View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9041_low_25 (Length: 219)

Name: NF9041_low_25
Description: NF9041
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9041_low_25
NF9041_low_25
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (15-219)||(2576-2789)
[»] chr1 (8 HSPs)
chr1 (15-219)||(20340253-20340466)
chr1 (17-219)||(16207951-16208162)
chr1 (15-213)||(28151992-28152199)
chr1 (17-219)||(20461205-20461416)
chr1 (15-213)||(51638348-51638555)
chr1 (15-213)||(10962800-10963007)
chr1 (15-95)||(41793226-41793306)
chr1 (15-95)||(28585238-28585318)
[»] chr7 (34 HSPs)
chr7 (23-214)||(16449810-16450010)
chr7 (17-219)||(16041449-16041660)
chr7 (15-213)||(26484826-26485033)
chr7 (23-213)||(2108817-2109016)
chr7 (15-213)||(2775491-2775698)
chr7 (15-213)||(39210827-39211034)
chr7 (25-219)||(31088278-31088481)
chr7 (25-219)||(45733586-45733789)
chr7 (15-210)||(4200682-4200886)
chr7 (13-213)||(5128124-5128333)
chr7 (15-210)||(26682804-26683008)
chr7 (15-207)||(2154711-2154912)
chr7 (15-207)||(10916672-10916873)
chr7 (15-207)||(11424580-11424781)
chr7 (16-207)||(16503185-16503385)
chr7 (15-213)||(26435389-26435596)
chr7 (16-207)||(16518221-16518421)
chr7 (15-213)||(5147144-5147351)
chr7 (15-213)||(31564194-31564401)
chr7 (15-213)||(26274898-26275105)
chr7 (15-213)||(3445438-3445645)
chr7 (15-213)||(4144927-4145134)
chr7 (15-213)||(24592345-24592552)
chr7 (15-213)||(11441704-11441911)
chr7 (15-213)||(26319673-26319880)
chr7 (15-213)||(26537674-26537881)
chr7 (15-213)||(26669718-26669925)
chr7 (15-213)||(9618783-9618990)
chr7 (15-213)||(16736264-16736471)
chr7 (15-213)||(16751318-16751525)
chr7 (15-213)||(17523664-17523871)
chr7 (15-213)||(17529344-17529551)
chr7 (15-213)||(45387475-45387682)
chr7 (15-95)||(31125179-31125259)
[»] chr2 (42 HSPs)
chr2 (17-219)||(21703073-21703284)
chr2 (24-219)||(27118809-27119013)
chr2 (20-219)||(19456333-19456541)
chr2 (20-219)||(27393090-27393298)
chr2 (25-219)||(3784775-3784978)
chr2 (15-219)||(34303210-34303423)
chr2 (25-219)||(16163720-16163923)
chr2 (25-219)||(34157132-34157334)
chr2 (15-213)||(40233638-40233845)
chr2 (25-207)||(31891245-31891436)
chr2 (15-210)||(27434351-27434555)
chr2 (15-201)||(9349889-9350084)
chr2 (15-207)||(23128473-23128674)
chr2 (15-207)||(12655675-12655876)
chr2 (15-207)||(28882347-28882548)
chr2 (15-210)||(20838048-20838252)
chr2 (15-213)||(22925935-22926142)
chr2 (15-201)||(12586949-12587144)
chr2 (15-201)||(27777361-27777556)
chr2 (15-201)||(27817119-27817314)
chr2 (15-201)||(12716509-12716704)
chr2 (15-201)||(13936451-13936646)
chr2 (15-201)||(16829245-16829440)
chr2 (15-201)||(16892041-16892236)
chr2 (15-213)||(32049925-32050132)
chr2 (15-213)||(37375288-37375495)
chr2 (15-201)||(39051729-39051924)
chr2 (18-201)||(27803846-27804038)
chr2 (15-213)||(260660-260867)
chr2 (91-213)||(34279576-34279698)
chr2 (15-213)||(37925620-37925827)
chr2 (50-213)||(34286481-34286653)
chr2 (50-213)||(34291541-34291713)
chr2 (15-95)||(39890328-39890408)
chr2 (15-213)||(21677089-21677296)
chr2 (15-213)||(34861807-34862014)
chr2 (15-213)||(37685816-37686023)
chr2 (15-213)||(37701081-37701288)
chr2 (15-95)||(11635093-11635173)
chr2 (15-95)||(11641282-11641362)
chr2 (15-213)||(31876408-31876615)
chr2 (15-95)||(19416406-19416486)
[»] chr5 (49 HSPs)
chr5 (17-219)||(22888604-22888815)
chr5 (17-219)||(25199163-25199374)
chr5 (15-213)||(29888897-29889104)
chr5 (15-210)||(23892349-23892553)
chr5 (20-219)||(33877381-33877589)
chr5 (25-219)||(11325928-11326131)
chr5 (25-219)||(13184473-13184676)
chr5 (25-219)||(13440319-13440522)
chr5 (15-210)||(23752265-23752469)
chr5 (15-213)||(9548358-9548565)
chr5 (15-207)||(24687972-24688173)
chr5 (15-210)||(33777630-33777834)
chr5 (15-207)||(22998929-22999130)
chr5 (15-207)||(23717803-23718004)
chr5 (15-213)||(37671298-37671505)
chr5 (15-207)||(11549500-11549701)
chr5 (15-207)||(24970164-24970365)
chr5 (15-207)||(30934779-30934980)
chr5 (15-213)||(13324644-13324851)
chr5 (15-213)||(15658575-15658782)
chr5 (15-213)||(31431580-31431787)
chr5 (23-213)||(18500553-18500752)
chr5 (15-201)||(24681592-24681787)
chr5 (15-201)||(24724119-24724314)
chr5 (15-213)||(28649375-28649582)
chr5 (15-201)||(33516508-33516703)
chr5 (15-201)||(40473364-40473559)
chr5 (15-213)||(43078392-43078599)
chr5 (14-213)||(32599286-32599494)
chr5 (15-213)||(9317591-9317798)
chr5 (15-213)||(12132295-12132502)
chr5 (15-213)||(30152158-30152365)
chr5 (15-213)||(31826222-31826429)
chr5 (15-213)||(37358458-37358665)
chr5 (15-213)||(37755120-37755327)
chr5 (15-213)||(37770802-37771009)
chr5 (15-95)||(18375227-18375307)
chr5 (15-213)||(3789681-3789888)
chr5 (15-213)||(8665290-8665497)
chr5 (15-213)||(15758672-15758879)
chr5 (15-213)||(26480532-26480739)
chr5 (15-95)||(6874572-6874652)
chr5 (15-213)||(2511191-2511398)
chr5 (15-213)||(29966881-29967088)
chr5 (15-213)||(30029555-30029762)
chr5 (15-213)||(30168609-30168816)
chr5 (15-213)||(34616658-34616865)
chr5 (15-93)||(5638179-5638257)
chr5 (92-213)||(28959687-28959808)
[»] scaffold0415 (2 HSPs)
scaffold0415 (17-219)||(1838-2048)
scaffold0415 (23-135)||(6223-6344)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (17-219)||(20513-20723)
scaffold0124 (15-201)||(30595-30790)
[»] chr6 (49 HSPs)
chr6 (15-219)||(22456795-22457008)
chr6 (15-219)||(27290231-27290444)
chr6 (15-213)||(14143146-14143353)
chr6 (15-213)||(26788072-26788279)
chr6 (15-213)||(27196445-27196652)
chr6 (15-213)||(27252588-27252795)
chr6 (20-219)||(13521939-13522147)
chr6 (25-219)||(33374127-33374330)
chr6 (25-219)||(28162779-28162982)
chr6 (25-219)||(8892182-8892384)
chr6 (25-219)||(8903417-8903619)
chr6 (15-210)||(22934741-22934945)
chr6 (15-210)||(23857186-23857390)
chr6 (15-207)||(26989135-26989336)
chr6 (18-213)||(16749982-16750186)
chr6 (15-213)||(26918508-26918715)
chr6 (125-219)||(22477253-22477347)
chr6 (15-207)||(13298812-13299013)
chr6 (15-207)||(24304479-24304680)
chr6 (15-207)||(24863851-24864052)
chr6 (15-213)||(29549603-29549810)
chr6 (15-210)||(27272441-27272645)
chr6 (14-213)||(27359852-27360060)
chr6 (14-213)||(27450195-27450403)
chr6 (15-213)||(4757892-4758099)
chr6 (15-213)||(4773134-4773341)
chr6 (15-213)||(4545636-4545843)
chr6 (29-207)||(27000207-27000394)
chr6 (15-201)||(30557877-30558072)
chr6 (15-213)||(34463207-34463414)
chr6 (15-207)||(15424178-15424379)
chr6 (15-201)||(4525426-4525621)
chr6 (15-213)||(4723995-4724202)
chr6 (15-213)||(16674267-16674474)
chr6 (15-201)||(17025417-17025612)
chr6 (15-213)||(27007855-27008062)
chr6 (15-95)||(17092301-17092381)
chr6 (15-213)||(26116271-26116478)
chr6 (15-213)||(29573141-29573348)
chr6 (15-213)||(3696209-3696416)
chr6 (15-213)||(28207582-28207789)
chr6 (15-213)||(29501543-29501750)
chr6 (20-207)||(20160835-20161031)
chr6 (20-207)||(22171800-22171996)
chr6 (15-95)||(27044643-27044723)
chr6 (14-213)||(26777475-26777683)
chr6 (90-213)||(16943972-16944095)
chr6 (15-95)||(16943888-16943968)
chr6 (15-95)||(27485384-27485464)
[»] chr4 (24 HSPs)
chr4 (17-219)||(15228010-15228221)
chr4 (17-214)||(1900402-1900608)
chr4 (20-213)||(15284851-15285053)
chr4 (25-219)||(24460533-24460736)
chr4 (20-219)||(14235448-14235656)
chr4 (50-219)||(15391291-15391469)
chr4 (15-210)||(17014149-17014353)
chr4 (15-207)||(24592232-24592433)
chr4 (15-207)||(14665170-14665371)
chr4 (15-213)||(36344433-36344640)
chr4 (15-213)||(31126436-31126643)
chr4 (15-213)||(6569999-6570206)
chr4 (15-213)||(14763222-14763429)
chr4 (15-213)||(33673716-33673923)
chr4 (15-213)||(18800531-18800738)
chr4 (15-201)||(21969859-21970054)
chr4 (15-213)||(5006019-5006226)
chr4 (15-201)||(39850796-39850991)
chr4 (15-213)||(40105556-40105763)
chr4 (15-213)||(54833533-54833740)
chr4 (15-212)||(14098688-14098894)
chr4 (15-95)||(27163235-27163315)
chr4 (15-213)||(30753900-30754107)
chr4 (92-213)||(34188964-34189085)
[»] chr3 (55 HSPs)
chr3 (17-219)||(18530474-18530685)
chr3 (15-213)||(31034076-31034283)
chr3 (15-213)||(32292844-32293051)
chr3 (20-219)||(16626470-16626678)
chr3 (24-219)||(5652473-5652677)
chr3 (25-219)||(4626030-4626233)
chr3 (25-219)||(17993753-17993956)
chr3 (25-213)||(5713319-5713516)
chr3 (25-213)||(5724229-5724426)
chr3 (25-213)||(5757051-5757248)
chr3 (25-213)||(5767942-5768139)
chr3 (15-207)||(15741053-15741254)
chr3 (15-207)||(18051360-18051561)
chr3 (15-207)||(18330767-18330968)
chr3 (15-213)||(7073304-7073511)
chr3 (15-213)||(22387537-22387744)
chr3 (15-207)||(15892665-15892866)
chr3 (15-210)||(6192411-6192615)
chr3 (15-213)||(29148714-29148921)
chr3 (15-201)||(29664929-29665124)
chr3 (15-207)||(4796612-4796813)
chr3 (15-207)||(8296070-8296271)
chr3 (15-213)||(11110308-11110515)
chr3 (15-207)||(8301226-8301427)
chr3 (15-213)||(4346646-4346853)
chr3 (15-213)||(4417011-4417218)
chr3 (15-201)||(20576806-20577001)
chr3 (15-207)||(35880864-35881065)
chr3 (15-213)||(8211830-8212037)
chr3 (15-213)||(10396225-10396432)
chr3 (15-213)||(18277011-18277218)
chr3 (15-213)||(18292312-18292519)
chr3 (15-213)||(18307613-18307820)
chr3 (15-213)||(22870815-22871022)
chr3 (15-213)||(22885874-22886081)
chr3 (15-213)||(28021367-28021574)
chr3 (15-213)||(28115913-28116120)
chr3 (15-213)||(48466019-48466226)
chr3 (15-210)||(4721726-4721930)
chr3 (15-213)||(21674785-21674992)
chr3 (15-213)||(51782115-51782322)
chr3 (15-213)||(51797205-51797412)
chr3 (15-213)||(5467077-5467284)
chr3 (15-213)||(6542421-6542628)
chr3 (15-213)||(36997036-36997243)
chr3 (15-213)||(5596316-5596523)
chr3 (15-213)||(31964432-31964639)
chr3 (15-213)||(50134030-50134237)
chr3 (15-95)||(17984915-17984995)
chr3 (15-95)||(18242958-18243038)
chr3 (15-213)||(5609281-5609488)
chr3 (15-213)||(28339394-28339601)
chr3 (15-213)||(5013804-5014011)
chr3 (15-213)||(47023545-47023752)
chr3 (15-95)||(24328378-24328458)
[»] chr8 (23 HSPs)
chr8 (24-219)||(19658926-19659129)
chr8 (25-219)||(44563226-44563427)
chr8 (24-219)||(33244790-33244994)
chr8 (50-219)||(22080790-22080968)
chr8 (15-213)||(18710717-18710924)
chr8 (15-210)||(16283583-16283787)
chr8 (15-207)||(27608782-27608983)
chr8 (15-219)||(9354747-9354961)
chr8 (15-207)||(16277691-16277892)
chr8 (15-207)||(14557761-14557962)
chr8 (15-213)||(12092601-12092808)
chr8 (15-207)||(19688235-19688436)
chr8 (15-201)||(29829465-29829660)
chr8 (15-207)||(2137136-2137337)
chr8 (15-182)||(189256-189432)
chr8 (15-213)||(3329384-3329591)
chr8 (15-213)||(31489627-31489834)
chr8 (15-213)||(19286593-19286800)
chr8 (15-213)||(19674572-19674779)
chr8 (15-213)||(31354655-31354862)
chr8 (15-213)||(19208237-19208444)
chr8 (15-213)||(28361832-28362039)
chr8 (15-213)||(33258854-33259061)
[»] scaffold0558 (1 HSPs)
scaffold0558 (70-219)||(1-159)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (15-198)||(536-728)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (50-219)||(21686-21864)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (15-207)||(46903-47104)
scaffold0089 (15-207)||(39987-40188)
scaffold0089 (15-207)||(29900-30101)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (15-207)||(47-248)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (16-207)||(27429-27629)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (15-213)||(9697-9904)
[»] scaffold0350 (1 HSPs)
scaffold0350 (15-213)||(7157-7364)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (15-213)||(26119-26326)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (15-213)||(8080-8287)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (15-213)||(14848-15055)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (15-213)||(8984-9191)
scaffold0159 (15-213)||(20146-20353)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (59-95)||(46764-46800)


Alignment Details
Target: scaffold0260 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 15 - 219
Target Start/End: Original strand, 2576 - 2789
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||    
T  2576 ggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggatattgttctcaaa 2675  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2676 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 2775  T
Q  206 aggtcagaatggaa 219  Q
    ||||||||| ||||    
T  2776 aggtcagaacggaa 2789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 8)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 15 - 219
Target Start/End: Original strand, 20340253 - 20340466
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||    
T  20340253 ggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggatattgttctcaaa 20340352  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20340353 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 20340452  T
Q  206 aggtcagaatggaa 219  Q
    ||||||||| ||||    
T  20340453 aggtcagaacggaa 20340466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 17 - 219
Target Start/End: Original strand, 16207951 - 16208162
Alignment:
Q  17 acatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggac---------attgttctcaaaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||    
T  16207951 acatcaagtctgggagctttctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaag 16208050  T
Q  108 ttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 207  Q
    ||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16208051 ttaactttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 16208150  T
Q  208 gtcagaatggaa 219  Q
    ||||||| ||||    
T  16208151 gtcagaacggaa 16208162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 28152199 - 28151992
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||         ||||||||||    
T  28152199 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatatctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 28152100  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| | |||||| || | |||||||||||| ||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28152099 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 28152000  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    ||||||||    
T  28151999 aggtcaga 28151992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 20461416 - 20461205
Alignment:
Q  17 acatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaaag 107  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||         | || ||||| |    
T  20461416 acatcaagtctgcgagcttgctcatatacctcaatcatgttcacaacagcgtgattcggaagaggattatcgaggacatgagggacgatattttcaaagg 20461317  T
Q  108 ttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 207  Q
    | |  ||||| || |  |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20461316 tcaattttccttggtctatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacctagagcaccttgatgaaaatcacacttgag 20461217  T
Q  208 gtcagaatggaa 219  Q
    ||||||| ||||    
T  20461216 gtcagaacggaa 20461205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 51638555 - 51638348
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||         | ||||||||    
T  51638555 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 51638456  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||| || |||| |||||||||||| ||||| ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  51638455 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 51638356  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  51638355 agatcaga 51638348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 10963007 - 10962800
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggac---------attgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | |  || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||         ||| ||||||||    
T  10963007 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacatttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 10962908  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||| |||    
T  10962907 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaagtcacatttg 10962808  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  10962807 agatcaga 10962800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 95
Target Start/End: Original strand, 41793226 - 41793306
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat 95  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||    
T  41793226 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacat 41793306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 28585318 - 28585238
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat 95  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||    
T  28585318 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacat 28585238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 141; Significance: 4e-74; HSPs: 34)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 23 - 214
Target Start/End: Original strand, 16449810 - 16450010
Alignment:
Q  23 agtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaaagttagct 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         | ||||||||||||| ||    
T  16449810 agtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacgttattctcaaaagttaact 16449909  T
Q  114 ttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 213  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16449910 ttccctgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 16450009  T
Q  214 a 214  Q
    |    
T  16450010 a 16450010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 16041660 - 16041449
Alignment:
Q  17 acatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaaag 107  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||    
T  16041660 acatcgagtctgggagcttcctcgtatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaag 16041561  T
Q  108 ttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 207  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16041560 ttaactttccctgatcaatgagctttttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacactttag 16041461  T
Q  208 gtcagaatggaa 219  Q
    ||||||| ||||    
T  16041460 gtcagaacggaa 16041449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 26485033 - 26484826
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||         ||||||||||    
T  26485033 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 26484934  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| | |||||| || | |||||||||||| ||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26484933 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 26484834  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    ||||||||    
T  26484833 aggtcaga 26484826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 23 - 213
Target Start/End: Original strand, 2108817 - 2109016
Alignment:
Q  23 agtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaaagttagct 113  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||         ||||||||||||| | ||    
T  2108817 agtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaact 2108916  T
Q  114 ttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 213  Q
    |||| || | |||||||||||| ||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2108917 ttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcaga 2109016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 2775698 - 2775491
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||         ||||||||||    
T  2775698 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 2775599  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| | |||||| || | |||||||||||| |||||||   |||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2775598 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 2775499  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    ||||||||    
T  2775498 aggtcaga 2775491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 39210827 - 39211034
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||         ||||||||||    
T  39210827 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 39210926  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| | |||||| || | |||||||||||| ||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  39210927 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccaaagcaccttgatggaaatcacatttg 39211026  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    ||||||||    
T  39211027 aggtcaga 39211034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 25 - 219
Target Start/End: Original strand, 31088278 - 31088481
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaaagttagcttt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||         | |||||||| || |  |||    
T  31088278 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 31088377  T
Q  116 ccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 215  Q
    || || |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  31088378 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 31088477  T
Q  216 ggaa 219  Q
    ||||    
T  31088478 ggaa 31088481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 25 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 45733789 - 45733586
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaaagttagcttt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||         | |||||||| || |  |||    
T  45733789 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 45733690  T
Q  116 ccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 215  Q
    || || |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  45733689 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 45733590  T
Q  216 ggaa 219  Q
    ||||    
T  45733589 ggaa 45733586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 4200886 - 4200682
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||         ||||||||||    
T  4200886 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttatcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 4200787  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| | |||||| || | |||||||||||| |||||||   |||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4200786 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 4200687  T
Q  206 aggtc 210  Q
    |||||    
T  4200686 aggtc 4200682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 5128333 - 5128124
Alignment:
Q  13 atggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctca 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||         | ||||||    
T  5128333 atggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctca 5128234  T
Q  104 aaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacact 203  Q
    ||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| ||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||| |||||||| |    
T  5128233 aaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcatccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatt 5128134  T
Q  204 tgaggtcaga 213  Q
    |||| |||||    
T  5128133 tgagatcaga 5128124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 210
Target Start/End: Original strand, 26682804 - 26683008
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcga---------ggacattgttctcaaa 105  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||         |||| || ||||||||    
T  26682804 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgacgacatgagggacgttattctcaaa 26682903  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
     || |  ||||| || |  ||||| || |||| |||||   |||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26682904 ggtcaattttccttggtctatgagtttttttaaaatgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 26683003  T
Q  206 aggtc 210  Q
    |||||    
T  26683004 aggtc 26683008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 2154912 - 2154711
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||         | ||||||||    
