View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9030_low_8 (Length: 469)

Name: NF9030_low_8
Description: NF9030
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9030_low_8
NF9030_low_8
[»] chr6 (37 HSPs)
chr6 (14-452)||(16838564-16839002)
chr6 (18-452)||(6005237-6005671)
chr6 (18-452)||(33330276-33330712)
chr6 (18-452)||(33335773-33336209)
chr6 (18-452)||(28155404-28155834)
chr6 (18-452)||(6438322-6438751)
chr6 (39-452)||(14737431-14737840)
chr6 (39-452)||(14742291-14742699)
chr6 (226-452)||(5343300-5343527)
chr6 (39-452)||(28184323-28184738)
chr6 (39-454)||(22010551-22010962)
chr6 (39-452)||(11856793-11857205)
chr6 (14-121)||(5343628-5343735)
chr6 (93-270)||(5674686-5674865)
chr6 (175-271)||(5757478-5757575)
chr6 (175-308)||(10077164-10077296)
chr6 (175-308)||(31086472-31086604)
chr6 (175-272)||(5572240-5572339)
chr6 (175-272)||(31979512-31979611)
chr6 (175-271)||(4629954-4630052)
chr6 (175-271)||(21356036-21356133)
chr6 (175-272)||(22963699-22963797)
chr6 (175-272)||(23824596-23824694)
chr6 (175-259)||(21801343-21801429)
chr6 (175-250)||(18232867-18232943)
chr6 (322-426)||(30125940-30126044)
chr6 (189-240)||(22709050-22709102)
chr6 (208-272)||(31936586-31936651)
chr6 (208-267)||(12195515-12195575)
chr6 (189-308)||(5017482-5017600)
chr6 (208-267)||(4816231-4816291)
chr6 (208-267)||(5273216-5273276)
chr6 (208-267)||(19704567-19704627)
chr6 (208-267)||(20915356-20915416)
chr6 (208-267)||(26932562-26932622)
chr6 (208-267)||(29754709-29754769)
chr6 (208-267)||(33309110-33309170)
[»] chr8 (36 HSPs)
chr8 (18-452)||(35745211-35745645)
chr8 (18-452)||(10684095-10684530)
chr8 (18-452)||(39784657-39785088)
chr8 (18-452)||(25328112-25328542)
chr8 (39-450)||(7289780-7290188)
chr8 (93-450)||(6311121-6311476)
chr8 (93-426)||(18853084-18853418)
chr8 (93-271)||(18870478-18870658)
chr8 (93-271)||(36979378-36979557)
chr8 (93-271)||(30655647-30655826)
chr8 (93-271)||(33037724-33037902)
chr8 (190-426)||(10689157-10689392)
chr8 (93-271)||(4759992-4760171)
chr8 (189-271)||(26287902-26287985)
chr8 (189-271)||(26301159-26301242)
chr8 (189-271)||(26313153-26313236)
chr8 (175-271)||(1261954-1262050)
chr8 (181-272)||(26403235-26403328)
chr8 (175-272)||(23799576-23799675)
chr8 (175-271)||(4456028-4456125)
chr8 (175-272)||(5702482-5702581)
chr8 (175-268)||(6127224-6127319)
chr8 (175-268)||(7412344-7412438)
chr8 (175-308)||(19175754-19175887)
chr8 (18-104)||(25327986-25328070)
chr8 (175-271)||(31071229-31071326)
chr8 (203-308)||(4696624-4696727)
chr8 (208-269)||(9765852-9765914)
chr8 (175-272)||(19752394-19752492)
chr8 (208-267)||(43079877-43079937)
chr8 (208-267)||(43082248-43082308)
chr8 (39-91)||(6311533-6311583)
chr8 (208-241)||(18810982-18811015)
chr8 (39-91)||(18870373-18870423)
chr8 (39-91)||(30655881-30655931)
chr8 (208-267)||(44721118-44721178)
[»] chr5 (46 HSPs)
chr5 (18-452)||(2785195-2785629)
chr5 (14-452)||(31396818-31397258)
chr5 (14-452)||(31401675-31402115)
chr5 (18-452)||(33791136-33791570)
chr5 (18-452)||(33767999-33768438)
chr5 (18-454)||(37556457-37556891)
chr5 (18-452)||(37561279-37561711)
chr5 (18-452)||(28807408-28807839)
chr5 (39-450)||(1457016-1457423)
chr5 (39-430)||(43592120-43592510)
chr5 (39-450)||(27444793-27445201)
chr5 (39-450)||(27449637-27450045)
chr5 (39-430)||(15044528-15044917)
chr5 (39-450)||(43598547-43598955)
chr5 (39-450)||(43604039-43604447)
chr5 (39-450)||(43609531-43609939)
chr5 (93-430)||(30631249-30631586)
chr5 (93-271)||(31180215-31180393)
chr5 (175-271)||(38192174-38192270)
chr5 (175-271)||(38219399-38219495)
chr5 (175-271)||(10281751-10281849)
chr5 (93-271)||(24135849-24136027)
chr5 (175-271)||(35387663-35387759)
chr5 (175-271)||(9353332-9353429)
chr5 (175-271)||(36932350-36932447)
chr5 (175-270)||(11916971-11917068)
chr5 (175-271)||(15464532-15464629)
chr5 (178-308)||(17003962-17004091)
chr5 (175-272)||(3880298-3880397)
chr5 (175-271)||(19588746-19588844)
chr5 (175-271)||(14520230-14520327)
chr5 (175-308)||(28832225-28832356)
chr5 (175-268)||(12084175-12084269)
chr5 (208-267)||(4410241-4410301)
chr5 (175-308)||(42127410-42127541)
chr5 (208-267)||(15552464-15552524)
chr5 (208-267)||(31179371-31179431)
chr5 (208-267)||(31542953-31543013)
chr5 (208-267)||(31545299-31545359)
chr5 (214-267)||(27910675-27910729)
chr5 (39-91)||(30631641-30631691)
chr5 (39-91)||(31180448-31180498)
chr5 (208-272)||(31300629-31300694)
chr5 (208-267)||(3373137-3373197)
chr5 (208-267)||(10749919-10749979)
chr5 (208-267)||(15354575-15354635)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (18-452)||(148787-149221)
[»] chr3 (55 HSPs)
chr3 (18-452)||(2676918-2677353)
chr3 (18-422)||(24967957-24968361)
chr3 (18-452)||(2672762-2673197)
chr3 (18-452)||(8512035-8512471)
chr3 (18-452)||(8516915-8517351)
chr3 (14-452)||(32475304-32475742)
chr3 (14-452)||(32480161-32480600)
chr3 (18-452)||(18656254-18656685)
chr3 (223-452)||(10207753-10207983)
chr3 (39-454)||(22173049-22173460)
chr3 (93-426)||(7167092-7167424)
chr3 (93-430)||(28503781-28504108)
chr3 (175-426)||(2671586-2671836)
chr3 (95-271)||(8738982-8739159)
chr3 (95-271)||(9091220-9091397)
chr3 (175-271)||(8477363-8477459)
chr3 (175-271)||(40372795-40372891)
chr3 (93-228)||(28501614-28501750)
chr3 (175-272)||(18552872-18552971)
chr3 (175-307)||(40592771-40592903)
chr3 (175-318)||(36029050-36029191)
chr3 (175-271)||(26928591-26928687)
chr3 (175-268)||(1736294-1736389)
chr3 (175-271)||(8370476-8370573)
chr3 (175-271)||(27974942-27975039)
chr3 (175-271)||(30709779-30709877)
chr3 (175-271)||(1305949-1306045)
chr3 (175-272)||(3715991-3716090)
chr3 (175-272)||(21711222-21711320)
chr3 (175-272)||(48438213-48438312)
chr3 (175-271)||(16264350-16264447)
chr3 (189-271)||(27986449-27986533)
chr3 (175-272)||(26298987-26299086)
chr3 (175-271)||(25795781-25795879)
chr3 (175-271)||(32143321-32143418)
chr3 (189-271)||(33386669-33386753)
chr3 (175-272)||(6794703-6794801)
chr3 (175-272)||(47923895-47923994)
chr3 (175-271)||(27452958-27453055)
chr3 (175-272)||(40844651-40844749)
chr3 (208-272)||(1417513-1417578)
chr3 (175-308)||(37466257-37466388)
chr3 (175-272)||(24695153-24695252)
chr3 (205-241)||(4386947-4386983)
chr3 (39-91)||(7167479-7167530)
chr3 (208-267)||(38210569-38210629)
chr3 (189-271)||(39039995-39040079)
chr3 (208-267)||(50494198-50494258)
chr3 (204-267)||(53894055-53894119)
chr3 (175-272)||(3328346-3328444)
chr3 (39-91)||(28501509-28501559)
chr3 (208-267)||(458483-458543)
chr3 (208-267)||(6063444-6063504)
chr3 (208-267)||(10621528-10621588)
chr3 (224-271)||(39153357-39153405)
[»] scaffold0197 (2 HSPs)
scaffold0197 (14-452)||(18992-19430)
scaffold0197 (18-452)||(14140-14575)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (18-452)||(2082-2516)
[»] chr2 (43 HSPs)
chr2 (18-452)||(19344241-19344676)
chr2 (18-452)||(19349099-19349534)
chr2 (22-452)||(32246605-32247035)
chr2 (39-452)||(39811843-39812252)
chr2 (126-454)||(44312563-44312889)
chr2 (93-271)||(11098844-11099023)
chr2 (93-380)||(14291380-14291668)
chr2 (175-426)||(9296401-9296651)
chr2 (175-271)||(3491751-3491847)
chr2 (175-271)||(25398496-25398592)
chr2 (175-308)||(21629910-21630041)
chr2 (175-268)||(13569331-13569426)
chr2 (184-272)||(8040059-8040149)
chr2 (175-271)||(25403634-25403730)
chr2 (175-272)||(10445443-10445542)
chr2 (175-272)||(17865202-17865301)
chr2 (175-272)||(34682333-34682432)
chr2 (175-270)||(34388859-34388956)
chr2 (175-308)||(8390149-8390281)
chr2 (175-272)||(14699007-14699105)
chr2 (175-272)||(20522219-20522318)
chr2 (189-271)||(40738844-40738926)
chr2 (175-271)||(28259177-28259274)
chr2 (175-270)||(10707251-10707348)
chr2 (178-308)||(31056008-31056139)
chr2 (175-272)||(33528620-33528719)
chr2 (175-272)||(39482930-39483029)
chr2 (175-308)||(16940208-16940340)
chr2 (175-308)||(17010873-17011005)
chr2 (175-308)||(33118102-33118234)
chr2 (175-241)||(25407653-25407719)
chr2 (175-271)||(23078470-23078567)
chr2 (175-271)||(42039669-42039766)
chr2 (208-267)||(35215586-35215646)
chr2 (208-267)||(35217963-35218023)
chr2 (175-268)||(2838029-2838124)
chr2 (175-268)||(2869692-2869787)
chr2 (175-271)||(36757762-36757859)
chr2 (208-268)||(1345574-1345635)
chr2 (211-267)||(45332181-45332238)
chr2 (208-267)||(23452237-23452297)
chr2 (208-267)||(36558864-36558924)
chr2 (208-267)||(36561141-36561201)
[»] chr7 (49 HSPs)
chr7 (14-452)||(24261150-24261589)
chr7 (18-452)||(24266033-24266468)
chr7 (14-452)||(16879892-16880331)
chr7 (14-452)||(16884748-16885186)
chr7 (18-452)||(19992133-19992565)
chr7 (18-452)||(21812071-21812503)
chr7 (39-452)||(24024181-24024591)
chr7 (39-452)||(31109438-31109846)
chr7 (39-452)||(12406153-12406562)
chr7 (39-452)||(12396733-12397142)
chr7 (186-452)||(4866551-4866816)
chr7 (93-426)||(20357464-20357797)
chr7 (93-426)||(2057806-2058146)
chr7 (93-271)||(1533360-1533540)
chr7 (175-271)||(18408764-18408860)
chr7 (175-271)||(21639809-21639905)
chr7 (175-272)||(29159802-29159901)
chr7 (175-271)||(18413641-18413736)
chr7 (175-271)||(21646007-21646103)
chr7 (175-272)||(46516309-46516408)
chr7 (175-272)||(49091660-49091759)
chr7 (175-270)||(21983285-21983383)
chr7 (175-308)||(2647695-2647827)
chr7 (175-308)||(33332449-33332581)
chr7 (175-308)||(55913-56045)
chr7 (175-271)||(44848684-44848781)
chr7 (175-272)||(9190008-9190106)
chr7 (208-272)||(20284088-20284153)
chr7 (175-272)||(2580389-2580487)
chr7 (175-272)||(4796666-4796765)
chr7 (175-272)||(35960815-35960914)
chr7 (175-308)||(21988873-21989005)
chr7 (208-272)||(9185198-9185263)
chr7 (208-268)||(28617258-28617319)
chr7 (208-267)||(31155911-31155971)
chr7 (175-271)||(2479337-2479433)
chr7 (203-271)||(47263678-47263745)
chr7 (39-91)||(20357359-20357409)
chr7 (208-267)||(1049296-1049356)
chr7 (208-267)||(2935497-2935557)
chr7 (208-267)||(3035953-3036013)
chr7 (39-90)||(4873310-4873359)
chr7 (208-267)||(7351652-7351712)
chr7 (224-271)||(8153466-8153514)
chr7 (208-267)||(9027194-9027254)
chr7 (208-267)||(22108295-22108355)
chr7 (208-267)||(22137306-22137366)
chr7 (208-267)||(40550055-40550115)
chr7 (208-267)||(40552333-40552393)
[»] chr1 (36 HSPs)
chr1 (18-452)||(43988293-43988731)
chr1 (18-452)||(25444923-25445354)
chr1 (18-452)||(39445320-39445750)
chr1 (18-452)||(44023708-44024137)
chr1 (18-452)||(1054846-1055276)
chr1 (39-452)||(41398058-41398466)
chr1 (39-271)||(41390582-41390811)
chr1 (18-165)||(25439730-25439875)
chr1 (93-346)||(24787281-24787534)
chr1 (175-271)||(24202769-24202865)
chr1 (175-308)||(16124515-16124648)
chr1 (175-272)||(47703935-47704034)
chr1 (175-271)||(19072928-19073026)
chr1 (175-271)||(19120818-19120916)
chr1 (175-272)||(27104371-27104470)
chr1 (175-271)||(26644897-26644994)
chr1 (175-271)||(19358843-19358939)
chr1 (175-271)||(19361432-19361528)
chr1 (175-271)||(19380072-19380168)
chr1 (175-308)||(13598364-13598496)
chr1 (175-308)||(29651777-29651909)
chr1 (175-272)||(9476260-9476359)
chr1 (374-452)||(41386569-41386646)
chr1 (175-271)||(3281708-3281805)
chr1 (178-271)||(37069770-37069864)
chr1 (186-308)||(775638-775759)
chr1 (175-308)||(47098824-47098955)
chr1 (175-241)||(21536569-21536635)
chr1 (175-271)||(13604623-13604720)
chr1 (208-267)||(9459419-9459479)
chr1 (208-267)||(9463246-9463306)
chr1 (208-267)||(16226386-16226446)
chr1 (175-272)||(32889438-32889536)
chr1 (208-308)||(47102874-47102972)
chr1 (208-267)||(23786058-23786118)
chr1 (208-267)||(51752582-51752642)
[»] scaffold0464 (1 HSPs)
scaffold0464 (18-452)||(183-613)
[»] chr4 (41 HSPs)
chr4 (18-452)||(18855547-18855977)
chr4 (18-452)||(3813844-3814274)
chr4 (18-452)||(5732484-5732915)
chr4 (18-452)||(45357130-45357560)
chr4 (18-452)||(45347650-45348081)
chr4 (39-452)||(9224261-9224670)
chr4 (39-452)||(9229048-9229457)
chr4 (39-450)||(51520280-51520688)
chr4 (139-451)||(56146664-56146974)
chr4 (93-271)||(24741941-24742120)
chr4 (94-372)||(29760542-29760821)
chr4 (175-308)||(16623292-16623425)
chr4 (175-308)||(39245960-39246092)
chr4 (175-272)||(10047378-10047477)
chr4 (175-308)||(38152438-38152570)
chr4 (189-271)||(28468542-28468625)
chr4 (175-308)||(16630679-16630812)
chr4 (175-272)||(36315229-36315327)
chr4 (175-272)||(36329438-36329536)
chr4 (175-271)||(3796518-3796616)
chr4 (175-271)||(5396671-5396768)
chr4 (175-270)||(5143260-5143357)
chr4 (175-270)||(5147678-5147775)
chr4 (181-272)||(24333808-24333901)
chr4 (175-271)||(31985634-31985730)
chr4 (189-272)||(5269204-5269289)
chr4 (178-266)||(6743417-6743507)
chr4 (175-270)||(3777550-3777646)
chr4 (208-267)||(16931789-16931849)
chr4 (208-267)||(16934143-16934203)
chr4 (208-267)||(22780373-22780433)
chr4 (208-267)||(44599838-44599898)
chr4 (189-272)||(25862035-25862120)
chr4 (46-91)||(29760875-29760919)
chr4 (175-234)||(5112275-5112335)
chr4 (208-267)||(6765117-6765177)
chr4 (208-267)||(7941596-7941656)
chr4 (208-267)||(18709164-18709224)
chr4 (39-98)||(18712620-18712677)
chr4 (208-267)||(22782738-22782798)
chr4 (175-308)||(54867150-54867281)
[»] scaffold0355 (3 HSPs)
scaffold0355 (55-452)||(9514-9904)
scaffold0355 (39-184)||(3703-3845)
scaffold0355 (300-452)||(1-145)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (196-452)||(181973-182230)
scaffold0009 (18-146)||(176808-176936)
[»] scaffold0135 (1 HSPs)
scaffold0135 (39-452)||(34916-35325)
[»] scaffold0188 (2 HSPs)
scaffold0188 (175-271)||(17952-18048)
scaffold0188 (175-271)||(24045-24141)
[»] scaffold0140 (3 HSPs)
scaffold0140 (175-271)||(8419-8516)
scaffold0140 (208-267)||(22343-22403)
scaffold0140 (208-267)||(24618-24678)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (175-308)||(85649-85780)
[»] scaffold0006 (3 HSPs)
scaffold0006 (175-308)||(5649-5781)
scaffold0006 (175-308)||(2458-2590)
scaffold0006 (175-271)||(133280-133377)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (175-272)||(10728-10827)
[»] scaffold0127 (1 HSPs)
scaffold0127 (374-452)||(34136-34213)
[»] scaffold0087 (2 HSPs)
scaffold0087 (175-271)||(43961-44058)
scaffold0087 (175-308)||(36832-36965)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (203-271)||(45253-45322)
[»] scaffold0479 (1 HSPs)
scaffold0479 (392-452)||(13169-13228)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (175-268)||(17266-17361)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (208-267)||(269-329)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (208-241)||(11500-11533)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (208-267)||(69292-69352)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 419; Significance: 0; HSPs: 37)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 419; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 16839002 - 16838564
Alignment:
Q  14 agatgggatcctttggggtgtgttcctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgagg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16839002 agatgggatcctttggggtgtgttcctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgagg 16838903  T
Q  114 atgggaaaataccaaagggtagatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggatt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16838902 atgggaaaataccaaagggtagatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggatt 16838803  T
Q  214 ggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgtttgttcgttttcttttatcgcttatcttgtatg 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16838802 ggagagctgctctctcccccagattaagccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgtttgttcgttttcttttatcgtttatcttgtatg 16838703  T
Q  314 cttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggttgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcact 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16838702 cttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttgaaggccatttgcactcatagattatctctatcact 16838603  T
Q  414 tgctccacacatcattggtttattctcattggtgtgaag 452  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16838602 tgctccacatatcattggtttattctcattggtgtgaag 16838564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 6005671 - 6005237
Alignment:
Q  18 gggatcctttggggtgtgttcctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgaggatgg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||    
T  6005671 gggatcctttggggtgtgttcctttgatgagagtgtttcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggattatgggttcatagtgtgagggtgg 6005572  T
Q  118 gaaaataccaaagggtagatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggag 217  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6005571 gaaaataccaaagggtaggtctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggag 6005472  T
Q  218 agctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgtttgttcgttttcttttatcgcttatcttgtatgcttg 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  6005471 agctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgtttgttcttttccttttatcgtttatcttgtatgcttg 6005372  T
Q  318 ttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggttgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgct 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6005371 ttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgct 6005272  T
Q  418 ccacacatcattggtttattctcattggtgtgaag 452  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6005271 ccacacatcattggtttattctcattggtgtgaag 6005237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 452
Target Start/End: Original strand, 33330276 - 33330712
Alignment:
Q  18 gggatcctttggggtgtgttcctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgaggatgg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33330276 gggatcctttggggtgtgttcctttgatgagagtgtttcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgaggatgg 33330375  T
Q  118 gaaaataccaaagggtagatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggag 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33330376 gaaaataccaaagggtagatctagggttttgtcatgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggag 33330475  T
Q  218 agctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgtttgttcgttttctttt-atcgcttatcttg-tatgct 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || | |||||||| ||||||    
T  33330476 agctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgtttgttc-ttttcttttcatggtttatcttgttatgct 33330574  T
Q  316 tgttagctcttagtgtgg-ttttgctatacattaggcttaggttgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcactt 414  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33330575 tgttagctcttagtgtggtttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcactt 33330674  T
Q  415 gctccacacatcattggtttattctcattggtgtgaag 452  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33330675 gctccacacatcattggtttattctaattggtgtgaag 33330712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 452
Target Start/End: Original strand, 33335773 - 33336209
Alignment:
Q  18 gggatcctttggggtgtgttcctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgaggatgg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33335773 gggatcctttggggtgtgttcctttgatgagagtgtttcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgaggatgg 33335872  T
Q  118 gaaaataccaaagggtagatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggag 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33335873 gaaaataccaaagggtagatctagggttttgtcatgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggag 33335972  T
Q  218 agctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgtttgttcgttttctttt-atcgcttatcttg-tatgct 315  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || | |||||||| ||||||    
T  33335973 agctgctctctcccccagattaggtcacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgtttgttc-ttttcttttcatggtttatcttgttatgct 33336071  T
Q  316 tgttagctcttagtgtgg-ttttgctatacattaggcttaggttgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcactt 414  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33336072 tgttagctcttagtgtggtttttactatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagtttggaggccatttgcactcatagattatctctatcactt 33336171  T
Q  415 gctccacacatcattggtttattctcattggtgtgaag 452  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33336172 gctccacacatcattggtttattctcattggtgtgaag 33336209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 18 - 452
Target Start/End: Original strand, 28155404 - 28155834
Alignment:
Q  18 gggatcctttggggtgtgttcctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgaggatgg 117  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  28155404 gggatcctatggggtgtgtgcctttgatgagagtgtttcttaggttgggaaaa--acattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgagagtgg 28155501  T
Q  118 gaaaataccaaagggtagatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggag 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  28155502 gaaaataccaaagggtagatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaa-agctaaattcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggag 28155599  T
Q  218 agctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcttttatcgcttatcttg--tatgc 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| | |||| || ||||||||  |||||    
T  28155600 agctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc-tttccatttaccgtttatcttgtttatgc 28155698  T
Q  315 ttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggttgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcactt 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  28155699 ttgttagctcttagtgtggttttgctatacacaagtcataggctgttttgttgttgttagcttgaagaccatttgctctcattgattatcactatcactt 28155798  T
Q  415 gctccacacatcattggtttattctcattggtgtgaag 452  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  28155799 gctccacacatcatt-gtttatt-gcattggtgtgaag 28155834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 18 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 6438751 - 6438322
Alignment:
Q  18 gggatcctttggggtgtgttcctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgaggatgg 117  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||    
T  6438751 gggatcctatggggtgtgtgcctttgatgagagagtttcttaggttgggaaaa--acattgtaatcaccttgggattttgggttcatagtgtgagagtgg 6438654  T
Q  118 gaaaataccaaagggtagatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggag 217  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6438653 gaaaataccaaagggtagttctagggtttgttcatgtgtaaagcttgacaagctagagtcttgtaac-cttttgtaacac-ttcacatattggattggag 6438556  T
Q  218 agctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcttttatcgcttatcttg--tatgc 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| || ||||||||  |||||    
T  6438555 agctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggacaacaatcttgctcggtgttttgttc-tttccttttaccgtttatcttgtttatgc 6438457  T
Q  315 ttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggttgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcactt 414  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||    |||||||||||| ||||||| |||||| |  ||||| ||||| | |||||||||    
T  6438456 ttgttagctctttgtgtggttttgctatacacta-gcttagggctgtttgttgttgtttgcttggaagccattggttctcattgattaccactatcactt 6438358  T
Q  415 gctccacacatcattggtttattctcattggtgtgaag 452  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  6438357 gctccacacatcatt-gtttatt-tcattggtgtgaag 6438322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 39 - 452
Target Start/End: Original strand, 14737431 - 14737840
Alignment:
Q  39 ctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgaggatgggaaaataccaaagggtaga-t 137  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |    
T  14737431 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaa--acattgtaatcaccttgggttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaat 14737528  T
Q  138 ctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagat 237  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14737529 ctagggtttgttcatatgtaaagcttgaag-gctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagat 14737626  T
Q  238 taggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcttttatcgcttatcttg-tatgc-ttgttagctc-ttagtgtgg 333  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||| | ||| ||| || ||| || ||||||    
T  14737627 taggccatattggctgaactggatcaacaatctt-ctcggtgttttgttc--tttcttttaccgcttatcttgttttgctttggtatctcttttgtgtgg 14737723  T
Q  334 ttttgctatacattaggcttaggttgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcattggtt 433  Q
    |||||||||||| ||| ||  || ||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  14737724 ttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt-gtt 14737822  T
Q  434 tattctcattggtgtgaag 452  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  14737823 tatt-tcattggtgtgaag 14737840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 39 - 452
Target Start/End: Original strand, 14742291 - 14742699
Alignment:
Q  39 ctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgaggatgggaaaataccaaagggtaga-t 137  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |    
T  14742291 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaa--acattgtaatcactttgggttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaat 14742388  T
Q  138 ctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagat 237  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14742389 ctagggtttgttcatatgtaaagcttgaag-gctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccaaat 14742486  T
Q  238 taggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcttttatcgcttatcttg-tatgc-ttgttagctcttagtgtggt 334  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||| | ||| ||| || ||||| |||||||    
T  14742487 taggtcatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc--tttcttttaccgcttatcttgttttgctttgatatctctttgtgtggt 14742583  T
Q  335 tttgctatacattaggcttaggttgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcattggttt 434  Q
    ||||||||||| ||| ||  || ||||||||||||||  |||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14742584 tttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtatgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt-gttt 14742682  T
Q  435 attctcattggtgtgaag 452  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  14742683 att-tcattggtgtgaag 14742699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 226 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 5343527 - 5343300
Alignment:
Q  226 tctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgtttgttcgttttcttttatcgcttatcttgtatgcttgttagctct 325  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5343527 tctcccctagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgtttgttcgttttcctttatcgtttatcttgtatgcttgttagctct 5343428  T
Q  326 tagtgtggtttt-gctatacattaggcttaggttgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacaca 424  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5343427 tagtgtggtttttgctatactttaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacaca 5343328  T
Q  425 tcattggtttattctcattggtgtgaag 452  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  5343327 tcattgacttattctcattggtgtgaag 5343300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 39 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 28184738 - 28184323
Alignment:
Q  39 ctttgatgagagtgtatcttaggtt-gggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgaggatgggaaaataccaaagggtaga- 136  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||     
T  28184738 ctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaaaacatagtaatcaccttgggttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaa 28184639  T
Q  137 tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccaga 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28184638 tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaag-gctagagtgttgtaac-cttttgtaacactttctcatattagattggagagctgctctctcccccaga 28184541  T
Q  237 ttaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcttttatcgcttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgtg 332  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||  ||||| |||||||||||  ||||| |||  | ||||| |||||    
T  28184540 ttaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc-tttctttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatctctt-gtgtg 28184444  T
Q  333 gttttgctatacattaggcttaggttgttttgttgttgttagcttggaggcca--tttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcattg 430  Q
    ||||||||||||| ||| ||  || ||||||||||||||| |||||||| |||  ||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28184443 gttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattg 28184344  T
Q  431 gtttattctcattggtgtgaag 452  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  28184343 gtttatt-tcattggtgtgaag 28184323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 39 - 454
Target Start/End: Original strand, 22010551 - 22010962
Alignment:
Q  39 ctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgaggatgggaaaataccaaagggtaga-t 137  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||| ||||| ||||||||||| |    
T  22010551 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaa--acattgtaatcaccttgggttttagggttcatattgtgagagtggggaaatatcaaagggtagaat 22010648  T
Q  138 ctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctaga-ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccaga 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22010649 ctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaag-gctagagttcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccaga 22010746  T
Q  237 ttaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcttttatcgcttatcttg-tatgc-ttgttagctcttagtgtgg 333  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  || |||||||||||||||||| | ||| ||| || ||||| ||||||    
T  22010747 ttaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc--ttccttttatcgcttatcttgttttgctttggtatctctttgtgtgg 22010843  T
Q  334 ttttgctatacattaggcttaggttgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcattggtt 433  Q
    |||||||||||| | | ||  ||  | |||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||    
T  22010844 ttttgctatacacttgtctagggcggctttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcatt-gtt 22010942  T
Q  434 tattctcattggtgtgaagat 454  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  22010943 tatt-tcattggtgtgaagat 22010962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 39 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 11857205 - 11856793
Alignment:
Q  39 ctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgaggatgggaaaataccaaagggtaga-t 137  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||| ||| ||||||||||||| |    
T  11857205 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaa--acattgtaatcaccttgggttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaat 11857108  T
Q  138 ctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctaga-ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccaga 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11857107 ctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaag-gctagagttcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccata 11857010  T
Q  237 ttaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgtttgttcgt--tttcttttatcgcttatcttg-tatgc-ttgttagctcttagtgtg 332  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||  || |||||||||||| ||||| | ||| ||| || ||||| |||||    
T  11857009 ttaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-cttggtgtttttttgttcttccttttatcgcttgtcttgttttgctttggtatctctttgtgtg 11856911  T
Q  333 gttttgctatacattaggcttaggttgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcattggt 432  Q
    ||||||||||||| ||| ||  || ||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||    
T  11856910 gttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcatt-gt 11856812  T
Q  433 ttattctcattggtgtgaag 452  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  11856811 ttatt-tcattggtgtgaag 11856793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 5343735 - 5343628
Alignment:
Q  14 agatgggatcctttggggtgtgttcctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgagg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  5343735 agatgggatcctttggggtgtgttcctttgatgagagtgaatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggattatgggttcatagtgtgagg 5343636  T
Q  114 atgggaaa 121  Q
     |||||||    
T  5343635 ttgggaaa 5343628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 93 - 270
Target Start/End: Original strand, 5674686 - 5674865
Alignment:
Q  93 tttagggttcatagtgtgaggatgggaaaataccaaagggtaga-tctagggtttgtt-catgtgtaaagcttgaatagcta--gattcttgtaactctt 188  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||| ||| ||||||||||||| ||||||  ||||| | ||||||| ||||| | |||||  | |||||||||| |||    
T  5674686 tttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctaggtcttgtttcttgtgtaa-gcttgca-agctattgtttcttgtaaccctt 5674783  T
Q  189 ttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatct 270  Q
    | ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5674784 t-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatct 5674865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 175 - 271
Target Start/End: Original strand, 5757478 - 5757575
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 271  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||    
T  5757478 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 5757575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 175 - 308
Target Start/End: Original strand, 10077164 - 10077296
