View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9042_high_5 (Length: 222)

Name: NF9042_high_5
Description: NF9042
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9042_high_5
NF9042_high_5
[»] chr5 (29 HSPs)
chr5 (1-209)||(27612981-27613189)
chr5 (1-209)||(27666043-27666251)
chr5 (1-209)||(40711405-40711613)
chr5 (1-209)||(16359127-16359335)
chr5 (1-209)||(34569119-34569327)
chr5 (1-209)||(41773467-41773675)
chr5 (1-209)||(22330440-22330648)
chr5 (1-209)||(27521031-27521239)
chr5 (1-209)||(37289049-37289257)
chr5 (1-209)||(19772585-19772793)
chr5 (1-209)||(22137293-22137501)
chr5 (1-209)||(22350544-22350752)
chr5 (1-209)||(29473626-29473834)
chr5 (1-209)||(14997292-14997500)
chr5 (1-209)||(27682953-27683161)
chr5 (1-209)||(20803222-20803430)
chr5 (1-209)||(18781739-18781947)
chr5 (7-201)||(21342973-21343167)
chr5 (1-209)||(21882399-21882607)
chr5 (7-209)||(25429046-25429248)
chr5 (7-209)||(26736286-26736488)
chr5 (1-198)||(23473831-23474028)
chr5 (1-197)||(21336847-21337043)
chr5 (26-183)||(23563746-23563903)
chr5 (1-54)||(23525867-23525920)
chr5 (41-111)||(20311573-20311643)
chr5 (23-183)||(20824086-20824246)
chr5 (21-89)||(22505406-22505474)
chr5 (11-198)||(28892505-28892692)
[»] chr1 (29 HSPs)
chr1 (1-209)||(16348038-16348246)
chr1 (1-209)||(41351111-41351319)
chr1 (1-209)||(51330935-51331143)
chr1 (1-209)||(21833010-21833218)
chr1 (1-209)||(33388472-33388680)
chr1 (1-209)||(19109076-19109284)
chr1 (1-209)||(24785300-24785508)
chr1 (59-209)||(21839658-21839808)
chr1 (1-209)||(17042458-17042666)
chr1 (8-209)||(21233181-21233382)
chr1 (20-207)||(22502751-22502938)
chr1 (1-198)||(16378813-16379010)
chr1 (7-209)||(21751645-21751847)
chr1 (1-78)||(20081819-20081896)
chr1 (65-207)||(21861880-21862022)
chr1 (65-207)||(22359751-22359893)
chr1 (9-132)||(429608-429731)
chr1 (1-63)||(21842066-21842128)
chr1 (26-183)||(19857039-19857196)
chr1 (26-132)||(20833368-20833474)
chr1 (27-132)||(22016214-22016319)
chr1 (23-84)||(38910291-38910352)
chr1 (98-209)||(20140791-20140902)
chr1 (47-198)||(21739525-21739676)
chr1 (23-84)||(12200382-12200443)
chr1 (23-132)||(31537462-31537571)
chr1 (23-132)||(48425689-48425798)
chr1 (23-132)||(52988557-52988666)
chr1 (50-198)||(20854252-20854400)
[»] chr8 (29 HSPs)
chr8 (1-209)||(17671836-17672044)
chr8 (1-209)||(19115159-19115367)
chr8 (1-209)||(19481886-19482094)
chr8 (1-209)||(20016077-20016285)
chr8 (1-209)||(18859336-18859544)
chr8 (1-209)||(22126773-22126981)
chr8 (1-209)||(22117989-22118197)
chr8 (1-209)||(30310958-30311166)
chr8 (1-209)||(22129431-22129639)
chr8 (6-209)||(15536142-15536345)
chr8 (1-209)||(19980726-19980934)
chr8 (9-209)||(32602904-32603104)
chr8 (1-209)||(21164352-21164560)
chr8 (1-209)||(22042586-22042794)
chr8 (1-209)||(22030862-22031070)
chr8 (7-209)||(21391681-21391883)
chr8 (7-209)||(21781007-21781209)
chr8 (7-209)||(21786175-21786377)
chr8 (1-209)||(22989804-22990012)
chr8 (7-209)||(21253704-21253906)
chr8 (7-209)||(22421712-22421914)
chr8 (1-209)||(22523305-22523513)
chr8 (11-209)||(22375277-22375475)
chr8 (1-209)||(22246247-22246455)
chr8 (70-209)||(21919987-21920126)
chr8 (65-209)||(23887787-23887931)
chr8 (47-132)||(22373705-22373790)
chr8 (65-198)||(21323157-21323290)
chr8 (23-111)||(22053720-22053808)
[»] chr7 (29 HSPs)
chr7 (1-209)||(10873372-10873580)
chr7 (1-209)||(14335078-14335286)
chr7 (1-209)||(44788731-44788939)
chr7 (1-209)||(8200730-8200938)
chr7 (1-209)||(8710287-8710495)
chr7 (1-209)||(18587551-18587759)
chr7 (1-209)||(11234593-11234801)
chr7 (1-209)||(13688723-13688931)
chr7 (1-209)||(18180427-18180633)
chr7 (1-209)||(15158437-15158645)
chr7 (1-209)||(11550482-11550690)
chr7 (1-209)||(14957236-14957444)
chr7 (1-209)||(17703835-17704043)
chr7 (1-209)||(12690184-12690392)
chr7 (1-209)||(9591050-9591254)
chr7 (47-209)||(14149862-14150024)
chr7 (83-209)||(16726845-16726971)
chr7 (10-184)||(14042402-14042576)
chr7 (10-184)||(14352432-14352606)
chr7 (1-182)||(15627233-15627414)
chr7 (10-108)||(15146312-15146410)
chr7 (153-201)||(15146416-15146464)
chr7 (27-183)||(15099987-15100143)
chr7 (50-159)||(13676184-13676293)
chr7 (47-132)||(14261649-14261734)
chr7 (47-132)||(19149771-19149856)
chr7 (47-132)||(20749170-20749255)
chr7 (23-132)||(26092178-26092287)
chr7 (11-183)||(18051321-18051493)
[»] chr6 (31 HSPs)
chr6 (1-209)||(28312187-28312395)
chr6 (1-209)||(25115109-25115317)
chr6 (1-209)||(29589955-29590163)
chr6 (6-209)||(27189993-27190196)
chr6 (6-209)||(27259044-27259247)
chr6 (1-209)||(28260713-28260921)
chr6 (1-209)||(28284995-28285203)
chr6 (1-209)||(28339462-28339670)
chr6 (1-209)||(2872318-2872527)
chr6 (1-209)||(22827871-22828079)
chr6 (1-209)||(16574447-16574655)
chr6 (1-209)||(16620725-16620933)
chr6 (1-209)||(24293298-24293506)
chr6 (1-209)||(27559485-27559693)
chr6 (1-209)||(5836744-5836952)
chr6 (1-209)||(16925156-16925364)
chr6 (1-209)||(19867244-19867452)
chr6 (1-209)||(22436426-22436634)
chr6 (9-201)||(18405468-18405660)
chr6 (86-209)||(16961082-16961206)
chr6 (11-209)||(20135531-20135729)
chr6 (11-209)||(22197140-22197338)
chr6 (7-209)||(23080980-23081182)
chr6 (30-209)||(18182912-18183091)
chr6 (26-183)||(19455606-19455763)
chr6 (26-198)||(19437570-19437742)
chr6 (1-111)||(30678540-30678650)
chr6 (47-132)||(21474234-21474319)
chr6 (68-198)||(15461904-15462034)
chr6 (47-132)||(25770478-25770563)
chr6 (68-132)||(24515997-24516061)
[»] chr4 (29 HSPs)
chr4 (1-209)||(12479293-12479501)
chr4 (1-209)||(16234103-16234311)
chr4 (1-209)||(17092260-17092468)
chr4 (1-209)||(8389105-8389313)
chr4 (1-209)||(19775904-19776112)
chr4 (1-209)||(23958440-23958648)
chr4 (1-209)||(27714029-27714237)
chr4 (6-209)||(19634829-19635032)
chr4 (1-209)||(8050734-8050942)
chr4 (1-209)||(40475733-40475941)
chr4 (6-209)||(14301095-14301298)
chr4 (1-209)||(18224557-18224765)
chr4 (1-209)||(14683260-14683468)
chr4 (1-209)||(16250961-16251169)
chr4 (1-209)||(15145003-15145212)
chr4 (57-209)||(16352697-16352849)
chr4 (7-209)||(14162163-14162365)
chr4 (1-209)||(14696794-14697002)
chr4 (1-209)||(16218923-16219131)
chr4 (1-209)||(16222243-16222451)
chr4 (7-209)||(14188199-14188401)
chr4 (7-209)||(16152-16354)
chr4 (74-209)||(22632393-22632528)
chr4 (68-209)||(14848543-14848684)
chr4 (6-61)||(16350670-16350725)
chr4 (47-132)||(15073129-15073214)
chr4 (23-84)||(29450930-29450991)
chr4 (29-132)||(14993766-14993869)
chr4 (23-132)||(3262187-3262296)
[»] chr3 (49 HSPs)
chr3 (1-209)||(3688255-3688463)
chr3 (1-209)||(5422540-5422748)
chr3 (1-209)||(12889021-12889229)
chr3 (1-209)||(13255002-13255210)
chr3 (1-209)||(20059664-20059872)
chr3 (1-209)||(16638085-16638293)
chr3 (1-209)||(16754311-16754519)
chr3 (1-209)||(43164987-43165195)
chr3 (1-209)||(48427759-48427967)
chr3 (1-209)||(15587002-15587210)
chr3 (1-209)||(26791023-26791231)
chr3 (1-209)||(15345855-15346063)
chr3 (1-209)||(15713666-15713874)
chr3 (1-209)||(6603048-6603255)
chr3 (1-209)||(10908522-10908730)
chr3 (1-209)||(53382628-53382836)
chr3 (12-195)||(26190937-26191120)
chr3 (1-209)||(10007912-10008120)
chr3 (1-209)||(15400127-15400335)
chr3 (1-209)||(15358395-15358603)
chr3 (1-209)||(16804557-16804765)
chr3 (1-209)||(24185502-24185710)
chr3 (1-192)||(15065400-15065591)
chr3 (1-209)||(16694476-16694684)
chr3 (1-209)||(14874178-14874386)
chr3 (7-183)||(14579024-14579200)
chr3 (7-209)||(17492163-17492365)
chr3 (1-209)||(15261942-15262150)
chr3 (7-209)||(12843719-12843921)
chr3 (65-209)||(18437452-18437596)
chr3 (50-198)||(31941236-31941384)
chr3 (11-132)||(47126343-47126464)
chr3 (23-132)||(10408367-10408476)
chr3 (47-132)||(12858140-12858225)
chr3 (47-111)||(14291177-14291241)
chr3 (50-198)||(31692833-31692981)
chr3 (14-132)||(12272737-12272855)
chr3 (65-209)||(11888027-11888172)
chr3 (26-183)||(11949532-11949689)
chr3 (65-150)||(13969783-13969868)
chr3 (50-198)||(10417693-10417841)
chr3 (11-183)||(13944372-13944544)
chr3 (23-89)||(12510104-12510170)
chr3 (32-198)||(13318132-13318298)
chr3 (29-111)||(16825908-16825990)
chr3 (65-183)||(44779595-44779713)
chr3 (26-115)||(17494062-17494151)
chr3 (23-132)||(28756718-28756827)
chr3 (26-114)||(12358151-12358239)
[»] chr2 (31 HSPs)
chr2 (1-209)||(16983564-16983772)
chr2 (1-209)||(17001324-17001532)
chr2 (1-209)||(9337906-9338114)
chr2 (1-209)||(9486540-9486748)
chr2 (1-209)||(21142952-21143160)
chr2 (1-209)||(22323253-22323461)
chr2 (1-209)||(27220340-27220548)
chr2 (1-209)||(44383481-44383689)
chr2 (1-209)||(10871174-10871382)
chr2 (1-209)||(24712358-24712566)
chr2 (1-209)||(24874661-24874869)
chr2 (1-209)||(27373593-27373801)
chr2 (1-209)||(24264694-24264902)
chr2 (1-209)||(41606296-41606504)
chr2 (1-209)||(24705393-24705601)
chr2 (1-209)||(24677811-24678019)
chr2 (1-209)||(24657569-24657777)
chr2 (6-209)||(23204638-23204841)
chr2 (1-183)||(11351622-11351804)
chr2 (1-209)||(21323177-21323385)
chr2 (7-209)||(23105645-23105847)
chr2 (10-209)||(23074187-23074386)
chr2 (7-209)||(22733691-22733893)
chr2 (1-120)||(23029372-23029491)
chr2 (1-90)||(45673923-45674012)
chr2 (11-180)||(24817761-24817930)
chr2 (170-209)||(11351800-11351839)
chr2 (26-132)||(23097954-23098060)
chr2 (26-159)||(23279150-23279283)
chr2 (11-111)||(19817269-19817369)
chr2 (26-115)||(23274011-23274100)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (1-209)||(10090-10298)
[»] scaffold0055 (1 HSPs)
scaffold0055 (1-209)||(21969-22177)
[»] scaffold0028 (4 HSPs)
scaffold0028 (1-209)||(11191-11399)
scaffold0028 (1-209)||(53449-53657)
scaffold0028 (1-209)||(17659-17867)
scaffold0028 (65-183)||(47952-48070)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (1-209)||(40877-41085)
scaffold0109 (6-209)||(13503-13706)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (1-209)||(3146-3354)
scaffold0044 (1-209)||(16882-17090)
[»] scaffold0017 (3 HSPs)
scaffold0017 (1-209)||(17440-17648)
scaffold0017 (8-201)||(195219-195412)
scaffold0017 (41-111)||(24126-24196)
[»] scaffold0560 (1 HSPs)
scaffold0560 (32-209)||(8146-8323)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (1-209)||(7980-8188)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (1-209)||(29302-29510)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (1-209)||(11730-11938)
[»] scaffold1459 (1 HSPs)
scaffold1459 (1-209)||(1406-1614)
[»] scaffold0079 (3 HSPs)
scaffold0079 (1-200)||(36229-36428)
scaffold0079 (65-209)||(28800-28944)
scaffold0079 (27-183)||(3466-3622)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (59-209)||(9662-9812)
[»] scaffold0550 (1 HSPs)
scaffold0550 (1-209)||(10532-10740)
[»] scaffold0393 (1 HSPs)
scaffold0393 (12-209)||(15379-15576)
[»] scaffold0102 (2 HSPs)
scaffold0102 (1-201)||(50719-50919)
scaffold0102 (26-111)||(42518-42603)
[»] scaffold0081 (2 HSPs)
scaffold0081 (1-209)||(21326-21534)
scaffold0081 (1-209)||(36750-36958)
[»] scaffold0080 (5 HSPs)
scaffold0080 (1-209)||(10612-10820)
scaffold0080 (1-209)||(13267-13475)
scaffold0080 (1-209)||(31606-31813)
scaffold0080 (1-209)||(37072-37279)
scaffold0080 (7-205)||(54363-54561)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (1-209)||(37194-37402)
scaffold0042 (1-208)||(26075-26282)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (1-209)||(35089-35296)
scaffold0022 (7-209)||(41354-41556)
scaffold0022 (7-209)||(75074-75276)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (34-209)||(551-726)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (7-209)||(25092-25294)
[»] scaffold0501 (1 HSPs)
scaffold0501 (1-209)||(12385-12593)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (7-183)||(3349-3525)
[»] scaffold0010 (4 HSPs)
scaffold0010 (1-152)||(14203-14354)
scaffold0010 (14-209)||(4637-4832)
scaffold0010 (26-132)||(44826-44932)
scaffold0010 (23-132)||(39729-39838)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (7-209)||(111287-111489)
scaffold0040 (1-209)||(17600-17808)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (1-208)||(10509-10716)
[»] scaffold1985 (1 HSPs)
scaffold1985 (56-209)||(1-154)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (9-181)||(18400-18572)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (7-209)||(103949-104151)
[»] scaffold0243 (2 HSPs)
scaffold0243 (23-208)||(24341-24526)
scaffold0243 (26-183)||(10171-10328)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (1-198)||(5846-6043)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (1-197)||(23907-24103)
scaffold0011 (26-209)||(151289-151472)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (7-209)||(1174-1376)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (7-209)||(7945-8147)
[»] scaffold0023 (4 HSPs)
scaffold0023 (7-209)||(151803-152005)
scaffold0023 (41-209)||(1919-2087)
scaffold0023 (65-209)||(47402-47546)
scaffold0023 (23-115)||(164797-164889)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (1-198)||(6606-6803)
scaffold0270 (1-198)||(13736-13933)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (84-209)||(27952-28077)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (9-209)||(8672-8872)
scaffold0358 (12-209)||(17868-18065)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (1-209)||(13853-14061)
[»] scaffold0621 (1 HSPs)
scaffold0621 (7-209)||(4156-4358)
[»] scaffold0114 (1 HSPs)
scaffold0114 (7-209)||(17728-17925)
[»] scaffold1881 (1 HSPs)
scaffold1881 (1-120)||(854-973)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (10-197)||(4317-4504)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (7-209)||(12594-12795)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (7-209)||(55850-56052)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (29-209)||(6489-6669)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (1-209)||(495742-495950)
scaffold0001 (65-111)||(452651-452697)
scaffold0001 (128-180)||(441441-441493)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (7-150)||(13865-14008)
scaffold0120 (98-183)||(8770-8855)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (6-209)||(216799-217002)
[»] scaffold1423 (1 HSPs)
scaffold1423 (7-209)||(758-960)
[»] scaffold0993 (2 HSPs)
scaffold0993 (41-209)||(604-772)
scaffold0993 (7-132)||(781-906)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (1-198)||(14640-14837)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (10-209)||(40888-41087)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (12-180)||(15364-15532)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (7-107)||(11260-11360)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (11-180)||(23682-23851)
scaffold0018 (11-180)||(9735-9904)
[»] scaffold0410 (1 HSPs)
scaffold0410 (1-71)||(1-71)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (132-209)||(52430-52507)
scaffold0031 (27-183)||(110358-110514)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (1-181)||(4838-5018)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (81-209)||(231-361)
[»] scaffold0423 (1 HSPs)
scaffold0423 (7-90)||(2643-2726)
[»] scaffold0312 (1 HSPs)
scaffold0312 (9-132)||(819-942)
[»] scaffold0130 (2 HSPs)
scaffold0130 (1-63)||(8155-8217)
scaffold0130 (47-132)||(4309-4394)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (6-95)||(15258-15347)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (74-209)||(7106-7241)
[»] scaffold1615 (1 HSPs)
scaffold1615 (92-209)||(1198-1315)
[»] scaffold1288 (1 HSPs)
scaffold1288 (26-183)||(254-411)
[»] scaffold0222 (1 HSPs)
scaffold0222 (26-183)||(20562-20719)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (70-209)||(20963-21102)
[»] scaffold1530 (1 HSPs)
scaffold1530 (26-159)||(355-488)
[»] scaffold0443 (1 HSPs)
scaffold0443 (23-132)||(11608-11717)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (41-125)||(8460-8544)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (47-183)||(60487-60623)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (65-209)||(114476-114620)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (26-209)||(5473-5656)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (11-198)||(94278-94465)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (26-181)||(98982-99137)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (66-180)||(5328-5442)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (26-132)||(919-1025)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (1-75)||(57988-58062)
[»] scaffold1477 (1 HSPs)
scaffold1477 (26-171)||(979-1124)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (47-132)||(4670-4755)
[»] scaffold0304 (1 HSPs)
scaffold0304 (65-198)||(923-1056)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (47-132)||(11759-11844)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (47-132)||(49297-49382)
[»] scaffold0298 (1 HSPs)
scaffold0298 (68-168)||(9667-9767)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (47-198)||(34070-34221)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (14-89)||(1270-1345)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (47-209)||(29249-29411)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (70-180)||(175788-175898)
[»] scaffold0664 (1 HSPs)
scaffold0664 (50-115)||(6854-6919)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (47-132)||(51611-51696)
[»] scaffold0509 (1 HSPs)
scaffold0509 (47-131)||(11630-11714)
[»] scaffold0261 (2 HSPs)
scaffold0261 (51-115)||(12770-12834)
scaffold0261 (51-115)||(20950-21014)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (50-198)||(53780-53928)
[»] scaffold0067 (1 HSPs)
scaffold0067 (47-183)||(29372-29508)
[»] scaffold0054 (1 HSPs)
scaffold0054 (47-111)||(63939-64003)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (50-198)||(325440-325588)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 29)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 27613189 - 27612981
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27613189 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 27613090  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27613089 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggta 27612990  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  27612989 tcttgatgt 27612981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 27666043 - 27666251
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27666043 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 27666142  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27666143 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggta 27666242  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  27666243 tcttgatgt 27666251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 40711613 - 40711405
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40711613 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 40711514  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40711513 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggta 40711414  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  40711413 tcttgatgt 40711405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16359335 - 16359127
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16359335 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 16359236  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16359235 aattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggta 16359136  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  16359135 tcttgatgt 16359127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 34569327 - 34569119
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34569327 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 34569228  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34569227 aattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggta 34569128  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  34569127 tcttgatgt 34569119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 41773675 - 41773467
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41773675 gtttggtcgcgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 41773576  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41773575 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggta 41773476  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  41773475 tcttgatgt 41773467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 22330440 - 22330648
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22330440 gtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 22330539  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22330540 aattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggta 22330639  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  22330640 tcttgatgt 22330648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 27521239 - 27521031
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27521239 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 27521140  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27521139 aattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggcgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggta 27521040  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  27521039 tcttgatgt 27521031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 37289049 - 37289257
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37289049 gtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 37289148  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37289149 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgtagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggta 37289248  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  37289249 tcttgatgt 37289257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 19772793 - 19772585
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19772793 gtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgatcctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 19772694  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  19772693 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagttgaagcaactggaacgcgacggta 19772594  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  19772593 tcttgatgt 19772585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22137501 - 22137293
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22137501 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 22137402  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22137401 aattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctaccaagcagctgaagcaactggaacgcgacggta 22137302  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  22137301 tcttgatgt 22137293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22350752 - 22350544
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22350752 gtttggtcgcgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 22350653  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22350652 aatttttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggagagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 22350553  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  22350552 tcttgatgt 22350544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 29473626 - 29473834
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29473626 gtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 29473725  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  29473726 aattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacgata 29473825  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  29473826 tcttgatgt 29473834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 14997292 - 14997500
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14997292 gtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 14997391  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  14997392 aattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcggagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacagta 14997491  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  14997492 tcttgatgt 14997500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 27682953 - 27683161
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27682953 gtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtgtgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactgtttagagtacaaccacgttcttatt 27683052  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||    
T  27683053 aattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcggagtttttatctactaagcagctgaaggaactggaacgcaacggta 27683152  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  27683153 tcttgatgt 27683161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 20803430 - 20803222
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||     
T  20803430 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattcttggtatgaagtggttagagtacaaccatgttcatatc 20803331  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20803330 aattgctttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctaccaagcagctgaagcaactggaacgcgaaggta 20803231  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  20803230 tcttgatgt 20803222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18781947 - 18781739
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||     
T  18781947 gtttggtcgtgattttgaaatggattaagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatc 18781848  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18781847 aattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgctgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctactaagcagctgaagcaaatggaacgcgatggta 18781748  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    | |||||||    
T  18781747 ttttgatgt 18781739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 7 - 201
Target Start/End: Original strand, 21342973 - 21343167
Alignment:
Q  7 tcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgt 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  21342973 tcgtgattttgaaatggatttagtttgtataccattgaacggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgt 21343072  T
Q  107 tttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtat 201  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21343073 tttagcaagtcagtttatttctattccgttgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctactaagcagctgaagcaaatggaacgcgatggtat 21343167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 21882607 - 21882399
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  21882607 gtttggtcgtgattttgagatggatttagtttgtctacctttaagcggtatggatgtgattcttggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatt 21882508  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21882507 aattgttttagcaagtcggtgtatttctcctccgtctaggaggaaagtggtgcagagttcttgtctaccaagcagctgaagcaactggaacgtgatggta 21882408  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    | |||||||    
T  21882407 ttttgatgt 21882399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 25429248 - 25429046
Alignment:
Q  7 tcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgt 106  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  25429248 tcgtgattttgagattgatttggtttgtctacctttgagtggtatggatgtaattcttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcacattaattgt 25429149  T
Q  107 tttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 206  Q
    ||||| || |||||  |||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| |||||||| ||||    
T  25429148 tttagtaaatcagtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagtttttgtctaccaagcagctgaagcagttagaacgtgatggtattttga 25429049  T
Q  207 tgt 209  Q
    |||    
T  25429048 tgt 25429046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 26736286 - 26736488
Alignment:
Q  7 tcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgt 106  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  26736286 tcgtgattttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggtatggatgtgatccttggaatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgt 26736385  T
Q  107 tttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 206  Q
    ||||| ||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||||| | ||||| | ||| || ||||    
T  26736386 tttagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcaaaatttttgtctatgaagcagctgaagcaattagaacgtggtggaattttga 26736485  T
Q  207 tgt 209  Q
    |||    
T  26736486 tgt 26736488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 23474028 - 23473831
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||| || || |||||| |||| |||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  23474028 gtttggtcgagattttgaaattgacttggtttgtttacctttgagtggaatggacgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatatt 23473929  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 198  Q
    ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||| |  ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  23473928 aattgttttagtaagtcggtgtatttttcttctgctgaagaagaaagtggtgcagaattcttgtctactaagcagctgaagcaattagaacgtgatgg 23473831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 21336847 - 21337043
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||| || || | |||| |||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  21336847 gtttggtcgcgattttgaaattgacttggattgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatatt 21336946  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatg 197  Q
    ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||| |  ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  21336947 aattgttttagtaagtcggtgtatttttcttctgctgaagaagaaagtggcgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaattagaacgtgatg 21337043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 183
Target Start/End: Original strand, 23563746 - 23563903
Alignment:
Q  26 ttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatt 125  Q
    ||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| ||||||||| | || ||||    
T  23563746 ttagtttgtttaccattgacgggtatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagcaagacggtgcatt 23563845  T
Q  126 tctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagca 183  Q
    | |||||    ||||| || ||||| ||||||||  |||||||||| ||| |||||||    
T  23563846 tttcttctacagaagaagagagtggagcagagttgctatctactaaacagttgaagca 23563903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 23525920 - 23525867
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatgga 54  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  23525920 gtttggtcgtgattttgagatggatttagtttgtctacctttgagcggtatgga 23525867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 41 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 20311643 - 20311573
Alignment:
Q  41 ttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 111  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||  ||| | |||| ||| |||||||||||    
T  20311643 ttgagtggtatggatgtgatactaggtatgaactggttggagtttaactatgttcatatcaattgttttag 20311573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 20824246 - 20824086
Alignment:
Q  23 gatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtac 122  Q
    |||||||| |||||||| |||   || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  ||   |||||||||||||| |||| | || |    
T  20824246 gatttagtgtgtctaccgttgttggggatggatgttattttcgggatgaattggttagagtataaccgagtctgtattaattgttttaacaagacggtgc 20824147  T
Q  123 atttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagca 183  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||| || ||||||| ||| |||||||    
T  20824146 acttttcttctgtggaagaagagagtggagcagagtttctaactactaaacagttgaagca 20824086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 22505474 - 22505406
Alignment:
Q  21 tggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacc 89  Q
    |||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||| ||||    
T  22505474 tggatttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtgatttttggaatgaattggttagagtataacc 22505406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 198
Target Start/End: Original strand, 28892505 - 28892692
Alignment:
Q  11 gattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgtttta 110  Q
    ||||||||| | || ||||| |||||||| |||   || |||||||| ||  | || ||||| ||||||||||| ||||  ||   ||||||||||||||    
T  28892505 gattttgaagtcgacttagtgtgtctaccgttgttggggatggatgtcatcttcgggatgaattggttagagtataaccgagtctgtattaattgtttta 28892604  T
Q  111 gcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 198  Q
     |||| | || || || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||| || ||||||| ||| |||||||  ||||||| |||||    
T  28892605 acaagacggtgcacttttcttctgtggaagaagagagtggagcagagtttctaactactaaacagttgaagcagttggaacgagatgg 28892692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 29)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 16348038 - 16348246
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16348038 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 16348137  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16348138 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 16348237  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  16348238 tcttgatgt 16348246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 41351111 - 41351319
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41351111 gtttagtcgtgattttgaaatggatttagtttgcctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaatcacgttcttatt 41351210  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41351211 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 41351310  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  41351311 tcttgatgt 41351319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 51330935 - 51331143
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51330935 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 51331034  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51331035 aattgttttagcaagtcagtgcatttcttttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 51331134  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  51331135 tcttgatgt 51331143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 21833218 - 21833010
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21833218 gtttggtcgtgatttcaaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 21833119  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21833118 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggta 21833019  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  21833018 tcttgatgt 21833010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 33388472 - 33388680
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33388472 gtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 33388571  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  33388572 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactgaaacgcgacggta 33388671  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  33388672 tcttgatgt 33388680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 19109284 - 19109076
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  19109284 gtttggtcatgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaatcacgttcttatt 19109185  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19109184 aattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaaatggaacgcgatggta 19109085  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    | |||||||    
T  19109084 ttttgatgt 19109076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 24785300 - 24785508
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||     
T  24785300 gtttggtcgtgattttgaaatggatctggtttgtctacctttgagcggtatggatgtaattatgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatc 24785399  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24785400 aattgttttagcaaatcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 24785499  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    | |||||||    
T  24785500 ttttgatgt 24785508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 59 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 21839808 - 21839658
Alignment:
Q  59 attctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagt 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21839808 attctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagt 21839709  T
Q  159 ttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21839708 ttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 21839658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 17042458 - 17042666
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||     
T  17042458 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatc 17042557  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||    
T  17042558 aattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgctgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctgctaagcagctgaagcaaatggaacacgatagta 17042657  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    | |||||||    
T  17042658 ttttgatgt 17042666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 8 - 209
Target Start/End: Original strand, 21233181 - 21233382
Alignment:
Q  8 cgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  21233181 cgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgtt 21233280  T
Q  108 ttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgat 207  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||    
T  21233281 ttagcaagtcagtgtatttctcttccgctgaagaggaaagtggtgcaaagttcgtatctactatgcagctgaagcaaatgaaacgcgatggtattttgat 21233380  T
Q  208 gt 209  Q
    ||    
T  21233381 gt 21233382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 20 - 207
Target Start/End: Original strand, 22502751 - 22502938
Alignment:
Q  20 atggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcag 119  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||     
T  22502751 atggatttagtttgtctacctttgagcggaatggatgtgattctgggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgttttagcaagtcaa 22502850  T
Q  120 tacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgat 207  Q
    |  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  22502851 tgtatttctcctccgttgaagaggaaagtggtgcagagttcttgtctaccaagcagctgaagcaactagaacgcgatggtattttgat 22502938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 16379010 - 16378813
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  16379010 gtttggtcgtgattttgagattgatttggtttgtttacctttgagcggaatggatgtaatcctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatt 16378911  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 198  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| |  || || || ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  16378910 aattgttttagcaagtcagtgtatttctcttctgctgaggaagagagtggagcaaagtttttgtctactaagcagctgaagcaattagaacgtgatgg 16378813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 21751847 - 21751645
Alignment:
Q  7 tcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgt 106  Q
    |||| ||||||| || ||| | |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  21751847 tcgtaattttgagattgatatggtttgtttacctttgagtggtatggatgtgattcttggcatcaactcgttagagtacaaccatgttcacattaattgt 21751748  T
Q  107 tttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 206  Q
    ||||| || || ||  ||||||||||    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |    
T  21751747 tttagtaaatcggtgtatttctcttctactgaagaggaaagtggcgcagagtttttgtctactaaacagctgaagcagttagaacgtgatggaatcttaa 21751648  T
Q  207 tgt 209  Q
    |||    
T  21751647 tgt 21751645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 20081819 - 20081896
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggtt 78  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20081819 gtttggtcgtgattttgagatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggtt 20081896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 65 - 207
Target Start/End: Original strand, 21861880 - 21862022
Alignment:
Q  65 ggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttat 164  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||  ||||| ||  |||||||||| |  ||||| ||| |||| |||||||| ||||    
T  21861880 ggtatgaactggttggagtacaaccatgttaatattaattgttttattaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaagaatgtggcgcagagttcttat 21861979  T
Q  165 ctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgat 207  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||    
T  21861980 ctacgaagcagctgaagcaattagaacgtgatggaatcttgat 21862022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 65 - 207
Target Start/End: Original strand, 22359751 - 22359893
Alignment:
Q  65 ggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttat 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||| ||||| || |||||  || ||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||| |    
T  22359751 ggtatgaactggttagagtataaccatgttcatattatttgctttagtaaatcagtgtatatctcttctgctgaagagaaaagtggtgcagagtttttgt 22359850  T
Q  165 ctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgat 207  Q
    ||||||||||||||||| |  | ||||| |||||||| |||||    
T  22359851 ctactaagcagctgaagtagttagaacgtgatggtattttgat 22359893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 132
Target Start/End: Original strand, 429608 - 429731
Alignment:
Q  9 gtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttt 108  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| || |  ||||||||||     
T  429608 gtgattttgagatggatttggtttgtctacatttgagtggtatggatgtgattcttggtatgaattggttggaatacaaccatgtgcacattaattgtta 429707  T
Q  109 tagcaagtcagtacatttctcttc 132  Q
     || ||||| ||  ||||||||||    
T  429708 cagtaagtcggtgtatttctcttc 429731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 21842128 - 21842066
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattct 63  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  21842128 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctgcctttgagcggtatggatgtgattct 21842066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 26 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 19857196 - 19857039
Alignment:
Q  26 ttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatt 125  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||||  ||| | || ||||||| ||||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||    
T  19857196 ttagtttgtttaccgttgactggtatggatgatatttttgggatgaacttgttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagcaagacagtgcatt 19857097  T
Q  126 tctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagca 183  Q
    | ||||| |  ||||| || ||||| ||||||||  ||||||| || ||| |||||||    
T  19857096 tttcttctgctgaagaagagagtggagcagagttcctatctacaaaacagttgaagca 19857039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 26 - 132
Target Start/End: Original strand, 20833368 - 20833474
Alignment:
Q  26 ttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatt 125  Q
    ||||||||| |||| ||||  || |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||||||| | || ||||    
T  20833368 ttagtttgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagcaagacggtgcatt 20833467  T
Q  126 tctcttc 132  Q
    | |||||    
T  20833468 tttcttc 20833474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 132
Target Start/End: Original strand, 22016214 - 22016319
Alignment:
Q  27 tagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacattt 126  Q
    |||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| ||||||||| | || |||||    
T  22016214 tagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagcaagacggtgcattt 22016313  T
Q  127 ctcttc 132  Q
     |||||    
T  22016314 ttcttc 22016319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 84
Target Start/End: Original strand, 38910291 - 38910352
Alignment:
Q  23 gatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 84  Q
    |||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  38910291 gatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgtgatttttggtatgaattggttagagta 38910352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 20140902 - 20140791
Alignment:
Q  98 attaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatg 197  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||  |||||||||  |  |||||||||||||| ||| | ||  | ||||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  20140902 attaattgctttagtaagtcggtgtatttctcttatgctgaagaggaaagtggcgcataattcatgtctactaagcagctgaagcagttagaacgtgatg 20140803  T
Q  198 gtatcttgatgt 209  Q
    |||| |||||||    
T  20140802 gtattttgatgt 20140791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 47 - 198
Target Start/End: Original strand, 21739525 - 21739676
Alignment:
Q  47 ggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaa 146  Q
    ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||| ||||| ||| | |  ||||| ||||| |  ||||| || |    
T  21739525 ggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatattaattgctttagtaagacggcgcatttttcttctgctgaagaagaga 21739624  T
Q  147 gtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 198  Q
    |||  || ||||| ||| ||||||| ||| |||||||| |||| || |||||    
T  21739625 gtgaagctgagttcttaactactaaacagttgaagcaattggagcgtgatgg 21739676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 23 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 12200443 - 12200382
Alignment:
Q  23 gatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 84  Q
    |||||||| ||||| || ||||  ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  12200443 gatttagtgtgtctgccgttgacgggtatggatgtgatttttggtatgaattggttagagta 12200382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 23 - 132
Target Start/End: Original strand, 31537462 - 31537571
Alignment:
Q  23 gatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtac 122  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||  | |||||||| |||||||| || || |  |||| ||| || || ||||| ||| | ||||    
T  31537462 gatttagtttgtctaccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagaatataatcgagttcatatcaactgctttagtaagacggtac 31537561  T
Q  123 atttctcttc 132  Q
    ||||||||||    
T  31537562 atttctcttc 31537571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 23 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 48425798 - 48425689
Alignment:
Q  23 gatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtac 122  Q
    |||||||||||||| || ||||  ||||||||||| ||  | |||||||| ||||||||||| || |  |||| ||| || || ||||| ||| | ||||    
T  48425798 gatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagtataatcgagttcatatcaactgctttagtaagacggtac 48425699  T
Q  123 atttctcttc 132  Q
    ||||||||||    
T  48425698 atttctcttc 48425689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 23 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 52988666 - 52988557
Alignment:
Q  23 gatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtac 122  Q
    |||||||||||||| || ||||  ||||||||||| ||  | |||||||| ||||||||||| || |  |||| ||| || || ||||| ||| | ||||    
T  52988666 gatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagtataatcgagttcatatcaactgctttagtaagacggtac 52988567  T
Q  123 atttctcttc 132  Q
    ||||||||||    
T  52988566 atttctcttc 52988557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 198
Target Start/End: Original strand, 20854252 - 20854400
Alignment:
Q  50 atggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtg 149  Q
    |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  ||   ||| |||||||||| |||| | || || || ||||| |  |||||||| ||||    
T  20854252 atggatgttattttcgggatgaattggttagagtataaccgagtctgtataaattgttttaacaagacggtgcacttttcttctgcggaagaggagagtg 20854351  T
Q  150 gtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 198  Q
    | ||||||||| || ||||||| ||| |||||||  ||||||| |||||    
T  20854352 gagcagagtttctaactactaaacagttgaagcagttggaacgagatgg 20854400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 29)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 17671836 - 17672044
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17671836 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 17671935  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17671936 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggta 17672035  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  17672036 tcttgatgt 17672044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 19115367 - 19115159
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19115367 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 19115268  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19115267 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggta 19115168  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  19115167 tcttgatgt 19115159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 19481886 - 19482094
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19481886 gtttagtcgtgattttgaaatggatttagtttgcctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaatcacgttcttatt 19481985  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19481986 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 19482085  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  19482086 tcttgatgt 19482094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 20016077 - 20016285
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20016077 gtttggtcgtgattttgaaatgggtttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 20016176  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20016177 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggta 20016276  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  20016277 tcttgatgt 20016285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18859544 - 18859336
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18859544 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggaagtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 18859445  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18859444 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtcaactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 18859345  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  18859344 tcttgatgt 18859336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 22126773 - 22126981
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22126773 gtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctctgagcggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 22126872  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22126873 aattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggta 22126972  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  22126973 tcttgatgt 22126981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 22117989 - 22118197
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  22117989 gtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctctgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacatttttatt 22118088  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22118089 aattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcggagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggta 22118188  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  22118189 tcttgatgt 22118197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 30310958 - 30311166
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||     
T  30310958 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatc 30311057  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30311058 aattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgctgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctactaagcagctgaagcaaatggaacgcgatggta 30311157  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    | |||||||    
T  30311158 ttttgatgt 30311166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 22129431 - 22129639
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||     
T  22129431 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatc 22129530  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22129531 aattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgctgaagaggaaagtggtgcagaattcttatctactaagcagctgaagcaaatggaacgcgatggta 22129630  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    | |||||||    
T  22129631 ttttgatgt 22129639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 6 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15536345 - 15536142
Alignment:
Q  6 gtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattg 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  15536345 gtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatgaatgtgattttgggtacgaattggttagagtacaaccatgttcatattaattg 15536246  T
Q  106 ttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttg 205  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  15536245 ttttagcaagtcagtgtatttctcttccgctgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctactaagcagctgaagcaaatggaacgcgatggtattttg 15536146  T
Q  206 atgt 209  Q
    ||||    
T  15536145 atgt 15536142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 19980934 - 19980726
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  |||    
T  19980934 gtttggtcgtgattttgagatggatttagtttgtctacccttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacatt 19980835  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19980834 aattgttttagcaagttagtgtatttctcctccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttgtctaccaagcagctgaagcaactggaacgggatggta 19980735  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    | |||||||    
T  19980734 ttttgatgt 19980726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 32603104 - 32602904
Alignment:
Q  9 gtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttt 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||    
T  32603104 gtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttt 32603005  T
Q  109 tagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatg 208  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  32603004 tagcaagtcagtgtatttctcttccgctgaagaggaaggtggtgcagagttcttatctactaaacagctgaagcaaatggaacgcgatggtattttgatg 32602905  T
Q  209 t 209  Q
    |    
T  32602904 t 32602904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 21164352 - 21164560
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  |||    
T  21164352 gtttggtcgtgatttcgagatggacttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacatt 21164451  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  21164452 aattgttttagcaagtcagtgtatttctcctcagtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaattggaacgcgatgata 21164551  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    | |||||||    
T  21164552 ttttgatgt 21164560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22042794 - 22042586
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||| |||     
T  22042794 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgaacggtatggatgtgattctaggtatgaattggttagaatacaaccatgttcatatc 22042695  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22042694 aattgttttagcaagttagtgtatttctcttccgctgaagaggaaagtggtgcagagttcttaactactaagcagctgaagcaaatggaacgcgatggta 22042595  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    | |||||||    
T  22042594 ttttgatgt 22042586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22031070 - 22030862
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||  || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||     
T  22031070 gtttggtcatgatttcgaaatggatttagtttgtctacatttaagcggtatggatgtaattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatc 22030971  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22030970 aattgttttagcaagtcagtgtgtttctcttccgctgaggaggaaagtggtgcatagtttttatctactaagcagctgaagcaaatggaacgcgatggta 22030871  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    | |||||||    
T  22030870 ttttgatgt 22030862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 21391681 - 21391883
Alignment:
Q  7 tcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgt 106  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  ||||||| |    
T  21391681 tcgtgattttgagatggatttagtttttctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattat 21391780  T
Q  107 tttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 206  Q
    | ||| ||||| ||  ||| |||||| |  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||    
T  21391781 tatagtaagtcggtgtattactcttctgctgaggaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcagttagaacgtgatggtatcttga 21391880  T
Q  207 tgt 209  Q
    |||    
T  21391881 tgt 21391883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 21781007 - 21781209
Alignment:
Q  7 tcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgt 106  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  ||||||| |    
T  21781007 tcgtgattttgagatggatttagtttttctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattat 21781106  T
Q  107 tttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 206  Q
    | ||| ||||| ||  ||| |||||| |  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||    
T  21781107 tatagtaagtcggtgtattactcttctgctgaggaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcagttagaacgtgatggtatcttga 21781206  T
Q  207 tgt 209  Q
    |||    
T  21781207 tgt 21781209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 21786175 - 21786377
Alignment:
Q  7 tcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgt 106  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  ||||||| |    
T  21786175 tcgtgattttgagatggatttagtttttctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattat 21786274  T
Q  107 tttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 206  Q
    | ||| ||||| ||  ||| |||||| |  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||| ||||    
T  21786275 tatagtaagtcggtgtattactcttctgctgaggaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcagttagaacgtgatggtattttga 21786374  T
Q  207 tgt 209  Q
    |||    
T  21786375 tgt 21786377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22990012 - 22989804
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||| || || |||||| |||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  22990012 gtttggtcgtgattttgaaattgacttggtttgtttacctttgagtggtatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatatt 22989913  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    ||||||||||| ||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||  ||| |||| || ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |    
T  22989912 aattgttttagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtgacgcatagttcttgtctactaagcagctgaagcaattagaacgtgatggaa 22989813  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  22989812 tcttgatgt 22989804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 21253906 - 21253704
Alignment:
Q  7 tcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgt 106  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| || |||||||| ||||  |||||||||    
T  21253906 tcgtgattttgagatggatttggtttgtctacctttgagtggtatgcatgtgattcttggtatgagctggttggaatacaaccatgttcacattaattgt 21253807  T
Q  107 tttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 206  Q
    | ||| |||||  |  |||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| || ||||    
T  21253806 tatagtaagtcgctgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcagttggaacgtgatggcattttga 21253707  T
Q  207 tgt 209  Q
    |||    
T  21253706 tgt 21253704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 22421712 - 22421914
Alignment:
Q  7 tcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgt 106  Q
    ||||||||||||||| || || |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  22421712 tcgtgattttgaaattgacttggtttgtttacctttgagtggtatggatgtaattcttggcatgaactagttagtgtacaaccatgttcatattaattgt 22421811  T
Q  107 tttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 206  Q
    ||||| ||||| ||  |||||||||| |  ||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||    
T  22421812 tttagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggtaagtggcgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaattggaacgtgatggaattttga 22421911  T
Q  207 tgt 209  Q
    |||    
T  22421912 tgt 22421914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22523513 - 22523305
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  22523513 gtttggtcttgattttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggtatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatatt 22523414  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    ||||||||||| ||||  ||  |||||||||| |  ||||| |||||| | ||| |||| || ||||| ||||||||||||||| | ||| | ||||| |    
T  22523413 aattgttttagtaagttggtgtatttctcttctgctgaagaagaaagtagcgcaaagttcttgtctaccaagcagctgaagcaattagaatgtgatggaa 22523314  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    | |||||||    
T  22523313 ttttgatgt 22523305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 209
Target Start/End: Original strand, 22375277 - 22375475
Alignment:
Q  11 gattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgtttta 110  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  22375277 gattttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgtttta 22375376  T
Q  111 gcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 209  Q
    | ||||| ||  |||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||| ||||||| ||| | ||||| || || || |||||||    
T  22375377 gtaagtcggtgtatttttcttctgccgacgaggaaagtggcgcagaattcttgtctactaagtagctgaatcaattagaacgtgaaggaattttgatgt 22375475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 22246247 - 22246455
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||| |||||||||||  |||| |||||| |||| |||||||  |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  22246247 gtttggtcgagattttgaaattaatttggtttgtttacctttgagtgaaatggatgtaatccttggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatt 22246346  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    | ||||||||| |||||  |  |||| ||||| |  |||||||||||||||||| | || || ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |    
T  22246347 agttgttttagtaagtcgatgtatttttcttctgctgaagaggaaagtggtgcataattcttgtctactaagcagctgaagcaattagaacgtgatggaa 22246446  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    | |||||||    
T  22246447 ttttgatgt 22246455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 70 - 209
Target Start/End: Original strand, 21919987 - 21920126
Alignment:
Q  70 gaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctact 169  Q
    ||||||||| || || ||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||  |||||| ||| |  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  21919987 gaactggttggaatagaaccatgttcacattaattgttttagtaagtcggtgtatttcttttctgctgaagaggaaagtggcgcagagtttttgtctact 21920086  T
Q  170 aagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 209  Q
    ||||||||||||||  | ||||| || ||||| |||||||    
T  21920087 aagcagctgaagcagttagaacgtgacggtattttgatgt 21920126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 65 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23887931 - 23887787
Alignment:
Q  65 ggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttat 164  Q
    |||||||||| |||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||  ||| |  || |||| |||||    ||||| |||||||| |||||||| |||     
T  23887931 ggtatgaactagttaaagtataaccatgttcatattaattgttttaataagccgatatatttttcttctactgaagaagaaagtggagcagagttcttaa 23887832  T
Q  165 ctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 209  Q
    |||||||||||||||| ||  | || || ||||| ||||||||||    
T  23887831 ctactaagcagctgaatcagttagatcgtgatggaatcttgatgt 23887787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 22373790 - 22373705
Alignment:
Q  47 ggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttc 132  Q
    ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||    
T  22373790 ggtatggatgtaatctttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatattaattgttttagtaagacggtacatttttcttc 22373705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 65 - 198
Target Start/End: Original strand, 21323157 - 21323290
Alignment:
Q  65 ggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttat 164  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || | ||| ||||||||||||||| | || ||||| ||||| |  ||||| || ||||| ||||| ||  |||    
T  21323157 ggtatgaactggttggagtataaccatgtccatatcaattgttttagcaagacggtgcatttttcttctgcggaagaagagagtggagcagaattcctat 21323256  T
Q  165 ctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 198  Q
    |||| || ||| ||||| |  |||| ||||||||    
T  21323257 ctacgaaacagttgaagtagttggagcgcgatgg 21323290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 22053808 - 22053720
Alignment:
Q  23 gatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 111  Q
    |||||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| |||||    
T  22053808 gatttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagtataaccgggttcatatcaattgctttag 22053720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 29)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 10873580 - 10873372
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10873580 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 10873481  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10873480 aattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 10873381  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  10873380 tcttgatgt 10873372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 14335286 - 14335078
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14335286 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 14335187  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14335186 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggta 14335087  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  14335086 tcttgatgt 14335078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 44788731 - 44788939
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44788731 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 44788830  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44788831 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggta 44788930  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  44788931 tcttgatgt 44788939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 8200938 - 8200730
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8200938 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 8200839  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8200838 aattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggta 8200739  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  8200738 tcttgatgt 8200730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 8710495 - 8710287
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8710495 gtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 8710396  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8710395 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggta 8710296  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  8710295 tcttgatgt 8710287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 18587551 - 18587759
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18587551 gtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaatcacgttcttatt 18587650  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18587651 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggta 18587750  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  18587751 tcttgatgt 18587759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 11234593 - 11234801
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11234593 gtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 11234692  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11234693 aattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggta 11234792  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  11234793 tcttgatgt 11234801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 13688931 - 13688723
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13688931 gtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 13688832  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13688831 aattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcggagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggta 13688732  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  13688731 tcttgatgt 13688723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18180633 - 18180427
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  18180633 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttctcatc 18180534  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18180533 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagag--tttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggta 18180436  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  18180435 tcttgatgt 18180427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 15158437 - 15158645
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15158437 gtttggtcgtgatttcaaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 15158536  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15158537 aattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcggagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggta 15158636  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  15158637 tcttgatgt 15158645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 11550482 - 11550690
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  11550482 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttggagtacaaccatgttcatatt 11550581  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  11550582 aattgttttagcaagtcagtgtattcctcttccgccgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctactaagcagctgaagcaaatggaacgtgatggta 11550681  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    | |||||||    
T  11550682 ttttgatgt 11550690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 14957444 - 14957236
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  14957444 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattttgggtatgaattggttggagtacaaccatgttcatatt 14957345  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  14957344 aattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgccgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctactaagcagctgaagcaaatggaacgtgatggta 14957245  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    | |||||||    
T  14957244 ttttgatgt 14957236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 17703835 - 17704043
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||     
T  17703835 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagaatacaaccatgttcatatc 17703934  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  17703935 aattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgctgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctactaagaagctgaagcaaatggaacgcgatggta 17704034  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    | |||||||    
T  17704035 ttttgatgt 17704043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12690392 - 12690184
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||| ||||    
T  12690392 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttggagtacaagcatgttcatatt 12690293  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  12690292 aattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgccgaagaagaatgtggtgcagagttcttatctactaagcagctgaagcaaatggaacgtgatggta 12690193  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    | |||||||    
T  12690192 ttttgatgt 12690184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 9591254 - 9591050
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||    ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || | |||     
T  9591254 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagttt----acctttgagcggtatggatgtgattctaggtatgaattggttagagtacaaccatgtacatatc 9591159  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9591158 aattgttttagcaagtcaatgtatttctcttccgctgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctactaagcagctgaagcaaatggaacgcgatggta 9591059  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    | |||||||    
T  9591058 ttttgatgt 9591050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 47 - 209
Target Start/End: Original strand, 14149862 - 14150024
Alignment:
Q  47 ggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaa 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||||  ||||||||||    
T  14149862 ggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccattttcatatcaattgttttagcaagtgagtgtatttctcttccgctgaagaggaaa 14149961  T
Q  147 gtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  14149962 gtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggagcgcgatggtattttgatgt 14150024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 83 - 209
Target Start/End: Original strand, 16726845 - 16726971
Alignment:
Q  83 tacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagc 182  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  16726845 tacaaccatgttcatatcaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgctgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctactaagaagctgaagc 16726944  T
Q  183 aactggaacgcgatggtatcttgatgt 209  Q
    || |||||||||||||||| |||||||    
T  16726945 aaatggaacgcgatggtattttgatgt 16726971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 14042576 - 14042402
Alignment:
Q  10 tgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgtttt 109  Q
    |||||||||||| || || |||||| |||| || |||||||||||||| || |   | |||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||| ||||    
T  14042576 tgattttgaaattgacttggtttgtttaccttttagtggtatggatgtaatccctagcatgaactggttagaatacaaccatgttcacattaattttttt 14042477  T
Q  110 agcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaa 184  Q
    || ||||| ||  |||||||||| |  ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  14042476 agtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaagaaagtggcgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaa 14042402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 14352606 - 14352432
Alignment:
Q  10 tgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgtttt 109  Q
    |||||||||||| || || |||||| |||| || |||||||||||||| || |   | |||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||| ||||    
T  14352606 tgattttgaaattgacttggtttgtttaccttttagtggtatggatgtaatccctagcatgaactggttagaatacaaccatgttcacattaattttttt 14352507  T
Q  110 agcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaa 184  Q
    || ||||| ||  |||||||||| |  ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  14352506 agtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaagaaagtggcgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaa 14352432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 15627414 - 15627233
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||| || |||||||| |||||||||||| | |  |||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||    
T  15627414 gtttggtcgagactttgaaattgatttagtttgtttgcatttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttggagtataaccatgttcatatt 15627315  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagc 182  Q
    ||||||||||  ||||| ||  |||| ||||| |  ||||| || ||||| || ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  15627314 aattgttttaataagtcggtgtatttttcttctgcggaagaagagagtggagcggagttcttaactactaagcagctgaagc 15627233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 108
Target Start/End: Original strand, 15146312 - 15146410
Alignment:
Q  10 tgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttt 108  Q
    ||||||||| || ||| | |||||| |||| ||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  15146312 tgattttgagattgatatggtttgtttacctttgagtggtatggatgtaatagttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcacattaattgttt 15146410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 201
Target Start/End: Original strand, 15146416 - 15146464
Alignment:
Q  153 cagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtat 201  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15146416 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtat 15146464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 183
Target Start/End: Original strand, 15099987 - 15100143
Alignment:
Q  27 tagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacattt 126  Q
    |||||||| |||| ||||  ||||||||||||||| | || ||||||| ||||||||| ||||  |||| ||| ||||| |||| |||| | || |||||    
T  15099987 tagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtgatttttgggatgaactagttagagtataaccgagttcatatcaattgctttaacaagacggtgcattt 15100086  T
Q  127 ctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagca 183  Q
     ||||| |  ||||| || ||||| || |||||  |||||||||| ||| |||||||    
T  15100087 ttcttctgctgaagaagagagtggagctgagttcctatctactaaacagttgaagca 15100143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 50 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 13676293 - 13676184
Alignment:
Q  50 atggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtg 149  Q
    |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| ||||||||| | || ||||| ||||| |  ||||| || ||||    
T  13676293 atggatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagcaagacggtgcatttttcttctgcggaagaagagagtg 13676194  T
Q  150 gtgcagagtt 159  Q
    | ||||||||    
T  13676193 gagcagagtt 13676184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 47 - 132
Target Start/End: Original strand, 14261649 - 14261734
Alignment:
Q  47 ggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttc 132  Q
    ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||   ||| ||||||||| ||||| ||| | || ||||| |||||    
T  14261649 ggtatggatgtgatttttgggatgaactggttagagtataaccgtattcatattaattgctttagtaagacggtgcatttttcttc 14261734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 47 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 19149856 - 19149771