T  2154912 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 2154813  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| ||||||||||| |||||||||||| | || || |||||||| |||||||| |||    
T  2154812 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcatccctcgacatcatgacctagggcgccttgatgaaaatcacatttg 2154713  T
Q  206 ag 207  Q
    ||    
T  2154712 ag 2154711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 207
Target Start/End: Original strand, 10916672 - 10916873
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||         | ||||||||    
T  10916672 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 10916771  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| |||| || |||||||| |||||||| |||    
T  10916772 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 10916871  T
Q  206 ag 207  Q
    ||    
T  10916872 ag 10916873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 207
Target Start/End: Original strand, 11424580 - 11424781
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||         | ||||||||    
T  11424580 ggacatcaagtctaggagtttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 11424679  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| |||| || |||||||| |||||||| |||    
T  11424680 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 11424779  T
Q  206 ag 207  Q
    ||    
T  11424780 ag 11424781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 207
Target Start/End: Original strand, 16503185 - 16503385
Alignment:
Q  16 gacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaaa 106  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||         | |||||||||    
T  16503185 gacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaa 16503284  T
Q  107 gttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttga 206  Q
    || |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| ||||  | ||||| || |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  16503285 gtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaaacatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttga 16503384  T
Q  207 g 207  Q
    |    
T  16503385 g 16503385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 26435596 - 26435389
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggac---------attgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||         ||| ||||||||    
T  26435596 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 26435497  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  26435496 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 26435397  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  26435396 agatcaga 26435389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 207
Target Start/End: Original strand, 16518221 - 16518421
Alignment:
Q  16 gacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaaa 106  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||         | |||||||||    
T  16518221 gacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaa 16518320  T
Q  107 gttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttga 206  Q
    || | |||||| |||| |||||||||||| || || ||| ||||  | ||||| || |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  16518321 gtcaactttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaaacatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttga 16518420  T
Q  207 g 207  Q
    |    
T  16518421 g 16518421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 5147144 - 5147351
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggac---------attgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||         ||| ||||||||    
T  5147144 ggacatcaagtctaggagcttcctcgcacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 5147243  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  5147244 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 5147343  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  5147344 agatcaga 5147351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 31564194 - 31564401
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||         | ||||||||    
T  31564194 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 31564293  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | | |||||||||||| || ||||| |||    
T  31564294 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttg 31564393  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  31564394 agatcaga 31564401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 26274898 - 26275105
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcga---------ggacattgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||         ||||||| ||||||||    
T  26274898 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 26274997  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || ||||| |||||||||||| | || ||||||||||| || ||||| |||    
T  26274998 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 26275097  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  26275098 agatcaga 26275105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 3445645 - 3445438
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgagg---------acattgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| |||| || ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||         ||||| ||||||||    
T  3445645 ggacatcaagtctaggagtttcctcacatacttcgatcatattcacagcagcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 3445546  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||| || |||| |||||||||||| ||||| ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  3445545 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 3445446  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  3445445 agatcaga 3445438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 4144927 - 4145134
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcga---------ggacattgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||         ||||||| ||||||||    
T  4144927 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 4145026  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||||| || ||||| |||    
T  4145027 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 4145126  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  4145127 agatcaga 4145134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 24592345 - 24592552
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcga---------ggacattgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||         ||||||| ||||||||    
T  24592345 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcgtgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 24592444  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || ||||| |||||| | |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  24592445 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 24592544  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  24592545 agatcaga 24592552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 11441911 - 11441704
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgagg---------acattgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||         ||||| ||||||||    
T  11441911 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 11441812  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  11441811 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 11441712  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  11441711 agatcaga 11441704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 26319673 - 26319880
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggac---------attgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||         ||| ||||||||    
T  26319673 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagtggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 26319772  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||||| || ||||| |||    
T  26319773 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 26319872  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  26319873 agatcaga 26319880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 26537674 - 26537881
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcga---------ggacattgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||         ||||||| ||||||||    
T  26537674 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 26537773  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||| || |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||| ||||| || |||    
T  26537774 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttg 26537873  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  26537874 agatcaga 26537881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 26669718 - 26669925
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcga---------ggacattgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||         ||||||| ||||||||    
T  26669718 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 26669817  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||||| || || || |||    
T  26669818 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 26669917  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  26669918 agatcaga 26669925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 9618990 - 9618783
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcga---------ggacattgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||         ||||||| ||||||||    
T  9618990 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 9618891  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || ||||| |||||| | |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  9618890 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 9618791  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  9618790 agatcaga 9618783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 16736264 - 16736471
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    |||||||||| || |||||||||||| | || || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||         | ||||||||    
T  16736264 ggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacggcggcatgattcggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 16736363  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||| || |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||| ||||| |||||||| |||    
T  16736364 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttg 16736463  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  16736464 agatcaga 16736471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 16751318 - 16751525
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    |||||||||| || |||||||||||| | || || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||         | ||||||||    
T  16751318 ggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacggcggcatgattcggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 16751417  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||| || |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||| ||||| |||||||| |||    
T  16751418 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttg 16751517  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  16751518 agatcaga 16751525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 17523871 - 17523664
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    |||||||||| || |||||||||||| | || || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||         | ||||||||    
T  17523871 ggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacggcggcatgattcggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 17523772  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||| || |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||| ||||| |||||||| |||    
T  17523771 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttg 17523672  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  17523671 agatcaga 17523664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 17529344 - 17529551
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    |||||||||| || |||||||||||| | || || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||         | ||||||||    
T  17529344 ggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacggcggcatgattcggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 17529443  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||| || |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||| ||||| |||||||| |||    
T  17529444 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttg 17529543  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  17529544 agatcaga 17529551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 45387682 - 45387475
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcga---------ggacattgttctcaaa 105  Q
    |||||||||| || |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||         ||||||| ||||||||    
T  45387682 ggacatcaagcctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 45387583  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||||| || || || |||    
T  45387582 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 45387483  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  45387482 agatcaga 45387475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 31125259 - 31125179
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat 95  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||    
T  31125259 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacat 31125179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 42)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 17 - 219
Target Start/End: Original strand, 21703073 - 21703284
Alignment:
Q  17 acatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggac---------attgttctcaaaag 107  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||    
T  21703073 acatcgagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaag 21703172  T
Q  108 ttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 207  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21703173 ttaactttccctgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatcctttgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 21703272  T
Q  208 gtcagaatggaa 219  Q
    ||||||| ||||    
T  21703273 gtcagaacggaa 21703284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 27119013 - 27118809
Alignment:
Q  24 gtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaaagttagctt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||         | |||||||| || |  ||    
T  27119013 gtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacaacagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgcgggacgttattctcaaaggtcaattt 27118914  T
Q  115 tccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaa 214  Q
    ||| || |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27118913 tccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaa 27118814  T
Q  215 tggaa 219  Q
     ||||    
T  27118813 cggaa 27118809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Original strand, 19456333 - 19456541
Alignment:
Q  20 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggaca---------ttgttctcaaaagtta 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||         || |||||||| || |    
T  19456333 tcaagtctgggagcttcctcacatacctcaatcatgttcacaacagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacgttattctcaaaggtca 19456432  T
Q  111 gctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 210  Q
      ||||| || |  |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19456433 attttccttggtctatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcattcttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 19456532  T
Q  211 agaatggaa 219  Q
    |||| ||||    
T  19456533 agaacggaa 19456541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 27393298 - 27393090
Alignment:
Q  20 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgag---------gacattgttctcaaaagtta 110  Q
    ||||| |||||| |||| |||||   ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||         ||||||||||||||||||||    
T  27393298 tcaagactgggaacttcttcataagtctcgatcatgttcacaacagcgtgattcggaagaggattgtcaagaacatgagggacattgttctcaaaagtta 27393199  T
Q  111 gctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 210  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27393198 actttccctgatcaatgagcttctttacaatgtacttcaaagcgtaacatccttcaacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcgcacttgaggtc 27393099  T
Q  211 agaatggaa 219  Q
    |||||||||    
T  27393098 agaatggaa 27393090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 25 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 3784978 - 3784775
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaaagttagcttt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||         | |||||||| || |  |||    
T  3784978 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 3784879  T
Q  116 ccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 215  Q
    || || |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  3784878 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 3784779  T
Q  216 ggaa 219  Q
    ||||    
T  3784778 ggaa 3784775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 219
Target Start/End: Original strand, 34303210 - 34303423
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||| |||||         | ||||||||    
T  34303210 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttatagcagcatgtttcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaa 34303309  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
     || |  ||||| || |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34303310 ggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttg 34303409  T
Q  206 aggtcagaatggaa 219  Q
    ||||| ||| ||||    
T  34303410 aggtccgaacggaa 34303423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 25 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 16163923 - 16163720
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaaagttagcttt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||         | |||||||| || |  |||    
T  16163923 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 16163824  T
Q  116 ccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 215  Q
    || || |  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  16163823 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgccatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 16163724  T
Q  216 ggaa 219  Q
    ||||    
T  16163723 ggaa 16163720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 25 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 34157334 - 34157132
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaaagttagcttt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||         | |||||||| || |  |||    
T  34157334 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 34157235  T
Q  116 ccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 215  Q
    || || |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  34157234 ccttggtctatgagttt-tttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 34157136  T
Q  216 ggaa 219  Q
    ||||    
T  34157135 ggaa 34157132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 40233845 - 40233638
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||         | ||||||||    
T  40233845 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcattttcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 40233746  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||| || |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  40233745 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 40233646  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    ||||||||    
T  40233645 aggtcaga 40233638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 25 - 207
Target Start/End: Original strand, 31891245 - 31891436
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcga---------ggacattgttctcaaaagttagcttt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||         |||| || |||| ||| || |  |||    
T  31891245 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacgtgagggacgttattcttaaaggtcaatttt 31891344  T
Q  116 ccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 207  Q
    || || |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| || |||||||| |||||||| |||||    
T  31891345 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgag 31891436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 210
Target Start/End: Original strand, 27434351 - 27434555
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||         | ||||||||    
T  27434351 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 27434450  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| |||    
T  27434451 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 27434550  T
Q  206 aggtc 210  Q
    |||||    
T  27434551 aggtc 27434555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 201
Target Start/End: Original strand, 9349889 - 9350084
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggaca---------ttgttctcaaa 105  Q
    |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||         |||||||||||    
T  9349889 ggacgtcaagaccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 9349988  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcaca 201  Q
    ||| ||||| || |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||| ||||||||    
T  9349989 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcaca 9350084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 207
Target Start/End: Original strand, 23128473 - 23128674
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||         | ||||||||    
T  23128473 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 23128572  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  23128573 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaaatcacatttg 23128672  T
Q  206 ag 207  Q
    ||    
T  23128673 ag 23128674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 12655876 - 12655675
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||||||||         | ||||||||    
T  12655876 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacggcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 12655777  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| |||||||| || |||||||||||| |||| || |||||||| |||||||| |||    
T  12655776 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 12655677  T
Q  206 ag 207  Q
    ||    
T  12655676 ag 12655675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 28882548 - 28882347
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||         | ||||||||    
T  28882548 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 28882449  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| |||| || |||||||| |||||||| |||    
T  28882448 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 28882349  T
Q  206 ag 207  Q
    ||    
T  28882348 ag 28882347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 20838252 - 20838048
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||  || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||         | ||||||||    
T  20838252 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcaaatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 20838153  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||     
T  20838152 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacattta 20838053  T
Q  206 aggtc 210  Q
    |||||    
T  20838052 aggtc 20838048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 22925935 - 22926142