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 272  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  10077164 ttcttgtaacttttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatcttg 10077263  T
Q  273 ctcggtgtttgttcgttttcttttatcgcttatctt 308  Q
     |  ||||||||||  ||||||| || |||||||||    
T  10077264 gt--gtgtttgttc-ctttctttcattgcttatctt 10077296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 175 - 308
Target Start/End: Original strand, 31086472 - 31086604
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 272  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31086472 ttcttgtaactcctttgtaacactttcatcatagtggattggagagttgctctctcccctagattagatcatattggactgaactgggtcaacaatcttg 31086571  T
Q  273 ctcggtgtttgttcgttttcttttatcgcttatctt 308  Q
     |  ||||||||||  ||||||| || |||||||||    
T  31086572 gt--gtgtttgttc-ctttctttcattgcttatctt 31086604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 175 - 272
Target Start/End: Original strand, 5572240 - 5572339
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 272  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  5572240 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatcttg 5572339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 175 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 31979611 - 31979512
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 272  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||| | || |||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  31979611 ttcttgtaactcttttgcaacactttcatcttagtggattggagggctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 31979512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 175 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 4630052 - 4629954
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 271  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| | || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  4630052 ttcttgtaactattttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctcttccctagattaggtcatattggactgaactgagtcaacaatctt 4629954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 175 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 21356133 - 21356036
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 271  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||    
T  21356133 ttcttgtaactctta-gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 21356036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 175 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 22963797 - 22963699
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattg-gctgaactgggtcaacaatcttg 272  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| || || ||||  | ||||||||||||||||||||    
T  22963797 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctct-ccccagatttggtcatattgcaccgaactgggtcaacaatcttg 22963699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 175 - 272
Target Start/End: Original strand, 23824596 - 23824694
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattg-gctgaactgggtcaacaatcttg 272  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| || || ||||  | ||||||||||||||||||||    
T  23824596 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctct-ccccagatttggtcatattgcaccgaactgggtcaacaatcttg 23824694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 259
Target Start/End: Original strand, 21801343 - 21801429
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  21801343 ttcttgtaactcttttgtaacacttttatcttagtggattggagagctgctcgctcccccagattaggtcatattggactgaactgg 21801429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 175 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 18232943 - 18232867
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg 250  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| || ||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  18232943 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtgaattggagggttgctctctcccccagattaggtcatattgg 18232867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 322 - 426
Target Start/End: Original strand, 30125940 - 30126044
Alignment:
Q  322 ctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggttgtttt-gttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctcca 420  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| ||| ||  || |||||| ||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||| | |||||||||    
T  30125940 ctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggctgtttttgttgtagttagcttggagaccatttgg-ctcatagattatcactacctcttgctcca 30126038  T
Q  421 cacatc 426  Q
    ||||||    
T  30126039 cacatc 30126044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 22709102 - 22709050
Alignment:
Q  189 ttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattag 240  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22709102 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattag 22709050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 208 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 31936651 - 31936586
Alignment:
Q  208 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 272  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||| || ||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  31936651 tggattggagagctgctctctctcccagactaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatcttg 31936586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 12195575 - 12195515
Alignment:
Q  208 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 267  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  12195575 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 12195515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 189 - 308
Target Start/End: Original strand, 5017482 - 5017600
Alignment:
Q  189 ttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccaca-ttggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgtttgttc 286  Q
    ||||||||| |||| |||| | |||||||| | |||||||||||| |||||||| || | ||| | |||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  5017482 ttgtaacactttcatcatagtagattggagggttgctctctcccctagattaggtcatatttgaccgaactgggtcaacaatcttggt--gtgtttgttc 5017579  T
Q  287 gttttcttttatcgcttatctt 308  Q
      ||||||| || |||||||||    
T  5017580 -ctttctttcattgcttatctt 5017600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 208 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 4816291 - 4816231
Alignment:
Q  208 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 267  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  |||| | |||||||||||||||    
T  4816291 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 4816231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 208 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 5273276 - 5273216
Alignment:
Q  208 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 267  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  |||| | |||||||||||||||    
T  5273276 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 5273216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 208 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 19704627 - 19704567
Alignment:
Q  208 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 267  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  |||| | |||||||||||||||    
T  19704627 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 19704567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 208 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 20915416 - 20915356
Alignment:
Q  208 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 267  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  |||| | |||||||||||||||    
T  20915416 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 20915356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 208 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 26932622 - 26932562
Alignment:
Q  208 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 267  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  26932622 tggattggagggttgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 26932562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 208 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 29754769 - 29754709
Alignment:
Q  208 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 267  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  29754769 tggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 29754709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 208 - 267
Target Start/End: Original strand, 33309110 - 33309170
Alignment:
Q  208 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 267  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  33309110 tggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 33309170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 395; Significance: 0; HSPs: 36)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 35745645 - 35745211
Alignment:
Q  18 gggatcctttggggtgtgttcctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgaggatgg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||    
T  35745645 gggatcctttggggtgtgttcctttgatgagagtgtttcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggattatgggttcatagtgtgagggtgg 35745546  T
Q  118 gaaaataccaaagggtagatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggag 217  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35745545 gaaaataccaaagggtaggtctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggag 35745446  T
Q  218 agctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgtttgttcgttttcttttatcgcttatcttgtatgcttg 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  35745445 agctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgtttgttcttttccttttatcgtttatcttgtatgcttg 35745346  T
Q  318 ttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggttgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgct 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35745345 ttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgct 35745246  T
Q  418 ccacacatcattggtttattctcattggtgtgaag 452  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35745245 ccacacatcattggtttattctcattggtgtgaag 35745211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 452
Target Start/End: Original strand, 10684095 - 10684530
Alignment:
Q  18 gggatcctttggggtgtgttcctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgaggatgg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||    
T  10684095 gggatcctttggggtgtgttcctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggattatgggttcatagtgtgaggttgg 10684194  T
Q  118 gaaaataccaaagggtagatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggag 217  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10684195 gaaattaccaaagggtaggtctagggttttgtcttgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggag 10684294  T
Q  218 agctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcttttatcgcttatcttgtatgctt 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10684295 agctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttcttttatcgtttatcttgtatgctt 10684394  T
Q  317 gttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggttgttttgttgttg-ttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttg 415  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  10684395 gttagctcttagtgtggatttgct-tacattaggcttaggctgttttgttgttgattagcttggaggccatttgcactcatagattacctctatctcttg 10684493  T
Q  416 ctccacacatcattggtttattctcattggtgtgaag 452  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  10684494 ctccacacatctttgatttattctcattggtgtgaag 10684530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 18 - 452
Target Start/End: Original strand, 39784657 - 39785088
Alignment:
Q  18 gggatcctttggggtgtgttcctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgaggatgg 117  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||    
T  39784657 gggatcctatggggtgtgtgcctttgatgagagagtctcttaggttgggaaaa--acattgtaatcaccttgggattttgggttcatagtgtgagagtgg 39784754  T
Q  118 gaaaataccaaagggtagatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggag 217  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39784755 gaaaataccaaagggtagttctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagagtcttgtaac-cttttgtaacac-ttcacatattggattggag 39784852  T
Q  218 agctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcttttatcgcttatcttgtatg--- 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||       
T  39784853 agctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttc-tttccttttaccgcttatcttgtttgtgc 39784951  T
Q  314 cttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggctta-ggttgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcac 412  Q
     |||  | ||||| |||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||| || |||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||    
T  39784952 tttggaatctctt-gtgtggttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttattggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcac 39785049  T
Q  413 ttgctccacacatcattggtttattctcattggtgtgaag 452  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  39785050 ttgctccacacatctttggtttatt-tcattggtgtgaag 39785088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 18 - 452
Target Start/End: Original strand, 25328112 - 25328542
Alignment:
Q  18 gggatcctttggggtgtgttcctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgaggatgg 117  Q
    |||||||| |||| |||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||  |||    
T  25328112 gggatcctatgggttgtgtgtctttgatgagagtgtctcttgggttgggaaaa--acattgtaatcaccttgggttttagggttcatgttgtgagagtgg 25328209  T
Q  118 gaaaataccaaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattgga 216  Q
    | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  25328210 ggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaag-gctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattgga 25328307  T
Q  217 gagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcttttatcgcttatct--tgtatg 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||| || ||||||  | ||||    
T  25328308 gagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc-ttttcctttaccgtttatctcgtttatg 25328405  T
Q  314 -cttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggctta-ggttgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatca 411  Q
      ||| || ||||| |||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||    
T  25328406 ttttggtatctctt-gtgtggttttgctatacactag--ttagggttgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatca 25328502  T
Q  412 cttgctccacacatcattggtttattctcattggtgtgaag 452  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  25328503 cttgctccgcacatcattgatttatt-tcattgttgtgaag 25328542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 39 - 450
Target Start/End: Original strand, 7289780 - 7290188
Alignment:
Q  39 ctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgaggatgggaaaataccaaagggtaga-t 137  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||| ||| ||||||||||||| |    
T  7289780 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaa--acattgtaatcaccttgggttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaat 7289877  T
Q  138 ctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctaga-ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccaga 236  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7289878 atagggtttgttcatgtgtaaagcttgaag-gctagagttcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccaga 7289975  T
Q  237 ttaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcttttatcgcttatcttgtat---gcttgttagctcttagtgtg 332  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  || |||||||| |||||||||| |   | |||||| ||||| |||||    
T  7289976 ttaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc--ttccttttatcacttatcttgtttatggtttgttatctctttgtgtg 7290072  T
Q  333 gttttgctatacattaggcttaggttgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcattggt 432  Q
    ||||||||||||| ||| ||  || || |||||||||||| | |||||| |||||||  ||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||| | ||    
T  7290073 gttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgtttggagaccatttgttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcaat-gt 7290171  T
Q  433 ttattctcattggtgtga 450  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  7290172 ttatt-tcattggtgtga 7290188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 93 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 6311476 - 6311121
Alignment:
Q  93 tttagggttcatagtgtgaggatgggaaaataccaaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctaga--ttcttgtaactcttt 189  Q
    ||||||||||||  ||||||  |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||  |||||||||| ||||    
T  6311476 tttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgt-cttgtgtaaagcttgaag-gctagagtttcttgtaac-cttt 6311380  T
Q  190 tgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttt-gttcgt 288  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||      
T  6311379 tgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc-- 6311283  T
Q  289 tttcttttatcgcttatcttgt--atgctt-gttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggttgttttgttgttgttagcttggaggcca 385  Q
     ||| ||| | |||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||  || || |||||||||||| |||||||  |||    
T  6311282 -ttcctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctcttagtgtggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggaaacca 6311184  T
Q  386 tttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcattggtttattctcattggtgtga 450  Q
    ||||  ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  6311183 tttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcatt-gtttatt-tcattggtgtga 6311121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 93 - 426
Target Start/End: Original strand, 18853084 - 18853418
Alignment:
Q  93 tttagggttcatagtgtgaggatgggaaaataccaaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagcta--gattcttgtaactcttt 189  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||  | |||||||||| ||||    
T  18853084 tttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtaaaatctagggtttgttcttgtgtaa-gcttgaat-gctattgtttcttgtaacccttt 18853181  T
Q  190 tgtaacacattcac-atattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcg 287  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||     
T  18853182 tgtaacactttcattatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-cttggtgttttgttc- 18853279  T
Q  288 ttttcttttatcgcttatcttg-tatgc-ttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttagg-ttgttttgttgttgttagcttggaggcc 384  Q
      ||| ||| | |||||||||| | ||| ||| || ||||| ||||||||||||| || |  || ||  ||  | |||| |||||||| |||||||  ||    
T  18853280 --ttcctttcttgcttatcttgttttgctttggtatctctttgtgtggttttgctctaaacaagtctagggcgtttttttttgttgtttgcttggaaacc 18853377  T
Q  385 atttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatc 426  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  18853378 atttg-actcatagattaccactatctcttgctccacacatc 18853418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 93 - 271
Target Start/End: Original strand, 18870478 - 18870658
Alignment:
Q  93 tttagggttcatagtgtgaggatgggaaaataccaaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagcta--gattcttgtaactcttt 189  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||  | |||||||||| ||||    
T  18870478 tttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaa-gcttgaat-gctattgtttcttgtaacccttt 18870575  T
Q  190 tgtaacacattcac-atattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 271  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  18870576 tgtaacactttcattatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggatgaactgggtcaacaatctt 18870658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 93 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 36979557 - 36979378
Alignment:
Q  93 tttagggttcatagtgtgaggatgggaaaataccaaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagcta--gattcttgtaactcttt 189  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||  | |||||||||| ||||    
T  36979557 tttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaa-gcttgaag-gctattgtttcttgtaacccttt 36979460  T
Q  190 tgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 271  Q
     ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36979459 -gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 36979378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 93 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 30655826 - 30655647
Alignment:
Q  93 tttagggttcatagtgtgaggatgggaaaataccaaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagcta--gattcttgtaactcttt 189  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||  | |||||||||| ||||    
T  30655826 tttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaa-gcttgaag-gctattgtttcttgtaacccttt 30655729  T
Q  190 tgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 271  Q
     ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30655728 -gtaacactttcatcatattagattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 30655647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 93 - 271
Target Start/End: Original strand, 33037724 - 33037902
Alignment:
Q  93 tttagggttcatagtgtgaggatgggaaaataccaaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagcta--gattcttgtaactcttt 189  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||| ||| ||  | ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||  | |||||||||| ||||    
T  33037724 tttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggtttgttcttgtgtaa-gcttgaag-gctattgtttcttgtaacccttt 33037821  T
Q  190 tgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 271  Q
     ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33037822 -gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 33037902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 190 - 426
Target Start/End: Original strand, 10689157 - 10689392
Alignment:
Q  190 tgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcg 287  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||     
T  10689157 tgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-cttggtgttttgttc- 10689254  T
Q  288 ttttcttttatcgcttatcttg-tatgc-ttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggttg-ttttgttgttgttagcttggaggcc 384  Q
      ||| ||| |  ||||||||| | ||| ||| || ||||| ||||||||||||| |||| ||  ||  ||||| ||||||||||||| |||||||  ||    
T  10689255 --ttcctttcttacttatcttgttttgctttggtatctctttgtgtggttttgctctacactacactagggttgtttttgttgttgtt-gcttggaaacc 10689351  T
Q  385 atttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatc 426  Q
    ||| | |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  10689352 attag-actcatagattaccactatctcttgctccacacatc 10689392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 93 - 271
Target Start/End: Original strand, 4759992 - 4760171
Alignment:
Q  93 tttagggttcatagtgtgaggatgggaaaataccaaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagcta--gattcttgtaactcttt 189  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||| ||| ||  | ||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||  ||||  | |||||||||| ||||    
T  4759992 tttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttgaag-gctattgtttcttgtaacccttt 4760089  T
Q  190 tgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 271  Q
     ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4760090 -gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 4760171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 189 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 26287985 - 26287902
Alignment:
Q  189 ttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 271  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26287985 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 26287902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 189 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 26301242 - 26301159
Alignment:
Q  189 ttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 271  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26301242 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 26301159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 189 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 26313236 - 26313153
Alignment:
Q  189 ttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 271  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26313236 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 26313153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 175 - 271
Target Start/End: Original strand, 1261954 - 1262050
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 271  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  1261954 ttcttgtaacccttt-gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggttgaactgggtcaacaatctt 1262050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 181 - 272
Target Start/End: Original strand, 26403235 - 26403328
Alignment:
Q  181 taactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 272  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  26403235 taactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 26403328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 175 - 272
Target Start/End: Original strand, 23799576 - 23799675
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 272  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  23799576 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcctccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 23799675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 175 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 4456125 - 4456028
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 271  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||| |||||||    
T  4456125 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggaccgaaccgggtcagcaatctt 4456028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 175 - 272
Target Start/End: Original strand, 5702482 - 5702581
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 272  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| | |||||||||||||| |||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  5702482 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcataggggattggagggatgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 5702581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 175 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 6127319 - 6127224
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaat 268  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||| | |||||| |||||||||    
T  6127319 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctcttccccaaattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaat 6127224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 175 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 7412438 - 7412344
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaat 268  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| | ||||||||||||||||    
T  7412438 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaat 7412344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 175 - 308
Target Start/End: Original strand, 19175754 - 19175887
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 272  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||| |||||||||||||     
T  19175754 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtggattggagagttgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatcttt 19175852  T
Q  273 ctcggtgtttgttcgttttcttttatcgcttatctt 308  Q
     |  ||||||||||  ||||||| || |||||||||    
T  19175853 ttgtgtgtttgttc-ctttctttcattgcttatctt 19175887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 104
Target Start/End: Original strand, 25327986 - 25328070
Alignment:
Q  18 gggatcctttggggtgtgttcctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcat 104  Q
    |||||||| |||| |||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25327986 gggatcctatgggttgtgtgtctttgatgagagtgtctcttgggttgggaaa--aacattgtaatcaccttgggttttagggttcat 25328070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 175 - 271
Target Start/End: Original strand, 31071229 - 31071326
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 271  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||| |||||||||||||    
T  31071229 ttcttgtaacccttt-gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactcggtcaacaatctt 31071326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 203 - 308
Target Start/End: Original strand, 4696624 - 4696727
Alignment:
Q  203 catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggct-gaactgggtcaacaatcttgctcggtgtttgttcgttttcttttatcgc 301  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||| |  ||||||||||  ||||||| || ||    
T  4696624 catagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggatcgaactgggtcaacaatcttggt--gtgtttgttc-atttctttcattgc 4696720  T
Q  302 ttatctt 308  Q
    |||||||    
T  4696721 ttatctt 4696727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 269
Target Start/End: Original strand, 9765852 - 9765914
Alignment:
Q  208 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatc 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||    
T  9765852 tggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatc 9765914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 175 - 272
Target Start/End: Original strand, 19752394 - 19752492
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 272  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||| | || ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  19752394 ttcttgtaactcatt-gtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccctagactaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatcttg 19752492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 267
Target Start/End: Original strand, 43079877 - 43079937
Alignment:
Q  208 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 267  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  43079877 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 43079937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 267
Target Start/End: Original strand, 43082248 - 43082308
Alignment:
Q  208 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 267  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  43082248 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 43082308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 6311583 - 6311533
Alignment:
Q  39 ctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttggg 91  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  6311583 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaa--acattgtaatcaccttggg 6311533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 241
Target Start/End: Original strand, 18810982 - 18811015
Alignment:
Q  208 tggattggagagctgctctctcccccagattagg 241  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18810982 tggattggagggctgctctctcccccagattagg 18811015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 91
Target Start/End: Original strand, 18870373 - 18870423
Alignment:
Q  39 ctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttggg 91  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  18870373 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaa--aacattgtaatcaccttggg 18870423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 30655931 - 30655881
Alignment:
Q  39 ctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttggg 91  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  30655931 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaa--acattgtaatcaccttggg 30655881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 208 - 267
Target Start/End: Original strand, 44721118 - 44721178
Alignment:
Q  208 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 267  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||  |||| | |||||||||||||||    
T  44721118 tggattggagagctgctctctcccgcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 44721178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 391; Significance: 0; HSPs: 46)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 391; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 2785629 - 2785195
Alignment:
Q  18 gggatcctttggggtgtgttcctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgaggatgg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||    
T  2785629 gggatcctttggggtgtgttcctttgatgagagtgtttcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggattatgggttcatagtgtgagggtgg 2785530  T
Q  118 gaaaataccaaagggtagatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggag 217  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2785529 gaaaataccaaagggtaggtctagggtttgttcatgagtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggag 2785430  T
Q  218 agctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgtttgttcgttttcttttatcgcttatcttgtatgcttg 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  2785429 agctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgtttgttcttttccttttatcgtttatcttgtatgcttg 2785330  T
Q  318 ttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggttgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgct 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2785329 ttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgct 2785230  T
