| ||  ||||||| |  || || ||||| | ||||||||| ||||| |||||| | ||||| ||||    
T  9918 tgtccgctttgatggtcagagagttcgagttacctgaacagttcagagaattgagtttcgtttgtgaat 9850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 140 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 27572 - 27445
Alignment:
Q  140 atggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaata 239  Q
    |||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||| | |||||| | |||||||| ||| |||| ||  |||    
T  27572 atggtgaaagaatttgaattgttggaacagtttagagacctgagtcttgtctgtgaattgtcatctcagagtatacagttggggatgctgaagattgata 27473  T
Q  240 gtgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
    || | |||||||| |||||| |||||||    
T  27472 gtaatttcttgaacagtatccgagaagc 27445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 128 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 18003 - 17862
Alignment:
Q  128 atgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgt 227  Q
    ||||| || |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||| |||||||||| || |||||| || | || |||     
T  18003 atgtccgctatgatggtaaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagatttgagtttagtatgc-aattgtcacctcatagtgtgaagctaggaatgc 17905  T
Q  228 tgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgca 270  Q
    | || ||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  17904 taaagattgatagtgaattcttgaacagtatcaaagaagcgca 17862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 29 - 197
Target Start/End: Original strand, 3289 - 3457
Alignment:
Q  29 agatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacaca 128  Q
    |||||| |||||||  |||| |||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || || |    
T  3289 agatggctagagttgctgaaagattatgacttcggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgtggttgccgatgctttgagcaggaagacattgcata 3388  T
Q  129 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaat 197  Q
    |||| ||  ||||||| |  || || ||||| | ||||||||| ||||| |||||| | ||||| ||||    
T  3389 tgtccgctttgatggtcagagagttcgagttacctgaacagttcagagaattgagtttcgtttgtgaat 3457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 107 - 283
Target Start/End: Original strand, 48168 - 48344
Alignment:
Q  107 ttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcacccc 206  Q
    ||||| ||||||||  | || ||||| || |||||||| || |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| || || || ||||| || |    
T  48168 ttgagcaggaagacactgcatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgatttgctggaacggtttagagacttgagtctggtatgtgagttgtcgcctc 48267  T
Q  207 agagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 283  Q
    ||||| | ||||| || ||| |||| || |||||||| ||||||  ||||||| |||| || ||||| || ||||||    
T  48268 agagtatacagttaggcatgctgaagattaatagtgatttcttgggtagtatccgagaggcacaacaagtggatgtc 48344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 1049 - 963
Alignment:
Q  98 gcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagt 184  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  1049 gcagatgctttaagtaggaagaccttgcatatgtccgctatgatggtaaaggagttcgagttgcttgaacagttaagagatttgagt 963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 259
Target Start/End: Original strand, 20467 - 20555
Alignment:
Q  171 ttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatc 259  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||| || ||| ||||  | || ||||| |||||||||||||||    
T  20467 ttagagacttgagtcttgtctgcgaattgacacctcagagtgtacagttagggatgctgaagtttaacagtgatttcttgaatagtatc 20555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 184
Target Start/End: Original strand, 16466 - 16603
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 146  Q
    ||||||| |||||||  |||||  |||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| ||  ||||||| |    
T  16466 aaggattttgattttcagttgagttatcatcctgggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggtta 16565  T
Q  147 aggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagt 184  Q
    | || ||||||||| |||| ||||||  ||||||||||    
T  16566 aagagtttgagttgattgagcagtttcaagacttgagt 16603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0048 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0048
Description:

Target: scaffold0048; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 120
Target Start/End: Original strand, 12900 - 12967
Alignment:
Q  53 tatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagac 120  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  12900 tatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 12967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 44 - 120
Target Start/End: Original strand, 23972 - 24048
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagac 120  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||  |||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  23972 ttgaaagattatgactttaggttgaattatcatctaggtaaagctaatgttgtcgcagatgccttgagtaggaagac 24048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 47 - 184
Target Start/End: Original strand, 2777 - 2914
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 146  Q
    ||||||| |||||||  |||||  |||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| ||  ||||||| |    
T  2777 aaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggtta 2876  T
Q  147 aggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagt 184  Q
    | || || || ||| |||| |||||| |||||||||||    
T  2877 aagagttggaattgattgagcagtttcgagacttgagt 2914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 71 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 842 - 729
Alignment:
Q  71 tatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagt 170  Q
    |||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| ||  ||||||| || || ||||| ||| |||| ||||    
T  842 tatcatcccgggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagtttgatttgtttgagcagt 743  T
Q  171 ttagagacttgagt 184  Q
    || |||||||||||    
T  742 ttcgagacttgagt 729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 47 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 24798 - 24661