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgagg---------acattgttctcaaa 105  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||         ||||| ||||||||    
T  22925935 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 22926034  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || ||||| |||||| | |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  22926035 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 22926134  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  22926135 agatcaga 22926142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 12587144 - 12586949
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggac---------attgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||         ||| ||||||||    
T  12587144 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 12587045  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcaca 201  Q
    ||| ||||| || |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || |||||||||||||||||| | |  ||||||||||| ||||||||    
T  12587044 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccttcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcaca 12586949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 27777556 - 27777361
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggac---------attgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||         ||| ||||||||    
T  27777556 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 27777457  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcaca 201  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||| ||||||||    
T  27777456 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcaca 27777361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 27817314 - 27817119
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggac---------attgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||         ||| ||||||||    
T  27817314 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 27817215  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcaca 201  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||| ||||||||    
T  27817214 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcaca 27817119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 201
Target Start/End: Original strand, 12716509 - 12716704
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||         | ||||||||    
T  12716509 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 12716608  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcaca 201  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||| ||||||||    
T  12716609 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcaca 12716704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 201
Target Start/End: Original strand, 13936451 - 13936646
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcga---------ggacattgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||         ||||||| ||||||||    
T  13936451 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 13936550  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcaca 201  Q
    ||| ||||| || |||| |||||||||||| || |||||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||| ||||||||    
T  13936551 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatgtacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcaca 13936646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 201
Target Start/End: Original strand, 16829245 - 16829440
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcga---------ggacattgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||         ||||||| ||||||||    
T  16829245 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 16829344  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcaca 201  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||| || |||||    
T  16829345 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcaca 16829440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 16892236 - 16892041
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcga---------ggacattgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||         ||||||| ||||||||    
T  16892236 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 16892137  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcaca 201  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||| || |||||    
T  16892136 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcaca 16892041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 32050132 - 32049925
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| | || |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||         | ||||||||    
T  32050132 ggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcaatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 32050033  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||||| || || || |||    
T  32050032 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 32049933  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  32049932 agatcaga 32049925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 37375495 - 37375288
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || | || || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||         | ||||||||    
T  37375495 ggacatcaagtctaggagcttccccacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 37375396  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||||||||||| || ||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||||| |||||||| |||    
T  37375395 agtcagctttccctgatcaacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttg 37375296  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  37375295 agatcaga 37375288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 201
Target Start/End: Original strand, 39051729 - 39051924
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcga---------ggacattgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||         ||||||| ||||||||    
T  39051729 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 39051828  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcaca 201  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||  | |  ||||||||||| ||||||||    
T  39051829 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatggcctaaggcaccttgatgaaaatcaca 39051924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 27804038 - 27803846
Alignment:
Q  18 catcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggac---------attgttctcaaaagt 108  Q
    |||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||         ||| |||||||||||    
T  27804038 catcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagt 27803939  T
Q  109 tagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcaca 201  Q
     ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||  | |  ||||||||||| ||||||||    
T  27803938 cagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatggcctaaggcaccttgatgaaaatcaca 27803846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 260660 - 260867
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||  | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||         | ||||||||    
T  260660 ggacatcaagtctaggaacttcctcgcacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgttgaggacatgcgggacattattctcaaa 260759  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  260760 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 260859  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  260860 agatcaga 260867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 91 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 34279698 - 34279576
Alignment:
Q  91 gacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttga 190  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || |||||||||    
T  34279698 gacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttga 34279599  T
Q  191 tggaaatcacacttgaggtcaga 213  Q
    || |||||||| ||||| |||||    
T  34279598 tgaaaatcacatttgagatcaga 34279576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 37925827 - 37925620
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggac---------attgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||         ||| ||||||||    
T  37925827 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 37925728  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || |||||||||||||| || || |||    
T  37925727 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatggaagtcgcatttg 37925628  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  37925627 agatcaga 37925620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 34286653 - 34286481
Alignment:
Q  50 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaa 140  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||         | ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||| || |    
T  34286653 atcatattcacggcagcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcgaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacga 34286554  T
Q  141 tgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 213  Q
    | ||| |||| || || || || |||||||| ||| | || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  34286553 tatacttcaaagcataacacccctcgacatcgtgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcaga 34286481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 34291713 - 34291541
Alignment:
Q  50 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaa 140  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||         | ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||| || |    
T  34291713 atcatattcacggcagcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcgaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacga 34291614  T
Q  141 tgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 213  Q
    | ||| |||| || || || || |||||||| ||| | || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  34291613 tatacttcaaagcataacacccctcgacatcgtgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcaga 34291541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 39890408 - 39890328
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat 95  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  39890408 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacat 39890328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 21677089 - 21677296
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||         | ||||||||    
T  21677089 ggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 21677188  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||||| || ||||| |||    
T  21677189 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 21677288  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  21677289 agatcaga 21677296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 34862014 - 34861807
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcga---------ggacattgttctcaaa 105  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||         ||||||| ||||||||    
T  34862014 ggacatctagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 34861915  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||||| || || || |||    
T  34861914 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 34861815  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  34861814 agatcaga 34861807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 37685816 - 37686023
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcga---------ggacattgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||| |||||||||||         ||||||| ||||||||    
T  37685816 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaaaaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 37685915  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||||| || || || |||    
T  37685916 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 37686015  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  37686016 agatcaga 37686023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 37701081 - 37701288
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcga---------ggacattgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||| |||||||||||         ||||||| ||||||||    
T  37701081 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaaaaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 37701180  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||||| || || || |||    
T  37701181 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 37701280  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  37701281 agatcaga 37701288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 95
Target Start/End: Original strand, 11635093 - 11635173
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat 95  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  11635093 ggacatcaagtctaggagcttcctcgcacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattatcgaggacat 11635173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 95
Target Start/End: Original strand, 11641282 - 11641362
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat 95  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  11641282 ggacatcaagtctaggagcttcctcgcacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattatcgaggacat 11641362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 31876615 - 31876408
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgagg---------acattgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||         ||||| ||||||||    
T  31876615 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 31876516  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || ||||| |||||| |||  ||||||||||| || ||||| |||    
T  31876515 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 31876416  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  31876415 agatcaga 31876408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 95
Target Start/End: Original strand, 19416406 - 19416486
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat 95  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||    
T  19416406 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacat 19416486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 136; Significance: 4e-71; HSPs: 49)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 22888815 - 22888604
Alignment:
Q  17 acatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaaag 107  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||    
T  22888815 acatcgagtctaggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaag 22888716  T
Q  108 ttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 207  Q
    ||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22888715 ttaactttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 22888616  T
Q  208 gtcagaatggaa 219  Q
    ||||||| ||||    
T  22888615 gtcagaacggaa 22888604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 17 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 25199374 - 25199163
Alignment:
Q  17 acatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaaag 107  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||    
T  25199374 acatcaagtctgggggctttctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaag 25199275  T
Q  108 ttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 207  Q
    ||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25199274 ttaactttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtactttaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 25199175  T
Q  208 gtcagaatggaa 219  Q
     |||||| ||||    
T  25199174 atcagaacggaa 25199163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 29888897 - 29889104
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcga---------ggacattgttctcaaa 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||    
T  29888897 ggacatcaagtctgggagcttcctcatacacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 29888996  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| | |||||| |||| |||||||||||| || |||||| |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  29888997 agtcaactttccttgatcaatgagcttcttcacgatgtacttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatatg 29889096  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    ||||||||    
T  29889097 aggtcaga 29889104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 23892553 - 23892349
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||    
T  23892553 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcacgttcacagcagcatgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 23892454  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||||| || |||||| |||  || ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23892453 agttaactttccttgatcaatgagcttcttcacgatgtacttcagagcatagcatctttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 23892354  T
Q  206 aggtc 210  Q
    |||||    
T  23892353 aggtc 23892349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 33877589 - 33877381
Alignment:
Q  20 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaaagtta 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||         ||||||||||||| |    
T  33877589 tcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtca 33877490  T
Q  111 gctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 210  Q
     |||||| || | |||||||||||| |||||||   |||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33877489 actttccttggttaatgagcttcttcacaatgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 33877390  T
Q  211 agaatggaa 219  Q
     ||| ||||    
T  33877389 cgaacggaa 33877381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 25 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 11326131 - 11325928
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaaagttagcttt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||         ||||||||||||| | ||||    
T  11326131 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcaacgtgattcggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaacttt 11326032  T
Q  116 ccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 215  Q
    || || | |||||||||||| ||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||     
T  11326031 ccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtccgaac 11325932  T
Q  216 ggaa 219  Q
    ||||    
T  11325931 ggaa 11325928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 25 - 219
Target Start/End: Original strand, 13184473 - 13184676
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaaagttagcttt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||         | |||||||| || |  |||    
T  13184473 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 13184572  T
Q  116 ccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 215  Q
    || || |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  13184573 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 13184672  T
Q  216 ggaa 219  Q
    ||||    
T  13184673 ggaa 13184676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 25 - 219
Target Start/End: Original strand, 13440319 - 13440522
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaaagttagcttt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||         | |||||||| || |  |||    
T  13440319 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcagaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 13440418  T
Q  116 ccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 215  Q
    || || |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  13440419 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 13440518  T
Q  216 ggaa 219  Q
    ||||    
T  13440519 ggaa 13440522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 210
Target Start/End: Original strand, 23752265 - 23752469
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggac---------attgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||         ||| ||||||||    
T  23752265 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 23752364  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| | || ||||||||||| |||||||| |||    
T  23752365 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttg 23752464  T
Q  206 aggtc 210  Q
    |||||    
T  23752465 aggtc 23752469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 9548358 - 9548565
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||         | ||||||||    
T  9548358 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 9548457  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||||    
T  9548458 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacacttg 9548557  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  9548558 agatcaga 9548565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 207
Target Start/End: Original strand, 24687972 - 24688173
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||         | ||||||||    
T  24687972 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 24688071  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| |||||||| |||| ||||||||| || || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  24688072 agtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagagcgccttgatggaaatcacatttg 24688171  T
Q  206 ag 207  Q
    ||    
T  24688172 ag 24688173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 33777834 - 33777630
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggac---------attgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||         ||| ||||||||    
T  33777834 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagtggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 33777735  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| |||||||| |||| ||||||||| || || || ||| |||| |||||||| || |||||||||||| |||| || |||||||| |||||||| |||    
T  33777734 agtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 33777635  T
Q  206 aggtc 210  Q
    |||||    
T  33777634 aggtc 33777630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 207
Target Start/End: Original strand, 22998929 - 22999130
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||||||||         | ||||||||    
T  22998929 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatggtttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 22999028  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||||    
T  22999029 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacacttg 22999128  T
Q  206 ag 207  Q
    ||    
T  22999129 ag 22999130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 207
Target Start/End: Original strand, 23717803 - 23718004
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggac---------attgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||         ||| ||||||||    
T  23717803 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 23717902  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| |||| || |||||||| |||||||| |||    
T  23717903 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 23718002  T
Q  206 ag 207  Q
    ||    
T  23718003 ag 23718004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 37671298 - 37671505
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||         ||||||||||    
T  37671298 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaa 37671397  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  37671398 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 37671497  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  37671498 agatcaga 37671505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 11549701 - 11549500
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||         | ||||||||    