Q  418 ccacacatcattggtttattctcattggtgtgaag 452  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2785229 ccacacatcattggtttattctcattggtgtgaag 2785195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 382; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 452
Target Start/End: Original strand, 31396818 - 31397258
Alignment:
Q  14 agatgggatcctttggggtgtgttcctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgagg 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  31396818 agatgggatcctttggggtgtgttcctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggattatgggttcatagtgtgagg 31396917  T
Q  114 atgggaaaataccaaagggtagatctagggtttgtt--catgtgtaaagcttgaatagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattgga 211  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31396918 atgggaaaatgccaaagggtagatctagggttttttgtcttgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattgga 31397017  T
Q  212 ttggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgtttgttcgttttcttttatcgcttatcttgta 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  31397018 ttggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgtttgtttgttttcttttatcgtttatcttgta 31397117  T
Q  312 tgcttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggttgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatca 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31397118 tgcttgttagctcttagtgtggttttgctttacattaggcttaggatgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatca 31397217  T
Q  412 cttgctccacacatcattggtttattctcattggtgtgaag 452  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31397218 cttgctccacacatcattgatttattctcattggtgtgaag 31397258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 378; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 452
Target Start/End: Original strand, 31401675 - 31402115
Alignment:
Q  14 agatgggatcctttggggtgtgttcctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgagg 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  31401675 agatgggatcctttggggtgtgttcctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggattatgggttcatagtgtgagg 31401774  T
Q  114 atgggaaaataccaaagggtagatctagggtttgtt--catgtgtaaagcttgaatagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattgga 211  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||  | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31401775 atgggaaaatgccaaagggtagatctagagttttttgtcttgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattgga 31401874  T
Q  212 ttggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgtttgttcgttttcttttatcgcttatcttgta 311  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31401875 ttggagagctgctctctcccccatattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgtttgttcgttttcttttatcgtttatcttgta 31401974  T
Q  312 tgcttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggttgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatca 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31401975 tgcttgttagctcttagtgtggttttgctttacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatca 31402074  T
Q  412 cttgctccacacatcattggtttattctcattggtgtgaag 452  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31402075 cttgctccacacatcattgatttattctcattggtgtgaag 31402115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 33791570 - 33791136
Alignment:
Q  18 gggatcctttggggtgtgttcctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgaggatgg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||    
T  33791570 gggatcctttggggtgtgttcctttgatgagagtgtttcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggattatgggttcatagtgtgagggtgg 33791471  T
Q  118 gaaaataccaaagggtagatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggag 217  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33791470 gaaaataccaaagggtaggtctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggag 33791371  T
Q  218 agctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgtttgttcgttttcttttatcgcttatcttgtatgcttg 317  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  33791370 agctgctctttcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgtttgttcttttccttttatcgtttatcttgtatgcttg 33791271  T
Q  318 ttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggttgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgct 417  Q
    ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33791270 ttagctctatatgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgct 33791171  T
Q  418 ccacacatcattggtttattctcattggtgtgaag 452  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33791170 ccacacatcattggtttattctcattgatgtgaag 33791136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 33768438 - 33767999
Alignment:
Q  18 gggatcctttggggtgtgttcctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtga---gga 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    ||     
T  33768438 gggatcctttggggtgtgttcctttgatgagagtgtttcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggattattggttcatagtgtggaggggt 33768339  T
Q  115 tgggaaaatacc--aaagggtagatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggat 212  Q
     ||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33768338 agggaaaataaccgaaagggtaggtctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggat 33768239  T
Q  213 tggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgtttgttcgttttcttttatcgcttatcttgtat 312  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||    
T  33768238 tggagagctgctctcccccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgtttgttcttttccttttatcgtttatcctgtat 33768139  T
Q  313 gcttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggttgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcac 412  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33768138 gcttgttagctctatatgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggtcatttgcactcatagattatctctatcac 33768039  T
Q  413 ttgctccacacatcattggtttattctcattggtgtgaag 452  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33768038 ttgctccacacatcattggtttattctcattgatgtgaag 33767999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 18 - 454
Target Start/End: Original strand, 37556457 - 37556891
Alignment:
Q  18 gggatcctttggggtgtgttcctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgaggatgg 117  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||    
T  37556457 gggatcctatggggtgtgttcctttgatgtgagtgtttcttaggttgggaaaaca---ttgtaatcaccttgggattttgggttcatagtgtgagagtgg 37556553  T
Q  118 gaaaataccaaagggtagatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggag 217  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37556554 gaaaataccaaagggtagttctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagatacttgtaac-cttttgtaacactttcacatattggattggag 37556652  T
Q  218 agctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttt-gttcgttttcttttatcgcttatcttgt--atgc 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||| || |||||||||  ||||    
T  37556653 agctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttc-tttccatttaccgtttatcttgtttatgc 37556751  T
Q  315 ttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggttgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcactt 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  37556752 ttgttagctcttagtgtggttttgctatacacaagtcataggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgctctcatagattatcactatcactt 37556851  T
Q  415 gctccacacatcattggtttattctcattggtgtgaagat 454  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  37556852 gctccacacatctttggtttattatcattggtgtgaagat 37556891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 18 - 452
Target Start/End: Original strand, 37561279 - 37561711
Alignment:
Q  18 gggatcctttggggtgtgttcctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgaggatgg 117  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||    
T  37561279 gggatcctatggggtgtgttcctttgatgtgagtgtttcttaggttgggaaaaca---ttgtaatcaccttgggattttgggttcatagtgtgagagtgg 37561375  T
Q  118 gaaaataccaaagggtagatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggag 217  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37561376 gaaaataccaaagggtagttctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagatacttgtaac-cttttgtaacactttcacatattggattggag 37561474  T
Q  218 agctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttt-gttcgttttcttttatcgcttatcttgt--atgc 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||| || |||||||||  ||||    
T  37561475 agctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttc-tttccatttaccgtttatcttgtttatgc 37561573  T
Q  315 ttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggttgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcactt 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  37561574 ttgttagctcttagtgtggttttgctatacacaagtcataggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgctctcatagattatcactatcactt 37561673  T
Q  415 gctccacacatcattggtttattctcattggtgtgaag 452  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  37561674 gctccacacatctttggtttattatcattggtgtgaag 37561711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 18 - 452
Target Start/End: Original strand, 28807408 - 28807839
Alignment:
Q  18 gggatcctttggggtgtgttcctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgaggatgg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||    
T  28807408 gggatcctttggggtgtgttcctttgatgagagtgtttcttaggttgggaaaa--acattgtaatcaccttgggattttgggttcatagtgtgagagtgg 28807505  T
Q  118 gaaaataccaaagggtagatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggag 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28807506 gaaaataccaaagggtagatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaa-agctagattcttgtaac-cttttgtaacac-ttcacatattggattggag 28807602  T
Q  218 agctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcttttatcgcttatcttg--tatgc 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| || ||||||||  |||||    
T  28807603 agctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttc-tttccttttaccgtttatcttgtttatgc 28807701  T
Q  315 ttgttagctcttagtgtgg--ttttgctatacattaggcttaggttgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcac 412  Q
    |||||||||||| | ||||  |||||||||||| || |||||||    |||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||| ||||||| |||||||    
T  28807702 ttgttagctctttgagtggttttttgctatacacta-gcttagggctgtttgttgttgtttgcttggaagccatttgttctcattgattatcactatcac 28807800  T
Q  413 ttgctccacacatcattggtttattctcattggtgtgaag 452  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28807801 ttgctccacacatcattggtttatt-tcattggtgtgaag 28807839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 39 - 450
Target Start/End: Original strand, 1457016 - 1457423
Alignment:
Q  39 ctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgaggatgggaaaataccaaagggtaga-t 137  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||| ||| ||||||||||||| |    
T  1457016 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaa--acattgtaatcaccttgggttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaat 1457113  T
Q  138 ctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctaga-ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccaga 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1457114 ctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaag-gctagagttcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccaga 1457211  T
Q  237 ttaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcttttatcgcttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgtg 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||   ||| ||| |  |||||||||  ||||| |||||| ||||| |||||    
T  1457212 ttaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc---ttcctttctttcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtg 1457307  T
Q  333 gttttgctatacattaggcttaggttgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcattggt 432  Q
    ||||||||||||| ||| ||  || || |||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||    
T  1457308 gttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcatt-gt 1457406  T
Q  433 ttattctcattggtgtga 450  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  1457407 ttatt-tcattggtgtga 1457423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 39 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 43592510 - 43592120
Alignment:
Q  39 ctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgaggatgggaaaataccaaagggtaga-t 137  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||  |||| ||| ||||||||||||| |    
T  43592510 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaa--acattgtaatcaccttgggttttagggttcatattaagagagtggggaaacaccaaagggtagaat 43592413  T
Q  138 ctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctaga-ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccaga 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43592412 ctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaag-gctagagttcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccaga 43592315  T
Q  237 ttaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcttttatcgcttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgtg 332  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  || |||||||| |||||||||  ||||| |||||| ||||| |||||    
T  43592314 ttaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc--ttccttttatcacttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtg 43592218  T
Q  333 gttttgctatacattaggcttaggttgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcattg 430  Q
    ||||||||||||| ||| ||  || || |||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||    
T  43592217 gttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcattg 43592120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 39 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 27445201 - 27444793
Alignment:
Q  39 ctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgaggatgggaaaataccaaagggtaga-t 137  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||  |||| ||| ||||||||||||| |    
T  27445201 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaa--acattgtaatcaccttgggttttagggttcatattaagagagtggggaaacaccaaagggtagaat 27445104  T
Q  138 ctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctaga-ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccaga 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27445103 ctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaag-gctagagttcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccaga 27445006  T
Q  237 ttaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcttttatcgcttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgtg 332  Q
    |||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  || |||||||| |||||||||  ||||| |||||| ||||| |||||    
T  27445005 ttaggctatattgcctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc--ttccttttatcacttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtg 27444909  T
Q  333 gttttgctatacattaggcttaggttgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcattggt 432  Q
    ||||||||||||| ||| ||  || || | |||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||    
T  27444908 gttttgctatacactagtctagggctgctatgttgttgtttgcttggagaccatttgtactcattgattaccactatctcttgctccacacatcatt-gt 27444810  T
Q  433 ttattctcattggtgtga 450  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  27444809 ttatt-tcattggtgtga 27444793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 39 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 27450045 - 27449637
Alignment:
Q  39 ctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgaggatgggaaaataccaaagggtaga-t 137  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||  |||| ||| ||||||||||||| |    
T  27450045 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaa--acattgtaatcaccttgggttttagggttcatattaagagagtggggaaacaccaaagggtagaat 27449948  T
Q  138 ctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctaga-ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccaga 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27449947 ctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaag-gctagagttcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccaga 27449850  T
Q  237 ttaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcttttatcgcttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgtg 332  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  || |||||||| |||||||||  ||||| |||||| ||||| |||||    
T  27449849 ttaggctatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc--ttccttttatcacttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtg 27449753  T
Q  333 gttttgctatacattaggcttaggttgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcattggt 432  Q
    ||||||||||||| ||| ||  || || | |||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||| | ||||| ||||||||||| |||||| ||    
T  27449752 gttttgctatacactagtctagggctgctatgttgttgtttgcttggagaccatttgtactcattgattaccactatctcttgctccacatatcatt-gt 27449654  T
Q  433 ttattctcattggtgtga 450  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  27449653 ttatt-tcattggtgtga 27449637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 39 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 15044917 - 15044528
Alignment:
Q  39 ctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgaggatgggaaaataccaaagggtaga-t 137  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |    
T  15044917 ctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaa-aacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaat 15044819  T
Q  138 ctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagat 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15044818 ctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaa-agctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccatat 15044721  T
Q  238 taggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcttttatcgcttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgtgg 333  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  || ||||| | ||||||||||  ||||| |||  | ||||| ||||||    
T  15044720 taggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-cttggtgttttgttc--ttccttttcttgcttatcttgtttatgctttggaatctctt-gtgtgg 15044625  T
Q  334 ttttgctatacattaggcttaggttgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcattg 430  Q
    |||||||||||| ||| ||  || ||||||||||||||| | |||||| |||||||  ||||| ||||| | ||||||||||||| |||| ||||||    
T  15044624 ttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgttggtttggagaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctctacacgtcattg 15044528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 39 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 43598955 - 43598547
Alignment:
Q  39 ctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgaggatgggaaaataccaaagggtaga-t 137  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||  |||| ||| ||||||||||||| |    
T  43598955 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaa--acattgtaatcaccttgggttttagggttcatattaagagagtggggaaacaccaaagggtagaat 43598858  T
Q  138 ctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctaga-ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccaga 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43598857 ctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaag-gctagagttcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccaga 43598760  T
Q  237 ttaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcttttatcgcttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgtg 332  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||  || |||||||| |||||||||  ||||| |||||| ||||| |||||    
T  43598759 ttaggccatattggctgaactggaccaacaatctt-ctcggtgttttgttc--ttccttttatcacttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtg 43598663  T
Q  333 gttttgctatacattaggcttaggttgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcattggt 432  Q
    ||||||||||||| ||| ||  || || |||||||||||| |||||||| ||| |||  ||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||    
T  43598662 gttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccaattgttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcatt-gt 43598564  T
Q  433 ttattctcattggtgtga 450  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  43598563 ttatt-tcattggtgtga 43598547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 39 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 43604447 - 43604039
Alignment:
Q  39 ctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgaggatgggaaaataccaaagggtaga-t 137  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||  |||| ||| ||||||||||||| |    
T  43604447 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaa--acattgtaatcaccttgggttttagggttcatattaagagagtggggaaacaccaaagggtagaat 43604350  T
Q  138 ctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctaga-ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccaga 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43604349 ctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaag-gctagagttcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccaga 43604252  T
Q  237 ttaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcttttatcgcttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgtg 332  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||  || |||||||| |||||||||  ||||| |||||| ||||| |||||    
T  43604251 ttaggccatattggctgaactggaccaacaatctt-ctcggtgttttgttc--ttccttttatcacttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtg 43604155  T
Q  333 gttttgctatacattaggcttaggttgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcattggt 432  Q
    ||||||||||||| ||| ||  || || |||||||||||| |||||||| ||| |||  ||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||    
T  43604154 gttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccaattgttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcatt-gt 43604056  T
Q  433 ttattctcattggtgtga 450  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  43604055 ttatt-tcattggtgtga 43604039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 39 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 43609939 - 43609531
Alignment:
Q  39 ctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgaggatgggaaaataccaaagggtaga-t 137  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||  |||| ||| ||||||||||||| |    
T  43609939 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaa--acattgtaatcaccttgggttttagggttcatattaagagagtggggaaacaccaaagggtagaat 43609842  T
Q  138 ctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctaga-ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccaga 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43609841 ctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaag-gctagagttcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccaga 43609744  T
Q  237 ttaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcttttatcgcttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgtg 332  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||  || |||||||| |||||||||  ||||| |||||| ||||| |||||    
T  43609743 ttaggccatattggctgaactggaccaacaatctt-ctcggtgttttgttc--ttccttttatcacttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtg 43609647  T
Q  333 gttttgctatacattaggcttaggttgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcattggt 432  Q
    ||||||||||||| ||| ||  || || |||||||||||| |||||||| ||| |||  ||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||    
T  43609646 gttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccaattgttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcatt-gt 43609548  T
Q  433 ttattctcattggtgtga 450  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  43609547 ttatt-tcattggtgtga 43609531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 93 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 30631586 - 30631249
Alignment:
Q  93 tttagggttcatagtgtgaggatgggaaaataccaaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctaga--ttcttgtaactcttt 189  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||| ||||    
T  30631586 tttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctatggtttgttcatgtgtaaagcttgaag-gctagagtttcttgtaacccttt 30631488  T
Q  190 tgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgt 288  Q
     ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| |||||||      
T  30631487 -gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgagtcaacaatctt-cttggtgttttgttc-- 30631392  T
Q  289 tttcttttatcgcttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggttgttttgttgttgttagcttggaggcca 385  Q
     ||| ||| |  |||||||||  ||||| |||||| || |   |||| |||||||||||| ||| ||  || ||||||||||||||| ||||| |  |||    
T  30631391 -ttcctttcttacttatcttgtttatgctttgttatctatatatgtgattttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtt-gcttgaaaacca 30631294  T
Q  386 tttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcattg 430  Q
    ||||  ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||    
T  30631293 tttgttctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattg 30631249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 93 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 31180393 - 31180215
Alignment:
Q  93 tttagggttcatagtgtgaggatgggaaaataccaaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctaga--ttcttgtaactcttt 189  Q
    |||| |||||||| ||||||  |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||  |||||||||| ||||    
T  31180393 tttatggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgt-cttgtgtaaagcttgaag-gctagagtttcttgtaacccttt 31180296  T
Q  190 tgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 271  Q
     ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31180295 -gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 31180215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 175 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 38192270 - 38192174
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 271  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38192270 ttcttgtaacccttt-gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 38192174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 175 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 38219495 - 38219399
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 271  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38219495 ttcttgtaacccttt-gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 38219399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 175 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 10281849 - 10281751
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 271  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| | |||||||||||||||||||    
T  10281849 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagatcaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 10281751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 93 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 24136027 - 24135849
Alignment:
Q  93 tttagggttcatagtgtgaggatgggaaaataccaaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctagatt-cttgtaactctttt 190  Q
    ||||||||||| | ||||||  |||| ||| ||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||| ||||| | |||||  || |||||||| ||||     
T  24136027 tttagggttcacattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctaggacttgttcttgtgtaa-gcttgca-agctatttttcttgtaacccttt- 24135931  T
Q  191 gtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 271  Q
    ||||||| |||| | || || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24135930 gtaacactttcatcttagtgcattggatagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 24135849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 175 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 35387759 - 35387663
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 271  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  35387759 ttcttgtaacccttt-gtaacactttcatcatagtagattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaattgggtcaacaatctt 35387663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 175 - 271
Target Start/End: Original strand, 9353332 - 9353429
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 271  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||    
T  9353332 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 9353429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 175 - 271
Target Start/End: Original strand, 36932350 - 36932447
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 271  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||    
T  36932350 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 36932447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 175 - 270
Target Start/End: Original strand, 11916971 - 11917068
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattcac-atattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatct 270  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| | ||||||||||||||||||    
T  11916971 ttcttgtaactcttttgtaacactttcattatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatct 11917068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 175 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 15464629 - 15464532
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 271  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| | |||||||||||||||||||    
T  15464629 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattagatcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 15464532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 178 - 308
Target Start/End: Original strand, 17003962 - 17004091
Alignment:
Q  178 ttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttgctc 275  Q
    |||||||||||||| || || |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||| |     
T  17003962 ttgtaactcttttgaaatactttcatcatagtggattgaagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttggt- 17004060  T
Q  276 ggtgtttgttcgttttcttttatcgcttatctt 308  Q
     ||||||||||  ||||||| || |||||||||    
T  17004061 -gtgtttgttc-ctttctttcattgcttatctt 17004091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 175 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 3880397 - 3880298
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 272  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||| | ||||||  ||||||||||||    
T  3880397 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctgcctcagattaggtcatattggacagaactgaatcaacaatcttg 3880298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 175 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 19588844 - 19588746
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 271  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||  || ||||| | |||||||||||||||||||    
T  19588844 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctccctaagattagttcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 19588746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 14520327 - 14520230
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 271  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||    
T  14520327 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtggattgaagagctgctctcccccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 14520230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 175 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 28832356 - 28832225
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 272  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||| | || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||| |||||||||||||||    
T  28832356 ttcttgtaactcatt-gtaacactttcatcttagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaaccgggtcaacaatcttg 28832258  T
Q  273 ctcggtgtttgttcgttttcttttatcgcttatctt 308  Q
     |  ||||||||| | ||||||| || |||||||||    
T  28832257 gt--gtgtttgtttg-tttctttcattgcttatctt 28832225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 268
Target Start/End: Original strand, 12084175 - 12084269
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaat 268  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || | ||| | ||||||||||||||||    
T  12084175 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctgccccatattaggtcatagtggaccgaactgggtcaacaat 12084269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 267
Target Start/End: Original strand, 4410241 - 4410301
Alignment:
Q  208 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  4410241 tggattggagagctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 4410301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 308
Target Start/End: Original strand, 42127410 - 42127541
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggct-gaactgggtcaacaatcttg 272  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||| | || |||||||| | ||||||||||||||||||||||| || ||| | | ||||||||||||||||||||    
T  42127410 ttcttgtaactcatt-gtaacactttcatcttagtggattggggggctgctctctcccccagattaggtcatattagatcgaactgggtcaacaatcttg 42127508  T
Q  273 ctcggtgtttgttcgttttcttttatcgcttatctt 308  Q
     |  ||||||||||  ||||||| || |||||||||    
T  42127509 gt--gtgtttgttc-ctttctttcattgcttatctt 42127541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 267
Target Start/End: Original strand, 15552464 - 15552524
Alignment:
Q  208 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 267  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  15552464 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 15552524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 31179431 - 31179371
Alignment:
Q  208 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 267  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  31179431 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 31179371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 267
Target Start/End: Original strand, 31542953 - 31543013
Alignment:
Q  208 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 267  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  31542953 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 31543013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 267
Target Start/End: Original strand, 31545299 - 31545359
Alignment:
Q  208 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 267  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  31545299 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 31545359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 214 - 267
Target Start/End: Original strand, 27910675 - 27910729
Alignment:
Q  214 ggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| | |||||||||||||||    
T  27910675 ggagagctgctctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 27910729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 30631691 - 30631641
Alignment:
Q  39 ctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttggg 91  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  30631691 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaa--acattgtaatcaccttggg 30631641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 31180498 - 31180448
Alignment:
Q  39 ctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttggg 91  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  31180498 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaa--acattgtaatcaccttggg 31180448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 272
Target Start/End: Original strand, 31300629 - 31300694
Alignment:
Q  208 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 272  Q
    |||||||||||| | ||||||||| |||| |||| || ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  31300629 tggattggagagtttctctctccctcagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 31300694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 208 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 3373197 - 3373137
Alignment:
Q  208 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 267  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  3373197 tggattggagggttgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 3373137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 208 - 267
Target Start/End: Original strand, 10749919 - 10749979
Alignment:
Q  208 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 267  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  10749919 tggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 10749979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 208 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 15354635 - 15354575
Alignment:
Q  208 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 267  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  15354635 tggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 15354575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 375; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 452
Target Start/End: Original strand, 148787 - 149221
Alignment:
Q  18 gggatcctttggggtgtgttcctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgaggatgg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||    
T  148787 gggatcctttggggtgtgttcctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggattatgggttcatagtgtgaggttgg 148886  T
Q  118 gaaaataccaaagggtagatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggag 217  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  148887 gaaattaccaaagggtagatctatggttttgtcttgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggag 148986  T
Q  218 agctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgtttgttcgttttcttttatcgcttatcttgtatgcttg 317  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  148987 agctactctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgtttgttcgttttcctttatcgtttatcttgtatgcttg 149086  T
Q  318 ttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggttgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgct 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  149087 ttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgct 149186  T
Q  418 ccacacatcattggtttattctcattggtgtgaag 452  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  149187 ccacacatcattgatttattctcattggtgtgaag 149221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 373; Significance: 0; HSPs: 55)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 452
Target Start/End: Original strand, 2676918 - 2677353
Alignment:
Q  18 gggatcctttggggtgtgttcctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgaggatgg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2676918 gggatcctttggggtgtgttcctttgatgagagtgtttcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgaggatgg 2677017  T
Q  118 gaaaataccaaagggtagatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggag 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2677018 gaaaataccaaagggtagatctagggttttgtcatgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggag 2677117  T
Q  218 agctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgtttgttcgttttctttt-atcgcttatcttg-tatgct 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || | |||||||| ||||||    
T  2677118 agctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgtttgttc-ttttcttttcatggtttatcttgttatgct 2677216  T
Q  316 tgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggttgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttg 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2677217 tgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgctctcatagattatctctatcacttg 2677316  T
Q  416 ctccacacatcattggtttattctcattggtgtgaag 452  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2677317 ctccacacatcattggtttattctcattggtgtgaag 2677353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 24968361 - 24967957
Alignment:
Q  18 gggatcctttggggtgtgttcctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgaggatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24968361 gggatcctttggggtgtgttcctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgaggatgg 24968262  T
Q  118 gaaaataccaaagggtagatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggag 217  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24968261 gaaagtaccaaagggtagatctcgggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggag 24968162  T
Q  218 agctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgtttgttcgttttcttttatcgcttatcttgtatgcttg 317  Q
    |||| |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24968161 agctactctctccccaaaattaagccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgtttgttcgttttcttttatcgtttatcttgtatgcttg 24968062  T
Q  318 ttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggttgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgct 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24968061 ttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgct 24967962  T
Q  418 ccaca 422  Q
    |||||    
T  24967961 ccaca 24967957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 452
Target Start/End: Original strand, 2672762 - 2673197
Alignment:
Q  18 gggatcctttggggtgtgttcctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgaggatgg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2672762 gggatcctttggggtgtgttcctttgatgagagtgtttcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttaaggttcatagtgtgaggatgg 2672861  T
Q  118 gaaaataccaaagggtagatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggag 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2672862 gaaaataccaaagggtagatctagggttttgtcatgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggag 2672961  T
Q  218 agctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgtttgttcgttttctttt-atcgcttatcttg-tatgct 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || | |||||||| ||||||    
T  2672962 agctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgtttgttc-ttttcttttcatggtttatcttgttatgct 2673060  T
Q  316 tgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggttgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttg 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  2673061 tgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttactctcatagattatctctatcacttg 2673160  T
Q  416 ctccacacatcattggtttattctcattggtgtgaag 452  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2673161 ctccacacatcattggtttattctcattggtgtgaag 2673197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 8512471 - 8512035
Alignment:
Q  18 gggatcctttggggtgtgttcctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgaggatgg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||    
T  8512471 gggatcctttggggtgtgttcctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggattatgggttcatagtgtgaggttgg 8512372  T
Q  118 gaaaataccaaagggtagatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggag 217  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8512371 gaaattaccaaagggtaggtctagggttttgtcttgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggag 8512272  T
Q  218 agctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcttttatcg-cttatcttgtatgct 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  8512271 agctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttcgttttcgtttatcgttttatcttgtatgct 8512172  T
Q  316 tgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggttgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttg 415  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8512171 tgttaactcttagtgtggttgtgctacacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcatagattatctctatcacttg 8512072  T
Q  416 ctccacacatcattggtttattctcattggtgtgaag 452  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8512071 ctccacacatcattgatttattctcattggtgtgaag 8512035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 8517351 - 8516915
Alignment:
Q  18 gggatcctttggggtgtgttcctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgaggatgg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||    
T  8517351 gggatcctttggggtgtgttcctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggattatgggttcatagtgtgaggttgg 8517252  T
Q  118 gaaaataccaaagggtagatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggag 217  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8517251 gaaattaccaaagggtaggtctagggttttgtcttgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggag 8517152  T
Q  218 agctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcttttatcg-cttatcttgtatgct 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  8517151 agctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttcgttttcgtttatcgttttatcttgtatgct 8517052  T
Q  316 tgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggttgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttg 415  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8517051 tgttaactcttagtgtggttgtgctacacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcatagattatctctatcacttg 8516952  T
Q  416 ctccacacatcattggtttattctcattggtgtgaag 452  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8516951 ctccacacatcattgatttattctcattggtgtgaag 8516915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 14 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 32475742 - 32475304
Alignment:
Q  14 agatgggatcctttggggtgtgttcctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgagg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  32475742 agatgggatcctttggggtgtgttcctttgatgagagtgaatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcatcttgggattatgggttcatagtgtgagg 32475643  T
Q  114 atgggaaa-ataccaaagggtagatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggat 212  Q
     |||||||  || |||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  32475642 ttgggaaatttatcaaagggtaggtctagggttttgtcttgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactc-tttgtaa-acattcacatattggat 32475545  T
Q  213 tggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcttttatcgcttatcttgta 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32475544 tggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttcttttatcgtttatcttgta 32475445  T
Q  312 tgcttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggttgttttgttgttg-ttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatc 410  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32475444 tgcttgttagctcttagtgtggatttgct-tacattaggcttaggctgttttgttgttgattagtttggaggccatttgcactcatagattacctctatc 32475346  T
Q  411 acttgctccacacatcattggtttattctcattggtgtgaag 452  Q
     ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  32475345 tcttgctccacacatctttgatttattctcattggtgtgaag 32475304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 14 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 32480600 - 32480161
Alignment:
Q  14 agatgggatcctttggggtgtgttcctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgagg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  32480600 agatgggatcctttggggtgtgttcctttgatgagagtgaatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcatcttgggattatgggttcatagtgtgagg 32480501  T
Q  114 atgggaaa-ataccaaagggtagatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggat 212  Q
     |||||||  || |||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  32480500 ttgggaaatttatcaaagggtaggtctagggttttgtcttgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactc-tttgtaa-acattcacatattggat 32480403  T
Q  213 tggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcttttatcgcttatcttgta 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32480402 tggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttggttggtgttttgttcgttttcttttatcgtttatcttgta 32480303  T
Q  312 tgcttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggttgttttgttgttg-ttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatc 410  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32480302 tgcttgttagctcttagtgtggatttgct-tacattaggcttaggctgttttgttgttgattagtttggaggccatttgcactcatagattacctctatc 32480204  T
Q  411 acttgctccacacatcattgg-tttattctcattggtgtgaag 452  Q
     ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  32480203 tcttgctccacacatctttggatttattctcattggtgtgaag 32480161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 18 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 18656685 - 18656254
Alignment:
Q  18 gggatcctttggggtgtgttcctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgaggatgg 117  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||    
T  18656685 gggatcctatggggtgtgtgcctttgatgagagtgtttcttaggttgggaaaa--acattgtaatcaccttgggattaagggtttatagtgtgagagtgg 18656588  T
Q  118 gaaaataccaaagggtagatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggag 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  18656587 gaaaataccaaagggtagatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaat-gctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggag 18656490  T
Q  218 agctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgt--tttcttttatcgcttatcttgtatgc 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| || ||  |||| |||| || ||||||||| |||    
T  18656489 agctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcagtgttttttttgttctttcctttaccgtttatcttgtttgc 18656390  T
Q  315 -ttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggctta-ggttgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcac 412  Q
     |||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||| | | |||||    
T  18656389 tttgttagctctttgtgtggtttttctatacacta-gcttagggctgttttgttgttgttagcttggagaccatttgttctcattgattaccaccatcac 18656291  T
Q  413 ttgctccacacatcattggtttattctcattggtgtgaag 452  Q
    ||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||    
T  18656290 ttgctccacacatcattg---tattttcattggtgtgaag 18656254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 223 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 10207983 - 10207753
Alignment:
Q  223 ctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgtttgttcgttttctttt-atcgcttatcttgt-atgcttgtta 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| ||||||||||    
T  10207983 ctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgtttgttc-ttttcttttcatggtttatcttgttatgcttgtta 10207885  T
Q  321 gctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggttgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctcca 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10207884 gctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctcca 10207785  T
Q  421 cacatcattggtttattctcattggtgtgaag 452  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10207784 cacatcattggtttattctcattggtgtgaag 10207753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 39 - 454
Target Start/End: Original strand, 22173049 - 22173460
Alignment:
Q  39 ctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgaggatgggaaaataccaaagggtaga-t 137  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||  |||| ||| ||||||||||||| |    
T  22173049 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaa--acattgtaatcaccttgggttttagggttcatattaggagagtggggaaacaccaaagggtagaat 22173146  T
Q  138 ctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctaga-ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccaga 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22173147 ctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaag-gctagagttcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccaga 22173244  T
Q  237 ttaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcttttatcgcttatctt-gtatgc-ttgttagctcttagtgtgg 333  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  || |||||| ||||||||||  | ||| ||| || ||||| ||||||    
T  22173245 ttaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc--ttccttttaccgcttatcttattttgctttggtatctctttgtgtgg 22173341  T
Q  334 ttttgctatacattaggcttaggttgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcattggtt 433  Q
    |||||||||||| ||| ||  || ||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||    
T  22173342 ttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcatt-gtt 22173440  T
Q  434 tattctcattggtgtgaagat 454  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  22173441 tatt-tcattggtgtgaagat 22173460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 93 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 7167424 - 7167092
Alignment:
Q  93 tttagggttcatagtgtgaggatgggaaaataccaaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagcta--gattcttgtaactcttt 189  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||  | |||||||||| ||||    
T  7167424 tttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaa-gcttgaag-gctattgtttcttgtaacccttt 7167327  T
Q  190 tgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcg 287  Q
     ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||     
T  7167326 -gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-cttggtgttttgttc- 7167230  T
Q  288 ttttcttttatcgcttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggttgttttgttgttgttagcttggaggcc 384  Q
      ||| ||| | ||||||||||  ||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||| ||  || ||||||||||||||| |||||||  ||    
T  7167229 --ttcctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggctgttttgttgttgtt-gcttggaaacc 7167133  T
Q  385 atttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatc 426  Q
    ||||   ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  7167132 attt-tgctcatagattaccactatctcttgctccacacatc 7167092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 93 - 430
Target Start/End: Original strand, 28503781 - 28504108
Alignment:
Q  93 tttagggttcatagtgtgaggatgggaaaataccaaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctaga--ttcttgtaactcttt 189  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||  |||||||||| ||||    
T  28503781 tttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttattcttgtgtaaagcttgaag-gctagagtttcttgtaac-cttt 28503878  T
Q  190 tgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttt-gttcgt 288  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||      
T  28503879 tgtaacactttctcatattggattggagagctgctctcttccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc-- 28503975  T
Q  289 tttcttttatcgcttatcttgtatgcttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggttgttttgttgttgttagcttggaggccattt 388  Q
     ||| ||| | | ||||  |      |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| |   || ||||||||||||||| |||||||  ||||||    
T  28503976 -ttcctttcttgtttatgct------ttgttatctctttgtgtggttttgctatacactagtcaagggctgttttgttgttgtt-gcttggaaaccattt 28504067  T
Q  389 gcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcattg 430  Q
       ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||    
T  28504068 -ttctcatagattatcactaccttttgctccacacatcattg 28504108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 175 - 426
Target Start/End: Original strand, 2671586 - 2671836
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgc 273  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  2671586 ttcttgtaacccttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-c 2671683  T
Q  274 tcggtg-tttgttcgttttcttttatcgcttatcttg-tatgc-ttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggttg-ttttgttgtt 369  Q
    | |||| |||||||   ||| ||| | |||||||||| | ||| |||||| ||||| |||||||||| || |||| ||| ||  || || ||||||||||    
T  2671684 ttggtgttttgttc---ttcctttcttgcttatcttgttttgctttgttatctctttgtgtggtttttctctacactagactagggctgtttttgttgtt 2671780  T
Q  370 gttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatc 426  Q
    ||| |||||||| |||||||  ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  2671781 gtttgcttggagaccatttg-gctcatagattaccactatctcttgctccacacatc 2671836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 95 - 271
Target Start/End: Original strand, 8738982 - 8739159
Alignment:
Q  95 tagggttcatagtgtgaggatgggaaaataccaaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagcta--gattcttgtaactcttttg 191  Q
    ||||||||||| ||||||  |||| ||||||  | ||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||  ||||  | |||||||||| |||| |    
T  8738982 tagggttcatattgtgagagtggggaaatacatatgggtagaatctagggattgttcttgtgtaa-gcttgaag-gctattgtttcttgtaacccttt-g 8739078  T
Q  192 taacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 271  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8739079 taacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 8739159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 95 - 271
Target Start/End: Original strand, 9091220 - 9091397
Alignment:
Q  95 tagggttcatagtgtgaggatgggaaaataccaaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagcta--gattcttgtaactcttttg 191  Q
    ||||||||||| ||||||  |||| ||||||  | ||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||  ||||  | |||||||||| |||| |    
T  9091220 tagggttcatattgtgagagtggggaaatacatatgggtagaatctagggattgttcttgtgtaa-gcttgaag-gctattgtttcttgtaacccttt-g 9091316  T
Q  192 taacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 271  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9091317 taacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 9091397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 175 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 8477459 - 8477363
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 271  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8477459 ttcttgtaacccttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 8477363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 175 - 271
Target Start/End: Original strand, 40372795 - 40372891
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 271  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40372795 ttcttgtaacccttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 40372891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 93 - 228
Target Start/End: Original strand, 28501614 - 28501750
Alignment:
Q  93 tttagggttcatagtgtgaggatgggaaaataccaaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctaga--ttcttgtaactcttt 189  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||  |||||||||| ||||    
T  28501614 tttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttattcttgtgtaaagcttgaag-gctagagtttcttgtaac-cttt 28501711  T
Q  190 tgtaacacattcacatattggattggagagctgctctct 228  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28501712 tgtaacactttctcatattggattggagagctgctctct 28501750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 175 - 272
Target Start/End: Original strand, 18552872 - 18552971
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 272  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  18552872 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 18552971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 175 - 307
Target Start/End: Original strand, 40592771 - 40592903
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 272  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  40592771 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtcgattggagagcttctctctcccacagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 40592870  T
Q  273 ctcggtgtttgttcgttttcttttatcgcttatct 307  Q
     |  |||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  40592871 gt--gtgtttgttccttttctttcattgcttatct 40592903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 175 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 36029191 - 36029050
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 272  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||| |    
T  36029191 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctttctcccccagattaggtcatattggacagaactgggtcaacaatctcg 36029092  T
Q  273 ctcggtgtttgttcgttttcttttatcgcttatcttgtatgcttgt 318  Q
     |  ||||||||||  ||||||| || ||||||||| |||||||||    
T  36029091 gt--gtgtttgttc-ctttctttcattgcttatctt-tatgcttgt 36029050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 175 - 271
Target Start/End: Original strand, 26928591 - 26928687
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 271  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  26928591 ttcttgtaacccttt-gtaacactttcatcatagtggattggagagttgctctctcccccagattaggtcatattggctgaactgggtcaacaatctt 26928687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 175 - 268
Target Start/End: Original strand, 1736294 - 1736389
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaat 268  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||    
T  1736294 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaat 1736389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 175 - 271
Target Start/End: Original strand, 8370476 - 8370573
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 271  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||    
T  8370476 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 8370573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 175 - 271
Target Start/End: Original strand, 27974942 - 27975039
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 271  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||    
T  27974942 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 27975039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 175 - 271
Target Start/End: Original strand, 30709779 - 30709877
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 271  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||    
T  30709779 ttcttgtaactcttttgtaacaatttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 30709877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 175 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 1306045 - 1305949
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 271  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| | || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1306045 ttcttgtaacccttt-gtaacactttcatcgtagtggattggagagctgctatctcccctagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 1305949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 175 - 272
Target Start/End: Original strand, 3715991 - 3716090
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 272  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  3715991 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtagattggagagctgctctctctcctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 3716090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 175 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 21711320 - 21711222
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 272  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  21711320 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtggatttgagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 21711222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 175 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 48438312 - 48438213
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 272  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||| |||||| |||||||    
T  48438312 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaataatcttg 48438213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 175 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 16264447 - 16264350
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 271  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||| |||||||||||||    
T  16264447 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctt 16264350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 189 - 271
Target Start/End: Original strand, 27986449 - 27986533
Alignment:
Q  189 ttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 271  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||    
T  27986449 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 27986533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 175 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 26299086 - 26298987
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattg-gctgaactgggtcaacaatcttg 272  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||  | ||||||||||||||||||||    
T  26299086 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtagattggagggctgctctctcccccagattatgtcatattgaaccgaactgggtcaacaatcttg 26298987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 175 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 25795879 - 25795781
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 271  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| | || | |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||| |||||||||||||    
T  25795879 ttcttgtaactctttcgtaacactttcatcttagtagattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctt 25795781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 175 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 32143418 - 32143321
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 271  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||| |||||||||||||    
T  32143418 ttcttgtaacccttt-gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctt 32143321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 189 - 271
Target Start/End: Original strand, 33386669 - 33386753
Alignment:
Q  189 ttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 271  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||| |||||||||||    
T  33386669 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactggatcaacaatctt 33386753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 175 - 272
Target Start/End: Original strand, 6794703 - 6794801
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 272  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |  ||| |||||||||||||||    
T  6794703 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattggacctaaccgggtcaacaatcttg 6794801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 175 - 272
Target Start/End: Original strand, 47923895 - 47923994
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggct-gaactgggtcaacaatcttg 272  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||| |||| | ||||| || |||||||||||||| |||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  47923895 ttcttgtaactcttttgtagcactttcatcatagtagattgaagggctgctctctcccctagattaggtcatattggatcgaactgggtcaacaatcttg 47923994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 27453055 - 27452958
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 271  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| | ||||||| |||||||||||    
T  27453055 ttcttgtaacccttt-gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccggattaggtcatattggaccgaactggatcaacaatctt 27452958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 40844749 - 40844651
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 272  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||| |||||||||| |||||||||||| || ||||| | ||||||  ||||||||||||    