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 146  Q
    ||||||| |||||||  |||||  |||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| ||  ||||||| |    
T  24798 aaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggtta 24699  T
Q  147 aggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagt 184  Q
    | || || || ||| |||| |||||| |||||||||||    
T  24698 aagagttggaattgattgagcagtttcgagacttgagt 24661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 47 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 14312 - 14175
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 146  Q
    ||||||| |||||||  |||||  |||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| ||  ||||||| |    
T  14312 aaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggtta 14213  T
Q  147 aggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagt 184  Q
    | || || || ||| |||| |||||| |||||||||||    
T  14212 aagagttggaattgattgagcagtttcgagacttgagt 14175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 47 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 8669 - 8532
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 146  Q
    ||||||| |||||||  |||||  ||||| ||| | || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| ||  ||||||| |    
T  8669 aaggattttgattttcagttgagttatcacccgaggaaggctaatgttgttgccgatgctttgagtaggaagactttgcatatgtctgctttgatggtta 8570  T
Q  147 aggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagt 184  Q
    | || || || ||| |||| |||||| |||||||||||    
T  8569 aagagttggaattgattgagcagttttgagacttgagt 8532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 47 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 401 - 340
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgcttt 108  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||  | ||||| ||||||||||||||    
T  401 aaggattatgatttcgggttgaattaccatccgggtaagactaatgttgttgcagatgcttt 340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 47 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 45749 - 45612
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 146  Q
    ||||||| |||||||  |||||  |||||||| || ||||| |||||  |||| |||||||||||||  ||||| || || ||||| ||  ||||||| |    
T  45749 aaggattttgattttcagttgagttatcatcccgggaaagcgaatgtttttgctgatgctttgagtaaaaagactttgcatatgtctgctttgatggtta 45650  T
Q  147 aggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagt 184  Q
    |||| || || ||| |||| |||||| |||||||||||    
T  45649 aggagttggaattgattgagcagtttcgagacttgagt 45612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 8600 - 8424
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagttattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 122  Q
    |||||||| ||||||||||   | ||||||| |||||||  |||||  |||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||| |    
T  8600 cagaggagttggttagagtaccttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtatgaagactt 8501  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattg 199  Q
    | || |||||  |  ||||||| || || || || ||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| | ||||||    
T  8500 tgcatatgtctcctttgatggttaaagagttggaattgattgagcagtttcgagacctgagttttgttagtgaattg 8424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0567 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0567
Description:

Target: scaffold0567; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 89 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 10656 - 10561
Alignment:
Q  89 aatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagt 184  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| ||  ||||||| || || || || ||| |||| |||||| |||||||||||    
T  10656 aatgttgttgccgatgctttgagtaggaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaattgattgagcagttttgagacttgagt 10561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 6578 - 6441
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 146  Q
    ||||||| |||||||  |||||  |||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||||| ||| | || || ||||| ||  ||||||| |    
T  6578 aaggattttgattttcagttgagttatcatcctgggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagtctttgcatatgtctgctttgatggtta 6479  T
Q  147 aggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagt 184  Q
    | || || || ||| |||| |||||| |||||||||||    
T  6478 atgagttggaattgattgagcagtttcgagacttgagt 6441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 184
Target Start/End: Original strand, 2854 - 2991
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 146  Q
    ||||||| |||||||  |||||  |||||||| |  || || |||||| |||  |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||  ||||||| |    
T  2854 aaggattttgattttcagttgagttatcatcccgcgaaggctaatgtatttgttgatgctttgagtagaaagactttacatatgtctgctttgatggtta 2953  T
Q  147 aggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagt 184  Q
    | || || || ||| |||| |||||| |||||||||||    
T  2954 aagagttggaattggttgagcagtttcgagacttgagt 2991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 25366 - 25229
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 146  Q
    ||||||| |||||||  |||||  |||||||  || || || ||||| ||||  |||||||||||||| ||||| || || ||||| ||  ||||||| |    
T  25366 aaggattttgattttcagttgagttatcatcttgggaaggctaatgtcgttgttgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggtta 25267  T
Q  147 aggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagt 184  Q
    | || ||||| ||| |||| |||||| |||||||||||    
T  25266 atgagtttgaattgattgagcagtttcgagacttgagt 25229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 25230 - 25093
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 146  Q
    ||||||| |||||||  |||||  |||||||| || ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| ||  ||||||| |    
T  25230 aaggattttgattttcagttgagttatcatcccgggaaagtgaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggtta 25131  T
Q  147 aggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagt 184  Q
    | || || || ||| |||| |||||| |||| ||||||    
T  25130 aagagttggaattgattgagcagtttcgagatttgagt 25093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University