T  11549701 ggacatcaagtctaggagcttcctcgcatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 11549602  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| |||| || |||||||| |||||||| |||    
T  11549601 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 11549502  T
Q  206 ag 207  Q
    ||    
T  11549501 ag 11549500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 24970365 - 24970164
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  ||| |  ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||         | ||||||||    
T  24970365 ggacatcaagtctaggagcttcctcacgtactttgatcatatttacagcagcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 24970266  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    |||  ||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| |||    
T  24970265 agtccgctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 24970166  T
Q  206 ag 207  Q
    ||    
T  24970165 ag 24970164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 30934980 - 30934779
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |  ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||         | ||||||||    
T  30934980 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatatacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 30934881  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| |||| || |||||||| |||||||| |||    
T  30934880 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 30934781  T
Q  206 ag 207  Q
    ||    
T  30934780 ag 30934779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 13324644 - 13324851
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||         | ||||||||    
T  13324644 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 13324743  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | | |||||||||||| || ||||| |||    
T  13324744 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttg 13324843  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  13324844 agatcaga 13324851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 15658575 - 15658782
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | |  || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||         | ||||||||    
T  15658575 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacatttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 15658674  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||||| |||||||| |||    
T  15658675 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttg 15658774  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  15658775 agatcaga 15658782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 31431787 - 31431580
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||         | ||||||||    
T  31431787 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 31431688  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || ||||| |||||||||||| | |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  31431687 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 31431588  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  31431587 agatcaga 31431580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 23 - 213
Target Start/End: Original strand, 18500553 - 18500752
Alignment:
Q  23 agtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggac---------attgttctcaaaagttagct 113  Q
    ||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||         ||| ||||||||||| ||||    
T  18500553 agtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagct 18500652  T
Q  114 ttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 213  Q
    ||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  18500653 ttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcaga 18500752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 24681787 - 24681592
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||         | ||||||||    
T  24681787 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 24681688  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcaca 201  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||| ||||||||    
T  24681687 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcaca 24681592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 24724314 - 24724119
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||         | ||||||||    
T  24724314 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 24724215  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcaca 201  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||| ||||||||    
T  24724214 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcaca 24724119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 28649582 - 28649375
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcga---------ggacattgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||         ||||||| ||||||||    
T  28649582 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 28649483  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||| || |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  28649482 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 28649383  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  28649382 agatcaga 28649375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 33516703 - 33516508
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcga---------ggacattgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||         ||||||| ||||||||    
T  33516703 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 33516604  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcaca 201  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||| || |||||    
T  33516603 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcaca 33516508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 201
Target Start/End: Original strand, 40473364 - 40473559
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||         | ||||||||    
T  40473364 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 40473463  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcaca 201  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||| ||||||||    
T  40473464 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcaca 40473559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 43078599 - 43078392
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||         | ||||||||    
T  43078599 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 43078500  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||||||||||| || ||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  43078499 agtcagctttccctgatcaacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 43078400  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  43078399 agatcaga 43078392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 213
Target Start/End: Original strand, 32599286 - 32599494
Alignment:
Q  14 tggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaa 104  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| | || || ||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||         | |||||||    
T  32599286 tggacatcaagtctaggggcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgattcggtagcggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaa 32599385  T
Q  105 aagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacactt 204  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || ||||| |||||| | |  ||||||||||| |||||||| ||    
T  32599386 aagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaatgcaccttgatgaaaatcacattt 32599485  T
Q  205 gaggtcaga 213  Q
    ||| |||||    
T  32599486 gagatcaga 32599494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 9317798 - 9317591
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcga---------ggacattgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||         ||||||| ||||||||    
T  9317798 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 9317699  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||||| || ||||| |||    
T  9317698 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 9317599  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  9317598 agatcaga 9317591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 12132502 - 12132295
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcga---------ggacattgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||         ||||||| ||||||||    
T  12132502 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 12132403  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||||| || ||||| |||    
T  12132402 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 12132303  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  12132302 agatcaga 12132295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 30152365 - 30152158
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcga---------ggacattgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||         ||||||| ||||||||    
T  30152365 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 30152266  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||||| || || || |||    
T  30152265 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 30152166  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  30152165 agatcaga 30152158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 31826222 - 31826429
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||         | ||||||||    
T  31826222 ggacatcaagtctaggagtttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 31826321  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||| || |||| |||||||||||| ||||| ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  31826322 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 31826421  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  31826422 agatcaga 31826429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 37358458 - 37358665
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggac---------attgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||         ||| ||||||||    
T  37358458 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaatattattctcaaa 37358557  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||| || |||| |||||| ||||| ||||| ||| |||| || || || || |||||||||||  | |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  37358558 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 37358657  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  37358658 agatcaga 37358665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 37755327 - 37755120
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||         | ||||||||    
T  37755327 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 37755228  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  37755227 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 37755128  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  37755127 agatcaga 37755120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 37770802 - 37771009
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||         ||||||||||    
T  37770802 ggacatcaagtctagaagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaa 37770901  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||| |  || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  37770902 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcatgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 37771001  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  37771002 agatcaga 37771009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 95
Target Start/End: Original strand, 18375227 - 18375307
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat 95  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||    
T  18375227 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcaatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacat 18375307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 3789888 - 3789681
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgagg---------acattgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||         ||||| ||||||||    
T  3789888 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 3789789  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||| || |||| |||||| ||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  3789788 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 3789689  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  3789688 agatcaga 3789681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 8665290 - 8665497
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||         | ||||||||    
T  8665290 ggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 8665389  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||||| || ||||| |||    
T  8665390 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 8665489  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  8665490 agatcaga 8665497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 15758672 - 15758879
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||         | ||||||||    
T  15758672 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 15758771  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||||| || ||||| |||    
T  15758772 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 15758871  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  15758872 agatcaga 15758879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 26480739 - 26480532
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcga---------ggacattgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||         ||||||| ||||||||    
T  26480739 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 26480640  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || ||||| |||||| | |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  26480639 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 26480540  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  26480539 agatcaga 26480532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 6874652 - 6874572
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat 95  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||    
T  6874652 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacat 6874572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 2511398 - 2511191
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    |||||||||| || |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||         | ||||||||    
T  2511398 ggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 2511299  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||||| || ||||| |||    
T  2511298 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 2511199  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  2511198 agatcaga 2511191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 29966881 - 29967088
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcga---------ggacattgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||         ||||||| ||||||||    
T  29966881 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 29966980  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || ||||| |||||| |||  ||||||||||| || ||||| |||    
T  29966981 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 29967080  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  29967081 agatcaga 29967088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 30029762 - 30029555
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgagg---------acattgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||         ||||| ||||||||    
T  30029762 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 30029663  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || ||||| |||||| |||  ||||||||||| || ||||| |||    
T  30029662 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 30029563  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  30029562 agatcaga 30029555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 30168816 - 30168609
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcga---------ggacattgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |         ||||||| ||||||||    
T  30168816 ggacatcaagtctaggagtttcttcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtgggacattattctcaaa 30168717  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||| || |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||| ||||| || |||    
T  30168716 agtgagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttg 30168617  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  30168616 agatcaga 30168609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 34616865 - 34616658
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgagg---------acattgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||         ||||| ||||||||    
T  34616865 ggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 34616766  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||| || |||| |||||| ||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  34616765 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 34616666  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  34616665 agatcaga 34616658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 5638257 - 5638179
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggac 93  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  5638257 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacaacggcatgatttggaagaggattgtcgaggac 5638179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 92 - 213
Target Start/End: Original strand, 28959687 - 28959808
Alignment:
Q  92 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 191  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||    
T  28959687 acattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgat 28959786  T
Q  192 ggaaatcacacttgaggtcaga 213  Q
    | || ||||| ||||| |||||    
T  28959787 gaaagtcacatttgagatcaga 28959808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 128; Significance: 2e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 17 - 219
Target Start/End: Original strand, 1838 - 2048
Alignment:
Q  17 acatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaaag 107  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||    
T  1838 acatcgagtctgggagcttcttcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaag 1937  T
Q  108 ttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 207  Q
    |||  ||||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1938 ttaa-tttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 2036  T
Q  208 gtcagaatggaa 219  Q
    ||||||| ||||    
T  2037 gtcagaacggaa 2048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 23 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 6344 - 6223
Alignment:
Q  23 agtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcga---------ggacattgttctcaaaagttagct 113  Q
    ||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||         ||||||| ||||||||||| ||||    
T  6344 agtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagct 6245  T
Q  114 ttccctgatgaatgagcttctt 135  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  6244 ttccctgatcaatgagcttctt 6223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 128; Significance: 2e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 17 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 20723 - 20513
Alignment:
Q  17 acatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaaag 107  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||    
T  20723 acatcgagtctgggagcttcttcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaag 20624  T
Q  108 ttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 207  Q
    |||  ||||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20623 ttaa-tttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 20525  T
Q  208 gtcagaatggaa 219  Q
    ||||||| ||||    
T  20524 gtcagaacggaa 20513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 30790 - 30595
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcga---------ggacattgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||         ||||||| ||||||||    
T  30790 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 30691  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcaca 201  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||| || |||||    
T  30690 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcaca 30595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 49)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 15 - 219
Target Start/End: Original strand, 22456795 - 22457008
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggac---------attgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||| ||||||||    
T  22456795 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcacgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaaattattctcaaa 22456894  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||||| |||||| || |  ||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22456895 agttaactttccttggtctatgagcttcttcacaatgtactttaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 22456994  T
Q  206 aggtcagaatggaa 219  Q
    |||| |||| ||||    
T  22456995 aggtaagaacggaa 22457008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 15 - 219
Target Start/End: Original strand, 27290231 - 27290444
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggac---------attgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||         ||||||||||||    
T  27290231 ggacatcaagtctaggagcttcctcatatacctcaatcatatttacagtagcatgattcggaagaagattgttgaggacatgagggacattgttctcaaa 27290330  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27290331 agttaactttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 27290430  T
Q  206 aggtcagaatggaa 219  Q
    ||||||||| ||||    
T  27290431 aggtcagaacggaa 27290444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 14143146 - 14143353
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||         ||||||||||    
T  14143146 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 14143245  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| | |||||| || | |||||||||||| ||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14143246 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 14143345  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    ||||||||    
T  14143346 aggtcaga 14143353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 26788279 - 26788072
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||         ||||||||||    
T  26788279 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 26788180  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| | |||||| || | |||||||||||| ||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26788179 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 26788080  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    ||||||||    
T  26788079 aggtcaga 26788072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 27196652 - 27196445
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||         ||||||||||    
T  27196652 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 27196553  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| | |||||| || | |||||||||||| ||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27196552 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 27196453  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    ||||||||    
T  27196452 aggtcaga 27196445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 27252588 - 27252795