T  40844749 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggatttgagggctgctctct-ccccagattaggtcatattggaccgaactgaatcaacaatcttg 40844651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 272
Target Start/End: Original strand, 1417513 - 1417578
Alignment:
Q  208 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 272  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  1417513 tggattggagggatgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 1417578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 37466388 - 37466257
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 272  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||| | || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||| | |||||| |||||||||||||    
T  37466388 ttcttgtaactcatt-gtaacactttcatcttagtggattggagggctactctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgtgtcaacaatcttg 37466290  T
Q  273 ctcggtgtttgttcgttttcttttatcgcttatctt 308  Q
     |  ||||||||||  ||||||| || |||||||||    
T  37466289 gt--gtgtttgttc-atttctttcattgcttatctt 37466257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 175 - 272
Target Start/End: Original strand, 24695153 - 24695252
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 272  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||| ||| | |||||||||||  |||||||| || ||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  24695153 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagcggattagagggttgctctctcccgtagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatcttg 24695252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 205 - 241
Target Start/End: Original strand, 4386947 - 4386983
Alignment:
Q  205 tattggattggagagctgctctctcccccagattagg 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4386947 tattggattggagagctgctctctcccccagagtagg 4386983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 7167530 - 7167479
Alignment:
Q  39 ctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttggg 91  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7167530 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaa-aacattgtaatcaccttggg 7167479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 267
Target Start/End: Original strand, 38210569 - 38210629
Alignment:
Q  208 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  38210569 tggattggagagctgctctctcccccatactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 38210629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 271
Target Start/End: Original strand, 39039995 - 39040079
Alignment:
Q  189 ttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 271  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||| || ||||| | ||||| |||||||||||||    
T  39039995 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagttgttctcttccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctt 39040079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 267
Target Start/End: Original strand, 50494198 - 50494258
Alignment:
Q  208 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 267  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  50494198 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 50494258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 53894119 - 53894055
Alignment:
Q  204 atattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 267  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  |||| | |||||||||||||||    
T  53894119 atattggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 53894055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 272
Target Start/End: Original strand, 3328346 - 3328444
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggc-tgaactgggtcaacaatcttg 272  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||| | || ||||||| || |||||||||||| | |||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||    
T  3328346 ttcttgtaactcatt-gtaacactttcatcttagtggattgaagggctgctctctcctctagattaggtcatattggaatgaactgggtcaacaatcttg 3328444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 91
Target Start/End: Original strand, 28501509 - 28501559
Alignment:
Q  39 ctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttggg 91  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  28501509 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaa--aacattgtaatcaccttggg 28501559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 208 - 267
Target Start/End: Original strand, 458483 - 458543
Alignment:
Q  208 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 267  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  |||| | |||||||||||||||    
T  458483 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaggttggaccgaactgggtcaacaa 458543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 208 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 6063504 - 6063444
Alignment:
Q  208 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 267  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||| ||||    
T  6063504 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtccacaa 6063444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 208 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 10621588 - 10621528
Alignment:
Q  208 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 267  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||  || ||||| | |||||||||||||||    
T  10621588 tggattggagggctgctctctcccccagactagctcagattggaccgaactgggtcaacaa 10621528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 224 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 39153405 - 39153357
Alignment:
Q  224 tctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 271  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  39153405 tctctcccccagattaggtcaagttggactgaactgggtcaacaatctt 39153357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 371; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 452
Target Start/End: Original strand, 18992 - 19430
Alignment:
Q  14 agatgggatcctttggggtgtgttcctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgagg 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  18992 agatgggatcctttggggtgtgttcctttgatgagagtgtttcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttggaattatgggttcatagtgtgagg 19091  T
Q  114 atgggaaaataccaaagggtagatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggatt 213  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  19092 ttgggaaattaccaaagggtagatctagggttttgtcttgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacactcacatattgtatt 19191  T
Q  214 ggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgtttgttcgttttcttttatcgcttatcttgtatg 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19192 ggagagctgctctctcccccagattaggccacaatggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgtttgttcgttttcttttatcgtttatcttgtatg 19291  T
Q  314 cttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggttgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcact 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19292 cttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcact 19391  T
Q  414 tgctccacacatcattggtttattctcattggtgtgaag 452  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19392 tgctccacacatcattgatttattctcattggtgtgaag 19430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197; HSP #2
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 452
Target Start/End: Original strand, 14140 - 14575
Alignment:
Q  18 gggatcctttggggtgtgttcctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgaggatgg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||    
T  14140 gggatcctttggggtgtgttcctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggattatgggttcatagtgtgaggttgg 14239  T
Q  118 gaaaataccaaagggtagatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggag 217  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14240 gaaattaccaaagggtaggtctagggttttgtcttgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggag 14339  T
Q  218 agctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcttttatcgcttatcttgtatgctt 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14340 agctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttcttttatcgtttatcttgtatgctt 14439  T
Q  317 gttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggttgttttgttgttg-ttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttg 415  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  14440 gttagctcttagtgtggatttgct-tacattaggcttaggctgttttgttgttgattagcttggaggccatttgcactcatagattacctctatctcttg 14538  T
Q  416 ctccacacatcattggtttattctcattggtgtgaag 452  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  14539 ctccacacatctttgatttattctcattggtgtgaag 14575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 367; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 452
Target Start/End: Original strand, 2082 - 2516
Alignment:
Q  18 gggatcctttggggtgtgttcctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgaggatgg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||    
T  2082 gggatcctttggggtgtgttcctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggattatgggttcatagtgtgaggttgg 2181  T
Q  118 gaaaataccaaagggtagatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggag 217  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2182 gaaattaccaaagggtagatctatggttttgtcttgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggag 2281  T
Q  218 agctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgtttgttcgttttcttttatcgcttatcttgtatgcttg 317  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  2282 agctactctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgtttgttcgttttcctttatcgtttatcttgtatgcttg 2381  T
Q  318 ttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggttgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgct 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  2382 ttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatggattatctttatcacttgct 2481  T
Q  418 ccacacatcattggtttattctcattggtgtgaag 452  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2482 ccacacatcattgatttattctcattggtgtgaag 2516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 349; Significance: 0; HSPs: 43)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 19344676 - 19344241
Alignment:
Q  18 gggatcctttggggtgtgttcctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaa-caacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgaggatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||    
T  19344676 gggatcctttggggtgtgttcctttgatgagagtgtttcttaggttgggaaaaacaacattgtaatcaccttgggattatgggttcatagtgtgagggtg 19344577  T
Q  117 ggaaaataccaaagggtagatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattgga 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19344576 ggaaaataccaaagggtaggtctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattgga 19344477  T
Q  217 gagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcttttatcgcttatcttgtatgct 315  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  19344476 gagctgctctctcccctagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttcttttccttttatcgtttatcttgtatgct 19344377  T
Q  316 tgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggttgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttg 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||    
T  19344376 tgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgctctcatagattaccactatctcttg 19344277  T
Q  416 ctccacacatcattggtttattctcattggtgtgaag 452  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  19344276 ctccacacatctttggtttatt-tcattggtgtgaag 19344241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 19349534 - 19349099
Alignment:
Q  18 gggatcctttggggtgtgttcctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaa-caacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgaggatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||    
T  19349534 gggatcctttggggtgtgttcctttgatgagagtgtttcttaggttgggaaaaacaacattgtaatcaccttgggattatgggttcatagtgtgagggtg 19349435  T
Q  117 ggaaaataccaaagggtagatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattgga 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19349434 ggaaaataccaaagggtaggtctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattgga 19349335  T
Q  217 gagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcttttatcgcttatcttgtatgct 315  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  19349334 gagctgctctctcccctagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttcttttccttttatcgtttatcttgtatgct 19349235  T
Q  316 tgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggttgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttg 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||    
T  19349234 tgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgctctcatagattaccactatctcttg 19349135  T
Q  416 ctccacacatcattggtttattctcattggtgtgaag 452  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  19349134 ctccacacatctttggtttatt-tcattggtgtgaag 19349099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 22 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 32247035 - 32246605
Alignment:
Q  22 tcctttggggtgtgttcctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgaggatgggaaa 121  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  32247035 tcctatggggtgtgtgcctttgatgagagtgtttcttaggttgggaaaa--acattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgagagtgggaaa 32246938  T
Q  122 ataccaaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagc 220  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  32246937 ataccaaagggtataatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaa-agctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagc 32246840  T
Q  221 tgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgt-tttcttttatcgcttatcttg--tatgc-t 315  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||| |  || |||| | ||||||||||  ||||| |    
T  32246839 tgctctctcccccagattaggccatattggctgaacaaggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttcctttttttcttgcttatcttgtttatgctt 32246740  T
Q  316 tgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggttgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttg 415  Q
    ||  | ||||| |||||||||||||||||| ||| ||  |  |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| | ||||||||||    
T  32246739 tggaatctctt-gtgtggttttgctatacactagtctaggactgttttgttgttgttagcttggagaccatttgttctcatagattaccactatcacttg 32246641  T
Q  416 ctccacacatcattggtttattctcattggtgtgaag 452  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32246640 ctccacacatcattggtttatt-tcattggtgtgaag 32246605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 39 - 452
Target Start/End: Original strand, 39811843 - 39812252
Alignment:
Q  39 ctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgaggatgggaaaataccaaagggtaga-t 137  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |    
T  39811843 ctttgttgagagtgtctcttaggttgagaaaa--acattgtaatcaccttgggttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaat 39811940  T
Q  138 ctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagat 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39811941 ctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaag-gctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagat 39812038  T
Q  238 taggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcttttatcgcttatcttgtatg---cttgttagctcttagtgtgg 333  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||| ||    |||  | ||||| ||||||    
T  39812039 taggccatattggctgaactggttcaacaatctt-ctcggtgttttgttc--tttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggaatctctt-gtgtgg 39812134  T
Q  334 ttttgctatacattaggctta-ggttgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcattggt 432  Q
    |||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  39812135 ttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatctttggt 39812233  T
Q  433 ttattctcattggtgtgaag 452  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  39812234 ttatt-tcattggtgtgaag 39812252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 126 - 454
Target Start/End: Original strand, 44312563 - 44312889
Alignment:
Q  126 caaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctaga-ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgc 223  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  44312563 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaag-gctagagttcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgc 44312660  T
Q  224 tctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcttttatcgcttatcttg-tatgc-ttgtta 320  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  || |||||||||||||||||| | ||| ||| ||    
T  44312661 tctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc--ttccttttatcgcttatcttgttttgctttggta 44312757  T
Q  321 gctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggttgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctcca 420  Q
     ||||| |||||||||||||||||| | | ||  ||  | |||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  44312758 tctctttgtgtggttttgctatacacttgtctagggcggctttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctcca 44312857  T
Q  421 cacatcattggtttattctcattggtgtgaagat 454  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  44312858 cacatcatt-gtttatt-tcattggtgtgaagat 44312889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 93 - 271
Target Start/End: Original strand, 11098844 - 11099023
Alignment:
Q  93 tttagggttcatagtgtgaggatgggaaaataccaaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagcta--gattcttgtaactcttt 189  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||  | |||||||||| ||||    
T  11098844 tttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaa-gcttgca-agctattgtttcttgtaacccttt 11098941  T
Q  190 tgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 271  Q
     ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11098942 -gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 11099023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 93 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 14291668 - 14291380
Alignment:
Q  93 tttagggttcatagtgtgaggatgggaaaataccaaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagcta--gattcttgtaactcttt 189  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||| ||| ||  | ||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||  ||||  | |||||||||| ||||    
T  14291668 tttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttgaag-gctattgtttcttgtaacccttt 14291571  T
Q  190 tgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcg 287  Q
     ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||     
T  14291570 -gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-cttggtgttttgttc- 14291474  T
Q  288 ttttcttttatcgcttatcttg-tatgc-ttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggttg-ttttgttgttgttagcttgga 380  Q
      ||| ||| | |||||||||| | ||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||  || || ||||||||||||| |||||||    
T  14291473 --ttcctttcttgcttatcttgttttgctttgttatctctttgtgtggttttgctctacattagtctagggctgtttttgttgttgtttgcttgga 14291380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 175 - 426
Target Start/End: Original strand, 9296401 - 9296651
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgc 273  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  9296401 ttcttgtaacccttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccaaattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-c 9296498  T
Q  274 tcggtg-tttgttcgttttcttttatcgcttatcttg-tatgc-ttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggttg-ttttgttgtt 369  Q
    | |||| |||||||   ||| ||| | |||| ||||| | ||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||| ||  || || ||||||||||    
T  9296499 ttggtgttttgttc---ttcctttcttgcttttcttgttttgctttgttatctctttgtgtggttttgctctacactagactagggctgtttttgttgtt 9296595  T
Q  370 gttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatc 426  Q
    ||| |||||||  ||||||   ||||||||||| | ||| |  ||||||||||||||    
T  9296596 gtttgcttggaaaccattt-tgctcatagattaccactaccttttgctccacacatc 9296651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 175 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 3491847 - 3491751
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 271  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3491847 ttcttgtaacccttt-gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 3491751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 175 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 25398592 - 25398496
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 271  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  25398592 ttcttgtaacccttt-gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggctgaactgggtcaacaatctt 25398496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 175 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 21630041 - 21629910
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 272  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21630041 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctct-ccccagattaggtcatattggactgaactgggtcaacaatcttg 21629943  T
Q  273 ctcggtgtttgttcgttttcttttatcgcttatctt 308  Q
     |  ||||||||||  ||||||| || |||||||||    
T  21629942 gt--gtgtttgttc-ctttctttcattgcttatctt 21629910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 175 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 13569426 - 13569331
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaat 268  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||    
T  13569426 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaat 13569331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 184 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 8040149 - 8040059
Alignment:
Q  184 ctcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 272  Q
    |||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8040149 ctcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggactgaactgggtcaacaatcttg 8040059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 175 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 25403730 - 25403634
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 271  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  25403730 ttcttgtaacccttt-gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggctgaactgagtcaacaatctt 25403634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 175 - 272
Target Start/End: Original strand, 10445443 - 10445542
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattcaca-tattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 272  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  10445443 ttcttgtaactcttttgtaacactttcataatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactggatcaacaatcttg 10445542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 175 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 17865301 - 17865202
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacatt-ggctgaactgggtcaacaatcttg 272  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  17865301 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggttgctctctcccccagattaggtcatattcgactgaactgggtcaacaatcttg 17865202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 175 - 272
Target Start/End: Original strand, 34682333 - 34682432
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattcac-atattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 272  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  34682333 ttcttgtaactcttttgtaacactttcattatagtggattggagagctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 34682432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 175 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 34388956 - 34388859
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatct 270  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| | ||| ||||||||||||||    
T  34388956 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctactctctcccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatct 34388859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 175 - 308
Target Start/End: Original strand, 8390149 - 8390281
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 272  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||| | |||||||||||||||| |||    
T  8390149 ttcttgtaactcttttttaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcattttggaccgaactgggtcaacaattttg 8390248  T
Q  273 ctcggtgtttgttcgttttcttttatcgcttatctt 308  Q
     |  ||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  8390249 gt--gtgtttgttc-atttctttcatcgcttatctt 8390281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 175 - 272
Target Start/End: Original strand, 14699007 - 14699105
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 272  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  14699007 ttcttgtaactcttttgtaac-ctttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 14699105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 175 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 20522318 - 20522219
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 272  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  20522318 ttcttgtaacccttttgtaacactttcatcatagtggattggagggttgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 20522219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 189 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 40738926 - 40738844
Alignment:
Q  189 ttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 271  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  40738926 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctc-cccccagattaggtcatattggctgaactgggtcaacaatctt 40738844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 175 - 271
Target Start/End: Original strand, 28259177 - 28259274
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 271  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| | |||||||||||||||||||    
T  28259177 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 28259274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 175 - 270
Target Start/End: Original strand, 10707251 - 10707348
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatct 270  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||| || ||||| | ||||||||||||||||||    
T  10707251 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagttgttctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatct 10707348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 178 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 31056139 - 31056008
Alignment:
Q  178 ttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattg-gctgaactgggtcaacaatc-ttgct 274  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||  | ||||| ||||||||||| ||| |    
T  31056139 ttgtaactcttttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccctagattaggtcatattgaaccgaactaggtcaacaatctttggt 31056040  T
Q  275 cggtgtttgttcgttttcttttatcgcttatctt 308  Q
      |||||||||| |||||||| || |||||||||    
T  31056039 --gtgtttgttccttttctttcattgcttatctt 31056008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 175 - 272
Target Start/End: Original strand, 33528620 - 33528719
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 272  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||||||||  |||| |||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  33528620 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggttgctctctttcccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 33528719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 175 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 39483029 - 39482930
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 272  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||| || ||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  39483029 ttcttgtaactcttttgtaacattttcatcatagtggattggaggcctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatcttg 39482930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 175 - 308
Target Start/End: Original strand, 16940208 - 16940340
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 272  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||| | || ||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  16940208 ttcttgtaattcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgatctttcccccagattatgtcatattggaccgaattgggtcaacaatcttg 16940307  T
Q  273 ctcggtgtttgttcgttttcttttatcgcttatctt 308  Q
     |  ||||||||||  ||||||| || |||||||||    
T  16940308 gt--gtgtttgttc-ctttctttcattgcttatctt 16940340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 175 - 308
Target Start/End: Original strand, 17010873 - 17011005
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 272  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||| | || ||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  17010873 ttcttgtaattcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgatctttcccccagattatgtcatattggaccgaattgggtcaacaatcttg 17010972  T
Q  273 ctcggtgtttgttcgttttcttttatcgcttatctt 308  Q
     |  ||||||||||  ||||||| || |||||||||    
T  17010973 gt--gtgtttgttc-ctttctttcattgcttatctt 17011005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 175 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 33118234 - 33118102
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 272  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||| | |||||| | |||||||||||    
T  33118234 ttcttgtaactattttgtaactctttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgagccaacaatcttg 33118135  T
Q  273 ctcggtgtttgttcgttttcttttatcgcttatctt 308  Q
     |  ||||||||||  ||||||| || |||||||||    
T  33118134 gt--gtgtttgttc-ctttctttcattgcttatctt 33118102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 25407719 - 25407653
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattagg 241  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25407719 ttcttgtaacccttt-gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattagg 25407653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 271
Target Start/End: Original strand, 23078470 - 23078567
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggct-gaactgggtcaacaatctt 271  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||| |||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||| || ||||| | |||||||||||||| ||||    
T  23078470 ttcttgtaactctttc-taacactttcatcatagtggattggagagttgttctctcccccatattaggtcatattggatcgaactgggtcaacattctt 23078567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 271
Target Start/End: Original strand, 42039669 - 42039766
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 271  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| | ||||| | |||||||||||    
T  42039669 ttcttgtaactcttc-gtaacactttcatcatagtggattagagagctgctctctcccacagattaggtcatattggaccgaactagatcaacaatctt 42039766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 35215646 - 35215586
Alignment:
Q  208 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 267  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  35215646 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 35215586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 35218023 - 35217963
Alignment:
Q  208 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 267  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  35218023 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 35217963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 268
Target Start/End: Original strand, 2838029 - 2838124
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattcacat-attggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaat 268  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||  | | |||||||||||  |||||||||||||||| |||| || ||||| | ||||||||||||||||    
T  2838029 ttcttgtaactcatttgtatcactttcattttagtggattggagatgtgctctctcccccagagtaggtcatattggaccgaactgggtcaacaat 2838124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 268
Target Start/End: Original strand, 2869692 - 2869787
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaat 268  Q
    |||||||||||| |||||| ||| |||| | || |||||||||||||| |||||||||| ||| |||| || ||||| | ||||||||| ||||||    
T  2869692 ttcttgtaactcctttgtatcactttcatcttagtggattggagagctactctctcccctagagtaggtcatattggaccgaactgggtaaacaat 2869787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 175 - 271
Target Start/End: Original strand, 36757762 - 36757859
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 271  Q
    ||||| ||||||||| | ||||| |||| |||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||| || ||||| | ||| |||||||||||||||    
T  36757762 ttcttataactcttt-gaaacactttcatcatactggattggagagctgttatcccccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatctt 36757859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 268
Target Start/End: Original strand, 1345574 - 1345635
Alignment:
Q  208 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaat 268  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||| |||| || ||||| | ||||||||||||||||    
T  1345574 tggatcggagaggtgctctctcccccagagtaggtcatattggaccgaactgggtcaacaat 1345635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 211 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 45332238 - 45332181
Alignment:
Q  211 attggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 267  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  45332238 attggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 45332181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 208 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 23452297 - 23452237
Alignment:
Q  208 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 267  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  |||| | |||||||||||||||    
T  23452297 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 23452237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 208 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 36558924 - 36558864
Alignment:
Q  208 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 267  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  36558924 tggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 36558864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 208 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 36561201 - 36561141
Alignment:
Q  208 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 267  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  36561201 tggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 36561141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 337; Significance: 0; HSPs: 49)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 452
Target Start/End: Original strand, 24261150 - 24261589
Alignment:
Q  14 agatgggatcctttggggtgtgttcctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgagg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  24261150 agatgggatcctttggggtgtgttcctttgatgagagtgaatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcatcttgggattatgggttcatagtgtgagg 24261249  T
Q  114 atgggaaaataccaaagggtagatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggatt 213  Q
     ||||||| ||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24261250 ttgggaaattaccaaagggtaggtctagggttttgtcttgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggatt 24261349  T
Q  214 ggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcttttatcgcttatcttgtat 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24261350 ggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttcttttatcgtttatcttgtat 24261449  T
Q  313 gcttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggttgttttgttgttg-ttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatca 411  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  24261450 gcttgttagctcttagtgtggatttgct-tacattaggcttaggctgttttgttgttgattagcttggaggccatttgcactcatagattacctctatct 24261548  T
Q  412 cttgctccacacatcattggtttattctcattggtgtgaag 452  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  24261549 cttgctccacacatctttgatttattctcattggtgtgaag 24261589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 452
Target Start/End: Original strand, 24266033 - 24266468
Alignment:
Q  18 gggatcctttggggtgtgttcctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgaggatgg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||    
T  24266033 gggatcctttggggtgtgttcctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggattatgggttcatagtgtgaggttgg 24266132  T
Q  118 gaaaataccaaagggtagatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggag 217  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24266133 gaaattaccaaagggtaggtctagggttttgtcttgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggag 24266232  T
Q  218 agctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcttttatcgcttatcttgtatgctt 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  24266233 agctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttcctttatcgtttatcttgtatgctt 24266332  T
Q  317 gttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggttgttttgttgttg-ttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttg 415  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  24266333 gttagctcttagtgtggatttgct-tacattaggcttaggctgttttgttgttgattagcttggaggccatttgcactcatagattacctctatctcttg 24266431  T
Q  416 ctccacacatcattggtttattctcattggtgtgaag 452  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  24266432 ctccacacatctttgatttattctcattggtgtgaag 24266468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 14 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 16880331 - 16879892
Alignment:
Q  14 agatgggatcctttggggtgtgttcctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgagg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  16880331 agatgggatcctttggggtgtgttcctttgatgagagtgaatcttaggttggaaaaacaacattgtaatcatcttgggattatgggttcatagtgtgagg 16880232  T
Q  114 atgggaaaat-accaaagggtagatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggat 212  Q
     ||||||| | | |||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  16880231 ttgggaaatttatcaaagggtaggtctagggttttgtcttgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttt-gtaaaacattcacatattggat 16880133  T
Q  213 tggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcttttatcgcttatcttgta 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16880132 tggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttcttttatcgtttatcttgta 16880033  T
Q  312 tgcttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggttgttttgttgttg-ttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatc 410  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16880032 tgcttgttagctcttagtgtggatttgct-tacattaggcttaggctgttttgttgttgattagcttggaggccatttgcactcatagattacctctatc 16879934  T
Q  411 acttgctccacacatcattggtttattctcattggtgtgaag 452  Q
     ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  16879933 tcttgctccacacatctttgatttattctcattggtgtgaag 16879892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 14 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 16885186 - 16884748
Alignment:
Q  14 agatgggatcctttggggtgtgttcctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgagg 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  16885186 agatgggatcctttggg-tgtgttcctttgatgagagtgaatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcatcttgggattatgggttcatagtgtgagg 16885088  T
Q  114 atgggaaaat-accaaagggtagatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggat 212  Q
     ||||||| | | |||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  16885087 ttgggaaatttatcaaagggtaggtctagggttttgtcttgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttt-gtaaaacattcacatattggat 16884989  T
Q  213 tggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcttttatcgcttatcttgta 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16884988 tggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttcttttatcgtttatcttgta 16884889  T
Q  312 tgcttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggttgttttgttgttg-ttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatc 410  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16884888 tgcttgttagctcttagtgtggatttgct-tacattaggcttaggctgttttgttgttgattagcttggaggccatttgcactcatagattacctctatc 16884790  T
Q  411 acttgctccacacatcattggtttattctcattggtgtgaag 452  Q
     ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  16884789 tcttgctccacacatctttgatttattctcattggtgtgaag 16884748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 18 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 19992565 - 19992133
Alignment:
Q  18 gggatcctttggggtgtgttcctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgaggatgg 117  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||    
T  19992565 gggatcctatggggtgtgttcctttgatgtgagtgtttcttaggttggggaaa-aacattgtaatcaccttgggattttgggttcatagtgtgagagtgg 19992467  T
Q  118 gaaaataccaaagggtagatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggag 217  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19992466 gaaaataccaaagggtagttctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttcacatattggattggag 19992368  T
Q  218 agctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcttttatcgcttatcttg--tatgc 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| || ||||||||  |||||    
T  19992367 agctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttc-tttccttttaccgtttatcttgtttatgc 19992269  T
Q  315 ttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggttgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcactt 414  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||    ||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||| ||||||| ||||||| |    
T  19992268 ttgttagctctttgtgtggttttgctatacacta-gcttagggctgtttgttgttgtaagcttggaagccatttgttctcattgattatcactatcacct 19992170  T
Q  415 gctccacacatcattggtttattctcattggtgtgaag 452  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  19992169 gctccacacatctttggtttatt-tcattggtgtgaag 19992133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 18 - 452
Target Start/End: Original strand, 21812071 - 21812503
Alignment:
Q  18 gggatcctttggggtgtgttcctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgaggatgg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||    
T  21812071 gggatcctttggggtgtgttcctttgatgagagtgtttcttaggttggggaaa-aacattgtaatcaccttgggattatgggttcatagtgtgagagtgg 21812169  T
Q  118 gaaaataccaaagggtagatctagggtttgttcatgtgtaaagctt-gaatagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattgga 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  21812170 gaaaataccaaagggtagatctagggtttgttcatgtgtaaagctttgacaagctagagtcttggaac-cttttgtaagac-ttcacatattggattgga 21812267  T
Q  217 gagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcttttatcgcttatcttg--tatg 313  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || ||||||||  ||||    
T  21812268 aagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttc-ttttcttttaccgtttatcttgtttatg 21812366  T
Q  314 cttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggttgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcact 413  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||| || |||||||    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||| ||    
T  21812367 cttgttaactctttgtgtggttttgctatacacta-gcttagggctgtttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcatagattaccactatctct 21812465  T
Q  414 tgctccacacatcattggtttattctcattggtgtgaag 452  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  21812466 tgctccacacatctttggtttatt-tcattggtgtgaag 21812503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 39 - 452
Target Start/End: Original strand, 24024181 - 24024591
Alignment:
Q  39 ctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgaggatgggaaaataccaaagggtaga-t 137  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||| ||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |    
T  24024181 ctttgttgagagtgtctcttgggtttggaaaa--acattgtaatcaccgtgggttttagggttcatcgtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaat 24024278  T
Q  138 ctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagat 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24024279 ctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaag-gctagagtcttgtaaca-ttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagat 24024376  T
Q  238 taggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgtttgttcgttttcttttatcgcttatcttg--tatgcttgttagctcttagtgtggtt 335  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    || ||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  24024377 taggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgtttttgttcttccttttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtggtt 24024476  T
Q  336 ttgctatacattaggcttaggttgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcattggttta 435  Q
    |||||||| | ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24024477 ttgctatatactagtcataggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcatt-gttta 24024575  T
Q  436 ttctcattggtgtgaag 452  Q
    || ||||||||||||||    
T  24024576 tt-tcattggtgtgaag 24024591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 39 - 452
Target Start/End: Original strand, 31109438 - 31109846
Alignment:
Q  39 ctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgaggatgggaaaataccaaagggtaga-t 137  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |    
T  31109438 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaa--acattgtaatcaccttgggttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaatatcaaagggtagaat 31109535  T
Q  138 ctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagat 237  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31109536 ctagggtttgttcatgtgcaaagcttgaag-gctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccctagat 31109633  T
Q  238 taggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcttttatcgcttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgtgg 333  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  || ||||| | | ||||||||  ||||| |||  | ||||| ||||||    
T  31109634 taggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc--ttccttttcttgtttatcttgtttatgctttggaatctctt-gtgtgg 31109730  T
Q  334 ttttgctatacattaggctta-ggttgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcattggt 432  Q
    |||||||||||| |||  ||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||    
T  31109731 ttttgctatacactag--ttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctgcacacatcatt-gt 31109827  T
Q  433 ttattctcattggtgtgaag 452  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  31109828 ttatt-tcattggtgtgaag 31109846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 39 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 12406562 - 12406153
Alignment:
Q  39 ctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgaggatgggaaaataccaaagggtaga-t 137  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||  |||| ||| ||||||||||||| |    
T  12406562 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaa--acattgtaatcaccttggcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaat 12406465  T
Q  138 ctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctaga-ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccaga 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  12406464 ctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaag-gctagagttcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctattctctcccccaga 12406367  T
Q  237 ttaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcttttatcgcttatcttg-tatgc-ttgttagctcttagtgtgg 333  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||| | ||| ||| || ||||| ||||||    
T  12406366 ttaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc--tttcttttaccgcttatcttgttttgctttggtatctctttgtgtgg 12406270  T
Q  334 ttttgctatacattaggcttaggttgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcattggtt 433  Q
    |||||||||||| ||| ||  || || |||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||    
T  12406269 ttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcatt-gtt 12406171  T
Q  434 tattctcattggtgtgaag 452  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  12406170 tatt-tcattggtgtgaag 12406153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 39 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 12397142 - 12396733
Alignment:
Q  39 ctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgaggatgggaaaataccaaagggtaga-t 137  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||   |||| ||| ||||||||||||| |    
T  12397142 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaa--acattgtaatcaccttgggttttagggttcatattgtgatagtggggaaacaccaaagggtagaat 12397045  T
Q  138 ctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctaga-ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccaga 236  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||  |||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12397044 ctagggtttgttcatgtgtaaagattaaag-gctagagttcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgttctctcccccaga 12396947  T
Q  237 ttaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttt-gttcgttttcttttatcgcttatcttgtat-gctt-gttagctcttagtgtgg 333  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  || | |||| |||||||||||| | |||| | || ||||| ||||||    
T  12396946 ttaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc--ttccctttaccgcttatcttgttttgctttggtatctctttgtgtgg 12396850  T
Q  334 ttttgctatacattaggcttaggttgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcattggtt 433  Q
    |||||||||||| ||| ||  || || |||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||    
T  12396849 ttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcatt-gtt 12396751  T
Q  434 tattctcattggtgtgaag 452  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  12396750 tatt-tcattggtgtgaag 12396733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 186 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 4866816 - 4866551
Alignment:
Q  186 cttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgt 284  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  4866816 cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgt 4866718  T
Q  285 tcgttttcttttatcgcttatcttg-tatgc-ttgttagctcttagtgtgg-ttttgctatacattaggcttaggttgttttgttgttgttagcttggag 381  Q
    ||  || |||||| ||||||||||| | ||| ||| || || || |||||| |||||||||||| ||| ||  |  ||||||||||||||| ||||||||    
T  4866717 tc--ttccttttaccgcttatcttgttttgctttggtatctttttgtgtggtttttgctatacactagtctaggactgttttgttgttgtttgcttggag 4866620  T
Q  382 gccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcattggtttattctcattggtgtgaag 452  Q
     |||||||  ||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  4866619 accatttgtcctcattgattaccactatctcttgctccacacatcatt-gtttatt-tcattggtgtgaag 4866551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 93 - 426
Target Start/End: Original strand, 20357464 - 20357797
Alignment:
Q  93 tttagggttcatagtgtgaggatgggaaaataccaaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagcta--gattcttgtaactcttt 189  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||| ||| ||  | ||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||  ||||  | |||||||||| ||||    
T  20357464 tttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcatgttcttgtgtaaagcttgaag-gctattgtttcttgtaacccttt 20357562  T
Q  190 tgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggt-gtttgttcgt 288  Q
     ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||      
T  20357563 -gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccaaattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-cttggtattttgttc-- 20357658  T
Q  289 tttcttttatcgcttatcttgtatgc-ttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggttg-ttttgttgttgttagcttggaggccat 386  Q
    || ||||| | ||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||| ||  || || |||||||||||||||||||||| ||||    
T  20357659 ttccttttcttgcttatcttgtttgctttgttatctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttgttagcttggagaccat 20357758  T
Q  387 ttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatc 426  Q
    |||  ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  20357759 ttg-gctcatagattaccactatctcttgctccacacatc 20357797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 93 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 2058146 - 2057806
Alignment:
Q  93 tttagggttcatagtgtgaggatgggaaaataccaaa-gggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagcta--gattcttgtaactctt 188  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||| ||| | || | ||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||  | |||||||||| |||    
T  2058146 tttagggttcatattgtgagagtggggaaacaacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttgaat-gctattgtttcttgtaaccctt 2058049  T
Q  189 ttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttc 286  Q
    | ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||    
T  2058048 t-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-cttggtgttttgttc 2057951  T
Q  287 gttttcttttatcgcttatcttg------tatgc-ttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggttg-ttttgttgttgttagcttg 378  Q
      || ||||||| ||||||||||      | ||| ||| || ||||| ||||||||||||| || |  || ||  ||  | ||||||||||||| |||||    
T  2057950 --ttccttttattgcttatcttgtttttttttgctttggtatctctttgtgtggttttgctctaaacaagtctagggcggtttttgttgttgtttgcttg 2057853  T
Q  379 gaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatc 426  Q
    ||  ||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  2057852 gaaaccatttg-actcatagattaccactatctcttgctccacacatc 2057806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 93 - 271
Target Start/End: Original strand, 1533360 - 1533540
Alignment:
Q  93 tttagggttcatagtgtgaggatgggaaaataccaaagggtaga-tctagggtttgtt-catgtgtaaagcttgaatagcta--gattcttgtaactctt 188  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||| | ||||||| ||||| | |||||  | |||||||||| |||    
T  1533360 tttagggttcatattgtgagagtgggaaaacaccaaagggtagaatctaggtcttgtttcttgtgtaa-gcttgca-agctattgtttcttgtaaccctt 1533457  T
Q  189 ttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 271  Q
    | ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1533458 t-gtaacactttcatcatattggattggagagatgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 1533540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 175 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 18408860 - 18408764
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 271  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18408860 ttcttgtaacccttt-gtaacactttcatcatactggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 18408764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 175 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 21639905 - 21639809
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattcac-atattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 271  Q
    |||||||||| |||| ||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21639905 ttcttgtaacccttt-gtaacactttcattatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 21639809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 175 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 29159901 - 29159802
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 272  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  29159901 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 29159802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 175 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 18413736 - 18413641
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 271  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18413736 ttcttgtaacccttt-gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccc-agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 18413641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 175 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 21646103 - 21646007
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 271  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21646103 ttcttgtaaccctttt-taacactttcatcatagtggattggagagctgctctcttccctagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 21646007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 175 - 272
Target Start/End: Original strand, 46516309 - 46516408
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 272  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  46516309 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 46516408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 175 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 49091759 - 49091660
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 272  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||    
T  49091759 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagttgctctcttccccagattaggtcatattggactaaactgggtcaacaatcttg 49091660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 175 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 21983383 - 21983285
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactctttt-gtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatct 270  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||    
T  21983383 ttcttgtaactctttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatct 21983285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 175 - 308
Target Start/End: Original strand, 2647695 - 2647827
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacatt-ggctgaactgggtcaacaatcttg 272  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  2647695 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagaataggtcatattgggccgaattgggtcaacaatcttg 2647794  T
Q  273 ctcggtgtttgttcgttttcttttatcgcttatctt 308  Q
     |  ||||||||||  ||||||| || |||||||||    
T  2647795 at--gtgtttgttc-ctttctttcattgcttatctt 2647827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 175 - 308
Target Start/End: Original strand, 33332449 - 33332581
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggct-gaactgggtcaacaatcttg 272  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| | | ||||||||||||||||||||    
T  33332449 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcttagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattagatcgaactgggtcaacaatcttg 33332548  T
Q  273 ctcggtgtttgttcgttttcttttatcgcttatctt 308  Q
     |  ||||||||||  ||||||| || |||||||||    
T  33332549 gt--gtgtttgttc-ctttctttcattgcttatctt 33332581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 175 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 56045 - 55913
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 272  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| || ||||| | |||||||||||| |||||||    
T  56045 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctct-ccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaataatcttg 55947  T
Q  273 ctcggtgtttgttcgttttcttttatcgcttatctt 308  Q
     |  |||||||||| ||| |||  || |||||||||    
T  55946 gt--gtgtttgttcctttccttccattgcttatctt 55913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 175 - 271
Target Start/End: Original strand, 44848684 - 44848781
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattg-gctgaactgggtcaacaatctt 271  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||  | |||||||||||||||||||    
T  44848684 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccaggttaggtcatattgaaccgaactgggtcaacaatctt 44848781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 175 - 272
Target Start/End: Original strand, 9190008 - 9190106
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 272  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  9190008 ttcttgtaactcatt-gtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 9190106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 20284153 - 20284088
Alignment:
Q  208 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 272  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  20284153 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 20284088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 2580487 - 2580389
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 272  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  2580487 ttcttgtaactcatt-gtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatcttg 2580389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 272
Target Start/End: Original strand, 4796666 - 4796765
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 272  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||  |||| | ||||||||| ||||||||||    
T  4796666 ttcttgtaactcttttgtaacaatttcatcatagtggatttgagggctgctttctcccccagattaggtcattttggaccgaactgggttaacaatcttg 4796765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 35960914 - 35960815
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattg-gctgaactgggtcaacaatcttg 272  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||  | ||||| ||||||||||||||    
T  35960914 ttcttctaactcatttgtaacactttcatcatagtggtttggagggctgctctctcccccagattaggtcatattgaaccgaactcggtcaacaatcttg 35960815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 175 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 21989005 - 21988873
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactctttt-gtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 271  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| || | |||||||||||| |||||||  | |||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||     
T  21989005 ttcttgtaactctttttgtaacactttcatcaaagtggattggagagttgctctc--ctccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctc 21988908  T
Q  272 gctcggtgtttgttcgttttcttttatcgcttatctt 308  Q
    | |  |||||||||| |||||||| || |||||||||    
T  21988907 ggt--gtgtttgttccttttctttcattgcttatctt 21988873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 208 - 272
Target Start/End: Original strand, 9185198 - 9185263
Alignment:
Q  208 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 272  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  | ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  9185198 tggattggagagcttctctctcccccagactaggttatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 9185263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 208 - 268
Target Start/End: Original strand, 28617258 - 28617319
Alignment:
Q  208 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaat 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| | ||||||||| ||||||    
T  28617258 tggattggagagctgctctctcccccagagtaggtcatattggaccgaactgggtaaacaat 28617319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 31155971 - 31155911
Alignment:
Q  208 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 267  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  31155971 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 31155911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 175 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 2479433 - 2479337
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 271  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||||| || ||||  | |||||||||||||||||||    
T  2479433 ttcttataactcttt-gtaacactttcatcatagtggatttgagagctgctctc-cccctagattaggtcatattgaaccgaactgggtcaacaatctt 2479337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 203 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 47263745 - 47263678
Alignment:
Q  203 catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 271  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||| || ||||| | |||||||||||||||||||    
T  47263745 catagtggattggagagctgc--tctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 47263678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 91
Target Start/End: Original strand, 20357359 - 20357409
Alignment:
Q  39 ctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttggg 91  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  20357359 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaa--aacattgtaatcaccttggg 20357409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 208 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 1049356 - 1049296
Alignment:
Q  208 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 267  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  |||| | |||||||||||||||    
T  1049356 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 1049296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 208 - 267
Target Start/End: Original strand, 2935497 - 2935557
Alignment:
Q  208 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 267  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  2935497 tggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 2935557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 208 - 267
Target Start/End: Original strand, 3035953 - 3036013
Alignment:
Q  208 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 267  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  |||| | |||||||||||||||    
T  3035953 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 3036013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 39 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 4873359 - 4873310
Alignment:
Q  39 ctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgg 90  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  4873359 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaa--aacattgtaatcaccttgg 4873310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 208 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 7351712 - 7351652
Alignment:
Q  208 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 267  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  7351712 tggattggagggctgctctctcccccatactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 7351652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 224 - 271
Target Start/End: Original strand, 8153466 - 8153514
Alignment:
Q  224 tctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 271  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  8153466 tctctcccccagattaggtcaagttggactgaactgggtcaacaatctt 8153514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 208 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 9027254 - 9027194
Alignment:
Q  208 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 267  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  9027254 tggataggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 9027194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 208 - 267
Target Start/End: Original strand, 22108295 - 22108355
Alignment:
Q  208 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 267  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  22108295 tggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 22108355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 208 - 267
Target Start/End: Original strand, 22137306 - 22137366
Alignment:
Q  208 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 267  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  22137306 tggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 22137366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 208 - 267
Target Start/End: Original strand, 40550055 - 40550115
Alignment:
Q  208 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 267  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  40550055 tggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 40550115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 208 - 267
Target Start/End: Original strand, 40552333 - 40552393
Alignment:
Q  208 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 267  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  40552333 tggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 40552393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 325; Significance: 0; HSPs: 36)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 452
Target Start/End: Original strand, 43988293 - 43988731
Alignment:
Q  18 gggatcctttggggtgtgttcctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgaggatgg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  43988293 gggatcctttggggtgtgttcctttgatgagagtgtttcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggattatgggttcatagtgtgaggatgg 43988392  T
Q  118 gaaaataccaaagggtagatctagggtttgtt--catgtgtaaagcttgaatagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43988393 gaaaatgccaaagggtagatctagggttttttgtcttgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattgg 43988492  T
Q  216 agagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttctttt-atcg-cttatcttgtat 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| || |  |||||||||||    
T  43988493 agagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtaaacaatcttgcttggtgttttgttc-ttttcttttcatggttttatcttgtat 43988591  T
Q  313 gcttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggttgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcac 412  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43988592 gcttgttagctcttagtgtggttgtgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcatagattatctctatcac 43988691  T
Q  413 ttgctccacacatcattggtttattctcattggtgtgaag 452  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  43988692 ttgctccacacatcattgatttattctcattggcgtgaag 43988731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 18 - 452
Target Start/End: Original strand, 25444923 - 25445354
Alignment:
Q  18 gggatcctttggggtgtgttcctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgaggatgg 117  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  25444923 gggatcctatggggtgtgtgcctttgatgagagagtttcttaggttgggaaaa--acattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgagagtgg 25445020  T
Q  118 gaaaataccaaagggtagatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggag 217  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  25445021 gaaaataccaaagggtagctctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggag 25445119  T
Q  218 agctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcttttatcgcttatcttg--tatgc 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| || ||||||||  || ||    
T  25445120 agctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttc-tttccttttaccgtttatcttgtttacgc 25445218  T
Q  315 ttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggttgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcactt 414  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||    |||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||| ||||||| ||||| |||    
T  25445219 ttgttagctctttgtgtggttttgctatacacta-gcttagggctgtttgttgttgtttgcttggaagccatttgttctcattgattatcactatcgctt 25445317  T
Q  415 gctccacacatcattggtttattctcattggtgtgaag 452  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25445318 gctccacacatcattggtttatt-tcattggtgtgaag 25445354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 18 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 39445750 - 39445320
Alignment:
Q  18 gggatcctttggggtgtgttcctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgaggatgg 117  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||    
T  39445750 gggatcctatggggtgtgtgcctttgatgagagagtttcttaggttgggaaaa--acattgtaatcaccttgggattttgggttcatagtgtgagagtgg 39445653  T
Q  118 gaaaataccaaagggtagatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggag 217  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39445652 gaaaataccaaagggtagttctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagagtcttgtaac-cttttgtaacac-ttcacatattggattggag 39445555  T
Q  218 agctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcttttatcgcttatcttg--tatgc 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| || ||||||||  |||||    
T  39445554 agctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttc-tttccttttaccgtttatcttgtttatgc 39445456  T
Q  315 ttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggttgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcactt 414  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||    |||||||||||| ||||||| ||||||||  | ||| ||||||| |||||||||    
T  39445455 ttgttagctctttgtgtggttttgctatacacta-gcttagggctgtttgttgttgtttgcttggaagccatttgttcacattgattatcactatcactt 39445357  T
Q  415 gctccacacatcattggtttattctcattggtgtgaag 452  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39445356 gctccacacatcattggtttatt-tcattggtgtgaag 39445320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 18 - 452
Target Start/End: Original strand, 44023708 - 44024137
Alignment:
Q  18 gggatcctttggggtgtgttcctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgaggatgg 117  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||    
T  44023708 gggatcctatggggtgtgtgcctttgatgagagagtttcttaggttgggaaaa--acattgtaatcaccttgggattttgggttcatagtgtgagagtgg 44023805  T
Q  118 gaaaataccaaagggtagatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggag 217  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44023806 gaaaataccaaagggtagttctagggtttgttcatgtgtaaagcttgacaagctagagtcttgtaac-cttttgtaacac-ttcacatattggattggag 44023903  T
Q  218 agctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcttttatcgcttatcttg--tatgc 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||| |  ||||||||  |||||    
T  44023904 agctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttc--tttcctttaccatttatcttgtttatgc 44024001  T
Q  315 ttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggttgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcactt 414  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||    |||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||| ||||||| |||||| ||    
T  44024002 ttgttagctctttgtgtggttttgctatacacta-gcttagggctgtttgttgttgtttgcttggaagccatttgttctcattgattatcactatcagtt 44024100  T
Q  415 gctccacacatcattggtttattctcattggtgtgaag 452  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44024101 gctccacacatcattggtttatt-tcattggtgtgaag 44024137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 18 - 452
Target Start/End: Original strand, 1054846 - 1055276
Alignment:
Q  18 gggatcctttggggtgtgttcctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgaggatgg 117  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||    
T  1054846 gggatcctatggggtgtgtgcctttgatgagagagtttcttaggttgggaaaa--acattgtaatcaccttgggattttgggttcatagtgtgagagtgg 1054943  T
Q  118 gaaaataccaaagggtagatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggag 217  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1054944 gaaaataccaaagggtagttctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagagtcttgtaac-cttttgtaacac-ttcacatattggattggag 1055041  T
Q  218 agctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcttttatcgcttatcttg--tatgc 314  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| || ||||||||  |||||    
T  1055042 agttgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttc-tttccttttaccgtttatcttgtttatgc 1055140  T
Q  315 ttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggttgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcactt 414  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||    ||||||||||| |||||||| | ||||||  | ||| ||||||| |||||||||    
T  1055141 ttgttagctctttgtgtggttttgctatacacta-gcttagggctgtttgttgttgtaagcttggaagacatttgttcacattgattatcactatcactt 1055239  T
Q  415 gctccacacatcattggtttattctcattggtgtgaag 452  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1055240 gctccacacatcattggtttatt-tcattggtgtgaag 1055276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 39 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 41398466 - 41398058
Alignment:
Q  39 ctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgaggatgggaaaataccaaagggtaga-t 137  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |    
T  41398466 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaa--acattgtaatcaccttgggttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaat 41398369  T
Q  138 ctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagat 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41398368 ctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaag-gctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagat 41398271  T
Q  238 taggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcttttatcgcttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgtgg 333  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||  || |||      |||||||||  ||||| ||| || ||||| ||||||    
T  41398270 taggccatattggctgacctgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc--ttcctt------cttatcttgtttatgctttggtatctctttgtgtgg 41398180  T
Q  334 --ttttgctatacattaggcttag----gttgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatca 427  Q
      |||||||||||| |||  ||||    ||| | ||||||||||| |||||||| |||| ||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  41398179 ttttttgctatacactag--ttagggctgttttgttgttgttgtttgcttggagaccatatgttctcattgattatcactatcacttgctccacacataa 41398082  T
Q  428 ttggtttattctcattggtgtgaag 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||    
T  41398081 ttggtttatt-tcattggtgtgaag 41398058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 39 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 41390811 - 41390582
Alignment:
Q  39 ctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgaggatgggaaaataccaaagggtaga-t 137  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |    
T  41390811 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaa--acattgtaatcaccttgggttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaat 41390714  T
Q  138 ctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagat 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41390713 ctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaag-gctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagat 41390616  T
Q  238 taggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 271  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  41390615 taggccatattggctgatctgggtcaacaatctt 41390582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 18 - 165
Target Start/End: Original strand, 25439730 - 25439875
Alignment:
Q  18 gggatcctttggggtgtgttcctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgaggatgg 117  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  25439730 gggatcctatggggtgtgtgcctttgatgagagagtttcttaggttgggaaaa--acattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgagagtgg 25439827  T
Q  118 gaaaataccaaagggtagatctagggtttgttcatgtgtaaagcttga 165  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25439828 gaaaataccaaagggtagctctagggtttgttcatgtgtaaagcttga 25439875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 93 - 346
Target Start/End: Original strand, 24787281 - 24787534
Alignment:
Q  93 tttagggttcatagtgtgaggatgggaaaataccaaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagcta--gattcttgtaactcttt 189  Q
    ||||||||||||| ||||||  | || ||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| |||||||  ||||  | |||||||||| ||||    
T  24787281 tttagggttcatattgtgagagttgggaaacaccaaagggtagaatctaggatttgttcttgtgtaatgcttgaag-gctattgtttcttgtaacccttt 24787379  T
Q  190 tgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgt 288  Q
     ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||      
T  24787380 -gtaacactttctcatattggattggagagctgctctcccccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-cttggtgttttgttc-- 24787475  T
Q  289 tttcttttatcgcttatcttgtatgc-ttgttagctcttagtgtggttttgctatacat 346  Q
    || ||||| | ||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||    
T  24787476 ttccttttcttgcttatcttgtttgctttgttatctctttgtgtggttttgctctacat 24787534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 175 - 271
Target Start/End: Original strand, 24202769 - 24202865
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 271  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24202769 ttcttgtaacccttt-gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 24202865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 175 - 308
Target Start/End: Original strand, 16124515 - 16124648
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 272  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||| |||||||||||||    
T  16124515 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttg 16124614  T
Q  273 ctcggtgtttgttcgttttcttttatcgcttatctt 308  Q
     |  |||||||||| |||||||| || |||||||||    
T  16124615 gt--gtgtttgttccttttctttcatagcttatctt 16124648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 175 - 272
Target Start/End: Original strand, 47703935 - 47704034
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 272  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  47703935 ttcttgtaattcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 47704034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 175 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 19073026 - 19072928
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 271  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||    
T  19073026 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 19072928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 175 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 19120916 - 19120818
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 271  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||    
T  19120916 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 19120818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 175 - 272
Target Start/End: Original strand, 27104371 - 27104470
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 272  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| | |||||| |||||||||||||    
T  27104371 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggttatattggaccgaactgtgtcaacaatcttg 27104470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 175 - 271
Target Start/End: Original strand, 26644897 - 26644994
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 271  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||    
T  26644897 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcataatggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 26644994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 175 - 271
Target Start/End: Original strand, 19358843 - 19358939
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 271  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||||    
T  19358843 ttcttgtaacccttt-gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattgactgaactgggtcaacaatctt 19358939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 175 - 271
Target Start/End: Original strand, 19361432 - 19361528
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 271  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||||    
T  19361432 ttcttgtaacccttt-gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattgactgaactgggtcaacaatctt 19361528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 175 - 271
Target Start/End: Original strand, 19380072 - 19380168
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 271  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||||    
T  19380072 ttcttgtaacccttt-gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattgactgaactgggtcaacaatctt 19380168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 175 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 13598496 - 13598364
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 272  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  13598496 ttcttgtatctcttttgtaacactttcatcatagtggattgaagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 13598397  T
Q  273 ctcggtgtttgttcgttttcttttatcgcttatctt 308  Q
     |  ||||||||||  ||||||| || |||||||||    
T  13598396 gt--gtgtttgttc-ctttctttcattgcttatctt 13598364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 175 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 29651909 - 29651777
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 272  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||| |||||||    
T  29651909 ttcttgtaattcttttgtaacactttcatcatagtggattggagtgctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaaaatcttg 29651810  T
Q  273 ctcggtgtttgttcgttttcttttatcgcttatctt 308  Q
     |  ||||||||||  ||||||| || |||||||||    
T  29651809 gt--gtgtttgttc-ctttctttcattgcttatctt 29651777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 175 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 9476359 - 9476260
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 272  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  9476359 ttcttataactcttttgtaatactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 9476260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 374 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 41386646 - 41386569
Alignment:
Q  374 gcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcattggtttattctcattggtgtgaag 452  Q
    |||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41386646 gcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattggtttatt-tcattggtgtgaag 41386569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 175 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 3281805 - 3281708
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 271  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||| ||||||    
T  3281805 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatcgtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaataatctt 3281708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 178 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 37069864 - 37069770
Alignment:
Q  178 ttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 271  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||    
T  37069864 ttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtggatcggagagatgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 37069770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 775759 - 775638
Alignment:
Q  186 cttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgtttg 283  Q
    |||||||||||| |||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| | ||| |||||||||||||||| |  |||||||    
T  775759 cttttgtaacactttcatcttagtggattggagagctactctctcccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatcttgat--gtgtttg 775662  T
Q  284 ttcgttttcttttatcgcttatctt 308  Q
    |||  ||||||| || |||||||||    
T  775661 ttc-ctttctttcattgcttatctt 775638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 175 - 308
Target Start/End: Original strand, 47098824 - 47098955
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 272  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||| | || |||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  47098824 ttcttgtaactcatt-gtaacactttcatcttagtggattggagggctgctctctcccccagattcggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 47098922  T
Q  273 ctcggtgtttgttcgttttcttttatcgcttatctt 308  Q
     |  ||||||||||  ||||||| || |||||||||    
T  47098923 gt--gtgtttgttc-ctttctttgattgcttatctt 47098955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 241
Target Start/End: Original strand, 21536569 - 21536635
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattcac-atattggattggagagctgctctctcccccagattagg 241  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21536569 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcattatagtggattggagagctgctctctcccccagattagg 21536635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 175 - 271
Target Start/End: Original strand, 13604623 - 13604720
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattg-gctgaactgggtcaacaatctt 271  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||  |  ||||||||||||||||||    
T  13604623 ttcttgtaactcttt-gtaacattttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattgaacctaactgggtcaacaatctt 13604720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 9459479 - 9459419
Alignment:
Q  208 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 267  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  9459479 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 9459419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 9463306 - 9463246
Alignment:
Q  208 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 267  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  9463306 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 9463246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 267
Target Start/End: Original strand, 16226386 - 16226446
Alignment:
Q  208 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 267  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  16226386 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 16226446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 32889536 - 32889438
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 272  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||| | ||||| | ||||||||||||    
T  32889536 ttcttgtaactcatt-gtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctatcccccagactaggtcatattggaccgaactagatcaacaatcttg 32889438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 208 - 308
Target Start/End: Original strand, 47102874 - 47102972
Alignment:
Q  208 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgtttgttcgttttcttttatcgcttatc 306  Q
    |||||||||  |||||||||||||| |||||||| || ||||| | |||||||||||||||| ||| |  ||||||||||  ||||||| || |||||||    
T  47102874 tggattggatggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaattttggt--gtgtttgttc-ctttctttgattgcttatc 47102970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 208 - 267
Target Start/End: Original strand, 23786058 - 23786118
Alignment:
Q  208 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 267  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  23786058 tggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 23786118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 208 - 267
Target Start/End: Original strand, 51752582 - 51752642
Alignment:
Q  208 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 267  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  |||| | |||||||||||||||    
T  51752582 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 51752642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0464 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 1)
Name: scaffold0464
Description:

Target: scaffold0464; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 18 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 613 - 183
Alignment:
Q  18 gggatcctttggggtgtgttcctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgaggatgg 117  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||    
T  613 gggatcctatggggtgtgtgcctttgatgagagagtttcttaggttgggaaaa--acattgtaatcaccttgggattttgggttcatagtgtgagagtgg 516  T
Q  118 gaaaataccaaagggtagatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggag 217  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  515 gaaaataccaaagggtagttctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagagtcttgtaac-cttttgtaacac-ttcacatattggattggag 418  T
Q  218 agctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcttttatcgcttatcttg--tatgc 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| || ||||||||  |||||    
T  417 agctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttc-tttccttttaccgtttatcttgtttatgc 319  T
Q  315 ttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggttgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcactt 414  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||    |||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||| ||||||| | |||||||    
T  318 ttgttagctctttgtgtggttttgctatacacta-gcttagggctgtttgttgttgtttgcttggaagccatttgttctcattgattatcaccatcactt 220  T
Q  415 gctccacacatcattggtttattctcattggtgtgaag 452  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  219 gctccacacatctttggtttatt-tcattggtgtgaag 183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 248; Significance: 1e-137; HSPs: 41)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 18 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 18855977 - 18855547
Alignment:
Q  18 gggatcctttggggtgtgttcctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgaggatgg 117  Q
    |||| ||| |||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||    
T  18855977 gggagcctatggggtgtttgcctttgatgagagagtttcttaggttgggaaaa--acattgtaatcaccttgggattgtgggttcatagtgtgagagtgg 18855880  T
Q  118 gaaaataccaaagggtagatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggag 217  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18855879 gaaaataccaaagggtagttctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagagtcttgtaac-cttttgtaacac-ttcacatattggattggag 18855782  T
Q  218 agctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcttttatcgcttatcttg--tatgc 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| || ||||||||  |||||    
T  18855781 agctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttc-tttccttttaccgtttatcttgtttatgc 18855683  T
Q  315 ttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggttgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcactt 414  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||    |||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||| ||||||| |||||||||    
T  18855682 ttgttagctctttgtgtggttttgctatacacta-gcttagggctgtttgttgttgtttgcttggaagccatttgttctcattgattatcactatcactt 18855584  T
Q  415 gctccacacatcattggtttattctcattggtgtgaag 452  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18855583 gctccacacatcattggtttatt-tcattggtgtgaag 18855547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 18 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 3814274 - 3813844
Alignment:
Q  18 gggatcctttggggtgtgttcctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgaggatgg 117  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||    
T  3814274 gggatcctatggggtgtgtgtctttgatgagagtgtttcttaggttgggaaaa--acattgtaatcaccttgggttttagggttcatagtgtgagagtgg 3814177  T
Q  118 gaaaataccaaagggtagatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggag 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3814176 gaaaataccaaagggtagatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaa-agctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttcacatattggattggag 3814079  T
Q  218 agctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttt-gttcgttttcttttatcgcttatcttgt--atgc 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||   ||| ||| | |||||||||||  ||||    
T  3814078 agctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgcatggtgttttgttc---ttcctttcttgcttatcttgtttatgc 3813982  T
Q  315 ttgttagctcttagtgtggtttt-gctatacattaggcttaggttgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcact 413  Q
    |||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| ||  |  ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| | ||||||||    
T  3813981 ttgttagctctttgtgtggtttttgcgatacactagtctaggactgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgctctcattgattaccactatcact 3813882  T
Q  414 tgctccacacatcattggtttattctcattggtgtgaag 452  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3813881 tgctccacacatcattggtttatt-tcattggtgtgaag 3813844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 18 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 5732915 - 5732484
Alignment:
Q  18 gggatcctttggggtgtgttcctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgaggatgg 117  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||    
T  5732915 gggatcctatggggtgtgtgcctttgatgagagtgtttcttaggttgggaaaa--acattgtaatcaccttgggattaagggtttatagtgtgagagtgg 5732818  T
Q  118 gaaaataccaaagggtagatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggag 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  5732817 gaaaataccaaagggtagatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaa-agctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggag 5732720  T
Q  218 agctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgt--tttcttttatcgcttatcttgtatgc 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| || ||  |||| |||| || ||||||||| |||    
T  5732719 agctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcagtgttttttttgttctttcctttaccgtttatcttgtttgc 5732620  T
Q  315 -ttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggctta-ggttgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcac 412  Q
     |||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||| | | |||||    
T  5732619 tttgttagctctttgtgtggttttactatacacta-gcttagggctgttttgttgttgttagcttggagaccatttgttctcattgattaccaccatcac 5732521  T
Q  413 ttgctccacacatcattggtttattctcattggtgtgaag 452  Q
    ||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||    
T  5732520 ttgctccacacatcattg---tattttcattggtgtgaag 5732484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 18 - 452
Target Start/End: Original strand, 45357130 - 45357560
Alignment:
Q  18 gggatcctttggggtgtgttcctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgaggatgg 117  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||    
T  45357130 gggatcctatggggtgtgtgcctttgatgagagagtttcttaggttgggaaaa--acattgtaatcaccttggggtttagggttcatagtgtgagagtgg 45357227  T
Q  118 gaaaataccaaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattgga 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  45357228 gaaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaa-agctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattgga 45357325  T
Q  217 gagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcttttatcgcttatcttgtatg-- 313  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||      
T  45357326 gagctgctctctcccccagattatgccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc-tttccttttaccgcttatcttgtttgtg 45357423  T
Q  314 -cttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggttgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcac 412  Q
      |||  | ||||| ||||||||||||| |||| ||| ||  |  ||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||| | |||||||    
T  45357424 ctttggaatctctt-gtgtggttttgctttacactagtctaggactgttttgttgttgttagcttgaagaccatttgttctcatagattaccactatcac 45357522  T
Q  413 ttgctccacacatcattggtttattctcattggtgtgaag 452  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  45357523 ttgctccacacatcatt-gtttatt-tcattggtgtgaag 45357560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 18 - 452
Target Start/End: Original strand, 45347650 - 45348081
Alignment:
Q  18 gggatcctttggggtgtgttcctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgaggatgg 117  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||    
T  45347650 gggatcctatggggtgtgtgcctttgatgagagtgtctcttaggttgggaaaa--acattgtaatcaccttggggtttagggttcatagtgtgagagtgg 45347747  T
Q  118 gaaaataccaaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctagat-tcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattgg 215  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  45347748 gaaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaag-gctagaggtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattgg 45347845  T
Q  216 agagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcttttatcgcttatcttgtatg- 313  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||     
T  45347846 agagctgctctctcccccagattaagccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc-tttccttttaccgcttatcttgtttgt 45347943  T
Q  314 --cttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggttgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatca 411  Q
       |||  | ||||| ||||||||||||| |||| ||| ||  |  ||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||| | ||||||    
T  45347944 gctttggaatctctt-gtgtggttttgctttacactagtctaggactgttttgttgttgttagcttgaagaccatttgttctcatagattaccactatca 45348042  T
Q  412 cttgctccacacatcattggtttattctcattggtgtgaag 452  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  45348043 cttgctccacacatcatt-gtttatt-tcattggtgtgaag 45348081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 39 - 452