Alignment:
Q  47 ggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttc 132  Q
    ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||| ||||| ||| |  ||||||| |||||    
T  19149856 ggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatattaattgctttagtaagacgatacatttttcttc 19149771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 47 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 20749255 - 20749170
Alignment:
Q  47 ggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttc 132  Q
    ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||| ||||| ||| |  ||||||| |||||    
T  20749255 ggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatattaattgctttagtaagacgatacatttttcttc 20749170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 23 - 132
Target Start/End: Original strand, 26092178 - 26092287
Alignment:
Q  23 gatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtac 122  Q
    |||||||||||||| || ||||  ||||||||||| ||  | |||||||| ||||||||||| || |  |||| ||| || || ||||| ||| | ||||    
T  26092178 gatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagtataatcgagttcatatcaactgctttagtaagacggtac 26092277  T
Q  123 atttctcttc 132  Q
    ||||||||||    
T  26092278 atttctcttc 26092287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 183
Target Start/End: Original strand, 18051321 - 18051493
Alignment:
Q  11 gattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgtttta 110  Q
    ||||||||| | |||||||| ||| |||| ||||  || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| ||||    
T  18051321 gattttgaagtagatttagtgtgtttaccgttgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgcttta 18051420  T
Q  111 gcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagca 183  Q
     |||| | || ||||| ||||| |  ||||| || ||||| |  ||  |||||||||| |||||| |||||||    
T  18051421 acaagactgtgcatttttcttctgctgaagaagagagtggagttgaaattttatctacaaagcagatgaagca 18051493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 31)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 28312395 - 28312187
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28312395 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaatcacgttcttatt 28312296  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28312295 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 28312196  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  28312195 tcttgatgt 28312187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 25115317 - 25115109
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25115317 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 25115218  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25115217 aattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaggaggaaagtggtgcaaagtttttatccactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 25115118  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  25115117 tcttgatgt 25115109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 29589955 - 29590163
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29589955 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 29590054  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29590055 aattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggta 29590154  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  29590155 tcttgatgt 29590163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 6 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 27190196 - 27189993
Alignment:
Q  6 gtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattg 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27190196 gtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaatcacgttcttattaattg 27190097  T
Q  106 ttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27190096 ttttagcaagtcagtacatttctcttctgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttg 27189997  T
Q  206 atgt 209  Q
    ||||    
T  27189996 atgt 27189993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 6 - 209
Target Start/End: Original strand, 27259044 - 27259247
Alignment:
Q  6 gtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattg 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27259044 gtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaatcacgttcttattaattg 27259143  T
Q  106 ttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27259144 ttttagcaagtcagtacatttctcttctgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttg 27259243  T
Q  206 atgt 209  Q
    ||||    
T  27259244 atgt 27259247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 28260713 - 28260921
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  28260713 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttaaagtacaatcacgttcttatt 28260812  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28260813 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgata 28260912  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  28260913 tcttgatgt 28260921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 28285203 - 28284995
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  28285203 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttaaagtacaatcacgttcttatt 28285104  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28285103 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgata 28285004  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  28285003 tcttgatgt 28284995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 28339462 - 28339670
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  28339462 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttaaagtacaatcacgttcttatt 28339561  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28339562 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgata 28339661  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  28339662 tcttgatgt 28339670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 2872318 - 2872527
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2872318 gtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 2872417  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagag-tttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggt 199  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  2872418 aattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttttatctactaagcagctgaagcaactagaacgcgacggt 2872517  T
Q  200 atcttgatgt 209  Q
    ||||||||||    
T  2872518 atcttgatgt 2872527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 173; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 22827871 - 22828079
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  22827871 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattgcttagagtacaaccacgttcttatt 22827970  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  22827971 aattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgaagagtttttatctactaagcaggtgaagcaactggaacgcgatgata 22828070  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  22828071 tcttgatgt 22828079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 169; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16574655 - 16574447
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16574655 gtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgcctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgtccttatt 16574556  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  16574555 aattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcggagtttttatctactaagcagctgaagcaactgaaacgcgacggta 16574456  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  16574455 tcttgatgt 16574447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 169; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 16620725 - 16620933
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16620725 gtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgcctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgtccttatt 16620824  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  16620825 aattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcggagtttttatctactaagcagctgaagcaactgaaacgcgacggta 16620924  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  16620925 tcttgatgt 16620933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 24293298 - 24293506
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24293298 gtttggtcgtgatttcaaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 24293397  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||    
T  24293398 agttgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcggagtttttatctactaagcagctgatgcaactggaacgtgacggta 24293497  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  24293498 tcttgatgt 24293506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 27559485 - 27559693
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||     
T  27559485 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacttttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatc 27559584  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27559585 aattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcaaagttcttatctactaagcaggtgaagcaactggaacgcgatggta 27559684  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    | |||||||    
T  27559685 ttttgatgt 27559693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 5836744 - 5836952
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||| || |||| ||||    
T  5836744 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctccctttgagcggtatggatgttattcttggtaggaattggttagagtacaatcatgttcatatt 5836843  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    ||||||  ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5836844 aattgtgctagcaagtcagtgtatttctcttcagtcgaagaggaaagtggtgcagaattcttatctactaaacagctgaagcaactggaacgcgatggta 5836943  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    | |||||||    
T  5836944 ttttgatgt 5836952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 16925156 - 16925364
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| || || || |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||     
T  16925156 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtttgcctttgagtggtatggacgtcatccttggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatc 16925255  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  16925256 aattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccatcgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctactaagcagctgaagcaaatgtagcgcgatggta 16925355  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    | |||||||    
T  16925356 ttttgatgt 16925364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 19867452 - 19867244
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  |||    
T  19867452 gtttggtcgtgatttcgagatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacatt 19867353  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  19867352 aattgttttagcaagtcagtgtatttctcctccgtcgaagaggaaagtggtgtagagttcttgtctaccaagcagctgaaacaactagaacgcgatggta 19867253  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    | |||||||    
T  19867252 ttttgatgt 19867244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22436634 - 22436426
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| ||||||||||||| || ||| | |||||  | || |||||||||||||  || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  22436634 gtttggtcgtgattttgagattgatatggtttgcttgcctttgagtggtatgggcgtcattcttggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatt 22436535  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22436534 aattgttttagcaagtcagtgtatttctctttcgtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttgtctaccaagcagctgaagcaactggaacgtgatggta 22436435  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    | |||||||    
T  22436434 ttttgatgt 22436426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Original strand, 18405468 - 18405660
Alignment:
Q  9 gtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttt 108  Q
    |||||||||||||  |||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||    
T  18405468 gtgattttgaaattaatttggtttgtctgcctttgagtggtatggatgtaattcttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcacattacttgttt 18405567  T
Q  109 tagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtat 201  Q
    ||| || |||||  |||||||||| |  |||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||||||    
T  18405568 tagtaaatcagtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcaaagtttttgtctaccaagcagctgaagcagttagaacgtgatggtat 18405660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 86 - 209
Target Start/End: Original strand, 16961082 - 16961206
Alignment:
Q  86 aaccacgttcttat-taattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaa 184  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16961082 aaccatgttcttatctaatagttttagcaagtcagtgtatttctcctcagtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctactaagcagctgaagcaa 16961181  T
Q  185 ctggaacgcgatggtatcttgatgt 209  Q
    |||||||| |||||||| |||||||    
T  16961182 ctggaacgtgatggtatattgatgt 16961206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 20135729 - 20135531
Alignment:
Q  11 gattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgtttta 110  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||| |||||||| || || |||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  20135729 gattttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatggactagttagagtacaaccatgttcatattaattgtttta 20135630  T
Q  111 gcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 209  Q
    | ||||||||  | || ||||  |  ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||  ||||| || |||||||    
T  20135629 gtaagtcagtgtacttttcttttgctgaagaagaaagtggagcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaattagaacatgatggaattttgatgt 20135531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 209
Target Start/End: Original strand, 22197140 - 22197338
Alignment:
Q  11 gattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgtttta 110  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||| |||||||| || || |||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  22197140 gattttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatggactagttagagtacaaccatgttcatattaattgtttta 22197239  T
Q  111 gcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 209  Q
    | ||||||||  | || ||||  |  ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||  ||||| || |||||||    
T  22197240 gtaagtcagtgtacttttcttttgctgaagaagaaagtggagcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaattagaacatgatggaattttgatgt 22197338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23081182 - 23080980
Alignment:
Q  7 tcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgt 106  Q
    |||||||| |||||| || || |||||| |||| |||| |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  23081182 tcgtgattatgaaattgacttggtttgtttacctttgattggtatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaatcatgttcatattaattgt 23081083  T
Q  107 tttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 206  Q
    ||||| ||||| ||  ||||||||||    |||||||||||||| ||| | ||||  ||||| |||||| |||||||| | ||||| ||||| || ||||    
T  23081082 tttagtaagtcggtgtatttctcttcttctgaagaggaaagtggcgcaaaattttggtctaccaagcagttgaagcaattagaacgtgatggaattttga 23080983  T
Q  207 tgt 209  Q
    |||    
T  23080982 tgt 23080980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 30 - 209
Target Start/End: Original strand, 18182912 - 18183091
Alignment:
Q  30 tttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctc 129  Q
    ||||| |||| ||| |||| |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||  | || ||    
T  18182912 tttgtttacctttgtgtggaatggatgtaatccttggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattaattattttagtaagtcagtgtacttttc 18183011  T
Q  130 ttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 209  Q
    ||| |  ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||| | | ||| ||||| || |||||||    
T  18183012 ttctgctgaagaagaaagtggagcagagttcttgtctactaagtagctgaagcaattaggacgtgatggaattttgatgt 18183091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 19455763 - 19455606
Alignment:
Q  26 ttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatt 125  Q
    ||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| ||||||||| | || ||||    
T  19455763 ttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagcaagacggtgcatt 19455664  T
Q  126 tctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagca 183  Q
    | |||||     |||| || ||||| ||||||||  |||||||||| ||| |||||||    
T  19455663 tttcttcttcttaagaagagagtggagcagagttcctatctactaaacagttgaagca 19455606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 19437742 - 19437570
Alignment:
Q  26 ttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatt 125  Q
    ||||||||| | || |||| |||||||||||| ||| | || ||||||| ||||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||||||| | || ||||    
T  19437742 ttagtttgttttcctttgactggtatggatgttatttttgggatgaacttgttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagcaagacggtgcatt 19437643  T
Q  126 tctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 198  Q
    | ||||| || ||||| ||  |||| ||| | ||  || ||||||| ||| |||||||  |||| ||||||||    
T  19437642 tttcttctgtggaagaagagggtggagcaaaattcctaactactaaacagttgaagcagttggagcgcgatgg 19437570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Original strand, 30678540 - 30678650
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||| || |||||| | |||||||| ||| | || |||||||| |||||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||  |||    
T  30678540 gtttggtcgagactttgaagttgatttagtctgttttcctttgagtggaatggatgtaatacttggtatgaattggttggagtataaccatgttcacatt 30678639  T
Q  101 aattgttttag 111  Q
    |||||||||||    
T  30678640 aattgttttag 30678650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 21474319 - 21474234
Alignment:
Q  47 ggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttc 132  Q
    ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||    
T  21474319 ggtatggatgtaatctttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatattaattgttttagtaagacggtacatttttcttc 21474234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 15462034 - 15461904
Alignment:
Q  68 atgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatcta 167  Q
    ||||| |||||||| || ||||  |||  |||||||||||||| |||| | || ||||| |||||  | ||||| || ||||| ||||||||| || |||    
T  15462034 atgaattggttagaatataaccgagtttgtattaattgttttaacaagacggtgcatttttcttctatggaagaagagagtggagcagagtttctaacta 15461935  T
Q  168 ctaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 198  Q
    |||| ||| |||||||  ||||||| |||||    
T  15461934 ctaaacagttgaagcagttggaacgagatgg 15461904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 47 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 25770563 - 25770478
Alignment:
Q  47 ggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttc 132  Q
    ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||| |||||| ||| || ||||||| |||||    
T  25770563 ggtatggatgtaatctttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatattaattattttagtaagacaatacatttttcttc 25770478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 68 - 132
Target Start/End: Original strand, 24515997 - 24516061
Alignment:
Q  68 atgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttc 132  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||||||| | || ||||| |||||    
T  24515997 atgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagcaagacggtgcatttttcttc 24516061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 29)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12479501 - 12479293
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12479501 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 12479402  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12479401 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggta 12479302  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  12479301 tcttgatgt 12479293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 16234103 - 16234311
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16234103 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 16234202  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16234203 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggta 16234302  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  16234303 tcttgatgt 16234311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 17092260 - 17092468
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17092260 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 17092359  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17092360 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggta 17092459  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  17092460 tcttgatgt 17092468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 8389313 - 8389105
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8389313 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggaatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 8389214  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8389213 aattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggta 8389114  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  8389113 tcttgatgt 8389105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 19775904 - 19776112
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19775904 gtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 19776003  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  19776004 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacagta 19776103  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  19776104 tcttgatgt 19776112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23958648 - 23958440
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23958648 gtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 23958549  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23958548 aattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggta 23958449  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  23958448 tcttgatgt 23958440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 27714237 - 27714029
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27714237 gtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 27714138  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27714137 aattgttttagcaagtcagtatatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggta 27714038  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  27714037 tcttgatgt 27714029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 184; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 6 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 19635032 - 19634829
Alignment:
Q  6 gtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattg 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19635032 gtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattg 19634933  T
Q  106 ttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttg 205  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19634932 ttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcaaagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttg 19634833  T
Q  206 atgt 209  Q
    ||||    
T  19634832 atgt 19634829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 8050734 - 8050942
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8050734 gtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 8050833  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  8050834 aattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacacgacggta 8050933  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  8050934 tcttgatgt 8050942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 40475941 - 40475733
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40475941 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 40475842  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40475841 aattgttatagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttgtatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggta 40475742  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  40475741 tcttgatgt 40475733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 6 - 209
Target Start/End: Original strand, 14301095 - 14301298
Alignment:
Q  6 gtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattg 105  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14301095 gtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattg 14301194  T
Q  106 ttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttg 205  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14301195 ttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcggagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttg 14301294  T
Q  206 atgt 209  Q
    ||||    
T  14301295 atgt 14301298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 18224557 - 18224765
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||      
T  18224557 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgttattttgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcataac 18224656  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18224657 aattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgttgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctactaagcagctgaagcaaatggaacgcgatggta 18224756  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    | |||||||    
T  18224757 ttttgatgt 18224765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 14683468 - 14683260
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  14683468 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcagtatggatgtgattctgggaatgaattggttggagtacaaccatgttcatatt 14683369  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  14683368 aattgttttagcatgtcagtgtatttctcttccgccgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctactaagcagctgaagcaaatggaacgtgatggta 14683269  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    | |||||||    
T  14683268 ttttgatgt 14683260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 16250961 - 16251169
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||     
T  16250961 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtataaattggttagagtacaaccatgttcatatc 16251060  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||    
T  16251061 aattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgctgaagaggaaagtggtgcagagttcttaactactaaatagctgaagcaaatggaacgtgatggta 16251160  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    | |||||||    
T  16251161 ttttgatgt 16251169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 15145003 - 15145212
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||||  |||    
T  15145003 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttaagcggtatggatgtgat-ctgggtataaactggttggaatacaaccatgttcacatt 15145101  T
Q  101 aattgttttag-caagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagt-ggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 198  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15145102 aattgttttagtcaagtcagtgtatttctcctccgtcgaagaggaaagtaggtgcagagttcttgtctaccaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 15145201  T
Q  199 tatcttgatgt 209  Q
    ||| |||||||    
T  15145202 tattttgatgt 15145212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 57 - 209
Target Start/End: Original strand, 16352697 - 16352849
Alignment:
Q  57 tgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcaga 156  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16352697 tgattcttggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcaga 16352796  T
Q  157 gtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 209  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16352797 gttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtattttgatgt 16352849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 14162365 - 14162163
Alignment:
Q  7 tcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgt 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14162365 tcgtgattttgaaatggatttagtttgtttacctttgagtggaatggatgtgattcttggcatgaactggttagagtacaaccatgttcttattaattgt 14162266  T
Q  107 tttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 206  Q
    ||||||||||| ||    ||||| || || ||||| ||||| || | |||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||    
T  14162265 tttagcaagtcggtgtccttctcctctgttgaagaagaaagcggagtagagttcttgtctaccaagcaactgaagcaactagaacgtgatggaattttga 14162166  T
Q  207 tgt 209  Q
    |||    
T  14162165 tgt 14162163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 14697002 - 14696794
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  14697002 gtttggtcgagattttgaaattgatttagtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatatt 14696903  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||| ||||| |  |||||||||||||| ||| | || || ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |    
T  14696902 aattgttttagtaagtcagtgtatttttcttctgctgaagaggaaagtggcgcaaaattcttttctactaagcagctgaagcaattagaacgtgatggaa 14696803  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    | |||||||    
T  14696802 ttttgatgt 14696794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16219131 - 16218923
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  16219131 gtttggtcgtgattttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatatt 16219032  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    ||||| ||||| ||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||| |||||||| || ||||  ||||||||||||||| | ||||| ||||| |    
T  16219031 aattggtttagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagttcttgtctatcaagcagctgaagcaattagaacgtgatggaa 16218932  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    | |||||||    
T  16218931 ttttgatgt 16218923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16222451 - 16222243
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  16222451 gtttggtcgtgattttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatatt 16222352  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    ||||| ||||| ||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||| |||||||| || ||||  ||||||||||||||| | ||||| ||||| |    
T  16222351 aattggtttagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagttcttgtctatcaagcagctgaagcaattagaacgtgatggaa 16222252  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    | |||||||    
T  16222251 ttttgatgt 16222243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 14188401 - 14188199
Alignment:
Q  7 tcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgt 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||    
T  14188401 tcgtgattttgaaatggatttagtttgtttacctttgagtggaatgaatgtgattcttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcttatcaactgt 14188302  T
Q  107 tttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 206  Q
    |||||||| || ||    | ||| || |  ||||| |||||||| |  ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||    
T  14188301 tttagcaattcggtgtcctcctcctctgctgaagaagaaagtggagtggagttcttgtctactaagcagctgaagcaactagaacgagatggaattttga 14188202  T
Q  207 tgt 209  Q
    |||    
T  14188201 tgt 14188199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 16152 - 16354
Alignment:
Q  7 tcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgt 106  Q
    |||||||||  |||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||    
T  16152 tcgtgatttctaaattgatttggtttgtttacctttgagtggtatggatgtaatccttggtatgaactggttaaagtacaaccatgttcacattaattgt 16251  T
Q  107 tttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 206  Q
    ||||| ||||| ||  ||||| |||| |  |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||  | ||||| |||||||| ||||    
T  16252 tttagtaagtcggtgtatttcccttctgctgaagaggaaagtggcgcaaagtttttgtctactaaacagctgaagcagttagaacgtgatggtattttga 16351  T
Q  207 tgt 209  Q
    |||    
T  16352 tgt 16354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 74 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22632528 - 22632393
Alignment:
Q  74 tggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagc 173  Q
    ||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||| || || ||  |||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  22632528 tggttggagtataaccatgttcatattaattgttttagtaaatcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagtttttgtctactaagc 22632429  T
Q  174 agctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 209  Q
    || |||||||  | ||||| |||||||| |||||||    
T  22632428 agttgaagcagttagaacgtgatggtattttgatgt 22632393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 68 - 209
Target Start/End: Original strand, 14848543 - 14848684
Alignment:
Q  68 atgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatcta 167  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||  || || ||  |||| ||||| |  |||||||||||||| ||| |  | || ||||    
T  14848543 atgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattattttattaaatcggtgtatttttcttctgctgaagaggaaagtggcgcaaaactcttgtcta 14848642  T
Q  168 ctaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 209  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| ||||| || |||||||    
T  14848643 ctaagcagctgaagcaattagaacgtgatggaattttgatgt 14848684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 6 - 61
Target Start/End: Original strand, 16350670 - 16350725
Alignment:
Q  6 gtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgatt 61  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  16350670 gtcgtgatttcgaaatggatctagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgatt 16350725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 15073214 - 15073129
Alignment:
Q  47 ggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttc 132  Q
    ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||    
T  15073214 ggtatggatgtaatctttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatattaattgttttagtaagacggtacatttttcttc 15073129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 84
Target Start/End: Original strand, 29450930 - 29450991
Alignment:
Q  23 gatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 84  Q
    |||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  29450930 gatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgtgatttttggtatgaattggttagagta 29450991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 132
Target Start/End: Original strand, 14993766 - 14993869
Alignment:
Q  29 gtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttct 128  Q
    |||||| |||| ||||  |||||| |||||||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||| ||||| ||| | || ||||| |    
T  14993766 gtttgtttaccgttgacgggtatgcatgtgatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatattaattgctttagtaagacggtgcattttt 14993865  T
Q  129 cttc 132  Q
    ||||    
T  14993866 cttc 14993869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 23 - 132
Target Start/End: Original strand, 3262187 - 3262296
Alignment:
Q  23 gatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtac 122  Q
    |||||||||||||| || ||||  ||||||||||| ||  | |||||||| ||||||||||| || |  |||| ||| || || ||||| ||| | ||||    
T  3262187 gatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagtataatcgagttcatatcaactgctttagtaagacggtac 3262286  T
Q  123 atttctcttc 132  Q
    ||||||||||    
T  3262287 atttctcttc 3262296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 49)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 3688463 - 3688255
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3688463 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttacagtacaaccacgttcttatt 3688364  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3688363 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 3688264  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  3688263 tcttgatgt 3688255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 5422540 - 5422748
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5422540 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 5422639  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5422640 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggta 5422739  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  5422740 tcttgatgt 5422748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12889229 - 12889021
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12889229 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 12889130  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12889129 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggta 12889030  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  12889029 tcttgatgt 12889021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 13255210 - 13255002
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13255210 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 13255111  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13255110 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggta 13255011  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  13255010 tcttgatgt 13255002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 20059664 - 20059872
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20059664 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 20059763  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20059764 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggta 20059863  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  20059864 tcttgatgt 20059872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16638293 - 16638085
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16638293 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 16638194  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16638193 aattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggta 16638094  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  16638093 tcttgatgt 16638085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 16754311 - 16754519
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16754311 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaatcacgttcttatt 16754410  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16754411 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaggaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 16754510  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  16754511 tcttgatgt 16754519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 43165195 - 43164987
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43165195 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 43165096  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43165095 aattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggta 43164996  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  43164995 tcttgatgt 43164987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 48427967 - 48427759
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48427967 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 48427868  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48427867 aattattttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggta 48427768  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  48427767 tcttgatgt 48427759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 15587002 - 15587210
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15587002 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgaatggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaatcacgttcttatt 15587101  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15587102 aattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggta 15587201  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  15587202 tcttgatgt 15587210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 26791023 - 26791231
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26791023 gtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 26791122  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26791123 aattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggta 26791222  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  26791223 tcttgatgt 26791231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 15345855 - 15346063
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15345855 gtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtaaggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 15345954  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  15345955 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactgaaacgcgacggta 15346054  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  15346055 tcttgatgt 15346063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 15713666 - 15713874
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15713666 gtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 15713765  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  15713766 aattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacgata 15713865  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  15713866 tcttgatgt 15713874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 6603255 - 6603048
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  6603255 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggtt-gagtacaatcacgttcttatt 6603157  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6603156 aattgttttagcaagtcaatacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 6603057  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    | |||||||    
T  6603056 ttttgatgt 6603048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 10908730 - 10908522
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10908730 gtttggtcgtcatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 10908631  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10908630 aattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggta 10908531  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  10908530 tcttgatgt 10908522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 53382628 - 53382836
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  53382628 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttggagtacaatcacgttcttatt 53382727  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  53382728 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctaccaaacagctgaagcaactggaacgcgatggta 53382827  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  53382828 tcttgatgt 53382836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 195
Target Start/End: Original strand, 26190937 - 26191120
Alignment:
Q  12 attttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26190937 attttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctaggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 26191036  T
Q  112 caagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcga 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26191037 caagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcga 26191120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 173; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 10008120 - 10007912
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10008120 gtttggtcgcgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 10008021  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  10008020 aattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcaactgaagcaactggaacgcgacggta 10007921  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  10007920 tcttgatgt 10007912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 169; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 15400127 - 15400335
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15400127 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctgcctttgagcggtatggatgtaattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 15400226  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15400227 aattgttttagtaagtcagtgcatttttcttccgtcgaagagaagagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 15400326  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  15400327 tcttgatgt 15400335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15358603 - 15358395
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  15358603 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctgcctttgagcggtatggatgtaattctgggtatgaactagttagagtgcaaccacgttcttatt 15358504  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15358503 aattgttttagcaagtcagtgcatttttcttccgtcgaagaggagagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacacgatggta 15358404  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  15358403 tcttgatgt 15358395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 16804557 - 16804765
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||     
T  16804557 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatc 16804656  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    |||| ||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16804657 aattattttaccaagtcagtgtatttctcttccgttgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaaatggaacgcgatggta 16804756  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    | |||||||    
T  16804757 ttttgatgt 16804765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 24185710 - 24185502
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  24185710 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttggagtacaaccatgttcatatt 24185611  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  24185610 aattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgccgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctactaagcagctgaagcaaatggaacgtgatggta 24185511  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    | |||||||    
T  24185510 ttttgatgt 24185502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 15065591 - 15065400
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||     
T  15065591 gtttggtcgtgattttgagatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattcttggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatc 15065492  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacg 192  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15065491 aattgttttagaaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctaccaagcagctgaagcaactggaacg 15065400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16694684 - 16694476
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||     
T  16694684 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtttggatttaattatgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatc 16694585  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16694584 aattgttttagcaagtcaatgtatttctcttccgctgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctactaagcagctgaagcaaatggaacgcgatggta 16694485  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    | |||||||    
T  16694484 ttttgatgt 16694476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 14874178 - 14874386
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||    
T  14874178 gtttggtcgtgattttgagatggatttagtttgtctacctttgagcggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttcgagtagaaccatgttcatatt 14874277  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14874278 aattattttagcaagtcagtgtatttctcctcagtcgaagaggaaattggtgcagagttcttgtttactaagcagctgaagcaactggaacgtgatggta 14874377  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    | |||||||    
T  14874378 tattgatgt 14874386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Original strand, 14579024 - 14579200
Alignment:
Q  7 tcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgt 106  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  14579024 tcgtgattttgaaattgatttggtttgtttgcctttgagtggtatggatgtgattctaggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgt 14579123  T
Q  107 tttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagca 183  Q
    ||||| ||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14579124 tttagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagaatttttatctactaagcagctgaagca 14579200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 17492365 - 17492163
Alignment:
Q  7 tcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgt 106  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  17492365 tcgtgattttgagattgatttggtttgtctacctttgagtggtatggatgtaattcttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcacattaattgt 17492266  T
Q  107 tttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 206  Q
    ||||| || || ||  |||||||||| |  |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||| ||||    
T  17492265 tttagtaaatctgtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcggagtttttgtctactaagcagctgaagcagttagaacgtgatggtattttga 17492166  T
Q  207 tgt 209  Q
    |||    
T  17492165 tgt 17492163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15262150 - 15261942
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||| |||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  15262150 gtttggtcgagattttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtgtgaactggttagagtacaaccatgttcatatt 15262051  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||| |||||    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |    
T  15262050 aattgttttagtaagtcagtgtatttttcttctactgaagaagaaagtggcgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaattagaacgtgatggaa 15261951  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    | |||||||    
T  15261950 ttttgatgt 15261942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 12843719 - 12843921
Alignment:
Q  7 tcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgt 106  Q
    ||||||||||||||| || || |||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  12843719 tcgtgattttgaaattgacttggtttgtttacctttgagtggtatggatgtaatcctgggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgt 12843818  T
Q  107 tttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 206  Q
    ||||| ||||| ||  |||||||||  |  |||||||||||||| ||| | || || ||||||||||||| ||||||  | ||||| ||||| || ||||    
T  12843819 tttagtaagtcggtgtatttctcttatgctgaagaggaaagtggcgcataattcttgtctactaagcagcagaagcagttagaacgtgatggaattttga 12843918  T
Q  207 tgt 209  Q
    |||    
T  12843919 tgt 12843921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 65 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18437596 - 18437452
Alignment:
Q  65 ggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttat 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||| ||  |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18437596 ggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatagtaattgttttagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggtgcagagtttttat 18437497  T
Q  165 ctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 209  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| ||||    
T  18437496 ctactaagcagctgaagcagttagaacgtgatggaatcttaatgt 18437452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 50 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 31941384 - 31941236
Alignment:
Q  50 atggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtg 149  Q
    |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |  ||||| || ||||    
T  31941384 atggatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatataaattgttttagcaagacagtgcatttttcttctgcggaagaagagagtg 31941285  T
Q  150 gtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 198  Q
    | ||||| ||  || ||||||| ||| |||||||| |||| ||||||||    
T  31941284 gagcagaattcctaactactaaacagttgaagcaattggagcgcgatgg 31941236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 47126464 - 47126343
Alignment:
Q  11 gattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgtttta 110  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| || |  |||| ||| || || ||||    
T  47126464 gattttgtaattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgtgatttttggtatgaattggttagagtataatcgagttcatatcaactgcttta 47126365  T
Q  111 gcaagtcagtacatttctcttc 132  Q
    | ||| | ||||||||||||||    
T  47126364 gtaagacggtacatttctcttc 47126343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 10408476 - 10408367
Alignment:
Q  23 gatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtac 122  Q
    |||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| || |  |||| ||| || || ||||| ||| | ||||    
T  10408476 gatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgtgatttttggtatgaattggttagagtataatcgggttcatatcaactgctttagtaagacggtac 10408377  T
Q  123 atttctcttc 132  Q
    ||||||||||    
T  10408376 atttctcttc 10408367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 132
Target Start/End: Original strand, 12858140 - 12858225
Alignment:
Q  47 ggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttc 132  Q
    ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  12858140 ggtatggatgtaatctttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatattaattgttttagtaagacggtacatttctcttc 12858225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 47 - 111
Target Start/End: Original strand, 14291177 - 14291241
Alignment:
Q  47 ggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 111  Q
    ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||    
T  14291177 ggtatggatgtgatttttgggatgaactggttagagtataaccatgttcatattaattgctttag 14291241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 50 - 198
Target Start/End: Original strand, 31692833 - 31692981
Alignment:
Q  50 atggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtg 149  Q
    |||||||| ||| | || |||||||| |||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||||||| | || ||||| ||||| |  ||||| || ||||    
T  31692833 atggatgttatttttgggatgaactgattagagtataaccgagttcatatcaattgttttagcaagacggtgcatttttcttctgcggaagaagagagtg 31692932  T
Q  150 gtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 198  Q
     |||||| ||  || ||||||| ||| |||||||| |||| ||||||||    
T  31692933 ttgcagaattcctaactactaaacagttgaagcaattggagcgcgatgg 31692981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 12272855 - 12272737
Alignment:
Q  14 tttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagca 113  Q
    |||||| | ||| |||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| |||||||    
T  12272855 tttgaagtcgatctagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagca 12272756  T
Q  114 agtcagtacatttctcttc 132  Q
    || | || ||||| |||||    
T  12272755 agacggtgcatttttcttc 12272737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 209
Target Start/End: Original strand, 11888027 - 11888172
Alignment:
Q  65 ggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttct-cttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttta 163  Q
    |||| ||||| ||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||  || || ||| |||| | |||| || ||||| || ||||| |||||||||||     
T  11888027 ggtaagaactagttggagtataaccatgttcatattaattgttttaataaatcggtatattttttcttctgttgaagaagagagtggagcagagtttttg 11888126  T
Q  164 tctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 209  Q
     |||||||||||||||| ||  | || || ||||| ||||||||||    
T  11888127 actactaagcagctgaaacagttagagcgggatggaatcttgatgt 11888172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 183
Target Start/End: Original strand, 11949532 - 11949689
Alignment:
Q  26 ttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatt 125  Q
    ||||||||| |||| ||||  || |||||||| ||| | |  ||||||||||| ||||| ||||  |||| ||| ||||||||||||||| | || ||||    
T  11949532 ttagtttgtttaccgttgatgggaatggatgttatttttgcgatgaactggttcgagtataaccgagttcatatcaattgttttagcaagacggtgcatt 11949631  T
Q  126 tctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagca 183  Q
    | ||||| |  ||||| || ||||| ||||||||  || ||||||| ||| |||||||    
T  11949632 tttcttctgcggaagaagagagtggagcagagttcctaactactaaacagttgaagca 11949689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 150
Target Start/End: Original strand, 13969783 - 13969868
Alignment:
Q  65 ggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtgg 150  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||| ||||| |||| |||| |||| ||||| ||||||| |||||| || |||||    
T  13969783 ggtatgaactggttggagtataaccatgttcatatcaattgctttaacaagacagtgcatttttcttccgccgaagaagagagtgg 13969868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 198
Target Start/End: Original strand, 10417693 - 10417841
Alignment:
Q  50 atggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtg 149  Q
    |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| |||   |||  |||||||||||||| |||| | || || || ||||| || ||||| || ||||    
T  10417693 atggatgttattttcgggatgaattggttagagtataactgagtttgtattaattgttttaacaagacggtgcacttttcttctgtggaagaagagagtg 10417792  T
Q  150 gtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 198  Q
    | ||||||||| || ||||||| ||| |||||||  ||||||| |||||    
T  10417793 gagcagagtttctaactactaaacagttgaagcagttggaacgagatgg 10417841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 13944544 - 13944372
Alignment:
Q  11 gattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgtttta 110  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| ||||  || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| ||||    
T  13944544 gattttgaagtagacttagtttgtctaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgcttta 13944445  T
Q  111 gcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagca 183  Q
     |||| | || ||||| ||||| |  ||||| || ||||| |  ||  |||||||||| |||||| |||||||    
T  13944444 acaagactgtgcatttttcttctgctgaagaagagagtggagttgaaattttatctacaaagcagatgaagca 13944372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 89
Target Start/End: Original strand, 12510104 - 12510170
Alignment:
Q  23 gatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacc 89  Q
    |||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||| ||||    
T  12510104 gatttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtgatttttggaatgaattggttagagtataacc 12510170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 198
Target Start/End: Original strand, 13318132 - 13318298
Alignment:
Q  32 tgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctctt 131  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| |||||||||| |||| | ||  |||| ||||    
T  13318132 tgtctaccgttgatgggtatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatataaattgttttaacaagacggtgtatttttctt 13318231  T
Q  132 ccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 198  Q
    | |  ||||| || ||||| | ||||||  || ||||||| ||| |||||||  ||||||| |||||    
T  13318232 ctgcggaagaagagagtggaggagagttcctaactactaaacagttgaagcagttggaacgagatgg 13318298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 111
Target Start/End: Original strand, 16825908 - 16825990
Alignment:
Q  29 gtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 111  Q
    |||||| |||| ||||  ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| |||||    
T  16825908 gtttgtttaccgttgacgggtatggatgtgatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttag 16825990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 44779713 - 44779595
Alignment:
Q  65 ggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttat 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||| ||| | || ||||| ||||| |  ||||| |||| ||| |  ||  ||||||    
T  44779713 ggtatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagtaagacggtgcatttttcttctgctgaagaagaaaatggagttgaaattttat 44779614  T
Q  165 ctactaagcagctgaagca 183  Q
    |||| |||||| |||||||    
T  44779613 ctacaaagcagatgaagca 44779595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 26 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 17494151 - 17494062
Alignment:
Q  26 ttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 115  Q
    ||||||||| |||| ||||  |||||| |||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| |||||||||    
T  17494151 ttagtttgtttaccgttgacgggtatgtatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagcaag 17494062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 23 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 28756827 - 28756718
Alignment:
Q  23 gatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtac 122  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||  | |||||||| |||||||| || || |  |||| ||| || || ||||| ||| | ||||    
T  28756827 gatttagtttgtctaccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagaatataatcgagttcatatcaactgctttagtaagacggtac 28756728  T
Q  123 atttctcttc 132  Q
    ||||||||||    
T  28756727 atttctcttc 28756718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 114
Target Start/End: Original strand, 12358151 - 12358239
Alignment:
Q  26 ttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaa 114  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||||||||| ||| | |  ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||||||    
T  12358151 ttagtttgtttagcgttgacgggtatggatgttatttttgcgatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagcaa 12358239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 31)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16983772 - 16983564
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16983772 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 16983673  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16983672 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggta 16983573  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  16983572 tcttgatgt 16983564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 17001532 - 17001324
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17001532 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 17001433  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17001432 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggta 17001333  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  17001332 tcttgatgt 17001324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 9338114 - 9337906
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9338114 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 9338015  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9338014 aattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggta 9337915  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  9337914 tcttgatgt 9337906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 9486748 - 9486540
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9486748 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 9486649  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9486648 aattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggta 9486549  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  9486548 tcttgatgt 9486540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 21142952 - 21143160
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21142952 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctaggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 21143051  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21143052 aattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 21143151  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  21143152 tcttgatgt 21143160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 22323253 - 22323461
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22323253 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttaggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 22323352  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22323353 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggta 22323452  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  22323453 tcttgatgt 22323461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 27220548 - 27220340
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27220548 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 27220449  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27220448 aattgttttagcaagtcagtacgtttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggta 27220349  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  27220348 tcttgatgt 27220340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 44383481 - 44383689
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44383481 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 44383580  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44383581 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgtagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggta 44383680  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  44383681 tcttgatgt 44383689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 10871382 - 10871174
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10871382 gtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 10871283  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10871282 aattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcggagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 10871183  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  10871182 tcttgatgt 10871174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 24712566 - 24712358
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24712566 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 24712467  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24712466 aattgttttagcaaatcagtacatttctcttccgtcgaagaggagagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggta 24712367  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  24712366 tcttgatgt 24712358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 24874661 - 24874869
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24874661 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacattcttatt 24874760  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24874761 aattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggagagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 24874860  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  24874861 tcttgatgt 24874869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 27373801 - 27373593
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27373801 gtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgcctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 27373702  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  27373701 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactgaaacgcgacggta 27373602  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  27373601 tcttgatgt 27373593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 24264902 - 24264694
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24264902 gtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 24264803  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24264802 aattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcggagtttctatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggta 24264703  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  24264702 tcttgatgt 24264694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 173; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 41606296 - 41606504
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41606296 gtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctatctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 41606395  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41606396 aattgttttagcaagtctgtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcggagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggta 41606495  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  41606496 tcttgatgt 41606504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 24705393 - 24705601
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||     
T  24705393 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtattaatatgattcttggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatc 24705492  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24705493 aattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctaccaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 24705592  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    | |||||||    
T  24705593 ttttgatgt 24705601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 24678019 - 24677811
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||    
T  24678019 gtttggtcgtgattttgagatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccatgttcacatt 24677920  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24677919 aattgttatagcaagtcagtgtatttctcctccgtcgaagaggaaagtggtgcaaagttcttatctaccaagcagctgaagcaactggaacacgatggta 24677820  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    | |||||||    
T  24677819 ttttgatgt 24677811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 24657569 - 24657777
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||| |||| |||     
T  24657569 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattcttgatatgaattgggtagagtacaaccatgttcatatc 24657668  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    |||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24657669 aattgttttagtcagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggagcagagttcttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 24657768  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    | |||||||    
T  24657769 ttttgatgt 24657777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 6 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23204841 - 23204638
Alignment:
Q  6 gtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattg 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  23204841 gtcgtgattttgtaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattg 23204742  T
Q  106 ttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttg 205  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23204741 ttttagcaagtcagtgtatttctcttccgctgaagaggagagtgatgcagagttcttatctactaagcagttgaagcaaatggaacgcgatggtatcttg 23204642  T
Q  206 atgt 209  Q
    ||||    
T  23204641 atgt 23204638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 11351622 - 11351804
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  11351622 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcgatatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatt 11351721  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagca 183  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  11351722 aattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctaccaagcagctgaagca 11351804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 21323177 - 21323385
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||| |||| |||     
T  21323177 gtttggtcgtgatttcgagatggatttagtttgtctacctttgagcggtgtggatgtgattctgggtatgaattggttgcaatacaaccatgttcatatg 21323276  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    || |||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21323277 aactgttttagcaagtcagtgtatttctcctcagtcgaagaggaaagtggcgcagagttcttgtctaccaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 21323376  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    | |||||||    
T  21323377 ttttgatgt 21323385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 23105645 - 23105847
Alignment:
Q  7 tcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgt 106  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  |||||||||    
T  23105645 tcgtgattttgagatggatttagtttgtctacctttgatcggtatggatgtgtttctgggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgt 23105744  T
Q  107 tttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 206  Q
    | ||| ||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||| ||||| || ||||    
T  23105745 tatagtaagtcggtgtatttctcttctgatgaagaggaaagtggcgcagagtttttgtctactaagcagctgaagtagttggaacgtgatggcattttga 23105844  T
Q  207 tgt 209  Q
    |||    
T  23105845 tgt 23105847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23074386 - 23074187
Alignment:
Q  10 tgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgtttt 109  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |    
T  23074386 tgattttgagattgatttggtttgtctacctttgagtggtatggatgtaattcttggtatgaattggttagagtacaaccatgttcacattaattgttat 23074287  T
Q  110 agcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 209  Q
    || ||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||| |||||||| |||||||    
T  23074286 agtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcaaagtttttatctaccaagcagctgaagcagttagaacgtgatggtattttgatgt 23074187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 22733691 - 22733893
Alignment:
Q  7 tcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgt 106  Q
    |||||||||| | || ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  22733691 tcgtgattttcagattgatttggtttgtctagctttgagtggtatggatgtaattcttggtatgacctggttagagtacaaccatgttcacattaattgt 22733790  T
Q  107 tttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 206  Q
    | ||| ||||| ||   ||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    ||||| |||||||| ||||    
T  22733791 tatagtaagtcggtgtttttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcagtaagaacgtgatggtattttga 22733890  T
Q  207 tgt 209  Q
    |||    
T  22733891 tgt 22733893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Original strand, 23029372 - 23029491
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  |||    
T  23029372 gtttggtcgtgatttcgagatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacatt 23029471  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagt 120  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  23029472 aattgttttagcaagtcagt 23029491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Original strand, 45673923 - 45674012
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacca 90  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45673923 gtttggtcgtgattttgaaatgaatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaacca 45674012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 180
Target Start/End: Original strand, 24817761 - 24817930
Alignment:
Q  11 gattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgtttta 110  Q
    |||||||| || ||||| |||||| | || |||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||  ||||| ||||  |||||||||| ||    
T  24817761 gattttgagattgatttggtttgtttgcctttgagtagaatggatgtaattcttggtatgaactggttggagtgtaaccatgttcacattaattgttata 24817860  T
Q  111 gcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaa 180  Q
      ||||| ||  |||| ||||  |||||||| || ||||  |||||||| || |||||||| || |||||    
T  24817861 ataagtcggtgtatttttcttttgtcgaagaagagagtgcagcagagttcttgtctactaatcaactgaa 24817930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 209
Target Start/End: Original strand, 11351800 - 11351839
Alignment:
Q  170 aagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11351800 aagcagctgaagcaactggaacgcgatggtattttgatgt 11351839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 26 - 132
Target Start/End: Original strand, 23097954 - 23098060
Alignment:
Q  26 ttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatt 125  Q
    ||||| |||||||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||||||| ||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||||||| | || ||||    
T  23097954 ttagtgtgtctaccgttgatgggtatggatgtcatttttggaatgaactgggtagagtataaccgtgttcatatcaattgttttagcaagacggtgcatt 23098053  T
Q  126 tctcttc 132  Q
    | |||||    
T  23098054 tttcttc 23098060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 23279283 - 23279150
Alignment:
Q  26 ttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatt 125  Q
    ||||||||| |||| ||||  || |||||||| ||| | || ||| ||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||||||| | || ||||    
T  23279283 ttagtttgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatggactggttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagcaagacggtgcatt 23279184  T
Q  126 tctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 159  Q
    | |||||    ||||| |||||||| ||||||||    
T  23279183 tttcttctacggaagaagaaagtggagcagagtt 23279150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 19817369 - 19817269
Alignment:
Q  11 gattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgtttta 110  Q
    ||||||| | |||| ||||| ||| | || |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || |  ||| | |||| ||||||||||||||    
T  19817369 gattttgcagtggacttagtctgtttgccgttgagtgggatggatgtgatactaggtatgaactggttggaatttaactatgttcatattaattgtttta 19817270  T
Q  111 g 111  Q
    |    
T  19817269 g 19817269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 26 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 23274100 - 23274011
Alignment:
Q  26 ttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 115  Q
    ||||||||| |||| ||||  || |||||||| ||| | || ||| ||||||||||||| ||||  |||| ||| |||||||||||||||    
T  23274100 ttagtttgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatggactggttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagcaag 23274011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 10298 - 10090
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10298 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgtttttatt 10199  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10198 aattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccctcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactgggacgcgatggta 10099  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  10098 tcttgatgt 10090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0055 (Bit Score: 181; Significance: 6e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0055
Description:

Target: scaffold0055; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22177 - 21969
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22177 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 22078  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  22077 aattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaaaaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactgaaacgcgacggta 21978  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  21977 tcttgatgt 21969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 181; Significance: 6e-98; HSPs: 4)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 11399 - 11191
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11399 gtttggtcgtgattttgaaatggatttggtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 11300  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11299 aattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggagagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcgactggaacgcgatggta 11200  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  11199 tcttgatgt 11191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 53657 - 53449
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  53657 gtttggtcgtgattttgaaatggatttggtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttatt 53558  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53557 aattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcaaagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 53458  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  53457 tcttgatgt 53449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 17867 - 17659
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17867 gtttggtcgtgattttgaaatggatttggtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 17768  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  17767 aattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggagagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcgactggaatgcgatggta 17668  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  17667 tcttgatgt 17659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 65 - 183
Target Start/End: Original strand, 47952 - 48070
Alignment:
Q  65 ggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttat 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||| ||| | || ||||| |||||    ||||| || ||||| |||||||| |||     
T  47952 ggtatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagtaagacggtgcatttttcttctacggaagaagagagtggagcagagttcttaa 48051  T
Q  165 ctactaagcagctgaagca 183  Q
    ||||||| ||| |||||||    
T  48052 ctactaaacagttgaagca 48070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 177; Significance: 1e-95; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 41085 - 40877
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  41085 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacattcttata 40986  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40985 aattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaggcagctgaagcaactggaacgcgatggta 40886  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  40885 tcttgatgt 40877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 6 - 209
Target Start/End: Original strand, 13503 - 13706
Alignment:
Q  6 gtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattg 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  13503 gtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcgttatggatgtgattttgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatataaattg 13602  T
Q  106 ttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttg 205  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  13603 ttttagcaagtcagtgtatttctcttccgctgaagaggaaagtggtgcagaattcttatctactaagcagctgaagcaaatggaacgcgatggtattttg 13702  T
Q  206 atgt 209  Q
    ||||    
T  13703 atgt 13706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 177; Significance: 1e-95; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 3354 - 3146
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3354 gtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 3255  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3254 aattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcgaagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggta 3155  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    |||||||||    
T  3154 tcttgatgt 3146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 17090 - 16882
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||     
T  17090 gtttagtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccgtgttcatatc 16991  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  16990 aattgttttagcaagtcagtgtacttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctactaagcagctgaagcaaatggaatgcgatggta 16891  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    | |||||||    
T  16890 ttttgatgt 16882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 153; Significance: 3e-81; HSPs: 3)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 17440 - 17648
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||     
T  17440 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcgatatggatgtgattcttggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatc 17539  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  17540 aattgttttagcaagtcagtatatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctactaagaagctgaagcaattggaacgcgatggta 17639  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    | |||||||    
T  17640 ttttgatgt 17648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Original strand, 195219 - 195412
Alignment:
Q  8 cgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgtt 107  Q
    |||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||| ||||  ||||||||||    
T  195219 cgtgatttcgagatggatttagtttctctacctttgagcggtgtggatgtgattctgggtatgaactgattgcaatacaaccatgttcacattaattgtt 195318  T
Q  108 ttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtat 201  Q
    | |||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  195319 tcagcaagtcagtgtatttctcctcagtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttgtctaccaagcagctgaagcaattagaacgcgatggtat 195412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 41 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 24196 - 24126
Alignment:
Q  41 ttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 111  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  ||||| |||| ||||||||| |||||    
T  24196 ttgagtgggatggatgtgatactaggtatgaactggttggagtttaaccatgttcatattaattgctttag 24126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0560 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0560
Description:

Target: scaffold0560; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 32 - 209
Target Start/End: Original strand, 8146 - 8323
Alignment:
Q  32 tgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctctt 131  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8146 tgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccacgttcttattcattgttttagcaagtcagtgcatttctctt 8245  T
Q  132 ccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 209  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8246 tcgttgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagaaactggaacgcgatggtatcttgatgt 8323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 149; Significance: 7e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 8188 - 7980
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  8188 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttggagtacaaccatgttcatatt 8089  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  8088 aattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgccgaagaggatagtggtgcagagttcttatctactaagcagctgaagcaaatggaacgtgatggta 7989  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    | |||||||    
T  7988 ttttgatgt 7980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 149; Significance: 7e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 29302 - 29510
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||     
T  29302 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacatttgagcggtatggatgtgattctggatatgaattggttagagtacaaccatgttcatatc 29401  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  29402 aattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctactaagcagctgaagaaactggagcgcgatggta 29501  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    | |||||||    
T  29502 ttttgatgt 29510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 149; Significance: 7e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 11730 - 11938
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||     
T  11730 gtttagtcgtgattttgaaatgaatttagtttgtctacccttgagcggtatggatgtgattatgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatc 11829  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11830 aattgttttagcaagtcagtgtatttctcttctgtcgaagaggaaagtggtgtagagttcttatctactaagcagctgaagtaactggaacgcgatggta 11929  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    | |||||||    
T  11930 ttttgatgt 11938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1459 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold1459
Description:

Target: scaffold1459; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 1406 - 1614
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||     
T  1406 gtttggtcgtgattttgagatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttacagtacaaccatgttcatatc 1505  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1506 aattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccatcgaagaggaaagtggtgtagagtttctatctactaagcagctgaagcaactgcaacgcgatggta 1605  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    | |||||||    
T  1606 ttttgatgt 1614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 144; Significance: 7e-76; HSPs: 3)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 36428 - 36229
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  36428 gtttggtcgtgattttgaaatggatctagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattcttggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatt 36329  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36328 aattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttgtttaccaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 36229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 65 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 28944 - 28800
Alignment:
Q  65 ggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttat 164  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  28944 ggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttgt 28845  T
Q  165 ctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28844 ctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtattttgatgt 28800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 3622 - 3466
Alignment:
Q  27 tagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacattt 126  Q
    |||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||  ||||||||| | || |||||    
T  3622 tagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattactttagcaagacggtgcattt 3523  T
Q  127 ctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagca 183  Q
     ||||| |  ||||| || ||||| || |||||  || ||||||| ||| |||||||    
T  3522 ttcttctgctgaagaagagagtggagctgagttcctaactactaaacagttgaagca 3466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 59 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 9812 - 9662
Alignment:
Q  59 attctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagt 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9812 attctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagt 9713  T
Q  159 ttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9712 ttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttgatgt 9662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 10532 - 10740
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||    
T  10532 gtttggtcgtgattttgagatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtaattctgggtatgaattggttagagtacaatcatgttcatatt 10631  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    | ||||||||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10632 agttgttttagcaagtcagtgtatttctcctctgtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttgtctactaagaagctgaagcaactggaacgcgatggta 10731  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    | |||||||    
T  10732 tattgatgt 10740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 134; Significance: 6e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 12 - 209
Target Start/End: Original strand, 15379 - 15576
Alignment:
Q  12 attttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 111  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  15379 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctaggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattaactgttttag 15478  T
Q  112 caagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 209  Q
    |||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  15479 caagtcggtgtatttctctttcgtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctaccaagcagctgaagcaactggaacgtgatggtattttgatgt 15576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 50719 - 50919
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||||  |||    
T  50719 gtttggtcgtgattttgagatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattatgggtatgaactggttaaaatacaaccatgttcacatt 50818  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  50819 aattgttttagcaagtcagtgtatttctcctcagtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactagaacgcgatggta 50918  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  50919 t 50919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 42603 - 42518
Alignment:
Q  26 ttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 111  Q
    ||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||| |||||    
T  42603 ttagtttgtttaccattgacaggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatattaattgctttag 42518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 21534 - 21326
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||  |||    
T  21534 gtttggtcgtgatttcgagatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgcgtatgaactggttggaatacaaccatgttcacatt 21435  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21434 aattgttttagcaagtcagtgtatttctcctccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttgtctaccaagcagctgaagcaacaggaacgcgatggta 21335  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    | |||||||    
T  21334 tattgatgt 21326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 36958 - 36750
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||  |||    
T  36958 gtttggtcgtgatttcgagatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgcgtatgaactggttggaatacaaccatgttcacatt 36859  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36858 aattgttttagcaagtcagtgtatttctcctccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttgtctaccaagcagctgaagcaacaggaacgcgatggta 36759  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    | |||||||    
T  36758 tattgatgt 36750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 5)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 10612 - 10820
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||     
T  10612 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattatgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatata 10711  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||| | || |||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  10712 aattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgctgaagaggaaagtggtgcaaaattcttatctactaagtagatgaagcaaatggaacgcgatggta 10811  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    | |||||||    
T  10812 ttttgatgt 10820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 13267 - 13475
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||     
T  13267 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattatgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatata 13366  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||| | || |||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  13367 aattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgctgaagaggaaagtggtgcaaaattcttatctactaagtagatgaagcaaatggaacgcgatggta 13466  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    | |||||||    
T  13467 ttttgatgt 13475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 31813 - 31606
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  31813 gtttggtcgtgattttgatatggatttagtttgtctacctttgagcggtttggatgtgattctaggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatt 31714  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    |||||||||||||||| |||   |||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  31713 aattgttttagcaagtaagt-gttttctcctctgtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttgtctactaagcagctgatgcgactggaacgcgatggta 31615  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    | |||||||    
T  31614 ttttgatgt 31606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 37279 - 37072
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  37279 gtttggtcgtgattttgatatggatttagtttgtctacctttgagcggtttggatgtgattctaggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatt 37180  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    |||||||||||||||| |||   |||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  37179 aattgttttagcaagtaagt-gttttctcctctgtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttgtctactaagcagctgatgcgactggaacgcgatggta 37081  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    | |||||||    
T  37080 ttttgatgt 37072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 54561 - 54363
Alignment:
Q  7 tcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgt 106  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  54561 tcgtgattttgagatggatttagtttgtttacctttgagtggtatggatgtgattcttggcatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgt 54462  T
Q  107 tttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttg 205  Q
    ||||| ||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||  | ||||| ||||| ||||||    
T  54461 tttagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagtttttgtctactaagcagttgaagcagttagaacgtgatggaatcttg 54363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 37194 - 37402
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| ||||||||||  | ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  |||    
T  37194 gtttggtcgtgatttcaagatggacttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacatt 37293  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37294 aattgttttagcaagtcagtgtatttctcctcagtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 37393  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    | |||||||    
T  37394 ttttgatgt 37402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 26282 - 26075
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||| || |||||||| ||||| |||||| | || |||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||    
T  26282 gtttggtcgagactttgaaattgatttggtttgtttgcctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttggagtataaccatgttcatatt 26183  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    ||||||||||  ||||| ||| |||| ||||| ||  |||| || ||||| || ||||||||  ||||||||||||| |||||  | || || ||||| |    
T  26182 aattgttttaataagtcggtatatttttcttctgttaaagaagagagtggggcggagtttttgactactaagcagctaaagcagttagagcgtgatggaa 26083  T
Q  201 tcttgatg 208  Q
    ||||||||    
T  26082 tcttgatg 26075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 35089 - 35296
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||||  |||    
T  35089 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttaagcggtatggatgtgat-ctgggtataaactggttggaatacaaccatgttcacatt 35187  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35188 aattgttttagcaagtcagtgtatttctcctccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttgtctaccaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 35287  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    | |||||||    
T  35288 ttttgatgt 35296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 41556 - 41354
Alignment:
Q  7 tcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgt 106  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || | |||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  41556 tcgtgattttgaaattgacttagtttgtttacctttgagtggtatggatgtaatccttgatatgaatttgttagagtacaaccatgttcatattaattgt 41457  T
Q  107 tttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 206  Q
    ||||| ||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||| | ||||| |||||||    
T  41456 tttagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaattagaatgtgatggaatcttga 41357  T
Q  207 tgt 209  Q
    |||    
T  41356 tgt 41354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 75276 - 75074
Alignment:
Q  7 tcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgt 106  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || | |||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  75276 tcgtgattttgaaattgacttagtttgtttacctttgagtggtatggatgtaatccttgatatgaatttgttagagtacaaccatgttcatattaattgt 75177  T
Q  107 tttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 206  Q
    ||||| ||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||| | ||||| |||||||    
T  75176 tttagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaattagaatgtgatggaatcttga 75077  T
Q  207 tgt 209  Q
    |||    
T  75076 tgt 75074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 34 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 726 - 551
Alignment:
Q  34 tctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttcc 133  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||     
T  726 tctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgttttagcaagtcagtgaatttctcctca 627  T
Q  134 gtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  626 gtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttgtctaccaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtattttgatgt 551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 111; Significance: 3e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 25092 - 25294
Alignment:
Q  7 tcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgt 106  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  25092 tcgtgattttgagatggatttagtttgtttacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactagttagagtacaaccatgttcacattaattgt 25191  T
Q  107 tttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 206  Q
    | ||| ||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| | ||||| || ||||    
T  25192 tatagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcagttggaatgtgatggcattttga 25291  T
Q  207 tgt 209  Q
    |||    
T  25292 tgt 25294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0501 (Bit Score: 109; Significance: 5e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0501
Description:

Target: scaffold0501; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12593 - 12385
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| ||||||||||||| || ||| | |||||  | || |||||||||||||| || ||||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  12593 gtttggtcgtgattttgagattgatatggtttgcttgcctttgagtggtatggacgtcattcttggtctgaattggttagagtacaaccatgttcatatt 12494  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12493 aattgttttagcaagtcagtgtatttctcctccgtcaaagaggaaagtggtgcagagttcttgtctaccaagcagctgaagcaactagaacgcgatggta 12394  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    | |||||||    
T  12393 ttttgatgt 12385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 109; Significance: 5e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 3525 - 3349
Alignment:
Q  7 tcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgt 106  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  3525 tcgtgattttgaaattgatttggtttgtctacctttgagtggtatggatgtaattcttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcacattaattgt 3426  T
Q  107 tttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagca 183  Q
    ||||| ||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3425 tttagtaagtcggtgtatttctcttctgcggaagaggaaagtggcgcagagtttttatctactaaacagctgaagca 3349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 104; Significance: 5e-52; HSPs: 4)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 14354 - 14203
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||     
T  14354 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatc 14255  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 152  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  14254 aattgttttagcaagtcagtgtatttttcttccgctgaagaggaaagtggtg 14203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 4832 - 4637
Alignment:
Q  14 tttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagca 113  Q
    |||||||| || ||||||||| |||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |    
T  4832 tttgaaattgacttagtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatcctgggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagta 4733  T
Q  114 agtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 209  Q
    |||||||| |||| |||||   |||||| || ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||||    
T  4732 agtcagtatatttttcttctaccgaagaagagagtggagcagaattcttgtctactaagcagctgaagcaattagaacgcgatggaattttgatgt 4637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 26 - 132
Target Start/End: Original strand, 44826 - 44932
Alignment:
Q  26 ttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatt 125  Q
    ||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||||| ||||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||||||| | || ||||    
T  44826 ttagtttgtttaccgttgacaggtatggatgttatttttgggatgaactagttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagcaagacggtgcatt 44925  T
Q  126 tctcttc 132  Q
    | |||||    
T  44926 tttcttc 44932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 23 - 132
Target Start/End: Original strand, 39729 - 39838
Alignment:
Q  23 gatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtac 122  Q
    |||||||||||||| || ||||  ||||||||||| ||  | |||||||| ||||||||||| || |  |||| ||| || || ||||| ||| | ||||    
T  39729 gatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagtataatcgagttcatatcaactgctttagtaagacggtac 39828  T
Q  123 atttctcttc 132  Q
    ||||||||||    
T  39829 atttctcttc 39838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 111287 - 111489
Alignment:
Q  7 tcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgt 106  Q
    ||||||||||||||| || || |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  111287 tcgtgattttgaaattgacttggtttgtttacctttgagtggtatggatgtgattcttggcatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgt 111386  T
Q  107 tttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 206  Q
    ||||| ||||| ||  |||||||||| |  ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |    
T  111387 tttagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaaaaggaaagtggcgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcagttagaacgtgatggaatcttaa 111486  T
Q  207 tgt 209  Q
    |||    
T  111487 tgt 111489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 17808 - 17600
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||| || |||||||| ||||| |||||| |||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||    
T  17808 gtttggtcgagactttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaatcatgttcatatt 17709  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    |||||||||   ||||| ||  |||| |||||    | ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| |    
T  17708 aattgttttgttaagtcggtgtatttttcttctactgtagaagaaagtggagcagagtttttgtctactaagtagctgaagcaattagaacgcgatggaa 17609  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    | |||||||    
T  17608 ttttgatgt 17600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 10716 - 10509
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||    
T  10716 gtttggtcgtgattttgaaattgatttagtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcacatt 10617  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||| |  |||||||||||| | | ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||  ||||| |    
T  10616 aattgttttagtaagtcagtgtatttctcttctgcggaagaggaaagtagcgtagagtttttgtctactaagcagctgaagcagttggaacctgatggaa 10517  T
Q  201 tcttgatg 208  Q
    | ||||||    
T  10516 ttttgatg 10509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1985 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold1985
Description:

Target: scaffold1985; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 56 - 209
Target Start/End: Original strand, 1 - 154
Alignment:
Q  56 gtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcag 155  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  1 gtgattctgggtatgaattggttggagtacaaccatgttcatattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcatcagacgaagaggaaagtggtgcag 100  T
Q  156 agtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 209  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  101 agttcatatctactaagcagctgaagcaaatggaacgagatggtatattgatgt 154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 97; Significance: 8e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 9 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 18572 - 18400
Alignment:
Q  9 gtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttt 108  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  18572 gtgattttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggtatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcacattaattgttt 18473  T
Q  109 tagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaag 181  Q
    ||| ||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18472 tagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagtttttgtctactaagcagctgaag 18400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 104151 - 103949
Alignment:
Q  7 tcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgt 106  Q
    ||||||||||||||| || || |||||| |||| |||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||    
T  104151 tcgtgattttgaaattgacttggtttgtttacctttgagtggcatggatgtaatcatgggtatgaactggttagagtacaaccatgttcacattacttgt 104052  T
Q  107 tttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 206  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||| || ||||    
T  104051 tttagcaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagtttttgtctaccaagcagctgaagcaattagaacgtgatggaattttga 103952  T
Q  207 tgt 209  Q
    |||    
T  103951 tgt 103949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 23 - 208
Target Start/End: Original strand, 24341 - 24526
Alignment:
Q  23 gatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtac 122  Q
    ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || || ||      
T  24341 gatttggtttgtttacctttgagtggtatggatgtgattcttggcatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaaatcggtgt 24440  T
Q  123 atttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatg 208  Q
    |||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||| ||||| || ||||||    
T  24441 atttctcttctgctgaagagaaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcagttagaacgtgatggaattttgatg 24526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 183
Target Start/End: Original strand, 10171 - 10328
Alignment:
Q  26 ttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatt 125  Q
    ||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||||||| | || ||||    
T  10171 ttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagcaagacggtgcatt 10270  T
Q  126 tctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagca 183  Q
    | ||||  |  ||||| || ||||| ||||||||  || ||||||| ||| |||||||    
T  10271 tttcttttgcggaagaagagagtggagcagagttcctaactactaaacagttgaagca 10328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 6043 - 5846
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||| ||| ||||||| ||||| |||||| |||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  6043 gtttggtcgagatgttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatcctgggtatgaactggttagagtgcaacaacgttcatatt 5944  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 198  Q
    ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  5943 aattgttttagtaagtcggtgtatttttcttcggttgaagaagaaagtggagcagagttcttatctactaagcagctgaagcaattagaacgtgatgg 5846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 23907 - 24103
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  23907 gtttggtcgagattttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatatt 24006  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatg 197  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  24007 aattgttttagtaagtcggtatatttttcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagttcttgtctaccaagcagctgaagcaattagaacgtgatg 24103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 26 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 151472 - 151289
Alignment:
Q  26 ttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatt 125  Q
    ||||||||| |||  ||||  ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||||||| | || ||||    
T  151472 ttagtttgtttacagttgacgggtatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagcaagacggtgcatt 151373  T
Q  126 tctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 209  Q
    | ||||| |  ||||| || ||||| ||||||||  ||||||| || ||| |||||||  |||| || ||||| ||||| ||||    
T  151372 tttcttctgcggaagaagagagtggagcagagttcctatctacgaaacagttgaagcagttggagcgtgatggaatcttaatgt 151289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 1376 - 1174
Alignment:
Q  7 tcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgt 106  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  1376 tcgtgattttgagattgatttggtttgtttacctttgagtggtacggatgtgattcttggcatgaactggttagagtacaaccatgtccatattaattgt 1277  T
Q  107 tttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 206  Q
    ||||| ||||  ||  |||||||||| |  |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| |||||||  | ||||| ||||| |||||||    
T  1276 tttagtaagttggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgtagagtttttgtctactaagcagttgaagcagttagaacgtgatggaatcttga 1177  T
Q  207 tgt 209  Q
    |||    
T  1176 tgt 1174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 8147 - 7945
Alignment:
Q  7 tcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgt 106  Q
    |||||||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  8147 tcgtgattttgagattcatttggtttgtctaccgttgagtgctatggatgtaattcttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcacattaattgt 8048  T
Q  107 tttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 206  Q
    ||||| || || ||  |||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||||||  | ||||| |||||||| ||||    
T  8047 tttagtaattctgtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagtttttgtcaattaagcagctgaagcagttagaacgtgatggtattttga 7948  T
Q  207 tgt 209  Q
    |||    
T  7947 tgt 7945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 4)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 152005 - 151803
Alignment:
Q  7 tcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgt 106  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||  |||||||||    
T  152005 tcgtgattttgagattgatttggtttgtttaccttttagtggtatggatgtgattcttggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgt 151906  T
Q  107 tttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 206  Q
    | ||| ||||| ||  ||||| |||| |  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| || ||||    
T  151905 tatagtaagtcggtgtatttcgcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcagttggaacgtgatggcattttga 151806  T
Q  207 tgt 209  Q
    |||    
T  151805 tgt 151803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 41 - 209
Target Start/End: Original strand, 1919 - 2087
Alignment:
Q  41 ttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaag 140  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||  |||| ||||| |  ||||    
T  1919 ttgagtggtatggatgtaatccagggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcggtgtatttttcttctgctgaag 2018  T
Q  141 aggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 209  Q
    | || ||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||    
T  2019 aagacagtgacgcagagttcttatctactaaacagctgaagcaattagaacgtgatggtattttgatgt 2087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 65 - 209
Target Start/End: Original strand, 47402 - 47546
Alignment:
Q  65 ggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttat 164  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||  |    
T  47402 ggtatgaactggttagagtacaatcatgttcacattaattgttttagtaagtcaatgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagttttagt 47501  T
Q  165 ctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 209  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| ||||    
T  47502 ctactaagcagctgaagcagttagaacgtgatggaatcttaatgt 47546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 115
Target Start/End: Original strand, 164797 - 164889
Alignment:
Q  23 gatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 115  Q
    |||||||| ||| |||| ||||  || || ||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| |||||||||||||||    
T  164797 gatttagtgtgtttaccgttgacgggaatagatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagcaag 164889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 6803 - 6606
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||| || || |||||| |||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  6803 gtttggtcgagattttgaaattgacttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatatt 6704  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 198  Q
    ||||||||||| ||||| ||  |||||||||| |  ||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  6703 aattgttttagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcacagagttcttatctaccaagcagctgaagcaattagaacgtgatgg 6606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 13933 - 13736
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||| || || |||||| |||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  13933 gtttggtcgagattttgaaattgacttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatatt 13834  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 198  Q
    ||||||||||| ||||| ||  |||||||||| |  ||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  13833 aattgttttagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcacagagttcttatctaccaagcagctgaagcaattagaacgtgatgg 13736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 84 - 209
Target Start/End: Original strand, 27952 - 28077
Alignment:
Q  84 acaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagca 183  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  27952 acaaccatgttcatattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtagaagaggaaagtggtgcagagttcttatctaccaagcagctgaagca 28051  T
Q  184 actggaacgcgatggtatcttgatgt 209  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||    
T  28052 actgaaacgcgatggtattttgatgt 28077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 8872 - 8672
Alignment:
Q  9 gtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttt 108  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||  ||||||||||     
T  8872 gtgattttgagatggatttagtttgtttacctttgagtggtatggatgtgattcttggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgtta 8773  T
Q  109 tagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatg 208  Q
    ||| ||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||  |||| |  ||||||| ||||| || ||||||    
T  8772 tagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagattttttgtctactaagcagtcgaagtagttggaacgtgatggcattttgatg 8673  T
Q  209 t 209  Q
    |    
T  8672 t 8672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18065 - 17868
Alignment:
Q  12 attttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 111  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||  |||||||||| |||    
T  18065 attttgagatggatttagtttgtttacctttgagtggtatggatgtgattcttggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgttatag 17966  T
Q  112 caagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 209  Q
     ||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||  |||| |  ||||||| ||||| || |||||||    
T  17965 taagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagattttttgtctactaagcagtcgaagtagttggaacgtgatggcattttgatgt 17868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 13853 - 14061
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||| |||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  13853 gtttggtcgagattttaaaattgatttagtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatatt 13952  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||| ||||| |  |||||||||||||| ||| | || || ||||||||||||||||||| | | ||||| ||||| |    
T  13953 aattgttttagtaagtcagtgtatttttcttctgctgaagaggaaagtggcgcataattcttgtctactaagcagctgaagctattagaacgtgatggaa 14052  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    | |||||||    
T  14053 ttttgatgt 14061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 87; Significance: 7e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 4358 - 4156
Alignment:
Q  7 tcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgt 106  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||| |||| |||||||||||| |||||||||| || |  || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  4358 tcgtgattttgagatcgatttggtttgtttacctttgagtggtatgaatgtgattcttggcaaaaattggttagagtacaaccatgttcatattaattgt 4259  T
Q  107 tttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 206  Q
    ||||| ||||| ||  |||||||||| |  ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||  ||||| |||||||    
T  4258 tttagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcacagagtttttgtctactaagcagctgaagcagttagaacatgatggaatcttga 4159  T
Q  207 tgt 209  Q
    |||    
T  4158 tgt 4156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 87; Significance: 7e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 17728 - 17925
Alignment:
Q  7 tcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgt 106  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||     ||| ||||  |||||||||    
T  17728 tcgtgattttgagatggatttagtttgcttacctttgagtggtatggatgtgattattggtatgaactggttggag-----ccatgttcacattaattgt 17822  T
Q  107 tttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 206  Q
    | ||| ||||||||  |||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| || ||||    
T  17823 tatagtaagtcagtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcagttggaacgtgatggcattttga 17922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1881 (Bit Score: 84; Significance: 4e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold1881
Description:

Target: scaffold1881; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Original strand, 854 - 973
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||     
T  854 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtgcaaccatgttcatatc 953  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagt 120  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  954 aattgtttcagcaagtcagt 973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 84; Significance: 4e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 4504 - 4317
Alignment:
Q  10 tgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgtttt 109  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  4504 tgattttgaaattgatttggtttgtttacctttgtgtggtatggatgtaattcttgtcatgaactggttagagtacaaccatgttcacattaattgtttt 4405  T
Q  110 agcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatg 197  Q
    || ||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||    
T  4404 agtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagttgcgcagagttcttatctactaaacagctgaagcaattagaacgtgatg 4317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 12594 - 12795
Alignment:
Q  7 tcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgt 106  Q
    |||| |||||||||| ||||| |||||  |||| ||||||||||||||| | ||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  12594 tcgtaattttgaaattgatttggtttgcttacctttgagtggtatggatataattcttggcatgcactggttagagtacaaccatgttcatattaattgt 12693  T
Q  107 tttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 206  Q
    ||||| || |  ||  |||||||||| |  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||||    
T  12694 tttagtaaattggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggtgcagag-ttctatctactaagcagctgaagcagttagaacgtgatggaatcttga 12792  T
Q  207 tgt 209  Q
    |||    
T  12793 tgt 12795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 55850 - 56052
Alignment:
Q  7 tcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgt 106  Q
    |||||||||  |||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||    
T  55850 tcgtgatttctaaattgatttggtttgtttacctttgagtggtatggatgtaatccttggtatgaactggttaaagtacaaccatgttcacattaattgt 55949  T
Q  107 tttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 206  Q
    ||||| ||||| ||  ||||| |||| |  |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||  | ||||| |||||||| ||||    
T  55950 tttagtaagtcggtgtatttcccttctgctgaagaggaaagtggcgcaaagtttttgtctactaaacagctgaagcagttagaacgtgatggtattttga 56049  T
Q  207 tgt 209  Q
    |||    
T  56050 tgt 56052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 29 - 209
Target Start/End: Original strand, 6489 - 6669
Alignment:
Q  29 gtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttct 128  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| || ||||| ||  ||||||    
T  6489 gtttgtttacctttgagtggtatggatgtaatccttggtatgaactggttatagtacaaccatgttcatattaattgtttaagtaagtcggtgtatttct 6588  T
Q  129 cttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 209  Q
    |||| |  |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||| || |||||||    
T  6589 cttctgctgaagaggaaagtggcgtagagttcttatctactaagcagctgaagcagttagaacgtgatggaattttgatgt 6669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 495950 - 495742
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||| |||||| |||| ||||| |||||| |||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  495950 gtttggtcgagatttttaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatatt 495851  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 200  Q
    ||||||||||| ||||| ||  |||| |||||    ||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||| |    
T  495850 aattgttttagtaagtcggtttatttttcttcttctgaagatgaaagtggcgcagagttcttgtctaccaagcagctgaagcaattagaacgtgatggaa 495751  T
Q  201 tcttgatgt 209  Q
    | |||||||    
T  495750 ttttgatgt 495742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 111
Target Start/End: Original strand, 452651 - 452697
Alignment:
Q  65 ggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 111  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  452651 ggtatgaactggttggagtataaccatgttcatattaattgttttag 452697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 441493 - 441441
Alignment:
Q  128 tcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaa 180  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||||||| || |||||||||||||||||    
T  441493 tcttctgtcgaagaagagagtggagcagagttcttgtctactaagcagctgaa 441441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 14008 - 13865
Alignment:
Q  7 tcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgt 106  Q
    |||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  14008 tcgtgactttgagattgatttggtttgtctacctttgagtggtatggatgtaattcttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcacattaattgt 13909  T
Q  107 tttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtgg 150  Q
    ||||| ||||| ||  |||||||||| || ||||||||||||||    
T  13908 tttagtaagtcggtgtatttctcttctgttgaagaggaaagtgg 13865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 98 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 8855 - 8770
Alignment:
Q  98 attaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagca 183  Q
    |||||||||||||| || |||||  |||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  8855 attaattgttttagtaaatcagtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagtttttgtctaccaagcagctgaagca 8770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 6 - 209
Target Start/End: Original strand, 216799 - 217002
Alignment:
Q  6 gtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattg 105  Q
    |||| |||||| |||| ||||| |||||| |||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  216799 gtcgagattttaaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattg 216898  T
Q  106 ttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttg 205  Q
    |||||| ||||| ||  |||| ||||| |  |||| ||||||||| ||| | || || ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| || |||    
T  216899 ttttagtaagtcggtgtatttttcttctgctgaagcggaaagtggcgcaaaattcttgtctactaagcagctgaaacaattagaacgcgatgggattttg 216998  T
Q  206 atgt 209  Q
    ||||    
T  216999 atgt 217002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1423 (Bit Score: 79; Significance: 4e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold1423
Description:

Target: scaffold1423; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 758 - 960
Alignment:
Q  7 tcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgt 106  Q
    |||||||||||| || ||| | |||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||    
T  758 tcgtgattttgagattgatatggtttgtttacctttgggtggtatggatgtgattatgggtatgaactggttagagtacatccatgttcacattaattgt 857  T
Q  107 tttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 206  Q
    | ||| ||||| ||  ||||||||||    |||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||| || ||||    
T  858 tatagtaagtcggtgtatttctcttctactgaagaggaaagtggcgaaaagtttttatctacaaagcagctgaagcagttagaacgtgatggcattttga 957  T
Q  207 tgt 209  Q
    |||    
T  958 tgt 960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0993 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0993
Description:

Target: scaffold0993; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 41 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 772 - 604
Alignment:
Q  41 ttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaag 140  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |   |||    
T  772 ttgagtggtatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaactatgttcacattaattgttttagtaagtcagtgtatttctcttctgctaaag 673  T
Q  141 aggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 209  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||| ||||| || |||||||    
T  672 aggagagtggcgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcagttagaacgtgatggaattttgatgt 604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0993; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 906 - 781
Alignment:
Q  7 tcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgt 106  Q
    |||||||||||| || || || |||||| |||  ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  906 tcgtgattttgagattgaattggtttgtttacgtttgagtggtatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcacattaattgt 807  T
Q  107 tttagcaagtcagtacatttctcttc 132  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||    
T  806 tttagtaagtcagtgtatttctcttc 781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 74; Significance: 4e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 14640 - 14837
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||| ||||| || || || || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  14640 gtttggtcgagattttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggaagtaatccttggaatgaactggttagagtacaaccatgttcatatt 14739  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 198  Q
    ||||||||||| ||||  ||  |||| ||||| |  |||||||||||||| ||| | || || ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  14740 aattgttttagtaagttggtgtatttttcttctgctgaagaggaaagtggcgcataattcttgtctactaagcagctgaagcaattagaacgtgatgg 14837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 72; Significance: 6e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 209
Target Start/End: Original strand, 40888 - 41087
Alignment:
Q  10 tgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgtttt 109  Q
    ||||||||| || ||| | |||||| |||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||    
T  40888 tgattttgagattgatatggtttgtttacctttgagtggtatggatttaattcttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcacattaaatgtttt 40987  T
Q  110 agcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 209  Q
    || ||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||  ||||| |  | ||||| |||||||| |||||||    
T  40988 agtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcaaagtttttgtctactaaacatttgaagtagttagaacgtgatggtattttgatgt 41087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 180
Target Start/End: Original strand, 15364 - 15532
Alignment:
Q  12 attttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 111  Q
    ||||||| || ||||| |||||| | || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||  |||||||||| ||     
T  15364 attttgagattgatttggtttgtttgcctttgagtggaatggatgtaattcttggtatgaactggttggagtataaccatgttcacattaattgttataa 15463  T
Q  112 caagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaa 180  Q
    |||||||||  |||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| || |||||||||||||||||    
T  15464 caagtcagtgtatttttcttctgtcgaagaagagagtggagcagagttcttgtctactaagcagctgaa 15532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 61; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 107
Target Start/End: Original strand, 11260 - 11360
Alignment:
Q  7 tcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgt 106  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||  |||||||||    
T  11260 tcgtgattttgagatggatttggtttgtctacctttcagtggtatggatgtgattcttggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgt 11359  T
Q  107 t 107  Q
    |    
T  11360 t 11360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 58; Significance: 1e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 180
Target Start/End: Original strand, 23682 - 23851
Alignment:
Q  11 gattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgtttta 110  Q
    |||||||| || ||||| |||||| | || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||  |||||||||| ||    
T  23682 gattttgagattgatttggtttgtttgcctttgagtggaatggatgtaattcttggtatgaactggttggagtataaccatgttcacattaattgttata 23781  T
Q  111 gcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaa 180  Q
     |||||| ||  |||| ||||| |||||| | || ||||| |||||||| || || ||||||||||||||    
T  23782 acaagtcggtgtatttttcttctgtcgaataagagagtggagcagagttcttgtcaactaagcagctgaa 23851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 180
Target Start/End: Original strand, 9735 - 9904
Alignment:
Q  11 gattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgtttta 110  Q
    |||||||| || ||||| |||||| | || |||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||  ||||| ||||  |||||||||| ||    
T  9735 gattttgagattgatttggtttgtttgcctttgagtagaatggatgtaattcttggtatgaactggttggagtgtaaccatgttcacattaattgttata 9834  T
Q  111 gcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaa 180  Q
      ||||| ||  |||| ||||  |||||||| || ||||  |||||||| || |||||||| || |||||    
T  9835 ataagtcggtgtatttttcttttgtcgaagaagagagtgcagcagagttcttgtctactaatcaactgaa 9904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 55; Significance: 9e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 71 - 1
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatga 71  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  71 gtttggtcatgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatga 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 132 - 209
Target Start/End: Original strand, 52430 - 52507
Alignment:
Q  132 ccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 209  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  52430 ccgtcgaagaggaaagtggtgtagagttcttgtctaccaagcagctgaagcagctggaacgcgatggtatgttgatgt 52507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 110514 - 110358
Alignment:
Q  27 tagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacattt 126  Q
    |||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| ||||||||| | || |||||    
T  110514 tagtttgtttacctttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagcaagacggtgcattt 110415  T
Q  127 ctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagca 183  Q
     ||||| |  ||||| || ||||| || |||||  |||||||||| ||| |||||||    
T  110414 ttcttctgcagaagaagagagtggagccgagttcctatctactaaacagttgaagca 110358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 5018 - 4838
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttatt 100  Q
    |||| |||| || |||||||| |||||||||||| |  | |||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||    
T  5018 gtttggtcgagactttgaaattgatttagtttgtttgtctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttggagtataaccatgttcatatt 4919  T
Q  101 aattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaag 181  Q
    |||||||| |  ||||| ||| |||| ||||| |  ||||| || ||||| ||| |||| ||  |||||||||||||||||    
T  4918 aattgtttcaataagtcggtatatttttcttctgctgaagaagagagtggagcaaagttattgactactaagcagctgaag 4838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 81 - 209
Target Start/End: Original strand, 231 - 361
Alignment:
Q  81 agtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagag--tttttatctactaagcagctg 178  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||| ||| ||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||| ||||||  ||||| ||||| |||||||||    
T  231 agtacaaccatgttcacattaattgttatagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagtttttttgtctaccaagcagctg 330  T
Q  179 aagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 209  Q
    |||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  331 aagcaactagaacgcaatggtattttgatgt 361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0423 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0423
Description:

Target: scaffold0423; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 90
Target Start/End: Original strand, 2643 - 2726
Alignment:
Q  7 tcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacca 90  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  2643 tcgtgattttgagatagatttggtttgtttacctttgagtggtatggatgtgattcttggtatgaactggttggaatacaacca 2726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0312 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0312
Description:

Target: scaffold0312; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 942 - 819
Alignment:
Q  9 gtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttt 108  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| || |  ||||||||||     
T  942 gtgattttgagatggatttggtttgtctacatttgagtggtatggatgtgattcttggtatgaattggttggaatacaaccatgtgcacattaattgtta 843  T
Q  109 tagcaagtcagtacatttctcttc 132  Q
     || ||||| ||  ||||||||||    
T  842 cagtaagtcggtgtatttctcttc 819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 8155 - 8217
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattct 63  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  8155 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattct 8217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 47 - 132
Target Start/End: Original strand, 4309 - 4394
Alignment:
Q  47 ggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttc 132  Q
    ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||| ||| | ||||| || |||||    
T  4309 ggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatatcaattgttttagtaagacggtacacttttcttc 4394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 6 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 15347 - 15258
Alignment:
Q  6 gtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttc 95  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15347 gtcgagattttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttc 15258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 74 - 209
Target Start/End: Original strand, 7106 - 7241
Alignment:
Q  74 tggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagc 173  Q
    ||||| ||||||||||| ||||  || ||||||| ||| ||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||    
T  7106 tggttggagtacaaccatgttcacatgaattgttctagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcggagaatttttgtctactaagc 7205  T
Q  174 agctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 209  Q
    ||||||||||  | ||||| |||||||| |||||||    
T  7206 agctgaagcagttagaacgtgatggtattttgatgt 7241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1615 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1615
Description:

Target: scaffold1615; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 92 - 209
Target Start/End: Original strand, 1198 - 1315
Alignment:
Q  92 gttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaac 191  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||||| ||  |||||||||| |   ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||  | ||||    
T  1198 gttcatattatttgttttagtaagtcggtgtatttctcttctgctaaagaggaaagtggcgcagagtttttgtctactaagtagctgaagcagttagaac 1297  T
Q  192 gcgatggtatcttgatgt 209  Q
    | |||||||| |||||||    
T  1298 gtgatggtattttgatgt 1315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1288 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1288
Description:

Target: scaffold1288; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 183
Target Start/End: Original strand, 254 - 411
Alignment:
Q  26 ttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatt 125  Q
    ||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||| | || ||||||||||||| ||| ||||  |||| ||||||||| ||||||||  | || ||||    
T  254 ttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtgatttttgggatgaactggttagggtataaccgagttcatattaattgctttagcaaaacggtgcatt 353  T
Q  126 tctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagca 183  Q
    | ||||| |  ||||| || ||||| || |||||  |||||||||| ||| |||||||    
T  354 tttcttctgctgaagaagagagtggagcggagttcctatctactaaacagttgaagca 411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 20719 - 20562
Alignment:
Q  26 ttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatt 125  Q
    ||||||||| |||| ||||  || |||||||| ||| | || ||||||| ||||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||    
T  20719 ttagtttgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaactagttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagcaagacagtgcatt 20620  T
Q  126 tctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagca 183  Q
    | ||||| |  ||| | |||||||| ||||||||  ||||||| || ||| |||||||    
T  20619 tttcttctgcggaacaagaaagtggagcagagttcctatctacaaaacagttgaagca 20562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 70 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 21102 - 20963
Alignment:
Q  70 gaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctact 169  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||  ||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||    ||| |||||||||| ||| | ||||| ||||||    
T  21102 gaactggttggagtataaccatgtttatattaattgttttagtaagtcggtgtatttctcttctactgaataggaaagtggcgcaaaatttttgtctact 21003  T
Q  170 aagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 209  Q
    ||||||||||| ||  ||||||  || ||||| |||||||    
T  21002 aagcagctgaaacagttggaacatgacggtattttgatgt 20963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1530 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1530
Description:

Target: scaffold1530; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 488 - 355
Alignment:
Q  26 ttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatt 125  Q
    ||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| ||||||||| | || ||||    
T  488 ttagtttgtttaccgttgacaggtatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgggttcatatcaattgctttagcaagacggtgcatt 389  T
Q  126 tctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 159  Q
    | ||||| |  ||||| || ||||| ||||||||    
T  388 tttcttctgcggaagaagagagtggagcagagtt 355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 11717 - 11608
Alignment:
Q  23 gatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtac 122  Q
    |||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| || |  |||| ||| || || ||||| ||| | ||||    
T  11717 gatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgtgatttttggtatgaattggttagagtataatcgggttcatatcaactgctttagtaagacggtac 11618  T
Q  123 atttctcttc 132  Q
    ||||||||||    
T  11617 atttctcttc 11608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 41 - 125
Target Start/End: Original strand, 8460 - 8544
Alignment:
Q  41 ttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatt 125  Q
    |||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||| ||||||||| ||| | |||||||    
T  8460 ttgagtggaatggatgtaatacttggtatgaactggttggagtataaccatgttcatattagttgttttagtaagacggtacatt 8544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 47 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 60623 - 60487
Alignment:
Q  47 ggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaa 146  Q
    ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||| ||||| ||| | || ||||| ||||| |  ||||| ||||    
T  60623 ggtatggatgtgatttttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatattaattgctttagtaagacggtgcatttttcttctgctgaagaagaaa 60524  T
Q  147 gtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagca 183  Q
    |||  || ||||| ||  ||||||| ||| |||||||    
T  60523 gtgaagctgagttcttgactactaaacagttgaagca 60487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 65 - 209
Target Start/End: Original strand, 114476 - 114620
Alignment:
Q  65 ggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttat 164  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||  ||||||||||||||| ||| | || ||||| ||||| |  ||||| || ||||  ||  |||||||      
T  114476 ggtatgaactggttggagtataaccatgtttatattaattgttttagtaagacggtgcatttttcttctgctgaagaagagagtgaagctaagtttttga 114575  T
Q  165 ctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 209  Q
    |||||||||||||||||||  | || || ||||| ||||||||||    
T  114576 ctactaagcagctgaagcagttagagcgtgatggaatcttgatgt 114620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 5656 - 5473
Alignment:
Q  26 ttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatt 125  Q
    ||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| ||||||||| |||| ||||    
T  5656 ttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgggttcatatcaattgctttagcaagacagtgcatt 5557  T
Q  126 tctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 209  Q
    | |||||    ||||| || ||||| || |||||  ||||||| || ||| |||||||  |||| || ||||| ||||| ||||    
T  5556 tttcttctacggaagaagagagtggagcggagttcctatctacgaaacagttgaagcagttggagcgggatggaatcttaatgt 5473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 198
Target Start/End: Original strand, 94278 - 94465
Alignment:
Q  11 gattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgtttta 110  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||||| |||   || |||||||| ||| | || ||||| |||||||| || ||||  ||   ||||||||||||||    
T  94278 gattttgaagtcgatttagtgtgtctaccgttgttggggatggatgttattttcgggatgaattggttagaatataaccgagtctgtattaattgtttta 94377  T
Q  111 gcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 198  Q
     |||| | || || || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||| || ||||||| ||| |||||||  ||||||| |||||    
T  94378 acaagacggtgcacttttcttctgtggaagaagagagtggggcagagtttctaactactaaacagttgaagcagttggaacgagatgg 94465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 181
Target Start/End: Original strand, 98982 - 99137
Alignment:
Q  26 ttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatt 125  Q
    ||||||||| | || ||||  ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||||||| | || ||||    
T  98982 ttagtttgtttgccgttgacgggtatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagcaagacggtgcatt 99081  T
Q  126 tctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaag 181  Q
    | ||||| |  ||||| || ||||| ||||| ||  || ||||||| ||| |||||    
T  99082 tttcttctgcggaagaagagagtggagcagaattcctaactactaaacagttgaag 99137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 66 - 180
Target Start/End: Original strand, 5328 - 5442
Alignment:
Q  66 gtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatc 165  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| ||||  ||| |||||| ||| ||||| ||  |||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| || ||    
T  5328 gtatgaactggttggagtataaccatgttcacattcattgttatagtaagtcggtgtatttttcttctgtcgaagaagatagtggagcagagttcttgtc 5427  T
Q  166 tactaagcagctgaa 180  Q
    ||||||  |||||||    
T  5428 tactaactagctgaa 5442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 26 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 1025 - 919
Alignment:
Q  26 ttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatt 125  Q
    ||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| ||||||||| | || ||||    
T  1025 ttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagcaagacggtgcatt 926  T
Q  126 tctcttc 132  Q
    | |||||    
T  925 tttcttc 919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Original strand, 57988 - 58062
Alignment:
Q  1 gttttgtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactg 75  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||    
T  57988 gtttggtcgagattttgaaattgatttggtttgtttacctttgagcggaatggatgtgatccttggtatgaactg 58062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1477 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1477
Description:

Target: scaffold1477; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 1124 - 979
Alignment:
Q  26 ttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatt 125  Q
    ||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||||| ||||||||| || |  |||| ||| ||||| ||||||||| | || ||||    
T  1124 ttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttgggatgaactagttagagtataatcgagttcatatcaattgctttagcaagacggtgcatt 1025  T
Q  126 tctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaa 171  Q
    | ||||| |  ||||| || ||||| ||||||||  ||||||||||    
T  1024 tttcttctgctgaagaagagagtggagcagagttcctatctactaa 979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 132
Target Start/End: Original strand, 4670 - 4755
Alignment:
Q  47 ggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttc 132  Q
    ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||| ||| |  ||||||| |||||    
T  4670 ggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatattaattgttttagtaagacgatacatttttcttc 4755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0304 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0304
Description:

Target: scaffold0304; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 198
Target Start/End: Original strand, 923 - 1056
Alignment:
Q  65 ggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttat 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| ||| ||||| | || ||||| ||||| |  ||||| || ||||| || |||||  |||    
T  923 ggtatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgcttttgcaagacggtgcatttttcttctgcggaagaagagagtggagcggagttcctat 1022  T
Q  165 ctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 198  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||| || |||||    
T  1023 ctactaaacagttgaagcagctggagcgtgatgg 1056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 11844 - 11759
Alignment:
Q  47 ggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttc 132  Q
    ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||| ||||| ||| | |||||||| |||||    
T  11844 ggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatattaattgctttagtaagacggtacatttttcttc 11759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 132
Target Start/End: Original strand, 49297 - 49382
Alignment:
Q  47 ggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttc 132  Q
    ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||| ||||| ||| |||| ||||| |||||    
T  49297 ggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatattaattgctttagtaagacagtgcatttttcttc 49382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 168
Target Start/End: Original strand, 9667 - 9767
Alignment:
Q  68 atgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatcta 167  Q
    |||||||||||||| || ||||  |||| ||| ||||||||||||||| | || ||||| ||||| |  ||||| |||||||| ||||||||  ||||||    
T  9667 atgaactggttagaatataaccgagttcatatcaattgttttagcaagacggtgcatttttcttctgcggaagaagaaagtggagcagagttcctatcta 9766  T
Q  168 c 168  Q
    |    
T  9767 c 9767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 47 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 34221 - 34070
Alignment:
Q  47 ggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaa 146  Q
    ||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||| |  |||| ||| ||||  ||||||||| | || ||||| |||||    ||||| || |    
T  34221 ggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtacaatcgagttcatatcaattactttagcaagacggtgcatttttcttctactgaagaagaga 34122  T
Q  147 gtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 198  Q
    |||| || |||||  |||||||||| ||| |||||||  ||||||| |||||    
T  34121 gtggagcggagttcctatctactaaacagttgaagcagttggaacgtgatgg 34070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 89
Target Start/End: Original strand, 1270 - 1345
Alignment:
Q  14 tttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaacc 89  Q
    |||||| |||| ||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||    
T  1270 tttgaagtggacttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataacc 1345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 29411 - 29249
Alignment:
Q  47 ggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaa 146  Q
    ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||| |||   |||||||| ||||  || || || || |    
T  29411 ggtatggatgtaatctttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatattaattgttttagtaagatggtacatttttcttatgttgaggaagaga 29312  T
Q  147 gtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttgatgt 209  Q
    |||  || ||||| ||  ||||||| ||| |||||||  | ||||| ||||| ||||||||||    
T  29311 gtgaagctgagttcttgactactaaacagttgaagcagttagaacgtgatggaatcttgatgt 29249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 180
Target Start/End: Original strand, 175788 - 175898
Alignment:
Q  70 gaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctact 169  Q
    |||||||||  |||| ||||| |||| |  |||||||||||| ||||| ||| |||| ||||| || ||||| || ||||| |||| ||| ||  |||||    
T  175788 gaactggttgaagtataaccatgttcattataattgttttagtaagtcggtatatttttcttctgttgaagaagagagtggagcagggttcttgactact 175887  T
Q  170 aagcagctgaa 180  Q
    |||||||||||    
T  175888 aagcagctgaa 175898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0664 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0664
Description:

Target: scaffold0664; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 50 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 6919 - 6854
Alignment:
Q  50 atggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 115  Q
    |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| |||||||||||||||    
T  6919 atggatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagcaag 6854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 47 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 51696 - 51611
Alignment:
Q  47 ggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttc 132  Q
    ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||  ||| | |||||||| |||||    
T  51696 ggtatggatgtaatctttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatattaattgttttattaagactgtacatttttcttc 51611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0509
Description:

Target: scaffold0509; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 11714 - 11630
Alignment:
Q  47 ggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctctt 131  Q
    ||||||||||| ||| | || ||||||||||| ||||| ||||| |||| ||| || |||||||| ||| |||| ||||| ||||    
T  11714 ggtatggatgtaatttttgggatgaactggttggagtataaccatgttcatatcaactgttttagtaagacagtgcatttttctt 11630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 51 - 115
Target Start/End: Original strand, 12770 - 12834
Alignment:
Q  51 tggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 115  Q
    ||||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| |||||||||    
T  12770 tggatgtgatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagcaag 12834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 51 - 115
Target Start/End: Original strand, 20950 - 21014
Alignment:
Q  51 tggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaag 115  Q
    ||||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| |||||||||    
T  20950 tggatgtgatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagcaag 21014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 53928 - 53780
Alignment:
Q  50 atggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtg 149  Q
    |||||||| ||| | || ||||||| ||||||||| ||||  |||| |||  |||||||||||||| | || ||||| ||||| |  ||||| || ||||    
T  53928 atggatgttatttttgggatgaactagttagagtataaccgagttcatatctattgttttagcaagacggtgcatttttcttctgcggaagaagatagtg 53829  T
Q  150 gtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 198  Q
    | ||||| ||  || ||||||| ||| |||||||  |||| ||||||||    
T  53828 gagcagaattcctaactactaaacagttgaagcagttggagcgcgatgg 53780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 29508 - 29372
Alignment:
Q  47 ggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaa 146  Q
    |||||||| |||||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| |||| |||| |  | ||||| ||||| |  ||||| || |    
T  29508 ggtatggaggtgatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttaacaagacgatgcatttttcttctgctgaagaagaga 29409  T
Q  147 gtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagca 183  Q
    |||| || |||||  |||||||||| ||| |||||||    
T  29408 gtggagctgagttcctatctactaaacagttgaagca 29372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 111
Target Start/End: Original strand, 63939 - 64003
Alignment:
Q  47 ggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 111  Q
    ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| |||||    
T  63939 ggtatggatgtgatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttag 64003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 325588 - 325440
Alignment:
Q  50 atggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtg 149  Q
    |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||| |||| |||||| ||| | || ||||| ||||| |  ||||| || ||||    
T  325588 atggatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattattttagaaagacggtgcatttttcttctgcggaagaagagagtg 325489  T
Q  150 gtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 198  Q
    | ||||| ||  || ||||||| ||| |||||||  |||| ||||||||    
T  325488 gagcagaattcctaactactaaacagttgaagcagttggagcgcgatgg 325440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University