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||         ||||||||||    
T  27252588 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 27252687  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| | |||||| || | |||||||||||| ||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27252688 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 27252787  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    ||||||||    
T  27252788 aggtcaga 27252795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Original strand, 13521939 - 13522147
Alignment:
Q  20 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaaagtta 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||         ||||||||||||| |    
T  13521939 tcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtca 13522038  T
Q  111 gctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 210  Q
     |||||| || | |||||||||||| |||||||   |||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13522039 actttccttggttaatgagcttcttcacaatgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 13522138  T
Q  211 agaatggaa 219  Q
     ||| ||||    
T  13522139 cgaacggaa 13522147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 25 - 219
Target Start/End: Original strand, 33374127 - 33374330
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaaagttagcttt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||         | ||||||||||| |  |||    
T  33374127 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttattctcaaaagtcaatttt 33374226  T
Q  116 ccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 215  Q
    || || |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  33374227 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 33374326  T
Q  216 ggaa 219  Q
    ||||    
T  33374327 ggaa 33374330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 25 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 28162982 - 28162779
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaaagttagcttt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||         | |||||||| || |  |||    
T  28162982 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 28162883  T
Q  116 ccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 215  Q
    || || |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  28162882 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatcctccgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 28162783  T
Q  216 ggaa 219  Q
    ||||    
T  28162782 ggaa 28162779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 25 - 219
Target Start/End: Original strand, 8892182 - 8892384
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaaagttagcttt 115  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||         | |||||||| || |  |||    
T  8892182 tctgggagcttcctcatatacttcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 8892281  T
Q  116 ccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 215  Q
    || || |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  8892282 ccttggtctatgagttt-tttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 8892380  T
Q  216 ggaa 219  Q
    ||||    
T  8892381 ggaa 8892384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 25 - 219
Target Start/End: Original strand, 8903417 - 8903619
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaaagttagcttt 115  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||         | |||||||| || |  |||    
T  8903417 tctgggagcttcctcatatacttcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 8903516  T
Q  116 ccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 215  Q
    || || |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  8903517 ccttggtctatgagttt-tttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 8903615  T
Q  216 ggaa 219  Q
    ||||    
T  8903616 ggaa 8903619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 210
Target Start/End: Original strand, 22934741 - 22934945
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||         | ||||||||    
T  22934741 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 22934840  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| |||    
T  22934841 agttagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 22934940  T
Q  206 aggtc 210  Q
    |||||    
T  22934941 aggtc 22934945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 210
Target Start/End: Original strand, 23857186 - 23857390
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||         | ||||||||    
T  23857186 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 23857285  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| |||    
T  23857286 agttagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 23857385  T
Q  206 aggtc 210  Q
    |||||    
T  23857386 aggtc 23857390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 26989336 - 26989135
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||         | ||||||||    
T  26989336 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 26989237  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| |||||||| |||| ||||||||||||||| || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| |||| || |||||||| |||||||| |||    
T  26989236 agtcagctttccttgatcaatgagcttctttacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 26989137  T
Q  206 ag 207  Q
    ||    
T  26989136 ag 26989135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 16750186 - 16749982
Alignment:
Q  18 catcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaaagt 108  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||         | |||||||||||    
T  16750186 catcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagt 16750087  T
Q  109 tagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgagg 208  Q
     |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| |||| || |||||||| |||||||| |||||     
T  16750086 cagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgaga 16749987  T
Q  209 tcaga 213  Q
    |||||    
T  16749986 tcaga 16749982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 26918715 - 26918508
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggac---------attgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||         ||| ||||||||    
T  26918715 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 26918616  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| |||||||| |||| ||| ||||| || || || ||| |||| |||||||| || |||||||||||| |||| || |||||||| |||||||| |||    
T  26918615 agtcagctttccttgatcaataagctttttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 26918516  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  26918515 agatcaga 26918508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 125 - 219
Target Start/End: Original strand, 22477253 - 22477347
Alignment:
Q  125 atgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaa 219  Q
    ||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  22477253 atgagcttcttcacaatgtactttaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggttagaacggaa 22477347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 207
Target Start/End: Original strand, 13298812 - 13299013
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||         | ||||||||    
T  13298812 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 13298911  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| | ||||||||| ||||| |||||| |||| || |||||||| |||||||| |||    
T  13298912 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagtgtagcatccctcgacgtcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 13299011  T
Q  206 ag 207  Q
    ||    
T  13299012 ag 13299013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 207
Target Start/End: Original strand, 24304479 - 24304680
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||         | ||||||||    
T  24304479 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 24304578  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| ||||  | ||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  24304579 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaatcatagcacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaaatcacatttg 24304678  T
Q  206 ag 207  Q
    ||    
T  24304679 ag 24304680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 24864052 - 24863851
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||         | ||||||||    
T  24864052 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 24863953  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| |||| || |||||||| |||||||| |||    
T  24863952 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 24863853  T
Q  206 ag 207  Q
    ||    
T  24863852 ag 24863851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 29549810 - 29549603
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggac---------attgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | || || |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||         ||| ||||||||    
T  29549810 ggacatcaagtccaggagcttcctcacacacttcgatcatgttcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 29549711  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||||| |||||||| |||    
T  29549710 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttg 29549611  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  29549610 agatcaga 29549603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 210
Target Start/End: Original strand, 27272441 - 27272645
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgagg---------acattgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| |||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||         ||||| ||||||||    
T  27272441 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcgatcatattcacagcagcatgatttggaagaggattatcgaggacatgcggaacattattctcaaa 27272540  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
     || ||||| || ||||  |||||||| || || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  27272541 ggtcagcttcccttgatcgatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagagcgccttgatggaaatcacatttg 27272640  T
Q  206 aggtc 210  Q
    |||||    
T  27272641 aggtc 27272645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 213
Target Start/End: Original strand, 27359852 - 27360060
Alignment:
Q  14 tggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaa 104  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||         | |||||||    
T  27359852 tggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaa 27359951  T
Q  105 aagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacactt 204  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || ||||| |||||||||||| | |  ||||||||||| || ||||| ||    
T  27359952 aagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacattt 27360051  T
Q  205 gaggtcaga 213  Q
    ||| |||||    
T  27360052 gagatcaga 27360060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 213
Target Start/End: Original strand, 27450195 - 27450403
Alignment:
Q  14 tggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaa 104  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||         | |||||||    
T  27450195 tggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaa 27450294  T
Q  105 aagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacactt 204  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || ||||| |||||||||||| | |  ||||||||||| || ||||| ||    
T  27450295 aagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacattt 27450394  T
Q  205 gaggtcaga 213  Q
    ||| |||||    
T  27450395 gagatcaga 27450403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 4758099 - 4757892
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||         | ||||||||    
T  4758099 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 4758000  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || ||||| |||||||||||| | |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  4757999 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 4757900  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  4757899 agatcaga 4757892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 4773341 - 4773134
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||         | ||||||||    
T  4773341 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 4773242  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | | |||||||||||| || ||||| |||    
T  4773241 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttg 4773142  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  4773141 agatcaga 4773134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 4545636 - 4545843
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||         ||||||||||    
T  4545636 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaa 4545735  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | | |||||||||||| || ||||| |||    
T  4545736 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttg 4545835  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  4545836 agatcaga 4545843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 29 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 27000394 - 27000207
Alignment:
Q  29 ggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggac---------attgttctcaaaagttagctttccct 119  Q
    |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||         ||| ||||||||||| |||||||| |    
T  27000394 ggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttcctt 27000295  T
Q  120 gatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 207  Q
    ||| ||||||||| || || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| |||| || |||||||| |||||||| |||||    
T  27000294 gatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgag 27000207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 201
Target Start/End: Original strand, 30557877 - 30558072
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcga---------ggacattgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||         ||||||| ||||||||    
T  30557877 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 30557976  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcaca 201  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||| || |||||    
T  30557977 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcaca 30558072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 34463207 - 34463414
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||         | ||||||||    
T  34463207 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 34463306  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  34463307 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 34463406  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  34463407 agatcaga 34463414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 207
Target Start/End: Original strand, 15424178 - 15424379
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggac---------attgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| |  ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||         ||| ||||||||    
T  15424178 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatactttgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgcgggacattattctcaaa 15424277  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| |||||||| |||| ||||||||| || || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| |||  || |||||||| |||||||| |||    
T  15424278 agtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccaaggcgccttgatgaaaatcacatttg 15424377  T
Q  206 ag 207  Q
    ||    
T  15424378 ag 15424379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 4525621 - 4525426
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||         ||||||||||    
T  4525621 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaa 4525522  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcaca 201  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||| || |||||    
T  4525521 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcaca 4525426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 4723995 - 4724202
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||         ||||||||||    
T  4723995 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcgaggacatgtggaacattgttctcaaa 4724094  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||||||||||| |||||| ||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  4724095 agtcagctttccctgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 4724194  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  4724195 agatcaga 4724202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 16674474 - 16674267
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggac---------attgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||         ||| ||||||||    
T  16674474 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 16674375  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||| || |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  16674374 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 16674275  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  16674274 agatcaga 16674267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 17025612 - 17025417
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgagg---------acattgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||         ||||| ||||||||    
T  17025612 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 17025513  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcaca 201  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||  | |  ||||||||||| ||||||||    
T  17025512 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaaatcaca 17025417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 27008062 - 27007855
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||         | ||||||||    
T  27008062 ggacatcaagtctaggagcttccttacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 27007963  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||||||||| | |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  27007962 agtcagctttccctggtcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 27007863  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  27007862 agatcaga 27007855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 95
Target Start/End: Original strand, 17092301 - 17092381
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat 95  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||    
T  17092301 ggacatcaagtttggtagcttcctcacatacctcagtcatgttcacagcagcgtggtttggaaggggattatcgaggacat 17092381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 26116271 - 26116478
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||         | ||||||||    
T  26116271 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 26116370  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  26116371 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 26116470  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  26116471 agatcaga 26116478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 29573348 - 29573141
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcga---------ggacattgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||         ||||||| ||||||||    
T  29573348 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 29573249  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||||| || ||||| |||    
T  29573248 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 29573149  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  29573148 agatcaga 29573141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 3696416 - 3696209
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggac---------attgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | |  || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||         ||| ||||||||    
T  3696416 ggacatcaagtctaggagcttcatcacacatttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 3696317  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||| || |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||| ||||| || |||    
T  3696316 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttg 3696217  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  3696216 agatcaga 3696209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 28207789 - 28207582
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgagg---------acattgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||         ||||| ||||||||    
T  28207789 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 28207690  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||| || |||| |||||| ||||| ||||| ||| |||| || || || || |||||||||||  | |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  28207689 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 28207590  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  28207589 agatcaga 28207582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 29501750 - 29501543
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgagg---------acattgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||         ||||| ||||||||    
T  29501750 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 29501651  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||| || |||| |||||| ||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  29501650 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 29501551  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  29501550 agatcaga 29501543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 20 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 20161031 - 20160835
Alignment:
Q  20 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcga---------ggacattgttctcaaaagtta 110  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| |         |||| || ||||| ||||| |    
T  20161031 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatgttcacaacagcatgattcagaagaggattgtcaagaacatgagggacgttattctcgaaagtca 20160932  T
Q  111 gctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 207  Q
    |||| |  || |  |||||||| || ||||| ||| |||| || ||||| ||||| ||||||||| | |  |||||||| |||||||||||||||||    
T  20160931 gcttccattggtctatgagctttttcacaatatacttcaaagcatagcacccttccacatcatgacctaaggcaccttggtggaaatcacacttgag 20160835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 20 - 207
Target Start/End: Original strand, 22171800 - 22171996
Alignment:
Q  20 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcga---------ggacattgttctcaaaagtta 110  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| |         |||| || ||||| ||||| |    
T  22171800 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatgttcacaacagcatgattcagaagaggattgtcaagaacatgagggacgttattctcgaaagtca 22171899  T
Q  111 gctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 207  Q
    |||| |  || |  |||||||| || ||||| ||| |||| || ||||| ||||| ||||||||| | |  |||||||| |||||||||||||||||    
T  22171900 gcttccattggtctatgagctttttcacaatatacttcaaagcatagcacccttccacatcatgacctaaggcaccttggtggaaatcacacttgag 22171996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 27044723 - 27044643
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat 95  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||    
T  27044723 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacat 27044643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 213
Target Start/End: Original strand, 26777475 - 26777683
Alignment:
Q  14 tggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaa 104  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||         | |||||||    
T  26777475 tggacatcaagtctaggattttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaa 26777574  T
Q  105 aagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacactt 204  Q
    |||| ||||| || |||| |||||| ||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||| || ||||| ||    
T  26777575 aagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacattt 26777674  T
Q  205 gaggtcaga 213  Q
    ||| |||||    
T  26777675 gagatcaga 26777683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 90 - 213
Target Start/End: Original strand, 16943972 - 16944095
Alignment:
Q  90 ggacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttg 189  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || ||||| |||||| |||  ||||||||    
T  16943972 ggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttg 16944071  T
Q  190 atggaaatcacacttgaggtcaga 213  Q
    ||| || ||||| ||||| |||||    
T  16944072 atgaaagtcacatttgagatcaga 16944095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 95
Target Start/End: Original strand, 16943888 - 16943968
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat 95  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||  || ||||| || || ||||||||||||||||    
T  16943888 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagtggcatgatttggtagcggattgtcgaggacat 16943968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 27485464 - 27485384
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat 95  Q
    |||||||||| || |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||    
T  27485464 ggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacat 27485384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 124; Significance: 6e-64; HSPs: 24)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 15228221 - 15228010
Alignment:
Q  17 acatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaaag 107  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         | |||||||| |    
T  15228221 acatcaagtctgggagctatctcatataccccaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgacggacgttattctcaaagg 15228122  T
Q  108 ttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 207  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15228121 ttaactttccctgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcgtgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 15228022  T
Q  208 gtcagaatggaa 219  Q
    ||||||| ||||    
T  15228021 gtcagaacggaa 15228010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 17 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 1900608 - 1900402
Alignment:
Q  17 acatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaaag 107  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||         | ||||||||||    
T  1900608 acatcgagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcaaggacataagggacattattctcaaaag 1900509  T
Q  108 ttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 207  Q
    ||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1900508 ttaactttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagtgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 1900409  T
Q  208 gtcagaa 214  Q
    |||||||    
T  1900408 gtcagaa 1900402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 20 - 213
Target Start/End: Original strand, 15284851 - 15285053
Alignment:
Q  20 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaaagtta 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||         | |||||||| || |    
T  15284851 tcaagtctgggagcttcctcacatacctcaatcatgttcacagcaacgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacgttattctcaaaggtca 15284950  T
Q  111 gctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 210  Q
      ||||| || |  |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15284951 attttccttggtctatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 15285050  T
Q  211 aga 213  Q
    |||    
T  15285051 aga 15285053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 25 - 219
Target Start/End: Original strand, 24460533 - 24460736
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaaagttagcttt 115  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||         | |||||||| || |  |||    
T  24460533 tctgggagcttcctcatatacttcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 24460632  T
Q  116 ccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 215  Q
    || || |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  24460633 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 24460732  T
Q  216 ggaa 219  Q
    ||||    
T  24460733 ggaa 24460736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Original strand, 14235448 - 14235656
Alignment:
Q  20 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggac---------attgttctcaaaagtta 110  Q
    ||||| ||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||    
T  14235448 tcaagactgggagcttcttcataggtctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacgtgagggacattgttctcaaaagtta 14235547  T
Q  111 gctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 210  Q
     ||||||||| |  |||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14235548 actttccctggtctatgagcttctttacaatgaacttcaaagcgtaacatccctcaacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtc 14235647  T
Q  211 agaatggaa 219  Q
      |||||||    
T  14235648 gaaatggaa 14235656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 50 - 219
Target Start/End: Original strand, 15391291 - 15391469
Alignment:
Q  50 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgag---------gacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaa 140  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||         |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||    
T  15391291 atcatgttcacagcagcgtgattcagaagaggattgtcaagaacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccctagtcaatgagcttctttacaa 15391390  T
Q  141 tgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaa 219  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  15391391 tgtacttcaaagcgtaacatccttcaacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcgcacttgaggtcagaacggaa 15391469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 17014353 - 17014149
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||         | ||||||||    
T  17014353 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 17014254  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| |||||||| || |||||||||||| |||| || |||||||| |||||||| |||    
T  17014253 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 17014154  T
Q  206 aggtc 210  Q
    |||||    
T  17014153 aggtc 17014149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 207
Target Start/End: Original strand, 24592232 - 24592433
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||         | ||||||||    
T  24592232 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgattgggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 24592331  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| |||||||| || |||||||||||| |||| || |||||||| |||||||| |||    
T  24592332 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 24592431  T
Q  206 ag 207  Q
    ||    
T  24592432 ag 24592433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 14665371 - 14665170
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||         | ||||||||    
T  14665371 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggatattattctcaaa 14665272  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| |||| || |||||||| |||||||| |||    
T  14665271 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 14665172  T
Q  206 ag 207  Q
    ||    
T  14665171 ag 14665170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 36344433 - 36344640
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||         | ||||||||    
T  36344433 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 36344532  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||||||||||| || ||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||||| |||||||| |||    
T  36344533 agtcagctttccctgatcaacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttg 36344632  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  36344633 agatcaga 36344640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 31126436 - 31126643
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggac---------attgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||         ||| ||||||||    
T  31126436 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 31126535  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  31126536 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 31126635  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  31126636 agatcaga 31126643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 6570206 - 6569999
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggac---------attgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||         ||| ||||||||    
T  6570206 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 6570107  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||| || |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | | |||||||||||| |||||||| |||    
T  6570106 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcacatttg 6570007  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  6570006 agatcaga 6569999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 14763222 - 14763429
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||         | ||||||||    
T  14763222 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 14763321  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  14763322 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 14763421  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  14763422 agatcaga 14763429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 33673716 - 33673923
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||         | ||||||||    
T  33673716 ggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 33673815  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  33673816 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 33673915  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  33673916 agatcaga 33673923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 18800531 - 18800738
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcga---------ggacattgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||         ||||||| ||||||||    
T  18800531 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 18800630  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||| || |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||| ||||| || |||    
T  18800631 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttg 18800730  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  18800731 agatcaga 18800738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 21970054 - 21969859
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| | |  |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||         | ||||||||    
T  21970054 ggacatcaagtctaggaacttcctcacacatttcaatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 21969955  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcaca 201  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||| ||||||||    
T  21969954 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcaca 21969859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 5006226 - 5006019
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcga---------ggacattgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || |||||| |||||||||||||||         ||||||| ||||||||    
T  5006226 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgattcagaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 5006127  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| | ||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  5006126 agtcaacttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 5006027  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  5006026 agatcaga 5006019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 39850991 - 39850796
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||| |||||||         | ||||||||    
T  39850991 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagggggttgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 39850892  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcaca 201  Q
    ||| ||||||||||||| || ||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||    
T  39850891 agtcagctttccctgatcaacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcaca 39850796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 40105556 - 40105763
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcga---------ggacattgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||         ||||||| ||||||||    
T  40105556 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 40105655  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||||| || ||||| |||    
T  40105656 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 40105755  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  40105756 agatcaga 40105763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 54833740 - 54833533
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgagg---------acattgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||         ||||| ||||||||    
T  54833740 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 54833641  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||| || |||| |||||| ||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  54833640 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 54833541  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  54833540 agatcaga 54833533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 14098894 - 14098688
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||         | ||||||||    
T  14098894 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 14098795  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||| || |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  14098794 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 14098695  T
Q  206 aggtcag 212  Q
    || ||||    
T  14098694 agatcag 14098688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 95
Target Start/End: Original strand, 27163235 - 27163315
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat 95  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  27163235 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacat 27163315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 30754107 - 30753900
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgagg---------acattgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||         ||||| ||||||||    
T  30754107 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 30754008  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||| || |||| |||||| ||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  30754007 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 30753908  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  30753907 agatcaga 30753900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 92 - 213
Target Start/End: Original strand, 34188964 - 34189085
Alignment:
Q  92 acattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgat 191  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || ||||  || |||||||| || |||||| | |  || ||||| || || ||||||||  | | |||||||||||    
T  34188964 acattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttgacgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcaccttgat 34189063  T
Q  192 ggaaatcacacttgaggtcaga 213  Q
    |||| |||||||| || |||||    
T  34189064 ggaagtcacacttaagatcaga 34189085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 112; Significance: 9e-57; HSPs: 55)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 17 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 18530685 - 18530474
Alignment:
Q  17 acatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggaca---------ttgttctcaaaag 107  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         || |||||||| |    
T  18530685 acattaagtctgggagctccctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacacgagggacgttattctcaaagg 18530586  T
Q  108 ttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 207  Q
    | |  ||||| || |  |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18530585 tcaattttccttggtctatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 18530486  T
Q  208 gtcagaatggaa 219  Q
    ||||||| ||||    
T  18530485 gtcagaacggaa 18530474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 31034076 - 31034283
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||         ||||||||||    
T  31034076 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 31034175  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| | |||||| || | |||||||||||| ||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31034176 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 31034275  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    ||||||||    
T  31034276 aggtcaga 31034283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 32293051 - 32292844
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||         ||||||||||    
T  32293051 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 32292952  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| | |||||| || | |||||||||||| ||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32292951 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 32292852  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    ||||||||    
T  32292851 aggtcaga 32292844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Original strand, 16626470 - 16626678
Alignment:
Q  20 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaaagtta 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||         | |||||||| || |    
T  16626470 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagtgtgattcggaagaggattgtcaaggacatgagggacgttattctcaaaggtca 16626569  T
Q  111 gctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 210  Q
      ||||| || |  |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16626570 attttccttggtctatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 16626669  T
Q  211 agaatggaa 219  Q
    |||| ||||    
T  16626670 agaacggaa 16626678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 5652677 - 5652473
Alignment:
Q  24 gtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaaagttagctt 114  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||         | |||||||| || |  ||    
T  5652677 gtctgggagcttcctcacatacctcaatcatgttcacagcagcatgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattt 5652578  T
Q  115 tccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaa 214  Q
    ||| || |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5652577 tccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaa 5652478  T
Q  215 tggaa 219  Q
     ||||    
T  5652477 cggaa 5652473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 25 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 4626233 - 4626030
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaaagttagcttt 115  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||         | |||||||| || |  |||    
T  4626233 tctgggagctttctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 4626134  T
Q  116 ccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 215  Q
    || || |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  4626133 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 4626034  T
Q  216 ggaa 219  Q
    ||||    
T  4626033 ggaa 4626030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 25 - 219
Target Start/End: Original strand, 17993753 - 17993956
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaaagttagcttt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||         | |||||||| || |  |||    
T  17993753 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 17993852  T
Q  116 ccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 215  Q
    || || |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||     
T  17993853 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacatttgaggtccgaac 17993952  T
Q  216 ggaa 219  Q
    ||||    
T  17993953 ggaa 17993956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 5713516 - 5713319
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcga---------ggacattgttctcaaaagttagcttt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||         |||| |||||||||||||| |||||     
T  5713516 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttc 5713417  T
Q  116 ccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 213  Q
    || |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  5713416 ccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcaga 5713319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 5724426 - 5724229
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcga---------ggacattgttctcaaaagttagcttt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||         |||| |||||||||||||| |||||     
T  5724426 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttc 5724327  T
Q  116 ccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 213  Q
    || |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  5724326 ccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcaga 5724229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 213
Target Start/End: Original strand, 5757051 - 5757248
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcga---------ggacattgttctcaaaagttagcttt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||         |||| |||||||||||||| |||||     
T  5757051 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttc 5757150  T
Q  116 ccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 213  Q
    || |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  5757151 ccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcaga 5757248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 213
Target Start/End: Original strand, 5767942 - 5768139
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcga---------ggacattgttctcaaaagttagcttt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||         |||| |||||||||||||| |||||     
T  5767942 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttc 5768041  T
Q  116 ccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 213  Q
    || |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  5768042 ccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcaga 5768139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 207
Target Start/End: Original strand, 15741053 - 15741254
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||         | ||||||||    
T  15741053 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 15741152  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  15741153 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcatccctcgacatcatgacccagagcgccttgatgaaaatcacatttg 15741252  T
Q  206 ag 207  Q
    ||    
T  15741253 ag 15741254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 18051561 - 18051360
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgagg---------acattgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||         ||||| ||||||||    
T  18051561 ggacatcaagtctaggagctttctcacatacttcaatcatgttcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 18051462  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| |||| || ||||||| ||||||||| |||    