Target Start/End: Original strand, 9224261 - 9224670
Alignment:
Q  39 ctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgaggatgggaaaataccaaagggtaga-t 137  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||| || |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||| |    
T  9224261 ctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaa--acattgtaatcaccttgggttttagggttcatagtgtgagagtggggaaacaccaaagggtagagt 9224358  T
Q  138 ctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctaga-ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccaga 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9224359 ctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaag-gctagagttcttctaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccaga 9224456  T
Q  237 ttaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcttttatcgcttatcttg-tatgc-ttgttagctcttagtgtgg 333  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  || |||||| ||||||||||| | ||| ||| || ||||| ||||||    
T  9224457 ttaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc--ttccttttaccgcttatcttgttttgctttggtatctctttgtgtgg 9224553  T
Q  334 ttttgctatacattaggcttaggttgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcattggtt 433  Q
    |||||||||||| ||| ||  || ||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||    
T  9224554 ttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcatt-gtt 9224652  T
Q  434 tattctcattggtgtgaag 452  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  9224653 tatt-tcattggtgtgaag 9224670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 39 - 452
Target Start/End: Original strand, 9229048 - 9229457
Alignment:
Q  39 ctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgaggatgggaaaataccaaagggtaga-t 137  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||| || |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||| |    
T  9229048 ctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaa--acattgtaatcaccttgggttttagggttcatagtgtgagagtggggaaacaccaaagggtagagt 9229145  T
Q  138 ctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctaga-ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccaga 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9229146 ctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaag-gctagagttcttctaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccaga 9229243  T
Q  237 ttaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcttttatcgcttatcttg-tatgc-ttgttagctcttagtgtgg 333  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||  || |||||| ||||||||||| | ||| ||| || ||||| ||||||    
T  9229244 ttaggccatattggctgaactgggttaacaatctt-ctcggtgttttgttc--ttccttttaccgcttatcttgttttgctttggtatctctttgtgtgg 9229340  T
Q  334 ttttgctatacattaggcttaggttgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcattggtt 433  Q
    |||||||||||| ||| ||  || ||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||    
T  9229341 ttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcatt-gtt 9229439  T
Q  434 tattctcattggtgtgaag 452  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  9229440 tatt-tcattggtgtgaag 9229457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 39 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 51520688 - 51520280
Alignment:
Q  39 ctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgaggatgggaaaataccaaagggtaga-t 137  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||  |||| ||| ||||||||||||| |    
T  51520688 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaa--acattgtaatcaccttgggttttagggttcatattaagagagtggggaaacaccaaagggtagaat 51520591  T
Q  138 ctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctaga-ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccaga 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51520590 ctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaag-gctagagttcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccaga 51520493  T
Q  237 ttaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcttttatcgcttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgtg 332  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  || |||||||| |||||||||  ||||| |||||| ||||| || ||    
T  51520492 ttaggccatattggcagaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc--ttccttttatcacttatcttgtttatgctttgttatctctttgtatg 51520396  T
Q  333 gttttgctatacattaggcttaggttgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcattggt 432  Q
    ||||||||||||| ||| ||  || || |||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||    
T  51520395 gttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcatt-gt 51520297  T
Q  433 ttattctcattggtgtga 450  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  51520296 ttatt-tcattggtgtga 51520280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 139 - 451
Target Start/End: Original strand, 56146664 - 56146974
Alignment:
Q  139 tagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctaga-ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagat 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56146664 tagggtttgttcatgtgtaaagcttgaag-gctagagttcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagat 56146761  T
Q  238 taggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcttttatcgcttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgtgg 333  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||  || |||||||| |||||||||  ||||| |||||| ||||| ||||||    
T  56146762 taggccatattggctgaactggaccaacaatctt-ctcggtgttttgttc--ttccttttatcacttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtgg 56146858  T
Q  334 ttttgctatacattaggcttaggttgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcattggtt 433  Q
    |||||||||||| ||| ||  || || |||||||||||| |||||||| ||| |||  ||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||    
T  56146859 ttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccaattgttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcatt-gtt 56146957  T
Q  434 tattctcattggtgtgaa 451  Q
    |||| |||||||||||||    
T  56146958 tatt-tcattggtgtgaa 56146974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 93 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 24742120 - 24741941
Alignment:
Q  93 tttagggttcatagtgtgaggatgggaaaataccaaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagcta--gattcttgtaactcttt 189  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||  | |||||||||| ||||    
T  24742120 tttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaa-gcttgaag-gctattgtttcttgtaacccttt 24742023  T
Q  190 tgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 271  Q
     ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24742022 -gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 24741941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 94 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 29760821 - 29760542
Alignment:
Q  94 ttagggttcatagtgtgaggatgggaaaataccaaagggtaga-tctagggtttgtt-catgtgtaaagcttgaatagcta--gattcttgtaactcttt 189  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||| ||||||  ||||| | ||||||| ||||| |  ||||  | |||||||||| ||||    
T  29760821 ttagggttcatagtgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctaggtcttgtttcttgtgtaa-gcttgcag-gctattgtttcttgtaacccttt 29760724  T
Q  190 tgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcg 287  Q
     ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||     
T  29760723 -gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-cttggtgttttgttc- 29760627  T
Q  288 ttttcttttatcgcttatcttg-tatgc-ttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggttgttttgttgttgtt 372  Q
      ||| ||| | |||||||||| | ||| |||||  ||||| ||||||||||||| |||| ||| ||  ||||||||||||||||||    
T  29760626 --ttcctttcttgcttatcttgttttgctttgttctctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggttgttttgttgttgtt 29760542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 175 - 308
Target Start/End: Original strand, 16623292 - 16623425
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattg-gctgaactgggtcaacaatcttg 272  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||  | ||||||||||||||||||||    
T  16623292 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattgaaccgaactgggtcaacaatcttg 16623391  T
Q  273 ctcggtgtttgttcgttttcttttatcgcttatctt 308  Q
     |  |||||||||| |||||||| || |||||||||    
T  16623392 gt--gtgtttgttccttttctttcattgcttatctt 16623425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 175 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 39246092 - 39245960
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 272  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  39246092 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 39245993  T
Q  273 ctcggtgtttgttcgttttcttttatcgcttatctt 308  Q
     |  ||||||||||  ||||||| || |||||||||    
T  39245992 gt--gtgtttgttc-ctttctttcattgcttatctt 39245960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 175 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 10047477 - 10047378
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 272  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  10047477 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 10047378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 175 - 308
Target Start/End: Original strand, 38152438 - 38152570
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattcac-atattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 272  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  38152438 ttcttataactcttttgtaacactttcaccatagtggattggagagctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 38152537  T
Q  273 ctcggtgtttgttcgttttcttttatcgcttatctt 308  Q
     |  ||||||||||  ||||||| || |||||||||    
T  38152538 gt--gtgtttgttc-ctttctttcattgcttatctt 38152570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 189 - 271
Target Start/End: Original strand, 28468542 - 28468625
Alignment:
Q  189 ttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 271  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  28468542 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattggctgaactgggtcaacaatctt 28468625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 175 - 308
Target Start/End: Original strand, 16630679 - 16630812
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 272  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| | || ||||| | ||||| ||||||||| ||||    
T  16630679 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgttctctcctccagattatgtcatattggaccgaactaggtcaacaaccttg 16630778  T
Q  273 ctcggtgtttgttcgttttcttttatcgcttatctt 308  Q
     |  |||||||||| |||||||| || |||||||||    
T  16630779 gt--gtgtttgttccttttctttcattgcttatctt 16630812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 175 - 272
Target Start/End: Original strand, 36315229 - 36315327
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 272  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||| |||||    
T  36315229 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacattcttg 36315327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 175 - 272
Target Start/End: Original strand, 36329438 - 36329536
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 272  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||| |||||    
T  36329438 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacattcttg 36329536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 175 - 271
Target Start/End: Original strand, 3796518 - 3796616
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 271  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||| || ||||| | |||||||||||||||||||    
T  3796518 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattagagagttgctctctcccccatattaggtcatattggacggaactgggtcaacaatctt 3796616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 175 - 271
Target Start/End: Original strand, 5396671 - 5396768
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 271  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||    
T  5396671 ttcttgtaactcttt-gcaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 5396768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 175 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 5143357 - 5143260
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatct 270  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||| ||||||||||||    
T  5143357 ttcttgtaaattttttgtaacactttcatcatagtgggttggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatct 5143260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 175 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 5147775 - 5147678
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatct 270  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||| |||||| || ||||| | ||||||||||||||||||    
T  5147775 ttcttgtaactattttgtaacactttcatcataatggactggagagctgctccctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatct 5147678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 181 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 24333901 - 24333808
Alignment:
Q  181 taactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 272  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| | |||||| || ||||||||||    
T  24333901 taactcttttgtaacacgttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgagttaacaatcttg 24333808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 271
Target Start/End: Original strand, 31985634 - 31985730
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 271  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||    
T  31985634 ttcttgtaacccttt-gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctct-ccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 31985730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 272
Target Start/End: Original strand, 5269204 - 5269289
Alignment:
Q  189 ttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 272  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  5269204 ttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatcttg 5269289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 178 - 266
Target Start/End: Original strand, 6743417 - 6743507
Alignment:
Q  178 ttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaaca 266  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||| || ||||| | ||||||||||||||    
T  6743417 ttgtagctcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccgtagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 6743507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 3777646 - 3777550
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatct 270  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||  | ||||| | ||||||||||||||||||    
T  3777646 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtggattggagagctactctctcctctagattaggttatattggaccgaactgggtcaacaatct 3777550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 16931849 - 16931789
Alignment:
Q  208 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 267  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  16931849 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 16931789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 16934203 - 16934143
Alignment:
Q  208 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 267  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  16934203 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 16934143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 22780433 - 22780373
Alignment:
Q  208 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 267  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  22780433 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 22780373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 44599898 - 44599838
Alignment:
Q  208 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 267  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  44599898 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 44599838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 272
Target Start/End: Original strand, 25862035 - 25862120
Alignment:
Q  189 ttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 272  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||| || ||||||| ||||| |||||| || ||||| | |||||| |||||||||||||    
T  25862035 ttgtaacactttcatcatagtggattggagggccgctctcttccccatattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttg 25862120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 29760919 - 29760875
Alignment:
Q  46 gagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttggg 91  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29760919 gagagtgtctcttgggttgggaaaa-aacattgtaatcaccttggg 29760875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 175 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 5112335 - 5112275
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattcacat-attggattggagagctgctctctccccca 234  Q
    |||||||||| | |||||||||| |||| || | |||||||||||||||||||| ||||||    
T  5112335 ttcttgtaacccatttgtaacactttcatattagtggattggagagctgctctcaccccca 5112275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 208 - 267
Target Start/End: Original strand, 6765117 - 6765177
Alignment:
Q  208 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 267  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  |||| | |||||||||||||||    
T  6765117 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 6765177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 208 - 267
Target Start/End: Original strand, 7941596 - 7941656
Alignment:
Q  208 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 267  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  |||| | |||||||||||||||    
T  7941596 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 7941656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 208 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 18709224 - 18709164
Alignment:
Q  208 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 267  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  18709224 tggattggaggactgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 18709164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 39 - 98
Target Start/End: Original strand, 18712620 - 18712677
Alignment:
Q  39 ctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagg 98  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  18712620 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaa--aacattgttatcaccttgggttttagg 18712677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 208 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 22782798 - 22782738
Alignment:
Q  208 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 267  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | ||||||| |||||||    
T  22782798 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactggatcaacaa 22782738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 175 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 54867281 - 54867150
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 272  Q
    ||||| ||||| ||||||||||  |||| |||| | ||||| || |||||||||||||| ||| |||| || ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  54867281 ttcttataactattttgtaacattttcatcatagttgattgaagggctgctctctcccc-agactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 54867183  T
Q  273 ctcggtgtttgttcgttttcttttatcgcttatctt 308  Q
     |  ||||||||||  ||||||| || |||||||||    
T  54867182 gt--gtgtttgttc-ctttctttcattgcttatctt 54867150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 3)
Name: scaffold0355
Description:

Target: scaffold0355; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 55 - 452
Target Start/End: Original strand, 9514 - 9904
Alignment:
Q  55 tcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgaggatgggaaaataccaaagggtagatctagggtttgttcatgt 154  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9514 tcttaggttgggaaaa--acattgtaatcaccttgggttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagatctagggtttgttcatgt 9611  T
Q  155 gtaaagcttgaatagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctga 254  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9612 gtaaagcttgaag-gctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctga 9709  T
Q  255 actgggtcaacaatcttgctcggtgttt-gttcgttttcttttatcgcttatcttgt--atgcttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggc 351  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||   ||| ||| | |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| |    
T  9710 actgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc---ttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctt-gtgtggttttgctatatactag-c 9803  T
Q  352 ttaggt-tgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcattggtttattctcattggtgtga 450  Q
    |||||  ||||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9804 ttagggctgttttgttgttgtttggttggagaccatttgctctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattggtttatt-tcattggtgtga 9902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 39 - 184
Target Start/End: Original strand, 3703 - 3845
Alignment:
Q  39 ctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgaggatgggaaaataccaaagggtagatc 138  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  3703 ctttgttgagagtgtctcttaggttaggaaaa--acattgtaatcaccttgggttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagatc 3800  T
Q  139 tagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctagattcttgtaac 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  3801 tagggtttgttcatgtgtaaagcttgaa-ggctagagtcttgtaac 3845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 300 - 452
Target Start/End: Original strand, 1 - 145
Alignment:
Q  300 gcttatcttgt--atgcttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggt-tgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcat 396  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||    
T  1 gcttatcttgtttatgcttgttagctc---gtgtggttttgctatacactag-cttagggctgttttgttgttgtttacttggagaccatttgctctcat 96  T
Q  397 agattatctctatcacttgctccacacatcattggtttattctcattggtgtgaag 452  Q
     |||      ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  97 tgat------tatcacttgctccacacatcattggtttatt-taattggtgtgaag 145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 203; Significance: 1e-110; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 196 - 452
Target Start/End: Original strand, 181973 - 182230
Alignment:
Q  196 acattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttctt 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  181973 acattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttctt 182072  T
Q  295 ttatcgcttatcttgtatgcttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggttgttttgttgttg-ttagcttggaggccatttgcact 393  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  182073 ttatcgtttatcttgtatgcttgttagctcttagtgtggatttgct-tacattaggcttaggctgttttgttgttgattagcttggaggccatttgcact 182171  T
Q  394 catagattatctctatcacttgctccacacatcattggtttattctcattggtgtgaag 452  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  182172 catagattacctctatctcttgctccacacatctttgatttattctcattggtgtgaag 182230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 18 - 146
Target Start/End: Original strand, 176808 - 176936
Alignment:
Q  18 gggatcctttggggtgtgttcctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgaggatgg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||    
T  176808 gggatcctttggggtgtgttcctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggattatgggttcatagtgtgaggttgg 176907  T
Q  118 gaaaataccaaagggtagatctagggttt 146  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  176908 gaaattaccaaagggtaggtctagggttt 176936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135 (Bit Score: 177; Significance: 3e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0135
Description:

Target: scaffold0135; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 39 - 452
Target Start/End: Original strand, 34916 - 35325
Alignment:
Q  39 ctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgaggatgggaaaataccaaagggtaga-t 137  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||| || |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||| |    
T  34916 ctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaa--acattgtaatcaccttgggttttagggttcatagtgtgagagtggggaaacaccaaagggtagagt 35013  T
Q  138 ctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctaga-ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccaga 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35014 ctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaag-gctagagttcttctaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccaga 35111  T
Q  237 ttaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcttttatcgcttatcttg-tatgc-ttgttagctcttagtgtgg 333  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||  || |||||| ||||||||||| | ||| ||| || ||||| ||||||    
T  35112 ttaggccatattggctgaactgggttaacaatctt-ctcggtgttttgttc--ttccttttaccgcttatcttgttttgctttggtatctctttgtgtgg 35208  T
Q  334 ttttgctatacattaggcttaggttgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcattggtt 433  Q
    |||||||||||| ||| ||  || ||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||    
T  35209 ttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcatt-gtt 35307  T
Q  434 tattctcattggtgtgaag 452  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  35308 tatt-tcattggtgtgaag 35325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 66; Significance: 5e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 175 - 271
Target Start/End: Original strand, 17952 - 18048
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 271  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17952 ttcttgtaacccttt-gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 18048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 175 - 271
Target Start/End: Original strand, 24045 - 24141
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 271  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24045 ttcttgtaacccttt-gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 24141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 3)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 175 - 271
Target Start/End: Original strand, 8419 - 8516
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 271  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||    
T  8419 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 8516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 208 - 267
Target Start/End: Original strand, 22343 - 22403
Alignment:
Q  208 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 267  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  22343 tggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 22403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 208 - 267
Target Start/End: Original strand, 24618 - 24678
Alignment:
Q  208 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 267  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  24618 tggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 24678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 175 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 85780 - 85649
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 272  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  85780 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatggtggattggagagccgctctctcccccagattaggtcatattggactgaactgggtcaacaatctag 85682  T
Q  273 ctcggtgtttgttcgttttcttttatcgcttatctt 308  Q
     |  |||||||||| |||||||| || |||||||||    
T  85681 at--gtgtttgttc-ttttctttcattgcttatctt 85649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 175 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 5781 - 5649
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 272  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  5781 ttcttgtatctcttttgtaacactttcatcatagtggattgaagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 5682  T
Q  273 ctcggtgtttgttcgttttcttttatcgcttatctt 308  Q
     |  ||||||||||  ||||||| || |||||||||    
T  5681 gt--gtgtttgttc-ctttctttcattgcttatctt 5649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 175 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 2590 - 2458
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 272  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| || |||||   ||||||||||||||||||||    
T  2590 ttcttataattcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctgtctcccccagattaggtcatattggagcgaactgggtcaacaatcttg 2491  T
Q  273 ctcggtgtttgttcgttttcttttatcgcttatctt 308  Q
     |  ||||||||||  ||||||| || |||||||||    
T  2490 gt--gtgtttgttc-ctttctttcattgcttatctt 2458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 175 - 271
Target Start/End: Original strand, 133280 - 133377
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattg-gctgaactgggtcaacaatctt 271  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||  |  ||||||||||||||||||    
T  133280 ttcttgtaactcttt-gtaacattttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattgaacctaactgggtcaacaatctt 133377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 175 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 10827 - 10728
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 272  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| | |||||||||||| |||||||    
T  10827 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaataatcttg 10728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0127 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0127
Description:

Target: scaffold0127; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 374 - 452
Target Start/End: Original strand, 34136 - 34213
Alignment:
Q  374 gcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcattggtttattctcattggtgtgaag 452  Q
    |||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34136 gcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattggtttatt-tcattggtgtgaag 34213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 175 - 271
Target Start/End: Original strand, 43961 - 44058
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 271  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||| | |||||||||||||||||||    
T  43961 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagaatagatcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 44058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 308
Target Start/End: Original strand, 36832 - 36965
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 272  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||| |||| |||||||||||| ||| |||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||     
T  36832 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtgggttggcgagctgctctcttccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttt 36930  T
Q  273 ctcggtgtttgttcgttttcttttatcgcttatctt 308  Q
        ||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  36931 tggtgtgtttgttc-ctttcttttattgcttatctt 36965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 203 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 45322 - 45253
Alignment:
Q  203 catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattg-gctgaactgggtcaacaatctt 271  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  | |||||| ||||||||||||    
T  45322 catagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattgaaccgaactgagtcaacaatctt 45253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0479 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0479
Description:

Target: scaffold0479; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 392 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 13228 - 13169
Alignment:
Q  392 ctcatagattatctctatcacttgctccacacatcattggtttattctcattggtgtgaag 452  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  13228 ctcattgattatcactatcacttgctccacatatctttggtttatt-tcattggtgtgaag 13169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 175 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 17361 - 17266
Alignment:
Q  175 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattg-gctgaactgggtcaacaat 268  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||||||||  |||| |||||| || ||||  | ||||||||||||||||    
T  17361 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcataatggattggagggttgctctctttcccatattaggtcatattgaaccgaactgggtcaacaat 17266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 267
Target Start/End: Original strand, 269 - 329
Alignment:
Q  208 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 267  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  269 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 11533 - 11500
Alignment:
Q  208 tggattggagagctgctctctcccccagattagg 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11533 tggattggagagctgctctctcccccagactagg 11500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 208 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 69352 - 69292
Alignment:
Q  208 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 267  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||| | |||||||||||||||    
T  69352 tggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 69292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University