T  18051461 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatagaaatcacatttg 18051362  T
Q  206 ag 207  Q
    ||    
T  18051361 ag 18051360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 18330968 - 18330767
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||         | ||||||||    
T  18330968 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 18330869  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| |||||||| || |||||||||||| |||| || |||||||| |||||||| |||    
T  18330868 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 18330769  T
Q  206 ag 207  Q
    ||    
T  18330768 ag 18330767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 7073511 - 7073304
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggac---------attgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||         ||| ||||||||    
T  7073511 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatgttcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 7073412  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||||| |||||||| |||    
T  7073411 agttagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttg 7073312  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  7073311 agatcaga 7073304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 22387537 - 22387744
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||         | ||||||||    
T  22387537 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 22387636  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| |||| || |||||||| |||||||| |||    
T  22387637 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 22387736  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  22387737 agatcaga 22387744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 207
Target Start/End: Original strand, 15892665 - 15892866
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||         | ||||||||    
T  15892665 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 15892764  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| |||    
T  15892765 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 15892864  T
Q  206 ag 207  Q
    ||    
T  15892865 ag 15892866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 6192615 - 6192411
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||         | ||||||||    
T  6192615 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 6192516  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| | || ||||||||||| |||||||| |||    
T  6192515 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttg 6192416  T
Q  206 aggtc 210  Q
    |||||    
T  6192415 aggtc 6192411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 29148714 - 29148921
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||         | ||||||||    
T  29148714 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 29148813  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| | || ||||||||||| |||||||| |||    
T  29148814 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttg 29148913  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  29148914 agatcaga 29148921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 201
Target Start/End: Original strand, 29664929 - 29665124
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggac---------attgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||         ||| ||||||||    
T  29664929 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcgtgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 29665028  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcaca 201  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||    
T  29665029 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcaca 29665124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 207
Target Start/End: Original strand, 4796612 - 4796813
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcga---------ggacattgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||         ||||||| ||||||||    
T  4796612 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 4796711  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| |||||||| |||| ||||||||| || || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| |||| || |||||||| |||||||| |||    
T  4796712 agtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 4796811  T
Q  206 ag 207  Q
    ||    
T  4796812 ag 4796813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 8296271 - 8296070
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||         | ||||||||    
T  8296271 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 8296172  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| | |||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  8296171 agtcaactttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaaatcacatttg 8296072  T
Q  206 ag 207  Q
    ||    
T  8296071 ag 8296070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 11110308 - 11110515
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||         | ||||||||    
T  11110308 ggacatcaagtcttggagcttcctcacacacttcaatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 11110407  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  11110408 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 11110507  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  11110508 agatcaga 11110515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 207
Target Start/End: Original strand, 8301226 - 8301427
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||         | ||||||||    
T  8301226 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 8301325  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || ||||| || || ||||||||| |||| || ||||||||||||||||| |||    
T  8301326 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctctacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 8301425  T
Q  206 ag 207  Q
    ||    
T  8301426 ag 8301427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 4346646 - 4346853
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggac---------attgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||         ||| ||||||||    
T  4346646 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattatcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 4346745  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  4346746 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 4346845  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  4346846 agatcaga 4346853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 4417218 - 4417011
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgagg---------acattgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||         ||||| ||||||||    
T  4417218 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 4417119  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||| ||||| |||||||| |||    
T  4417118 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttg 4417019  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  4417018 agatcaga 4417011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 201
Target Start/End: Original strand, 20576806 - 20577001
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggac---------attgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||         ||| ||||||||    
T  20576806 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 20576905  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcaca 201  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||| ||||||||    
T  20576906 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcaca 20577001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 15 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 35881065 - 35880864
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcga---------ggacattgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||         ||||||| ||||||||    
T  35881065 ggacatcaagtctaggagtttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 35880966  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| |||||||| |||| ||||||||| || || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| | || || |||||||| |||||||| |||    
T  35880965 agtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcgccttgatgaaaatcacatttg 35880866  T
Q  206 ag 207  Q
    ||    
T  35880865 ag 35880864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 8212037 - 8211830
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcga---------ggacattgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||         ||||||| ||||||||    
T  8212037 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 8211938  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||| || |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  8211937 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 8211838  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  8211837 agatcaga 8211830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 10396432 - 10396225
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcga---------ggacattgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||         ||||||| ||||||||    
T  10396432 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 10396333  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
     || ||||| || |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||||| |||||||| |||    
T  10396332 ggtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttg 10396233  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  10396232 agatcaga 10396225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 18277011 - 18277218
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||         | ||||||||    
T  18277011 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 18277110  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  18277111 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 18277210  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  18277211 agatcaga 18277218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 18292312 - 18292519
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||         | ||||||||    
T  18292312 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 18292411  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  18292412 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 18292511  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  18292512 agatcaga 18292519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 18307613 - 18307820
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||         | ||||||||    
T  18307613 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 18307712  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  18307713 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 18307812  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  18307813 agatcaga 18307820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 22870815 - 22871022
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||         | ||||||||    
T  22870815 ggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 22870914  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  22870915 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 22871014  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  22871015 agatcaga 22871022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 22885874 - 22886081
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||         | ||||||||    
T  22885874 ggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 22885973  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  22885974 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 22886073  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  22886074 agatcaga 22886081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 28021574 - 28021367
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcga---------ggacattgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||         ||||||| ||||||||    
T  28021574 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgggggacattattctcaaa 28021475  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||| || |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||| | | |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  28021474 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcataacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 28021375  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  28021374 agatcaga 28021367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 28115913 - 28116120
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||         | ||||||||    
T  28115913 ggacatcaagtctaggagcttcctcgcacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 28116012  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
     || |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | | |||||||||||| |||||||| |||    
T  28116013 tgtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcacatttg 28116112  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  28116113 agatcaga 28116120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 48466226 - 48466019
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggac---------attgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||         ||| ||||||||    
T  48466226 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 48466127  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  48466126 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 48466027  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  48466026 agatcaga 48466019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 4721930 - 4721726
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||         | |||| |||    
T  4721930 ggacatcgagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacaacggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctaaaa 4721831  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| |||||||| |||| |||||| || || || || ||| |||| | |||||| || |||||||||||| |||| || |||||||| |||||||| |||    
T  4721830 agtcagctttccttgatcaatgagatttttcacgatatacttcaaagtgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 4721731  T
Q  206 aggtc 210  Q
    |||||    
T  4721730 aggtc 4721726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 21674992 - 21674785
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgagga---------cattgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||         |||| ||||||||    
T  21674992 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtggagcattattctcaaa 21674893  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||| || |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  21674892 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 21674793  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  21674792 agatcaga 21674785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 51782322 - 51782115
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgagg---------acattgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||         ||||| ||||||||    
T  51782322 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 51782223  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| |||||||||||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  51782222 agtcagctttccctgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 51782123  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  51782122 agatcaga 51782115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 51797412 - 51797205
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgagg---------acattgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||         ||||| ||||||||    
T  51797412 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 51797313  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| |||||||||||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  51797312 agtcagctttccctgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 51797213  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  51797212 agatcaga 51797205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 5467284 - 5467077
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcga---------ggacattgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||         ||||||| ||||||||    
T  5467284 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 5467185  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| || || || |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  5467184 agtcagtttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 5467085  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  5467084 agatcaga 5467077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 6542421 - 6542628
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||         ||||||||||    
T  6542421 ggacatcaagtctaggagcttccttacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaa 6542520  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  6542521 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 6542620  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  6542621 agatcaga 6542628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 36997036 - 36997243
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||         | ||||||||    
T  36997036 ggacatcaagtctaggagtttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcgaggacatatgggacattattctcaaa 36997135  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||| || |||| |||||||||||| ||||| ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  36997136 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 36997235  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  36997236 agatcaga 36997243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 5596316 - 5596523
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgagg---------acattgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||         ||||| ||||||||    
T  5596316 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 5596415  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||| || |||| |||||| ||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  5596416 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 5596515  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  5596516 agatcaga 5596523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 31964432 - 31964639
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgagg---------acattgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||         ||||| ||||||||    
T  31964432 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 31964531  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || ||||| |||||| | |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  31964532 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 31964631  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  31964632 agatcaga 31964639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 50134030 - 50134237
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgagg---------acattgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||         ||||| ||||||||    
T  50134030 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 50134129  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || ||||| |||||| | |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  50134130 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 50134229  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  50134230 agatcaga 50134237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 95
Target Start/End: Original strand, 17984915 - 17984995
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat 95  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  17984915 ggacatcaagtctaggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacat 17984995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 18243038 - 18242958
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat 95  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||    
T  18243038 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacat 18242958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 5609281 - 5609488
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    |||||||||| || |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||         | ||||||||    
T  5609281 ggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 5609380  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || |||||||| |||||| | |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  5609381 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccttcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 5609480  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  5609481 agatcaga 5609488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 28339601 - 28339394
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||         | ||||||||    
T  28339601 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 28339502  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || ||||| |||||| | | |||||||||||| |||||||| |||    
T  28339501 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcacatttg 28339402  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  28339401 agatcaga 28339394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 5014011 - 5013804
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||         | ||||||||    
T  5014011 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 5013912  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||||| || || || |||    
T  5013911 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 5013812  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  5013811 agatcaga 5013804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 47023752 - 47023545
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||  || ||||| || || ||||||||||||||||         | ||||||||    
T  47023752 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagtggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 47023653  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||||| || || || |||    
T  47023652 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 47023553  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  47023552 agatcaga 47023545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 24328458 - 24328378
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat 95  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||    
T  24328458 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacat 24328378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 23)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 19658926 - 19659129
Alignment:
Q  24 gtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaaagttagctt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||         | |||||||| || |  ||    
T  19658926 gtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgcgggacgttattctcaaaggtcaattt 19659025  T
Q  115 tccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaa 214  Q
    ||| || |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19659026 tccttggtctatgagttt-tttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaa 19659124  T
Q  215 tggaa 219  Q
     ||||    
T  19659125 cggaa 19659129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 25 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 44563427 - 44563226
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaaagttagcttt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||         | ||||||||||| | ||||    
T  44563427 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtt-acagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaagtcaacttt 44563329  T
Q  116 ccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 215  Q
    || || |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  44563328 ccttggtctatgagttt-tttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 44563230  T
Q  216 ggaa 219  Q
    ||||    
T  44563229 ggaa 44563226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 33244994 - 33244790
Alignment:
Q  24 gtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaaagttagctt 114  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||         | |||||||| || |  ||    
T  33244994 gtctgagagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtggttcggaagaggattgtcgaggacatgcgggacgttattctcaaaggtcaattt 33244895  T
Q  115 tccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaa 214  Q
    ||| || |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33244894 tccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccagcgcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaa 33244795  T
Q  215 tggaa 219  Q
     ||||    
T  33244794 cggaa 33244790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 50 - 219
Target Start/End: Original strand, 22080790 - 22080968
Alignment:
Q  50 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgag---------gacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaa 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||         |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  22080790 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcaagaacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccctggtcaatgagcttctttacaa 22080889  T
Q  141 tgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaa 219  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  22080890 tgtacttcaaagcgtaacatccttcaacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcgcacttgaggtcagaacggaa 22080968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 18710924 - 18710717
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgagg---------acattgttctcaaa 105  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||         ||||| ||||||||    
T  18710924 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 18710825  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || ||||| |||||||||||| | || ||||| ||||| ||||||||||||    
T  18710824 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctagggcaccctgatgaaaatcacacttg 18710725  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  18710724 agatcaga 18710717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 16283787 - 16283583
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||         | ||||||||    
T  16283787 ggacaacaagtctaggagcttcctcacatacttcaatcatgttcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 16283688  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || ||||| ||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||| |||    
T  16283687 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccttcgacatcatgacccagggtgccttgatggaaatcacatttg 16283588  T
Q  206 aggtc 210  Q
    |||||    
T  16283587 aggtc 16283583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 207
Target Start/End: Original strand, 27608782 - 27608983
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||         | ||||||||    
T  27608782 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 27608881  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || |||||||| |||||||||||| |||| || |||||||| |||||||| |||    
T  27608882 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcatccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 27608981  T
Q  206 ag 207  Q
    ||    
T  27608982 ag 27608983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 9354961 - 9354747
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||         | ||||||||    
T  9354961 ggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 9354862  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttcttt-acaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacactt 204  Q
     || |  ||||| || |  ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9354861 ggtcaattttccttggtctatgagttttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacgtcatgacccatagcaccttgatggaaatcacactt 9354762  T
Q  205 gaggtcagaatggaa 219  Q
    |||||| ||| ||||    
T  9354761 gaggtccgaacggaa 9354747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 16277892 - 16277691
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||||||||         | ||||||||    
T  16277892 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacggcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 16277793  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| |||||||| || |||||||||||| |||| || |||||||| |||||||| |||    
T  16277792 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 16277693  T
Q  206 ag 207  Q
    ||    
T  16277692 ag 16277691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 14557962 - 14557761
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggac---------attgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||  || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||         ||| ||||||||    
T  14557962 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcacatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgcgggacattattctcaaa 14557863  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| |||| || |||||||| |||||||| |||    
T  14557862 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 14557763  T
Q  206 ag 207  Q
    ||    
T  14557762 ag 14557761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 12092601 - 12092808
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||         | ||||||||    
T  12092601 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 12092700  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | | |||||||||||| || ||||| |||    
T  12092701 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttg 12092800  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  12092801 agatcaga 12092808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 15 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 19688436 - 19688235
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||         | ||||||||    
T  19688436 ggacatcaagtctaggagcttcctcgcatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 19688337  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| | |||||| |||| ||||||||| || || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  19688336 agtcaactttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaaatcacatttg 19688237  T
Q  206 ag 207  Q
    ||    
T  19688236 ag 19688235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 29829660 - 29829465
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||         | ||||||||    
T  29829660 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 29829561  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcaca 201  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||| ||||||||    
T  29829560 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcaca 29829465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 15 - 207
Target Start/End: Original strand, 2137136 - 2137337
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| || | || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||         | ||||||||    
T  2137136 ggacatcaagtctaggagctttctcacatgcttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgagacattattctcaaa 2137235  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| |||||||| |||| ||||||||| || || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| |||  || |||||||| |||||||| |||    
T  2137236 agtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccaaggcgccttgatgaaaatcacatttg 2137335  T
Q  206 ag 207  Q
    ||    
T  2137336 ag 2137337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 189432 - 189256
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgagg---------acattgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||  || ||||| ||||||||||||||||||         ||||| ||||||||    
T  189432 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattaacagaggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 189333  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagag 182  Q
    ||| |||||||| |||| ||| ||||| || || || ||| |||| |||||||| || |||||||||||| ||||||    
T  189332 agtcagctttccttgatcaataagctttttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagag 189256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 3329384 - 3329591
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||  || ||||| |||||||||||||| |||||||         ||||||||||    
T  3329384 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagtggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaa 3329483  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||| || |||| || ||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | | |||||||||||| || ||||| |||    
T  3329484 agtcagcttcccttgatcaacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttg 3329583  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  3329584 agatcaga 3329591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 31489627 - 31489834
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcga---------ggacattgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||         ||||||| ||||||||    
T  31489627 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 31489726  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||| || |||| |||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||| ||||| || |||    
T  31489727 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttg 31489826  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  31489827 agatcaga 31489834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 19286800 - 19286593
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgagg---------acattgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||         ||||| ||||||||    
T  19286800 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 19286701  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||| || |||| |||||| ||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  19286700 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 19286601  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  19286600 agatcaga 19286593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 19674779 - 19674572
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgagg---------acattgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||         ||||| ||||||||    
T  19674779 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 19674680  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||| || |||| |||||||||||| ||||| ||| |||| || || || |  |||||||||||| | |  ||||| ||||| |||||||| |||    
T  19674679 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacctctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttg 19674580  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  19674579 agatcaga 19674572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 31354862 - 31354655
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgagg---------acattgttctcaaa 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||         ||||| ||||||||    
T  31354862 ggacatcaagtctgggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 31354763  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || ||||| |||||| | |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  31354762 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 31354663  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  31354662 agatcaga 31354655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 19208237 - 19208444
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcga---------ggacattgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||         ||||||| ||||||||    
T  19208237 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 19208336  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || ||||| |||||| | |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  19208337 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 19208436  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  19208437 agatcaga 19208444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 28361832 - 28362039
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcga---------ggacattgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||         ||||||| ||||||||    
T  28361832 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 28361931  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || ||||| |||||| | |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  28361932 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 28362031  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  28362032 agatcaga 28362039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 33259061 - 33258854
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgagg---------acattgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||| | || ||||| || || ||||||||||||         ||||| ||||||||    
T  33259061 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacaacggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 33258962  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || ||||| |||||| |||  ||||||||||| || ||||| |||    
T  33258961 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 33258862  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  33258861 agatcaga 33258854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0558 (Bit Score: 87; Significance: 7e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0558
Description:

Target: scaffold0558; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 70 - 219
Target Start/End: Original strand, 1 - 159
Alignment:
Q  70 attcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcat 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||         ||||||| || |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  1 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggacgttgttctcgaaggttaactttccctgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcat 100  T
Q  161 ccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaa 219  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  101 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaa 159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 198
Target Start/End: Original strand, 536 - 728
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgag---------gacattgttctcaaa 105  Q
    |||| ||||| |||||| |||| |||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||         |||||| ||||||||    
T  536 ggacgtcaagactgggaacttcttcataagtctcgatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcaagaacatgagggacattattctcaaa 635  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatc 198  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  636 agttaactttccctgatcaatgagcttctttacaatgtacttcaaagcgtaacatccttcaacatcatggcccagagcatcttgatggaaatc 728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 50 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 21864 - 21686
Alignment:
Q  50 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgag---------gacattgttctcaaaagttagctttccctgatgaatgagcttctttacaa 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||         ||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  21864 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcaagaacatgagggacattgttcttaaaagttaactttccctggtcaatgagcttctttacaa 21765  T
Q  141 tgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaa 219  Q
    | ||| |||| ||||| |||||||| ||||| ||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  21764 tctacttcaaagcgtaacatccttcaacatcttggcccagagccccttgatggaaatcgcacttgaggtcagaacggaa 21686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 207
Target Start/End: Original strand, 46903 - 47104
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||         | ||||||||    
T  46903 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 47002  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| |||||||| || |||||||||||| |||| || |||||||| |||||||| |||    
T  47003 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 47102  T
Q  206 ag 207  Q
    ||    
T  47103 ag 47104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 207
Target Start/End: Original strand, 39987 - 40188
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||         | ||||||||    
T  39987 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 40086  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| |||||||| |||| |||||||| ||| || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| |||    
T  40087 agtcagctttccttgatcaatgagctccttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 40186  T
Q  206 ag 207  Q
    ||    
T  40187 ag 40188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 30101 - 29900
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| |||| || ||||| || ||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||         | ||||||||    
T  30101 ggacatcaagtctaagagcttcctcacatacttcgatcatatttacagtggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 30002  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| || ||||| || |||||||| ||| |||| || ||||| ||||||||||| |||    
T  30001 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcgtgacccagggcgccttggtggaaatcacatttg 29902  T
Q  206 ag 207  Q
    ||    
T  29901 ag 29900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 66; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 207
Target Start/End: Original strand, 47 - 248
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||         | ||||||||    
T  47 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 146  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| |||||||| |||| |||||||||||| || || ||| |||| |||||||| || |||||||||||| |||  || |||||||| |||||||| |||    
T  147 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccaacgcgccttgatgaaaatcacatttg 246  T
Q  206 ag 207  Q
    ||    
T  247 ag 248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 61; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 27629 - 27429
Alignment:
Q  16 gacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat---------tgttctcaaaa 106  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||         | |||||||||    
T  27629 gacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaa 27530  T
Q  107 gttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttga 206  Q
    || |||||||| |||| ||| |||||||| || || ||| |||| || ||||| || |||||||||||| |||| || |||||||| |||||||| ||||    
T  27529 gtcagctttccttgatcaataagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttga 27430  T
Q  207 g 207  Q
    |    
T  27429 g 27429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 60; Significance: 9e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 9904 - 9697
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggac---------attgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||         ||| ||||||||    
T  9904 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 9805  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||| || |||| |||||||||||| ||||| ||| |||| || || || || |||||||||||| | |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  9804 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 9705  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  9704 agatcaga 9697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 7157 - 7364
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggac---------attgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||         ||| ||||||||    
T  7157 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagtggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 7256  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||||| || ||||| |||    
T  7257 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 7356  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  7357 agatcaga 7364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 26119 - 26326
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggac---------attgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | |  || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||         ||| ||||||||    
T  26119 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacatttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 26218  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||||| || ||||| |||    
T  26219 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 26318  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  26319 agatcaga 26326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 8287 - 8080
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgagg---------acattgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||         ||||| ||||||||    
T  8287 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 8188  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||| || |||| |||||| ||||| ||||| ||| |||| || || || || |||||||||||  | |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  8187 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 8088  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  8087 agatcaga 8080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 14848 - 15055
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcga---------ggacattgttctcaaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||  |||||||| || ||||| ||||||||||||||||         ||||||| ||||||||    
T  14848 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcacattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 14947  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || ||||| |||||| | |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  14948 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 15047  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  15048 agatcaga 15055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 8984 - 9191
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcga---------ggacattgttctcaaa 105  Q
    |||||||||| || |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||         ||||||| ||||||||    
T  8984 ggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 9083  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||||| || || || |||    
T  9084 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 9183  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  9184 agatcaga 9191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 20353 - 20146
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcga---------ggacattgttctcaaa 105  Q
    |||||||||| || |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||         ||||||| ||||||||    
T  20353 ggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 20254  T
Q  106 agttagctttccctgatgaatgagcttctttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgatccagagcaccttgatggaaatcacacttg 205  Q
    ||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||| |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||||||| || || || |||    
T  20253 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 20154  T
Q  206 aggtcaga 213  Q
    || |||||    
T  20153 agatcaga 20146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 59 - 95
Target Start/End: Original strand, 46764 - 46800
Alignment:
Q  59 acagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacat 95  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  46764 acagcagcatgatttggaagaggattgtcgaggacat 46800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University